UG meeting
高エネ機構・物構研
構造生物学研究センター
千田俊哉

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Menu
PACのこと課題審査についてBT の配分方法について
CryoEM
その他

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PACのこと

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PACの評点について

分布、せまっ！

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PACどうする？
物質構造科学研究所放射光共同利用実験申請書
Application form for synchrotron radiation experiments at Photon Factory (PF)

物質構造科学研究所長 殿

審査しない
自動化を活用すれば、全員に配分可能かも課題の動向を知ることができない

区分 Category

実験責任者 pokesperson

申請日 Date

氏名 Name

所属、職名
Affiliation,
Position

希望審査分科
esearch field
連絡先住所
Mailing
address

FAX

Tel.
E-mail(日本語)
実験課題名
Proposal title(英 訳)

研究分野キーワード
Keywords for research field

実験手法キーワード
Keywords for experimental methods特殊な運転モード

希望pecial ring operation mode if necessary

Ⅰ．希望ビーム タイム

Contact Person in Japan (海外からBeam time request

ステーショ ン

希望時期

希望時間

tationyear/monthbeam time

氏

申請場合)

名(Name)所属・職名(Affiliation＆Position)

審査は必要
課題の選別は必要
審査書類の質の差が大きい
審査員を悩ますテクニック（ボヤかして書いてあるww）
内容（Science）の審査が可能な書類が欲しい
連絡先住所(Address)

Tel.

FAX

E-mailビーム タイム 合計
Total of beam time

受理年月日
受理番号

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課題の分類

新規構造の解析
生化学（反応機構、基質特異性）
生物学志向
創薬関連（化合物探索）
タンパク質工学的課題など

6例えば・・・・
生化学課題の場合
ターゲットの名前何をどこまで明らかにするのか？
課題の当該分野における意義結晶構造でどこまでやって、それ以外でどこまでやるのか？
プロジェクトの現状
必要な結晶構造に対応する結晶の準備状況
他分野との連携状況（分光学、測度論など）
具体的な現チーム構成を書いてもらう必要あり構造データだけで何かができるという状況は少ない
High impactな研究は、multidisciplinaryなものが多い
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例えば・・・・
創薬関連課題の場合創薬ターゲットの名前
創薬ターゲットとして適切である理由
プロジェクトの現状
必要な結晶構造に対応する結晶の準備状況
他分野との連携状況（合成展開、細胞実験、動物実験など）
構造生物学課題の場合
構造解析ターゲットの名前
構造解析を行いたい理由
プロジェクトの現状
必要な結晶構造に対応する結晶の準備状況
他分野との連携状況（生化学、分子生物学、細胞生物学など）
8実験手法の欄に関して埋めて欲しいけど、埋めるのが馬鹿らしい気持ちもわかる
現状では、真面目さ、不真面目さの指標に。。。。
それも一つの指標ではあるが、ここでそれをやるのか？
基本的に同じ実験。解析法などのQ&Aタイプにしたら？
変則的実験の場合は記載は必須

9Preliminary dataの収集に関して原則は、申請して測定することになっているが。。。。
Preliminary dataが無いと申請書も書けない
何故か審査で問題になりがち（笑）
LabにX線装置が無いところも多い（SBRCも無い）
Preliminary dataをキチンと集められる仕組みが必要
Rapid accessなど（登録制にする？）
安全管理との関連もある

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BT配分の問題
配分方法を考え直す時期に来ているのではないか？
効率よくBTを使い、最大の論文成果を出すことが必要
少しずつ変わっては来ているが。。。。
Technologyの進歩により、BTの最適な使い方は変化している
24時間働けますか？
全自動測定が可能に（ロボットは、24時間働けますっ！）
人は 24時間働いてはダメな時代に。。
論文数の質の向上と増加を図るには？
PAC審査を変える？申請書を変える？
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夜の問題

