Vol.

242022

甲南大学先端生命工学研究所

078-303-1147

Contents
はじめに
FIBER 伝説
海外連携研究レポート

FIBER 研究最前線レポート
未来大学 in NanoBioNow
PICK UP FIBER／FIBER 余話

FIBER 伝説

FIBER
伝説

はじめに

学問を繋ぎ、核酸化学の国際的研究拠点へ

甲南大学先端生命工学研究所（Frontier

FIBER 所長

Institute for Biomolecular Engineering
Research: 略称 FIBER）は生命分子工学分野において世界最高水準の研究・教育を実施する研究所として 2003 年に設立されました。本機関誌 NanoBioNow は、FIBERの 理 念、研 究、成 果をよりわかりやすく、
より面白く伝える作りになっています。

「常ニ備 ヘヨ」。これは甲 南 学 園 創 立 者
平生釟三郎先生のことばの一つです。新型
コロナウイルスのように、突如私たちの生活が感染症などに脅かされることが今後も起こり得ると思われます。私たち科学者はそのような脅威に対抗するためにも生命化学を日々研究していかなくてはなりません。
FIBER は化学の基礎と応用の両輪で研究を進め、社会に役に立つサイエンスやエン
ジニアリングを展開して参ります。
本号担当編集四領域を束ねて「ひと」を科学することを目標に日々研究が行われています。

本号の案内人 Ｓ所長

FIBER では生命・健康・材料・環境の

FIBER 准教授 高橋俊太郎

杉本直己

FIBER の新展開について書きたい。
2011 年に発行された成書 核酸化学のニュートレンド（日本化学会編） の巻頭言で私は、「核酸化学が熱い。いつ新しい発見があっても不思議ではない状況です。」と書いた。
それから10 年以上経過して、核酸化学の学問はさらに熱くなっている。COVID-19における
mRNAワクチンの開発など、核酸化学は一般にも注目され始めている。
この 間 2017 年 に、日 本 核 酸 化 学 会（The Japan Society of Nucleic Acids Chemistry,
略称 JSNAC）がスタートした。初代会長として、私は、会員の利便性や社会的な存在感を鑑み、三つの大きな 繋ぐ を、JSNAC の大きな役割と考えた（詳細は、核酸化学会誌 2017 年第 1 号
巻頭言参照）。
この JSNAC の三つの 繋ぐ は、FIBER の今後にも重要と考えられるので、ここで紹介する。
（１）世界を繋ぐ。
研究テーマは個人の発想に基づくのは当然であるが、素晴らしい成果を得るには優れた共
同研究は欠かせない。FIBER も、研究成果を世界に発信し、国際共同研究に繋ぐ努力を行わ
ないといけない。そのためには現在も進めてはいるが、国際シンポジウムやミニシンポジウム、
レクチャーツアーなどの交流活動を一層盛んに行う必要があろう。
（２）分野を繋ぐ。
核酸は、遺伝子発現におけるセントラルドグマ（中心教義）の概念に基づき、タンパク質な
どの多くの生命分子の情報を握る重要な分子である。それゆえ、核酸化学は、学問のセントラルドグマとして、核酸だけでなく多種多様な生命分子の研究分野に大きな影響を及ぼし、偉大な貢献をなす可能性がある。さらに、核酸化学を基に、医薬系だけではなく、農学や情報学などの広範な分野への展開が盛んになるであろう。また、FIBER の研究成果を他の分野の研究者に広め、その反響をフィードバックすることが求められることになろう。
（３）時代を繋ぐ。
迸る情熱によって奔走した創生期の FIBER の意気込みや熱き想い、巧みな技を次に繋ぐことも重要である。シニアには経験の蓄積があり、若者には改革の勇気がある。 The Futureof the Past の視点から、シニアと若手（海外で活躍が期待される若手も）を繋ぐことができ
れば、FIBER は光り輝けるものに発展できよう。
今年度から日本学術振興会のご支援のもと、「研究拠点形成事業」が FIBER を中核として始まった。日本、英国、米国、イタ
リア、インド、スロベニアが連携する核酸
化学の国際研究拠点形成である。今後のFIBER の展開を期待していただきたい。


01

2022

2022

02

FIBER 伝説

FIBER
伝説

はじめに

学問を繋ぎ、核酸化学の国際的研究拠点へ

甲南大学先端生命工学研究所（Frontier

FIBER 所長

Institute for Biomolecular Engineering
Research: 略称 FIBER）は生命分子工学分野において世界最高水準の研究・教育を実施する研究所として 2003 年に設立されました。本機関誌 NanoBioNow は、FIBERの 理 念、研 究、成 果をよりわかりやすく、
より面白く伝える作りになっています。

「常ニ備 ヘヨ」。これは甲 南 学 園 創 立 者
平生釟三郎先生のことばの一つです。新型
コロナウイルスのように、突如私たちの生活が感染症などに脅かされることが今後も起こり得ると思われます。私たち科学者はそのような脅威に対抗するためにも生命化学を日々研究していかなくてはなりません。
FIBER は化学の基礎と応用の両輪で研究を進め、社会に役に立つサイエンスやエン
ジニアリングを展開して参ります。
本号担当編集四領域を束ねて「ひと」を科学することを目標に日々研究が行われています。

本号の案内人 Ｓ所長

FIBER では生命・健康・材料・環境の

FIBER 准教授 高橋俊太郎

杉本直己

FIBER の新展開について書きたい。
2011 年に発行された成書 核酸化学のニュートレンド（日本化学会編） の巻頭言で私は、「核酸化学が熱い。いつ新しい発見があっても不思議ではない状況です。」と書いた。
それから10 年以上経過して、核酸化学の学問はさらに熱くなっている。COVID-19における
mRNAワクチンの開発など、核酸化学は一般にも注目され始めている。
この 間 2017 年 に、日 本 核 酸 化 学 会（The Japan Society of Nucleic Acids Chemistry,
略称 JSNAC）がスタートした。初代会長として、私は、会員の利便性や社会的な存在感を鑑み、三つの大きな 繋ぐ を、JSNAC の大きな役割と考えた（詳細は、核酸化学会誌 2017 年第 1 号
巻頭言参照）。
この JSNAC の三つの 繋ぐ は、FIBER の今後にも重要と考えられるので、ここで紹介する。
（１）世界を繋ぐ。
研究テーマは個人の発想に基づくのは当然であるが、素晴らしい成果を得るには優れた共
同研究は欠かせない。FIBER も、研究成果を世界に発信し、国際共同研究に繋ぐ努力を行わ
ないといけない。そのためには現在も進めてはいるが、国際シンポジウムやミニシンポジウム、
レクチャーツアーなどの交流活動を一層盛んに行う必要があろう。
（２）分野を繋ぐ。
核酸は、遺伝子発現におけるセントラルドグマ（中心教義）の概念に基づき、タンパク質な
どの多くの生命分子の情報を握る重要な分子である。それゆえ、核酸化学は、学問のセントラルドグマとして、核酸だけでなく多種多様な生命分子の研究分野に大きな影響を及ぼし、偉大な貢献をなす可能性がある。さらに、核酸化学を基に、医薬系だけではなく、農学や情報学などの広範な分野への展開が盛んになるであろう。また、FIBER の研究成果を他の分野の研究者に広め、その反響をフィードバックすることが求められることになろう。
（３）時代を繋ぐ。
迸る情熱によって奔走した創生期の FIBER の意気込みや熱き想い、巧みな技を次に繋ぐことも重要である。シニアには経験の蓄積があり、若者には改革の勇気がある。 The Futureof the Past の視点から、シニアと若手（海外で活躍が期待される若手も）を繋ぐことができ
れば、FIBER は光り輝けるものに発展できよう。
今年度から日本学術振興会のご支援のもと、「研究拠点形成事業」が FIBER を中核として始まった。日本、英国、米国、イタ
リア、インド、スロベニアが連携する核酸
化学の国際研究拠点形成である。今後のFIBER の展開を期待していただきたい。


01

2022

2022

02

海外連携研究レポート

海外連携
研究
レポート

日本学術振興会 令和４（2022）年度「研究拠点形成事業」の「先端拠点形成型」に採択された研究プロジェクトが発足しました！

［核酸化学CRISTER制御コンソーシアム］
海外連携

複製を制御

採択課題名：「非二重らせん核酸を活用した遺伝子発現の制御法を開発する核酸化学研究拠点」

三重らせん

DNAポリメラーゼ

N. Sugimoto, et al.,J. Am. Chem. Soc.,
143, 16458 (2021)

転写を制御

DNA

甲南大学FIBER

四重らせん

テロメラーゼスリーウェイ
ジャンクション

RNAポリメラーゼ

RNAポリメラーゼ

神戸大学
教授 田中成典（計算科学）

翻訳を制御

内
携
連

バルジ

准教授
遠藤玉樹

上級技術員
大山 達也

携

准教授
高橋俊太郎

Carnegie Mellon大学
准教授

Subha Das

准教授
建石寿枝

東京医科歯科大学
教授 横田隆徳（脳神経病態学）★

（核酸合成化学）名古屋大学
准教授 夏目敦至（脳腫瘍学）（核酸分析化学）（核酸構造物理化学）

四重らせん

Calcu�a 大学
准教授

Sudipta Bhowmik

Janez Plavec

RNA
キンクターン

インターナルループ

連（核酸構造化学）

国立NMRセンター教授
ヘアピン（核酸物理化学）★
Chris�ne Cardin

国

リボソーム

コーディネーター（研究統括）★ 所長・教授 杉本直己

Reading大学
教授

ホリデー
ジャンクション

N. Sugimoto, et al.,Angew. Chem. Int. Ed.,55, 899 (2016)

N. Sugimoto, et al.,J. Am. Chem. Soc.,
140, 642 (2018)

特任助教
松本 咲

Padova大学教授

三重らせん キッシングループ シュードノット

Sara N. Richter★

（核酸分子生物学）

非二重らせん構造と生体内での役割
非二重らせん構造とその生体内での役割★ ：女性研究者

本拠点形成事業における研究組織図
本拠点形成事業における研究組織図■ キックオフシンポジウム
ひらめき☆ときめきサイエンス
2022年４月21日(日本学術振興会支援事業)（オンライン）
86

Universe18 FIBER International Lectures 70
Series131 FIBER Webinar Universe18

Lectures In

The Kick-off Symposium2022
of International ResearchCenter of Nucleic Acids
Chemistry for Developing
THU
Methods to Regulate Gene
16:00-17:00 JST
Expression Using
Non-Canonical Structure of Online lecture
Nucleic Acids

4. 21

本研究拠点形成事業では、核酸の構造と安定性の解析を基にして、化学的手法によりJAPAN SOCIETY FOR THE PROMOTION OF SCIENCE Core-to-Core Program

既存のゲノム編集技術を改良するとともに、細胞内の環境に応答した核酸の構造変化によって制御される遺伝子発現機構を解明していきます。さらに、その機構を制御することにより、ゲノム 非 編集による革新的な疾患遺伝子の発現制御法を開発することを目標
といたします。そのために、本国の研究拠点となる甲南大先端生命工学研究所（FIBER）の研究グループと国内の連携研究グループおよび高い専門技術を有する5カ国（英国、Professor
University of Reading,
U. K.

