令和 2 年度

「富岳」成果創出加速プログラム「大規模データ解析と人工知能技術によるがんの起源と多様性の解明」
成果報告書

令和 3 年 5 月 28 日
国立大学法人 東京医科歯科大学
宮野悟

１．補助事業の目的 .................................................................... - 1 ２．当該年度（令和２年度）の事業実施計画............................................... - 1 ３．当該年度（令和２年度）の実施内容（成果）........................................... - 2 3.1 大規模データ解析アプリケーションの実装と実行.................................... - 2 3.1.1 Genomon と Virtual Grid Engine の実機への実装準備、SiGN パッケージの実機への実装準備.................................................................................. - 2 3.1.2 説明可能な Deep Tensor の実機実装............................................. - 3 3.1.3 500 検体の Genomon での解析を実施 ............................................. - 4 3.1.4 大規模シーケンスデータ解析、ネットワーク解析、説明可能な Deep Tensor 解析をつなぐ- 6
3.2 大規模データ創出によるとがんの起源と多様性の解明................................. - 8 3.2.1 A-1）クローン拡大履歴の解析のために、同一幹細胞由来領域(単一クリプト)、あるいは単一細胞由来培養のコロニーの全ゲノムシーケンスを行う。................................. - 8 3.2.2 A-2）A-1 で決定した分子クロックを用いたがんの初期病変の全ゲノムシーケンシンスによるクローン履歴の推定法の検討を行う。................................................. - 9 3.2.3 ネットワーク解析と研究目標との調整を行う。.................................. - 10 3.3 プロジェクトの総合的推進 ....................................................... - 12 3.3.1 運営委員会 ................................................................. - 12 3.3.2 ホームページ ............................................................... - 12 3.3.3 ニュースレター発行（電子版）................................................ - 13 ４．活動（研究会の活動等） ........................................................... - 14 4.1 研究会 ......................................................................... - 14 4.2 受賞等 ......................................................................... - 14 4.3 メディアへの情報発信、ウェブサイト等での情報公開................................ - 14 4.4 書籍 ........................................................................... - 14 ５．実施体制 ......................................................................... - 15 5.1 業務主任者 ..................................................................... - 15 5.2 業務項目別実施区分 ............................................................. - 15 -- 2 -

補助事業の名称「富岳」成果創出加速プログラム
大規模データ解析と人工知能技術によるがんの起源と多様性の解明

１．補助事業の目的
ゲノムシーケンスデータ解析パイプライン Genomon 及びネットワーク解析アプリケーションとネット
ワーク深層学習システム Deep Tensor 等により、正常組織においてどのように遺伝子変異クローンが生じるのか、遺伝子変異ないしその組み合わせがどのように細胞の表現型を決定するのか、さらには、その多様性・複雑性のために研究が進んでいないゲノムの構造異常が発がんにどう関わるのか、について解明する。

２．当該年度（令和２年度）の事業実施計画(1) 大規模データ解析アプリケーションの実装と実行
・Genomon と Virtual Grid Engine の実機への実装準備、SiGN パッケージの実機への実装準備
・説明可能な Deep Tensor の実機実装
・500 検体の Genomon での解析を実施。
・大規模シーケンスデータ解析、ネットワーク解析、説明可能な Deep Tensor 解析をつなぐ。
(2) 大規模データ創出によるとがんの起源と多様性の解明
A-1）クローン拡大履歴の解析のために、同一幹細胞由来領域(単一クリプト)、あるいは単一細胞由来
培養のコロニーの全ゲノムシーケンスを行う。
A-2）A-1 で決定した分子クロックと組み合わせることで、がんの初期病変の全ゲノムシーケンスによるクローン履歴の推定法を検討する。
・ネットワーク解析と研究目標との調整を行う。
(3) プロジェクトの総合的推進
プロジェクト全体の連携を密としつつ円滑に運営していくための運営会議をビデオ会議システムなどを適宜利用して１ヶ月～３ヶ月に１回の頻度で開催し、進捗状況を把握し、研究開発の進め方や課題等について検討する。プロジェクト内の研究の進捗状況および成果の発表のためのワークショップ等を年１回程度の頻度で開催する。プロジェクトで得られた成果については学会発表等により、積極的に公表するとともに、ホームページを開設する。一般を対象としたアウトリーチ活動を研究の進捗をみながら行う。また、他のプロジェクトとの連携などにより、効率的・効果的な研究の推進を行
う。

- 1 -

３．当該年度（令和２年度）の実施内容（成果）
3.1 大規模データ解析アプリケーションの実装と実行
3.1.1 Genomon と Virtual Grid Engine の実機への実装準備、SiGN パッケージの実機への実装準備
Genomon、Virtual Grid Engine、および SiGN パッケージ（SiGN-L1、SiGN-BN、SiGN-SSM）の「富岳」
実機上へのインストールおよび実行テストを実施した。全ソフトウェアのインストールおよびテスト実行を完了し、最新版のソフトウェアの公開を下記 URL にて実施した。
Genomonhttps://bitbucket.org/genomon_wg/genomonpipeline/src/GPF_develop/

Virtual Grid Engine
https://github.com/SatoshiITO/VGESiGN（SiGN-L1、SiGN-BN、SiGN-SSM）
https://ytlab.jp/sign/index_ja.html

また、Genomon に関しては後述の大規模検体解析の準備として、これまでテストに使用してきた標準データセット（腫瘍・正常検体 1 ペア＋対照用正常データ 11 検体：コントロールパネル）とこれを解析可能な最小限の「富岳」リソース（96 ノード）でのチューニングを実施した。大規模解析に関しては後述の 3.1.3 節で述べる。
まず、9 月までの「富岳」供用開始前評価環境では MPI 通信ライブラリを始めとする数々の問題により、正常に実行できる環境を整えることに多大な時間を取られた。表 3.1.1-1 に代表的なシステム関連トラ
ブルを列挙する。
表 3.1.1-1 Genomon 実行におけるシステム関連トラブル（9 月 15 日までのもの）

（注２）

（注 1）

注 1）TCP/IP 版 MPI に関しては 3.1.3 節を参照のこと。
注 2）LLIO 障害 2 については、再現性のないエラーのため解決したかどうかは判定できない。

- 2 -10 月ごろから実行環境（コンパイラおよび pysam 等のインストール済み OSS のバージョンアップや調整など）が安定してきたことと、Lightweight Layered IO-Accelerator（LLIO）システムが一部使用可能になったことから、LLIO を使用した高速化作業を進めた。Genomon はターゲットアプリの中で最も I/O 比率が高く、LLIO による高速化の恩恵を最も期待できるアプリだからである。
LLIO には 3 種類（ノード内テンポラリ、共有テンポラリ、第 2 階層キャッシュ）の領域が存在し、それぞれ使用用途や領域の大きさ、I/O 性能等が異なる。Genomon ではアプリの性質から主に共有テンポラ
リと第 2 階層キャッシュの使用がメインとなっている。まず、パイプライン中で使用する各種データベ
ースファイルを共有テンポラリに設置した。これらは 9 ファイル 8.7GiB である。また、LLIO を使用する
ことで逆に性能が劣化する場合も確認された。例えば、コントロールパネルのデータは解析内容からラン
ダムアクセスであり、キャッシングの効果が低く、並列に同時実行される他の cat 処理と SSD に対する
I/O 競合の影響のほうが大きく出てしまうため、キャッシング対象から除外した。
これらの調整を実施し、最終的に予想される Genomon の予測解析性能を表 3.1.1-2 に示す。最終性能
は、対「京」比 23.4 倍、6091 検体/日の解析性能（予測値）となった。
表 3.1.1-2 Genomon の「富岳」における予測解析性能

注）96 ノードでの性能から全系へ線形補間した予測値
3.1.2 説明可能な Deep Tensor の実機実装
富士通研究所は、グラフ構造データに対する説明可能な AI「Deep Tensor」を開発した[3.1.2-1]。Deep
Tensor は、ニューラルネットワークと融合させたテンソル分解を用いて、テンソル表現されたグラフ構
造データから重要な特徴を抽出することができる。また、遺伝子発現データ解析への適用を通じて、Deep
Tensor の説明可能性を高めた TRIP 技術を開発した[3.1.2-2]。今年度は、Deep Tensor／TRIP の「富岳」
上での適用のため、大規模遺伝子ネットワークへの適用時におけるボトルネック解析とコード最適化を実施した。
「富岳」に搭載されている A64FX プロセッサの高いメモリ性能を最大限に引き出す最適化も含め、最適化実施前に比べ約４倍の高速化を実現し、最終的に Intel CPU や GPU と同程度の性能を達成した（表 3.1.2-1）。ここで、Intel CPU や GPU はチップに搭載されている資源すべてを活用しているのに- 3 -対して、A64FX プロセッサはチップに搭載された資源の 4 分の 1 のみ利用している。従って、複数のパラメータを並行して探索するケースの場合、A64FX では 4 つ同時にプログラムを実行できるため、4 回分の探索を約 443 秒で行うことができる。すなわち、Intel CPU と比較して 2.5 倍、GPU に対して 3.2 倍効率的に探索できることを意味する。
表 3.1.2-1 Deep Tensor の 100 epoch あたりの学習時間

最適化実施前

最適化実施後Intel (1 socket)

783 秒

278 秒

GPU (V100)

762 秒

358 秒

1,678 秒

443 秒

A64FX 搭載 FX700 (1 CMG)

参考文献
[3.1.2-1] Koji Maruhashi, Masaru Todoriki, Takuya Ohwa, Keisuke Goto, Yu Hasegawa, Hiroya
Inakoshi, Hirokazu Anai: Learning Multi-Way Relations via Tensor Decomposition With Neural
Networks. AAAI 2018: 3770-3777[3.1.2-2] Koji Maruhashi, Heewon Park, Rui Yamaguchi, Satoru Miyano: Linear Tensor Projection
Revealing Nonlinearity. CoRR abs/2007.03912 (2020)
3.1.3 500 検体の Genomon での解析を実施
結論から述べると、本年度実施予定であった 500 検体の解析は実施不可能であった。理由は、2021 年
5 月現在の「富岳」のシステム状況においても、960 ノード（10 検体同時解析に相当）使用時のジョブ実
行に不具合を生じ、解析を実施できない状況だからである1。2021 年 4 月 16 日、医科歯科大学、「富岳」
運用技術部門、および富士通の 3 者による原因究明チームが立ち上げられ、現在、調査が始まっているが原因の特定には至っていない。なお、FS2020 プロジェクトのターゲットアプリケーションとしてのGenomon の問題サイズにおいては 96 ノード実行時の性能を基に「京」との性能比較を行った。
本問題の発覚は、2021 年 2 月 19 日以降であった。理由は、2021 年 2 月 16 日～18 日の 3 日間に実施された「富岳」のメンテナンス後に初めて、「富岳」のシステムソフトウェアの不具合が解消され、Genomon（正確には補助ソフトウェアである Virtual Grid Engine、以降 VGE）を 200 ノード以上で実行可能な環境が提供されたからである。
VGE はグリッドエンジン（GE）バッチジョブシステムが搭載されていないスーパーコンピュータ上に、仮想的な GE 機能を提供するソフトウェアである。本ソフトウェアは Python 言語で記述され、MPI4PY ラ
イブラリを通じて MPI 通信ライブラリを利用する並列ソフトウェアとして実装している。
「京」コンピュータ、京都大学情報環境機構のスーパーコンピュータ Camphor2（システム A）、および東京大学医科学研

