委託プロジェクト研究「ゲノム情報を活用した農産物の次世代生産基盤技術の開発」
平成２９年度

最終年度報告書

13405915

イネのDNAマーカー育種の利用推進
研究実施期間
代表機関
研究開発責任者

平成２５年度～平成２９年度（５年間）
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 次世代作物開発研
究センター
山本 敏央
国立研究開発法人

農業・食品産業技術総合研究機構 （次世代作物開発

研究センター、農業環境変動研究センター、九州沖縄農業研究センター、
遺伝資源センター）
地方独立行政法人

北海道立総合研究機構

地方独立行政法人

青森県産業技術センター農林総合研究所

茨城県農業総合センター
栃木県農業試験場
三重県農業研究所
秋田県農業試験場
福岡県農業総合試験場
共同研究機関山形県農業総合研究センター
長野県農業試験場
愛知県農業総合試験場
宮城県古川農業試験場
富山県農林水産総合技術センター
滋賀県農業技術振興センター
公立大学法人

福井県立大学

国立大学法人

名古屋大学

国立大学法人

東京農工大学東洋大学
ホクレン農業総合研究所
研究開発責任TEL ：029-838-7006

者

FAX ：029-838-7408

連絡先

E-mail：yamamo101040@affrc.go.jp

別紙様式３．最終年度報告書

１頁

～

105頁

上川農業試験場

＜別紙様式３．最終年度報告書＞
Ⅰ－１．年次計画
RBS1001
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９担当研究機関・研究室
機関研究室（１）各公設試育成途中材料のゲノム選抜による耐病性遺伝
子高速導入の支援

次世代作物開発研究
センター

育種法開発ユニット（２）フルゲノムマーカーを用いた「きたゆきもち」背景へのpi21の高速導入

北海道立総合研究機
構上川農業試験場

水稲グループ（３）pi21が導入された「きたゆきもち」の系統選抜と特性の把握

北海道立総合研究機
構上川農業試験場

水稲グループ（４）フルゲノムマーカーを用いた「ほっかりん」背景へのPi35の高速導入

青森県産業技術セン
ター農林総合研究所

藤坂稲作部（５）Pi35が導入された「ほっかりん」の系統選抜と特性の把握

青森県産業技術セン
ター農林総合研究所

藤坂稲作部（６）フルゲノムマーカーを用いた「ふくまる」背景への
Stvb-iの高速導入

茨城県農業総合センター

生物工学研究所
普通作育種研究室（７）Stvb-iが導入された「ふくまる」の系統選抜と特性の把握

茨城県農業総合センター

生物工学研究所
普通作育種研究室（８）フルゲノムマーカーを用いた「なすひかり」背景への
Stvb-iの高速導入

栃木県農業試験場

水稲研究室（９）Stvb-iが導入された「なすひかり」の系統選抜と特性の把握

栃木県農業試験場

水稲研究室（１０）フルゲノムマーカーを用いた「三重23号」背景へのpi21の高速導入

三重県農業研究所

農産研究課（１１）pi21が導入された「三重23号」の系統選抜と特性の把握

三重県農業研究所

農産研究課

１．ゲノム選抜育種による病害
抵抗性品種開発の加速1

1

RBS1002
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９担当研究機関・研究室
機関研究室

課題１．いもち病抵抗性・
縞葉枯病抵抗性・カドミウ
ム低吸収性遺伝子を導入したちくし89号の育成①SNP解析による個体選抜

農研機構

次世代作物研究センター
福岡県農林業総合 農産部
試験場
福岡県農林業総合 農産部
試験場
福岡県農林業総合 農産部
試験場
農研機構
農業環境変動研究センター②戻し交配③単独系統選抜④生産力検定試験⑤カドミウムの定量解析
課題２．いもち病抵抗性・カドミウム低吸収性遺伝子を導入した秋田106号の育成①SNP解析による個体選抜

農研機構

②戻し交配

次世代作物研究センター
秋田県農業試験場 作物部③栽培特性の評価

秋田県農業試験場 作物部④カドミウムの定量解析

農研機構

2

農業環境変動研究センターRBS1003
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９担当研究機関・研究室
機関

研究室

１．ゲノム選抜育種による出穂期改良品種開発の加速1（１）出穂期遺伝子アリル
構成およびSNP遺伝子型
調査

農研機構 次世代 稲形質評価ユ
作物開発研究セン ニット
ター（２）「つや姫」の早生型の準同質遺伝子系統の作
出山形県農業総合研 水稲部
究センター 水田
農業試験場

（３）「信交538号」の早生型の準同質遺伝子系統の作出

長野県農業試験場 育種部（４）「あいちのかおり
SBL」の早生型の準同質遺伝子系統の作出

愛知県農業総合試 作物開発部
験場

3

RBS1004
研究課題

研究年度

担当研究機関・研究室

２５ ２６ ２７ ２８ ２９

機関

研究室

１．ゲノム選抜育種による出穂期改良品種開発の加速２（１）全ゲノムSNP遺伝子型調

農研機構

査

稲形質評価ユニット①多型マーカーの作成および出穂期遺伝子型の調査②選抜系統の対象遺伝子近傍および全ゲノムの背景調査（２）「東北206号」の晩生型の準同質遺伝子系統の作出
宮城県古川農業試験①全ゲノムSNP遺伝子型調査を

作物育種部

場

用いた「東北206号」の晩生型の準同質遺伝子系統の選抜②作出した準同質遺伝子系統の形質評価（３）「てんたかく」の早生型の準同質遺伝子系統の作出①全ゲノムSNP遺伝子型調査を

富山県農林水産総合用いた「てんたかく」の早生型

技術センター

育種課の準同質遺伝子系統の選抜②作出した準同質遺伝子系統の形質評価（４）「みずかがみ」の晩生型の準同質遺伝子系統の作出①全ゲノムSNP遺伝子型調査を用いた「みずかがみ」の晩生型の準同質遺伝子系統の選抜

滋賀県農業技術振興②作出した準同質遺伝子系統の

センター

形質評価

4

栽培研究部

RBS2001
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９担当研究機関・研究室
機関

研究室

福井県立大学

生物資源開発研

１．種子形制御遺伝子の利用を起点としたイネの多収化戦略（１）コシヒカリ背景大粒変異体の生産性評価

究センター分子生物学
福井県立大学（２）コシヒカリ背景大粒変異体の原因遺伝子単離（３）極大粒系統の有す
売る種子サイズQTLの単離及びNIL化による有用性の評価（４）種子形制御遺伝子と、その他の有用遺伝子の集積による生産性の評
価

福井県立大学

生物資源学部
分子生物学
生物資源開発研
究センター
分子生物学

福井県立大学

5

生物資源学部
分子生物学

RBS2002
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９担当研究機関・研究室
機関研究室

１．イネの登熟最適化を実現する理想的穂型の構築と超多収育種への応用（１）穂形を制御する有用
遺伝子の単離・同定

名古屋大学

生物機能開発利用研
究センター（２）日本型品種，既存の多収品種/系統へ導入

名古屋大学

生物機能開発利用研
究センター（３）効果の検証と問題点
の解明

名古屋大学

（４）理想的穂形のデザイ
ン

名古屋大学

（５）超多収を実現する
供給親の育成名古屋大学

生物機能開発利用研
究センター
生物機能開発利用研
究センター

6

生物機能開発利用研究センター

RBS2003
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９担当研究機関・研究室
機関研究室

１．イネの強稈性に関与する有用遺伝子の単離とその集積(1) 強稈性に関与する有用

東京農工大学形質の QTL のマッピング

植物生産科学講座(2) 強稈性に関与する有用名古屋大学

植物分子育種分野(3) 強稈QTLの原因遺伝子の単離と機能解明

名古屋大学

植物分子育種分野(4) 同定した遺伝子を利用した強稈遺伝子をもつ同質

富山県農林水産総形質の QTL の特定合技術センター

作物課

東京農工大学

植物生産科学

遺伝子系統の開発(5) 強稈遺伝子の集積系統の開発

講座
富山県農林水産総 作物課
合技術センター

7

RBS2004
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９

１．シンク及びソースに関わる遺伝子の有用性評価（１）TGW6の評価担当研究機関・研究室
機関

研究室

農業生物資源研究所

植物生産生理機能研究ユニット

東洋大学（２）TGW6の持つ高温登熟障害耐性の評価

植物ゲノム科学研究室

8

RBS2005
研究課題

研究年度

担当研究機関・研究室

２５ ２６ ２７ ２８ ２９

機関

研究室

１．インディカ多収品種の収量性向上に向けた遺伝解析と育種的農研機構作物研究 稲生理分野
所
稲遺伝子分野（１）個葉光合成QTLの単離農研機構作物研（２）穂数QTLのマッピン
グ（３）新規収量性関連QTL
の探索

究所

稲生理分野
稲遺伝子分野農研機構作物研

稲生理分野

究所

9

RBS2006
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９担当研究機関・研究室
機関研究室(1) 個葉光合成速度および葉身傾斜角度に関するQTLの詳細なマッピング

農研機構次世代作物 稲形質評価ユ開発研究センター
ニット
東京農工大(2) 葉面温度に関するQTL単離のための詳細なマッピング

農研機構次世代作物 稲形質評価ユ
ニット
開発研究センター
畑作物形質評価ユニット(3) 個葉光合成速度および葉身傾斜角度に関するQTLの候補遺伝子の特定農研機構次世代作物 稲形質評価ユ開発研究センター
ニット
東京農工大(4) 葉面温度に関するQTLの候補遺伝子の特定（計画変更につき中止）
農研機構次世代作物 稲形質評価ユ
ニット
開発研究センター
東京農工大(5) 個葉光合成速度および葉身傾斜角度に関するQTLの育種素材としての価値評価

10

RBS2007
研究課題

研究年度

担当研究機関・研究室

２５ ２６ ２７ ２８ ２９

機関

研究室

富山県農林水産総合

育種課・農業バ

遺伝子の単離技術センター・農業

イオセンター（１）低温土中出芽性に関す研究所

１．低温土中出芽性に寄与する

るQTLのマッピングおよび単離①qESS11の単離②qESS4のマッピング（２）低温土中出芽性と穂発芽耐性を集積した中間母本の育成（３）低温土中出芽性遺伝子の集積①qESS11およびqESS4の集積効果②qESS11およびqESS4のsd1との集積効果11

RBS2008
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９

１．qSES11およびqSES71の効果検証（「ほしのゆめ」背景）（１）NILおよび集積系統の育成（２）各QTL単独での苗立ち性向上効果の検証

担当研究機関・研究室
機関

研究室

ホクレン

農業総合研究所

道総研上川農試
ホクレン

水稲グループ
農業総合研究所

道総研上川農試

水稲グループ

道総研上川農試

水稲グループ

ホクレン

農業総合研究所

域を絞り込むホクレン
道総研上川農試

農業総合研究所
水稲グループ

３．育種素材の開発（１）「ほしまる」背景のNIL育成（２）NILの苗立ち性評価（３）NILの農業形質評価

ホクレン

農業総合研究所

NILの苗立ち性を評価する（３）他形質への影響評価
NILの農業形質を評価する（４）集積効果の検証
集積系統の苗立ち性を評価する

２．マッピング
効果が期待されるQTLの候補領

道総研上川農試 水稲グループ
道総研上川農試 水稲グループ

12

RBS2009
研究課題

研究年度

担当研究機関・研究室

２５ ２６ ２７ ２８ ２９

機関

研究室

（1） 深根性遺伝子の導入による多収性および耐倒伏性の向上①候補遺伝子の検出②候補遺伝子絞り込み③選抜DNAマーカー化④準同質遺伝子系統の作製⑤収量性および耐倒伏性の評価

農業生物資源研究 イネゲノム育（2） 深根性遺伝子の導入による干ばつ耐性の向上①候補遺伝子絞り込み②機能解析③選抜DNAマーカー化④準同質遺伝子系統の作製⑤干ばつ耐性の評価

農業生物資源研究 イネゲノム育所

種研究ユニット所

種研究ユニット13

RBS2010
研究課題

研究年度
２５ ２６ ２７ ２８ ２９担当研究機関・研究室
機関研究室

１．粗放栽培への適応を目指した育種素材の作出（１）幅広い分げつ性を与える野生イネ遺伝子の同定

農業生物資源研究 植物生産生理機能研究ユニ所
ット（２）上記遺伝子を導入したコシヒカリの疎植
適性の検討

農業生物資源研究 植物生産生理機能研究ユニ所
ット（３）上記遺伝子を導入したコシヒカリの準同質遺伝子系統の構築

農業生物資源研究 植物生産生理機能研究ユニ所
ット

14

RBS2011
研究課題

研究年度

担当研究機関・研究室

２５ ２６ ２７ ２８ ２９

１．良食味関連遺伝子の単離と機能解析
（１）コシヒカリの持つ良食味遺伝子の解析

機関

農研機構

研究室

九州沖 稲育種グルー

縄農業研究センタ プー（２）空育162号の持つ良食味遺伝子の解析

稲形質評価ユ
次世代 ニット
作物開発研究セン 米品質ユニッ
ター
ト
農研機構

（３）北海PL9号の持つ良食味遺伝子の解析

稲育種ユニット15

RBS3001
研究課題

研究年度

担当研究機関・研究室

２５ ２６ ２７ ２８ ２９

機関

研究室

全て農研機構１. 育種素材における遺伝子型調

次世代作物開発研究セン 稲形質評価ユニット

査支援（系１）ター

２．マッピング、遺伝子単離のための支援（系２）

次世代作物開発研究セン 稲形質評価ユニット
育種法開発ユニット
ター
稲形質評価ユニット（１）タイピング支援（２）マーカー開発（３）BACライブラリー作成

育種素材開発ユニッ（４）コンストラクトおよび形質転換

ト

体作成
３．塩基配列解析とSNPアレイの開発

次世代作物開発研究セン（１）SNP情報の抽出

ター（２）SNPマーカーの設定とカスタム

遺伝資源センター化

次世代作物開発研究セン（３）SNPバリデーション

育種法開発ユニット
植物多様性活用チーム
稲形質評価ユニット

ター

４．塩基配列解析とSNPアレイの開発

稲形質評価ユニット（１）有用遺伝子選抜マーカーセッ

次世代作物開発研究セン

トの開発

ター

（２）有用遺伝子選抜マーカーのバ

稲形質評価ユニット

リデーション
５．塩基配列解析とSNPアレイの開発

植物多様性活用チー（１）解析集団の養成と形質評価

遺伝資源センター（２）解析集団のタイピング

次世代作物開発研究セン（３）集団構造の解析

ター
遺伝資源センター

16

ム
稲形質評価ユニット
植物多様性活用チームⅠ－２．実施体制
課題
番号

RBS
1001

研究項目

担当研究機関・研究室
機関

研究担当者

研究室

研究開発責任者

農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲形質評価ユ ◎ニット

ゲノム選抜育種による病害抵抗性品種開
発の加速1

作物研究所

稲育種研究分 ○ 田中 淳一
野（H25～H27）

稲研究領域

山本 敏央

農研機構 次 基盤研究領域 育種法開発ユ ○ 米丸 淳一
世代作物開発ニット（H28～H29）
研究センター（地独）青森 藤坂稲作部
県産業技術センター農林総合研究所

須藤 充（H28～H29）（地独）青森 藤坂稲作部
県産業技術センター農林総合研究所

今 智穂美（H25～H26）（地独）青森 藤坂稲作部
県産業技術センター農林総合研究所

森山 茂治（H25～H29）（地独）青森 藤坂稲作部
県産業技術センター農林総
合研究所

小林 渡
（H25）

（地独）青森 藤坂稲作部
県産業技術センター農林総合研究所

清藤 文仁（H26～H27）（地独）青森 藤坂稲作部
県産業技術センター農林総合研究所

落合 祐介（H27～H29）

茨城県農業総 生物工学研究 普通作育種研 深沢 芳隆
合センター
所
究室
（H25～H29）
茨城県農業総 生物工学研究 普通作育種研 川又 快
合センター
所
究室
（H25～H28）
茨城県農業総 生物工学研究 普通作育種研 秋田 和則
合センター
所
究室
（H29）

17

茨城県農業総 生物工学研究 普通作育種研 岡本 和之
合センター
所
究室
（H25～H29）
三重県農業研 伊賀農業研究 伊賀農業研究 太田 千尋
究所
室
課
（H25）
三重県農業研 伊賀農業研究 伊賀農業研究 瀬田 聡美
究所室課（H26～H27）
三重県農業研 伊賀農業研究 伊賀農業研究 太田 雄也
究所室課（H28～H29）
三重県農業研 生産技術研究 農産研究課
究所
室

大野 鉄平
（H29）

三重県農業研 生産技術研究 農産研究課究所室
三重県農業研 農産研究課
究所

山川 智大
（H25～H26、
H29）
松本 憲悟
（H25～H28）

三重県農業研 生産技術研究 農産研究課
究所
室

高橋 武志
（H29）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 佐藤 毅
（H25～H28）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 平山 裕治（H25～H29）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 前川 利彦（H25～H29）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 佐藤 博一（H25）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 木内 均
（H25～H29）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 藤田 正平（H29）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 西村 努
（H25～H29）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 道満 剛平（H26～H29）

18

RBS
1002

ゲノム選抜育種による病害抵抗性品種開発の加速2

栃木県農業試 研究開発部
験場

水稲研究室

若林（星） 一好
（H25～H27）

栃木県農業試 研究開発部
験場

水稲研究室

青沼 伸一
（H25～H26）

栃木県農業試 研究開発部
験場

水稲研究室

伊澤 由行
（H25～H29）

栃木県農業試 研究開発部
験場

水稲研究室

木村 守
（H27～H29）

栃木県農業試 研究開発部
験場

水稲研究室

菅谷 和音
（H27～H28）

栃木県農業試 研究開発部
験場

水稲研究室

竹内 菜央子（H28～H29）

栃木県農業試 研究開発部
験場

水稲研究室

吉田 彩花
（H29）

農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲育種ユニッ 石井 卓朗
ト（H27～H29）

農研機構 次 基盤研究領域 育種素材開発 ○ 宇賀 優作
世代作物開発ユニット（H25～H29）
研究センター
秋田県農業試 作物部
験場

水稲育種担当 川本 朋彦（H25～H29）

秋田県農業試 作物部
験場

水稲育種担当 佐藤 健介（H25～H26）

秋田県農業試 作物部
験場

水稲育種担当 高橋 竜一（H25～H29）

秋田県農業試 作物部
験場

水稲育種担当 柴田 智
（H27～H29）

秋田県農業試 作物部水稲育
験場
種担当
農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

加藤 和直（H25～H29）
稲形質評価ユ 上田 忠正
ニット（H27～H29）

農研機構 農 有害化学物質 作物リスク低 石川 覚
業環境変動研 研究領域
減ユニット
（H25～H29）
究センター
福岡県農業総 農産部
合試験場

19

水稲育種チー 和田 卓也
ム
（H25）

RBS
1003

ゲノム選抜育種による出穂期改良品種開発の加速1

福岡県農林業 農産部
総合試験場

水稲育種チー 宮原 克典
ム（H26～H29）

福岡県農林業 農産部
総合試験場

水稲育種チー 山口 修
ム
（H26～H29）

福岡県農林業 農産部
総合試験場

水稲育種チー 石橋 正文
ム（H26～H29）

農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲形質評価ユ ○ 堀 清純
ニット
（H25～H29）

愛知県農業総 作物研究部
合試験場

作物研究室

伊藤 晃
（H25～H26）

愛知県農業総 作物研究部
合試験場

作物研究室

野々山 利博
（H25～H26）

愛知県農業総 作物研究部
合試験場

作物研究室

加藤 満
（H25～H29）

愛知県農業総 作物研究部
合試験場

作物研究室

杉浦 和彦
（H25～H29）

愛知県農業総 作物研究部
合試験場

作物研究室

濱頭 葵
（H27～H29）

愛知県農業総 作物研究部
合試験場

作物研究室

井手 康人
（H27～H29）

愛知県農業総 作物研究部
合試験場

作物研究室

荒川 みずほ
（H28～H29）

山形県農業総 水田農業試験 水稲部
合研究センタ 場ー中場 勝（H25～H28）

山形県農業総 水田農業試験 水稲部
合研究センタ 場
ー

後藤 元
（H25）

山形県農業総 水田農業試験 水稲部
合研究センタ 場ー

渡部 貴美子（H26～H29）

山形県農業総 水田農業試験 水稲部
合研究センタ 場ー阿部 洋平（H26～H29）

山形県農業総 水田農業試験 水稲部
合研究センタ 場ー鈴木 隆由輝（H26～H28）20

山形県農業総 水田農業試験 水稲部
合研究センタ 場ー本間 猛俊（H26～H29）

山形県農業総 水田農業試験 水稲部
合研究センタ 場ー

中場 理恵子
（H29）

山形県農業総 水田農業試験 水稲部
合研究センタ 場
ー

石塚 和
（H29）

長野県農業試 育種部
験場

牛山 智彦
（H25）

長野県農業試 育種部
験場

高松 光生
（H25～H29）

長野県農業試 育種部
験場

細井 淳（H25～H29）

長野県農業試 育種部
験場

矢ケ崎 和弘（H26）

長野県農業試 育種部
験場

吉田 清志
（H27）

長野県農業試 育種部
験場

酒井 長雄
（H28～H29）

農業生物資源 農業生物先端 イネゲノム育 田口 文緒
研究所
ゲノム研究セ 種研究ユニッ （H25）
ンター
ト
RBS
1004

ゲノム選抜育種による出穂期改良品種開発の加速2

農業生物資源 農業生物先端 イネゲノム育 ○ 田口 文緒
研究所
ゲノム研究セ 種研究ユニッ （H25）
ンタート
農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲形質評価ユ ○ 溝淵 律子
ニット（H26～H29）

宮城県古川農 作物育種部
業試験場

遠藤 貴司
（H25～H29）

宮城県古川農 作物育種部
業試験場

佐伯 研一
（H25～H27）

宮城県古川農 作物育種部
業試験場

中込 佑介
（H26～H29）

宮城県古川農 作物育種部
業試験場

21

育種班

佐藤 浩子
（H26～H29）

宮城県古川農 作物育種部
業試験場

育種班

石森 裕貴
（H28～H29）

滋賀県農業技 栽培研究部
術振興センター山田 善彦（H25～H27）

滋賀県農業技 栽培研究部
術振興センター谷口 真一（H28～H29）

滋賀県農業技 栽培研究部
術振興センター

水稲育種・原 宮村 弘明
種担当（H25～H27）

滋賀県農業技 栽培研究部
術振興センター

水稲育種・原 西谷 清彦
種担当（H26～H27）

滋賀県農業技 栽培研究部
術振興センター

水稲育種・原 椎木 咲帆
種担当（H28～H29）

滋賀県農業技 栽培研究部
術振興センタ
ー

水稲育種係

日野 耕作
（H25～H29）

滋賀県農業技 栽培研究部
術振興センタ
ー

水稲育種係

森 茂之
（H25～H28）

滋賀県農業技 栽培研究部
術振興センタ
ー

水稲育種係

吉田 貴宏
（H25～H29）

滋賀県農業技 栽培研究部
術振興センタ
ー

水稲育種係

西村 卓真
（H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合センター農業バイオセ 村田 和優
ンター（H25～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

池田 博一
（H26）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

蛯谷 武志
（H25～H28）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

山口 琢也
（H25～H29）

22

RBS
2001

種子形制御遺伝子の利用を起点としたイネの多収化戦略富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

伊山 幸秀
（H25～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

稲原 誠
（H26）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

育種課

小島 洋一朗（H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 尾崎 秀宣
ンター（H27～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 藤田 健司
ンター（H25～H26）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 廣川 智子
ンター・育種 （H25）
課

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 金田 宏
ンター・育種 （H27～H28）
課

福井県立大学 生物資源学部 分子生物学研 ○ 岩崎 行玄
究領域（H25～H26）
福井県立大学 生物資源開発 分子生物学研 三浦 孝太郎
研究センター 究領域（H25～H26）

RBS
2002

RBS
2003

イネの登熟最適化を実現する理想的穂型の構築と超多収育種への応用

イネの強稈性に関与する有用遺伝子の単離とその集積

名古屋大学

生物機能開発 有用農業形質 ○ 北野 英己
利用研究セン 保存分野
（H25～H29）
ター

名古屋大学

生物機能開発 高次生体分子 芦苅 基行
利用研究セン 機能研究分野 （H25～H29）
ター

東京農工大学 大学院農学府 植物生産科学 ○ 大川 泰一郎（H25～H29）
東京農工大学 大学院農学府 植物生産科学 金勝 一樹
講座（H25～H29）
富山県農林水 農業研究所
産総合センター農業バイオセ 村田 和優
ンター（H25～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

23

池田 博一
（H26）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

蛯谷 武志
（H25～H28）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

山口 琢也
（H25～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

伊山 幸秀
（H25～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

稲原 誠
（H26）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

育種課

小島 洋一朗（H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 尾崎 秀宣
ンター（H27～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 藤田 健司
ンター（H25～H26）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 廣川 智子
ンター・育種 （H25）
課

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 金田 宏
ンター・育種 （H27～H28）
課

名古屋大学

RBS
2004

RBS
2005

シンク及びソースに関わる遺伝子の機能解析と有用性評価

インディカ多収品種の収量性向上に向けた遺伝解析と育種的利用

生物機能開発 植物分子育種 松岡 信
利用研究セン 分野（H25～H29）
ター

農業生物資源 植物科学研究 植物生産生理 ○ 石丸 健
研究所
領域機能研究ユニ （H25～H26）
ット
東洋大学

生命科学部生 植物ゲノム科 廣津 直樹
命科学科
学研究室
（H25～H26）

作物研究所

稲研究領域

作物研究所

稲研究領域

作物研究所

稲研究領域

24

稲生理分野

○ 高井 俊之（H25～H26）
谷口 洋二郎（H25～H26）

稲育種研究分 田中 淳一
野
（H25）

RBS
2006

光合成効率を高める
QTLの単離と集積

作物研究所

稲研究領域

稲研究分野

加藤 浩
（H25）

作物研究所

稲研究領域

稲生理分野・ 近藤 始彦
水稲多収生理 （H25～H26）
プロジェクト

農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲形質評価ユ ○ 山本 敏央
ニット（H25～H29）

東京農工大学平沢 正（H25～H29）

東京農工大学 グローバルイ
ノベーション
研究院

安達 俊輔（H27～H29）

農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲形質評価ユ 上田 忠正
ニット（H25～H29）

農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲形質評価ユ 山内 歌子
ニット（H25～H29）

農研機構 次 畑作物研究領 畑作物形質評 福田 篤徳
世代作物開発 域価ユニット（H25～H28）
研究センターRBS
2007

低温土中出芽性に寄与する遺伝子の単離

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

育種課

富山県農林水 農業研究所
産総合センター農業バイオセ 村田 和優
ンター（H25～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

池田 博一
（H26）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

蛯谷 武志
（H25～H28）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

伊山 幸秀
（H25～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術セ
ンター

育種課

稲原 誠
（H26）

25

○ 山口 琢也
（H25～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

育種課

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 尾崎 秀宣
ンター（H27～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 荘司 和明
ンター（H25～H29）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 藤田 健司
ンター（H25～H26）

