特定非営利活動法人

日本バイオインフォマティクス学会
ニュースレター第 43 号

学会ホームページ https://www.jsbi.org/
お問い合わせ jimu@mail.jsbi.org
C

O

N

T

E

N

T

S

巻頭言

1

会員による著書紹介

11

国際会議参加報告

2

学会からのお知らせ

12

国際会議開催報告

3

学会議事録等14

バイオインフォマティクス分野の新学科設立

6

学会の現況

20

地域部会・公募研究会活動報告

7

編集後記

22

10

日本のバイオインフォマティクス研究室

巻

頭

言

JSBi会長挨拶
AI・ビッグデータ時代の生命医薬学を主導するバイオインフォマティクスを目指して2023年4月 か ら、 日 本 バ イ オ イ ン フ ォ マ テ ィ ク ス 学 会

ので、そのようなコンテンツの（JSBi）の会長に就任いたしました。バイオインフォマティ

拡充を後押ししていきたいと考

クスは学術的にも社会的にも年々重要性が増しており、本学

えています。おかげさまでJSBi

会はバイオインフォマティクス分野の中心的なコミュニティの会員数は増加傾向にありますになります。その中で、JSBiの会長職を引き継ぐことになり、が、JSBiに新しく入会していた大きな責任を感じております。これまでの会長の岩崎先生やだいた方の期待を裏切らないよ

五斗先生の基本的な路線は維持しつつ、より一層の発展がでうに、これまでの会員と新しいきるよう、微力ながら尽力していきたいと考えています。

会員の両者にとって役立つサー

第1に、当然ながら、JSBiの会員の皆様にメリットを感じ

ビスの提供や更に活性化する方てもらえる学会を目指したいと考えております。お金を払っ策などを皆様のご意見も伺いながら出していければと考えてて会員になっていただいている皆様に、所属することの特典います。また、正会員や学生会員だけでなく、賛助会員の企を提供することは学会の責務だと感じています。会員の皆様

業様にも満足していただける学会にしたいので、企業の視点の研究教育活動に役立つ情報を提供できるように、バイオイ

からのご意見も伺いながら学会運営を展開していければと考

ンフォマティクスに関する最近の成果や動向にアクセスしやえています。

すい環境づくりに努めたいと考えています。例えば数年前か第2に、会員の皆様が交流しやすい学会を目指したいと考ら始まったJSBi Bioinformatics Reviewは若手中心に進めてえております。そのためにも年会は一番重要なイベントになくれていますが、これまでバイオインフォマティクスに関わります。AI・ビッグデータが当たり前の時代になり、近年

りのなかった研究者に興味を持ってもらうきっかけにもなっのバイオインフォマティクスが関わる研究領域は、生命科学ており、バイオインフォマティクスの研究者でも新たな研究だけでなく、医学、薬学、化学、農学、環境学、数理科学、テーマに参入するときに日本語による解説は非常に有用です

情報科学など様々な領域へと及んでいます。医薬生命情報学
No.43（June, 2023）

1

JSBi News Letter

連合大会として年会を毎年開催していますが、研究領域の広第3に、学会運営の安定化や年会開催の円滑化のための体がりを踏まえ、より一層様々な分野の研究者に参加していた制作りを考えております。これまでの学会運営は、幹事の先だけるような年会にできればと思います。賛否両論あるかも

生や事務局のスタッフの献身的なエフォートに支えられていしれませんが、私は国内学会は交流の場という側面が大きい

るところが大きいと思います。学会運営に必須の情報を複数と考えています。研究や教育に関する情報交換、win-winの人で共有してバックアップするような体制構築ができないか関係になる共同研究パートナーを見つけるなど、会員の皆様

検討したいと考えています。またこれまでの年会開催は、大が交流しやすい場を提供していきたいと考えています。コロ会長を務める先生やその研究室メンバーにとって大きな負担

ナ禍の影響で、この数年間は年会はオンラインでしたが、昨になっていました。私も2020年度に年会の大会長を努めた

年度（2022年度）の年会は久しぶりに対面で行われ、対面時に非常に苦労しました。経験がなくても年会開催の準備やの良さを再認識する年会となりました。特に、ポスターセッ

運営を問題なく行えるように、業務内容を分かりやすく文書

ションで、熱気を凄く感じました。最近ではオンライン会議

化して整備し、大会長になった人が困らないように、年会業にも慣れてきつつありますが、やはり直接顔を合わせて議論

務の引き継ぎを円滑化するための体制やルールを構築していすることは何物にも代えがたいものです。その年の大会長ときたいと考えています。

も連携しながら、関連分野や分野外の研究者にも興味を持っこれらの点は幹事・理事を始め会員の皆様のご協力なくして参加してもらえるような企画やセッションの充実を図りたてはできないことです。気づいたことや改善点のアイデアな

いと思います。また若手支援で計画している後藤修先生の基

どがありましたら、皆様の声を遠慮なく届けていただけると金の規程を整備し、若手研究者の年会参加のサポートに向け幸いです。これから2年間、JSBiの発展に尽力して参ります。

た運用も進めて参ります。会員の皆様も、ワークショップのどうぞよろしくお願いいたします。

ご提案、口頭発表やポスター発表の申し込みなど、ご協力い山西

ただけると幸いです。

芳裕（名古屋大学大学院情報学研究科）

国際会議参加報告
GLBIO2023
田原沙絵子（筑波大学医学群医学類6年）

2023年5月15日から5月18日にかけて、カナダのモントリ

は36演 題（採 択 率41%）、ポ ス

オールで行われたGreat Lakes Bioinformatics Conference

ターは69演題（採択率97%）、（GLBIO2023）に参加させていただきました。今回は私にlateポスターは11演題（採択率

とって初めての国際学会参加で、戸惑いも多々ありましたが、69%）となっていました。口頭学会参加者の方は、大変優しく親切で、熱心にディスカッショ

発表では、シングルセル手法・ンすることができました。GLBIO2023は日本人がほとんど

regulatory genomics や GWAS

参加していない学会であったこともあり、本稿では、その学に関連する手法、系統樹や次元会の様子をお伝えできれば幸いです。

圧縮のアルゴリズムなどの内容

GLBIO2023は、ISCBの関連グループであるGreat Lakes

2を広くカバーしている印象でしBioinformatics Consortium（GLBC）が運営する国際学会で、た。参加者のほとんどは、カナダ・アメリカの大学に所属しGreat Lakes（五大湖）周辺の研究者らのネットワークを広げ、ている方で、他の日本人研究者と会うことはありませんでしコネクションを作っていこうという趣旨で開催されている国た。ISMB等の大きな学会に比べると小規模の学会ではありま際学会です。前大会はコロナ禍でオンライン形式でしたが、したが、coffee breakやバーチャルプラットフォームなどを

今大会はオンサイトとオンラインのハイブリット開催となり通して、より多くの方と顔見知りになり、親密にディスカッ

ました。私は、幸いにもTravel Fellowship Awardをいただ

ションをすることができる印象を抱きました。

いたため、旅費の一部を支援していただく形で、カナダ・モ

私は、“Potential impact of unmeasured transcription factor

ントリオールのMcGill大学で現地参加致しました。参加者はChIP-seq data on human omics studies”というタイトル

200人程度で、Full paperは6演題（採択率55%）、Oral session

でポスター発表させていただきました。ポスター内容は、事No.43（June, 2023）

前にバーチャルで5分程度のフラッシュトークとポスター

でポスター発表の著者らとチャットができるようになっておPDFの形で公開されるようになっており、オンラインでポス

り、コネクションをつくって行こうという本会の趣旨に沿っター発表のビデオとアブストラクトを見て予習をし、オンサた素晴らしいハイブリット形式となっていました。実際に、イトで気になる発表を見に行くことができました。現地での現地の学生の方何人かと親しくなり、学会終了後に食事へ行

ポスター発表では、ランチタイムと同じ時間帯に設定されてき、研究内容や問題意識の共有をしたりすることができましいたこともあり、フランクな状態で話しやすく、どの参加者た。

の方も親身に研究について聞いてくださりました。鋭い指摘

GLBIO2023への参加は、私にとって初めての一人海外渡や良いフィードバックをもらい、今後の良いコネクションを

航・国際学会参加であり、一人も知り合いがいない中での参作ることができました。また、オンラインでは、学会の前後

加で不安と緊張に押し潰されていましたが、研究の話をすればすぐに打ち解けられ、概ね楽しむことができました。また、バイオインフォマティクスを志す研究者が、日々抱いている
様々な問題意識は世界共通であることを認識できたことも私の中では大きな収穫でした。国際学会の雰囲気を知ることができ、大変刺激的で有意義な経験をすることができたのも、素晴らしい指導とサポートをしてくださった尾崎先生、なら

