eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012「研究助成機関が刊行するオープンアクセス誌」

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル
マーク･パターソン（eLife マネージング・エグゼクティブ・エディター）

講演要旨2011 年 11 月より現職。もともと遺伝学の研究者で、1994 年に科学系出版業界に入り、「Trends in Genetics」の Editor となった。Nature に数年勤務したが、その間「Nature Reviews」の創刊に携わり、2003 年 PLoS に移った。PLoS では Director of Publishing として何誌かの PLoS 雑誌の創刊を手掛け、Open Access Scholarly Publishers Association の設立者の一人でもある。また UK Open Access Implementation Group のメンバーの一人でもある。

マーク・パターソン
2011年11月より現職。もともと遺伝学の研究者で、1994年に科学系出版業界に入り、「Trends in
Genetics」の Editor となった。Nature に数年勤務したが、その間「Nature Reviews」の創刊に携わり、2003年 PLoS に移った。PLoS では Director of Publishing として何誌かの PLoS 雑誌の創刊を手掛け、Open Access Scholarly Publishers Association の設立者の一人でもある。また UK Open Access Implementation Group のメンバーの一人でもある。

はじめに

仕組み、eLife が行っていること、そして今日までの

本日は、まず私の経歴を簡単にご紹介します。オー

進捗状況についてそれぞれお話をさせていただきます。

プンアクセスとも関連がありますし、私が研究に対す

簡単にいえば、eLife は、研究助成機関であるウエルるオープンアクセスという概念に注目し、これを支持

カム・トラスト、ハワード・ヒューズ医学研究所、そしている理由とも関係しているからです。次に、オー

してマックス・プランク協会によるサポートを受けた、

プンアクセスを推進するために重要なこととして、英リサーチコミュニケーションの改善促進を目指す新た国および世界各地におけるオープンアクセスポリシーな取組です。

に関するこれまでの動きをご紹介します。最後に、
eLife に関するプレゼンテーションをしたいと思います。ここでは、創刊を目指した理由と目標、eLife のNational Institute of Informatics

略歴
私は、研究者としてキャリアをスタートさせました

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 20121

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル（図 1）。遺伝学とゲノミクスの研究を 13 年ほど行い、と考えました。そこで、必要となる遺伝子データベー

その後、科学に関する視野を広げたいという思いから、スを保持していたロンドンの研究所を訪ねましたが、1994 年に出版界へと転身しました。執筆や編集の作

それによってこの遺伝子が成し得ることを見いだすこ

業が好きなので、最終的には愛読誌の一つ、「Trendsとができたのです。ところが、今やこうした比較は数in Genetics」の仕事をするようになりました。この秒で行うことができます。現在では、当時では考えら仕事を通じて、遺伝学に関する視野を広げることがでれなかったようなスピードで何桁もの配列データを生きたと感じています。その後、オープンアクセス出版

成することができます。遺伝子配列データベースは実に移る機会を得て、2003 年には設立時から PLoSに効果的なツールへと発展し、今日では公共のオープ（Public Library of Science）に移り、その後 8～9

ンデータベースもみられます。

年は PLoS で働きました。そして昨年、eLife に移っ

科学分野のオープンデータを共有することで得られた成果の一つに、ヒトゲノムプロジェクト（図 3）がてきました。
博士論文を執筆していた 1985 年には、プロジェク

挙げられます。昨年発表された分析によれば、ヒトゲトの一環として、小遺伝子の DNA 配列の生成にも取ノムプロジェクトには 40 億ドルが投資され、そこかり組みました（図 2）。当時はマンチェスターでこのら推定 8,000 億ドルの経済生産と 30 万を超える雇用作業を行っていましたが、データ生成後、このデータを生み出しました。このことは、研究成果のオープンと他のデータの間に類似性があるかどうかを探りたい

かつフリーな共有がもたらす成果を見事な説得力をも1

1

これまでのキャリア
これまでのキャリア
博士号
博士号 研究
研究
1982年
1982年
ポスドク
ポスドク

1985年
1985年
講師
講師
1990年
1990年
TIG
TIG
1994年
1994年

出版
出版
NatureNature
1999年
1999年
PLoS
PLoS
2003年
2003年

オープンアクセス出版
オープンアクセス出版
eLife
eLife
2011年
2011年

（図 1）

（図 3）
2

2

記憶に残る出来事
記憶に残る出来事
2001年3月23日
2001年3月23日•• マンチェスターでのマンチェスターでのシーケンシング
シーケンシング•• ロンドンでのロンドンでの
配列比較
配列比較

（図 2）

National Institute of Informatics（図 4）

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 20122

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナルって示しています。

政府がこのような見解を示すようになった理由の一2001 年に Science に掲載されたオープンアクセス

つに、世界各地における厳しい経済状況の影響が挙げとそのメリットに関する初期の論文の中で、著者はこられます。知識や情報に対するアクセスの向上は革新

れを遺伝子配列データにたとえ、既刊文献の「ジェンを推進し、ひいては経済発展の後押しにも結びつくとバンク」を設立するようなものだと述べています（図考えられているのです。こうしたことを背景に、英国