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 廣川 智子
ンター・育種 （H25）
課

富山県農林水 農業研究所
産総合技術センター

農業バイオセ 金田 宏
ンター・育種 （H27～H28）
課

RBS 寒地におけるイネ圃場 ホクレン農業
2008 苗立ち性に関するQTL 総合研究所のマッピングと集積
ホクレン農業総合研究所

小島 洋一朗（H29）

作物生産研究 畑作物開発課 ○ 岩田 夏子
部（H25～H29）
作物機能開発課

ホクレン農業 作物機能開発
総合研究所課

山田 ちなつ
（H25）
忠村 一毅
（H26）

ホクレン農業 作物生産研究 畑作物開発課 乕田 淳史
総合研究所
部（H25～H29）
北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 佐藤 毅
（H25～H28）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 平山 裕治（H25～H29）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 前川 利彦（H25～H29）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 佐藤 博一（H25）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 木内 均
（H25～H29）26

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 西村 努
（H25～H29）

北海道立総合 研究部
研究機構 上川農業試験場

水稲グループ 道満 剛平（H26～H29）

RBS 生産性向上をめざした 農業生物資源 農業生物先端 イネゲノム育 ○ 宇賀 優作
2009 イネ根系形態遺伝子の 研究所
ゲノム研究セ 種研究ユニッ （H25～H26）
解析
ンター
ト
RBS 粗放栽培への適応を目 農業生物資源 植物科学研究 植物生産生理 ○ 稲垣 言要2010 指した育種素材の作出 研究所
領域
機能研究ユニ （H25～H26）
ット
RBS 良食味関連遺伝子の単 農研機構 九 水田作研究領 稲育種グルー ○ 竹内 善信
2011 離と機能解析
州沖縄農業研 域プ（H25～H29）
究センター
農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲育種ユニッ 黒木 慎ト
（H28～H29）

農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲形質評価ユ 堀 清純
ニット
（H25～H29）

農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

米品質ユニッ 鈴木 啓太郎
ト（H25～H29）

RBS ゲノム選抜育種に必要 農業生物資源 農業生物先端 イネゲノム育 ○ 福岡 修一
3001 な基盤技術の開発
研究所
ゲノム研究セ 種研究ユニッ （H25～H27）
ンター
ト
農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

稲形質評価ユ ○ 山内 歌子
ニット（H28～H29）

農業生物資源 農業生物先端 イネゲノム育 山内 歌子
研究所
ゲノム研究セ 種研究ユニッ （H27）
ンタート
農研機構 遺 植物多様性活伝資源センタ 用チーム
ー農研機構 次 稲研究領域
世代作物開発研究センター

江花 薫子（H25～H29）
稲形質評価ユ 山本 敏央
ニット（H25～H29）

農研機構 次 基盤研究領域 育種素材開発 杉本 和彦
世代作物開発ユニット（H25～H29）
研究センター

27

農研機構 次 基盤研究領域 育種法開発ユ 米丸 淳一
世代作物開発ニット（H25～H29）
研究センター（注１）

研究開発責任者には◎、小課題責任者には○、実行課題責任者には△を付すこと。

28

中課題番号

13405915

研究期間

平成２５～２９年度

大課題名

ゲノム情報を活用した農産物の次世代生産基盤技術の開発

中課題名

イネのDNAマーカー育種の利用推進

代表機関・研究開発責国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 次世代作物開発

任者名

研究センター 稲研究領域 稲形質評価ユニット・ユニット長・山本 敏央

Ⅰ－１．研究目的
分子生物学の進歩とゲノム情報の蓄積によって、イネの農業形質を司る多くの遺伝子が明らかとなり、これらを活用して従来よりも育成期間が短縮した実用品種が開発されている。
しかしながらこのような取り組みは一部の育種機関で実施されているのみで、多くの公設試や企業が取り組みやすいイネ品種開発加速のための仕組みづくりが求められている。
このため、本研究では、
１．ゲノム選抜育種による病害抵抗性品種開発の加速1２．ゲノム選抜育種による病害抵抗性品種開発の加速 2３．ゲノム選抜育種による出穂期改良品種開発の加速 1４．ゲノム選抜育種による出穂期改良品種開発の加速 2５．種子形制御遺伝子の利用を起点としたイネの多収化戦略（H26 年度に終了）
６．イネの登熟最適化を実現する理想的穂型の構築と超多収育種への応用
７．イネの強稈性に関与する有用遺伝子の単離とその集積
８．シンク及びソースに関わる遺伝子の機能解析と有用性評価（H26 年度に終了）
９．インディカ多収品種の収量性向上に向けた遺伝解析と育種的利用（H26 年度に終了）
１０．光合成効率を高める QTL の単離と集積１１．低温土中出芽性に寄与する遺伝子の単離１２．寒地におけるイネ圃場苗立ち性に関する QTL のマッピングと集積１３．生産性向上をめざしたイネ根系形態遺伝子の解析（H26 年度に終了）
１４．粗放栽培への適応を目指した育種素材の作出（H26 年度に終了）
１５．良食味関連遺伝子の単離と機能解析
１６．ゲノム選抜育種に必要な基盤技術の開発
により、ゲノム選抜育種に有用な交配用イネ育種素材を提供するとともに、ゲノム育種支援を活用した水稲品種開発の全国的な加速を目標とする。
その結果、１．地域のニーズに合った優良な水稲品種の短期間での開発
２．水稲育種に対する企業等の新規参入による活性化が期待される。

29

Ⅰ－２．研究結果
本中課題では上記Ⅰ－１に掲げた課題群を大きく3つの系に分けて研究を推進した。系１（育種支援システムの開発）では公設試の既存品種（系統）に病害抵抗性遺伝子または出穂期
遺伝子を付与した準同質遺伝子系統を遺伝背景選抜と並行して行うことで加速する。系2（育種素材の開発）では種子形、穂長、強稈性、止め葉面積、個葉光合成速度、葉身傾斜角度、低温土中出芽（直播適性）、根系、良食味に関する原因遺伝子を単離同定し準同質遺伝子系統（NILs）を作出する。系3（ゲノム育種基盤技術の開発）では、中核機関が開発した既存SNPタ
イピングアレイを用いて系１のタイピング支援を行うとともに、並行して、これまでに蓄積した日本型在来種および栽培種のSNP情報を精査し、日本の栽培イネ品種群を精度高く識別する
2000カ所のSNP情報からなる新タイピングアレイを開発する
系１では、茨城県および栃木県において縞葉枯病抵抗性を付与した「ひたちIL3号」（図1）および「栃木IL31号」が完成した。三重県においていもち病圃場抵抗性を付与した「三重33号」（図2）が完成した。これらについては複数年の奨励品種決定調査が継続中である。山形
県および宮城県では出穂期を早生化または晩生化した「山形144号」および「東北229号」が完成し、秋田県および福岡県では低カドミ吸収といもち病抵抗性を両立させる系統を選抜した。
これらについては終了年次翌年度より奨励品種決定調査に進む。富山県では早生化による粒厚減少を補償するQTLを検出して併せて集積した系統を選抜した。北海道、青森県および愛知県については導入遺伝子の特性は確認できたが、生産力検定試験による形質の同質程度の確認が残されている。長野県および滋賀県では目標とする遺伝子型系統は選抜できたが、想定された
早晩性の変化が得られず目的とした育成系統が得られていない。

図1.茨城県で育成した縞葉枯病抵抗性系統「ひたちIL3号」（ふくまるの準同質遺伝子系統）

図2.三重県で育成したいもち病抵抗性系統「三重33号」（三重23号の準同質遺伝子系統）

30

系２では、新規のシンクサイズ関連遺伝子座として穂軸長（qPRL5）、二次枝梗数（qSRN2）、既知の遺伝子座のアリルとして先端分枝（qSRN7）、一次枝梗長（qPBL6）を単離同定した。また新規の登熟関連遺伝子座として心白率（WCR3）および完全粒割合（NGR1）の存在を明らかにした。稈の強度に関わる遺伝子（SCM2,SCM3,SCM4）を単離同定し（図3）、4つのQTLの集積系統について挫折型およびたわみ型の倒伏抵抗性が強化されていることを示した。
また相対的に耐倒伏性が劣る日本型栽培品種においても稈強度に貢献する皮層繊維組織の厚さに関わるQTLが存在することを明らかにした。気孔伝導度を高めることによって乾物増加に貢献するQTLを明らかにした。インド型品種と比較して相対的に光合成能力に劣る日本型品種にも個葉光合成速度を高めるQTLが存在することを明らかにした。光合成速度には集積効果があることを明らかにした。この他、水稲の乾物生産に間接的に貢献する形質として種子形、止め
葉面積、群落葉面温度、葉身傾斜角度、水伝導度、葉色低下抑制に関わるQTLを明らかにして育種選抜用DNAマーカーが開発された。
発芽能力の高い在来水稲品種から低温土中出芽性に関する遺伝子（qESS11）を同定し、穂発
芽耐性遺伝子との集積によって直播適性と穂発芽耐性を両立する系統を作出した（図4）。北
海道品種の苗立ち率を改善するQTL（qSES11）が既知の北海道の直播適性品種の更なる苗立ち率向上に貢献することを明らかにした。コシヒカリの良食味を決定する遺伝子および北海道米の食味向上に貢献した遺伝子を同定し、いずれもアミロースの発現制御に関わっていることを明らかにした。この他、ストレス環境下での生産性に貢献する形質として、根系、分けつ可塑性に関するQTLを明らかにして育種選抜用DNAマーカーが開発された。

図3. 強稈遺伝子の単離と集積による耐倒伏性向上コシヒカリ系統の育成（東京農工大学）
左は強稈性遺伝子SCM3の単離の様子を、右上は集積系統のグラフ遺伝子型を、右下はその草型と稈径を示す。

31

図4.苗立性と穂発芽耐性を両立した実用性の高い育種素材の開発（富山県農林水産総合技術センター）
苗立ちを向上させるQTL（qESS11）に穂発芽耐性を向上させるQTL（Sdr1またはSdr4）を組み合わせた集積系統の苗立ちと収量性の関係

系3では、国内品種および有用な育種母本の塩基配列情報をもとに5000カ所以上のSNP情報を獲得し、その中から913カ所の識別精度の高いSNPを選定し、日本の主要な栽培稲品種192種でゲノムワイドSNP遺伝子型を明らかにした。また今後のアジア栽培品種からの有用遺伝子導入を目的としたゲノム育種の効率化のためにこれらの遺伝子型を効率的に識別する汎用SNPセットを選定した。またイネゲノム中の10カ所のいもち病抵抗性遺伝子座に存在する23の対立遺伝
子を同時に識別するSNPアレイの実効性を系1の参画機関の育成系統を用いて検証した。
プロジェクト期間中の5年間で系1の支援メニュー290件と系2の支援メニュー117件を遅滞なく遂行するとともに、次世代ゲノム基盤プロの他のコンソーシアムの課題についても積極的に支援を行うことでプロジェクト全体に大きく貢献した。
Ⅰ－３．今後の課題系１については完成系統の農業特性の評価による同質性および安定性の確認が残されている。また一部系統では期待した表現型効果が得られなかったものもあったことから、遺伝子と遺伝背景（遺伝子間相互作用）および環境（地域や年次間相互作用）との関連については体系的に明らかにし、将来に渡って育種ビッグデータとして活用していく取り組みが必要である。
系2についても、成果をそのまま育種に組み入れることが可能な遺伝子もいくつか得られたが、単離同定した新規の遺伝子の多面発現や相互作用などを明らかにしながら育種的価値を判断する必要がある。
系3については、遺伝背景選抜の期間やコストの削減については技術の進歩に併せて適宜改善や修正が必要である。

32

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS1001
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: ゲノム選抜育種による病害抵抗性品種開発の加速 1
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農研機構 次世代作物開発研究センター・基盤研究領域・育種法開発ユニット・米丸淳一
１）研究目的
病虫害抵抗性は多くの場合、作用力が大きい少数の遺伝子が効果を示すことから、これらの遺伝子を導入対象にした Marker-assisted Selection (MAS) が効果的である。近年、道府県に設置されている公設試で育成した各地域に適した水稲基幹品種が広く普及しているが、それらの中には食味は優れるものの病虫害抵抗性に課題がみられる品種は多い。一方、最近では、SNP アレイ等の技術開発により、迅速なゲノムワイドジェノタイピングが可能となってきた。そこで、最新のジェノタイピング技術を用い、効率的な連続戻し交配と MAS によって、公設試で育成された水稲基幹品種に病虫害抵抗性を付与した品種候補を迅速に育成することを目的としたイネの DNA マーカー選抜育種における有効な支援システムを構築する。
２）研究成果【方法】
各公設試（5 道県）の基幹品種と有用な病害抵抗性遺伝子を保有するドナー品種を交配し、ゲノム
ワイドジェノタイピングを用いて遺伝背景を確認すると同時に、導入対象領域について近傍領域の遺伝子型による「削り込み」を実施し、候補系統の育成を行った。育成された候補系統については、各公設試において、系統選抜、増殖、生産力検定試験を行い、基幹品種との比較を行い特性を評価した。
また、必要に応じ、遺伝子ピラミディングのための交配を実施するとともに、遺伝子ピラミディングのための交配後代からゲノム選抜によりピラミディング系統を選抜することを行った。各公設試において最終的に得られた系統の特性の精査により、イネの DNA マーカー選抜育種における支援システ
ムの有効性の検証を行った。
【結果】

1) 北海道「きたゆきもち」を連続親に、「ともほなみ」を供与親にした連続戻し交配とゲノム選抜を実施した。2 年間合計 3 回の戻し交配という少ない交配回数で、いもち病抵抗性遺伝子 pi21 および近傍領域が「ともほなみ」型に固定、それ以外の領域が「きたゆきもち」型に固定した個体を得た。生産力検定試験および特性検定試験の結果から、育成系統の葉いもち圃場抵抗性は「きたゆきもち」より 2 ランク程度強化された。育成系統の農業特性は「きたゆきもち」とほぼ同等であった (表 1、写真 1)。

RBS100133

表 1. 育成系統の主要特性 (平成 29 年度、生産力検定試験)

写真 1. 育成系統 (右 3 系統) における葉いもち圃場抵抗性2) 青森県「ほっかりん」に Pi35 を導入した同質遺伝子系統の育成を目的として、平成 29 年度に 6 系統について生産力検定及び特性検定を実施した。供試系統は、全ていもち病抵抗性が葉いもち、穂いもちともに「ほっかりん」よりも明らかに強かった (写真 2、表 3)。また、供試系統のうち、「相 1222」は、生育特性、収量性、品質などの特性が最も「ほっかりん」に類似していたことから、「ふ系 IL15 号」の地方番号を付名した (表 2、表 3)。

写真 2. 葉いもち圃場抵抗性検定 左：Pi35 導入系統、右：ほっかりん

RBS100134

表 2.「ふ系 IL15 号」の生育・収量調査結果

表 3.「ふ系 IL15 号」の特性検定結果

3) 栃木県「なすひかり」に縞葉枯病抵抗性遺伝子 Stvb-i を導入した準同質遺伝子系統「栃木 IL31 号」を育成した (写真 3)。平成 29 年度は、奨励品種決定調査 (標肥、多肥、普通植) での比較を行った
ところ、稈長、穂長がやや長いものの、出穂期、成熟期ともほぼ同じで生育期間中の差は無く、収量も同等であった (表 4)。諸特性についても、平成 29 年度は夏季の天候不順の影響があったと思われるが、「なすひかり」とほぼ同等であることを確認できた。縞葉枯病抵抗性について、
現地試験で確認を行ったところ、「なすひかり」が 38.6 ％の発病株率に対し、「栃木 IL31 号」での発病は認められなかった。また、玄米重は「なすひかり」に対し 108 ％であった (表 5)。

写真 3. 平成 29 年 8 月 21 日撮影

奨励品種決定調査

RBS100135

表 4. 奨励品種決定調査における生育・収量調査結果（平成 29 年度）

表 5. 現地試験成績（平成 29 年度、真岡市）

4) 茨城県「ふくまる」に縞葉枯病抵抗性遺伝子 Stvb-i を導入した準同質遺伝子系統「ひたち IL3 号」を育成した（写真 4）。「ひたち IL3 号」は「ふくまる」と比べて、出穂期、成熟期、倒伏やいもち被害程度、稈長、穂長、玄米品質は差がなかった。玄米重の標準比率は 100 ％であり、玄米千粒重は 0.3g 重かった (表 6)。また、食味官能評価は「ふくまる」と同等であった。縞葉枯病が発生する現地圃場における縞葉枯病発病程度は、「ふくまる」が発病株率で 97.5 ％、発病茎率で 43 ％の被害が認められたのに対して、「ひたち IL3 号」の発病は株率で 4.2 ％、茎率で 0.1％にとどまり、罹病株の発病も軽微であった (図 1)。縞葉枯病の影響により玄米重の標準比率
は 285 ％となり、「ひたち IL3 号」の縞葉枯病抵抗性が確認された。

写真 4. 「ひたち IL3 号」の草姿 (左：ふくまる、右：ひたち IL3 号)

RBS100136

表 6. 「ひたち IL3 号」の生産力検定試験結果 (平成 29 年度)

図 1. イネ縞葉枯病発生圃場における株ごとの発病程度 (平成 29 年度)

5) 三重県
pi21 を導入した「三重 23 号」の同質遺伝子系統の中から、昨年度の各種試験結果から絞り込
んだ 1 系統に地方系統番号「三重 33 号」を付与し、奨励品種決定試験本調査に供試して、特性調査を行った (写真 5)。また松阪市と伊賀市の県内 2 か所で、現地適応性試験を実施した。供試した系統は、松阪市の試験で千粒重がやや小さくなるものの、収量はほぼ同程度で、出穂期
や稈長、穂長などその他の生育特性も、連続戻し交配親である「三重 23 号」とほぼ同等である
ことを確認した (表 7、表 8)。またコシヒカリを基準とした食味官能評価でも「三重 23 号」と食味評価に差はみられなかった (表 7)。

RBS100137

写真 5. 「三重 33 号」の草姿 (左上：分けつ期、右上：成熟期、下：伊賀市圃場)

表 7. 「三重 33 号」の奨励品種決定調査試験結果 (平成 29 年度)

表 8. 「三重 33 号」のの現地試験調査結果 (平成 29 年度)【考察】
ゲノムワイドジェノタイピングを用いた戻し交雑を 2 ないし 3 回行うことで遺伝背景がほぼ戻し交雑親と同一の準同質遺伝子系統の育成が可能であったことから、本研究で用いた育種支援システム
は、基幹品種に有用な病害抵抗性遺伝子を迅速に導入するために有用であると考えられた。
３）成果活用における留意点

1) 各公設試の基幹品種を遺伝背景にした準同質遺伝子系統（品種候補）が育成され、必要に応じた領域の削込みと、育成した系統の特性把握が行われたことから、地方系統番号や奨励品種決定試験供試等を経て、将来の品種および育種母材としての活用が期待できる。
2) 栽培環境によっては、戻し交雑親と異なった表現型を示す可能性を完全に排除できないことから、複数環境および複数年にわたる評価を行うことが望ましい。
RBS100138４）今後の課題

1) Pi35 および pi21 の導入過程において、千粒重がやや小さくなるほか食味を低下させるなどの影響がみられた。基幹品種の遺伝背景との相互作用、導入領域もしく導入過程で残存する島状の領域などの影響など種々の可能性が考えられるが、栽培環境条件によっても変動していることから、今後それらの可能性を検討する必要がある。
2) 冬期の世代促進により迅速な固定作業を行っているが、圃場における形質評価を伴わない過程においては今以上の世代促進が可能であることから、さらなる世代促進技術の利用が求められる。
3) 複数の遺伝子領域を迅速に導入する方法の効率化については今後検討が必要である。

RBS100139

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS1002
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: ゲノム選抜育種による病害抵抗性品種開発の加速 2
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農研機構 次世代作物開発研究センター・基盤研究領域・育種素材開発ユニット・宇賀優作
１）研究目的「ちくし 89 号」は福岡県農林業総合試験場が育成した中生・多収で高温耐性に優れる有望系統である。福岡県農林業総合試験場では、効率的な連続戻し交雑と DNA マーカー選抜によって、「ちくし 89 号」を遺伝的背景とし、いもち病抵抗性と縞葉枯病抵抗性ならびに低カドミ吸収性を有する水稲品種の育成をめざす。
「秋田 106 号」は秋田県で育成された系統で食味も優れるが、カドミウム高濃度圃場での栽培では汚染米が生産される可能性があり、いもち病抵抗性にも課題が残っている。そこで、秋田県農業試験場では、効率的な連続戻し交雑と DNA マーカー選抜によって、「秋田 106 号」を遺伝的背景とし、いもち病抵抗性ならびに低カドミ吸収性を有する水稲品種の育成をめざす。
２）研究成果
課題 1．福岡県育成系統「ちくし 89 号」に、いもち病抵抗性遺伝子 Pb1 および縞葉枯病抵抗性遺伝子 Stvb-i 、カドミウム低吸収性遺伝子 osnramp5-2 を導入した品種候補を育成する「ちくし 89 号」を戻し交雑親とし、いもち病抵抗性遺伝子 Pb1 および縞葉枯病抵抗性遺伝子 Stvb-iの供与親に「つやおとめ」、カドミウム低吸収性遺伝子 osnramp5-2 の供与親に農環研育成の「lcdkmt2」（後の「コシヒカリ環 1 号」）を用いた（図 1）。各交配毎に MAS および SNP マーカーによる背景調査を実施することで、BC3F1 でそれぞれ遺伝子の置換率（SNP 数・平均値）が 80.4%、88.8%の系統を得た。さらに、3 遺伝子を集積する BC3F1 同士の交配時にも SNP 情報を活用することで、最終的に 98.3 ％が「ちくし 89 号」型となった系統（F4 時点）を得た（図 2）。4 年目より生産力検定試験を実施し、得られた系統の栽培特性が「ちくし 89 号」と同等に中生・多収で高温耐性を有することを確認。また、特性検定により、穂いもち抵抗性、縞葉枯病抵抗性、カドミウム低吸収性を確認した（表 1、図 3）。

RBS100240

RBS1002

41

RBS100242

課題 2．秋田県育成系統「秋田 106 号」に、いもち病抵抗性遺伝子 pi21 およびカドミウム低吸収性遺伝子 osnramp5-2 を導入した品種候補を育成する
いもち病抵抗性 NIL の育成は、pi21 を持つ「東北 209 号」と交配した後、「秋田 106 号」を 2 回戻し交配して、遺伝的背景が「秋田 106 号」に近い個体を選抜した（図 4）。遺伝的背景が最も「秋田106 号」に近い個体はヘテロ率が 11%（多型数/全 SNP 数=9/79）で組み替え箇所は 2 箇所残っていると考えられた。カドミウム低吸収性 NIL の育成は、osnramp5-2 を持つ「コシヒカリ環 1 号」と交配した後、「秋田 106 号」を 3 回戻し交配して、遺伝的背景がほぼ「秋田 106 号」となった個体（多型数/全 SNP 数=0/89）を得た（図 4）。いもち病抵抗性 NIL を母親、カドミウム低吸収性 NIL を父親として交配を行い、98 粒の F1 種子を得た。さらにマーカー選抜及びゲノム選抜を行い、pi21 とosnramp5-2 をホモで持つ「秋田 106 号 NIL」最終個体（F2）を 14 個体得た。「秋田 106 号 NIL」はいずれも導入遺伝子の周辺以外は遺伝的背景が全て「秋田 106 号」に置き換わっていた（図 5）。「秋田 106 号 NIL」の栽培特性を調べたところ、稈長は「秋田 106 号」よりやや短かったが、出穂期や穂長、穂数はほぼ同等だった。また、カドミウム低吸収性 NIL を秋田県内現地圃場で栽培してカドミウ
ム吸収性を調べたところ、茎葉、玄米ともに「秋田 106 号」よりも低い結果が得られた。

RBS100243

３）成果活用における留意点
課題 1．
現在、地方系統番号の付与および、次年度の奨励品種決定調査への供試に向け関係機関と協議中である（2018 年 1 月時点）。
課題 2．
最終系統については世代を進めて系統展開し、生育調査や収量調査結果がまとまった時点で品種登録を目指す。中間母本として育成した「カドミウム低吸収性 NIL」は交配母本としても利用できる。
４）今後の課題
課題 1．
品種化に向け、引き続き系統適応性試験等に供試し、栽培適性や特性検定の評価を見極める必要が
ある。
課題 2．
pi21 と osnramp5-2 をホモで持つ「秋田 106 号 NIL」の育成は F3 種子を得て個体選抜まで進んだ。
今後も引き続き生育調査や収量調査等を行い、品種登録に向けてデータを蓄積する必要がある。

RBS100244

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS1003
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: ゲノム選抜育種による出穂期改良品種開発の加速 1
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農研機構 次世代作物開発研究センター・稲研究領域・稲形
質評価ユニット・堀清純
１）研究目的イネの開花時期（出穂期）は品種の地域適応性を決定する重要な農業形質である。近年のイネゲノム研究の成果により、イネの主要な出穂期（開花時期）を制御する遺伝子がいくつも単離され、育種に利用可能な有用アリル（変異）が複数同定されている。そこで、イネゲノム研究成果の育種現場への普及促進をはかるために、これまでの知見を利用して出穂期を改変した品種開発が加速する実例を積極的に作り出すことを目指す。本研究では、山形県、長野県および愛知県が育成した主要水稲品種や有望系統について、栽培地域の拡大や作期分散を可能にするため、連続戻し交配と世代促進を実施
して特定のイネ出穂期遺伝子だけを導入して出穂期を改変した準同質遺伝子系統を作出する。選抜過程で SNP ジェノタイピングアレイ等の技術を用いて遺伝的背景を明らかにし、品種候補系統の育成
を最速で行う。このことを通じて参画機関の山形県、長野県および愛知県にゲノム選抜育種技術の浸透を図り、イネの DNA マーカー選抜育種における有効な支援システムを構築する。
２）研究成果（１）出穂期遺伝子アリル構成および全ゲノム SNP 遺伝子型の調査
山形県、長野県および愛知県の複数の育成系統や奨励品種について出穂期遺伝子のアリル構成を調査して、導入する出穂期遺伝子および連続戻し交配に用いる系統・品種（遺伝子供与親と戻し交配反復親）を選定した。その後、山形県、長野県および愛知県で作出した戻し交配後代集団について、出穂期遺伝子のアリル構成と全ゲノム SNP ジェノタイピングアレイによる遺伝背景を調査した。取得
した遺伝子型調査の結果を各県に返送して、戻し交配や自殖を行う個体を選抜した。
（２）「つや姫」の早生型の準同質遺伝子系統の作出
山形県育成の「つや姫」と「森多早生（Hd17 供与親）」の F1 個体に「つや姫」を連続戻し交配した後代集団の中から、出穂期遺伝子 Hd17 がヘテロ接合体型でそれ以外のゲノム領域が「つや姫」に大きく置換した個体を選抜した。選抜個体の自殖後代集団の出穂期を調査したところ、「森多早生」型の Hd17 を持つ個体が平均して 3〜5 日程度早くなっており、目的の出穂時期の早生系統が作出可能であると考えられた。さらに連続戻し交配後の選抜個体の自殖種子を採取して、出穂期遺伝子 Hd17
が「森多早生」型でそれ以外のゲノム領域が「つや姫」に置換した個体を選抜した。作出した BC4F5
世代および BC5F5 世代の準同質遺伝子系統の 5 系統について、Hd17 極近傍の SNP マーカーを用いた遺伝子型調査を行い、選抜系統が約 139 kbp の導入断片を持つことを明らかにした（図 1）。
平成 28〜29 年に生産力検定試験に供試し、生育、収量、玄米品質、食味特性等について調査を行った。準同質遺伝子系統は、出穂期が「つや姫」と比較していずれも 4〜5 日早まり、稈長は 3〜6cm短くなった。収量性については、いずれの系統でも精玄米重は「つや姫」並であったが、全重が少なくなった（表 1）。玄米品質については、いずれの系統も「つや姫」並〜やや劣った（表 2）。食味官
能試験では、系統間で差が見られた。そのうち 2 系統（庄 5537、庄 5538）の食味評価が特に良好であった。
5 系統のうち、庄 5537 に地方系統番号を付し、「山形 144 号」として選抜した。

