－1－－2－－3－－4－－5－－6－－7－－8－－9－－10－－11－－12－－13－－14－－15－－16－－17－－18－－19－－20－－21－

7研究施設の現状と将来計画（分子研リポート 2016 より転載）

計

研究

算

ンター用

，子，理論，

算ンター

論算，，

，

スー理
，ー

ン

ス

算

型スクトーサイドPC クラスタ高速分子シミュレータラ

算富士通， サーバ

ンノード 342，ュータアー

テクNUMA 型インター，ン富士通ュータプロ，1800 TByteディスク

バワークディレクトリ量子

分NAMD，Gromacs

算ラレル NFS

用

装

ノー数ノード32 ノーア，8 TB メモリ性能 12 GB/s能サーバPRIMEHPC FX10システム1000 TB，16CPU
ン

ア，ュータ用，富士通
ラネクトPRIMERGY CX2550M1
算PC クラスタPC クラスタ，分子，28 CPUインター，数

運用56 GB/s

算ディスクームディレクトリ能，306 研究施設の現状と将来計画－22－429.7 Tflops

ア，Gaussian 09，Gamess，Molpro，Molcas，Turbomole，分子数，演算サーバックアップ領域総演算性能

フト

算302.8ファイルサーネクト用システムア，128 GB理論総演算性能高速，演算サーバシステム

用InfiniBand FDRノード，インストール，

算総理論ネクトデータインター
算用，1024 CPUア，，演算サーバ，ファイルサーバ，フロントエンドサーバ，運用管理クラスタ33.2 TB

バ分子，容量 400 TB，

用

能量子メモリ型ス分子

ア高速演算サーバ，ード高

ラムノード 260運用，Tofu インターネットワーク装置Tflops，総メモリ容量，InfiniBand QDR，UV2000領域用，NFS，高性能分子シミュレータメモリ運用，装外部磁気ディスク96 ノードネクト性，16 CPU，vSMPメモリシステム32 GB メモリ

リPRIMEHPC FX10，GPGPU TeslaM2090高速磁気ディスク装置，バイ富士通演算ノードメモリシステム，NVIDIAメモリPRIMERGY RX300S7

