サイエンス
レビュー
ience
eview
地球規模生物多様性情報機構のデータを利用して行われた 1 年間の
研究の概要

2014

Global Biodiversity Information Facility

2

序文
今年度の「サイエンス・レビュー」は、程度の差こそあれ GBIF により利用可能となったデータに基づく研究が引き続き増加していることを示しています。今年度の選り抜きの論文に見られる興味深い特徴の 1 つは、
過去に起こった絶滅の原因を GBIF を介したデータを利用して特定したことです。特に、人間が影響を及ぼしたと考えられる絶滅（大型哺乳類）と影響を及ぼしていないと考えられる絶滅（マヨルカマウンテンゴート）を識別したのが注目に値します。これは、GBIF が現存の生物多様性だけでなく、既に絶滅した生物に関するデータも対象としていることを示しています。GBIF の対象範囲は空間と時間の両面で拡大していると言えるでしょう。
「サイエンス・レビュー」で要約された研究を閲覧する中で気にかかったのは、GBIF.org の利用者がGBIF 経由のデータに基づく豊富な研究を容易には見つけることができないという現状です。特定のデータセットを目的として GBIF のページを利用する際に、そのデータセットを用いた研究を確認することができたら素晴らしいと思いませんか。あるいは、地図を操作して GBIF 経由のデータに基づ
く研究の地理的分布を確認できたらどうでしょうか。GBIF や、より広範な科学者コミュニティの他の情報源は、データ自体を表示するのとまったく同様に研究成果を表示するツールを開発し、データのみならず知見を探求する方法を生み出すことはできないでしょうか。ますます多くの研究が蓄積されている中、このような構想を描くことができるでしょう。

ROD PAGE
GBIF 科学委員会委員長

GBIF 科学委員会 2014Roderic Page、委員長

副委員長
M a r kA r t u r o

C o s t e l l o

A r i ñ o

C o s s i

J e a n

G a n g l o

委員Elizabeth Arnaud Guy
Cochrane Kathy Willis

3サイエンス・レビューとはGBIF サイエンス・レビューは事務局の文献追跡プログ
ラムに基づくもので、GBIF の地球規模のインフラを介して利用された生物多様性に関するデータの研究利用と引用を把握するための進行中の取組みです。サイエンス・レビューの各号では、GBIF 経由のデータを多く利用した、その年の査読付き科学論文の一覧を取りまとめています。
この文献アーカイブは一層の充実をみせており、2014
年には 350 本の論文が追加されました。これらの文献
は、GBIF.org の関連する文脈で部分的に取り上げられています。事務局の会報である GBits や広報部の毎月更新されるスライド http://gbif. org/newsroom/uses の利用
も、1 年を通して注目に値するものでした。また 2008年から 2014 年の間の引用に関する一覧表は、http://
gbif.org/mendeley または http://www.mendeley.com/
groups/1068301/gbif-public-library からご覧いただけます。

GBIF が見落とした研究利用がありましたら、
comms@gbif.org まで引用情報をお伝えください。
サイエンス・レビューで使用した分類は、GBIF が支援する研究の主な対象領域を検索しやすくすることを意図していますが、中には当然複数のトピックにまたがる論文もあります。分かりやすくするために、このよ
うな論文はこのレビューでは単一の分類にのみ収録しました。著者の国籍情報は、著者情報で確認できる所
属機関の所在地に基づいています。紹介した論文の助成情報は、論文の謝辞を参照しました。
各セクションの冒頭で要約した例は、いくつかの主な研究成果に焦点を当てています。これらの研究は、GBIF の参加者と出版社のネットワークを介した無料およびオー
プンアクセス利用に促進されたものです。

目次
利用と傾向.................................................................................................................................................................. 4
侵入性外来種 ............................................................................................................................................................. 6
気候変動の影響 ....................................................................................................................................................... 13
種の保全と保護区 .................................................................................................................................................. 19
生物多様性と人間の健康 ..................................................................................................................................... 25
食糧、農業、生物燃料 .......................................................................................................................................... 26
生態系サービス ....................................................................................................................................................... 28
生物多様性科学の進歩 .......................................................................................................................................... 30
データ管理................................................................................................................................................................ 45
データ資料................................................................................................................................................................ 47
研究インフラとしての GBIF ................................................................................................................................ 48

4

利用と傾向
以下では、GBIF を介したデータの利用情報を視覚的に示しています。査読付き論文の発表数が毎年増加しているだけでなく、研究論文でデータを利用した著者の所属機関がある国、島嶼、領土の数も増加していることが分かります。それぞれの傾向からは、
GBIF のネットワークが生物分野に関連する科学研究に及ぼす影響が広がっていることが分かります。

GBIF 経由データを利用した査読付き論文の年間発表数

2014

229

2012
169

2011
148

2010
89

2009
2008

350

249

2013

52

100

200

300

CBD: GBIF 経由データの量は愛知目標 19 の達成へ向けた進捗を示す
地球規模生物多様性概況第 4 版（GBO-4）で、生物多様性条約（CBD）は、生物多様性に関する知見の共有に関する愛知目
標 19 達成に向けた進捗の主な指標として、
GBIF ネットワークを通じて利用されたデータ量を取り上げました。
生物多様性に関する情報を共有するためのシステム構築におけるこれまでの進捗は「軌道に乗っている」と評価される一方、GBO-4 ではデータ利用や意思決定に役立つ、より整備されたモデ
ルと技術に対していっそうの投資が必
要になることが強調されています。
詳細は www.cbd.int/gbo4

5

著者の国籍別の論文数

2014 年に発表された査読付き論文で GBIF
経由データを利用した
著者の国籍数114 アメリカ
45 イギリス

77

41 スペイン37 ドイツ32 オーストラリア
21 メキシコ
20 フランス • イタリア
19 ブラジル • オランダ • 南アフリカ
17 カナダ
16 アルゼンチン
14 ポルトガル • スイス
13 中国
10 ポーランド
9 コロンビア
8 インド • ノルウェー
7 ベルギー • スウェーデン
6 チェコ共和国 • ケニア • ニュージーランド • ロシア
5 デンマーク • エクアドル • フィンランド • ギリシャ
4 オーストリア
3 チリ • ハンガリー • イラン • パナマ • トルコ

2 コスタリカ • エチオピア • アイスランド • イスラエル • 日本 • ペルー • ルーマニア
セルビア • スロバキア
1 ベラルーシ • ボリビア • ブルネイ・ダルサラーム • ブルガリア • カメルーン • クロア
チア • エジプト・エストニア • フェロー諸島 • フランス領ポリネシア • インドネシア •コソボ • ルクセンブルグ• マラウイ • マレーシア • マルタ • モロッコ • ナミビア • ネパール • ニューカレドニア• ナイジェリア • パプアニューギニア • ルワンダ • シンガポー
ル • スーダン • チュニジア • ウガンダ ・ウルグアイ • イエメン
GBIF 地域

ニア

アジア

アフリカ

ヨーロッパ

ラテンアメリカ 北アメリカ

オセア

侵入種
asives6

侵入的移入種例
より、在来範囲および北アメリカにおいて「強力な予測能力を有した」結果が得られましたが、データの政治的ギャップから生じる
空間的な偏りの影響も強調されました。将来のモデル予測と環境管理における利用を改善するため、著者らは「これら顕著なデータの欠落が見られる領域（特にその欠落が政治的地図と一致する場合）に焦点を当てる」取組
みを奨励しています。
生態学的予測の改善

Bradley BA, Early R & Sorte CJB (2014) Space to invade?
Comparative range infilling and potential range of invasive
and native plants.（侵入するための空間とは。侵
入植物種と在来植物種の範囲埋塞および潜在的範囲の比較）Global Ecology and Biogeography.
doi:10.1111/geb.12275
著者の国籍: アメリカ、イギリス、ポルトガル、
スペイン
助成元: アメリカ国防総省、戦略的環境研究および開発プログラムHYDRILLA VERTICILLATA, CC BY-NC 2002, JON SULLIVANHTTPS://FLIC.KR/P/EHS8IN

地理的に偏ったデータが分布モデルに及ぼす影響を測定Barnes MA, Jerde CL, Wittmann ME et al. (2014) Geographic
selection bias of occurrence data influences transferability ofinvasive Hydrilla verticillata distribution models.（出現デー
タの地理的選択の偏りが侵入種 Hydrilla verticillata 分
布 モ デ ル の 移 動 性 に 及 ぼ す 影 響 ） Ecology and
Evolution. doi:10.1002/ece3.1120.
著者の国籍: アメリカ、中国、オーストラリア
助成元: アメリカ陸軍工兵隊; アメリカ海洋大気庁;
アメリカ魚類野生生物基金; アメリカ森林局; 自然保護協会（The Nature Conservancy）

種分布モデルでは在来種より非在来種の方が潜在的な範囲が非対称に狭いと予測されるという仮説を検証するため、アメリカにおける
13,575 種の在来種、固有種、外来種、侵入種の植物種の分布を比較することで、これらのグループの異なる範囲属性が生態学的予測にどのように影響し得るかが検討されました。
GBIF を「我々が対象とした種すべての地球規
模の分布データを一貫して提供しうる唯一のデータ源」としたうえで、論文では侵入種は予想される程度の範囲埋塞（range infilling）を達成していないとの結論が得られ、「アメリカに導入された植物には未だ侵入のための十分な空間がある」ことが指摘されました。

この研究では、水生植物 Hydrilla verticillata を対象として、出現データの地理空間的偏りが種分 迅速な警戒リストを用いた侵入種によるリスク
布モデルに及ぼす影響を評価しました。この種 の軽減
はもともと中央アジアとオーストラリアに生息 Faulkner KT, Robertson MP, Rouget M et al. (2014) A
していましたが、現在では「恐るべき地球規模 simple, rapid methodology for developing invasive speciesの侵入種」として中央アメリカおよび南アメリ watch lists.（侵入種の警戒リスト構築のための簡易かつ迅速な方法）Biological Conservation 179: 25-32.
カ、アフリカ、ヨーロッパ、ニュージーランド、
doi:10.1016/j. biocon.2014.08.014
および北アメリカの温暖地域の大部分で見られ著者の国籍: 南アフリカます。そのため、 GBIF の地球規模のネットワー 助成元: 南アフリカ環境省; DST-NRF 侵入生物学
クがこの種の研究に非常に貢献しました。
センター
GBIF.org などのデータ源からの 4,336 件の H.
verticillata の記録（在来範囲内で特定された
1,000 件以上を含む）から開始されたこの研究
では、さまざまな国および在来範囲内で無作為抽出されたサンプルから在来範囲のデータを除外するモデルが開発されました。これに潜在的な侵入的外来種を防ぐためのバイオ
セキュリティーの枠組みの開発は、資源の乏しい多くの国にとって非常に複雑で経費がかさむ可能性があります。南アフリカの研究者により、侵入を予測する 3 つの一貫した予測子（先例、環境の適合性、導入の取組み）に基づき種の警戒リスクを作成する、迅速でコスト効果の高い方法が提案されました。419 種の侵入種に関する GBIF 経
由のデータなどの情報源を利用した研究か
ら、この技術によって分類群を超えた主な脅威の初期評価を迅速かつ透明性を持って実施することができ、また大規模な資金や科学的投資がなくても、さまざまな国や地方の規模で適用できることが示されました。

