GSC-IVD-003 2_A* 2024 年 5 月 改訂（第 2 版）

使用の前に本電子化された添付文書をよく読むこと。

体外診断用医薬品

2024 年 3 月 作成（第 1 版）

製造販売承認番号 30500EZX00053000

百日咳菌核酸キット

GeneSoC® 百日咳菌検出キット【全般的な注意】【操作上の注意】

1. 本製品は遺伝子解析装置 GeneSoC® mini の専用試薬である。

1. 測定試料の性質・採取法

2. 本製品は体外診断用医薬品であり、それ以外の目的には使用でき(1) 対象検体ない。

鼻咽頭ぬぐい液

3. 本製品の判定が陰性であっても、百日咳菌感染を否定するもので(2) 検体の採取法はない。

1) 鼻咽頭ぬぐい液は、滅菌ぬぐい棒を鼻腔内にゆっくり挿入し、鼻腔4. 臨床診断は本製品での検査結果だけでなく、他の検査結果や臨床の奥にあてた後に数回回転させ、ぬぐい液を採取する。

症状などに基づいて総合的に判断すること。

2) 採取した検体は速やかに使用すること。

5. 電子添文の内容に従い使用すること。電子添文以外の使用目的及

3) 検体採取の際に発生するエアロゾル等によって、DNA が検査環境中び使用方法で取得した検査結果については保証できない。に飛散し、コンタミネーションが発生する場合があるため、検体採6. 使用する試薬・装置の電子添文及び取扱説明書をよく読んでから取と本製品の使用は別の部屋で行うこと。

使用すること。

2. 妨害物質・妨害薬剤【形状・構造等（キットの構成）】

検体に含まれる可能性のある以下の物質及び薬剤について、表中の濃1. PCR Reaction Mix...................................... 1 本

度における本製品の判定への影響は認められなかった。

デオキシリボヌクレオシド三リン酸物質・薬剤

DNA Polymerase
内因性物質

2. Primer/Probe Mix (Bp) ................................. 1 本
Bp フォワードプライマー（Bp FP）
Bp リバースプライマー（Bp RP）
3. Positive Control DNA (Bp) ............................. 1 本
4. RNase-free Water...................................... 1 本

鼻咽頭ぬぐい液－血液－クラリスロマイシン

6.25 mg/mL

エリスロマイシン

100 mg/mL

アジスロマイシン水和物

100 mg/mL

レボフロキサシン水和物

6.25 mg/mL

ミノサイクリン塩酸塩

12.5 mg/mL

Bp プローブ（Bp Probe）
抗菌剤濃度【使用目的】
鼻咽頭ぬぐい液中の百日咳菌ゲノム DNA の検出（百日咳菌感染の診断

3. 交差反応性
交差反応する可能性のある下記の菌 12 種類について測定した結果、補助）Bordetella holmesii 及び Bordetella bronchiseptica との交差反応【測定原理】が認められたが、それ以外の菌との交差反応は認められなかった。

本製品は鼻咽頭ぬぐい液から抽出した百日咳菌 DNA のうち一部の領域について、リアルタイム Polymerase Chain Reaction（PCR）法により微生物の名称

Bordetella parapertussis

Streptococcus pneumoniae

Bordetella holmesii

Moraxella catarrhalis

Bordetella bronchiseptica

Mycobacterium tuberculosis

Mycoplasma pneumoniae

Staphylococcus aureus

びにそれに相補的な配列をもつプライマー及びプローブも含んでいる。

Chlamydophila pneumoniae

Haemophilus influenzae

はじめに鼻咽頭ぬぐい液から抽出した百日咳菌 DNA 及び試薬中の IC

Legionella pneumophila

Klebsiella pneumoniae

核酸増幅し 1)、蛍光測定によってリアルタイムに百日咳菌 DNA を検出する試薬である。本製品のプライマー及びプローブは百日咳菌特異的な配列（IS481 遺伝子）に設計されている。また、核酸増幅の工程に問題がないことを確認するための内部コントロール（以下、IC）の DNA 並

DNA を高温により 2 本鎖から 1 本鎖に変性させる。1 本鎖になった百日

また、百日咳菌以外への交差反応の可能性について in silico 解析に

咳菌 DNA 及び IC DNA に本製品のプライマーが結合し、DNA 合成酵素より検討した結果、アメリカ国立生物工学情報センター（NCBI）のデ（DNA Polymerase）により DNA が増幅合成される。本製品のプローブ

ータベースに登録されているウイルス 14,743 配列、真菌類 4,533,288は蛍光物質及びクエンチャー物質により標識されており、プローブが配列、バクテリア 26,307,191 配列、Human Genome and Transcript

