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微生物系統保存施設 MCC メールニュース No. 3 (2016.9.30 発行)
国立研究開発法人国立環境研究所━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━つくばでは曇や雨の天気が続き、爽やかな秋晴れの日が待ち遠しい今日この頃です。国立環境研究所 微生物系統保存施設(MCC-NIES)から MCC メールニュース No. 3 をお届けします。
━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━
ホームページ紹介
NIES 株トピックス MALDI-TOF MS を用いた Microcystis aeruginosa 株のタイピング
NIES 株を使った論文 (2016 年 5～9 月分)
新規公開微生物株 (2016 年 5～9 月分)
お知らせ
第 1 回 藻類培養トレーニングコース開催報告━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
ホームページ紹介━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
当施設のホームページコンテンツや使い方などについてご紹介します。今回は「継代培養、培地作成、凍結保存の方法」のページ、そして今回新たに整備した「技術動画」と「藻類の動画」についてご紹介します。
●「継代培養、培地作成、凍結保存の方法」のページでは、継代培養や培地作成といった培養株の基本的な取り扱いに加えて、凍結保存、無菌検査、廃棄方法について、写真付きで紹介しています。また当施設にお寄せ頂いた質問への回答「よくある質問」や初心者の方にご注意頂きたい点についてまとめたページへ「微生物株取り扱いについて（初心者用）」のリンクもありますので、併せてご活用ください。
「継代培養、培地作成、凍結保存の方法」のページは以下から
http://mcc.nies.go.jp/method/method_j.html「微生物株取り扱いについて（初心者用）」のページは以下から
http://mcc.nies.go.jp/manual_for_beginners/manual_for_beginners_j.html

●「微生物系統保存施設 技術動画」として、NO. 001～005 の動画を「国立環境研究所動画チャンネル」から公開しました。今回は培養株の植え継ぎ方法に関する動画をまとめて公開しています。動画の下の「もっと見る」をクリックすると動画の解説文が表示されます。
微生物系統保存施設 技術動画 NO. 001 滅菌操作と植え継ぎ方法
https://www.youtube.com/watch?v=0cBK4_qXVaw
微生物系統保存施設 技術動画 NO. 002 細胞懸濁液の接種方法
https://www.youtube.com/watch?v=f5yxev7yO0k
微生物系統保存施設 技術動画 NO. 003 寒天培地培養株の植え継ぎ方法 ー細胞の分取ー
https://www.youtube.com/watch?v=_VqwrSGAUnI
微生物系統保存施設 技術動画 NO. 004 寒天培地培養株の植え継ぎ方法 ー細胞の接種ー
https://www.youtube.com/watch?v=CzdeSmd9lJI
微生物系統保存施設 技術動画 NO. 005 シャジクモの植え継ぎ方法
https://www.youtube.com/watch?v=xzncBLba_Ak●「藻類・プロティストムービー」として、NO. 001～004 の動画を「国立環境研究所動画チャンネル」から公開しました。動画の下のリンクをクリックすると撮影に使った株の株情報が表示されます。今後も藻類培養株の動画を増やしていく予定です。
藻類・プロティストムービー NO. 001 Volvox aureus (NIES-541)
https://www.youtube.com/watch?v=D0DKVeADVUs
藻類・プロティストムービー NO. 002 Euglena gracilis (NIES-48)
https://www.youtube.com/watch?v=3PE0-nt8BSQ
藻類・プロティストムービー NO. 003 Karenia mikimotoi (NIES-2411)
https://www.youtube.com/watch?v=HVVZJe_dBU0
藻類・プロティストムービー NO. 004 Chlorarachnion reptans (NIES-624)
https://www.youtube.com/watch?v=WKfn5-VBYf4━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━NIES 株トピックス
MALDI-TOF MS を用いた Microcystis aeruginosa 株のタイピング━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━

MALDI-TOF MS とは、マトリックス支援レーザー脱離イオン化法(MALDI)と飛行時間型質量分析法(TOF MS)を組み合わせた手法で、近年、バクテリアなどの微生物の迅速同定技術として注目されています。本手法で得られる微生物株由来のタンパク質パターンに基づいて、種や種以下のレベルでの識別が高い再現性をもって可能なこと、またランニングコストが１検体あたり約 50 円と安価なことから、バクテリアのカルチャーコレクションにおける種同定や株のタイピング、そして臨床微生物検査等で広く使われています。
今回の NIES 株トピックスでは、世界ではじめて、本手法をシアノバクテリアに適用したSun et al. (2016)の研究を紹介します。Sun らは、まず全ゲノムが決まっている Microcystis
aeruginosa (NIES-843)を用いて、最適な分析条件の検討と主要なリボゾームタンパク質の同定を行いました。これを基に、様々な環境から分離された 55 株の Microcystis 株（いずれも NIES 株）について、バイオマーカーとして選定した 13 のリボゾームタンパク質の出現パターンの比較解析を行いました。その結果、55 株を 47 タイプに識別でき、クラスター解析で 5 つの主要グループに類別できました。これは有毒株を多く含む 2 グループと無毒株のみからなる 3 グループで、このグルーピングの結果は、Tanabe et al. (2007)の 7 つのハウスキーピング遺伝子を用いた MLST (Multi Locus Sequence Typing)解析の結果とよく一致していました。
本研究により、MALDI-TOF MS がシアノバクテリアの種内分類群の識別や株のタイピングに有効な方法であることが示されました。従来の遺伝子解析と比べて、より簡便に、低コストで、短時間に同等の結果を得ることが可能なことから、今後、アオコのモニタリングへの利用なども期待されます。
Sun, L. W., Jiang, W. J., Sato, H., Kawachi, M., & Lu, X. W. (2016). Rapid Classification
and Identification of Microcystis aeruginosa Strains Using MALDI–TOF MS andPolygenetic Analysis. PloS one, 11(5), e0156275.
http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0156275
MALDI-TOF MS の原理や活用方法についてのレビューは以下から
https://www.jstage.jst.go.jp/article/massspec/56/3/56_3_83/_article/-char/ja/
http://www.eiken.co.jp/modern_media/backnumber/pdf/MM1204_02.pdf━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━NIES 株を使った論文 (2016 年 5～9 月分)━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━

