2013. 9. 22
第54回歯科基礎医学会学術大会・総会
ランチョンセミナー：エルゼビア社主催
若手研究者のためのAuthor Workshop

学術論文作成の基本とEESを用いたJournal of Oral Biosciences誌への投稿方法について
大島勇人
Journal of Oral Biosciences 誌編集長
新潟大学大学院医歯学総合研究科
histoman@dent.niigata‐u.ac.jp

論文の構造Title（タイトル）→内容を明確に示す
Authors（著者）→authorshipが分かるようにする
Abstract（抄録）→何をしたかを簡潔に説明する
Keywords（キーワード）→論文が抄録・索引サービスで正しく識別されるようにする
1. Introduction（序文）→背景・仮説を説明し、研究の目的を示す
2. Materials & methods（方法）→データの収集方法や実験方法を説明する
3. Results（結果）→何を発見したかを説明する
4. Discussion（考察）→研究結果の意味を検討する• Acknowledgements（謝辞）→研究を支援した人が分かるようにする• Conflict of interest（利益相反）→利益相反の有無を明示する• References（参考文献）→過去に出版された論文が分かるようにする• Supplementary material（補足資料）→専門家向けの補足資料を提供する••••

論文を書く事の重要性• Publish or Perish：「出版せよ、そうでなければ消えてしまいなさい」（アメリカのアカデミズムの格言）– 研究はその成果としての論文や本の出版を伴う– 出版することで、社会にそれを還元する義務を負っている– 論文や本を出版しない教員は、現場からの「消滅・退場」Perishに値する• And then all rubbish prevail：「粗造濫造」– 生産性だけが優先されれば、研究と論文の質の低下を招く（児玉昌己［久留米大学］）• Work, Finish, Publish：「はたらき、まとめ、出版せよ」（MichaelFaraday [1971‐1867]）

Form http://blog.arjournals.com/2012/07/publish‐
or‐perish‐current‐trend‐in.html]

研究の戦略
1. 研究目的を考える–––

まず、自分は何を知りたいか？ 何を見つけたいか？ 何を示したいか？ を考える
目的のない研究は、研究のための研究、論文のための研究になる
Rationale（理論的根拠）が重要である

2. 目的が決まったら– 解決するための手段を考える– 研究手段を考えることはきわめて難しい– 研究手法を多くもっている研究者ほど問題解決能力が高くなる– 研究は数学である（研究手法＝公式）

研究と論文の構成
研究

Introduction
科研費申請

References

論文• 大きな研究テーマを設定する• 自分＆過去の研究をベースに未解決の問題点を整理する• 仮説を提唱する• 具体的な研究目的を設定する

Discussion
References• 本研究で明らかになったこと（新しい所見）を説明する• 研究結果の意味を検討する• 過去の研究結果と比較する

Rationaleが重要

Methods• 研究目的を達成するための有効な研究方略を考える• 研究内容を適確に伝えるタイト
ルを考える

Title

References• 研究を実施する• 実験結果を検証する

Results

演繹法

Trial and error• 図表の作製

帰納法• 何をしたかを簡潔に説明する

Abstract

科研費申請アイデアのまとめ方• 応募内容の全体構想を考えてから、細部の項目を仕上げていく• 研究のアイデアは常日頃からノートに記録しておく• マインドマップ（中心となるテーマを中央に書き、そこから自由に枝を伸ばしながらメモを取る方法）はアイデアをまとめるのに役に立つ

From http://e‐doc.xii.jp/archives/327

演繹法と帰納法
相互検証・使い分け•

演繹法とは– 一般的原理から論理的推論により結論として個々の事象を導く方法– 演繹法の欠点は、正しくない、あるいは使用するのが適切ではない前提を用いてしまうことがある

•

帰納法とは
– 個々の事象から、事象間の本質的な結合関係（因果関係）を推論し、結論として一般的原理を導く方法– 帰納法の欠点は、全事例を網羅するか、それと同等の論理証明をしない限り、帰納した結論（帰結）は必ずしも確実な真理ではなく、ある程度の確率を持ったものに過ぎない••••

先入観や偏見、曖昧さの排除
複雑な問題は分解し、複数の単純な問題にして解決を図り（分析）、単純な問題の解決結果を、それらの関連性に基づいて再構築し、複雑な問題の解決へと進む（総合）
可能な限り全ての事例や仮説を揃え（枚挙）、背理法や統計的検定といった選別手段により不適切な事例や仮説を排除していく（排除法）
自説に都合の悪い事例や仮説でも、敢えて取り上げて検証する姿勢（客観的批判）をもち、原理を実際に検証する作業（実験）、及び、原理を広範囲の事例と照らし合わせて確認する作業（照合）を行う

