Journal of Environmental Biotechnology（環境バイオテクノロジー学会誌）
Vol. 14, No. 2, 113–118, 2015

総

説（特集）

インドール型オートインデューサーと大腸菌の社会活動
Indole Auto-inducer and Social Behavior in Escherichia coli
平川

秀忠 1*，富田治芳 2,3

Hidetada Hirakawa * and Haruyoshi Tomita2,3
1

群馬大学先端科学研究指導者育成ユニット 〒 371–8511 群馬県前橋市昭和町 3–39–22
2
群馬大学医学系研究科細菌学 〒 371–8511 群馬県前橋市昭和町 3–39–22
3
群馬大学医学系研究科附属薬剤耐性菌実験施設 〒 371–8511 群馬県前橋市昭和町 3–39–22* TEL: 027–220–7975 FAX: 027–220–7909* E-mail: hirakawa@gunma-u.ac.jp
1
Advanced Scientific Research Leaders Development Unit, 3–39–22 Showa-machi, Maebashi, Gunma 371–8511, Japan2
Department of Bacteriology, 3–39–22 Showa-machi, Maebashi, Gunma 371–8511, Japan
3
Laboratory of Bacterial Drug Resistance, Gunma University, Graduate School of Medicine,
3–39–22 Showa-machi, Maebashi, Gunma 371–8511, Japan
1

キーワード：インドール，社会活動，クオラムセンシング，薬剤耐性，病原性
Key words: Indole, Social behavior, Quorum sensing, Drug resistance, Virulence（原稿受付 2015 年 2 月 21 日／原稿受理 2015 年 2 月 27 日）

1.

はじめに

細菌は様々な環境において集団を形成し，オートイン
デューサーと呼ばれる言語様化学物質を介してお互いにコミュニケーションを行っている。細菌の集合体はしば
しば「バイオフィルム」と呼ばれ，「病原細菌による慢性
感染部位（気道・膀胱・皮膚上皮細胞内外や歯のプラー
ク）」や，「カテーテルのつまり」，「排水溝にできるぬめ
り」
，
「土壌中」
，
「植物内にできる根瘤など」我々にとって身近に観察される。近年，細菌の集団活動（社会活動）を取り扱う学問は，Sociology（社会学）と Microbiology（微生物学）の融合分野として「Sociomicrobiology（社会微生物学）」と呼ばれるようになった 17)。細菌の社会活動を担うコミュニケーション物質であるオートイン
デューサーは，細菌密度がある閾値を超えた時に爆発的に産生され，個々の細菌の遺伝子発現パターンとそれに伴う表現型を変動させる。従って，細菌の社会活動は，菌密度に依存していることから，「Quorum Sensing（クオラムセンシング）」とも呼ばれている 2)。クオラムセ
ンシングが最初に発見されたのは，海洋細菌による生体発光現象からであるが，その後，多くの細菌からもクオ
ラムセンシング現象が発見され，その役割は生体発光に留まらず，二次代謝制御，DNA の取り込み・伝達，バイオフィルム形成，抗生物質耐性，病原細菌の毒素産生に関連するものなど多岐に渡っており，クオラムセンシ
ングは基礎生物学から医学まで幅広い分野で注目を浴び
てきた。

2.

大腸菌が産生するインドール型
オートインデューサー

従来からオートインデューサーには，主に「アシル
ホ モ セ リ ン ラ ク ト ン 型 」「DPD（4,5-Dihydroxy-2,3pentanedione）型」「オリゴペプチド型」の 3 つのファ
ミリーが知られてきた 1)。
近年，これらの 3 ファミリーに加えて，様々な細菌か
ら新規のオートインデューサー分子が同定されている。
オートインデューサーの共通の特徴として，1）菌密度がある閾値を超えた時に爆発的に産生される。2）シグナルとして特異的なレセプターに作用し，それ自身もし
くは下流の転写制御因子を活性化させる。3）活性化された転写制御因子が標的遺伝子のプロモーターに結合
し，転写活性を増減させる。4）オートインデューサー
生合成遺伝子も標的遺伝子であるため，その転写がオー
トインデューサー自身によって活性化される（オートレ
ギュレーション）。が挙げられる。
以前に著者らのグループは，インドールという化合物
が，大腸菌群の社会活動を担うオートインデューサーであることを見出した 5)。インドールは，大腸菌が持つトリプトファナーゼ（Tryptophanase EC4.1.99.1）によってトリプトファンから生合成されるが，これまではトリ
プトファンからピルビン酸へと代謝される過程で生じる代謝副産物であると考えられてきた。一方で，インドー
ルは大腸菌を含む特定の腸内細菌科の検出マーカーとしても利用されているが，インドール産生の生理的意義や役割に関してはほとんど明らかになっていなかった。著
者らの実験において，様々な大腸菌株（非病原性，病原

