ゲノム研究分野
Division of Genomics Research
〒

―

岐阜市柳戸

番

E-mail：mgrc@gifu-u.ac.jp
TEL：

―

―

FAX：

―

―

目

次

―

分野長あいさつ ……………………………………………………………

―新任教員あいさつ …………………………………………………………

―

ゲノム研究分野職員名簿 …………………………………………………

⑴ 専任教員………………………………………………………………………
⑵ 非常勤職員……………………………………………………………………
⑶ 研究員…………………………………………………………………………
平成 年度利用登録者及び研究テーマ………………………………………
ゲノム研究分野機器紹介………………………………………………………
利用の手引き⑴ 規 約…………………………………………………………………………
⑵ 利用者負担額料金表…………………………………………………………
⑶ DNA シーケンス受託解析・料金 …………………………………………
平成 年度活動状況報告⑴ 講習会・トレーニングコース・講演会等…………………………………
⑵ ゲノム研究分野利用状況……………………………………………………
⑶ 共同スペース利用状況………………………………………………………
⑷ 平成 年度業績論文等………………………………………………………
⑸ ゲノム研究分野教員の教育研究活動等……………………………………
⑹ 補助金関連採択状況…………………………………………………………
⑺ 新聞報道………………………………………………………………………

―

分野長あいさつ学内生命科学研究のさらなる発展を目指してゲノム研究分野長

下澤伸行

ゲノム研究分野では平成 年 月より新助教として理学部出身の高島茂雄先生を迎え、応用生物科
学系、医学系の 人の教員により、それぞれの立場で全学の研究基盤整備から共同研究も視野に、岐阜大学の生命科学研究の発展に寄与して行きたいと考えています。
研究基盤につきましては、根幹となる DNA シークエンス受託解析に加えて、定量 PCR、マイク
ロアレイスキャナー、マルチビーズバイオアッセイ、MS／MS 解析、光学系の解析機器に顕微鏡、バイオインフォマティクス支援システム等を整備し、各機器の説明会、講習会を開催しながら学内利用を拡大し、より多くの研究者への研究基盤の提供を図っています（ ．ゲノム研究分野機器紹介およびホームページ http://lsrcgenome.sakura.ne.jp/参照）。
また DNA シークエンス受託解析につきましては、岐阜薬科大学の利用拡大も踏まえ、医学部棟階の医学系研究科共通機器センターに受託サンプル保管用の冷蔵庫を設置して、こちらから回収するとともに、平成 年度に引き続き、 年度も新規利用者や第 四半期（ ― 月）にはキャンペーン
価格で提供しています。運営費交付金や研究費獲得が厳しい折、維持、保守管理、更新等にかかる費用を確保した上で、出来るだけ学内研究者が利用し易い形で提供し、研究が発展されることを期待しています。それとともに、輩出された論文等の業績につきましては、是非とも ARIS 等に掲載の上、年度末の利用者登録更新時にはゲノムまでお知らせ頂ければ幸いです。
医薬工農獣医が つのキャンパスに集結している本学の特性を活かして、研究基盤を介した共同研
究の展開も視野に、本学の生命科学分野の教育研究活動の推進に寄与して参りたいと存じますので、引き続きご指導の程、宜しくお願い申し上げます。

―

―

―

新任教員あいさつ
長良川を越えて岐阜大学へ
ゲノム研究分野助教

高島

茂雄

月 日よりゲノム研究分野の助教として採用されました。九州（福岡県）生まれの私には、岐阜
県はもとより中部地方はあまりなじみが無い土地なのですが、長良川をはじめ大小多くの河川と山々に囲まれた街並みはとても新鮮で、特に金華山の山頂に見える岐阜城を見上げながらの通勤を毎朝楽しんでおります。
研究活動としてはこれまでショウジョウバエやメダカなどを研究材料として発生遺伝学を軸とした基礎研究を行ってまいりました。ショウジョウバエでは消化管を対象にその発生過程や幹細胞を制御する遺伝子機構の研究を行い、メダカでは頭部形成や左右軸形成過程における遺伝子群の働きを遺伝
子突然変異体を用いて研究してきました。下澤先生や須賀先生とは研究のバックグラウンドが違いますが、異なった切り口から研究を進めていければと考えています。
よい研究を行うためにはよい研究アイデアを元にしっかりとした研究計画を立てることが必要だと
常日頃から心がけるようにしています。しかしながら近年の生命科学研究は細部まで事細かく調べることを要求される一方で、ゲノム解析など大規模で広範な解析も要求されるようになりました。それらの研究を遂行するためには複雑な機器を利用して様々なタイプのデータを出さなければならず、必然的にそれらの機器の利用が研究計画に含まれることになります。しかしながら往々にしてそれらの機器は扱いが難解で特に高額機器の場合は利用を見合わせがちになってしまいます。ゲノム研究分野
棟には様々な研究設備、機器が揃っています。皆さんによりよい研究を行ってもらうために、なるべ
く多くの方々に気軽に共通利用機器を使ってもらえるようにお手伝いできればと思っています。それらの設備、機器についてより深く知ってもらい使いこなしてもらうことで研究計画を綿密で幅広いものに出来ますし、また新たな研究アイデアが浮かぶこともあるでしょう。気軽にご質問などをしていただければと思います。よろしくお願いいたします。

―

―

―
⑴

ゲノム研究分野職員名簿（平成 年以降）
専任教員

．教授（分野長）
．准教授
．助教

⑵

伸行
晴久
朋子（平成 年 月まで）
茂雄（平成 年 月から）非常勤職員（注：＊は、教員個人の研究費で雇用）．事務補佐員
．技術補佐員
．技術補佐員
．技術補佐員＊．研究補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊

⑶

下澤
須賀
長瀬
高島

小林 陽子
平井 さやか
脇原 祥子
船坂 美佳
本田 綾子
梶原 尚美
瀬尾 道（平成 年 月まで）
スコット 暁子（平成 年 月まで）
桐山 寛子（平成 年 月まで）
豊吉 佳代子（平成 年 月から）
大場 亜希子（平成 年 月から）研究員

