課題番号：２７指１４０１

研究課題名：ＮＣＧＭにおける戦略的なバイオリソース収集と、多層的オミックス解析及びメ

タゲノム解析での活用を目指した病院コホート研究主任研究者名 ：大西 真
分担研究者名 ：加藤規弘、潟永博之、考藤達哉、狩野繁之、植木浩二郎、日ノ下文彦、廣井透雄、
秋山 徹、美代賢吾、大河内仁志、安田和基
キーワード：バイオリソース、バイオバンク、ゲノム医療

研究成果：近年、バイオバンク事業を取り巻く環境は国際的に急速に変動し、そのゲノム医科学研究における重要性は年々増大しつつある。ナショナルセンターのバイオバンクは、①各々が担当する疾患に係るバイオリソースの収集を行うこと〔疾患バイオバンクの構築〕、②その利用により疾患の解明・克服に貢献すること〔研究活用〕、③共同研究以外でも外部機関へ提供（分譲）できる仕組みを構築すること〔産学官連携の推進〕が求められている。
したがって、NCGM バイオバンクの構築においては、感染症（HIV、肝炎及び国際感染症）と糖尿病等の生活習慣病（糖尿病と大血管合併症）などを共に担当する当センターの特長を十分に生かした戦略的なバイオリソース収集と、病態・経過に応じた付随医療情報のデータベース（DB）
化が必要である。そして、多層的オミックス解析のための、DNA・RNA・タンパク等の検体収集及び腸内細菌叢も対象としたメタゲノム解析のための検体収集を、イベントの発症前後などのマル
チポイントで行うべく、本研究で「病院コホート体制・システム」の整備を目標とする。そのために（Ⅰ）バイオバンク推進体制を部局横断的なものに再編し、個別診療科等の要望とセンター事業との融合を図ること、及び（Ⅱ）戦略的に検体・医療情報を収集するシステム〔多層的オミックス解析のための、DNA・RNA・タンパク等の収集、及び腸内細菌叢（マイクロバイオーム）も対象としたメタゲノム解析のための検体収集をマルチポイントで行う仕組み〕の２つを研究の柱とする。そのうえで（Ⅲ）検体・医療情報の有効な研究活用（分譲含む）を目標とする。
以下、分担課題ごとに、研究成果の概要を述べる。
【NCBN 及びメディカルゲノムセンター】ナショナルセンター・バイオバンク・ネットワーク（NCBN）との連携では、共同研究・分譲の手続き整備に関して NCGM が先導的役割の一翼を担い、NCGM バ
イオバンク・ホームページ上にも手続きを分かり易く公開することができた。また NCGM メディカ
ルゲノムセンターとの連携において、循環器内科等の収集検体を用いたゲノム解析を実施することができた。
【HIV】NCGM エイズ治療・開発センター（ACC）では 2000 人以上の HIV 感染者の経時的な血液検体を管理し、さらに年 150 人程度の新患患者の検体を追加収集している。各被験者からは、血漿、生きた状態の末梢血単核球と臨床情報を収集している。こうした HIV 感染者につき、初年度（平成 27 年度）に 318 人、2 年度目に 301 人、3 年度目に 288 人から、臨床残余検体をバイオバンクに組み入れることに関する同意を取得した。収集したバイオバンク検体や医療情報を活用して、
大きく ACC 独自の臨床研究を行うと共に、センター病院眼科との共同研究や他研究機関（熊本大学）との共同研究に取り組み、その成果を学術誌に発表した。
【肝炎】肝炎・免疫研究センターが位置する国府台病院では、バイオバンク事業に関わる診療科
を順次拡大してきた。肝臓内科、消化器内科を中心に整備を始め、2 年度目までに総合内科、児童精神科が加わり、3 年度目からリウマチ膠原病科、耳鼻咽喉科、外科も参画する形とした。初年度（平成 27 年度）に 682 人、2 年度目に 503 人、3 年度目に 356 人から、臨床残余検体をバイ

オバンクに組み入れること及び新規に収集することに関する同意を取得した。また国府台病院バイオバンクでは、経時的な採血により、慢性疾患の病態の変遷を追えるようにするべく、各診療科でこの採血方式を採用した。DB 構築では、電子カルテから SS-MIX2 を通してバイオバンク DB
へ臨床データを移すための設計を行い、同データベースには、採血管と匿名化検体チューブとの紐付け機能、NCBN 中央バイオバンクのカタログ DB への出力機能及び問診票の OCR 取り込み機能を備えるようにした。検体管理体制も整備し、フリーザー温度と室温の常時監視システムを構築した。
【国際感染症】初年度（平成27年度）には、国際感染症に関するバイオバンクの推進体制構築を、研究所の国際感染症部門（熱帯医学・マラリア研究部、感染症制御研究部、難治性ウイルス感染症研究部）が核となり､肝炎・免疫研究センターや臨床部門（ACC、国際感染症センター（DCC）、センター病院の総合感染症科及び国際診療部）と共に部局横断的に着手し、さらにDCC が中心となり、３カ年度かけて検体・医療情報収集体制の整備を行った。本研究事業では、マラリア患者を対象例として、①外来・入院の、どのタイミングで被験者に研究参加を依頼し、誰がベースラ
インの医療情報を収集するか、②診療科・群別の研究用DB フォーマットを作成したうえで、それに誰が正確な病名を含めたデータを入力するか、③全例で採取する血液試料以外のもの（尿・便、組織検体、病原体などの“特殊検体”）を如何にして臨床研究試料管理室に渡すか、そのためのラベル打ち出しをどうするか、などの具体的課題を検討した。その他に、④熱帯医学・マラリア研究部に保有されている既存検体（特にフィールド調査を通じて取得した検体を含む）を例として、バイオバンクへの移行・連携、⑤収集済み検体をカタログDB に登録するための処理なども検討し、すべての既存検体のリストアップを行った。こうして３年間で整備した収集体制を基に、国際感染症の各種試料の数、付随医療情報量を着実に増やした。これらをもとに、医師主導治験として、以下３つの、マラリア診断法・治療法に係る産学連携での開発研究のためのプロトコー
ルを作製した。
（１）マラリア患者からのEDTA 全血採取とフローサイトメトリー法の応用による超迅速診断法の開発。（２）マラリア患者からのヘパリン全血採血（または、ろ紙採血）とLAMP 法によるDNA 診断法の開発。（３）マラリア患者のリンパ球の採取と抗体治療薬の開発研究。
【 糖 尿 病 】 糖 尿 病 内 分 泌 内 科 の 個 別 研 究 で あ る MISSION-DM-END （ 倫 理 委 員 会 承 認 番 号
NCGM-A-000240-01）を平成 28 年度から開始し、入院患者の入院時と退院時のペア血液試料を中心に、過去の試料と統合した時系列バイオリソースバンクを構築している。平成 28 年度に 400 例以上の検体を収集し、同意の得られたものはバイオバンクへも分与しつつ、年間 200 例程度のエントリーを予定している。主に血糖コントロール目的で入院した患者さんから同意を得て、入院翌日の空腹時の血液サンプルと退院の前日またはその近傍での血液サンプルを採取してペアサンプ
ルとしている。このような、代謝状態の異なる同一人物のペアサンプルは極めてユニークであり、
住民コホートなどを除けば、同一人物を長期間にわたって追跡している事例も希である。また平成 28 年度の後半から血液と一緒に糞便の採取も開始しており、年間 100 例前後のサンプルが期待できる。これらの解析からは、短期的な代謝状態の変化に伴う、血清バイオマーカーや腸内細菌叢の変化などの情報が得られると期待され、糖尿病治療薬の腸内細菌叢に対する影響さらには
長期血清パネルの解析から、合併症予測因子の同定も計画している。また、バイオバンクにも臨
床情報を提供している SS-MIX2 を利用した大規模データベース研究 J-DREAMS を全国 35 施設の参加を得て開始しており、既に 3500 例以上の糖尿病患者が登録されている。

