社団法人

バイオ産業情報化コンソーシアム

JOURNAL
2009-JANUARY

Winter冬号
conversation

対 談
統合データベース プロジェクトリーダー

五條堀 孝 氏成田 公明

バイオ産業情報化コンソーシアム 専務理事

topics

トピックス

経済産業省ライフサイエンス統合データベース・ポータルサイト「MEDALS」公開
ヒトタンパク質発現用クローンの整備及び分譲開始
第6回国際バイオデータ相互運用性会議
JBIC2008プロジェクト研究成果報告会
report報 告上海調査団派遣
米国BIO International Conventionに出展
BioJapan2008に出展

五條堀 孝 氏社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム 専務理事 成田公明
統合データベース

プロジェクトリーダー

p.1-7

ガリレオ・ガリレイが最初の会員である
ローマ法王庁科学アカデミー会員に進化学者として初めて選任される
成田：五條堀先生は今般ローマ法王庁科学アカデミー会員に選任されました。 心からお祝い申し上げます。この法王
庁科学アカデミー会員というのは大変名誉ある地位で、ガリ
レオ・ガリレイ以来の長い歴史を誇っていると聞きましたが。

五條堀

五條堀：どうも有難うございます。この度ローマ法王庁科

孝（ごじょうぼり たかし） 理学博士

学アカデミーの永世会員に選任され、去る10月末にローマ大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構
国立遺伝学研究所 副所長・教授

法王ベネディクト16世から会員メダルをいただきました。ガ

独立行政法人 産業技術総合研究所 研究顧問
（バイオメディシナル情報研究センター）（併任）

リレオが最初の会員でしたが、地動説を唱えてアカデミー

1979年 九州大学大学院理学研究科博士課程理学博士取得
80年 テキサス大学ヒューストン校集団遺伝学センター上級研究員
82年 同 助教授
83年 国立遺伝学研究所生理遺伝部門研究員
90年 同 遺伝情報研究センター教授
01年 同 生命情報・DDBJ研究センター長・教授
07年 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構
国立遺伝学研究所 副所長・教授を追われました。その後長い間、彼がローマ法王庁から破門されていたことに対するトラウマが歴代のローマ法王、
カトリック教会にあり、それ故、現在のローマ法王庁には科学を尊敬し、大切にしたいとの気持ちがあります。現法王の前のヨハネ・パウロ 2世が「アカデミーでは全ての自由

1

conversationが保障されている、何を話しても良く、ローマ法王と法王

成田：どのような方がアカデミーの会員になられているので庁は一切その内容に関与しない」と宣言しています。

しょうか。

成田：ガリレオに対する異端審問裁判の判決が見直され、ガ

五條堀：今回、新たに8人が加わり、総会員数は92人にリレオの破門が解かれたのはガリレオの死後350年も経っなりました。そのうち25名がノーベル賞受賞者で、過去たヨハネ・パウロ 2世時代の1992年ですからね。こうしの会員も含めれば42名のノーベル賞受賞者がアカデミーて得られた「科学の自由」には歴史的な重みがあります。