4）。これは、遺伝子データのオープンな共有により、ではオープンアクセスが強い支持を集めています。

そのデータを解析し、それを効果的なものとする新た英国におけるもう一つの動きは、デイム・ジャネッ

なツールやリソースがもたらされるという考え方です。

ト・フィンチが議長を務めるフィンチグループです。

また、公開された文献の共有でも同様のことが起こりフィンチグループの使命は、研究情報へのアクセス向ます。オープンリソースを作成すれば、それが研究や上の方法を検討することでした。数カ月前にフィンチ

教育などにとって、より一層効果的なものとなるのでグループが発表した報告書は、特に著者の掲載料支払す。私はこうした関係を遺伝子学と文献の間につくりいを助成する仕組みを実現しようと、先ほど申し上げたいと思っています。

たようなオープンアクセス出版の概念を原則として強ここで重要なのは、オープンアクセスは、単なるフく支持しています。

リーアクセスにとどまらないということです。オープ

研究助成機関もポリシーを強化しています。ウエル

ンアクセスによりアクセスや再利用の障壁が取り除か

カム・トラストは 2006 年頃からポリシーを策定してれることで、文献は一層効果的なツールとなるのです。

いますが、最近になってポリシーを強化し、研究成果を再利用できるようにリベラルなライセンスを使用す

オープンアクセスポリシーの状況

ることの重要性を強調しています。また、このポリシ

次に、オープンアクセス分野におけるポリシーの進

ーの遵守率を高めるために制裁措置も実施しています。

展についてです。英国では、過去半年～1 年の間に目同様に、英国のすべての公的研究助成機関が属する英覚ましい進展がみられました。オープンアクセスに対国リサーチカウンシルズは、オープンアクセスに対すする支持は政府の最高レベルで表明されています。英るポリシーを強化し、掲載料の支払いを支援していま国のデービッド・ウィレッツ大学・科学担当大臣は、す。この活動にはマスコミも大きく注目していますが、「政府は、公的資金で賄われた研究成果は公的にアク

これは、オープンアクセスに対する認識が科学界をはセス可能とすべきだと考えており、この原則は学術界

るかに超えて、一般社会へと広がっていることを意味を超えて適用される」と述べています。

しており、望ましいことです（図 5-6）。
5

英国
英国 ―
― その1
その1
•• 政府最高レベルでの支持
政府最高レベルでの支持•• 「政府は、公的資金で賄われた研「政府は、公的資金で賄われた研究成果は公的にアクセス可能とす
究成果は公的にアクセス可能とすべきだと考えており、この原則はべきだと考えており、この原則は学術会を越えて適用される」学術会を越えて適用される」•• デービッド・ウィレッツ
デービッド・ウィレッツ 大学・科
大学・科
学担当大臣
学担当大臣

（図 5）

National Institute of Informatics

6

5

6

英国
英国 ―
― その2
その2
•• フィンチグループ：
フィンチグループ：
掲載料の助成によるOA出版を強く掲載料の助成によるOA出版を強く支持
支持•• ウエルカム・トラスト：
ウエルカム・トラスト：
ポリシーを強化、非常にリベラル
ポリシーを強化、非常にリベラルなライセンス（CC-BY）と遵守さなライセンス（CC-BY）と遵守されない場合の制裁を強調れない場合の制裁を強調•• 英国リサーチカウンシルズ：
英国リサーチカウンシルズ：
ポリシーを強化、掲載料の支払い
ポリシーを強化、掲載料の支払い
を支援
を支援

（図 6）

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 20123

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル
このように、ポリシーに関する進展の多くで、再利用の重要性が強調されているのと同時に、クリエイテ「科学情報へのオープンアクセスが必要だ」と述べています。

ィブ・コモンズの帰属ライセンス（略称 CC BY）が米国では Research Works Act という法案が審議さオープンアクセス出版における代表的な基準となりつれていましたが、これに関しては特に学術界からの反つあり、全面的な基準の形成に役立っています。クリ

対が大きく、支持を集められませんでした。この法案

エイティブ・コモンズのライセンスは著作権法に基づは、アメリカ国立衛生研究所のパブリックアクセスポ

くもので、確固たる法的根拠を持っています。一般のリシーを覆す試みで、一部の出版社が支持していまし人でも分かりやすいようにしたバージョンもあり、そた。しかし、反対意見がみられたため、現在法案は取の文献を使って何をしてもよいということが強調されり下げられています。また、これによりオープンアクています。

セスへの支持も拡大しました。今年は多数の署名を集

しかし、英国における進展についてもう一つ申し上めた請願書も提出され、オバマ政権の返答を待っていげておきたいのが、オープンアクセスの関係者全員がるところです。また、Federal Research Public Ac-

