自然教育園報告Ⓒ 2022

第 54 号：23 − 26,2022.

国立科学博物館附属自然教育園

自然教育園の毎木データベース
下田彰子１, ＊・梶並純一郎２・海老原淳３１

国立科学博物館附属自然教育園，２NPO 法人地域自然情報ネットワーク，３国立科学博物館植物研究部

Akiko Shimoda1, Junichiro Kajinami2, Atsushi Ebihara3: Every tree database of the Institute for
Nature Study. Miscellaneous Reports of the Institute for Nature Study (54): 23–26, 2022.
1

Institute for Nature Study, National Museum of Nature and Science, 2 The Geoecological Conservation Network, 3 Department ofBotany, National Museum of Nature and Science

はじめに報が作成された。なお，調査対象としたすべての樹木には，個体管理ができるよう，幹に番号ラベルを取付けら

自然教育園では，都市域の環境下における森林の変遷れている。

を知ることを目的として，1965 年以降毎木調査を継続している。1965 〜 2010 年の間で計 8 回の毎木調査が実施

データベースの内容され，萩原（2016）ではその結果を活用して自然教育園における樹木の推移が報告されている。この調査結果は，都市林としては類を見ないほどのデータ量である。

データベースを構成する主な情報は，以下に示す通り，今回，本データを Web 上に公開したので，概要を紹

樹木の種名，位置座標，胸高周囲等である。

介する。
・樹木番号

毎木調査の概要tree̲no・種和名

speciesj

・種学名speciese

・位置座標（緯度・経度）latitude/longitude
東京都港区の国立科学博物館附属自然教育園は面積約

単位：10 進経緯度，小数点以下８桁20ha の樹林で，1949 年に全域が国の天然記念物に指定

座標系：経緯度，測地系：日本測地系 2011

されている。1965 年以降，表 1 に示す通り，計 8 回の毎GCS̲JGD̲2011（EPSG：6668）

木調査が行われ，データ化されている。なお，開園した
1949 年にも毎木調査が実施されているが，現存するデータは集計結果の一部と主要木の分布図のみであり（萩原・生死※ 2020 年時点：生存〇，萌芽△，枯死×，生木伐採＋・胸高周囲・樹高2016），今回のデータ公開の対象外としている。

life̲deathgbr（単位：m）

height（単位：m）※ 2007 年，2010 年のみ

毎木調査は，園内に生育する胸高周囲 30cm 以上の樹木を対象に，種名，胸高周囲，樹高（2007・2010 年のみ）

また，データ件数は以下のとおりである。

が実施された。胸高周囲は 0.01 ｍ単位で，樹高は 0.1 ｍ

総データ件数（総個体数）：16,130 件単位で計測されている。また，位置については全域に 102020 年時点の生存個体数（萌芽は除く）：10,891 件

ｍ× 10 ｍのメッシュを作って四隅に杭を設置し，その杭から樹木までの距離と，樹木と杭の位置関係により情* E-mail: a-shimoda@kahaku.go.jp− 23 −

本データベースは，「国立科学博物館標本・資料統自然教育園報告第 54 号：23 − 26,2022.

表 1．1965 年以降に実施された自然教育園の毎木調査概要．

図 1．利用者用インターフェースの検索画面．

合データベース」（http://db.kahaku.go.jp/webmuseum/）ある。また，検索画面で検索条件を入力せずに検索を実中の一分類，「自然教育園行することで，全件ダウンロードも可能な仕組みになっ毎木」として公開した。本サイトは，国立科学博物館のホームページのほか，自然ている。

教育園ホームページ（http://www.ins.kahaku.go.jp/）内の「自然教育園の生物データベース」からアクセスできデータベース公開の意義と利用の可能性る仕組みになっている。上記項目のうち，種和名，種学
名，生死（2020 年），胸高周囲（2010 年），樹高（2010 年）

