大安研ニュース No.12

地方独立行政法人大阪健康安全基盤研究所（３）水道水における PFAS の現状

ヨーロッパやアメリカ合衆国のいくつかの州では水道水は PFAS が摂取される

PFOS と PFOA 以外の PFAS を合算しΣPFAS とし経路のひとつです。厚生労働省て規制する考え方が出てきています（表 1）。ΣPFAS

は水道水に含まれる暫定目標値の対象が最も多い EU では 20 種が指定されています。

を PFOS と PFOA を合算してまた、どのような構造の PFAS を規制するべきかと50ng（ナノグラム）/L 以下としの議論も進められています。しかし、まだ議論の途まし た（表 1）。1ng は 1g の中であり、統一された見解がないことや、日本ではこ10 億分の 1 です。令和 2 年度に 32 種の PFAS をのような議論自体が行われていないことから、検出さ対象に実施した大阪府との調査では、検出された濃れた PFAS についての評価が困難です。

度が暫定目標値を超えることはありませんでしたが、PFAS の健康リスクや環境リスクを正しく評価するすべての水道水から PFOS と PFOA が検出されましために、大阪健康安全基盤研究所では国立医薬品食た。また、PFOS と PFOA 以外に多くの PFAS が品衛生研究所や東京都健康安全研究センター等の研

検 出 さ れ、日本 の 水 道 水 に お いても 多 種 多 様 な究機関と協力し、分析法の開発、日本国内におけるPFAS が存在していることが明らかとなってきていま存在状況の把握、世界の動向について積極的な情報す。

収集を行っています。

（生活環境課）

だいあん

けん ニュ

ース
No.12
2021年11月

地方独立行政法人大阪健康安全基盤研究所（略称「大安研（だいあんけん）」）は、皆さまの健康に役立つ情報を分かりやすくお届けするため、「大安研ニュース」を発行しています。
……………………

大安研ニュース

No. 12目

次・微生物の遺伝子を「全部」読む -------------------------------------------------------- １・身近にあるPFAS（ピーファス） ------------------------------------------------------ ３

表１ 各国の基準値（ng/L）
国・州

PFOS ＋ PFOA

日本

50

アメリカ合衆国

70

EU

ΣPFAS

ΣPFAS の内訳

100

PFBS, PFPS, PFHxS, PFHpS, PFOS, PFNS, PFDS,

90

スウェーデンPFUdS, PFDoS, PFTrDS, PFBA, PFPA, PFHxA,

ヒト・動物をはじめとする生物は、生命活動の維PFHpA, PFOA, PFNA, PFDA, PFUdA, PFDoDA,持や子孫へ形質（性質や特徴）を受け渡すための設PFTrDA

計図として、多数の遺伝子のかたまりを持っています。

PFBS, PFHxS, PFOS, 6:2FTS, PFBA, PFPeA, PFHxA,PFHpA, PFOA, PFNA, PFDA

100

デンマーク

PFBS, PFHxS, PFOS, PFOSA, 6:2FTS, PFBA, PFPeA,PFHxA, PFHpA, PFOA, PFNA, PFDA

全体を解読することは技術的に容易ではありませんでた遺伝子のみを増やして取り出すことのできる技術でした。1990 年代後半にインフルエンザ菌（表 1参照）

すが、これを利用して、ある遺伝子（A）を増幅します。

大安研ニュース第 11 号にて誤記がございましたので、下記のとおり訂正いたします。のゲノム配列が解読され、さらには 2003 年にヒト増やした遺伝子（A）を蛍光物質で目印を付け、サのゲノム配列の解読の完了が発表されるなど、技術的ンガーシーケンサーという機器で分析することで、そ● ２ページ（タイトル）（誤）デオキシニバレルーノ⇒（正）デオキシニバレノールな問題が解決されていきましたが、実際に行うには多の遺伝子配列を読むことができます。一般的にこの大なコストや労力が必要で、一般的な研究・検査としシーケンサーは、サンプルあたり数百～千個の配列を● ３ページ（誤）正の走行性⇒（正）正の走光性て行うのはまだまだ難しいものでした。