JSBi News Letterびに協力してくださった全ての方のおかげになります。この場を借りて御礼申し上げ、
本稿の結びとさせていただきます。

写真1：Coffee breakでポスター付近に集まる参加者の様子

写真2：筆者がポスター前で撮影した写真

国際会議開催報告
ICBCB2023
田口善弘（中央大学理工学部物理学科）

今回、中国杭州市にある浙江大学で4/21-23の日程で行われ言うとChairだ ったMing Chen

た2023 11th International Conference on Bioinformatics

が友人だったから（後述）に尽and Computational Biology（以下、ICBCB2023）に参加、きる。採択された内容はIEEEの講演し一部運営にも関わったのでその報告を行いたい。JSBiのプロシーディングには掲載され事実上の年会となっているIIBMPとICBCBが扱う研究分野はほるがはっきりとしたジャーナル

ぼ被っている。group photoからも解るように100人程度の規トラックはない（後述）。

模の小さな研究集会である。似たような名前のこの手の研究会

杭州市は大学の名前にもなっはたくさんあるが、そのなかでなぜICBCB2023に行ったかとている浙江省の省都であり、位No.43（June, 2023）

3

JSBi News Letter

置的には上海から電車（新幹線）で1時間程度の位置にある。

されおり、オンラインの方はでなくてOKという扱いだった。

また、南宋の首都だったこともある歴史ある街であり、総人

講演はKeynoteが4つ、invitedが13、その他一般講演が74

口は一千万を越え、13路線におよぶ地下鉄網が網の目の様という布陣であったが、オンサイトの一般講演はオンラインに張り巡らされた昨今の中国の大都市の例に漏れない発展著

では配信されず、ちゃんと登録料を払っているであろうオン

しい都市である。会場となった浙江大学もTHE（タイムズ

ライン参加者にはオンサイトでの一般講演の内容はうかがい

ハイヤーエデュケーション）の世界大学ランキングで67位知ることができないような作りになっていて、invitedのう（2022年ランキング）と東大以外のすべての日本の大学をち、午後の一般講演の枠の合間に行われた4つの講演もオン上回る世界的な研究大学である。

ライン配信はされていないように見えた。良くも悪くもオン

ICBCB2023が行われたのは浙江大学メインキャンパスの片ラインはおまけ的な扱いの運営がされていた。23日の午前

隅にあるホテルで、これは大学が経営しているホテルだそうにもkeynoteとinvitedがあったのだが聴衆は20人しかいなである。僕は事情があってこのホテルには滞在できなかった

い感じだった。

のであるが、小規模の国際会議をやる場合にも会場探しに奔

オンサイトの講演内容は十分にレベルが高いもので、少な走し無くてはいけない日本の大学人からみると大学が会議場

くともIIBMPでの口頭講演に匹敵するレベルの高さでKeynote

付きのホテルを持っているというのは大いに羨ましく感じた。

やinvitedも含めて時間と手間をかけて参加したのにの内容か

また、Ming Chenの話ではミッキーという愛称で呼ばれていというがっかり感は全く無く非常に充実した内容であった。

る有能な秘書がすべてを取り仕切っていて自分は何もしていここでは講演内容以外のいろいろな印象について述べたい

ない、ということだった。フルオンラインだったIIBMP2021と思う。まず、中国人ではないオンサイトの参加者はほぼ皆のプログラム委員長をやらせて頂いた時に現地実行委員会の無だった様に見えた。僕ともう一人オックスフォード大から大変な労力を脇で見ていた立場からすると非常に羨ましく思の参加者が明らかに中国人で無かったのだが彼もキャンパス

えた（ミッキーの話では彼女は国際会議専任の秘書でそれだ

見学会に中国人女性連れで現れたので僕もMing Chenの友人

けをやっているということだった）。

として参加したということを考えるとオンサイトの参加者に

日程的に4/21-23と言っても中国で開催される中小規模のは純粋な非中国人は皆無だったと言ってもいいかもしれない。

国際会議によくあるように初日の4/21はレジストレーション

実際、
休憩時間など完全に中国語の会話の時間になってしまっだけで研究発表が行われるのは4/22と4/23のみである。また、ていた。そのような環境なのに国内会議の趣が無かったのは、（ポスト）コロナ時代のご多聞に漏れず、この会議もオンサ

前述の内容の質の高さもさることながら、アメリカの一流大イトとオンラインのハイブリッドで行われたが、4/22がオン

学のポスドクや院生とおぼしき若手が当該大学の所属のまま

サイト、4/23はオンラインと完全に日程が別れており、オン講演を行っていて、実際に研究が行われている場所に関するライン開催の4/23についてはオンサイトの会場のたぐいは限り十分に国際性が感じられたということがある。IIBMPでまったく準備されず、各自勝手にログインして下さい、といはこの様な立場での若手の発表はあまり見られない。日本のう感じで開催されていてかなり盛り上がりを欠いていた。そ現在の若手研究者のキャリア形成は海外の一流大学で博士号の意味ではこれまた中国で開催される国際会議で常態化してをとったり、ポスドクを経験した後抜擢されて日本の大学でいるno show（論文は採択されたがそれはあくまで実績作り

PIになるということがあまり行われておらず、対して中国のであって実際の学会参加は交通費などを節約するために出席

大学ではこれが一般的（な様に見える）なので、若手が安心しない）防止のための代替策という感じであって、おまけのして海外で活躍できるのが理由かもしれない。また、女性参様な感じであった。実際、オンサイト参加者用に4/23午後に加者の多さも目立った。バイオインフォマティクスは若い分

はon line講演と並行する形で堂々とキャンパス見学会が企画

グループフォト：会場となった大学経営のホテルの正面玄関の前で。

4

No.43（June, 2023）

休憩時間：オンサイトの講演の間には茶菓が振る舞われた野であり、日本の研究集会でも往々にして僕が最年長になってしまうことが多いのであるが、それに輪をかけて若手が多くその半分は普通に女性の様に感じられた。また、若者の中にはすでにPIとなっているものも多いとのことだった（ただし、Ming Chenの話では日本と同じく5年の任期付きでその間に成果が出せなければ簡単に首を切られるという厳しさのよ
うだったが）。Ming Chenの話ではBioinformaticsのポスドク
はアメリカより給料が高いぐらいだそうで若い人にも人気の分野だと言うことであった。
キャンパス見学のことも少しだけ触れておく。参加したのは数少ない外国人と他大から来た学生で十数名規模だったがMing Chenは丁寧に広大なメインキャンパスを何時間もかけ

キャンパス見学会：大学の記念館の中でキャンパスの立体模型を説明するMing Chenて案内してくれた。池や森があり野鳥が飛んでいる広大な美
しいキャンパスに次々と新しい建物が立てられており世界的している（国民の意思と関係なく政府が決断できるから）こな研究大学で学ぶ環境と良好な住環境が一千万都市の傍らにとのコインの裏面かとちょっと複雑な気分になった。
最後にMing Chenとの馴れ初めに触れて終わりにする。
Ming Chenとは2019年にキューバで開催された国際会議に室セミナー（いわゆる進捗報告会）にも誘われたのだが、な

共に招待講演者として選ばれて出会ったのが縁である。このんとそれは日曜の19：00のことで僕のために特別にその時間

研究会はキューバまでの交通費は招待講演者でも自分で出さにしたのかと思ったら毎週その時間だそうで、学生は文句をなくてはならず、そんな条件でわざわざ行くのかと感じる日

言わないのかと尋ねたらMing Chenは灯りが明々と灯ってい本人は多いと思うが、行った先でたった2名の東洋人としてる高層の学生寮を指差して「見ろ、ここの学生はみんな日曜知り合いになり、過去のICBCBではKeynoteも頼まれたしの夜も働いているんだ」と平然と言ったので驚いてしまった。

Publicity Chairというよく解らない立場だが運営側にも入れ環境にも学生の熱心さにも恵まれた浙江大学がちょっとうてもらっている。それでTHEのランキングで京大より上のらやましくもなったが、それでも考えさせられることはあり、大学の教授とコネができたと思うと自腹を切って招待講演者

それはキャンパス見学会の最中に起きた。Ming Chenは浙として行くという謎の行動も案外無駄ではなかったのかな、

江大学のことをとても誇りに思っているらしく、我々に大学と今でも思っている（その縁で今回のICBCB2023のジャーの歴史を展示した学内の博物館を見せるのを楽しみにしていナルトラックのゲストエディタも頼まれたはずだったが、現たのだが、実際に行ってみると入館を拒否された。どうやら

状まだ特集号は立ち上がっていないようである）。どんな研

誰か「偉い人」が急に来ることになったらしく、その人はま究会でも後に繋げられるかは本人次第なのでコロナで途絶えだ来ていないにも関わらず、入館が許されなかったのだ。温がちであった交流も再開する昨今、積極的にその手の研究会

厚なMing Chenがかなり怒っていたので彼らにとっても余にも行っておくほうが良いのではと改めて感じた次第であ程のことだったのだろうけど、その偉い人はきっと共産党のる。最後に自分がKeynoteだったICBCB2020でIEEEのプロ関係者で、そういう人が来るとなると問答無用で博物館の様

シーディングが事故で刊行されず、採択された論文の掲載がな公的な場所が立入禁止になってしまうのには違和感を持っ翌年送りになってしまったことがあった。僕を信頼して（宣た（僕は結構、中国で中小規模のバイオインフォマティクス

