Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 1

Mascot Server version 2.7 Windows 版

アップグレード手順
この書類は、version 2.6 の Mascot Server(Windows 版)を version 2.7 へアップグレードする手順について説明しています。新規にインストールする場合はインストール DVD 内 または弊社日本語資料サイト上の Mascot_Server_v2.7_Win_新規インストール手順.pdf をご覧ください。

● ver. 2.7 アップグレードで特に注意して頂きたい事▼ アップグレード操作の前に、ver.2.6 のライセンスシリアル情報を弊社までお送り頂く必要があります。お送り頂いた情報を元に ver.2.7 用の新たなライセンスを発行しお送りいたします。詳細は手順「1-1.ver.2.6 情報の弊社への送付」(P.4～)をご覧ください。
▼ 日本で購入されたライセンスのみ、ver.2.7 では 1CP ライセンスあたりで使用できるコア数が 4 から 6 へ増加します。コンピュータに余剰コアがある場合、検索速度の向上が見込まれます。
▼ 別の PC への移行をご検討の場合、恐れ入りますがその旨弊社までご連絡ください。
▼ 作業前にデータのバックアップを取っていただく事を強く推奨いたします。（手順「1-2.バックアップ」（P.5～）をご参照ください。）▼ オンラインによるライセンス認証を行います。MASCOT Server が インターネットへの接続ができるかご確認ください。ただし以降の手順で記されているように接続できない場合にも対処法がございます。

● アップグレード操作前に必要な事アップグレード操作前に、ver2.6 ライセンス情報の弊社への送付と外付けディスクなどへのバックアップが必要となります。詳細はアップグレード手順「1. MASCOT Server ver2.6 情報の弊社への送付と関連ファイルのバックアップ」(P.4～)をご覧ください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 2● アップグレード時に準備するもの
1. Mascot Server version 2.7 のインストール DVD
2. MASCOT Server のプロダクトキー情報（ver.2.7 用、英数字 4×5 = 20 文字）
3. MASCOT Server のインターネットへの接続環境（接続できない場合でも別途方法有）
4. Windows へログインするユーザー名とパスワード (Admin 権限が必要)
5. (MASCOT Security 機 能 を 使 っ て い る 場 合 ) MASCOT Administrator 権 限 を 持 つ
ユーザー名とパスワード● アップグレード作業の流れ****最低限、5 までのステップで MASCOT Server が動くようになります。*****
1.

MASCOT ver.2.6 ライセンス情報の弊社への送付とバックアップ

2.

windows へのログオン

3.

起動中の他アプリケーションソフトウェアの終了

4.

MASCOT Server ver. 2.7 へのアップグレード

5.

MASCOT Server の ライセンス認証

6.

MASCOT Server のデータベース環境設定画面を開く

7.

ファイルダウンロードとデータベース構築確認

8.

MASCOT Server の動作確認

9.

MASCOT Daemon アップグレード (別資料、ご利用の方のみ)● アップグレードに要する時間
アップグレードの操作自体は 30 分以内に終わりますが、以下の 2 つの要素により作業の前後で大きく時間がかかる事があります。
■アップグレード作業前：ライセンス情報送付とバックアップ
ライセンス情報をお送り頂き、新たなシリアルライセンスを返送するまでに１～2 営業日かかる事があります。またバックアップはファイルサイズにより大きく前後します。特にこれまでの検索で結果ファイルが大量にある場合は遅くなり、場合によっては数時間かかる事があります。
■アップグレード作業後:データベースダウンロード、再構築
目安の作業時間には、 バージョンアップ後自動的に行われるデータベースファイルの更新の時間を含めていません。 構築完了までの大まかな目安として 1 時間～3 日程度かかります。特にNCBIprot などサイズの大きなデータベースはダウンロードやデータベースの構築に時間がかかります。構築完了したデータベースは検索可能ですが、構築中のデータベースが残っている場合、動作が遅くなります。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 3● インストールチェック表
項目チェック

