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平成２５年度変更実施方針
バイオテクノロジー・医療技術部
１． 件 名： プログラム名：健康安心イノベーションプログラム(大項目) 後天的ゲノム修飾のメカニズムを活用した創薬基盤技術開発
２． 根拠法
独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発機構法第１５条第１項第２号
３． 背景及び目的・目標
現在の医薬品開発においては、副作用が少なく効果的な薬の開発のため、ゲノム情報を活用した創薬研究が主流となってきている。創薬における研究開発費が1物質当たり500億円を超え増加の一途をたどる一方で、新薬上市件数は低下するという世界的傾向の中、創薬研 究の効率 を上 げ、研 究開 発リスクを低減 させることが喫緊の課題となっている。医 薬産業政策研究所「製薬産業の将来像」によれば、創薬プロセスにおけるボトルネックの一つとして、標 的 分 子 候 補 と疾 病 の関 係 を推 定 し、新 薬 の目 標 を確 定 する「ターゲットバリデーション」が挙げられており、画期的な新薬を生み出すためには、基礎研究の進展に伴う新しい知見を取り込み、新規メカニズムに基づく創薬標的分子を同定していくことが重要である。
近年のギガシーケンサー及び高精 度質 量分 析装 置等の解 析技 術の急速 な進展により、後天的ゲノム修飾が疾患等の原因として重要な因子であることが相次いで明らかになり、世界 中の研究 者の注 目 を集めている。後 天 的 ゲノム修 飾 は、癌や、アルツハイマー病 等の精神疾患 、生 活習 慣病等の後天的 疾患の原因として重要な因子であるとともに、ヒトの病気、老化、発生、分化、成長に大きな役割を果たしていることが判明し始めており、その解析と制御が、新 しい創 薬 標 的の創 出や新しい作 用 機 序を持つ治 療薬 等の開 発に資すると期 待 されている。技術戦略マップ2009（平成21年4月経済産業省策定）においても、後天的ゲノム修飾の解析は、波及効果が高く、「画期的な医薬品の開発」、「医薬品開発の効率化」に資する重要技術として位置づけられている。また、「医療イノベーション５か年戦略」（平成２４年
６月医療イノベーション会議策定）においても、「その他個別化医療実 現に向けた研究の推進」として位置づけられている。
しかし、後天的ゲノム修飾 の解析等の技術開発は世界最先端の分野であり、後天的ゲノム情報と疾患との関連は未だに十分には解明されておらず、解明に必要となる臨床情報の付随した検体の入手も困難である。また研究を開始するためには、高精度の解析技術や情報処理技術等、後天的ゲノム解析のための先進的技術導入や専門的人材の育成等に莫大な時間と投資が必要であり、民間企業等が独自に研究を進めるのは極めてリスクが高い。このため米 国 では、NIH（国 立 衛 生 研 究所 ）のロードマップの一つに位 置づけ、2008年 より5年間で総額1億9000万ドルを超えるプロジェクトを、大学・研究機関を中核として開始している。我が国においても、企業・研究者・臨床家の連携の下に一体的なオープンイノベーションを可能とする世界トップレベルの産学連携体制を構築し、最適な技 術・情報基盤を確立するためには、国の支援が不可欠である。
本事業では、企業ニーズを取り入れ、参画企業とともに疾患の原因となる後天的ゲノム修1