【大血管合併症】循環器内科、心臓血管外科、神経内科、脳神経外科の４診療科を対象に、各々本研究事業の初年度（平成 27 年度）入院患者の 10%を、2 年度目以後のバイオバンク参加登録者数の目標値とした。４診療科合わせた年間目標数は 236 名であり、最初の２カ年度よりも大きく増加して３年度目は 382 名を登録した。
【マイクロバイオーム】消化器疾患と紐付けられた患者の唾液・糞便のマイクロバイオームを収集し、疾患との関係を明らかにするべく病原体の配列情報を取得した。すでに 3400 例以上の検体から、マイクロバイオーム解析用 DNA の抽出を完了しており、そのうち 2347 検体について、highcoverage（平均 1G bp 以上）の次世代シーケンサーデータ取得を完了した。
【データベース】電子カルテでの、対象者のリクルート方法を改善し、診療情報の匿名化抽出機
能、当該検体の有無・件数などの検索機能、病棟で収集した検体の登録機能などを開発した。NCGM
バイオバンクでの in house DB 開発のための検討ののち、in house DB の構築・運用（LIMS による臨床情報の表示・検索・抽出や電子カルテでの同意ステータス機能の実装）を進めた。NCBN 中
央バイオバンクへのカタログデータ・アップロード処理の最適化も行った。
【試料管理・分譲・解析】血液検体に関する品質管理システムの強化・改良を進めて、本事業開始以前よりもはるかに DNA の抽出量が安定した。センター病院（ACC を除く）では、初年度（平成 27 年度）に 544 人、2 年度目に 2113 人、3 年度目に 1954 人からバイオバンク参加の同意を取得した。主な検体は、DNA、血漿、血清であるが、一部（1290 検体）については RNA も収集し保存している。
【倫理課題・情報発信】本研究開始時の NCGM バイオバンクの大きな課題に関し、各々、以下の成果を上げて一定の基盤整備を行うことができた。1）バイオバンク収集試料の拡充：血液以外の検体や経時的なリソース収集、個別研究との連携を成立させると共に組織バンク などの要件検討を行った。2）試料等の提供体制：分譲と共同研究に分けた提供様式の整備、「検体利用審議会議」の設立と倫理委員会との役割分担を行い、外部提供の実績を作ることができた。3）企業ニーズの把握：企業担当者等との面談・意見交換を積極的に行った。4）広報活動：体制をわかりやすく外部に発信する HP を整えた。

Subject No.

：27S1401

Title：Strategic collection of bio-resource at NCGM and hospital-based cohort study

aiming at multi-omics and meta-genomic analyses
Researchers ：Shin Ohnishi, Norihiro Kato, Hiroyuki Gatanaga, Tatsuya Kanto, Shigeyuki Kano,
Kojiro Ueki, Fumihiko Hinoshita, Yukio Hiroi, Toru Akiyama, Kengo Miyo, Hitoshi Okochi,
Kazuki Yasuda
Key word：bio-resource, biobank, genomic medicine

Abstract：The biobank is becoming a more and more important tool in the study of genomic

medicine, while its surrounding environments have globally changed in these years. Biobanks in
the National Research Centers for Advanced and Specialized Medical Care (National Centers:
NCs) are expected to construct disease-oriented bio-resources, to contribute to the elucidation oftarget diseases, and to prepare a collaborative system with academia and industry research
institutes. Accordingly, in the construction of the NCGM biobank, we should keep in mind two
points, i.e., the strategic collection of bio-resource to appeal the strength and characteristics ofNCGM and the construction of database for clinical information that is longitudinally collected.
Also, we aim at establishing a hospital-based cohort study by collecting samples used for
multi-omics and metagenomics analyses at multiple time points before and after the
disease-associated events such as surgical procedures. A variety of disease samples, which wereavailable at NCGM providing comprehensive medical care, were collected and the sample size
substantially increased, while those for two key disease entities, infectious disease (e.g., HIV-1,
hepatitis, and emerging/re-emerging infectious diseases) and metabolic disorder such as diabetes,
were intensively collected.
For these purposes, we set two principal themes and a goal: (I) to reorganize the biobank systemcross-divisionally such that the motivation of individual clinical divisions and the overall goal of
the institution are integrated complementarily and (II) to develop the institutional system forstrategic collection of bio-resources and the associated clinical information plus (III) to make use of
the collected samples and information via collaboration and/or allocation with an appropriatematerial transfer agreement. We show principal achievements made for each individual theme as
below.
1. National Center Biobank Network (NCBN) and NCGM Medical Genomics Center
For the inter-NC cooperation within NCBN, the NCGM Biobank played a part of establishing theprocedures to make use of the collected samples and information via collaboration and/or
allocation with an appropriate material transfer agreement. Also, in the collaboration with the
NCGM Medical Genomics Center, part of the samples that were collected principally at theDivision of Cardiology and deposited in the NCGM Biobank are used for genomic analysis.
2. Human immuno-deficiency virus type 1 (HIV-1)
At the NCGM AIDS Clinical Center (ACC), blood samples from >2,000 HIV-1 patients have been
stored longitudinally, and 150 new-patients samples per year are additionally being collected toincrease its bio-resource size. From each participant, plasma and viable PBMC (peripheral bloodmononuclear cell) are collected for research. By using the bio-resource materials and associatedResearchers には、分担研究者を記載する。

clinical information thus collected, a number of research activities have been successfully
performed by either the ACC staff alone or as a collaborative work between ACC and otherinstitutes and their achievements published in a number of academic journals.
3. Hepatitis
Bio-resources including blood from hepatitis patients have been collected at the Research Centerfor Hhepatitis and Immunology in the NCGM Kohnodai Hospital. To make the clinical courses ofchronic disorder such as hepatitis-associated cirrhosis and liver cancer to be followed up, samplesof each patient are collected longitudinally at multiple points. Biobank facilities in the NCGM
Kohnodai Hospital, in particular, the database and sample storage systems, are constructedindependently of but in cooperation with those in the NCGM Center Hospital.
4. Emerging/re-emerging infectious diseases
Construction of biobank for emerging/re-emerging infectious diseases have been carried out withmalaria patient samples as a model case of the infectious disease entity, involving the NCGM staff
from the sector of emerging/re-emerging infectious diseases at the Research Institute, ACC andthe NCGM Disease Control and Prevention Center (DCC).
5. Diabetes
In 2016, a research project named MISSION-DM-END was started; in which paired blood samples
are collected from each hospitalized patient, twice, on admission and before discharge. When thepatients have provided an appropriate written consent, part of their samples for
MISSION-DM-END can be deposited to the NCGM Biobank. In this project, feces have beencollected from each patient, which is expected to provide useful information for
microbiome-associated changes, thereby constituting the biomarker for diabetes and its vascularcomplications. Moreover, a large-scale database research, named J-DREAMS(Japan Diabetes compREhensive database project based on an Advanced electronic Medical record
System), is in progress at the Diabetes Research Center, NCGM.
6. Macroangiopathy
To collect samples from patients with diabetic microangiopathies or other vascular complications,a number of divisions in the NCGM Center Hospital, including Divisions of Cardiology, Neurology,
Cardiovascular Surgery and Neurosurgery have participated in the NCGM Biobank, by setting
their target number of annual recruitment.
7. Microbiome
To clarify the pathophysiological impact of microbiome, particularly, in the gut, feces fromoutpatients of Gastroenterology Division have been collected together with detailed
epidemiological information for lifestyle. Thus far, microbiome DNAs from a total of >3,400
samples have been extracted and more than two-thirds of them have been subjected tonext-generation sequencing.
8. Database
After reviewing the existing systems of in-house (or intra-facility) database compatible withbiobank in other research institutes, those for NCGM Biobank have been constructed and refined;
for instance, the improvement of recruiting participants, the anonymization of clinical information
Researchers には、分担研究者を記載する。

in the electric medical record, and the optimization of uploading necessary information to thecatalogue-based DB at the Central Biobank of NCBN.
9. Bioresource maintenance
Substantial efforts have been made to improve the quality control of DNA extraction from blood
samples, resulting in much higher and more stable yields of DNA, as compared to the situation
before the current project started. In the NCGM Biobank, RNA samples were also collected frompart of the individuals (1290 samples in total), in addition to DNA, plasma and serum.
10. ELSI and public relations
A number of issues, which the NCGM Biobank was confronted with at the beginning of this project,
have been resolved to some extent as follow. (1) Enlargement of the Biobank resources from theviewpoint of ethical clearance. (2) Establishment of ethically appropriate procedures whenproviding the NCGM Biobank resources to investigators who belong to the outside institutions
including private-sector corporations. (3) Public relations by improvement of homepage.