こうした進展を好意的に受け止めているわけではない

cess Act という法案も審議中ですが、こちらは米国にということです。大多数の人々は、これまでの動きをおけるすべての主要な公的研究助成機関へのパブリッ

オープンアクセスにとって素晴らしい前進であると捉クアクセスを拡大するものです。

えていますが、グリーンオープンアクセスに比べてゴポリシーの進展がオープンアクセスの推進に向けてールドオープンアクセスに対する支持が大きすぎると極めて重要であることに、疑問の余地はありません。

して、不満を抱いている人もいます。ゴールドオープ

土屋教授は昨日、この方向を目指した文部科学省発行

ンアクセスは掲載料の支払いが前提となっているのにの報告書についてお話しされました。これがポリシー

対し、グリーンオープンアクセスは、機関リポジトリ

に関する何らかの進展につながるかどうか現時点ではに収録されてオープンアクセスが可能となる仕組みで定かではありませんが、他国における多くの進展に鑑す。

みれば、日本もオープンアクセスポリシーを策定する

個人的には、どちらの方法も必要だと考えています。

好機を迎えているといえるでしょう。

リサーチコミュニケーションの世界は全体として、印刷物からオンライン方式へと大規模かつ複雑な移行を

eLife とは？

遂げつつあります。この過渡期をうまく乗り越えるに

さて、ここからは eLife に焦点を絞ってお話ししま

はもうしばらく時間がかかりますし、最適な状況に達す。eLife が他の取組と最も大きく異なる点は、科学するためには複合的な方法が必要です。ですから、グ分野における実践者と資金提供者の協力によるものだ

リーンもゴールドもどちらも必要であることは間違いという点です。eLife はリサーチコミュニケーションありません。例えば、PeerJ のような新たな実験的ジの改善を目的としています。最初の目標は、研究者主ャーナルが必要とされているのです。

導で eLife というジャーナルを創刊し、生命科学全般

英国外でも重要な進展がみられます。欧州委員会はにおける優れた研究成果の基盤とすることです。また、

先日、Horizon 2020 という欧州委員会の主要な助成

eLife を研究成果発表を通じてイノベーションを披露

プログラムの一般原則に、オープンアクセスを採用すする場にしたいとも考えています。

ることを発表しました。このプログラムは 800 億ユーロの研究・革新プログラムで、欧州政府の最高レベ
ルからの支持も得ています。ニーリー・クロエス氏はNational Institute of Informatics

創刊を目指した理由
eLife は 2011 年 6 月に初めて発表されましたが、

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 2012

4

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル
それ以前から、研究助成各機関は何カ月も議論を重ね

プンアクセスになっているかを表すものです。特に、ていました。

素晴らしい研究成果を発表したいと考えている著者に現在、出版界でオープンアクセス出版が定着していとっては、まだ長い道のりが待っています。論文を掲ることは間違いありません。そのことは、大手のオー載できるジャーナルの選択肢を見ても、大部分は購読

プンアクセス出版社 3 社、BioMed Central、PLoS、制のジャーナルです。このため、最高の科学を惹きつ

Hindawi により出版されたオープンアクセスの論文

け、オープンアクセスをより広く推進できるような最数の増加を見ても明らかです。2011 年には、この 3

高レベルのオープンアクセスジャーナルが真に必要と社だけで計 5 万件の論文が出版されています（図 7）。

されています。基本的には、これが eLife の創刊を目しかし、オープンアクセスは氷山の一角にすぎませ指すことになった第一の理由です。

ん。必ずしも最適の方法とは言えませんが、オープン

もう一つの理由はジャーナルの掲載プロセスに関すアクセスの量を調べる極めて簡単な方法は、PubMed

るものです（図 9）。Nature および Science に掲載さに収録されている論文全体のうち、PMC（PubMed

れた意見をご紹介していますが、特に一流のジャーナ

Central）でオープンアクセスとなっている論文の割ルにおいて科学者が論文を掲載してもらうために、た合を示すことです（図 8）。この割合は徐々に増加しどらなければならないプロセスが批判されています。

てはいますが、いまだに約 1 割にとどまっています。

これらのジャーナルに論文を発表するための競争は極

これはいわば、生物医学の文献がどの程度完全なオー

めて激しく、また常に激化の一途をたどっています。

7

7

また、査読者が論文を批評したり、論文をそのジャーナルに必要とされるレベルに引き上げる要件として著

OA出版論文数の増加
OA出版論文数の増加

者に実験を求めたり、非常に強硬な態度に出ることも多々あります。多くの科学者、そしてある分野の科学

出版物
出版物
BMC
BMC
PLoS
PLoS
HindawiHindawi

研究助成機関は、こうした要求には理不尽かつ非現実的なものが多いという見方を示しています。科学者が修正した論文を提出しても掲載が却下される場合もあります。そこで、できる限り公正で建設的かつ効率的なプロセスを目指し、科学と科学者の主導による編集プロセスを考案したいと考え、eLife 創刊を目指した

（図 7）

のです。
8

創刊を目指した理由1
創刊を目指した理由1ーー OA推進OA推進％：PubMedに収録されている全論文のうち、％：PubMedに収録されている全論文のうち、PMC
PMC (Pubmed(Pubmed Central)でオープンアクセスとCentral)でオープンアクセスとなっている論文の割合なっている論文の割合（図 8）