飾の効果的・効率的解析手法の開発を行い、後天的ゲノム修飾を高感度で検出するシステムを構築するとともに、複数種類の癌との関連づけを行うための基盤技術を世界に先駆けて開発し、後 天的ゲノム修 飾に起因する複数 種類の癌に対し、後天 的ゲノム修飾を制御する分子等を用いた探索的実証研究を通じて、基盤技術としての有用性を検証する。
これにより、プロジェクト期間中に最先端の技術を、学から民へと移転をするとともに、創薬ターゲットとなりうる後天的ゲノム修飾が解析されれば、企業による医薬品開発が加速されることが期待される。さらに将来、個人の後天的ゲノム修飾情報に基づいて疾患の個体差や進行度に応 じた標的 治 療 薬 による質と費 用 対効 果の高い治療が実 現されれば、国民の健康の維持・増進や医療産業等のイノベーション、医療財政の負担軽減、我が国の国際競争力の強化に大きく寄与することを期待できる。
なお、本研究開発は、個別化医療・予防医療・再生医療の実現や画期的な新薬の開発、医療機器、福祉機器等の開発・実用化を促進することによって健康寿命を延伸し、今後、世界に類を見ない少子高齢化社会を迎える我が国において、国民が健康で安心して暮らせる社会の実現を目指すことを目的とする「健康安心イノベーションプログラム」の一環として実施する。
（１）最終目標（平成２６年度末）
後天的ゲノム修飾を現状の100倍程度高感度かつ高精度に解析する技術、及び解析データの標準的情報処理技術を確立する。
開発した解析技術を活用し、ヒト臨床サンプルを対象として、後天的ゲノム修飾と疾患 とを関連づける創薬・診断標的候補分子を選定する。
候補分子を制御する因子を用いて創薬・診断標的としての妥当性を検証することにより、本事業で開発した後天的ゲノム修飾解析基盤技術の有用性を実証する。
（２）中間目標（平成２４年度末）
後天的ゲノム修飾を現状の10倍程度高感度に解析する技術、及び解析データの情報処理技術を開発する。
開発した解析技術を活用し、ヒト臨床サンプルを対象として、後天的ゲノム修飾と疾患とを関連づける創薬・診断標的候補分子を探索する。
候補分子を制御する因子を用いて創薬・診断標的としての妥当性を検証することにより、本事業で開発した後天的ゲノム修飾解析基盤技術の有用性を確認する。
４．事業内容４．１ 平成２４年度委託事業内容（成果）
東京大学先端科学技術研究センター 教授 油谷浩幸氏をプロジェクトリーダーとし、先進的なエピゲノム修飾解 析技術および質 量分析 技術を有する東 京大学 先 端科学技 術研究センターを集中 研とするオープンラボを中核に、医療機 関および製薬・診 断企業から構成されるエピゲノム技術研究組合が参加する研究体制によって推進した。
研究開発項目①「後天的ゲノム修飾解析技術開発」（１）後天的ゲノム制御に関わるヒストン修飾等についての高感度かつ網羅的な解析技術の開発
ヒストン修飾解析等に必要となる多種類の解析用抗体からなる抗体パネルを作製し、後天2

