PubMed 利用マニュアル
PubMed の特徴とそれを生かした使い方

2012
産業医科大学図書館

はじめに
PubMed には便利な機能が用意されており、それらを十分理解すると効率的な検索を行うことができます。このマニュアルをご活用頂き的確かつ迅速な文献検索作業にお役立て頂ければ幸いです。

目次

１ ＰｕｂＭｅｄとは･････････････････････････････････････････････････････････････････････4
1-1

PubMed とは ／ 1-2 アントレの PubMed 以外のﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽ ／ 1-3

1-4

PubMed のデータ構成 ／ 1-5 リンク機能 ／ 1-6 アクセス方法

PubMed のデータ

２ ＰｕｂＭｅｄの画面の名称･････････････････････････････････････････････････････････････7
３ 入力のルールについて･････････････････････････････････････････････････････････････････8
3-1 論理演算子機能 ／ 3-2 フレーズ(複合語検索) ／3-3

Automatic

Term Mapping

機能（自動マッピング） ／ 3-4 トランケーション機能（前方一致検索）
3-5

Limits 機能

４ キーワードについて･･･････････････････････････････････････････････････････････････････13
4-1

MeSH（メッシュ）とは ／ 4-2

MeSH Major Topic(メジャートピック) ／4-3

MeSH の階層構造 ／ 4-4 Mesh のサブヘディング ／ 4-5 ストップワード（Stopwords）
５ Advanced
おすすめ

Search（より高度な検索） ･･････････････････････････････････････････････････15

5-1 検索フィールド指定検索 ／ 5-2

Index 機能 ／5-3

Search Histor 機能(検索の履歴）

６ 検索の実際･･･････････････････････････････････････････････････････････････････････････17
6-1 テーマからの検索 ／ 6-2 検索ﾌｨﾙｰﾄﾞを限定しての検索 ／ 6-3 著者名からの検索
6-4 雑誌名からの検索 ／
6-6-2

おすすめ

6-5 MeSH からの検索 ／ 6-6-1 サブヘディング

MeSH Browser(MeSH の詳細情報)

７ 検索結果について･････････････････････････････････････････････････････････････････････23
7-1 表示 ／ 7-2

Details(検索式の表示) ／ 7-2-1 検索式の確認

7-2-2 検索式の登録と再検索
7-3

Display Settings（表示の変更）／ 7-4

Send to（出力形式の選択）

7-4-1

Clipboard（検索結果の一時保存）／ 7-4-2 File(ダウンロード) ／7-4-3

E-Mail（電子メール送信）／ 7-4-4

7-4-4-1

Collections の表示・編集・削除

Collections（検索結果を長期保存・公開する）／／ 7-5

Related Citation（関連文献の表示）

7-6 検索結果の印刷 ／ 7-6-1 選んで印刷する場合 ／ 7-6-2

いくつかの検索結果をまとめて印刷する場合（クリックボードを使う）

８ Journals

Database 機能（収載誌名リスト）････････････････････････････････････････････35

９ Single Citation Matcher 機能（特定の文献を簡単検索）･･･････････････････････････････35

2

10 Clinical
10-1

Queries 機能（治療、診断、病因、予後に限定）････････････････････････････････36

Clinical Queries 感度・特異度

11 My NCBI 機能 （アラート機能・検索の保存）･･･････････････････････････････････････････38
おすすめ

11-1 My NCBI の主な機能 ／ 11-2

User Name と Password の登録 ／11-3 アラート登録11-4 アラート設定の削除 ／ 11-5 電子メールアドレスおよびパスワードの変更
12 Filters（検索結果のフィルター表示）･･･････････････････････････････････････････････････41
13 Preferences（キーワードのハイライト表示）･････････････････････････････････････････････42
14 PubMed 活用テクニック Q&A ･･･････････････････････････････････････････････････････････43
Ｑ１ 年齢・性別・言語で限定をしたい
Ｑ２ 論文や雑誌の種類で限定をしたい
Ｑ３ フィールドを選択しながら検索をしたい
Ｑ４ 語尾のあいまいなキーワードで検索をしたい
Ｑ５ Journal のタイトルや発行年等が分かっている大量の論文の PubMed ID を取得したい。
Ｑ６ MeSH の階層構造を見ながら検索をしたい
Ｑ７ MeSH の各件数を見ながら検索をしたい
Ｑ８ 前の検索結果を利用して検索をしたい
Ｑ９ 文献の著者名・タイトル・雑誌名・巻号年・ページ数の確認をしたい
Ｑ１０ 正式な雑誌名を確かめたい／略誌名を知りたい
Ｑ１１ 検索結果を定期的に電子メールで受け取りたい
Ｑ１２ ダウンロードしたデータを利用してオリジナルデータベースを作りたい
Ｑ１３ 検索結果をＲＳＳフィードで受け取りたい
Ｑ１４ EBM に使える文献を短時間で検索をしたい
Ｑ１５ 診療ガイドライン作成のために網羅的検索をしたい

15 全文（フルテキスト）を入手･････････････････････････････････････････････････････････47
15-１ リンクリゾルバ（360LINK）
16

例題

１：胃癌の再発について⇒「ヘリコバクター・ピロリ菌除菌によって早期胃がん

患者における再発がどの程度予防できるか」
例題（履歴検索）･････････････････48

２：アトピー性皮膚炎（atopic dermatitis）の食事療法（diet therapy）に関する文献を調べたい。内容が中心となっている論文だけに絞って検索したい。（MeSH 検索）

例題

３：HER2 陽性乳がん（her2 positive breast cancer）に効果ある、ラパチニブ（lapatinib）
に関して、根拠の確かな文献に絞って検索したい （Limit 検索）

17 おもなフィールドのタグと検索方法の解説 ････････････････････････････････････････････51
18 Publication Types(資料種類)････････････････････････････････････････････････････････52
19 Ages･･･････････････････････････････････････････････････････････････････････････････53
20 サブセット：Subsets････････････････････････････････････････････････････････････････54
21 サブヘディング･････････････････････････････････････････････････････････････････････54
22

ストップワード（Stopwords）････････････････････････････････････････････････････････56

3

１

ＰｕｂＭｅｄ（パブメド）とは

1-1

PubMed とは

PubMed は、インターネットで提供される MEDLINE データベースのことです。1997 年 6 月にNLM（National Library of Medicine；米国国立医学図書館）は、インターネット上で 24 時間
無料で利用できる FreeMEDLINE サービスを開始しました。

MEDLINE とは、世界約７０カ国、４，８００誌以上の文献を検索できる医学文献データベースです。医学用語や著者、雑誌名などのキーワードから文献情報（タイトル、著者名、雑誌名、抄録など）を調べることができます。最近はリンク機能が強化され、文献の全文も参照できるものがあります。MEDLINE は、さまざまなデータベース会社（EBSCO 社、
Ovids 社、Silverplatter 社など）から提供されています。

PubMed は、NLM 内の NCBI（National Center for Biotechnology Information、国立バイオテク
ノロジーインフォメーションセンター）が作成している、Entrz（アントレ）という統合型分子生物学データベースの一部として一般公開している MEDLINE です。
Entrez（アントレ）とは、NLM 内の National Center for Biotechnology Information（NCBI:
国立バイオテクノロジーインフォメーションセンター）が提供している統合型分子生物学
データベースです。PubMed のほか、DNA やタンパク質の配列情報、ゲノム・マップ、タン
パク質構造などのデータベースがあります。これらの情報は互いにリンクしており、参照できる構造になっています。

1-2

アントレの PubMed 以外のデータベース

アントレには PubMed のような文献情報や電子ジャーナルのほかに DNA やタンパク質構造などの非文献情報の様々なデータベースが含まれています。

① Nucleotide Database
Nucleotide Database は、遺伝子の核酸塩基配列のデータベースです。
NIH（National Instituties of Health)の GenBank のほか、日本の DNA DataBank of Japan（DDBJ）とヨーロッパの European Molecular Biology Laboratory（EMBL)から塩基配列データを検索できます。

4

② Protein Database
Protein Database は、GenBank や DNA DataBank of Japan（DDBJ)、European Molecular
Biology Laboratory（EMBL)などの DNA 配列から翻訳されたタンパク質配列データを検索できます。
遺伝子から翻訳されてできたタンパク質のアミノ酸配列のデータベースです。
③ Genome Database
Genome Database は、1,600 種類以上のウィルスと 180 種類以上の細菌のゲノム情報を検索できます。
④ Structure Database
Structure Database は、生体高分子の三次元構造をキーワードで検索・表示できるデータ
ベース、Molecular Modeling Database（MMDB)を提供しています。
⑤ OMIM

Database

OMIN Database の OMIN は Online Mendelian Inheritance in Man の略で、ヒトの遺伝子や遺伝子疾患に関する情報の統合データベース（Knowledge Base）です。各遺伝子に関する膨大な文献情報とテキストなどが参照できます。この基になったデータは Mendelian
Inheritance in Man（Johns Hopkins Univ

刊）という教科書で、そのオンライン版である

OMIN は毎日更新されています。
ヒトの遺伝子や遺伝性の疾患に関する情報の統合データベースです。
⑥ Taxonomy Database
Taxonomy Database は、系統分類データベースで、NCBI 内の各データベースに登録された遺伝子情報を持つ生物が検索できます。
国によってバラバラだった遺伝子データベースの分類を統一するために作られ、今では EMBL
や DDBJ、SWISS-PROT などにも採用されています。
⑦ PubMed Central（PMC)
PubMed Central（PMC)は、論文の全文を無料で閲覧できるデジタル・アーカイブで、NCBI
が PubMed や GenBank での経験を踏まえ、世界的規模の科学コミュニティの一つとして開発したものです。当初は研究者に直接投稿させて公開する構想もありましたが、出版界等からの強い反対があり、現在は雑誌論文を投稿する形で 216 タイトルの雑誌から 30 万件以上の文献が収録されています。
⑧ NLM Catalog
NLM

Catalog では、NLM での所蔵資料に限らず図書や雑誌、視聴覚資料、コンピュータソフ

ト、電子的情報源などの書誌情報を検索できます。
⑨ Clinical Trials.gov（p.7）

ClinicalTrials.gov は、NLM が 2001 年 2 月から無料で公開している臨床試験データベースです。臨床試験の協力者を募集したい公共や民間の研究者と臨床試験が進行中の新しい治療法を受けたい患者のための情報を提供しています。現在、米国の National Institutes of
Health をはじめ、各政府機関、製薬企業などが行っているかすでに終了した臨床試験の情報が登録されています。PubMed のトップページの「More Resources」に表示されている「Clinical Trials」をクリックします。
5

1-3

PubMed のデータ

(1)収録範囲：1946 年以降の医学論文＋電子ブック(2)収録件数：約 2,100 万件（毎日 2,000－4,000 件追加）
(3)収載雑誌：現行約 5,600 誌（61 言語－英語 91％） 日本発行 168 誌
1-4

PubMed のデータ構成【画面表示】
PubMed－as suppliedby Publisher
PubMed－in process
PubMed－indexed for MEDLINE
PubMed1-5

日本語 73 誌

データの状態出版社から最近送られてきたﾃﾞｰﾀ
MEDLINE に収録されないﾃﾞｰﾀ
出版日以降に MEDLINE への収録が決まった雑誌のﾃﾞｰﾀ索引作業中（書誌ﾃﾞｰﾀのﾁｪｯｸや MeSH 付与）
MEDLINE の収録範囲のもので、MeSH や Publication
Type、Registry Number と共にすでに索引され、書誌ﾃﾞｰﾀもすでにﾁｪｯｸされているﾃﾞｰﾀ
MEDLINE の収録対象外、または、雑誌が MEDLINE に収録が決まる前に出版された号に掲載された記事

