Journal of Environmental Biotechnology（環境バイオテクノロジー学会誌）
Vol. 17, No. 1, 9–15, 2017

総

説（特集）

水処理微生物を機能制御する素材開発戦略
Material Development Strategy to Control Microbes for Wastewater Treatment
加藤紀弘 1,*，岡野

千草 2，高山友理子 1，奈須野恵理 1，飯村兼一 1，諸星知広 1

Norihiro Kato *, Chigusa Okano , Yuriko Takayama , Eri Nasuno , Ken-Ichi Iimura and Tomohiro Morohoshi1
1,

2

1

1

1

宇都宮大学大学院工学研究科 〒 321–8585 栃木県宇都宮市陽東 7–1–2
宇都宮大学地域共生研究開発センター 〒 321–8585 栃木県宇都宮市陽東 7–1–2* TEL & FAX: 028–689–6154* E-mail: katon@cc.utsunomiya-u.ac.jp
1
Graduate School of Engineering, Utsunomiya University, 7–1–2, Yoto, Utsunomiya, Tochigi 321–8585, Japan
2
Collaboration Center for Research and Development, Utsunomiya University,
7–1–2, Yoto, Utsunomiya, Tochigi 321–8585, Japan
1

2

キーワード：クオラムセンシング，バイオフィルム，アシルホモセリンラクトン，活性汚泥
Key words: quorum sensing, biofilm, acylhomoserine lactone, activated sludge
（原稿受付

1.

2017 年 3 月 29 日／原稿受理

はじめに

都市下水や工業排水などの水質改善に利用される活性汚泥法は，完成度の高い技術として多くの地方自治体，
企業で利用されている。原水に含まれる有機，無機物質
組成の影響に加えて，屋外に設置された活性汚泥施設は
気温などの季節変動の影響を受けやすいことから，汚泥の細菌叢は変化し処理性能にも反映する。年間を通じて安定した処理性能を維持し，活性汚泥細菌の個々のポテンシャルを最大限に引き出すためには，まだ多くの挑戦的な課題が残されている。硝化細菌，脱窒細菌などの処
理活性に関する基礎，応用研究は進められているものの，汚泥に存在する個々の微生物の機能を制御する研究開発はこれまでにそれほど多くはなく，水処理微生物の2017 年 4 月 27 日）

機能制御技術は大きな可能性を有している。環境に適応し生存する細菌は，個体間のシグナリングにより集団としてある特定遺伝子の発現を誘導し，集団としての微生物機能をコントロールする例も報告されている 1)。このクオラムセンシング（QS）機構は，物質生産，病原性，バイオフィルム形成などの多様な機能に関与している（図 1）2,3)。
多様な細胞間情報伝達物質が報告されるなか，N-ア
シルホモセリンラクトン（AHL）は，多くのグラム陰性細菌で利用される共通の分子骨格を有するシグナル分子として生産されている 4)。活性汚泥からも AHL シグナルが検出されるため，この細菌群集の中には，AHL生産菌が存在する。興味深いことに AHL 分解能を有する細菌も共存しており，活性汚泥では複雑なシグナリン

図 1．シグナル分子を介した微生物間コミュニケーションによる機能制御。

加藤

10

グが行われている。栃木県内の生活排水を処理する複数の浄化センターから採取したすべての活性汚泥試料から
AHL 合成細菌と AHL 分解細菌が単離されている。単離 さ れ た AHL 合 成 細 菌 107 株 中 102 株 は Aeromonas
属細菌であるのに対し，単離された AHL 分解細菌 46 株
中 21 株は Acinetobacter 属細菌であった 5)。
これまでに AHL シグナルを基質とする微生物由来の酵素としては，ホモセリンラクトン部位を開環する
Lactonase，アミド結合部位を加水分解し有機酸とホモセリンラクトンを得る Acylase に加え，アシル鎖に結合したカルボニル基と反応する酸化還元酵素の存在も知られている 6,7)。AHL-acylase の反応により得られるホモセ
リンラクトン，AHL-lactonase の反応により得られる Nアシルホモセリンは，どちらも AHL レセプターとの親和性が激減するため，これらの酵素反応は AHL シグナ
ルの不活化に有効である。ただし AHL-lactonase による加水分解は，溶液全体を酸性条件へと pH 変化させることでエステル形成反応が化学的に進行可能であるため，
再びホモセリン部位を脱水縮合し AHL シグナルの QS
活性が復活することがあり得る。活性汚泥から単離した
Acinetobacter 属細菌は AHL-acylase を生産している 8)。
AHL を細菌同士のシグナル分子として生産し，代謝機能を制御する細菌群を人為的にコントロールする素材を設計するには，QS 機構の活性化過程において細胞内で起こる現象を分子レベルで理解することが重要となる。
2.

