検査案内
2023 ～ 2024

個人情報保護方針
当社は，事業活動を通じて取得する個人情報等の保護に対する社会的要請を十分に認識し，以下の基本的な個人情報保護方針（以下「本保護方針」といいます。）を定め，全従業者に個人情報保護に関わる安全管理措置を周知徹底することをもって個人情報の保護に努めてまいります。なお，本保護方針において「個人情報」とは，個人情報の保護に関する法律（以下「個人情報保護法」といいます。）第2条に規定する個人情報をいいます。
1. 事業者の名称
株式会社 Cancer Precision Medicine
2. 個人情報の取得および利用（1）当社は，当社が実施する各種解析サービス又は解析業務等達成のために必要な範囲において，適正かつ適法な手段により個人情報を取得し，利用いたします。目的外の利用はいたしません。
（2）当社は，個人情報保護法その他の法令に定める場合を除き，あらかじめご本人の同意を得ないで，要配慮個人情報を取得いたしません。
3. 個人情報の第三者への提供
当社は，個人情報保護法その他の法令に定める場合を除き，あらかじめご本人の同意を得ることなく，個人情報を第三者へ提供はいたしません。
4. 業務委託等に伴う個人情報の提供
当社は，業務の一部を外部に委託する場合，当該事業者を適切に選定し，委託契約において，安全管理措置，秘密保持，再委託の条件その他の個人情報の適正な取り扱いに必要な事項を定め，適切に監督いたします。
5. 関係法令・ガイドライン等の遵守
当社は，個人情報の取扱いに関する法令，国が定める指針その他の規範を遵守します。
6. 安全管理措置に関する事項
当社は，個人情報の漏洩等を防止するための体制の構築・維持，役職員に対する教育・啓発活動その他の情報セキュリティ
施策を講じ，個人情報の安全管理に努めます。
7. 継続的改善について
当社は，個人情報保護体制を継続的に維持・向上させるため，個人情報を保護するための管理体制を継続的に見直し，改善を図ります。

8. 開示請求等の手続
当社は，法令等で定める個人情報に関する利用目的の通知，開示，訂正又は利用停止等のご請求があった場合には，誠実な対応に努めます。
9. お問合せ窓口
当社における個人情報の取扱いに関するご質問やご苦情，および前項の個人情報に関するご請求に関しては下記の窓口にて承ります。
株式会社 Cancer Precision Medicine
担当部署：業務マネジメントグループ
電話番号：044-201-8092
なお，本個人情報保護方針の詳細につきましては，当社ホームページに「個人情報の管理について（プライバシーポ
リシー）」として記載しております。
［URL］https://www.cancerprecision.co.jp/assets/pdf/cpm_privacypolicy.pdf

1

目

次

検査ご利用の手引き 
略称一覧 
掲載内容・検査項目欄の見方 
免疫治療

3
9
10

関連検査

分子標的治療薬選択

関連検査

治療効果・再発のモニタリング

関連検査

研究検査

ネオアンチゲン解析 
がん遺伝子発現解析 

1115

がん遺伝子変異解析 
リキッドバイオプシー（パネル解析）

19
21

リキッドバイオプシー（デジタル PCR・cfDNA 定量）免疫反応解析（IFN-γ ELISPOT 解析）23
25

免疫反応解析（MHC テトラマー解析）
免疫反応解析（TCR/BCR レパトア解析）

27
28

検体採取方法・検体の取扱い 31

検査概要および検査結果の見方
はじめに―がんの種類に合わせた治療から，遺伝子異常のタイプに合わせた治療へ― 

43

検査項目一覧

44

コラム：リキッドバイオプシー

免疫治療―血液によるがん検査―

58

がん遺伝子発現解析 

分子標的治療薬選択

62

関連検査 

62

がん遺伝子変異解析 Oncomine Pan-Cancer パネル解析
リキッドバイオプシー

68

臨床試験情報レポート

治療効果・再発のモニタリング



関連検査 

デジタル PCR 

76
77
77
80

cfDNA 定量検査 
IFN- γ ELISPOT 解析

46
48
48

関連検査 

ネオアンチゲン解析



85



MHC テトラマー解析 

89
89

TCR/BCR レパトア解析 

91

研究検査 

検査方法の概略 95

検体容器の取扱い方法 

97

研究グレードペプチド
参考文献一覧 

合成サービスについて 

99
101

2

検査ご利用の手引き
検査ご利用の手引き

1.

ご契約

検査受託のお申込みの際は，CPMクリニカルラボまでご連絡ください。
当社担当者より，検査委受託のご契約についてご案内いたします。契約締結後，検査受託を開始いたします。
（ご連絡の際は，8ページ「12. 検査に関するお問い合わせ」をご覧ください。）

2.

検査のご依頼方法

2-1.

事前準備

11ページからの各検査項目のページをご確認いただき，各検査における検体の採取方法，必要な資材，設備等をご確認，ご準備ください。
2-2.

検査のご依頼● 検査依頼書の準備
所定の検査依頼書に，依頼内容をご記入ください。（検査依頼書の記入方法については，7ページ「9. 検査依頼書の記入方法」をご参照ください。
）● 検体の準備
各検査項目指定の方法に従って，検体を採取してください。検体容器には，所定の検体ラベルに必要事項をご記入のうえ貼付してください。
（検体ラベルについては，5ページ「5. 検体ラベルについて」をご参照ください。）

3

検査ご利用の手引き● 集荷のご依頼（集荷依頼書の準備，集荷依頼のご連絡）
集荷ご希望日の前営業日の正午までに，所定の検査依頼書および集荷依頼書（下記「記入例」参照）をメール添付のうえ，下記送付先までご連絡ください。担当者より，依頼受付のご連絡をいたします。
（月曜日集荷のご連絡は，
前週金曜日の17時までお受けいたします。土・日・祝日は集荷および検査のご依頼はお受けしておりません。
）
support@cancerprecision.co.jp

集荷依頼書送付先

CPMクリニカルラボ

受付担当宛

集荷依頼書（「検体受領・搬送日誌及び検体受付・仕分作業日誌」） 記入例：
施設担当者

CPM受付担当者

精度管理責任者

管理者

/

/

/

/

㊞

検体受領・搬送日誌及び検体受付・仕分作業日誌

2023/8/16///

受領・搬送（太枠内を施設にてご記入ください）

施設コード（もしくは施設名）

枚数

総数

5

10

細胞

組織

FFPE

保存別検体数
血漿

その他

全血

10

室温

冷蔵

冷凍

超冷凍

搬送箱内温度確認

搬送箱数

室温
冷蔵
冷凍・超冷凍太枠内のご記入をお願いいたします。

確認時刻

9℃～30℃

2℃～8℃

依頼書5枚：：

CPM到着時

：

全血

/

搬入日時

/

℃

℃

℃

℃

,

：

℃
℃

冷蔵
冷凍

搬送手段

検体に関して特に附記する事項

ご連絡事項がある場合に、ご利用ください

□その他（
個

）

/

/

,

事故記録及び処理記録事項

NA

/

/

,

：

PA

/

/

,

：

TB

/

/

,

：

EL

/

/

,

：

TE

/

/

,

：

作業終了時刻

記入する

□飛行機

搬出日時

仕分
仕分先受領日時

検査項目 検体数個

項目

輸送担当者は、集荷時に検体ラベルと検体数を確認後、★の箇所を記入する（詳細はマニュアル参考のこと）－15℃～－85℃

各2本（室温保存）

検査*依頼書と検体が一致していれば✓を：室温□自動車 □鉄道【例】下記の依頼内容の場合、記入は赤字の通りとなります
℃
℃
℃
個

中間地点

照合
結果*

10

10

種類別検体総数

/

受付

検体数

依頼書

受領時刻★

ABCクリニック

出発時★

輸送担当者

：

□（CPM記入）搬送箱内に検体が残っていないことを確認した。

申し送り事項・その他備考

担当者

検査項目：NA：ネオアンチゲン／がん遺伝子変異解析 PA：LB(パネル解析） TB：TCR/BCR EL：ELISPOTTE：MHCテトラマー● キャンセルについてご依頼いただいた検体集荷日の前日18時以降（当日含む）および検体集荷後のキャンセルの場合は，所定のキャン
セル料をいただきます。

2-3.

集荷

ご指定の日時に，集荷員が専用輸送ボックスを持参して伺いますので，検体，検査依頼書および集荷依頼書をお渡しください。
（検体は，原則として院内検査室でまとめてご提出ください。）
なお，検査依頼書は1部をコピーのうえ，原本を集荷員にお渡しください。コピー 1部は医療機関にて保管をお願いい
たします。
2-4.

搬送

お預かりした検体は，CPMクリニカルラボに搬送いたします。
検体受領場所：［

検体平均搬送時間：
［約

］
時間］

4

検査ご利用の手引き

3.

特定感染症患者の検体受託について当社の受託体制および「感染症の予防及び感染症の患者に対する医療に関する法律」等（その後の改正を含む）により，下記に該当する感染症確定者，疑似症状者，無症状病原体保有者の検体については，受託することが出来ませんので，予めご了承ください。
[特定感染症]・1類感染症
エボラ出血熱，クリミア・コンゴ出血熱，痘そう，南米出血熱およびラッサ熱のウイルス性出血熱，ペスト，マー
ルブルグ病
・重症急性呼吸器症候群（SARS）

4.

検体容器について検体容器については，97ページ「検体容器の取扱い方法」をご参照ください。

5.

検体ラベルについて

検体ラベルには，「施設コード」「患者ID」「材料」および「輸送温度帯」等必要事項を

例記入し，提出容器に貼付してください。

6.

検体の保管期間および返却

検査終了後の残余検体は，検査結果の納品より30日間保管いたします。保管期間を過ぎた検体につきましては，当社で適正に廃棄させていただきます。検体の返却が必要な場合は，事前にご相談ください（検査費用とは別途費用が発生いたします）。ただし，「残余検体」とは，臨床検査を終了した既存試料のことをいいます。検体から抽出された核酸等，検査により得られた中間産物については，この限りではなく，当社で適正に廃棄させていただきます。

7.

再検査について再検査が必要と判断される場合には，当社の再検査基準に基づいて再検査を実施いたします。なお，ご提出いただい
た検体量が検査必要量に満たない場合は，再検査が実施できないことがありますのでご了承ください。

5

免責について検査ご利用の手引き

8.

ご依頼いただいた検査は，当社の検査実施基準に基づいて実施いたしますが，お預かりした検体の状態や，検査方法の技術的限界等により，適切な検査結果をご提供することが困難な場合があります。その場合は，当社はその検査結果に対し免責とさせていただきます。
当社は科学的専門性に基づき得られた検査結果を提供しております。一方，検査結果は直ちに診断もしくは治療目的等に利用できるものではなく，本検査の結果に基づき行う診断等は医師の責任のもとに行われるものであることにご留意ください。

6

検査ご利用の手引き

9.

検査依頼書の記入方法

色の付いている欄

内をご記入ください。

・「患者ID」欄には，患者IDのみをご記入ください。氏名を記入しないようご注意ください。
記入例（ネオアンチゲン解析）
検体送付担当者様へ

検査依頼書
施設名

科名

担当医

コピー1部を貴施設にて保管して くださ い。
施設コード

ABCクリニック

○○

患者ID

CL123

検査依頼日

○○科
○○

※個人名は記載しないようお願いいたします

123456

性別

2023年
連絡先

CPM管理No.

本依頼書を1部コピーの上，原本 を集荷 担当者 にお渡 しくだ さい。

1月

生年月日（西暦）

男

23日

・

女

1956年

検体採取日

03-123-456

12月

3日

時刻

1月

2023年

22日

11時

00分

【遵守事項のご確認】□ 英語での検査結果報告を希望する検査の実施に際し，関連するガイドラ イン， 指針等 の主旨 を尊重 し，被検者様のインフォームド・コンセン トが得 られた ことを 確認さ れた※英語での検査結果報告を希望される場合は，各欄を英語でご記入ください。

担当医師のご署名をお願いいたします 。

2023

1

年

月

22 日

〇〇 〇〇

担当医師名（自筆）〔依頼内容〕
がん種

採取部位

大腸がん

病期

原発巣

検体返却

Ⅲ

要 ・ 不要□ ネオアンチゲン解析（1100）

腫✓腫瘍組織（ □✓核酸安定化試薬・冷蔵□□ 核酸安定化試薬除去後，冷凍□ 超冷凍）□ 腫瘍細胞（ □ 核酸安定化試薬・冷蔵□ 核酸安定化試薬除去後，冷凍□ 超冷凍）

瘍□ FFPEスライド（冷蔵）検

腫瘍部の確認方法

体

FFPE検体の場合

検□ RNAシーケンスを実施する（1135）

解析方法□ RNAシーケンスを実施せず，がんの発現データベースを使用する□ 核酸安定化試薬除去後，冷凍□ 超冷凍） （採取部位：□ 核酸安定化試薬除去後，冷凍□ 超冷凍）

細胞数

1

本・枚

cells/本

解析済みの対照データをご利用の場合，該当の検査番号（1101、FFPE1102）

ネオアンチゲン解析
追加データ解析□ 挿入・欠失変異（1133）✓□ 遺伝子変異解析（1110）✓□ 血液（ □冷蔵

□ HLAクラスⅡ拘束性（1134）✓□ 遺伝子発現解析（1120）

解析済みのデータをご利用の場合，該当の検査番号□ ネオアンチゲン解析［血液］（1138）□ ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-cancerパネル解析）（1137）
検体数（血液）□室温）□ 血漿・バフィーコート（超冷凍）解析済みのデータをご利用の場合，該当の検査番号

グレー部分は検査No.
検体受領日（8桁）

CPM記入欄

NA
担当者

ー
検体No.

対照C

本

□ HLAクラスⅡ拘束性（1134）

冷蔵：2℃～8℃

腫瘍T

本□ 遺伝子変異解析（1110）

追加データ解析No.

検体数（バフィーコート）※ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-cancerパネル解析）の場合は記載してください。

□ 挿入・欠失変異（1133）

ネオアンチゲン解析

項目

検体数（血漿）本

HLA型（HLA-AおよびB）

7

）

検体数

□ 正常細胞（ □ 核酸安定化試薬・冷蔵

体

cells/本□ すべて使用する（腫瘍部30%以上）✓血液（超冷凍）
□

照

細胞数

2
本・枚

□ HE染色スライドおよび腫瘍部マーキング画像□ 正常組織（ □ 核酸安定化試薬・冷蔵

対

検体数

施設コード

保管場所
冷蔵庫・超低温フリーザー
冷蔵庫・超低温フリーザー

/

/

,

連絡事項

冷凍：-25℃～-15℃

超冷凍：-85℃～-70℃

室温：9℃～30℃

検査結果のご報告

検査ご利用の手引き

10.

検査結果は，検査委託契約書内の記載内容に準じて，所定の様式にてご報告いたします。

11.

料金の請求とお支払い方法

ご契約に従ってご請求申し上げます（原則として1 ヶ月分をまとめてご請求申し上げます）。請求書記載の支払期日までに，指定の銀行口座に請求金額を振込にてお支払いください。

12.

検査に関するお問い合わせ

検査に関するご質問等につきましては，当社CPMクリニカルラボまでお問い合わせください。
お問い合わせ先  CPMクリニカルラボ

検査受付担当

電話番号：044-201-8092
Email（各種お問い合わせ）：support@cancerprecision.co.jp

お問い合わせ対応時間：平日 9：00 ～ 18：00（土・日・祝日を除く）

13.

倫理指針について

当社では，「医療における遺伝学的検査・診断に関するガイドライン」（日本医学会）および「人を対象とする生命科学・医学系研究に関する倫理指針」（文部科学省・厚生労働省・経済産業省）等のガイドラインおよび指針を遵守し，検査を受託しています。

8

略称一覧
略称一覧
9

略称

正式名称

BCR

B 細胞受容体（B cell receptor）

cfDNA

セルフリー DNA（Cell free DNA）

cfRNA

セルフリー RNA（Cell free RNA）

CT

コンピューター断層撮影（Computed Tomography）

CTL

細胞傷害性 T 細胞（Cytotoxic T lymphocyte）

DNA

デオキシリボ核酸（Deoxyribonucleic acid）

DPBS

ダルベッコリン酸緩衝生理食塩水（Dulbecco's phosphate buffered saline）

FFPE

ホルマリン固定パラフィン包埋（Formalin fixed paraffin embedded）

HE

ヘマトキシリン・エオシン（Hematoxyrin Eosin）

HLA

ヒト白血球型抗原（Human leukocyte antigen）

IFN-γ

インターフェロン - ガンマ（Interferon-γ）

Indel

挿入・欠失変異（insertion/deletion）

MHC

主要組織適合遺伝子複合体（Major histocompatibility complex）

mRNA

メッセンジャー RNA（messenger RNA）

MRI

磁気共鳴画像（Magnetic Resonance Imaging）

NGS

次世代シーケンス（Next generation sequencing）

PBMC

末梢血単核球（Peripheral blood mononuclear cells）

PCR

ポリメラーゼ連鎖反応（Polymerase chain reaction）

RNA

リボ核酸（Ribonucleic acid）

SNV

一塩基変異（Single nucleotide variant）

TCR

T 細胞受容体（T cell receptor）

掲載内容・検査項目欄の見方「検査材料名（必要量）」を必ずご確認のうえ，必要な検体を採取してください。
必要量は，原則として再検査に応じられるように設定してあります（一部除く）。検体量が必要量を満たさず検査が実施できない場合は，その旨ご連絡いたします。
● 検体容器
検体容器の取扱いについては，下記の例をご参照ください。取扱い方法に条件がある項目もありますので，備考欄
もしくは97ページ「検体容器の取扱い方法」もご参照ください。

掲載内容・検査項目欄の見方● 検査材料および必要量（例）検体がPBMCの場合
検査材料名

検体

（必要量）

容器
BT7

PBMC

遠心分離

検体容器BT7に血液を採取し，遠心分離後，PBMC 1×106 cellsを別容器CT2に移し替えてご提出ください。

↓（1 × 106 cells）

CT2● 保存方法および安定性
検体採取後は，指定の「保存方法」に従って保存し，ご提出ください。
冷蔵：2℃～ 8℃

冷凍：-25℃～ -15℃

超冷凍：-85℃～ -70℃

室温：9℃～ 30℃

その他，指定の保存温度「安定性」は，指定の保存方法に従った場合の検体の保存可能期間の目安です。
● 所要期間原則として，当社に検体を搬入した翌日を起算日とし，結果報告するまでの期間です。
再検査の場合や土・日・祝日の前後，記載されている材料以外でのご依頼の場合は，さらに日数を要する場合があります。
● 欄外および検体採取方法・検体の取扱い
検体を適正に採取するために，検体採取時に留意していただきたい事項です。欄外および「検体の採取・取扱い方法」
をご参照ください。記載の方法と異なる方法で採取した場合は，正確な結果が得られない可能性があります。
● 主な単位
mL

milliliter (=0.001 L)

μL

microliter (=10-6 L)mgmilligram (=0.001 g)

ng

nanogram (=10-9 g)

10

免疫治療

関連検査

免疫治療 関連検査

ネオアンチゲン解析●腫瘍組織（新鮮組織・FFPE），細胞を用いた検査「腫瘍検体」および「対照検体（正常検体）」（それぞれ1検体）をセットでご提出ください。
例）「腫瘍検体」の腫瘍組織＋「対照検体」の血液
検査項目名

項目

検査材料名，必要量

検体

保存方法

所要

コード

（採取方法掲載ページ）

容器

（安定性）

期間

実施料

検査方法

検査結果

腫瘍組織
3 mm 角 4個

以下のいずれかもしくは30 mg 片・核酸安定化試薬を

RL2（P. 31）

CT2

腫瘍検体

2個程度※2※1

添加し，冷蔵（1ヶ月）
もしくは冷凍（1年）
・液体窒素で凍結の腫瘍細胞※3

うえ，超冷凍（1年）

2×106 cells 以上

・遺伝子変異数を2本（P. 33）

・アミノ酸置換遺伝子

未染色 FFPE
スライド※４，※5

1100

必要量は※6
ネオアンチゲン
解析

対照なし

採血

2 mL

FFPE

↓
CT2

対照検体（正常検体）（P. 36）

・ネオアンチゲン
1ヶ月 未収載 NGS 法

BT2

血液

・HLA 型（薄切後6週間）（P. 34）

1101

1135

―

変異数

冷蔵

超冷凍（1年）

HLA クラスⅠ
アミノ酸置換を伴う
以下のいずれか2×106 cells 以上
正常組織
3 mm 角 4個
もしくは30 mg片
2個程度※2●検査対象（HLA-A および B），

正常細胞（PBMC 等）を2本（P. 33）

ペプチドリスト

SNV・核酸安定化試薬を

RL2
CT2

添加し，冷蔵（1ヶ月）
もしくは冷凍（1年）
・液体窒素で凍結のうえ，超冷凍（1年）（P. 31）
冷蔵：2℃～8℃

冷凍：-25℃～ -15℃

超冷凍：-85℃～ -70℃

※1：検体中の腫瘍細胞の割合が30% 以上であるものをご提出ください。腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝
子変異を検出できない場合があります。
（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」）※2：検体容器1本あたり，組織片1個を保存してください。
※3：腹水・胸水細胞を使用する場合は，14ページ「腹水・胸水からの検査について」をご参照ください。
※4：FFPE 検体からのネオアンチゲン解析方法については，13ページ「FFPE 検体からのネオアンチゲン解析について」をご参照ください。
※5：腫瘍部位の確認のため，HE 染色標本および原則病理医が腫瘍部位をマーキングした画像（もしくは標本）を合わせてご提出ください。ご提出が難しい場合は，組織全体に占める腫瘍部位の割合が30% 以上であるものをご提出ください。腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝子変異を検出できない場合があります。

マーキング画像のご提出，腫瘍部位の割合の確認のいずれも難しい場合は，事前にご相談ください。
（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」）※6：腫瘍部のサイズによる。目安は，切片厚10 µm，腫瘍部1.5 cm ×1.5 cm の場合，スライド10枚以上。

スライドの作製が難しい場合は，事前にご相談ください。

11●血液を用いた検査（リキッドバイオプシー）
項目 検査材料名，必要量
コード （採取方法掲載ページ）
血漿5 mL ×3本，
およびバフィーコート
採取した全量（P. 37）

ネオアンチゲン
解析

検体容器

保存方法

所要

（安定性）

期間

実施料

検査方法

BT7

・遺伝子変異数

遠心分離・アミノ酸置換遺伝子

超冷凍
↓
血漿・
（1年）
バフィーコート：CT5

変異数
・HLA 型・ネオアンチゲン

1138

6週間 未収載 NGS 法

［血液］
血液
RT11

（P. 39）ペプチドリスト●検査対象

冷蔵もしくは室温

30 mL 以上

検査結果

免疫治療 関連検査

検査項目名

HLA クラスⅠ拘束性

推奨：18℃～25℃（HLA-A および B），（5日）

アミノ酸置換を伴う
SNV

血漿5 mL ×2本，
およびバフィーコート
採取した全量ネオアンチゲン（P. 37）

解析（Oncomine
Pan-Cancer
パネル解析）

1137

BT7

・cfDNA 抽出結果

遠心分離

・遺伝子変異検出頻度

超冷凍
↓
血漿・
（1年）
バフィーコート：CT5・適応薬剤候補
・ネオアンチゲン
1ヶ月 未収載

血液20 mL 以上
（P. 39）HLA-A および -B のRT11

HLA 型の情報※をターゲット
シーケンス法超冷凍：-85℃～ -70℃

●検査対象

冷蔵もしくは室温

HLA クラスⅠ拘束性

推奨：18℃～25℃（HLA-A および B），（5日）

アミノ酸置換を伴う
SNV

ご提供ください。
冷蔵：2℃～8℃

ペプチドリスト

室温：9℃～30℃※4桁表記（「A2402」等）

BT2, BT7

CT2・CT5

RL2

RT11

真空採血管
EDTA-2Na 入
BT2：2 mL ⽤
BT7：7 mL ⽤

滅菌クライオチューブ
CT2：2 mL ⽤
CT5：5 mL ⽤

核酸安定化
試薬入り
マイクロチューブ

リキッドバイオプシー
専用採血管（PAXgene）

CT2 CT5

検体容器には，所定の検体ラベルを貼付してください。（3ページ「ご利用の手引き」参照）

12

●追加データ解析

免疫治療 関連検査

検査項目名

項目

所要

コード

期間

実施料

検査方法

検査結果
・遺伝子変異数
・挿入・欠失遺伝子変異数

ネオアンチゲン解析（追加データ解析

挿入・欠失変異）挿入・欠失変異に由来するネオアンチゲンを予・HLA 型1133

2週間 未収載 データ解析 ・ネオアンチゲンペプチドリスト
●検査対象

測します。

HLA クラスⅠ（HLA-A および B）拘束性，
挿入・欠失変異（Indel）
・遺伝子変異数・アミノ酸置換遺伝子変異数

ネオアンチゲン解析（追加データ解析

HLA クラス II 拘束性）

H
 LAクラスⅡ（HLA-DR）拘束性のネオアンチゲンを・HLA 型1134

2週間 未収載 データ解析 ・ネオアンチゲンペプチドリスト●検査対象：

予測します。

HLA クラスⅡ（HLA-DR）拘束性，
アミノ酸置換を伴う SNV

ネオアンチゲン解析（追加データ解析

遺伝子変異解析）

全遺伝子変異の情報を解析し、適応薬剤等を探・遺伝子変異リスト
1110

1週間 未収載 データ解析 ・DNA ミスマッチ修復遺伝子変異
・適応薬剤候補

索します。
ネオアンチゲン解析（追加データ解析・オンコアンチゲンの遺伝子発現量

遺伝子発現解析）ネオアンチゲン解析の検査結果を利用し，オンコアンチゲンや免疫関連分子の遺伝子発現量を解析します。

1120

1週間 未収載 データ解析

・免疫関連分子の遺伝子発現量（解析対象の遺伝子は，17ページ「がん遺伝子
発現解析 解析対象遺伝子」をご参照ください。
）※「ネオアンチゲン解析［血液］」の場合は実施不可

