2020 年度（令和 2 年度）
先導科学研究科 研究科報目次2020 年度の先導科学研究科を振り返る ····································································1
先導科学共働プログラム ·······················································································3
生命共生体進化学専攻の教員及び専門分野 ······························································ 21

学生2020 年度在籍者 ································································································ 22
博士研究 ·········································································································· 25
海外における活動 ······························································································ 26

教員
外国人招聘研究者 ······························································································ 27
アウトリーチ活動 ······························································································ 28

各教員の研究教育業績（分野別）
統合人類学分野 ································································································· 33
沓掛 展之（教授： 動物行動学、霊長類学） ··························································· 33
本郷 一美（准教授： 環境考古学（動物考古学）、先史人類学） ································· 37
蔦谷 匠（助教： 生物考古学、自然人類学、霊長類学） ·········································· 41
進化生物学分野 ································································································· 45
颯田 葉子（教授： 生理進化学、ゲノム遺伝学） ····················································· 45
田辺 秀之（准教授： 分子細胞遺伝学、染色体ゲノム進化学） ··································· 51
大田 竜也（准教授： 分子進化学）······································································· 55
五條堀 淳（講師： 自然人類学、分子進化学、集団遺伝学） ······································ 59
寺井 洋平（助教： 適応と種分化の機構、分子進化生態学） ······································ 63
行動生物学分野 ································································································· 69
蟻川 謙太郎（教授： 神経行動学、感覚生理学） ····················································· 69
木下 充代（准教授： 神経行動学、生理行動学、認知科学） ······································ 73
渡邊 崇之（助教： 神経行動学、神経進化発生学、分子遺伝学） ································ 77
理論物学分野 ···································································································· 81
佐々木 顕（教授： 数理生物学、理論進化学） ························································ 81
印南 秀樹（教授： 集団遺伝学、ゲノム進化学） ····················································· 85

大槻 久（准教授： 理論生物学、進化ゲーム理論） ·················································· 89
宅野 将平（助教： ゲノム進化学・エピジェネティクス） ········································· 93
科学と社会分野 ································································································· 97
伊藤 憲二（准教授： 科学史）············································································· 97
飯田 香穂里（准教授： 科学技術史）·································································· 101
水島 希（助教： 科学技術社会論、科学技術とジェンダー） ···································· 105
大西 勇喜謙（助教： 科学哲学・科学技術社会論） ················································ 109
共同利用機器支援事業担当 ················································································ 113
松下 敦子（講師： 神経解剖学・微細形態学） ······················································ 113

参考資料2020 年度年間授業計画・時間割 ········································································ 116
2020 年度シラバス ··························································································· 121

2020 年度の先導科学研究科を振り返る

言うまでもなく 2020 年の主役は新型コロナであった。先導科学研究科も新型コロナの影
響を大きく受け、正着がわからない状況の中、葉山キャンパスにおける活動の規制、オンライン体制への移行など、数々の決断を下した。先導研において有症状の感染者が出ていない
ことは不幸中の幸であるが、限られた時間のなかで研究を進めなくてはいけない大学院生
や博士研究員にとっては、制約が多く、辛い一年になってしまった。
新型コロナに翻弄される状況は今後も続くと予想されるが、ここでは前向きになれることを敢えて書いてみる。先導研で展開する二つの分野（進化、科学と社会）の重要性を、今回の新型コロナの流行によって、より強く感じることとなった。新型コロナウィルスに見られる突然変異とそれに伴う形質変化、変異株間の系統関係、実効再生産数など、その理解には進化生物学の知見が必要とされる。また、それらの知見が一般社会においてどのように受け止められ、有益に用いられるか、または誤用されてしまうのか、人文・社会科学の立場か
ら専門的な分析が必要である。先導研における研究教育プログラムは、これらの必要性を満たすことができるものである。この文章を書いている 2021 年 4 月までに３名の助教が先導研に着任した。新しい力が加わったことによって、今後、先導研の活動がより活発化することが期待される。

2021 年 4 月
研究科長 沓掛展之1

2

先導科学共働プログラム3

2020先導科学共働プログラム採択課題
国際共同研究代表者氏名

研究課題

蟻川 謙太郎昆虫視覚進化研究の国際的協力体制の構築颯田 葉子

インドネシアAyam Cemani chickenの起源

本郷 一美

東アジアのイヌ・オオカミの系統についての考古科学的研究

佐々木 顕

病原体の毒性と多様性進化の理論的研究

萌芽的共同研究
代表者氏名

研究課題

印南 秀樹

競走馬生産における遺伝子診断の導入

寺井 洋平

共生体の極限環境への適応とその成立過程

木下 充代

光環境と視覚システムの進化学的研究

沓掛 展之

シナントロープの認知行動学：人新世における適応戦術

4

2020 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
国際共同研究研究課題

昆虫視覚進化研究の国際的協力体制の構築
蟻川謙太郎

代表者氏名

木下充代 (Assoc Prof, SOKENDAI)
Anna Stöckl (Assist Prof, University of Würzburg, Germany)
Gregor Belušič (Assoc Prof, University of Ljubljana, Slovenia)
Michael Perry (Assist Prof, University of California San Diego, USA)共同研究者氏名（所属）Mathias Wernet (Prof, Free University of Berlin, Germany)
Ullasa Kodandaramaiah (Assoc Prof, IISER Trivandrum, India)
Hema Somanathan (IISER Trivandrum, India)
Marko Ilić (Postdoc, SOKENDAI, University of Ljubljana, Slovenia)
Clément Cecetto (Postdoc, SOKENDAI)

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

1,450,0000

800,000

100,000

550,000

00

執行額

1,218,38100

110,070

1,108,311

0

0

研究成果
① 研究経緯私たちは昆虫の色覚機構について、主として視細胞の生理学的性質と、個体の視覚認知の両面から研究を進めてきた。アゲハでは複眼視細胞の配列が完全に分かり、ヒトをも凌ぐ鋭い色覚をもつことも分かった。現在は、視細胞が受けた信号が中枢で処理されて行動に結びつく機構に着目、進化学の視点をとり入れて研究している。コアは、色覚が貧弱なショウジ
ョウバエとの比較である。色覚機構の何がどう進化したかを知るためには、ショウジョウバ
エとアゲハを含む数種の昆虫での比較研究が必須である。さらに、研究を野外での行動解析へ拡げることで、より確実かつ興味深い研究へと発展する。2020年度は、前年度までに始めた世界の若手・中堅研究者との共同実験を進めて論文化する一方、研究を野外での行動解析へと拡げ、さらに広く国際的協力体制を構築することを目指して研究を始めた。
計画段階では、2020年7月にポルトガル・リスボンで開催される国際神経行動学会に出席・議論を深める予定だったが、これは、4月下旬に2年間の延期が決まった。一方、感染症は秋頃には終息するとの期待をもって、ドイツおよびインドからの招へい（あるいは先方への派遣）を計画していた。6月にはオーストラリア・メルボルン大学から共同研究の申込みがあり、本課題に関係の深い内容だったことから、こちらの冬季にメルボルンでの野外調査も計画した。しかし感染症蔓延の影響は想像以上に深刻で、海外渡航を伴うすべての計画は断念

5

せざるを得なかった。そのため、研究活動はすべてオンラインでの情報交換で進めた。

② 成果

Anna Stöckl 助教(Univ Würzburg)とは、2種のスズメガ（昼行性のホウジャク、夜行性のベニスズメ）で視覚第一次中枢（視葉板）の解剖学的研究を開始した。総研大で視葉板の電子顕微鏡連続横断画像を取得したのち、スタックのデータをHDで送付、大学院生が解析を始めた。解析は現在も継続している。私は当該大学院生のPhD committee memberとして研究指導に当たっており、これまでに２回Zoomでのミーティングを行った。
Gregor Belušič 准教授(Univ Ljubljana)とは、これまでに行った共同研究の中から２件を論文化するとともに、他の研究者とも共同で総説を執筆した。Marko Ilić博士は総研大での特別研究員を終えてBelušič研究室に異動し、本研究に継続して参加した。

Mathias Wernet教授 (Free Univ Berlin)とは色覚進化研究の進むべき方向性について議論した。single cell RNA-seqによるtranscriptomicsで神経細胞ごとに遺伝的系譜を解明した上で、電視顕微鏡によるconnectomicsで神経回路の実体を把握、回路の機能を生理および行動解析で解明するという大枠を作った。この枠組みでアゲハ、ミツバチ、バッタの視覚第二次中枢（視髄）の微小回路を解析する計画を、フランスCNRSの若手PIを加えた３者で策定した。
これは外部資金の獲得に結びつく可能性も高く、今後の発展が大いに期待される。
Michael Perry助教 (UCSD)とは複眼形態形成の進化的分子機構に関する情報交換を続け、その結果、渡邊助教との３者共同研究としてコオロギ複眼におけるSpineless遺伝子の機能解明を2021年度の共働プロとして立ち上げることができた。
Hema Somanathan教授、Ullasa Kodandaramaiah准教授 (IISER-Trivandrum) とは、博士研究員によるシロチョウ視覚生態学実験に関する討論を行った。インドからはIISERとの関係で
National Center for Biological Sciences in Bengaluruの大学院生からもコンタクトがあり、チョ
ウ類色覚の理論的解析に関する討論を行った。
木下准教授とCecetto博士とは、総研大でアゲハ中枢の動き感受性ニューロン活動の波長依存性を解析している。

③ 発表リスト
1.

2.
3.
4.

5.

van der Kooi C, Doekele G. Stavenga DG, Arikawa K, Belušič G, Kelber A (2021) Evolution of
insect colour vision – from spectral sensitivity to visual ecology. Annual Review of Entomology,
66:435-461
Stavenga DG, Leertouwer H, Arikawa K (2020) Colouration principles of the Great purple emperor
butterfly, Sasakia charonda. Zoological Letters, 6:13, doi.org/10.1186/s40851-020-00164-6
Pirih P, Meglič A, Stavenga D, Arikawa K, Belušič G (2020) The Red Admiral butterfly’s living
light sensors and signals. Faraday Discussions, doi.org/10.1039/D0FD00075B
Meglič A, Ilić M, Quero C, Arikawa K, Belušič G (2020) Chiral ommatidia with a spin in thecolourful eyes of the flathead oak borer, Coraebus undatus (Coleoptera: Buprestidae) Journal of
Experimental Biology 223, jeb225920. doi:10.1242/jeb.225920
Nagloo N, Kinoshita M, Arikawa K (2020) Spectral organization of the compound eye of a
migrating nymphalid, the Chestnut tiger butterfly, Parantica sita. Journal of Experimental Biology
10.1242/jeb.217703

6

2020 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
国際共同研究研究課題

インドネシア Ayam Cemani chicken の起源

代表者氏名

颯田葉子
Anik Budhi Dharmayanthi (インドネシア科学院)

共同研究者氏名（所属）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

700,0000

400,000

300,000

0

0

0

執行額

688,000

00

688,000

0

0

0

研究成果
研究経緯と成果： インドネシアや、ベトナム、中国など特にアジア地域には、内臓や筋肉、血管などの上皮細胞にメラニン色素が沈着する Fibromelanosis を示すニワトリがいる。Indonesian
Cemani は中国の烏骨鶏（Silky）とともにその代表的な品種として知られている。Indonesian
Cemani の Fibromelanosis の原因因子が、２０番染色体に位置する END3（endothelin3）という色素細胞等の分化を調節するペプチドの遺伝子領域が重複を起こしたことによることが、明らかになっており、研究分担者の Anik Budhi Dharmayanthi は Indonesian Ayam Cemani での変異が Silkyと同じであり、その変異の起源はニワトリの家畜化と同じ頃まで遡ることを示した。しかし、
Fibromelanosis を除いては、Ayam Cemani と Silky は形態的に大きな違いがある。また、インドネ
シアでの伝承によると、Ayam Cemani は Indonesia の家禽である Kedu と呼ばれる系統が起源とされている。2019 年度の本プログラムのサポートによる共同研究で、現在世界中で羽が黒色のニワトリの系統のゲノム配列が決定され公開されているので、これらの配列を用いて黒色ニワ
トリの系統進化を探る研究を行った。ゲノムレベルでは、黒色のニワトリの系統は中国系、インドネシア系、アメリカ系の３つの系統に分かれることを明らかにした。また、インドネシアのAyam Cemani 系統では、中国系、インドネシア系、アメリカ系の３つの系統の混合の度合いが染7

色体ごとに異なっていた。しかし、この結果は、Ayam Cemani 1 系統のゲノム配列に基づく結果
であり、Ayam Cemani の遺伝的多様性が高いことは、研究分担者の先行研究で明らかになっており、Ayam Cemani の集団レベルでの解析が必要である。また、Ayam Cemani と Kedu の系統関係も明らかになっていない。そこで本研究では Ayam Cemani のゲノムがどのように成立したかをAyam Cemani、Kedu の集団レベルの解析から明らかにすることを目的とする。そのために、Ayam
Cemani、Kedu の複数個体のゲノム情報が必要となる。これまでゲノム配列を明らかにした Ayam
Cemani は１個体のみであるため、まずは、複数個体の Ayam Cemani ゲノム配列を明らかにすることを目指した。しかし、コロナウィルスの影響で、研究分担者の訪日が叶わず、ゲノム配列決定をインドネシアで委託することとした。さらに、研究分担者がコロナに感染し、入院・加療することとなり、研究計画は大幅に遅れた。その中でも、Ayam Cemani７個体のゲノム配列決定を委託し 2021 年 3 月には、その配列が納品された。また、Kedu のゲノム配列に関しては、Ulfah
et al. (2016) Genetic features of red and green junglefowls and relationship with Indonesian native chickens
Sumatera and Kedu Hitam (BMC Genomics 17:320) に報告されている 10 個体のゲノム配列の情報を用いることとした。
解析はこれから行うが、PSMC(Pairwise Sequentially Markovian Coalescent)かその改良法である
MSMC(Multiple Sequentially Markovian Coalescet)を使い、集団動態を明らかにしたり、D 統計や
f 統計を用いることで、Cemani と Kedu を含むその他のニワトリの間での gene flow を推定するなどを行う。この解析には、Ulfah らの論文から得られる野鶏(赤色野鶏と青襟野鶏)および、
Kedu 以外の黒色羽ニワトリでゲノム情報が入手可能なものも含めて解析することとする。

発表リスト
未定

その他
コロナウィルスの感染拡大に伴い、インドネシアからの訪日が叶わず、塩基配列の決定は、インドネシアで委託せざるを得なかった。
また、共同研究者がコロナに感染し、入院・加療が必要となり、研究計画は大幅に遅れた。研
究費の執行状況でも、12000 円の残額を生じた。

8

2020 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
国際共同研究東アジアのイヌ・オオカミの系統についての考古科学的

研究課題

研究
本郷一美

代表者氏名

袁靖（復旦大学科技考古研究院・教授/ 中国社会科学院・考古研究所・研究員）
趙欣（中国社会科学院・研究員）
寺井洋平（総合研究大学院大学 先導科学研究科）
石黒直隆（総合研究大学院大学 先導科学研究科）
共同研究者氏名（所属）松村秀一（岐阜大学）
茂原信生（奈良文化財研究所）
覚張隆史（金沢大学 国際文化資源学研究センター）
菊地大樹（総合研究大学院大学 先導科学研究科）
Shayire Xiaokaiti（総合研究大学院大学 先導科学研究科）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

1,450,000

01,100,000

450,000

200,000

0

40,000

執行額

1,450,000

0956,087

393,500

100,41300

研究成果①研究の経緯日本列島にイヌが導入されたのは縄文時代で、中国での家畜イヌの出現よりやや遅れる。イ
ヌは最も早く人間と密接に関わり馴化された動物であるが、東アジアでのオオカミとイヌの分化過程は十分に明らかになっていない。日本列島におけるイヌの出現状況から、固有種とされる絶滅したニホンオオカミが家畜化されたとは考えにくいが、ニホンオオカミとイヌが交雑した可能性は考えられる。本研究の目的は、タイリクオオカミと日本固有種とされた絶滅したニ
ホンオオカミとの関係および東アジア本土のイヌと日本犬の関係を探ることである。そのために、現存するニホンオオカミの骨格および縄文時代の遺跡出土のオオカミ、イヌ骨格と、中国大陸の遺跡から出土したオオカミ、イヌの形態や遺伝的特徴の比較研究を行う。
②成果
石黒・本郷がベルリン自然史博物館所蔵のニホンオオカミ骨格から2018年に採取したサンプ
ルおよび石黒がライデン博物館所蔵のタイプ標本から採取したサンプルのゲノム解析を寺井・松村が進め、その一部を発表した。並行して大学院生のシャイラー・ショケットの博士論文研究の一部として日本および中国の遺跡から出土したイヌの古代DNA分析を進めている。覚張・ショケットが富山県の小竹貝塚（縄文時代）、千葉県の須和田遺跡（平安、古代）のイヌ骨格からのDNA抽出に成功し、解析中である。ニホンオオカミとイヌの食性の違いを探るために安定同位体分析も行った。

9中国の遺跡出土犬の研究に関しては、袁靖教授の協力を得て本郷と趙欣研究員が共同研究を行う合意を交わしたことにより大学院生のショケットが社会科学院の古代DNA研究室で研究することが可能になった。ショケットは2020年12月〜2021年1月に北京に滞在し、趙欣研究員の指導のもとで山東省の遺跡から出土したイヌ骨格の古代DNA抽出し、ゲノム解析を進めている。
本研究の中国の出土犬に関する部分を、中国で最先端の考古科学研究を推進している中国社
会科学院、復旦大学との共同研究として位置づけ、研究者・学生の交流が始まったことは本研究の成果の一つである。当初の計画では袁靖教授と趙欣研究員を日本に招聘する予定だった
が、コロナ感染症の拡大のために実現しなかった。しかし国費留学生のショケットが中国に渡航することができ社会科学院のラボで実験を開始したことで、本研究の目的の一つである学生の国際的な研究活動の支援は達成された。
③発表リスト
論文
Matsumura, S., Terai, Y., Hongo, H., Ishiguro, N. (2020) Analysis of the Mitochondrial Genomes ofJapanese Wolf Specimens in the Siebold Collection, Leiden. Zoological Science, 38(1):60-66,
doi.org/10.2108/zs200019.
その他
覚張隆史・山崎京美（2021）「市川市出土縄文・古代犬骨のゲノム解析に向けての事前調査報
告」、市史研究いちかわ、12 号、120〜131 頁
口頭発表
寺井洋平、五條堀淳、本郷一美、松村秀一、石黒直隆（2020) 日本犬の成立に寄与したニホン
オオカミのゲノム領域(日本進化学会 第 22 回大会 2020 年 9 月 6 日～9 日,オンライン）
寺井洋平（2020) ニホンオオカミとの交雑を経た日本犬の成立.(遺伝研研究会 コンパニオンア
ニマルのゲノム医療 2020 年 12 月 12 日オンライン)
Terai, Y. (2021) Evolutionary relationship between Japanese and Indonesian dogs. (Workshop on
Whole Genome Sequencing: A Case with Kintamani Dogs. Jan 29, 2021 Virtual)10

2020 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
国際共同研究研究課題

病原体の毒性と多様性進化の理論的研究
佐々木顕

代表者氏名

Sébastian Lion（フランス国立科学研究センターCNRS）
Mike Boots（カリフォルニア大学・バークレー校）
共同研究者氏名（所属） Ulf Dieckmann（国際応用システム分析研究所(IIASA)・進化生態プログラム）
佐藤正都（生命共生体進化学専攻）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

1,450,000

01,250,0000

200,000

00

執行額

1,327,604

0001,327,604

0

0

研究成果
① 研究経緯伝染病は人類にとっての最大の脅威のひとつであるが、病原体の急速で予測不可能な進化がその制圧を著しく困難にしている。病原体の毒性（病原体が感染した宿主を死亡させる度合い）の進化に関しても、シンプルな古典的描像が近年崩壊を起こし始めている。1980 年代の
毒性進化の理論および（ウサギ粘液腫ウイルス等を用いた）実証研究は、病原体がその基本
再生産数 R0（流行初期において１次感染者１個体が産み出す２次感染者数の期待値）を最大にする方向に進化するという簡明な理論を確立した。これによって、病原体の毒性進化の予測は、感染率・回復率と毒性の間のトレードオフ（機能的制約）を実験的に測ることによって可能になるかと思われた。しかし、近年、空間構造が毒性進化に双安定性（初期状態に応じて、弱毒化と強毒化のどちらにも進化することが可能になる）をもたらす現象や (Boots,
Hudson and Sasaki, Science 2004)、病原体・宿主間関係に生態学的フィードバックの次元が２以上の場合に、病原体形質の進化的分岐による多様化が生じる現象 (e.g. Lion and Metz, TREE,2017)などが次々と明らかになり、病原体と宿主の相互作用のもとでの病原体毒性の進化の複雑性が再認識されるようになった。そこで本研究では、病原体と宿主の共進化の最前線で研究する理論生物学者を先導研に継続的に招聘し、先導研教員を核とした共同研究を推進して、病原体の毒性と多様性の進化の新しいパラダイムの構築を目指す理論研究の成果を発信するプロジェクトを立ち上げた。

11

②

研究成果
これらの研究者・研究グループとの共働を目指して、2018 年度から始まった共働プログ
ラム国際共同研究では、以下のような興味深い研究成果を得ている。
1) 抗原エスケープと病原体毒性の同時進化。インフルエンザ A 型ウイルスやエイズウイル
ス、C 型肝炎ウイルス、そして SARS-CoV2 でもその兆候が見え始めているが、抗原遺伝子の多様化によって宿主免疫から連続的にエスケープ（抗原連続変異 antigenic drift）
する病原体においては、一過性の流行を起こす病原体(例えば SARS-CoV1)や、新生児、若年層への感染によって疫学的平衡状態に維持される病原体(麻疹、風疹等の多くの法定伝染病やインフルエンザ C 型ウイルス等)に比べて、高い病原体の毒性が進化することを理論的に示すとともに、交差免疫のもとでの抗原性の飛躍的進化と、それに伴う毒性の急上昇が起こるタイミングなどを疫学パラメータと遺伝分散パラメータから解析的に予測する理論を構築した。この理論解析には、宿主免疫による淘汰圧のもとでの抗原系統の多様化・分岐と、病原体の毒性・病原性形質の進化の同時進化の解析的な取り扱いが必要となるが、この困難な課題を、佐々木が開発した適応進化動態と量的形質遺伝
モデルの融合理論(Oligomorphic dynamics – Sasaki & Dieckmann 2011)を抗原連続進化モデ
ルに適用するように発展させることで可能となった。研究成果は Nature Ecology and
Evolution に投稿中である。(BioRxiv: Akira Sasaki, Sébastien Lion, Mike Boots. The impact ofantigenic escape on the evolution of virulence. doi: https://doi.org/10.1101/2021.01.19.427227
2) クラス構造のもとでの進化動態。宿主の状態の多様性が病原体の形質進化に与える影響
を、宿主クラス間の状態遷移を伴う生態学的ダイナミクスに進化ダイナミクスを結合する理論を開発した。クラス構造のもとでの進化動態に関しては、各クラスの「繁殖価」
で重みをつけた形質平均や形質分散の動態として着目することが有効であることを我々は見出し、さらに Oligomorphic dynamics によるアプローチを導入することで。投稿
準備中論文：Lion S, Boots M, Sasaki A. “Oligomorphic dynamics for structured populations: ageneral model”; Lion S, Boots M, Ito H, Sasaki A. “Oligomorphic dynamical on evolutionary
diversification of pathogens with super-infection”,
3) 宿主メタ個体群の不均一性と病原体の毒性の進化。2019 年 6 月の佐藤および佐々木のIIASA 訪問時に開始された Ulf Dieckmann との共同研究において、局所集団間の移住の異質性が、病原体の毒性を必ず上昇させるという、きわめて一般的な結果を発見した。
この研究成果は佐藤の学位論文の一部としてまとめられ、佐藤の SOKENDAI 賞受賞理由の一つとなった。現在、佐藤を筆頭著者として投稿準備中：Sato M, Dieckmann U, Sasaki
A. “Metapopulation heterogeneities in host migration, growth, carrying capacity, and immunity
loss always increase pathogen virulence”

122020 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究
研究課題

競走馬生産における遺伝子診断の導入
印南秀樹

代表者氏名

印南秀樹 集団遺伝学 先導科学研究科 教授 総括
佐藤文夫 獣医学 JRA 日高育成牧場
共同研究者氏名（所属）

研究員

Jeffrey Fawcett ゲノム情報学 理化学研究所

獣医、育成実習
上級研究員 解析坂本貴洋 学生 先導科学研究科 学生 DNA データ解析
須田鷹雄 競馬評論家 フリー 現地検証デザイン等
若原隆宏 記者 東京中日スポーツ メディア担当

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

4,800,000

1,440,000

300,000

3,000,000

60,00000

執行額

2,698,936

1,414,209

01,027,663

257,06400

研究成果① 初年度からの研究経緯
本研究プログラムの目的は、ゲノム遺伝の「机上の理論」を、いっきに現場検証レベルに発展させるためのものである。研究対象は競走馬（サラブレッド）で、ゲノム解析結果をウマの生産性向上に繋げる。本プロジェクトの一部に対して、先導科学共働プログラムのサポートを受けた。
なお、ギャンブルに関係する本研究対象は、JSPS などからの資金援助は困難なものと考える。

② 成果
２０１８年８月に印南、フォーセット、坂本の三人で、２０１８年９月に印南、フォーセット、須田の３人で、北海道の有力牧場を視察した。その際、日本最大級の生産牧場からサンプル提供を受けた。ノーザンファーム（生産ランクング１位）、社台ファーム（生産ランクング２位）、ビッグレッドファーム（生産ランクング 8 位）等である。この３牧場で日本の馬産の半分以上を担う大牧場である。さらには、日高地方の個人経営の牧場からも理解を得て、これらの牧場からもサンプル提供を受けた（ハクレイファーム、ベルサイユファーム、前原牧場）。合計で概ね４０
０頭に及ぶ、大きな成果であった。２０２０年度には、さらに２００頭追加し、前年度分の４００頭と合わせ、計６００頭の DNA を抽出、全ゲノム多型解読した。そして、２０１８年以前に解読したサンプルも含め、合計１０００頭以上の全ゲノム塩基多型（60 万 SNPs）データの解析を行った。まず親世代の種牡馬のゲノムを推定し、その情報や家系を加味した形で関連解析（GWAS）等の解析を行った。それによって、ウマの競走能力や生産能力に関与する遺伝子の候13

補をいくつか発見することができた。これらの遺伝子情報を使って効率の良い種牡馬 x 繁殖牝馬の組み合わせを探すアルゴリズムを開発し、将来的には、実際の繁殖に導入を試みる。同時に、候補遺伝子の一つ一つは、さらなる検証を重ね、特許取得につなげたい。

海外からの研究者の招聘なし③ 発表リストJeffrey A. Fawcett, Fumio Sato, Takahiro Sakamoto, Watal M. Iwasaki, Teruaki Tozaki, Hideki Innan, 2019.
Genome-wide SNP analysis of Japanese Thoroughbred racehorses PLOS ONE 14: e0218407
Fawcett, J. A., H. Innan, T. Tsuchiya, and F. Sato, 2021. The effects of the first and last mating age on therelationship between the advancing age and reproductive performance of Japanese Thoroughbred
broodmares. J. Equine Sci. in press.
サラブレッドの競走能力と遺伝子
印南秀樹 生物の科学 遺伝 ２０２０年５月号
サラブレッドにおける良い種牡馬の条件
坂本貴洋、印南秀樹 ウマ科学会 ２０１９年１２月

東京

その他特記事項
プレスリリース
https://www.soken.ac.jp/news/6317/
研究費獲得
２０１９年度競走馬生産育成研究助成事業「競走馬生産育成向上のための遺伝子診断法の開発」（３００万円 x ２年）

14

2020 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究
研究課題

共生体の極限環境への適応とその成立過程
寺井 洋平

代表者氏名

佐々木 顕（総研大・先導研）
宅野 将平（総研大・先導研）
河野 美恵子 (スウェーデン自然科学博物館)
共同研究者氏名（所属）別所和博（総研大・先導研）
内海 邑（総研大・先導研）
佐藤 正都（総研大・先導研）
大村 嘉人（国立科学博物館）
Mats Wedin（スウェーデン自然科学博物館）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

4,800,000

3,990,000

200,000

300,000

310,000

00

執行額

4,800,084

4,006,524

0379,785

413,775

0

0

研究成果
(1)

初年度からの研究経緯: 高温、高圧、乾燥、強酸などの極限環境はバクテリアや古細菌などの原生生物の適応が知られているが、高等生物でも複数の生物が共生した共生体を形成することにより適応が可能となる。このような共生体の１つに藻類と菌類の共生を主軸とした地衣類があり極限環境で生育している。しかし、藻類と菌類以外にどのような生物が共生体の構成生物であり、どのようにして極限環境への適応を成し遂げているかは明らかになっていない。本研究では、乾燥環境に生育するハコネサルオガセ(Usnea hakonensis)と、硫黄が噴出する環境に生育するイオウゴケ(Cladonia theiophila)の２種類の地衣類を生命共生体のモデルとして用いて、それぞれの共生生物の培養、それらのゲノム解析、および数理生物学的アプローチから共生による極限環境への適応とその維持機構や進化条件等を解明することを目的として研究を行
なった。
(2)

