課題番号：２８指１１０１
研究課題名：ＮＣＧＭにおけるゲノム医療実施体制の構築と推進に関する研究主任研究者名 ：加藤規弘
分担研究者名 ：矢野 哲、七野浩之、清松知充、岡﨑敦子、竹内史比古
キーワード：ゲノム医療、遺伝性疾患、遺伝カウンセリング
研究成果：
近年、ゲノム医学研究が進展し、その成果を臨床現場に導入すべく、ゲノムの個人差に係る情報（ゲノム情報）を用いた、疾患発症リスクや治療反応性（薬物副作用リスク含む）の予測が試みられる段階になってきた。対象疾患は遺伝性疾患から癌などの多因子疾患へと拡がり、対象データも遺伝子変異から遺伝子多型、ゲノム・プロファイリングへと拡がりつつある。ゲノム医療の実用化に向けた取組みは国際的に進められており、わが国でも国家プロジェクトとして始められることとなった。本研究では、こうした背景を踏まえて、ＮＣＧＭにおけるゲノム医療実施体制の構築と推進を目的とする。
平成 18 年から、各種のヒト遺伝学的検査に保険が適用されるようになった。現時点では、疾患の診断等に関わる検査として遺伝性疾患 75 種、悪性腫瘍組織検査 9 種（抗腫瘍剤感受性検査含む）
及び造血器腫瘍、そしてファーマコゲノミクス（pharmacogenomics：PGx）検査 1 種が、薬事承認されている。近年、癌などの個別化医療の実践に不可欠なコンパニオン診断薬の開発が注目されている。また平成 30 年度から、がんゲノム医療の遺伝子パネル検査が先進医療として開始されることとなった。これは悪性腫瘍組織のドライバー変異の診断目的であるものの、生殖細胞系列変異についても、個別の遺伝子変異だけでなく、非常に多くの変異・バリエーションをひとまとめにして（ゲノム・プロファイリングとして）遺伝学的検査に活用する試みが始まっている。今後、多因子疾患の易罹病性診断目的にも拡がる可能性が高い。安全性、倫理性を確保しつつ、高度な診断技術の臨床応用を促すための、ゲノム医療推進体制の構築と推進は喫緊の課題であり、必要性が高い。
本研究は、ゲノム医療の実用化に向けた、①ＮＣＧＭメディカルゲノムセンターの「組織・体制」の整備、②研究から診療への「橋渡し」の在り方、③「提供サービス」の明確化と開発研究としての戦略性、の大きく３つの課題から成る。各々についての取り組みの概要は以下の通りである。
① 当センター内で遺伝学的検査／解析を行うための体制を整備し、平成 29 年 11 月より施設内遺伝学的検査の試験運用を開始した。その際、遺伝子パネル検査と whole exome sequencing (WES)
で産出される大規模データの処理、及び臨床的注釈付けに関しては「ゲノム医療支援部門」と「臨床ゲノム解析部門」のスタッフ（分担研究者の竹内と岡﨑）が協力して「解析パイプライン」の整備に取り組んだ。また日常診療として遺伝情報を安全に格納し、関連診療科との情報の授受を安全かつ効率的に行うために、ICT 企業と協力して「ゲノム患者カルテ」を開発し、
平成 29 年 8 月より臨床ゲノム科で運用を開始した。
② 特発性心筋症、致死性不整脈、家族性高コレステロール血症、マルファン症候群、多発性内分泌腺腫症、褐色細胞腫、筋ジストロフィーなどについて、解析の技術的精度、科学的妥当性の評価・検討を行い、被検者への報告書フォーマットを作成した。関連する専門診療科と臨床ゲ
ノム科及びメディカルゲノムセンターとの連携を円滑にすべく、メディカルゲノムセンター運
営委員会を月１回開催し、個別疾患症例の検討（専門家パネルの役割）やクリニカル・シーク
エンスに関わる諸課題検討のために、平成 29 年 7 月より臨床ゲノム連絡会も開催している。
③ ゲノム情報の網羅的解析では、診療科の枠を超えた診断・治療が重要となり、高度総合医療を担う病院を擁する点はＮＣＧＭの大きな特長である。大きく、希少・難病、がん、出生前遺伝学的検査を対象として「提供サービス」の明確化と開発研究としての重点化を行った。特に希少・難病では、医療実装として脊髄性筋萎縮症に関する保険適用薬の投与とグローバル治験への参加を行うと共に、臨床研究として腹膜偽粘液腫に関する患者登録と原因解明に向けた研究基盤の整備を行った。また、がんゲノム医療連携病院の指定のための準備を行った。

Subject No.

