Newsletter for Chem-Bio Informatics Society Members
情報計算化学生物学会

広報誌

No.1 2009 （2009 年 1 月 16 日発行）

年頭のご挨拶
新年、明けましておめでとうございます。ＣＢ
Ｉ学会に集っ てくださる 皆様におか れましても、
気 持 ち も 新 た に ２ ０ ０ ９ 年 の ス タ ート を 切 ら れたことと存じます。本年も、論理的創薬研究と
生 命 シ ス テ ム の 解 明 を 中 心 に 据 え た、 異 分 野 が
渦 巻 く 躍 動 感 の あ る 活 動 を 展 開 し てい き た い と思っています。
昨 年 は 核 内 レ セ プ タ ー に 焦 点 を 当て て 、 年 会と 月 例 講 演 会 を 意 識 的 に 企 画 し て きま し た 。 講
演会の回数を重ねるごとに、メタボリックシン
河合隆利 CBI 学会会長

ドロームのみならず、ガンや神経変性疾患、薬物 代 謝 な ど 広 い 分 野 に わ た る 核 内 レセ プ タ ー の関与を再認識するとともに、そのリガンドとな性を持った活動をしている学会です。同分野のる脂溶性物質の新たな生理活性と構造や物性、
時 間 的 空 間 的 局 在 の 妙 に た め 息 を つく こ と も 少研究者が集まって研究成果を発表しあう情報交
換の場以上の有意義な機会を韓国大会に準備すなくありませんでした。皆様の中にもご自身のるつもりです。渡航費の負担が大きくなく、移研 究 に 少 な か ら ず ヒ ン ト を 与 え て くれ る 講 演 があったものと推察しております。本年も毎回幅動に要する時 間的損失も 少ないすぐ お隣の外国、韓国へぜひ皆さんもご参加ください。

広い領域のテ ーマを取り 上げていく 予定ですが、で き る だ け 多 く の 講 演 会 に ご 参 加 いた だ き 、 知
識 と 人 脈 の 幅 を 広 げ て い く こ と に 活か し て い た
だければ幸いです。
本年の年会は 11 月 4 - 6 日の３日間、韓国で行います。関心領域がたいへん近い韓国の K SB S B
学会と合同で、ソウルもしくはその近郊で開催の予定です。ＣＢＩ学会は目的にむかって方向目末筆となりますが、この一年が会員のみなさ
まにとって、すばらしい年となることを願っております。本年もどうぞよろしくお願いいたします。
２００９年１月１６日
ＣＢＩ学会会長
河 合 隆 利 （ エ ー ザ イ 株式 会 社 ）次

年頭のご挨拶

ＣＢ Ｉ学 会会 長C B I 学会、2 0 0 9 年度に向けての展望

神沼二眞（C B I 学会事務局担当理事）

河合 隆利（エ ーザ イ）

2 0 0 8 年大会報告

大会実行委員長

岡崎康司（埼玉医科大学

ゲノム医学研究センター）

１
２
６

大会 S 3 セッション「オミックスと経路網：核内受容体とメタボリック症候群および関連疾患」報告水野 洋介（埼 玉医 科大 学

ゲノ ム医 学研 究 セン ター ）８

今後の講演会予定

CBInews は講演会で配布しておりますが。webでもご覧いただけます。
http://www.cbi.or.jp/cbi/CBInews/cbi_news.html

CBI NEWS No.1 20091

CBI 学会、 2009年度に向けての展望

はじめに

2009-2010 年の展望

年が改まりましたので、事務局からもご挨拶を兼ねたでは、これからの 2年は、どのように展開されていくお知らせをさせていただきます。昨年は、とくに後半にのでしょうか？事務局から見ますと、来年は学会と名称なって、経済や社会ともに厳しく暗い話題が多くなりまを変更してから 10 年めとなる年であり、2010 年は、会した。そこで、思い出しました話があります。ある時、の活動が開始されてから 30 年になる年であります。会

カエルがミルクの壷に落ち、溺れそうになってしまいま

としては、
当然世代交代が大きく進むべき節目の時期でしたが、必死に足を動かしているうちに、ミルクがヨーあり、学会としても離陸期から巡航状態に移行していな

グルトになって固まったので外にでられた、という話でければならない時期にあると、考えております。それゆす。逆境にあっても、努力を諦めてはいけないというユえ、「2010 年をめざして、諸活動を発展的に継続していダヤ人の例え話だそうです。私たちも、本年は状況がよけるような体制を整えておく」ということが、事務局のくなることを願いながら、希望を失うことなく前に進ん

当面の基本使命と考えております。

でいかなければならないと考えております。

幸いと言いますか、CBI 学会は、2000 年から 2008年

さて、いつもお話していることですが、CBI 学会は、の間に、多くの活動を実験的に行ってきました。例えば

生命科学とITという、猛烈に進歩している科学と技術に大会にしても、さまざまな形式を試みてきました。学会

活動の基盤を置いています。したがってその運営は、2誌についても、
オンライン英文誌という難度の高い目標

匹の荒馬を同時に乗りこなすロデオのごとく難しく、先に挑戦し、またそれとの関係で和文誌の刊行も開始しまを見るというような余裕はいつもほとんどありません。

した。また、Solutionガイドや、翻訳本ではありますが、

それでもなんとか2年ぐらいは先を見ながら諸事計画す

単行本の自主刊行も試みております。
研究講演会においるように努めています。しかし、そのような活動を無事ては、Drug Discoveryへの計算機の応用という不易の課に終えると、また、新しい企画に頭を悩ますことになり題とともに、Post Genome時代に適応するための新しいます。そこで以下では、2010 年を睨みながら、事務局

