GraphPad Prism バイエル
有限会社エムデーエフ
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内容で使用されるGraphPad Prismは、Prism バージョン 8 です。

目次

目次
第1章 1：カラムプロット/Column形式データによる棒グラフ

304. . . . . . .ラフ. . . . . . . .の作成................................................................................................................ 4
カラム. . . .棒グ
2 列の記述統計量の計算................................................................................................................................... 83 結果シ. . . .ート. . . . . . .の. . . .内容. . . . . . . .について............................................................................................................ 94 カラム. . . . . .棒グ. . . . . . .ラフ. . . . . . . .の編集.............................................................................................................. 105 散布図と. . . . . . . . . .バイ. . . . . . .オリ. . . . . . . .ンプロット.......................................................................................................... 151

索引© 2020 有限会社エムデーエフ

1741GraphPad Prism バイエル

1：カラムプロット/Column形式データによる棒グラフ
Prismで作成可能な棒グラフは、大きく分けて3つのタイプに分類することが出来ます。
· この章では、カラム棒グラフの作成とフォーマット方法を説明します。 カラム棒グ

表示
1 ル 変数
便利 1列形式
そt 検定や1-way ANOVA 実行 列 統計量 求め もル ロ /G ouped形式 ・シル 変数 2 場合
『2： ルロ /G ouped形式
よ』 参照
ださい
折れ線
同時 ロ
り 水 向 位置 X 指定
場合 『 ：線 ロ 』 参照 ださい
ヒストグラム—度数を棒グラフで示すもの—については『3：ヒストグラムと度数分布』で解説します。
ラフは入力したY値(データセット)の平均値をします。 グ ープのグラフ作成には、このカラム棒グラフがです。 にY値を入力するなので、 のままをでき、 値のをること 可能です。
· グ ーププ ット r
データート (グ ープが つの)の棒グ
ラフは、
グ ーププ ット r
データに る棒グラフ をしてく。
· 棒グラフとグラフをにプ ットした 、棒の 平方 のを 値でする
は、 4 棒グラフと曲 のプ ット をしてく。

1.1

カラム棒グラフの作成

ようこそ/Welcome

ロ表示されます。 そこでカラムプ

Prismを起動するとダイア グがの項目を選択します。

ロット/Column
ここに示すグラフを作成してみましょう。

ロ

1 ル 変数eat e t Group です。このグルー
t eated a e o eated
されています。よってダイアプ ットするデータは グ ープのデータ Tr m n
プは3つの群—Un r, Pl c b , Tr—から構成© 2020 有限会社エムデーエフ

1：カラムプロット/Column形式データによる棒グラフ

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ログでは 列に繰り返し値を入力/Enter replicate values, stacked into columnsを選択し、OKをクリックします。

X列 り
1行 表示され い A
いれり
場合

列だ

され変数 ル 示 も向 位置 行形 り

ここで作成するデータには はあ ません。Y のデータセット けで構成ます。以下の図で 目にて る ,B,Cはグ ープのレベ を す のです。 値が存在しな 訳ですから、こ らのデータの縦方 の( )には意味はあません。データを繰 返し観測したにこの うなデータセットの にな ます。

りXルよ

表示され いル テ ブ 名を右クリ ク
いシ 名の変更 Re e ee
ブル名や 析結果 シ 名
ブル名 利用 自 命名されもちろ 後 個別 シ 名 変更

左側のナビゲータにて るデフォ トの ー ルッ して、開たメニューから ート/ nam sh tを選択し目的のテーを入力します。グラフ 解の ート はデータテーをして 動的にます。
ん、 からに ート をできます。

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次のページに示すデータを実際にデータシートに入力してください。列名も図と同じように入力します。グループ全体の名前(グループ変数の名称)をテーブルに入力することはできません。Y列のラベルに「Untreated」, 「Placebo」, 「Treated」と入力します。

数値の表示形式は簡単に変更できます。表示形式を変更する列を選択し、変更/Change メニューで 数値表示形式/Decimal format... で変更します。あるいは
列を選択したまま右クリックし、数値表示形式/Decimal format... を選択するか、ツールバーのボタンをクリックして変更することも可能です。
カラム棒グラフが自動的に作成されます。画面左側のナビゲータ画面のグラフでPlasma level of GP-14858 というシート名をクリックします。