リンク機能

検索結果（詳細画面）には、電子ジャーナルへのリンクアイコンが表示され、ワンクリックで全文を読むことができます。
また、電子ジャーナルや雑誌への案内、相互貸借への申込がスムーズに行うためのツールとして
リンクリゾルバ（p.47）を利用できます。

なお、このツールは図書館ホームページからアクセスしないと利用できません。
PubMed の検索は、必ず図書館ホームページからご利用ください。
1-6

アクセス方法

図書館ホームページの「医学情報（DB）検索」からアクセスしてください。

6

２

ＰｕｂＭｅｄの画面の名称思いついたｷｰﾜｰﾄﾞをｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに入力し[Search] をｸﾘｯｸすると検索結果一覧が表示されます。

My NCBI：ﾒｰﾙでのｱﾗｰﾄの登録、検索式の保存と再検索 （p.38）

詳細な項目で検索が可能＜PubMed Tools：便利な検索機能＞
条件を絞って検索が可能
PubMed Mobile：モバイル版
Single Citation Matcher:特定の論文を簡単検索（p.35）
Batch Citation Matcher：PubMed の ID の取得（p.43）
Clinical Queries:比較的根拠の確かな文献を検索（p.36）
Topic-Specific Queries：特定トピックに絞った検索＜More Resources：検索に役に立つその他の情報資源とその紹介＞＜Using PubMed：PubMed の使い方＞
MeSH Database ： よ り 適 切 な ｷ ｰ ﾜ ｰ ﾄ ﾞ を 探 す
PubMed Quick Start Guide：クイックガイド（p.19）

Full Text Article：全文入手方法

Journals Database:雑誌名から収載された文PubMed FAQｓ：FAQ

献を検索

PubMed Tutorials：チュートリアル（自己学習）（p.35）

Clinical Trials：臨床試験のﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽ

New and Noteworthy：最新情報

7

３．入力のルールについて①論理演算子（AND、OR、NOT）は、原則として大文字です。
②AND、OR、NOT 以外は、大文字、小文字の区別はありません。
③ギリシャ文字は英語に変えて入力します。
（α⇒alpha④記号は省略します。
（‘

！

？

％

＄

（AIDS

＝

β⇒betaaids）

γ⇒gamma）⇒省略）但し、－（ﾊｲﾌﾝ）は、ｽﾍﾟｰｽにします。

⑤ウムラウト(~)、アクサンテギュ（‘）などのアクセント記号は省略します。
3-1

論理演算子機能

データベース検索でキーワードを組み合わせるには、論理演算子を使います。
、NOT（論理差）の３種類があります。
論理演算子には、AND（論理積）、OR（論理和）※AND、OR、NOT は大文字で入力してください。
論理演算子

意

味

入 力 例
lung neoplasms AND smoking

ＡＮＤ両方の検索条件をみたす

ＯＲ
ＮＯＴ

少なくともどちらか一方の検索条件をみたす前の条件をみたすが後ろの条件をみたさない[AND 検索]jpn[la]allergy[OR 検索]AA

OR eng[la]NOT egg[NOT 検索]
B

A

B

B

異なった論理演算子を使う場合は、最初に行う検索式を（ ）で囲んでください。
(jpn[la]3-2

OR eng[la]) AND lung neoplasms AND smoking

フレーズ（複合語検索）

PubMed は、フレーズリスト（Phrase

List）から検索します。多くのフレーズは、Automatic

Term Mapping 機能によってフレーズとみなされます。
「poisonivy」と入力すると、PubMed はこれをフレーズとみなし、１つのキーワードとして文献を探します。しかし、適当なキーワードが見つからない時はうまくいきません。例えば、「Single cell」と入力して検索すると、single

cell は Phrase

List にないため、PubMed は「Single」と「cell」を別々に検索して掛け合わせます。
これを回避するために検索したいフレーズを”例〉”singlecell””（ダブルクｵーテーション）で囲みます。
”infection

8

control”

3-3

Automatic

Term

Mapping 機能（自動マッピング）

Automatic Term Mapping は、サーチボックスにキーワードを入力し、［Search］をクリックす
ると、システムが持っている変換テーブル（同義語辞書）を参照し、自動的に適切な検索を行います。
ユーザーが、キーワードや検索フィールドを気にすることなく入力し検索できるシステムとなっています。なお、システムの判断が不適切な場合は、検索結果画面の[Details]（参照：p.26）
で確認が可能で不適切な用語については、削除することができます。
たとえば、gallstones（胆石）で検索すると、
gallstones に対応する MeSH 用語である cholelithiasis（胆石症）＋
フリーターム（自由語）の gallstones の両方の語で検索します。
（フリータームとは、MeSH 用語に対して、入力したままの形で検索する語のことをいいます。）

3-4

トランケーション機能（前方一致検索）
単数形と複数形を一緒に検索するなど、語尾変化のある単語をまとめて検索したいときは、語尾の最後にアスタリスク（＊）を入れます。
なお、PubMed では、前方一致検索はできますが、後方一致検索や中間一致検索はできません。
「occup＊」と入力し、［Search］をクリックすると、occupation、occupations、occupationalなどが一度に検索できます。

注意①自動マッピングや MeSH の下位語を含んだ検索はできません。
②MeSH 階層構造の下位語の含めた検索、いわゆる explosion もされませんので、注意が必要です。
例えば、「heart

attack＊」と検索したとき、MeSH 用語である myocardial infaraction にマッピングされませんし、myocardial stunning や shock，cardiogenic などの下位語の MeSH も検索されません。
③具体的にどのように検索されたかを確かめるには、［Details］（p.26）をクリックします。
④短い語でトランケ―ションを使うと、非常に多くの用語を検索することになります。
検索されるのは、最大 600 語です。
⑤フレーズを検索したい場合、キーワードを””（ダブルクｵーテーション）で囲みます。

フレーズ検索は、スペースが途中に入ると検索されません。「infection＊」と検索したとき、
infections は検索されますが、infection control は、検索されません。

9

3-5

Limits 機能

Limits 画面は、検索後、検索結果一覧画面の左側に表示されますので、検索条件を指定し検索結果を絞り込みます。
Limits は一度設定すると、解除するまですべての検索に適用されます。
解除したいときは、チェックを外すか、[Clear

All]をクリックします。

表示されていない項
目を表示「Apply」をクリックす

続きを表示

るとチェックを入れた
項目で絞り込まれます。

解徐[Tex availability（抄録の有無、テキスト）]「Text availability」では、抄録の有無、フルテキストの閲
覧の文献に限定することができます・Abstractavailable･･･抄録データあり

・Free full text available･･･無料電子ｼﾞｬｰﾅﾙのみ
・Full text available･･･電子ｼﾞｬｰﾅﾙのみ[Publication dates（出版時期）]「Publication dated」では、出版された日付で限定して検索できます。
・5years･･･最新 5 年
・10 年 years･･･最新 10 年
・Custom range･･･日付の範囲を指定できます。月と日の入力は任意です。
日付の範囲を現在までとしたい時は、

10

To の後を空白にします。

[Species（種）]「Species」では、対象を人間か動物に制限して、検索できます。この場合、検索は「MEDLINE」からの引用だけに制限されます。

[Article types(論文の種類)]「Article types」では、論文の種類で制限して検索できます。
・Clinical Trial（臨床試験）・Meta-Analysis（メタアナリシス）
・Practice Guideline（臨床ガイドライン）
・Randomized Controlled
Trial（ﾗﾝﾀﾞﾑ化比較試験）
・Review（総説）・Systematic Reviews（システマティク・レビュー）※その他は、「Publication Type」（p.52）を参考にしてください。

[Languages（言語）][Sex（性別）]「more」をくりすると、英語以外の言語
リストが表示されます。

「Choose additional filters」をクリックすると表示されていない項目が表示されます。
「Subjects」、「Journal categories」、「Ages」、「Search fields」
その項目にチェックを付けると、左画面に該当の絞込み項
目が表示されます。

[Subjects（収載された雑誌のグループ）
・AIDS・・・ｴｲｽﾞ
・Bioethics・・・生命倫理学
・Cancer・・・癌・Complementary

Medicine・・・補完医療

・Dietary Supplements・・・食事療法
・History of Medicine・・・医学史
・Toxicology・・・毒物学
・Veterinary Science・・・獣医学

11

[Journal categories（雑誌分類）]

・Core clinical journals・・・臨床のｺｱｼﾞｬｰﾅﾙ
・Dental journals・・・歯科ｼﾞｬｰﾅﾙ
・MEDLINE・・・MEDLINE に収録されているｼﾞｬｰﾅﾙ
・Nursing journals・・・看護ｼﾞｬｰﾅﾙ

「Core clinical journal」で限定すると、PubMed が選んだ「主要な臨床雑誌約 120 誌」に限定することができます。
タイトルリストはこちら＜http://www.nlm.nih.gov/bsd/aim.html＞※ヒットした結果に、この 120 誌が含まれない場合は、 Core
clinical journals の限定項目も表示されません。

[Ages（年齢）]Infant: birth-23 months
Child: 0-18 years
Adult:19+ years
Adult: 19-44 years
Aged: 65+ years
Newborn: birth-1 month
Infant: 1-23 months
Preschool Child: 2-5 years
Child: 6-12 years
Adolescent: 13-18 years
Yong Adult：19-24 years
Middle Aged: 45-64 years
Middle Aged + Aged: 45+ years
80 and over: 80+ years

幼児全部（２３ヶ月）
小児全部（０～１８歳）
成人全部（１９歳以上）
成人（１９～４４歳）
老人（６５歳）
新生児（1 ヶ月以下）
幼児（１～２３ヶ月）
未就学児（２～５歳）
小児（６～１２歳）
青年（１３～１８歳）
青年（１９～２４歳）
中年（４５～６４歳）
中年以上
８０歳以上

[Search fields（検索フィールド）]「Search fields」では、検索フィールド（検索項目）を限定して検索できます。参照（p.51）

12

４

キーワードについて

いかに検索主題に合致したキーワードを選択するか、これが検索精度を高める重要なポイントといえます。特に、MeSH 用語を利用することが有効な検索方法です。
4-1

MeSH（メッシュ）とは

MeSH は、Medical

Subject

Headings の略で、アメリカの国立医学図書館（National

Library

Of Medicine，NLM）が索引誌 Index Medicus の見出し語として約 40 年前に作成し、その後 MEDLINE
データベースのシソーラスとして利用されるようになったものです。毎年改訂されています。
★ シソーラスとは、さまざまな医学用語をできるだけ統一して使えるようにまとめられた用語集のことです。
「癌」という言葉が研究者によって cancer carcinoma neoplasms など、いろいろな用語で表現されています。
これらのどの単語を用いればよいのか？
こういった問題を解決するのが MeSH です。

考えられる全ての単語で検索すべきなのか？
《文献での表現》《MEDLINE のキーワード》

cancercarcinoma

ＭｅＳＨ

neoplasms

neoplasms「癌」についての文献を調べるには”neoplasms”という MeSH を用いて検索すればよいのです。
タイトルや抄録に”neoplasms”という単語が含まれていなくても、”neoplamsms”に関する文
献ならばヒットします。
各文献を MEDLINE（PubMed）に登録する際に、単に文献のタイトルや著者名を入力するだけでなく、インデクサーがこの文献はどういうテーマについて扱っているかまで調べて、適当な MeSH を入力していますので、適合率は高くなります。
MeSH には、２つの大きな特徴があります。
１つは用語間の階層構造がしっかりしていること、もう１つは各用語に共通性の高い約 80 語をサブヘディングとして分けていることです。