上記「追加データ解析」は，検査データ保管期間内（ネオアンチゲン解析の検査結果の納品より２年間）の場合に実施可能です。

FFPE 検体からのネオアンチゲン解析について（項目コード：1135）
FFPE 検体を使用する場合は，FFPE 専用試薬を使用した RNA シーケンス解析を実施し，遺伝子の発現レベルを解析します。ただし，FFPE 検体から抽出した RNA の品質が検査実施基準を満たさない場合は，RNA シーケンス解析を実施せず，がんの遺伝子発現データベースのデータを用いて解析します。RNA の品質が検査実施基準を満たさない場合は，ご連絡いたします。
（詳細は，次ページの「検体の品質確認について」および50ページ「FFPE 検体を用いた検査について」をご参照ください。
）

ペプチドの販売について
当社では，研究グレードの合成ペプチド（ネオアンチゲンペプチド，オンコアンチゲンペプチド）を販売しております。詳細は，99ページ「研究グレードペプチド 合成サービスについて」をご覧ください。

13

検体の品質確認についてする場合はご連絡いたします（ご依頼時のご連絡先に，メールにてご連絡いたします）。各検査材料における抽出核
酸の品質基準は，下表の通りです。
・DNA もしくは cfDNA の品質が検査実施基準を満たさず，検査が継続できない場合（品質確認までの費用が発生いたします。
）
・RNA の品質が検査実施基準を満たさず，腫瘍検体からの RNA シーケンス解析が実施できない場合

免疫治療 関連検査

検体から核酸（DNA，RNA，cfDNA）を抽出後，抽出した核酸の品質確認を行います。品質確認の結果，以下に該当（DNA を用いた全エクソーム解析データのみで検査継続可）・検査を継続できるが，いずれかの核酸が品質基準を満たさず，データの信頼性が低下するリスク，および以降の工程で継続不可となる可能性がある場合〔品質基準〕
腫瘍検体における

品質基準

検査材料

DNA：収量200 ng 以上，
新鮮組織・細胞検査不可基準
DNA：収量200 ng 未満，
もしくはメインピーク300 bp 未満

および DIN 6.0以上
RNA：収量200 ng 以上，RNA：収量100 ng 未満，
もしくは DV200 30％未満

および RIN 6.0以上
DNA：収量500 ng 以上，および DIN 3.0 以上もしくは
FFPE

メインピーク1000 bp 以上
RNA：収量20 ng 以上，DNA：収量200 ng 未満，
もしくはメインピーク300 bp 未満
RNA：収量20 ng 未満，
もしくは DV200 30％未満

および DV200 70% 以上

血液●ネオアンチゲン解析［血液］●ネオアンチゲン解析［血液］

cfDNA：収量100 ng 以上

cfDNA：収量100 ng 未満●ネオアンチゲン解析●ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）

cfDNA：収量20 ng 以上，

cfDNA：収量8ng 未満，
もしくはゲノム DNA の混入5％以上

およびゲノム DNA の混入5％未満
ゲノム DNA：収量40 ng 以上，

ゲノム DNA：収量40 ng 未満，

および DIN 6.0以上

および DIN 6.0未満

DIN（DNA Integrity Number）／ RIN（RNA Integrity Number）：核酸の分解度を示す評価する指標。1～10の値で示します。
（1= 完全に分解された状態，10= ほとんど分解していない状態）
DV200：核酸の分解度を示す評価する指標。200ヌクレオチド以上の RNA 断片の割合を示します。

同一患者での再検査について
一度検査を実施した患者について，異なる腫瘍検体で再検査を実施する場合は，検査データ保管期間内（検査結果の納品より2年間）に再検査を依頼された場合は初回検査の対照検体の検査結果を使用できます。対照検体を再度ご提出いただく必要はありません（項目コード：ネオアンチゲン解析1101，ネオアンチゲン解析［血液］1138）。

腹水・胸水からの検査について腫 瘍検体として腹水・胸水中の細胞を用いる場合は，回収した細胞を「腫瘍細胞」としてご提出ください（回収方法の指定は特にありません）。回収した細胞中に腫瘍細胞が30% 以上含まれるよう，顕微鏡下で腫瘍細胞の含有率を確認後に遠心するか，フローサイトメトリー等により腫瘍細胞を回収してください。腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝子変異を検出できない場合があります。
（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」）

14がん遺伝子発現解析
免疫治療 関連検査

以下のいずれかをご提出ください。

検査項目名

項目

検査材料名，必要量

検体

保存方法

所要

コード

（採取方法掲載ページ）

容器

（安定性）

期間

もしくは30 mg 片
※2

2個程度

FFPE
1155

腫瘍検体

発現解析

※1

RL2

添加し，冷蔵（1ヶ月）

CT2

もしくは冷凍（1年）

・オンコアンチゲンの遺伝子発現量・液体窒素で凍結の（P. 31）

・免疫関連分子のうえ，超冷凍（1年）

腫瘍細胞※3

遺伝子発現量1ヶ月

2×106 cells 以上

未収載

NGS 法

未染色 FFPE（解析対象の遺伝子は，17ページ「がん遺伝子を2本（P. 33）

スライド

検査結果

・核酸安定化試薬を3 mm 角 4個

がん遺伝子

検査方法

以下のいずれか

腫瘍組織

1150

実施料

―

冷蔵
（薄切後6週間）※4発現解析 解 析 対 象遺伝子」をご参照ください。
）

必要量は※5（P. 34）
冷蔵：2℃～8℃

冷凍：-25℃～ -15℃

超冷凍：-85℃～ -70℃

※1：検体中の腫瘍細胞の割合が30% 以上であるものをご提出ください。腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝
子変異を検出できない場合があります。
（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」）※2：検体容器1本あたり，組織片1個を保存してください。
※3：腹水・胸水細胞を使用する場合は，次ページ「腹水・胸水からの検査について」をご参照ください。
※4：腫瘍部位の確認のため，HE 染色標本および原則病理医が腫瘍部位をマーキングした画像（もしくは標本）を合わせてご提出ください。ご提出が難しい場合は，組織全体に占める腫瘍部位の割合が30% 以上であるものをご提出ください。腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝子変異を検出できない場合があります。

マーキング画像のご提出，腫瘍部位の割合の確認のいずれも難しい場合は，事前にご相談ください。
（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」）※5：腫瘍部のサイズによる。目安は，切片厚10 µm，腫瘍部1.5 cm ×1.5 cm の場合，スライド10枚以上。

スライドの作製が難しい場合は，事前にご相談ください。

CT2

RL2

滅菌クライオチューブ
2 mL ⽤

核酸安定化
試薬入り
マイクロチューブ

検体容器には，所定の検体ラベルを貼付してください。（3ページ「ご利用の手引き」参照）

15

検体の品質確認について

絡いたします（ご依頼時のご連絡先に，メールにてご連絡いたします）。各検査材料における抽出核酸の品質基準は，下表の通りです。
・RNA の品質が検査実施基準を満たさず，検査が継続できない場合（品質確認までの費用が発生いたします。）
・検査を継続できるが，RNA が品質基準を満たさず，データの信頼性が低下するリスク，および以降の工程で継続

免疫治療 関連検査

検体から核酸（RNA）を抽出後，抽出した核酸の品質確認を行います。品質確認の結果，以下に該当する場合はご連不可となる可能性がある場合〔品質基準〕
腫瘍検体における

品質基準

検査材料
新鮮組織・細胞FFPE

RNA：収量200 ng 以上，検査不可基準
RNA：収量100 ng 未満，

および RIN 6.0以上
RNA：収量20 ng 以上，もしくは DV200 30％未満
RNA：収量20 ng 未満，

および DV200 70% 以上

もしくは DV200 30％未満

RIN（RNA Integrity Number）：核酸の分解度を示す評価する指標。1～10の値で示します。
（1= 完全に分解された状態，10= ほとんど分解していない状態）
DV200：核酸の分解度を示す評価する指標。200ヌクレオチド以上の RNA 断片の割合を示します。

同一患者での再検査について
一度検査を実施した患者について，異なる腫瘍検体で再検査を実施する場合は，検査データ保管期間内（検査結果の納品より2年間）に再検査を依頼された場合は初回検査の対照検体の検査結果を使用できます。対照検体を再度ご提出いただく必要はありません（項目コード：ネオアンチゲン解析1101，がん遺伝子変異解析1141）。

腹水・胸水からの検査について
腫瘍検体として腹水・胸水中の細胞を用いる場合は，回収した細胞を「腫瘍細胞」としてご提出ください（回収方法の指定は特にありません）。回収した細胞中に腫瘍細胞が30% 以上含まれるよう，顕微鏡下で腫瘍細胞の含有率を確認後に遠心するか，フローサイトメトリー等により腫瘍細胞を回収してください。腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝子変異を検出できない場合があります。（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」）

ペプチドの販売について
当社では，研究グレードの合成ペプチド（ネオアンチゲンペプチド，オンコアンチゲンペプチド）を販売しております。詳細は，99ページ「研究グレードペプチド 合成サービスについて」をご覧ください。

16がん遺伝子発現解析

解析対象遺伝子

免疫治療 関連検査「がん遺伝子発現解析」の解析対象遺伝子は，以下の通りです。
分類
オンコアンチゲン（がん細胞における発現の亢進が報告されている遺伝⼦）

遺伝⼦名（別名）

遺伝⼦名（別名）

CDC45L（CDC45）

T 細胞への抗原提⽰に関連する

B2M

CDCA1（NUF2）

遺伝⼦

CALR

CDH3

CANX

DEPDC1

HLA-A

ECT2

HLA-B

FOXM1

HLA-C

GPC3

HLA-DPA1

HIG2（HILPDA）

HLA-DPB1

HJURP

HLA-DQA1KIF20A

HLA-DQA2

KNTC2（NDC80）

HLA-DQB1

KOC1（IGF2BP3）

HLA-DRAMELK

HLA-DRB1MPHOSPH1（KIF20B）

HLA-DRB5

NEIL3

HLA-E

RNF43

HLA-F

SPARC

HLA-G

TOMM34

HLA-H

TOPK（PBK）

IFNA1

UBE2T

IFNA2

URLC10（LY6K）

IFNB1

WDRPUH（WDR16）

IFNG

免疫細胞（T 細胞、B 細胞、

CD19

IRF1

抗原提⽰細胞）に関連する

CD28

MICA

CD4

MICB

CD68

PSMB8（LMP7）

CD80

PSMB9（LMP2）

CD86

TAP1

CD8A

TAP2

CD8B

TAPBP

遺伝⼦

IL2RA（CD25）
T 細胞の抗原認識および活性化

CD247に関連する遺伝⼦

CD27（TNFRSF7）
CD3D
CD3E
CD3G
GZMA
GZMB
ICOS
LAMP1（CD107a）
TNFRSF9（4-1BB）（次ページへつづく）

17

分類

（つづき）

ケモカイン / サイトカイン

遺伝⼦名（別名）
CCL17

分類
サイトカイン受容体

遺伝⼦名（別名）TNFRSF10ACCL19TNFRSF10B

CCL2TNFRSF10CCCL20TNFRSF10DCCL21

TNFRSF11ACCL22TNFRSF11B

CCL4

TNFRSF12ACCL5TNFRSF13B

CCR10TNFRSF13CCCR4TNFRSF14CCR5TNFRSF16（NGFR）

CCR6

TNFRSF17CCRL2TNFRSF19

CD40（TNFRSF5）TNFRSF19L（RELT ）CD40LG（CD40L, TNFSF5）TNFRSF1A

CD70（TNFSF7）TNFRSF1BCXCL10TNFRSF21

CXCL11TNFRSF25（DR3）CXCL13TNFRSF27（EDA2R）CXCL9TNFRSF3（LTBR）

FASLG（TNFSF6）TNFRSF6（FAS）

IL10

TNFRSF6B（DCR3）IL12ATNFRSF8（CD30）

IL12RB2

免疫抑制細胞

CTLA4

IL17A

（制御性 T 細胞）に関連する

FOXP3

IL17RB

遺伝⼦

TGFB1

IL23A

免疫チェックポイント分⼦

BTLA

IL6

（T 細胞の活性化抑制に関連

C10orf54（VISTA,VSIR）

PRF1

免疫治療 関連検査

分類する遺伝⼦）

CD274（PD-L1）

TBX21

CD276

TGFB2

HAVCR2（TIM3）

TGFB3

IDO1（IDO）

TNF（TNFA）

LAG3

TNFSF1（LTA）

PDCD1（PD-1）

TNFSF10PDCD1LG2（PD-L2）

TNFSF11TIGIT

TNFSF12TNFSF13
TNFSF13B
TNFSF14
TNFSF15
TNFSF18（GITRL）
TNFSF3（LTB）
TNFSF4（OX40L）
TNFSF8TNFSF9（4-1BBL）

18分子標的治療薬選択

関連検査

分子標的治療薬選択 関連検査

がん遺伝子変異解析「腫瘍検体」および「対照検体（正常検体）」（それぞれ1検体）をセットでご提出ください。
例）「腫瘍検体」の腫瘍組織＋「対照検体」の血液

検査項目名

項目

検査材料名，必要量

検体

保存方法

所要

コード

（採取方法掲載ページ）

容器

（安定性）

期間

実施料

検査方法

検査結果

腫瘍組織
3 mm 角 4個

以下のいずれかもしくは30 mg片
※2

2個程度
腫瘍検体
※1

（P. 31）腫瘍細胞※3・核酸安定化試薬をRL2添加し，冷蔵（1ヶ月）

CT2

もしくは冷凍（1年）
・液体窒素で凍結の2×106 cells

うえ，超冷凍（1年）

以上を2本（P. 33）未染色 FFPE
スライド※4（必要量は※5）

1140

冷蔵

対照なし

血液

1141

2 mL

↓
CT2

（P. 36）・アミノ酸置換遺伝子
1ヶ月

BT2
採血

・遺伝子変異数（薄切後6週間）（P. 34）

がん遺伝子
変異解析

―

未収載

超冷凍（1年）

NGS 法

変異数・DNA ミスマッチ修復
遺伝子変異
・適応薬剤候補

対照検体（正常検体）

正常細胞（PBMC 等）
2×106 cells 以上

以下のいずれかを2本・核酸安定化試薬を（P. 33）RL2添加し，冷蔵（1ヶ月）

正常組織

CT2

もしくは冷凍（1年）
・液体窒素で凍結の3 mm 角 4個
もしくは30 mg片うえ，超冷凍（1年）

※2

2個程度
（P. 31）
冷蔵：2℃～8℃

冷凍：-25℃～ -15℃

超冷凍：-85℃～ -70℃

※1：検体中の腫瘍細胞の割合が30% 以上であるものをご提出ください。腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝
子変異を検出できない場合があります。
（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」）※2：検体容器1本あたり，組織片1個を保存してください。
※3：腹水・胸水細胞を使用する場合は，次ページ「腹水・胸水からの検査について」をご参照ください。
※4：腫瘍部位の確認のため，HE 染色標本および原則病理医が腫瘍部位をマーキングした画像（もしくは標本）を合わせてご提出ください。ご提出が難しい場合は，組織全体に占める腫瘍部位の割合が30% 以上であるものをご提出ください。腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝子変異を検出できない場合があります。

マーキング画像のご提出，腫瘍部位の割合の確認のいずれも難しい場合は，事前にご相談ください。
（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」）※5：腫瘍部のサイズによる。目安は，切片厚10 µm，腫瘍部1.5 cm ×1.5 cm の場合，スライド10枚以上。

スライドの作製が難しい場合は，事前にご相談ください。

19

検体の品質確認について

絡いたします（ご依頼時のご連絡先に，メールにてご連絡いたします）。各検査材料における抽出核酸の品質基準は，下表の通りです。
・DNA の品質が検査実施基準を満たさず，検査が継続できない場合（品質確認までの費用が発生いたします。）
・検査を継続できるが，DNA が品質基準を満たさず，データの信頼性が低下するリスク，および以降の工程で継続不可となる可能性がある場合〔品質基準〕
腫瘍検体における

品質基準

検査材料
新鮮組織・細胞検査不可基準

DNA：収量200 ng 以上，DNA：収量200 ng 未満，

および DIN 6.0以上

もしくはメインピーク300 bp 未満

DNA：収量500 ng 以上，
FFPE

分子標的治療薬選択 関連検査

検体から核酸（DNA）を抽出後，抽出した核酸の品質確認を行います。品質確認の結果，以下に該当する場合はご連および DIN 3.0 以上もしくはメインピーク1000 bp 以上

DNA：収量200 ng 未満，
もしくはメインピーク300 bp 未満

DIN（DNA Integrity Number）：核酸の分解度を示す評価する指標。1～10の値で示します。
（1= 完全に分解された状態，10= ほとんど分解していない状態）

同一患者での再検査について
一度検査を実施した患者について，異なる腫瘍検体で再検査を実施する場合は，検査データ保管期間内（検査結果の検収より2年間）に再検査を依頼された場合は初回検査の対照検体の検査結果を使用できます。対照検体を再度ご提出いただく必要はありません（項目コード：1141）。

腹水・胸水からの検査について
腫瘍検体として腹水・胸水中の細胞を用いる場合は，回収した細胞を「腫瘍細胞」としてご提出ください（回収方法の指定は特にありません）。回収した細胞中に腫瘍細胞が30% 以上含まれるよう，顕微鏡下で腫瘍細胞の含有率を確認後に遠心するか，フローサイトメトリー等により腫瘍細胞を回収してください。腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝子変異を検出できない場合があります。（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取
扱い規程」
）

BT2

CT2

RL2

真空採血管
EDTA-2Na 入
2 mL ⽤滅菌クライオチューブ
2 mL ⽤

核酸安定化
試薬入り
マイクロチューブ

検体容器には，所定の検体ラベルを貼付してください。（3ページ「ご利用の手引き」参照）

20

リキッドバイオプシー（パネル解析）
分子標的治療薬選択 関連検査

以下のいずれかをご提出ください。

検査項目名

項目 検査材料名，必要量
コード （採取方法掲載ページ）

検体容器

バフィーコート
採取した全量Oncomine
Pan-cancer

2100（P. 37）

所要
期間

検査方法

検査結果

遠心分離

超冷凍
↓
血漿・
（1年）
バフィーコート：CT5

・cfDNA 抽出結果
・遺伝子変異検出
2週間 未収載

冷蔵

※1

パネル解析

実施料

BT7

血漿5 mL ×2本，
および

保存方法
（安定性）

頻度

ターゲット

シーケンス法 ・偽陽性確認結果
・適応薬剤候補

もしくは室温血液20 mL 以上

RT11

・品質確認結果（5日）
推奨：（P. 39）18℃～25℃
・cfDNA 抽出結果

Oncomine

・遺伝子変異検出

Pan-cancer
パネル解析

2152 （不要）※2――

2週間 未収載

cfDNA

頻度

ターゲット

シーケンス法 ・偽陽性確認結果
・適応薬剤候補

定量検査後※2
冷蔵：2℃～8℃

・品質確認結果
超冷凍：-85℃～ -70℃

室温：9℃～30℃●追加データ解析
検査項目名

項目

所要

コード

期間

2153

2週間 未収載 データ解析 ・関連治療情報

実施料

検査方法

リキッドバイオプシー

・遺伝子変異リスト

臨床試験情報レポート※3「OncominePan-cancer パネル解析」の検査結果

・臨床試験情報に基づき，関連する臨床試験情報を報告いたします。
追加データ解析

検査結果

・アミノ酸置換遺伝子変異数

ネオアンチゲン解析「OncominePan-cancer パネル解析」で取得したデータを用いて，ネオアンチゲンを予測します。

・ネオアンチゲンペプチドリスト
2903

2週間 未収載 データ解析

HLA-A および -B の HLA 型の情報※4をご提供いた

●検査対象

だきます。

HLA クラスⅠ（HLA-A および -B），SNV

上記「追加データ解析」は，検査データ保管期間内（Oncomine Pan-cancer パネル解析の検査結果の納品より2年間）の場合に実施可能です。

BT7

CT5

RT11

真空採血管
EDTA-2Na 入
7 mL 用滅菌クライオチューブ
5 mL 用

リキッドバイオプシー
専用採血管（PAXgene）

検体容器には，所定の検体ラベルを貼付してください。（3ページ「ご利用の手引き」参照）

21

※1：抽出した cfDNA 量の報告が必要な場合は，「cfDNA 定量検査」をご依頼ください。続けてパネル解析を実施する
場合は，「Oncomine Pan-cancer パネル解析

cfDNA 定量検査後」をご依頼ください。

cancer パネル解析

cfDNA 定量検査後」をご依頼ください。（検査内容は「Oncomine Pan-cancer パネル解析」と同一です。
）
「cfDNA 定量検査」で抽出された cfDNA（既存検体）を利用できる場合，再度検体を提出する必要はありません。
既存検体の利用可否がご不明な場合は，お問い合わせください。
※3：リキッドバイオプシー

臨床試験情報レポートの作成は，ライフテクノロジーズジャパン株式会社へ解析デー

タを送付して行います。ライフテクノロジーズジャパン株式会社において解析されたデータは，レポート作成
業務完了後に適切にサーバーから削除されます。
※4：4桁表記（「A2402」等）

分子標的治療薬選択 関連検査

※2：「cfDNA 定量検査」実施後，3か月以内に「Oncomine Pan-cancer パネル解析」を行う場合は，「Oncomine Pan-

検体の品質確認について
核酸（cfDNA およびゲノム DNA）抽出後，品質確認を行います。品質確認の結果，以下に該当する場合はご連絡い
たします（ご依頼時のご連絡先に，メールにてご連絡いたします）。品質基準は下表の通りです。
・cfDNA もしくはゲノム DNA の品質が検査実施基準を満たさず，検査が継続できない場合（品質確認までの費用が発生いたします。
）
・検査を継続できるが，cfDNA もしくはゲノム DNA が品質基準を満たさず，データの信頼性が低下するリスク，および以降の工程で継続不可となる可能性がある場合〔品質基準〕
品質基準
cfDNA
ゲノム DNA

検査不可基準収量20 ng 以上，

収量8 ng 未満，

ゲノム DNA の混入5％未満

もしくはゲノム DNA の混入5％以上

収量40 ng 以上，DIN 6.0以上

収量40 ng 未満，DIN 6.0未満

DIN（DNA Integrity Number）：核酸の分解度を示す評価する指標。1～10の値で示します。
（1= 完全に分解された状態，10= ほとんど分解していない状態）

バフィーコートを用いた偽陽性確認について
血漿を用いたパネル解析により検出された遺伝子変異が，その変異が正常細胞に由来する変異（偽陽性）である可能性を確認するため，バフィーコートを用いて同様にパネル解析（偽陽性確認検査）を実施します。詳細は69ページ「偽陽性の確認について」をご参照ください。

22

治療効果・再発のモニタリング

関連検査

治療効果・再発のモニタリング 関連検査

リキッドバイオプシー（デジタル PCR・cfDNA 定量）
以下のいずれかをご提出ください。

検査項目名

項目
検査材料名，必要量
コード （採取方法掲載ページ）

検体容器
BT7

血漿
5 mL ×2本（P. 37）

デジタル PCR
検査対象の遺伝子変異を

所要
期間

遠心分離

超冷凍

↓
CT5

（1年）
冷蔵

2200

実施料

20 mL 以上

RT11

検査方法

検査結果

・cfDNA 抽出結果
2週間 未収載

もしくは室温血液選択ください。

保存方法
（安定性）

デジタル
PCR 法

・遺伝子変異検出
頻度・品質確認結果（5日）
推奨：（P. 39）18℃～25℃
BT7

血漿1.5 mL ×2本，およびバフィーコート
採取した全量※3
cfDNA 定量
検査※1，※2（P. 37）

遠心分離

超冷凍
↓
（1年）
血漿・バフィーコート
：CT5

2151

冷蔵
血液

1週間 未収載 分子分光法

・cfDNA 濃度
・品質確認結果

もしくは室温

10 mL 以上※4

RT11

（5日）
推奨：

（P. 39）18℃～25℃
冷蔵：2℃～8℃

超冷凍：-85℃～ -70℃

室温：9℃～30℃※1：
「cfDNA 定量検査」実施後，3か月以内に「Oncomine Pan-cancer パネル解析」を行う場合は，「Oncomine Pancancer パネル解析

cfDNA 定量検査後」をご依頼ください。（検査内容は「Oncomine Pan-cancer パネル解析」と同一です。
）「cfDNA 定量検査」で抽出された cfDNA（既存検体）を利用できる場合，再度検体を提出する必要はありません。
既存検体の利用の可否がご不明な場合は，お問い合わせください。
※2：以下の場合は検査結果が高値となる場合があり，正確な結果が得られない可能性があります。

