Journal of Environmental Biotechnology（環境バイオテクノロジー学会誌）
Vol. 8, No. 2, 99–103, 2008

原 著 論 文（通常論文）

好熱性コラーゲン分解酵素生産菌 Thermobifida sp. 4-2-1 株の分離とキャラクタリゼーション
Isolation and Characterization of a Thermophilic Bacterium Producing Collagenolytic Enzyme,
Thermobifida sp. Strain 4-2-1
大野正博1,2，山口晴彦2，高橋征司2，中山亨2*

MASAHIRO OHNO, HARUHIKO YAMAGUCHI, SEIJI TAKAHASHI and TORU NAKAYAMA
福島県ハイテクプラザ 研究開発部 〒 963–0215 郡山市待池台 1–12
東北大学大学院工学研究科 バイオ工学専攻 〒 980–8579 仙台市青葉区荒巻字青葉 6–6–11* TEL: 022–795–7270 FAX: 022–795–7270* E-mail: nakayama@seika.che.tohoku.ac.jp
1
Fukushima Technology Centre, 1–12 Machiikedai, Koriyama 963–0215, Japan1

2

2

Department of Biomolecular Engineering, Graduate School of Engineering, Tohoku University, 6–6–11 Aoba, Aramaki,
Aoba-ku, Sendai 980–8579, Japan（原稿受付

2008 年 7 月 7 日／原稿受理

2008 年 10 月 1 日）

Composting of biomaterials generally proceeds under thermophilic and slightly alkaline conditions. To enzymatically accelerate decomposition of collagen-based materials, such as jellyfish, during composting, we screened bacterial strains that
produce thermostable collagenolytic activity with optimum pH at alkaline region. The best producer of such activity, strain
4-2-1, was a thermostable actinomycete, which was identified as a strain of the genus Thermobifida on the basis of 16S
rDNA sequence and cell-wall amino-acid composition. This is the first example of Thermobifida strain producing a collagenolytic activity. The collagenolytic activity was produced in the culture supernatant of the actinomycete and displayed the
maximum at pH 8.5 and 80°C. Proteolytic degradation of type I collagen and jellyfish could be eﬃciently attained by incubation of these materials with culture supernatant of the strain at 70°C for 1 h and 40 h, respectively. These results suggestthat strain 4-2-1 may serve as an eﬃcient catalyst for composting or bioprocessing of collagen-based biomaterials.
Key words: bioprocess, compost, collagenolytic enzyme, thermophilic, Thermobifida sp.
キーワード：バイオプロセス，コンポスト，コラーゲン分解酵素，好熱性，Thermobifida 属

1. 緒

言

コラーゲンは皮膚や骨，軟骨，腱，血管壁など動物の主要構造タンパク質であり，哺乳動物が持つタンパク質
では最も含有量が高い。細胞増殖や分化にも深く関係し研究の歴史は古く，現在では化粧品や健康補助食品への利用も多い。一方，畜肉加工場や水産加工場では大量のコラーゲン含有廃棄物が排出されているが，そのほとん
どは利用されずに焼却などにより廃棄処分されている。
その廃棄物をバイオプロセスにより発酵分解しコンポスト化するにはコラーゲンを速やかに分解する必要がある
が，コラーゲンは強固な線維構造をもつため一般的なタンパク分解酵素は直接作用することができない。コラー
ゲンに直接作用し特異的に分解する酵素はコラゲナーゼと呼ばれ，動物体内のコラーゲン代謝に関連した研究や病原菌由来の酵素として研究がなされてきた3–6,11,17,18)。
微生物による発酵分解プロセスでは発酵熱により発酵物が高温になる上，発酵生成物により pH が変動する。