該当 P

作業前：以下のものを準備
ver. 2.7 インストール DVD
ver.2.7 のプロダクトキー（英数字 4×5=20 文字） : 手順 1-1 により取得
コンピュータのインターネットへの接続 （接続できない場合も別途方法有、詳細
は手順書 5,P.14～をご参照ください）
MASCOT Server コンピュータへのログインユーザー名とパスワードの確認(MASCOT Security 機能ご利用の方) MASCOT Administrator 権限を持つ ユ ー ザ ー名 と パス ワ ード （ わ から な い 場 合も サ ー バ ーへ ロ グイ ンし て
セキュリティ機能をオフにすれば作業可能です）
作業内容
1. MASCOT Server ver2.6 情報の弊社への送付と関連ファイルのバックアップ

4

1-1. ver.2.6 情報の弊社への送付

4

1-2. MASCOT Server 現環境のバックアップ

5

2. Windows へのログオン

6

3. 起動中の他アプリケーションソフトウェアの終了

6

4. MASCOT Server version 2.7 アップグレード

6[Cluster ご利用の方] インストール途中 ： Cluster ノード設定

9[Cluster ご利用の方] インストール後 :11

MASCOT Service 設定

5. MASCOT Server ライセンス認証145-1. ライセンス認証画面表示

145-2. ライセンス認証サイトへのアクセス

15

5-3. ライセンス認証

17

6. MASCOT Server のデータベース環境設定画面を開く

22

7. ファイルダウンロードとデータベース構築確認

25

7-1.ダウンロード進捗の確認

25

7-2.ファイルの変換・検索テスト進捗の確認

26

8. MASCOT Server の動作確認

27

8-1. Database status 画面、Status 項目”In use”確認

27

8-2. 過去の検索結果の閲覧

28

8-3. 検索テスト

28

9. MASCOT Daemon アップグレード

別紙Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 4● アップグレード手順

1.

MASCOT Server ver.2.6 情報の弊社への送付と関連ファイルのバックアップ■ 1-1. ver.2.6 情報の弊社への送付
アップグレード前に、現在使用している MASCOT Server ver.2.6 のライセンスシリアル並びに関連情報を弊社までお送り頂く必要がございます 。ウェブブラウザで MASCOT Home の 画面から
Database Status ( 画面中ほど、Mascot Utilities セクションにあるハイパーリンク) をクリックする
か、アドレス部分に以下の URL 情報を入力・エンターを押して、Database Status 画面を開きます（*「ホスト名」と記述している部分には各 PC のホスト名または IP アドレスを入力してください）。

アドレス欄に直接入力する場合

http://ホスト名/mascot/x-cgi/ms-status.exe

Home 画面にある「Database Status」
リンクをクリックします

Database Status 画面の上から 2 行目に、MASCOT Server のバージョンが記されています。次
頁図のように、シリアル、CPU 情報がわかる 3 行（または 2 行）をコピーして、テキストファイルに貼り付けてください。

*

Database Status 画面で Error の表示が出ている場合は MASCOT サービス、データベースに関するトラブルが発生している事が考えられます。一度 PC を再起動して頂き再度 Databasestatus ページをご確認ください。トラブルが解決しないようでしたら弊社までご連絡ください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 5

シリアル並びに CPU の情報がわかる部分をコピーする

テキストファイルに貼り付ける

上記ファイルそのものを添付ファイルとして、あるいはファイルの内容をコピーしてメールの本体に貼り付け、弊社へメールをお送りください。

メールアドレス : support-jp@matrixscience.com
件名 (例,必須ではありません) : ver.2.7 ライセンスについて

折り返し１～２営業日以内に、弊社より新たな ver.2.7 用のシリアルライセンス（英数字 4 x 5 =20文字）をお送りいたします。

■ 1-2. バックアップ
Mascot Server がインストールされているフォルダ（通常のインストールでは C:\Inetpub\mascotフォルダ）全体をバックアップしてください。
バックアップの方法は各ユーザー様にお任せいたします。やり方がよくわからない場合、外付け

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 6

ハードディスク、または D ドライブなど MASCOT の dat ファイルバックアップ用に備え付けられた内部ハードディスクに「mascotbk20200314」などのフォルダを作成し、そこへ C:\Inetpub\mascot
フォルダを丸ごとファイルコピーする方法をお勧めいたします。コピー先フォルダの残り容量にご注意ください。

2.