RBS100345

（３）「信交 538 号」の早生型の準同質遺伝子系統の作出
長野県育成の「信交 538 号」と「信交 534 号（Ghd7 供与親）」の後代個体に「コシヒカリ BL3-2（Hd16 供与親）」を交配した 3 系 F1 個体に「信交 538 号」を連続戻し交配した後代集団の中から、出穂期遺伝子 Ghd7 または Hd16 がヘテロ接合体型でそれ以外のゲノム領域が「信交 538 号」に大きく置換した個体を選抜した。選抜個体の自殖後代集団の出穂期を調査したところ、「信交 534 号」型のGhd7 を持つ個体が平均 6 日、「コシヒカリ BL3-2」型の Hd16 を持つ個体が平均 10 日の早生になっ

RBS100346

ており、これらの出穂期遺伝子の導入により目的の出穂時期の早生系統が作出可能であると考えられた。さらに連続戻し交配後の選抜個体の自殖種子を採取して、出穂期遺伝子 Ghd7 が「信交 534 号」
型または Hd16 が「コシヒカリ BL3-2」型でそれ以外のゲノム領域が「信交 538 号」に置換した個体を選抜した。作出した BC4F3 世代の準同質遺伝子系統の 6 系統について、Ghd7 および Hd16 極近
傍の SNP マーカーを用いた遺伝子型調査を行い、選抜系統が約 1.5 Mbp または約 1.7 Mbp の導入断片を持つことを明らかにした（図 2）。作出した準同質遺伝子系統について、県内 2 か所の試験圃
場（須坂市標高 340m、原村標高 1020m）において出穂日および他の農業形質を調査した。
「信交 534号」型の Ghd7 を持つ系統は「信交 538 号」と比較して、須坂市の試験栽培圃場では約 10 日の早生となり約 9cm 稈長が短く穂数は多く、玄米重は少なかった（表 3）。原村試験地圃場では約 10 日の早生および約 15cm の短稈となり、収量性はやや少ないが千粒重が大きかった。
「コシヒカリ BL3-2」型の Hd16 を持つ系統は、「信交 538 号」と比較して、須坂市の試験栽培圃場では 1 日の早生で稈長は同程度、玄米重、千粒重とも同程度であった。原村試験地圃場では出穂期および稈長は同程度、収量性と千粒重は同程度であった。

RBS100347

（４）「あいちのかおり SBL」の早生型の準同質遺伝子系統の作出
愛知県育成の「あいちのかおり SBL」と「あ系 883（Hd1、Hd17、Hd18 供与親）」、「コシヒカリ（Hd1、Hd16、Hd18 供与親）」、「あ系 873（Hd1、Hd17 供与親）」を連続戻し交配した後代集団の中から、出穂期遺伝子がヘテロ接合体型でそれ以外のゲノム領域が「あいちのかおり SBL」に大きく置換した個体を選抜した。選抜個体の自殖後代集団の出穂期を調査したところ、全ての出穂期遺伝子組み合わせの中で供与親型の Hd1 および Hd17 を持つ個体が平均 10 日の早生になっており、これら
2 つの出穂期遺伝子の導入により目的の出穂時期の早生系統が作出可能であると考えられた。さらに連続戻し交配後の選抜個体の自殖種子を採取して、出穂期遺伝子 Hd1 および Hd17 が「あ系 873」型
でそれ以外のゲノム領域が「あいちのかおり SBL」に置換した個体を選抜した。作出した BC3F4 世
代の準同質遺伝子系統の 2 系統について、Hd1 および Hd17 極近傍の SNP マーカーを用いた遺伝子型調査を行い、選抜系統が約 1.2 Mbp または約 1.1 Mbp の導入断片を持つことを明らかにした（図3）。圃場栽培により農業形質を確認した結果、作出した準同質遺伝子系統の出穂期は「あいちのかお
り SBL」と比較して約 8 日〜10 日早生化しており、目標の早生熟期であった（表 4）。準同質遺伝子
系統の穂数は「あいちのかおり SBL」と比較しやや少なく、精玄米重はやや減少しており、玄米の粒
大は「あいちのかおり SBL」とほぼ同等であった。

３）成果活用における留意点
山形県、長野県および愛知県において、出穂期遺伝子だけを導入した準同質遺伝子系統を短期間でRBS100348

作出し、各系統の出穂期改変効果および栽培特性を評価した。最終年度までに品種候補系統としての適性を評価できたことから、ゲノム選抜育種技術の浸透を図りイネの DNA マーカー選抜育種における有効な支援システムを構築するという課題目標を達成できたと考えている。しかしながら、異なる遺伝背景における出穂期遺伝子の効果の違いや他の農業形質への多面発現的な影響が明らかとなった事例があり、そのような場合は作出系統を交配母本として利用する等さらなる育種選抜が必要である。
４）今後の課題
これまでの基礎的な研究成果により出穂期を制御する遺伝子が多数単離されているが、上記のように異なる遺伝背景における出穂期遺伝子の効果の違いや他の農業形質への多面発現的な影響はまだ完全に解明されていない。遺伝子情報にもとづく出穂期のデザイン育種をさらに推進するためには、本研究課題も含めた育種選抜の事例を蓄積して成果情報を積極的に公表していくことが重要である。

RBS100349

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS1004
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: ゲノム選抜育種による出穂期改良品種開発の加速 2
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農研機構 次世代作物開発研究センター・稲研究領域・稲形
質評価ユニット・溝淵律子
１）研究目的イネの開花時期（出穂期）は品種の地域適応性を決定する重要な農業形質である。近年のイネゲノム研究の成果により、イネの主要な出穂期（開花時期）を制御する遺伝子がいくつも単離され、育種に利用可能な有用アリル（変異）が複数同定されている。そこで、イネゲノム研究成果の育種現場への普及促進をはかるために、これまでの知見を利用して出穂期を改変した品種開発が加速する実例を積極的に作り出すことを目指す。本研究では、宮城県、富山県及び滋賀県が育成した主要水稲品種や有望系統の栽培地域を拡大するため、連続戻し交配と世代促進を実施して特定のイネ出穂期遺伝子だけを導入した準同質遺伝子系統を作出する。選抜過程で SNP ジェノタイピングアレイ等の技術を用いて遺伝的背景を明らかにし、品種候補系統の育成を最速で行う。このことを通じて参画機関の宮城県、富山県及び滋賀県にゲノム選抜育種技術の浸透を図り、イネの DNA マーカー選抜育種における有効な支援システムを構築する。
２）研究成果【宮城県古川農業試験場】
Hd1 ，Hd16 ，Hd18 の全てがコシヒカリ型で遺伝背景が東北 206 号型に置換した 2 系統を選抜した。Hd1 ，Hd16 ，Hd18 の全てをコシヒカリ型で導入することで，目的熟期（「東北 206 号」より 7から 10 日出穂が遅い）になることが明らかとなり，選抜した 2 系統 (「東北 229 号」、「東 1672」) の遺伝子型が出穂期遺伝子近傍以外は，ほぼ東北 206 号型に置換され，表現型も晩生化した以外は，ほぼ同等であった。
「東北 229 号」、「東 1672」の出穂期、生産力、高温登熟耐性等の各種特性の評価が2 カ年で大きく変わらないことを確認した。

RBS100450

【富山県農林水産総合技術センター】「てんたかく」を 2〜3 日極早生化した NIL 候補系統については、完成系統を選抜し、目標を達成した。また、極早生化にともない、稈長が短くなり、蛋白含量が増加して食味が低下する問題点が生じたが、厚粒化遺伝子を集積することによって、これらの問題点を克服した改良系統を育成することに成功した。
【滋賀県農業技術振興センター】
出穂期遺伝子について Hd1 のみを導入した７系統を生産力検定試験および高温登熟性検定に供し、形質の評価を行ったところ、いずれの系統も当初の目的熟期（「みずかがみ」より 10 日から２週間出
穂が遅い）より遅かったが（「みずかがみ」より 24 − 26 日遅い）、生産力検定試験（奨励品種決定調
査）で特性が優良と判断された「大育 3301」（Hd1 のみを導入）、「大育 3304」（Hd1 と同時に Pb1 、Stvb-i を導入）にそれぞれ地方系統番号「滋賀 80 号」、「滋賀 81 号」を付した。

３）成果活用における留意点【宮城県古川農業試験場】
昨年度選抜した「東北 229 号」，「東 1672」の 2 系統を生産力検定試験，各種特性検定試験に供試し，昨年度の評価を確認した。残された問題はない。
【富山県農林水産総合技術センター】
これまでに、「てんたかく」の遺伝的背景をもち、Hd16 を含む 141kbp および 208kbp の領域のみが「コシヒカリ」型に置換された Hd16 − NIL を２系統（と系 1630、富山 90 号）育成し、今年度は生産力検定の２年目を行った。また、「てんたかく」の遺伝的背景をもち、粒厚を厚くする qGTH3を含む 1.4Mbp の領域が「コシヒカリ」型に置換された qGTH3 − NIL を２系統（と系 1632、と系

RBS100451

1643）育成し、生産力検定の２年目を行った。さらに、Hd16 − NIL と qGTH3 − NIL の交配後代から、両者を「コシヒカリ」型で有し、その他の領域がすべて「てんたかく」型に置換された集積系統（PYL）を８系統育成し、今年度は生産力検定を行った。その結果、2 系統（と系 1647、と系 1648）
で、出穂期が早く、特に収量および品質、食味が優れていたことから、有望と考えられた。今後は系統の固定化を進め、複数年の形質評価を行う必要がある。
【滋賀県農業技術振興センター】
出穂期遺伝子について Hd1 のみを導入した７系統を生産力検定試験および高温登熟性検定に供し、形質の評価を行ったところ、当初の目的熟期より遅かったので、Hd16 による早生化を期待して集積系統を作出して評価した。Hd1 、Hd16 を導入した 15 系統（Pb1 、Stvb-i を同時に導入）は、過年度の結果から「みずかがみ」より１週間程度の晩生化が予想されたが平成 29 年度の結果はそれとは異なり、出穂期が年次間で大きく異なったため、選抜を行わなかった。
４）今後の課題【宮城県古川農業試験場】
目的の出穂期遺伝子を持ち，それ以外の遺伝背景と表現型が「東北 206 号」と同一性が高い「東北229 号」が得られたことから，最終目標を達成した。「東北 229 号」を奨励品種決定調査に供試する。
【富山県農林水産総合技術センター】
目的領域以外にノイズのない Hd16 と qGTH3 のピラミディング系統を８系統選抜できており、最終目標を達成できている。このうちの４系統を有望系統として、次年度以降も奨励品種決定調査に供試することとしている。
【滋賀県農業技術振興センター】
滋賀県農業技術振興センターでは、H29 年度生産力検定試験（奨励品種決定調査）で特性が優良と判断した Hd1 のみを導入した「大育 3301」、Hd1 、Pb1 、Stvb-i を導入した「大育 3304」にそれぞれ地方系統番号「滋賀 80 号」、「滋賀 81 号」を付し、次年度以降、詳細な特性を把握するために、引き続き生産力検定試験に供する。

RBS100452

「イネのDNAマーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915

研究期間: 平成25～29年度

中課題名: イネのDNAマーカー育種の利用推進(RBS)
小課題番号: RBS2001

研究期間: 平成25～26年度

小課題名: 種子形制御遺伝子の利用を起点としたイネの多収化戦略
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 福井県立大学・生物資源学部・分子生物学研究領域・
岩崎行玄
１）研究目的
種子形は、イネの収量性を決定づける一要因であると共に、イネの農産物としての品質・規格に係わる重要な形質である。本研究課題では、実用性の見込める新奇種子形制御遺伝
子の単離と機能解析を行い、種子のかたち作りの理解を深めるとともに、種子以外の有用
遺伝子を集積し、多収化の可能性を探る
これらの目的を達成するために、以下の研究開発を実施する。

（１） コシヒカリ背景大粒変異体の生産現場での利用可能性を評価し、有望な変異体の品種化を目指す。
（２） コシヒカリ背景大粒変異体の下に二電子を単離するための雑種集団を作成
し、遺伝子マッピングを行う事で、種子形成に係わる遺伝子の理解を深める。
（３） QTL 解析により、極大粒系統の保有する種子を大きくする遺伝子を同定し、NIL 化を行い、育種利用の可能性を検討する。
（４） コシヒカリ大粒変異体及び大粒遺伝子の NIL に、矮性（sd1）、種子数（Gn1a）、
強稈（SCM2）、枝梗数（WFP）などを制御する遺伝子を集積し、その生産性を評価する。
２）研究成果１コシヒカリ大粒変異体を用いた研究

コシヒカリ背景大粒変異体の栽培試験を行い、収穫した玄米を1.9mmのふるいで選別すること
で市場価値のある玄米の収量（精玄米重）を比較する事でその有用性を評価した。その結果、種子が大型化し、玄米が大型化することで単位面積当たり精玄米重がコシヒカリよりも増加する２系
統を見出すことに成功した（図１）。これら２系統の内、１系統については次世代シークエンサーを用いた遺伝子マッピングにより、候補となる遺伝子変異を見出す事に成功した。

53

２極大粒系統を用いたQTL解析
コシヒカリや日本晴といった標準的な品種と比べて著しく大きな種子を形成する極大粒系統・BG23とLG10と、これらの染色体上に設計したPCRマーカー（図２）を用いて種子形に関するQTL
解析を行った。BG23とLG10を交配したF2集団を用いて種子形に関するQTL解析を行ったところ、新奇と考えられる種子長に関するQTLを4箇所、種子幅に関するQTLを2箇所検出する事が出来た（図３）。

54

研究成果の公表実績（研究論文）
1.

Segami S., Yamamoto T., Oki K., Noda T., Kanamori H., Sasaki H., Mori S., Ashikari M., Kitano H.,
Katayose Y., Iwasaki Y*., Miura K*.
Detection of Novel QTLs Regulating Grain Size in Extra-Large Grain Rice (Oryza sativa L.) Lines.

（学会発表）
1.

瀬上修平、山本竜也、隠岐勝幸、野田智紀、金森裕介、佐々木晴美、森聡美、芦苅基行、北野英己、片寄裕一、岩崎行玄、三浦孝太郎
イネ極大粒系統が有する種子形を制御する新奇QTLの検出
日本育種学会 第128会講演会2016 （新潟大学 2015年9月11-12日）

2.

中村麻由美、山本竜也、堀川実穂、林猛、中岡史裕、小林麻子、冨田桂、三浦孝太郎、岩崎行玄
コシヒカリの米粒を大きくする事で収量増加を狙う突然変異育種
コシヒカリ一族サミット（福井県国際交流会館 2014 年 11 月 21 日),

３）成果活用における留意点
本研究で得られたコシヒカリ大粒変異体の遺伝子変異は、大粒化に必要な遺伝子マーカーとして利用可能である。
本研究で得られたコシヒカリ背景大粒変異体は、これまでに全国で作出されたコシヒカ
リ背景の有用遺伝子NIL系統と交配する事で、容易に集積系統化することが可能である。

４）今後の課題
コシヒカリ大粒系統は有用性が確認されたので、品種登録を行う。原因遺伝子が特定出来ていない１系統については、今後遺伝子単離を目指して試験をする必要がある。
極大粒系統のQTL解析については、今後遺伝子単離を目指して試験を継続する必要がある。

55

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS2002
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: イネの登熟最適化を実現する理想的穂型の構築と超多収育種への応用
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 名古屋大学・生物機能開発利用研究センター・有用農業形
質保存分野・北野英己
１）研究目的
イネのシンクサイズ（穎果の数と種子の大きさ・重さ）を遺伝的に制御する有用遺伝子が多数存在することが既往の研究成果により明らかにされてきた。そのため、シンクサイズを遺伝的に改良する
ことは比較的容易であり、本研究課題で取り上げた実験系統を用いて 1 穂に千粒を着生する系統も育成可能であることを実験的に明らかにした。また、穂軸および 1 次枝梗のサイズを独自に制御する遺伝子も見出し、稈長に関わりなく種子数の増加に合わせて穂長が 40cm を越える巨大穂系統を育成す
ることも可能であることを明らかにした。これらの結果から、これまでに同定した穂の着粒数の増減に関わる遺伝子の個々の作用力の特異性を生かして穂の着粒密度や穎果の空間配置を人為的に制御することが可能となることが示唆された。
しかし、シンクサイズとソース能のバランスを考慮し、特定の遺伝的背景のもとでシンクサイズ（着粒数）を増大させることが実際の収量増大に何処まで寄与するかについては解明に至っていない。
また、穂の大きさは幼穂分化後のメリステムの分化能力とその後の形態形成によってもたらされることから、穂の大小は形成過程に要する時間と開花後のシンクへの養分転流に要する時間および穂のエージングの進行に大きく影響すると予想された。従ってこれらの事象における最適なバランスが問題となると考えられた。
そこで、本小課題では、先の小課題（QTL-1001）に続いて穂形に特徴を示す系統群を用いてシン
クサイズの制御に関わる未知の有用遺伝子の単離・同定を行うとともに、これらの遺伝子領域をコシヒカリに導入した NIL 系統群を育成して、先に多収品種のハバタキに見出されたシンクサイズを増大する 3 種類の QTL 領域をコシヒカリの遺伝的背景に導入した NIL 系統群とともに、穎果数の増減
およびそれらの空間分布と穂の登熟力との関係を実験的に明らかし、超多収を実現する理想的な穂型構造を明らかにすることを最終目標に据えて研究を推進することとした。
２）研究成果期間全体にわたる研究方法
本小課題では、まず穂形に顕著な特徴を有するインド型、熱帯ジャポニカ系統を片親に、コシヒカ
リなどの代表的な日本稲との雑種分離集団を用いて QTL 解析により穂形および種子の着粒数（シンクサイズ）に関わる未知の有用遺伝子の単離・同定を行った。
また、これまでに同定した穂のシンクサイズ増大に関わる有用遺伝子に加え、新規に同定した遺伝子を導入した育種素材 (NIL 系統群) を開発し、それらを用いて穂の穎果数の増減、およびそれらの空間分布と穂の登熟力との関係を実験的に明らかにすることを目標にした。なお、穂形や登熟能に関わる遺伝子の同定には、在来品種群を用いた GWAS 解析も試みた。これらの解析から得られた結果をもとに、超多収を実現する理想的な穂型構造を明らかにすることを最終目標に研究を推進した。
期間全体を通じて得られた研究成果（１）穂形およびシンクサイズ増大に関わる新規有用遺伝子の単離イネの在来品種には多様な穂形変異が存在しており、穂の着粒数についても系統間に大きな変異が存在することが知られている (図 1)。本小課題では、穂形と着粒数に注目して長穂性に特徴を有する
日印交雑系統の ST-1、特異的な穂の高次分枝を示す NTP 型の ST-5、および、極多粒の巨大穂を有RBS200256

する印度型の VT-101 を母本にコシヒカリとの交雑後代を用いて QTL 解析による穂形および新規のシンク増大遺伝子の単離を試みた。

本小課題の期間全体を通じて、コシヒカリ/ST-1 の組合せからは、主として穂軸長に関与する qPRL5と 1 次枝梗長に関与する qPbl6 の原因遺伝子を単離した。qPRL5 は GA の合成酵素の 1 つである第 1染色体上の Sd1 とは異なる第 5 染色体上の GA20 oxidase をコードする同祖遺伝子変異であった。一方、qPbl6 はハバタキの第 6 染色体上にある Apo1 と同一の変異遺伝子であった。さらに、Apo1 座にはこれとは若干作用力の異なる自然変異 (アリル) が存在することを見出した。つぎに、コシヒカ
リ/ST-5 の組合せを用いて検出された qSrn7 の遺伝子単離を進めた結果、穂の高次分枝を促進する本QTL は、第７染色体上に存在する既知の Fzp 座の変異に由来していることが判明した。この Fzp は穂で無数に分枝を繰り返す奇形的な突然変異 (ヌルアリル) として同定されていたが、ST-5 の qSrn7
は同座の部分的機能を有する弱いアリルであると推定された。この ST-5 のアリルをコシヒカリに導入した NIL では、2 次枝梗数が有意に増加して 1 穂粒数も増えたが、ST-5 のような奇形的な穂形は示さなかった。さらに、qSrn7/Fzp の配列情報をもとに世界のコアコレクションの中から 30 系統をランダムに選定し同座の遺伝子型を調査したところ、カサラスを含む約 30 ％にあたる 13 系統が ST-5型のアリルを有していることが判明した。
一方、コシヒカリ/VT-101 の組合せで検出された多粒性を示す 2 カ所の QTL について遺伝子単離を進めた結果、第 1 染色体上の QTL は既知のハバタキの Gn1 と同一変異を有していたが、第 2 染色体上に検出された qSrn2 は、Gn1 と同様サイトカイニンの合成経路で機能する酵素をコードする遺伝子変異に起因することが判明した。Gn1 はサイトカイニンの合成経路で活性型のサイトカイニンを分解する酵素 (CKX) をコードしており、qSrn2 もサイトカイニンの合成経路で活性型のサイトカ
イニンを不活型に変換する酵素をコードする遺伝子変異に起因することを確認した。

RBS200257

（２）GWAS による登熟能に関わる遺伝子の単離数年にわたって 170〜200 系統の在来品種を用いて行った種子の登熟性に関わる調査形質を用いた
GWAS 解析から、第 8(Wcr3 :心白率) と第 11 染色体 (Ngr1 :完全粒の割合) 上の 2 カ所に極めて再現性のある QTL が検出された。この内、登熟性を向上させる可能性のある Ngr1 に着目して LD 解析を進め、座乗する原因遺伝子の候補領域を 292kb 内に絞り込んだ。この候補領域について変異ブラウザを作成 してアミノ酸置換を伴う遺伝子を探索したところ、条件に合致する遺伝子が 1 つのみ見出された。そこでこの候補遺伝子の機能を調べるため、CRISPR により機能欠損系統を作成し、胚乳の登熟過程を昼温 35 度、夜温 30 度の高温で生育させた結果、対照とした日本晴のすべての玄米が白濁したのに対して、遺伝子破壊株は白濁程度が明らかに軽減していた。さらに胚乳の登熟温度を昼温
28 度、夜温 23 度下でこの遺伝子が破壊されたアリルを有するどんとこいに、日本晴の機能型ゲノムや胚乳で特異的に発現するグロブリンプロモーターで本遺伝子を強発現させると、すべての胚乳が白濁することが確認された (図 2)。これらの結果から、Ngr1 の候補遺伝子は胚乳の白濁を誘導する機能を持つことが確認され、この機能を抑制することで正常な登熟を誘導する機能を付与することができる遺伝子の有力候補と考えられた。

（３）NIL 系統群を用いたシンクサイズの増大と登熟能に関する解析
イネの穂に着生する種子の着粒数増加に寄与する既知の有用遺伝子として、Gn1、Apo1、Wfp、Dep1 などが単離・同定されてきた。このうちハバタキから見出された Gn1 は、コシヒカリに導入することで約 30 ％の着粒数を増加させるが、ハバタキの平均的な穂はコシヒカリの 2 倍以上の着粒数を示すことから、本遺伝子のみでハバタキの多粒性を説明することはできない。そこで、コシヒカリ/ハバタキの交雑後代からさらにシンク増大に関わる QTL の探索を試みたところ、第 1 染色体上の Gn1
以外に第 2、6、8 染色体上の 3 領域に着粒数増加に寄与する新たな QTL が見出された（QTL-1001）。
本小課題では、ハバタキから見出された第 1(Gn1 )、第 6(Apo1 )、第 8(Wfp ) の 3 領域を単独、あるいは複数領域をピラミディングしたコシヒカリの遺伝的背景を有する 7 種類の NIL 系統を育成し (図3)、着粒数の増加効果を確認するとともに着粒数と登熟能の関係を検討した (図 4)。

RBS200258

調査対象としたビラミディング系統の 1 穂粒数は、コシヒカリの平均 150 粒に対して 1 穂粒数が300 粒を越える系統が含まれていたが、これらの系統間では、1 次枝梗数については顕著な有意差は認められなかった。また、先端から基部までの各 1 次枝梗上の 2 次分枝数は、基部と先端の 4 本から中央部の 12 本の範囲で異なっていたが、系統間には明瞭な差異は見られなかった。そのため、1 穂
粒数の違いは主に 2 次枝梗上の種子数の違いによるものであった。玄米を枝梗上の着生位置別に配置した標本を用いて玄米の外観品質を調査した結果、登熟不良を呈した玄米は、一般に弱勢穎果と呼ば

RBS200259

れる枝梗先端次位の位置に多く出現していたが、この傾向は比較した系統間で共通していた。このよ
うな不完全粒の発生頻度は、他の着生位置で見られた玄米も含めて 7〜15 ％の範囲に分布していた。
このような不完全粒や乳白粒などの出現頻度には、系統間では顕著な差異は認められなかった。このことは、コシヒカリのような日本型のイネの遺伝的背景においても 2 倍程度のシンク増大による多収性の実現が可能性の 1 つとして成立することを示唆しているが、実際の現場で安定栽培を可能とする品種育成においては、このようなシンクの改変とともに稈形質や草型、ソース能の改変と合わせて検討する必要が有る。
本小課題で新規に見出されたシンク増大に寄与する qSrn2 や、qPrl5 などの穂形改良に有効と思われる遺伝子の NIL 化についても順次作業を進め、これらの系統群を用いて穂形と登熟能との関係を実証的に検討することで理想的な穂形構造を提案することを最終目標にしてきたが、多数の標本を効率的に解析する手法と技術の開発が進まなかったため未達成に終わったことは反省点として残った。
３）成果活用における留意点
本小課題で取り上げた穂形改変やシンクサイズ増大に寄与すると考えられる遺伝子の単離過程や機能解析の詳細については、学術論文その他を通じて順次公開する予定である。また、解析に用いた新規の遺伝子を保有する系統や、複数の有用遺伝子を集積した NIL 系統群についてもオリジナリティを担保できる範囲で育種素材として利用できるような対応を進めていく予定である。
４）今後の課題
当初計画した穂形の改変およびシンクサイス増大に効果を示す QTL に関しては、目標としてかかげた 4 つの QTL 座（qPrl5、qPbl6、qSrn7、qSrn2 ) における原因遺伝子の単離を全て達成することができた。しかし、これらの遺伝子を導入した NIL 系統群を用いた穂形構造と登熟性の関係解明に関する課題については、系統育成に時間を要したことや多数の標本を用いた定量的な計測技術を確立することができなかったことから一部の解析に留まることとなった。そのため、期間内に達成できな
かった課題については、今後も多収を実現する理想的な穂形構造の解明に繋がる成果をあげることを最優先の課題として継続して取り組んでいく予定である。一方、在来品種を用いた GWAS 解析からも期間内に種子の登熟性の向上に寄与すると考えられる遺伝子座（Ngr1 ）の単離・同定に成功した。
全期間を通じて得られた研究成果の詳細に関しては論文等で順次公開していくとともに、これらの成果を実践的な育種に利用可能とするリソース (中間母本) として整備充実に向けた作業を進めている。