バイオプロセスへの利用を目的として，Tsuruoka らは酸性域でのコンポスト化へ利用する目的で仙台市の土壌から酸性に至適 pH を持つ耐熱性コラーゲン分解酵素生産菌を分離し13)，酵素の立体構造解析を行った19)。また，
Okamoto らは土壌中から至適 pH が中性域であり至適温度が 60°C であるコラーゲン分解酵素を生産する細菌を分離した9)。最近では，Uesugi らが土壌中から分離した Streptomyces omiyaensis により分泌される酵素のコ
ラーゲン分解性について報告した14)。深海からコラーゲ
ン分解酵素の探索も試みられており，Kurata らは好ア
ルカリ性のコラーゲン分解酵素生産菌を分離し，Alkalimonas 属の新種であるとした2)。また，Yanagawa らはクラゲを分解する目的で，海浜堆積物から至適温度中温・至適 pH 中性のコラーゲン分解酵素を生産する細菌を分離し，Brachybacterium 属であると同定した16)。一
般的なコンポスト化装置において，有機性廃棄物を発酵分解させた際にはアミン類の生成により発酵物 pH 環境
が弱アルカリ域で推移することが多い。そこで，至適

100

大野

pH が弱アルカリ域であり，かつ高温に耐性を持つコ
ラーゲン分解酵素を取得することを目的とし，その生産菌を各種環境中から検索した。
2.
2.1.

材料及び方法微生物及び培養条件

環境中や有機性廃棄物発酵処理物から，好気条件下
70°C で GY 寒天培地8)（1.5％ Bacto Gelatin, 0.01％ Bacto Yeast Extract, 0.85％ NaCl, 0.5％ KH2PO4, 0.001％
MgSO4·7H2O, 1.5％寒天；pH 8.5）に生育する好熱性微生物を多数分離した。これら分離株を培養するため，
GY 培地を改変した GY 改変培地（1.5％ Bacto Gelatin,
0.5％ Bacto Yeast Extract, 1.0％ Bacto Peptone, 0.85％
NaCl, 0.5％ KH2PO4, 0.001％ MgSO4·7H2O; pH 8.5），あるいは Nutrient Broth 培地にさらに酵母エキスを加えた
NB 改変培地（0.5％ Bacto Yeast Extract, 0.5％肉エキス，
1.0％ Bacto Peptone, 0.5％ NaCl; pH 8.5）を用いて振盪培養（170 rpm）を行った。培養する際には，培地に 1
白金耳植菌して前培養した後，対数増殖期の培養物から
本 培 養 培 地 に 1/500 量 植 菌 し た。Thermobifida fusca
NBRC 14071T 株及び Thermobifida alba NBRC 15853T 株
は（独）製品評価技術基盤機構から購入し，NB 改変培地を用いて分離株と同様に培養を行った。
Bacto Yeast Extract, Bacto Peptone 及び Bacto Gelatin
は Becton, Dickinson and Company 社から購入した。その他の試薬は，特に指定しない限り和光純薬工業（株）
より特級グレードを購入して用いた。
2.2.

分離微生物の分類同定取得した微生物の分類同定を，16S rRNA をコードす
る DNA（16S rDNA）の塩基配列相同性を指標として以下の方法で実施した。PrepMan Ultra Reagent（Applied
Biosystems 社製）を用いて，分離株のゲノム DNA を抽出した。抽出した DNA を鋳型とし，16S rDNA 用のプライマーを使用して 16S rDNA 遺伝子を増幅した。PCR
プ ラ イ マ ー と し て は 9F（5'-GTGTTTGATCCTGGCTCAG-3'），339F（5'-CTCCTACGGGAGGCAGCAG-3'），785F（5'-GGATTAGATACCCTGGTAGTC-3'），1099F（5'-GCAACGAGCGCAACCC-3'），1510R（5'-GGCTACCTTGTTACGA-3'），1242R（5'-CCATTGTAGCACGTGT-3'），802R（5'-TACCAGGGTATCTAATCC-3'），536R（5'-GTATTACCGCGGCTGCTG-3'） を 使 用 し た7)。PCR
増幅産物の塩基配列を CEQTM2000XL DNA Analysis System（Beckman Coulter 社製）を用いて解析し，BLAST1)による相同検索結果から微生物を分類同定した。微生物
細胞壁ペプチドグリカンの精製と精製試料の分析は，内
田15) 及び鈴木12) の手法に従い，高速液体クロマトグラ
フィーを用いて分析した。
2.3.

