GBits

no. 32 Jan 2013

協力・援助 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2

生物多様性データのアクセスポータル

GBIF に 30 万ユーロ拠出－欧州新制度立ち上げを支援

科学と政策に関する新機構の設立を支援する

データの公開 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2

GBIF
新たに設立される「生物多様性及び生態系サービスに関する政府間科学政策プラットフォーム（IPBES）」の働きを支える上で、GBIF コミュニティーには重要な役割があると、GBIF事務局長 Donald Hobern 氏は、語ります。
第一回 IPBES 総会（1 月 21～26 日、ボン）後に開かれた会合において、Hobern 氏は講演しましたが、この総会では、IPBESの働きを進めるための運営組織や人員配置が議決されました（プレス発表については、http://www.ipbes.net/をご覧ください）。
GBIF 事務局では、ボンの総会に先立って、IPBES の事業プログラムに関し GBIF が支援できる領域について説明した資料を用意しました。支援の内容として、次の事項があり、GBIFの活動案は 2013 年中に策定されることになっています。
 情報が不足している分野を特定し、優先順位をつけること。
 長期観察モニタリング・プログラムとの協力関係を結ぶこと。
 機能の強化。
 データ、情報、知識へのアクセスを向上すること。

データペーパー公開を推進するプロジェクト
を支援

インフォマティクス . . . . . . . . . . . . . . 2
GBIF ポータルから重複データを削除

科学と政策 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
GBIF ネットワーク内外の活動 . . . . . 3
コロンビア
ブラジル
フランス
デンマーク
ドイツ
アイルランド
CBOL

新規データ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
オーストリアエストニア
アイルランド
イギリス
フランス
コロンビア
オランダ

推薦・提案の受付開始 . . . . . . . . . . . . 5
GBIF 科学賞受賞候補者の推薦を募集中
メンタリング・プログラムの提案を受付中

ニュースから . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
インドの生物多様性データシステムがまもな
く始動
GBIF の働きが『International Innovation』誌の記事に
GBIFガーナの主席代表であるAlfred Oteng-Yeboah氏は、ボンで開催された総会にてIPBES事務局の次長に選出されました。

今後のイベント予定 . . . . . . . . . . . . . 6

IPBES 総会後に、Hobern 事務局長は、次のように語りました。

会議とワークショップ
トレーニングイベント

Continued on page 2...

To subscribe to the newsletter, please contact info@gbif.org

GBits...continued from page 1「IPBESの運営枠組みが制定されたのを受けて、我々でも、どのようにしてこの新しい機構と建設的な協力関係を結ぶことができるのかという点について、GBIF 参加国、利害関係者やパートナーと話し合うことができると期待しています。生物多様性に関連する既存の制度と協力し、重 複 を 避 けつ つ 独自 の 領 域を 構 築す る と いう こと がIPBES の原則です。GBIF が 10 年以上にわたって築き上げてきた生物多様性データアクセス・インフラストラクチャーは、IPBES の今後の働きを支える重要な基盤になると思います。
」

IPBES の事業計画に関する協議が今後数ヶ月行われます。
GBIF では、国際自然保護連合（IUCN）や国際科学会議（ICSU）に関連する利害関係者グループの他、UNESCO政府間海洋学委員会（IOC）傘下の海洋生物地理情報シス
テム（OBIS）等 GBIF ネットワークにデータを公表している主要な機関等と密接に連携するつもりです。
IPBES に対して OBIS、IUCN その他の機関から提出された討議用資料は、www.ipbes.net/bonnからダウンロードすることができます。

