課題番号：26指114

研究課題名：臨床データのCDISC標準化に関するフィージビリティスタディ

主任研究者名 ：大津 洋 ( 2015年までは田中康博)
分担研究者名 ：- (2014, 佐藤泉/ 2014-2015, 川崎洋平)
キーワード：CIDSC,バイオバンク,臨床データ,データマネージメント,標準化

研究成果

：

研究概要
NCGM はじめ NC が保有するバイオバンクのデータ（臨床データや検体データ）は、臨床研究（試験）や治験に利用される。データが治験に利用されるためには、主に海外製薬企業が中心となり FDA への電子申請文書の電子データ形式として採用され、普及してきた CDISC 標準に対応できることも必要であると考えられる。
一方、JCRAC データセンターでは主に多施設の研究者（医師）主導の臨床研究データマネージメントを請け負っているが、NCGM が行う医師主導治験のデータセンターを担えるためには、PMDA へ提出する電子申請文書が 2016 年から CDISC 形式による受け入れ義務化を控え、医師主導治験が実施された暁には、十分に対応できることが必要となる。
そのため、バイオバンクと臨床研究データマネージメントの両局面において共通する臨床データについての CDISC 標準化のための技術開発と実証評価を行う。その一方で、標準化後の臨床データの利用についても可能な限り国際的な動向を調査する。
方法・研究結果
Biobank:(Step1) CDISC SDTM とバイオバンクのデータフォーマットのマッピングを行う(Step2) CDISC ADaM に変換可能かどうかを検討する。
JCRAC(Clinical Data):(Step1) 基幹システムとして、REDCap を導入する・GAP 分析を行う(Step2) REDCap 上で、CDISC の一連のデータ交換・分析が可能かを調査・研究を行う。
2014

2015

Biobank

Step 1JCRAC (Clinical Data)

Step1

2016
Step2

Step2

初年度は国内外の CDISC 関係の動向を生で把握するため、CDISC Japan ユーザー会に参加し、連携を図った。CDSIC の中心となる SDTM(Study Data Tabulation Model：申請臨床試験データモデル)のユーザ
ー会活動を始め、企業、アカデミアのユーザー会メンバとの情報交流を行った。一方、通信規約
ODM(Operational Data Model)については、調査研究の結果拠点間の連携を行うためには、開発費には当時、少なくとも 3000 万円程度はかかり、３～５年以上かけてじっくり取り組まないと難しいと判断した。ODM については基本検討や期間内での実例調査にとどめ、継続的に調査は進めるものの、核となる STDM に注力した取組みとすることとした。
（JCRAC データセンター）
本研究を進める上での研究環境として EDC（Electronic Data Capture）の REDCap を導入し、サーバーを 2014 年 3 月に稼動を開始した。本研究の狙いは REDCap を使って、これに CDISC 対応の実証評価を行うことである。まず REDCap 自身の使い方、利用習熟に取り掛かった。REDCap は Vanderbilt 大学の開発であるため、操作説明、マニュアルに相当するものが日本語化されていない状況下で、JCRAC デー
タセンターで受託している臨床研究の症例登録票（CRF）を試験的に利用し、症例登録画面の作成や、データのアップロード、ダウンロードの等、基本的な機能の確認をとおして、REDCap 機能を理解し、本システムの適用範囲（限界）を調べた。2015 年３月末時点で、システムの適正な動作運転がなされていると判断し、JCRAC の基幹システムとして公開した。
2-3 年度目は、REDCap 上での CDISC 評価のため、JCRAC で模擬臨床研究を立ち上げて連携を行うこととした。当初は SDTM ユーザー会と連携して、アカデミアと企業が同じシステム上にデータを入れることを想定し準備を進めていたが、十分な期間が取れないことにより、内部プロジェクト評価を行うこととした(左図）。同時に、REDCap 自身も CDISC 対応するモジュールを公開したため、JCRAC もバージョンアップし、CDISC が基本としている ODM フォーマットの入出力が可能となったため、期間内でのフィージビリティ研究が容易となった。当初想定していた計画としては違うが、結果的には予定通りのフィージビリティ研究が実施でき、日本臨床試験学会学術総会にてその成果を発表できた。
この中で、臨床データの交換には、CDISC ODM を使うことが可能であること、ODM 形式であれば、解析ソフトウェアの SAS などの CDISC と親和性の高いものであれば、バージョンの問題に注意すれば利用は容易であることを発表した。命名規約については、CDISC の規約(CDASH など)を理解しておく必要性はあるが、これは、テンプレートを今後整備していけばよいと判断している。
最近の日本のアカデミアの発表の場合、CDISC の情報規約である ODM を無視した規格の利用についての発表が多いが、我々は CDISC の基本に忠実に対応が可能であることを明言しているのが特徴的である。
これにより、CDISC だけではなく、医療情報の標準規格（HL7 Version3/ XML フォーマット）といったXML 記述のものに対しても応用可能になる基盤ができたと考えている（下図）Input example

