切片 in situ ハイブリダイゼーション習得キット
Section in situ hybridization starting Kit
製品マニュアルCat No.AA-4020～ご使用前に本誌をよくお読みいただき、正しいお取り扱いをお願い致します～【製品説明】
本製品は、in situ hybridazation （ISH) を初めて実施する方のため、これまで 2～3 日かかっていた作業時間を出来るだけ短縮し、1 日でより簡便に切片 ISH を体験できるよう開発したハイブリダイゼーション練習用キットです。ISH 法は、原位置(in situ）での核酸（RNA・DNA) の発現場所を形態的に評価する手法であり、浸透性の良い胚などを用いた方法（ホールマウント in situ hybridization）と組織を薄く切った切片を用いた方法（切片 in situ hybridization）の 2 種類があります。
本製品は、切片を用いて mRNA の発現を評価するキットです。
プローブ作製の練習用キットであるプローブ合成トライアルセット(Cat No.AA-4010) の姉妹品です。

【製品内容】
製品内容

内容量

マウス精巣切片

10 枚

プリザベーションプレート（プローブ）

400ng/spot×10 spots/枚×2 枚

Hybridization buffer（ハイブリ溶液）

200μl×16

保存方法：4℃
使用期限：製品の外箱に別途記載【取扱い注意】■一般的注意・本試薬はなるべく早く使用し、有効期限を過ぎた試薬は使用しないで下さい。記載された使用方法及び使用目的以外の使用については、染色結果の信頼性を保証できないので、記載内容に従い使用して下さい。
・本試薬は直射日光に当てないで下さい。
・本試薬は微生物に汚染されないようにして下さい。
・本試薬が皮膚および粘膜に直接接触することを避け、万一触れた場合は、水で十分洗い流して下さい。
・本試薬の使用後は封をきちんと閉めて下さい。
・製品内の容器および付属品等は他の目的に転用しないで下さい。
・使用後の容器を廃棄する場合には、廃棄物に関する規定に従い、実験産業廃棄物等区別して廃棄して下さい。

■染色上の注意
・反応の際には組織が乾燥しないように注意し、必要に応じて湿潤箱を使用して下さい。
・実験操作中は RNase（汗や唾液に含まれる）を混入させないように注意し、操作を行って下さい。

-1-

【原理】a) 組織の固定―mRNA を細胞内に保存する－細胞が死ぬと細胞内の mRNA の分解が急速に進むため、この分解を防ぎ出来るだけ生きている時と近い状態に細胞や組織を保存する必要がある。これを固定と呼ぶが、in situ hybridazation （ISH) 法においては、この作業が実験の成否に大きく影響する。
mRNA の分解は急速に進むものと考えられているので、一秒でも早く固定しなければならない。（実験動物の場合、潅流固定することを推奨する。ヒトの場合も、数分以内には固定するのが好ましい。）
固定法には、一般的に 2 つの方法（アルデヒド固定とアルコール固定）が開発されてきたが、研究目的に応じて最適の固定法を検討する必要がある。in situ hybridazation （ISH) 法においては、一般的に 4%パラフォルムアルデヒド（PFA）を固定法として用いる場合が多い。
1. アルデヒド固定 (PFA 固定・ホルマリン固定)
アルデヒド系の固定液を用いてタンパク質を架橋することにより固定する
2. アルコール固定 (FAA 固定など)
アルコールで、タンパク質を変形させることにより固定するb) プローブの調製固定により細胞内に保存した目的の mRNA を検出するため、その mRNA と特異的にハイブリダイズする(目的の mRNA と相補的な配列を持つ)RNA プローブが必要である。
目的の mRNA とハイブリダイズしたプローブの位置を可視化するために、RNA プローブにはあらかじめ標識物質を結合させ、酵素抗体法または蛍光抗体法により可視化を可能にする。
＊目的の mRNA と相補的な配列の RNA プローブをアンチセンスプローブ（AS）と呼び、ネガティブコントロールとして、目的の遺伝子と同じ配列で組織内の mRNA とはハイブリダイズしない RNA プローブをセンスプローブ（SE）と呼ぶ。

c) 前処理
固定した組織に対するプローブの非特異的な吸着を防ぐ目的と結合組織などを分解しプローブの浸透性を良くする目的で行う。プローブの浸透性を良くするために、タンパク質分解酵素(ProteinaseK)を用いて処理を行う。タンパク質分解酵素の処理に関しては、組織の種類、固定法と密接に関係し、in situ hybridazation （ISH)の結果に大きく左右する重要な因子であるため、実験ごとに濃度・反応時間・反応温度などの条件を十分検討しなければいけない。

d) Hybridization
目的の mRNA と相補的な配列を持つ DIG を標識した RNA プローブをハイブリダイズさせるが、それぞれの遺伝子ごとにハイブリ温度（Tm 値）が決定され、その遺伝子の至適温度でハイブリダイズさせる。
Tm は塩基配列の GC 塩基対の含量、配列の長さ、ハイブリ溶液の塩濃度や組成などによって変化する。
経験的な式を下記に記す。
<完全に塩基対が一致している場合>

