文部科学省科学研究費助成事業

学術変革領域研究 (A）

生体反応の集積・予知・創出を基盤としたシステム生物合成科学〜予知生合成科学〜News Letter

No. 2
March 2024

CONTENTS
P. 1

第１期公募班

P. 2

日本農芸化学会 2023 年度広島大会シンポジウム

P. 2

日本薬学会 143 年会シンポジウム

P. 2Japan-German Joint Symposium on Natural Product Biosynthesis

P. 3

特別講演会（Prof. Marnix Medema）

P. 3

第２回公開シンポジウム

P. 3

ETH サマースクール

P. ４

Piel Lab Reunion Symposium

P. ５

若手合宿勉強会

P. ６

日本放線菌学会広島大会（共催）P. ６

Gaussian による量子化学計算についてワークショップ

P. ６

ICCP450/JSSX 2023（共催）P. ６

第 33 回イソプレノイド研究会（共催）P. ７

日本科学振興協会 年次大会 2023「会いに行ける科学者フェス」

P. ７

特別講演会（Prof. Yi Tang）

P. ７

植物化学シンポジウム（共催）P. ７

ヨーロッパ講演旅行記（東京大学大学院薬学系研究科 牛丸理一郎）

P. ９

ISBOC-13

P. 10

The 1st Taiwan-Japan Bilateral Symposium on Natural Products Biosynthesis

P. 11

The 6th Symposium on Advanced Biological Inorganic Chemistry

P. 11

第３回公開シンポジウム

P. 12

お知らせ（論文発表、受賞、今後の予定）

第１期公募班
A01 生体反応の集積

酵素反応の予知と酵素活性の向上を可能とする物理学ベース

構造類似糖脂質 MPIase、BPF、ECA の生合成酵素の探索・の理論的手法の開発

比較による糖付加戦略の解明

新井宗仁（東京大学大学院

西山賢一（岩手大学

総合文化研究科）

農学部）
機械学習と実験の融合による PLP 依存性酵素の酸素反応性

糸状菌由来新規酸化酵素ファミリーの機能開拓

予測モデルの開発と機能予知

尾崎太郎（東北大学

野口智弘（産業技術総合研究所

薬学研究科）

情報・人間工学領域）

新規炭素－ヒ素結合形成反応を基盤とした未開拓天然物生合

A03 生体反応の創出

成経路の集積ペプチド修飾酵素の基質配列の深層学習による人工グリコシ

星野翔太郎（学習院大学

理学部）

ル化ペプチドの創製
後藤佑樹（東京大学大学院

理学系研究科）ラジカル SAM 酵素による炭素ラジカル反応の集積
工藤史貴（東京工業大学

中分子創薬を目指した創薬ターゲット特異的結合 RiPPs ア理学院）

ナログの創出
尾仲宏康（学習院大学

新型テルペン環化酵素の同定とゲノムマイニングによる未踏

理学部）

生合成情報の集積
佐藤努（新潟大学大学院

大規模ゲノム改変にもとづいた合成生物学育種による天然物

自然科学研究科）

生産に特化した麹菌の創出
丸山潤一（東京大学大学院

フェアリー化合物の生合成・代謝メカニズムの解明
崔宰熏（静岡大学

農学生命科学研究科）

農学部）
有機合成化学を駆使したエンジイン抗生物質の生合成機構解植物ゲノム中の多重化酵素遺伝子の機能解析による天然変異

明への挑戦

酵素反応の集積西川俊夫（名古屋大学

水谷正治（神戸大学

生命農学研究科）

農学研究科）
有機触媒反応から学ぶ光駆動型ラジカル酵素の創製加藤俊介（大阪大学大学院

既存の手法では見出せない天然物生合成遺伝子クラスターの工学研究科）

予知と精密解析
堤隼馬（北里大学

ポリシストロニック遺伝子群の合理的構築を志向した短鎖連感染制御科学府）

結配列の解析
鈴木宏和（鳥取大学

AI を活用した未知の二次代謝生合成酵素の機能解明と分子工学研究科）

間相互作用の精密解析
高橋俊二（理化学研究所

人工低分子抗体を介した酵素機能改変による次世代型オリゴ

環境資源科学研究センター）

糖プレバイオティクスの創出
田中俊一（京都府立大学

機械学習を利用した天然化合物生合成遺伝子クラスターの進

生命環境科学研究科）

化的デザイン
梅村舞子（産業技術総合研究所

ジテルペン合成酵素を用いた人工テルペン類の創製

生命工学領域）

品田哲郎（大阪公立大学大学院

理学研究科）

A02 生体反応の予知
遺伝子情報に基づく天然物の化学構造推定

ファージ提示法で得られたペプチド配列リソースの標的指向

南篤志（北海道大学

型修飾法の開発

理学研究院）

松原輝彦（慶應義塾大学

理工学部）

多コピー生物のアイソフォームと酵素近接性に注目した生合
成反応効率の変動予測

炭素をつなぐ：SAMT 自在制御基盤の確立

長由扶子（東北大学

野田修平（神戸大学大学院

農学研究科）

1

科学技術イノベーション研究科）

大環状化機構の移植による新奇環状中分子化合物の創製に関各公募班の研究内容については領域 HP に掲載しています。

する研究

以下の QR コードからアクセスしてください。

工藤慧（産業技術総合研究所

生命工学領域）

三重結合アミノ酸生合成系を改変したクリックケミストリー
指向型ペプチド合成系の構築
藤城貴史（埼玉大学

理工学研究科）

日本農芸化学会 2023 年度広島大会シンポジウム「生合成研究の変革を目指して」

計画班 A01-4

淡川 孝義（理化学研究所環境資源研究センター）

日時：2023 年 3 月 15 日（水） 15:00 〜 17:00

計画班 A02-1

杉山 龍介（千葉大学大学院薬学研究院）

場所：オンライン開催

計画班 A02-2

佐藤 玄（山梨大学工学部）

発表者：

計画班 A02-3

寺田 透（東京大学大学院農学生命科学研究科）

計画班 A01-1

葛山 智久（東京大学大学院農学生命科学研究科）

計画班 A03-3

荘司 長三（名古屋大学大学院理学研究科）

計画班 A01-3

丸山 千登勢（福井県立大学生物資源学部）

計画班 A03-4

勝山 陽平（東京大学大学院農学生命科学研究科）

日本薬学会 143 年会シンポジウム「生合成酵素と創薬化学の新展開」

計画班 A01-4

牛丸 理一郎（東京大学大学院薬学系研究科）

日時：2023 年 3 月 28 日（火） 9:00 〜 11:00

計画班 A03-2

脇本 敏幸（北海道大学大学院薬学研究院）

場所：北海道大学札幌キャンパス

計画班 A03-3

荘司 長三（名古屋大学大学院理学研究科）

発表者：
Yi Tang（Department of Chemical and BiomolecularEngineering, University of California at Los Angeles）
大洞光司（大阪大学大学院工学研究科）