的ゲノム修飾に由来する複数種類の癌のヒト臨床サンプルおよび代表的なヒト正常細胞を対象として、多種類のヒストン修飾や修飾因子を系統的にマッピングする技術を開発した。
また、質量分析法等を用いて、ヒストン修飾の組み合わせコード（アセチル化、リン酸化、メチル化 修 飾の組み合わせ）を測 定するための解 析基 盤 技 術を構 築するとともに、解 析に必要な検体の微量化を実現する高感度解析技術を開発した。
【実施項目】① DNAメチル化の網羅的解析技術開発（国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合）
全ゲノムバイサルファイトショットガンシーケンス法 （WGBS法 、PBAT法 ）により、ヒト癌組織のＤＮＡ異常メチル化を1塩基レベルで解析した。さらに、DNA脱メチル化に関与するハイドロキシメチル化については、より高解像度な網羅的解析法の開発に着手した。
② 高感度エピゲノム解析技術開発（国立大学法人東京大学、国立大学法人東京大学分生研、エピゲノム技術研究組合）
微量検体からのChIP解析プロトコールのうち、特に染色体の可溶化プロトコールについて重点的に検討し、数十倍以上の微量化を実現した。また、パーソナル型シーケンサーの導入により、改良プロトコールの評価を迅速化した。
③ 修 飾ヒストン抗 体パネルの研 究 開 発 （国立大学法人大 阪 大 学 、国立大学法人東 京大学、エピゲノム技術研究組合）
モノクローナル抗体の親和性と修飾の組み合わせの認識について、FRAPやELISAによる測定を行った。それらの抗体を大量に精製して供給するとともに、ヒストン修飾レベルを少数細胞で評価する系を開発した。
④ ヒストンテール修飾の系統的解析技術開発 （国立大学法人東京大学 、エピゲノム技術研究組合、独立行政法人産業技術総合研究所）
新規導入した質量分析計を用いて、検出したH4テール組み合わせの信頼性検証を行い、さらなる高感度化を行った。SRMによる定量法の高精度化を行った。
（２）エピゲノム情報解析基盤技術の開発（国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合、独立行政法人産業技術総合研究所）
後天的疾患を有する臓器の後天的ゲノム修飾を解析して得られる膨大な情報と既存の生命情報データを統合し、取得データから必要な情報を効率的に抽出し可視化するため、IT技術等を活用した新たな標準的情報処理技術を開発した。
【実施項目】
RNA-seq解析パイプラインによる新規ノンコーディング転写産物の予測について、既存研究の結果を基に改良を行った。
エピゲノム情報に特化した独自の検索・可視化ツールを開発・改良するとともに、プロジェク
トで取得した組織・疾患別転写情報、DNAメチル化情報、ヒストン修飾情報を体系的に収納するためのデータベースを開発した。
研究開発項目②「後天的ゲノム修飾と疾患とを関連づける基盤技術開発」(1) 後天的ゲノム修飾と疾患とを関連づける基盤技術の開発
どのような後 天的 ゲノム修 飾 の変 化によってどのような後 天 的 疾患が発 生するか、疾 患と後天的ゲノム修飾の関連づけを行った。
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解析対象となる複数種類の癌のヒト臨床サンプルを効率的に収集し、上記①で開発された後天的ゲノム修飾解析基盤技術等も活用して、後天的ゲノム修飾の組み合わせの解析等により得られる情報基盤を用いて疾患と正常の比較分析を行うことにより、疾患発症に関わる後天的ゲノム修飾異常を引き起こす原因因子等を探索するとともに、新たな創薬・診断の標的候補分子を同定した。
【実施項目】① 臨床検体の収集と病理解析（国立大学法人東京大学、国立大学法人東京大学人体病理学、国立大学法人東京医科歯科大学）
胃癌、肺癌、肝癌、胆膵癌を中心に、およそ30例(累積計90例)の腫瘍組織からの検体採取を行うとともに、体系的にDNA及びRNAの抽出・精製を行った。またこれらの癌種について、癌特異的タンパク質、核酸の発現評価を迅速に行うための組織アレイの構築を行うとともに、修飾ヒストンの免疫組織染色を実施した。
② Xenograftパネルの研究開発（国立大学法人東京大学、公益財団法人がん研究会）
膵癌、胃癌の転移例を含むdirect xenograftおよび細胞株の樹立を継続した。
③ エピゲノム変異発癌モデルの研究開発（国立大学法人東京大学、国立大学法人東京大学消化器内科、独立行政法人理化学研究所）
肝癌／膵癌発症モデルマウスとG9aあるいはJhdm2a欠損マウスの掛け合わせによる癌発症実験を継続し、その解析を行った。さらに、PRDM改変マウスを用いて、PRDMの癌発症における役割について検討した。
④ エピゲノム修飾の特異性を規定する非コードRNA機能の研究開発（国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合、独立行政法人産業技術総合研究所、協和発酵キリン株式会社）
ヒト癌 細 胞 株 および臨 床 腫 瘍 検 体 のRNA-seqによる解 析 を実 施 し、機 能 性 非 コードRNA候補の選抜を行った。非コードRNAとエピゲノム関連複合体との相互作用解析や機能阻害解析を実施した。
⑤ 癌診断メチル化マーカーに関する研究開発 （国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合）
450Kエピジェノタイピングアレイを用いて、手術検体における癌組織と非癌部組織のプロファイルを比較し、癌組織に特異的な異常メチル化マーカーの同定を行った。ヒト血液検体を用いて、選抜した診断マーカーの検出に着手した。
⑥ 癌細 胞制 御にかかわるエピゲノム創 薬標 的 分子に関する研 究開 発 （国立大学法人東京大学、国立大学法人東京大学消化器内科、エピゲノム技術研究組合）
大腸癌、胃癌、肺癌などの癌細胞株を中心に、主要なヒストン修飾変異の有無およびDNAメチル化の修飾状 態 の変化を検討した。さらに、これらの修飾を制 御する標的候 補遺伝子に対する、shRNAを用いた癌細胞株における表現型解析を行った。タンパク質複合体解析等を通じ、協働して作用するタンパク質等を同定することにより、エピゲノム修 飾の制御システムを解明し、新たな創薬診断の標的候補分子を同定した。
研究開発項目③「探索的実証研究」(1) 後天的ゲノム修飾を再現性よく定量的に解析するハイスループットアッセイ技術の開発（国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合）
上記①で開発した後天的ゲノム修飾解析基盤技術をベースとして、標的分子に対する後4

