第 30 回分子シミュレーション討論会

講演プログラム（2016 年 10 月 30 日 最終更新）

主催: 分子シミュレーション研究会
協賛: 日本化学会, 日本生物物理学会, 日本薬学会, 日本コンピュータ化学会,
分子科学会, 日本物理学会, 応用物理学会, 高分子学会, 溶液化学研究会, 化学工学会
協賛企業 : 株式会社 HPC テック, 株式会社クロスアビリティ, 株式会社 JSOL, 東京工業大学学術国際情報センター,
リアルコンピューティング株式会社, 株式会社菱化システム
会期: 2016 年 11 月 30 日（水）〜2016 年 12 月 2 日（金）会場
: 大阪大学 基礎工学国際棟 シグマホール （大阪大学豊中キャンパス）〒 560-8531 大阪府豊中市待兼山町 １−３
阪急宝塚線石橋駅より 徒歩 20 分, もしくは 大阪モノレール柴原駅より 徒歩 8 分
HP: http://sympo.mol-sim.jp/mssj30/

講演番号 1 桁目 : 発表日
講演番号 2,3 桁目: 通し番号
講演番号記号: L=25 分講演（発表 20 分＋討論 5 分）
: S=15 分講演（発表 12 分＋討論 3 分）
IL=招待講演（発表 45 分＋討論 5 分）
AL=受賞講演（発表 30 分＋討論 5 分）
: P=ポスター発表
S, P=15 分講演+ポスター発表
講演者記号記号 : ○印=発表者

1 日目— 休憩 10:50-11:00 —11 月 30 日（水）9:00-10:00 開場，受付
10:00-10:05 開会の辞

会長

岡崎

進（名大）

— 午前の部 —10:05-10:50 口頭発表（溶液 I）
座長：光武亜代理（慶大）
水溶液中のオキシルシフェリン異性体の安定性（東大物性研1 , 原研2 ）○野口良史1 , 樋山みやび1 ,志賀基之2 , 杉野修1 , 秋山英文1
102S Kirkwood-Buff 積分に基づく溶液の分子構造を再現する可分極分子力場の検討−尿素溶液を例として（東工大 ACLS1 , 東工大生命理工2 , ヨーク大化3 ）○千葉峻太朗1 , 古田忠臣2 , 清水青史3103S 分子動力学シミュレーションによる温度・圧力
制御下での振動差スペクトルの効率的な計算手法と水への応用（東北大院理1 , 京大 ESICB2 ）○城塚達也1 , 森田
明弘1,2

101S

11:00-12:00 ポスター発表 101P-158P（奇数）（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）— 昼食 12:00-13:00 —— 午後の部 —13:00-14:00 ポスター発表 101P-158P（偶数）（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）

14:00-14:45 口頭発表（計算手法 I）
座長：松本充弘（京大）
104S アンブレラ積分による自動アンブレラサンプリ
ングアルゴリズム（阪大理）○満田祐樹, 山中秀介, 川上貴資, 奥村
光隆
105S 分子シミュレーションにおける三体ポテンシャ
ルを含んだ系の局所応力テンソルの非一意性（東大物性研）○中川恒, 野口博司

106S マルチタイムステップ数値積分法 (RESPA) に基づく分子動力学計算での圧力値算出における問題（名大院工 計算セ1 , 名大院工2 ）○安藤嘉倫1 , 吉
井範行1,2 , 山田篤志2 , 岡崎進2

— 休憩 14:45-14:55 —14:55-16:05 口頭発表（材料）
座長：鷲津仁志（兵庫県立大）107L ガラスの振動特性と熱物性：弾性不均一性を基盤とした理論構築（東大院総合文化）水野英如
108S 粗視化分子動力学法によるポリエチレンの破壊プロセスに高分子鎖末端が与える影響（東北大金研1 ,JST さきがけ2 ）○樋口祐次1,2 , 久保百司1
109S 周期振動下高密度分散系の粒子軌道に関する可逆・不可逆不連続転移（名大理1 , モンペリエ大2 ）○川崎猛史1 ,Ludovic
Berthier2
110S リチウムイオン電池における Li イオンの動的挙動解明（工学院大）○齋藤周平, 高羽洋充

