AMEDのミッション
データシェアリングはなぜ難しいか？

日本医療研究開発機構 理事長
末松 誠
No conflict of Interests to be declared
Japan Open Science Summit JOSS Lecture 6-19-18

Balkanization
同じ日本語を話していても、話が通じない、どうコミュニケーションを取ったらよいかが判らない状態

Patients’ Need and Physicians’ Desire

Sequencers vs Physicians
Scientists vs Bureaucrats
University vs Industry
It was long time ago in the galaxy…..

University vs University
Medicine vs Other Sciences

Bureaucrats vs Bureaucrats
AMEDのミッションはCatalyst

共有しなければならない疾患構造毎の問題意識（研究開発に必須の患者登録は共通の課題）

1. 認知症(Dementia)(社会保障コストをスイカとすると、研究開発費は種一つ分）

2. がん(Cancer)(現時点ではゲノム医療の社会実装で救われる患者は全体の数％）
3. 難病・未診断疾患(Rare and Undiagnosed Diseases)（遺伝子治療等のモダリティ改革が必要。95%の疾患は治療法なし）
4. 感染症(Infectious diseases)（2050年には地球上の疾患死はがんを上回る。AMRの克服）
5. 再生医療（工業化ができるかできないか？医療の社会実装が可能か？）

6. 人材育成：大学の改革と連動した10年を見越したFundingのしくみ
Academia vs Indutry： At least 2-fold efforts to coordinate

ＡＭＥＤと研究開発プロジェクト○ AMED（日本医療研究開発機構）は、国の医療分野の研究費を集約して、基礎から実用化まで切れ目のない研究支援を実施。
○ 関連する研究開発事業を、５つの「横断型」と４つの「疾患領域対応型」の統合プロジェクト等にまとめ、連携させて推進。

IRUD with UDN-Int’n

From SCRUM-Japan to -Asia(Oncomine Cancer Research Panel)

DATA SHARINGDATA Sharing for patient to overcome diagnostic oddysey

Diagnosis network utilizing Nan-Byo measures
Diagnosis

Upon Japanese Universal Healthcare SystemClinicalCenters

Outpatient department-based

Collaboration with Nan-Byo researchers
1. Undiagnosed for >6 months; AND,Eligible
Criteria

2-1. Multiple organ symptoms; OR

2-2. Genetic disorders suspectedAn example of completely new disease(OMIM#616737)
Large platelets Curved fingers Swollen legs

First two patients
Patient 1
52,000/µl

Patient 2
50,000/µl
Takenouchi and Kosaki AJMG 2016

Both patients hadmutation in a gene calledCDC42.

Three more patients
have been identified
subsequently.

438の病院で「みんなで神経衰弱」

Private Universities+
Regional Core Hospitals

Imperial Universities+National Centers2-yr track record
国内483の協力医療機関がネットワークを構築
ToMMO (Tohoku Univ)
東北メディカルメガバンク
による健常日本人のバリアント
情報の共有による診断の加速

IRUD-P（until FY2017）
Registered families＞3500;
New disease 17 families + 2 case matcheswith foreign countries
N-of-1: >100 families: Successful Dx 34％(<5 candidate variants)
IRUD 診断委員会＋中央倫理審査委員会

半年以内の結果返却
約860例

IRUD Beyond
Beyond diagnosis
Nation-wide Dx coverage→bridging from TR to Tx
Supporting Pre-orphan drug development and drug repositioning
Basic sciences of gene editing Utilization of iPS cells for screening drugs

IRUD

Beyond genotyping
What is missing in genotyping ? How can we
improve deep-phenotyping ?
What is missing in WGS ? Enrichment of phenotyping technologies

Beyond borders
Global data sharing and fostering young
investigators through bilateral funding
Global data sharing: UDN-International/NIH, Australia, Hong-Kong, Singapore, Lithuania,
Spain
iPS research: UK(MRC/NIHR) AMED provides bilateral budgets for fostering
young investigators Interstellar Initiatives with NYAS (Basic Sciences FY2016~)

January 11, 2016: MOC between NIH and AMED
（In the guest hall of National Academy of Sciences）✔Empowering historical collaboration in infectious diseases and surveillance✔Data sharing with UDN-Int’n and Early Cancer Diagnosis in NCI✔ToMMo provides high-quality genome variant data for open resources

AMEDの国際連携
協力に関する覚書締結国・共同研究事業実施国
保健省（リトアニア）
平成28年度締結
MRC（英国）平成28年度締結

SEIDI（スペイン）
平成29年度締結

ロンドン事務所

NIH（米国）平成27年度締結

ワシントンDC事務所

シンガポール事務所
A*STAR（シンガポール）
平成27年度締結

国際的研究連携の枠組みへの参画

HIROs

Diagnostic success
List of genomic diagnoses
First year(Spring, 2017)

Second year(Spring, 2018)

