Mode d'emploi

MagDEA® Dx SV
Version 2.2
Contenu : 30 avril. 2024

48 essaisCe réactif est conçu pour les systèmes d'automatisation. Veuillez lire attentivement et bien
comprendre ce document et le manuel d'utilisation du système avant de l'utiliser. Les séries
geneLEAD et magLEAD sont appliquées en tant que systèmes automatisés.
Cette nouvelle révision des instructions d’utilisation (IFU) inclut les modifications suivantes :- Ajout de l’échantillon cible à la section Utilisation prévue.
La composition, l’utilisation et les performances du produit restent inchangées.

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Sommaire
Symboles ..................................................................................................................................... 3
Résumé des caractéristiques du produit ........................................................................................ 4
2.1. Introduction ............................................................................................................................. 4
2.2. Utilisation prévue ..................................................................................................................... 4
2.3. Principe d'extraction (technologie Magtration®)......................................................................... 5
2.4. Contenu du kit.......................................................................................................................... 5
2.5. Avertissements et précautions spécifiques aux composants ....................................................... 6
2.6. Temps de traitement ................................................................................................................ 8
2.7. Conditions de stockage ............................................................................................................. 8
3. Comment utiliser ce produit ......................................................................................................... 8
3.1. Consignes de sécurité ............................................................................................................... 8
3.2. Procédure d’utilisation ............................................................................................................. 9
4. Performances des réactifs ............................................................................................................ 94.1. Test de linéarité d'extraits de diverses matrices d'échantillons, dopés avec le bactériophage ADN
M13 ............................................................................................................................................... 94.2. ADN génomique de sang complet humain ............................................................................... 10
5. Dépannage .................................................................................................................................11
1.
2.

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1.

SymbolesDispositif médical de diagnostic in vitro
Représentant autorisé dans la Communauté européenne
Mise en garde
Code de lot/numéro de lot
Numéro de catalogue
Contenu
Identification unique de l'appareil
Limites de température
Suffisant pour
Ne pas réutiliser
Consulter le mode d’emploi
FabricantDate limite d’utilisation
Toxicité aiguë

Toxicité aquatique aiguë

Inflammable

Danger pour la santé

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2.

Résumé des caractéristiques du produit

2.1. Introduction
MagDEA® Dx SV est le réactif d'extraction d'acide nucléique pour le système d'extraction–diagnostic
entièrement automatisé. (Les séries geneLEAD et magLEAD sont appliquées en tant que systèmesautomatisés.) Le système est basé sur la technologie Magtration® et il est possible d'utiliser des échantillons
jusqu'à 200 µL ou jusqu’à 400 µL. L'acide nucléique extrait peut être utilisé pour l'analyse PCR ou RT-PCR entemps réel, et il est possible d'utiliser ce kit de réactifs spécifique par une procédure simple. Le systèmed'extraction automatisé PSS est basé sur la technologie Magtration® et les particules magnétiques, et il n'ya pas besoin d'étapes de centrifugation ou de colonne de centrifugation. L'utilisation de MagDEA® Dx SV
réduit considérablement le risque de contamination depuis l'extérieur. Un autre avantage est que cetteprocédure extrait un acide nucléique de haute qualité plus rapidement qu’un processus manuel.
2.2. Utilisation prévue« MagDEA Dx SV » est une cartouche prête à l’emploi qui contient des réactifs destinés à l’extraction età la purification des acides nucléiques (AN). Ces réactifs sont utilisés en combinaison avec les systèmesmagLEAD et geneLEAD.
Le protocole d’isolation des acides nucléiques s’appuie sur des billes magnétiques et est conçu pour la
préparation automatisée d’ADN génomique (humain, bactérien et viral) et d’ARN génomique viralextrêmement purs à partir des échantillons cliniques humains mentionnés ci-dessous.
Les performances du produit sont fondées sur l’évaluation des performances réalisée à partir des typesd’échantillon ci-dessous.
: sang total collecté dans de l’EDTA ou du citrate, plasma sanguin collecté dans de l’EDTA ou du citrate,
sérum, urine, liquide cérébrospinal (LCS), expectoration, selles, prélèvements respiratoires(prélèvement nasal, prélèvement de gorge).