妊娠中の方，移植を受けた方，炎症・糖尿病・組織外傷・敗血症・自己免疫疾患・心疾患のある方，

激しい運動
※3：
「cfDNA 定量検査」に続けて「Oncomine Pan-cancer パネル解析」を予定されている場合は，

血漿：5 mL ×2本，バフィーコート：採取した全量をご提出ください。

※4：
「cfDNA 定量検査」に続けて「Oncomine Pan-cancer パネル解析」を予定されている場合は，

血液 20 mL 以上（リキッドバイオプシー専用採血管2本）をご提出ください。

BT7

CT5

RT11

真空採血管
EDTA-2Na 入
7 mL 用滅菌クライオチューブ
5 mL 用

リキッドバイオプシー
専用採血管（PAXgene）

検体容器には，所定の検体ラベルを貼付してください。（3ページ「ご利用の手引き」参照）

23

デジタル PCR

検査対象遺伝子変異での検査をご希望の場合は，ご相談ください。

遺伝子

塩基変異

アミノ酸置換遺伝子

塩基変異

アミノ酸置換APC

c.4216C>T

p.Q1406Ter

SF3B1

c.2098A>G

p.K700E

BRAF

c.1799T>A

p.V600ETP53

c.517G>A

p.V173M

FGFR3c.742C>T

p.R248C

c.536A>G

p.H179R

GNAS

c.602G>A

p.R201H

c.569C>T

p.P190L

IDH1

c.394C>T

p.R132C

c.584T>C

p.I195T

c.394C>A

p.R132S

c.586C>T

p.R196Ter

IDH2

c.419G>A

p.R140Q

c.659A>G

p.Y220C

KRAS

c.34G>T

p.G12Cc.701A>G

p.Y234C

c.35G>A

p.G12Dc.734G>A

p.G245D

c.34G>A

p.G12Sc.733G>A

p.G245S

c.35G>T

p.G12Vc.742C>T

p.R248W

c.38G>A

p.G13Dc.817C>T

p.R273C

c.183A>C

p.Q61Hc.818G>A

p.R273H

c.182A>T

p.Q61Lc.818G>T

p.R273L

MAP2K1c.370C>T

p.P124S

c.838A>G

p.R280G

NRAS

c.35G>A

p.G12Dc.844C>T

p.R282W

PIK3CAc.263G>A

p.R88Q

c.1624G>A

p.E542K

c.1633G>A

p.E545K

治療効果・再発のモニタリング 関連検査

「デジタル
PCR」では，検査依頼時に検査対象の遺伝子変異を以下より選択してください。記載のない遺伝子変異

検体の品質確認について
核酸（cfDNA）抽出後，品質確認を行います。品質確認の結果，以下に該当する場合はご連絡いたします（ご依頼時のご連絡先に，メールにてご連絡いたします）。品質基準は下表の通りです。
・cfDNA の品質が検査実施基準を満たさず，検査が継続できない場合（品質確認までの費用が発生いたします。
）
・検査を継続できるが，cfDNA が品質基準を満たさず，データの信頼性が低下するリスク，および以降の工程で継続不可となる可能性がある場合〔品質基準〕
検査項目

核酸

デジタル PCR

cfDNA

cfDNA
定量検査

品質基準

検査不可基準収量20 ng 以上，

収量8 ng 未満，

ゲノム DNA の混入5％未満

もしくはゲノム DNA の混入5％以上

品質基準なし24

免疫反応解析（IFN-γ ELISPOT 解析）
治療効果・再発のモニタリング 関連検査

検査項目名

項目
コード

IFN-γ
ELISPOT
解析

3200

検査材料および試料名
必要量（採取方法掲載ページ）

検体

保存方法

所要

容器

（安定性）

期間

PBMC

BT7

抗原ペプチド 1種類

分離

あたり3×106 cells↓（P. 40）CT2

抗原ペプチド※1［ネオアンチゲン］

1採血ポイントあたり

MT2

粉末 1 mg

実施料

検査方法

検査結果
・抗原ペプチド特異的

細胞保存液を添加し，免疫反応判定液体窒素保存もしくは・抗原ペプチド特異的

超冷凍（1年）
1ヶ月 未収載

IVS 法

スポット数

ELISPOT 法

冷凍※2（各ペプチドの●検査対象

安定性に従う）

HLA クラスⅠ
およびクラスⅡペプチド
・抗原ペプチド特異的

ELISPOT
解析

BT7

PBMC

IFN-γ
各種

［オンコアンチゲン］

抗原ペプチド 1種類
6

分離

あたり3×10 cells↓（P. 40）CT2

免疫反応判定細胞保存液を添加し，液体窒素保存もしくは6週間 未収載

超冷凍（1年）IVS 法
ELISPOT 法・抗原ペプチド特異的
スポット数
●検査対象
次ページ参照冷凍：-25℃～ -15℃

超冷凍：-85℃～ -70℃

※1：凍結乾燥粉末，純度95% 以上※2：別途適切な保存条件がある場合は，その条件に従って保存，ご提出ください。

〔品質基準〕
品質基準
PBMC

生細胞数

3×106 cells 以上

検査不可基準細胞生存率

50% 以下，および生細胞数

2×106 cells 未満

BT7

CT2

MT2

真空採血管
EDTA-2Na 入
7 mL 用滅菌クライオチューブ
2 mL ⽤滅菌スクリューキャップ
マイクロチューブ
2 mL ⽤

検体容器には，所定の検体ラベルを貼付してください。（3ページ「ご利用の手引き」参照）

25

IFN-γ ELISPOT 解析［オンコアンチゲン］ 検査対象ペプチド
HLA 型
A2402

A0201

CDC45L

○

CDCA1

○

○

CDH3

○

○

DEPDC1

○

○

ECT2

A0206

○

A1101

A3303

A0101

A0301

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

FOXM1

○

○

GPC3

○

○

○

○

○

HIG2
HJURP

○

○

KIF20A

○

○

KNTC2

治療効果・再発のモニタリング 関連検査

抗原名

○

KOC1

○

MELK

○

○

MPHOSPH1

○

○

○

NEIL3

○

○

○

RNF43

○

○

SPARC

○

TOMM34

○

○

TOPK

○

○

UBE2T

○

URLC10○○WDRPUH○○VEGFR1○VEGFR2

○

○

○

○

○

〇：検査可能なオンコアンチゲンペプチド

26

研究検査
研究検査

免疫反応解析（MHC テトラマー解析）
研究検査は，研究を目的とした検査であり，当社の通常受託の検査項目と異なります。基準値および臨床的意義が明
確にならない項目もございますので，内容をご理解のうえご依頼いただくようお願いいたします。

検査項目名

項目

検査材料名，必要量

検体

保存方法

所要

コード

（採取方法掲載ページ）

容器

（安定性）

期間

PBMC

BT7

抗原ペプチド1種類あたり

MHC
テトラマー

分離

↓

6

3300

解析※1

6×10 cells

CT2（P. 40）抗原ペプチド※2
1採血ポイントあたり検査方法

陽性細胞の検出頻度

液体窒素保存もしくは超冷凍（1年）

検査結果
MHCテトラマー

細胞保存液を添加し，IVS 法
1ヶ月 未収載（%）

フローサイト
メトリー法

冷凍※3

●検査対象
HLA-A*24:02

MT2 （各ペプチドの安定性に粉末 1 mg
冷凍：-25℃～ -15℃

実施料

HLA-A*02:01

従う）

超冷凍：-85℃～ -70℃

※1：ご提供いただいた抗原ペプチドを用いて，解析に使用する蛍光標識 MHC テトラマーをカスタムで作製します。
ペプチドの HLA に対する結合親和性が低い場合，MHC テトラマーを作製できないことがあります。
※2：凍結乾燥粉末，純度95% 以上※3：別途適切な保存条件がある場合は，その条件に従って保存，ご提出ください。

〔品質基準〕
品質基準
PBMC

生細胞数

6×106 cells 以上

検査不可基準細胞生存率

50% 以下，および生細胞数

3×106 cells 未満

BT7

CT2

MT2

真空採血管
EDTA-2Na 入
7 mL 用滅菌クライオチューブ
2 mL ⽤滅菌スクリューキャップ
マイクロチューブ
2 mL ⽤

検体容器には，所定の検体ラベルを貼付してください。（3ページ「ご利用の手引き」参照）

27

免疫反応解析（TCR/BCR レパトア解析）
確にならない項目もございますので，内容をご理解のうえご依頼いただくようお願いいたします。

検査項目名

項目

検査材料名，必要量

検体

保存方法

所要

コード

（採取方法掲載ページ）

容器

（安定性）

期間

実施料

検査方法

解析

3101

［血液］

解析

3102

［組織］

・T 細胞受容体

PBMC

分離

5～10×106 cells を2本↓（P. 41）RL2 ・核酸安定化試薬をCT2
添加し，冷蔵（1ヶ月）

3 mm 角 4個もしくはRL2

30 mg 片2個程度※2

CT2

レパトア情報以下のいずれかもしくは冷凍（1年）

組織

TCR レパトア

検査結果
・シーケンス結果

BT7
TCR レパトア

研究検査

研究検査は，研究を目的とした検査であり，当社の通常受託の検査項目と異なります。基準値および臨床的意義が明（多様度指数，
1ヶ月 未収載

ターゲット

上位10クローンのシーケンス法

遺伝子情報および・液体窒素で凍結のうえ，

頻度分布円グラフ）

超冷凍（1年）●検査対象（P. 31）

TCRαおよびβBT7PBMC

BCR レパトア
解析※1

分離

要問合 5～10×106 cells を2本（P. 41）

［血液］

↓
RL2
CT2

組織

BCR レパトア
解析※1［組織］
冷蔵：2℃～8℃

要問合

3 mm 角 4個もしくは※230 mg 片2個程度

RL2
CT2

・シーケンス結果

以下のいずれか・B 細胞受容体

・核酸安定化試薬を添加し，冷蔵（1ヶ月）
もしくは冷凍（1年）

1ヶ月 未収載

ターゲット
シーケンス法・液体窒素で凍結のうえ，
超冷凍（1年）

レパトア情報（多様度指数，
上位10クローンの遺伝子情報および
頻度分布円グラフ）（P. 31）
冷凍：-25℃～ -15℃

超冷凍：-85℃～ -70℃

※1：以下の解析項目から選択してください。
BCR：重鎖・・・IgG，IgM，IgA，IgD，IgE
軽鎖・・・IgL，IgK※2：検体容器1本あたり，組織片1個を保存してください。

BT7

CT2

RL2

真空採血管
EDTA-2Na 入
7 mL 用滅菌クライオチューブ
2 mL ⽤

核酸安定化
試薬入り
マイクロチューブ

検体容器には，所定の検体ラベルを貼付してください。（3ページ「ご利用の手引き」参照）

28

検体の品質確認について
研究検査

核酸（RNA）抽出後，品質確認を行います。品質確認の結果，以下に該当する場合はご連絡いたします（ご依頼時のご連絡先に，メールにてご連絡いたします）。各検査材料における抽出核酸の品質基準は，下表の通りです。
・RNA の品質が検査実施基準を満たさず，検査が継続できない場合（品質確認までの費用が発生いたします。）
・検査を継続できるが，RNA が品質基準を満たさず，データの信頼性が低下するリスク，および以降の工程で継続不可となる可能性がある場合〔品質基準〕
検査材料
PBMC

組織

品質基準
RNA：収量200 ng 以上，検査不可基準
RNA：収量100 ng 未満，

および RIN 6.0以上
RNA：収量200 ng 以上，もしくは RIN 6.0未満
RNA：収量100 ng 未満，

および RIN 6.0以上

RIN（RNA Integrity Number）：核酸の分解度を示す評価する指標。1～10の値で示します。
（1= 完全に分解された状態，10= ほとんど分解していない状態）

29

もしくは RIN 6.0未満

研究検査

30

検体採取方法・検体の取扱い
検体採取方法・検体の取扱い● 組織検体【該当検査項目】
検査項目

検査要綱掲載ページ

ネオアンチゲン解析（腫瘍組織・正常組織）

P. 11

がん遺伝子発現解析（腫瘍組織）

P. 15

がん遺伝子変異解析（腫瘍組織・正常組織）

P. 19

TCR レパトア解析［組織］P. 28

BCR レパトア解析［組織］P. 28【採取方法】
以下の①（推奨）もしくは②の方法で保存してください。

①核酸安定化試薬を用いた検体保存（推奨）遺伝子解析に必要な核酸を安定化させるため，以下の保存方法を推奨いたします。
試薬・資材

・核酸安定化試薬入りマイクロチューブ（検体容器 RL2）もしくは核酸安定化試薬※※以下の製品を推奨いたします。
RNAprotect Tissue Reagent（QIAGEN，Cat. No. 76104もしくは76106）
もしくは RNAprotect Tissue Tubes（QIAGEN，Cat. No. 76154）
・RNase-free ピペットチップ（推奨）1. 採
 取した組織を3 mm 角に細断してください。
（提出する検体量の目安：重量30 mg 以上を2個，もしくは3 mm 角を4個程度）

手順

2. 組 織を核酸安定化試薬入りマイクロチューブ（もしくは核酸安定化試薬500 µL 以上を添加した検体
容器 CT2）に移し，完全に浸漬させてください。検体容器1本あたり，組織片1個を保存してください。
3. 冷蔵で一晩浸漬してください。
4. 一晩浸漬後，検体提出まで冷蔵で保存，もしくは溶液を除去し冷凍で保存してください。
（保存期間：冷蔵にて1ヶ月，冷凍にて1年間）

31

・液体窒素・滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）

手順

組織を採取後，滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）に移し，すみやかに液体窒素にて凍結してください。
凍結させた組織は，提出まで超冷凍にて保存してください（保存期間：1年間）。

検体採取方法・検体の取扱い

試薬・資材② 液体窒素凍結による検体保存

32

● 細胞
検体採取方法・検体の取扱い【該当検査項目】
検査項目

検査要綱掲載ページ

ネオアンチゲン解析（腫瘍細胞・正常細胞）

P. 11

がん遺伝子発現解析（腫瘍細胞）

P. 15

がん遺伝子変異解析（腫瘍細胞・正常細胞）

P. 19【採取方法】
以下の①（推奨）もしくは②の方法で保存してください。

①核酸安定化試薬を用いた検体保存（推奨）遺伝子解析に必要な核酸を安定化させるため，以下の保存方法を推奨いたします。
試薬・資材

・核酸安定化試薬※※以下の製品を推奨いたします。
RNAprotect Tissue Reagent（QIAGEN，Cat. No. 76104もしくは76106）
もしくは RNAprotect Tissue Tubes（QIAGEN，Cat. No. 76154）
・RNase-free ピペットチップ（推奨）1. 採
 取した細胞を滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）に移し，500 µL 以上の核酸安定化試薬を添加してください。
手順

2. 冷蔵で一晩浸漬してください。
3. 一晩浸漬後，検体提出まで冷蔵で保存，もしくは溶液を除去し冷凍で保存してください。
（保存期間：冷蔵にて1ヶ月，冷凍にて1年間）

試薬・資材② 液体窒素凍結による検体保存・液体窒素
・滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）

手順

細胞を採取後，滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）に移し，すみやかに液体窒素にて凍結してください。
凍結させた検体は，提出まで超冷凍にて保存してください（保存期間：1年間）。

33

● FFPE 検体
遺伝子検査についても，以下に準じた方法で検体を作製・保管することを推奨いたします。
（参考文献：日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」）【該当検査項目】
検査項目

検査要綱掲載ページ

ネオアンチゲン解析（腫瘍組織）

P. 11

がん遺伝子発現解析（腫瘍組織）

P. 15

がん遺伝子変異解析（腫瘍組織・正常組織）P. 19

検体採取方法・検体の取扱い

遺伝子関連検査に用いる FFPE 検体は，以下に記載する方法での作製・保管が推奨されています。当社で実施する【採取方法】
Ⅰ．組織検体の固定方法
採取した組織は，以下に従って固定してください。
手術による採取

摘出後すみやかに冷蔵保存し，1時間～遅くとも3時間以内に固定開始（摘出後30分以上室温保持は回避）

固定までの時間

内視鏡・生検による採取
固定溶液

中性緩衝ホルマリン溶液（ホルマリン濃度 10％（3.7％ ホルムアルデヒド））
組織重量の約10倍量

固定温度・時間

室温，6～48時間※1

固定後の保管

冷蔵が望ましい注意事項

採取後すみやかに固定

固定時間短縮のため，組織を4～5 mm 角程度の大きさに細断するか，組織が大きい場合は1 cm 間隔で入割して固定することが望ましい※1：ホルマリン過固定による検体の品質低下について
ホルマリン固定による核酸品質への影響として，核酸の断片化や核酸塩基の化学修飾※2等が知られています。
過固定によりこれらの反応が進んだ場合，核酸の収量不足や品質低下により検査を継続できない可能性や，検査を継続しても過固定に起因する塩基置換が遺伝子変異として多数検出され，検査結果の精度が低下する
可能性があります。
※2：特に，シトシン（C）の加水分解に伴う脱アミノ化によりウラシル（U）に置換し，その後の PCR 増幅反応によってチミン（T）が生成（C ＞ T
置換）されることが知られています。

Ⅱ．未染色 FFPE スライドの準備
・可能な限り作製後3年以内のブロックを使用し，出血，壊死，炎症細胞（非腫瘍細胞）が多いブロックは避けてください。
・核酸分解を防止するため，グローブを着用してください。
・標本作製時は，他検体のコンタミネーション（混入）を防止するため，検体ごとにミクロトーム刃を交換してください。
・切片の伸展・乾燥のための加熱は避けてください。

34

・HE 染色標本および原則病理医が腫瘍部をマーキングした画像（もしくは標本）を合わせてご提出ください。
HE 染色標本およびマーキング画像の提出が難しい場合は，腫瘍割合が30% 以上の標本をご提出ください。


検体採取方法・検体の取扱い
35

腫瘍細胞の割合が低いと，腫瘍由来の遺伝子変異を検出できない場合があります。
・提出枚数は，腫瘍部の大きさにより異なります。
提出枚数の目安：切片厚10 µm，腫瘍部 1.5 cm ×1.5 cm の場合，10枚以上・可能な限り薄切後６週間以内の標本を，冷蔵にて保存し，ご提出ください。
（薄切後６週間以上経過した検体は解析に適しません。）

● 血液（対照検体用）
検査項目

検査要綱掲載ページ

ネオアンチゲン解析（対照検体）

P. 11

がん遺伝子変異解析（対照検体）

P. 19【採取方法】
試薬・資材

・真空採血管 EDTA-2Na 入り 2 mL 用（検体容器 BT2） 1本（EDTA-2K 真空採血管も使用可 ）検体採取方法・検体の取扱い【該当検査項目】

・滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2） 1本

手順

真空採血管（EDTA-2Na 入り 2 mL 用，検体容器 BT2）で採血後，採取した血液を滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）に移してください。
検体はすみやかに超冷凍にて凍結し，提出まで保存してください（保存期間：1年間）。

【ご注意】
真空採血管のまま凍結を行う場合は，採血管が破損する恐れがあるため，可能な限り上記手順でご準備ください。

36

● 血漿およびバフィーコート（リキッドバイオプシー用）
検体採取方法・検体の取扱い【該当検査項目】
検査項目

検査要綱掲載ページ

ネオアンチゲン解析［血液］

P. 12

ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）

P. 12

Oncomine Pan-Cancer パネル解析

P. 21

デジタル PCR

P. 23

cfDNA 定量検査

P. 23

【採取方法】
・真空採血管 EDTA-2Na 入り 7 mL 用（検体容器 BT7）
：血液採取用ネオアンチゲン解析［血液］・・・4～5本
ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）
・・・3本
Oncomine Pan-Cancer パネル解析・・・3本
試薬・資材

デジタル PCR・・・3本
cfDNA 定量検査・・・2本・滅菌クライオチューブ 5 mL 用（検体容器 CT5） ※バフィーコート分取用は2 mL 用でも代用可
ネオアンチゲン解析［血液］・・・血漿分取用3～4本，バフィーコート分取用1本
ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）
・・・血漿分取用2本，バフィーコート分取用1本
Oncomine Pan-Cancer パネル解析・・・血漿分取用2本，バフィーコート分取用1本
デジタル PCR・・・血漿分取用2本（バフィーコートは不要）
cfDNA 定量検査・・・血漿分取用2本，バフィーコート分取用1本

1．採血
真空採血管（EDTA-2Na 入り，検体容器 BT7）にて必要量の血液を採取してください。
●採血量

ネオアンチゲン解析［血液］・・・30 mL 以上
ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）
・・・20 mL 以上
Oncomine Pan-Cancer パネル解析・・・20 mL 以上
デジタル PCR・・・20 mL 以上
cfDNA 定量検査・・・10 mL 以上●採血管に規定量の血液を採取してください。採血量が採血管の規定量に満たない場合，ゲノム DNA 混入の原因となり，正確な結果が得られない可能性があります。

冷蔵で6時間以内に2．へ37

2．遠心分離2,000 G，4℃にて10分間遠心してください。
G = 1.118 × 10-5 × r × n2
r：遠心機のローター半径（cm）
n：1分間あたりの回転数（rpm）

3．血漿の分取ピペットの先端がバフィーコートに触れないように血漿を分取し，

必要本数の滅菌クライオチューブ（検体容器 CT5）に移してください。

⾎漿バフィーコート
⾚⾎球

検体採取方法・検体の取扱い●遠心機回転数の計算式

この部分の⾎漿を分取してください

バフィーコート層から1cm程度残してください●バフィーコートが混入しないよう，十分注意してください。もしバフィーコートが混入してしまった場合は，血漿を採血管に戻し，再度２．の遠心からやり直してください。

4．バフィーコートの分取
血漿を分取後，さらにバフィーコートを分取し，滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）に移してください。

⾎漿（分取後）バフィーコート
⾚⾎球

少量廃棄してください

バフィーコートを別途分取してください●「デジタル PCR」の場合は，バフィーコートは提出不要です。

5．検体の保存分取した血漿およびバフィーコートは，検体提出まで超冷凍（-85℃～ -70℃）で保存してください。

【ご注意】採血後6時間以内に血漿分離ができなかった場合や，血漿にバフィーコートの混入があった場合は，正確な結果が得られない可能性がありますので，十分注意してください。

38

● 血液（リキッドバイオプシー用）
検体採取方法・検体の取扱い【該当検査項目】
検査項目

検査要綱掲載ページ

ネオアンチゲン解析［血液］

P. 12

ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）

P. 12

Oncomine Pan-Cancer パネル解析

P. 21

デジタル PCR

P. 23

cfDNA 定量検査

P. 23

【採取方法】

試薬・資材

・リキッドバイオプシー専用採血管 PAXgene（検体容器 RT11，10 mL 用）
ネオアンチゲン解析［血液］・・・3本ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）
・・・2本
Oncomine Pan-Cancer パネル解析・・・2本
デジタル PCR・・・2本
cfDNA 定量検査・・・1本

1．採血リキッドバイオプシー専用採血管 PAXgene（検体容器 RT11）を室内温度（15℃～25℃）になじませた後，必要量の血液を採取してください。
※採血管の詳細な使用方法は，製品添付文書をご参照ください。
採血には，BD バキュティナ ® セーフティロック ™ ブラッドコレクションセット（ホルダー付）の使用が推奨されています。異なる製品を使用すると，採血ができない場合があります。
●採血量

ネオアンチゲン解析［血液］・・・30 mL 以上
ネオアンチゲン解析（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）
・・・20 mL 以上
Oncomine Pan-Cancer パネル解析・・・20 mL 以上
デジタル PCR・・・20 mL 以上
cfDNA 定量検査・・・10 mL 以上

2．転倒混和
採血管をゆっくり8～10回程度転倒混和してください。
採 取した検体は，立てた状態で提出まで冷蔵もしくは室温（推奨：18℃～25℃）で保存してください。