増幅合成された DNA に結合すると、DNA 合成酵素の 5’→3’エキソヌ

Database に登録されているヒト 204,921 配列のうち、ウイルス、真菌クレアーゼ活性によりプローブが分解される。この分解により、蛍光物

類、ヒトについては交差反応が起こる可能性のある配列は認められな質とクエンチャー物質の分子間距離が離れ、蛍光物質が蛍光を発する

かった。バクテリアについては、上記の Bordetella holmesii 及びようになる。この蛍光強度を経時的に測定することにより、検体中の百Bordetella bronchiseptica に加えて、Staphylococcus aureus Lr12日咳菌 DNA 及び IC DNA を検出する。

－1－

株で交差反応が起こる可能性が認められた。

ぐため、マイクロピペットのプッシュボタンは第 1 ストップまで押して注入し、第 2 ストップまで押し込まないこと。

【用法・用量（操作方法）】(4) 専用測定チップを専用機器にセットし、2.で設定した条件で測定を1. 必要な器具、機材、試薬等開始する。

(1) DNA 抽出用試薬（推奨：プレシジョン・システム・サイエンス社(5) 測定終了後、専用機器の表示画面上で測定結果を確認する。

MagDEA® Dx SV 又は同等の性能を有する DNA 抽出用試薬）(2) 反応液調製用チューブ（0.2～1.5 mL）

精度管理を目的として測定を行う場合、陽性コントロールとして(3) マイクロピペット及びフィルター付きピペットチップ

Positive Control DNA (Bp)、陰性コントロールとして RNase-free(4) 冷却用チューブラック

Water を用いてサンプル溶液と同様に上記(1)～(5)の操作を行う。

(5) 氷（クラッシュアイス）又はそれに相当するもの(6) 微量簡易遠心機【測定結果の判定法】(7) ボルテックスミキサー

専用機器の画面上に表示された測定結果について以下の判定方法に従®

(8) GeneSoC mini 専用測定チップ（杏林製薬 別売品、以下、専用測定い、判定する。無効となった場合はサンプル溶液を用いて再測定する。

チップ）(9) 遺伝子解析装置 GeneSoC® mini（杏林製薬 別売品、以下、専用機

百日咳菌IC

判定＋＋陽性＋－

陽性－＋陰性－－無効器）
2. 専用機器の設定
専用機器の取扱説明書に従い、下記のとおりプロトコルを設定する。
(1) 検出チャネル
百日咳菌：Cy5（測定波長 630 nm 以上）＜判定上の注意＞

IC：HEX（測定波長 580～680 nm）

1. 増幅曲線の形状は必ず確認すること。著しい増幅曲線の乱れがある(2) PCR サイクル

場合は、同じサンプル溶液を用いて再測定するか、又はサンプル溶

ステップ

温度（℃）

時間（秒）

サイクル数

19610

19656462

液を希釈して再測定すること。
2. 本製品で陰性と判定されても、症状が持続し、百日咳菌の感染が否定できない状況では再度検査を実施する必要がある。

50

3. 検体採取、輸送、保存が不適当な検体、菌量が微量な検体、又は DNA抽出が不適当なサンプル溶液を測定した場合は、偽陰性となる可能

3. サンプル溶液の調製性がある。

DNA 抽出用試薬にて鼻咽頭ぬぐい液から抽出した DNA をサンプル溶液

4. 本製品のプライマー及びプローブは百日咳菌において保存性が高とし、使用時まで氷冷保存する。サンプル溶液は原則として直ちに使い領域に設計されているが、この領域に変異が生じた場合は検出感用すること。なお、DNA 抽出操作の詳細は DNA 抽出用試薬の使用方法

度を低下させる可能性が考えられるため、判定が陰性であっても百に従う。

日咳菌の感染を否定するものではない。

4. 試薬の調製

5. 本製品は Bordetella holmesii 及び Bordetella bronchiseptica と(1) PCR Reaction Mix 及び Primer/Probe Mix (Bp)の交差反応が認められるため、感染リスクの高い免疫抑制状態にあ融解後、ボルテックスし、スピンダウンしてから使用する。使用時

る患者、慢性肺疾患に罹患している患者、動物接触者においては、まで氷冷保存し、使用後は速やかに-20±5℃で保存する。

本製品における判定に留意すること。

(2) Positive Control DNA (Bp)及び RNase-free Water
精度管理を行う際に融解し、ボルテックス、スピンダウンしてから【性能】使用する。使用時まで氷冷保存し、使用後は速やかに-20±5℃で保1. 感度・正確性存する。