Mise en garde⚫

Règlement (UE) 2017/746 Annexe VIII RÈGLES DE CLASSIFICATION À la suite de l'évaluation
selon la règle 1-5, ce produit est de classe « A » car il correspond à la Règle 5 (a).

⚫

Les performances du kit MagDEA Dx SV ont été établies par une évaluation des performances
à l'aide des matrices d'échantillons mentionnées ci-dessus pour l'extraction de l'acide
nucléique.
La validation du kit est limitée aux matrices d'échantillons mentionnées ci-dessus dans lasection Utilisation prévue.
Aucune garantie n'est donnée pour l’utilisation d’échantillons différents de ceux validés par
Precision System Science Co., Ltd. L'utilisateur est responsable de valider les performances duproduit s'il est utilisé avec des tests différents de ces échantillons.

⚫

Informez votre représentant PSS et votre autorité compétente locale de tout incident grave
pouvant survenir lors de l'utilisation de ce produit.

⚫

L'utilisateur est responsable de valider les performances du produit s'il est utilisé avec destests différents de ceux validés par PSS comme indiqué dans le mode d’emploi.

⚫

Ce produit doit être manipulé par du personnel qualifié, compétent et formé aux techniquesde biologie moléculaire, telles que l'extraction, l'amplification et la détection d'acides
nucléiques, afin d'éviter des résultats incorrects avec des conséquences potentiellement
graves pour le patient lors des étapes ultérieures de l'analyse effectuée sur les acides

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nucléiques extraits.

2.3. Principe d'extraction (technologie Magtration®)
La technologie Magtration® est basée sur des particules magnétiques situées à l'intérieur d'une pointe,
pour séparer les particules du liquide. (1) L'échantillon est préparé. (2) Les protéines contenues dansl'échantillon sont lysées à l'aide de la protéinase K et d'une solution de lyse. (3) L'acide nucléique est absorbé
par des particules magnétiques à surface hydrophile à l'aide d'ions chaotropes et d'alcool. (4) Les particulesmagnétiques sont récupérées à partir du tampon de réaction par la technologie Magtration®. (5) Les
particules magnétiques sont lavées à l'aide d'un tampon de lavage contenant de l'alcool. (6) Les particulesmagnétiques sont récupérées du tampon de lavage par la technologie Magtration®. (7) L'acide nucléique estélué en utilisant de l'eau chaude comme tampon d'élution, et l'éluat est récupéré dans le tube de collecte.

Échantillon

LysecellulaireAN
Adsorption
auxparticulesmagnétiques

Séparation
magnétique

LavageSéparation
magnétique

Élution

2.4. Contenu du kit
Le kit contient 48 cartouches unitaires d'extraction d'acide nucléique préremplies
Chaque cartouche d'extraction d'acide nucléique contient :Cartouche de réactif d'extractiond'acide nucléique
Puits 8

Puits 1
Code 2D

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Puits NoNom du réactif

Quantité1

Solution de lyse

400 µL

2

Solution PK

80 µL

3

Solution de transport

80 µL

4

Particules magnétiques

200 µL

5

Tampon de liaison

1000 µL

6

Tampon de lavage 1

1200 µL

7

Tampon de lavage 2

700 µL8

Eau distillée

1200 µL

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2.5. Avertissements et précautions spécifiques aux composants
Les composants suivants du MagDEA Dx SV contiennent des réactifs dangereux.
Pour plus d'informations, veuillez consulter les fiches de données de sécurité.
Déclarations de danger et précautions SGH des composants :Solution de lyse
Contient du chlorure d'hexadécyltriméthylammonium et du chlorure de guanidinium
Danger
H302 :

Nocif en cas d'ingestion.

H315 :

Provoque une irritation cutanée.

H319 :

Provoque une grave irritation des yeux

H335 :

Peut irriter les voies respiratoires.

H400 :

Très toxique pour les organismes aquatiques.

H410 :

Très toxique pour les organismes aquatiques, entraîne des effets néfastes à long terme.

P261 :

Éviter de respirer les poussières/fumées/gaz/brouillards/vapeurs/aérosols.

P264 :

Se laver les mains soigneusement après manipulation.

P270 :

Ne pas manger, boire ou fumer en manipulant ce produit.

