令和３年度高性能汎用計算機高度利用事業「富岳」成果創出加速プログラム「大規模データ解析と人工知能技術によるがんの起源と多様性の解明」
成果報告書

令和４年５月３０日
国立大学法人 東京医科歯科大学
宮野

悟

目次
補助事業の名称 ........................................................................................................................................ - 1 1．補助事業の目的................................................................................................................................... - 1 2．当該年度（令和３年度）の事業実施計画........................................................................................... - 1 3．当該年度（令和 3 年度）の実施内容（成果） ................................................................................... - 2 3.1 大規模データ解析アプリケーションの実装と実行 ........................................................................ - 2 3.1.1 Genomon で 3,000 例の解析を実施する。 ............................................................................. - 2 3.1.2 クローンを単位としたネットワークの時間変化を SiGN でネットワークとして捉える方式を開発。 ......................................................................................................................................... - 4 3.1.3 説明可能な Deep Tensor に得られたネットワークデータをもちこみクローン間の因果関係の抽出を検討する。 ................................................................................................................... - 7 3.2 大規模データ創出によるとがんの起源と多様性の解明................................................................. - 9 3.2.1 膵がん、大腸がん、胃がん、および乳がんの初期病変の全ゲノムシーケンシンスによるクローン履歴を推定。 ....................................................................................................................... - 9 3.2.2 新規シングルセル解析プラットフォームを用いることにより、同一患者内で同一環境内に存在する複数クローンを区別して比較することで、新たな変異を獲得することにより引き起こされる形質変化や、特定の変異が選択される環境変化の改正を行う。 ..................................... - 10 3.2.3 大規模な検体集積を行ってきた骨髄性腫瘍 4000 検体、小児急性リンパ性白血病 1000 検体、悪性リンパ腫 500 検体の大規模な試料を用いた網羅的なドライバー遺伝子異常の解析を行う。
............................................................................................................................................... - 11 3.3 プロジェクトの総合的推進 ......................................................................................................... - 12 3.3.1 運営委員会 ............................................................................................................................ - 12 3.3.2 ニュースレター発行（電子版）............................................................................................ - 12 4．活動（研究会の活動等） .................................................................................................................. - 13 4.1 研究会 .......................................................................................................................................... - 13 4.2 受賞等 .......................................................................................................................................... - 13 4.3 メディアへの情報発信、ウェブサイト等での情報公開............................................................... - 13 4.4 書籍 .............................................................................................................................................. - 13 5．実施体制............................................................................................................................................ - 14 5.1

業務主任者 ................................................................................................................................. - 14 -5.2

業務項目別実施区分................................................................................................................... - 14 --1-

補助事業の名称「富岳」成果創出加速プログラム
大規模データ解析と人工知能技術によるがんの起源と多様性の解明

1．補助事業の目的
ゲノムシーケンスデータ解析パイプライン Genomon 及びネットワーク解析アプリケーションとネット
ワーク深層学習システム Deep Tensor 等により、正常組織においてどのように遺伝子変異クローンが生じるのか、遺伝子変異ないしその組み合わせがどのように細胞の表現型を決定するのか、さらには、その多様性・複雑性のために研究が進んでいないゲノムの構造異常が発がんにどう関わるのか、について解明する。

2．当該年度（令和 3 年度）の事業実施計画(1) 大規模データ解析アプリケーションの実装と実行
・Genomon で 3,000 例の解析を実施する。
・クローンを単位としたネットワークの時間変化を SiGN でネットワークとして捉える方式を開発。
・説明可能な Deep Tensor に得られたネットワークデータをもちこみクローン間の因果関係の抽出を検討する。
(2) 大規模データ創出によるとがんの起源と多様性の解明
・膵がん、大腸がん、胃がん、および乳がんの初期病変の全ゲノムシーケンシンスによるクローン履歴を推定。
・新規シングルセル解析プラットフォームを用いることにより、同一患者内で同一環境内に存在する
複数クローンを区別して比較することで、新たな変異を獲得することにより引き起こされる形質変化や、特定の変異が選択される環境変化の改正を行う。
・大規模な検体集積を行ってきた骨髄性腫瘍 4000 検体、小児急性リンパ性白血病 1000 検体、悪性リ
ンパ腫 500 検体の大規模な試料を用いた網羅的なドライバー遺伝子異常の解析を行う。
(3) プロジェクトの総合的推進
プロジェクト全体の連携を密としつつ円滑に運営してくための運営会議をビデオ会議システムなどを適宜利用して 1 ヶ月～3 ヶ月に 1 回の頻度で開催し、進捗状況を把握し、研究開発の進め方や課題等について検討する。プロジェクト内の研究の進捗状況および成果の発表のためのワークショップ等を年 1回程度の頻度で開催する。プロジェクトで得られた成果については学会発表や当該事業で開設したホームページ上で、積極的に公表する。一般を対象としたアウトリーチ活動を研究の進捗を見ながら行う。また、他のプロジェクトとの連携などにより、効率的・効果的な研究の推進を行う。

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3．当該年度（令和 3 年度）の実施内容（成果）
3.1 大規模データ解析アプリケーションの実装と実行
3.1.1 Genomon で 3,000 例の解析を実施する。
本年度、最初に取り組んだ課題は Genomon による多数検体の同時解析における障害の原因解明である。
「富岳」上での多数検体同時解析に障害があることは、昨年度の成果報告書にて記載した通りである。
表 1 に、「富岳」ジョブスケジューラの出力したログファイル等から確認された障害の一覧を示す。このうち、再現性のある障害は SIO エラーおよび結果出力の異常の 2 種である。以降、この二つに関して、「富岳」運用部門との共同による原因究明の結果を説明する。
表 3.1.1-1 多数検体同時解析時の障害リスト
症状

再現性

ラージページ使用時にメモリ消費量が多くなってしまう×

異常なメモリ消費量を示す

×

SIO エラーが起きているジョブがある○

ジョブ終了ステータスは正常（Normal）なのに、結果が一部のみ○

今回の多数検体解析では 10 パイプライン（異なる入力データセット 10 個）を同時に、独立に投入する形である。障害の原因として考えられる問題は、(A)パイプラインの多数検体同時解析機能そのもの、(B)入力データセットの不具合、(C)「富岳」と多数検体解析に起因する不具合、の 3 つである。まず、(A)および(B)の可能性について調査を実施した。
Genomon の性能評価では、1 パイプラインに対し 96 ノードを割り当て、入力データのサイズはおよそ 410GB 程度であった。障害のあったデータセット（以後、本データセットと呼ぶ）は平均約 370GB であり、データ量的には性能評価に使用した標準データセットより小さく、従って計算ノードのディスク容量およびメモリ容量で問題が起こることはない。先の(A)および(B)の可能性を調査するため、ここでは960 ノードを使用し 1 パイプラインおよび 5 パイプラインのテスト計算を実施した。その結果、どちらのテストもジョブが正常に終了することが確認された（図 3.1.1-1）。5 パイプラインについては、残り

図 3.1.1-1 960 ノード使用した本データセットに対する検証結果（左：1 パイプライン、右：5 パイプライン、カラーは各プロセスが実行中のタスク分類を示す。
）-2-

のデータセットについても同様に計算ジョブを実行し、正常に結果を得ることが出来た。よって、
Genomon の複数検体解析機能に問題がないこと(A)、および、全入力データの健全性(B)が確認された。
このことから、今回の障害は、「富岳」上で Genomon による多数検体の同時解析を実施する際にのみ起こる不具合が原因であると推測される。
図 3.1.1-1 に示したテスト計算における VGE（Virtual Grid Engine）各ワーカーの動作状況では、1 パ
イプラインと 5 パイプラインでの計算完了に要する時間に 2 倍以上の開きが確認できる。本テスト計算
における各パイプラインは独立動作であり、パイプライン間の依存関係は存在しない（Embarrassingly
Parallel: EP）。すなわち、1 パイプラインに対して 96 ノード分の計算資源を割り当て、10 パイプライン
分の計算を 1 ジョブにまとめた（96 ノード 1 パイプラインに対し、960 ノードで 10 パイプライン）だ
けの状態である。複数パイプラインの計算を纏めることによる負荷上昇は、Genomon の動作補助を担当している VGE 部分にのみ発生するが、こちらは京コンピュータ上で約 25,000 ワーカー（ノード）[3.1.11]および 75,000 ワーカー（ノード）での実績があり、約 4,000 ワーカーを使用する本テストではオーバーヘッドはほぼ無視しうることが分かっている。よって、本テスト計算における 2 ケースの解析時間に大きな開きは生じないはずであるが、テスト結果からは大きな開きが確認できるため、原因は「富岳」における複数パイプラインの同時解析の際に発生する不具合(C)と断定した。
以上のことから、「富岳」運用部門との共同調査を実施し、複数の原因の特定に至った。第 1 に、シス
テムの Quota 制限に到達したことでファイル書き込みが制限された。デフォルトの i-node 数制限が 30Mであり、これを超えたためにジョブが停止させられていたのである。こちらは、上限拡大申請により速やかに問題が解決した。第 2 に、ファイルシステムへの過負荷が確認された。Genomon では最初の処理がインプットファイルの分割であり、基本的にはファイルシステムの性能がそのまま処理時間に直結する。
10 パイプラインを同時に計算した場合、この分割処理で発生する I/O 負荷が「富岳」ファイルシステム
にとって非常に大きな負担であることが確認された。そのため、ファイルシステムの処理能力を最大限発揮できるよう、ジョブの割り当て形状を変更し、出来得る限り SIO/GIO ノードを沢山使用できる割り当て形状に変更した。この改良によりファイル I/O（unlink）に掛かる処理時間を 8.2 時間から 4 時間に短縮することに成功した。しかし、この改良を実施しても MDS の性能限界のためにパイプライン数を増やすことは出来ず、これ以上の高速化は不可能であるとの結論に至った。なぜなら、本ジョブの計算量でMDS への負荷が 50%（2 台中 1 台へのもの）であり、他ユーザジョブとの競合を考えた場合、これ以上増やせないとの判断になったからである。そのため、「富岳」の大規模ノード数の利用と VGE による動的負荷分散の効率的利用を断念し、インプットファイルの分割数を削減することにした。最終的に、初期設定の 25%まで分割数を削減することで、ノード形状変更後の 2.2 倍程度まで高速化に成功した（図3.1.1-2）。

-3-図 3.1.1-2 分割数削減前後での計算時間の変化（上：削減前、下：25%に削減後）
これ以上の分割数削減では計算時間の高速化が見られなかったため、この設定をもって「富岳」でのGenomon の安定稼働状態とした。
この設定を用いて多数検体の解析を実施し、東京大学ヒトゲノム解析センター（HGC）SHIROKANE
システムでの解析と合わせて計 3,000 検体の解析を実施した。
参考文献[3.1.1-1] Ito, S., Yadome, M., Nishiki, T. et al. Virtual Grid Engine: a simulated grid engine environment forlarge-scale supercomputers. BMC Bioinformatics 20, 591 (2019).
3.1.2 クローンを単位としたネットワークの時間変化を SiGN でネットワークとして捉える方式を開発。
本年度は、一細胞遺伝子発現データにおける実時間および仮想時間、また各種特徴量次元に沿った細胞クローンネットワークの推定およびネットワーク群の解釈方式の開発を目指して、SiGN モデルを基にした機械学習モデル群を開発した(Park et al., J Comp Biol, 2022; PLoS one, 2022)。同手法群では、多次元細胞空間における各種コンテキストに沿った細胞クローンごとのネットワーク推定およびネットワー
ク群の解釈を可能することを目指している。本年度は、異なる表現型および genetic dependency を持つ細胞株をクローンとみなし、多種の細胞株からなるデータセットに同方式を適用することで、抗がん剤の耐性を獲得するメカニズムの解明を目指し、薬剤感受性・耐性を支配している機構を反映した遺伝子ネッ
トワークの推定および解析を行い、関連するマーカー探索や遺伝子間の制御関係を抽出した。以下に、各手法について説明する。

