— 85 —SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）［大規模科学計算システム］

アプリケーションサービスの紹介
情報部情報基盤課 共同利用支援係

はじめにƦ ÕȘɃțɅoōèĝwŔħȔȖȠȶǥǫǀ9sŴƁŔħǀÀ7ĆǀåŽőÜǀȡɅț7ĆĦǪPȁȯȾȏɅȔȼɃȚȭȢȄȅȁǾǀ=ĉľǪǈŋÑǩǋǊǖǤȒɅȫȖǖǤǈǲǘǁÕğǥǫǀ:ȐɃȬȺɅț LX
406Re-2 ǥȒɅȫȖǾŅǡǤǈǻȁȯȾȏɅȔȼɃȚȭȢȄȅȁǪĮǾǖǲǘǁ
I 1. ¥¿É®Í±ÇÌ³¾¹§¨¥°Í¼²À²¹ȁȯȾȏɅȔȼɃȚȭȢȄȅȁ
9sŴƁŔħȚȭȢȄȅȁ
KıųŀC³ĬȯɁȎȽȶĴQaÀ)ŔħȚȭȢȄȅȁ
òĉåŽőÜȯɁȎȽȶåŽőÜĉòĉȯȾȳȖȢȚȭȢȄȅȁ
řaőÜȚȭȢȄȅȁ

Gaussian
GRRM11Mathematica
Marc/Mentat
PatranMATLABȒɅȫȖȲȖȢ

front.cc.tohoku.ac.jpƦ ȁȯȾȏɅȔȼɃȚȭȢȄȅȁǪĮǫǀǪ URL ǪÕȘɃțɅoōèĝwŔħȔȖȠȶ Web ȱɅȕǩǶµŶǖǤǈǲǘǁ
http://www.ss.cc.tohoku.ac.jp/application/index.html
Ʀ Õğ Ǫ5|ǫ 2015  3 ÏĄ`ǪǶǪǥǘǪǥǀȁȯȾȏɅȔȼɃȚȭȢȄȅȁǪȨɅȕȼɃȁȞȯǷ=ĉÄôǪÎÃ eǩǢǈǤǫǀWeb ȱɅȕǾƓÈǔėŜǏǟǕǈǁ

ご利用の前にn リモートログインƦ ȖɅȩɅȐɃȬȺɅțǀ:ȐɃȬȺɅțǰȾȸɅȢɁȎȃɃǘǻ§ƝǥǘǁSSHɈSecure SHellɉ´ĵǾŅǈǲ
ǘǁȁȯȾȏɅȔȼɃǾ=ĉǘǻƔǫǀ:ȐɃȬȺɅțǩɁȎȃɃǖǲǘǁGUI ȁȯȾȏɅȔȼɃǾ=ĉǘǻfQ
ǫǀGUI ア プ リ ケ ー シ ョ ン を 利 用 す る 方 法 ǾQǽǚǤǔJýǏǟǕǈǁ
I 2. M?0±²¸Ã),P5
ȔȖȠȶ

ȲȖȢT

OS

ÅÕŝćh

:ȐɃȬȺɅț
LX 406Re-2

front.cc.tohoku.ac.jp

Linux

UTF-8

Ʀ SSH ǫŻ%ųǪȡɅțǾÉOEǘǻǓǦǥx1ǾƥǵǞȯɁȎȽȶǥǘǁ=ĉǖǤǈǻĤÔǍ UNIX,
Linux, OS X ǪfQǫ SSH ȍȽȃȁɃȢȚȭȢǍȃɃȖȢɅȿǕǼǤǈǲǘǁȃɃȖȢɅȿǕǼǤǈǨǈfQǫĤ
ÔǪĨĆľǩǔēŢǏǟǕǈǁ
Ʀ :ȐɃȬȺɅțǪ OS ǫ Linux ǥǘǁ2ƋƈÉOÄǩǸǻŜŗǪǳ=ĉǥǎǲǘ1ǁȁȉȄɃȢÑǪf
Qǫǀ3S=ĉ½¹#ǩ=ĉċţǖ=ĉľĎOǦ;ÓȩȖɂɅȣǾďŅǖǤǶǹǈǲǘǁ

ƬƦȩȖɂɅȣŜŗÄǫ ƭƫƬư  Ư Ï ƬƮ ÅǥëǖǲǖǞǁƦ

— 86 —

SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）

Ʀ :ȐɃȬȺɅțǰǪ;[ɁȎȃɃÈǩǫ2ƋƈǦĞ}ƈǪȱȁǾ¥ǘǻŋǍǇǺǲǘǁƈȱȁǪ¥ÄôǩǢǈǤǫÕś105ȱɅȕǪǃSSH ȁȍȘȖŜŗƈĈ¥ȒɅȨǪ=ĉÄôǄǾǔJýǏǟǕǈǁƦ ǨǋǀTļǪ=ĉľĎOǥǪȔȖȠȶ=ĉǫěëǖǲǘǁȩȖɂɅȣǀĞ}ƈǀȩȖȭɀɅȗǪǈ[ǖǫǀìȁȍȘȖǪȾȖȍɈìɁȎȃɃǀȍȽȃȁɃȢǪǨǺǘǲǖǀÉOEǕǼǞŻ%ǪÊƘǀȒɅȨǰǪ¾»ĦɉǍƚǩƥǏǀomHƐǥǘǁ=ĉľĐƇǾŅǉǓǦǩǸǻƌĶ®ŭĦǫďĈǖǲǚǿǪǥǀ=ĉǕǼǻÄǫǜǼǝǼǥ=ĉċţǾǋơǈǈǞǖǲǘǁ

Ʀ
【UNIX, Linux からのログイン】
Ʀ Ʀ ǃțɅȵȤȿǄǀǃĤÔǄǀǃterminalǄǨǧǪ SSH ȍȽȃȁɃȢȚȭȢǾůCǖǲǘǁȐȴɃȣǾ0AǘǻȯɁɃȯȢǍňęǕǼǀȐȴɃȣǪǠMǑĂ£ǩǨǺǲǘǁ
É²¹ 1. ¯Ì½ÆÍ´Ë­¦Ì

localhost$	
  ssh	  -­‐i	  ~/.ssh/id_rsa	
  利用者番号@front.cc.tohoku.ac.jp	
  Enter	
  passphrase	
  for	
  key	
  '/home/localname/.ssh/id_rsa':パスフレーズを入力	
  （初回接続時のメッセージ）	
  :	
  yes	
  を入力	
  front1	
  $	
  （コマンド待ち状態）	
  【OS X からのログイン】
Ʀ ǃțɅȵȤȿ.appǄǾůCǖǲǘǁ´ĵÄôǫŕǦSǗǥǘǁ【Windows からのログイン】l zzr ¬È¦¥Ì¹³¾¹µ§ÌËÍº¦Ì²¹ÍÊ^Ʀ SSH ȍȽȃȁɃȢȚȭȢǪǢǥǇǻǃTera TermǄǦǈǉȭȾɅȚȭȢǾȃɃȖȢɅȿǖǲǘǁǪȱɅȕǌǹȜȄɃɁɅȣǥǎǲǘǁ2015  3 ÏĄ`ǪÎÃĀǫ 4.86 ǥǘǁȜȄɃɁɅȣȃɃȖȢɅȿâǾŅǡǤǏǟǕ
ǈǁ
Tera Term ȜȄɃɁɅȣȱɅȕɏƦ
http://sourceforge.jp/projects/ttssh2/Ʀl  ¯Ì½ÆÍ´ %E^
Ʀ ǃȲȖȢTǄǾ¯yǀǃȒɅȫȖǄǫ SSH2 ǾƂ«ǖǀ[OK]Ǿ¬ǖǲǘǁ