成果: 1) イオウゴケの生育に必要な物質。北海道、東北、関東、九州のイオウゴケの生育地で火山性ガスを調べた。その結果、どの生育地でも必ず存在していたのは硫化水素であり、また硫化水素濃度勾配に沿ってイオウゴケの数が変わることを考慮すると、イオウゴケは硫化水素を利用して生育すると考えられる。2) イオウゴケは三者共生系。北海道、東北、関東、九州のイオウゴケから抽出したゲノム DNA を次世代シークエンスで決定すると、イオウゴケは菌類(Cladonia)、藻類(Asterochloris)、好酸性菌が必ず存在し、イオウゴケは三者共生系であることが明らかになった。3) 三者共生系のゲノム。イオウゴケを構成する菌類(Cladonia)、藻類(Asterochloris)、好酸性菌のゲノムを決定すると、それぞれ 36 Mb, 55.5 Mb, 6 Mb であった。4) ゲノムからみた硫化水素利用。好酸性菌のゲノムには硫化水素代謝に関わる遺伝子が存在し、このバクテリアを介してイオウゴケが硫化水素を利用している可能性を示した。5) 三者共生系の進化。三者共生系の進化を数理モデルにより調べると、共生を構成する種数が多くても分業は容易に進化し、種数が多いほど冗長性のある分業パターンが進化しやすいことが明らかになった。6)
三者共生系の分散。DNA の遺伝的距離から共生に関わる三者の分散パターンを調べると、菌類と好酸性菌は一緒に分散し、藻類は分散先で現地調達していることが示された、このことは、土壌の DNA と子器の DNA からも支持された。7) ハコネサルオガセの菌類と藻類の単独培養株と15

再合成株の遺伝子発現の変化を調べることにより、共生に関わる遺伝子を明らかにし、それらの共生での役割を推定した。8) DNA のメチル化違いを利用して、イオウゴケから抽出したゲノム
DNA をバクテリアと菌類および藻類に分離し、バクテリアの長鎖次世代シークエンスを行なった。9) イオウゴケから抽出した total RNA から菌類、藻類、バクテリアすべてのリボゾーマル
RNA を除去する方法を確立し、すべての共生体の遺伝子発現を一度の RNA 次世代シークエンスで解析することを可能とした。10) 硫化水素濃度の高い場所で生育するイオウゴケの集団と低い場所の集団それぞれ３株の全共生体の遺伝子発現を RNA 次世代シークエンスで解析した。その結果、硫化水素濃度が高いと藻類のミトコンドリア遺伝子の多くの発現量が上がることが明らかになった。このことからバクテリアが代謝した硫化水素が藻類のミトコンドリアでのエネ
ルギー産生に関わっていることが予想された。11）水平伝達率の進化とその推定。イオウゴケは
硫黄噴出口ごとに点在するため、分集団での水平伝達率の進化をモデル化して配列データに適用し、分集団の絶滅率が低い状況では必須共生でも相手を失うリスクのある水平伝達が容易に進化すること、好酸性細菌の水平伝達率は 69% 程度であることなどを明らかにした。12）共生系における進化的自殺。共生系における絶滅リスクを明らかにするため、共生細菌による搾取と宿主による共生への依存の共進化をモデル化し、逆説的に寄生系に比べ相利系の方が絶滅に向
かって進化しやすいこと、この絶滅に向かう状況でも共生をやめる進化は生じず宿主は共生者と共倒れすることを明らかにした。
(3) 発表リスト（論文や学会発表、予定を含む）
発表論文
Uchiumi, Y., Ohtsuki, H. & Sasaki, A. Evolution of self-limited cell division of symbionts. Proceedingsof the Royal Society B: Biological Sciences, 286, 20182238, doi:10.1098/rspb.2018.2238, (2019) 査
読あり
Kono M, Kon Y, Ohmura Y, Satta Y, Terai Y. In vitro resynthesis of lichenization reveals the genetic
background of symbiosis-specific fungal-algal interaction in Usnea hakonensis. BMC Genomics doi:
10.1186/s12864-020-07086-9 (2020) 査読あり
Uchiumi, Y. & Sasaki, A. Evolution of division of labour in mutualistic symbiosis. Proceedings of theRoyal Society B: Biological Sciences, 287(1930), 20200669, doi: 10.1098/rspb.2020.0669, (2020) 査
読あり
内海邑. “相利共生系における共生者の分裂自粛の進化.” 数理解析研究所講究録, (2020), 2166,
32–36 査読なし
Uchiumi, Y., Sato, M. & Sasaki, A. Evolutionary double suicide in symbiotic systems. (in prep.)
Uchiumi, Y., Sasaki, A. & Terai, Y. “Low risk of extinction promotes horizontal transmission even in
obligate mutualism.” (in prep.)学会発表河野美恵子 寺井洋平. “地衣類・イオウゴケの共生を介した環境適応". 日本進化学会第 21 回
大会, 北海道大学. 2019 年 8 月
内海邑. “細胞内共生者における分裂自粛の進化と毒性の進化". 研究集会「数理生物学の歩みとこれからの展望」, ビジョンセンター横浜, 神奈川. 2019 年 9 月 28 日
内海邑, 佐々木顕. "相利共生系における分業の進化". 第 29 回日本数理生物学会大会, 東京工業大学, 東京. 2019 年 9 月 14 日 – 16 日
内海邑. “細胞内共生者は増殖を自粛するか（シンポジウム「種間相互作用の進化的帰結」）”. 第
16 回 生物数学の理論とその応用, 京都大学数理解析研究所, 京都. 2020 年 1 月 27 日 –31 日
内海邑. “相利共生系における水平伝達型から垂直伝達型への進化的移行". 日本生態学会第 67回大会, 名城大学, 愛知. 2020 年 3 月 4 日 – 8 日
内海邑, 佐々木顕. "相利共生系における分業の進化". ゲーム理論ワークショップ 2020, 駒澤大学, 東京. 2020 年 3 月 8 日 – 10 日
内海邑，佐藤正都，佐々木顕. “相利共生系における進化的心中”．第 30 回日本数理生物学会大会，名古屋大学，愛知，2020 年 9 月 20 日 – 22 日
内海邑，佐藤正都，佐々木顕. “共生系における進化的心中”．第 68 回日本生態学会大会，岡山大学，岡山，2021 年 3 月 17 日 – 21 日
(4) その他参考になることがら（任意）について
共生関連遺伝子を明らかにした成果について、プレスリリースを行なった。

16

2020 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究（
研究課題

光環境と視覚システムの進化学的研究
木下 充代

代表者氏名

寺井洋平（総研大・先導研）
Dan Eric Nilsson (Lund University）
Jochen Smolka (Lund University）
共同研究者氏名（所属） Michael Bok (University Bristol）

Cynthia Tedore (Hamburg University)
清古 貴（総研大・先導研）
南木 悠（総研大・先導研）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

4,800,000

01,000,000

600,000

1,600,000

1,600,000

0

執行額

2,848,461

00167,200

135,0652,546,1960

研究成果① 初年度からの研究経緯
本課題では、アゲハチョウとウミヘビを対象に、視覚系と光環境との関係を明らかすることで、感覚の環境適応及び進化の理解を目指して、実験生物学的な研究を展開した。初年
度は光環境の測定法を確立し、生息域における行動観察等を行った。次年度は、生息環境の
光環境の測定を行った。最終年度は、花粉分析によるアゲハチョウの野外における訪花傾向と、ウミヘビ視覚系の多様性を中心に明らかにした。

② 成果
視覚系の光環境への適応を明らかする目的で、アゲハチョウでは野外で訪問する花を、ウミ
ヘビでは網膜に発現する視物質とその特性を明らかにした。一方で、生息環境の光特性はEnvironment light field (ELF) 法により測定しより正確な生息光環境の理解を進められ、両種の視覚系の光環境適応についてより深い考察が可能となった。
アゲハチョウの訪花特性と生息域の光環境：赤い花を好むと言われているナミアゲハを対象に、その訪花を野外観察及び体表に付着した花粉分析（形態・遺伝子）により明らかにした。春から初夏の個体から、最大130分類群の花粉を同定した。春には草本の花粉が多く検出できたのに対し、初夏では木本の分類群が4分の３まで増えた。つまり、アゲハは木本の開花が始まるとこれらをよく訪花している可能性がある。今回の結果は、アゲハが赤系の花を好むという通説に反し、花粉を同定した花の色は赤も含むが多岐に渡っていた。特に、木本の花は、ヒトからみてシロ・薄黄色が多い。アゲハの色覚学習・弁別能力が優れていることを考えると、訪花した結果蜜を得られた花の色をよく覚えて効率的な訪花を実現しているのだろう。また、ナミアゲハの飛来は空も見えるひらけた場所でよく観察できたが、他のアゲハチョウ類の飛来は木洩れ日のある林の中に偏っていた。アゲハチョウ科の視覚系は比較的類似しているので、生息環境の好みは視覚系と直接の関係性はないようだ。
ウミヘビの視覚系と海洋適応：陸生のウミヘビの近縁種１種、完全海棲と両生のウミヘビの系統からそれぞれ３種から上述した3つのオプシン遺伝子の配列を決定した。配列の解析か
ら、RH1に１つ、LWSに5つの吸収波長の変化に関わる塩基置換が存在することを明らかに17した。また、これらの塩基置換には、正の選択が働いてきたことを進化解析から明らかにした。これらのことから、ウミヘビは海棲適応に伴い、視物質が吸収する波長域を進化させてきたことが予想された。実際に視物質の吸収波長に変化があるかを明らかにするため、強制発現したオプシンタンパク質を発色団（レチノール）と結合させて視物質を再合成し、その吸収波長を測定した。RH１視物質では完全海棲と両生の種で吸収波長の違いが見られた。
また、LWS 視物質は１種でしか測定を成功しなかったが、この種の吸収波長を基準として、他種のLWS 視物質吸収波長を予測した。また胃内容物の魚種の生息水深からウミヘビの捕食推進も予測した。その結果、深く潜水する種と沖合性の種ではLWS 視物質の吸収極大が短波長側へ大きく変化していた。これらは深い水深と沖合における青が主な光の成分となっている環境への適応のためであると考えられた。これらの成果を論文として発表した。

③ 全発表リスト<論文>
Seiko T, Kishida T, Toyama M, Hariyama T, Okitsu T, Wada A, Toda M, Satta Y, Terai Y. Visual
adaptation of opsin genes to the aquatic environment in sea snakes. BMC Evolutionary Biology
20, 158 (2020)<学会発表>• 南木悠,日下石碧,寺井洋平,丑丸敦史,木下充代．花粉形態と DNA メタバーコーディン
グによるチョウの訪花植物の同定．第 66 回 日本生態学会／2019 年 3 月, 神戸国際会議場，神戸．
• Nammoku Y, Nikkeshi A, Terai Y, Ushimaru A, Kinoshita M． Flower visited by Yptima
butterflies identified by pollen analysis. 17th International Society for Behavioral Ecology. 2018
年 8 月 Minneapolis, USA.
• 清古貴,岸田拓士,戸田守,颯田葉子,寺井洋平 ウミヘビの視覚の海棲適応 第 20 回 日
本進化学会／2018 年 8 月, 東京大学，東京• Seiko T, Kishida T, Toda M, Toyama M, Hariyama T, Okitsu T, Wada A, Satta Y, Terai Y. Visual
adaptation of sea snake. SMBE meeting, 2018 年 6 月, Yokohama, Japan• 南木悠,日下石碧,寺井洋平,丑丸敦史,木下充代．野外観察と花粉分析によるアゲハチョ
ウの訪花行動の解明．第 67 回 日本生態学会，2019 年 3 月, 名城大学，名古屋．
（現地開催中止・要旨集およびネット配信によるプログラム一部開催となった。
）• Seiko T, Kishida T, Toda M, Satta Y, Terai Y. “Visual Adaptation of Full and Semi Aquatic Sea
Snakes” World Congress of Herpetology (WCH9), 943, Dunedin, New Zealand, 2020 年 1 月.
• 清古貴,岸田拓士,戸田守,颯田葉子,寺井洋平，ウミヘビの視覚の海棲環境への適応.日本
爬虫両棲類学会第 58 回大会. P57. 岡山, 2019 年 11 月.
• 南木悠,日下石碧,寺井洋平,丑丸敦史,木下充代.ナミアゲハの訪花の季節変化と性差 第
35 回 個体群生態学会，オンライン，2020 年 11 月
• 南木悠,日下石碧,寺井洋平,丑丸敦史,木下充代.春から初夏におけるナミアゲハの訪花傾
向 第 68 回 日本生態学会，オンライン，2021 年 3 月• 木下充代.アゲハチョウの視覚系と訪花行動 ―実験室から野外へー 第 68 回 日本生態学会，オンライン，2021 年 3 月 招待講演
• Yohey Terai, Visual adaptation leads to the breeding color diversity in cichlid fish, The 24th
International Pigment Cell Conference, 2020 6/18-21, Invited symposium,④ その他参考になることがら
Takashi Seiko, Doctor thesis “Visual adaptation to the aquatic environment in sea snakes”, March
2021, School of Evolutionary studies of Biosystems, The Graduate University for Advanced Studies

18

2020 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究
研究課題

シナントロープの認知行動学:人新世における適応戦術
沓掛展之

代表者氏名

沓掛展之（総研大）高畑優（総研大）
共同研究者氏名（所属）加藤貴大（総研大）内田健太（UCLA）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

4,550,000

2,640,000

1,320,000

490,000

145,000

00

執行額

3,229,956

2,900,634

306,6020

22,72000

研究成果① 初年度からの研究経緯
現在、人新世(anthropocene)という新しい地質年代が命名されるほど、様々な生物学的現象に人間活動が強い影響を及ぼしている。急激な人為的変容のため、長い時間かけて適応進化によってデザインされた生物形質が、人工環境において不適応となっている事例が多く報告されている。その一方で、適応進化によってデザインされた認知行動が、人工環境に進出・生活するうえでの前適応の役目を果たし、人工環境を積極的に利用する共生種（シナントロープ）も確認されている。
本研究は、人の生活環境を利用し共生する動物（シナントロープ）を対象に、これまでに明らかにされていない、認知行動形質に見られる適応性を明らかにすることを目的とする。今年
度は、初年度の活動を継続し、人工環境下における認知行動の特性を適応論的な観点から分析することを計画していた。しかし、新型コロナの流行と付随する事象により、計画通りに研究を進めることができなかった。そのため、リスとスズメに関する研究計画を縮小して実施し、その他の研究は中止した。

② 成果
帯広地域におけるキタリス（エゾリス）を対象に、人付けと餌付けを伴う都市部と、自然環境での生態を比較し、人工環境への進出によって生じる利益とコストを検証した。これまでの我々の研究から、都市部に生息する個体は、自然状態に生息する個体と比較して、人への警戒心が低く、栄養価の高い餌付け餌により依存し、身体的コンディションが良いことがわかっている。これらの結果は、都市部がキタリスにとって好ましい生息環境であることを示唆している。それにも関わらず、個体の再視認率（生存率・定着率と相関する指標）は、都市部と自然環境の間で有意に違わないため、都市部がキタリスにとって必ずしも恵まれた環境ではないと

19

も考えられる。この結果の原因として、都市部における個体間競争の激しさと順位関係の形成が原因であると仮説を立て、今年度の調査で検証する予定であった。しかし、コロナの影響で野外調査を十分に実施することができなかった。そのため、次年度以降の調査を行うための準備を行なった。また、秋季の餌貯蔵行動がどのような経済的意思決定に基づいているかを調べた。キタリスは秋に餌を地中に隠し、資源が乏しい冬季に利用する。餌付け餌を利用し高い局
所的密度で生活する都市部のキタリスは、野生状態における個体とは異なる貯食行動を行なっている可能性がある。この可能性を実験的に検証した。
秋田県大潟村において、人工環境におけるスズメの繁殖パターンを調査した。とくに、内分泌測定のための試料と行動データを取得した。また、初年度に収集したデータの分析と論文取りまとめを集中して行なった。

③ 発表リスト•

高畑優・内田健太・嶌本樹・沓掛展之・大槻久 都市郊外に生息するキタリスの生存率と寿命推定 第39回日本動物行動学会大会 2020/11/20-22 オンライン④ その他
支出しなかった約132万円を返納した。令和３年度に継続課題として「人新世における適応
進化：人工環境に暮らす野生動物の行動生態」（研究期間１年）を申請し、実施することに
なった。

20

生命共生体進化学専攻の教員と専門分野
２０２０年度 教員一覧
氏名
職名等

研究分野

佐々木 顕

教授

研究科長

数理生物学、理論進化学

蟻川謙太郎

教授

専攻長

神経行動学、感覚生理学

颯田 葉子

教授

副専攻長

生理進化学、ゲノム遺伝学

印南 秀樹

教授

学術情報基盤センター長（兼）本部図書館長、副研究科長

集団遺伝学、ゲノム進化学

沓掛 展之

教授

進化行動生態学、動物行動学

本郷 一美

准教授

環境考古学（動物考古学）、先史人類学

田辺 秀之

准教授

分子細胞遺伝学、染色体ゲノム進化学

大田 竜也

准教授

分子進化学

伊藤 憲二

准教授

科学史

飯田 香穂里

准教授

科学史

木下 充代

准教授

神経行動学、生理行動学

大槻 久

准教授

理論生物学、進化ゲーム理論

五條堀 淳

講師

自然人類学、分子進化学、集団遺伝学

寺井 洋平

助教

種分化の機構、分子進化生態学

宅野 将平

助教

ゲノム進化学、エピジェネティクス

水島 希

助教

科学技術社会論、科学技術とジェンダー

大西 勇喜謙

助教

科学哲学

蔦谷

助教

（9月1日就任）

自然人類学、霊長類学、生物考古学

渡邊 崇之

助教

（10月1日就任）

神経行動学、神経進化発生学

松下 敦子

講師

共同利用機器支援事業担当

神経解剖学、微細形態学

匠

21

学生
2020年度在籍者◎5年一貫制課程○2011年度（4月）入学
学生氏名
藤木 信穂

○2013年度（4月）入学
学生氏名
秋山 辰穂

岩﨑 理紗

西山 久美子

清古 貴

佐藤 正都

南木 悠

西條 未来

大槻 久
佐々木 顕
伊藤 憲二
颯田 葉子
寺井 洋平
水島 希

指導教員

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導
副指導

○2017年度（4月）入学
学生氏名

蟻川 謙太郎
木下 充代
寺井 洋平
水島 希
颯田 葉子
本郷 一美
五條堀 淳
大田 竜也
飯田 香穂里
五條堀 淳
颯田 葉子
大槻 久
水島 希

指導教員

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導

○2016年度（4月）入学
学生氏名

伊藤 憲二
大槻 久
飯田 香穂里

指導教員

主任指導
副指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導
副指導

○2015年度（4月）入学
学生氏名
大家 岳

指導教員

主任指導
副指導
副指導

佐々木 顕
大槻 久
飯田 香穂里木下 充代
蟻川 謙太郎
寺井 洋平
水島 希

指導教員

主任指導
副指導
副指導
副指導

沓掛 展之
大槻 久
寺井 洋平
飯田 香穂里

職名研究タイトル

准教授
高エネルギー加速器研究所の装置開発
准教授
における産業界の役割の歴史的研究
准教授

職名研究タイトル教 授
准教授 鱗翅目昆虫視覚の多様化メカニズムの解明：色覚の性的二型、日周環境への適
助 教 応
助 教
教 授
准教授
日本人特異的な遺伝的適応を示す遺伝
講 師
子群のゲノムワイドな探索
准教授
准教授
講 師
教 授 ヒトの文字文化多様性はディスクレシア
准教授 関連遺伝子の中立進化で説明できるか
助 教

職名研究タイトル

准教授
利他行動と罰の共進化に関する理論的
教 授
研究
准教授
教 授
助 教 ウミヘビの視覚の段階的な海棲適応
助 教

職名研究タイトル

教 授
生態系を支える相利共生系進化の理論
准教授
的研究
准教授
准教授
教 授
野外のナミアゲハにおける花色選好性
助 教
助 教

職名

研究タイトル

教授
准教授 チドリ目における対捕食者行動の意思決
助 教 定
准教授

22

○2017年度（4月）入学
学生氏名
青野 圭

坂本 貴洋

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導

○2019年度（4月）入学
学生氏名
桑野 友輔

高畑 優

山川 真徳

山田 優佳

本郷 一美
五條堀 淳
飯田 香穂里印南 秀樹
宅野 将平
大西 勇喜謙

指導教員

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導

○2020年度（4月）入学
学生氏名
亀嶋 恵介

指導教員

佐々木 顕
大槻 久
大西 勇喜謙
沓掛 展之
寺井 洋平
水島 希
沓掛 展之
寺井 洋平
大西 勇喜謙

指導教員

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導

専攻長（仮）
沓掛 展之
未
沓掛 展之
木下 充代
寺井 洋平
伊藤 憲二

◎5年一貫制課程（3年次編入学）○2017年度（4月）入学
指導教員
学生氏名
杉田 あき

濱崎 真夏

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導

○2018年度（4月）入学
学生氏名
壹岐 朔巳

安家 叶子

指導教員

主任指導
副指導
副指導

○2020年度（4月）入学
学生氏名

沓掛 展之
寺井 洋平
水島 希
印南 秀樹
寺井 洋平
大西 勇喜謙

沓掛 展之
大槻 久
水島 希

指導教員

主任指導
副指導
副指導

沓掛 展之
大槻 久
飯田 香穂里

職名研究タイトル准教授
動物考古学的研究による先史時代の琉
講 師
球列島におけるイノシシとヒトの関係
准教授
教 授 生態的種分化の初期におけるgenomic
助 教 islands of speciationの進化の理論的記
助 教 述

職名

研究タイトル

教 授生育環境にあわせた昆虫の休眠卵生産
准教授
戦略
助 教
教 授
餌付けがもたらすキタリスの繁殖成績へ
助 教
の影響評価
助 教
教 授
ハダカデバネズミにおける地中生活・集助 教
団生活への社会生態学適応助 教

職名研究タイトル

教授
教 授
准教授 同時的雌雄同体のウミウシ類における多助 教 様な繁殖戦略
准教授

職名研究タイトル教 授
助 教 ムササビの森林内における分布と利用
助 教
教 授
助 教 ヒトセントロメアDNA配列の進化
助 教

職名研究タイトル

教 授
ニホンザルにおける行動伝染と行動協調
准教授 の社会的影響要因
助 教

職名研究タイトル

教 授 Cooperation and reconciliation in a
准教授 cooperative breeder, the African
准教授 painted dog Lycaon pictus

23

○2020年度（4月）入学
学生氏名

指導教員

主任指導
XUAYIRE XAOKAIT副指導
副指導

本郷 一美
寺井 洋平
飯田 香穂里

職名研究タイトル

准教授
Zooarchaeological study of domestic dog
助 教 in East Asia
准教授

24

博士研究
2020 年度課程博士取得者
氏名

学位取得

学位論文タイトル

副論文タイトル

障害学および進化学からみた「障害」－ 障害概念のモデル分類からの示唆 －西山 久美子

2020
前期

博士
(理学)

The investigation of thesignature of selection on
genes associated withdyslexia of Chinesecharacters
漢字ディスレクシア関連遺伝
子に対する自然選択の痕跡に
ついて

佐藤 正人

2020
後期

博士
(理学)

Evolution of symbiotic
systems in extreme andheterogeneousenvironments

博士
(理学)

胃がんのリスクアレルを通して探る、日本人の遺伝的な多様性及び集団動態の解析
Study of genetic variationand demographic history of
the Japanesefrom the viewpoint of a risk
allele of gastric cancer

岩崎 理紗

2020
後期

明治期における進化論と思想『日本人』に関する記述の変遷から考える、教育・
研究活動・社会背景の関係-1950年～2000年代、主要４社の高校歴史教科書の分析-

2020 年度副論文合格者
氏名

副論文合格者

南木 悠

2020
前期

壹岐 朔巳

2020
前期

副論文タイトル
千葉ニュータウン 21 住区の自然保護運動において科学者の果たした役割−科学者個人の立場から「科学者の社会的責任」を考える
人新世における「個体」概念の変容

25

海外における活動

2020年度 海外移動経費支援対象者※）2020年は新型コロナウイルス感染症拡大の影響で海外派遣は中止となった。

26

教員
外国人招聘研究者※）2020 年は新型コロナウイルス感染症拡大の影響で外国人研究者の招聘はなし。

27

アウトリーチ活動（１）講演会（生命共生体進化学専攻説明会）
日付

場所

2020.5.16

フクラシア
品川

2020.11.14

オンライン
開催

講師

イベント・テーマ

新型コロナウイルス感染拡大防止のため開催中止

恐怖の伝染病の謎にせまる

教授

佐々木 顕

ゲノム情報に挑んでみよう！！

准教授

大田 竜也

ウマの家畜化
－なぜ日本にロバがもたらされなかった？

准教授

本郷 一美

（２）学術講演会（先導科学研究科）
日付
2020.11.3

場所

イベント・テーマ
新型コロナウイルス感染拡大防止のため開催中止

葉山キャンパス（３）横高アカデミア2020
日付

内容2020.10.29「都市に住む野生動物の生態」 於 神奈川県立横須賀高等学校

講師
教授

沓掛 展之

（４）一般市民講座
内容

講師

渋谷ハチコウ大学講義*新型コロナウイルス感染拡大防止のため開催中止

助教

寺井 洋平

渋谷ハチコウ大学講義
ダーウィンと『種の起源』」（映像）2021年2月

准教授

飯田 香穂里

中央区民カレッジ「動物の認知能力－アゲハチョウの視覚世界を知る－」

准教授

木下 充代

中央区民カレッジ「総研大講師陣がおくるサイエンスセミナー」

准教授

大槻 久

文京アカデミー「動物の視覚の世界－アゲハチョウの場合－」

准教授

木下 充代

文京アカデミー「総合研究大学院大学講師陣による『科学探求講座』「生物界の協力とその成り立ち」

准教授

大槻 久

文京アカデミーダーウィンと『種の起源』」（オンライン）2021年2月

准教授

飯田 香穂里28

（5）理科ハウス講義
内容講師

新型コロナウイルス感染拡大防止のため開催中止

助教

寺井 洋平

（6）特別講義
内容

日付

講師

2020.10月

神奈川県立鎌倉高校にて特別講義

教授

蟻川 謙太郎2020.12月

自由学園リビングアカデミーにて特別講義

教授

蟻川 謙太郎（7）執筆活動等
内容

教員【プレスリリース】ウンチは宝の山：生態学研究の新手法「糞プロテオミクス分析」
2020.4.28

助教

蔦谷 匠

NPO法人FENICSのメールマガジンでのエッセイ執筆

助教

蔦谷 匠

「ヒトゲノム事典」の執筆・編集

教授

颯田 葉子

「遺伝学の百科辞典」の執筆・編集

教授

颯田 葉子

「社会への負の影響大きい 学術会議問題」（共同通信配信）信濃毎日新聞2020年
11月6日他

准教授

飯田 香穂里（8）インタビュー報道等
教員

内容
NHKインタビュー2020年10月13日（2020年10月14日NHKニュースおよび『NHKオンラ
准教授
イン』で報道）伊藤 憲二

共同通信社インタビュー2020年10月16日（2020年11月1日『中国新聞』等で報道）

伊藤 憲二

准教授

「被爆者らに放射性物質注入 幻の原子力平和利用 1950年代 広島、長崎 日米共同研究の経緯判明」（共同通信配信）長崎新聞2020年8月5日他「米内部文書をもと准教授に解明、『日本たばこ』戦略」しんぶん赤旗2021年2月24日,たばこ関連で他2本

科学コミュニケーションに関する専門家有志の会「新型肺炎サイコムフォーラム」での活動

助教

飯田 香穂里

水島 希

29

30

教員の研究教育業績【 分 野 別 】

31

32

統合人類学分野
沓掛 展之（教授：動物行動学、霊長類学、表現型の進化生物学）
1. 研究テーマ
1. 脊椎動物の社会・行動・認知・コミュニケーション
哺乳類、鳥類、両生類、魚類の社会行動・コミュニケーション・認知を、野外・実験状況下にて研究した。
今年度は、霊長類の行動伝播に関する論文が受理された。
2. 表現型の進化生物学
一般性の高い表現型進化の理論・分析を提唱することを目的とし、今年度は、以前、開発した統計手法の高速化と拡張を行った。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学（２単位、集中講義、「認知行動の進化」「人間行動の進化」を担当）