話題も積極的に紹介してきました。
そのような活動を通としてどんな企画を考えているかをご紹介し、
会員の皆

じて、
「CBI 学会の Image」も序々に形づくられてきた様のご意見やご提案をいただく、呼び水とさせていただ

ように思われまし、
外部にも認知されてきたように思わきます。

れます。以下、多少個別に状況をご説明します。

昨年の大会の意義

大会と学術誌の刊行

昨年度の事務局は、「核内受容体と生活習慣病」を本年の年次大会は、国外での共同開催という、これもテーマとした国際シンポジウムを兼ねた大会の開催に焦初めての試みですが、それが終わった2010年以後は、国点を合わせて、エンジンを全開していました。このため

際シンポジウムのような、あるテーマに集中した研究集

スタッフ一同、
オーバーヒートに近い状態となっていま

会としてのシンポジウムと、年次大会とは、明確に分離

したが、
幸い、
実行委員長の岡崎康司先生と委員の皆様、して実行する方がよいのではないかという感触をえてい河合会長、役員の皆様、財務面で支えてくださいました

ます。そして年次大会の開催は、「よい意味での年中行

企業の皆様、その他会員や会に参加してくださった方々事」でもよいのではないかと考えています。

など、多くの皆様のご尽力により、無事にこれを終える

Journal の刊行は未だ困難な点がいろいろあります

ことができました。
この大会の意義は人によっていろいが、担当されている刊行委員、編集委員の方々が努力さろであろうと思いますが、事務局としましては、CBI学れて下さっておられますので、いずれ知名度や投稿数も会の７つの関心領域のうちの第6分野「疾病と制御のモ増大していくだろうと期待しております。また、少なくデル」
を本格的に立ち上げるための大きな一歩になった

とも雑誌の形式や刊行の仕事としては、すでに形ができと考えております。すなわち、この大会の後の 11 月 19てきたように思われます。

日に開催された Modeling & Simulation 関連の研究講

以上のように、通常の学会では最も基本的な活動であ演会を含め、現在掲げている活動方針である、Pathway/

る、年次大会の開催と学術誌の刊行は、かたちができて

Network to Disease に、どのように Approachすべきかきたと言えると思います。すなわちこれらの活動は、財が、はっきりしてきたように思われます。

務的な裏づけがあれば、継続的に発展させていかれる事業となったのではないかと考えています。

2

CBI NEWS No.1 2009

研究講演会したがって、研究講演会に関するご意見、ご提案があ上記以外の活動で大きいのは、月例の研究講演会でる方は、事務局にその旨連絡しておいていただければ、す。その運営においては、常に不易というべき「医薬品お話を聞く機会をつくることにしておりますので、ぜひ開発への情報計算技法の応用」という課題と、流行とも気軽に声を掛けてください。とくにSolution系の法人会いうべき「ゲノム革命に象徴される生物医学の急激な進員の関係者の方のより積極的なご意見をお待ちしています。

歩に適応していく」ための話題、という２つの目標のバランスをとっていくことが求められています。
事務局で考慮すべき課題

は、そのように心がけているのですが、実際の企画には、

それでは主に研究講演会を企画するために、考慮しな

相当の時間と労力がとられるため、どうしても企画がければならない現在の課題は何でしょうか？企画のため偏っていると思われる時期が生じてしまいます。
とくにには情報収集が欠かせません。現在、事務局でWatchし

最近は、長い歴史のある情報計算技法分野で魅力的な話ている主な情報は、Nature, Drug Discovery Today,

題を提供できるような企画をすることが、事務局としてNature Reviews Drug Discovery, BioIT World、は難しく感じており、適切な企画が提案されるのを待っ

Cambridge Health Institute の Seminar、Keystoneていることが多くなっています。

Symposia、NIH の Seminar などですが、NPR（米国

こうした状態を、「事務局は CBI学会の原点である計のラジオ放送）のScience Fridayのような一般向きの番

算創薬関連の話題を軽視している」と受け取られること

組や、Biomedical Computation Review (National NIH

もあるようですが、「事務局が軽視している」というのCenter for Biomedical Computing が出している、物理は、まったくの誤解であり、そうした提案をする余力が系の生物計算専門（季刊）誌 ) などもなかなか興味深い

事務局にはなく、それを補っていただけるような具体的情報源です。国内情報では、ファルマシア、化学と工業、な提案がむしろ少ない、というのが真相です。この点を日経のBTJジャーナルなどです。新聞は、日経産業新聞、含め、研究講演会のテーマは常に不足しており、事務局