Researchers には、分担研究者を記載する。

研究成果概要（27指1401）「ＮＣＧＭにおける戦略的なバイオリソース収集と、多層的オミックス解析及びメタゲノム解析での活用を目指した病院コホート研究 」【研究目的】 感染症と糖尿病等の生活習慣病などを共に担当する当センターの特長を十分に生かした戦略を立案し、ナショナルセンター・バイオバンクに対する、①「疾患バイオバンク」の構築、②バイオリソースの「研究活用」、③「産学官連携の推進」の社会的要請に対応すべく、バイオバンク戦略を見直して、その基盤整備を加速・強化する 。

【計画年度】３年研究の３年目【実施体制】
主任研究者：大西 真
分担研究者：加藤規弘、潟永博之、考藤達哉、狩野繁之、植木浩二郎、日ノ下文彦、廣井透雄、秋山徹、
美代賢吾、大河内仁志、安田和基【研究成果】
1. バイオバンク推進体制の再編
l バイオバンク推進体制を部局横断的なものに再編したうえで、個別診療科等の要望とセンター事業との融合を図り、診療科群／グループ毎に検体・医療情報の収集戦略を立てて、重点的な取り組みに着手し推進した。
l バイオバンク協力推進WG 、試料管理・分譲・解析WG 、In houseデータベース開発WG 、倫理手続き・広報WG の4つのworking groupを設置し、各々の課題に取り組んだ。

2. 戦略的な検体・医療情報の収集
l DNAのみならず、多層的オミックス解析のためのRNA・タンパク等の検体収集、及び腸内細菌叢を対象としたメタゲノム解析のための検体収集も行い、順次バイオバンク検体数を増やした。腸内細菌叢に関しては、すでに3400以上の検体から解析用DNAの抽出を完了し、そのうち3分の2以上についてシーケンスデータ取得を完了した。
l 感染症（HIV、肝炎、国際感染症）と糖尿病等の生活習慣病（糖尿病と大血管障害）を主軸疾患としつつも、高度総合診療を担う医療機関という特長を生かした、多面的な個別研究の推進に伴うバイオリソース収集を開始し規模を拡張した。
１／４

国際医療研究開発費事後報告

NCGMバイオバンクと中央バイオバンクとの連携(NCBNは第１期での体制)

NCGMバイオバンク含むローカルバンク
共同研究調整窓口担当

情報窓口担当渉外窓口担当検体窓口担当共同研究を中心に各NCローカル
バンクが主体的に推進

One Stop
サービス

広報活動

検索ツール

認知度向上

カタログDB提供

l 学会/展示会での広報・宣伝

l Homepage管理

l 外部からの問い合わせ対応

l パンフレット作成

l カタログ検索の利便性向上

l 各ローカルバンクでの活動
状況の把握

l ニュースレター発行
l (シンポジウム開催)

カタログDBの活用促進

試料活用
提供 (分譲) 検討段階

l 収集検体数の定期的な集計
外部への対応支援

中央DB・広報部門

NCBN中央バイオバンク
２／４

l 提供 (分譲) の具体的手続きを検討
l 中央バイオバンクでの試料管理は今後の課題

各種手続き文書の整備
ユーザーのニーズ調査

中央バイオバンク
事務局

倫理的な対応NCGMバイオバンクと中央バイオバンクとの連携
NCGMバイオバンクの組織体制(NCBNは第１期での体制)

NCGMバイオバンク
運営委員会

事業の適正かつ円滑な実施に必要な重要事項の審議や決定を行う

NCGMバイオバンク
調整委員会

運営委員会での基本的な決定事項・指示に従い、必要な実務を司る

委員長
副院長 (バイオバンク担当)、副所長
4つのWG長、糖尿病研究センター長

試料管理・分譲・
解析WG

倫理手続き・広報
WG

バイオバンク協力
推進WG

In houseデータ
ベース開発WG

臨床研究試料管理室

臨床研究試料支援室

バイオリソース管理室

臨床情報DB管理室

連携

連携

連携

連携

ナショナルセンターバイオバンクネットワーク（NCBN）の検討部会

検体システム検討部会

試料等利活用検討部会
３／４

情報システム検討部会

今後の計画• バイオバンクの基盤は、高品質な生体試料の収集・管理と、詳細かつ高精度な付随医療情報のデータベース化である。今後、検体の利活用を一層促すべく、研究用の医療情報データベース（in house DB）及び産官学連携での検体利活用体制の整備を更に進めていく 。
• NCGMバイオバンク で保有しているような、豊富な臨床情報を備えて追跡可能性が高い試料について、多層的オミックス基盤データを整備し、公平な形でデータシェアリングできるようなシス
テムを検討していく 。

ＮＣＧＭにおけるバイオバンク推進体制の再編に係る研究分担研究者：大西 真

NCGMバイオバンクの組織体制(NCBNは第１期での体制)

NCGMバイオバンク
運営委員会

事業の適正かつ円滑な実施に必要な重要事項の審議や決定を行う

NCGMバイオバンク
調整委員会

運営委員会での基本的な決定事項・指示に従い、必要な実務を司る

委員長
副院長 (バイオバンク担当)、副所長
4つのWG長、糖尿病研究センター長

試料管理・分譲・
解析WG

倫理手続き・広報
WG

バイオバンク協力
推進WG

In houseデータ
ベース開発WG

臨床研究試料管理室

臨床研究試料支援室

バイオリソース管理室

臨床情報DB管理室

連携

連携

連携

連携

ナショナルセンターバイオバンクネットワーク（NCBN）の検討部会

検体システム検討部会

試料等利活用検討部会
３／４

情報システム検討部会

本研究におけるNCGMバイオバンクの目指すもの

目的

ナショナルセンター・バイオバンクに対する、①「疾患バイオバンク 」の構築、②バイオリソースの「研究活用 」、③「産学官連携の推進 」という社会的要
請に応えるべく、バイオバンク戦略を見直し、その基盤整備を加速・強化する方法• 感染症と糖尿病等の生活習慣病の重点的な試料収集と活用に向けて、関連診療科のグループ化を推進する• 多層的オミックス解析とメタゲノム解析のための検体を収集する• バイオバンク推進体制を部局横断的なものに再編
し、個別診療科等の要望とセンター事業との融合を図
る

期待される
効果

病院コホート研究体制が整備されて、大規模な疾患バイオバンクへと発展し、その研究活用や産学官連携が進むと期待される

NCGMバイオバンクでの、NCBNおよびメディカルゲノムセンターとの連携に係る研究分担研究者：加藤規弘

NCGMバイオバンク含むローカルバンク
共同研究調整窓口担当

情報窓口担当渉外窓口担当検体窓口担当共同研究を中心に各NCローカル
バンクが主体的に推進

One Stop
サービス

広報活動

検索ツール

認知度向上

カタログDB提供

l 学会/展示会での広報・宣伝

l Homepage管理

l 外部からの問い合わせ対応

l パンフレット作成

l カタログ検索の利便性向上

l 各ローカルバンクでの活動
状況の把握

l ニュースレター発行
l (シンポジウム開催)