RBS200260

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS2003
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: イネの強稈性に関与する有用遺伝子の単離とその集積
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 東京農工大学・大学院農学府・植物生産科学・大川泰一郎
１）研究目的
イネの耐倒伏性には地上部の重さ、長さ、稈の強度などが関与し、従来の育種法では比較的選抜が容易な sd1 などの半矮性遺伝子を利用し改良されてきた。しかしながら、超多収達成を考えると稈自体の強度を高める必要があるが、強稈遺伝子についてはほとんど研究されていない。強稈性に関与する複数の要素形質に分けて、優良なアリルをもつ複数の強稈品種から QTL とその原因遺伝子を特定し、DNA マーカー選抜育種を活用し、それらの遺伝子領域を個々にもつ系統を開発しひとつの品種に集積することによって、耐倒伏性に優れる品種の効率的な育成が可能となる。本研究では、強稈質のコシヒカリ、リーフスターと稈の太いタカナリ、ハバタキ、中国 117 号などの組合せを用いて、それぞれの品種のもつ稈の太さおよび強稈質とそれらに関わる稈の構造に関与する QTL を特定し、QTL の原因遺伝子を単離し、それらを用いた強稈遺伝子利用による分子育種を目指す。
２）研究成果研究方法
挫折型およびたわみ型の耐倒伏性に関わる稈基部伸長節間の挫折荷重を出穂後 15 日に精密材料試
験機（テンシロン，エーアンドディ社製）を用いて測定し、稈の挫折時モーメント，及びヤング率を測定した。測定後、節間中央部の横断面の稈の長径、短径、中空楕円の長径、短径を測定し、断面係数、及び断面 2 次モーメントを求めた。曲げ応力は稈の挫折時モーメント＝断面係数×曲げ応力、曲げ剛性は曲げ剛性＝断面 2 次モーメント×ヤング率の式より算出した。節間中央部の徒手切片を作成し、皮層繊維組織に局在するリグニンをフロログルシン塩酸で染色後、薄片をデジタル生物顕微鏡で観察・撮影し、画像計測ソフトを用いて皮層繊維組織の厚さを測定した。また、走査型電子顕微鏡を用いて、皮層繊維組織細胞数の計測を行った。リーフスターとコシヒカリの RILs 94 系統の遺伝子型の解析には SNP マーカーを用い，QTL cartographer ver.2.5 により QTL の検出を行った。
研究結果（１）強稈関連形質の QTL のマッピング
１）タカナリ背景のコシヒカリ断片をもつ染色体断片置換系統（CSSLs）とタカナリとの比較から推定した結果、コシヒカリ型で小さくなる領域は断面係数では第 5, 6, 8 染色体であった。逆にコシヒ
カリ型で大きくなる領域は、稈の挫折時モーメントでは第 1, 11 染色体、断面係数では第 1 染色体、
曲げ応力では第 6, 8, 11 染色体であった（図 1A）。コシヒカリ背景のタカナリ断片 CSSLs とコシヒ
カリとの比較から強稈関連形質の QTL を推定した結果、タカナリ型で大きくなる領域は稈の挫折時
モーメントでは第 1,5,6,8,12 染色体、断面係数では第 3,5,6 染色体、曲げ応力では第 2,6,11 染色体であった（図 1B）。これらの解析から、断面係数の QTL を第 1,5,6 染色体に、曲げ応力では第 11 染色体に正逆で重なりあう領域を確認した。同じくコシヒカリとタカナリの正逆 CSSLs を用いて、強稈質に関わる皮層繊維組織の厚さの QTL の推定を行った。タカナリ背景コシヒカリ CSSLs から、第1,2,3,7,8,9,11 染色体にコシヒカリの対立遺伝子が皮層繊維組織を厚くする QTL が推定された（図 2,3）。一方、コシヒカリ背景タカナリ CSSLs から，第 2,9 染色体にタカナリの対立遺伝子が皮層繊維組織を薄くする QTL が推定された。2 か年にわたり第 2,9 染色体に皮層繊維組織に効果のある領域
を正逆 CSSLs で推定した。

RBS2003

61

RBS2003

62２）極強稈品種リーフスターとコシヒカリより作出した組換え自殖系統群 (RILs) を用いて、リー
フスターのもつ極強稈性に関与する太稈及び強稈質関連形質の QTL の検出を行った。リーフスターの対立遺伝子が稈の挫折時モーメントを高める QTL を第 3 染色体、断面係数では第 2，3，5 染色体に検出した (表 1)。また、強稈質に関わる稈の細胞壁成分のセルロース，ヘミセルロース含有率および密度について，第 5 染色体の短腕と長腕に２か所、リーフスターの対立遺伝子がセルロース含有率、ヘミセルロース含有率および密度を高める QTL を検出した（表 2）。

RBS2003

63

RBS2003

64

（２） 強稈遺伝子の単離と機能解析
強稈品種リーフスターの親のコシヒカリと中国 117 号の戻し交雑自殖系統（BILs）を用いた解析から検出されている第 2,3 染色体の太稈 QTL のうち、効果の大きい第 3 染色体長腕の QTL の絞り込みを行い、BC5 F4 組換え固定系統を用いたファインマッピングより太稈 QTL を 9.97kb（SNPV318 03〜RM15767 間）の領域に特定し、STRONG CULM3 (SCM3 ) と名付けた（図 4）。

ファインマッピングによって特定された領域内に、単一の FINE CULM1 (FC1 ) が座乗することを見出し、この遺伝子の機能解析を行った。稈基部節間が形成される時期の FC1 の発現は、枝梗分
化期の茎頂分裂組織で特異的に発現するとともに、コシヒカリに比較して中国 117 号型のアリルで発現量が高かった（図 5）。中国 117 号とコシヒカリの FC1 ゲノムを日本晴に導入したところ、コシヒ
カリ FC1 ゲノム導入個体はベクターコントロール導入個体と同様の断面係数を示したが、中国 117
号 FC1 ゲノムを導入した個体の断面係数は有意に上昇した（図 6）。さらに、FC1 cDNA を過剰発現させた形質転換個体も同様に、断面係数は有意に上昇した（図 6）。これらの結果から、SCM3 の原
因遺伝子は FC1 であり、中国 117 号は機能獲得型のアリルと結論した。

RBS2003

65

RBS2003

66

（３）強稈 NIL, 集積系統の育成と評価
強稈品種リーフスターの親のコシヒカリと中国 117 号の戻し交雑自殖系統（BILs）を用いた解析から検出されている第 2, 3 染色体の太稈 QTL の NIL を育成した。第 3 染色体の FC1 を含む 163kb の中国 117 号型の断片をもつコシヒカリ背景の NIL-SCM3 (BC6 F4 ) を育成した。また、第 2 染色体に2.09Mb の中国 117 号の断片をもつコシヒカリ背景の NIL-SCM4 （BC6 F7 ）を育成した。また、コシ
ヒカリとハバタキと CSSLs から特定した第 1,6 染色体の太稈 QTL について、第 6 染色体の APO1 を含む 484kb のハバタキ型の断片をもつ NIL-SCM2 を育成し、「コシヒカリ富農 SCM1 号」として品種登録を行った。さらに、第１染色体の Gn1 を含む 3.57Mb のハバタキ型の断片をもつ NIL-SCM1を育成した。
ハバタキの SCM1 、SCM2 と中国 117 号の SCM3 、SCM4 を組み合わせ、稈を太くする集積効果の高い組み合わせを検討するため、すでに育成した２つの太稈 QTL の集積系統を選抜・育成し、３つの太稈
QTL の集積 NIL-SCM1+SCM2+SCM3、NIL-SCM1+SCM2+SCM4、NIL-SCM1+SCM3+SCM4、
NIL-SCM2+SCM3+SCM4（以下、SCM1+2+3，SCM1+2+4，SCM1+3+4, SCM2+3+4 とする）、
さらに４つの太稈 QTL の集積 NIL-SCM1+SCM2+SCM3+SCM4（以下、SCM1+2+3+4）を選抜・育成し（図 7）、挫折型およびたわみ型倒伏抵抗性の評価を行った。

挫折型倒伏抵抗性に関わる断面係数は四集積系統、三集積系統、二集積系統、単独 NIL、コシヒカ
リの順で大きく、集積の効果が認められた（表 3, 図 8）。四集積系統の SCM1+2+3+4 の断面係数はコシヒカリの約 1.8 倍に増加した。曲げ応力は集積により減少し、その結果、断面係数と曲げ応力の積である稈の挫折時モーメントは集積により増加し、SCM1+2+3+4 はコシヒカリに比べて約 1.3 倍に増加した。

RBS2003

67

RBS2003

68たわみ型倒伏抵抗性に関わる断面 2 次モーメントは四集積系統、三集積系統、二集積系統、単独
NIL、コシヒカリの順で大きく、集積効果があり SCM1+2+3+4 はコシヒカリの約 2.2 倍と著しく増加した（表 3、図 9、図 10）。ヤング率は集積により増加し、その結果、断面 2 次モーメントとヤン
グ率の積である曲げ剛性は集積により著しく増加し、SCM1+2+3+4 はコシヒカリに比べて約 2.7 倍に増加した。

RBS200369

ハバタキ由来の SCM1 、SCM2 に中国 117 号の SCM3 、あるいは SCM4 を集積すると、断面係数は増加し、両方を集積するとさらに断面係数は増加した（図 11A）。一方、中国 117 号由来の SCM3、
SCM4 にハバタキの SCM1 、あるいは SCM2 を集積しても断面係数は増加し、両方を集積するとさらに増加し（図 11B）、断面 2 次モーメントにも同様の集積効果があり、他品種に由来する QTL を多く集積することにより、断面係数、断面２次モーメントが増加することを確認した。
台風ジェネレーターによる倒伏抵抗性の評価から、四集積系統はコシヒカリより挫折型、たわみ型
倒伏抵抗性が強化されていることを確認した（図 12）。
以上、強稈品種ハバタキおよび中国 117 号に由来する SCM1 〜SCM4 の４つの QTL のすべての組み合わせを用いて断面係数、断面 2 次モーメントへの集積効果と倒伏抵抗性への効果を検討した結果、多く集積するほど断面係数および断面 2 次モーメントは増加し、ヤング率への多面的効果に
よって曲げ剛性が増加し、挫折型倒伏抵抗性、とくにたわみ型倒伏抵抗性が強化させることが明らかとなった。

RBS200370３）成果活用における留意点
育成した強稈 NIL-SCM1〜SCM4 とそれらの集積系統を育種素材として活用し、共同研究の育種機関などと共同で育成品種の育成者権を取得することを検討する。
４）今後の課題
強稈品種はそれぞれ異なる原因遺伝子によって太稈、強稈質となっており、さらに複数のドナー親から QTL とその原因遺伝子を特定し、太稈 QTL と強稈 QTL との集積を行うことにより、倒伏抵抗性の向上が期待できる。本研究課題では、主に太稈 QTL の原因遺伝子の単離と NIL 育成およびそれらの集積系統の育成を行ったが、今後、強稈質に関わる細胞壁成分のセルロース、ヘミセルロース、リグニンに関連する QTL の特定と原因遺伝子の単離、それらの NIL 育成と集積効果の検討を行う必要がある。その上で、複数の太稈 QTL と強稈質 QTL の集積を行い、倒伏抵抗性を強化した集積系統の育成し、良食味品種や多収品種の改良に適用することが今後の課題である。

RBS200371

「イネのDNAマーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915

研究期間: 平成25～29年度

中課題名: イネのDNAマーカー育種の利用推進(RBS)
小課題番号: RBS2004

研究期間: 平成25～26年度

小課題名: シンク及びソースに関わる遺伝子の機能解析と有用性評価
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農業生物資源研究所・植物科学研究領域・植物生産
生理機能研究ユニット・石丸健
１）研究目的
イネの生産性を飛躍的に高めるには、シンクサイズとソース能の両方を向上させていく
必要があ る。シンクサイズの主要な決定要因である粒形に関わる複数の遺伝子が単離されてきている。一方、ソース能は多くの形質が複雑に関連し決定されることに加え、関与する形
質が互いに影響を及ぼし合うため、ソース能の改変に繋がる有効な情報は極めて少ない。本研究は、粒形に関わるアリルの導入によるシンクサイズ並びにソース能を改変した育種素材の開発・評価を目的とする。
２）研究成果(1) TGW6 の評価

TGW6 は、カサラスから見出された粒長及び粒重に関与する QTL の原因遺伝子である(Ishimaru et al., Nature Genet. 2013)。TGW6 は、シンクでは胚乳細胞の数を増加させ粒長を伸ばし同時にソース能も向上させることにより、一遺伝子で粒長のみならず粒重をも増加させる。米の食味評価に実績のある穀物検定協会に依頼し、専門パネラーによる食味官能試験を実施した。なお、食味評価には検定協会の指示に基づき整粒を用いた。食味評価の結果、
NILTGW633の「総合評価」、「味」、「粘り」に関してはコシヒカリと同等であったが、「外観」と「香り」についてはコシヒカリに比べ5%レベルで差があり良いという結果になった。
NILTGW633 はコシヒカリと比較して、1.8mm でふるったお米、整粒とも「粘り」に関わるアミ
ロース含量には有意な差が見られなかったが、玄米タンパク質含有量は減少した。タンパク質は
水を通さないためお米の吸水を阻害するため、タンパク質が少ないお米は吸水が良く炊き上がりがふっくらとなるとされている。したがって、NILTGW633はコシヒカリと比較して粘りは変わらな
いが、ふっくらとしていると考えられた。

(2) 高温登熟障害に対する TGW6 の被害軽減能の評価

近年の気温上昇に伴い、イネの登熟過程が障害を受け整粒比率が低下する高温登熟障害が各地で問題となっている。昨年度は、登熟期間の気温が最も高い地域のひとつである群馬県館林市に隣接する板倉町において栽培し、TGW6 の導入により整粒比率が有意に増加することを確認した。2年間同様の栽培を行い、栽培年次の違いによる環境変化の影響を調べた。その結果、コシヒカリの整粒比率 7.8%に対して NILTGW633 は 14.7%と整粒比率の有意な増加を確認することができた。

72

３）成果活用における留意点
2年間でTGW6の特性を明らかにできた。広く使ってもらえるよう、他の多収品種に導入し同様の効果得られることを確認する必要がある。

４）今後の課題
TGW6に関する研究成果は既に特許出願している。成果をどのように社会実装に繋げるかが課題となる。

73

「イネのDNAマーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915

研究期間: 平成25～29年度

中課題名: イネのDNAマーカー育種の利用推進(RBS)
小課題番号: RBS2005

研究期間: 平成25～26年度

小課題名: インディカ多収品種の収量性向上に向けた遺伝解析と育種的利用
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 作物研究所・稲研究領域・稲生理分野・高井俊之
１）研究目的近年のイネゲノム研究の進捗により、複雑形質である収量性に関しても遺伝研究が進んできている。しかしながら、これまでの研究は主に多収品種が有する遺伝要因の探索・解明を中心に行われてきており、多収品種の収量性向上を目指した遺伝研究は非常に限られている。本研究課題
は、既存のインド型多収品種の更なる収量増加に関与すると考えられるQTLs の探索・単離同定に加え、それらQTLs の集積を通して増収効果を検討し、増収メカニズムの解明と多収育種素材の開発に資することとする。
２）研究成果I. 研究方法(ア) シンク・ソース能QTLのマッピング
著者らはこれまでに、インド型多収品種タカナリと日本型品種コシヒカリ交雑集団を作出し(Takai et al., 2014)、タカナリを遺伝背景にもつ遺伝解析材料を用いて第7染色体上にコシヒカ
リ型が個葉光合成能を高めるQTL-GPS7、第3染色体上にコシヒカリ型が穂数を増やすQTL-MP3をそれぞれ検出した。
a GPS7

GPS7を有するCSSL およびタカナリについて、生育期間を通して光合成速度の推移を調査した。
また、候補領域の組み換え固定系統7系統を用いて、穂ぞろい期の止葉の光合成速度を測定しマッピングを進めた。
b MP3

MP3を有するCSSL およびタカナリについて、移植～出穂期までの分げつ数の推移を複数の栽培条件で調査した。さらに、候補領域の組み換え固定系統9系統を用いて、穂ぞろい期に穂数を調査しマッピングを進めた。絞り込んだ候補遺伝子についてタカナリとコシヒカリ間で配列解析を行った。
(イ) CSSLsの多肥条件下での収量試験
タカナリ背景CSSLsのうち弱勢や極晩生系統を除く35系統およびタカナリを各系統22.2株 m-2、6条× 20株、3反復で栽培した。N施肥は基肥として緩効性肥料LP40(4gN m-2)とLP100(8gN m-2) を、穂肥としてLP40(6gN m-2) を施用した(合計18gN m-2)。成熟期に各試験区内部の40株(4条× 10株)を坪刈りし、収量および収量構成要素を調査した。

II. 研究結果(ア) シンク・ソース能QTLのマッピング
a GPS7

GPS7を有するCSSL(SL-GPS7)およびタカナリの生育期間中の光合成速度を調査した結果、移植後１ヶ月では両者に差が無いものの、最高分げつ期頃からSL-GPS7の光合成速度がタカナリより高く
74

なり、登熟中期頃までその差が観察された(図1)。穂ぞろい期の止葉の光合成速度について組み換
え固定系統を用いて置換マッピングを進めた結果、GPS7の候補領域をID07_38からID07_57の154kb

**

**

n.s.

30

ID07_57

ID07_42

ID07_39

ID07_38

ID07_60

ID07_34

ID07_32

ID07_30

Photosynthesis
rate (μmol m-2 s-1)
20

25

30

2

35

40

*

***

ID07_27

Marker

40

**

3

n.s.
20

Heading

5SL-GPS7
Takanari

27

*

10

*
**

Photosynthesis rate
(μmol m-2 s-1)

ID07_20まで狭めた(図1)

9

0

20

40

60

80

100

120

140

n.s.

0
12

n.s.

Days after transplanting (d)
15

154kb

図1

第７染色体の個葉光合成QTL-GPS7の特性とマッピング

1)***、**、*はそれぞれ0.1％、1％、5％水準で有意差があることを示す。
2)図右の白抜きはコシヒカリ型、黒塗りはタカナリ型の領域をそれぞれ示す。

b MP3

MP3を有するCSSL(SL-MP3)およびタカナリの移植～出穂期までの分げつ数の推移を調査した結果、標準栽培では、移植後18日目でSL-MP3の分げつ数がタカナリよりも多くなり、最高分げつ数
および最終的な出穂期の有効分げつ数(穂数)も多く推移した(図2)。疎植栽培でも同様の推移が観察されたが、多肥栽培では生育初期には差は見られず、最高分げつ期以降でSL-MP3の分げつ数がタカナリよりも多く推移した。穂ぞろい期の穂数について組み換え固定系統を用いて置換マッピ
ングを進めた結果、MP3の候補領域をID03_8からID03_16の899kbまで狭めた(図2)。

30**** ***

*
*

30

** **

20

10

**

*

0
0

80

SL-MP3

40

Takanari
*** *

30

*
*
*** ***

20

10

40

60

80

ID03_16

ID03_17

ID03_7

RM3513

RM8208

RM15612

RM5488

RM7431

RM1334

RM15164

Marker

0

20

0

20

40

Panicle number(no. plant-1)
0

5

10

15

20

n.s.

4

n.s.

20

n.s.

49

n.s.

51

n.s.

11

***

52

***

57

***

55

***

41

899kb

図2

第3染色体の穂数QTL-MP3の特性とマッピング

75

60

80

100

Days after transplanting (d)Days after transplanting (d)ID03_860

ID03_19

40

Days after transplanting (d)ID03_20

20*【多肥栽培】
施肥：18gN m‐2
裁植密度：30cm×15cm

50

*

0
0

**

*

ID03_4

10

Takanari

ID03_320*** ***

40

ID03_1***

SL-MP3

Tiller number (no.)

Takanari【疎植栽培】
施肥：6gN m‐2
裁植密度：30cm×30cm

50

ID03_1840

RM3204

Tiller number (no.)

SL-MP3

Tiller number (no.)

【標準栽培】
施肥：6gN m‐2
裁植密度：30cm×15cm

50

(イ) CSSLsの多肥条件下での収量試験
多肥条件下でタカナリ背景CSSLsを栽培した結果、タカナリの玄米収量が1kg m-2を超える高収量水準での試験となった(図3)。収量構成要素の1つである穂数に関しては、第3染色体の一部がコ
シヒカリ型に置換されたSTK10がタカナリに対して有意に多くなったが、これはMP3の効果であると考えられた。一穂籾数についてはタカナリに比較して有意に増加するCSSLは見られなかった。
一方で、登熟歩合と1000粒重においては、タカナリに対して有意に増加する系統が複数観察されたが、これらは一穂籾数の減少を伴っていることが多く、結果として多肥条件下においてタカナ
リの玄米収量を有意に上回るCSSLsは確認できなかった。

図3

タカナリ背景CSSLsの多肥条件下での収量および収量構成要素の比較

1) ***、**、*は Dunnett 検定でそれぞれ 0.1％、1%、5%水準でタカナリとの間に有意差があることを示す。

３）成果活用における留意点
残念ながら多肥条件下の収量試験では、タカナリの収量を有意に上回るCSSLsが認められなかったため、新規のQTL検出はできなかった。今後はGPS7とMP3に絞って研究を進めることになるが、各々のNILの作成に加えて両QTLの集積系統を作成し、その収量評価をすることが重要であると考えている
４）今後の課題

GPS7およびMP3の候補遺伝子を絞り込むためには更にマッピングを進める必要がある。現在大規模選抜により、候補領域内で組換えを起こした個体由来の組換え固定系統を作出している。これ
ら固定系統を用いた高精度連鎖解析により候補遺伝子の絞込みを目指す。同時に、NILの作出も進め、GPS7およびMP3の収量への寄与を収量試験により検証する。

76

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS2006
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: 光合成効率を高める QTL の単離と集積小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農研機構 次世代作物開発研究センター・稲研究領域・稲形
質評価ユニット・山本敏央
１）研究目的
収量性の中でも特にソース能と呼ばれる光合成効率 (炭酸同化効率) に関わる諸形質は極めて解析
困難な量的形質である。このような形質の遺伝的基礎を明らかにするためには環境や他のゲノム領域の影響を極力排除した実験系を作って解析を行う必要がある。本研究では、ソース能に関わる諸形質のうち、1) 個体として備えるべき重要な要因である個葉光合成速度、また光合成速度を高める要因として期待される蒸散および吸水に関わる諸形質、2) 群落として備えるべき重要な要因である葉身傾
斜角度、に注目し、それらに関係する QTL の単離同定を行う。また QTL 領域を限定した準同質遺伝子系統を作出し、育種素材としての価値を検討すると同時に遺伝子の機能を解明する。
２）研究成果多収で個葉光合成速度の高いインド型品種タカナリやハバタキと日本型品種コシヒカリの交雑後代から作出した正逆の染色体断片置換系統群および戻し交雑固定系統群等を用いて、個葉光合成速度、
葉面温度、葉身傾斜角度に関する QTL 解析を行った。また登熟期間中の光合成活性に優れた多収品
種アケノホシとコシヒカリの交雑後代から作成した組み換え自殖固定系統群を用いて出液速度および葉色低下に関する QTL 解析を行った。検出された QTL の連鎖解析による候補遺伝子の絞り込みを行うとともに、QTL を含む準同質遺伝子系統の栽培試験によってこれら QTL の作物生産に対する貢献を明らかにした。
(1) タカナリ対立遺伝子が個葉光合成速度を高める QTL
第 10 染色体の長腕に位置し、気孔伝導度を高めることで個葉光合成速度を増加させる QTL の候
補領域を 450kb に絞り込んだ（図 1）。この QTL を含む 2.7Mb のタカナリゲノム断片を持つコシヒ
カリ準同質遺伝子系統は個葉光合成速度が高いことに加えて、出穂期以降の地上部乾物重の増加を示した（図 2）。

RBS200677

(2) ハバタキ対立遺伝子が個葉光合成速度を高める QTL
ハバタキ対立遺伝子が光合成速度を高める QTL,qCAR8 を同定した。さらにファインマッピン
グによって CAR8 がコードするタンパク質が CCAAT-box-binding 転写因子である OsHAP3H であり、これは開花時期の制御に関わる遺伝子 DTH8/Ghd8/LHD1 と同じであることを明らかにした（図3）。NIL(CAR8) の高い光合成速度には、葉の窒素含量が高いことによって RuBP 再生速度が大きい
こと、根からの水輸送能力が大きく気孔伝導度が大きいことが関与していた。

(3) コシヒカリ対立遺伝子が個葉光合成速度を高める QTL
タカナリ背景の戻し交雑固定系統群において、タカナリを上回る個葉光合成速度を示す系統が複数得られたことから、個葉光合成速度を高めるコシヒカリ対立遺伝子が存在することが示された（図4）。これら高光合成系統はタカナリ同様に葉が厚いことに加えて、コシヒカリと同様に小さく内部突起が発達した葉肉細胞形態を示し、その結果として葉肉コンダクタンスが高まり個葉光合成速度の増加に繋がると考えられた。戻し交配集団の QTL によって関与する QTL は第１染色体短腕、長腕、第 3 染色体、第 7 染色体などに推定された（図 5）。

(4) タカナリ対立遺伝子が葉面温度を低下させる QTL
戻し交雑固定系統群について最高分けつ期から出穂期にかけて赤外線サーモグラフィーで熱画像をRBS200678

撮影し、タカナリ対立遺伝子が群落の葉面温度を約 0.5 度下げる QTL を第 11 染色体に見出した。このゲノム領域をタカナリ型で有するコシヒカリ準同質遺伝子系統は葉温を低下させるとともに個葉光合成速度を上げる効果を有していた（図 6）。

(5) タカナリ対立遺伝子が葉身傾斜角度を高める QTL
スマートフォンの加速度センサーを用いた角度測定ソフトを利用して、タカナリ型対立遺伝子が葉身傾斜角度を高める QTL を第 3 染色体に見出した。このゲノム領域（約 3Mb）をタカナリ型で有するコシヒカリ準同質遺伝子系統（NIL3）はコシヒカリよりも群落における受光態勢に優れ（図 7）、
また高い地上部乾物重を示した（図 8）。

(6) アケノホシ対立遺伝子が水伝導度を高める QTL および葉色低下を抑制する QTL
アケノホシ型対立遺伝子で出液速度を高める QTL を第 2 染色体長腕に検出した（図 9）。同 QTLを含むコシヒカリ遺伝背景の染色体断片置換系統は登熟期間中の光合成速度が高い傾向が見られた。
アケノホシ型対立遺伝子で出穂期以降の葉色低下を抑制する QTL を第 3 染色体に検出した（図 10）。
同 QTL を含むコシヒカリ遺伝背景の染色体断片置換系統は登熟期間中の窒素の蓄積を高める傾向が見出された。

RBS200679

３）成果活用における留意点
タカナリは現在でも国内で最多収の水稲品種の一つである。また最近は業務用多収品種などの育成に外国稲（インド型）遺伝資源の利用が進む。このような背景から本成果である QTL 情報、選抜用DNA マーカーおよび準同質遺伝子系統は、多収性に関わるゲノム育種選抜に利用可能である。しかしタカナリを母本とした既存品種については既に本課題で明らかにした QTL が備わっている可能性があり事前の確認が必要である。
４）今後の課題
本課題で対象としたソース能関連形質は総じて環境影響を受けやすく、また単一個体やヘテロ接合
個体での評価が極めて困難な複雑形質である。このため見出した QTL の存在は確実と考えられるものの 5 年間では遺伝子の特定には至らないものも多かった。特に個葉光合成速度や葉面温度は 7 月から 8 月の天候に左右されることもあり、評価法については今後とも周辺技術の進歩に合わせて改善される必要がある。乾物生産の増加が確認された個葉光合成速度や葉身傾斜角度についても年次変動や環境影響を考慮して形質発現の安定性については引き続き確認を続ける必要がある、また子実生産に貢献するかどうかも引き続き検討が必要である。