協力・支援
GBIF receives €300,000 to assist in
GBIF に 30 万ユーロ拠出－欧州新制度立ち上げを支援

a

GBIF では現在、欧州生物多様性観察ネットワーク（EUpublic toBON）を立ち上げる新規事業に参画しています。EU BON
は、科学者、政策決定者や公衆が広範な生物多様性情報にThe EU BON project, funded by the European Union,アクセスできるように支援することを目的としています。

brings together 30 partners from 18 countries. The

workBON
will計画には、EUcost €9 million,
spread over four andヶ国かa half
このEUが資金提供を行い、18years.
ら 30 の協力機関の参加により進められています。事業総額はAmong
900 万ユーロで、4the products年半の期間に支出されます。
will be a European integrated
当計画により、ヨーロッパ統合版生物多様性ポータルサイ
science data
and a framework for open datapublishing.
トの構築、市民参加型科学データを扱う際の手引きの作成やデータ公表を行うための枠組み作り等が行われます。

include helping to improve data standards
GBIF€300,000,が関与する分野では、データ基準や互換性の向上、
andinteroperability,providing a metadata registry andメタデータ・レジストリー及びカタログの作成、堅固なウ
catalogue, and providing access to data through robustェッブサービスに基づいたデータアクセスの提供等があweb services.
り、総額で約 30 万ユーロの費用が計上されています。

データの公開データペーパーの公開プロジェクトを支援
GBIF 事務局では、スペイン、ラテンアメリカ及びアジアにおいて計画されている生物多様性データを用いたデータペーパーの公開を推進する 3 プロジェクトを支援すると表明しました。
この 3 プロジェクトは、昨年提案された要請に応じて計画されたものであり、その要請では、GBIF ノードの働きを活性化し、詳細なデータセットの記述方法（メタデータ）を作成し、学術誌に発表できる文化を推進するべきであるとの意見が示されました。
GBIF スペインが開催するプロジェクトでは、データ公表能力のある 20 以上のスペイン国内機関を対象として、3 月にデータペーパーの公表に関するワークショップを開催することとなっています。このワークショップの目標は、各参加機関が論文を公表するようになることです。
また、フンボルト研究所が発行している機関誌 『BiotaColumbiana』では、GBIF モデルに準拠したデータペーパーの発表に関する特集記事を掲載することになっています。
同誌は、ラテンアメリカにおいて生物多様性データペーパーを掲載する最初のジャーナルとなります。
三つ目は、インドのナショナルノードのとりまとめを行っているインド野生研究所が開催するプロジェクトで、スペイン及びコロンビアが開発した訓練用資材を用いて、データペーパーの公表を推進するワークショップを行います。
このワークショップでは、南アジア及び東南アジアから最低でも 20 件の論文投稿に加えて、新規データセットが GBIFネットワークに公開されることを目標としています。各プロジェクトには、GBIF コアファンドから 5,000 ユーロが援助されます。
詳 細 に つ い て は 、 GBIF 事 務 局 の Vishwas Chavan（vchavan@gbif.org）までお問い合わせください。

インフォマティクス

EU BON is led by the Museum für Naturkunde,
EU BONは、ベルリン自然史博物館が中心になって進めて
Berlin,and will contribute to the Group on Earth

GBIF ポータルから重複データを削除

おり、地球観測グループ生物多様性観察ネットワーク(GEOBON). An EU BON ‘kickbe（GEOBON）にデータを提供します。EU
BONwill
キックオ
heldinBerlin
from13-15February,precededbyフ会合がベルリンにて 2 月 13～15 日に開催の予定です。
Nature andそれに先立ち、211～12 日には、
「自然とガバナンス－Governance -月Biodiversity
Data,Science, and the
生物多様性データ、科学及び政策とのインターフェース」
Policy Interface, taking place on 11-12 February.と題した国際シンポジウムが開かれることになっています。

GBIF ウェブサイトを注意深くご覧になった人は、お気づきかも知れません。2012 年 12 月時点のデータ件数が 3 億 8,900万から 3 億 8,300 万に減少しています。

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これは、ソフトウェアの処理技術が向上し、古いデータや重複の特定・削除が容易に行えるようになった結果です。
GBIF コミュニティーが開発しているインフォマティクス用のツールによって、古いデータの削除を行い、GBIF ネットワークを経由してアクセスできるデータの整理を行いました。

no 32 Jan 2013

変更の詳細については、GBIF 開発者用ブログに GBIF システ
ム解析担当の Andrea Hahn が記した説明があります。詳細についてはこちらをご覧ください。