Total

3/12

4/19

7/31=23%• Brown-Vialetto-Van Laere syndrome 2 （SLC52A2, 2012)[Riboflavin transporter mutation]• Microcephaly with or without chorioretinopathy,
lymphedema, or mental retardation （KIF11, 2012)• Atypical Hunter syndrome, adult-onset (IDS)• Visceral myopathy (ACTG2, 2012)[enteric type gamma-actin gene]• Cornelia de Lange syndrome (SMC1A)• Epileptic encephalopathy, child-onset(CHD2, 2012)• Nemaline Myopathy (ACTA1, 2001)

Improvement of diagnostic ratewithin the IRUD network~March 2017

~March 2018

N=2500N=3700Inventions of ground-breaking software algorithm
Improved detection of large deletion / insertion
Improved detection of somatic mosaicism日本のデータシェアリングシステム（IRUD Exchange)が世界の「神経衰弱」ネットワークに仲間入り

IRUD Beyond
Beyond diagnosis
さらに正確かつ迅速な診断 ＞＞＞新規治療法の開発推進・
ゲノム編集技術、遺伝子治療技術などの基礎・応用研究推進Supporting Pre-orphan drug development and drug repositioning
Basic sciences of gene editing Utilization of iPS cells for screening drugs

IRUD

Beyond genotyping
ゲノム解析でわからないことの補完・患者さんとともにある難病の基礎研究の推進
What is missing in WGS ? Enrichment of phenotyping technologies

Beyond borders
国境を越えた臨床情報の共有・国境を越えた倫理審査
国境を越えたDatabaseのSustainabilityの担保
課題: 希少がん患者さんの救済のための研究開発の方向性： 希少難病と区別する必要があるのか？（登録期間：平均4年～4.5年といわれる）

AMED Management System（AMS)
for data-driven policy making
H27年度

H28年度

構築開始

試用開始

H29年度
データの蓄積と運用開始・運用増大 → 効率化

分析基盤検討◆ AMSの整備状況

・分野、領域による配分状況
・研究者、機関のネットワーク・論文動向、等の分析から着手

研究者
提出

H31年度頃

運用、分析の定常化
データ蓄積→ 分析向上
・課題の効率的管理と評価への反映
・分野、領域ごとの適切な資源配分・ファンディングの効果の把握
等に活用

AMS
・計画書
・契約書
・報告書

データをキレイに（名寄せ等同定化）

AMED研究開発タグ
（手作り）

・研究課題
・配分金額
・研究者、研究機関
・成果（論文）・成果（特許）・AMED研究開発タグ※ 以下はAMSへの導入を検討中
課題評価の点数
評価委員情報研究者情報
追跡情報（課題終了後の特許、企業導出等）

国の戦略・政策論文データベース

等
学術雑誌論文・電子Ｊ・電子ＤＤＳ

特許データベース※ 特許公開後充実

Balkanized Local Cohort Studies
How to aggregate information of preclinical dementia ?

Why not ? Data Sharing and Integration
JPHC/JPHCNextn ≈ 60,000
J-MICCn ≈ 100,000

Hirosaki(Aomori)n = 2,390
ToMMon ≈ 50,000

JACCn ≈ 120,000

Obu(Aichi)
n = 1,422

Nagahama Nakajima(Ishikawa)(Shiga)≈ 10,000 n = 1,525

Ama(Shimane)n = 832

Hisayama(Fukuoka)
n = 1,710

Arao(Kumamoto)n = 1,589

JPSC-AD (n ≈10,857)
ToMMo (n ≈ 50,000)
Orange (n ≈ 4,500)
Nagahama (n ≈10,500)

Nakayama(Ehime)n = 921

Yahaba(Iwate)n = 787
Itabashi(Tokyo)
n = 600
Arakawa(Tokyo)n=1,103Midori(Aichi)
Takahama n = 1,156(Aichi)n = 726

TotalParticipants≈ 360,000

診療画像等ナショナルデータベースの構築：応用物理、計算科学への期待：ICT技術や人工知能（AI）による利活用を見据えたインフラ整備）
日本病理学会

理事長：深山 正久
病理専門医数：2300名
日本消化器内視鏡学会

理事長：田尻久雄
消化器内視鏡
専門医数：16,200名

診療画像等データベース
プラットフォームの形成

国立情報学研究所 (NII)

診療情報
患者背景
治療内容
合併症

・疾患レジストリとの連携・人材育成
・広域連携・分散統合型のプラットフォーム

・AI解析等による診療支援ソフトや診断補助システムの開発

日本医学放射線学会

理事長：本田 浩
放射線科専門医数：6300名

臨床研究中核病院等
・効率的な臨床研究･治験への応用

未来に向けて皆さんの力が必要な挑戦✔ 医療機関の広域連携・分散統合による課題解決✔ 疾患の構造と動態が見えるNation wide registryの確立✔ 死蔵データの再利用による課題解決（AIによる創薬スクリーニングなど）✔ 2020年の医療用ID番号導入に伴う 医療用画像情報の統合的利活用✔ 極度に個別化・拠点化した医療機器開発支援の改革とAROの充実

No man is an island, entire of itself.
Every man is a piece of continent, a part of the main.
Any man’s death diminishes me, because I am involvedin mankind, and therefore, never send to know
for whom the bell tolls; it tolls for thee.