GraphPad Prism バイエル
有限会社エムデーエフ
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このガイドの内容は、Prism 8 のヘルプに準じております。

目次

目次
第1章 はじめに第2章 5： t 検定の実行

304
4. . . . . . . . . . . . . . . . . . .フ. . .作成......................................................................................................... 5
データ. . . .入力とグラ
2 分析の実行................................................................................................................................... 93 分析結果を見る................................................................................................................................... 13
4 分析. .の. . . .や. . . .り. . .直し...................................................................................................................... 151

索引© 2020 有限会社エムデーエフ

1741GraphPad Prism バイエル

はじめに
この資料は、GraphPad Prismユーザーが、自身でデータの読み込みから分析およびグラフの作成までを学習するための資料です。GraphPad Prismの操作について、詳細について説明が行われています。
例を順番に読む必要はありません。直接最も興味のある例に進むことをお勧めします。
章の見出しだけでは分からないテクニックを見つけるために、目次と索引を調べましょう。
説明と図はWindows版 Prism についてのもですので、例題の中にはMac版 Prism とは多少異なるものもあります。
このマニュアルを、お使いのコンピュータで読みながら、各ステップを試してみることをお勧めします。
始める前に、Prismの 表示/View メニューを使用して、ナビゲータとすべてのオプションのツールバーがコンピュータに表示されていることを確認してください。

25： t 検定の実行ｔ検定は、異なる処置が施された2つの群の結果を比較するために使用される典型的な検定です。もちろん、実験を行う前に綿密な実験計画が必要であり、集計されるデータも予測される範囲内に収められているようなものでなければなりません。そして、実験結果は慎重に吟味されなければなりません。
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5： t 検定の実行
2.15

データ入力とグラフ作成

ようこそ/Welcome ダイアログで新しいテーブルとグラフ/New Table & Graphからカラムプロット/Columnを選択します。また、新規テーブルへデータの入力/インポート/Enter or import data into a new table を選択後、列に繰り返し値を入力/Enter replicate values, stacked into columns を選びます。 最後に作成/Createボタンをクリックします。Prism がデータテーブルを表示します。

以下にに示すデータを入力してください。2つのグループ 「Con rol と「 rea ed におけるデータを比較してみましょう。
tTt」

的な 計 フ では次に示すようなインデックス多いようです。
一般」

統ソトGroup Value© 2020 有限会社エムデーエフ

でデータを入力することが形式

14.5

1

3.7

6GraphPad Prism バイエル
15.3

15.4

1

3.9

2

5.6

2

6.4

2

6.4

2

6.0

2

5.7のインデックスの でグループを させ、 の にデータを入力します。
Prismはこのようなインデックス を ー していません。 詳細は ユーザー イ の データのインポートおよびエクスポート を してください。
グラフを表示してみましょう。ナビゲーターで、グラフフ ルダーの下に作成されたデータシー とのグラフシー をクリックしてください。グラフの はの目的によ て異なるでしょう。しかし、2つのグループの を的確に示すが です。ここで 用するデータは を行う前後のデータですが、 前後のはないものとします。ですから、グループの異なるデータ を で結 ようなグラフは 適 です。
開いた グラフ形式の変更/Change Graph Type ダイアログで、散布図/Scattter
plot を選択し、プロット/Plot で 平均値/Mean を設定します。
左側列

判別形式

ズガ

ドサポ

『右側列

ト日本語』

参照

ォト名研究者

同じ名称

トっ種類

大切関係

利応情報

治療

事

治療

点同士

不線対

ぶ切© 2020 有限会社エムデーエフ

5： t 検定の実行

7

OKボタンをクリックすると、 入力されたデータによるグラフが表示されます。更に作成されたグラフのY軸をダブルクリックし、開かられた軸のフォーマット/ Format
Axesダイアログで、以下の図のように設定を行います。

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8GraphPad Prism バイエル

このグラフの をカラム散布図と呼びます。全てのデータ がプロッ され、カラム( )ごとにグループ化されています。各グループの水平 は平均値を示しています。
平均値の横棒だけでなく SEM や SD のエラーバーも表示する場合は変更/Change…
XY列の外観表示/Column Appearance…と操作し (あるいは、グラフ上の任意の箇所をダブルクリックし)、開いた グラフフォーマット/Format Graph ダイアログ
で、外観/Appearance タブにある プロット/Line at ロップダウンリス で変更します。
事列点ト線ドト© 2020 有限会社エムデーエフ

5： t 検定の実行

9グラフの を箱ひげ図や棒グラフに変更する時は 変更/Change… グラフ形
式/Graph Type… と操作します。のあるグループデータの場合、 のあるデータ を直 で結 前後比較/before-and-after グラフも 用できます。
形式

対応

対応

同士線ぶ

利2.2

分析の実行

グラフを作成したところでツールバーの 分析/Analyze アイコンをクリックします。カラム分析/Column analyses からｔ検定(及びノンパラメトリック検定)/ttests (and nonparametric tests) を選択します。 データシー には目的のデータ以外のデータは入 ていないので、分析するデータを設定する 分析するデータセッ
ト/Analyze which data sets? の項目で全て(2つ)のデータセッ が選択されていることを確認してください。もちろん、複数のデータセッ が用意されている場合は比較する2つのデータセットを選択し、OKボタンをクリックします。
トっトト© 2020 有限会社エムデーエフ