7

Higgins SI & Richardson DM (2014) Invasive plants havebroader physiological niches.（侵入的植物種は生理学的生態的地位の幅が広い）Proceedings of the National
Academy of Sciences of the United States of America. 111(29):10610-10614. doi:10.1073/pnas.1406075111
著者の国籍 : ニュージーランド、南アフリカ
助成元: オタゴ大学; 科学技術部 – 国立研究財団

過去の侵入を調査することで、特定種の生理学的特性がその種の有する侵入可能性をどのように示し得るかが検証されました。経験に基づくハインドキャスト試験により、アカシ
アおよびユーカリの実地調査を行いました。
この 2 種グループの近縁種である 749 種は、本来の生育地であるオーストラリアからはるかに離れたところで見られます。
この研究では、2 グループに関する GBIF 経由の地球規模のデータを、成長率、呼吸、温度、土壌窒素などの生理学的および環境的変数で測定して、侵入の成功を決定する一連の特性に焦点を絞り、幅広い環境的状況における種の耐性が注目されました。

に関する GBIF 経由データに基づき地球規模のモデルを生成した後、ベルファストに拠点を置く著者らは、これらのデータをさまざまな人間および生理化学的変数の地域データと組み合わせ、洗練しました。このシンプルな方法によって地域の侵入予測は大幅に改善され、土地利用、栄養濃度、自然景観に関連する要素が明らかに重要であることが示されました。
問題のある植物のプロファイリング

Kuester A, Conner JK, Culley T et al. (2014) How weeds
emerge: a taxonomic and trait-based examination using
United States data.（雑草はどのように発生するのか: アメリカのデータを使った分類および特性に基づく評価）The New Phytologist 202(3):1055-68. doi:10.1111/nph.12698
著者の国籍: アメリカ
助成元: 国立科学財団

侵入性植物の研究に共通する比較枠組みの 1
つは、雑草として帰化し侵入種となる「連続体」の中に導入種を位置付けることです。この枠組みは有用ではあるものの、除草剤耐性という新しくコストのかかる問題に対応できません。この研究では、GBIF などのデータ源
注目に値するのは、モデル適合度の検証のため、 を利用することで、雑草性、侵入性、除草剤
オーストラリア外のアカシアとユーカリに関す 耐性を持つ「問題のある植物」の分類学的、
る GBIF の全記録からなる独立したデータセッ
生理学的および生化学的特性を超えてアメリ
トを用いて予測が行われた点です。これにより、 カで広範に見られるパターンを 探査しました。
ユーカリ記録の 95%、アカシア記録の 83%が正
この研究では代表的な科の多数種や少数種の確に予測されました。
調査にとどまらず、「理想的侵入種」の潜在地球規模でモデル化し、地域規模で洗練する的な多数の特徴を探りました。侵入的雑草種
Kelly R, Leach K, Cameron A et al. (2014) Combining global および「問題のない」導入された非雑草種のclimate and regional landscape models to improve
導入時間という単一の変数の調査では、アメprediction of invasion risk.（地球規模の気候モデルとリカの植物標本に関してすべて GBIF 経由の出
地域規模の景観モデルを組み合わせ、侵入リス
クの予測精度を高める）Diversity and Distributions 20(8): 現データが用いられました。その結果、特に繁殖能力が高く、農場に導入されて多くの場
884-894. doi:10.1111/ddi.12194
合除草剤耐性を持つことになり得る種につい著者の国籍: イギリスて、警戒が必要な植物の属と特性が特定され助成元: 自然遺産研究パートナーシップ（北アイルランド環境省 & クィーンズ大学ベルファス
ました。
ト）
地球規模の気候生態的地位モデルは、種分布と生息地の適合性の変化によって侵入種がもたらすリスクを予測するのに幅広く利用されています。しかしこうしたモデルは、侵入生物学におけるより細かい要因、例えば土地利用、地形、土壌および水化学などが果たす役割を見落とす可能性があります。その理由の一つとして、こうした特性に関する信頼性のある地球規模のデータの不足が挙げられます。
15 種（アイルランドに既に定着した 8 種と、7種の他のリスクの高い種）の非在来水生植物種

侵入種
asives侵入に成功する種の特性とは

侵入種
ves

8

「アカシア」の潜在的大量発生を管理
Li G, Xu G, Guo K et al. (2014) Mapping the Global
Potential Geographical Distribution of Black Locust(Robinia pseudoacacia L.) Using Herbarium Data and a
Maximum Entropy Model.（植物標本データと最大エントロピーモデルを用いたニセアカシア（Robinia pseudoacacia L.）の地球規模の潜在的地理的分布マッピング）Forests 5(11): 2773-2792.
doi:10.3390/ f5112773
著者の国籍: 中国
助成元: 中国国家自然科学基金, 高等教育博士課
程特別研究基金, 土壌および水保全研究所
北アメリカ東部在来種のニセアカシア（Robinia
pseudoacacia）は、過去 300 年間にわたり世界で幅広く導入されてきました。 R. pseudoacacia には著しい経済的および生態学的価値があります
が、ヨーロッパ、アジア、南太平洋の一部で制御不可能な侵入種となっていることを考慮するとその価値には著しいリスクが伴います。
ニセアカシア (ROBINIA PSEUDOACACIA], CC BY-SA 2015 HARUM.KOH
https://flic.kr/p/seQTyw

この研究では、主に 32,434 種の GBIF 経由の植物標本記録に基づき、ニセアカシアが現在占めている地域と潜在的に「侵入可能な分布」
地域をモデル化しました。得られた結果は、自然資源に関する意思決定者が、 R.
pseudoacacia への適切な対応として植林と侵入管理のどちらをどこで行うべきなのかを評価する際に役立つ可能性があります。
地球規模の侵入性と希少性の小規模な予測因子
Pandit MK, White SM & Pocock MJO (2014) The contrasting
effects of genome size, chromosome number and ploidy
level on plant invasiveness: a global analysis.（ゲノムサ
イズ、染色体数、倍数性レベルが植物の侵入性に及ぼす影響の比較: 地球規模の解析）The New
Phytologist 203(2): 697-703. doi:10.1111/nph.12799
著者の国籍: インド、イギリス
助成元: 自然環境研究会議
絶滅の危機に晒される植物もあれば、侵入種になる植物もあるのはなぜでしょうか。この研究では、遺伝的および細胞遺伝的特性（ゲノムサイズ、染色体数、染色体セット（倍数性レベル））を比較し、これらの変数を用いて熱帯地域から寒帯地域まで幅広く分布する
62 属 890 種の一連の顕花植物の相対的希少性
または侵入性を予測できるか検証しました。
GBIF 経由データを利用することで、侵入性はゲノムサイズと負の相関があり、染色体数および倍数性レベルと正の相関があるという結論が得られました。また同じデータから、こうした特性に緯度が及ぼす影響の並行調査も実現しました。その結果、緯度が高まるとともにゲノムサイズが直線的に増加することが示された一方で、緯度は侵入性または細胞遺伝的特性の差の説明においては重要ではないと考えられました。
侵入種と脅威に晒された種との間で予想される
対立
Rose JP & Todd BD (2014) Projecting Invasion Risk of
Non-Native Watersnakes (Nerodia fasciata and Nerodia
sipedon) in the Western United States.（アメリカ西部
における非在来水ヘビ（Nerodia fasciata およびNerodia sipedon）の侵入リスク予測）PLoS ONE
9[6): e100277. doi:10.1371/journal.pone.0100277

9Lithurgus huberi は、アメリカの非社会性ハチの中で旧世界産属を唯一代表しています。主アメリカ東部の 2 種の在来種（キタミズベヘにブラジルとアルゼンチンに生息し、その付ビ（ Nerodia fasciata ）とナンブミズベヘビ
近で広く分布しているものの、局所的には希（Nerodia sipedon ））は、近年北アメリカ西部
で繁殖能力のある個体群として定着しました。 少な外来種だと考えられています。最近の野外調査による新たな観察結果に基づき、この地域に多くある改変された淡水系にこれらの研究では、宿主の植物種の分布がこのスペシ捕食者がもたらすリスクを測定するため、こャリスト種のハチに及ぼし得る影響が評価さの研究では、脅威に晒された在来種との将来れました。調査に値する他の地域を特定する的対立を評価するという明確な意図のもと、だけでなく、この手法によりハチの分布に対2 種のヘビの北アメリカ西部における潜在的する（気候などの非生物的変数ではなくむし
分布がモデル化されました。
ろ）生物的変数の影響を測定することができ研究では、GBIF などの情報源からの 2 種のました。
Nerodia 種の出現記録が、侵入が予想される範囲を示す分布モデルに入力されました。次に、 L. huberi に花粉を提供することで知られる 7
その結果と、現在類似の生態的地位を占める潜 種の宿主植物モデルに GBIF 経由の出現データ
在的被食者および捕食者である在来種の既知の などを取り入れることによって、ハチと宿主の両者の大部分が一致していることが予測さ範囲とが比較されました。その結果、2 種の侵入種は共に、連邦および州の危惧種とされるヘ れました。これらの結果は、どのように生物
ビ、サンショウウオ、カエルなどカルフォルニ 的および非生物的要因が交差し、ハチの生態
ア州の水生在来種の数種に深刻な脅威をもたら 的地位を調整しているかを示していると考えす可能性があることがわかりました。さらに、 られる一方で、気候が大規模な種の分布を決
他の地域において在来種保護を担う当局が対応 定する主な変数であるという広く受け入れら策をとるうえで役立つよう、類似の侵入を評価 れた仮説も支持しています。
する体系的援用可能モデルを設計する試みが、詳細に述べられています。
侵入モデルの比較と対照

種の分布に対する生物的および非生物的影響
Silva DP, Gonzalez VH, Melo GAR et al. (2014) Seeking theflowers for the bees: Integrating biotic interactions into nichemodels to assess the distribution of the exotic bee
speciesLithurgus huberi in South America.（ハチのための花を探して: 南アメリカにおける外来ハチ種（Lithurgus huberi）の分布を評価するため生態的地位
モデルに生物的相互作用を組み込む）EcologicalModelling 273: 200-209. doi:10.1016/j.ecolmodel.2013.11.016
著者の国籍: ブラジル、アルゼンチン
助成元: ブラジル科学技術開発局 (CNPq); ホイットリー野生生物保護基金

Tingley R, Vallinoto M, Sequeira F & Kearney MR (2014)
Realized niche shift during a global biological invasion.
（地球規模の生物学的侵入により生じた生態的地位転移） Proceedings of the National Academy of
Sciences of the United States of America 111[28): 10233-8.
doi:10.1073/ pnas.1405766111
著者の国籍: オーストラリア、ブラジル、ポルトガ
ル
助成元: カナダ自然科学工学研究会議; Endeavour
International 社; シドニー大学; オーストラリア研究会
議; ヨーロッパ社会基金およびポルトガル教育科学
省; ブラジル科学技術開発局; ブラジル科学技術省;

欧州地域開発基金
侵入種の予測精度を改善するため、この研究では GBIF 経由のデータなどを用いてオオヒキガ

侵入種
asives

著者の国籍: アメリカ

エル（Rhinella marina）の世界規模の侵入を把握するための 2 モデルが比較されました。第一の生理学的および機構的モデルではカエルの特性が新しい環境に適応するかどうか（基本的生態的地位転移）が評価されました。一方、第二のモデルでは生物的条件および非生物的条件の影
響の組み合わせ（実現した生態的地位転移）を考慮し、カエルの在来個体群が制限される条件下において他の種が果たす役割に焦点を当てました。壊滅的な影響を受けているオーストラリ
アではこのような制限はありません。それぞれの生態的地位転移における動態をよりよく把握することで、侵入種管理戦略は改善されるでしょう。
オオヒキガエル (RHINELLA MARINUS] CC BY 2011, BRIANGRATWICKE https://flic.kr/p/ayvEys