— 休憩 16:05-16:15 —16:15-17:10 口頭発表（計算手法 II）
座長：米澤康滋（近大）

111S リガンド-タンパク質複合体の分散力相互作用の検討: Hartree-Fock 理論に対する分散力補正 (2)（徳島大院薬）○吉田達貞, 岡尚生, 谷山萌, 西村
兆二朗
112S 量子化学計算による電子雲の 3D プリンタ出力
用コード開発（東大物性研1 ,（株）クロスアビリティ2 ）○山崎淳1 , 古宇田光1 , 長代新治2 , 千田範夫2 , 古賀良
太2113L 分子動力学に向けた多体ポテンシャル関数の自動コード生成を行うメタコンパイラ DAMA の開発（核融合研）伊藤篤史

2 日目

12 月 1 日（木）— 午前の部 —9:00-9:55 口頭発表（ソフトマター I）

座長：山本量一（京大）

201S 分子動力学法を用いた脂質膜における細孔形成
過程の自由エネルギー解析（名大院工）○宮崎裕介, 篠田渉, 岡崎進
202S 対向する自己駆動粒子系におけるレーン形成とその動的な転移の解明（新潟大院自然1 , 阪大基礎工2 ）○池田光佑1 , 金
鋼2203L 理想ガラス状態のエネルギー地形とエントロピー（モンペリエ大1 , 東大総合文化2 , 名大理3 ）尾澤
岬1 ,Walter Kob1 , ○池田昌司2 , 宮崎州正3— 休憩 9:55-10:05 —10:05-10:50 口頭発表（生体分子 I）
座長：奥村久士（分子研）

204S ウリジンシチジンキナーゼの基質特異性の理論的解明（総研大遺伝1 , 筑波大数物2 , 筑波大計算セ3 , 阪大
生命機能4 , 神奈川工科大教育セ5 , 産総研ナノシ
ス6 , 阪大理7 , 大阪市大理8 ）○田中弥1,2 , 庄司光
男2,3 , 友池史明4 , 氏家謙2 , 花岡恭平2 , 原田隆平2 ,栢沼愛2,3 , 神谷克政5 , 石田豊和6 , 増井良治7,8 , 倉
光成紀7 , 重田育照2,3205S ペプチドの凝集過程についての特に密度依存性に着目した解析（名大院理1 , 名大構造生物センター2 , 名大計算科学センター3 , 名大情報基盤センター4 ）○榮慶
丈1 , 岡本祐幸1,2,3,4
206S 緩和モード解析を用いた蛋白質のダイナミクスの研究（慶大理工1 , さきがけ2 ）○光武亜代理1,2 , 高野宏1

— 休憩 10:50-11:00 —11:00-12:00 ポスター発表 201P-258P（奇数）（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）— 昼食 12:00-13:00 —— 午後の部 —13:00-14:00 ポスター発表 201P-258P（偶数）（講演タイトルはプログラムの末尾に記載）

14:00-14:50 招待講演 I座長：杉田有治（理研）

— 休憩 10:25-10:35 —207IL 計算科学・情報科学が拓く創薬の未来（京大医）奥野恭史— 休憩 14:50-15:00 —10:35-11:20 口頭発表（モデリング）
座長：荒井規允（近大）

15:00-15:50 招待講演 II
座長：松林伸幸（阪大）

208IL ナノスケール化学反応系に対する分割統治型密度汎関数強束縛分子動力学 (DC-DFTB-MD) シ
ミュレーション
（早大先進理工）中井浩巳— 休憩 15:50-16:00 —304S 大規模分子動力学法による固体酸化物形燃料電池における Ni 多結晶の破壊プロセスの検討（東北大金研）○許競翔, 樋口祐次, 尾澤伸樹, 久保百司
305S 強磁場下における磁性微粒子の高濃度薄膜形成に関するブラウン動力学シミュレーション（和高専機械1 , 明石高専機械2 ）○早坂良1 , 大村
高弘1 , 藤原誠之2306S 銅めっきによる溝埋め込みにおける銅（I）イオ
ンの働き（京大情報）○北原稔也, 金子豊, 船越満明

16:00-16:35 学術賞受賞講演
座長： 斉藤真司（分子研）— 休憩 11:20-11:30 —209AL 受賞講演
11:30-12:30 口頭発表（量子系）
16:35-17:15 研究会総会