-4-

図 3.1.2-1 多次元細胞空間における遺伝子ネットワーク推定手法
まず、薬剤感受性・Genetic Dependency による多次元細胞空間における遺伝子ネットワーク推定手法（Park et al., J Comp Biol, 2022）について説明する。抗がん剤の耐性を獲得するメカニズムの解明のた
め、細胞の特徴として、抗がん剤感受性とそれのターゲット遺伝子の Genetic Dependency を考慮し、多次元細胞空間における遺伝子ネットワークを推定した。推定された膨大・大量のネットワークを解釈のための数理モデル（NetSCCA）を開発した（図 3.1.2-1）。NetSCCA は、「薬剤感受性を持ち、その薬剤のターゲット遺伝子に依存している細胞」と「薬剤耐性を持ち、その薬剤の target 遺伝子に依存しない細胞」におけるそれぞれの遺伝子ネットワークを説明するのに重要な成分を抽出する技術であり、抽出された重要成分を解析することによって、その細胞における特徴を遺伝子間の因果関係として抽出可能な技術である。本研究では、Erlotinib と Gefitinib に着目し、「Erlotinib sensitivity & EGFR/NR1I2 dependency
specific network」と「Gefitinib sensitivity & EGFR dependency specific network」を推定し、2 つ薬剤の耐性のマーカー探索を行った。解析の結果、P63 に対する Keratin gene family の影響が薬剤感受性を持
つ細胞から耐性を持つ細胞に変化することによって、弱くなるまたは消失することが確認でき、P63 とKeratin gene family 間の因果関係を Erlotinib と Gefitinib 耐性のマーカーとして提案した。

-5-

図 3.1.2-2 細胞（株 or クローン）遺伝子ネットワーク推定手法および重要制御関係発見技術
次に、薬剤感受性・体制を支配する細胞株ごとの遺伝子ネットワーク推定および重要制御関係発見技術（Park et al., PLoS One, 2022）について説明する。従来の研究（発現量ベクトルに基づく予測モデル）の改善のため、薬剤感受性ネットワークを一細胞株単位で推定し、ネットワークを input とする予測モデ
ルを構築した。予測モデルとして、予測精度を優先し深層学習モデル（deep neural network, kernel support
vector machine, random forest）を使用した。しかしながら、深層学習モデルは、予測結果に関する解釈やマーカー探索が不可能という限界があり（Black box model）、感受性・耐性メカニズム解明には不十分である。Black Box 問題を解決するため、薬剤感受性の予測・説明における各 gene-gene interaction の重要度を提示可能な Xprediction を開発した（図 3.1.2-2）。開発した技術は、推定されたネットワークから
各 gene-gene interaction を消去した時の予測結果と消去なし場合の予測結果を評価・比較することによって、各 gene-gene interaction の薬剤耐性の予測に対する重要度を評価する技術である。深層学習モデ
ルの結果に重要な input を提示することで、薬剤感受性・耐性獲得メカニズム解明に重要なエビデンス提供や関連マーカー探索を可能にする技術である。開発した Xprediction を用いて、5 個の EGFR TKIs
（afatinib, dacomitinib, erlotinib, gefitinib, and osimertinib）の薬剤感受性ネットワーク解析を行い、EGFR
TKIs マーカーを抽出した。開発された技術は EGFR TKIs の薬剤感受性予測において、高予測精度を達成することが確認できた。また、抽出されたマーカーを従来の文献に基づいて validation した結果、強いエ
ビデンスを持っていることが確認できた。以上のように、単一細胞クローンネットワークの解析につながる結果を得た。
参考文献[3.1.2-1] Park H, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S. Uncovering Molecular Mechanisms of Drug Resistance
via Network-Constrained Common Structure Identification. J Comput Biol. 29(3):257-75 (2022).
[3.1.2-2] Park H, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S. Xprediction: Explainable EGFR-TKIs response
prediction based on drug sensitivity specific gene networks. PLoS One. 17(5):e0261630 (2022).

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3.1.3 説明可能な Deep Tensor に得られたネットワークデータをもちこみクローン間の因果関係の抽出を検討する。
令和 2 年度実施の説明可能な AI である Deep Tensor による分析を発展させ、令和 3 年度は説明可能な
AI である Wide Learning を用いて開発した特徴的な因果関係を持つ条件を網羅的に抽出する技術「発見する AI」による分析を実施した。しかし、ヒトの全 2 万個の遺伝子を対象とした網羅的な探索には通常の計算機で 4,000 年以上かかる試算であったため、処理の高速化が課題であった。今回、ヒトの全遺伝子を実用的な時間で分析できるよう条件探索と因果探索を行うアルゴリズムを並列化し、「富岳」上に実装することで、計算性能を最大限引き出した。DepMap[3.1.3-1]の公開データに対して本技術を実行した結果、ヒトの全遺伝子に対して条件と因果関係を一日以内で網羅的に探索し、肺がんの治療薬に耐性を持つ原因となる遺伝子を特定することに成功した。本成果は富士通と東京医科歯科大学の合同プレスリリー
スとして 2022 年 3 月 7 日に発表した[3.1.3-4]。以降、詳細を報告する。
薬剤開発や既存薬の再配置では臨床治験を効率よく実施することが求められている。そのためには、その薬剤の効果が期待される（遺伝子発現量や変異についての「条件」に合致する）患者をおおまかに同定する必要がある。しかし、薬剤の効果は、個人や臓器における遺伝子やその発現量などの条件によって異なる。その条件を単純に枚挙してもその総数は全人類の総数をはるかに上回り、1,000 兆通りを超える(注1)ほど膨大である。専門家は、これまでの研究成果とデータに基づき、特定の条件を設定し、実証してきた。しかし、こうした限界が見えてくる中、AI を活用して起こり得る条件を網羅的に探索しながら、データ駆動型の研究を加速し、医療や創薬を劇的に進歩させることが強く期待されている。
富士通では、重要な組み合わせを漏れなく超高速に見つける技術「Wide Learning[3.1.3-2]」を用いることで、特徴的な因果関係をもつ条件を網羅的に抽出する技術を開発した[3.1.3-3]。しかし、ヒトの全遺伝子を対象とした網羅的な探索には通常の PC だと 4,000 年以上かかる（試算）ため、処理の高速化が課題となっていた。
今回、ヒトの全遺伝子に対して 1 日以内の実用的な時間で分析できるよう、条件探索技術と因果探索技術を並列化し、スーパーコンピュータ「富岳」上で実装した。
「富岳」の持つプロセッサ間とプロセッ
サ内の並列性にあわせてアプリケーションを階層的に並列化することで、計算性能を最大限引き出している。更に、統計的な情報から AI を使い、有望な遺伝子の組み合わせに絞り込むことで、網羅的探索を
実用的な時間内に収める事ができた。
通常、一般に知られているデータマイニング技術は、専門家なら誰もが知っているたくさんのあまり価値のない事実を提示することが多い。そのため、現場は、「その中にはひょっとしてだれも見ていない有用な事実があるかもしれないが、それを探しだすことは大変な労力が必要で合理性がない」と考える。本
技術はその思考を一変する端緒となることが期待できる。
本技術を「富岳」上にて 10,000 ノード（
「富岳」全体では 158,976 ノード）を用いて実行したところ、ヒトの全遺伝子に対して条件と因果関係を 1 日以内で網羅的に探索することができた。肺がんの治療薬として知られるゲフィチニブは、EGFR 経路というがんの増殖を促進するメカニズムを標的とした分子標的薬であり、この活性化を押さえることでがんの進行を抑える薬として開発された。ところがゲフィチ
ニブの経口投与を続けると耐性が発生する現象が知られている。そこで、前出の DepMap の肺がん細胞株約 300 種についてその遺伝子発現データとゲフィチニブの感受性・耐性データを解析し、ゲフィチニ-7-

ブが効かない「がん細胞株の条件」と「ゲフィチニブが効かないメカニズム」を網羅的に探索した。その結果、「３つの転写因子 ZNF516, E2F6, EMX1 の発現量が低い」という「条件」を探り当て、その条件を満たす肺がん細胞株では、転写因子 SP7 と PRRX1 をトリガーとするメカニズムが耐性を生み出していることが最も強い因果として示唆された（図 3.1.3-1）。

図 3.1.3-1 「転写因子 ZNF516, E2F6, EMX1 の発現量が低い」条件下で新たに見出された因果関係(1) ZNF516：EGFR の発現を抑えることに寄与している遺伝子で、EFGR 経路を抑制することで細胞増殖をおさえる機能がある(Nat Commun. 2017 Sep 25;8(1):691）。この発現が低いことは、ゲフィチニブが標的としている経路が活性化している可能性があり、ゲフィチニブの効果が期待できる可能性ある。
(2) E2F6：転写因子 E2F ファミリーのひとつで、転写因子 E2F1 と E2F2 が細胞周期経路を回して細胞増殖を促進する一方、この遺伝子はその機能を阻害して細胞周期が回りにくくするといわれている（肝臓がんでの実験）。しかし、その機構は未解明である(Cell Signal. 2014 May;26(5):1075-1081)。この遺伝子の発現が低い、つまり、細胞周期経路に抑制がかかっていない可能性があり、細胞増殖が促進されている可能性がある。ゲフィチニブ標的の対象外の経路である。
(3) EMX1：腫瘍抑制遺伝子としての EMX1 および EMX2 の可能性は、いくつかのがんで示唆されている。Wnt 経路は細胞周期経路を促進することが知られているが (Crit Rev Biochem Mol Biol. 2017
Dec;52(6):614-637)、EMX1 遺伝子は Wnt 経路を抑制することが知られている(J Exp Clin Cancer Res.
2021 Aug 7;40(1):247)。この遺伝子の発現が低い、つまり、Wnt 経路は抑制されず、細胞周期がよく回っているため細胞増殖が進行している可能性が考えられる。これもゲフィチニブ標的の対象外の経路である。
以上をまとめると、Wide Learning は、ゲフィチニブあっても細胞増殖がとまらない（ゲフィチニブが効かない）がん細胞株の「条件」を探し出したと推察される。この条件を満たすがん細胞株において Wide
Learning が示唆した遺伝子間の因果関係を調べた。すると、骨形成において、遺伝子発現のスイッチとして働くことが知られている転写因子 SP7 （別名 Osterix）(Developmental Cell. 9 May 2016; 373: 238253)が、ゲフィチニブが効かないことの因果の上流に位置していた。