侵入種

10

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著者の国籍: アメリカ, カナダ, フェロー諸島,
ノルウェー, アイスランド, スウェーデン, イギ
リス, スイス助成元: 国立科学財団; アメリカ魚
類野生生物局; アイスランド研究基金; アイスラ
ンド研究センターおよび農務省; ノルウェー研究
会議; スウェーデン環境研究会議, 農業科学および空間計画; カナダ国際極年プログラム; アーク
ティックネット; パークス・カナダ; 北方科学訓練プログラム; カナダ自然科学工学研究会議; ア
メリカ森林局; 国際熱帯林業研究所; プエルトリ
コ大学

気候変動の影響を予測するための 3 つの典型的な手法のそれぞれに制約があることは、よく認識されています。しかし、そのひとつひ
とつ（実験、モニタリング観測、いわゆる「空間－時間」置換）によって分析された先行研究は決して多くはありません。GBIF 経由
データを適用し、北アメリカおよびヨーロッ
パの 85 種の北極およびアルペン植物群集を構成している種の温暖な生態的地位のベースラインを決定することで、この国際的研究チ

ームは各手法の結果を体系的に比較しました。
研究者の評価によれば変化の全体的な傾向と方向性には一貫性がありますが、現在の生態学的システムのパターンに基づく推定ではそれらが過大評価されるという注目すべき傾向もまた確認されました。これは、実験的な温暖化と長期的なモニタリングが、影響を予測する最も正確な方法を提供し得ることを示しています。
高緯度 ≠ 低リスク
Gerick AA, Munshaw RG, Palen WJ et al.
(2014) Thermal physiology and species
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vulnerability of temperate amphibians.
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doi:10.1111/jbi.12261
著者の国籍: カナダ, アメリカ
助成元: カナダ自然科学工学研究会議; カナダリサーチチェアプログラム

比較的高緯度に生息する変温動物は、熱安全域（TSM）が広いかもしくは温度変化に対する耐性を備えているため、熱帯の変温動物よりも気候変動の影響を受けにくいという仮説が広く受け入れられてきました。

気候変動

14

しかし、北アメリカ北部の 3 種のカエル（Speaintermontana、Rana aurora、Pseudacris regilla）の生理学と分布に対する温度上昇の影響を詳細に調査することで、著者らはこの仮説とその証明に従来用いられていた分析手法を問い直しました。 太平洋コーラスガエル (PSEUDACRIS REGILLA). © 2013 STEVENJOHNSON

これらの分析から、極端な気温ではなく長期的な平均気温を利用した場合、両生類などの温度に依存して繁殖する種に対する将来的な気候の影響が過小評価される可能性があることが強調されました。さらに、GBIF 経由データなどを利用して予測した分布モデルでは、急速な温度変化がこれらの種の TSM を急激に低下させることを示しています。すなわち、曝露自体が致死的ではない場合でも、捕食によって個体生存率の低下につながり得ることが示唆されました。
これらすべてから、研究対象の全 3 種が、2050
年までにさらに深刻なリスクに晒される懸念の原因が強調されました。

イベリア植物相の短期予測 Heap MJ, Culham A, Lenoir

J et al. (2014) Can the Iberian Floristic Diversity WithstandNear-Future Climate Change? Open Journal of Ecology
04(17): 1089-1101. doi:10.4236/ oje.2014.417089
著者の国籍: イギリス, フランス, スペイン
世紀末の気候変動が種に及ぼす影響の予測には、データおよび排出シナリオの両方が長期的に不確かであるという問題が付きまといます。一方で、土地管理者や政策決定者は、いまこの瞬間に短期的意思決定を行う必要性に直面しています。

地理的に孤立したイベリア半島では、ヨーロッパの代表的な植物多様性が多くみられると考えられている。そのため、この研究では 3,267 種の半島植物種の GBIF 経由データを利用して脆弱な種とその生息地を特定し、既存の保護区（PA）ネットワークによって 2020 年まで植物相の多様性が効果的に保護されるかどうかを評価しました。
その結果、いくつかの重要な発見がなされました。第一に、短期間に限れば、既存の PA は北方の別の生息地の約 100 種を除き保全することができると考えられます。しかし、一方で「イベリア植物多様性の長期的見通しは不明確」だとされました。従来受け入れられていた考えとは反対に、種の範囲の移行は均一に極方および上方へ向かうわけではなく、地域の気候、地形、北方種への極端な負荷が、西方および東方への顕著な移動傾向に影響するでしょう。
熱帯アンデスのかけがえのない種を守る

Ramirez-Villegas J, Cuesta F, Devenish C et al. (2014).
Using species distributions models for designing
conservation strategies of Tropical Andean biodiversity
under climate change. Journal for Nature Conservation 22(5):391–404. doi:10.1016/j.jnc.2014.03.007
著者の国籍 : コロンビア, イギリス, エクアドル,
ペルー, カナダ
助成元: スペイン国際協力開発省; 山岳パートナー
シップおよびスイス開発協力省; CGIAR
熱帯アンデスは豊かな種多様性を有しており、その多くは地球上に類を見ません。しかし、資源の過剰利用、人口増加、将来的な気候変動によって、これらの地域の狭い範囲に分布する多くの固有種に非常に深刻な一連の脅威がもたらされています。
この論文では、以前 Warren ら(2013) (http://dx.doi.
org/10.1038/nclimate1887) が用いた GBIF 由来のデータが利用され、鳥類 1,555 種と維管束植物
9,457 種の生態的地位モデルが作成されました。
これは、潜在的な気候変動の影響を包括的に推定するためです。その結果得られたパターンは、
時間尺度と分散シナリオの違いによって大きな変化を示しましたが、予測される変化は依然として「極めて深刻」であり、鳥類よりも植物で絶滅リスクが高まるという結果が得られました。
またこの研究自体には含まれていないものの、
土地利用の変化による影響が予想されることが強調され、景観規模の状況、ネットワーク、開発戦略に焦点を当てた地域保全手法が提案され
ました。

15

気候変動

気候変動と生息地喪失: どちらがより深刻か

Riordan EC & Rundel PW (2014) Land Use Compounds
Habitat Losses under Projected Climate Change in a
Threatened California Ecosystem. PLoS ONE 9(1):e86487. doi:10.1371/journal.pone.0086487
著者の国籍: アメリカ
助成元: カルフォルニア大学ロサンゼルス校
基金
人間社会の拡大によって開発の負荷が既に深刻化している地域では、気候変動は、種多様性に関する第二の深刻な脅威を引き起こします。この研究では、多数の固有種や脅威にさらされた種を含む多様性に富む植物生息地であるカルフォルニア州において、開発と気候変動がセージ低木地の主な構成種 20 種に対してもたらした影響を調査しました。在来の範囲はカルフォルニア州の南西部および中西部
であり、これらの地域では密生した個体群の中心地周辺で土地利用が変化したために、すでに特有の沿岸低木地が元来の範囲の 10%まで減少しています。
GBIF 経由および植物標本データを利用することで、将来的な気候変動と土地利用のシナリ
オに基づく評価に関連するモデルが作成されました。その結果、沿岸のセージ低木における生息地喪失は、気候変動と同程度の規模の影響を及ぼすことが予想されました。このよ
うな様々な変化要因が互いに組み合わさることで負の影響が構成される可能性があるので、保全計画者と資源管理者は両方に対処することが重要であると強調されました。
大型哺乳類の絶滅: 誰が（何がではなく）引き起
こしたのか

Sandom C, Faurby S, Sandel B & Svenning J (2014)
Global late Quaternary megafauna extinctions linked tohumans, not climate change. Proceedings of the Royal
Society/Biological Sciences 281(1787). doi:10.1098/
rspb.2013.3254
著者の国籍: デンマーク
助成元: 15 Juni Fonden; 欧州研究会議
過去 130,000 年間に多数の大型哺乳類が各大陸から消滅しました。急速にして広範囲にわたる
この前例のない消滅の原因は依然謎のままです
が、気候変動と人口の拡大が主な原因だと考えられています。絶滅した 177 種もしくは大陸から消滅した哺乳類の GBIF 経由の出現データを部分的に用いて、この研究では、この大規模な第四紀の絶滅に関する「初の包括的かつ種レベルの詳細な地球規模の大型動物相の分析」の証拠が示されました。

パープルセージ (SALVIA LEUCOPHYLLA) は、気候変動と土地利用の両方の長期的影響に直面する沿岸セージ低木地を構成する 20 種の 1 つです。CC BY-NC 2003 ANITA GOULD HTTPS://FLIC.KR/P/RHPN

氷河期および間氷期の気候変動、さらに現代の人類および絶滅した人類と祖先の古生物地理学的拡
大を統合・比較することで、この研究は各地域を超えた種レベルの絶滅への相対的影響を評価しました。その結果、ホモ・サピエンスが初めてヒト亜科として現れた地域で均一的に多くの種の絶滅が見られたことから、現代の人類が他の大型哺乳類の絶滅に対して大きな影響を及ぼしたことが示されました。

16

気候変動

気候移行予測の長期的な地上テスト

Savage J & Vellend M (2014) Elevational shifts, biotic
homogenization and time lags in vegetation change during 40
years of climate warming. Ecography. doi:10.1111/ecog.01131
著者の国籍: カナダ
助成元: カナダ自然科学工学研究会議
植物の分布高度が上昇しているのは気候の影
響でしょうか。植物群集への影響を検証する
ため、この研究では、ケベック州南部の低山帯保護区に設置された半永久的植生プロット
で以前実施された調査を繰り返し、北アメリ
カ東部の GBIF 経由の出現記録を重ね合わせました。その結果、変化が比較的遅く、種の反応が予想よりも遅い可能性が示唆されたものの、40 年間の観測を通じて気候予測の主要素（高度分布への移行、生物多様性の変化、生物的均質化）が観測されました。
ヤギ糞の化石によるマヨルカヤギの絶滅のハイ
ンドキャスティング

Welker F, Duijm E, van der Gaag KJ et al. (2014)
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Myotragus balearicus. Quaternary Research 81(1): 106116. doi:10.1016/j.yqres.2013.10.006
著者の国籍: オランダ, スペイン
助成元: オランダ研究会議
4 千年から 5 千年前にかけて、地中海のマヨル
カ島に生息するドワーフマウンテンヤギのMyotragus balearicus の生存が確認されなくなりました。人類が同時期にその島に住むようになったことを考えると、この小型で移動の遅い固有種は、他の場所の大型哺乳類と同様、人間が住むようになった直後に絶滅するという運命を辿ったのだとする仮説が広まっています。
しかし、古代の DNA や花粉、大型化石、以前は多数生息していたものの現在では希少種である Buxus balearica に関する GBIF および
Naturalis 経由の標本データを利用して再構築した気候モデルを解析することで、この研究で導き出された結論はより複雑になり、解釈が難しくなりました。M. balearicus の糞の化石から、この動物が少なくとも季節的にはこの植物に依存していたことが示されました。この植物種はマヨルカ島の主な「古い」植物種として植生していましたが、降雨量の減少に伴い小規模な山岳個体群に戻りました。人間との接触や摩擦を除外することはできないものの、考古学的証拠の不足から、急速な植生変化が小型のマヨルカヤギの消滅を引き起こしたとは言えないまでも、その一因となった可能性が示唆されました。