4-2

MeSH Major

Topic（メジャートピック）

選んだ MeSH 用語をさらに論文の中心テーマにしている文献に絞って検索できます。

13

4-3

MeSH の階層構造（Tree

Structures）

MeSH 用語は、すべて一般的な広い意味の用語から特定の狭い意味の用語まで、いわゆる階層構
造になっています。PubMed では、文献の主題を表すためにできるだけ下位の MeSH 用語を付与しています。適当な MeSH 用語がない場合は、そのすぐ上位の MeSH を付与しています。
検索する場合は、できるだけテーマにぴったりの MeSH を探し、適当なものがなければ、その上位語としてできるだけ適切な MeSH を使います。
上位語
階層構造

下位語

4-4

MeSH のサブヘディング（Subheadings）（サブヘディングリスト

p.54）

MeSH に加えて Subheadings（副標目）も知っておく必要があります。
サブヘディングとは、各用語に共通する大きな概念について別にまとめたものです。
「癌の治療」について探す場合、「癌」は、”neoplasms”という MeSH を選び、「治療法」については、サブヘディングの”drugtherapy”、”radiology”、”surgery”などを必要に応じて選ぶ、というような使い方をします。
複数のサブヘディングを含めて検索するときにはいくつでも加えていくことができます。
サブヘディングは、８０個以上あり、各 MeSH と組み合わせ可能なサブヘディングは決まっています。当然、組み合わされないものもあります。
たとえば、「看護教育」の「治療法」という組み合わせはできません。
PubMed では入力された用語を自動的に MeSH に変換するようになっていますので、
MeSH を意識しなくてもそれなりに検索はできます。しかし、MeSH の仕組みや個々の意味を理解していると、さらに効果的な検索ができ、検索結果を評価できます。
＜MeSH

Database 機能（p.19）参照＞★ インデクサーが論文を読み内容に相応しいサブヘディングを付与していますので効果的に絞り込むことができます。

4-5

ストップワード（Stopwords）
PubMed には、検索効率を高めるために、ストップワードと呼ばれる検索の対象とならない
用語群があります。 例】a、and、do、etc、me、much、of、she、to、up、what、yet など
但し、掛け合わせのための大文字ＡＮＤは使用できます。
Quality of life はフレーズとして認識されます。（ｽﾄｯﾌﾟﾜｰﾄﾞﾘｽﾄ p.56）
14５

Advanced Search（より高度な検索）

Advanced Search では、検索フィールドの指定検索や履歴検索を行うなどきめ細かな検索ができます。
ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞのｻｰﾁﾎﾞｯｸｽの下にある[Advanced]をｸﾘｯｸします。

5-1

検索フィールド指定検索①ﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから検索するﾌｨｰﾙﾄﾞを選びます。
②検索ﾌｨｰﾙﾄﾞを選択し、ﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力するとｸｴﾘｰﾎﾞｯｸｽに検索式が自動的に入力されます。
③「AND、OR、NOT」を選び、[Search]をｸﾘｯｸすると検索結果画面に展開します。

検索式が表示され[Edit] をｸﾘｯｸして編集ができます。

ます。

5-2

Index 機能入力されたｷｰﾜｰﾄﾞについて、語尾の変化ごとの文献の件数を見ることができます。
語尾のあいまいな検索をしたい場合に便利です。
①ｷｰﾜｰﾄﾞを入力後、「Show index list」をｸﾘｯｸすると、その言葉を含む候補語のﾘｽﾄが表示されます。
※複数のｷｰﾜｰﾄﾞを選択するときは、［Ctrl］ｷｰを押しながらｸﾘｯｸします。

15

5-3

Search History 機能（検索の履歴）
Search History は、検索したｷｰﾜｰﾄﾞと文献数が、集合番号（＃○）を付けられた形で表示れます。その検索結果を利用して論理演算子（AND、OR、NOT）を使った検索ができます。

《集合番号同士の組み合わせの場合》（＃１ AND ＃２ AND #５）①検索結果画面のｻｰﾁﾎﾞｯｸｽの下の[Advanced]をｸﾘｯｸします。
②検索の履歴が表示されますので、再検索したい集合番号（#○）か「Add」をｸﾘｯｸして検索式を作成し、[Search]をｸﾘｯｸします。

全て削除します。
「Delete from

history」：集合番号の検索結果を削除します。

検索の履歴が表示されます。

「Show Search results」：検索結果に展開します。
「Show search details」：「Search Details」
画面に展開します。（ｷｰﾜｰﾄﾞを確認可）

件数をｸﾘｯｸすると「Save in NCBI」：MY NCBI に保存します。

検索結果に展開します。

《集合番号とで組み合わせ》（＃１ AND neuron）①集合番号の[AND in builder]か[Add]をｸﾘｯｸすると、ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに表示されます。
②追加したいｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、[Search]をｸﾘｯｸします。

※検索番号には必ず「＃」を付けてください。
「＃」を付けないとその数字で別の検索を実行します。
※History 機能が記憶している検索履歴は 100 番までです。検索番号がこれを超えると古いものから順番に消去され、各番号が付け替わります。
※初期値設定では、最新 5 件が表示されますので、すべての履歴を表示させるには、下部にある[MoreHistory]をｸﾘｯｸします。そうすると、全ての履歴が表示されﾎﾞﾀﾝ名が[Less History] に変わります。
※[Less History]をｸﾘｯｸすると、履歴表示が最新 5 件に戻ります。
※検索も何もしないで８時間経つと、検索履歴は自動的に削除されます。
16

６

検索の実際

6-1

テーマからの検索

大文字･小文字どちらでも構いません。入力されたｷｰﾜｰﾄﾞをﾀｲﾄﾙや抄録から探したり、
MeSH というｿｰﾗｽの統制語で探します。
①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽにｷｰﾜｰﾄﾞを入力していくと、ｵｰﾄｺﾝﾌﾟﾘｰﾄ機能によりｷｰﾜｰﾄﾞの候補語が表示されます。

ｵｰﾄｺﾝﾌﾟﾘｰﾄ機能②該当する用語（「asbestos lung cancer」）を選択すると、検索結果画面に展開します。

PubMed 個別の番号

6-2

検索フィルードを限定しての検索
ﾌｨｰﾙﾄﾞを限定すると、そのﾌｨｰﾙﾄﾞにｷｰﾜｰﾄﾞが含まれるものだけを検索してきます。
検索ﾌｨｰﾙﾄﾞ（ﾀｲﾄﾙなど）を限定する方法には２通りあります。

(1)ｷｰﾜｰﾄﾞの後ろに検索したいﾌｨｰﾙﾄﾞ名をつける方法
・tonegawa ｓ[au]AND heart［ti］-------------ﾀｲﾄﾙに限定

・tonegawa ｓ[au]AND 1992:2002[dp] ----------出版年（1992-2002）で限定

・tonegawa ｓ[au]AND english[la] ------------言語（英語）で限定

・tonegawa ｓ[au]AND review[pt] -------------出版ﾀｲﾌﾟ（ﾚﾋﾞｭｰ）に限定(2)「Advanced Search」の「Builder」でﾌｨｰﾙﾄﾞを限定する方法
・Author を選択し、tonegawa ｓを入力します。
17

6-3

著者名からの検索
著者名で検索するときは、ﾗｽﾄﾈｰﾑ(姓)をﾌﾙで、ﾌｧｰｽﾄﾈｰﾑとﾐﾄﾞﾙﾈｰﾑはｲﾆｼｬﾙで入力します。
大文字、小文字の区別はありません。
2002 年から、ﾌﾙﾈｰﾑで入力ができます。但し、ﾌﾙﾈｰﾑが入力されている文献のみが対象です。

①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに著者名と検索ﾌｨｰﾙﾄﾞ名［au］を入力し、［Search］をｸﾘｯｸします。
<1>「Smith R」と入力 ⇒Smith RD も Smith RB も検索されます。
16015 件

<2>「Smith R＠」と入力 ⇒ Smith R だけが検索されます。

3049 件6-4

雑誌名からの検索

雑誌名で検索するときは、ﾌﾙﾀｲﾄﾙ、略誌名、ISSN から検索できます。
＜検索方法１＞①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに雑誌名と検索ﾌｨｰﾙﾄﾞ名［ta］を入力し、［Search］をｸﾘｯｸします。

＜検索方法２＞①「Advanced Search」の Builder でﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから[Journal] を選択し、雑誌名を入力し［「Search」をｸﾘｯｸします。

「Show Index」
をｸﾘｯｸすると候補語が表示されます。

フルタイトル
略誌名
ISSN
誌名が不確だったら

New England Journal of Medicine（of も必要。Med など略すと無効。）
N Engl J Med
００２８－４９７３
N＊ E＊ J＊ M＊（”＊”を使って前方一致検索可）「Journals Database」（p.35）や「Index 機能」（p.15）機能も参照してください。

18

6-5

MeSH からの検索

MEDLINE（PubMed）には、一貫性のある索引基準に基づき統制語ｷｰﾜｰﾄﾞ（MeSH）がインデクサーにより付与されています。検索ﾃｰﾏを表す適切な MeSH 用語を探すことが第１のﾎﾟｲﾝﾄです。
例〉エイズの薬物療法に関する文献について
Acquired Immunodeficiency syndrome／drug therapy[MH]“AIDS”と入力した場合は、・“AIDS”という単語がﾀｲﾄﾙ、抄録、などにある文献をすべて含まれます。
・“AID（補助）”の複数形（AIDS）が検索されてきます。
薬物療法は、ｻﾌﾞﾍﾃﾞｨﾝｸﾞの“drug therapy”で特定したほうが適切です。

思いつく言葉から MeSH を選んで検索する場合は、「MeSH Database」を使います。
①ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの[More Resources]の［MeSH Database］もしくはﾒﾆｭｰから「MeSH」を選択します。
②ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに思いつくｷｰﾜｰﾄﾞを入力し、［Search］ をｸﾘｯｸします。

③入力したｷｰﾜｰﾄﾞに関連すると思われる MeSH 用語が簡単な説明と一緒に表示されます。
④ﾘｽﾄ中で適当な MeSH 用語にﾁｪｯｸを付け「Add to Search builder」をｸﾘｯｸすると、builder 画面に表示されますので、［Search PubMed］をｸﾘｯｸすると検索を行います。
★［PubMed－Major Topic］ではその MeSH が中心的な主題の文献を実行します。

それぞれの用語の部分をｸﾘｯｸすると、ｻﾌﾞﾍﾃﾞ
ｨﾝｸﾞや階層構造が表示され、詳細な条件の設

検索結果

定や複数の MeSH 用語を組み合わせて検索で
きます。

19

6-6-1

Subheadings（サブヘディング）

ｻﾌﾞﾍﾃﾞｨﾝｸﾞ（Subheadings：副標目）は、各用語に共通する大きな概念について別にまとめたものです。MeSH を効果的に絞り込むことができます。インデクサーにより付与されています。
①ﾘｽﾄ中の用語をｸﾘｯｸすると、MeSH 用語で使用できるｻﾌﾞﾍﾃﾞｨﾝｸﾞや階層構造が表示されます。
②適当なｻﾌﾞﾍﾃﾞｨﾝｸﾞにﾁｪｯｸを付けます。（複数選択し場合、OR 検索となります）③MeSH 用語を中心に扱った文献だけに限定するか、または、その MeSH 用語の下位の用語も含めて検索するかどうかを指定します。