P271 :

Utiliser seulement en plein air ou dans un endroit bien ventilé.

P273 :

Éviter le rejet dans l’environnement.

P280 :

Porter des gants de protection/des vêtements de protection/un équipement de protection des yeux/
du visage.

P301+P312 :EN CAS D'INGESTION : Appeler un CENTRE ANTIPOISON ou un médecin en cas de malaise.

P302+P352 :EN CAS DE CONTACT AVEC LA PEAU : Laver abondamment à l'eau.

P304+P340 :EN CAS D'INHALATION : Transporter la personne à l’extérieur et la maintenir dans une position où ellepeut confortablement respirer.

P305+P351+P338 :EN CAS DE CONTACT AVEC LES YEUX : Rincer avec précaution à l'eau pendant plusieurs minutes.
Enlever les lentilles de contact si la victime en porte et si elles peuvent être facilement enlevées
Continuer à rincer.

P312 :

Appeler un CENTRE ANTIPOISON ou un médecin en cas de malaise.

P321 :

Traitement spécifique.

P330 :

Rincer la bouche.

P332+P313 :En cas d'irritation cutanée : Consulter un médecin.

P337+P313 :Si l'irritation oculaire persiste, consulter un médecin.

P362 :

Enlever les vêtements contaminés.

P391 :

Recueillir le produit répandu.

P403+P233 :Stocker dans un endroit bien ventilé. Maintenir le récipient fermé de manière étanche.

P405 :

Conserver sous clé.

P501 :

Éliminer le contenu/récipient conformément à la règlementation nationale.

Tampon de liaison Tampon de lavage 1 et Tampon de lavage 2
Contient du propan-2-ol

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Danger
H225 :

Liquide et vapeurs très inflammables.

H319 :

Provoque une sévère irritation des yeux.

H335 :

Peut irriter les voies respiratoires.

H361 :

Susceptible de nuire à la fertilité ou au fœtus.

H370 :

Cause des dommages aux organes.

H372 :

Cause des lésions aux organes en cas d’exposition prolongée ou répétée.

H373 :

Peut causer des dommages aux organes à la suite d’expositions répétées ou d’une exposition
prolongée.

P201 :

Se procurer les instructions spéciales avant utilisation.

P202 :

Ne pas manipuler avant d'avoir lu et compris toutes les précautions de sécurité.

P210 :

Tenir à l'écart de la chaleur, des surfaces chaudes, des étincelles, des flammes nues et de toute autre
source d’inflammation. Ne pas fumer.

P233 :

Maintenir le récipient fermé de manière étanche.

P240 :

Mise à la terre/liaison équipotentielle du récipient et du matériel de réception.

P241 :

Utiliser du matériel électrique/de ventilation/ d’éclairage.

P242 :

Ne pas utiliser d’outils produisant des étincelles.

P243 :

Prendre des mesures de précaution contre les décharges statiques.

P260 :

Ne pas respirer les poussières/fumées/gaz/brouillards/vapeurs/aérosols.

P261 :

Éviter de respirer les poussières/fumées/gaz/brouillards/vapeurs/aérosols.

P264 :

Se laver les mains soigneusement après manipulation.

P270 :

Ne pas manger, boire ou fumer en manipulant ce produit.

P271 :

Utiliser seulement en plein air ou dans un endroit bien ventilé.

P280 :

Porter des gants de protection/des vêtements de protection/un équipement de protection des yeux/
du visage.

P303+P361+P353 :EN CAS DE CONTACT AVEC LA PEAU (ou les cheveux) : Enlever immédiatement tous les vêtements
contaminés. Rincer la peau à l’eau/se doucher.

P304+P340 :EN CAS D'INHALATION : Transporter la personne à l’extérieur et la maintenir dans une position où ellepeut confortablement respirer.

P305+P351+P338 :EN CAS DE CONTACT AVEC LES YEUX : Rincer avec précaution à l'eau pendant plusieurs minutes.
Enlever les lentilles de contact si la victime en porte et si elles peuvent être facilement enlevées
Continuer à rincer.

P308+P311 :En cas d’exposition ou d’inquiétude : Appeler un CENTRE ANTIPOISON ou un médecin.

