製品一覧（核酸抽出・精製試薬）
RNA

対象試料

total RNA

動物組織/培養細胞…スピンカラム精製

品名

動物組織/培養細胞/細菌
植物組織
全血/血清
small RNA
動物組織/培養細胞
液体試料
ウイルスRNA
体液（鼻咽頭ぬぐい液、唾液等）
土壌微生物RNA 土壌
dsRNA
植物/真菌
動物組織/培養細胞
DNA

対象試料

genomic DNA

動物組織/培養細胞
動物組織/魚介類/昆虫
全血/血清/血漿/(培養細胞*)
毛髪/爪/口腔粘膜植物（葉）植物/酵母/細菌

糞便

穀物
加工食品

● RNA-Seq解析用のRNA抽出に● ISOGEN II● 高分子/低分子RNAの分画が可能● ISOGEN with Spin Column● ISOGENとスピンカラムのセット品● ISOGEN● RNA/DNA/タンパク質の分画が可能● ISOSPIN Plant RNA● RNA-Seq解析用のRNA抽出に● ISOGEN with Spin Column● ISOGENとスピンカラムのセット品● ISOGEN-LS● 液体試料に特化したRNA抽出試薬● ISOGEN II● 高分子/低分子RNAの分画が可能● ISOSPIN Liquid Sample miRNA● 全血、唾液、尿にも対応● ISOSPIN Viral RNA● PCR法等で高感度に検出可能● ISOIL for RNA● 抽出困難な火山灰土壌にも対応

Code No.

製品名容量希望納入価格（税別）● ISOVIRUS● ウイルス二本鎖RNAの抽出キット

310-09151

ISOSPIN Soil DNA

50 回用54,000円● ISOVIRUS II● ウイルス二本鎖RNAの抽出キット

核酸精製共沈剤
核酸抽出用
試料保存液

特長
● 約30分間でゲノムDNAを抽出● ISOSPIN Tissue DNA● 粘性物質の多い試料からも抽出可能● ISOSPIN Blood & Plasma DNA● 断片化DNA、循環DNAも効率よく回収● ISOHAIR● マウス体毛や爪からもDNA抽出可能● ISOSPIN Plant DNA● 試料の粘性物質を効率良く除去● ISOPLANT● 植物試料はグラインド不要● ISOPLANT II● 阻害物質を効果的に除去可能● ISOSPIN Soil DNA● 次世代シーケンサーでの解析にも● ISOIL● 加熱抽出法で高分子DNAを抽出● ISOIL for Beads Beating● 強固な細胞壁の微生物からも抽出可● ISOSPIN Fecal DNA● 次世代シーケンサーでの解析にも● ISOFECAL● 加熱抽出法でグラム陰性菌の検出に● ISOFECAL for Beads Beating● 強固な細胞壁の微生物からも抽出可● GM quicker● トウモロコシ・ダイズ等の穀粒用● GM quicker 2● コメ、ナタネ、ジャガイモ用● GM quicker 3● 幅広い種類の加工食品に対応● GM quicker 4● 加工食品中のDNA回収率を向上

対象試料特長● NGS解析に使用可能な高純度なDNAが得られる（実験データ参照）● 火山灰土壌（黒ボク土）からもDNA抽出可能（実験データ参照）● 強固な細胞壁を有する微生物からもDNA抽出可能● フェノール・クロロホルム不要● 操作時間は約45分間● RNase A 添付（別途購入不要）

他社品では抽出困難だった 火山灰土壌(黒ボク土) からも NGS解析に最適 なDNAが得られます！

● 加温のみで約30分で抽出● 大腸菌からのプラスミドDNA抽出

キット内容特長● ISOSPIN PCR Product● 約20分間でPCR産物を精製● ISOSPIN Agarose Gel● 高濃度Agaroseゲル（5％以下）も対応● Ethachinmate● アルコール沈殿用共沈剤● Gene Keeper
RNA & DNA stabilization solution● 試料は37℃で2日間、25℃で2週間、4℃で1ヶ月、-20℃で1年間保存可能* 「ISOSPIN Blood & Plasma DNA」のプロトコールを改変して、培養細胞からゲノムDNA抽出が可能です（参照：当社製品ウェブサイトのQ&A）。

詳細は弊社ウェブページよりご参照下さい。
ニッポンジーン 核酸抽出・精製

ISOSPIN Soil DNAは、スピンカラムを用いて土壌からDNAを抽出・精製するためのキットです。
土壌に至適化した抽出液とビーズビーティングによる物理的な破砕の併用によって、非火山灰土壌だけでなく、火山灰土壌（黒ボク土）からも効率よくDNAを抽出することが可能です。

● 加熱・遠心により約15分で抽出

品名

PCR産物
アガロースゲル核酸
組織/細胞等土壌からのDNA抽出キット

ISOSPIN Soil DNA● ISOGENOME

動物組織/植物組織/細胞/血液 ● Template Prepper for DNA
genomic DNA（簡易DNA抽出） 毛根● ISOHAIR EASY
Plasmid DNA
大腸菌● ISOSPIN Plasmid
その他

