Newsletter for Chem-Bio Informatics Society Members
情報計算化学生物学会

広報誌

No.6 2008 （2008 年 12 月 16 日発行）

KSBSB-CBI 2009 Joint Symposium にむけた取り組み（２） KSBSB の 2008 年度年会レポート
CBI 学会会長の河合です。来年度の CBI 学会の年会
は、韓国の KSBSB 学会と合同で 11 月 4-6 日の３日間ソウル近郊にて開催する予定です。なぜ今韓国なのか、CBIは何をしようとしているのか、といった疑問に答を見つけるべく、CBI Newsを通してリアルタイムで取り組み状況をお伝えし、「よし、韓国大会へ行ってみよう」と思わず口ずさんでしまうことを期待して始めた連載の第二弾です。今回は 11/13-14に開催された KSBSBの年会「Bioinfo2008 参加報告」です。
KSBSB (Korean Society for Bioinformatics andSystems Biology) は 2000 年に設立された学会で、ちょうどCBI研究会が学会になった年と同じであるため、年会開催は CBI と同じ９回目となります（写真１）。会場となった忠北大學校（Chungbuk National University）

写真１．K S B S B 年会の会場となった忠北大學校の N o v a
Aper io Cult ure ホール。招待講演者一行がホテルからバスで移動してきたところ。垂れ幕は学会のものかと思っは、ソウルからバスに乗ること約 2 時間、ソウルの南東ていたが、手前は英語のスピーチコンテスト、奥は東ア130kmにある清州市 (Cheongju)の大学です。清州市はジア文明の再認識（トンアジア、ムンメンウィ、チェイ

世界最古の金属活字が作られたことで有名な街ですが、ンシク）。その奥に見えるのが B i o i n f o 2 0 0 8 の看板。

日本人にとっては学会開催の１ヶ月前にヨン様が花冠文化勲章を授与された街と言った方がわかりやすいかもしれません。CBI学会からは神沼二眞先生と徳島大学・中まえですが、アメリカ在住の韓国人研究者や中国人研究馬寛先生、私の３名が招待を受け、招待講演と開会式で者が呼ばれていたことです。エール大学の Philip Kimの来賓挨拶を行ってきました。KSBSBは４つの関心領先生はタンパク‐タンパク相互作用の分子構造学的考察

域 S y s t e m s B i o l o g y, O m i c s , D ru g D e s i g n &を加えた論文を 2006 年に Science に出した若き韓国人

Development Application, およびNano-Bioを定めておホープ、シアトルのシステムズバイオロジー研究所のり、CBIの７つの関心領域と共通するものが多い学会で

Qiang Tian先生は幹細胞研究グループのリーダーです。

す。２日間にわたって開催されたBioinfo2008はすべて生命科学に関わるNature, Scienceの論文に中国や韓国招待講演で構成されており、日本からは東工大・秋山泰の研究者の名前がないものを見つけることが難しい時代

先生、東大・宮野悟先生、産総研・福田賢一郎先生、アであるにも関わらず、あまり日本で拝聴することのないメリカからもRuben Abagyan先生といったCBI学会年

アジア系の研究者が韓国には来て講演しているという感会でもこれまでにご講演いただいた方々が招待されておじでした。
これはもうすでに日本パッシングが始まってり、全体的にスコープのよく似た大会でした。違いはといるのではないか、と不安を持たずにはいられませんでいうと、韓国の大学の先生のご講演が多いことはあたりした。

目次

K SBSB-CBI 2 00 9 J o int Sympo sium にむけた取り組み

河合隆利（エーザイ）

１

神沼二眞

３

（２）K S B S B の 2 0 0 8 年度年会レポート
講演 会解 題：C B I 学会 とし てア ル ツハ イマ ー 疾患 にど う 取り 組む か？

（C B I 学会 事 務 局 担当 理 事 、講演 会 世 話 人）

CBI NEWS No.6 20081学会初日のセッションがすべて終わるとレセプションだったのですが、その前に講演会場を利用して清州の民族舞踊のパフォーマンスがありました（写真２）。
２日間の学会終了後はソウルへ移動し延世(Yonsei)大学内の宿泊施設に泊まりました。翌日、帰国フライトまでの空き時間神沼先生と大学の周りを散歩しました。
延世大学のすぐ南隣に位置する世界最大規模の女子総合大学である梨花 (Ewha)大学の中を進み、梨花大学のシンボル的な建造物、地下５階のむき出しビル E w h aCampus Center の写真を撮りに行きました。このビルでBioinfo2008の前日私たちも参加したサテライトミーティングが行われたので、記念撮影をと思ったわけです。
ここで年末ジャンボ宝くじとお年玉つき年賀ハガキの１等が同時に当たったような、ありえないことが起こ