Sara N. Richter

Janez Plavec

Professor
University of Padua,
Italy

Professor
National Institute of Chemistry,
Slovenia

スロベニア、米国、インド、イタリア）の海外研究グループ（連携拠点）が連携して研究交流活動を実施して参ります。

Subha Das

Associate Professor
Carnegie Mellon University,
U. S. A.

Christine Cardin

Takanori Yokota

Professor
Tokyo Medical and Dental University,Japan

Shigenori Tanaka
Professor
Kobe University,
Japan

Naoki Sugimoto

Sudipta Bhowmik

Professor
Konan University(FIBER), Japan

Assistant Professor
University of Calcutta,
India

Atsushi Natsume
Professor
Nagoya University,
Japan【参加人数：41名】 国内 18名 国外 23名
Hisae Tateishi - Karimata
Associate Professor
Konan University(FIBER)

詳細は研究拠点形成事業HPをご覧ください。

https://www.konan-u.ac.jp/hp/ctc_fiber/
03

2022

Shuntaro Takahashi

Associate Professor
Konan University(FIBER)

Tamaki Endoh

Associate Professor
Konan University(FIBER)

Organized by
Konan University,

Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER)

Jointly organized by

The Council of the Hyogo-Kobe Science Cluster

Saki Matsumoto

Assistant Professor
Konan University(FIBER)

Tatsuya Ohyama

Technical Assistant
Konan University(FIBER)

Contact information

Konan University
Tel 078-303-1147

Email fiber@adm.konan-u.ac.jp
http://www.konan-fiber.jp【参加国：６ヵ国】 日本、スロベニア、米国、
英国、インド、イタリア

2022

04

海外連携研究レポート

海外連携
研究
レポート

日本学術振興会 令和４（2022）年度「研究拠点形成事業」の「先端拠点形成型」に採択された研究プロジェクトが発足しました！

［核酸化学CRISTER制御コンソーシアム］
海外連携

複製を制御

採択課題名：「非二重らせん核酸を活用した遺伝子発現の制御法を開発する核酸化学研究拠点」

三重らせん

DNAポリメラーゼ

N. Sugimoto, et al.,J. Am. Chem. Soc.,
143, 16458 (2021)

転写を制御

DNA

甲南大学FIBER

四重らせん

テロメラーゼスリーウェイ
ジャンクション

RNAポリメラーゼ

RNAポリメラーゼ

神戸大学
教授 田中成典（計算科学）

翻訳を制御

内
携
連

バルジ

准教授
遠藤玉樹

上級技術員
大山 達也

携

准教授
高橋俊太郎

Carnegie Mellon大学
准教授

Subha Das

准教授
建石寿枝

東京医科歯科大学
教授 横田隆徳（脳神経病態学）★

（核酸合成化学）名古屋大学
准教授 夏目敦至（脳腫瘍学）（核酸分析化学）（核酸構造物理化学）

四重らせん

Calcu�a 大学
准教授

Sudipta Bhowmik

Janez Plavec

RNA
キンクターン

インターナルループ

連（核酸構造化学）

国立NMRセンター教授
ヘアピン（核酸物理化学）★
Chris�ne Cardin

国

リボソーム

コーディネーター（研究統括）★ 所長・教授 杉本直己

Reading大学
教授

ホリデー
ジャンクション

N. Sugimoto, et al.,Angew. Chem. Int. Ed.,55, 899 (2016)

N. Sugimoto, et al.,J. Am. Chem. Soc.,
140, 642 (2018)

特任助教
松本 咲

Padova大学教授

三重らせん キッシングループ シュードノット

Sara N. Richter★

（核酸分子生物学）

非二重らせん構造と生体内での役割
非二重らせん構造とその生体内での役割★ ：女性研究者

本拠点形成事業における研究組織図
本拠点形成事業における研究組織図■ キックオフシンポジウム
ひらめき☆ときめきサイエンス
2022年４月21日(日本学術振興会支援事業)（オンライン）
86

Universe18 FIBER International Lectures 70
Series131 FIBER Webinar Universe18

Lectures In

The Kick-off Symposium2022
of International ResearchCenter of Nucleic Acids
Chemistry for Developing
THU
Methods to Regulate Gene
16:00-17:00 JST
Expression Using
Non-Canonical Structure of Online lecture
Nucleic Acids

4. 21

本研究拠点形成事業では、核酸の構造と安定性の解析を基にして、化学的手法によりJAPAN SOCIETY FOR THE PROMOTION OF SCIENCE Core-to-Core Program

既存のゲノム編集技術を改良するとともに、細胞内の環境に応答した核酸の構造変化によって制御される遺伝子発現機構を解明していきます。さらに、その機構を制御することにより、ゲノム 非 編集による革新的な疾患遺伝子の発現制御法を開発することを目標
といたします。そのために、本国の研究拠点となる甲南大先端生命工学研究所（FIBER）の研究グループと国内の連携研究グループおよび高い専門技術を有する5カ国（英国、Professor
University of Reading,
U. K.

Sara N. Richter

Janez Plavec

Professor
University of Padua,
Italy

Professor
National Institute of Chemistry,
Slovenia

スロベニア、米国、インド、イタリア）の海外研究グループ（連携拠点）が連携して研究交流活動を実施して参ります。

Subha Das

Associate Professor
Carnegie Mellon University,
U. S. A.

Christine Cardin

Takanori Yokota

Professor
Tokyo Medical and Dental University,Japan

Shigenori Tanaka
Professor
Kobe University,
Japan

Naoki Sugimoto

Sudipta Bhowmik

Professor
Konan University(FIBER), Japan

Assistant Professor
University of Calcutta,
India

Atsushi Natsume
Professor
Nagoya University,
Japan【参加人数：41名】 国内 18名 国外 23名
Hisae Tateishi - Karimata
Associate Professor
Konan University(FIBER)

詳細は研究拠点形成事業HPをご覧ください。

https://www.konan-u.ac.jp/hp/ctc_fiber/
03

2022

Shuntaro Takahashi

Associate Professor
Konan University(FIBER)

Tamaki Endoh

Associate Professor
Konan University(FIBER)

Organized by
Konan University,

Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER)

Jointly organized by

The Council of the Hyogo-Kobe Science Cluster

Saki Matsumoto

Assistant Professor
Konan University(FIBER)

Tatsuya Ohyama

Technical Assistant
Konan University(FIBER)

Contact information

Konan University
Tel 078-303-1147

Email fiber@adm.konan-u.ac.jp
http://www.konan-fiber.jp【参加国：６ヵ国】 日本、スロベニア、米国、
英国、インド、イタリア

2022

04

海外連携研究レポート

海外連携
研究
レポート

2022年10月にFIBER教員らがスロベニアに訪問し、研究交流活動を行いました。

海外共同研究者紹介
Plavec教授はスロベニア
国立NMRセンターの所長で、核酸構造のNMR研究における世界的な第一人者です。
今回採択された研究拠点形成
事業のスロベニア側拠点
コーディネーターでもあります。

少人数で現地を訪問し、共同研究に関する
ディスカッションを行いました。

Prof. Janez Plavec
Message from Janez to FIBER
Prof. Sugimoto s group and Prof. Plavec s group have collaborated on various aspects of nucleic acidchemistry, biochemistry and biophysics with a focus on the development of diseases in which the structureand function of non-canonical structures are likely to play an critical role. By combining the thermodynamic
approach of Prof. Sugimoto s group with the structural biology approach of Prof. Plavec's group, we haveelucidated the intracellular mechanism of disease development mediated by non-canonical structures andcontributed to development of potential interventions. These comprehensive, collaborative studies of thesequence-dependent structural and thermodynamic properties of non-canonical motifs provide a deeper
understanding of the structural and physical properties of various disease-related nucleic acid motifs and thus
advance bioengineering technology related to non-canonical structures.
FIBER at Konan University has established itself not only as an important international scientiﬁc institution,
but also as an important catalyst that promotes both deeper understanding and broader scope. It is only
natural that fostering innovative research and education in the ﬁeld of biomolecular science and engineering
has led FIBER and Prof. Sugimoto to assemble an international team of collaborators from around the world.
The Core-to-Core program is led by the world-renowned Prof. Sugimoto from Kobe, Japan. He has establishedan active collaboration with the Core-to-Core Program, linking world-class research centers in research areasthat are considered groundbreaking and internationally important in Japan. In addition to promoting researchin these areas and building core research and education centers, the Core-to-Core Program also focuses on
nurturing the next generations of trailblazing young researchers.
On a personal note, being proud of long-term friendship and very productive collaboration with Prof.
Sugimoto and his team members, I wish to emphasize our commitment to encourage young scientists toparticipate in the Core-to-Core program. FIBER invites students and postdoctoral fellows who are doing
excellent research work in their home countries and want to actively participate in scientiﬁc activities in the
future to attend a public lecture “FIBER Special Lecture for Young Generations organized on an ongoing basis.