：28S1101

Title：Construction of clinical implementation system of genomic medicine at NCGM andits promotion
Researchers： Norihiro Kato, Tetsu Yano, Hiroyuki Shichino, Tomomichi Kiyomatsu, Atsuko

Okazaki, Fumihiko Takeuchi
Key word： genomic medicine, genetic disease, genetic counseling

Abstract：Recently, genomic medicine has drawn substantial attention as its research hasdeveloped remarkably and has now come to the stage of applying some of the achievements into
the daily medical care, thereby attempting to predict individual’s disease risks and drug responses(including adverse drug reactions) based on his/her genomic information. The range of target
diseases is expanding from hereditary disease to multifactorial disease such as cancer, while therange of target data is also expanding from genetic mutations, polymorphisms to genomic profiling,i.e., a set of genetic variants associated with the target diseases. A variety of projects are being
undertaken globally to accelerate the implementation of genomic medicine. Under suchcircumstances, the main purpose of this study is to construct a clinical implementation system ofgenomic medicine and to promote it at National Center for Global Health and Medicine (NCGM).
For these purposes, we set three principal themes: (I) to develop “systems and infrastructures” ofMedical Genomics Center (MGC) at NCGM and (II) to establish the institutional system fortranslating research achievements into clinical practices and (III) to clarify the scope and range ofclinical services and efficient strategies of genomic medicine. The study achievements in this year
can be summarized as below.
1. Systems and infrastructures
Trial operation of intra-facility genetic testing was initiated in November 2017, where the staff ofMedical Genomics Center cooperated to set up analytical pipelines for processing of large-scale
genomic data and clinical interpretation of gene-panel testing and whole exome sequencing results.
In addition, an electric medical record system compatible with genomic medicine was developed incollaboration with the ICT (information and communication technology) company andimplemented in the clinical setting in November 2017 at NCGM.
2. Translation of research achievements into clinical practices
For a variety of genetic diseases (e.g., idiopathic cardiomyopathy, fatal arrhythmia, familial
hypercholesterolemia, pheochromocytoma), technical (or analytical) validity as well as scientificvalidity were evaluated and the format of genetic testing report was prepared. To facilitate thecooperation between the associated clinical divisions and Medical Genomics Center, the working
committee was organized and held regularly, plus the clinical conference of genomic medicine was
set up to resolve issues related to clinical sequencing.
3. Clarification of the scope and range of clinical services related to genomic medicine
Largely, three areas (i.e., hereditary disease, cancer and non-invasive prenatal genetic testing)were designated as high-priority areas at NCGM; for example, spinal muscular dystrophy wasplaced as a disease of great interest for clinical application. An institutional system was preparedfor gene-panel testing in cancer genomic medicine, which was expected to start in FY2018.
Researchers には、分担研究者を記載する。

１．研究成果概要（２８指１１０１）「ＮＣＧＭにおけるゲノム医療実施体制の構築と推進に関する研究」【研究目的】近年、ゲノム情報を用いた、疾患発症リスクや治療反応性（薬物副作用リスク含む）の予測が試みられる段階となり、わが国でも国家プロジェクトとして始められることとなった。本研究では、ＮＣＧＭにおけるゲノム医療実施体制の構築と推進を目的とする。