日本経済新聞などです。これでは、到底十分とは言えまとしては具体的な提案をいつもお待ちしている状況にあせんが、これだけでも常に見ているのは結構大変です。

ります。ただ事務局が、「あちらこちらですでに話され皆様が事務局でもアクセス可能なよい情報源をご存知でている講演者や話題は、CBI学会としては積極的には取したら、ぜひ教えていただきたいところです。また、研り上げなくてもよいのではないか」、と考えていること

究講演会やCBI学会の活動の企画に役立ちそうな情報をは事実です。しかし、実際に具体的に提案された話題に随時提供いただけましたら、大変助かります。

対応しなかったというようことは、
これまで記憶にあり皆様もすでにご存知かと思いますが、これらの情報源ません。この点、皆様の積極的な提言をぜひお願いいたからの情報で研究講演会などの企画に反映させるべきとします。

思われるTrendを列挙してみます。

企画のための会合（１）超高速sequencer開発と$1,000.ゲノム時代の到来、研究講演会を企画するためには、情報収集が欠かせま（２）non-coding RNA、RNAi、epigenetics など、遺伝せん。そうした情報収集として事務局が試みているの子発現機構の複雑さに関する相次ぐ発見、は、研究講演会後の非公式の会合です。これまでの研究（３）新型万能細胞Induced Pluripotent Stem (iPS)Cell

講演会の企画は、
主に製薬企業の研究者の意見を収集しの作成とその利用、て進めてきました。
それを少し組織的にするために、「創（４）GPCR の構造決定が相次いでいること、

薬方法論懇談会」という（非公式の）組織を設置してい（５）情報計算資源を特定の重要な医学問題の解決に集ます。しかし、Solution系の企業会員からのご意見やご中するという、caBIG のような研究戦略、希望を聞くことも重要と考えております。以前は、こう（６）いわゆる Systems Biology と呼ばれている

した懇談会を独自に招集していたのですが、皆様お急がPathway/Network の Modeling ＆ Simulation技法

しく、出席していただくのが難しいため、「月例の研究への関心の高まり

講演会後に非公式に集まれるメンバーだけでも集まっていただく」、というかたち（非公式会合）にしましたと

これら以外にも興味深い話題はあると思われますが、ころ、気軽にご意見をいただくことができるようにな問題は、こうした新しい潮流への適応について語っていり、だんだん時間的な余裕をもって研究講演会を企画でただける適切な講演者を探すことです。例えば、「RNA

きるようになってきました。ただし、非公式会合とは言に関する新しい知見を医薬品開発に生かす」というよう

え、内容によっては、議事録にして、役員に閲覧していな講演会を企画したいと、この2年ほど考えてはいたの

ただいたり、
さらにより広く会員にお知らせしたりするですが、事務局では適当な講演者が（国内では）見つけこともあります。ただ事務局としては、どなたが研究講られず、いまだに実現していません。いずれにしても、演会に参加されるかは、直前でなければ知ることができ

Trendy な話題に関する研究講演会について、具体的なず、ご相談できる方が出席しておられるかどうかは、講提言をしていただければ、大変有難いと思います。

演会の日が近づくまでわからない、ということが多いのです。

CBI NEWS No.1 2009

3

残されている事業課題
年次報告にも毎年書いていることですが、CBI学会の活動として最後に挙げているのが、教育と研究開発事業

存度の増大と、それによる研究人口の増大と研究の加速という、動きと連動しているように思えます。下記はその一例です。

です。このうち教育とは、CBI学会参加者の裾野を広げることを目標に、Tutorial講座を開催することやそのた・Philip E. Bourne, J. Lynn Fink, Mark Gerstein, Open Access:

めの教材を作成する、というような活動を意味していま

Talking Full Advantage of the Content, PLoS Computational

す。系統立ってはいませんが、そうした活動は、継続しBiology 4, 1-3, March 2008.

ております。研究開発事業とは、CBI学会のウエブサイ

・ R. Nuzzo, The Golden Age of Public Databases: Speedingト（http://www.cbi.or.jp/cbi/jigyou/about_jigyou.html）

Biomedical Discovery, Biomedical Computation Review, Fallにも提示してある、CBI Research Initiative や CBI

2008, pp.8-16.

Grand Challengeの具体化を意味します。このウエブサ・S Houlton, Wellcome boost for open-access chemistry, Nature

イトが作成されたのは、2002 年頃ですが、そこに書かReviews Drug Discovery, 7: 789-790, 2008.