．特別協力研究員．特別協力研究員．特別協力研究員

竹本 靖彦
野原 大輔
長瀬 朋子（平成 年 月から）――

平成 年度利用登録者及び研究テーマ（平成 年 月現在）
学

部

講 座 等

利用責任者

登録番号

教育学

家政教育

長 野 宏 子ED―

研 究 テ ー マ
伝統発酵食品中の微生物とその動き

崇ED―

野生植物の自殖率推定、野生生物の系統推定と父性解析

地域科学

地域政策

向 井 貴 彦RS―

魚類の DNA 解析

医学

腫瘍病理学

久 野 壽 也MD―

遺伝子改変マウスを用いたがん研究

医学

分子病態学

木 村 正 志MD―

リングフィンガープロテイン の機能解析 細胞周期関連遺伝子の技能解析

医学

神経内科・老年学

犬 塚

貴

MD―

プロテオーム解析による疾患特異的マーカーの検索

医学

病態情報解析医学

清 島

満

MD―

肝細胞の機能解析

医学

整形外科学

大 野 貴 敏MD―

遺伝子のサブクローニング

医学

神経生物

中 川 敏 幸MD―神経発生・神経変性機構の分子メカニズムの解析

医学

病態制御学

安 田

満

MD―

尿路性器感染症分離菌に関する研究

医学

薬理病態学

西 脇 理 英MD―

低分子量ストレス蛋白質の生体内における役割について

医学

総合病態内科学梶 田 和 男MD―

成熟脂肪細胞増殖がインスリン感受性に及ぼす影響の検討

医学

産婦人科

森重 健一郎MD―

大腸菌を用いた未知タンパクの発現

医学

腫瘍外科学

吉 田 和 弘MD―

臨床検体、細胞株の遺伝子解析

医学

消化器病態学 清 水 雅 仁

MD―受容体型チロシンキナーゼを標的とした EGCG、及び非環式レチノイドによる肝線維化・発癌予防の検討

教育学

理科教育（生物） 三 宅

登録
人数

病理部

廣 瀬 善 信MD―

固形がんにおける遺伝子の検索

医学

再生医科学

青 木 仁 美MD―

遺伝子組換えマウスの作製及び解析

医学

再生分子統御学江 崎 孝 行MD―

微生物の分類と同定

医学

皮膚病態学

清島 真理子MD―

ヒト唾液中のヘルペスウイルス量の測定

医学

腫瘍制御学

後 藤 尚 絵MD―

paraffin 切片材料から採取した検体で、悪性リンパ腫診断における良性、悪性の鑑別のための塩基配列解析

医学

再生医科学

本 橋

力

MD―

マウス神経堤細胞の遺伝子網羅的解析

医学

病態制御学

長 岡

仁

MD―

抗体遺伝子改変の分子機構の解析

医学

神経統御学

山 口

瞬

MD―

マウス・ラットの脳組織のイメージング解析および遺伝子
発現の解析

工学

応用分子生物学横 川 隆 志EG―

タンパク質合成系に関わる因子の遺伝子解析とその遺伝子産物の機能解析工学

生体反応工学 喜多村 徳昭

EG―

創薬を指向した機能性オリゴ核酸の開発に関する研究

工学

生命情報工学 上 田

浩

EG―三量体 G 蛋白質を介する細胞骨格制御機構の解明

工学

生体物質工学 石 黒亮

EG―

蛋白質の高圧巻き戻り実験工学

生命情報工学 森 田 洋 子

EG―神経細胞の損傷及び細胞死における神経栄養因子の働き

工学

生命情報工学 吉 田

EG―

人体の脂質代謝研究や酸化ストレス研究および食品化学分
野の研究

工学

物質機能工学 岡

医学

敏
夏 央

EG―

ヌクレオチド類縁体の質量分析

応用生物科学 生産環境科学 百 町 満 朗

AG―

有用微生物を用いた植物病害の生物的防除

淳AG―

家畜ホルモン遺伝子の定量

応用生物科学 生産環境科学 山 本 謙 也

AG―

動物卵成熟過程における細胞骨格の役割

応用生物科学 獣医微生物学 福 井 博 一AG―

キクの花芽分化に関連する遺伝子を解明する

応用生物科学 食品生命科学 矢 部 富 雄

AG―

食品成分の機能解析

応用生物科学 食品生命科学 中 村 浩 平

AG―

環境中原核生物の多様性解析、キシリトール高生産性 Aspergillus oryzae の遺伝子工学的創出

応用生物科学 分子生命科学 中 川寅AG―

レニン―アンギオテンシン系の生化学

応用生物科学 植物細胞工学 小 山 博 之AG―

低リン酸耐性植物の作出戦略

応用生物科学

生態環境学

岩 澤

―

―

学

部

登録
人数

講 座 等

利用責任者

登録番号

食品科学

中 川 智 行AG―

ラットの腸内微生物層の解析 メチロトローフ酵母のメタ
ノール代謝制御に関する研究 出芽酵母のストレス応答機
構に関する研究 新規乳酸菌の分離と応用

応用生物科学 応用生命科学 岩 間 智 徳

AG―

細菌の走化性

応用生物科学 応用生命科学 長 岡AG―

食品成分による脂質代謝関連遺伝子発現の総合解析

応用生物科学利

研 究 テ ー マ

応用獣医学

鈴 木 正 嗣AG―

知床半島におけるエゾシカの遺伝学的多様性の解明にむけた遺伝学的解析 国内の野生動物におけるリケッチア保有状況の実態調査にむけた遺伝学的解析 タヌキ、イノシシなどの野生動物の疥癬罹患状況についての遺伝学的解析
外来生物に対する避妊ワクチンの開発（遺伝学的研究）

応用生物科学獣医学

前 田 貞 俊AG―

動物の免疫疾患における分子病態の解明

応用生物科学臨床獣医学

村 瀬 哲 磨AG―

哺乳動物精子の受精能力に関する研究

応用生物科学

獣医生理学

応用生物科学

椎 名 貴 彦AG―

消化管組織に発現する遺伝子およびその産物の解析

応用生物科学 環境生態科学 土 田 浩 治

AG―

鱗翅目、膜翅目、その他の昆虫の DNA 解析

応用生物科学 食品生命科学 鈴 木 文 昭

AG―

哺乳動物由来組換え型タンパク質の定量法の確立と応用

応用生物科学 分子生命科学 光 永

徹AG―

植物ポリフェノールの構造解析に関する研究

応用生物科学

獣医解剖学

齋藤 正一郎AG―

脊椎動物脳における各種分子配列の解析

応用生物科学

獣医病理学

酒 井 洋 樹AG―

伴侶動物の腫瘍の分子病理学的解析

連合獣医学

臨床獣医学

深 田 恒 夫AG―

疾病動物から分離された菌株の分子生物学的同定

応用生物科学獣医学

大 場 恵 典AG―

マイクロアレイを用いた発育不良牛の原因遺伝子の解析

応用生物科学応用獣医学

石 黒 直 隆AG―

蛋白質の精製と泳動 プリオン蛋白質の生化学的性状の解析 核酸精製と分析 プリオン遺伝子の解析、各種動物由来遺伝子の構造解析

応用生物科学

応用獣医学

杉 山

誠

AG―

人獣共通感染症病原体の遺伝子解析

応用生物科学食品科学

岩 本 悟 志AG―

食品の高付加価値化に関する基礎的研究

応用生物科学

獣医寄生虫病学

鬼 頭 克 也AG―

伴侶動物の遺伝性疾患を対象にした分子生物学的研究

応用生物科学食品科学

西 津 貴 久AG―

パスタ進行性クラックの観察

応用生物科学 応用動物科学 伊 藤 愼 一

AG―

動物（鳥類・哺乳類）の遺伝子解析

連合農学

ゲノム微生物学

AG―

腸内細菌のゲノム解析

応用生物科学

獣医学

鈴 木

徹

森

崇

AG―

犬の腫瘍と microRNA の関連について

研AG―

DNA により魚類などの移動を調査する

応用生物科学 応用動物科学 松 村 秀 一

AG―

哺乳類・鳥類・魚類の遺伝的多型の研究

植物分子生理学山 本 義 治AG―

植物プロモーターの機能解析

応用生物科学 食品生命科学 安 藤 弘 宗AG―

蛍光偏光法による蛍光標識糖鎖とレクチンの結合測定

動物生産栄養学

八代田 真人AG―

放牧経験がウシの第一胃内微生物に及ぼす影響

応用生物科学 生物有機化学 柳 瀬 笑 子

AG―小豆色素成分の構造研究

応用生物科学AG―

イヌアトピー性皮膚炎関連分子の検索

応用生物科学 食品生命科学 平 松
応用生物科学
応用生物科学獣医学

柴 田 早 苗応用生物科学獣医学

高 須 正 規AG―

シバヤギの遺伝的多様性に関する研究

連合創薬

医療情報学

桑 田 一 夫DM―

論理的創薬によるプリオン病の治療薬開発とその応用

連合創薬

創薬科学

赤 尾 幸 博DM―

ラベル化した RNA 分子の細胞内変化と導入効率の確認

流域圏

植生資源研究部門

景 山 幸 二RY―

土壌微生物の分子分類および分子生態

流域圏

水質安全研究分野

李

富 生

RY―

河床堆積微生物の解析

情報メディア
情報メディア
篠 田 成 郎
開発研究部門IM―

森林内土壌微生物の生息数に及ぼす水文条件の影響に関す
る検討

生命科学

ゲノム研究分野須 賀 晴 久LS―

フザリウム菌のゲノム解析

生命科学

ゲノム研究分野

下 澤 伸 行LS―

遺伝性疾患の診断、病態解明、治療法の開発

生命科学

動物実験分野 平 田 暁 大LS―

実験動物を用いた発がん研究

生命科学

嫌気性菌研究分野

田中香お里

LS―

細菌ゲノムのシーケンス

生命科学

機器分析分野 犬 塚 俊 康LS―海洋生物由来の二次代謝産物の構造解析

生命科学

機器分析分野 鎌 足 雄 司

LS―タンパク質の立体構造および揺らぎの情報に基づいた創薬――ゲノム研究分野機器紹介⑴

識別結果を見やすく表
示、＋／−アッセイサ

DNA・ゲノム関連機器〈― 〉（― ） マルチキャピラリー DNA シーケンサー
ABI Prism
Genetic Analyzer

ンプルを自動的に判定、本体前面からの簡単なプレートセッティ

アプライドバイオシステム社
色蛍光標識を用いた
蛍光ジデオキシターミ

ング、 色フィルタホ
イ ー ル と、CCD カ メラによる多色蛍光検

ネーター法及び 色蛍
光プライマー法による出。

DNA の塩基配列を決定する装置。電気泳動
キャピラリを 本装基準としたサンプルと
ABI PRISM
Real-time PCRの CT（Threshhold Cycle）値の差を用いる相対定量の実験、自動解析が可備。ポリマー充填、サ
ンプル注入、分離と検能。発現定量・SNP タイピング・細菌検査等幅広い
アプリケーションに対応。