【計画年度】３年研究の２年目【実施体制】
主任研究者：加藤 規弘
分担研究者：矢野 哲ら計５名【研究成果】
１）ＮＣＧＭメディカルゲノムセンター （MGC）の「組織・体制」の整備
当センター内で遺伝学的検査／解析を行うために「解析パイプライン」等を整備し、平成29年11月
より施設内遺伝学的検査の試験運用を開始した。日常診療として遺伝情報を安全に格納し、関連診療科との情報の授受を安全かつ効率的に行うために、ICT企業と協力して「ゲノム患者カルテ」を開発し、平成29年8月より 運用を開始した。
２）研究から診療への「橋渡し」の在り方に関する検討
様々な遺伝性疾患について解析の技術的精度、科学的妥当性の評価・検討を行い、被検者への報告書フォーマットを作成した。解析・報告のための手順を整理した。
３） 「提供サービス」の明確化と開発研究としての戦略性の検討
大きく、希少・難病、がん、出生前遺伝学的検査を対象として「提供サービス」の明確化と開発研究としての重点化を行った。がんゲノム医療連携病院の指定のための準備を行った 。
【今後の計画】３つの課題を継続するとともに、品質管理のための標準作業手順書や倫理的手続きなど、当施設におけるゲノム医療推進体制構築に向けた実務的な準備を進める。
１／２

国際医療研究開発費H29報告

（２８指１１０１）「ＮＣＧＭにおけるゲノム医療実施体制の構築と推進に関する研究」【研究概要】

課題

lIn house検査／解析のためのインフラ・体制整備

１）組織・体制の整備
２）研究から診療への「橋渡し」
３）「提供サービス」等の明確化

l遺伝学的検査の解析・報告のための手順整理
l特定の遺伝性疾患に関する治験、治療の開始

NCGM
メディカルゲノムセンター（MGC）

NCBN中央バイオバンク

NCGMバイオバンク

ゲノム臨床応用部門

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臨床ゲノム解析部門

ゲノム医療支援部門

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国際医療研究開発費H29報告

国際医療研究開発費（２８指１１０１）平成29年度報告書
ゲノム医療実施体制構築におけるバイオインフォマティクスに関する検討
竹内史比古・国立国際医療研究センター• 目的• 次世代シーケンサの解読結果からの個人ゲノムデータ作成のための、
ＩＴシステムの開発• 背景• 患者個人のゲノムを解読して疾患原因変異を同定し、診断・治療に活かせるようになりつつある• 各人は多数の変異（数万個とか）を持つので、疾患原因変異の絞り込
みに、情報解析が必要• 結果• 個人ゲノムデータの臨床的解釈について、要件を整理した• 要件を満たすＩＴシステムとしてVarSeqを選定した• 精度と処理能力を実際の罹患者データで評価した• 課題• DNA解読から遺伝子検査レポート作成までの一連の流れについて、品質保証と処理能力の評価が必要

1

国際医療研究開発費（２８指１１０１）平成29年度報告書
ゲノム医療実施体制構築におけるバイオインフォマティクスに関する検討
竹内史比古・国立国際医療研究センター

1. 個人ゲノムデータの臨床的解釈の要件: DNA変異のアノテーション・フィル
タリングができること• NGS解析のQC• 一般集団のアリル頻度によるフィルタリング• タンパク遺伝子に及ぼす影響（LoF, missense）でのフィルタリング• ClinVarアノテーションの付加

2. 要件を満たすＩＴシステムとしてVarSeq を選定した
3. 処理能力と精度を実際の罹患者データで評価した• 全エクソーム解読• 3検体ずつ x 8回実施
• 計算時間約1日• ターゲット領域の8割5分以上を高信頼度で解析できた• TruSight One 大規模パネル解読• 3検体ずつ x 2回実施
• 計算時間約12時間• ターゲット領域の8割5分以上を高信頼度で解析できた2

