カスタム DNA/RNA 合成

カスタム DNA/RNA 合成
DNA 合成 脱塩グレード ( チューブ納品 )合成スケール

合成可能塩基数

お見積もり・ご注文方法 ▶▶▶ p.50

保証収量

価格 (/base)

25 nmole

15 ～ 60

3 ODs

100 nmole

10 ～ 90

6 ODs¥54250 nmole

5 ～ 100

15 ODs¥100

1 µmole5 ～ 100

50 ODs¥180

5 µmole5 ～ 100

250 ODs¥1,46010 µmole

5 ～ 100

500 ODs¥2,760

納品形態

納期

空気乾燥品

2 ～ 4 営業日※

¥27

・保証収量は 20 bases 以上の修飾なしの場合です。ウェブサイトからお見積もり頂ければ、正確な保証収量がご確認頂けます。
・精製オプションの種類、価格、保証収量は p.3 をご参照ください。
・101 bases 以上は Ultramer® DNA 合成で受注可能です。p.5 をご参照ください。
・DNA/RNA キメラオリゴをご依頼の場合は、p.6 の「カスタム RNA 合成」をご参照ください。
・修飾オプションは p.7 〜 11 をご参照ください。
※ウェブオーダーの場合、午前 11 時までにご注文頂ければ、翌々営業日に納品できます。稀に QC にパスしないために遅れる事があります。
※￥3,000 以上のご注文で送料無料となります。詳細は p.83 をご参照ください。

100% QCIDT はすべてのオリゴ合成品に対して、Electrospray ionization (ESI) 質量分析による分子量確認を行なっております。
このデータは IDT ウェブサイトにログインすることでダウンロードできます。 ( データの取得方法は p.48 をご参照ください。）■ 50 bases の脱塩グレードのオリゴ合成品の ESI 質量分析データの例

Intensity

105
1009590858075706560

15,420.35550454035302520151050-511,000

12,00013,00014,00015,00016,00017,00018,00019,00020,000Calculated Molecular Weight:（理論値）15,423.0
Measured Molecular Weight: （実測値）15,420.3
配列：5'- TTT CGA GTG ATG GTT GTG CCT GCA CGA GAT TCA CAT TCA CGT CTC GGG AA -3'

Spec sheet
納品時には下記のような内容の Spec sheet をお送りしています。 （例）50 bases, 脱塩グレード

合成スケール , 合成塩基数
Sequence - Desalting

配列名

25 nmole DNA Oligo, 50 Bases

5- TTT CGA GTG ATG GTT GTG CCT GCA CGA GAT TCA CAT TCA CGT CTC GGG AA -3配列

納品量Properties

Amount of Oligo

Tm (50 nM NaCl): 70.2 °C
GC Content: 50%
Molecular Weight: 15423
nmoles/OD 260: 2.1μg/OD 260: 32.5
Ext. Coefficient: 474400 L/(mole·cm)

13OD260=27.3nMoles=

For 100 μM : add 273 μL

0.42mg100 μMにするための溶媒量 (TE推奨)

2Integrated DNA Technologies MBL 株式会社 (IDT-MBL KK)

E-mail：oligo@mbl.co.jp

カスタム DNA/RNA 合成

保証収量 （チューブ納品、プレート納品共通）
合成スケール

精製

25 nmole

100 nmole

250 nmole

1 µmole5 µmole10 µmole

3 ODs

6 ODs

15 ODs50 ODs250 ODs

500 ODs

PAGE-

1 OD

2 ODs

10 ODs50 ODs100 ODs

HPLC-

1 OD

4 ODs20 ODs

100 ODs

200 ODs

Ion-Exchange-HPLC (IE-HPLC)

-

1 OD

4 ODs

20 ODs100 ODs

200 ODs

RNase-Free HPLC

-

1 OD

4 ODs

20 ODs100 ODs

200 ODs

Dual HPLC

-

1 OD

2 ODs

10 ODs50 ODs100 ODs

Dual PAGE & HPLC(PAGE と HPLC の 2 回精製 )