出、データ解析は全て
ABI
Genetic Analyzer
自動。GeneMapper により AFLP 解析、SNPs 解析にも対応。 ウェルある〈― 〉（― ） リアルタイム定量 PCRABI Step one plus

いは ウェルプレートを 枚セット可能。 ．時間で塩基× 試料の分析が可能、受託解析に使用。
台所有。本機で DNA シーケンスの受託解析も行っている。

アプライドバイオシステム社
色／ ウェルフォーマットで、精度の高い定量リア
ルタイム PCR を実現。FAMTM／SYBRⓇ Green、VICⓇ／JOETM、ROXTM、TAMRATM などの蛍光色素が検出でき、遺伝子発現解析、病原遺伝子の定量、SNP ジェ
ノタイピング、プラス／マイナス・アッセイなどの実験が出来る。従来の個体どうしの比較のみならず、集団間の比較を行うことが可能。

〈― 〉（― ） マルチキャピラリー DNA シーケンサー
ABI Prism
XL Genetic Analyzer
アプライドバイオシステム社
DNA の塩基配列決定やフラグメント解析に利用。
ジェネティックアナライザ同様、 本キャピラ
リーを搭載するが、新型ポリマーでより短時間で配列の決定が可能。

ABI Step one plus〈― 〉（― ） DNA マイクロアレイヤー
ABI Prism

STAMP MAN
モリテックス
スライドグラスでGenetic Analyzer〈― 〉（― ） DNA 多型解析ソフト

枚、メン

ブレンで 枚が設定可能。マイクロタイタープレート 枚

ジーンマッパーアプライドバイオシステム社
DNA フラグメントのサイズコールからアレルコールを行うジェノタイピングソフトウェア。

分を 枚のスライドグラスにスポット。小型なため、ヒトの全遺伝子（＞ 万）等には向かないが、
個以下の遺

〈
― 〉
（
― ） リアルタイム定量 PCR伝子を対象とした実験や実験

ABI PRISM
アプライドバイオシステム社
リアルタイム定量 PCR システムと専用試薬の組合せ
により、指数関数的な増幅領域での検出が可能。

系の開発に最適。

STAMP MAN〈― 〉（
― ） DNA マイクロアレイチャンバー
Hybri Chamber
モリテックスDNA マイクロアレイのハイブリダイゼーションのた

多色プローブによる検出に対応、PCR 増幅プロットのリアルタイムモニタリング、融解曲線分布、アレル――

め の イ ン キ ュ ベ ー タ。温度、湿度のコントロールがでは SDS-PAGE で得る結果を、専用チップを使用して短時間、簡単に得るための装置（最大 サンプルの出来るため、密閉型マイク
ロアレイ用ケースなどは不定性および定量のデジタル デ ー タ を 分 で 取 得 可能）。抽出した RNA の品質評価も可能。
但し、本装置は共同利用方法及び料金体系を検討中で要。
恒温浴槽を用いないため、少量試料でコンタミネ ー
ションのない実験が可能。
温度設定範囲： 〜 ℃
湿度設定範囲： 〜 ％RH

すので、使用を希望される方はゲノム分野までご相談下さい。

Hybri Chamber〈― 〉（― ） DNA マイクロアレイスキャナー
GTMAS SCAN Ⅱ
モリテックス

Bioanalyzer

パワーツインレーザーを搭載し、共焦点方式によ〈― 〉（― ） ハイブリダイゼーションオーブン
GA

る高感度 波長同時測定のマイクロアレイ専用スキャナー。 蛍光同時取

アジレントテクノロジー社
DNA マイクロアレイのハイブリダイゼーション
ためのインキュベータ。
取り外 し 可 能 な ロ ー タ
ラックを備え、回転速度とハイブリダイゼーショ
ン温度の設定が可能。最大 個のオリゴ DNA マ
イクロアレイ用ハイブリ
ダイゼーションチャンバを固定可能。

り込み 電子増倍管によGTMAS SCAN Ⅱ
る高感度検出。解析用のソフトウェア、Array Pro Analyzer が付属。
励起波長： nm、 nm。Cye 、Cye の検出に 最
適。
〈
― 〉
（
― ） DNA マイクロアレイスキャナー（旧）Array Scan
アジレントテクノロジー社
Cy 、Cy の二色法と単色法に対応する高機能スキャ
ナ。 枚のスライドガラスを装着できるカルーセルを有 す る。励 起 波 長： nm、 nm。Cy 、Cy の 検出に最適。
年に応用生物科学部が学長裁量経費にて導入、その後ゲノム研究分野に移管された。

G

A

〈
― 〉
（
― ）
、（ ） サーマルサイクラー
MyCycler（ ）、iCycler（ ）バイオラッド社
ポリメラーゼチェインリアクション（PCR）に利用するサーマルサイクラー。温度グラジエント機能により〈― 〉（― ） DNA マイクロアレイスキャナー（新）Array Scan

一度に各種アニーリング温度の試験が可能。MyCycler

アジレントテクノロジー社
Agilent DNA マイクロアレイスキャナ（旧）
（ 〈
― 〉
―
（ ）
）の後継機種で、解像度が µm に高められたことで K／枚などの高密度アレイの分析が可能。

は ウェルプレート、iCycler はリアクションモジュー
ルの交換により ウェルプレートと ウェルプレートに対応。

Array Scan

MyCycler

iCycler〈― 〉（― ） バイオアナライザ〈― 〉（― ） エレクトロポレーター

Bioanalyzer
アジレントテクノロジー社
通常、DNA 分析ではゲル電気泳動、タンパク質分析

Gene Pulser Ⅱ
バイオラッド社
エレクトロポレーションとは、電気パルスにより瞬間――

的に細胞に穿孔し DNA 等の高分子を細胞に導入する方法。大腸菌をはじめとする細菌の形質転換、動植物細胞に DNA を導入に使用。

MALDI-TOF／TOF
Bruker Ultraflex〈― 〉（― ） 質量分析装置
UPLC-MS

Gene Pulser Ⅱ

日本ウォーターズ社
耐圧性に優れ、〈― 〉（― ） マルチビーズバイオアッセイ装置
Luminex

液によるグラディエント分析が可能。UV 検出器を備えている。ESI 法

ミリポア社
少量（〜 µL）の試料をもとにマイクロビーズとフによる質量分析が可能。

ローサイトメトリーを利用して最大 項目までサイトカインやリン酸化タンパク質などの定量測定ができる他、SNPs など DNA、microRNA の分析などにもUPLC-MS〈― 〉（― ） プロテインシーケンサー
ABI Model
アプライドバイオシステム社
タンパク質の N 末端からアミノ酸配列を決定するための装置。 pmol の 標 準
サンプルの場合、残基程度解析が可能。

利用可能。

Luminex〈― 〉（― ） パルスフィールドゲル電気泳動装置
CHEF­DR Ⅱ
バイオラッド社
数百から数メガベース以上の DNA のシャープな分離が可能。クロモゾームマッピング、RFLP 分析、ジー
ンマッピング等に使用。

ABI Model〈― 〉（― ） ラボラトリーオートメーションシステム
Biomekベックマンコールター社
サンプリング、
分注、希釈、吸引濾過等の作業を 連単位で行
な う 自 動 化 装 置。
DNA シーケンス反Biomek応。プロテオーム解析等に使用。

CHEF-DRII

⑵

〈
― 〉
（
― ） スポット回収装置

タンパク質・プロテオーム関連機器

PROTEINEER SPG
日本ブルカー・ダルトニクス社〈― 〉（― ） MALDI-TOF／TOF 質量分析装置

二次元電気泳動

Bruker Ultraflex
日本ブルカー・ダルトニクス社

後のゲルから、
スポットを自動MALDI-TOF による総 MS 解析と、 MALDI-TOF ／TOF タンデム質量分析を用いた詳細な MS／MS 解析
により、高い確度とハイスループットでタンパク質の的に切り出すことが可能。