コラーゲン基質分解試験

コラーゲン分解活性の測定のために，アゾ色素結合性のコラーゲン粉末である Azocoll（Calbiochem 社製）を
基 質 と し て 使 用 し た。Azocoll 25 mg，4 mM Tris-HCl（pH 8.5），Tween 80 2.5 mg，適宜希釈した培養上清を混合し，最終液量が 2.5 ml となる反応溶液組成とした。

他

あらかじめ反応温度で保持しておいた反応溶液に酵素溶液を加え，反応を開始した。指定しない限り 60 分間イ
ンキュベートした後，直ちに反応液を氷冷するとともに
1 M 酢酸バッファー（pH 4.5）を 5 ml 加え反応を停止さ せ た。 コ ラ ー ゲ ン 分 解 活 性 は， 反 応 後 の 上 清 の
540 nm における吸光度の増加（dA540）から見積もり，
1 分間に Azocoll 1 μg を分解する酵素量を 1 Unit とした。
また，I 型コラーゲンの分解試験ではウシアキレス腱
由来コラーゲン（Sigma-Aldrich 社製，Collagen from bovine achilles tendon）を基質として用い，基質 2 mg に対し培養上清 0.5 ml を加え分解の様子を目視で観察した。
ブランクでは，培養上清の代わりに未使用の培地を加えた。
クラゲを基質とした分解試験では，一般に食用として流通している塩蔵クラゲ（見永物産株式会社製）をもとにクラゲ基質を調製した。すなわち，塩蔵クラゲを蒸留
水で数回洗浄し，0.8％の食塩水に一晩浸漬した後，3 mm 角のステンレスメッシュで水切りしクラゲ基質とした。クラゲ基質 1 g に対し培養上清 5 ml を作用させ，固形物分解の様子を目視で観察した。ブランクにおいては，培養上清の代わりに未使用の培地を加えた。
3.
3.1.

結果と考察

好熱性コラーゲン分解酵素生産菌の分離と同定

環境中や有機性廃棄物発酵処理物から純粋分離した好熱性微生物をそれぞれ GY 改変培地で培養し，各培養
液上清中のコラーゲン分解活性を測定した。分離株のうち，いくつかの株の培養液上清に高いコラーゲン分解活性が見られ，いずれも細胞外にコラーゲン分解酵素を分泌していることが示唆された。これらのうち，70°C から 80°C の酵素反応温度においてコラーゲン分解活性が高かった 4-2-1 株について，16S rDNA の塩基配列（約1500 bp）による分類同定を試みた。その結果，4-2-1 株
は T. fusca NBRC 14071T 株 と 98.6 ％，T. alba NBRC
15853T 株と 97.6％の相同性を示し，放線菌 Thermobifida 属に分類されると推定された（Fig. 1）。また，細胞壁アミノ酸を分析したところ，グルタミン酸，アラニン，
meso- ジ ア ミ ノ ピ メ リ ン 酸 が 検 出 さ れ， こ の こ と は
Thermobifida 属の化学分類学的特徴と合致していた。T.
fusca を始め Thermobifida 属はコンポスト中に一般的に存在する菌であり，好熱性セルラーゼや好熱性プロテアーゼを生産する。しかし，特異的なタンパク質である
コラーゲンを分解するという酵素活性については報告がなく，本報告は Thermobifida 属の菌の培養液中にコラー
ゲン分解活性が存在するという初めての報告である。
3.2.