National Institute of Informatics

9

8

9

創刊を目指した理由2
創刊を目指した理由2
ーー 査読の改革
査読の改革

マーティン・ラフ、アレグザンダー・ジョンソン、
マーティン・ラフ、アレグザンダー・ジョンソン、
ピーター・ウォルター
ピーター・ウォルター（図 9）

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 20125

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル
三つ目の理由は、コンテンツの公開に関するものでる研究成果を掲載したいと考えています。例えば、生す（図 10）。ジャーナルは印刷物として発展してきた物学的過程について新たな重要な理解をもたらす研究

ため、オンラインジャーナルについてはデジタルファ

成果や、優れた新手法についての研究成果で新たな研ーストして捉えられておらず、印刷物の需要という観究の門戸を開くもの、あるいは形質転換トマトの新た点からの制約や影響を受けすぎているという見方があな作出方法などです。このように、私たちは「インパります。このため、コンテンツの公開や普及を改善すクト」ということを非常に広義に解釈し、世の中に最る基盤として eLife を利用したいと考えたのです。

も大きな影響を及ぼし得る科学について掲載していきこのように、オープンアクセス、優れた掲載プロセたいと考えているのです。

ス、効率的で効果的なコンテンツの公開方法という三

私たちは、eLife に掲載するコンテンツについて野

つの主要分野で差別化を図ると同時に、変化をもたら心的な考えを持っていますし、成功に向けた素晴らしすプロジェクトにしたいとも思っています（図 11）。

い基盤を備えているとも考えています。これは eLife

eLife を通じて、リサーチコミュニケーションにおけが、リサーチコミュニケーションは研究プロセス自体る変化をより広く推進していきたいと考えています。

に欠かせないという認識を持った、世界で最も名だた

単にジャーナルとして成功を収めるだけでなく、それる三つの研究助成機関の支援を受けているからです。

以上の影響力を持つようになりたいと考えています。

しかし、eLife については、これら研究助成機関から独立して編集作業が行われるということも非常に重要

eLife の仕組みとは？

であるため、この原則に基づいた運営を実施していき

eLife で取り扱う範囲、すなわち掲載するコンテンます。

ツの主題領域については、できる限り広範な内容を網eLife に携わる編集者は皆、学術研究者です（図羅し、基礎科学、基礎から応用分野に及ぶ研究、臨床12）。eLife は元 PNAS 編集長のランディ・シェクマ

研究に至るまでの生命科学を扱いたいと思っています。

ン編集長(EIC)をはじめ、副編集長(Deputy Editor)2

これは、１つのジャーナルが取り扱う範囲としては類名、上級編集者(Senior Editor)17 名、さらに約 180を見ない広さとなっています。

名の査読編集者(Reviewing Editor)で構成されていま

そして、このジャーナルには最も有意義で優れた研す。彼らはいずれも定評のある著名な科学者であり、究成果を掲載したいと考えています。従ってコンテン学術会で eLife に対する信頼が急速に高まっている要

ツは精選することになりますが、私たちは「インパク員ともなっています。

ト」という考え方をより幅広く捉え、実用的意義のあ

eLife の編集プロセスはやや変わっています（図
11
11

10
10

創刊を目指した理由３
創刊を目指した理由３ーー デジタルファースト
デジタルファースト
•• 印刷出版プロセスによ
印刷出版プロセスによる制限が多いる制限が多い•• デジタルファーストにす
デジタルファーストにすべき時期が来ているべき時期が来ている

http://www.fybridphotos.com/object
http://www.fybridphotos.com/object
s_stock_photo_1130183.html
s_stock_photo_1130183.html（図 10）

National Institute of Informatics

eLife
eLife ー
ー 目標
目標
迅速で公
迅速で公
平、決断力
平、決断力
に富んだ
に富んだ
プロセス
プロセス

オープン
オープン
アクセス
アクセス

変化を
変化を
もたらす
もたらす

デジタル
デジタル
メディア
メディア
の活用
の活用

（図 11）

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 2012

6

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル13）。第一段階はほぼ標準的なもので、選定のプロセに理解できますし、Reviewing Editor が非合理的だ

スがあります。eLife では掲載するコンテンツを精選と判断した Reviewer の要求はプロセスから排除されしていきますが、これは、掲載基準を満たさない多くます。これは、著者が積極的に査読プロセスに関われの論文が却下されることを意味しています。私たちは、るようにするための一つの方法です。

編集者が基準を満たさない論文を速やかに却下し、査著者から修正された論文が戻ってきたら、読に回す論文を絞り込んだ後に全文査読を行い、かつReviewing Editor はほとんどの場合、Reviewer の意

著者にとっても効率的で時間のかからないプロセスを

見を再度聞くことはせずに論文を審査します。既に追求しています。

Reviewer の意見や Reviewing Editor 自身の意見、次の段階では、査読を取り仕切る Reviewing Edi-

そして原稿自体の評価に多くの時間をかけているからtor に論文が正式に割り当てられます。その後、一風です。こうすることで、論文の提出から受理までの時変わったことを行います。査読者から査読結果が届い間も短縮できるのです。