の会員になっています。日本からの会員は野依良治博士と私で、私は進化学者として初めての会員です。

五條堀：今回、授与式と同時に開催された「宇宙と生命

まもなく、今回の会議の声明文を出しますが、その冒頭の進化」に関するシンポジウムでは、JBICプロジェクトでにおいて宇宙、世界や生命そして人間が「創造主なる神」

開発されたH-InvDB（ヒト遺伝子アノテーション統合デー

によって創造されたとする創造論（creationism）
と生命や

タベース）
も紹介し、ヒト脳で発現する遺伝子が、約7億宇宙の精妙なシステムが知性ある設計者によって設計され年前に出現して最も原始的な脳をもつと言われているプラ

たとする知的設計論（intelligent design：ID論）には科学

ナリアや、神経細胞はあるが脳をもたないヒドラにも見つ的根拠が全くないと言い切ります。そして、科学的事実とかることを発表しました。

信仰は両立できると述べます。世界には約10億人のカト

講演後にはニコラ・カビボ科学アカデミー会長の他、聴リック信者がおられ、2005 年には米国のブッシュ大統領

講したノーベル賞メンバー等が来られて、講演は素晴らが、進化論を教える時にはID論についても教えるべきと発しかったと激賛してくれました。

言しているほどですから、大きな影響があると思います。

キリスト教には二つの創造があり、一つは宇宙、もう一つが人間です。その人間の脳で発現している遺伝子とほ

成田：ブッシュ大統領は、民主党が提出したES細胞研究助

とんど同じ遺伝子が原始的な生物の中にもあるということ

成法案に対し、道徳的な境界を越えるものとして2006年

は、学問的には当然の事実ですが、彼らにとっては衝撃に拒否権を行使しました。

的だったようです。
五條堀：ヨーロッパの方が両者をはっきりと分けています。
来年はGMO（Genetically Modified Organism）
を取り上げてシンポジウムを開催する予定です。その時々で重要なテーマで開催するところがアカデミーの良い点です。

基盤的な研究を継続的に行うことの重要性
成田：先生は総合科学技術会議等の場で日本のライフサイ
エンス政策全般に関与されていますね。

五條堀：日本の総合科学技術会議等では各種のロード
マップ等を作り、それなりに将来の方向性も議論してきました。しかし、作られたロードマップ、方針がなかなかう
まく実行されません。提案権が各省に別れているところは良い点でもありますが、作成されたロードマップを実現す

ローマ法王庁より授与されたメダルを手に2

るための選択と集中のメカニズムが機能しにくくなっていると思います。

成田：ロードマップには色々なことが記載されていますが、そのなかでプライオリティは余りついていませんね。総合科
学技術会議に総合調整権はありますが、基本的には各省が予算要求する訳ですから。バイオといっても薬・医療の他にエネルギー、食糧もあります。商品市況の高騰を背景にこの夏まではエネルギーとか食糧の方が薬よりもプライオリ
ティが高いという人もいましたが、リーマン破綻後、商品市
況が暴落すると、そのように言う人も少なくなりました。
バイオの中でもこのようなプライオリティづけの問題がある訳ですから、ライフサイエンス関連の予算のパイを増しかしながら、ライフサイエンス部門においてはN I H

やすとなると、当然、他の分野の予算を削ることになりま（National Institutes of Health：国立衛生研究所）の存す。そのためには政治力と言いますか、その源である国民

在感は圧倒的です。さらに、オバマ次期米国大統領は米の理解をひろく得ることが必要です。そのための努力を研国の発展には科学技術への投資が不可欠と捉え、NIH等

究者ももう少しすべきでしょう。特に昨今のような景気・雇の予算を倍増させると公約しています。また、高騰する医用情勢の下では平時以上の努力が必要です。

療費抑制の観点から「予防医学の重要性」を唱えています。
日本でも、ライフサイエンス研究の重要性はひろく理解

五條堀：確かにそうです。それに加え、民間セクターかされていますが、性急な成果を求める声が欧米と比べて強らの協力がもっとあっても良いと思います。

いのも事実です。iPS（人工多能性幹細胞）が出来れば再生文部科学省の科学研究費補助金（科研費）
は、全て

医療はすぐにでも実現すると思ってしまう。iPSを薬の毒性の領域で大体2,000億円位です。一方、日本の企業上評価に使うとなれば実用化は早いかもしれませんが、本当位50社の研究開発費は合計で10兆円弱ありますので、にヒトの再生医療に利用しようとすると、制度の問題もあっそのうちの1%でも良いから、各企業が大学や公立研究て日本ではそう簡単にはいかないと思います。そうすると、機関と連携してくれればと思います。

今度は急に裏切られた気持ちになって成果が全然出ないと

海外では、Microsoft社のビル・ゲイツ氏がグランド言い出すわけです。 基盤的な研究には時間がかかるから、

チャレンジプログラムと称してBill & Melinda Gates

今はこの部分をきっちり育てていく必要がある、すなわちFoundationを作りました。ヘルスケア分野で世界的にグ「継続は力なり。」という訴え方が足りないと思います。