課題番号：２８指１１０１
研究課題名：ＮＣＧＭにおけるゲノム医療実施体制の構築と推進に関する研究
分担研究課題名：ゲノム医療推進体制構築におけるメディカルゲノムセンター整備の検討
主任研究者名 ：加藤規弘
分担研究者名 ：加藤規弘
キーワード：ゲノム医療、遺伝子診断
研究成果：
ゲノム情報の診断的活用は臨床現場に導入されつつある。対象疾患は遺伝性疾患から癌などの多因子疾患へと拡がり、対象データも遺伝子変異から遺伝子多型、ゲノム・プロファイリングへと拡がってきている。遺伝学的検査は、保険適用と共に先進医療としても実施され、その申請に係る臨床試験が必要となる。本研究は、こうした背景を踏まえて、ＮＣＧＭにおけるゲノム医療
実施体制の構築と推進を目的とした。当センターの診療科として、特に以下の３課題に取り組む
ことを目標としている。２年度目は、各課題に対して以下のように取り組んだ。
１）組織・体制
センター病院臨床ゲノム科の外来機能整備とともに、当センター内で遺伝学的検査／解析を行
うための体制も整備した。具体的には、遺伝子パネル検査を従来からの次世代シーケンサーで実施するとともに、新たに導入した次世代シーケンサーで全エクソーム・シーケンス（WES）を実施
できる体制も整えて、平成 29 年 11 月より施設内遺伝学的検査の試験運用を開始した。その際、遺伝子パネル検査と WES で産出される大規模データの処理、及び臨床的注釈付けに関してはメディカルゲノムセンターの「ゲノム医療支援部門」と「臨床ゲノム解析部門」のスタッフ（分担研
究者の竹内と岡﨑）が協力して「解析パイプライン」の整備を進めた。難病などの遺伝性疾患の発症前診断に関して従来の研究用の倫理審査委員会だけでは十分な対応が困難であることから、診療用の「病院倫理委員会」を平成 29 年 7 月に新設する運びとなった。また日常診療として遺伝情報を安全に格納し、関連診療科との情報の授受を安全かつ効率的に行うために、ICT 企業と協力して「ゲノム患者カルテ」を開発し、平成 29 年 8 月より臨床ゲノム科で運用を開始した。
２）研究から診療への橋渡し
当センターでの対象疾患の診療状況と遺伝カウンセリング実施状況を調査・検討した上で、解析の可否を整理した。高度総合医療を担う病院を擁する関係上、疾患専門性の強い他のナショナ
ルセンターとは事情が異なるものの、今後、市中病院にゲノム医療が展開する上でモデル・シス
テムを提供できることが利点であり、それを目指して「橋渡し」を行う。小児疾患・先天代謝障
害や家族性腫瘍の他、循環器疾患（協力研究者 廣井）、神経・筋疾患（協力研究者 竹内壯介）、内分泌疾患（協力研究者 田辺）の専門家の協力のもと、特発性心筋症、致死性不整脈、家族性高コレステロール血症、マルファン症候群、多発性内分泌腺腫症、褐色細胞腫、筋ジストロフィーなどについて、解析の技術的精度、科学的妥当性の評価・検討を行い、被検者への報告書フォー
マットを作成した。関連する専門診療科と臨床ゲノム科及びメディカルゲノムセンターとの連携を円滑にすべく、メディカルゲノムセンター運営委員会を月１回開催し、さらに個別疾患症例の検討（専門家パネルの役割）やクリニカル・シークエンスに関わる諸課題検討のために、平成 29
年 7 月より臨床ゲノム連絡会を開催している。
３）提供サービスの明確化
大きく、希少・難病、がん、出生前遺伝学的検査を主な対象として「提供サービス」の明確化と開発研究としての重点化を行った。特に希少・難病では、医療実装として脊髄性筋萎縮症に関する保険適用薬の投与とグローバル治験への参加を行うと共に、臨床研究として腹膜偽粘液腫に関する患者登録と原因解明に向けた研究基盤の整備を行った。また、がんゲノム医療連携病院の指定のための準備を行った。

課題番号：28指1101

研究課題名：着床前診断 (preimplantation genetic diagnosis; PG) および無侵襲的出生前遺伝学的検査(non-invasive prenatal genetic testing; NIPT) に向けた医療体制構築と推進に関する研究主任研究者名 ：加藤規弘
分担研究者名 ：矢野