座長：伊藤篤史（核融合研）
水素分子クラスターの基底状態と魔法数（金沢大理工）○三浦伸一
308S 酸化セリウム触媒の酸・塩基特性に関する理論的研究（北大触媒研1 , 東北大院工2 ）○中山哲1 , 田村正
純2 , 清水研一1 , 長谷川淳也1309S 水素分子凝集系における過冷却状態の達成とその特異な動的性質（京大院理1 ,JST さきがけ2 ）金賢得1,2
310S 水素結合を含んだアニオン的ヘテロ型複合体における核磁気共鳴化学シフトの溶媒・温度効果（RIST 神戸センター1 , 原子力機構2 ）○太田幸
宏1 , 志賀基之2

307S— 移動 17:15-17:30 —17:30-19:30 懇親会
会場：大阪大学会館 アセンブリーホール

3 日目

12 月 2 日（金）— 午前の部 —9:30-10:25 口頭発表（生体分子 II）
座長：齋藤大明（理研）
Hras-GTP / GDP 複合体の GTP / GDP と溶媒水
分子との水素結合状態の分子動力学法による研究（東京薬科大生命科学1 , 金沢大国際基幹教育院2 ,金沢大理工3 ）○宮川毅1 , 森河良太1 , 高須昌子1 ,杉本公一2 , 川口一朋3 , 長尾秀実3302S ポリオウィルス-レセプター間相互作用の分子論的研究（名大院工1 , 名大院工計算セ2 , 阪大蛋白研3 ）○藤本和士1 , 水谷圭介1 , 小嶋秀和1 , 山田篤志1 , 安藤
嘉倫1 , 吉井範行2 , 篠田渉1 , 中川敦史3 , 岡崎進1
303L 創薬応用へのメタダイナミクスによる構造探索とアルケミカル自由エネルギー計算（富士通研）○谷田義明, 松浦東

301S— 昼食 12:30-13:30 —— 午後の部 —13:30-14:30 口頭発表（溶液 II）
座長：藤本和士（名大）311S 分子動力学法によるアルゴンの融解エントロピー（法大生命）片岡洋右
312S 分子動力学を基盤とした錯体キラルドーパントが有するらせん誘起力の理論的予測（北里大理）○渡辺豪, 吉田純
313S 第一原理分子動力学計算による水溶液中でのCO2 とアミンの反応の自由エネルギー解析（関電技研1 , 電中研材料研2 , コメニウス大理3 , ス

ロバキア科学アカデミー無機研4 ）○窪田善之1 ,
大沼敏治2 ,Tomás̆ Buc̆ko3,4314S DA 型高分子半導体溶液薄膜における界面配向形成の MD 計算による検討（産総研1 , 東大2 ）○米谷慎1 , 松岡悟志1 , 堤純也1 ,長谷川達生1,2— 休憩 14:30-14:40 —14:40-15:30 口頭発表（アモルファス）
座長：秋元琢磨（慶大）
315L 不規則原子配列を記述するための多胞体の命名法（産総研）○西尾憲吾, 宮崎剛英
316L パーシステントホモロジーを用いたガラスの中
距離秩序構造の統一的記述（東北大 AIMR）中村壮伸— 休憩 15:30-15:40 —15:40-16:35 口頭発表（ソフトマター II）
座長：篠田渉（名大）317S 表在性膜タンパク質の脂質膜上での不均一拡散（ 慶 大 院 理 工1 , オック ス フォー ド 大 理2 , 慶
大 理 工3 ）○ 山 本 詠 士1 , 秋 元 琢 磨1 ,Antreas C.
Kalli2 ,Mark S. P. Sansom2 , 泰岡顕治3318S ミセル、ヘキサゴナル、膜構造における界面活性剤分子の拡散および集団運動（名大院工計算セ1 , 名大院工2 ）○吉井範行1,2 , 岡
崎進1,2319L 自発的に運動する細胞集団のモデリングとシミュ
レーション（京大工）○山本量一,Simon Schnyder

16:35-16:40 閉会の辞

松林伸幸（阪大）

ポスター発表(下線は 15 分口頭発表と同じ)