伝を頼まれたので国内向けに告知を行いました）投稿してくの国際会議で行っているのだが過去にも同じようなことがださった皆さんにはこの場を借りて深くお詫びします。

JSBi News Letter

用意されていると思うと浙江大学の学生は非常に恵まれていると感じた。実はキャンパス見学会の後にMing Chenの研究あった）。日本でアカデミアに十分な投資がされないのは民主主義だから（＝国民がそれを望まないから）という面があ会議のサイト：http://www.icbcb.org/

ると思うと、この「事故」は浙江大学が恵まれた環境を満喫

No.43（June, 2023）

5

バイオインフォマティクス分野の新学科設立〇東京医薬看護専門学校バイオデータサイエンス学科が開講しました笈川 あずさ（滋慶学園 東京医薬看護専門学校 バイオデータサイエンス学科）
岩崎 渉（東京大学 大学院新領域創成科学研究科・同学科アドバイザー）
バイオインフォマティクスを身につけるには、生命科学と情報科学という大きく異なる2つの分野を学ぶことが必要です。そういった理由からも、これまでバイオインフォマティ
クスを学べる環境は一部の大学や大学院に留まっており、研究室での研究活動を通じた学びが重視されてきました。一方
で、データサイエンス系の人材（技術者）への社会ニーズはJSBi News Letter

一般に高まり続けており、多様な人材を育成できる幅広い環境の整備が進みつつあります。バイオインフォマティクス分野においてもそうした裾野の広い人材育成を行うため、2023年4月に、東京医薬看護専門学校バイオデータサイエン長の黒川顕先生、産業技術総合研究所主任研究員の延 優先

ス学科が新規設置されました。専門学校では、バイオインフォ生が参画し、カリキュラム作成のアドバイスやオープンキャ

マティクスを学ぶことができる初めての学科となります。

ンパス、高校教員向け講習会の実施などを行なってきました。

東京医薬看護専門学校は1979年に東京薬学専門学院とし今後、例えば医療・ヘルスケアの分野においては、より多て開校し、1984年に東京医薬専門学校と改組、2022年に看くの個人が多様なバイオデータを活用する社会が訪れると考護学科を新設し、現校名となりました。現在はバイオ系学科

えられます。そうした中では、基礎研究は当然のこと、予防と医療系国家資格学科を中心に14学科を運営しており、医療・医療・個別化医療なども含めた臨床現場、
民間企業によるサー

健康産業業界に貢献する人材育成を行なっています。例えば、

ビスの開発・運営など、より多くの、また、様々なタイプのバイオ系の技術者を養成する生命工学技術科（現：くすり総バイオインフォマティクス人材が必要とされてくるでしょ合学科）を1985年に設置し、大学や公的機関の研究所でのう。今回のバイオデータサイエンス学科の設置により、東京インターンシップ教育などを通じて多くの卒業生を業界へ輩

医薬看護専門学校にとっては次世代医療・創薬に対応できる

出してきました。バイオデータサイエンス学科では、これら教育機関へと進歩していくきっかけになるとともに、多様なの経験や資源を活用し、コンピュータを用いた大規模バイオ

人材を育成することでバイオインフォマティクス分野のさらデータ解析ができるバイオインフォマティクス技術者の養成なる発展に貢献していければと考えています。

を4年課程で行います。開講にあたり、顧問として千葉大学

ぜひ、本学会の先生方にも本バイオデータサイエンス学科

未来医療教育研究機構特任教授の菅野純夫先生、アドバイに注目いただくとともに、ご指導・ご鞭撻をいただければ幸ザーとして筆者の一人（岩崎）のほか国立遺伝学研究所副所

いです。

実習室1

6

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実習室2

実習室3
実習室4

JSBi News Letter

地域部会・公募研究会活動報告
北海道地域部会遠藤俊徳（北海道大学情報科学研究院・JSBi北海道地域部会長）

令和4年度はSARS-CoV-2オミクロン株を中心にCOVID-19

学：《最強素材》クモ糸と《最流行拡縮が繰り返され、翻弄された年でした。私が大会委員

強生物》クマムシ」が開催され長を務めた日本遺伝学会第94回札幌大会は、会場確保の問題ました。周知期間は短かったもも含めて現地開催の可否判断ができず、準備に手間取りましのの、COVID-19が小康状態とた。最終的にはハイブリッドで開催しましたが、予想以上になったこともあってか、200の現地参加者が多く盛会となりました。一方で、毎年この時期

座席は満席で、多数の立ち見がに実施される全学停電・電気設備点検日との兼ね合いもあっ出るほどでした。事後の懇親会て、事前の日程調整がうまく行かず、日本バイオインフォマも盛況で、関心の高さを伺わせ

ティクス学会の年会である生命医薬情報学連合大会と会期がました。地域部会活動としての重なってしまいました。両方に出席したい学生や関係者もい事前計画ではありませんでした

るので、今後はうまく調整できればと思っています。

が、バイオインフォマティクスへの期待と関心は徐々に高

令和4年10月17日（月）には佐藤昌直氏（北海道大学大学

まっていることを反映したものと思います。こうした場がま

院農学研究院）の企画により、農学部大講堂にて、荒川和晴

だ少ないので、今後は不定期でも良いので、こうした活動を氏（慶應義塾先端生命科学研究所）による講演「最強の生物

継続できればと考えています。

No.43（June, 2023）

7

関西地域部会

JSBi News Letter鎌田

真由美（京都大学大学院

医学研究科・JSBi関西地域部会長）

関西地域部会では、バイオメディカルにおける教育・啓発、

個人情報保護法の改正に伴い、産官学マッチングや異分野融合によるイノベーション促進を押さえておくべきポイントにつ

目的に、年に2回、バイオメディカル研究会を開催しており

いてご講演をいただきました。

ます。関西のみならず、全国からアカデミアや製薬企業など

京都大学の黒田知宏先生には、多様な方に参加をいただいております。2022年度は、5月

医療情報の管理とそのデータ活20日と12月7日に、第32回・第33回研究会を開催いたしま用のためにどういった基盤が必した。

要なのかについて、京都大学医第32回研究会は「最先端構造解析技術」をテーマに、構学部附属病院での取り組みを通造生物学・情報生物学・創薬の各側面から、5名の先生にごしてお話いただきました。
また、講演をいただきました。研究会のイントロダクションとして、

国立がん研究センターの河野隆志先生からは、がん遺伝子パ

長浜バイオ大学の白井剛先生には、構造決定の歴史的背景とネル検査で産み出される膨大なデータを管理する“C-CAT”

現状ついてご紹介をいただきました。そして、構造決定の実での取り組みについて、研究事例も踏まえてご紹介をいただ

験的側面からのお話として、大阪大学の加藤貴之先生にクラきました。そして情報技術について、産業技術研究所の花岡

イオ電子顕微鏡による構造解析の歴史から今後の見通しにつ悟一郎先生より、秘密計算の基本から技術発展の状況と、今いて、また、大阪大学の栗栖源嗣先生から、構造決定された後期待される実践的応用に向けた取り組みについてご講演を

構造情報の扱いについて、Protein Data Bankでの取り組み

いただきました。最後のディスカッションでは、参加者からを通してお話をいただきました。さらに、情報生物学の側面いただいたご質問、特に、亡くなった方のデータの扱いやゲからのご講演として、東京工業大学の大上雅人先生から、ノムデータを個人情報とする定義などについて、講師の先生

AlphaFold2の相互作用解析への応用等について、最新のごからご意見をいただきました。

研究を通して紹介いただきました。最後に、創薬の観点から

第31回・32回ともに、参加者からは「満足した」「大変勉のお話として、ぺプチドリーム株式会社の舛屋圭一先生に、強になった」とのお声をいただきました。快くご講演を引き創薬における構造解析の重要性と今後の構造予測への期待に受けて下さった講師の先生とご参加くださった皆様、運営委

ついて講演をいただきました。

員と事務局の皆様に、心から感謝申し上げます。

第33回研究会は「個人情報とデータ利活用」をテーマに、2023年度も2回の研究会開催を予定しております。次回、個人情報に該当するデータを扱う際に遵守すべき法令につい第34回研究会は、7月下旬〜8月に「配列を超えたゲノム構て学ぶとともに、実際どのようにデータを利活用するのか/

造解析」をテーマに開催予定です。今回はオンライン形式でできるのか、そして、今後適用が期待される情報技術に関しの開催ですので、是非、会員の皆様のご参加をお待ちしておて、4名の講師からご講演をいただきました。法令に関してります。

は、厚生労働省の鈴木和代先生より、令和4年に施行された

九州地域部会
竹本8

和広（九州工業大学大学院情報工学研究院・JSBi九州地域部会長）

令和5年度より前任の山西芳裕先生（現 名古屋大学大学院

研究者の方々が多くおられます

情報学研究科）から九州地域部会の部会長を引き継がせて頂が、地理的な制約もあり、連携きました。これまで、新型コロナウイルス感染症（コロナ）に課題が残されてきました。この影響で地域部会の活動は長く制限されておりましたが、コのような課題に対応するため