1

COVID-19 解析のため 140 検体の解析を試みたが、計算ジョブが正常に完了したものは 1 ジョブ 20 検
体分のみであり、他の 120 検体分に関してはすべて異常終了であった。

- 4 -

究所ヒトゲノム解析センターのスーパーコンピュータ SHIROKANE での動作実績を持ち、75000 ノード（京）までの動作確認を実施済みである。
当課題および Genomon ワーキンググループ（以下、WG）メンバーは、2020 年 3 月以降に提供されていた「富岳」共用前評価環境を用いて「富岳」実機における Genomon の動作確認およびチューニング等を実施していた。本 WG 内において、2020 年 4 月の段階で「富岳」では Genomon が実行できない問題が確認された。富士通による調査の結果、「富岳」に実装されている MPI 環境（以下、TOFU 版 MPI）において、特定の条件環境が揃った際に Python の multiprocessing モジュールの子プロセス生成に問題を生じる障害が原因であるとの報告を受けた。
本来、発見された障害は迅速に修正対応されて然るべきであるが、富士通の報告では本障害はシステム
ソフトウェアの根本的部分に原因があり、対応に時間的猶予を求められたため、WG において以下の合意を形成した。
本障害の修正対応は 2020 年夏頃を目処に富士通が実施する
修正対応が完了するまで、TOFU ネットワークを使わない TCP/IP 版の MPI 環境（以下、TCP/IP 版 MPI）
を Genomon の暫定実行環境として富士通が早急に提供する
ただし TCP/IP 版 MPI はスケーラビリティに問題があり実運用時のユーザ利用を想定していないため
Genomon 向けに暫定利用という条件で使う
当課題および WG では上記暫定環境にて基本データセットを用いて「富岳」上でのチューニング作業等を先行実施し、修正対応の完了を待つ「富岳」上の Genomon では富士通が開発した LLIO ファイルシステムの利用を想定して開発が進んでいたが、LLIO ファイルシステムの大規模利用は、2021 年 2 月 1 日まで実施できず、1 検体毎にパイプラインするために必要な最小ノードサイズで性能測定を行う
本合意に基づき、TCP/IP 版を用いて実行可能な最小限のノード数である 96 ノードでの実行確認およびチューニングを 2020 年夏まで実施した。しかしながら、2020 年 8 月 18 日の WG において、富士通から夏中の修正対応が困難なため、10 月以降の対応へと延期要請が出され、やむなく受理することとなった。
TOFU 版 MPI の障害対応完了報告の第 1 報は 2020 年 12 月 1 日であった（言語版数 lang/tcsds-1.2.28a）。
しかし、同環境でのテストの結果、いまだ障害が残っており、複数検体解析は依然として実行不可能な状況であった。富士通による再調査の結果、新たな障害（2 件）であることが判明（2020 年 12 月 24 日）した。その対応は 2021 年 2 月 16 日～18 日にかけて行われたメンテナンス中に実施されることとなり、確認作業は 2021 年 2 月中旬まで持ち越された。2021 年 2 月 19 日以降、漸く複数検体解析が実行可能な環境が提供された。そこで 960 ノード 10 検体同時解析のテストをしたところ、我々のレベルでは原因が特定できない様々な不具合を生じて実行できない状態が確認された。
最終的に、本年度（R2 年度）に当課題および WG で複数解析のテストを実施できた期間は実質約一ヶ月
のみ（メンテナンス等により 2 週間ほど使用できない期間が年度末までに存在したため）であった。この
短い期間では、新たに発見されたシステムに起因すると想定される問題への対応は残念ながら不可能で
あった。

- 5 -

3.1.4 大規模シーケンスデータ解析、ネットワーク解析、説明可能な Deep Tensor 解析をつなぐ
がんの悪性化メカニズムの１つである上皮系細胞から間葉系細胞への転換(Epithelial-Mesenchymal
Transition: EMT)を決定する遺伝子ネットワークの解析のため、説明可能な AI 技術を開発し、ネットワ
ーク解析に基づく EMT メカニズム解明を行った。EMT を決定する遺伝子ネットワークは Sanger Instituteの 762 種のがん細胞株・約 13,000 個の遺伝子発現データ（大規模 RNA シーケンスデータから定量化可能）から、EMT の度合を定量化した変量を細胞の特徴を表すモジュレータとして使用して個々の細胞に対して推定された 762 個の遺伝子ネットワークである(Shimamura et al., 2011)。
膨大・大量のネットワークの総合的理解のため、説明可能な AI 技術である Deep Tensor の改善版 Tensor
Reconstruction based Interpretable Prediction (TRIP)を富士通人工知能研究所との共同研究で開発した（Maruhashi et al., 2020）。従来の AI 技術は人間以上の予測精度を実現できるが、何を学習して、どんな根拠でそのような結果が導出されたのかの解釈性問題（Black Box）があり、専門家の判断に説明責任が問われる医療分野などへの適用には限界あることは、AI のボトルネックとして知られている。本
研究では、その問題を解決するため、予測精度と共に結果に関する解釈性を持つグラフ構造のデータ（頂点間の関係の強さを要素とする行列や行列を拡張したテンソルデータ）解析の説明可能な AI 技術を開発した。
開発した TRIP は、予測と低次元部分空間
推定に関する二つ損失関数に基づいて学習するため、予測精度と解釈性を同時に達成できる AI 技術である。すなわち、テン
ソル分解を応用し多数の頂点の線形結合で表現される少数の成分を抽出し、それらの成分の間の関係によって元のグラフ構
造データを人間が理解しやすい低次元部
分空間に近似する方法である。その時、予測に必要とされる特徴が極力保持される
図 3.1.4-1 説明可能な AI「TRIP」の予備実験

ように、抽出される成分を学習し、抽出された成分間を分析することにより予測理由を提示する、説明可能な AI 技術である（図 3.1.4-1）。
開発された TRIP を用いて、各細胞の EMT 状態を決定している 762 個の遺伝子ネットワークを解析することにより、上皮系細胞から間葉系細胞への転換の予測と、その予測理由を人が理解できる形で提示することから、上皮間葉転換メカニズムの解明を行った（Park et al., 2020）。従来のテンソル分解方法である
TuckerNN (Kolda and Bader, 2009)の予測精度を比較したところ、予測性能が大幅に向上できていることが確認された（図 3.1.4-2(a)）
。
上皮系細胞から間葉系細胞への転換のメカニズムの解明するため、762 個の遺伝子ネットワークを表すのに重要な成分（regulator 側から 50 個、target 側から 50 個）を取り出し、Regulator 側の第 1・2・3 成分に着目して、各成分の領域における EMT 誘導転写因子（EMT-activating transcription factors: ZEB1,
ZEB2, SNAIL1, SNAIL2, TWIST1）のネットワークの解析し、EMT マーカーの探索を行った（図 3.1.4-2(b)）[3.1.4-3]。

- 6 -図 3.1.4-2 説明可能な AI による EMT ネットワーク解析概念図取られたマーカーには、EMT ネットワーク構築の時（Shimamura et al., 2011）見つけられたマーカーも含まれているが、その時点では立証できなかった EMT 関連メカニズムが、10 年経った今、ほとんど解明できていることが確認できた。 すなわち、10 年前のデータから、その後 10 年間の研究によって明らかにされた EMT に関する結果が説明可能 AI により再現できた。この研究により、大規模シーケンスデー
タ解析、ネットワーク解析、説明可能な Deep Tensor 解析をつなぐ大枠ができ、そこでの AI の高度予測性と解釈性の重要さが確認できた。
開発された TRIP は「富岳」上で実装済みであり、高速化されたことも確認でき、「富岳」の計算パワーに基づく説明可能な AI の活用が今後のがんの起源と多様性の解明研究全体の進展に寄与することが強く期
待される。
参考文献
[3.1.4-1] Kolda TG, and Bader BW (2009) Tensor decompositions and applications. SIAM Review,
51(3):455–500.
[3.1.4-2] Maruhashi K, Park H, Yamaguchi R, Miyano S (2020) Linear Tensor Projection Revealing
Nonlinearity. arXiv: 12007.03912, http://arxiv.org/abs/2007.03912.
[3.1.4-3] Park H, Maruhashi K, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S. (2020) Global gene network
exploration based on explainable artificial intelligence approach PLoS ONE 15(11); e0241508.

- 7 -[3.1.4-4] Shimamura T, Imoto S, Shimada Y, Hosono Y, Niida A, et al. (2011) A novel network
profiling analysis reveals system changes in epithelial-mesenchymal transition. PLoS ONE 6(6):e20804.
3.2 大規模データ創出によるとがんの起源と多様性の解明
3.2.1 A-1）クローン拡大履歴の解析のために、同一幹細胞由来領域(単一クリプト)、あるいは単一細胞由来培養のコロニーの全ゲノムシーケンスを行う。
乳腺の異型増殖性病変は前がん病変であり、その一部が非浸潤性乳管がん(DCIS; Ductal carcinoma insitu)を経て浸潤がんに至ると考えられている。こうした前がん病変と乳がんは同一のクローンに由来することが想定されるが、クローンの拡大や乳がんへの進展がどのように起こるのかについては未だ明らかになっていない。そこで、乳がんの発生初期の遺伝学的なクローン進化の過程を明らかにするために、
前がん病変と乳がんが併存している症例を選び、多部位サンプリング・全ゲノムシーケンスを行い、系統樹解析を行うことで正常乳管上皮細胞から乳がんが発生するまでのクローン拡大・クローン進化の履歴を追うことを試みた。
クローン拡大履歴の時間的な経過を推定するためには、分子クロックとしてその臓器の正常な細胞の年間変異率（一年間に単一細胞に蓄積する体細胞変異の数）を計測する必要がある。まず、正常乳腺由来
試料から上皮マーカー特異的抗体（抗 EpCAM 抗体）を結合した磁気ビーズを用いて乳管上皮細胞を分離し、単一細胞培養を行った。得られた単一細胞由来オルガノイドは非常に小さく、DNA 量が少ないため、シーケンス前に全ゲノム増幅を行う必要があった。全ゲノム増幅により生じるエラーを除去するために、
細胞溶解・DNA 抽出後の検体を 2 分割し、それぞれ独立して全ゲノム増幅および全ゲノムシーケンスを行い、両者で共通して認められる変異を「単一細胞に蓄積した体細胞変異」として変異数を計測した（図3.2.1-1）。