特長● ISOSPIN Cell & Tissue RNA

品名

土壌（非火山灰土壌/火山灰土壌/活性汚泥）

NGSを用いた菌叢解析に最適！

検索

室温保存・・・・・・・・・・・ 30 ml × 1本
Lysis Solution BB・・・・・・・・・・
5 ml × 1本
Lysis Solution 20S
・・・・・・・・・・・・
5 ml × 1本
Lysis Solution A
・・・・・・・・・・・・・・・・・ 2.5 ml × 1本
SE Buffer・・・・・・・・・・・・・・・・・ 62 ml × 1本
SB Buffer・・・・・・・・・・・・・・・・・ 30 ml × 1本
SW Buffer・・・・・・・・・・・・・・・・・
5 ml × 1本
TE (pH8.0)
・・・・・・・ 0.5 ml × 1本
RNase A (100 mg/ml) ※・・・・・・・・・・・・・・・ 50 本 × 1袋
Beads Tube
・・・・・・・・・・・・・・・ 50 本 × 1袋
Spin Column※ RNase Aは室温保存可能ですが、長期間使用しない場合は、冷蔵または冷凍（-20℃）で保管して下さい。

火山灰土壌(黒ボク土)用の補助試薬〒930‐0834 富山市問屋町二丁目7番18号
TEL： 076‐451‐6548 FAX： 076‐451‐6547
URL： https://www.nippongene.com

本東京本店 〒103-0023 東京都中央区日本橋本町二丁目4番1号 TEL ：03-3270-8571 (代表)0120-052-099

フリーファックス

製品名容量

希望納入価格（税別）

313-06221

Lysis Solution BB SP1

50 ml

3,200円アロフェン質を非常に多く含む黒ボク土など、DNA抽出が困難な土壌からでもキット添付のLysis Solution BBの代わりに本品（Lysis Solution BB SP1）を使用することでDNAの回収量を向上させることができます。

社 〒540-8605 大 阪 市 中 央 区 道 修 町 三 丁 目 1 番 2 号 TEL ：06-6203-3741 (代表)
フリーダイヤル

Code No.

0120-052-806

20230221HT

プロトコール実験データ２： 土壌サンプルからのDNA抽出（吸光度と電気泳動結果）

使用する土壌や目的に合わせて最適なプロトコールを選択できます土 壌

推奨プロトコール

目 的

非火山灰土壌
火山灰土壌（黒ボク土）

非火山灰土壌および黒ボク土から、本品と他社品（A, B, C）でDNA抽出を行い、吸光度測定とアガロースゲル電気泳動により比較を行った。

PCR等で解析を行う場合、DNAの断片化を抑えたい場合❶ 標準プロトコール

NGSで菌叢解析を行う場合❷ NGS用プロトコール

PCR等で解析を行う場合、DNAの断片化を抑えたい場合❸ 標準プロトコール SP1NGSで菌叢解析を行う場合❹ NGS用プロトコール SP1

黒ボク土

非火山灰土壌
《 吸光スペクトル 》《 吸光スペクトル 》
221.8

続 き

Lysis Solution BB ※1 600 µL
Lysis Solution 20S ※2 100 µL
Lysis Solution A
100 µL
RNase A
10 µL

Spin Column （混合液を全量添加）ビーズ破砕（4,200～6,800 rpmで3分間）

遠心（13,000×g, 30 秒間）
ろ液を破棄
SB Buffer
600 µL
遠心（13,000×g, 1 分間）※3遠心（12,000×g, 15 分間）

他社品A

1.4

他社品B

1.4

1.2

他社品C

1.2

SE Buffer
50 µL
ボルテックス
遠心（20,000×g, 5 分間）

上清 400 µL
30 µL
350 µL

10.8

0.8
0.6

0.4

0.4

0.20.2

抽出キット

実験データ１： NGSを用いた土壌細菌叢解析
オートクレーブ処理した土壌サンプル（①～⑤：非火山灰土壌、⑥,⑦：黒ボク土）に製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンター(NBRC)の菌体カクテル（Cell-Mock-001）を添加し、本品の各プロトコールと、他社品（A, B, C）のプロトコールに従いDNAを抽出した。
それぞれの方法で抽出したDNAについて、16S rRNA遺伝子（V3V4領域）をNGS解析して比較した。
黒ボク土
Pseudomonas putida

Staphylococcus epidermidis

Parabacteroides distasonis

Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii

Escherichia coli (K-12株)

Cutibacterium acnes subsp. acnes

Comamonas terrigena

Corynebacterium striatum

Enterocloster clostridioformis

Clostridium butyricum

Bacteroides uniformis

Biﬁdobacterium pseudocatenulatum

Acinetobacter radioresistens

Bacillus subtilis subsp. subtilis

Pseudomonas pu�da

80%

Parabacteroides distasonis
Escherichia coli (K-12株）

70%

Comamonas terrigena

Rela�ve abundance(％)