— 87 —

アプリケーションサービスの紹介Ʀ ǃȻɅȓTǄǩ=ĉľĎOǀǃȩȖȭɀɅȗǄǩƈȱȁǾ¥ǖǞƔǩ0AǖǞǶǪǾ0AǀǃRSA/DSA ƈǾǉǄǾƂ«ǖǀǃĞ}ƈǄǩ$uǖǞĞ}ƈǪȭȀȃȿǾ¯yǖǲǘǁ
ɈĞ}ƈȭȀȃȿǪƂ«Čƛǥǫǀ­sǃǘǱǤǪȭȀȃȿ(*.*)ǄǾƂ«ǖǲǘɉ[OK]Ǿ¬ǘǻǦ´ĵǕǼǲǘǁ

ƦƦ【シェルの初期設定】
Ʀ oōèĝwŔħȔȖȠȶǥǫǀ ǋDǵǪ;ÓćhŖyǾĉ¢ǖǤǈǲǘǁ ǓǼǩǸǺȩȖǨǧǪcÕđǨŖ
yǀǲǞPȁȯȾȏɅȔȼɃǪćhmÀĦǍŀCđǩŖyǕǼǲǘǁǓǼǫǀ=ĉĐƇÈǩ(ǂǪ ID ǩǇǹǌǗǵŅǡǤǈǲǘǪǥǀ ŻǫâǪŋǫǇǺǲǚǿǁƦ ȁȯȾȏɅȔȼɃǍ=ĉǥǎǨǈǦǈǉfQǩǫǀ ǓǪŖyǍmÌǕǼǤǈǻǓǦǍĽǊǹǼǲǘǁ .cshrc ȭȀȃȿ(csh Ǿ=ĉǘǻfQǀȘɃțɅǪōy))Ʀ ǲǞǫ .login ȭȀȃȿɈsh Ǿ=ĉǘǻfQɉǩǀȘɃțɅǥĉ¢ǖǤǈǻ;ÓŖyȭȀȃȿƦ /usr/skel/Cshrc ǲǞǫ/usr/skel/Login ǾŠǳŷǴŖyǦǨǡǤǈǻǓǦǾėŜǖǤ
ǏǟǕǈǁŖyǾmÌǖǞfQǫǀŖyǾKÇǕǚǻǞǵǩɁȎȃɃǖĒǖǤǏǟǕǈǁ

【ファイル転送】l ¯ÂÌºÈ¦Ì¾¤¦ÊTU^Ʀ ɁɅȉȿĤÔǌǹǃscpǄǀǃsftpǄȐȴɃȣǍ=ĉǥǎǲǘǁǧǠǹǪȐȴɃȣǶŻ%ıųǫÉOEǕǼǤǈǲ
ǘǪǥx1ǪƥǈȭȀȃȿŵźǍǥǎǲǘǁ=ĉÄôǩǢǈǤǫǜǼǝǼǪȴȥȺȁȿǾǔJýǏǟǕǈǁƦl ¥¿É®Í±ÇÌ£ 6¾¤¦ÊTU^Ʀ ȭȀȃȿŵźǾŅǉňđǨȁȯȾȏɅȔȼɃǫ Linux ǥǫǃgftpǄǀWindows ǥǫǃWinSCPǄǀOS X ǥǫǃCyberduckǄǨǧǥǘǁ=ĉÄôǩǢǈǤǫǜǼǝǼǪȴȥȺȁȿǾǔJýǏǟǕǈǁȁȯȾȏɅȔȼɃǪŖyǩǋǈǤǀŵźȯɁȢȐȿǫ SSH2 ǾƂ«ǖǤǏǟǕǈǁŻ%ıųǫÉOEǕǼǲǘǁl  >+£ 6¾¤¦ÊTU^Ʀ ȘɃțɅɌF Ǫ=ĉēŢ{ǩŖĻǕǼǞ08AĤÔǾ=ĉǖǤǀUSB ´ĵɈUSB3.0 ɉǪ HDD ǩȲɅȶȡȂɀȍȢȾǪȡɅțǾȐȬɅǘǻǓǦǍǥǎǲǘǁȘɃțɅ5ȦȞȢɂɅȍǌǹǪȁȍȘȖǥǀƥżǨȭȀȃȿǪȐȬɅǍNĿǥǘǁ=ĉÄôǫȘɃțɅǲǥǋYǈQǽǚǏǟǕǈǁ

— 88 —

SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）n GUI アプリケーションを利用する方法
Ʀ GUI ǾĉǈǞȁȯȾȏɅȔȼɃɈMSC. Mentat, Mathematica, MATLABɉǪzŅǩǫǀɁɅȉȿȴȔɃǩ X
Window System ćhǪŖyǍŋǥǘǁƦ

【UNIX, Linux からの利用】ƦƦ çúǥ X Window System ǍȃɃȖȢɅȿǕǼǤǈǲǘǁɁɅȉȿĤÔǌǹǪæǩɁȎȃɃǖǤǏǟǕǈǁ
X Forwarding ǩǸǺɁɅȉȿČƛǩȁȯȾȏɅȔȼɃČƛǍňęǕǼǲǘǁ
Ʀ
É²¹ 2. Matlab £Q¢	
  localhost$	
  ssh	  -­‐i	  ~/.ssh/id_rsa	
  利用者番号@front.cc.tohoku.ac.jp	
  Enter	
  passphrase	
  for	
  key	
  '/home/localname/.ssh/id_rsa':パスフレーズを入力	
  （初回接続時のメッセージ）	
  :	
  yes	
  を入力	
  front1	
  $	
  matlab	
  	
  
	
  

ƿɌƦ oÁtǪƽXƾǥǘǁ【Windows からの利用】l 6¥¿É®Í±ÇÌ£ 6¢^Ʀ Windows ĉ X ȒɅȨǫǀX ȒɅȨȚȭȢǦǖǤǈǏǢǌǪȷɅȉǌǹŪlǕǼǤǈǲǘǁƦ Ʀ ɄASTEC-X ɈȁȖȠȞȍɄȆȞȍȖɉƦ Ʀ ɄExceedɈOpen Text ExceedƦ ȈɅȯɃȠȋȖȢɄȆȍȔɅȣɉƦ ǜǼǝǼǪ=ĉÄôǩǢǈǤŚǖǏǫPĚǪ HP ǾǔJýǏǟǕǈǁǧǠǹǪȚȭȢǶüÂŘ"ĀǍǇǺǲǘǁ	 l ~ 9 t £¦Ì²¹ÍÊ¢^Ʀ Windows ǩǃOracle VM VirtualBoxǄɈǃVirtualBoxǄɉǦǈǉ¡EȚȭȢȄȅȁǾȃɃȖȢɅȿǖǀǜǪć
hǩ Linux ǾȃɃȖȢɅȿǖǲǘǁƦ ǃVirtualBoxǄǫǪȱɅȕǌǹȜȄɃɁɅȣǥǎǲǘǁǃVirtualBox platform packagesǄɈĄ`ĉǖǤǈ
ǻ OS ǩQǡǞǶǪɉǦǃVirtualBox Extension PackǄǪÄǾȜȄɃɁɅȣǖǀȃɃȖȢɅȿǾŅǡǤǏǟǕǈǁȃ
ɃȖȢɅȿÄôǪŚĭǫȴȥȺȁȿǾǔJýǏǟǕǈǁ2015  3 ÏĄ`ǪÎÃĀǫ 4.3.24 ǥǘǁ
VirtualBox ȜȄɃɁɅȣɏ

