オープンサイエンス概論～オープンサイエンスの推進と機関リポジトリ～
国立情報学研究所

オープンサイエンス基盤研究センター
尾城孝一

オープンサイエンス「オープンサイエンスとは、公的研究資金を用いた研究成果（論文、生産された研究データ等）について、科学界はもとより産業界及び社会一般から広く容易なアクセス・利用を可能にし、知の創出に新たな道を開くとともに、効果的に科学技術研究を推進することでイノベーションの創出につなげることを目指した新たなサイエンス」
内閣府『我が国におけるオープンサイエンス推進のあり方について～サイエンスの新たな飛躍の時代の幕開け～』（2015年3月30日）
http://www8.cao.go.jp/cstp/sonota/openscience/1

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

現状

2

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

機関リポジトリ公開機関数（国内）

OpenDOAR May-2017
http://www.opendoar.org/
United States, 498

United Kingdom,
252
Japan, 211

Others, 1651

実際は第1位（779）

機関リポジトリ公開数の推移. 国立情報学研究所.
https://www.nii.ac.jp/irp/archive/statistic/
最終更新日:2017.5.8

Germany, 195
Spain, 125
Poland, 92 Brazil, 92

3

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

France, 119
Italy, 110

2017/6/23

機関リポジトリのコンテンツ
資源タイプ別コンテンツ（日本全体）
46, 0%
614, 0%Departmental Bulletin Paper（紀要論文）
Journal Article（学術雑誌論文）

10926, 0%4346, 0%32180, 2%251775, 13%Thesis or Dissertation（学位論文）
Research Paper（研究報告書）

34578, 2%42690, 2%

Article（一般雑誌記事）

53595,
3%

Data or Dataset（データ・データベース）
Technical Report（テクニカルレポート）

55733, 3%60496, 3%97855, 5%1041354, 53%Conference Paper（会議発表論文）
Book（図書）
Presentation（会議発表用資料）

279331, 14%

Learning Material（教材）Preprint（プレプリント）
Software（ソフトウェア）
Others（その他）

NII_IRDBコンテンツ分析 2017.4 http://irdb.nii.ac.jp/analysis/index.php

4

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

（参考）査読済み学術論文の捕捉率の試算
2014年に出版された国内研究者による学術論文（Web of Science収録）は、約78,000件
日本の機関リポジトリに登録されている、学術雑誌掲載論文（本文あり）のうち、2014年出版の英語論文は、4,813件（NIIの統計、2016年2月18日現在）

捕捉率は、約6%5

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

機関リポジトリのコンテンツ
資源タイプ別コンテンツ（千葉大学）
190, 0%89, 35, 0%
0% 53, 0%742, 1% 321, 0%
1502, 2%20,0%

14, 0%

1972, 2%

Data or Dataset（データ・データベース）

0, 0%

Journal Article（学術雑誌論文）
Departmental Bulletin Paper（紀要論文）
8618, 10%

Thesis or Dissertation（学位論文）
Research Paper（研究報告書）
Learning Material（教材）Presentation（会議発表用資料）
Conference Paper（会議発表論文）

25341, 28%52212, 57%

Book（図書）Technical Report（テクニカルレポート）
Preprint（プレプリント）
Article（一般雑誌記事）
Software（ソフトウェア）
Others（その他）

NII_IRDBコンテンツ分析 2017.4 http://irdb.nii.ac.jp/analysis/index.php

6

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

千葉大学学術成果リポジトリ（CURATOR）

http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/?lang=0（萩庭さく葉データベース）
7

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会2017/6/23

研究データに関する調査報告倉田敬子、松林麻美子、武田将季．日本の大学・研究機関における研究データの管理，保管，公開：質問紙調査に基づく
現状報告．情報管理．2017, vol. 60, no. 2, p. 119-127.
http://doi.org/10.1241/johokanri.60.119

調査対象

大学268＋研究機関226＝計494機関

調査項目
1.
2.
3.
4.