同定が可能。総括的な MS／MS 情報が極微量の試料サンプルから数秒で得られる。 fmol 以下のペプチド
試料についてアミノ酸配列の決定が可能。

PROTEINEER SPG

―

―

⑶

〈
― 〉
（
― ） 蛍光発光イメージングシステム
AEQUORIA

光学系分析機器〈― 〉（― ） マルチ蛍光スキャナー
Typhoon
アマシャムバイオサイエンス社
放射性同位体と蛍光、ケミルミネッセンスの

浜松ホトニクス社
超高感度冷却 CCD カメラにより組織レベルの蛍光・発光の検出が可能。
つのス

キャンモードと、高い感度と解像度によるマイクロア
レイ解析、フラグメント解析や、二次元電気泳動解析
等に対応。

AEQUORIA〈― 〉（― ） 微量サンプル分光光度計
蛍光スキャナー Typhoon

NanoVue
GE ヘルスケアバイ

〈
― 〉
（
― ）
、（ ） マルチラベルプレートリーダー
WallacARVOsx（ ）オサイエンス社
キュベットを使用せWallacARVO SX-DELFIA（ ）パーキンエルマーライフサイエンス社
ARVOsx は
ウェルプレートをはじめ、様々プレートを用
いて蛍光、
発光、
蛍光偏
光をハイスループット
で測定可能。 、 、
ウェル標準プレー
ARVOsx（ ）ト、 、 、 、 ウェ Wallac
WallacARVOSX-DELFIA（ ）ル培養プレートに対応。ARVOsx-DELFIA は時間分解蛍光測定が可能。

ず、少量試料の測定が可能。
CyDye 標 識、核 酸 濃度・純度、タンパク質濃度などの測定に使用。

NanoVue

〈
― 〉
（
― ）
分光光度計
Ultrospecpro
GE ヘルスケアバイ
オサイエンス社
紫外から可視領域における試料の吸光度が測Ultrospecpro
定 で き る 装 置。 µlの微量試料に対応。核酸やタンパク質の濃度測定など
に利用。

〈
― 〉
（
― ） マルチラベルプレートリーダー
WallacDELFIA
パーキンエルマーライフサイエンス社
ユ ー ロ ピ ウ ム（Eu）の 持
つ遅延蛍光特性を利用。パルス状 に 励 起 光 を 当 て、
バックグラウンドの自家蛍光が消失した後に励起光を

⑷

〈
― 〉
（
― ）
共焦点レーザースキャ
ン顕微鏡

測定する装置。感度は RIA

LSM
カールツァイス社に 匹 敵。 穴 マ イ ク ロ プ
レートを使用。プレートワッシャーも装備。
Wallac

光学顕微鏡

DELFIA〈― 〉（― ） 冷却 CCD カメラ
Ez-キャプチャー AE-

倒 立 型 顕 微 鏡。光 源 にAr（ nm）及 HeNe（nm）レーザーを搭載、ATTO 社
冷却 CCD カメラを利用してピンホールの自動制御に
よりクリアな共焦点蛍光発光を 検 出 す る。ウ ェ ス タ
ン・サザン・ノーザンブロッ
トにおけるケミルミ検出など像が得られる。細胞内にLSMおけるタンパク質の局在等の解析に力を発揮。また、焦点面を変化させながらに利用可能。

Z 軸の連続画像を取り込み、コンピュータ上で立体画像構築が可能。

Ez-キャプチャー AE-

―

―

〈
― 〉
（
― ） 共焦点レーザースキャン顕微鏡
LSM
カールツァイス社、 、 、 、・枚までの自動スポットマッチング

・マーカー／マーカースポットからの分子量・等電点
決定・マッチングスポットの量変化の表示
・インターネットデータベースの検索

nm の レ ー ザ ー を 搭 載。タイムシリーズ、FRAP、FRET の他に、スペクトルイ
メージング（近接した蛍光の分離、スペクトルカーブの測定）も可能。

・ D DIGE に対応〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置
Image Master VDS
GE Healthcare Bioscience 社〈― 〉（― ） 蛋白質立体構造情報解析装置
DSModeling
Accelrys 社
蛋白質・核酸の立体構造を 次元的に可視化する装LSM置。ホモロジーモ
デリング法とモレキュラーダイナ

〈
― 〉
（
― ）
倒立型蛍光顕微鏡
Axiovert
カールツァイス社
〈
― 〉
（
― ）
正立型顕微鏡Axioscop
カールツァイス社〈― 〉（― ） 実体顕微鏡
Stemi＋
カールツァイス社

ミックス法により高分子の立体構造を予測するシステム。

〈― 〉（― ） プロテオミクス支援システム
MASCOT
Matrix Science 社
タンパク質の遺伝子同定を支援するシステム。
データベースをもとに仮想上のペプチド断片のセットを発生、MALDI-TOF によるペプチド MS フィンガー
プリンティングや TOF/TOF 解析で得られる試料のデータと照合することにより遺伝子を同定。

Axioscop⑸

DSModeling

バイオインフォマティクス関連機器〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置
Image Master Platinum
アマシャムバイオサイエンス社
二次元電気泳動で分離されたタンパ
ク質スポットパ
ターン、等電点、
分子量、ボリューム 等 を 解 析。Im-

ProteinLynx Global SERVER（PLGS）

ageMasterD
Elite 、 D DataImage Master Platinum
base は 種 類 以上のゲルの比較解析からスポットの有無、増減の数値〈― 〉（― ） プロテオミクス支援システム
ProteinLynx Global SERVER（PLGS）
Waters 社

化やデータベース化をサポート。ゲル、ブロッティン
グメンブレンの画像はデスクトップスキャナー Im-

Waters Xevo QTof の精密質量データを基として、独自のフィルタリング機能や計算機能を用いて解析を行

age Scanner またはバリアブルイメージアナライザー
Typhoon などの画像解析装置からは TIFF 形式の取り込みが可能。

う、定量的および定性的プロテオミクス研究の MS イ
ンフォマティクスプラットフォームである。

主要機能・スポット検知、バックグラウンド削除

―

―

⑹

〈
― 〉
（
― ） 密閉式冷却遠心分離器
SORVALL LEGEND RT+

クロマトグラフィー・電気泳動関連機器〈― 〉（― ） 高速液体クロマトグラフィー
HPLC（AKTA）

日本ケンドロ社
最 高 krpm（ ，xg）。

GE HealthcareBioscience 社
ポンプ、検出器、フラクションコレクターを内蔵した

ロ ー タ： ml× 本。
マイクロプレートやハ一体型の低圧クロマトグラフィーシステム。His-tag
タンパク質などの精製に利用できる。

イコニックの遠心分離が 可 能。マ イ ク ロ プ
レートによるエタノー
ル沈殿等に使用。

SORVALL LEGEND RT

〈
― 〉
（
― ）
プレート遠心機
TS-LC
トミー精工

HPLC（AKTA）〈― 〉（― ） 等電点電気泳動システム
IPGphor + SE
Ruby＋Ettan Dalt
アマシャムバイオサイエンス社
等電点電気泳動と SDS ポリアクリルアミドゲル電気泳動により、数千個のタンパク質を次元で展開。

TS-LC⑻

培養機・細胞破砕機〈― 〉（― ） 振盪培養機
TA- R-FF
高崎科学器械
IPGphor + SE⑺

本の ml フラ
スコを往復または
旋回で振盪。温度
範囲： ℃〜 ℃。
振盪スピード：〜 rpm。

Ruby

遠心分離機

〈
― 〉
（
― ）
超遠心分離機Optima L- K
ベックマンコールター
社

上：往復振盪専用
下：旋回振盪専用

最 高 krpm。 ml×本の超遠心分離が可能。

〈
― 〉
（
― ）
ジャーファーメンター
MBFME
EYELA 社

Optima L- K

大腸菌などの微生物を
大 量 培 養 に 使 用。
ジャー容量： L。一度に最大 L の培養が〈― 〉（
― ） 微量超遠心分離機
Optima TL
ベックマンコールター社
最高 krpm。微量
試 料 ．ml× 本 の可能。

超遠心分離が可能。
MBF-

Optima TL

―

―

ME

〈
― 〉
（
― ） フレンチプレス
型

〈
― 〉
（
― ） ストマッカー
Stmacher
Circulator
Seward 社
ポリエチレンの袋にサ

大岳製作所
大岳手動式プレス型の仕様変

ンプルを入れ、圧縮をくり返すことで温和な更により、嫌気条件下での細胞破砕を可能にした装置。従来通りの使用も可能。 ml の標準セル（〜

条件で組織をホモゲナ
イズ。食品中の微生物検査等に使用。

⑻

細胞破砕機， kgf / cm ≒ ， psi）とml の高圧対応セル（耐圧未定おそらく ， kgf / cm ≒ ，

ストマッカー〈― 〉（― ）ポリトロンホモゲナイザー

フレンチプレスpsi）で、酵母の粉砕等に使用。

PTKinematica 社〈― 〉（― ） 密閉型超音波破砕機
Biorupter

ドライブシャフトの先端にある回転刃を高速で回転させることで生じる
水流と、キャビテーションによる超コスモバイオ社
密閉式で複数試料の同時超音波処理が可能。

音波で試料を破砕。動物や植物の組織からの RNA 抽出等に使用。

ml 用スピッ ツ な ら
最大 本、 ．ml マイ
クロチューブなら本、 ml チ ュ ー ブ なら 本。マ ル チ タ イ
マーにより破砕時間のセットが可能。