 研究指導1. 杉田あき （主任指導）「ムササビの生態」

2. 壹岐朔巳 （主任指導）「ニホンザルの社会行動」

3. 西條未来 （主任指導）「鳥の対捕食者行動」

4. 安家叶子（主任指導）「リカオンの社会行動」

5. 高畑優 （主任指導）「エゾリスの都市生態」

6. 山川真徳 （主任指導）
7. 山田優佳（主任指導）「ハダカデバネズミの認知行動」「ウミウシの繁殖」

 全学教育1. 統合進化学（１単位、「Animal Behaviour」を担当）

 他大学等における授業
1. なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）

1. Iki S, Kutsukake N. in press. Japanese macaques relax vigilance when surrounded by kin. Anim
Behav
学術研究図書33

該当なし
 学会発表学会発表
1. 沓掛展之・長谷川克：哺乳類社会における血縁淘汰：繁殖価の重要性 日本進化学会第 22 回オンライン大会 2020/9/6-9
2. 野間野史明・沓掛展之：雌雄が装飾を持つ闘魚 Betta brownorum における同性間闘争の性差 第 39 回日
本動物行動学会大会 2020/11/20-22 オンライン
3. 高畑優・内田健太・嶌本樹・沓掛展之・大槻久：都市郊外に生息するキタリスの生存率と寿命推定 第 39回日本動物行動学会大会 2020/11/20-22 オンライン
4. 山川真徳・三浦恭子・沓掛展之：真社会性ハダカデバネズミにワーカー内カーストは存在するのか 第 39回日本動物行動学会大会 2020/11/20-22 オンライン
5. 原野智広・沓掛展之：イタチ科における水生適応に伴う体サイズ進化の速度と方向性 日本生態学会
2021/3/17-21 オンライン
6. Hase, K., Kutsukake, N. Knowing kin and non-kin: self-referent phenotype matching and conspecificpreference in frog tadpole 日本生態学会 2021/3/17-21 オンライン
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1. 沓掛展之：真社会性ハダカデバネズミの集団意思決定と対立 公開シンポジウム「動物たちの意図共有」
日本学術会議統合生物学委員会・心理学・教育学委員会・基礎生物学委員会合同行動生物学分科会
2021/3/21、オンライン
 外部資金1. 日本学術振興会 科学研究費・基盤 B「協同繁殖種における装飾の性差と同性内変異：社会淘汰理論の検証」研究代表者：沓掛展之（2017-2021）総額 13,600 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人

34

該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動1. なし
 学外委員会活動
1. なし
 アウトリーチ活動
1. 沓掛展之 横高スーパーサイエンスハイスクール担当 「都市に住む野生動物の生態」 横高アカデミア 横須
賀高校 2020/10/29

 学術誌編集活動
1. Primates, Advisory Board (2009-2020)
2. Journal of Ethology, Associate Editor (2011-)
3. Biology Letters, Editorial Board (2016-)

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 全学教育委員会
2. 全学評価実施委員会
3. 動物研究検証委員会
 部局委員会等への貢献
1. 教務
2. 過半数代表補佐
3. スーパーサイエンスハイスクール担当
4. 共働プログラムワーキンググループ
5. センター化計画ワーキンググループ
 大学事業
1. なし

35

36

統合人類学分野
本郷 一美（准教授： 環境考古学（動物考古学）、先史人類学）
1. 研究テーマ
1. 家畜化過程の研究
西アジアにおける偶蹄類（ヒツジ、ヤギ、ウシ、ブタ）の家畜化の過程に関する研究を継続した。初期の定住狩猟採集民による野生動物資源の利用、新石器時代の食糧生産開始、「新石器化」に伴う家畜の伝播、農耕牧畜社会の成立に至るまでの生業と社会の変化について、進化学的視点で研究を行った。複数の科研費の助成を受けている。
2. ニホンオオカミの形態と系統に関する共同研究
ニホンオオカミの起源と系統および日本在来犬との関係を探る研究。明治期のニホンオオカミ資料と、遺跡から出土するオオカミ、イヌの骨格の形態やサイズのデータを収集するともに、海外の博物館所蔵のニホン
オオカミサンプルのゲノム分析を行った。
3. 遺跡出土犬のゲノム解析
大学院生の博士論文に関わる共同研究として、縄文時代の小竹貝塚（富山県）、平安時代の須和田遺跡（千葉県）から出土した日本犬、および中国の複数の遺跡から出土した犬の古代 DNA 解析を進めた。

2. 教育
 担当授業
ミクロ・マクロ生物学 （２コマを担当）
環境人類学特論 研究指導1. 青野圭（主指導）「動物考古学的手法による先史時代の琉球列島におけるイノシシとヒトの関係についての研究」
2. 岩崎理紗（副指導）「日本人特異的な遺伝的適応を示す遺伝子群のゲノムワイドな探索」
3. ショカット・シャイラー（国費留学生）「日本と中国の遺跡から出土したイヌの系統」
 全学教育1. 生命科学リトリート担当教員として、リトリートに参加
 他大学等における授業
該当なし

37

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Matsumura, S., Terai, Y., Hongo, H., Ishiguro, N. (2020) Analysis of the Mitochondrial Genomes of Japanese Wolf
Specimens in the Siebold Collection, Leiden. Zoological Science, 38(1):60-66, doi.org/10.2108/zs200019.
2. Hongo, H., Kikuchi, H., Nasu, H. (in press) Beginning of pig management in Neolithic China: Comparison ofdomestication processes between northern and southern regions. Animal Frontier.
学術研究図書（分担執筆）
1. 本郷一美 (印刷中）「外題：自然科学者との共同研究ー家畜の動物考古学」『松井章著作集』 新泉社
2. Cucchi, T., Domont, A., Harbers, H., Leduc, C., Guidez, A., Bridault, A., Hongo, H., Price, M., Peters, J., Briois, F., Guilaine,J., and Vigne, J.-D. (in press) Bones geometric morphometrics illustrate 10th millennium cal. BP domestication of autochthonous
Cypriot wild boar (Sus scrofa circeus nov. ssp) Vigne, J.-D. et al (eds) Klimonas. Paris: CNRS Editions
口頭発表
寺井洋平、五條堀淳、本郷一美、松村秀一、石黒直隆「日本犬の成立に寄与したニホンオオカミのゲノム領域」（日本進化学会 第 22 回大会 オンライン 2020 年 9 月 6 日～9 日）
 外部資金研究代表者
1. 日本学術振興会科学研究費補助金 基盤 B (2018-2020 年度) 定住狩猟採集民から農耕牧畜社会へ：ティ
グリス川上流域における 4 千年の過程を探る
2. 先導科学共働プログラム・国際共同研究 東アジアのイヌ・オオカミの系統についての考古科学的研究
研究分担者
1. 日本学術振興会科学研究費補助金 基盤 B (2020-2024 年度) 東南アジア大陸部における後期更新世人類の環境適応の解明（研究代表者：新潟医療福祉大学・澤田純明）
2. 日本学術振興会科学研究費補助金 基盤 C（一般）（2020-2014 年度） 絶滅したニホンオオカミの遺伝的変遷と移動を探る動物考古学的研究（研究代表者：総合研究大学院大学先導科学研究科・客員研究員・石黒直隆）
3. 日本学術振興会科学研究費補助金 基盤 A (2019-2022 年度) ポスト古代ゲノム解読期における家畜化概念のヒューマンアニマルボンド的学融合刷新（研究代表者：東京大学総合研究博物館・遠藤秀紀）
4. 日本学術振興会科学研究費補助金 新学術領域新学術領域（研究領域提案型） (2018-2022 年度) 「都市文明の本質：古代西アジアにおける都市の発生と変容の学際研究」 計画研究： 西アジア先史時代における生業と社会構造（領域代表者：筑波大学・山田重郎、計画研究代表者：筑波大学・三宅 裕）
5. 日本学術振興会科学研究費補助金 基盤 B

(2018-2021 年度) 西アジア新石器時代における社会の複雑化（研究代表者：筑波大学・三宅 裕）
6. 日本学術振興会科学研究費補助金 基盤 S (2019-2023 年度) 中東部族社会の起源：アラビア半島先原始遊
牧文化の包括的研究 （研究代表者：金沢大学・藤井純夫）
7. 人間文化研究機構 基幹研究プロジェクト『文明社会における食の布置』 「食と文明」研究ユニット38 外国招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 海外出張
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動1. International Council for Archaeozoology 理事、国際委員
2. International Council for Archaeozoology, ASWA (Archaeozoology of Southwest Asia and Adjacent
Areas) Working Group 代表
3. 生き物文化誌学会 監事
4. 日本人類学会 評議員、骨考古学分科会幹事
5. 日本動物考古学会 役員
6. 日本西アジア考古学会 監事
 学外委員会活動
1. 若狭三方縄文博物館 運営委員
2. 吉田学記念 文化財科学研究助成基金 運営委員
 アウトリーチ活動
1.

該当なし

 学術誌編集活動
1. 日本考古学協会

Japanese Journal of Archaeology 編集委員

 学術誌査読活動
1. Journal of Archaeological Science report
2. Anthropological Science39

3. 考古学研究
4. 動物考古学
5. 帝京大学文化財研究所研究報告

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.

苦情等処理協議会

2.

全学学生支援委員会

3.

全学入試監理委員会

4.

ヒトゲノム・遺伝子解析研究倫理委員会

 部局委員会等への貢献
1.

生命科学リトリート 担当教員

2. 入試委員
 大学事業
該当なし

40

統合人類学分野
蔦谷 匠（助教： 自然人類学、生物考古学、霊長類生態学）
1. 研究テーマ
1. 生物考古学
遺跡から発掘された古人骨や動物骨を分析し、過去の人類や動物の生きざまを調べている。特に、出産、子育て、食べ物、死亡に注目している。これらは生物集団の人口動態や健康状態を決定する重要な要因である。どのような文化や自然環境のもとで人類や動物の生きざまが決まり、それが進化適応や社会情勢にどう影響していくかまでを明らかにすることを目指している。
安定同位体分析や古代プロテオミクス分析によって、遺物に残された微量の分子を調べ、そうした証拠をもとに、すでに観察することもできなくなった過去の生命現象を明らかにしている。考古学者や骨形態学者と共同で研究を進めており、発掘調査や骨標本の整理にも参加した。
2. 霊長類生態学
チンパンジーやオランウータンなど特にヒトに近縁な霊長類を対象にして、行動観察からは知るのが難しい
生命現象を調べている。観察対象の霊長類個体を識別して行動を観察すれば、多くのことがわかるが、観察からは知るのが難しい行動や、観察から調べるにはあまりの多くの手間と労力がかかる行動も多く存在する。安定同位体分析やプロテオミクス分析を応用することで、そうした問題を解決したいと考えている。
糞や体毛や採食物など、個体を傷つけないで手に入る試料を安定同位体分析したりプロテオミクス分析したりすることで、コドモの発達、食性、健康状態などを明らかにした。動物園などの飼育個体で基礎検討し、野生の個体に応用を進めている。霊長類学者や生態学者と共同で研究を進めており、野外調査にも参加した。
3. 生物と文化のミスマッチ
ヒトが進化を通じて身につけてきた生物学的な性質と、現代の社会や文化の現状がミスマッチを起こしている状況について、調査をしたり議論したりしている。また、夫婦や親族のあいだに閉じないシェアハウスでの子育てなど、現代日本での子育てのあり方の多様性を、社会学者と共同で研究している。
「どうして現代日本ではこんなに子育てが大変なんだろう？」という自身の思いから始まった研究であり、そのため特に妊娠出産や子育てに注目している。現代人の子育てを縛る常識や「当たり前」の価値観は、実は数年から数十年で変遷する。数百万年の時間軸を考慮する人類進化の知見を提供することで、すこし異なる視点を持ちこみ、よりすこやかな子育ての実現に貢献できると考えている。

2. 教育
 担当授業
1. 環境人類学特論（2 単位、集中講義）中の 1 コマを担当
 研究指導41

該当なし
 全学教育
該当なし
 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物 (*は責任著者)
原著論文（査読あり）
1. Tsutaya T*, Mackie M, Sawafuji R, Miyabe-Nishiwaki T, Olsen JV, Cappellini E*. in press. Faecal
proteomics as a novel method to study mammalian behaviour and physiology. Molecular Ecology
Resources DOI: 10.1111/1755-0998.13380.
2. Tsutaya T*. 2020. Blurred time resolution of tooth dentin serial section. American Journal of Physical
Anthropology 173: 748–759. DOI: 10.1002/ajpa.24113.
3. Halffman CM*, Potter BA*, McKinney HJ, Tsutaya T, Finney BP, Kemp BM, Bartelink EJ, Wooller
MJ, Buckley M, Clark CT, Johnson JJ, Bingham BL, Lanoë FB, Sattler RA, Reuther JD. 2020.
Ancient Beringian paleodiets revealed through multi-proxy stable isotope analyses. Science
Advances 6: eabc1968. DOI: 10.1126/sciadv.abc1968.
4. 澤藤りかい, 蔦谷匠* 2020. 質量分析を利用したプロテオミクスの考古学・古人類学における応用.
Anthropological Science (Japanese Series) 128: 1–19. DOI: 10.1537/asj.200213.
書籍分担執筆（査読あり）
5. Tsutaya T*, Kakinuma Y, Yoneda M. 2020. Reconstructed weaning ages in urbanized cities of
premodern Japan provide insight into the relationship between employment and fertility. In: Thebioarchaeology of urbanization: the biological, demographic, and social consequences of living incities. Edited by Betsinger TK, DeWitte SN. Springer. p. 459–482. DOI: 10.1007/978-3-030-534172_18
 学会発表1. 蔦谷匠, Anna Wong, Peter T. Malim, Henry Bernard, 小川奈々子, 大河内直彦, 田島知之, 金森朝子, 久世濃子. 安定同位体分析による野生オランウータンの食性推定. 第 36 回日本霊長類学会大会. 2020 年
12 月, 岐阜 (オンライン開催).
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
該当なし

42

 外部資金
1. 日本学術振興会学術研究助成基金助成金基盤研究（C）「古人骨のプロテオミクス・ホルモン分析による妊娠マーカー検出法の開発」研究代表者：蔦谷匠（2019〜2022）総額 3,300 千円
2. 日本学術振興会学術研究助成基金助成金基盤研究（C）「絶滅危惧種オランウータンの野生復帰事業改善を目的とした法医学的研究」研究代表者：久世濃子（2019〜2022）総額 3,400 千円
3. 日本学術振興会学術研究助成基金助成金基盤研究（C）「多面的新手法による中近世日本人のライフヒストリ
ーの復元：生物考古学の新展開を探る」研究代表者：長岡朋人（2019〜202３）総額 3,400 千円
4. 日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B）「人骨から読み解く日本列島人の食生活―食物の変遷と多様性の復元―」研究代表者：澤藤りかい（2020〜2023）総額 4,400 千円
5. 日本学術振興会科学研究費補助金学術変革領域研究（A)「同位体比分析から見たヒトとモノの動態復元」研究代表者：米田穣（2020〜2024）総額 9,600 千円
6. 日本学術振興会学術研究助成基金助成金国際共同研究加速基金（国際共同研究強化 B）「古代プロテオミクスの基盤・拠点整備のための海外共同研究」研究代表者：太田博樹（2020〜2022）総額 8,400 千円
7. 四方記念地球環境保全研究助成「安定同位体分析によるボノボのコドモの食資源推定」研究代表者：蔦谷匠（2020〜2021）総額 482 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招へいした外国人
該当なし
総研大国際共同学位プログラム構築支援経費にて招へいした外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動該当なし

43

 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
以下プレスリリースの出版
https://www.soken.ac.jp/news/6964/
以下エッセイの執筆
https://tsutatsuta.net/other/peru/
 学術誌編集活動
該当なし
 学術誌査読活動
1. Archaeological and Anthropological Sciences
2. Archaeological Research in Asia
3. Forensic Anthropology
4. Journal of Archaeological Science: Reports
5. Journal of Human Evolution
6. Methods in Ecology and Evolution
7. Philosophical Transactions of the Royal Society B

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
該当なし
 部局委員会等への貢献
該当なし
 大学事業
該当なし

44

進化生物学分野
颯田 葉子（教授： 生理進化学、ゲノム遺伝学）
研究テーマ
1. ヒトのゲノムに刻まれた環境変化への適応
ヒトの疾病に関わる遺伝子の SNP（疾病 SNP）の多くが他の霊長類で保存されている祖先型であることがあきらかになっている。これらの SNP がヒトの疾病と関わるようになったのは、ヒト特異的な環境変化がその引き金となり、ヒトで新たに疾病抵抗性 SNP が出現したという仮説の元に、疾病 SNP と疾病抵抗性
SNP の分岐年代や疾病抵抗性 SNP の正の自然選択の可能性等について解析している。独自に開発した
2DM SFS(two dimensional site frequency spectrum) 法を用いた解析を行い、乳糖耐性関連変異、胃癌発症関連遺伝子、識字障害(デスクレシア)関連遺伝子のそれぞれに働く正の自然選択を明らかにし、その自然選択の生物学的理由を論じた。結果は国際誌に掲載された(原著論文 1,3,4)。
また、九州大学、国立遺伝学研究所の共同研究者とともに、精神疾患に関連した遺伝子の進化を調べているが、遺伝子の転写活性の程度がヒトの脳の発達と社会性の発展に伴い自然選択のターゲットとなったことを議論した論文を現在投稿中である。また、その遺伝子の多様性形成に旧人からの異種間浸透が関与している可能性が明らかとなり、現在解析を進めている。
このほかに、台湾の漢民族の人々のゲノム配列を用いた解析の共同研究に参加した。(原著論文 5)
2. ニワトリの家禽化プロセスの研究
これまでニワトリで、過剰な色素沈着のみられる Fibromelanosys という突然変異が固定したインドネシアのAyam Cemani という系統の進化と起源を解明する試みを行ってきた。Fibromelanosys の表現型の特徴の一つとして、羽の色が黒色になることが知られている。現在世界には、羽が黒色のニワトリの系統が多くある
が、全ての系統が Fibromelanosys ではない。現在、これらのニワトリのゲノム配列が決定され公開されているので、これらの配列を用いて黒色ニワトリの系統進化を探る研究を行ってきた。ゲノムレベルでは、黒色のニワトリの系統は中国系、インドネシア系、アメリカ系の３つの系統に分かれることを明らかにした。しかし
Ayam Cemani の系統では、中国系、インドネシア系、アメリカ系の３つの系統の混合であり、その度合いが染色体ごとに異なり、さらに詳細な検討が必要であった。そこで、Ayam Cemani７個体のゲノム配列決定を業者に委託し、その結果を得ている。解析はこれから行う予定である。
また、Ayam Cemani のゲノム中のヘテロ接合度の極めて低い領域を自然選択の標的領域候補として、他のニワトリゲノム配列とともに解析したところ、卵の産生量に関連する遺伝子が自然選択の候補として検出された。
以上の研究はインドネシアの研究者との共同研究である。本年度は、コロナ感染拡大の影響を受け共同研究の計画が大幅に遅れた。

45

3. 両生類の分子系統学
これまで、行ってきた様々な霊長類の系統の分岐時間と祖先集団の遺伝的多様性についての研究を両生類ゲノムに発展させた。両生類のゲノム配列は、これまでアフリカツメガエル（X.laevis)とネッタイツメガエル(X.
tropicalis)でカバレージの高い配列が得られている。ただし、アフリカツメガエルは４倍体、ネッタイツメガ
エルが２倍体という違いがある。アフリカツメガエルの４倍体ゲノムを構成する S と L のサブゲノムの配列が同定され、このサブゲノムの分岐は、およそ 3300 万年前という結果が、またこの 4 倍体形成の時の雑種形
成は、1800 万年前と推定された。この情報を用いて、アフリカツメガエルとネッタイツメガエルまたサブゲノムとの祖先集団のサイズの推定を行なった。結果は、祖先集団のサイズが 100 万個体となり、非常に大きいものとなった。そこで、霊長類の場合と同様に、突然変異率の不均一性を取り入れた最尤法を用いてみたが、突然変異率の不均一性を示すパラメータは不均一性があまり大きくないことを示し、結果的に祖先集団のサイズは 100 万個体のオーダになった。また、染色体間、あるいは、同一染色体内での塩基置換の程度の不均一性も調べたところ、確かに、各染色体の末端部分に向かって塩基置換の程度が上昇していく傾向を示すこと、また、この染色体の中での塩基置換の程度は染色体の塩基組成の染色体上のパターンと相関を示すことが明らかになった。この結果は国際誌に掲載された（原著論文７）。
また、種内に X Y の Z W の両方の性染色体システムを多型的に持つツチガエルのゲノム配列の決定をおこなった。これまでの解析により、ツチガエルは２倍体であるにもかかわらず、他の２倍体ゲノムを持つカエルの６倍以上のゲノムサイズであり、repetitive 配列の含量が非常に多いことがわかった。さらに、A I を用いた BLSOM 解析を行い、ツチガエルの染色体の特徴を明らかにした（原著論文８）4.

その他の共同研究
１）2 年前に学位を授与した学生との共同研究で、学位論文の一部を論文化した。地衣類の再合成を行い、再合成時に発現する遺伝子の同定を行なった。（原著論文２）
２）ウミヘビの海棲適応と視覚の変異に関する学生の学位研究の共同研究者となった。正の自然選択の検出方法について学生と議論した。（原著論文６）
３）台湾のオオコウモリ（タイワンオオコウモリ）と沖縄に生息するオオコウモリ（オリイオオコウモリ）の集団の遺伝的多様性の比較研究に参加した。（原著論文９）

教育


担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学（2 単位、集中講義）



研究指導
1. 岩崎理紗（主任指導）「胃がんのリスクアレルを通して探る、日本人の遺伝的な多様性及び集団動態の解析」2021 年 3 月 24 日学位授与
2. 清古貴（主任指導）「Visual adaptation to the aquatic environment in the sea snakes」
3. 西山久美子（副指導）「The investigation of the signature of selection on genes associated with dyslexia
of Chinese characters」2020 年 9 月学位授与

 全学教育46

1. 統合進化学（２単位、集中講義）
 他大学等における授業
1. 北里大学にて遺伝学（後期）を担当（2020 年 9 月〜2021 年 1 月）
研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
1.

Satta Y, N. Takahata, (2020) Population genomics on the origin of lactase persistence in Europe andSouth Asia. BioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.30.179432. Archivo CL-2020, 99-117.
2.

Kono M, Y Kon, Y Ohmura, Y Satta, Y Terai, (2020) In vitro resynthesis of lichenization reveals thegenetic background of symbiosis-specific fungal-algal interaction in Usnea hakonensis. Research Square DOI:
https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-26809/v4. BMC Genomics 21, 671. https://doi.org/10.1186/s12864-020-07086-93.

Nishiyama KV, Y Satta, J Gojobori, (2020) Do Genes Associated with Dyslexia of Chinese Characters

Evolve Neutrally? Genes 2020, 11(6), 658; https://doi.org/10.3390/genes11060658
4.

Iwasaki RL, K Ishiya, H Kanzawa-Kiriyama, Y Kawai, J, Gojobori, Y Satta, (2020) Evolutionary

History of the Risk of SNPs for Diffuse-Type Gastric Cancer in the Japanese Population. Genes 2020, 11(7),775; https://doi.org/10.3390/genes11070775
5.

Lo YH, HC Cheng, CN Hsiung, SL Yang, HY Wang, CW Peng, CY Chen, KP Lin, ML Kang, CH

Chen, HW Chu, CF Lin, MH Lee, Q Lau, Y Satta, CJ Lin, M Lin, SM Chaw, JH Loo, CY Shen, WY Ko,(2020) Detecting genetic ancestry and adaptation in the Taiwanese Han people. Molecular Biology and
Evolution, msaa276 https://doi.org/10.1093/molbev/msaa276
6.

Seiko T, T Kishida, M Toyama, T Hariyama, T Okitsu, A Wada, M Toda, Y Satta, Y Terai, (2020)

Visual adaptation of opsin genes to the aquatic environment in sea snakes. BMC Evolutionary Biology 20(1), 1-13
7.

Lau Q, T. Igawa, H. Ogino, Y. Katsura, T. Ikemura, Y. Satta, (2020) Heterogeneity of synonymous

substitution rates in the Xenopus frog genome, PLoS ONE https://doi.org/10.1371/journal.pone.0236515
8.

Katsura Y, T Ikumura, R Kajitani, A Toyoda, T Itoh, M Ogata, I Miura, K Wada, Y Wada, Y Satta,(2021) Comparative genomics of Glandirana rugosa using unsupervised AI reveals a high CG frequency,
Life Science Alliance. http://doi.org/10.26508/lsa.202000905
9.

Lin K-P, S-M Chaw, Y-H Lo, T Kinjo, C-Y Tung, H-C Cheng, Q Lau, Y Satta, M Izawa, S-F Chen, W-

Y Ko, (2021) Genetic differentiation and demographic trajectory of the insular Formosan and Orii’s flying
foxes, Journal of Heredity, esab007, https://doi.org/10.1093/jhered/esab007

47

学術研究図書1. 颯田葉子 「2.5.17 ヒトの進化と遺伝子の進化」動物の事典(末光隆志：総編集)第２章「動物の進化」
pp.96-98, 朝倉書店 (2020)
2. 颯田葉子 「分子進化と疾患」ヒトの分子進化からみた疾患の理解 「医学のあゆみ」273 巻 4 号：
pp.287-292.
 学会発表
１. 岩﨑理紗、石谷孔司、神澤秀明、河合洋介、五條堀淳、颯田葉子 「diffuse type の胃がんのリスクアレ
ルが日本人で高頻度に至った進化的要因の解明 」日本進化学会第 22 回オンライン大会 2020 年 9 月 6
日〜9 日
２. 岩﨑理紗、石谷孔司、神澤秀明、河合洋介、五條堀淳、颯田葉子 「diffuse type の胃がんのリスク SNPの東アジア人における動態」第 74 回日本人類学会 2020 年 10 月 31 日〜11 月 1 日、オンライン
 企画したシンポジウム等
１. Genome Concept Centennial Conference (GCCC) 2021.2.15~2.17 Online
２. 日本進化学会第 22 回オンライン大会 国際プレナリーレクチャー
 基調講演・招待講演
1. Yoko Satta, Population genomics on the origin of lactase persistence in Europe and South Asia, Genome
Concept Centennial Conferenc (GCCC) 2021.2.15~2.17 Online
 外部資金1. 日本学術振興会 研究補助金 基盤研究(C)「精神疾患関連遺伝子から探る現生人類における社会の変化・発展の遺伝的基盤」研究代表者：早川敏之、研究分担者：颯田葉子（2019〜2021）
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
GGS prize 2020 (遺伝学会)

48

社会貢献
 学会活動
1. 日本進化学会副会長（2020 年７月末より）
2. GGS prize selection committee 学外委員会活動
1. 日本遺伝学普及会評議員
2. 公益信託進化学振興木村資生基金運営委員
3. ADRC(Asian DNA Repository Consortium) のメンバー
 アウトリーチ活動
1. 「ヒトゲノム事典」の執筆・編集
2. 「遺伝学の百科辞典」の執筆・編集
 学術誌編集活動
1. Molecular Biology and Evolution, Associate Editor
2. Genmome Biology and Evolution, Associate Edior
3. Scientific Reports, Senior Editor
4. Genes and Genetic Systems (GGS), Associate Editor
大学運営 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 先導科学研究科特定有期助教（「科学と社会」分野）選考委員会
2. 人間を対象とする研究倫理審査委員会
3. ヒトゲノム・遺伝子研究倫理委員会
4. 動物研究検証委員会
5. 遺伝子組み換え安全委員6. 化学物質適正管理委員会
7. 環境安全管理協議会（オブザーバー）
 部局委員会等への貢献
1. 副専攻長2. 試薬管理担当
3. 実験排水管理
4. 廃棄物管理
 大学事業
1. 先導科学研究科特定有期助教（「科学と社会」分野）選考委員会の委員長を務めた。
2. 施設係の神奈川県横須賀三浦地域県政総合センター環境課への対応に協力した。