RBS200680

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS2007
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: 低温土中出芽性に寄与する遺伝子の単離小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 富山県農林水産総合技術センター・農業研究所・育種課・山口琢也
１）研究目的
直播は、水稲における主要な低コスト化技術のひとつであるが、苗立の不安定性などの理由から、全国的な普及率は極めて小さい。本研究では、苗立性を決定する主因子として「低温土中出芽性」に着目し、「阿波赤米」等に由来する低温土中出芽性に寄与する遺伝子の単離を行う。また、本州以南での水稲育種に活用可能な、「コシヒカリ」を遺伝背景とする低温土中出芽性の準同質遺伝子系統（NIL）の開発を行う。従来から行われてきた単交配による育種では、苗立性と穂発芽性の連鎖を切った系統は育成できず、有用な中間母本を得るに至らなかった。そこで、本研究では、遺伝背景を「コシヒカリ」に統一し、ピンポイントで低温土中出芽性を改良した系統と、穂発芽耐性を改良した系統をそれぞれ交配し、これらの集積を行うことにより、実用性が極めて高い育種素材の作出を試みる。
２）研究成果研究方法（１）形質評価方法
低温土中出芽性は、種子を休眠打破・消毒後、15 ℃・3 日間の浸種を行い、20 粒 6 反復で播種を行った。播種深度は深さ 1cm とし、代掻き土壌を覆土した。播種後は、落水条件、15 ℃一定で、30日間静置し土中出芽率を調査した。低温伸長性は、種子を休眠打破し、種子消毒および 15 ℃・3 日
間の浸種を行い、30 ℃で催芽を行った後、鳩胸種子を湿らせたペーパータオル上に 20 粒ずつ播種した。15 ℃で 7 日間、暗黒下で静置後の芽長を測定した。低温発芽性は、種子 100 粒をろ紙を敷いたシャーレに入れて加水し、15 ℃で 7 日間静置した後、3 反復で発芽率を調査した。穂発芽性は、出穂後 40〜45 日目にサンプリングした穂を 48 時間以内に脱粒し、100 粒を湿度 100%・28 ℃の条件に 7日間置いた後、3 反復で発芽率を調査した。圃場での機械播種実験は、I 社条播機で、無催芽・カル
パー無コーティングとして行い、乾籾換算で 4.0kg/10a の播種量とした。播種後は落水出芽法により出芽促進させ、30 日後に苗立調査を行った。
（２）材料養成
コシヒカリ背景で、阿波赤米型で低温土中出芽性を高める QTL（qESS11、qESS4）について、BC4または BC5 を用いた CSSLs を養成し、組み換え自殖固定系統の選抜を行い、候補領域を絞り込む
材料の養成を行った。また、それぞれについて準同質遺伝子系統（NILs）の作出を行い、最終的にqESS11 と qESS4 の集積系統（PYLs）の育成を行った。qESS11 については、穂発芽性を促進する
多面発現があったため、コシヒカリ背景で穂発芽耐性を向上させる Kasalath 由来の Sdr1、Sdr4 およびハバタキ由来の Sdr7 との PYLs を養成した。また、直播試験にあたり、コシヒカリは倒伏が問題となることから、qESS11, qESS4, sd1 の集積系統を養成した。
（３）qESS11 の単離
qESS11 に関しては、160kbp の候補領域の BAC クローンの解読を行い、候補遺伝子の絞り込みを行った。さらに、BAC クローンをカバー領域が段階的に異なるサブクローンへ分割し、再分化効率に優れる「SL201」（「コシヒカリ」を遺伝背景として第 1 染色体短腕を Kasalath 型で有する染色体
断片置換系統）へ候補領域を導入した形質転換体を作成した。収穫した T1 種子により出芽特性の形

RBS200781質評価を行い、候補領域を狭小化し、絞り込まれた候補遺伝子については、過剰発現体を作成するとともに、CRISPR/Cas9 系による「阿波赤米」型遺伝子のノックアウトを行った。
研究結果（１）qESS11 の NIL 育成および穂発芽耐性遺伝子の集積
QTL 解析において最も寄与率の高い遺伝子であった qESS11 に関して、組み換え点の異なる 22 種
類の組み換え自殖固定系統群によるマッピングを行った結果、「日本晴」ベースで 81kbp まで絞り込みを行う事ができた（図 1）。これらの情報を用い、阿波赤米型の断片長が 210k, 236k, 455kbp の 3
種類の qESS11 − NIL 作出を行ったところ（図 2）、低温土中出芽性に優れるほかは、収量性及び品
質、食味がコシヒカリと同等であることが確認できた。
しかしながら、qESS11-NIL には穂発芽しやすいという多面発現が存在したため、穂発芽耐性遺伝
子との集積実験を試みた（図 3）。その結果、穂発芽耐性遺伝子と qESS11 を共存させることにより、多面発現を抑制し、高い苗立ち性を得ることができることが分かった（図 4）。
さらに、これらの系統について、4 月中旬の低温条件において直播試験を行った結果、育成系統は高い苗立性を示し、直播における収量性の安定に寄与できることが示唆された（図 5）。
（２）qESS4 の NIL 育成および qESS11 との集積
QTL 解析において低温伸長性の改善効果を有する qESS4 に関して、組み換え点の異なる 14 種類の組み換え自殖固定系統群によるマッピングを行った結果、約 500kbp まで絞り込みを行う事ができた（図 6）。そこで、阿波赤米型の断片長が 750kbp の qESS4 − NIL を作出したところ、低温土中出芽性に優れるほかは、収量性及び品質、食味がコシヒカリと同等であることが確認できた。そこで、前述の主導遺伝子 qESS11 と、qESS4 の集積系統の作出を行ったところ、ふたつの QTL を組み合わせることにより、より高い低温伸長性を得ることができた（図 7）。また、コシヒカリは直播で倒伏しやすいため、短稈化を行うことで倒伏の軽減を図れるが、sd1 で短稈化すると、低温伸長性が劣る問題があった。そこで、qESS4、qESS11、sd1 の集積実験を行ったところ、阿波赤米由来の土中出芽性遺伝子が存在すれば、sd1 の負の効果がキャンセルされ、高い低温伸長性を得ることが可能であった。
（３）qESS11 の単離組み換え自殖系統によるマッピングを行った結果、qESS11 の候補領域は「日本晴」ベースで 81kbp
であったが、BAC クローンの塩基配列の解読を行ったところ、「阿波赤米」ではゲノム構造が大きく異なり、当該領域が 160kbp とほぼ２倍の長さになっていた。また、NCBI のデータベース検索では、「阿波赤米」の当該領域には、「日本晴」に存在しない複数の遺伝子が座乗していることが明らかになった。そこで、BAC クローンを 10〜40kbp のサブクローンへ分割し、160kbp 全体をカバーする 10 個のサブクローンとして形質転換体を作出したところ、Sbc-6 のみで、浸種後 7 日目の発芽率
が「コシヒカリ」よりも高まることが明らかになった（図 8）。また、Sbc-6 は、14 日目までの伸長性も優れていたため、qESS11 の候補領域は、3.4kbp に狭小化された。これにより、「阿波赤米」配列上の候補遺伝子は 1 つになったため、過剰発現体の作成を行ったところ、阿波赤米型で出芽が促進されることが確認できた。さらに、準同質遺伝子系統（と系 1528）を材料としたゲノム編集によるターゲット遺伝子のノックアウトを行ったところ、qESS11 が破壊されることにより、低温発芽性および低温伸長性が低下することが確認できた。

RBS200782

RBS2007

83

RBS2007

84

RBS200785３）成果活用における留意点
qESS11 は、単独では穂発芽性の多面発現があるため、Sdr1 などの穂発芽耐性遺伝子と集積することで、実用化をはかる事ができる。
育成した qESS11 および qESS4 の NILs およびそれらの集積系統については、育種素材として活用
し、共同研究機関などと共同で、品種の育成者権を取得することを検討する。
４）今後の課題
低温土中出芽性に関しては、阿波赤米の遺伝解析により、原因遺伝子を特定することができたが、今後は、出芽後の初期伸長性を高める新たな遺伝子資源の発掘を行い、本研究で育成した NILs との集積により、直播での苗立ち性がより安定した母本の育成を行っていく必要がある。
また、qESS11 と相互作用して低温土中出芽性を決定している遺伝子が明らかになれば、種子発芽の制御メカニズムが明らかになり、ゲノム編集や突然変異体の作出によって、さらに苗立ち性に優れた遺伝資源の作出を行うことができると考えられる。

RBS200786「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS2008
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: 寒地におけるイネ圃場苗立ち性に関する QTL のマッピングと集積小課題代表研究機関・研究室・研究者名: ホクレン農業総合研究所・作物生産研究部・畑作物開発課・岩田夏子１）研究目的
水稲直播栽培は稲作の規模拡大および省力化に不可欠な栽培技術である。寒地である北海道で直播栽培を普及させるためには、高度苗立ち性 (seedling establishment) を有する早生の直播栽培向け品
種の開発が必要である。苗立ち性は年次変動が大きいため安定した選抜が重要であり、苗立ち性に関する選抜技術 (DNA マーカー) の開発および利用が有効であると考えられる。我々はこれまでに、苗立ち性が優れるポルトガル由来の水稲品種「Arroz Da Terra」(ADT) と苗立ち性が劣る北海道の栽
培品種「ほしのゆめ」の間で遺伝解析を行い、「ADT」由来の苗立ち性および低温発芽性を向上させる複数の量的形質遺伝子座 (QTL)、qSES11 、qSES7-1 等を見出した。本課題では、これらの QTLを対象として、(1) 単独および集積効果の検証、(2) 有望な QTL のマッピング、(3) 高度苗立ち性を有する準同質遺伝子系統 (NIL) の育成を行い、選抜 DNA マーカーおよび育種素材を開発する。
２）研究成果(1) 研究方法
ア．苗立ち性 QTL の効果検証とマッピング「ほしのゆめ」の遺伝背景において、「ADT」由来の qSES11 および qSES7-1 の苗立ち性に対する単独および集積効果、他形質への影響評価を行い、2 つの QTL の育種利用の方針を検討した。
qSES11 については組み換え固定系統群を作出し、候補領域の絞り込みを行った。
圃場での苗立ち性検定 (圃場苗立ち性検定) は、シーダーテープで加工した 1 系統 50 粒の種籾 (催
芽処理なし) を、試験用木枠 (底面は金網) に固定し、播種深度が 1cm となるよう水田土壌を覆土後、圃場に設置した。湛水下で約 30 日間養成し、本葉が展開した個体を苗立ち個体として苗立ち率を調査した。
イ．QTL の農業形質への影響評価「ほしのゆめ」背景の NIL を移植栽培により栽培し、移植 1 か月後（移植栽培）の茎数および草丈、出穂期、成熟期、成熟期の稈長、穂長、穂数、倒伏程度、精玄米重、精玄米千粒重、籾数、耐冷性（冷水かけ流し検定）、葉いもち病抵抗性、玄米の粒形（粒厚、粒幅、粒長）および品質を調査した。
ウ．育種素材の開発
北海道の直播栽培用品種「ほしまる」（苗立ち性弱）へ苗立ち性 QTL を導入した NIL を育成し、苗立ち性および農業形質を評価した。苗立ち性は上記アと同様に、農業形質は上記イと同様に、移植栽
培と直播栽培により評価した。
(2) 研究結果
ア．苗立ち性 QTL の効果検証とマッピング(ア)NIL および集積系統の育成 (平成 25 年〜26 年)
北海道の栽培品種「ほしのゆめ」を反復親、qSES11 および qSES7-1 領域がそれぞれ「ADT」型の戻し交雑自殖系統 (ほしのゆめ/ADT//ほしのゆめ BC1 F6 ) を 1 回親として戻し交雑を行った。BC3世代において、「ほしのゆめ」と「ADT」の間で多型を示す全染色体に分布する 189 個の SNP マー
カーおよび 74 個の SSR マーカーを用いた遺伝子型判定を行い、対象領域以外の SNP および SSR マー
カーが全て「ほしのゆめ」型に置換した個体を選抜した。BC4 世代において、qSES11 領域を含む 7

RBS200887

Mbp が「ADT」型に固定した系統 (S11A-HS)、qSES7-1 候補領域を含む 10 Mbp が「ADT」型に固定した系統 (S7-HS)、2 領域がともに「ADT」型に固定した集積系統を育成した（図 1）。

(イ) 各 QTL 単独での効果検証（平成 26〜27 年）およびマッピング（平成 26 年〜28 年）
2 か年（平成 26 年〜27 年）の圃場苗立ち性検定の結果、qSES11 と qSES7-1 の各 QTL 領域が単独で「ADT」型の系統の苗立ち率は、同領域が「ほしのゆめ」型の系統より、qSES11 では 8.4〜13.7%、qSES7-1 では 11.2〜14.5%有意に高く、各 QTL の単独での苗立ち率向上効果が認められた（図2）。qSES11 の候補領域の絞り込みを行い、選抜 DNA マーカーを開発した。

（ウ）QTL の集積効果の検証（平成 27〜28 年）
qSES11 および qSES7-1 の 2 領域が「ADT」型の集積系統の苗立ち率は、1 領域ずつが「ADT」型の NIL よりもやや高い傾向が認められたものの、有意な差は認められず、2 か年（平成 27 年〜28 年）

RBS200888

を通じて明瞭な集積効果は検出されなかった（図 3）。

イ．QTL の農業形質への影響の評価（平成 27 年〜28 年）
qSES11 および qSES7-1 領域を「ADT」型に置換した場合の農業形質への影響を検討するため、NIL と遺伝背景に用いた「ほしのゆめ」との農業形質の比較を行った。2 か年の評価を通して、qSES11領域を含む 7 Mbp が「ADT」型に置換されると、「ほしのゆめ」と比べて、初期生育茎数（移植 1 か
月後の茎数）と成熟期の穂数が増加し、玄米粒厚の減少が認められたが、精玄米重の減少は認められなかった（表 1）。なお、出穂期、成熟期、耐冷性、稈長、穂長、粒長、葉いもち病抵抗性について
は 3 か年を通じて qSES11 領域の影響は認められなかった。一方で、qSES7-1 領域が「ADT」型の系統（S7-HS）は、「ほしのゆめ」と比較して、早生および短稈化、精玄米重の減少、玄米の着色などの違いが認められた（表 2）。よって、本研究課題における育種素材の開発に際しては、2 種の QTLのうち農業形質への影響がより少ない qSES11 を優先することとした。

RBS200889

ウ．育種素材の開発
より直播適性の高い育種素材を開発するため、「ほしのゆめ」背景の NIL（S11A-HS）を 1 回親、北海道の直播栽培向け品種「ほしまる」を反復親とした戻し交雑を行い、「ほしまる」への「ADT」型
qSES11 の導入を進めた。BC4 F1 世代において全ゲノムの SNP タイピングを行い、対象領域以外の
SNP マーカーが全て「ほしまる」型に固定し、qSES11 領域がヘテロ型の 1 個体を選抜した。BC4 F3世代においてヘテロの領域が固定した個体を選抜し、「ADT」型 qSES11 領域がホモ型に固定した
NIL を作出した。作出した NIL の苗立ち性および農業形質を評価した（平成 29 年）。
平成 29 年度は高温で推移したため、全体的に生育が早く、例年の調査時期（播種 30 日後）には親品種間の苗立ち率の差が小さかった。よって、平成 29 年度は、例年より早い播種後 11 日目の出芽率を指標として供試系統を評価した。その結果、「ほしまる」背景の NIL の出芽率は、「ほしまる」より有意に高く、qSES11 は「ほしまる」背景においても有意な効果を示すことが確認された（図 4）。
農業形質については、NIL では「ほしまる」と比較して、成熟期の穂長、千粒重、粒長および粒幅の減少が認められたものの、直播栽培と移植栽培のいずれにおいても精玄米重の減少は認められなかった（表 3）。初期生育茎数、出穂期、成熟期、成熟期の稈長、穂数、1 穂籾数、倒伏程度、葉いも
ち病抵抗性、穂ばらみ期耐冷性については、NIL と「ほしまる」との間に差は認められなかった（表3 抜粋して記載）。以上の評価を通じて、「ほしまる」背景に「ADT」由来の qSES11 が導入された
NIL は、苗立ち性が向上し、「ほしまる」との同質性が高まったことが確認された。

RBS200890３）成果活用における留意点
qSES11 の 1 領域では、「Arroz Da Terra」の苗立ち性には到達しない。より高い苗立ち性の付与を目標とする場合には、qSES11 を保持する個体を DNA マーカー選抜した上で、表現型に基づいて高度苗立ち性系統を選抜する等が必要と考えられる。
４）今後の課題
より高度な苗立ち性の付与のためには、新たな苗立ち性因子の探索および qSES11 との集積利用が必要と考えられる。

RBS200891

「イネのDNAマーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915

研究期間: 平成25～29年度

中課題名: イネのDNAマーカー育種の利用推進（RBS）
小課題番号: RBS2009

研究期間: 平成25～26年度

小課題名: 生産性向上をめざしたイネ根系形態遺伝子の解析
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農業生物資源研究所・農業生物先端ゲノム研究センター・イネゲノム育種研究ユニット・宇賀優作
１）研究目的近年の地球規模での環境変動や人口増加に対し、国内外における稲生産を安定・増産させることは重要な育種課題である。根系は土壌からの養水分の吸収にとって必須の器官であり、とくに、深根性（根が深く張ること）は収量や耐倒伏、干ばつ耐性などに関わる重要な農業形質である。しかし、形質評価の困難さのためにこれまで育種対象とならなかった。本研究課題では、イネの生産性向上をめざし、深根性に関与する量的形質遺伝子座（QTL）
を1つ以上単離・同定し、その準同質遺伝子系統（NIL）を育成する。さらに、深根性遺伝子を導入した品種について収量性、耐倒伏性ならびに耐乾性への効果を検証し、品種育成につなげる。本課題は以下の2つからなる。
課題1：深根性遺伝子の導入による多収性および耐倒伏性の向上
これまでに、浅根型品種（IR64）と同品種に深根性遺伝子DRO1を導入した系統を比較栽培した結果、DRO1を導入した系統で登熟性や耐倒伏性が改善し、収量が10%向上することが分かった。国産飼料イネの中には、根が浅く登熟の悪い品種がみられることから、深根化により登熟性を改善し収穫量を上げることをめざす。そこで、飼料イネと深根型品種
Kinandang Patong（KP）との交配より得た解析集団から深根性に関与するQTLを新たに同定する。さらに、準同質遺伝子系統を作製し、収量および倒伏性への効果を明らかにする。
課題2：深根性遺伝子の導入による干ばつ耐性の向上
浅根性品種の干ばつ耐性を強化することを目標に、これまでに遺伝効果の大きい深根性遺伝子を第4染色体に発見した（DRO2）。本研究では、DRO2の単離ならびに同定を行う。
さらに、NILを作製し、干ばつ試験を行うことで、DRO2の耐乾性への効果を明らかにする。
また、DRO1単独では十分な深根化には至っていないことから、更なる深根化をめざして、
DRO1に相加的に働く新奇な深根性QTLの検出を試みる。
２）研究成果課題1：深根性遺伝子の導入による多収性および耐倒伏性の向上
飼料イネ3 品種（モミロマン、夢あおば、タチスガタ）とKPの交配から作製した3つのF2 集団について、バスケット法を用いて深根率を求めた。また、SNP およびSSR マーカ
ーを用いて連鎖地図を作製し、QTL 解析を行った。QTL解析の結果、統計的に有意なQTLs
が各解析集団から見つかった（図1）。モミロマンとKPのF2集団（MoK-F2、127系統）からは、第4染色体に深根率（50°）に関与するQTLを1つ見出した。このQTLは連鎖地図上での位置関係から既報のDRO2に対応すると考えられた。夢あおばとKPのF2集団（YuK-F2、
129系統）からは、第2および第4染色体に深根率（50°）に関与するQTLsを見出した。また
第2および第6染色体に深根率（70°）に関与するQTLsを見出した。タチスガタとKPのF2集団（TaK-F2、125系統）からは、深根率（50°）ではQTLを検出できなかったが、深根率（70°）

92

では、第2染色体上に見出した。本QTLはYuK-F2で検出した第2染色体上のQTLと同じ可能性がある。これらの解析は、これまで我々が報告した深根性QTL以外に、第2および第6染
色体に新規な深根性QTLが存在することを示している。よって、第2および第6染色体のQTLsをDRO4およびDRO5と名付けた。
図1 飼料イネ3品種と深根品種Kinandang Patong（KP）のF2集団における深根率QTLsの染色体上の位置MoK-F2
10
8
6
4
2
0
10
8
6
4
2
0

LOD値

RDR50 (5.76)

RDR70 (5.79)

1

YuK-F2

2

3

4

5

6

7

8

10
8
6
4
2
0
10
8
6
4
2
0

LOD値

RDR50 (5.85)

RDR70 (5.79)

1

2

3

4

5

6

7

8

9 10 11 12

10
8
6
4
2
0

RDR50 (5.91)

LOD値

TaK-F29 10 11 12

10
8
6
4
2
0

RDR70 (5.81)

1

2

3

4

5

6

7

8

9 10 11 12

MoK-F2:モミロマン x KP由来のF2、YuK-F2:夢あおば x KP由来のF2、TaK-F2:タチスガタ x
KP由来のF2。RDR50：深根率（50°）、RDR70:深根率（70°）。矢頭は統計的に有意なQTLのピークを指す。破線とカッコ内の数字はLODの閾値を表す。各集団の図下に染色体番号を示す。
課題2：深根性遺伝子の導入による干ばつ耐性の向上
浅根型品種ARC5955 とKPのF2 集団より見出したDRO2について、ファインマッピングのための組換え自殖固定系統（BC2F4） を選抜した。DRO2 の候補遺伝子領域を絞り込む

93

ため、これら組換え自殖固定系統を用いてDRO2 のファインマッピングを行い、候補領域
を数Mbpまで絞り込んだ。
更なる深根化をめざして、DRO1に相加的に働く新奇な深根性QTLの検出を試みるため、
Dro1-NIL（IR64背景にKP由来の機能型DRO1を導入した準同質遺伝子系統）とKPを交配し自殖させたF2集団を作製した。バスケット法により8週間栽培したイネ個体について深根率を調査するとともに、バスケットから根を洗い出し、根伸長角度を調査した。さらに、得られた表現型データとSNPマーカーの遺伝子型データを用いてQTL解析を行った。深根
率では、LODの閾値を超えるQTLは検出されなかった。一方、根伸長角度では、LODの閾
値を超えた有意なQTLが第7 染色体に１つ検出された（図2）。本QTLはIR64とKPから作製した組換え近交系統群やCSSLsからは見出せていないことから、機能型のDRO1 を持った遺伝背景でのみ検出できるQTL であると推察された。また、本QTLは新奇であったことから、DRO3と命名した。
図2

Dro1-NILとKPのF2集団（n=122）における深根率および根伸長角度のQTLの位置

破線はLODの閾値を表す。

LOD score8

深根率(%)

6
4
2
0
1

2

3

4

5

6

7

8

LOD score

8

9S 9L 101112根伸長角度(°)

6
4
2
0
1

2

3

4

5

6

7

8

9S 9L 101112３）成果活用における留意点
課題1の成果として新たにDRO4とDRO5を見出すことができたが、このうち、DRO4はKP
型で深根にすることから、飼料イネの深根化に有効なアリルであると推察される。また、
モミロマンの浅根性にはDRO2が関与していることがわかった。モミロマンにKP型のDRO2を導入することで登熟性が向上するかどうかを明らかにすることは、飼料イネ品種の多収化にとって重要な知見をもたらすと考える。DRO5はKP型で浅根となるため、深根化には利用することが難しいと考える。課題2において見出したDRO3は機能型DRO1を遺伝背景に持つ品種において機能を発揮すると推察される。非機能型のDRO1を持った品種では深根化
しないことが推察されるため、育種素材としての利用には注意が必要である。

94４）今後の課題
課題1では、DRO2およびDRO4の深根型アリルを飼料イネにマーカー選抜法により導入し、元品種に対して多収となるかどうかを明らかにする必要がある。課題2では、DRO2およびDRO3の単離・同定を進めるとともに、NILを作製し、干ばつ条件下で耐性を示すかど
うかを明らかにする必要がある。

95

「イネのDNAマーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915

研究期間: 平成25～29年度

中課題名: イネのDNAマーカー育種の利用推進(RBS)
小課題番号: RBS2010

研究期間: 平成25～26年度

小課題名: 粗放栽培への適応を目指した育種素材の作出
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農業生物資源研究所・植物科学研究領域・植物生産
生理機能研究ユニット・稲垣言要
１）研究目的現代の農業経営環境においては、生産物の高収量、高品質化に加えて、農作業の低コスト化、省力化が求められている。イネ栽培では、疎植による低コスト化や、直播による省力化が実際に行われている。本研究は、この二つの栽培法の利点を考慮し、低コストで低労力な栽培法に適したイネ品種を生み出す元となる育種素材を作出することを目的とする。
具体的には、栽植密度を大きく低下させた疎植で低コスト化を行ったとしても、十分な収量を与える効果を持つ遺伝子を野生イネ遺伝子資源から探索・同定し、その遺伝子を活用するための基盤知識を得ることが本研究の目的である。この目的の達成のために本研究では、野生イネの染色体上に存在する、栽培イネより「幅広い分げつ性」を与える領域に着目する。この染色体領域は、特に疎植では、栽培イネを大きく上回る穂数を与え、栽培イ
ネを上回る収量を与える可能性があるので、この領域を持つ系統を疎植で栽培し、その農業形質を解析して、疎植に対する適性、特に収量性を検討する。加えて、この形質に関わる染色体領域を絞り込み、原因遺伝子を同定するとともに、同定された遺伝子領域だけを持つ準同質遺伝子系統を確立させる。
２）研究成果1) 幅広い分げつ性を与える野生イネ染色体領域の遺伝学的絞り込み
KR ILs 系統群（旧農研機構・作物研、現農研機構・次世代作物開発研究センター：コシヒ カ リ ／ O. rufipogon （ タ イ 原 産 ） IRGC-ACC104814 染 色 体 断 片 導 入 系 統 群
http://www.naro.affrc.go.jp/nics-neo/contents/ine_idensi/kr_ils/index.html）には、疎植の時の穂数が栽培イネより大きく増える系統、いわゆる、幅広い分げつ性を示す系統が含まれていた。
そこで、この形質を与える野生イネ由来の染色体領域を遺伝学的に同定するため、
幅 広 い 分 げ つ 性 を 示 す KR IL 系 統（BC4F5）を出発材料にコシヒカリによってさらに１回戻し交配して BC5F2 を得て、その世代の個体の表現型タイピングと遺伝型タイピングを行った。その結果、幅広い分げつ性を与える遺伝子は７番染
色体に座乗していることが判明した。７
番 染 色 体 に つ い て コ シ ヒ カ リ ／ O.
rufipogon ヘ テ ロ の 株 の BC5F3 世 代 を750 個体、BC5F4 世代を 300 個体圃場展
開し、それらについて表現型タイピング