ポリトロン
ホモゲナイザー〈― 〉（― ） 電動ミンサー
MS B
南常鉄工社
精肉店等で使われているものと同じ電動ミンチ。
牛、豚等の大量の組織からの抽出作業に威力を発揮。AC V で稼働。

Biorupter〈― 〉（― ） マルチビーズショッカー
MB GU（S）
安井器機株式会社
試料をガラスビーズやメタルコーンと共に撹拌することで破砕。試料間のクロスコンタ
ミネーションや RNase の混

〈
― 〉
（
― ）

入を防止。酵母、バクテリア、
カビ、固い動物組織、植物組DNA 擅断装置
Hydroshear
ジーンマシーンズ社µm 程度のオリフィスを通過させる際に発生する物

織を数十秒〜数分で破砕。
マルチビーズショッカー

〈
― 〉
（
― ）

理的擅断力により DNA 等の高分子を切断。ランダム

凍結プレス破砕装置
MB GU（S）
クライオプレな切断が起きることから、
ショットガンライブラリーの作成等に有効。

ス CPマイクロテック・ニチオン社
液体窒素で凍結させた試料を、ステンレスチャンバーに入れ、圧搾空気により駆動されたハンクライオプレス CP-

電動ミンサー

マーで衝撃をあたえることで破砕。骨組織や、木質等も破砕が
可能。

―

―

Hydroshear

利用の手引き（平成 年 月 日改変）⑴

規

約

．大型機器の利用① 大型機器の内容
ここでの大型機器とは以下にあげる装置を示す。
［DNA・ゲノム関連機器］
DNA シーケンサ（ABI、ABIXL）
DNA 多型解析ソフト（Gene Mapper）
リアルタイム定量 PCR（ABI PLISM、Step one Plus）
マイクロアレイヤー（STAMP MAN）
マイクロアレイチャンバー（Hybri Chamber）
マイクロアレイスキャナー（Agilent、GTMAS SCAN）
バイオアナライザー（Agilent）
ハイブリダイゼーションオーブン（Agilent）
エレクトロポレーター（Gene Pulser）
マルチビーズバイオアッセイ装置（Luminex）［タンパク質・プロテオーム関連機器］
質量分析装置（MALDI-TOF／TOF、UPLC MS）
プロテインシーケンサ（ABI ）ラボラトリーオートメーションシステム（Biomek）
スポットピッカー（PROTEINER SPG）
［光学系分析機器］
マルチ蛍光イメージスキャナ（Typhoon）
マルチラベルプレートリーダー（ARVOsx、ARVOsx-DELFIA、DELFIA
冷却 CCD カメラ（Ez−キャプチャー AE）
蛍光発光イメージングシステム（AEQUORIA）
微量サンプル分光光度計（NanoVue）［顕微鏡］
共焦点レーザースキャン顕微鏡（LSM 、LSM ）倒立型蛍光顕微鏡（Axiovert）
正立型顕微鏡（Axioscop）［バイオインフォマティクス］
電気泳動ゲル画像解析装置（Image Master Platinum、Image Master VDS）
蛋白・核酸立体構造情報解析装置（DS Modeling）
プロテオミクス支援システム（MASCOT）
プロテオミクス支援システム ProteinLynx Global SERVER［クロマトグラフィー・電気泳動関連機器］
高速液体クロマトグラフィー HPLC
等電点電気泳動システム（IPGphor＋SE
Ruby＋Ettan Dalt ）［遠心分離機］
超遠心分離機（Optima L- K）
微量超遠心分離機（Optima TL）［培養機・細胞破砕機］
振盪培養機（TA- R-FF）
ジャーファーメンター（MBFME）――）

フレンチプレス（型）
密閉型超音波破砕機（Biorupter）
マルチビーズショッカー（MB GU（S））
ポリトロンホモゲナイザー（PT）② 利用者の資格利用できる者は、利用する装置の説明会に参加した者、装置の操作に習熟した者及び装置の操作に習熟した者の下で利用する者とする。
③ 利用の手続き
利用する場合は、生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野（以下「ゲノム研究分野」という。
）のホームページ（http://www .gifu-u.ac.jp/〜lsrc/dgr/）にて機器予約の手続きを行うものとする。
ただし、DNA シーケンサ／
は、電話にて利用の手続きを行うものとする。
④ 消耗品の経費負担
利用に伴う消耗品については経費負担責任者が負う。
⑤ 機器不調の報告
機器に不備の箇所がある場合は、直ちに管理室に連絡すること。不調のまま使用してはならない。
⑥ 機器の損傷
利用者の不注意によって機器を損傷したり、不調にした場合の修理費は経費負担責任者が負う。
．機器の利用記録
大型機器及び使用記録簿がもうけられている機器を利用した場合は、その都度必要事項を記入しなければならない。
．実験室等の利用① 利用手続き
植物用グロースキャビネット、実験台、実習室、研修セミナー室、Ｐ レベル実験室、植物
栽培室、Ｐ 温室を利用しようとする場合は、それぞれ利用申込書（別紙様式第 号〜第 号）
により手続きを行うものとする。
（書式のダウンロード http://www .gifu-u.ac.jp/〜lsrc/dgr/dl/）② 利用終了、中止の際の原状復帰
利用者は、教育・研究を終了または中止したときは、速やかに実験室等を原状に復帰し、管理室に報告してゲノム研究分野の行う利用終了確認を受けなければならない。
③ ゲノム研究分野内の禁煙と飲食ゲノム研究分野内は禁煙とし、飲食は所定の場所で行うこととする。
．機器の運搬① 機器の搬入利用者がゲノム研究分野に持ち込む機器は必要最小限の小型機器とし、大型機器を搬入してはならない。小型機器を搬入する場合は小型機器搬入申込書（別紙様式第 号）により手続きを行うものとする。
（書式のダウンロード http://www ．
gifu-u.ac.jp/〜lsrc/dgr/dl/）② 搬入した小型機器の所属表示、維持・管理
搬入した小型機器には利用責任者の氏名、連絡先を明記することとし、その維持・管理は、利用責任者が行うものとする。
③ 搬入した小型機器の搬出搬入した小型機器の承認期間が満了したときは速やかに搬出するものとする。
――

④ 機器の搬出・貸出
利用者がゲノム研究分野所有の機器の搬出・貸出を希望する場合は、当分野に相談するものとする。
．時間外の利用
ゲノム研究分野の定められた利用時間外に本分野を使用する者は、時間外利用願いを提出しなけ
ればならない。
（書式のダウンロード http://www ．
gifu-u.ac.jp/〜lsrc/dgr/dl/）．カードの使用① 入退室の方法
ゲノム研究分野及びゲノム研究分野の RI 実験室への出入りは専用の自動記録式磁気カード（以下「利用カード」という。
）を使用する。
② カードの受け渡し
利用カードは管理室から貸与する。
③ カード転用の禁止
利用カードは転用してはならない。
④ カード紛失の届け出義務
利用カードを紛失した場合は直ちに管理室に届け出なければならない。
⑤ カードの返却
利用カードは利用終了後、速やかに管理室に返却しなければならない。
．利用者負担額
利用者の負担額は、利用者負担額料金表のとおりとし、運営費交付金、寄付金、受託研究費、科学研究費補助金振替により行う。
．緊急事態発生の措置
緊急事態が発生した場合、各部屋には緊急避難経路、ガスの元栓の場所、電源の場所を表示してあるので、それを参照して適切に対処すること。
．利用上の問題点の処理利用者が、ゲノム研究分野を利用する上で、不便に感ずることなど、問題が生じた場合は、ゲノム研究分野の専任教官を通じてセンター長に申し出るものとする。センター長は、必要に応じて運営委員会で審議の上、改善を図るものとする。

