緒言Preface

なぜ教科書を書くのか？ これは，ここ数年間，やり遂げな・還元よりもむしろ統合に努める．この手法は，システム生物ければならない仕事の山に直面しては落胆し，しばしばいらだ

学を科学的方法の時代に支配的な知的枠組み（paradigm）ちとともに，何度となく自身に発し続けてきた問いである．著と捉える人々を満足させる．また，研究の基データと，基者達は，何年間にもわたって，Manchester 大学の菌学概論データからどのようにして解釈が導かれたのかについても示コースで教授してきた．2000 年以降，インターネット / インす．

トラネット配信された菌学概論コースの履修単位が，ますます・システム生物学を，問題の最適・有効な解決手法を数学的・重要視されている．菌学概論コースでは，登録した端末利用学科学的に策定するための手順（operational research proto-

生にインターネットを通して流される，ダウンロードできるcols）の観点から捉える人々のために，あらゆる種類のコンPDF の形の講義ノート，フラッシュ・ムービーの形のパワーピュータを用いたモデル化実験（computational modelling）

ポイント説明資料，放送映像および音声ファイルなどの形の資や生命情報科学（bioinformatics）についても扱う．

料が，毎年改訂されて提供される．さらに，学生に対しては，・天体物理学から動物学までの多様な学際分野（interdisciplin-学部イントラネットからダウンロードできる，PDF の形の広ary sources）から得られた，生物システムについてのデー範な参考資料のフルテキスト版も提供される．2008/2009 年

タを統合する．の学期までには，これらの資料は精選され，まったく新しいオンライン方式の教科書，「（現代菌類学大鑑）」の最初の原稿，にまとめあげられた．

・最後に，CD を付録とすることにより（訳注：本翻訳書には，CD は付録されていない），システム生物学をすべてのコンピュータで扱いやすいものとした．CD の特徴は，教科このような事情で，われわれは，教科書を執筆しようという書全体のハイパーリンク版，完全に統合化されたサイバー菌決断を，特にはしなかった．そうではなく，執筆しようという類の世界についてのウェブサイト，および近隣物体検知相互決断は，毎日の（そして，毎年の）教育から生じたものであ作用に基づき菌類成長をシミュレーションするプログラムなる．ここ 20 年間ほどは，われわれの教育課程では，菌類界どを，登載していることである．

（Kingdom Fungi）を，菌類自身の特質から考えて真核生物の主要な界の 1 つとして描いてきた．菌類は，それ自身の独特原稿のこの構成は，「」を，の細胞現象，発育現象および生活様式を有している．そして，菌類生物学の教科書としてユニークなものとする．他のユニー

あらゆる生態系と食物網において，きわめて重要な役割を果た

クな特徴としては，この教科書が，まさにこの世紀に執筆されしている．さらに，われわれは，これらのすべてを理解するたたということ，菌類界を，個々に興味深いが，しかしなお各々めの機会を，生物学を専攻する学部学生に与えることが不可欠

独立した生物の多様なグループとして扱うよりも，固有のおもであると考えている．

しろさを有する生物システム（biological system）として「新これらの資料を印刷された原稿にまとめる際に，この機会を世紀」にふさわしい扱いをしたこと，などがある．われわれ利用して，システム生物学（systems biology）についての，は，この教科書をガイドブック（Guidebook）とよぶ．なぜな

次に示すようなさまざまな定義を満足させるように原稿を構成

らば，われわれは，菌類界全体を，包括的に，同時にモノグラした．

フ的に捉えて執筆することが不可能であることに，常に気づいていたからである．そこで，われわれは，休日に旅行者を目的

・われわれは，生物システムの機能やふるまいを明らかにする地にいざなう案内書をモデルとすることに決めたのである．こために，菌類と他の生物との間の相互作用に力点を置く．

れらの案内書は，目的地を包括的に描くものではなく，興味をvi

緒

言

もつかもしれない広範な場所に読者の関心を引き寄せ，もし読いるのである．

者がある場所に興味を示したら決心をするのに十分な情報を与過去 25 年間にわたって，大学に進学する学生の数は非常にえ，さらにその場所にどのようにして行くかを示すものであ増加した．しかし，この事態は，学生一人当たりに支給されるる．「」の各部分は，読者を菌類生物学の興財政的援助の実質的な減少をもたらした．教育関係法令の変更