天的ゲノム修飾を再現性よく定量的に解析する手法を開発するとともに、多数の試験サンプルに対して適応可能な、高感度かつ高精度な経時的ハイスループットアッセイ法及び培養細胞ベースのアッセイ系を構築した。
【実施項目】
細胞周期でのヒストンH4テールの修飾組み合わせ検出の高精度化のため、新規導入したOrbitrap ELITEでのH4テール定量の高感度化と、複数の修飾組み合わせパターンの同時検出技術を確立した。

In silico スクリーニングと in vitro アッセイに加えて、天然物ライブラリースクリーニングやペプチドライブラリースクリーニングの系を確立し、さらなるハイスループット化を行った。
(2) 探索的実証研究（国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合、株式会社未来創薬研究所）
後天的ゲノム修飾と癌を関連づける複数の創薬・診断標的候補分子に対し、これらの標的 候 補 分 子 を制 御 する化 合 物 を高 感 度 かつ高 精 度 な定 量 的 アッセイ法 を用 いて探 索 した。
【実施項目】
メチル化酵素と阻害活性化合物を共結晶化し、X 線結晶構造解析に着手した。
数種の標的候補分子について、 in silico スクリーニング、天然物ライブラリースクリーニ
ングとペプチドライブラリースクリーニングを平行して実施 した。
アッセイ系構築に用いることのできる活性を保持した酵素タンパク質を用いて、モノクローナル抗体作成を継続した。
研究開発項目④「総合調査研究」（エピゲノム技術研究組合）
エピゲノム技術開発研究に関わる、研究促進のための活動を中心とし、国内外の技術動向調査及び情報収集を行った。特に、進歩の目覚しい次世代シーケンサーや質量分析技術の進展は、研究 開発項 目①、②と密接に関係しており、この技術動 向は、今後のプロジェクト戦略を考える上で必要であるので、調査研究として実施した。
【実施項目】
次世代シーケンサーや質量分析装置の技術開発動向の調査を引続き行った。とりわけ、次世代シーケンサーについて、長いリード長、早い反応時間を特徴とする解析プラッ
トフォームについて評価 を続けると共に、ナノポアシーケンシングの研究動向 についても注視した。
４．２ 実績推移
H22 年度