Windows へのログオン

Administrator 権限（管理者権限）を持ったユーザーでログオンしてください。弊社納入コンピュータをご利用の場合通常は Administrator 権限を持つ mascot ユーザーが作成されています。mascot でログオンしてください。

3.

起動中の他アプリケーションソフトウェアの終了

アップグレード作業を行う前に、起動している他のアプリケーションソフトウェアを終了してください。

4.

MASCOT Server ver. 2.7 へのアップグレード

Mascot Server version 2.7 のアップグレードに要する時間は、DVD 内に予め準備されているデータベースファイル SwissProt リリース 2019_10, PRIDE_Contaminants_20160906 のセットアップも含め 30 分以内です。

初めにver.2.7 のインストールDVDを光学ドライブに挿入してください。DVD はMATRIX_SCIENCEという名称でマウントされます。setup64.exe をダブルクリックしてください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 7

windows 側に、下図左のようにインストーラーの実行について確認を求められることがありますが「実行」を選択してください。
また下図右のように関連プログラムとして、VisualC++ 2015 などの インストールを MASCOT のインストール前に求められる事があります。特に問題がなければインストールを行ってください。

関連プログラムのインストールが終わると、MASCOT Server の バー ジョンアッ プが始まります。「Next」を押してください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 8

License Agreement が表示されます。
内容をご覧いただき、特に問題がなければ「I accept the terms in the LicenseAgreement」にチェックを入れ、「Next」を押してください。

プロ ダクト キー 入力 が必 須 で ある事 を通知する画面が表示されます。「Next」を押してください。

インストール内容とインストール箇所を確認
す る 画 面 が 現 れ ま す 。 「 Location 」 と し てver.2.6 で使用していたフォルダが指定されているか、ご確認ください。
またご利用の SwissProt のバージョンが「 2019_10 」 より新 しい 場 合、 「 Sequence
Database and Libraries」において、これをインストールしないように右図内の青い丸の中にあるハードディスクマークをクリックし、X に変更してください。設定後、「Next」ボタンを押します。

現在ご利用の SwissProt が「2019_10」
より新しい場合、DVD 内にある SwissProtをコピーしないよう設定を変更してください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 9

続いて Cluster システムの設定を行います。
Cluster システム を利用しておらず 1 台のCluster を使用しない場合、「 Enable

PC だけで MASCOT Server の計算を行う

Mascot cluster mode」のチェックが外場合、チェックが付いていないのを確認してれているのを確認し、「Next」から「Next」ボタンを押してください。その場合以下の Cluster 利用者向けの設定に関する記述箇所を飛ばしてください。なお通常はCluster を使っておらずチェックをはずす方が正しい設定です。Cluster システム (複数台のPC を 利 用 す る 構 成 ) を ご 利 用 の 方 は「Enable Mascot Cluster mode」にチェックを入れ、「Configure」ボタンを押して node PC に関する設定が正しいかを確認してから「Next」ボタンを押してください（以下緑色の記述箇所をご参照ください）。

**** 【Cluster システム をご利用の場合】 Node に関する設定 の確認****Nodeに関する設定が現れます（下図）。

以下の設定が正しいか、一度確認してください。
・ nodeのIPアドレスと名称
・ Port番号（デフォルトは5001と設定されているケースがほとんどです）
・ nodeが使用するプロセッサー数（１プロセッサーあたり6コアまで）
・ UNC Node Path 。通常は \\PC名\C:\mascotnode(あるいはmsnode)です。
・ Node Directory。通常は C:\mascotnode(あるいはmsnode)です。

設定が確認できましたら、「OK」ボタンを押してください。

＊ Clusterのケースにおける設定終わり

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 10

すべての項目を設定し終わると、インストール開始となります。「Install」ボタンを押してください。
ファイルコピーが開始されます。

途中、ver.2.6で使用していた設定ファイルについてバックアップがとられ、その保存場所について示したダイアログが現れます。
そのまま「OK」を押してください。

SwissProtなどのデータベース設置を選択した場合、インストール後半で圧縮ファイルの展開と解凍が行われます。その操作中である事を表すコマンドプロンプトが途中表示さます。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 11

インストールが完了すると、右図のようなダイアログが現れます。「Open Mascot
server status page」のチェックが入っているのを確認した上で、「Finish」ボタンを押してください。