味をもつ分野に導く．そして，おそらく教科書としては珍しいは，生物科学研究の幅を狭め，研究は，ますます，課題のよりのだが，関連の情報をさらにもたらしてくれる外部資料の参考生物医学的な面に集中するようになった．これらの結果，英国文献も提供している．それらの参考文献のあるものは，インでも世界的にも，大学で教授される生物科学的課題の範囲は，ターネット資料，とりわけビデオであり，他の文献は印刷紙媒必然的に狭められている．

体であり，論文である．もし，読者が，幸運にも Manchester

生物科学の教育と研究におけるこれらの変化は，いくつかの大学の学生として菌学概論コースを受講することができれば，特徴によって促進された．大学は，生物科学関係の学科を合併

マウスをちょっとクリックするだけで，700 以上のこのようし，スケールメリットを求めた．たとえば，Manchester 大学な論文の，PDF ファイルの形の全文を，学部イントラネットは，生物科学関係の 11 の学科を，1 つの生物学科に合併したから即座にダウンロードできるだろう．

（Wilson, 2008）．この学科は，2004 年に，UMIST（University本書では，他の約 7,000 頁のリプリント・コレクションをof Manchester Institute of Science and Technology） と Man-提供することはできないが，これらのコレクションに素早くアchester の Victoria 大学が合併した時にできた，新しい理工科クセスする方法を提供することはできる．ここに示された参考

大学の生命科学部になった．

文献のほとんどは，DOI ナンバーをもっている（実際，完全な英国のほとんどの大学が，Manchester 大学のイニシアチブDOI URL をもつ）ことに気づくだろう．頭文字語 DOI は，デに従ったのにもかかわらず，Oxford 大学と Cambridge 大学のジタルオブジェクト識別子（digital object identifier）を表し，みが，現在でも，菌類学の教育と研究のための伝統的な主役学電子文書（あるいは，他の電子オブジェクト）が，インター科である植物学科をもっている．生物科学教育における，このネット上のどこに存在し，固定されているかを特異的に確認すような広がりの狭小化は，たとえば分類学や生態学などの伝統る．他の文書情報は，どこで文書を見い出すかも含めて，時間的な生物学の領域の多くのスタッフが，分子生物学の重要性とともに変化する可能性がある．しかし，当該文書の DOI ナと，分子生物学が彼らが専攻する学問領域に及ぼす影響を正しンバーは変化せず，常に読者を元の電子文書に導いてくれる．

く評価し得なかったがゆえに，深刻化した．事実，1980 年代印刷された情報を用いてこれらの参考文献の 1 つにアクセスには，ある生物科学関係のスタッフは，分子生物学を，彼らのするためには，ブラウザに DOI URL を入力すると，元の出版研究にはほとんどあるいはまったく関係のない自己完結型の学社のウェブサイト上の文書に導かれるだろう．一方，本書に添問分野である，と見ていた．不幸なことに，多くの菌類学者が付の CD 版にある DOI ナンバーをもつ参考文献は，ライブハイこのような意見をもっていた．そこで，この教科書の 1 つのパーリンクであるので，ライブでインターネットに接続してい目的は，菌類学のあらゆる分野にとっての分子生物学の重要性

れば，マウスをちょっとクリックするだけで，元の出版社のについての，このなかなか消えない疑いを晴らすことである．

ウェブサイトにアクセスできるだろう．ほとんど常に，論文のそのために，分子レベルからの見方が，菌類についてのわれわ抜粋あるいは要約に自由にアクセスできるだろう．しかし，もれの理解をいかに向上させてくれるのかを，教科書の初めからし所属する研究機関が，当該出版社の出版物の購読契約を継続実例を挙げて説明しようと思う．

していれば，その論文のフルテキストをダウンロードすること政府が，当然のごとく健康管理に重要性を置くがゆえに，必ができるだろう．ダウンロードした文書を自身のハードディス然的に，資金提供機関は菌類学を含む他の学問分野を犠牲にしクに保存すれば，あなた自身のリプリント・コレクションを構て，生物医学的研究に財政支援を集中させるようになった．