49

50

進化生物学分野
田辺 秀之（准教授： 分子細胞遺伝学、染色体ゲノム進化学）
1. 研究テーマ
細胞核における染色体テリトリー・遺伝子領域の空間配置がどのように制御されているのか、染色体ゲノム進化
学的な観点から、分子細胞遺伝学的なアプローチ（マルチカラーFISH 法、2D-/3D-FISH 法）を駆使して、以下のテーマに取り組んでいる。
1. 染色体テリトリーの核内配置分子基盤に関する研究
テナガザルにおける急速な染色体進化に着目し、ヒト染色体の R/G バンド各領域に由来する進化的転座切断
点（Breaks of Synteny; BOS）
、LAVA 反復配列に着目した 3D-FISH 法により、放射状核内配置の核内モデルの検証を行った。また染色体テリトリー研究に関するレビュー論文をまとめた（Archivio Vol. CL, 2020）。
2. マウス受精卵・初期胚および異種間ハイブリッドにおける染色体テリトリー・遺伝子領域の空間配置解析
マウス受精卵、初期胚を対象として、3D-FISH 法に適したチャンバーグラス（EASI-FISH chamber）を用いた遺伝子空間配置解析を行った。マウス卵にモリアカネズミ精子を顕微受精させ、異種間ハイブリッド ES
細胞を樹立し、核型分析、マルチカラーFISH 法による染色体解析を行った。
3. ヒト 21、18、13 トリソミー細胞における染色体テリトリーの核内空間配置解析
ヒト 21、18、13 トリソミー由来の各種細胞株を用いて、2D-/3D-FISH 法により、3 本のトリソミー染色体
テリトリーの核内空間配置解析を行った。21 トリソミーの分子治療を目指して、iPS-アストロサイト分化誘導系により基礎的な検討を行った。また、カニクイザル 17 番染色体（ヒト 13 番染色体に対応）トリソミー
個体由来の染色体、細胞核を用いて、2D-/3D-FISH 法による解析を行った。
4. 遺伝子水平伝搬に関するに爬虫類、両生類を用いた分子細胞遺伝学的研究
ヘビからカエルに水平伝搬したと考えられる LINE トランスポゾン（Bov-B）の起源と進化を探ることを目的として、マダガスカル産カエル（マンテラ）、ネッタイツメガエル、ヒキガエルの染色体・細胞核標本の作製を行い、FISH 法による検討を行った。
5. 霊長類における反復配列 DNA のクロマチン動態と進化的意義
ヨザル 2 種（Aotus arazae, Aotus lemurinus）における視細胞核での 3 種類のメガサテライト反復配列
DNA（Owl-Rep、Owl-Alp1、Owl-Alp2）の核内空間配置の比較解析を行い、レンズとしての機能を獲得し。
た年代の推定を行った（論文発表；Tanabe et al., Genome Biology and Evolution, 2021）
6. 脊椎動物、無脊椎動物各種由来のバイオリソースとしての細胞資源化に関する研究
希少生物種の各種細胞の収集・樹立・染色体標本の作製を通じて、バイオリソースとしての研究資源化を図った。ウマ、ヘビ、カエル数種の繊維芽細胞の樹立、上皮系細胞の初代培養を行うとともに、海産無脊椎動51

物のミドリイシサンゴの受精卵より、染色体標本の作製を行った。また、現代人ヒト集団稀少サンプル DNA（宝来コレクション）を活用した分子人類学的研究を推進した。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学（集中講義、進化生物学分野「生体物質と細胞・遺伝情報の発現・タンパク質」を担当）
2. 先導科学実習（「細胞組織科学」を担当）
3. 細胞生物学特論
4. 統合生命科学 統合進化学（“Chromosome organization, dynamics, and evolution”を担当）
 研究指導動物由来の初代細胞培養、蛍光顕微鏡および共焦点レーザースキャン顕微鏡を用いた観察実験等
 全学教育生命科学リトリート（オンライン）に参加
 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Tanabe H, Kusakabe KT, Imai H, Yokota SI, Kuraishi T, Hattori S, Kai C, Koga A.
The heterochromatin block that functions as a rod cell microlens in Owl monkeys formed within a 15Myr time span. Genome Biology and Evolution. 2021 Mar 1;13(3):evab021. doi: 10.1093/gbe/evab021.
2. Tanabe H. Chromosome territories and their spatial radial organization in the nuclear architecture.
Archivio per l’Antropologia e la Etnologia Volume CL (2020) pp.9-25.
学術研究図書該当なし
 学会発表学会発表
1. Hiromi Matsumae, Takehiro Sato, Chiara Barbieri, Kae Koganebuchi, Nao Nishida, Eriko Ochiai,
Motoki Osawa, Tadashi Imanishi, Ryosuke Kimura, Hideyuki Tanabe, Atsushi Tajima, Hiroki Oota,
Kentaro K. Shimizu. Genome-wide analysis of the Nivkh people in Sakhalin supported for the
relationships between peopling history and linguistic diversity in Northeast Asia. サハリン先住民族ニブフのゲノムワイド解析は、北東 アジアにおける集団史と言語多様性の関連を支持する、日本進化学会
第 22 回オンライン大会、2020 年 9 月

52

2. Hideyuki Tanabe：Spatial radial distribution of breaks of synteny observed in gibbon-humanchromosomes within the nucleus. 7th Asia-Pacific Chromosome Colloquium (APCC7), November 2020,
Busan, Korea
企画したシンポジウム等
1. 染色体研究の温故知新：様々な生物ゲノムの基本となる染色体研究の面白さ
日本遺伝学会第 92 回大会ワークショップ（熊本大学）→コロナ禍の影響で中止
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金1. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（B）一般「マダガスカルでの遺伝子水平伝播パンデミックとヘビによる世界的な伝播因子拡散の実証」研究代表者：倉林 敦 研究分担者：田辺秀之（2018〜2022）
2. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（B）一般「ゲノム組成の変化を伴ってヨザルで実現した暗環境への適応：霊長類全般での再現性」研究代表者：古賀章彦 研究分担者：田辺秀之（2019〜2021）
3. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（C）一般「異種間顕微授精によるトゲネズミ雄性 2 倍体胚由来
ES 細胞の樹立と配偶子形成の誘導」研究代表者：三谷 匡 研究分担者：田辺秀之（2018〜2021）
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
Best Poster Award, 7th Asia-Pacific Chromosome Colloquium (APCC7)

4. 社会貢献
 学会活動1. 一般財団法人 染色体学会 理事 ・遺伝学用語検討委員会委員長・将来構想委員会委員長
2. APCC（アジア太平洋染色体コロキウム）国際組織委員53

 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
1. 一般財団法人 染色体学会 Chromosome Science 誌 動物医学分野 編集長

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 安全衛生委員会
 部局委員会等への貢献
1. ヒトゲノム遺伝子解析研究倫理審査委員会
2. 遺伝子組換え実験安全委員会
3. 化学物質適正管理委員会
 大学事業
該当なし

54

進化生物学分野
大田 竜也（准教授： 分子進化学）
1. 研究テーマ
1. 脊椎動物における免疫システムの進化の研究
硬骨魚類（主に新鰭亜綱に属する魚類）のゲノムおよびトランスクリプトーム解析に基づき、脊椎動物での免疫システムの分子進化・起源を探る（国際共同研究）。
2. 被子植物における生殖システムの進化の研究
タデ科植物での多様な生殖システムの進化を解明することを目的に、ソバ属植物のゲノム・トランスクリプ
トーム等の NGS データを解析する。特にフツウソバにおける異型花型自家不和合性を司る S 遺伝子領域の解明を行う（国内共同研究）。
3. 縄文時代の植物大型化のメカニズム解明
縄文時代の中期以降に観察される種子の大型化の進化的要因（人為選択の影響等）を明らかにするため、ア
ズキやダイズ等の栽培化（ドメスティケーション）の過程を考古学ならびに遺伝学的な観点から検証する（国内共同研究）。
4. 鱗翅目における嗅覚遺伝子の進化
鱗翅目における嗅覚の多様性およびその進化過程を明らかにするため、嗅覚遺伝子多重遺伝子族を分子進化学的な観点から検証する（先導科学研究科内共同研究）。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学（２単位、集中講義、「分子進化学・分子系統学」を担当）
2. 統合進化学（２単位、集中講義、「ゲノム， 染色体， 細胞」を担当）
 研究指導1. 岩﨑理紗（副指導） 全学教育
該当なし
 他大学等における授業
該当なし

55

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
Li Y, Omori A, Flores RL, Satterfield S, Nguyen C, Ota T, Tsurugaya T, Ikuta T, Ikeo K, Kikuchi M, Leong
JCK, Reich A, Hao M, Wan W, Dong Y, Ren Y, Zhang C, Zeng T, Uesaka M, Uchida Y, Li X, Shibata TF,
Bino T, Ogawa K, Shigenobu S, Kondo M, Wang F, Chen L, Wessel G, Saiga H, Cameron RA, Livingston B,
Bradham C, Wang W, Irie N. (2020) Genomic insights of body plan transitions from bilateral to pentameral
symmetry in Echinoderms. Communications Biology 3:1-10, https://doi.org/10.1038/s42003-020-1091-1.
学術研究図書該当なし
 学会発表
学会発表
1. Ota T., Aii J, Ueno M, Ohsawa R, Saito H, Shirasawa K, Takeshima R, Nakazaki T, Nishimura K,
Hara T, Hirakawa H, Fawcett J, Matsui K, Mizuno N, Yasui Y.: Genomic characterization ofheteromorphic self-incompatibility locus in buckwheat. 日本進化学会第 22 回オンライン大会、2020 年
9月
企画したシンポジウム等
1. 日本進化学会第 22 回オンライン大会、2020 年 9 月 6 日～9 日（大会実行委員）
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金該当なし
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし

56

 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動1. 一般社団法人日本進化学会 専務理事 (～2020 年 8 月)、監事 (2020 年 9 月～)
 学外委員会活動
国際生物学オリンピック日本委員会 委員
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
1. 国際科学雑誌 Plant Gene Associate Editor
 学術誌編集査読活動
1. Plant Gene
2. Scientific Reports
3. Zoological Research

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 遺伝子組換え実験安全委員会
2. ヒトゲノム遺伝子解析実験倫理審査委員会
 部局委員会等への貢献
1. 統合部局情報セキュリティ委員会
 大学事業
該当なし

57

58

進化生物学分野
五條堀 淳（講師： 自然人類学、分子進化学、集団遺伝学）
1. 研究テーマ
1. 古代ゲノムを用いた東アジア人の成立の過程の解明
東アジア地域では一般に土壌の条件と気候から、古人骨が発掘されにくく、また古人骨に残存している DNA
も多くはない。次世代シーケンサの登場と DNA 抽出技術の進歩により、日本を含めた東アジア地域から出土される人骨から、全ゲノム塩基配列決定を行うことも可能になった。ゲノムの遺伝情報から、現代人と古代人のつながりや、時空間的な広がりの様子を明らかにすることができる。この研究では、旧石器時代、縄文時代、弥生時代の人骨からそれぞれ DNA を塩基配列を決定することで、東アジア人の成立の過程を明らかにすることを目的としている。本研究は東大、東邦大、中国杭州師範大学、農研機構、産総研との共同研究である。
2. 希少変異を用いたヤポネシアと近隣の集団の比較
集団中に見つかる希少変異（＝低頻度変異）は集団特異的なものが多く、集団間でそれが共有される場合には、より遺伝的に近い集団同士の組み合わせで、より多くの希少変異が共有されるという性質がある。この性質を用いて、古代人を含むヤポネシア集団と近隣の集団を比較し、ヤポネシア集団の形成史や極東地域の人類集団の形成史の解明につなげることが本研究の目的である。
3. 希絶滅したニホンオオカミの遺伝的特性をゲノムから明らかにする。
ニホンオオカミは明治時代に絶滅した日本列島の本州に分布していたオオカミである。ニホンオオカミの標本や骨から DNA 抽出を行い、全ゲノム塩基配列を決定した。タイプ標本であるオランダのライデンの剥製標本からも DNA 抽出を行い、全ゲノム塩基配列を決定した。また日本犬のゲノムも複数の個体について全
ゲノム塩基配列を決定した。これらの結果と、先行研究で発表されている様々な犬種やハイイロオオカミ、
古代のイヌやオオカミの全ゲノム塩基配列を比較することで、ニホンオオカミ集団の遺伝的位置づけや、ハイイロオオカミやイヌとの関連を明らかにする。本研究は先導研寺井先生、先導研本郷先生と岐阜大学との共同研究である。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ･マクロ生物学（2 単位、集中講義）
2. 統合進化学 （2 単位、集中講義）
3. 先導科学実習（2 単位、集中講義）
 研究指導1. 西山久美子（主任指導）「ヒトの文字文化多様性はディスレクシア関連遺伝子の中立進化で説明できるか」（2020 年 9 月学位取得）

592. 岩崎理紗 （副指導）「日本人特異的な遺伝的適応を示す遺伝子群のゲノムワイドな探索」（2021 年 3 月
学位取得）
3. 青野圭 （副指導）「琉球列島におけるイノシシとヒトの関係」
 全学教育
該当なし
 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
・Gojobori, J. (2020) “Rare allele sharing in the East Asian” Archivio per l’Antropologia e laEtnologia - Vol. CL・Nishiyama, K. V., Satta, Y. & Gojobori, J. (2020) “Do Genes Associated with Dyslexia of Chinese
Characters Evolve Neutrally?” Genes 11, 658.
・Iwasaki, R. L., Ishiya K, Kanzawa-Kiriyama, H, Kawai, Y. Gojobori, J. Satta. Y. (2020)“Evolutionary History of the Risk of SNPs for Diffuse-Type Gastric Cancer in the Japanese
Population.” Genes 11, 775.
 学会発表学会発表
1. 五條堀淳 ”Rare allele sharing in Yaponesians and its surrounding populations”, 日本進化学会第 22 回
企画シンポジウム「多彩な研究による日本列島人の形成と発展の歴史の解明」2020 年 9 月オンライン開催
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金1. 文部科学省: 新学術領域研究(研究領域提案型) 計画研究「ヤポネシア人の人口推定を中心とした巨大データ解析」研究代表者:長田直樹 研究分担者:五條堀淳 (2018-2022) 総額 49,140 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし

60

総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本遺伝学会 2019・2020 年度全国区評議員 2019 年 3 月〜
 学外委員会活動
1. 令和 2 年度国家公務員採用総合職試験（化学・生物・薬学）試験専門委員 2019 年 7 月 ～2020 年 7 月
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
Molecular Biology and Evolution 誌 Academic Editor
PLOS ONE 誌 Academic Editor
iDarwin 誌 Academic Editor

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
化学物質適正管理委員会
 部局委員会等への貢献
試薬管理担当実験排水管理共働プログラムワーキンググループ
 大学事業
該当なし

61

62

進化生物学分野
寺井 洋平（助教： 適応と種分化の機構、分子進化生態学）
1. 研究テーマ
1. ニホンオオカミと日本犬ゲノムの研究
これまでの研究で、日本犬ゲノムにはニホンオオカミ由来の領域が存在し、このような領域が日本犬の成立に関わった可能性を示してきた。本年度はニホンオオカミと日本犬(秋田犬、柴犬、紀州犬)のゲノムをデータ
ベース由来の世界各地のハイイロオオカミと犬種のゲノム、計 140 個体程度の解析を行なった。その結果、ニホンオオカミは現存のハイイロオオカミ、氷河期のオオカミ、現存のイヌや古代犬とは完全に独立した亜種であることを示した。さらに日本犬は東南アジアの犬種を含む古いイヌの系統に含まれ、この系統の犬種のゲノムにはニホンオオカミ由来の領域が含まれることも明らかになった。また、共同研究者の協力により縄文時代のイヌや奈良平安、江戸時代のイヌのゲノムの決定も行なった。現在これらのゲノムを解析し、日本犬の成立過程を明らかにしている。
2. 地衣類の共生による環境適応の研究
これまで硫黄噴出口付近に生育するイオウゴケは藻類、菌類、好酸性バクテリアの３者からなる基本構成である可能性を示してきた。今年度はイオウゴケから抽出した total RNA から菌類、藻類、バクテリアすべてのリボゾーマル RNA を除去する方法を確立し、すべての共生体の遺伝子発現を一度の RNA 次世代シークエ
ンスで解析することを可能とした。その方法を用いて硫化水素濃度の高い場所で生育するイオウゴケの集団と低い場所の集団それぞれ３株の全共生体の遺伝子発現を RNA 次世代シークエンスで解析した。その結果、硫化水素濃度が高いと藻類のミトコンドリア遺伝子の多くの発現量が上がることが明らかになった。このことからバクテリアが代謝した硫化水素が藻類のミトコンドリアでのエネルギー産生に関わっていることが予想された。別の地衣類、ハコネサルオガセの菌類と藻類の単独培養株と再合成株の遺伝子発現の変化を調べることにより、共生に関わる遺伝子を明らかにし、それらの共生での役割を推定した。この結果ついて論文にまとめ雑誌に掲載した。
3. サンゴの種間の違いに関わるゲノム領域
イシサンゴ目ミドリイシ科ミドリイシ属の 1 種、コユビミドリイシ(Acropora digitifera)には隠蔽種とされる

A. sp. 1 がいることが報告されていた。これらの 2 種は形態的な類似性が高く、交雑も可能であるが産卵時期が異なるため分化していると考えられていた。本年度は A. digitifera に加えて A. sp. 1 のゲノムを複数個体で決定し解析を行なった。その結果、これら 2 種は遺伝的に極めて近縁であり、ほとんどのゲノム領域に分化は見られなかった。しかし、一部のゲノム領域は２種間で完全に分化しており、このような分化した領域に存在する遺伝子が、2 種の違いを生み出していると考えられる。
4. スラウェシ島固有のマカクを用いた種分化と適応の研究
これまでインドネシア スラウェシ島固有のマカクの全エキソン配列の決定を、分布が隣接する 6 種の複数個体を用いて行っていた。本年度はこれらの種の適応と種分化に関わる遺伝子の候補の解毒関連遺伝子につい63

て酵素活性と細胞膜上での局在の解析を行った。その結果、種間で異なるアミノ酸置換は、酵素活性と細胞膜局在には関わらず、それ以外の機能の違いを生み出す可能性を示唆した。また、スラウェシマカク 6 種と外群であるアカゲザル、カニクイザル、ブタオザルにおいて偽遺伝子化した遺伝子を抽出した。その結果、広域に分布する外群の種に比べて、スラウェシマカクでは偽遺伝子化した遺伝子が非常に多いことが明らかになった。これらの遺伝子は地域適応の際に生存に必須でなくなり偽遺伝子化した、つまり適応の副産物として偽遺伝子化したと考えられる。
5. ヒト特異的皮膚形質の遺伝子基盤に関する研究
これまでの研究で、他の類人猿の種と比較して、皮膚の構造タンパク質遺伝子の発現がヒト特異的に高くなっていることを明らかにしてきた。これまではプロモーターアッセイ用のベクターに汎用のプロモーターを組み込み、その上流に発現調節領域の候補を組み込むことでヒト特異的発現をさせる変異を見出そうとしていた。しかし、汎用プロモーターが皮膚培養細胞には適さないことが明らかになったため、2020 年度は４つの構造タンパク質遺伝子のプロモーター領域をエピゲノムデータから推定し、それをベクターに組み込みプ
ロモーター活性を調べた。その結果、推定したプロモーター領域が皮膚培養細胞内でプロモーター活性を示
すことを明らかにした。このベクターに転写調節領域を組み込み、どの変異がヒト特異的遺伝子発現を作り出しているかを明らかにする予定である。
6. 海棲爬虫類の視覚の適応の研究
これまでの研究でウミヘビの薄明視を司る RH1 オプシンと長波長に感受性のある LWS オプシンの機能が多様化していることを示してきた。2020 年度は、LWS 視物質の機能の多様化は水深により変わる光環境への適応であること、および海棲哺乳類とウミヘビ類のオプシンの進化の違いは、視細胞の構成の違いに起因することを論文にまとめ、国際誌に掲載した。またウミガメとヌマガメ 2 種の眼の全 RNA 次世代シークエンス解析から、それそれの種の持つオプシンとそれらの発現量を明らかにした。現在、海棲適応におけるオプシンの役割を考察している。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ･マクロ生物学（2 単位、集中講義）
2. 生物多様性特論（１単位、集中講義）
3. 考究の講師を１名担当
 研究指導1. 秋山 辰穂（副指導）「鱗翅目昆虫視覚の多様化メカニズムの解明:色覚の性的二型、日周環境への適応」
2. 清古 貴（副指導）「ウミヘビの視覚の段階的な海棲適応」
3. 南木 悠（副指導）「野外のナミアゲハにおける花色選好性」
4. 杉田 あき（副指導）「ムササビの空間分布」
5. 西條 未来（副指導）「チドリ目における対捕食者行動の意思決定」
6. 高畑 優（副指導）「都市に生息するエゾリスの餌付けによる影響」
7. 山川 真徳（副指導）「真社会性哺乳類ハダカデバネズミにおける社会生態学的適応」
8. 山田 優佳（副指導）「同時的雌雄同体のウミウシ類における多様な繁殖戦略」

64

9. XIAYIRE XIAOKAITI（副指導）「Zooarchaeological study of domestic dog in East Asia」
 学位論文および進級審査
学位論文審査委員
清古貴
進級審査主査高畑 優
山川 真徳
 全学教育1. なし

 他大学等における授業
1. 京都大学霊長類研究所の大学院生指導
2. 京都大学野生動物研究センターの大学院生指導協力
3. 東北大学大学院生命科学研究科の大学院生指導協力

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Seiko T, Kishida T, Toyama M, Hariyama T, Okitsu T, Wada A, Toda M, Satta Y, Terai Y. Visual adaptation of opsin genes
to the aquatic environment in sea snakes. BMC Evolutionary Biology 20, 158 (2020)
2. Matsumura S, Terai Y, Hongo H, Ishiguro N. Analysis of the Mitochondrial Genomes of Japanese Wolf Specimens in
the Siebold Collection, Leiden. Zoological Science doi:10.2108/zs200019 (2021)
3. Kono M, Kon Y, Ohmura Y, Satta Y, Terai Y. In vitro resynthesis of lichenization reveals the genetic background of
symbiosis-specific fungal-algal interaction in Usnea hakonensis. BMC Genomics doi: 10.1186/s12864-020-07086-9(2020)
4. 石黒直隆、松村秀一、寺井洋平、本郷一美, オオカミやヤマイヌと呼ばれたシーボルトが残した二ホンオ
オカミ標本の謎, Journal of the Japan Veterinary Medical Association, in press
5. Takahashi-Kariyazono S, Sakai K, Terai Y. Presence–absence polymorphisms of single-copy genes in the stony coral
Acropora digitifera. BMC Genomics 21:158, doi.org/10.1186/s12864-020-6566-4 (2020)

総説等（査読なし）
なし
学術研究図書なし

65 学会発表
学会発表
1.

寺井洋平、五條堀淳、本郷一美、松村秀一、石黒直隆、日本犬の成立に寄与したニホンオオカミのゲノム領域、
日本進化学会 第 22 回大会 2020 年 9 月

2.

寺井洋平、日本犬に近縁な犬種は、遠く離れて生き残っていた、第二回くにうみミーティング 2021 年 3 月

3.

仮屋園志帆、寺井洋平、ミドリイシ属サンゴの幼生から稚サンゴまでの水槽飼育、日本動物学会関東支部大会、
2020 年

4.

仮屋園志帆、寺井洋平、コユビミドリイシサンゴにおける遺伝子有無の多型、日本進化学会第 22 回大会、2020
年

5.

仮屋園志帆、寺井洋平、コユビミドリイシ種内における遺伝的な違いに関する研究、日本サンゴ礁学会第 23 回
大会、2020 年

6.

荒川那海, Kanthi Arum Widayati, Laurentia Henrieta Permita Sari Purba, Xiaochan Yan, 今井啓雄, Bambang Suryobroto, 寺
井洋平、スラウェシマカクにおける環境適応と偽遺伝子化、日本進化学会第 22 回 2020 年 9 月

企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1. Yohey Terai, Evolutionary relationship between Japanese and Indonesian dogs, Workshop on Whole
Genome Sequencing: A Case with Kintamani Dogs: online Jan 29, 2021
2. 寺井洋平、ニホンオオカミとの交雑を経た日本犬の成立、遺伝研研究会 コンパニオンアニマルのゲノム医療 2020 年 12 月
3. Yohey Terai, Visual adaptation leads to the breeding color diversity in cichlid fish, The 24th International
Pigment Cell Conference, 2020 June
 外部資金1. 科学研究費補助金 新学術領域研究(公募研究)「日本犬の成立に寄与したニホンオオカミのゲノム領域の解明」研究
代表者：寺井洋平（2019〜2020）総額 8,000 千円

2. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 C「適応の副産物としての種分化: 環境適応が引き起こす生殖的隔離」研究代表者：寺井洋平（2018〜2020）総額 4,290 千円
3. 科学研究費補助金 基盤研究 B 「陸から海にもどった羊膜類の適応形質進化機構の法則を探」研究分担者 (研究代表者: 土岐田 昌和)（2019〜2022）総額 13,200 千円

4. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 C「絶滅したニホンオオカミの遺伝的変遷と移動を探る動物
考古学的研究」研究分担者 (研究代表者: 石黒直隆)（2020〜2022）総額 300 千円
5. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 C「潮汐環境に適応した体内時計の分子基盤の解明」研究分
担者 (研究代表者: 佐藤綾)（2018〜2020）総額 800 千円
6. 日本学術振興会 研究拠点形成事業 先端拠点形成型「大型動物研究を軸とする熱帯生物多様性保全の国際研究拠点」(研究参加者) 研究代表者：幸島司郎（2017〜2022）総額 90,000 千円
7. 日本学術振興会 二国間交流事業共同研究（インドネシア）「多様なインドネシア産霊長類の分子生態研究」

66

(研究参加者) 研究代表者：今井啓雄（2018〜2020）総額 4,950 千円

 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本進化学会 代議員
 学外委員会活動なし
 アウトリーチ活動
1. 渋谷ハチコウ大学講義 (新型コロナウイルスの感染防止のため講義は中止)
2. 理科ハウス講義(新型コロナウイルスの感染防止のため講義は中止)
 学術誌編集活動
1. iDarwin Associate Editor

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
なし
 部局委員会等への貢献
1. 研究体験実習担当
2. アカデミックアドバイザー

67

3. 実験排水管理
4. SNS 広報
 大学事業
1. 文京アカデミア「総研大講師陣による科学探究講座」打ち合わせ
2. 渋谷区ハチコウ大学「渋谷ハチコウ大学×総研大」打ち合わせ

68

行動生物学分野
蟻川 謙太郎（教授： 神経行動学、感覚生理学）
1. 研究テーマ
1. アゲハ視覚系における波長情報処理機構の解析
アゲハの第一次視覚中枢（視葉板）に微小電極を刺入、視細胞の終末部および視覚二次ニューロン（LMC）の樹状突起付近から分光感度を記録した上で色素を注入、細胞の形態を調べた。明らかになった細胞形態を
電子顕微鏡連続画像から得られた細胞形態と照合し、細胞の解剖学的タイプと反応特性の関係を解明する実験を継続している。
科研費で導入した SBF-SEM を用いて、アゲハで視葉板の更に一段奥に位置する第二次中枢（視髄）の連続画像を得た。画像は、視髄を構成するモジュール（カラム）を横断する方向に合わせた。カラムは単一の個眼に対応する構造で、2 本の長視細胞（長い軸索をもち、視髄で終末する視細胞、LVF）と 4 本の LMC の軸索末端部を含む。20 個のカラムについて LVF と LMC の末端部形態を調べた。LVF には、カラムによって末端部の枝分かれが密なものと疎らなものがある一方、LMC の終末形態にはこれまでのところカラム間での差異は認められなかった。
2. 昆虫視覚系の比較形態学にもとづく進化学研究
SBF-SEM を用いて、昆虫複眼の形態学的研究を進めた。チョウ目ではタテハチョウ科を中心に、ハエ目ではヒトスジシマカについて、複眼網膜の連続横断画像を得た。視葉板については、ヒトスジシマカ、ツチイ
ナゴ、モンシロチョウ、ミツバチについて比較解剖学実験を進めている。モンシロチョウについては、一部細胞形態の同定を完了した。
3. 昆虫視覚進化研究の国際的協力体制の構築
先導科学共働プログラムの国際共同研究として実施した。ドイツ、インド、スロベニア、アメリカの研究機関に所属する若手・中堅の研究者とメール等で連絡をとり、共同研究を進めた。詳細は共働プログラムの報告書を参照。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ･マクロ生物学（2 単位、集中講義）
 研究指導1. 秋山辰穂（主任指導）「鱗翅目昆虫における視覚の多様性と環境適応：色覚の性的二型、日周環境への適応」
2. 南木悠（副指導） 全学教育該当なし。

69

 他大学等における授業
1.

横浜市立大学大学院にて集中講義（2020 年 8 月、オンライン）

2.

信州大学理学部にて集中講義（2020 年 9 月、オンライン）

3.

自由学園最高学部にて集中講義（2020 年 10 月、オンライン）

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
1.

Arikawa K, Nakatani Y, Koshitaka H, Kinoshita M: Foraging small white butterflies, Pieris rapae, searchflowers using color vision. Frontiers in Ecology and Evolution, doi: 10.3389/fevo.2021.650069

2.

van der Kooi C, Doekele G. Stavenga DG, Arikawa K, Belušič G, Kelber A (2021) Evolution of insect colour
vision – from spectral sensitivity to visual ecology. Annual Review of Entomology, 66:435-461

3.

Stavenga DG, Leertouwer H, Arikawa K (2020) Colouration principles of the Great purple emperor
butterfly, Sasakia charonda. Zoological Letters, 6:13, doi.org/10.1186/s40851-020-00164-6

4.

Pirih P, Meglič A, Stavenga D, Arikawa K, Belušič G (2020) The Red Admiral butterfly’s living light sensors
and signals. Faraday Discussions, doi.org/10.1039/D0FD00075B

5.

