第 15 回

三大学交流セミナー～農学・医学・保健医療学へのデータサイエンスの活用～《プログラム・抄録集》

日時

令和５年９月２８日（木）会場

茨城大学農学部

16:30～19:30（第Ⅰ部）フードイノベーション棟 霞光ホール（第Ⅱ部）こぶし会館 1 階
東京医科大学茨城医療センター・茨城県立医療大学・茨城大学農学部

《 プ ロ グ ラ ム 》
16:30～16:35

開会の辞
茨城大学農学部長 宮口右二

【第Ⅰ部】（会場：フードイノベーション棟 霞光ホール）
16:35～17:40

講 演

１．「農学・環境分野におけるデータサイエンス」
茨城大学農学部地域総合農学科 准教授 庄山紀久子
２．「データを用いてスキルとパフォーマンスを評価する」
茨城県立医療大学人間科学センター 教授 井田博史
３．「研究の要となる統計処理について考える」
東京医科大学茨城医療センター呼吸器外科

17:40～17:55

講師 中嶋英治

ポスター発表フラッシュトーク----------------------------------------------------------------------------------

17:55～18:20

休 憩（会場移動）----------------------------------------------------------------------------------【第Ⅱ部】（会場：こぶし会館 1 階）
18:20～19:20

ポスターセッション

19:20～19:30

閉会の辞
講

評

茨城県立医療大学学長 松村 明

次回開催の挨拶 東京医科大学茨城医療センター
病院長 福井 次矢-1-

「農学・環境分野におけるデータサイエンス」

茨城大学
農学部地域総合農学科 准教授
庄山 紀久子

略歴1995 年
1998 年
1998 年2008 年
2010 年2015 年
2019 年2022 年

東京農業大学農学部 卒業
東京農工大学大学院農学研究科修士課程 修了
民間コンサルタント 勤務
北海道大学大学院環境科学院博士課程 修了
国立環境研究所 研究員
国連大学サステイナビリティ高等研究所 講師
防災科学技術研究所 主幹研究員
茨城大学農学部地域総合農学科 准教授

近年の気候・生態系変動による影響もあり、農林水産業や防災、生物多様性保全など様々な自然環境分野においてデータサイエンスの活用が求められている。茨城大学農学部では、農学分野の専門知識とデータサイエンスの素養を併せ持つ人材の育成に取り組んでおり、またデータ分析を行う際に必要となる統計的手法を活用した教育研究の発展を目指し、教員や若手研究者を対象とした統計エキスパート人材育成事業に参画している。
本講演では農学・環境分野における課題解決を目的としたデータサイエンスの活用と意思決定支援に関する研究事例を紹介する。持続的かつ健康的な地域社会の実現に貢献するデータサイエンスの可能性について、どのような連携が必要なのか、今後の展開を考えていきたい。

-2-

「データを用いてスキルとパフォーマンスを評価する」

茨城県立医療大学
人間科学センター 教授
井田 博史

略歴1999 年 東京大学大学院総合文化研究科修士課程 修了
2003 年 東京工業大学大学院社会理工学研究科後期博士課程 修了
2003 年 国立身体障害者リハビリテーションセンター研究所 流動研究員
2006 年 神奈川工科大学ヒューマンメディア研究センター PD 研究員
2010 年 東京医科歯科大学教養部保健体育学研究室 特任助教
2012 年 イリノイ大学シカゴ校理学療法学科 リサーチアソシエイト
2012 年 上武大学ビジネス情報学部 講師
2014 年〃准教授
2021 年〃教授
2023 年 現職

スポーツの競技場面において，予測の素早さと正確さはプレーのパフォーマンスに大きく影響します．多くの先行研究において，熟練者は対戦相手の動作から効果的に予測情報を抽出することが示唆されているものの，その詳細についてはまだ不明な点が多くあります．本講演では，テニス熟練者の認知的スキルに関して，動作データと予測判断スコアとの定量的関係を統計学的に調べた研究成果について紹介します．
一方，リハビリテーション分野では近年，ヴァーチャルリアリティ（VR）を利用した立位・歩行バランス機能訓練に大きな期待がよせられています．これまで，VR における姿勢保持や動作遂行のパフォーマンスが，実際の世界におけるそれらとは相違することが報告されています．本講演では，多点皮膚マーカ法や近似一般化尤度比法など時系列動作データの解析法を紹介しつつ，今後の姿勢研究の展望について議論します．