10GraphPad Prism バイエル

パラメータ: t 検定 (およびノンパラメトリック検定)/Parameters: t Tests (andNonparametric Tests) ダイアログボックスの実験意図タブとオプションタブで分析に必要な内容を設定します。
· 目的の検定手法が分か ている場合は ロップダウンリス からそれを選択します。Prismは自動的にオプションの設定を行います。 番下の ヘルプ/Learn
ボタンで 用するヒン が得られます。
· 目的のオプションを選択します。 Prism は自動的に検定方法を変更します。
っドト

一利ト

この他にも検定を行うにあた て、実験意図タブではユーザが決めるべき項目があります。
· 「の有無を設定します。 2つのグループ間のデータで が取れている
場合は 対応あり/Paired を選びます。 グループ間の の例をひとつあげてみます。例えば、ある個人について 前のデータ「con rol と、 後のデータ「 rea ed を取 たとします。このような場合のデータは「 のあるものとして考えます。ヘルプ/Learn ボタンを 用すると、このような例がたっ対応」

対応

対応

治療tt」

tっ」

治療対応」

利© 2020 有限会社エムデーエフ

5： t 検定の実行

11

くさん紹介されています。いま、操作しているデータは の無いものとします。
· 目的のデータが ウス(正規)分布と仮定できない場合は、ノンパラメトリック
検定/nonparametric test のオプションをチェックします。 ンプルデータを元に、母集団の分布をPrismが自動的に 定するような機能は用意されていません。実験に する既知の 柄から、分布に する設定を行 てください。 t検定はパラメ リック検定のひとつです。分布を仮定するにあたり、詳細なが必要な場合は ヘルプ/Learn ボタンをクリックします。
· 等分散に疑問がある場合には、Wel chの補正/ Wel ch's correcti on を選択します。
対応ガサ

判関事

関っト情報

各データグループの記述 計量が必要な場合は オプション/Option タブで· 片 または両 検定の設定を行います。
的には両 検定が 用されます。
場合は詳細な の入手には ヘルプ/Learn ボタンを 用してください。
· 各列の記述統計量のテーブルを作成/ Descripti ve statistics for each data
set のオプションを選択します。
· オプションの設定に自信が無い場合や明確でない場合は、Prismのデフ ル の設定に従うか、推奨/recommend とな ているものを選択してください。
統側

側

一般情報側

利利ォ

っダイアログの様子を次に示します。

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ト12GraphPad Prism バイエル© 2020 有限会社エムデーエフ

5： t 検定の実行

13

OKボタンをクリックするとダイアログが閉 られ、分析結果が結果/Resul sセクションに表示されます。
じ2.3

t

分析結果を見る

記述 計量を求めるオプションを選択していれば、ナビゲーター画面のResul フ ルダの下に 記述統計/ Descriptive statistics というシー が作成されます。
統t

ォ

ト

検定の結果の 結果の表/Tabular results タブに表示されます。そのシー を実際に見てみるとP値は0.0055とな ています。 前と後で母集団が等しいと仮定したとき、 ンプリングした2つのデータのような差が生 る可能性は僅か、0.55% しかなtトっサ© 2020 有限会社エムデーエフ

治療

じ14

GraphPad Prism バイエル

いということです。これは有意水準として 用される5%よりもはるかに小さい値です。つまり、2つのグループには明らかな差があると 定できます。
シー には両 の平均値の差が1.46と計算されています。母集団の平均の差に する
95%信頼区間は 0.5669 ～ 2.353です。 この は、周知のように平均値の差がこの範囲に存在する確率が95% であるということです。実際、何回も実験を行うと、この範囲のなかにほとんどの値が収まります。
利判ト者

関事

※SEMA： AのSEM (標準誤差) SEM ： のSEM (標準誤差)です。
列,B

列B

すべての 計分析は仮定に いています。ツールバーにある チェック/Interpret
アイコンをクリックすると、仮定を確認するための イン が表示されます。
統基づポト© 2020 有限会社エムデーエフ

5： t 検定の実行

15

必要に て ルプ機能を使 て、P値、有意水準、信頼区間などについても、その意味を確認しておきましょう。
また、Prismでは のないｔ検定を実行すると自動的に2つの群の分散を比較する検定も 時に行われます。 検定での 無仮説は、「比較する2群の分散はほ 等しい です。
応じっヘ対応F同F

帰ぼ」

ここでは、 検定量は 4.2 2、分子の自 ( n)は 4、分母の自 ( d) は 4です。P値は 0.1 9で、 無仮説は でき 2群の分散はほ 等しいと えます。
F8872.4

帰由度

棄却

DF由度

ずぼDF

言

分析のやり直しパラメータを変更して分析をやり直すことができます。ナビゲーターウ ン ウで目的の分析結果シー を選択します。
そして 変更/Change メニューから 分析パラメータ/Analysis Parameters… を選択します。パラメータ: t 検定 (およびノンパラメトリック検定)/Parameters: tTests (and Nonparametric Tests) ダイアログが表示されますので、そこでを変更します。このダイアログは、目的の結果シー を表示させ、ツールバーあるいは結果シー の 分析パラメータの変更/Change analysis parameters アイコンをクリックしても表示されます。
ィドト

、

条件トト

そして OK ボタンをクリックします。すると、 計算が実行され、 たな分析結果シー が表示されます。
再ト© 2020 有限会社エムデーエフ

新索引

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