05

2022

国際シンポジウムに参加し、専任教員に加え、若手研究者（特任教員、技術員）が研究成果の講演を行いました。
2022

06

海外連携研究レポート

海外連携
研究
レポート

2022年10月にFIBER教員らがスロベニアに訪問し、研究交流活動を行いました。

海外共同研究者紹介
Plavec教授はスロベニア
国立NMRセンターの所長で、核酸構造のNMR研究における世界的な第一人者です。
今回採択された研究拠点形成
事業のスロベニア側拠点
コーディネーターでもあります。

少人数で現地を訪問し、共同研究に関する
ディスカッションを行いました。

Prof. Janez Plavec
Message from Janez to FIBER
Prof. Sugimoto s group and Prof. Plavec s group have collaborated on various aspects of nucleic acidchemistry, biochemistry and biophysics with a focus on the development of diseases in which the structureand function of non-canonical structures are likely to play an critical role. By combining the thermodynamic
approach of Prof. Sugimoto s group with the structural biology approach of Prof. Plavec's group, we haveelucidated the intracellular mechanism of disease development mediated by non-canonical structures andcontributed to development of potential interventions. These comprehensive, collaborative studies of thesequence-dependent structural and thermodynamic properties of non-canonical motifs provide a deeper
understanding of the structural and physical properties of various disease-related nucleic acid motifs and thus
advance bioengineering technology related to non-canonical structures.
FIBER at Konan University has established itself not only as an important international scientiﬁc institution,
but also as an important catalyst that promotes both deeper understanding and broader scope. It is only
natural that fostering innovative research and education in the ﬁeld of biomolecular science and engineering
has led FIBER and Prof. Sugimoto to assemble an international team of collaborators from around the world.
The Core-to-Core program is led by the world-renowned Prof. Sugimoto from Kobe, Japan. He has establishedan active collaboration with the Core-to-Core Program, linking world-class research centers in research areasthat are considered groundbreaking and internationally important in Japan. In addition to promoting researchin these areas and building core research and education centers, the Core-to-Core Program also focuses on
nurturing the next generations of trailblazing young researchers.
On a personal note, being proud of long-term friendship and very productive collaboration with Prof.
Sugimoto and his team members, I wish to emphasize our commitment to encourage young scientists toparticipate in the Core-to-Core program. FIBER invites students and postdoctoral fellows who are doing
excellent research work in their home countries and want to actively participate in scientiﬁc activities in the
future to attend a public lecture “FIBER Special Lecture for Young Generations organized on an ongoing basis.

05

2022

国際シンポジウムに参加し、専任教員に加え、若手研究者（特任教員、技術員）が研究成果の講演を行いました。
2022

06

松本助教と高橋准教授は核酸の四重らせん構造の細胞内構造変化の定量的解
析に関する研究を共同で行っています。

FIBER
研究最前線
レポート

Dr. Saki Matsumoto &Dr. Shuntaro Takahashi

高圧力で核酸の構造変化を定量的に解析する。
卵に熱ではなく高圧力をかけると、、、

FIBER研究最前線レポート

米国化学会誌が発刊する誌の表紙（Supplemental Cover）
を飾りました。
Q どのくらいの圧力をかけて研究をしているの？
核酸やタンパク質などの生体分子の構造変化を見るには数千気圧の圧力が必要で、実験では 2,000 気圧くらいまでの静水圧をかけます。地球上で最も深いところのマリアナ海溝は水深 10,994m ですが、そこにかかる圧力は約1,000 気圧ですので、地球上の圧力より大きい圧力を用いて実験しています。
高圧力を発生する特殊な機械が必要ですが、実際に圧力をかけるのはサンプルの入ったわずか数 mL の溶液なので、手動のポンプで簡単に達成できる圧力です。

Q 今回の研究でわかったことは？
水中に溶けている分子は、水分子が取り囲むように相互作用（水和）することにより溶液中で安定に存在します。分子と分子が結合する際には表面の水和が除かれるなど、水和の変化が起こります。細胞内のように様々な分子が高濃度に溶け合っている環境（分子クラウディング環境）では、水和が変化し、7000気圧10分(25℃）

ゆで 卵ができる。

現象 圧力で分子（卵のタンパク質）の構造が変化した。
理由 圧力が上がると分子は体積が小さくなるように変化する。

dG = – SdT + VdP

G：ギブス自由エネルギー
S：エントロピー V：体積
T：温度
P：圧力

圧力を変えることで、構造変化に伴う体積変化がどのくらいなのか知ることができる。

核酸に高圧力をかけたら？

分子同士の相互作用も変化します。核酸（DNA や RNA）は標準的な二重らせん構造以外にも四重らせん構造を形成することで、遺伝子の発現レベルを調節するなどの役割があることが近年明らかになってきました。今回の研究では、
グアニン四重らせん構造の水和のメカニズムを明らかにするために、高圧力を

掲載された
誌の
表紙（Supplementary Cover)。
四重鎖の中心付近に水和する量が少ない
様子を示している。

用いた熱力学解析と分子動力学シミュレーションを組み合わせて四重らせん周囲の水和量を測定しました。その結果、グアニン四重らせん構造はその末端部と中央部とで水和量の偏りがあり、中央部の水和量が少ないことが見出されました。それにより、中央部に結合する化合物は水和の影響をあまり受けない結合様式を示すことが推測されました。実際に、抗生物質の一種で、グアニン四重らせんの中央部に結合するnetropsin の結合を解析したところ、netropsin の結合挙動には分子クラウディング環境の影響を受けないことが示されました。

Q 国際共同研究の成果ですね？
本研究は、インドの Calcutta 大学の Sudipta Bhowmik 先生に協力していただきました。Bhowmik 先生はかつて

二重らせん

変化なし

FIBERに博士研究員として在籍した経緯があり、以降共同研究を継続しております。今年度から採択された日本学術振興会
研 究 拠 点 形 成 事 業 でも Bhowmik 博 士 はインド側 の 拠 点 代 表としてプロジェクトに参 画して い ただ い ております。
Bhowmik 博士の得意とする天然化合物と核酸との相互作用解析によって、今回プロジェクト初年度から素晴らしい成果を発表することができました。化合物が細胞内でグアニン四重らせんにどのように結合するかを予測する手法はこれまで例が無く、今回の解析法を活用することで新しい薬剤などの開発の発展が今後期待できます。

四重らせん

なぜ？？

一本鎖になる四重らせんがほどけて一本鎖になる際に二重らせんよりも遙かに多くの水分子が結合（水和）する。水和する水分子は溶液中より体積が小さくなる。そのため、高圧力を加えると一本鎖に変化する。

体積値として調べることで、核酸の構造変化と水和を定量的に知ることができる！
最近の主な業績
S. Matsumoto, S. Takahashi, S. Bhowmik, T. Ohyama, and N. Sugimoto,
Volumetric strategy for quantitatively elucidating local hydration network around a G-quadruplex,
Anal. Chem., 94, 7400-7407 (2022).

07

2022

Bhowmik博士からメッセージをいただきました。
I was postdoctoral fellow under Prof. Naoki Sugimoto in the year 2013-2014. It was fun working therewith him and other members in a world class research infrastructure and vibrational atmosphere. Aftercoming back to India, my research collaboration with FIBER is getting stronger and we have publishedsome very good research papers in renounced journals. Even I am part of JSPS core to core research
project in FIBER. I would like to spread my good wishes to all the faculties, researchers, staﬀs andstudents of FIBER. Keep on doing the good work for the welfare of the mankind as well as environment.

2022

08

松本助教と高橋准教授は核酸の四重らせん構造の細胞内構造変化の定量的解
析に関する研究を共同で行っています。

FIBER
研究最前線
レポート

Dr. Saki Matsumoto &Dr. Shuntaro Takahashi

高圧力で核酸の構造変化を定量的に解析する。
卵に熱ではなく高圧力をかけると、、、

FIBER研究最前線レポート

米国化学会誌が発刊する誌の表紙（Supplemental Cover）
を飾りました。
Q どのくらいの圧力をかけて研究をしているの？
核酸やタンパク質などの生体分子の構造変化を見るには数千気圧の圧力が必要で、実験では 2,000 気圧くらいまでの静水圧をかけます。地球上で最も深いところのマリアナ海溝は水深 10,994m ですが、そこにかかる圧力は約1,000 気圧ですので、地球上の圧力より大きい圧力を用いて実験しています。
高圧力を発生する特殊な機械が必要ですが、実際に圧力をかけるのはサンプルの入ったわずか数 mL の溶液なので、手動のポンプで簡単に達成できる圧力です。

Q 今回の研究でわかったことは？
水中に溶けている分子は、水分子が取り囲むように相互作用（水和）することにより溶液中で安定に存在します。分子と分子が結合する際には表面の水和が除かれるなど、水和の変化が起こります。細胞内のように様々な分子が高濃度に溶け合っている環境（分子クラウディング環境）では、水和が変化し、7000気圧10分(25℃）

ゆで 卵ができる。

現象 圧力で分子（卵のタンパク質）の構造が変化した。
理由 圧力が上がると分子は体積が小さくなるように変化する。

dG = – SdT + VdP

G：ギブス自由エネルギー
S：エントロピー V：体積
T：温度
P：圧力

圧力を変えることで、構造変化に伴う体積変化がどのくらいなのか知ることができる。

核酸に高圧力をかけたら？

分子同士の相互作用も変化します。核酸（DNA や RNA）は標準的な二重らせん構造以外にも四重らせん構造を形成することで、遺伝子の発現レベルを調節するなどの役割があることが近年明らかになってきました。今回の研究では、
グアニン四重らせん構造の水和のメカニズムを明らかにするために、高圧力を