ロナの位置づけが5類感染症に変更されたことに伴い、活動に、オンラインの良いところはを再開・拡大させていく所存です。とはいうものの、九州地活用しつつ、九州の自然、歴史、域部会での交流が制限されて久しく、このような状況の中で文化、産業を生かしながら、バ

九州地域部会としての活動をどのよう再開させていくかを模

イオインフォマティクス研究者索しているところです。九州地域は個々で見れば素晴らしいが集まって自由闊達に意見を交No.43（June, 2023）

流できるような場を作りたいと考えているところです。
ただ、こと、TwitterなどのSNSを通してお気軽にご意見をお寄せ

私の見識の狭さから目の届かないところも多いかと存じまいただければ幸いです。多くのJSBi学会員にとって有意義なす。企画やイベントに関しては、皆様から多くのご意見、ご部会となるように努めてまいりますので、今後ともご指導い

要望、ご提案をいただけると幸いです。メールはもちろんのただければ幸いです。よろしくお願い申し上げます。

沖縄地域部会
池松 真也（沖縄工業高等専門学校 生物資源工学科・JSBi沖縄地域部会長）
2023年のJSBi沖縄地域部会の活動がスタートしました。

継続として、沖縄県商工労働部

新型コロナウィルスの影響も少しずつ和らぎ、感染症法上

ものづくり振興課の「健康・医の位置づけが、2023年5月8日（月）に「5類」に移行しま療データサイエンス人材育成事した。

業」の実施です。もう1点は、そのような中で、沖縄地域部会では今年度の重点行動とし

沖縄地域部会の学会員の増員とて、次の2点に取り組んでいきます。1つは、昨年度からの「バイオインフォマティクス技

沖縄県委託事業 令和５年度「健康・医療データサイエンス人材育成事業」

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JSBi News Letter

術者認定試験」合格者数8名以上の目標を達成することです。
1点目は添付のチラシに記載の事業案内に従って進行していきます。基本的にオンラインでの講義となりますが、社会的に対面での行事も盛んになってきていますので、今年度は、初めての試みとして「シンポジウム」
を企画しました。本学会長であります山西芳裕先生、広島大学の坊農秀雅先生、そして、産総研の井口亮先生に登壇していただく予定です。沖縄でのバイオインフォマティクスの普及を目指し、2024年10月に沖縄（那覇文化芸術劇場なはーと、他）で開催が予定されていますAsia Pacific Bioinformatics Joint
Congress2024につなげていきたいと考えています。
2点目の会員増員活動については、やはり次年度の国際学会が沖縄で開催されることで、先ずは企業様との連携で当該イベントを盛り上げていけるように準備し、多くの学会員の方々に「沖縄良かったよね〜」と思っていただけるように取り組んでいきたいと思います。
以上、2023年も、沖縄からも発信に努め、是非学会にご協力をお願いし、多くの皆様にサポートいただければと思います。どうぞ、よろしくお願い致します。

【受講お申し込み方法】
申込フォームまたは QR コードから受講お申し込みください。

https://forms.oﬃce.com/r/1QjfX6eMAQ
健康・医療データサイエンス人材育成委託業務受託コンソーシアム
一般社団法人トロピカルテクノプラス

E-mail: bsjinzai0406@ttc.co.jp TEL: 098-982-1100

No.43（June, 2023）

9日本のバイオインフォマティクス研究室
沖縄工業高等専門学校

生物資源工学科（池松研究室）

JSBi News Letter與古田英裕（沖縄工業高等専門学校

専攻科

生物資源工学コース1年）

沖縄工業高等専門学校（通称：沖縄高専）は2004年に設どの知の遺産や、縦の繋がりを立され、“日本の最南端にある高専”として知られています。

大切にしています。最近では、自然に囲まれ、教室からは海が見える素敵な校舎に、私達のGitを使ったコード管理や、手生物資源工学科、池松研究室はあります。池松先生の下、本

順 書 の 作 成、Snakemakeと い科5年生が4名、専攻科1年が3名、専攻科2年が2名所属してうツールを使ったワークフロー

おります。

の構築など、新しく研究室で研専攻している生物資源工学コースは、多種多様な亜熱帯性究を始める5年生がDry解析を資源など、立地条件に恵まれた生物資源を利用し、社会に貢始めやすいように資料を整理し献できるような学習を行っております。そのため、当研究室

ています。
また、
バイオインフォでは、マティクス技術者認定試験合格を目指した、学内向けの勉強

・沖縄の生物資源の「抗腫瘍活性能」や「抗アレルギー能」などの生理活性能評価会を研究室主体で開催しています。学科・学年を問わず、参加者を募っており、入学したての本科1年生から、バイオイ

・大宜味村（沖縄県内）長寿者の腸内細菌叢解析

ンフォマティクスに触れる機会があるのは、貴重な環境だと

・沖縄県産島豆腐およびパイナップルなどから単離された

自負しています。

乳酸菌の利用法検討

このような人材育成に関連し、沖縄高専は池松先生を中心のような、幅広い研究テーマを進めております。それぞれがに、『「Society 5.0型未来技術人財」
育成事業 GEAR5.0 防災・

違う分野を研究しているため、毎週行っているラボミーティ

減災・防疫分野』の中核拠点校として取り組みを行っていまングをはじめとした、ラボ内でのコミュニケーションは、新す。昨年度の12月には、「第1回ライフサイエンス・カンファ

鮮なアイディアを交換することができます。卒研室では、真レンス」をOISTで開催し、研究者および先生方の講演や、ん中にお土産などのお菓子が置いてあり、ラボ内の距離が近旭川高専、長岡高専、鶴岡高専、和歌山高専、宇部高専、新いこともこの研究室の良いところだと思います。

居浜高専の学生達と研究紹介・意見交換などを行いました。

大学の研究室との違いの一つ、「5年生から研究室に配属

その他にも、食品開発を行う県内企業がヒト介入試験を行され、最短で1年間、専攻科に進学したとしても3年間で研うための体制として「ヒト介入試験プラットフォーム構築事究室を卒業してしまう」というところに課題があります。学業」を実施しています。この事業では、次世代シーケンサー

部2年生の年齢で研究を始めることができるという魅力があのMiSeqと昨年度に導入された、NextSeqを活用して試験のる一方、1年間で各自が与えられたテーマを卒業論文としてデータ解析を行っています。

まとめなければならないため、歴代の先輩方の実験ノートな

冒頭でも少し紹介しましたが、池松研究室の一大テーマに、「大宜味村長寿者の腸内細菌叢解析」があります。大宜味村
は沖縄高専より北部に位置する村で、「長寿の里」として知られています。一方で、沖縄県はかつて「日本一の長寿県」として知られていましたが、厚生労働省による令和2年度の調査では、47都道府県中、女性が16位、男性はなんと43位という残念な結果となっています。沖縄県の長寿復活は早急に取り組むべき課題であるという考えから、当研究室では腸内細菌叢の視点で大宜味村長寿者の「長寿のカギ」を探索、沖縄
県産食材を利用した健康長寿を目指しています。
「大好きな沖縄で沖縄の研究をし、沖縄に貢献する」というのは、とてもワクワクするので、研究を進める推進力になっています。
最後になりますが、池松先生の「WetとDryの両方を扱え

10

No.43（June, 2023）

る人材に」という教えをベースに、日々の研究に取り組んでいます。今後も、「バイオインフォマティクスに興味のある
中学生・高専生を増やす」といった、人材育成も含めて頑張っていきますので、応援していただけると嬉しいです。

JSBi News Letter

会員による著書紹介
複雑ネットワークと制御理論（阿久津達也、ホセ・ナチェル著）
近年、生体ネットワークの制御に関して、ドライバー遺伝子などの推定も含め、様々な研究が行われています。また、
生体ネットワークを含む複雑ネットワーク一般の制御に関しても様々な研究が行われています。しかし、筆者らの知る限
り、複雑ネットワークと制御理論の関係について明確かつ詳細に説明した本は（洋書も含め）ありませんでした。
本書では、グラフ理論や制御理論についての予備知識なしに複雑ネットワークに対する制御理論の本質を理解できることを目的としています。最初にグラフ理論、複雑ネットワー
ク、制御理論のそれぞれのエッセンスを説明した後で、複雑
ネットワークに対する制御理論の核心となる構造可制御性に

タイトル：複雑ネットワークと制御理論ついて詳細に説明しています。そして、グラフ理論における筆者：阿久津達也、ホセ・ナチェル

いくつかの概念と構造可制御性の関係、キャビティ法を用い216頁、4,950円、2023年6月刊行、森北出版

た制御頂点数解析、多層ネットワークの制御、バイオインフォ

https://www.morikita.co.jp/books/mid/081881

マティクスへの応用などについて説明しています。さらに、感染症ネットワークにおけるグラフの特徴量と感染伝播速度の関係性についても説明しています。コンパクトながらもこれらの分野の主要概念が明確に理解できることを心掛けて執筆されています。
本書では数学的厳密性を保ちつつも豊富な図や例を用いて、わかりやすく説明しています。その結果、2種類の読み方が可能となっています。定理の証明などの詳細は無視して例や図を主に見ることにより感覚的に当該分野の概要を理解
しようという読み方と、証明なども読み演習問題も解くことにより当該分野の研究を開始するに十分な素養を身につけようという読み方です。本書が多くの方々の目に触れ、バイオインフォマティクス研究の発展に寄与することを期待しています。
No.43（June, 2023）11

