【現職】
東京大学大学院 医学系研究科 システムズ薬理学教室 教授
理化学研究所 生命機能科学研究センター 合成生物学研究チーム チームリーダー【略歴】
1975 年福岡県生まれ。2000 年東京大学医学部卒業、2004 年同大大学院医学系研究科修了。
2003 年から理化学研究所にてシステムバイオロジー研究チームのチームリーダー、2009 年からプロジェクトリーダー、2011 年から生命システム研究センターのグループディレクターを経て 2013
年より東京大学大学院医学系研究科 教授。現在、理化学研究所・生命機能科学研究センター・
チームリーダー、東京大学大学院情報理工学研究科・システム情報学専攻教授（兼担）、東京大学ニューロインテリジェンス国際研究機構主任研究員（兼担）、大阪大学客員教授などを兼務。
「細胞を創る」研究会 会長(2008 年)。 さきがけ「細胞機能の構成的な理解と制御」研究領域総括（2011 年―2018 年）。時間生物学会大会長（2015 年）。日本学術会議 若手アカデミー代表(2015 年―2018 年)。日本イノベーター大賞・優秀賞（2004 年）、東京テクノフォーラム 21・ゴール
ドメダル（2005 年）、文部科学大臣賞 若手科学者賞（2006 年）、日本 IBM 科学賞（2009 年）、日本学術振興会賞（2011 年）、塚原仲晃記念賞（2012 年）、第 15 回山崎貞一賞（2015 年）、第 4回イノベーター・オブ・ザ・イヤー(2017 年)、第 50 回 市村学術賞功績賞(2018 年)等を受賞。
【研究】
哺乳類の概日時計と睡眠・覚醒リズムをモデルとしながらシステム生物学的なアプローチを用いて一貫して時間生物学を展開してきました。これまでに、哺乳類概日時計の転写回路を同定し、そこに遅れを持ったフィードバック構造モチーフが複数含まれていることを明らかにしてきました(Ueda et al, 2002, Ueda et al, 2005, Ukai-tadenuma et al, 2008, Ukai-tadenuma 2011)。また、概日時計分野において未解明の問題であったシンギュラリティ現象（概日時計が真夜中の光を浴びると止まる現象）が複数の概日時計細胞の脱同調で引き起こされることを明らかに(Ukai et al,2007)し、さらに、概日時計の温度補償性（温度によらず概日周期が約 24 時間と一定である現象）が温度によらないリン酵素反応で担われており(Isojima et al, 2009)、それが酵素内の温度依存的な２つのブレーキ機構（高温で基質との親和性の低下と生成物との親和性の増加）によって担われていることを明らかに(Shinohara et al, 2017)してきました。哺乳類の睡眠研究においては、
カルシウムやその下流のリン酸化酵素 CaMKIIα/βが、ノンレム睡眠の制御に重要な役割を果たしていること(Tatsuki et al, 2016, Sunagawa et al, 2016)や、２つのムスカリン受容体（Ｍ１および
Ｍ３）がレム睡眠の制御に必須遺伝子であることを発見(Niwa et al, 2018)しました。これらの研究の過程で発明した分子時刻法(Ueda et al, 2004, Minami eet al, 2009, Kasukawa et al, 2012,
Narumi et al, 2016)や臓器・全身を透明化し全細胞解析を実現するＣＵＢＩＣ法(Susaki et al, 2014,
Tainaka et al, 2014, Susaki et al, 2015, Kubota et al, 2017, Nojima et al, 2017, Murakami et al,
2018, Tainaka et al, 2018)は現在世界中の研究者によって使われています。また、ノックアウトマ
ウスやノックインマウスを交配を経ずに作成し非侵襲的に表現型解析する次世代遺伝学の概念を Triple-CRISPR 法（Sunagawa et al, 2016）、ＥＳマウス法(Ode et al, 2017, Ukai et al, 2017)、Ｓ
ＳＳ法(Sunagawa et al, 2016)を確立することで具現化することに成功しています。

