2020 年 11 ⽉ 22 ⽇
公益財団法⼈船井情報科学振興財団御中

イェール⼤学 感染症疫学 博⼠課程 4 年
塩⽥ 佳代⼦2016 年度派遣奨学⽣ 第⼗回（最終回）
留学報告書
2020 年 8 ⽉末⽇をもって無事に Yale University での博⼠課程を修了することができましたので、この最終報告書にて⼀連の流れと卒業後の進路についてご報告させていただきます。

博⼠号最終審査
博⼠論⽂内容私の博⼠論⽂は「ワクチンの集団レベルでの効果を正確に推定する」ということが⼤きなテーマでした。「集団レベルの効果」というのは、ワクチンを打った⼈が直接享受する効果（directeffect）だけではなく、ワクチンを打ってない⼈も集団内の感染者が減り間接的に守られる（indirect effect）ということを考慮しています。また、ワクチン接種率（集団内で何パーセントの⼈がワクチンを受けるか）も集団レベルの効果に影響します。ワクチンの個⼈レベルの効
果は臨床試験などで何度も確かめられてから市場に出るのですが、集団レベルの効果は様々な因⼦に影響を受けてしまうため予測・推定ともに⾮常に困難です。たとえば新しく導⼊されたワクチンの効果を評価したいときに、導⼊前後 5 年間（合計 10 年間）の病気の発⽣率を⽐べるとしましょう。当然導⼊後に発⽣率が下がっていることを期待するわけですが、たとえばこの 10 年の間に病気の診断・調査・報告の質が向上したり、病院の数が増えて医療へのアクセスが改善することで、以前は⾒過ごされていた症例も特定できるようになったとします。そうす
ると病気の発⽣率が⼀⾒上がっているように⾒えることがあります。⼀⽅、上下⽔道の整備や⼿洗いなど⽇々の衛⽣状況の改善により、ワクチンが導⼊される以前から病気の発⽣率が⼤幅に下がっていることもよくあります。この場合ワクチンで予防された症例数とそれ以外の要因によって防がれた症例数を分けて推測しないといけません。こういった問題を解決し、より正確に集団レベルのワクチンの効果を推定することで、今後のワクチン政策や公衆衛⽣政策に⽣かすということが私のテーマでした。

私の博⼠論⽂は全部で 4 章に分かれています。前半の 2 章は⽅法論的な研究で、ワクチンの集団レベルでの効果をより正確に推定するための統計⼿法を 2 つ開発しました。後半の 2 章は実際にその⼿法を⽤いてワクチンの集団レベルでの効果を推定しました。3 章ではロタウイルスワクチンの効果をボリビア、エルサルバドール、グアテマラ、ホンジュラス、パラグアイ、ベネズエラで評価し、4 章では肺炎球菌ワクチン（PCV）の効果をアルゼンチン、ブラジル、コロンビア、ドミニカ共和国、エクアドル、ガイアナ、ホンジュラス、メキシコ、ニカラグア、ペルーで調べました。
幸いなことに、以下のように 4 章全て既に査読付きジャーナルに publish されています（2 章は現在 in press で 2021 年春頃 publish 予定）。卒業までにこの段階まで持っていけたことを⾮常に嬉しく思っています。
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Chapter 1: Shioda K, Schuck-Paim C, Taylor RJ, Lustig R, Simonsen L, Warren JL, Weinberger DM.
Challenges in Estimating the Impact of Vaccination with Sparse Data. Epidemiology. 2019
Jan;30(1):61-68. doi: 10.1097/EDE.0000000000000938. PMID: 30334918; PMCID: PMC6276862.
Chapter 2: Shioda K, Cai J, Weinberger DM, Warren JL. Incorporating information on control
diseases across space and time to improve estimation of the population-level impact of vaccines.
Epidemiology. (In press)
Chapter 3: Shioda K, de Oliveira LH, Sanwogou J, Rey-Benito G, Nuñez Azzad D, Castillo RE,Gamarra Ramírez ML, Von Horoch MR, Weinberger DM, Pitzer VE. Identifying signatures of theimpact of rotavirus vaccines on hospitalizations using sentinel surveillance data from Latin
American countries. Vaccine. 2020 Jan 10;38(2):323-329. doi: 10.1016/j.vaccine.2019.10.010.
Epub 2019 Oct 28. PMID: 31672333.
Chapter 4: de Oliveira LH*, Shioda K*, Valenzuela MT, Janusz CB, Rearte A, Sbarra AN, Warren JL,Toscano CM, Weinberger DM; Multinational Study for PCV Impact in Mortality Study Team.
Declines in pneumonia mortality following the introduction of pneumococcal conjugate vaccines
in Latin American and Caribbean countries. Clin Infect Dis. 2020 May 25:ciaa614. doi:
10.1093/cid/ciaa614. Epub ahead of print. PMID: 32448889. (*Equal contribusion)

博⼠号最終審査のスケジュール

前回の報告書（2020 年 6 ⽉ 第 9 回）でも少々書かせていただきましたが、私の所属するイェール⼤学公衆衛⽣⼤学院感染症疫学科（Department of Epidemiology of Microbial Diseases at Yale
School of Public Health）の博⼠号審査は⼀般的なものより少し段階が多いです。
1. 2020 年 6 ⽉ 10 ⽇：Dissertation readers を 3 ⼈選んで公衆衛⽣⼤学院の Graduate Studies
Executive Committee 会議にて承認を受けました。Dissertation readers は dissertation
advisory committee（DAC。博⼠論⽂研究を直接指導する先⽣たち）とは全く別で、イェール⼤学内部から 2 ⼈、⼤学外部から 1 ⼈、私の博⼠論⽂のテーマに近いことをやっている教授を選出する必要があります。イェール⼤学外部の reader は DAC と過去 3 年共

2.
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5.