ラントを申請してもらっており、これから色々と良い成果が出てきそうです。英国には医学研究支援等を目的とする

五條堀：全く同感です。我々科学者の責任でもあるのでウェルカム財団（Wellcome Trust）
があります。日本の経

すが、流行は作るのだけれども、盛り上がりが続かない。

済力からすると、このような民間主導のものがあっても良タンパク工学でもバイオインフォマティクスでもそうでした。

いのでないかと思います。

その分野で優秀な人が育ってもすぐに消えてしまう。

成田：日米間では寄付金税制が異なるという点に加え、芸成田：日米の違いという意味において非常にシンボリックな術、文化、科学技術の振興のために民間の果たす役割も異例 が あります 。 J B I C が 設 立された日 の 1 0 日 程 前 のなります。米国では例えばメトロポリタンオペラの運営のた

2000年6月末に当時のクリントン米国大統領と国際ヒトゲ

めの経費は民間からの寄付にその多くを依存しています。

ノムプロジェクトを推進したフランシス・コリンズ米国立ヒト3

conversation

フォマティクスに対する期待が最も高まっていた時期であり、特にIT系企業ではバイオインフォマティクス関連マー
ケットの急拡大を期待していたところも多かったようです。
しかしながら現実はそうはなりませんでした。
日本のIT系企業は、国際競争力はあるはずですがソフト的なもの、バイオで言えばバイオインフォマティクスのところの層が厚くありません。欧米では、インフォマティクスに対し、大変重要なものという認識があるのに対し、日本では必ずしもそうではないと思われるのですが。

五條堀：残念ながらそうです。その理由のうちの一つは、日本のITにおいてソフトウェアは「おまけ」的存在であったゲノム研究所（NHGRI）所長等がヒトゲノム配列のドラフト点です。SunとかAppleのように、現在はむしろソウト

版を作成した旨の記者会見を行いました。

ウェアがハードウェアを決める時代になっていますが、まだその席上、コリンズ所長が、Today is most certainly「おまけ」
といった見方が残っています。昔、データはタダ

not the end of genomics, but perhaps it's the end

で貰うものとの認識があり、データベースを作ること自体もof the beginning. と述べています。この言葉は、第二研究者がやるべきではないとの風潮で、論文にもなりませ

次世界大戦時の北アフリカ戦線で、1942年、英国のモンんでした。しかし、今はデータベースを作れば、Nucleic

ゴメリー将軍がそれまで圧倒的優位を誇っていたロンメル将

Acids Researchといったインパクトファクターが高い雑誌

軍率いるドイツ東アフリカ軍団を初めて撃破した際に、勝利にも取り上げられます。時代は大きく変わりました。

に沸く英国民に対し、戦いは終わったのではなく、むしろこ

トランスレーショナルリサーチでは、基礎的な研究かられから本格的な戦いが始まるという趣旨でチャーチル英国首応用的な研究に行くところをうまく繋げないといけません。

相が述べた言葉 Now this is not the end. It is not

そのトランスレーショナルリサーチで基盤となるのはトランス

even the beginning of the end. But it is, perhaps,

レーショナル・インフォマティクスであると思っています。実the end of the beginning. にならったものです。

際に「モノ」が物理的に流れることも必要ですが、情報でこれは要するに、ヒトゲノム解析に携わったコリンズ所長自「モノ」をつないでいく必要があります。ゲノム、タンパクらが、ゲノムの研究はこれで終わったのではなく、むしろこ

質、医療情報とか健康予防、創薬、これらを繋げるのれから本格的に始まるものである旨述べたということであり、がインフォマティクスです。分子情報も大事だし、高次の現に、米国はその後もゲノム研究に力を入れて来ました。

医療情報も大事だし、なかには留意すべき個人情報もありますけれども、それらをうまく繋げていくのが今後の重要

これに対し、日本では、ポストゲノムという言葉に象徴な課題ではないでしょうか。

されるように、ヒトゲノムの解読は終了したものとして、そアノテーター（生物データに注釈を付与する専門家）にれ以外の分野に重点的に研究費が配分されるようになった

関していうと、国立遺伝学研究所では採用してから大体訳です。

半年以上教育にかかります。アノテーターには色々な雇用形態がありますが、一般の民間企業と比べると待遇のバイオインフォマティクスを強化するには問題がありますので、優秀な人が来てもすぐに退職してしまうことがあります。

成田：JBICはヒトゲノムドラフト配列解読宣言がなされた
直後の2000年7月に設立されました。当時はバイオイン

成田：企業においてアノテーター的職種を求めているとこ

4

するとそれなりの努力が必要になります。

ろはありますか。また、大学ではどうですか。

しかし、金融危機の前でしたがインド国内ではお金が五條堀：企業における需要は、残念ながら、最近は余り結構動いている感じで、コルカタにすでにあるI n d i a n

