BioResource Now ! Vol.7 No.8

BioResource Now !
Issue Number 7

August 2011

国内外のバイオリソースを巡る様々な問題や取り組みについて、毎月ホットな話題をこのニュースレターで紹介していきます。

星野 敦 (基礎生物学研究所)・ 仁田坂 英二 (九州大学大学院理学研究院)

研究とバイオリソース
No.11
じょうほう通信No.60

アサガオリソース最新情報

P1 - 2

スマートフォンに迫るウィルスの脅威

P2

アサガオホームページ
http://mg.biology.kyushu-u.ac.jp/

研究とバイオリソース〈No.11〉

星野 敦 ・ 仁田坂英二
2012年から GBI （地球規模生物多様性情報機構は第３期へ
アサガオリソース最新情報
基礎生物学研究所 モデル生物研究センター
1

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後編＞

九州大学大学院理学研究院
菅原秀明2
国立遺伝学研究所
特任教授 生物科学部門

アサガオは日本独自のバイオリソー
スで、江戸時代後期に起源を持つ多種多様な変異体が保存されています。ここでは、
第 2 期 NBRP の 4 年間（平成 19〜22 年度）での進展を中心にしてアサガオリソースの現状を紹介します。

第2期NBRPアサガオの実施体制
第 1 期（平成 14〜18 年度）は、中核機関と 2 つのサブ機関でスタートしましたが、第 2 期では、体制を見直して九州大学（代表機関）と基生研（分担機関）が担当しています。九州大学ではアサガオと近縁種系
統、基生研では主に DNA クローンを扱っています。相互に事業を補完して、バックアップ体制も整えてきています。

アサガオと近縁種系統
昨年度末までに 552 系統を収集し、第 1 期の分と合わせて 1,750 系統を保存しています。国内の研究者や愛好家が主要な寄託元で、野生系統や近縁種は国外の研究者からも収集しています。毎年 500〜800系統の 2,500 本程度を栽培して系統更新、特性の調査記録、提供用種子の確保を行っています。また、ヘテロ接合の状態で、不稔変異を保存している系統の遺伝子型調査の為、短日下で開花が早まる冬期には、数千〜数万本を温室で栽培しています。これらの栽培過程では新しい変異体も発見されており（図 1）、転移活性の高い内在性トランスポゾンが変異の原因であると思われます。
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2

アサガオは花成を研究する上で、極めて優れた特性をもつ短日植物です。芽生えに暗期を一度与えると、花成を誘導することができ、その暗期に短い光照射を行うことで誘導を解除（光中断）できます。この花成研究の材料として、標準系統「ムラサキ（Violet）」は国内外で広く利用されており、その研究成果は論文として 500 報以上あるとされています。ここまで利用された理由
は、丸種（京都市の種苗会社）が販売していた均質な種子が入手し易かったことにあります。しかし、丸種に自家受粉種子を提供していた、京都大学の篠崎眞輝先生が退官 さ れ た 為 に、販 売 が 中 止 さ れ ま し た。
NBRP アサガオでは、ムラサキを使ってきた研究者の強い要望を受けて、急遽、種子の増産に取り組むことに決めましたが、キログラム単位で種子のリクエストに応じることや、均質な種子を確保することに大きな困難が予想されました。そこで、中核機関では網室（図 2）を新設して、交雑のない均質な種子の増産を開始し、今年度から試験的に種苗会社での委託栽培を行っています。

図2：標準系統ムラサキの栽培の様子。
昆虫による交雑が起こらないように、網を張った施設内で栽培している。

CF

図1：第2期に見つかったアサガオの変異体。
A; 左右の裂片が欠損し、花弁の伸長も抑えられている。
B; 向軸側の組織が背軸側の組織に転換している。
C; 葉や花が萎縮し、著しい易変性を示す。
D; 花芽が形成されない。
E; 市販系統から見つかった新規の立田(maple)変異。
F; 米田芳秋（静岡大名誉教授）によってメキシコの自然集団から得られた夜咲き系統。

アサガオのBACクローン
第 1 期では EST クローンを中心に収集しましたが、第 2 期では 55,296 の BACクローンを収集して提供を開始しました。
BAC クローンは東京古型標準型（Q1065）の実生から抽出した DNA を用いて作成されており、ゲノム断片化に異なる制限酵素を使った 2 種類のライブラリーがあります。平均鎖長は 100 kb 前後で、ゲノムのカバー率は 5〜6 倍程度になります。アサガオはゲノム配列が未解読であり、これらの BAC クローンの配列も整備されていな*1
い為、4 次元の DNA プール（図3）を作成してクローンを提供する環境を整えました。
ユーザーには最初に、DNA プールを提供してスクリーニングをして頂き、ポジティブだったクローンを改めて提供しています。
ア サ ガ オ の ゲ ノ ム サ イ ズ は 800Mbp〜1,000M bp と推測されており、現在、新学術領域ゲノム支援で解読が行われています。
その一環として収集した BAC クローンの末端配列も整備できる予定です。なお、DNAプールの作成には、メダカリソース中核機関（基生研）の成瀬先生、竹花研究員のご協力がありました。この場をお借りして感謝致します。