114

平川，富田

性株）の生育段階におけるインドール産生を調べたとこ
ろ，インドール産生は対数増殖期後期以降に促進されることが分かった（図 1A）。さらに，インドール産生量は基質となるトリプトファンの添加量を増やすことで，最大 2 mM 近くまで増大した（図 1B）。しかしながら，ト
リプトファナーゼ遺伝子（tnaA）欠損株では，定常期においてもインドール産生は観察されなかった。TnaAの発現自体はインドールによって誘導されるため，インドール産生は対数増殖期以降において正のフィードバッ
クを受けている。このような産生機構は，「アシルホモ
セリンラクトン型」など他のオートインデューサーと非常に類似している。さらに，著者らのグループは，このインドールが大腸菌群の薬剤耐性と病原性を増大させることも発見した。以下の項目で，インドールオートイン
デューサーと，大腸菌群が行うインドール型社会活動の役割と仕組みについて解説を行う。
3.

図 1．大腸菌のインドール産生
A． 野 生 株 大 腸 菌（Wild-type） の ト リ プ ト フ ァ ナ ー ゼ（TnaA） 依 存 的 な イ ン ド ー ル 産 生 B． 野 生 株 大 腸 菌（Wild-type）と tnaA 欠損株（DtnaA）の生育 C．トリプ
トファン添加による野生株大腸菌（Wild-type）のインドー
ル産生量の影響

大腸菌群のインドール型社会活動と薬剤耐性

著者らのグループは以前に，大腸菌の異物排出遺伝子の発現誘導条件を調べていた過程で，幸運にもインドー
ルがそれらの発現を誘導する物質であることを発見した。
異物排出蛋白質とは，細胞内に取り込まれた様々な薬物や毒物などを細胞外へと排出する，細菌を含む生物が普遍的に持つ生体防御因子の一つである。とりわけ，細菌にとっての異物排出蛋白質は，抗菌剤の排出も行うことから抗菌剤に対する自然抵抗性因子としての側面を持っている 15)。大腸菌には約 20 種類の異物排出遺伝子が存在しているが，通常の培養条件下では数種類を除いて，ほとんど発現していないことが分かっていた 16,18)。
著者らは，各異物排出遺伝子のプロモーター活性を
LacZ レポーターによって測定する系を構築し，様々な培養条件下においてプロモーター活性の変化量を調べた。その実験過程で，野生株において排出遺伝子のうち
mdtEF のプロモーター活性が対数増殖期後期以降に飛躍的に増大することがわかった（図 2A）11)。一方，tnaA欠損株（インドール非産生株）の mdtEF プロモーター
活性は，対数増殖期後期以降に幾分増大はするものの，その活性は野生株と比べて有意に低かった（図 2A）。このことは，対数増殖期後期以降における mdtEF の発現誘導に，部分的ではあるがインドール型オートイン
デューサーが関与していることを示している。著者らは，インドールによる他の排出遺伝子の発現誘導についても検討を行った結果，前述の mdtEF に加えて acrD，
emrK など数種類の排出遺伝子の発現を 5〜7 倍増大させることを見出した 5,11)（図 2B）。実際に，インドール
によって前述の排出遺伝子の発現が亢進した時に，これらの基質であるローダミン 6G，クリスタルバイオレッ
ト，SDS（Sodium Dodecyl Sulfate），カルベニシリンに対する耐性度が増大することを確認した。
さらに著者らは，インドールによる acrD の発現誘導
は，二成分情報伝達系の BaeSR と CpxAR を介して行われていることも明らかにしている 5)。二成分情報伝達系とは，細菌に備わっている環境感知応答システムであり，栄養成分や温度，浸透圧など様々な環境変化を感知するレセプター蛋白質（センサーキナーゼ）とそれらの環境変化に適応するために遺伝子発現パターンを変化させる転写制御因子（レスポンスレギュレーター）から構成されている。baeSR，cpxAR それぞれの単独欠損株では野生株で観察されたインドールによる acrD の誘導は部分的に消失し，baeSRcpxAR 二重欠損株においては，
誘導能は完全に消失した。元々，BaeSR と CpxAR は膜ストレスに対して感知応答する二成分情報伝達系として