学会からのお知らせ
2023年日本バイオインフォマティクス学会年会・第12回生命医薬情報学連合大会 開催概要
第12回生命医薬情報学連合大会・日本バイオインフォマ
ティクス学会年会（IIBMP 2023）を2023年9月7日から9月9日までの日程で千葉県柏市柏の葉キャンパスエリアに立地する柏の葉カンファレンスセンターにて開催します。会場は、秋葉原からつくばエクスプレスで30分の柏の葉キャンパス
駅から徒歩1分と非常にアクセスの良い場所にあります。羽田空港からも直通バスがあり、日本各地からのご来場も比較的容易です。

JSBi News Letter

まず、柏の葉という場所について少しご紹介させていただ
きます。柏の葉エリアは、比較的新しい街です。1992年にりの第一人者の方をお呼びし、病気をなくすと言う目的のた

国立がん研究センター東病院、2000年に東京大学柏キャン

めにタッグを組んで今できることについて議論を行う予定でパスができましたが、その当時は公共交通機関がほとんど無す。こちらは、一般の方の参加も含め、街を巻き込んだ形式

くアクセスが非常に不便でした。しかしながら、2005年荒にすることを画策しています。その他にもいくつか仕掛けをれ地の中につくばエクスプレスの柏の葉キャンパス駅ができ用意しておりますので、ぜひご来場いただき体験していただてから環境が激変しました。その後、ショッピングモールやければ幸いです。

タワーマンションが建ち、様々なアンケートで住民の満足度が高い街になりました。
そして、この町には、がんセンターや東大以外にも千葉大学、国立情報学研究所、産業技術総合研究所もあり、「柏の葉キャンパス駅」の名前に相応しい研究街でもあります。実
際に、街では自動運転バスや電動キックボードの実証実験等
がまちづくりの一環として行われています。このような産学協賛の下地が既にあるまちで生物学・医学・情報学を融合した学会を行うことが今後の共同研究や各分野のさらなる発展に必ずや貢献するだけでなく、ひいては地域の発展に繋がると強く確信し、この地での開催を決定した次第です。
今回のテーマは、「人工知能技術（AI）とバイオインフォ
マティクス（BI）融合によりがん医療インフォマティクス（CI）へ繋ぐ未来」です。AIの技術は、マッハの速度で革新しており、これを無視したバイオインフォマティクスはも
はや成立しないと言っても過言ではありません。そして、これを医療に発展させていくがん医療インフォマティクス（cancer clinical informatics：CI）という用語をあえて作りました。AI＋BI＝CIという公式ができるような学会にしたいと思っております。もちろん、医療だけではなく、環境、
メタゲノム、遺伝学、アルゴリズム、ゲノム解析といった
AI、BI、CIに関連する内容での参加登録も大歓迎いたします。
本学会では、盛り上がるような仕掛けをいくつか考えております。その一つが、最終日に行われる一般公開シンポジウ
ム「柏発！世界から病気をなくす。〜情報科学の医療活用〜」です。このシンポジウムでは、医学・生物学・情報学・街作12

No.43（June, 2023）

研究者のみならず地域の皆様にも多くご参加いただき、学問と社会基盤の関係性、各分野がどのようにがん研究、診療へつながるのかを、最先端の研究についての話題も交えつつ

ともに議論し、共有できるような大会にしたいとおもってお開催概要

ります。どうぞ、皆様のご参加とご支援をよろしくお願いい
たします。
大会長
（東京大学大学院

穣

新領域創成科学研究科）
実行委員長（国立がん研究センター

鈴木

山下

理宇

会

期：2023年9月7日（木）〜9月9日（土）会

場：柏の葉カンファレンスセンター（千葉県柏市）

ＵＲＬ：https://www.jsbi.org/iibmp2023
テーマ：人工知能技術（AI）とバイオインフォマティクス（BI）
融合によりがん医療インフォマティクス（CI）へ繋

先端医療開発センター）ぐ未来
主催：日本バイオインフォマティクス学会（JSBi）
日本オミックス医学会

後

援：情報計算化学生物学会（CBI）

バイオインフォマティクス技術者認定試験

開催報告

画しています。受験者数がどこ（CBT）を継続し、受験者数は515名、合格者269名となりまで伸びるかわかりませんが、ました。受験者数は2021年の483名よりわずかに増え、合認定試験の認知度を高め、国家格率は例年と同じです。そこから首席合格者二人、若手奨励

資格への道を開くためにも受験

賞二人を選出しました。奨励賞を4年連続で輩出した沖縄県者数の増加は必要です。合格者

では健康・医療データサイエンス人材育成事業の成果として、に送るシールにも合格年の記載

沖縄工業高等専門学校がプレスリリースも実施しました。

をはじめました。運営コストはJSBi News Letter

2022年の技術者認定試験はコンピュータを用いた形式

CBT試験は60問120分の4者択一式で、改訂されたばかり増加するため受験料は少し値上の指定教科書「バイオインフォマティクス入門」（慶應義塾

げさせて頂く予定です。コロナ

大学出版）にある各章ごとに認定試験委員が問題集合を管理下で挑戦を続けてきた認定試験制度は事務局の齊藤友紀さん

しています。受験者毎にランダムに出題される問題と全員解（東京大学）と委員の先生方（資格試験のため匿名）の尽力答する問題を設定し、正解率を考慮しながら問題集合を更新により支えられています。また沖縄で特別会場を設置・担当します。認定試験合格者は年会費免除という制度を学会理事

してくださった池松真也先生にも御礼申し上げます。

の皆様にお認めいただいたお陰で、会員数の増加にも大きく

有田（国立遺伝学研究所

貢献できているようです。

正規

生命情報・DDBJセンター）

CBTの利点を更に活かすべく2023年は年間2回の実施を計

退任のご挨拶
日本バイオインフォマティクス学会会員の皆様れました。また、2022年はコロナの状況が見えない中でした

2021年4月より会長に着任し、この3月で2年間の任期を終えることになりました。
任期中は、学会の様々な活動に対して多大なご支援をいたが、オンサイトでの開催に舵を切り、テーマも環境から健康までとすべてのバイオの分野をカ

だき、感謝申し上げます。

バーするもので、500名を超え

着任当初の目標としてる参加者がありました。直接顔

1. バイオインフォマティクスという学問のこれからの発展を合わせて議論できることの良2. その中での若手支援と研究活性化の重要性さを改めて感じられた方も多3. 研究者を含めたアウトリーチの拡充

かったのではないでしょうか。
大会長を務められた浜田先生、の3つを挙げました。それぞれ、これまでの活動の継続を基

水口先生を始め、関係者の皆様に感謝申し上げます。2023

本としつつ、発展させるというスタンスで進めてきました。

年度は柏の葉で9月7日〜9日に開催されます（大会長：鈴木バイオインフォマティクスという学問の発展としては、年穣先生、実行委員長：山下理宇先生）。詳細は現在最終調整会を中心として幅広い分野の研究者に参加していただけるよ

中ですが、ぜひご予定下さい。

うなテーマ設定をしていただきました。2021年の年会は前

また、2024年の国際会議開催に向けた準備も進んでいます。

年に引き続きオンライン開催で1,000名を超える方が参加さ

APBioNET、ISCB、APBC、AASBi/GIW、BioClues、
No.43（June, 2023）

13

GOBLETと共同でAsia & Pacific Bioinformatics Joint Congress

有志による輪読に使っているなどの報告もいただいていまを2024年10月22日（火）〜25日（金）に沖縄県那覇市で開催す

す。Wikipediaの記載内容ブラッシュアップなどはできませる予定です。現在、ローカルオーガナイザを中心に APBioNETんでしたので、次期執行部へ引き継ぎたいと思います。

など国際委員会のメンバーとも相談しつつ内容を詰めているとこの2年間は前会長の岩崎先生を中心とした学会の改革がころです。台風の時期も過ぎ、いい季節ですので、今から日程

軌道に乗り、安定した運営ができました。会員数も着実に増を確保していただければ幸いです。

え1,000人を超える勢いです。学会運営を支えてくれてきた

若手支援と研究活性化についてはOxford Journals-JSBi
Prizeと 研 究 会 支 援 を 継 続 し て 行 っ て お り ま す。Oxford

変お世話になりました。ありがとうございました。

Journals – JSBi Prizeの募集は年度明けに行いますので、一方で、新しい方向性を打ち出すなど積み残した課題も多奮ってご応募下さい。若手支援で計画していた、後藤修先生

