提案書の骨子（案）
サブテーマ

項目

小項目

①動向調査、及び戦略立案（１）戦略評価・実行評価
責任者：高木利久（ROIS/東大教授）②事務局、及び連絡調整機能③データ収集と統合化のフィージビリティスタディ
（２）統合データベース開発

1)テキストを中心とする知識獲得利用①共通基盤技術 技術の開発
責任者：大久開発
保公策（NIG 教授）
責任 者： 高木 利久（ROIS/東大教2)統合 DB 構築技術、DB 標準化技術、授）DB 相互運用性向上技術の開発②統合データベースの開発・運用②-1 ヒト統合デ
責任 者： 大久 保 ータベースの開公策（NIG 教授） 発・運用
責任者：大久保公策（NIG 教授）

資料２−１

1)ヒト統合化のための辞書構築と知識整理

2)ヒト統合ＤＢの開発
3)医学、薬学関連
情報との連携研究参画者

１．ライフサイエンス（医療、農業などの応用も含む）、ＤＢ、情報技術の動向調査
２．ライフサイエンスプロジェクトの現状、動向調査
３．上記に基づく報告書作成、戦略立案、情報提供(ホームページ、ポータルサイト他にて）【運営委員会】○○（×大教授、バイオ）
秋山(CBRC センター長)、大久保（NIG 教授）、大倉（JST 部長）、勝木(基生研所長）、金久（京大教授）、久 特任教授 1(バイオ DB)原（九大教授）、五條堀（NIG 教授）、小原（NIG 所長）、榊（理研センター長）、高木（ROIS/東大教授）、田 特任助教授 1(知財・特許)
畑（かずさ副所長）、辻井（東大教授）、中村桂（生命誌館長）、中村春（阪大教授）、堀田（ROIS 機構長）、 研究補助 1
増保（東理大教授）、松原（DNA チップ研社長）、吉田（東大名誉教授）
坂内（NII 所長）、浅井（CBRC/東大教授）、関連省庁代表：農水、厚労、経産、関連分野代表：創薬、化合物、医療、特許
１．戦略立案委員会の事務局機能
２．各省庁および関係機関・団体との連携のための連絡調整機能○○（×大教授、情報処理）３．ＤＢ利用者、産業界との協議会の事務局機能研究員１（情報科学）
４．出版社や学会および DB サービス業者との連携のための連絡調整機能研究補助 1
５．外国の関連機関との連携のための情報提供と連絡調整機能６．下記のプロジェクトチームの連絡調整統合機能
１．医療データの収集と統合化のフィージビリティスタディ
特任教授 1(バイオ情報)
２．その他の新興分野のデータの収集と統合化のフィージビリティスタディ
研究員 1（バイオ）１．文献検索・クラスタリング・ランキング・要約技術の開発、高速検索・情報収集エンジンの開発
高野（NII 教授）、辻井（東大教授）
２．オントロジー（辞書、インデックス、専門用語）自動構築技術の開発
特任助教授 1（情報科学）
３．論文、教科書からの知識の表現、抽出、利用に関する技術の開発、オープンアクセス化への対応
研究員 4（情報科学 2、バイオ 2）
４．画像、ポンチ絵、図表など文字以外のデータからの知識発見とアノテーション技術の開発
研究補助 1
５．異種データベースからの知識発見、機械学習技術の開発
片山（東大助手）
１．情報共有、情報交換のためのＷＥＢ技術開発
浅井（CBRC センター長）
２．情報の暗号化、個人情報の保護技術の開発
野口（CBRC 副センター長）
３．新開発測定装置から出てくる新規データの解析・格納法の開発
特任助教授 1（情報科学）
４．ワークフロー技術、並列処理技術、シミュレーション技術との連携
研究員 3（情報科学 2、バイオ 1）
研究補助 1
１．論文、教科書からの知識抽出システム開発とそれによるヒト知識の整理
２．ヒトデータ統合化のためのインデックスや各種辞書の構築
３．細胞、組織、器官、個体などの高次レベルの整理棚構築
４．知識整理や辞書構築のための専門家（がん、免疫、脳など）集団からの意見集約と事務局機能
５．文献情報（おもに日本語解説記事や特許情報）との連携による情報提供
１．（知識、機能を中心とした）ヒト統合ＤＢ構築とその運用・公開
２．既存の（構造、測定データを中心とした）ヒト統合 DB との連携による相互運用性の向上
３．ヒトゲノムブラウザの構築・運用・公開
４．ヒト統合 DB のための高精度アノテーション実施
１．医療、医薬品に関するデータとの連携（将来的にはこれらも統合）
２．医療への応用、創薬との連携のためのソフトウェア開発