読むことができるため、１つの遺伝子（数百～数千個70＜大安研ニュース第 11 号の誤記訂正について＞を開設しました！
ぜひご覧ください！
大安研ちゃんねる

発行者

地方独立行政法人

大阪健康安全基盤研究所
Osaka Institute of Public Health〒537-0025 大阪府大阪市東成区中道 一丁目3番69号
TEL：06-6972-1321 FAX：06-6972-2393
E-mail：webmaster@iph.osaka.jp
Web：http://www.iph.osaka.jp/

４

サンガーシーケンサー
で配列を読むPFHxS, PFOS, PFHxA, PFOA, PFNA

メイン州

「大安研ちゃんねる」PCR で増幅PCR（ポリメラーゼ連鎖反応）という方法は、狙っ20または保持されています。
ますが、１つの遺伝子を読むことはできても、ゲノム

マサチューセッツ州「大安研ちゃんねる」で検索！

遺伝子（A）PFHxS, PFOS, PFHxA, PFOA, PFNA. PFDAPFHxS, PFOS, PFHxA, PFOA, PFNA

YouTube にて公式チャンネル

それぞれの生物内に DNA や RNA という物質として

図１ 遺伝子の解析工程（サンガー法）

20

QR コードを読み取る !

このような遺伝子のかたまりは”ゲノム”と呼ばれ、細菌やウイルスなどの微生物もまたゲノムを持っていバーモント州

動画配信を始めました！

微生物の遺伝子を「全部」読む

近年、遺伝子解析技術が著しく進歩したことで、私の配列からなる）の解読に適しており、現在最も普及たちの研究所（大安研）でもこの”ゲノム”の解読をしているシーケンサーです。得られたデータは波形と行うことができるようになってきています。ここでは、して確認することができ、最終的に遺伝子の配列とし大安研で行っている微生物の遺伝子解析を例に、１つて ATGC ～の記号に変換されたものを解析に用いまの遺伝子やゲノムをどのように解読しているか説明しす（図２）。

ます。
大安研ホームページには、その他多くのトピックスやイベント案内などを掲載しています（１）微生物の遺伝子を１つ読む

解析は、目的に応じて様々なやり方で行いますが、ここで例としてあげた遺伝子（A）が検出されている

まず、細菌やウイルスが持っているある１つの遺伝かどうかを調べる場合には、Web サイト※で Blast

子をどのように読むかについて説明します（図１）。というソフトウェアを使ってデータベースを検索し、確１

地方独立行政法人大阪健康安全基盤研究所

大安研ニュース No.12

図２ 遺伝子の波形・配列データの例

認することができます。学術論文などで発表された遺ありませんでした。ところが近年、”次世代シーケン

病原体との違いや繋がりなどを明らかにすることがでかない新たな細菌を発見したりなど、様々なところでサー（NGS）“と呼ばれる新しいタイプのシーケンサーきます。

ゲノムデータが活用されるようになってきています。

がいくつも開発され、普及が進んできたことから、微（３）終わりにまた、下水や河川水、ヒトの腸内環境などに含まれる生物をはじめとするゲノムの解読を行うことが可能と技術の進歩と共に様々な分野で遺伝子およびゲノム微生物の遺伝子検出などにも使われるようになってきなってきています。ゲノムの解読には、生物種や解析の解読を行うことの重要性が年々高まってきています。ており、今後、ゲノムの解読とそのデータの活用は、の目的、NGS の種類などによって、様々な方法が用私たちが扱っている微生物分野では、新型コロナウイますます進んでいくものと考えられます。

