CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

目次（1）CBI 学会 2015 年大会報告
CBI 学会 2015 年大会を終えて

講演演題一覧

片倉 晋一（CBI 学会 2015 年大会

大会実行委員長、第一三共 RD ノバーレ株式会社） …………………

1………………………………………………………………………………………

2

フォーカストセッション報告……………………………………………………………………

3

科研費新学術領域研究「分子ロボティクス」公開シンポジウム …………………………… 11
市民講座「地域医療のイノベーションと ICT( 情報通信技術 )－災害時にも対応できる医療情報を－」………… 12
FMO チュートリアル ……………………………………………………………………………… 14「安全性（毒性）評価支援システム」勉強会 …………………………………………………… 14
企業展  ……………………………………………………………………………………………… 15
ポスター発表  ……………………………………………………………………………………… 16（2）解説論文「高精度量子化学計算による 弱い水素結合の研究」
高橋 修（広島大学 サステナブル・ディベロップメント実践研究センター）……………

17（3）CBI ジャーナル便り（3）…………………………………………………………………………

22（4）講演会予告   …………………………………………………………………………………………

23（5）委員会報告  …………………………………………………………………………………………

24

CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

CBI 学会 2015 年大会

創薬のオープンイノベーション－新領域と in silico の接点－
iPS 創薬・アカデミア創薬・ビッグデータ
日時：2015 年 10 月 27 日（火）- 29 日（木）会場：タワーホール船堀（東京都江戸川区船堀 4 - 1 - 1）
CBI 学会 2015 年大会 大会長：

堀内 正（慶應義塾大学）

CBI 学会 2015 年大会 大会実行委員長： 片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ株式会社）

CBI 学会 2015 年大会を終えてCBI 学会 2015 年大会 大会実行委員長

片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ株式会社）

CBI 学会 2015 年大会は 10 月 27 日（火）から 29 日
（木）した。特にフォーカストセッションは予想を超える参加者の 3 日間にわたり、タワーホール船堀にて開催されました。

のため部屋の変更を余儀なくされ、参加を希望される皆本大会では「創薬のオープンイノベーション－新領域と in様にご不便をおかけしてしまいました。大会の主催者としsilico の接点－」をテーマとして、慶應義塾大学の堀内大ては嬉しい限りですが、今後、プログラムの構成等、そ会長のもと、iPS 創薬、アカデミア創薬、ビッグデータとのようなことのないよう今回の反省を活かしていきたいという 3 つのトピックを取り上げました。

考えています。

1 日目の iPS 創薬での慶應義塾大学の福田恵一先生、また、新たな領域であり更なる発展が期待される科研

京都大学の高橋良輔先生、2 日目のアカデミア創薬での費新学術領域研究「分子ロボティクス」の公開シンポジウ

医薬基盤・健康・栄養研究所の米田悦啓先生、株式会社

ム、企業の視点から最新の技術紹介やご講演をいただい東京大学 TLO の山本貴史先生、3 日目のビッグデータでたスポンサードセッション、そして江戸川区より後援いたの塩野義製薬の北西由武先生、北海道大学の田中譲先

だいた市民講座があわせて開催され、より多様な内容とし生のプレナリー講演は、参加者の皆様より大変好評を頂て本会を盛り上げていたことをご報告したいと思います。

きました。ご講演頂きました先生方に感謝申し上げます。
また、招待講演の先生方にも厚く御礼申し上げます。

最後に、今回はオープンイノベーションと計算化学に携わる研究者がお互いに意見を交換し、ネットワークを形

今回は、昨年まで分野ごとに企画されていた大会企画

成する「交流の場」となることを意図して大会を企画いた

セッションをやめフォーカストセッションに統一し、フォーしました。しかしながら、全てがうまくいったわけではあ

カストセッションを従来の講演会形式にとらわれず研究りません。今後も参加された皆さんにとって有意義な大者同士が自由に企画して専門分野の議論を深める場とな

会となるよう運営していきたいと思いますので、企画、運るよう企画しました。それにより 2015 大会は各トピック

営に関してご意見をいただければ幸いです。

について最先端のお話を聞くプレナリー講演、招待講演

次回は 10 月 25 日（火）から 10 月 27 日（木）まで同と、CBI の母体である計算化学を中心に深く掘り下げたじくタワーホール 船堀にて「in silico 創薬の将来－生体議論の場としてのフォーカストセッションの 2 つの柱から分子シミュレーション、構造生物学、ビッグデータの連なる形式となりました。

携からアカデミア創薬へ」というテーマで開催されます。

このような新たな試みのもと、470 名を超える方々に

今大会同様、多数の皆様のご参加をお待ちしております。

参加いただき大盛況のうちに大会を終えることができま1

CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

講演 演題一覧＊講演の要旨は大会 HP からダウンロードできます
http://cbi-society.org/taikai/taikai15/index.html

10 月 27 日（火）大会１日目＜大会長講演＞
堀内 正（慶應義塾大学）「アカデミア創薬とオールジャパンのオープンイノベーション」＜プレナリー講演＞「iPS 創薬」
福田 恵一（慶應義塾大学）「iPS 由来再生心筋細胞を用いた心臓創薬システムの開発」
高橋 良輔（京都大学）「iPS 細胞でパーキンソン病の臨床はどう変わるか」＜招待講演＞「iPS 創薬」
水口 裕之（大阪大学／医薬基盤・健康・栄養研究所）「ヒト iPS 細胞由来肝細胞の創薬研究への応用」
妻木 範行（京都大学 iPS 細胞研究所）「iPS 細胞モデルによる骨系統疾患の病態解明と創薬」
浅見 麻乃（武田薬品工業株式会社）「製薬企業におけるヒト iPS 細胞技術の確立と応用」

堀内正先生

福田恵一先生高橋良輔先生

水口裕之先生

妻木範行先生

浅見麻乃先生10 月 28 日（水）大会２日目＜プレナリー講演＞「アカデミア創薬」
米田 悦啓（医薬基盤・健康・栄養研究所）「日本におけるアカデミア創薬～医薬基盤・健康・栄養研究所の役割～」
山本 貴史（株式会社東京大学 TLO）
「日本では産学連携で創薬は実現するか？」＜招待講演＞「アカデミア創薬」
片岡 徹（神戸大学）「ras がん遺伝子産物を分子標的とした抗がん剤のインシリコ創薬」
松本 俊二（富士通株式会社未来医療開発センター）「IT 創薬の現状と今後」
奥野 恭史（京都大学）「京大発ベンチャーから生まれたスパコン創薬コンソーシアム」

米田悦啓先生山本貴史先生

片岡徹先生

松本俊二先生

奥野恭史先生10 月 29 日（木）大会３日目＜プレナリー講演＞「ビッグデータ」
北西 由武（塩野義製薬株式会社）「データ駆動型の医薬品研究開発を目指して」
田中 譲（北海道大学）「ビッグデータ：ブームから挑戦へ」＜招待講演＞「ビッグデータ」
船津 公人（東京大学）「医薬品創薬から製造までのビッグデータからの知識創出基盤の確立」
玉谷 卓也（P5 株式会社／順天堂大学）「ゲノム情報活用による個別化がん医療」
鈴木 蘭美（エーザイ株式会社） "Preventative Precision Medicine Through Public Private Partnership"

北西由武先生

田中譲先生

船津公人先生

玉谷卓也先生鈴木蘭美先生2

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フォーカストセッション報告
第 2 分野（インシリコ創薬）口頭発表◇ 10 月 27 日（火）14:00-15:30

4 階研修室

CBI 学会では、様々な関心領域が増えてきていますが、MDる研究者に大変参考になる内容でした。また佐山先生自らア

計算の普及や化合物データベースの充実により、構造活性相

ゴニスト合成とモデル構造を用いた考察も行っており、ウェッ

関やモデリングなどのベーシックなインシリコ創薬への関心もトからインシリコまで幅広く展開した内容に、製薬企業の研究更に高まっています。本セッションでは、口頭発表を通じてイ者からも質問も多く、よい議論が行われました。

ンシリコ創薬に取り組む若手研究者をもっと露出させ、分野全北海道大学の五十嵐学先生には、「インフルエンザウィルス

体を盛り上げる機会にしたいと考え、ポスター発表から興味深

HA 亜型間交差反応性抗体の抗原認識機構の計算科学解析」

い研究内容を 3 件選定し、筆頭の先生方に口頭発表をお願いをテーマに、16 種類の亜型に分類されるインフルエンザウィ

しました。

ルス HA と中和活性を持つモノクローナル抗体 S139/1 の亜型

九州大学の澤田隆介先生には、「化合物・タンパク質間イン

間交差反応の原子レベルでのメカニズム解明に計算科学的手

ターラクトーム情報とオミックスデータに基づくドラッグリポ法を適用した例について発表いただきました。HA と抗体の複ジショニング」をテーマに、薬物に関するケミカル情報や薬合体モデリングと MD 計算を通じた自由エネルギー計算を用

理作用情報、インターラクトーム情報、疾患に関するフェノタいることで、選択的相互作用を定量的に評価することに成功しイプ情報などのオミックスデータを融合解析し、ドラッグリポた事例や、更に抗原認識機構における各アミノ酸の相互作用

ジショニングを行うためのインシリコ手法の開発について発表の寄与についての詳細な解析を行った結果など、今後、感染

いただきました。また、日欧米の全ての既存薬に適用し、様々症研究におけるインシリコのアプローチが非常に有用であるこな疾患に対する既存薬の新規効能を予測した事例についてもと印象づける内容でした。

紹介いただきました。薬物を標的タンパク質情報を介して疾患お陰様で、本セッションは、立ち見が出るほどの盛況となりに結びつけることが実際に可能になってきたことを実感させるました。各発表に会場から多くの質問をいただき、良い議論の刺激的な内容でした。

場となりました。また、佐山先生は、ベストポスター賞、澤田

東京大学の佐山美紗先生には、「GPCR と脂質リガンドの結先生は、エクセレントポスター賞を受賞いたしました。3 名の合モデルに基づくリガンドの構造展開」をテーマに、GPR34

先生方、そしてセッションに参加された全ての方々にお礼申しを例に合成アゴニストとの結合モデル の構築、構造活性相上げます。

関の 考察、モデルに基づくア ゴニ ストの構 造 展開について（モデレーター：福澤薫（日本大学）、広川貴次（産業技術総合

発 表いただきました。GPCR のモデリングにおける注 意 点、研究所）、高岡雄司（ダッソー・システムズ・バイオビア株式会社）、

Induced Fit Docking や MD 計算を活用したリガンド結合構

多田幸雄（東京工業大学））造の構築と評価は、GPCR を標的としたインシリコ創薬に携わ

第 3 回計算毒性学研究会「dry と wet の毒性研究インターフェイス
			（Interface between dry and wet studies on toxicity）」◇ 10 月 27 日（火）14:00-15:30

401 号室これまでに、計算毒性学研究会は、２つの講演会（第１回目

開催趣旨は、計算毒性学研究会が発足して、いよいよ２年

計算毒性学研究会キックオフミーティング 2013 年 10 月 27 日目に入ったが、計算毒性学研究会の大きな目的の一つは、毒（月）13:25-17:30 タワーホール船堀

第性学における wet study と dry study のフュージョンである、

１回計算毒性学研究会「計算毒性学と ADME/T スクリーニンと筆者は考えている。そこで、この場を提供するインターフェ

グ」2013 年 10 月 29 日（水）14:00-15:30 4 階研修室）を開イスとなればと思いを巡らせ、湯田浩太郎（インシリコデータ）

催し、今回、2015 年大会のフォーカストセッションとして、第氏とともに世話人として企画した。

研修室、第２回目

3 回計算毒性学研究会：dry と wet の毒性研究インターフェイ

はじめに、筆者から、「薬物毒性研究における dry と wetス（Interface between dry and wet studies on toxicity）のインターフェイスとして」と題して、これまでの CBI におけと題して第３回目を開催した。