クオラムセンシングシグナルの分子間相互作用

海洋性細菌 Vibrio fischeri は N-(3-oxohexanoyl)homoserine lactone（3oxoC6HSL）をシグナル分子として生産し，レセプター LuxR と複合体を形成することで QS機構を活性化する 9)。LuxR はその N 末端ドメインでシグナル分子と，C 末端ドメインで標的遺伝子プロモーターと相互作用する二つの結合サイトを有するレセプターである。AHL をシグナル分子とする複数のグラム陰性細菌において，LuxR とアミノ酸シークエンスの相同性が高いレセプターの存在が知られ LuxR family と呼ばれている。本解析では LuxR family に属する SpnR を生産す
る Serratia marcescens AS-1 をモデル QS 細菌として選択し，N-hexanoylhomoserine lactone（C6HSL），標的遺伝子プロモーター spn box，遺伝子工学的手法により単離，精製した SpnR の三者間の分子間相互作用を水晶振動子

他

マイクロバランス（Quartz Crystal Microbalance: QCM）
法を用いて評価した（図 2）10,11)。精製タグとしてマルトース結合タンパク質（MBP）を N 末端に付与した
MBP-SpnR（70.5 kDa）を大量発現し，アフィニティカ
ラムで分取し実験に供した。カップ型セルの底面に設置した金電極表面にカルボキシル基末端を有する自己組織化膜を調製し，アシル鎖末端で C6HSL を固定化した修飾センサーを作製した。同様に自己組織化膜にアビジンを固定化し，ビオチン修飾した spn box をバイオアフィ
ニティにより吸着させた DNA 修飾センサーを作製した。解析にはネットワークアナライザーを用い，セルへ
外部から添加した MBP-SpnR と固定化 C6HSL 間の親和性，MBP-SpnR と固定化 spn box 間の親和性をアド
ミッタンス解析した 12)。どちらの試験でも，修飾セン
サーへ MBP-SpnR を添加した直後から共振周波数の減少（ΔF）が見られ，電極表面へ MBP-SpnR が取り込まれていく経時変化が追跡可能であった。
QS 関連分子が複合体を形成する際の安定度定数をQCM 法で見積もると，SpnR は spn box に対しネガティ
ブレギュレーターとして機能することが示唆される。低菌体密度で AHL シグナルが低濃度の QS 不活性状態において，レセプター SpnR は spn box に結合し存在している。増殖に伴い QS 機構の活性化が起こる AHL の閾
値濃度は，SpnR が AHL と複合体を形成し spn box からの解離が起こる条件であると推察される。QS 機構の制御機構としては，LuxR family のレセプターがポジティ
ブレギュレーターとして機能する例も報告されており 13)，代謝機能を人為制御したい細菌の QS 機構の作用機序は単一ではない。しかし，どちらの制御様式でもAHL 濃度の上昇が代謝機能発現のトリガーとなっており，担体への捕捉や酵素分解により AHL を低濃度に維持することで，人為的に QS 機構の不活性状態を維持可
能となる。
3.
3.1

微生物を機能制御する素材開発

素材開発のストラテジー

細胞間情報伝達機構を有する細菌群の代謝機能を人為的にコントロールするには，この細胞間コミュニケー
ションを遮断し，個々の微生物細胞の孤立環境を人為的に構築すれば良い（図 3）。本機構では “Quorum” の文
字通り，仲間の数が増え定足数に達したか否かを，シグ