39

● PBMC（免疫反応解析用）

検査項目

検査要綱掲載ページ

IFN-γ ELISPOT 解析［ネオアンチゲン］，［オンコアンチゲン］

P. 25

MHC テトラマー解析

P. 27【採取方法】
リンパ球比重分離液を用いた密度勾配遠心法により，PBMC を分離してください。
試薬・資材・リンパ球比重分離液：Ficoll 液もしくは Lymphoprep™

検体採取方法・検体の取扱い【該当検査項目】

・緩衝生理食塩水（DPBS 等）
・細胞凍結保存溶液
・50 mL 遠心チューブ
・凍結処理容器
1. 真
 空採血管（EDTA-2Na 入り）にて血液を採取した後，室温保存のうえ，30時間以内に2. 以降の操作を実施してください。
2. 5
 0 mL 遠心チューブに・リンパ球比重分離液を分注し，緩衝生理食塩水にて2倍希釈した血液を重層してください。（血液：リンパ球比重分離液＝1：1～2：1）
3. 9
 00 G，20℃にて30分間遠心後（アクセル・ブレーキは Slow，可能であればスイングローター推奨），
緩衝生理食塩水を20 mL 分注した50 mL 遠心チューブに PBMC 層を回収してください。

手順

4. 回収した PBMC に緩衝生理食塩水を添加して50 mL にし，PBMC を懸濁後，550 G（もしくは600 G），
20℃にて10分間遠心してください。
5. 上
 清を除去後，ペレットを30 mL の緩衝生理食塩水に懸濁し，400 G，20℃にて5分間遠心してください。
6. 上
 清を除去後，ペレットを30 mL の緩衝生理食塩水に懸濁し，細胞数を計測後，400 G，20℃にて5分間遠心してください。
7. 上清を除去し，ペレットを細胞凍結保存溶液で懸濁してください。
8. 凍
 結処理容器を用いて超冷凍（-85℃～ -70℃）にて一晩程度予備凍結後，液体窒素中もしくは超冷凍にて保存してください。（保存期間：1年間）

備考●採血量の目安
血液1 mL あたり PBMC 1×106 cells 程度（分離できる PBMC 数には個人差がありますので，ご留意く
ださい。）→必要細胞数3×106 cells の場合，採血量3 mL が目安になります。

遠心機回転数の計算式
G = 1.118 × 10-5 × r × n2
r：遠心機のローター半径（cm）
n：1分間あたりの回転数（rpm）

40

● PBMC（遺伝子解析用）
検体採取方法・検体の取扱い【該当検査項目】
検査項目

検査要綱掲載ページ

TCR レパトア解析［血液］

P. 28

BCR レパトア解析［血液］

P. 28【採取方法】
リンパ球比重分離液を用いた密度勾配遠心法により PBMC を分離後，遺伝子解析に必要な核酸を安定化させるため，
核酸安定化試薬を使用して保存（もしくは液体窒素凍結により保存）してください。
Ⅰ . PBMC の分離
試薬・資材・リンパ球比重分離液：Ficoll 液もしくは Lymphoprep™
・緩衝生理食塩水（DPBS 等）
・50 mL 遠心チューブ
1. 真 空採血管（EDTA-2Na 入り）にて血液を採取した後，室温保存のうえ，30時間以内に2. 以降の操作を実施してください。
2. 5
 0 mL 遠心チューブにリンパ球比重分離液を分注し，緩衝生理食塩水にて2倍希釈した血液を重層してください。（血液：リンパ球比重分離液＝1：1～2：1）
3. 900 G，20℃にて30分間遠心後，緩衝生理食塩水を20 mL 分注した50 mL 遠心チューブに PBMC 層を回収してください。

手順

4. 回収した PBMC に緩衝生理食塩水を添加して50 mL にし，PBMC を懸濁後，550 G，20℃にて10分間
遠心してください。
5. 上
 清を除去後，ペレットを緩衝生理食塩水の30 mL に懸濁し，400 G，20℃にて5分間遠心してください。
6. 上清を除去後，ペレットを緩衝生理食塩水の30 mL に懸濁し，細胞数を計測後，400 G，20℃にて5分間遠心してください。
7. 上清を除去後，分離した PBMC を「Ⅱ . PBMC の保存」に従って保存してください。
●採血量の目安備考

血液1 mL あたり PBMC 1×106 cells 程度（分離できる PBMC 数には個人差がありますので，ご留意く
ださい。）→必要細胞数5～10×106 cells の場合，採血量5～10 mL が目安になります。
●単核球分離用採血管は使用いただけません。

遠心機回転数の計算式
G = 1.118 × 10-5 × r × n2
r：遠心機のローター半径（cm）
n：1分間あたりの回転数（rpm）

41

Ⅱ . PBMC の保存
遺伝子解析に必要な核酸を安定化させるため，以下の保存方法を推奨いたします。
試薬・資材

・核酸安定化試薬※※以下の製品を推奨いたします。
RNAprotect Tissue Reagent（QIAGEN，Cat. No. 76104もしくは76106）
もしくは RNAprotect Tissue Tubes（QIAGEN，Cat. No. 76154）
・RNase-free ピペットチップ（推奨）1. 採
 取した細胞を滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）に移し，500 µL 以上の核酸安定化試薬を添加

検体採取方法・検体の取扱い①核酸安定化試薬を用いた検体保存（推奨）

してください。
手順

2. 冷蔵で一晩浸漬してください。
3. 一晩浸漬後，検体提出まで冷蔵で保存，もしくは溶液を除去し冷凍で保存してください。
（保存期間：冷蔵にて1ヶ月，冷凍にて1年間）②液体窒素凍結による検体保存
試薬・資材

・液体窒素
・滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）

手順

細胞を採取後，滅菌クライオチューブ（検体容器 CT2）に移し，すみやかに液体窒素にて凍結してください。
凍結させた検体は，提出まで超冷凍にて保存してください（保存期間：1年間）。

42

検査概要および検査結果の見方
検査概要および検査結果の見方

はじめに―がんの種類に合わせた治療から，遺伝子異常のタイプに合わせた治療へ―「がんプレシジョン※医療」は，個々のがん患者さんに，最適な医療を，最適なときに提供する医療です。当社は，がんの診断（分子標的治療薬を適用できる遺伝子変異の検出）や個別化がん免疫療法のための検査から，治療効果・再発の確認まで，「がんプレシジョン医療」におけるがんの治療をサポートする検査を提供します。
※プレシジョン（precision）：英語で「精密な」「正確な」という意味。
2015年1月20日に米国のオバマ大統領（当時）が行った一般教書演説の中で，「プレシジョン・メディシン・イニシアティブ（精密医療計画）」という言葉を用いたことで，「がんプレシジョン医療」が日本でも知られるようになりました。

がん遺伝子検査

治療薬のある
遺伝子変異あり
10%～30%分子標的治療薬による治療

治療効果・再発のモニタリング●リキッドバイオプシー（がん遺伝子パネル解析、
cfDNA定量検査、デジタルPCR）〇●リキッドバイオプシー（がん遺伝子パネル解析）●がん遺伝子変異解析

がんの
早期発見

治療薬のある
遺伝子変異なし
70%～90%×

個別化がん免疫療法●ネオアンチゲン解析●がん遺伝子発現解析

ネオアンチゲン免疫療法
オンコアンチゲン免疫療法など

免疫療法の効果確認●免疫反応解析（ELISPOT解析など）

緑字︓CPMが提供する検査

遺伝子解析による個別化医療と当社で実施する検査● 個別化がん免疫療法について
一般的に，治療薬（分子標的薬）を選択するために行われる遺伝子検査（がん遺伝子パネル検査等）では，がんの異常に合った既存の治療薬が見つかる患者さんはおよそ10％～30％といわれています。治療薬が見つからない場合には，ネオアンチゲンやオンコアンチゲン等のがん特異的な抗原を用いて，個別化がん免疫療法を行うことができます。
（参考文献：Morisaki, et al. Immunol Invest. 2020:1-18.）

 がん遺伝子パネル検査
患者さんの腫瘍組織や血液をつかって，がんに関連する多数の遺伝子変異を同時に調べる検査。一般的に数十～数百の遺伝子について解析し，見つかった遺伝子変異の情報から，がんの異常に合った治療薬（分子標的薬）を選択することをおもな目的として行われます。

 ネオアンチゲン
がん細胞で起こった遺伝子異常によって作られる新たながんの抗原。正常なタンパク質と性質が異なることから，
強い免疫反応を引き起こし，がん免疫療法の理想的なターゲットと考えられています。
（参考文献：Hacohen, et al. Cancer Immunol Res. 2013;1（1）:11-5.）

 オンコアンチゲン
がん細胞で特異的に高発現し，正常細胞ではほとんど発現が認められないタンパク質。免疫反応を引き起こす抗原性を有しており，免疫治療に利用することができます。
（参考文献：Mizukami, et al, Cancer Sci. 2008;99（7）:1448-54.）43

検査項目一覧

次世代シーケンス技術を用いたがん遺伝子の網羅的解析により，がん免疫療法の標的候補を探索する検査
検査項目名
ネオアンチゲン解析

がん遺伝子発現解析

検査内容
ネオアンチゲン免疫治療に利用できるネオアンチゲン候補を探索する検査
オンコアンチゲンや免疫チェックポイント分子等，免疫に関連する分子の発現量を解析する
検査

概要掲載
ページ

P. 48

P. 58

検査概要および検査結果の見方● 免疫治療 関連検査

● 分子標的治療薬選択 関連検査
次世代シーケンス技術を用いたがん遺伝子の網羅的解析により，分子標的治療薬（適用薬剤）候補を探索する検査
検査項目名
がん遺伝子変異解析

Oncomine Pan-cancer
パネル解析

検査内容
がん組織中の全遺伝子変異の情報を解析し，DNA ミスマッチ修復遺伝子変異の情報や，検出された遺伝子変異に適応する分子標的薬候補を探索する検査

概要掲載
ページ

P. 62

血液中に流れ出したがん由来の遺伝子を解析することにより，遺伝子の異常（変異等），
検出された遺伝子変異のタイプに合った分子標的薬を選択するためのP. 68

リキッドバイオプシーがん遺伝子パネル検査● 治療効果・再発のモニタリング 関連検査
治療の効果や経過をモニタリング（追跡）する検査。再発の兆候の確認にも利用できます。
検査内容

概要掲載
ページ

特定された遺伝子変異について，高感度にモニタリングする検査（リキッドバイオプシー）

P. 77

検査項目名
デジタル PCR

cfDNA 定量検査

IFN-γ ELISPOT 解析

血液（血漿）中に含まれる cfDNA の量を測定し，がんの有無や治療効果・再発を
モニタリングする検査（リキッドバイオプシー）
免疫治療に利用した抗原（ネオアンチゲンペプチド，オンコアンチゲンペプチド等）に対する免疫応答を確認する検査

P. 80

P. 85

● 研究検査研究を目的とした検査であり，当社の通常受託の検査項目と異なります。基準値および臨床的意義が明確にならな
い項目もございますので，内容をご理解のうえご依頼ください。
検査項目名
MHC テトラマー解析

TCR/BCR レパトア解析

検査内容
フローサイトメトリーにより，抗原ペプチドに対する抗原特異的 T 細胞を検出する検査
次世代シーケンス解析により，検体中に存在する T/B 細胞受容体（TCR/BCR）の遺伝子情報を網羅的に解析する検査

概要掲載
ページ

P. 89

P. 91

※「リキッドバイオプシー」については，46ページをご参照ください。

44

検査目的・検査材料による検査選択ガイド
検査概要および検査結果の見方「免疫治療」のための検査
ネオアンチゲン免疫治療

検査材料

オンコアンチゲン・
その他免疫治療

腫瘍組織
FFPE組織リキッドバイオプシー

腫瘍組織
FFPE組織ネオアンチゲン解析

ネオアンチゲン解析［血液］

がん遺伝子発現解析「分子標的薬剤治療」のための検査

検査材料

腫瘍組織
FFPE組織リキッドバイオプシー

がん遺伝子変異解析

Oncomine Pan-Cancer
パネル解析「治療効果・再発モニタリング」のための検査

検査材料

PBMC

リキッドバイオプシー

IFN-γ
ELISPOT解析

デジタルPCR
cfDNA定量検査

免疫治療の効果の確認（免疫反応解析）

45

col

n
um

― 血液によるがん検査 ―リキッドバイオプシーとは
血液等の体液を用いて，診断や治療法の選択や治療効果の予測等を行う手法を，リキッドバイオプシーといいます。
リキッドバイオプシーでは，内視鏡や針によりがんの組織を採取する従来の組織生検にくらべて体に負担をかけることなく，くり返し検査を行うことができます。また，組織生検では採取した組織の一部の情報しか得られないのに対し，
リキッドバイオプシーでは体全体に存在するがんの情報を把握することができることも特長のひとつです。

血液などの体液の情報から，病気の有無や性質

手術や内視鏡，針などによって組織の一部を採取を調べることし，顕微鏡で病変について調べること■ 患者さんの負担が小さい■ 患者さんの負担が大きい■ 病変部位が採取できない場合でも実施できる■ 病変部位によっては採取が難しい■ 適切なタイミングで，くり返し検査できる■ 病状によって実施できないこともある

検査概要および検査結果の見方

リキッドバイオプシー

リキッドバイオプシーと生検のちがい血液によるがん検査・がんの早期発見とモニタリング
血液には，がん細胞や，がん組織から遊離した核酸（Cell-free DNA/
RNA；cfDNA/cfRNA）が流れ出しています。当社のリキッドバイオプシー
検査では，血液中に流れ出したがん由来の DNA および RNA を検出することで，がんのスクリーニング（健康診断），再発モニタリングや，適用できる分子標的薬の選択を行います。

がん細胞から遊離したDNA46

cfDNA/RNA によるリキッドバイオプシー検査では，ごく微量ながんの遺伝子異常を検出できるため，MRI や CT 等の画像診断より早期にがんの兆候を発見できることが報告されており，がんの早期診断への応用が期待されています。

検査概要および検査結果の見方（参考文献：Tang, et al. Cell Biosci. 2016;6:32.）

リキッドバイオプシーによるがんの早期検出とモニタリング

当社のリキッドバイオプシー検査
当社では，リキッドバイオプシーとして，目的別に「Oncomine Pan-cancer パネル解析」，「デジタル PCR」，「cfDNA
定量検査」の3種類の検査を提供しています。
血液から
cfDNA/RNAを抽出

遺伝子変異

cfDNA定量検査
cfDNAの量の測定（健康診断など）

パネル解析
次世代シーケンサーを用いた遺伝子変異の検出

がん治療薬の選択
遺伝子変異A

遺伝子変異B

遺伝子変異C

デジタルPCR法
特定の遺伝子変異の経時的な検出（再発モニタリング）

47

免疫治療

関連検査

「ネオアンチゲン解析」は，腫瘍検体と対照（正常）検体の遺伝子解析により，がん細胞でのみ起こっている遺伝子
変異とネオアンチゲン候補を見つけ出す検査です。ネオアンチゲンとは，がん細胞で起こった遺伝子変異によって新たに作られるがん特異的な抗原のことをいいます。ネオアンチゲンは，正常なタンパク質と性質が異なることから強い免疫反応を引き起こすことが期待され，がん免疫療法の理想的なターゲットと考えられています。
（参考文献：Hacohen, et al. Cancer Immunol Res. 2013;1（1）:11-5.）

検査概要および検査結果の見方

ネオアンチゲン解析● 検査方法
腫瘍検体（新鮮組織等）と対照検体（血液等）から DNA を，さらに腫瘍検体から RNA を抽出し，それぞれシーケンシ
ング（DNA：全エクソーム解析，RNA：RNA シーケンス解析）を行います。血液から検査するリキッドバイオプシーの場合は，セルフリー DNA（cell-free DNA；cfDNA）を抽出して全ゲノム解析を行うとともに，対照として血液中の正常細胞（バフィーコート）から抽出したゲノム DNA を用いて全エクソーム解析を行います。腫瘍検体（もしくは血中 cfDNA）と対照検体のシーケンスデータの比較により，がん細胞のみで起きている遺伝子変異を特定し，さらに変異した遺伝子のがんでの発現量を確認します。変異遺伝子の発現量および HLA 分子への結合力の強さ等から，免疫治療に有効と考えられるネオアンチゲンペプチドを見つけ出し，検査結果として報告します。
（参考文献：Kato, et al. Oncotarget. 2018;13;9（13）:11009-11019.）① 核酸抽出対照（正常）検体
血液など

腫瘍検体
新鮮組織／FFPE／血液（リキッドバイオプシー）② 全エクソーム解析／全ゲノム解析※③ RNAシーケンス解析※※※※リキッドバイオプシーの場合は実施なし※リキッドバイオプシーの場合

がん細胞のみで起きている遺伝子変異を特定する

各遺伝子ががん細胞でつくられている量（発現量）を調べる④ がんで発現している変異遺伝子の選択⑤ ネオアンチゲン予測

親和性 高

親和性 低

HLA分子
ネオアンチゲンペプチド
正常細胞の全エクソーム解析データからHLAタイプを調べ、HLA分子に結合する遺伝子変異を含むペプチド（ネオアンチゲンペプチド）をコンピュータで予測する

ネオアンチゲン解析

解析フロー

48

①核酸抽出・品質確認
各検体から核酸を抽出します。それぞれ品質を確認し，品質基準を満たさない場合はご連絡いたします。


検査概要および検査結果の見方（14ページ「検体の品質確認について」参照）②全エクソーム解析／全ゲノム解析
腫瘍検体（新鮮組織／細胞／ FFPE）と対照検体から抽出した DNA を用いて，全エクソームのシーケンシングを行います。腫瘍検体として血液を利用する場合は，cfDNA を用いて全ゲノム解析を行います。得られた両検体のシー
ケンスデータを比較することにより，がん細胞のみで起きている遺伝子変異を特定します。
解析対象の遺伝子は，ヒトの全遺伝子（約2万遺伝子）※1です。
※1：全エクソーム解析ではヒトゲノムのうちタンパク質をコードするエクソン領域のみ，全ゲノム解析ではヒトゲノムを構成する DNA の塩基配列全てを解析します。

③ RNA シーケンス解析
腫瘍検体から抽出した RNA のシーケンシングを行います。得られた RNA シーケンスデータより，各遺伝子の発現量を確認します。

④がんで発現している変異遺伝子の選択
全エクソーム／全ゲノムシーケンスデータと RNA シーケンスデータを比較することにより，がん細胞のみで発現している遺伝子変異を特定します。

⑤ネオアンチゲン予測
対照検体の全エクソームシーケンスデータから患者さんの持つ HLA 型を調べ，HLA 分子に結合しがん特異的な免疫反応を誘導するペプチド（ネオアンチゲンペプチド）を予測します※2。
※2：ネオアンチゲン予測方法
ネオアンチゲンの予測方法は，以下の通りです。
1. 免疫細胞の標的を同定する・アミノ酸置換を伴う（正常細胞にはない変異タンパク質を生成する）遺伝子変異を選択する
・HLA に強く結合するアミノ酸置換を含むペプチドを予測する
・変異遺伝子の発現を確認し，がんでの発現量が多いペプチドを選択する
2. がん細胞に特異的な抗原を選択する
・がん細胞に特異的な（正常細胞にはない新規の）ペプチド配列のみを抽出する
・アミノ酸置換位置が T 細胞受容体もしくは HLA いずれとの結合にも影響しないと予測されるペプチドを除く［検査対象］
検査項目名

HLA 型

アミノ酸置換を伴う

ネオアンチゲン解析（［FFPE］，［血液］，（Oncomine Pan-Cancer パネル解析）を含む）

変異タイプ

HLA クラスⅠ拘束性

一塩基変異（SNV）（HLA-A および B）

49

追加データ解析

挿入・欠失変異

追加データ解析

HLA クラスⅡ拘束性

挿入・欠失変異（Indel）
HLA クラスⅡ拘束性

アミノ酸置換を伴う（HLA-DR）

一塩基変異（SNV）

FFPE 検体を用いた検査についてます。特に RNA は非常に壊れやすい物質であるため，FFPE 検体からの RNA シーケンス解析が実施できないケースが多くみられます。そのため，FFPE 検体を検査に使用する場合は，FFPE 検体解析用の試薬で RNA シーケンス解析を実施します。RNA の品質が検査実施基準を満たさない場合は，RNA シーケンス解析を実施せず，がんの遺伝子発現データベース※3のデータを用いて解析を行います（RNA シーケンス解析によるデータを用いた場合と比較し，検査結果の精度が低下します）。
検査に使用する FFPE 検体の作製においては，組織を採取後可及的速やかに10% 中性緩衝ホルマリン溶液にて固定し，（経年劣化の点で）作製後3年以内のブロックを使用することが推奨されます。推奨される FFPE 検体の作
製方法の詳細については，34ページ「検体採取方法・検体の取扱い（FFPE 検体）」をご参照ください。

検査概要および検査結果の見方

FFPE 検体は，FFPE の特性や作製方法，保存期間・保存状態等により，検体の品質が低下している場合があり※3：The Cancer Genome Atlas（TCGA）データベース

追加データ解析について
ネオアンチゲン解析では，取得したシーケンスデータを用いて，以下のデータ解析を追加で行うことができます。
挿入・欠失による遺伝子変異に由来するネオアンチゲンを予測します。
挿入・欠失変異

通常の「ネオアンチゲン解析」では，アミノ酸置換を伴う一塩基変異（SNV）を対象としているため，挿入・欠失変異に由来するネオアンチゲン候補が新たに見つかる可能性があります。

HLA クラスⅡ
拘束性

HLA クラスⅡ（HLA-DR）拘束性のネオアンチゲンを予測します。
HLA クラスⅡ拘束性ペプチドは，CTL やマクロファージ，ナチュラルキラー（NK）細胞を活性化させるヘルパー T 細胞を誘導する役割を持っています。

ネオアンチゲン解析で取得したデータ（全エクソーム／全ゲノムシーケンスデータ）を
遺伝子変異解析利用して全遺伝子変異の情報を解析し，DNA ミスマッチ修復遺伝子変異の情報や，見つかった遺伝子変異に適応する分子標的治療薬候補を探索します。
（解析の詳細は，62ページ「がん遺伝子変異解析」と同様です。）

RNA シーケンスデータを用いて，オンコアンチゲンおよび免疫に関連する分子の遺伝
遺伝子発現解析

子発現量を解析します。
（解析の詳細は，58ページ「がん遺伝子発現解析」と同様です。
）※「ネオアンチゲン解析［血液］」の場合は実施不可

50

● 検査結果報告の内容
検査概要および検査結果の見方「ネオアンチゲン解析」では，以下の結果を報告いたします。
（「追加データ解析


遺伝子変異解析」の結果報告内容は「がん遺伝子変異解析」と，「追加データ解析

遺伝子発現解析」の結果報告内容は「がん遺伝子発現解析」と同様です。それぞれ63ページおよび61ページ「検査結果報
告の内容」をご参照ください。
）

報告例1：

①
①

NA

②
②

①解析結果
解析の結果として，以下の項目を示します。
項目
遺伝子変異数

内容
挿入・欠失，サイレンス・ミスセンス変異を含むすべての遺伝子変異数を示します。

アミノ酸置換遺伝子変異数

すべての遺伝子変異のうち，アミノ酸置換を伴う遺伝子変異数を示します。
アミノ酸置換遺伝子変異数（TMB；Tumor Mutation Burden）は，免疫チェッ
クポイント阻害薬の有効性と相関があることが報告されています。全がん種における TMB が102.5以上の場合は，PD-1抗体が有効であることが示されています。
（参考文献：Cristescu R, et al. Science. 2018;362（6411）.）

ネオアンチゲンペプチド数

アミノ酸置換ペプチドのうち，HLA クラスⅠ（HLA-A，B および C）に結合すると予測されるペプチドの数を示します。（同一の変異に由来する，異なるペプ
チド配列も含む）

51

項目

内容
予測されたネオアンチゲンペプチドの中から，次項「②ネオアンチゲンペプ
チドリスト」の基準に従って選択されたペプチドの数を示します。予測された全ネオアンチゲンペプチドのうち，より治療に適していると考えられるペ
プチドの数を示しています。

HLA 型

全エクソーム／全ゲノムシーケンスデータから解析された HLA 型を示します。
ネオアンチゲンペプチドの予測に HLA 型が必要であるほか，免疫療法を行う
うえでも有用な情報になります。

②ネオアンチゲンペプチドリスト

検査概要および検査結果の見方

治療候補ペプチド数

予測された全ネオアンチゲンペプチドより選択されたネオアンチゲンペプチド（治療候補ペプチド）の情報を，
HLA 親和性の高い順に示します。
治療候補ペプチドは，以下の基準に従って選択されます。

ネオアンチゲン（治療候補ペプチド）選択基準
項目
結合する HLA 型

基準値
HLA-A もしくは -B

説明
予測された全ネオアンチゲンペプチドのうち，HLA-A
もしくは HLA-B に結合するペプチドのみを選択します。一般的に HLA-C は発現量が低いことから，対象から除外しています。

ネオアンチゲン発現量≧5

遺伝子変異を含む mRNA の発現量から，発現の高（20,000,000リード中）いネオアンチゲンを選択します。腫瘍検体の RNA
シーケンス解析を行わなかった場合（FFPE 検体を用いた場合等）は，がんの遺伝子発現データベース（TheCancer Genome Atlas（TCGA）データベース）における mRNA 発現量（中央値）を用いて選択します。（対象
がん種のデータセットを使用，標準基準値：≧100）≧5で選択されるネオアンチゲンペプチドがなかった
場合，≧1にて解析を行います。

