シラバス項目指定検索（シラバス参照）

2024/07/09 9:50

シラバス項目指定検索（シラバス参照）／授業情報参照

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詳細情報／Detailed Information

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基本情報/Basic Information
開講科目名／Course
時間割コード／Course Code

ドラッグデザイン特論／Basics on Practical Drug Design
47240-59

共通科目コード／Common Course CodeGFS-MJ7D09L1

学部/大学院／Undergraduate/Graduate

大学院／Graduate

開講所属／Course Offered by

新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻／Graduate School of Frontier Sciences
Computational Biology and Medical Sciences

ターム・学期／Term・Semester

2024年度／Academic Year曜限／Day, Period
開講区分／semester offered

Ａ１／A1

集中／IntA1A2／A1A2

単位数／Credits

2.0

学年／YearM1/M2/D1/D2/D3

他学部履修／Available to students in other 可faculties
備考／Notes
主担当教員／Main Instructor

広川貴次、齋藤裕

教室／Classroom

担当教員情報/Instructor Information
教員名／Instructor

教員所属名／Affiliation

職名／Job Title

広川貴次

メディカル情報生命専攻

齋藤裕

メディカル情報生命専攻

伊藤耕一

メディカル情報生命専攻

教授

浅井潔

メディカル情報生命専攻

教授

木立尚孝

メディカル情報生命専攻

准教授

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基本情報／Basic Information

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授業計画詳細情報／Class Schedule Details

講義題目／Subtitle
授業の目標、概要／Course Objectives/
Overview

本講義では、バイオインフォマティクスとケモインフォマティクスによる創薬研究の目的・原理・現状を理解することを目標とします。タンパク質立体構造に基づく医薬品探索（Structure-based drug design）、化合物情報に基づく医薬品探索（Ligand-based drugdesign）の基礎を学び、蓄積・共有されつつある遺伝情報・構造生物学の膨大なデータを活用する機械学習による生体分子設計を紹介します。

授業情報／Class information
授業のキーワード／Keywords

日本語用／Japanese

ドラッグデザイン、創薬インフォマティクス、機械学
習

英語用／Englishdrug design, drug discovery informatics, machinelearning【講義日程・担当】
木曜4，5限（14:55-16:40, 16:50-18:35）のうち、以下の日程・担当で講義を行う。
11月 7日 広川
11月28日 広川
12月12日 広川
12月19日 齋藤
1月 9日 広川
1月23日 広川

授業計画
／Schedule【講義内容】
広川担当分
１．化合物情報に基づく医薬品探索
分子表現と類似性検索
化合物データベース
記述子による薬らしさの表現、ファルマコフォア、最適化手法
２．タンパク質立体構造に基づく医薬品探索
Pre-Docking（レセプターモデリング、分子動力学、標的タンパク質同定）
Docking (探索/スコアリング、Induced-Fit、バーチャルスクリーニング）
Post-Docking（ポーズ判定、高精度エネルギー計算、相互作用フィンガープリント）
３．応用事例解説
タンパク質-タンパク質阻害剤探索、ドラッグリポジショニング等
齋藤担当分
４． 機械学習による生体分子設計
機能性タンパク質の設計
mRNAの設計（翻訳効率の向上）
プロモーターDNAの設計（転写活性の向上）

授業の方法／Teaching Methods

オンライン講義を行う。

成績評価方法／Grade Evaluation

出席、小テスト、およびレポートによる。

教科書／Textbook

特に定めない参考書／Reference

特に定めない

履修上の注意・準備学習等（予習、復習）／Notes on Taking the Course／Assignments / Instructions
for Preparation and Review

オンライン講義を予定している。
オンライン講義URLは変更されることがあるので、毎回確認して参加すること。
２０１９年度の情報生命科学特別講義Ⅲを履修して単位を取得したものは、本科目を履修できない。

関連ホームページ／Course-Related Websites
その他／Others

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／Laboratory room phone no
授業使用言語2024/07/09 9:51
／Language Used in Class
優評価「上位3割」適用科目／Grading guidelines subject

日本語

シラバス項目指定検索（シラバス参照）

適用しない／Not apply

後期教養教育科目／Liberal Arts Education for
該当科目でない／Course not applicable
Undergraduate (SeniorDivision) & Graduate Students
LMS連携有無／LMS link or not

LMS連携有／Link

オンライン授業URL／Online Class URL
オンライン授業内容／Online Class Information
授業実施形態／Course delivery modalities

オンライン型（オンラインのみで実施）／Fully Online: All classes conducted online

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