From http://www.abysshr.com/mdklg010.html

神戸大学 近藤昭彦教授のスライドを改変論文を強く意識して研究を進める• 実験が終了してから論文を作成するのではなく、作成しながら実験を行う• 研究とは新たなフィロソフィーを生み出す作業であり、データを集める作業ではない• フィロソフィーを良く伝えるためには、コアとなるデータを厳選して図表にまとめ、分かりやすい順番で組み立てる（骨格を作る）ことが、重要である• コアデータは再現性を慎重に確認し、磨き上げる• Beauty is truth, truth beauty (John Keats)：美しい写真は真実である

神戸大学 近藤昭彦教授のスライドを改変

論文執筆の前に• 強力な論文とは→Novel, Clear, Useful, Exciting!
– Novel, clear, useful, excitingなメッセージを発信している– 論理構成がしっかりしている– 他人本位（読者の視点に立った記述）で、エディター、レビュアー、そして読者が科学的な重要性を容易に理解できる• 自分に問いかけよう→すべて”Yes”ならすぐに執筆開始！
– 新しく、興味深い知見が得られているだろうか？
– 現在ホットなテーマだろうか？
– 何か困難な問題に答えを提示しているだろうか？
– 現時点で発表して良いだろうか？

神戸大学 近藤昭彦教授のスライドを改変

適切なジャーナルを選ぼう• 研究領域の現在のトレンドやホットなテーマを良く理解する• どのジャーナルが適した投稿先か、しっかり選ぶ– Impact factor、ジャーナルのスコープ、どんなテーマの論文が良く掲載されているか、自分の論文の参考文献・・・・• Impact factorを気にしすぎないようにする• 真筆前に、投稿しようとするジャーナルのGuide to Authors
をじっくり読んで、体裁をきちんと守って執筆する• 同じジャーナルに掲載されている類似テーマの論文を参考にする• Journal of Oral Biosciencesへの投稿を考える

神戸大学 近藤昭彦教授のスライドを改変

科学的な重要性をつかみ易い論文を！
• エディター・レビュアーは忙しい！
– Abstract, Introduction, Conclusionを読んだだけで、「何が問題で、何を行って、どの様なインパクトのある結果が得られたか」がよく分かるようにする• 論文を書いてジャーナルに投稿すると、審査され、大幅な改訂を求められたり、掲載を断られる場合がある→そのこと自体が大きな勉強になる• レビューにはきちんと答える→論文を良くするチャンスである• レビュアーが誤解している場合もあるので、その場合は、きちんと丁寧に説明する。

執筆前に論文の骨格を考える
Introduction

Research
objectives

Background•••

何故本研究を実施する必要があるのか？
問題点は何なのか？
仮説を提唱する

それぞれのsection間で内容の重複を避け、各section相互を有機的に関連づけることが、科学的な重要性をつかみ易い論文を作成するコツである•Materials &methods

研究目的を達成する研究方略が立案されていなければならない

Discussion•••

Resultsで示された結果の意
味・意義を示す
未解決の問題や臨床的意義など今後の展望も示す
IntroductionとResultsの繰り返しを避ける

Results••

本研究で明らかになった結果（所見）を示す
論文の善し悪しはResultsで決まる

論文の骨格（実例）Introduction
Research
objectives

Background•
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3Mixの臨床応用について－外傷歯治療への3Mixの応用の限界を述べる
歯の再植後の歯髄治癒パターンについて－再植歯の歯髄治癒パターンを調整することの重要を述べる
歯の再植後の歯髄治癒パターンの決定因子について－細菌の関与について述べる
再植歯への抗菌薬の効果について－
過去の研究では、細胞増殖・分化、アポトーシスの様な細胞レベルの検索がなされていないことを述べる
In vivo再植動物実験の限界について－歯髄再生には着目していないことを述べる••

マウス意図的遅延再植への3Mix応用の動物実験モデルの確立
歯髄・歯根膜への3Mixの効果を免疫組織化学的・酵素組織化学的解析とTUNEL評価

Materials &methods
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•
•

動物実験モデルの説明（Table 1）
組織標本作製免疫組織化学及びTUNEL評価
酵素組織化学
細胞増殖とアポトーシスの統計処理
アンキローシスと歯根吸収の統計処理