図 3.2.1-1 正常乳腺の単一細胞由来オル

図 3.2.1-2 正常乳管上皮細胞の年間変異率

ガノイドのシーケンス- 8 -様々な年齢の検体を解析（17 症例 45 検体）することで、一年当たりの変異獲得数を算出し、正常乳管上皮細胞の年間変異率を決定した。観察された体細胞変異数に対し、年間変異率が常に一定である（体細胞変異数が年齢に比例して増える）と仮定する線形モデルと、年間変異率が閉経前後で変化すると仮定す
る線形混合モデルの二つを当てはめたところ、変異率が閉経前後で変化するモデルのほうが有意に当て
はまりがよかった（ANNOVA、P 値 1.42 × 10-9）（図 3.2.1-2）。年間変異率が閉経前後で 1/3 以下に減少するというこのモデルは、閉経を契機に腺管が萎縮傾向になり乳管上皮のターンオーバーも劇的に減少する、という正常乳腺の生理的な変化に矛盾しないものであった。
3.2.2 A-2）A-1 で決定した分子クロックを用いたがんの初期病変の全ゲノムシーケンシンスによるクローン履歴の推定法の検討を行う。
次に、発がん初期の遺伝学的なクローン進化の履歴を辿るために、乳がん患者 6 例の手術材料のホル
マリン固定パラフィン包埋（FFPE; formalin fixed paraffin embedded）標本を用いて、同一乳腺内のがん病変および前がん病変からマイクロダイセクションによる多部位サンプリング（合計 36 検体、平均 6
検体/例）および全ゲノムシーケンスを行い、様々な進展段階の病変の遺伝子変異情報を元に系統樹解析を行った。これらの症例では、乳がんの発生に関わるとされているドライバー遺伝子異常を含む複数の遺伝子異常を有する細胞が乳腺内に広範にクローン拡大し、その拡大した領域内で場所ごとにさらに個別の遺伝子異常が蓄積し、多彩な病変が形成されたことが示唆された（図 3.2.2-1）。A-1 で決定した分子ク
ロック（正常乳管上皮細胞の年間変異率）を用いて最初のドライバー遺伝子異常が獲得された時期およびクローン拡大が始まった時期の推定を行ったところ、これらの発がん初期の重要なイベントは、臨床的に乳がんが診断される数十年前にすでに起こっていたと推察された。

図 3.2.2-1 乳がん症例におけるクローン履歴解析の一例
この手法により、発がん初期のクローン拡大・クローン進化の履歴をより詳細に辿ることが可能になっ

- 9 -

た。
3.2.3 ネットワーク解析と研究目標との調整を行う。
RNA sequence を行うことで得られる遺伝子発現データは、各々の遺伝子がその一つの検体において多く/少なく発現しているかのデータに過ぎないが、多数の検体を集めることにより、遺伝子同士がどのよ
うに相互作用を及ぼしているかを推定することが可能になる（遺伝子ネットワーク、図 3.2.3-1）。この遺伝子ネットワーク解析を用いると、例えば、手術後に長期生存が得られた群と手術後に死亡した群を比べることで遺伝子相互関係がどのように異なるかを明らかすることが可能である。また、2 群のみの解析だけでなく、連続値（例えば、Myc に関連する pathway の発現の多寡）での解析が可能であり、遺伝子ネットワークの連続的な変化を観察することが可能である。このような遺伝子ネットワークの変化に寄与しうる因子を Modulator と呼んでいる（図 3.2.3-2）。

図 3.2.3-1 遺伝子ネットワークの概念図
1. 遺伝子発現データ
大腸癌に罹患した患者で原発巣を手術で摘出している 3,108 症例から RNA（DNA も同時に）を抽出した。これらの検体に対して、次世代シーケンサーを用いた RNA sequence を行った。この解析により、各々の症例において 20295 遺伝子の発現データが明らかになった。
2. Modulator
・ 遺伝子変異 profile
RNA と同時に抽出した DNA を使用し、targeted capture sequence（大腸癌に関連する 169 遺伝子を対象とした）を行った。この解析により、各々の症例における遺伝子変異 profile を明らかにした。
・ 臨床情報手術を受けた後の生存時間、術後再発の有無、手術時の Stage（進行度）、病理所見、性別、年齢等の収集を行っている。

- 10 -

図 3.2.3-2 Modulator による遺伝子ネットワークの変化
以上を踏まえ、解析に用いる遺伝子発現データの filtering を開始した。すなわち、腫瘍コンテンツの高い検体の選別、RNA sequence data の quality が十分な検体の選別、検体の中で発現が十分に高い遺伝子の選別を開始した。
また、Modulator に関しても、情報の収集を継続する。また、追加で Modulator なりうる因子に関しても検討に着手した。今後は集めた情報を用いて順次ネットワーク解析を行う。

- 11 -

3.3 プロジェクトの総合的推進
プロジェクト全体の連携を密としつつ円滑に運営していくため、運営委員会や研究会の開催等、参画各機関の連携・調整を行った。特に、プロジェクト全体の進捗状況を確認しつつ計画の合理化を検討し、必要に応じて調査或いは外部有識者を招聘して意見を聞くなどの方策を取り、プロジェクトを推進した。
当初計画ではプロジェクトの研究成果を発表するワークショップの開催を予定していたが、令和 2 年
度の新型コロナウイルスの感染拡大と感染防止のための緊急事態宣言の発令を踏まえ、新型コロナウイ
ルスの影響とその解析評価等の緊急対応に注力することとし、ワークショップ開催は見合わせた。プロジ
ェクトの進捗と得られた成果については、ホームページの開設と運営、ニュースレター（電子版）の発行、広報活動やアウトリーチ活動への参加などを通じて積極的に公開した。
3.3.1 運営委員会
プロジェクト運営を円滑かつ効率的に行うために、本課題責任者、参加機関および協力機関の関係者などで構成した運営委員会を実施している。研究開発およびプロジェクトの総合的推進における活動進捗の確認や計算資源の配分、課題についての調整等を、参画各機関と協調して行った。
令和 2 年度は以下の日程で開催した。
第1回

7 月 21 日（火） ZOOM によるオンライン開催

第2回

8 月 26 日（水） ZOOM によるオンライン開催

第3回

9 月 11 日（金） ZOOM によるオンライン開催

第 4 回 10 月 7 日（水） ZOOM によるオンライン開催
第 5 回 12 月 23 日（水） ZOOM によるオンライン開催
第6回

1 月 29 日（金） ZOOM によるオンライン開催

第7回

3 月 23 日（火） ZOOM によるオンライン開催

3.3.2 ホームページ
プロジェクト発足に伴い、新規にプロジェクトホームページ（図 3.3.2-1）を開設した。プロジェクトの周知および成果公開のため、概要、研究内容、研究成果、イベント・ニュースおよび問い合わせの各ページを作成し公開した。URL は以下の通りである。
https://odcla.mddsc.jp/- 12 -

図 3.3.2-1 プロジェクトホームページ（TOP 画面）
3.3.3 ニュースレター発行（電子版）
一般および企業等を対象として、研究開発の進捗や成果などを分かりやすく説明することで研究活動の理解を深めるとともに、社会における重要性や価値の理解促進を図るため、ニュースレター(図 3.3.31)を発行しホームページ上で公開した。

図 3.3.3-1 ニュースレターVol.1- 13 -

４．活動（研究会の活動等）
4.1 研究会
特記事項なし。
4.2 受賞等
特記事項なし。
4.3 メディアへの情報発信、ウェブサイト等での情報公開
日付

見出し

医学のあゆみ2020 年 6 月 28 日

データ駆動型サイ

宮野悟（東京医科エンスの未来歯科大学）

スーパーコンピュ宮野悟（東京医科ータ「富岳」の可能

歯科大学）

中央公論

2020 年 8 月 28 日

備考

著者名と所属※

メディア名称性について
国立大学法人東京2020 年 11 月 20 日

東京医科歯科大学

https://pr.fujit

国立大学法人東京医科歯科大学・株と富士通研究所、

su.com/jp/news/2

医科歯科大学式会社富士通研究「富岳」を用いて020/11/10.html

株式会社富士通研

所

がんの遺伝子ネッ

共同プレスリリース

究所

トワーク分析を 1
日以内に実現(株)富士経済2021 年 1 月 25 日

ゲノム医療の最新

宮野悟（東京医科

動向について歯科大学）

4.4 書籍特記事項なし。

- 14 -

５．実施体制
5.1 業務主任者（受託者（委託先））
役職・氏名 国立大学法人東京医科歯科大学 M&D データ科学センター
特任教授 宮野 悟
E-メールアドレス： miyano@hgc.jp
TEL：03-5280-8620 FAX: 03-5280-8632（再委託先）
役職・氏名 国立大学法人京都大学大学院 医学研究科腫瘍生物学講座 教授 小川 誠司
E-メールアドレス：sogawa-tky@umin.ac.jp
TEL：075-753-9285 FAX: 075-753-9282（再委託先）
役職・氏名 愛知県がんセンター研究所 システム解析学分野 分野長 山口 類
E-メールアドレス：r.yamaguchi@aichi-cc.jp
TEL：052-764-9889 FAX：052-764-9889
5.2 業務項目別実施区分
業務項目

担当機関

担当責任者

（１）大規模データ解析アプリ

東京医科歯科大学 M&D データ科学セ

宮野 悟（特任教授）

ケーションの実装と実行

ンター
愛知県がんセンター研究所システム

山口 類（分野長）

解析学分野（２）大規模データ創出による

京都大学大学院医学研究科腫瘍生物とがんの起源と多様性の解明

学講座（３）プロジェクトの総合的推東京医科歯科大学M&Dデータ科学セン進ター- 15 -

小川 誠司（教授）宮野 悟（特任教授）

Betten1 gakkaitouhappyouzisseki
学術論文誌発表リスト
掲載した論文（発表題

発表者氏名

目）

発表した場所

発表し

国（学会誌・雑誌等名）

た時期

内・
外の
別

A Case of Tyrosine

Imataki O, Ishida T,

Case Rep Oncol. ,13(1):449-

2020 年

Kinase Inhibitor-

Kubo H, Uemura M,

55.

4月

Resistant Chronic

Nanya Y, Kawakami K,

Myeloid Leukemia,

Ogawa S, Kadowaki N.

Intern Med. ,59(8):1081-6.

2020 年

国外

Chronic Phase withASXL1 Mutation.
Secondary Pulmonary

Hashimoto M, Itonaga

Alveolar Proteinosis

H, Nannya Y,

Following Treatment

Taniguchi H, Fukuda

with Azacitidine for

Y, Furumoto T,

Myelodysplastic

Fujioka M, Kasai S,

Syndrome.

Taguchi M, Taniguchi

国外

4月

H, Sato S, Sawayama
Y, Atogami S,
Iwasaki K, Hata T,
Soda H, Moriuchi Y,
Nakata K, Ogawa S,
Miyazaki Y.
DNA methylation-

Kimura S, Seki M,

Leukemia. ,34(4):1163-8.

based classification

Kawai T, Goto H,

reveals difference

Yoshida K, Isobe T,

between pediatric T-

Sekiguchi M,

cell acute

Watanabe K, Kubota

lymphoblastic

Y, Nannya Y, Ueno H,

leukemia and normal

Shiozawa Y, Suzuki

thymocytes.

H, Shiraishi Y, Ohki

2020 年
4月

K, Kato M, Koh K,
Kobayashi R, Deguchi
T, Hashii Y, Imamura
T, Sato A, Kiyokawa
N, Manabe A, SanadaM, Mansour MR, Ohara- 16 -

国外

A, Horibe K,
Kobayashi M, Oka A,
Hayashi Y, Miyano S,
Hata K, Ogawa S,
Takita J.
Pathogenic

Mori M, Hira A,

Haematologica. ,105(4):1166-

2020 年

mutations identified

Yoshida K, Muramatsu

7.

4月

by a multimodality

H, Okuno Y,

approach in 117

Shiraishi Y, Anmae

Japanese Fanconi

M, Yasuda J, Tadaka

anemia patients.