築することができる．

20 世紀後半に，生物科学教育に対する財政支援が縮小され，われわれがこの教科書を執筆したことについては，さらに広支援が生物医学的研究に向けられたことは，大学がその生物科い理由がある．その理由とは，菌類学の教育には，ある種のや学関係学科を再建する方策に，強く影響を与えた．今日では，さしい，愛のある思いやりが必要だ，ということである．このそのような学科のあるものは，その活動のほとんどを，医学にようなやさしさや思いやりがすべて失われる危険にさらされておける教育・研究について認知されている必要を満たすために

緒言費やしている．すなわち，これらの学科は，おもに，医学的活の数には，地球上で最大の生物が含まれている．すなわち，ワ動を支えるか応援するために活動している．われわれの見解でタゲナラタケ（は，このような形の学科間の関係は，生物科学あるいは医学，gon 州の Malheur National Forest で，約 8.9 km もの面積をいずれの領域にとっても質の高い研究を生み出せない可能性が覆っていた（ 14.4 節参照）．菌類の中にはまた，地球上で最も高い．このような環境で，アカパンカビ（）早く移動するある種の生物が含まれる．というのは，ある菌類を用いた G. ビードル（George Beadle）と E. テータム（Edward種の胞子は，射出される時に，スペースシャトルの打ち上げ時Tatum）の研究，分裂酵母（）をに宇宙飛行士が経験するよりも，数千倍大きな加速力に曝され用 い た P. ナ ー ス（Paul Nurse） の 研 究， あ る い は 出 芽 酵 母るからである（ 9.8 節参照）．菌類は，さらに，生物量（bio-（mass）の再循環の大部分，特に植物遺体の分解に関わること） を 用 い た L. ハ ー ト ウ ェ ル（Lee）の 1 個体の菌糸体は，Ore2ビードルとテータによって，この惑星に基本的な生態学的サービスを提供していム，およびナースとハートウェルが，結局彼らをノーベル賞受る．腐生的な分解は，ほとんどの菌類の特徴的な生活様式であ賞者とした研究を始めた時に，彼らは，彼らの研究が医学につる．この菌類の活性がなくなると，われわれは，植物遺体のリながることをほとんどまったく気づいていなかった．われわれターの下に埋められてしまうだろう（第 10 章参照）．

Hartwell）の研究は，花開いただろうか？の見解では，生物科学と医学関係の部門は，緊密に協働しなけ

菌類が人間生存に果たしている貢献もまた，劣らずに重要でればならない．しかし，各々の分野は，お互いに独立し，さらある．次のようなもののない生活を，想像してもらいたい．すに多かれ少なかれ，各々は各々の専門領域のあるゆる面の発達

なわち，パン，アルコール，抗生物質，清涼飲料（クエン酸）・を促すべきである．もし，進化がわれわれに何かを教えてくれ

コーヒーあるいはチョコレート，チーズ［菌類凝固素（fungalるとすれば，それは，大きな遺伝子プールをもった個体群がもrennet）］・サラミあるいは醤油，移植を受けた患者の免疫反応つ強みについてである．人間生物学科には，多くのアカデミッを抑制し臓器拒絶反応を防ぐシクロスポリン（cyclosporine），クな多様性はない．

非常に多くの人々のコレステロール値を制御し，日々を元気に上述したことすべてから考えて，この教科書の底流にある目生かすスタチン（statins），さらに今日最も広範に用いられて的は，ヒトと経済にとっての菌類の幅広い重要性について強調いる農業用抗真菌剤のストロビルリン（strobilurins）などのすることである．現代のわれわれの存在は，時々刻々，菌類のない生活である．これらのない生活を想像してもらえば，われ活動に依存している．われわれがこの問題について執筆する決われが今日享受している生活よりも，はるかに満ち足りない生断をした時に，最も重視したポイントは，菌類はおそらく，こ活を思い浮かべることができるだろう．の惑星で最も重要な生物界を構成している生物を包含している

しかし，菌類は，常に善意に満ちているわけではない．われのにもかかわらず，これらの生物はしばしば，大多数の生物学

われの作物のすべてには菌類病が存在し，多くの場合，作物生者によって避けて通られるか，無視されているということであ産業は収穫高の 20〜50 ％の損失があると推定されている．さる．前の文章で，「重要な」という単語を用いたが，それは，らに，ヒトに対する菌類感染症は，単に足水虫だけの問題では分子系統学が，動物と菌類をともに進化の樹の根元に置いていない．すなわち，AIDS 患者の多くは，現在では菌類感染症でるからである．最初の真核生物は，現在その界に備わっている亡くなっている．また，慢性的免疫不全患者への菌類の日和見特徴から，「本質的に菌類的なもの」として認識されてきたと感染は，ますます重要性が増している臨床上の課題である．