いられますが、ここでは大安研で実施しているものをルスの世界的な広がりを見えるようにしたり、薬の効（細菌課）例として説明していきます。

伝子情報は、国際的なデータベース（DDBJ、GenBank、図３の新型コロナウイルスのゲノムは約 3 万個のEMBL）で登録・管理されており、インターネットをRNA で構成されています。そのため、まず RNA か通じて公開されています。このため、検索したい遺伝ら DNA に書き換えを行います。この DNA を元に、子配列さえあれば、誰でも手軽かつ無料で検索・解ゲノム全体をカバーするように設計された PCR を実析できるようになっています。

施すると、約 100 種類の切れ切れの断片としてゲノ（１）便利な PFAS（ピーファス）

6,300 種の PFAS をリストアップしています。これ※DDBJ センター（国立遺伝学研究所）

ム全体が増幅されます。次に、この増幅した断片をサ傘や靴、車のフロントガラスに撥

らの中で最も知られているのがペルフルオロオクタン

http://ddbj.nig.ac.jp/blast/blastn?lang=ja など

ンプルとし、試薬で処理を行い NGS で解析すると、水剤を噴霧すると、雨を弾くように

ス ルホン 酸（PFOS）とペ ルフルオロオクタン 酸（２）微生物のゲノム（遺伝子全部）を読む

サンプルに含まれる全ての断片の配列情報を得ることなり、ビチャビチャになったり視界（PFOA）です。図 1 に示すように PFOS と PFOAができます。

が悪くなったりすることがありませは直鎖状に並んだ炭素原子のすべてにフッ素原子が結ん。フッ素コーティングされたフラ合している特徴的な構造をしています。この 2 つの物培養して細菌そのものを大量に増やします。増えた細イパンやカーペット、車のボディは汚れがつきにくく、質は約 20 年前に環境汚染物質として報告されていま菌を回収し、含まれる全ての DNA、すなわちゲノム洗うのが楽です。フライドポテト

す。PFOS と PFOA は環境中への残留性、生物へDNA を抽出し、これをサンプルとして用います。この紙容器は油を弾き、手に油がつの蓄積性および毒性からその取り扱いを規制する国際

ちらもウイルスと同様に、前処理、NGS 解析を行う

くことなく食べることができます。

条約である「残留性有機汚染物質に関するストックホことで、ゲノム配列を取得することができます。

これらはほんの一例ですが、私たルム条約（通称 POPs 条約）」により、製造・使用

ちは日常生活で様々な PFAS（ピーファス）と呼ばれを制限および廃絶する対象とされています。日本もこンプルの種類などによりますが、１つのサンプルあたる化学物質を使用し、生活の便の条約の締結国であるため、国内ではこの 2 つの物※歴史的な経緯からこの名前が付けられたが、インフルエンザの病原体ではない

り数百～ 1 万個程度の長さの断片配列として数万～数利さや快適さなどを享受していま質の使用が規制されています。しかし、PFOS と表１に示したように、ヒトに比べて微生物のゲノム十万本が得られます。このままではその後の解析に使す。

PFOA 以外の PFAS については規制がないため、使は遙かに小さいものの、代表的なウイルスで 1 ～ 3 万、うことが難しいため、もともとのゲノムの形に再構成

しかし、近年、私たちが使用代表的な細菌である大腸菌で 500 万の遺伝子配列で（アセンブル・マッピング等）する必要があります。

し続けている PFAS が世界規模構成されています。先に述べたサンガーシーケンサー

再構成したゲノム配列は、どういう遺伝子がどういうで問題になっています。PFAS は人工的に合成されたを用いた方法でこれらのゲノムを読むとすると、ウイ位置にのっているか（アノテーション等）、遺伝子に特化学物質のグループであり、容易に分解されない性質

ルスでも 200 回以上、大腸菌で 1 万回以上のデータ

徴的な変わっているところはないか（変異解析等）とから半永久的に生体内や環境中に残り続けるといわれを取得する必要があるため、解読することは簡単ではいった解析を行い、その病原体のゲノムの特徴や他のています。