S, Kinoshita K,

Stem Cell Res. ,44:101755.

2020 年

国外

Osumi T, Noguchi Y,
Adachi S, Kobayashi
R, Kawabata H, Imai
K, Morio T, Tamura
K, Takaori-Kondo A,
Yamamoto M, Miyano
S, Kojima S, Ito E,
Ogawa S, Matsuo K,
Yabe H, Yabe M,
Takata M.
TET2Secardin L, Limia

haploinsufficiency

CEG, di Stefano A,

alters reprogramming

Bonamino MH, Saliba

into induced

J, Kataoka K, Rehen

pluripotent stem

SK, Raslova H, Martycells.

C, Ogawa S,

国外

4月

Vainchenker W,
Monte-Mor B, Plo I.
A frequent nonsense

Mizumaki H,

mutation in exon 1

Hosomichi K,

across certain HLA-A

Hosokawa K,

and -B alleles in

Yoroidaka T, Imi T,

leukocytes of

Zaimoku Y, Katagiri

patients withT, Nguyen MAT, Tranacquired aplastic

DC, Elbadry MIY,

anemia.

Chonabayashi K,

Haematologica. ,in press

2020 年
5月

Yoshida Y, Takamatsu- 17 -

国外

H, Ozawa T, Azuma F,
Kishi H, Fujii Y,
Ogawa S, Tajima A,
Nakao S.
Dasatinib Is an

Nguyen TB, Sakata-

Effective Treatment

Yanagimoto M,

forFujisawa M, Nuhat

Angioimmunoblastic

ST, Miyoshi H,

T-cell Lymphoma.

Nannya Y, Hashimoto

Cancer Res. ,80(9):1875-84.

2020 年

国外

5月

K, Fukumoto K,
Bernard OA, Kiyoki
Y, Ishitsuka K,
Momose H, Sukegawa
S, Shinagawa A,
Suyama T, Sato Y,
Nishikii H, Obara N,
Kusakabe M,
Yanagimoto S, Ogawa
S, Ohshima K, Chiba
S.
Linear Tensor

Maruhashi K, Park H,

arXiv: 2007.03912

2020 年

Projection Revealing

Yamaguchi R, Miyano

Nonlinearity.

S

Predisposed genomic

Katagiri S,

Haematologica. ,105(7):e337-

2020 年

instability in pre-Makishima H, Azuma

e9.

7月

treatment bone

K, Nannya Y, Saitoh

marrow evolves toY, Yoshizawa S,

therapy-related

Akahane D, Fujimoto

myeloid neoplasms in

H, Ito Y, Velaga R,

malignant lymphoma.

Umezu T, Ohyashiki

Blood. ,136(2):157-70.

2020 年

国外

7月
国外

JH, Ogawa S,
Ohyashiki K.
SF3B1-mutant MDS as

Malcovati L,

a distinct disease

Stevenson K,

subtype: a proposal

Papaemmanuil E,

from theNeuberg D, Bejar R,

International

Boultwood J, Bowen

Working Group for

DT, Campbell PJ,

7月- 18 -

国外

the Prognosis of

Ebert BL, Fenaux P,

MDS.

Haferlach T, Heuser
M, Jansen JH,
Komrokji RS,
Maciejewski JP,
Walter MJ, Fontenay
M, Garcia-Manero G,
Graubert TA, Karsan
A, Meggendorfer M,
Pellagatti A,
Sallman DA, Savona
MR, Sekeres MA,
Steensma DP, Tauro
S, Thol F, Vyas P,
Van de Loosdrecht
AA, Haase D, Tuchler
H, Greenberg PL,
Ogawa S, HellstromLindberg E, Cazzola
M.

Resistance of KIR

Nguyen MAT, Hosokawa

Immunohorizons. ,4(7):430-2020 年

Ligand-Missing

K, Yoroidaka T,

41.

7月

Leukocytes to NK

Maruyama H, Espinoza

Cells In Vivo in

JL, Elbadry MI,

Patients with

Mohiuddin M, Tanabe

Acquired Aplastic

M, Katagiri T,

Anemia.

Nakagawa N,

国外

Chonabayashi K,
Yoshida Y, Arima N,
Kashiwase K, Saji H,
Ogawa S, Nakao S.
Whole-Exome

Okano T, Imai K,

J Clin Immunol. ,40(5):729-

2020 年

Sequencing-Based

Naruto T, Okada S,

40.

7月

Approach forYamashita M, Yeh TW,

Germline Mutations

Ono S, Tanaka K,

in Patients with

Okamoto K, Tanita K,

Inborn Errors of

Matsumoto K,

Immunity.

Toyofuku E, Kumaki-- 19 -

国外

Matsumoto E, Okamura
M, Ueno H, Ogawa S,
Ohara O, Takagi M,
Kanegane H, Morio T.
Integrated

Sekiguchi M, Seki M,

NPJ Precis

2020 年

multiomics analysis

Kawai T, Yoshida K,

Oncol. ,0.180555555555556

7月

of hepatoblastoma

Yoshida M, Isobe T,

unravels its

Hoshino N, Shirai R,

heterogeneity and

Tanaka M, Souzaki R,

provides novel

Watanabe K, Arakawa

druggable targets.

Y, Nannya Y, Suzuki

Blood. ,136(6):684-97.

2020 年

国外

H, Fujii Y, Kataoka
K, Shiraishi Y,
Chiba K, Tanaka H,
Shimamura T, Sato Y,
Sato-Otsubo A,
Kimura S, Kubota Y,
Hiwatari M, Koh K,
Hayashi Y, Kanamori
Y, Kasahara M,
Kohashi K, Kato M,
Yoshioka T,
Matsumoto K, Oka A,
Taguchi T, Sanada M,
Tanaka Y, Miyano S,
Hata K, Ogawa S,
Takita J.
LUBAC accelerates

Jo T, Nishikori M,

B-cellKogure Y, Arima H,

lymphomagenesis by

Sasaki K, Sasaki Y,

conferring

Nakagawa T, Iwai F,

resistance toMomose S, Shiraishi

genotoxic stress on

A, Kiyonari H,

B cells.

Kagaya N, Onuki T,

8月

Shin-Ya K, Yoshida
M, Kataoka K, Ogawa
S, Iwai K, TakaoriKondo A.

- 20 -

国外

High prevalence of

Shirai R, Osumi T,

Eur J Hum2020 年

SMARCB1

Terashima K,

Genet. ,28(8):1124-8.

8月

constitutional

Kiyotani C, Uchiyama

abnormalities

M, Tsujimoto S,

including mosaicism

Yoshida M, Yoshidain malignant

K, Uchiyama T,

rhabdoid tumors.

Tomizawa D, Shioda

Commun Biol. ,3(1):544.

2020 年

国外

Y, Sekiguchi M,
Watanabe K, Keino D,
Ueno-Yokohata H,
Ohki K, Takita J,
Ito S, Deguchi T,
Kiyokawa N, Ogiwara
H, Hishiki T, Ogawa
S, Okita H,
Matsumoto K,
Yoshioka T, Kato M.
Comprehensive

Kubota Y, Seki M,

genetic analysis of

Kawai T, Isobe T,

pediatric germ cell

Yoshida M, Sekiguchi

tumors identifies

M, Kimura S,

potential drug

Watanabe K, Sato-targets.

Otsubo A, Yoshida K,

国外

9月

Suzuki H, Kataoka K,
Fujii Y, Shiraishi
Y, Chiba K, Tanaka
H, Hiwatari M, Oka
A, Hayashi Y, Miyano
S, Ogawa S, Hata K,
Tanaka Y, Takita J.
The transcription

Miyazaki K, Watanabe

factor E2A activates

H, Yoshikawa G, Chen

multiple enhancers

K, Hidaka R, Aitanithat drive Rag

Y, Osawa K, Takeda

expression in

R, Ochi Y, Tani-Ichi

developing T and B

S, Uehata T,

cells.

Takeuchi O, Ikuta K,

Sci Immunol. ,5(51).

Ogawa S, Kondoh G,- 21 -

2020 年
9月

国外Lin YC, Ogata H,
Miyazaki M.
[How Does Aging

Yokoyama A, Kakiuchi

Gan To Kagaku

2020 年

Contribute toN, Yoshizato T, Muto

Ryoho. ,47(9):1281-6.

9月

Cancer?].

M, Ogawa S.

Clinical utility of

Yasuda T, Sanada M,

Cancer Sci. ,111(9):3367-78.

2020 年

target capture-based

Nishijima D,

panel sequencing in

Kanamori T, Iijima

hematological

Y, Hattori H, Saito

malignancies: A

A, Miyoshi H,

multicenter

Ishikawa Y, Asou N,

feasibility study.

Usuki K, Hirabayashi

国外

国外

9月

S, Kato M, Ri M,
Handa H, Ishida T,
Shibayama H, Abe M,
Iriyama C, Karube K,
Nishikori M, Ohshima
K, Kataoka K,
Yoshida K, Shiraishi
Y, Goto H, Adachi S,
Kobayashi R, Kiyoi
H, Miyazaki Y, Ogawa
S, Kurahashi H,
Yokoyama H, Manabe
A, Iida S, Tomita A,
Horibe K.
Implications of

Bernard E, Nannya Y,

TP53 allelic state

Hasserjian RP,

for genome

Devlin SM, Tuechler

stability, clinical

H, Medina-Martinez

presentation andJS, Yoshizato T,

outcomes in

Shiozawa Y, Saiki R,

myelodysplastic

Malcovati L, Levine

syndromes.

MF, Arango JE, Zhou

Nat Med. ,26(10):1549-56.

2020 年
10 月

Y, Sole F, Cargo CA,
Haase D, Creignou M,
Germing U, Zhang Y,
Gundem G, Sarian A,- 22 -

国外

van de Loosdrecht
AA, Jadersten M,
Tobiasson M,
Kosmider O, Follo
MY, Thol F, Pinheiro
RF, Santini V,
Kotsianidis I,
Boultwood J, Santos
FPS, Schanz J,
Kasahara S, Ishikawa
T, Tsurumi H,
Takaori-Kondo A,
Kiguchi T,
Polprasert C,
Bennett JM, Klimek
VM, Savona MR,
Belickova M, Ganster
C, Palomo L, Sanz G,
Ades L, Della Porta
MG, Elias HK, Smith
AG, Werner Y, Patel
M, Viale A, Vanness
K, Neuberg DS,
Stevenson KE,
Menghrajani K,
Bolton KL, Fenaux P,
Pellagatti A,
Platzbecker U,
Heuser M, Valent P,
Chiba S, Miyazaki Y,
Finelli C, Voso MT,
Shih LY, Fontenay M,
Jansen JH, Cervera
J, Atsuta Y,
Gattermann N, Ebert
BL, Bejar R,
Greenberg PL,
Cazzola M,- 23 -

Hellstrom-Lindberg
E, Ogawa S,
Papaemmanuil E.
Genetic andInagaki-Kawata Y,

clinical landscape

Yoshida K,of breast cancers

Kawaguchi-Sakita N,

with germline

Kawashima M,

BRCA1/2 variants.

Nishimura T, Senda

Commun Biol. ,3(1):578.

