その PCR の結果
ほんと !?

Short Lecture ２０２２年４月２８日

時々、検査結果に翻弄される！
1. 施設入所の高齢女性が急に38℃の発熱
SARS-CoV-2-Ag 検査 で陽性！
2. 発熱した高齢女性が時間外に来院
SARS-CoV-2-PCR（NEAR法）で陽性！
3. 大腿骨頚部骨折で救急搬送された高齢女性
SARS-CoV-2-PCR（NEAR法）で陽性！
4. 出産直後の妊婦
SARS-CoV-2-PCR（NEAR法）で陽性！
Baby はどうする ！？

検査の解釈や検査精度• 完全な検査法はない• 既知の濃度の陽性対照を複数使用することで信頼性を確保しているリアルタイム RT-PCR を基準として比較すると、抗原定性検査はウイルス量が少な
い検体での検出感度が低い• 抗原定性検査は、検体の粘性が高い場合や小児などに偽陽性が生じることが報告• 簡易核酸検査である等温核酸増幅法も、反応によって生じる濁度や蛍光強度を測定する機器では、検体によっては偽陽性が生じる可能性がある

模擬ウイルスを用いたPCR検査薬の一斉試験
国内で用いられているCOVID-19診断用核酸増幅検査薬の信頼性を確認する目的で，コピー数を規定した同一の試料（ウイルスRNA および 模擬ウイルス）を用いて、一斉試験を実施した
留意事項：
増幅原理，測定装置，検体の前処理法などの違いから様々な種類が存在し，汎用性，簡便性，迅速性，スループット，コスト等の観点から，それぞれの検査薬に特徴的な利点がある．今回の検証で指標とした検出感度のみで検査薬の優劣が判断されるわけではない
本試験は精製されたウイルスRNAあるいは模擬ウイルスを用いた検証であるため，本来の検査対象（臨床検体）に含まれる宿主核酸等の夾雑物の影響が除外されている点に注意が必要「COVID-19診断用核酸増幅検査薬 一斉試験の結果報告（公開版）」より一部改変
２０２１年２月２６日 国立医薬品食品衛生研究所

試験結果
43000

17000

4300

1700

100%

100%

100%

100%

100%

100%

製品名（検査薬）

コピー/ｍLコピー/ｍL

LAMP 法100%

BD-MAX PCRGene Xpert PCR

コピー/ｍL コピー/ｍL430

1700コピー/ｍL

コピー/ｍL

コピー/ｍL

100%

83%

33%0%100%83%100%

83%0%100%

100%

100%

100%0%

NEAR 法「COVID-19診断用核酸増幅検査薬 一斉試験の結果報告（公開版）」より一部改変
２０２１年２月２６日 国立医薬品食品衛生研究所

結論• NIHSの「COVID-19診断用核酸増幅検査薬 一斉試験の結果報告（公開版）」を示した。
• GeneXpert、BD‐MAX、LAMP法の順に検出感度が優れている印象あり。
• NEAR法を他の検査薬と比較したデータは見当たらなかった。RT‐PCRと比較し陽性一致率 94.7％、陰性一致率 98.6％ の報告があり、劣っているとは言えない。
これらの検査法に優劣は付けられない
NEAR法陽性、LAMP陰性となる理由は不明だった

COVID-19 診断学
疫学、検査特性柏崎の感染率 0.5％
人口：10万人、約500人 ⇒ 4月上旬10日間 の感染
検査A：感度70％ 特異度99％

感染あり

感染なし

合計

検査陽性

350

1,000

1,350

検査陰性

150

98,50098,650

合計

500

99,500100,000• 実際に感染している人より多くの人(1,000)が偽陽性と判定
陽性的中率は26％(350/1,350)となる• 陽性的中率は、感染率が低くなるほど 低くなる

柏崎の感染率 0.2％
人口：10万人、約200人 ⇒ 4月下旬10日間 の感染
検査A：感度70％ 特異度99％

感染あり

感染なし

合計

検査陽性

140

1,000

1,140

検査陰性

60

98,80098,860合計

200

99,800100,000• 偽陽性は1,000人と不変• 陽性的中率が12％(140/1,140)にまで低下• 感染率が低くなると、検査Aの信頼性は一段と低下する

柏崎の感染率 0.5％
人口：10万人、約500人 ⇒ 4月上旬10日間 の感染
検査B：感度95％ 特異度99％（検査Aより高感度）

感染あり

感染なし

合計

検査陽性

475995

1,470

検査陰性

2598,505

98,530

合計

50099,500

100,000• 高感度でも陽性的中率は26％から32％までしか上がらない• 感度が良い検査でも、常に一定数の偽陽性がでる• 感染率が低ければ、偽陽性は増える

臨床診断の確率を高めるために疫学情報と問診・診察から臨床診断の確率を高める
検査前確率、 尤度比、 検査後確率を用いた考え方

検査前確率

検査前に、集団にどのくらいその疾患を持っている者がいるかという確率⇒ 有病率、感染率 と同じ

検査後確率

その集団のうち、その検査でどれだけその疾患を持っている者が発見されるかという確率⇒ 陽性的中率と同じ・・・そこで尤度比という考え方

尤度比有病者がその検査結果となる確率と、非有病者がその検査結果となる確率の比⇒ 有病率は排除

陽性尤度比有病者が検査陽性(真陽性)である尤度＝(感度)と、非有病者が検査陽性(偽陽性)である尤度＝(1-特異度)の比＝(感度)/(1－特異度)

陰性尤度比＝(1－感度)/(特異度)実際には 陽性尤度比 をどう利用するか

事前オッズ × 陽性尤度比= 検査陽性の時の事後オッズ
オッズ：有病の見込みある事象をそれ以外の事象で割ったもの例）100人中 10人にあるとされる疾患の場合⇒ オッズ：10/（100－10）＝0.11⇒ 確率 ：10/100＝0.1⇒ オッズ＝確率/（１－確率）⇒ 確率 ＝オッズ/（1+オッズ）
注）尤度比は、「事前・事後確率の比」ではなく「事前・事後オッズの比」例題）30才 男性 主訴、発熱、咽頭痛、頭痛
生来健康。２日前から発熱、咽頭痛、頭痛が出現し、発熱外来を受診した。
仕事が忙しく帰りは深夜である。家族に感冒様症状の者はいない。
（カラオケ店で、COVID-19のクラスターが発生したという情報入手）数日前、同僚と一緒にカラオケに行ったことを白状した。
医師A
感冒様症状だが、コロナの可能性はどうだろう。まじめで仕事も大変そう。
疲れもあるんだろうな。家族も心配なことだろう。
⇒ a) COVID-19 最近減ってきたから10～20％ってところでしょ。
カラオケ！ やばいんじゃないの？ この人は関係なさそうだけど。
それにしても、コロナが流行ってきてなあ 感染率上昇かあ。
⇒ b) COVID-19
えー！

30～40％ってところかなあ。どおかなあ。

カラオケ行ってたの、この人！

⇒ c) COVID-19 80％！

決まりじゃん！

医師Aの診断
事前オッズ × 陽性尤度比 ＝ 事後オッズ
事前確率20％

0.25

40％

0.67

80％

4

PCR検査(A)
感度70％
特異度95％
陽性尤度比＝143.5

事後確率78％

6.3

86％

5698％

事前確率を高くすれば検査後確率も高くなるTake home message• 検査結果を過信しない• 基本は患者の状態と診断を追求する姿勢• 感染率、有病率を疫学を踏まえ意識• 事前確率を高める努力が重要（診察力のスキルアップ）