中村（生命誌館長）
小笠原（NIG 助手）
研究員 2（情報科学 1、知財・特許 1）
アノテータ/キュレータ 2、研究補助 1○○（×大教授、医療）
金城（阪大助教授）
研究員 1（バイオ 1）
アノテータ/キュレータ 3、研究補助 1
特任助教授 1(創薬)②-2 モデル生
物・産業応用生物統合データベースの開発・運用
菅原秀明（NIG教授）①ポータル技術開発、広報、普及啓
発

１．論文、教科書からの知識抽出システム開発とそれによる各モデル生物、産業応用生物知識の整理
２．これらの生物の遺伝子名や機能の辞書の構築
３．比較ゲノム解析、相互運用性向上のための整理棚の構築
４．それぞれの生物毎の専門家集団（発生、微生物、植物、など）からの意見集約と事務局機能
５．文献情報（おもに日本語解説記事や特許情報）との連携による情報提供
１．（知識、機能を中心とした）モデル生物、産業応用生物それぞれの統合 DB 構築とその運用・公開
２．生物種を横断した比較解析用統合 DB 構築とその運用・公開
３．それぞれの生物毎のゲノムブラウザの構築・運用・公開
４．モデル生物、産業応用生物の高精度アノテーション実施
５．生命研究、及び産業応用との連携のためのソフトウェア開発

黒川（奈良先助教授）
内山（基生研助手）
特任助教授 1(バイオ DB)
研究員 2（バイオ１、情報科学 1）
アノテータ/キュレータ 4、研究補助 1
中村（かずさ室長）
長村（農資研 DNA バンク長）、特任助教授 1(情報科学)
研究員 1（バイオ 1）
アノテータ/キュレータ 6、研究補助 1

１）ポータル技術開発

１．ＤＢサービス・解析サービスサイトに関する最新情報の自動収集エンジンの開発、運用
２．上記のサービスのために必要なインデックスや用語の収集とその自動化技術開発
３．データベースやソフトウェアの利用法に関する情報の収集・編集・提供およびその自動化技術開発
４．検索のパーソナル化（利用者の興味、レベルに応じた情報提供）とそのための技術開発

松本（奈良先教授）
坊農（埼玉医大助教授）
特任助教授(情報科学)
キュレータ 2、研究補助 1

2）広報、普及啓発

１．情報提供の日本語化とそのための対訳辞書、技術開発
２．我が国の活動や研究者に関する情報の外国への提供（英語）・海外の情報のサマリー
３．教育プログラム、教材の開発
４．ニュース記事、コラムの作成

特任教授（医療）特任助教授(バイオ)キュレータ 2、研究補助 11)モデル生物統合化、産業応用生物統合化のための辞書構築と知識整理
2)モデル生物統合
ＤＢ、産業応用生
物統合ＤＢの開発

責任者：川本祥子（NII 特任助教授）

１．ポータルサイト、高度検索サービスの維持・管理・更新・運用・公開
２．ポータルサイト構築のための専門家の意見集約システムの開発、運用
３．利用者の意見集約（モニター・ランキングシステム）の開発、運用
４．データベース、ソフトウェアの利用法等に関する相談窓口
５．他のポータルサイト、情報提供機関との連携（文献情報との連携を含む）
６．センター全体のホームページ（日本語、英語）の構築、運用
７．講習会、シンポジウムの開催
８．ニュースレター、パンフレットの発行

藤山（NII 教授）、川島(東大助手)
研究員 1（バイオ DB）
キュレータ/アノテータ 2、

2）データベースの受入と運用

１．基盤的なＤＢの相互運用
２．プロジェクトＤＢの受け入れと相互運用可能ＤＢへの変換と運用・公開
３．国内外の主要ＤＢの更新維持管理（JST）２
研究員 1（情報科学）
キュレータ/アノテータ 1、 SE1

1）キュレータ・アノ
テータの養成１．実データを用いたキュレータ・アノテータ教育の実践
２．教育プログラム・教材の実践・評価

外部委託機関（長浜バイオ大）
研究補助 12）ＤＢ構築者の養成

１．大学の専門教育との連携

外部委託機関（東大）
研究補助 1

3）ＤＢ高度利用者の養成

１．大学の専門教育との連携

外部委託機関（お茶大）研究補助 1（３）統合データ
ベース支援

1）ポータル整備・②ポータル整備・運用、データベース 運用
責任者：未定 の受入と運用責任者：（JST）③人材育成
責任者：未定