わが国の指定難病とOrphanet登録疾患
鎌谷 洋一郎
東京大学新領域創成科学研究科

難病と対応するOrphanetコードの取得
ddrareによる難病英語病名

野田班ICD-10コード

文字列マッチ率の高いOrphanet病名を取得

ICD-11 coding tool（公式）を用いてICD-11
コードを付与OMIMコードから責任遺伝子を取り出し、概要・診断基準等、並びに臨個票と照合してマニュアル・キュレーション

OrphanetからリンクするOMIMコードについて、IRUD対応表と照合してチェック

Orphanet 3914病名のうち881病名をカバー
Orphanet: ORDO_en_3.1.owl
OMIM: 2021-05-12にダウンロード

一意のOrphanetコードがつかない難病（１）• 6:パーキンソン病• 13:多発性硬化症／視神経脊髄炎• 18:脊髄小脳変性症（多系統萎縮症を除く。）• 48:原発性抗リン脂質抗体症候群• 66:IgA腎症• 68:黄色靭帯骨化症• 69:後縦靭帯骨化症• 70:広範脊柱管狭窄症• 72:下垂体性ADH分泌異常症 （SIADHの対応コードがない）• 73:下垂体性TSH分泌亢進症

一意のOrphanetコードがつかない難病（２）• 74:下垂体性PRL分泌亢進症• 76:下垂体ゴナドトロピン分泌亢進症• 82:先天性副腎低形成症 （SF-1/Ad4BP異常症のコードがない）• 92:特発性門脈圧亢進症• 96:クローン病• 97:潰瘍性大腸炎• 98:好酸球性消化管疾患 （N-FPIESの対応コードがない）• 101:腸管神経節細胞僅少症• 116:アトピー性脊髄炎

ICD-10コードによる分類

OrphanetコードのICD-10分類をもとに、指定難病の対象となっているかどうかの割合がICD-10
章別にばらつきがあるか確認した。
下記疾患群は比較的難病がよくカバーしているとわかった。
• 血液及び造血器の疾患並びに免疫機構の障害（D50－D89）• 内分泌，栄養及び代謝疾患（E00－E90）• 神経系の疾患（G00－G99）• 呼吸器系の疾患（J00－J99）

別の難病に同じORPHAコードがアサインされる（１）notationlabel

alternative_term

病名1

病名2

ORPHA:34587

Glycogen storage disease due to
LAMP-2 deficiency

Danon disease

19:ライソゾーム病
ダノン病（Danon病）

ORPHA:365

Glycogen storage disease due toacid maltase deficiency

Pompe disease

19:ライソゾーム病
ポンぺ病（Pompe病）

31:ベスレムミオパチー
ダノン病（Danon病）
256:筋型糖原病
筋型糖原病II型（ポンぺ（Pompe）病）
159:色素性乾皮症
多発性スルファターゼ欠損症

19:ライソゾーム病
マルチプルサルファターゼ欠損症

ORPHA:585

Multiple sulfatase deficiency

ORPHA:104

Leber hereditary optic neuropathy

LHON|Leber optic atrophy

21:ミトコンドリア病
レーバー病

302:レーベル遺伝性視神経症

ORPHA:75840

Congenital muscular dystrophy,
Ullrich type

Scleroatonic musculardystrophy|UCMD|Ullrich disease

29:ウルリッヒ病

113:筋ジストロフィー
Ullrich型先天性筋ジストロフィー

ORPHA:98911

ORPHA:98909

Distal myotilinopathy

Desminopathy

ORPHA:3453

Autoimmune polyendocrinopathy
type 1

ORPHA:567

22q11.2 deletion syndrome

ORPHA:634

Netherton syndrome

Desmin-related myofibrillar
myopathy

APECED syndrome|HAM syndrome

Bamboo hair syndrome|ComèlNetherton syndrome|NS30:遠位型ミオパチー
筋原線維性ミオパチー（myofibrillarmyopathy）
30:遠位型ミオパチー
筋原線維性ミオパチー（myofibrillar
myopathy）

113:筋ジストロフィー
ミオチリン異常症

113:筋ジストロフィー
肢帯型筋ジストロフィー2R

65:原発性免疫不全症候群
カンジダ感染と外胚葉形成異常を伴う
83:アジソン病
自己免疫性多腺性内分泌不全症
I型（HAM症候群）（APECED）
65:原発性免疫不全症候群
胸腺低形成症候群203:22q11.2欠失症候群