ネオアンチゲンペプチドの≦50 nM

HLA 親和性HLA との親和性の高いネオアンチゲンペプチドを選択します。
≦50 nMで選択されるネオアンチゲンペプチドがなかった場合，≦500 nM にて解析を行います。
（≦50 nM は強い親和性，50～500 nM は弱い親和性を示します。）

同一変異由来の

最も HLA 親和性の強い

同一の遺伝子変異に由来する，異なるペプチド配列（アペプチドがあった場合

1種を選択

ミノ酸数の違いや，HLA 拘束性の違い等）が複数ある
場合に，最も HLA 親和性の高い一種を選択します。
（同一変異由来のペプチドもネオアンチゲンとして有用であると考えられますが，より多様な T 細胞を誘導するという観点で，このような選択を行っています。
）

52

QC
報告例2（検査中止時）：

検査概要および検査結果の見方③③③ DNA/RNA の QC 結果（核酸の品質）
検体から抽出した核酸（DNA/RNA）の品質が検査実施基準を満たさず，検査を中止した場合は，品質データを報
告いたします。
項目

内容

収量（µg）

検体より抽出した核酸（DNA もしくは RNA）の量

分解度

核 酸 の 分 解 度 を，DNA は DNA Integrity Number（DIN），RNA は RNA
Integrity Number（RIN）で示します。DIN/RIN はアジレント社の核酸品質測定システムで得られたプロファイルから核酸の分解度を客観的に評価する指標で，1～10の値で示します。
（1= 完全に分解された状態，10= ほとんど分解していない状態）

メインピーク（bp）（FFPE 検体の場合）
分解指標

DV200（%）（FFPE 検体の場合）

53

検体より抽出した DNA 中の，主要な断片のサイズを示します。

200ヌクレオチド以上の RNA 断片の割合を示します。

報告例3（追加データ解析

挿入・欠失変異）
：

Indel

⑤

検査概要および検査結果の見方

④
④

④解析結果
解析の結果として，以下の項目を示します。
項目
挿入・欠失遺伝子変異数
ネオアンチゲンペプチド数

内容すべての遺伝子変異のうち，挿入・欠失を伴う遺伝子変異数を示します。
挿入・欠失遺伝子変異によるアミノ酸置換ペプチドのうち，HLA クラスⅠ
（HLA-A，B および C）に結合すると予測されるペプチドの数を示します。
（同一の変異に由来する，異なるペプチド配列も含む）

治療候補ペプチド数

予測された，挿入・欠失遺伝子変異に由来するネオアンチゲンペプチドの中から，次項「⑤ネオアンチゲンペプチドリスト」の基準に従って選択されたペプ
チドの数を示します。予測された全ネオアンチゲンペプチドのうち，より治療に適していると考えられるペプチドの数を示しています。

HLA 型

全エクソーム／全ゲノムシーケンスデータから解析された HLA 型を示します。
ネオアンチゲンペプチドの予測に HLA 型が必要であるほか，免疫療法を行うう
えでも有用な情報になります。

54

⑤ネオアンチゲンペプチドリスト
予測された全ネオアンチゲンペプチドより選択されたネオアンチゲンペプチド（治療候補ペプチド）の情報を，

検査概要および検査結果の見方

HLA 親和性の高い順に示します。
治療候補ペプチドは，以下の基準に従って選択されます。

ネオアンチゲン（治療候補ペプチド）選択基準
項目
結合する HLA 型

基準値
HLA-A もしくは -B

説明
予測された全ネオアンチゲンペプチドのうち，HLA-A
もしくは HLA-B に結合するペプチドのみを選択します。一般的に HLA-C は発現量が低いことから，対象から除外しています。

ネオアンチゲン発現量≧5

遺伝子変異を含む mRNA の発現量から，発現の高（20,000,000リード中）いネオアンチゲンを選択します。腫瘍検体の RNA
シーケンス解析を行わなかった場合（FFPE 検体を用いた場合等）は，がんの遺伝子発現データベース（TheCancer Genome Atlas（TCGA）データベース）における mRNA 発現量（中央値）を用いて選択します。（対象
がん種のデータセットを使用，標準基準値：≧100）≧5で選択されるネオアンチゲンペプチドがなかった
場合，≧1にて解析を行います。

ネオアンチゲンペプチドの≦50 nM

HLA 親和性HLA との親和性の高いネオアンチゲンペプチドを選択します。
≦50 nMで選択されるネオアンチゲンペプチドがなかった場合，≦500 nM にて解析を行います。
（≦50 nM は強い親和性，50～500 nM は弱い親和性を示します。）

同一変異由来の

最も HLA 親和性の強い

同一の遺伝子変異に由来する，異なるペプチド配列（アペプチドがあった場合

1種を選択

ミノ酸数の違いや，HLA 拘束性の違い等）が複数ある
場合に，最もHLA 親和性の高い一種を選択します。
（同一変異由来のペプチドもネオアンチゲンとして有用であると考えられますが，より多様な T 細胞を誘導するという観点で，この選択を行っています。）

55

報告例4（追加データ解析

HLA クラスⅡ拘束性）：

検査概要および検査結果の見方

⑥
⑥

⑦
⑦

⑥解析結果
解析の結果として，以下の項目を示します。
項目内容

アミノ酸置換遺伝子変異数

すべての遺伝子変異のうち，アミノ酸置換を伴う遺伝子変異数を示します。
アミノ酸置換遺伝子変異数（TMB；Tumor Mutation Burden）は，免疫チェック
ポイント阻害薬の有効性と相関があることが報告されています。全がん種における TMB が102.5以上の場合は，PD-1抗体が有効であることが示されています。
（参考文献：Cristescu R, et al. Science. 2018;362（6411）.）

ネオアンチゲンペプチド数

アミノ酸置換ペプチドのうち，HLA クラスⅡ（HLA-DR）に結合すると予測されるペプチドの数を示します。
（同一の変異に由来する，異なるペプチド配列も含む）

治療候補ペプチド数

予測されたネオアンチゲンペプチドの中から，次項「⑦ネオアンチゲンペプチ
ドリスト」の基準に従って選択されたペプチドの数を示します。予測された全ネオアンチゲンペプチドのうち，より治療に適していると考えられるペプチドの数を示しています。

HLA 型

全エクソーム／全ゲノムシーケンスデータから解析された HLA 型を示します。
ネオアンチゲンペプチドの予測に HLA 型が必要であるほか，免疫療法を行うう
えでも有用な情報になります。

56

⑦ネオアンチゲンペプチドリスト
予測された全ネオアンチゲンペプチドより選択されたネオアンチゲンペプチド（治療候補ペプチド）の情報を，

検査概要および検査結果の見方

HLA 親和性の高い順に示します。
治療候補ペプチドは，次の基準に従って選択されます。

ネオアンチゲン（治療候補ペプチド）選択基準
項目
結合する HLA 型

基準値
HLA-DR

説明
検出された遺伝子変異情報から，HLA-DR に結合する
ネオアンチゲンペプチドを解析します。

ネオアンチゲン発現量≧5

遺伝子変異を含む mRNA の発現量から，発現の高い（20,000,000リード中）

ネオアンチゲンを選択します。腫瘍検体の RNA シー
ケンス解析を行わなかった場合（FFPE 検体を用いた場 合 等）は，が ん の 遺 伝 子 発 現 デ ー タ ベ ー ス（TheCancer Genome Atlas（TCGA）データベース）における mRNA 発現量（中央値）を用いて選択します。（対象
がん種のデータセットを使用，標準基準値：≧100）≧5で選択されるネオアンチゲンペプチドがなかった
場合，≧1にて解析を行います。

ネオアンチゲンペプチドの≦50 nM

HLA 親和性HLA との親和性の高いネオアンチゲンペプチドを選択します。
≦50 nMで選択されるネオアンチゲンペプチドがなかった場合，≦500 nM にて解析を行います。
（≦50 nM は強い親和性，50～500 nM は弱い親和性を示します。）

同一変異由来の

最も HLA 親和性の強い

同一の遺伝子変異に由来する，異なるペプチド配列（アペプチドがあった場合

1種を選択

ミノ酸数の違いや，HLA 拘束性の違い等）が複数ある
場合に，最もHLA 親和性の高い一種を選択します。
（同一変異由来のペプチドもネオアンチゲンとして有用であると考えられますが，より多様な T 細胞を誘導するという観点で，このような選択を行っています。
）

57

がん遺伝子発現解析
量を解析する検査です。
 オンコアンチゲンは，がん細胞で特異的に高発現し，正常細胞ではほとんど発現が認められないタンパク質で，がん細胞の生存や増殖に必須の機能を持ち，免疫反応を引き起こす抗原性を有しています。オンコアンチゲンに由来するペプチドを免疫治療に用いることにより，がん細胞を傷害する T 細胞を誘導することができます。
 また，免疫治療の効果は免疫チェックポイント分子や HLA の発現量等の影響を受けると考えられており※1，これらの分子の発現量を確認することで，免疫チェックポイント阻害剤の併用や抗原（HLA 拘束性）の選択等，治療の選択に役立てることができます。
（参考文献：Mizukami, et al, Cancer Sci. 2008;99（7）:1448-54.）

検査概要および検査結果の見方

 腫瘍検体の遺伝子解析により，オンコアンチゲンおよび免疫チェックポイント分子等免疫に関連する分子の発現※1：免疫チェックポイント分子が発現していると，免疫が抑制され，免疫治療の効果が抑えられることが知られています（参考文献：Ohaegbulam,et al. Trends Mol Med. 2015;21（1）:24-33.）。また，HLA 分子の発現が低い場合，がん細胞が抗原提示をできず，免疫細胞によるがん細胞の攻撃が期待できないと考えられています（参考文献：Hicklin, et al. Mol Med Today. 1999;5（4）:178-86.）。

● 検査方法
腫瘍検体（腫瘍組織等）から RNA を抽出してシーケンスを行い，オンコアンチゲンおよび免疫に関連する分子のがん細胞での遺伝子発現量を解析します。
①核酸抽出・品質確認
腫瘍検体（がん細胞）から RNA を抽出し，品質を確認します。
品質確認の結果，品質基準を満たさない場合はご連絡いたします。
（16ページ「検体の品質確認について」参照）① 核酸抽出RNA② RNA シーケンス解析
腫瘍検体から抽出した RNA を用い，RNA のシーケンシングを② RNAシーケンス解析③ 遺伝子発現情報の解析
がん遺伝子発現解析

解析フロー

行います。

③遺伝子発現情報の解析得られた腫瘍検体の RNA シーケンスデータから，オンコアン
チゲンおよび免疫に関連する分子のがん細胞での遺伝子発現量を解析します。

58

解析対象遺伝子
解析対象の遺伝子は，以下の通りです。

検査概要および検査結果の見方

分類
オンコアンチゲン（がん細胞における発現の亢進が報告されている遺伝⼦）

遺伝⼦名（別名）

遺伝⼦名（別名）

CDC45L（CDC45）

T 細胞への抗原提⽰に関連する

B2M

CDCA1（NUF2）

遺伝⼦

CALR

CDH3

CANX

DEPDC1

HLA-A

ECT2

HLA-B

FOXM1

HLA-C

GPC3

HLA-DPA1

HIG2（HILPDA）

HLA-DPB1

HJURP

HLA-DQA1KIF20A

HLA-DQA2

KNTC2（NDC80）

HLA-DQB1

KOC1（IGF2BP3）

HLA-DRAMELK

HLA-DRB1MPHOSPH1（KIF20B）

HLA-DRB5

NEIL3

HLA-E

RNF43

HLA-F

SPARC

HLA-G

TOMM34

HLA-H

TOPK（PBK）

IFNA1

UBE2T

IFNA2

URLC10（LY6K）

IFNB1

WDRPUH（WDR16）

IFNG

免疫細胞（T 細胞、B 細胞、

CD19

IRF1

抗原提⽰細胞）に関連する

CD28

MICA

CD4

MICB

CD68

PSMB8（LMP7）

CD80

PSMB9（LMP2）

CD86

TAP1

CD8A

TAP2

CD8B

TAPBP

遺伝⼦

IL2RA（CD25）
T 細胞の抗原認識および活性化

CD247に関連する遺伝⼦

CD27（TNFRSF7）
CD3D
CD3E
CD3G
GZMA
GZMB
ICOS
LAMP1（CD107a）
TNFRSF9（4-1BB）（次ページへつづく）

59

分類

（つづき）

ケモカイン / サイトカイン

遺伝⼦名（別名）
CCL17

分類
サイトカイン受容体

遺伝⼦名（別名）TNFRSF10ACCL19TNFRSF10B

CCL2TNFRSF10CCCL20TNFRSF10DCCL21

TNFRSF11ACCL22TNFRSF11B

CCL4

TNFRSF12ACCL5TNFRSF13B

CCR10TNFRSF13CCCR4TNFRSF14CCR5TNFRSF16（NGFR）

CCR6

TNFRSF17CCRL2TNFRSF19

CD40（TNFRSF5）TNFRSF19L（RELT）

CD40LG（CD40L, TNFSF5）TNFRSF1A

CD70（TNFSF7）TNFRSF1BCXCL10TNFRSF21

CXCL11TNFRSF25（DR3）CXCL13TNFRSF27（EDA2R）CXCL9TNFRSF3（LTBR）

FASLG（TNFSF6 ）TNFRSF6（FAS）

IL10

TNFRSF6B（DCR3）IL12ATNFRSF8（CD30）

IL12RB2

免疫抑制細胞

CTLA4

IL17A

（制御性 T 細胞）に関連する

FOXP3

IL17RB

遺伝⼦

TGFB1

IL23A

免疫チェックポイント分⼦

BTLA

IL6

（T 細胞の活性化抑制に関連

C10orf54（VISTA,VSIR）

PRF1

検査概要および検査結果の見方

分類する遺伝⼦）

CD274（PD-L1）

TBX21

CD276

TGFB2

HAVCR2（TIM3）

TGFB3

IDO1（IDO）

TNF（TNFA）

LAG3

TNFSF1（LTA）

PDCD1（PD-1）

TNFSF10PDCD1LG2（PD-L2）

TNFSF11TIGIT

TNFSF12TNFSF13
TNFSF13B
TNFSF14
TNFSF15
TNFSF18（GITRL）
TNFSF3（LTB）
TNFSF4（OX40L）
TNFSF8TNFSF9（4-1BBL）

60

● 検査結果報告の内容
検査概要および検査結果の見方「がん遺伝子発現解析」では，以下の結果を報告いたします。
（「ネオアンチゲン解析

追加データ解析

遺伝子発現解析」でも，同様の結果を報告いたします。）

報告例1：

①

発現

・・・

①遺伝子発現情報解析対象の各遺伝子の発現量を，TPM ※3で示します。
※3：TPM（transcripts per million）値
遺伝子の発現量を示す。遺伝子の長さや解析のばらつきに関わらず，遺伝子間の比較ができるように補正された値。

報告例2（検査中止時）：P. 53 「ネオアンチゲン解析」報告例2（検査中止時）と同様

61

分子標的治療薬選択 関連検査

 腫瘍検体と対照（正常）検体の遺伝子解析により，すべての遺伝子の中からがん細胞で起こっている遺伝子変異を解析する検査です。見つかった遺伝子変異のリスト，DNA ミスマッチ遺伝子修復遺伝子の変異の情報，および見つかった遺伝子変異に適応する分子標的治療薬候補を報告いたします。がん遺伝子パネルでは特定の遺伝子領域のみを確認するのに対し，がん遺伝子変異解析では全遺伝子領域を網羅的に解析します。（本検査では，遺伝性のがんに見られる遺伝子変異を対象とした解析は実施いたしません。）

検査概要および検査結果の見方

がん遺伝子変異解析● 検査方法
腫瘍検体（腫瘍組織等）と対照検体（血液等）から DNA を抽出してシーケンスを行い，それぞれのシーケンスデータの比較解析により，がん細胞で起きている遺伝子変異（DNA ミスマッチ修復遺伝子の変異を含む）を特定します。
さらに，特定された遺伝子変異のデータから，適応する分子標的治療薬候補を探索します。
①核酸抽出・品質確認
腫瘍検体（がん細胞）と対照検体（正常細胞）から DNA を抽出します。それぞれ品質を確認し，品質基準を満たさない場合はご連絡いたします。
（20ページ「検体の品質確認について」参照）① 核酸抽出DNA

DNA②全エクソーム解析② 全エクソーム解析

腫 瘍検体と対照検体から抽出した DNA を用いて，全エクソー
ムのシーケンシングを行います。
全エクソーム解析による解析対象の遺伝子は，ヒトの全遺伝子（約2万遺伝子）です。

③ 変異遺伝子の検出
がん細胞のみで起きている遺伝子変異を特定する④ 適応薬剤の探索
がん遺伝子変異解析③変異遺伝子の検出
腫瘍検体と対照検体の全エクソームシーケンスデータを比較することにより，がん細胞でのみ起きている遺伝子変異（DNA ミ
スマッチ修復遺伝子の変異も含む）を特定します。

解析フロー④適応薬剤の探索
分子標的治療薬のデータベースから，検出された遺伝子変異に適応する分子標的治療薬を探索します。対象のエビデンスレベ
ルはレベル1～4です。
（詳細は65ページ「検査結果報告の内容
③ OncoKB における適応薬剤候補」および「④適応薬剤候補」をご参照ください。
）

62

● 検査結果報告の内容
検査概要および検査結果の見方「がん遺伝子変異解析」では，以下の結果を報告いたします。
（「ネオアンチゲン解析

変異追加データ解析

遺伝子変異解析」でも，同様の結果を報告いたします。）

①

報告例1：

①
①

変異

②
②
②

OncoKBにおける適応薬剤候補検出された遺伝⼦変異に対する薬剤と、その薬剤に対応する⽇本国内の医薬品（PMDAにより承認された医療⽤医薬品）の情報（品名、薬効分
類、効能効果）のうち、OncoKB（http://www.oncokb.org/）によるエビデンスレベル1および2に該当する薬剤を⽰します。
各レベルの定義は以下の通りです。
レベル1︓当該がん種において、FDA承認を受けた治療薬への応答を予測するFDAが認めたバイオマーカー。
レベル2︓当該がん種において、FDA承認を受けた治療薬への応答を予測する標準治療バイオマーカー。もしくは，異なるがん種において，FDA承認を受けた治療薬への応答を予測する標準治療バイオマーカー。
（参考⽂献︓「次世代シークエンサー等を⽤いた遺伝⼦パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」）
遺伝⼦変異
遺伝⼦名

検出された
*1

変異

データベース上
*2

の表記

薬剤名と
組み合わせ

国内における医療⽤医薬品
品名

メクトビ
Binimetinib (Binimetinib)+
Encorafenib ビラフトビ(Encorafenib)
アービタックス
Cetuximab (Cetuximab)+
Encorafenib ビラフトビ(Encorafenib)
Cobimetinib

BRAF

p.V600E

V600E

ー(Cobimetinib)ー
Cobimetinib (Cobimetinib)+
Vemurafenib ゼルボラフ(Vemurafenib)

効能効果

抗悪性腫瘍剤
MEK阻害剤・BRAF遺伝⼦変異を有する根治切除不能な悪性⿊⾊腫

抗悪性腫瘍剤
BRAF阻害剤

・BRAF遺伝⼦変異を有する根治切除不能な悪性⿊⾊腫

抗悪性腫瘍剤
抗ヒトEGFRモノク
ローナル抗体・RAS遺伝⼦正常型の治癒切除不能な進
⾏・再発の結腸・直腸癌, 頭頸部癌

抗悪性腫瘍剤
BRAF阻害剤

・BRAF遺伝⼦変異を有する根治切除不能な悪性⿊⾊腫ーーーー

抗悪性腫瘍剤
BRAF阻害剤

・BRAF遺伝⼦変異を有する根治切除不能な悪性⿊⾊腫タフィンラー(Dabrafenib)

抗悪性腫瘍剤
BRAF阻害剤

・BRAF遺伝⼦変異を有する悪性⿊⾊腫
・BRAF遺伝⼦変異を有する切除不能な進
⾏・再発の⾮⼩細胞肺癌

タフィンラーDabrafenib (Dabrafenib)+
Trametinib メキニスト(Trametinib)

抗悪性腫瘍剤
BRAF阻害剤

・BRAF遺伝⼦変異を有する悪性⿊⾊腫
・BRAF遺伝⼦変異を有する切除不能な進
⾏・再発の⾮⼩細胞肺癌

抗悪性腫瘍剤
MEK阻害剤・BRAF遺伝⼦変異を有する悪性⿊⾊腫
・BRAF遺伝⼦変異を有する切除不能な進
⾏・再発の⾮⼩細胞肺癌

抗悪性腫瘍剤
抗ヒトEGFRモノク
ローナル抗体・RAS遺伝⼦正常型の治癒切除不能な進
⾏・再発の結腸・直腸癌, 頭頸部癌

抗悪性腫瘍剤
BRAF阻害剤

・BRAF遺伝⼦変異を有する根治切除不能な悪性⿊⾊腫

Dabrafenib

ベクティビックス
Panitumuma (Panitumumab)
b
+
ビラフトビ
Encorafenib (Encorafenib)

63

薬効分類

*3

③

その他の情報

レベル3︓説得⼒のある臨床的エビデンスが、当該がん種において治療薬への応答を予測するバイオマーカーであることを⽀持しているが、バイオマーカーも治療薬も標準治療ではない。もしくは、説得⼒のある臨床的エビデンスが、異なるがん種において治療薬への応答を予測するバイオマーカーであることを⽀持しているが、バイオマーカーも治療薬も標準治療ではない。
レベル4︓説得⼒のある⽣物学的エビデンスが治療薬への応答を予測するバイオマーカーであることを⽀持しているが、バイオマーカーも治療薬も標準治療ではない。
（参考⽂献︓「次世代シークエンサー等を⽤いた遺伝⼦パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」）

遺伝⼦名

KRAS

遺伝⼦変異
*1

検出された変異
p.G12D

データベース上の表記

発がん性及び変異の影響

この変異のエビデンスレベル

薬剤名と組み合わせ

*2

G12D

機能獲得型がん遺伝⼦変異*1︓全エクソームシーケンス解析で得られた遺伝⼦変異*2︓検出された変異に対応する、参照データベースにおける変異情報

3

Cobimetinib④④

検査概要および検査結果の見方検出された遺伝⼦変異に対する薬剤と、その薬剤に対応する⽇本国内の医薬品（PMDAにより承認された医療⽤医薬品）の情報（品名、薬効分
類、効能効果）のうち、OncoKBによるエビデンスレベル3および4に該当する薬剤を⽰します。
各レベルの定義は以下の通りです。

コメント:

遺伝⼦変異リスト

別紙参照［ご報告は以上です］

⑤
⑤

64

①解析結果解析の結果として，以下の項目を示します。

検査概要および検査結果の見方

項目内容

遺伝子変異数

挿入・欠失，サイレンス・ミスセンス変異を含むすべての遺伝子変異数

アミノ酸置換遺伝子変異数

すべての遺伝子変異のうち，アミノ酸置換を伴う遺伝子変異数
アミノ酸置換遺伝子変異数（TMB；Tumor Mutation Burden）は，免疫チェッ
クポイント阻害薬の有効性と相関があることが報告されています。全がん種における TMB が102.5以上の場合は，PD-1抗体が有効であることが示されています。
（参考文献：Cristescu R, et al. Science. 2018;362（6411）.）

HLA 型

全エクソームシーケンスデータから解析された HLA 型を示します。免疫療法を行ううえで有用な情報になります。

② DNA ミスマッチ修復遺伝子変異
検出された全遺伝子変異のうち，DNA ミスマッチ修復遺伝子 MLHs，MSHs，PMSs における遺伝子変異を示します。

DNA ミスマッチ修復について
DNA ミスマッチ修復とは，DNA を複製する時に生じた塩基配列のミスマッチ（間違い）を修正する機構です。
DNA ミスマッチ修復遺伝子が変異すると，DNA の複製ミスを修復できなくなるため，複製のたびにミスが蓄積される結果，遺伝子変異が増加し，細胞のがん化を引き起こします。また，マイクロサテライト（1～数塩基の塩基配列が繰り返す部分）の変異が起こりやすくなり，腫瘍組織と正常組織でマイクロサテライトの反復回数の違い（マイクロサテライト不安定性（MSI））が生じる原因となります。
遺伝子変異数や DNA ミスマッチ修復遺伝子変異は，免疫チェックポイント阻害薬の有効性と相関があることが報告されています（参考文献：Cristescu R, et al. Science. 2018;362（6411）.）。