哲

キーワード

：着床前診断, 出生前遺伝学的検査, 遺伝カウンセリング

研究成果：本研究は、ゲノム医療の実用化に向けた、①メディカルゲノムセンターの「組織・体制」の整備、②研究から診療への「橋渡し」の在り方、③「提供サービス」の明確化と開発研究としての戦略性、の３つの課題から成る。その達成目標は、① 施設全体としてのゲノム医療の診療（臨床応用）／支援／解析部門に必要なスタッフと業務内容を整備すること② 必要となる機器類の保有状況・スタッフの余力等を調べ、臨床試験実施の申請を予定している出生前遺伝学的検査に関して、解析の技術的精度、科学的妥当性を予備的に評価・検討すること③ 当センターの様々な疾患の専門家を擁する利点を生かした「全人的」なゲノム・カウンセリングを
自施設で行うと共に、データ解釈にも対外的に貢献することの 3 つである。以下、各々の目標について概要を記載する。
1）組織・体制
産婦人科においては、平成 26 年 10 月に当センター産婦人科高度生殖医療センターが開設され、通常の体外受精-胚移植の症例数も増加し軌道に乗ってきた。まずは、今後の出生前遺伝学的検査と遺伝カウンセリングの実施予測を立て、ゲノム医療推進体制の構築に向けた課題の抽出を行っている。近
隣医療機関の遺伝カウンセリング体制を見学し、当施設で必要となる医療スタッフ、スペース、設備等を見積もり、可能な部分については逐次準備を進めている。当施設スタッフに対して臨床遺伝専門
医、遺伝カウンセラー、遺伝専門看護職、不妊症専門看護職などの取得を奨励している。平成 29 年度に当院助産師 1 名が不妊症専門看護師資格を取得した。平成 30 年度に当院産婦人科医師 1 名が臨床遺伝専門医資格を取得予定である。
2）研究から診療への橋渡し
平成 28 年度から当院中央検査部門では、メディカルゲノムセンターにおけるプレシジョン・メディ
シンの実施に向けて施設内の体制を整えてきている。外注が適切と考えられる遺伝学的検査について
は、外注検査委託のシステム・フローを整備している。臨床試験実施の申請を予定している出生前遺伝学的検査に関して、解析の技術的精度、科学的妥当性を予備的に評価・検討している。当センター
での遺伝学的検査のオーダー、患者への結果説明に係る標準作業手順書等を作成している。
3）戦略性
高度総合医療を担う病院を擁する点は、当院の大きな特長である。ゲノム情報の網羅的解析では、診療科の枠を超えた診断・治療が重要であるが、当院ではそれが可能である。すでに、着床前診断や無侵襲的出生前遺伝学的検査を施行するための手技は完成している。
4）平成 29 年度の業績
高本真弥：出生前診断の現状と課題

保健の科学

第 59 巻（4）231-235 2017 年

高本真弥, 定月みゆき, 中西美紗緒，大石 元，矢野 哲：遺伝学的異常を有する児の分娩歴のある妊婦への一般診療における対応

第 3 回日本産科婦人科遺伝診療学会学術講演会

2017 年 12 月

兵庫

課題番号

：28指1101

研究課題名：小児疾患のゲノム医療体制構築と推進に関する研究主任研究者名 ：加藤規弘
分担研究者名 ：七野浩之
キーワード：ゲノム医療、小児診療、遺伝子診断、遺伝カウンセリング
研究成果：（１）研究目的：ゲノム医療の実用化を小児領域で進めるには、①メディカルゲノムセンター
内で小児診療が行えるように整備すること、および②研究から診療への「橋渡し」の在り方を検討すること、そして③「提供サービス」を明確化し、あらたに開発研究しなければならないことを明確にすることなどの課題を検討することが必要である。本研究では、ＮＣＧＭにおける小児に対するこのようなゲノム医療実施体制の基盤構築と推進を目的とした。
（２）研究成果：
遺伝学的検討は小児臨床現場ですでに行われ始めているが、個々の事例では医学的な意味が明らかとなる場合とそうでない場合とがあり慎重な対応が必要である。明らかな異常が必ずしも治療や予後の改善には結びつかないこと、いまだ未確立の領域のため結果の意味付けに不明なことが多々あること、遺伝学的にも常に多様性を考慮した対応を必要としていることなどの多くの問題点がある。しかし、こうした状況を考慮してもなお遺伝学的検討により得られる知見は重要なものであり、いくつかの疾患では遺伝学的検討が実際の治療と密接に関連するものも出始めている。脊髄性筋萎縮症（SMA）に対しては、責任遺伝子および類縁遺伝子の定量的評価を行って、それを基に根治療法を行う薬剤が開発された。本分担研究では、今年度は、SMA を主として取り上げ、その治療を行うことを基に医療体制を整えることを行った。
１）組織・体制：初年度の準備を基に、新たに臨床ゲノム科に臨床遺伝専門医を迎え、小児科と協力して診療および研究の体制を整えた。また小児科からは新規に臨床遺伝専門医取得を目指
して研修を開始した医師が 1 名いる。
２）研究から診療への橋渡し：SMA については保険承認を受けた薬ができたため、ゲノム診断を基に適応症例を臨床ゲノム科から紹介を受け、患者に対して根治療法を 2 例に行った。その他の対象疾患についても遺伝カウンセリングを実施し、またゲノム検査を行った。とくに小児がんについては腫瘍検体によるゲノム診断を実施し、予後と密接に関連する異常が見られた場合には治療の増強などを行った。並行して臨床ゲノム科と協力して、当センター内で検査・解析する遺伝学的検査の検討を行った。
３）戦略性：様々な疾患の専門家を擁する利点を生かした「全人的」なゲノム・遺伝カウンセ
リングを自施設で行うために、臨床遺伝専門医資格の取得を推奨した。また臨床ゲノム科のカウンセラーとの協力を開始した。
３）今後の拡充：
今後は医療実装が比較的早いと見込まれる小児がんや希少疾患・難病及び感染症について、関連する診療科や臨床ゲノム診療科との連携を一層強化し、診療実績の向上と研究への被験者の参加協力を促していく。特に当院におけるメディカルゲノムセンターの「組織・体制」の整備を小児領域においても重点的に進める。