図3：BACの4次元DNAプール。72枚の384穴プレートに納められたBACクローンを4つのパターンで混合してDNAを抽出し、6枚の96プレートと12本のチューブに保存している。

広報啓発の取り組みNBRP アサガオグループは、アサガオの研究者コミュニテイが集う研究集会を主催しています。平成 20 年と 22 年には、第 5 回と 6 回の研究集会が基生研で行われました。次回は来年（平成 24 年）の夏頃に、九州大学で行われる予定です。
次ページへ続く

BioResource Now ! Vol.7 No.8

今後、ゲノム配列に系統や DNA クローンの情報を統合することで、より研究者に優しいリソースに発展させたいと考えています。ご支援を引き続き賜りますよう、よろしくお願い致します。■For first screening*1 クローンプールを用いたスクリーニング
少ない実験回数で目的のクローンをスクリーニングする
1-6
7-12
13-18
19-2425-30
方法。アサガオの BAC、384 穴（16x24) プレートが37-42
43-48
49-54
55-60
61-66
72 枚の場合は、6 枚を 1 組として以下の 4 種類（4 次元）のプールを作成しています。

1-6（24 列 x6 プレート）を含むプール：16 プール x12 組み
3）6 枚のプレートの各列をまとめた 96 クローン（16 行 x6 プレート）を含むプール：24 プール x12 組み4）各プレートの 384 クローンを含むプール：6 プール x12 組み

7-12

43 -4813 -1849 -5419 -2455 -60

25 -3061 -66

31-36

67 -72

1-6Superpools
123

4

568

910 11 12AAB

121718AB

121718BC

D341920C

D

341920C

E

F

562122EF

562122

DGH

782324GH

782324E

I

J

910

12IJ

910

78FKL

1112

34K

L

1112

910

G

M

N

131456M

N131411

12

H

O

P

1516O

P

1516

Row
pools
A~P

じょうほう通信7-12

7Column Plate
pools pools
1~24
1~6

[ 第 60 回 ]

Row
pools
A~P

Column Plate
pools pools
1~24
7~1210 分

セキュリティーソフト選びは、機能の有無に留意
セキュリティソフトは、有償から無償のものまで各社から様々な製品が提供されていますが、以下の様な機能があるものを選ぶと良いでしょう。
● 本体メモリーや SD メモリーカードのウイルススキャン● 悪意あるアプリケーションのダウンロードのブロック● 不要な電話や SMS※1 などのテキストメッセージのブロック● 紛失した際のリモートでのデータ消去やロック機能※１ ショートメッセージサービスの略。送信する側が料金を払い受信側は無料でメッセージを受け取ることが出来るサービス

アプリは信頼できるサイトから取得、インストール時のパーミッションを必ずチェックする
Android アプリは、インストールする際に必ずアクセスする情報（個人情報、GPS 位置情報、ネットアクセス等）のパーミッション確認画面が表示されます ( 図３)。インストールする際には、面倒がらずにアプリの内容とアクセスする情報に不審な点が無いか、必ずチェックします。
但し、アプリが潜在的に悪質かどうかを見極めるのは難しいため、信頼できるマーケット（携帯電話会社がサービスしているマーケット等）を利用することをお薦めします。

図２．Android 端末のマルウェア事例
ヘビがエサを食べるゲームを装っているが、裏では GPS による位置情報を外部サーバに勝手に送る

オープンゆえにリスクも高い Android 端末
Google が開発した Android は、ライセンス料がフリーで仕様も公開されており、アプリケーションを自由に配布できるなどオープン性が特徴ですが、それ故にマルウエアも登場しやすく、パソコンと同等以上のセキュリティ対策が欠かせません。さらに、個人情報はパソコンよりも多く格納されているケースが多いため、今後 Android を狙ったマルウェアは爆発的に増加してくることが予想されます。

