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微生物系統保存施設 MCC メールニュース No. 2 (2016.05.31 発行)
国立研究開発法人国立環境研究所━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━新年度を迎え、新緑の美しい季節となりました。国立環境研究所 微生物系統保存施設(MCC-NIES)から
MCC メールニュース No. 2 をお届けします。本年度も変わらぬご支援、ご利用をどうぞよろしくお願い申し上げます。

━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━
ホームページ紹介
NIES 株トピックス

ゲノム解析株 Leptolyngbya sp.(NIES-2104)について

NIES 株を使った論文 (2016 年度 1～4 月分)
新規公開微生物株 (2016 年度 1～4 月分)
NIES 株の遺伝子登録についてお知らせ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
ホームページ紹介━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
当施設のホームページコンテンツや使い方についてご紹介します。今回は「検索 Tips」と「株イメージ」について。
「検索 Tips」のページでは、様々な検索方法を紹介しています。例えば、全文検索で産地や株の特性などからも検索することができます。利用したい株が絞り込めない場合には、是非、直接 mcc@nies.go.jp
までご相談ください。
「検索 Tips」のページは以下から
http://mcc.nies.go.jp/search_tips_j.html「株イメージ」のページでは、「分類群別」、「NIES 番号順 」、「アルファベット順」別に画像検索ができます。今回、82 枚の画像が追加登録され、試験管で培養されている状態や走査型電子顕微鏡(SEM)の画像が加わりました。培養状態の画像では、元気な細胞が試験管のどこに集まっているか、どのような色を呈しているかがわかります。
「株イメージ」のページは以下から
分類群別：http://mcc.nies.go.jp/top.do?forwardType=7
NIES 番号順：http://mcc.nies.go.jp/top.do?forwardType=4

アルファベット順：http://mcc.nies.go.jp/top.do?forwardType=6━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━NIES 株トピックス
ゲノム解析株 Leptolyngbya sp.(NIES-2104)について━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
Leptolyngbya 属は非常に細い糸状性のシアノバクテリアです。Leptolyngbya boryana という種は、世界中の淡水環境から採取されますが、乾燥ストレスに弱いことが知られていました。Leptolyngbya sp.
NIES-2104 は日本陸域の乾燥試料から採取された株で、L. boryana に近縁な株です。MCC-NIES では、
この Leptolyngbya sp. NIES-2104 の完全ゲノム配列を決定して、L. boryana のゲノムとの比較解析を行いました (Shimura et al. 2015)。その結果、陸域と淡水という生息環境の違いに関係すると考えられる、いくつかの特徴的な遺伝的差異が明らかになりました。L. boryana は低酸素条件で機能する窒素固定遺伝子群とクロロフィル合成系遺伝子をもつのに対し、Leptolyngbya sp. NIES-2104 は、これらをもたないことがわかりました。淡水環境では頻繁に低酸素条件に曝されるのに対し、陸域環境では低酸素条件が起こりにくいため、このような違いが見られるのだと考えられます。また Leptolyngbya sp.
NIES-2104 は抗酸化物質として働くマイコスポリン様アミノ酸の合成遺伝子群をもつのに対し、L.
boryana はこれらをもたないことがわかりました。陸域環境では淡水環境に比べて乾燥に伴う強い酸化ストレスに曝されるため、このような違いが見られるのだと考えられます。
Leptolyngbya sp. NIES-2104 のゲノム情報は国際塩基配列データベースに登録、公開されております（アクセッション番号: BBWW01000001-BBWW01000005）。また Leptolyngbya sp. NIES-2104 は、MCC-NIES より入手可能です。
http://mcc.nies.go.jp/strainList.do?strainId=2496
参考文献の Shimura et al. (2015)は以下から
http://dx.doi.org/10.1093/dnares/dsv022
Leptolyngbya sp.(NIES-2104)以外に、2014～2016 年にかけて 6 株のシアノバクテリア株のゲノム解析が行われました。ゲノム解析が行われた NIES 株リストは以下から
http://mcc.nies.go.jp/topics-j.html━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━NIES 株を使った論文 (2016 年 1～4 月分)━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
当施設から提供された NIES 株を使って出された研究成果が次々と発表されています。
2016 年に出された成果論文リストとリンク情報は以下から
http://mcc.nies.go.jp/07information/reference2016_j.html

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新規公開微生物株 (2016 年 1～4 月分)━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
2016 年度 4 月までにご寄託頂いた 18 株について、データベースへの登録と培養状態の確認作業が終了して、みなさまにご利用頂けるようになりました。
2016 年度の新規寄託株リストは以下から
http://mcc.nies.go.jp/07information/07strain2015_j.html━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━NIES 株の遺伝子登録について━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━DDBJ や NCBI な ど の 国 際 塩 基 配 列 デ ー タ ベ ー ス へ NIES 株 を 登 録 す る 際 に は 、「 strain 」 と「culture_collection」に NIES 番号を登録してください。「strain」には NIES 番号を登録し、NIES と番号の間には必ず‘-（ハイフン）’をつけてください（例：NIES-123）。「culture_collection」の場合、<institution-code>には NIES、<culture_id>には NIES 番号の数字のみを登録します（NIES-123 の場合：123）。
DDBJ は qualifier key から、NCBI は Providing Source Information in your Submission からの登録になります。また登録後には直接 mcc@nies.go.jp にご連絡くださいますよう、よろしくお願いします。

━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━お知らせ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━[新たに無菌化された NIES 株]
NIES-778

Micrasterias foliacea[2016 May]

NIES-2892

Haematococcus sp.

[2016 May]

NIES-981

Cyanobium sp.

[2015 Dec]

NIES-2549Microcystis aeruginosa

NIES-3351

Ostreopsis cf. ovata[2014 Nov]
[2014 Sept][種名等の分類名の変更]●遺伝子解析から以下の NIES 株の学名を変更しました。
NIES-329

Ulothrix variabilis→ Klebsormidium sp.

NIES-981

Synechococcus sp.

→ Cyanobium sp.

●属の修正および新設により以下の学名に変更しました。

NIES-2682

Bolidomonas pacifica→ Triparma pacifica

NIES-3369

Bolidomonas sp.

→ Triparma sp.

NIES-3370

Bolidomonas pacifica→ Triparma eleuthera

NIES-3371

Bolidomonas pacifica var. eleuthera

NIES-2320

Chlamydomonas sp.

→ Rhysamphichloris similis

NIES-2321

Chlamydomonas sp.

→ Rhysamphichloris similis

NIES-2322

Chlamydomonas sp.

→ Rhysamphichloris similis

NIES-2575

Chloromonas carrizoensis→ Triparma eleuthera→ Ixipapillifera deasonii[国立環境研究所夏の大公開のお知らせ]
今年の国立環境研究所一般公開（夏の大公開）は 7 月 23 日（土）に開催されます。微生物系統保存施設
では、「藻類の世界をのぞいてみよう」というテーマで、藻類釣りゲームや電子顕微鏡観察などの楽しい企画を準備しております。開催場所は環境生物保存棟です。お時間のある方はぜひお越しください！昨年の案内や開催報告は以下から
http://www.nies.go.jp/event/kokai/2015/index.html
https://www.nies.go.jp/event/2015/20150806/20150806.html━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
メールニュースは 1、5、9 月月末に発行します。
過去のメールニュースは以下から
http://mcc.nies.go.jp/07information_j.html#mail_news━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
メールニュースの受信停止は、mcc@nies.go.jp までご連絡ください。
ご質問、ご意見は、mcc@nies.go.jp までご連絡ください。
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