2020 年

国外

10 月

N, Shiozawa Y,
Takeuchi Y, Inoue Y,
Sato-Otsubo A, Fujii
Y, Nannya Y, Suzuki
E, Takada M, Tanaka
H, Shiraishi Y,
Chiba K, Kataoka Y,
Torii M,
Yoshibayashi H,
Yamagami K, Okamura
R, Moriguchi Y, Kato
H, Tsuyuki S,
Yamauchi A, Suwa H,
Inamoto T, Miyano S,
Ogawa S, Toi M.
Fusion partner-

Matsuo H, Yoshida K,

specific mutation

Nakatani K, Harata

profiles and KRAS

Y, Higashitani M,

mutations as adverse

Ito Y, Kamikubo Y,

prognostic factors

Shiozawa Y,

in MLL-rearranged

Shiraishi Y, Chiba

AML.

K, Tanaka H, Okada

Blood Adv. ,4(19):4623-31.

2020 年
10 月

A, Nannya Y, Takeda
J, Ueno H, Kiyokawa
N, Tomizawa D, Taga
T, Tawa A, Miyano S,
Meggendorfer M,
Haferlach C, Ogawa
S, Adachi S.

- 24 -

国外

Landscape of driver

Ueno H, Yoshida K,

Blood Adv. ,4(20):5165-73.

mutations and their

Shiozawa Y, Nannya

clinical impacts in

Y, Iijima-Yamashita

pediatric B-cell

Y, Kiyokawa N,

precursor acute

Shiraishi Y, Chiba

lymphoblastic

K, Tanaka H, Isobeleukemia.

T, Seki M, Kimura S,

2020 年

国外

10 月

Makishima H,
Nakagawa MM,
Kakiuchi N, Kataoka
K, Yoshizato T,
Nishijima D, Deguchi
T, Ohki K, Sato A,
Takahashi H, Hashii
Y, Tokimasa S, Hara
J, Kosaka Y, Kato K,
Inukai T, Takita J,
Imamura T, Miyano S,
Manabe A, Horibe K,
Ogawa S, Sanada M.
Novel COL4A1

Ogura H, Ohga S,

Hum Genome Var. ,7(1):42.

mutations identified

Aoki T, Utsugisawa

in infants withT, Takahashi H, Iwai

congenital hemolytic

A, Watanabe K, Okuno

anemia in

Y, Yoshida K, Ogawa

association withS, Miyano S, Kojima

brain malformations.

S, Yamamoto T,

2020 年

国外

11 月

Yamamoto-Shimojima
K, Kanno H.
Global gene network

Park H, Maruhashi K,

exploration based on

Yamaguchi R, Imoto

explainable

S, Miyano S

PLoS ONE 15(11); e0241508.

2020 年

国外

11 月

artificial
intelligenceapproach
Two Aldehyde

Dingler FA, Wang M,

Mol Cell. ,80(6):996-1012

2020 年

Clearance Systems

Mu A, Millington CL,

e9.

12 月

Are Essential to

Oberbeck N, Watcham- 25 -

国外

Prevent Lethal

S, Pontel LB,

Formaldehyde

Kamimae-Lanning AN,

Accumulation in Mice

Langevin F, Nadlerand Humans.

C, Cordell RL, Monks
PS, Yu R, Wilson NK,
Hira A, Yoshida K,
Mori M, Okamoto Y,
Okuno Y, Muramatsu
H, Shiraishi Y,
Kobayashi M,
Moriguchi T, Osumi
T, Kato M, Miyano S,
Ito E, Kojima S,
Yabe H, Yabe M,
Matsuo K, Ogawa S,
Gottgens B,
Hodskinson MRG,
Takata M, Patel KJ.

VAV1 mutations

Fukumoto K, Sakata-

Blood. ,136(26):3018-32.

contribute to

Yanagimoto M,

development of T-

Fujisawa M, Sakamotocell neoplasms in

T, Miyoshi H,

mice.

Suehara Y, Nguyen

2020 年

国外

12 月

TB, Suma S,
Yanagimoto S,
Shiraishi Y, Chiba
K, Bouska A, Kataoka
K, Ogawa S, Iqbal J,
Ohshima K, Chiba S.
Genomic analysis of

Kanamori T, Sanada

Br J Haematol. ,191(5):755-

2020 年

multiple myeloma

M, Ri M, Ueno H,

63.

12 月

using targeted

Nishijima D, Yasuda

capture sequencing

T, Tachita T, Narita

in the JapaneseT, Kusumoto S,

cohort.

Inagaki A, Ishihara
R, Murakami Y,
Kobayashi N,
Shiozawa Y, Yoshida- 26 -

国外

K, Nakagawa MM,
Nannya Y, Shiraishi
Y, Chiba K, Tanaka
H, Miyano S, Horibe
K, Handa H, Ogawa S,
Iida S.
Co-mutation

Todisco G, Creignou

Leukemia. ,in press

pattern, clonal

M, Galli A,

hierarchy, and clone

Guglielmelli P, Rumi

size concur to

E, Roncador M, Rizzo

determine disease

E, Nannya Y, Pietra

phenotype ofD, Elena C, Bono E,

SRSF2(P95)-mutated

Molteni E, Rosti V,

neoplasms.

Catricala S, Sarchi

2020 年

国外

12 月

M, Dimitriou M,
Ungerstedt J,
Vannucchi AM,
Hellstrom-Lindberg
E, Ogawa S, Cazzola
M, Malcovati L.
XPO1 inhibitors

Boons E, Nogueira

Blood Cancer J. ,11(2):27.

represent a novel

TC, Dierckx T,

therapeutic option

Menezes SM,

in Adult T-cell

Jacquemyn M, Tamir

Leukemia, triggering

S, Landesman Y,

p53-mediatedFarre L, Bittencourt

caspase-dependent

A, Kataoka K, Ogawa

apoptosis.

S, Snoeck R, Andrei

2021 年

国外

1月

G, Van Weyenbergh J,
Daelemans D.
ClonalFujishima N, Kohmaru

hematopoiesis in

J, Koyota S, Kuba K,

adult pure red cell

Saga T, Omokawa A,

aplasia.

Moritoki Y, Ueki S,

Sci Rep. ,11(1):2253.

Ishida F, Nakao S,
Matsuda A, Ohta A,
Tohyama K, Yamasaki
H, Usuki K,- 27 -

2021 年
1月

国外Nakashima Y, Sato S,
Miyazaki Y, Nannya
Y, Ogawa S, Sawada
K, Mitani K,
Hirokawa M.
Association ofKimura S, Sekiguchi

PLoS One. ,16(1):e0245526.

high-risk

M, Watanabe K,

neuroblastoma

Hiwatarai M, Seki M,

classification based

Yoshida K, Isobe T,

on expression

Shiozawa Y, Suzuki

profiles with

H, Hoshino N,

differentiation andHayashi Y, Oka A,

metabolism.

Miyano S, Ogawa S,

2021 年

国外

1月

Takita J.
Discovery of

Li X, Kim W, Arif M,

Functional

Gao C, Hober A,

Alternatively

Kotol D, Strandberg

Spliced PKM

L, Forsstrom B,

Transcripts in Human

Sivertsson A,

Cancers.

Oksvold P, Turkez H,

Cancers (Basel). ,13(2).

2021 年

国外

1月

Grotli M, Sato Y,
Kume H, Ogawa S,
Boren J, Nielsen J,
Uhlen M, Zhang C,
Mardinoglu A.
Development ofNakamura F, Arai H,

Philadelphia

Nannya Y, Ichikawa

chromosome-negative

M, Furuichi S,

acute myeloid

Nagasawa F,

leukemia with IDH2

Takahashi W, Handa

and NPM1 mutations

T, Nakamura Y,

in a patient with

Tanaka H, Nakamura

chronic myeloid

Y, Sasaki K, Miyano

leukemia who showed

S, Ogawa S, Mitani

a major molecularK.

Int J Hematol. ,in press

2021 年
1月

response to tyrosine
kinase inhibitor
therapy.

- 28 -

国外

Acquisition of

Nishimura A,

Pediatr Blood

2021 年

monosomy 7 and a

Hirabayashi S,

Cancer. ,68(2):e28799.

2月

RUNX1 mutation in

Hasegawa D, Yoshida

Pearson syndrome.

K, Shiraishi Y,

Blood. ,in press

2021 年

国外

Ashiarai M, Hosoya
Y, Fujiwara T,
Harigae H, Miyano S,
Ogawa S, Manabe A.
HLA class I allele-

Hosokawa K, Mizumaki

lacking leukocytes

H, Yoroidaka T,

predict rare clonal

Maruyama H, Imi T,

evolution to MDS/AML

Tsuji N, Urushihara

in patients with

R, Tanabe M, Zaimoku

acquired aplastic

Y, Nguyen MAT, Tran

anemia.

DC, Ishiyama K,

国外

3月

Yamazaki H, Katagiri
T, Takamatsu H,
Hosomichi K, Tajima
A, Azuma F, Ogawa S,
Nakao S.
Targeted deep next

Okabe M, Morishita

generation

T, Yasuda T,

sequencing

Sakaguchi H, Sanada

identifies potential

M, Kataoka K, Ogawa

somatic and germline

S, Shiraishi Y,

variants for

Ichiki T, Kawaguchi

predisposition to

Y, Ohbiki M,

familial Burkitt

Matsumoto R, Osaki

lymphoma.

M, Goto T, Ozawa Y,

Eur J Haematol. ,in press

2021 年

国外

3月

Miyamura K.
Chromatin-

Ochi Y, Ogawa S.

Cancers (Basel). ,13(6).

Spliceosome

2021 年

国外

3月

Mutations in Acute
Myeloid Leukemia.
Absence of a common

Klimkowska M, Nannya

founder mutation in

Y, Gran C, Mansson

patients with

R, Douagi I, Ogawa

Blood. ,137(9):1260-3.

2021 年3月

cooccurring- 29 -

国外

myelodysplastic

S, Nahi H, Tobiasson

syndrome and plasmaM.

cell disorder.
ClinicalKaburagi T, Yamato

Haematologica. ,in press

significance of RAS

G, Shiba N, Yoshida

pathway alterations

K, Hara Y, Tabuchi

in pediatric acuteK, Shiraishi Y, Ohki

myeloid leukemia.

K, Sotomatsu M,

2021 年

国外

3月

Arakawa H, Matsuo H,
Shimada A, Taki T,
Kiyokawa N, Tomizawa
D, Horibe K, Miyano
S, Taga T, Adachi S,
Ogawa S, Hayashi Y.
Unbiased Detection

Ishida Y, Kakiuchi

Clin Cancer

2021 年

of Driver Mutations

N, Yoshida K, Inoue

Res. ,27(6):1756-65.

3月

in Extramammary

Y, Irie H, Kataoka

Paget Disease.

TR, Hirata M,
Funakoshi T,
Matsushita S, Hata
H, Uchi H, Yamamoto
Y, Fujisawa Y,
Fujimura T, Saiki R,
Takeuchi K,
Shiraishi Y, Chiba
K, Tanaka H, Otsuka
A, Miyano S,
Kabashima K, Ogawa
S.

- 30 -

国外

学会等口頭発表リスト
発表した成果（発表 発表者氏名
題目、口頭・ポスタ （所属機関）

発表した場所

発表した時期国内・外の別（学会等名）

ー発表の別）
Clonal evolution

Tomomi Nishimura,

Americanof proliferative

Nobuyuki Kakiuchi,

Association

lesions into

Kenichi Yoshida,

for Cancer

breast cancers.