MeSH 用語が文献の中心的主題に限定検索の有無

下位語を含む検索の有無④ｻﾌﾞﾍﾃﾞｨﾝｸﾞなどの設定をしたら、［Add to search builder］をｸﾘｯｸします。
⑤選択した MeSH 用語が入力された形でﾎﾞｯｸｽに表示されますので、［Search PubMed ］をｸﾘｯｸするとﾎﾞｯ
ｸｽの中の検索式を実行します。

用語の組み合わせを編集することもでき
ます。

検索結果

20

ｻﾌﾞﾍﾃﾞｨﾝｸﾞ･ﾘｽﾄの下にある２つの設定部分です。

※「Restrict Search to Major Topic」･･･MeSH 用語が文献の中心的主題（Major Topic)
として索引された文献だけを検索する時にﾁｪｯｸを付けます。初期値では、中心的主題だけではなく選択した MeSH 用語が付与された文献をすべて検索します。
※「Do Not Explode this term」･･･選択した MeSH 用語の階層構造での下位語を含めないでで検索する時にﾁｪｯｸを付けます。初期値設定では、下位語をすべて含めて検索します。
このとき複数の階層構造があるものはすべて下位語が含まれます。

ｻﾌﾞﾍﾃﾞｨﾝｸﾞ･ﾘｽﾄの下方には「Entry Terms」と「階層構造」が表示されます。

＜Entry Terms ＞

Entry Terms とは、
この MeSH 用語への参照語です。

＜階層構造＞MeSH は、広い意味の上位語か

上位語

ら特定の狭い意味の下位語まで、階層構造になっています。
上位語や下位語に適当な語があればその語をｸﾘｯｸして変更
できます。

下位語

21

6-6-2MeSH Browser（MeSH の詳細情報）

MeSH Database で MeSH 用語をﾘｽﾄ表示をした画面の右側の[NLM MeSH Browser]を選択すると、その MeSH
用語に関する詳細な情報が参照できるようになっており、精密な検索を行う場合便利です。
各 MeSH 用語の PubMed での索引法や簡単な解説のほか、MeSH 用語として採用された年やそれ以前に用いられていた MeSH 用語なども参照できます。
①MeSH Database で MeSH 用語を表示し、［NLM MeSH Browser］をｸﾘｯｸします。

「Endometrial Stromal Tumors」の情報表示画
面です。
「Annotation」・・・索引法「History Note」・・・MeSH 用語ができた年「Previous Indexing」・・・それ以前の索引語※「Endometrial Stromal Tumors」は組織タイプの MeSH と共に索引され、1992-2002 年はEndometrial Neoplasms（子宮内膜腫）がそれ以前は Uterine Neoplasms（子宮腫瘍）が使われていたことがわかります。

22

７

検索結果について

7-1

表示
検索結果は、それらの書誌情報が自動的に画面に表示されますが、表示形式は変更することができます。
・検索結果の文献ﾘｽﾄは、入力の新しいものから順に表示されます。
・表示形式の初期設定は Summary 形式で、著者名（青字）、ﾀｲﾄﾙ、収載雑誌名、巻・号・頁・年が表示されます。
・表示形式･表示件数を変更するには・・・［Display Settings］をｸﾘｯｸします。

・出力形式を選択するには・・・[Send to]をｸﾘｯｸします。

各文献に付与されている個の番

関連文献のリストの表示

・次のようなﾒｯｾｰｼﾞが表示される場合があります。
【画面表示】
PubMed－as suppliedby Publisher
PubMed－in process
PubMed－indexed for MEDLINE
PubMed

データの状態出版社から最近送られてきたﾃﾞｰﾀ
MEDLINE に収録されないﾃﾞｰﾀ
出版日以降に MEDLINE への収録が決まった雑誌のﾃﾞｰﾀ索引作業中（書誌ﾃﾞｰﾀのﾁｪｯｸや MeSH 付与）
MEDLINE の収録範囲のもので、MeSH や Publication
Type、Registry Number と共にすでに索引され、書誌ﾃﾞｰﾀもすでにﾁｪｯｸされているﾃﾞｰﾀ
MEDLINE の収録対象外、または、雑誌が MEDLINE に収録が決まる前に出版された号に掲載された記事

23

検索結果の右側には次のようなﾒﾆｭｰが表示されます。

Filter your results：
ﾌｨﾙﾀｰを通した検索結果が表示されます。ﾃﾞﾌｫﾙﾄでは検索結果中のﾚﾋﾞｭ
ｰ論文の数と、無料で全文が公開されている論文の数が表示されます。
Manage Filters をｸﾘｯｸすると、My
NCBIにてﾌｨﾙﾀｰが変更できます。
（参照 p.41）

Results by year:
検索結果を年ごとにグラフ化しています。

Related searches：
検索語の提案PMC Images search：
PubMed Central の画像を検索

24Title with your search terms：
入力語がタイトルに含まれる文献リストの、上限 20 件を表示。
過去に PubMedde 詳細表示（single
record display）をされた回数の多い順に表示されます。

Free

full-text

articlesin

PubMed Central:
PubMedCentaral で閲覧できるフル
テキスト

Find related data：
PubMed をはじめ、NCBI が提供する各種ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽから、検索結果の関連情報を探し出すことができます。

Search details：
ここを見ると自動ﾏｯﾋﾟﾝｸﾞ機能によって、どんな用語で検索されているのかを知ることができます。表示しきれない場合に「>>See more」を押すと、大検索ﾌｨｰﾙﾄﾞ名

きく表示される「Search Details」の画面につながります。

Recent activity：
利用者の最新 5 つの検索履歴を表示します。My NCBIにﾛｸﾞｲﾝしておくと、検索履歴が全て、My saved data の中の Recent activity に最長 6 ヶ月間記
録することができます。

25

7-2

Details（検索式の表示）

7-2-1

検索式の確認検索した結果が今ひとつ良くない、たとえば不要なもの（ﾉｲｽﾞ）が多い、逆に必要なものが見つからない、という場合は検索式を確認してみましょう。
①検索結果の右下に表示されている「Search details」で確認できます。
全部表示しきれていない場合は、「See more」をｸﾘｯｸすると大きな画面で見ることができます。
Advanced Search の画面最上部にある「Details」をｸﾘｯｸしても同じ画面にいきます。

検索ﾌｨｰﾙﾄﾞ名②このようなｼｽﾃﾑの判断が不適切である場合、ここで書き換えることができます。
検索式を書き換えて[Search]をｸﾘｯｸすると、書き換えた検索式で再検索してくれます。

7-2-2

検索式の登録と再検索

検索式を登録しておいて、後日、再検索ができます。
①［Details］の画面で［URL］をｸﾘｯｸします。
検索式が入力ﾎﾞｯｸｽに入力された画面になります。
②この画面でﾌﾞﾗｳｻﾞのﾌﾞｯｸﾏｰｸ（お気に入り）に登録します。
③再検索するときは、ﾌﾞｯｸﾏｰｸから呼び出すと同じ検索をしてくれます。

※History で番号を用いた検索式（＃1 AND ＃2）は保存できません。
※複数の検索式を管理したり、定期的に新しい文献を見たいときは、［ＭｙＮＣＢＩ］が便利です。
26

7-3

Display Settings(表示形式、表示件数、表示順の変更)
表示形式の初期設定は、Summary 形式（書誌情報のみ）
1 画面 20 件、最近加えられたﾃﾞｰﾀ順になっています。

・Format･･･表示形式
・Items per Page･･･１画面の表示件数
・Sort by･･･表示順
・Pub Date･･･出版順
・First Author･･･第一著者名順
・Last Author･･･最終著者名順
・Journal･･･雑誌名順
・Title･･･文献のタイトル順

Abstract 形式

MEDLINE 形式

電子ｼﾞｬｰﾅﾙへのﾘﾝｸｱｲｺﾝが表示でき＜必要な文献を再表示する場合＞①ﾀｲﾄﾙを見ながら各文献の左のﾁｪｯｸﾎﾞｯｸｽにﾁｪｯｸを付けます。
②[Apply]をｸﾘｯｸすると、ﾁｪｯｸしたものだけを表示します。

ま す 。「 + 」 の 行 を ｸ ﾘ ｯ ｸ す る とPublication Type や MeSH Termsなどが見られます。

必要な文献だけを印刷したい時に便利です

27

7-4

Send to（出力形式の選択）
・File･･･ﾀﾞｳﾝﾛｰﾄﾞ（p.30）

検索結果の出力形式を選択できます。

・Clipbord･･･一時保存（p.28）
・Collections･･･長期保存（p.31）
・E-Mail･･･ﾒｰﾙ送信（p.30）
・Order･･･文献注文
・Citation manager･･･外部の引用管理ｿﾌﾄで使用するためのﾌｧｲﾙを生成。

・My Bibliography･･･My NCBI へ展開。
自分が執筆した論文や図書ﾘｽﾄを作成するためのｽﾍﾟｰｽです。PubMed の Send
to からﾃﾞｰﾀを取り込むだけでなく、ﾃﾝﾌﾟﾚｰﾄに沿って図書の書誌情報などを7-4-1

手入力できます。

【Clipboard】（検索結果の一時保存）

検索結果を一時的に保管しておき、最後にまとめて印刷や保存ができます。
①検索結果からｸﾘｯﾌﾟﾎﾞｰﾄﾞに入れたい文献のﾁｪｯｸﾎﾞｯｸｽにﾁｪｯｸを付けます。
②右上にある[Send to]をｸﾘｯｸすると、出力形式を選ぶﾒﾆｭｰが表示されます③「Clipboard」にﾁｪｯｸを付け、下に表示される「Add to Clipboard」をｸﾘｯｸします。

④指定した文献だけをｸﾘｯﾌﾟﾎﾞｰﾄﾞへ保存できます。

28

＜保存してデータを表示する場合＞①保存しておいたﾃﾞｰﾀを表示するには、[××items]をｸﾘｯｸします。

保存ﾃﾞｰﾀを表示します。

＜保存したﾃﾞｰﾀを削除する場合＞
・全てのﾃﾞｰﾀを削除する場合･･･ﾍﾟｰｼﾞ上部に表示された「Remove all items」をｸﾘｯｸします。
・１件ﾃﾞｰﾀを削除したい場合は･･･そのﾃﾞｰﾀの最後にある「Remove from clipboard」をｸﾘｯｸします。
・いくつかの文献を選んで削除したい場合･･･各ﾃﾞｰﾀの最初についている□にﾁｪｯｸを付け、ﾍﾟｰｼﾞの上の方に表示される「Remove selected items」という表示ｸﾘｯｸします。

全てのﾃﾞｰﾀを消去

１件データを削除したい場合

データを選択し削除したい場合

ｸﾘｯﾌﾟﾎﾞｰﾄﾞに保存中のﾃﾞｰﾀには[Itemin clipboard]と表示されます。

・ｸﾘｯﾌﾟﾎﾞｰﾄﾞには 500 件までﾃﾞｰﾀが保存できます。このﾃﾞｰﾀは検索を終了しても 8 時間有効です。
・ｸﾘｯﾌﾟﾎﾞｰﾄﾞ内に保存ﾃﾞｰﾀの重複があった場合は、一方が自動的に除去されます。

29

7-4-2【File】(ダウンロード)