本データべースは，都市域に残存する孤立林である自の 5 項目から検索が可能であり，検索結果は一覧画面と詳細表示画面の 2 段階で表示される。

然教育園において，1965 年以降継続して実施されている検索でヒットしたデータは，ダウンロードボタンを押

毎木調査結果によるもので，正確な緯度経度を伴ってい下することによって，csv 形式でダウンロードが可能でることにより，GIS で利用可能なデータである。日本に− 24 −

下田ほか：自然教育園の毎木データベース

おける都市の孤立林に関しては，石田ほか（1998）によデータベースはほとんど存在しない。こういった背景かる緑化樹木の孤立二次林への侵入や，戸島ほか（2004）

ら，自然教育園でも毎木調査データをオープン化するこによる都市域の孤立林で進行する偏向遷移など，多くのとで，より多くの人に活用して頂ければと考え，今回公研究成果が報告されている。一方で，都市の孤立林にお開に至ったものである。

いて，60 年以上にわたり 5 〜 10 年単位で高頻度に蓄積

本データは，研究を目的とした学術的な利用だけではされ，高い精度の位置情報を持つ樹木データの事例はほなく，科学的な学習の観点からの利用も考えられる。樹

とんど存在しない。萩原（2016）では，自然教育園に生木の変遷は時間がかかるとともに，目の前で見ることが育する各樹木の個体数の推移や分布状況が整理され，樹できないため，その理解は難しいものとなっている。本木の変遷がよく分かる。この事例に見るように，本デー

データベースを活用し，樹木の変遷を可視化して教材とタは，今後，都市域の樹林の変遷を知る手がかりとしてすることで，自然への理解が進むことが期待できる。図非常に貴重である。

2 は 1965 年と 2007 年の全樹木のデータを可視化したも研究やサービスの発展等の利点があることなどから，ので，全域で樹木の数が増加していることがよくわか

国際的に科学データのオープン化が進んでいる。日本でる。また，図 3 は，シュロの変遷を可視化したものであも，科学情報はオープン化の重点分野であり，今後，こる。シュロは亜熱帯性の外来種で，近年，自然教育園でのオープン化の動きは急速に進むことが予想されている急増する樹木の一つである。シュロの増加要因について（大澤ほか，2014）。樹木データに関連するものでは，森は，冬季の気温上昇の可能性が示唆されており（萩原，林総合研究所による森林動態データベース（新山ほか，2013），シュロ増加の可視化は，ヒートアイランド等の2003）などいくつかのデータベースが存在する。ただし，人間活動の影響と自然を考える素材となり得る。樹木のその多くは天然林のデータであり，都市の孤立林の樹木変遷を可視化したこれらの教材は，「自然教育園で学ぶ

図 2．毎木調査データの可視化事例．

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引用文献

自然のメカニズム」（https://shizen-mechanism.kahaku.
go.jp/）のコンテンツとして，自然教育園のホームページからアクセスできる。本データベースの公開により，萩原信介．2013，シュロの異常繁殖：自然林でなぜシュ学習の観点からもより活用が図られることを期待していロが増えたのか，濱尾章二・松浦啓一（編）大都会にる。

息づく照葉樹の森，東海大学出版会，p42-43．
萩 原 信 介．2016， 自 然 教 育 園 に お け る 過 去 60 年 間 の樹木の推移，国立科学博物館附属自然教育園（編），謝

辞863pp．
石田弘明・服部保・山戸美智子．1998，都市林の生態学

本データ公開の一部は，JSPS 科研費 JP18H00761 の助成的研究Ⅱ．三田市フラワータウンにおける緑化樹木のを受け実施した。

孤立二次林への侵入，人と自然 ,（9）：p.27-32．
新山

馨・武生雅明・河原崎里子．2003，森林動態デー

タベースの開発，第 40 回情報科学技術研究集会予稿集，p103-106．
大澤剛士・神保宇嗣・岩崎亘典．2014，「オープンデー
タ」という考え方と，生物多様性分野への適用に向けた課題，日本生態学会誌 ,（64）：p.153-162．
戸島久和・小池文人・酒井暁子・藤原一繪．2004，都市域孤立林における偏向遷移，日本生態学会誌，（54）：p133-141．

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