平成 27 年度 名古屋市立大学特別研究奨励費補助事業

東山動物園「DNA バーコードプロジェクト」
報告書

名古屋市立大学
大学院システム自然科学研究科
生物多様性研究センター

はじめに2006 年 4 月、カナダ北部バンクス島で１頭のクマが射殺されました。遠目からみると、その個体はホッキョクグマのようでしたが、幾つかの形態的特徴がグリズリーによく似ていました。そこで DNA 分析が行われ、このクマはグリズリー（♂）とホッキョクグマ（♀）の交雑種であることが判明しました。2010 年 4 月、カナダ北部ビクトリア島で射殺されたクマは、DNA 分析から、父親はグリズリー、母親はホッキョクグマとグリズリーの雑種、つまり雑種第二世代であることが明らかになりました。このように、遺伝子の塩基配列情報は形態的特徴からではわからない、遺伝的な関係について貴重な情報を提供してくれます。
「DNA バーコードプロジェクト」とは、生物種毎に遺伝子が異なることを利用し、特定の遺伝子の塩基配列を分析することで専門家でなくとも種同定を可能にするプ
ロジェクトです。DNA は４種の塩基が１列に並んだ構造をしていますが、その配列データが“バーコード”に似ている事から、“DNA バーコード”と呼ばれています。
動物ではチトクローム酸化酵素サブユニット I(COI)遺伝子が標準的なバーコード領域とされており、“DNA バーコード”と“COI 遺伝子の塩基配列”とは、ほぼ同じ意味で取り扱われています。卵や幼体のように成長途中のため特徴がよく見分けられない、毛や体の一部、糞などの試料しか得られない等、様々な状況においても微量の検体から遺伝子を解析することで種同定が可能になります。このシステムが機能するためには、すべての生き物を対象とした DNA バーコードのデータベースが必要です。
現在、DNA バーコードに関するバーコードデータの作成や応用を支援するシステ
ムとして BOLD Systems（http://www.boldsystems.org）が公開されています。ここでは DNA バーコードデータベースを構築しており、種同定への利用が可能となっています。国内にも、日本バーコードオブライフ・イニシアティブ（JBOLI）という組織があり、日本における DNA バーコーディングの普及や関連プロジェクトの支援がなされています。しかしながら、これまでに発見、分類されている動物が 953,434 種(Mora, C. et al. Pros Biology PLoS Biol 9(8): e1001127. 2011)であるのに対し、BOLD Systems には、2016 年３月末時点で 167,208 種しか登録されておらず、これは学名のついた全動物のおよそ 17％にすぎません。従って、DNA バーコードプロジェ
クトを機能させるためには、まずデータベースそのものを充実させることが早急に取り組むべき課題であると言えます。

-1-図１. DNAバーコードの種内多様性の大きさと種間の違いの関係

DNAバーコードには、ある程度の種内多様性があります。一般的にその多様性は２~５％と考えられています。そして、種が異なればDNAバーコードの違いはより大きな値になると期待されます。DNAバーコードの「種内多様性の大きさ」と「近縁種との違いの程度」とのひらきを“DNAバーコードギャップ（図１(Ａ)）”といい、このひらきがはっきりと存在する場合は、DNAバーコードにより確実に種同定をする事ができます。しかしながら、DNAバーコードギャップの大きさは生物種により様々であり、DNAの違いだけでは種同定が難しい事もあります（図１(Ｂ)）。例えば、ある動物種において、データベースにDNAバーコードの登録が一つしかない場合は種内多様性の大きさがわからず、種同定システムとしては不十分ということになります。このような観点からも、既登録種であってもDNAデータベースには多くの登録が望まれています。
しかしながら、現在、希少動物や絶滅危惧動物は保護されており、その遺伝子を分析する機会はそれほど多くはありません。そこで、名古屋市立大学大学院システム自然科学研究科生物多様性研究センターでは、貴重な動物を多く飼育展示している東山動物園と協力して希少動物のDNAバーコード（COI遺伝子）の分析を行なっています。2010
年４月から2016年３月にわたり、陸上動物33種（34個体)、メダカ、カダヤシを中心とする淡水魚69種（84個体）のDNA分析を終え、得られた遺伝子データは、DNA Data Bankof Japan (DDBJ)に登録しました。これらのデータはWeb上で世界中から閲覧、利用することができ、前述のBOLD Systemsにおいても、DDBJに登録したデータを含めた検索が可能です。
ここでは、東山動物園の哺乳類とメダカ類から得られたデータがBOLD Systemsにおいてどのように判定されるか、また、データベースへの登録がどの程度有用であるのかについて検討しました。
-2-

１.哺乳類のDNAバーコード
哺乳類とは、ミルクで子どもを育てる恒温脊椎動物のことで、多くは、皮膚が変化した毛をまとっています。図２に示すように、単孔類、有袋類、有胎盤類の３つに分類されます。

図２. 哺乳綱の分類
生物は、大分類から小分類に向かって、基本的には界—門—綱—目—科—属—種となっていますが、生物によって様々な中間分類があり、哺乳綱を目に分類するまでに、この図のように分類することが
できます。
なお、
「類」は正確な表記ではありませんが、わかりやすくするためにこのように表記しています。

-3-

１-１.単孔類
単孔類とは、カモノハシのように卵を産む哺乳類の一群で、哺乳類の中では最も原始的であると考えられています。現生する単孔類はわずか５種であり、３種についてはDNAデータベースに１配列ずつの登録があります。新規に登録することができれば貴重なデータとなるのですが、単孔類の分析は今回行っていません。
１-２.有袋類
有袋類とは、胎盤を持たない、もしくは、持っていても貧弱なためお腹にある育児嚢で子供を育てる哺乳類のことで、ここでは、有袋類３種についてDNAバーコードの分析を行いました（図３）。BOLD Systemsには、それぞれの動物に対して一種類の配列が登録されており、東山動物園の動物のDNAバーコードは、それらと99％一致しました。このため、３種ともDNAバーコードで正しく同定ができました。
コアラ(Phascolarctos cinereus)のDNAバーコードがもっとも似ていたのはハイイ
ロジネズミオポッサム(Monodelphis domestica)ですが、類似度は83％しかありませんでした。同じ有袋類であっても、コアラはオーストラリアの固有種、ハイイロジネ
ズミオポッサムは中米の固有種であり、お互い異なる大陸で生息しています。DNAバ
ーコードの類似度の低さは、大陸が離れ離れになった遠い昔に種分化が起こったことを反映しているのかもしれません。
ヒメウォンバット(Vombatus ursinus)に最も類似性の高い動物は、類似度91％のキ
タケバナウォンバット(Lasiorhinus krefftii)であり、種同定には十分な違いです。
ベネットアカクビワラビー(Macropus rufogriseus rufogriseus)にDNAバーコードが最も似ていたのは、89％の一致度でクロカンガルー(Macropus fuliginosus)とタマーワラビー(Macropus eugenii)で、これも種同定が十分可能でした。
このように、有袋類ではバーコードギャップが大きく、種同定が容易に感じられます。しかしながら、カンガルー科だけに着目してもその種類は50種以上であり、これらのDNAバーコードがすべて登録されているわけではありません。全ての配列データ
がデータベースに登録されると、バーコードギャップのはっきりしない種がでてくる
かもしれません。やはり、データベースの充実が望まれます。