カタログDBの活用促進

試料活用配布 (分譲) 検討段階

l 収集検体数の定期的な集計
外部への対応支援

中央DB・広報部門(NCBNは第１期での体制)

NCBN中央バイオバンク

l 配布 (分譲) の具体的手続きを部会で検討中
l 中央バイオバンクでの試料管理は今後の課題

各種手続き文書の整備
ユーザーのニーズ調査

中央バイオバンク
事務局

倫理的な対応NCGMメディカルゲノムセンターとバイオバンクの連携
NCGM
メディカルゲノムセンター（MGC）

NCBN中央バイオバンク

NCGMバイオバンク

ゲノム臨床応用部門

臨
床
研
究
試
料
支
援
室

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ノ
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医
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臨
床
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室

臨床ゲノム解析部門

ゲノム医療支援部門

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進

ゲ
ノ
ム
医
療
研
究
推
進
室

（27指1401）「NCGMバイオバンクでの、HIVの戦略的な検体・医療情報の収集に係る研究」 分担研究者：潟永博之

1997年以来、HIV受診
患者全員ﾚｼﾞｽﾄﾘ登録.
診療目的で検体保存.
2000人以上のHIV感染者の経時的な血液検体+新患約150人/年
plasmaviable PBMC
臨床情報

ﾊﾞｲｵﾊﾞﾝｸへの参加同意取得「HIV疾患ﾊﾞｲｵﾊﾞﾝｸ」へ
H26年度実績 623人
H27年度実績 318人
H28年度実績 301人
H29年度実績
288人
合 計
1530人

HIV疾患ﾊﾞｲｵﾊﾞﾝｸの検体・医療情報を用いた研究成果●眼科との共同研究「HIV多剤併用時代における眼梅毒の予後」

Tsuboi, et al. Sex Transm Infect.

●熊本大学との共同研究「CTL逃避変異の蓄積とHIVのフィットネス」「NK細胞によるHIV-1のコントロール」「HIV-1 vpr に自然に生じる多型変異と臨床データ」「単一逃避変異のT細胞とHIVへの共生への影響」

Murakoshi, et al. J Virol.
Lin, et al. Cell Rep.
Kamori, et al. J Med Virol.
Sun, et al. Cell Rep.

●ACC独自の臨床研究「良好な抗HIV療法でもCD4細胞数の回復は不完全」 Mutoh, et al. Clin Infect Dis.
「HIV感染者の腎障害の頻度と関連因子」
Nishijima, et al. Sci Rep.
「HIV感染者における抗結核薬の有害事象」
Matono, et al. AIDS Pt Care
STDS.
「抗HIV薬tenofovirのアジア人の腎機能への影響」
Suzuki, et al. AIDS Pt Care STDS.
「HIV感染者の見逃されているアメーバ性虫垂炎」
Kobayashi, et al. J Clin Microbiol.
「梅毒罹患後5か月以内に生じた脳ゴム腫」
Tsuboi, et al. Emerg Infect Dis.
「細胞内AZT3リン酸は血漿中AZT濃度と比例しない」 Kinai, et al. J AIDS.
「東京のHIV感染者における梅毒罹患率」
Nishijima, et al. PLoS One.
「多型変異によって誘導されるrilpivirine耐性変異」
Hayashida, et al. J Antimicr Chem.
「ABCB1とABCG2に変異を持つ患者のraltegravir濃度」 Tsuchiya, et al. J AIDS.
「尿中β2microglobulinによる腎機能の予知」
Nishijima, et al. AIDS.
*黒字：医療情報のみ使用。 *赤字：HIV検体＋医療情報使用。

H29年度同意取得状況
1200

肝臓内科

1000

消化器内科

800

総合内科

600

児童精神科

400

リウマチ膠原病科

200

耳鼻いんこう科
外科

0
４月 5月

6月

7月

8月

9月 10月 11月 12月 1月

2月

3月

H29年度システム改修
バイオバンクデータベースとSS-MIX2との連動
連動項目名
患者基本情報処方オーダ情報
注射オーダ情報
検体検査依頼情報
検査結果情報放射線オーダ情報
生理検査オーダ情報
内視鏡オーダ情報
入院情報
注射入院実績情報
注射外来実績情報
放射線実績情報
生理検査実績情報
内視鏡実績情報
食事依頼
細菌検査依頼情報
細菌検査結果

状況
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み
連動済み

本年度から
新規参加

H27-29年度の同意取得状況
1200
肝臓内科

1000

消化器内科

800

総合内科

600

児童精神科

400

耳鼻いんこう科

リウマチ膠原病科
外科

200
0
H27

H28

H29

H27-29年度のシステム開発「電子カルテ」
同意ステータス機能の追加「バイオバンクデータベース」• 採血管と匿名化チューブの紐付け• 中央バイオバンク用の出力機能• 問診票のOCR取り込み機能「検体管理」
フリーザー温度と室温の監視機能追加

課題番号：27 指 1401

研究課題名

：NCGM バイオバンクでの、国際感染症の戦略的な検体・医療情報の収集に係る研究主任研究者名 ：大西真

分担研究者名 ：狩野繁之
キーワード：バイオバンク、マラリア、PBMC、インフォームドコンセント

研究成果：当該研究の研究目的は、国立国際医療研究センター（NCGM）のナショナルセンター（NC）としてのバイオバンク構想で：〔①バイオバンクの構築〕特に NCGM が所掌するところの国際感染症に係るバイオリソースの収集を行うこと、〔②研究活用〕その利用により国際感染症の病態の解明と克服に貢献すること、〔③産学官連携の推進〕共同研究以外でも外部機関へ提供（分譲）できる仕組みを構築することが求められているが、国立研究開発法人としての社会的要請が高い。その期待に応えるべく、本分担研究では、NCGM バイオバンク戦略における国際感染症の基盤整備を加速・強化することを研究目的とした。
もちろん、バイオバンクの基盤は、高品質な生体試料の収集・管理と、詳細かつ高精度な付随医療
情報のデータベース化である。ナショナルセンター・バイオバンク・ネットワーク（NCBN）の発足後 4年余が経過し、今後、検体の利活用を一層促すことが肝要であるため、NCGM バイオバンクでの国際感染症の試料の収集、研究用の医療情報データベース（in house DB）及び検体利活用体制の整備に係る部分の比重が大きくなっている。一般的な疫学研究や観察研究に用いるだけでなく、創薬・個別化医療の開発を目指した研究、さらには、産学官連携によって、最先端のゲノム医科学研究や企業の製品開発等に活用するための特別な“バイオバンク戦略”が、NCGM の国際感染症部門でも必要である。
すなわち、国際感染症の高度総合医療を担う病院として、NCGM は ACC、DCC､外国人医療を担当する診療科を擁し、さらには研究所における国際感染症部門はそれらの診療部門と密接な連携を保っており、この総合的国際感染症臨床研究体制は 6 つの NC の中において当センターの大きな特長となっている。国際感染症の重点的な試料収集と活用に向けて、その基盤整備を推進することで、多層的オミッ
クス解析のための DNA・RNA・タンパクならびに病原体の収集とメタゲノム解析のための検体収集を、イベントの発症前後など、時系列に沿ってマルチポイントで行えるような病院コホート研究体制が整備され、大規模な国際感染症バイオバンクへと発展し、研究活用や産学官連携が進むと期待された。
そして、３年間の研究実施期間全体を通して、NCGM バイオバンク戦略における国際感染症の基盤整備を加速・強化することで、病院コホートの整備に貢献することを大きな目標とした。
研究の進捗と結果
初年度（平成２７年度）には、国際感染症バイオバンク推進体制を、研究所国際感染症部門（熱帯医学・マラリア研究部、感染症制御研究部、難治性ウイルス感染症研究部）を核として､肝炎免疫研究センターや臨床部門（ACC、DCC、感染症科、国際診療部）と部局横断的に構築し、検体・医療情報の収集戦略をたてて、上記の重点的な取り組みに着手した。２年度目（平成２８年度）には、メディカ
ルゲノムセンター（MGC）が 4 月 1 日付けで発足したこともあり、本研究事業も本格的に進められる必要があり、NCGM のバイオバンクは MGC と連携してゲノム医療の実現化に確実な貢献を開始した。３年
度目（平成 29 年度）の半ばに NCBN 事業は開始後 6 年経過する運びとなり、NCGM のバイオバンクとして検体の収集実績とともに活用実績が求められる状況となった。この流れの中で、下記の項目で本分
担研究は研究成果をあげた。
● 国際感染症バイオバンク協力推進
目標としては、施設内及び外部機関との共同研究に繋げるべく、各部局で、より包括的な Clinicalquestion の解決を目指して、バイオリソースの収集を拡充していくこと。更に MGC 事業での被検者（遺伝子検査の対象者など）の検体・情報収集体制へも必要に応じて展開していくことである。
具体的には、DCC が中心となって、検体・情報収集体制の整備を開始した。マラリア患者を最初の対象として、①外来・入院の、どのタイミングで被験者に研究参加を依頼し、誰がベースラインの医療情報を収集するか、②診療科群別の研究用 DB フォーマットを作成したうえで、それに誰が正確な病名を含めたデータを入力するか、③全例で採取する血液試料以外のもの（尿・便、組織検体、病原体などの“特殊検体”）を如何にして臨床研究試料管理室に渡すか、その必要性があるか。そしてそのた