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転写因子 SP7 は、主に幹細胞や骨分化・形成との関連において注目されてきた。最近、乳がんのリンパ節転移に関連しており、浸潤・転移に関与しているという報告があったが、薬剤耐性についての言及はない(Cell Death Dis. 2019 Jan 10;10(1):28)。
PRRX1 は、肢芽中胚葉の発達の初期などの間葉系の細胞で発現する転写因子で、SP7 とともに幹細胞研究の中で注目されてきた(Nature. 2013 Mar 14;495(7440):227-30)。間葉系細胞は細胞遊走性をもっている細胞である。PPRX1 は幹細胞性の維持に貢献し、また上皮間葉転換（EMT）（がんが転移する際に上皮系の細胞から遊走性を獲得した間葉系の細胞に転換する現象）を制御することが知られている(Transl
Lung Cancer Res. 2020 Jun;9(3):731-744)。そして、EMT が肺がんにおけるゲフィチニブ耐性のメカニズムであるという総説も最近出ている(Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2019 Jan;1871(1):29-39)。しかし、現時点において、SP7 をゲフィチニブ耐性につなぐ一貫した論文は発表されておらず、実験系の研究によって詳細な詰めが行われることが期待される。
今回の研究で驚くべきことは、「富岳」でパワーアップした Wide Learning が、１日で、わずか 300 ほ
どのがん細胞株データから上述のストーリーを示唆したことである。また、ゲフィチニブ以外の薬剤に対しても同様の方法で、データから、特定の細胞株における強い因果関係を抽出することが可能である。
（注１）

考えられる条件の総数は 1,000 兆通りを超える：がんに関係することがわかっている主な 50 個の遺伝子の組み合わせに限定しても、各遺伝子の発現量は最低でも 2 分類あり（遺伝子の発現の「有り」「無し」など）、2 を 50 乗した場合、1,000 兆通りを超える。

参考文献[3.1.3-1] DepMap(https://depmap.org/portal/)[3.1.3-2] 正解が少ないデータでも高精度に学習する AI の新技術「Wide Learning」を開発（2018 年 9 月
19 日プレスリリース） （https://pr.fujitsu.com/jp/news/2018/09/19-2.html ）[3.1.3-3] ヒトやモノなどのデータの一つひとつが持つ特徴的な因果関係を発見する技術を開発(2020 年
12 月 17 日プレスリリース) (https://pr.fujitsu.com/jp/news/2020/12/17.html)[3.1.3-4] スーパーコンピュータ「富岳」と「発見する AI」で、がんの薬剤耐性に関わる未知の因果メカ
ニ ズ ム を 高 速 に 発 見 す る 新 技 術 を 開 発 (2022 年 3 月 7 日 プ レ ス リ リ ー ス )(https://pr.fujitsu.com/jp/news/2022/03/7.html)

3.2 大規模データ創出によるとがんの起源と多様性の解明
3.2.1 膵がん、大腸がん、胃がん、および乳がんの初期病変の全ゲノムシーケンシンスによるクローン履歴を推定。
がんの初期病変は、しばしば正常組織中の正常細胞にまで起源をたどることが可能である。今年度は主に乳腺および膵において癌患者の切除組織を用いた検討を行った。正常組織中の遺伝子変異クローンは微小であるため、新鮮凍結標本もしくはアルコールベースの固定後標本から切片を作成した後、レーザー
マイクロダイセクションを用いて上皮細胞を採取し、全ゲノム解析ないし全エクソン解析により遺伝子変異を同定した。同定した変異のアレル頻度は、検体中の変異細胞分画を表し、同一症例由来の複数検体で検出された遺伝子変異情報を用いてクローン構造解析を行った。乳腺では癌と共通する起源を有する
前癌病変や正常細胞を検出し得た。正常細胞から癌へと至る系統樹において、各分岐点の遺伝子変異の数-9-から年代推定が可能である。このため、様々な年齢の患者から上皮細胞を採取し、単一細胞由来コロニーを全ゲノム解析することで乳腺において変異蓄積速度を求めた。この結果に基づけば、乳がんの起源細胞
は診断の約 10～20 年前に生じ、特に幼少期にまで遡ることが判明した。今後はさらに症例の蓄積し、正常組織における遺伝子変異クローンからの発がんについて解析を続ける。
また、本課題での成果のがんの多様性の解明について、がん発症後のがんの進化モデルの観点から宮野のグループを中心として研究してきたものを総括した Review 論文発表した(Niida et al. J. of Human
Genet. 2021;66: 869–878)。これは、本課題におけるもう一つのテーマ「がんの起源の解明」は、がんが発症する前の状態に注力し、がんへの移行をゲノムの変異としてとらえるものである。この Review 論文
は、本課題では、その２つをブリッジするものである。2019 年度に終了した新学術領域「システム癌新次元（領域番号：４７０１：領域代表 宮野悟）では、当時「がんの起源」と「がんの多様性」の両面からの研究は、その端緒はつけられてはいたが、科学的成果の発表までには至っていなかった。その後、がんの起源の解明が、がん研究の中心の一つになっている現在、発がん後のがんの進化による多様性の獲得についての知見を数理モデルによるアプローチとして総括しておくことががんの起源から発がん、そして多様性の獲得を理解するために学問上重要と考えこの Review を発表した。
以上のことから、本研究の背景には「富岳」以前に終了した新学術領域研究によるデータ獲得と多様性に関連する初等的データ解析研究があり、「富岳」では「がんの起源と多様性の解明」につなげることができた。小川の研究の方向を的確にすることに貢献したことは言うまでもない。
がんはゲノムが進化していく過程で複雑性（ヘテロ性）を獲得することがこれまでの研究で知られているが、その背景にある数理的仕組みはよくわかっていなかった。これまで多くの研究者のチャレンジはあったが、小規模トイモデルにとどまっていた。大規模なエージェントモデリングのためには、大規模な 4次元情報（位置、時間）を含むがんゲノムデータが不可欠であるが、本課題が始まる前に終了していた新学術領域で、小川とともに九州大学病院別府病院外科の三森功士教授は大腸がんに関する最適なデータを取得しており、新井田と宮野はそのデータに基づく数理モデリング（100 万細胞レベル）をとおして、大腸がんの早期から末期に至るまでのがんの多様性の獲得について大腸がんの手術検体との比較により重要な知見を得ていた。国立がん研究センターの柴田龍彦教授は本 Review を書く際に、これまでの知見について情報を提供した。その観点から、三森教授と柴田教授は 2021 年度の本研究課題の協力者とはしていない。がんの起源を解明する研究に重要な研究手法をあたえる Review である。
3.2.2 新規シングルセル解析プラットフォームを用いることにより、同一患者内で同一環境内に存在する
複数クローンを区別して比較することで、新たな変異を獲得することにより引き起こされる形質変化や、特定の変異が選択される環境変化の改正を行う。
ドライバー変異の獲得とクローン選択の繰り返しによってがんは発症、進展する。遺伝子変異の有無に基づいて細胞を分離することは不可能であるため、我々は遺伝子変異と遺伝子発現を同時に測定可能なシングルセル解析プラットフォームを開発した。この系を用いて、骨髄異形成症候群（MDS）から急性白血病（AML）に進展した症例と、健常高齢者の骨髄で認められる前白血病細胞であるクローン造血の症例の解析を行った。治療下での白血病進展例の解析では、複数の異なる RAS 経路の変異を有する独立したクローンを認めた。興味深いことに、拡大傾向にあるクローンでは、E2F 経路などの増殖シグナルや- 10 -

UPR シグナルの亢進を認め、難治性クローンの病態を理解する上で興味深い結果であった。
健常高齢者における、白血病ドライバー変異を有する細胞（クローン性造血）の解析では、変異を有する細胞で同様に E2F 経路などの増殖シグナルの亢進を認めた。重要なことに、TET2 変異を有する高齢者の、TET2 変異を有しない細胞に増殖シグナルやインターフェロン反応の亢進を認め、骨髄環境に異常を生じていることが明らかになった。いずれの系も引き続き詳細な解析を継続している。
3.2.3 大規模な検体集積を行ってきた骨髄性腫瘍 4,000 検体、小児急性リンパ性白血病 1,000 検体、悪性リンパ腫 500 検体の大規模な試料を用いた網羅的なドライバー遺伝子異常の解析を行う。
骨髄系腫瘍については、全ゲノムシーケンス 436 例、全エクソームシーケンス 673 例の解析を実施することで、遺伝子変異、コピー数異常、構造異常といったゲノム異常の全体像を明らかにすると共に、
CHD4、NFIX、HNRNPK などの新規ドライバー遺伝子の候補を検出した。また、全ゲノムシーケンスに基づく非コード領域の変異から、転写調節領域や non-coding RNA における新規ドライバー候補を探索した。小児急性リンパ性白血病については、1,003 例のターゲットシーケンス解析を実施し、CCND3、CICなどリンパ性白血病では報告のなかったドライバー遺伝子の変異を見出した。また、ゲノム異常の統合解析によって、ETV6-RUNX1 サブタイプと CCND3 変異、hypodiploid サブタイプと CIC 変異、TCF3-PBX1
サブタイプと PHF6 変異の間に興味深い共存関係を発見した。今後は、900 例の骨髄系腫瘍について解析深度の高い全ゲノムシーケンスを実施することで、コーディング領域、非コード領域のドライバーの探索、並びにコピー数異常、構造異常についても、さらに詳細な解析を行っていく。
悪性リンパ腫の最頻病型である DLBCL の 456 例の検体を用いて、臨床病理学的・分子病理学的検討を行い、*BCL2、MYC*転座を有する症例群の本邦における実態を調べ、診断基準の変更を提唱した。PTCLNOS の遺伝学的特徴から大きく 3 つの亜型に分類できる事を示した 。384 検体のウイルス関連リンパ腫を含む様々な亜型のリンパ腫を解析し、EBV 関連リンパ腫の 22％に PD-L1/PD-L2 の異常があることを発見した。皮下脂肪織炎様 T 細胞リンパ腫(SPTCL)の原因遺伝子として*TIM3*の胚細胞変異を発見した。

- 11 -

3.3 プロジェクトの総合的推進
プロジェクト全体の連携を密としつつ円滑に運営していくため、運営委員会や研究会の開催等、参画各機関の連携・調整を行った。特に、プロジェクト全体の進捗状況を確認しつつ計画の合理化を検討し、必要に応じて調査或いは外部有識者を招聘して意見を聞くなどの方策を取り、プロジェクトを推進した。またニュースレター（電子版）発行、ホームページ運営、シンポジウム等の参加、人材育成活動、広報活動
やアウトリーチ活動への参加などを通じて研究の進捗と連携を推進した。プロジェクトの今後の展開に資するため、得られた成果については、積極的に公表した。
3.3.1 運営委員会
プロジェクト運営を円滑かつ効率的に行うために、本課題責任者、参加機関および協力機関の関係者などで構成した運営委員会を実施している。研究開発およびプロジェクトの総合的推進における活動進捗の確認や計算資源の配分、課題についての調整等を、参画各機関と協調して行った。
令和 3 年度は以下の日程で開催した。
第1回

6 月 25 日（金）ZOOM によるオンライン開催

第2回

7 月 29 日（木） ZOOM によるオンライン開催

第3回

8 月 27 日（金） ZOOM によるオンライン開催

第4回

9 月 24 日（金） ZOOM によるオンライン開催

第 5 回 10 月 22 日（金）ZOOM によるオンライン開催
第 6 回 11 月 26 日（金） ZOOM によるオンライン開催
第 7 回 12 月 24 日（金）ZOOM によるオンライン開催
第8回