管理検体を測定したとき、陰性管理検体は陰性、陽性管理検体は陽5. 測定（操作）法性と判定される。

(1) 下記のとおり、氷上にて PCR Reaction Mix、Primer/Probe Mix (Bp)

2. 同時再現性を反応液調製用チューブに添加し、混合後、スピンダウンする。

管理検体を 3 回同時に測定したとき、陰性管理検体は全て陰性、陽性管理検体は全て陽性と判定される。

反応液 1 テスト分の試薬量
チューブ識別色

試薬使用量（μL）

青

PCR Reaction Mix

12.0

緑

Primer/Probe Mix (Bp)

6.0

合計

18.0

3. 最小検出感度
20 コピー/テスト(2) 測定直前に氷上にて(1)の溶液に 2.0μL のサンプル溶液を添加し、混合後、スピンダウンする。
(3) 専用測定チップ付属の使用方法に従い、2～20μL 用マイクロピペットを用いて、専用測定チップの試料導入口から(2)の溶液を 17.0～19.0μL 注入する。この時、専用測定チップへの気泡の混入を防－2－4. 相関性試験成績(3) 試薬及び器具等を廃棄する場合は、医療用廃棄物に関する規定、水本製品と既承認品及び既存リアルタイム PCR 法（以下、既存 PCR質汚濁防止法などの法令や自治体等の規定に従って処理すること。

法）の検査結果を比較し、本製品の性能を評価した。試験には鼻咽(4) 検体の取扱い時に検体が飛散したりこぼれたりした場合は、直ちに頭拭い液 125 例を用いた。

次亜塩素酸ナトリウム又は消毒用アルコール等によりふき取るこ

既承認品との相関と。

既承認品

本製品

【貯蔵方法・有効期間】

陽性

陰性

計

貯蔵方法：-20±5℃

陽性521365

有効期間：12 ヵ月

陰性06060【包装単位】

計

5273125

陽性一致率100% (52/52)

陰性一致率82.2% (60/73)

全体一致率

89.6% (112/125)

製品コード

製品名

GSC-IVD-003

GeneSoC 百日咳菌検出キット

40 Tests【主要文献】既存 PCR 法との相関

1) 岩浪哲, Precision Medicine 2(10), 928-931 (2019)

既存 PCR 法

本製品

包装単位

®

陽性陰性計

陽性62365

陰性06060計

6263125

陽性一致率100% (62/62)

陰性一致率95.2% (60/63)

全体一致率

97.6% (122/125)【問い合わせ先】
杏林製薬株式会社

くすり情報センター

電話： 0120-952956
受付時間： 9：00～17：00 （土・日・祝日を除く）*【製造販売業者の名称及び住所】
杏林製薬株式会社〒100-0004 東京都千代田区大手町一丁目 3 番 7 号

5. 較正用基準物質に関する情報
百日咳菌の IS481 遺伝子の配列を含む人工合成 DNA を用いている。

【使用上又は取扱い上の注意】
1. 取扱い上（危険防止）の注意(1) 検体は感染の恐れがあるものとして取り扱いに注意し、必要なバイオハザード対策を実施すること。
(2) 検体及び本製品を取り扱うときは保護眼鏡、使い捨て手袋、マスク、作業着等の防護具を着用し、測定終了後はよく手を洗うこと。作業過程ごとに手袋を変えるなど、操作には細心の注意を払うこと。
(3) 試薬が誤って皮膚・目・粘膜に付着した場合は、直ちに大量の水で十分に洗い流し、必要に応じて医師の手当てを受けること。
2. 使用上の注意(1) 本製品は指定の貯蔵方法で保存すること。
(2) 本製品の凍結融解の回数は必要最低限とすること。
(3) 有効期間を過ぎた本製品は使用しないこと。
(4) 本製品は他のロットと組み合わせて使用しないこと。また、同一のロットであっても試薬の注ぎ足しは行わないこと。
(5) 本製品は光への暴露が最小限となるよう注意すること。
(6) 本製品を取り扱う際は核酸の分解を防ぐため、汗や唾液に含まれるDNase のコンタミネーションに注意すること。
(7) 機器や器具は適切に点検・校正されたものを使用すること。
3. 廃棄上の注意(1) 検体及び検体が接触したピペットチップや容器は感染性のあるものとして、各施設のバイオハザード取扱規定に従い、医療廃棄物として処理すること。
(2) 測定に使用した専用測定チップは注入孔を覆っているシールを剥がさずに、焼却処理又はビニール袋を二重に覆って医療廃棄物として処理する。増幅産物による汚染を防ぐため、廃棄の際にオートクレーブは行わないこと。
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