大腸菌のインドールシグナリング

知られていたが，著者らの実験結果から本システムはイ
ンドールの感知も行っていることが示唆される。別グループの報告によると，高濃度のインドール（約 4 mM以上）は細胞膜に酸化様ストレスを与える 3)。著者らの実験で用いたインドール濃度は（1〜2 mM）と生理的な濃度であるため，膜ストレスの可能性を完全に排除することはできないものの，別の機構で BaeSR と CpxARに作用しているのではないかと推測している。一方，
mdtEF や emrK といったインドールによって発現誘導される他の排出遺伝子は baeSRcpxAR 二重欠損株でも，野生株同様発現誘導は観察されたことから，BaeSR とCpxAR とは異なる誘導経路があることが示唆された。
これまでに，少なくとも mdtEF の発現誘導に関しては，RNA シャペロン蛋白質である Hfq をコードする遺伝子を欠損させるとその誘導は完全に消失することは突き止めているが，この誘導経路の最上流に位置するレセプ
ターの同定には至っていない。
ごく最近著者らは，排出系以外にもインドール型社会活動によって薬剤耐性が増強される機構も明らかにしている。後述する著者らの一連の実験において，腸管出血性大腸菌 O157（Enterohaemorrhagic E. coli: EHEC）のホスホマイシンに対する自然抵抗性にインドール型社会活動が寄与していることを証明した 10)。
ホスホマイシンは，O157 のグリセロール 3 リン酸輸
送体（GlpT）とグルコース 6 リン酸輸送体（UhpT）に
よ っ て 菌 体 内 へ と 取 り 込 ま れ， 細 胞 壁 合 成 酵 素（MurA）の働きを阻害することで抗菌活性を示す 13)。本
抗菌剤は，現在医療の現場で中心的に用いられている
ベータラクタム系やキノロン系抗菌剤に対して耐性化した菌（耐性菌）にも有効であることから，その有用性が再認識されている。加えて後述のように，O157 感染症に対しては，溶血性尿毒症症候群（HUS）の発症リス
クを抑えるという報告があり，O157 感染症治療薬の一つとしても期待されている 8)。しかしながらホスホマイ
シンは，相対的に抗菌活性が弱いことが知られている。
著者らは一つの仮説として，細菌はホスホマイシンに対する何らかの自然抵抗性因子を保持しているのではないかと考えてきた。著者らの実験データから，インドール
は，前述の CpxAR を活性化させ，glpT と uhpT の遺伝
子発現を抑制することで，ホスホマイシン取り込み能を低下させることがわかった。著者らは，CpxAR を恒常的に活性化させた変異体（cpxAR*）と外部からインドールを添加した株で実験を行ったところ，これらの株はインドール非産生親株（Parent）と比較して，glpT とuhpT の mRNA 量と細胞内のホスホマイシン蓄積量が約 50 倍低い値を示した（図 3A，B）。これらの株の間でホスホマイシン処理による生存率比較を行った結果，
CpxAR 活性化株はインドール非産生親株よりも約 10 倍
高い生存率を示した（図 3C）。もともとホスホマイシン
は，Streptomyces fradiae や Pseudomonas putida などの土壌細菌によって産生されることが知られている 4)。実際に，インドール非産生親株と CpxAR 恒常活性化株をそれぞれ S. fradiae と 24 時間共培養を行ったところ，
インドール非産生親株では単独培養時と比べて CFU（Colony Forming Unit） が 約 2% で あ っ た の に 対 し，CpxAR 恒常活性化株は約 17％であった（図 3D）。このことから，O157 のインドール型社会活動は，自然環境
中（家畜の糞便中，その付近の土壌）において，ホスホ
マイシン産生土壌細菌に対する自然抵抗性（生体防御）の役割を担っていると考えられる。
インドールは，産生菌（大腸菌群）自らに作用するだけでなく，インドールを産生しない他の菌種にも作用することが，他のグループによって報告されている 12,19)。
インドールが緑膿菌のバイオフィルム形成を阻害し，サ
ルモネラ菌の抗生物質耐性を増大させる。従って，大腸菌群によって産生されるインドールは大腸菌自身が社会活動を行うためのコミュニケーション物質以外にも他の種族の細菌にとっての社会活動にも影響を及ぼしているのかもしれない。
4.