高速1 ノード量子UV2000総メモリ容量 55 TByte80 GB/sドSGIOS（Linux2.6）

PC クラスタ部，性能CPU（Intel Xeon）128 GB メモリ高速分子シ

用性算PRIMERGY RX300S7，40 GB/s

算

能総演算性能 188.7 Tflops性，シミュレータ用システム容量システム，子論

運用ド，CPUン，，数，ネットワーク管高性能分子シミュレータ，分子シミュレーシークトシステム，，ュータプロ，

運用用サーミュレータ，，ネットワーク

プロ
用ンター分，Amber，，量子データース，量子，用
子分，性

算
プロ231ループーム用用，総数 787，，

算置， ストノサイエンスアプリ

ン

ン（）エネルー高ン

ンーシアムュータワークシ，量子スクールフト理論

算分子理論理論シップ），外，クト用）ーシアム

プロ， ードップ（フラッ

，（分

エア（，

）フト用
ーシンタースト，高性能システム算，クト）能デバイスー

用

数分ンター

ースデータ136,758
用データ

算
ンュータ，分部（20%，スーーィンタースクール分子シミュレーシンスクール

用高速分子シミュレータシステムクラスタ演算サーバ型番：富士通 PRIMERGY RX300S7ＯＳ：LinuxCPUCore 数：5472（16CPUCore × 342 ノード）総理論性能：126.9 Tflops（371.2 Gflops × 342 ノード）+21.2 Tflops（TeslaM2090 x32）総メモリ容量：43.7 TB（128 GB × 342 ノード）高速 I/O 演算サーバ型番：SGI UV2000ＯＳ：LinuxCPUCore 数：1024総理論性能：21.2 Tflops（20.8 Gflops/CPUCore）総メモリ容量：8.0 TBディスク容量：400 TB（/work）
用サーバ型番：富士通 PRIMEHPC FX10ＯＳ：LinuxCPUCore 数：1536（16CPUCore × 96 ノード）総理論性能：20.2 Tflops（13.2 Gflops/CPUCore）総メモリ容量：3.0 TB（32 GB × 96 ノード）ディスク容量：48 TB（/k/home）研究施設の現状と将来計画 307－23－外部磁気ディスク装置型番：PANASAS PAS12，PAS11総ディスク容量：1000 TB高速ネットワーク装置型番：Force10 Z9000高性能分子シミュレータシステム演算サーバ型番：富士通 PRIMERGY CX2550M1ＯＳ：LinuxCPUCore 数：7280（28CPUCore × 260 ノード）総理論性能：302.8 Tflops（1164.8 Gflops × 260 ノード）総メモリ容量：33.2 TB（128 GB × 260 ノード）ファイルサーバ型番：富士通 PRIMERGY RX300S7（8 ノード）ＯＳ：Linux総メモリ容量：1024 GB（MDS: 128 GB × 2 ノード＋ OSS: 128 GB × 6 ノード）ディスク容量：1800 TB（/home（300 TB），/save（600 TB），/week（300 TB），バックアップ領域（600 TB））フロントエンドサーバ型番：富士通 PRIMERGY RX300S7（4 ノード）ＯＳ：Linux総メモリ容量：512 GB（128 GB × 4 ノード）運用管理クラスタ型番：富士通 PRIMERGY RX200S7（16 ノード）ＯＳ：Linux総メモリ容量：512 GB（32 GB × 16 ノード）高速ネットワーク装置型番：Force10 S4810308 研究施設の現状と将来計画－24－－1－－2－－3－－4－－5－－6－－7－－8－－9－－10－－11－－12－－13－－14－－15－－16－－17－－18－－19－－20－－21－－22－－23－－24－－25－－26－－27－－28－－29－－30－－31－－32－－33－－34－－35－－36－－37－－38－－39－－40－－41－－42－－43－－44－－45－－46－－47－－48－－49－－50－－51－－52－－53－－54－－55－－56－－57－－58－－59－－60－－61－－62－－63－－64－－65－－66－－67－－68－－69－－70－－71－－72－－73－－74－－75－－76－－77－－78－－79－－80－－81－－82－－83－－84－－85－－86－－87－－88－－89－－90－－91－－92－－93－－94－－95－－96－－97－－98－－99－－100－－101－－102－－103－－104－－105－－106－－107－－108－－109－－110－－111－－112－－113－－114－－115－－116－－117－－118－－119－－120－－121－－122－－123－－124－－125－－126－－127－－128－－129－－130－－131－－132－－133－－134－－135－－136－－137－－138－－139－－140－－141－－142－－143－－144－－145－－146－－147－－148－－149－－150－－151－－152－－153－－154－－155－－156－－157－－158－－159－－160－－161－－162－－163－－164－－165－－166－－167－－168－－169－－170－－171－－172－－173－－174－－175－－176－－177－－178－－179－－180－－181－－182－－183－－184－－185－－186－－187－－188－－189－－190－－191－－192－－193－－194－－195－－196－－197－－198－－199－－200－－201－－202－－203－－204－－205－－206－－207－－208－－209－－210－－211－－212－－213－－214－－215－－216－－217－－218－－219－－220－－221－－222－－223－－224－－225－－226－－227－－228－－229－－230－－231－－232－－233－－234－－235－－236－－237－－238－－239－－240－－241－－242－－243－－244－－245－－246－－247－－248－－249－－250－－251－－252－－253－－254－－255－－256－－257－－258－－259－－260－－261－－262－－263－－264－－265－－266－－267－－268－－269－－270－－271－－272－－273－－274－－275－－276－－277－－278－－279－－280－－281－－282－－283－－284－－285－－286－－287－－288－－289－－290－－291－－292－－293－－294－－295－－296－－297－－298－－299－－300－－301－－302－－303－－304－－305－－306－－307－－308－－309－－310－－311－－312－－313－－314－－315－－316－－317－－318－－319－－320－－321－－322－－323－－324－－325－－326－－327－－328－－329－－330－－331－－332－－333－－334－－335－－336－－337－－338－－339－－340－－341－－342－－343－－344－－345－－346－－347－－348－－349－－350－－351－－352－－353－－354－－355－－356－－357－－358－－359－－360－－361－－362－－363－－364－－365－－366－－367－－368－－369－－370－－371－－372－－373－－374－－375－－376－－377－－378－－379－－380－－381－－382－－383－－384－－385－－386－－387－－388－－389－－390－－391－－392－－393－