--

1 OD

5 ODs

25 ODs50 ODs

脱塩グレード・上記の保証収量は 20 〜 50 bases の修飾なしの場合です（脱塩グレードは 20 bases 以上）。ウェブサイトからお見積もり頂ければ、正確な保証収量がご確認頂けます。

精製オプション （チューブ納品、プレート納品共通）
オリゴ DNA ヌクレオチド合成や、PrimeTime® qPCR Probes など、15 〜 60 bases の精製オリゴはすべて Capillary Electrophoresis (CE) による純度確認を行なっています。こちらのデータも ESI 質量分析データ同様、IDT ウェブサイトよりダウンロードできます。( データの取得方法は p.48 をご参照ください。）※配列や混合塩基との兼ね合いで、CE データが取得できないものもございます。

合成スケール

精製

25 nmole

100 nmole

250 nmole

1 µmole5 µmole10 µmole

PAGE-¥6,400¥9,600¥15,200¥94,100¥144,900

HPLC-¥6,400¥9,600¥15,200¥37,000¥56,300

Ion-Exchange-HPLC (IE-HPLC)-¥6,400¥9,600¥15,200¥37,000¥56,300

RNase-Free HPLC-

¥10,400¥15,200¥24,100¥52,300¥90,100

Dual HPLC-¥12,000¥18,500¥28,900¥76,400¥116,700

Dual PAGE & HPLC(PAGE と HPLC の 2 回精製 )--¥20,100¥37,000¥144,000¥221,300

Capillary Electrophoresis Analysis
配列：5'- TTT CGA GTG ATG GTT GTG CCT GCA CGA GAT TCA CAT TCA CGT CTC GGG AA -3'■ HPLC 精製後の CE 分析データの例（純度 97.3%）
Channel A
171266055

0.125

0.125

Migration Time

0.100

0.075

0.075

0.050

0.050

0.025

0.025

45.75847.23347.45447.76748.71249.53850.55450.82951.55852.24252.708

AUAU

0.100

0.000
202530354045500.000
55

Minutes

60657075

上記の配列において、HPLC 精製および PAGE 精製を行いました。左図はそれらの CE 分析のデータです。
HPLC 精製は 85％以上の純度を期待できる精製の第一選択肢で、各種修飾とも相性が良く、HPLC 精製を行うことで付加できる修飾も数多く存在します。ただし、60 bases 以上では精製能が下がってしまいます。
PAGE 精製は、90％以上の純度が期待できます。ただし、収量が小さく、修飾との相性が良くないため、60 bases 以上や、高い純度を必要とする一本鎖 DNA オリゴにおすすめです。
※ HPLC、PAGE 精製ともに純度を保証するサービスではありません。

■ PAGE 精製後の CE 分析データの例（純度 95.7%）
0.06

Channel A
172994987
Migration Time

0.06

0.04

0.02

0.020.00

20304050

Minutes

52.98753.35053.91354.14254.56755.00847.52148.00848.30849.112

AUAU0.04

60700.0080その他オプション
オプション名

合成スケール
25 nmole

100 nmole

250 nmole

1 µmole5 µmoleアニーリング-¥6,000¥8,000¥9,000--NA+ Salt Exchange-¥12,000¥12,000¥12,000¥31,200¥36,200

詳細、ご注文は MBL ライフサイエンスサイト http://ruo.mbl.co.jp/bio/idt/index.html をご利用下さい。

10 µmole3お見積もり・ご注文方法 ▶▶▶ p.58

カスタム DNA/RNA 合成

DNA 合成 脱塩グレード ( プレート納品 )合成スケール

合成可能塩基数

保証収量

500 pmole

15 ～ 60

納品量 500 pmole

価格 (/base)¥1525 nmole

15 ～ 60

3 ODs¥18100 nmole

10 ～ 90

6 ODs¥40250 nmole

5 ～ 100

15 ODs¥80

1 µmole5 ～ 100

50 ODs¥160プレート種類

最小発注本数

384 well プレートのみ

288 well 以上

96 well プレートまたは384 well プレートを選択可能

96 well プレート：
24 well 以上
384 well プレート：
96 well 以上

納品形態

納期

空気乾燥品

3～5営業日・保証収量は 20 bases 以上の修飾なしの場合です。ウェブサイトからお見積もり頂ければ、正確な保証収量がご確認頂けます。
・精製オプションの種類、価格、保証収量は p.3 をご参照ください。
・101 bases 以上は Ultramer® DNA 合成で受注可能です。p.5 をご参照ください。
・最小発注本数について：96 well プレートの場合、1 プレートにつき 24 well 以上のご注文をお願いいたします。
例 /primer Mix オプションで各 well2 本ずつ発注の場合、48 本の注文が必要です。各 well1 本の場合は 24 本で発注可能です。