Clusterシステムをご利用の方は現状でMASCOT Serviceが動いていません。
ログインユーザーであるmascotにてMASCOT Serviceを動かすよう設定をする必要があります。
詳しくは以降の緑線部分:「MASCOT Serviceのmascot ユーザーによる開始設定」をご覧ください。

*Cluster システムご利用の場合：MASCOT Service のmascotユーザーによる開始設定

MASCOT Server をClusterシステムでご利用の場合、インストール後MASCOT Server のサービスは自動的に開始されません。MASCOTのサービスを mascotユーザーで開始するよう設定を変更した後、改めてサービスを開始する必要があります。

まず、コントロールパネルを起動します。（操作例: windows
マーク右側の検索欄で「control」と入力すると候補に「コントロールパネル」が挙がってくるので選択、など。
右図）

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 12

コントロールパネルの、「システムとセキュリティ」→「管理ツール」→「サービス」を選びます。

「システムとセキュリティ」→「管理ツール」→「サービス」

サービス一覧の中で「Matrix Science Mascot Service」という項目を探し、ダブルクリックします（下図）。

「Matrix Science Mascot Service」を探し、ダブルクリック

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 13「ログオン」タブ内の「アカウント」にて、以下の設定を入力します。

・アカウント→ ログオンユーザー(mascotなど)
・パスワード→ mascotユーザーログイン時のパスワード入力後、「OK」ボタンを押します。

例ではアカウントmascotで、パスワード「ログオン」タブでユーザー名とパスワード入力し、にはmascotのログイン時パスワードを「OK」ボタンを押します

入力しています。

Matrix Science Mascot Service を選んだ状態で右クリック→「開始」を選びます。MASCOT
Serviceが開始されます。開始時にエラーが出た場合はお手数ですが弊社までご連絡ください。

***** MASCOT クラスターシステム利用者向けの特殊設定終わり *****

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 14

状況によってはMASCOTインストール後にシステム再起動が求められることがあります。再起動を実施してください。

5.

MASCOT Server の ライセンス認証

アップグレード後、ライセンスの登録と認証が必要となります。ver.2.6 からアップグレードを行った
お客さまも、ver.2.7 用のライセンスで登録と認証を再度行う必要があります。ライセンス認証は WEBブラウザ画面を通じて行います。ライセンス登録と認証は基本的にオンラインで行うため、MASCOTServer コンピュータ（あるいは server へ接続している別の PC） をインターネットへ接続した方が簡単に認証できます。但し PC を直接インターネットへ接続できない場合でもインターネットに繋がっている
別の PC からライセンスの登録と認証を行う事ができます。

■ 5-1. ライセンス認証の案内画面を表示させる方法
ライセンス認証が完了していない状態で database status (Home ->Database status) を開くと、「Mascot Server Product Key Registration」ページに誘導する画面が現れます。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 15■ 5-2. ライセンス認証サイトへのアクセス方法
ライセンス認証のサイトへアクセスする方法は、操作をしている端末がインターネットへ接続しているかどうかにより対処法が異なります。直接接続できない場合は登録に必要な情報を集めたファイル「registration.xml」をserver から入手しておく必要があります。

■ 認証操作をしているPCをインターネットに繋いでいて直接登録と認証を行う場合：
案内画面内にある「Register Online Now」ボタンを押してください。

← インターネット経由で直接ライセンス登録＆認証■ 何らかの理由で認証操作をしているPC をインターネットに繋いでいない場合：
案内画面内にある「No Internet connection」をクリックします。

インターネットに繋がっておらず、直接登録できない場合「No Internet connection」をクリック

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 16

遷移した画面で「Save Registration File」ボタンを押してregistration.xml ファイルを保存してください。

「 Save Regstration File 」 を ク リ ッ ク し て
registration.xml ファイルを保存

このファイルをインターネットに接続しているPCへ持ち運びブラウザのアドレス部分に
http://www.matrixscience.com/licensing/registerと入力して画面を開いてください。

インターネットにつながっている端末へregistration.xml ファイルを移した後、ブラウザでhttp://www.matrixscience.com/licensing/register へ接続