Meglič A, Ilić M, Quero C, Arikawa K, Belušič G (2020) Chiral ommatidia with a spin in the colourful eyes ofthe flathead oak borer, Coraebus undatus (Coleoptera: Buprestidae) Journal of Experimental Biology 223,
jeb225920. doi:10.1242/jeb.225920

6.

Nagloo N, Kinoshita M, Arikawa K (2020) Spectral organization of the compound eye of a migrating
nymphalid, the Chestnut tiger butterfly, Parantica sita. Journal of Experimental Biology
10.1242/jeb.217703

 学会発表1.

Arikawa K, Wakita D, Ilic M, Shibasaki H, Kinoshita M: Sequential wavelength information processing in
the optic lobe of a butterfly, Papilio xuthus. The 42nd Annual Meeting of the Japanese Society for
Comparative Physiology and Biochemistry, Nov 2020, Yamagata、対面開催

2.

Cechetto C, Kinoshita M, Stewart F, Arikawa K: Chromatic contrast-sensitive medulla motion sensitive
neurons in a butterfly, Papilio xuthus. 日本動物学会第 91 回大会、2020 年 9 月、オンライン開催

3.

Ilic M, Belusic G, Arikawa K: Spectral and spatial opponency in the lamina of a butterfly Papilio xuthus. 日
本動物学会第 91 回大会、2020 年 9 月、オンライン開催

企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1.

Arikawa K: Butterfly color vision – another view of our world. Plenary lecture at the 2nd International
Symposium for Color Science and Art 2020-2021, Tokyo Polytechnic University, March 2021, Tokyo, Online
worldwide70

2.

蟻川謙太郎：チョウの見る色の世界を探る．リベラルアーツ学会大会における特別講演、2020 年 9 月、オンラ
イン開催

3.

Arikawa K: A colorful story on butterfly vision. Conference on the Series Neuroscience & Behavior in
Quarantine Times: June 2020, Online worldwide

 外部資金1. 日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（S）「視細胞間シナプスがつくる波長対比性の神経行動学的解析」研究代表者：蟻川謙太郎（2018〜2022）総額 200,200 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招へいした外国人
該当なし
総研大国際共同学位プログラム構築支援経費にて招へいした外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動1. 公益社団法人日本動物学会 副会長、理事
2. 日本比較生理生化学会 幹事
3. 視覚科学フォーラム 運営委員
 学外委員会活動
1. 日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
2. 大学改革支援・学位授与機構 専門委員
 アウトリーチ活動
1. 神奈川県立鎌倉高等学校にて、特別講義（2020 年 10 月、対面）

71

2. 自由学園リビングアカデミーにて、特別講義（2020 年 12 月、対面）
 学術誌編集活動
1. Journal of Comparative Physiology A 編集委員
2. Frontiers in Physiology 編集委員
3. Journal of Experimental Zoology 編集顧問
4. Frontiers in Neuroscience 編集顧問
5. Arthropod Structure and Development 編集顧問
 学術誌査読活動
1. Journal of Comparative Physiology A
2. Journal of Experimental Biology
3. Current Biology
4. Proceedings of the National Academy of Science, USA
5. Living Machines
6. Ecosphare

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 教育研究評議会委員
2. 学長選考委員会委員
3. ハラスメント防止委員会委員
4. 財務マネージメント委員会委員
 部局委員会等への貢献
1. 生命共生体進化学専攻長
2. 先導科学共働プログラム WG 委員長
3. 遺伝子組み替え実験安全委員会委員長
4. 動物研究検証委員会委員
 大学事業
該当なし。

72

行動生物学分野
木下 充代（准教授： 神経行動学、生理行動学、認知科学）
1. 研究テーマ
1. 鱗翅目昆虫の触覚葉における性差と多様性
昆虫の触角にある匂い受容細胞から最初に情報を受ける脳領域を触角葉という。触角葉は、多数の小さな球状の構造（糸球体）からなる。各糸球体は、異なる匂い物質の情報処理単位であり、その数は匂い受容体の数をほぼ一致する。一般に鱗翅目昆虫では、糸球体数が６０前後、フェロモン受容に関わる巨大糸球体を除くと、一般臭の処理関わるものは小さくそのサイズはほぼ均一であると言われている。
ナミアゲハの触角葉の糸球体構成を調べたところ、メスで大きく発達した３つの糸球体を発見した。この性的二型は、アゲハの生得的な色の好みが特定の植物由来の匂いによって変わり、その匂いの影響に性差があることと何らかの関係があると予測している。この色の好みと匂いの関係は、他のチョウでは報告がない。そこで、シナプシン抗体で染色した試料を用いて、アゲハチョウ類を中心に触角葉にある性的二型の有無を調べた。面白いことに、ナミアゲハと同じ属であるモンキアゲハでは明確な性的二型があるのに対し、属が異なるアオスジアゲハでは性的二型が見られなかった。またタテハチョウ・シロチョウ数種においても触角葉に性的二型はなかった。今後さらに多くの種での比較検討が必要であるが、ナミアゲハ触角葉の性的二型はアゲハ属に特有の形態のようだ。本研究は、専攻の松下敦子（本専攻・講師）との共同研究である。
2. アゲハチョウの高次中枢神経を対象とした神経生理学
複感覚の入力を受けるキノコ体に視覚中枢から投射する神経群を対象に、細胞内記録を行い分光及び光強度応答を精査した。紫外から赤の波長域まで 23 の単色光への応答（n=20）の記録を解析したところ、非常に鋭い波長特性を示す 5 種と比較的広い波長域に応答する 5 種の、２タイプがあることがわかった。いずれのタイプも、反対色性を示し、その波長特性は網膜にある視細胞とは一致しなかった。紫外と赤に感度を持つ神経は広帯域に、青またはオレンジに感度を持つものは狭い波長域でのみ興奮性応答を示す傾向にある。これは、ナミアゲハの波長弁別能と酷似しており、キノコ体に入力する光感受性細胞は知覚と一致する情報を表している可能性が高い。
動き知覚に関わる神経機構を解明する目的で、視覚中枢にある方向選択性を示す動き感受性神経の波長特性を中心に研究を進めた。第 2 視覚中枢の巨大動き感受性神経に、緑／緑、緑／赤、緑／青のいずれかの組
み合わせのストライプ動きを提示、緑の光強度を変えた時の、応答の変化を観察した。動き知覚神経は、緑／緑の組み合わせでは、２つの緑の光強度が同じになったところで応答が消失する。ところが、緑／赤、緑／青の組み合わせの時は、緑の光強度によらず応答することがわかった。このことは、アゲハでは動き知覚
神経に、緑以外の受容細胞からも入力があることを示しており、過去の行動実験の結果とよく一致した。昆
虫の動き知覚は緑受容細胞依存であるとされているが、アゲハでは複数の受容型の視細胞が関わることが神経生理学レベルでも明らかになった。
3. アゲハチョウの訪花特性の解明
ナミアゲハの訪花特性を調べるため、4 月中旬から６月下旬まで野外で採集したアゲハ（３６個体）の体表

73

花粉の形態及び遺伝情報を解析した。花粉形態では７６分類群、マーカー遺伝子（ITS1,2）では 130 分類群を同定した。アゲハの飛翔観察数から、５月までを１期、６月を２期として同定した花粉を精査したとこ
ろ、どちらの手法においても、１期は草本であるのが２期で木本の顕花植物の花粉が増えた。この傾向は、木本の多くが初夏（６月）に花をつけることと考え併せ、アゲハは木本の花が増えてくると積極的にこれらを利用するようになった結果を反映したと考えている。アゲハは一般に赤い花を好むチョウとして知られているが、今回体表から検出できた花粉の献花植物に訪問しているとすると、草本・木本問わず多くの植物を利用しており、その中に赤い花も含まれることがわかってきた。本研究は、寺井洋平（本専攻・助教）
・丑丸
敦（神戸大・教授）
・日下石碧（筑波大・博士研究員）との共同研究として実施している。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ･マクロ生物学（２単位、行動分野 集中講義）
2. 先導科学実習（２単位、実習）
3. 神経行動学特論 （１単位、集中講義）
 研究指導1. 秋山辰穂（副指導）「鱗翅目昆虫における視覚の多様性と環境適応：色覚の性的二型、日周環境への適応」
2. 南木悠（主指導）「野外におけるアゲハチョウの訪花特性」
 全学教育フレッシュマンコース (２単位、集中講義）研究者のための伝える技術 講義担当
 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
Kinoshita, M. and Stewart, JF. Retinal organization and visual abilities for flower foraging in swallowtail
butterflies (2020) Current Opinion in Insect Science 42: 76-83
 学会発表1. 南木悠・日下石碧・寺井洋平・丑丸敦史・木下充代，ナミアゲハの訪花の季節変化と性差．第 35 回 個
体群態学会，2020 年 11 月 京都 (オンライン開催)．
2. 南木悠・日下石碧・寺井洋平・丑丸敦史・木下充代，春から初夏におけるナミアゲハの訪花傾向：野外観
察と体表花粉の分析．第 68 回 日本生態学会，2020 年 3 月, 岡山 (オンライン開催)．
3. Arikawa K, Wakita D, Ilic M, Shibasaki H, Kinoshita M: Sequential wavelength information
processing in the optic lobe of a butterfly, Papilio xuthus. The 42nd Annual Meeting of the JapaneseSociety for Comparative Physiology and Biochemistry, Nov 2020, Yamagata
4. Cechetto C, Kinoshita M, Stewart F, Arikawa K: Chromatic contrast-sensitive medulla motion74sensitive neurons in a butterfly, Papilio xuthus. 日本動物学会第 91 回大会、2020 年 9 月 （オンライン
開催）
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1. アゲハチョウの視覚系と訪花行動 ― 実験室から野外へ ― 第 68 回生態学会大会 2021 年 3 月，岡山
（オンライン開催）
2. アゲハの高次中枢における波長情処理 第 23 回生理研研究会 視覚フォーラム 2020 年 9 月（オンライン開催）
 外部資金1. 先導科学研究科・共働プログラム萌芽的共同研究 「光環境と視覚システムの進化学的研究」研究代表
者：木下充代 (2018〜2020) 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本比較生理生化学会 将来計画委員
2. 日本比較生理生化学会 評議員
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
東京都３区において一般市民講座の講義を担当． 各講義名は以下の通り
文京アカデミア「動物の視覚世界 ― アゲハチョウの場合 ― 」

75

中央区サイエンスセミナー「動物の認知能力 ― アゲハチョウの視覚世界を知る ― 」
渋谷区 YouTube 講座「アゲハチョウが見ている世界 ― 動物の認知能力を測る ―」 学術誌編集活動
1. J. Comp. Physiol. A, J. Exp. Biol, Biol letters, Naturwisenshaften, Proc Royal Soci. B, Zool Letter,
PLOS one, J. Comp. Neurol, Behav Eco Soci 等の査読を行なった。
2. ISRN Zoology、Zoological Science、Frontier of Insect Science の Editorial Board を務めた。

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. ハラスメント相談（苦情相談）員・環境安全協議会オブザーバー
 部局委員会等への貢献
1. 学術情報基盤センター本部図書館専門部会の葉山図書委員を務めた。
 大学事業
該当なし

76

行動生物学分野
渡邊 崇之（助教： 神経行動学、神経遺伝学）
1. 研究テーマ

1. 性決定遺伝子 doublesex に依存した不完全変態昆虫神経系の性決定機構の解明
ショウジョウバエなどの進化的に後発な完全変態昆虫に属する昆虫は、神経系の性差を生み出す分子メカニズ
ムとして、転写因子である fruitless 遺伝子と doublesex 遺伝子に依存した２つの経路を有する。一方、コオロギなどの原始的な不完全昆虫に属する昆虫では fruitless 遺伝子は性決定に寄与しないことを明らかにしてきた。本研究は、コオロギを材料に doublesex 遺伝子に依存した性決定システムが不完全変態昆虫の脳・神経回路の性決定に寄与するという仮説を立証することを目的としている。これまでにコオロギ脳内で発現する

doublesex 遺伝子の機能解析を目的として、CRISPR/Cas9 システムを利用した doublesex 遺伝子の遺伝子破壊や、doublesex 遺伝座への蛍光タンパク質遺伝子の挿入による doublesex 発現細胞の可視化に取り組んできた。また、昆虫の doublesex 遺伝子の分子進化の解析から、コオロギの doublesex 遺伝子は他昆虫のものと異なる DNA 結合能や共役因子との結合能を有することを予想しており、この予想を裏付ける生化学的解析を準備している。今年度は、前所属の北海道大学から総合研究大学院大学への異動があったため、遺伝子破壊系統の作出や遺伝子挿入の予備実験、生化学的解析のためのタンパク質発現ベクターの構築などを進めた。来年
度は、遺伝子破壊系統を用いた RNA-seq 解析や遺伝子挿入系統の樹立、doublesex タンパク質の生化学的解析を進めていく予定である。
2. コオロギをモデルとした形態的多型に伴う行動多型の神経基盤の解明
多くの昆虫は集団密度に依存して形態的な多型を生じることが知られている。私の研究材料であるフタホシコ
オロギでは、幼虫期を単独で過ごした個体と集団中で過ごした個体で大サイズに明瞭な差が生じる。さらに、単独飼育群と集団飼育群には、成虫オス間の闘争行動の強度に差があることも報告されていた。本研究では単独飼育群と集団飼育群の闘争性の差を生み出す分子神経基盤について調査している。現在、佐倉緑准教授（神戸大学）と共同で、単独飼育群と集団飼育群の闘争性の差異についての行動学実験を進めており、これまでに幼虫期の集団密度に依存して、接触刺激に対する逃避行動に差異が生じることを見出している。加えて、この行動の差異の背景にある分子神経基盤を探る目的で、単独飼育群と集団飼育群の脳で発現する遺伝子群を網羅的に比較するトランスクリプトーム解析を試みたが、サンプル調整に不備があり RNA-seq 解析を実施するに至らなかった。来年度、詳細な行動学実験を実施するとともに、トランスクリプトーム解析を再度実施する予定である。
3. コオロギ脳で学習成立時に賦活化する生体アミン作動性神経細胞群の探索
複数の昆虫種で砂糖水の摂食が味覚中枢である食道下神経節内のオクトパミン作動性ニューロンを賦活化することが知られている。私はこれまでにコオロギを材料に神経活動マーカーを利用した全脳活動マッピング法を確立しており、この方法を利用して、砂糖水の摂食により食道下神経節の DUM1/2 オクトパミン作動性ニ
ューロン群が賦活化することを確かめている。現在、水波誠教授（北海道大学）と共同で、食道下神経節のオクトパミン作動性ニューロン群が古典的条件付けにおいてどのような機能を果たすかを調査している。水波誠77

教授は、これまで行ってきたコオロギを材料とした学習・記憶研究を通して、古典的条件付けが成立すると、
条件刺激（報酬としての砂糖水）の提示によってのみ賦活化するオクトパミン作動性ニューロン群が、無条件
刺激（匂い）の単独提示によって賦活化するはずだという仮説を提案している。全脳活動マッピング法を利用して、この仮説を検証することが本研究の目的である。今年度は学習実験を組み立てる上で必要な、神経活動マーカーの発現強度の経時変化を調査した。次年度は、報酬や罰の提示によって賦活化する神経細胞群の差異を調査し、学習成立前後で無条件刺激に対して応答する神経細胞群が異なるか否かを検討する予定である。
4. 成虫コオロギオス間の闘争行動に関与する生体アミン作動性神経細胞群の探索
成虫コオロギオス間の闘争行動は、オクトパミンやセロトニンなどの生体アミンにより制御されることが知られている。現在、佐倉緑准教授（神戸大学）と共同で、神経活動マーカーを利用した全脳活動マッピング法を利用して、闘争行動を制御すると考えられる生体アミン作動性神経細胞群を探索している。今年度、闘争行動
後のコオロギ脳で発現する神経活動マーカーの検出を試みたが、これまでに再現性の高い結果を得ることができていない。実験技術や染色条件の至適化が必要だと考えられる。また、現在、コオロギで利用可能な全脳活動マッピング法は遺伝子導入系統を利用する必要があり、飼育や行動学実験に制約がある。この制約を取り除くために、コオロギが内在して持つ初期応答遺伝子に対する抗体を準備した。来年度、この抗体が神経活動マーカーとして利用可能かを評価する予定である。
5. ゴキブリ目昆虫の性フェロモン受容体遺伝子の進化・多様性の解析
ゴキブリ目昆虫はペリプラノン誘導体を性フェロモンとして利用することが知られる。現在、渡邉英博助教（福岡大学）、水波誠教授（北海道大学）、西野浩史助教（北海道大学）と共同で、ワモンゴキブリの触覚で発現す
る性特異的な嗅覚受容体遺伝子の機能解析を実施し、性フェロモン受容体遺伝子の同定と機能解析を進めている。本研究では、先行研究で発表されたゴキブリ触角トランスクリプトームデータベースより解析対象となる遺伝子の配列を得て、RNAi 法による発現抑制実験と触角に存在する嗅覚受容感覚毛の電気生理学実験を組み合わせる（渡邊はデータベース解析と RNAi 実験を担当）。これまでに、嗅覚共役受容体遺伝子の解析や性フェロモン受容体候補遺伝子の解析を進めている。加えて、ワモンゴキブリ以外のゴキブリ目昆虫に本研究スト
ラテジーを拡張すべく、８種類のゴキブリ目昆虫の触角を対象としてトランスクリプトーム解析を実施する。
今年度、トランスクリプトーム解析に供する RNA サンプルの調整を進め、来年度に RNA-seq 解析を実施す
る予定である。

2. 教育
 担当授業
該当なし。
 研究指導該当なし。
 全学教育該当なし。
 他大学等における授業

78

1.

北海道大学にて非常勤講師として学生実習を担当（2020 年 4 月~2021 年１月、３時間 x 30 回）

3. 研究
 学術出版物
和文総説（査読あり）
1.

渡邊崇之 (2020) 「昆虫脳性分化機構の進化を探る： 不完全変態昆虫を材料とした研究から見えてきたこと」比較生理生化学 37 巻 2 号 p. 130-138

 学会発表
1. 立石康介、渡邊崇之、西野浩史、水波誠、渡邊英博：ワモンゴキブリの嗅覚共受容体(Orco)の同定と機能解析. 第 65 回日本応用動物昆虫学会大会、２０２１年３月、島根企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金1. 日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（C）「形態的可塑性とリンクした行動戦略の多型はどのような神経基盤により生じるのか？」研究代表者：渡邊崇之（2019〜2021 年度）総額 3,400 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招へいした外国人
該当なし
総研大国際共同学位プログラム構築支援経費にて招へいした外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

79

4. 社会貢献
 学会活動該当なし
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
1. Frontiers in Behavioral Neuroscience 編集委員
 学術誌査読活動
1. Frontiers in Behavioral Neuroscience
2. Frontiers in Behavioral Neuroscience
3. Frontiers in Behavioral Neuroscience
4. Communications Biology
5. BMC Genomics

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
該当なし
 部局委員会等への貢献
該当なし
 大学事業
該当なし

80

理論生物学分野
佐々木 顕（教授： 数理生物学、理論進化学）
1. 研究テーマ
2021 年度の研究テーマ：宿主・病原体系の多様化を伴う適応進化の一般理論や、「同所的・側所的・異所的種分化」の包括理論を可能にする「多峰分布量的形質遺伝学」(Oligomorphic dynamics)の論文を Sébastien Lion 博士(モンペリエ), Mike Boots 博士(UC バークレー)と共同研究している。佐藤正都博士（東大）、Ulf Dieckmann 博士(IIASA)とメタ個体群における移動分散や生産性の不均一性が病原体の毒性の進化にどのような影響を与えるかを研究している。これらの不均一性が常に病原体の毒性を増加させるという一般的な結論を既に得ている。その他、別所
和博博士（埼玉医大）と海洋での浮遊幼生の移動分散構造と局所適応進化の一般論について、海藻の「子育て」形質(gametophyte への投資)における「雌雄対立」の進化について、内海邑（日大）、佐藤正都博士と、共生系における
形質共進化が共生系を自滅させる一般的傾向について、伊藤洋博士（総研大）と適応進化する分類群の進化動態の解析により、辺境での生きた化石種の出現の必然性、分布中心での種分化ホットスポットの存在などについて、佐伯晃
一博士（東大）とウイルスの「細胞接触感染」(cell-to-cell infection)による多剤抵抗性の進化の促進について、
伊藤真利子博士（立教大）と動物やヒトの順次意思決定系における「集団知」の効率や「情報カスケード」（意思決定の独立性の喪失による集団知の劣化）リスクの評価について、鈴木清樹博士（総研大)と遺伝子組み換え作物(BI作物)への抵抗性出現を阻止するために国際的に採用されている強散布/保護区戦略の理論的な再検討について研究し
ている。

2. 教育
佐藤正都君（５年一貫博士課程５年生、2021 年 3 月学位取得）の博士論文研究主任指導：極限環境における熱水噴出孔群集における共生系の進化に関する数理モデルによる研究を指導。研究成果は佐藤を筆頭著者として
The American Naturalist 誌に受理、2021 年 3 月に掲載。メタ個体群構造のもとでの移動分散や生産性の非均一性のもとでの病原体毒性の進化についての共同研究のため、佐藤正都、Ulf Dieckmann(IIASA)、佐々木の３者の週１回のペースでオンライン打ち合わせを通じて国際共同研究の指導を行う。これらの研究成果を中心とした博士論文を提出
し、3 月に博士号取得。この博士論文研究の内容に関して SOKENDAI 賞（総合研究大学院大学博士論文学長賞）を受賞した。桑野友輔君(５年一貫博士課程２年生)の博士論文研究主任指導：数理生物学の基礎学力の習得とともに、変動環境下での蚊の休眠戦略、気温・湿度依存的な休眠打破戦略の進化モデルの構築や解析、先行研究との関連調査について研究指導した。
 担当授業
1. 数理生物学特論（３年ごと開講）
2. ミクロ･マクロ生物学（理論生物学）（毎年開講）
3. 生物統計学（毎年開講）
4. 統合生命科学シリーズ講義（毎年開講）
 研究指導1. 佐藤正都 （５年一貫博士課程５年生、主任指導）81

2. 桑野友輔 （５年一貫博士課程２年生、主任指導）

3. 研究
水平感染で共生者を獲得するサンゴ、地衣、マメ科植物根粒などの相利共生系において、必須代謝物生産に関する共生種間の「分業」の度合いの進化に関する新しい理論を提案し、定着先のハビタットで共生者を獲得できる確率と分業の度合いやパターンの関係などを解析し、Proc Roy Soc Lond B に掲載した(Uchiucmi U and Sasaki A, 2020 年 7月)。深海の熱水噴出口群集で１次生産者の役割を果たし、その相互依存性の強さでも知られる「ハオリムシと硫黄酸化細菌の相利共生系」の維持と進化の謎に関して、共生細菌による宿主ハオリムシの搾取の程度の進化が相利共生
系全体の進化を駆動することを見出し、長命の宿主の進化や、共生系の維持の条件、共生細菌の進化による共生系全体の崩壊の起こる条件などを数理モデルで明らかに、American Naturalist に掲載した(Sato M, Sasaki A. 2021 年
3 月)。投稿中の論文：コロナウイルスの不顕性感染の進化を感染４状態モデル（未感染性/感染性)x(未発症/発症)で解析する(Kumata, Sato and Sasaki, Viral Evolution)、抗原連続変異と病原体毒性の同時進化を Oligomorphic
dynamics で解析する(Sasaki A, Lion S, and Boots M, Nat Ecol Evol)、共生系と寄生系において進化的自殺の起こる条件(Uchiumi U, Sato M, and Sasaki A, Ecol Let)など。
 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Sato M, Sasaki A. Evolution and maintenance of mutualism between tubeworms and sulfur-oxidizing
bacteria. The American Naturalist 197(3) 351-365 (2021).
2. Uchiumi Y, Sasaki A. Evolution of division of labour in mutualistic symbiosis. Proceedings of the Royal
Society B: Biological Sciences 287 (1930) 20200669 (2020).
学術研究図書該当なし
 学会発表（同じテーマの複数発表は省く）
1. 佐々木 顕・進化疫学理論による COVID-19 パンデミックの流行と進化予測。日本生態学会第 68 回全国大会(2021 年 3 月、岡山)
2. 佐藤正都、Ulf DIECKMANN、佐々木 顕。メタ個体群における移動率や環境収容力の不均一性は強毒性の進化を常に促進する。日本生態学会第 68 回全国大会 (2021 年 3 月、岡山)
3. 内海 邑、佐藤正都, 佐々木顕。共生系における進化的心中。日本生態学会第 68 回全国大会 (2021 年 3 月、
岡山)
4. 熊田隆一、佐藤正都、佐々木 顕。新型コロナウイルスの潜伏期間の進化解析。日本生態学会第 68 回全国大会 (2021 年 3 月、岡山)
5. 別所和博、堀正和、佐々木 顕。ステージ構造を示す水産有用種のメタ個体群動態モデル。日本生態学会第68 回全国大会 (2021 年 3 月、岡山)
6. 桑野友輔、佐々木 顕。予測不能な季節変化における蚊の最適な休眠戦略。日本生態学会第 68 回全国大会(2021 年 3 月、岡山)
7. 佐々木 顕、佐藤正都、熊田隆一。日本における SARS-CoV-2 流行解析：実効再生産数 Rt と 23403A/G 系統
置換、Mobility Trends。日本数理生物学会大会（2020 年 9 月、名古屋）
8. 別所一博、大槻久、佐々木 顕。haploid-diploid 植物における子育ての進化についての数理的研究。日本

82

数理生物学会大会（2020 年 9 月、名古屋）
9. 伊藤 洋、佐々木 顕。適応度の汀線方程式は生きた化石の普遍性を示す。日本数理生物学会大会（2020 年
9 月、名古屋） 外部資金1. 科学研究費補助金・挑戦的研究（萌芽）「R0 中心性に基づく大規模階層ネットワーク上の流行動態・防除理論の新展開」研究代表 (2019-2020) 500 万円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招へいした外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献2020 年 1 月より、理論生物学の国際的基幹誌である Journal of Theoretical Biology の Editor in Chief を勤めている。日本科学技術振興機構(JST)「未来社会創造事業・共通基盤」の専門アドバイザーを 2019 年 6 月から継続している。日本学術振興会の科学研究費補助金事業に関しては、2020 年度以降は「国際強化(B)」の審査員を務めている。
2020 年 11 月の大学院説明会における学術講演会においてコロナウイルス関係の最近の研究成果について解説する講演を行う。みすず書房から刊行する W.D.Hamilton 著 Narrow Roads to Gene Land, Volume 1 の監訳が最終段階の作業に入った。
 学会活動
1. 日本進化学会幹事(2018-)
 学外委員会活動
1.

日本学術振興会特別研究員審査委員

2.

日本学術振興会特別研究員科学研究費補助金審査委員

3.

科学技術振興機構(JST)未来社会創造事業「共通基盤」の専門アドバイザー(2019-）

 アウトリーチ活動831. 2020 年 11 月の大学院説明会における学術講演会においてコロナウイルス関係の最近の研究成果について講演
 学術誌編集活動
1.

Journal of Theoretical Biology, Editor in Chief (2020-)

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 先導科学研究科研究科長
2. 運営会議委員、教育研究評議会評議員、危機管理委員会委員、ハラスメント相談員協議会委員、環境安全管理協議会委員長、財務マネジメント委員会会員、不正防止計画室会議委員、SOKENDAI 賞選考委員、発明委員会委員、知的財産室委員、学術情報基盤センター運営委員、情報セキュリティ委員、附属図書館運営委員。
 部局委員会等への貢献
1. 先導的共協プログラムワーキンググループ
 大学事業
該当なし

84

理論生物学分野
印南 秀樹（教授： 集団遺伝学、ゲノム進化学）
1. 研究テーマ
1. 遺伝学ベースのゲノム進化研究
ゲノムは生命体の設計図であり、これが突然変異によって変化すること、そしてそれが次世代に受け継がれることが、進化の源である。このプロセスを理論的に理解し、ゲノムデータを見ることによって、DNA レベ
ルの進化のメカニズムを解明する。

2. 教育
 担当授業1. 集団遺伝学（１単位、集中講義）
2. ミクロ･マクロ生物学（２単位、集中講義）
3. 副論文の書き方（１単位、集中講義）
4. 科学論文の書き方 （２単位、eLearning）
 研究指導1. 濱崎真夏 （主任指導）
2. 坂本貴洋 （主任指導）
 全学教育研究者のための"伝える"技術@フレッシュマンコース
 他大学等における授業
名古屋大学農学部

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Govindaraju, D., and H. Innan, 2020. Mutation load and aging. in Encyclopedia of Gerontology andPopulation Aging. doi.org/10.1007/978-3-319-69892-2_733-1
2. Innan, H., V. Reiner and D. Govindaraju, 2020. Genetic and epigenetic Muller’s ratchet as amechanism of frailty and morbidity during aging: a demographic genetic model. Hum. Genet. 139:
409-420.
3. Iwasaki, W. M., Kijima and H. Innan, 2020. Population genetics and molecular evolution of DNA
sequences in transposable elements. II. Accumulation of variation and evolution of a new subfamily.
Mol. Biol. Evol. 37: 355-364.

