The 5th International Symposium on
Dynamical Ordering of Biomolecular
Systems for Creation of Integrated
FunctionsJanuary 21-22, 2017
The University of Tokyo, Komaba Campus, Tokyo, JapanCONTENTS
Campus Map………………………

1

Program………………………

2

List of Posters………………………

5

Abstracts —Invited Lectures—
Abstracts —Posters—…

25………………

39

Organizer:
Shuichi Hiraoka (The University of Tokyo)
Supported by Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas from the Ministry of Education,
Culture, Sports, Science and Technology of Japan0 1020

Prospectus_2015_Map_念2.indd 1

150100M

至 吉祥寺For Kichijoji

Bldg.15

Bldg.22号館

Bldg.14

14号館

駒場小学校

Bldg.55号館

Bldg.1212号館

Bldg.1111号館

掲示板

Auditorium

Bldg.88号館

学際交流ホール

Bldg.1

1号館

Bldg.1010号館

Bldg.99号館

駒場保健センター
Komaba HealthService Center

Bulletin
BoardsKomaba-Todai-Mae
Station東口
East Gate

北館
KCP North Bldg.

教職員
テニスコートTennis Courts

矢内原公園
Yanaihara Park

駒場図書館
Komaba Library

ピンク：教室棟
Pink：lecture room Bldg.

ホール
Multi-purpose Hall

Coop Cafeteria(Sat. 11:00-14:00)
House

15/07/21 14:15･･･自動体外式除細動器（AED）設置場所
Locations of an Automated External Deﬁbrillator至 渋谷
For Shibuya

Venue forthe Symposium

炊事門
Suiji Gate

柏蔭舎
Hakuinsha
Pavilion

ItalianTomato
駒場池（一二郎池） (cafe)
Komaba-ike Pond
(Sat.&Sun.
10:00-17:00)（Ichiniro-ikePond）
数理ｱﾈｯｸｽ
Math Sci Annex

紫：研究棟
Purple：research Bldg.

梅林門
Bairin Gate

NCoop Store(Sat.
11:00-17:00)
多目的

男女共同参画支援施設
Day Care Center

第一体育館
Gym 1

キャンパスプラザ
A棟
B棟
Campus Plaza
Bldg. A Bldg. B

第二体育館
Gym 2

数理科学研究科棟
Graduate School of Mathematical Sciences Bldg.

初年次活動センター
First-Year Activity Center

Art Museum
Science Museum

裏門
Rear Gate

駒場和館
コミュニケーション･プラザ
Komaba Communications Plaza
南館
KCP
KCP South Bldg.
Japanese-style

ロッカー棟

Komaba Museum

駒場博物館

美術博物館
自然科学博物館

Bldg.101

101号館

East

ポンプ室

Komaba Campus

Komaba Ⅰ CAMPUS MAP （as of July 2015）

駒場Ⅰキャンパス配置図（2015.7 現在）
The University of Tokyo

全学共同
トレーニング体育館
利用施設
Training Gym
University-wide joint
use facility シャワー室
Shower Rooms

21 Komaba Center
for Educational
Excellence（21 KOMCEE）

West

課外活動施設Extra-Curricular
学生会館
Activities Bldg. Student Bldg.

第一グラウンド
Athletic Field 1

アドミニストレーション棟
正門守衛所 Administration Oﬃce 書庫
Gatehouse
102号館
正門Bldg.102
Main Gate
バレーボールコート
情報教育棟
東大口 Volleyball Courts
Information Education Bldg.
Todai Gate
目黒区駐輪場

講堂（900番教室）
Lecture Theater

Bldg.1313号館

Bldg.7

7号館

Auditorium

Bldg.18

京王井の頭線 駒場東大前駅
西口 Inokashira-Line,Komaba-Todai-Mae Station
West Gate

坂下門
Sakashita Gate

Lever son Verre
(Banquet)