くあります。
これらについては力不足をお詫びするとともに、の基金の規程がまだできておりません。これについては、年

2023年度からの会長である山西先生に託したいと思います。

会優秀発表賞や旅費支援などの形で整える予定で検討しておよろしくお願いいたします。

ります。もう少しお待ちいただければ幸いです。

最後になりましたが、学会員の皆様に改めて感謝申し上げ

アウトリーチについてもバイオインフォマティクス技術者

JSBi News Letter

理事・幹事の先生方、総務担当の岩崎先生と牛山さんには大ますとともに、引き続き学会活動へのご支援・ご協力をいた

認定試験の受験者、JSBi Bioinformatics Reviewのアクセス

だければ幸いです。

数など着実に伸びており、バイオインフォマティクスの裾野

2021年度-2022年度 日本バイオインフォマティクス学会会長の広がりを感じています。JSBi Bioinformatics Reviewでは

五斗

進

学会議事録等
特定非営利活動法人日本バイオインフォマティクス学会 2023年度通常総会議事録
1．日時

2023年3月29日（水）17：30〜18：00

第三号議案

2．場

所

オンライン

3.1

3．正会員総数
出席した会員数内訳

役員選任の承認可否

新理事候補者の承認

751名

議長は、理事11名が2023年3月31日に任期満了となる257名ため、その改選について議場に諮ったところ、当法人の細

本人出席

35名

則第2条に定める選挙（2023年2月7日〜 2月21日実施）

委任状・電磁的表決出席222名により選出された新理事候補者10名が、出席した会員の（権限を議長に委任202名、議決権の過半数を持って異議なく可決決定され、被選任者

議決権行使20名）

は、いずれもその就任（就任日 2023年4月1日）を承諾した。
3.2 理事長の承認 および3.3 理事長の承認および理事長の4．議事録署名人選任の経過
定款第26条により議長を五斗進理事長が務めることと理事としての任期が、理事長の任期よりも先に終了してしまうことに伴う新理事候補者 1 名（細則第2条（5）による）なった。議長が定足数を確認し、議長が松井求理事ならびに議長は、2023年3月31日付での理事長の任期満了に伴尾崎遼理事を議事録署名人に指名したところ、満場異議なくい、細則第3条に基づき、山西芳裕副理事長を理事長にこれを承認した。

選任することの承認、および、細則第2条（5）に基づき、理事長の理事としての任期が、理事長の任期よりも先に

5．議事の経過の概要及び議決の結果終了してしまうことに伴う新理事候補者1名の承認につ第一号議案

2022年度事業報告および収支決算の承認可否

いて議事に諮ったところ、出席した会員の議決権の過半

議長は、これを議事に諮ったところ、満場一致を持って異数を持って異議なく可決決定され、被選任者は、いずれ

議なく可決決定した。

もその就任（就任日2023年4月1日）を承諾した。
3.4

2023年度事業計画および収支予算の承認可否

議長は、総会に先立って本日13時30分より行われた、

議長は、これを議事に諮ったところ、満場一致を持って異2023年3月31日付での任期満了に伴い、副会長選挙の報

第二号議案

議なく可決決定した。

14

副理事長の承認

No.43（June, 2023）

告を行った。当法人の定款第14条および細則第4条に基づき、理事21名、および新理事候補者10名による会長選

3.6

新監事の承認挙の投票の結果、浜田道昭理事が過半数を獲得し副会長

議長は、監事 河合盛進会員、根本航会員が2023年3月に指名された。浜田道昭理事を選任することを議場に31日で任期満了につきその改選方を議場に諮ったとこ

諮ったところ出席した会員の議決権の過半数を持って異ろ、満場一致をもって、河合盛進会員、西村陽介会員が議 な く 可 決 決 定 さ れ、 被 選 任 者 は そ の 就 任（就 任 日監事に選任され、被選任者はいずれもその就任（就任日2023年4月1日）を承諾した。

2023年4月1日）を承諾した。

3.5 副理事長の理事としての任期が、副理事長の任期よりも先に終了してしまうことに伴う新理事候補者1名（細以上により議事が終了し、議長は18時閉会を宣言した。

則第2条（5）による）
該当しないため、審議しなかった。

上記の議決を明確にするために、議長および議事録署名人
において次に記名押印する。

最後に改選される理事氏名は下表にまとめた。
2023年3月29日

2023年3月31日に2023年4月1日に任期終了となる理事11名就任する理事11名

特定非営利活動法人日本バイオインフォマティクス学会

潔

有田

正規

浅井

潔

有田

正規

理

長

五斗

進

印

荻島

創一

尾崎

遼

岩崎

渉

大上

雅史

事

議事録署名人

松井

求

印

木下

賢吾

五斗

進

河口

理紗

小寺

正明

議事録署名人

尾崎

遼

印

清水

佳奈

白井

剛

清水

佳奈

松田

秀雄

竹本

和広

福永

津嵩

松本

拡高

水谷紗弥佳

山西

芳裕

山西

芳裕

JSBi News Letter

浅井

特定非営利活動法人 日本バイオインフォマティクス学会 第28回理事会議事録日時

2023年3月29日（水）13：30〜17：30

場

所

東京大学柏の葉キャンパス 駅前サテライト6

別紙1.1 2022年度事業報告書

階605（千葉県柏市）、オンライン

別紙1.2 2022年度財産目録

五斗進理事長、山西芳裕副理事長、浅井潔理

別紙1.3 2022年度貸借対照表

事・新理事、有田正規理事・新理事・幹事、別紙1.4 2022年度活動計算書

荻島創一理事、尾崎遼理事・幹事、清水佳奈

別紙1.5 2022年度計算書類の注記

理事・新理事、白井剛理事・幹事、竹本和広

別紙1.6 予算対比正味財産増減計算書（理事会のみ）

理事、福永津嵩理事、沖真弥理事、鎌田真由

別紙2.1 2023年度事業計画案

美理事・幹事・地域部会長、川上英良理事、

別紙2.2 2023年度予算案

木下聖子理事、佐藤健吾理事、遠里由佳子理

別紙3-6 第28回理事会審議事項（第三号議案〜六号議案）

出

席

者

事、夏目やよい理事、浜田道昭理事・幹事、松井求理事、山下理宇理事・幹事（表決書提出） 該当者なし
以上
オブザーバ

20名出席扱い（報告事項参照資料）
別紙h1.1 年会幹事

2024年年会について

別紙h1.2 2022年度年会開催報告（後日追加）＊＊

別紙h1.3 2023年度年会開催報告 （当日共有）＊

奥田修二郎幹事、笠原浩太幹事、岩崎渉新理

別紙h3 認定試験幹事

事・幹事、松本拡高新理事・幹事、水口賢司

別紙h4 研究会幹事

幹事、大上雅史新理事・幹事、大林武幹事、

別紙h5 ニュースレター幹事

武藤愛幹事、齋藤裕幹事、河口理紗新理事、

別紙h6 JSBi Bioinformatics Review幹事

小寺正明新理事、松田秀雄新理事、西村陽介

議長（審議事項参照資料）

2022認定試験実施報告＊

研究会開催報告
報告事項

Bioinformatics Review誌報告

新監事、河合盛進監事、事務局総務牛山絵美

別紙h8 ISCB幹事

報告事項

子

別紙h11 連携幹事 情報計算化学生物（CBI）
学会との連携五斗進理事長（定款35条による）

別紙h11 連携幹事 参考資料
別紙h14 活性化幹事 要望書のルール案＊

配布資料
議事次第

別紙h18.1 総務幹事

会員統計 審議事項議事録（2019年度、2022年度後半分）
No.43（June, 2023）

15

別紙h18.2 総務幹事

2022年度版JSBi年間業務予定表

別紙h26 公募研究会

2022b-05「第33回バイオメディ

カル研究会（関西地域部会）「個人情報の扱いすることとした。
3.4

副理事長の承認とデータ利活用」」

議長は、総会に先立って本日13時30分より行われた、＊当日幹事から直接共有された資料

2023年3月31日付での任期満了に伴う副会長選挙の報告＊＊後日幹事から提出された資料を行った。当法人の定款第14条および細則第4条に基づき、理事21名、および新理事候補者10名による会長選挙

五斗理事長、山西副理事長より第28回理事会開催にあたっの投票の結果、浜田道昭理事が過半数を獲得し副会長にて挨拶があり、議事録署名人として松井求理事、尾崎遼理事指名された。浜田道昭理事を選任することを議場に諮っが指名され、満場異議なくこれを承認した。