ないのですが、次世代シーケンサーが普及すれば企業に

Statistical Instituteに分所として バイオインフォマティク

も需要が生じると予想しています。最近、長浜バイオ大

スの研究所を作る計画があると聞きました。

学がアノテーターの専門課程を作りました。競争倍率は結構高いと聞いています。

成田：去る5月に中国の医薬分野における現況を調査する
ためJBICの会員企業の方々と上海の広大な張江バイオ特

成田：日本の場合、数学とバイオの両方に通じた人材の育区を訪問しました。上海には、総合的な製薬会社はまだあ成が余りうまくいっていないことの要因として、大学受験

りませんが、スクリーニングだけ、毒性評価だけとかあるの際に数学が好きか否かで進路を決める傾向があることも仕事を部分的に請け負う会社が米国帰りの研究者等によりあげられます。

設立されており、米国等の外資系の会社はこれらの会社をうまく使っているようでした。

五條堀：そういうことも影響していると思います。
外国では、米国がヨーロッパと一緒になってバイオキュ

五條堀：中国は特区的な政策が得意ですので、良いとこ

レーター（バイオ関連情報を抽出整理し定型化した表現にろはどんどん発展させます。そのようなやり方で日本が一変換してデータベース構築を支援する。）学会を作ろうとし本抜かれることがあるかもしれません。現在行われてい15ています。Nature 9月号には、増大するペタバイト（10 ）る1,000人ゲノム解析プロジェクトでも英国のサンガー研究

規模の生物学的情報（BIG DATA）
に対する特集が組ま

所、米国のNHGRIの他に中国の北京ゲノム研究所深圳

れており、私も The future of biocuration を共著で発が参加しており、日本はいわば蚊帳の外です。

表しました（Nature . 2008 Sep 4；455（ 7209）：47−50）。
成田：シンガポールも重要です。前に、シンガポールを訪問した際、政府の高官から「金はいくらでもあるから要らな台頭するアジアい。 特区を作ったので場所も要らない。 欲しいのは人です。」と言われました。 そして、日本の某大学の研究室をそっくりそのまま受け入れたのです。

成田：インドはITに強いと言われていますが、バイオイン
フォマティクスについてはどうでしょうか。

五條堀：シンガポール政府はライフサイエンス、バイオイン
五 條 堀：去る1 0 月に H U G O（ H u m a n G e n o m e

フォマティクス等に特化しようとしています。選択と集中を

Organisation）のミーティングでインドのハイデラバードをやっている点がすごいですね。

訪問しました。インドでは確かにこの分野で潜在能力をもつ人が多く、バイオインフォマティクスについても一生懸命

成田：シンガポールは淡路島ほどの大きさですから、産業

やっています。しかし、ワークショップで話してもらうと、タ構造を如何に付加価値の高いものにするかが最大の関心

イトルは良いのですが何となく問題が解けていない感じが事で、付加価値の低いものは全部やめてしまいます。今シします。インドにはまだバイオインフォマティクスを吸収出来

ンガポール本島にある産業は、付加価値が高い金融、バイるインフラ、大企業が存在しません。日本にも似たところ

オ等のハイテク、それから観光です。

がありますが、ソフトウェア、データベースを作成し、それらをどこかに売り込もうとすると、インド国内では売り込み

五條堀：しばらくすると、健康産業、医療産業への対応

先がなかなか見つかりません。次に、外国に売り込もうとが正に問題になってくると思います。

5conversation

成田：シンガポール政府は、医療産業では、世界中から富裕に対して、08年から10年位まではシーケンス革命の時代層を集めて良い病院で治療させようと考えているようです。

で、ゲノム革命とシーケンス革命を分けて考えましょうと提日本で何か新しいことをやろうとすると、治験、混合診療

唱しています。ゲノム革命ではゲノムが解読されることにといった問題が生じます。そうすると、シンガポールに行っ意味がありましたが、シーケンス革命ではゲノムの配列をて高度医療を受けるとか、次世代シーケンサーにより解読決めますが、それ以外もやる。タンパク質間相互作用、された個人のゲノム配列を使ったテーラーメイド医療を受

