PubMed 関連情報データベース
Entrzd（アントレ）データベース

利用ガイド

2012
産業医科大学図書館

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PubMed 関連情報データベース

PubMed は関連情報を探すためのﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽへﾘﾝｸされています。

ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽはｻｰﾁﾎﾞｯｸｽの横のﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから選択します。
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NLM Catalog

NLM Catalog は、NLM での所蔵資料に限らず図書、雑誌、視聴覚資料、ｺﾝﾋﾟｭｰﾀｿﾌﾄ、電子的情報源などの書誌情報を検索できます。
検索方法は、ｷｰﾜｰﾄﾞを掛け合わせる演算子（AND、OR、NOT は大文字）や各機能の使い方など、基本的には PubMed の場合と同様です。
①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[Search]をｸﾘｯｸします。
②検索件数が表示されます。
③ﾀｲﾄﾙの部分をｸﾘｯｸすると、詳細情報が表示されます。
④[NLM ID]を ｸﾘｯｸすると LocatorPlus の情報が表示され、NLM の配架場所などが参照できます。

※図書だけでなくﾋﾞﾃﾞｵﾃｰﾌﾟなどが検索されます。

NLM の配架場所などが参照できます。

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1-2MEDLINEPlus＜http://medlineplus.gov/＞

上記の URL にｱｸｾｽすると[MedlinePlus]が表示されます。
MEDLINEPlus は、様々な一般向けの医学情報を検索できます。患者や一般の人々向けに開始されたｻｰﾋﾞｽで、政府機関や専門学会が提供する医学・医療情報や病院や医師のﾘｽﾄ、臨床試験や医薬品の情報などが参照できます。対象はあくまでも一般の人々を意識していて、医学知識があまりなく、英語に堪能でない人にもわかりやすいように、ｽﾍﾟｲﾝ語での情報提供もある他、文字の少ない、ｲﾗｽﾄや音声による 165 種類以上の自己学習ﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑ（Interactive Tutrials)も提供されています。
ｷｰﾜｰﾄﾞで検索する方法とﾒﾆｭ-から選択しながら目的の情報を探す方法があります。
① ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[GO]をｸﾘｯｸします。
② 左側にｺﾝﾃﾝﾂごとの検索結果が表示され、右側にそれぞれの見出しと情報の制作元が表示されています。
③Medical Dictionary の検索もできます。

ﾒﾆｭｰから選びながら目的の情報を探すこともできます。

疾患や症状に関する情報が記載され関連のある他のｻｲﾄにﾘﾝｸされています

医薬品情報では、米国薬局方に収載される医療用・一般用医薬品の医学事典は、豊富な写真やｲﾗｽ情報が掲載されています。商品名

ﾄにより分かりやすく解説さや分類、薬剤情報、使用の注意、れています。

副作用などが参照できます。

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ClinicalTrials gov

PubMed ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの More Resources でClinical Trials をｸﾘｯｸすると ClinicalTrials gov 画面に展開します。ClinicalTrials gov は、NLM が 2001 年 2 月から無料で公開している臨床試験のﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽです。臨床試験の協力者を募集したい公共や民間の研究者と臨床試験が進行中の新しい治療法を受けたい患者のための情報を提供しています。現在、米国の National Institutes of Health をはじめ、各政府機関、製薬企業などが行っているかすでに終了した、臨床試験の情報が登録されています。
① ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに疾病名や治療薬名を入力し、[Search]をｸﾘｯｸします。
※そのほか実施場所を指定した検索や病状、ｻﾎﾟｰﾄ機関、助成団体なども検索できます。
② 臨床試験が表示されますので、研究名をｸﾘｯｸします。
入力したｷｰﾜｰﾄﾞにｽﾍﾟﾙﾐｽがあっても、ある程度認識されます。

近いｷｰﾜｰﾄﾞがﾘｽﾄｱｯﾌﾟされます

各研究名をｸﾘｯｸすると、臨床試験の目的やｽﾎﾟﾝｻｰのほかの研究対象の疾患と治療法などの概要、応募基準と採用基準なども参照できます。

募集開始前

協力者を募集中

4下方には、実施場所や連絡先、MEDLINEPlus へのﾘﾝｸもあります。

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アントレの PubMed 以外のデータベース

PubMed のﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞのｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰからﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽを選択します。

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Nucleotide Database（GenBank)

ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから［Nucleotide］を選択すると、Nucleotide Database 画面に展開します。
Nucleotide Database は、National Institutes of Health（NIH)の GenBank のほか、日本のDNA DataBank of Japan（DDBJ)とﾖｰﾛｯﾊﾟの European Molecular Biology Laboratory（EMBL）から塩基配列データを検索できます。

検索方法は、ｷｰﾜｰﾄﾞを掛け合わせる演算子（AND、OR、NOT は大文字）や各機能の使い方など、基本的には PubMed の場合と同様です。
①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[Search]をｸﾘｯｸします。
②検索結果が表示されます。CenBank へのｴﾝﾄﾘｰや詳細情報やﾘﾝｸが表示されます。
初期値は GenBankですが、他にも FASTA 形式や Graphic 形式など、様々な形式で表示できます。