表１ 生物の種類別ゲノムのサイズ
生物の種類

ゲノムのサイズ（概数）（ウイルス）
インフルエンザ A ウイルス
新型コロナウイルス１万３千個３万個（細菌）
インフルエンザ菌※

180 万個大腸菌

500 万個ウイルスよりも大きいゲノムを持つ細菌では、まず取得したゲノム配列のデータは、NGS の種類やサ（哺乳類）
ヒト

30 億個

身近にあるPFAS（ピーファス）（２）PFAS とは用することが可能であり、代替物質も使われています。

PFOSPFOAPFAS はその構造式に炭素原子とフッ素原子を持った化合物であり、ペルフルオロアルキルおよびポリフルオロアルキル化合物とも呼ばれています。PFAS は
新型コロナウイルス

PCR で増幅前処理培養し、ゲノム DNA を抽出
大腸菌

２NGS（次世代シーケンサー）で配列を読む

図３ NGS（次世代シーケンサー）によるゲノム解析の手順

図１ PFOS と PFOA の構造式

生物が摂取した PFOS と PFOA は生体内に蓄積し、撥水剤、撥油剤、防汚剤、泡消火剤、化粧品など様々

動物実験では生殖、発達、肝臓、腎臓、免疫系へのな製品に使用されています。PFAS に含まれる炭素影響を引き起こします。また、ヒトではコレステロー原子とフッ素原子の結合力は非常に強く、分解されずル値の上昇、乳児の出生体重の低下、免疫への影響、に便利な製品の機能が長持ちします。しかし、この発 が ん 性（PFOA）、甲 状 腺 ホ ル モ ン へ の 影 響

分解されにくい性質が長期間にわたり生体内や環境中（PFOS）が報告されています。しかし、PFOS とに残り続ける要因となってしまっています。

PFOA 以外の PFAS の影響については研究がほとん

ア メリ カ 合 衆 国 環 境 保 護 庁（USEPA）は 約ど実施されていません。

３

地方独立行政法人大阪健康安全基盤研究所

大安研ニュース No.12

図２ 遺伝子の波形・配列データの例

認することができます。学術論文などで発表された遺ありませんでした。ところが近年、”次世代シーケン病原体との違いや繋がりなどを明らかにすることがでかない新たな細菌を発見したりなど、様々なところでサー（NGS）“と呼ばれる新しいタイプのシーケンサーきます。

ゲノムデータが活用されるようになってきています。

がいくつも開発され、普及が進んできたことから、微（３）終わりにまた、下水や河川水、ヒトの腸内環境などに含まれる生物をはじめとするゲノムの解読を行うことが可能と技術の進歩と共に様々な分野で遺伝子およびゲノム微生物の遺伝子検出などにも使われるようになってきなってきています。ゲノムの解読には、生物種や解析の解読を行うことの重要性が年々高まってきています。ており、今後、ゲノムの解読とそのデータの活用は、の目的、NGS の種類などによって、様々な方法が用私たちが扱っている微生物分野では、新型コロナウイますます進んでいくものと考えられます。

いられますが、ここでは大安研で実施しているものをルスの世界的な広がりを見えるようにしたり、薬の効（細菌課）例として説明していきます。

伝子情報は、国際的なデータベース（DDBJ、GenBank、図３の新型コロナウイルスのゲノムは約 3 万個のEMBL）で登録・管理されており、インターネットをRNA で構成されています。そのため、まず RNA か通じて公開されています。このため、検索したい遺伝ら DNA に書き換えを行います。この DNA を元に、子配列さえあれば、誰でも手軽かつ無料で検索・解ゲノム全体をカバーするように設計された PCR を実析できるようになっています。