掲載された
誌の
表紙（Supplementary Cover)。
四重鎖の中心付近に水和する量が少ない
様子を示している。

用いた熱力学解析と分子動力学シミュレーションを組み合わせて四重らせん周囲の水和量を測定しました。その結果、グアニン四重らせん構造はその末端部と中央部とで水和量の偏りがあり、中央部の水和量が少ないことが見出されました。それにより、中央部に結合する化合物は水和の影響をあまり受けない結合様式を示すことが推測されました。実際に、抗生物質の一種で、グアニン四重らせんの中央部に結合するnetropsin の結合を解析したところ、netropsin の結合挙動には分子クラウディング環境の影響を受けないことが示されました。

Q 国際共同研究の成果ですね？
本研究は、インドの Calcutta 大学の Sudipta Bhowmik 先生に協力していただきました。Bhowmik 先生はかつて

二重らせん

変化なし

FIBERに博士研究員として在籍した経緯があり、以降共同研究を継続しております。今年度から採択された日本学術振興会
研 究 拠 点 形 成 事 業 でも Bhowmik 博 士 はインド側 の 拠 点 代 表としてプロジェクトに参 画して い ただ い ております。
Bhowmik 博士の得意とする天然化合物と核酸との相互作用解析によって、今回プロジェクト初年度から素晴らしい成果を発表することができました。化合物が細胞内でグアニン四重らせんにどのように結合するかを予測する手法はこれまで例が無く、今回の解析法を活用することで新しい薬剤などの開発の発展が今後期待できます。

四重らせん

なぜ？？

一本鎖になる四重らせんがほどけて一本鎖になる際に二重らせんよりも遙かに多くの水分子が結合（水和）する。水和する水分子は溶液中より体積が小さくなる。そのため、高圧力を加えると一本鎖に変化する。

体積値として調べることで、核酸の構造変化と水和を定量的に知ることができる！
最近の主な業績
S. Matsumoto, S. Takahashi, S. Bhowmik, T. Ohyama, and N. Sugimoto,
Volumetric strategy for quantitatively elucidating local hydration network around a G-quadruplex,
Anal. Chem., 94, 7400-7407 (2022).

07

2022

Bhowmik博士からメッセージをいただきました。
I was postdoctoral fellow under Prof. Naoki Sugimoto in the year 2013-2014. It was fun working therewith him and other members in a world class research infrastructure and vibrational atmosphere. Aftercoming back to India, my research collaboration with FIBER is getting stronger and we have publishedsome very good research papers in renounced journals. Even I am part of JSPS core to core research
project in FIBER. I would like to spread my good wishes to all the faculties, researchers, staﬀs andstudents of FIBER. Keep on doing the good work for the welfare of the mankind as well as environment.

2022

08

FIBER 研究最前線レポート

未来大学
in
NanoBioNow

核酸構造に及ぼす空間の影響を明らかにする！

■ FIBER 未来大学オンライン配信特別シリーズ
FIBER 核酸化学ユニバース

Dr. Sunipa
Sarkar

89

ER

Se

es In

Lectur

ar
Webin

rse21

Unive

2年
R202

4 FIB
ries13

FIBER 博士研究員
PhD
インド出身
研究テーマ：「細胞模倣環境下におけるG 四重らせんの構造と機能の解析」
趣味：映画鑑賞 / 旅行（主に山岳）

国内外の多くの方に参加いただけるよう
ハイブリッド形式で講演会を開催しました。

FIBE

73
tures
l Lec

tiona

erna
R Int

:00
〜 11
9:30 ture Hall

11月１イブリッド料開催

FIBE

日 7F Lec

ハ

11

参加

化学
核酸 バース
ユニ

無

介して
を紹
成果
ご専
究が
研究
新の る創薬研 活用し
、最
よ
酸を
物に
聘して
化合
と、核 をお招きを招究 者 工の核酸生、
e 先生
adtk ngang 先 究者など
人
する研
ley-R
活躍 会では、
研
Be
Se
で
の
ie
ng
分 野 本講演
業等
Kath
の Xi
化学
、企
る
ィ校
大学
核酸
機関
目とな カウンテ 南洋理工
線の
研究
。
１回
第一
モア
ール
および 行います
第１は、す。
ルティ シンガポ す。大学
で
演会
会で
学ボ
英語
の
本講
きま
講演
ド大
演は
専門
く
だ
ン
講
ご
だ
た
ラ
。※
発が
いた
演い
メリー
術開
ご講
ります
米国
の技
門の
交えて ちしてお
11:00
診断
果を
待
工学
10:15究成
をお
た医
の研
参加
のご
最新
し、 分野からい幅広

0:15

9:30~1P

SGnXingl University,
ang logtatios
ica
ifesm
ic
Man
ctralule Dyna
ispe
Mult iomolecenesis gh NIR
g
B
u
o
f
o
ms
Thro
Path
and cessing t Paradig
Pro orescen
Flu
せ

Beng

no
Prof.
Tech
ang
Nany
A
dtke ty, US
y-Ra e Coune Sele Baltimor
therin ryland,
ns -

o
mele
e
r cha cleosid
culauMole ility in n designす。
しまflexibiral drug
いた ます。
願い
らお っておりムか
antiv
なProf. Ka ty of Ma
rsi
Unive

ォー 込制とみフ
し込 、事前申の申04
bsite の関係上
s/36 す。
ィは weの方 キュリテ
rchive しま
希望.jp/aをご案内いたせ先に参加 演会はセ
fiber
わ
講
※本
nan-日以内に詳細がお問い合 ます。
ko
http://込み後、2、お手数ですお願いいたししお申 ない場合 ますよういが.30
返信 をくださ
2.10
絡
)
ご連
:202
FIBER

締切

申込

学
甲南大
主催：

究所（
工学研
生命
先端

わ
い合
所
お問
研究
工学 パス
生命
先端 ドキャン
大学
甲南 アイラン.ac.jpト 3-1147-uーan
ポ 8-30m.kon

Tel 07 fiber@ad n-fiber.jplスター
Emai www.kona
スクラ
http://
イエン
うごサ
、ひょ
学会
酸化
核
日本
共催：

I joined FIBER as a postdoctoral researcher in July 2022. I was born and raised in West
Bengal, India. I got my bachelor's and masterʼs degree from the University of Calcutta
and the Indian Institute of Engineering Science and Technology, Shibpur,
respectively. I graduated with Ph. D. in Science from the Indian Association for the
Cultivation of Science, Kolkata, India in 2021. During my Ph. D., some pioneer
research works of FIBER helped me to acquire scientiﬁc ideas and motivated me to
conduct excellent research works. I am glad to have the opportunity to grow andgain more skills from the stalwart people at FIBER. My research interests are focusedon investigation of G-quadruplex and hairpin equilibrium of RNA and DNA inside cell
mimicked nanoconﬁnement and artiﬁcial viral capsid. I am enjoying the delicious
food items, weather and scenic beauty of Kobe. The gentlemanly behaviour of all
Japanese people makes me feel very safe and cheerful.

09

2022

2022

10

FIBER 研究最前線レポート

未来大学
in
NanoBioNow

核酸構造に及ぼす空間の影響を明らかにする！

■ FIBER 未来大学オンライン配信特別シリーズ
FIBER 核酸化学ユニバース

Dr. Sunipa
Sarkar

89

ER

Se

es In

Lectur

ar
Webin

rse21

Unive

2年
R202

4 FIB
ries13

FIBER 博士研究員
PhD
インド出身
研究テーマ：「細胞模倣環境下におけるG 四重らせんの構造と機能の解析」
趣味：映画鑑賞 / 旅行（主に山岳）

国内外の多くの方に参加いただけるよう
ハイブリッド形式で講演会を開催しました。

FIBE

73
tures
l Lec

tiona

erna
R Int

:00
〜 11
9:30 ture Hall

11月１イブリッド料開催

FIBE

日 7F Lec

ハ

11

参加

化学
核酸 バース
ユニ

無

介して
を紹
成果
ご専
究が
研究
新の る創薬研 活用し
、最
よ
酸を
物に
聘して
化合
と、核 をお招きを招究 者 工の核酸生、
e 先生
adtk ngang 先 究者など
人
する研
ley-R
活躍 会では、
研
Be
Se
で
の
ie
ng
分 野 本講演
業等
Kath
の Xi
化学
、企
る
ィ校
大学
核酸
機関
目とな カウンテ 南洋理工
線の
研究
。
１回
第一
モア
ール
および 行います
第１は、す。
ルティ シンガポ す。大学
で
演会
会で
学ボ
英語
の
本講
きま
講演
ド大
演は
専門
く
だ
ン
講
ご
だ
た
ラ
。※
発が
いた
演い
メリー
術開
ご講
ります
米国
の技
門の
交えて ちしてお
11:00
診断
果を
待
工学
10:15究成
をお
た医
の研
参加
のご
最新
し、 分野からい幅広

0:15

9:30~1P

SGnXingl University,
ang logtatios
ica
ifesm
ic
Man
ctralule Dyna
ispe
Mult iomolecenesis gh NIR
g
B
u
o
f
o
ms
Thro
Path
and cessing t Paradig
Pro orescen
Flu
せ

Beng

no
Prof.
Tech
ang
Nany
A
dtke ty, US
y-Ra e Coune Sele Baltimor
therin ryland,
ns -

o
mele
e
r cha cleosid
culauMole ility in n designす。
しまflexibiral drug
いた ます。
願い
らお っておりムか
antiv
なProf. Ka ty of Ma
rsi
Unive