65:原発性免疫不全症候群
ネザートン（Netherton）症候群

159:色素性乾皮症
ネザートン症候群

別の難病に同じORPHAコードがアサインされる（２）notationlabel

alternative_term

病名1

病名2

ORPHA:79259

Glycogen storage disease due toglucose-6-phosphatase deficiency
type Ib

65:原発性免疫不全症候群
糖原病Ib型

256:筋型糖原病
肝型糖原病Ib型グルコース-6-ホスファターゼトランスポーター異常症

ORPHA:79477

Griscelli syndrome type 2

65:原発性免疫不全症候群
Griscelli症候群2型

164:眼皮膚白皮症
グリセリ(Griscelli)症候群

ORPHA:352687

Congenital muscular alphadystroglycanopathy with brain andeye anomalies

ORPHA:157846

Neuroferritinopathy

ORPHA:157850

Pantothenate kinase-associatedneurodegeneration

Lissencephaly type 2 with muscular 113:筋ジストロフィーand ocular involvement|MDDGA
α-ジストログリカン異常症

137:限局性皮質異形成
古典型滑脳症119:アイザックス症候群
NBIA3（神経フェリチン症）

121:神経フェリチン症

NBIA1

119:アイザックス症候群
NBIA1

9:神経有棘赤血球症
パンテトン酸キナーゼ関連神経変性症

Chédiak-Higashi disease

164:眼皮膚白皮症
チェディアック・東(ChediakHigashi)症候群

65:原発性免疫不全症候群
チェディアック・東（ChédiakHigashi）症候群

ORPHA:167

Chédiak-Higashi syndrome

ORPHA:375

Anti-glomerular basement
membrane disease

221:抗糸球体基底膜腎炎

220:急速進行性糸球体腎炎

ORPHA:366

Glycogen storage disease due toglycogen debranching enzyme
deficiency

Cori disease|GSDIII

256:筋型糖原病
肝型糖原病III型

256:筋型糖原病
筋型糖原病III型（コーリー（Cori）病）

ORPHA:367

Glycogen storage disease due toglycogen branching enzyme
deficiency

Andersen disease|GSD type IV

256:筋型糖原病
肝型糖原病IV型

256:筋型糖原病
筋型糖原病IV型（アンダースン（Andersen）病）

ORPHA:1872

Cone rod dystrophy

301:黄斑ジストロフィー
90:網膜色素変性症0 錐体ジストロフィー、および錐体杆体杆体錐体ジストロフィ
ジストロフィー

遺伝子の重複について• OrphanetからリンクするOMIM遺伝子の検討• Phenotype mapping key 3以上を対象• key 1はassociationのみ• key 2はlinkageのみ• key 3は、原因バリアントが分子生物学的に解明されている• key 4は、多数の遺伝子が絡むdeletion/duplicationの関与が示されている• 遺伝モードが明記されているもののみを対象（OMIMにはsusceptibility
geneのみならずsomatic mutationも入力されている）• のべ1110の常染色体劣性遺伝する遺伝子• のべ648の常染色体優性遺伝する遺伝子• のべ114のX連鎖する遺伝子• 161遺伝子が、異なる難病に跨り2回以上報告されていた• そのうち44遺伝子は、OMIM IDは同じ。119遺伝子が、異なる難病、異なるOMIM IDで、同じ遺伝子

CFH gene variations• 65:原発性免疫不全症候群• Factor H欠損症の原因。
• homozyogousまたはcompound het？

• 109:非典型溶血性尿毒症症候群• 複数ある先天性aHUSの原因遺伝子の一つ。
• hetの場合？

• 223:一次性膜性増殖性糸球体腎炎• MPGN type IIの原因。homoの場合とされる• 加齢黄斑変性症• コモンディジーズ。リスクの小さいバリアントの場合？
• Y402Hは1コピーでリスク2-4倍（2コピーで3-7倍）

現状、単一遺伝子の証拠がない難病• mapping key≥3で遺伝モードが記載された遺伝子のOMIMレコー
ドとのリンクがない難病• 116/333あった。

謝辞• 慶應大学 小崎健次郎教授• 奈良県立医科大学 野田龍也准教授