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 17■ 5-3. ライセンス認証
プロダクトキーを入力する画面が現れます。別途お知らせしたver.2.7用のライセンス20文字の半角英数字を、ハイフン付きで入力してください。入力後、「Start」ボタンを押してください。

MASCOT Server から直接認証サイトへ繋いでおらず別端末から接続している場合、以下の操作を追加で行い registration.xml ファイルをアップロードしてください。

＊別端末でインターネットに繋いでライセンス登録する場合

最初に保存したProduct registration file (registration.xml ファイル)をアップロードする画面が現れます（下図）ので、registration.xmlファイルをアップロード→ 「Continue」をクリックしてください。

registration.xml を ア ッ プ ロ ー ド 後 、「Continue」をクリック***** MASCOTとは別端末でライセンス登録を行う場合に行う追加の操作 終わり

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 18

続いてライセンス情報を登録する画面が現れます。赤い * が付いている項目に関しては必須項目ですので必ず入力してください。入力内容については、下図例を参考にしてください。

＊欄は入力必須
日本語×、すべて英語でライセンス登録者とは別の人へライセンスファイルを送りたい場合、「Email address(CC)」欄にメールアドレスを入力してください。
また、ここで入力した人が弊社からの各種ソフトウェアのバージョンアップ等のお知らせ(英語版)が必要かどうかを選択してください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 19

画面下部にはMASCOT Server のライセンスに関する規約が表示されます。文章に目を通して問題ない場合には「I accept the terms of the licence agreement」を選び、「Create licence」ボタンを押してください。

「Licence agreement」の内容に問題がなければ、「I accept the terms of the licence agreement」
を選択し、「Create Licence」ボタンを押してください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 20

無事登録が終わると以下のような画面が表示され、登録したメールアドレスにライセンスファイルが送付されます。ライセンスファイルは、「(ライセンス文字列).lic」というファイル名です。
MASCOT Server がインターネットに繋がっている状態でライセンシング作業を行った場合、「savenow」リンクを押すとライセンスファイルが直接サーバーに保存され、すぐに利用可能な状態になります。

MASCOT Server がインターネットに繋がっていれば、「save now」ボタンですぐにライセンスファイルが所定の場所に保存され、MASCOT が使用可能になります。

直接ライセンスファイルをセットする認証がうまく行くと、遷移画面の 1 行目にその旨メッセージが現れます。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 21

MASCOT server がインターネットに繋がっていない場合、登録メールに送付されたメールに添付されたライセンスファイルをネットワーク経由やフラッシュメモリなどでMASCOT Server PCまで運び、licファイルをMASCOTインストールディレクトリ下の、config/licdb へコピーしてください。MASCOT
インストールディレクトリは通常 C:\inetpub\mascot ですので、licdb の場所はC:\inetpub\mascot\config\licdbとなります。ライセンスファイル設置直後からMASCOT Serverが正常に動作します。バージョンアップ後各データベースの構築が行われ、検索可能になるのに少し時間がかかります。ライセンス登録の内容を確認するため、Database StatusページのLicense infoのリンクを押し、ライセンス情報が正しく表示されている事を確認してください。操作後も画面にライセンス登録を求めるエラーメッセージが出る場合は弊社までご連絡ください。

Database Status 画面で、「Licence Info」リンクをクリックし、登録したライセンス情報が表示されているかご確認ください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 22

6.

MASCOT Server のデータベース環境設定画面を開くバージョンアップ後「Database Manager」 ページ上で、使用するデータベースについての設定を確認してください。データベースの環境設定を行う画面へアクセスするためには MASCOT のライセンス
登録後 Web ブラウザで Home → Configuration Editor → Database Manager を開きます（下図）。

Home の Configuration Editor -> Database Manager

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 23

Database Managerを開いた際、以下のように利用中のデータベース一覧画面が表示されれば特に問題はありません。確認は終了です。

設定内容の確認が必要なデータベースが存在する場合、以下のような設定変更画面が現れます。

【選択項目の目安】●カスタムデータベース、公開 DB だが抜き出しルール変更時など→ Keep as Custom● 公 開 デ ー タ ベ ー ス で mascot デ フ ォ ル ト 設 定 準 備 さ れ て い る→ Synchronise with ‘XXXXXXX’