https://www.virtualbox.org/wiki/Downloads

— 89 —

アプリケーションサービスの紹介

VirtualBox 4.3.24 Q7\

Ʀ Linux ǪȡȂȖȢȾȫȺɅȔȼɃǀȨɅȕȼɃǩǸǡǤǫ GUI ȁȯȾȏɅȔȼɃǍìǖǏňęǕǼǨǈfQǍǇǺǲ
ǘǁȘɃțɅǥCėŜǾŅǡǤǈǻǪǫǀDebian 7.4.0 ǥǘǁǪȱɅȕǌǹȜȄɃɁɅȣǖǀVirtual BoxǪ¡ćhǩȃɃȖȢɅȿǖǤǏǟǕǈǁX Window System Ǫ=ĉǟǑǨǹȃɃȖȢɅȿ CDɈ680MBɉǪȃɃȖȢɅȿǥNĿǥǘǁȃɃȖȢɅȿÄôǪŚĭǫPȴȥȺȁȿǾǔJýǏǟǕǈǁ
Debian ȜȄɃɁɅȣɏ

http://www.debian.org/CD/

Ʀ Linux ǾȃɃȖȢɅȿ GNOME classic ȸɅȣǥůCǖǀLinux ǪĤÔǌǹ ǅUNIX, Linux ǌǹǪ=ĉǆ ǦS
æǩ=ĉǥǎǲǘǁ
Windows ¢ÐÑÒÓÔÎDebian 7.4.0Ï

— 90 —

SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）【OS X からの利用】
Ʀ OS X ǥǫçúǥ X Window System ćhǪǃX11.appǄǍȃɃȖȢɅȿǕǼǤǈǲǘǪǥǀOS X ǪĤÔǌǹ
ǅUNIX, Linux ǌǹǪ=ĉǆǦSæǩ=ĉNĿǥǘǍǀGUI ȁȯȾȏɅȔȼɃǩǸǡǤǫňęǪ4QǍǇǻf
QǍǇǺǲǘǁǜǪfQǫǀ Windows に仮想的な Linux をインストールする場合	
 ǦSæǪÄôǥǀLinux ǾȃɃȖȢɅȿǖǤǔ=ĉǏǟǕǈǁ	
 
	
 
	
 

— 91 —

アプリケーションサービスの紹介

アプリケーションソフトウェア
ƚıƤđ9sŴƁŔħȯɁȎȽȶƦƦƶƸƼƻƻƹƸƺ ȯȾȳȖȢȔȖȠȶƦ
Ʀ^KıųŀC³ĬȯɁȎȽȶƦ ƦƦòĉåŽőÜȯɁȎȽȶƦƦƦƦåŽőÜĉòĉȯȾȳȖȢȚȭȢȄȅȁƦ
ƦÀ7ĆȯɁȎȽȶƦƦƦƦĝw©ņŔħœŝƦ
Ʀ
Ʀ

[C]9

qehƦq}^qyyuff^uzmcu^d^uzmcu^uƦ
uzmcxƦu Ʀuk{tklƦ

SWM?¿Ë­ÈÃ Gaussian09

Ʀ Gaussian ǫǀCarnegie-Mellon owǪ Pople Ǿ ǦǖǤƋďǕǼǞ9sŴƁŔħȯɁȎȽȶȩȞȏɅȕǥǘǁĩ]ǩǽǞǻƚıƤđȸȡȿǋǸǮGıƤđȸȡȿǾȒȳɅȢǖǤǈǲǘǁƦ ÕȘɃțɅǪ Gaussian ǩǫǀǪǸǉǨāƉǍǇǺǲǘǁ
•	  Îo ƭƯ :ǲǥǪ:7ĆǍŅǊǀzŅÈƌǪĔĺǍNĿǥǘǁƦ•	  ȖȍȽȞȝȭȀȃȿƧȠɃȳȽȾȭȀȃȿƨǾƥżǨ ƷƷƵ ȡȂȖȍǩĻǏǓǦǩǸǺǀȭȀȃȿ08AÈƌǍĔĺǕ
ǼǲǘǁƦn サービスホスト・バージョン
front.cc.tohoku.ac.jp Ʉ Gaussian09 D.01

n 利用方法Ʀ ǫ Gaussian =ĉÄôǪãŋǥǘǁ

【実行コマンド】
Ʀ Gaussian ǪȃɃȯȞȢȭȀȃȿǫǀ­sǾ .com Ǧǖǲǘǁ ( ɏƦ e2-01.com )Ʀ ȃɃȯȞȢȭȀȃȿǾ Windows ǪȆȡȂțǥ¥ǖǞfQǀ­s.com ǪȭȀȃȿǫ Windows ǥǫzŅȭȀ
ȃȿǦŜŧǕǼǻǞǵǀ ŞǡǤȜȮȿȍȾȞȍǨǧǥȃɃȯȞȢȭȀȃȿǾzŅǖǨǈǸǉǔö¢ǏǟǕǈǁ ǲǞǀȭȀȃȿŵźȚȭȢǥ front ǩŵźǘǻƔǩǫȁȖȋɅȸɅȣǾ¯yǖǀŵźǖǤǏǟǕǈǁ
Ʀ front.cc.tohoku.ac.jp ǩɁȎȃɃǀ subg09 ȐȴɃȣǩȋȺɅTǦ0AȯɁȎȽȶTǾ¯yǘǻǓǦǩǸǺǀȨ
ȞȝȾȍȆȖȢǦǖǤzŅǕǼǲǘǁȾȍȆȖȢǫȁȯȾȏɅȔȼɃĉǪ=ĉ£ɈıƀÈƌü>ƎǀÎo:À
24ǀÎoȷȸȾ 128GBɉǩª0ǖǲǘǁ— 92 —

SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）

É²¹ 3. e2-01.com £K-¢¯ÂÌº(subg09 ¯ÂÌº¾¤¦Ê£#¢Z" .com £:¡)	
  [front1	
  ~]$	
  subg09	
  -­‐q	  lx	
  -­‐b	
  a	
  e2-­‐01	  	
  【12 および 24 並列実行の指定】
Ʀ ÕȘɃțɅǥȒɅȫȖǖǤǈǻ Gaussian ǥǫǀ12 ǋǸǮ 24 :ǥǪ:7ĆǍNĿǥǘǁoǎǨ9sǪőÜǩǛǭǔ÷ĉǏǟǕǈǁƦ
12 ǲǞǫ 24 :ǥzŅǘǻǩǫǀȿɅȢȘȍȔȼɃǩ Link 0 ȐȴɃȣǪ%NProc=:ÀǾŹBǖǲǘǁ§0A
ǪfQǫǀȠȋȖȢȆȡȂțǥ/ƟŅǩŹBǀ GaussView ĦǥǫȃɃȯȞȢȭȀȃȿ¥ČƛǪ Link 0 sectionǪƜǩŹBǖǤǏǟǕǈǁ
Ʀ【使用メモリ量の指定】
Ʀ zŅǖǤǃȷȸȾƅǍŲǺǨǈǄǦǈǉȆȽɅǩǨǡǞfQǫǀ Link 0 ȐȴɃȣ %Mem= ǥĉȷȸȾƅǾiǷǖ
ǤǏǟǕǈǁ
Ʀ
É²¹ 4. 24 ÄÅÉ 16GB N£¦Ì¿·¹¾¤¦Ê e2-01.com £G¢	
  [front1	
  ~]$	
  cat	
  e2-­‐01.com	
  ^¦Ì¿·¹¾¤¦Ê£I<^	
  	
  %NProc=24	
  	
  	
  	
  ^ & 	  
	  %Mem=16Gb	
  	
  	
  	
  ^ÄÅÉX 	
  	
  	
  	
  
	
  #	
  RHF/6-­‐31G(d)	
  Pop=Full	
  Test	  	  	  Formaldehyde	
  Single	
  Point	
  
	
  
	
  0	
  1	
  
	
  C	
  	
  	
  0.	
  	
