製品シート

Multiplexed Gene Fragments
Twist Bioscience のシリコンベースの DNA「書き込み」技術は、高品質なオリゴヌクレオチドの大規模な並行合成を実現します。
当社の Multiplexed Gene Fragments（MGF）は、DNA 合成におけるスケール効率と優れた技術を活かし、301 ～ 500 塩基対からなる何十万個の遺伝子断片をまとめたユニークなプールを提供します。このような遺伝子断片のプールにより、プライム編集、極めて複雑な CRISPR ベースの機能的スクリーニング、ペプチドおよびタンパク質工学、抗体発見、大規模並列レポーターアッセイ（MPRA）などのハイスループットスクリーニングなど、必要なバリアント数に対して断片当たりのコストが障壁となり得るアプリケーションに応用できます。

最長 500 塩基対の遺伝子断片を制限のないプールサイズでご提供できることにより、従来は実現不可能であったり、コスト面で困難であったりした、多様性の高いスクリーニングアプリケーションが可能となりました。例えば、フルナノボディ（VHH）の配列はプール断片内に収まるため、研究者は制限なく、ユニークな希望の抗体配列をデザインすることができます。抗体サイズがより大きい場合には、MGF のプールをつなぎ合わせて完全にペアとなった重鎖／軽鎖の組み合わせを生成する方法で、抗体工学用途に大量 スクリーニングを実施している研究例もあります。1 さらに、CRISPR 実験では多遺伝子ファミリーや広範なゲノム領域をターゲットとするため、1 つの MGF 内で複数の gRNA 配列をデザインし、正確な組み合わせの遺伝子プローブとして使用することもできます。

デザイン合成1. https://doi.org/10.1101/2024.03.14.585103

研究用。診断目的には使用しないでください。

仕様• 二本鎖 DNA
• 断片長：301 ～ 500 bp• プールサイズ：最小 1,000 配列から、最大数なし• 納品形式：凍結乾燥状態のプールサンプルを 1 本のチューブに• 納期：8 ～ 12 営業日

主な利点• 大規模な遺伝子断片の合成と、カスタマイズ可能なデザインオプション• 最長 500 bp のハイスループットスクリーニング• 低エラー率でプール品質を最大化• 断片長および GC 含有量に関係なく均一な表現

増幅断片QC

発送・実験開始MULTIPLEXED GENE FRAGMENTS | TWIST BIOSCIENCE

幅広いワークフローに簡単に統合可能

Twist の Multiplexed Gene Fragments は、これまでにないデザインオプションを提供することで、あなたの研究を前進させ、新しいスクリーニング方法の開発を可能にするデザインの可能性を解き放ちます。10,000 ～ 1,000,000 個からなる Multiplexed GeneFragments を利用してどのような研究が可能となるのでしょうか？以下の例をご覧ください。

抗体およびナノボディの発見・エンジニアリング
可変領域全体を 1 つの断片に合わせることができます。
• 最長 500 bp（コーディング領域：460 bp）で重鎖可変領域全体をカバーするため、研究者はハイスループット抗体エンジニアリング用抗体バリアントのプールを作成可能• 抗体発見実験に必要とされる完全かつ正確な配列のデザインが可能

高い均一性と低いキメラ率により、お客様の研究を加速させます

長さや GC 含有量にかかわらず、Twist の Multiplexed GeneFragments は、何十万個からなる複雑な DNA 断片を集約した高品質なプールを並行して生成します。

Twist の Multiplexed Gene Fragments のプールは、オーダーされたすべての配列を網羅的に表現することで、バリアント構築を精密に制御し、より的を絞った合理的なスクリーニングを実現します。

500 bp のデュアル gRNA バリアントの Multiplexed Gene
Fragments のプールではドロップアウトが最小限に抑えられ、断片の完全な表現を実現していることを示しています（図 1）。
これは、450 bp のトリプル gRNA バリアントのプールでも同様です（図 2）。最後に、GC 含有量が最大 80% で広範囲に GC が存在するバリアントを有する Multiplexed Gene Fragments のプー
ルでも、高い表現性とバイアスを最小限に抑えられた結果を示しました（図 3）。