⑵

利用者負担額料金表
事

項

料金

備考

， 円／人・年

年度毎の更新 ／ 〜 ／． 登録料（ ） 登録料
．大型機器

※n―
〈n〉
（
― n）
は管理番号

⑴ DNA・ゲノム関連機器
〈
― 〉
（
― ）
、
（ ） DNA シーケンサー、（No． 〜 （
）反応済）

〈
― 〉
（
― ）
、
（ ） DNA シーケンサー、（No． 〜 （）反応前）

円／サンプル
別紙参照

〈
― 〉
（
― ） DNA 多型解析ソフト ジーンマッパー

――

〈
― 〉
（
― ） リアルタイム定量 PCR ABI PRISM

円／使用

〈
― 〉
（
― ） リアルタイム定量 PCR ABI Step one plus

円／使用

〈
― 〉
（
― ） DNA マイクロアレイヤー STAMP MAN， 円／使用〈― 〉（― ） DNA マイクロアレイチャンバー Hybri Chamber

―

―

円／使用

〈
― 〉
（
― ） DNA マイクロアレイスキャナー GTMAS SCAN II
〈
― 〉
（
― ）
旧、
（ ）
新

Agilent DNA マイクロアレイスキャナ
（旧）
（新）

〈
― 〉
（
― ） Agilent

バイオアナライザ〈― 〉（― ） Agilent G

A Hybridization Oven

円／使用
， 円／スキャン――， 円／使用〈― 〉（― ） エレクトロポレーター Gene Pulser II

――

〈
― 〉
（
― ） マルチビーズバイオアッセイ装置 Luminex

円／使用

〈
― 〉
（
― ） パルスフィールドゲル電気泳動装置 CHEF-DRII円／泳動⑵ タンパク質・プロテオーム関連機器〈― 〉（― ） 質量分析装置 MALDI-TOF/TOF， 円／時間〈― 〉（― ） 質量分析装置 UPLC-MS， 円／使用〈― 〉（― ） プロテインシーケンサー Model， 円／サイクル〈― 〉（― ） ラボラトリーオートメーションシステム Biomek

――

〈
― 〉
（
― ） スポット回収装置 PROTEINEER SPG， 円／時間⑶ 光学系分析機器〈― 〉（― ） マルチ蛍光スキャナ Typhoon

円／使用

〈
― 〉
（
― ） マルチラベルプレートリーダー Wallac〈― 〉（― ） マルチラベルプレートリーダー Wallac

ARVO SX

円／時間

ARVO SX­DELFIA

円／時間

〈
― 〉
（
― ） マルチラベルプレートリーダー Wallac

DELFIA――〈― 〉（― ） 冷却 CCD カメラ Ez-キャプチャー AE-

円／時間

〈
― 〉
（
― ） 蛍光発光イメージングシステム AEQUORIA

円／使用

〈
― 〉
（
― ） 微量サンプル分光光度計 NanoVue

――

⑷ 顕微鏡
〈
― 〉
（
― ） 共焦点レーザースキャン顕微鏡 LSM

円／使用

〈
― 〉
（
― ） 共焦点レーザースキャン顕微鏡 LSM， 円／使用〈― 〉（― ） 倒立型蛍光顕微鏡 Axiovert

円／使用

〈
― 〉
（
― ） 正立顕微鏡 Axioscop――⑸ バイオインフォマティクス〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置 Image Master D Platinum， 円／使用〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置 Image Master VDS

――

〈
― 〉
（
― ） タンパク質立体構造情報解析装置 DSModeling， 円／年＊ ， 円／使用〈― 〉（― ） プロテオミクス支援システム MASCOT

――

〈
― 〉
（
― ） プロテオミクス支援システム ProteinLynx Global SERVER――⑹ クロマトグラフィー・電気泳動関連機器〈― 〉（― ） 高速液体クロマトグラフィー HPLC（AKTA）

， 円／日

〈
― 〉
（
― ） 等電点電気泳動システム IPGphor＋SE， 円／使用Ruby＋Ettan Dalt

⑺ 遠心分離機〈― 〉（― ） 超遠心分離機 Optima L- K

， 円／時間〈― 〉（― ） 微量超遠心分離機 Optima TL， 円／時間⑻ 培養機・細胞破砕機〈― 〉（― ） 振とう培養器 TA- R-FF〈― 〉（― ） ジャーファーメンター MBF〈― 〉（
― ） フレンチプレス

――
ME

――

型

――

〈
― 〉
（
― ） 密閉型超音波破砕機 Biorupter〈― 〉（― ） マルチビーズショッカー MB

――
GU
（S）

――

〈
― 〉
（
― ） ポリトロンホモゲナイザー PT-――．実験室・実験台⑴

動物遺伝子実験室（⑵

P レベル実験室⑶

植物用グロースキャビネット コイトトロン
（

⑷

植物栽培室

）実験台（ スペース分:中央実験台半分）

， 円／月
， 円／週

）

， 円／月
， 円／月

―

―

＊専用パスワードを使用する場合

⑸

P 温室

， 円／月

⑹

研修セミナー室

円／時間

学外対象

時間外利用料金

円／使用

土日祝日他
当分野が定める休館日．時間外利用料金⑴⑶

DNA シーケンス受託解析・料金

生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野では、DNA 受託解析を行っています。
DNA シーケンス受託料金
サンプル数

金 額

金額／サンプル

納 期

から サンプルまでは サンプルあたり円

翌 日から サンプルまでは サンプルあたり円

翌 日＊利用料は四半期ごとにどの経費（運営費交付金、寄付金、受託研究費等、科学研究費補助金）で賄
うか各予算担当者に通知してください。
＊大量のサンプルを扱う場合、科学研究費補助金の申請時には研究経費使用内訳のその他の項目に計上してください。
大量サンプルの特別料金＊ サンプル単位の大量サンプルについては、以下のとおり特別割引があります。
＊必ずしも同時に サンプルまとめる必要はありません。実験スケジュールに応じて柔軟に対応します。
＊ゲノムプロジェクトや大規模 SNP 解析等を計画されている方は、あらかじめご相談ください。
＊アッセンブリー、アノテーションについては、ご相談ください。
＊以下の価格は、一例です。試薬の価格などにより変動する場合があるのでその都度の見積もりをいたします。
大量 DNA シーケンス受託料金
サンプル数

金額

金額／サンプル

値引率

おおよその納期

￥ ，

￥

．

週間

￥

￥

．

週間

，

￥

．

週間

，

￥ ， ，

￥

．

ヶ月

，

￥ ， ，

￥

．

ヶ月

，

￥

＊ cm キャピラリーを用い、サンプルあたり 塩基を解読した場合＊ well のプレートを使用します。
＊ well プレート単位であれば同時にサンプルを用意する必要はありません。
＊たとえば、週に プレートごとというような計画も可能です。
DNA フラグメント解析＊AFLP、マイクロサテライト他、各種 DNA フラグメント解析を行っています。
＊反応済試料 サンプルあたり 円。
＊ただし、大量サンプルについては特別割引をしますのでご相談ください。

――

S rRNA 配列解析による微生物の同定サービス＊微生物の同定を、 S rRNA の配列を比較することにより行います。
＊PCR 法による、 S rDNA 領域の増幅。
＊サイクルシーケンス法による DNA シーケンスの解析。
＊シークエンチャーによる配列の連結。
＊データベース照合による菌の同定。
価

格

￥ ， 円

納

期

約 週間

略

・微生物の同定を、 S rRNA の配列を比較することにより行います。
・細菌の単離、DNA の抽出は、ユーザに行っていただきます。
・PCR 法による、 S rDNA 領域の増幅。
・サイクルシーケンス法による DNA シーケンスの解析。
・シークエンチャーによる配列の連結。
・データベース照合による菌の同定。

概平成 年度活動状況報告⑴

講習会・トレーニングコース・講演会等◆平成 年 月 日（水） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［遺伝子導入装置 Neon Transfection system］

参加者 名◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［質量分析装置 Waters UPLC/MS Xevo Qtof］

参加者 名◆平成 年 月 日（金） ： 〜 ： 、 ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［蛍光発光イメージングシステム AEQUORIA］

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［プロテオミクス支援システム Mascot］

参加者 名◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ： 、 ： 〜 ： 、日（水） ： 〜 ： 、 ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［共焦点レーザー顕微鏡 Carl Zeiss LSM

］

参加者 名

CA］

参加者 名

◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［リアルタイム定量 PCR StepOnePlus］

参加者 名◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［DNA マイクロアレイスキャナシステム（新） G――◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ：中学生のための生命科学体験プログラム「君にもできる DNA 鑑定」

参加者 名◆平成 年 月 日（水） ： 〜 ： 、 日（木） ： 〜 ：高校生のための生命科学体験プログラム「ゲノムって何？」

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［次世代ゲノムシークエンサー ロシュ

］

参加者 名

◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［リアルタイム定量 PCR StepOnePlus 講習会］