ResultsDiscussion••••

マウス動物実験モデルの確立に成功－3Mixが歯髄再生に効果的に働く
3Mixの濃度と治癒パターンとの関係について－歯髄再生には適切な3Mix濃度が必要である
3Mixの応用とアンキローシスについて－3Mixはアンキローシスを促進するが、PBSの洗浄で改善する未解決の問題－歯根膜への影響やヒトとマウスのギャップについて述べる

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Fig .1：対照群
Figs. 2‐4：実験群
Table 2：治癒パターン
Fig. 5：細胞増殖活性Fig. 6：TUNEL評価

From Author Pack 学術ジャーナルに論文を出版するための手引き

Introduction• BackgroundとResearch objectivesに分かれる• 研究する問題、問題の背景説明、研究を行う理由について明確に述べる• 関連の研究をまとめて前後関係を説明し、自分の論文が既に発表されている論文とどう違うのか、どんな課題に答えているのかを述べる• 反論、あるいは支持する他の人の研究結果があれば言及する• 実験、仮説、研究する問題点、一般的な実験の計画や方法も、簡潔に説明する• 最後に研究の具体的な目的を述べる

From Author Pack 学術ジャーナルに論文を出版するための手引き

Materials and methods•

Materials and Methods or Experimental Methods（材料、研究方法、実験的方法）など•

このセクションの主な目的は、読者が同じ研究を反復できるよう十分な情報を与えること•どのように問題点を研究したのかを説明し、手順を明確にし、それらを可能な限り時間軸に沿って並べる
新しい方法を取り入れた場合は、詳細な説明が必要••

新しい方法でなければ、方法の名前を挙げ、既に発表されている論文を引用す
る•

その方法に修正を加えている場合は、元の論文を参照するとともに、修正点を書き加える
器具や装置、使用した材料について述べ、供給元を明確にする
観察の頻度、記録したデータのタイプも明記する
測定値は正確に、誤差も記録する使用した統計的試験があれば明記し、数値結果の正当性を実証する
過去時制を使用し（Resultsも過去時制）、一人称を使用しない

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神戸大学 近藤昭彦教授のスライドを改変

Results• 研究結果を客観的に提示し、発見したことを言葉で表現する→明確かつ論理的な順序に従って述べる• 研究から得られた主要な結果のみを示す– ということは全部の結果ではない→取捨選択が重要– Methods sectionで記述した実験から得られた結果を記載する

過去の報告と異なる結果や予想外の結果は強調する
統計的な解析は極めて重要である
適切な対照実験を行うことが重要である
図で示すか、表にまとめるか→どちらが効果的か良く検討する• 結果の分析を述べてはいけない→Discussionで述べる••••

神戸大学 近藤昭彦教授のスライドを改変

Discussion•••

結果の意味や意義を伝える→研究が科学知識の進歩にどのように寄与するかを説明する
論文において最も重要な場所であり、多くの論文がDiscussionが弱いために掲載不可となっている。
以下の点を記述できているか。
– データが、introductionで述べた問題や研究目的とどう関係しているか– 各データの意味や意義はどうか– 各データは他の研究者の報告と整合する結果となっているか– 何か限界は無いか– 論理的に結論を導き出せるか•してはいけないこと– 結果から導き出せないところまで、飛躍して述べること– 突然新しいタームやアイデアを述べ出すこと神戸大学 近藤昭彦教授のスライドを改変

Conclusion
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•
•••

独立した項目である場合とDiscussionに含める場合がある
包括的かつ具体的な結論を示す
どのように利用や拡張ができるか、適当であれば示す
将来の実験プラン（既に始めているかも含めて）を示す
論文の要約はしない（要約はAbstractで）インパクトの評価を行うことは避ける
感覚的な表現（e.g. low/high, extremely, enormous, rapidly,dramatic, considerably, massive, major/minor, ……）は避ける→できるだけ定量的な表現を心がける

Authors• 著者一覧には、研究に関与した人、すなわち、データや結論を公式養護し、最終原稿を承認した人だけを含める• その研究の遂行および論文の執筆に最も大きく貢献した人を第一著者とする• equally contributedとして第一著者を2名とする場合がある• コレスポンティングオーサーがジャーナルとのやり取りの窓口となり、著者を代表して論文の責任を負う（last authorの場合が多い）• Authorshipについては、Harvard Faculty Authorship
Guidelinesを参照
https://research.bidmc.harvard.edu/Policies/Authorship.asp

From Author Pack 学術ジャーナルに論文を出版するための手引き

Title• タイトルは、論文の内容を明確かつ正確に表現し、読者がそれを見て論文を読むべきかどうかを判断できるものでなければならない• タイトルは、論文の広告でもある→魅力的でないタイトルの論文は対象読者に決して届かない• 具体的なタイトルを決める→A study of ～, Investigation of～, Observations on ～など、無駄な言葉は省く• 略語や隠語を使ってはならない• タイトルに使用されている言葉は抄録・索引サービスにキーワードとして索引づけされるため、タイトルの正確さが重要となる。

Keywords• KeywordsにはMeSHを用いる– MeSH (Medical Subject Headings) is the NLM
controlled vocabulary thesaurus used forindexing articles for PubMed.