現在は、週末以外は24時間サポート
夜間サポートは廃止の方向を考えています（コスト、働き方改革）
夜は全自動、昼間は短いビームタイムなどで対応

全自動測定に移行するために必要な講習会なども検討したい

12例えば、、、
全自動を大幅に導入
自動処理・自動測定は、大抵の場合は人より優秀です
失敗したものは、後からマニュアルで再チャレンジしたら？
結晶化プレートからその場ですくいたい
実験室でやって来て欲しい
クライオプロテクタントのスクリーニングは？
UniPacで可能です。短いビームタイムを何回も配分
自動測定をどう使って測定するのか、実験の方法を開発するのも大切なこと。
ユーザーと施設が共同でそのような開発を行うことも必要では？それをコミュニティで共有することも重要。全体のレベルアップを考えてください。
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私は何の専門家？
結晶構造解析の専門家は、、、理論を理解して、システムの開発に協力して欲しい
BTをどう使うかという測定法の開発も大事！
全体の10-20%程度になれば。。。。
それ以外の人（これが多数派 90%以上）は、、、、生物学・生化学・タンパク質科学の進歩に貢献
構造解析分野が進むべき方向を考える（構造をどう使うか？）
構造情報の使い方を指導する
構造の質を担保するための教育
それ以外の人が多数派 （90%以上）になったことは、タンパク質結晶構造解析分野の最大の達成の１つ！次に進もう！
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とりあえずは、代表者の方々を中心に議論を進めることを認めていただきたいです。
よろしくお願いいたします。

Cryo-EM

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Cryo-EM立ち上げ状況
2017.11 - 2018.3：建屋建設、電気工事、装置納入
2018.4 ：トレーニングスタート
2018.6 ：国際セミナー1＆施設見学会
2018.9 ：PF研究会開催
2018.10：共同利用開始
2018.11：国際セミナー2, 3
2018.12：クライオ電顕解析初心者講習会
2019.1 ：国際セミナー4
2019.2 : NYSBC施設視察
2019.3 ：拡張工事（防湿対策など）
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運営体制
導入＆運営

湯本史明、千田俊哉

サンプル調製、測定技術指導

川崎政人、安達成彦

解析指導

守屋俊夫

ネットワーク＆解析環境

山田悠介、篠田晃

事務補佐

増田千穂

Tietz Video and Image Processing Systems
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荒牧慎二

SBRC国際Cryo-EMセミナーシリーズ
2018年度
1st: 2018.6.22

Dr. Arjen Jakobi (Delft University of Technology, Netherlands)

2nd: 2018.11.2

Dr. Sam Li (University of California, San Francisco, USA)

3rd: 2018.11.7

Dr. Yuzuru Ito (Stockholm University, Sweden)

4th: 2019.1.22

Mr. Markus Stabrin (Max Planck Institute, Germany)

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PF研究会の開催 2018年9月7-8日
発起人：姚閔（北大）
世話人：千田俊哉 (KEK)
参加者: 181名
懇親会: 120名
施設見学: 80名

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25名が実習に参加
RELION-3.0beta（Schors H.W. Scheres, MRC-LMB）
講師：安永卓生（九工大）
インストラクター：重松秀樹（理研）
インストラクター：守屋俊夫（KEK）
インストラクター：荒牧慎二（Tietz）

来年度も開催予定
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週間スケジュール

月火水木

金調整

User1

User2

User3

連続測定（User 1/2/3）

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土日

利用の実際ハイエンド電顕での測定 E2

週末連続測定＋解析

UserE1(O/N)
E0
条件検討

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2018年度 10月ー３月の利用状況
休止
修理

メインテンスアカデミア
18グループ

セミナーなど

アカデミア
企業
SBRC
セミナー利用など
メインテナンス
修理
休止

SBRC

企業
13社

企業利用はMT全体の30%程度
年間：200日 MT + 60日 留保

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施設利用
アカデミア
グリッド, 液体窒素, ろ紙などの消耗品
その他

4.8万円/日
4万円
0.8万円

企業
グリッド, 液体窒素, ろ紙などの消耗品
保守費＊
業務委託
その他

24万円/日
4万円
10万円
6万円
4万円

＊AMEDが保守費用の6割を負担（アカデミア分）。残りの4割分について分担。

（企業利用の場合は、電顕操作代＋指導料などが別途必要です）
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まずはお問い合わせくださいhttps://www.binds.jp/
Tel: 029-8790-6176（増田）

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その他
物構研の放射光科学研究系で組織改編が４月から構造生物学研究センターは変わらず
SLSとのMOUが結ばれる予定（夏季のBT）

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Fin