P308+P313 :En cas d’exposition prouvée ou suspectée : Appeler un CENTRE ANTIPOISON ou un médecin.

P312 :

Appeler un CENTRE ANTIPOISON ou un médecin en cas de malaise.

P314 :

Consultez un médecin en cas de malaise.

P321 :

Traitement spécifique.

P337+P313 :Si l'irritation oculaire persiste : Consulter un médecin.

P370+P378 :En cas d'incendie : Utiliser du dioxyde de carbone, de la mousse, de la poudre chimique sèche et del'eau pulvérisée pour l’extinction.

P403+P233 :Stocker dans un endroit bien ventilé. Maintenir le récipient fermé de manière étanche.

P403+P235 :Stocker dans un endroit bien ventilé. Tenir au frais.

P405 :

Conserver sous clé.

P501 :

Éliminer le contenu/récipient conformément à la règlementation nationale.

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2.6. Temps de traitement
Le temps de fonctionnement dépend du protocole.
Protocole

Protocole 200 µL

Protocole de sang complet de 400 µL

Protocole d’autre matrice de 400 µL

Temps deEnviron 25 min.

Environ 40 min.

Environ 30 min.

traitement

2.7. Conditions de stockage
Conserver le kit de réactifs d'extraction entre 10 et 30 °C. Ne pas congeler, et conserver le réactif à l'abri
des températures élevées, de l'humidité ou des vibrations. Pour éviter que le kit de réactifs ne soit exposé
à la lumière directe du soleil, veuillez conserver les réactifs dans des boîtes externes pour les stocker après
utilisation.
Toujours stocker les cartouches du kit avec le sceau vers le haut et non inclinées.

3.

Comment utiliser ce produit

3.1. Consignes de sécurité
Vérifier les éléments suivants avant utilisation.

・ Ce kit de réactifs d'extraction est dédié uniquement au système d'automatisation. Par conséquent,veuillez lire attentivement le manuel d'utilisation de l'instrument avant de l'utiliser.
・ En cas de messages d'erreur de l'instrument, veuillez consulter le manuel d'utilisation de l'instrument.
Remarques pour une utilisation en toute sécurité
・ Comme le réactif à l'intérieur de la cartouche préemballée contient des matières toxiques ou
inflammables, consulter les mentions de danger et de mise en garde de la fiche de données de sécurité(FDS) et faire attention au paragraphe concernant la manipulation en sécurité.
・ Suivre les consignes de sécurité du laboratoire et faire attention aux risques d'infection.
・ Ne pas boire et ne pas fumer à proximité de la zone de test.
・ Porter des gants de protection, une blouse et un équipement de protection des yeux lors de l'utilisation
du kit.
・ Jeter les gants et se nettoyer soigneusement les mains après utilisation.
Remarques concernant l'élimination
・ Lors de l'élimination des réactifs ou des consommables, les manipuler en tant que risques d'infection.
Consulter la FDS et suivre votre règlementation régionale pour les produits jetables.
・ Les réactifs comprennent de l'alcool isopropylique, donc à tenir à l'écart du feu ou des objets explosifs
lors de l'élimination.
Remarques sur les performances des réactifs
・ Ne pas utiliser lorsque la cartouche ou le sceau en aluminium est endommagé ou fuit.
・ Ne pas utiliser de kit de réactifs périmé.
・ Ne pas réutiliser la cartouche d'extraction ou le portoir de pointes.
・ Ne pas endommager ou salir le code 2D.
・ Avant utilisation, si le réactif adhère à la paroi à l'intérieur du puits de la cartouche, faire vibrer/donner
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un à-coup brièvement pour que les gouttes tombent sans créer de bulles.
・ L'élution est constituée d'eau distillée, mais le volume d'élution final peut varier en raison des résidus
sur les particules magnétiques, la surface de la pointe ou en raison de l'évaporation.
・ Ne pas laisser le réactif trop longtemps sur l'instrument avant de commencer.
・ Il est recommandé d'utiliser des contrôles pour la PCR, tels que le contrôle interne ou le contrôle positif,pour obtenir des résultats de diagnostic fiables.
3.2. Procédure d’utilisation
Avant utilisation, veuillez lire attentivement la procédure d'utilisation du système d'automatisation dansle manuel d'utilisation.
Un kit de consommables vendu séparément est nécessaire.
1. Allumer l'instrument.
2. Sélectionner les fonctions à partir de l'interface utilisateur graphique (GUI).
3. Préparer la cartouche de réactif d'extraction, le jeu de pointes inclus dans le kit de consommables vendu
séparément et échantillonner en utilisant l'interface graphique. Avant utilisation, si le réactif colle àl'intérieur de la paroi du puits de la cartouche, faire vibrer brièvement pour que les gouttes tombent
sans créer de bulles.
La consommation d'un échantillon est la suivante. Préparer le réactif et les consommables selon
l'interface graphique de l'instrument.
Cartouche d'extraction d'acide nucléique MagDEA® Dx SV
1 pce
Jeu de pointes
1 pce
Tube de collecte
1 pce
Tube d’échantillon
1 pce
4. Sélectionner le protocole à l'aide de l'interface graphique de l'instrument ou du PC.
5. S’assurer de régler correctement MagDEA® Dx SV, le tube d'échantillon ou le tube de sonication (sinécessaire, le capuchon de sonication), le tube de collecte pour l'élution, le portoir de pointes et les
cartouches PCR en fonction des instructions de l'interface graphique.
6. Fermer le capot avant de l'instrument.
7. Appuyer sur le bouton Démarrer pour démarrer le processus d'extraction d'acide nucléique.
8. Une fois le processus terminé, ouvrir le capot avant en suivant les instructions de l'interface graphique.