ダイアナギンボシヒョウモンのメス (SPEYERIA DIANA), アメリカ
オクラホマ州ウォシタ国立森林 CC BY-NC 2015 GREG LASLEY
HTTP://INATURALIST.ORG/OBSERVATIONS/1651875

気候が蝶の減少における生活史の変化を引き起こす

Wells CN & Tonkyn DW (2014) Range collapse in the Diana
fritillary, Speyeria diana [Nymphalidae]. Insect Conservation
and Diversity 7(4): 365-380. doi:10.1111/icad.12059
著者の国籍: アメリカ
助成元: クレムゾン大学; サラ・ブラッドレイ・タ
イソン記念フェローシップ; ブルーリッジ・パー
クウェイ基金; アメリカ自然史博物館
ダイアナギンボシヒョウモン (Speyeria diana) は、
北アメリカに生息する大型の美しい蝶で、歴史的範囲においてますます希少になっています。この研究は、蝶の分布域がアメリカ南東部から移動していることに関する初の論文であり、その結果、ダイアナギンボシヒョウモ
ンはオランダ人探検家ピーター・クレイマー
が 1777 年に記録した大西洋海岸平野からは姿を消し、南アパラチアおよびアーカンソー
州・オクラホマ州の高地に別々の 2 個体群が存続するのみであることが明らかになりました。
GBIF 経由データなどの包括的な記録の蓄積を利用したこの分析から、この種が高地へ移動していること、またメスの飛行時期が早期化していることが示されました。このどちらも気候変動による影響の予測と一致しています。
しかし、低地でダイアナギンボシヒョウモンが見られなくなった理由ははっきりとはせず、南部の森林の消失や低木を好む鹿の増加、火災の発生様式の変化など多数の要因が考えら
れます。

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種の保全

Branchini S, Pensa F, Neri P et al. (2014) Using a citizen
science program to monitor coral reef biodiversity throughspace and time. Biodiversity and Conservation 24(2): 319336.
doi:10.100?/s10531-014-0810-?
著者の国籍 : イタリア
助成元: イタリア教育省, 大学および研究部; エジプ
ト・アラブ共和国観光省; エジプト観光局; イタリ
ア観光業協会; Settemari; 国際スキューバナイトロッ
クス安全性協会; TuttoTurismo; Neos; 水中生物プロジ
ェクト; プロジェクト啓発基金; Viaggio nel Blu および
ホリデーサービスダイビング局; イタリア環境、土地、海洋保護省

世界のサンゴ礁への脅威によって、豊かな海洋
生態系と重要な生態系サービスが危機に瀕しています。SCUBA 環境のための観光（STE）のよ
うな新しい研究プロジェクトは、サンゴ礁の生命をモニタリングするボランティアダイバーの情熱に以前にもまして助けられるようになっています。ダイバーは 4 年間にわたって紅海における海洋動物 72 種の観測データを収集し、レクリエーション調査プロトコルが検証されました。また STE により、相対的希少性を評価するために GBIF 経由の出現データが利用されました。
得られたデータからは、紅海北部のサンゴ礁の健全性または生物多様性の状況に著しい変化は見られなかったものの、保護戦略の違い
による傾向が示されました。さらに、ダイバ
ーの観測の分析から、臨時の非専門家であっても保全ボランティアと同じ精度で調査を実施できることが示され、エジプト観光省の環境管理政策において、こうしたモニタリング
プログラムによる貢献のコスト効果と信頼性が高いことが示唆されました。
ペルー保護区ネットワークにおけるギャップに対処する体系的手法
Fajardo J, Lessman J, Bonaccorso E et al. (2014)
Combined use of systematic conservation planning,
species distribution modelling, and connectivity analysis
reveals severe conservation gaps in a megadiverse
country [Peru). PLoS ONE 9(12): e11436?.
doi:10.13?1/journal. pone.011436?
著者の国籍: スペイン, エクアドル, アメリカ, イ
ギリス, ペルー
助成元: Santander Universidades; スペイン経済および競争力省; Universidad Tecnológica Indoamérica

エジプト紅海ハラヒリーフの 2 人のダイバー CC BY 2011 DEREK KEATSHTTPS://FLIC.KR/P/ALCBXD

20 世紀の保全は、保護区（PA）を選択する機会、意識、政治に依存していました。しかし、GIS と意思決定支援ツールの進歩によって、現在の難題を取り組みやすいものに変えつつあります。世界で最も生物多様性に富む国々で脅威が増す中、この研究は時宜を得ているといえるでしょう。
まずペルーの PA が現在同国のメガダイバシテ
ィをどの程度良好に保護しているかが調査され、主にアマゾン保全地に重点を置いていることが明らかとなりました。次に体系的な分析によって、いかによりよく代表的・効果的かつ接続性のある補完的ネットワークを拡大し、また優先するかが提示されました。2,869 種のペルーの動植物（部分的に GBIF 経由データを利用）分
布モデルに場所選択アルゴリズムを適用した後、ペルーアンデスおよび太平洋沿岸の主要地域保
全における深刻なギャップに対応しつつ最大限の接続性を達成する方法が求められました。

20

地球規模両生類評価の範囲地図の精度の検証

す。

種の保全

Ficetola GF, Rondinini C, Bonardi A et al. (2014) Habitat
availability for amphibians and extinction threat: a global
analysis. Diversity and Distributions 21: 302–311.
doi:10.1111/ddi.12296
著者の国籍: イタリア, フランス
助成元: ミラノビコッカ大学
IUCN が打ち立てた 2004 年世界両生類評価（GAA）のために作成された範囲地図は、現在それが自体画期的であり、脊椎動物の固有綱の分布情報に関する唯一の公式な地球規模の情報源です。保全のみならず生物地理学、生態学、進化学の研究でもますます幅広く利用されていることから、著者らは特に種の範囲の想定される端で、地図の誤差と精度の程度を評価および定量化することを試みました。
この研究では、GBIF 経由の 4,507 種の両生類種の記録およびより最近の精選された観測デー
タ（GBIF 経由データで補完）のみから作成された地図と GAA の地図を比較しました。この組み合わせによる分析から、GAA の範囲は相対的に精度が高いことが示されました。その一方、大陸規模サンプリングに偏りがあること、南アメリカおよび熱帯アジアで一層の投資とデータ活用が必要であることもまた強調されました。
レッサーパンダにおける一貫性・透明性のあるベースラインデータの作成,

Kandel K, Huettmann F, Suwal MK et al. (2014) Rapid
multi-nation distribution assessment of a charismaticconservation species using open access ensemble
model GIS predictions: Red panda (Ailurus fulgens) in the
Hindu-Kush Himalaya region. Biological Conservation 181:150161. doi:10.1016/j.biocon.2014.10.007
著者の国籍: ネパール, アメリカ, イギリス
助成元: 長尾自然環境財団, 日本; オレゴン動物園財団; ルフォード小規模助成基金; 絶滅危惧種のための人民基金; チェスター動物園; Idea Wild
レッサーパンダ（Ailurus fulgens）は、樹上に住む希少な哺乳類であり、ヒンドゥークシー・
ヒマラヤ地域（HKH）の人里から離れた地域に生息しています。竹の低木が密生する山岳地
帯の侵入不可能な森林に生息していることが多いため、このひっそりと暮らすカリスマ的な生物の研究は、一層困難なものとなっています。IUCN はすでに少ない個体群の減少が推定されることから、A. fulgens を「脆弱」とリスト化しています。しかしデータが比較的乏しいため、主にネパールの採食地の糞の 1,120の観測を含む新しいデータセット（およびGBIF.org を介するデータ）の価値が増していま

ネパールドバテ付近のレッサーパンダ (AILURUS FULGENS] CC BY-NC-ND
2014 MICHAEL BAMFORD HTTPS://FLIC.KR/P/Q62S5G

これらの種分布モデルは、レッサーパンダが最も生息していると考えられる地域を予測し、HKH の科学に基づく種および生息地
管理ベースラインデータを構築することを目指しています。データセットとモデリングのためのオープンアクセスの規約によって、どちらも将来の研究と評価において広く利用されるでしょう。
ギアナにおける生物多様性保全のための種の豊
富さの評価

McPherson TY (2014) Landscape scale species
distribution modeling across the Guiana Shield to inform
conservation decision making in Guyana. Biodiversity andConservation 23(8): 1931-1948. doi:10.1007/s10531-0140696-4
著者の国籍 : アメリカ

ギアナが直面する保全問題は、不十分かつ分散した生物多様性データ、国内の専門性と資金の制約、さらに資源開発と利用による経済的利益への可能性に対して高まる関心などで、南方の熱帯地域の国々に共通しています。しかし、26 億年の歴史を持つギアナ高地の他の国と同様、利用可能な科学的情報が不足していても、生物学的な豊かさが示されています。
この研究では、世界の自然史博物館と植物標本（GBIF をデータ源の 1 つとして利用）の標
本データが収集され、まず景観規模の 7 分類群に基づくグループの種の豊富さがモデル化されました。国の保護区ネットワークの構築に寄与するため、地図は 3 つの保全シナリオに適用されました。そのうち 2 つのシナリオ
はギアナの先住民の利害を代弁もしくは説明しており、また生物多様性に関して先住民が持つ伝統的知識は、未だ知られていないデー
タ源の大部分を成しています。

21

スペイン生物圏保護区に必要な種の情報源改善

PLATE 62, 出典 JOHN JAMES AUDUBON’S BIRDS OF AMERICA (1827)

この研究では、アンゴラの主な材木用樹木 18
種を特定した後、GBIF を介して公表された
62 コレクションの 2,253 標本記録が利用されました。樹木の生物地理学的パターンにおける重要な違いが明らかとなったことに加え、これらの結果から、特にカビンダのマヨンベ
森林を中心に植生する 11 種の保全をさらに優先する必要があることが示されました。

UNESCO 生物圏保護区（BR）は、生物多様性
保全と社会経済的開発の関係を改善する最良の手法と情報交換について学ぶ場としての役割を担っています。このプロジェクトでは、効果を検証するために、世界で 2 番目に大きな自然ポートフォリオを形成するスペインの
45 の BR のうち 34 カ所で脅威に晒された種および晒されていない種の主な情報源３つを評価しました。

リョコウバトの消滅に関する遡及的研究

は、脅威に晒されている淡水魚と両生類が、BR 独自の管理文書では最も反映されなかった点です。これは、複数の情報源（GBIF を含む）の利用によって保護区における種管理の科学的基盤が改善されうることを示しています。

この論文では、この最後の鳥の消滅の 100 年間における急速な減少と絶滅を、包括的な再構築と遡及的な IUCN レッドリストの評価によって描いています。GBIF 経由の標本記録は、リョコウバトの不規則な移動、生息地喪失、
営巣地の破壊を示す極めて詳細なモデルの中でも、繁殖生息地の部分に寄与しました。

Stanton JC. Present-day risk assessment would havepredicted the extinction of the passenger pigeon[Ectopistes migratorius). Biological Conservation 180: 1120. doi:10.1016/j.biocon.2014.09.023
著者の国籍: アメリカ