-4-

コアラ

登録されているデータ数

80

コアラ
他種

60
40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

87

86

85

84

83

82

81

80

86

85

84

83

82

81

80

85

84

83

82

81

80

配列の類似性（％）

ヒメウォンバット

登録されているデータ数80

ヒメウォンバット
他種

60
40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

87

配列の類似性（％）

ベネットアカクビワラビー

登録されているデータ数80

べネットアカクワラビー
他種

60
40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

87

86

配列の類似性（％）

図３. 有袋類３種の遺伝的距離と既登録配列数-5-

１-３.有胎盤類
有胎盤類とは、妊娠中に胎盤を通して胎児を成長させる哺乳類のことで、現生哺乳類の９割以上を占めています。有胎盤類は、大きく４つのグループ（ユウアルコ
ントグリレス獣類、ローラシア獣類、南米獣類、アフリカ獣類）に分けられます（図２）。今回は、ユウアルコントグリレス獣類からは霊長目と齧歯目に属する動物、ローラシア獣類からは食肉目、鯨偶蹄目とセンザンコウ目に属する動物を分析し、南米獣類からは有毛目の動物を分析しました。なお、アフリカ獣類に属する動物は分析をしていません。以下、順番に結果を示します。
１-３-１.ユウアルコントグリレス獣類
霊長目から、４種（ニシローランドゴリラ、スマトラオランウータン、パタスモ
ンキー、クロシロエリマキキツネザル）を分析しました（図４）。データベースにはそれぞれ数種、または、それ以上の配列が登録されており、東山動物園の動物の DNA
バーコードと全く同じ配列もありました。
東山動物園で飼育されていたニシローランドゴリラ（Gorilla gorilla gorilla）
はニシゴリラの一亜種で、DNA バーコードによりヒガシゴリラ(Gorilla beringei)と区別可能でした。
オランウータン（Pongo）には、スマトラ島に生息する種（Pongo abelii）とボ
ルネオ島の種（Pongo pygmaeus）の２種がいますが、以前は同種内別亜種とされていました。分析したスマトラオランウータンと 100％一致する配列がボルネオオラ
ンウータンとして登録されていますが、この配列は、２種のオランウータンが同種とされていた時代のデータである可能性があります。これを別扱いすれば、スマト
ラオランウータンとボルネオオランウータンの類似度は 94％となり、両者を DNA バ
ーコードで区別できると考えられます。
パタスモンキー(Erythrocebus patas)の種内多様性は２％、バーコードギャップ
は３~５％あるので、登録されているデータを見る限り DNA バーコードによる種同定が可能と言えます。
クロシロエリマキキツネザル(Varecia variegate)は、東山動物園の個体と同一の塩基配列が既に登録されていました。その一方で、98％一致する配列としてアカエリマキキツネザル(Varecia rubra)のものもありました。この２種は同じエリマキ
キツネザル属に属しており、DNA バーコードによる種の区別は難しいのかもしれま
せん。この点をはっきりさせるためには、今後、遺伝子データの登録数を増やす必要があるようです。

-6-ニシローランドゴリラ

登録されているデータ数100

ニシローランドゴリラ
80

ヒガシゴリラ

60

他種

40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92 91 90 89 88
配列の類似性（％）

87

86

85

84

83

82

81

80

スマトラオランウータン

100
登録されているデータ数

スマトラオランウータン
80

ボルネオオランウータン

60

他種

40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

87

86

85

84

83

82

81

80

87

86

85

84

83

82

81

80

84

83

82

81

80

配列の類似性（％）

パタスモンキー登録されているデータ数100

パタスモンキー

80

他種

60
40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92 91 90 89 88
配列の類似性（％）

クロシロエリマキキツネザル
登録されているデータ数100

クロシロエリマキキツネザル
80

アカエリキツネザル
他種

60
40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92 91 90 89 88
配列の類似性（％）

87

86

85

図４. 霊長目４種の遺伝的距離と既登録配列数-7-齧歯目からは、アメリカビーバー(Castor canadensis)、ミユビトビネズミ（Dipus

sagitta）、シマクサマウス（Lemniscomys barbarous）の３種について分析しました（図５）。
ビーバー科のアメリカビーバーは、すでに多くのDNAバーコードが登録されており、
それらと99％一致しました。それに対し、データベースに登録のある同属のヨーロッパビーバー(Castor fiber)とは86％の類似性しか得られず、非常に明確なDNAバーコ
ードギャップが見られました。しかも、類似性が82~83％になると、類縁関係とは無関係な鳥類や魚類までヒットしました。これらの結果は、近縁種とはいえアメリカビ
ーバーとヨーロッパビーバーはかなり昔に種分化したことを示しているのかもしれません。
トビネズミ科に属するミユビトビネズミのDNAバーコードはデータベースに登録がなく、83~87％の類似度で他の齧歯類や鳥類がヒットしました。近縁種の登録が少ないため、DNAバーコードにより種同定が可能かどうかは、データベースの充実を待ってから評価する必要があります。
ネズミ科に属するシマクサマウスのDNAバーコードもデータベースに登録されておらず、89％以上類似した配列もありませんでした。トビネズミ科と同様に、ネズミ科の動物もデータベースの充実が望まれるところです。