Context

Type1

SS-MIX data because it has become a basic CSV, character type andUsing SS-MIX Datathe project format If the note only possible incorporation.
But, in the HL7 format of the format it was necessary to remake
all.
Type2

Using CDISC ODMODM format from the HIS could not be output. It attempts to create
according to the REDCap of ODM format Although uptake is an error.
In REDCap Ver6.10.3 it was not able to incorporation.

Type3

Using CSV_Fileno problem. If the note only character type and the project of theformat was possible incorporation.

Output Example
TypeA

TypeB

Using CDISC

ODM format from the HIS could not be output. It attempts to createODM/SDTM

according to the REDCap of ODM format Although uptake is an error.

Usingno problem.

(SAS/SPSS)CSV etc.
なお、標準化の実証評価の途中で、IMDRF(International Medical Device Regulatory Forum)やレギュラトリーサイエンスなど国際協議機関に参加でき、実証後の利活用について議論が可能となった。
実証実験の先の利活用を検討するに値する CDISC 等への知見や、標準化の意識の高まりを受け、IMDRF

methodology WG に PMDA のミラーグループ一員(non regulatory agency)として、London(UK)/Moscow(Russia) F2F meeting の参加、また、その後の Web meeting への参加を通じて、臨床試験だけではない、臨床疫学やレジストリ研究におけるデータの標準化について議論した。その成果の一部は、IMDRF document などの作成に貢献した。
（バイオバンク）
分担研究者の佐藤（当時）を中心に、NCBN 中央データベース管理部門でカタログデータベースに用いている個票データフォーマットの項目を SDTM のドメイン、変数にどこまで変換が可能かについて調べた。左図は、NCBN 中央管理部門が持っている個票データフォーマットとのマッピングモデル、右側がそれを基とした、適合割合を支援した。

おおよそ全体の 7 割程

度の項目は変換可能であるが、治験では使用しないバイオバンク独自の検体に関する項目など、独自に SDTM 用に変数を定義する必要があることが分かった（図）。その結果については、日本計算機統計学会第 28 回シンポジウム（2014 年 11 月 14 日、15 日、沖縄科学技術大学院大学）および日本臨床試験学会第 6 回学術集会総会（2015 年 2 月 20 日）で発表し、論文としてまとめ発表された。
2 年度目は、分担研究者の川崎（当時）を中心に、佐藤の実施した SDTM 変換のフィージビリティスタ
ディの結果を受けて、ADaM(Analysis Dataset Model：申請統計解析データモデル)への変換についての調査を行った。その結果については、日本臨床薬理学会第 36 回学術総会（2015 年 12 月 9 日～11 日）にて発表した。バイオバンクデータの CDISC 化についてのフィージビリティスタディの基本的な検討は目標を達成した。
現時点の調査した限りでは、バイオバンクデータに関する国際的な標準化の目立った動きはなく、ましてや CDISC というキーワードが飛び交う状況ではないという判断のもと、臨床試験や治験を実施する上で、バイオバンク試料等を利用するという局面が出てくるのであれば、むしろそのような展開になるべきと考えるが、それを見越した地ならしを進めておき、業界のデータ標準化を先導的に牽引していくという視点では、取り組むべき価値は十分あると考える。

Subject No.