Japan-German Joint Symposium on Natural Product Biosynthesis
日時：2023 年 4 月 2 日（日）〜 4 月 3 日（月）L13: Pierre Stallforth, HKI Jena

場所：京都タワーホテル

L14: Atsushi Minami, Hokkaido University

発表者：

L15: Georg Pohnert, University of Jena

L01: Tomohisa Kuzuyama, The University of Tokyo

L16: Fumitaka Kudo, Tokyo Institution of Technology

L02: Russell Cox, University of Hannover

L17: Tobias Gulder , TU Dresden

L03: Chitose Maruyama, Fukui Prefectural University

L18: Ikuro Abe, The University of Tokyo

L04: Eric Helfrich, University of Frankfurt

L19: Jeroen Dickschat, University of Bonn

L05: Hiroki Oguri, The University of Tokyo

L20: Takayoshi Awakawa, The University of Tokyo

L06: Osami Shoji, Nagoya University

L21: Helge Bode, MPI Marburg

L07: Robin Teufel, University of Basel

L22: Kazuo Shin-ya, AIST

L08: Hajime Sato, University of Yamanashi

L23: Mami Yamazaki, Chiba University

L09: Tohru Terada, The University of Tokyo

L24: Christine Beemelmanns, University of Leipzig

L10: Toshiyuki Wakimoto, Hokkaido University

L25: Satoshi Yuzawa, Keio University

L11: Lena Barra, University of Konstanz

L26: Till Schäberle, University of Gießen

L12: Kenji Watanabe, University of Shizuoka

L27: Yasushi Ogasawara, Hokkaido University

2

第２回公開シンポジウム

L28: Roderich Süßmuth, TU Berlin

日時：2023 年 6 月 10 日（土）〜 6 月 11 日（日）L29: Yohei Katsuyama, The University of Tokyo
L30: Jürgen Rohr, University of Kentucky

場所：北海道大学大学院薬学研究院

L31: Yuki Goto, The University of Tokyo

発表者：

L32: Konrad Tiefenbacher, University of Basel

公募班

L33: Teigo Asai, Tohoku University

計画班 A01-4

牛丸 理一郎（東京大学大学院薬学系研究科）

L34: Elke Dittmann, University of Potsdam

計画班 A02-3

森脇 由隆（東京大学大学院農学生命科学研究科）

L35: Hiroyasu Onaka, The University of Tokyo

計画班 A03-1

谷藤 涼（東京大学大学院理学系研究科）

計画班 A03-3

有安 真也（名古屋大学大学院理学研究科）

ショートプレゼンテーション＆ポスター発表

特別講演会

日時：2023 年 6 月 2 日（金）場所：東京大学大学院薬学系研究科
講師：Prof. Marnix Medema (Wageningen University)
演題：Artificial Intelligence Approaches to Natural ProductDiscovery

ETH サマースクール────────────────────────────────
日時：2023 年 6 月 12 日（月）〜 6 月 16 日（金）場所：ETH, Switzerland
静岡県立大学薬学部

講師

岸本 真治

2023 年 6 月 12-16 日の 5 日間、チューリッヒの ETH にて

Rutz が担当し、LC-MS/MS データをデータベースと比較し開催された Summer School on Applied Meta-Omics に参加て化合物のアノテーションを行う方法やサンプル間での変した。本会は天然物研究に関連するオミクスについての講義化がある化合物の探索を学んだ。これに先立って行われたとワークショップを通じた知識と解析方法の習得、および若Nicola Zamboni や Justin J.J. van der Hooft の講演でメタボ

手研究者同士の交流を行うことを目的としている。参加者はローム解析のために開発したという多数のツールが紹介さ博士課程の学生とポスドクで、主催者やワークショップ担当

れていたが、人の手を煩わせずに正確な解析結果を得るこ者もまた多くが若手研究者であり、各国の 20-30 代の研究者とに注力して開発しているとのことだった。3 日目のメタゲが集まる場となった。

ノム解析は 2021 年に Piel 研から独立した Serina Robinson

会の 1-3 日目は朝 8 時 30 分から夜 19 時まで講義とワークと ETH の砂川研のポスドク Lucas Paoli が担当し、メタゲ

ショップ、参加者による研究発表がスケジュールされた非常ノムの分別とゲノム再構築および AntiSMASH を用いた解に濃密なものであった。１日目のトランスクリプトーム解析

析を行った。メタゲノム解析の手法を詳しく聞くのは初めて

はミシガン大学の Roland Kersten が担当で、RNAseq のデーであったため内容が新鮮であった。また、詳細は割愛するがタから de novo アッセンブリを行い、そこから RiPPs のコ

4 日目はチューリッヒ近くのエントレブッフ・ユネスコエコ

ア配列を見つける操作を行った。ノートパソコンを使ったパークへと赴き参加者同士の交流を深め、5 日目は Novartis

de novo アッセンブリが想像以上に早く終わったのは驚きでやバイオベンチャーの講師による企業での研究と起業についあった。2 日目のメタボローム解析は Hertweck 研のポスドての講演を聞き充実した日々だった。

ク Guy Schleyer と ETH の Zamboni 研のポスドク Adriano

今回の渡航で各種オミクス関連の知識・解析方法の取得は

3

もちろんのこと、日本での学会参加とは異なる刺激を海外のて下さった「予知生合成科学」と領域代表の葛山先生にはこ

若手研究者から受けることができた。このような機会を与えの場を借りて深くお礼申し上げたい。

Piel Lab Reunion Symposium────────────────────────────────
日時：2023 年 7 月 7 日（金）場所：ETH, Switzerland
東京大学大学院農学生命科学研究科

助教

白石 太郎

2023 年 7 月に Jörn Piel 教授の ETH Zurich 着任 10 周年

くの先生方が Ripps 関連の生合成に関する講演だった中、核を 記 念 し た シ ン ポ ジ ウ ム「Piel Lab Reunion Symposium」

酸系化合物生合成の講演を行ったため、その部分においてはが開催された。運よく講演の機会をいただき、さらに幸運な

特に興味を持っていただけた。近年の Ripps の生合成に傾倒ことに本領域「予知生合成科学」よりサポートをしていただ

する状況の打破には一様に頭を悩ませているとのことだっいたので本稿ではそれについて報告する。

た。またポリケチド合成酵素に関連する内容も含んでいたた

筆者は 2021 年 4 月から 2022 年 3 月までの一年間、博士研

め、その部分では有益な助言もいただくことができた。

究員として Jörn Piel 教授のもとで働いていた。Jörn Piel 教

講演会の後は研究室ツアーと、各国の会社や研究所で働く

授は天然物化学分野で著名な成果を数多く報告しており、本卒業生によるショートトーク（雑談会？）が催された。この領域に参画されている方々もご存知のことと思う。近年ではショートトークでは各国における博士号取得者のキャリア形