-8-アメリカビーバー

登録されているデータ数80

アメリカビーバー
ヨーロッパビーバー
その他

60
40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

87

86

85

84

83

82

81

80

87

86

85

84

83

82

81

80

87

86

85

84

83

82

81

80

配列の類似性（％）

ミユビトビネズミ

登録されているデータ数100

ミユビトビネズミ
その他

80
60
40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

配列の類似性（％）

シマクサマウス

登録されているデータ数100

シマクサマウス

80

その他

60
40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

配列の類似性（％）

図５. 齧歯目３種の遺伝的距離と既登録配列数-9-

１-３-２.ローラシア獣類
食肉目のうちネコ科は、共通祖先から現生の８系統が生じたと考えられています（図６）。近年のDNA分析結果によると、1,080万年前最初に分かれたのはヒョウ系統
であり、この系統からはヒョウ(Panthera pardus)を、そして、670万年前に分かれた
ピューマ系統からはジャガランディ(Puma yagouaroundi)、620万年前に分かれたベン
ガルヤマネコ系統からはスナドリネコ(Prionailurus viverrinus)とベンガルヤマネ
コ(Prionailurus bengalensis)を分析しました（図７）。
ヒョウのDNAバーコードは、種内多様性が３％、DNAバーコードギャップは３~４％となり、DNAバーコードによる種同定が可能でした。
ジャガランディのDNAバーコードは、種内多様性が１％であるのに対し、DNAバーコードの最もよく似ていたピューマ(Puma concolur)でさえも91％の類似度しかありませんでした。したがって、どちらもピューマ系統に属しますが、DNAバーコードによる種同定は十分に可能です。他方、ジャガランディはリンクス系統のオオヤマネコ(Lynx lynx)とも91％の類似度でした。ピューマ系統とリンクス系統が分かれたのは720万年前、ピューマ系統内でピューマとジャガランディが別れたのはおよそ200万年前と推定されています。DNAバーコードの違いが種同定に用いることができても、これだけでは、進化系統の推定には使えない一つの例と言えます。
スナドリネコのDNAバーコードは、96~100％の範囲でデータベース既存のスナドリ
ネコと一致し、種内多様性は４％でした。一方、近縁種であるベンガルヤマネコの登録配列とも95~97％の一致を示しました。すなわち、スナドリネコとベンガルヤマネ
コの間には、はっきりとしたバーコードギャップが見られな
いということになります。
ベンガルヤマネコのDNAバー
コードも分析しましたが、ベンガルヤマネコには十数種の亜種が含まれており、その種内多様性は５％でした。また、スナ
ドリネコとの類似度が92~97％であるため、バーコードギャッ
プはありませんでした。
図６. ネコ科の進化系統樹と主な生息地- 10 -

ヒョウ

80
登録されているデータ数

ヒョウ
60

その他

40
20
0
100

99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

87

86

85

90

89

88

87

86

85

90

89

88

87

86

85

90

89

88

87

86

85

配列の類似性（％）

ジャガランティ

登録データのある個体数

80

ジャガランティ
その他

60
40
20
0
100

99

98

97

96

95

94

93

92

91

配列の類似性（％）

スナドリネコ

登録されているデータ数80

スナドリネコ
ベンガルヤマネコ
その他

60
40
20
0
100

99

98

97

96

95

94

93

92

91

配列の類似性（％）

ベンガルヤマネコ
登録されているデータ数80

ベンガルヤマネコ
60

その他

40
20
0
100

99

98

97

96

95

94
93
92
91
配列の類似性（％）

図７. 食肉目ネコ科４種の遺伝的距離と既登録配列数- 11 -

食肉目クマ科のメガネグマ(Tremarctos ornatus)については、データベースに１配列のみ登録があり、今回の分析で得られた配列と99％一致しました（図８）。次いで配列が類似していたのはショートフェイスベア（Arctodus simus）の91％であり、メガネグマはDNAバーコードで同定が可能でした。しかしながら、種内多様性を評価するためにはまだまだデータが不足しています。
食肉目アザラシ科ゴマフアザラシ(Phoca largha)については６配列が登録されており、その遺伝的多様度は１％でした。近縁他種とは98％以下の類似性しか見られなかったので、DNAバーコードにより区別することは可能でしたが、95~98％の類似度
で数種類の近縁種が含まれていました。それぞれの種のデータを増やし、遺伝的多様度を確かめる必要があります。

メガネグマ

登録されているデータ数

80

メガネグマ
60

その他

40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92 91 90 89 88
配列の類似性（％）

87

86

85

84

83

82

81

80

87

86

85

84

83

82

81

80

ゴマフアザラシ
登録されているデータ数80

ゴマフアザラシ
60

その他

40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92 91 90 89 88
配列の類似性（％）

図８. 食肉目２種の遺伝的距離と既登録配列数- 12 -

鯨偶蹄目ウシ科ボンゴ（Tragelaphus eurycerus）については、東山動物園のボン
ゴのDNAバーコードと99~100％一致する配列が登録されており、種内多様性が１％、バーコードギャップは３~５％となりました（図９上段）。ボンゴに対するDNAバーコードは機能すると言えます。
アルパカ(Lama pacos/Vicugna pacos)は、ラクダ科ビクーニャ属に属するとする説とラマ属に属するとする説があり、結論は未だ出ていません。DNAバーコードでは、アルパカは、リャマ属のリャマ(Lama glama)、グアナコ(Lama guanicoe)に近く、種の判別ができないもののビクーニャ(Vicugna vicugna)とは少し異なるという結果が得られました（図９下段）。アルパカとリャマは、野生種であるグアナコを原種として紀元前に家畜化されたのではないかとする説があり、DNAバーコードはそれを支持しているように思われます。ただし、アルパカのDNAバーコードには種内多様性が５％もあり、同時に、ビクーニャとの違いも５％でした。従って、より詳細なデータを今後も増やして慎重に検討する必要があります。

ボンゴ

登録されているデータ数

80

ボンゴ
60

その他

40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

87

86

85

84

83

82

81

80

85

84

83

82

81

80

アルパカ

80
登録されているデータ数

92 91 90 89 88
配列の類似性（％）

アルパカ

アルパカ
リャマ
グアナコ
ビクーニャ

近縁種

60

その他
40
100

99

98

97

96

95

20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

87

86

配列の類似性（％）

図９. 鯨偶蹄目２種の遺伝的距離と既登録配列数- 13 -

センザンコウ目に属するミミセンザンコウ(Manis pentadactyla)の DNA バーコー
ドは、データベースに 40 配列もの登録がありました（図 10）。登録データと比較す
ると、東山動物園からのデータとの類似度は 85~99％と幅があり、このように種内多 様 性 が 大 き い 例 は 殆 ど あ り ま せ ん 。 ま た 、 イ ン ド セ ン ザ ン コ ウ (Manis

crassicaudata)との類似度は 93~95％であり、ミミセンザンコウとインドセンザン
コウの間には DNA バーコードギャップが存在しないことになります。さらに、デー
タベースにミミセンザンコウとして登録されている３配列（類似度：85％、87％、88％）は、その配列間でも類似性は高くなく、それぞれがミミセンザンコウの亜種、あるいは、別種である可能性が考えられます。各登録個体の採集地、形態的特徴などの情報が明らかになれば、この点についても何らかの知見が得られるかもしれま
せん。今後の研究に期待したいところです。