る活動および講演の内容を紹介しながら、開催趣旨の説明を

3

CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号行った。続いて、苗代一郎先生（医薬品医療機器総合機構

新式モデリングを用いた有害性推論手法の開発」と題した dry

薬 審 査 第一 部） より、「 規 制当 局に お ける Computational

study の講演があった。両先生の講演を通して、あらためて、

Toxicology の現状」と題した講演があり、日米間におけるこ本研究会が dry と wet の協働的研究を促進させる場となるよの領域の進展度の大きな開き、日本の遅れを実感する内容でうにと願う思いを強くした。

あった。この段階で、参加者が会場から溢れたため、急遽会

最後に、湯田浩太郎先生（株式会社インシリコデータ）よ

場を変えるという “嬉しい誤算”（世話人の一人である湯田先生

り、「計算毒性学研究の潮流：EUROTOX2015 参加発表報告」の言葉）があった。より広い会場へと場を移した後、「インビトロ・と題した世界 の潮流の紹介があり、キーワードとしての「inインシリコ融合型の毒性予測システムの開発」と題し、吉成浩

silico」が非常に目立ったが、実体の無いものが多いとのこと

一先生（静岡県立大学薬学部 衛生毒性学分野）から、wet おであった。参加者数は 40 名強。本研究会は、機会を捉えて今よび dry の研究を通した内容の講演があった。さらに、吉成後も活動して行く予定である。

先生と共同研究をされている竹下潤一先生（国立研究開発法（モデレーター：湯田浩太郎（株式会社インシリコデータ）、水人産業技術総合研究所 安全科学研究部門）より、「構造方程間俊（松山大学））

第 10 回 FMO 研究会「異分野に広がる FMO 法の活用」◇ 10 月 27 日（火）16:30-17:45

4 階研修室参加者：65 名

た GPCR 構造解析と FMO 計算法などを組み合わせた構造ベー

講演者と演題：ス創薬の実効性や課題についての話題をご提供頂きました。

（1）鶴田宏樹（神戸大学）

非経験的電子状態計算手法である FMO 計算によって実験値を

GPCR 構造解析と創薬における FMO 活用の提案（2）杉本学（熊本大学）
電子状態インフォマティックスによる生体分子機能解析（3）嶋根康弘（海洋研究開発機構）
耐熱性β -フルクトフラノシダーゼの開発

補完していく可能性を示していただきました。
杉本先生には、電子状態計算で得られる数値データから様々な情報を獲得するためのケモインフォマティクス手法についてご紹介いただきました。FMO 計算の利用としては、フラグメント間の相互作用エネルギーを用いて、タンパク質からリガンドが受ける場の類似性について表現するユニークな試みと今日本発の理論手法であるフラグメント分子軌道（FMO）法

後の可能性について議論いただきました。

の普及に伴って、FMO 法が生命科学の幅広いタンパク質の理

嶋根先生には、産業応用を目的とした酵素の耐熱化につい論的な解析に有効であることが判ってきています。これまでのてご発表いただきました。まずは、実験的にランダム変異で熱FMO 研究会ではシミュレーション研究の専門家や創薬化学の安定性が向上した変異酵素を分離し、次にその耐熱化機構を研究者にご講演いただくことが中心でしたが、第 10 回となる

古典分子動力学と FMO を用いて明らかにし、その知見に基づ

今回は、実験的手法やインフォマティクス手法との融合によっいてさらに熱安定性を上げる酵素の設計に成功した、とのことて開ける、FMO 法の新たな研究領域への展開について議論すでした。実験と計算を有効に組み合わせた、タンパク質工学のる場を設けました。３名の先生方にご登壇いただき、それぞれモデルとなるような研究例でした。

のご専門分野における FMO 法の有効活用について、実例や今後の展望を交えながらご紹介いただきました。
鶴田先生には、ご専門の X 線結晶構造解析と計算科学とを会場からもさかんにコメントや質問が出て、FMO 法が、実験とのコラボにより、ますます発展していくことを感じさせる
セッションになりました。

融合した産学官連携でのソリューション創出に関する取り組み（モデレーター：福澤薫（日本大学）、古明地勇人（産業総合研

状況についてご解説いただくとともに、抗 GPCR 抗体を用い

究所））

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ゲノムコホートが拓くゲノム・オミックス医療◇ 10 月 27 日（火）16:00-17:30 4 階研修室
バイオインフォマティクスの医学応用として、ゲノムコホート

等の第１世代（生得的）ゲノム医療の開始、eMERGE プロジェが拓くゲノム・オミックス医療というフォーカストセッションをクトによる EMR に基づく GWAS、医療ビッグデータまで米国開催した。

での状況をレビューいただき、精密医療の 3 つの要点として、

米国ではオバマ大統領が 2015 年 1 月 20 日に一般教書演説

精密医療における遺伝要因と環境要因の相互作用の解明、日にて精密医療（Precision Medicine）のプログラムを発表する

常モニタリング情報の包摂、そして、ゲノムコホートの重要性

なか、わが国においては内閣官房 健康・医療戦略室のゲノムについてご講演いただいた。

医療実現推進協議会が 7 月 15 日に中間とりまとめ（案）を発

松田教授は、バイオバンクジャパン、オーダーメイド医療実表するなど、国内外でゲノム・オミックス医療の実現に向けた

現プロジェクトについて、2003 年から第１コホート 47 疾患

動きが急である。これまで本フォーカストセッションでは、第20 万人、2013 年から第 2 コホート 38 疾患 10 万人が形成され、1 回は「バイオインフォマティクスと医療情報学」、第 2 回は「ゲDNA と血清、臨床情報がバンクされていること、非来院の患

ノム電子カルテ」について取り上げ、非常に活発で有意義な議者を中心に、厚労省の人口動態統計を参照しながら生存調査論を行うことができました。第 3 回ではゲノムコホートに焦点を実施しており、94.7% もの高い追 跡率での追 跡調査を実を当て、国内外のゲノムコホートの動向や、ゲノムコホートに施しているなどバイオバンクジャパンの状況についてレビュー

よるゲノム・オミックス医療などを中心に、現状の課題と将来いただいた。こうして構築されているバイオバンクジャパンの展望などについて、2 人の演者にご講演いただいた。

試料・情報を用いての GWAS について、食道がんと十二指腸潰瘍での解析例をご講演いただいた。食道がんでの解析の結「わが国のゲノム・オミックス医療の実現と東北メディカル・メ

果、ADH1B1、ALDH2、喫煙、飲酒で相乗的にがんのリスク

ガバンク機構の取り組み」

が 190 倍高まること、十二指腸潰瘍での解析の結果、疫学に田中 博（東北大学東北メディカル・メガバンク機構）

おいて十二指腸潰瘍の患者は胃がんリスクが低いことが知られ「ゲノム医療の実現に向けた BiobankJapan の取り組み 」ていたが、その分子メカニズムが rs2294008 の機能解析に

松田

浩一（東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻クリニカルシークエンス分野）

より明らかになり、PSCA を標的とした抗体薬の開発も検討されたことをご講演いただいた。
35 名の方々にご参加いただき、お 2 人の演者のご講演に基田中博特任教授は、ゲノム・オミックス医療を基軸概念としづき、問題意識の共有やブレークスルーの可能性についてのて、第１世代（生得的）ゲノム医療、第２世代（後天的）オミッ

議論する場となった。ご講演いただいたお 2 人の先生とご参

クス医療、第３世代システム分子医療の 3 つの世代に分類して、加いただいた方々に深く感謝したい。

2007 年の次世代シーケンスの革命から、米国での 2010 年か（モデレーター：荻島創一（東北大学東北メディカル・メガバ

らの原因不明先天的疾患の原因遺伝子の診療の現場での診断ンク機構））

計算毒性学関連研究、Tox21 DATA Challenge 2014						
参加入賞報告およびシステム実施例◇ 10 月 27 日（火）16:00-17:30

401 号室本セッションは、FS-02「dry と wet の毒性インターフェイ

開発においては、有益な作用メカニズムを同定するだけではス」に引き続き、計算毒性学分野における最新の話題についなく、潜在的な安全性につながる望ましくない非標的活性メて３名の方にご講演をいただきました。会場は、延べ 60 名以

カニズムの探索と予測も重要であり、これらの作用を予測す

上の予想を超えた参加者により熱気につつまれておりました。

るソフトウエアを自社開発したことを述べられました。そのシ

これは、如何にこの 分野が急 速に重要性を増し、様々な立ステムには、１種の分子について予測解析する場合、200 種場の方々が必要としている解析技術であるかを示しています。

の安全性影響を含む 850 種の異なる分子メカニズムを予測最初の演者である Josep Prous Jr 氏（Prous Institute for

することができる技術が搭載されていることを示されました。

Biomedical Research、スペインバルセロナ市）からは、In-

次いで、国立環境研究所・環境リスク研究センター古濱彩子

silico off-target pharmacology profiling に つ いて、 医 薬主任研究員からは、「環境分野の毒性予測研究の海外動向と

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号
生態毒性予測研究の紹介」の講演がありました。今年 6 月にイオアッセイ値の 情報とについて、ランダムフォレスト法を

ギリシアで開催された CMTPI-2015 において、PBT（難分解性・

駆使した解 析手法により栄 光をつかみ取られました。他の生体蓄積性・毒性）指標の主成分分析のような多変量解析によ上位チ ームでは、 ディープラーニン グ 法 の 活 用も あったとる分類予測研究や、古濱氏が発表した芳香族アミンとフェノーのこと、今後、人 工 ニューラル ネットワークの 活用が 毒 性

ル類の定量的構造・活性・活性相関（QSAARs）による生態予 測 の 要になる可能 性 が あることも 示 唆 さ れていました。

毒性予測研究について興味深い事例を述べていただきました。

このように、計算毒性学は様々な研究分野に深く関係してい最 後 に 植 沢 芳 広 先 生（ 明 治 薬 科 大 学 臨 床 薬 剤 学 研 究ます。今回のセッションが、参加された皆様方の研究や業務

室 ） か ら は、 米 国 NIH 主 催 に よる「 毒 性 予 測 コン ペ ティの一助になればと願っております。ご協力いただいた関係者のシ ョ ン “Tox21 DATA Challenge 2014” 参 加 報 告 」 の 講

皆様及びご参加いただいた皆様に、末筆ながら感謝申し上げ

演をいただきました。そのコンペにおいて、先 生は エ ストます。

ロ ゲン 受 容 体 活 性 化合 物 を 最 高 精 度 で 予 測することに 成（モデレーター： 湯田浩太郎（インシリコデータ）、曽根秀子（国功さ れ、 分 子 構 造 の 記 述子 情 報と Tox21 で 提 供 さ れるバ

立環境研究所）、狩野敦（株式会社菱化システム））

第 3 回 オミックス解析における実務者意見交換会◇ 10 月 28 日（水）14:00-15:30
ゲノム・トランスクリプトーム・プロテオーム・メタボローム
をはじめとするオミックス解析は、分子生物学・医学・薬学・

401 号室のあり方や偶発的所見の取り扱いなど、倫理的な配慮についても課題の提起をいただいた。

農学などの分野に、大きな発展をもたらしている。2013 年度

次に、慶應義塾大学医学部臨床遺伝学センターの小崎健次の大会から始まった本フォーカストセッションは、今年で 3 年郎先生より、「未診断疾患研究における臨床情報の標準化・共目を迎えた。2015 年は、1 月 20 日のオバマ米大統領による有の重要性」についてのご発表をいただいた。小児科の医師

精密医療に関する一般教書演説から始まり、7 月には本邦でもとして、希少疾患や診断がつかない疾患に特有の研究の難し

内閣官房の健康・医療戦略室が推進する「ゲノム医療実現推進

さについて、ご自身が直面している課題に基づくお話をいただ

協議会」の中間とりまとめが発表されるなど、世界各国での精いた。疾患原因遺伝子としての確立のためには、少なくとも家

密医療の本格的な幕開けを予感させる動きが目立っている。

系的に独立な 2 例以上で極めて高い症状の類似性を証明する

さて、今年度では遺伝情報の産出と利活用のプロセスに焦点必要があるが、現状では患者の紹介は医師同士の個人的なネッを当て、最新のシーケンシング解析技術や、次世代シーケン