写真２．清州市は 韓国のち ょうど中 心に位置 し、三国時りました。
デジカメのスクリーンに映っている被写体の代から栄 える歴史 ある街。学会初日 の晩、会場の舞 台上女性から突然 “Kawai-san”と声をかけられたのです。２で催され た民族舞 踊。清州市は 世界最古 の金属活 字が作

日まえに 130km 離れた清州市の学会会場で会った Sun

られたこ とで有名 な街だが 、この学会 が開催さ れる一月

Choi先生でした（写真３）。Choi先生からは学部学生数ほど前、ペ・ヨンジュ ン氏が花 冠文化勲 章を授与 された

名を一週間ほど日本に研修に行かせたいのだが、CBI学ことで一 躍脚光を 浴びる。授与式当 日は、我々の宿 泊し会でその窓口をしてくれないかと相談を持ちかけられてたホテ ルが日 本人女 性客で 満室に なった そうで ある。

いたところでした。
ここであったのはもはや偶然ではな
く必然。
日本での研修旅行の実現を約束して韓国を後にしました。
韓国ミニ情報：ホテルのコンセントはソウルも清州

次回は、梨花女子大学の学生さんたちの研修旅行についてご報告できるのではないかと思っております。

も 22 0V の丸い形をしたものでした。ホテルのアメニ
ティグッズの中には歯ブラシが入っていません。リサイクル法で無料配布が禁止されているそうです。

（エーザイ株式会社河合隆利）

歯ブラシセットは日本から持っていきましょう。

写真３．ソウルの新村地区にある梨花女子大学のシンボル的建造物 E w h a C a m p u s C e n t e r 。 旅の記録にと写真を撮っていたらデジカメのファインダーの中から突然 K a w a i - s a n ・と声をかけられ、何がおこったかわからずしばらく口が開いたままに。２日前 1 3 0 k m 離れた清州市で会った S u n

C h o i 先生だった。学部学生の日本での研修旅行の窓口を頼まれ、この偶然は必然です、とすぐその場で C B I 学会が窓口になるこ とを 引 き受 け た。

2

CBI NEWS No.6 2008

講演会解題：C B I 学会としてアルツハイマー疾患にどう取り組むか？
本年最後の研究講演会「神経変性疾患の標的と創薬- Ｉ」は、高齢化社会の大きな問題になっている、アルツハイマー疾患を始めとする神経変性疾患にどう取り組むかを、じっくりと考えていくための、基本的な情報収集に位置づけています。

Metabolic Syndromeとの関係

Adipocyte、β細胞などにおいては、こうした UPR 経路が活性化されやすく、それらが、動脈硬化、インシュリ開催趣旨にも述べていますように、「神経変性疾患の標的と創薬- Ｉ」と題する今回の講演会は、この数年集ン抵抗性や肥満、神経変性症、糖尿病などを招く、という仮説が提唱されています[1]。

中的に取り上げてきました、「核内受容体と生活習慣病」のような取り組みを他の主要な疾患に拡張していく、という活動の最初の一歩として企画しました。
とくに今回

核内受容体との関係

は、Metabolic Syndrome とアルツハイマー疾患に代表される神経変性症Neurodegenerative Diseaseとの関連をさらに、上記の仮説において、代謝と炎症を結びつけ探るという意味で、小胞体ストレス ER（endoplasmic

る転写因子が脂質のセンサーと呼ばれる核内受容体、reticulum）stressを一つの出発点とすることにしました。

PPARやLXRであることも指摘されています。2006年のその理由は、Metabolic Syndrome が、がんやアルツハ

CBI 学会の年次大会に招聘した、（当時）GSK（Glaxo

イマー疾患のような神経変性症Neurodegenerative disease

SmithKlein）社の研究担当副社長であった A. Roses氏は、の引き金になる可能性が指摘されていることです。
これ「アルツハイマー疾患は脳の糖尿病だ」と言い、同社がについては、2008 年 7 月 24 日の Nature 誌に論文が特集

糖尿病薬をアルツハイマー疾患治療の治験に使っているされています。
その分子メカニズムとして疑われているのは、炎症でと話してくれました。代表的な糖尿病薬として PPAR³
Agonists が知られていますが、PPAR³ Agonists がアルす。すなわち、Metabolic Syndrome とは、内臓脂肪組織ツハイマー疾患に有効であるという報告は増えていますが肥大した状態ですが、そうした脂肪組織からは、TNF-[2]。LXR の役割については、本年度の大会で、Tontonoz