ミミセンザンコウ

登録されているデータ数80

ミミセンザンコウ
60

インドセンザンコウ
その他

40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

87

86

85

84

配列の類似性（％）

図10. ミミセンザンコウの遺伝的距離と既登録配列数- 14 -

83

82

81

80

１-３-３.南米獣類
有 毛 目 オ オ ア リ ク イ 科 コ ア リ ク イ 属 に 属 す る ミ ナ ミ コ ア リ ク イ (Tamandua

tetradactyla)については、データベースに 11 配列が登録されており、東山動物園で得られた DNA バーコードはそれらと 97~100％の類似度でした（図 11）。同属近縁種のキタコアリクイ(Tamandua mexicana)の配列は一つしか登録されていませんが、配列類似度は 97％で、ミナミコアリクイの種内多様性の範囲内にあります。つまり、
DNA バーコードではこの両者を区別できません。

ミナミコアリクイ

登録されているデータ数80

ミナミコアリクイ
キタコアリクイ

60

その他
40
20
0
100 99

98

97

96

95

94

93

92

91

90

89

88

87

86

85

84

配列の類似性（％）

図11. ミナミコアリクイの遺伝的距離と既登録配列数- 15 -

83

82

81

80

２.メダカ類のDNAバーコード
メダカ科（Adrianichthyidae）メダカ属(Oryzias)の魚をメダカと呼び、現在36種に正式な学名がつけられています。また、広義のメダカでは、メダカ属と外見が類似しているカダヤシ目（Cyprinodontiformes）のカダヤシ属（Gambusia）やグッピー属（Poecilia）も含まれるため、その数は1,000種あまりになります。
今回は、「東山動物園 世界のメダカ館」で維持されている魚類から100検体を分析しました（資料２）。内訳は次の通りです。メダカ属は25個体（学名の確定している
メダカ20個体、不明種５個体）、カダヤシ目は71個体、メダカ類以外は４個体（アカザ、ヨシノボリ、ホトケドジョウ、イトモロコ）です。なお、同種で複数個体存在す
る検体を分析し、その結果が同一の塩基配列であった場合は、重複する配列をデータ
ベース登録から除外しました。
２-１.メダカ（メダカ科メダカ属）
DNAバーコードを登録した個体のうち、６種についてはデータベースに登録がありましたが、同一の塩基配列ではありませんでした（表１）。このなかでは、日本のメ表１．メダカ属(Oryzias)
和名
セレベスメダカ不詳
ジャワメダカマルモラータスメダカ
メダカ（ 佐渡 ）メダカ（ 名古屋 ）チュウゴクメダカ
ホライクティス・セトナイ
ハイナンメダカ
マタノメダカ
インドメダカタイメダカ
ネブロサスメダカ
ニグリマスメダカ
ペクトラリスメダカ
スラウェシコモリメダカ
ネオンブルーオリジアス
メダカ属の一種（ 東チモール ）メダカ属の一種（ カンボジア ）メダカ属の一種（ Tiu湖 ）メダカ属の一種（ Poso湖 ）種間の違い *

種内多様性
学名

類似性(%)

Oryzias celebensis
Oryzias dancena
Oryzias javanicus
Oryzias marmoratus
Oryzias latipes
Oryzias latipes
Oryzias sinensis
Oryzias setnai
Oryzias curvinotus
Oryzias matanensis
Oryzias melastigma
Oryzias minutillus
Oryzias nebulosus
Oryzias nigrimas
Oryzias pectoralis
Oryzias sarasinorum
Oryzias sp.
Oryzias sp.
Oryzias sp.
Oryzias sp.
Oryzias sp.

100
98.93
90.50～89.30
99.54
99.54～84.64
98.62～85.60
98.17
-

*

学名

Oryzias woworae
Pseudocorynopoma doriae
Pseudocorynopoma doriae
Oryzias woworae
Pseudocorynopoma doriae
Oryzias sinensis
Oryzias latipes
Acentrogobius sp.
Oryzias marmoratus
Oryzias marmoratus
Oryzias dancena
Pseudocorynopoma doriae
Oryzias marmoratus
Oryzias marmoratus
Gobiidae Acentrogobius
Oryzias marmoratus
Fundulopanchax scheel
Oryzias dancena
Oryzias dancena
Oryzias marmoratus
Erithacus rubecula；データベースに登録されている近縁種のうち最も配列が類似しているものを示す。
- ; データベースに登録がない。

- 16 -

類似性(%)
88.12
85.31
86.55
88.83
86.37
84.40
86.64
82.76
89.91
93.11
98.93
85.84
89.91
90.21
85.28
89.60
95.58
98.93
98.01
89.77
83.07

ダカのみ種内配列類似度が86~99％もありました。前述のように、種内多様性が16％と大きいことは、そのデータには複数種が混在していることを示唆しています。実際、2012年、遺伝子研究により、それまで1種とされていた日本のメダカが「南日本集団（Oryzias latipes）」と「北日本集団（Oryzias sakaizumii）」の２つに分けられる
ことが報告されました（Asai, T., H. Senou and K. Hosoya, Ichthyol. Explor.
Freshwat. 22(4):289-299. 2012）。そして、2013年には、「南日本集団」にミナミメ
ダカ、「北日本集団」にキタノメダカという和名がつけられました。しかしながら、DNAバーコードデータベースではまだこの２種の区別はされておらず、全てがメダカ(Oryzias latipes)として登録されています。今回分析した２個体のメダカ（佐渡と名古屋）は、2011年のものであったために両者とも学名をOryzias latipesとして記載していますが、メダカ（佐渡）のDNAバーコードはキタノメダカと考えられている
新潟のメダカと99.54％の類似度であり、また、メダカ（名古屋）はミナミメダカと思われる松山のメダカと99.09％の類似度でした。したがって、メダカ（佐渡）はキ
タノメダカ(Oryzias sakaizumi)、メダカ（名古屋）はミナミメダカ(Oryzias latipes)である可能性が極めて高いと考えられます。
東山動物園で飼育されているジャワメダカのDNAバーコードも、データベースにあるジャワメダカの配列とは90％程度の類似性しか見られず、互いに、別種または亜種である可能性も考えられます。メダカの分類学における今後の進展に期待したいものです。
ホライクティス・セトナイを始め、DNAバーコードが全く登録されていなかったメダカ９種を、今回初めて登録することができました。これらのなかで、インドメダカ(Oryzias melastigma)のDNAバーコードは、Oryzias dancenaと98.93％と高い類似度を示しましたが、両者は生息域がインド、バングラデシュと同じ地域であり、近縁種であるのかもしれません。それ以外のメダカ８種のDNAバーコードは、データベースに登録されていたメダカの塩基配列との類似度が82.76％~93.11％しかありませんでした。つまり、データベースに登録された種とは異なる可能性が極めて高いということです。今後、データベースが充実し、これらの種がDNAバーコードにより同定されるようになって欲しいものです。
上述のように、正式に学名のつけられたメダカが36種しかいない現状で、20種ものメダカのDNAバーコード配列を登録できたことはとても価値のあることです。
なお、学名が確定していないメダカ（“Oryzias sp.”として記載）は５個体ありました。この中で、ネオンブルーオリジアスは、観賞用として人為的な交配が進んでいるために正確な分類が困難になっています。原種と確認された個体のデータが得られなければ、正確なデータベース作成は難しいのかもしれません。他の４個体につい- 17 -