特にカイメンの共生微生物をはじめとする難培養微生物が生成について、色々な経験談を聴くことができ、自身の知見を産する天然化合物に関する研究や Ripps の生合成に関する研広げることができた。

究で優れた成果を多数、報告されている。またその卒業生のショートトークの後は ETH の敷地内で BBQ パーティー

多くが各国で PI として活躍していることも申し添えておく。

が執り行われた。ここでは私が在籍した当時の研究室メン

発端は 2023 年の三月頭に当時の同僚で今回のシンポジウ

バーの近況を聞くことができた。博士号を取得して新天地にムの幹事である Piel 研のポスドクの Mathijs（現 Radboud

移る学生や、新たに研究室をもつことが決まっているポスド

University の Junior Group Leader）から講演の依頼メール

クなどに再び出会えたことは自身のモチベーションの向上とが来たことから始まる。当時は予算の目処がつかなかったのなった。また、私が在籍する以前に所属していた著名な PI

で保留で返事をしたのだが、その後本領域代表の葛山先生にたちと交流ができたことも非常に有意義だった。

相談したところ、ご支援いただけることとなったため、晴れ

たった 1 日だけで身内の小さなシンポジウムではあったて参加することとなった。本会の趣旨は、ボン大学時代を含が、コロナ禍で交流が少なかった私の留学時代を相補するよむ Piel 研の当時のメンバーおよび現メンバーが一同に介しうな、ヨーロッパを中心とした知人を増やす非常に有意義なて旧交を温め、お互いの研究を共有し、更なる発展の機会とものとなった。そして Piel 研のメンバーのエネルギーと強するとのことである。参加者は、ヨーロッパはもちろんのこいつながりを再確認するとともに、自身もその一員として恥と、アメリカ、シンガポール、中国、ベトナムそして日本とじぬよう精進していくための決意を新たにする機会ともなっ世界中から集まっており、改めて Piel 研の裾野の広さを実た。シンポジウムを企画してくれた Mathijs をはじめとする感した。

現 Piel 研メンバーと、講演を行う機会を与えてくださった

本シンポジウムの講演者は基本的には独立 PI ということ

Jörn Piel 教授に厚く御礼申し上げたい。また金銭的援助にではあったのだが、日本特有の研究室の一般的なシステム

ついてご快諾いただいた本領域の領域長である葛山智久教授（講座制）を紹介した上で私の研究についても講演させていに御礼申し上げたい。

ただいた。身内同士の非公開シンポジウムということもあり多くの講演者が積極的に未発表データを含む発表を行ったた
め、最新の知見を直接聴くことができる非常に興味深いシン
ポジウムだった。新進気鋭のトップ研究者たちが鎬を削って Ripps をはじめとする新規天然物の発見手法の開発とその生合成酵素の機能解析について発表する中で、トリを飾った
Jörn が発表の中で小難しいことを考えなくても新しいものは見つかるとおっしゃっていたのは興味深かった。

ランチ後の研究室前での集合写真

私自身の発表については、詳細は割愛させていただくが多4若手合宿勉強会
日時：2023 年 8 月 26 日（土）〜 8 月 27 日（日）場所：伊豆山研修センター「予知生合成科学若手合宿勉強会に参加して」
新潟大学大学院自然科学研究科

助教

上田

大次郎

この度は予知生合成科学ニュースレターにご寄稿させていいただきました。今回から特に AI 関係の方々と深く語り合

ただく機会をいただき広報の先生方ありがとうございます。

う機会が多くあり今後の研究でやってみたいことを妄想する

駄文失礼いたします。私は、学生時代から前々身の学術領域ことができました。他大の方と久しぶりに議論しましたので「生合成マシナリー」、前身の「生合成リデザイン」にご縁が次の日に座長があるにも関わらず 3 時頃まで飲み明かしてしあって勉強させていただいております。

まいました。

今回、コロナ禍もあり、2019 年以来の若手合宿勉強会（前2 日目は、朝のセッションで座長を務めさせていただきま

身の領域では若手シンポジウム）参加となりました。学生時した。前日遅くまで議論で盛り上がっていたため皆さんグ

代はガンガン質問させていただきもしかするとご迷惑をおかロッキーかと思いきや、学生さんや若手の先生方から多岐にけしていたかもしれませんが、大変勉強になり貴重な経験とわたる質問が出ておりました。

なっておりました。そのこともあり、今回は学生に質問して2 日間を通して改めて対面でのこの様な会の大切さを実感

いただこうと比較的おとなしくしておりました（その後の飲いたしました。若手の会を主催してくださった先生方に改め

み会で気になったことを時間かけて回答いただいた先生方あて御礼申し上げます。これからもこの会で得た様々な情報とりがとうございました）。開始当初はなかなか学生からの質

人脈を生かし精進して参ります。

問は出ておりませんでしたが、場が温まるにつれて学生からの鋭い質問が多々出てきておりました。特に北海道大学脇本先生、松田先生の研究室の学生が積極的にいい質問をしており大変刺激を受けました。
1 日目の夜には久しぶりの対面での懇親会でした。質問しきれずにうずうずしていたものを一気に発散でき勉強させて─────────────────────────────────────────────────────────「2023 年若手合宿勉強会 参加報告」
北海道大学薬学部薬学科６年

山田

唯人

2023 年 8 月 26、27 日の 2 日間、静岡県熱海市にて若手合る楽しさを知るとともに、他の研究領域から自身の研究を捉

宿勉強会が開催され、59 名の参加がありました。私はポスえ直す必要性を感じました。この経験をもとに、より一層私ター発表で本勉強会に参加し、今回執筆の機会をいただきま

自身精進して研究に邁進する所存です。

したので参加報告をいたします。

本勉強会への参加に際して、脇本敏幸先生、松田研一先生

私は「NRPS-PKS ハイブリッド型天然物生合成におけるをはじめとする諸先生方のご指導を賜りました。また、勉強フラビン依存性酸化酵素による a- ケトアミド形成」という会を企画・運営してくださいました勝山陽平先生、淡川孝義

題目でポスター発表しました。新型コロナウイルスの影響等

先生、白石太郎先生には本勉強会でのポスター発表という貴もあり、私にとって初の現地開催での発表であったため非常重な機会をいただきました。さらに、学術変革領域研究（A）に緊張しましたが、最終的には議論に没頭することができた「予知生合成科学」領域代表の葛山智久先生、本勉強会で議と感じております。発表を通して多くのご助言をいただきま