熟練の観察者であるジョン・ジェームズ・オ
ーデュボンは、1813 年、3 日間にわたってケ
ンタッキー州の空を覆ったリョコウバトの群れを素晴らしい表現で描きましたが、101 年
これらの分析の結果、情報は驚くほど部分的であることが明らかとなりました。管理文書、 後にはこれを相殺するかのように、Ectopistes
migratorius は説明のつかない悲劇的な絶滅をGBIF 経由データ、国家地図、レッドブックか迎えました。北アメリカで最も豊富だった鳥らは保護区ごとに異なる種リストが作成されはどのようにしてこんなにも急激に消滅した
たものの、組み合わされた情報源で挙げられのでしょうか。そして、絶滅を食い止めるたた 566 種のうち 3 つの情報源すべてに記載されめに何かできることはあったのでしょうか。
ていたのは 75.9%のみでした。最も懸念すべき

アンゴラの材木用樹木の保全評価

Romeiras MM, Figueira R, Duarte MC et al. Documenting
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herbarium records: a conservation perspective based onnative trees from Angola. PLoS ONE 9(7): e103403.
doi:10.1371/journal.pone.0103403
著者の国籍: ポルトガル, イギリス
助成元: ポルトガル科学技術財団
材木取引の国際化に伴い、一部の樹木種への負荷が増してきました。しかし、他の熱帯国と同様、アンゴラの商業的価値のある材木種に関するベースライン科学データが不足しているので、禁止令、規制、持続可能な伐採枠組みでは制御できない急速な過剰利用が起こるリスクがあります。
アフリカ南部で最大の面積を誇るこの国の広大な森林は、その大部分が政府に所有されていますが、最近実施された野外調査では、独立戦争と市民戦争のそれぞれに該当する植物学デー
タ間の 40 年にわたるギャップを埋めることができませんでした。
リョコウバト (ECTOPISTES MIGRATORIUS, 旧称 COLUMBA MIGRATORIA],

種の保全

Pino-Del-Carpio A, Ariño AH & Miranda R (2014) Dataexchange gaps in knowledge of biodiversity: implications forthe management and conservation of Biosphere Reserves.
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著者の国籍: スペイン
助成元: Association of Friends of the University ofNavarra22

種の保全

その結果、主な原因が数十年間の商業的な過ヨーロッパの最も保護された両生類は殺虫剤か剰伐採だったという大きな謎が解明されただ
ら守られているかけでなく、定期的にレッドリストを作成する
Wagner N, Rödder D, Brühl CA et al. (2014) Evaluating the
ことで、絶滅リスクの高まりを明らかにできrisk of pesticide exposure for amphibian species listed in
ることも示され、環境が急変する現代においAnnex II of the European Union Habitats Directive. Biologicalて種モニタリング戦略の重要性を示しました。 Conservation 176: 64-70. doi:10.1016/j.biocon.2014.05.014
著者の国籍: ドイツ
ケニアにおける公園の生物多様性保護の効果測
助成元: Deutsche Forschungsgemeinschaft
定1992 年、欧州連合の生息地指令は保護区のNatura 2000 ネットワークを EU の自然保護の柱として立ち上げました。同指令の附属書 II では、25 種の両生類などの掲載種のため特別保護区（SAC）の利用を指定しています。しかし、SAC に含まれる農場で除草剤や殺菌剤を定期利用しているため、あらゆる生活段階で19 世紀後半以降のケニアの哺乳類群集の科学
両生類が脅かされています。これは、両生類
的記述は、植民地時代の猛獣狩りの歴史的標本や第二次世界大戦後に設立された国立公園にお の表皮には透過性があり、他の動物よりも高ける近年の観測により豊富に保存されています。 い化学濃度を急速に吸収するためです。
この事例研究では、これらのデータ（多くはこの研究では、殺虫剤を定期使用している
GBIF 経由）を利用することで、保護区の生物
SAC の土地の割合を算出し、GBIF 経由データ
多様性保護に対する長期的影響を調査しました。
などの情報源を利用することで最も高いリス
この研究地域を含む 6 つの公園にわたって地クのある両生類のほぼすべてが十分に保護さ域の哺乳類群集における一部の種の置換と固れていることが明らかとなりました。しかし、有性の低下が詳述された一方、この分析によ
場所と国の規模を超えた曝露レベルに違いがり、これらの保護区で環境変化や人間の侵略見られ、SAC 管理計画で現在実施されているにも関わらず種の豊富さが維持されているこ両生類モニタリングに警告を与えるものと考とが示されました。
えられました。
Tóth AB, Lyons SK, & Behrensmeyer AK (2014) A Century of
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PLoS ONE 9(4): e93092. doi:10.1371/journal.pone.0093092 A
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RL, Machado RB et al.

Formulating conservation targets
for a gap analysis of endemic
lizards in a biodiversity hotspot

Biological Conservation
180: 1-10

doi:10.1016/j.
biocon.2014.09.016

Brazil, Australia

Stanton JC

Present-day risk assessment
would have predicted theextinction of the passenger
pigeon ( Ectopistes migratorius ]Biological Conservation
180: 11-20

doi:10.1016/j.
biocon.2014.09.023

United States

Tóth AB, Lyons SK,& Behrensmeyer AK

A Century of Change in Kenya’s
Mammal Communities: Increased
Richness and Decreased Uniquenessin Six Protected Areas

PLoS ONE 9(4]: e93092

doi:10.1371/journal.
pone.0093092

United States

Wagner N, Rödder
D, Brühl CA et al.

Evaluating the risk of pesticide
exposure for amphibian species
listed in Annex II of the European
Union Habitats Directive

Biological Conservation
176: 64-70

doi:10.1016/j.
biocon.2014.05.014

S pai nGermany

25

生物多様性と人間の健康例
エボラウイルス宿主動物の生態的地位のマッ
ピング Pigott DM, Golding N, Mylne A et al. (2014)2014 年、アフリカ西部で記録上最大規模であり、同地域では初となるエボラ感染症が蔓延しました。研究者の国際チームは、流行リスクが最も ウマヅラフルーツコウモリ (HYPSIGNATHUS MONSTROSUS) とその子
高い地域と国を特定することを試みました。ウ 供 CC BY-NC 2012 STEPHEN C SMITH HTTPS://FLIC.KR/P/BUNXGS
イルスの真の保有宿主は未だ明らかになってい既知の治癒の源は見落とされているのかませんが、コウモリがエボラや他の糸状ウイル
スのライフサイクルの中で重要な役割を果たし Amirkia V & Heinrich M (2014) Alkaloids as drug leads – Aているという疑いがあります。GBIF 経由の出現 predictive structural and biodiversity-based analysis.
データを利用したこの研究では、人間へのエボ Phytochemistry Letters 10: xlviii–liii. doi:10.1016/j.
ラ感染の保有宿主である疑いが最も高いウマヅ phytol.2014.06.015
著者の国籍 : イギリス
ラコウモリ（Hypsignathus monstrosus）、コクビ
ワフルーツコウモリ（Myonycteris torquata）、フ アルカロイドは現代の医学で過小評価されているのでしょうか。この研究では、既知のアルカランケオナシケンショウコウモリ（Epomops
franqueti）の 3 種の範囲がモデル化されました。 ロイドの植物源の GBIF 経由の出現記録を部分的に利用し、人間の治癒に 4,000 年以上の間用
これらのデータをこれまでの人獣共通感染症
いられてきた、アルカロイドに基づく新薬が激の位置データと組み合わせることで、人口計減した潜在的な理由を調査しました。
2200 万人に上る中央・西アフリカの 22 カ国にわたってリスクのある地域が特定されました。
この研究により、これらの発見がエボラ蔓延を監視する際の優先順位付けやリスクのある地域の診断能力を改善するのに役立つとして
います。

人間の健康

Mapping the zoonotic niche of Ebola virus disease in Africa.
eLife 3: e04395. doi:10.7554/eLife.04395
著者の国籍: イギリス, アメリカ, カナダ, スウェーデン
助成元 : オックスフォード大学; ビルおよびメリン
ダ・ゲイツ基金; 医学研究会議; バイオテクノロジー
および生物化学研究会議; ドイツ学術交換サービス;
アメリカ国立医学図書館; 欧州連合第７研究・技術
開発フレームワーク・プログラム; カナダ健康研究所; ウェルカム・トラスト; 科学技術局; フォガーテ
ィ国際センター; アレルギーおよび感染症国立研究所

AUTHORSTITLE

JOURNAL

DOI/URLAUTHOR COUNTRIES

Amirkia V & Heinrich M

Alkaloids as drug leads – A
predictive structural andbiodiversity-based analysis

Phytochemistry
Letters 10: xlviii–liii

doi: 10.1016/j.
phytol.2014.06.015

United Kingdom

Anza M, Haile E,
Tadesse S et al.

Aconiferyl alcohol derivative from theroots of Zanthoxylum chalybeum

Journal of Coastal Life
Medicine 2(12): 970-974

doi: 10.12980/
JCLM.2.201414J56

Ethiopa

Borokini TI

Okoubaka Aubrevillei (Pelleg& Norman): A Synthesis of
Existing Knowledge for
Research and Conservationin West and Central Africa

Journal of Biology andLife Science 6(1): 67-93

doi: 10.5296/
jbls.v6i1.6399

Nigeria

Capinha C, Rocha
J & Sousa CA

Macroclimate Determines the Global
Range Limit of Aedes aegypti

EcoHealth 11(3):420-428

doi: 10.1007/
s10393-014-0918-y

Portugal

Ding WX, Gu
JY, Cao L et al.

Traditional Chinese herbs as chemical
resource library for drug discovery ofanti-infective and anti-inflammatory

Journal of
Ethnopharmacology
155(1): 589-598

doi: 10.1016/j.
jep.2014.05.066

China

26

食糧、燃料、繊維

R COUNTRIESGrech-Baran M,
Sykłowska-Baranek
K & Pietrosiuk A

Biotechnological approaches toenhance salidroside, rosin and its
derivatives production in selected
Rhodiola spp. in vitro cultures

Phytochemistry Reviews

doi: 10.1007/s11101
014-9368-yPolandMonroe BP, Nakazawa
YJ, Reynolds MG et al.

Estimating the geographic
distribution of human Tanapox
and potential reservoirs using
ecological niche modelingInternational Journalof Health Geographics
13(1]: 34

doi: 10.1186/1476
072X-13-34

United States

Ondrejicka DA, Locke
SA, Morey K et al.

Status and prospects of DNA
barcoding in medically importantparasites and vectors

Trends in Parasitology30(12]: 582-591

doi: 10.1016/j.
pt.2014.09.003

CanadaPigott DM, Golding
N, Mylne A et al.

Mapping the zoonotic niche ofEbola virus disease in Africa

eLife 3: e04395

doi: 10.7554/
eLife.04395

United Kingdom, UnitedStates, Canada, Sweden

Samy AM, van deSande WWJ, Fahal
AH & Peterson AT

Mapping the potential risk ofmycetoma infection in Sudan
and South Sudan using
ecological niche modeling.