1 月 28 日（金） ZOOM によるオンライン開催

第9回

2 月 25 日（金） ZOOM によるオンライン開催

第 10 回 3 月 25 日（金） ZOOM によるオンライン開催
3.3.2 ニュースレター発行（電子版）
一般および企業等を対象として、研究開発の進捗や成果などを分かりやすく説明することで研究活動の理解を深めるとともに、社会における重要性や価値の理解促進を図るため、ニュースレター(図 3.3.31)を発行しホームページ上で公開した。

図 3.3.3-1 ニュースレター（No.2 ~ No.4）- 12 -

4．活動（研究会の活動等）
4.1 研究会
日時

研究会名

場所

人数

2022 年 3 月 3 日

令和 3 年度シンポジウム 大規模データ解析と人工知能技術によ

オンライン

181

るがんの起源と多様性の解明
4.2 受賞等
小川弥穂, 次世代研究者賞, 「富岳」成果創出加速プログラム研究交流会, 2022 年 3 月 13-14 日
4.3 メディアへの情報発信、ウェブサイト等での情報公開
スーパーコンピュータ「富岳」と「発見する AI」で、がんの薬剤耐性に関わる未知の因果メカニズムを高速に発見する新技術を開発(2022 年 3 月 7 日プレスリリース)(https://pr.fujitsu.com/jp/news/2022/03/7.html)
4.4 書籍特記事項なし。

- 13 -

5．実施体制
5.1

業務主任者（受託者（委託先））
役職・氏名 国立大学法人東京医科歯科大学 M&D データ科学センター 特任教授 宮野 悟
E-メールアドレス： miyano[あっとまーく]hgc.jp（再委託先）
役職・氏名 国立大学法人京都大学大学院 医学研究科腫瘍生物学講座 教授

小川 誠司

E-メールアドレス：sogawa-tky[あっとまーく]umin.ac.jp（再委託先）
役職・氏名 愛知県がんセンター研究所 システム解析学分野 分野長 山口 類
E-メールアドレス：r.yamaguchi[あっとまーく]aichi-cc.jp※[あっとまーく]は適切な記号に変換して使用すること。
5.2

業務項目別実施区分
業務項目

担当機関

担当責任者

（１）大規模データ解析アプリケ

東京医科歯科大学 M&D データ科学セ

宮野 悟（特任教授）

ーションの実装と実行

ンター
愛知県がんセンター研究所システム

山口 類（分野長）

解析学分野（２）大規模データ創出によると

京都大学大学院医学研究科腫瘍生物

がんの起源と多様性の解明

学講座（３）プロジェクトの総合的推進

東京医科歯科大学M&Dデータ科学セン 宮野 悟（特任教授）
ター- 14 -

小川 誠司（教授）別添１ 学会等発表実績
学術論文誌発表リスト
掲載した論文
（発表題目）

発表した場所

発表者氏名（学会誌・雑誌等名）

発表

国内・

した

外 の

時期

別
国外

Uncovering Molecular

Park H, Yamaguchi

J Comput Biol.,2022

Mechanisms of Drug

R, Imoto S, Miyano

29(3):257-75.

年1

Resistance via Network-

S.

月Constrained Common
Structure
Identification
Molecular classification

Fujii Y, Sato Y,

Cancer Cell.

2021

and diagnostics of upper

Suzuki H, Kakiuchi

2021;39(6):793-809 e798.

年6urinary tract urothelial

N, Yoshizato T,

carcinoma.

Lenis AT, Maekawa

国外

月S, Yokoyama A,
Takeuchi Y, Inoue
Y, Ochi Y, Shiozawa
Y, Aoki K, Yoshida
K, Kataoka K,
Nakagawa MM, Nannya
Y, Makishima H,
Miyakawa J, Kawai
T, Morikawa T,
Shiraishi Y, Chiba
K, Tanaka H, Nagae
G, Sanada M,
Sugihara E, Sato
TA, Nakagawa T,
Fukayama M, Ushiku
T, Aburatani H,
Miyano S, Coleman
JA, Homma Y, Solit
DB, Kume H, Ogawa
S.
A genetically defined

Hoyer K,

EBioMedicine.

2021

signature ofHablesreiter R,

2021;66:103327.

年4responsiveness toInoue Y, Yoshida K,- 15 -

月国外

erlotinib in early-stage

Briest F, Christen

pancreatic cancer

F, Kakiuchi N,

patients: Results from

Yoshizato T,

the CONKO-005 trial.

Shiozawa Y,
Shiraishi Y,
Striefler JK,
Bischoff S, Lohneis
P, Putter H, Blau
O, Keilholz U,
Bullinger L, Pelzer
U, Hummel M, Riess
H, Ogawa S, Sinn M,
Damm F.

High prevalence of

Kato H, Maezawa Y,

Exp Hematol. 2022.

2022

myeloid malignancies in

Nishijima D,

年2progeria with Werner

Iwamoto E, Takeda

月

syndrome is associatedJ, Kanamori T,

with p53 insufficiency.

Yamaga M, Mishina

国外

T, Takeda Y, Izumi
S, Hino Y, Nishi H,
Ishiko J, Takeuchi
M, Kaneko H,
Koshizaka M, Mimura
N, Kuzuya M,
Sakaida E, Takemoto
M, Shiraishi Y,
Miyano S, Ogawa S,
Iwama A, Sanada M,
Yokote K.
Discovery of Functional

Li X, Kim W, Arif

Cancers (Basel).

2021

Alternatively Spliced

M, Gao C, Hober A,

2021;13(2)年1PKM Transcripts in Human

Kotol D, Strandberg

Cancers.

L, Forsstrom B,

月.

Sivertsson A,
Oksvold P, Turkez
H, Grotli M, Sato
Y, Kume H, Ogawa S,
Boren J, Nielsen J,- 16 -

国外

Uhlen M, Zhang C,
Mardinoglu A.
Stratification of

Li X, Kim W,

iScience.

2021

patients with clear cellJuszczak K, Arif M,

2021;24(7):102722.

年7renal cell carcinoma toSato Y, Kume H,

facilitate drug

Ogawa S, Turkez H,

repositioning.

Boren J, Nielsen J,

国外

月

Uhlen M, Zhang C,
Mardinoglu A.
Alteration of the immune

Mikami T, Kato I,

Cancer Sci.

2021

environment in bone

Wing JB, Ueno H,

2022;113(1):41-52.

年 11marrow from children

Tasaka K, Tanaka K,

with recurrent B cell

Kubota H, Saida S,

precursor acuteUmeda K, Hiramatsu

lymphoblastic leukemia.

H, Isobe T,

国外

月Hiwatari M, Okada
A, Chiba K,
Shiraishi Y, Tanaka
H, Miyano S,
Arakawa Y, Oshima
K, Koh K, Adachi S,
Iwaisako K, Ogawa
S, Sakaguchi S,
Takita J.
Indolent feature of

Nikaido M, Kakiuchi

Helicobacter pylori-

N, Miyamoto S,

年5uninfected intramucosal

Hirano T, Takeuchi

月

signet ring cellY, Funakoshi T,

carcinomas with CDH1

Yokoyama A,

mutations.

Ogasawara T,
Yamamoto Y, Yamada
A, Setoyama T,
Shimizu T, Kato Y,
Uose S, Sakurai T,
Minamiguchi S,
Obama K, Sakai Y,
Muto M, Chiba T,
Ogawa S, Seno H.

- 17 -

Gastric Cancer. 2021.

2021

国外

Clonal evolution andOchi Y, Yoshida K,

Nat Commun.

2021

clinical implications ofHuang YJ, Kuo MC,

2021;12(1):2833.

年5genetic abnormalities in

Nannya Y, Sasaki K,

blastic transformation

Mitani K, Hosoya N,

of chronic myeloid

Hiramoto N,

leukaemia.

Ishikawa T,

国外

月

Branford S,
Shanmuganathan N,
Ohyashiki K,
Takahashi N, Takaku
T, Tsuchiya S,
Kanemura N,
Nakamura N, Ueda Y,
Yoshihara S, Bera
R, Shiozawa Y, Zhao
L, Takeda J,
Watatani Y, Okuda
R, Makishima H,
Shiraishi Y, Chiba
K, Tanaka H, Sanada
M, Takaori-Kondo A,
Miyano S, Ogawa S,
Shih LY.
Frequent mutations in

Polprasert C,

Leuk Lymphoma.

2020

HLA and related genes in

Takeuchi Y,

2021;62(1):95-103.

年9extranodal NK/T cell

Makishima H,

lymphomas.

Wudhikarn K,

月Kakiuchi N,
Tangnuntachai N,
Assanasen T, SitthiW, Muhamad H,
Lawasut P,
Kongkiatkamon S,
Bunworasate U,
Izutsu K, Shiraishi
Y, Chiba K, Tanaka
H, Miyano S, Ogawa- 18 -

国外

S, Yoshida K,
Rojnuckarin P.
Soluble PD-L1 works as a

Sagawa R, Sakata S,

JCI Insight. 2022;7(1).

2022

decoy in lung cancer

Gong B, Seto Y,

年1immunotherapy via

Takemoto A, Takagi

月

alternative

S, Ninomiya H,

polyadenylation.

Yanagitani N, Nakao

国外

M, Mun M, Uchibori
K, Nishio M,
Miyazaki Y,
Shiraishi Y, Ogawa
S, Kataoka K,
Fujita N, Takeuchi
K, Katayama R.
Combined landscape of

Saiki R, Momozawa

Nat Med. 2021.

2022

single-nucleotide

Y, Nannya Y,

年7variants and copy number

Nakagawa MM, Ochi

月

alterations in clonal

Y, Yoshizato T,

hematopoiesis.

Terao C, Kuroda Y,

国外

Shiraishi Y, Chiba
K, Tanaka H, Niida
A, Imoto S, Matsuda
K, Morisaki T,
Murakami Y,
Kamatani Y, Matsuda
S, Kubo M, Miyano
S, Makishima H,
Ogawa S.
Genomic analysis of two

Sato-Otsubo A,

Pediatr Blood Cancer.

2022

rare cases of pediatricOsumi T, Yoshida M,

2022;69(3):e29427.

年3

Ph-positive T-ALL.

Iguchi A, Fukushima

国外

月T, Nakabayashi K,
Ogawa S, Hata K,
Kato M.
Frequent genetic

Shimada K, Yoshida

Blood. 2021;137(11):1491-

2021

alterations in immune

K, Suzuki Y,

1502.

年3

checkpoint-related genes

Iriyama C, Inoue Y,
Sanada M, Kataoka- 19 -

月国外

in intravascular large

K, Yuge M, Takagi

B-cell lymphoma.

Y, Kusumoto S,
Masaki Y, Ito T,
Inagaki Y, Okamoto
A, Kuwatsuka Y,
Nakatochi M,
Shimada S, Miyoshi
H, Shiraishi Y,
Chiba K, Tanaka H,
Miyano S, Shiozawa
Y, Nannya Y, Okabe
A, Kohno K, Atsuta
Y, Ohshima K,
Nakamura S, Ogawa
S, Tomita A, Kiyoi
H.

ClinicalTanaka H, Lee H,

Int J Infect Dis. 2021.