このアプリが下記にアクセスするのを許可する：
あなたの場所粗い（ネットワークスペース）場所

ネットワーク通信

完全インターネットアクセス

システムツール

電話がスリープになるのを防ぐ

図 3. アクセス情報の確認画面を必チェックする

以下にセキュリティ対策についてまとめた図を示します。スマートフォンには大切なデータが保存されていることを常に意識しながら、便利に使いこなしていきましょう。
図．対策まとめ図
セキュリティ対策ソフト①ウェアを導入する

Android 端末のセキュリティ対策

信用できるマーケット

セキュリティ対策は、Google が機能やサービスを一通り揃えているわけではなく、サードパーティの製品やサービスをユーザが選び組み合わせる必要があります。Android 端末もインターネットにつないで情報をやりとりする以上、セキュリティ対策ソフトの導入は今後必須となってきます。また、怪しいアプリをインストールしない様、注意する必要があります。

お 知らせ37 -42

まず、１）を鋳型にして 12 反応の PCR を行います。
続いて目的クローンを含む組みの、２）から４）のプールを鋳型にして 46 反応（16+24+6）の PCR を行います。
合計で 58 反応の PCR で目的クローンを選抜できます。
１）は 12 本のチューブ に、２）から４）は 6 枚の 96
穴プレートに納められています。

2011 年夏商戦に NTT ドコモや KDDI、ソフトバンクモ
図 1. スマートフォン
バイルの携帯電話 3 社は Android スマートフォン ( 図１)の新製品を多数投入し、各社こぞって新機種の利便性を ●自由にアプリケーションをインストールし、機能拡アピールしています。特に Android 端末は、全世界・国 張が出来る携帯電話
内共に利用者数が iPhone を超えて 1 位となり利用者が ●インターネット接続が前提となる急増しています。
利用者数の増加に比例して、Android 端末をターゲットとしたマルウェア（ウィルスを含む不正プログラム）も今年に入って増加しており、今まで安全と言われていた公式 Android マーケットで不正アプリが発見されたり、金銭狙いのマルウェアも発見されています ( 図２)。

3 月初め、米シマンテックなどが公式のAndroid マーケットで、不正アプリが発見されたと報告

For second screening

含むプール：12 組み

2）6 枚のプレートの各行をまとめた 144 クローン

爆発的に増える Android 端末とそれを狙うマルウェア

384 well plate

12 Superpools

1）6 枚のプレートの全てをまとめた 2,304 クローンを

スマートフォンに迫るウィルスの脅威

31-36
67-72

Matrix pools plate loading pattern

九州大学では、来月の日本植物細胞分子生物学会（平成 23 年 9 月 6 日〜8 日）に合わせて、アサガオ観察会も開催されます。

紛失に備えてリモート⑤ でのデータ消去やロック機能を設定しておく② からアプリをダウロードする

アプリインストール時③ のパーミッションを必ず確認する

インターネット④ 使用しないアプリはアンインストールする( 山川 武廣 )ニュースレターのダウンロード先
URL: www.shigen.nig.ac.jp/shigen/news/

詳細は http://www.nbrp.jp/ からご覧になれます

NBRP 事後評価報告書を公開いたしました。

NewsLetter に掲載されているあらゆる内容の無断転載・複製を禁じます。
すべての内容は日本の著作権法、及び国際条約により保護されています。

平成 23 年度 NBRP「ゲノム情報等整備プログラム」(2011.4 - 2012.3) の課題選定結果発表！

Contact Address
連絡先 〒411-8540 静岡県三島市谷田 1111
国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
TEL055-981-6885 ( 山崎 )E-mail brnews@chanko.lab.nig.ac.jp[ 日本遺伝学会第 83 回大会 ] NBRP シンポジウム開催
9 月 20 日午後・9 月 22 日午後

Editor's Note

バ イ オリソ ー ス 情 報

今年の夏はアサガオやゴーヤで緑のカーテンを作って節電に貢献された方も多かったのではないでしょうか。ちょうどよいタイミングでアサガオリソー
スの話題を提供していただくことができました。新しい変異体の発見が続く一方でゲノムリソースも充実してきたようですので、今後の研究の発展が楽しみです。系統が愛好家の方からも寄託されるリソースは珍しいと思います。
昔ながらの系統名、たとえば「青斑入蝉葉桜鼠色丸咲大輪」なんて素敵ですね。
ちなみにこの系統の遺伝子型は、v1 re dg bv;;mg pr [lt] di?
詳しくはホームページをご覧ください。(Y.Y.)(NBRP) www.nbrp.jp/(SHIGEN) www.shigen.nig.ac.jp/indexja.htm(WGR) www.shigen.nig.ac.jp/wgr/(JGR) www.shigen.nig.ac.jp/wgr/jgr/jgrUrlList.jsp

BioResource Now !
Issue Number 7 August 20112