Streptococcus mutans

Bacteroides uniformisAcinetobacter
解析番号 radioresistens

50%0320

抽出法③
他社品Asubsp. Delbrueckii
Lactobacillus
delbrueckii

非火山灰土壌

➃他社品BCu�bacterium
acnessubsp. acnes⑤⑥

他社品C
本品 標準プロトコール SP１⑦
参照1

本品 NGS用プロトコール SP1Corynebacterium striatum
Clostridium butyricum

20%

220

240

260

280

300

320

《 D N A 収 量と純度 》
抽出キット

DNA収量（ng)＊ A260/A280 A260/A230

DNA収量（ng)＊ A260/A280 A260/A230（標準プロトコール）

本品

9.72

1.82

2.23

（標準プロトコール SP1）

本品

9.08

1.87

2.58

他社品A

0.58

2.340.15

他社品A

1.50

1.70

0.33

他社品B

16.72

1.87

0.11

他社品B5.541.550.04

他社品C

11.36

1.86

1.77

他社品C

1.66

1.370.66*土壌1 mgあたり《 電気泳動図 》②③*土壌1 mgあたり《 電気泳動図 》

①④②③④

レーン
① 本品（標準プロトコール）② 他社品A③ 他社品B④ 他社品Cレーン① 本品（標準プロトコール SP1）
② 他社品A③ 他社品B④ 他社品C

抽出したDNA 5 µLを泳動
1% Agarose S

抽出したDNA 7.5 µLを泳動
1% Agarose S【結果】 本品は非火山灰土壌において、他社品よりも高純度なDNAを抽出できた。また、他社品では抽出が困難であった黒ボク土においても、Lysis Solution BB SP1（別売）を使用することで高収量・高純度なDNAを抽出できた。

土壌②
本品
NGS用プロトコール
Staphylococcus
epidermidis

30%

他社品C

Wavelength(nm)①
本品 標準プロトコール
Streptococcus
mutans40%

黒ボク土

本品の各種プロトコールにおいて0.5ｇの土壌からDNA抽出を行い、吸光度測定により収量を算出した後、200 ngのDNAをアガロースゲル電気泳動に供した。

非火山灰土壌
M①② ③ ➃

黒ボク土①② ③ ➃

M

Biﬁdobacterium pseudocatenulatum

V3V4領域解析結果（NBRCデータ）※4
Bacillus sub�lis subsp. Sub�llis
参照2
理論値（NBRCデータ）※4

10%
0%

300

他社品B

実験データ３： 本品の各種プロトコールによるDNA抽出（電気泳動結果）

Clostridium clostridioforme

60%

280

《 D N A 収 量と純度 》

①90%

260

他社品A

Wavelength(nm)DNA溶液

100%240

再度行う※1 火山灰土壌の場合は、Lysis Solution BBの代わりに別売のLysis Solution BB SP1 (Code No. 313-06221) を使用。 ⇒【プロトコール❸,❹】※2 NGSで菌叢解析を行う場合は、Lysis Solution 20Sの添加量を10 µLに変更。 ⇒【プロトコール❷,❹】※3 別途 ビーズ式破砕装置（2 mLチューブ対応）を使用。ボルテックスでの代用は不可。

非火山灰土壌

220

本品(SP1使用)

10.60

ろ液を破棄
600 µLSW Buffer
遠心（13,000×g, 1 分間）ろ液を破棄
TE100 µL
遠心（13,000×g, 1 分間）

上清 400 µL

SB Buffer
エタノール

1.61.6Abs

Beads Tube 土壌 500 mg

1.8Abs

標準プロトコール本品※4 「参照1」（V3V4領域解析結果、NBRC）と「参照2」（理論値、NBRC）は、菌体カクテル（Cell-Mock-001）に添付のデータシートに記載された割合です（参考値）。
1①2②3③4④5⑤6⑥7⑦NIITE
参照1

理論値
参照2

【結果】 非火山灰土壌においては、本品のNGS用プロトコールで抽出したDNAの解析データ（解析番号②）は、NBRCが示す解析結果（参照１）と近い結果が得られた。また、黒ボク土においては、他社キット(A, B, C)で抽出したDNAでV3V4領域がPCRで増幅できなかったのに対して、本キットのNGS用プロトコールでオプションのLysis Solution BB SP1（別売）を使用することで非火山灰土壌とほぼ同様の結果が得られた。

① : 標準プロトコール② : NGSプロトコール③ : 標準プロトコール SP1➃ : NGSプロトコール SP1
M : Marker 6（λ/StyI digest）【結果】 標準プロトコールでは断片化の少ないDNAを得ることができた。

アガロースゲル電気泳動図（1% Agarose S）