PLOS Neglected Tropical
Diseases 8(10]: e3250

doi:10.1371/journal.
pntd.0003250

United States, Egypt,
Netherlands, Sudan

Turi CE, Shipley
PR & Murch SJ

North American Artemisia species
from the subgenus Tridentatae(Sagebrush]: a phytochemical,
botanical and pharmacological review

Phytochemistry 98: 9-26

doi:10.1016/
j.phytochem.
2013.11.016

Canada

食糧、農林水産業、生物燃料
例
イギリスの漁業の収益性に対する気候影響の予測Jones MC, Dye SR, Pinnegar JK et al. (2014) Using scenarios
to project the changing profitability of fisheries under climatechange. Fish and Fisheries doi:10.1111/faf.12081
著者の国籍: カナダ, イギリス
助成元: イギリス環境、食糧、地域省; 日本財団; ナ
ショナル ジオグラフィック協会; カナダ自然科学工学研究会議; 欧州連合第７研究・技術開発フレーム
ワーク・プログラム; 自然環境研究会議

気候変動が海洋生物種分布の大規模な移行を引き起こすと予想される中、この研究ではイギリスの漁業への潜在的影響を調査するためいくつかのシナリオが検討されました。GBIF などの地
球規模のデータベースから種分布モデルの構築に必要な 31 種の魚類および脊椎動物の出現データを利用し、さらにこれらを関連付けることで費用対効果分析を行いました。
その結果、ヨーロピアンシーバスやイワシなどの数種は増加すると予測されたものの、海洋生産性、合計漁獲高および漁獲量、さらにそれに伴う漁業の収益性は今後低下することが示されました。この研究により、これらの影響が直接的に種分布または個体数の変化から生じるものであれ、間接的に操業経費の変化から生じるものであれ、予測される収入減少を最小化または食い止めるための最も効果的な手段として適応能力の向上と多様化が推奨されました。
メバジスジーのコーニッシュタウンを築いた富は、港を我が家とする小型漁船の成功から生まれました。PHOTO CC BY-SA
2014 LOCO STEVE HTTPS://FLIC.KR/P/OG3E1S

27

野生トウガラシの追跡
Kraft KH, Brown CH, Nabhan GP et al. (2014) Multiplelines of evidence for the origin of domesticated chili
pepper, Capsicum annuum, in Mexico. Proceedings of the
National Academy of Sciences of the United States ofAmerica 111(17):6165-70. doi:10.1073/pnas.1308933111
著者の国籍 : アメリカ, ケニア, メキシコ, フランス
助成元 : フルブライトプログラム; カルフォルニア

大学メキシコアメリカ研究所; カリフォルニア大学デービス校植物科学部

作物種の地理的起源と特徴を突き止めるためには、通常、澱粉や花粉粒などの古代の植物学的残存物の遺伝的および考古学的分析を組
み合わせます。現代の栽培化されたトウガラ
シの野生の起源を見出すため、この研究では、言語学的モデルおよび生態学的モデルを加えて手法を拡張しました。言語学的モデルでは北東および中東メキシコの原史時代の言語の作物に関連する語彙が再構築され、一方生態学的モデルでは、GBIF 経由データを利用することで約 6,000 年前の Capiscum annuum
var. glabriusculum の分布モデルが作成されました。
それぞれの分野から独立して得られた証拠は、若干異なる地域を示唆しましたが、トウガラシに近縁の野生種に人間が初めて関心を持ったのは従来考えられていたよりもはるかに南方だったという仮説を立てることで、メキシコの食糧
作物はメソアメリカの肥沃な三日月地帯を起源とすることが示されました。

食糧、燃料、繊維

bibliography

生態系サービス

28

Sánchez S, Gómez
E, Martín M et al.
AUTHORS

Experiments on the life cycle andfactors affecting reproduction of
TITLE
Sphaerosporella brunnea provide
evidence for rapid asexual
propagation by conidiospores andfor homothallism in an
ectomycorrhizal competitor ofcultivated truffle species

Shabani F, Kumar
L & Taylor S

Fungal Ecology 8: 59-65

Spain, Austria

JOURNAL

doi:10.1016/j.
funeco.2013.12.003
DOI/URL

Distribution of Date Palms
in the Middle East Based on
Future Climate Scenarios

Experimental Agriculture51(2]: 244-263.

doi:10.1017/
S001447971400026X

Austr ali a

Shabani F & Kumar L

Sensitivity Analysis of CLIMEXParameters in Modeling Potential
Distribution of Phoenix dactylifera L.

PLoS ONE 9(4]: e94867

doi:10.1371/journal.
pone.0094867

Austr ali a

Tendall DM, Hellweg
S, Pfister S et al.

Impacts of river water consumption
on aquatic biodiversity in life cycle
assessment--a proposed method,
and a case study for Europe

Environmental
Science & Technology
48(6]: 3236-44

doi:10.1021/
es4048686

Switzerland, Netherlands

Vanderplank S, Ezcurra
E, Delgadillo J et al.

Conservation challenges in athreatened hotspot: agriculture
and plant biodiversity losses in
Baja California, Mexico

Biodiversity andConservation: 23(9]:2173-2182

doi:10.1007/s10531014-0711-9

MexicoVolk GM, Chao
CT, Norelli J et al.

The vulnerability of US apple(Malus] genetic resources

Genetic Resources
and Crop Evolution

doi:10.1007/s10722014-0194-2

United States

Wang W, Tang
X, Zhu Q et al.

Predicting the impacts of climatechange on the potential
distribution of major native nonfood bioenergy plants in China

PLoS ONE 9(11]: e111587 doi:10.1371/journal.
pone.0111587

AUTHOR COUNTRIES

Chi na

生態系サービス
ヨーロッパにおける野生食糧の経済的価
値の算出
Schulp CJE, Thuiller W & Verburg PH (2014) Wild food inEurope: A synthesis of knowledge and data of terrestrial
wild food as an ecosystem service. Ecological Economics
105: 292–305. doi:10.1016/j.ecolecon.2014.06.018
著者の国籍: フランス, オランダ
助成元: ERA-Net; 欧州連合第７研究・技術開発フ
レームワーク・プログラム

野生食糧の採集と消費は、重要な文化的生態系サービスと認識されているものの、この提供の定量的測定は困難でした。この研究では、GBIF およびその他の情報源から野生食糧種のデータを総合し、出現密度や収集および狩猟データを利用することで、ヨーロッパで消費される野生動植物の価値の定量化とマッピングが行われました。

ストックホルム、タクシンゲ城南で販売される野生のコケモモ
CC BY-NC 2010 VILSESKOGEN HTTPS://FLIC.KR/P/8ZVJYJ

29

ベニン、ボヒコンの騒々しい市場 CC BY-NC-ND 2008
ADAM COHN HTTPS://
FLIC.KR/P/5R6DTW

西アフリカの薬用植物の脆弱性評価

bibliography
AUTHORSTITLE

JOURNAL

DOI/URLAUTHOR COUNTRIESConvertino M, MuñozCarpena R, Kiker GA et al.

Design of optimal ecosystemmonitoring networks: hotspot
detection and biodiversity patterns

Stochastic
Environmental Researchand Risk Assessment

doi: 10.1007/s00477
014-0999-8

United States

Nuutinen V, Butt KR,
Jauhiainen L et al.

Dew-worms in white nights:
High-latitude light constrains
earthworm ( Lumbricus terrestris )behaviour at the soil surface

Soil Biology andBiochemistry 72: 66-74

doi: 10.1016/j.
soilbio.2014.01.023

United Kingdom,
Finland, United States

Schulp CJE, Thuiller
W & Verburg PH

Wild food in Europe: A synthesis ofknowledge and data of terrestrial
wild food as an ecosystem service

Ecological Economics
105: 292–305.

doi:10.1016/j.
ecolecon.2014.06.018

France, Netherlands

Schulp CJE, Burkhard
B, Maes J et al.

Uncertainties in ecosystemservice maps: a comparisonon the European scale

PLoS ONE9(10): e109643

doi:10.1371/journal.
pone.0109643

Netherlands, Germany, Italy

Schulp CJE, Lautenbach
S & Verburg PH

Quantifying and mapping ecosystemservices: Demand and supply ofpollination in the European Union

Ecological Indicators
36: 131–141

doi:10.1016/j.
ecolind.2013.07.014

Netherlands, Germany

van Andel TR, Croft
S, van Loon EE et al.

Prioritizing West African medicinal
plants for conservation andsustainable extraction studies
based on market surveys andspecies distribution models

Biological Conservation
181: 173-181

doi:10.1016/j.
biocon.2014.11.015

Netherlands

生態系サービス

van Andel TR, Croft S, van Loon EE et al. (2014) Prioritizing
West African medicinal plants for conservation and sustainable
extraction studies based on market surveys and species
distribution models. Biological Conservation 181: 173-181.
doi:10.1016/j.biocon.2014.11.015
著者の国籍 : オランダ
助成元: オランダ科学研究機関

野生の薬用植物は、サハラ以南のアフリカの人々にとって健康および取引の重要な資源です。この研究は、ガーナとベニンの薬草市場の定量的調査を 12 種の商業的に抽出可能な薬用植物の初の詳細な分布地図（GBIF 経由デー
タを利用）と組み合わせることで、西アフリ
カの生態系の重要な供給サービスを守るため、過剰採取に対する種の潜在的脆弱性を評価し
ました。

30

生物多様性科学の進歩
examples
分布モデルから種の偏り除去するデータのサブ
サンプリング
Beck J, Böller M, Erhardt A et al. (2014)
Spatial bias in the GBIF database andits effect on modeling species’
geographic distributions. Ecological
Informatics 19: 10-15. doi:10.1016/j.
ecoinf.2013.11.002
著者の国籍: スイス
助成元: スイス国立科学基金

生物多様性科学

種の分布データにおける空間的偏りは、種の真の密度よりむしろ不均等なサンプリングや移動などの要因を反映したデータセットの記録密度から生じます。こうした不正確さの把握や考慮、除去は、研究および意思決定のための分布モデルを開発しそ
サルジニアナガレイモリ ( EUPROCTUS PLATYCEPHALUS ) CC BY-NC 2014 JAKOB H.
の適用を改善するうえで重要
HTTPS://FLIC.KR/P/NHKGOK
なステップです。
この研究では、ユーラシアの普通種の蝶であるコヒオドシ（Algais uriticae）の事例を用いることで、GBIF 経由データの空間的クラスタリングのモデル精度に及ぼす影響が調査されました。データが豊富で広く分布する種には、結果として得られるモデルの予測強度を損なうことなく空間的偏りを除去するサブ
サンプリングのルーチンが推奨・提案されました。
農園樹に必要な気候に関するオープンアクセ
スデータによる知見の改善
Booth TH (2014) Using biodiversity databases to verify andimprove descriptions of tree species climatic requirements.
Forest Ecology and Management 315: 95-102. doi:10.1016/
j.foreco.2013.12.028
著者の国籍 : オーストラリア
助成元: CSIRO

気候研究は在来種への影響に注目する傾向がありますが、気候変動は重要な商業種にとっても脅威となっています。オーストラリアのユーカリとアカシアは、90 カ国以上で植樹されており、この研究では、Atlas of Living
Australia と GBIF から利用可能なオープンアク
セスデータが気候要件についての既存の商業的林業情報をどのように改善しうるかが報告されました。

Eucalyptus nitens および E. botryoides（在来範囲内および外）の出現記録の詳細な分析により、森林管理者がこうしたデータを脆弱性の評価や適応戦略の計画に適用する方法が示されました。
ヨーロッパの爬虫類と両生類のマッピング
Creemers R, Denoël M, Campos J et al. (2014) Updated
distribution and biogeography of amphibians and reptilesof Europe. Amphibia-Reptilia 35(1): 1-31.
doi:10.1163/15685381-00002935
著者の国籍: ポルトガル, イタリア, オランダ, フラ
ンス, セルビア, ベルギー, ロシア, ギリシャ, スペイ
ン, ドイツ
助成元: Societas Europaea Herpetologica; Fundação para aCiência e Tecnologia（ポルトガル）; スペイン環境省;
セルビア共和国教育省科学開発部; Fonds de laRecherches Scientifique（ベルギー）; Generalitat deCatalunya（スペイン; Alexander von Humboldt
Foundation