Yasuhide Takeuchi,

Research(ポスター）

Hirona Maeda,

AnnualYusuke Shiozawa,

Meeting 2020

2020/4/24-4/29

国外

2020/10/1-10/3

国内

Masahiro M.
Nakagawa, Yotaro
Ochi, Yukiko
Kawata, Kosuke
Aoki, Masahiro
Hirata, Tatsuki R.
Kataoka, Takaki
Sakurai, Satoko
Baba, Yuichi
Shiraishi, Kenichi
Chiba, Kengo
Takeuchi, Hironori
Haga, Satoru
Miyano, Masakazu
Toi, Seishi
Ogawa. (Kyoto
Univ)
Clonal evolution

Tomomi Nishimura,

The 79thof proliferative

Nobuyuki Kakiuchi,

Annuallesions into

Kenichi Yoshida,

Meeting ofbreast cancers

Yasuhide Takeuchi,

the Japanese(口頭）

Hirona Maeda,

CancerYusuke Shiozawa,

Association

Masahiro Hirata,
Tatsuki R.
Kataoka, Takaki
Sakurai, Satoko
Baba, Kengo- 31 -

Takeuchi, Hironori
Haga, Satoru
Miyano, Masakazu
Toi, Seishi Ogawa.
(Kyoto Univ)
乳管上皮増殖性病

西村 友美, 垣内

The 28th

変から乳癌へ至る

伸之, 吉田 健一,

Annualクローン進化 (口竹内 康英, 前田

Meeting of頭）紘奈, 塩澤 裕介,

the Japanese中川 正宏, 越智

Breast Cancer

陽太郎, 川田 有

Society

2020/10/13

国内

2020/10/1-10/3

国内

国内

希子, 平田 勝啓,
片岡 竜貴, 桜井孝規, 馬場 郷子,
白石 友一, 千葉健一, 竹内 賢吾,
羽賀 博典, 宮野悟, 戸井 雅和, 小川誠司. (Kyoto

Univ)
Analysis of

Ryosaku Inagaki,

The 79th

mechanisms

Masahiro M

Annualunderlying clonal

Nakagawa, Yasuhito

Meeting ofevolution of MDS

Nannya, Xingxing

the Japaneseand AML by

Qi, June Takeda,

Cancersingle-cell

Akinori Yoda,

Association

DNA/RNA

Ayana Kon, Hideki

sequencing (口Makishima, Seishi

頭）Ogawa (Kyoto Univ)

Analysis of

Ryosaku Inagaki,

The 82nd

2020/10/10-

mechanisms

Masahiro M

Annual

10/12

underlying clonal

Nakagawa, Yasuhito

Meeting ofevolution of MDS

Nannya, Xingxing

the Japaneseand AML by

Qi, Zhao Lanying,

Society ofsingle-cell

June Takeda,

Hematology

DNA/RNA

Akinori Yoda,

sequencing (口Ayana Kon, Hisashi

頭）Tsurumi, Hideki- 32 -

Makishima, Seishi
Ogawa (Kyoto Univ)
Analysis of

Ryosaku Inagaki,

63nd ASH

2020/12/11-

Clonal Evolution

Masahiro M

Annual12/14

of AML Using

Nakagawa, Yasuhito

Meeting and

Simultaneous

Nannya, Xingxing

Exposition

Single-cell

Qi, Lanying Zhao,

DNA/RNA Analysis

June Takeda,(ポスター）

Akinori Yoda,

国外

Ayana Kon, Hisashi
Tsurumi, Hideki
Makishima, Seishi
Ogawa (Kyoto Univ)
Genetic profiling

Yotaro Ochi,

The 79thand prognosis of

Kenichi Yoshida,

Annualblast crisis in

Ko Sasaki, Noriko

Meeting ofchronic myeloid

Hosoya, Yusuke

the Japaneseleukemia

Shiozawa, Yasuhito

Cancer

慢性骨髄性白血病

Nannya, Takayuki

Association

急性転化の遺伝学

Ishikawa, Yuichi

的機序と予後 (口Shiraishi, Kenichi

頭）Chiba, Hiroko

2020/10/1-10/3

国内

国外

Tanaka, Masashi
Sanada, Hideki
Makishima, Akifumi
Takaori-Kondo,
Satoru Miyano,
Kinuko Mitani, andSeishi Ogawa(Kyoto Univ)
Prognostic

Yotaro Ochi,

63nd ASH

2020/12/11-

Relevance of

Kenichi Yoshida,

Annual

12/14

Genetic

Ying-Jung Huang,

Meeting and

Abnormalities in

Ming-Chung Kuo, Ko

Exposition

Blastic

Sasaki, Noriko

Transformation of

Hosoya, Nobuhiro
Hiramoto,- 33 -

Chronic Myeloid

Rabindranath Bera,

Leukemia (口頭）Yasuhito Nannya,
Yusuke Shiozawa,
June Takeda,
Yosaku Watatani,
Hideki Makishima,
Yuichi Shiraishi,
Kenichi Chiba,
Hiroko Tanaka,
Masashi Sanada,
Takayuki Ishikawa,Akifumi TakaoriKondo, Satoru
Miyano, Kinuko
Mitani, Seishi
Ogawa, and LeeYung Shih (Kyoto
Univ)

COMBINED COHESIN-

Yotaro Ochi, Ayana

25th Congress

RUNX DEFICIENCY

Kon, Toyonoriof theSYNERGISTICALLY

Sakata, Masahiro M

EuropeanPERTURBS

Nakagawa, Naotaka

Hematology

CHROMATIN LOOPING

Nakazawa, Masanori

Association(口頭）

Kakuta, Keisuke
Kataoka, Haruhiko
Koseki, Manabu
Nakayama, Daisuke
Morishita,
TatsuakiTsuruyama,
Ryunosuke Saiki,
Akinori Yoda,
Rurika Okuda,
Tetsuichi
Yoshizato, Kenichi
Yoshida, Yusuke
Shiozawa, Yasuhito
Nannya, Shinichi- 34 -

2020/6/11-6/21

国外

Kotani, Yasunori
Kogure, Nobuyuki
Kakiuchi, Tomomi
Nishimura, Hideki
Makishima, Luca
Malcovati, Akihiko
Yokoyama, Kengo
Takeuchi, Eiji
Sugihara, Taka-aki
Sato, Masashi
Sanada, Akifumi
Takaori-Kondo,
Mario Cazzola,
Mineko Kengaku,
Satoru Miyano,
Katsuhiko
Shirahige, Hiroshi
I Suzuki, andSeishi Ogawa(Kyoto Univ)
Distinct ethnic,

Rurika Okuda,

25th Congressclinical, andYasuhito Nannya,of thegenetic

Yotaro Ochi,

Europeancharacteristics

Kazuhisa

Hematology

of der(1;7) in

Chonabayashi,

Association

myelodysplastic

Ayana Kon, Hideki

syndromes. (ポスMakishima,

ター）

Tetsuichi
Yoshizato,
Yasunobu Nagata,
June Takeda,
Kenichi Yoshida,
Masashi Sanada,
Yuichi Shiraishi,
Satoru Miyano,
Wolfgang Kern,
Constance Regina
Baer, Niroshan- 35 -

2020/6/11-6/21

国外

Nadarajah, Tamara
Alpermann, Claudia
Haferlach, Yoshiko
Atsuta, Senji
Kasahara, Hiroshi
Handa, Shigeru
Chiba, Kazuma
Ohyashiki, Torsten
Haferlach,
Yoshinori Yoshida,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
Distinct ethnic,

Rurika Okuda,

The 79th

clinical, andYasuhito Nannya,

Annualgenetic

Yotaro Ochi,

Meeting ofcharacteristics

Kazuhisa

the Japaneseof der(1;7) in

Chonabayashi,

Cancermyelodysplastic

Maria Creignou,

Association

syndromes. (口Hideki Makishima,

頭）June Takeda, Ayana

2020/10/1-10/3

国内

国内

Kon, Satoru
Miyano, Hiroshi
Handa, Shigeru
Chiba, Kazuma
Ohyashiki, Torsten
Haferlach, Eva
HellstromLindberg, Seishi
Ogawa (Kyoto Univ)
Distinct ethnic,

Rurika Okuda,

The 82nd

2020/10/10-

clinical, andYasuhito Nannya,

Annual

10/12

genetic

Yotaro Ochi,

Meeting ofcharacteristics

Kazuhisa

the Japaneseof der(1;7) in

Chonabayashi,Society of

myelodysplastic

Maria Creignou,

Hematology

syndromes. (口Hideki Makishima,

頭）Tetsuichi
Yoshizato,- 36 -

Yasunobu Nagata,
June Takeda,
Kenichi Yoshida,
Masashi Sanada,
Ayana Kon, Yuichi
Shiraishi, Satoru
Miyano, Wolfgang
Kern, ConstanceRegina Baer,
NiroshanNadarajah, Tamara
Alpermann, Claudia
Haferlach, Yoshiko
Atsuta, Senji
Kasahara, Hiroshi
Handa, Shigeru
Chiba, Kazuma
Ohyashiki, Torsten
Haferlach,
Yoshinori Yoshida,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
Multiple

Tatsuki Ogasawara,

The 79th

2020/10/1-10/3

国内

paragangliomas

Yoichi Fujii,

Annualshowed parallel

Yusuke Shiozawa,

Meeting ofevolution with

Hideki Makishima,

the Japaneseunique HIFα

Eijiro Nakamura,

Cancermutations in

Tomoaki Tanaka,

Association

cyanotic

Yuichi Shiraishi,

congenital heart

Satoru Miyano,disease (ポスタ

Seishi Ogawaー）(Kyoto Univ)

The role ofYasuhito Nannya,

The 82nd

2020/10/10-

国内

germline and

Hideki Makishima,

Annual

10/12

somatic DDX41

June Takeda,

Meeting of

mutations on

Yukihide Momozawa,

the Japanese

myeloid

Ryunosuke Saiki,Society of

Tetsuichi

Hematology- 37 -

malignancies. (口Yoshizato, Yasushi

頭）Miyazaki, Takayuki
Ishikawa, Hisashi
Tsurumi, Senji
Kasahara, Akifumi
Kondo-Takaori,
Kazuma Ohyashiki,
Toru Kiguchi,
Fumihiko Matsuda,
Jaroslaw
Maciejewski, Eva
Hellström
Lindberg, Chantana
Polprasert, Mario
Cazzola, Torsten
Haferlach,
YoichiroKamatani,
Michiaki Kubo,
Satoru Miyano,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

The role ofYasuhito Nannya,

The 79th

germline and

Hideki Makishima,

Annualsomatic DDX41

June Takeda,

Meeting of

mutations on

Yukihide Momozawa,

the Japanese

myeloid

Ryunosuke Saiki,

Cancermalignancies. (口Yasushi Miyazaki,

Association

頭）Takayuki Ishikawa,Kazuma Ohyashiki,Eva Hellström
Lindberg, Mario
Cazzola, Torsten
Haferlach,
YoichiroKamatani,
Michiaki Kubo,
Satoru Miyano,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)- 38 -