図 2．QCM 法を用いる分子間相互作用解析。（a）AHL 固定化電極（左），DNA プロモーター固定化電極（右）。（b）センサーグラム
イメージ。

水処理微生物を機能制御する素材開発戦略

11

図 3．QS シグナルの遮断による細胞間コミュニケーションの制御素材。

ナル分子の濃度をインターフェースとしてセンシングしている。グラム陰性細菌の場合，細胞内外の AHL 濃度が一定値を超えると，レセプターと AHL の複合体が安定となり標的遺伝子のプロモーター部位と相互作用する。その結果として，下流遺伝子の発現が誘導される。
このシークエンシャルな過程を撹乱し，遺伝子発現を阻害する最もシンプルな手法は，AHL シグナルのみを系外に除去することである。細胞間情報伝達機構のシグナル分子を細胞外部でトラップする手法は，QS に依存した代謝機能の不活性状態を維持する共通の戦略となる 14)。細胞間シグナルとして AHL を利用する細菌が多々存在することから，AHL シグナルと高い親和性を有する素材は，多くの菌種に汎用的に効果が期待されるため，微生物複合系の機能制御にも適している。
細胞間コミュニケーションを遮断する第二の方法は，酵素反応による選択的なシグナル分子の不活化であり，AHL を 基 質 と す る ク オ ラ ム ク エ ン チ ン グ（Quorum
quenching）細菌の利用や，細菌由来の酵素の工学的利用が期待される 15)。優れた固定化酵素の開発は，細胞間コミュニケーションの阻害に有効である。
第三の方法は，シグナル分子の拮抗阻害剤による QS阻害法であり，これまでにも多くの AHL アンタゴニス
トが試験されている 16,17)。本稿では，AHL トラップ素材の設計，クオラムクエンチング細菌を利用する酵素法に関し解説することとする。
3.2

シグナル分子の捕捉

AHL 分子は水溶液中で水素結合部位を有するホモセ
リンラクトン環と疎水性を示すアシル鎖からなるノニオ
ン性界面活性剤の構造となっており，水溶液への溶解度はアシル鎖長に大きく依存する。比較的疎水性の強い低分子化合物を捕捉し，ときには放出も可能とする担体はQS 機構の人為制御に効果的で，これまで開発されてきた薬物輸送システム（Drug delivery system: DDS）の薬
物キャリアはシグナル分子の捕捉に利用できる可能性が高い。そこで本研究では，疎水性空孔に疎水基を包接し水溶液へ分散させるナノカプセルとして利用されるシク
ロデキストリン（CD）および自己組織化高分子ミセルの利用を検討した。
CD は α-1,4-glucopyranose が 6 から 8 分子結合したオリゴ糖で，それぞれ α-，β-，γ-CD と呼ばれる環状分子である。生体への安全性も高いオリゴ糖であることから，DDS における利用のみではなく，香り成分のトラップ剤として食品添加物としても利用され，多くの国々でその利用が認可されている。市販されている CD は例
えばコーンスターチなどを原料としており，様々な産業分野で利用実績のある素材の利用は，水処理微生物の制御に適用する際に，浄化する水の安全を担保する面からも重要である。
低コストの素材を設計するには，CD の分離，再利用を視野にいれた固定化素材が鍵となる。水中での利用となることからヒドロゲルビーズや親水性高分子フィル
ム，大量生産を視野に入れた高分子ファイバー不織布，
耐圧性および耐久性を視野にいれたポリスチレンミクロ
スフェア表面への固定化など多様な素材を調製し，QS機構の抑制効果を示した 18)。固定化 CD を用いた AHL
シグナルのトラップは，バイオフィルムの形成阻害にも効果を発現する。MF 膜や UF 膜を用いる膜分離活性汚泥法（Membrane Bioreactor: MBR）や，二次処理水のRO 膜処理プロセスではバイオファウリングに起因する