ォー 込制とみフ
し込 、事前申の申04
bsite の関係上
s/36 す。
ィは weの方 キュリテ
rchive しま
希望.jp/aをご案内いたせ先に参加 演会はセ
fiber
わ
講
※本
nan-日以内に詳細がお問い合 ます。
ko
http://込み後、2、お手数ですお願いいたししお申 ない場合 ますよういが.30
返信 をくださ
2.10
絡
)
ご連
:202
FIBER

締切

申込

学
甲南大
主催：

究所（
工学研
生命
先端

わ
い合
所
お問
研究
工学 パス
生命
先端 ドキャン
大学
甲南 アイラン.ac.jpト 3-1147-uーan
ポ 8-30m.kon

Tel 07 fiber@ad n-fiber.jplスター
Emai www.kona
スクラ
http://
イエン
うごサ
、ひょ
学会
酸化
核
日本
共催：

I joined FIBER as a postdoctoral researcher in July 2022. I was born and raised in West
Bengal, India. I got my bachelor's and masterʼs degree from the University of Calcutta
and the Indian Institute of Engineering Science and Technology, Shibpur,
respectively. I graduated with Ph. D. in Science from the Indian Association for the
Cultivation of Science, Kolkata, India in 2021. During my Ph. D., some pioneer
research works of FIBER helped me to acquire scientiﬁc ideas and motivated me to
conduct excellent research works. I am glad to have the opportunity to grow andgain more skills from the stalwart people at FIBER. My research interests are focusedon investigation of G-quadruplex and hairpin equilibrium of RNA and DNA inside cell
mimicked nanoconﬁnement and artiﬁcial viral capsid. I am enjoying the delicious
food items, weather and scenic beauty of Kobe. The gentlemanly behaviour of all
Japanese people makes me feel very safe and cheerful.

09

2022

2022

10

未来大学
in
NanoBioNow

未来大学 in NanoBioNow

FISNAは国内外の核酸化学の著名な研究者を招待して議論する国際会議です。コロナ禍の影響で、3年ぶりの開催となりました。

FIBER International Summit for Nucleic
87
Acids 2022 (FISNA 2022)
日時
会場

Lectures In

2022

2022年７月13〜15日
甲南大学ポートアイランドキャンパス

July/

FIBER
F
IBER International Summit for Nucleic Acids 2022

7F Lecture room

Sannomiyain person & on line

7/13 Wed
Prof. Christine Cardin

F
Free
to
to Participate
Particticipate

10:10 -

University of Reading, UK

7/13 wed

Eriks Rozners

Professor, Chemistry, Department of Chemistry,
Binghamton University, State University of New York

Amide-Modified RNA: Using
Protein Backbone to Modulate
Function of RNA
10:45 -

Masayasu Kuwahara

Professor, Department of Chemistry, College of Humanities andSciences, Nihon University

Detection systems using
formation of ternary
initiation complexes

7/13 Wed
Prof. Kyeong Kyu Kim

11:20 -

Shigeori Takenaka

Professor, Faculty of Engineering Department of Materials
Science, Kyushu Institute of Technology

Electrochemical detectionof G-quartet RNA for
SARS-CoV-2

Sungkyunkwan University, Korea

14:20 -

Kyeong Kyu Kim

Professor, Department of Molecular Cell Biology,
Sungkyunkwan University School of Medicine

Noncanonical DNAs:
structure, function andmodulation

7/15 Fri
Prof. Janez Plavec

15:00 -

Christine Cardin

Professor, Chemistry Department, University of Reading

Recognition of DNA
G-quadruplex topology byruthenium polypyridyl
complexes

Slovenian NMR Center, Slovenia

9:00 -

IKEA

Sannomiya↑Port Island

Kobe City
Medical Center
Kobe Airport General Hospital

KONAN Univ.
Port Island Campus

Iryo Center st.

Keisan Kagaku Center

7/14 thu

Danzhou Yang

Distinguished Professor, Associate Dean for Graduate Programs
College of Pharmacy, Purdue University Martha and Fred Borch
Endowed Chair in Cancer Therapeutics, Purdue Cancer Center,
Purdue University

DNA G-quadruplex:
Structures, Functions, andDrug Targeting
9:35 -

Talk session fromyoung researchers

Jaepil Jeong

Department of Chemistry, Carnegie Mellon University

Sodium pyruvate based systems forbiocompatible click chemistry andpolymer grafts from DNA

Hidenori Okamura

The Institute of Multidisciplinary Research for Advanced
Materials,Tohoku University

至神戸空港

9:00 -

9:40 -

Peptide chemistry-mediatednucleic acid delivery forplant organellar
modifications

Kazunori Matsuura

Expanding the toolbox of non-natural
nucleosides for functionalization ofoligonucleotides

10:45 -NMR study of the ensemble of structures
DGRSWHGE\*ULFKUHJLRQIURP· 875RI
tyrosine kinase 2 (TYK2) mRNA

University of Ljubljana,
Slovenian NMR Centre at the National Institute of Chemistry

Artificial Virus-like Materials
constructed by
Self-assembly of Peptides

Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research(FIBER),
Konan University

11:20 -

Maria Toplishek

Saki Matsumoto

Professor, Department of Chemistry and Biotechnology,
Graduate School of Engineering, Tottori University

Janez Plavec

Regulation of transition between
canonical and non-canonical DNA
structures by DNA modifications

Professor, University of Ljubljana,
Slovenian NMR Centre at the National Institute of Chemistry

University of Ljubljana,
Slovenian NMR Centre at the National Institute of Chemistry

Folding of G-rich sequences
into non-G-quadruplex
structures

Peter Podbevšek

Oxidative lesions in non-canonical DNA
structures

We welcome your participation to "FIBER International
Contact information
Summit for Nucleic Acids (FISNA) 2022". All audiences
Konan University
except for participants from Konan University are invited toTel 078-303-1147
view only online (ZOOM) this year. Please visit and apply via
Email fiber@adm.konan-u.ac.jp
following website.

http://konan-fiber.jp/archives/3368

http://www.konan-fiber.jp

Once your registration has been accepted,
we will send you an e-mail within two working days.

Application Deadline:July 10th, 2022

Organized by Konan University, Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER)
This symposium is a part of the projects funded by JSPS grants “Core-to-Core programs”, “Bilateral programs”, and “Promotion of Joint International Research”.
Jointly organized by The Council of the Hyogo-Kobe Science Cluster, The Chubei ltoh Foundation

Slovenian NMR Center, Slovenia

Binghamton University, USA

7/14 Thu
Prof. Danzhou Yang
Purdue University, USA

Carnegie Mellon University, USA

2022

Keiji Numata

Professor, Biomaterial Chemistry, Chair in Polymer
Material Chemistry
Department of Material Chemistry, Graduate School of Engineering,
Kyoto University

7/15 Fri
Prof. Bruce Armitage11

7/15 fri

Bruce Armitage

Invasion of G-Quadruplex
and i-Motif DNA by PNA

7/13 Wed
Prof. Eriks Rozners

Slovenian NMR Center, Slovenia

13th
15th

Professor, Chemistry
Co-Director, Center for Nucleic Acids Science andTechnology, Carnegie Mellon University

7/14 Thu
Dr. Peter Podbevšek

7/14 Thu
Dr. Maria Toplishek

Series132

FIBER Webinar Universe
Universe19
FIBER International Lectures 71

ハイブリッド型シンポジウムとして FIBER から講演を発信しました。国外からの招待講演者以外をオンライン参加に限り、3 日目を完全オンラインにするなど、感染対策を施しながら開催しました。また、本シンポジウムは JSPS 研究拠点形成事業の一環として、各国のコーディネーターが研究成果を発表しました。

2022

12

未来大学
in
NanoBioNow

未来大学 in NanoBioNow

FISNAは国内外の核酸化学の著名な研究者を招待して議論する国際会議です。コロナ禍の影響で、3年ぶりの開催となりました。

FIBER International Summit for Nucleic
87
Acids 2022 (FISNA 2022)
日時
会場

Lectures In

2022

2022年７月13〜15日
甲南大学ポートアイランドキャンパス

July/

FIBER
F
IBER International Summit for Nucleic Acids 2022

7F Lecture room

Sannomiyain person & on line

7/13 Wed
Prof. Christine Cardin

F
Free
to
to Participate
Particticipate

10:10 -

University of Reading, UK

7/13 wed

Eriks Rozners

Professor, Chemistry, Department of Chemistry,
Binghamton University, State University of New York

Amide-Modified RNA: Using
Protein Backbone to Modulate
Function of RNA
10:45 -

Masayasu Kuwahara

Professor, Department of Chemistry, College of Humanities andSciences, Nihon University

Detection systems using
formation of ternary
initiation complexes

7/13 Wed
Prof. Kyeong Kyu Kim

11:20 -

Shigeori Takenaka

Professor, Faculty of Engineering Department of Materials
Science, Kyushu Institute of Technology

Electrochemical detectionof G-quartet RNA for
SARS-CoV-2

Sungkyunkwan University, Korea

14:20 -

Kyeong Kyu Kim

Professor, Department of Molecular Cell Biology,
Sungkyunkwan University School of Medicine

Noncanonical DNAs:
structure, function andmodulation

7/15 Fri
Prof. Janez Plavec

15:00 -

Christine Cardin

Professor, Chemistry Department, University of Reading

Recognition of DNA
G-quadruplex topology byruthenium polypyridyl
complexes

Slovenian NMR Center, Slovenia

9:00 -

IKEA

Sannomiya↑Port Island

Kobe City
Medical Center
Kobe Airport General Hospital

KONAN Univ.
Port Island Campus

Iryo Center st.