当施設から提供された NIES 株を使って出された研究成果が次々と発表されています。
2016 年に出された成果論文リストとリンク情報は以下から
http://mcc.nies.go.jp/07information/reference2016_j.html━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
新規公開微生物株 (2016 年 5～9 月分)━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
2016 年度 9 月までにご寄託頂いた 11 株について、データベースへの登録と培養状態の確認作業が終了して、みなさまにご利用頂けるようになりました。
2016 年度の新規寄託株リストは以下から
http://mcc.nies.go.jp/07information/07strain2015_j.html━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━お知らせ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━●以下の 7 株で新たに全ゲノムやオルガネラゲノムが解読されました。
NIES-88 Microcystis aeruginosa
NIES-981 Cyanobium sp.
NIES-2202 Chlamydomonas applanata
NIES-2207 Chlamydomonas asymmetrica
NIES-2212 Chlamydomonas debaryana
NIES-2242 Chlamydomonas sphaeroides
NIES-3754 Fischerella sp.
●以下の 2 株が新たに無菌化されたました。
NIES-850 Pseudochattonella verruculosa [2016 Aug]
NIES-2412 Acaryochloris marina [2016 Aug]
●遺伝子解析や形態観察に基づいて、以下の NIES 株の学名を変更しました。
NIES-504 Phormidium foveolarum → Leptolyngbya sp.
NIES-2122 Phormidium ambiguum → Leptolyngbya sp.
NIES-2129 Plectonema calothricoides → Leptolyngbya sp.

NIES-558 Chattonella marina var. antiqua → Chattonella marina var. marina
NIES-73 Dolichospermum flos-aquae → Sphaerospermopsis kisseleviana●属の修正や新設により、以下の NIES 株の学名を変更しました。
NIES-40 Anabaena affinis → Dolichospermum affine
NIES-41 Anabaena circinalis → Dolichospermum circinale
NIES-806, 835 Anabaena compacta → Dolichospermum compactum
NIES-833 Anabaena lemmermannii → Dolichospermum lemmermannii
NIES-815,816,817,834,

1723

Anabaenaplanctonica→Dolichospermum

planctonicum
NIES-824, 1724 Anabaena smithii → Dolichospermum smithii
NIES-76 Anabaena spiroides → Dolichospermum spiroides
NIES-2285, 2286 Klebsormidium flaccidum → Klebsormidium nitens
NIES-966, 1369 Glaucocystis nostochinearum → Glaucocystis oocystiformis
NIES-1961 Glaucocystis nostochinearum → Glaucocystis miyajii
NIES-2141 Glaucocystis nostochinearum → Glaucocystis geitleri━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
第 1 回 藻類培養トレーニングコース開催報告━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
2016 年 9 月 1 日に、当施設におきまして、第 1 回 藻類培養トレーニングコースを開催しました。今回は 4 名の参加者をお迎えし、講義の後に、培地作成、藻類培養株の生育検査方法、植継ぎ方法について実習形式で学んで頂きました。コースの合間に施設見学や細胞単離方法のデモを行い、質疑応答と意見交換で終了、となりました。講義で使用した動画の一部は「微生物系統保存施設 技術動画」として公開しています。
今回のトレーニングコースには多数の方にご応募をいただきました。年２回くらいのペースで、今後は受講人数も増やして開催する予定ですので、今回参加頂けなかった方は、次の機会に是非ご応募ください。なお次回のトレーニングコースについては、来年１月のメールニュースでご案内する予定です。

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メールニュースは 1、5、9 月月末に発行します。
過去のメールニュースは以下からhttp://mcc.nies.go.jp/07information_j.html#mail_news━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
メールニュースの受信停止は、mcc@nies.go.jp までご連絡ください。
ご質問、ご意見は、mcc@nies.go.jp までご連絡ください。
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━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━発行
国立研究開発法人国立環境研究所
微生物系統保存施設
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MCC Mail News No. 3 (2016.9.30 発行)━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━