85

4. Govindaraju, D. R., H. Innan, and R. A. Veitia 2020 The Muller’s ratchet and aging. Trends in Genet.

36: 395-402.
5. Niida, A., T. Hasegawa, H. Innan, T. Shibata, K. Mimori, and S. Miyano 2020. A unified simulation
model for understanding the diversity of cancer evolution. PeerJ 8: e8842
6. Takahashi, K., and H. Innan, 2020. Duplication with structural modification through extrachromosomal
circular and lariat DNA in the human genome. Sci. Rep. 10: 7150.
7. Sakamoto, T. and H. Innan, 2020. Establishment process of a magic trait allele subject to both divergent
selection and assortative mating. Theor. Popul. Biol. 135: 9-18.
8. Sugihara, Y., Darkwa, K., Yaegashi, H., Natsume, S., Shimizu, M., Abe, A., Hirabuchi, A., Ito, K.,
Oikawa, K., Tamiru-Oli, M., Ohta, A., Matsumoto, R., Paterne, A., De Koeyer, D., Pachakkil, B.,
Yamanaka, S., Muranaka, S., Takagi, H., White, B., Asiedu, R., Innan, H., Asfaw, A., Adebola, P., R.
Terauchi 2020. Genome analyses reveal the hybrid origin of the staple crop white Guinea yam(Dioscorea rotundata). Proc. Natl. Acad. Sci. USA 117: 31987-31992.
9. Sakamoto, T., and H. Innan, 2021. Establishment of a new sex-determining allele driven by sexuallyantagonistic selection. G3 11:1-14.
10. Innan, H., and T. Sakamoto, 2021. Multi-dimensional diffusion process of allele frequencies in
population genetics. Proc. Jpn. Acad. Ser. B. 97: 134-143.
11. Fawcett, J. A., H. Innan, T. Tsuchiya, and F. Sato, 2021. The effects of the first and last mating age on
the relationship between the advancing age and reproductive performance of Japanese Thoroughbred
broodmares. J. Equine Sci. in press.
12. Sakimura S, Nagayama S, Fukunaga M, Hu Q, Kitagawa A, Kobayashi Y, Hasegawa T, Noda M,
Kouyama Y, Shimizu D, Saito T, Niida A, Tsuruda Y, Otsu H, Matsumoto Y, Uchida H, Masuda T,
Sugimachi K, Sasaki S, Yamada K, Takahashi K, Innan H, Suzuki Y, Nakamura H, Totoki Y, Mizuno
S, Ohshima M, Shibata T, Mimori K. 2021. Impaired tumor immune response in metastatic tumors is aselective pressure for neutral evolution in CRC cases. PLoS Genet. 2021. 17:e1009113.
13. Innan, H., D. Vaiman, and R. A. Veitia, 2021. Predictable increase in female reproductive window: A
simple model connecting age of reproduction, menopause and longevity. BioEssays in press
14. サラブレッドの競走能力と遺伝子 生物の科学 遺伝 ２０２０ （査読なし）
学術研究図書該当なし
 学会発表
学会発表
1. 坂本貴洋、印南秀樹 ２０２０年９月 日本数理生物学会 名古屋
企画したシンポジウム等なし

86基調講演・招待講演なし
 外部資金
1. 科研費 基盤 B セントロメア進化のミステリーを解き明かす（代表） ８４５万
2. 国際水産資源変動メカニズム等解析事業共同研究（代表） ３８０万
3. ゲノム情報によるマアジ太平洋系群等の集団遺伝学解析研究委託（代表） ４３５万
4. 競走馬生産育成研究助成事業 競走馬生産育成向上のための遺伝子診断法の開発（代表） ３００万
5. 理研 iThems 共同研究（代表） ７００万
6. 先導研共働プログラム 競走馬生産における遺伝子診断の導入（代表） ４８０万
7. 寄付金 サラブレッドゲノム（代表） ２００万
8. AMED 老化リボソームの実体解明と機能強化による健康寿命の延長（分担） ３００万
9. 集団ゲノミクスを用いた社会性進化の解析（分担） ８０万
10. The role of non-allelic gene conversion in the evolution of Transposable Elements（分担） １０万
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本学術振興会 特別研究員等審査会委員・専門委員
2. 日本遺伝学会の評議員
 学外委員会活動なし
 アウトリーチ活動

87

なし
 学術誌編集活動
1. Journal of Theoretical Biology, Associate Editor
2. Genes and Genetic Systems, Associate Editor

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 苦情処理相談員
 部局委員会等への貢献
1. 情報セキュリティ委員会
2. 情報セキュリティ専門委員会
3. 情報システム専門委員会
4. 学術情報基盤センター本部図書館専門部会
5. 財務マネージメント委員会
 大学事業1. 学術情報基盤センター長
2. 図書館長

88

理論生物学分野
大槻 久（准教授：理論生物学、進化ゲーム理論）
1. 研究テーマ
1. 変動環境下での病原体の適応戦略の解明
変動環境下では自らにとって有利なタイミングで感染・増殖をする病原体が有利となる。女性の体は女性ホルモンに関する変動環境を提供する一方で、男性は恒常的環境であるとみなすことができるので、性特異的な病態が進化する可能性がある。そこで潜伏期間(latency)をウイルスの進化形質とした進化モデルを構築
し、性特異的な潜伏期間が進化する条件を探った。その結果、女性ホルモンの平均レベルが男女間で異なっていることは性特異的な潜伏期間の進化には全く寄与せず、女性体内でのホルモンレベルの振動こそが性特
異的潜伏期間の進化に強く影響することを見出した。
2. 集団内順位と学習傾向に関する研究
順位制の存在する集団では劣位個体が個体学習(trial-error 型の、新規行動獲得のための学習）に多く投資する傾向が見られる。他者の行動を見様見真似で獲得する社会学習のコストが小さいのに対し、個体学習のコストはそれより相対的に大きいため、個体学習の進化は進化的なパラドックスであった。そこで劣位個体による個体学習は優位個体に勝つための代替戦術であるという仮説を提唱し、この仮説を数理モデルで検証した。解析の結果、仮説は支持され、劣位個体が集団の累積的文化進化に寄与していることを見出した。
3. 時空間的に異質な環境下での分散率の進化
昨年度は空間的に異質なパッチ状の集団での分散率の進化、および分散形質の進化的分岐条件を調べた。今
年度は空間的異質性に加えて時間的にもパッチの質が変動する場合にモデルを拡張し、分散率の進化等の解析を開始した。解析は中途段階にあるが、空間的異質性だけでは分散率は一般的に低下するが、時間的異質性があると必ずしもそうとは限らないことを見出した。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロマクロ生物学（社会生物学）（２単位授業の一部、集中講義）
2. 統合進化学（２単位授業の一部、集中講義）
3. 先導科学実習（プログラミング基礎）（２単位授業の一部、集中講義）
 研究指導1. 大家 岳（主任指導）

2. 藤木 信穂 （副指導）3. 西山 久美子 （副指導）4. 佐藤 正都 （副指導）5. 壹岐 朔巳 （副指導）896. 西條 未来 （副指導）7. 桑野 友輔 （副指導） 全学教育
該当なし
 他大学等における授業
1. 東京大学教養学部前期課程非常勤講師「適応行動論」（学部 1,2 年生向け） 2020.4.6 – 2020.7.13

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Ohtsuki, H., Rueffler, C., Wakano, J.Y., Parvinen, K. & Lehmann, L. "The components of directionaland disruptive selection in heterogeneous group-structured populations." Journal of Theoretical
Biology, (2020) 507, 110449, doi.org/10.1016/j.jtbi.2020.110449
2. Nagawsawa, M., Mogi, K., Ohtsuki, H. & Kikusui, T. "Familiarity with humans affect dogs’ tendencies
to follow human majority groups." Scientific Reports, (2020) 10, 7119, doi:10.1038/s41598-020-640585
学術研究図書該当なし
 学会発表学会発表
1. 大槻 久、Claus Rueffler、Joe Yuichiro Wakano、Kalle Parvinen、Laurent Lehmann "血縁度と繁殖価を用いた自然選択の分解定理について" ゲーム理論ワークショップ 2021 （オンライン参加）
2021.3.9
2. Hisashi Ohtsuki "Evolution of coordinated cooperation" Eurasian Summit for Models of Society 2021
（オンライン参加） 2021.3.2
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1. 大槻 久 "ヒトの社会性の起原に関する理論的展開" 東京外国語大学アジア・アフリカ研究所「社会性の起原と進化：人類学と霊長類学の協働に基づく人類進化理論の新開拓」定例研究会（オンライン開催）
2021.2.13
2. 大槻 久 "協力の起源と維持機構―その進化生物学的考察―" 国立民族学博物館共同研究会 カネとチカラの民族誌：公共性の生態学にむけて（オンライン開催） 2020.7.4

90 外部資金
1. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 C「進化動態理論の統合による自然選択の複合的理解：進化
ゲーム・血縁・繁殖価を軸として」研究代表者 大槻 久（2020-2022）2020 年度総額 300 千円（直接経費）
2. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 S「集合行動の認知・神経・生態学的基盤の解明」（代表：亀田達也）研究分担者 大槻 久（2016-2020）2020 年度分配金総額 300 千円（直接経費）
3. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 B「「こころを想定するこころ」の進化と発達：「心理化傾向」仮説に基づく統合的検討」（代表：橋弥和秀）研究分担者 大槻 久（2019-2023）2020 年度分配金総額
350 千円（直接経費）
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本人間行動進化学会 常務理事
2. 日本数理生物学会 運営委員
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
1. 中央区民カレッジ『総研大講師陣がおくるサイエンスセミナー』 「進化が紡ぐ生き物の協力」築地社
会教育会館 2 階講習室 2020.11.21
2. 文京アカデミー 総合研究大学院大学講師陣による『科学探求講座』 「生物界の協力とその成り立
ち」アカデミー文京 地下 1 階学習室 2020.11.21

91

 学術誌編集活動
1. Faculty member, Faculty of 100 (Theoretical Biology)
2. Reviewing Editor, Journal of Evolutionary Biology
3. Editorial Board, Journal of Theoretical Biology
4. Associate Editor, Theoretical Population Biology

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 部局情報セキュリティ委員会（部局技術担当者）
 部局委員会等への貢献
1. 教務担当
2. オリエンテーション担当
3. ハラスメント総合窓口担当
4. プリンタ、スキャナ、学生パソコン管理担当
5. サーバ管理担当
 大学事業
該当なし

92

理論生物学分野
宅野 将平（助教： ゲノム進化学・エピジェネティクス）
1. 研究テーマ
1. 遺伝子ボディ領域における DNA メチル化の進化パターンの解明
被子植物 5 種、裸子植物 1 種において、遺伝子転写領域の DNA メチル化状態が遺伝子発現に与える影響を明らかにした。また、DNA メチル化状態が遺伝子配列進化に及ぼす影響を明らかにした (カリフォルニア大
学 Gaut 教授との共同研究)。
2. 雑種強勢におけるエピジェネティクス機構の役割
シロイヌナズナやハクサイにおける雑種強勢の役割の解明を行った(神戸大学藤本准教授との共同研究)。
3. マカクの種分化機構に関する研究
スラウェシマカクの種分化プロセスの解明を行なった (生命共生体進化学専攻寺井洋平助教との共同研究)。
4. タルホコムギにおける集団遺伝学的研究
タルホコムギの種内変異のパターンを明らかにした (福井県立大学松岡准教授との共同研究)。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロマクロ生物学（総括、集団遺伝学（自然選択）を担当、２単位、集中講義）
2. 先導科学実習（プログラミング実習を担当、２単位、集中講義）
3. 先導科学特論 XVI (エピジェネティクス・ゲノム進化学特論、２単位、集中講義)
 研究指導1. 濱崎真夏（副指導）2. 坂本貴洋（副指導） 全学教育1. フレッシュマンコース（研究者のための伝える技術：ライティングを担当、２単位、集中講義）
 他大学等における授業

該当なし
3. 研究
 学術出版物

93原著論文（査読あり）
1. N. A. Espinas, L. Furci, Y. Shimajiri, Y. Harukawa, S. Miura, S. Takuno, H. Saze (2020).
Transcriptional regulation of genes bearing intronic heterochromatin in the rice genome.
PLoS Genetics 16, e1008637.
学術研究図書該当なし
 学会発表該当なし
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
該当なし

 外部資金1. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（B）「アポミクシス形質を獲得してクローン胚を形成するコムギの作出と関連遺伝子の同定」 研究分担者 (2019-2023) 総額 4,000 千円
2. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（B）「アブラナ科野菜の雑種強勢発現機構の解明」 研究分担者 (2019-2021) 総額 1,500 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞

94

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本エピジェネティクス研究会
2. 日本遺伝学会
 学外委員会活動
該当なし
アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
該当なし

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
該当なし
 部局委員会等への貢献
該当なし
 大学事業
1. 英語広報2. 専攻ウェブサイト、SNS、計算機サーバ管理者

95

96

科学と社会分野
伊藤 憲二（准教授： 科学史）
1. 研究テーマ
1. 「日本における高エネルギー物理学の成立とその社会文化的背景、1955-1971」
本研究の目的は、日本における高エネルギー物理学の成立を、物理学の内的な発展と同時に、社会文化的背景から理解することである。今年度は文献調査を中心に、核物理学をめぐる外交的な側面についての研究を進めた。
2. 「仁科芳雄の伝記的研究」
仁科芳雄は、戦前から戦後の日本の物理学において大きな役割を果たした。上記の戦前日本の原子物理学の成立についての研究における重要な研究対象であった、その研究成果の発表の一環として、仁科芳雄についての伝記的著作を準備している。本年度は全 41 章のうち 39 章まで終了した。
3. 「占領期日本の科学技術政策の再検討」
Bowling Green State University の Walter Grunden 博士および SUNY Brockport の Takashi Nishiyama
博士と共同研究により、占領期日本のＧＨＱによる科学技術政策を見直す研究を行っている。
4. 「日本における科学者の成立」
Cardiff University の Ruselle Meade 博士および Ian Rapley 博士と共同で、日本における「科学者」というカテゴリーの成立に関する共同研究を行っている。
5. 「核外交の史的研究」
先導科学共働プログラムによって開催された国際シンポジウムをきっかけとして始まった共同研究である。
National Technical University of Athens の Maria Rentetzi 教授と、核開発の歴史研究を、外交と核物質・装置に焦点をおいて研究している。二つの学術雑誌に特集号を出版予定であり、掲載予定の論文のうち、二本を除くすべてがアクセプトされ、校正に入った。伊藤による単著論文が二本、共著論文が二本掲載予定であり、そのうち二本は研究科報執筆時点でオンライン出版された（以下の業績リストには含めていない）。
6. 「学術雑誌の歴史的研究」「フレッシュマンコース」における「研究の社会史」の授業のための基礎研究として、学術雑誌の歴史についてのレビューと独自研究を行っている。
7. 「グローバル時代の認識論」
グローバルな観点からの認識論についてのハンドブックの執筆チームに加わり、日本を例とした知識生産のグローバル化についての理論的な研究を行っている。本年度にアクセプトされ、最終稿を提出した。

97

8. 「日本における女性科学者の誕生についての系統的研究」
古川安先導科学研究科客員研究員を研究代表者とする科研費研究プロジェクトである。初年度の本年度は文献調査を中心に進めた。

2. 教育
 担当授業
1. フレッシュマンコース（「研究の社会史」担当）
2. 科学と社会副論文入門（共同担当）
3. 科学技術社会論入門（本年度は開講せず）
4. 科学技術社会論特論（本年度は開講せず）
5. 科学・技術と社会Ⅱ（共同担当）
 研究指導1. 藤木信穂 （主任指導）
 全学教育1. フレッシュマンコース（共同担当）担当授業と重複
2. 科学・技術と社会 II（共同担当）担当授業と重複 他大学等における授業
該当なし。

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
該当なし
学術研究図書1. 伊藤憲二「専門知と社会：科学論の「第三の波」論とそのゆくえ」松本三和夫編『科学社会学』東京大学
出版会、2021 年 2 月、55－78 頁．
．
2. 伊藤憲二「仁科芳雄と日独青年物理学者たち（三）：K・ビルスと戦前日本の外国人研究者（後編）」『窮理』17 号、2020 年 12 月、57－65 頁．
3. 伊藤憲二「学術会議の問題、安易な「民営化」が解決策にならないと言える理由：専門知と民主制はどうあるべきか」『現代ビジネス』2020 年 10 月、https://gendai.ismedia.jp/articles/-/76358
4. 伊藤憲二「仁科芳雄と日独青年物理学者たち（三）：K・ビルスと戦前日本の外国人研究者（前編）」『窮理』16 号、2020 年 12 月、56－63 頁．
5. 伊藤憲二「仁科芳雄と日独青年物理学者たち（二）：W・クロルと台湾」『窮理』15 号、2020 年 12 月、
54－63 頁．
 学会発表

98

学会発表
該当なし
企画したシンポジウム等
1. Webinar (online workshop series): Negotiating Radiation Protection. Co-convener with Maria
Rentetzi, Angela Creager, Susan Lindee.
基調講演・招待講演
1. Kenji Ito, “Transnational Scientific Advising: The Occupied Japan, the United States National
Academy of Sciences, and the Establishment of the Science Council of Japan.” The 3rd Meeting ofAsia in History of Science Diplomacy. March 12, 2021 (Online seminar series).
 外部資金1. 科学研究費助成事業・基盤研究(C)日本における高エネルギー物理学の成立とその社会文化的背景、1955‐
1971(研究代表者）
2. 科学研究費助成事業・基盤研究(C)日本における女性科学者の誕生についての系統的研究（分担研究者）
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
1．１４回日本科学史学会論文賞（日本科学史学会）伊藤憲二「竹内時男と人工放射性食塩事件：1940 年代
初めの科学スキャンダル」『科学史研究』288 号（2019 年 1 月号）、266-283 頁に対して．

4. 社会貢献
 学会活動
1. Engaging Science, Technology, and Society, Editorial Board member 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動

99

1. NHK インタビュー2020 年 10 月 13 日（2020 年 10 月 14 日 NHK ニュースおよび『NHK オンライン』で報道）
2. 共同通信社インタビュー2020 年 10 月 16 日（2020 年 11 月 1 日『中国新聞』等で報道）
 学術誌編集活動
1. Engaging Science, Technology, and Society, Editorial Board member
2. History and Technology, Guest Editor
3. Centaurus, Guest Editor

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. フレッシュマンコース実施委員会
 部局委員会等への貢献
1. 入試広報委員会
2. 先導科学共働プログラムワーキンググループ
3. 科学と社会ワーキンググループ
4. 先導科学研究科特定有期助教（科学と社会分野）選考委員会
 大学事業
該当なし

100

科学と社会分野
飯田 香穂里（准教授：科学技術史）
1. 研究テーマ
1. 日本の生物医学と放射線との関係についての歴史学的研究
主に 1945-1960 年の間、日本の生物・医学系研究者が放射線の健康影響に関する問題をどのように扱ったのか、また一方で原子力平和利用をどのように推進したのかについて調査を行っている。今年度は、感染症の影響で新たな調査に行くことができなかったが、昨年度に引き続き、原爆傷害調査委員会（ABCC）とその周辺の日本の医学者コミュニティの関係について手元にある資料で調査を進めた。
2. 遺伝学史関連資料整理
引き続き、国立遺伝学研究所所蔵資料の調査・整理を行い、研究所設立期の資料の一部をデジタル化した（国立遺伝学研究所共同研究）。
3. 日本の集団遺伝学史
昨年度に引き続き、木村資生を中心とする日本の初期の集団遺伝学者のネットワークについて分析を進めた（JSPS 特別研究員との共同研究）。
4. 戦後日本の遺伝学史
小麦の遺伝学者木原均が 1950 年代後半から 1960 年代にかけてアメリカのロックフェラー財団から支援を受けて行った稲の研究について、調査・分析を行った。戦時中の木原の研究からの連続性とアジア地域との関連を視野に論文をまとめ、出版した。

2. 教育
 担当授業
1. 科学と社会副論文入門 （１単位；分担）
2. フレッシュマン・コース「研究者と社会」（秋１単位；分担）3. 科学・技術と社会Ⅱ （１単位；分担） 研究指導【副論文指導担当】
1. 安家 叶子
2. Xiayire Xiaokaiti
3. 青野 圭4. 西條 未来101 全学教育
1. フレッシュマン・コース（上記参照）
 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
1.

Iida, K. Postwar reconstruction of Japanese genetics: Kihara Hitoshi and the Rockefeller Foundation rice project inCold War Asia. Historia Scientiarum 30 no.3 (2021): 176-194.

2.

Iida, K. Introduction: Transformation of East Asian scientific community through wartime to the Cold War: Casesfrom the bioscience fields. Historia Scientiarum 30 no.3 (2021): 135-137.

学術研究図書該当なし
 学会発表学会発表
該当なし（感染症の影響で中止）企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演「原爆傷害調査委員会と日本の科学者コミュニティー：被爆地におけるそれぞれの『原子力平和利用』運動」第 230 回広島大学平和センター研究会、2021 年 3 月（オンライン開催）.
 外部資金1. 平成３０−令和２年度科学研究費（日本学術振興会）基盤研究（C）研究テーマ「『原子力の平和利用』キャン
ペーン：アイソトープと医学・生物学者の役割」総額 3,250 千円（研究代表）.
2. 平成２９−令和２年度科学研究費（日本学術振興会）挑戦的研究（開拓）「日本の学術体制史研究：研究基盤となる日本学術会議資料整備と研究環境構築の検討」総額 18,330 千円（分担）.
3. 2020 年度放射線災害・医科学研究拠点共同研究（重点⑤）研究テーマ「ABCC/RERF 関連資料を利用した放射線災害による健康影響研究史の基礎的研究」200 千円（研究代表）.
4. 2020 年度大学共同利用機関法人情報・システム研究機構国立遺伝学研究所共同研究（Ａ）91 千円（分担）.
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし

102

総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
Jean-Baptiste Grodwohl（英国・ケンブリッジ大学、研究員、2019/11~2020/07）
JSPS 外国人特別研究員（欧米短期）「進化中立説とその学派の歴史：木村資生と日本の集団遺伝学の形成について」共同研究を行った。
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本科学史学会生物学史分科会 生物学史研究 編集委員会
2. 日本科学史学会 欧文誌 Historia Scientiarum 編集委員会
3. 日本科学史学会編『科学史事典』（丸善）編集委員
4. American Philosophical Society, The Mendel Newsletter 編集委員
 学外委員会活動
1. 上記参照 アウトリーチ活動
1. （執筆）「社会への負の影響大きい 学術会議問題」（共同通信配信）信濃毎日新聞 2020 年 11 月 6 日他.
2. （講演）「ダーウィンと『種の起源』」渋谷ハチコウ大学（渋谷区）、アカデミー文京（文京区）2021 年 2月（それぞれ映像とオンライン）.
3. （取材協力）「被爆者らに放射性物質注入 幻の原子力平和利用 1950 年代 広島、長崎 日米共同研究の経緯判明」（共同通信配信）長崎新聞 2020 年 8 月 5 日他；「米内部文書をもとに解明、『日本たばこ』戦略」しんぶん赤旗 2021 年 2 月 24 日.たばこ関連で他 2 本.
 学術誌編集活動
1. 上記参照

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 学術情報基盤センター本部図書館専門部会

103

2. 附属図書館運営委員会電子資料専門部会
3. ハラスメント防止委員会
 部局委員会等への貢献
1. 図書委員
2. ハラスメント総合窓口
 大学事業
特になし

104

科学と社会分野
水島 希（助教： 科学技術社会論、科学技術とジェンダー）1. 研究テーマ
1. 原子力災害後の市民放射能測定
2011 年の福島第一原子力発電所事故の後、全国で生じた母親らを中心とした放射能測定運動の歴史的、社会技術的研究を行っている。本年度は、先導研・先導科学共働プログラムの助成（延長）を受けたベルギー・
日本共同研究グループで、日本における放射能市民測定の歴史的背景、及び現在の国際動向を踏まえた日本
における「市民科学」の受容に関する論文を執筆、出版した（日本語、共著、査読あり）。
また本年度は「災害時における女性たちの対応と科学技術」という枠組みから、コロナ禍におけるマスク
制作活動を分析し、さらにそれを（女性が多く関わっている）市民放射能測定運動へと広げる試みを行なった。コロナ禍におけるマスク制作のジェンダー分析に関しての論文（日本語、共著、査読なし）を出版し、放射能測定―マスク制作のジェンダー分析論文を現在投稿中である（英語、共著、査読中）。
2. フェミニズム科学論研究
科学技術が女性の生活に及ぼす影響やジェンダー役割等との相互作用を、特に女性運動で培われてきた理念
やフェミニズム理論から分析を行う。本年度は、Karen Barad を中心に新マテリアル・フェミニズムの理論的基盤の研究を行なった（論文準備中）。
3. コロナ禍における科学コミュニケーション
科学コミュニケーションに関する専門家有志の会「新型肺炎サイコムフォーラム」に参加し、そこで行われた科学コミュニケーションの取り組みについて storytelling 概念を用いた分析を共同研究にて行い、原著論文として刊行した（英語、共著、査読あり）。

2. 教育
 担当授業
1. 科学技術と社会Ⅱ（「科学と社会」分野教員合同、１単位）
2. 生命科学と社会Ⅰ（「科学と社会」分野教員合同、１単位）
3. 生命科学と社会Ⅱ（「科学と社会」分野教員合同、１単位）
4. 科学技術社会論Ⅰ（１単位）
5. 社会調査法（１単位） 研究指導1. 西山久美子（副論文修了、投稿論文準備中）
2. 杉田あき（副論文修了、投稿論文準備中）
3. 南木悠（2020 年度・副論文終了）
4. 壹岐朔巳（2020 年度・副論文終了）1055. 高畑優 他大学等における授業1.

東京医科歯科大学教養部 担当授業科目：「科学と社会」（後期、2 単位）2.

東京都立神経病院看護科 難病看護ジェネラルコース 担当授業科目：「生命倫理/医療倫理」（集中講義とグループワーク）（令和 2 年 10 月 30 日実施）

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. ミヒェル・ヴァン・アウドヒュースデン，ヨーク・ケネンス, 吉澤剛，水島希，イネ・ヴァン・ホーイヴィーヒェン, 「原子力をめぐる科学技術イノベーションガバナンスへの道─福島原発事故後の市民科学に関する日本-ベルギー共同研究プロジェクトからの示唆」, 『科学技術社会論研究』, 第 18 号, pp.58–73,
2020.
2. Igarashi, Y., Mizushima, N. and Yokoyama, H. M. ‘Manga-based risk communication for the COVID19 pandemic: a case study of storytelling that incorporates a cultural context’. JCOM 19 (07), N02.
2020. https://doi.org/10.22323/2.19070802.
原著論文（査読なし）
1.

水島希, 山崎明子. 「手作りマスクが再編するジェンダー秩序－手仕事と科学の狭間で－」, f visions,no.1, pp.23-29, 2020. （英語版：Mizushima, N. and A. Yamasaki. 2021. “The reconfiguration of thegender order through handmade masks: Between handwork and science, ” Voices from Japan(English edition of f visions), No.35, pp.34–43.）

学術研究図書該当なし
その他
1.

原塑, 水島希, 東島仁, 石原孝二., 「市民科学、医学・臨床研究への市民参画と当事者研究の相互関係を考える」, 『科学技術社会論研究』, 第 18 号, pp.9-32, 2020.

 学会発表学会発表
1. 水島希「日本の科学—社会関係とジェンダー：手作りマスクと市民放射能測定を事例に」, 2020 年度科学技術社会論学会年次学術大会, オーガナイズドセッション『コロナ禍の市民科学：市民はパンデミックへの対策にいかに関与しうるか』, 2020 年 12 月 5 日（神戸大学、オンライン）
企画したシンポジウム等
1.