  	
  0.	
  	
  	
  0.	
  
	
  O	
  	
  	
  0.	
  	
  1.22	
  	
  0.	
  
	
  H	
  	
  .94	  	
  -­‐.54	
  	
  0.	
  
	
  H	
  -­‐.94	
  	
  -­‐.54	
  	
  0.	
  
	
  
[front1	
  ~]$	
  subg09	
  -­‐q	  lx	
  -­‐b	
  a	
  e2-­‐01	  	
  【実行結果の確認】
Ʀ ŔħǍįǘǻǦǀȃɃȯȞȢȭȀȃȿTǩ­s.log ǍǢǑǹǼǞĲÞȭȀȃȿ ( ɏ e2-01.log )Ǎ¥ǕǼǲǘǁŔħĲÞǾǫǗǵǀCPU ÈƌǨǧǪŔħéĉƅǩƍǘǻ eǶǓǓǩUǲǼǲǘǁ
ìįǨǹǬǀǓǪȭȀȃȿǪÔǩ ǃNormal termination of Gaussian 09.ǄǦǈǉȷȞȘɅȕǍ8AǕǼǲǘǁȭȀȃȿǪÔǾňęǘǻ tail ȐȴɃȣǥėŜǥǎǲǘǁ

アプリケーションサービスの紹介— 93 —

É²¹ 5. GD.;O[front1	
  ~]$	
  tail	
  e2-­‐01.log	
  
	
  :	
  
	
  Job	
  cpu	
  time:	  	  0	
  days	  	  0	
  hours	  	
  0	
  minutes	
  30.7	
  seconds.	
  	
  File	  lengths	  (MBytes):	  	
  RWF=	
  	
  	
  11	
  Int=	
  	
  	
  	
  0	
  D2E=	
  	
  	
  	
  0	
  Chk=	
  	
  	
  	
  8	
  Scr=	
  	
  	
  	
  1	
  
	
  Normal	
  termination	
  of	
  Gaussian	
  09	
  at	
  Mon	
  Nov	  1	  12:00:00	
  2006.	
  
	
  

•	
  ĲÞȭȀȃȿǪŚĭǨŌÄǫǀȴȥȺȁȿĦǾǔJýǏǟǕǈǁƦ

【チェックポイントファイル】
Ʀ ȝȅȞȍȳȃɃȢȭȀȃȿǫǀȡȭȇȿȢǥ¥ǕǼǻĲÞȭȀȃȿɈ.log ȭȀȃȿɉǸǺŚĭǨĲÞǍ8AǕǼǀŔ
ħǪǷǺĒǖǷĲÞǾČ,ňęǘǻǞǵǨǧǩĉǕǼǲǘǁȝȅȞȍȳȃɃȢȭȀȃȿǾ8AǘǻǩǫǀȿɅȢȘȍȔȼɃǩ Link 0 ȐȴɃȣǪ _m jチェックポイントファイル名 ǾŹBǖǲǘǁ

n マニュアルƦ ÕȘɃțɅÕƣ 1 ƒ =ĉēŢ{ǩǪŮÂǾ+ǊǤǇǺǲǘǁ
•
•
•
•
•
•
•
•

ƗsåŽŤǩǸǻEwǪ³ñ ĥĀ,ȊȄȔȁɃĚ,1998
Gaussian 09 User's Reference
Gaussian 09 IOps Reference
Gaussian 09 Online Manual, http://www.gaussian.com/
Gaussian ȯɁȎȽȶǩǸǻƅsEwŔħȴȥȺȁȿƦ ɏƦ d¤êɊ Z8Ā
ǘǐǥǎǻƅsEwŔħȫȌȤɅȗȴȥȺȁȿƦ ɏƦ íêƆ ɊŦŢĚǘǐǥǎǻ9sȔȵȺɀɅȔȼɃȫȌȤɅȗȴȥȺȁȿƦ ɏƦ ƉìƑɊŦŢĚ
Gaussian ȯɁȎȽȶǥwǯ eEwɄŔħEwzƤƦ ɏƦ d¤êɊ Z8Ā

Gaussian ¿ÉÁ²¹±²¸Ã GaussView
Ʀ GaussView ǫǀ9sŴƁŔħȯɁȎȽȶ Gaussian ǪȯȾȳȖȢȔȖȠȶǥǘǁWindows 8/7/Vista, LinuxºŶǪȩȚȐɃǨǧǥCǖǀ0AȡɅțǪ¥ǀŔħĲÞǪNŎEǾ 3 ê.đǩŅǉǓǦǍǥǎǲǘǁ

n バージョンưƪƫƪƱƦ
^n お申し込み^Ʀ =ĉǔÑǪÄǩǀ GaussView Ǫ CD-ROM ǾŬǖ8ǖǈǞǖǲǘǁƦ Ʀ =ĉØƦ Ʀ Ʀ Ʀ ɄÚFow5ǪÄ

— 94 —

SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）

Ʀ CD-ROM ǫǀǋ§ÀǥǘǍ Gaussian =ĉċţÍǾȲɅȶȱɅȕǸǺȜȄɃɁɅȣǖǤǔŕ0ǪǀȘɃțɅǲǥĒ´ǋűǖǏǟǕǈǁ

n 利用方法Ʀ ȃɃȖȢɅȿÄôǀȡɅț¥ÄôǨǧǩǢǈǤǫSßȴȥȺȁȿǲǞǫǪɑɒǾǔJýǏǟǕǈǁ
^ȪȺɅȾɃȍȖ Gauss View 5ɏ http://www.hulinks.co.jp/software/gaussview/Ʀ :ȐɃȬȺɅț front.cc.tohoku.ac.jp Ǫ Gaussian ǥőÜǾzŅǘǻ§ƝƦƦ
1. 0AȡɅț¥ǀGaussian ǪȃɃȯȞȢȭȀȃȿǃ.comǄǦǖǤȆȍȖȳɅȢǖǲǘǁ
2. ȃɃȯȞȢȭȀȃȿǾ front.cc.tohoku.ac.jp ǩŵźǖǲǘǁ
3. front.cc.tohoku.ac.jp ǩɁȎȃɃǖǲǘǁ
4. subg09 ȐȴɃȣǩǸǺőÜǾzŅǖǲǘǁ
5. ĲÞȭȀȃȿǾŵźǖ GaussView ǥňęǖǲǘǁ
ƦȝȅȞȍȳȃɃȢȭȀȃȿ(.chk)ǫǀGaussian ǪȻɅȠȂȾȠȂȐȴɃȣ formchk ǩǸǺÍ(.fchk)ǩm¸ŵźǖǤǏǟǕǈǁ