修飾オプション （プレート納品）
合成スケール

修飾

500 pmole

25 nmole

100 nmole

250 nmole

1 µmole5' Phosphorylation¥1,600¥1,600¥1,600¥2,000¥3,600

5' Amino Modifier C6¥1,900¥1,900¥1,900¥2,800¥4,000

5' Amino Modifier C12¥4,400¥4,400¥4,400¥5,600¥8,400--¥6,400¥8,000¥12,000¥9,200

5' Acrydite™
5' I-Linker 1.2
5' Biotin
5' 6-FAM™

--¥4,400¥6,000¥3,200¥3,200¥3,200¥4,000¥8,000--¥4,800¥6,000¥12,000

3' deoxyUridine--¥1,600¥1,900¥2,800Int deoxyUridine

¥600

¥600

¥600

¥800

¥1,200

5' deoxyInosine

¥600

¥600

¥600

¥800

¥1,200

分注オプション
Primer Mix（各 well に 2 種類のオリゴを等量ずつ Mix）

無償

Normalization（各 well に等量のオリゴを分注）

無償

Normalization and remainder（各 well に等量分注、残りを別プレートで納品）

有償（価格はお問い合わせください）

Normalization 例：25 nmole 合成スケールで、修飾なし、15 〜 60 bases のオリゴ合成品の場合、最大 10 nmole/well で納品可能です。

プレートオプション
2 種のプレートを選択することが出来ます。
形状（例 : 96 穴プレート）

ウェル最大溶液量

96 wellwell position の記載

底の形状

300 µL

V-Bottomプレート
384 well

80 µL

96 well

800 µL

Deep well
プレート
384 well

ウェルの深さ

約 12 mm

有約 40 mm

有180 µL

4
Integrated DNA Technologies MBL 株式会社 (IDT-MBL KK)

E-mail：oligo@mbl.co.jp

カスタム DNA/RNA 合成

Ultramer® DNA 合成
Ultramer® とは、1 本鎖 DNA（ssDNA）を 200 塩基まで合成出来るサービスです。
ゲノム編集や次世代シーケンス用オリゴなど、純度や長さが必要なアプリケーションにお使いください。

チューブ納品
精製

お見積もり・ご注文方法 ▶▶▶ p.54

合成可能塩基数脱塩

45 ～ 200

PAGE

60 ～ 200

納品量

価格（/base）

4 nmole精製（1 本あたり）¥120

20 nmole
お問合せ※

納品形態

納期-

5 ～ 10 営業日

¥240-

¥120

¥15,200

空気乾燥品

5 ～ 10 営業日
約 10 営業日※ウェブサイトからお見積もり頂ければ、正確な保証収量がご確認頂けます。

プレート納品
精製

お見積もり・ご注文方法 ▶▶▶ p.58

合成可能塩基数脱塩

45 ～ 200

納品量価格（/base）

200 pmole¥24

4 nmole¥64

20 nmole¥128

プレート種類最小発注本数

96 well プレートまたは384 well プレートを選択可能

288 well 以上

納品形態

96 well プレート：24 well 以上
384 well プレート：96 well 以上

空気乾燥品

納期
約 10 営業日
5 ～ 10 営業日
5 ～ 10 営業日

・最小発注本数について：96 well プレートの場合、1 プレートにつき 24 well 以上のご注文をお願いいたします。
例 /primer Mix オプションで各 well2 本ずつ発注の場合、48 本の注文が必要です。各 well1 本の場合は 24 本で発注可能です。