通常は選択項目を変更することなく「Import」を押すだけで OK

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 24

初期設定画面で提示されている設定内容は以下の2択です。
-Keep as Custom: 前バージョンで利用していて今後も使用予定のデータベースについて、これまでのバージョンで利用していた設定内容をそのまま継続して利用する-

Synchronise with --: データベースの設定ファイルであるconfiguration.xml ファイルの設定を適用し、以降も定期的に変更がないかチェックし続ける

通常は、MASCOTがデフォルトで選択している方をご利用ください。ただし以下の2例でデフォルト設定を変える事があります。
-

SwissProtのフォーマットについて意図的に設定を変えている場合など、変更されてほしくない
場合は「Synchronise --」を選択せず、「Keep as Custom」にします。

-

これまで使用していた設定に不満がある状態で「Synchronise --」が提示された場合は、「▼Differences」をクリックし展開して表示される内容をご覧いただき、問題がなさそうであれば「Synchronise --」の提示内容に変更してもよいかと思います。

すべてのデータベースで設定が終了したら、画面下の「Import」ボタンを押します。

Import

ボタンを押すと画面が切り替わり、左側の「Database Manager」->「Databases」

選択時と同じ画面へ移行しますMascot Server version 2.7 アップグレード手順 25

7.

ファイルダウンロードとデータベース構築確認

アップグレード時にswissprotデータベースファイルの使用を選択した場合、または新たにデータベースを使用するように設定変更すると、「データベースファイルのダウンロード」 →「MASCOT用のデータベースファイル変換」 →「検索テスト」 が行われます。データベースファイルのダウンロード
進捗状況確認についてはDatabase manager ページのRunning tasksで、ダウンロード後のファイル変換や検索テストの進捗状況確認は Database Status 画面で行います。

■ 7-1. ダウンロード進捗の確認
各データベースのダウンロード操作は「Running task」として扱われます。Taskの進捗度合いは下図のように「Tasks」セクションにて確認する事ができます。「Database Manager」画面の左フレーム、 「Running tasks」をクリックすると、現在実行・実行待ちとなっているTaskが一覧で表示されます。Taskは「実行待ち」「実行中」「実行終了」の各セクションに分かれて表示されています（下図）。 実行したTaskが実行終了の欄へ移行し、「Last message」の欄に「(success)’DB名’successfully updated」と表示されればダウンロード終了です。

実行待ち→

実行中 →
(success) DB successfully updated と表示されればダウンロード完了
実行終了→

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 26■ 7-2. ファイルの変換・検索テスト進捗の確認
ファイルダウンロードが終了後、MASCOT Serverプログラム側(ms-monitor.exe) が自動的にダウンロードしたファイルをMASCOT で検索できるようファイル変換を行います。変換状況は、
Database Status (Home -> Database Status)でデータベース毎に確認できます（下図）。
各データベースの 「Filename」項目に、（Database名）_ (バージョンまたは日付) .fasta と 表示されています。後部の (バージョンまたは日付) の記述部分でデータベースの新しさを確認してください。
また「Status」項目ではデータベースの現状を確認できます。

ダウンロード後のファイル変換
作業進捗を確認する場合「Filename」項目にはファイルのバージョン情報が含まれる

Status が 「 In use 」 に な れ ば構築完了です。

上記例のPRIDE_Contaminantsのように、２つの日付のデータベースが表示されているケースがあります。「Filename」項目と「Status」項目を見比べてください。例の上図では、日付が20160906のStatus 項目は「Not in use」となっています。一方より新しい20160908の方は「In use」となっています。これは20160906の方は既に使用されておらず、新しい20160908の方が現在使用可能となっている事を表しています。ダウンロードを開始したデータベースについて、Statusが「In use」になるまでお待ち下さい。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 27

8.