2021

Characteristics ofMorita A, Namkoong

年9Patients with

H, Chubachi S,

月Coronavirus Disease

Kabata H, Kamata H,(COVID-19): Preliminary

Ishii M, Hasegawa

Baseline Report of Japan

N, Harada N, Ueda

COVID-19 Task Force, aT, Ueda S, Ishiguro

Nation-wide Consortium

T, Arimura K, Saito

to Investigate HostF, Yoshiyama T,

Genetics of COVID-19.

Nakano Y, Mutoh Y,

国外Suzuki Y, Murakami
K, Okada Y, Koike
R, Kitagawa Y,
Tokunaga K, Kimura
A, Imoto S, Miyano
S, Ogawa S, Kanai
T, Fukunaga K,
Japan C-TF.
Oncogenic FGFR1

Tasaka K, Ueno H,

mutation andYamasaki K, Okuno

年2amplification in common

T, Isobe T, Kimura

月

cellular origin in a

- 20 -

Cancer Sci. 2021.

2022

国外

composite tumor with

S, Umeda K, Hara J,

neuroblastoma andOgawa S, Takita J.

pheochromocytoma.
A possible association

Yasudo H, Ando T,

Hepatology. 2021.

2021

between a novel NLRP1

Maehara A, Ando T,

年3mutation and an

Izawa K, Tanabe A,

月

autoinflammatory disease

Kaitani A, Nomura

involving liver

S, Seki M, Yoshida

cirrhosis.

K, Oda H, Okamoto

国外

Y, Wang H, Kamei A,
Kojima M, Kimura M,
Uchida K, Nakano N,
Kaneko J, Ebihara
N, Hasegawa K,
Shimizu T, Takita
J, Ogawa H, Okumura
K, Ogawa S, Tamura
N, Kitaura J.
Clonal expansion in non-Kakiuchi N, Ogawa

cancer tissues.

S.

Nat Rev Cancer. 2021.

2021

国外

年2
月

A growing genetic tree

Ogawa S.

in the soil of prostate.

Cell Stem Cell.

2021

2021;28(7):1185-1187.

年7

国外

月
Mathematical Modeling

Aoki K, Suzuki H,

Cancer Res.

2021

and Mutational Analysis

Yamamoto T,

2021;81(18):4861-4873.

年7Reveal Optimal Therapy

Yamamoto KN, Maeda

to Prevent Malignant

S, Okuno Y, Ranjit

Transformation in Grade

M, Motomura K, Ohka

II IDH-Mutant Gliomas.

F, Tanahashi K,
Hirano M, Nishikawa
T, Shimizu H,
Kitano Y, Yamaguchi
J, Yamazaki S,
Nakamura H,
Takahashi M, Narita
Y, Nakada M,
Deguchi S,- 21 -

月国外

Mizoguchi M, Momii
Y, Muragaki Y, Abe
T, Akimoto J,
Wakabayashi T,
Saito R, Ogawa S,
Haeno H, Natsume A.
Clonal hematopoiesis isArends CM,

Blood. 2022;139(10):1593-

2022

associated with improved

Dimitriou S,

1597.

年3

survival in patients

Stahler A,

with metastatic

Hablesreiter R,

colorectal cancer from

Strzelecka PM,

the FIRE-3 trial.

Stein CM, Tilgner

国外

月M, Saiki R, Ogawa
S, Bullinger L,
Modest DP,
Stintzing S,
Heinemann V, Damm
F.
Patient-specific MDS-RS

Asimomitis G,

Blood Adv. 2022.

2022

iPSCs define the mis-

Deslauriers AG,

年1spliced transcript

Kotini AG, Bernard

月repertoire and chromatin

E, Esposito D,

landscape of SF3B1-

Olszewska M, Spyroumutant HSPCs.

N, Arango Ossa JE,

国外Mortera-Blanco T,
Koche RP, Nannya Y,
Malcovati L, Ogawa
S, Cazzola M,
Aaronson SA,
Hellstrom-Lindberg
E, Papaemmanuil E,
Papapetrou EP.
Aged healthy mice

Chin DWL, Yoshizato

Blood. 2022;139(4):629-

2022

acquire clonal

T, Virding Culleton

634.

年1

hematopoiesis mutations.

S, Grasso F,

月

Barbachowska M,
Ogawa S, Jacobsen
SEW, Woll PS.

- 22 -

国外

Proteogenomic

Hirama T, Tokita S,

JCI Insight. 2021.

2021

identification of an

Nakatsugawa M,

年7immunogenic HLA class I

Murata K, Nannya Y,

月neoantigen in mismatch-

Matsuo K, Inoko H,

repair-deficient

Hirohashi Y,

colorectal cancer

Hashimoto S, Ogawa

tissue.

S, Takemasa I, Sato

国外

N, Hata F, Kanaseki
T, Torigoe T.
The Evolving Genomic

Hirata H, Niida A,

Cancer Res. 2021.

2021

Landscape of Esophageal

Kakiuchi N, Uchi R,

年 10

Squamous Cell Carcinoma

Sugimachi K, Masuda

月

Under Chemoradiotherapy.

T, Saito T,

国外

Kageyama SI,
Motomura Y, Ito S,
Yoshitake T,
Tsurumaru D,
Nishimuta Y,
Yokoyama A,
Hasegawa T, Chiba
K, Shiraishi Y, Du
J, Miura F, Morita
M, Toh Y, Hirakawa
M, Shioyama Y, Ito
T, Akimoto T,
Miyano S, Shibata
T, Mori M, Suzuki
Y, Ogawa S,
Ishigami K, Mimori
K.
Successful treatment of

Honda T, Yamaoka M,

Int J Hematol.

2021

hepatosplenic T-cell

Terao YM, Hasegawa

2022;115(1):140-145.

年9lymphoma with

D, Kumamoto T,

fludarabine, high-dose

Takagi M, Yoshidacytarabine andK, Ogawa S, Goto H,

subsequent unrelated

Akiyama M.

月umbilical cord bloodtransplantation.

- 23 -

国外

Mapping the humanInitiative C-HG.

Nature. 2021.

2021

genetic architecture of

年7

COVID-19.

月

Reduced-intensity

Koyamaishi S, Kamio

Bone Marrow Transplant.

2021

conditioning isT, Kobayashi A,

2021;56(5):1013-1020.

年5effective forSato T, Kudo K,

hematopoietic stem cell

Sasaki S, Kanezakitransplantation in young

R, Hasegawa D,

pediatric patients with

Muramatsu H,

Diamond-Blackfan anemia.

Takahashi Y,

国外

国外

月

Sasahara Y,
Hiramatsu H, Kakuda
H, Tanaka M,
Ishimura M, Nishi
M, Ishiguro A, Yabe
H, Sarashina T,
Yamamoto M, Yuza Y,
Hyakuna N, Yoshida
K, Kanno H, Ohga S,
Ohara A, Kojima S,
Miyano S, Ogawa S,
Toki T, Terui K,
Ito E.
Patient-specific MDS-RS

Asimomitis G,

Blood Adv. 2022.

iPSCs define the mis-

Deslauriers AG,

年1spliced transcript

Kotini AG, Bernard

月repertoire and chromatin

E, Esposito D,

landscape of SF3B1-

Olszewska M, Spyroumutant HSPCs

N, Arango Ossa JE,
Mortera-Blanco T,
Koche RP, Nannya Y,
Malcovati L, Ogawa
S, Cazzola M,
Aaronson SA,
Hellstrom-Lindberg
E, Papaemmanuil E,
Papapetrou EP.

- 24 -

2022

国外

[Acquired platelet

Momose H, Nishikii

Rinsho Ketsueki.

2021

dysfunction with severe

H, Kozuma Y, Ota-

2021;62(9):1406-1411.

年9

bleeding tendency inTsutsumi I, Nannya

triple-negative

Y, Yoshida C,

myelofibrosis].

Komeno T, Kusakabe

国内

月

M, Yokoyama Y, Kato
T, Kurita N,
Sootome A, SakataYanagimoto M, Obara
N, Hasegawa Y,
Ogawa S, Chiba S.
Analysis of disease

Mu A, Hira A, Niwa

Blood. 2021;137(15):2021-

2021

model iPSCs derived from

A, Osawa M, Yoshida

2032.

年4

patients with a novel

K, Mori M, Okamoto

Fanconi anemia-like

Y, Inoue K, Kondo

IBMFS ADH5/ALDH2

K, Kanemaki MT,

deficiency.

Matsuda T, Ito E,

国外

月

Kojima S, Nakahata
T, Ogawa S, Tanaka
K, Matsuo K, Saito
MK, Takata M.
Clonal Cytopenia of

Murakami K,

Intern Med. 2021.

2021

Undetermined

Yamaguchi Y, Kida

年5Significance in a

Y, Morikawa Y,

月

Patient with Congenital

Ujiie H, Sugahara

Wilms' Tumor 1 and

H, Nannya Y, Ogawa

Acquired DNMT3A GeneS, Kanakura Y.

国外

Mutations.
Development ofNakamura F, Arai H,

Philadelphia chromosome-

Nannya Y, Ichikawa

年1negative acute myeloid

M, Furuichi S,月leukemia with IDH2 andNagasawa F,

NPM1 mutations in a

Takahashi W, Handa

patient with chronic

T, Nakamura Y,

myeloid leukemia who

Tanaka H, Nakamura

showed a major molecular

Y, Sasaki K, Miyano

response to tyrosine

S, Ogawa S, MitaniK.

- 25 -Int J Hematol. 2021.

2021

国外

kinase inhibitor
therapy.
Targeted deep next

Okabe M, Morishita

Eur J Haematol. 2021.

2021

generation sequencing

T, Yasuda T,

年7identifies potential

Sakaguchi H, Sanada

月

somatic and germline

M, Kataoka K, Ogawa

variants for

S, Shiraishi Y,

predisposition to

Ichiki T, Kawaguchi

familial Burkitt

Y, Ohbiki M,

lymphoma.

Matsumoto R, Osaki

国外

M, Goto T, Ozawa Y,
Miyamura K.
Clonal evidence for the

Ono R, Ueno H,

Cancer Sci. 2021.

2021

development of

Yoshida K,

年5neuroblastoma withTakahashi S,月

extensive copy-neutral

Yoshihara H, Nozaki

loss of heterozygosity

T, Suzuki K,

arising in a mature

Nakazawa A, Saiki

teratoma.

R, Seki M, Takita

国外J, Ogawa S, Manabe
A, Hasegawa D.
Complete Bone Marrow

Saito K, Sato T,

Intern Med. 2022.

2022

Necrosis with Charcot-

Notohara K, Nannya

年2Leyden Crystals Caused

Y, Ogawa S, Ueda Y.

月

国外

by Myeloid Neoplasm with
Mutated NPM1 and TET2.
Germline RUNX1

Sakurai M, Nannya

Ann Hematol.

2022

translocation in

Y, Yamazaki R,

2022;101(1):237-239.

年1familial platelet

Yamaguchi K, Koda

disorder with propensity

Y, Abe R, Yokoyama

to myeloid malignancies.

K, Ogawa S, Mori T.

Essential

Sasaki K, Nannya Y,

Hematology.

2021

thrombocythaemia with

Nakamura Y,

2021;26(1):594-600.

年 12aggressive

Ichikawa M, Ogawa

megakaryocytosis after

S, Mitani K.

myelofibrotictransformation.

- 26 -

国外

月

月

国外

Optimization of

Senda N, Kawaguchi-

Cancer Sci. 2021.