表２．配列が登録されていたメダカ類(カダヤシ目)
和名

種内多様性
学名

類似性(%)

アルファロ・クルトラートゥス
アルファロ・フーベリー
アメカ・スプレンデンス
アフィオセミオン・カリウルム
ペロネソックス・ベリザヌス
ブラキラピス・エピスコピ*
カラコドン・アウダックス
カラコドン・ラテラリス
キプリノドン・マクラリウス
アフィオセミオン・シーリ
ガムブシア・ヴィッタータ
ジラーディヌス・ミクロダクティルス**
ランプリクティス・タンガニカヌス
リミア・ヴィッタータ
パキパンチャックス・プレフェリアイ
セルフィン・モーリィ**

Alfaro cultratus
Alfaro huberi
Ameca splendens
Aphyosemion calliurum
Belonesox belizanus
Brachyrhapis episcopi
Characodon audax
Characodon lateralis
Cyprinodon macularius
Fundulopanchax scheeli
Gambusia vittata
Girardinus microdactylus
Lamprichthys tanganicanus
Limia vittata
Pachypanchax playfairii
Poecilia velifera

プリアペラ・インターメディア
クセノフォルス・カプティブス
ソードテール*クシフォフォルスネザファルコヨテル*

Priapella intermedia
99.36
Xenoophorus captivus
100
Xiphophorus helleri
98.15～97.45
Xiphophorus nezahualcoyotl 100～96.60

99.21
95.66
100
99.70～92.28
99.39～94.57
99.53～95.50
100
99.68
100
100
100～99.26
94.26～93.18
99.63
99.84～98.14
99.81
98.29～96.43

種間の違い
学名
Alfaro huberi
Alfaro cultratus
Xenotoca variata
Aphyosemion celiae
Xiphophorus maculatus
Brachyrhaphis roswithae
Characodon lateralis
Characodon audax
Cyprinodon nevadensis pectoralis
Fundulopanchax gardneri nigerianus
Gambusia marshi
Girardinus metallicus
Pseudocorynopoma doriae
Poecilia vivipara
Alepes melanoptera
Poecilia latipinna
Poecilia sphenops
Poecilia Mexicana
Xenotoca eiseni
Poecilia latipinna
Xiphophorus montezumae

類似性(%)
88.26
88.84
95.99
92.13
86.08
99.39
97.93
98.25
96.94
88.89
93.24
99.68
84.78
90.97
85.71
99.84
99.84
96.08
94.90
97.84
96.76

* ；種内多様性の中に他種が入り込んでいるために同定不可能。
**；報告されている配列よりも他種の配列に似ている。

ては、新種の可能性が高いと考えられます。今後、これらのメダカが新種として認められる時には、このDNAバーコードデータが役に立つかもしれません。
２-２.その他のメダカ類（カダヤシ目）
カダヤシ目のメダカ類では、45種のDNAバーコードを決定しました（表２、表３）。
表２に示した20種についてはデータベースに登録があり、うち７種は既登録データと100％一致し、残りの13種は新規配列でした。BOLD Systemsを用いた種同定を前者の20種について試みました。その結果、15種についてはバーコードギャップがあり種同定が可能でしたが、３種（ブラキラピス・エピスコピ、ソードテール、クシフォフォ
ルス ネザファルコヨテル）はバーコードギャップがなく同定不可能でした。さらに、残りの２種（ジラーディヌス・ミクロダクティルス、セルフィン・モーリィ）については、同種の登録配列よりも他種配列の方が類似性の高いものも見つかりました。例
えば、東山動物園のセルフィン・モーリィ(Poecilia velifera)のDNAバーコードは、
同種名で登録されている最も類似した配列との類似度は98.29％ですが、別種である

Polacilia latipinnaやPoecilia sphenopsの登録配列とは99.84％でした。偶然かも- 18 -

しれませんが、おそらくはこの３種は遺伝的に近縁な関係にあると推察されます。今後、近縁他種を含めた、分布、形態的特徴、遺伝的特徴などに関する研究の進展が期待されます。
表３に示した残り25種については、データベースに同種の配列登録がありませんでした。中でも、別種も含め、95％以上類似した塩基配列の登録もない個体が15種もあり、これら配列の登録は非常に有用なもとなりえます。その一方で、他種で類似度の高い塩基配列（95％以上）が登録されている場合は、その個体のDNAバーコードが種同定に使えるかどうかを慎重に考慮する必要があります。例えば、ポエキリア・スフ
ェノプスのDNAバーコードは、Poecilia mexicana、 Poecilia orri、Poecilia teresae、

Fundulus limaと完全に一致しました。これらの種はいずれも中米原産の種であり、非常に近縁な関係にあるのかもしれません。いずれにせよ、この４種をDNAバーコードで区別することは不可能です。

表３．配列の登録されていなかったメダカ類(カダヤシ目)
和名
ヨツメウオ
アフィオセミオン・ボルカナム
バンディッドランプアイ
カルフバッシア・ストゥアーティ
エピプラテス・シンガ
イリオドン・クサントゥシ
リミア・ペルギアエ
リミア・ニグロファスキアータ
ノソブランキウス・フォーシャイ
セレベス・ハーフビー
ノソブランキウス・ローレンシー
ノソブランキウス・パトリザイ
ノソブランキウス・ルブリピニス
ポエキリア・チカ
ポエキリア・メイランディ
ポエキリア・パラエ
ポエキリア・スフェノプス