たら、査読者同士で協議を行い、論文に対する意見のeLife では著者に最高の体験をしていただくことも相違を議論します。そして Reviewing Editor が査読目標としており、そのために私たちが著者に約束して結果の論点を 1 通のレターにまとめ、著者はまとまいることをウェブサイト上に「Charter for

った指示が記載された 1 通のレターを受け取ること

Authors」としてまとめています（図 14）。

になります。著者は論文を発表するための要件を明確

次に、コンテンツの公開とデジタルファーストについて、主要な点を三つお話しします。掲載する論文数については制限を設けるつもりはありませんし、常識

編集グループ
編集グループの範囲内であれば論文の長さを制限するつもりもあり••編集長
編集長 (EIC)(EIC)••副編集長
副編集長 2人
2人(Deputy(Deputy Editor)
Editor)••上級編集者
上級編集者 17人
17人
(Senior(Senior Editor)
Editor)••180人規模の180人規模の
査読編集者
査読編集者

ません。論文が取り扱う範囲に関しては提言を行いますが、著者に理不尽な制約を与えることもありません。

(Reviewing(Reviewing Editor)
Editor)

基本的なデータを示し、補足的な情報へのアクセスを改善するために、ビデオやオーディオなどのリッチメ
ディアを論文に盛り込むことを奨励して、できる限り有益なフォーマットにしたいと考えています。オンラ
インコンテンツに関しては、掲載後に付加価値をいか（図 12）に付けられるかが重要な側面となります。私たちはこ13
13eLifeの編集プロセス
eLifeの編集プロセス
上級編集者
上級編集者
(Senior(Senior
Editor)
Editor)

査読に回す論文数を制限
査読に回す論文数を制限
BRE
BRE(Reviewing(Reviewing
Editor)
Editor)Reviewerによる協議
Reviewerによる協議

査読を経た
査読を経た
決定
決定

一貫した指示
一貫した指示――的を絞った修正的を絞った修正
BRE
BRE(Reviewing(Reviewing
Editor
Editor（図 13）

National Institute of Informatics

修正回数を制限
修正回数を制限（図 14）

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 20127

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル
れを実現する方法を示したいと考えていますが、その中に論文があるようなもので、再利用の面でも役立ち一つの方法が論文メトリクスの追加によるものです。

ませんし、閲覧されにくいということになります。

最初からデジタル化することはもちろんのこと、コ

このレポートに記載されていることが、私たちが全ンテンツをできる限り有益にするために最も重要なの

般的に解決しようとしている問題です（図 16）。しかは、コンテンツをより多くの人が無料で閲覧できるよしこの報告書でも、この問題はオンラインで対処できうにすることです。私たちは、クリエイティブ・コモ

るとされています。さらなる改善の可能性もあり、既ンズのライセンスを使用しています。コンテンツはすにこの方向に向かっている出版社もあります。例えば、

べて PMC（PubMed Central）に収録され、掲載料

経済協力開発機構（OECD）の教科書には、グラフのはかかりません。eLife の競合相手である購読制のト下にリンクがあります（図 17）。リンクをクリックすップジャーナルでも、掲載料は通常発生しないからでるとエクセルの表が開くので、要約データから生デー

す。少なくとも当面は、掲載料が発生しないというの

タに移動し、再度グラフを作成することもできて便利

は非常に重要です。

です。そのデータを他のデータと比較し、要約データ

eLife では補足的な情報へのアクセスも改善したいをより効果的にすることもできます。私たちは、主なと考えています（図 15）。これに関しては、補足的な

データセットを Dryad など適切なリポジトリに収録

情報に関するリンクが多いために、それらへのアクセ

して利用可能にすることも著者に求めていきますが、スが難しいことが問題となっています。これは論文の特定のリポジトリへの収録は要求しません（図 18）。

15
15

補足的な
補足的なファイル
ファイルを利用可能にを利用可能に（図 15）（図 17）「膨大なデータから導き出され「膨大なデータから導き出された公の成果物は、それらデータ
た公の成果物は、それらデータから切り離されている、つまりから切り離されている、つまり科学的な取り組みに不可欠な要
科学的な取り組みに不可欠な要
素－アイデアとエビデンスが分
素－アイデアとエビデンスが分離しているように」離しているように」（図 16）

National Institute of Informatics（図 18）

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 20128

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル
なぜならリポジトリは分野によって異なるからです。

能になります。eLife では、こうすることで研究論文

さらに、論文提出時には、使用したデータセットにと基本データをより効果的に結びつけられると考えて関する情報も提出してもらいます。使用したデータセいます。

ットを引証し、それがどこで入手できるのかを明示す

次に、掲載後のコンテンツに付加価値を付与する方

ることを著者に奨励し、それによってデータセット共法についてお話しします。私たちは、その論文がもた

有の効果を一層分かち合うことを奨励していきますらした影響力に関するメトリクスや指標を付け加える（図 19）。

方法も非常に重要だと考えています（図 21）。PLoS

文書による研究の説明と基本データを結びつけるた

はこの分野では先駆者としての役割を果たしてきておめには、まずは説明文と他の場所に収録されていたかり、PLoS に掲載されるすべての論文には上部にメトもしれない基本データセットを結びつけ、次に要約デ