H23 年度

H24 年度

委託

委託

委託実績額推移 （百万円）
一般勘定（交付金）：

273445808

特許出願数 （件）015

論文発表数 （報）73222フォーラム等 （件）1225165

５． 事業内容
５．１ 平成２５年度事業内容（計画）
東京大学先端科学技術研究センター 教授 油谷浩幸氏をプロジェクトリーダーとし、先進的なエピゲノム修飾解析技術および質量分析技術を有する東京大学先端科学技術研究センターを集中研とするオープンラボを中核に、医療機関および製薬・診断企業が構成するエピゲノム技術研究組合が参加する研究体制によって推進する。
研究開発項目①「後天的ゲノム修飾解析技術開発」(1) 後天的ゲノム制御に関わるヒストン修飾等についての高感度かつ網羅的な解析技術の開発
ヒストン修飾解析等に必要となる多種類の解析用抗体からなる抗体パネルを作成し、後天的疾患に由来する複数種類の癌のヒト臨床サンプルおよび代表的なヒト正常細胞を対象として、多種類のヒストン修飾や修飾因子を系統的にマッピングする技術を開発する。
また、質量分析法等を用いて、後天的ヒストン修飾の組み合わせコード（アセチル化、リン酸化、メチル化修飾の組み合わせを判定）を測定するための解析基盤技術を構築するとともに、解析に必要な検体の微量化を実現する高感度解析技術を開発する。
【実施項目】① DNAメチル化の網羅 的 解析技 術開 発 （国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合）
全ゲノムバイサルファイトショットガンシーケンス法 （WGBS法 、PBAT法 ）により、ヒト癌組織のDNA異常メチル化を１塩基レベルで解析する。さらに、DNA脱メチル化に関与するハイドロキシメチル化についても、より高解像度な網羅的解析法の確立を目指す。
② 高感度エピゲノム解析技術開発（国立大学法人東京大学、国立大学法人東京大学分生研、エピゲノム技術研究組合）
微量検体からのChIP解析プロトコールのうち、特に染色体の可溶化プロトコールについて重点的に検討する。
③ 修 飾ヒストン抗 体パネルの研 究 開 発 （国立大学法人大 阪 大 学 、国立大学法人東 京大学、エピゲノム技術研究組合）
モノクローナル抗体の親和性と修飾の組み合わせの認識について、FRAPやELISAによる測定を行う。それらの抗体を用いて、ヒストン修飾レベルを少数細胞で評価する系を開発する。また、抗体を大量に精製し、供給する。
④ ヒストンテール修飾の系統的解析技術開発 （国立大学法人東京大学 、エピゲノム技術研究組合、独立行政法人産業技術総合研究所）
新規導入した質量分析計を用いて、検出したH4テール組み合わせの信頼性検証を行う。さらなる高感度 化を行 い、ChIPで共沈降されるヒストンテールの修飾組み合わせの解析を目指す。SRMによる定量法の高精度・高感度化を行う。
ヒストンH3テールの解 析 技術も確 立する。解 析能 力が既存 機器に比べて40倍高い最新の分 析 機 器を導 入し、ヒストンH3テールの修飾 組み合わせ検 出の高 感 度 化および信頼性検証を加速する。
(2) エピゲノム情報解析基盤技術の開発（国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合、独立行政法人産業技術総合研究所）
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後天的疾患を有する臓器の後天的ゲノム修飾を解析して得られる膨大な情報と既存の生命情報データを統合し、取得データから必要な情報を効率的に抽出し可視化するため、IT技術等を活用した新たな標準的情報処理技術を開発する。
【実施項目】
RNA-seq解析パイプラインによる新規ノンコーディング転写産物の予測について、既存研究の結果をもとに改良を行う。
エピゲノム情報に特化した独自の検索・可視化ツールを開発・改良するとともに、組織・疾患別転写情報、DNAメチル化情報、ヒストン修飾情報を体系的に収納するために開発したデータベースに、プロジェクトで取得したデータを実装する。
研究開発項目②「後天的ゲノム修飾と疾患とを関連づける基盤技術開発」(1) 後天的ゲノム修飾と疾患とを関連づける基盤技術の開発
どのような後 天的 ゲノム修 飾の変 化によってどのような後 天 的 疾患が発 生するか、疾 患と後天的ゲノム修飾の関連づけを行う。
解析 対 象となる複 数種 類 の癌のヒト臨 床サンプルを効率 的に収 集 し、上 記 研 究開 発項
目①で開発 される後 天的 ゲノム修 飾 解析 基 盤 技術 等も活 用 して、後 天 的ゲノム修 飾の組み合わせの解析等により得られる情報基盤を用いて疾患と正常の比較分析を行うことにより、疾患発症に関わる後天的ゲノム修飾異常を引き起こす原因因子等を探索するとともに、新たな創薬・診断の標的候補分子を同定する。
【実施項目】① 臨床検体の収集と病理解析（国立大学法人東京大学、国立大学法人東京大学人体病理学、国立大学法人東京医科歯科大学、学校法人日本大学）
胃癌、肺癌、肝癌、胆膵癌を中心に、30例程度(累積計120例)の腫瘍組織からの検体採取を行うとともに、体系的にDNA及びRNAの抽出・精製を行う。また、これらの癌種について、癌特異的タンパク質、核酸の発現評価を迅速に行うための組織アレイの構築を行う。
② Xenograftパネルの研究開発（国立大学法人東京大学、公益財団法人がん研究会）
膵癌、胃癌の転移例を含む、direct xenograftおよび細胞株の樹立を継続する。さらに、樹立したxenograft組織及び細胞株を用いたエピゲノム解析を実施する。
③ エピゲノム変異発癌モデルの研究開発（国立大学法人東京大学、国立大学法人東京大学消化器内科、独立行政法人理化学研究所）
肝癌/膵癌発症モデルマウスとG9aあるいはJhdm2a欠損マウスの掛け合わせによる癌発症実験を継続する。さらに、PRDM改変マウスを用いて、PRDMの癌発症における役割について検討する。
④ エピゲノム修飾の特異性を規定する非コードRNA機能の研究開発（国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合、独立行政法人産業技術総合研究所、協和発酵
キリン株式会社、国立大学法人北海道大学）
ヒト癌 細 胞 株 および臨 床 腫 瘍 検 体 の RNA-seqによる解 析 を実 施 し、機 能 性 非 コードRNA候補の選抜を行う。非コードRNAとエピゲノム関連複合体との相互作用解析や機能阻害解析を継続する。
⑤ 癌診断メチル化マーカーに関する研究開発 （国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合）
450Kエピジェノタイピングアレイを用いて、手術検体における癌組織と非癌部組織のプ7