DNAにおけるタンパク質の結合部位、各種RNA、ある

けた方が早いということになります。

いはメタゲノミクス、エピゲノミクス等の解析です。

狭いところで最も付加価値の高い産業を集めているシン

日本でもシーケンス革命を起こそうとの機運が出てきてガポールはある意味我々の見本になります。その中にバイいますが、そういう情報を出した時に何ができるのか、将オが入っている点に注目すべきです。 少し前の統計です

来のGDPにどう繋がるのか、医療がどのように変わってが、シンガポールの一人当たりのGDPは日本を抜いたそ

行くのかが、一般の国民、そして役所の方にも分るよううです。

な説得力が必要ですね。コリンズ博士、ベンター博士はそこを言い切っているのです。

次世代シーケンサーはバイオの世界を変える

成田：米国の場合、ターゲットを明確に打ち出します。 研
究者はある意味では経営者でもあるわけですから、そうい

五條堀：2002年当時、米国には、次世代シーケンサー開うことを言わなければならないのです。

発のマインドがあり予算も投入されていましたが、日本ではゲノム研究は終わったとの意識が強すぎて投入されません

五條堀：我々は、ある意味研究の目的だけで終わってしでした。その差が今になって結果として現れ、米国ではまっているところがあるのかもしれませんね。

超高速、ローコストのシーケンサーが開発されました。
成田：薬の研究開発は、他の食糧、エネルギー分野にも応
成田：去る6月に米国サンディエゴで開催された米国BIO

用可能な一番ファインな最先端技術を駆使しています。薬International Conventionで、フランシス・コリンズ博士にはならないけどエネルギー分野に利用できる、そんな例

は、2012年の米国のGDPのうち20%が医療費になるが今後出てくるかもしれません。

と予想しています。各個人のゲノム配列を次世代シーケンサーで決めて、個人に合った付加価値の高い医療が出来る

五條堀：そういう、夢のある話をしたいですね。ただ、次からそうなるのだと言うのです。

世代シーケンサーで解析すると大量のデータが出てきます

一方、クレイグ・ベンター博士は、これからは次世代から、それを一定の目的をもって処理するとなると優秀なイシーケンサーを使ってもっぱら環境問題、食糧問題に貢献

ンフォマティシャンが大勢必要となります。そういう意味でもしたいとのことでした。ヒトゲノムの解析はもう行わないもバイオインフォマティクスはますます重要になり、JBICの果のの、良い研究成果が得られれば創薬にも是非活用したい

たす役割も大きくなります。

とのことでした。
日本では、次世代シーケンサーは超高速、ローコストと生命の神秘を求めていう話だけが強調されますが、非常に付加価値が高い機械なので、要はどのような目的をもってこれを使うかという点が大事です。

成田：バイオの研究はタンパク質、RNAにしても研究領域が細分化されています。 研究者がそれぞれの分野で深掘

五條堀：2000年から03年はゲノム革命の時代であったのり研究をすることは勿論重要ですが、バイオの研究は究極

6

的には生命体に関係しているのですから、これらの研究成

成田：あれだけ科学的にゲノムを研究したコリンズ博士が、果もすべて何らかの形で相互に関連しているはずです。

ある意味では宗教家であり、The Language of God −一般の製造業でいえば、部品工場で造られた精度の高A Scientist Presents Evidence for Belief−（ゲノム

い標準化された部品を組立工場で組立ててはじめて一つのと聖書：NTT出版）という本を書いています。ゲノムを研究製品が完成します。それと同様に、各分野の研究成果に対した人がこのような本を書いていることが象徴的ですね。

していかに横串を刺して繋いでいくか、いわば横串研究といったものがバイオの研究の世界でブレークスルーを生み

五條堀：コリンズ博士はバチカンでも講演しましたが、彼出していくことになるのではないかと思います。

自身をThe Scientist as Believer、つまり、科学者であっても信仰者とし、彼の心の中で矛盾をなくしたいと考

五條堀：生命には歴史があるものですから、私は、そのえています。創造論信奉者は激しく反発するけれど、彼

横串は進化と捉えています。ラットをやってもマウスをやっは進化を認めています。しかし、一方では神を信じていてもヒトに繋がってくるのです。ある意味では、それは比る。私の場合は、キリスト教ではなく仏教的ですから、そ較を通して可能になることでもあるので、現在、たしかにこまで苦労して整合性をもたす必要があるのかとも思いま「比較」、「進化」がホットなトピックスになっています。進すが、信仰をもたれた以上、そういう努力がされるのは化は過去のことを見るだけでなく、機能や構造もわかろう