12

加藤

他

図 4．エレクトロスピニング法を用いた CD 固定化不織布の調製。

分離性能の低下を解決することが重要な課題である。耐久性の高い CD 固定化素材は，長期連続使用を念頭に置いた水処理プロセスへの利用には重要となる。
CD へ の AHL シ グ ナ ル の ト ラ ッ プ は 核 磁 気 共 鳴（1H-NMR）測定により確認し，形成した複合体の安定性は，前述した QCM 法を用いた物理化学的な解析により結合定数を定量的に求め評価可能である 19)。QCM の金電極上に作製した自己組織化膜にアミノ基を導入した β-CD を固定化し，外部添加した C6HSL との相互作用を追跡すると，共振周波数の減少が観測されることか
ら包接複合体の形成が示唆される。異なる基質濃度におけるセンサーグラムを速度論的解析によりカーブフィット
し速度定数を見積もり，固定化 β-CD と C6HSL の結合定数（K）を算出すると K=7×102（M–1）である。AHL
レセプターである SpnR と C6HSL の結合定数とは桁違いに小さいものの，ナノモルオーダーで生産されるシグナル分子を捕捉するには実用レベルとなる。
エレクトロスピニング法を用いることで高分子水溶液からファイバー不織布を調製可能である（図 4）。結晶性の高い高分子が溶解した溶液を，ニードル電極から吐出し 10〜20 kV の電圧を印加することで，溶液ジェット
は静電的引力によりコレクター電極へと飛行する。その間に溶媒である水が蒸発し，高分子鎖間に強い物理的相互作用が働くことで形成した乾燥ファイバーは，コレク
ター電極上に回収される。例えば α-CD を固定化したポリビニルアルコール（PVA）の水溶液を電界紡糸し得られたファイバー不織布は，培養液中の C6HSL および

図 5．CD 固定化不織布を用いる S. marcescens AS-1 のProdigiosin生産阻害。

3oxoC6HSL を捕捉し S. marcescens AS-1 の QS 機構を介した Prodigiosin 生産の誘導を効果的に阻害する（図5）20)。
AHL の捕捉には，ブロックコポリマーの自己組織化により形成される高分子ミセルも利用可能である。生体安全性の高いポリエチレンオキシド（EO）とポリプロ
ピレンオキシド（PO）から構成される EO-PO-EO 型トリブロックコポリマーは，Poloxamer と呼ばれプルロ
ニックの商品名でも知られる 21)。水溶液中では PO が疎水処理微生物を機能制御する素材開発戦略

水性ドメインとして働くため両親媒性分子として機能し，
臨界ミセル濃度（CMC）よりも高濃度の条件では安定なミセルを形成する。分子量 12.6 kDa の Poloxamer 407
を Luria-Bertani（LB） 培 地 に 分 散 さ せ 動 的 光 散 乱 法（DLS）で流体力学的直径を，静的光散乱法で見かけの分子量を計測すると，約 10 分子が集積した 18 nm のミセルが観測される 22)。CMC 未満まで希釈すると，DLS
測定時のピークは消失し Poloxamer 分子の脱会合も追跡される。S. marcescens AS-1 の培養液に自己組織化ミセルを共存させることで，AS-1 株の Prodigiosin 生産は有意に阻害されミセルへの AHL シグナルの捕捉効果が観測される。更に，この AHL をトラップしたミセルを含む培地から AS-1 株を除き，AHL 合成遺伝子破壊株で あ る S. marcescens AS-1 ΔspnI 株 を 植 菌 し た。
Poloxamer の CMC 未 満 ま で 培 地 を 希 釈 す る と，AHL
生産能の無い AS-1 ΔspnI 株において Prodigiosin 生産が誘導されることから，ミセルからの AHL の放出によるQS 機構の活性化も操作可能である（図 6）23)。このように微生物のシグナル分子と相互作用する機能性ナノ粒子
を AHL 捕捉担体として用い，細胞機能の発現をコントロールする新しいテクノロジーの発展が期待できる。
3.3 シグナル分子の不活化
活 性 汚 泥 か ら 単 離 さ れ た AHL 分 解 活 性 を 有 す る
Acinetobacter sp. の菌体をアルギン酸ナトリウム水溶液に懸濁させ，ゲル化剤となる CaCl2 水溶液に滴下することで容易にゲルビーズを作製可能であり，クオラムクエ
ンチングに利用する固定化微生物を調製できる。AHLの分解活性を試験するため，S. marcescens AS-1 株を植菌した LB 培地に固定化ゲルビーズを浸漬し所定時間振とう培養すると，Prodigiosin の生産阻害が観測される。
緑色蛍光タンパク質 GFPuv を発現する Pseudomonas
aeruginosa PAO1 gfpuv+ を植菌した LB 培地にカバーガラスを浸漬し，ガラス表面に形成されたバイオフィルム
を B 励起蛍光観察した（図 7）。GFP 蛍光で菌体を含む
バイオフィルムの分布状態を可視化すると，control では

13

全体に広がるバイオフィルムが観察されるのに対し，Acinetobacter sp. を固定化したゲルビーズを共存させると有意にバイオフィルム量は少ない。活性汚泥槽から単離したクオラムクエンチング細菌を利用して，バイオ
フィルムの形成阻害を誘導可能である。
4.