Tm=81.5+16.6(logM)+0.41(%GC 含量)-0.72(%formamide 濃度)-500/L( M=一価の正イオンのモル濃度、L=プローブの長さ(base))

DNA は、A=T または G≡C という相補的な塩基の水素結合により安定な 2 重らせん構造を形成している。DNA の水素結合を切り離し（変性させ）、１本鎖にする方法の一つとして、加熱が用いられる。温度を徐々に高くすると、DNA の 2 重らせんが切り離され、1 本鎖になっていくが、温度が低い時の DNA をヘリックス 100%とし、高温で吸光度が一定になる状態をヘリックス 0％とすると、ヘリックス 50%になる温度（融解温度（Tm）と呼ぶ）を決定することができる。
ハイブリ温度は、Tm より 5℃～20℃低い温度で行う。どの程度塩基対のマッチを許容するかを stringency というが、Tm より 20℃低い温度でハイブリさせると、stringency は非常に高くなる。

-2-e) プローブの検出（酵素抗体法または蛍光抗体法）
適当な抗原（標識物質）を結合させた核酸 (RNA) を合成し、その抗原に対する抗体を用いて、発色または蛍光により可視化する。
本キットでは、酵素抗体法を使用し検出することを推奨する。DIG 標識 プローブにアルカリホスファターゼ (AP) を標識した DIG に対し特異的な抗体を反応させる。そして、アルカリホスファターゼ(AP)の基質を反応させ発色により検出する。

原理f) 観察と記録
結果を顕微鏡で観察し、写真として記録する。

染色の例：マウス精巣における protamine1 遺伝子の発現

発色基質：NBT/BCIP
対比染色：Nuclear Fast Red-3-

【プロトコール】■必要な試薬・器具・機器（試薬）
必要量については容量が 30ｍL の染色バットを使用した際の目安となります。
使用する染色バットの容量に応じてご用意ください。

必要試薬

必要量

備考

組成①※

PBS

200 mL

137mM NaCl,2.7mM KCl ,8mM Na2HPO4,1.5 mM リン酸二水素カリウム

②

キシレン

100 mL

キシレン③100％エタノール

50 mL

100％エタノール④70％エタノール

50 mL

70％エタノール/PBS⑤50％エタノール

50 mL

50％エタノール/PBS⑥25％エタノール

50 mL

25％エタノール/PBS⑦ProteinaseK※/PBS50 mL

1 ug/ml ProteinaseK/PBS※
20 mg/mLProteinaseK（滅菌水に溶解）を事前に調整しストックしておく （遮光 -20℃保存 ）。
反応直前に PBS で希釈し使用する。(用事調整)⑧PBS-Glycine※

50 mL

2 mg/ml Glycine/PBS(室温保存)⑨4×SSC※

150 mL水酸化ナトリウムで pH7.0 にあわせオートクレーブで滅菌する。(室温保存)⑩0.1×SSC※

50 mL⑪TTBS※

300 mL

0.6 M NaCl
0.06 M sodium citrate
15 mM NaCl
1.5 mM Sodium citrate
5 M NaCl
20 mM Tris-HCl (pH8.0)
0.1%Tween20⑫Prehybridization buffer
2×SSC / 50 % ホルムアミド

4×SSC に等量のホルムアミドを加える。(室温保存)

150 ml

塩酸あるいは水酸化ナトリウムで pH7.4 にあわせオートクレーブで滅菌する。(室温保存)※
4×SSC を 40 倍希釈して用いる。(室温保存)(室温保存)

保湿液⑬ブロッキング溶液※

5 ｍL

⑭抗体溶液

2 ml

⑮発色バッファー※

60 ml

1% (w/v)Blocking powder*/TTBS*Roche 1 096 176
Anti-Digoxigenin-AP*
500 倍希釈 *Roche