非常に良いことだと思います。

とする必要があることから、進化的な考え方が創薬や恐らく医療にも役立つと思います。

成田：宗教から離れて自由に研究を行った結果、再び宗教

進化的な考え方は統合的なツールともなり得ます。こ的なものに戻るというのはライフサイエンス分野の研究のの進化的な考え方は、本当に基礎的な進化を研究する

奥深さを示しているものと思われます。今般、先生が進化のに大事なものであると同時に、異なる様々な情報を繋ぐ学者として初めてローマ法王庁科学アカデミー会員に列せ

ところの非常に重要な考え方にもなり得ると思います。

られたということの意味を改めてかみしめて対談を終わり

ゲノムが全てを決めているとの考えが一般に浸透してたいと思います。本日はどうも有難うございました。

いますが、環境も重要であり、教育も努力も必要だということを我々科学者は発信しなければなりません。また、ヒトは皆異なっていることが大事で、異なっていないといろ
いろな改善が起こらないわけです。

成田：先生の研究でもヒトでは一定の確率で変異が起きているということですが、正にそういうことなのですね。 神様が同じものを作ったつもりでも、変異があると皆違うということですね。

五條堀：科学の事実を安易に人生の教訓にもち込んではいけませんが、非常に示唆に富む事実ですね。変異があるから多様性があり、多様性があるから環境の変化にも適応し、我々人類が生きてこられたのです。次の世代に異なるものを残して環境の変化に適応していこうというのですか
ら、攻めの生き様としていろいろなことを教えてくれますね。
数多くの賞状と世界7都市の時計が架けられている教授室にて

7

p.8

TOPIC 1

経済産業省ライフサイエンス統合
データベース・ポータルサイト「MEDALS」公開
JBICとBIRC（産業技術総合研究所・バイオメディシナル
情報研究センター）
は、経済産業省が関わったライフサイエ
ンス分野の研究成果であるデータベースと解析ツールの情報を整理した「経済産業省ライフサイエンス統合データベー
ス・ポータルサイトMEDALS（METI Database portal for
Life Science）」を、2008年10月29日に公開しました。
MEDALSではデータベースや解析ツールを探したり、ME
DALSオリジナルのツール群を利用することができます。
公開は、経済産業省の委託プロジェクト「統合データベースプロジェクト」の活動の一環であり、研究成果等を広く有効利用してもらい、ライフサイエンス分野における研究開発を促進することを目的としています。

http://medals.jp

是非、ホームページへアクセスしてみて下さい。

p.8-9

TOPIC 2ヒトタンパク質発現用クローンの整備および分譲開始
JBICはNEDO（独立行政法人新エネルギー・産業技術70％に対応するヒトGatewayエントリークローンを作製しまし総合開発機構）からの委託により、平成12年〜17年度の6た。エントリークローンからは発現ベクターとの部位特異的年間、「タンパク質機能解析プロジェクト」、「タンパク質機

組み換えにより容易に発現クローンを作製できます。

能解析・活用プロジェクト」を実施し、N E D O「完全長75種類のフォスファターゼを小麦胚芽無細胞タンパク質

cDNA構造解析プロジェクト（FLJ cDNAプロジェクト）」の合 成 用の発 現ベクターを用いて作 製 すると、5 8 種 類成果をもとに、約 2 万 2 千個といわれるヒト全遺伝子の約（77%）
で活性を確認出来ました。

8

p.8-9TOPIC 2クローンの情報はJBICのホームページからアクセスでき

Goshima, N. et al. Human protein factory for converting

ます（HGPD: Human Gene and Protein Database）。

the transcriptome into an in vitro–expressed proteome.

また、エントリークローンは、NITEバイオテクノロジー本部

Nature Methods 5, 1011 - 1017 (2008)

生物遺伝資源部門（NBRC）から入手可能ですので（1ク

Maruyama, Y. et al. Human Gene and Protein Database

ローン：大学等；15,750円、民間；31,500円）、タンパク質を(HGPD): a novel database presenting a large quantity of

用いた様々な解析研究にご利用いただければと思います。

experiment-based results in human proteomics.

