嫌気性菌研究分野
Division of Anaerobe Research〒501-1193 岐阜市柳戸 1 番１
E-mail : kenki@gifu-u.ac.jp
TEL : 058-230-6554, 6555
FAX : 058-230-6551

目・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・

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91◆ 嫌気性菌研究分野
1 沿革

次

2 職員構成・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・

3 研究と活動の方針「4 つの柱」
4 分野施設と御主な設備

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5 嫌気性菌保存菌株の保有状況

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99

6 分野の業務と支援
7 支援の実績

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8 教員の研究･教育･社会活動・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・

100◆ 嫌気性菌研究分野
嫌気性菌研究分野は主にヒト・動物に由来する偏性嫌気性菌（酸素存在が生存に不利に働く細菌）を幅広く扱っている国内で唯一の研究施設である。始まりは、我が国における臨床嫌気性菌研究のパイオニアである故鈴木祥一郎、故上野一惠の両岐阜大学名誉教授の業績に対して 1978 年（昭和 53 年）に設置された医学部附属嫌気性菌実験施設である。以来、岐阜大学の特色ある施設として、我が国における臨床嫌気性菌学の発展に寄与してきた。現在では、科学研究基盤センターの 1 分野として、臨床細菌のみにかかわらず、嫌気的環境での実験についてのコンサルテーション、機器の供与、偏性嫌気性菌の分譲等の支援を行っている。施設の成り立ちと性質上、他分野と異なり、学内共同利用施設
では無く、感染症領域とライフサイエンス研究に関わる嫌気性菌のレファレンスセンター機能を持つ施設として、全国的な支援を行っている。

1

沿革
昭和 53 年 10 月

医学部附属嫌気性菌実験施設開設される
施設長 鈴木祥一郎（併任）、専任教授 上野一惠

昭和 54 年 4 月

施設長 上野一惠 着任

平成 5 年 3 月

施設長 上野一惠 退任

平成 5 年 4 月

施設長 渡邉邦友 着任

平成 15 年 4 月

改組により生命科学総合実験センター嫌気性菌実験分野
分野長 渡邉邦友

平成 17 年 4 月

改称により生命科学総合研究支援センター嫌気性菌研究分野
分野長 渡邉邦友（平成 25 年 3 月まで）
田中香お里（平成 25 年 4 月～）

平成 30 年 4 月

2

改組により研究推進･社会連携機構 科学研究基盤センター嫌気性菌研究分野

職員構成
教授：田中香お里助教：後藤隆次

林将大

特任助教：楊馥華

技術補佐員：中川朗子

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3

研究と活動の方針「4 つの柱」

1）嫌気性菌感染症についての基礎的臨床細菌学的な研究を行う。
この研究成果により、これまでも臨床嫌気性菌学の発展に貢献してきた。分離･培養･同定ツールの発展により、臨床嫌気性菌の疫学も過渡期にあり、また、微生物は、社会情勢、生活習慣等でもたらされる環境変化により変化しうるため、情報の Up Date が必要である。疫学情報の充実が、正しい診断法に基づく適切な治療法の選択を可能にし、治療法の改良や新しい治療法の開発に繋がるとともに、予防医学にも繋がる。
2）研究成果の応用、嫌気性菌感染症の診断法の基準化やマニュアル化、そしてその教育普及を行う。
当施設で毎年 1 回 1 週間の日程で行う嫌気性菌検査技術夏期セミナーは、すでに 40 年以上の歴史があり、嫌気性菌感染症診断のための技術指導と情報提供の場であり続けている。さらに、受講者に対する講習会終了後の支援活動は、電話や e-mail でのコンサルテーション、検体からの病原菌の細菌学的検査サポートの形で実施している。また、研究成果を導入した、菌感染症の診断法の標準化、マニュアル化に努める。
3）臨床現場からの嫌気性病原菌の収集と保存およびその分与を行う。
その性質上、患者からの嫌気性病原菌の収集は通性菌に比べて、極めて難しい仕事である。当分野では、嫌気性菌の参考菌株や全国各地の病院からの診断支援依頼を通して分離、同定した菌株を保存している。
現在のところ、保存株数は 7,000 株以上で、多様な臨床分離の偏性嫌気性菌を含むコレクションとして、国内に類を見ない。これらの菌株については当施設の重要な研究材料として用いられている他、国内外の大学、研究所など研究教育施設や、製薬あるいは試薬の開発に関係している民間の研究所に分与されており、研究、教育、産業育成に有効利用されている。
4）臨床医に対する嫌気性菌と嫌気性菌感染症に関する啓蒙活動を積極的に行う。
今日の大学医学部における感染症学の講義が内科学の講義全体に占める割合は、極めて少ないことがわかっている。感染症学の中でも、嫌気性細菌学に関する講義の占める割合はさらに極めて少なく、その教育のほとんどは、卒後教育に依存しなければならない現状である。嫌気性細菌学と嫌気性菌感染症の率後教育のための、本施設の役割はわが国において極めて大きく、常に新しい情報の収集に努め、求めに応じて対応できる態勢を整えている。