培養液上清のコラーゲン分解活性の消長

70°C から 80°C においてコラーゲン分解活性が高かった 4-2-1 株について，NB 改変培地を用いて 50°C で振盪培養し，培養液上清中の 80°C におけるコラーゲン分解活性を T. fusca NBRC 14071T 株及び T. alba NBRC
15853T 株 の 培 養 液 上 清 の 活 性 と 比 較 し た（Fig. 2）。
4-2-1 株の活性は培養 6 日間で活性が最大になり，その後 30 日間にわたって徐々に減少していった。4-2-1 株の乾燥菌体重量は培養 4 日前後で最大となり，8 日後には

耐熱性コラーゲン分解酵素

Fig. 1. Phylogenetic tree showing relationships between isolated
strain, 4-2-1, and related bacteria.
The tree was constructed by the neighbour-joining method10)
based on full-length 16S rDNA sequences of strain 4-2-1 andrelated bacteria. The numbers at the branch points are bootstrap values. Nucleotide sequence accession numbers areshown in parentheses. The bar indicates 0.01 substitution per
nucleotide position.

その約 1/3 に減少し，溶菌が進んでいると考えられたが，コラーゲン分解活性は培養 8 日後でも大きな低下はなかった。一方，T. alba NBRC 15853T 株では，培養 6 日間で活性が最大になり，その活性値は 4-2-1 株の約 7 倍だった。しかし，培養 8 日間で活性が急激に減少し，これは T. alba NBRC 15853T 株により生成されたプロテアーゼによりコラーゲン分解酵素が消化されたことによるものと推測する。酵素のバイオプロセスへの利用を考えると分解活性の持続性は重要な要素であり，T. alba
NBRC 15853T 株における活性の急激な低下は応用面でデメリットとなりうる。T. fusca NBRC 14071T 株では培
養 6 日間で活性が最大になり，その活性値は T. alba
NBRC 15853T 株の約 44％だったが，急激な活性の減少は見られず，バイオプロセスへの利用に有利であると考
えられた。
3.3.

コラーゲン分解活性の反応温度依存性と反応 pH
依存性

4-2-1 株について，GY 改変培地を用いて 60°C で 12日間培養し，培養上清中の pH 8.5 におけるコラーゲン
分解活性の反応温度依存性を測定した。また，T. alba
NBRC 15853T について，NB 改変培地を用いて 50°C で
3 日間培養を行い，培養上清中の pH 8.5 におけるコラー
ゲン分解活性の反応温度依存性を測定し，4-2-1 株と比較した（Fig. 3）。T. alba NBRC 15853T においては至適
温度が 70°C 付近であるのに対し，4-2-1 株では 80°C 付
近と高かった。一般に，至適温度の高い酵素は温度安定性や保存安定性が高い傾向があるとされており，本酵素の安定性が高いことが期待された。
また，4-2-1 株及び T. alba NBRC 15853T 株について，80°C で の 反 応 pH 依 存 性 を Fig. 4 に 示 す。T. alba
NBRC 15853T 株では，NB 改変培地を用いて 50°C で 3日間培養を行った培養液上清中の pH 依存性を調べたところ，至適 pH は 6.6 付近だった。一方，4-2-1 株ではNB 改変培地を用いて 60°C で 12 日間培養を行った培養

101

Fig. 2. Time course of production of collagenolytic activity in culture supernatant of Thermobifida strains.
The collagenolytic activity was determined at 80°C and pH 8.5
using Azocoll as a substrate as described in the text. The activities in culture supernatant of strain 4-2-1 (□), Thermobifida fusca NBRC 14071 T (○), and Thermobifida alba
NBRC15853T (△) are shown. Values are means of duplicate
determinations.

Fig. 3. Effect of tempereture on collagenolytic activity in culture
supernatant of strain 4-2-1 and Thermobifida alba.
The collagenolytic activity was determined at pH 8.5 using
Azocoll as a substrate as described in the text. □, strain 4-21; ○, Thermobifida alba NBRC15853T.