6.
7.

同研究していないこと・論⽂を⼀緒に出していないことが条件だったので、それを満たすのが難しかったです。
2020 年 6 ⽉ 19 ⽇：DAC の 3 ⼈の教授（Drs. Daniel Weinberger (chair), Virginia Pitzer, JoshuaWarren）に博⼠論⽂をメールで送信。
2020 年 7 ⽉ 9 ⽇：DAC の 3 ⼈の教授と Closed defense を実施。約 2 時間で、dissertation全章について発表・議論し、先⽣たちからの質問に答えた。コロナウイルス対策でZoom で実施。最後私は退出し、先⽣たちのみで 15 分ほど会議し、合否を決定。
2020 年 8 ⽉ 7 ⽇：3 ⼈の dissertation readers および Yale Graduate School of Art andSciences に dissertation を提出。30 ⽇間の審査期間スタート。
2020 年 8 ⽉ 24 ⽇：Public defense を実施。コロナウイルス対策で基本的に zoom で実施。DAC の 3 ⼈の先⽣、クラスメイト 3 ⼈、そして夫の 7 ⼈のみ⼤学のオーディトリア
ムで対⾯で参加。
2020 年 9 ⽉ 6 ⽇：3 ⼈の dissertation readers からの評価を受け、博⼠号取得が正式に決定。
2020 年 12 ⽉：博⼠号授与。

Public defense

本来ならばこれまでお世話になった⼈をたくさん招待して、家族や親戚も来て、⼀種のお祭りのような場になるのですが（特にうちの学科では⼀番の関⾨である closed defense を突破した後に public defense が⾏われるため、よほどのことがない限りは不合格にならないだろうという安⼼感もあります…）、コロナ対策で Zoom になってしまいました。⼀つ良かったのは、⽇本の家族や⾊々な国の共同研究者、イェール卒業⽣、⽇本でお世話になった先⽣・先輩⽅も参加できたということです。合計で 70 ⼈が 7 つのタイムゾーンから参加してくれたようで、本当に嬉しく思いましたしとても感謝しています。最後は夫、家族、クラスメイトが準備してくれたショートムービーもサプライズで流れ、とても感動しました。

卒業後の進路就職活動に関しては前回の報告書（2020 年 6 ⽉ 第９回）にも記載させていただきましたが、2020 年 8 ⽉ 31 ⽇にイェールを卒業してすぐ、9 ⽉ 1 ⽇から Emory University の Department ofEpidemiology および Department of Environmental Health にて勤務し始めました。予定通り
Connecticut 州 New Haven 市からリモートワークをしています。⽇本でいうと、函館に住みながら福岡の⼤学にリモートワークしているような感じです。前回の報告書で⼼配していた F-1 visa
Optional Practical Training（OPT）は public defense 前⽇（就職約 1 週間前）に無事届きました。
Emory では 2 つのラボに雇われていて、50:50 で時間を分けて働いています。Dr. Matthew
Freeman とは One Health（環境・動物・⼈間の健康問題を包括的にみて改善するアプローチ）

に関する問題に取り組んでいます。アフリカ諸国でどうしたら 5 歳未満の⼦どもの下痢症をもっと減らせるか、数理モデルやフィールドワークを⽤いて研究しています。特に⾷中毒や動物個体・フンとの接触などを介した動物からの感染を研究しています。Dr. Benjamin Lopman とは新型コロナウイルスの研究をしていて、つい先⽇⼀本⽬のプレプリント（査読前の論⽂）を出すことができました。とりあえずは 2 年の契約で、その後延⻑するか他のポジションにアプライするかはその時のコロナウイルスの状況や夫の仕事の状況などを⾒て決めたいと思っています。

最後に2016 年 8 ⽉から 2020 年 8 ⽉までの PhD 学⽣⽣活は本当に充実していました。特に研究以外の⾯では 20 代の頃には想像できなかったようなチャレンジにたくさん遭遇した 4 年間で、⼼折れそうになった瞬間も何度もありました。こうして最後まで到達できたのは財団のみなさまの温かいご⽀援のおかげです。この 4 年間で得た様々な経験、知識、スキル、⼈間関係は本当に掛け替えのないもので、これからのキャリア・⼈⽣に深くつながっていくと思います。私にアメリカでの博⼠課程に挑戦するチャンスをくださり本当にありがとうございました。

塩⽥佳代⼦
Kayoko Shioda, PhD, DVM, MPH
kayoko.shioda@aya.yale.edu