リクスタブがついています。タブをクリックすると論ータとソースデータを結びつけ、その後、図表と論文文についてのデータを見ることができます。時系列的で要約されている内容を補足し、それに関するさらなに累積利用数を表示するグラフや、PLoS およびる情報と実例を提供する図表を結びつけなければなり

PMC (PubMed Central)における使用を示す棒グラフ

ません（図 20）。ここで重要なのが、これらすべてのもあります。棒グラフをクリックすると、その月の使研究対象にそれぞれ固有の識別子とメタデータがつく

用の詳細を見ることができます。

という点です。これによって、検索、閲覧、引用が可

使用データの下には、引用やソーシャルウェブメト
リクスなどの各種データが表示されています。さまざ
まなデータを収集して、論文にデータをちりばめることもできます。こうすることで、その論文がもたらす
影響力を感じることができます。リサーチコミュニケーションにおいて、より多元的で重要な点は、こうした方法により、ジャーナルのインパクトファクターへの執着を捨て、その論文が特に有意義な点やそれがもたらす影響力についてデータを基に論文を真価で評価できるようになるということです。私は、インパクトファクターはあまり好きではありません。インパクト（図 19）

ファクターは革新を妨げるものです。リサーチコミュ
20
20

再現性
再現性を強化を強化•• 文書による説明から一次文書による説明から一次
データソース
データソースへへ•• 要約データから一次データ・
要約データから一次データ・
ソースデータへ
ソースデータへ•• 主要図表から補足的な図
主要図表から補足的な図
表へ
表へ•• すべてが検索・閲覧・引用
すべてが検索・閲覧・引用
可能
可能（図 20）

National Institute of Informatics（図 21）

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 20129

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル
ニケーションにおいてオンラインコミュニケーション

情報に関しては、eLife ではインフラを完備していが実力を発揮できるよう、インパクトファクターに取ます（図 23）。今年末までにジャーナルを創刊したいって代わる方法が強く求められています。

と考えたので、まずは既存のインフラを使用しなけれですから、来年末にウェブサイトを立ち上げ、ソースデータに触れたいと望む読者や利用者の方々に、そばなりません。技術開発については大きな志を持っていますが、まずはここから始めていきます。

のサイトを通じて素晴らしい体験をしていただきたい

eLife では 6 月から投稿の受付を開始していますが、と考えています。複数の場所でコンテンツを増やした

これまでに 100 件を超える論文の投稿がありました。

いと考えているため、コンテンツは PMC（PubMed

既に 4 件の論文について受理済みです。投稿数より

Central）に収録します。機関リポジトリや他の場所も重要なのは論文の質ですが、eLife には優れた論文にもコンテンツを収録していきたいと思っています。

の投稿がありました。受理された論文の一つは既にマ

多くの人がコンテンツにアクセスできるようにするのスコミで紹介されています。この論文は「Science」

みならず、システム的な面でもアクセスしやすいものに取り上げられており、ほかにも「Discover」やとし、ぜひ論文メトリクスにおける改善を図りたいと「The Scientist」に取り上げられています。また、考えています。

論文自体も著者のウェブサイトで読むことができ、「近刊の eLife に掲載予定」とも記載されています（図 24）。これは、eLife のコンテンツに関して私た

進捗状況
私が昨年 11 月に eLife の取組を開始したときに、重点的に取り組まなければならないと感じたことが二つあります。一つはジャーナルを支援し運営するため

23
23

インフラ
インフラ
DDeesig
signn bbyy RRipipeeに必要なスタッフチーム、もう一つは出版を支援するために必要なインフラです。
チーム全員の紹介はしませんが、ここではジェニフ

eeJoJouurrnnaal lPr
Preessss

HHigighhWWiriree

TN
TNQQ

ァー・マクレナンを紹介いたします（図 22）。ジェニ
ファーは米国の SPARC に勤務したこともあり、
eLife のコミュニケーションとマーケティングを担当
しています。他のチームメンバーも、出版界における

eeLife
Life
AAPI
PI
Sto
StorreePM
PMCC（図 23）

素晴らしい経験を持っています。

（図 22）

National Institute of Informatics（図 24）

第 4 回 SPARC Japan セミナー2012 Aug 23, 201210

eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル
ちが成し遂げようとしていることが、正確に論文の著

リティーなものであって、スコープが広く、特に査読者たちに示されているという証拠なので、最も効果的のプロセスなどに特徴を持って、さらにデータの運用

なマーケティングとも言える素晴らしいことなのです。

にもいろいろなテクノロジーを投入しているというこ

これにより、eLife にこのような質の高い投稿がさらとで、雑誌自身としてのトップレベルを目指すことがに増えることを心から望んでいます。

目標なのだと、今初めて理解しました。

eLife は望ましい発展を遂げつつあります。私たち

それでもなお、最初の誤解に基づく質問ですが、やは、eLife が教育、革新、そしてさらなる研究のため

はり特殊な研究助成機関によるサポートを得ているとの効果的なリソースに姿を変えていく中で、この発展いうのは、ほかにないユニークさだと思います。これがリサーチコミュニケーションに大きな影響を与え、がいつまで続くかは分からないにしても物理の分野で研究文献に関する当初のビジョンを推進するための一は SCOAP 3 があり、複数のサブスクライバーが複数助となることを期待しています。