れている理念は、ほとんど変化していません。しかし具体的な目標と実現手段は少しずつ変わってきています。

こうした動きは、さらに「生物医学の特定の、重要な

この計画の難しさは、裏付けとなる資金がないこと、こ領域の問題解決にIT資源と人材を集中する」という戦略の事業の必要性を、
とくに企業会員が感じていないことと関係しているように思われます。
その最も顕著な例はにあると思われます。

NIHによるcaBIG（The cancer Biomedical Informatics

しかし、個人的には、このような目標に挑戦すること

Grid Project, https://caBIG.nci.nih.gov）ですが、網羅

が、CBI学会が時代を先導するためには、どうしても必的ながん研究の一部である Epigenomics 計画において要だと考えております。とくに暗い話題が多い現在、明も 、「 こ う し た 網 羅 的 な プ ロ ジ ェ ク ト に は 強 力 な

日への挑戦課題を提示することが、学会に長く関わってbioinformatics の基盤 platform が必要であるから、こいる者の役割の一つではないかと考えております。
これの計画の初期の段階ではcentral relational databaseとについては、1 月および 3 月の Workshop の形式をとっ

既存のデータにウエブからアクセスできるようなインた研究講演会から紹介していきたいと考えております。

ターフェースを構築することを優先しなければならな

そこでは、医薬品開発における産学（官）の連係や、若い」と述べられています。

手研究者が活躍していただける機会をつくりだすことなど、今日的な問題を意識しております。

The American Association for Cancer Research Human
Epigenome Task Force and European Union, Network

研究者 Communityの構築
以上さまざまな活動や機会を通じて、私たちは、C h e m - B i o I n f o r m a t i c s に関 心 の あ る 研 究 者のof Excellence, Scientific Advisory Board, Moving
AHEAD with an international human epigenome
project, Nature, 454: 711-715.

Communityをつくっていくことに寄与したいと考えております。具体的には、そのための情報交換環境を整備

このような戦略的な動きは、がんに限らず、生物医学することですが、
最近こうした試みに関する話題が多くのさまざまな重要領域ですでに始まっているように思わ見かけられるようになりました。下記はその一部です。

れます。私たちが提案している、昨年の大会のテーマにも関係した「核内受容体とメタボリック症候群に情報計・M. Woldrop, Wikinomics, Nature, 455: 22-25, 2008.

算からアプローチする」という計画もその一つの例で・D. Howe et al., The Future of biocuration, 455: 47-

す。この大会に招聘されたドイツの肝臓モデル計画の50, 2008.
・Jon W. Huss III et al., A Gene Wiki for Community

リーダーの一人である Matthias Reuss（University of
Stuttgart）教授は、「現在、メタボリック症候群に国がAnnotation of Gene Function, PLoS Biol 6(7): e175, July 8

連係して（Systems Biology という枠で）取り組む計画

2008

が欧州で検討されている」と語っていました。こうした・L. D. Stein, Towards a CyberInfrastructure for Biological

動きも、概念としては、当たり前と言えば当たり前です

Sciences: Progress, Visions and Challenges, Nature Review

が、実行は（政治と同じで）なかなか難しいと思われます。

Genetics 9: 678-688, Sep. 2008
・A. J. Williams, Internet-based tools for

現在のCBI学会の事務局は、お金なし、要員なしですが、比較的気楽に動けるアカデミアの若手研究者の協力

communication and collaboration in chemistry, Drugが得られれば、井戸の水を汲みだすときの呼び水にあた

Discovery Today, 13(11-12): 502-506, 2008

るような、最初のコンテンツの作成は可能だと思いま・T. Slater, C. Bouton and E. S. Huang, Beyond data

す。また、CBI学会が研究者同士の協力の触媒の役割を

integration, Drug Discovery Today, 13(13-14): 584-

果たすことも、十分可能と思います。このことは、CBI

589, 2008.

Grand Challengeと関係させて、もう少し具体的に提案していくつもりです。

こうした動きは、Public Database の充実とそれへの依4

CBI NEWS No.1 2009

頭の痛い財務問題

増え、
いまや公的な施設として復活できそうにまでなっ

最後にどうしても避けて通れない問題を提示させていている、という話です。これまでのCBI学会の運営でも、ただきます。それは活動の財源の問題です。交響楽団ともう存続できないと感じたことが幾度もありました。
そか各種の NPO でも、事情は同じと思いますが、有意義

ういう時、不思議に救いの手が差し伸べられてきましな企画を考えるのは楽しいことですが、その裏づけとな

た。CBI学会が今日まで存続できたことは、そうした多る財源について考えるのはそう簡単ではありません。
昨

くの手のお陰です。しかし、30年近く存続できたという

年、オーケストラの経営という珍しい本が出されたのでこと自体、慣れを生み、考えが固定していることがある

読んでみたのですが、あまり参考にはなりませんでし

ようにも思われます。それを積極的に探して、打破し続た。CBI 学会の諸活動でも、意外と見えないところで、けていかないと、会の継続的な運営は難しくなってしま

経費は発生しています。
事務局がどこかの研究機関に寄うと思います。

生するなら、話は別ですが、独立している場合、不断の事務局として希望をもっているのは、
最近は意見を寄工夫が要求されます。この点に関しても、よいアイデア

せてくださる方が多くなったことです。
これは事務局とや手伝ってくださる方が出てきてくださることを期待ししては大変有難いことです。本当はblogなどによる、よております。理想を言えば、現在程度の活動を続けるた

り活発な意見交換の仕組みをつくることができればよい

めには、現在より収入が５割程度増えて欲しいのです。

のですが、
いまは、
それに裂く要員の余裕がありません。
このことも含め、学会のウエブサイトは大幅に直したいと考えています。
こうしたことについても協力してくだ

おわりに最初にミルクに落ちたカエルの話をしましたが、まささる方が名乗り出てくだされば、大変有難いと思いまにそれに似た話をお正月のラジオで聞きました。
それはす。末尾ながら、本年が皆様にとりまして良い年になる

