科学技術振興機構
バイオサイエンスデータベースセンターの取り組み
2015.07.03
JaLC研究データDOI登録実験 中間報告会
櫛田達矢（NBDC/JST）

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目次
1. テスト実施方針
2. 生命科学系データベースアーカイブとは
3. クリエイティブ・コモンズ（CC）
4. テストの方法••

登録対象データと登録対象件数
テスト登録方法

5. 結果
6. 課題と検討事項
7. 本番登録の予定
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1. テスト実施方針• NBDCがサービスを提供している「生命科学系データベースアーカイブ」（https://dbarchive.biosciencedbc.jp/）に収録されているデータセットに対してDOIを付与するテストを行う。JaLCのDOI登録インターフェースを使用し、生命科学系データベースアーカイブのメタデータがDOI登録にもそのまま活用できるか、不足の項目があるかなどを確認し、本格運用開始に備えることを目的とする。
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2. 生命科学系データベースアーカイブ
データセットを長期間安定に維持保管し、データ説明（メタデータ）を統一して検索 を容易にすると共に、利用許諾条件などの明示を行うことで、多くの人が容易にデータへアクセスしダウンロードを行えるようにする
サービス

102 件のデータ デー
タベース、約500 件のデータセットを収録 （ 2015 年 6 月 現在）。

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データベースとそのメタ情報

データセットとそのメタ情報

データセットのリスト

個々のデータセットは、説明のページ（固有のURL）を持ち、メタデータ、データセットへのリンク、利用許諾（クリエイティブ・コモンズ）などの情報を収録。

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3. クリエイティブ・コモンズ（CC）
再利用と共有を促進する仕組み

４種類のマークを組み合わせて６種類の利用条件を選択することができる

CC-BY ジャパンクリエイティブ・コモンズ・ジャパン（http://creativecommons.jp/licenses/）

生命科学系データベースアーカイブで用いられる標準的なライセンス6© 2015

統合データベース講習会 Licensed Under CC 表示 2.1 日本

4. テストの方法•

登録対象データと登録対象件数– 生命科学系データベースアーカイブに収録されているデータセット全件（約500データセット（102データベース））– 登録対象件数（登録実験済の数）：74データセット（17データベース）•

テスト登録方法– 登録のインターフェースは、Web入力、XML一括入力の両方を使用した。
– RAは、JaLCを選択。
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実施体制
NBDC（バイオサイエンスデータベースセンター）「研究データへの DOI 登録実験プロジェクト」チーム
責任者：櫛田研究員（NBDC研究員、ライフサイエンスDB統合のための基盤整備）
・JaLCとの連絡
・DOI登録の方式の検討
・データ登録、更新、削除
・成果報告および報告書作成

生命科学系データベースアーカイブチーム（3名）
・メタデータ作成

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5. 結果 (1/2)• 生命科学系データベースアーカイブのメタデータが、新規作成、修正することなく、ほぼそのままの形でJaLCの研究データ登録に流用できることを確認した（表）。

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表．メタデータ項目の比較と値の一例
メタデータ項目（主なもの）
生命科学系データベースアーカイブ

JaLCのメタデータ

JaLCメタデータの値

データ名

title

データURLurl

作成者氏名

creator (ja)

春島嘉章、倉田のり、長村吉晃、矢野昌裕、佐々木卓治*

作成者英名

creator (en)Yoshiaki Harushima, Nori Kurata, Yoshiaki Nagamura,
Masahiro Yano, Takuji Sasaki

作成者所属

affiliation

社団法人農林水産先端技術研究所、農業生物資源研究所、
社団法人農林水産先端技術研究所、農業生物資源研究所、
農業生物資源研究所

利用許諾

rights_url

http://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/rgp-gmap98/lic.html

運用開始年月日

publication_date
DOI

1998/1/17
10.14977/01.rgp_gmap98_genotype_data
国立研究開発法人 科学技術振興機構
Japan Science and Technology Agency (JST)publisher

RGP gmap98 - 遺伝子型データ
http://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/rgp-gmap98/data4.html

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5. 結果 (2/2)• ランディングページは、生命科学系データベースアーカイブのデータセットの「説明ページ」が適当であることを確認した。

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ランディングページの例 (ダウンロード)
データベース名データセット名

DOI

10.14977/01.rgp_gmap98_genotype_data

ランディングページのURL（データURL）

http://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/rgpgmap98/data-4.html
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ランディングページの例 (簡易検索)13© 2015NBDC/JST Licensed Under CC 表示 2.1 日本

ランディングページの例 (利用許諾)

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6. 課題と検討事項•

Suffixのデザインをどうするか。人間が可読なもの（データセットの名称を含むSuffix）にするか否か（シリアル番号）について検討中。
10.14977/01.rgp_gmap98_genotype_data
PrefixSuffix•JaLCのメタデータ項目の作成者および寄与者のそれぞれにどの情報を入力すべきか結論が出ていない。

•

データ更新時の新DOIの付与や新旧データの保管が必要になった場合へ対応が決まっていない。
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7. 本番登録の予定• 前述の課題を解決した時点で、登録を開始したい。

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