-3-

「研究の要となる統計処理について考える」

東京医科大学茨城医療センター
呼吸器外科 講師
中嶋 英治

略歴1994 年
2001 年
2005 年2009 年
2011 年

東京医科大学医学部 卒業
東京医科大学医学研究科 博士
University of Colorado Health Science Center:Research Fellow
東京医科大学 呼吸器・甲状腺外科学分野 助教
東京医科大学 呼吸器・甲状腺外科学分野 講師【背景】研究を始める前に結果を得るための数の設定を行い、最後に得られた結果を解析する、つまり統計は研究の要と言える。しかしながら、必ずしも統計の専門家のいる環境で研究が行えるとは限らない。これまで作成した論文で用いた統計処理について、振り返り考えてみる。【症例数の設定】日本人の非小細胞肺癌において EGFR 遺伝子変異が存在する確率は 50%、PCR 法が EGFR 遺伝子変異を検出できる確率は 90%（先行研究の結果）である。
PCR 法で検出される EGFR 遺伝子変異肺癌と PCR 法で検出されない EGFR 遺伝子変異肺癌の予後を比較する。非小細胞肺癌症例を全体で 300 例を目標として EGFR 遺伝子変異肺癌が 150 例、PCR 法で検出される EGFR 遺伝子変異肺癌 135 例と PCR 法で検出されない
EGFR 遺伝子変異肺癌 15 例で予後比較を行うことを目標とする。【集積結果】非小細胞肺癌
254 例、EGFR 遺伝子変異肺癌 117 例（46%）であった。PCR 法で検出された EGFR 遺伝子変異肺癌は 109 例（109/117: 93%）、PCR 法で検出されなかった EGFR 遺伝子変異肺癌は 8 例（8/117: 7%）であった。109 例と 8 例で Kaplan-Meier curve を用いて予後比較を行った。【まとめ】PCR 法で検出されない EGFR 遺伝子変異肺癌が非小細胞肺癌の中から抽出される確率は 5%（15/300）の予測であった。実際は 254 例中 8 例で 3%であった。希少な症例における統計処理は、研究開始前の計画通りであっても結論に限界が生じてしまう。しかしながら、肺癌の分子標的治療における標的遺伝子の割合は、肺腺癌の中で EGFR 50%, ALK 5%、BRAF1%であり、非小細胞肺癌中の 3%であっても検出可能な検査が望ましいと締めくくった。これまで作成した他の論文で用いた Fisher’s exact test や Cohen’s Kappa coefficient についても紹介する。

-4-ポスターセッション【茨城大学】
P01

細胞膜透過ペプチドを用いた昆虫生体内タンパク送達法の確立
農学研究科 1 年 竹中 彩

P02

（指導教員：菊田真吾）

アピオスの機能性成分に関する研究
農学研究科 2 年 本藤 大芽 （指導教員：上妻由章）

P03

昆虫食の安全性～アブラゼミおよびミンミンゼミの衛生指標菌について～
農学研究科 2 年 上田 拓郎 （指導教員：鈴木穂高）

P04

マウスはだんだん塩を好きになる？－長期観察から得られたこと―
農学研究科 1 年 酒井 一吹 （指導教員：豊田淳）【茨城県立医療大学】
P05

Aging in Place 達成のための住民参加型食支援システム構築に関する地域研究
看護学科 助教 矢野 聡子

P06

小児リハビリテーションにおける先端ロボット技術による動作支援―機器開発・臨床研究から医師主導治験へ―
理学療法学科 助教 黒田 真由美

P07

高純度の培養神経細胞を用いたシステイン取り込み機構の解明
人間科学センター 准教授 相良 順一

P08

健常者を対象とした味覚と不安・抑うつの関連性
医科学センター 助教 石山 すみれ【東京医科大学茨城医療センター】
P09

The role of hydrophobic bile acids in the progression to NASH by using amouse model with human-like bile acid composition
消化器内科 上田 元、本多 彰、宮﨑 照雄、池上 正

P10

胆汁酸組成の変化がタウリンの合成・胆汁酸抱合に及ぼす影響
共同研究センター 宮﨑 照雄、上田 元、池上 正、本多 彰P11細胞株を用いた腸管レナラーゼの抗炎症機能の検証
消化器外科 青木 海、菅澤 威仁、竹越 一博-5-◇ポスター発表者へのご案内◇
１．ポスター発表フラッシュトークについて“ポスターセッション”は第Ⅱ部に行いますが、第Ⅰ部のおわりに、発表内容を“各自１分間で PR”していただく「ポスター発表フラッシュトーク」を予定しています。その際に映写するフラッシュトーク発表用スライド（１枚）をご用意願います。発表者の交代を円滑に行うため、スライドは事前にご提出ください。スライド提出にかかる詳細は、以下のとおりです。
【ファイル形式】 PDF ファイル
【ファイル名称】 （大学名）_（発表者氏名）.pdf【送信先】

茨城大学農学部総務グループ 〈Agr-soumu@ml.ibaraki.ac.jp〉【提出締切】

令和 5 年 9 月 26 日（火）13:00 時

２．ポスターについて
・ポスターは、Ａ０サイズ(縦 1189mm×横 841mm)以下で作成してください。
・ポスター掲示は、こぶし会館 1 階で行います。ポスター掲示用のボードを設置しておきますので、各自の番号をご確認の上、所定の場所に貼付してください。
・ポスター貼付は、16:00～16:30 の間にお願いします。貼付用の画鋲等は、会場に用意しています。
・セミナー終了後のポスター撤去は、各自でお願いします。

◇会場案内図◇※お車でお越しの方へ
上記地図に記載の駐車場をご利用ください。

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