経営難に陥り、廃止が目前に迫った、鶴岡市立加茂水族

ことを願っております。

館の話です。館長と館員がなんとかしようと、さまざま
CBI学会事務局担当理事

なクラゲを育てて展示していたところ、次第に来場者が売中
絶賛発

薬づくりの真実

臨床から投資まで

神沼二眞訳

多田幸雄 堀内正監修

神沼二眞（CBI 学会出版）

販売中！ CBI 学会 HP よりご注文いただけます。

http://cbi-society.org/cbi/DDpress/book_DrugDiscovery.html
定価 3,000 円【読者の声】○

以前から気になっていた本の和訳があることを、「ファルマシア」の新刊紹介で知りました。翻訳していただき感謝します。

○

この本を発見されたこと、紹介の重要性を強く認識されたことに敬意を表します。バイオ・ビジネス、ベンチャー・ビジネスに１９８９年ころからグローバルに関わっている身には、認識していることばかりですが、アカデミア、製薬企業の研究者、経営者までが、ほとんど認識していないのが現状ですので、本書の価値は非常に大きく、1000 部は即売り切れになり、増刷になるものと思います。

「出版経緯」の記事

http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20060313/bartfai.html

CBI NEWS No.1 2009

5

2008年大会報告“International Symposium on Pathway/Network to Disease and Drug Discovery Specially
Focused on Nuclear Receptors and Metabolic Syndrome”
2008 年大会
岡崎康司（埼玉医科大学

岡崎康司

大会実行委員長

ゲノム医学研究センター）

大会委員長

はじめに

大会総括

2008 年 10 月 22 日から 24 日の 3 日間にわたって、学上記にある大会趣旨に基づき、従来からのCBI学会の術総合センター（東京）において、情報計算化学生物学

7 つの関心領域を十分に意識した上で、なおかつ 1 つの会（CBI 学会）年会を開催しました。

大きな研究テーマについて考えられるような国際学会を基調講演および招待講演として国内外から総計23名

目指すということで、その実行委員長として小生が任命の方々にご講演頂くことができ、また一般演題（ポスされました。約 1 年半の準備期間をもって、実行委員のター発表）は84演題と、総勢107名の演者の方々にホッ

皆様、CBIの関心領域委員の皆様、ロジスティック委員

トな話題を提供頂き、活発な討論が行なわれました。

の皆様の多大な貢献により、大会テーマで掲げた、「核座長を務めて頂いた諸先生方、そして会員の方々をは内受容体ならびにメタボリック症候群関連」
についてのじめ御出席頂いた 362名の皆様、さらにその他協賛、寄専門家に国内外よりご参加頂き、最先端の話題を提供頂付、機器展などの関係者の皆様方の御協力により、本年くことができました。
これだけの数の専門家に一同にお会は無事閉会することができました。ここに、大会実行

集まり頂けたことはCBI学会としても光栄の至りと考え委員長として心より感謝申し上げます。

ています。今回の大会では、特に大会実行委員会の大会

以下に、年会のご報告とともに趣旨説明などを通して、2008 年大会を振り返ってみたいと思います。

顧問として数々のご助言を頂いた東京大学教授 門脇孝先生、
東京大学教授加藤茂明先生によるところが大きく、ここで改めて感謝の意を表したいと思います。個別

開催趣旨のセッションでは実行委員の先生方が、1ヶ月に 1 度程

現在 C B I 学会は生物医学や創薬への計算

度のペースで集まって討議をした結果すばらしいセッ（Informatics & Computing）技法の応用を学会の重要ションを設けることができ、またすばらしい演者を招待なミッションとしているが、ポストゲノム（シークエン

できたものと思っています。

ス）時代といわれる現在、生物医学や創薬が必要として一番気を使った点は、CBI学会の7つの関心領域であいる情報計算技法は明らかに、拡大変化している。そのる１．分子計算

２．分子認識一つの方向は米国のNIH が主導している、「生物医学のる情報計算技術

４．
ゲノムワイドな実験データの解析

重要な問題領域の解決に情報計算資源を集中する」
とい３．分子生物学におけ５．医薬品研究と毒性研究支援システム

６．疾病メ

うやり方である。「Pathway/Network to Disease &カニズムと制御モデル

７．その他 との関連付けでしDrug Discovery-Specially Focused on Nuclear

た。これらの関心領域との関連を意識しながら、今回のReceptors and Metabolic Syndrome（疾病経路網から

大会テーマである「Pathway/Network to Disease &の疾患と創薬‐とくに核内受容体と生活習慣病に焦点をDrug Discovery -Specially Focused on Nuclear

当てて）」をテーマとするこの大会では、社会的に大きReceptors and Metabolic Syndrome（疾病経路網からな問題となっているメタボリック症候群問題解決に情報の疾患と創薬‐とくに核内受容体と生活習慣病に焦点を計算からの資源や研究者を集中する」という理念を具体当てて）」を実現するために、1 日目から 3 日目までが的に追求することをめざしている。しかし、各テーマはテーマ的にシームレスにつながるように配慮しました。