種間の違い
学名

学名

Anableps anableps
Aphyosemion volcanum
Aplocheilichthys spilauchen
Carlhubbsia stuarti
Epiplatys singa
Ilyodon xantusi
Limia perugiae
Limia nigrofasciata
Nothobranchius forerschi
Nomorhamphus liemi
Nothobranchius lourensi
Nothobranchius patrizii
Nothobranchius rubripinnis
Poecilia chica
Poecilia maylandi
Poecilia parae
Poecilia sphenops

エンドラーズ・グッピー
Poecilia wingei
エンドラーズ・ライブベアラ
Poecilia wingei
プロカトーパス・アベランス
Procatopus aberrans
ポエキリオプシス・グラキリス
Poeciliopsis graclis
プセウドクシフォフォルス・ビマクラータス Pseudoxiphophorus bimaculatus
スクリプトアフィオセミオン・グィグナルディ Scriptaphyosemion guignardi
クシフォフォルス・クレメンキアエ
Xiphophorus clemenciae
クシフォフォルスマヤエ
Xiphophorus mayae- 19 -

Dendropsophus microcephalus
Pseudocorynopoma doriae
Pseudocorynopoma doriae
Phallichthys fairweatheri
Acheilognathus yamatsutae
Ilyodon furcidens
Limia vittata
Limia vittata
Nothobranchius orthonotus
Dermogenys sp.
Nothobranchius furzeri
Pseudocorynopoma doriae
Nothobranchius furzeri
Poecilia mexicana
Poecilia mexicana
Poecilia branneri
Poecilia mexicana
Poecilia orri
Poecilia teresae
Fundulus lima
Poecilia reticulate
Poecilia reticulate
Pseudocorynopoma doriae
Pseudocorynopoma doriae
Heterandria bimaculata
Scriptaphyosemion roloffi
Xiphophorus variatus
Xiphophorus hellerii

類似性(%)
86.83
84.78
84.60
90.17
92.32
100
93.98
94.57
85.38
99.35
86.29
84.48
85.28
95.75
99.85
88.43
100
100
100
100
97.67
100
84.60
84.60
99.39
88.10
96.61
98.60

おわりに
野生で見つかったホッキョクグマの雑種の話から本報告書を書き始めましたが、このことは、自然界だけでなく動物園でも起こりうるようです。1876 年、シュトゥットガルト（ドイツ）の動物園で、ホッキョクグマ(♂)とヒグマ(♀)が交配して、双子が生まれたという記録があります。1936 年には、スミソニアン国立動物園（アメリカ）でも、ホッキョクグマ(♂)とアラスカヒグマ(♀)の雑種３頭が誕生したそうです。BBC の報道によると、21 世紀になってからもヨーロッパの複数の動物園にはホッキョクグマとヒグマの雑種と思われる個体が飼育されています(http://news.bbc.co.uk/earth/hi/earth_news/newsid_8321000/8321102.stm)。雑種第３世代、第４世代となると、形態的特徴からだけではその生い立ちを知ることは不可能です。DNA バーコードだけでは万全とは言えませんが、動物園が飼育、展示をしている動物について、遺伝子レベルでも把握しておくことは意味のあることではないでしょうか。
今回の取り組みでは、貴重な陸上動物の DNA バーコードを登録することができただけでなく、メダカ類に関しても多くの DNA バーコードデータを登録することができました。メダカ類には、正式な学名がつけられていない種がまだまだ存在し、これからも新種記載が増えると思われます。そのような時に、今回登録した東山動物園・メダカ類の DNA バーコードデータが活用されるかもしれません。従って、当研究センターとしては、これからも地道に遺伝子データの蓄積をしていきたいと考えています。
なお、本プロジェクトは、平成 22 年に取り交わされた「東山動植物園と名古屋市立大学との連携に関する覚書」に基づき、両者で協力して行っている取り組みの一つです。試料収集にあたっては、東山総合公園長 月東靖詞氏、東山動物園園長 橋
川央氏をはじめ、多くの皆様にご協力頂きました。そして、2014 年度まで名古屋市立大学 生物多様性研究センターに所属していた村瀬幸雄氏には、遺伝子解析を行って頂きました。ご支援、ご協力を頂いた皆様には、この場をかりて深く感謝申し上げます。

- 20 -

資料編
資料１．サンプルリスト(動物編)
番号
HA001
HA002
HA003
HA004
HA005
HA006
HA007
HA008
HA009
HA010
HA013
HA014
HA015
HA016
HA017
HA018
HA019
HA020
HA021
HA022
HA023
HA024
HA025
HA026
HA027
HA028
HA029
HA030
HA031
HA032
HA033
HA034
HA035
HA036
HA037
HA038
HA039

和名(学名)

SDNCU 番号 INSDC(DDBJ)番号

パタスザル ( Erythrocebus patas )ゴマフアザラシ ( Phoca largha )シナガチョウ ( Anser cygnoides )アルパカ ( Vicugna pacos )フサホロホロチョウ ( Acryllium vulturinum )ワライカワセミ ( Dacelo novaeguineae )コアラ ( Phascolarctos cinereus )ミユビトビネズミ ( Dipus sagitta )シマクサマウス ( Lemniscomys barbarus )ベネットアカクビワラビー( Macropus rufogriseus rufogriseus )ダチョウ ( Struthio camelus )ショウジョウトキ ( Eudocimus ruber )ニシローランドゴリラ ( Gorilla gorilla gorilla )エボシカメレオン ( Chamaeleo calyptratus )エボシカメレオン ( Chamaeleo calyptratus )シチメンチョウ ( Meleagris gallopavo )コサンケイ ( Lophura edwardsi )セイラン ( Argusianus argus )ベンガルヤマネコ ( Prionailurus bengalensis )コビトカバ ( Hexaprotodon liberiensis )アメリカビーバー ( Castor Canadensis )アルダブラゾウガメ ( Testudo gigantean )ミナミコアリクイ ( Tamandua tetradactyla )ウォンバット ( Vombatus ursinus )カミツキガメ ( Chelydra serpentine )ボンゴ ( Tragelaphus eurycerus )ヒョウ ( Panthera pardus )ジャガランディ ( Puma yagouaroundi )スナドリネコ ( Prionailurus viverrinus )メガネグマ ( Tremarctos ornatus )ナイルワニ ( Crocodylus niloticus )スマトラオランウータン ( Pongo abelii )ニシローランドゴリラ ( Gorilla gorilla gorilla )クロシロエリマキキツネザル ( Varecia variegate )ミミセンザンコウ ( Manis pentadactyla )マヌルネコ ( Otocolobus manul )コアラ ( Phascolarctos cinereus )SDNCU-A2684
SDNCU-A2685
SDNCU-A2686
SDNCU-A2687
SDNCU-A2688
SDNCU-A2689
SDNCU-A2690
SDNCU-A2691
SDNCU-A2692