修飾オプション
納品形態
精製・納品量

修飾

チューブ

プレート

脱塩・4 nmole

脱塩・20 nmole

PAGE

脱塩・200 pmole

脱塩・4 nmole

脱塩・20 nmole

5' Phosphorylation¥3,200¥4,000¥4,000¥1,600¥1,600¥2,000

3' Phosphorylation¥4,000¥4,800¥4,800-¥4,000¥4,800

5' Biotin¥7,200¥8,800¥8,800¥3,200¥3,200¥4,000

5' Amino Modifier C6¥4,100¥5,100-¥1,900¥1,900¥2,800

5' Amino Modifier C12¥8,800¥11,200-¥4,400¥4,400¥5,600

3' Amino Modifier¥4,500¥5,600--¥4,500¥5,600Int Spacer 18¥8,000¥9,600¥9,600-¥8,000¥9,600

5' deoxyInosine, 5' deoxyUridine¥1,600¥1,900¥1,900

¥600

¥600

¥800

Int deoxyInosine, Int deoxyUridine¥1,600¥1,900¥1,900

¥600

¥600

¥800

2'-O-Methyl RNA bases¥1,300¥2,100¥2,100¥1,300¥1,300¥2,100

3' Ribo A, C, G, U

¥4,800¥6,400¥6,400-¥4,800¥6,400

5' 5-Methyl dC, Int 5-Methyl dC¥8,000¥9,600¥9,600-¥8,000¥9,600

¥500

¥500

¥500-

¥500

¥500

¥7,200¥8,800¥8,800---

Phosphorothioate Bond
3' C3 Spacer

カップリング効率と Ultramer® DNA 合成
カップリング効率とは、オリゴ 1 塩基を伸長させる効率です。業界水準でも約 98.5% ですが、Ultramer ® DNA 合成のカップリング効率は99.5% です。一見小さな差ですが、長いオリゴ合成の場合、下図のような差になって表れます。
（IDT 調べ）

カップリング効率と正確に合成されるオリゴとの関係

正確に合成されるオリゴの割合

100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%

99.5%（IDT Ultramer®オリゴ）

30%99.2%（IDT オリゴ）

20%
10%0%98.5%（業界標準）
020406080

100120140160180

200

合成オリゴの長さ（bases）
200 bases のオリゴ合成の場合、正確に合成されるオリゴの割合はカップリング効率 98.5% の場合は約 5% であるのに対し、99.5% の場合は、約 40% になります。このカップリング効率の高さは、原料コストを抑え、お客様への提供価格を下げることにもつながっています。
製造に投入する原料に対して、得られるオリゴ合成品の収量を多くすることができるからです。

5
詳細、ご注文は MBL ライフサイエンスサイト http://ruo.mbl.co.jp/bio/idt/index.html をご利用下さい。

カスタム DNA/RNA 合成

カスタム RNA 合成
合成スケール

お見積もり・ご注文方法 ▶▶▶ p.56

合成可能塩基数価格 (/base)■ RNA 等の指定方法

納期100 nmole

10 〜 90¥880

250 nmole

5 〜 90¥1,1201 µmole

5 〜 90¥2,5705 µmole5 〜 50¥8,85010 µmole

5 〜 50¥16,900

IDT の修飾塩基の表記方法 :RNA ⇒ "r"、2'-O methyl ⇒ "m"、Phosphorothioate Bond ⇒ "*"例えば RNA はこのように記載して下さい。
[rArCrCrGrArUrUrArCrCrGrArUrArU]

5 ～ 10 営業日■ 注意
修飾を指定する "r" 等が稀に半角ではなく、全角になっている場合があります。その場合、IDT order ページでは " ｒ " 等が判断できず、
例えば [rArCCrGrA] のようにウェブサイトに登録され、結果、RNAと DNA のキメラオリゴが合成されてしまいます。弊社でも確認は行いますが、修飾等の入力の際はご注意ください。ウェブサイトに
DNA 形式で入力後、[Convert to RNA] をクリックし、一括で変換する方法がお勧めです。

・70 bases 以上や、ヘアピン構造を取る配列には、別途加算料金がかかります。まずはお問い合わせください。
・修飾オプションは p.7 〜 11 をご参照ください。[R] マークのある修飾が RNA に付加できる修飾です。
・CRISPR/Cas9 用 RNA をお探しの場合は p.34 Alt-R ™ CRISPR-Cas9 System をご参照ください。