論してくださった諸先生方および学生の方々にも大変お世話したので今後の研究に活かしていきたいと思いました。

になりました。この場をお借りして厚く御礼申し上げます。

今回の若手合宿勉強会では様々な研究領域の方々と交流す5

日本放線菌学会広島大会（共催）────────────────────────────────
日時：2023 年 9 月 7 日（木）〜 9 月 8 日（金）場所：東広島芸術文化ホール くらら

Gaussian による量子化学計算についてワークショップ
日時：2023 年 9 月 16 日（土）場所：東京大学大学院薬学系研究科「量子化学計算ワークショップに参加して」
学習院大学理学部生命化学科

助教

星野翔太郎

2023 年 9 月 16 日（土）、東京大学薬学部において量子化

かりやすく解説頂きました。そして Gaussian 導入に必要と学計算ワークショップが開催されました。本ワークショップ

なる計算機のスペックや、論文投稿に際して必要な図表（エは A02-2 計画班の内山真伸先生（東京大学大学院 薬学系研

ネルギーダイヤグラムなど）の作成についても、実演を交え究科）及び佐藤玄先生（山梨大学 工学部）にオーガナイズ

つつ解説頂きました。最後に質疑応答の時間が設けられまし

頂き、汎用量子化学計算ソフトウェア Gaussian の使用方法

たが、予定の時刻を過ぎてもフロアからの質疑は止まず、そについて、佐藤先生を講師としてご解説頂きました。今回はの多くは学生からであったことも印象的でした。

オンサイト開催となりましたが、学生や若手教員を中心に参本ワークショップの結果、筆者を含め領域内研究者の量子

加者は 40 名に達しました。

化学計算に関する理解が大いに深まり、また Gaussian の導本講習は将来的な Gaussian の導入・活用を考えている実

入・活用に対するハードルも大きく下がったと感じています。

験系研究者を主な対象としており、「どうすれば Gaussian

今後、第 2 回量子化学計算ワークショップが開催された折にを用いてスペクトル予測や反応解析が出来るようになるのは、引き続き参加させて頂きたいと思います。

か ?」といった実践的な部分に重点が置かれました。最初に最後にこのような貴重かつ有益な機会を設けて下さりまし

Gaussian のインストール手順や基本操作に関する説明が行た内山先生、佐藤先生及びセットアップに携わったスタッフ

われ、続いて量子化学計算で用いられる関数の種類やそれらの皆様方に厚く御礼申し上げます。

の選択基準など、最低限必要となる背景知識の解説が行われました。
その後はより実践的な内容へと移行し、テルペノイド生合
成中のカルボカチオン転移を題材に、反応経路探索の方法を
佐藤先生に実演頂きました。その中で、（遷移状態や中間体の）構造最適化及び振動解析の方法や、log ファイルの読み方など、学術論文からは窺い知ることが難しい部分についても分

ICCP450/JSSX 2023（共催）（The international joint meeting of the 23rd International Conference on Cytochrome P450 (ICCP450) and the 38th Annual
Meeting of the Japanese Society for the Study of Xenobiotics (JSSX) (2023 ICCP450/JSSX International Joint meeting)────────────────────────────────
日時：2023 年 9 月 25 日（月）〜 9 月 29 日（金）場所：静岡コンベンションアーツセンター グランシップ

第 33 回イソプレノイド研究会（共催）────────────────────────────────
日時：2023 年 9 月 29 日（金）〜 10 月 1 日（日）場所：島根大学生物資源科学部

6日本科学振興協会 年次大会 2023「会いに行ける科学者フェス」

────────────────────────────────
日時：2023 年 10 月 7 日（土）〜 10 月 13 日（金）場所：秋葉原 UDX
ポスター発表：放線菌がつくる薬
発表者：
高木 基樹（東京大学大学院農学生命科学研究科学術専門職員）
愛場 雄一郎（名古屋大学大学院理学研究科准教授）

特別講演会────────────────────────────────
日時：2023 年 11 月 6 日（月）場所：東京大学農学部フードサイエンス棟
講師：Prof. Yi Tang (University of California, Los Angeles)
演題：Discovery of New Structures, Enzymes and Functions from Fungal Biosynthetic Pathways

第 59 回植物化学シンポジウム（共催）────────────────────────────────
日時：2023 年 11 月 10 日（金）場所：東京大学山上会館

ヨーロッパ講演旅行記
日時：2023 年 11 月 12 日（日）〜 11 月 30 日（木）東京大学大学院薬学系研究科

助教

牛丸 理一郎2023 年 11 月に生合成研究についての意見交換と講演のたた。また、Anthony Green 教授ともディスカッションする

めのヨーロッパ渡航を学術変革 A「予知生合成科学」によっ

時間を頂いた。Green 教授は天然あるいは de novo 合成タンて支援いただき、イギリス、フランス、スイス、ドイツのパク質の内部に非天然アミノ酸を導入し様々な非天然型酵素

10 大学を訪問したので、本体験記として報告する。

反応の開発に成功している。変異体の作製や反応スクリーニ
ングなど実験の自動化がかなり進んでいるようであった。論

講演の概要

文には記述されていないような、反応設計の工夫や難しさに我々は複雑な化学構造を持つ生物活性天然物の生合成研究

ついても丁寧に説明していただいた。

を行なっている。最近、チオフラノース、シクロプロパン、エポキシド、アジリジンなどの環構築を触媒する鉄酵素のラジカル反応メカニズムの詳細を解明した。本講演旅行では、これらの成果を中心に最新のトピックに焦点を当て、1 時間弱の講演を行った。
マンチェスター大学
11 月 12 日に東京を出発し、ロンドンを経由して、マンde Visser 研究室のメンバーとチェスターに到着した。マンチェスター大学では Samuel de
ウォーリック大学

Visser 教授にホストしていただいた。今年夏に、de Visser
研究室から阿部研究室に数ヶ月留学していた学生に大学の構

14 日、 マ ン チ ェ ス タ ー か ら コ ヴ ェ ン ト リ ー に 向 か い、

内を案内していただいた。de Visser 教授とはヘム酵素や非ウォーリック大学を訪問した。Gregg Challis 教授にホスト

ヘム鉄酵素などのモデル化や触媒反応の計算について議論しをしていただいたが、エポキシケトンの生合成など最新の成7

果を共有していただいた。翌 15 日には、ウォーリック大学
にて構造生物学シンポジウムがあり、イリノイ大学の Nair
Satish 教授が基調講演をされていた、RiPP 抗生物質の生合成のご講演には非常に感銘を受けた。また、講演後にディスカッションの機会を頂き、筆者らが解析している鉄酵素の構
造解析についても助言をいただくことができた。
オックスフォード大学
16 日、Chris Schofield 教授にホストをしていただきオッ
クスフォード大学を訪問した。Schofield 教授非ヘム鉄酵素