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4

分野施設と主な設備
嫌気性菌研究分野は、医学部棟 7 階に位置し、P2 レベルの微生物実験室と系統保存室を備えている。
I. 嫌気性グローブボックス（1 台）、嫌気性ワークステーション（1 台）
酸素を含まない混合ガス環境（窒素 82％程度、炭酸ガス 8％程度、水素 10％程度）下での作業、培養が可能

テーハー式アナエロボックス ANX-1W 【平沢製作所】
他 1台

II. ガス置換装置（1 台）
高度な嫌気状態を必要とする培地等の調整に使用する器機

ガス置換装置（GR-8 型）【三紳工業】

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III.

微生物同定システム（MALDI TOF MS）

MALDI TOF MS による細菌・真菌の同定装置
データベースがあれば、迅速で高精度な同定が可能
VITEK MS Plus
【ビオメリュー】

VI. 菌株保存用超低温フリーザー（3 台）94

5嫌気性菌保存菌株の保有状況a) 嫌気性菌レファレンス菌株

約290株

保有菌株概要（属）アクチノバクテリア門 ActinobacteriaI.

アクチノマイセス属 ActinomycesMobiluncus

モビルンカス属

プロピオニバクテリウム属 Propionibacterium
II. ビフィドバクテリウム属 Bifidobacterium
III. アトポビウム属 Atopobium
コリンセラ属 Collinsella
オルセネラ属 Olsenella
IV. エガーセラ属 Eggerthella
スラッキア属 Slackia
ファーミキューテス門 Firmicutes
クロストリジウム属 Clostridium
ペプトストレプトコッカス属 Peptostreptococcus
フィネゴルディア属 Finegoldia
パルビモナス属 Parvimonas
ペプトニフィルス属 Peptoniphilus
アネロコッカス属 Anaercoccus
フィリファクター属 Filifactor
ユーバクテリウム属 Eubacterium
モギバクテリウム属 Mogibacterium
シュードラミニバクター属 Pseudoramibacter
シュードフラボニフラクタ属 Pseudoflavonifracter
ディアリスター属 Dialister
ベイヨネラ属 Veillonella
ブレイディア属 Bulleidia
ソロバクテリウム属 Solobacterium
スタフィロコッカス属 Staphylococcus
ゲメラ属 Gemella
ラクトバチラス属 Lactobacillus
プロテオバクテリア門

Proteobacteria

β プロテオバクテリア綱 Betaproteobacteria
サッテレラ属 Sutterellaδ プロテオバクテリア綱 Deltaproteobacteria95

デスルフォビブリオ属 Desulfovibrio
バイオフィラ属 Bilophila
ε プロテオバクテリア綱 Epsilonproteobacteria
カンピロバクター属 Campylobacter
バクテロイデス門

Bacteroidetes

バクテロイデス属 Bacteroides
ポルフィロモナス属 Porphyromonas
プレボッテラ属 Prevotella
カプノサイトファーガ属 Capnocytophaga
フゾバクテリア門

Fusobacteria

フゾバクテリウム属 Fusobacterium
レプトトリキア属 Leptotrichiab) 各種感染症、病態由来の嫌気性菌臨床分離株

約8,900株

菌株由来概要胆道感染症、腹腔内感染症、腸管感染症、脳膿瘍、菌血症、皮膚軟部組織感染症、その他の産婦人科感染症、耳鼻咽喉科感染症、口腔外科領域感染症、呼吸器科領域感染症、整形外科感染症、便、鼻腔サンプル、院内環境
保有菌株概要（属）アクチノバクテリア門 ActinobacteriaI.

アクチノマイセス属 Actinomyces
モビルンカス属 Mobiluncus
キュティバクテリウム属 Cutibacterium
シュードプロピオニバクテリウム属 PseudopropionibacteriumII.

ビフィドバクテリウム属 Bifidobacterium
ガードネレラ属 Gardnerella
パラスカルドビア属 Parascardovia
スカルドビア属 Scardovia