CBI 学会の７つの関心領域との対応がつくように配慮さ

1日目の午前中は、メタボリック症候群および核内受容れている。この意味で参加者は「Nuclear Receptors」だ

体と疾患に関する包括的な話を、生活習慣病の専門家、

けでなく、生物医学と創薬への情報計算の応用に関心の香川女子栄養大学

ある幅広い研究者を想定している。

1 日目の午後には、核内受容体を中心に、メタボリック

香川靖男先生にご講演頂きました。

症候群との関連などについて各分野の専門家からご講演頂き、2 日目の午前のセッションでは、核内受容体を創薬標的とする計算科学的アプローチやトキシコロジーに

6

CBI NEWS No.1 2009

ついてその分野の専門家に御講演を頂きました。2日目の午後は、
オミックス、
パスウエイ、
ネットワークをテー

優秀賞（the Excellent Posters）

マとした核内受容体の標的あるいはメタボリック症候群
へのアプローチについてご講演頂きました。このセッYoshitake Cho

ションのレポートは本誌 8 ページ（水野 report）参照頂“DEC is a nuclear receptor co-repressor”

きたいと思います。3 日目の午前は、核内受容体の構造解析を用いた創薬的アプローチや創薬標的としての核内受容体についてより実践的な話についてご講演頂き、
午
後のセッションでは、核内受容体を標的とした疾患へのHajime Sugiyama“A New Method for Prediction of Protein-Ligand
Interactions by means of Knowledge Based

アプローチならびにメタボリック関連疾患について御講

Potential”

演頂きました。また、ランチョンセミナーとして 2日目

Masahiro Matsumotoに東京大学教授

門脇孝先生から生活習慣病の分子機

構・遺伝子素因やテーラーメード医療の展望につきご講
演頂き、3日目には東京大学教授

加藤茂明先生よりビ

タミンDの活性化に関与するCYP27B1のビタミンD受“Theoretical study of protoporphyrinogen IX
oxidation mechanism in protoporphyrinogenoxidase”

容体による抑制機構の最新の知見についてご講演頂きま

Yutaka Nakachi

した。また 2 日目の特別講演では、理研オミックスセン“Identification of Novel PPAR gamma Target

ター長の林崎良英先生より、
ゲノムワイドなトランスク

Genes and Response Elements by Integrated
Analysis of ChIP-on-chip and Microarray
Expression Data during 3T3-L1 Adipocyte
Differentiation”
Atsushi Kasuya“Landscapes of Solubility and Metabolic
Stability on Molecular Weight-Lipophilicity
Maps”

ポスター会場風景

Kazunari Iwamoto“Elucidation of the deregulation of G1/S

リプトーム解析についての最先端の報告がなされましtransition induced by DNA-damage at late G1

た。全体を通して、非常に高いレベルの講演と質疑応答がphase”

なされました。

ポスター発表（一般演題）
一般演題としては、従来と同じくCBI関連領域からのポスター応募を募りました。
今回は大会テーマを強調しすぎたあまり、
多少の誤解があった部分もありますが最終的に総計84演題が発表され盛会裏に終了することができました。3 日目の閉会式の場で、河合隆利CBI学会
会長からポスター賞の発表、授賞式があり、受賞者に賞状および副賞を贈呈しました。受賞演題は表の通りです。関係者の方々にお祝い申し上げます。

最後に外国招待講演者の方々から、「とてもinformativeでat受賞式風景かったと思います。本大会の運営にあたっては、CBI学会事務局の皆様の多大な努力と、
東京医科歯科大学

田home な会であった」、「自国でこの会を開催したい」と

中博教授の研究室の大学院生の皆様の貢献が誠に大であいった感想を頂き、とても有意義な年会とすることがでりました。末筆ながらお礼を申し上げます。

きました。外国人研究者間では、異分野での共同研究を

本大会の閉会式に続いて、九州大学教授

本大会での出会いから進めることができたとの声も聞かより、 2009 年度の大会は、2009 年 11 月 4 日（水）～ 6

れました。
シンポジウムでは計算化学者の方々にとって日（金）ソウルで、日韓共同開催となることがアナウン

はなじみのない部分も多々あったかも知れませんが、ポスされました。ぜひ、今後ともCBI学会が国際的な舞台

スターセッションでは議論が盛り上がっており大変良で広く認められ、活発な運営が行なわれることを期待し

岡本正宏理事ています。

CBI NEWS No.1 20097

2 0 0 8 年 C B I 学会年会国際シンポジウム
S 3 セッション「オミックスと経路網：核内受容体とメタボリック症候
群および関連疾患」報告

今回は 2008 年 10 月 22 日から 24 日にかけて「核内受容体とメタボリック症候群国際シンポジウム」というテーマで東京の一橋記念講堂で開催された 2008年CBI学会年会についてレポートする。私は現在、埼玉医科大学 ゲノム医学研究センターにおいて、今回の大会実行委
員長でもある岡崎康司所長・ゲノム科学部門教授の研究室において、
メタボリックシンドロームとの関連性が高い PPAR などの核内受容体を中心に研究活動を行ってVincent Laudet 博士いる。今回の先生方の発表では PPAR を含めた核内受容体やそのリガンドの話、様々な生物種におけるそれらの機能の話など、自分の研究内容とも密接に関連する話
題が多様に盛り込まれていて、非常に刺激的な内容で２番目の講演はフランスEcole Normale Superieure deあった。
以下に本セッションにおける４人の演者のご講