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1：カラムプロット/Column形式データによる棒グラフ

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グラフ形式の変更/Change Graph Type ダイアログが表示されます。目的のグラフ形式をクリックすると画面下に、グラフのサムネイルが表示されます。上図からも明らかなように一グループ変数の場合、カラムグラフ以外にもドットプロット(カラム散布図)や箱ひげ図が用意されています。ここでは棒グラフを作成します。 OK ボタンをクリックするとグラフが作成表示されます。

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8GraphPad Prism バイエル

各それぞれ異パン
塗り ぶ
それ
識別 容易 り 自さ同じ様式 変更 場合 ｢設定 一 変更 次 ボ ン

Prismは棒グラフの 棒をなる ター とカラーでつ します。にたグラフ でのデータセットのがにな ます。 動的に作成
る ての棒のター とカラーをにするは カラム棒グラフのをしてく。 てのデータセットのを 度でする の タ の方法がて ます。

より描画され上
れ 全
塗りパ ン編集｣ 参照 ださい 全
利用紹介され い1.2

列の記述統計量の計算

各列の記述統計量を求めてみましょう。分析/Analyze ボタンをクリックします。カラム分析/Column analyses のリストから 記述統計/Descriptive Statisticsを選択し、OKボタンをクリックします。次に表示される パラメータ： 列の統計/Parameters: Column Statistics ダイアログで求めたい記述統計量の項目をチェックします。

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1：カラムプロット/Column形式データによる棒グラフ

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OKボタンをクリックしてダイアログを閉じると、Prismは記述統計量を 結果/Resultsシートに出力します。

析結果シートは常にデータテーブルとリンクしています。よって、データを更析結果シートの内容も自動的に更新されます。

この分すると分新1.3

結果シートの内容について

列の統計/Column statistics
ロ
記述統計量計算や正規性検定
い 1標本ｔ検定 行ル 設定 基本 記
述統計量 され標準偏差 SD や標準誤差 SEM 一般 手 計算され いパ ン ル い
次 よ 算 され い例 サン ル数 各 共 等 5
各群の25%の順位は0.25*(5+1)= 1.5 となり、各群でデータを小さい方から順に並べると、Untreated の25%パーセンタイル値は、3*1+(3.4-3)*0.5=3.2。同様にPlaceboの25%パーセンタイル値は、2.3*1+(3.12.3)*0.5=2.7 となります。中央値(50%パーセンタイル値)、75%パーセンタイル値も同様に算出されます。
Prismのダイア グでは、、ある はを うことが可能です。デフォ トのでは、的なが出力ます。
( )()は的な 法でて ますが、 ーセ タイ 値につ ては、Prismでは の うに 出て ます。この では、プは 群 に しく なので、カラム棒グラフの編集
ナビゲータで黄色の グラフ/Graphs アイコンをクリックし、グラフを画面に表示します。次のように操作してグラフの見栄えを編集してみましょう。
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10GraphPad Prism バイエル

目的:
方法:
棒の表示スタイル 棒をダブルクリックします。グラフフォーマット/Format Graph ダイア
ログの 外観/Appearance タブを選択します。編集対象となるデータセットを確認します。 それから 背景/Fill, パターン/Pattern , 枠線/Border などの項目を変更します。外観/Appearance のドロップダ
ウンリストを利用すると、データの表示方法を例えば、箱ひげ図などに変更できます。ひとつのグラフ画面上で、異なるプロットスタイルを混在させることも可能です。すべてのデータセットの表示形式を同時に変更する
場合は すべて/All ボタンをクリックしてから、編集作業を行います。