CRF$A¿Ë­ÈÃ GRRM11
Ʀ GRRM ǫǀ2002 ǩÚFowɈ¿±ɏoƄ2ǀ&kɌɏ?ĊĆǀÈɉǥ>ǍƋrǕǼǀǜǪƋďǍſǵǹǼǤǀ2011 ǩǫ GRRM11ɈƋďľɏ ?ĊĆǀƉĊÐǀťþq6ǀoƄ2ɉǦǖǤǏ=ĉǕǼǻǸǉǩǨǺǲǖǞǁGRRM ǩǫǀǪǸǉǨāƉǍǇǺǲǘǁ
••g09 Ƿ g03 ȯɁȎȽȶǨǧǾĉǈǞƚıƤđƅsEwŔħǩcǣǈǤǀPEwǥňǕǼǻåŽ
ǷKıųǾŀCđǩ³Ĭǖǲǘǁ
ŇåŽǌǹ8ďǖǤǀǜǪW]ǩu`ǘǻKıųǾǀȳȠɃȔȹȿǪƚšXÄîǳǾá8ǖǤǀĪĴđǩšǱǒǻŰąƛ³ĬȁȿȑȾȗȶǍºŶǕǼǤǋǺǀÙNĿǥǇǡǞɎIsǪKıųŀC³ĬǾŅǉǓǦǍǥǎǲǘǁ

n サービスホスト・バージョン
front.cc.tohoku.ac.jp Ʉ 11.01

n 利用方法Ʀ =ĉÄôǫȘɃțɅǪȲɅȶȱɅȕɈhttp://www.ss.cc.tohoku.ac.jp/application/grrm11.htmlɉǾǔŏǏǟǕ
ǈǁn GRRM プログラムの詳細
Ʀ GRRM ǪŚĭǩǢǈǤǫǀNPO ô ƅsEw³ĬĕĠ¦Ɉhttp://iqce.jp/ɉǀEwKıųŀC³ĬǪ
Web ȱɅȕ(http://grrm.chem.tohoku.ac.jp/GRRM/)ǾJýǖǤǏǟǕǈǁǲǞǀGRRM ȯɁȎȽȶǫĄ`Ǖǹ

— 95 —

アプリケーションサービスの紹介ǩƋďǍſǵǹǼǤǈǲǘǁ=ĉôǪŚĭǷÃǖǈ
(žĳ/ȁȣɀȖɏohnok@m.tohoku.ac.jp)eǾǻǩǫǀƋďľǦžĳǾǦǻǓǦǾǋDǵǖǲǘǁ

n GRRM プログラムの文献と研究成果発表時の引用義務
Ʀ GRRM11 ǾĉǈǤǞ¥ÞǾ2ňǘǻǦǎǫǀêǪǸǉǨǥǀŃľT, ȯɁȎȽȶT, version TɈGRRM
8AǪ log ȭȀȃȿJýɉǾĉÁăǦǖǤŕŶǖǤǏǟǕǈǁ	  Satoshi	  Maeda,	
  Yuto	  Osada,	  Keiji	  Morokuma,	
  and	
  Koichi	
  Ohno,	  GRRM11,	
  	
  Version	  11.01,	
  2011.	
  	
  Ʀ ǲǞǀGRRM ȯɁȎȽȶǩºŶǕǼǞȈȯȔȼɃǪŚĭǩǢǈǤǫǀǜǼǝǼŕǪÁăǾJýǖǤǏǟǕ
ǈǁǓǼǹǪȈȯȔȼɃǾ=ĉǖǤǞĕĠ¥ÞǾ2ňǘǻƔǩǫǀêǩęǘ GRRM ǩƍǘǻɍǢǪcÕÁă
(1)-(3)ǋǸǮǀǩęǕǼǞPȈȯȔȼɃǩǘǻÁăǾĉǖǨǑǼǬǨǺǲǚǿǁ
l qyyui^^(1) K. Ohno, S. Maeda, A Scaled Hypersphere Search Method for the Topography of Reaction
Pathways on the Potential Energy Surface., Chem. Phys. Lett., 2004, 384, 277-282.; (2) S. Maeda, K.
Ohno, Global Mapping of Equilibrium and Transition Structures on Potential Energy Surfaces by the
Scaled Hypersphere Search Method: Applications to Ab Initio Surfaces of Formaldehyde and Propyne
Molecules., J. Phys. Chem. A, 2005, 109, 5742-5753.; (3) K. Ohno, S. Maeda, Global Reaction Route
Mapping on Potential Energy Surfaces of Formaldehyde, Formic Acid, and their Metal Substituted
Analogues., J. Phys. Chem. A, 2006, 110, 8933-8941.
l gxzrzi^^
S. Maeda, K. Ohno, A New Approach for Finding a Transition State Connecting a Reactant and a
Product without Initial Guess: Applications of the Scaled Hypersphere Search Method to Isomerization
Reactions of HCN, (H2O)2, and Alanine Dipeptide., Chem. Phys. Lett., 2005, 404, 95-99.
l zm~i^^
S. Maeda, K. Ohno, Conversion Pathways between a Fullerene and a Ring among C20 Clusters by aSphere Contracting Walk Method: Remarkable Difference in Local Potential Energy Landscapesaround the Fullerene and the Ring., J. Chem. Phys., 2006, 124, 174306/1-7.
l tknnb^vtb^vy|vi^
S. Maeda, K. Ohno, Structures of Water Octamers (H2O)8: Exploration on Ab Initio Potential Energy
Surfaces by the Scaled Hypersphere Search Method., J. Phys. Chem. A, 2007, 111, 4527-4534.
l p^ki^
S. Maeda, K. Ohno, Lowest Transition State for the Chirality-Determining Step in Ru{(R)-BINAP}Catalyzed Asymmetric Hydrogenation of Methyl-3-Oxobutanoate., J. Am. Chem. Soc., 2008, 130,17228-17229.
l o^ki^
S. Maeda, K. Ohno, K. Morokuma, An Automated and Systematic Transition Structure Explorer in
Large Flexible Molecular Systems Based on Combined Global Reaction Route Mapping andMicroiteration Methods., J. Chem. Theory Comput., 2009, 5, 2734-2743.
l wi^
S. Maeda, K. Ohno, K. Morokuma, Updated Branching Plane for Finding Conical Intersections without
Coupling Derivative Vectors., J. Chem. Theory Comput., 2010, 6, 1538-1545.
l upi^
S. Maeda, K. Ohno, K. Morokuma, Automated Global Mapping of Minimum Energy Points on Seams of
Crossing by the Anharmonic Downward Distortion Following Method: A Case Study on H2CO., J. Phys.

— 96 —

SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）

Chem. A, 2009, 113, 1704-1710.; S. Maeda, K. Ohno, K. Morokuma, Exploring Multiple Potential
Energy Surfaces: Photochemistry of Small Carbonyl Compounds, Adv. Phys. Chem. 2012, 2012,
268124.

n マニュアル
Ʀ PDF ǪȴȥȺȁȿǍȘɃțɅǪȲɅȶȱɅȕǌǹJýǥǎǲǘǁ
•GRRM ȯɁȎȽȶ=ĉȊȃȣ
•GRRM ǪzŅÄôɈÚFowȒȃȨɅȒȃȆɃȖȘɃțɅĹɉƦ ÕȘɃțɅÕƣ 1 ƒ =ĉēŢ{ǩǪŮÂǾ+ǊǤǇǺǲǘǁ
•GRRM11 User ManualɈłŝĀɉ

16/VK-¿Ë­ÈÃ MSC.Marc / MSC.Marc Mentat
Ʀ MSC.Marc ǫÐƎŋīôǩǸǻƚĸòĉåŽőÜȯɁȎȽȶǥǘǁč ǥǏ=ĉǕǼÎǶŘ"ǾMǑǤǈǻȯɁȎȽȶǪǢǥǀǜǪ¨ǊǻőÜǫǪŻǺƚǩĩ]ǩǽǞǡǤǈǲǘǁƦ ƚĸɋomɋ´Œɋgɋ@gɋĖjɋÿɋCđƚĸɋhčƚĸøǦ^Ǫž¥ɋƗïǦÿǪž¥ɋÿǦAǪž¥Ʀ MSC.Marc Mentat ǫǀòĉåŽőÜȯɁȎȽȶ Marc ǪřaȯȾɋȳȖȢȯɁȘȞȒǦǖǤǀÐƎŋīȸȡȿǪ¥ǋǸǮőÜĲÞǪňęǍŅǊǲǘǁ

n サービスホスト・バージョン
front.cc.tohoku.ac.jp Ʉ MSC.Marc /MentatƦ 2013n 利用方法
Marc ǪȯȾȳȖȢȯɁȘȞȒǦǖǤǀMentat Ǫǩ MSC.Patran Ƕ·!ǖǤǈǲǘǁ