2021

prediction methods for

Sakita N, Kawashima

年6risk assessment ofM, Inagaki-Kawata

月

pathogenic germline

Y, Yoshida K,

variants in the Japanese

Takada M, Kataoka

population.

M, Torii M,

国外

Nishimura T,
Kawaguchi K, Suzuki
E, Kataoka Y,
Matsumoto Y,
Yoshibayashi H,
Yamagami K, Tsuyuki
S, Takahara S,
Yamauchi A,
Shinkura N, Kato H,
Moriguchi Y,
Okamura R, Kan N,
Suwa H, Sakata S,
Mashima S,
Yotsumoto F,
Tachibana T, Tanaka
M, Togashi K, Haga
H, Yamada T, Kosugi
S, Inamoto T,
Sugimoto M, Ogawa
S, Toi M.
Identification of an

Shibata S, Inano S,

Int J Hematol.

2021

asymptomatic Shwachman-

Watanabe M,

2022;115(3):428-434.

年 10Bodian-Diamond syndrome

Fujiwara K, Ueno H,

mutation in a patient

Nannya Y, Kanda J,

with acute myeloid

Kawasaki N, Okamoto

leukemia.

Y, Takiuchi Y,
Fukunaga A, Tabata
S, Ogawa S,
Takaori-Kondo A,
Kitano T.

- 27 -

月国外

Next-generation

Shimizu T, Kondo T,

J Cell Mol Med.

2021

sequencing in two cases

Nannya Y, Watanabe

2021;25(14):7095-7099.

年6of de novo acute

M, Kitawaki T,

basophilic leukaemia.

Shindo T, Hishizawa

国外

月M, Yamashita K,
Ogawa S, TakaoriKondo A.
Genetic features of B-

Shirai R, Osumi T,

Cancer Rep (Hoboken).

2021

cell lymphoblastic

Sato-Otsubo A,

2021:e1559.

年9lymphoma with TCF3-PBX1.

Nakabayashi K, Mori

国外

月

T, Yoshida M,
Yoshida K, Kohri M,
Ishihara T, Yasue
S, Imamura T, Endo
M, Miyamoto S, Ohki
K, Sanada M,
Kiyokawa N, Ogawa
S, Yoshioka T, Hata
K, Takagi M, Kato
M.
Profiling the inhibitory

Takamatsu K, Tanaka

Nat Commun.

2021

receptors LAG-3, TIM-3,

N, Hakozaki K,

2021;12(1):5547.

年9and TIGIT in renal cell

Takahashi R,

carcinoma reveals

Teranishi Y,

malignancy.

Murakami T,

国外

月

Kufukihara R, Niwa
N, Mikami S,
Shinojima T, Sasaki
T, Sato Y, Kume H,
Ogawa S, Kakimi K,
Kamatani T, Miya F,
Tsunoda T, Aimono
E, Nishihara H,
Sawada K, Imamura
T, Mizuno R, Oya M.
Basal cell carcinoma on

Takata M, Komori T,

J Eur Acad Dermatol2021

the ventral site of the

Ishida Y, Fujimoto

Venereol. 2022;36(2):e128-

年9

e130.

月

- 28 -

国外

finger with an intronic

M, Ogawa S,

deletion of SUFU gene.

Kabashima K.

Highly immunogenic

Takeuchi Y,

Sci Immunol.

2021

cancer cells requireTanegashima T, Sato

2021;6(65):eabc6424.

年 11

activation of the WNTE, Irie T, Sai A,

pathway for

Itahashi K, Kumagai

immunological escape.

S, Tada Y, Togashi

国外

月Y, Koyama S, Akbay
EA, Karasaki T,
Kataoka K, Funaki
S, Shintani Y,
Nagatomo I, Kida H,
Ishii G, Miyoshi T,
Aokage K, Kakimi K,
Ogawa S, Okumura M,
Eto M, Kumanogoh A,
Tsuboi M, NishikawaH.
Co-mutation pattern,

Todisco G, Creignou

Leukemia. 2021;35(8):2371-

2020

clonal hierarchy, and

M, Galli A,

2381.

年 12

clone size concur to

Guglielmelli P,

determine disease

Rumi E, Roncador M,

phenotype of SRSF2(P95)-

Rizzo E, Nannya Y,

mutated neoplasms.

Pietra D, Elena C,

国外

月Bono E, Molteni E,
Rosti V, Catricala
S, Sarchi M,
Dimitriou M,
Ungerstedt J,
Vannucchi AM,
Hellstrom-Lindberg
E, Ogawa S, Cazzola
M, Malcovati L.
The HTLV-1 viral

Vandermeulen C,

PLoS Pathog.

2021

oncoproteins Tax and HBZO'Grady T, Wayet J,

2021;17(9):e1009919.

年9reprogram the cellular

Galvan B, Maseko S,

mRNA splicing landscape.

Cherkaoui M,
Desbuleux A, Coppin- 29 -

月国外

G, Olivet J, Ben
Ameur L, Kataoka K,
Ogawa S, Hermine O,
Marcais A, Thiry M,
Mortreux F,
Calderwood MA, Van
Weyenbergh J,
Peloponese JM,
Charloteaux B, Van
den Broeke A, Hill
DE, Vidal M,
Dequiedt F, Twizere
JC.
Maturing papillomatous

Tsujimura M, Kaku

Pathol Int. 2022;72(1):59-

2021

nevoid melanoma in the

Y, Takeuchi Y,

64.

年 10

scalp mimicking

Ishida Y, Fujimotorecurrent melanocytic

M, Usui S, Yamada

nevus: A case report ofY, Ogawa S, Shea

previously undescribed

CR, Haga H.

国外

月

subtype of nevoidmelanoma.
Dramatic response to

Wada F, Hiramoto N,. Am J Hematol. 2021.

2021

encorafenib in a patient

Yamashita D, Hara

年5with Erdheim-Chester

S, Furukawa Y,月

disease harboring theIshii J, Nagata K,

BRAF(V600E) mutation

Nannya Y, Ogawa S,

国外

Ishikawa T.
A histone modifier,

Yamamoto K, Goyama

Cell Rep.

2021

ASXL1, interacts with

S, Asada S, Fujino

2021;36(8):109576.

年8NONO and is involved inT, Yonezawa T, Satoparaspeckle formation in

N, Takeda R,

hematopoietic cells.

Tsuchiya A,
Fukuyama T, Tanaka
Y, Yokoyama A, Toya
H, Kon A, Nannya Y,
Onoguchi-Mizutani
R, Nakagawa S,
Hirose T, Ogawa S,- 30 -

月国外

Akimitsu N,
Kitamura T.
Two novel high-risk

Yasuda T, Sanada M,

Blood. 2021.

2022

adult B-cell acute

Kawazu M, Kojima S,

年3lymphoblastic leukemia

Tsuzuki S, Ueno H,

月

subtypes with highIwamoto E, Iijima-

expression of CDX2 andYamashita Y, Yamada

IDH1/2 mutations.

T, Kanamori T,

国外

Nishimura R,
Kuwatsuka Y, Takada
S, Tanaka M, Ota S,
Dobashi N, Yamazaki
E, Hirose A,
Murayama T, Sumi M,
Sato S, Tange N,
Nakamura Y,
Katsuoka Y, Sakaida
E, Kawamata T, Iida
H, Shiraishi Y,
Nannya Y, Ogawa S,
Taniwaki M, Asou N,
Hatta Y, Kiyoi H,
Matsumura I, Horibe
K, Mano H, Naoe T,
Miyazaki Y,
Hayakawa F.
Hematopoietic stem

Yoroidaka T,

Leukemia. 2021.

progenitor cells lacking

Hosokawa K, Imi T,

年4

HLA differ from those

Mizumaki H,

月lacking GPI-anchored

Katagiri T,

proteins in the

Ishiyama K,

hierarchical stage andYamazaki H, Azuma

sensitivity to immune

F, Nanya Y, Ogawa

attack in patients with

S, Nakao S.

acquired aplastic
anemia.

- 31 -

2021

国外

NUDT15 variants confer

Yoshida M,

Blood Adv. 2021.

2021

high incidence of second

Nakabayashi K, Yang

年 12malignancies in children

W, Sato-Otsubo A,

月with acute lymphoblastic

Tsujimoto SI,

leukemia.

Ogata-Kawata H,

国外

Kawai T, Ishiwata
K, Sakamoto M,
Okamura K, Yoshida
K, Shirai R, Osumi
T, Moriyama T,
Nishii R, Takahashi
H, Kiyotani C,
Shioda Y, Terashima
K, Ishimaru S, Yuza
Y, Takagi M,
Arakawa Y,
Kinoshita A, Hino
M, Imamura T,
Hasegawa D,
Nakazawa Y, Okuya
M, Kakuda H,
Takasugi N, Inoue
A, Ohki K, Yoshioka
T, Ito S, Tomizawa
D, Koh K, Matsumoto
K, Sanada M,
Kiyokawa N, Ohara
A, Ogawa S, ManabeA, Niwa A, Hata K,
Yang JJ, Kato M.
HLA class I allele-

Hosokawa K,

Blood. 2021.

lacking leukocytes

Mizumaki H,

年6predict rare clonal

Yoroidaka T,

月evolution to MDS/AML in

Maruyama H, Imi T,

patients with acquired

Tsuji N, Urushiharaaplastic anemia.

R, Tanabe M,
Zaimoku Y, Nguyen
MAT, Tran DC,- 32 -

2021

国外

Ishiyama K,
Yamazaki H,
Katagiri T,
Takamatsu H,
Hosomichi K, Tajima
A, Azuma F, Ogawa
S, Nakao S.
Clinical significance of

Kaburagi T, Yamato

Haematologica.

2022

RAS pathway alterations

G, Shiba N, Yoshida2022;107(3):583-592.

年3

in pediatric acute

K, Hara Y, Tabuchi

myeloid leukemia.

K, Shiraishi Y,

国外

月Ohki K, Sotomatsu
M, Arakawa H,
Matsuo H, Shimada
A, Taki T, Kiyokawa
N, Tomizawa D,
Horibe K, Miyano S,
Taga T, Adachi S,
Ogawa S, Hayashi Y.
Whole-genome landscape

Kogure Y, Kameda T,

Blood. 2022;139(7):967-

2022

of adult T-cell

Koya J, Yoshimitsu

982.

年2

leukemia/lymphoma

M, Nosaka K,

月Yasunaga JI,
Imaizumi Y,
Watanabe M, Saito
Y, Ito Y, McClure
MB, Tabata M,
Shingaki S,
Yoshifuji K, Chiba
K, Okada A,
Kakiuchi N, Nannya
Y, Kamiunten A,
Tahira Y, Akizuki
K, Sekine M, Shide
K, Hidaka T, Kubuki
Y, Kitanaka A,
Hidaka M, Nakano N,
Utsunomiya A, Sica

- 33 -

国外

RA, AcunaVillaorduna A,
Janakiram M, ShahU, Ramos JC,
Shibata T, Takeuchi
K, Takaori-Kondo A,
Miyazaki Y,
Matsuoka M,
Ishitsuka K,
Shiraishi Y, Miyano
S, Ogawa S, Ye BH,
Shimoda K, Kataoka
K.
Single-Cell Analysis of

Koya J, Saito Y,

Blood Cancer Discov.

2021

the Multicellular

Kameda T, Kogure Y,

2021;2(5):450-467.