検索した結果を USB ﾒﾓﾘｰやﾊｰﾄﾞﾃﾞｨｽｸなどに保存できます。
①［Send to］をｸﾘｯｸするとﾒﾆｭｰが表示されますので、［File］にﾁｪｯｸを付けます。
②自動的に設定項目が表示されますので、[Format]（ﾀﾞｳﾝﾛｰﾄﾞの表示形式）と[Sort by]（表示順）
を指定します。
③[Create File] をｸﾘｯｸすると保存確認画面が表示され保存できます。
※一度に保存できる数は、5,000 件までです。
※文献管理ｿﾌﾄなどに取り込む場合は、Format
で MEDLINE を選択します。

※文献検索ｿﾌﾄとして「Mendeley」を無料で利用できます。下記のｱﾄﾞﾚｽにｱｸｾｽしてください。
＜http://www.mendeley.com/＞PubMed の検索結果を「RefWorks」「EndNote」に読み込むことができます。

7-4-3【 E-mail】（電子メール送信）

検索結果を電子ﾒｰﾙで送信できます。
①［Send to］ﾒﾆｭｰから［E-mail］にﾁｪｯｸを付けます。
②自動的に設定項目が表示されますので[Format]（送信形式）、[Sort by]（送信ﾃﾞｰﾀの順番）、[Number to send]（送信件数）をﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから選択し、[Start from citation]（何番目から送信するか）を指定します。
③[E-mail]（送信先の電子ﾒｰﾙｱﾄﾞﾚｽ）、[Additional text](ｺﾒﾝﾄ)を設定し、［E-mail］をｸﾘｯｸします。
※ｺﾝﾒﾝﾄの入力は任意です。

・一度に送信できるのは 200 件までです。
・事前に文献のﾁｪｯｸﾎﾞｯｸｽにﾁｪｯｸを付けておくと、指定した文献だけを送信します。
・何も指定しないと、Summary 形式で最近の文献から 20 件が送られてきます。
・Format で Summary あるいは Abstract を選択すると、本文が HTML 形式の電子ﾒｰﾙとなり、文献のﾀｲﾄﾙなどにﾘﾝｸが付きます。

30

7-4-4【Collections】（検索結果を長期保存・公開する）

検索結果を長期保存する時は「Collections｣を使います。
①検索結果の一覧から保存したい文献にﾁｪｯｸを付けて選択します。
文献を選択しない場合は、すべての検索結果(上限 5,000 件)が保存されます。
②[Send to]から[Collections]にﾁｪｯｸを付け[Add to Collections]をｸﾘｯｸします。

My NCBI へ Sign In をしていないとき
は、Username／Password の画面が表示されますので入力し、[Sign In]をｸﾘｯｸします。

「Username／Password」の登録方法
は、「p.37」参照してください。

③[Create new collection]にﾁｪｯｸを付け、collection 名を入力し[Save] をｸﾘｯｸします。
＜既存 Collection に文献を追加する場合＞③[Append to an existing collection]にﾁｪｯｸを付け、Collection 名をﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰから指定し[Save]をｸﾘｯｸします。

31

7-4-4-1

Collections の表示・編集・削除

My NCBI の My Saved Data 内の Collections ﾍﾟｰｼﾞで各 Collection の表示・編集・削除ができます。
①ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞから Sign In をｸﾘｯｸし、Username／Password を入力します。
②ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞから[My NCBI]をｸﾘｯｸすると My NCBI 画面に展開します。
③[Collections] が画面の右に表示されます。
④表示の場合は･･･該当の検索名をｸﾘｯｸします。
削除の場合は･･･該当の検索名にﾁｪｯｸを付け[Delete]をｸﾘｯｸします。
編集の場合は･･･該当の検索名にﾁｪｯｸを付け検索名の横の（edit）をｸﾘｯｸします。
Collection 同士の結合の場合･･･該当の検索名にﾁｪｯｸを付け[Merge]をｸﾘｯｸします。

①

②

③

④

⑤

①：Private(自分専用)と Public(共有)の設定を切り替えられます。Public を選ぶと Direct URL が生成されます。この Collection の文献リストを公開するときには、URL を他者へ知らせたり、ホームページ等にリンクを作成します。
②：Collection 名の変更、共有設定の URL 等の確認ができます。
③：文献をテキストファイルとして保存できます。
④：文献を CSV ファイルとして保存できます。
⑤：文献の並び替えができます。（出版年、著者名、タイトル）
32

7-5

Related Citation 機能（関連文献の表示）
Related Citation は、MeSH、ﾀｲﾄﾙ、抄録中のｷｰﾜｰﾄﾞが自動的に分析して関連性の高い文献へﾘﾝｸする機能です。特に新しいﾃｰﾏや名称が確定していない疾患などに関する文献を検索するとき有効です。

①検索結果の Summary 表示画面で、[Related Citations]をｸﾘｯｸすると、関連文献を表示できます。

関連文献＜＜Abstract 形式＞＞

Abstract 形 式 で は 、 Related
Citation の枠内に関連性の高い順に 5 件の文献が表示されます。ｶｰｿﾙを置くとより詳しい情関連文献リストを表示

報が見られます。

Abstract 形式でこの文献を引用している文献 28 件をみることができます。
但し、PubMed Central に全文が収録されているものが対象になります。そのため、引用ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽ「Web of Science」
では引用した文献は 124 件になります。

33

7-6

検索結果の印刷

ﾌﾞﾗｳｻﾞの印刷機能では、画面に表示されているものを印刷しますので、検索した結果を印刷するためには、一度画面に表示させなければなりません。

ﾌｧｲﾙ（F）から印刷（P）を選ぶか印刷
ﾎﾞﾀﾝをｸﾘｯｸして印刷します。

7-6-1

選んで印刷する場合①検索結果のﾘｽﾄの中から、印刷したい文献の左横のﾁｪｯｸﾎﾞｯｸｽにﾁｪｯｸを付けます。
②ﾘｽﾄのﾄｯﾌﾟに表示されている[Display Settings]をｸﾘｯｸします。
③[Apply]をｸﾘｯｸすると、選択したﾘｽﾄのみが再表示されますので､ﾌﾞﾗｳｻﾞ機能で印刷します。

7-6-2

いくつかの検索結果をまとめて印刷する場合（クリックボードを使う）
いくつかの検索を行う場合で、最後にそれらの検索結果をまとめて印刷したい時は、
Clipboard＜ｸﾘｯﾌﾟﾎﾞｰﾄﾞ＞（p.28）を使います。

34

８

Journals

Database 機能（収載誌名リスト）

雑誌名・略誌名を調べたり、雑誌名・略誌名から特定の雑誌に収載された論文を検索できます。
①ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞ[More Resources]で［Journals Database］を選択しｸﾘｯｸします。
②ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに調べたい雑誌名を入力し、［Search］をｸﾘｯｸします。
③雑誌のﾌﾙﾀｲﾄﾙ、ISSN(p はﾌﾟﾘﾝﾄ版、e は電子版)と略誌名が表示されます。
④右端の［Add to search builder ］をｸﾘｯｸするとｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに雑誌名が表示されますので、［Search PubMed］を選択すると、この雑誌に掲載された文献を検索できます。
略誌名や創刊等の雑誌に関する詳細情報が表示されます。

９SingleCitation

Matcher 機能（特定の文献を簡単検索）

特定の文献を探したいとき、文献を引用するときなどに Single

Citation Matcher 機能が便利です。文献ﾘｽﾄの書誌事項に不完全なものがある場合、この機能によって複数の PMID（PubMedの文献番号）または UID（MEDLINE の文献番号）を一括して調べられます。
①ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの[PubMed Tools]から［Single

Citation Matcher］を選択し、分かっている項目を入力し、［Go］をｸﾘｯｸします。

第一著者の文献に限定して検索するときはﾁｪｯｸを付けます。

35

10

Clinical

Queries 機能（治療、診断、病因、予後に限定）

Clinical Queries は、主に臨床医学領域の文献検索における利用を想定した検索機能です。研究ﾃﾞｻﾞｲﾝに着目したｷｰﾜｰﾄﾞのまとまりであるﾌｨﾙﾀｰが入力したｷｰﾜｰﾄﾞに自動的に付与されて検索されます。

①

②

①

③

Category＜臨床研究ｶﾃｺﾞﾘｰ＞
・etiology：病因
・ｄiagnosis：診断・ｔherapy：治療・ｐrognosis：予後・clinical prediction guides：
臨床予測指針Scope＜検索の範囲と性格＞
・narrow：狭い・broad：広い②「Systematic Reviews」は、入力したｷｰﾜｰﾄﾞを系統的ﾚﾋﾞｭｰ、ﾒﾀｱﾅﾘｼｽ、臨床試
験のﾚﾋﾞｭｰ、科学的根拠に基づく医療、ｺﾝｾﾝｻｽ開発会議、および MEDLINE から検索します。Article Type の Meta-analysis を使った検索よりも広く検索できます。

③「Medical Genetics」は、遺伝学関係の文献を検索します。
・All（全て）、・Diagnosis（診断）、・Differential Diagnosis（鑑別診断）、
・Clinical Description（臨床記述）、
・Management（ﾏﾈｼﾞﾒﾝﾄ）、・Genetic Counseling（遺伝ｶｳﾝｾﾘﾝｸﾞ）、・Molecular Genetics（分子遺伝学）、・Genetic
36 Testing（遺伝学的検査）、

10-1

Clinical Queries 感度・特異度

Clinical Queries 機能で使用される検索ﾌｨﾙﾀｰは、McMaster 大学の R.Brian Haynes らの研究成果に基づいています。このﾌｨﾙﾀｰの内容とそれを用いた検索結果、そして手作業でﾘｽﾄｱｯﾌﾟした文献ﾘｽﾄの一致率を表した表は以下のとおりです。

ｶﾃｺﾞﾘｰ

Therapy（治療）

Diagnosis（診断）

Etiology（病因）

prognosis（予後）Clinical
Prediction
Guides
（臨床予
測指針）

検索の性格

感度／
特異度

sensitive/broad（感度が高い検索）

感度 99%
特異度 70%Specific/narrow（特異度が高い検索）

感度 93%
特異度 97%sensitive/ broad（感度が高い検索）

感度 98%
特異度 74%

Specific/narrow（特異度が高い検索）

感度 64%
特異度 98%sensitive/ broad（感度が高い検索）

感度 93%
特異度 97%

Specific/narrow（特異度が高い検索）

感度 51%
特異度 95%sensitive/ broad（感度が高い検索）

感度 90%
特異度 80%Specific/narrow（特異度が高い検索）
sensitive/board（感度が高い検索）

感度 52%
特異度 94%感度 96%
特異度 79%Specific/narrow（特異度が高い検索）感度 54%
特異度 99%

自動的に掛け合わせられる検索式（clinical［Title/Abstract］ AND trial[Title/Abstract]） OR clinical
trials[MeSH Terms] OR clinical trial[Publication Type] OR
Random*[Title/Abstract] OR random allocation{MeSH Terms}
OR therapeutic use[MeSH Subheading](randomized controlled trial[Publication Type] OR(randomized[Title/Abstract] AND controlled[Title/Abstract]
AND trial[Title/Abstract](sensitive*[Title/Abstract] OR sensitivity and specificity[MeSH
Terms] OR diagnos*[Title/Abstract] OR diagnosis[MeSH:noexp]
OR diagnostic*[MeSH:noexp] OR
diagnosis,differential[MeSH:noexp] OR
diagnosis[Subheading:noxp](spedificity[Title/Abstract] OR etiology(risk*[Title/Abstract] OR risk*[MeSH:noexp] OR
risk*[MeSH:noexp] OR cohort studies[MeSH Terms] ORgroup*[Text Word])(relative[Title/Abstract] AND risk*[Title/Abstract]) OR(relative risk[Text Word] OR risks[Text Word] OR cohort studies[MeSH:noexp] OR (cohort[Title/Abstract] AND
Stud*[Title/Abstract])(incidence[MeSH:noexp] OR mortality[MeSH Terms] OR follow
up studies[MeSH:noexp] OR prognos*[Text Word] OR
predict*[Text Word] OR course*[Title/Abstract])(prognos*[Title/Abstract] OR (first[Title/Abstract] AND
Episode[Title/Abstract]) OR cohort[Title/Abstract])(predict*[tiab] OR predictive value of tests[mh] OR scor*[tiab]
OR observ*[tiab] OR obsever variation[mh])(validation[tiab] OR validate[tiab])