なお、プロジェクトの成果は右記に発表されました。

Nucleic Acids Research. 37, D762 - D766 (2009)p.9-10

TOPIC 3

第6回国際バイオデータ相互運用性会議
10月27日〜29日、バイオデータベースのデータ記述形
式の国際標準規格を策定するため第6回国際バイオデー
タ相互運用性会議をJBICにおいて開催しました。今年も、国内の専門家に加え、アイスランド、英国、インド、米国、
南アフリカから計10名が来日し、国立遺伝学研究所菅原秀明教授を議長にして熱心な討論が行われました。
今回の会議の主要な目的は、ソフトウェアの標準化団体
であるOMG（Object Management Group）
により遺伝型−
表現型データベースのデータ記述規格の国際標準として採択されたPAGE-OM（Phenotype And Genotype Object
Model）の最終版を作成することです。
データベースの記述規格とは、具体的にはデータベースのデータの構造とデータ間の関係についての規格です。
OMGの標準規格としては、OMGのソフトウェア開発標準
規格のObject指向と呼ばれる開発技術を用いて実装シス
テム（コンピュータに実装可能なシステム）まで開発することが求められます。Object指向開発ではシステムをクラスと呼ぶ子要素に分解し、クラス間の関係をクラス図と呼ばれる図で表現します。データベースの記述規格ではデータの塊がクラスに相当します。表現型データ記述部のクラス図と、クラス内のデータ間の関係の概念図を右に示します。
会議の初日には、遺伝型−表現型の最近の研究動向把握のため6名のメンバー（Debasis Dash 博士：インドInstituteof Genomics and Integrative Biology、Albert Vernon
Smith博士：アイスランドIcelandic Heart Association、Anthony J. Brooks教授：英国University of Leicester、小島俊男博士：理化学研究所、村松正明教授：東京医科歯科
大学、徳永勝士教授：東京大学）
から講演をいただきました。

クラス図（上）と、クラス内のデータ間の関係の概念図（下）9p.9-10TOPIC 328日〜29日の2日間では菅原教授議長のもと、PAGE-OMの最終版作成に向けて活発な議論が行われました。議論の内容はコンピュータツールを用いてクラス図に反映され、クラス図をもとにXML（Extensible Markup Language）
を用いた実装システムを作成しました。さらに付随するドキュメントも作成し、12月に開催されるOMGのテクニカルミーティングに向けて、無事、それらをOMGに提出することが出来ました。
ご協力いただいている国内外の研究者、会員企業の皆様のおかげで非常に実り高い会議を実施することができました。皆様に心より感謝申し上げます。