MPRA スクリーニング
コーディング領域を拡大し、UTR/mRNA 最適化スクリーニングのためのゲノムコンテクストを追加できます。
mRNA ワクチンの開発発現レベル、半減期、また RNA 安定性の向上などをスクリーニングするため、ご関心の全ての領域をコードするデザインを作成できます。
AI/ML の構築のためのハイスループットスクリーニング• Multiplexed Gene Fragments の高い均一性と表現により、100% に近い AI 向けデザインが可能となり、選択性を向上• 300mer の断片をつなぎ合わせることによって生じる不正確さがなく、完全な AI デザインが過少表現されることもない
300BP 以上のコーディング領域を有する断片プールサンプ
ルを必要とする、あらゆるアプリケーション向け• タンパク質および酵素工学• パスウェイエンジニアリング• 遺伝子相互作用研究

400

300

リード数

極めて複雑な CRISPR およびペアプライム編集スクリーニング
500 bp の断片を使用することで、1 つの配列でより多くのガイドをデザインできます。
• より複雑なスクリーニングに向けて、より多くのタンデムリピート（4 ～ 6 塩基）を組み込む• 高いターゲット効率で複数の遺伝子をノックアウト• ガイドの不十分な構造による潜在的なオフターゲット効果を低減• 手間と時間のかかるガイド RNA の構築を省略200100002040

存在量表現されている断片の割合（％）

99.99%

ドロップアウト

0.01%

シーケンスカバレッジ
多様性

95/5 パーセンタイル値

90/10 パーセンタイル値
DOC-001499 改訂1.0版

8060

キメラ率

55 倍

100120140

図 1. 500 bp の Multiplexed
Gene Fragments のプールにおいて、各デュアル gRNA バリ
アント（X 軸）に対するリード数をマッピングしたグラフ。

10,000
3.03
2.35
5.5%

2

MULTIPLEXED GENE FRAGMENTS | TWIST BIOSCIENCE

350
300
250

リード数

20099.97%

ドロップアウト

0.03%

シーケンスカバレッジ

150

多様性

100

90/10 パーセンタイル値

02040

存在量

6080

キメラ率

10030 倍10,00095/5 パーセンタイル値

500

表現されている断片の割合（％）

42.8753.6%

図 2. 450 bp の Multiplexed Gene Fragments の増幅プールにおいて、各トリプル gRNA バリアント（X 軸）に対するリード数をマッピングしたグラフ。

140

リード数120表現されている断片の割合（％）

99.9%

ドロップアウト

0.01%

シーケンスカバレッジ

1008060

多様性

4095/5 パーセンタイル値

2090/10 パーセンタイル値

017.6

22.4

26.8

31.6

36.0

40.8

45.2

50.0

54.4

59.2

63.6

68.4

72.8

55 倍
7,000
3.3
2.4

77.6

GC (%)
図 3. 500 bp 長の Multiplexed Gene Fragments の増幅プールの GC プロット。
GC 含有量最大 77.6% で GC が広範囲に存在していても、バイアスは最小限に抑えられている結果を示している。X 軸は GC 含有量が異なる 14 種類の配列グループのカテゴリー、Y 軸はリード数を示す。

DOC-001499 改訂1.0版

3

MULTIPLEXED GENE FRAGMENTS | TWIST BIOSCIENCE

Twist Bioscience と提携することで、品質と規模に妥協は必要ありません。

当社は、より良い世界を創造するお客様に貢献します。私たちのお客様は、弊社の合成 DNA ツールを活用することで、ヘルスケア、農業、工業化学、学術研究およびデータストレージなどの分野において、私たちの生活だけでなく、地球の持続可能性の向上を目指しています。
さらに詳しく知る
twistbioscience.com
sales@twistbioscience.com

これらの製品は、Twist の Supply Terms and Conditions（www.twistbioscience.com/supply-terms-and-conditions）に記載の特定使用制限の対象です。
DOC-001499 改訂 1.0 版
DOC-001499 改訂1.0版

4