：26A-114

Title：Feasibility study on CDISC standards in Clinical data

Researchers：Hiroshi Ohtsu (2015-2016)
Yasuhiro Tanaka (2014-2015)
Kohei Kawasaki (2014 -2015)
Izumi Sato (2014)

Key word：CDISC, Biobank, clinical data , data management, scandalization

Abstract：

Biobank data (clinical data and specimen data) owned by NCGM, including NCGM, are used forclinical research (trials) and clinical trials. In order for data to be used for clinical trials, it isnecessary to be able to respond to the popular CDISC standard, mainly adopted as an electronic
data format of electronic application documents to FDA, mainly by overseas pharmaceuticalcompanies.
Otherwise, JCRAC data center is mainly undertaking clinical research data management led bymulticenter researchers (physicians), but in order to be able to bear the data center ofdoctor-initiated clinical trial conducted by NCGM, the electronic application document to besubmitted to PMDA Is obliged to accept CDISC format from 2016, and it is necessary to be able torespond adequately when the doctor-led clinical trial is implemented.
For this reason, we will conduct technical development and empirical evaluation for CDISC
standardization on common clinical data in both phases of biobank and clinical research data
management. And, we will investigate international trends as much as possible about the use ofstandardized clinical data.

Method:We designed the feasibility plan for 2 types data as follow:
・Biobank:
1.

Mapping between CDISC SDTM domains / variable and individual data format using in
NCBN central database management

2.

From result of #1 , we examined the applicability to CDISC ADaM・JCRAC(Clinical data):
1.

Adopt REDCap (Vanderbilt University) as JCRAC’s backbone system to use data
management and use CDISC standards

2.

Feasibility Study using REDCap ( EDC -> SDTM or ODMResearchers には、分担研究者を記載する。

-> ADaM)

2014

2015

Biobank

Step 1JCRAC (Clinical Data)

Step1

2016
Step2

Step2

Result:(Biobank)
As we reported in I.Sato et al (2016), regarding the problematic but classifiable items, out of thevariables of medical history, surgical history, transfusion history, and family history, the reasonsfor the problematic classifications were because of disparities in the methods of categorizing theselections and the treatment of date data from the SDTM. In addition, some question items andexisting variables had to be changed and supplemental materials created. A complete breakdownof the ‘‘problematic but classifiable’’ items is presented. Overall, 50%–70% of the required items ineach domain were fulfilled.
Common additional items such as STUDYID, USUBJID, and ARM needed to be included toachieve 100.0% fulfillment of the required items. The proportion of variables in the LB domain was
low at 33% because additional test items such as LBTESTCD and LBTEST needed to be included(Fig 1).
Of course, there is possible also converted to ADaM (Kawasaki et al,2015), but, it is necessary topay attention to the SDTM compatibility of each domain.

Figure 1

Proportions of required items that were fulfilled by the National Center Biobank

Network data in each domain (%).

Researchers には、分担研究者を記載する。

(JCRAC)We succeeded in introducing REDCap as a core data management system for clinical research,
and we upgraded to REDCap which corresponded to CDISC ODM format. (Step 1)
At the same time, because discussion was also being made on research utilization of medical
information, we conducted a feasibility study as an object of survey here as well.
Input example

Context
SS-MIX data because it has
become a basic CSV, character
type and the project format

Type1

Using SS-MIX DataofIf the note only possible
incorporation.
But, in the HL7 format of theformat it was necessary toremake all.
ODM format from the HIS could
not be output. It attempts tocreate according to theType2

Using CDISC ODMREDCap of ODM format Although
uptake is an error. In REDCap
Ver6.10.3 it was not able toincorporation.
no problem. If the note only

Type3

Using CSV_Filecharacter type and theproject of the format waspossible incorporation.

Output Example
ODM format from the HIS could
not be output. It attempts toTypeA

Using CDISC ODM/SDTM

create according to theREDCap of ODM format Although
uptake is an error.

TypeBUsing (SAS/SPSS)CSVetc･･

no problem.

It is distinctive that we clearly state that it is possible to faithfully respond to the basic of CDISC.
By doing this, we believe that the infrastructure has become available not only for CDISC but also
for XML description such as medical information standard (HL 7 Version 3 / XML format).