参加者 名

◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［次世代シーケンサ Ion PGM］

参加者 名

⑵

ゲノム研究分野利用状況

―

―

⑶

共同スペース利用状況
室名（室番号）

利用責任者（登録番号）

動物遺伝子実験室（）

鈴木 文昭（AG― ）動物遺伝子実験室（）

福井 博一（AG― ）植物栽培室（）

小山 博之（AG― ）植物栽培室（）

百町 満朗（AG― ）植物用グロースキャビネット

須賀 晴久（LS― ）Ｐ 温室

百町 満朗（AG― ）

F 実験室

⑷

光永

徹（AG― ）

平成 年度業績論文等

EG［ ］ Yamamoto, H., Iguchi, K., Ohno, S., Yokogawa, T., Nishikawa, K., Hoshino, M.（）. “Activation of large form galanin-LI by extracellular processing in small cell lung carcinoma tissue.”Protein Pept Lett :.
――EG［ ］ Nagae, R., Sato, K., Yasui, Y., Banno, Y., Nagase, T., Ueda, H.（）. “Gs and Gq signalings regulate hPEM- -induced cell responses in Neuro- a cells.” Biochem. Biophys. Res. Commun.
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EG［ ］ Oh-hashi, K., Kunieda, R., Hirata, Y., Kiuchi, K.（）. “Biosynthesis and secretion of mouse
cysteine-rich with EGF-like domains .” FEBS Lett.
:.
［ ］ Hirata, Y., Yamamoto, H., Atta, M., Mahmoud, S., Oh-hashi, K., Kiuchi, K.（）. “Chloroquine
inhibits glutamate-induced death of a neuronal cell line by reducing reactive oxygen species
through sigma- receptor.” J Neurochem.
:- .
MD［ ］ Itoh, M., Li, S., Ohta, K., Yamada, A., Hayakawa-Yano, Y., Ueda, M., Hida, Y., Suzuki, Y., Ohta, E.,
Mizuno, A., Banno, Y., Nakagawa, T.（）. “Cayman Ataxia-Related Protein is a PresynapseSpecific Caspase- Substrate.” Neurochemical research :.
［ ］ Li, S., Itoh, M., Ohta, K., Ueda, M., Mizuno, A., Ohta, E., Hida, Y., Wang, M., Takeuchi, K., Naka）. “The expression and localization of Prune mRNA in the central nervous sysgawa, T.（tem.” Neuroscience Letters:- .
［ ］ Ohta, K., Mizuno, A., Li, S., Itoh, M., Ueda, M., Ohta, E., Hida, Y., Wang, M., Furoi, M., Tsuzuki, Y.,
Sobajima, M., Bohmoto, Y., Fukushima, T., Kobori, M., Inuzuka, T., Nakagawa, T.（）. “Endoplasmic reticulum stress enhances γ-secretase activity.” Biochem Biophys Res Commun:- .
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groEL, and rpoB gene sequences.” Microbiol. Cult. Coll. : - .
［ ］ Zhang, J., Hung, P. V., Hayashi, M., Yoshida, S., Ohkusu, K., Ezaki, T.（）. “DnaJ sequences ofBacillus cereus strains isolated from outbreaks of hospital infection are highly similar to Bacillus anthracis.” Diagnostic Microbiology and Infectious Disease :- .
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―

―

Biol
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］ 下澤伸行（）
。脳肝腎症候群（ツェルウェーガー症候群）。東京、中山書店。
］ 下澤伸行（）
。Zellweger 症候群。東京、診断と治療社。
］ 下澤伸行（）
。RCDP type 。東京、診断と治療社。
］ 鈴木康之、小関道夫、下澤伸行（）
。 副腎白質ジストロフィー。東京、診断と治療社。
］ 三善陽子、酒井規夫、池田佳世、長谷川泰浩、橘真紀子、清原由起、山田寛之、近藤宏樹、濱田悠介、木村志保子、里龍晴、峰淳史、神尾範子、鈴木保宏、塩見正司、太田秀明、下澤伸行、
大園恵一（）
。 副腎白質ジストロフィーの日本人男児 例に置ける副腎機能解析。 日本
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⑸ゲノム研究分野教員の教育研究活動等① 教育活動大学院連合創薬医療情報研究科（下澤）
代謝病態制御学特論
医学部（下澤）テュトーリアル「成育」コース小児病態学「遺伝性小児神経筋疾患」 時間
大学院連合農学研究科（須賀）副指導教員
大学院応用生物科学研究科（須賀）分子植物病原学特論 単位
主指導教員
応用生物科学部（須賀）応用植物科学実験及び実験法Ⅰ 単位 人で分担
応用植物科学実習Ⅱ 単位 人で分担
分子植物病理学 単位
ゲノム科学 単位人で分担（ 回講義分）
微生物学 単位人で分担（ 回講義分）
卒業研究
単位
学外での講義国立大学法人島根大学医学部「成長発達」講義（下澤）「ペルオキシソーム病と神経疾患」 時間 出雲、
． ．

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―

②研究活動〈学術論文〉（和文著書）
なし（英文原著））Shaheen R, Al-Dirbashi OY, Al-Hassnan ZN, Al-Owain M, Makhsheed N, Basheeri F, Seidahmed
MZ, Salih MAM, Faqih E, Zaidan H, Al-Sayed M, Rahbeeni Z, Al-Sheddi T, Hashem M, Kurdi W,
Shimozawa N, Alkuraya FS. Clinical biochemical and molecular characterization of peroxisomal
diseases in Arabs. Clin Genet : - ,.
）Matsukawa T, Asheuer M, Takahashi Y, Goto J, Suzuki Y, Shimozawa N, Takano H, Onodera O,
Nishizawa M, Aubourg P, Tsuji S. Identification of novel SNPs of ABCD , ABCD , ABCD , and
ABCD genes in patients with X-linked adrenoleukodystrophy（ALD）based on comprehensive
resequencing and association studies with ALD phenotypes. Neurogenetics. : - ,.
）Morita M, Shimozawa N, Kashiwayama Y, Yasuyuki Suzuki, Tsuneo Imanaka. ABC subfamily D
proteins and very long chain fatty acid metabolism as novel targets in adrenoleukodystrophy.
Current Drug Targets :- ,.
）Shimozawa N, Honda A, Kajiwara N, Sachi Kozawa, Tomoko Nagase, Yasuhiko Takemoto,
Yasuyuki Suzuki. X-linked adrenoleukodystrophy: Diagnostic and follow-up system in Japan. J
Hum Genet. :- ,.
）Shimozawa N. Molecular and clinical findings and diagnostic flowchart of peroxisomal diseases.
Brain Dev :- ,.
）Kozawa S, Honda A, Kajiwara N, Takemoto Y, Nagase T, Nikami H, Okano Y, Nakashima S, Shimozawa N. Induction of peroxisomal lipid metabolism in mice fed a high-fat diet. Mol Med Report :,.
）Kanzawa N, Shimozawa N, Wanders RJA, Ikeda K, Murakami Y, Waterhamn HR, Mukai S, Fujita
M, Maeda Y, Taguchi R, Fujiki Y, Kinoshita T. Defective lipid remodeling of GPI anchors in peroxisomal disorders, Zellweger syndrome and rhizomelic chondrodysplasia punctata. J Lipid Res,in press.
）Suga H, Nakajima T, Kageyama K, Hyakumachi M. The genetic profile and molecular diagnosisof thiophanate-methyl resistant strains of Fusarium asiaticum in Japan. Fungal Biol:,.
）Li M, Suga H, Kageyama K. “A multiplex PCR for the detection of Phytophthora nicotianae and P.
cactorum, and a survey of their occurrence in strawberry production areas of Japan.” Plant Desease :,.
）Pu Y, Netsu O, Suzuki N, Uehara-Ichiki T, Sasaya T, Wei T, Li Y, Omura T, Kikuchi A, Moriyasu
Y, Tomaru M, Yan J, Suga H, Hagiwara K, Akita F, Shimizu T. Rice dwarf viruses with disfunctional genomes generated in plants are filtered out in vector insects: implications for the origin of
the virus. Journal of Virology :,.
）Kuales G, De Mulder K, Glashauser J, Salvenmoser W, Takashima S, Hartenstein V, Berezikov E,
Salzburger W, Ladurner P. Boule-like genes regulate male and female gametogenesis in the flat- ,.
worm Macrostomum lignano. Dev Biol:
）Takashima S, Younossi-Hartenstein A, Ortiz PA, Hartenstein V. A novel tissue in an establishedmodel system: the Drosophila pupal midgut. Dev Genes Evol: - ,.
）Takashima S, Adams KL, Ortiz PA, Ying CT, Moridzadeh R, Younossi-Hartenstein A, Hartenstein V. Development of the Drosophila entero-endocrine lineage and its specification by the
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.