1 日目
GPU を用いた近傍リスト作成の高速化-短距離相互作用分子動力学（広大院総）○佐久間翔太, 宗尻修治
102P ニッチとシードを組み込んだ進化論的計算によるクラスターの構造（北大院理）竹内浩
101P

103P 零多重極子和法の実装と PME 法との比較（東大新領域1 , 阪大蛋白研2 ）○桜庭俊1 , 福田育夫2104P 105S 参照
B 型肝炎ウイルス-新規抗ウイルス薬 C13 複合体の分子動力学シミュレーション（北里大院理1 , 北里大理2 , 中央大理工3 , 大阪市
立大院医学4 ）○佐藤俊輔1 , 渡辺豪2 , 岩舘満雄3 ,
梅山秀明3 , 早川路代4 , 村上善基4 , 米田茂隆2106P 気泡生成現象を利用した分子モーターモデルの散逸粒子動力学シミュレーション〜ATP サイク
ル中の分子間距離の検討による歩行モデルの改良〜（近大院理工1 , 近大理工2 ）○北條雅一1 , 荒井規
允2107P MD シミュレーションによるアミノ酸アナログに対する共溶媒効果の自由エネルギー解析（阪大基礎工）○小林遊磨, 山守優, 石塚良介, 松
林伸幸
108P 分子動力学シミュレーションと多変量解析によるによる転写因子足場蛋白質の研究（近大先端研・JST-CREST）米澤康滋
109P 生体分子の定温定圧レプリカ置換分子動力学シ
ミュレーションの開発（総研大1 , 分子研2 ）○山内仁喬1,2 , 奥村久士1,2
110P 脂質二重膜における PI(4,5)P2 の安定性の解析（広市大情報1 , 近大先端研2 , 東北大情報3 , 東北大
メガバンク4 , 東北大5 ）○近藤寛子1 , 米澤康滋2 ,木下賢吾3,4,5 , 鷹野優1
111P 緩和モード解析による蛋白質系の遅い緩和ダイ
ナミクスの抽出（慶大理工1 ,JST さきがけ2 ）○唐澤直之1 , 光武
亜代理1,2 , 高野宏1
112P 生物学的レアイベントを再現する構造サンプリ
ング手法の開発（筑波大計セ）○原田隆平, 重田育照
113P 分子動力学法による抗 B 型肝炎ウイルス薬の機能解明に向けた力場開発（名大院工）○深井基裕, 藤本和士, 篠田渉, 岡崎進
114P Molecular Tailoring Approach を用いた α ヘリックスに働く水素結合の量子化学的解析（阪大蛋白研1 , 阪大院理2 , 広市大院情報3 ）○草鹿あゆみ1,2 , 鷹野優3 , 中村春木1
115P 206S 参照