トワークに依存している。これを効率化して希少疾患・未診断

シングを用いた診療・診断への取り組み（クリニカル・シーケ

疾患の研究および治療を加速するために、患者の症状をデーンシング）などを中心に、現状の課題と将来展望などについタベース化して患者のマッチングを行うための環境整備の重要て広くご討論いただくことを目標とした。毎回議論が盛り上が性や、日本でのマッチング用データベースの構築についてのごり、時間の超過が課題となっていたため、今回は演者を 2 人

提案をいただいた。また、症状を体系化して検索可能な形でに絞ることで演者・参加者・モデレーターが十分なディスカッ

提供するための Human Phenotype Ontology についてのごションができるように配慮した。

紹介をいただいた。

最初の話題提供は、「臨床情報とゲノム情報の接続について」

今回は約 20 名のご参加をいただいた。会場に挙手アンケーをテーマに、Genomedia 株式会社 代表取締役社長 山田智之

トをとったところ、製薬企業 4 割、IT 企業 4 割、アカデミア

氏よりご講演をいただいた。まず、ヒトゲノム解析とその結果

2 割（生物・情報・医学系など）となっており、企業の方々にを利用した社会実装についての各国の動向についてのご紹介も強いご関心をお持ちいただいていることに気付くことができがあった。欧米各国や日本のみならず、中国でも精密医療にた。今後は、製薬企業の現場でオミックス解析に関わる方に向けた取り組みが始まっているなど、世界的な現状についておお話しをいただくなど、CBI 学会の特色を生かした取り組みも話をいただいた。また、Genomedia 社が考えるゲノム情報の企画していきたい。

臨床応用についてのビジョンと製品についてご紹介をいただい（モデレーター： 茂櫛薫（順天堂大学大学院医学研究科）、神

た。さらに会場に向けた議論のポイントとして、対象者の同意

田将和（埼玉医科大学ゲノム医学研究センター））

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

製薬企業の創薬分子設計戦略とビッグデータの利用◇ 10 月 28 日（水）14:00-15:30

4 階研修室大会 2 日目の 10 月 28 日（水）14:00-15:30 にタワーホーで議論するとともに、適宜、会場からのコメントや挙手によるル船堀 4 階研修室にて、「製薬企業の創薬分子設計戦略とビッ

アンケート調査をお願いして、活発な意見交換が行われました。

グデータの利用」と題してフォーカストセッションを開催しま

最後に、モデレーターから、AMED で最近スタートした体内した。当初、会場を 406（定員 40 名）に設定していましたが、動態と毒性のデータベース拡充とそれに基づいた予測プラット

参加希望者多数のため研修室に移動しました。最終的に 71 名

フォーム開発のプロジェクト（創薬インフォマティクス支援プロと多くの参加者にお集まりいただき、この分野への関心の高さジェクト）の紹介がありました。さらに、このような国家プロジェを改めて感じました。

クトを呼び水として、産官学が協力してオールジャパンの創薬

セッションでは、アステラス製薬の石原先生、帝人ファーマの佐々木先生、杏林製薬の橋本先生の 3 人の話題提供者に、

情報データベースを構築する構想と、それを実現する際に解決しなければならない課題について議論が行われました。

創薬の現場におけるビッグデータの取り扱い、予測や設計へ

最後にその構想に対して現場の研究者としてどのように思うの利用法について紹介していただくとともに、現場で日々感じか聞いたところ、約半数くらいの参加者から賛意を得ることがている問題を提起いただきました。代表的な問題としては、化できました。この構想の実現は、日本国内すべての企業と研究

合物の活性値として複数のグループから報告されている異なる機関の創薬に関わる非常に重要な課題だと思いますので、来アッセイ系の値をどのように扱うか、予測モデルを作成する際

年度以降も同じテーマでのセッションを継続的に開催したいとに企業内データと公知データをどのように統合するかなどがあいうことになりました。

りました。それらの問題について、モデレーターを含めた 4 人（モデレーター：本間光貴（理化学研究所））

創薬オープンイノベーションにおける Big Data プラットフォーム◇ 10 月 28 日（水）16:00-17:30

4 階研修室大会 2 日目の 10 月 28 日（水）16:00-17:30 にタワーホー視化するといった相乗効果が求められるようになっていること

ル船堀 4 階研修室にて、標記のフォーカストセッション（以下を示していただきました。更に、CDD VAULT を使用することFS）を開催し 12 名のご参加者にお集まりいただきました。

によって、インターネット環境と Web ブラウザのみでデータ

最 近 で は Bill & Melinda Gates 財 団 の MM4TB や NIHの共有や可視化ができることをご紹介いただきました。

Blueprint のような国境を越えたオープンイノベーションのプ

その後会場より多くのご発言をいただき、時間を延長する

ロジェクトが進行しており、効果的にデータを活用することが、ほど活発な討論をいただくことができました。クラウドサービ

この様な形態のプロジェクトの進行を左右することは明確で

スは利便性やコストパフォーマンスが高い一方で、特に国内企す。今回こうした課題を解決する手段としてクラウドベースの業ではセキュリティ面でのリスクを懸念し敬遠される傾向にあ

プラットフォーム（CDD VAVULT）を紹介し、創薬オープンイ

り、研究者のニーズの高さに反して、導入に際しては承認を得

ノベーションにおけるビッグデータ処理や解析に求められるプ

られにくいとのご意見をいただきました。そのため、こうしたラットフォームについて討論することを目的としました。

環境上で研究情報を解析し、共有するためには、システムその初めに本 FS の モ デレータである本 間光貴（理 化 学 研 究

ものの信頼性に加えてリスク判定なども合理的に判断できる所）より創薬イノベーションを取り巻くこうした状況を述べ、情報が必要とのご意見もいただきました。研究用クラウドシス

次 い で CDD VAULT の 開 発 元 で あ る Collaborative Drug

テムのあり方を理解するための有用な場になりました。

Discovery 社 CEO の Barry A. Bunin より、現代の創薬環境

ご講 演いただきました CDD 社 Barry A. Bunin 氏、ご参を取り巻く課題と解決法について提起いただきました。化学や加いただきました皆様、CBI 学会 2015 年大会関係者およびバイオの分野では目まぐるしい技術革新により、画期的な合成

CBI 学会事務局の皆様に、末筆ながら深くお礼を申し上げます。

手段や生物工学的な手法が開発されている。こうした変化に（モデレーター：本間光貴（理化学研究所）、岡崎泰典（株式会

対応し、創薬研究を効果的に推し進めるためには、ソフトウェ

社菱化システム））アは複雑に見える科学的な事象を簡略化したり、データを可7

CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

in silico によるポリファーマコロジー創薬◇ 10 月 28 日（水）16:00-17:30

401 号室

従来の in silico 創薬では、標的蛋白質の立体構造をベース

算システム生物学的アプローチが重要となってきていることとした Structure Based Drug Design (SBDD) とリガンド

を Bosutinib の複数のキナーゼに対する作用などを例に提示

ベースの Ligand Based Drug Design (LBDD) により、主にした。二件目は、データマイニングとしての多重標的相互作

単一の蛋白質に対して選択的に作用して機能を制御する化合用解析と題して北海道大学の瀧川一学准教授より、医薬品化物の獲得を目指してきた。これに対し、複数の蛋白質との相合物の臨床有効性や安全性は個々の標的に対する作用のみで互作用によりこれらを同時に制御するポリファーマコロジーのはなく、生体内に存在する多数のタンパク質に対する横断的重要性が指摘されている。ポリファーマコロジーでは、化合物

な活性プロファイルによって規定されること、one drug, oneと複数の蛋白質の膨大な相互作用についての解析が必要とさ

target ではなく one drug, many targets を考えることを目れるため、ChEMBL, PubChem 等の公共データベースを利用

指して、データマイニングを駆使した大規模な低分子化合物とすることで in silico からの強力なアプローチが可能だと考えタンパク質の一次情報に基づく網羅的な多重標的相互作用プロられる。

ファイリングに関する研究事例に関して講演を頂いた。三件目

本フォーカストセッションでは、ポリファーマコロジーを専はポリファーマコロジー的アプローチに基づく機械学習を用い門とする３名の方にご講演をお願いした。一件目は、計算シス

た薬剤副作用予測と題して理化学研究所の佐藤朋広研究員よテム生物学によるポリファーマコロジーへのアプローチと新たり、オフターゲット相互作用に起因する薬剤副作用に着目し、な合理的創薬パラダイムと題して医薬基盤・健康・栄養研究

機械学習を用いて低分子化合物 - タンパク質間相互作用を網所の水口賢司が講演し、ゲノム科学とハイスループット技術の羅的に予測することでポリファーマコロジーに基づいて薬剤副進 展に伴い、 薬 効・毒 性作用の予測を行う新規手法、及び、構築された副作用予測モに関係する多様で大量のデルを解析することで逆に副作用の原因となるタンパク質を予実験データの利用が可能

測する試みについてご講演を頂いた。

となり、従 来 型の枠 組み

参加者は立ち見を含めて 73 名にも及び、本分野への興味のは変革を迫られているこ高さが伺えた。

と、単に LBDD と SBDD

（モデレーター：の組み合わせを越えた計関嶋政和（東京工業大学））

水口賢司（医薬基盤・健康・栄養研究所）、

アクセラレータを用いた生命科学計算◇ 10 月 29 日（木）13:30-15:00

4 階研修室大会 3 日目の午後に、フォーカストセッション「アクセラレーの開発者の一人で、このうち最も時間を要する二電子積分のタを用いた生命化学計算」が開催されました。本セッションでGPU 化を中心に、詳しく解説して下さいました。次に、理化

は、特定の計算に特化した演算装置であるアクセラレータを利学研究所生命システム研究センターの森本元太郎先生に「タン用することで、通常の CPU を用いた計算に比べ、大幅に計算

パク質全原子モデルのミリ秒シミュレーションに向けて」とい

効率を高める研究をされている二人の先生方に、生命科学へうタイトルでご講演頂きました。森本先生は、分子動力学専用の応用を踏まえてご講演頂きました。専門的な内容なので、プ

計算機 MDGRAPE-4 の開発者の一人で、ハードウエアの設計

ログラム開発などに携わる限られた方のみの参加を予想してからプログラム開発、さらには応用計算の可能性までをわかりおりましたが、当日は、応用計算を行っている方や企業の研究やすく解説して下さいました。

者にもお集まり頂き、総勢 25 人の参加者と共にセッションを開始することができました。

それぞれの講演では、会場からも複数の意見や質問が出て、活発な議論が展開された共に、生命科学分野におけるアクセ

最初に、筑波大学計算科学研究センターの梅田宏明先生にラレータへの期待を伺い知ることができる有意義な講演会と「GPGPU 化 OpenFMO プログラムの開発」というタイトルでなりました。最後に、本セッションの開催にご尽力くださった

ご講演頂きました。梅田先生は、フラグメント分子軌道（FMO）

大会事務局の皆様に心より感謝申し上げます。

法を超 並列で実 行できる OpenFMO と呼ば れるプログラム（モデレータ－：石川岳志（長崎大学））

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

先端的計測技術◇ 10 月 29 日（木）13:30-15:00

401 号室

近年、抗体医薬品、核酸医薬品などのバイオ医薬品の開発

5 番目は、荒木徹平先生（阪大・産研）より、有機トランジが盛んである。生体高分子をベースにしたこれらの医薬品はよスタを用いた超軽量・超薄膜生体センサに関する御発表をいり複雑な分子作用機序や分子動態を示すので、開発においてただいた。1-2 μ m の極薄フィルムを用いる事で、ウェラブル