科学と政策
通常通り、今回の GBits2013 年 1 月号に併せて、過去 2 ヶ月間に GBIF データの使用状況を要約した『GBits ScienceSupplement』が発行されました。第 6 号では、気候変動が北欧のほ乳類に及ぼす影響を予測した研究や台湾沖の活火山離島に見られる軟体動物の調査を解説した最新のGBIF データペーパーについて報告があります。
ダウンロードはこちらから。

GBIF ネットワーク内外の活動
コロンビア
コロンビアの新規ポータルサイト
GBIF コロンビアノードでは、コロンビアの生物多様性情報にアクセスするポータルサイトを新設しました。このサイト
は、http://www.sibcolombia.net からアクセスできます。
このサイトでは、コロンビアの生物多様性情報機構である生物多様性情報システム（SiB）が公開している生物種データや分類リストを閲覧、検索、ダウンロードできます。SiB では、協力機関である博物館、植物園、大学や政府系機関のデータを公表しています。データは、コロンビアの行政区分である県（departamento）レベルでも検索可能です。

国立計算科学研究所（LNCC）がとりまとめを行います。
GBIF ノードマネジャー委員会のブラジル代表は、LNCC の Luiz Gadelha 氏です。連絡先については、GBIFのホームページ(http://www.gbif.org/communications/directory-ofcontacts/)に詳細が掲載されています。

フランス
クラウドソーシングにより植物標本のデジタル化を推進
GBIF フランスノードの運営を行っている国立自然史博物館（MNHN）では、保管している膨大な植物データのデジタル化を進めるに当たり、一般市民に協力を呼びかけることとしました。
ウェブサイト（lesherbonautes.mnhn.fr）には、博物館の植物標本館で分類した約 600 万種類の植物標本のスキャン画像がアップされ、ボランティアは、画像に含まれる基本情報を転記することができるようになっています。
この作業を一人で行うと、およそ 500 年を要すると推計されています。一般人に参加協力してもらうために、250～2500 の標本画像からなる「ミッション」が設定されています。ボランティアは、画像を選び、ラベルの情報を入力します。
収集品をデジタル化することにより、オンラインでのデータ公開、検索、アクセスが可能となり、学術研究への貢献が期待されます。このプロジェクトで作成されたデータは、国立自然遺産インベントリ（INPN）等国規模のデータベースの他、GBIF 等の国際データネットワークに登録されます。

SiB では、GBIF が開発したオープンソースのソフトウェアをカスタマイズしてポータルサイトを制作しました。GBIF が開発したソースコードを再利用することによって、データ統合・公開用プラットフォームの開発が 6 年以上も短縮できまし た 。 コ ロ ン ビ ア 版 の ソ ー ス コ ー ド は 、http://code.google.com/p/sibdataportal/で見ることができます。

このデジタル化プロジェクトは、MNHN、フランス語圏の植物学者ネットワークであるTela Botanica 及びフランスの自然史コレクションに含まれる生物多様性データを調査するプロジェクトである E-ReColNat が共同主催しています。

また、SiB では、『ポータルサイトにデータを公開するための7 ステップ』を作成しています。このガイドは、GBIF インテグレーテッド・パブリッシング・ツールキット（IPT）を用いて一次生物多様性データを公表するためにCanadensys が作成した手引きを改定したものです。

オーストラリアのボランティアは、GBIF ノードの一つであるアトラス・オブ・リビング・オーストラリア（ALA）が運営する「生物多様性ボランティアポータル」を通して、生物多様性データのディジタル化の支援を開始しています。

ブラジル
GBIF 代表及びノードマネジャーを指名
GBIF に新たに参加したブラジルでは、国の代表として GBIFネットワークへの参加を調整する個人や機関名が発表されました。GBIF 理事会へのブラジル主席代表は、ブラジル科学技術開発省（MCTI）政策調査開発局長 Carlos Nobre 氏が務めます。副代表は、 MCTI の産業政策開発課長 MercedesBustamante 氏です。ブラジルのナショナルノードは、リオデジャネイロ州ペトロポリスにある MCTI 傘下のデンマーク
動物コレクション管理用新ツールを公開
デンマーク動物博物館が動物コレクション管理のために開発したツールであるパピス（Papis）が自由に使えるようになりました。パピスは、GBIF と互換性があり、新しい生物多様性データの管理に有益なソフトウェアの一つに数えられます。