105P

116P FKBP とリガンドとの複合体形成に関する結合
自由エネルギー変化の非経験的分子軌道法に基づく相関解析
（徳島大院薬）○岡尚生, 谷山萌, 吉田達貞
117P Prediction of Tankyrase2-ligand Binding Affinities Using Molecular Mechanics and Quantum Me-chanics Calculations（理研）○沖本憲明, 大塚教雄, 平野秀典, 泰地真
弘人
118P POPC の膜電位に関する理論的研究（金沢大院自然）○伊藤誠一朗, 川口一朋, 長尾
秀実
119P 分子動力学シミュレーションによるナノ空間におけるエポキシ樹脂の充填挙動の解析（デンソー1 , 阪大基礎工2 ）○森穂高1,2 , 松林伸
幸2 , 泉龍介1 , 今井博和1
120P イオン液体におけるイオンペア交換のダイナミ
クス（名大院工1 , 名大2 , 産総研3 , 山口大4 , 横国大5 ）○平川真志1 , 篠田渉2 , 岡崎進2 , 都築誠二3 , 上野
和英4 , 渡邊正義5121P 固体高分子中における水の再結晶化メカニズムの解明（富山大院理工）○八十島亘宏, 源明誠, 石山達也
122P MD/DFT 自己無撞着計算法を用いた水溶液系の力場開発（阪大基礎工1 , 京大 ESICB2 ）○石塚良介1,2 , 松
林伸幸1,2123P A molecular dynamics study of hydrogen hydrate（金沢大院自然）○ Yudha Arman, 三浦伸一
124P 分子動力学法を用いた不均一気泡核生成（慶大理工）○徐東郁, 泰岡顕治
125P 液体アルカンに溶存する球状分子の拡散挙動とその構造寿命（新潟大院自然1 , 新潟大理2 ）○石井良樹1 , 大鳥
範和2
126P 微小液滴の蒸発にともなう冷却と凝固（京大院工）○粟生貴志, 松本充弘
127P 充填氷の構造とダイナミクス（金沢大院自然）○池沢将人, 三浦伸一
128P 水/アルコール 2 成分系における表面張力温度依
存性の解明（東理大理工1 , 東理大 RIST2 ）○坂口裕宜1 , 金
子敏宏1,2 , 上野一郎1,2
129P 液体の積分方程式理論とストリング法を結合した最小自由エネルギー経路計算法の開発（金沢大院自然）○水谷優斗, 岩崎宏, 三浦伸一
130P 不凍タンパク質の近傍での氷生成：TIP4P/Ice とAMBER ポテンシャルを用いた MD シミュレーション（名工大工1 , 名造大2 ）○石田雅祥1 , 尾形修司1 ,鍜島康裕2 , 浦長瀬正幸1 , 田村友幸1
131P 修飾シクロデキストリンが形成する包接化合物の構造解析（山口大院創成科学）○下枡晴菜, 浦上直人, 山
本隆
132P 第一原理計算を用いた水素ハイドレートの振動解析（ 慶 大 理 工1 , 工 学 院 大 工2 ,Colorado Schoolof Mines3 ）○ 山 田 基1 , 平 塚 将 起2 ,David T.
Wu3 ,Amadeu K. Sum3 , 泰岡顕治1
133P 水―メタノール混合系中の音速〜分子動力学シ
ミュレーション〜（広大院総合）○立花優侑, 宗尻修治
134P エネルギー表示法とベネット受容比法による水・オクタノール分配係数の推算（東レ1 , 阪大院理2 , 阪大院基礎工3 ）○北畑雅弘1 ,
川上智教1 , 茂本勇1 , 満田祐樹2 , 松林伸幸3135P ナノ液滴界面での液晶に媒介される自己集合の散逸粒子動力学シミュレーション（近大理工）○井口拓弥, 荒井規允
136P 水-メタノール液滴に対する凹凸構造のある表面の濡れ性（福井大工1 , 慶應大理工2 ,Univ. Nebraska3 ）○古石貴裕1 , 泰岡顕治2 ,X. C. Zeng3
137P 粗視化分子動力学シミュレーションによる溶媒がポリマーブラシの摩耗に与える影響（東北大1 , 京大2 ）○高桑諒1 , 大谷優介1 , 西松毅1 ,
樋口祐次1 , 尾澤伸樹1 , 辻井敬亘2 , 久保百司1
138P 閉じ込め系における界面活性剤水溶液の自己集合構造と自己集合プロセスの散逸粒子動力学法
シミュレーション（近大理工）○吉本裕貴, 荒井規允
139P 分子動力学シミュレーションとエネルギー表示
溶液理論によるタンパク質の共溶媒変性効果の自由エネルギー解析（阪大基礎工）○山守優, 松林伸幸
140P Janus 表面を持つナノチューブ内における界面活性剤水溶液の自己集合に関する散逸粒子動力学シミュレーション（近大院理工1 , 近大理工2 ）○小林祐生1 , 荒井規
允2141P せん断流れ下におけるテレケリックポリマー水溶液の散逸粒子動力学シミュレーション（近大理工）○西村真都, 荒井規允
142P 202S 参照
143P 高分子結晶膜の CO2 分離性能を単結晶モデルと表面を含むモデルで見る（福井大院工）○清水洸佑, 玉井良則
144P シリカガラスにおける水分子による化学ボンド
破壊の温度依存性：ハイブリッド量子古典シミュ
レーション（名工大工）○佐藤美希, 河野貴久, 尾形修司, 浦
長瀬正幸, 田村友幸
145P 分子動力学シミュレーションによる層状グラフェ
ンの低摩擦機構解析（兵県大院）○前田達也, 鷲津仁志
146P 講演取消
147P MD シミュレーションによる半導体材料の結晶成長解析（京大工）○張鳴鏑, 松本充弘