• 論文にはMeSHが割り当てられている

From Author Pack 学術ジャーナルに論文を出版するための手引き

Abstract•

抄録は、50～300語で問題点、方法、結果、そして結論をまとめたもの•

読者が論文全体を読むかどうかを判断できるだけの十分な情報を含んでいる必要がある
単体でも内容が分かるように、過不足なく記述する
Objectives, Methods, Results, Conclusionsを含める••

From Author Pack 学術ジャーナルに論文を出版するための手引き

Acknowledgments• 協力者、指導教員、無償で材料を提供してくれた人な
ど、研究を支援してくれた人の名前を挙げる• 科研費など研究費の支援を受けた場合は、ここに記載することが多い– Fundingが独立している場合もある

From Author Pack 学術ジャーナルに論文を出版するための手引き

References• 過去に発表された論文を参考にする際は、必ず出典を明らかにする• 自分の実験や「常識」で得られない情報はすべて、引用として示す必要があるFrom http://ipw.naist.jp/conflict_of_interest/index.html

Conflict of interest• 「利益相反」とは、教職員が得る外部利益と、教職員として保持すべき大学のインテグリティ（社会的信頼）とが両立しえない状態のことをいう。
• 「利益相反」は産官学連携活動に伴って必ず発生し、これ自体は決して悪いことではない。
– たとえば、産学連携活動を行うにあたって、個人としての責務を負い利益を得ることは、自己の成果に対するコミットメントを増大させ、研究推進のインセンティブとなり、社会にも絶大な利益をもたらしている
産官学連携活動を加速させる一面を持っている。この行為を、利益相反行為に該当する可能性は高いからといってすべて禁止するとなると、意欲が減退し、結果として産官学連携活動が阻害されるおそれがある。したがって、一概に「利益相反＝悪」とは言えない。ただし、利益相反行為を何の対応もせずに放置したり、隠していたりすると問題になる。

From Author Pack 学術ジャーナルに論文を出版するための手引き

Supplementary material• 通常、科学論文に生データは記載しないが、データが有用と考えられる場合、論文に添付することができる• 補足資料には、生データの表、動画、写真、複雑な3Dモデルなども含めることができる

ees.elsevier.com/job/

クリック

Original article: < 3,000 words
Review: < 6,000 words
Short communication: < 1,500 words
Technical note: < 1,500 words
Letter: < 600 words
This journal requires no page charges.

EndNoteファイルをGuide for Authorsからダウンロードする。

• ピクセルとDPIについて理解する。
• 画像ファイルは300dpiを選択する。
• Single columnか1.5 columnかFull widthを選択する。
• 最大190 mm×240 mm• ビットマップ画像編集ソフトウェア（例えばPhotoshop）を使って画像を作成する。
• TIFFファイルで保存する。

••
•
•

2,244 pixel X 2,835 pixelのキャンパスに図を配置していく。
図を二列に配列するなら、1,122 pixel幅の図を並べる。
図を三列に配列するなら、748 pixel幅の図を並べる。
PSDファイルとレイヤーを統合したTIFFの二つを保存する。

クリック

クリック

クリック

今日は時間がないので、クリック

クリック

クリック

Editorをイメージして、査読をして欲しい分野を選ぶ。

AnatomyMicrobiology

Physiology
Microbiology
Biochemistry
AnatomyPathology

Physiology
PharmacologyBiochemistryPathology

クリック

クリック

クリック
クリック

最も自分の研究を理解して、適確なsuggestionを頂ける査読候補者を3名記載する。

Conflict of interest• Journal of Oral Biosciences（JOB）誌は皆様の投稿をお待ちしています！
• JOB誌の発展は歯科基礎医学会の発展に繋がり、学会の発展は歯科医学の発展に繋がる

参考文献• 近藤昭彦（神戸大学教授）「ジャーナルエディ
ターからみたよい論文とは」– エルゼビア Author Workshop（2011年11月8日）資料– http://japan.elsevier.com/news/events/aw/kobe_prof_kondo.pdf• Author Pack 学術ジャーナルに論文を出版するための手引き（エルゼビア社）– http://japan.elsevier.com/publishing/authorpack_jp_200911.pdf