の出版社をサポートしていくという動きもありますが、
eLife は eLife で、複数のファンドが一つの雑誌の立コメント

ち上げを見守っていこうというのはユニークなところだと思います。

（土屋）

ご講演の中で、日本ではオープンアクセス

今日はそれについてあまりお話しになりませんでしに対するポリシーが少しアンクリアだと私から聞いた

たが、どうしてなのでしょうか。また、ファンド自身というお話がありました。確かに、今年 7 月に文部がずっと続けば、またその特徴も続くのでしょうが、科学省から「学術情報の国際発信流通力強化に向けた途切れた場合には普通の APC モデルの雑誌として、基盤整備の充実について」という報告書が出ています。

他の雑誌と、今お話しになった雑誌のユニークさを生

この中でオープンアクセスについて触れており、さらかして戦っていくのだと思います。そのファンドにつに科研費の改革と、機関リポジトリの推進・振興については、どのような見通しを持っておられますか。まいて触れているので、一見ポリシーがあるように見えた、それに関連して、どうしてこのようなファンドかるのですが、あくまで文書のステータスは「審議のまらのバックアップを受けることができたのか。これはとめ」ですから、結論として何らかの提案あるいは勧非常に素晴らしいことだと思いますが、その背景を簡告をするという性質のものではありません。読んで勉

単にお話しいただければと思いました。

強にはなりますが、これによって、では次はここに予
eLife の取組は、私が参加する前か算が付く、このような法律ができるというようなこと（パターソン）に至るものではないので、アンクリアであるとコメン

ら始まっていました。最初に研究助成機関から話があトしたということです。

ったのです。研究助成機関は、科学分野では効果的なコミュニケーションが行われておらず、そのために自分たちの助成対象である科学が過小評価されていると考えています。研究助成機関は、リサーチコミュニケ（Q1）

IOP の亀田と申します。大変面白いお話をーションの改善は研究そのものに欠かせないと考えてありがとうございました。実は、私はお話を聞くまで、

おり、eLife はこうした研究助成機関の直接行動を象

この雑誌について大きな誤解をしていました。この雑徴するものとも言えます。

誌のユニークネスは、ファンドの仕方なのだと思って

研究助成機関からは eLife に対して複数年にわたる

いましたが、お話を聞いて、この雑誌自身がハイクオ非常に強いコミットメントが表明されている一方で、National Institute of Informatics

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eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナル
eLife 自体が持続可能であることも求められています。

（パターソン）

APC の方向を目指し、他の資金源も探っていかなけ

さんあります。例えば、実施中の研究が多すぎて、科ればならないでしょう。今のところ、持続可能な道筋

学者が内容を消化できずに不満を抱えているというケが明確になっているわけではありません。私たちは最ースが増えています。オープンアクセスを採用すれば、

高のジャーナルを創刊することに注力しています。そ

文献を原材料とみなしてそれに基づいたツールを構築

れにより、持続可能な道筋のための基盤を構築するこすることができ、科学者は場所を問わず自分の研究にとができるからです。将来的に研究助成機関からの資

最も関連のある情報を見いだすことができるため、こ金源が得られる可能性もあります。eLife が影響力のうした状況でも役立ちます。こうすることで、オープある新たなジャーナルとして定着すれば、さらなる資ンコンテンツを極めて有効に使用することができるの金源を生み出すスピンオフ商品の発売開始など、多くです。

の可能性が見えてきます。

この考え方が優れている理由はたく

もう一つの例は、文献に関して知りたいことが発生した場合です。例えば、生物医学で、ある遺伝子と特（Q2）

物質・材料研究機構の谷藤です。一番特徴

定の病気が関連しているという証拠を得たいとしまし的だと思ってお聞きしたかったのは、この 1 年、こょう。そう思っても、答えを得るまでには長い時間がの SPARC セミナーでも話題に出なかったリユースのかかります。しかし、より優れたツールがあって、相話です。アクセスの障害をなくすオープンアクセス、互利用可能なオープンリソースとして文献を利用でき

さらにアクセスが自由になったことによって、より自るのであれば、こうした疑問に対する答えをより効果

由にイノバティブなサイエンスを目指したリユースの的かつ有意義な方法で得ることができます。私たちに話として、いろいろと取り組む姿勢をお話しになりまは答えが分からないことが多いのですから。しかし、したが、仕組みとしては元データを生ファイルの形で実際にはこうした優れたツールは存在しません。文献