148P 応力印加による結晶性高分子の破壊機構の解明（福井大院工）○山田忠明, 玉井良則
149P 全原子 MD による高分子に吸収された水のエネ
ルギー相関解析（阪大基礎工）○石田菜穂, 石塚良介, 松林伸幸
150P 分子動力学法による α-Al2 O3 基板上の ZnO 結
晶成長シミュレーション（東北大金研）○川岸俊介, 許競翔, 大谷優介, 西松毅, 樋口祐次, 尾澤伸樹, 久保百司
151P 高速熱流体潤滑における壁面近傍でのレナード・ジョーンズ液体の固体化（兵県大院）大川凌152P ボルツマンの輸送方程式を用いた熱輸送の解析（京大工）松本充弘, 向井竣輔, ○秋月聖也
153P 第一原理分子動力学法による Si 基板表面-水間の界面自由エネルギーの評価（名工大1 ,（株）デンソー2 ,（株）豊田中央研究所3 ）○浦長瀬正幸1 , 田中宏一2 , 森穂高2 , 田嶋聡
美3 , 尾形修司1154P 密度汎関数理論によるルチル型 TiO2 (110) 表面
における格子間チタン由来の余剰電子に関する研究（慶大理工）○森田一軌, 澁谷泰蔵, 泰岡顕治
155P フラグメント分子軌道法を活用したタンパク-リ
ガンド系の大規模分子軌道解析（理研 QBiC1 , 東大理2 ）○大塚教雄1 , 沖本憲明1 ,
泰地真弘人1 , 常行真司2
156P 密度汎関数理論およびドッキング計算に基づく
CYP1A2 におけるカフェインの代謝部位選択性の検討（徳島大院薬）○西村兆二朗, 吉田達貞
157P 液体水素における非平衡熱伝導状態の実現と分子熱流解析（京大理1 ,JST さきがけ2 ）○阿部紀遥1 , 金賢得1,2
158P QM/MM 法を用いたグリコーゲンシンターゼキ
ナーゼ-3β と 7-アザインドール誘導体の結合相互作用解析（徳島大院薬）○谷山萌, 岡尚生, 吉田達貞

2 日目
201P Multiple program/multiple data molecular dynamics method with multiple time step integrator forlarge biological systems（理研）○ Jaewoon Jung, 杉田有治
202P Green-Kubo 式による粘度算出の計算条件依存性（（株）クロスアビリティ1 , 阪大基礎工2 ）○竹内宗孝1 , 坂牧隆司1 , 松林伸幸2203P 112S 参照
204P マルチカノニカルアンサンブルを生成する一般
化ハイブリッドモンテカルロ法の開発（金沢大院自然）○田川従道, 三浦伸一

205P 蛋白質間相互作用のエネルギー密度積分におけるクーロン場近似の影響と適切な積分範囲（早大物理）○水原志暢, パーキン暖, 高野光則
206P 電解質水溶液中の一様に帯電した球殻内に生成される負圧の分子論的解明（名大院工）○島航平, 小嶋秀和, 藤本和士, 篠田
渉, 岡崎進207P 強磁場下における磁性微粒子の薄膜形成条件の解析（和高専機械）○硲俊浩, 早坂良
208P プローブ分子によるタンパク質の結合ポケット
探索（富士通研）○佐藤博之, 松浦東
209P 204S 参照
210P 水溶液中のタンパク質間静電相互作用の粗視化
モデル（金沢大理工）○川口一朋, 長尾秀実
211P 分子シミュレーションによるタンパク質の結合
ポケット解析と基質の結合構造予測（理研 QBiC）○齋藤大明, 沖本憲明, 泰地真弘人
212P 粗視化ゲルモデルを用いた生体関節潤滑機構の研究（京大院工）○矢上翔太, 佐野晃二郎, 松本充弘
213P 活性化および非活性化ロドプシンのの内部結合
水の比較の分子シミュレーション（慶應大1 ,Frank Laboratory of Neutron Physics,
Joint Institute for Nuclear Research2 ）○友部勝
文1 , 山本詠士1 ,Kholmirzo2 , 泰岡顕治1214P リン脂質二重層膜中でのコレステロール間側方相互作用のリン脂質種依存性（名大院工1 , 名大院工 計算科学セ2 ）○松岡漢
斗1 , 安藤嘉倫2 , 岡崎進1,2
215P ヘマグルチニンと GM3 分子間のリガンド−受容体相互作用の解析（慶大理工）○九十九慶之, 山本詠士, 井上堅斗,
泰岡顕治, 三上益弘
216P アミノアシル tRNA 合成酵素での基質結合における自由エネルギー計算と分子構造からの考察（分子研1 , 総研大2 ）○森義治1 , 奥村久士1,2
217P 複数タンパク構造を用いた分子ドッキング手法に関する研究（理研 QBiC）○平野秀典, 沖本憲明, 藤田茂雄,
泰地真弘人
218P 分子シミュレーションを用いたメタンハイドレートの相平衡条件予測方法（慶大院1 , 慶大院理工2 ,CSM3 , 慶大理工4 ）○湯原
大輔1 ,Paul E. Brumby2 ,David T. Wu3 ,Amadeu K.
Sum3 , 泰岡顕治4219P ナノチューブ内におけるメタン分子の分子動力学シミュレーション（近大理工）○勝部康平, 荒井規允
220P 分子動力学計算を用いた界面における氷 Ih の安