研究成果および研究データのオープン化に関する方針の認知度
研究成果のオープン化の現状
研究データの保管に関するガイドラインの整備、研究データに関する支援状況、研究データの公開の現状
研究データの公開等の今後のあり方

調査手順

宛先は「研究データ管理・保存関連部署」
回答部署の決定は各機関の判断
質問紙による調査
有効回答数151票（有効回答率30.6%）

8

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

調査結果（抜粋）
回答者の職位
オープン化方針の認知度

9平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

調査結果（抜粋）
研究不正対応のための研究データガイドラインの制定

プラットフォーム整備状況
研究データ管理計画作成の状況

10

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

考察「日本の大学・研究機関では研究データの管理、保管、公開について、十分な認識もなく、現時点では具体的な動きは何もみられない」

11

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

国内機関リポジトリのマッピング
階層クラスタリングと多次元尺度構成法による２次元マッピング
4: 学術雑誌論文IR
1: 一般的（紀要）IR

2: 紀要・博論ハイブリッドIR

1 ：一般的(紀要)IR 2 ：紀要・博論ハイブリッドIR 3：データIR 4 ：学術雑誌論文IR 5 ：一般雑誌論文IR 6：書籍IR
7 ：リサーチペーパーIR 8：テクニカルレポートIR 9 ：学位IR

前田朗氏（東京大学）提供
12

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

機関リポジトリの目的と達成状況
1.

これまであまり流通してこなかった学術資料（灰色文献、例えば紀要、学位論文、研究報告等）を保存・公開していくこと。

2.

査読済み学術論文を著者が自主的に保存・公開する（セルフアーカイブ）ことにより、オープンアクセスに寄与すること。
→いわゆるグリーンOA

3.

論文のエビデンスとなった研究データの保存・公開の受け皿となること。

13

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

周辺の話題14

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

プレプリントサーバ
名称

分野

開始年

掲載論文概数

AgriXiv

農学

2017

10

arXiv.org

物理学等

1991

1,270,000

bioRxiv

生物学

2013

11,000

BITSS

全般

2017

10

ChemRxiv

化学

CogPrints

認知科学

1997

4,200

Cryptology ePrint Archive

暗号学

1996?

10,000engrXiv

工学

2016

100

LawArXiv

法学

2017

130

PeerJ Preprints

全般

2013?

3,000

PhilSci-Archive

科学哲学

2001

5,500

PsyArXiv

心理学

2016

500

RePEc

経済学

1997

1,200,000

SocArXiv

社会科学

2016

1,100

SSRN

社会科学

1994

740,000

備考
査読済み論文含む

準備中
査読済み論文含む

ワーキングペーパー、査読済み論文含む

2016年にエルゼビアが買収
2017.6.2時点

15

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

プレプリントの増加（主要プレプリントサーバの分野別論文数）（生物学プレプリントの年間登録数の伸び）（主要プレプリントサーバの年間登録数の伸び）

By Jordan Anaya
http://asapbio.org/preprint-info/biology-preprints-over-time

Open Science Monitor - European Commissionより
http://ec.europa.eu/research/openscience/index.cfm?pg=home&section=monitor
16