は、その計測が鍵となる。本フォーカストセッションでは、気のみならず、インプラントでの生体計測が可能となりつつある鋭の研究者に御発表いただいた。前半は高感度・高精度な生とのことである。後半 2 題は、Body/Organs on-a-Chip に

体計測に関して 5 名の若手研究者に、後半は培養細胞を利用関する御発表で、6 番目の金森敏幸先生（産総研）からは、なした人工人体代謝系の計測に関して 2 名の日本をリードする研ぜ今 Body/Organs on-a-Chip なのかの背景等に関する御紹究者に御発表いただいた。

介をいただいた。世界では様々な大プロジェクトが動いており、開催趣旨説明が多田隈によりなされたあと、渡邉力也先生（東大・工 / さきがけ）より、「マイクロチップを利用した膜輸

日本でも産業界からの要望を汲み取り、早急な対応が望まれるとのことである。

送体の超高感度活性計測システム」と題して、トップダウン技

最 後 の 酒井康 行 先 生（東 大・工）からは、Body/Organs

術によって作られるマイクロチャンバー（1 枚のチップに 10 万

on-a-Chip に関する具体的なお話をいただいた。生体内組織

個のチャンバー）を用いた、様々な膜蛋白質に応用可能な迅速・の階層構造を再構成することにより、医薬品等の体内動態を高精度な測定に関しての御発表いただいた。1 分子レベルで反映したより詳細な解析が可能になるとの展望をお示しいただの検出・活性測定が可能とのことである。ついで、遠藤慧先生

いた。Body/Organs on-a-Chip で解析することで、１＋１＝ 2（東大・新領域 9 より、細胞内の miRNA 活性を用いた細胞の以上の相乗効果の解析を可能とすることができるが、その点か

プロファイリングと分画についての御発表をいただいた。5 箇らすると、多数の臓器を連結するのではなく、2，3 の臓器を所の miRNA 結合部位を持つ mRNA を細胞内に導入する事で、一つにまとめることが最初の取り組み対象との見解であった。

30-60 種類の細胞を現実的なレベルで分けることが可能であ

最後に石田よりまとめの言葉があった。

り、細胞状態のモニターにも使えるとの事である。

各分野で活躍されている研究者が集い、全体的に非常に活

3 番目は、加藤竜司先生（名大・創薬科学）より、機械学習発な議論であった。今後、先端的な計測が Body/Organ on-を用いた細胞の非染色 フェノタイプスクリーニングに関する

a-Chip と組合さり、バイオインフォマティックスの基盤的な御発表をいただいた。現時点では細胞を集団として扱うと、細データとなる事を期待したい。最後に御講演いただいた先生

胞品質の定量値を安定して得ることが可能とのことである。4方、御参加いただいた皆様、CBI 学会 2015 年大会関係者な

番目は、小口祐伴先生（東大・理）より、1 細胞からの DNA/

らびに、CBI 学会事務局の皆様にこの場をお借りし、厚く御礼

RNA サンプルを非増幅にシークエンスする手法に関する御発を申し上げます。

表をいただいた。確立した技術を用いることで、1 細胞に全部（モデレーター：石田誠一（国立医薬品食品衛生研究所）、多田

で 30 万本あるとされる mRNA の解析が可能であると見込ま

隈尚史（京大・iCeMS））

れるとのことである。

粗視化シミュレーションの創薬への応用◇ 10 月 29 日（木）15:30-17:00

4 階研修室

本年 2 月に「粗視化による生体系のシミュレーション」と題れましたが、講師を除いて 27 名の方にご参加頂きました。

した研究講演会を開催したところ大変好評でしたが、限られ高岡からの簡単なイントロダクションの後、まずは本年 2 月

た時間の中で議論が深まらなかったと感じており、今回少し小の研究講演会でご講演頂いた名大笹井先生および京大高田先さめの部屋でのより活発な議論を期待し、本フォーカストセッ

生の研究室に在籍した経験があり、CafeMol の開発者でもあションを企画しました。

る検崎先生にご登壇頂きました。前半は CaffeMol の概要と大会最終日最後のセッションであり、また計算科学のスポ応用例の紹介、後半は現在先生が取り組んでいらっしゃるとい

ンサードセッションと重なったため参加者が少ない事が想定さう核酸とタンパク質から成る系のシミュレーションについてご9CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号
講演頂きました。

加者の皆様にお礼申し上げます。

続 いて 2 月 の 講 演 会 で も ご 講 演 頂 い た 寺 田 先 生 か ら、Martini ポテンシャルを用いたタンパク質と低分子リガンドのドッキングシミュレーションについてご紹介頂きました。

「Introduction」
髙岡雄司 （ダッソー・システムズ・バイオビア）

一口に粗視化シミュレーションと言っても両先生方のアプロー「生体分子粗視化シミュレータ CafeMol と DNA/ タンパク質チは異なっており、またいずれの場合においてもタンパク質の複合体のシミュレーション」

形を X 線構造に留めるためのポテンシャルを加える必要があ

検崎博生 （理化学研究所情報基盤センター）

るなど、all atom シミュレーションに比べるとまだハードルが「粗視化分子動力学シミュレーションで探るタンパク質・リガン高いという印象でしたが、それだけに得られる知見は新鮮なもド結合過程」のであり、今後さらに研究が進むことを期待しております。

寺田透 （東京大学大学院農学生命科学研究科）

末筆になりましたが、手弁当にも関わらず快く講師をお引き受けくださった両先生、また議論に加わってくださった多くの参（モデレーター：髙岡雄司（BIOVIA））

個別化医療研究会「個別化医療と医療情報」◇ 10 月 29 日（木）15:30-17:00
2015 年 10 月 29 日（木）、標題のフォーカストセッション

406 号室「個別化医療を目指した大規模前向きコホートと健常人バイオ（以下 FS）を開催し、29 人の参加者にお集りいただきました。

バンク」

本 FS は、個別化医療研究会の活動の一環として行われたもの

3. 鈴木 昭之（ファイザー株式会社）です。個別化医療研究会は CBI 学会の研究会として設立され、「個別化医療と Modeling & Simulation」

2015 年 5 月 15 日にキックオフミーティングを岐阜薬科大学

4. 中村 光浩（岐阜薬科大学医薬品情報学研究室）

で開催しました。キックオフミーティングでは、（独）医薬品「ビッグデータと個別化医療の実際」

医療機器総合機構、基礎研究、臨床研究および企業の講師の先生方より個別化医療をそれぞれの立場から俯瞰した講演をしていただきました。

劉先生のご講演は、製薬企業のバイオマーカー戦略の現状と課題について、医薬品開発の効率化と PGx、コンパニオン

今回の FS では、製薬企業のバイオマーカー戦略、企業内診断薬などの現状を解説していただきました。高井先生には、での Model and simulation 事例、東北で行われている疫学

東北メディカル・メガバンク計画のバイオバンクおよびコホー研究など、上述のキックオフミーティングと相補的な内容を企ト調査による、個別化医療の研究基盤構築の将来ビジョンを画いたしました。今回、CBI 学会にご参加の先生方と一緒に、解説していただきました。鈴木先生には、医薬品開発の定量情報計算化学生物学の枠にとらわれず、広く臨床分野も含めた的意思決定手法（Modeling & Simulation）を，変動要因の「個別化医療」をキーワードとした諸問題、アイディア、展望な探索などの個別化医療への応用を説明していただきました。中どを討議する場を提供することができたのではないかと考え村は、医療現場で別化医療に用いられる解析ツール使用時のます。各講演者には、基礎的な事項から実際の経験を交えた

ピットフォール、大規模有害事象副作用データベース（JADER）

具体的な事例までお話いただくことができました。会場からのからのエビデンスの事例を説明いたしました。

質問・コメントも活発で、参加者の方々がこの領域に興味をお本 FS で個別化医療と医療情報の現状を知ることができまし持ちであることを感じさせられました。

た。また、CBI 学会参加者の知識とスキルを広く国民あるいなお本 FS では以下の方々にご講演いただきました（敬称略）。

は臨床現場に反映させていくことの必要性が浮き彫りとなり、
これらの課題を参加者の間で共有できたことは有意義であった

1. 劉 世玉（小野薬品工業（株）トランスレーショナルメディショと思います。最後に、ご講演くださった先生方、ご参加いただンセンター）

きました皆様、CBI 学会 2015 年大会関係者および事務局の「製薬企業における個別化医療の取り組み」

皆様に心より御礼申し上げます。

2. 高井 貴子（東北メディカルバンク・メガバンク機構 医療情（モデレーター : 中村光浩（岐阜薬科大学 実践薬学大講座 医報 ICT 部門）

薬品情報学研究室））

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

科研費新学術領域研究「分子ロボティクス」公開シンポジウム- 折り紙工学および群知能との接点を探る CBI 学会 2015 年大会の一環として開催した分子ロボティクスシンポジウムですが、多くの方の協力により無事成功裏に終わらせることができました。今回は、「折り紙工学および群知能との接点を探る」
をシンポジウムテーマとし、27 日に 2 件の招待講演と 6 件の一般講演、28 日には 5 件の招待講演と総合討論を企画しました。また、30 件のポスター発表がありました。
学際的なテーマは大勢の研究者の関心を呼び、27 日は 79 名、28 日は 72 名の参加者が集いました。
この場を借りて講演者ならびに関係者に御礼申し上げます。
プログラム
10 月 27 日（火）14:00-14:30 オリガミ工学と分子ロボティクス「 DNA オリガミ～構造 DNA ナノテクノロジーの最前線」
		 村田 智（東北大学）「 折紙工学の現状と課題」
		 萩原 一郎（明治大学）
16:00-17:30

一般公募講演セッション		 角五 彰（北海道大学）「 DNA を用いた生体分子モーターの集団運動制御」「 粉体の動力学をモチーフとした搬送ロボットシステムの提案」
		 菅原 研・土井 洋平（東北学院大学）「 Self-oscillation in population protocols」
		 Anissa Lamani（九州大学）
		 安井 真人（理化学研究所）「 ゆらぎの大きい環境下で細胞が電場を認識するメカニズム」
		 遠藤 政幸（京都大学）「 分子ロボットの感覚となる DNA オリガミ構造体と脂質二重膜との相互作用」「鎖置換反応をもちいた化学反応ネットワークの力学的特徴と分子ロボットの知能への応用」
		 鈴木 泰博（名古屋大学）
17:30-19:30

ポスター発表（CBI 学会大会ポスター会場）

10 月 28 日（水）14:00-15:30

分子ロボットにおける「知能」とは？

パート１

		 萩谷 昌己（東京大学）「 分子ロボットあるいは learnion と computon による知能モデルの提案」
		 Olaf Witkowski（Univ.of Tokyo）「 Signal-Driven Swarm Intelligence and Evolutionary Robotics」「 群れにおける内部予期」
		 郡司 ペギオ 幸夫（早稲田大学）
16:00-17:30

分子ロボットにおける「知能」とは？

パート２

		 木賀 大介（東京工業大学）「 生命の起源と初期進化における、情報と「知能」の出現」
		 中島 秀之（公立はこだて未来大学）「知能と環境」（モデレーター）および講演者ー総合討論「分子ロボットにおける『知能』とは？」
		 小長谷 明彦（東京工業大学）
17:30-18:30 ポスター発表（CBI 学会大会ポスター会場）

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

市民講座「地域医療のイノベーションと ICT（情報通信技術）－災害時にも対応できる医療情報を－」今回の市民講座「地域医療のイノベーションと ICT」は、江戸川区民を含む参加者に対して「個人向け健康情
報管理サービスシステム」について最新の情報を提供し、同時に現状の問題点と将来展望について議論できる
オープンな場をセットした。江戸川区の後援という理由で、多くの市民が今回の市民講座に参加して、活発な質質疑応答が繰り広げられた。中には、大腸がんの治療を受けて 10 年以上経過した市民や、人工肛門を付けている方も参加されて、自らの経験に基づいた具体的な質問が出された。