・Clinical Queries 機能は、目的のﾃｰﾏについてもれなく文献を探したい場合には不向きな機能ですの
で、利用にあたっては注意してください。
・短時間で精度の高い文献をいくつか検索するときの specificity は有効ですが、sensitivity でも再現率は１００％ではないわけで、診療ｶﾞｲﾄﾞﾗｲﾝの作成など網羅的な検索する場合は、MeSH や
Publication Type、Subheadings、ﾌﾘｰﾜｰﾄﾞなどを駆使して、検索することが必要です。
・多忙な臨床医が臨床上の疑問に答える論文を効率よく検索できるようにあらかじめ構成されたｻｰﾋﾞｽ
です。
37

11

Ｍｙ

11-1

ＮＣＢＩ機能（アラート機能、検索式の保存）

My NCBI の主な機能（PubMed へ様々の個人設定ができる機能）<1>My Save Data：検索式の保存、保存した検索式を自動的・定期的に実行し、結果を電子ﾒｰﾙ
で配信（ｱﾗｰﾄ機能）、検索結果の長期保存・公開<2>Search Filters：検索結果のﾌｨﾙﾀﾘﾝｸﾞ（５つまでﾌｨﾙﾀｰ設定が可能）<3>Preferences ：画面のｶｽﾀﾏｲｽﾞ(例)：検索ｷｰﾜｰﾄﾞをﾊｲﾗｲﾄ表示

11-2

User

Name と Password の登録①ﾄｯﾌﾟ画面の右端の［Sign In］をｸﾘｯｸすると[My NCBI Sign in]画面に展開します。

②［Register for an account］をｸﾘｯｸすると、設定画面に展開しますので必要事項を入力後[Register]をｸﾘｯｸします。

③NCBI より登録したﾒｰﾙｱﾄﾞﾚｽに“Ｍｙ ＮＣＢＩ automatic updates confirmation”というﾀｲﾄﾙで確認のﾒｰﾙが届きます。
④My NCBI へ Sign In すると、画面右上に Username が表示されます。

登録済みの検索式や検索結果の管理、各機能を行うことができます。

38

11-3

アラートの登録①検索後、ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽの上の［Save Search］をｸﾘｯｸします。

②［My NCBI Sign In］画面が表示されますので、登録している Username と Password を入力し[Sign In]
をｸﾘｯｸします。

③［Save Search］画面に展開しますので、[Save]をｸﾘｯｸすると、詳細設定画面に展開します。
保存した検索を自動実行して電子ﾒｰﾙへ結果を送信させる設定ができます。
送信頻度等を入力し、[Save]をｸﾘｯｸします。

・送信頻度は、毎月／毎週／毎日から選択可能です。その他にも、表示形式や件数を指定できます。

39

11-4

アラート設定の削除

My NCBI の画面で行います。
①Sign In した後[My NCBI]をｸﾘｯｸします。

②My NCBI 画面に展開しますので、[Saved Searches]から登録している検索式が表示されますので、削除したい検索式にﾁｪｯｸを付け、[Delete PubMed Searches]をｸﾘｯｸします。

11-5

電子メールアドレスおよびパスワードの変更①Sign In した後[My NCBI]をｸﾘｯｸします。
②My NCBI 画面から[Preferences]ｸﾘｯｸします。
③Common Preferences 画面から[Password]または、[E-mail Address]をｸﾘｯｸし変更します。

40

12

Filters（検索結果のフィルター表示）
検索を実行すると、その結果が自動的にﾌｨﾙﾀｰﾘﾝｸﾞされ、ｸﾞﾙｰﾌﾟが作成されます。（ﾌｨﾙﾀｰ機能）
各ｸﾞﾙｰﾌﾟは、検索結果の表示画面の右上の[Filter your results]に表示されます。ﾌｨﾙﾀｰは 5 つまで個人設定ができます。
初期設定は、Review(ﾚﾋﾞｭｰ文献)、Free Full Text（無料の電子ｼﾞｬｰﾅﾙ文献）です。
①[Manage Filters]をｸﾘｯｸします。My NCBI へ Sign In をしていない時は[Username／Password]の画面が表示されますので入力します。
ﾌｨﾙﾀｰの解除は、My NCBI へ Sign In をし、[Filters]画面でﾁｪｯｸﾎﾞｯｸｽのﾁｪｯｸを外します。

②ﾌｨﾙﾀﾘﾝｸﾞしたい項目にチェックを付けます。

任意のﾌｨﾙﾀｰを作成できます。
例は、英語と日本語の文献に限定する場合

Properties

41

13

Preferences（ｷｰﾜｰﾄﾞのﾊｲﾗｲﾄ表示）
検索したｷｰﾜｰﾄﾞをﾊｲﾗｲﾄ表示する時は、[Preferences]で設定します。
ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの My NCBI に Sign In した後、画面の上の[NCBI Site Preferences]をクリックします。
ﾊﾟｽﾜｰﾄﾞや電子ﾒｰﾙｱﾄﾞﾚｽなどの個人設定が変更できます。

Abstract
画面

リンクリゾルバへ

42

14

PubMed 活用テクニック Q＆A

Ｑ１

Ｑ２

Ｑ３

Ｑ４

年齢・性別・言語で限定をしたい。 －Limits 機能－
Ａ1 Limits 機能を使うと簡単に限定できます。
①検索結果画面の左に「Limit」項目が表示されます。
・年齢 ⇒「Ages」 ・性別 ⇒「Gender」 ・言語⇒「Languages」②該当の項目にチェックを付けると検索を実行します。
★ Limits は一度設定すると、解除するまですべての検索に適用されます。
解除したいときは、［Limits］のﾁｪｯｸをはずすか、「Clear All」をｸﾘｯｸします。
論文や雑誌の種類で限定をしたい。 －Limits 機能－
Ａ２ Limits 機能を使うと簡単に限定できます。
①検索結果画の面左に「Limit」項目が表示されます。
・文献の種類⇒「Article types」②該当の項目にチェックを付けると検索を実行します。
★Limits は一度設定すると、解除するまですべての検索に適用されます。
解除したいときは、［Limits］のﾁｪｯｸをはずすか、「Clear All」をｸﾘｯｸします。
★Limits 画面に表示されないその他の「Publication Type」を指定するには、次の方法を行ってください。
①ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに Article type 名の後ろに［PT］と付けます。
②Advanced 画面で、検索ﾌｨｰﾙﾄﾞを「Article Type」に指定し入力します。
フィールドを選択しながら検索をしたい。 －Advanced 検索－
Ａ３ Advanced Search の Search Builder を使うと便利です。
①ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの［Advanced］をｸﾘｯｸします。
②Builder で検索ﾌｨｰﾙﾄﾞを選択し、ｷｰﾜｰﾄﾞを入力します。
③[Search]をｸﾘｯｸすると、検索を実行します。
語尾のあいまいなキーワードで検索をしたい。 －ﾄﾗﾝｹｰｼｮﾝ、Index 機能－
Ａ４ ﾄﾗﾝｹｰｼｮﾝ記号を（＊）語尾を付けるか、Advanced Search を使います。
１．ｷｰﾜｰﾄﾞを入力する際に語尾に＊をつけると、さまざまな語形を検索できます。
Environmet＊ ⇒ environment、environments、environmental も検索します。

Ｑ５

２．①ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの［Advanced Search］をｸﾘｯｸします。
②Search Builder で検索ﾌｨｰﾙﾄﾞを選択し、ｷｰﾜｰﾄﾞを入力します。
③［Show index］をｸﾘｯｸします。
④入力したｷｰﾜｰﾄﾞについて、語尾変化ごとの用語が表示されます。
⑤用語ﾘｽﾄの中から適当なものを選択をし、[Search]をｸﾘｯｸすると検索を実行します。
複数の語を選択するときは、［Ctrl］を押しながらｸﾘｯｸしてください。
Journal のﾀｲﾄﾙや発行年等がわかっている大量の論文の PubMed ID を取得したい－Batch Citation Matcher－
Ａ５ Batch Citation Matcher を使うとよいでしょう。
①ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの「PubMed Tools」の中にある[Batch Citation Matcher]をｸﾘｯｸします。
②Select database で、PubMed ID か Medline ID かを選択します。
③自分の Email ｱﾄﾞﾚｽを入力し、PMID を調べたい書誌の書誌事項を次の形式で入力します。
ｼﾞｬｰﾅﾙのﾌﾙﾀｲﾄﾙ or 正しい略語 |年|ﾎﾞﾘｭｰﾑ番号|最初のﾍﾟｰｼﾞ|筆者の名前|適当な文字列| （句読点なしで）④[Go]をｸﾘｯｸすると、しばらくすると、E-mail が送られてきます。
43