施すると、約 100 種類の切れ切れの断片としてゲノ（１）便利な PFAS（ピーファス）

6,300 種の PFAS をリストアップしています。これ※DDBJ センター（国立遺伝学研究所）

ム全体が増幅されます。次に、この増幅した断片をサ

傘や靴、車のフロントガラスに撥

らの中で最も知られているのがペルフルオロオクタン

http://ddbj.nig.ac.jp/blast/blastn?lang=ja など

ンプルとし、試薬で処理を行い NGS で解析すると、水剤を噴霧すると、雨を弾くように

ス ルホン 酸（PFOS）とペ ルフルオロオクタン 酸（２）微生物のゲノム（遺伝子全部）を読む

サンプルに含まれる全ての断片の配列情報を得ることなり、ビチャビチャになったり視界（PFOA）です。図 1 に示すように PFOS と PFOAができます。

が悪くなったりすることがありませは直鎖状に並んだ炭素原子のすべてにフッ素原子が結ん。フッ素コーティングされたフラ合している特徴的な構造をしています。この 2 つの物

培養して細菌そのものを大量に増やします。増えた細イパンやカーペット、車のボディは汚れがつきにくく、質は約 20 年前に環境汚染物質として報告されていま菌を回収し、含まれる全ての DNA、すなわちゲノム洗うのが楽です。フライドポテト

す。PFOS と PFOA は環境中への残留性、生物へDNA を抽出し、これをサンプルとして用います。この紙容器は油を弾き、手に油がつの蓄積性および毒性からその取り扱いを規制する国際

ちらもウイルスと同様に、前処理、NGS 解析を行うくことなく食べることができます。

条約である「残留性有機汚染物質に関するストックホことで、ゲノム配列を取得することができます。

これらはほんの一例ですが、私たルム条約（通称 POPs 条約）」により、製造・使用ちは日常生活で様々な PFAS（ピーファス）と呼ばれを制限および廃絶する対象とされています。日本もこンプルの種類などによりますが、１つのサンプルあたる化学物質を使用し、生活の便の条約の締結国であるため、国内ではこの 2 つの物※歴史的な経緯からこの名前が付けられたが、インフルエンザの病原体ではない

り数百～ 1 万個程度の長さの断片配列として数万～数利さや快適さなどを享受していま質の使用が規制されています。しかし、PFOS と表１に示したように、ヒトに比べて微生物のゲノム十万本が得られます。このままではその後の解析に使す。

PFOA 以外の PFAS については規制がないため、使は遙かに小さいものの、代表的なウイルスで 1 ～ 3 万、うことが難しいため、もともとのゲノムの形に再構成

しかし、近年、私たちが使用代表的な細菌である大腸菌で 500 万の遺伝子配列で（アセンブル・マッピング等）する必要があります。

し続けている PFAS が世界規模構成されています。先に述べたサンガーシーケンサー

再構成したゲノム配列は、どういう遺伝子がどういうで問題になっています。PFAS は人工的に合成されたを用いた方法でこれらのゲノムを読むとすると、ウイ位置にのっているか（アノテーション等）、遺伝子に特化学物質のグループであり、容易に分解されない性質

ルスでも 200 回以上、大腸菌で 1 万回以上のデータ

徴的な変わっているところはないか（変異解析等）とから半永久的に生体内や環境中に残り続けるといわれを取得する必要があるため、解読することは簡単ではいった解析を行い、その病原体のゲノムの特徴や他のています。

表１ 生物の種類別ゲノムのサイズ
生物の種類

ゲノムのサイズ（概数）（ウイルス）
インフルエンザ A ウイルス
新型コロナウイルス

１万３千個
３万個

（細菌）
インフルエンザ菌※

180 万個大腸菌

500 万個ウイルスよりも大きいゲノムを持つ細菌では、まず取得したゲノム配列のデータは、NGS の種類やサ（哺乳類）
ヒト

30 億個

身近にあるPFAS（ピーファス）（２）PFAS とは用することが可能であり、代替物質も使われています。

PFOS

PFOA

PFAS はその構造式に炭素原子とフッ素原子を持った化合物であり、ペルフルオロアルキルおよびポリフルオロアルキル化合物とも呼ばれています。PFAS は
新型コロナウイルス