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GBits
動物コレクションの管理には、乾燥状態のものや液体保存など種々の方法で保存された標本のカタログ化を行いますが、フィールドノートが残されていることも多く、植物コレクションよりも管理が複雑になります。パピスを用いることにより、標本データの保存、標本の貸出管理やメンテナンスの維持等を行うことができます。
パピスは、FileMaker ソフトウェアをベースにしています。
GBIF オンライン・リソース・センターには、他の自然史コレクション管理用ツールも掲載されています。

ドイツ
生物多様性データのアノテーションを行うシステムの試作版アノシス（AnnoSys）は、インターネット経由で入手できる生物多様性データに対してコメントをつけるシステムです。ドイツ GBIF ノードを運営しているベルリン・ダーレム植物園・植物博物館（BGBM）では、アノシスの試作版に対して検証を行いました。
この試作版は、数週間後に一般検証用に公開されることになっており、2014 年 4 月には利用が開始される予定です。
アノシスは、ユーザーが使いやすいインターフェースを有し、単一のデータセットや複数のコレクションに対してアノテーションを行うことができる他、アノテーション検索機能もあります。
このシステムには、誤りの訂正や大勢の人が入力した場合のヌケを修正する機能があり、品質管理上重要な機能を提供します。
このプロジェクトには、ドイツ研究基金（DFG）が資金援助を行っています。アノシスに関する詳細は、https://annosys.bgbm.fu-berlin.de/にあります。
問 い 合 わ せ の 連 絡 は 、 BGM の Okka Tschoepe 氏（o.tschoepe@bgbm.org）まで。

アイルランドデータセンター2013 年ワークショップの予定を発表
アイルランドの国立生物多様性データセンター（NBDC）
は、2013 年のトレーニングワークショップの詳細を公表しました。アイルランド国内の生物を調査し、多様性データの記録を行うボランティアや専門家の能力向上に資することを目的として、本年は、26 のワークショップが予定されています。
今年のプログラムには、一般的な生物種を対象とした初心者用入門・再教育コースに加えて、調査活動に現在従事している人々のレベルを高める専門家コースもあります。
詳細は、NBDC のウェブサイトをご覧ください。

4CBOL
GBIFのパートナー機関 CBOLがグーグルから 300万ドル授与
バーコードオブライフ・コンソーシアム（CBOL）は、ワシントン条約に指定された生物種の DNA バーコード・ライブラリーを作成することを目的として、グーグル・グローバルインパクト賞 300 万ドルが授与されました。
ワシントン条約は、正式名称を「絶滅の危惧野生動植物種の国際取引に関する条約（CITES）」といい、野生動植物種を保護するために国際取引を規制した政府間協定です。
CBOL は、GBIF の準参加機関であり、発展途上国 6 ヶ国と協力して本プロジェクトを推進します。DNA ライ
ブラリーは、野生種の商取引を取り締まる国境警備や通関担当官にとって役立つツールとなります。
詳細についてはこちらをご覧ください。

新規データ
オーストリア
オーストリア技術院の遺伝子保存センターには、50 万種を超える動植物の DNA サンプルが保管されており、オーストリア技術院では、そのうち 21,600 件のデータを公開しました。ヨーロッパ中から集めた遺伝情報に対して、オンラインでアクセスが可能です。
（http://data.gbif.org/datasets/resource/14569）。

エストニア
エストニア環境省傘下のエストニア環境情報センター
では、自然観察データベースのうち 166,500 件のデータを公開しました。このデータベースは、市民ボランテ
ィアが観察したエストニアの生物種を記録するもので、更に情報を追加入力するように呼びかけています。
（http://data.gbif.org/datasets/resource/14570）