石川 智久 （NPO 法人地方再興・個別化医療支援理事長 ）「妻のガン闘病から学んだこと：個別化医療の重要性」
患者間における薬物応答性の違いは、その人の生活習慣に加えて、ゲノム配列の 個人 差（遺伝 子 多型） によるものと考えられる。遺伝子多型に基づく効果的な医療「個別化医療」の実現が今求められている。個別化医療を実現するために遺伝子多型と薬効および副作用の関係を明らかにする必要がある。薬物の副作用に関係する遺伝子多型を診断し、薬物療法の安全性を向上させるための（石川直子）の卵巣がんのインフラ整備が緊急に求められている。妻
闘病生活で経験した分子標的薬アバスチンによる重篤な副作用（消化管穿孔と腹膜炎）を説明して、癌治療における個別化医療の重 要性を訴えた。

北岡 有喜 （国立病院機構・京都医療センター医療情報部

部長）「個人向け健康医療福祉履歴管理（PHR）サービス『ポケットカルテ』- 臨床研究基盤としてのこれまでの取組と今後の展開について-」阪神・淡路大震災や東日本大震災では、多くの医療機関での診断
記録が喪失し、服用中の薬剤や治療経過、検査値などのデータが失われたために、避難所等における患者への医療対応が困難になった事実がある。そのような苦い事実を踏まえへて、「患者自身のデータは自ら守る」と「診療記録の電子保存」および「クラウド ICT
京都医療センター
ネットワークの活用」というコンセプトのもとに、とその近郊の病院は、個人向け健康情報管理サービスシステムを開始した。その経緯と潜在してい問題点、並びに解決方法を詳しく説「ポケットカルテ」の将来展開および IBM ワトソ明した。さらに、ンの医療への応用に関して、魅力的な動画を紹介した。

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

岡崎 光洋 （一般社団法人スマートヘルスケア協会

代表理事）「“あなたをよく知る手帳” お薬手帳の効用、電子化でもっと活用！」
数年前に、個人の医療や健康に関する情報を電子的に蓄積し、効
果的に健康管理を実現するための「どこでも MY 病院」構想が示された。その構想において、お薬手帳の電子化が本格的に検討され、災害時におけるお薬手帳の重要性が認識されるようになった。
現在では、日本薬剤師会や薬局を運営する会社が、使いやすいお薬
手帳アプリを作成し、スマートフォンでも利用できるようになってきている。今回の市民講座では、お薬手帳の利便性と重要性を市民に知ってもらうことと、インターネットやスマートフォンで利用する電子化お薬手帳のメリットを説明した。そして地域包括ケアにおいても、その真価が発揮されるケースを紹介した。

塚原 祐輔 （株式会社理研ジェネシス

代表取締役社長）「遺伝子検査・体質に基づく医療と健康管理」
日本社会においては歴史的に類を見ない少子高齢化が進行している。2025 年には全人口の 35% 以上を 65 歳以上の高齢者が占めることになると推測されている。高齢者においては、脳血管疾患、
虚血性心疾患、癌、糖尿病、骨粗鬆症などの生活習慣病の患者数が増加しており、地方における経済力と健全な生活基盤の 低下は深刻な 課 題である。患者間における薬 物応 答 性の 違いを 予 測するために、 副 作用に関 係する遺 伝 子 多型を診 断し、 薬 物 療 法 の 安
全性を向上させるための技術的進歩を、ゲノムの基 本的な知識から順 序たてて市民に分かりやすく説明した。

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

FMO チュートリアル
創薬研究に役立つ機能の紹介と 新開発の FMO 計算支援ソフト "FU" と GAMESS を用いた計算実習2015 年 10 月 26 日（月）13:30-17:30

401 号室

講師：北浦和夫（神戸大学）、Dmitri G. Fedorov（産業技術総合研究所）
プログラム：１. 講義 （13:30-15:10）
						

FMO 法の説明						

創薬で役立つ機能（部分構造最適化、溶媒モデル等）の説明

						GAMESS-FMO の説明				

２. 実習 （15:20-17:00）

						

FMO 計算支援ソフトウェア「ＦＵ」の機能と使い方						

モデル系を用いた様々なＦＭＯ計算の実習						

タンパク質 - リガンド複合体モデルの計算と結果のグラフ化

				

３. 質疑応答 （17:00-17:30）「安全性（毒性）評価支援システム」勉強会
2015 年 10 月 26 日（月）12:45-17:00

4 階研修室開催趣旨：現在、化合物に関係する殆ど総ての分野で「安全性（毒性）評価」の重要性が高まっている。創薬におけ		

る毒性や副作用、一般化合 物における REACH 等で代 表される化合 物規制、環 境分野における環 境毒性、実 験 動		

物に代わるバーチャル実験としての適用。このように様々な研究分野で、安全性評価の重要性が増大している。 「安		

全 性（毒性）評 価」自体は、安全 性（毒性）の特徴から、実データ主義が取られていたが、時代の進 展とともにイ		ンシリコによる化合物安全性評価を積極的に採用するという流れが定着しつつある。これに従い、現実的に「安全性		 （毒性）評価支援システム」を利用する事が必要となりつつある。

現在、比較的多数の「安全性（毒性）評価支援

		システム」が大学、研究機関、ソフト関連企業等で開発されている。日本でも、最新の「安全性（毒性）評価支援システ

		ム」が販売／展開されている。これらのシステムを充分に活用し、その力を充分に発揮できるようにするにはシステムの内		

容を充分に理解する事が必要であるが、そのような事を学ぶ機会が殆ど無い。今回は、日本で販売されている多くの商		

用システムの方々や企業のご協力を得て、日本で展開されている殆どの「安全性（毒性）評価支援システム」のご講演をい		

ただけることになった。様々なシステムを一堂に会して、勉強できる貴重な機会を生かし、安全性評価のなんたるかを学ん

		

でほしい。

プログラム：
		

12:45-13:00

挨拶および安全性評価システムの概要：湯田浩太郎

		

13:00-13:30

ADMEWORKS: 株式会社富士通九州システムズ、古賀裕美

		

13:30-14:00

Derek Nexus： CTC ライフサイエンス株式会社

		

14:00-14:30

Leadscope： CTC ライフサイエンス株式会社

		

14:30-15:00

CASE：構造活性相関による毒性予測ソフトウェア CASE Ultra インフォコム株式会社		

15:20-15:50

Percepta：より効率的な意思決定のためのインシリコ物性・ADME・毒性 予測を備えた

				

自社ポータルサイトの構築

富士通株式会社、古田一匡

		

15:50-16:30

SYMMETRY：創薬研究・医薬品開発のための包括的支援システム

		

16:30-17:00 討論および名刺交換会

株式会社菱化システム、狩野敦

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

企業展
出展企業一覧
< スポンサードセッション >株式会社 iPS ポータル /iPS ビジネス促進拠点
理化学研究所 HPCI 計算生命科学推進プログラム
株式会社レベルファイブ< ランチョンセミナー >エルゼビア・ジャパン株式会社
サターラ合同会社
株式会社菱化システム
パトコア株式会社
CBI 学会総会
株式会社ワールドフュージョン
< スポンサー企業企画枠 >みずほ情報総研株式会社< ブース >
エルゼビア・ジャパン株式会社
株式会社菱化システム
株式会社ナベ インターナショナル
株式会社タロウ
株式会社クロスアビリティ
株式会社フィアラックス
株式会社富士通九州システムズ
科研費新学術領域研究「分子ロボティクス」
コニカミノルタ株式会社
エディテージ（カクタス・コミュニケーションズ株式会社）
みずほ情報総研株式会社
株式会社レベルファイブ / ディスカヴァリソース株式会社 /株式会社情報数理バイオ株式会社 iPS ポータル /iPS ビジネス促進拠点
株式会社ワールドフュージョン
理科研株式会社
神戸市／計算科学振興財団（FOCUS）
HPC システムズ株式会社
CTC ライフサイエンス株式会社
株式会社 BB ブリッジ
コンフレックス株式会社< 広告掲載 >化学情報協会
みずほ情報総研株式会社
株式会社菱化システム
株式会社カモソフトウェアジャパン
オープンアイ・ジャパン株式会社
株式会社レベルファイブ< カタログ設置 >オープンアイ・ジャパン株式会社

場所
日時
福寿桃源（2F） 27 日 16:00-17:30
福寿桃源（2F） 28 日 16:00-17:30
福寿桃源（2F） 29 日 15:30-17:00
場所
日時
研修室（4F）
27 日 12:00-13:30
401（4F）
27 日 12:00-13:30
研修室（4F）
28 日 11:30-13:00
401（4F）
28 日 11:30-13:00
研修室（4F）
29 日 12:00-13:30
401（4F）
29 日 12:00-13:30
場所
日時
402（4F）
29 日 13:30-15:00
ブース番号
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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

ポスター発表ポスター賞
Best Poster◆ P2-06 Misa Sayama		

Title: Ligand-Guided Approach to Validate Computational Hydrophobic Binding				 Pocket Models of Lipid GPCRs
		

Author: Misa Sayama, Tomohiko Ohwada, Takatsugu Hirokawa, Sho Nakamura,				 Sejin Jung, Masaya Ikubo, Yuko Otani

Excellent Poster◆ P1-05 Shota Uehara		

Title: Incorporation of Water Displacement Effect into Scoring Functions for 						 Protein-ligand Docking						Author: Shota Uehara, Shigenori Tanaka◆ P2-02 Ryusuke Sawada
		

Title: Target-based Drug Repositioning Using Large-scale Chemical-protein 						 Interactome Data		

Author: Ryusuke Sawada, Hiroaki Iwata, Yoshihiro Yamanishi◆ P4-02 Atsuko Sato		

Title: The site of CYP3A4 metabolism prediction of tolterodine using MD and its				 application to compound design		Author: Atsuko Sato, Hitomi Yuki, Chiduru Watanabe, Jun-ichi Saito, Teruki Homma◆ P4-07 Yuki Asako		

Title: High-Performance Prediction for Estrogenic Compounds based on the 							Tox21 10K Compound Library 			Author: Yuki Asako, Yoshihiro Uesawa

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CBI 学会誌 第 3 巻 第 4 号，17-21 ページ，2015 年

解説論文

高精度量子化学計算による 弱い水素結合の研究高橋修

広島大学サステナブル・ディベロップメント実践研究センター〒739-8526 東広島市鏡山 1-3-1
E-mail: shu@hiroshima-u.ac.jp(論文受付日 November 5, 2015 ; 公開日 November 30, 2015)

要旨： 弱い非共有結合型の水素結合の１つである CH···π 相互作用は物理,化学，そして生物において重要な役割を演じている。ここでは水素結合の定義を紹介し, CH···π 水素結合の位置づけを確認する。次にいくつかの CH···π 水素結合の実験的な証拠を述べる。
次に有機化学において重要な配座，反応性，分子認識のような問題に対して最近の研究
例を紹介する。
Abstract：CH···π interaction, which is one of weak non-covalent hydrogen bonds (H-bonds),
plays an important role in physics, chemistry, and biology. First, definition of the H-bond isintroduced, and a position of the CH···π H-bond is confirmed. Next, several experimental
evidence of the CH···π H-bond are described. Then, consequence of the CH···π H-bond inorganic chemistry such as conformation, reaction selectivity, and molecular recognition is
discussed especially from recent results.
キーワード: CH···π 水素結合，CH···O 水素結合，高精度分子軌道計算１．弱い水素結合
１.１