96を行うと共に遺伝型タイピングを行った。その解析により、栽培イネに幅広い分げつ性を与えている野生イネの染色体領域は短腕側末端近傍 266 kbp 内に存在することが明らかになった（図１）。
2) 形質転換イネを用いた幅広い分げつ性を与えている遺伝子の同定の試み
遺伝学的な絞り込みの結果、幅広い分げつ性を与えている野生イネ由来の遺伝子は、７番染色体上の 266 kbp 内に存在することが示された。絞り込まれた領域には、イネアノテーションデータベース（RAP-DB）によると 27 遺伝子の存在が予想された。この遺伝子群の中には草型制御に関わることが知られている Prostrate growth 1（Prog1）遺伝子が存在していた。Jin ら（Nature Genetics 2008 40:1365-1369）は、野生イネ型の Prog1 遺伝子は分げ
つ数を増やすことを示唆しており、幅広い分げつ性を与える遺伝子の候補として有望と考えられたため、野生イネ Prog1 遺伝子についてコシヒカリに形質転換して、その表現型の解析を行った。その結果、野生イネ Prog1 遺伝子の導入によって、イネの分げつは傾き、それと相関して、分げつ数が増加する傾向が示され、幅広い分げつ性を与えている遺伝子
は Prog1 である可能性が高まった（図２）。

3) 各種栽培法における幅広い分げつ性を保持するイネの農業特性の検討
コシヒカリ／O. rufipogon 染色体断片置換系統群中に見いだされた幅広い分げつ性を持つ系統をコシヒカリで１回戻し交配した系統の後代（BC5F4世代）から７番染色体短腕以外の領域が全てコシヒカリ染色体に戻った系統を単離し、この系統を KRK 3-5-6 と名付けた。
KRK 3-5-6 系統ならびに自殖後代を疎植で圃場において夏作し、農業形質の測定を行った。
【草姿】
コシヒカリは、栄養生長期も生殖生長期も分げつはほぼ直立状態であった（図３Ａ）。一97

方、KRK 3-5-6 系統の分げつは著しく傾き、開帳した。しかし、栄養生長期に開帳する KRK
3-5-6 系統は生殖生長期に入ると一転して直立してくるため、コンバインなどの機械刈り
適性は失わないことが明らかになった（図３Ａ）。疎植は土壌面に光が入り込みやすく、これは雑草の繁茂につながる。幅広い分げつ性を付与する遺伝子を持つイネが栄養生長期に分げつを開帳させる性質は、多分げつと相まって土壌面に光を入りにくくし、雑草の繁茂を抑える働きがある（図３ＢC）。

【分げつ数、穂数、草丈】
株間 36 cm の疎植の場合、KRK 3-5-6 系統は、コシヒカリの 1.5 倍程度の穂数を示し、株間 54 cm の場合、KRK 3-5-6 系統は、コシヒカリの 2 倍程度の穂数を示した（図４）。
分げつ数の推移を播種後日数でプロットしたところ、密植（株間 18 cm）では、コシヒカリ、KRK 3-5-6 系統ともに、播種後 55 日目で分げつ数の増加が頭打ちになるが、疎植（株間 54 cm）では、播種後 88 日目まで分げつ数の増加が見られた（図５）。KRK 3-5-6 系統は、疎植では常にコシヒカリの倍の分げつ数を示すところに特徴がある。コ
シヒカリに比べ、KRK 3-5-6 系統では無効分げつが多く出現する傾向が見られ、この点については改良の余地がある
（図５）。

98

分げつが増える系統は、一般的に矮性化する傾向を示すことが多い。しかし、KRK 3-5-6系統は、多分げつにもかかわらず、コシヒカリとほぼ同様の草丈を示した（図６Ａ）。
【百粒重、収量性】
KRK 3-5-6 系統の籾の百粒重は、コシヒカリと同等であった（図６Ｂ）。また、株間 54
cm の疎植においては、KRK 3-5-6 系統はコシヒカリより 10% 程度増収の傾向を与えた。
このことから KRK 3-5-6 系統は収量性において疎植適性を持っている（図６C）。

【倒伏性】
疎植においては、コシヒカリがほとんど倒伏しないのに対し、KRK 3-5-6 系統は、なびき型倒伏した個体が出現する。そこで倒伏性に影響するファクターとして、地際から10cm の位置の茎の短径を測定した（図７）。疎植において
コシヒカリが 4 mm の平均値を示す一方、KRK 3-5-6 系統の短径の平均値は 2.5 mm で、コシヒカリより 63 % 小さ
く、この値は、密植のコシヒカリの短径より小さい。KRK
3-5-6 系統は、稔実率はコシヒカリ並みに高いこともあり、
穂数増のトレードオフとして茎径が小さくなったことで登99

熟した穂を支えきれなくなって倒伏傾向を示すと考えられた。
4) 準同質遺伝子系統の構築
幅広い分げつ性を与える野生イネ由来の遺伝子を持つ準同質遺伝子系統を得るため、KR
ILs 系統群の一系統（BC4F5）を出発材料にコシヒカリによってさらに３回戻し交配してBC7F4 を得た。
これらから、表現型タイピングと遺伝型タイピングを行い、野生イネ由来の染色体領域
が７番染色体短腕 358 kb 以下にまでに絞り込まれた準同質遺伝子系統を得た。

３）成果活用における留意点
１）栽培イネに幅広い分げつ性を与えている野生イネ由来の遺伝子は、効果が大きすぎる傾向がある。穂数の倍化が、茎径の著しい減少につながり倒伏耐性が低下している。このため、穂数増加についてよりマイルドな表現型を与えるアリル（スーパーアリル）を探索する必要があると考えている。
２）本系統は、もともと倒伏し易いコシヒカリを背景にしていることに加え、上に述べたように新たに導入された形質のトレードオフで倒伏耐性がさらに低下した。そこで少数の遺伝子で強稈形質を獲得している品種との交配を行って、倒伏耐性を向上させる試みが必要である。
４）今後の課題
１）これまでの農業特性の検討には BC5F4 世代を用いており、準同質遺伝子系統が使われていない。準同質遺伝子系統による農業特性の検討が必要である。
２）今回構築した準同質遺伝子系統も、倒伏耐性は低いと想定される。強稈の準同質遺伝子系統との交配による遺伝子集積で、幅広い分げつ性と耐倒伏性を併せ持つ系統の構築

100が必要と考えられる。
３）本研究では、疎植適性を判断するのに株間 54 cm という過疎植状態で研究を行っている。反収を密植並みに維持でき、コスト低下につながる、最大の株間を確定するなど、本形質を持つイネを現場で活用するための最適な疎植栽培条件を確定していく必要がある。

101

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS2011
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: 良食味関連遺伝子の単離と機能解析
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農研機構 九州沖縄農業研究センター・水田作研究領域・稲育種グループ・竹内善信
１）研究目的
水稲の主要な育種目標である良食味の選抜は食味官能試験により行われており、多くのサンプルと時間・労力が必要である。選抜の効率化を進めるため、良食味水稲品種コシヒカリと、近年注目されているゆめぴりか、おぼろづきの育種素材である空育 162 号と北海 PL9 の持つ良食味の遺伝的要因の解明とその DNA マーカーを作成する。既に、予備的な QTL 解析が終了しており、コシヒカリの良食味に関連する QTL を第 3 染色体の短腕末端上に、空育 162 号と北海 PL9 の良食味に関連する
QTL を各々第 2 および第 9 染色体上にマッピングしている。本研究課題では、マップベースクロー
ニング法と TILLING 法等を使って良食味に関連する遺伝子を単離・同定する。さらに準同質遺伝子
系統を用いた生理的および物理的・化学的な解析により、デンプンや低分子糖などの糖質やアミノ酸などを含めた食味関連物質の生合成経路における目的遺伝子の機能を明らかにする。
２）研究成果（１）コシヒカリの持つ良食味遺伝子の解析
コシヒカリの良食味に関与する第 3 染色体短腕上の QTL については、候補領域内で組換えを起こした 115 個の固定系統の食味官能試験により候補領域の絞り込みを行った（Takeuchi et . al . 2008）。
また、候補領域内の遺伝子についての突然変異体を評価するとともに準同質遺伝子系統を用いて目的遺伝子の機能を明らかにした。
（２）空育 162 号の持つ良食味遺伝子の解析
空育 162 号のアミロース含有率に関与する第 2 染色体上の QTL については、候補領域内を 74.9kbに絞り込むことができた（Takemoto-Kuno et . al . 2015）（図 1A）。いただきを遺伝的背景にした
空育 162 号の有するアミロース含有率を持つ準同質遺伝子系統（NIL110）は、いただきよりもアミロース含有率が１ポイント程度低下し、アミロース含有率の低減効果があった（図 1B）。また、この系統の炊飯米の表層の粘りは少し強くなることを明らかにした（図 1C）。
（３）北海 PL9 号の持つ良食味遺伝子の解析
北海 PL9 の持つアミロース含有率に関与する第 9 染色体上の QTL は、QTL 近傍の組換え系統を作成し、候補領域の絞り込みを進めた（Ando et . al . 2010）。

RBS2011102

３）成果活用における留意点
コシヒカリの良食味に関与する第 3 染色体短腕上の QTL は、食味が劣る系統・品種の食味を向上させるための素材として活用できる。
空育 162 号の第 2 染色体上の QTL 情報は、空育 162 号を供与親とした育種材料からアミロース含有率がやや低い系統を DNA マーカー選抜するために利用できる。本研究のアミロース含有率は、いただきに対して空育 162 号の第 2 染色体上の遺伝子を導入した準同質遺伝子系統を次世代作物開発研究センターの圃場で栽培して得られた結果であり、検出されたアミロース低減効果は地域および導入
系統毎に確認する必要がある。
４）今後の課題
コシヒカリ、空育 162 号および北海 PL9 の良食味 QTL を各々第 3、第 2 および第 9 染色体上に見出し、候補領域の絞り込みを進めたものの、遺伝子の単離・同定はできていない。遺伝子を単離・同定するとともに、機能の解析を進めることにより、食味を解明するための新しい知見が得られると考えている。また、得られた情報を活用することにより種々食味特性を持つ良食味品種の育成が可能になると考えている。得られた情報は、広く公開し、実際の品種育成などの現場で活用できる体制を整えたいと考えている。

RBS2011103

「イネの DNA マーカー育種の利用推進」最終年度報告書
中課題番号: 13405915
研究期間: 平成 25〜29 年度
中課題名: イネの DNA マーカー育種の利用推進 (RBS)
小課題番号: RBS3001
研究期間: 平成 25〜29 年度
小課題名: ゲノム選抜育種に必要な基盤技術の開発
小課題代表研究機関・研究室・研究者名: 農研機構 次世代作物開発研究センター・稲研究領域・稲形
質評価ユニット・山内歌子
１）研究目的
本研究では品種育種機関で必要とするＤＮＡマーカー解析の支援を行うとともに、日本で広く使われるイネ品種および育種母本のゲノムワイドな１塩基多型 （SNP）情報およびハプロタイプ情報を収集し、広く利活用できる体制を整える。具体的には、日本のイネ育種集団において効率的な遺伝子型の調査を可能とする多数の SNP マーカーを開発し、活用しやすいようにカスタム化し、日本稲コアコレクションや基幹品種パネル等の遺伝子型情報や日本稲雑種集団での形質遺伝子座情報を追加
し、SNP 解析基盤を整備する。さらに、本課題で取り扱う有用遺伝子のドナー品種および反復親品
種等のゲノム解読を行い、品種特異的な SNP 情報を含めた選抜手法を確立する。これらの研究資源を活用して、本プロジェクトで開発する育種素材の遺伝子型を雑種集団の初期段階から調査し、効率的なゲノム選抜を行うことで品種育成を加速する。
２）研究成果(1) 品種開発/育種素材開発選抜支援の実施
品種育成を行う課題群（系１）で取り扱う育種素材を対象に、各世代での選抜に必要な DNA マー
カーの設計およびそれらを用いた解析を行った。育種を行う上で有用な遺伝子を同定し、育種素材の開発を行う課題群（系２）に対する支援では、精密連鎖解析のための遺伝子型調査、マーカー作成、
BAC ライブラリーの作成、遺伝子組換え個体の作成、スクリーニング等を行った（IVG3003 との連携支援）。全研究期間において、のべ 440 件の支援を実施し、課題全体の進捗に大きく貢献した。
(2) SNP 情報の収集及び検証
育種支援に活用できるマーカーを整備するため、公的配列データベース、取得済みの NGS 及び新たに解読した 42 品種の NGS 情報を利用して、SNP 情報の収集・整理を行った。これにより、様々な日本水稲品種の育種集団において遺伝背景の選抜に十分な SNP 情報を収集できた。収集した SNPのうち、5144 個についてバリデーション（実験による DNA マーカーとしての利用可能性の検証）を行い、4530 個が利用可能となった。
(3) SNP アレイの開発整備したマーカーを SNP アレイ解析ステムで活用するため、実験条件を検討し作業工程を確立した。当初は Illumina 社 GoldenGate システム ( 768 SNP アレイ) を想定し、768 個の汎用性の高いマーカーを選定する予定であったが、同システムのサポート中止に伴い、Fluidigm 社 EP1 システム( 96 SNP ) の解析系に変更した。EP1 システムを用い、事前の情報に基づき任意の解析集団の交配
組み合わせで多型となるマーカーのみを利用した場合、192 個程度のマーカーによって、GoldenGateの 768 SNP アレイに匹敵する解析精度を得ることができる。このシステムを活用して、遺伝子型情報を収集し、様々な遺伝資源で利用可能なマーカーセットを作成できることを確認した。また、いもち病圃場抵抗性遺伝子、出穂期遺伝子、縞葉枯抵抗性遺伝子などの有用遺伝子の選抜に有効なマーカーを設定した。以上の取り組みから、品種開発の目的に応じたマーカーセット（ SNP アレイ）を用いることで、育種選抜の初期段階で、最良の遺伝子型の個体を選抜することが可能となった。
(4) 形質情報の整備・集団構造の解析

RBS3001104

交配組合せの決定などの育種戦略を立てる上で役立つ基礎データを得るため、日本品種を交雑した 19 集団についてマーカー情報を整備し、基本形質（到花日数、稈長、穂長、穂数、粒型）に関与する遺伝子座を検出した。片親をコシヒカリに統一し、各集団において、各々85〜200 個のマーカーを用いて解析したところ、ほぼすべての集団/形質の組合せで QTL を検出できた。出穂では、多くの集団で Hd1、Hd3a、Hd6/Hd16 遺伝子座近傍に QTL を検出し、多くの日本品種がこれらの遺伝子座でコシヒカリとは異なる遺伝子を持つことが示唆された。一方、限られた品種のみで検出される遺伝子座があり、在来品種や各地域の品種などに特徴的な集団構造の存在も示唆された。以上のことから、在来品種や各地域の品種の体系的な解析によって、新たな遺伝子の発掘とその分布を整理することが可能であり、育種戦略の策定に役立つものと考えられた。
３）成果活用における留意点
当プロジェクトを通じて、様々な交配組み合わせの育種集団を、育種の初期から効率よく選抜できる DNA マーカー育種の基盤を構築した。NGS データの積極的な活用と Fluidigm 社 EP1 システ
ムの導入により、課題ごと、育成の段階ごとに最適なマーカーセットを用いた低コストで迅速な支援を実現した。これにより、年間 100 件程度の支援を実施し、当プロジェクトの目標達成の推進に貢献した。その一方で、取り扱うデータ量が増加し、作業内容が高度化した。したがって、今後の技術更新への対応も含めて、それに携わる人材の能力維持は、基盤の管理上極めて重要である。
４）今後の課題
NGS データから得られる SNP 情報をもとに、DNA マーカー育種を行う時代となった。NGS 解析では、膨大なデータが得られる一方で、一定量含まれる誤りなどを避け、必要なデータを効率的に取り出すことが必要であり、データ処理技術の向上が求められる。構築した基盤を幅広く活用し、さらに多くの品種育成課題に対応するためには、自動化できる工程を増やすなどの改善が必要である。
例えば、Fluidigm 社 EP1 システムでの解析は、ユーザーの要望に応じたきめ細やかなマーカー選定が特長であるが、マーカーの選定に多くの時間を費やしているので、この工程を自動化するプログラムの開発が必要である。また、Illumina 社 GoldenGate システム廃止の例は、機器サポート面でのリ
スク回避の重要性を提示した。低コストで運用でき、かつ自動化に適した新たな遺伝子型解析システ
ムの導入を検討し続ける必要がある。

RBS3001105

Ⅴ これまでの研究実施期間における研究成果（論文発表、特許他）【一般公表可】

課題番号 13405915

成果等の集計数
学術論文
課題
番号学会等発表（口頭またはポスター）

和文

欧文

国内

国際

4

28

110

31

13405915

出版
図書

7

国内特許権等

国際特許権等

出願

取得

出願

取得

0

0

0

0

発表会
の主催 アウト
報道件 普及しう（シンポ リーチ活
数
る成果
動
ジウム・
セミナー
14

4

2

1

（１）学術論文
区分； ①原著論文、 ②その他論文
整理番
タイトル
著者
区分
機関名
号
農業生 The mesophyll anatomy enhancing CO2 diffusion is a key trait for
S. Adachi, T. Nakae, M.
物資源 improving rice photosynthesis
Uchida, K. Soda, T. Takai, T.
研究所,
Oi, T. Yamamoto, T. Ookawa,
1①
東京農
H. Miyake, M. Yano, T.
工大学
Hirasawa
農業生 インドール酢酸-グルコース加水分解酵素の欠失はイネの粒重と収量を増物資源 加させる
石丸健, 廣津直樹
2
②
研究所,
東洋大
学
農業生 Loss of function of the IAA-glucose hydrolase gene TGW6 enhances rice K. Ishimaru, N. Hirotsu, Y.
物資源 grain weight and increases yield
Madoka, N. Murakami, N.
研究所、
Hara, H. Onodera, T.
3①
東洋大Kashiwagi, K. Ujiie, B.
学
Shimizu, A. Onishi, H.
Miyagawa, E. Katoh
作物研 A natural variant of NAL1, selected in high-yield rice breeding programs, T. Takai, S. Adachi, F.
究所、農 pleiotropically increases photosynthesis rate
Taguchi-Shiobara, Y. Sanoh業生物
Arai, N. Iwasawa, S.
資源研
Yoshinaga, S. Hirose, Y.
究所、東Taniguchi, U. Yamanouchi, J.
京農工
Wu, T. Matsumoto, K.
4①
大学
Sugimoto, K. Kondo, T. Ikka,
T. Ando, I. Kono, S. Ito, A.
Shomura, T. Ookawa, T.
Hirasawa, M. Yano, M. Kondo,
T. Yamamoto

1

掲載誌

掲載
発行
巻
ペー 発行年月（号）
ジ

J Exp Bot

64(4)

1061
1072

FIRSTAUTHOR's

2013

2

2013

5

Nat Genet

45(6)707711

2013

6

Sci Rep

3

2149

2013

8

5

6

7

8

9

10

11

12

②

農業生
物資源
研究所

深根性遺伝子による根系の形態の制御は干ばつのもとでのイネの増収を
可能にする

農業生
物資源
研究所

Control of root system architecture by DEEPER ROOTING 1 increases
rice yield under drought conditions

宇賀優作

①

A major QTL controlling deep rooting on rice chromosome 4

①

農業生
物資源
研究所

Genomics-assisted allele mining and its integration into rice breeding

②

農業生
物資源
研究所

イネ深根性遺伝子による耐乾性の遺伝的改良

②

農業生
物資源
研究所

Alleles Affecting 30 Traits for Productivity in Two Japonica Rice
Varieties, Koshihikari and Nipponbare (Oryza sativa L.)

①

農業生
物資源
研究所
名古屋
大学

A novel AP2-type transcription factor, SMALL ORGAN SIZE1, controlsorgan size downstream of an auxin signaling pathway

①

45(9)

1097
1102

2013

9

Y. Uga, E. Yamamoto, N.
Kanno, S. Kawai, T.
Mizubayashi, S. Fukuoka

Sci Rep

3

3040

2013

10

Genomics of Plant
251Genetic Resources 2(10) 265

2013

12

根の研究

22(4)

1311392013

12

Plant Prod Sci

17(1)

4765

2014

1

K. Aya, T. Hobo, K. Sato897Izawa, M. Ueguchi-Tanaka, H. Plant Cell Physiol 55(5)912
Kitano, M. Matsuoka

2014

5

Y. Arai-Sanoh, T. Takai, S.
Yoshinaga, H. Nakano, M.
Kojima, H. Sakakibara, M.
Kondo, Y. Uga

2014

7

Kazuhiro Ujiie, Ken Ishimaru

2

8

Nat Genet

宇賀優作

農業生 Deep rooting conferred by DEEPER ROOTING 1 enhances rice yield in
物資源 paddy fields
研究所、
他

2013

Y. Uga, K. Sugimoto, S.
Ogawa, J. Rane, M. Ishitani,
N. Hara, Y. Kitomi, Y. Inukai,
K. Ono, N. Kanno, H. Inoue, H.
Takehisa, R. Motoyama, Y.
Nagamura, J. Wu, T.
Matsumoto, T. Takai, K.
Okuno, M. Yano

Yamamoto T, Uga Y, Yano M①

ライフサイエンス
新着論文レビュー

Sci Rep

4

5563

名古屋
大学
13

14

15

16

17

18

Utilization of stiff culm trait of rice smos1 mutant for increased lodging
resistance①

K. Hirano, A. Okuno, T. Hobo,
R. Ordonio, Y. Shinozaki, K.
Asano, H. Kitano, M.
Matsuoka

PLoS One

9(7)

e960
09

2014

7

①

東京農 Increased lodging resistance in long-culm, low-lignin gh2 rice for improved
T. Ookawa, K. Inoue, M.
工大学、 feed and bioenergy production
Matsuoka, T. Ebitani, T.
名古屋
Takarada, T. Yamamoto, T.
大学、富Ueda, T. Yokoyama, C.
山県農Sugiyama, S. Nakaba, R.
林水産
Funada, H. Kato, M.
総合技
Kanekatsu, K. Toyota, T.
術セン
Motobayashi, M. Vazirzanjani,
ター、他
S. Tojo, T. Hirasawa

Sci Rep

4

6567

2014

10

BMC Plant Biol

14

295

2014

11

日本作物学会紀事 83(4)299304

2014

11

①

②

農業生 Genetic mechanisms underlying yield potential in the rice high-yielding
物資源 cultivar Takanari, based on reciprocal chromosome segment substitution
研究所、 lines
作物研
究所
農業生
物資源
研究所

イネの粒形制御に関わる遺伝子の単離とその作用

農業生
物資源
研究所

The roots of future rice harvests

石丸 健, 氏家 和広②①

T. Takai, T. Ikka, K. Kondo, Y.
Nonoue, N. Ono, Y. AraiSanoh, S. Yoshinaga, H.
Nakano, M. Yano, M. Kondo,
T. Yamamoto

名古屋 Isolation of a novel lodging resistance QTL gene involved in strigolactone
大学、東 signaling and its pyramiding with a QTL gene involved in another京農工 mechanism
大学、富
山県農
林水産
総合技
術セン

3

Ahmadi N., Audebert A.,
Bennett M.J., Bishopp A., de
Oliveira A. C., Courtois B.,
Diedhiou A., Dievart A.,
Gantet P., Ghesquiere A.,
Guiderdoni E., Henry A.,
Inukai Y., Kochian L., Laplaze
L., Lucas M., Luu D.T.,
Manneh B., Mo X.,
Muthurajan R., Perin C.,

Rice

7

29

2014

12

K. Yano, T. Ookawa, K. Aya,Y. Ochiai, T. Hirasawa, T.
Ebitani, T. Takarada, M. Yano,
T. Yamamoto, S. Fukuoka, J.
Wu, T. Ando, R. L. Ordonio, K.
Hirano, M. Matsuoka

Mol Plant8(2)303314

2015

2

作物研
究所

19

20

21

22

qAC2, a novel QTL that interacts with Wx and controls the low amylose
content in rice (Oryza sativa L.)

①

②

①

①

23

①

24

①

農業生
物資源
研究所

Yoko Takemoto-Kuno, Hiroki
Mitsueda, Keitaro Suzuki,
Hideyuki Hirabayashi, Osamu
Ideta, Noriaki Aoki, Takayuki
Theor Appl Genet. 128( 563Umemoto, Takuro Ishii, Ikuo
4) 573Ando, Hiroshi Kato, Hiroshi
Nemoto, Tokio Imbe,
Yoshinobu Takeuchi

2015

4

Uga Y., Kitomi Y., Ishikawa S.,
Yano M.

Breed. Sci.

65(2)1111192015

4

T. Yamamoto, T. Suzuki, K.
Suzuki, S. Adachi, J. Sun, M.
Yano, T. Ookawa, T. Hirasawa

Plant Sci

242

2702772016

1

Kiyosumi Hori, Keitaro
Suzuki, Ken Iijima, Kaworu
Ebana

Breed. Sci.

66(2)309318

2016

4

2016

6

2016

7

Genetic improvement for root growth angle to enhance crop production

農業生 Detection of QTL for exudation rate at ripening stage in rice and its
物資源 contribution to hydraulic conductance
研究所、
東京農
工大学、
他
次世代 Variation in cooking and eating quality traits in Japanese rice germplasm
作物開 accessions
発研究
セン
ター、農
業生物
資源研
究所、作
物研究
所
農研機 Hd18, encoding histone acetylase related to Arabidopsis FLOWERING
構 次世 LOCUS D, is involved in the control of flowering time in rice.
代作物
開発研
究セン
ター
東京農 Precise estimation of genomic regions controlling lodging resistance using
工大学、 a set of reciprocal chromosome segment substitution lines in rice
農業生
物資源
研究所、
他

4

Shibaya T, Hori K, OgisoTanaka E, Yamanouchi U,
1828
Shu K, Kitazawa N, Shomura Plant Cell Physiol 57(9) A, Ando T, Ebana K, Wu J,
1838
Yamazaki T, Yano M
Ookawa T, Aoba R,
Yamamoto T, Ueda T, Takai
T, Fukuoka S, Ando T,
Adachi S, Matsuoka M,
6(30Ebitani T, Kato Y, MulsantiSci Rep.
1-12
572)
IW, Kishii M, Reynolds M,
Pinera F, Kotake T, Kawasaki
S, Motobayashi T, Hirasawa
T

25

26

27

①

①

①

28

①

29

①

30

②

31

②

32

②

次世代 ゲノム情報を活用した日本水稲の品質や食味を制御する遺伝子の探索
作物開
発研究
センター
農研機 Fine Mapping of Carbon Assimilation Rate 8, a Quantitative Trait Locus
構 次世 for Flag Leaf Nitrogen Content, Stomatal Conductance and
代作物 Photosynthesis in Rice
開発研
究セン
ター, 東
京農工
大学
Characterization of a genomic region that maintains chlorophyll and東京農 nitrogen contents during ripening in a high-yielding stay-green rice
工大学、 cultivar
農研機
構
東京農 A quick determination of root resistance to water transport in paddy rice.
工大学、
農研機
構
Leaf photosynthetic rate and mesophyll cell anatomy changes during
東京農 ontogenesis in backcrossed indica x japonica rice inbred lines
工大学
農研機 Genetic dissection of agronomically important traits in closely related
構 次世 temperate japonica rice cultivars.
代作物
開発セン
ター
農研機 A novel QTL associated with rice canopy temperature difference affects
構 次世 stomatal conductance and leaf photosynthesis
代作物
開発セン
ター
農研機 A near-isogenic rice line carrying a QTL for larger leaf inclination angle
構 次世 yields heavier biomass and grain
代作物
開発セン
ター

5

堀清純

日本食品科学工学 63(1 484会誌
0) 4872016

11

Adachi S, Yoshikawa K,
Yamanouchi U, Tanabata T,
Sun J, Ookawa T, Yamamoto Front Plant Sci
T, Sage RF, Hirasawa T,
Yonemaru J.