課題番号：28指1101

研究課題名：下部消化管外科疾患のゲノム医療実施体制の構築と推進に関する検討

主任研究者名 ：加藤規弘

分担研究者名 ：矢野

秀朗

キーワード

：遺伝性大腸癌、リンチ症候群、家族性腺腫性ポリポーシス

研究成果

：

ゲノム情報の診断的活用は臨床現場に導入されつつある。対象疾患は遺伝性疾患から癌などの多因子疾患へと拡がり、対象データも遺伝子変異から多型、ゲノム・プロファイリングへと拡がりつつある。コンパニオン診断薬として遺伝学的検査の需要も増加している。保険適用と共に先進医療としても実施され、その申請に係る臨床試験が必要である。
こうした背景を踏まえて、本研究では当センターにおけるゲノム医療推進体制構築と推進に関する検討をおこなうことであったが、分担研究者として、特に下部消化管外科領域(主に大腸癌・大腸の消化管間質腫瘍・その他腫瘍)を対象とした研究を行った。
全大腸癌の約 5－10%において遺伝性要因が強く関与しているとされている。いわゆる遺伝性大腸癌として日常診療で遭遇する機会が比較的多いのが、リンチ症候群（Lynch syndrome）と家族性腺腫性ポリポーシス(familial adenomatous polyposis)である。
当センター外科で、アムステルダム基準を満たすリンチ症候群に対して治療を行った患者は 1983年以降 17 家系、18 人であった。若年患者が多く、右側結腸大腸癌が多かった。
一方、家族性腺腫性ポリポーシスに対して治療を行った患者は 1989 年以降、14 人、10 家系であった。特に近年ではほぼ全例に対して全結腸切除がおこなわれていた。
いずれも、常染色体優性遺伝で原因遺伝子も同定されているが、他臓器病変も含めたスクリーニン
グ、手術適応、サーベイランス、本人および血縁者への遺伝カウンセリングの問題など、今後解決すべき課題が明らかとなった。今後、上記患者群においてさらに詳細な検討を試みたい。
また、大腸癌由来の腹膜病変には、通常の大腸癌腹膜播種以外に腹膜偽粘液腫がある。腹膜偽粘液腫は典型的には虫垂腺腫または虫垂がんの穿孔によりゼリー様物質が腹腔内に大量に貯留、増殖する状態（jelly belly）をいい、血行性・リンパ行性転移は起こさず、専ら腹腔内を拡がりゼリーが蓄積する病態で、放置すると死に至る予後不良の希少疾患である。2010 年 1 月より 2013 年 6 月までに当センターにおいて 27 例の腹膜偽粘液腫症例に対し手術が施行され、2014 年 10 月には「腹膜偽粘液腫の減量切除術に対する周術期腹腔内化学療法」が厚生労働省より先進医療 B として新規承認された。2014
年 11 月から臨床研究を開始し 2017 年 2 月までに予定 75 症例の登録を終えている。この原因不明で難治性の腹膜偽粘液腫は、ゲノム医療研究の対象となり得る。当センターは少なくとも東日本においては唯一上記治療を行える施設であり、腹膜偽粘液腫については全国から患者の紹介がある状況となっている。まだ観察期間は短いものの、治癒切除に至らない症例も少なからずあり、治癒切除後の早期に術後再発を来した例もある。これらのとくに難治症例において、ゲノム医療研究は今後のブレークスルーを期待できる非常に有望なツールと考えられ、バイオバンク整備とともにこれを進めていく。