Keisan Kagaku Center

7/14 thu

Danzhou Yang

Distinguished Professor, Associate Dean for Graduate Programs
College of Pharmacy, Purdue University Martha and Fred Borch
Endowed Chair in Cancer Therapeutics, Purdue Cancer Center,
Purdue University

DNA G-quadruplex:
Structures, Functions, andDrug Targeting
9:35 -

Talk session fromyoung researchers

Jaepil Jeong

Department of Chemistry, Carnegie Mellon University

Sodium pyruvate based systems forbiocompatible click chemistry andpolymer grafts from DNA

Hidenori Okamura

The Institute of Multidisciplinary Research for Advanced
Materials,Tohoku University

至神戸空港

9:00 -

9:40 -

Peptide chemistry-mediatednucleic acid delivery forplant organellar
modifications

Kazunori Matsuura

Expanding the toolbox of non-natural
nucleosides for functionalization ofoligonucleotides

10:45 -NMR study of the ensemble of structures
DGRSWHGE\*ULFKUHJLRQIURP· 875RI
tyrosine kinase 2 (TYK2) mRNA

University of Ljubljana,
Slovenian NMR Centre at the National Institute of Chemistry

Artificial Virus-like Materials
constructed by
Self-assembly of Peptides

Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research(FIBER),
Konan University

11:20 -

Maria Toplishek

Saki Matsumoto

Professor, Department of Chemistry and Biotechnology,
Graduate School of Engineering, Tottori University

Janez Plavec

Regulation of transition between
canonical and non-canonical DNA
structures by DNA modifications

Professor, University of Ljubljana,
Slovenian NMR Centre at the National Institute of Chemistry

University of Ljubljana,
Slovenian NMR Centre at the National Institute of Chemistry

Folding of G-rich sequences
into non-G-quadruplex
structures

Peter Podbevšek

Oxidative lesions in non-canonical DNA
structures

We welcome your participation to "FIBER International
Contact information
Summit for Nucleic Acids (FISNA) 2022". All audiences
Konan University
except for participants from Konan University are invited toTel 078-303-1147
view only online (ZOOM) this year. Please visit and apply via
Email fiber@adm.konan-u.ac.jp
following website.

http://konan-fiber.jp/archives/3368

http://www.konan-fiber.jp

Once your registration has been accepted,
we will send you an e-mail within two working days.

Application Deadline:July 10th, 2022

Organized by Konan University, Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER)
This symposium is a part of the projects funded by JSPS grants “Core-to-Core programs”, “Bilateral programs”, and “Promotion of Joint International Research”.
Jointly organized by The Council of the Hyogo-Kobe Science Cluster, The Chubei ltoh Foundation

Slovenian NMR Center, Slovenia

Binghamton University, USA

7/14 Thu
Prof. Danzhou Yang
Purdue University, USA

Carnegie Mellon University, USA

2022

Keiji Numata

Professor, Biomaterial Chemistry, Chair in Polymer
Material Chemistry
Department of Material Chemistry, Graduate School of Engineering,
Kyoto University

7/15 Fri
Prof. Bruce Armitage11

7/15 fri

Bruce Armitage

Invasion of G-Quadruplex
and i-Motif DNA by PNA

7/13 Wed
Prof. Eriks Rozners

Slovenian NMR Center, Slovenia

13th
15th

Professor, Chemistry
Co-Director, Center for Nucleic Acids Science andTechnology, Carnegie Mellon University

7/14 Thu
Dr. Peter Podbevšek

7/14 Thu
Dr. Maria Toplishek

Series132

FIBER Webinar Universe
Universe19
FIBER International Lectures 71

ハイブリッド型シンポジウムとして FIBER から講演を発信しました。国外からの招待講演者以外をオンライン参加に限り、3 日目を完全オンラインにするなど、感染対策を施しながら開催しました。また、本シンポジウムは JSPS 研究拠点形成事業の一環として、各国のコーディネーターが研究成果を発表しました。

2022

12

未来大学 in NanoBioNow

実験教室■ 若手研究者による講演会■ FIBER

若い世代の特別講演会
8

FIBER未来大学

FIBER Webinar Universe15

若い世代の特別講演会

Special Lecturesfrom Outstanding 2.9
Young Scientists
2022

Wed

15:20 - 16:45

参加費無料

申込み締切り：2022 年 2 月 4日（金）15:55 - 16:20

16:20 - 16:45

日時
会場■ FIBER 核酸化学ユニバース☆Rising Stars

RisingS
RisingStars
tars

先端生命工学研究所 (FIBER) では、公開講演会「FIBER 未来大学 - FIBER FUTURE COLLEGE -」を開催しております。
今回は、「FIBER 若い世代の特別講演会」をオンライン配信で開催します。本講演会では、ナノバイ
オの研究分野において、最先端の研究を国際的に牽引していくことが期待される博士課程の大学院
生や博士研究員など、若手研究者から日頃の研究成果を発表していただきます。
大学および研究機関、企業等の研究者の皆様など、幅広い分野の皆様のご参加をお待ち申し上げております。
＊本講演会は、英語での講演会です。

15:20 - 15:45■ ひらめき☆ときめきサイエンス ( 日本学術振興会支援事業 )2022 年 8 月 8・9 日
甲南大学ポートアイランドキャンパス

核酸化学ユニバース

Lectures in
Series 128
FIBER International Lectures69
核酸化学ユニバース

未来大学 in NanoBioNow

5KěGSPGEKĂEEJGMKECĚSěRCNFEĚGCUCIGOHOĚKIONTEĚGOěKFGSHORIGNOMGSECĚG&0#
CSSGMDĚX
名古屋大学大学院 物質理学専攻化学系 稲垣 雅仁 博士
Study of secondary structures formedby G-rich region from 5’-UTR of tyrosine
kinase 2 (TYK2) mRNA
Maria Toplishek 博士
スロベニア国立NMRセンター
Damage-induced changes in DNA structureスロベニア国立NMRセンター

お申し込み

Peter Podbevšek 博士

講演は日本語で行います
ZOOM によるオンライン開催 講演は日本語で行います

FIBER Future College 88

Lectures in NANO BIO NOW Series 133
FIBER Webinar Universe 20

FIBER 核酸化学ユニバース 10

先端生命工学研究所 (FIBER) は、日本核酸化学会(JSNAC) と共催で FIBER 核酸化学ユニバース☆
Rising Stars を開催します。本フォーラムでは核酸化学の研究分野において、最先端の研究を国際的に牽引していくことが期待される若手研究者をお招きし、最新の研究成果についてご講演いただきます。
大学および研究機関、企業等の研究者など、幅広い分野の皆様のご参加をお待ちしております。

※本 講 演会はセキュリティの関 係 上事前申込制となっております 。

ポートアイランドキャンパス事務室
Tel 078-303-1147 Fax 078-303-1495
Email fiber@adm.konan-u.ac.jp
http://www.konan-fiber.jp

http://konan-fiber.jp/archives/3110

お申し込 み 後 、2 日以内に詳 細をご 案内いたします 。返信がない場 合 、

お手 数ですがお問い合わせ先にご 連 絡をくださいますようお願いいたします 。

主催 甲南大学先端生命工学研究所 (FIBER)
共催 ひょうご神戸サイエンスクラスター協議会 / 新学術領域研究「分子夾雑化学」/ 日本核酸化学会

7 月26 日 火

10:00~12:00

10:00- SAKI MATSUMOTO

松本 咲 先生

խ

甲南大学先端生命工学研究所 (FIBER)

10:30- SEFAN ASAMITSU

朝光 世煌 先生

理化学研究所 生命機能科学研究センター
脳エピトランスクリプトミクス研究チーム

11:00- SHIHO MAKINO

牧野 支保 先生
東京大学 定量生命科学研究所
遺伝子発現ダイナミクス研究分野

11:30- KUNIHIKO MORIHIRO

森廣 邦彦 先生उਖः়ॎच

ൖવপ৾এ‫॔ॺش‬ॖছথॻय़কথঃ५হਜ஼

‫ ٿ‬ઋૺ৘রఙય௃ਣવ঴  ഛ৯  ୞ 

TEL 078-303-1147 FAX078-303-1495
MAIL fiber@adm.konan-u.ac.jp

主 催 甲南大学先端生命工学研究所
Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER)

DNA 修飾による
CpGアイランドDNAの構造制御
神経細胞における
グアニン四重鎖DNAの役割

優秀な業績をあげている若手研
若い世代をencourageする企画

オートファジーによるRNA分解の選択性です。日本核酸化学会（JSNAC）

ヘアピン核酸技術による新分類の核酸医薬開発
参 加 希 望の方は w e b s i t e の申し込みフォームからお 願いいたします。※ 本 講 演 会はセキュリティの関 係 上 、事 前申込 制となっております。
お申し込み後 、2日以内に詳 細をご案 内いたします。返 信 がな
い場 合 、お 手 数ですがお 問い合わせ先にご連 絡をくださいますようお 願いいたします。

共 催 日本核酸化学会

今回のテーマは新型コロナウイルスの検査で知られるPCR 検査について実験しました。

究者に招待講演をしていただき

申し込み方法甲南大学

参加無料

http://konan-ﬁber.jp/archives/3457

東京大学大学院工学系研究科

参加希望の方は we b s i te の申し込 みフォームからお願いいたします 。

2022 年

ひょうごサイエンスクラスターとの共催イベントとして開催しました。

■ Nano Bio College

教員らが丁寧に実験を指導しました。

「ナノバイオ 70億人を支える10億分の１のテクノロジー」

N

ano
2
2022B
o10
i
ollege

未来大学

Konan FIBER 甲南大学先端生命工学研究所

ナ ノ

バ イ オ

カ レ ッ ジ

受講無料

申込締切：
2022 年 2 月 4 日 ( 金 )15:20 ~ 16:50

Thu

ZOOMによるオンライン講演会

キャンパスツアーを実施しました。

क़ॖঝ५૎ഉඪपয়ठ਱ऊअற෷৲৾

本講座はバイオ（生物）をナノ（10 億分の 1）レベルで活用する最先端技術“ナノバイオテクノロジー”
に関して様々なトピックを取り上げてわかりやすく解説する人気シリーズです。
今回は、『ウイルス感染症に立ち向かう核酸化学』と題し、昨年に引き続き医薬品業界における最先端の科学技術トピックスを解説いたします。特別講義として、核酸医薬をご専門とされる徳島大学の南川典昭先生にご講演いただきます。南川先生には、新型コロナウイルスの治療や予防に用いられている核酸系治療薬や mRNA ワクチンに関する現状について、最新の研究成果を交えながらご紹介いただきます。また、未来講義として FIBER 教員からウイルス感染症に関連する FIBER の最新の研究成果も踏まえた講義を行います。