めのラベル打ち出し等をどうするか、などの課題を検討した。その他に、④熱帯医学・マラリア研究部にすでに保有する既存検体（特にフィールド調査を通して取得した検体を含む）を例として、バイオバンクへの移行・連携、⑤収集済み検体をカタログ DB に登録するための処理なども検討し、既存検体のすべてのリストアップを行った。
当該分担研究班として検討された検体・情報収集体制に基づき、検体・情報の収集を進め、３年間で達成した国際感染症検体・情報収集体制を基に、各種試料の数、付随医療情報量を着実に増やした。
これらを元に、医師主導治験として３つのマラリア診断法ならびに治療法の開発のためのけ検体収集法を整理し、プロトコールを作製した。それらのテーマは：（１）マラリア患者からの EDTA 全血採取とフローサイトメトリー法の応用による超迅速診断法の開発（シスメックス株式会社との共同研究）（２）マラリア患者からのヘパリン全血採血（またはろ紙採血）と LAMP 法による DNA 診断法の開発（栄研化学株式会社との共同研究）（３）マラリア患者のリンパ球の採取と抗体治療薬の開発研究（株式会社イーベックとの共同研究）
これらの研究に資するバイオバンクのあり方を重点的に検討した。
● 試料管理・分譲・解析
これまでは、国際感染症研究として患者 DNA を採取するに当たっては、血液を遠心分離し血漿とバフィーコートのみを分注・保管していた。今後、バフィーコートだけでなく、あらゆる細胞／臓器などの検体からも DNA 抽出すること、さらには RNA 採取用として、末梢血単核球の total RNA、microRNAも採取することを計画した。特殊検体の処理・管理に係るシステムについての SOP 作製は課題を残している。施設内及び外部機関との共同研究に対応すべく、分析・解析のための共通プラットフォームの整備（オミックス解析基盤データの共有化・DB 化を含む）としては、特に全ゲノムシークエンシン
グへの対応を進めた。実績としては、上記の３）の研究における、輸入熱帯熱マラリア患者の PMBC を分離し、それを使った完全ヒト型抗体の作成に成功した。今後はこの抗体治療薬としての有用性にかかる前臨床試験を別途研究費を獲得して進めて行く。
● In house データベース開発
本研究は、研究班全体の研究進捗と歩調を合わせるが、輸入マラリアに関して新規に DCC で収集するベースラインの医療情報等（既存試料の付随医療情報を含む）の、in house DB への移行・集約に際して、電子カルテからの持続的抽出の可否を選別し、手作業／自動更新すべき DB 化項目を検討した。
その結果、収集した国際感染症患者検体の付随医療情報のうち、電子カルテから取り出せるものについては、SS-MIX 標準化ストレージの活用を進めた。in house DB の機能の充実のためには、オミック
スデータと医療情報の連結システムの整備を進め、MGC での運用に繋げて行く必要があることが認識された。
● 倫理手続き・広報
マラリア患者の末梢血単核細胞（PBMC）採取に関して倫理審査委員会に諮り、その承認を得た。研究目的は、上記イーベック社との（３）の共同研究で、マラリア原虫抗原に特異的に反応する完全ヒト型抗体の作製である。IC（informed consent）の取得から検体採取に至るまで、DCC の担当医師と相談してプロトコールを作製した。なお当センターで収集された試料の共同研究／分譲のための手続き
も、国際感染症研究分担研究班として先陣を切っておこなった。偶発的所見への対応や、協力者・被験者への情報提供などには、MGC 事業と連携して取り組んだ。
さらに、シスメックス社との共同研究（上記（１））におけるマラリア患者からの血液検体の採取にかかる倫理委員会審査も承認を得、採血後すぐに診断にたどり着けるための搬送法等についても検討した。現在、栄研化学社との共同研究（上記（２））の倫理委審査のためのプロトコールも作製中
で、本年度９月の委員会に提出予定である。
当該研究３年間を通して、国際感染症の戦略的な検体・医療情報の収集をその研究テーマとして展開し、NCGM におけるバイオバンクやメディカルゲノムセンターのシステム作りに貢献する成果をあげてきたが、それにとどまらず、収集した検体を利用して医師主導で臨床試験につながる研究テーマを創出して、新たな診断法や治療法の開発に着手するという当初の計画を上回る成果をあげることが出
来た。

課題番号

：２７指１４０１：ＮＣＧＭバイオバンクでの、糖尿病等代謝性疾患の戦略的な検体・医療情報の収集に係る研究
研究課題名

主任研究者名 ：大西真
分担研究者名 ：植木浩二郎
キーワード：疾患レジストリー、患者血清パネル、腸内細菌

研究成果

：

患者パネルの作成については、糖尿病・内分泌・代謝疾患解析のためのバイオリソースバンクの構築(MISSION-DM-ENDO)（倫理委員会承認番号 NCGM-A-000240-01）を 2016 年から開始し、入院患者の入院時、退院時ペア血液試料を中心とし、過去の試料と統合した時系列バイオリソースバンク構築している。年間 200 例程度のエントリーを予定しており、「入退院時ペア血清・DNA」のパネル作成を開始しているが、これまでほぼ予定通りの収集が達成されている。実際のプロセスとして、主に血糖コントロール目的で入院した患者から同意を得て、入院翌日の空腹時の血液サンプルと退院の前日乃至その近傍での血液サンプルを採取してペアサンプルとしている。このような、代謝状態の異なる同一人物のペアサンプルは極めてユニークである。また、同意が得られた患者については、NCGM バイオ
バンクにも資料を提供している。これまでの実績から約 10-20％の症例は、過去 8 年以内に当院入院加療を受け、研究用の入退院時血清収集（このときも空腹時で統一）に協力したことがあると見積もられるため、これらのサンプルもパネルに組み込み、長期をカバーする経時的な血清パネルを構築している。このような同一人物を長期間にわたって追跡している事例も住民コホートなどを除けば希である。また、2017 年どの後半から糞便についても採取を開始しており、年間 100 例前後のサンプルが期待できる。これらの解析からは、短期的な代謝状態の変化による血清バイオマーカーや腸内細菌の変化などの情報が得られることが期待され、また糖尿病治療薬の腸内細菌叢に対する影響、さらには長期血清パネルの解析から合併症予測因子の同定を計画している。また、糖尿病に伴う NASH などの肝臓併発症と腸内細菌叢との関連の解明にも寄与するものと考えられる。現在、血液サンプルについて
は、多層的マルチオミックス解析の準備を進めている。

