第 46 回生体分子科学討論会プログラム
口頭発表

第 1 日目 6 月 21 日(金) 13:00 開会
13:10 – 14:10 口頭発表１ 座長: 鬼頭(西岡) 宏任 (筑波大)
1. 新奇ロドプシンファミリーSchizorhodopsin (SzR)による光駆動内向きプロトン輸送◯井上 圭一 1,2, 角田 聡 1,3, Manish Singh1, 今野 雅恵 1, 富田 紗穂子
1, 中村 良子 1, 渡辺 大輝 4,5, 内橋 貴之 4, Rohit Ghai6, Oded Béjà7,
神取 秀樹 1,8
(1 名工大・院・工学, 2 東大・物性研, 3JST・さきがけ, 4 名大・院・理学, 5 生命創成探究センター, 6 チェコ科学アカデミー, 7 イスラエル工科大学, 8 名工大・オプトバイオ研究センター)
2. 新規な銅含有亜硝酸還元酵素の立体構造と触媒反応におけるバリエーシ
ョン米田 涼平 1, 堀部 和也 1, 越山 達貴 1, 山本 裕輔 1, 石原可奈子 1, 永田 智大 1, 舩橋靖博１, 平 大輔 2, ◯野尻 正樹 1
(1 阪大院・理, 2 崇城大・生物生命)
3. 分光計測による霊長類青感受性視物質の光反応中間体構造解析◯華井 竣平 1, 佐々木 拓磨 1, 片山 耕大 1 , 今井 啓雄 2 , 神取 秀樹 1
(1 名工大, 2 京大・霊長研)
14:10 – 14:25 休憩 (15 分)

14:25-15:05 招待講演 1 座長: 重田 育照 (筑波大)
基礎的な分子化学からタンパク質内反応を理解する◯石北 央 (東大・先端研)15:05 – 15:20 休憩 (15 分)

15:20 – 16:40 口頭発表２ 座長: 庄司 光男 (筑波大)4. 光合成反応中心での電荷分離機構の理論研究◯田村 宏之 1, 斉藤 圭亮 1, 石北 央 1(1 東大・先端研)
5. レチナールタンパク質の吸収波長制御機構の解明◯野地 智康 1, 斉藤 圭亮 1, 田村 宏之 1, 石北 央 1(1 東大・先端研)
6. Water-Splitting Mechanism of Photosystem II and Ammonia Binding
Sites Near Oxygen Evolving Complex◯Manoj Mandal1,2, M. R. Gunner2, Hiroshi Ishikita1(1RCAST, Univ. of Tokyo, Japan, 2Dep. of Phys., City College of NewYork, USA)7. ヘムをもつ DNA 酵素◯山本 泰彦 1, 篠宮 僚介 1, 小谷 弘明 1, 荒木 はるか 1,柴田 友和 1,百武 篤也 1, 柳澤 幸子 2, 小倉 尚志 2, 逸見 光 3, 鈴木 秋弘 4, 根矢三郎 5, 小島 隆彦 1(1 筑波大院・数物, 2 兵庫県大院・生命理, 3 農研機構・食品研究部門, 4長岡高専・物質工, 5 千葉大院・薬)16:40 – 16:55 休憩 (15 分)

16:55 – 18:25 ポスター発表 1 (奇数番号・ポスター賞審査)
18:30 – 20:30 懇親会 (大学会館レストランプラザ 筑波デミ)

第 2 日目 6 月 22 日(土)9:30 – 10:10 招待講演 2 座長: 園山 正史 (群馬大)モルビリウイルス属の細胞侵入機構と創薬への取り組み◯前仲 勝実 (北大・薬学院)

10:10 – 10:25 休憩 (15 分)

10:25 – 11:25 口頭発表３ 座長: 堀 優太 (筑波大)8. ヒトガレクチン 1 が起こす酸化的構造変化の時間分解赤外分光計測◯黒井 邦巧 1, 植木 睦貴 1, 中林 孝和 1(1 東北大院・薬)9. 機能性タンパク質 Photozipper の構造と反応◯三野 広幸 1, 佃野 弘幸 1, 小関 康平 1, 小林 樹 2, 久冨 修 2(1 名大院・理, 2 阪大院・理)10. 窒素系三座配位子を用いた二核銅–活性酸素錯体の制御◯阿部 司 1, 塩田 淑仁 1, 吉澤 一成 1
(1 九大・先導研)

11:25 – 11:40 休憩 (15 分)

11:40 – 12:20 招待講演 3 座長: 鷹野 優 (広島市大)タンパク質の動的構造と機能◯久保 稔 (兵庫県大院・生命理)