2020/10/1-10/3

国内

Frequent

Yoshikage Inoue,

The 79th

mutational

Nobuyuki Kakiuchi,

Annualalterations to

Kenichi Yoshida,

Meeting ofevade the immune

Yusuke Shiozawa,

the Japanesesystem in

Yuichi Shiraishi,

Cancercolorectal cancer

Kenichi Chiba,

Association

with POLE geneTetsuichi

mutation (口頭）

Yoshizato,

2020/10/1-10/3

国内

2020/4/24-4/29

国外

2020/4/24-4/29

国外

Yasuhide Takeuchi,
Hiroko Tanaka, Ai
Okada, Satoshi
Nagayama, Satoru
Miyano, Yoshiharu
Sakai, Seishi
Ogawa (Kyoto Univ)
Frequent genomic

Yoshikage Inoue,

Americanalterations toNobuyuki Kakiuchi,

Association

evade the immune

Kenichi Yoshida,

for Cancer

system in

Yasuhide Takeuchi,

Researchcolorectal cancer

Yusuke Shiozawa,

Annualwith POLE gene

Yuichi Shiraishi,

Meeting 2020

mutation (ポスタ

Kenichi Chiba,ー）Tetsuichi
Yoshizato, Hiroko
Tanaka, Ai Okada,
Satoshi Nagayama,
Satoru Miyano,
Yoshiharu Sakaiand Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

Analysis of

Nobuyuki Kakiuchi,

Americanclonal expansion

Kenichi Yoshida,

Associationin epithelium

Motoi Uchino,

for Cancer

affected by

Takako Kihara,

Research

ulcerative

Akaki Kotaro,

Annualcolitis reveals

Yoshikage Inoue,

Meeting 2020

frequent

Kenji Kawada,

mutations

Satoshi Nagayama,- 39 -

affecting IL-

Akira Yokoyama,

signaling pathway

Tomonori Hirano,

and novel cancer

Yasuhide Takeuchi,

vulnerability (ポHiroyuki Miyoshi,

スター）

Yoshiharu Sakai,
Hironori Haga,
Seiichi Hirota,
Hiroki Ikeuchi,
Osamu Takeuchi,
Satoru Miyano,
Hiroshi Seno,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

Analysis of

Nobuyuki Kakiuchi,

The 79th

clonal expansion

Motoi Uchino,

Annualin epithelium

Takako Kihara,

Meeting ofaffected by

Kotaro Akaki,

the Japanese

ulcerative

Yoshikage Inoue,

Cancercolitis reveals

Akira Yokoyama,

Associationnovel cancer

Tomonori Hirano,

vulnerability/潰

Seiichi Hirota,

瘍性大腸炎におけHiroki Ikeuchi,

る大腸上皮クロー

Osamu Takeuchi,

ン進化から明らか

Satoru Miyano,となった大腸がん

Hiroshi Seno,の脆弱性 (口頭）

Seishi Ogawa

2020/10/1-10/3

国内

2020/10/1-10/3

国内(Kyoto Univ)
Tissue remodeling

Nobuyuki Kakiuchi,

The 79thby positively

Akira Yokoyama,

Annualselected clones

Motoi Uchino,

Meeting ofin esophagus and

Takako Kihara,

the Japanesecolon/遺伝子変異

Kotaro Akaki,

Cancerクローンによる食Yoshikage Inoue,

Association

道および大腸組織

Tomonori Hirano,の再構築の解明

Seiichi Hirota,(口頭）

Hiroki Ikeuchi,
Osamu Takeuchi,
Satoru Miyano,- 40 -

Hiroshi Seno,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
潰瘍性大腸炎にお垣内 伸之、妹尾Japan

ける大腸上皮細胞

浩、小川 誠司

Digestiveのクローン進化と(Kyoto Univ)

Disease Week

Analysis of

Nobuyuki Kakiuchi

The rd Annual

clonal expansion

and Seishi Ogawa

Meeting ofin epithelium(Kyoto Univ)

the Molecular

2020/11/5-11/8

国内

2020/12/2-12/4

国内

2021/2/27

国内

2020/4/24-4/29

国外

発がん (口頭）

affected by

Biologyulcerative

Society ofcolitis revealsJapanfrequent
mutationsconverging on
NFKBIZ and novel
cancervulnerability/潰瘍性大腸炎における上皮細胞のクローン進化と大腸発
がん (口頭）炎症性腸疾患の発垣内 伸之 (Kyoto

日本消化器病癌メカニズム (口Univ)

学会近畿支部頭）

第 65 回教育講演会

Genetic analysis

Tomonori Hirano,

Americanof metachronousNobuyuki Kakiuchi,

Association

pancreatic

Yasuhide Takeuchi,

for Cancer

cancers (ポスタ

Yoshikage Inoue,

Researchー）

Tomomi Nishimura,

AnnualYoichi Fujii,

Meeting 2020

Akira Yokoyama,
Hideki Makishima,
Toshihiko Masui,
Shinji Uemoto,
Sachiko- 41 -

Minamiguchi),
Hironori Haga,
Kenichi Chiba,
Hiroko Tanaka,
Yuichi Shiraishi,
Satoru Miyano,
Norimitsu Uza,
Yuzo Kodama,
Hiroshi Seno, andSeishi Ogawa(Kyoto Univ)
Genetic analysis

Tomonori Hirano,

The 79thof metachronousNobuyuki Kakiuchi,

Annualpancreatic

Yasuhide Takeuchi,

Meeting ofcancers (ポスタToshihiko Masui,

the Japaneseー）

Yuichi Shiraishi,

Cancer

Satoru Miyano,

Association

2020/10/1-10/3

国内

2020/10/1-10/3

国内

国内

Norimitsu Uza,
Yuzo Kodama,
Hiroshi Seno, andSeishi Ogawa(Kyoto Univ)
The functional

Kon A, Nakagawa

The 79throle of compound

MM, Inagaki R,

AnnualDDX41 germline

Kataoka K, Ochi Y,

Meeting ofand somatic RH

Makishima H,

the Japanesemutations in the

Nakayama M, Koseki

Cancerdevelopment of

H, Nannya Y, Ogawa

Association

myeloid neoplasms

S (Kyoto Univ)(口頭）
The functional

Kon A, Nakagawa

The 82nd

2020/10/10-

characterization

MM, Inagaki R,

Annual

10/12

of compound DDX41

Kataoka K, Ochi Y,

Meeting of

germline andMakishima H,

the Japanesesomatic R52H

Nakayama M, KosekiSociety ofmutations in the

H, Nannya Y, Ogawa

Hematology

development ofS (Kyoto Univ)

myeloid- 42 -

malignancies (口頭）Functional

Kon A, Nakagawa

63nd ASH

2020/12/11-

characterization

MM, Inagaki R,

Annual12/14

of compound DDX41

Kataoka K, Ochi Y,

Meeting andgermline andMakishima H,

Exposition

somatic R525H

Nakayama M, Koseki

mutations in the

H, Nannya Y, Ogawa

development ofS (Kyoto Univ)

国外

myeloidmalignancies (ポスター）Distinct

Yoichi Fujii,

Americanmolecular

Yusuke Sato,

Association

subtypes and a

Hiromichi Suzuki,

for Cancer

high diagnostic

Yusuke Shiozawa,Research

urinary biomarker

Tetsuichi

Annualof Upper Urinary

Yoshizato, Kenichi

Meeting 2020

Tract Urothelial

Yoshida, Yuichi

Carcinoma (ポスタ

Shiraishi, Tohruー）Nakagawa, Hiroaki

2020/4/24-4/29

国外

2020/7/17-7/20

国外

Nishimatsu,
Toshikazu Okaneya,
Masashi Sanada,
Hideki Makishima,
Satoru Miyano,
Yukio Homma,
Haruki Kume,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
Molecular

Yoichi Fujii,

Europeansubtypes andYusuke Sato,

Urologynovel diagnostics

Hiromichi Suzuki,

Associationof upper urinary

Yusuke Shiozawa,

Annualtract urothelial

Tetsuichi

Meeting 2020

carcinoma (ポスタ

Yoshizato, Kenichiー）

Yoshida, Yuichi- 43 -

Shiraishi, Tohru
Nakagawa, Hiroaki
Nishimatsu,
Toshikazu Okaneya,
Masashi Sanada,
Hideki Makishima,
Satoru Miyano,
Seishi Ogawa,Haruki Kume
(Kyoto Univ)
Distinct

Yoichi Fujii,

Americanmolecular

Yusuke Sato,

Urology

subtypes and a

Hiromichi Suzuki,

Associationhigh diagnostic

Yusuke Shiozawa,

Annualurinary biomarker

Tetsuichi

MeetingofYoshizato, Kenichi

upper urinary

tract urothelial

Yoshida, Yuichi

carcinoma (口頭）

Shiraishi, Tohru

2020/7/19

国外

国内

Nakagawa, Hiroaki
Nishimatsu,
Toshikazu Okaneya,
Masashi Sanada,
Hideki Makishima,
Satoru Miyano,
Seishi Ogawa,Haruki Kume
(Kyoto Univ)
上部尿路上皮癌のYoichi Fujii,

第 108 回日本

2020/12/22-

変異に基づく 分子

Yusuke Sato,泌尿器科学会12/24

病型分類 (口頭）

Hiromichi Suzuki,

総会

Yusuke Shiozawa,
Tetsuichi
Yoshizato, Kenichi
Yoshida, Yuichi
Shiraishi, Tohru
Nakagawa, Hiroaki
Nishimatsu,
Toshikazu Okaneya,- 44 -

Masashi Sanada,
Hideki Makishima,
Satoru Miyano,
Seishi Ogawa,Haruki Kume
(Kyoto Univ)
上部尿路上皮癌のYoichi Fujii,

第 108 回日本

2020/12/22-

変異に基づく分子

Yusuke Sato,泌尿器科学会12/24

病型分類とその臨

Hiromichi Suzuki,

総会

床応用の可能性

Yusuke Shiozawa,(口頭）

Tetsuichi

国内

Yoshizato, Kenichi
Yoshida, Yuichi
Shiraishi, Tohru
Nakagawa, Hiroaki
Nishimatsu,
Toshikazu Okaneya,
Masashi Sanada,
Hideki Makishima,
Satoru Miyano,
Seishi Ogawa,Haruki Kume
(Kyoto Univ)
Molecular

Yoichi Fujii,

The 79thclassification

Yusuke Sato,

Annualand novel

Hiromichi Suzuki,

Meeting of

diagnostics ofYusuke Shiozawa,

the Japaneseupper urinary

Tetsuichi

Cancertract urothelial

Yoshizato, Kenichi

Association

carcinoma (口頭）

Yoshida, Yuichi
Shiraishi, Tohru
Nakagawa, Hiroaki
Nishimatsu,
Toshikazu Okaneya,
Masashi Sanada,
Hideki Makishima,
Satoru Miyano,
Yukio Homma,- 45 -

2020/10/1-10/3

国内

Haruki Kume,
Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

Combined

Ryunosuke Saiki,

63nd ASH

2020/12/11-

Landscape of Gene

Tetsuichi

Annual

12/14

Mutations andYoshizato,

Meeting and

Copy Number

Yasuhito Nanya,

Exposition

Alterations in

Yukihide Momozawa,

ClonalChikashi Terao,

Hematopoiesis:

Yuichi Shiraishi,

Analysis in ,Kenichi Chiba,

Japanese

Hiroko Tanaka,

Individuals (口Atsushi Niida,

頭）Seiya Imoto,

国内

Koichi Matsuda,
Takayuki Morisaki,
Yoshinori
Murakami, Yoichiro
Kamatani, Michiaki
Kubo, Satoru
Miyano, Hideki
Makishima, Seishi
Ogawa (Kyoto Univ)
INTEGRATED

Ryunosuke Saiki,

25th Congress

LANDSCAPE OF GENE

Tetsuichi

of theMUTATIONS AND

Yoshizato,

European

COPY NUMBER

Yukihide Momozawa,

Hematology

ALTERATIONS IN

Chikashi Terao,

Association

CLONAL

Yuichi Shiraishi,

HEMATOPOIESIS:

Kenichi Chiba,

ANALYSIS IN ,Hiroko Tanaka,

JAPANESE

Koichi Matsuda,

INDIVIDUALS (口Takayuki Morisaki,

頭）Yoshinori
Murakami, Yoichiro
Kamatani, Michiaki
Kubo, Satoru- 46 -

2020/6/11-6/21

国内

Miyano, Hideki
Makishima, Seishi
Ogawa (Kyoto Univ)
Integrated

Ryunosuke Saiki,

The 79th

Analysis of Gene

Tetsuichi

AnnualMutations andYoshizato,

Meeting of

Copy Number

Yukihide Momozawa,

the Japanese

Alterations in

Chikashi Terao,

CancerClonalYuichi Shiraishi,

Association

hematopoiesis (口Kenichi Chiba,

頭）Hiroko Tanaka,

2020/10/1-10/3

国内

国内

Koichi Matsuda,
Takayuki Morisaki,
Yoshinori
Murakami, Yoichiro
Kamatani, Michiaki
Kubo, Satoru
Miyano, Hideki
Makishima, Seishi
Ogawa (Kyoto Univ)
Landscape of Gene

Ryunosuke Saiki,

The 82nd

2020/10/10-

Mutations and

Tetsuichi

Annual

10/12

Copy Number

Yoshizato,

Meeting of

Alterations in

Yukihide Momozawa,

the Japanese

ClonalChikashi Terao,

Society of

Hematopoiesis (口Yuichi Shiraishi,

Hematology

頭）Kenichi Chiba,
Hiroko Tanaka,
Koichi Matsuda,
Takayuki Morisaki,
Yoshinori
Murakami, Yoichiro
Kamatani, Michiaki
Kubo, Satoru
Miyano, Hideki
Makishima, Seishi
Ogawa (Kyoto Univ)- 47 -

Distinct

Masahiro M

63nd ASH

2020/12/11-

pathogenesis of

Nakagawa, Ryosaku

Annual12/14

clonalInagaki, Yutaka

Meeting andhematopoiesis

Kuroda, Yasuhito

Exposition

revealed by

Nannya, Zhao

single cell RNA

Lanying, Yotaro

sequencing

Ochi, June Takeda,

integrated with

Xingxing Qi,

highly sensitive

Akinori Yoda,

genotyping method

Ayana Kon,

(ポスター）

Nobuyuki Kakiuchi,

国外

Hideki Makishima,
Shuichi Matsuda
and Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
Early Clonal

Masahiro M

The 79th

evolution of

Nakagawa, Ryosaku

Annualmyeloid

Inagaki, Yasuhito

Meeting of

malignancies.

Nannya, Zhao

the Japanese(口頭）

Lanying, Yotaro

CancerOchi, June Takeda,

Association

2020/10/1-10/3

国内

国内

Xingxing Qi,
Akinori Yoda,
Ayana Kon,
Nobuyuki Kakiuchi,
Hideki Makishima,
Shuichi Matsuda
and Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
DistinctMasahiro M

The 82nd

2020/10/10-

pathogenesis of

Nakagawa, Ryosaku

Annual10/12

clonalInagaki, Yutaka

Meeting ofhematopoiesis

Kuroda, Yasuhito

the Japaneserevealed by

Nannya, Zhao

Society ofsingle-cell

Lanying, Yotaro

Hematology

RNA/DNAOchi, June Takeda,

sequencing (口Xingxing Qi,

頭）Akinori Yoda,- 48 -Ayana Kon,
Nobuyuki Kakiuchi,
Hideki Makishima,
Shuichi Matsuda
and Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
DistinctMasahiro M

25th Congress

pathogenesis of

Nakagawa, Ryosaku

of theclonalInagaki, Yutaka

Europeanhematopoiesis

Kuroda, Yasuhito

Hematology

revealed by highNannya, Zhao

Association

throughput single

Lanying, Yotarocell RNAOchi, June Takeda,

sequencing

Xingxing Qi,

integrated with

Akinori Yoda,

highly sensitive

Ayana Kon,

genotyping method

Nobuyuki Kakiuchi,(ポスター）

Hideki Makishima,

2020/6/11-6/21

国外

2020/10/1-10/3

国内

Shuichi Matsuda
and Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
JAK STAT Pathway

June Takeda,

The 79this a Promising

Kenichi Yoshida,

AnnualTherapeutic

Akinori Yoda,

Meeting oftarget in Acute

Yasuhito Nannya,

the Japanese

Erythroid

Lee−Yung Shih,

Cancer

Leukemia (口頭）

YotaroAssociationOchi,Kenichi
Chiba, Yuichi
Shiraishi, Yusuke
Shiozawa,
Tetsuichi
Yoshizato, Ayana
Kon, Cassandra
Kerr, Yasunobu
Nagata, Toshiyuki
Kitano, Akira
Hangaishi, Ken- 49 -

Ishiyama, Hisashi
Tsurumi, Yasushi
Miyazaki, Nobuhiro
Hiramoto, Takayuki
Ishikawa, Masahiro
M. Nakagawa ,Akifumi Takaori−
Kondo, Shigeru
Chiba, Hideyuki
Nakazawa, MingChung Kuo,Keisuke
Kataoka, Ryunosuke
Saiki, Masashi
Sanada, Hiroko
Tanaka, Kensuke
Usuki, Shuichi
Miyawaki, Satoru
Miyano, Jaroslaw
P. Maciejewski,
Arnold Ganser,
Michael Heuser,
Felicitas Thol,
Hideki Makishima,and Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
急性赤白血病に対June Takeda,

The 82nd

2020/10/10-

する JAK STAT パス

Kenichi Yoshida,

Annual10/12

ウェイ阻害薬の有Akinori Yoda,

Meeting of

用性の検討 (口Yasuhito Nannya,

the Japanese頭）Lee−Yung Shih,Society of

YotaroHematology

Ochi,Kenichi
Chiba, Yuichi
Shiraishi, Yusuke
Shiozawa,
Tetsuichi
Yoshizato, Ayana
Kon, Cassandra- 50 -

国内

Kerr, Yasunobu
Nagata, Toshiyuki
Kitano, Akira
Hangaishi, Ken
Ishiyama, Hisashi
Tsurumi, Yasushi
Miyazaki, Nobuhiro
Hiramoto, Takayuki
Ishikawa, Masahiro
M. Nakagawa ,Akifumi Takaori−
Kondo, Shigeru
Chiba, Hideyuki
Nakazawa, MingChung Kuo,Keisuke
Kataoka, Ryunosuke
Saiki, Masashi
Sanada, Hiroko
Tanaka, Kensuke
Usuki, Shuichi
Miyawaki, Satoru
Miyano, Jaroslaw
P. Maciejewski,
Arnold Ganser,
Michael Heuser,
Felicitas Thol,
Hideki Makishima,and Seishi Ogawa(Kyoto Univ)
NOVEL MOLECULAR

June Takeda,

25th Congress

PATHOGENESIS AND

Kenichi Yoshida,of the

THERAPEUTIC

Akinori Yoda,

European

TARGETS IN ACUTE

Yasuhito Nannya,

Hematology

ERYTHROID

Lee−Yung Shih,

Association

LEUKEMIA (ポスタ

Yotaroー）Ochi,Kenichi
Chiba, Yuichi
Shiraishi, Yusuke- 51 -

2020/6/11-6/21

国外

Shiozawa,
Tetsuichi
Yoshizato, Ayana
Kon, Cassandra
Kerr, Yasunobu
Nagata, Toshiyuki
Kitano, Akira
Hangaishi, Ken
Ishiyama, Hisashi
Tsurumi, Yasushi
Miyazaki, Nobuhiro
Hiramoto, Takayuki
Ishikawa, Masahiro
M. Nakagawa ,Akifumi Takaori−
Kondo, Shigeru
Chiba, Hideyuki
Nakazawa, MingChung Kuo,Keisuke
Kataoka, Ryunosuke
Saiki, Masashi
Sanada, Hiroko
Tanaka, Kensuke
Usuki, Shuichi
Miyawaki, Satoru
Miyano, Jaroslaw
P. Maciejewski,
Arnold Ganser,
Michael Heuser,
Felicitas Thol,
Hideki Makishima,and Seishi Ogawa(Kyoto Univ)- 52 -

Genotype-

June Takeda,

63nd ASH

2020/12/11-

Phenotype

Kenichi Yoshida,

Annual

12/14

Relationships andAkinori Yoda,

Meeting andTherapeutic

Yasuhito Nannya,

Exposition

Targets in Acute

Lee−Yung Shih,

Erythroid

Yotaro

Leukemia (ポスタOchi,Kenichiー）

Chiba, Yuichi
Shiraishi, Yusuke
Shiozawa,
Tetsuichi
Yoshizato, Ayana
Kon, Cassandra
Kerr, Yasunobu
Nagata, Toshiyuki
Kitano, Akira
Hangaishi, Ken
Ishiyama, Hisashi
Tsurumi, Yasushi
Miyazaki, Nobuhiro
Hiramoto, Takayuki
Ishikawa, Masahiro
M. Nakagawa ,Akifumi Takaori−
Kondo, Shigeru
Chiba, Hideyuki
Nakazawa, MingChung Kuo,Keisuke
Kataoka, Ryunosuke
Saiki, Masashi
Sanada, Hiroko
Tanaka, Kensuke
Usuki, Shuichi
Miyawaki, Satoru
Miyano, Jaroslaw
P. Maciejewski,
Arnold Ganser,
Michael Heuser,- 53 -

国外

Felicitas Thol,
Hideki Makishima,and Seishi Ogawa(Kyoto Univ)

加齢に伴うゲノム

Seishi Ogawa

The 79th

異常と発がん (口(Kyoto Univ)

Annual頭）

2020/10/3

国内

2020/10/3

国内

2020/10/16

国内

2020/11/27

国内

2020/11/21

国内

2021/3/12-3/13

国内

Meeting of
the JapaneseCancer
Association

Mutaions inSeishi Ogawa

The 79th

normal tissues(Kyoto Univ)

Annual

(口頭）

Meeting of
the JapaneseCancer
Association

がんの起源についSeishi Ogawa

関西医科大学て (口頭）(Kyoto Univ)

大学院セミナー

がんの起源についSeishi Ogawa

第 31 回日本消て (口頭）(Kyoto Univ)

化器癌発生学会総会

がんの起源についSeishi Ogawa

第 84 回日本皮て (口頭）(Kyoto Univ)

膚科学会東京支部学術大会Cancer mutations

Seishi Ogawa

in normal tissues(Kyoto Univ)

CVMW2020(口頭）- 54 -