アグリゲノミクス・ソリューション

分子利用（DNAマーカー）育種、病原体検出、品質管理評価のためのフレキシブルで経済的なハイスループット・ツール
Highlights
動植物育種研究者や種子生産者は、現在および将来の作物について、動植物の生産と市場投入を革新し、加速するための新しいツールを必要としています。そのためには、形質、品質、純度に関する貴重な情報を提供する動植物や種子の遺伝データを理解し管理することが必要です。
PCRによるジェノタイピング、シーケンサーによるジェノタイピング
RNA-Seqなどのソリューションを大規模に導入する際の難しさは、費用対効果が高く、導入が容易で拡張性があり、どの生物種やアプリケーションタイプにも使用できるよう柔軟なパネルデザインを提供するプラットフォームを見つけることにあります。

X9™ Real-Time PCR SystemとJuno™ Systemで、考えてみませんか？
病原体検出、種子品質管理、動植物育種のためのコスト効率の高いハイスループット自動化ソリューションで、あらゆるワークフローに容易に組み込むことができます。

マーカー（アッセイ）数技術

解析方法

品質管理および病原体検出

 汎用性

PCRやGBS（Genotyping bySequencing）における低密度から高密度までのマーカー利用研究を、一貫した再現性の高い結果でサポート。

 効率的自動化システムやナノリットルスケールの反応により、コストと作業時間を削減。

 フレキシブル

ケミストリーやワークフローを変更することなく、アッセイターゲットの追加や削除、サンプルバッチのサイズ調整を容易に実施可能。

マーカー利用選抜 ・ 育種

ゲノミック
セレクション ・ プレディクション

シーケンスによるジェノタイピング

高密度 RNAシーケンス

1-20

100s〜1,000s>10,000s

PCRJuno System

GBSおよび全トランスクリプトームのライブラリー調製の自動化

X9 Real-Time PCR System

ハイスループットジェノタイピングや病原体の検出
Figure 1. X 9 S y s t e m と Juno Systemが、少アッセイから多アッセイの分析のニーズまで、完全なソリューションを提供。

1

2

3

4

5

サンプルからRNA/DNAを抽出。

D3™サービス利用し、PCRパネルをデザイン注文可能。

IFC にサンプルとアッセイをアプライ。

X9 Real-Time PCR
Systemにて、PCRとデ解析。

ータ取得。

96.96 IFC

192.24 IFC

24.192 IFC

48.48 IFC

サンプル数

961922448

アッセイ数

962419248

Figure 2. X9 Systemを用いたPCRワークフローの例。
わずか30分～1時間の作業時間で、最大192**サンプルを同時に低コストで処理することができます。アッセイはアプリケーション（TaqMan®、KASP™）やスループットのニーズに応じて適合させることができます。
(** 現行対応サンプル数については、お問い合わせください。)

トータル4-5時間 * のうち30分～1時間* がハンズオンタイム

処理時間/IFC(*使用IFCに依存。)

この SNPマーカーセットは、現在までに、亜種間集団を用いた分子育種における一次解析において、他のハイスループットSNPジェノタイピングシステムよりも迅速でコスト効率の高いツールを提供しています。
From: “QTL analysis of rice grain size using segregating populations derived from the large grain line.” Agriculture (2021)

サンプルからRNA/DNAを抽出する。

高密度マーカー
スクリーニグ1

シーケンスによるジェノタイピング

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2

3

4

5

6

D3サービスを利用し、GBSパネルをデザイン、注文可能。

IFCにサンプルとアッセイをアプライ。

Juno Systemにて、ライブラリーの自動調製。

Illumina® シーケン
サーでシーケンス。

解析。

atcggctagt
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atcggctagt
atcgtctagt

23

RNA、試薬、オリゴ Juno System にてdTビーズを48.Atlas™ RNA-seq ライブラ
IFCにアプライ。
リーの自動調製。

456

バーコード付きライブラリーを回収し、プール。

Illumina® シーケン
サーでシーケンス。

解析。

Figure 3. Juno Systemを用いたN G S ワークフローの例。
シーケンシングによるジェノタイピングやRNA-seqのライブラリー調製を同一プラットフォーム上で行うことができます。

LP 48.48 IFC
アプリケーション

48.Atlas IFC

アンプリコンライブラリーの調製

全トランスクリプトーム
RNA-seq

48

192

48

48
(4,800ターゲット)

24(2,400ターゲット)-サンプルインレット
アッセイインレット

LP 192.24 IFC

Junoシステムは、複数のサンプルから異なる標的領域を増幅するための費用対効果の高いアプローチである。
... だけでなく、装置やサンプルの取り扱い、技術者の時間を短縮することができます。... Junoなら、2年以内に元が取れるでしょう。
From: “Microfluidic Enrichment Barcoding (MEBarcoding): a
new method for high throughput plant DNA barcoding.”
Scientific Reports (2020)

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