二次処理水の抱えるリスク

一方，活性汚泥二次処理水を RO 膜分離により工業用水などを得る膜分離プロセスでは，RO 膜に形成されるバイオフィルムに起因するファウリングが問題となる。
そこで，都市下水を処理する広島県の浄化センターから提供いただいた二次処理水をガラスフィルターで濾過した後に AHL 生産が確認される細菌を単離し，16S rRNA
系統解析を行った。AHL 生産の確認は Chromobacterium
violaceum VIR07 をセンサー株とするバイオアッセイにより，アシル鎖長が C8 から C14 の長鎖 AHL の生産を評価した（表 1）24)。同定されたのはすべて Pseudomonas
chlororaphis あるいは Pseudomonas veronii である。ポリスチレン製のマイクロタイタープレートで，それぞれの培養液を 30°C で 18 h インキュベートしバイオフィル
ム形成試験を行った。所定時間後にクリスタルバイオ
レット（CV）染色液を混合した。菌体を染色した CVをエタノール抽出し 570 nm における吸光度測定によりバイオフィルム量を評価すると，単離株はどれも P.
aeruginosa PAO1 株と同等のバイオフィルム形成能を示している。二次処理水にはバイオフィルム形成能を有する長鎖 AHL 生産株が複数残存しており，これを膜分離するプロセスではバイオファウリングの要因の一つとなり得ることが示された。更に興味深いことに，C4〜C8のアシル鎖長を有する短鎖 AHL の生産株は単離されな
いにもかかわらず，二次処理水からは短鎖 AHL が検出される。複雑な生態系を有する活性汚泥で排水の COD
成分，窒素分を除外した後には，菌体が互いに通信した
シグナル分子が微量ながらも混入している。菌体密度が低い二次処理水であっても，豊富なシグナル分子を抱え

図 6．高分子ミセルを用いるクオラムセンシングの抑制と活性化。

加藤

14

他

図 7．クオラムクエンチング細菌固定化ゲルビーズを用いるバイオフィルム阻害試験。
表 1．二次処理水から単離した細菌の AHL とバイオフィルム生産能
菌種名
Pseudomonas chlororaphis
Pseudomonas chlororaphis
Not identified
Pseudomonas veronii
Pseudomonas veronii
Pseudomonas veronii
Pseudomonas veronii
Pseudomonas veronii
a
b

株番号

長鎖 AHL 分解能 a

バイオフィルム形成能（A570）b

1
2
4
6
9
10
13
14

+++
++
+
+++
+++
+++
+++
+++

0.20
0.34
0.53
0.26
0.20
0.42
0.20
0.18

+++: <24 h, ++: 24 〜 72 h, +: >72 h
Incubation (30°C, 18 h), CV staining

ることで，バイオフィルム形成のリスクは増大している。二次処理水を用水として有効利用し，設備トラブルを未然に防ぐには，これらのシグナル分子の不活化が新
たなストラテジーとして期待される。

い。微生物のシグナル分子と相互作用する機能性担体の開発は，細胞機能の発現をコントロールする新しいテクノロジーの発展につながる。
謝

5.

おわりに

複雑な生態系を形成する活性汚泥には，細胞間の情報伝達機構により集団として生物機能を制御する細菌群，そしてシグナル分子を酵素反応により不活性とする細菌群が混在している。本稿では，QS 機構を人為的にコントロールする素材開発の指針を解説した。例えば，QS機構の作用機序を考えれば，QS 抑制によりバイオフィ
ルムの発達を阻害する効果は十分に見込める。しかし，菌体の固体表面への初期付着は QS 機構とは無関係に生じるため，決して万能の方策ではない。二次処理水などのシグナル分子が蓄積し易い系では，設備トラブルの回避に QS シグナルの不活化技術の導入は有効かもしれな

辞

本研究は JST CREST「持続可能な水利用を実現する
革新的な技術とシステム」研究領域，「ナノテクノロジーとバイオテクノロジーの融合による革新的な水処理微生物技術の開発」の研究助成を受けたものである。二次処
理水の提供，共同研究を推進した広島大学環境安全セン
ター，西嶋渉博士，大野正貴博士に感謝の意を表する。

文

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