PCR で増幅前処理培養し、ゲノム DNA を抽出
大腸菌

２NGS（次世代シーケンサー）
で配列を読む

図３ NGS（次世代シーケンサー）によるゲノム解析の手順

図１ PFOS と PFOA の構造式

生物が摂取した PFOS と PFOA は生体内に蓄積し、撥水剤、撥油剤、防汚剤、泡消火剤、化粧品など様々

動物実験では生殖、発達、肝臓、腎臓、免疫系へのな製品に使用されています。PFAS に含まれる炭素影響を引き起こします。また、ヒトではコレステロー原子とフッ素原子の結合力は非常に強く、分解されずル値の上昇、乳児の出生体重の低下、免疫への影響、に便利な製品の機能が長持ちします。しかし、この発 が ん 性（PFOA）、甲 状 腺 ホ ル モ ン へ の 影 響

分解されにくい性質が長期間にわたり生体内や環境中（PFOS）が報告されています。しかし、PFOS とに残り続ける要因となってしまっています。

PFOA 以外の PFAS の影響については研究がほとん

ア メリ カ 合 衆 国 環 境 保 護 庁（USEPA）は 約ど実施されていません。

３

大安研ニュース No.12

地方独立行政法人大阪健康安全基盤研究所（３）水道水における PFAS の現状

ヨーロッパやアメリカ合衆国のいくつかの州では水道水は PFAS が摂取される

PFOS と PFOA 以外の PFAS を合算しΣPFAS とし経路のひとつです。厚生労働省て規制する考え方が出てきています（表 1）。ΣPFAS

は水道水に含まれる暫定目標値の対象が最も多い EU では 20 種が指定されています。

を PFOS と PFOA を合算してまた、どのような構造の PFAS を規制するべきかと50ng（ナノグラム）/L 以下としの議論も進められています。しかし、まだ議論の途まし た（表 1）。1ng は 1g の中であり、統一された見解がないことや、日本ではこ10 億分の 1 です。令和 2 年度に 32 種の PFAS をのような議論自体が行われていないことから、検出さ対象に実施した大阪府との調査では、検出された濃れた PFAS についての評価が困難です。

度が暫定目標値を超えることはありませんでしたが、PFAS の健康リスクや環境リスクを正しく評価するすべての水道水から PFOS と PFOA が検出されましために、大阪健康安全基盤研究所では国立医薬品食た。また、PFOS と PFOA 以外に多くの PFAS が品衛生研究所や東京都健康安全研究センター等の研

検 出 さ れ、日本 の 水 道 水 に お いても 多 種 多 様 な究機関と協力し、分析法の開発、日本国内におけるPFAS が存在していることが明らかとなってきていま存在状況の把握、世界の動向について積極的な情報す。

収集を行っています。

（生活環境課）

だいあん

けん ニュ

ース
No.12
2021年11月

地方独立行政法人大阪健康安全基盤研究所（略称「大安研（だいあんけん）」）は、皆さまの健康に役立つ情報を分かりやすくお届けするため、「大安研ニュース」を発行しています。
……………………

大安研ニュース

No. 12目

次・微生物の遺伝子を「全部」読む -------------------------------------------------------- １・身近にあるPFAS（ピーファス） ------------------------------------------------------ ３

表１ 各国の基準値（ng/L）
国・州

PFOS ＋ PFOA

日本

50

アメリカ合衆国

70

EUΣPFAS

ΣPFAS の内訳

100

PFBS, PFPS, PFHxS, PFHpS, PFOS, PFNS, PFDS,

90

スウェーデンPFUdS, PFDoS, PFTrDS, PFBA, PFPA, PFHxA,

ヒト・動物をはじめとする生物は、生命活動の維PFHpA, PFOA, PFNA, PFDA, PFUdA, PFDoDA,持や子孫へ形質（性質や特徴）を受け渡すための設PFTrDA