ロファイルを比較し、癌組織に特異的な異常メチル化マーカーの同定を引き続き実施する。ヒト血 液検 体を用いて、選 抜した診断マーカーにつき、多検 体 処理が可 能な高感 度検出法を確立し、企業による臨床応用（実用化）研究につなげる。
⑥ 癌細 胞制 御にかかわるエピゲノム創 薬標 的 分子に関する研 究開 発 （国立大学法人東京大学、国立大学法人東京大学消化器内科、エピゲノム技術研究組合）
大腸癌、胃癌、肺癌などの癌細胞株を中心に、主要なヒストン修飾変異の有無およびDNAメチル化の修飾状態の変化を検討する。さらに、これらの修飾を制御する標的候補遺伝子に対するshRNAを用いた、癌細胞株における表現型解析を行う。タンパク質複合体解析等を通じ、協働して作用するタンパク質等を同定することにより、エピゲノム修飾の制御システムを解明し、新たな創薬診断の標的候補分子を同定する。
研究開発項目③「探索的実証研究」(1) 後天的ゲノム修飾を再現性よく定量的に解析するハイスループットアッセイ技術の開発（国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合）
上記①で開発される後天的ゲノム修飾解析基盤技術をベースとして、標的分子に対する後天的ゲノム修飾を再現性よく定量的に解析する手法を開発するとともに、多数の試験サンプルに対して適応可能な、高感度かつ高精度な経時的ハイスループットアッセイ法及び培養細胞ベースのアッセイ系を構築する。
【実施項目】
細胞周期でのヒストンH4テールの修飾組み合わせ検出の高精度化のため、SRMでのH4テール定量の高感度化と、複数の修飾組み合わせパターンの同時検出技術を確立する。