これらの患者の臨床情報の収集にも貢献する方策として、NCGM と日本糖尿病学会は共同事業として診療録直結型全国糖尿病データベース事業(J-DREAMS)も 2015 年から開始している(Sugiyama et al.
Diabetol Int 2017)。J-DREAMS では、電子カルテに診療テンプレートを組み込むことによって、疾患
パネルの情報としても重要な家族歴・既往歴・合併症の状況・喫煙や飲酒などの生活歴に加え、診療ごとの体重や血圧等の情報が、処方や血液・尿データとともに SS-MIX2 に格納されるシステムであり、診療そのものがデータベース構築になるという画期的システムである。現在、NCGM ではおよそ 2500
名以上の糖尿病患者のデータベースが既に構築され、コホートとして前向きに追跡されている。
J-DREAMS は、2018 年 5 月時点で 35 施設 3500 名以上が登録されており、現在約 45 施設まで参加施設が拡大している。これらのデータの AI 等による解析により合併症の予測因子や合併症抑制のための治療アルゴリズムの策定が可能になるものと考えられる。また、日本医師会が実施している糖尿病デー
タベース J-DOME との連携によって、我が国の糖尿病診療の実態解明にも貢献するものを考えられる。

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課題番号
研究課題名

：２７指１４０１：十分な水分摂取による体内水バランスへの影響とCKD進行抑制の検討
保存期CKD糖尿病・非糖尿病患者において主任研究者名 ：日ノ下 文彦
分担研究者名 ： 近藤 勲, 別府 寛子, 塩路 慎吾, 坂本 絵美, 新井 洋平, 三谷 佑望, 多
田 真奈美
キーワード
：BCM, CKD, 水分摂取
研究成果
：本研究は担当者の移動に伴い, 再度内容の精査を行った上で 2017 年 1 月 25
日に倫理委員会に研究内容の提出を行い, 承認を受けた. 当科では, 2015 年に低 Na 血症を呈する病態である, 鉱質コルチコイド反応性低 Na 血症 (MRHE) と SIADH の鑑別における BCM(Body composition monitor)の有用性を検討する試験も行っており, 2015 年に日本腎臓病学会で発表し, その有用性を示してきた. 昨年度スタッフ間での研究の組み込みマニュアルを作成, 患者記入用のシートを準備し, 現在は特に当科初診の患者を中心に引き続き参加者を選別している状況である.

大血管グループ
採血数

同意数
400
350
300
250
200
150
100
50
0

循環器内科

•

循環器内科 （目標達成率 46/124=0.37）

心臓血管外科
神経内科
脳神経外科

–
–
–

•

心臓血管外科
神経内科
脳神経外科

平成26年度までは外来患者を中心に登録が進んでいたが、入院患者を中心に収集することにバイオバンクの方針が変更されている。
循環器内科独自のバイオバンクがあり、病院のバイオバンクへの提供を拒否されることがある。
同意数に比較して採血数が少ない理由は、同意により循環器内科からバイオバンクへの寄託としている。
診療体制の大幅な変更があり、入退院支援センターによるサポートが進んできている。

神経内科 （目標達成率 0/36=0.00）
–

•

循環器内科

心臓血管外科 （目標達成率 10/24=0.41）
–

•

400
350
300
250
200
150
100
50
0

脳梗塞などの収集を個別に依頼したが、全く効果が出ていない。

脳神経外科 （目標達成率 326/52=6.27）–

バイオバンクファンドによる研究費の補助もあり、脳梗塞、脳出血などの急性期の大血管疾患症例の収集が爆発的に増加した。

大血管グループ• H30年度のグループ全体としての新規目標数– センター全体の事業としてバイオバンク事業をさらに推進するため、理事長からの提案により、各診療科で入院患者の約20%の登録を目標とすることとなった。
••••

循環器内科（H２９年度目標１２４名 → H３０年度目標 ２４０名）
心臓血管外科（ ２４名 → ２４名）
神経内科（ ３６名 → ６０名）
脳神経外科（１２０名 → １２０名）• 脳神経外科は入退院支援センターの助けもなく、バイオバンクファンドによる爆発的な増加を持続している。心臓血管外科は入退院支援セン
ターにより堅調、循環器内科はやや低下、神経内科には引き続き協力要請を行う。
• 循環器内科ではバイオバンクファンドがあまり有効でなかった。クリニカ
ルパスはできているので、入退院支援センターへの移行が望まれる。
• 全体としては、目標236に対し、382と十分に達成する事ができた。
• 今後は新規目標に向けてさらなる努力が必要である。

研究所のマイクロバイオーム解析体制
秋山 徹
国立国際医療研究センター

目的：消化器内科において消化器疾患と紐付けられた患者のマイクロバイオームを解析し、疾患とマ
イクロバイオームの関係を明らかにする。
手法：１）研究所に搬送いただいた便および唾液から共同
研究先である服部研と同じ酵素法を使用してDNAを精製。
２）HiSeqにてショットガンシーケンス（1サンプルあた
り平均1G塩基）で配列情報を取得する。
３）専用の高速コンピュータで、マイクロバイオーム
を解析。

これまでの解析状況
便DNA抽出済み（酵素法）：3401検体（内訳、健常人422名、サンプリング法検討400
名、非健常人2448名、潰瘍性大腸炎79名、クローン病18名、IBD34名)
シーケンスデータ取得済み: 2347検体(平均1G塩基以上)
マイクロバイオーム１次解析完了済み：80検体
膵臓癌研究用唾液
DNA抽出済み（酵素法）：97検体

In-house データベース（DB）開発WG 報告書
In-house DB開発のための検討•

国内事例調査•運⽤フローの検討とユースケースごとのシステム機能とユーザの定義

バイオバンク事業に取り組んでいる他施設を訪問し、システム状況の調査と意⾒交換を実施•
⻑寿医療研究センター：LIMS無、SS-MIX連携•
東北メディカル・メガバンク：LIMS有、SS-MIX連携無•
岡⼭⼤学バイオバンク：LIMS有、SS-MIX連携有システム

In-house DB運⽤における機能

ユーザー

電⼦カルテ

同意患者のカルテにフラグを⽴てる

患者コーディネート担当者

SS-MIX2*標準化ストレージ

電⼦カルテの臨床データを蓄積

情報管理部⾨

匿名化管理システム

患者番号を連結可能匿名化・管理

患者コーディネート担当者

In-house DB（LIMS**）

臨床データをSS-MIX2から取得、検索・閲覧機能を提供

情報管理部⾨採⾎管管理システム

採⾎管の到着確認システム

病院検査部*SS-MIX2**LIMS•••

同意患者の採⾎管の到着確認、または同意取得⽇の夜間バッチで、カルテから匿名化管理システムに電⽂送信し匿名化処理を実⾏
夜間バッチでLIMSがSS-MIX2標準化ストレージから臨床情報の差分を収集

In-house DBの要件定義•••: 電子カルテベンダーに依存せず、電子カルテの診療情報を保存するストレージ: Laboratory Information Management System