年9Ecosystem in Viral

Yuasa M, Nagasaki

Carcinogenesis by HTLV-1

J, McClure MB,

国外

月Shingaki S, Tabata
M, Tahira Y,
Akizuki K,
Kamiunten A, Sekine
M, Shide K, Kubuki
Y, Hidaka T,
Kitanaka A, Nakano
N, Utsunomiya A,
Togashi Y, Ogawa S,
Shimoda K, Kataoka
K.
Modeling colorectal

Niida A, Mimori K,

J. of Human Genet.

2021

cancer evolution

Shibata T, Miyano

2021;66: 869–878.

年5

S.

月

- 34 -

国外

学会等口頭発表リスト
発表した成果
（発表題目、口頭・発表者氏名発表した場所

発表した時

国内・（所属機関）（学会等名）

期外の別2022/3/14

国内

ポスター発表の別）
スーパーコンピュ

小川弥穂

文部科学省

ーターを活用した(東京医科歯科大学 M&D データ科学センスーパーコンピ

全ゲノムシーケン

ター統合解析分野, 東京大学医科学研

ューター「富岳」

スに基づくがんゲ

究所造血病態制御学分野)

成果創出加速プ

ノム医療の現場

ログラム(ポスター)

研究交流会

Molecular

Yoshikage Inoue, Nobuyuki Kakiuchi,

Americanclassification

Kenichi Yoshida, Yasuhito Nanya,

Association

and risk

Yusuke Shiozawa, Yasuhide Takeuchi,

for Cancer

stratification of

Yoichi Fujii, Yuichi Shiraishi,

Researchcolorectal cancer

Kenichi Chiba, Tetsuichi Yoshizato,

Annual Meeting(ポスター）

Satoshi Nagayama, Yoshiharu Sakai,

2021

(web)

2021/4/10

国外

2021/4/10

国外

2021/4/10

国外

Seishi Ogawa (Kyoto Univ)
Genetic analysis

Tomonori Hirano, Nobuyuki Kakiuchi,

Americanof metachronous

Yasuhide Takeuchi, Tomomi

Association

pancreatic

Nishimura, Toshihiko Masui, Sachikofor Cancer

cancers(ポスタMinamiguchi, Hironori Haga,

Researchー）

Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka,

Annual Meeting

Yuichi Shiraishi, Satoru Miyano,

2021

Norimitsu Uza, Yuzo Kodama, Hiroshi
Seno, and Seishi Ogawa, (Kyoto
Univ)
Clonal expansion

Yoshihiro Ishida; Nobuyuki

Americanof skinKakiuchi; Yoichi Fujii; Tomonori

Association

keratinocyte (口Hirano; Yoshikage Inoue; Tomomi

for Cancer

頭）Nishimura; Tatsuki Ogasawara;

Research

Hirona Maeda; Yuichi Shiraishi;

Annual Meeting

Kenichi Chiba; Hiroko Tanaka;

2021

Satoru Miyano; Atsushi Otsuka;
Kenji Kabashima; Seishi Ogawa(Kyoto
Univ)- 35 -

Clonal evolution

Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

AACR Annualand chronic

2021/4/13

国外

2021/7/1

国内

2021/9/3

国内

2021/9/11

国外

2021/9/23

国内

Meeting 2021

inflammation(口頭）
乳管上皮増殖性病

西村 友美、垣内 伸之, 吉田 健

第 29 回変から乳癌へ至る

一, 竹内 康英, 前田 紘奈, 塩澤

乳癌学会学術総クローン進化(口裕介, 中川 正宏, 越智 陽太郎,

会頭）

佐伯 龍之介, 川田 有希子, 片岡
竜貴 , 桜井 孝規, 馬場

日本

郷子, 白

石

友一, 千葉 健一, 竹内 賢吾, 羽賀博典, 宮野 悟, 戸井川誠司(Kyoto Univ)

雅和, 小尿路上皮癌におけ藤井陽一、佐藤悠佑,垣内伸之, 白石友第 86 回日本泌

る尿中ゲノムバイ

一, 西松寛明,岡根谷利一, 牧島秀樹,

尿器科学会東部

オマーカーの臨床

川合剛人, 中川徹, 宮野悟, 小川誠司,

総会

応用の可能性(口久米春喜(Kyoto Univ)

頭）Clonal expansion

Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

2021 JCA-AACR

in apparently

2021 Precisionnormal tissues

Cancer(口頭）

Medicine
International
Conference

Clonal evolution

Yotaro Ochi, Kenichi Yoshida,

第 83 回日本血and clinicalYasuhito Nannya, Ko Sasaki, Kinuko

液学会学術集会

impact of genetic

Mitani, Noriko Hosoya, Nobuhiro

lesions in blast

Hiramoto, Takayuki Ishikawa, Kazuma

crisis of chronic

Ohyashiki, Naoto Takahashi, Tomoiku

myeloid leukemia.

Takaku, Shun Tsuchiya, Nobuhiro(口頭）

Kanemura, Nobuhiko Nakamura,
Yasunori Ueda, Satoshi Yoshihara,
Yusuke Shiozawa, Lanying Zhao, June
Takeda, Yosaku Watatani, Rurika
Okuda, Hideki Makishima, Yuichi
Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko
Tanaka, Masashi Sanada, Akifumi
Takaori-Kondo, Satoru Miyano, Lee-- 36 -

Yung Shih and Seishi Ogawa. (Kyoto
Univ)

The molecular

Ayana Kon, Masahiro M Nakagawa,

第 83 回日本血pathogenesis of

Keisuke Kataoka, Ryosaku Inagaki,

液学会学術集会

DDX41-mutated

Hideki Makishima, Manabu Nakayama,

myeloid neoplasms

Haruhiko Koseki, Yasuhito Nannya,(口頭）

Seishi Ogawa. (Kyoto Univ)

Post- azacitidine

Nannya Yasuhito, Magnus Tobiasson,

第 83 回日本血clone size

Sato Shinya, Elsa Bernard, Ohtake

液学会学術集会

predicts long-

Shigeki, Takeda June1, Zhao

term clinical

Lanying, Kusakabe Manabu, Shibata

outcome of

Yuhei, Nakamura Nobuhiko, Watanabe

patients with

Mizuki, Hiramoto Nobuhiro, Shiozawa

myelodysplastic

Yusuke1, Shiraishi Yuichi,

syndromes andMakishima Hideki1, Nakagawa

acute myeloid

Masahiro1, Taguchi Masataka,leukemia(口頭）Kiguchi Toru, Ohyashiki Kazuma,

2021/9/23

国内

2021/9/23

国内

2021/9/23

国内

2021/9/30

国内

Ishikawa Takayuki, Takaori Akifumi,
Tsurumi Hisashi, Kasahara Senji,
Chiba Shigeru, Naoe Tomoki, Miyano
Satoru, Elli Papaemanui, Miyazaki
Yasushi, Eva Hellström Lindberg,
Ogawa Seishi. (Kyoto Univ)
造血器腫瘍臨床に

Yasuhito Nannya(Kyoto Univ)

おけるパネル検査

第 83 回日本血液学会学術集会の活用 ~生殖細胞
系列変異~(口頭）
Non-cellMasahiro M Nakagawa, Ryosaku

第 80 回 日本

autonomous

Inagaki, Yasuhito Nannya1, Zhao

癌学会学術総会

effects of

Lanying, Yotaro Ochi, June Takeda1,

mutated cells in

Xingxing Qi1, Akinori Yoda, Ayana

the pathogenesis

Kon, Tetsuichi Yoshizato, Nobuyuki

of clonal

Kakiuchi, Hideki Makishima, Shuichi- 37 -

hematopoiesis.

Matsuda and Seishi Ogawa(Kyoto

(口頭）

Univ)

Combined

Ryunosuke Saiki, Yukihide Momozawa,

第 83 回日本血landscape ofYasuhito Nannya, Masahiro M

液学会学術集会

single-nucleotide

Nakagawa, Yotaro Ochi, Tetsuichi

variants andYoshizato, Chikashi Terao, Yutaka

copy-number

Kuroda, Yuichi Shiraishi, Kenichi

alterations in

Chiba, Hiroko Tanaka, Atsushi

clonalNiida, Seiya Imoto, Koichi Matsuda,

hematopoiesis (口Takayuki Morisaki, Yoshinori

頭）Murakami, Yoichiro Kamatani,

2021/9/23

国内

2021/9/24

国内

2021/9/24

国内

2021/9/24

国内

Shuichi Matsuda, Michiaki Kubo,
Satoru Miyano, Hideki Makishima,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
慢性疾患の克服を

垣内 伸之(Kyoto Univ)

第 1 回 関西共目指した細胞のク

創の場 若手人

ローン進化の解析

材育成セミナー(口頭）
CTX-712, a novel

Akinori Yoda, Daisuke Morishita,

第 83 回日本血CLK inhibitor

Yotaro Ochi, Akio Mizutani, June

液学会学術集会

targeting myeloid

Takeda, Hirokazu Tozaki, Yoshihikoneoplasms with

Satoh, Yasuhito Nannya, Hideki

SRSF2 mutation(口Makishima, Hiroshi Miyake, Seishi

頭）Ogawa(Kyoto Univ)

EPOR/JAK/STAT

June Takeda , Kenichi Yoshida ,第 80 回 日本

Pathway is a

Akinori Yoda , Masahiro Nakagawa ,癌学会学術総会

Promising

Yasuhito Nannya , Lee-Yung Shih,

Therapeutic

Kenichi Chiba , Yuichi Shiraishi ,TargetYoichiro Ochi , Takuto Mori ,in Acute

Lanying Zhao , Rurika Okuda ,Erythroid

Xingxing Qi , Daisuke Morishita ,Leukemia(口頭）Yasunobu Nagata, AkiraHangaishi , Ken Ishiyama ,TsurumiHisashi, Toshiyuki Kitano ,- 38 -

Yasushi Miyazaki 0 , Nobuhiro
Hiramoto , Takayuki Ishikawa ,Akifumi Takaori-Kondo , Hiroko
Tanaka , Kensuke Usuki , Shuichi
Miyawaki , Satoru Miyano , Arnold
Ganser , Michael Heuser , Felicitas
Thol , Ming-Chung Kuo , Hideki
Makishima and Seishi Ogawa(Kyoto
Univ)
Combined

Ryunosuke Saiki, Yukihide Momozawa,

16th

landscape ofYasuhito Nannya, Masahiro M

International

single-nucleotide

Nakagawa, Yotaro Ochi, Tetsuichi

Congress onvariants andYoshizato, Chikashi Terao, Yutaka

Myelodysplasti

copy-number

Kuroda, Yuichi Shiraishi, Kenichi

c Syndromes

alterations in

Chiba, Hiroko Tanaka, Atsushi

clonalNiida, Seiya Imoto, Koichi Matsuda,

hematopoiesis:

Takayuki Morisaki, Yoshinori

analysis in

Murakami, Yoichiro Kamatani,

11,234 Japanese

Shuichi Matsuda, Michiaki Kubo,

individuals.（口Satoru Miyano, Hideki Makishima,

頭）Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

骨髄性腫瘍の遺伝

越智陽太郎(Kyoto Univ)

第 83 回日本血子変異による転写

2021/9/24

国外

2021/9/25

国内

液学会学術集会異常の解明と新規治療法の開発（口頭）DiseaseSeishi Ogawa(Kyoto Univ)