8

60

2017

1

Yamamoto, T., Suzuki, T.,
Suzuki, K., Adachi, S., Sun, J., Field Crops
ResearchYano, M., Ookawa, T.,
Hirasawa, T.

206

54

2017

3

Adachi, S., Ookawa, T.,
Hirasawa, T.

Plant Production
Science20(3) 273

2017

4

He W, Adachi S, Sage RF,
Ookawa T, Hirasawa T

Photosynth Res

134( 271)
38

2017

10

Kiyosumi Hori, Toshio
Yamamoto, Masahiro Yano

Breeding Science

67(5) 427

2017

11

Fukuda A, Kondo K, Ikka T,
Takai T, Tanabata T,
Yamamoto T

Breeding Science

in
pres
s

2018

in
pres
s

2018

San NS, Ootsuki Y, Adachi S,
Field Crops
Yamamoto T, Ueda T,
Tanabata T, Motobayashi T, Research
Ookawa T, Hirasawa T

（２）学会等発表（口頭またはポスター）
整理番
タイトル
号

発表者名

機関名

発行年

発行
月

育種学研究

2013

1

学会等名

1

山本敏央, 高井俊之, 安達俊輔, 田口
文緒, 荒井裕見子,
岩澤紀生, 吉永悟
志, 廣瀬咲子, 谷口洋二郎, 山内歌子,
多収イネ品種タカナリの持つ個葉光合成速度を増加させるＱＴＬ 呉健忠, 松本隆, 杉 農業生物資源研究所, 作物
本和彦, 近藤勝彦, 研究所, 東京農工大学の単離一家崇志, 安藤露,河野いづみ, 伊藤幸恵, 正村純彦, 大川泰一郎, 平沢正,矢野昌裕, 近藤始彦

2Identification and pyramiding of quantitative trait loci for therate of leaf photosynthesis in rice

Adachi S, Baptista
L, Murata K,
東京農工大学, 農業生物資
Yamamoto T,
源研究所
Ebitani T, Ookawa
T, Hirasawa T

Plant Genetics andBreeding
Technologies

2013

2

3

Identification of chromosomal regions controlling leaf
photosynthetic rate in rice through the use of progeny of elitejaponica and high-yielding indica cultivars

Yamashita M, Takai
東京農工大学, 農業生物資
T, Yamamoto T,
Ookawa T, Yano M, 源研究所
Hirasawa T

Plant Genetics andBreeding
Technologies

2013

2

4

Molecular breeding of root system architectures for enhancing
drought avoidance in rice

宇賀優作

農業生物資源研究所

Annual workshop
for TARI-NTUIRRI collaboration

2013

2

農業生物資源研究所

日本作物学会春季
講演会 講演要旨
集 日本作物学会
紀事

2013

3

5

イネの深根性の根型育種と耐乾性

宇賀優作

6

6

鈴木惟史, 山本敏
イネの登熟期の葉の緑色程度の減少を抑制する量的形質遺伝
央, 鈴木健司, 安達 農業生物資源研究所, 東京
子座の検討 ―コシヒカリとアケノホシの組換え固定系統群にお俊輔, 大川泰一郎, 農工大学
ける出穂期の等しい系統を用いて―
矢野昌裕, 平沢正日本作物学会紀事

2013

3

7

タカナリを遺伝背景とするコシヒカリ染色体断片置換系統群を用 市原直登, 中江徹,
農業生物資源研究所, 大学
いて推定した光合成速度を高める量的形質遺伝子座の作用機 山本敏央, 大川泰院農学府一郎, 平沢正構

日本作物学会紀事

2013

3

8

大槻洋介, 山下雅
タカナリ対立遺伝子がコシヒカリ遺伝背景の水稲の葉身傾斜角 大, 山本敏央, 七夕 農業生物資源研究所, 東京
高也, 大川泰一郎, 農工大学
度を高める量的形質遺伝子座平沢正

日本作物学会紀事

2013

3

9

水稲における倒伏抵抗性に関与する強稈遺伝子座の推定－コ 岡庭侑香, 山本敏
農業生物資源研究所, 東京
シヒカリとタカナリの染色体断片置換系統および組換固定系統を 央, 平沢正, 大川泰
農工大学
一郎
用いて－

日本作物学会紀事

2013

3

10

細谷啓太, 新田洋
染色体断片置換系統を用いた白色不透明部を有する米粒の発 司, 浅木直美, 塩津
農業生物資源研究所
文隆, 氏家和広, 石
生回避機構の解析
丸健

日本作物学会第235回講演会要旨
集

2013

3

11

中江徹, 山本敏央,
第1染色体長腕のコシヒカリの対立遺伝子がタカナリを遺伝背景
上田忠正, 大川泰 農業生物資源研究所, 東京とする水稲の光合成速度を高める量的形質遺伝子座のマッピン
一郎, 矢野昌裕, 平 農工大学
グと作用機構沢正

日本作物学会紀事

2013

3

12

鈴木惟史, 山本敏
第2染色体長腕のアケノホシ対立遺伝子はコシヒカリ背景のイネ 央, 鈴木健司, 安達 農業生物資源研究所, 東京
俊輔, 大川泰一郎, 農工大学の水伝導度を高める
矢野昌裕, 平沢正日本作物学会紀事

2013

3

13

深根性遺伝子を活用した耐乾性イネ育種の可能性

第89回作物研究所
セミナー

2013

7

宇賀優作

農業生物資源研究所

7

14

DRO1, quantitative trait locus controlling root systemarchitecture, enhances drought avoidance in rice

Uga Y, K.
Sugimoto, S.
Ogawa, J. Rane, M.
Ishitani, N. Hara, Y.
Kitomi, Y. Inukai, K.
農業生物資源研究所
Ono, N. Kanno, H.
Inoue, J. Wu, T.
Matsumoto, T.
Takai, K. Okuno, M.
Yano

15

オーキシンにより制御される深根性QTLはイネの耐乾性を高め
る

宇賀優作

16

山本一洋, 山本敏
水稲の倒伏抵抗性を高める強稈関連形質の遺伝子座の推定― 央, 上田忠正, 杉山 農業生物資源研究所, 東京
知里, 岡庭侑香, 平 農工大学
コシヒカリとタカナリの正逆染色体断片置換系統群を用いて―
沢正, 大川泰一郎

日本作物学会第236回講演会要旨・
資料集

2013

9

17

細谷啓太, 新田洋
染色体断片置換系統を用いた白色不透明部を有する米粒の発司, 浅木直美, 塩津
農業生物資源研究所
生回避機構の解析 白色不透明部におけるデンプン蓄積構造の文隆, 小久保敏明,
品種・系統間差異
氏家和広, 石丸健

日本作物学会第236回講演会要旨
集

2013

9

18

國島 健, 藤城 靖
子, 中野 利哉, 武
イネにおける分げつ次位・節位と子実生産力の関連性に関わる
田 泰実, 石原 亮
遺伝学的研究太, 保浦 徳昇, 北
野 英己

名古屋大学

日本育種学会第第124回講演会講演
要旨集 育種学研
究

2013

10

19

イネの耐乾性向上をめざした国際連携によるゲノム育種

宇賀優作

農業生物資源研究所

日本育種学会秋季
講演会 講演要旨
集育種学研究

2013

10

20

イネの長穂性を制御するqPrl5 の解析

保浦徳昇, 安藤考紀, 藤城靖子, 池田
真由子, 松岡 信, 名古屋大学
土井一行, 北野英己

日本育種学会第第124回講演会講演
要旨集 育種学研
究

2013

10

21

イネの穂における維管束の数と横断面積の品種間差異

太田自由, 保浦徳昇, 池田真由子, 北 名古屋大学
野英己

日本育種学会中部地区談話会第21回
講演会

2013

10

農業生物資源研究所

8InterDrought4

2013

9

第86回日本生化学
会大会

2013

9

22

23

イネ第4染色体に見出した新規な深根性QTL、DRO2

宇賀優作, 山本英司, 菅野徳子, 河合 農業生物資源研究所, 野菜
佐和子, 水林達実, 茶業研究所
福岡修一

日本育種学会秋季
講演会 講演要旨
集育種学研究201310

コシヒカリ突然変異体における収量関連形質の変異當山恒顕, 北野英名古屋大学
己

日本育種学会第第124回講演会講演
要旨集 育種学研
究

2013

10

農業生物資源研究所創立30周年記念
シンポジウム 最新
アグリバイオテクノ
ロジーが開く新しい
世界－期待される
食・農・新産業への
貢献－

2013

10

2013

10

日本育種学会第124回講演会 講演
要旨集 育種学研
究

2013

10

24

新しい育種素材の開発に向けたイネゲノム情報の利用

山本敏央

農業生物資源研究所

25

水稲苗立ちにおける低温耐性を高める「阿波赤米」由来の‘qESS11b’のファインマッピング

山口琢也, 表野元
富山県農林水産総合技術セ 日本育種学会第保, 伊山幸秀, 森川
ンター
124回講演会
真紀子, 蛯谷武志

26

後藤元, 堀清純, 米
水稲品種「つや姫」の全ゲノムシークエンスと有用遺伝子近傍領 丸淳一, 山本敏央, 山形県農業総合研究セン
西村真紀子, 西尾 ター, 農業生物資源研究所
域の由来
剛, 中場勝27

丸山甲晃, 伊山幸日本育種学会第水稲品種コシヒカリを遺伝背景とする強稈関連量的形質遺伝子 秀, 蛯谷武志, 小林 富山県農林水産総合技術セ
124回講演会要旨俊也, 平沢正, 大川 ンター, 東京農工大学
座の集積
集
泰一郎

2013

10

28

藤城靖子, 保浦 徳
昇, 石原 亮太, 武
超多粒性イネを用いた穂の高次分枝を制御するqSRN7 のファイ
田 泰実, 國島 健, 名古屋大学, 他
ンマッピング池田 真由子, 経塚
淳子, 北野 英己

2013

10

9

日本育種学会第第124回講演会講演
要旨集 育種学研究

日本イネ在来品種と育成品種における食味関連形質および品
種間差異

堀清純, 鈴木啓太
農業生物資源研究所, 作物郎, 江花薫子, 矢野研究所
昌裕

日本育種学会第123回講演会 講演
要旨集 育種学研
究

2013

10

30

DRO2, quantitative trait locus controlling deep rooting on
chromosome 4 detected in three rice mapping populations

Uga Y, E.
Yamamoto, N.
Kanno, S. Kawai, T. 農業生物資源研究所
Mizubayashi, S.
Fukuoka

7th International
Rice Genetics
Symposium

2013

11

31

Estimation of the locus for the traits associated with a strong
culm, using reciprocal chromosome segment substitution lines
derived from the cross between rice varieties, Koshihikari and
Takanari

Kazuhiro
Yamamoto, Toshio
Yamamoto, Chisato
東京農工大学Sugiyama, Tadashi
Hirasawa, Taiichiro
OokawaThe 7th Rice
Genetics
Symposium
Abstract

2013

11

32

Genetic improvement of root system architectures to enhancedrought avoidance in rice

宇賀優作

農業生物資源研究所

7th International
Rice Genetics
Symposium

2013

11

33

Identification and characterization of QTL involving rate ofphotosynthesis in high yielding rice

Toshiyuki Takai

作物研究所

7th Intenational
Rice Genetics
Symposium, Book
of Abstracts

2013

11

34

QTL analysis for higher order branching of panicle in riceincreasing grain number.

Yasuko Fujishiro,
Hobo Tokunori,
Mayuko Ikeda,
Hidemi Kitano

名古屋大学

7th International
Rice Genetics
Symposium, Final
program andabstract book

2013

11

35

鈴木惟史, 山本敏
アケノホシの染色体断片をコシヒカリ遺伝背景イネの第2染色体 央, 安達俊輔, 大川 農業生物資源研究所, 東京
泰一郎, 矢野昌裕, 農工大学に置換した系統の水伝導度と気孔伝導度
平沢正

日本作物学会第102回関東支部講
演会

2013

12

29

10

36

コシヒカリ／タカナリ染色体断片置換系統群を用いた水稲の倒伏抵抗性に関与する形質のQTLの推定

青羽遼, 山本敏央,
農業生物資源研究所, 東京
平沢正, 大川泰一
農工大学郎

日本作物学会関東
支部会報

2013

12

37

山下雅大, 山本敏
タカナリの染色体断片をコシヒカリ遺伝背景イネの第10染色体に 央, 上田忠正, 七夕 農業生物資源研究所, 理化
高也, 大川泰一郎, 学研究所, 東京農工大学
置換した系統の光合成速度と乾物生産
平沢正

日本作物学会第102回関東支部会

2013

12

38

深根性遺伝子を活用した耐乾性作物の開発

2013植物科学シン
ポジウム

2013

12

39

水稲の光合成速度を高める第10染色体に座上する量的形質遺 山下雅大, 山本敏
農業生物資源研究所, 東京
伝子座(QTL)の作用機構―コシヒカリとタカナリの組換え固定系 央, 上田忠正, 大川
農工大学
泰一郎, 平沢正統を用いて―

日本作物学会第102回関東支部講
演会

2013

12

40

Cloning of a QTL increasing leaf photosynthesis rate in rice

Plant and Animal
Genome XXII
Conference, Book
of Abstracts

2014

1

41

山口 琢也, 伊山 幸
日本育種学会第秀, 杉本 和彦, 表
富山県農林水産総合技術セ 125回講演会 講演‘qESS11b’に穂発芽耐性遺伝子を集積することによって低温苗
野 元保, 藤田 健
ンター, 農業生物資源研究所 要旨集 育種学研
立性と穂発芽耐性は両立できる司, 村田 和優, 蛯
究
谷 武志

2014

3

42

イネの穂を走行する維管束の横断面積と着粒数との関係

宇賀優作

農業生物資源研究所

Toshiyuki Takai,
Toshio Yamamoto, 作物研究所
Tadashi Hirasawa

名古屋大学

日本育種学会第125回講演会

2014

3

43

コシヒカリ/Oryza rufipogon染色体断片置換系統群から単離され稲垣言要
た疎植条件下で多分げつ化する系統の解析

農業生物資源研究所

日本育種学会第125回講演会 講演
要旨集 育種学研
究

2014

3

44

Genetic improvement of root growth angle has a positive impact
Uga Y.
for drought avoidance in rice

農業生物資源研究所

GRiSP workshop‘Roots for the
future’

2014

5

北野英己

11

45

Prospects of breeding by design for root system architecturesin crops

Uga Y.

農業生物資源研究所

Rhizopolis lecture

2014

5

46

「外国稲由来の圃場苗立ち性に関する遺伝解析」

岩田夏子

ホクレン農業総合研究所

第３回北海道イネ
研究会

2014

7

47

根系形態の遺伝的制御による干ばつ耐性イネ品種の開発

宇賀優作

農業生物資源研究所

2014イネ分子遺伝学ワークショップ

2014

7

48

Analysis of QTLs for strong culm traits, using reciprocal
chromosome segment substitution lines derived from the crossbetween rice varieties, Koshihikari and Takanari

K. Yamamoto, T.
Yamamoto, C.
Sugiyama, T.
Hirasawa, T.
Ookawa

東京農工大学The 9th Asian
Crop Science
Conference

2014

9

49

木富悠花, 山本英司, 菅野徳子, 河合
DRO3、DEEPER ROOTING 1の遺伝経路上に見出されたイネ第7佐和子, 水林達実, 農業生物資源研究所
染色体の根伸長角度QTL
福岡修一, 宇賀優作

第126回講演会日本育種学会 育種学研究 16(別2)

2014

9

The 9th Asian
Crop Science
Conference

2014

9

The 9th Asian
Crop Science
Conference

2014

9

2014

9

T. Kobayashi, R.
Aoba, T.
Yamamoto, T.
Takai, C. Sugiyama,
東京農工大学K. Yamamoto, T.
Hattori, M.
Vazirzanjani, T.
Hirasawa, T.
Ookawa50

Estimation of quantitative trait loci associated with lodging
resistance using a set of reciprocal chromosome segment
substitution lines derived from crosses between rice varieties
Koshihikari and Takanari

51

T. Ookawa, T.
Kobayashi, T.
New approach for improving the lodging resistance in rice using
Ebitani, T.
superior alleles of strong culm genes in natural variants.
Yamamoto, T.
Hirasawa

52

イネの粒厚を高め収量性に寄与するQTLのマッピング

東京農工大学, 富山県農林水産総合技術センター

山口 琢也, 表野元
保, 田口文緒, 伊山 富山県農林水産総合技術セ 日本育種学会第126回講演会
幸秀, 藤田健司, 蛯 ンター
谷 武志

12

53

インド型多粒イネ「VT-101」を用いた穂の分枝構造に関するQTL
北野英己
解析

名古屋大学

氏家和広, 石丸健 農業生物資源研究所

日本育種学会第126回講演会

20149

日本作物学会第38回講演会 講演要
旨集日本作物学会
紀事

2014

9

2014

9

54

コシヒカリ、IR64の収量性に対するsd-1及びGS3の影響

55

コシヒカリ/Oryza rufipogon染色体断片置換系統群から単離され稲垣言要
た疎植条件下で多分げつ化する系統の解析(2)

農業生物資源研究所

日本育種学会第126回講演会 講演
要旨集 育種学研
究

56

河合佐和子, 木富悠花, 菅野徳子, 水
農業生物資源研究所
異なる根伸長角度を示すイネ3品種から見出された深根性QTLs
林達実, 福岡修一,
宇賀優作

第126回講演会日本育種学会 育種学研究 16(別2):

2014

9

57

超多粒性イネの穂における高次分枝を制御するqSRN7の解析

北野英己

名古屋大学

日本育種学会第126回講演会

2014

9

58

米の食味、成分、品質に関する遺伝子の単離と機能解析

堀 清純

農業生物資源研究所

第41回食品の物性に関するシンポジ
ウム

2014

9

2014

11

59

Genetic control of root system architecture improves drought
avoidance in rice

Uga Y.

農業生物資源研究所

International
Workshop on Plant
Water StressResponses andWater-Use
Efficiency

60

ゲノム育種による環境オンデマンドな根系改良

宇賀優作

農業生物資源研究所

インターゲノミクス
セミナー

2014

11

61

中村麻由美, 山本竜也, 堀川実穂, 林
コシヒカリの米粒を大きくする事で収量増加を狙う突然変異育種 猛, 中岡史裕, 小林 福井県立大学
麻子, 冨田桂, 三浦
孝太郎, 岩崎行玄

コシヒカリ一族サ
ミット

2014

11

13

62

鈴木浩貴, 松木美
水稲の強稈性に関与する太稈，強稈質関連形質の量的形質遺紗, 山本敏央, 上田
東京農工大学, 他
伝子座解析 －リーフスターとコシヒカリの組換え自殖系統を用い
忠正, 平沢正, 大川て－泰一郎

日本作物学会関東
支部第103回講演
会

2014

12

63

服部智宏, 山本敏
水稲の倒伏抵抗性に関わる強稈質関連形質の量的形質遺伝子
央, 青羽遼, 平沢 東京農工大学, 他
座の推定 ―コシヒカリとタカナリの組換え固定系統を用いて―正, 大川泰一郎

日本作物学会関東
支部第103回講演
会

2014

12

64

粒形遺伝子TGW6の導入によるコシヒカリ特性改良の試み

氏家和広, 石丸健 農業生物資源研究所

日本作物学会関東
支部会報

2014

12

65

A Takanari (indica) genome segment on chromosome 3
increases dry matter production and grain yield as well as leaf
inclination angle in rice with a Koshihikari (japonica) genetic
background

Nan Su San,
Otsuki Y,
Yamamoto T, Ueda 東京農工大学, 農業生物資
源研究所
T, Tanabata T,
Ookawa, Hirasawa
T

第８回アジア作物
学会議

2014

9

66

Hirasawa T,
A Takanari (indica) genome segment which increases dry matterYamashita M,
東京農工大学, 農業生物資
production and grain yield as well as the rate of leaf
Yamamoto T, Ueda
源研究所
photosynthesis in rice with a Koshihikari (japonica) genetic
T, Otsuka C,
background
Ookawa T

第８回アジア作物
学会議

2014

9

67

A Takanari genome segment on chromosome 4 increases leaf
inclination angle, dry matter production and grain yield of ricewith a Koshihikari genetic background

Nan S.S, Otsuki Y,
Yamamoto T, Ueda
東京農工大学, 農業生物資
T, Tanabata T,
源研究所
Ookawa T,
Hirasawa

日本作物学会第238回講演会

2014

9

68

Characterization of a Koshihikari (japonica) allele located on
chromosome 1 that increases the leaf photosynthesis rate ofrice with a Takanari (indica) genetic background

Atobe M, Nakae T,
Yamamoto T, Ueda
東京農工大学, 農業生物資
T, Adachi S,
源研究所
Ookawa T,
Hirasawa T

第８回アジア作物
学会議

2014

9

14

69

Estimation and characterization of quantitative trait loci that
increase the rate of leaf photosynthesis of a rice cultivar thathas been known as rice having the highest recorded rate ofphotosynthesis

Ochiai T, Adachi S,
Yamamoto T, Ueda 東京農工大学, 農業生物資源研究所
T, Ookawa T,
Hirasawa T

第８回アジア作物
学会議

2014

9

70

福田篤徳, 近藤勝
イネの葉面温度QTLの染色体断片置換系統を用いたポット試験 彦, 七夕高也, 安達
農業生物資源研究所, 他
俊輔, 矢野昌裕, 山による特性評価
本敏央

日本育種学会第125回講演会

2014

3

71

鈴木惟史, 山本敏
コシヒカリ遺伝背景イネの老化過程における光合成速度の低下 央, 安達俊輔, 大川 農業生物資源研究所, 東京を抑制する第3染色体短腕のアケノホシ染色体断片の作用機構 泰一郎, 矢野昌裕, 農工大学
平沢正

日本作物学会第237回講演会

2014

3

72

登熟期に高い光合成能力を示す水稲品種アケノホシが持つ水伝導度と葉色維持に関わるＱＴＬの特性

山本敏央, 鈴木惟史, 鈴木健司, 安達 農業生物資源研究所, 東京
俊輔, 大川泰一郎, 農工大学
平沢正, 矢野昌裕

日本育種学会第126回講演会

2014

9

73

山下雅大, 山本敏
葉の光合成速度を高めるタカナリ対立遺伝子を第10染色体に持 央, 上田忠正, 大塚 農業生物資源研究所, 東京
千夏子, 大川泰一 農工大学
つコシヒカリ遺伝背景イネの乾物生産と収量郎, 平沢正日本作物学会第237回講演会

2014

3

74

Optimization of Seed Germinability for Direct Seeding By
Stacking QTLs in Rice

Takuya Yamaguchi,
Yukihide Iyama,Kazuhiko Sugimoto,富山県農林水産総合技術セMotoyasu
ンター
Omoteno, Kenji
Fujita, Kazumasa
Murata, Takeshi
Ebitani

Plant and Animal
Genome XXIII
Conference, Book
of Abstracts

2015

1

Research to dramatically improve rice leaf photosynthesis withmarker assisted selection

Adachi S, Ochiai T,
Ao R, Takai T,
東京農工大学, 農業生物資
Kondo M,
源研究所
Yamamoto T,
Hirasawa T

Plant & Animal
Genome XXIII
Conference

2015

1

75

15

水鳥 希洋人, 山口
富山県農林水産総合技術セ 第56回日本植物生
琢也, 山田 哲也,
ンター, 東京農工大学
理学会
金勝 一樹

76

qLTG3-1を持つ準同質遺伝子系統を用いた低温条件下で吸水させた種子のプロテオーム的解析

77

落合隆行, 安達俊
コシヒカリ対立遺伝子がタカナリ遺伝背景イネの光合成速度を高 輔, 山本敏央, 上田 農業生物資源研究所, 東京
忠正, 大川泰一郎, 農工大学
めるQTLの推定と作用機構
平沢正

2015

3

日本作物学会紀事

2015

3

78

光合成速度を高める量的形質遺伝子座(QTL)を集積した水稲の 跡部雅史, 安達俊
葉の光合成速度および子実・乾物生産特性－日本型品種コシヒ 輔, 青莉紗子, 山本 東京農工大学, 農業生物資
カリ染色体断片をインド型品種タカナリの第1染色体と第7染色体 敏央, 上田忠正, 大 源研究所
川泰一郎, 平沢正に置換した水稲を用いて－

日本作物学会紀事

2015

3

79

光合成速度を高める量的形質遺伝子座(QTL)を集積した水稲の 青莉紗子, 跡部雅
葉の光合成速度と子実・乾物生産特性－日本型品種コシヒカリ 史, 安達俊輔, 山本 東京農工大学, 農業生物資
染色体断片をインド型品種タカナリの第7染色体の短腕側と長腕 敏央, 上田忠正, 大 源研究所
川泰一郎, 平沢正側に置換した水稲を用いて－

日本作物学会紀事

2015

3

80

ゲノム情報を活用した日本水稲の品質や食味を制御する遺伝子
堀清純
の探索.