X軸タイトルの編 「Xタイトル/Xtitle」をクリックします。 新しいタイトルを入力します。
ギリシャ文字を入力する時はa アイコンを利用します。入力を終えたら余集
白をクリックします。
軸タイトル位置の 軸タイトルの周辺にマウスを移動すると両端に矢印が表示されます。この
調整時にマウスをドラッグして軸タイトルを移動します。
目盛ラベル位置の 軸をダブルクリックします。軸のフォーマット/Format Axes ダイログ
から目的の タイトルとフォント/Titles & Fonts タブを選択します。そ調整
して 数値とラベル…軸からの距離/N umbering and labeling…
Distance from axis を編集して軸からの距離を設定します。
Y 軸タイトルの編 デフォルトの「Yタイトル/Ytitle」 をクリックするとタイトルが回転し、水平になります。新しいタイトルを入力します。ギリシャ文字の入力には集アイコンを利用します。入力を終えたら余白をクリックします。
Y軸目盛と数値の Y軸をダブルクリックします。 範囲/Range の項目の上の 範囲と…/Auto… のチェックを外すと表示範囲を指定できます。軸とそのオ編集
プション設定を変更します。
エラーバーをSEM 棒をダブルクリックして 外観/Appearance タブを表示します。すべからSDに変更する て/All ボタンをクリックし、プロット/Plot を SD付き平均値/Mean &SD に変更します。
1.4

カラム棒グラフの編集
ブル

グラフフォーマット/Format Graph ダイアログがグラフ上のデータセット/Data sets on Graph タブを使っ紹介

棒グラフをダクリックするとます。ここではた棒グラフの方法をします。

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1：カラムプロット/Column形式データによる棒グラフ

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棒の並べ替えプロットするデータセット（左から右へ）/Data sets plotted (left to right) の項
目で棒の並び順を変更できます。目的のデータセットを選択したら、画面右にある 一番上へ/Top , 上へ/ Up , 下へ/Down , 一番下へ/Bottom ボタンをクリックします。逆順/Reverse ボタンを使うと、全く逆の順序に並べ替えられます。

棒の間隔を変更する

間隔 一様 変更 場合 選択した… /Space between … の項目を利用しれ 編集 も全体 さ 変わりません。棒の間隔をお大きくす
逆 幅 狭 り棒の太さを変更する
棒の間隔を一様に変更する場合は、グラフの設定/ Graph Settings タブの カラムバーの太さ / Dimensions の項目で行います。
棒のをにするは、ます。こ をして グラフの大き はると、 に棒の が ま ます。

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12GraphPad Prism バイエル

X軸の右端に表示されるハンドルをドラッグして棒の間隔を広げることもできままた、す。

だ も同時に太くなってしまいます。軸の下に表示されるラベルが長く、隣ル 間隔が狭い場合にはこの方法で間を広げた方が、美しく見えます。
ある棒とその他の棒との間隔を意図的に広げたいような場合は次のようにします。プ
ロットするデータセット/Data sets plotted セクションで目的のデータセットを選択します。そのデータセットの左側の間隔が大きくなります。次に 選択したデータセッ
トと前のデータセットとの間隔/Space between selected data set and theprevious one: の値を変更します。次の図のようにすると、2番目と3番目の棒の間隔が広がります。
この方法 と棒のラベ との© 2020 有限会社エムデーエフ

1：カラムプロット/Column形式データによる棒グラフ

棒グラフの各バーに注釈を付ける© 2020 有限会社エムデーエフ

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注釈/Annotations

タブで、各バーの内部や上部にデータについての統計量を書き込むことができます。

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1：カラムプロット/Column形式データによる棒グラフ

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注意：· 注釈の内容は変更できません。
· 注釈をバーの上部に表示する場合、Y軸の範囲の指定によっては表示されない場合があります。
· フォントの指定を行う場合、サイ によっては注釈が表示されない場合があります。
· 注釈の をとに変更することはません。

色 列ご1.5

ズ

出来

散布図とバイオリンプロット
散布図の見た目

GraphPad Prism ８から、散布図を作成するアルゴリズムに変更があり、そのため同じデータであっても、作成される群データの散布図は以前のバージョンとは見た目が少し異なります。

バイオリンプロット/Violin

GraphPad Prism ８から追加されたバイオリンプロットは、群でのデータのバラツキを視覚的に分かり易く説明できます。

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索引

索引

-VViolin 15-A-

Analyze 8
Annotations 10
Appearance 9-Cha ge
ha ge G aph ype 4
ouou a ay e 8o u tat t 8

C n4
C nr
TC l mn 4
C l mn n l s s
C l mn s is ics-DData sets on Graph 10
Data sets plotted 10
Decimal format 4
Dimensions 10
Distance from axis 9-FFormat Axes 9
Format Graph 9-GGraph Settings 10
Graphs 9Grouped 4-NNumbering and labeling 9-RRename sheet
Results 8

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