Piel 教授と反応解析の第一人者であるが、筆者が学生の頃から研究対象
バーゼル大学が近いこともあり、Schofield 教授の論文を読み勉強していたため、今回実際にお会いし、今後の天然物化学、酵素学研

21 日はバーゼルに移動した、バーゼル大学を訪問した。

究の展望等について意見交換することができ、大変感激した。

フラビン酸化酵素の専門家の Robin Teufel 教授にホストし筆者の講演後にも多くの助言をいただいた。Schofield 研究ていただいた。フラビン酸化酵素が関わる生合成や酵素反応室の研究員の方々には、プロリン水酸化酵素、イソペニシリ

機構解析意外にも植物由来生物活性分子やその生合成研究に

ン合成酵素、ACC 酸化酵素などの非ヘム鉄鉄酵素についてついての進行中のプロジェクトについても議論した。

の最新の研究結果を紹介していただいた。
パリ - シテ大学
17 日には列車でオックスフォードからパリに向かいパリ- シテ大学の Olivier Ploux 教授の研究室を訪問した。Ploux
教授と Méjean 教授にシアノバクテリア由来天然物の生合成について解説していただいた。筆者もシアノバクテリアを研究対象として扱っているため、シアノバクテリアの培養方法
や生合成解析方法などについても助言をいただいた。

講演後、Teufel 教授とストラスブルグ大学
22 日、Joseph Moran 教 授 に ホ ス ト を し て い た だ き ス
ト ラ ス ブ ル グ 大 学 を 訪 問 し た。Moran 教 授 は、Prebiotic
chemistry や生命の起源を研究対象にしており、非酵素的な一次代謝物の変換など中心に解析している。代謝経路の進化など新たな視点について議論でき、同時に生化学反応における酵素の寄与や本質的な意義について深く考えさせられた。
また、若手研究者の Bonfio 博士、Mayer 博士、Ragazzon 博
士との生命の起源や超分子化学についてのディスカッションと意見交換も大変刺激的だった。
Ploux 教授、Méjean 教授

ETH チューリッヒ
19 日はパリからチューリッヒに移動した。Jörn Piel 教授にホストをしていただき、ETH を訪問した。海洋微生物由
来 RiPP のプレニル化、環化や、ラジカル SAM 酵素による
ペプチドスプライシングなどを解説していただいた。また、
Piel 研究室のメンバーにも最新の研究結果を紹介していただ
いたが、ゲノムマイニングから酵素応用研究まで幅広く、いずれの研究もユニークで大変興味深かった。

Moran 教授との夕食

8

グルノーブル構造生物学研究所

由来天然物生合成研究について紹介していただいた。

23 日は飛行機と電車を乗り継いで、ストラスブルグからグルノーブルに移動し、24 日グルノーブル構造生物学研究
所の Yvain Nicolet 教授研究室を訪問した。グルノーブル構
造生物学研究所では生体分子構造解析のためシンクロトロンや顕微鏡などの施設、機器が充実しており、特に Nicolet 教
授はヒドロゲナーゼ、ニトロゲナーゼ、ラジカル SAM 酵素などの多核金属酵素を対象に研究している。最新の研究結果に加え、嫌気性金属酵素の構造解析、反応解析技術についても紹介していただいた。また、鉄酵素の収斂進化などの研究も非常に興味深かった。またヒドロゲナーゼの結晶構造解析

講演後 Pohnert 教授、Wichard 博士とで有名な Fontecilla-Camps 教授とも議論することができ感
ドレスデン工科大学

激した。

最 終 日 と な っ た 29 日、 ド レ ス デ ン 工 科 大 学 の Tobias
Gulder 教授の研究室を訪問した。Gulder 研究室では幅広い生合成経路を対象にした生合成研究に加え生合成酵素の生体触媒としての利用を目指す研究を展開している。酸化反応やラジカル反応など筆者の研究との共通点もあり、自身の研究に生かせる点も多くあった。
おわりに今回の講演旅行では、密度の濃い充実した日々を体験することができ、多くの著名な先生方と研究に関する議論や意見

Nicolet 研究室メンバー、Fontecilla-Camps 教授との昼食交換ができた貴重な経験であった。また先生方からは激励のイェーナ大学

言葉をいただき、研究に取組む気持ちを新たにした次第であ

27 日、グルノーブルからイェーナに移動し、イェーナ大る。最後になったが、日々研究の指導をしてくださり、また学の Georg Pohnert 教授の研究室を訪問した。珪藻に関連す

ツアーのアレンジに協力して下さった阿部郁朗先生に心かるケミカルエコロジーについてのオリジナリティーある研究ら御礼申し上げたい。また、学術変革 A「予知生合成科学」

を解説していただいき、生物学と化学の両方の観点で非常にによる支援を快諾していただきました領域代表の葛山智久先

興味深かった。Hans-Dieter Arndt 教授と Dirk Hoffmeister

生と貴重な時間を割いてホストをして下さった先生方に深く教授からもそれぞれ、生物活性天然物の全合成研究やキノコお礼申し上げたい。

ISBOC-13（13th International Symposium on Bioorganic Chemistry）
日時：2023 年 12 月 18 日（月）〜 12 月 20 日（水）場所：Nanyang Technological University, Singapore
東京大学大学院理学系研究科化学専攻 教授

大栗 博毅

2023 年 12 月 18 日から 20 日にかけて、シンガポールの南ておりました。アジアを中心に世界中から科学者、ポストド

洋理工大学（Nanyang Technological University）で開催さク研究者、学生約 280 人が参加し、生物有機化学、生物化学、れた IUPAC の国際生物有機化学シンポジウム（ISBOC-13）

バイオアナリシス、生物分子、医薬品および治療薬の開発、へ参加し、招待講演を行いました。ISBOC シリーズは 1986

合成生物学、構造生物学、計算化学生物学、プロテオミクス

年に Ronald Breslow 教授によってニューヨークで創設され、などの多岐に渡る分野での最先端の議論が展開されました。

約 3 年ごとに世界各地で開催されてきました。ISBOC-13 はPlenary Speaker の 内 で は、 菅 裕 明 先 生（ 東 京 大 学 ）、

南洋理工大学、シンガポール国立大学の共催で、“Chemical

Jon Clardy 先生（Harvard 大学）、Ben Davis 先生（Oxford

Biology: Innovation for Better Health”をテーマとして掲げ大学）から、本学術領域の研究に深く関連する最先端で刺9激的な講演がありました。今回の ISBOC-13 の Chair を務め果たし、心温まる一時を過ごすとともに、時代の変化を実感られた南洋理工大学の Bengang Xing 先生は数年来の知り合しました。中国のトップ研究者は、ゲノムワイドでの研究をいで、昨年２月の Asian Chemical Biology Initiative の会議