未来講義

薬の標的になるRNAの 構造と機能

甲南大学 先端生命工学研究所
准教授 遠藤 玉樹

15:40 ~ 16:00

ウイルス遺伝子の変異と環境

甲南大学 先端生命工学研究所
准教授 高橋 俊太郎

ணख੢ा্১FIBER のホームページ、メール、FAX のいずれかより
お申し込みください。詳細は追ってご連絡いたします。
メール、FAX でのお申し込みの際は、① ご氏名 ② ご所属 ③ ご連絡先を記載してください。
※申し込み後 3 日以内に返信がない場合は、お手数ですが、問い合わせ先までご連絡ください。

主催 甲南大学

未来講義

16:05 ~ 16:50

特別講義

RNAウイルス感染症の治療と予防徳島大学薬学部大学院薬科学教育部
教授 南川 典昭उਖः়ॎच

甲南大学先端生命工学研究所（FIBER）〒650-0047

神戸市中央区港島南町7丁目1-20

TEL 078-303-1147 FAX 078-303-1495
E-mail fiber@adm.konan-u.ac.jp
http://www.konan-fiber.jp

共催 ひょうご神戸サイエンスクラスター協議会

例年東京駅に隣接するネットワークキャ
ンパス東京で開催する一般向けの最先端講義です（今回はオンライン開催）。
今回はウイルス感染症に立ち向かう核
酸化学というテーマで、FIBER教員と徳島大学の南川教授の講義を行いました。
南川教授には主に新型コロナウイルスの治療薬についてご解説いただきました。

オンラインで過去にFIBERに在籍していた国外の若手研究者と英語での交流を行いま
した。

参加者の声

15:20 ~ 15:40

参加者にDNA博士号が授与されました。

普段できない実験や交流ができて、とても楽しかった。
裏付けを理解できたときの達成感がすごくあり、やりがいを感じることができた。
最後のカードゲームはもう少し時間を増やしてほしい。

実験のデザインやディスカッションを通じて、課題を解決
していきます。研究者としてのライフワークを体験してもらうのが狙いです。今年度は新型コロナウイルスの影響で延期になっていた昨年度分と合わせて２回開催しました。

13

2022

2022

14

未来大学 in NanoBioNow

実験教室■ 若手研究者による講演会■ FIBER

若い世代の特別講演会
8

FIBER未来大学

FIBER Webinar Universe15

若い世代の特別講演会

Special Lecturesfrom Outstanding 2.9
Young Scientists
2022

Wed

15:20 - 16:45

参加費無料

申込み締切り：2022 年 2 月 4日（金）15:55 - 16:20

16:20 - 16:45

日時
会場■ FIBER 核酸化学ユニバース☆Rising Stars

RisingS
RisingStars
tars

先端生命工学研究所 (FIBER) では、公開講演会「FIBER 未来大学 - FIBER FUTURE COLLEGE -」を開催しております。
今回は、「FIBER 若い世代の特別講演会」をオンライン配信で開催します。本講演会では、ナノバイ
オの研究分野において、最先端の研究を国際的に牽引していくことが期待される博士課程の大学院
生や博士研究員など、若手研究者から日頃の研究成果を発表していただきます。
大学および研究機関、企業等の研究者の皆様など、幅広い分野の皆様のご参加をお待ち申し上げております。
＊本講演会は、英語での講演会です。

15:20 - 15:45■ ひらめき☆ときめきサイエンス ( 日本学術振興会支援事業 )2022 年 8 月 8・9 日
甲南大学ポートアイランドキャンパス

核酸化学ユニバース

Lectures in
Series 128
FIBER International Lectures69
核酸化学ユニバース

未来大学 in NanoBioNow

5KěGSPGEKĂEEJGMKECĚSěRCNFEĚGCUCIGOHOĚKIONTEĚGOěKFGSHORIGNOMGSECĚG&0#
CSSGMDĚX
名古屋大学大学院 物質理学専攻化学系 稲垣 雅仁 博士
Study of secondary structures formedby G-rich region from 5’-UTR of tyrosine
kinase 2 (TYK2) mRNA
Maria Toplishek 博士
スロベニア国立NMRセンター
Damage-induced changes in DNA structureスロベニア国立NMRセンター

お申し込み

Peter Podbevšek 博士

講演は日本語で行います
ZOOM によるオンライン開催 講演は日本語で行います

FIBER Future College 88

Lectures in NANO BIO NOW Series 133
FIBER Webinar Universe 20

FIBER 核酸化学ユニバース 10

先端生命工学研究所 (FIBER) は、日本核酸化学会(JSNAC) と共催で FIBER 核酸化学ユニバース☆
Rising Stars を開催します。本フォーラムでは核酸化学の研究分野において、最先端の研究を国際的に牽引していくことが期待される若手研究者をお招きし、最新の研究成果についてご講演いただきます。
大学および研究機関、企業等の研究者など、幅広い分野の皆様のご参加をお待ちしております。

※本 講 演会はセキュリティの関 係 上事前申込制となっております 。

ポートアイランドキャンパス事務室
Tel 078-303-1147 Fax 078-303-1495
Email fiber@adm.konan-u.ac.jp
http://www.konan-fiber.jp

http://konan-fiber.jp/archives/3110

お申し込 み 後 、2 日以内に詳 細をご 案内いたします 。返信がない場 合 、

お手 数ですがお問い合わせ先にご 連 絡をくださいますようお願いいたします 。

主催 甲南大学先端生命工学研究所 (FIBER)
共催 ひょうご神戸サイエンスクラスター協議会 / 新学術領域研究「分子夾雑化学」/ 日本核酸化学会

7 月26 日 火

10:00~12:00

10:00- SAKI MATSUMOTO

松本 咲 先生

խ

甲南大学先端生命工学研究所 (FIBER)

10:30- SEFAN ASAMITSU

朝光 世煌 先生

理化学研究所 生命機能科学研究センター
脳エピトランスクリプトミクス研究チーム

11:00- SHIHO MAKINO

牧野 支保 先生
東京大学 定量生命科学研究所
遺伝子発現ダイナミクス研究分野

11:30- KUNIHIKO MORIHIRO

森廣 邦彦 先生उਖः়ॎच

ൖવপ৾এ‫॔ॺش‬ॖছথॻय़কথঃ५হਜ஼

‫ ٿ‬ઋૺ৘রఙય௃ਣવ঴  ഛ৯  ୞ 

TEL 078-303-1147 FAX078-303-1495
MAIL fiber@adm.konan-u.ac.jp

主 催 甲南大学先端生命工学研究所
Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER)

DNA 修飾による
CpGアイランドDNAの構造制御
神経細胞における
グアニン四重鎖DNAの役割

優秀な業績をあげている若手研
若い世代をencourageする企画

オートファジーによるRNA分解の選択性です。日本核酸化学会（JSNAC）

ヘアピン核酸技術による新分類の核酸医薬開発
参 加 希 望の方は w e b s i t e の申し込みフォームからお 願いいたします。※ 本 講 演 会はセキュリティの関 係 上 、事 前申込 制となっております。
お申し込み後 、2日以内に詳 細をご案 内いたします。返 信 がな
い場 合 、お 手 数ですがお 問い合わせ先にご連 絡をくださいますようお 願いいたします。

共 催 日本核酸化学会

今回のテーマは新型コロナウイルスの検査で知られるPCR 検査について実験しました。

究者に招待講演をしていただき

申し込み方法甲南大学

参加無料

http://konan-ﬁber.jp/archives/3457

東京大学大学院工学系研究科

参加希望の方は we b s i te の申し込 みフォームからお願いいたします 。

2022 年

ひょうごサイエンスクラスターとの共催イベントとして開催しました。

■ Nano Bio College

教員らが丁寧に実験を指導しました。

「ナノバイオ 70億人を支える10億分の１のテクノロジー」

N

ano
2
2022B
o10
i
ollege

未来大学

Konan FIBER 甲南大学先端生命工学研究所

ナ ノ

バ イ オ

カ レ ッ ジ

受講無料

申込締切：
2022 年 2 月 4 日 ( 金 )15:20 ~ 16:50

Thu

ZOOMによるオンライン講演会

キャンパスツアーを実施しました。

क़ॖঝ५૎ഉඪपয়ठ਱ऊअற෷৲৾

本講座はバイオ（生物）をナノ（10 億分の 1）レベルで活用する最先端技術“ナノバイオテクノロジー”
に関して様々なトピックを取り上げてわかりやすく解説する人気シリーズです。
今回は、『ウイルス感染症に立ち向かう核酸化学』と題し、昨年に引き続き医薬品業界における最先端の科学技術トピックスを解説いたします。特別講義として、核酸医薬をご専門とされる徳島大学の南川典昭先生にご講演いただきます。南川先生には、新型コロナウイルスの治療や予防に用いられている核酸系治療薬や mRNA ワクチンに関する現状について、最新の研究成果を交えながらご紹介いただきます。また、未来講義として FIBER 教員からウイルス感染症に関連する FIBER の最新の研究成果も踏まえた講義を行います。

未来講義

薬の標的になるRNAの 構造と機能

甲南大学 先端生命工学研究所
准教授 遠藤 玉樹

15:40 ~ 16:00

ウイルス遺伝子の変異と環境

甲南大学 先端生命工学研究所
准教授 高橋 俊太郎

ணख੢ा্১FIBER のホームページ、メール、FAX のいずれかより
お申し込みください。詳細は追ってご連絡いたします。
メール、FAX でのお申し込みの際は、① ご氏名 ② ご所属 ③ ご連絡先を記載してください。
※申し込み後 3 日以内に返信がない場合は、お手数ですが、問い合わせ先までご連絡ください。