【run_marc コマンドでの解析実行】l G¯ÂÌº^Ʀ Marc Ǫ0AȭȀȃȿǫǀ­sǾ .dat Ǧǖǲǘǁ ( ɏƦ job-name.dat )Ʀ front.cc.tohoku.ac.jp ǩɁȎȃɃǀƦ run_marc ȐȴɃȣǩ0AȭȀȃȿTǾ¯yǖzŅǘǻǓǦǩǸǺǀȨȞ
ȝȾȍȆȖȢǦǖǤőÜǍŅǽǼǲǘǁȕȼȮȍȽȖǪ¯yǫŋǇǺǲǚǿǁŀCđǩȁȯȾȏɅȔȼɃĉǪ=ĉ£ɈıƀÈƌü>ƎǀÎoȷȸȾ 128GBɉǩª0ǕǼǲǘǁ
É²¹ 6. job-name.dat £K-¢¯ÂÌº(run_marc ¯ÂÌº¾¤¦Ê£#¢Z" .dat £:¡)	
  [front1	
  ~]$	
  run_marc	  -­‐jid	
  job-­‐name	
  -­‐v	
  n	
  
	
  

— 97 —

アプリケーションサービスの紹介

I 3. run_marc ª¿±ÇÌȈȯȔȼɃ-jid (-j) job-name (ƞ)şÆ0AȭȀȃȿT job-name.dat Ǿ¯y-cpu 秒数

cpu ÈƌǪ>Ǝ

-ver (-v)

yes(ȡȭȇȿȢ)noȨȞȝȾȍȆȖȢª0?ǩėŜǘǻǁ
ȨȞȝȾȍȆȖȢǾǞǟǠǩª0ǘǻǁ

-user (-u) user_nameȻɅȓȒȮȿɅȝɃ user_name.f Ǿ¯y•	  ǜǪǪȈȯȔȼɃǫǀǃȴȥȺȁȿ ƴ ĹƦȯɁȎȽȶ0AƦƇ ƳƦň ƳƩƭǄƦǾǔJýǏǟǕǈǁƦƦl ƦƦK-D.^Ʀ ȨȞȝȾȍȆȖȢǍįǘǻǦǀ
job-name.out
job-name.log
job-name.t16
job-name.sts
job-name.batch_err_log

ǩǪǸǉǨȭȀȃȿǍ¥ǕǼǲǘǁ
(őÜĲÞ)(őÜɁȎ)(ȳȖȢȭȀȃȿ)(ȖȠɅțȖɀȳɅȢȭȀȃȿ)(ȆȽɅɁȎ)Ʀ őÜÈǪ¯yǩǸǡǤǀǓǪǩǶȭȀȃȿǍ¥ǕǼǲǘǁǜǼǹǪȭȀȃȿǪãŋǫǀǃȴȥȺȁȿ ƴ ĹȯɁȎȽȶ0AƦƇ ƳƦň ƳƩƬǄƦǾǔJýǏǟǕǈǁƦ
l B8^`^a^Ʀ őÜĲÞȭȀȃȿ( job-name.out )ǪÔǩǇǻ marc exit number ǩǸǺǀìǩįǖǞǌǀȆȽɅįǌǀǲǞȆȽɅįǪfQǫǜǪI\ǍǽǌǺǲǘǁ
É²¹ 7. B8£;O¢(tail ¯ÂÌº job-name.out +£I<)	
  	
  [front1	
  ~]$	
  tail	  job-­‐name.out	  	
  ***********************************************************	  	
  MSC.Marc	  Exit	  number	  3004	  	
  check	
  marc	  exit	  passed	
  [front1	
  ~]$	  	  

— 98 —

SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）

I 4. B8
įĎO
3004
13
2004
3002

şÆ
ìįƦ
0AȡɅțǩȡɅțȆȽɅǍá8ǕǼǞǁƦ
@mǍďĈǖǤǈǻǀǲǞǫ1@ȴȢȾȍȖǍƚìyȴȢȾȍȖǩǨǡǤǈǻǁƦ¯yǖǞȾȒȃȍȿÀ5ǥL×ǖǨǈǁƦ

•	  ǓǪǪĎOǩǢǈǤǫǀǃȴȥȺȁȿ ƴ ĹƦȯɁȎȽȶ0AƦƇ ƲǄƦǾǔJýǏǟǕǈǁƦ

【プリポストプロセッサ Mentat からの解析実行】l u Q^
Ʀ Mentat ǪůCǩǫǀ:ȐɃȬȺɅțǩ´ĵǘǻƔǩ X forwarding ǪŖyǾŅǉŋǍǇǺǲǘǁ
Mentat2013 ǥǫÃ GUI Ǿ²ĉǖǤǈǲǘǁÙǪ Classic GUI ǫ mentat.classic ǦǈǉȐȴɃȣǥǔ=ĉǥǎǲǘǁ
É²¹ 8. mentat Q(2	  yourhost$	
  ssh	  -­‐X	
  front.cc.tohoku.ac.jp	
  –l	
  利用者番号	
  
	
  	
  	
  :	
  
	
  [front1	
  ~]$	
  mentat	
  	
  	
  

	
  

（新 GUI 版）	
 

	
  
	
  [front1	
  ~]$	
  mentat.classic	
  	
  （Classic 版）	
 	  l K-G^ Î' q|s 3Ï^Ʀ Mentat ǥȸȡȿǾ¥ǖǀőÜǪǞǵǪŖyǾŅǡǞǀțȮȷȥȺɅ őÜȕȼȮ Ʀ -> Ãō -> őÜțȃȯǾƂ« ->Ʀ zŅ -> zŅɈ1ɉ
Ǧǈǉ¼ǾǘǻǓǦǥǀȨȞȝȾȍȆȖȢǦǖǤőÜǾzŅǖǲǘǁ
ȟɅȿȨɅȷȥȺɅ ȭȀȃȿɈFɉ Ʀ -> Íǎ8ǖ -> Marc 0A...
ǦǘǻǓǦǥǀrun_marc ȐȴɃȣĉ0AȭȀȃȿ( .dat ȭȀȃȿ)Ǿ¥ǘǻǓǦǍǥǎǲǘǁ
l K-G^ Îm 3Ï^
Mentat ǥȸȡȿǾ¥ǖǀőÜǪǞǵǪŖyǾŅǡǞǀȷȃɃȷȥȺɅ JOBS Ʀ ->Ʀ RUN Ʀ -> Ʀ submit1
Ǧǈǉ¼ǾǘǻǓǦǥǀȨȞȝȾȍȆȖȢǦǖǤőÜǾzŅǖǲǘǁ
ȖțȠȂȞȍȷȥȺɅ FILES Ʀ -> Ʀ MARC INPUT FILE WRITE
ǦǘǻǓǦǥǀrun_marc ȐȴɃȣĉ0AȭȀȃȿ( .dat ȭȀȃȿ)Ǿ¥ǘǻǓǦǍǥǎǲǘǁ

n サンプルプログラムƦ
【Marc】
ȴȥȺȁȿ E ĹǩµŶǕǼǤǈǻ ƠǍǀ:ȐɃȬȺɅț front.cc.tohoku.ac.jp Ǫ/usr/ap/MSC2013/marc2013/demo/ǩǇǺǲǘǁȐȬɅǖǤǔ=ĉǏǟǕǈ
【Mentat】
ȴȥȺȁȿǃȻɅȓȊȃȣǄ ǩµŶǕǼǤǈǻ ƠȭȀȃȿǍǀ:ȐɃȬȺɅț front.cc.tohoku.ac.jp Ǫ/usr/ap/MSC2013/mentat2013/examples/marc_ug/ǩǇǺǲǘǁȐȬɅǖǤǔ=ĉǏǟǕǈǁ