課題番号
研究課題名

：28指1101：ＮＣＧＭにおけるゲノム医療実施体制の構築と推進に関する研究
分担課題名/ゲノム医療実施体制構築におけるデータベースに関する検討
主任研究者名 ：加藤 規弘
分担研究者名 ：岡﨑 敦子
キーワード
研究成果

：ゲノム医療、データベース、遺伝統計学的手法：本分担研究では当センターにおけるゲノム医療を支えるデータベースの構築を目的とし、平成 29 年 6 月末の時点で、日本人患者のデータを臨床的解釈するのに適した、利便性の高い臨床ゲノム情報統合データベースのプロトタイプを作成し、ホームページ上で公開済みである（対象疾患：米国 ClinGen Actionability Working Group のキュレーション済みの疾患に日本人で重要と考えられる疾患を加えた計 70 疾患）。さらに個別疾患変異の同定及び新規疾患変異を同定するための遺伝統計学的手法に対する論文発表 2 本および総説 1
本の執筆、国際学会の workshop での発表を行った。1 年目に整備したゲノム解析基盤を医療実装と研究開発の両者に効率的に利活用し、自施設の約 200 検体および共同研究施設 2 施設の計 1000 検体のゲノム解析を行った。さらに最先端のゲノム医療を支えるデータベース・解析プラットフォームを提供する米国 Fabric Genomics 社のシステムを、クラウド上に患者情報のアップロードを必要としない“Stand-alone”型で国内で初めて導入する体制整備・それに必要なハードウェアの整備を行いゲノム解析基盤への統合を行った。
[論文]
1. Imai-Okazaki A, Kohda M, Kobayashi K, Hirata T, Sakata Y, Murayama K, Ohtake A,
Okazaki Y, Nakaya A, Ott J. HDR-del: A tool based on Hamming distance for prioritizing
pathogenic chromosomal deletions in exome sequencing. Hum Mutat.2017;38:1796-1800.
2. Imai-Okazaki A, Kishita Y, Kohda M, Yatsuka Y, Hirata T, Mizuno Y, Harashima H, Hirono
K, Ichida F, Noguchi A, Yoshida M, Tokorodani C, Nichiuchi R, Takeda A, Nakaya A, Sakata
Y, Murayama K, Ohtake A, Okazaki Y. Barth Syndrome: Different Approach to Diagnose. J
Pediatr. 2018;193:256-260.
[総説]
1. Imai-Okazaki, Atsuko and Ott, Jurg (January 2018) Genetic Linkage Mapping. In: eLS.
John Wiley & Sons, Ltd: Chichester. DOI: 10.1002/9780470015902.a0005360.pub2[学会発表]
1. Incorporation of Originally-Developed Statistical Genetics Methods into a ClinicalSequencing Platform to Improve Efficiency and Quality of Variant Annotation
Atsuko Imai-Okazaki1, Fumihiko Takeuchi1, Reiko Arakawa1, Kengo Miyo1, Kayoko Saito1,
Jurg Ott2, Norihiro Kato1
1

National Center for Global Health and Medicine, Japan; 2 Rockefeller University, USA

Keysyone Symposia:One Million Genomes: From Discovery to Health (G1), June 4-8, 2018,
Hannover, Germany

研究発表及び特許取得報告について

課題番号：28指1101
研究課題名：ＮＣＧＭにおけるゲノム医療実施体制の構築と推進に関する研究主任研究者名：加藤 規弘
論文発表
論文タイトル著者

掲載誌

Matsumoto K,
Shichino H,
Pediatr Blood
PhaseIstudyofperifosinemonotherapyinpati
Kawamoto H,
Cancer. 2017entswith
Kosaka Y, Chin
Nov;64(11)recurrentorrefractoryneuroblastoma
M, Kato K,
Mugishima H

Impact of persistent left ventricularregional wall motion abnormalities inchildhood cancer survivors after
anthracycline therapy: Assessment of
global left ventricular myocardial
performance by 3D speckle-tracking
echocardiography.