いうことは，妥当なことである．それゆえ，ある意味，それら不幸なことに，菌類は，高等生物の中でこのように大きなグの原始的な「菌類」が，効果的に，いわゆる高等生物の生活様ループを構成しているのにもかかわらず，学校レベル以上の現式を創り出した，のである．菌類は，地球上で，生命にとって在の生物学の授業のほとんどは，植物についてほんの少し教え重要な生物であり続けている．なぜなら，動物は持続的に存在るだけで，動物についてのみ教えている．世界中の学校教育課するために植物に依存し，植物は菌類に依存している（陸上植程は，菌類生物学についてはほとんど完全に沈黙を守ってお物の 95 ％以上は，菌根が形成され根が十分に機能するためり，ほとんどの学校教育課程は，動物と植物を比較するというに，根に菌類が感染することが必要である．13.8 節参照）かビクトリア時代の固定観念を頑なに保ち続けている．しかし，らである．菌類の種数は，控えめに 150 万種と見積もられて菌類は，植物ではないし，植物とは非常に異なっている．それいるが，真の種数はこの数よりもずっと多いと考えられる．こゆえ，いかなる菌類についてであれ，植物生物学にいかに多く

vii

viii

緒

言の時間を割いても菌類を理解することはできない．同じよう

教 授；Clark 大 学 の Manfred Binder 博 士；Chicago 大 学 の C.に，菌類は，分子的関係では，動物とより密接な分類学的関係

Kevin Boyce 教 授；Montréal 大 学 の Jacques Brodeur 教 授；があるが，菌類は動物ではないし，菌類生物学がないことを動Western Australia 大 学 の Mark Brundrett 教 授；Reading の物学により時間をかけることで補うことはできない．さらに，

emapsite.com sales team の James Burn 氏；Chichester のわれわれが調べた限りでは，学校の科学教育課程（「生物学」

Sheila Fisher 氏に特化していると主張している課程でさえも）のいずれもが，www.forestryimages.org； Wisconsin 大 学 Platteville の Eliza-

地球上に生息するさまざまな種類の生物すべてについて十分な

beth Frieders 博士；Dundee 大学，FRSE の G. M. Gadd 教授：説明をしていなかった．このような結果，学校の生徒や大学のImperial College London，Medical School の Daniel Henk 博

学生のほとんど（そして，現在のほとんどの大学の学者は，同士；Clark 大学の David S. Hibbett 教授；日本の国立科学博物じシステムを通過してきているので，彼らも）は，菌類の生物館の保坂健太郎博士；Washington DC の国立自然史博物館の学について無知であり，それゆえ，彼ら自身が日々の生活で菌Carol Hotton 博士；Washington DC の国立自然史博物館 の F.

類に依存していることについても無知である．この事実は，無M. Hueber 博 士；Michigan 大 学 の Timothy Y. James 博 士；

知の自給サイクルであり，菌類を気にも留めない学術機関をもLandcare Research New Zealand の P. R. Johnston 博士；スミたらす．すべては，国立学校の教育課程における，菌類生物学

ソ ニ ア ン 協 会 の Tom Jorstad 氏；Pamela Kaminski 氏 http://の公平な扱いの欠如によってもたらされた．このことは，ヨーpkaminski.homestead.com；Bryce Kendrick 博 士 http://www.

ロッパ，南北アメリカ，およびオーストラレーシア，すなわちmycolog.com；

事実上ほとんどの英語圏を通じて，当てはまるように思う．

ARS Peoria の Cletus P. Kurtzman 博士；Agriculture and Agri‑と Jack Fisher 氏；Forestry Images http://の Geoffrey Kibby 氏；USDA/

われわれは，生物科学関係の学科は，過度の専門化を警戒す

Food Canada Ontario の Roselyne Labbé 博 士；Western On-る必要があると信じている．とりわけ，ほとんどの大学が，生tario 大 学 の Marc‑André Lachance 博 士；Göteborg 大 学 の物医学的活動に集中するという同一の戦略に従っているので，