たところ、満場一致をもって異議なく可決決定され、被選任者はその就任（就任日 2023年4月1日）を承諾した

議案

ため、総会に議案として付議することとした。

〈審議事項〉
第一号議案

2022年度事業報告および収支決算の承認可否

大林幹事より別紙1.1-1.6を基に2022年度事業報告および

JSBi News Letter

収支決算について報告が行われた。慎重な審議の結果、

3.5

副理事長の理事としての任期が、副理事長の任期よりも先に終了してしまうことに伴う新理事候補者1名（細
則第2条
（5）
による）

2022年度事業報告および収支決算は全会一致で可決され、該当しないため、審議しなかった。

総会に議案として付議することが承認された。
最後に改選される理事氏名を下表にまとめた。
第二号議案

2023年度事業計画および収支予算の承認可否

大林理事・幹事より別紙h2.1、h2.2を基に2023年度事業

2023年3月31日に2023年4月1日に任期終了となる理事11名就任する理事11名

計画および収支予算について報告が行われた。慎重な審議の

浅井

潔

有田

正規

浅井

潔

有田

正規

結果、2022年度事業計画および収支予算案は全会一致で可

荻島

創一

尾崎

遼

岩崎

渉

大上

雅史

決され、総会に議案として付議することが承認された。

木下

賢吾

五斗

進

河口

理紗

小寺

正明

清水

佳奈

白井

剛

清水

佳奈

松田

秀雄

竹本

和広

福永

津嵩

松本

拡高

水谷紗弥佳

山西

芳裕

山西

芳裕

第三号議案
3.1

役員の選任の承認可否（理事・監事）

新理事候補者の承認
五斗理事長は、理事11名が2023年3月31日に任期満了となるため、その改選について議場に諮ったところ、当3.6

新監事の承認法人の細則第2条に定める選挙（2023年2月7日〜 2月21

議長は、監事 河合盛進会員、根本航会員が2023年3月日実施）により選出された新理事候補者10名が全会一致

31日で任期満了につきその改選方を議場に諮ったとこ

で 決 定 さ れ、 被 選 任 者 は い ず れ も そ の 就 任（就 任 日ろ、満場一致をもって、河合盛進会員、西村陽介会員が2023年4月1日）を承諾したため、総会に議案として付議監事に選任され、被選任者はいずれもその就任（就任日することとした。

2023年4月1日）を承諾したため、総会に議案として付議することとした。

3.2

理事長の承認 および3.3

理事長の承認および理事長の理事としての任期が、理事長の任期よりも先に終了してしまうことに伴う新理事候補者1名（細則第2条（5）による）
議長は、2023年3月31日付での理事長の任期満了に伴

16

第四号議案

地域部会長の承認可否

五斗理事長より、2023年度の地域部会長について以下の提案があり、全会一致で異議なく可決された。
遠藤俊徳（北海道大学大学院情報科学研究院）北海道地域

い、細則第3条に基づき、山西芳裕副理事長を理事長に部会選任することの承認、および、細則第2条（5）に基づき、木下賢吾（東北大学大学院情報科学研究科）東北地域部会

理事長の理事としての任期が、理事長の任期よりも先に

鎌田真由美（京都大学大学院医学研究科）関西地域部会

終了してしまうことに伴う新理事候補者1名の承認につ森田瑞樹（岡山大学大学院ヘルスシステム統合科学研究科）

いて議事に諮ったところ、満場一致をもって異議なく可

中国・四国地域部会

決決定され、被選任者は、いずれもその就任（就任日竹本和広（九州工業大学大学院情報工学研究院）九州地域

2023年4月1日）を承諾したため、総会に議案として付議

部会

No.43（June, 2023）

池松真也（沖縄工業高等専門学校生物資源工学科）沖縄地

手、連携、研究会、ダイバーシティ推進、人材育成等に域部会携わる幹事によって構成される審査委員会が審査する（ただし利害関係のある者は当該公募研究会の審査には第五号議案

幹事の承認可否関わらないものとする）。審査委員会は、提出された計五斗理事長より、2023年度の幹事について以下の提案が画書に対して以下の観点から審査し、支援額を決定する。

あり、全会一致で異議なく可決された。

また必要に応じて申請者に計画の変更を要請する。採択

会長補佐：五斗進、岩崎渉
総務：岩崎渉結果は申請者に通知するとともに会員にも公表する。
（1）研究会がバイオインフォマティクスおよび関連分野の年会：木下賢吾、山下理宇（2023年大会長）、岩崎渉（2024年大会長）

発展に寄与するか。
（2）
研究会が法人とその会員、および広く社会に貢献するか。

会計：大林武

（3）
研究会の計画が実行可能で適切な費用を計上しているか。

認定試験：白井剛（4）
その他、審査会が必要と定めた評価事項。

研究会：岩崎渉
ニュースレター：尾崎遼、松本拡高〈報告事項〉

JSBi Bioinformatics Review：松本拡高、尾崎遼【各幹事、会長からの報告】

ダイバーシティ推進：武藤愛

1下理事・幹事）

若手：大上雅史

水口幹事より2022年度年会開催報告があった。特に3年振渉外：浜田道昭りのオンサイト開催（千里ライフサイエンスセンター・大連携：鎌田真由美

阪府豊中市）を実現し、500名を超える参加者が参加し、広報：齋藤裕

会計が黒字となったことなどが述べられた。山下理事・幹人材育成：有田正規、白井剛

事より別紙h1.3に基づき2023年度年会開催計画について

活性化：奥田修二郎

報告があった。年会幹事予定者の岩崎幹事より別紙h1.1

個別化医療推進：木下賢吾に基づき2024年度年会開催計画の進捗について報告がGenome Informatics：山西芳裕

あった。

JSBi News Letter

年会（木下賢吾理事・幹事・地域部会長、水口幹事、山ISCB：岩崎渉

また、大林幹事より、2022年度年会開催報告と2023年度
第六号議案

研究会運営規定改定の承認可否

年会開催計画については、年会開催規定第9条（開催計画）

岩崎幹事より別紙3-6を基に規定について以下の通りに改および第10条（開催報告書）に基づき、それぞれ資料に定したい旨の説明され、これを議事に諮ったところ、全会一基づき報告及び理事の承認を得る必要があるとの指摘があ

致で可決決定された。

り、後日メール審議を行うこととなった。

【旧】
（審査）
第5条

2

会計（大林幹事、笠原幹事）提出された計画書は理事会が別途定める委員で構大林理事・幹事より、インボイス制度への対応方針につい成する「審査委員会」が審査する。審査委員会は、提出ては、現状維持（適格請求書発行事業者にならない）とすされた計画書に対して以下の観点から審査し、支援額をること、2023年度は消費税納税年度であることが改めて決定する。また必要に応じて申請者に計画の変更を要請報告された。また、本体会計と事業会計（主に年会事業）する。採択結果は申請者に通知するとともに会員にも公の報告書に会計監査時にズレが生じてしまう問題について表する。

言及があり、後日、年会幹事と会計幹事にてミーティング（1）
研究会がバイオインフォマティクスおよび関連分野のを行うこととなった。

発展に寄与するか。
（2）
研究会が法人とその会員、および広く社会に貢献するか。

3

認定試験（白井理事・幹事）（3）
研究会の計画が実行可能で適切な費用を計上しているか。

白井理事・幹事より、別紙h3に基づき2022年度認定試験（4）その他、審査会が必要と定めた評価事項。

の開催報告があった。また、2023年度より年2回の開催（1回目7-8月、2回目11-12月）を行うことが報告された。

【新】

大林幹事より、2023年度開催の収支報告については、（審査）

2024年1月までに提出するよう依頼があった。

第5条

提出された計画書は全理事および学会活性化、若No.43（June, 2023）174

研究会（岩崎幹事）

鎌田理事・幹事・地域部会長より、別紙h11に基づき、生岩崎理事長・幹事より、別紙h4に基づき、2022年度公募研

物科学学会連合での活動について報告があった。また、生究会の開催報告・2023年度公募研究会の採択報告があった。

物科学学会連合のMLを活用できることについて案内があった。その他、連携の一環として、齋藤裕会員（20225

ニュースレター（尾崎理事・幹事、松本幹事）

年OJP受賞者）がCBI学会で講演し、江崎先生（2022年

尾崎理事・幹事より、別紙h5に基づき、ニュースレター

CBI学会若手奨励賞受賞者）が2023年度JSBI年会にて講に関する報告があった。次回第43号ニュースレターは年演を行う予定であることが報告された。

会開催前までに発行を目指していること、また、ニュース
レターの一部のブログサービスであるnoteへの掲載につ

12

広報（齋藤幹事）

いて、2022年9月公開後、約1000ビューとなったことが2023年年会ホームページについて、現状を確認するため、報告された。

山下理事・幹事とミーティングをすることとなった。

6

JSBi Bioinformatics Review（松本幹事、尾崎幹事・理事）
松 本 幹 事 よ り、 別 紙h6に 基 づ き、JSBi Bioinformatics

13

人材育成（有田幹事、白井理事・幹事）

報告は特になかった。

Reviewに 関 す る 報 告 が あ っ た。6月 上 旬 に 第4巻1号

JSBi News Letter（2023）、11月には4巻2号（2023）の公開を予定してい14活性化（奥田幹事）ることが報告された。特に4巻2号（2023）について、執奥田幹事より、別紙h14に基づき、要望書の依頼への対応

筆希望者や推薦などの依頼があった。

ルール案について報告があった。文章などの確認を行い、後日メール審議にて承認が得られ次第、ホームページに掲

7

ダイバーシティー推進（武藤理事・幹事）

載することとなった。

武藤理事・幹事より、2022年IIBMP実行委員会として、
今回より行動規範を追記したことが改めて報告された。また、オブザーバー加盟学協会として参加している男女共同