アイルランドGBIF ネットワークにより公開された新規データセッ
トには、ボランティア・ダイバーがアイルランド沿岸で観察した海洋生物種 31,000 件のデータが掲載されています。国立生物多様性データセンターにある GBIF
ノードにより今回公開されたデータは、海洋生物の特定・記録を行うダイバーに対して訓練コースを提供している海洋探索プロジェクトの成果です。
（http://data.gbif.org/datasets/resource/14563）
フランス
パリにある国立自然史博物館では、林野庁 （OfficeNational de Forêts）の職員が国内（コルシカ島を含む。
）の公営林で確認した動物、植物及び菌類約 40 万件のデータを公開しました。

no 32 Jan 2013イギリス
イギリスの規制当局に対して、侵略的外来海洋生物に関し警告を発するシステムが、GBIF ネットワー
クを介してアクセス可能となりました。イギリスの国内生物多様性ネットワークでは、海洋生物種の多様性を脅かす外来種として、チュウゴクモクズガ
ニ、日本産ワカメ及びホヤに関する 121 件のデータを公表しました。このデータは、2010 年から開始された「侵略種記録計数（RISC）及び ALERT プロジ
ェクト」によるもので、オンラインの登録フォーマットにより一般市民から提供があったデータを取りまとめています。データには、画像の添付が必須となっており、専門家が確認したデータのみがデー
タベースに登録されます。登録されたデータは、外. 来種管理事務局（NNSS）に即座に通知され、侵略種の拡大防止に活用されます。
（http://data.gbif.org/datasets/resource/14568）

日本産ワカメ（Undaria pinnatifida）。
写真提供：Kathryn Birch – ウェールズ・カントリーサイド・カウンシル（CCW）

当データセットは、国立自然遺産インベントリ（INPN）に含まれます。このインベントリは、フランス本国及び海外県・領土における陸上・海洋生物の多様性に関する情報をオンラインで提供するものです。
（http://data.gbif.org/datasets/resource/14580）

推薦・提案を募集中

コロンビア

賞金額が 3 万ユーロのエビー・ニールセン賞は、生物多様性インフォーマティックスとバイオシステマテ
ィクスとを結び併せて優れた研究を行った個人やグループに対して贈られます。詳細についてはこちらをご覧ください。

コロンビアのカサナーレ州にあるNPO 法人カサナーレ学友協会（ABC）では、州内にあるティニヘ湖で観察される鳥類・ほ乳類に関する 3,535 件のデータを公表しました。このうち 3,400 件以上は、2009 年の雨期及び乾期に観察された鳥類のデータです。
（http://data.gbif.org/datasets/resource/14557
and http://data.gbif.org/datasets/resource/14559）
また、コロンビアの NPO 法人であるセルバ協会は、カリブ海沿岸地方にあるシエラ・ネバダ・デ・サンタ・マルタ山地で実施した鳥類標識調査により捕獲・再捕獲した鳥に関する 5,250 件のデータを公開しました。
各データには、地理座標、高度、捕獲日、標識調査員（バンダー）名、個々の鳥の特徴及び標識数が記録されます。この調査に参加したバンダーは、全員が調査許可証を有しており、データ品質は、担保されています。
（http://data.gbif.org/datasets/resource/14571）
オランダ
オランダ王立釣協会は、魚類データの蓄積と分析を行う標準データベースとして用いられているピスカリア・データベースから 38 万件のデータを公開しました。このデータセットには、ブルヘッド（ナマズの一種）やキタカワカマス等の一般的なものから、オランダの絶滅危惧種であるスナヤツメ等の珍しい種類まで含まれています。
（http://data.gbif.org/datasets/resource/14574）

GBIF 科学賞受賞候補者の推薦を募集中
GBIF では、2013 年エビー・ニールセン賞及び若手研究者賞の受賞候補者の推薦を受け付けています。

若手研究者賞は、議決権参加国又は準参加国の大学院生で生物多様性インフォーマティックスにおいて革新的な研究を行った人に対して贈られます。4 千ユーロが二名に贈られます。詳細についてはこちらをご覧ください。