221P

222P

223P

224P

225P

226P

定性に関する研究（慶大理）○今井尚子, 徐東郁, 高岩大輔, 泰岡顕治
分子動力学法を用いたアルカンの均一液滴核生成の解析（慶大理工）○阿由葉翔, 徐東郁, 泰岡顕治
水和イオン対解離過程の多次元自由エネルギー
地形解析（量研機構）米谷佳晃
直鎖アルカン・アルコールの粘弾性緩和：並進
配向結合と不均一構造の効果（名大院工）山口毅[C2 mim][BF4 ] イ オ ン 液 体 中 で 生 成 す る
Co(II)(OH2 )4 錯体周辺の溶媒和構造とソルバト
クロミズムに関する理論的研究（お茶大院人間文化創成科学1 , 東工大原研2 , お
茶大基幹研究院3 ,JST さきがけ4 ）○黒木菜保子1 ,鷹尾康一朗2 , 森寛敏3,4
3D-RISM 理論を用いた水溶液中におけるアラニ
ンジペプチドの自由エネルギー地形の評価（金沢大院自然）○山口智, 岩崎宏, 三浦伸一
110S 参照

227P レプリカ交換分子動力学法を用いたナノスリッ
ト細孔内の氷/水相平衡シミュレーション（慶大理工）○山光隆一, 野村昴太郎, 泰岡顕治
228P 蒸発に伴うナノ粒子凝集の分子シミュレーショ
ン（日立）○杉井泰介, 保坂知幸, 吉村一樹, 石井
英二
229P 102S 参照
230P 水アルコール混合溶液中のポルフィリンモノカ
ルボン酸自己組織化ダイマーの安定化機構についての分子動力学シミュレーション（北大工1 , 北大総化2 ）○佐藤信一郎1,2 , 佐藤友
亨2 , 水谷駿介2 , 和田拓馬1
231P 超臨界 LJ 流体における Stokes-Einstein の関係の破綻：気体から液体まで（新潟大院自然1 , 新潟大理2 ）○宮本祥平1 , 石井良樹1 , 大鳥範和2232P 疎水表面付近における水の誘電率低下の分子描
像（早大物理）○佐々木徹, 佐藤昂人, 大貫隼, 高野
光則
233P 非調和振動ポテンシャルを用いた赤外線領域における D-グルコース水溶液内水分子の振動解析（慶大理工1 , 富山大工2 ）○中村真二郎1 , 友部勝
文1 , 山本詠士1 , 石山達也2 , 泰岡顕治1234P 水−メタノール混合系におけるメタノールのポ
テンシャルモデルの開発（広大院総）○山崎真史, 宗尻修治
235P 201S 参照

多体散逸粒子動力学法を用いた親水/疎水のパターンを有する固体表面上の高分子液滴に関する研究（近大理工）○西脇拳四郎, 荒井規允
237P 磁性微粒子の薄膜形成に及ぼす液体の温度変化の影響（和高専機械）○ Ariff Hanafi, 早坂良
238P 散逸粒子動力学シミュレーションを用いた分子認識機能を持つトリブロックポリマーモデルによる自己集合構造（近大理工）○荒木雄介, 荒井規允
239P 318S 参照