LC144609
LC143634
LC145060
LC143635
LC145061
LC145062
LC143636
LC144614
LC144615

SDNCU-A2693
SDNCU-A2694
SDNCU-A2695
SDNCU-A2696
SDNCU-A2697
SDNCU-A2698
SDNCU-A2699
SDNCU-A2700
SDNCU-A2701
SDNCU-A2702
SDNCU-A2703
SDNCU-A2704
SDNCU-A2705
SDNCU-A2706
SDNCU-A2707
SDNCU-A2708
SDNCU-A2709
SDNCU-A2848
SDNCU-A2710
SDNCU-A2711
SDNCU-A2712
SDNCU-A2713
SDNCU-A2714
SDNCU-A2715
SDNCU-A2716
SDNCU-A2717
SDNCU-A2718
SDNCU-A2719

LC143637
LC145063
LC145064
LC144610
LC145065
LC145066
LC145067
LC145068
LC143638
LC144616
LC145069
LC143639
LC143640
LC145070
LC143641
LC153097
LC143642
LC143643
LC143644
LC145071
LC144611
LC144612
LC144613
LC145059
LC143645

番号：東山動物園から標本を提供していただいた時の個体番号、SDNCU 番号：名古屋市立大学大学院システ
ム自然科学研究科「標本庫」の登録番号、INSDC(DDBJ)番号：DNA バーコード（COI 遺伝子の塩基配列）の国
立遺伝学研究所 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)への登録番号。
DDBJ は、NCBI(National Center for Biological Information)、EMBL(The European Biomolecular Laboratory)
とともに国際塩基配列データベース(INSDC：the International DNA Data Banks)を構築している。

- 21 -

資料２-１．サンプルリスト(魚編)
番号
HA101
HA102
HA103
HA104
HA105
HA106
HA107
HA108
HA109
HA110
HA111
HA112
HA113
HA114
HA115
HA116
HA117
HA118
HA119
HA120
HA121
HA122
HA123
HA124
HA125
HA126
HA127
HA128
HA129
HA130
HA131
HA132
HA133
HA134
HA135
HA136
HA137
HA138
HA139
HA140
HA141
HA142
HA143
HA144
HA145
HA146

和名(学名)

SDNCU 番号 INSDC(DDBJ)番号

ネブロサスメダカ ( Oryzias nebulosus )マタノメダカ ( Oryzias matanensis )ペクトラリスメダカ ( Oryzias pectoralis )不詳 ( Oryzias dancena )メダカ属の一種 ( Oryzias sp. )メダカ属の一種 ( Oryzias sp. )ハイナンメダカ ( Oryzias curvinotus )セレベスメダカ ( Oryzias celebensis )ニグリマスメダカ ( Oryzias nigrimas )メダカ属の一種 ( Oryzias sp. )クシフォフォルス モンテズマエ ( Xiphophorus montezumae )ニグリマスメダカ ( Oryzias nigrimas )ジャワメダカ ( Oryzias javanicus )チュウゴクメダカ ( Oryzias sinensis )ポエキリア チカ ( Poecilia chica )
クシフォフォルス ネザファルコヨテル( Xiphophorus nezahualcoyotl )ガムブシア ヴィッタータ ( Gambusia vittata )アカザ ( Liobagrus reinii )インドメダカ ( Oryzias melastigma )タイメダカ ( Oryzias minutillus )メコンメダカ ( Oryzias mekongensis )ジャワメダカ ( Oryzias javanicus )ルソンメダカ ( Oryzias luzonensis )プロカトーパス・シミリス ( Procatopus similis )アフィオセミオン・ボルカナム ( Aphyosemion volcanum )ホトケドジョウ ( Lefua echigonia )セレベス・ハーフビーク ( Nomorhamphus liemi )セレベス・ハーフビーク ( Nomorhamphus liemi )セレベス・ハーフビーク ( Nomorhamphus liemi )セレベス・ハーフビーク ( Nomorhamphus liemi )チャパリクティス パルダリス ( Chapalichthys pardalis )ポエキリア メイランディ ( Poecilia maylandi )アルファロ・クルトラートゥス ( Alfaro cultratus )ジラーディヌス ファルカトス ( Girardinus falcatus )ポエキリオプシス グラキリス ( Poeciliopsis gracilis )ブラキラピス・エピスコピ ( Brachyrhaphis episcopi )ヨシノボリ属の一種 ( Rhinogobius sp. )ホライクティス・セトナイ ( Oryzias setnai )ネオンブルーオリジアス ( Oryzias sp. )フンデュロパンチャクス・マルモラトゥム( Fundulopanchax marmoratus )クシフォフォルス マヤエ ( Xiphophorus mayae )プセウドクシフォフォルス・ビマクラータス( Pseudoxiphophorus bimaculatus )カルフバッシア・ストゥアーティ ( bsia stuarti )ノソブランキウス・ローレンシー( Nothobranchius lourensi )アフィオセミオン・カリウルム ( Aphyosemion calliurum )ジラーディヌス ファルカトス ( Girardinus falcatus )- 22 -

SDNCU-A2748
SDNCU-A2749
SDNCU-A2750
SDNCU-A2751
SDNCU-A2752
SDNCU-A2753
SDNCU-A2754
SDNCU-A2755
SDNCU-A2756
SDNCU-A2757
SDNCU-A2758
SDNCU-A2759
SDNCU-A2760
SDNCU-A2761
SDNCU-A2762

LC153098
LC153099
LC153100
LC153101
LC153102
LC153103
LC153104
LC153105
LC153106
LC153107

SDNCU-A2763
SDNCU-A2764
SDNCU-A2765
SDNCU-A2766
SDNCU-A2767
SDNCU-A2768
SDNCU-A2769
SDNCU-A2770
SDNCU-A2771
SDNCU-A2772
SDNCU-A2773
SDNCU-A2774
SDNCU-A2775
SDNCU-A2776
SDNCU-A2777
SDNCU-A2778
SDNCU-A2779
SDNCU-A2780
SDNCU-A2781
SDNCU-A2782
SDNCU-A2783
SDNCU-A2784
SDNCU-A2785
SDNCU-A2786