Researchers には、分担研究者を記載する。

研究課題名 ： 26指114 臨床データのCDISC標準化に関するフィージビリティスタディ
主任研究者名 ：大津 洋
分担研究者名 ：キーワード ：CIDSC,バイオバンク,臨床データ,データマネージメント,標準

研究背景
NCGMはじめNCが保有するバイオバンクのデータ（臨床データや検体データ）は、臨床研究（試験）や治験に利用される。データが治験に利用されるためには、主に海外製薬企業が中心となりFDAへの電子申請文書の電子データ形式として採用され、普及してきたCDISC標準に対応できることも必要であると考えられる。
一方、JCRACデータセンターでは主に多施設の研究者（医師）主導の臨床研究データマネージメントを請け負っているが、NCGMが行う医師主導治験のデータセンターを担えるためには、PMDAへ提出する電子申請文書が2016年からCDISC形式による受け入れ義務化を控え、医師主導治験が実施された暁には、十分に対応できることが必要となる。そのため、バイオバンクと臨床研究データマネージメントの両局面において共通する臨床データについてのCDISC標準化のための技術開発と実証評価を行う。その一方で、標準化後の臨床データの利用についても可能な限り国際的な動向を調査する。

1

研究課題名 ： 26指114 臨床データのCDISC標準化に関するフィージビリティスタディ
主任研究者名 ：大津 洋
分担研究者名 ：キーワード ：CIDSC,バイオバンク,臨床データ,データマネージメント,標準研究方法
本研究が扱う情報は、中央バイオバンクが持つカタログデータ（以下、Biobankデータ）とJCRACデータセンターが取り扱う臨床研究データ（以下、JCRAC）がある。
それぞれをStep1,2 とし、期間内でのフィージビリティ研究を行うこととした。

Biobank
JCRAC（Step1）CDISC SDTM とバイオバンクのデータフォーマットのマッピングを行う(Gap分析）(Step1)基幹システムとして、REDCapを導入する/Gap分析を行う

2014(Step2) REDCap上で、CDISCの一連のデータ交換・分析が可能かを調査・研究を行う。

2015

Biobank

Step 1JCRAC (Clinical

Step1

Data)

（Step2) CDISC ADaMに変換可能かどうかを調査す
る

2016
Step2

Step22

研究課題名 ： 26指114 臨床データのCDISC標準化に関するフィージビリティスタディ
主任研究者名 ：大津 洋
分担研究者名 ：キーワード ：CIDSC,バイオバンク,臨床データ,データマネージメント,標準

結果：定義したマッピングでの適合容易性は以下のようになった。

BioBankにおけるフィージビリティ研究(2014-2015)(Step1,2)CDISC SDTM とバイオバンクのデータフォーマットのマッピングの実施(Gap分析および解析可能性の検討

NCGN中央管理部門が持っている個票データフォーマットとのCISC SDTMへのマッピングマッピングモデルを策定し、その程度適合するのかを検討した。

また、全体としては、おおよそ全体の7割程度の項目は変換可能であるが、ドメイン別にみてみると、バラつきがあることが分かった（図） 。
同時に、治験では使用しないバイオバンク独自の検体に関する項目など、独自にSDTM用に変数を定義する必要があることが分かった。

考察
計画時に想定していたバイオバンクデータに関する国際的な標準化の目立った動きはなく、ましてやCDISCというキーワードが飛び交う状況ではないという判断のもと、臨床試験や治験を実施する上で、バイオバンク試料等を利用するという局面が出てくるのであれば、むしろそのような展開になるべきと考えるが、それを見越した地ならしの一歩となったと考える。

3

研究課題名 ： 26指114 臨床データのCDISC標準化に関するフィージビリティスタディ
主任研究者名 ：大津 洋(Step2) EDCap上で、CDISCの一連のデータ交換・分析が可能かを調査・研究を行う。
分担研究者名 ：キーワード ：CIDSC,バイオバンク,臨床データ,データマネージメント,標準の導入とフィージビリティ研究(Step1)REDcapの導入とデータの利活用について
REDCapのJCRACデータセンターへの導入とともに、CDISC形式と医療情報の厚労省標準規格SS-MIXについて、REDC介してデータの入出力が可能かどうかを実施。
Input example