水素結合の定義

分子は原子から構成されており,様々な種類の化学結合で結び付けられている。共有結合は，原子間に２つもしくはそれ以上の電子を共有し結び付けられることで強い結合を構成するのに対し,非共有結合は弱いが,様々な化学現象に対して重要な役割を演じている[1][2]。
水素結合の定義は化学の発展とともに拡張されてきた。Pauling によると,水素結合は２つの極性原子(X,Y)の間に水素が入り込むことによって生じる
クーロン相互作用もしくは双極子－双極子相互作用である。水素供与体である XH は正に分極しており,一方水素受容体である Y は孤立電子対を有し，負に分極している。
現代的な定義は Pimentel と McClellan[3]によって与えられた。さらに最近,IUPAC はその技術レポー
ト[4]に以下のように記している。This is an attractive
interaction between a hydrogen atom from a molecule ora molecular fragment X-H in which X is more
electronegative than H, and an atom or a group of atoms
in the same or a different molecule, in which there isevidence of bond formation. このレポートでは６つの水素結合の特徴が列挙されている。本解説で説明する CH…π 結合はじめ，種々の弱い水素結合ももちろんこの範疇に入る。

１.２

水素結合の内訳

水素結合はその強さによって分類できる。結合の性質を理解するため,エネルギー分割法が用いられてきた。古くは Hatree-Fock 近似に基づく，いわゆ
る“北浦－諸熊分割”[5]がある。彼らの先駆的な手法に続く形で,いくつかエネルギー分割法が提案されている。最近は symmetry adapted perturbation theory(SAPT)法[6]が広く用いられている。SAPT 法による

17

解説論文

CBI 学会誌 第 3 巻 第 4 号，17-21 ページ，2015 年

いくつかの典型的な水素結合のエネルギー成分を表１に示す。相対的には強い水素結合では静電エネ

ルギーが支配的であるのに対し,弱い水素結合では分散力の寄与が大きい。

Table 1. Energy decomposition for various types of hydrogen bonds using SAPT method (in kcal mol-1).

a

Ees

a

Edisp

a

Eothera

Etotal

OH···O b
OH···N b
OH···π b
NH···O b
NH···N b
NH···π b
CH···O b
CH···N b
CH···π b

H2O···H2O
H2O···NH3
H2O···C2H4
NH3···H2O
NH3···NH3
NH3···C2H4
CH4···H2O
CH4···NH3
CH4···C2H4-4.60 -8.22 8.30
-6.10 -11.15 11.76-2.57 -3.82 4.96
-2.15 -3.81 4.14
-2.75 -5.14 5.84
-1.34 -1.79 2.55
-0.45 -0.89 1.61
-0.65 -1.32 2.32
-0.81 -0.57 1.45

-1.38
-2.10
-0.78
-0.50
-0.79
-0.23
-0.10
-0.30
-0.03

-2.36
-3.05
-2.24
-1.61
-2.05
-1.59
-0.98
-1.17
-1.58

-0.94
-1.55
-0.68
-0.37
-0.60
-0.28
-0.09
-0.18
-0.07

1.79
1.83
1.49
1.77
1.87
1.33
2.00
2.03
0.71

0.51
0.5
0.87
0.75
0.75
1.19
2.18
1.8
1.95

OH···π c
NH···π c
CH···π c
CH···π d

H2O···C6H6
NH3···C6H6
CH4···C6H6
C2H2···C6H6

-2.86
-2.08
-1.27
-2.54

-1.05
-0.60
-0.10
-0.55

-3.18
-3.32
-2.4
-3.75

---0.16
-0.72

1.03
0.98
0.68
1.14

1.11
1.60
1.89
1.48

3.78
3.40
2.23
5.46

Eind

a

example

-2.94
-2.05
-0.86
-2.89

Eer

a

Type ofH-bond

Ees/Etotal Edisp/Etotala

The total interaction (Etotal), electrostatic (Ees), exchange repulsion (Eer), induction (Eind), dispersion (Edisp), and othereffects (Eother) energies, respectively.
bThis work.
cReference [7].
dReference [8].

１. ３結晶構造データベース解析

弱い水素結合の決定的な証拠を与えたのはケンブリッジの結晶構造データベース[9]解析であろう。
梅沢ら[10]は上のデータベースを用いて分子内および分子間 CH…π 結合を検索した。すると分子内では,芳香族間と CH の間の距離が van der Waals 距離よりも短くなっているものが全体の約 29％ヒットした。
これは他の OH…π, NH…π 結合が 1.4%, 2.7%であったものと比べると圧倒的に多い。分子間では，さらに差が広がり, CH…π，OH…π, NH…π の順に 75.1%,
5.1%,9.3%であった。もちろんこれらの割合はデータ
ベースのエントリー数が変われば変わってくると思われるが,傾向はあまり変わらないであろう。あきらかに結晶中で分子内，分子間 CH…π 結合は重要である。

水素結合は方向性を示す。XH…Y の３つの原子はほぼ直線になる傾向にある。CH…π 結合も同様の傾向が認められる。このことは計算化学的にも分光学的にも示された[11]。CH…π 結合は主には分散力であるが,方向性を有し,方向性を示さない分散力とは性格が異なる。

２．弱い水素結合系に対する高精度量子化学計算
以下ここ十数年にわたり,我々のグループで行ってきた弱い水素結合系に対する量子化学計算を紹
介する。

２.１

配座解析

配座の安定性は分子構造を決めるためのキーポ
イントのひとつである。n-ブタンはメチル基の位置によりアンチ,ゴーシュ形をとり，エネルギー的には

18

解説論文

CBI 学会誌 第 3 巻 第 4 号，17-21 ページ，2015 年

アンチ系の方が安定である。これは一般に２つのメチル基間の立体反発によって理解されている。しかしながら，一方のメチル基を他の官能基に置換した分子の場合は必ずしもアンチ形が安定ではない。
我々は分子内 CH···O, CH···N, CH···π 水素結合のモデルとして,CH3-Y-CH2-X 分子 (X=OH, OCH3, F, Cl,
CN, CCH, and C6H5; Y=O,CH2)に対して高精度理論計算を行った[12]。アンチ,ゴーシュ配座の自由エネ
ルギー差を表２に示す。MP2/6-311++G(3df,3pd), G3
レベルにおいて,全ての分子に対してゴーシュ系の方が安定である。Y=O の場合のほうが Y=CH2 のときよりもエネルギーが大きくなるのは官能基間の距離が短くなり相互作用が強くなるためである。このことから，これらの分子において官能基間に引力がはたらいていることがわかる。

れの高精度分子軌道計算により,配座の順序まで正確に再現でき,分子内の引力的な CH···π 水素結合がこれらの分子において支配的に作用していることがわかる。

Table 2. Difference in the Gibbs energy (in kcal mol-1)
between the anti- and gauche conformers of
CH3-Y-CH2-X (X; OH, OCH3, F, Cl, CN,
CCH, and C6H5: Y=O, CH2) at
MP2/6-311++G(3df,3pd) with thermal
corrections and G3 theory.

X

MP2

Y=O
G3

Y=CH2
MP2
G3

OH
OCH3
F
Cl
CN
CCH
C6H5

2.35
2.86
4.02
4.00
1.68
0.98
1.09 a

2.20
2.45
3.76
3.71
1.26
0.94
--

0.04
1.30
0.12
0.17
0.24
0.09
0.07 a

0.06
0.11
0.12
0.10
0.14
0.05
--

Fig.1. Stable rotamers of Ph-CHMe-X-R (X=CO, CH2,
O, S, SO, SO2; R=H, Me, Et, i-Pr, t-Bu).
CH···π 水素結合は環状分子に対しても作用する。
1-置換シクロヘキサンはアキシアル形よりエカトリ
アル形の方が安定である。しかしイソメントン，イソカルボメントンのようなイソプロピル基を有す
る不飽和シクロヘキサン誘導体はアキシアルの方が安定である。この異常なふるまいは C=O のπ軌道と CH の間の引力的な CH···π 水素結合によって理解することができる。我々は高精度分子軌道計算を行い,このことを確かめた[18]。
さらに大きな分子に対する応用例を示す。ステロ
イド骨格分子においてしばしば folded 配座が観測される。Burgstahler らは,レボピマリン酸は folded 配座として観測されると報告した。高精度分子軌道計算
を２つの配座に対して行った結果,予想通り folded
配座のほうが安定であった。これは 10b に位置する
メチル基の中と CH と共役しているジエン環の sp2炭素の間にはたらく引力的な CH···π 水素結合が示
唆される。
H
H

i-C3H7C10

CH3

aMP2/6-311G(d,p) level of approximation.
HOOC

CH3

i-C3H7

次にもう少し大きな分子に対し, CH···π 水素結合の関係する分子内相互作用を議論する。ターゲット
は Ph-CH2-X-R と Ph-CHMe-X-R (X=CO, CH2, O, S,
SO, SO2; R=H, Me, Et, i-Pr, t-Bu) で あ る[13][14][15][16][17]。これらの系は西尾らによって
CH···π 水素結合の存在が指摘された分子でもある。
当時 MM モデル計算も行われていたが,配座のエネ
ルギー順序までは正確に再現できなかった。われわ

i-C3H7
CH3
CH3

CH3
CH3
HOOC
HOOC

Fig.2. Folded and extended conformations oflevopimaric acid.

19

CBI 学会誌 第 3 巻 第 4 号，17-21 ページ，2015 年

解説論文

２.２

アノマー効果

次に弱い水素結合の１つである CH···n 結合の寄与する系を紹介する。通常の立体化学とは異なり,糖のような環状化合物において,C1 位に電子吸引基がある場合,エカトリアルよりもアキシアルの方が優位になるのがアノマー効果である。この現象は炭水化物に限らず,オキサン，ジオキサンのような六員環環状化合物の立体化学へ拡張される。
アノマー効果の説明のために,いくつかの説が提案されている。エドワード[19]は endocyclic 酸素の孤立電子対と pyranoside の exocyclic CO 結合の双極子の間の相互作用によって説明できるとした。また
他の解釈として,軌道相互作用を基にした説明もなされている[20]。
我々はモデル分子としてオキサン，ジオキサンを用い,アキシアル－エカトリアル配座に対して理論計算を行った。結果を Table 3 に示す。全ての場合においてアキシアルの方が安定である。置換基の孤立電子対と 1,3 位にあるアキシアル水素との間の分子
内 CH···n 結合が寄与しているのではないかと解釈している。

の官能基間の相互作用は化学を語る上で重要であることは今までの膨大な研究成果からよく認識されていると思われる。官能基で化学を語る方がやりやすい。上で述べたように,現代では弱い相互作用も全て水素結合に含めるようだ。
化学的精度の要求される分野では，電子相関を含め構造を決め,さらに官能基間の相互作用を語る必要があることは共通認識となったと言えよう。電子相関エネルギーは一電子軌道描像では捕らえることができない。今後は一電子描像の上で描かれていた理論および解釈は問い直す必要が生じるかもしれない。
また，電子相関を入れた計算をたんぱく質のような巨大系にそのまま適用するのは現実的ではなく,また場合によっては非効率である。現代では,FMO
法のような巧みな手法を用いることで相互作用を議論することができる。今後の巨大系への電子状態計算の適用により,分子デバイスの設計,生体機能発現機構の解明，新薬開発などに高精度分子軌道計算の活躍する分野が広がっていくことであろう。

参考文献
[1]

Table 3. Difference in the Gibbs energy (in kcal mol-1)a,calculated at the MP2/6-311++G(d,p) level,
between the axial and equatorial conformers of
2-substituted oxanes and 1,3-dioxanes.