FacultyHouse

第二グラウンド
Athletic Field 2（2015 年 8 月竣工）

18号館

アドバンストリサーチ ラボラトリー
Advanced ResearchLaboratory

Komaba International 噴水
Building for Education Fountainand Research

駒場国際教育研究棟

Bldg.1717号館

Bldg.33号館

駒場 ファカルティ・ハウス
Komaba Faculty House

Bldg.16

16号館

15号館

テニスコートTennis Courts

更衣室
及び倉庫
Outﬁt RoomandWarehouse

テニスコートTennis Courts

野球場
Baseball Field

ラグビー場
Rugby Field

格技場
Gym

弓道場
Kyudo Range

新宿方面
For Shinjuku.）） veり A通 ori
手 -d
山 te（ a線 m号 Ya
六 r（状 la
環 ircuC.6ON

西門
West Gate三昧堂
Zanmai-do

隠寮
In-ryo上原2丁目交差点
Uehara 2-chome Crossing

東北沢方面
For Higashi-Kitazawa

北門（野球場門）
温室
North Gate Greenhouse

面 a
方 uy
谷 ib
渋 Shr
Fo

PROGRAM

Saturday, January 21, 2017
9:00-9:10

Opening Remarks by Koichi Kato

9:10-9:50

L01

Chair : Kazunori Sugiyasu
Ilme Schlichting (Max Planck Institute for Medical Research)“Myoglobin-CO Dissociation: Challenges and Insights”

9:50-10:20

L02

10:20-10:50

Daisuke Suzuki (Shinshu University)“Artificial Polymeric Microhydrogels toward Autonomous Soft Materials”
Coffee Break
Chair : Masahiro Higashi

10:50-11:30

L03 Robert Grosse (University of Marburg)

11:30-12:00“Formin and Function in Cellular Actin Assembly”
L04 Masanori Tachikawa (Yokohama City University)“Molecular Dynamics Study on Substituent and Solvent Effects for Nanocube
Formed with Gear-shaped Amphiphile Molecules”

12:00-12:40

Poster Preview (only poster prize candidates)

12:40-13:00

Group Photo

13:00-14:30

Lunch

14:30-16:30

Poster Session 1 (Odd Poster Number)
Chair : Susumu Uchiyama

16:30-17:10 L05 Christian Griesinger (Max Planck Institute for Biophysical Chemistry)“NMRBased
StructuralBiology
InImmunity
Neurodegeneration/Protection”
17:10-18:10

Panel Discussion

18:30-20:30

Banquet2andSunday, January 22, 2017
Chair : Hiroyuki Miyake
9:10-9:50

9:50-10:20

L06

L07

Jonathan R. Nitschke (University of Cambridge)“Transformative Cages and Luminous Chains: Functional Systems throughSubcomponent Self-Assembly”
Ryota Iino (Okazaki Institute for Integrative Bioscience)“Single-Molecule Dynamics of Natural and Engineered Molecular Motors”

10:20-10:50

Coffee Break
Chair : Hiroyoshi Matsumura

10:50-11:30

11:30-12:00

12:00-12:15

L08 Bernard R. Brooks (National Institutes of Health)“Recent Advances in Multi-Scale Methods for Examining Free Energies andMacromolecular Mechanisms”
L09 Eri Chatani (Kobe University)“Nucleation Dynamics in Amyloid Formation As Investigated by the Analysis ofPrefibrillar Intermediates”
L10 Shingo Fukuda (University of California)“Direct Observation of Dynamics of Photosynthetic Complexes on GranaMembranes by High-Speed Atomic Force Microscopy”

12:15-12:30

L11 Yoshitake Sakae (Nagoya University)“Conformational Analysis of Oligosaccharides by Self-Guided Langevin
Dynamics Simulation”

12:30-14:00

Lunch

14:00-16:00

Poster Session 2 (Even Poster Number)

16:00

Closing Remarks by Koichi Kato3

Poster Sessions
Date
Poster Session 1: 14:30-16:30, Saturday, January 21
Odd Poster Numbers (P001, P003, P005 … P105)
Poster Session 2: 14:00-16:00, Sunday, January 22
Even Poster Numbers (P002, P004, P006 … P104)

lAll posters should be put on the boards by 14:30 on Saturday, January 21, and be removedl

between 16:00 and 16:30 on Sunday, January 22.
Presenting authors are requested to stay with their posters during the session time.

BanquetDate
18:30-, Saturday, January 21

Place
Lever son Verre, Komaba4