Ｑ６

Ｑ７

Ｑ８

Ｑ９

Ｑ10

Ｑ11

Ｑ12

MeSH の階層構造を見ながら検索をしたい。 －MeSH Database－
A６ 思いつく言葉から MeSH を選んで検索する場合は、MeSH Database 機能が便利です。
①ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの[More Resources]の中にある［MeSH Database］をｸﾘｯｸします。
②画面上部の Box にｷｰﾜｰﾄﾞを適当に入力して、［Go］をｸﾘｯｸします。
③入力したｷｰﾜｰﾄﾞに対応する MeSH 用語が、簡単な説明と階層構造と画面の下方にに表示されますので該当の用語をｸﾘｯｸします。
④画面右側の[Add to search builder]をｸﾘｯｸし［PubMed］をｸﾘｯｸすると検索を行います。
MeSH の各件数を見ながら検索をしたい。 －Advanced Search(Index／Preview 機能)－
Ａ８ 文献を見ながら MeSH を選んで検索する場合は、Search Builder を使います。
①Advanced Search の Surch Builder の左のﾎﾞｯｸｽのﾌﾟﾙﾀﾞｳﾝﾒﾆｭｰで「MeSH Terms」を選択します。
②右側の Box に検索したいｷｰﾜｰﾄﾞを入力して、［Show index］をｸﾘｯｸすると、ｷｰﾜｰﾄﾞのﾘｽﾄが文献数と一緒に表示されます。
③候補語ﾘｽﾄから適当なｷｰﾜｰﾄﾞを選択し、[AND][OR][NOT]を使って検索式を作成し[Search] をｸﾘｯｸすると検索を実行します。
④検索結果を表示するときは、画面中央に出ている検索式右側の数字をｸﾘｯｸします。
※Show Index を使って MeSH 用語を検索する方法は、文献を確認しながら選ぶ場合に適当です。
※MeSH Database は、MeSH 用語を参照したり、MeSH の階層構造（上下の MeSH 用語）を確認
できますが、検索を実行するまで件数が分からないので不便な面もあります。
前の検索結果を利用して検索をしたい。 －Advanced Search、AND、OR、NOT－
Ａ８ Advanced Search を使うとよいでしょう。
①ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの Advanced Search をｸﾘｯｸすると、［History］が表示されます。
②それまでの検索式と検索結果の件数が表示され、それぞれの検索式の集合番号、または集合番号とｷｰﾜｰﾄﾞを使って検索します。
文献の著者名・タイトル・雑誌名・巻号年・ページ数の確認をしたい。
－Single Citation Matcher－
Ａ９ Single Citation Matcher を使うとよいでしょう。
ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの[PubMed Tools]で［Single Citation Matcher］をｸﾘｯｸし、検索する手がかりの情報を入力します。
正式な雑誌名を確かめたい／略誌名を知りたい －Journals Database－
Ａ10 Journals Database を使うとよいでしょう。
ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの「More Resources」で［Journals Database］をｸﾘｯｸし、調べたい雑誌名を入力します。正確な誌名が不明なときは、分かっている部分だけ入力すると、それらを含む雑誌がﾘｽﾄ表示されます。
検索結果を定期的に電子メールで受け取りたい。 －My NCBI－
Ａ１１ My NCBI を使うとアラート（SDI）を利用できます。
検索を実行した後、[Save Search] をｸﾘｯｸすると［My NCBI］画面に展開します。
[Save]をｸﾘｯｸすると詳細設定画面に変わります。詳細設定画面では、保存した検索式を自動実行して電子ﾒｰﾙへ結果を送信させる設定ができます。
※My NCBI を利用する場合は、Username と Password の登録が必要です。
※検索式を長期保存し繰り返し利用したい場合も My NCBI を利用します。
ﾀﾞｳﾝﾛｰﾄﾞしたﾃﾞｰﾀを利用してｵﾘｼﾞﾅﾙﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽを作りたい－文献管理ｿﾌﾄ－
Ａ１１ ｵﾝﾗｲﾝﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽからﾀﾞｳﾝﾛｰﾄﾞしたﾃﾞｰﾀを管理するためのｿﾌﾄを利用すると便利です。
一般的な文献管理ｿﾌﾄの主たる機能は①ｵﾘｼﾞﾅﾙの文献ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽ作成②論文執筆時の参考文献ﾘｽﾄ作成、の 2 つです。市販されている有用ｿﾌﾄでは「EndNote」やﾈｯﾄﾜｰｸ型の「RefWorks」、
無料で利用出来るﾌﾘｰｿﾌﾄの「Ref for Windows」があります。
※「Ref for Windows」（無料）を利用する場合は、次のｱﾄﾞﾚｽにｱｸｾｽしてください。
＜http://members3.jcom.home.ne.jp/refwin/＞※PubMed での保存は、MEDLINE 形式にしおきます。
44

Ｑ13

検索結果を RSS フィードで受け取りたい
Ａ13 RSS ﾘｰﾀﾞｰで更新情報が取得できます。
登録しておいたｻｲﾄの更新情報を自動的に表示してくれる RSS を使って PubMed の検索結果を配信させることができます。
※RSS ﾘｰﾀﾞｰには、様々な種類があり機能や使用方法がそれぞれ異なります。
例としてﾌﾞﾗｳｻﾞ（Internet Explorer 8）に RSS を登録します。
① 検索実行後、ｻｰﾁﾎﾞｯｸｽ上部の[RSS]をｸﾘｯｸするとﾒﾆｭｰが表示されます。
② 設定を確認し、[Create RSS]をｸﾘｯｸします。
③ 別のﾒﾆｭｰに変わりますので、[XML]をｸﾘｯｸします。
④ ﾌﾞﾗｳｻﾞの画面が移動しますので[このﾌｨｰﾄﾞを購読する]をｸﾘｯｸします。
⑤ 続き[お気に入りﾊﾞｰ]にﾁｪｯｸを付け、[購読]をｸﾘｯｸすると RSS の登録が完了します。
⑥ お気に入りの[ﾌｨｰﾄﾞ]内にあるﾘﾝｸをｸﾘｯｸすると最新情報を表示できます。
EBM に使える文献を短時間で検索をしたい －Clinical Queries－
Ａ14 Clinical Queries を使うとよいでしょう。
ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞの「PubMed Tools」で［Clinical Queries］をｸﾘｯｸすると、入力したｷｰﾜｰﾄﾞ
について、比較的根拠の確かな文献に絞って検索できます。
診療ガイドライン作成のために網羅的検索をしたい。
Ａ15 考えられるすべての方法で検索します。
MeSH や Publication Type、その他適当なｷｰﾜｰﾄﾞを使って検索します。
診療ｶﾞｲﾄﾞﾗｲﾝ作成の基となるようなｴﾋﾞﾃﾞﾝｽﾚﾍﾞﾙの高い文献（研究ﾃﾞｻﾞｲﾝの確かな臨床試験報
告など）を網羅的に検索するには、適当な Medical Subject Headings（MeSH）や Subheadings、Publication Type を使う必要があります。
また、考えられるﾌﾘｰﾜｰﾄﾞをすべて使うことも必要です。
下記に挙げたｷｰﾜｰﾄﾞ類は、質の良い文献に絞り込むためのカナダの McMaster 大学の研究成果の基づき、Rochester 大学の医学図書館で選定されたもので広く用いられています。
また、Yale 大学ではこれらのｷｰﾜｰﾄﾞを PubMed 用に翻訳したものを以下に URL で公開しています。＜http://www.med.yale.edu/library/education/guides/page/71＞

Ｑ14

Ｑ15

＝治療＝に関する網羅的検索に用いるｷｰﾜｰﾄﾞ類

Words］［Publication

Clinical Protocols

Clinical Trail

Clinical trial＊

Clinical Trials

Comparative Study

Double blind＊

Comparative Study

Controlled clinical Trial

Placebo＊Double blind study

Multicenter study

Random＊Epidemiologic

Practice guideline

Single blind＊

Randomized controlled Trial

Triple blind＊

as topic

research

DesignFeasibility studies
Pilot

projects

PlacebosResearch design
Treatment outocome

Type］

［Text

[MeSH]

下線のついた語は Best Term で、これらだけ検索しても、すべての語で検索される文献の多くが検索され、網羅性より効率性を優先する場
合に便利です。
実際の PubMed の検索では、これらのｷｰﾜｰﾄﾞすべてを OR でつないで 1 行
で入力します。上記の Yale 大学の Web ｻｲﾄにはその形式でもきさいされていますので、ｺﾋﾟｰしてｻｰﾁﾎﾞｯｸｽに貼り付けてつかうか、My NCBI に登録しておくと便利です。
45

＝診断＝に関する網羅的検索に用いるｷｰﾜｰﾄﾞ類［MeSH］［Publication Types］

Area under curve

Consensus

Diagnosis，differential［Title／Abstractdevelopment
conference

Words」
Double blind＊

Diagnositic erros

Controlled clinical trial

Random＊Double blind method

Randomized controlled

Sensitivity

Likelihood functions
Random allocation

Trial
Practice guideline

Reproducibility of
results
Sensitivity and specificity
Single blind method

Single blind＊
Sencificity
Triple blind＊［All

Fields］

False negative＊
False positive＊
Likelihood ratio＊
Predictive value＊＝病因＝に関する網羅的検索に用いるｷｰﾜｰﾄﾞ類［MeSH］［Publication Type］

Age factors

Controlled clinical trial

Case control studies

Practice guideline

Causa＊

Cohort studies

Randomized controlled

Cohort＊Comorbidity

Trial

Epidemiolog ic factors［Title／Abstract
Words」

Predispos＊
Random＊Epidemiologic studies［All Fields］

Odds ratio

Case control＊

Risk

Odds ratio＊

Risk＊＝予後・自然経過＝に関する網羅的検索に用いるｷｰﾜｰﾄﾞ類［MeSH］［Title／Abstract

Cohort studies
Disease progression
Morbidity
Mortality
Outcome assessment

Words」
CourseInception cohort＊“Natural history”

Outcome＊Predict＊
Prognost＊

Prognosis
Survival analysis［All Fields］

46

15．全文（フルテキスト）を入手
リンクリゾルバの導入により、所蔵確認や相互貸借の申込みをスムーズに行うことができます。
15-1 リンクリゾルバ（360LINK）
各種文献データベース、電子ジャーナル、図書館蔵書検索システム（OPAC）等様々なツールを相互にリンクさせ、必要な文献をスムーズに入手できるよう支援するシステムです。
医中誌 Web から産業医科大学電子ジャーナルリストや蔵書検索へシームレスにつなぎ、再検索の必要なくフルテキストを探すことができます。

①②③「OAIster」等
で全文を見れる場合がありますので検索
してみてください。

書架に探しに行ってください。

④

オンラインで申し込んだ方には文献が届いたらメールでお知らせ
しますので、カウンターまで取りにきてください。

47

16

例題

例題

１．胃癌の再発について⇒ 「ヘリコバクター・ピロリ菌（除菌）によって早期胃がん患者における再発がどの程度予防できるか」（履歴検索）

P 患者・病態・疾患：胃癌患者（早期）へ → 「early gastric cancer」「early-stage stomach cancer」
I 介入：ヘリコバクターピロリ菌（除菌）は →「Helicobacter pylori」「helicobacter infection」
C 比較：しないときに比べてO アウトカム：再発を減らせるか？ → 「recurrence」（予防：prevention）

結果: 34 低品位患者 h. ピロリ菌陽性率は 94% (32 34 の) だった。すべての 24 h. ピロリ菌陽性であった高品位の患者を選択しました。チピロリだった根絶評価可能 H. pylori 陽性低悪性度患者の 97 ％ （30） の 31 と 92% (22 24 の) 高品位の患者は、CR に 80% につながったので (24 30、95% 信頼区間 [CI] の 65% ～ 95% =) 64 ％ (14 22, 95% 信頼区間の
42 ～ 86% =) 患者のそれぞれ。なしのいずれかの 5 症例は当初ピロリ負または永続ピロリ菌感染後抗生物質 CR を達成しました。追跡期間中央値で完全な 5 年以上の後、3 (13%) 低品位患者高品位の患者では腫瘍の再発が認められた.
結論: 抗 h.ピロリ菌治療初期段階 H. pylori 陽性胃癌 DLBCL(MALT) の処理オプションの 1 つとして考慮可能性があり

48
ます、このような腫瘍の治療としての使用を検証する大規模前向き研究を実施する必要があります。

例題

２．アトピー性皮膚炎（atopic dermatitis）の食事療法（diet therapy）に関する文献を調べたい。上記の内容が中心となっている論文だけに絞って検索したい。

MeSH 検索（MeSH 検索）AND 検索49

例題

３

HER2 陽性乳がん（her2 positive breast cancer）に効果ある、ラパチニブ（lapatinib）

に関して、根拠の確かな文献に絞って検索したい。

Article

Types

で絞りこむ

50

（Limit 検索）

17

おもなフィールドのタグと検索方法の解説

フィールド名Affiliation
All Fields
Author Name

タグ
［AD］
［ALL］
［AU］

Corporate Author
EC/RN Number

[CN]
［RN］

Entrez Date

［EDAT］

Filter［FILTER］

First Author Name
Full Author Name

[１AU]
[FAU]

Grant Number
Issue
Investigator
Journal Title

「GR」
［IP］
[IR]
[TA]