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

ElsevierのBioRN

ライフサイエンス分野のプレプリントサーバ
SSRNネットワークの1 サービス
既に、4,000を超えるワーキングパーパーを収録

https://www.elsevier.com/solutions/ssrn/biorn17

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

研究者向けSNS
https://www.researchgate.net/
https://www.mendeley.com/

ResearchGate
Mendeley
Academia.edu

https://www.academia.edu/
18

•
•
•
•
•
•

論文の登録・共有
メトリックス（評価指標）
コメント付与・アノテーション
レコメンデーション
プロファイル
文献管理

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

ResearchGate
東京大学
ユーザ数：6,411
論文数：128,706（2017.6.6 現在）

759

6716

23760

4160

UTokyo Repositoryのコンテンツ内訳
05000

10000

15000

20000

25000

30000

Journal Article（学術雑誌論文）

Thesis or Dissertation（学位論文）

Departmental Bulletin Paper（紀要論文）

Others（その他）

35000

40000

NII_IRDBコンテンツ分析 2017.5 http://irdb.nii.ac.jp/analysis/index.php19

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

Ranking Web of Repositories（Top Portals）

http://repositories.webometrics.info/en/top_portals

20

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

研究者SNSに対する反論
A social networking site is not an open access repository

University of California. Office of Scholarly Communication
http://osc.universityofcalifornia.edu/2015/12/a-social-networking-site-is-not-an-open-access-repository/index.html
21

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

データジャーナル
データジャーナルとはデータそのものを記述する「データ論文」を掲載
データ論文には、データ生成の手法、特性、利用方法などを記載
原著論文と同じ出版プロセス（査読・審査）
実データは推奨データリポジトリに保管

データジャーナルによってデータの利活用を促進
データの検証可能性の向上
データ作成者、データ採取者の業績を明確に表現

ジャーナル名出版社

URL

Data in Brief

Elsevierhttps://www.journals.elsevier.com/data-in-brief

Geoscience Data Journal

Wiley

http://rmets.onlinelibrary.wiley.com/hub/journal/1
0.1002/(ISSN)2049-6060/

Scientific Data

Springer Nature

https://www.nature.com/sdata/22

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

Scientific Dataのサンプル

Dryad（データリポジトリ）

データ論文

推奨データリポジトリ• 海外の主要な分野別データリポジトリ• Dryadやfigshareなどの汎用リポジトリ

研究データの海外流出のおそれ23

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

Elsevierの研究データ原則
研究データは全ての研究者に無料で利用できるように研究者が自らの研究データへのアクセスやその利用についてコントロールできるように研究分野の要請を考慮
研究データの効率的な再利用を促進
プラットフォーム、出版、ツール、キュレーションサービ
スによりデータの価値を高める
付加価値サービスのコストに配慮
https://www.elsevier.com/about/ourbusiness/policies/research-data24

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

Elsevierと研究データ
Data in Brief（データジャーナル）Mendeley Data（データリポジトリ）

DataSearch（データ検索ツール）25

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

機関リポジトリの立ち位置
プレプリントサーバ

研究者向けSNSIR

データリポジトリ
26

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

コミュニティの取り組み

27

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

COAR Next Generation Repositories
NGRがなぜ必要なのか？
リポジトリを学術情報流通システム全体のランドスケープの中にきちんと位置づけることにより、現在の学術情報流通システムの変容を促したい
そのためには、世界中に分散したリポジトリを連携させ、そのグローバルなネットワークの基盤の上に、さまざまな付加価値サービス（査読、注釈、コメント等）のレイヤを展開する必要がある
こうしたグローバルなリポジトリのネットワークを発展させるには、人だけでなくマシン・ユーザを想定した最新の標準的なウェブ技術を採用した次世代リポジトリが必要となる
28

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

COAR NGR WG
Eloy Rodrigues, chair (COAR, Portugal)
Andrea Bollini (4Science, Italy)
Alberto Cabezas (LA Referencia, Chile)
Donatella Castelli (OpenAIRE/CNR, Italy)
Les Carr (Southampton University, UK)
Leslie Chan (University of Toronto at Scarborough, Canada)
Rick Johnson (SHARE/University of Notre Dame, US)
Petr Knoth (Jisc and Open University, UK)
Paolo Manghi (CNR, Italy)
Lazarus Matizirofa (NRF, South Africa)
Pandelis Perakakis (Open Scholar, Spain)
Oya Rieger (Cornell University, US)
Jochen Schirrwagen (University of Bielefeld, Germany)
Daisy Selematsela (NRF, South Africa)
Kathleen Shearer (COAR, Canada)
Tim Smith (CERN, Switzerland)
Herbert Van de Sompel (Los Alamos National Laboratory, US)
Paul Walk (EDINA, UK)
David Wilcox (Duraspace/Fedora, Canada)