αやIL-6のような免疫因子 Cytokineが放出されます。そうした Cytokineは NF-κ Bが関与する慢性的な炎症反応

教授が、最近の発見の一部を報告されています[3]。さらに、PPAR³ だけでなく、その共役因子 PGC1 αを介しを引き起こします。こうした慢性的な炎症が脂肪組織た運動の効用に関する報告もなされています[4]。

Adipocyte で続くとインシュリン抵抗性や 2 型糖尿病の発症とを招き、（Macrophage のような）免疫細胞で起きさらに、Hormone Replacement Therapy (HRT) とのると血管壁に蓄積する動脈硬化症 Arteriosclerosis とな関連で、エストロゲンがアルツハイマー疾患の改善に有り、脳の神経細胞で起きるとアルツハイマー疾患やパー効であるという経験則が語られていますが、これについキンソン病のような神経変性疾患となり、肝細胞などでても Wyeth 社が、マウスを使って、ER αには結合せず起きるとがんになる、という考えです。こうした考えはER βに結合する化合物に、アルツハイマー疾患の改善まだ作業仮設の域にとどまっていますが、支持者を増や効果があるという、興味深い結果を出しています [5]。

しているように見えます。
この代謝疾患と炎症応答を関係づける分子機構として最近注目されているのが、ER（endoplasmic reticulum）

その他の標的seladin-1

stress 小胞体ストレスです。小胞体はタンパク質の折りたたみ工場と見なされています。
すなわち可溶性タンパ

アルツハイマー疾患の治療標的として最近注目されてク質や膜たんぱく質の生合成、折り畳み、アセンブリー、いるのが、seladin-1 (SELective AD INdicator-1) という遺修飾に関わっています。
細胞内に正常に折り畳まれてい伝子です。これは、2000 年に、アルツハイマー疾患状態ないタンパク質が増大してくると、小胞体内のunfolded-の脳の関係領域で発現が抑制されている遺伝子として発protein-response (UPR) 経路が活性化され、これが炎症を見され、神経系を保護する働きがあるとして、アルツハ引き起こす可能性が指摘されています。それゆえ、大量イマー疾患治療の標的になるのではないかと注目されるのタンパク質を分泌するように分化した細胞群、例えばようになりました。これはコレステロールの合成（生合M acroph age、神経細胞 O ligodendrocyt e、脂肪細胞成の最後のステップ）に触媒として関与している酵素をCBI NEWS No.6 20083

コードする遺伝子であり、caspase 3 の働きを抑制して情報計算技法の役割

apoptosis を抑制すること、Thyroid horomone の影響を受けること、LXRの標的遺伝子であることなど、急速に知上記では触れませんでしたが、情報計算の専門家の立見が蓄積されています[6]。また、計算機で構造から治療場から、神経変性症にどのような問題があるかは、例え薬を探索する研究も始まっています。

ば文献[10]がわかりやすいと思います。

HDAC（Histone deacetylase）

速に進歩しています。現在、ＣＢＩ学会は、Pathway/他の分野もそうですが、神経変性症に関する研究も急
Network to Disease & Drug Discoveryを活動の標語とDNAが巻きついているタンパク質であるヒストンのしています。神経変性症に関してもそうした「経路網か末端のいくつかの残基がアセチル化される現象は、遺伝ら疾病を理解する」、ということが現実性を帯びてきた子発現を制御する、いわゆる epigenetic な過程（postように思われます。また、ER αと ER β、LXR、PPAR

translational modification）として、とくにがん化とのなどの核内受容体や、Sirtuin のような多くの疾患に関係関係が指摘されており、その阻害剤が抗がん剤となるとした薬物標的や、seladin-1のような新標的も見えてきていう視点から薬物標的として、創薬研究者の関心も高くいます。GWA（genome-wide association study）を含め、なっています。これについてはすでにCBI学会の講演会

こうした研究には情報計算の専門家が協力すべき多様なでも講演したいただいたことがありますが、現在、ヒス課題が数多くあります。
また、標的が想定された場合は、トン脱アセチル化酵素histone deacetylaseの阻害剤は、計算創薬的な技法の出番であることは、言うを待ちませ中枢神経系の薬のとしても注目されています。
比較的最ん。しかし情報計算の専門家が、そうした料理すべき材

近の Nature Review Drug Discovery 誌には、その状況料が提供されるのをただ待つだけという姿勢では、国際が紹介されています[7]。標的としてのHDACとして、新競争には脱落していくような気がします。私たちが、核たに浮上してきたのは、Sirtuin です。Sirtuin は、メタ内受容体と生活習慣病（NR-MS）計画で提案してきたよ