SS-MIX2の臨床情報を取得し、Viewerでの表⽰・検索を可能とした取得情報は、患者基本（⽣年、性別、来院⽇、病名(ICD10)）、検体検査（JLAC10）、処⽅（HOT9）とし、厚⽣労働省標準コードで保存することとした
患者ごとの病名や検査・処⽅の履歴の検索を可能都市、GUIでSQLを発⾏し、⾃由な条件で患者絞込検索を可能としたIn House DBの構築と運用
バイオバンク

病院情報システム
検体到着情報をリアルタイムで電文送信

検体到着管理システム
TRIPS

検体ラベルを
発行

電子カルテ

中央バイオバンク
カタログDB

匿名化管理
システム

同意情報送信臨床情報抽出指示

同意情報入力同意者の匿名化番号CSV
取込み

コーディネータ

検体情報を登録

検体登録担当者

SS-MIX2•

臨床情報をバッチで抽出

LIMSによる臨床情報の表⽰・検索・抽出
ICD10コードで病名を表⽰主・副を複数表⽰することも可能

検査実施⽇ごとに規定した検査項⽬の結果値を表⽰

情報担当者

LIMS
臨床情報を
抽出、加工

•

分譲

電⼦カルテに同意ステータス機能を実装

課題番号：27指1401
研究課題名：NCGMバイオバンクでの試料管理、分譲、解析に係る研究主任研究者名 ：大西真
分担研究者名 ：大河内仁志
キーワード：バイオバンク、DNA
研究成果：
当センターのバイオバンクでは平成 24 年より検体収集を開始し、血清、血漿、DNA、
RNA を収集している。当初は DNA 抽出を行わず、DNA 抽出用にバフィーコートとして凍結保存していたが、平成 27 年 4 月より新たに特任研究員を採用してバフィーコー
トから DNA の抽出を開始した。平成 27 年 9 月から RNA 用の血液の採取を開始したが、現体制ではマンパワーが不足することが明らかとなった。そこで RNA 検体処理にかかるコストを検討したところ、抽出業務を外注にした場合と担当者を増員して自前で行った場合のいずれも、かなりの額の追加費用が発生することが判明した。費用対効果の観点から病院や研究所に RNA 検体の使用見込みをアンケート調査したが、特に積極的な使用希望が認められなかった。そこで多大な労力をかけてまで RNA サンプルを収集する必要はないとバイオバンク運営委員会で最終的に判断されたため、平成 28 年 9月をもって RNA 用採血を中止した。既存の採血分 1290 検体については RNA の抽出を行って、凍結保存することとした。
平成 30 年 3 月末時点の有効患者検体数は血漿 6059
血清 6060
バフィーコート 6002
抽出済み検体数
DNA 6326
RNA 1290となった。
抽出済み DNA 検体数が有効患者検体数よりも多くなっている理由は、複数回採血している患者がおり、１回採血：5728、２回採血：260、３回以上採血：14 となっているためである。
特筆すべきは、平成 28 年４月の時点での DNA 検体数は 2322 であり、その中で DNA 量が 5ug/vial 以上ある検体は 26%しかなかったが、平成 29 年 3 月末の時点では DNA 検
体数は 4142 となり、5ug/vial 以上ある検体は 46% になった。さらに平成 30 年 3 月
末時点の検体数は 6326 となり、5ug/vial 以上ある検体は 57.5%となった。平成 29 年
度だけでみると新たに 2184 検体増えたが、そのうちの 80%近くが 5ug/vial 以上ある
検体となっており、得られる DNA 量は非常に安定していることが示された。実際に
2.5ug/vial 未満となった、いわゆる十分な DNA 量が確保できなかったのはわずか 24
検体であり、率にすると１％程度である。もともと白血球数が少ない場合には得られる DNA 量は少なくなるので、この 1%という数値はやむをえないと考えられた。一方で
平成 27 年 4 月以前に収集したサンプルでは、得られる DNA 量にばらつきが見られたが、それ以降のサンプルではほとんどばらつきが見られなかったことより、単なる経時的な劣化現象では説明がつかず、バフィーコートの採取法に何らかの問題があったことが示唆された。

これまでバイオバンクの検体情報は病院のシステムと切り離された形で、管理されていたが、匿名化や登録に際して煩雑な手続きが必要になるため、一元管理が望ましいと考えられた。そこでソフトを見直して一元管理すべく統合することになり、徐々に改善されつつあるが、まだ完全な統合に至っていないため、今後速やかな統合が望まれる。
分譲実績について平成 28 年度は企業に１件だけであったが、平成 29 年度は２企業と１大学に有償分譲を行った。内部利用を含めた提供数として平成 28 年度は３件、平成 29 年度は８件となっている。
組織バンクの整備にも尽力し、液体窒素タンクを揃えて受け入れ態勢を整えた。特に腫瘍病変の場合はガン部と正常部を分けて採取する必要があり、また迅速に処理して凍結保存することが望まれる。動線の確認とマンパワーの問題が課題としてあげられ、今後解決していく必要があると考えられた。

課題番号：27指1401

研究課題名：NCGMバイオバンクでの、倫理課題・情報発信等に係る研究主任研究者名 ：大西真

分担研究者名 ：安田

和基

キーワード

：個別研究、共同研究、分譲、検体利用審査会議、ホームページ

研究成果：本研究では、当センターの特質を活かしたバイオバンク構築、及びその利活用において、倫理手続き、及び広報（アウトリーチを含む）について、「倫理手続き・広報 WG（ワーキンググループ）」として、他の WG や調整委員会とも連携しながら、課題を整理し事業を推進しつつ、最適のシステムを探索する。倫理的課題については、NCBN（ナショナルセンターバイオバ
ンクネットワーク）全体での討議事項も踏まえながら、当センターにおける全体的な枠組・ルール作りと、個別の案件への対応を並行してすすめてゆく。広報については、双方向的な情報発信体制により、センター内に対しては、職員への情報共有と議論の活性化を行い、センター外に対しては、アカデミア、企業、及び患者さんを含む一般社会への情報発信によりバイオバンクの理念と現状についての理解を深め、利活用推進を目指す。
平成 27 及び 28 年度の成果としては、倫理関連では、利活用の点からニーズの大きい臨床試料として、DNA・血清・血漿以外の組織や体液、経時的サンプリング、あるいは個別研究での既取得試料なども、一定の手続きのもと受け入れ可能としたこと、試料等提供を「分譲（有償）」と「共同研究」に分けてそれぞれの体制の整備を行い、外部提供の実績をつくったこと、などが挙げられる。また広報関連では、特に、外部向け HP の大幅な改定を行い内容を充実させた。
これを受けて、平成 29 年度は引き続き以下の成果を得た、【試料収集と倫理】バイオリソース収集における、個別研究とバイオバンク事業との連携を引き続き推進した。具体的には、説明同意取得の方法やその同意の範囲、既取得試料か新規収集試料
か、などから、主なパターンを大別し、職員にも周知し運用した。これにより、NCGM 内の過去あるいは進行中の個別研究の activity が NCGM-BB に反映され、またバイオバンクファンドで支援する個別研究にとっても新たな motivation となることが期待された。さらに外科手術試料の組織バンク構想とバイオバンクとの連携について、倫理的な側面の整備や、具体的なフローについて検討を行った。
【有償分譲を含む試料等提供】バイオバンクで収集された試料等の利活用を促進した。具体的には、「バイオバンク検体利用会議」の規程を再整備した上で、同会議での承認、および外部有償
分譲の場合は分譲先の倫理委員会での承認、を前提に、当センター倫理委員会では、原則として迅速審査で審議可能とした。これにより、バイオバンク試料等の企業への分譲（有償）の迅速化を図ることができた。また利活用のニーズを把握するため、企業担当者との面談・意見交換を行っているほか、NCBN と製薬協との会合に参加し、企業ニーズやバイオバンクに求められる要件について、積極的に意見交換を行った。
【バイオバンクに関する広報活動】バイオバンクに関する広報活動として、ホームページ等のさらなる大幅な改定を行い、レイアウトを一新して見やすくするとともに、内容を充実させた。特に NCGM のバイオバンクの特徴をわかりやすく発信するために、バイオバンク体制、試料等収集・保管実績、疾病の内訳、外部提供に至る流れ、利活用実績等の項目を充実させた。

研究発表及び特許取得報告について

課題番号：27指1401
研究課題名：ＮＣＧＭにおける戦略的なバイオリソース収集と、多層的オミックス解析及びメタゲノム解析での活用を目指した病院コホート研究主任研究者名：大西 真
論文発表
論文タイトル

著者

掲載誌

掲載号

年

Induction of IFN-lambda3 as anadditional effect of nucleotide, notnucleoside, analogues: a new potential
target for HBV infection.