液 上 清 中 の 至 適 pH は 7.6 か ら 8.7 の 領 域 に あ り，T.
alba NBRC 15853T 株と比較して高かった。一般に，有機性廃棄物を発酵分解させた際にはアミン類の生成により発酵物の pH が 8 前後の弱アルカリ域で推移することが多い。4-2-1 株の培養液のコラーゲン分解活性の至適
pH は，有機性廃棄物発酵分解環境と合致する弱アルカリ域であり，発酵分解システムへの利用が期待できる。
3.4.

I 型コラーゲン及びクラゲ基質に対する分解活性

4-2-1 株について，NB 改変培地を用いて 60°C で 8 日間培養し，その培養上清を各基質に混合して分解状態を目視で観察した。コラーゲンはその形状と機能によって20 種類以上の型に分類されているが，そのうち最も代表的なコラーゲンである I 型コラーゲンに対する分解活

102

大野

Fig. 4. Effect of pH on collagenolytic activity in culture supernatant of strain 4-2-1 (left panel) and Thermobifida alba
NBRC15853T (right panel).
The collagenolytic activity was determined using Azocoll as a
substrate at 80°C in the following buffers (20 mM): acetic acid-sodium acetate (pH 4.4–5.7, □), sodium phosphate(pH 5.9–8.0, ●), Tris-HCl (pH 6.1–8.1, △), Glycine-NaOH(pH 7.5–10.1, ■), Na2CO3/NaHCO3 (pH 9.0–9.9, ○).

他

する分解活性を持つことが確認された。
そこで，次にコラーゲン含有性有機質であるクラゲを用いて分解試験を行った。I 型コラーゲン分解試験と同じ培養上清を用いてクラゲ基質に対する分解試験を行ったところ，70°C で 15 時間後にはクラゲ基質の分解残渣がわずかになり，30 時間後には固形物が目視で確認できない状態まで崩壊した（Fig. 5, lower panels）。
4-2-1 株培養上清中のコラーゲン分解活性に関する以上の結果から，4-2-1 株が生産する酵素が高温弱アルカ
リ性条件下でコラーゲン含有性有機質を分解する酵素として利用できることが示唆された。今後，4-2-1 株が生産する好熱性コラーゲン分解酵素について詳細に解析
し，バイオプロセスへの応用を検討する予定である。将来，本酵素がコラーゲン含有有機性廃棄物のコンポスト化に利用され，バイオマス利活用推進の一助となることを期待したい。
謝

本研究を実施するにあたり，試料の採取にご協力いた
だいた福島大学共生システム理工学類産業システム工学
専攻の佐藤理夫教授，並びに本宮市白沢有機センターの方々に深く感謝いたします。また，研究を遂行するにあたって，実験のサポートをしていただいた福島県ハイテ
クプラザ臨時技能員の安藤由花さん，田平ともみさんに深く感謝いたします。

文

Fig. 5. Enzymatic digestion of type I collagen and jellyfish.
(Upper panels) Type I collagen, 2 mg (dry weight), was incubated with 0.5 ml of un-inoculated medium (A, used as a
blank) or 0.5 ml of culture supernatant of strain 4-2-1 (B) at
70°C and pH 8.5 for 0 min (left) and 60 min (right).
(Lower panels) Jerryfish, 1 g (wet weight), was incubated with
5 ml of un-inoculated medium (C, used as a blank) or 5 ml ofculture supernatant of strain 4-2-1 (D) at 70°C and pH 8.5 for
0 hr (left) and 30 hr (right).

性を観察した。ウシアキレス腱由来の I 型コラーゲンに培養上清を 70°C で作用させ 60 分後の状態を観察した
ところ，ブランクではほとんど固形物の量に変化が認められなかったが，培養上清を添加した区ではコラーゲン
基質が確認できない状態まで分解された（Fig. 5, upper
panels）。さらに，80°C でも同様に作用させたところ，
60 分後には基質が確認できない程度に分解された。これらのことから，4-2-1 株が生産するコラーゲン分解酵
素は 70°C から 80°C の高温領域で I 型コラーゲンに対辞献1) Altschul, S.F., W. Gish, W. Miller, E.W. Myers, and D.J.
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