Molpro 2021.3.1
ウェブページ
https://www.molpro.net/

バージョン
2021.3.1 (latest commit: 2021/11/23 17:31:27 +0100)

ビルド環境
GCC 9.3.1 (devtoolset-9)
Intel Parallel Studio 2018 update4 (mkl and mpi)
Global Arrays Toolkit 5.8

ビルドに必要なファイル
Molpro_release.tar.gz (ダウンロードした Molpro_release を tar.gz で固めたもの)
ga-5.8.tar.gz
work.patch
work directory のデフォルト値を変更
patch-argos-binput.F
patch-cic-ItfFortranInt.hpatch-common_modules-common_cconf1
巨大 CI 計算用のパラメータ変更
patch-mpp-ga_impl_select1 ノード時のスクラッチファイルのデフォルト設定の変更
patch-common_modules-common_cftypes
patch-util-iom
patch-util-iow
システムのライブラリ側で対応できていない文字列用 findloc のための work-around(CentOS 7 環境で devtoolset-9 を使って shared 設定でビルドしたために必要になった回避策です。)
secure_snprintf.patch
GA のビルドエラー回避
token

ビルド手順
#!/bin/sh
GA_VERSION=5.8
GA_ARCHIVE=/home/users/${USER}/Software/GlobalArrays/${GA_VERSION}/ga-${GA_VERSION}.zip
MOLPRO_VERSION=2021.3.1
MOLPRO_DIRNAME=Molpro_release
PARALLEL=12
BASEDIR=/home/users/${USER}/Software/Molpro/${MOLPRO_VERSION}
MOLPRO_TARBALL=${BASEDIR}/${MOLPRO_DIRNAME}.tar.gz
PATCH_SNPRINTF=$BASEDIR/secure_snprintf.patch
PATCH0=${BASEDIR}/work.patch
PATCH1=${BASEDIR}/patch-argos-binput.F
PATCH2=${BASEDIR}/patch-cic-ItfFortranInt.h
PATCH3=${BASEDIR}/patch-common_modules-common_cconf1
PATCHX=${BASEDIR}/patch-mpp-ga_impl_select
PATCH10=${BASEDIR}/patch-common_modules-common_cftypes
PATCH11=${BASEDIR}/patch-util-iom
PATCH12=${BASEDIR}/patch-util-iow
TOKEN=${BASEDIR}/token
WORKDIR=/work/users/${USER}

GA_INSTALLDIR=${WORKDIR}/ga-temporary
INSTALLDIR=/local/apl/lx/molpro${MOLPRO_VERSION}#-----------------------------------------umask 0022
ulimit -s unlimited
export LANG=
export LC_ALL=C
export OMP_NUM_THREADS=1
cd $WORKDIR
if [ -d ga-${GA_VERSION} ]; then
mv ga-${GA_VERSION} ga_tmp
rm -rf ga_tmp &fi
if [ -d ga-temporary ]; then
mv ga-temporary ga_tmp_tmp
rm -rf ga_tmp_tmp &fi
if [ -d ${MOLPRO_DIRNAME} ]; thenmv ${MOLPRO_DIRNAME} molpro_tmp
rm -rf molpro_tmp &fimodule purgemodule load scl/devtoolset-9
module load mkl/2018.0.4
module load mpi/intelmpi/2018.4.274
unzip -q ${GA_ARCHIVE}#tar zxf ${GA_ARCHIVE}
cd ga-${GA_VERSION}
export CFLAGS="-mpc80"
export FFLAGS="-mpc80"
export FCFLAGS="-mpc80"
export CXXFLAGS="-mpc80"
export F77=mpif90
export F90=mpif90
export FC=mpif90
export CC=mpicc
export CXX=mpicxx
export MPIF77=mpif90
export MPICC=mpicc
export MPICXX=mpicxx
export GA_FOPT="-O3"export GA_COPT="-O3"export GA_CXXOPT="-O3"# --with-ofi failed...
./autogen.sh
cp -f $PATCH_SNPRINTF autotools/m4-1.4.17/
cd $WORKDIR/ga-${GA_VERSION}./autogen.sh./configure --enable-i8 \--with-mpi3 \--prefix=${GA_INSTALLDIR}
make -j ${PARALLEL}
make checkmake install
cp config.log ${GA_INSTALLDIR}

cd ../tar zxf ${MOLPRO_TARBALL}
cd ${MOLPRO_DIRNAME}
patch -p0 < ${PATCH0}
patch -p0 < ${PATCH1}
patch -p0 < ${PATCH2}
patch -p0 < ${PATCH3}
patch -p0 < ${PATCHX}
patch -p0 < ${PATCH10}
patch -p0 < ${PATCH11}
patch -p0 < ${PATCH12}
export PATH="${GA_INSTALLDIR}/bin:$PATH" # where ga-config exists
CPPFLAGS="-I${GA_INSTALLDIR}/include" \LDFLAGS="-L${GA_INSTALLDIR}/lib" \./configure --prefix=${INSTALLDIR}
sed -i -e "s/^VERBOSE.*$/VERBOSE=/" CONFIG
make -j ${PARALLEL}
cp $TOKEN lib/.token
make tuning
MOLPRO_OPTIONS="" make quicktest
MOLPRO_OPTIONS=-n2 make test

メモ(パッチファイルは /local/apl/lx/molpro2021.3.1/patches 以下にまとめて置いてあります)
ga のテストが一個前回と同様に失敗しています
molpro のテストはすべて通過していますslater はテストを通過しなかったため、あらかじめ無効化しています
このバージョンでは 1 ノードでの実行時にはローカルディスクを使う設定がデフォルトとなっていますが、当センターのシステムではローカルディスクは利用できないため、デフォルト設定を従来のものに変更しています。
実行時に "--ga-impl disk" をつけることで本来のデフォルト設定(disk option)になります。
インストール後、一部ファイルのパーミッション等を一部変更しています(上記手順には含まれていません)
CentOS 7 + devtoolset-9 環境ではリンク時に findloc の文字列版のためにエラーとなります
同等機能の関数を用意することで無理矢理回避しています(static link ならば問題無くビルドできたかもしれません)