III. アトポビウム属 Atopobium
コリンセラ属 Collinsella
オルセネラ属 Olsenella
IV. エガーセラ属 Eggerthella
スラッキア属 Slackia
ファーミキューテス門 Firmicutes
クロストリジウム属 Clostridium
96ペプトストレプトコッカス属 Peptostreptococcus
フィネゴルディア属 Finegoldia
パルビモナス属 Parvimonas
ペプトニフィルス属 Peptoniphilus
アネロコッカス属 Anaercoccus
フィリファクター属 Filifactor
ユーバクテリウム属 Eubacterium
モギバクテリウム属 Mogibacterium
シュードラミニバクター属 Pseudoramibacter
シュードフラボニフラクタ属 Pseudoflavonifracter
ディアリスター属 Dialister
ベイヨネラ属 Veillonella
ブレイディア属 Bulleidia
ブラウティア属 Blautia
ソロバクテリウム属 Solobacterium
スタフィロコッカス属 Staphylococcus
ゲメラ属 Gemella
ラクトバチラス属 Lactobacillus
プロテオバクテリア門 Proteobacteria
β プロテオバクテリア綱 Betaproteobacteria
サッテレラ属 Sutterella
エイケネラ属 Eikenellaδ プロテオバクテリア綱 Deltaproteobacteria
デスルフォビブリオ属 Desulfovibrio
バイロフィラ属 Bilophila
ε プロテオバクテリア綱 Epsilonproteobacteria
カンピロバクター属 Campylobacter
バクテロイデス門

Bacteroidetes

バクテロイデス属 Bacteroides
ポルフィロモナス属 Porphyromonas
プレボッテラ属 Prevotella
カプノサイトファーガ属 Capnocytophaga
フゾバクテリア門

Fusobacteria

フゾバクテリウム属 Fusobacterium
レプトトリキア属 Leptotrichia

97スピロケータ門 Spirochaetes
ブラキスピラ属 Brachyspira
シネルギステス門

Synergistete

シネルギステス属 Synergistes
年度別内訳
年

GAI No.

収集株数

1991〜2008(# 91000～08503)

7119

2009

(# 09001～09209)

209

2010

(# 10001～10202)

2022011(# 11001～11207)

207

2012

(# 12001～12149)

149

2013

(# 13001～13107)

107

2014

(# 14001～14227)

227

2015

(# 15001～15240)

240

2016

(# 16001～16135)

135

2017

(# 17001～17313)

313

2018

(# 18001～18160)

160

2019

(# 19001～19029)

29

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分野の業務と支援
1) 菌株維持・系統保存
2) 嫌気性菌の生態などに関する問い合わせへの対応
3) 培養法など研究上の技術的な相談への対応
4) 嫌気環境を必要とする研究の支援
5) 嫌気性菌を中心とした細菌同定、感受性測定
6) 嫌気性菌の国内外の研究者に対する分譲（管理体制・設備が整っている研究室対象）
日本細菌学会教育用菌株の分与
日本化学療法学会 MIC 測定委員会指定コントロール菌株の分与
各種同定用キットの精度管理用菌株の分与
抗菌薬、試薬開発のための菌株の分与
7) 臨床嫌気性菌についての講習会開催
嫌気性菌検査技術セミナー

7

支援の実績（1）相談・問合せ・検査依頼
・内因性劇症ウエルシュ菌感染症分離菌の解析： 1 件
・Clostridium butyricum 菌血症分離菌の PFGE 解析： 1 件

2株・臨床材料から分離された嫌気性菌の詳細同定と薬剤感受性試験： 5 件 7 株‐遷延化した肺化膿症 1 件 3 株、‐敗血症分離菌

1 件、‐心内膜炎分離菌 1 件‐呼吸器感染症 1 件、‐血培分離菌（小児急性リンパ性白血病） 1 件
・臨床材料から分離された嫌気性菌の詳細同定： 5 件
血液培養分離菌 4 件、関節液由来 1 件
・臨床材料から分離された嫌気性菌の薬剤耐性因子検索、薬剤耐性確認： 1 件
腹腔内感染症由来バクテロイデス（カルバペネム耐性遺伝子）・歯科材料から分離された嫌気性菌の同定： 1 件
・研究手法、培養、同定、感受性測定法など実験上の技術的な相談への対応+：
学内； 2 件、学外；大学 3 件、企業 2 件（2）新規保存数 29 株
（3）菌株分譲 Fusobacterium nucleatum 4 株， Clostridium perfringens

991株

（4）臨床嫌気性菌についての講習会開催
今日の大学医学部における感染症学の講義が内科学の講義全体に占める割合は、極めて少ないことがわかっている。また、感染症学の中でも、嫌気性細菌学に関する講義の占める割合はさらに極めて少なく、その教育のほとんどは、卒後教育に依存しなければならない現状である。検査技師の教育に関しても同様のことが言える。嫌気性細菌学と嫌気性菌感染症の卒後教育における本施設の役割は、わが国において極めて大きいと考えられる。
嫌気性菌感染症は、内科、外科、整形外科、産婦人科、耳鼻咽喉科、歯科口腔外科など幅広い領域で見られ、嫌気性菌の臨床検査は感染症の診断・治療に重要である。本セミナーは、嫌気性菌および嫌気性菌感染症に興味のある方々に、最新の情報を交えた全般的な知識と検査に関わる技術を習得して頂くことを目的として講義と実習を実施している。（定員 20 名）《第 48 回嫌気性菌検査セミナー》までの累計
総参加人数：約 1724 名《第 49 回嫌気性菌検査セミナー》
開催期間：令和 1 年 7 月 26 日（金）〜7 月 28 日（日）参加者：23 名【医療機関 17、大学（教育･研究）3、検査センター2、企業 1；臨床検査関係 17 名、医師･歯科医師 4 名、研究者 1 名、学術･営業等 1 名；9 都道府県】