4.

Performances des réactifs

Les tests de performance ont été validés à l'aide de geneLEAD XII plus de PSS. Le résultat PCR de l'extrait
dépend des conditions PCR et du système d'amplification.
4.1. Test de linéarité d'extraits de diverses matrices d'échantillons, dopés avec le bactériophage ADN M13
Le bactériophage d'ADN M13, en utilisant 10 µL et 7 concentrations différentes, a été ajouté à 200 µLd’échantillons de fluides corporels humains suivants : sérum, plasma (EDTA-2Na), plasma (ACD), écouvillon(gorge), écouvillon (nasal), liquide céphalo-rachidien (LCR) et urine. Ces échantillons ont été préparés aux
nombres finaux de 1 × 102, 3, 4, 5, 6 7 et 8 copies/extraction (5 répétitions). L'ADN a été extrait à l'aide de
MagDEA® Dx SV sur geneLEAD XII plus, et les extraits ont été amplifiés par PCR à l'aide d'ABI 7500 Dx fast(sonde TaqMan spécifique à M13). 100 copies/extraction ont été détectées dans tous les tests. Les pentes,

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le coefficient de détermination (R2), l'efficacité de la PCR et l'ordonnée à l'origine ont été calculés à l'aide
des valeurs Ct obtenues à partir d'échantillons entre 1 x 102-8 copies/extraction (tableau 1). Aucune
différence n'a été observée entre les espèces d'échantillons. La courbe d'amplification PCR et le graphiquede tracé de linéarité utilisant le sérum sont illustrés dans la figure 1.
Tableau 1.

L'analyse du test de linéarité montrant les valeurs Ct obtenues à partir de sept matricesd’échantillons humains différents.
Sérum

PlasmaPlasmaÉcouvillon

Écouvillon(EDTA)(ACD)(Gorge)(nasale)

FSC

Urine

Pente

-3,447-3,406-3,415-3,369-3,391-3,361-3,397

Coefficient de détermination (R2)

0,995

0,997

0,998

0,999

0,999

0,996

0,998

Efficacité de la PCR (%)

95,02796,59496,25398,061

97,21598,40596,954

Ordonnée à l'origine

41,86341,556

41,782

41,097

41,46340,88341,052sérum

copies/ext.

Figure 1.

Graphique de tracé de linéarité montrant le nombre de copies et les valeurs Ct du sérum
contenant le bactériophage M13 comme données typiques.

4.2. ADN génomique de sang complet humain
L'ADN génomique a été extrait d'échantillons de sang complet humain EDTA-2Na (échantillon A) ou
ACD (échantillon B) à l'aide de MagDEA® Dx SV pendant 6 jours au total (6 répétitions par cycle). Les nombresde globules blancs (GB) des échantillons A et B étaient respectivement de 6,4 et 9,2 k/µL. Les concentrations
et puretés des extraits ont été mesurées à l'aide du spectromètre ND-1000 (NanoDrop) (Figure 2). Après 6essais, il n'y avait pas de variations significatives entre les deux échantillons.