1 093 274

ブロッキング溶液
100 mM NaCl ,100 mM Tris-HCl (pH9.5)
50 mM MgCl２,0.1 % Triton X-100

⑯発色液

10 ｍL

450ug/ml NBT*1
175ug/ml BCIP*2
発色バッファー

⑰TE (pH8.0)

50 mL

10mM Tris-HCl(pH8.0),
1mM EDTA⑱

滅菌水1000 ml⑲

封入剤10 ml

65℃中で振盪しながら完全に溶解する (用事調整)

用事調整

用時調整

70mg/mL NBT/70% ジ メ チ ル ホ ル ム ア ミ ド お よ び
50mg/ml BCIP/100% ジメチルホルムアミドをそれぞれ事前に調整しストックしておく （遮光 -20℃保存 ）。
発色直前に発色バッファーで 450 ug/ml NBT、175 ug/ml BCIP に希釈し使用する。(用事調整)(室温保存)(室温保存)

70% Glycerol / H2O(室温保存)※Wash バッファーセット（AA-4021） として別販売している試薬です。

-4-

（器具）
器具

参考器種

使用工程

①

染色バット

アズワン #1440001；乾熱滅菌をかけたものを使用すること

全行程

②

ピンセット

乾熱滅菌をかけたものを使用すること

全行程

③

湿潤箱

耐熱性のものを使用すること

PreHybridization

Hybridization ,抗体反応、発色反応④

パップペン

フナコシ S-PAP-M など

Blocking 前⑤

パラフィルムHybridization⑥50 mL ビーカー

ハイブリ後の洗浄⑦

使い捨て手袋

全行程⑧

キムワイプ・キムタオル

全行程⑨カバーガラス⑩

マニュキュア・トップコート

封入⑪マイクロピペット

全行程

マツナミ 22mm×22mm #C0022221 など

封入

（機器）
機器
①

参考機種

使用工程

ハイブリダイゼーション
タイテック HB-80 など

PreHybridization 、Hybridization、 洗浄

アステック BI-516H B など

RNA Probe 溶出インキュベーター
② ブロックインキュベーター
③ 光学顕微鏡

観察-5-■操作手順① スライドガラスのラべル
スライドガラス（マウス精巣切片）のフロスト部分に、プローブ名（アンチセンスプローブ（AS）・センスプローブ（SE）と区別がつくように）等を記入する。

② プローブの溶出
本製品の hybridization 溶液 200μl 中に、プリザベーションプレートのろ紙（紙チップ）を一枚落とし、65 度に温めたブロックイ
ンキュベーターにて、プローブの溶出を行う。
＊60 分を目安にハイブリダイゼーションの工程の前にあらかじめ溶出させておく<プローブ溶出方法>
取り出す部分のアルミシールを剥がした後(カッターなどで、1 箇所分にカットするとよい) フィルムを外し、ピペットチップの先などを使い、紙チップをハイブリバッファーの入ったチューブへ落とし、65 度にてインキュベーションを1 時間程度行う。

①②③④

② 前処理
表に記載の試薬を上から順に指定の時間・温度で反応させ、液交換を行う。
１） 組織が浸る程度に染色バットに試薬を移す。

処理工程

試薬名

時間

温度

２） スライドガラスを染色バット内の溶液に浸し、指定の時間静置する。

処理工程

キシレン

10 分

室温

キシレン

10 分

室温

100% エタノール

5 分

室温

70% エタノール/H2O

5 分

室温

50% エタノール/PBS

5 分

室温

25% エタノール/PBS

5 分

室温

PBS

5 分

室温

proteinaseK/PBS

10 分

室温

Glycine /PBS

2 分

室温

PBS

5 分

室温

３） ピンセットでスライドガラスを溶液から取り出し、次の試薬を入れた染色バットに移す。
４） 反応したあとの試薬は、指定の廃棄方法に従って廃棄し、精製水脱包埋剤処理（滅菌済み）でバット内を洗浄し、新しい液に交換する。

タンパク質分解酵素処理③ プレハイブリダイゼーション
染色バット内に Prehybridization buffer （2×SSC/50%ホルムアミド） を組織が浸るぐらい入れ、 65 度で 5 分間静置する
あらかじめ Prehybridization buffer （2×SSC/50%ホルムアミド）は 65℃にあたためておくとよい。