[2]
[3]
[4]

X

Oxane

1,3-dioxane

OCH3
F
Cl
Br

1.25
2.47
2.57
3.08

1.94
3.42
4.31
5.45

a

[5]

ΔGeq-ax=Geq-Gax.
[6]

３．終わりにここ十数年にわたり,筆者らが行ってきた弱い相互作用系の理論計算の結果の一部を紹介した。この解説は以前我々のグループが執筆した総説にもっと詳しい記述がある[21][22]。興味のある方はそちらも参照いただきたい。
本論文では水素結合の定義を確認するところからはじめた。CH と n（非共有電子対）, π（π軌道）との間には電子密度の勾配が生じるため,相互作用があることは万人が認めるところであろう。また上

[7]

[8]

Scheiner, S. Hydrogen bonding. Oxford Universty
Press: New York, 1997
Nishio, M.; Hirota, M.; Umezawa, Y. The CH/πInteraction, Wiley-VCH: New York, 1998
Pimentel, G. C.; McClellan A. L. The Hydrogen
Bond, Freeman: San Francisco, 1960
Arunan, E.; Desiraju, G. R.; Klein, R. A.; Sadlej,
J.; Scheiner, S.; Alkorta, I.; Clary, D. C.; Crabtree,
R. H.; Dannenberg, J. J.; Hobza, P.; Kjaergaard, H.
G.; Legon, A. C.; Mennucci, B.; Nesbitt, D. J.
Defining the hydrogen bond: An account (IUPAC
Technical Report). Pure Appl Chem. 2011, 83,
1619. doi:10.1351/pac-rep-10-01-01
Kitaura, K; Morokuma, K. A new energy
decomposition scheme for molecular interactions
within the Hartree-Fock approximation. Int J
Quantum
Chem.
1976,
10(2),
325-340.
doi:10.1002/qua.560100211
Jeziorski, B.; Moszynski, R.; Szalewicz, K.
Perturbation Theory Approach to Intermolecular
Potential Energy Surfaces of van der Waals
Complexes. Chem Rev. 1994, 94(7), 1887-1930.
doi:10.1021/cr00031a008
Bloom, J. W. G.; Raju, R. K.; Wheeler, S. E.
Physical Nature of Substituent Effects in XH/πInteractions. J Chem Theory Comput. 2012, 8(9),3167-3174. doi:10.1021/ct300520n
Mishra, B. K.; Karthikeyan, S.; Ramanathan, V.
Tuning the C-H•••π Interaction by Different
Substitutions in Benzene- Acetylene Complexes. J
Chem Theory Comput. 2012, doi:10.1021/ct300100h

20

解説論文

CBI 学会誌 第 3 巻 第 4 号，17-21 ページ，2015 年[9][16] Takahashi, O.; Kohno, Y.; Saito, K.; Nishio, M.
Prevalence of the alkyl/phenyl-folded conformation
in benzylic compounds C6H5CH2-X-R (X = O,
CH2, CO, S, SO, SO2): Significance of the CH/πinteraction as evidenced by high-level ab initio MO
calculations. Chem Eur J 2003, 9(3), 756-762.
doi:10.1002/chem.200390084[17] Takahashi, O.; Saito, K.; Kohno, Y.; Suezawa, H.;
Ishihara, S.; Nishio, M. The conformation of
1-alkyl-2-phenylpropan-1-ols studied by ab initio
MO calculations. Relevance of the CH/π and OH/πhydrogen bonds. Bull Chem Soc Jpn 2003, 76(11),2167-2173. doi:10.1246/bcsj.76.2167[18] Takahashi, O.; Yamasaki, K.; Kohno, Y.; Kurihara,Y.; Ueda, K.; Umezawa, Y.; Suezawa, H.; Nishio,
M. The conformation of alkyl cyclohexanones andterpenic ketones. Interpretation for the 'alkylketone
effect' based on the CH/π(CO) hydrogen bond.
Tetrahedron2008,
64(10),
2433-2440.
doi:10.1016/j.tet.2007.12.052[19] Edward, J. T. Chem. Ind. London, 1955, pp 1102.
[20] Romers, C.; Altona, C; Buys H R, Havinga E. Top.
Stereochem., 1969; Vol.4, pp 39.
[21] Takahashi, O.; Kohno, Y., Nishio, M. Relevance of
weak hydrogen bonds in the conformation oforganic compounds and bioconjugates: Evidence
from recent experimental data and high-level ab
initio MO calculations. Chem Rev 2010, 110
6049-6076. doi: 10.1021/cr100072x[22] Takahashi, O. CH…π Interaction in Organic
Molecules, in:, Noncovalent Forces; Scheiner, S.
Ed.; Springer International Publishing, 2015;
pp.47-68. doi: 10.1007/978-3-319-14163-3

Allen, F. The Cambridge Structural Database: aquarter of a million crystal structures and rising.
Acta Crystallographica Section B 58 (3 Part1),
2002, 380-388. doi:doi:10.1107/S0108768102003890[10] Umezawa, Y.; Tsuboyama, S.; Takahashi, H.;
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doi:10.1016/S0040-4020(99)00539-6[11] Takahashi, O.; Kohno,Y.; Iwasaki, S.; Saito, K.;
Iwaoka, M.; Tomoda, S.; Umezawa, Y.; TsuboyamaS.; Nishio, M. Hydrogen-bond-like nature of theCH/π interaction as evidenced by crystallographic
database analyses and ab initio molecular orbital
calculations. Bull. Chem. Soc. Japan 2001, 74(12),2421-2430. doi:10.1246/bcsj.74.2421[12] Takahashi, O.; Yamasaki, K.; Kohno, Y.; Ueda, K.;
Suezawa, H.; Nishio, M. The origin of thegeneralized anomeric effect: possibility of CH/n
and CH/π hydrogen bonds. Carbohydr Res 2009,
344(10), 1225-1229. doi:10.1016/j.carres.2009.04.011[13] Takahashi, O.; Yasunaga, K.; Gondoh, Y.; Kohno,
Y.; Saito, K.; Nishio, M. The conformation of
2-phenylpropionaldehyde and alkyl 1-phenylethyl
ketones as evidenced by ab initio calculations.
Relevance of the CH/π and CH/O interactions instereochemistry. Bull Chem Soc Jpn 2002, 75(8),1777-1783. doi:10.1246/bcsj.75.1777[14] Takahashi, O.; Gondoh, Y.; Saito, K.; Kohno, Y.;
Suezawa, H.; Yoshida T.; Ishihara, S.; Nishio, M.
The alkyl/phenyl-folded conformation of alkyl
1-phenylethyl sulfides and sulfones as evidenced
by ab initio MO calculations. Implication for the
1,2-asymmetric induction. New J Chem 2003,
27(11), 1639-1643. doi: 10.1039/B303268J[15] Takahashi, O.; Kohno, Y.; Gondoh, Y.; Saito, K.;
Nishio, M. General preference for alkyl/phenyl
folded conformations. Relevance of the CH/π andCH/O interactions to stereochemistry as evidenced
by ab initio MO calculations. Bull Chem Soc Jpn
2003, 76(2), 369-374. doi:10.1246/bcsj.76.369

21

CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

CBI ジャーナル便り（3）◆ シミュレーションのみの論文投稿に期待
創薬に於いてインシリコ科学は着実にその実績を収めておりますが、シミュレーションのみの論文は殆どないと思われます。しかし、インシリコ科学のより一層の発展を期待して、今後 CBI ジャーナルはインシリコシミュレーションのみの論文を積極的に受理して行きたいと考えておりますので、宜しくお願い致します。今回、その先鞭として、東海大学の平山令明先生より HLA-A*24:02 を認識す
る分子メカニズムに関する論文をご投稿頂いております。

◆ 論文分野の追加と CBI Journal Supplement Site 新設
論文の種類として、Original、Review、Communication に Opinion を加えました。また、イン
シリコシミュレーションで得られた PDB ファイル等のインシリコ科学で得られた結果が、関連分野で広く活用されることを目指して、CBI Journal Supplement Site を新設致しました。
    >>>     http://cbi-society.info/supplement/10.1273/cbij-15-1/◆ 速報 CBI ジャーナル新掲載論文「乳がんに対して抗ガン活性を有するペプチドが HLA-A*24:02 を													

認識する分子メカニズムに関する研究」

平山令明（東海大学

糖鎖科学研究所）

要旨：Her-2/neu を過剰発現する乳がんの治療において、トラスツズマブを用いた受動免疫治療法
は大きな成功を収めてきた。しかし、耐性出現等による再発の問題が深刻な問題として起こることも分かってきた。そこで、ペプチド・ワクチンを用いる能動免疫治療法の試みがされている。これまでに何種類かの有効なペプチドが見いだされ、少なくとも E75 と GP2 という９量体ペプチドが治験に進んでいる。また、２０量体の CH401MAP というぺプチドも乳がん・ワクチンとして使用することに期待が寄せられている。これらのペプチドの免疫活性発現において、ペプチドが HLA 分子と結合することが第一の必須段階である。次に、ペプチドが T 細胞受容体（TCR）に提示される。しかし、これらのペプチドがどのように HLA と結合して TCR に提示されるか、その分子メカニズムはこれまで解明されていない。そこで、 本研究では、日本人に最も普遍的にみられる HLA-A*24:02 をこれらのペプチドがどのように分子認識するかをドッキング・シミュレーションにより解析した。２０量体の CH401MAP については、すべての９残基と HLA-A*24:02 との相互作用を解析し、DTILWKDIFという配列を持つ９量体ペプチドが相互作用上重要であることを示した。本研究の結果、分子認識機構に関して二つの重要なことが明かになった。第一は、これらの３種類のペプチドが結合する
HLA-A*24:02 の抗原ペプチド結合溝には、これらのペプチドを認識する共通のアミノ酸残基があることである。第二は、TCR との相互作用には、これらのペプチドに共通に見られる３種類の類似原子団が関与していることである。これらの知見は、より治療効果の高いペプチド・ワクチンを今後分子設計する上で非常に重要な手がかりになると思われる。

CBI ジャーナルは J-STAGE にて論文を公開しています
https://www.jstage.jst.go.jp/browse/cbij/-char/en

CBI ジャーナル編集委員会
22

CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

講演会

今後の講演会 予定
第 367 回 CBI 学会講演会「薬物動態分野における in vitro 実験法およびヒト動態予測のための解析法：
			

実験条件の違いにより生じる予測結果の相違を理解する」

日時：2015 年 12 月 15 日（火）10:30-18:00
場所：東京大学山上会館 2 階

大会議室（東京都文京区本郷 7-3-1）

世話人：杉山 雄一、吉門 崇（理化学研究所）

第 368 回 CBI 学会講演会「『京』からポスト『京』へ－革新的創薬基盤の構築に向けた取り組み」
日時：2016 年 1 月 13 日（水）13:00-16:50
場所：東京大学山上会館 2 階

大会議室（東京都文京区本郷 7-3-1）

世話人：大元 和之（小野薬品工業株式会社）、石川 誠（日産化学工業株式会社）、
谷村 直樹（みずほ情報総研株式会社）

第 369 回 CBI 学会講演会「ゲノム医療 －個別化医療に向けた研究の最前線－」
日時：2016 年 2 月 5 日（金）13:10-16:45
場所：東京大学山上会館 2 階

大会議室（東京都文京区本郷 7-3-1）

世話人：松本 俊二（富士通株式会社）、谷村 隆次（東レ株式会社）、大軽 貴典（田辺三菱製薬株式会社）

第 370 回 CBI 学会講演会「分子イメージングと創薬」

日時：2016 年 3 月 3 日（木）13:20-17:30
場所：東京大学山上会館 2 階

大会議室（東京都文京区本郷 7-3-1）

世話人：上村 みどり、松本 由之（帝人ファーマ株式会社）、相良 武（大鵬薬品工業株式会社）、緑川 淳（株式会社ワー
ルドフュージョン）

23

CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

委員会報告
Committee【総会】
日時：2015 年 10 月 29 日（木）12:00-12:30
場所：タワーホール船堀 4 階 401 号室（東京都江戸川区船堀 4-1-1）
参加人数： 48 名
議題：CBI 学会の事業活動に関する報告【評議員会】
日時：2015 年 10 月 29 日（木）12:40-13:30
場所：タワーホール船堀 4 階 403 号室（東京都江戸川区船堀 4-1-1）
出席者（敬称略）： 田中 博（東北大学東北メディカル・メガバンク機構 / 東京医科歯科大学）、新井 好史（大正製薬）、石川岳志（長崎大学）、石田 誠一（国立医薬品食品衛生研究所）、岡部 隆義（東京大学）、粕谷 敦（第一三共）、片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ）河合 隆利（エーザイ）、
小長谷 明彦（東京工業大学）高岡 雄司（ダッソー・システムズ・バイオビア）、
多田 幸雄（東京工業大学）田中 成典（神戸大学）、本間 光貴（理化学研究所）、水口 賢司（医薬基盤・健康・栄養研究所）水間 俊（松山大学）、宮本 秀一（崇城大学）、茂櫛 薫（順天堂大学）
欠席者（敬称略）： 相田 美砂子（広島大学）、石川 智久（NPO 法人地方再興・個別化医療支援）、磯野 克己（かずさＤＮＡ研究所）、
一石 英一郎（国際医療福祉大学病院）、岡本 正宏（九州大学）、荻島 創一（東北大学東北メディカル・メガバンク機構）、坂田 恒昭（塩野義製薬／大阪大学）、菅原 秀明（国立遺伝学研究所）、杉山 雄一（理化学研究所）中馬 寛（徳島大学）、藤 博幸（関西学院大学）、冨田 勝（慶應義塾大学）、
中井 謙太（東京大学医科学研究所）中田 吉郎（群馬大学）、
西沢 元仁（日本 OTC 医薬品協会）、広野 修一（北里大学）、福澤 薫（日本大学）、船津 公人（東京大学）、美宅 成樹（豊田理化学研究所 ）、山内 あい子（徳島大学）、湯田 浩太郎（インシリコデータ）
議題：（1）評議員会の位置づけについて（2）次期会長選挙について
資料：（1）関西部会報告
		① CBI 学会の現状と課題		