図 2．インドールオートインデューサーによる大腸菌異物排出
遺伝子の誘導A．野生株大腸菌（Wild-type）と tnaA 欠損株（DtnaA）の生育に伴う mdtEF プロモーターの活性変化 B．インドー
ル添加による排出遺伝子 mRNA の変動（定量的リアルタ
イム PCR 法により定量）

115

インドール型社会活動と腸管出血性大腸菌の病原性

細菌の社会活動に関する研究が開始されて以来，細菌の社会活動が病原性に関係しているという報告が，緑膿菌を皮切りに様々な菌種からなされてきた。その中で著者らは，インドール型社会活動が腸管出血性大腸菌
O157 の病原性に寄与することを発見した 6)。O157 は，

116

平川，富田

図 3．O157 のホスホマイシン自然抵抗性におけるインドール社会活動の役割
A．tnaA 欠損親株（Parent）と CpxAR 活性化株（cpxAR*）における菌体内ホスホマイシン蓄積量の比較 B．tnaA 欠損親株
（Parent）と CpxAR 活性化株（cpxAR*），インドール添加による glpT，uhpT，murA mRNA の変動（定量的リアルタイム PCR
法により定量） C．インドール非添加，添加時におけるホスホマイシン処理後の生存率比較 D．tnaA 欠損親株（Parent），
CpxAR 活性化株（cpxAR*）と S. fradiae との共培養 24 時間後の CFU（Colony Forming Unit）の割合（%）（単独培養後を 100%とした時）。

III 型分泌蛋白質とベロ毒素という 2 種類の代表的な病
原性蛋白質を産生し，宿主の細胞に傷害を与えることが知られている 9,14)。前者は，ニードル型構造を持つ蛋白質複合体を介して分泌され宿主の腸管上皮細胞へ作用し，Attaching and Eﬀacement（A/E）lesion と呼ばれるアクチン集積を起こさせる。その結果，宿主に重篤な下痢症状を惹き起こさせる。後者は，宿主の蛋白質合成を阻害し，出血性の下痢に加え，致死性の溶血性尿毒症症
候群（HUS）と呼ばれる病態を惹き起こす。著者らの実験において，O157 野生株（インドール産生株）を
HeLa 細胞に感染させたところ，HeLa 細胞 100 個当たり の A/E lesion 形 成 数（ ア ク チ ン 集 積 頻 度 ） は，
14+/–3 個であった。一方，tnaA 遺伝子欠損 O157 株（インドール非産生株）を感染させたときには，A/E lesion
形成数が，6+/–2 個と野生株感染時と比べて約半数であった（図 4A）。しかしながら，tnaA 欠損株をインドー
ル存在下で培養を行った後，HeLa 細胞に感染させると，野生株感染時とほぼ同程度のアクチン集積頻度を示した（18+/–3 個）。
III 型分泌蛋白質をコードする遺伝子は，ニードル型分泌装置をコードする遺伝子と共に，LEE（Locus ofEnterocyte Eﬀacement）と呼ばれる染色体上の遺伝子クラスター中に存在している 14)。その中で，アクチン集積を 起 こ さ せ る 主 要 な 分 泌 蛋 白 質 と し て EspB と Tir（Eﬀector）が，これらを宿主細胞内へ輸送するために必
須な EspA（Translocator）が詳細に研究されている。著者 ら の 実 験 か ら， イ ン ド ー ル 添 加 に よ っ て，espA，
espB を含む LEE4 オペロンのプロモーター活性が 2.66倍増大した（図 4B）。次いで，LEE1 オペロンのプロモーター活性が 2.05 倍増大した。LEE1 には各 LEE プロモー
ターを正に制御する転写制御因子 Ler をコードする遺伝
子 ler が含まれている。一方，tir 遺伝子を含む LEE5 や分泌装置を形成する構造蛋白質をコードする遺伝子が存在する LEE2，LEE3 のプロモーター活性はインドール
によって有意に増大しなかった。野生株，tnaA 欠損株
をインドール存在，非存在下で培養し，EspA，EspB の菌体外（分泌画分）と菌体内量をウエスタンブロッティ
ン グ に よ り 調 べ た 結 果，tnaA 欠 損 株 は 野 生 株 よ りEspA，EspB いずれの量も少ない傾向を示し，インドー
ル添加によって増大が見られた。以上の結果から，インドール型社会活動は，O157 の III 型分泌蛋白質依存的な病原性（宿主細胞のアクチン集積能）に寄与している