Karl‑Henrik Larsson 教授；オーストラリア国立植物園の Heino

そのように信じている．われわれは，生物科学関係学科が警戒

Lepp 博士；Alabama 大学の Peter M. Letcher 教授；中国科学するようになることに，わずかの望みを抱いているのだけれど

院 北 京 の Xingzhong Liu 教 授；Lambert Spawn Co. の Markも…．われわれは，食糧安全保障に関する関心が高まるにつれ

Loftus 博 士；Maine 大 学 の Joyce E. Longcore 博 士；Tennes-て，英国が，現在核工学者が存在しないことを残念に思っていsee 大 学 の P. Brandon Matheny 博 士； ス イ ス の Audrius

るように，菌類学者や植物科学者がいないことを残念に思い，

Meškauskas 博 士；Wyoming 大 学 の Steven L. Miller 教 授；

食糧安全保障関係の生物科学のみを重視するようになることをと USDA Forest Service の Randy Molina 博士；Re-懸念している．ヨーロッパが，大学と研究機関の双方に眼の肥

gensburg の H. Peter Molitoris 教 授； 王 立 Ontario 博 物 館 とえた菌類学者を維持することは重要である．そして，われわれToronto 大学の Jean‑Marc Moncalvo 博士；Stockport の Eliza-

は，これらの人々を教育するために，この教科書を執筆したのbeth Moore 氏；NASAʼs Space Telescope Science Institute；だ．

Wisconsin 大 学 Madison 校 の Stephen F. Nelsen 博 士；Lund

われわれは，このガイドブックに建設的な意見を寄せてくれ

大学の Birgit Nordbring‑Hertz 教授；South Manchester 大学病たわれわれの学生諸君に心からの感謝を申し上げて，序言を閉院の Lily Novak Frazer 博士；Mintraching‑Sengkofen Germany

じたい．事実，ガイドブックは，学生諸君の意見によってここの Ingo Nuss 博 士；USDA/ARS Peoria の Kerry OʼDonnell 博

何年にもわたってブラッシュアップされてきた．また，このガ士；ART Zürich の Fritz Oehl 博士；Bergen 大学の Lise Øvreås

イドブックを作成する間，援助の手を差し延べ，理解を示して

博 士； ス ミ ソ ニ ア ン 協 会 の Mary Parrish 氏；Aarhus 大 学 のくれた家族にも感謝したい．最後に，出版に先立って情報を提Jens H. Petersen 博士；Edinburgh 大学 Institute of Cell Biolo-

供し，この本で用いたイラストレーションを提供して下さるた

gy の Nick D. Read 教 授；Bourgogne 大 学 INRA の Dirk Re-

めに時間と努力を費やして下さった多くの友人と研究者仲間

decker 教 授；Cranfield 大 学 の Karl Ritz 教 授； メ キ シ コ，に，次にお名前をあげて，感謝申し上げたい：Louisiana 州立

Autónoma de Tlaxcala 大 学 の Carmen Sánchez 博 士；Mont-大学の M. Catherine Aime 教授；Newcastle upon Tyne 大学のpellier 大学の Marc‑André Selosse 教授；Wake Forest 大学のG. W. Beakes 博士；Louisiana 州立大学の Meredith Blackwell

Sabrina Setaro 博 士；

編 集 幹 事，Philadelphia に あ緒る Saint Josephʼs 大学の Karen Snetselaar 博士；Malcolm Storey 氏，http://www.bioimages.org.uk；（株）テクノスルガ・
ラ ボ の 杉 山 純 多 教 授；American Type Culture Collection のSung‑Oui Suh 博士；Manchester の John L. Taylor 氏；Bergen
大学の Vigdis Torsvik 教授；Exeter 大学の John Webster 教授；
SUNY‑ESF New York の Alexander Weir 博士；Boise 州立大学の Merlin M. White 教授；Photography Illinois の Alex Wild 氏；
中国科学院北京の Ence Yang 氏．
David Moore ，Geoffrey D. Robson ，Anthony P. J. Trinci
文献
Wilson, D. (2008). Reconfiguring Biological Sciences in the Late Twentieth Century: A study of the University of Manchester. Manchester,
UK: Centre for the History of Science, Technology and Medicine.
ISBN‑10: 095589719X, ISBN‑13: 978‑0955897191.

言ix