Societas Europaea Herpetologica のヨーロッパにおける両生類および爬虫類地図（The Atlas ofAmphibians and Reptiles in Europe）のために開発された種分布地図は、非常に使いやすく、この研究で初めて公開されました。しかし、1997 年以降 GIS や計算能力の発展、出現デー
タの蓄積に伴い、科学的状況は大きく変わり、同時に分類学に関する理解の向上にも寄与してきました。

31

GBIF.org などの情報源から現在利用可能なデー
タで更新したところ、新たな地図では 218 の分類群（両生類 73 および爬虫類 145）の地図が更新され、また European herpetofauna データのために相互的かつ動的なオンラインシステム構築に向けた取組みが進められました。これに伴う分析では、今後の調査研究の主な領域を絞るため、種の豊富さと固有性のパターン、さらに主要な空間的・分類的ギャップを特定する試みがなされました。
両生類の利用可能な生息地の推定

Ficetola GF, Rondinin C, Bonnardi A et al. (2014) Habitat
availability for amphibians and extinction threat: a global
analysis. Diversity and Distributions 21: 302-311.
doi:10.1111/ddi.12296
著者の国籍: イタリア, フランス
助成元: ミラノビコッカ大学

ンプリングの偏りを修正する 5 つの提案された方法を検証し、「架空」および実際の種の記録を用いることで（後者はホワイトスポットスラ
イミーサラマンダー（Plethodon cylindraceus）に関する GBIF 経由データを含む）、モデル精度が幅広い条件下で比較されました。
修正方法の選択では、偏りの種類と程度が重要であることが示されたうえ、記録の体系的なサンプリングにより、最良かつ最も一貫性のある機能モデルが作成されることが明らかとなりました。さらに、最も効果的な結果や今後の研究における主な領域が提示されました。
種構成の主な決定要因を明らかにするマルチスケー
ル解析

種分布モデルからサンプリングの偏りを除去する
方法の比較

Fourcade Y, Engler JO, Rödder D et al. (2014) Mapping
Species Distributions with MAXENT Using a Geographically
Biased Sample of Presence Data: A Performance
Assessment of Methods for Correcting Sampling Bias. PLoS
ONE 9(5): e97122. doi:10.1371/journal.pone.0097122
著者の国籍: フランス, ドイツ
助成元: Plan Loire Grandeur Nature; 欧州地域開発基金; ドイツ連邦環境財団
種分布モデリング（SDM）は特定の種が生息する可能性の最も高い地域を推定する保全科学と実践で幅広く利用されているものの、未だ元データの偏りに起因する誤差の影響を受けやすいという欠点があります。この研究は、SDM のサ

ヤドリギの行く末の決定

Lira-Noriega A & Peterson AT (2014) Range-wide
ecological niche comparisons of parasite, hosts anddispersers in a vector-borne plant parasite system. Journal of
Biogeography doi:10.1111/jbi.12302
著者の国籍: アメリカ
助成元: カンザス大学; Consejo Nacional de Ciencia yTecnologıa, Mexico; GBIF 若手研究者賞
寄生虫、宿主、ベクターの生態学的動態を形成する気候要因については、あまり解明されていません。

生物多様性科学science

Kent R, Bar-Massada A & Carmel Y (2014) Bird andmammal species composition in distinct geographic regions
and their relationships with environmental factors across
両生類は世界で最も危機に瀕した動物の１綱で multiple spatial scales. Ecology and evolution 4(10): 1963-71l.
あり、生息地の減少と劣化はかつてないほどの doi:10.1002/ece3.1072
脅威となっています。この認識にもかかわらず、 著者の国籍: イギリス, イスラエル
生息地の利用可能性の定量的評価は、ごく一部 助成元: イスラエル科学基金; イスラエル科学技術省の種に関して実施されたのみです。
地球規模の種構成パターンを決める環境要因
この論文では、GBIF および Ficetola ら（p.20 参とは一体何でしょうか。この研究では、オー照）の解析で利用されたその他の情報源を再利 ストラリアやアメリカ大陸にまたがる哺乳類
用することで、両生類の生息可能地に関する初 の分布と鳥類の繁殖分布の比較マルチスカラの地球規模の評価が作成されました。近年の高 ー分析によってその答えを探りました。
精度のデータセットを 2004 年地球規模両生類評価の土地被覆、高度、種範囲の地図と組み合 1,376 種の鳥類（オーストラリア 572 種/アメリわせた結果、5,363 種の両生類の分布がより正カ 804 種）および 655 種の哺乳類（オーストラ
確に予測できる推論的好適生息地モデルが得ら リア 371 種/アメリカ 284 種）に関する GBIF 経れました。この手法では、好適および非好適な 由の記録を利用し、大陸規模の分析を 10 km 2 か生息地を定義することで専門家による 3 次元地 ら 10,000 km 2 の範囲でグリッドセルを体系的に図がより洗練され、「粗削りながら強力な」評 拡大することで、綱の分布への環境要因の影響
価が提供されます。さらに、データ不足の地域 の調査を行いました。その結果、継続的な逆効で大幅な優先順位が定められ、生息地要件のよ 果が見られたものの、気候および土地利用/土り詳細な研究の必要性が強調されました。
地被覆があらゆる規模で種構成の変異を最もよく説明しうることが明らかとなりました。

32

reveal ancient evolutionary history: the Case of Hypericum[Hypericaceae). Systematic Biology 64(2): 215-232.
doi:10.1093/sysbio/syu088
著者の国籍 : スペイン, フランス, アメリカ, イギリス
助成元: スペイン科学省

砂漠ヤドリギ (PHORADENDRON CALIFORNICUM], カルフォルニア
コーチェラ・バレー CC BY-SA 2008 JOE DECRUYENAEREHTTPS://FLIC.KR/P/4MWQEV

この研究では、砂漠ヤドリギ（ Phoradendron
californicum ）の分布が、ソノラ砂漠とモハベ砂漠に固有の生態的地位、寄生する樹木種の生態的地位、種子を分散する鳥類の生態的地
位のいずれに依存しているかを分析しました。

生物多様性科学

この研究では、寄生虫、8 種の普通種の宿主（GBIF 経由記録を利用）、10 種の普通種の鳥類分散者の重複量がモデル化・比較され、その結果、ヤドリギが好適で利用可能な地域
内でのみ宿主種に寄生することを支持する幅
広い証拠を見出しました。
資本、能力、自然遺産に関する国家バラン
スシートの評価

Lira-Noriega A & Soberón J (2014) The relationship among
biodiversity, governance, wealth, and scientific capacity ata country level: Disaggregation and prioritization. Ambio.
doi:10.1007/s13280-014-0581-0
著者の国籍: アメリカ
助成元: JRS 生物多様性財団
この研究は 200 以上の国および領土における生物多様性の豊富さ、経済力、制度面での能力の関係を調査したもので、科学的能力の指標の一部として GBIF を活用した多数の記録が使用されました。得られた全体像は単純なものではなく、経済力と能力のパターンは従来考えられていたものとは矛盾する複雑なパターンを示しました。著者らは、分析や科学政策のために未だ利用することのできない主要な生物多様性データ（デジタル化の有無は問わない）へのアクセス改善にむけて協力を奨励しています。
バック・トゥ・ザ・フューチャー: 化石記録を種分
布モデリングに組み込む

Meseguer AS, Lobo JM, Ree R et al. (2014) Integrating
Fossils, Phylogenies, and Niche Models into Biogeography to

祖先種の範囲を探る研究では、化石と現在の観察の両方が利用されますが、こうした再構築の背後にある仮定は不確かさを伴います。その理由としては、歴史的絶滅率の変動性が高いので、重要でありながら観察できない科学的証拠が失われることがあげられます。この研究では、大規模かつよく知られた植物属と新たに利用可能となった地球規模の古気候モデルを利用して、オトギリソウ、セント・ジョーンズ・ワートの再構築された歴史における生態学的および気候情報に化石記録を関連付けました。GBIF 経由の現存種の出現データによって、主な分散経路
や障害、さらに近年の長期気候サイクルによるユーラシアでの高い絶滅率が特定できました。
花粉はアンデスの影響の制限を示す

Palazzesi, L, Barreda, VD, Cuitiño, JI et al. (2014) Fossil
pollen records indicate that Patagonian desertification was
not solely a consequence of Andean uplift. Nature
Communications 5:3558. doi:10.1038/ncomms4558
著者の国籍 : アルゼンチン, イギリス, ブラジル
助成元: Agencia Nacional de Promoción Científica yTecnológica; Consejo Nacional de Investigaciones
Científicas y Técnicas
パタゴニアの過酷で乾燥した草原は、明らかに、1400 万年前から 1200 万年前の南アンデスの隆起によって生じた雨蔭により生成したと考えられます。しかし、植物の種の豊富さに関するこの研究は、パタゴニア東部の浅海堆積物の化石胞子と花粉粒に基づき、過去にはより動的であった可能性を示唆しています。
GBIF 経由の最近縁種の記録を用いたところ、
気候感度の高い植物近縁種により、熱帯雨林のシダおよび裸子植物がより以前に出現していたことが示されました。過去 600 万年間にこの地域から熱帯植物および湿潤地帯植物が消滅したことが示すのは、アンデスの隆起は砂漠化を開始したにすぎず、その後の気候変動によって砂漠化が促進されたという別のシナリオを示しています。
新熱帯区のシタバチ—連続体か別個体か

Silva DP, Vilela B, De Marco P & Nemésio A (2014) Using
Ecological Niche Models and Niche Analyses to UnderstandSpeciation Patterns: The Case of Sister Neotropical Orchid
Bees. PLoS ONE 9(11): e113246. doi:10.1371/journal.
pone.0113246

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著者の国籍: ブラジル
助成元: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e

遺伝子または生態はヘビを区分するか

Tarroso P, Pereira RJ, Martínez-Freiría F et al. (2014)
Hybridization at an ecotone: ecological and genetic barriers
between three Iberian vipers. Molecular Ecology 23(5):1108-23. doi:10.1111/mec.12671
アマゾンおよび大西洋の森林では、過去 2300
万年の間、拡大と縮小の交互のサイクルが繰り 著者の国籍: ポルトガル
返されてきました。これらのプロセスによって、 助成元: Fundação para a Ciência e Tecnologia; 欧州地
域開発基金
シタバチ属 Eulaema および Eufriesea のいくつか
Tecnológico [CNPq); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pe
soal de Ensino Superior (CAPES)

9 種の毒ヘビに関する GBIF.org などの情報源のデータを利用した生態的地位モデルが構築され、さらにモデルの中心からの距離が環境的
好適性、潜在的個体数、そして事故リスクの尺度として適用されました。予測結果は対象
種によって異なるものの、この手法はさらに幅広く一般的に適用可能で、ヘビ個体群の密度推定とも組み合わせられることが示されました。