進めるパワーとスピードは圧倒的で、かつての米国と比肩す

で筆者の口頭発表の座長をしてくださりました。そのようなるかそれ以上の勢いを感じました。生合成関連の生物有機化

ご縁もあり、今回は Bengang Xing 先生から直接お声がけを学においても、独創性の高いアプローチが肝心なので、我々頂き、制ガン剤エクテナサイジン類の生合成を拡張するアプ

個々の強みを生かしつつ、共同研究で相乗効果を生み出しな

ローチについて２５分間の招待講演とセッションの座長を務

がら新展開を拓いていこう！という想いを強めました。本国めました。

際会議の参加においてご支援を頂いた領域代表の葛山智久先

久しぶりの対面での国際会議で旧友や研究仲間との再会を生や関係者に感謝申し上げます。

The 1st Taiwan-Japan Bilateral Symposium on Natural Products Biosynthesis
日時：2023 年 12 月 25 日（月）〜 12 月 28 日（木）場所：Academia Sinica, 台湾
東京大学大学院農学生命科学研究科

助教

白石 太郎

2023 年 12 月 25 日に台湾の Academia Sinica にて開催さ昼食時は Chung-Han Chu 先生と同席し留学時代の研究の話れた The 1st Taiwan-Japan Bilateral Symposium on Natural

や台湾での研究室の立ち上げおよび運営に関する話を伺うこ

Products Biosynthesis に て、 幸 い に も 講 演 を 行 う 機 会 をとができた。シンポジウム後の懇親会では構造生物学を専門いただいた。参加にあたり、本領域より援助をいただいたとされる Hsin-Yang Chang 先生と同席することができ、私ので本稿ではその報告をさせていただく。本シンポジウム

自身も研究対象としているプレニル基転移酵素について意見

は、台湾と日本の天然物科学者の交流の機会を設けるため交換を行うことができた。

に Academia Sinica の Tsung-Lin Li 教授と、本領域にも参また Academia Sinica 内の研究施設の見学もさせていた

画されている学習院大学の尾仲宏康教授により企画されただいた。想像以上に研究設備が整っており、特にタンパク

シンポジウムである。Academia Sinica での講演会に加え、質の構造解析に関連する設備は充実していると感じた。まNational Research Institute of Chinese Medicine での講演聴た National Research Institute of Chinese Medicine お よ び

講と研究所見学、そして国立陽明交通大学のいくつかの研究

国立陽明交通大学の見学でもその研究設備、特に質量分析室の見学もさせていただいた。日本側からは阿部郁朗先生を機の充実ぶりには非常に感銘を受けた。National Research

はじめとして本領域に参画している小笠原泰志先生、丸山Institute of Chinese Medicine では植物をはじめとする膨大

千登勢先生、松田研一先生、星野翔太郎先生が参加し講演で多様な漢方関連資料を見学することができ大変感銘を受けを行った。また台湾からは Tsung-Lin Li 先生をはじめとした。

て Hsiao-Ching Lin 先生、Chung-Han Chu 先生、Hsin-Yang

以上、本シンポジウムの開催により、これまで交流がほとChang 先生、Wen-Tai Li 先生、Chin-Yuan Chang 先生が講んどなかった台湾の研究者との新たなつながりを構築でき、演された。

また大変貴重な経験をすることもできた。今回の訪問を機会

Hsiao-Chin Lin 先生のゲノムマイニングによる化合物探索

として、日台の研究交流が盛んになり、共同研究にも繋がるとその生合成研究や、Li 先生によるユニークな生合成酵素と思われる。企画いただいた Tsung-Lin Li 先生と阿部先生、の構造解析はもちろんのこと、ホウ素を取り込んだ擬似天然

尾仲先生を初め、非常に手厚くもてなしてくださった台湾の物の合成など、生合成研究にとどまらない多岐にわたる分野

スタッフの方々に厚く御礼申し上げたい。

の講演が並び非常に勉強になるシンポジウムであった。また

10

講演者の集合写真

National Research Institute of Chinese Medicine にて

The 6th Symposium on Advanced Biological Inorganic Chemistry
日時：2024 年 1 月 7 日（日）〜 1 月 9 日（火）場所：コルカタ、インド名古屋大学大学院理学研究科教授

荘司 長三

学術変革 A「予知生合成科学」からいただいた助成によい、多くの参加者に聴いていただくことができました。また、り、インドのコルカタで開催された The 6th Symposium on

学会期間中には著名な研究者と有意義な議論や情報交換の機

Advanced Biological Inorganic Chemistry（SABIC-2024）に会を得て、新たな研究方針やコラボレーションの可能性が広参加してまいりました。https://www.indiabioinorganic.org/

がりました。予知生合成科学についても紹介し、興味を持っこの学会はインドの化学者だけでなく、欧米やアジアの著名てもらえたと感じております。今回、学術変革 A「予知生な研究者が集まり、生物無機化学に関する最新の研究成果や合成科学」の助成により自身の研究を広く発信する機会を得

知見を共有する場として定着しつつある国際会議です。今ることができましたことに心より感謝申し上げます。今回の回は、招待講演者として参加し、「Use of Decoy Molecules

学会参加を通じて得た知見や交流を活かし、今後も斬新な研to Manipulate P450BM3 Biotransformation」のタイトルで究成果を上げることと国際的なネットワークの構築に努めてP450BM3 によるガス状アルカンの水酸化を中心に講演を行まいります。

第３回公開シンポジウム
日時：2024 年 2 月 16 日（金）〜 2 月 17 日（土）計画班 A02-1

山崎真巳（千葉大学大学院薬学研究院）

場所：東京大学大学院理学系研究科

計画班 A02-2

内山真伸（東京大学大学院薬学系研究科）

発表者：

計画班 A02-3

寺田透（東京大学大学院農学生命科学研究科）

新井 宗仁（東京大学大学院総合文化研究科）

計画班 A03-1

大栗博毅（東京大学大学院理学系研究科）

特別講演

中野 祥吾（静岡県立大学食品栄養科学部）

計画班 A03-2

脇本敏幸（北海道大学大学院薬学研究院）

計画班 A01-1

葛山智久（東京大学大学院農学生命科学研究科）

計画班 A03-3

荘司長三（名古屋大学大学院理学研究科）

計画班 A01-2

渡辺賢二（静岡県立大学薬学部）

計画班 A03-4

勝山陽平（東京大学大学院農学生命科学研究科）

計画班 A01-3

丸山千登勢（福井県立大学生物資源学部）

公募班 A01

尾崎太郎（東北大学薬学研究科）

計画班 A01-4

淡川孝義（理化学研究所環境資源科学センター）

公募班 A01

星野翔太郎（学習院大学理学部）

11

公募班 A01

水谷正治（神戸大学農学研究科）

公募班 A02

南篤志（北海道大学理学研究院）

公募班 A03

後藤佑樹（東京大学大学院理学系研究科）

公募班 A03

加藤俊介（大阪大学大学院工学研究科）

公募班 A03

工藤慧（産業技術総合研究科生命工学領域）

公募班 A03

田中俊一（京都府立大学生命環境科学研究科）

お知らせ
論文発表

────────────────────────────────
A01

A02

Nagata R, Nishiyama M, Kuzuyama T

Matsuyama T, Togashi K, Nakano M, Sato H, Uchiyama M

Substrate recognition mechanism of a trichostatin

Revision of the peniroquesine biosynthetic pathway by

A-forming hydroxyamidotransferase.

retro-biosynthetic theoretical analysis: ring strain controls

Biochemistry. 2023, 62, 1833-1837.

the unique carbocation rearrangement cascade.