オーガナイズドセッション『コロナ禍の市民科学：市民はパンデミックへの対策にいかに関与しうるか』1062020 年度科学技術社会論学会年次学術大会（2020/12/5-6）,オーガナイザー：水島希
発表者：
水島希（総合研究大学院大学）「日本の科学—社会関係とジェンダー：手作りマスクと市民放射能測定を事例に」
網盛一郎（東京大学）「コロナ禍における大学発スタートアップの布マスク・医療用防護服生産とその意
義」
ヨーク・ケネンス（ルーヴェン・カトリック大学）「新型コロナウイルス感染症と向き合う DIY 活動：ベルギーにおける手作りマスクの市民運動」
上田昌文（NPO 法人市民科学研究室）「市民科学は感染症（拡大）予防に寄与できるか」
ディスカッサント：吉澤 剛（オスロ都市大学）、一方井 祐子（東京大学）
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金
1. 科研基盤研究（Ｃ）,「放射能市民測定運動におけるフェミニスト・スタンドポイント研究」（研究代表者：水島希, 2018 年度～2021 年度）
2. 科研基盤研究（Ｃ）,「日本における女性科学者の誕生についての系統的研究」（研究代表者：古川安・総合研究
大学院大学・客員研究員, 研究分担者：伊藤憲二・総合研究大学院大学・准教授, 水島希・総合研究大学院大学・助教, 2020 年度～2023 年度）
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動該当なし

107

 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
1. 科学コミュニケーションに関する専門家有志の会「新型肺炎サイコムフォーラム」での活動
 学術誌編集活動
該当なし

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 葉山内委員会：「人間を対象とする研究倫理審査委員会」委員
 部局委員会等への貢献
該当なし
 大学事業
該当なし

108

科学と社会分野
大西 勇喜謙（助教： 科学哲学）
1. 研究テーマ
1. 自然種と科学的実在論論争との関連について
化学物質から生物、疾患にいたるまで、科学では様々な分類体系が用いられており、理論による現象の予測・説明・操作能力は、部分的にはそれらの分類が世界を「正しく」捉えていることが原因と考えられる。
そうした「自然な」分類体系は、人為的・恣意的な分類と対比してしばしば自然種と呼ばれ、古くから哲学
的分析の対象となってきた。本研究では、Davide Serpico 氏とともに、そうした自然種に関する近年の有力な説の一つである恒常的性質クラスター説（Homeostatic Property Cluster theory; HPC theory）への代表的な批判や対案を比較検討したうえで、自然種に関する実在論の主張可能性について考察した。2020 年度はその成果をまとめ、ドイツ科学哲学会の国際誌へ発表した。
2. データ同化についての科学哲学的分析
気象学や海洋学においては、近年、データ同化と呼ばれる、データを用いてシミュレーションモデルの精緻化などを行う手法が盛んに用いられるようになってきており、他の諸分野においてもさらなる応用が期待されている。2020 年度は、コロナの影響もあり海外での滞在研究や研究会の開催ができず、主に関連文献の調査にあたった。
3. 深層学習を用いた研究の科学的実在論論争への含意に関する研究
ディープ・ニューラルネットワーク（DNN）と呼ばれる機械学習技術は 2012 年頃を境に急激な発展を遂げており、基礎研究から応用研究まで、幅広く科学研究の手法として用いられるようになってきている。本研
究では、DNN を用いた研究の、科学的実在論論争への含意について考察している。2020 年度は論文の大まかな構想をまとめ、執筆を進めた。
4. 科学的実在論論争における観察装置の位置付けに関する調査
歴史上、顕微鏡や望遠鏡などの新たな観察装置が登場した際には、未知の世界に関する知識を生産する装置としての信頼性が議論されてきた。本研究では、そうした観察・視覚化装置について、科学的実在論論争との関連から分析を行なっている。2020 年度は、各種電子顕微鏡の開発史を専門とする研究員を雇用し、予備的な事例調査を行なった。

2. 教育
 担当授業
1. 副論文入門（共同担当）
2. 科学・技術と社会 II （共同担当）

109 研究指導（副論文担当）
1.

濱崎真夏

2.

坂本貴洋

3.

桑野友輔

4.

山川真徳

 全学教育1.

フレッシュマン・コース「研究者と社会」前期・後期（共同担当）

 他大学等における授業
1. 東京電機大学にて「研究者倫理」（前期 12 コマ）

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
Yukinori Onishi and Davide Serpico (Co-first). “Homeostatic property cluster theory without homeostaticmechanisms: Two recent attempts and their costs.” Journal for General Philosophy of Science, 2021
(Online first).
学術研究図書該当なし
 学会発表学会発表
該当なし
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金1. 日本学術振興会 科学研究費 若手研究「科学的表象理論に基づく『データのモデル』の分析と科学的実在論論
争への含意の検討」2018-2020 年度. 総額 3,250 千円 （研究代表）
2. 日本学術振興会 科学研究費 基盤 B「 科学的実在論論争の歴史的パースペクティブ上での再検討」2018-2020
年度. 総額 7,930 千円 （分担） 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員

110

該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動該当なし
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
該当なし

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 教務係
2. 助教選考委員
 部局委員会等への貢献
該当なし
 大学事業
該当なし

111

112

共同利用機器支援事業担当
松下 敦子（講師： 神経解剖学・微細形態学）
1. 研究テーマ
1.

昆虫視覚第一次中枢の比較形態学的研究（学内共同研究）
これまでのナミアゲハの視覚第一次中枢（視葉板）の連続電顕画像によって得られた知見に加え、比較形態学の観点から他の昆虫（スズメガ、ツチイナゴ）の視葉板についても、試料調製を行って連続電顕画像を得た。
本研究は本学蟻川謙太郎教授の昆虫視覚系の比較形態学プロジェクトの一環である。

2.

チョウ類神経叢サイズの種間比較（学内共同研究）
脳を構成する個々の領域（神経叢）の大きさはその種の生態的背景（季節型、雌雄など）を反映しているといえる。これを指標にして数種のチョウ類の脳を蛍光抗体を用いて共焦点顕微鏡観察を行った。今回は嗅覚第一次中枢である触角葉を構成する糸球体の大きさに注目した。その結果、モンキアゲハやアオスジアゲハのメスに特異的に大きな糸球体があり、これはナミアゲハの知見と共通していることがわかった。本研究は本学木下充代准教授のチョウ類の脳地図作成プロジェクトの一環である。

3.

ゴキブリ触角葉における性フェロモン応答に関わる神経回路の免疫組織化学的研究（共同研究）
ゴキブリの匂い源定位のメカニズムを明らかにするため、ゴキブリ触角葉の性フェロモン特異的糸球体における、感覚神経と二次神経（S, L タイプ）とのシナプス接続を、免疫組織化学的手法を用いて探索した。これまでに感覚神経と二次神経の二重標識を試みてきたが、標識効率をさらに上げるためにこれまでの染色手法の改良を試みた。本研究は西野浩史博士（北海道大学・助教）との共同研究として実施している。

4.

弱電気魚中脳における電気受容神経経路の解剖学的研究（共同研究）
高周波（1kHz 以上）の交流電流を発生する弱電気魚（アプテロノータス）の中脳には巨大な電気感覚系の中枢（中脳大細胞核、MMN）がある。本研究では MMN を構成する細胞を電子顕微鏡により観察し、MMN 内在性の大細胞細胞体のほか、小細胞等を確認した。これらの基本構造は他の弱電気魚との共通性が高いことがわかった。本研究は川崎雅司博士（バージニア大学・教授）との共同研究として実施している。

2. 教育
 担当授業（20 年度は休講）
先導科学実習（分担）：走査型・透過型電子顕微鏡（主担当）、細胞組織科学（副担当）
 研究指導電子顕微鏡または光学顕微鏡使用者への技術指導
 全学教育
該当なし
 他大学等における授業

113

該当なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読有り）
該当なし
 学会発表該当なし
 企画したシンポジウム等
該当なし
 基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金該当なし
 外国人招聘
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動
日本比較生理生化学会 評議員
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
該当なし

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
安全衛生委員会
環境安全管理協議会（オブザーバー）
 部局委員会等への貢献
化学物質適正管理委員会
試薬管理担当共同利用機器（透過型電子顕微鏡、走査型電子顕微鏡、共焦点レーザー顕微鏡）の葉山外研究者への技術提供
研究支援担当 大学事業
該当なし

114

参考資料

115

2020年度 年間授業計画

4月
日

授業

5月
イベント・他日

授業

6月
イベント・他

日

1 水

1 金

1 月

2 木

2 土

2 火

3 日

憲法記念日

3 水

4 土

4 月

みどりの日

4 木

5 日

5 火

こどもの日

5 金

6 月

6 水

振替休日

6 土

7 火

7 木

8 水

8 金

9 木

9 土

9 火

10 金

10 日

10 水

11 土

11 月

12 日

12 火

春期休業

3 金

13 月
14 火

生物科学副論文入門
オリエンテーション・研究者
ガイダンス・実験安全講習会

図書館
ガイダンス

14 木
15 金

16 木

16 土

17 金

17 日

18 土

18 月

19 日

19 火

21 火

ミクロ・マクロ生物学
進化生物学基礎

ミクロ・マクロ生物学
理論生物学基礎田辺・大田・
寺井・颯田

20 水

印南・宅野・
佐々木・大槻

21 木

22 水
23 木
24 金

22 金

ミクロ・マクロ生物学
行動生物学基礎

ミクロ・マクロ生物学
統合人類学基礎

先導科学実習

科学と社会副論文入門
科学技術社会論入門

11 木

分子生物学

先導科学実習

12 金

分子生物学

13 土

先導科学実習14 日

細胞組織科学

先導科学実習15 月

細胞組織科学
入試説明会（品川）

先導科学実習
電子顕微鏡学

先導科学実習
電子顕微鏡学学生
健康診断

先導科学実習科学技術社会論入門

16 火

先導科学考究①

17 水

生物統計学 （佐々木）18 木

生物統計学 （佐々木）19 金

生物統計学 （佐々木）

望月敦史

20 土
21 日

行動の神経生理学

先導科学実習22 月

行動の神経生理学

科学技術社会論入門

24 日

24 水

生物統計学 （大槻）25 木

生物統計学 （大槻）26 金

生物統計学 （大槻）伊藤・飯田・
水島・大西

28 火

30 木

8 月

五條堀・本郷26 火

29 水

先導科学実習プログラミング実習

23 火

26 日
科学と社会副論文入門
3-4限

先導科学
プログレス
先導科学
プログレス

23 土

25 月

27 月

運営会議

蟻川・木下・沓掛

25 土

27 水

先導科学実習
野外実習

先導科学実習
野外実習
安全衛生
講習/見学会

28 木
昭和の日

29 金
30 土

イベント・他

7 日

プログラミング実習

13 水

15 水

20 月

先導科学実習

授業

27 土
28 日

オープン
キャンパス

29 月

科学と社会副論文入門
科学技術社会論入門

30 火

31 日

116

2020年度 年間授業計画

7月
日

授業

8月
授業

9月

イベント・他日

イベント・他

日

運営会議

1 土

1 火

1

水

2

木

2 日

2 水

3

金

3 月

3 木

4

土

4 火

4 金

5

日

5 水

5 土

6

月

7

火

8

水

9

木

科学と社会副論文入門
科学技術社会論入門

社会調査法特論（水島）
社会調査法特論
（水島）

6 木

入試

6 日

7 金

入試

7 月

8 土

8 火

9 日

9 水

10 月

11 土

11 火

11 金

12 日

12 水

12 土

13 木

13 日

14 金

14 月

15 土

15 火

16 日

16 水

17 金

17 月

17 木

18 土

18 火

18 金

19 日

19 水

19 土

20 木

20 日

21 金

21 月

科学技術社会論入門

14 火
15 水
16 木

20 月
21 火

細胞生物学特論（田辺）
細胞生物学特論（田辺）

科学と社会副論文入門
科学技術社会論入門

先導科学考究②
藤本明洋

22 土

22 水

イベント・他

科学と社会副論文入門
3-4限

10 木

10 金

13 月

山の日

授業

夏季休業

先導科学考究③
粕谷英一

22 火
夏季休業

23 木

海の日

23 日

23 水

24 金

スポーツの
日

24 月

24 木

25 土

25 火

フレッシュマン
コース

25 金

26 日

26 水

フレッシュマン
コース

26 土

27 月

27 木

フレッシュマン
コース

27 日

28 火

28 金

フレッシュマン
コース

28 月

29 水

29 土

30 木

30 日

31 金

31 月

学位記授与式

29 火
夏季休業

30 水

117

2020年度 年間授業計画

10月
日

授業

11月
イベント・他

日

1 木

1 日

2 金

2 月
夏季休業

3 土

3 火

4 日

4 水

授業

12月
イベント・他

日

科学史・科学技術社会論Ⅱ

2 水科学史・科学技術社会論Ⅰ

3 木
運営会議

4 金

アカデミア探訪準備
夕食会

フレッシュマンコー
ス

5 木

5 土

6 火

ITリテラシー・入学式・
アカデミア担訪①・懇親会

フレッシュマンコー
ス

6 金

6 日

7 水

アカデミア担訪②・研究者と社会

フレッシュマンコー
ス

7 土

7 月

8 木

研究者と社会
研究者と社会

フレッシュマンコー
ス

8 日

8 火

9 金

研究者のための“伝える”
技術・写真撮影・閉会

フレッシュマンコー
ス

9 月
10 火

11 日

11 水

12 月
13 火
14 水
15 木
16 金

科学史・科学技術社会論Ⅱ

12 木

科学史・科学技術社会論Ⅰ

先導科学考究④

13 金

吉村 崇

バイオインフォマ
ティクス特論 （田村）バイオインフォマ
ティクス特論 （田村）

14 土
15 日

科学英語
（Todd）

16 月

17 土
学生委員

18 日

前泊して準備科学史・科学技術社会論Ⅱ

9 水

科学史・科学技術社会論Ⅰ

先導科学考究⑤

10 木

丑丸敦史

集団遺伝学特論（印南）
集団遺伝学特論（印南）
科学英語（Todd）
入試説明会（品川）
先導研学術講演会
in 湘南国際村Festival

統合進化学
（颯田）
統合進化学
（五條堀）
科学英語
（Todd）

科学史・科学技術社会論Ⅰ

環境考古学特論（本郷）
環境考古学特論
（本郷）

11 金
12 土
13 日
湘南国際村
Festival

14 月

湘南国際村
Festival

15 火

科学史・科学技術社会論Ⅱ

16 水

科学史・科学技術社会論Ⅰ

科学史・科学技術社会論Ⅱ
科学史・科学技術社会論Ⅰ

先導科学考究⑥
佐藤 靖
統合進化学
（大槻）

17 火

17 木

統合進化学
（沓掛）

18 水

18 金

科学英語
（Todd）

生命科学リトリート

19 木

19 土

20 火

生命科学リトリート

20 金

20 日

21 水

21 土

21 月

22 木

22 日

22 火

生命科学リトリート

23 金

23 月

23 水

生命科学リトリート

24 土

24 火

24 木

25 日

25 水

25 金

科学史・科学技術社会論Ⅱ

勤労感謝の
日

26 木

先導科学プログレス

26 土

27 火

27 金

先導科学プログレス

27 日

28 水

28 土

28 月

29 木

29 日

29 火

30 金
31 土

科学史・科学技術社会論Ⅰ

科学英語（Todd）

30 月

科学史・科学技術社会論Ⅱ
科学史・科学技術社会論Ⅰ

運営会議

科学史・科学技術社会論Ⅱ

19 月

26 月

イベント・他

1 火

5 月

10 土

授業

30 水

冬季休業

31 木

118

2020年度 年間授業計画

1月
日

授業

2月
イベント・他

1 金

日
1 月

冬季休業

2 土

2 火

授業

3月
イベント・他

統合進化学（大田、田辺、颯田）

運営会議

3 水

3 水

4 月

4 木

5 火

5 金

5 金

6 土

6 土

7 日

7 日

6 水

運営会議

7 木
オープン
キャンパス

生命科学と社会Ⅰ

4 木（大西・水島・飯田）

8 月

入試

8 月

9 土

9 火

入試

9 火

10 日

10 水

8 金

11 月

成人の日

10 水
建国記念日

11 木

11 木

12 金

12 金

13 土

13 土

14 日

14 日

15 金

15 月

15 月

16 土

16 火

16 火

17 日

17 水

17 水

18 月

18 木

18 木

19 金

19 金

12 火
13 水

科学・技術と社会Ⅱ

14 木

科学・技術と社会Ⅱ

19 火
20 水
21 木

（伊藤・飯田・水島・大西）（伊藤・飯田・水島・大西）

先導科学考究⑦土岐田昌和

神経行動学特論（木下）
神経行動学特論
（木下）

春季休業

20 土

21 日

22 金

22 月

22 月

23 土

23 火

24 日

24 水
25 木

26 火

26 金

27 水
28 木

生物多様性特論（寺井）
生物多様性特論
（寺井）

天皇誕生日

23 火
24 水

植物進化発生学特論（長谷部）

学位記授与式

25 木

（長谷部）

植物進化発生学特論

春季休業

20 土

21 日

25 月

イベント・他

2 火

3 日（大西・水島・飯田）

授業

1 月

先導科学考究⑧長谷川奉延
生命科学と社会Ⅰ

日

春季休業

26 金

27 土

27 土

28 日

28 日

29 金

29 日

30 土

30 月

31 日

31 火

119

生命共生体進化学専攻 時間割 (2020年度）
前期 時間割
時間
9:00～
１限
10:30

月

２限

10:40～
12:10

３限

13:00～
14:30

科学と社会副論文入門
前期8時限

４限

14:40～
16:10

科学技術社会論入門
前期8時限

５限

16:20～
17:50

前期 講義日程
科学と社会副論文入門＠共通棟103-104

火水

集中講義科目（下記参照）
先導科学考究15:00～
前期３回

4/27, 6/8, 6/29, 7/6, 7/20, 9/7

科学技術社会論入門@先導研棟310

6/8, 6/15, 6/22, 6/29, 7/6, 7/13, 7/20

先導科学考究＠共通棟103-104

6/16, 7/21, 9/15

先導科学プログレス＠共通棟2階講義室

6/4, 6/5

前期 集中講義日程
フレッシュマンコース

金木※日程調整中生物科学副論文入門

4/13

生物統計学

6/17-19(共通棟103-104), 6/24-26(先導研棟306)

ミクロマクロ生物学@先導研棟114

4/20-21, 4/23-24

先導科学実習5/7-8, 5/11-12, 5/14-15, 5/18-19, 5/21-22, 5/25-26 *5/25-26は野外実習

社会調査法特論@共通棟103-104

7/8, 7/9

細胞生物学特論@共通棟103-104

7/15, 7/16

後期 時間割
時間
9:00～
１限
10:30
10:40～
２限12:10

月

13:00～
14:30

科学史・科学技術社会論Ⅱ

３限

14:40～
16:10

科学史・科学技術社会論Ⅲ

４限
５限

16:20～
17:50

火

先導科学考究15:00～
後期5回

後期8時限

金

木

集中講義科目（下記参照）

後期8時限

後期 講義日程
統合進化学

水科学英語Ⅰ～Ⅴ
後期 全10 時限(Office hour;
14:40-16:10)

12/2, 12/3, 12/16, 12/17, 2/1

科学英語Ⅰ～Ⅴ

10/16,30,11/13,18,12/18

科学史・科学技術社会論Ⅱ

10/12, 10/26, 11/2, 11/9, 11/16, 11/30, 12/7, 12/14

科学史・科学技術社会論Ⅰ

10/12, 10/26

先導科学考究10/13, 11/10, 12/15 ,1/19, 2/2

先導科学プログレス

11/26, 11/27

後期 集中講義日程
フレッシュマンコース

10/5-9

生命科学と社会Ⅰ

2/3,4

科学・技術と社会Ⅱ

1/13,14

バイオインフォマティクス特論

10/14,15

集団遺伝学特論

11/11,12

環境考古学特論

12/9,10

神経行動学特論

1/20,21

植物進化発生学特論@共通棟103-104

2/25, 2/26
120

2020 年度シラバス

121

講義コード30DESa0101

講義名

科学論⽂の書き⽅

講義開講時期

通年(前期開始) Whole Year

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

総合・国際教育科⽬群

授業を担当する教員

印南 秀樹

担当教員
⽒名
印南

秀樹

授業の概要
⼀流の国際誌に掲載される論⽂は質の⾼さに加え、表現的技法にも優れている。この講義では、英語論⽂に関する様々な技法を演習する。
到達⽬標
英語論⽂に関する様々な技法を習得すること。
成績評価基準

成績評価⽅法授業への貢献度及びレポート
本科⽬の成績評価はＰ（合格）またはＦ（不合格）の２種類の評語をもって⾏う。
レポートは、本講義で学んだことをまとめて、前期に履修登録した学⽣は２０２１年１⽉２５
⽇ー３１⽇、後期に履修登録した学⽣は２０２１年７⽉２５⽇ー３１⽇の期間内にinnanhk@soken.ac.jpまで提出すること。
授業計画
授業計画︓
1. 基本⽂法
2. 段落構成
実施場所
122

e-learning
教材はCD(rmvbファイル)で配布される。
視聴環境は各⾃で整えること。
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
特になし
備考
本科⽬は2022年3⽉末をもって閉講します。

123

講義コード30DESa0102

講義名

科学論⽂の書き⽅

講義開講時期

通年（後期開始） 2nd - 1st

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

総合・国際教育科⽬群

授業を担当する教員

印南 秀樹

担当教員
⽒名
印南

秀樹

授業の概要
⼀流の国際誌に掲載される論⽂は質の⾼さに加え、表現的技法にも優れている。この講義では、英語論⽂に関する様々な技法を演習する。
到達⽬標
英語論⽂に関する様々な技法を習得すること。
成績評価⽅法授業への貢献度及びレポート
本科⽬の成績評価はＰ（合格）またはＦ（不合格）の２種類の評語をもって⾏う。
レポートは、本講義で学んだことをまとめて、前期に履修登録した学⽣は２０２１年１⽉２５
⽇ー３１⽇、後期に履修登録した学⽣は２０２１年７⽉２５⽇ー３１⽇の期間内にinnanhk@soken.ac.jpまで提出すること。
授業計画
授業計画︓
1. 基本⽂法
2. 段落構成
実施場所
e-learning
教材はCD(rmvbファイル)で配布される。
124

視聴環境は各⾃で整えること。
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
特になし
備考
本科⽬は2022年3⽉末をもって閉講します。

125

講義コード30DESa0201

講義名

⽣命科学と社会Ⅰ

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

総合・国際教育科⽬群

授業を担当する教員

飯⽥⾹穂⾥、⽔島希、⼤⻄勇喜謙、TBA

担当教員
⽒名
⼤⻄

勇喜謙

授業の概要
（集中講義）⽣命科学を取り巻く倫理的社会的課題やその歴史的背景について、講義、クラス
内課題等を通して考察する。
到達⽬標
現在の⽣命科学に関する倫理的、社会的、哲学的、歴史的理解を深める。
成績評価⽅法
クラス内での議論への貢献、授業内課題、レポート等
授業計画
Date: February 3-4， 2021
Topics to be covered:
1. ダーウィン進化論による変⾰
The Darwinian Revolution (Iida)
2. ⽣物学と思想
Biology and Ideology (Iida)
3. ⽣命科学と疑似科学１︓理論の性質の違い︖
Life science and pseudo-science 1: diﬀerence in the nature of theories (Onishi)
4. ⽣命科学と疑似科学２︓研究実践の違い︖
Life science and pseudo-science 2: diﬀerence in research practice (Onishi)

1265-8 ⽣命科学とELSILife Science and ELSI (Ethical， Legal and Social Implications) (Mizushima)
実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
英語（参加者全員が⽇本語が理解できる場合は⽇本語）
教科書・参考図書
適宜指⽰する。
Introduced in class.

127

講義コード30DESa0501

講義名

科学・技術と社会Ⅱ

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

総合・国際教育科⽬群

授業を担当する教員

伊藤憲⼆、飯⽥⾹穂⾥、⽔島希、⼤⻄勇喜謙

担当教員
⽒名
伊藤

憲⼆

授業の概要
科学技術が多⼤な社会的影響をもたらし，またその維持に多くの社会的⽀援を要する現代において、研究者には、科学と社会との関係に対する深い理解が求められる。本授業では、科学技術社会論における様々なトピックを紹介することで、科学技術の性質や、これを取り巻く様々な社会的問題について、より広範な視点を提供することを⽬的とする。
到達⽬標
科学技術の性質や社会との関係について、様々な観点から考察することができる。
成績評価⽅法
授業内活動
授業計画
担当教員︓伊藤憲⼆，飯⽥⾹穂⾥，⽔島希，⼤⻄勇喜謙
授業計画︓▶ セクション１（⼤⻄）
科学の社会的側⾯と合理性１︓科学の合理性への疑念
科学の社会的側⾯と合理性２︓社会性と合理性との調停の試み▶ セクション２（飯⽥）
放射線と社会︓歴史的視点
産業と科学とリスク議論▶ セクション３（伊藤）128

研究の社会史から考える︓復習と補⾜▶ セクション４（⽔島）科学コミュニケーションと社会的意思決定
詳細は後⽇に告知する。
Instructors: Kenji Ito， Kaori Iida， Nozomi Mizushima， Yukinori OnishiContents:<b>Section1 </b> (Onishi)
Social Aspects and Rationality of Science 1: Challenges against rationality of science
Social Aspects and Rationality of Science 2: Reconciling social nature of science and its
rationality<b>Section2</b> (Iida)
Radiation and Society from a Historical Perspective
Industry， Science， and Risk Controversy<b>Section 3</b> (Ito)Thinking from Social History of Research: Recap and Supplement<b>Section 4</b> (Mizushima)
Science Communication and Social Decision Making on Science & Technology
Details will be announced later.
実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
英語（参加者が⽇本語話者のみの場合は⽇本語）
教科書・参考図書
特になし
None
備考
特になし

129

講義コード

10DESb0701

講義名

科学と社会副論⽂⼊⾨

講義開講時期

前期 1st Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

基礎教育科⽬群

授業を担当する教員

伊藤憲⼆、飯⽥⾹穂⾥、⽔島希、⼤⻄勇喜謙

担当教員
⽒名
飯⽥

⾹穂⾥

授業の概要
科学と社会副論⽂のための研究計画の⽴て⽅・論⽂の書き⽅の基礎を講義、ディスカッショ
ン、宿題等を通して学ぶ。
到達⽬標
各⾃が副論⽂のテーマを選び、それをもとに研究計画を書き上げることを⽬的とする。
成績評価⽅法授業への貢献度、提出物、ディスカッション参加。
本科⽬の成績評価はＰ（合格）またはＦ（不合格）の２種類の評語をもって⾏う。
授業計画
開講⽇︓4/27 (⽉ 3-4限)，6/8 (⽉ 3限)，6/29 (⽉ 3限)，7/6 (⽉ 3限)，7/20 (⽉ 3限)，9/7(⽉ 3-4限)1.イントロ2.研究とは︓トピック、問いと意義、⽂献の使い⽅
3.研究の⽅法１
4.研究の⽅法２
5.論証
6.研究計画のプレゼン
実施場所
130

葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
参考書︓適宜紹介
It will be introduced during class， if necessary.
備考
If you are English speakers， please contact Dr. Kaori Iida before the course starts.
iida_kaori@soken.ac.jp131講義コード

10DESb1401

講義名

⽣物科学副論⽂⼊⾨

講義開講時期

前期 1st Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

基礎教育科⽬群

授業を担当する教員

先導研教員

担当教員
⽒名
印南

秀樹

授業の概要
⽣物科学副論⽂のための研究計画の⽴て⽅・論⽂の書き⽅の基礎を講義、ディスカッション、宿題等を通して学ぶ。
到達⽬標
各⾃が副論⽂のテーマを選び、それをもとに研究計画を書き上げることを⽬的とする。
成績評価⽅法授業への貢献度、提出物、ディスカッション参加
授業計画
1.イントロ2.研究とは︓トピック、問いと意義
3.⽂献について︓選択する、読む、使う、引⽤する
4.研究の⽅法
5.論証
6.研究計画︓アウトライン、その他ライティング基礎
7.研究計画のプレゼン
実施場所
葉⼭キャンパス132

使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
参考書︓適宜紹介
It will be introduced during class， if necessary.