アプリケーションサービスの紹介— 99 —n マニュアルƦ
PDF ǪȴȥȺȁȿǾ·!ǖǤǈǲǘǁ
PȴȥȺȁȿǫǀ:ȐɃȬȺɅțɈfront.cc.tohoku.ac.jpɉ ǪǪȡȂɀȍȢȾǩǇǺǲǘǁ
/usr/ap/MSC2013/mentat2013/doc/
release_guide.pdf:Ʀ Release GuideɈ2013 łŝĀɉ
release_guide.pdf:Ʀ What’s newɈ2013 łŝĀɉ
mt_help_ref.pdf:Ʀ MSC.Marc Mentat Help ReferenceɈ2013 łŝĀɉłÁȴȥȺȁȿƦ Ʀ /usr/ap/MSC2013/mentat2013/doc/(volavole)vola.pdf:Ʀ Volume AɏTheory and User Information
volb.pdf:Ʀ Volume BɏElement Library
volc.pdf:Ʀ Volume CɏProgram Input
vold.pdf:Ʀ Volume DɏUser Subroutines and Special Routinesvole.pdf:Ʀ Volume EɏDemonstration Problems
XÁȴȥȺȁȿ (MSC.Marc2003 Ā)Ʀ Ʀ /usr/ap/MSC2013/mentat2013/doc/japanese/
vola.pdf:Ʀ A Ĺ ĆŤǋǸǮȻɅȓɅ evolb.pdfƦ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ :Ʀ B Ĺ ŋīȽȃȮȽȾ
volc.pdfƦ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ:Ʀ C Ĺ ȯɁȎȽȶ0A
vold.pdfƦ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ:Ʀ D Ĺ ȻɅȓȒȮȿɅȝɃǋǸǮā<ȿɅȝɃ
vole.pdfƦ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ:Ʀ E Ĺ ƠƖ
new_features.pdfƦ :Ʀ ÃéĿȊȃȣ
marc_ug.pdfƦ Ʀ Ʀ Ʀ :Ʀ ȻɅȓȊȃȣ
mt_help_ref.pdfƦ Ʀ :Ʀ Mentat 2003 ȰȿȯȾȭȀɀɃȖ
xsec_adden.pdfƦ Ʀ :Ʀ ȣȋȺȷɃȢŉŲŮÂ*YJ@2¿Ë­ÈÃ16¿ÉÁ²¹³¾¹§¨¥ MSC.PatranƦ MSC.Patran ǫǀÐƎŋīôåŽőÜȯɁȎȽȶ MSC.Nastran ĉǦǖǤƋďǕǼǞȯȾȳȖȢȚȭȢȄȅȁǥ
ǘǁÕȘɃțɅǥǫ Marc Ǫ=ĉǾȒȳɅȢǘǻǞǵǩȒɅȫȖǖǤǈǲǘǁ
Ʀ MSC.Patran ǫnǏǪ CAD ǩǘǻȜȃɀȍȢȃɃțɅȭȅɅȖǾǖǤǀìėǥŸżǨ CAD ĂǪȃɃȳɅȢǍNĿǥǘǁǕǹǩ-ǼǞāƉǦǖǤǀƥðúǪȷȞȔȺ¥éĿǷNŎEéĿǩBǊǀ Marc ǦǪŐXǍƥǈǓǦǍ°ǒǹǼǲǘǁ

n バージョン
MSC.Patran2014 Windows ĀɊLinux Ān お申し込み=ĉØɈǪØǾǘǱǤùǞǖǤǈǻÄɉƦ ɄoōèĝwŔħȔȖȠȶǪ=ĉľĎOǾ®ǡǤǈǻÄƦ ɄÕȘɃțɅǥȒɅȫȖǖǤǈǻ Marc ǪȯȾȳȖȢǦǖǤ=ĉǘǻÄ=ĉǔÑǪÄǫǀ3S=ĉ½¹#ǲǥǋYǈQǽǚǏǟǕǈǁ

— 100 —&

SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）

4¿Ë­ÈÃ Mathematica

Ʀ Mathematica ǫ Stephen Wolfram ǩǸǡǤǹǼǞǀȯɁȎȽȵɃȎœŝǾ+ǊǞÀ7ĆȔȖȠȶǥǘǁ
Mathematica ǪéĿǫǀÀ)ŔħǀŕOŔħǀȎȽȭȂȞȍȖǦǈǉ 3 Ǣǩo<ǥǎǀǓǪ 3 ǢǍǦǨǡǤǈǷǘǈȃɃțȭȅɅȖǾ·!ǖǤǈǲǘǁ

n サービスホスト・バージョン^
front.cc.tohoku.ac.jp Ʉ version 9.0.1

n 利用方法【Mathematica の起動】^l q|s 3^
Ʀ GUI ĀǪ Mathematica ǪůCǩǫǀ:ȐɃȬȺɅțǩ´ĵǘǻƔǩ X forwarding ǪŖyǾŅǉŋǍǇǺǲǘǁ
É²¹ 9. GUI 3Q(2	  yourhost$	
  ssh	  -­‐X	
  front.cc.tohoku.ac.jp	
  –l	
  利用者番号	
  
	
  	
  	
  :	
  
[front1	
  ~]$	
  mathematica	  	
  É²¹ 10. ¸«²¹3Q(2	  yourhost$	
  ssh	  	
  front.cc.tohoku.ac.jp	
  –l	
  利用者番号	
  
	
  	
  	
  	
  :	
  
[front1	
  ~]$	
  math	  	  •	  Mathematica ǪcÕđǨǈÄǫǀƦȴȥȺȁȿɄJĽŮÂƦǷǀWeb ǨǧǾǔJýǏǟǕǈǁƦ

n マニュアル・参考資料
JĽŮÂÕȘɃțɅÕƣɌƒ =ĉēŢ{ǩǀǪŮÂǾ+ǊǤǇǺǲǘǁ
•ȖȠȂɅȮɃȄȿȭȽȶ Mathematica ȮȞȍ (ÅÕŝĀ) ɏ ȢȞȩɃ•
Mathematica ÄôǦĉ ɏ J.W. ȎɀȃɊȒȃȆɃȠȂȖȢĚ
•Mathematica ȯɁȎȽȵɃȎ©ô ɏ R. ȷɅȜɅɊȢȞȩɃ•0Ɗ MathematicaƦ ɏƦ ÅÕ Mathematica ȻɅȓɅɊÚƗéow8Ā•ǫǷǽǌǺ MathematicaƦ ɏƦ äIſɊ3ġ8Ā•
ǶǡǦ Mathematica ǥÀwǾƦ ɏƦ RĊv ɊbƢƣ