主催 甲南大学

未来講義

16:05 ~ 16:50

特別講義

RNAウイルス感染症の治療と予防徳島大学薬学部大学院薬科学教育部
教授 南川 典昭उਖः়ॎच

甲南大学先端生命工学研究所（FIBER）〒650-0047

神戸市中央区港島南町7丁目1-20

TEL 078-303-1147 FAX 078-303-1495
E-mail fiber@adm.konan-u.ac.jp
http://www.konan-fiber.jp

共催 ひょうご神戸サイエンスクラスター協議会

例年東京駅に隣接するネットワークキャ
ンパス東京で開催する一般向けの最先端講義です（今回はオンライン開催）。
今回はウイルス感染症に立ち向かう核
酸化学というテーマで、FIBER教員と徳島大学の南川教授の講義を行いました。
南川教授には主に新型コロナウイルスの治療薬についてご解説いただきました。

オンラインで過去にFIBERに在籍していた国外の若手研究者と英語での交流を行いま
した。

参加者の声

15:20 ~ 15:40

参加者にDNA博士号が授与されました。

普段できない実験や交流ができて、とても楽しかった。
裏付けを理解できたときの達成感がすごくあり、やりがいを感じることができた。
最後のカードゲームはもう少し時間を増やしてほしい。

実験のデザインやディスカッションを通じて、課題を解決
していきます。研究者としてのライフワークを体験してもらうのが狙いです。今年度は新型コロナウイルスの影響で延期になっていた昨年度分と合わせて２回開催しました。

13

2022

2022

14

PICK UP FIBERPICK UP FIBER

FIBER に関する記事

受賞・ニュース
Dipanwita Banerjee 博士研究員がISNAC2022 で Ohtsuka Award（ISNAC Outstanding Oral
Presentation Award for Young Scientist 2022）を受賞
Dipanwita Banerjee（FIBER 博士研究員）が「日本核酸化学会第6回年会・ISNAC2022
第 49 回 国 際 核 酸 化 学シンポジウム」で「Ohtsuka Award（ISNAC Outstanding
Oral Presentation Award for Young Scientist 2022）」を 受 賞 し ま し た。ま た、ISNAC2022 では、研究拠点形成事業にて共同研究を実施している英国 Reading 大学、Kane McQuaid 博士研究員も Ohtsuka Award を受賞しました。
2022年3月24日 神戸新聞 朝刊（転載許諾済）

松本 咲 特任助教
公益財団法人ひょうご科学技術協会の学術研究助成に採択
松本 咲 特任助教の研究申請が、公益財団法人ひょうご科学技術協会の学術研究助成に採択されました。
研究テーマ：核酸の高次構造による老化促進メカニズムの解明

15

2022

2022年3月28日 産経新聞大阪本社版 朝刊（転載許諾済）

2022

16

PICK UP FIBERPICK UP FIBER

FIBER に関する記事

受賞・ニュース
Dipanwita Banerjee 博士研究員がISNAC2022 で Ohtsuka Award（ISNAC Outstanding Oral
Presentation Award for Young Scientist 2022）を受賞
Dipanwita Banerjee（FIBER 博士研究員）が「日本核酸化学会第6回年会・ISNAC2022
第 49 回 国 際 核 酸 化 学シンポジウム」で「Ohtsuka Award（ISNAC Outstanding
Oral Presentation Award for Young Scientist 2022）」を 受 賞 し ま し た。ま た、ISNAC2022 では、研究拠点形成事業にて共同研究を実施している英国 Reading 大学、Kane McQuaid 博士研究員も Ohtsuka Award を受賞しました。
2022年3月24日 神戸新聞 朝刊（転載許諾済）

松本 咲 特任助教
公益財団法人ひょうご科学技術協会の学術研究助成に採択
松本 咲 特任助教の研究申請が、公益財団法人ひょうご科学技術協会の学術研究助成に採択されました。
研究テーマ：核酸の高次構造による老化促進メカニズムの解明

15

2022

2022年3月28日 産経新聞大阪本社版 朝刊（転載許諾済）

2022

16

PICK UP FIBER

Cover Gallery 〜表紙として採択された最近の論文〜

ACCESS MAP

RNAシュードノット構造の安定性を予測する方法の開発
神戸三宮

Kobe-Sannomiya

計算科学
センター

神戸三宮

Kobe-Sannomiya

大阪難波
Osaka-Namba

S. Satpathi, T. Endoh,
and N. Sugimoto
Applicability of nearestneighbour model forpseudoknot RNAs
Chem. Commun., 58,5952-5955 (2022).

四重らせん構造の水和研究による新規薬剤設計に関する研究

FIBER余話

S. Matsumoto, S. Takahashi, S. Bhowmik, T. Ohyama,
and N. Sugimoto
Volumetric strategy for quantitatively elucidating
local hydration network around a G-quadruplex,
Anal. Chem., 94, 7400-7407 (2022).

本号担当編集高橋 俊太郎

本号の表紙絵のモチーフである孫悟空は、如意棒と呼ばれる棒を自分の意によって自在に伸ばしたり元に戻したりすることができました。そんな物語のように、遺伝子も自分の意のままに変化させられないだろうか、、、。FIBER では今年度から日本学術振興会研究拠点形成事業に採択されたプ

ロジェクトにより、そのようなチャレンジングな技術の開発に取り組みます。既存の手法であるゲノム編集技術（CRISPR/Cas9）は遺伝子の情報（塩基配列）を書き換える技術で、治療法がない遺伝性疾患を治療できることが期待されています。しかし遺伝子の書き換えにより、新たな疾患を発症する可能性があるという深刻なリスクもあります。そこで本プロジェクトでは遺伝子を書き換えることなく、遺伝子の構造を如意棒のように自在に変えることで遺伝情報の発現を制御する「ゲノム非計算科学センター駅
Keisankagaku Center

JR「三ノ宮」駅、阪急・阪神「神戸三宮」駅、神戸市営地下鉄「三宮」
駅よりポートライナーに乗り換
え、「計算科学センター」駅下車
し、徒歩3分。

編集技術」の開発を目指します。本事業は FIBERを中心とした五カ国を研究拠点として行う

大型国際共同研究プロジェクトです。新型コロナウイルスの流行から早３年が経過し、ようやく国外の研究者との対面での研究交流が再開されつつあります。2022 年10月に行ったスロベニアでの共同研究では、現地の共同研究者をはじめ各国の研究者と直に議論でき、対面での交流の重要性を再認識しました。一方、この3 年で培ったオンラインでのつながりにより全世界から10を超える

国々とネットワークを築くことができました。対面・オンラインそれぞれの素晴らしさを活かしつつ、世界を先導する核酸研究組織として展開するFIBER の事業を今後とも是非ご注目ください。
17

2022

2022

18

PICK UP FIBER

Cover Gallery 〜表紙として採択された最近の論文〜

ACCESS MAP

RNAシュードノット構造の安定性を予測する方法の開発
神戸三宮

Kobe-Sannomiya

計算科学
センター

神戸三宮

Kobe-Sannomiya

大阪難波
Osaka-Namba

S. Satpathi, T. Endoh,
and N. Sugimoto
Applicability of nearestneighbour model forpseudoknot RNAs
Chem. Commun., 58,5952-5955 (2022).

四重らせん構造の水和研究による新規薬剤設計に関する研究

FIBER余話

S. Matsumoto, S. Takahashi, S. Bhowmik, T. Ohyama,
and N. Sugimoto
Volumetric strategy for quantitatively elucidating
local hydration network around a G-quadruplex,
Anal. Chem., 94, 7400-7407 (2022).

本号担当編集高橋 俊太郎

本号の表紙絵のモチーフである孫悟空は、如意棒と呼ばれる棒を自分の意によって自在に伸ばしたり元に戻したりすることができました。そんな物語のように、遺伝子も自分の意のままに変化させられないだろうか、、、。FIBER では今年度から日本学術振興会研究拠点形成事業に採択されたプ

ロジェクトにより、そのようなチャレンジングな技術の開発に取り組みます。既存の手法であるゲノム編集技術（CRISPR/Cas9）は遺伝子の情報（塩基配列）を書き換える技術で、治療法がない遺伝性疾患を治療できることが期待されています。しかし遺伝子の書き換えにより、新たな疾患を発症する可能性があるという深刻なリスクもあります。そこで本プロジェクトでは遺伝子を書き換えることなく、遺伝子の構造を如意棒のように自在に変えることで遺伝情報の発現を制御する「ゲノム非計算科学センター駅
Keisankagaku Center

JR「三ノ宮」駅、阪急・阪神「神戸三宮」駅、神戸市営地下鉄「三宮」
駅よりポートライナーに乗り換
え、「計算科学センター」駅下車
し、徒歩3分。

編集技術」の開発を目指します。本事業は FIBERを中心とした五カ国を研究拠点として行う

大型国際共同研究プロジェクトです。新型コロナウイルスの流行から早３年が経過し、ようやく国外の研究者との対面での研究交流が再開されつつあります。2022 年10月に行ったスロベニアでの共同研究では、現地の共同研究者をはじめ各国の研究者と直に議論でき、対面での交流の重要性を再認識しました。一方、この3 年で培ったオンラインでのつながりにより全世界から10を超える

国々とネットワークを築くことができました。対面・オンラインそれぞれの素晴らしさを活かしつつ、世界を先導する核酸研究組織として展開するFIBER の事業を今後とも是非ご注目ください。
17

2022

2022

18

Vol.

24
2022

甲南大学先端生命工学研究所

078-303-1147

Contents
はじめに
FIBER 伝説
海外連携研究レポート

FIBER 研究最前線レポート
未来大学 in NanoBioNow
PICK UP FIBER／FIBER 余話