236P

240P 散逸粒子動力学シミュレーションを用いたテレ
ケリックポリマーによる超分子ネットワークの緩和挙動（近大理工）○脇本宏平, 荒井規允
241P パーシステントホモロジーを用いた乱れた系の降伏点前後での構造変化の探索（東北大 AIMR1 ,JST さきがけ2 ）○白井達彦1,2 ,中村壮伸1,2
242P 高分子力学ネットワークの粘弾特性（慶大理工）○名取慧, 高野宏
243P CNT の強度特性（成蹊大理工）○吉田智, 坂本昇一, 富谷光良
244P 全原子分子動力学法による有機系単分子膜形成
過程の解析（兵庫県大（院）1 , 兵庫県大2 ）○小西正和1 , 鷲津仁志2245P ナノチャネル内流れのすべり速度に対する分子
内自由度による影響（東理大理工1 , 東理大 RIST2 ）○長沼誉里香1 , 金
子敏宏1,2 , 上野一郎1,2
246P カーボンナノチューブに内包された有機分子の第一原理ダイナミックス（名工大工）○小柳津翔太, 尾形修司, 都築貴寛,
浦長瀬正幸, 田村友幸
247P MD シミュレーションを用いたパーフルオロア
ルキル化合物が形成する Langmuir 膜の構造解析（阪大基礎工1 , 京大化研2 ）○中田幸司朗1 , 石塚良介1 , 松林伸幸1 , 長谷川健2
248P NEMS 摺動界面に用いる人工材料設計指針としてのナノ動摩擦法則の探究（I）（金沢工大 EOE 応用研究セ）○町野太樹, 池田
聖, 東側大輝, 林啓治
249P NEMS 摺動界面に用いる人工材料設計指針としてのナノ動摩擦法則の探究（II）（金沢工大 EOE 応用研究セ）○齋藤公希, 町野太樹, 林野光輝, 林啓治
250P NEMS 摺動界面に用いる人工材料設計指針としてのナノ動摩擦法則の探究（III）（金沢工大 EOE 応用研究セ）○小松央征, 齋藤公希, 中野高嗣, 林啓治
REBO 分子動力学法による高水素含有アモル
ファス炭素膜の摩擦シミュレーション（兵庫県大）○秋山博俊, 鷲津仁志
252P 高分子鎖切断を記述可能な新規ポテンシャルモ
デルの開発および破断の分子動力学シミュレー
ション（名大院工1 , 京大福井謙一セ2 ）○服部智成1 , 藤
本和士1 , 埜崎寛雄1 ,Rajdeep Singh Payal1 , 中垣雅
之2 , 榊茂好2 , 篠田渉1 , 岡崎進1
253P Density functional approach and random matrix
theory to proteogenesis（日大理工）山中雅則
254P QM/MM-ER 法による光化学系 II の Mn クラス
ターにおける一電子酸化反応の自由エネルギー解析（東北大院理1 , 京大 ESICB2 ）○鈴岡大樹1 , 高橋
英明1 , 森田明弘1,2
255P ポルフィリン環の構造歪みがヘムの電子構造と酸化還元電位に与える影響の計算科学的研究（阪大蛋白研1 , 阪大院理2 , 広市大院情報3 ）○今田康博1,2 , 中村春木1 , 鷹野優3
256P 周期境界条件化での高速な QM/MM 理論の開発（分子研1 , 総研大2 ）○西澤宏晃1 , 奥村久士1,2
257P 混合 MC/MD 反応法における QM/MM 計算による汎用的エネルギー評価法の開発（名大院情報科学1 , 京大 ESICB2 ,CREST-JST3 ）○藤江拓哉1 , 竹中規雄1,2 , 鈴木雄一1 , 長岡正隆1,2,3258P 分割統治型密度汎関数強束縛分子動力学法のシ
クロファン類の異性化反応への応用（早大先進理工1 , 早大理工研2 , 京大 ESICB3 ,JSTCREST4 ）○黄毅聰1 , 西村好史2 , 小野純一1 , 鹿又宣弘1 , 中井浩巳1,2,3,4

251P