日本食品科学工学会第62回大会

2015

8

イネの着粒数に関わるqSRN7による着粒構造制御の解析

保浦徳昇, 藤城靖子, 石原亮太, 太田
自由, 國島健, 縣 名古屋大学, 他
歩, 池田真由子, 経
塚淳子, 北野英己

日本育種学会第128回講演会 講演
要旨集 育種学研
究

2015

9

インド型多粒イネ「VT-101」の穂形質を特徴付けるQTLの同定

太田自由, 保浦徳昇, 當山恒顕, 安藤
考紀, 縣歩美, Tran
名古屋大学
Dang Xuan, Tran
Dang Khanh, Le
Hung Linh, 北野英
己

日本育種学会 第128回講演会 講演
要旨集 育種学研
究

2015

9

81

82

農業生物資源研究所

16Tadashi Hirasawa,
Chikako Otsuka,
Masahiro
東京農工大学, 農業生物資
Yamashita, Toshio
源研究所
Yamamoto,
Tadamasa Ueda,
Taiichiro Ookawa

International
Society of Root
Research, 9thInternational
Symposium

2015

10

83

Characterization of a quantitative trait locus for increasing
hydraulic conductance of rice84

中西愛, 青莉紗子,
小島安裕, 古川航インド型水稲品種タカナリと日本型品種コシヒカリの個葉光合成大, 大塚千夏子, 大 東京農工大学
特性の解析―特に葉内のCO2拡散に注目して―
川泰一郎, 平沢正,
安達俊輔

日本作物学会関東
支部第104回講演
会

2015

12

85

大塚千夏子, 安達
俊輔, OwusuAnsah Beatriceインド型水稲品種タカナリの第10染色体領域を日本型水稲品種 Joy, 青莉紗子, 小 農業生物資源研究所, 東京
島安裕, 中西愛, 古 農工大学
コシヒカリに置換した系統の光合成速度が高くなる要因
川航大, 山本敏央,
上田忠正, 大川泰一郎, 平沢正日本作物学会関東
支部第104回講演
会

2015

12

2015

12

2015

12

86

水稲における強稈関連形質の量的形質遺伝子座の集積効果

吉村大, 蛯谷武志,
日本作物学会関東
伊山幸秀, 平沢正, 富山県農林水産総合技術セ
支部第104回講演
安達俊輔, 大川泰 ンター, 東京農工大学
会
一郎

87

水稲の強稈性に関わる皮層繊維組織を厚くする量的形質遺伝
子座の特定―タカナリを遺伝背景とするコシヒカリ第2, 9染色体の組換え固定系統を用いて―

神山遼, 山本敏央,
上田忠正, 福岡修
農業生物資源研究所, 東京
一, 安藤露, 平沢
農工大学
正, 安達俊輔, 大川泰一郎

17

日本作物学会関東
支部第104回講演会

88

青莉紗子, 安達俊輔, 落合隆行, 跡部
多収性インド型水稲品種タカナリの個葉光合成速度の向上に関雅史, 大塚千夏子, 東京農工大学, 農業生物資
わる日本型品種コシヒカリに由来する5つのQTL領域の作用機児玉明日香, 山本 源研究所
構敏央, 上田忠正, 大川泰一郎, 平沢正日本作物学会関東
支部第104回講演
会

2015

12

89

第一染色体長腕側に葉身傾斜角度に関わるQTLをもつ染色体
断片置換系統の成長と乾物生産

鈴木佳純, 安達俊輔, 山本敏央, 上田 農業生物資源研究所, 東京
忠正, 大川泰一郎, 農工大学
平沢正

日本作物学会関東
支部第104回講演
会

2015

12

90

村本奈美, 安達俊輔, 鈴木惟史, 鈴木
東京農工大学, 農業生物資
登熟期の葉の老化を抑制する遺伝子座の推定,―コシヒカリ，ア健司, 近藤勝彦, 山
源研究所
ケノホシに由来する染色体断片置換系統群(CSSLs)を用いて―
本敏央, 大川泰一郎, 平沢正日本作物学会関東
支部第104回講演
会

2015

12

2016

3

山口琢也, 溝淵律
日本育種学会第子, 福岡修一, 田口
富山県農林水産総合技術セ
129回講演会 講（塩原）文緒, 北澤
ンター、農研機構
演要旨集
則之, 伊山幸秀, 藤田健司, 蛯谷武志91「コシヒカリ」型のqGTH3は収量性の向上に貢献する92

竹本陽子, 平林秀
次世代作物開発研究セン
イネのアミロース含有率に関与するqAC2の登熟温度に対する効介, 石井卓朗, 山口ター
果誠之, 竹内善信

日本育種学会第129回講演会

2016

3

93

青莉紗子, 中西愛,
コシヒカリ対立遺伝子が光合成速度を高める量的形質遺伝子座 小島安裕, 安達俊(QTL)を集積したタカナリを遺伝背景とする水稲の光合成速度と 輔, 山本敏央, 上田 東京農工大学、農研機構
忠正, 大川泰一郎,
乾物および子実生産平沢正

日本作物学会第241回講演会

2016

3

18

94

柴谷多恵子, 堀清純, 小木曽映里, 山
日本育種学会第内歌子, 朱紅加, 北農研機構 次世代作物開発研
シロイヌナズナFLDのイネ相同遺伝子Hd18の単離と開花時期制
129回講演会 育種
澤則之, 正村純彦,
究センター
御への関与
学研究
安藤露, 江花薫子,
呉健忠, 山崎俊正,
矢野昌裕

2016

3

95

佐伯研一, 遠藤貴
宮城県古川農業試験場、山 日本育種学会第宮城県と山形県におけるイネ出穂期遺伝子Hd1，Hd16，Hd18の 司, 中込佑介, 阿部
形県農業総合研究センター、 129回講演会 講
洋平, 溝淵律子, 水
出穂特性評価演要旨集
農研機構
林達実, 福岡修一

2016

3

96

古川航大, 青莉紗子, 大塚千夏子, 中
水稲の個葉光合成速度に関わるタカナリ型GPSアリルを有する 西愛, 小島安裕, 高
東京農工大学井俊之, 大川泰一
コシヒカリ準同質遺伝子系統の光合成特性郎, 平沢正, 安達俊輔

日本作物学会第241回講演会

2016

3

97

水稲の個葉光合成速度に関わる自然変異遺伝子CAR8の生理学的作用機構の解析

吉川和萌, 安達俊輔, 七夕高也, 大川
東京農工大学、農研機構
泰一郎, 米丸淳一,
平沢正

日本作物学会第241回講演会

2016

3

98

大塚千夏子, 安達俊輔, 吉川和萌, 山
第１０染色体長腕にコシヒカリの光合成速度を高めるタカナリ対
本敏央, 上田忠正, 東京農工大学、農研機構
立遺伝子を有する準同質遺伝子系統の水分生理特性
大川泰一郎, 平沢正

日本作物学会第241回講演会

2016

3

99

安達俊輔, 吉川和萌, 山内歌子, 七夕
Map-based cloning of Carbon Assimilation Rate 8 that increases 高也, Jian Sun, 山
東京農工大学、農研機構
本敏央, Rowan
CO2 assimilation rate in rice
Sage, 平沢正, 米丸
淳一

European
Networks
Conference on
Algal and Plant
Photosynthesis

2016

4

19

100

ごはんの「おいしさ」の違いをCE-TOFMS解析で探る

堀清純

次世代作物開発研究セン
ター

日本食品科学工学会第63回大会

2016

8

101

イネの量的形質の選抜マーカーの開発の現状について

山本敏央

農研機構

園芸学会平成28年度秋季大会公開シ
ンポジウム

2016

9

寒地におけるイネ圃場苗立ち性に関するQTLの効果検証

岩田夏子, 西村努,
平山裕治, 佐藤毅, ホクレン、道総研上川農試
乕田淳史

日本育種学会第130回講演会 講演
要旨集 育種学研
究

2016

9

非破壊的な手法を用いたイネの穂の形質評価の試み

保浦徳昇, 太田自由, 縣 歩美, 北野 名古屋大学
英己

日本育種学会第130回講演会講演
要旨集 育種学研
究

2016

9

104

イネの穂構造を制御するAPO1アリルの探索

太田自由, 保浦徳昇, 安藤考紀, 石原亮太, 縣歩美, 池田 名古屋大学
真由子, 土井一行,
北野英己

日本育種学会中部地区談話会第24回
講演会

2016

11

105

小島安裕, 青莉紗子, 大塚千夏子, 寺
コシヒカリ対立遺伝子が多収インド型品種タカナリに対して光合 崎千鶴, 上田忠正,
東京農工大学、農研機構
山本敏央, 大川泰
成速度を高める第3染色体QTLの光合成関連形質の解析一郎, 平沢正, 安達俊輔

日本作物学会第105回関東支部講
演会

2016

12

106

釜洞瑛里, 蛯谷武
異なる水稲品種に由来する強稈遺伝子の組合せが強稈関連形 志, 伊山幸秀, 安達 東京農工大学、富山県農林俊輔, 平沢正, 大川 水産総合技術センター
質の集積効果に及ぼす影響泰一郎

日本作物学会関東
支部第105回講演
会

2016

12

102

103

20

107

川辺裕也, 山本敏
水稲の強稈性に関連する皮層繊維組織の厚さに関わる量的形
央, 上田忠正, 安達 東京農工大学、次世代作物
質遺伝子座の同定－タカナリを遺伝背景にもつコシヒカリ第2, 9
俊輔, 平沢正, 大川 開発研究センター
染色体の組換え固定系統を用いて－
泰一郎

日本作物学会関東
支部第105回講演
会

2016

12

108

田原佳奈子, 山本
水稲の倒伏抵抗性に関与する極強稈関連形質の量的遺伝子座
敏央, 上田忠正, 安 東京農工大学、次世代作物解析―高バイオマス長稈系統TAT-26とタカナリのF2分離集団を達俊輔, 平沢正, 大 開発研究センター
用いて―
川泰一郎

日本作物学会関東
支部第105回講演
会

2016

12

109

寺崎千鶴, 青莉紗子, 大塚千夏子, 小多収水稲品種タカナリの個葉光合成速度を高める第１染色体コ 島安裕, 上田忠正,
東京農工大学、農研機構
山本敏央, 大川泰
シヒカリ染色体領域の生理学的作用
一郎, 平沢正, 安達俊輔

日本作物学会第105回関東支部講
演会

2016

12

110

Tadashi Hirasawa,
Takayuki Ochiai,
Risako Ao,
Yasuhiro Kojima, Ai
Quantitative Trait Loci for Enhancing Photosynthesis in
Progeny of Rice ‘Takanari’ × Koshihikari’ and Effects of Their Nakanishi, Toshio 東京農工大学、農研機構
Yamamoto,
Pyramiding
Tadamasa Ueda,
Taiichiro Ookawa,Shunsuke Adachi

14th International
Symposium on
Rice Functional
Genomics

2016

9

111

井手康人、堀清純、伊藤晃、杉浦
早生遺伝子を導入した「あいちのかおりSBL」準同質遺伝子系統
和彦、濱頭葵、加の育成と形質評価
藤満、野々山利博、中嶋泰則愛知県農業総合試験場、農
日本育種学会第研機構次世代作物開発研究
131回講演会
センター

2017

3

112

太田自由・保浦徳
日本育種学会第昇・安藤考紀・石原名古屋大学生物機能開発利 131回講演会 講
イネの穂の1次枝梗長制御遺伝子qPBL6における準同質遺伝子
亮太・縣歩美・池田
演要旨集 育種学
用研究センター系統を用いた機能解析
真由子・土井一行
研究
1・北野英己

2017

3

21

113

青莉紗子・中野瑠
水稲品種コシヒカリの対立遺伝子がタカナリに対して光合成速度
璃・安達俊輔・岩田
東京農工大学、農研機構を高めるQTLの集積効果の解析－1~5個のQTLを有する系統を
洋佳・山本敏央・大用いて－川泰一郎・平沢正日本作物学会第243回講演会.

2017

3

114

中野瑠璃・青莉紗
水稲品種コシヒカリの対立遺伝子がタカナリに対して光合成速度 子・安達俊輔・山本
東京農工大学、農研機構を高めるQTL集積系統の乾物重，収量と収量構成要素の解析. 敏央・大川泰一郎・
平沢正

日本作物学会第243回講演会.

2017

3

115

水稲品種コシヒカリの個葉光合成速度を高める第4および第10染色体のタカナリ対立遺伝子を集積した系統の光合成特性.

大塚千夏子・安達俊輔・小島安裕・寺
崎千鶴・山本敏央・ 東京農工大学、農研機構
上田忠正・大川泰
一郎・平沢正日本作物学会第243回講演会

2017

3

116

日本水稲遺伝資源における炊飯米の食味関連形質のゲノムワ
イドアソシエーション解析.

堀清純, 米丸淳一,
鈴木啓太郎, 飯島健, 辻井良政, 小俣
農研機構 次世代作物開発
衣央梨, 仁木沙都
センター
美, 木村圭一, 朱紅加, 山崎将紀, 江花
薫子, 高野克己

日本育種学会

2017

3

117

釜洞瑛里。蛯谷武志、伊山幸秀、松 東京農工大学、名古屋大学、
日本作物学会第異なる水稲品種に由来する強稈遺伝子の組合せが強稈関連形
岡信、矢野憲司、 富山県農林水産総合技術セ
243回講演会.
質の集積効果に及ぼす影響
ンター
安達俊輔、平沢正、大川泰一郎

20173

Gordon Research
Conference CO2
Assimilation in
Plants from
Genome to Biome

2017

5

次世代作物開発研究センター主催シ
福岡県農林業総合試験場、
ンポジウム「競争福岡県農林水産部、次世代力の高い水稲品種
作物開発研究センター、農業開発に向けたDNA
環境変動研究センター
マーカー技術の活
用と連携」

2017

6

安達俊輔、平沢正、山本敏央、上東京農工大学、農研機構
田忠正、大川泰一
郎

118

QTL analysis and gene pyramiding for improvement of ricephotosynthesis

119

石橋正文、宮原克典、山口修、和田
ゲノムワイド・ジェノタイピングを用いたMASによるPb1、Stvb-iお卓也、宮崎真行、
よびosnramp5-2の効率的な導入
宇賀優作、福岡修
一、石川覚

22

120

121

122

123

124

125

126

次世代作物開発研究センター主催シ
高橋竜一、川本朋
秋田県農業試験場、農業環 ンポジウム「競争秋田106号のいもち病抵抗性およびカドミウム低吸収性の同時 彦、柴田智、加藤
境変動研究センター、次世代 力の高い水稲品種
和直、石川覚、福改良開発に向けたDNA
作物開発研究センター
岡修一、宇賀優作
マーカー技術の活用と連携」
阿部洋平、本間猛
農研機構シンポジ
俊、渡部貴美子、
ウム「競争力の高
中場勝、鈴木隆由 山形県農業総合研究セン
い水稲品種開発に
良食味品種「つや姫」の早生化の試み
輝、中場理恵子、 ター、農研機構次世代作物
向けたDNAマー
石塚和、後藤元、 開発研究センター
カー技術の活用と齋藤寛、堀清純、連携」
山本敏央
農研機構シンポジ
ウム「競争力の高
長野県農業試験場、農研機
高松光生、細井い水稲品種開発に複数の出穂期遺伝子を導入した耐冷性と高温耐性を有する系
淳、酒井長雄、堀 構次世代作物開発研究セン
向けたDNAマー
統の育成
ター
清純
カー技術の活用と連携」
農研機構シンポジ
ウム「競争力の高
井手康人、伊藤愛知県農業総合試験場、農い水稲品種開発に
早生化遺伝子を導入した「あいちのかおりSBL」準同質遺伝子系 晃、杉浦和彦、濱研機構次世代作物開発研究
向けたDNAマー
頭葵、加藤満、堀統の育成
センター
カー技術の活用と清純
連携」
Nomura, T.,
Yamamoto, T.,
Analysis on the quantitative trait loci for the strong-culm and
The 9th Asian
Ueda, T.,yield associated traits in rice, using F2 populations derived from
Crop Science
Yonemaru, J., Abe, 東京農工大学
a cross between the super thick-culm and super grain-bearing
Conference
A., Adachi, S.,line LTAT-29 and TakanariHirasawa, T. andOokawa, T.
Mulsanti,
I.,Yamamoto, T.,
Estimation of the Quantitative trait loci Associated with
The 9th Asian
Breaking and Bending Types Lodging Resistance in Rice Using Ueda, T., Samadi,
東京農工大学
Crop Science
Chromosome Segment Substitution Lines Derived from a Cross A., Adachi,
Conference
S.,Hirasawa, T. andbetween Takanari and Koshihikari
Ookawa, T.
Identification of the quantitative trait loci for breaking andbending types lodging resistance in rice, using recombinant
inbred lines derived from Koshihikari and a Strong culm variety,
Leaf StarSamadi, A.,
Yamamoto, T.,
Ueda, T., Adachi,
S., Hirasawa, T.
and Ookawa, T.

23

東京農工大学The 9th Asian
Crop Science
Conference

2017

6

2017

6

2017

6

2017

6

2017

6

2017

6

2017

6

127

128

129

Ookawa, T.,
Kamahora, E.,
Ebitani, T.,
Development of the pyramiding lines with strong culm genes
東京農工大学
Yamaguchi, T.,
derived from crosses among the SCM near isogenic lines in rice
Murata, K., Iyama,Y., Ozaki, H. andAdachi, S.
Dry matter and grain production of a near-isogenic line carrying 平沢正, 安達俊輔、山本敏央、上a 'Takanari' (high yielding, indica) allele for increased leaf
東京農工大学、農研機構
inclination angle in rice with the ‘Koshihikari’ (japonica) genetic 田忠正、大川泰一
郎
background山口 琢也, 伊山 幸
低温土中出芽性と穂発芽耐性の集積による直播栽培向けコシヒ
秀, 杉本 和彦, 池 富山県農林水産総合技術セ
カリ系統の育成 ～ デザイン育種によってコシヒカリの直播適性
田 博一，蛯谷 武 ンター，農研機構を向上させる ～志福岡修一、山内歌
農研機構
子、江花薫子The 9th Asian
Crop Science
Conference

2017

6

第９回アジア作物
学会議

2017

6

農研機構主催シン
ポジウム「競争力の高い水稲品種開発に向けたDNA
マーカー技術の活
農研機構 次世代

2017

6

2017

6

作物開発研究セン
ター主催シンポジ
ウム 競争力の高130

ゲノム育種の加速に向けた育種基盤および技術開発

131

イネ縞葉枯病抵抗性を付与した「なすひかり」栃木IL31号の育成
伊澤由行
について

栃木県農業試験場

栃木県育種懇話会

2017

8

132

石橋正文、宮原克典、山口修、和田
ゲノムワイド・ジェノタイピングを用いたMASによるPb1、Stvb-iお卓也、宮崎真行、
よびosnramp5-2の効率的な導入
宇賀優作、福岡修
一、石川覚

福岡県農林業総合試験場、第80回 九州農業
福岡県農林水産部、次世代研究発表会（作物
作物開発研究センター、農業部会）
環境変動研究センター

2017

9

133

出穂期遺伝子Hd16、Hd18が福岡県における水稲の出穂期にお 石橋正文、宮原克
福岡県農林業総合試験場
よぼす影響
典、山口修

日本育種学会 第132回講演会

2017

10

134

石森裕貴・佐伯研一・遠藤貴司・佐藤
宮城県古川農業試験場，宮出穂期遺伝子Hd1，Hd16，Hd18をコシヒカリ型で保有する晩生系 浩子・中込佑介・溝城県庁，農研機構次世代作
淵律子・田口文緒・
統「東北229号」の育成
物開発研究センター
福岡修一・山内歌子・安藤露日本育種学会第132回講演会 育
種学研究

2017

10

24

135

西村卓真・吉田貴
宏・森 茂之・椎木
日本育種学会第ゲノム選抜育種により水稲早生品種「みずかがみ」へ出穂期遺 咲帆・日野耕作・山 滋賀県農業技術振興セン
ター・滋賀県庁農政水産部農 132回講演会 育伝子及び病害抵抗性遺伝子を導入した準同質遺伝子系統群の 田善彦・ 正村純
種学研究
彦・福岡修一・山内 業経営課・
形質評価
歌子・田口文緒・溝
淵律子

2017

10

136

太田自由・保浦徳
日本育種学会第昇・縣歩美・當山恒名古屋大学生物機能開発利 132回講演会 講
印度型多収イネ「VT-101」の着粒数に関するQTLの組み合わせ 顕・Dang Xuan
演要旨集 育種学
Tran、Dang Khanh 用研究センター
効果研究
Tran、Hung Linh
Le、北野英己

2017

10

137

野村知宏・山本敏
水稲の収量および倒伏抵抗性関連形質の量的形質遺伝子座解 央・上田忠正・米丸
析―極多着粒・極強稈系統LTAT-29とタカナリのF2分離集団を 淳一・阿部陽・高木 東京農工大学
宏樹・安達俊輔・平用いて―沢正・大川泰一郎

2017

10

2017

10

2018

3

2018

3

2018

3

138

139

140

141

日本育種学会第132回講演会要旨
集 育種学研究山口琢也、川原善
富山県農林水産総合技術セ
浩、仲條眞介、遠ンター、農研機構、岩手県農 日本育種学会第阿波赤米に由来する低温土中出芽性遺伝子は障害型耐冷性を
藤貴司、石森裕
業研究センター、宮城県古川 132回講演会
向上させる
貴、伊山幸秀、荘農業試験場
司和明
道満剛平、佐藤博
日本育種学会第一、平山裕治、佐133回講演会 講演
ゲノム選抜による北海道水稲品種へのいもち病抵抗性遺伝子 藤毅、藤田正平、
道総研上川農試
要旨集 育種学研
福岡修一、山内歌
pi21の高速導入と準同質遺伝子系統の評価
究子、田中淳一、米丸淳一
西村卓真 椎木咲帆・吉田貴宏・森
茂之・山田善彦・日日本育種学会第ゲノム選抜育種により水稲早生品種「みずかがみ」へ出穂期遺 野耕作
滋賀県農業技術振興セン
133回講演会 講演
伝子及び病害抵抗性遺伝子を導入した「滋賀80号」「滋賀81号」 正村純彦4・福岡修 ター・滋賀県庁農政水産部農要旨集 育種学研の育成
一4・山内歌子4・田 業経営課・究
口文緒４・溝淵律子
岩田夏子、 西村イネ圃場苗立ち性遺伝子座qSES11を導入した準同質遺伝子系
努、平山裕治、 乕 ホクレン、道総研上川農試
統の評価
田淳史

25

日本育種学会第133回講演会 講演
要旨集 育種学研
究

（３）出版図書
区分； ①出版著書、 ②雑誌（注）（１）学術論文に記載したものを除く、重複記載をしない。）、 ③年報、 ④広報誌、 ⑤その他
整理番
号

区分

著書名（タイトル）

1②

JATAFFジャーナル(ごく限られた品種しか持っていないイネ有用遺伝子TGW6の単離と利用)

2

②

3

著者名

機関名

出版社

発行 発行
年
月

農業生物資源研究所

公益社団法人農林
水産・食品産業技 2013
術振興協会

9

進研ゼミ高校講座・受験エンカレッジ生物10月号(干ば宇賀優作
つに強いイネをつくり発展途上国の農業に貢献)

農業生物資源研究所

ベネッセコーポレー
2013
ション

10

②

明日の食品産業(多収イネの光合成能力に貢献する
遺伝子の特定)農業生物資源研究所, 作物研究所

食品産業センター

2014

7

4

②

ニューカントリー(多収稲の光合成能力に貢献するGPS
山本敏央
遺伝子を発見)農業生物資源研究所

北海道協同組合通
2014
信社

8

5

②

光合成研究と産業応用最前線(作物の光合成速度を向上させる自然変異遺伝子の解明)

農研機構 作物研究所, 農業 株式会社エヌ・
生物資源研究所
ティー・エス

6②

BIO INDUSTRY(大型台風に負けない強稈性をもつ耐
大川泰一郎
倒伏性イネの開発)

7①

作物生産生理学の基礎(倒伏とそのメカニズム、作物生産生理学の基礎)（４）国内特許権等
整理番
特許権等の名称号

石丸健

山本敏央, 高井俊之

安達俊輔, 山本敏央

大川泰一郎

2014

12

東京農工大学

シーエムシー出版 201512

東京農工大学

農文教

10

2016

発明者

権利者
（出願人等）

機関名

特許権
等の種
類

番号

出願年月日

取得年月
日

発明者

権利者
（出願人等）

機関名

特許権
等の種
類

番号

出願年月日

取得年月
日

「該当無し」（５）国際特許権等
整理番
特許権等の名称号「該当無し」

26

出願国（６）報道等
区分；①プレスリリース、②新聞記事、③テレビ放映、④その他
区分

記事等の名称

掲載紙・放送社名等

掲載年

掲載月

掲載日

機関名

②

米の粒を長く重くするカサラスTGW6遺伝子
食品産業新聞
を発見

2013

4

22

農業生物資源研究所②

米粒長く重くする遺伝子インディカで特定

日本農業新聞

2013

4

16

農業生物資源研究所④

米粒の長さ、重さに関係新規遺伝子を発見 化学工業日報

2013

4

16

農業生物資源研究所②

高収量期待のイネ遺伝子特定

毎日新聞

2013

5

9

農業生物資源研究所②

収量高める育種に可能性

農業共済新聞

2013

5

15

農業生物資源研究所①

世界初、イネの干ばつ耐性を高める深根性遺伝子を発見- 干ばつに強い作物の開発に新たな道を開く -

2013

8

2

農業生物資源研究所、他②

日本経済新聞、日経産業新聞、日本農業新聞、化学工業
世界初、イネの干ばつ耐性を高める深根性
日報、日刊工業新聞、茨城新遺伝子を発見聞、毎日新聞、農業共済新聞、朝日新聞2013

85

農業生物資源研究所①

倒れにくいコシヒカリをつくる－茎を太くする
遺伝子の集積によるイネ品種の改良－

2013

10

7

日本育種学会②

遺伝情報：ゲノムの解読で進むイネ改良

2014

8

7

農業生物資源研究所①

大型台風に耐える最強のイネの謎を解明～
強稈性と低リグニン性の両立により食用、飼料、バイオマスエネルギー用新品種開発に
道を開く～

2014

10

10

東京農工大学③

Episode 5 The Technology: Japan'sInnovative Breakthroughs, Tackling Climate NHK World
Change

2014

12

12

農業生物資源研究所

毎日新聞

27

備 考

④

特A品種「とちぎの星」の話を中心に水稲研
地方ラジオ「ＣＲＴ栃木放送」
究室の業務、現在取り組んでいる有望系統の番組「ＮＯＳＡＩのひろば」（なすひかり準同質系統含む）について

2016

4

3

栃木県農業試験場①

イネの茎を強くし倒れにくくするゲノム領域を高精度に特定～スーパー台風に負けないイ
ネ品種の開発に道を開く～

2016

7

27

東京農工大学、農研機構次世代作物開発研究センター②

倒伏に強い領域 稲ゲノムで特定

2016

7

29

東京農工大学、農研機構

日本農業新聞（７）普及に移しうる成果
区分；①普及に移されたもの、製品化して普及できるもの、②普及のめどがたったもの、製品化して普及のめどがたったもの、③主要成果として外部評価を受けたもの
普及（製品化）
成果の名称
機関名
主な利用場面
普及状況
区分
年月

③

平成24年度日本育種学会奨励賞(イネの根の形態と構造に関農業生物資源研究所
する遺伝解析と耐乾性育種へ
の展開)

2013

3

③

日本作物学会第236回講演会
優秀発表賞(水稲の倒伏抵抗性を高める強稈関連形質の遺伝
東京農工大学子座の推定－コシヒカリとタカ
ナリの正逆染色体断片置換系
統群を用いて－)

2013

10

③

第126回講演会日本育種学会
優秀発表賞(DRO3、DEEPERROOTING 1の遺伝経路上に見 農業生物資源研究所
出されたイネ第7染色体の根伸長角度QTL)

2014

11

③

第13回日本農学進歩賞(イネ深根性遺伝子の同定と機能解析 農業生物資源研究所
および耐乾生育種への応用)

2014

11

28

（８）発表会の主催の状況（シンポジウム・セミナー等を記載する。）
整理番
発表会の名称
号

年月日

開催場所

参加者
数

機関名

1

気候変動適応技術の開発・連携促進セミナー(水稲いもち病
抵抗性育種における圃場抵抗性の利用 ～ゲノム研究と育種
フロントラインの連携～)

2015

10

20

北海道農業研究センター

30

農業生物資源研究
所

1

農林水産省委託プロジェクト 研
究「ゲノム情報を活用した農産
物の次世代生産基盤技術の開発プロジェ ク ト」シンポジウム(地域との連携による作物ゲノ
ム育種推進体制の構築と実践
ゲノム 情報活用時代における作物育種の進展と将来展望 )

2015

11

11

つくば国際会議場

200

農業生物資源研究
所

備 考（９）アウトリーチ活動の状況
当事業の研究課題におけるアウトリーチ活動の内容は以下のとおり。
区分； ①一般市民向けのシンポジウム、講演会及び公開講座、サイエンスカフェ等、 ②展示会及びフェアへの出展、大学及び研究所等の一般公開への参画、③その他（子供向け出前授業等）
整理番
参加者
アウトリーチ活動
年月日
開催場所
主な参加者
機関名
区分
号
数
新潟大学生、県農業大学校生、新潟「にいがた夢農業・人づくり事業」
農業・バイオ専門新潟大学中央図書館ライブラ
共通講座シンポジウム（新潟大学
農研機構
1
①
2016
10
28
250
学校生、教職員、
リーホール
農学部主催）にて山本敏央が基
県内農業研究・普調講演および学生との意見交換
及 機関等

29

備考