15

個別化医療推進（木下賢吾理事・幹事）

特に報告はなかった。

参画学協会連絡会の分担金は、今後正式加盟学協会となっても変更なしであることが報告された。

16

Genome Informatics（五斗理事長・幹事）

特に報告はなかった。
8

ISCB（岩崎幹事）
岩崎幹事より、別紙h8に基づき、ISCBに関する報告があっ17

会長（五斗理事長・幹事）た。 特 に、 岩 崎 幹 事 のISCB Board Member の 任 期 が五斗理事長より、後藤名誉会員からの寄付金の有効活用に

2024年1月で終了することから、ISCB Board Member公ついて検討中であることが報告され、用途（賞金・旅費・参募について積極的に推薦をお願いする旨の依頼があった。

加費補助）、利用期間（単発・継続）、効果などを検討し、後日、活用方法についてメール審議を行うこととなった。

9

若手（大上理事・幹事）
大上理事・幹事より、IIBMP2022のキャリアパス・ダイバー18

総務（岩崎幹事）

シティ合同セッションにて、「博士人材の多様なキャリア

岩崎理事・幹事より別紙h18に基づき、会員数等の統計情パス」についてのセッションを開催したこと、Oxford

報・メール審議（2022年9月〜2023年3月、2019年4月〜

Journals-Japanese Society for Bioinformatics Prizeにつ

2020年3月）・総務の年間作業表について報告があった。

いて対応したことが報告された。また、福永理事より生命白井理事・幹事より入会特典の効果測定・定着率確認を行

情報若手の会との連携状況について質問があり、大上理事・

うのはどうかとの提案があった。総務にて、確認すること

幹事より、現在はそれぞれが独立しているが連携の可能性となった。

があれば、検討していきたいと回答した。
19
10

渉外（浜田理事・幹事）

会長補佐（木下賢吾理事・幹事・地域部会長、岩崎幹事）

特に報告はなかった。

浜田幹事より、2022年度には賛助会員が一社退会したことが報告された。

【地域部会長からの報告】
20

11

18

連携（鎌田理事・幹事・地域部会長）

No.43（June, 2023）

北海道地域部会（遠藤地域部会長）

特に報告はなかった。

21

東北地域部会（木下地域部会長）

特に報告はなかった。

27

監事からのコメント（根本監事、河合監事）

河合監事より、年会収支簿と本体収支簿の記載方法のずれについて改善依頼があった。
その他、学会本体の資産が年々

22

関西地域部会（鎌田地域部会長）

特に報告はなかった。

増えているが、資産の活用方法について例えば、女性会員の増加や年会での託児所の設置などの提案があった。清水
理事より、子供を年会に連れて行くにあたりかかる経費の23

中国・四国地域部会（森田地域部会長）

特に報告はなかった。

補助金を申請するという方法もあることが述べられた。また、認定試験事務局の人件費に関しても、懸念事項として
上がった。

24

九州地域部会（山西地域部会長）
以上

山西副理事長・地域部会長より、地域部会長が竹本和広会員（九州工業大学大学院情報工学研究院）に代わることが報告された。
25

沖縄地域部会（池松地域部会長）

上記の議決を明確にするために、議長および議事録署名人
において次に記名押印する。

JSBi News Letter

特に報告はなかった。

以上により議事が終了し、議長は17時30分閉会を宣言した。

2023年3月29日
26

公募研究会 第33回バイオメディカル研究会（鎌田真

特定非営利活動法人日本バイオインフォマティクス学会
長

五

斗

進

印

2022年12月7日に開催された「第33回バイオメディカル

議事録署名人尾崎

遼

印研究会（関西地域部会）「個人情報の扱いとデータ利活用」」

議事録署名人松井求

印

由美地域部会長）

理事について別紙h26をもとに確認を行った。

No.43（June, 2023）

19

学会の現況
有効会員数（2023年6月現在）正会員：761名

特定非営利活動法人
会
副

会

長
長

山西
浜田

学生会員：244名

日本バイオインフォマティクス学会

地域部会長

遠藤 俊徳 （北海道大学大学院情報科学研究院）北海道地域部会
木下 賢吾 （東北大学大学院情報科学研究科）東北地域部会
鎌田真由美 （京都大学大学院医学研究科）関西地域部会
森田 瑞樹 （岡山大学大学院ヘルスシステム統合科学研究科）中国・四国地域部会
竹本 和広 （九州工業大学大学院情報工学研究院）九州地域部会
池松 真也 （沖縄工業高等専門学校生物資源工学科）沖縄地域部会理

沖真弥 （京都大学大学院 医学研究科）
鎌田真由美 （京都大学大学院 医学研究科）
川上 英良 （理化学研究所 先端データサイエンスプロジェクト）
木下 聖子 （創価大学 糖鎖生命システム融合研究所）
佐藤 健吾 （東京電機大学 システムデザイン工学部）
遠里由佳子 （立命館大学 情報理工学部）
夏目やよい （医薬基盤・健康・栄養研究所）
浜田 道昭 （早稲田大学 理工学術院）
松井
求 （東京大学大学院 新領域創成科学研究科）

JSBi News Letter

事

監

事

河合
西村

盛進 （トヨタ紡織株式会社）陽介 （海洋研究開発機構）

賛助会員一覧

（2023年6月現在、賛助会員口数および五十音順）
株式会社日立製作所
岩井化学薬品株式会社
株式会社BlueMeme
富士通株式会社
株式会社アンプラット
エーザイ株式会社
国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部
Crimson Interactive Pvt. Ltd.
塩野義製薬株式会社
住友化学株式会社
タカラバイオ株式会社
田辺三菱製薬株式会社
中外製薬株式会社
学校法人滋慶学園東京医薬看護専門学校
株式会社ナベ インターナショナル
ノボザイムズジャパン株式会社
一般社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム
有限会社パスウェイソリューションズ
三井情報株式会社

No.43（June, 2023）

名誉会員：5名

2023年度役員一覧

芳裕 （名古屋大学大学院 情報学研究科）
道昭 （早稲田大学 理工学術院）

山下 理宇 （国立がん研究センター 先端医療開発センター）
浅井潔 （東京大学大学院 新領域創成科学研究科）
有田 正規 （情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所）
岩崎
渉 （東京大学大学院 新領域創成科学研究科）
大上 雅史 （東京工業大学 情報理工学院）
河口 理紗 （京都大学 iPS細胞研究所）
小寺 正明 （株式会社Preferred Networks）
清水 佳奈 （早稲田大学 理工学術院）
松田 秀雄 （大阪大学 大学院情報科学研究科）
松本 拡高 （長崎大学 情報データ科学部）
水谷紗弥佳 （東京工業大学 生命理工学院）
山西 芳裕 （名古屋大学大学院 情報学研究科）

20

賛助会員：19社

JSBi News Letter

情報系技術者を募集しています
私たちは遺伝子治療、ワクチン製造、ゲノム解析などの革新的なバイオ技術の開発を通じて社会に貢献することを目指しています。情報技術の進化を活かし、バイオインフォマティクスの最先端トレンドにも挑戦。新たな領域での成長や社会的意義を実感したい方、多様な技術に関わりたい方、歓迎！
 遺伝子医療・再生医療
 PCR・NGS関連新製品開発
 バイオインフォマティクス解析 シーケンスデータ品質管理
 業務効率化パイプライン構築
 クラウド・ネットワークシステム構築など、活躍できる業務をご用意してお待ちしています！
http://www.takara-bio.co.jp/kaisha/boshu.htm

日本バイオインフォマティクス学会ニュースレター第43号
発 行 日

2023年7月31日

発 行 者

特定非営利活動法人日本バイオインフォマティクス学会（理事長 山西芳裕）

編

尾崎遼・松本拡高（学会幹事）、牛山絵美子（学会事務局）

集

デザイン

ウチダヒロコ組

勝美印刷株式会社版

No.43（June, 2023）

21

JSBi News Letter

編集後記
季節が巡り、国内でも活動や交流になってきたことと思います。9月に千葉県柏市で開催される2023年日本

バイオインフォマティクス学会年会・第12回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2023）が楽しみですね。

また、p.12-13にさらっと記載がありますが、来年2024年10月にはJSBi共同開催の国際会議 Asia & Pacific

Bioinformatics Joint Congress が沖縄で予定されています！ こちらも今からカレンダーに書き込んでおきたいですね。

今号は特集はお休みですが、次号に向けて準備を進めておりますので、ご期待ください。

JSBi Bioinformatics Review は前号から「ChIP-Atlas 〜転写制御ランドスケープの歩き方〜」「COVID-19

パンデミック下におけるウイルスゲノム疫学の発展」「難病・希少疾患のためのゲノム医療とバイオインフォマ

ティクス」「ゲノムワイド関連解析のその先へ：統計的fine-mappingの基礎と発展」「タンパク質の言語モデル」
が公開となりました。スマホでも読みやすくしてあるのでぜひお読みください。

（尾崎・松本）みなさまこんにちは。
「学会の現況」を編集して気がつきましたが、学会会員数が1999年の学会設立から初めての1000名越えとなりました。来年2024年には、本学会は25周年の節目を迎えます。今後もより良い学会
運営ができるよう、みなさまのご意見・ご要望を、近くの理事・幹事の先生方や事務局へお寄せいただければと思います。柏で開催される年会でもどうぞお気軽にお声がけください。

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No.43（June, 2023）（事務局総務・牛山）