ボリック症候群でも注目されていますが、NAD 依存性

うに、いまや重要なのは、個々の技法よりは、生物医学のヒストン脱アセチル化酵素であり、class III HDACとの主要な領域の問題解決のための研究者 Community を呼ばれて、他の HDAC と構造が異なっています。

形成することです。そうした戦略思考の重要さは、とくに若手の研究者に理解していただきたいと思います。

興味深いことは、この HDAC 阻害剤が、ヒストンのなお 、上記 の 原 稿を 急 い で書 い た 後 に、N a t u r eアセチル化をもたらし、記憶の増強とシナップス可塑性Reviews Drug Discoveryの最新号に、ERストレスと創をもたらすことです。さらに最近、Kim N. Greenetらは、薬に関する総説[11]が掲載されていることに気がつきま

その阻害剤である nicotinamide（ビタミン B3）が、認したので、文献として追加しておきます。

知機能障害の回復につながることをマウス（3xTg-AD）を使った実験で報告しています [8]。これは現在容易に（文責、CBI学会事務局担当理事、入手できるサプリメントが、アルツハイマー疾患の改善講演会世話人、神沼二眞）をもたらすという、かなり衝撃的な話であり、最近マスメデイア（欧米の）でも、話題になりました。計算機によるSirtuinの阻害剤開発研究もすでに始まっています。

Conformational Disease

文献[1] Kezhong Zhang & Randal J. Kaufman, “Fromendoplasmic-reticulum stress to the inflammatory
Response”, Nature, 454, 455-462 (2008).
[2] A. Bernardo and L. Minghetti, “Regulation of Glial

タンパク質の misfolding という分子機構が関係した

Cell Functions by PPAR γ Natural and Synthetic

疾患は、Conformational Disease という概念で捉えらAgonists”, PPAR Research, Vol. 2008, Article ID

れていますが、これに属する疾患としては、

864140[3] S. J. Bensinger & P. Tontonoz, “Integration ofA l z h e i m e r ’ s d i s e a s e 、P a rk i n s o n ’ s D i s e a s e 、れるいくつかの疾患があります。Alzheimer’s disease

metabolism and inflammation by lipid-activatednuclear receptors”, Nature, 454, 470-477 (2008).

が amyloid（タンパク質）の misfoldingに関係している[4] Christoph Handschin & Bruce M. Spiegelman, “Theのに対し、肺気腫（emphysema）、若年性認知症、肝硬role of exercise and PGC1α in inflammation andHuntington’s Disease、および Serpinopathies と呼ば変（liver cirrhosis）を含む Serpinopathies は、serpinprotein の polymerization が原因になります。この最後の例については、最近 M. Yamazaki らがＸ線結晶解析を基礎にした分子機構の解明を報告しています[9]。

4chronic disease”, Nature, 454, 463-469 (2008).
[5] Feng Liu et al., “Activation of estrogen receptor-βregulates hippocampal synaptic plasticity andimproves memory”, Nature Neuroscience, 11(3): 334-CBI NEWS No.6 2008

343 (2008).
[6] A. Peri and M. Serio, “Neuroprotective effects of(2008).
[9] M. Yamazaki et al., “Crystal structure of a stable

the Alzheimer’s disease-related gene seladin-1”,
Journal of Molecular Endocrinology, 41: 251-261

dimer reveals the molecular bas is of s erp inpolymerization”, Nature, 455, 1255-1258 (2008).

(2008).
[7] A. G. Kazantesev, L. M. Thompson, “Therapeutic[10] R. Nuzzo,” Computing the Ravages of Time：Using
Algorithms To Tackle Alzheimer’s Disease”,

application of histone deacetylase inhibitors for

Biomedical Computing Review, 9 (2007).

central nervous system disorders”, Nature Reviews
Drug Discovery, 7: 854-868 (2008).

(http://www.biomedicalcomputationreview.org/3/4/5.pdf)[8] Kim N. Greenet et al., “Nicotinamide Restores
Cognition in Alzheimer’s Disease Transgenic Mice[11] Inki Kim, Wenjie Xu and John C. Reed, Cell deathand endoplasmic reticulum stress: disease relevance

via a Mechanism Involving Sirtuin Inhibition andSelective Reduction of Thr231-Phosphotau”, Theand therapeutic opportunities, Nature Reviews Drug
Discovery, 7: 1013-1030, 2008.