③ OncoKB における適応薬剤候補
検出された遺伝子変異に対する薬剤（分子標的治療薬）と，その薬剤に対応する日本国内の医薬品（PMDA ※1により承認された医療用医薬品）の情報（品名，薬効分類，効能効果）を示します。
検出された遺伝子変異に対する薬剤は，知識ベース OncoKB ※2によるエビデンスレベル1および2に該当する薬剤より示します。各レベルの定義は以下の通りです。
（参考文献：
「次世代シークエンサー等を用いた遺伝子パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」）
レベル1：当該がん種において，FDA ※3承認を受けた治療薬への応答を予測する FDA が認めたバイオマーカー。
レベル2：当該がん種において，FDA 承認を受けた治療薬への応答を予測する標準治療バイオマーカー。
もしくは，異なるがん種において，FDA 承認を受けた治療薬への応答を予測する標準治療バイオマー
カー。
※1：医薬品医療機器総合機構※2：米国メモリアル・スローン・ケタリングがんセンターで開発された，がんプレシジョン医療に関する知識ベース。がんのゲノム変化に関する生物学的および臨床の情報が含まれています。
※3：米国食品医薬品局

65

④その他の情報（適応薬剤候補）
検出された遺伝子変異に対する薬剤（分子標的治療薬）と，その薬剤に対応する日本国内の医薬品（PMDA によりレベル3および4に該当する薬剤を示します。各レベルの定義は以下の通りです。
（参考文献：
「次世代シークエンサー等を用いた遺伝子パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」）
レベル3：説得力のある臨床的エビデンスが，当該がん種において治療薬への応答を予測するバイオマーカーであることを支持しているが，バイオマーカーも治療薬も標準治療ではない。もしくは，説得力のある臨床的エビデンスが，異なるがん種において治療薬への応答を予測するバイオマーカーである
ことを支持しているが，バイオマーカーも治療薬も標準治療ではない。
レベル4：説得力のある生物学的エビデンスが治療薬への応答を予測するバイオマーカーであることを支持しているが，バイオマーカーも治療薬も標準治療ではない。

検査概要および検査結果の見方承認された医療用医薬品）の情報（品名，薬効分類，効能効果）について，知識ベース OncoKB によるエビデンス⑤遺伝子変異リスト検出された遺伝子変異について，以下の結果を示します。
項目

内容

遺伝子名

変異が検出された遺伝子の名称

全長タンパク質内の全長タンパク質においてアミノ酸の変化している位置とアミノ酸の種類をアミノ酸置換位置示します。
例）

p.E545K・・・アミノ酸配列の545番目の E（グルタミン酸）がK（リシン）に置換されている
p.E545X・・・アミノ酸配列の545番目の E（グルタミン酸）が終止コドン（X）に置換されている
p.E545fs・・・アミノ酸配列の545番目の E（グルタミン酸）に
フレームシフト変異が起きている
p.545_550del・・・545～550番目のアミノ酸が欠失している
UNKNOWN・・・タンパク質に翻訳される領域が不明瞭であるため，変異による詳細が不明である場合

遺伝子変異タイプ

遺伝子変異のタイプを示します。
・nonsynonymous SNV：アミノ酸が置換され、タンパクの性質が変わる
一塩基変異（SNV）
・synonymous SNV：アミノ酸が置換されず、タンパクの性質が変わらない
一塩基変異（SNV）
・splicing：イントロンとエクソンのスプライシング部位に起こる変異・stopgain：アミノ酸のコドンを終止コドンに変える変異・stoploss：終止コドンが消失する変異・frameshift insertion：塩基の挿入によるフレームシフト変異・nonframeshift insertion：フレームシフトの起こらない塩基の挿入
・frameshift deletion：塩基の欠失によるフレームシフト変異・nonframeshift deletion：フレームシフトの起こらない塩基の欠失・unknown：タンパク質に翻訳される領域が不明瞭であるため，変異による詳細が不明である場合

66

項目

内容

検査概要および検査結果の見方

腫瘍組織における正常型のリード数， 全エクソーム解析によって得られた，腫瘍組織における正常型のリード数
変異型のリード数，
変異の頻度（全エクソーム解析結果）

および変異型のリード数，変異の検出頻度を順に示します。
例）35,6,0.146・・・正常型のリード数：35，
変異型のリード数：6，
変異の検出頻度：0.146（14.6%）

正常組織における正常型のリード数， 全エクソーム解析によって得られた，正常組織における正常型のリード数
変異型のリード数，
変異の頻度（全エクソーム解析結果）

および変異型のリード数，変異の検出頻度を順に示します。
例）35,0,0.000・・・正常型のリード数：35，
変異型のリード数：0，
変異の検出頻度：0.000（0%）

報告例2（検査中止時）：P. 53 「ネオアンチゲン解析」報告例2（検査中止時）と同様

67

Oncomine Pan-Cancer パネル解析
Cell-Free Assay（Thermo Fisher Scientific）による検査です。がん細胞から血液中に遊離した核酸（cfDNA およびcfRNA）を抽出し，がんに関連する遺伝子変異を検出します。検出された遺伝子変異の情報に加え，遺伝子変異に適応する分子標的治療薬を報告いたします。オプションの「リキッドバイオプシー 臨床検査情報レポート」では，検出された遺伝子変異に関連する臨床試験情報を報告します。
検査
遺伝子変異A

がん細胞から遊離したDNA

遺伝子変異B

検査概要および検査結果の見方

 主要ながん種に関連する遺伝子変異を含む，52遺伝子のリキッドバイオプシーパネル Oncomine™ Pan-Cancer

遺伝子変異C● 検査対象の遺伝子
がんに関連する遺伝子のうち，主要ながん種の遺伝子変異を網羅した全52遺伝子，900以上の変異箇所を対象とし，患者さんごとにどの遺伝子に変異があるかを検出するがん遺伝子パネル検査です。適応する分子標的治療薬※1がある遺伝子変異（actionable mutation）も含んでおり，治療効果が期待できる分子標的治療薬を見つけることができます。あらかじめ分離した血漿を検体とする場合は，核酸として cfDNA に加え cfRNA を利用できるため，より多くの遺伝子変異について解析ができます。
※1：FDA（米国食品医薬品局）承認薬および / もしくは日本国内において PMDA（医薬品医療機器総合機構）により承認された医療用医薬品

おもな対象がん種
膀胱がん，大腸がん，食道がん，胃がん，頭頚部がん，その他脳・中枢神経系がん，乳がん，子宮頸がん，
子宮内膜がん（子宮体がん），卵巣がん，腎がん，肝がん，肺がん，悪性黒色腫，膵がん，前立腺がん，肉腫，
甲状腺がん

等

標的遺伝子
900以上の変異箇所（ホットスポット※2，挿入・欠失）や TP53等のがん抑制遺伝子※3等を含む，全52遺伝子。
※2：遺伝子変異の多発域※3：細胞のがん化を防ぐためにはたらく遺伝子

ホットスポット遺伝子（1塩基変異，短い挿入・欠失）

がん抑制
遺伝子

コピー数
変異遺伝子

融合遺伝子

METエキソン
14スキッピング変異
MET

AKT1

FGFR3

MTOR

APC

CCND1

ALK

ALK

FGFR4

NRAS

FBXW7

CCND2

BRAF

AR

FLT3

NTRK1

PTEN

CCND3

ERG

ARAF

GNA11

NTRK3

TP53

CDK4

ETV1

BRAF

GNAQ

PDGFRA

CDK6

FGFR1

CHEK2

GNAS

PIK3CA

EGFR

FGFR2

CTNNB1

HRAS

RAF1

ERBB2

FGFR3

DDR2

IDH1

RET

FGFR1

MET

EGFR

IDH2

ROS1

FGFR2

NTRK1

ERBB2

KIT

SF3B1

FGFR3

NTRK3

ERBB3

KRAS

SMAD4

MET

RET

ESR1

MAP2K1

SMO

MYC

ROS1

FGFR1

MAP2K2FGFR2

MET「血液」検体の場合，検出可能な遺伝子変異「血漿」検体の場合，検出可能な遺伝子変異
赤字︓FDA承認薬のある標的遺伝子68

● 検査方法
検査概要および検査結果の見方

血液中に遊離した核酸（血漿検体の場合は cfDNA および cfRNA，血液検体の場合は cfDNA）を血漿より抽出し，品質確認を行います。抽出した核酸を用いて，がん遺伝子パネル「Oncomine™ Pan-Cancer Cell-Free Assay」（Thermo
Fisher Scientific）で解析を行います。同時に，バフィーコートからゲノム DNA を抽出し，同様のパネル検査を行います（偽陽性確認検査）。取得した遺伝子情報よりデータ解析を行い，結果を報告いたします。偽陽性確認検査は，血漿を用いたパネル検査で検出された遺伝子変異がクローン性造血（clonal hematopoiesis：CH）由来の変異（偽陽性）である可能性を確認するために行います。偽陽性確認検査においても同一の変異が検出された場合は，その遺伝子変異の検出は偽陽性と考えられるため，その旨を報告いたします。

採血

血漿＋バフィーコート
または

血液

核酸抽出・品質確認

・血漿→cfTNA または 血液→cfDNA・バフィーコート→ゲノムDNA

パネル検査

がん遺伝子パネル
Oncomine Pan-Cancer Cell-Free
Assay

偽陽性確認検査

データ解析

結果報告

遺伝子変異の検出

バフィーコートから抽出した
ゲノムDNAを用いた同様のパネル検査

偽陽性確認検査でも同じ変異が検出された場合は，偽陽性の可能性があるため，その旨を報告します。

検出された変異が正常な血液細胞でもみられる
クローン性造血由来の変異でないことを確認する
ための検査

リキッドバイオプシー（パネル解析）のながれ
偽陽性の確認について
リキッドバイオプシー検査では，がん由来ではないクローン性造血による遺伝子変異も，がん由来と同じくひとつの遺伝子変異として検出される場合があります。その場合，検査結果は偽陽性となり，一般的にリキッドバイ
オプシーの検査を行ううえで大きな懸念点とされています。
（参考文献：Acuna-Hidalgo, et al. Am J Hum Genet.
2017 6;101（1）:50-64.）
当社では，正常細胞（白血球等が含まれるバフィー

遺伝子変異
遺伝子変異

コート）を用いて同様の検査をすることにより，検出された遺伝子変異がクローン性造血由来の変クローン性造血異であるかどうかを確認しています。それにより，がん由来の遺伝子変異のみを報告することができ

増殖

血液細胞

クローン性造血による変異のある遺伝子ます。
（参考文献：Chang, et al. Mol Oncol. 2020; doi:
10.1002/1878-0261.12727.）

がん細胞●クローン性造血（clonal hematopoiesis：CH）
がん細胞から遊離したDNA（cfDNA）

遺伝子変異検出（がん由来）
遺伝子変異検出（偽陽性）

69

血液細胞が増えるときに，加齢等によって遺伝子変異を持った血液細胞が増えていく現象。

検査対象の遺伝子変異の検出率について

脳・中枢
神経系

遺伝子

頭頚部

甲状腺

肺

乳

食道

胃

大腸

肝

膵

腎

膀胱

前立腺

子宮頚

子宮内膜

悪性
黒色腫

卵巣

肉腫

ホットスポット・
がん抑制遺伝子

AKT1
ALK
APC
AR
ARAF
BRAF
CHEK2
CTNNB1
DDR2
EGFR
ERBB2
ERBB3
ESR1
FBXW7
FGFR1
FGFR2
FGFR3
FGFR4
FLT3
GNA11
GNAQ
GNAS
HRAS
IDH1
IDH2
KIT
KRAS
MAP2K1
MAP2K2
MET
MTOR
NRAS
NTRK1
NTRK3
PDGFRAPIK3CA
PTEN
RAF1
RET
ROS1
SF3B1
SMAD4
SMO
TP53

1.09

3.16

5.77

4.35

1.25

62.66

1.98

12.87

1.37

1.10

1.17

2.40

1.55

2.76

5.14

7.55

2.17

1.18

1.13

2.37

1.41

5.87

1.87

6.08

12.62

73.76

4.35

2.21

1.14

1.10

6.54

5.83

1.36

1.10

3.04

3.43

5.10

1.19

1.25

1.38

2.21

1.98

3.94

1.10

1.24

6.31

11.66

1.64

1.54

2.21

6.54

6.17

1.10

3.04

25.54

4.12

8.94

1.55

3.31

5.37

3.26

2.50

2.49

4.97

4.44

3.95

3.36

2.31

2.28

1.66

10.05

4.97

1.38

2.69

1.24

1.10

2.34

4.12

7.11

4.13

1.66

4.97

9.11

17.50

1.09

1.73

1.24

3.74

4.12

2.79

1.45

1.10

4.21

3.26

3.50

4.12

1.58

2.21

1.10

4.67

2.23

1.78

1.54

4.33

3.87

2.57

2.57

1.58

3.08

4.70

3.14

10.96

6.17

1.18

3.21

1.18

1.98

2.37

3.21

2.36

1.18

1.41

5.73

3.87

14.87

2.64

10.02

9.98

1.20

4.26

1.74

8.02

1.50

1.39

6.46

1.74

6.26

1.49

1.74

26.61

5.98

3.14

3.71

7.44

1.20

2.72

4.18

8.02

1.20

3.33

5.57

8.22

2.62

10.76

1.74

5.48

11.85

19.57

1.09

1.98

1.05

5.87

4.69

1.90

3.21

1.74

15.85

9.83

1.13

14.07

3.17

1.04

1.19

4.14

5.09

4.48

1.74

7.05

6.41

3.14

9.98

11.09

1.48

1.39

2.72

3.14

2.54

2.22

2.57

5.49

3.26

9.11

42.02

1.63

1.73

1.66

1.64

2.57

1.48

1.78

8.52

2.10

2.23

1.66

2.34

3.95

5.19

2.38

3.31

7.71

1.06

62.72

7.38

2.45

1.36

1.78

3.65

2.21

3.04

2.40

1.36

2.37

3.16

8.27

2.76

4.21

4.80

3.80

1.18

2.51

2.37

6.73

1.10

4.21

6.17

2.45

8.77

17.00

8.17

34.30

8.29

15.89

25.04

3.53

16.17

2.57

6.25

5.39

2.76

2.72

8.18

6.52

2.57

2.77

4.33

1.14

3.31

4.44

5.32

1.36

5.93

6.63

2.07

3.31

5.84

8.23

2.17

1.19

3.17

1.66

1.10

2.57

4.29

2.72

1.18

2.57

2.88

6.63

7.48

12.18

1.09

21.30

1.10

4.67

3.09

84.53

46.50

59.69

66.06

34.30

●

ERBB2

融合遺伝子

ALK
ROS1
NTRK

●
●

●

●

（％）
100
50
40
30
20
10
5
1

100

50

40

30

20

10

5

●
●
●

●
●

●
●

5.12

1.57

1.71

4.11

5.56

2.72

3.14

9.59

2.16

5.23

19.37

1.20

1.74

3.13

6.20

4.31

1.92

1.13

5.43

1.07

1.05

1.28

4.53

13.11

1.05

4.31

2.22

1.39

6.26

1.92

8.12

2.72

3.14

9.20

4.94

2.09

9.59

1.92

10.23

49.51

2.40

65.36

1.20

21.23

2.57

28.22

3.95

3.43

7.32

2.22

●

●

10.18

1.92

13.70

1.92

9.98

2.22

1.07

4.18

4.50

1.39

5.68

7.32

37.77

49.63

11.56

●

●

2.99

2.99

7.69

23.03

5.13

2.77

88.01

●

●
●

2.99

9.38

3.41

3.83

1.07

5.20

11.73

1.39

5.43

2.14

8.76

27.08

1.39

4.94

1.98

58.58

1.68

6.07

1.27

1.71

11.09

4.20

1.98

2.25

1.18

29.35

5.13

2.35

11.35

1.48

1.03

2.02

1.13

3.66

1.71

70.55

5.06

2.37

1.25

40.43

3.20

4.20

1.48

3.52

6.52

2.34

1.28

2.56

1.20

7.83

1.07

1.71

6.07

2.21

1.04

1.71

2.99

2.47

4.94

1.90

1.10

3.17

3.41

1.20

4.31

1.63

15.10

1.38

1.03

1.20

1.73

2.23

2.37

10.87

4.26

5.23

1.18

1.54

1.48

3.20

9.14

1.03

47.49

50.32

10.62

2.96

2.56

2.35

1.73

1.63

4.29

7.24

13.22

4.18

4.18

1.89

1.35

2.13

2.40

1.71

2.47

2.17

1.20

1.17

2.09

3.46

1.48

1.18

3.36

2.17

1.73

1.18

2.17

コピー数変異凡例︓

2.90

検査概要および検査結果の見方

本検査の対象となる遺伝子変異について，がん種別の検出頻度は以下の通りです。

●

14.50

37.61

●
●

●

●

例︓
APC 遺伝子変異︓大腸がん症例の約70%に APC 遺伝子変異が確認されている
KRAS 遺伝子変異︓膵がん症例の約60%に KRAS 遺伝子変異が確認されている
BRAF 遺伝子変異︓悪性黒色腫症例の約50%に BRAF 遺伝子変異が確認されている

1

参照データベースおよび文献︓
 遺伝子変異The Cancer Genome Atlas（TCGA）データベース（https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/tcga）
 ERBB2 コピー数変異
HER2 がんの特徴と治療戦略（乳がん，胃がん，胆管がん，肺がん等）医学のあゆみ 269 (3), 199-202, 2019-04-20
 ALK 融合遺伝子
Morris, et al. Science. 267(5196): 316-317, 1995，Lin, et al. Mol. Cancer Res. 7: 1466-1476, 2009，
日本肺癌学会「肺癌患者における ALK 融合遺伝子検査の手引き」（2021 年 10 月 20 日 第 4.0 版）
 ROS1 融合遺伝子
Charest, et al. Genes Chromosomes Cancer. 37(1): 58-71, 2003，
Rikova, et al. Cell. 131(6): 1190-1203, 2007，Lee, et al. Cancer 119: 1627-1635, 2013，
Birch, et al. PLoS One 6: e28250, 2011
 NRTK 融合遺伝子
Jones, et al. Nat Genet 45(8): 927-932, 2013，Stransky, et al. Nat Commun 5: 4846, 2014，
Leeman-Neill, et al. Cancer 120(6): 799-807, 2014，Laé, et al. Mod Pathol 22(2) : 291-98, 2009，
Vaishnavi, et al. Nat Med 19(11): 1469-72, 2013，Créancier, et al. Cancer Lett 365(1): 107-111, 2015，
Zehir, et al. Nat Med 23(6): 703-713, 2017，Wiesner, et al. Nat Commun 5: 3116 791-798, 2014.

70

追加解析について

検査概要および検査結果の見方

Oncomine Pan-Cancer パネル解析では，以下の解析を追加で行うことができます。
リキッドバイオプシー

Oncomine Pan-Cancer パネル解析の検査結果に基づき，関連する臨床試験

臨床試験情報レポート

情報を報告いたします。

追加データ解析ネオアンチゲン解析「Oncomine Pan-cancer パネル解析」で取得したデータを用いて，ネオアン
チゲンを予測します。
検査対象：HLA クラスⅠ（HLA-A および -B），SNV

検査の限界について・リキッドバイオプシーによる検査は，体内に存在するがんをすべて検出できるものではありません。がん細胞から血液中に流れ出ている cfDNA 量が十分にない場合（低腫瘍量や粘液がん等）や，がんの遺伝子異常のタイプによって，検出できない場合があります。
・リキッドバイオプシーで検出される遺伝子変異から，がんの部位を特定することはできません。

● 検査結果報告の内容
報告例1：

①

LB

71

②

検査概要および検査結果の見方

③

④
④

72

検査概要および検査結果の見方⑤⑥①核酸（cfDNA）抽出結果
血漿1 mL あたりから抽出された cfDNA の量を示します。
cfDNA 量によるがんのモニタリングの基準値については，80ページ「cfDNA 定量検査」をご参照ください。

②遺伝子変異検出結果
変異が検出された※4遺伝子について，以下の情報を示します。
項目

内容

遺伝子名

変異の検出された遺伝子名

遺伝子変異

遺伝子が変異している箇所を示します。
例）塩基変異：c.35G>A・・・当該遺伝子の塩基配列35番目の G が A に変異
アミノ酸置換：p.G12D・・・アミノ酸配列の12番目の G（グリシン）がD（アスパラギン酸）に置換されている

変異タイプ

遺伝子変異のタイプを示します。
SNV：一塩基変異

検出頻度（％）

Indel：挿入・欠失変異

各遺伝子において変異が検出された頻度を示します（各遺伝子全リード数中の変異の割合）。

偽陽性確認検査でのバフィーコートを用いた偽陽性確認検査における，各遺伝子変異の検出頻度を示します。

検出頻度（％）

バフィーコートから変異が検出された場合（＝クローン性造血由来の変異（偽陽性）の可能性が考えられる場合）は，備考欄に「クローン性造血由来の変異の可能性があります」と表示されます。

73

項目

内容
検出された遺伝子変異について，血漿での検出頻度とバフィーコートを用いた偽陽性

検出頻度と偽陽性

確認検査での検出頻度をグラフで示します。各遺伝子変異について，偽陽性であるこ確認検査結果の比較とを確認できます。
例）報告例1において，BRAF（左），TP53（中央）・・・バフィーコートからの遺伝子変異の検出なし（がん由来の遺伝子変異）
GNAS（右）・・・バフィーコートからの遺伝子変異の検出あり（クローン性造血由来の偽陽性）※4：遺伝子変異の陽性基準値（カットオフ値）は以下の通りです。
項目

検査概要および検査結果の見方

各遺伝子変異の陽性基準値

検出カウント≧3

検出頻度≧0.07％③ OncoKB における適応薬剤候補
検出された遺伝子変異に対する薬剤（分子標的治療薬）と，その薬剤に対応する日本国内の医薬品（PMDA ※5により承認された医療用医薬品）の情報（品名，薬効分類，効能効果）を示します。検出された遺伝子変異に対する薬剤は，知識ベース OncoKB ※6によるエビデンスレベル1および2に該当する薬剤より示します。各レベルの定義は以下の通りです。
（参考文献：
「次世代シークエンサー等を用いた遺伝子パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」）
レベル 1：当該がん種において，FDA ※7承認を受けた治療薬への応答を予測する FDA が認めたバイオマーカー。
レベル2：当該がん種において，FDA 承認を受けた治療薬への応答を予測する標準治療バイオマーカー。
もしくは，異なるがん種において，FDA 承認を受けた治療薬への応答を予測する標準治療バイオマー
カー。
※5：医薬品医療機器総合機構※6：米国メモリアル・スローン・ケタリングがんセンターで開発された，がんプレシジョン医療に関する知識ベース。がんのゲノム変化に関する生物学的および臨床の情報が含まれています。
※7：米国食品医薬品局④その他の情報（適応薬剤候補）
検出された遺伝子変異に対する薬剤（分子標的治療薬）と，その薬剤に対応する日本国内の医薬品（PMDA により承認された医療用医薬品）の情報（品名，薬効分類，効能効果）について，知識ベース OncoKB によるエビデンス
レベル3および4に該当する薬剤を示します。各レベルの定義は以下の通りです。
（参考文献：
「次世代シークエンサー等を用いた遺伝子パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」）
レベル3：説得力のある臨床的エビデンスが，当該がん種において治療薬への応答を予測するバイオマーカーであることを支持しているが，バイオマーカーも治療薬も標準治療ではない。もしくは，説得力のある臨床的エビデンスが，異なるがん種において治療薬への応答を予測するバイオマーカーであることを支持しているが，バイオマーカーも治療薬も標準治療ではない。
レベル4：説得力のある生物学的エビデンスが治療薬への応答を予測するバイオマーカーであることを支持しているが，バイオマーカーも治療薬も標準治療ではない。

⑤品質確認結果
検査工程での品質確認の結果を示します。

74

⑥検査実施項目検査を実施した項目（遺伝子）を示します。

検査概要および検査結果の見方

報告例2（検査中止時）：⑦⑦

核酸の品質が検査実施基準を満たさなかった場合に，検体から抽出した核酸（血漿検体の場合は cfTNA，血液検体の場合は cfDNA）の品質データを報告いたします。

報告例3（追加データ解析

75⑦核酸の品質（検査中止時のみ）

ネオアンチゲン解析）：P. 51 「ネオアンチゲン解析」報告例1と同様

リキッドバイオプシー

臨床試験情報レポート

たします。
 レポート作成は，ライフテクノロジーズジャパン株式会社へ解析データを送付して行います。解析データは，レポー
ト作成業務完了後に破棄もしくはサーバーから削除されます。

①関連するバイオマーカー
検出された遺伝子変異に関連する承認薬の情報（関連治療情報，臨床試験数）を示します。

②変異の詳細検査概要および検査結果の見方

 「Oncomine Pan-Cancer パネル解析」の検査結果に基づき，関連する分子標的治療薬や臨床試験の情報を報告い検出された遺伝子変異の詳細な情報（遺伝子名，アミノ酸変化，コーディング，変異 ID，遺伝子座，アリル頻度，
転写産物，変異の影響）を示します。
（遺伝子変異のタイプにより，一部の項目は表示されない場合があります。
）③関連治療情報（概要・詳細）
検出された遺伝子変異に関連する治療（分子標的治療薬）について，各国の承認状況※と，日本国内を含む各国の臨床試験の進行状況（詳細は④）を示します。
※米国…