Murata K, Asano M,
Matsumoto A,
Sugiyama M, Nishida
N, Tanaka E, Inoue
T, Sakamoto M,
Enomoto N,
Gut
Shirasaka T, Honda
M, Kaneko S,
Gatanaga H, Oka S,
Kawamura YI, Dohi
T, Shuno Y, Yano H,
Mizokami M.

2

2018年

Interferon-free therapy with direct
acting antivirals for HCV/HIV-1 coinfected Japanese patients with
inherited bleeding disorders.

Uemura T, Tsukada
K, Mizushima D,
Aoki T, Watanabe K,
Kinai E, Teruya K, PLoS One
Gatanaga H, Kikuchi
Y, Sugiyama M,
Mizokami M, Oka S.

10

2017年

Time to development of ocular syphilis
after syphilis infection.

Tsuboi M, Nishijima
Journal ofT, Yashiro S,
Infection andTeruya K, Kikuchi
Y, Katai, Gatanaga Chemotherapy
H, Oka S.

1

2018年

s13340-0170326-y

2017年

Sugiyama T, Miyo K,
Tsujimoto T,
Design of and rationale for the Japan
Kominami R, Ohtsu
Diabetes compREhensive database project H, Ohsugi M, Waki
Diabetol Int
based on an Advanced electronic Medical K, Noguchi T, Oherecord System (J-DREAMS).
K, Kadowaki T,
Kasuga M, Ueki K,
Kajio H

Plasma adiponectin levels, APIPOQ
variants, and incidence of type 2
diabetes: a nested case-control study.

Goto A, Noda M,
Goto M, Yasuda K,
Mizoue T, Yamaji T, Diabetes Res Clin
127: 254-264.
Sawada N, Iwasaki
Pract
M, Inoue M, Tsugane
S.

Hiramoto M, Udagawa
A type 2 diabetes-associated SNP in
H, Ishibashi N,
KCNQ1 (rs163184) modulates the binding Takahashi E,
Int J Mol Med
activity of the locus for Sp3 andKaburagi Y,
Lsd1/kdm1a, potentially affecting CDKN1C Miyazawa K,
expression.
Funahashi N, Nammo
T, Yasuda K

2017年5月

41(2): 717-728 2018年2月

研究発表及び特許取得報告について

学会発表
タイトル

発表者

学会名

場所

年月

坪井基行、西島健、
HIV患者における梅毒罹患から眼梅毒発症ま日本感染症学会
照屋勝治、潟永博
での期間についての検討.
之、菊池嘉、岡慎一.

東京2017年4月

西島健、潟永博之、
上村悠、柳川泰昭、
小林泰一郎、水島大
梅毒の治療効果判定における倍数希釈法と自 輔、青木孝弘、木内
日本感染症学会
英、矢崎博久、源河
動化法の比較検討.
いくみ、田沼順子、
塚田訓久、照屋勝治、菊池嘉、岡慎一.

東京2017年4月

上村悠、塚田訓久、
柳川泰昭、水島大
HCV/HIV-1重複感染血友病患者におけるDAA治 輔、青木孝弘、渡辺
療後の腫瘍マーカーと肝線維化マーカーの推 恒二、木内英、田沼移.
順子、照屋勝治、潟永博之、菊池嘉、岡慎一.

日本エイズ学会

東京

2017年11月

石田裕樹、上村悠、
日本国内のHIV/HCV重複感染者におけるHCV分 林田庸総、土屋亮
子疫学的研究.
人、菊池嘉、潟永博
之、岡慎一.

日本エイズ学会

東京

2017年11月

榊原綾乃、高野ゆか
国立国際医療研究センター国府台病院消化器 り、小海川いづみ、
内科におけるバイオバンクの実施状況と患者 加賀朋子、考藤達
意識調査哉、上村直実、杉山真也

第62回日本人類遺神戸
伝学会

2017年11月

5.J-DOITからJ-DREAMSへ

第60回日本糖尿病
名古屋学会年次学術集会

2017年5月

植木浩二郎

遠矢 真理, 西嶋 傑,
永田 尚義, 須田 亙,
メタゲノムデータを用いた日本人腸内細菌叢
秋山 徹, 秋山 純一, 日本細菌学会と食・生活習慣の関連解析
大杉 満, 上村 直実,
服部 正平

福岡

2018年3月

山内玲, 美代賢吾,
宮本恵成, 長澤直人,
第37回医療情報学 グランキューブ
効率・効果的な診療とプライバシーを両立し奥村恭平, 石割大範,
2017年11月
連合大会
大阪
たゲノム診療用電子カルテ機能の開発
小南亮太, 中川陽介,
加藤規弘

研究発表及び特許取得報告について

宮本恵成, 美代賢吾,
個人情報保護に配慮したゲノム医療対応電子 齋藤加代子, 山内玲, 日本人類遺伝学会
神戸国際会議場 2017年11月
カルテシステムの開発
長澤直人, 奥村恭平, 第62回大会
加藤規弘

美代賢吾, 小南亮太,
バイオリソースと診療情報との結合:収集か
第36回医療情報学
渡辺浩, 森田瑞樹,
パシフィコ横浜 2016年11月
ら連携へ
連合大会
荻島創一, 島貫秀之

島貫秀之, 佐藤泉美,
田中康博, 新保卓郎,
西本寛, 若尾文彦,
原口亮, 大塚文之,東山綾, 高田彰, 永ナショナルセンター・バイオバンクネット 井秀明, 波多野賢二, 第35回医療情報学 沖縄コンベン
2015年11月
ションセンター
ワークのカタログデータベースシステム構築 松村亮, 菊池嘉, 日 連合大会
ノ下文彦, 廣井透雄,
美代賢吾, 小塚和人,
渡辺浩, 岩田悟, 丹
藤昌治, 望月修一,
加藤規弘「糖尿病の遺伝素因—最新のトピックスと展
安田和基
望—」

第5回Diabetes
Research
Conference inTochigi「肥満や関連疾患の遺伝素因は、どこまでわ
安田和基
かったのか」

肥満と糖尿病を考佐倉える会

2017年12月

国内外のバイオバンクの動向やNCBNの取組み
加藤規弘
について.

第22回日本薬剤疫京都学会

2016年11月

宇都宮2017年6月

その他発表(雑誌、テレビ、ラジオ等)
タイトル

発表者

発表先

場所

年月日

安田和基

『糖尿病専門医研
修ガイドブック改訂第7版』診断と治療社、P92-94

2017年5月

企画編集『糖尿病の「体質」：発症する人と安田和基
しない人の違いはなにか？』

月刊糖尿病l9巻7号（P7-P109）

2017年7月「DTC(direct-to-consumer)検査としての遺
安田和基
伝子検査」

糖尿病診療マスター 15巻7号

2017年7月「発症遺伝子の解析」

特許取得状況について※出願申請中のものは(

発明名称)記載のこと。
登録番号該当なし※該当がない項目の欄には「該当なし」と記載のこと。
※主任研究者が班全員分の内容を記載のこ

特許権者(申請者）
登録日(申請日)（共願は全記載）

出願国