HDAC の特異的阻害剤である Trichostatin A の末端ヒドロ

JACS Au. 2023 15, 1596-1603.

キサム酸基を生成する hydroxyamidotransferase の構造基盤「Rretro-Biosynthetic Analysis（逆生合成解析手法）」を開発を解明。末端ヒドロキサム酸基を持つ構造多様な化合物の創し、セスタテルペン化合物 peniroquesin の複雑な生合成反製に期待。

応機構を解明。テルペン化合物以外の複雑な天然物の生合成
経路解析へも応用が期待。
A01
Ushimaru R, Lyu J, Ling M, Abe I
Multiple C-C bond cleavage reactions catalyzed by
tolyporphin tetrapyrrole biosynthetic enzymes.
J. Am. Chem. Soc. 2023,145, 9834-9839.
テトラピロール生合成経路における炭素ー炭素結合切断酵素を同定。さらなるテトラピロール二次代謝物の新規生合成経路解析に期待。
A03
Arima K, Akiyama S, Shin-Ya K, Matsuda K, Wakimoto T
Carrier protein mediated formation of thedihydropyridazinone ring in actinopyridazinone biosynthesis.
Angew. Chem. Int. Ed. 2023, 62, e202305155.
微生物のもつ緻密な含窒素複素環生合成経路を解明。有用な複素環の効率的な合成法の確立に期待。

12

A03

A03

Kato S, Takeuchi K, Iwaki M, Miyazaki K, Honda K,

Fujita J, Amesaka H, Yoshizawa T, Hibino K, Kamimura N,

Hayashi T.

Kuroda N, Konishi T, Kato Y, Hara M, Inoue T, Namba K,

Chitin- and streptavidin-mediated affinity purification

Tanaka SI, Matsumura H

systems: a screening platform for enzyme discovery.

Structures of a FtsZ single protofilament and a double-

Angew. Chem. Int. Ed. 2023, 62, e202303764.

helical tube in complex with a monobody.

安価なキチン粉末を用いたタンパク質精製手法を確立。本手Nat. Commun. 2023, 14, 4073.

法を酵素スクリーニングへと応用することで、非天然のシク

細胞分裂反応の基盤となるタンパク質フィラメントの溶液構

ロプロパン化反応を触媒する酵素を同定することに成功。

造を世界で初めて明らかに。創薬への応用も期待。

A03

A03

Shikai Y, Kawai S, Katsuyama Y, Ohnishi Y

Kawai S, Yamada A, Du D, Sugai Y, Katsuyama Y, Ohnishi Y

In vitro characterization of nonribosomal peptide

Identification and analysis of the biosynthetic gene clustersynthetase-dependent O-(2-hydrazineylideneacetyl) serine

for the hydrazide-containing aryl polyene spinamycin.

synthesis indicates a stepwise oxidation strategy to

ACS Chem. Biol. 2023, 18, 1821-1828.

generate the α -diazo ester moiety of azaserine.

Spinamycin 生合成遺伝子クラスターを発見し、亜硝酸を利Chem. Sci. 2023, 14, 8766-8776.

用したヒドラジド生合成機構を提唱することに成功。

Azaserine 生合成経路の解析から新たなジアゾ基合成メカニ
A03

ズムを発見。

Tay G, Wayama T, Takezawa H, Yoshida S, Sato S, Fujita M,
Oguri H.
Synthetic modulation of an unstable dehydrosecodine-type
intermediate and its encapsulation into a confined cavity
enable Its X-ray crystallographic observation.
Angew. Chem. Int. Ed. 2023, 62, e202305122.
植物薬用成分の生合成：６０年来の謎に迫る！合成化学と超分子化学の融合により不安定中間体の結晶構造解析に成功。

A03
Ariyasu S, Yonemura K, Kasai C, Aiba Y, Onoda G, Shisaka
Y, Sugimoto H, Tosha T, Kubo M, Kamachi T, Yoshizawa K,
Shoji O
Catalytic oxidation of methane by wild-type cytochrome
P450BM3 with chemically evolved decoy molecules.
ACS Catal. 2023, 13, 8613–8623.
P450 による触媒的メタン水酸化。長鎖脂肪酸水酸化酵素を
メタン水酸化用デコイ分子により誤作動させるアプローチ。

13

A01

A01-02

Hoshino S, Ijichi S, Asamizu S, Onaka H

Ushimaru R, Ding Y, Mori T, Miyamoto K, Uchiyama M,

Insights into arsenic secondary metabolism in actinomycetes

Abe I

from the structure and biosynthesis of bisenarsan.

Structural and mechanistic insights into the C-C bond-

J. Am. Chem. Soc. 2023, 145, 17863-17871.

forming rearrangement reaction catalyzed by heterodimeric

放線菌由来初の有機ヒ素二次代謝産物 bisenarsan について、

hinokiresinol synthase.

その化学構造及び生合成経路を解明。今後のヒ素天然物探索

J. Am. Chem. Soc. 2023, 145, 21966-21973.

研究の大きな足掛かりに。

植物由来代謝物ノルリグナンの生合成における炭素骨格形成
反応の触媒メカニズムを解明。

A03
Stanfield JK, Onoda H, Ariyasu S, Kasai C, Burfoot EM,

A02

Sugimoto H, Shoji O

Ooka K, Arai M

Investigating the applicability of the CYP102A1-decoy-

Accurate prediction of protein folding mechanisms bymolecule system to other members of the CYP102A

simple structure-based statistical mechanical models.

subfamily.

Nat. Commun. 2023, 14, 6338.