計図として、多数の遺伝子のかたまりを持っています。

PFBS, PFHxS, PFOS, 6:2FTS, PFBA, PFPeA, PFHxA,PFHpA, PFOA, PFNA, PFDA

100

デンマーク

PFBS, PFHxS, PFOS, PFOSA, 6:2FTS, PFBA, PFPeA,PFHxA, PFHpA, PFOA, PFNA, PFDA

全体を解読することは技術的に容易ではありませんでた遺伝子のみを増やして取り出すことのできる技術でした。1990 年代後半にインフルエンザ菌（表 1参照）

すが、これを利用して、ある遺伝子（A）を増幅します。

大安研ニュース第 11 号にて誤記がございましたので、下記のとおり訂正いたします。のゲノム配列が解読され、さらには 2003 年にヒト増やした遺伝子（A）を蛍光物質で目印を付け、サのゲノム配列の解読の完了が発表されるなど、技術的ンガーシーケンサーという機器で分析することで、そ● ２ページ（タイトル）（誤）デオキシニバレルーノ⇒（正）デオキシニバレノールな問題が解決されていきましたが、実際に行うには多の遺伝子配列を読むことができます。一般的にこの大なコストや労力が必要で、一般的な研究・検査としシーケンサーは、サンプルあたり数百～千個の配列を● ３ページ（誤）正の走行性⇒（正）正の走光性て行うのはまだまだ難しいものでした。

読むことができるため、１つの遺伝子（数百～数千個70＜大安研ニュース第 11 号の誤記訂正について＞を開設しました！
ぜひご覧ください！
大安研ちゃんねる

発行者

地方独立行政法人

大阪健康安全基盤研究所
Osaka Institute of Public Health〒537-0025 大阪府大阪市東成区中道 一丁目3番69号
TEL：06-6972-1321 FAX：06-6972-2393
E-mail：webmaster@iph.osaka.jp
Web：http://www.iph.osaka.jp/

４

サンガーシーケンサー
で配列を読むPFHxS, PFOS, PFHxA, PFOA, PFNA

メイン州

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ますが、１つの遺伝子を読むことはできても、ゲノム

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遺伝子（A）PFHxS, PFOS, PFHxA, PFOA, PFNA. PFDAPFHxS, PFOS, PFHxA, PFOA, PFNA

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それぞれの生物内に DNA や RNA という物質として

図１ 遺伝子の解析工程（サンガー法）

20

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このような遺伝子のかたまりは”ゲノム”と呼ばれ、細菌やウイルスなどの微生物もまたゲノムを持っていバーモント州

動画配信を始めました！

微生物の遺伝子を「全部」読む

近年、遺伝子解析技術が著しく進歩したことで、私の配列からなる）の解読に適しており、現在最も普及たちの研究所（大安研）でもこの”ゲノム”の解読をしているシーケンサーです。得られたデータは波形と行うことができるようになってきています。ここでは、して確認することができ、最終的に遺伝子の配列とし大安研で行っている微生物の遺伝子解析を例に、１つて ATGC ～の記号に変換されたものを解析に用いまの遺伝子やゲノムをどのように解読しているか説明しす（図２）。

ます。
大安研ホームページには、その他多くのトピックスやイベント案内などを掲載しています（１）微生物の遺伝子を１つ読む

解析は、目的に応じて様々なやり方で行いますが、ここで例としてあげた遺伝子（A）が検出されている

まず、細菌やウイルスが持っているある１つの遺伝かどうかを調べる場合には、Web サイト※で Blast

子をどのように読むかについて説明します（図１）。というソフトウェアを使ってデータベースを検索し、確１