WG 2016年4月設置

Kazu Yamaji (National Institute of Informatics, Japan)

次世代リポジトリにとって、優先度の高い機能を洗い出すために12のユーザ・ス
トーリーを作成し、パブコメを通じて意見集約（60以上のコメント）
Next Generation Repositories, February 7, 2017 – draft for public comment
https://www.coar-repositories.org/files/COAR-Next-Generation-Repositories-February-7-2017.pdf

技術リコメンデーションを作成し、2017年夏に公開する予定
29

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

European Open Access Platform
商業出版社の学術誌システムから完全に独立した
オープンアクセス出版流通プラットフォーム
コミュニティ層（編集・査読、研究者間コミュニケーション）
論文の質の保証と評価

プロダクト層（プレプリント、データ、ソフトウェア）

ジャーナル層（オーバーレイジャーナル）論文（プレプリント）の登録とタイムスタンプ（プライオリティ）；
アーカイブとアクセス

論文の流通
インフラ層
（大学図書館がホストする機関リポジトリ群）

http://blogs.lse.ac.uk/impactofsocialsciences/2017/04/10/
rather-than-simply-moving-from-paying-to-read-to-paying-to-publish-its-time-for-a-european-open-access-platform/30

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

JPCOARの活動

オープンアクセス方針策定支援ツールの作成
JPCOARスキーマ（メタデータ）策定
RDMトレーニングツールの開発

31

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

オープンアクセス方針支援ツールの作成
オープンアクセス方針策定ガイド
第1章 OA方針の策定・実施
第2章 OA方針の構成要素
付録1 実施計画例
付録2 OA方針雛形
付録3 オープンアクセスとは

http://id.nii.ac.jp/1458/00000021/

オープンアクセス方針リンク集

https://jpcoar.repo.nii.ac.jp/?page_id=53
32

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

JPCOARスキーマ（メタデータ）の策定
基本方針

オープンサイエンス・オープンアクセス方針に対応したデータ要素の追加と整理
識別子の拡充にともなうメタデータ構造の修正
国際的に相互運用性の高いデータ交換のためのスキーマ
定義

JPCOARスキーマガイドライン
JPCOARスキーマ準拠メタデータサンプル集

33

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

RDMトレーニングツールの開発
目的

学習者が研究データ管理（RDM: Research Data Management）に関する基礎的な知識を習得する
RDMサービス構築の足掛かりを得る

内容

全7章から構成されるeラーニング教材
動画、理解度確認テスト、ワーク

受講対象者

図書館、IT部門、研究支援部門の職員（URA）等
オープンサイエンスや研究データ管理に関心のある教職員

教材の公開

スライドとスクリプト（JPCOARサイト）
http://id.nii.ac.jp/1458/00000023/

JMOOC/gaccoで開講（2017年11月予定）
34

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

データのライフサイクルと教材の構成
12

生成
1

25367

1

再利用 4
56572

加工

研究データのライフサイクル

1231

公開 4
567

1

2

352

分析

保存 4
567

・The UK Data Archive（ http://www.data-archive.ac.uk/create-manage/life-cycle ）・RDM Support - basic training course for information specialists（http://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.1285313） より
35

1

1章

導入

22章

データ管理計画

3

3章

保存と共有

4

4章

組織化・メタデータ

55章

法倫理的問題

66章

ポリシー

7

7章

サポートサービスの検討

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

NIIの取り組み36

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

NII研究データ基盤• 機関リポジトリ＋分野別リポジトリやデータリポジトリとも連携• 研究者や所属機関、研究プロジェクトの情報とも関連付けた知識ベースを形成• 研究者による発見のプロセスをサポート

for Data

分野別リポジトリ

メタデータ集約・管理
知識ベースの構築

データ検索基盤

DOI

ORCID

検索・利用

for Data

アクセスコントロール

実験データ
収集装置

成果論文

解析用
計算機

管理・保存

海外の研究データ
公開基盤

研究データ

機関向け研究データ管理

公開・蓄積

データ管理基盤

データ公開基盤• データ収集装置や解析用計算機とも連携• 研究遂行中の研究データなどを共同研究者間やラボ内で共有・管理• 組織が提供するストレージに接続した利用が可能