Type1

Context

Using

SS-MIX

・REDCapデータ（CSVファイル）とODMファイルの検証＆ODMファイルの再利用
REDCapからCSVとODMを抽出し、抽出されているデータに関して差異が無いことを検証した。
プロジェクトから出力したODMファイルは、新規プロジェクト作成時にCRFとデータはすべてREDCapにアップロードできる ことが検証できた。（一部割付設定、サーベイ設定は不可）
これにより、REDCapではODMファイルの扱いをone-wayでなくtwo-wayで行うことができる。
・REDCapから抽出されたODMファイルが、CDISC標準規格に基づいているか検証
REDCapからODMファイルを抽出した場合、CDISC標準規格に定義されている、AdminData定義（管理情報：研究者やデータマネージャー、施設名、署名等）が出力されない。REDCapの場合はStudyのタグ内に記載されていた。 他のタグについては、ODMに定義されている内容で出力できていることが検証できた。
・ODMファイルの利活用
MS ExcelにてXMLファイルをデータ形式で確認することは可能であるが、不要な情報も同時に表示されている。
スタイルシートを作成することによって、CSV形式やその他の形式に変換も可能なので、これまでのデータ変換のプログラムがあれば、 それを有効活用することも可能。SAS proc xmlも利用可能だが、サポートしているODMVersionに注意が必要。

SS-MIXデータは基本CSVになっているため、文字タイプとプロジェクトのフォーマットだけ注意すれば取込み可能。しかしHL7形式のフォーマットではすべて作り替える必要があった。

Data

Type2

Using

CDISC ODMHISからODMフォーマットは出力できない。REDCapのODMフォーマットに合わせて作成を試みるが取込みはエラーとなる。
REDCap Ver6.10.3では取込みできなかった。

Type3

Using

CSV_File

問題なし。文字タイプとプロジェクトのフォーマットだけ注意すれば取込み可能だった。

TypeA

Using

CDISC ODM/SDTM

HISからODMフォーマットは出力できない。REDCapのODM
フォーマットに合わせて作成を試みるが取込みはエラーとなる。

TypeB

Using

(SAS/SPSS)CSV

問題なし

スタイルシートを作成してODMファイルをCSVに変換してみる(msxsl.exeの利用の例[Saxonでも可]）Output Example

etc･･

考察

本研究の実施中に、医療機器の国際標準化（行政）団体であるIMDRFに参加し、レジストリデータベースの利用WGの参画とドキュメントの作成に寄与した。 4

研究発表及び特許取得報告について

課題番号：26指114
研究課題名： 臨床データのCDISC標準化に関するフィージビリティスタディ
主任研究者名：大津洋

論文発表
論文タイトル

著者

掲載誌

掲載号

年

Clinical Data Interchange Standards
Consortium Standardization of Biobank
Data: A Feasibility Study

Izumi Sato,
Yohei Kawasaki, BIOPRESERVATION
Yasuhiro Tanaka AND BIOBANKING
et al.

Vol.14 No.1

2016

研究者主導研究におけるCDISC標準規格群への対応

大津

45巻5号

2017

洋

薬理と治療学会発表
タイトル

臨床研究におけるICT標準化の取り組みと現状・将来像について

発表者
大津田中
岩本豊田
北島

学会名

場所

年月

洋
康博
智子
あこ浩二

第７回日本臨床試名古屋
験学会

2016年2月

洋

第16回 CRCと臨床試験のあり方を考大宮える会議 2016 in大宮

2016年9月

2016年9月

研究者主導研究におけるCDISCへの対応

大津Feasibility study in REDCap using
standard data structures

Hiroshi Ohtsu,
Ako Toyoda,
Koji Kitajima

REDCapCon

臨床研究におけるCDISC標準規格群利用に関する研究

大津北島
岩本豊田

洋
浩二
智子
あこ

第８回日本臨床試大阪
験学会

2017年1月

洋療レギュラトリー
サイエンス研究所
東京(IMeRS)公開シンポ
ジウム

2017年3月

Real world evidence -戦略的レジストリネットワーク

大津NC, USA研究発表及び特許取得報告について

その他発表(雑誌、テレビ、ラジオ等)
タイトル

発表者

発表先

場所

年月日

該当なし

特許取得状況について※出願申請中のものは(発明名称)記載のこと。
登録番号

該当なし

※該当がない項目の欄には「該当なし」と記載のこと。
※主任研究者が班全員分の内容を記載のこと。

特許権者(申請者）
登録日(申請日)（共願は全記載）

出願国