12:30 – 14:00 ポスター発表２ (偶数番号・昼食時間を含む)

14:00 – 14:15 休憩 (15 分)
14:15 – 15:15 口頭発表４ 座長: 西澤 宏晃 (筑波大)
11. ヘムの構造歪みに着目した統計解析・電子状態計算による構造機能相関の解明とデータベースの構築◯近藤 寛子, 兼松 佑典, 藤井 理則, 石井 学, 舛本 現, 今田 康博,吉田 孝, 鷹野 優
(1北見工大・工, 2広市大・院情報, 3理研・BDR, 4理研・ISC, 5阪大・蛋白研)
12. 蛋白質中電子トンネル移動の第一原理計算◯鬼頭(西岡) 宏任 1,2, 安藤 耕司 3
(1JST さきがけ, 2 筑波大・計算セ, 3 東京女子大・情報理)13. 光化学系 II 酸素発生中心における水分解反応機構についての理論解析◯庄司 光男 1, 磯部 寛 2,重田 育照 1,中嶋 隆人 3,山口 兆 4(1 筑波大, 2 岡山大, 3R-CCS, 4 阪大)

15:15 閉会ポスター発表 (奇数番号: ポスター賞の審査対象)
第 1 日目 6 月 21 日(金) 16:30 – 18:00 (奇数番号)
第 2 日目 6 月 22 日(土) 12:30 – 14:00 (偶数番号)
1. ニトリルヒドラターゼの中性子構造解析に向けた取り組み◯辻井啓夢１, 林英輝 1, 松村洋寿 1, 野村高志 2, 當舎武彦 3,玉田太郎 4,
日下勝弘 5, 久保稔 2, 城宜嗣 2, 尾高雅文 1(１秋大院・理工, ２兵庫県大院・生命理学, 3 理研・SPring-8, 4 量子科学技術研究開発機構, 5 茨大･フロンティア応用原子科学研究センター)
2. Molecular Tailoring Approach による α ヘリックス中の水素結合エネルギーの量子化学的解析

3.

4.

5.

6.