キメラ DNA
合成スケール修飾

100 nmole

250 nmole

¥54

¥100

100 nmole

250 nmole

1 µmoleRNase Free HPLC 精製¥10,400¥15,200¥24,100¥52,300¥90,100

Annealing Service¥6,000¥8,000¥9,000¥45,000¥45,000

キメラ DNA bases (1 塩基あたり )1 µmole5 µmole¥180

10 µmole¥1,460¥2,760オプション
精製・その他

合成スケール
5 µmole10 µmole

・RNA 合成では、PAGE 精製には対応しておりません。

価格例／記載例■ RNA

配列：rGrGrUrUrCrUrArGrGrCrArUrCrGrCrUrGrCrGrGrG
価格 ￥28,880 ＝ RNA 21 bases × ￥880 ＋ RNase Free HPLC ￥10,400
条件：100 nmole 合成スケール、RNase Free HPLC 精製 ⇒ 保証収量 0.8 ODs = 4 nmoles = 27.1 µg、納期 5 〜 10 営業日■ RNA/DNA キメラ

配列：CCAATACACGACTAGTCGrGrGrGrG
価格 ¥14,892 = DNA 18 bases × ￥54 ＋ RNA 4 bases × ￥880 ＋ RNase Free HPLC ￥10,400
条件：100 nmole 合成スケール、RNase Free HPLC 精製 ⇒ 保証収量 0.8 ODs ＝ 3.7 nmoles ＝ 25.2 µg、納期 5 〜 10 営業日アンチセンスオリゴ合成
特定の mRNA を特異的に分解し発現を阻害する方法として、アンチセンスオリゴ技術があります。2-O-Methyl RNA や Phosphorothioate Bond などを用いる事によって、ヌクレアーゼ耐性や、ターゲット mRNA への強い結合力を持つアンチセンスオリゴになります。修飾の詳細は、各修飾の説明 (p.11) をご覧ください。
合成スケール修飾

100 nmole

250 nmole

5 µmole10 µmole¥1,200¥1,900¥2,800¥12,800¥24,100

¥500

¥500

¥800

¥3,200¥4,800100 nmole

250 nmole

1 µmole5 µmole10 µmole

HPLC 精製¥6,400¥9,600¥15,200¥37,000¥56,300

Na+ Salt Exchange¥12,000¥12,000¥12,000¥36,200¥36,200

2'-O-Methyl RNA (1 塩基あたり )Phosphorothioate Bond (1 箇所あたり )1 µmoleオプション精製合成スケール

価格例／記載例■ Phosphorothioate Bond (PS oligo)

配列：G ＊ A ＊ G ＊ A ＊ A ＊ A ＊ T ＊ C ＊ A ＊ C ＊ G ＊ C ＊ A ＊ C ＊ A ＊ A ＊ T ＊ G
価格 ￥15,872 ＝ DNA 18 bases × ￥54 ＋ PS 17 bonds × ￥500 ＋ HPLC ￥6,400
条件：100 nmole 合成スケール、HPLC 精製 ⇒ 保証収量 1 ODs = 5.4 nmoles = 31 µg、納期 5 〜 10 営業日■ 2'-O-Methyl / DNA キメラ PS oligo

配列：mU ＊ mC ＊ mC ＊ mU ＊ mG ＊ C ＊ G ＊ A ＊ A ＊ A ＊ T ＊ G ＊ T ＊ C ＊ C ＊ mA ＊ mU ＊ mC ＊ mG ＊ mU6

価格 ￥28,440 ＝ DNA 10 bases × ￥54 ＋ 2OMet 10 bases × ￥1,200 ＋ PS 19 bonds × ￥500 ＋ HPLC ￥6,400
条件：100 nmole 合成スケール、HPLC 精製 ⇒ 保証収量 1 ODs = 5.3 nmoles = 35.1 µg、納期 5 〜 10 営業日

Integrated DNA Technologies MBL 株式会社 (IDT-MBL KK)

E-mail：oligo@mbl.co.jp