MDS20212021/9/25

国外

Genetic analysis

Tomonori Hirano, Nobuyuki Kakiuchi,

第 80 回 日本

2021/9/30

国内

of synchronous or

Yasuhide Takeuchi, Toshihiko Masui,

癌学会学術総会

metachronous

Yuichi Shiraishi, Satoru Miyano,multiple

Norimitsu Uza, Yuzo Kodama,pancreaticAtsuhiro Masuda, Takeshi Tanaka,

cancers（ポスタHiroshi Seno, Tsutomu Chiba, Seishiー）Ogawa(Kyoto Univ)

Progression
Biology（口頭）- 39 -

Distinct

Masahiro M Nakagawa, Ryosaku

第 83 回日本血pathogenesis of

Inagaki, Yutaka Kuroda, Yasuhito

液学会学術集会clonalNannya, Zhao Lanying, Yotaro Ochi,

hematopoiesis

June Takeda, Xingxing Qi, Akinori

revealed by

Yoda, Ayana Kon, Tetsuichi

single-cell

Yoshizato, Nobuyuki Kakiuchi,

sequencing. （口Hideki Makishima, Shuichi Matsuda

頭）and Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

Clonal evolution

Tomomi Nishimura, Nobuyuki

第 80 回 日本

of proliferative

Kakiuchi, Kenichi Yoshida, Yasuhide

癌学会学術総会

lesions into

Takeuchi, Hirona Maeda, Yusuke

breast cancers

Shiozawa, Masahiro Hirata, Tatsuki（口頭）

R. Kataoka, Takaki Sakurai, Satoko

2021/9/23

国内

2021/10/1

国内

2021/10/1

国内

2021/10/1

国内

2021/10/1

国内

Baba, Kengo Takeuchi, Hironori
Haga, Satoru Miyano8), Masakazu
Toi, Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
CTX-712, a novel

Akinori Yoda, Daisuke Morishita,

第 80 回 日本

CLK inhibitor

Yotaro Ochi, Akio Mizutani, June

癌学会学術総会

targeting myeloid

Takeda, Hirokazu Tozaki, Yoshihikoneoplasms with

Satoh, Yasuhito Nannya, Hideki

SRSF2 mutation

Makishima, Hiroshi Miyake, Seishi（口頭）

Ogawa(Kyoto Univ)

Genetic

Yoshikage Inoue, Nobuyuki Kakiuchi,

第 80 回 日本

classification in

Kenichi Yoshida, Yasuhito Nanya,

癌学会学術総会

colorectal cancer

Yusuke Shiozawa, Yasuhide Takeuchi,（口頭）

Yoichi Fujii, Yuichi Shiraishi,
Kenichi Chiba, Tetsuichi Yoshizato,
Satoshi Nagayama, Yoshiharu Sakai,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

Clonal expansion

Hirona Maeda, Nobuyuki Kakiuchi,

第 80 回 日本

in bile duct

Takashi Ito, Eri Ogawa, Masahiro

癌学会学術総会

associated with

Shiokawa, Norimitsu \uza, Yoko

chronic

Tanaka, Yasuhito Nannya, Hideki

inflammation（口Makishima, Hiroaki Yasuda, Yuzo

頭）Kodama, Shinji Uemoto, Satoru
Miyano, Seishi Ogawa(Kyoto Univ)- 40 -ETNK1 mutations

Rurika Okuda, Yasuhito Nannya,

第 83 回日本血defines a

Yotaro Ochi, Kazuhisa Chonabayashi,

液学会学術集会

subclass of

Hideki Makishima, Tetsuichi

der(1;7)(q10;p10)

Yoshizato, Yasunobu Nagata, Junein

Takeda, Kenichi Yoshida, Masashi

myelodysplastic

Sanada, Ayana Kon、 Yuichi

syndromes（口頭）Shiraishi, Satoru Miyano, Yoshiko

2021/9/23

国内

2021/10/1

国内

2021/10/2

国内

2021/10/2

国内

Atsuta, Senji Kasahara, Hiroshi
Handa, Shigeru Chiba, Kazuma
Ohyashiki, Yoshinori Yoshida,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
Der(1;7)(q10;p10)

Rurika Okuda, Yasuhito Nannya,

第 80 回日本癌presents with a

Yotaro Ochi, Kazuhisa Chonabayashi,

学会学術総会

unique genetic

Hideki Makishima, Tetsuichi

profile andYoshizato, Yasunobu Nagata, Junefrequent ETNK1

Takeda, Kenichi Yoshida, Masashi

mutations in

Sanada, Ayana Kon、 Yuichi

myeloid neoplasms

Shiraishi, Satoru Miyano, Yoshiko（口頭）

Atsuta, Senji Kasahara, Hiroshi
Handa, Shigeru Chiba, Kazuma
Ohyashiki, Yoshinori Yoshida,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

がんの起源を探っ

垣内 伸之(Kyoto Univ)

第 80 回 日本て（口頭）

癌学会学術総会

Clonal evolution

Yotaro Ochi, Kenichi Yoshida,

第 80 回 日本

and prognostic

Yasuhito Nannya, Ko Sasaki, Kinuko

癌学会学術総会

impact of

Mitani, Noriko Hosoya, Takayuki

mutations in

Ishikawa, Kazuma Ohyashiki, Naoto

blast crisis of

Takahashi, Hideki Makishima, Yuichi

chronic myeloid

Shiraishi, Masashi Sanada, Akifumi

leukemia

Takaori-Kondo, Satoru Miyano, and（口頭）

Seishi Ogawa(Kyoto Univ)- 41 -

The molecular

Ayana Kon, Masahiro M Nakagawa,

第 80 回 日本癌

pathogenesis of

Keisuke Kataoka, Ryosaku Inagaki,

学会学術総会

DDX41-mutated

Hideki Makishima, Manabu Nakayama,

myeloid neoplasms

Haruhiko Koseki, Yasuhito Nannya,（口頭）

Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

Combined

Ryunosuke Saiki, Yukihide Momozawa,

The 80thlandscape ofYasuhito Nannya, Masahiro M

Annual Meeting

single-nucleotide

Nakagawa, Yotaro Ochi, Tetsuichi

of thevariants andYoshizato, Chikashi Terao, Yutaka

Japanese Cancecopy-number

Kuroda, Yuichi Shiraishi, Kenichir Association

alterations in

Chiba, Hiroko Tanaka, Atsushi

clonalNiida, Seiya Imoto, Koichi Matsuda,

hematopoiesis（口Takayuki Morisaki, Yoshinori

頭）Murakami, Yoichiro Kamatani,

2021/10/2

国内

2021/10/2

国内

2021/10/2

国内

2021/11/13

国外

Shuichi Matsuda, Michiaki Kubo,
Satoru Miyano, Hideki Makishima,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
Clonal evolution

Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

and chronic

第 80 回日本癌学会学術総会

inflammation（口頭）Combined

Ryunosuke Saiki, Yukihide Momozawa,

American Heartlandscape ofYasuhito Nannya, Masahiro M

Association

single-nucleotide

Nakagawa, Yotaro Ochi, Tetsuichi

Scientificvariants andYoshizato, Chikashi Terao, Yutaka

Sessions 2021

copy-number

Kuroda, Yuichi Shiraishi, Kenichi

alterations in

Chiba, Hiroko Tanaka, Atsushi

clonalNiida, Seiya Imoto, Koichi Matsuda,

hematopoiesis and

Takayuki Morisaki, Yoshinori

their impact on

Murakami, Yoichiro Kamatani,

hematological andShuichi Matsuda, Michiaki Kubo,

cardiovascular

Satoru Miyano, Hideki Makishima,outcomes（口頭）Seishi Ogawa (Kyoto Univ)- 42 -

コルチゾール産生

藤井陽一、樋口誠一郎、佐藤悠佑、白第 109 回日本泌腺種における石友一、宮野悟、久米春喜、市川智

尿器科学会総会

CTNNB1 の新規構造

彦、岩間厚志、田中知明、小川誠司

異常と分子分類(Kyoto Univ)

2021/12/7

国内

2021/12/11

国外

2021/12/11

国外

2021/12/13

国外

（口頭）
Functional roles

Ayana Kon, Masahiro M Nakagawa,63rd ASH

of DDX41

Keisuke Kataoka, Ryosaku Inagaki,

Annual Meeting

mutations in the

Hideki Makishima, Manabu Nakayama,and Exposition

development ofHaruhiko Koseki, Yasuhito Nannya,

myeloid

Seishi Ogawa (Kyoto Univ)

malignancies(口頭)DistinctMasahiro M Nakagawa, Ryosaku

63rd ASH

pathogenesis of

Inagaki, Yutaka Kuroda, Yasuhito

Annual MeetingclonalNannya, Lanying Zhao, Yotaro Ochi,

and Exposition

hematopoiesis

June Takeda, Xingxing Qi, Akinori

revealed by

Yoda, Ayana Kon, Nobuyuki Kakiuchi,

single cell RNA

Hideki Makishima, Shuichi Matsuda

sequencing

and Seishi Ogawa (Kyoto Univ)

integrated withhighly sensitive
genotyping
method. (口頭)
EPOR/JAK/STAT

June Takeda , Kenichi Yoshida ,63rd ASH

Signaling Pathway

Akinori Yoda , Masahiro Nakagawa ,Annual Meetingas Therapeutic

Yasuhito Nannya , Lee-Yung Shih,and Exposition

Target of Acute

Kenichi Chiba , Yuichi Shiraishi ,Erythroid

Yoichiro Ochi , Takuto Mori ,Leukemia(口頭)Lanying Zhao , Rurika Okuda ,Xingxing Qi , Daisuke Morishita ,Yasunobu Nagata, AkiraHangaishi , Ken Ishiyama ,TsurumiHisashi, Toshiyuki Kitano ,Yasushi Miyazaki 0 , Nobuhiro
Hiramoto , Takayuki Ishikawa ,Akifumi Takaori-Kondo , Hiroko
Tanaka , Kensuke Usuki , Shuichi
Miyawaki , Satoru Miyano , Arnold- 43 -

Ganser , Michael Heuser , Felicitas
Thol , Ming-Chung Kuo , Hideki
Makishima and Seishi Ogawa (Kyoto
Univ)
潰瘍性大腸炎にお垣内 伸之(Kyoto Univ)

Crohn's &ける上皮細胞の自Colitis, Let's

然選択についてMeet everyONe!

2022/1/20

国内

2022/2/26

国内

2022/3/8

国外

2022/3/26

国内

～遺伝子変
異クローン進化の観点から～(口頭)
コルチゾール産生

藤井陽一、樋口誠一郎、佐藤悠佑、白第 31 回泌尿器腺種における石友一、宮野悟、久米春喜、市川智科分子・細胞研

CTNNB1 の新規構造

彦、岩間厚志、田中知明、小川誠司

究会

異常と分子分類(口(Kyoto Univ)

頭)Molecular

Yoichi Fujii, Haruki Kume, Seishi

Global Virtual

classification

Ogawa(Kyoto Univ)

Congress on

and diagnostics

Cancerof upper urinary

Research &Drug

tract urothelial

Developmenｔ

carcinoma(口頭)Life history ofSeishi Ogawa(Kyoto Univ)

The 3rdbreast cancer

International

inferred fromcancerphylogenies(口頭)symposium- 44 -