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Protein Database
ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから［Protein］を選択すると、Protein Database 画面に展開します。
Protein Database は、GenBank や DNA DataBank of Japan（DDBJ）、European Molecular BiologyLaboratory（EMBL）などの DNA 配列から翻訳されたﾀﾝﾊﾟｸ質配列データを検索できます。
検索方法は、ｷｰﾜｰﾄﾞを掛け合わせる演算子（AND、OR、NOT は大文字）や各機能の使い方など、基本的には PubMed の場合と同様です。
①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[Search]をｸﾘｯｸします。
②検索結果が表示されますので、ﾀｲﾄﾙをｸﾘｯｸすると、[GenPept]形式が表示されます。

そのﾚｺｰﾄﾞだけを他の表示形式を選んで表示できます。

Graphic 形式

GenPept 形式
詳細情報が表示されます。

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Genome Database

ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから［Genome］を選択すると、Genome Database 画面に展開します。
Genome Database は、1,600 種類以上のｳｨﾙｽと 180 種類以上の細菌のｹﾞﾉﾑ情報を検索できます。ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞには、最新のｹﾞﾉﾑ情報が掲載されています。
検索方法は、ｷｰﾜｰﾄﾞを掛け合わせる演算子（AND、OR、NOT は大文字）や各機能の使い方など、基本的には PubMed の場合と同様です。
①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[Search]をｸﾘｯｸします。
②検索結果のﾀｲﾄﾙをｸﾘｯｸすると、詳細ｹﾞﾉﾑ情報や文献情報、ﾘﾝｸが表示されます。
検索結果のﾃﾞｰﾀは、様々な形式で表示されます。

GenBank 形式
詳細なｹﾞﾉﾑ情報や文献情報様々なﾘﾝｸが表示されます。

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Structure Database

ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから［Structure］を選択すると、Structure Database 画面に展開します。
Structure Database は、生体高分子の三次元構造をｷｰﾜｰﾄﾞで検索できるﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽ、Molecular Modeling Database（MMDB）を検索できます。

検索方法は、ｷｰﾜｰﾄﾞを掛け合わせる演算子（AND、OR、NOT は大文字）や各機能の使い方など、基本的には PubMed の場合と同様です。
①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[Search]をｸﾘｯｸします。
②検索結果のﾀｲﾄﾙもしくは画像をｸﾘｯｸすると構造情報が表示されます。

立体構造が表示されます。

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PMC（PubMed Central） Database

ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから［PMC］を選択するとから【PMC】画面に展開します。
PMC（PubMed Central）は、論文の全文を無料で閲覧できるﾃﾞｼﾞﾀﾙ・ｱｰｶｲﾌﾞで、NCBI がPubMed や GenBank での経験を踏まえ、世界的規模の科学ｺﾐｭﾆﾃｨの一つとして開発したものです。
検索方法は、ｷｰﾜｰﾄﾞを掛け合わせる演算子（AND、OR、NOT は大文字）や各機能の使い方など、基本的には PubMed の場合と同様です。
①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[Search]をｸﾘｯｸします。
②検索結果が表示され、各ﾃﾞｰﾀの下に抄録や全文へのﾘﾝｸﾎﾞﾀﾝが表示されます。

全 文

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OMIM Database

ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから［OMIM］を選択すると、OMIM Database 画面に展開します。
OMIM Database は、Online Mendelian Inheritance in Man の略で、ﾋﾄ遺伝子や遺伝子疾患に関する情報の統合ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽ（Knowledge Base）です。各遺伝子に関する膨大な文献情報とﾃｷｽﾄなどが参照できます。この基になったﾃﾞｰﾀは Mendelian Inheritance in Man（JohnsHopkins Univ。刊）という教科書で、そのｵﾝﾗｲﾝ版である OMIM は毎日更新されています。
Molecular Modeling Database（MMDB）を検索できます。
検索方法は、ｷｰﾜｰﾄﾞを掛け合わせる演算子（AND、OR、NOT は大文字）や各機能の使い方など、基本的には PubMed の場合と同様です。
① ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから［OMIM］を選択します。
② 画面上部のｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[Go]をｸﾘｯｸします。
③ 検索結果が表示されますので、ｱｸｾｽ番号をｸﾘｯｸすると、詳細情報が表示されます。

疾患に関する解説やこれまでの研究のﾚﾋﾞｭｰ、参考文献ﾘｽﾄ、改訂の履歴などが参照できます。また、配列情報やﾏｯﾌﾟ情報へのﾘﾝｸもあります。

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Taxonomy Database

ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから［Taxonomy］を選択すると、Taxonomy Database 画面に展開します。
Taxonomy Database は、系統分類ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽで、NCBI 内の各ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽに登録された遺伝子情報を持つ生物が検索できます。国によってﾊﾞﾗﾊﾞﾗだった遺伝子ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽの分類法を統一るすために作られ、今では EMBL や DDBJ、SWISS-PTOT などにも採用されています。
検索方法は、ｷｰﾜｰﾄﾞを掛け合わせる演算子（AND、OR、NOT は大文字）や各機能の使い方など、基本的には PubMed の場合と同様です。
① ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから［Taxonomy］を選択します。
② ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[Search]をｸﾘｯｸします。
③ 検索結果が表示されますので、ﾀｲﾄﾙをｸﾘｯｸすると詳細情報が表示されます。

＜Taxonomy Browser＞
下位概念が階層構造で表示される他、上位概念が上部に横並びに列挙されています。
ｹﾞﾉﾑ情報や各 Entrez ﾃｰﾀﾍﾞｰ
ｽのﾃﾞｰﾀ数やﾘﾝｸが表示されます。

ｹﾞﾉﾑ情報や各Entrez ﾃｰﾀﾍﾞｰｽのﾃﾞｰﾀ数やﾘﾝｸが表示されます。

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