大腸菌のインドールシグナリング

117

図 4．インドールオートインデューサーによる O157 の III 型分泌蛋白質依存的な病原性誘導
A．野生株（Wild-type）および，tnaA 欠損株（DtnaA）をインドール非存在，存在下で培養・HeLa 細胞感染後のアクチン集積頻度（感染 HeLa 細胞 100 個あたりのアクチン集積数） B．tnaA 欠損株（DtnaA）をインドール非存在，存在下で培養後の LEE
遺伝子群のプロモーター活性変化ことが示された。
尚，O157 のもう一つの主要な病原因子であるベロ毒
素産生量の定量（VTEC-RPLA「生研」を利用したラテックス凝集反応法により）も行ったが，tnaA 欠損，インドール添加いずれによっても影響を受けなかった。
何故，インドール型社会活動が III 型分泌蛋白質依存
的な病原性を高めるのかその正確な理由は未だ不明であるが，III 型分泌蛋白質は，腸管上皮細胞のアクチンを集積させることで下痢を起こさせることができるため，
著者らは，O157 が腸管感染部位において Competitor となる腸内常在細菌を便と共に強制的に排除，もしくは
O157 自身が宿主の免疫系から逃れるために腸管からの離脱を行っているのではないかと推測している。
5.

おわりに

細菌は，単細胞生物であるが，実際は様々な環境中で集団を形成している。彼らはただ漠然と凝集しているわ

けではなくオートインデューサーと呼ばれる細菌の言語様物質を介して社会活動を行い，あたかも多細胞生物であるかのように振る舞っている。集団の中にいる個々の細菌の社会活動の仕組みをより詳細に明らかにしていく
ことで，環境中における細菌の振る舞いや生命活動をより深く理解することに繋がると期待される。
オートインデューサーは，「アシルホモセリンラクト
ン型」「DPD 型」「オリゴペプチド型」の 3 大ファミリーが知られてきたが，近年，著者らのグループが発見した
インドールなど，上記のファミリーに属さないユニークなものが報告されつつあり，細菌の社会活動研究の未来
はさらなる可能性が広がっている。これまでに，著者らが明らかにしたインドール型オートインデューサーを介した大腸菌群の社会活動の役割と推測される生理的意義については，改めて図 5 にまとめて掲載している。
近年，細菌の社会活動を人為的に制御する試みがなされている 7)。なぜなら，細菌の社会活動は，細菌の病原性，薬剤耐性などの制御に関与しているため，新たな抗平川，富田118

図 5．大腸菌のインドール型社会活動の役割と生理的意義

菌剤や感染抑制・防止剤となりうる有力な候補である。
そのため，将来人為的に細菌の社会活動をコントロールする手法が確立できれば，これまで治療が困難であった
薬剤耐性菌や強毒性病原細菌による感染症の克服も可能になると期待される。
文

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