非公開

共有

Hot
StorageHot
Storage

Cold
Storage

Cold
Storage

公開
Hot
Storage
Cold
Storage

長期保存対応ストレージ領域• データ管理基盤における簡便な操作で研究成果の公開が可能• 図書館員やデータキュレータによる、メタデータや公開レベル統計情報などの管理機
能の提供

直結
37

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

研究データの保管・公開・検索の流れ①研究データ管理基盤
データを保管 研究者が簡便な手順で研究データをストレージに保存。研究段階からメタデータを簡単に付与でき研究者
る機能や研究データの利用頻度に応じて保存するストレージを自動で振り分ける機能を提供。
公開用メタデータの登録

分野毎のデータリポジトリ②研究データ公開基盤
各大学が公開する研究データのメタデータと実際のデータへのリンク情報を提供。公開する研究データ毎に固有の識別子（DOI）を付与。
メタデータの収集

検索

利用者

38

③研究データ検索基盤
研究データ公開基盤や分野毎のデータリポジトリに登録された研究データを横断的に検索。研究データに関連する論文の書誌情報も提供。

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

研究ワークフローと研究データ基盤の役割
公開・インターネット
NIIが提供非公開・ラボ
情報基盤センターなどが管理

海外サービス連携

データ検索基盤

従来知見調査新しい研究着手

図書館員
キュレータなどがサポート○ 図書館員、キュレータによるメタデータチェック○ DMPとの整合性確認○ エンバーゴの設定○ DOIの付与

39

実験・解析
大学等研究チーム○ 従来知見（論文や実験データ）の取得、整理○ 独自の実験データや解析結果の管理、共有

新たな研究成果

公開

論文執筆・投稿

論文・データ登録

論文採録

データ公開基盤（JAIRO Cloudの強化）

HotStorage（OSFの活用）（CiNiiのリニューアル）○ 他の論文等とのリンク情報を機械的に付与○ 名寄せ処理などを実施○ 各公開基盤（機関リポジトリ）からの情報を収集

データ管理基盤

公開OK
ファイル＋メタデータ
平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会○ 執筆論文の管理、共有○ 図表等の管理、共有○ エビデンスデータの整理

非公開希望

ColdStorage

非公開データの長期保存
2017/6/23

ロードマップ（計画案）

40

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

今後に向けて

41

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

次世代リポジトリの方向性（私見）
学術情報流通プラットフォームとしてのリポジトリ

学術誌に受理された論文の再掲ではなく、プレプリントの流通基盤としてのリポジトリの可能性
リポジトリのネットワークの上位レイヤに査読やオーバーレイジャーナルなどのサービスを構築
研究者のワークフローの中に位置づける

ソーシャルメディアの特徴の取り込み
メトリックス（評価指標）
コメント付与・アノテーション
レコメンデーション

データリポジトリ

信頼できるデータリポジトリの要件を満たした機能（例えば、
DSAとICSU-WDSの合同WGによる「信頼できるデータリポジトリの中核的な統一要件」）

42

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23

日本のリポジトリのポテンシャル
700のリポジトリ
200万件の多様なコンテンツ
システム基盤JAIRO Cloud
JPCOAR（メタデータ）スキーマ
研究データ基盤

オープンサイエンス時代の次世代リポジトリ
理念の再構築と実践

コミュニティJPCOARJANULオープンアクセス委員会

43

平成29年度国立大学図書館協会総会研究集会

2017/6/23