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PubMedによる指定難病と他疾患との創薬研究動向の⽐較○平⽥誠、坂⼿⿓⼀

国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所

難治性疾患研究開発・⽀援センター

厚⽣労働省の指定難病の創薬については、他疾患で開発された薬剤指定難病と他疾患とで4,800薬物が共有されていた。1,000薬物につの適応拡⼤であったり、逆⽅向の適応拡⼤であったりすることがある。

いて時系列での論⽂数の変化をみると、92.6％の薬物で他疾患の⽅がそうした適応拡⼤については、それら疾患間の関連性についても情報

指定難病より先に論⽂報告され、逆は約1.5％のみであった。疾患間が得られるものと考えられる。そこで我々は、PubMed全論⽂のタイでの論⽂数の時系列変化、及び疾患ごとの薬物の論⽂数の時系列変化

トルと要旨をテキストマイニングにより解析し、疾患（指定難病、他について解析した結果を報告する。

疾患）と薬物とが共起する論⽂を抽出して、研究動向を分析した。指定難病はDDrare1)、他疾患はMalaCards2)から、薬物はDrugBank3)か1) DDrare︓https://ddrare.nibiohn.go.jp

らリストを作成し、共起関係における頻出語の影響は、IDF（Inverse

2) MalaCards︓https://www.malacards.org

Document Frequency）値を算出して除去した。その結果、PubMed3) DrugBank︓https://go.drugbank.com

約3,400万論⽂のうち、約9,100薬物について約1,100万論⽂が得られた。そのうち指定難病332疾患について約36万論⽂、他疾患約10,000疾患について約517万論⽂が得られた。薬物についてみると、トーゴーの⽇シンポジウム2022

Licensed under a Creative Commons 表⽰4.0国際ライセンス©2022 平⽥ 誠（国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所）

1. PubMedのテキストマイニング
表１. 解析データ（2022年7⽉取得）

表１の解析データを⽤いて、PubMed全論⽂を対象に、疾患（指定難病、他疾患）と薬物とが共起する論⽂を抽出して、研究動向を分析した。共起関係における頻出語の影響を除去するため、IDF値を利論⽂疾患⽤した⽅法（Modified IDF）により、頻出薬物を抽出した。
その結果、PubMed約3,400万論⽂のうち、約9,100薬物について

薬物

データソース

サイズ

備考

PubMedDDrare（指定難病）

約3,400万 タイトル、要旨
英語疾患名（同義語、細分名を含む1,871の338
うち原則4⽂字以上のもの）

MalaCards
DrugBank v5.1.9

約22,000 ここから上記難病を除いた疾患
約15,000 Name, Synonyms

約1,100万論⽂が得られた。そのうち指定難病332疾患について約36万論⽂、他疾患約10,000疾患について約517万論⽂が得られた。
薬物についてみると、指定難病と他疾患とで4,800薬物が共有されていることがわかった。

9,131薬物 (100.0%)
他疾患 9,981疾
患5,165,584論⽂

指定難病 332疾患
362,752論⽂

Modified IDF Modified Inverse Document Frequency
出現回数は多いが、出現⽂書数が少ない語句が重要として薬物を抽出

mIDFm = log (全薬物の論⽂数+ １)
薬物mの論⽂数＋１

指定難病 332疾患
22薬物(0.2%)

4,798薬物(52.5%)

3,784薬物(41.4%)

527薬物(5.7%)

他疾患 9,977疾患x log ( 薬物mの論⽂数 )図１. テキストマイニングにより抽出された薬物数

トーゴーの⽇シンポジウム2022

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2. 指定難病と他疾患の研究動向の⽐較
表２. 指定難病と他疾患の両⽅と共起する薬物トップ20

指定難病と他疾患の両⽅と共起した4,798薬物のうち、mIDFスコ
アの⼤きいトップ1,000薬物を解析⽤に抽出した（トップ20薬物を表２に⽰す。）。トップ1,000薬物のそれぞれについて、指定難病と他疾患のどちらで先に論⽂が現れたかを⽐較した。その結果、92.6％の薬物で他疾患の⽅が指定難病より先に論⽂報告されたことがわかった。

指定難病が先

同年

他疾患が先

15薬物
(1.5%)

59薬物(5.9%)

926薬物(92.6%)

指定難病が他疾患より平均2.9年早い

他疾患が指定難病より平均12.5年早い

全体として他疾患が指定難病より平均11.5年早い

図２.指定難病と他疾患の両⽅と共起する薬物トップ1,000における最初の論⽂出現年の⽐較

トーゴーの⽇シンポジウム2022

mIDFスコア 薬物（DrugBank）
175.25

DB105832345678910111213141516171819
2075.23
74.89
74.81
74.80
74.78
74.73
74.71
74.69
74.6874.64
74.59
74.57
74.56
74.52
74.44
74.43
74.41
74.39
74.39

DB00761
DB09421DB00480
DB06273
DB09035
DB00853DB00005
DB15274
DB01073
DB01101
DB00317DB00530
DB14954
DB09037
DB00398
DB00642
DB06186
DB01268
DB00188

Clostridium tetani toxoid antigen(formaldehyde inactivated)
Potassium chloride
Protirelin
Lenalidomide
Tocilizumab
Nivolumab
Temozolomide
Etanercept
Pertussis vaccine
Fludarabine
Capecitabine
Gefitinib
Erlotinib
PIK3CA
Pembrolizumab
Sorafenib
Pemetrexed
Ipilimumab
Sunitinib
Bortezomib

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3. 薬物ごとの論⽂数の時系列変化
2020

（凡例）
指定難病のみの論⽂

2010

疾患ごとの薬物の論⽂数の時系列変化

（対数）
100

他疾患のみの論⽂
指定難病と他疾患の両⽅の論⽂

10
2022

パターン１︓指定難病が早い
DB08820 Ivacaftor
全531論⽂
指定難病︓5疾患
他疾患︓103疾患

パターン２︓他疾患が早い
DB00002 Cetuximab
全5,700論⽂
指定難病︓25疾患
他疾患︓591疾患

パターン３︓同年
DB06273 Tocilizumab
全4,185論⽂
指定難病︓76疾患
他疾患︓793疾患

トーゴーの⽇シンポジウム2022

144. レノックス・ガストー症候群︓196薬物
DB06201 Rufinamide
DB00555 Lamotrigine
DB00313 Valproic AcidDB00349 Clobazam
DB00273 Topiramate
DB09061 CannabidiolDB00949 Felbamate
Cannabidiolは、レノックス・ガストー症候群とドラベ症候群で、2018年にFDAで承認されたが、その時期に論⽂が多い。

まとめ

本研究では指定難病と他疾患についての研究論⽂を調査して、共通の約4,800薬物を抽出した。そのうち90%以上の薬物が、他疾患で先に論⽂報告されている傾向であった。⼀⽅で、指定難病で先に論⽂報告されていたり、論⽂数が多い薬物も⾒つかった。また、疾患ごとの薬物のトレンドを明らかにすることができた。これらのデータは、解析を進めることにより、創薬標的探索の基礎データとなることが期待される。
Licensed under a Creative Commons 表⽰4.0国際ライセンス©2022 平⽥ 誠（国⽴研究開発法⼈ 医薬基盤・健康・栄養研究所）