Okuma H, Noto
N, Tanikawa S,
Kanezawa K,
Hirai M,
Shimozawa K,
Yagasaki H,
Shichino H,
Takahashi S.

J Cardiol

Yamanaka J,
Moyamoya syndrome in a pediatric patient Nozaki I,
J Infectwith congenital human immunodeficiency Tanaka M,
virus type 1 infection resulting in
Uryuu H, Sato Chemother.
intracranial hemorrhage.
N, Matsushita
T, Shichino H.

掲載号

64(11).

年

2017年

70(4)、396-401 2017年

24(3)220-223

2018年

HDR-del: A tool based on Hamming
distance for prioritizing pathogenic
chromosomal deletions in exome
sequencing.

Imai-Okazaki
A, Kohda M,
Kobayashi K,
Hirata T,
Sakata Y,
Murayama K,
Ohtake A,
Okazaki Y,
Nakaya A, Ott
J.

Hum Mutat

38:1796-1800.

2018年

Barth Syndrome: Different Approach to
Diagnose

Imai-Okazaki
A, Kishita Y,
Kohda M,
Yatsuka Y,
Hirata T,
Mizuno Y,
Harashima H,
Hirono K,
Ichida F,
Noguchi A,
Yoshida M,
Tokorodani C,
Nichiuchi R,
Takeda A,
Nakaya A,
Sakata Y,
Murayama K,
Ohtake A,
Okazaki Y.

J Pediatr.

193:256-260.

2018年

研究発表及び特許取得報告について

Underestimated amoebic appendicitis
among HIV-1-infected individuals inJapan.

Kobayashi T,
Watanabe K,
Yano H, Murata
Y, Igari T,
Nakada-Tsukui
K, Yagita K,
J Clin Microbiol 55:313-320
Nozaki T, Kaku
M, Tsukada K,
Gatanaga H,
Kikuchi Y, Oka
S

2017年

学会発表
タイトル

発表者

高本真弥,
定月みゆき
遺伝学的異常を有する児の分娩歴のある妊婦
中西美紗緒
への一般診療における対応
大石 元
矢野 哲

学会名

場所

年月

第3回日本産科婦人科遺伝診療学会学 兵庫
術講演会

2017年12月

山内玲, 美代賢
吾, 宮本恵成,
長澤直人, 奥村第18回日本医療情効率・効果的な診療とプライバシーを両立し大阪
恭平, 石割大
報学会学術大会
たゲノム診療用電子カルテ機能の開発
範, 小南亮太,
中川陽介, 加藤規弘

2017年11月

宮本恵成, 美代
個人情報保護に配慮したゲノム医療対応電子 賢吾, 山内玲, 第62回日本人類遺神戸
カルテシステムの開発
長澤直人, 奥村 伝学会恭平, 加藤規弘

2017年11月

日本オミックス医療学会シンポジウ 東京
ム2017年6月

ゲノム医療を支える統合データベースの構築 加藤規弘

その他発表(雑誌、テレビ、ラジオ等)
タイトル
出生前診断の現状と課題

発表者
高本真弥

Genetic Linkage Mapping. In: eLS. John
Wiley & Sons, Ltd: Chichester. Genetic
Linkage Mapping. In: eLS. John Wiley &Sons, Ltd: Chichester.

特許取得状況について

第59巻（4）231-235

年月日
2017年

2018年1月

BIO Clinica

矢野秀朗、合田
臨床消化器内科
良政、秀野泰隆※出願申請中のものは(

発明名称

保健の科学

場所

Imai-Okazaki A
and Ott J

ゲノム医療を支える統合データベースの構築 加藤規弘

「特殊な大腸腫瘍・腫瘍様病変」虫垂腫瘍

発表先第32巻（6）182017年6月
22
第32巻（7）252-256

2017年6月)記載のこと。
登録番号該当なし※該当がない項目の欄には「該当なし」と記載のこと。
※主任研究者が班全員分の内容を記載のこ

特許権者(申請者）
登録日(申請日)（共願は全記載）

出願国