アプリケーションサービスの紹介=— 101 —

HM?LP MATLABƦ MATLAB ǫƥéĿǨÀ)ŔħéĿǦnǨNŎEéĿǾ+ǊǞ©ņŔħȚȭȢȄȅȁǥǘǁĝwđǀw
đ9ƄǪæǂǨÀ)Ŕħ(āǩŅ:ûħ)ǀȡɅțőÜǀȔȵȺɀɅȔȼɃǀǋǸǮȫȕȺȁȽȃșɅȔȼɃǪǞǵǪĴQćhǾ·!ǖǤǈǲǘǁ

n サービスホスト・バージョン
front.cc.tohoku.ac.jpƦ ɄƦ R2014a (8.3.0)

n ToolboxȘɃțɅǥ0ǖǤǈǻ Toolbox ǥǘǁ
MATLAB
Simulink
Curve Fitting Toolbox
Communications System Toolbox
MATLAB Compiler
Control System Toolbox
DSP System Toolbox
Fuzzy Logic Toolbox
System Identification Toolbox
Image Processing Toolbox
MATLAB Corder
Model Predictive Control Toolbox
Neural Network Toolbox
Optimization Toolbox
Partial Differential Eauation Toolbox
Fixed-Point Toolbox
Robust Control Toolbox
Simulink Corder
Simulink Control Design
Signal Processing Toolbox
Symbolic Math Toolbox
Simulink Design Optimization
Statistics Toolbox
Simulink Verification and Validation
Wavelet Toolboxn 利用方法【MATLAB の起動】l q|s 3^
Ʀ GUI Ā MATLAB ǪůCǩǫǀ:ȐɃȬȺɅțǩ´ĵǘǻƔǩ X forwarding ǪŖyǾŅǉŋǍǇǺǲ
ǘǁ

— 102 —SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）

É²¹ 11. GUI 3 MATLAB Q	
  yourhost$	
  ssh	  -­‐X	
  front.cc.tohoku.ac.jp	
  –l	
  利 用者番号	
  
	
  	
  	
  :	
  	
  	
  	
  
	
  [front1	
  ~]$	
  matlab	  	  l ¸«²¹3^^ GUI ǾĉǚǙǀȐȴɃȣȽȃɃǥůCǘǻǓǦǶǥǎǲǘǁ
É²¹ 12. ¸«²¹3 MATLAB Q	
  (yourhost)$	
  ssh	
  front.cc.tohoku.ac.jp	
  –l	
  利用者番号	
  
	
  	
  	
  :	
  	
  	
  	
  
	
  [front1	
  ~]$	
  matlab	
  –nojvm	
  –nosplash	
  –nodesktop	
  -­‐nodisplay	
  
	
  
	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  <	
  M	
  A	
  T	
  L	
  A	
  B	
  (R)	
  >	
  
	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  Copyright	
  1984-­‐2014	
  The	  MathWorks,	
  Inc.	
  	
  
	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  R2014a	
  (8.3.0.532)	
  64-­‐bit	
  (glnxa64)	
  	
  
	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  February	
  11,	  2014	
  
	
  	
  
	
  	
  To	
  get	
  started,	
  type	  one	  of	
  these:	
  helpwin,	
  helpdesk,	
  or	
  demo.	
  	  	
  For	
  product	
  information,	
  visit	
  www.mathworks.com.	
  
>>	
  
	
  	
  

アプリケーションサービスの紹介— 103 —l »·¶ 4^
Ʀ MATLAB Ǫİǳŷǳ:7ĆéĿǾĉǖǀ24 :ǲǥǪ7ĆǍNĿǥǘǁÎoȷȸȾǶ 128GB ǲǥ=
ĉNĿǥǘǁoōèǨŔħǩǔ=ĉǏǟǕǈǁǞǟǖǀȨȞȝ7ĆǥǫȎȽȭ¶ČǨǧČƛ8AǪǇǻȯɁȎȽȶǷǀřđǨ7ĆǫŅǊǲǚǿǁ
Ʀ function ǦǖǤ¥ǖǞ test ǾzŅǘǻǞǵǩǫǪæǨȨȞȝȾȍȆȖȢĉȔȅȿȖȍȾȯȢȭȀȃȿǾ¥ǖǲǘǁȾȍȆȖȢǫȁȯȾȏɅȔȼɃĉǪ=ĉ£ǩª0ǖǲǘǁƦ
É²¹ 13. »·¶É¬©²¹¾¤¦Ê	
  [front1	
  ~]	
  cat	
  job-­‐m	  	  ←バッチリクエストファイルの中身を表示	
  
	
  
#PBS	
  –q	
  lx	
  -­‐b	  a	
  	
  ←アプリケーション専用の利用形態を指定	
  	
  	
  
cd	
  $PBS_O_WORKDIR	
  matlab	
  –nojvm	
  –nosplash	
  –nodesktop	
  -­‐nodisplay	
  –r	
  test	
  	
  
	
  

Ʀ ǪȐȴɃȣǥȾȍȆȖȢǾª0ǖǲǘǁ
É²¹ 14. É¬©²¹!(2	
  [front1	
  ~]$	
  qsub	  job-­‐m	
  Request	
  1234.job	
  submitted	
  to	
  queue:	
  ap.	  	  Ʀ
MATLAB ǪcÕđǨǈÄǫǀ ȴȥȺȁȿɄJĽŮÂǨǧǾǔJýǏǟǕǈǁ

n サンプルプログラム
Ʀ MATLAB ǩǫũ~ǨȡȸǍǇǺǲǘǪǥǀǔ=ĉǏǟǕǈǁMATLAB ǥǀdemo ȐȴɃȣǾzŅǘǻǦǀȡ
ȸČƛǍƋǎǲǘǁ

n マニュアル・参考資料【マニュアル】
Ʀ ÅÕŝȈɃȽȃɃȴȥȺȁȿǍ2ƋǕǼǤǈǲǘǁǪȱɅȕǾǔJýǏǟǕǈǁ
http://www.mathworks.co.jp/help/ja_JP/techdoc/index.html

Ʀ【参考資料】Ʀ ÕȘɃțɅÕƣɌƒ =ĉēŢ{ǩǀǪŮÂǾ+ǊǤǇǺǲǘǁ
MATLAB ǩǸǻ>ĆŤǪcĘ ɏ Ƅõ*ńɊÚƗéow8Ā
MATLAB ǩǸǻ>ǪǞǵǪȔȖȠȶSy ɏ Ųġ&ɊÚƗéow8ĀǟǼǥǶǽǌǻ MATLABƦ ɏƦ óIƕģɊbƢƣǫǷǽǌǺ MATLAB ĥ 2 Ā ɏ ŁƄƑɊ3ġ8Ā
ÎÃ MATLAB ȧɃȣȮȞȍĥ 3 Ā ɏ ÝŅɊĜXȔȖȠȶ

— 104 —

ƦƦƦ
ƦƦƦ
ƦƦƦ
ƦƦƦ

SENAC Vol. 48, No. 2（2015. 4）

MATLAB ȎȽȭȂȞȍȖƖ ɏ _ AɊÒ'Í
MATLAB Ǧ=ĉǪzƔ ɏ _ AɊȒȃȆɃȖĚ
MATLAB ǪķQĉƦ ɏƦ ƥŨƃpɊàF8ĀÎÃǊǻɆMATLABƦ ɏƦ ƙ ūɊŦŢĚǊǻɆMATLAB/Simulink ȯɁȎȽȵɃȎƦ ɏƦ ƙ ūɊŦŢĚ
MATLAB ǩǸǻČ,ɇÇ,%O7ĆƦ ɏƦ ÖÛìVɊCQ 8Ā
Matlab ǩǸǻȎȽȭ¶ČƦ ɏƦ ŊÖĢƦ (eś SENAC Vol.37 No.1 (2004-1))ƥéĿÀ)ŔħɄNŎEéĿȚȭȢ MATLAB ǪcÕđǨǈÄƦ ɏƦ Ə_ËƦ Ʀ Ʀ Ʀ Ʀ (eś SENAC Vol.46 No.3 (2013-7))