-6-

④ ハイブリダイゼーション
１） ピンセットで保湿液（2×SSC/50%ホルムアミド）からスライドガラスを取り出し、組織に触れないように注意し、スライドガラスに付着している水滴をキムワイプなどでよく取り除く。
２） スライドガラス上の組織切片に、あらかじめ溶出したプローブ溶液 （2μg/ml） 全量を切片を覆うようにマイクロピペットで滴下する。（プローブの種類とラべルした切片の種類が間違っていないか確認して、プローブをのせる。）
３） ピンセットを用いて空気が入らないように、切片にパラフィルムを注意深くかぶせる (右写真)。
４） 湿潤箱にキムワイプを敷き、保湿液 （2×SSC/50%ホルムアミド） を適量しみこませる。
５) 湿潤箱に、スライドガラスを置き蓋を閉め、ハイブリダイゼーションインキュベーターの中に入れて 65 度で 60 分以上反応させる⑤ プローブ洗浄
ハイブリ後、スライドガラスを 4×SSC の中に移し、液中内で処理工程

切片の剝離に注意して、静かにパラフィルムを取り除く(下写真)。ピンセットでパラフィルムを除去したスライドガラ

Probe Wash

スを取り出し、右表の通りプローブの洗浄を行う。

①

試薬名時間

温度

2XSSC/50%ホルムアミド

5 分

65℃

0.1XSSC

5 分

65℃

TTBS30 分

室温②⑥ ブロッキング・抗体反応・抗体洗浄１） ピンセットでスライドガラスを取り出し、水滴をよく取り除き、スライドの縁に沿ってパップペンで切片の周りを囲み、湿潤箱に載せる。
２） パップペンで囲まれた部分に、ブロッキング溶液を約 500μl 注ぎ、5 分室温で反応させる。
３） ブロッキング溶液の液を切り、同様に抗体溶液 (500 倍希釈) を約 500μl 注ぎ、30 分室温で反応させる。
４） 抗体の液をよく切り、染色バット内に入れた TTBS で 10 分間室温にて静置し、抗体の洗浄を行う。
これを 4 回繰り返す。

⑦ 発色反応～封入
１） ピンセットでスライドガラスを取り出し、キムワイプで水滴をよく取り除く。
２） 約 500μl 発色液を注ぎ、30 分間アルミホイルなどで遮光し、室温で反応させる。
３） 発色液を切り、染色バット内に入れた TE で 5 分間室温にて静置し、発色反応を停止させる。
４） ピンセットでスライドガラスを移し、PBS で 5 分間室温にて静置する。
５） スライドガラスを染色バットから取り出し、水滴をよく取り除き、70%グリセロールにて封入する。
カバーガラスが動かないようマニュキュアなどでカバーガラスの縁を塗り固定する。
必要に応じて、対比染色 （nuclear Fast Red など） を行う。

-7-簡易プロトコール
工程

使用試薬

時間 (分)

ハイブリバッファー

60 分

キシレン

10 分

100 % エタノール

回数

温度

備考

チェック✓

スライドラベル
プローブ溶出

65℃
2回

染色バット

室温

5 分

染色バット

室温

70 % エタノール

5 分

染色バット

室温

50 % エタノール/PBS

5 分

染色バット

室温

25 % エタノール/PBS

5 分

染色バット

室温

PBS

5 分

染色バット

室温

前処理

ProteinaseK/PBS

10 分

染色バット

室温

反応停止

Glycine /PBS

2 分

染色バット

室温

洗浄

PBS

5 分

染色バット

室温

Prehybridization buffer＊

5 分

染色バット

65℃

＊予め 65℃で温めておく。

RNA Probe/
Hybridization buffer

60 分

湿潤箱/保湿液65℃

パラフィルムでカバーする。

染色バット

室温

４XSSC 中で静かにパラフィルムを剥がす。

脱パラフィン

プレハイブリダイゼーション
ハイブリダイゼーション
脱パラフィルム

4×SSC

プローブ洗浄Prehybridization buffer＊

5 分

染色バット

65℃

＊予め 65℃で温めておく。

0.1XSSC＊

5 分

染色バット

65℃

＊予め 65℃で温めておく。

TTBS

30 分

染色バット

室温
組織の周りの余分な液を拭き取った後、ブロッキング

パップペン周りを囲うように描く
ブロッキング溶液

5 分

湿潤箱/H2O

室温

組織の上に滴下する

抗体反応

抗体溶液

30 分

湿潤箱/H2O

室温

組織の上に滴下する

抗体洗浄

TTBS

10 分

染色バット

室温

4回

室発色

発色液

30 分

湿潤箱/H2O

温・組織の上に滴下する

遮光
反応停止

封入TE

5 分

染色バット

室温

PBS

5 分

染色バット

室温

70% グリセロール/PBS

室温

カバーガラスの縁をマニュキアで固定する。

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