教会の壁のムカデ綱 (CHILOPODA], ポリギロス北東 CC BY 2015 LUC T.
HTTPS://FLIC.KR/P/UJULPY

生物多様性科学の下位個体群が孤立し、同じ種の別の個体群と 地中海とヨーロッパ-シベリア生物地域の間の考えるべきか、それとも別の種と考えるべきか
移行帯に位置する北スペインのエブロ高地地という意見の不一致が生じています。GBIF.org
域では、「姉妹」種である Vipera aspis と V.
およびその他の情報源のデータにより生態学的 latastei、および遺伝的に異なる V. seoanei の 3
生態的地位モデルを構築することで、このブラ 種の毒ヘビの生息範囲が重なっています。こジルの研究チームはハチが現在生息する環境のの「3 種の接触地帯」では異種交配も決してま重複を測定しました。差異の比較により、今後 れではありません。この研究では、種の境界の研究のための主な新領域が特定されると共に、 を形成する過程を調査する独自の基盤を構築
2 個体群間における分類の分割が支持されまししました。
た。
GBIF.org などの情報源のデータを利用した分布
ヨーロッパにおける多様性の痕跡の研究
モデルと野外標本の遺伝子分析を組み合わせ
Simaiakis SM & Strona G (2014) Patterns and processes in ることで、繁殖力のある雑種が存在していて
the distribution of European centipedes (Chilopoda).
も生態学的境界によって各種にとって好適な
Journal of Biogeography 42[6]: 1018-1028.
生息地が明確になっているので、種の区別を
doi:10.1111/jbi.12463 著者の国籍: ギリシャ
効果的に維持しているという結果が示されました。
ムカデ類には過去数億年にわたる世界規模の歴史と重要な生態系機能があるにも関わらず、 毒ヘビによる咬傷のリスク推定への生態的地位モ
その科学的解明はあまり進んでいません。こ
デルの適用の研究では、GBIF 経由データなどを利用する
Yañez-Arenas C, Peterson AT, Mokondoko P et al. (2014) The
ことで、ヨーロッパのムカデ綱 585 種の主な
Use of Ecological Niche Modeling to Infer Potential Risk Areas
パターンとプロセスが特徴付けられました。
of Snakebite in the Mexican State of Veracruz. PLoS ONE 9(6):
これにより、同地域に 4 カ所の生物地理学的e100957. doi:10.1371/journal.pone.0100957
区分が存在することが明らかになりました。
著者の国籍: メキシコ, アメリカ
これにはバルカン半島の潜在的な土壌無脊椎
助成元: CONACYT
動物のホットスポットが含まれ、この場所が熱帯地方では毒ヘビに咬まれることによる人間
近年の更新世氷河のからの小規模な避難所での死亡と病気は、世界保健機関が「顧みられなあった可能性が示唆されました。
い熱帯病」と分類するほど頻繁に起きています。
この研究が焦点を当てているのは、21 種の毒ヘビが生息し、毒ヘビによる咬傷率がメキシコ
で 2 番目に高いベラクルス州の分析です。毒ヘビの好適生息地の推定が信頼できるリスク予測
として信頼できるかどうかが検証されました。

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例
データの品質と整理を合理化するツール

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著者の国籍 : イタリア
助成金: 欧州連合第７研究・技術開発フレームワ
ーク・プログラムSingh G & de By RA (2015) Spatial Extent Models for Natural
Language Phrases Involving Directional Containment.
Transactions in GIS 19: 202–224. doi:10.1111/tgis.12105
著者の国籍: オランダ

この研究では、D4Science データインフラスト
ラクチャ（GBIF、OBIS、およびその他の情報源
からの種の出現データの取得と作成を支援）によって開発された一連のツールが紹介されました。これらのツールの目的は、研究者がデータの質を評価し整理するのに必要とする時間を短縮することです。

GBIF 経由の地理コードが付けられていない記録は数百万件にのぼり、「中央北部カルフォ
ルニア」といった地名辞典形式の地名に空間的な一帯を割り当てる事例が激増しています。
この研究では、「ブラジル鳥類ガイド」（Ornithological Gazetteer of Brazil）(Paynter andTraylor 1991) 上下巻を用いて、一貫性があり推奨される手法を見出すべく、複数の自然言語
表現の空間的な解釈が比較・検証されました。

複雑なモデルより重要であるクリーンな地球
規模データデジタル化済みコレクションによる標本データの地理参照の改善

García-Roselló E, Guisande C, Manjarrés-Hernández A etal. (2014) Can we derive macroecological patterns fromprimary Global Biodiversity Information Facility data?
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著者の国籍: スペイン, コロンビア, アメリ
カ
助成元: ENDESA

Van Erp M, Hensel R, Ceolin D & van der Meij M (2014)
Georeferencing Animal Specimen Datasets. Transactions in
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著者の国籍 : オランダ
助成元: 欧州連合第７研究・技術開発フレームワ
ーク・プログラムデータ管理

この研究では、地球規模のモデルにおけるデータサンプリングの偏りと質の影響による問題を把握するため、利用可能なすべての海洋にのみ生息する魚類種の GBIF 経由データを用いて、一般的な 4 つの手法が比較されました。その結果、研究者により元のデータをクリーン化し、自己相関のために修正し、種の豊富さの明らかな過小評価を考慮すると、正確に分布を予測するためには、データの量と質を改善する作業の方が洗練された数理モデルの開発よりも重要である可能性が高いことが示されました。

地理的な正確性の欠如は、歴史的な自然史コレ
クションを公表する取り組みにおいて主要な課
題となっています。この研究では、この課題に対するオランダの Naturalis の一貫した手法が詳
細に紹介されています。Naturalis により「町/都市」、「県/州」、「座標」といった、フィールドに必要な情報が収集者の標本カードでは構造化されてはいるものの十分に説明されていないというレガシーデータの課題が解決されました。その手法の中心となったのは、既存のGBIF 経由出現データを提案された地理参照の
質と精度を改善するドメイン固有の知識基盤として利用することで、場所の特定のない記録を大幅に削減することでした。

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データ管理

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ZooKeys 451: 49-60

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研究インフラ

48

研究インフラストラクチャとしての GBIF
今年度の 科学レビュー の最後では、GBIF を介して利用および提供されたデータの適用ではなく、データおよび研究インフラストラクチャとしての GBIF ネットワークの要素を記述もしくは比較した査読付き論文が取り上げられま す。これまでの「GBIF に関する」論文では、新しい生物多様性研究基盤の将来を見据えた計画に焦点を当てる傾向にありましたが、現在では生物学やその他の科学者や研究者が標準、ツール、データモデル、またはワークフロー
を開発する際、GBIF の提供する事例を頻繁に取り上げる傾向にあります。また同時に、課題への対処法を検討し、ビッグデータの時代において関連する先例を探ります。

例
生態学的モデルのためのオープンアクセスモデ
ルへ向けて
Bonet FJ, Pérez-Pérez R, Benito BM et al. (2014)
Documenting, storing, and executing models in Ecology: A
conceptual framework and real implementation in a globalchange monitoring program. Environmental Modelling &Software 52: 192-199. doi:10.1016/j.envsoft.2013.10.027 著
者の国籍 : スペイン
助成元: アンダルシア地域政府

モデリングとデータ処理は、生態学的研究になくてはならないものとなっていますが、こうした作業の記述、蓄積、操作に関する最良の手法および分析手順に関する手引きはあま
りありません。スペイン人の著者らにより、シエラネバダ地域における環境モニタリング
プログラムで使用されたワークフローベース
ツールである ModeleR が説明されました。
GBIF でモデル化されたデータ公表にオープン
アクセスの手法を適用して、他の研究者も共有から実行までできるようにリポジトリの関連付けと統合することで、ツールの協働的機能を拡張することが提案されました。
オープンアクセスデータを通じた長期的な研究価値の向上Costello MJ, Appeltans W, Bailly N et al. (2013) Strategies
for the sustainability of online open-access biodiversity
databases. Biological Conservation 173:155-165.
doi:10.1016/j.biocon.2013.07.042
著者の国籍: ニュージーランド, ベルギー, ドイツ,
オランダ, フィリピン, アメリカ, イギリス
助成元: 欧州連合第７研究・技術開発フレームワ
ーク・プログラムこの研究では、多額な研究助成金の下で収集された生物多様性データについて、「プロジェクト助成が終了した際に停滞することが多い」ことに注意を促し、協働的データインフ
ラが研究の価値を維持するために果たし得る

重要な役割を探りました。大規模な地球規模のデータベースで実現する固有の科学的洞察は台頭したばかりであり、科学および学術コミュ
ニティとその後援者は、オープンアクセスの取り組みに寄与することの学術的および科学的価
値を十分に認識する必要があるとしています。
ロシアの生物多様性データを統合する
国家的利益の説明
Ivanova NV & Shashkov MP (2014) Approaches toDevelopment of Common Information Resource on Species
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http://www.matbio.org/article.php?journ_id=18&id=199&lang=eng
著者の国籍: ロシア

著者らは GBIF ネットワークをロシア人に紹介し、GBIF のコミュニティ標準が国家レベルで生物多様性データを集積および統合するロシ
ア生物多様性データベースの構築にどのように役立つ可能性があるかを示しました。

仮想標本集の比較
Jones T, Baxter D, Hagedorn G et al. (2014) Trends inaccess of plant biodiversity data revealed by Google
Analytics. Biodiversity Data Journal 2: e1558. doi:10.3897/
BDJ.2.e1558
著者の国籍: アメリカ, ドイツ, オーストラリア

この研究では、Google アナリティクスを用いて GBIF.org を含む 15 の異なるオンラインリソースが提供する植物の生物多様性データのデジタル世界における存在性が分析されました。
この分析から得られた知見は、有用性、デザイン、今後の生物多様性情報科学における発展の可能性に関する指標と共に、比較統計を提供しています。

49

種と生物多様性に関して地球規模の情報における科学的評価

統合型公表ツールキットを通じた生物多様性データセットの公表と共有

Pimm SL, Jenkins CN, Abell R et al. (2014) The biodiversityof species and their rates of extinction, distribution, andprotection. Science 344(6187): 1246752-1246752.
doi:10.1126/science.1246752
著者の国籍: アメリカ, スイス, ブラジル, イギリス
助成元: CAPES—Ciência Sem Fronteiras

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この研究チームは、生物多様性および生態系
サービスに関する政府間科学政策プラットフ
ォーム（IPBES）によって近日行われる評価に寄与するため、絶滅率、分布、保護に着目し、種の情報（および認識された情報の不足）を批判的に吟味しました。GBIF ネット
ワークなどの新しい地球規模のデータソー
スを介して生物多様性情報が著しく拡大していることを取り上げ、種の絶滅率の推定
分析と更新におけるこれらのデータベースの役割を強調しました。著者らは種の絶滅
率は自然の背景絶滅率よりも 1,000 倍高いという仮説を立てましたが、これでもまだ過小評価されている可能性があると指摘しました。

bibliography

著者の国籍: デンマーク, アメリカ, ベルギー

GBIF 事務局の開発者は、アメリカの VertNET とベルギーの INBO のパートナーと協力し、統合型公表ツールキット（IPT）ソフトウェアの特徴と機能を説明しました。IPT を起ち上げる必要性とその作成および継続的な進歩、生物多様性研究コミュニティとデータ公表への影響について概説しています。

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研究インフラAUTHORS

GBIF 事務局

広報チーム

Universitetsparken 15
DK-2100 Copenhagen Ø
Denmark

SAMPREETHI AIPANJIGULYKYLE AARON COPAS
TIM HIRSCHMAHEVA BAGARD LAURSEN

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