Language
MeSH Date［LA］［MHDA］MeSH Major Topic
MeSH Subheadings［MAJR］［SH］

MeSH Terms

［MH］

検索方法
第１著者の所属機関、住所、電子メールアドレスの検索
Pubmed での検索可能なフィールド内での検索ができます。
著者名 Pubmed の著者名データはフルネームではなく、名字とスペースを挟んで最初の 2 文字のイニシャル
PubMed は自動的に前方一致検索をします。
団体著者名
酵素番号と Chemical Abstracts Service（CAS）のレジストリ-番号での検索できます。
PubMed にデータ登録された日付または期間。期間の場合はコロン（：）を挟んで指定します。
例】 2006：2007［EDAT］ 2006/01：2007/04［EDAT］
LinkOut に関連して使用するタグ
LinkOut リンクのあるものを探す場合は loall［SB］、無料の全文電子ジャーナルリンクあるものを探す場合は、free full text［SB］、全文にリンクあるものは、full text［SB］で検索します。
なお、［Limits］機能でフルテキストのみに絞り込むこともできます。
第一著者名
著者のフルネーム。2002 年以降に出版された文献について検索でき
ます。
交付金番号
文献が掲載された雑誌の号数
NASA で活動しているおもな研究者名。著者名と同様の形式で入力。
収載雑誌の略誌名、正式名、ISSN 番号
雑誌名がカッコを含む場合は、カッコをはずして入力します。
例】J Hand Surg[AM] → J Hand Surg AM
文献が記述された言語
MeSH 用語が付与された日付または期間期間の場合はコロン（：）で挟んで指定します。
例】 2006：2007［MHDA］ 2006/01：2007/04［MHDA］
文献の主要トピックスを表す MeSH 用語
サブヘディング
通常、文献の主題をより的確に表すために MeSH と用いられますが、このタグで別に検索することでより広い検索ができます。
例】 therapeutic use［SH］ 、therapy「SH」・・・・治療を広く検索
サブヘディングにも MeSH のような階層構造があり、PubMed は自動的にそれらを含めて検索します。下位のサブヘディングを含めない場
合は、therapy［ＳＨ：NOEXP］ のように検索します。
MeSH 用語
熟練の主題アナリストによって通常 10～12 語付与されます。特定の狭い語から一般的な広い語までの階層構造を持ち、サブヘディングとの組み合わせで用います。ＭｅＳＨは下位に特定のより狭い語がある
場合は自動的それらを含めて検索します。
下位のＭｅＳＨ用語を含めない場合は、hypertension［MH：NOEXP］
や hypertension［MAJR：NOEXP］のように検索します。
MeSH 用語がカッコを含む場合は、カッコをｽﾍﾟｰｽに置き換えます。
例】 Benzo(a)purene → Benzo a pryrene[MH]51

NLM Unique ID
Other Term

［JID］
［OT］

Pagination［PG］

Personal Name as
Subject
Pharmacologic
Action MeSH Terms
Place of Publication
Publication Date
Publication Type
Publisher Identifier
Secondary Source ID［PS］

NLM LOCATORPlus の ID 番号
MeSH 用語ではないキーワード NLM 以外の組織、NASA の宇宙飛行関連など文献が記載されている最初のページ
最初のページ（スペース）最後のページ
著者名ではなく文献の主題としての個人名［PA］

薬理学的作用を持つ物質

［PL］
「DP」
［PT］
「AID」
［SI］

SubsetSubstance Name
Text Word

［SB］
［NM］
［TW］

Title
Title／Abstract
Unique Identifiers［TI］［TIAB］［UID］

Volume［VI］

出版国
文献が発表された日付または期間
文献の出版形態
出版社によって付与された、DOI のような文献 ID 番号
文献で触れられている二次情報データバンクや分子シーケンス受付
番号
収載誌の種類を限定するものと主題を限定するものがあります。
化学物質名
文献のタイトル、抄録、MeSH、サブヘディング、化学物質名、
文献の主題としての個人名、二次資料データの各フィールド内に含まれる言葉や数字
文献のタイトル中の言葉
文献のタイトルや抄録中の言葉
PubMed や MEDLINE の ID 番号。ｸｴﾘｰﾎﾞｯｸｽに ID 番号をｽﾍﾟｰｽで区切って入力すれば［UID］ は付けなくても PubMed は自動的にそれらを ID 番号と認識して OR 検索を行います。
収載誌の巻数

18

Publication

Types（資料種類）

Addresses
Bibliography
Biography
Case Reports
Classical Article
Clinical Conference
Clinical Trial
Clinical Trial，Phase Ⅰ
Clinical Trial，Phase Ⅱ
Clinical Trial，Phase Ⅲ
Clinical Trial，Phase Ⅳ
Comment
Congresses
Consensus Development Conference
Consensus Development Conference，NIH
Controlled Clinical Trial
Corrected and Republished Article
Dictionary
Directory
Duplicate Publication

アドレス
書誌
伝記
症例報告
古典的論文
臨床病理検討会
臨床試験
第一相試験
第二相試験
第三相試験
第四相試験
コメント
会議
コンセンサス開発会議
NIH コンセンサス開発会議
比較臨床試験
改訂版再録文献
辞典
ディレクトリー二重出版
52

Editorial
Evaluation Studies
Festschrift[for commemorative articles]
Government Publications
Guideline
Historical Article
Interview
Journal Article
Lectures
Legal Cases
Legislation
LetterMeta-Analysis
Muｌｔｉｃｅｎｔｅｒ Ｓｔｕｄｙ
ＮｅｗｓＮｅｗｓｐａｐｅｒ Ａｒｔｉｃｌｅ
ＯｖｅｒａｌｌPatient Education Handout
Periodical Index
Practice Guideline
Published Erratum
Randomized Controlled Trial
Retracted Publication
Retraction of Publication
Review
Scientific Integrity Review
Technical Report
Twin Study
Validation Studies

19

エディトリアル
評価研究
記念論文集
政府刊行物
ガイドライン
医学史的記事
インタビュー
雑誌記事
講義録
判例
法令
レター
メタアナリシス
多施設共同研究
ニュース
新聞記事
概観
患者教育用パンフレット
雑誌記事索引診療ガイドライン
記事訂正
ランダム化比較試験
撤回文献
撤回表明
レビュー
米国研究不正管理局報告書
技術レポート
双生児による研究
バリデーション研究

Ages
All Infant: birth-23 months
All Child: 0-18 years
All Adult:19+ years
Newborn: birth-1 month
Infant: 1-23 months
Preschool Child: 2-5 years
Child: 6-12 years
Adolescent: 13-18 years
Adult: 19-44 years
Middle Aged: 45-64 years
Middle Aged + Aged: 45+ years
Aged: 65+ years
80 and over: 80+ years

幼児全部（２３ヶ月）
小児全部（０～１８歳）
成人全部（１９歳以上）
新生児（1 ヶ月以下）
幼児（１～２３ヶ月）
未就学児（２～５歳）
小児（６～１２歳）
青年（１３～１８歳）
成人（１９～４４歳）
中年（４５～６４歳）
中年以上
老人（６５歳）
８０歳以上

53

20

サブセット：Subsets
主題の限定
主題の限定
主題の限定
主題の限定
収載誌の限定収載誌の限定
主題の限定
データの限定収載誌の限定
データの限定
データの限定
主題の限定
主題の限定

21

AIDS
Bioethics
CancerComplementary Medicine
Core clinical journals
Dental journals
History of Medicine
MEDLINE
Nursing journals
OLDMEDLINE for Pre１９６６
PubMEDCentral
Space Life Sciences
Toxicology.

エイズ
生命倫理
癌
補完医療・代替医療
主要誌
歯科関係
医学史
MEDLINE データ
看護関係
OLDMEDLINE データ
無料電子ジャーナルが有効なもの
宇宙医学
毒性学

サブヘディング
abnormalities
administration & dosage
adverse effects
agonists
analogs & derivatives
analysis
anatomy & histology
antagonists & inhibitors
biosynthesis
blood
blood supply
cerebrospinal fluid
chemical synthesis
chemically induced
chemistry
classification
complications
congenital
contraindications
cytology
deficiency
diagnosis
diagnostic use
diet therapy
drug effects
drug therapy
economics
educationembryology

AB
AD
AE
AG
AA
AN
AH
AI
BI
BL
BS
CF
CS
CI
CH
CL
CO
CN
CT
CY
DF
DI
DU
DH
DE
DT
EC
ED
EM

奇形
薬物投与と投与量
有害作用 副作用
アゴニスト
類似体と誘導体
分析
解剖学と組織学
拮抗物質と阻害物質
生合成
血液血液供給 血液循環
脳脊髄液
化学合成
化学的誘発
化学
分類
合併症
先天性
禁忌
細胞学
欠乏
診断
診断用 診断への利用
食事療法
薬物作用
薬物療法
経済学
教育
発生学
54

enzymology
epidemiology
ethicsethnology
etiology
genetics
growth & development
historyimmunology
injuries
innervation
instrumentation
isolation & purification
legislation & jurisprudence
manpower
metabolism
methods
microbiology
mortality
nursing
organization & administration
parasitology
pathogenicity
pathology
pharmacokinetics
pharmacology
physiology
physiopathology
poisoning
prevention & control
psychology
radiation effects
radiography
radionuclide imaging
radiotherapy
rehabilitation
secondarysecretion
standards
statistics & numerical data
supply & distribution
surgery
therapeutic use
therapy
toxicitytransmission
transplantation
trendsultrasonography
ultrastructure

EN
EP
ES
EH
ET
GE
GD
HI
IM
IN
IR
IS
IP
LJ
MA
ME
MT
MI
MO
NU
OG
PS
PY
PA
PK
PD
PH
PP
PO
PC
PX
RE
RA
RI
RT
RH
SC
SE
ST
SN
SD
SU
TU
TH
TO
TM
TR
TD
US
UL

酵素学
疫学
倫理学
民俗学
病因
遺伝学
成長と発育
歴史
免疫学
損傷
神経支配
機器
分離と精製
法律学 法制と法学
人的資源
代謝
方法
微生物学
死亡率
看護
組織と管理
寄生虫学
病原性
病理学
薬物動態学 薬物速度論
薬理学
生理学
生態生理学
中毒
予防と抑制
心理学
放射線作用 放射線効果
Ｘ線撮影
放射性核種イメージング
放射線療法
リハビリテーション
二次性 続発性分泌
標準統計と数値データ
供給と配分
外科学
治療用 治療への利用
治療
毒性
伝播
移植
傾向
超音波検査 超音波画像
超微細構造
55

urineutilization
veterinary
Virology

22

UR
UT
VE
VI

尿
利用
獣医学
ウイルス学

ストップワード（Stopwords）

Ａ
Ｂ
Ｃ
D
Ｅ
Ｆ
H
Ｉ
J
Ｋ
Ｍ
N
Ｏ
P
Ｑ
Ｒ
Ｓ

a, about, again, all, almost, also, although, among, an, and, anther, any, are, as, atbe, because, been, before, being, between, both, but, bycan, could
did, do, does, due, during
each, either, enough, especially, etc
for, found, from, further
had, has, have, having, here, how, howeveri, if, in, into, is, it, its, itself
justkg, kmmade, mainly, make, may, mg, might, ml, mm, most, mostly, mustnearly, neither, no, nor
obtained, of, often, on, our, overall
perhapsquite
rather, really, regarding
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参考資料：阿部信一著「図解56

PubMed の使い方」