メンタリング・プログラムの提案を受付中
GBIF メンタリング・プログラムの枠で 2013 年に実施する計画の提案を GBIF 参加ノードから受け付けています。提案の締切りは、2013 年 4 月 2 日で、採択された提案は、2013 年 4 月末までに発表されます。
GBIF メンタリング・プログラムは、GBIF 参加ノードが専門知識を共有できるように結び合わせるプログ
ラムです。参加国において生物多様性情報機構を速やかに立ち上げることを目的としています。
2013 年の提案について、詳細はこちらをご覧ください。

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ニュースからインドの生物多様性データシステムがまもなく始動
インドの全国版ヒンズー語新聞は、インドの生態系データにアクセスするシステムであるインド生物多様性グリッドの試作版に対して、検証が進行中であると報じました。このプロジェクトには、インドのGBIF パートナー機関が関与しており、インドの生物多様性情報総合評価（NBIO）の草案に盛り込まれた提言に従い実施されています。この草案は、2012 年10 月にハイデラバードで開催された生物多様性条約締約国会議で発表されたものです。
記事は、こちらから読むことができます。
GBIF の働きが『International Innovation』誌の記事にGBIF 理事会の議長 Joanne Daly 氏、事務局長 Donald
Hobern 氏及び上席プログラム推進担当官 Tim Hirsch
氏は、 北米版『International Innovation』誌 1 月号で、GBIF の今後の課題と未来について語っています。
記事は、こちらから読むことができます。

今後のイベント予定
会議とワークショップ
生物多様性情報アーキテクチャ・ワークショップ2013 年 2 月 4～8 日、南アフリカ、ケープタウン、キルステンボッシュ
主催：南アフリカ国立生物多様性研究所（SANBI）「自然とガバナンス－生物多様性データ、科学及び政策とのインターフェース」シンポジウム
2013 年 2 月 11～12 日、ドイツ、ベルリン
詳細はこちら。
EU BON キックオフ会合
2013 年 2 月 13～15 日、ドイツ、ベルリン
詳細はこちら。
第 1 回アイ・オン・アース・ユーザー会議
主催：欧州環境庁（EEA）
2013 年 3 月 4～6 日、アイルランド、ダブリン
詳細はこちら。

ヨーロッパ地域ノード会議
2013 年 3 月 6～8 日、フィンランド、ヨエンスウ
詳細はこちら。
ラテンアメリカ地域ノード会議
2013 年 3 月 11～13 日、コスタリカ、サントドミンゴ・デ・エレディァ
アフリカ地域ノード会議
2013 年 4 月 16～18 日、南アフリカ、プレトリア

トレーニングイベント「種保存のための能力向上会議」に併行して開催する訓練
ワークショップ2013 年 2 月 15 日、コロンビア、ヴィラ・デ・レイヴァ
詳細はこちら。
生物多様性データのクリーニングと公開に関する ICIPE 主
催訓練セミナー2013 年 2 月 18～22 日、ケニヤ、ナイロビ
詳細はこちら。
GBIF スペイン主催生物多様性データ移行ワークショップIII
2013 年 2 月 19～20 日、スペイン、マドリッド
詳細はこちら。
ICIPE 主催生態ニッチモデリング・コース
2013 年 2 月 25～28 日、ケニヤ、ナイロビ
詳細はこちら。
世界分類学イニシアティブ（GTI）に基づく CBD 主催分類能力向上ワークショップ2013 年 3 月 4～7 日、セネガル、ダカール
詳細はこちら。
生物多様性情報訓練コース
2013 年 6 月 3～28 日、ベルギー、テルビュレン
参加申込締切日：2013 年 3 月 15 日
詳細はこちら。

GBIF の Vision：科学、社会及び持続可能な未来のために、生物多様性情報が全域で自由に利用可能な世界の実現を目指します。

GBIF の Mission：生物多様性情報を提供する世界随一の情報発信源となると共に、環境と人類の福祉に役立つ賢明な解決策を提供することを目指します。

GBIF 本部
Universitetsparken 15
DK-2100 Copenhagen ØDenmark
http://www.gbif.org/

電話：+45 35 32 14 70
Fax：+45 35 32 14 80

66E-mail: info@gbif.org
過去の GBits ニュースレター・アーカイブ：
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