Journal of Neuroscience, 28(45):11500-11510

売中絶賛発

薬づくりの真実

臨床から投資まで神沼二眞訳

多田幸雄 堀内正監修（CBI 学会出版）

販売中！ CBI 学会 HP よりご注文いただけます。

http://cbi-society.org/cbi/DDpress/book_DrugDiscovery.html
定価 3,000 円【読者の声】○

以前から気になっていた本の和訳があることを、「ファルマシア」の新刊紹介で知りました。翻訳していただき感謝します。

○

この本を発見されたこと、紹介の重要性を強く認識されたことに敬意を表します。バイオ・ビジネス、ベンチャー・ビジネスに１９８９年ころからグローバルに関わっている身には、認識していることばかりですが、アカデミア、製薬企業の研究者、経営者までが、ほとんど認識していないのが現状ですので、本書の価値は非常に大きく、1000 部は即売り切れになり、増刷になるものと思います。

「出版経緯」の記事

http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20060313/bartfai.html

CBI NEWS No.6 20085

今後の講演会予定
第293 回CBI研究講演会 「アカデミアにおける創薬と計算化学」
開催趣旨：現在、「薬をつくる」ことは専ら製薬企業で行われています。それは、薬となる候補化合物を、実際に規制の対象である医薬品に仕上げる過程に巨額の資金がいるからです。この３０年ほどの間に、多くのいわゆるバイオベンチャーが創薬に挑んできましたが、ほとんどが失敗してきました。その理由は、科学としての創薬には、さまざまな分野を統合した知が必要なことと、開発過程の後半に巨額の資金がいることが挙げられています。
一方、
ヒ
トゲノム解読計画は、多くの画期的な薬を世に出すことに寄与すると期待されていましたが、現実はまだ、そうなっていません。そこで注目されているのは、アカデミアにおける創薬への取り組みですが、そこには新しい戦略思考が要求されます。CBI学会は、1981 年の活動開始以来、産官学の研究者が連係して、論理的な創薬方法論の普及を基本目標としてきました。いまやそこで蓄積してきたさまざまな経験と知恵を、新しい戦略思考に転換すべき時が来たと感じております。Workshop の形式をとったこの講演会は、このことを目的として開催されます。この課題に関心のある幅広い関係者の参加を期待しています。なお、CBI 学会が刊行している「薬づくりの真実」と、G. P.
ピサノ著、「サイエンス・ビジネスの挑戦」、日経 BP, 2008 が、この Workshop のよい背景資料になっています。
日時 ： 2009 年 1 月 16 日（金）13:00-17:00
場所 ： 東京大学山上会館大会議室
世話人 ： 岡部隆義（東京大学）、多田幸雄（大鵬薬品）、神沼二眞（広島大学、東京医科歯科大学）
プログラム
１．趣旨説明、多田幸雄（大鵬薬品）
２．
「アカデミアにおける創薬基盤」岡部隆義（東京大学）
３．
「大学が有する化合物利用の仕組みづくり」奥山彬（NPO 法人化合物活用センター）
４．
「大学化合物ライブラリーを用いたパーキンソン病治療薬の in silico 開発」有賀寛芳（北大大学院薬学研究科）
５．総合討論：創薬に関する産学連係の戦略
大学の視点から（飯島洋 、日本大学薬学部）、医薬品開発の産学連係とは（多田幸雄、大鵬薬品）,アカデミアへの計算創薬の開放（神沼二眞）、他。
講演会参加費：法人賛助会員： 無料、個人会員（非営利）：無料、個人会員（一般企業）：\5,000、ビジター（非営利）：\1,000、ビジター（一般企業）：\10,000
出席を希望される方は事前に必ず事務局セミナー受付seminar@cbi-society.org に連絡してください。

2009 年 3 月 12 日（木）講演会：Workshop 生物医学と創薬を変える IT －その１
年度末の総会：09 年の活動計画と組織
Bioinformatics関連の活動懇談会

2009 年 4 月 3 日（月）講演会：
「神経系のチャネル・シグナルの生理と病態」
（仮題）
世話人

2009 年 4 月－ 5 月

森 泰生（京都大学）、澤田光平（エーザイ株式会社）

講演会：「メタボロミクスの実証研究 - 創薬の基礎から臨床まで」（仮題）
場所：慶應大学・三田キャンパス講堂
世話人

堀内正（慶應大学）、藤原巌（大日本住友製薬）

発行 ： 情報計算化学生物学会(CBI 学会)事務局 〒158-0097 東京都世田谷区用賀 4-3-16イイダビル301
Tel.03-5491-5423 Fax.03-5491-5462

6

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CBI NEWS No.6 2008