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Tableau 2.

A 260/280 et l'A 260/230 de l'ADN génomique d'un échantillon de sang complet.
A260/230

A260/280

Spécimen A

1,70 ± 0,11

1,88 ± 0,06

Spécimen B

1,85 ± 0,17

1,89 ± 0,05

7.00

Rendement (µg)

6.00
5.00

Spécimen
A 6.4 k/uL)Specimen
A (wbc4.00(globules blancs 6,4 k/uL)

3.00
SpecimenB (wbcSpécimen
B 9.2 k/uL)

2.00(globules blancs 9,2 k/uL)

1.00
0.00
Day11 JourDay 22 JourDay 33 JourDay 44 JourDay 55 JourDay 66
Jour
Figure 2.

5.

Rendement de l’ADN génomique à partir d'un échantillon de sang complet.

Dépannage

En cas de découverte d'une erreur générale, veuillez suivre la procédure ci-dessous. Veuillez suivre lemanuel d'utilisation de l'instrument en cas d'erreur de l'instrument.
(1) Faible rendement d'extraction, pas assez pur
Cause première
Mesure corrective
État de l'échantillon
Vérifier si les conditions de stockage de l'échantillon sont appropriées ou
non.
Utiliser un échantillon frais ou un échantillon stocké dans des conditions
appropriées. La quantité d'extraction peut varier pour un échantillon
réfrigéré ou congelé.
État du réactif
Vérifier que les conditions de stockage de la cartouche de réactif
d'extraction sont appropriées. En cas de stockage du kit au réfrigérateur,placer le réactif à température ambiante avant utilisation.
Ne pas congeler le réactif et éviter les lieux de stockage soumis à desvibrations.
Articles solides restants
Certains extraits d'échantillons spécifiques avec des éléments solides
restant à l'intérieur peuvent provoquer un empilement dans les pointes
et le processus de mélange peut ne pas fonctionner correctement.
L'échantillon doit contenir une solution claire pour une manipulation en
douceur avec une pipette de 1000 uL. Ne pas utiliser d'échantillon solide
pour l'extraction.
Contamination
Bien nettoyer toutes les pièces de l'instrument après utilisation, ycompris toutes les surfaces en utilisant de l'hypochlorite de sodium à
0,1 %, puis nettoyer avec de l'éthanol à 70 %.
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Problème du systèmed'automatisation(2) L'ARN est dissout
Cause première
Trop grande quantité
dans l'échantillon
Stockage trop long del'élution
Contamination par de la
RNase externe

Consulter le code d'erreur du système d'automatisation et agir
conformément à la mesure corrective.

Mesure corrective
En cas d'ajout d'une concentration d'échantillon trop élevée, la RNase nepeut pas être inactivée. Réduire la concentration de l'échantillon.
Ne pas conserver l'échantillon élué trop longtemps à températureambiante après l'extraction. Serrer le bouchon du tube d'élution dès que
possible et conserver les échantillons à -80 °C.
Bien nettoyer toutes les pièces de l'instrument après utilisation, ycompris toutes les surfaces en utilisant de l'hypochlorite de sodium à
0,1 %, puis nettoyer avec de l'éthanol à 70 %. Après utilisation, nettoyer
soigneusement toutes les pièces de la surface de l'instrument à l'aide
d'un agent d'élimination de la RNase.

Magtration® et MagDEA® sont des marques déposées appartenant à Precision System Science Co., Ltd.
Ces explications sont basées sur les conditions de avril 2022.
Veuillez noter que les informations telles que les spécifications peuvent être modifiées sans préavis.

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Tél. : +81 (0) 47-303-4801 Fax : +81 (0) 47-303-4811
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Courriel : service@pss.co.jp
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5673 West Las Positas Blvd., Suite 202, Pleasanton, CA 94588, U.S.A.
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55122 Mainz, Mombacher Str. 93, Germany
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Westervoortsedijk 60 6827 AT Arnhem The Netherlands

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