In silico 阻害剤スクリーニングと in vitro アッセイに加えて、天然物ライブラリースクリーニングや阻害ペプチドライブラリースクリーニングの系を確立し、さらなるハイスループット化を行う。さらに、培養細胞ベースのスクリーニング系の開発を行う。
項目①で検討中のH3テール解析技術を用いて、H4テール解析に用いた試料の解析を行い、解析手法の検証を行う。
(2) 探索的実証研究（国立大学法人東京大学、エピゲノム技術研究組合、株式会社未来創薬研究所）
後天的ゲノム修飾と癌を関連づける複数の創薬・診断標的候補分子に対し、これらの標的候補分子を制御する化合物を高感度かつ高精度な定量的アッセイ法を用いて探索する。
さらに、腫瘍細胞及び xenograft を用いた機能評価、エピゲノム修飾に与える影響の検討を次世代シーケンサーにより迅速化して標的としての妥当性を効率的に検証することによって、本事業で開発した後天的ゲノム修飾に着目した創薬基盤技術の有用性を実証する。
【実施項目】
数種の標的候補分子について、in silico スクリーニング、天然物ライブラリースクリーニ
ングと阻害 ペプチドライブラリースクリーニングを平 行して実 施することにより複数の手法の比較検証を行い、その妥当性を評価する。
メチル化修飾酵素と阻害活性化合物あるいは結合ペプチドを共結晶化し、X 線結晶構造 解析を行い、さらに高い阻害 活性 を持つ化 合物の設 計を目 指す。これら化合 物について、化合物投与時のがん細胞株の細胞生物学的解析、質量分析計によるターゲット修飾の解析により、化合物評価法としての妥当性を評価する。
8アッセイ系構築に用いることのできる活性を保持した酵素タンパク質を用いて、モノクローナル抗体作製を継続する。
研究開発項目④「総合調査研究」（エピゲノム技術研究組合）
エピゲノム技術開発研究に関わる研究促進のための活動を中心とし、国内外の技術動向調査及び情報収集を行う。特に、次世代シーケンサーや質量分析技術の進展は研究開発
項目①及び②と密接に関係しており、この技術動向は今後のプロジェクト戦略を考える上で必要である。以 上の技 術 開発 は今後も大きく進 展 していく可 能 性が大きいので、主たる調査研究として継続 的に実施する。また、本プロジェクト実施内容に関連する外部動向 調査（エピゲノム解析やメチル化修飾酵素阻害などの阻害剤開発動向）を継続的に行っていくことも必要となる。
【実施項目】
次 世 代 シーケ ンサー や 質 量 分 析 装 置 の技 術 開 発 動 向 とエピゲノム 修 飾 酵 素 の阻 害剤開発状況の調査を引続き行う。とりわけ、長いリード長、早い反応時間を特徴とする解析プラットフォームについて評 価 を続 けると共 に、ナノポアシーケンシング 装 置 の開 発 動 向についても注視する。また、エピゲノム関連 研究として遺伝 子変 異解 析と癌細 胞集団の異質 性 に着 目 した研 究 を調 査 するとともに、関 係 した阻 害 剤 の開 発 動 向 について調 査 を行う。
５．２ 平成２５年度事業規模
一般勘定（交付金）

委託事業
５１０百万円（継続）注：事業規模については、変動があり得る。

６． その他重要事項(1) 評価の方法
NEDOは、技術的および政策的観点から、研究開発の意義、目標達成度、成果の技術的意義並びに将来の産業への波及効果等について、外部有識者による研究開発の中間評価を平成２４年度に実施した。また、中間評価結果を踏まえ、プロジェクトの加速等見直しを行った。なお、評価の時期については、当該研究開発に係る技術動向、政策動向や当該研究開発の進捗状況等に応じて、前倒しする等、適宜見直すものとする。
(2) 運営・管理
当 該 プロジェクトの実 施 にあたっては、「ヒトゲノム・遺 伝 子 解 析 研 究 に関 する倫 理 指 針 」（平成16年 文部科学省・厚生労働省・経済産業省告示第１号）等、関連指針を厳守する。
また、本研究開発成果の事業化においては、「産業経済分野のうち個人遺伝情報を用いた事業分野における個人情報保護ガイドライン」（平成 16年12月17日 経済産業省）等を厳守する。
７． スケジュール
平成２５年 ９～１０月
平成２６年 ２～３月

プロジェクト運営会議
プロジェクト運営会議

9８． 実施方針の改訂履歴（１）平成２５年２月

制定（２）平成２５年７月

共同実施先（日本大学）の追加に伴う改訂（３）平成２５年８月

共同実施先（北海道大学）の追加に伴う改訂（４）平成２５年１１月

開発 成果 創出 促進 制 度 の対 象事 業と して 決 定 され たことに伴う事業規模の改定

10（別紙）実施体制図「後天的ゲノム修飾のメカニズムを活用した創薬基盤技術開発」

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