②施策（案）

		③体制（案）

		④会長選挙（案）について【創薬研究会運営委員会】
第 19 回創薬研究会運営委員会
日時：2015 年 9 月 8 日（火）10:00-12:00
場所：東京大学山上会館 会議室 001（東京都文京区本郷 7-3-1）
出席者（敬称略）： 大元 和之（小野薬品工業）、大軽 貴典（田辺三菱製薬）、片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ）、狩野 敦、相良 武（大鵬薬品工業）、佐藤 秀行（オープンアイ・ジャパン）、嶋（菱化システム）、小長谷 明彦（東京工業大学）、高土居 雅法（杏林製薬）、田上 宇乃（味の素）、
根 みゆき（中外製薬）、高岡 雄司（ダッソー・システムズ・バイオビア）、谷村 隆次（東レ）、中嶋 久士（興和）、新美 達也（アス多田 幸雄（東京工業大学）、谷村 直樹（みずほ情報総研）、矢城 美代子（大正製薬）、塚田 優子（CBI 学会事務局）
テラス製薬）、松本 俊二（富士通）、松本 由之（帝人ファーマ）

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

欠席者（敬称略）： 岡部 隆義（東京大学）、石川 誠（日産化学工業）、田中 博（東京医科歯科大学）、本間 光貴（理化学研究所）、緑川 淳（ワールドフュージョン）、水間 俊（松山大学）
議題：（1）2015 年大会について

片倉大会実行委員長より

		①プログラム、出展企業ブース、フォーカストセッションの大枠の説明

		②参加登録数（9/7 現在）150 名弱、ポスター投稿 50 件と少なめ、企業からの投稿をお願いしたい。

		③企業からのポスター投稿をアカデミアも含めた問題共有の場として活用してほしい。

		④市民講座のチラシについて･･･ 江戸川区後援、江戸川区公共施設の掲示及び区内医院 200 箇所に配布		⑤分子ロボシンポジウムチラシ説明（2）関西部会報告

小長谷理事

		

①年 4 回実施

		② AI 創薬研の立ち上げ計画有り（3）執行部会報告

10 名程度の出席
小長谷理事

		

① 2015 年度講演会実績報告

		②海外からの入会者向け英文ページ見本

		③会費はクレジット決済、講演会、ジャーナル投稿料のメリット有り

参加者増加傾向（4）講演会企画進捗状況の報告
		①講演会予定一覧参照（5）グループ討議（6）その他
		① WebEX にて大会市民講座（10/29）を JSBi 大会（京大）に配信予定

		②今後、講演会も WebEX にて法人企業に向けて配信（ライブのみ）を検討中

資料：（1）関西部会報告（2）-1 2015 年上半期 _ 講演会参加者人数（2）-2 海外入会登録ページ（3）講演会・研究会予定一覧【関西部会】
第 7 回関西部会運営委員会
日時：2015 年 8 月 22 日（土）13:00-15:00
場所：（財）都市活力研究所セミナールーム（大阪市北区大深町 3-1 グランフロント大阪タワー C 7F）
出席（敬称略）： 小長谷 明彦（東京工業大学）、森 浩禎（奈良先端大学）、坂田 恒昭（関西副部会長、大阪大学、塩野義製薬）、、六嶋 正知（塩野義製薬）、山崎 一人（大日本住友製薬）、水口 賢司（医薬基盤・健康・栄木下 誉富（大阪府立大学）、志水 隆一（都市活力研究所）、田中 成典（関西部会長、神戸大学）、牛尾（書記、神戸大学）
養研究所）
欠席（敬称略）：石正城 敏博（大阪大学）、鶴田 宏樹（神戸大学）、奥野 恭史（京都大学）、田口 隆久（産業技術総合研究所）、、早乙女 周子（京都大学）
森 一郎（神戸大学）
議題：（1）次回（2015 年 11 月 5 日）の CBI 学会関西部会講演会について（2）次々回（2016 年 4 月頃）の CBI 学会関西部会講演会について（3）後の活動・CBI 学会関西部会講演会について意見交換（4）次回関西運営委員会日程確認

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号【執行部会】
第 25 回執行部会
日時：2015 年 10 月 8 日（木）18:15-19:45
場所：東京工業大学 田町 CIC 506 号室（東京都港区芝浦 3-3-6）
出席者（敬称略）：小長谷 明彦（東京工業大学）、片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ）、河合 隆利（エーザイ）、多田 幸雄（東、高岡 雄司（ダッソー・システムズ・バイオビア）、水間 俊（松山大学・スカイプ）、小澤 陽子（事務局）
京工業大学）
欠席者（敬称略）：田中 博（東北メディカルメガバンク機構／東京医科歯科大学）、石川 智久（NPO 法人地方再興・個別化医、岡部 隆義（東京大学創薬機構）、田中 成典（神戸大学）、福澤 薫（日本大学）、本間 光貴（理化学研究所）
療支援）
議題：（1）2015 年大会進捗状況（2）次期会長について（3）次期創薬研究会運営委員会主査について（4）アドバイザーについて（5）大会時の総会議題と資料について（6）大会時の評議員会議題と資料について（7）2016 年大会企画委員について（8）レンタルサーバ（１台まるごと占有）の提案（9）2018 年大会会場予約について（報告）資料：（1）2015 年大会企業展申し込み状況（2）2015 大会ポスター投稿数と参加申し込み者数（3）アドバイザーについて（小長谷先生案）（4）総会議題（案）と資料（案）（5）評議員会議題（案）と資料（案）＜＜保留＞＞（6）2016 年大会委員一覧（7）レンタルサーバ（１台まるごと占有）の提案（小長谷先生）（8）2018 年大会日程と会場【2016 年大会拡大実行委員会】
第 1 回 2016 年大会拡大実行委員会
日時：2015 年 10 月 28 日（水）12:00-13:30
場所：タワーホール船堀 4 階 403 号室（東京都江戸川区船堀 4-1-1）
出席者（敬称略）：後藤 俊男（理化学研究所）、本間 光貴（理化学研究所）、広川 貴次（産業技術総合研究所）、横山 茂之（理、奥野 恭史（京都大学大学院）、
相良 武（大鵬薬品工業）、
田中 成典（神戸大学大学院）、
岡部 隆義（東京大学）、
化学研究所）、
河合 隆利（エーザイ）、
水間 俊（松山大学）、
石川 智久（NPO 地方再興・個別化医療支援）、小長谷 明彦（東京工業大学）、小宮山 直美（事務局）、小澤 陽子（事務局）
片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ）
欠席者（敬称略）：竹中 登一（（独）医薬基盤研究所、（公財）ヒューマンサイエンス振興財団）、田中 博（東北メディカル・、高岡 雄司（ダッソー・システムズ・バイオビア株式会社）、多田 幸雄（東京工メガバンク機構／東京医科歯科大学）、福澤 薫（日本大学）
業大学）
議題：（1）各委員の自己紹介（2）2016 年大会の概要の説明（3）委員の構成（4）大会までのスケジュールについて（5）スポンサー募集とポスター募集について（6）プログラムの枠組みと部屋の使用について

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号（7）講師選定に関して
資料：（1）2016 年大会委員一覧（2）2016 年大会の概要（2015 年大会予稿集より）（3）大会までのスケジュール（4）2016 年大会の仕事とスケジュール（事務局作成）（5）タワーホール船堀 施設利用料金見積書（6）プログラム枠（案）（7）講演者候補【CBI ジャーナル編集委員会】
2015 年第 1 回 CBI ジャーナル編集委員会
日時：2015 年 10 月 27 日（木）18:15-19:45
場所：タワーホール船堀 4 階 403 号室（東京都江戸川区船堀 4-1-1）
出席者（敬称略）：多田 幸雄（東京工業大学）、石川 岳志（長崎大学）、福澤 薫（日本大学）、河合 隆利（エーザイ）、 平山 令、広川 貴次（産業技術総合研究所）、荻島 創一（東北大学 東北メディカル・メガバンク機構）、茂櫛 薫（順明（東海大学）、
森岡 涼子（国立環境研究所）、
水間 俊（松山大学）、
石川智久（NPO 地方再興・個別化医療支援）
、
石田 誠一
（国
天堂大学）
、粕谷 敦（第一三共）、本間 光貴（理化学研究所）、湯田 浩太郎（インシリコデータ）、塚立医薬品食品衛生研究所）
田 優子（事務局）
欠席者（敬称略）：（敬称略、分野順）：宮本 秀一（崇城大学）、森 寛敏（お茶の水女子大学）、大田 雅照（中外製薬）、
片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ）、高岡 雄司（ダッソーシステムズ・バイオビア）、中馬 寛（徳島大学）、Paul Horton（産業技術総合研究所）、
一石 英一郎（国際医療福祉大学病院）、
門田 幸二（東京大学）、
小西 智一（秋田県立大学）、
田中 博（東京医科歯科大学）、福島 敦史（理化学研究所）、美宅 成樹（豊田理化学研究所）、矢野 健太郎（明治大学）、菅野 清彦（東邦大学）、小長谷 明彦（東京工業大学）、岡部 隆義（東京大学）、木賀 大介（東京工業大学）、萩谷 昌己（東京大学）、
福井 一彦（産業技術総合研究所）、山村 雅幸（東京工業大学）
報告事項：（1）2015 年度 論文投稿の状況（2）投稿料変更について（3）学会ホームページの英文ページ開設について（4）資料保存のためのレンタルサーバーについて
討議事項・提案事項：（1）各委員の自己紹介（2）投稿料の変更（3）ホームページ English HOME の改正（4）レンタルサーバーによる Supplementary Materials への対応
（5）論文の種類の変更（6）CBI ジャーナルの概要の改定（7）投稿論文を増やすために（8）その他（9）和文誌について（10）次回の予定
添付資料：（1）2015 年ジャーナル編集委員名簿（2）2015 年度 CBI ジャーナル 論文投稿・刊行状況一覧
（3）CBI ジャーナル編集委員会 報告、提案事項

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CBI 学会誌 2015 年 第 3 巻 第 4 号

CBI 学会誌 第 3 巻 第 4 号
		2015 年 11 月 30 日発刊

		

制作責任：小長谷 明彦

		

制作：小澤 陽子

			

湯川 真澄

塚田 優子

高橋 まき 町田 規子

塩塚 真理

小宮山 直美		

発行：CBI 学会

		

ISSN：2189-7069

		

本著作物の著作権は著者にあり、CBI 学会は、本著作物に関する		

冊子および電子媒体による複製、配布、改変、再出版の権利を持つ。

CBI 学会