取ることができるか、それごとの利用回数を計れるかがオープンアクセスで利用可能になりさえすれば、文など、日本でもまだ存在していない先端的なことを実献をより効果的なものとする方法はいくらでもありま証しようとされていますが、科学者コミュニティは本す。

当に、その論文が持つ文脈の中において意味のあるデータを生データとして取って、何かを加えてリユース（Q3）

しようというニーズがあるのでしょうか。

興味深い講演をありがとうございました。

科学とは本来、先人の研究があり、その知見に基づ

科学技術政策研究所の林と申します。大変

私は前職が日本化学会のパブリッシャーだったので、いて次の方が積み重ねることによって進展してきていその観点から質問があります。データの方のパブリッます。それは何もリユースを保証したり、簡易的にしシングにも手を出すそうですが、そこにもやはりコスたりしなくても、科学者たちはそれをしてきている。

トの問題が出ると思います。データハンドリングをしそれは引用という形であるかもしれないし、その論文ようと思うと、例えばデータのコピーエディットのよが持っている文脈でのデータを読み取って、同じ実験

うなものが必要になってくると、そこにコストが発生をしたり、違う手法で理論計算したりすることで、既する。そうすると、それは APC にはね返りかねないにやっていることなのに、それをあえてオープンアク

勢いがあるのではないかという点について、どのようセス化をすることで、より加速し、イノバティブになにお考えでしょうか。

ることのニーズとは、どういうものなのでしょうか。

二つ目は、お話を伺っていると、Patterson さんが目指していることとして、単にオープンアクセス雑誌

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eLife ― 研究者主導の生命科学・生物医科学分野のオープンアクセスジャーナルの出版ではなく、研究者の情報受発信スタイルを変えようというミッションが見えてきます。特にこれもデ（Q4）

筑波大学の佐藤翔です。大変面白いお話をータの話ですが、データハンドリングに対して研究者

ありがとうございました。

に新しいサービスを提供しようと思うと、結果的に研単に良い雑誌を作るというだけではなく、学術出版

究者の実験手法、研究手法の新しい提供というシステに対してもっと波及していくような影響を与えたいとムに踏み込まざるを得ないと思います。すると、雑誌いうお話があったと思いますが、具体的にどのような出版ありきではなくて、研究者の研究スタイルそのもことをして、大きな影響を与えていくおつもりなのでのを変え得るプラットフォームにいずれは転換されよ

しょうか。例えば、eLife が PLoS ONE 並みのすごうとしているのではないかとお見受けしましたが、そく大きな雑誌であれば、1 社で大きな影響を与えるとのようなビジョンがそもそもおありでしょうか。

いうこともあり得そうに思いますが、どうもお話を伺っていると、どれぐらいの規模感なのか分かりません。

（パターソン）

今のところ、私たちはデータ出版を

このままだと、内島さんからお話があった Create

目指しているわけではありません。掲載する論文とデChange のときのように、いい雑誌はできたけれども、ータをより効果的に結びつけようとしているのです。

大きな変化があったのかということになるのかどうか、

これには一部のソースデータファイルも含まれますが、よく見えませんでしたが、どのような方向に波及して大きなファイルではありません。ソースデータは

いく、影響力を増していこうというビジョンがあれば

eLife がホストする小さなファイルで、発生するコス

ぜひお聞きしたいと思います。

トも少なくて済みます。私たちはこれを大きなデータ
私は、発行部数で eLife の影響力をとは分けて考えています。大きなデータセットについ（パターソン）ては、適切と思われるイニシアチブと協力し連携でき測ろうとは考えていません。究極的には自分たちの作るようにしたいと考えています。今回は触れませんで業や世の中の仕組みを通して、自分たちの理解を豊かしたが、データハンドリングやデータパブリッシングにするために研究をしていたり、世界中の生活を改善に特化したものなど、沢山の取組みがあります。

するために研究をしていたりするので、研究成果の利

eLife の任務は、データを結びつけることです。

用可能性や、それがさらなる研究や他の目的のために

私たちの行っていることが研究方法に与えかねない

どのように利用できるかということに、影響を与えら影響に関するご指摘については、私はむしろ逆だと思れるものにしたいと望んでいます。この最終目的の達います。出版とは研究を促進するためのものですから、成に向け、いかに研究を利用するかについて、eLife

出版のあり方を変える必要はあると思いますが、研究が何らかの形で変化をもたらしつつ貢献できれば素晴

方法を変えるのではなく、研究を可能にし、促進してらしいことだと考えています。

いかなければなりません。研究の再現性の欠如も問題
点として指摘されていますが、私たちは出版社として、データから方法論、結果、議論、そして最終的な結論に至るまで、人々がロジックを追って、そのロジックの一部を再現したり検証したりできるように、研究成果をできる限り効果的に提示しなければなりません。
私たちは出版というものを、研究を促進し、その研究の波及効果を生み出すものとして捉えるべきなのです。

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