FDA（米国食品医薬品局），NCCN（全米総合癌センターネットワーク）

欧州…

EMA（欧州医薬品庁），ESMO（欧州臨床腫瘍学会）④臨床試験情報検出された遺伝子変異に関連する治療（分子標的治療薬）について，日本国内を含む各国の臨床試験の詳細を示します。

76

検査概要および検査結果の見方

治療効果・再発のモニタリング 関連検査
（デジタル PCR・cfDNA 定量・IFN-γ ELISPOT 解析）
デジタル PCR
 パネル解析等によりあらかじめ特定された遺伝子変異について，簡便かつ高感度に検出する検査で，検査対象の遺伝子変異の検出頻度を報告いたします。血液中に存在する cfDNA の遺伝子変異の検出頻度は，手術や治療等でがんが縮小すると数値が下がり，がんの進行や再発により増大すると数値が上がる傾向があります。そのため，定期的にデジタル PCR の検査を行うことで，がんの治療効果やがんの進行・再発をモニタリングすることができます。
（参考文献：Suzuki, et al. Oncotarget. 2020; 11:3198-3207.）● 検査対象の遺伝子変異「デジタル
PCR」では，パネル解析等によりあらかじめ特定されている遺伝子変異の中から，モニタリングする遺伝子変異を選択します。解析が可能な遺伝子変異は，以下の通りです。（掲載のない遺伝子変異での検査をご希望の場合は，ご相談ください。
）
遺伝子

77

塩基変異

アミノ酸置換遺伝子

塩基変異

アミノ酸置換APC

c.4216C>T

p.Q1406Ter

SF3B1

c.2098A>G

p.K700E

BRAF

c.1799T>A

p.V600ETP53

c.517G>A

p.V173M

FGFR3c.742C>T

p.R248C

c.536A>G

p.H179R

GNAS

c.602G>A

p.R201H

c.569C>T

p.P190L

IDH1

c.394C>T

p.R132C

c.584T>C

p.I195T

c.394C>A

p.R132S

c.586C>T

p.R196Ter

IDH2

c.419G>A

p.R140Q

c.659A>G

p.Y220C

KRAS

c.34G>T

p.G12Cc.701A>G

p.Y234C

c.35G>A

p.G12Dc.734G>A

p.G245D

c.34G>A

p.G12Sc.733G>A

p.G245S

c.35G>T

p.G12Vc.742C>T

p.R248W

c.38G>A

p.G13Dc.817C>T

p.R273C

c.183A>C

p.Q61Hc.818G>A

p.R273H

c.182A>T

p.Q61Lc.818G>T

p.R273L

MAP2K1c.370C>T

p.P124S

c.838A>G

p.R280G

NRAS

c.35G>A

p.G12Dc.844C>T

p.R282W

PIK3CAc.263G>A

p.R88Q

c.1624G>A

p.E542K

c.1633G>A

p.E545K

● 検査方法行います。抽出した核酸を用いて，デジタル PCR 法を用いて検査対象の遺伝子変異を検出し，その頻度を算出します。

採血

核酸（cfDNA）抽出・
品質確認

血漿 または 血液デジタルPCR検査

データ解析

結果報告

遺伝子変異の検出頻度の算出

検査概要および検査結果の見方

血 液，もしくは血液から分離した血漿より，がん細胞やがん組織から遊離した核酸（cfDNA）を抽出し，品質確認を● 検査結果報告の内容「デジタル PCR」では，以下の結果を報告いたします。

報告例1：

検査対象の遺伝⼦変異
遺伝⼦名

塩基変異

※

アミノ酸置換c.35G>T

KRAS

①
①

※

p.G12V※遺伝⼦が変異している箇所を⽰します。
例）遺伝⼦名︓KRAS ，塩基変異︓c.35G >A，アミノ酸置換︓p.G12Vの場合…KRAS 遺伝⼦の塩基配列の35番⽬のGがTに変異し、アミノ酸配列の12番⽬のGがVに置換している。

【今回の結果】
核酸の品質（cfDNA抽出結果）
cfDNA量 (ng/mL)

※

②
②

88.2
※⾎漿1mLあたりから抽出されたcfDNA量

遺伝⼦変異検出結果
遺伝⼦名
KRAS

c.35G>T

検出カウントアミノ酸置換

塩基変異

正常型

p.G12V③（今回分）（今回分）③

検出頻度（%）

変異型
8

2588

0.31

コメント

【前回までの結果】
遺伝⼦変異検出結果
検査依頼⽇
今回

遺伝⼦名

20XX/XX/XX KRAS

塩基変異
c.35G>T

アミノ酸置換

検出カウント正常型③（今回および過去分）③（今回および過去分）

検出頻度（%）

変異型

p.G12V

2588

8

0.31

20XX/XX/XX KRAS

c.35G>T

p.G12V

3063

44

1.42

20XX/XX/XX KRAS

c.35G>T

p.G12V

2867

0

0.00

20XX/XX/XX KRAS

c.35G>T

p.G12V

2553

13

0.51

20XX/XX/XX KRAS

c.35G>T

p.G12V

2680

310

10.37

遺伝⼦変異検出頻度の経時変化
遺伝⼦変異検出頻度の経時変化

KRAS
KRAS c.35G>T
c.35G>T

検出頻度（%）
検出頻度（%）

12.00
12.00

③
③
③

10.37
10.37

10.00
10.00
8.00
8.00
6.00
6.00

0.00
0.00

⾎漿量
⾎漿量

cfDNA濃度cfDNA濃度✔
✔

✔
✔

ddPCR解析
ddPCR解析
ドロップレット作製 ドロップレット測定
ドロップレット作製 ドロップレット測定

4.00
4.00
2.00
2.00

品質確認結果
品質確認結果
核酸抽出
核酸抽出

0.51
0.51

0.00
0.00

1.42
1.42

0.31
0.31

検査番号
検査番号

✔
✔

✔
✔

cfDNAサイズ
cfDNAサイズ／gDNA混⼊／gDNA混⼊

判定
判定

✔
✔

✔
✔

データ解析
データ解析

判定
判定

✔
✔

✔
✔

④
④
④

✔︓品質に問題なし✔︓品質に問題なし［ご報告は以上です］［ご報告は以上です］

78

①検査対象の遺伝子変異
検査対象の遺伝子変異について，以下の情報を示します。

検査概要および検査結果の見方

項目

内容

遺伝子名

検査対象の遺伝子の名称

塩基変異

検査対象とする塩基変異を示します。
例）c.35G>T…塩基配列の35番目の G（グアニン）が T（チミン）に変異している

アミノ酸置換

塩基変異によってアミノ酸が置換している箇所を示します。
例）p.G12V…アミノ酸配列の12番目の G（グリシン）が V（バリン）に置換している②核酸（cfDNA）抽出結果
血漿1 mL あたりから抽出された cfDNA の量を示します。
cfDNA 量によるがんのモニタリングの基準値については，80ページ「cfDNA 定量検査」をご参照ください。

③遺伝子変異検出結果
検査対象の遺伝子変異について，今回および過去の計10回まで（最長5年間）の検出結果を示します。以下の情報を示します。
項目内容検出カウント

検査対象の遺伝子について，正常型と変異型の検出カウントをそれぞれ示します。

遺伝子変異の検査対象の遺伝子変異が検出された頻度（正常型と変異型の合計カウント数中の変異検出頻度（％）

型検出カウントの割合）を示します。

遺伝子変異検出頻度の経時変化

遺伝子変異の検出頻度の経時変化をグラフで示します。

④品質確認結果
検査工程での品質確認の結果を示します。
報告例2（検査中止時）：P. 75 「Oncomine Pan-Cancer パネル解析」報告例2（検査中止時）と同様

79

cfDNA 定量検査や治療効果・再発をモニタリングする検査です。
 血液中に流れ出した cfDNA の量は，健常人では少なく，がん患者さんでは多くなることが知られています。また，体内に存在する腫瘍が大きくなるほど，血液中に流れ出す cfDNA の量が増加する傾向があり，cfDNA 量を測定する
ことによって，がんの健康診断やモニタリングに利用することができます。
（社内データ，および参考文献：Newman,
et al. Nat Med. 2014;20（5）:548-54, Kustanovich, et al. Cancer Biol Ther.
2019;20（8）:1057-1067.）● 検査方法

検査概要および検査結果の見方

 一定量の血液中に含まれる，がん細胞やがん組織から遊離した核酸（cfDNA）の量を測定することで，がんの有無

血液，もしくは血液から分離した血漿より，がん細胞やがん組織から遊離した核酸（cfDNA）を抽出し，血漿1 mL
あたりの cfDNA 濃度を測定します。

採血

核酸抽出

血漿＋バフィーコート

血漿→cfTNA血液血液→cfDNA

またはまたは

cfDNA定量検査

結果報告

cfDNA定量検査

Oncomine Pan-Cancerパネル解析
パネル検査

がん遺伝子パネル
Oncomine Pan-Cancer
Cell-Free Assay

データ解析

遺伝子変異の検出

リキッドバイオプシー（パネル解析）結果報告

 「cfDNA定量検査」で抽出した核酸を使用して，続けて「Oncomine Pan-cancer パネル解析 cfDNA 定量検査後」を実施することができます。検査内容は「Oncomine Pan-cancer パネル解析」と同一です。

80

検査概要および検査結果の見方

検査結果報告の内容●●
検査結果報告の内容● 検査結果報告の内容
報告例：
報告例︓
報告例︓

検査概要および検査結果の⾒⽅
検査概要および検査結果の⾒⽅①

品質確認結果
品質確認結果

核酸抽出
核酸抽出

品質確認項目
品質確認
品質確認項目
品質確認
品質に問題なし
cfDNA濃度 (ng/μL)
品質に問題なし
cfDNA濃度 (ng/μL)
cfDNAサイズ
品質に問題なし
cfDNAサイズ
品質に問題なし※3
品質に問題なし
gDNA混⼊※3
品質に問題なし
gDNA混⼊※48ng以上︓パネル解析が可能です
cfDNA量※48 ng以上︓パネル解析が可能です
cfDNA量※3 gDNAの混⼊を認めた場合、オプションとしてがんの遺伝⼦変異を検出する「リキッドバイオプシー（パネル解析）」を実施するためには再度採⾎が必要です。
※3 gDNAの混⼊を認めた場合、オプションとしてがんの遺伝⼦変異を検出する「リキッドバイオプシー（パネル解析）」を実施するためには再度採⾎が必要です。
※4 cfDNA量 8 ng以上の場合、オプションとしてがんの遺伝⼦変異を検出する「リキッドバイオプシー（パネル解析）」を実施することが可能です。
※4 cfDNA量 8 ng以上の場合、オプションとしてがんの遺伝⼦変異を検出する「リキッドバイオプシー（パネル解析）」を実施することが可能です。
cfDNA量 8 ng未満の場合、「リキッドバイオプシー（パネル解析）」を実施するためには再度採⾎が必要となります。
cfDNA量 8 ng未満の場合、「リキッドバイオプシー（パネル解析）」を実施するためには再度採⾎が必要となります。

②②②［ご報告は以上です］［ご報告は以上です］① 核酸（cfDNA）測定結果① 核酸（cfDNA）測定結果抽出された核酸（cfDNA）について，以下の情報を⽰します。検査結果は，今回および過去の計 10 回まで（最⻑ 5 年間）の抽出された核酸（cfDNA）について，以下の情報を⽰します。検査結果は，今回および過去の計 10 回まで（最⻑ 5 年間）の結果を⽰します。
結果を⽰します。
項目
項目
cfDNA 濃度cfDNA 濃度（ng/mL）（ng/mL）

81

内容
内容
⾎漿 1 mL あたりから抽出された cfDNA の量を，数値および経時変化のグラフで⽰します。
⾎漿 1 mL あたりから抽出された cfDNA の量を，数値および経時変化のグラフで⽰します。

①核酸（cfDNA）測定結果
抽出された核酸（cfDNA）について，以下の情報を示します。検査結果は，今回および過去の計10回まで（最長5項目

内容

cfDNA 濃度

血漿1 mL あたりから抽出された cfDNA の量を，数値および経時変化のグラフで示します。

（ng/mL）
cfDNA レベルcfDNA 濃度から区分したレベルを示します。（根拠データは，次ページ「参考データ」をご参照ください。）
レベル
L1
L2
L3

cfDNA 濃度検査概要および検査結果の見方年間）の結果を示します。

説明4.20 ng/mL 未満 健常者の67.5％が示すレベルです。
健常者の21.5％，ステージ I/II のがんに罹患している人の32.2％

4.20～7.40 ng/mL が示すレベルです。
7.41 ng/mL 以上

健常者の11.0％，ステージ I/II のがんに罹患している人の50.4％が示すレベルです。

L2，L3の場合は，定期的な検査によるモニタリングをご検討ください。
ただし，cfDNA 濃度には個人差があるため，L2や L3であっても継続的な増加が認められない
場合は，がんに起因するものではないことが考えられます。（継続的な増加については，以下の「前回比」を参照してください。）
前回比（％）

前回値からの変化の割合を示します。
体内に存在するがんが大きくなるほど，血液中に流れ出す cfDNA の量が増加することが知られています。そのため，cfDNA 濃度をモニタリングすることによって，がんの有無や大きさの変化をモニタリングすることができます。
前回と比較して50% 以上の増加が認められる場合や，50％未満であっても継続して増加傾向が認められる場合，がんが存在している可能性が考えられます。
前回比

説明+50％以上

前回より50% 以上の増加が認められます。精密検査の実施をご検討ください。

±50％未満-50％以下cfDNA 濃度の前回と比較して，数値に大きな変動は認められません。
以前より継続して増加があった場合は，精密検査の実施をご検討ください。
前回より50% 以上減少しています。治療を受けている場合は，治療の効果を反映していると考えられます。

cfDNA 濃度の経時変化をグラフで示します。

経時変化②品質確認結果
検査工程での品質確認の結果を示します。

82

● 参考データ（当社データ）
図 a はがん患者さん202名（胃がん・大腸がん ステージⅠ/Ⅱ
115名，ステージⅢ / Ⅳ 87名）の cfDNA 濃度を示します。
がんが進行すると cfDNA 濃度も上昇する傾向が見られます。

⾎漿中のcfDNA濃度 (ng/mL)

検査概要および検査結果の見方

がん患者における cfDNA 濃度

ま た，健 常 者 200 名 の cfDNA 濃 度 の 中 央 値 3.53 ng/mL（社内データ）に対し，ステージⅠ/Ⅱのがん患者さんでは7.41 ng/mLであり，顕著な差が認められています。
（P<0.0001）（参考文献：Suzuki, et al. Oncotarget. 2020; 11:3198-3207.）

がん患者
ステージI/II
n=115

がん患者
ステージIII/IV
n=87

がん患者における血漿中の cfDNA 濃度（図 a）

cfDNA レベルの基準値
感度 83.5％
特異度 67.5％

50.4％
89.0％

L1

L2

L3

4.20未満

4.20〜7.40

7.41以上

⼈数（人）

80
60
40
20

感度…ある疾患を持つ人のうち，検査で陽性と正しく判定される割合

0

特異度…ある疾患を持たない人のうち，血漿中のcfDNA濃度（ng/mL）

検査で陰性と正しく判定される割合

健常者200名の cfDNA 濃度の分布（図 b）
健 常者200名の cfDNA 濃度を測定した結果，図 b に示す通りに分布していました。各 cfDNA 濃度に対応する
cfDNA レベル（L1～ L3）は図中に示す通りです。
「感度」はステージⅠ/Ⅱのがん患者さん115名（胃がん・大腸がん）の cfDNA 濃度測定値より算出しており（図 aおよび次ページ「補足」参照），基準値を上回るステージⅠ/Ⅱのがん患者さんの割合を示します。
「特異度」は基準値を下回る健常者の割合を示します。図 b に示す通り，L1の基準値

cfDNA 濃度4.20 ng/mL を上回るステー

ジⅠ/Ⅱ の が ん 患 者 さ ん の 割 合 は83.5%，4.20 ng/mL を 下 回 る 健 常 者 は67.5％ と な り，同 様 に L3の 基 準 値
7.41 ng/mL を上回るステージⅠ/Ⅱのがん患者さんの割合は50.4%，7.41 ng/mL を下回る健常者は89.0％となります。

83以上のデータより，各レベルに属する健常者およびステージ I/II のがん患者さんの割合は，以下の通りとなります。
cfDNA 濃度L1

4.20 ng/mL 未満

L2

4.20～7.40 ng/mL

L3

7.41 ng/mL 以上

説明
健常者の67.5％が示すレベルです。
健常者の21.5％，ステージ I/II のがんに罹患している人の32.2％が示すレベルです。
健常者の11.0％，ステージ I/II のがんに罹患している人の50.4％が示すレベルです。

（補足）
健常者200名と，ステージ I/II のがん患者115名（胃がん・大腸がん）の cfDNA 濃度の ROC 曲線※

検査概要および検査結果の見方

レベル

cfDNA レベルの基準値 4.20 ng/mL および感度，特異度は，検査や診断薬の性能を示す ROC 曲線により算出しています。
カットオフ値：4.20 ng/mL
感度：83.5％

特異度：67.5％

AUC：0.811
95％信頼区間：0.762～0.861※ ROC 曲線（Receiver Operating Characteristic curve）とは検査や診断薬の性能をグラフに表したもの。検査における異常と正常を区別するカットオフポイントごとに真陽性率（感度）と偽陽性率（特異度）
を計算し，縦軸に感度，横軸に特異度をプロットして表す。ROC 曲線の下の部分の面積を AUC（Area Under the Curve）といい，値が1に近いほど判別能が高いことを示す。

cfDNA 量の変化によるがんの再発モニタリング
30.0

⾎漿1 mLあたりのcfDNA量 (ng/mL)

がん患者さんにおいて血漿中の cfDNA 量の再発・化学療法 開始

変化をモニタリングしたところ，図 c のように，がんの再発前に cfDNA 量が上昇し，化25.0

学療法による治療後に低下がみられました。
20.0
15.0
10.0

画像診断前のがんの増⼤→cfDNA検査によるがんの早期発⾒

5.0
0.0

術前

術後

3ヶ⽉

6ヶ⽉

治療によるがんの縮⼩

9ヶ⽉

12ヶ⽉

1年3ヶ⽉

血漿中 cfDNA 量のモニタリング（図 c）

84

IFN-γ ELISPOT 解析（免疫反応解析）
検査概要および検査結果の見方

 末梢血から分離した末梢血単核細胞（Peripheral Blood Mononuclear Cells；PBMC）を検体とし，患者さんの体内におけるペプチド特異的な細胞性免疫応答を解析する検査です。ペプチド刺激によって活性化された T 細胞が産生するインターフェロン（IFN）-γ を ELISPOT 法によって検出することにより，抗原特異的な免疫応答を評価します。
検査対象は，ネオアンチゲンペプチド（HLA クラスⅠおよびクラスⅡ拘束性）およびオンコアンチゲンペプチド（HLA
クラスⅠ拘束性）です。HLA クラスⅠ拘束性ペプチドの場合は細胞傷害性 T 細胞（CTL）の，HLA クラスⅡ拘束性ペプ
チドの場合はヘルパー T 細胞の抗原特異的活性化を解析します。
 がん免疫療法は免疫細胞の働きを高めることでがん細胞を排除する治療法で，治療に利用した薬剤自体ががん細胞に作用するのではなく，利用した薬剤によって教育され活性化した体内の免疫細胞ががん細胞を攻撃することが特徴です。そのため，がん免疫療法の効果は，体内の免疫細胞の活性化（免疫応答）を確認することによって評価することができます。
（参考文献：Kono, et al. J Transl Med. 2012;10: 141.）
ELISPOT（Enzyme-Linked ImmunoSpot）法とは
ELISA（Enzyme-Linked Immunosorbent Assay）をベースとして，特定の抗体やサイトカインを生成・分泌する免疫細胞を単一細胞レベルで検出する高感度な免疫モニタリング手法です。特定の免疫応答で見られるような存在比率の低い細胞の解析に特に有用で，がんや自己免疫疾患，感染症，アレルギー等の様々な疾患において，
抗原特異的免疫応答を研究するために，幅広く利用されています。がん免疫療法においては，治療に利用した
抗原ペプチドに対する特異的 CTL の誘導を確認することができ，抗腫瘍効果との関連を検討することができます。
R/S
ratio

Pre
treatment

＋

－

＋

4w

－

＋

8w

－

＋

12w

－

＋

16w

－

1.00
0.50
0.25
0.13

抗原ペプチド特異的スポット数検出例
ペプチドワクチン治療前（Pre treatment）と比較し，ペプチドワクチン治療後4週（4w）からペプチ
ドワクチン治療後16週（16w）にかけて抗原ペプチド特異的な免疫反応が誘導されています。
免疫反応と全生存期間
ペプチドワクチン治療後に，抗原ペプチドに対する特異的な免疫反応が認められるがん患者さんでは，認められないがん患者さんと比較し生存期間が長いことが報告されています。また，抗原ペプチド特異的免疫反応が認められるがん患者さんの中でも，より多くの種類のペプチドに対する免疫反応が認められるほど，生存期間が長い傾向にあることが報告されています。
（参考文献：Kono
et al, Journal of Translational Medicine. 2012.）

免疫反応と全生存期間の解析例

85

● 検査方法
ELISPOT 法では，抗ヒト IFN-γ 抗体を底部にコーティングした培養プレートに，前培養した PBMC を一定量分注後，免疫反応を評価したいペプチドを添加し，一晩培養します。T 細胞から IFN-γ が分泌され，抗ヒト IFN-γ 抗体と結合します。この状態をスポットとして可視化して IFN-γ を産生する細胞を検出し，抗原ペプチド特異的な免疫反応を評価します。
※1：IVS 法（In vitro sensitization）
試験管内での抗原刺激によって，抗原特異的リンパ球の活性化や増殖を促す方法。

検査概要および検査結果の見方

IVS 法 ※1 に よ り PBMC の 前 培 養 を 行 っ た 後，ELISPOT 法 を 用 い て T 細 胞 か ら 産 生 さ れ る IFN-γ を 検 出 し ま す。

IFN-γ ELISPOT 解析のながれ86

● 検査結果報告の内容
検査概要および検査結果の見方

報告例：

抗原ペプチド特異的免疫反応判定
ペプチド名

※

検体名

ワクチン投与前

ワクチン投与後Peptide ①－－

Peptide ②－+++

Peptide ③

－

－

①
①

※免疫反応判定ー

︓免疫反応が認められない+

︓弱い免疫反応が認められる++ ︓やや強い免疫反応が認められる+++︓強い免疫反応が認められるNA

︓検査が実施できなかった場合

免疫反応判定は，IFN-γスポット数を利⽤した河野らによる判定法（⼀部改変）に基づいて実施しています。
（参考︓Kono K, et al, J Transl Med. 2012;10:141.）

コメント

抗原ペプチド特異的スポット数（検査結果詳細）◆項⽬の説明◆
ペプチド＋︓ 患者由来細胞がペプチド存在下で産⽣したIFN-γの検出結果
ペプチドー︓患者由来細胞がペプチド⾮存在下で産⽣したIFN-γの検出結果
ペプチド特異的スポット数（Specific spots）︓「ペプチド＋」と「ペプチド－」のスポット数の差%Specific spots︓「ペプチド＋」のスポット全数に占めるペプチド特異的スポットの割合
陽性コントロール︓患者由来細胞が刺激物質（PMA および Ionomycin）存在下で産⽣したIFN-γの検出結果
陰性コントロール︓患者由来細胞が刺激物質⾮存在下で産⽣したIFN-γの検出結果

ペプチド名
検体名

Peptide ①
ワクチン投与前

ワクチン投与後

ペプチド＋

66.3

46.0

ペプチドー

66.0

46.3

ペプチド特異的スポット数（Specific spots）

0.3

-0.3

%Specific spots

0.5

-0.7

陽性コントロール

353.7

339.0

陰性コントロール

8.0

10.3

Peptide ②

ペプチド名
検体名

ワクチン投与後

ペプチド＋

63.0

249.3

ペプチドー

62.7

50.3

ペプチド特異的スポット数（Specific spots）

0.3

199.0

%Specific spots

0.5

79.8

陽性コントロール

413.7

416.0

陰性コントロール

10.3

10.7

・・・

87

ワクチン投与前②②

①抗原ペプチド特異的免疫反応判定
各抗原ペプチドに対する免疫反応の強さを，4段階で判定※2します。がん免疫療法により，抗原ペプチドに対す－：免疫反応が認められない+：弱い免疫反応が認められる++：やや強い免疫反応が認められる+++：強い免疫反応が認められるNA：検査が実施できなかった場合※2：免疫反応判定は，Kono らによる判定法（一部改変）に基づいて実施しています。（参考：Kono K, et al, J Transl Med. 2012; 9;10:141.）