―

―

（英文総説）なし（和文原著）なし（和文総説））下澤伸行。脳肝腎症候群（ツェルウェーガー症候群）：症候群ハンドブック、東京：中山書店。
。
pp ― 、）下澤伸行。Zellweger 症候群、先天代謝異常症 Diagnosis at a Glance 日本先天代謝異常学会編、。
東京：診断と治療社。pp ― 、）鈴木康之、小関道夫、下澤伸行。副腎白質ジストロフィー。先天代謝異常症 Diagnosis at a Glance。
日本先天代謝異常学会編、東京：診断と治療社。pp ― 、）下澤伸行。RCDP type 。先天代謝異常症 Diagnosis at a Glance 日本先天代謝異常学会編、東。
京：診断と治療社。pp ― 、）三善陽子、酒井規夫、池田佳世、長谷川泰浩、橘真紀子、清原由起、山田寛之、近藤宏樹、濱田
悠介、木村志保子、里 龍晴、峰 淳史、神尾範子、鈴木保宏、塩見正司、太田秀明、下澤伸行、
大園恵一。副腎白質ジストロフィーの日本人男児 例に置ける副腎機能解析、日本内分泌学会雑。
誌。 suppl ― 、）下澤伸行。ペルオキシソーム病（Zellweger 症候群、原発性高シュウ酸尿症 型）。別冊日本臨。
床 新領域別症候群シリーズ No 腎臓症候群（第 版） ― 、（その他）
なし〈学会発表〉（国際）
Simultaneous detection ofandusing multiplex PCR. Kageyama Koji, Asano Takahiro, Otsubo Kayoko, Suga Haruhisa. nd Korea-Japan
Joint Symposium in
Annual Meeting of the Phytopathological Society of Japan, 福 岡（福 岡 国際会議場）,／ .
Specific detection of Type and Type isolates of
by loop-mediated isothermal amplification reaction. Hieno Ayaka, Kuno Syuhei, Fukuta Shiro, Suga Haruhisa, Simizu Masafumi, Hyakumachi Mitsuro. nd Korea-Japan Joint Symposium in
Annual Meeting of the／ .
Phytopathological Society of Japan, 福岡（福岡国際会議場）,
Natural deletion of FGSG
gene lost both of pathogenicity and perithecium development inspecies complex. Suga H, Scott T, Hirata Y, Nakajima T, Kageyama K,／ .
Hyakumachi M. IUMS
札幌, 札幌（札幌コンベンションセンター）,
Development of multiplex PCR for the detection of
and
and a
survey of their occurrence in the main strawberry production areas of Japan. Li Mingzhu, Asano
Takahiro, Suga Haruhisa, Kageyama Koji. Asian Mycological Congress-AMC, Incheon, Ko／ .
rea,
Multi-locus phylogenetic and morphological analyses of the newly established genus.
Baten Md Abdul, Hotta Keisuke, Suga Haruhisa, Kageyama Koji. Asian Mycological Congress／ .
AMC, Incheon, Korea,
Pythium flora diversity in cool temperate and subtropical areas of Japan. Kageyama Koji, Motohashi Keiichi, Abdelzaher Hani Mohamed Awad, Li Mingzhou, Suga Haruhisa. Asian Mycological／ .
Congress-AMC, Incheon, Korea,（国内）
ペルオキシソーム病の診断 ABC。下澤伸行。第 回先天代謝異常学会セミナー、パシフィコ横浜、
―

―

／ 。
iPS 細胞を用いたペルオキシソーム病神経系モデル構築の試み。長瀬朋子、玉置也剛、柴田敏之、
國貞隆弘、鈴木康之、下澤伸行。第 回日本先天代謝異常学会。第 回アジア先天代謝異常症シ／ 。
ンポジウム、千葉、
LC／MS を用いた極長鎖脂肪酸迅速測定の開発。長瀬朋子、梶原尚美、鈴木康之、下澤伸行。第／ 。
回日本先天代謝異常学会、第 回アジア先天代謝異常症シンポジウム、千葉、The phenotype and genotyoe of Vietnamses patients with X-linked adrenoleukodystrophy（XALD）. Dung Chi Vu, N Shimozawa, TH Bui, KN Nguyen, NTB Can, HT Nguyen, LT Nguyen．第／ 。
回日本先天代謝異常学会、第 回アジア先天代謝異常症シンポジウム、千葉、
生後より痙攣・肝機能異常を呈し、PEX 変異が同定された Zellweger 症候群の一例。神賓理子、
濱田悠介、富永康仁、和田和子、酒井規夫、下澤伸行、大園恵一。第 回日本先天代謝異常学会、／ 。
第 回アジア先天代謝異常症シンポジウム、千葉、
副腎白質ジストロフィーに対する造血幹細胞移植効果：国内症例の包括的検討。小関道夫、下澤伸
行、矢部普正、加藤俊一、加藤剛二、加我牧子、辻 省次、鈴木康之。第 回日本先天代謝異常／ 。
学会、第 回アジア先天代謝異常症シンポジウム、千葉、の 系統分化を支持する一塩基多型の検出。須賀晴久、月星隆雄、上垣隆一、／ 。
中島 隆、景山幸二、百町満朗、日本植物病理学会、福岡（福岡国際会議場）、
PCR によるイチゴ萎黄病菌および炭疽病菌の同時検出のための前培養条件。平山喜彦、畠久美子、／
西崎仁博、須賀晴久、鈴木 健、岡山健夫、日本植物病理学会、福岡（福岡国際会議場）、。
とを繰り返し接種した土壌における、および
属菌の菌量の消長。久野修平、吉岡洋平、清水将文、須賀晴久、福田至朗、百／ 。
町満朗、日本植物病理学会、福岡（福岡国際会議場）、
種の属菌によるカンゾウの苗立枯病（新称）。景山幸二、渡會 実、岩下龍郎、冨田正／ 。
裕、末松 優、福井博一、須賀晴久、日本植物病理学会、福岡（福岡国際会議場）、のフモニシン産生能の有無を識別する DNA マーカーの開発。須賀晴久、月星隆雄、上垣隆一、中島 隆、景山幸二、百町満朗、第 回日本マイコトキシン学会学術講演会、／ 。
東京（タワーホール船堀）、
チオファネートメチル耐性ムギ類赤かび病菌に対するテブコナゾール処理効果。須賀晴久、スコット暁子、景山幸二、百町満朗、中島 隆、日本植物病理学会関西部会、香川（サンポートホール
／ 。
高松）
、
PCR によるイチゴ萎黄病菌の同定。須賀晴久、第 回フザリウム研究会、福山（福山市鞆公民館）
、
／ 。
〈受賞等〉
下澤伸行：小児医学川野賞（平成 年度）⑹

補助金関連採択状況

下澤伸行
平成 年度文部科学省科学研究費基盤研究（C）（ ）（研究代表者）「温度感受性に基づく代謝機能回復因子の網羅的探索と新規治療法の開発」（ 千円）
平成 年度厚生労働科学研究費補助金（難治性疾患克服研究事業）（分担研究者）「ライソゾーム病（ファブリ病含む）に関する調査研究」（ ， 千円）平成 年度厚生労働科学研究費補助金（難治性疾患克服研究事業）（分担研究者）「ファール病（特発性両側性大脳基底核・小脳歯状核石灰化症）の診断方法の確立と治療法の開発」（ ， 千円）平成 年度小野医学研究助成金（研究代表者）――

「極長鎖脂肪酸代謝異常症の病態解明と治療法の開発」（ ， 千円）須賀晴久
科学研究費補助金基盤研究（C）（研究代表者）「カビ毒汚染の原因となっている植物病原菌の宿主
内進展遺伝子の解明」（ 千円）
農林水産省委託プロジェクト研究（生産・流通・加工工程における体系的な危害要因の特性解明とリスク低減技術の開発、農業・食品産業技術総合研究機構）（研究代表者）「薬剤耐性を持つ麦類
赤かび病菌の遺伝子診断と伝播抑制技術の開発」（ ， 千円）新たな農林水産政策を推進する実用技術開発事業（イチゴ健全種苗生産のための病害検査プログラ
ムの構築）（研究担当者）「イチゴ萎黄病菌検出プライマーの作製」（ ， 千円）⑺

新聞報道

年 月 日（水）中日新聞「中学生が DNA 鑑定」（転載許可済）――