J. Inorg. Biochem. 2023, 245, 112235.

タンパク質が形をつくる仕組みの正確な予測法 ―最新の AI

デ コ イ 分 子 を 用 い る 酵 素 誤 作 動 手 法 が CYP102A1にも解けない難問を物理学理論で解決、医療用・産業用タン（P450BM3）だけでなく、CYP102A5 と CYP102A7 にも有パク質の新規設計に利用可能。

効であること明らかにした。
A01-02
A03

Ushimaru R, Cha L, Shimo S, Li X, Paris JC, Mori T,

Kodama Y, Ariyasu S, Karasawa M, Aiba Y, Shoji O

Miyamoto K, Coffer L, Uchiyama M, Guo Y, Chang WC,

Highly selective hydroxylation of gaseous alkanes at theAbe I

terminal position by wild-type CYP153A33.

Mechanistic analysis of stereodivergent nitroalkane

Catal. Sci. Technol. 2023, 13, 6146-6152.

cyclopropanation catalyzed by nonheme iron enzymes.

野生型 CYP153A33 によるプロパンの１位選択的水酸化とメ

J. Am. Chem. Soc. 2023, 145, 24210-24217.

タン水酸化を達成。

４つのシクロプロパン立体異性体を選択的に作り分ける酵素群を発見し、その環化反応メカニズムを提唱。
A03
Zhang Y, Hamada K, Satake M, Sengoku T, Goto Y, Suga H
Switching prenyl donor specificities of cyanobactin
prenyltransferases.
J. Am. Chem. Soc. 2023, 145, 23893-23898.
シアノバクチン類プレニル転移酵素を改変し、自然界未知の様式のペプチドプレニル化反応を実証。
A03
Chang JS, Vinogradov AA, Zhang Y, Goto Y, Suga H
Deep learning-driven library design for the de novo
discovery of bioactive thiopeptides.
ACS Cent. Sci. 2023, 9, 2150-2160.
与えられた人工基質配列が擬天然物へと変換されるか否かを予測する深層学習モデルを構築。擬天然チオペプチドライブ
ラリーの設計に活用。

14

A01

A01

Hibi G, Shiraishi T, Umemura T, Nemoto K, Ogura Y,

Zhou L, Awakawa T, Ushimaru R, Kanaida M, Abe I

Nishiyama M, Kuzuyama T

Characterization of aziridine-forming

Discovery of type II polyketide synthase-like enzymes for

dependent oxygenase in L-isovaline biosynthesis

the biosynthesis of cispentacin.

Org. Lett. 2024, 26, 724-727.

Nat. Commun. 2023, 14, 8065.

イソバリン生合成に関わるアジリジン合成α - ケトグルタル

非タンパク質構成アミノ酸シスペンタシンと植物毒素コロ

酸依存性酸化酵素の機能解析。

α -ketoglutarate-

ナチンに含まれる非芳香族 5 員環骨格を生合成するための II
A01-02型 PKS 様酵素を発見し、その反応機構を提唱。

Zhao F, Moriwaki Y, Noguchi T, Shimizu K, Kuzuyama,
A03

Terada T

Kato H, Sakuta M, Tsunoda T, Nakashima Y, Morita H,

QM/MM study of the catalytic mechanism and substrate

Ogasawara Y, Dairi T

specificity of the aromatic substrate C-methyltransferase

Peptide epimerase responsible for D-Amino Acid

Fur6

introduction in poly- γ -glutamic acid biosynthesis.

Biochemistry 2024, in press.

Biomacromolecules 2024, 25, 349-354.

QM/MM 法によるメチル基転移酵素の触媒反応と基質特異

納豆の糸の成分であるポリグルタミン酸の生合成に関わるペ性のメカニズムの解明。

プチド異性化酵素を解明。
A03
A03

Kudo K, Nishimura T, Izumikawa M, Kozone I, Hashimoto J,

Kawai S, Yamada A, Katsuyama Y, Ohnishi Y

Fujie M, Suenaga H, Ikeda H, Satoh N, Shin-ya K

Identification of the p-coumaric acid biosynthetic gene

Capability of a large bacterial artificial chromosome clone

cluster in Kutzneria albida: insights into the diazotization-

harboring multiple biosynthetic gene clusters for the

dependent deamination pathway.

production of diverse compounds

Beilstein J. Org. Chem. 2024, 20, 1-11.

J. Antibiot. 2024, in press.

亜硝酸を利用したジアゾ基形成を介した p- クマル酸生合成

1 つの巨大 BAC（細菌人工染色体）クローンの異種発現に経路の解明。

より異なるタイプの生合成遺伝子クラスターから化合物を生産。

A01-03
Ueda D, Matsuda N, Takaba Y, Hirai N, Inoue M, Kameya

A03

T, Abe T, Tagaya N, Isogai Y, Kakihara Y, Bartels F,

Sakata S, Li J, Yasuno Y, Shinada T, Shin-ya K, Katsuyama Y,

Christmann M, Shinada T, Yasuda K, Sato T

Ohnishi Y

Analysis of vitamin D receptor binding affinities of

Identification of the cirratiomycin biosynthesis geneenzymatically synthesized triterpenes including ambreincluster in Streptomyces cirratus: elucidation of theand unnatural onoceroids

biosynthetic pathways for 2,3-diaminobutyric acid andSci. Rep. 2024, 14, 1419.

hydroxymethylserine

龍涎香主成分アンブレインのビタミン D 受容体結合能を解Chem. Eur. J. 2024, in press.

明。酵素合成した非天然型・天然型トリテルペンの中からア

Cirratiomycin の 生 合 成 遺 伝 子 ク ラ ス タ ー を 同 定 し、2ンブレインよりも結合親和性が高い化合物を発見。

つ の 非 タ ン パ ク 質 性 ア ミ ノ 酸（diaminobutyric acid、hydroxymethylserine）の生合成機構を解明。

15

受賞

────────────────────────────────
令和５年度 日本薬学会生薬天然物部会奨励研究

第 24 回 酵素応用シンポジウム 研究奨励賞『放線菌における未利用二次代謝経路を活用した新規天然物

計画班 A01-4

牛丸 理一郎の探索』
公募班 A01

日本生薬学会 学術奨励賞

星野 翔太郎計画班 A01-4

牛丸 理一郎令和５年度 日本放線菌学会浜田賞
計画班 A01-1

第 22 回 天然物化学談話会 奨励賞

白石 太郎

計画班 A01-4

牛丸 理一郎Asian Core Program Advanced Research Network
Lectureship Award from China

日本薬学会 奨励賞

公募班 A03

計画班 A01-4

後藤 佑樹

牛丸 理一郎今後の予定────────────────────────────────
日本農芸化学会 2024 年度年会シンポジウム

第４回公開シンポジウム「物質生産技術の革新を目指した予知生合成科学」

2024 年 7 月 20 日（土）〜 7 月 21 日（日）2024 年 3 月 25 日（月）名古屋大学大学院理学研究科

東京農業大学
US-Japan Seminar on Biosynthesis of Natural
Products
2024 年 5 月 20 日（月）〜 5 月 24 日（金）軽井沢プリンスホテルウェスト国際会議場

16

MEMO

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