国際会議出席者

p.10

TOPIC 4

JBIC2008プロジェクト研究成果報告会
恒例のJBICプロジェクト研究成果報告会を10月31日に大学院新領域創成科学研究科 菅野 純夫教授には特別講

東京コンファレンスセンター・品川にて開催し、JBICが実施

演として「次世代シーケンサーの出現と今後のライフサイエン

している下記の5つのプロジェクトの研究内容と成果についス研究へのインパクト」のタイトルで講演していただきました。

て口頭発表（13件）とポスター発表（40件）を行いました。

報告会への出席者数は延べ334名で、報告会後の懇● 創薬加速に向けたタンパク質構造解析基盤技術開発

親会とも盛況のうちに終了することができました。皆様のご● 化合物等を活用した生物システム制御基盤技術開発

参加、ご協力に対して深く御礼申し上げます。

● 機能性RNAプロジェクト

当日配布した要旨集の入手をご希望の方は、JBIC戦

● 遺伝子発現解析技術を活用した個別がん医療の実現と

略企画本部までご連絡下さい。

抗がん剤開発の加速

JBIC2009プロジェクト研究成果報告会は下記の通り開● 統合データベース

催予定ですのでよろしくお願い致します。

また、上記の他に、4月に設立された産業技術総合研究
所 バイオメディシナル情報研究センターの体制、研究内容

開 催 日：2009年10月30日（金）等について嶋田 一夫センター長から紹介があり、東京大学

開催場所：東京コンファレンスセンター・品川

嶋田センター長によるバイオメディシナル情報研究センターの紹介

ポスター会場にて10報p.11-12

告5月

上海調査団派遣

上海で開催される「バイオテクチャイナ2008」、「バイ政府は欧米の製薬企業で新薬開発経験をもつ優秀な中

オ・医薬フォーラム開幕式」への参加、および中国の行国人研究者を「海亀作戦」により中国に呼び戻し、中国

政機関・研究機関・企業を訪問し、中国の医薬分野にでの新薬開発力のレベルアップを図っています。中国でおける現状と最新動向について調査するため、5月27日の新薬開発の動向についても注意深く見守る必要があ〜6月1日に上海を訪問しました。調査団にはJBIC会員

ると感じました。

企業とJBICから合計11名が参加し、訪問先は日本の現地法人、欧米ビッグファーマの現地法人、上海市政
府機関、CRO（Contract Research Organization）、
公的研究機関を含む15機関
（場所）
でした。
日本現地法人の苦労話、欧米ビッグファーマ現地法
人の研究戦略、上海市政府機関のバイオ医薬に対する意気込み等から中国医薬産業の現状と将来を垣間見ることができ、大変有意義な一週間でした。
中国の医薬品（western-type pharmaceuticals）の総売り上げは192億USD（2005年）
であり、ほとんどはジェネリック医薬品か新薬のコピー医薬品ですが、年率二ケタ増の成長で、近い将来、中国市場は日本市場を上海人民政府の医薬関連機関幹部との情報交換、懇談（張江生物医薬基地本部）

抜いて世界第2位に成長すると予測されています。中国

6月

米国BIO International Conventionに出展

6月17日〜20日、米国San Diegoで開催された「米国の展示会は米国Atlantaで5月18日〜21日に開催される予BIO（Biotechnology Industry Organization）

定です。JBICは2008年2月からBIOの会員になっており、International Convention」に出展し、JBICの紹介と2009年も参加を予定しております。

JBICが実施しているプロジェクトの成果であるH-InvDB（ヒトの遺伝子と転写産物を対象とした統合データベース）とmyPresto（分子シミュレーションシステム）を紹介しました。myPrestoは展示ブースに設置した大型モニターを用いてVTRにより紹介しました。
バイオテクノロジー関連での展示会では世界最大級というだけあって、J. Craig Venter Institute のVenter会長の他、Arnold Schwarzenegger California州知事、Colin Powell前国務長官が基調講演する等大変な活況で、70カ国から20,108人の参加者があったと報告されています。
JBICのブースにも大勢の人が立ち寄りました。2009年

展示会場内のJAPAN Pavilion11

報p.11-12

告10月

BioJapan 2008に出展

10月15日〜17日にパシフィコ横浜で開催された
BioJapan 2008に主催者として出展いたしました。
JBICのブースでは、パネルとプラズマディスプレ
イでJBICの活動を紹介するとともに、新しい試みとしてJBICベンチャー会員企業紹介コーナーを設け、会社のパンフレットを置くとともに、会社紹介のプレゼンテーションを行いました。多くの方にブースを訪問していただき、有難うございました。

JBICブースにおける会員企業によるプレゼンテーション

職

員

紹

事

介
牛嶋 彩乃（うしじま あやの）

務

局

よ

研究開発本部■業務内容
JBIC TR（トランスレーショナル リサーチ）
プロジェクトの経理、庶務等の事務を担当しており、鶴見リーディングベンチャープラザ内にあるJBIC分室とBIRC（バイオメディシナル情報研究センター）を行き来しています。
■自己紹介
Ｂ級グルメ食べ歩きが好きなので、美味しく食べるために週１回ピラティスに通っています。ピラティスは胸式呼吸でお腹の深層にある筋肉に働きかけ身体のゆがみやバラ
ンス改善に役立つエクササイズです。 動物が好きで、家では2匹の猫を飼っています。毎日を明るく楽しく過ごすことがモットーで、近い将来（？）に備えて料理教室にも通っています。鶴見に来られた時はJBIC分室にも是非お立ち寄り下さい。

JBIC JOURNAL

2009年1月 冬号（2009年1月発行）

編集
発行

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URL：http://www.jbic.or.jp

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