近藤寛子１, 草鹿あゆみ２, 山中 秀介３, 中村 春木２, ◯鷹野優４(１北見工大・工, ２阪大・蛋白研, ３阪大・院理, ４広島市大・院情報)マクロファージ遊走阻害因子(MIF-1)と D-Dopachrome tautomerase(MIF-2)に対する関節リウマチ治療薬メトトレキサートの相互作用◯中垣尊１,出茂鮎美２,杉島小雪１,面川歩３,松村洋寿１,尾高雅文１,涌井
秀樹１(１秋大院・理工、２秋大・理工、３秋大院・医学系研究科)
非線形光学イメージングに向けた無蛍光性分子プローブの開発と応用◯百武篤也 1, 水口高翔 2, 塗谷睦生 2, 安井正人 2, 山本泰彦 1(１筑波大数理，２慶応大医)
赤外吸収を用いたペプチド二面角の構造解析手法の開発：基礎とポリプ
ロリンへの応用◯宮田大輔１, 平松弘嗣２, 中林孝和 1(１東北大・薬,２国立交通大学)
生体膜に接した水中におけるイオンの分布◯高橋輝行１, 重田育照２(１筑波大・数理, ２筑波大・計セ)
7. 蛋白質結晶中の空隙へのゲスト蛋白質包摂手法の開発と結晶構造解析への応用◯橋本翼１, 松井崇２, 小川智久 1, 田中良和 1(１東北大院・生命、２北里大・理)8. 四重鎖 DNA の形成様式がヘムをもつ DNA 酵素の性質に与える影響◯荒川和基, 山田果央, 片平裕弥, 越智健太郎, 中山優作, 荒木はるか, 篠宮僚介, 百武篤也, 山本泰彦
(筑波大院・数物)
9. ハロゲン結合に関わる静電相互作用と分極の電子密度解析に基づくモデリング◯齋藤健人, 鳥居肇(静岡大・総合科学技術研究科 工学専攻)
10. 3'末端に I-カルテットをもつ四重鎖 DNA とヘムの複合体の研究◯菅原綾 1, 篠宮僚介 1, 木下真志 1, 柴田友和 1, 百武篤也 1, 山本泰彦
1
, 柳澤幸子 2, 小倉尚志 2, 鈴木秋弘 3, 根矢三郎 4(１筑波大院・数理, ２兵庫県大院・生命理, 3 長岡高専・物質工, 4 千葉大院・薬)11. イミダゾール錯体の水素結合ネットワークに基づくプロトン伝導性◯関口健介, 山田和樹, 樋口直, 伊藤雅季, 亀渕萌, 田所誠(東理大・理)12. ヘム鉄の軸配位子としてイミダゾールをもつミオグロビンの研究◯杉田達郎 1, 百武篤也 1, 山本泰彦 1, 松尾貴史 2, 廣田俊 2, 鈴木秋弘
3, 根矢三郎 4, 荘司長三 5, 渡辺芳人 5(1 筑波大院・数理, 2 奈良先端大・物質創成, 3 長岡高専・物質工,4千葉大院・薬, 5 名大院・理)13. 低温赤外分光法による Heliorhodopsin の初期中間体構造解析◯橋本真典, 富田紗穂子, 片山耕大, 古谷祐詞, 神取秀樹
(名工大・院工)
14. 量子化学計算に基づく分子動力学シミュレーションの拘束手法とエネル
ギー保存の検証○西澤宏晃, 重田育照
(筑波大・計セ)
15. 植物クリプトクロム 2 のホモオリゴマー時の構造状態の解析◯縣和哉１, 山田大智２, 神取秀樹 1(１名工大・院工, ２兵県大・生命理)
16. 水素結合型ビイミダゾール/イミダゾールを含む Ru 錯体の構造と電気化学的性質◯山田和樹, 関口健介, 樋口直, 亀渕萌, 田所誠(東理大・理)17. 全反射赤外分光法によるムスカリン性アセチルコリン受容体 2 の活性化
機構解析◯魲洸平 1, 片山耕大 1, 寿野良二 2, 神取秀樹 1(1 名工大・工, 2 関西医大・医)18. チロシン配位の天然の変異ヘモグロビンで観測される帰属未定の振動バンドの挙動と性質◯長友重紀１，２, 寺田拓人２, 庄司光男３, 重田育照３, 中谷清治１，２, 廣田
俊４, 長井雅子５, 北川禎三６(１筑波大・数物, ２筑波大・数理, ３筑波大・CCS, ４奈良先端大・物質創成, ５法政大・ナノテク研, ６兵庫県立大)19. ウシ血清アルブミンの熱変性に伴う水和状態の変化：テラヘルツ分光法で観測される水和数と示差走査熱量測定で観測される不凍水量の変化の違い◯金子亜由美，菱田真史，山村泰久，齋藤一弥(筑波大・数物)
20. 高精度ペアワイズアラインメントと中間アラインメント評価に基づく新規多重アラインメント手法 cs-FORTE の開発◯山守優１, 小田俊之 1, 山田和範 4, 富井健太郎 1,2,3(１産総研・人工知能研究センター, 2 産総研・創薬基盤研究部門, 3 産総研東工大・RWBC-OIL, 4 東北大院・情報科学研究科)
21. リン脂質二重膜の積層構造と水和水量の相関の可能性◯長山拓馬，菱田真史，山村泰久，齋藤一弥(筑波大・数理)
22. C 型フィコシアニン色素の吸収スペクトルに関する量子化学計算◯三嶋謙二１, 庄司光男 1, 重田育照 1(１筑波大・CCS)
23. 異種由来のサブユニットを持つハイブリッド F1-ATPase の 1 分子回転観察◯渡邉亮１, 上野博史 1, 鈴木俊治２, 小林稜平１, 野地博行 1(１東大・院工, ２東工大・化生研)
24. FMO 法と QM/MM 法によるサルコシンオキシダーゼの反応機構の検討◯阿部幸浩１, 庄司光男２, 西矢芳昭３(１ＨＰＣシステムズ, ２筑波大・数理, ３摂南大・理工)
25. TRPV1 のシステインの役割を解明するための構造生物学的研究◯田中美葵 1, 早川香織 1, 小川臨 2, 黒川竜紀 2, 3, 松井敏高 4, 森泰生
2, 海野昌喜 1, 5