MASCOT Server の動作確認

すべての設定後、MASCOT Server の各種動作確認をしてください。動作確認の方法はご利用者にお任せいたしますが、弊社からは以下３つの確認を提案いたします。

8-1. Database status 画面における、各データベースの Status 項目の確認
8-2. 過去の検索結果の閲覧確認
8-3. 検索テスト■ 8-1. Database status 画面における、各データベースの Status 項目の確認
Home から「Database Status」 のハイパーリンクをクリックします。

DatabaseStatus

Home の Database Status をクリック

画 面 に て 、各データベースの「Status」項目を見ます。
右図のように「In Use」であれば問題ありません。

各データベースの Status 項目が”In Use”であるかをチェック。
Halted なら PC 再起動

ファイルダウンロード後のデータベース再構築ですが、「1.データベースの構築」→「2.検索テスト」→「3.使用可能 (In use)」という過程を経ます。Statusの表示が「Creating compressed files N%」 となっている場合、step1 のデータベース構築中です。
また status 表示が「Running 1st test」の場合、step2 の検索テスト実行中です。これらの表記は特に問題ありません。次のステップに移行するまでお待ちください。
Status が「Halted:Failed to map」となっている場合、まずは PC を再起動してもう一度ご確認ください。同じエラーが出た場合、status 項目のすぐ隣に現れているハイパーリンク「compressionwarning」「Check error log」をクリックし、エラー内容を確認してわかる範囲でご対処頂き、ご不明な点がございましたら弊社までご連絡ください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 28■ 8-2. 過去の検索結果の閲覧確認
Database Status 画面を確認後、過去の検索結果の閲覧に問題がないか確認します。
Home から Search Log のハイパーリンクをクリックします。

任意の Job#をクリックし過去の検索結果が問題なく表示される事を確認してください。これまでと同じフォーマット形式の画面が現れない、または表示時に赤字の Warning が出るようになった場合は、（以前のバージョンでも出ている場合を除く、）お手数ですが弊社までご連絡ください。

■ 8-3. 検索テスト
検索のテストについては、いつも実施している方法で検索してください。手元に適切なデータがない場合、DVD の mskk/sampledata の中に含まれている各種 mgf ファイルを使って検索を試みたり、質量分析装置の付属ソフトウェアからの検索を行ってみてください。
うまくいかない場合、次頁の手順で順に検索のテストを行って頂き、どの段階で問題が生じるかご確認ください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 29[検索でエラーとなる場合にお試し頂きたい事]

1. すべてのケース：データベースを変えて検索してください。

上記方法で検索可能だった場合：最初に選択したデータベースに問題が生じている可能性があります。Home -> Database Status ページで該当データベースの status 項目をご覧ください(本資料の P27～をご参照ください)。また問題が生じているデータベースの名称を確認するとともに、MASCOT Server の logs ディレクトリにある、monitor.log, errorlog.txt ファイル内に該当データベースに関するメッセージがないかご覧ください。ご不明な場合はこれらのファイルを弊社までお送りください。

2.

Daemon や各社分析ソフトウェアから検索を行っている場合：検索手段を変えて検索してください。
- 他のソフトウェアからでなく MASCOT Server PC にある WEB ブラウザから、Search logなどにある過去の検索結果を開き、再検索などで検索テストを行ってください。
- 他端末のブラウザや Daemon、メーカー付属の解析ソフトウェアがあればそこから検索を行ってください。

*ブラウザからの再検索方法が良くわからない場合、とりあえず home->Search log から過去の検索結果を開き、再検索を行う方法などをご提案します。

上記方法で問題が解決した場合：ネットワークや MASCOT セキュリティシステム、Daemon や各種ソフトウェアのバージョンの組み合わせに何らかのトラブルが発生している可能性があります。
関連のありそうな項目について簡単にご確認頂いた後、弊社までトラブルの内容をご連絡ください。

9.

MASCOT Daemon アップグレード（別資料）

MASCOT Server のバージョンアップに伴い、MASCOT Daemon のバージョンアップも行って頂く事をお勧めいたします。Daemon のアップグレード手順に関しては別資料「Mascot Daemonマニュアル」
URL: http://www.matrixscience.jp/pdf/jap_mdaemon_manual.pdfの「2.インストレ ーションと環境設定」 -「2.3 バージョンアップ」にまとめてありますのでそち らをご覧ください。

Mascot Server version 2.7 アップグレード手順 30● 技術サポートアップグレードに関してご質問等ありましたら弊社技術サポートにご連絡ください。
電子メール：support-jp@matrixscience.com

電話：03-5807-7897

ファックス：03-5807-7896