ITがきり拓く新しい農業
農林水産省委託IT研究プロジェクト「データベースモデル協調システムの開発」
成果発表会

国のIT施設「電農館」の産官学利用

農林水産技術会議事務局 筑波事務所電子計算課
大 橋 光 一

農林水産研究計算センター
電農館

農林水産研究計算センター
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農林水産試験研究の情報流通基盤としての電子計算機共同利用の推進
具体的には• 農林水産省所管の試験研究機関 １つの政策研究所と８つの独立行政法人を中心とした電子計算機の共同利用施設で、コンピュータシステム及びネットワークの整備・運営を行っている。
（農林水産技術会議事務局組織規程）

歴 史
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１９７９年 農林研究団地で、共同利用計算機センターとして運用開始
１９９１年 TCP/IPプロトコルによる全国ワイドエリアネットワークを構築
１９９３年 大型汎用計算機から、スーパコンピュータ、機関サーバ系システムへ（メール、計算、DB)変更し、研究者が用途に応じ自由に使うことができる情報処理環境を構築
MAFFIN(農林水産省研究ネットワーク）、インターネット接続
開始
１９９７年 ネットワークライブラリシステム（電子図書館）開始、サーバ/クライアントシステムの強化
２００１年 地域に配置していた機関サーバ系システムを筑波の計算センターに集中する構成にした
２００２年 電農館オープン
２００６年 産官学連携の推進を支える基盤センターへ

運用しているシステム
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科学技術計算システム（１９７９〜）
ベクトル型計算機、スカラ型計算機、統計解析、数値DB

ネットワークサービスシステム（１９９３〜）
メールサービス、Webサービス、情報交換サービス、利用者検索

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MAFFIN（農林水産省研究ネットワーク）（１９９１〜）
日本全国の約１００ヶ所の農林水研究機関を接続、つくばWAN,SINET,JGN2等の他の研究ネットワークとの連携協力、国際稲研究所と結ぶ日本フィリピン回線を保有し、ＡＰＡＮ（アジア太平洋高度ネットワーク）を通して、アジア、アメリカ、ヨーロッパ等世界中の研究ネットワークと連携

農学情報資源システム（１９９８〜）
衛星画像DB、Bio-mirror

デジタルコミュニティシステム（２００１〜２００５）
電農館（PCクラスタ、バーチャルラボ、衛星受信解析、ディスクストレージ）

科学技術計算システムの概要
SCSポータル

利用者ｓｃai

お知らせ
ファイル転送ジョブ管理
アプリ利用Web学習
支援申込み
FAQ検索

ジョブ投入

ｓｃap
ｓｃｓｘ
ｓｃｓtat高速ストレージ
・ホームディレクトリ
・ワーク領域click here.

ネットワークサービスシステム
E-mailサービス
 機関公式Webサービス
 情報交換サービス
 利用者統合認証 留学、出張先からの内部サービスの利用
 セキュリティ管理MAFFIN（農林水産省研究ネットワーク）
農林水産研究に関わる国、独立行政法人等の研究機関を接続
 全国の研究所の情報格差の解消を目指す

研究者数人の小さな研究支所にも、大規模な研究所と同じ情報資源（スーパコンピュタ等の計算環境、データベース検索、インターネットサービス）を提供

全国を広域イーサネット網で接続（１０−１００Mbps）
 筑波農林団地内は、Gigabiイーサネット接続（２Gbps

10Gbps）

農林水産研究基本計画
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平成１７年３月に策定された、「農林水産研究基本計画」に即して、研究重点目標の実現と研究システム改革（我が国農林水産研究勢力（ALL Japan)を対象とした研究行政の展開、研究企画、立案機能の機能強化）、産官学連携の強化、研究の国際化、研究成果の現場への普及、国民との双方向コミュニケーション強化等実施していく農林水産研究計算センター
ALL Japanへ

来年度、計算センター施設・設備を農林水産研究勢力全体（ALL JAPAN)へ拡大
但し、当面は、農林水産省の競争的研究資金等を交付されているもの。

利用者の範囲：大学、都道府県研究機関、民間等対象となるシステム：科学技術計算システム
ネットワークサービスシステム
デジタルコミュニティシステム（電農館）

電農館： 情報通信共同利用館

電農館（平成１４年１２月）
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農林水産研究情報デジタルコミュニティ事業（平成１３〜１７年度）の一環として遠隔地等異なる地点の研究者の共同研究を支援するコンピュータ・ネットワーク上の仮想的な研究室(バーチャル・ラボ）
農林水産研究の基礎的技術情報を収集し・蓄積し、研究者が共通に使えるデジタルアーカイブを構築・提供するための基盤施設

電農館の施設・設備
研究グループ単位でのデータ共有、配布等が行える仮想的な研究室（バーチャル・ラボ）
 大規模ストレージディスク
 地球環境衛星MODISを受信・提供する衛星画像受信、解析システム
 PCクラスタ（PC64台、128CPU） VCホール
 オープンラボバーチャル・ラボ（共同研究・情報共有サーバ）
小型汎用的な計算・情報共有処理
 データ計算や加工処理
 データベースの構築 研究者の情報共有 研究成果発信（Webからの公開など）
・利用例
東北地方気象メッシュデータ作成
やませなどによる水稲冷害予測 ・東北農業研究センター
・研究計算センターから得られる数値基礎情報（気象・地理）を独自の研究成果と融合させ、さらにGISアプリケーションを用いて気象災害メッシュデータを作成。水稲冷害予測と共に一般にも公開。
精度の高いデータとして宮城県や国立感染症研究所へもデータ提供している。
福島県農業試験場 研究用基礎データとして利用

宮城県庁

計算センター
数値基礎データ

定期的に取得

メッシュデータはスパコンで計算

国立感染症研究所

マラリア蚊の北進シミュレーション

宮城県冷害予測の公表利用例（バーチャルラボ＆衛星データ）

衛星を用いた水循環モニタリング
農業環境研究所 森林総合研究所 国際農業研究センター

研究計算センターで提供する衛星データおよび気象データ、GISアプリケーションを活用し、東南アジア地区の大規模な水循環システムについて解明するプロジェクト。
プロジェクトの経過生産物として、水田マップや灌漑マップ、土地の被覆図、土地利用図などを作成し、関係国への提供も行っている。

計算センター
・衛星画像
・GISアプリカンボジア政府から水循環による研究功績を顕彰され勲章授与をうける森林総合研澤田
管理官

PCクラスタＰＣを６４台（１２８CPU)を並列高速計算
 並列化プログラミングとチューニング
 並列化済みフリーソフト（ゲノム関連）
 利用目的別に使うコンピュータを分割大規模ディスクストーレージ
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１００ＴＢ（テラバイト）大容量ファイルシステム

MODIS 準リアルタイム画像（Level1b処理時間：約２０分）

AQUA

TERRA

TeraScan システム(IMAPP)

VCホール（大規模プレゼンテーション室）
研究発表やプレゼンテーションに活用している。
 可視化画像により３D立体画像として投射し、実験や観察では得られない事象を仮想的な空間に表すことができる。
オープンラボ
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研究者等へのオープンスペース

電農館から提供している協調プロの成果
気象データ仲介ソフトMetBroker フィールドサーバ
 蓄積した過去の電子メールを知識源として活用するMoka
 リアルタイム海況情報提供システム
 農業技術体系のデータベース （予定）

電農館とITプロとの連携
プロジェクトの成果のうち，研究者や一般の利用に向けてサービスを開始できるものについては，
 順次，運用体制・仕組みを作って「電農館」のサービスとしていきたい

成果利用イメージ

ありがとうございましたm(̲ ̲)m