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教員の研究・教育・社会活動【論文等】
原著（和文）
1. 田中香お里．臨床検査で遭遇しうる嫌気性菌の新菌種．日本臨床微生物学会雑誌，29 巻:1-6, (2019)
原著（欧文）
1. Utari F, Itam A, Syafrizayanti S, Hasvini W, Ninomiya M, Koketsu M, Tanaka K, Efdi Mai, Isolation offlavonol rhamnosides from Pometia pinnata leaves and investigation of α-glucosidase inhibitory activityof flavonol derivatives, Journal of Applied Pharmaceutical Science, 2019, 9 (8):53-65.
2. Sano H, Wakui A, Kawachi M, Kato R, Moriyama S, Nishikat M, Washino J, Abiko Y, Mayanagi G,Yamaki K, Sakashita E, Tomida J, Kawamura Y, Tanaka K, Takahashi N, Sato T, Profiling of microbiota
in liquid baby formula consumed with an artificial nipple, Biomedical Research (Tokyo), 2019,40(4):163-168.
3. Utari F, Ninomiya M, Tanaka K, Myat Neo Win K, Nishina A, Koketsu M, N2-Methylaurantiamide
acetate: a new dipeptide from Mimusops elegi L. Flowers, Medical Chemistry Research, 2019,28:797-803.
4. Kutsuna R, Miyoshi-Akiyama T, Mori K, Hayashi M, Tomida J, Morita Y, Tanaka K, Kawamura Y,
Description of Paraclostridium bifermentans subsp. muricolitidis subsp. nov., emended description of100

Paraclostridium bifermentans (Sasi Jyothsna et al., 2016), and creation of Paraclostridium bifermentans
subsp. bifermentans subsp. Nov, Microbiology and Immunology, 2019, 63:1-10.
5. Sato MP, Ogura Y, Nakamura K, Nishida R, Gotoh Y, Hayashi M, Hisatsune J, Sugai M, Takehiko I,
Hayashi T, Comparison of the sequencing bias of currently available library preparation kits for Illumina
sequencing of bacterial genomes and metagenomes, DNA Research, 2019, 26(5):391-398.

【学会】
国内学会
1）第 30 回日本臨床微生物学会総会（平成 31 年 2 月 1 日～3 日, 東京）達人セミナー2「嫌気性菌感染症のピットフォール」，演者 田中香お里
2）第 93 回日本感染症学会総会･学術講演会（平成 31 年 4 月 4 日～6 日, 名古屋）シンポジウム 9「実践で役立つ臨床で重要な嫌気性菌感染症の診断と治療」 1. 嫌気性菌に関する新しい分類オーバービュー，演者 田中香お里
3）第 93 回日本感染症学会総会･学術講演会（平成 31 年 4 月 4 日～6 日, 名古屋）合同シンポジウム
5 ｢嫌気性菌感染症診療・研究の up-to-date｣，司会 田中香お里
4）第 93 回日本感染症学会総会･学術講演会（平成 31 年 4 月 4 日～6 日, 名古屋）合同シンポジウム
5 ｢嫌気性菌感染症診療・研究の up-to-date｣，1. 嫌気性菌の分類について～Clostridium 属を中心に～，演者 林将大5）第 93 回日本感染症学会総会･学術講演会（平成 31 年 4 月 4 日～6 日, 名古屋）会長企画 2 小部屋の小道 ｢嫌気性菌の小部屋｣，企画者 田中香お里
6）第 67 回日本化学療法学会西日本支部総会／第 89 回日本感染症学会西日本地方会学術集会／第89 回日本感染症学会西日本地方会学術集会（令和 1 年 11 月 7 日～9 日，浜松）シンポジウム 2 ｢腸内細菌学の基礎から臨床応用｣，司会 田中香お里【教育分担】
田中香お里：連合創薬医療情報研究科（併任）
医学部医学科 テュートリアル テューター
医学部医学科 生命科学実習特別講義
医学部医学科 選択テュートリアル
全学共通教育 医学部看護学科 講義
後藤 隆次： 医学部医学科

テュートリアル テューター

林

テュートリアル テューター

将大： 医学部医学科

医学部医学科 選択テュートリアル【社会活動】
田中香お里：岐阜県建築審査会委員（平成 21 年度～平成 31 年度）

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