Lyon の Institut de Genomique Fonctionnelle de Lyon

演についてレポートする。

(IGFL)から招かれたVincent Laudet博士によるものであった。Laudet 博士は、ナメクジウオを使って、核内

本セッションは、埼玉医科大学ゲノム医学研究セン
ター所長の岡崎康司教授の講演から始まった。
岡崎教授
は理化学研究所在籍時代には、本年会2日目の特別講演
演者の林崎良英先生の研究室に所属し、当時まだ黎明期であったDNAマイクロアレイの開発に尽力し、また、マウスエンサイクロペディアプロジェクトにおいて国際的受容体に対するリガンドの使われ方についての研究について発表された。ナメクジウオは脊索動物の一種であり、ヒトを始めとする脊椎動物の祖先であると言われている。
今年の６月にナメクジウオのゲノムが解読されたというニュースがあった事もあり、非常に興味深く聴講させて頂いた。

に非常に著名な関連研究者を多数集めた FANTOM1、

ナメクジウオはその成長過程で、プランクトン様の状

FANTOM2 プロジェクトを率いて、大規模に収集され態から水底生活を営む形態に変態するが、その際に甲状たcDNAに機能注釈をつける研究を成し遂げられた。現腺ホルモンが必要であることが分かっている。
甲状腺ホ

在は内科医としての豊富な知識と経験も存分に生かしなルモンは脊索動物や脊椎動物でよく保存された重要なホがら、
メタボリックシンドロームと骨粗鬆症に関する研

ルモンである。甲状腺ホルモンには T3 と T4 があり、こ究を精力的に行っておられる。今回の発表では、間葉系

れらが甲状腺ホルモン受容体に結合する事により機能す

幹細胞が脂肪細胞、
骨芽細胞分化する際の遺伝子ネット

る。ヒトでは T3 の生理活性は強いが、ナメクジウオのワーク制御についての内容であった。間葉系幹細胞は、甲状腺ホルモン受容体である AmphiTR は T3 とは結合

脂肪細胞分化誘導培地や BM P (B one Morp hgen ic

しない。Laudet 博士は最近、甲状腺ホルモン誘導体のProtein)等の刺激により種々の細胞に分化する。脂肪細一種であるTRIAC (Triiodothyroacetic acid)がナメクジ胞、骨芽細胞のそれぞれの方向への分化過程における細ウオにおいて AmphiTRを活性化し、変態を誘導する事

かなタイムポイントでの遺伝子発現レベルを、アレイを

を明らかにした。また、ヒトのエストロゲン受容体はエ使って網羅的に探索した結果、脂肪分化、骨芽細胞を調

ストロゲンと結合して様々な生体機能を調節するが、ナ

節する新たな転写因子を含めたいくつかの遺伝子とそれメクジウオのホモログであるAmphiERは、エストロゲ

らの制御関係が明らかになった。
このうちの一つについンを結合しない事が分かった。AmphiERを活性化するてはノックアウトマウスでは脂肪蓄積が亢進し、骨分化リガンドはナメクジウオでは見つかっていない。
ではナが抑制される事が分かり、
脂肪細胞と骨芽細胞の分化を

メクジウオではエストロゲンはどんな受容体と結合して調節する重要な因子である事が解明された。
この結果は機能するのか？エストロゲンはナメクジウオでは創薬標的を考えていく上での大変重要な知見になると考AmphiERではなく、ステロイド受容体(SR)に作用するえられた。

事が分かった。このように、ホルモンとその受容体は多8CBI NEWS No.1 2009

４番目の講演は東京大学先端研の児玉龍彦教授であった。
核内受容体を中心とした複合体によるゲノム機能の調節を解明するために、
近年はショットガンプロテオー
ム法が用いられる事が多い。この手法は、タンパク質複合体 を消 化し てペ プ チド にま で分 解 して から 、L C MSMS（液体クロマトグラフィー - タンデム質量分析法）により解析を行うことにより、複合体に含まれるタ
ンパク質の構成を一気に解明しようとするものである。
Matthias Reuss 博士

演者はこの手法を用いて、PPAR を中心とした複合体
コンプレックスの解析を行っている。
タンパク質の機能を解析する場合、単に１対１のタンパク -タンパク相互

くの生物種で保存されているが、それらの使われ方は進化の過程で大きく変遷しており、生物種によって異なる事が明らかになった。
これは単に各生物種のゲノム配列が明らかになるだけでは生命現象が解明されない事の一端を示している。
３番目はドイツ Stuttgart 大学の Matthias Reuss 博士による講演であった。Reuss博士は、HepatoSysプロ
ジェクトに深く関わっている研究者である。HepatoSys
は肝細胞を用いたシステムバイオロジーを研究するドイ
ツの国家プロジェクトであり、肝臓の機能をシステムバ
イオロジー的に解析する様々なプロジェクトが平行して進行している。この中で演者らは、解毒代謝機構を研究