【所属学会】「細胞を創る」研究会、日本分子生物学会、日本生化学会、日本薬理学会、
日本睡眠学会、日本生物物理学会、日本マーモセット研究会、日本抗加齢学会、日本神経科学学会、Society for Research on Biological Rhythms (SRBR)、Society for Neuroscience (SfN)、
European Sleep Research Society (ESRS)、European Biological Rhythms Society (EBRS)

フリガナ

氏名

ウ エ ダ

AE

上田

E

AE

泰己

機関名・
所属部署名

所属機関 ①

AE

役職

教授

役職

チームリーダー

とうきょうと ぶんきょうく ほ ん ご う

機関名・
所属部署名

所属機関 ②
フ リ ガ ナ所在地

9 日（42 歳）〒113-0033
東京都 文京区 本郷 ７－３－１

E

AE

AE

9月

（2018 年 8 月 28 日現在）

E

東京大学 大学院医学系研究科
機能生物学専攻
システムズ薬理学教室

フ リ ガ ナ

所在地
AE

生年月日 1975 年

ヒロ キ

AE

E

AE

AE

AE

国立研究開発法人 理化学研究所
生命機能科学研究センター
合成生物学研究チーム〒565-0871
大阪府吹田市山田丘 1-3 大阪大学 生命システム棟 3 階

連絡先

Tel:06-6105-5241
Fax:06-6105-5241
E-mail: uedah-tky@umin.ac.jp

学歴

1994.3 久留米大学附設高校卒業
2000.3 東京大学医学部卒業
2004.3 東京大学大学院医学系研究科博士課程修了

研究歴（主な職歴と研究内容）

1997-1998 ソニーコンピューターサイエンス研究所 研究アシスタント
細胞シミュレーションシステムの開発
1998-2000 ERATO 北野プロジェクト 研究アシスタント
組織シミュレーションシステムの開発
1999-2000 山之内製薬株式会社 研究アシスタント
体内時計の発振機構のモデル化
2000-2001 山之内製薬株式会社 研究員（修士卒扱い）
体内時計の同調機構のモデル化
2001-2002 山之内製薬株式会社 研究員（ポスドク扱い）
ショウジョウバエ体内時計の発現解析
2002-2004 山之内製薬株式会社 研究員（グループリーダー）
哺乳類体内時計のシステム生物学研究
2003-2010.3 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター
システムバイオロジー研究チーム チームリーダー
哺乳類体内時計・体節時計のシステム生物学研究2009.10-2014.10 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター
システムバイオロジー研究プロジェクト プロジェクトリーダー
2011.4 -2018.3 理化学研究所 生命システム研究センター
細胞デザインコア コア長
合成生物学研究グループ グループディレクター
2018.4 -現在 理化学研究所 生命機能科学研究センター
合成生物学研究チーム チームリーダー
2004.10-2013.3 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター
機能ゲノミクスサブユニット ユニットリーダー（兼任）2005-2006 東北大学 加齢医学研究所
客員教授 （兼任）
2005- 現在 徳島大学 ゲノム機能研究センター