(1 茨城大院・理工, 2 京都大院・工, 3 大分大・医, 4 東北大・多元研, 5茨城大・iFRC)
26. 一つの相補的な水素結合で連結され Re(III)/Re(IV)混合原子価錯体の重水素化挙動◯松野匠, 中尾正樹, 石塚友也, 原田翔平, 山根健史, 亀渕萌, 田所誠(東理大・理)27. 酸化型[Ni-Fe]ヒドロゲナーゼの活性中心金属錯体の構造◯石川航平１, 庄司光男２, 重田育照２(１筑波大・数理, ２筑波大・CCS)28. プロトン-電子共役移動を示すレニウム二核錯体の電子状態:大きなゼロ
磁場分裂を持つ錯体の ESR スペクトル解析法◯山根健史１, 松野匠 1, 原田翔平 1, 亀渕萌 1, 佐藤和信２, 工位武治２,田所誠 1(１東理大・理, ２阪市大院・理)29. 環状ジペプチドの安定構造における系統的な傾向と特徴◯栁昂輝(筑波大・数理, 筑波大・CCS)
30. 代謝部位予測のための半経験的分子軌道法の検証◯齋藤徹, 山本聖也, 鷹野優(広島市立大・情報)
31. 分裂酵母のアクチン束化タンパク質 Ain1 の分子動力学的検討◯森田陸離 1, 會田勇斗 2, 中野賢太郎 1, 原田隆平 3, 重田育照 3(１筑波大・生命環境科学, ２筑波大・生命環境, 3 筑波大・CCS)
32. 自由エネルギー反応経路探索法を用いたアラニンペプチドの反応経路ネットワーク解析◯満田祐樹, 重田育照
(筑波大・CCS)
33. 1,8-ANS を用いたヒト心臓由来脂肪酸結合タンパク質 FABP3 のリガン
ド結合特性解析◯徳留俊 1, 野村舞 2, 林史夫 3, 杉山成 4, 松岡茂 5, 村田道雄 6, 園山
正史 1(1 群馬大・院理工, 2 群馬大・理工, 3 群馬大・機器分析セ, 4 高知大・理工, 5 大分大・院医, 6 阪大・院理)
34. 分子動力学シミュレーションによる味覚受容体タンパク質のリガンド解離機構の解明

◯會田勇斗１, 原田隆平２, 重田育照２(１筑波大・生物, ２筑波大・CCS)
35. 界面活性剤 Triton X-100 による光受容膜タンパク質 Proteorhodopsin の可溶化および脂質二分子膜への再構成◯山本愛理 1, 林史夫 2, 菊川峰志 3,4, 園山正史 1,5,6(1 群馬大・院理工, 2 群馬大・機器分析セ, 3 北大・先端生命, 4 北大・国際連携研究教育局, 5 群馬大・食健康セ, 6 群馬大・未来先端)
36. 二核銅錯体の酸素活性種生成過程とメタン活性化過程の理論的研究◯堀優太 1,2, 塩田淑仁 2, 重田育照 1, 小寺政人 3, 吉澤一成 2(１筑波大・CCS, ２九州大先導研, 3 同志社大・理工)37. インターフェロンα分泌機構解明のための構造生物学的研究◯渡邊ほのか 1, 和田俊樹 2, 海野昌喜 1,3(１茨城大院・理工, ２金沢医科大・免疫学, 3 茨城大・iFRC)
38. 光合成アンテナ蛋白質 LHCII におけるエネルギー移動経路と光保護作用
水野雄貴１, 鈴木匠 1, 石北央 1,2, ◯斉藤圭亮 1,2(１東京大・工・応用化学, ２東京大・先端研)
39. 分子動力学法を用いた抗 HIV 中和抗体 PG9 と PG16 の CDR-H3 についての構造ゆらぎの比較◯田邊直己１, 桐林遼 1, 近藤寛子２, 黒田大祐 3, 齋藤徹１, 香田次郎１,釘宮章光１, 中野靖久１, 津本浩平 3,4, 鷹野優１
(１広島市大院・情, ２北見工大・工, 3 東大院・工, 4 東大医科研)
40. キャップ依存性エンドヌクレアーゼの薬剤耐性メカニズムの解明◯吉野龍ノ介１, 安尾信明２, 関嶋 政和２(１筑波大・CCS, ２東工大・情理)
41. 翻訳伸長因子 EF-1a 及び EFL のインシリコモデリング構造解析◯坂本航太郎, 栢沼愛, 稲垣祐司, 橋本哲男, 重田育照(筑波大)42. 遺伝的アルゴリズムを用いた生体分子の構造サンプリング手法の提案◯榮慶丈１, John E. Straub２, 岡本祐幸３(１高度情報科学技術研究機構, ２Boston University, ３名古屋大学理学部)
43. Water-Splitting Mechanism of Photosystem II and Ammonia Binding
Sites Near Oxygen Evolving Complex◯Manoj Mandal1,2, M. R. Gunner2, Hiroshi Ishikita1(1RCAST, Univ. of Tokyo, 2Dep. of Phys., City College of New York)
44. P450nor の N2O 生成過程の反応機構解析◯兼松佑典 1, 久保稔 2, 城宜嗣 2, 鷹野優 1

(1 広市大・院情報, 2 兵庫県大院・生命理)45. カスケード選択型分子動力学シミュレーションの開発と応用◯原田隆平, 重田育照
(筑波大・計セ)