LC153111
LC153112
LC153113
LC153114
LC153115SDNCU-A2787
SDNCU-A2788

LC153754
LC153755

SDNCU-A2789
SDNCU-A2790

LC153756
LC153757

SDNCU-A2791
SDNCU-A2792
SDNCU-A2793

LC153758
LC153759

LC153108
LC153109
LC153110

LC153115
LC153117
LC153118

LC153119
LC153120

LC153751
LC153752
LC153753

資料２-２．サンプルリスト(魚編)
番号
HA147
HA148
HA149
HA150
HA151
HA152
HA153
HA154
HA155
HA156
HA157
HA158
HA159
HA160
HA161
HA162
HA163
HA164
HA165
HA166
HA167
HA168
HA169
HA170
HA171
HA172
HA173
HA174
HA175
HA176
HA177
HA178
HA179
HA180
HA181
HA182
HA183
HA184
HA185
HA186
HA187
HA188
HA189
HA190

和名(学名)

SDNCU 番号 INSDC(DDBJ)番号

ペロネソックス・ベリザヌス ( Belonesox belizanus )エンドラーズ・グッピー ( Poecilia wingei )リミア・ペルギアエ ( Limia perugiae )ドワーフモスキートフィッシュ ( Heterandria formosa )セルフィン・モーリィ ( Poecilia velifera )リミア・ニグロファスキアータ ( Limia nigrofasciata )ポエキリオプシス・グラキリス ( Poeciliopsis gracilis )スクリプトアフィオセミオン・グィグナルディ( Scriptaphyosemion guignardi )アフィオセミオン・シーリ ( Fundulopanchax scheeli )
アフィオセミオン・ボルカヌム ( Aphyosemion volcanum )パキパンチャックス・プレフェリアイ( Pachypanchax playfairii )ソードテール ( Xiphophorus hellerii )イチモンジタナゴ ( Acheilognathus cyanostigma )エンドラーズ グッピー ( Poecilia wingei )エピプラテス・シンガ ( Epiplatys singa )パキパンチャックス・プレフェリアイ( Pachypanchax playfairii )メダカ属の一種 ( Oryzias sp. )カラコドン アウダックス ( Characodon audax )ランプリクティス・タンガニカヌス( Lamprichthys tanganicanus )ジラーディヌス・メタリクス ( Girardinus metallicus )フンジュルス・ハテロクリトス ( Fundulus heteroclitus )マルモラータスメダカ ( Oryzias marmoratus )スラウェシコモリメダカ ( Oryzias sarasinorum )ミナミメダカ ( Oryzias latipes )ミナミメダカ ( Oryzias latipes )アフィオセミオン・シーリ ( Aphyosemion schrli )ノソブランキウス・パトリザイ ( Nothobranchius patrizii )ノソブランキウス・ルブリピニス( Nothobranchius rubripinnis )ノソブランキウス・フォーシャイ
( Nothobranchius foerschi )プリアペラ・インターメディア ( Priapella intermedia )カダヤシ ( Gambusia affinis )ヨツメウオ ( Anableps anableps )プロカトーパス・アベランス ( Procatopus aberrans )プロカトーパス・アベランス ( Procatopus aberrans )プロカトーパス・ノトタエニア ( Procatopus nototaenia )プロカトーパス・グラシリス ( Procatopus aberrans )カラコドン・アウダックス ( Characodon audax )クセノフォルス カプティブス ( Xenoophorus captivus )イリオドン・クサントゥシ ( Ilyodon xantusi )ポエキリア・パラエ ( Poecilia parae )リミア・ヴィッタータ ( Limia vittata )キプリノドン・マクラリウス ( Cyprinodon macularius )カラコドン・ラテラリス ( Characodon lateralis )エンドラーズ・ライブベアラ ( Poecilia wingei )- 23 -

SDNCU-A2794
SDNCU-A2795
SDNCU-A2796
SDNCU-A2797
SDNCU-A2798
SDNCU-A2799
SDNCU-A2800

LC153760
LC153761
LC153762

SDNCU-A2801
SDNCU-A2802
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LC153766
LC153767

SDNCU-A2804
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SDNCU-A2808

LC153768
LC153769
LC153770
LC153771

SDNCU-A2809
SDNCU-A2810
SDNCU-A2811

LC153763
LC153764
LC153765

LC153772
LC153773

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SDNCU-A2819
SDNCU-A2820

LC153774

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LC154802SDNCU-A2822
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SDNCU-A2837

LC154803
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LC154805
LC154806
LC154807

LC154796
LC154797
LC154798
LC154799
LC154800
LC154801

LC154808
LC154809
LC154810
LC154811
LC154812
LC154813
LC154814

資料２-３．サンプルリスト(魚編)
番号
HA191
HA192
HA193
HA194
HA195
HA196
HA197
HA198
HA199
HA200

和名(学名)

SDNCU 番号 INSDC(DDBJ)番号

アメカ・スプレンデンス ( Ameca splendens )セルフィン・モーリィ ( Poecilia velifera )バンディッドランプアイ ( Aplocheilichthys spilauchen )アルファロ・フーベリー ( Alfaro huberi )ファリクティス・アマテス ( Phallichthys amates )ジラーディヌス・ミクロダクティルス( Girardinus microdactylus )
クシフォフォルス・クレメンキアエ( Xiphophorus clemenciae )ポエキリア・スフェノプス ( Poecilia sphenops )ジラーディヌス・メタリクス ( Girardinus metallicus )イトモロコ ( Squalidus gracilis gracilis )SDNCU-A2838
SDNCU-A2839
SDNCU-A2840
SDNCU-A2841
SDNCU-A2842

LC154815

SDNCU-A2843

LC154818

SDNCU-A2844
SDNCU-A2845
SDNCU-A2846
SDNCU-A2847

LC154819
LC154820

LC154816
LC154817

番号：東山動物園から標本を提供していただいた時の個体番号、SDNCU 番号：名古屋市立大学大学院システ
ム自然科学研究科「標本庫」の登録番号、INSDC(DDBJ)番号：DNA バーコード（COI 遺伝子の塩基配列）の国
立遺伝学研究所 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)への登録番号。
DDBJ は、NCBI(National Center for Biological Information)、EMBL(The European Biomolecular Laboratory)
とともに国際塩基配列データベース(INSDC：the International DNA Data Banks)を構築している。

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平成 27 年度 名古屋市立大学特別研究奨励費補助事業
東山動物園「DNA バーコードプロジェクト」
報告書
2016 年７月

印刷・発行

発行元 名古屋市立大学大学院システム自然科学研究科生物多様性研究センター
編集センター長 森山昭彦、プロジェクト推進員 鈴木美恵子
住所〒467-8501 名古屋市瑞穂区瑞穂町字山の畑 1
Tel.052-872-5851
協力

名古屋市緑政土木局東山総合公園〒464-0804 名古屋市千種区東山元町 3-70