客員教授 （兼任）2006.4- 現在 大阪大学 理学研究科（生物） 連携大学院（招聘教授）
2009.4-2013.3 京都大学 理学研究科（数学） 併任教授
2010.4-2013.3 国立遺伝学研究所 客員教授
2011.7 ＪＳＴさきがけ「細胞機能の構成的な理解と制御」研究領域総括
2012.10-2013.9 東京大学大学院 医学系研究科 客員教授 （兼任）2013.10- 東京大学大学院医学系研究科機能生物学専攻システムズ薬理学教室 教授
2016.4- 東京大学大学院情報理工学研究科システム情報学専攻 教授（兼担）2017.10- 東京大学国際高等研究所ニューロインテリジェンス国際研究機構 主任研究員（兼担）2001 年 ショウジョウバエ研究会 森脇大五郎 あたますっきり賞
2002 年 Sleep Research Society/SRBR Joint Meeting Travel Award
2004 年 日本イノベーター大賞・優秀賞
2005年 東京テクノフォーラム２１・ゴールドメダル
2006年 文部科学大臣賞 若手科学者賞
2006 年 Genome Technology “Tomorrow’s PI”
2007 年 第 5 回日本時間生物学会 学術奨励賞
受賞歴、表彰歴 2009 年 第 23 回日本 IBM 科学賞
2011 年 日本学術振興会賞
2011 年 Changemakers of the year 2011
2011 年 永瀬賞（フロンティアサロン）
2012 年 塚原仲晃記念賞
2015 年 第 15 回山崎貞一賞
2017 年 第 4 回イノベーター・オブ・ザ・イヤー
2018 年 第 50 回 市村学術賞功績賞
2003 年 第 53 回ノーベル賞受賞者会議（リンダウ会議）第一回日本参加者メンバー
2005 年 科学技術振興機構研究開発戦略センター G-TEC（生物医学研究におけるシステム的研究アプローチ）EU 視察団 メンバー
2005 年 第 1 回「細胞を創る」会議 Co-organizer
2005 年 第 2 回「細胞を創る」会議 Co-organizer
2006 年 第 3 回「細胞を創る」会議 Co-organizer
2006 年 第 4 回 CDB シンポジウム Logic of Development Co-organizer
2006 年 第６回日米先端工学(JAFoE)シンポジウム・運営委員
2006 年 International Conference on Systems Biology 2006 Program Committee
2006 年 International workshop on Synthetic biology "synthetic approaches
to cellular functions" Co-organizer
2007 年 第 1 回日仏先端科学(JFFoS)シンポジウム・スピーカ(システム生物学）
委員等
2007 年 第１０回日米先端科学(JAFoS)シンポジウム・チェア(システム生物学）
2007 年「細胞を創る」研究会 0.0 Co-organizer
2007 年 BMB2007(第 30 回分子生物学会、第 80 回生化学会)プログラム委員（生物時計）2008 年 第２回日仏先端科学(JFFoS)シンポジウム・運営委員(生物学）
2008 年 JST 分野融合フォーラム・企画委員
2008 年 CSHL/Welcome Trust Computational Cell Biology, Program Committee
2008 年 Society for Research on Biological Rhythms (SRBR), Program Committee
2008 年 Synthetic Biology 4.0, Program Committee
2008 年 「細胞を創る」研究会 初代会長
2008 年 17th CDB Meeting “Towards Synthesis of Cells”, Co-Organizer
2009 年 京都大学数理解析研究所シンポジウム Co-organizer,

2009年 千里ライフサイエンスセミナー「細胞の計算メカニズム」Co-organizer
2009年 「細胞を創る」研究会 2.0 大会長
2010年 日英 Synthetic Biology Workshop Co-organizer
2010 年 Genes to Cells, Associate Editor
2011年 CDB Meeting 2011“Epigenetic Landscape in Development and Diseases”, Co-Organizer
2011 年 EMBO Journal, Scientific Advisory Board
2011 年 さきがけ「細胞機能の構成的な理解と制御」研究総括
2012 年 ACS Synthetic Biology, Scientific Advisory Board
2013 年 日本分子生物学会 理事
2013 年 日本時間生物学会 理事
2013 年 Associate Editor for Neuroscience Research2014 年 Associate Editor for IEEE Life Sciences Letters
2014 年 Associate Editor for NPJ Systems Biology and Applications
2014 年 " Homeodynamics in Clocks, Sleep and Metabolism Tokyo Translational
Therapeutics Meeting " Organizer
2014 年 日本学術会議連携会員
2015 年 日本学術会議 若手アカデミー代表
2015 年 第 22 回日本時間生物学会 大会長2016 年 International Advisory Board for Advanced Biosystems
2018 年 Asian Forum on Chronobiology Program Committee
2018 年 iScience, Scientific Advisory Board

Publication (Original Paper)
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