検査概要および検査結果の見方

る特異的 CTL が誘導された場合，抗原ペプチド特異的免疫反応が認められ，抗腫瘍効果が期待されます。

②抗原ペプチド特異的スポット数
検出された IFN-γ スポットの個数を示します。この数値を基に，抗原ペプチド特異的免疫反応の強さを判定します。

88

研究検査
検査概要および検査結果の見方（研究検査）

研究検査は，研究を目的とした検査であり，当社の通常受託の検査項目と異なります。基準値および臨床的意義が明確にならない項目もございますので，内容をご理解のうえご依頼いただくようお願いいたします。

MHC テトラマー解析（免疫反応解析）
 蛍光標識した MHC テトラマーを用いたフローサイトメトリーにより，抗原ペプチドに対する抗原特異的 T 細胞を検出します。がん免疫療法で投与した抗原ペプチドに対する特異的 CTL が誘導されているかどうかを確認することができるため，治療効果との関連を検討することができます。
（参考文献：Yoshitake, et al. Clin Cancer Res. 2015;21（2）:312-21.）

MHC テトラマー解析法とは
Ｔ細胞は，細胞表面に発現している T 細胞受容体（TCR）を通じて MHC- ペプチド複合体を特異的に認識して結合します。MHC テトラマー解析法は，MHC 分子とペプチド断片の複合体試薬（MHC テトラマー）を用いて，それに結合した抗原特異的 T 細胞をフローサイトメトリー※1により検出する手法で，感染症やがん免疫療法，自己免疫疾患等の基礎研究や臨床開発において，Ｔ細胞免疫応答のモニタリング法として広く利用されています。
抗原特異的 T 細胞の分離・回収にも利用できるため，抗原特異的 T 細胞の機能等の詳細な解析に応用することができます。
※1：フローサイトメトリー 蛍光色素で標識したモノクローナル抗体で染色した細胞を，高速度で流しながらレーザー光を照射し，前方散乱光（細胞の大きさ）や90°

MHC-ペプチドテトラマー

散乱光（細胞の内部構造），蛍光強度（細胞表面の対応抗原）から個々の細胞を解析する方法。

Pre
Treatment
0.12%

4w

8w
2.62%

12w
38.67%

16w
73.73%

74.67%

CD8

ペプチド特異的 MHC テトラマー陽性細胞の検出
ペプチドワクチン治療前（Pre treatment）と比較し，治療後4週（4w）から治療後16週（16w）にかけてペプチド特異的 MHC テトラマー陽性細胞の検出頻度の増加が認められます。

89

● 検査方法
テトラマー）を用いて，それに結合した目的の抗原特異的 T 細胞を，フローサイトメトリーによって検出します。
※2：IVS 法（In vitro sensitization）
試験管内での抗原刺激によって，抗原特異的リンパ球の活性化や増殖を促す方法。

検査概要および検査結果の見方（研究検査）

IVS 法※2により PBMC の前培養を行った後，指定された抗原ペプチドを提示した蛍光標識 MHC- ペプチド複合体（MHC

MHC テトラマー解析のながれ● 検査結果報告の内容
報告例：
検査結果
検体番号

ペプチド名／コード

HLA型

検査結果
※

MHCテトラマー陽性細胞の検出頻度（%）

XXXX

URLC10

A*24:02

0.01

YYYY

URLC10

A*24:025.65①①※CD8陽性T細胞中に存在する抗原ペプチド-MHC複合体を認識するT細胞の割合
NA︓検査が実施できなかった場合

コメント① MHC テトラマー陽性細胞の検出頻度
CD3陽性 CD4陰性 CD8陽性細胞中の，抗原ペプチド特異的 MHC テトラマー陽性細胞の検出頻度を示します。

90TCR/BCR レパトア解析
検査概要および検査結果の見方（研究検査）

 次世代シーケンス技術を用いた遺伝子解析により，検体中に存在する抗原を認識する T/B 細胞受容体（TCR/BCR）の遺伝子情報（V 遺伝子，J 遺伝子，CDR3領域），および各 T/B 細胞クローンの種類および頻度を網羅的に解析します。
生体内の免疫状態はさまざまな疾患やその治療効果に関連しているため，「TCR/BCR レパトア解析」により疾患の状態や治療後の免疫細胞の変化を知ることができます。
（参考文献：Daiko, et al. Cancer Immunol Immunother. 2020. doi: 10.1007/s00262-020-02619-3.）

T/B 細胞と TCR/BCR レパトア解析
T/B 細胞は，細胞膜上に発現している T/B 細胞受容体（TCR/BCR）によって抗原を認識しています。T/B 細胞はあらゆる抗原に反応するために，骨髄や胸腺で前駆細胞から分化・成熟する際に遺伝子を DNA レベルで組み替える「遺伝子の再構成」を行い，多様性を生み出しています。
「TCR/BCR

レパトア解析」では，次世代シーケンサーを用いた遺伝子解析技術により，TCR や BCR 遺伝子の配列を定量的に決定することで，組織や末梢血中のリンパ球の種類や頻度を詳細に解析します。免疫状態の変化のモニタリングや疾患に関連するリンパ球を同定する等，治療や診断のための有効手段となることが期待されています。

検査の利用例・自己免疫疾患…疾患関連 TCR の同定，免疫反応モニタリング
・がん（免疫）治療…治療効果の評価，腫瘍特異的 TCR の検出・臓器移植後の拒絶反応…移植後の免疫状態の評価，GVHD・GVL の予測
・感染症…ウイルス特異的 TCR/BCR の同定
・食物・その他のアレルギー…アレルギー関連 TCR/BCR の同定
・薬疹・薬剤誘導性肝障害…免疫応答の分子機構の解明

91

● 検査方法
セットを用いたターゲットシーケンスにより TCR/BCR 由来の塩基配列を取得し，データ解析により多様度指数の算
出や TCR/BCR 遺伝子（V 遺伝子，J 遺伝子，CDR3領域）の決定を行います。
（参考文献：Fang, et al. Oncoimmunology. 2014; 3（12）:e968467.）

PBMC① 核酸抽出

② ターゲットシーケンス③ データ解析● 多様度指数● TCR/BCRの遺伝子情報● 各クローンの検出頻度

RNA

検査概要および検査結果の見方（研究検査）

検体（PBMC，がん組織）から核酸（RNA）を抽出し，品質確認を行います。抽出した RNA を用いて，単一プライマー

TCR/BCR レパトア解析のながれ● 検査結果報告の内容
報告例1：

①
①

シーケンス結果
TCRβ

TCRα
検体名

シーケンスリード数

T細胞受容体の種類

シーケンスリード数

T細胞受容体の種類

XXXX

23210

3744

70088

10374

YYYY

31607

7409

11740017194

T細胞受容体の多様度指数
検体名

※

TCRα

TCRβ

XXXX

491.1

556.9

YYYY

51.3

28.4

②
②

※T細胞受容体の多様度指数
多様度指数 ⾼ ︓ 多様性が⾼い（多くの種類のT細胞が存在している）
多様度指数 低 ︓ 多様性が低い（特定のT細胞が増加している）

92

検査概要および検査結果の⾒⽅（研究検査）③③

T細胞受容体の遺伝⼦情報（検出頻度上位10クローン）
検体名︓

XXXX

検査概要および検査結果の見方（研究検査）【TCRα】
クローンNo.

V遺伝⼦

J遺伝⼦

CDR3領域のアミノ酸配列1

TRAV12-2*01

TRAJ39*01

CALGSNMLTF

1.924

2

TRAV13-1*01

TRAJ15*01

CAMRGRAGTALIF

1.904

3

TRAV21*01

TRAJ39*01

CASPGRDAGNMLTF

0.954

4

TRAV10*01

TRAJ22*01

CAARAFSSGSARQLTF

0.944

5

TRAV35*01

TRAJ37*01

CVVMASNTGKLIF

0.860

6

TRAV17*01

TRAJ42*01

CAFYGGSQGNLIF

0.692

7

TRAV21*01

TRAJ13*01

CAAPPPPGGYQKVTF

0.677

8

TRAV29/DV5*01

TRAJ26*01

CAYRSAWGQNFVF

0.667

9

TRAV22*01

TRAJ44*01

CAERATGTASKLTF

0.638

10

TRAV22*01

TRAJ37*01

CAAKSSNTGKLIF

0.563

検出頻度（％）【TCRβ】
検出頻度（％）

V遺伝⼦

J遺伝⼦

CDR3領域のアミノ酸配列

1

TRBV27*01

TRBJ1-1*01

CASSLYLQNTEAFF

1.595

2

TRBV7-9*01

TRBJ1-1*01

CASSLYLQNTEAFF

1.552

3

TRBV3-1*01

TRBJ2-4*01

CSARDLREAAKNIQYF

1.453

4

TRBV27*01

TRBJ2-1*01

CASSLAGAPYNEQFF

1.002

5

TRBV3-1*01

TRBJ2-7*01

CASSPGTGGNEQYF

0.799

6

TRBV27*01

TRBJ2-7*01

CASSFPGQLNSGQYF

0.728

7

TRBV10-3*01

TRBJ2-1*01

CASSSGTGNNEQFF

0.706

8

TRBV12-3*01

TRBJ2-1*01

CASSKDGSYNEQFF

0.590

9

TRBV15*01

TRBJ2-1*01

CASSIGGRQFF

0.573

10

TRBV12-4*01

TRBJ2-3*01

CSARPPGSTDTQYF

0.566

クローンNo.

T細胞受容体クローンの頻度分布（検出頻度上位10クローン）
検体名︓

XXXX

【TCRα】【TCRβ】■ クローンNo. 1■ クローンNo. 2■ クローンNo. 3■ クローンNo. 4■ クローンNo. 5■ クローンNo. 6■ クローンNo. 7■ クローンNo. 8■ クローンNo. 9■ クローンNo. 10■ クローンNo. 1■ クローンNo. 2■ クローンNo. 3■ クローンNo. 4■ クローンNo. 5■ クローンNo. 6■ クローンNo. 7■ クローンNo. 8■ クローンNo. 9■ クローンNo. 10

④
④
④

・・・
・・・

①シーケンス結果
各 検体の TCR/BCR 各鎖（TCRα，β，BCR IgG，IgM，IgA，IgD，IgE，IgL，IgK）について，シーケンスリード数
および検出された TCR/BCR の種類を示します。

RNAの品質
検体名② T（B）細胞受容体の多様度指数

材料

Total RNA量（ g）

RNAの分解度（

XXXX

PBMC

1.2

YYYY

PBMC

0.2

各 検体の TCR/BCR 各鎖（TCRα，β，BCR IgG，IgM，IgA，IgD，IgE，IgL，IgK）について，その多様度を逆シン※ RNAの品質⽬安

プソン指数で示します。

検体から抽出したRNAの品質を確認しています。

・多様度が低い（＝多様度指数が小さい）⇒

特定の T/B 細胞が増加している
良好 A︓ RIN 6.0以上（検査継続）・多様度が高い（＝多様度指数が大きい）⇒

B︓ RIN 3.0以上〜6.0未満（検査継続）
特定の T/B 細胞の増加がみられず，多くの種類のT/B 細胞が存在

している

不良

C︓ RIN 3.0未満（検査中⽌）③ T（B）細胞受容体の遺伝子情報（検出頻度上位10クローン）
各検体の TCR/BCR の各鎖について，検出頻度上位10クローンの以下の遺伝子情報を示します。
・V 遺伝子・J 遺伝子の情報，CDR3領域のアミノ酸配列
・各クローンの検出頻度

93

・・・

④ T（B）細胞受容体クローンの頻度分布（検出頻度上位10クローン）
各検体の TCR/BCR の各鎖について，「TCR/BCR クローンの遺伝子情報」で示した上位10クローンの頻度分布を，報告例2（検査中止時）：
RNAの品質
検体名

材料

Total RNA量（ g）

RNAの分解度（RIN）

※

判定

XXXX

PBMC

1.2

9.4

検査継続

YYYY

PBMC

0.2

1.8

検査中⽌

⑤
⑤

※ RNAの品質⽬安
検体から抽出したRNAの品質を確認しています。
良好

A︓ RIN 6.0以上（検査継続）

不良

C︓ RIN 3.0未満（検査中⽌）

B︓ RIN 3.0以上〜6.0未満（検査継続）⑤核酸の品質（検査中止時のみ）

検査概要および検査結果の見方（研究検査）

円グラフで示します。各クローンの発現の偏りを視覚的に確認できます。

核酸の品質が検査実施基準を満たさなかった場合に，検体から抽出した核酸（RNA）の品質データを報告いたします。

94

検査方法の概略
検査方法の概略■全エクソーム解析ヒトゲノムのうちタンパク質をコードするエクソン領域（エクソーム）を選択的にキャプチャーし，効率的に解析する手法。疾患を引き起こす多くの遺伝子変異はエクソン領域に位置することが知られています。

■全ゲノム解析
ヒトゲノムを構成する DNA の塩基配列を全て解読すること。

■ターゲットシーケンス法
目的のゲノム領域のみを濃縮し，シーケンスによりそれらの塩基配列を決定する方法。

■デジタル PCR（Droplet Digital PCR）法
核酸を高感度に絶対定量する解析方法。DNA サンプルをドロップレット中にランダムに分配し，ターゲット配列を含むドロップレットと含まないドロップレットを生成して PCR を行います。ドロップレット毎に独立した PCR 反応が行われるため，増幅が検出されたドロップレットを陽性，増幅がなかったドロップレットを陰性として各ドロップレット増幅の有無を解析することで，サンプルに含まれるターゲット配列の正確な絶対定量測定を行います。

■フローサイトメトリー
蛍光色素で標識したモノクローナル抗体によって染色した細胞を，流路に整列させ流すことにより、照射したレーザー光を受けた細胞の蛍光、散乱光を検出し，細胞の大きさ，形状や細胞の内部構造，タンパク質や遺伝子等の情報か
ら個々の細胞を解析する方法。

■ ELISPOT（Enzyme-Linked ImmunoSpot）法
ELISA（Enzyme-Linked Immunosorbent Assay）をベースとして，特定の抗体やサイトカインを生成・分泌する免疫細胞を単一細胞レベルで検出する高感度な免疫モニタリング手法。

■ NGS（Next Generation Sequencing；次世代シーケンス）法
次世代シーケンサーを用いて，膨大な数の遺伝子の塩基配列を同時並行的に決定する方法。

■ RNA シーケンス解析
細胞中に存在するすべての遺伝子転写産物（トランスクリプトーム）の配列・発現量を解析する手法。サンプル中のトランスクリプトームを網羅的に解析し，各遺伝子転写産物を定量することができます。従来のマイクロアレイ等の手法に比べ，RNA シーケンス解析はバックグラウンドが低く高精度です。

95

検査方法の概略

96検体容器の取扱い方法
検体容器の取扱い方法

検体の採取量，提出量は11ページからの検査要綱ページを，検体の採取方法は各検査項目ページ「検体の採取・取扱い方法」をご確認ください。有効期間は目安とお考えください。
検体容器は，一部当社にて販売しております。購入をご希望の際は，次ページ「検体容器の購入方法」をご覧ください。本項に記載のない検体容器，試薬，資材については，担当者までお問い合わせください。

容器形態

検査項目

BT2・BT7
真空採血管

・ネオアンチゲン解析

EDTA-2Na 入・ネオアンチゲン解析［血液］，（Oncomine Pan-Cancer［貯蔵］室温［有効期間］2年

パネル解析）
・がん遺伝子変異解析
・がん遺伝子発現解析
・TCR/BCR レパトア解析
・IFN-γ ELISPOT 解析
・MHC テトラマー解析

BT2：2 mL 用
BT7：7 mL 用
CT2・CT5

・ネオアンチゲン解析

滅菌クライオチューブ

・ネオアンチゲン解析［血液］，（Oncomine Pan-Cancer
パネル解析）
・がん遺伝子変異解析［貯蔵］室温［有効期間］なし

・がん遺伝子発現解析
・cfDNA 定量検査
・Oncomine Pan-Cancer
パネル解析
・デジタル PCR

CT2

CT5

・TCR/BCR レパトア解析
・IFN-γ ELISPOT 解析

CT2：2 mL

・MHC テトラマー解析

CT5：5 mL
MT2
滅菌スクリューキャップ
マイクロチューブ

MT2：2 mL 用

97

［貯蔵］室温・IFN-γ ELISPOT 解析［有効期間］なし

・MHC テトラマー解析

備考

容器形態

検査項目

備考

核酸安定化試薬入り
マイクロチューブ
・ネオアンチゲン解析［貯蔵］室温・がん遺伝子変異解析［有効期間］1年

・がん遺伝子発現解析
・TCR/BCR レパトア解析

当社にて販売しております。
ご依頼方法は下記の「検体容器の購入方法」をご覧ください。

検体容器の取扱い方法

RL2

RL2：1.5 mL 用
RT11

［指定製品］

リキッドバイオプシー

日本ベクトン・ディッキンソン社

専用採血管

［貯蔵］

（PAXgene）

高温，多湿，
直射日光を避け，
4℃～25℃

パクスジーン DNA 採血管 ccfDNA・ネオアンチゲン解析

採血管貼付の219AFBZX00028000）［血液］，（Oncomine Pan-

冷蔵保管の場合は，Cancer パネル解析）
採血前に室内温度
15℃ ～25℃ に な
・Oncomine Pan-Cancer
じませてください。
パネル解析［有効期間］（医療機器認証番号：

・デジタル PCR・cfDNA 定量検査

・採血には，BD バキュティナ ®
セーフティロック™ ブラッドコレ
クションセット（ホルダー付）の使用が推奨されています。
（医療機器認証番号：
220AFBZX00064000）
・当社にて販売しております。

ラベルに記載ご依頼方法は下記の「検体容器の購入方法」をご覧ください。

RT11：10 mL 用

検体容器の購入方法● ご依頼
ご希望のキットおよび個数を，下記の「ご依頼・検収連絡先」までメールにてご連絡ください。当社より受付完了のご連絡をいたします。

● 納品・検収製品は，依頼受付より5営業日以内に発送いたします。受領後製品をご確認いただき，3営業日以内に下記の「ご依頼・検収連絡先」まで検収のご連絡をお願いいたします。（3営業日経過後ご連絡がない場合は，検収が完了したものとみなします。
）● 請求・支払ご契約に従ってご請求申し上げます（原則として1ヶ月分をまとめてご請求申し上げます）。請求書記載の支払期日までに，指定の銀行口座に請求金額を振込にてお支払いください。
ご依頼・検収連絡先

support@cancerprecision.co.jp

CPM クリニカルラボ

受付担当宛

98

研究グレードペプチド 合成サービスについて
研研研研研研研研研研 研研研研研研研研研研

当社では，樹状細胞療法等にご利用いただける研究グレードの合成ペプチド（ネオアンチゲンペプチド，オンコア
ンチゲンペプチド）を販売しております。

● 取引きのお申込み
購入をご希望の際は，当社 CPM クリニカルラボまでお問い合わせください。
当社担当者より，製品仕様，見積等についてご案内いたします。ペプチド提供委託契約締結後，お取引きを開始いたします。
（ご連絡の際は，８ページ「12. 検査に関するお問い合わせ」をご覧ください）

研

● ご依頼
所定の「ペプチド合成依頼書」にご依頼内容をご記入いただき，下記の「ご依頼・検収連絡先」までメールにてご送付ください。当社より受付完了のご連絡をいたします。

● 納品・検収
製品は，メーカーより医療機関へ直送いたします（通常納期：受注受付日より2～3週間）。
製品発送時に，メーカーより発送のご連絡をいたします。
納品物は以下の通りです。
・ペプチド合成製品
・品質保証書受領後納品物をご確認いただき，受領より3営業日以内に下記の「ご依頼・検収連絡先」までメールにて検収のご連絡をお願いいたします。3営業日経過後ご連絡がない場合は，検収が完了したものとみなします。

● 請求・支払ご契約に従ってご請求申し上げます（継続してお取引きいただくお客様は，原則として1ヶ月分をまとめてご請求申し上げます）。
請求書記載の支払期日までに，指定の銀行口座に請求金額を振込にてお支払いください。

ご依頼・検収連絡先

support@cancerprecision.co.jp
受付時間：

CPM クリニカルラボ

受付担当宛

平日 9：00～18：00（土・日・祝日を除く）

12：00まで当日受付扱い。12：00以降のご依頼の場合は，翌日の受付となります。

99

● 販売可能なオンコアンチゲンペプチド

HLA 型
A2402

A0201

CDC45L

○

CDCA1

○

○

CDH3

○

○

DEPDC1

○

○

ECT2

A0206

○

A1101

A3303

A0101

A0301

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

○

研

抗原名

○

FOXM1

○

○

GPC3

○

○

○

○

○

HIG2
HJURP

○

○

KIF20A

○

○

KNTC2

研研研研研研研研研研 研研研研研研研研研研

オンコアンチゲンペプチドは，以下のとおりご用意しております。

○

KOC1

○

MELK

○

○

MPHOSPH1

○

○

○

NEIL3

○

○

○

RNF43

○

○

SPARC

○

TOMM34

○

○

TOPK

○

○

UBE2T

○

URLC10○○WDRPUH○○VEGFR1○VEGFR2

○

○

○

○

○

〇：ご用意のあるオンコアンチゲンペプチド100

参考文献一覧
参考文献一覧

● 検体採取方法・検体の取扱い▪日本病理学会「ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程」（平成30年3月1日）● がんプレシジョン医療▪Hacohen, et al. Cancer Immunol Res. 2013;1(1):11-5.
▪Mizukami, et al, Cancer Sci. 2008;99(7):1448-54.
▪Morisaki, et al. Immunol Invest. 2020:1-18.

● ネオアンチゲン解析・がん遺伝子変異解析・がん遺伝子発現解析▪Hacohen, et al. Cancer Immunol Res. 2013;1(1):11-5.
▪Kato, et al. Oncotarget. 2018;13;9(13) :11009-11019.
▪Cristescu R, et al. Science. 2018;362(6411).
▪日本臨床腫瘍学会，日本癌治療学会，日本癌学会
「次世代シークエンサー等を用いた遺伝子パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」（2020年5月15日 第2.1版）▪Mizukami, et al, Cancer Sci. 2008;99(7):1448-54.
▪Ohaegbulam, et al. Trends Mol Med. 2015;21(1):24-33.
▪Hicklin, et al. Mol Med Today. 1999;5(4):178-86.

● リキッドバイオプシー（Oncomine Pan-Cancer パネル解析・デジタル PCR・cfDNA 定量検査）▪Tang, et al. Cell Biosci. 2016;6:32▪Suzuki, et al. Oncotarget. 2020; 11:3198-3207.
▪Acuna-Hidalgo, et al. Am J Hum Genet. 2017 6;101(1):50-64.
▪Chang, et al. Mol Oncol. 2020; doi: 10.1002/1878-0261.12727.
▪日本臨床腫瘍学会，日本癌治療学会，日本癌学会
「次世代シークエンサー等を用いた遺伝子パネル検査に基づくがん診療ガイダンス」（2020年5月15日 第2.1版）▪Newman, et al. Nat Med. 2014;20(5):548-54.
▪Kustanovich, et al. Cancer Biol Ther. 2019;20(8):1057-1067.
▪The Cancer Genome Atlas（TCGA）データベース
https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/tcga▪HER2がんの特徴と治療戦略（乳がん，胃がん，胆管がん，肺がん等）医学のあゆみ
269 (3), 199-202, 2019-04-20▪Morris, et al. Science. 267(5196): 316-317, 1995
▪Lin, et al. Mol. Cancer Res. 7: 1466-1476, 2009
▪日本肺癌学会「肺癌患者における ALK 融合遺伝子検査の手引き」（2021年10月20日▪Charest, et al. Genes Chromosomes Cancer. 37(1): 58-71, 200▪Rikova, et al. Cell. 131(6): 1190-1203, 2007

101

第4.0版）

▪Lee, et al. Cancer 119: 1627-1635, 2013
▪Birch, et al. PLoS One 6: e28250, 2011
▪Stransky, et al. Nat Commun 5: 4846, 2014
▪Leeman-Neill, et al. Cancer 120(6): 799-807, 2014
▪Laé, et al. Mod Pathol 22(2) : 291-98, 2009

参考文献一覧

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▪Vaishnavi, et al. Nat Med 19(11): 1469-72, 2013
▪Créancier, et al. Cancer Lett 365(1): 107-111, 2015
▪Zehir, et al. Nat Med 23(6): 703-713, 2017
▪Wiesner, et al. Nat Commun 5: 3116 791-798, 2014

● 免疫反応解析（IFN-γ ELISPOT 解析・MHC テトラマー解析・TCR/BCR レパトア解析）▪Kono, et al. J Transl Med. 2012;10:141.
▪Yoshitake, et al. Clin Cancer Res. 2015;21(2):312-21.
▪Daiko, et al. Cancer Immunol Immunother. 2020. doi: 10.1007/s00262-020-02619-3.
▪Fang, et al. Oncoimmunology. 2014; 3(12):e968467.

102

株式会社Cancer Precision Medicine

CPMクリニカルラボ〒210-0005〒210-0821（キャンサープレシジョンメディシン，略称：CPM） （川崎市指令健医第288号
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