作用を観察するよりも、あるタンパク質を中心として形成された複合体が、また別のタンパク質複合体とどのように関係しているかを解析する事が重要になってきている。例えば、PPAR , RXR , RXR 複合体は、スプライ
シングを担うスプライセオソームA複合体や、翻訳調節の機能を持つEIF3e複合体等とも相互作用を行う。ゲノムの機能を調節するタンパク質の解析を行う際には、各タンパク質複合体内構成成分やその変化を観察するだけではなく、これらの複合体間の相互作用を視点に入れた
ダイナミックな視点からとらえる必要がある事を考えさせられた。演者はまた、核内受容体 Coup-TFII による
ChIP アッセイを行ったり、PPAR と RXR を含む複合体がヒストン H3K9や H4K20と相互作用してヒストン
メチル化を調節する事も明らかにし、
ヒストンメチル化

するグループを率いている。
具体的には肝細胞をリファ

酵素機能によって脂肪細胞分化が制御されて糖尿病など

ンピシン処理した細胞を用いて発現アレイにより発現プの病気にも関連する可能性についても発表され、非常にロフィールを作成し、核内受容体の調節ネットワークの興味深い内容であった。

詳細な 解析 を行っ てい る。リファ ンピ シンは 細菌 のRNA ポリメラーゼに作用する抗生物質であり、結核やハンセン病の治療に用いられる薬剤である。本薬剤は、肝臓において薬物代謝酵素である CYP3A4 を誘導した
り、様々な肝機能障害を起こす副作用があるなど、肝臓における代謝作用と密接な関わりがある。演者らは、本薬剤の代謝時における核内受容体を中心とした制御ネッ
トワークを網羅的に描出した。この中で、薬物や毒物な
どの様々なゼノバイオティクスの刺激に応じて、複数の核内受容体が様々な組み合わせで活性化する事により、個々の刺激に応じた特徴的な転写調節が行われる事を体系的に明らかにした。
肝細胞においては代謝解毒作用な
どの様々な重要な機能があるが、核内受容体ネットワー
クの様々なクロスレギュレーションによりその機能がファインチューニングされている事が、今回のグラフィ
カルな発表において強く印象づけられた。

最後に今回の４人の演者は、核内受容体というキーワードの元に、PPAR の役割を含めた脂肪・骨芽細胞分化の制
御、生物種における核内受容体の使われ方の違い、肝臓における解毒代謝機構における核内受容体の機能、
核内受容体複合体やヒストンとの関連性の解析といった、
それぞれ非常にユニークな研究を行い、様々な重要な知見を発表されていた。
無数の刺激によりそれぞれの核内受容体が様々な形で作用し、多くの生物種を通して非常に多岐にわたるゲノム機能の調節を担っている事を改めて意識させられた。
今回勉強させていただいた事を糧にして、私も核内受容体の働きを視野に入れた研究活動を通して、生活習慣病等の改善に少しでも貢献できるようになりたいと願ってやまない。
水野 洋介（埼玉医科大学 ゲノム医学研究センター）

CBI NEWS No.1 20099

今後の講演会予定
1 月 16 日

講演会：Workshop アカデミアにおける創薬と計算化学
計算化学関連の活動懇談会

3 月 12 日

講演会：Workshop 生物医学と創薬を変える IT‐その１
年度末の総会：09 年の活動計画と組織
Bioinformatics関連の活動懇談会

4月3日

講演会：神経機能・病態における細胞シグナルとイオンチャネルの制御と役割
世話人 森 泰生（京都大学）、澤田光平（エーザイ株式会社）
講師：John MacDonald(The University of Toronto)、古谷和春 ( 阪大院医 )、倉智嘉久 ( 阪大院医 )、柚崎通介 ( 慶大医 )、井本敬二 ( 生理学研究所 )、尾藤晴彦 ( 東大院医 )、真下知士（京大院医）、芹川忠夫（京大院医）

4 月‐5 月

講演会：メタボロミクスの実証研究 - 創薬の基礎から臨床まで（仮題）
場所：慶應大学・三田キャンパス講堂
世話人 堀内 正（慶應大学）、藤原 巌（大日本住友製薬）（案）6 月 xx 日

薬物動態：薬物代謝酵素と Detox 防御機構（案）8 月第 1 週

CBI/KSBSB Joint Meeting の Promotion を兼ねた Tutorial/ 講演会

11 月 4‐6 日

BIOINFO

2009（CBI/KSBSB Joint Meeting 2009）11 月 25 日（水） 講演会：
「ケモメトリックスと創薬」（仮題）
世話人：船津公人（東大・工）、藤原 巌（大日本住友製薬）
場所：未定

発行 ： 情報計算化学生物学会(CBI 学会)事務局 〒158-0097 東京都世田谷区用賀 4-3-16イイダビル301
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