133

講義コード

10DESb0801

講義名

科学技術社会論⼊⾨

講義開講時期

前期 1st Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

基礎教育科⽬群

授業を担当する教員

伊藤憲⼆

担当教員
⽒名
伊藤

憲⼆

授業の概要
この授業は新⼊⽣のうち「科学と社会」分野を専攻することに関⼼のある者を対象として、科学と社会についての基本的⽂献のうち、邦訳のあるものを読む。履修者はすべての課題⽂献を読み、毎回それについての書評論⽂を提出することを必須とする。⾮⽇本語話者が履修する場
合、すべての授業を英語で⾏うので、履修者はこれらの⽂献を英語で読み、英語で討論することを求められる可能性がある。
到達⽬標
科学技術社会論の基本的的⽂献を読解し、考察することを⽬的とする。
成績評価⽅法提出された要約、および授業中の発⾔や、討論、質疑応答を通して、⽂献の理解度と、それに基づいた考察を評価する。
授業計画
１
２
３

イントロダクション
R・K・マートン『社会理論と社会構造』第四部
T・クーン『科学⾰命の構造』

４ D・ブルア『数学の社会学』
５ S・シェイピン、S・シャッファー 『リヴァイアサンと空気ポンプ』
６ B・ラトゥール『科学が作られているとき』
７．L・ウィナー『鯨と原⼦炉』
134

８．まとめ
実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
授業計画を参照
See the course outline.
備考「科学と社会」分野で学位論⽂を書く者は履修すること。⽂献の選択は交渉可能。履修予定者
は、必ず4⽉中に担当教員と電⼦メールを⽤いて連絡を取り、相談の上履修すること。また、この授業は必要に応じて、遠隔的に実施することがありうる。

135

講義コード

10DESb0201

講義名

⽣物統計学

講義開講時期

前期 1st Half

基準単位数

2

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

基礎教育科⽬群

授業を担当する教員

佐々⽊ 顕、⼤槻 久

担当教員
⽒名
佐々⽊
⼤槻

顕
久

授業の概要
⽣物学的データの統計解析について、その基本理論の講義と統計パッケジーを⽤いた実習を通じて、統計解析の⼿法の習得と統計的思考についての理解を深めることを⽬指す。（集中講義）到達⽬標
Rパッケージを⽤いた分散分析、回帰、モデル選択、⼀般化線形モデルなどの統計解析技術を習得するとともに、その基礎となる統計理論の理解を深める。
成績評価⽅法授業への貢献度及びレポート
授業計画
担当教員︓佐々⽊ 顕、⼤槻 久
開講⽇︓5/17-19，5/24-26
授業計画︓
前半（佐々⽊担当）︓
1.統計学の基本的な考え⽅
2.統計学の基本（確率，確率分布，平均，分散，正規分布，独⽴性，t分布，推定，検定，尤
度）
3.対象群間の統計的⽐較（分散分析，平⽅和の分解，分散の⽐の分布，F検定）1364.連続変数の間の統計的関係I（回帰，回帰係数，回帰係数の分布とt検定）
5.連続変数の間の統計的関係II（回帰平⽅と残差平⽅の⽐の分布とF検定，決定係数）6.複数の説明変数I（重回帰，調整平⽅和，統計的消去）
7.複数の説明変数II（多元配置分散分析，交互作⽤，モデル選択）
8.離散データの解析（ロジステック回帰の例）・多変量解析（判別，パターン認識の例）
後半（⼤槻担当）
9. 適合度検定と独⽴性の検定
10. 種々のパラメトリック統計とノンパラメトリック統計
11. ⼀般化線形モデル(GLM)
12. ⼀般化線形混合モデル(GLMM)
13. ベイズ統計学の基礎
Lecturer: Akira Sasaki，Hisashi Ohtsuki
Schedule: May 17th-19th and 24th-26th
Contents:
First half by Sasaki:
1. Introduction to statistics: basic ideas and history
2. Basic statistical tools
3. Statistical comparison between groups (ANOVA)
4. Statistical relationship between continuous variables， I (regression)
5. Statistical relationship between continuous variables， II (more on regression)
6. Multiple explanatory variables (multiple regression)
7. Multiple explanatory variables (MANOVA， interaction， and model selection)
8. Discrete variables (Logistic regression - an example of generalized linear model)
Second half by Ohtsuki:
9. Goodness-of-ﬁt test and test of independence
10. Various parametric and non-parametric tests
11. Generalized linear model (GLM)
12. Generalized linear mixed model (GLMM)
13. Basic Bayesian statistics
実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
参考書︓『⼀般線形モデルによる⽣物科学のための現代統計学』共⽴出版
137

『データ解析のための統計モデリング⼊⾨
岩波書店『統計学⼊⾨』東京⼤学出版会

⼀般化線形モデル・階層ベイズモデル・MCMC』『⾃然科学の統計学』東京⼤学出版会『The R Tips--データ解析環境Rの基本技・グラフィクス活⽤集』オーム社『Rで学ぶ統計学⼊⾨』東京化学同⼈
備考
その他︓授業ではフリーの統計パッケージＲを⽤いたデータの解析を⾏うので、各⾃のノートパソコンにRとRStudioをインストールしておくこと。

138

講義コード

10DESb1501

講義名

ミクロ・マクロ⽣物学

講義開講時期

前期 1st Half

基準単位数

2

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

基礎教育科⽬群

授業を担当する教員

宅野将平

担当教員
⽒名
宅野

将平

授業の概要
・前期集中講義
・数理⽣物学、進化⽣物学、統合⼈類学、⾏動⽣物学の基本的概念を学ぶ。全体を通じて、進化学を包括的に理解する。
到達⽬標
・⽣命共⽣体進化学専攻における研究で必須となる⽣物学の基礎を習得する。
・⽣命共⽣体進化学専攻で開講される他の講義・実験での理解を深めることができる。
・多種多様な視点で⽣物学における重要な課題を考えることができる。
成績評価⽅法・75%以上の出席を単位認定条件とする。
・講義中での議論 50%
・数理⽣物学、進化⽣物学、統合⼈類学、⾏動⽣物学に関するレポート 50%
授業計画
授業計画︓
4⽉20⽇（⽉）1時限︓⽣体物質と細胞・遺伝情報の発現・タンパク質（⽥辺秀之）
4⽉20⽇（⽉）2時限︓⽣物進化（進化系統等）（⼤⽥⻯也）
4⽉20⽇（⽉）3時限︓⽣物進化（種分化・発⽣）（寺井洋平）
4⽉20⽇（⽉）4時限︓⽣理・代謝・免疫（颯⽥葉⼦）
4⽉21⽇（⽕）1時限︓集団遺伝学（遺伝的多様性）（印南秀樹）
4⽉21⽇（⽕）2時限︓集団遺伝学（⾃然選択）（宅野将平）
139

4⽉21⽇（⽕）3時限︓理論⽣物学︓⽣態と進化（佐々⽊顕）
4⽉21⽇（⽕）4時限︓理論⽣物学・社会⽣物学（⼤槻久）4⽉23⽇（⽊）1時限︓神経⾏動学・神経⽣理学（蟻川謙太郎）
4⽉23⽇（⽊）2時限︓神経⾏動学・認知脳科学（⽊下充代）
4⽉23⽇（⽊）3時限︓ 認知⾏動の進化（沓掛展之）
4⽉23⽇（⽊）4時限︓ ⼈間⾏動の進化（沓掛展之）
4⽉24⽇（⾦）1時限︓ ⾃然⼈類学・進化遺伝学（五條堀淳）
4⽉24⽇（⾦）2時限︓ 先史⼈類学（本郷⼀美）
4⽉24⽇（⾦）3時限︓ 環境考古学（本郷⼀美）
実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
特になし
N/A

140

講義コード

10DESb0501

講義名

統合進化学

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

2

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

基礎教育科⽬群

授業を担当する教員

Yoko Satta,Tatsuya OtaHideyuki Tanabe and others

担当教員
⽒名
颯⽥

葉⼦

授業の概要
地球上の⽣命体は、分⼦・細胞から社会・⽣態まで複雑さの異なるさまざま階層（システム）から構成されている。その各システムの進化を、”システムを構成する各要素”、”要素間の相互作⽤”及び”相互作⽤の記述（理論）”という観点から論述する。
到達⽬標
To get basic knowledege of biology， from the viewpoint of Evolution.
成績評価⽅法essay
The grading of this course is either P(Pass) or F(Failure).
授業計画
Lecturer: Yoko Satta， Tatsuya Ota， Hideyuki Tanabe， Hisashi Otsuki， Nobuyuki，Kutsukake， Jun Gojobori
Schedule: December 2，3，16，17， 2020， February 1， 2021
Contents:
1. Tree of life - basic knowledge of molecular evolution（Yoko Satta)
2. Human evolution - genetics， adaptation， environment(Jun Gojobori)
3. Prediction for future -mathematical and theoretical biology(Hisashi Ohtsuki)
4. Animal behaviour - mechanism and evolution(Nobuyuki Kutsukake)5. Genomes， chromosomes， and cells(Yoko Satta， Tatsuya Ota， Hideyuki Tanabe)
実施場所
葉⼭キャンパス
141

使⽤⾔語
英語
English
教科書・参考図書
特になし
Not speciﬁed
備考
特になし

142

講義コード

10DESb0601

講義名

先導科学実習講義開講時期

前期 1st Half

基準単位数

2

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

基礎教育科⽬群

授業を担当する教員

⼤槻久、⽊下充代、沓掛展之、五條堀淳、宅野将平、⽥辺秀之、寺井洋平、松下敦⼦

担当教員
⽒名
⽊下

充代

授業の概要
・前期集中／実習
・⽣物学の発展に寄与してきた重要かつ基礎的な実験⽅法の知識と技術に直接触れることを通じて、実験⽣物学の俯瞰的理解を⽬指す。各実験技術に触れるだけでなく、レポート作成技術についても指導する。（実習）到達⽬標
実験⽣物学を俯瞰的に理解すること。
成績評価⽅法授業への貢献度及びレポート
授業計画
担当教員︓⽊下 充代、⽥辺 秀之、⼤槻 久、沓掛 展之、五條堀 淳、宅野 将平、寺井 洋平、松
下 敦⼦
授業計画︓
5/ 7， 8: プログラミングの基礎
5/11， 12: 分⼦⽣物学
5/14， 15: 細胞組織科学
5/18， 19: 電⼦顕微鏡学
5/21， 22: ⾏動の神経⽣理学1435/25， 26: 野外実習（⾏動⽣態／植物⽣態）

Lecturer: Michiyo Kinoshita， Hideyuki Tanabe， Hisashi Otsuki， Nobuyuki
Kutsukake， Jun Gojobori， Shohei Takuno， Yohei Terai， Atsuko Matsushita
Schedule:
5/ 7， 8: Basic skills of computer programing
5/11， 12: Molecular biology
5/14， 15: Cellular and tissue science
5/18， 19: Electron microscopy
5/21， 22: Behavioral Neurophysiology
5/25， 26: Behavioral ecology and plant ecology
実施場所
葉⼭キャンパス周辺、動物園
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
実習書
Laboratory course manual
備考
実習書の対応部分を読んでくること。

144

講義コード

10DESb0602

講義名

先導科学実習講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

2

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

基礎教育科⽬群

授業を担当する教員

⼤槻久、⽊下充代、沓掛展之、五條堀淳、宅野将平、⽥辺秀之、寺井洋平、松下敦⼦

担当教員
⽒名
⽊下

充代

授業の概要
・後期集中／実習
・⽣物学の発展に寄与してきた重要かつ基礎的な実験⽅法の知識と技術に直接触れることを通じて、実験⽣物学の俯瞰的理解を⽬指す。各実験技術に触れるだけでなく、レポート作成技術についても指導する。（実習）到達⽬標
実験⽣物学を俯瞰的に理解すること。
成績評価基準

成績評価⽅法授業への貢献度及びレポート
授業計画
担当教員︓⽊下 充代、⽥辺 秀之、⼤槻 久、沓掛 展之、五條堀 淳、宅野 将平、寺井 洋平、松下 敦⼦
授業計画 「⽇程については各教員に問い合わせること」
プログラミングの基礎
野外実習（⾏動⽣態／植物⽣態）
145

分⼦⽣物学
細胞組織科学
電⼦顕微鏡学
神経⽣理学

Lecturer: Michiyo Kinoshita， Hideyuki Tanabe， Hisashi Otsuki， Nobuyuki
Kutsukake， Jun Gojobori， Shohei Takuno， Yohei Terai， Atsuko Matsushita
Schedule (Contact the faculty members.)
Basic skill of computer programing
Behavioral ecology and plant ecology
Molecular biology
Cellular and tissue science
Electron microscopy
Neurophysiology
実施場所
葉⼭キャンパス周辺、動物園
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
実習書
Laboratory course manual
備考
実習書の対応部分を読んでくること。

146

講義コード

10DESb1601, 10DESb1701, 10DESb1801,1 0DESb1901, 10DESb2001

講義名

科学英語（基礎）Ⅰ～Ⅴ

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

基礎教育科⽬群

授業を担当する教員

Taji Gohmaru

担当教員
⽒名
⼤⻄

勇喜謙

授業の概要
This course is based on an education program developed by scientists at NIG. The
contents cover various issues and weakpoints that are frequently observed in scientiﬁcsituations. Ample opportunity is provided to practice various skills necessary for various
aspects of scientiﬁc presentation and discussion. Students will receive advice andguidance from a native speaker of English.
到達⽬標
The course aims to provide an fundamental understanding of how to construct aneﬀective scientiﬁc presentation. This includes how to recognize and overcome typical
patterns of speech that impact comprehension， and learning to address importantconsiderations when discussing scientiﬁc logic.
成績評価⽅法in-class activities， completion of assignments
授業計画
Date: 10/16， 10/30， 11/13， 12/4， 12/18
Week 1 Introduction to scientiﬁc presentation and Conveying your message
Week 2 Summarizing & presentation titles and Speaking for Maximum Comprehension
Week 3 ”Flow”， ”focus”， and emphasizing key ideas
Week 4 Clarity in scientiﬁc explanations and Techniques for asking questions
147

Week 5 Techniques for answering questions and Q&A practice for individual research
topicClasses will be in a workshop format， emphasizing active learning through practicalexperience.
実施場所
Hayama Campus
使⽤⾔語
Taught in English but with Japanese support according to student needs.
（主に英語、⽣徒のニーズに合わせて⽇本語サポートも有り）
教科書・参考図書
Handouts to be provided in class.

148

講義コード

20DESc0201

講義名

環境考古学特論

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

統合⼈類学特論群

授業を担当する教員

本郷⼀美

担当教員
⽒名
本郷

⼀美

授業の概要
【3年毎開講】
環境考古学の様々な研究例から、過去の⼈間と環境および⾃然資源の関係についての研究⼿法と、どのような情報が得られるかを学ぶ。特に動植物遺存体の分析による過去の⽣業の研究について論じる。⾻形態⽐較や炭化種⼦同定について、⽐較標本を⽤いて例⽰する。
到達⽬標
環境考古学の様々な研究⼿法を理解し、過去の⼈類と環境について考察する。動物考古学と植物考古学の⼿法について学ぶ。
成績評価⽅法授業中のディスカッション等への貢献、積極的な参加
授業計画
担当教員︓本郷 ⼀美
開講⽇︓12/9-11
授業計画︓
1. イントロダクション︓ 環境考古学とは
2. 環境考古学の様々な研究
3. 動物考古学
4. 植物考古学実施場所

149

葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
参考図書
ジェームズ・ラッカム「動物の考古学」（本郷⼀美訳）學藝書林 1997.
Smith， B. The Emergence of Agriculture. Scientiﬁc American Library 1995.
College， S. et al (eds.) The origins and spread of domestic animals in Southwest Asia
and Europe. Left Coast Press. 2013
備考
特になし
環境考古学、資源利⽤、家畜化、栽培化

Environmental archaeology， Resource

exploitation， domestication

150

講義コード

20DESd0201

講義名

細胞⽣物学特論

講義開講時期

前期 1st Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

進化⽣物学特論群

授業を担当する教員

⽥辺 秀之

担当教員
⽒名
⽥辺

秀之

授業の概要
【3年毎開講】
DNA・クロマチン・染⾊体を中⼼に細胞内における超分⼦構造体について概説し、細胞周期動態、染⾊体ダイナミクスと核⾼次構造、エピジェネティクス、ゲノム進化、遺伝医学などについて講述する。
到達⽬標
DNA・クロマチン・染⾊体の細胞内における基本的な構造と機能に関する知識を習得し、染⾊体ダイナミクスと核⾼次構造、エピジェネティクス、ゲノム進化、遺伝医学などに関する理解を深める。
成績評価⽅法授業への貢献度およびレポート
授業計画
開講⽇︓7/15， 16， 2020
授業計画︓
1. 真核細胞の構造と機能
2. 細胞核⾼次構造と遺伝⼦発現調節
3. 核内染⾊体テリトリーとゲノム機能発現
4. 霊⻑類・哺乳類における染⾊体進化とゲノム進化
5. ヒト染⾊体異常と臨床細胞遺伝学・遺伝医学
6. エピジェネティクスと再⽣医療
151

7. 染⾊体研究と細胞核ダイナミクス研究の歴史と展望
実施場所
共通棟講義室（総研⼤・葉⼭キャンパス）
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
Molecular Biology of THE CELL (5th Edition)
関連URL

http://www.esb.soken.ac.jp/research/index.html#hideyuki_tanabe
関連URLの説明
ESB専攻の各教員の研究内容
備考
染⾊体テリトリー・細胞核⾼次構造・染⾊体進化

152

講義コード

20DESe0201

講義名

神経⾏動学特論

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

⾏動⽣物学特論群

授業を担当する教員

Michiyo Kinoshita

担当教員
⽒名
⽊下

充代

授業の概要
【3年毎開講】
・後期集中講義・動物の⾏動の制御に関わる感覚・中枢・運動神経系のしくみを、具体的な研究例をもとに説明する。授業を通して、分野のコンセプトと、⽬的に応じて使われるさまざまな実験的アプローチを解説する。
到達⽬標
動物⾏動の背景にある神経系のしくみを調べる分野の俯瞰的理解を⽬的とする
成績評価⽅法演習(30%) レポート(70%)
授業計画
授業計画︓
1. ⾏動学の中の神経⾏動学
2. 神経科学の基礎
3. ヒトの視覚系
4. 昆⾍の視覚⾏動
5. 定位⾏動
6. 記憶と学習の古典的研究
7. 昆⾍の嗅覚学習と記憶のメカニズム
153

実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
⾏動の神経⽣物学 ⼭元⼤輔訳
Behavioral Neurobiology G. Zupanc
備考
特になし

154

講義コード

20DESf0201

講義名

集団遺伝学特論

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

理論⽣物学特論群

授業を担当する教員

印南秀樹

担当教員
⽒名
印南

秀樹

授業の概要
【3年毎開講】
集団遺伝学は、進化プロセスの最⼩単位である世代レベルでの対⽴遺伝⼦の頻度変化を解明することによって、進化のメカニズムを解明しようという学問である。集団遺伝学の歴史、基礎
理論、そして今後の展望などについて講義する。
到達⽬標
未記⼊
成績評価⽅法授業への貢献度及びレポート
授業計画
開講⽇︓11/11，12
授業計画︓
1. 表現型多型の集団遺伝学
2. 単⼀遺伝⼦座における基礎理論
3. 染⾊体多型及びタンパク多型の集団遺伝学
4. DNA 多型の集団遺伝学
5. Coalescent 理論の基礎 １
6. Coalescent 理論の基礎 ２
7. ゲノム時代の集団遺伝学
実施場所
155

葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
Genetics 1930備考
特になし

156

講義コード

20DESg0501

講義名

科学史・科学技術社会論Ⅰ

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

科学と社会科⽬群

授業を担当する教員

⽔島 希（先導研「科学と社会」分野）

担当教員
⽒名
⽔島

希

授業の概要
科学技術社会論の基礎を学ぶ。基礎的なテキストを講読したのち、科学技術への市⺠参加、ジェンダーと科学技術、科学コミュニケーションなど、いくつかのトピックを取り上げ議論を⾏う。（講義）
到達⽬標
科学技術社会論の基礎知識の習得。
成績評価⽅法
要約レポート70%， 最終レポート30%
授業計画
開講⽇︓後期・毎週⽉曜3限を予定（詳細については開講前に担当教員に連絡のこと）
授業計画︓科学と社会についての⼊⾨書および論⽂を読み、その内容を確認しつつ、討論する。
実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
157

教科書・参考図書
The Handbook of Science and Technology Studies (MIT Press; 4th ed. 2016)158

講義コード

20DESg0601

講義名

科学史・科学技術社会論Ⅱ

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

科学と社会科⽬群

授業を担当する教員

伊藤憲⼆

担当教員
⽒名
伊藤

憲⼆

授業の概要
「科学と社会」分野の⼤学院⽣を主たる対象とし、科学技術社会論の研究者となるための基礎的な英語⽂献を読む。履修者はすべての課題⽂献を読み、それに基づいた総説論⽂を提出することを必須とする。
到達⽬標
科学技術社会論の重要⽂献を読み、それについて討論する機会を提供することを⽬的とする。
成績評価⽅法提出された要約、および授業中の発⾔や、討論、質疑応答を通して、⽂献の理解度と、それに基づいた考察を評価する。
授業計画
1. Introduction
2. A. Pickering ed. Science as Practice and Culture
3. M. Lynch， Scientiﬁc Practice and Ordinary Action
4. H. Collins， Changing Order
5. S. Epstein， Impure Science
6. H. Collins & R. Evans， ”The Third Wave of Science Studies”
7. P. L. Galison， Image and Logic
8. Conclusion
実施場所
159

葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
授業計画を参照。
See the cours outline
備考「科学と社会」分野の⼤学院⽣を主たる対象とする。「科学技術社会論⼊⾨」を履修していることを前提とする。授業内容は、履修者と相談の上決めるので、履修希望者は、少なくとも最初の授業の⼆週間前までに担当教員に必ず連絡すること。

160

講義コード

20DESh0101

講義名

先導科学特論Ⅰ(バイオインフォマティクス特論）

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

先導科学特論授業を担当する教員

⽥村 浩⼀郎

担当教員
⽒名
印南

秀樹

授業の概要
【3年毎開講】
分⼦進化・分⼦系統解析は、⽣物進化のプロセスとしくみを理解するための必須の⼿段で、現在、⽣物学の広い範囲の分野で活⽤されている。しかし、その具体的な⽅法理論は⾮常に複雑で、通常ピューター・プログラムの助けを借りて⾏われる。本講義では、分⼦進化・分⼦系統解析の⽣物学的・理論的基盤とコンピューターを⽤いるための実践的⼿法について学び、⾃⾝の研究に利⽤できるようにする。
到達⽬標
分⼦進化・分⼦系統解析の基盤を理解し、⾃⼒で解析ができるようになること。
成績評価⽅法授業への貢献度及びレポート
授業計画
担当教員︓⽥村浩⼀郎 （⾸都⼤学東京)
授業計画︓10/14-15
1.DNA 塩基置換とアミノ酸置換の⽣物学的基盤
2.DNA 塩基置換数推定の理論的基盤
3.分⼦時計の基礎と応⽤
4.配列データの多重アライメント
5.分⼦系統樹推定の理論的基盤
6.分⼦系統樹推定の実践と応⽤
161

7.分⼦系統樹を⽤いたバイオインフォマティクス
実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
分⼦進化と分⼦系統学（培⾵館）
備考
特になし

162

講義コード

20DESh0401

講義名

先導科学特論Ⅳ（植物進化発⽣学特論）

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

先導科学特論授業を担当する教員

⻑⾕部光泰

担当教員
⽒名
⻑⾕部
颯⽥

光泰
葉⼦

授業の概要
【3年毎開講】
陸上植物は緑藻類から進化し、コケ植物、⼩葉植物、シダ植物、種⼦植物の4つの単系統群が現⽣しています。系統関係に基づき、系統樹のどこでどのような発⽣様式と形態が進化すること
で陸上植物の多様性が⽣み出されたかを総覧します。
Land plants evolved from green algae and divided into four extant monophyletic
groups: bryophytes， lycophytes， monilophytes， and spermatophytes. Based on
phylogenetic relationships， evolution of developmental patterns and resulted
morphology will be overviewed.
到達⽬標
陸上植物の発⽣進化の全体像を理解する。General view of the evolution of development
and morphology should be understood.
成績評価⽅法(1) 授業での発表、(2)授業後のレポート。
授業計画
担当教員︓⻑⾕部光泰 （総研⼤基礎⽣物学専攻)
開講⽇︓2021年 2/25， 2/26
授業計画︓
「陸上植物の形態進化」（裳華房）の下記の内容を学⽣が分担して発表し、教員が説明を加える。
第1章 植物と陸上植物の定義

163

トピックス︓祖先形質と派⽣形質
1．１ 葉緑体を⼀次共⽣として持つ⽣物の単系統性はまだ確定していない
1．２ ⼆次植物は単系統群ではない
1．3 「植物」の使い⽅
1．4 陸上植物
第2章 膈膜形成体植物2．1 体の先端に幹細胞を形成する仕組みの進化
2．2 成⻑途中で新しい幹細胞を作る仕組み
トピックス︓幹細胞のすぐ隣に幹細胞ができない仕組み
2．3 膈膜形成体を介した細胞質分裂の進化
2．4
2．5
2．6
2．7
2．8

表層微⼩管による細胞伸⻑制御
中⼼体の消失と前期前微⼩管束による細胞分裂⾯制御機構の進化
隠蔽前期前微⼩管束の位置はどのように決まるのか
先端成⻑する⽷状吸収組織
疎⽔性細胞外⽣体⾼分⼦―1︓スポロポレニン

第3章 陸上植物の多様性︓ヒメツリガネゴケとシロイヌナズナの⽐較
3．1 陸上植物の⽣活史
3・２ 胞⼦から原⽷体︓胞⼦の最初の分裂で幹細胞を作る
トピックス︓相同性、同⼀性、オルソログ、パラログ
3．３ 原⽷体の枝分かれ︓発⽣の途中で分化細胞から新しい幹細胞を作る
3．４ クロロネマからカウロネマへの転換︓幹細胞の性質の変化
3．５ 茎葉体の形成︓⽷状の体から茎葉構造への転換
3．6 茎葉体頂端幹細胞の形成
3．７ 茎葉体頂端幹細胞から葉頂端幹細胞が繰り返し作られ葉序ができる
3．８ 葉は1つの葉頂端幹細胞に起源する
3．9 分泌⽑
3．10 仮根3．１1 茎葉体頂端幹細胞が造精器頂端幹細胞に変化する
3．１2 造卵器は造卵器頂端幹細胞から形成されるトピックス︓雌雄異株性3．１3 受精卵の最初の分裂で胞⼦体頂端幹細胞ができる
3．14 被⼦植物の配偶体世代3．15 被⼦植物の胞⼦体世代︓胚発⽣トピックス︓幹細胞の定義
3．16 被⼦植物の胞⼦体世代︓根3．17 被⼦植物の胞⼦体世代︓栄養シュートの葉序3．18 被⼦植物の胞⼦体世代︓葉3．19 被⼦植物の胞⼦体世代︓⽣殖シュート、花、種
トピックス︓幹細胞化の進化
第４章 陸上植物の系統と共通祖先の形態
164

トピックス︓基部系統
4．１ 現⽣陸上植物の系統関係
4・2 前維管束植物が陸上植物の共通祖先の可能性がある
トピックス︓の変化と組織分化
4．3 陸上植物の共通祖先を知る⽅法
第5章 膈膜形成体緑藻類から陸上植物への進化
5．1 多細胞胞⼦体の獲得トピックス︓胞⼦体と配偶体の発⽣プログラムのスイッチ
トピックス︓胞⼦体世代の延⻑
5．2
5．3
5．4
5．5

胞⼦や受精卵から幹細胞ができるまでに多細胞体を形成する
前の分裂⾯と交わるような分裂をする頂端幹細胞
外界に接しない細胞を作る分裂︓体の内側と外側を分ける分裂
表⽪細胞

5・6 疎⽔性細胞外⽣体⾼分⼦―2︓クチクラ
5．7 気孔5．8 造精器と造卵器
5．9 受精卵と若い胞⼦体が親植物体の中で成⻑する
５. 10 原形質連絡による細胞間コミュニケーション
5．11 細胞死による⽔通導細胞形成
トピックス︓体外⽔輸送5．12 栄養通導細胞を形成する
5．13 胞⼦嚢の進化
5．14 ⼆叉分枝
第6章 コケ植物の進化
6・1 コケ植物の共有派⽣形質1︓胞⼦体の退縮と配偶体への半寄⽣
6・2 コケ植物の共有派⽣形質2︓胞⼦嚢内で胞⼦とともに弾⽷を形成する
6．3 コケ植物の共有派⽣形質3︓介在分裂組織
6・4 ツノゴケ類の共有派⽣形質
6．5 セン類とタイ類の共有派⽣形質トピックス︓葉状性タイ類の進化
6．6 タイ類の共有派⽣形質
6．7 セン類の共有派⽣形質トピックス︓コケ植物の精⼦媒介
第7章 維管束植物の進化
7．1 疎⽔性細胞外⽣体⾼分⼦―3︓クチン、スベリン、リグニン
7．2 カスパリー線
7．3 ⽔通導組織の細胞壁が⼆次肥厚し仮導管が進化
トピックス︓仮導管と導管の進化
トピックス︓セン類の乾燥耐性
7．4 数細胞からできる胞⼦嚢の進化
165

第8章 ⼩葉植物への進化
8．1 茎の⼀次⽊部が⼼原型原⽣中⼼柱から外原型原⽣中⼼柱へ進化
8．2 複数の幹細胞を持つ茎頂と根端分裂組織
トピックス︓頂端幹細胞の数とニッチ細胞
8．3
8．4
8．5
8．6

⼩葉
⼩葉の向軸側に胞⼦嚢形成
アステロキシロンと⼩葉植物での中⼼柱の変化
根の進化

トピックス︓内⽣発⽣と外⽣発⽣トピックス︓根の収斂
8．7 配偶体の縮⼩8．8 現⽣ヒカゲノカズラ類の共有派⽣形質︓地中性配偶体
8．9 単軸分枝
トピックス︓フィログロッサム
8．10 ⼩⾆8．11 異形胞⼦性
トピックス︓異形胞⼦性の進化と⽣育環境
8．12 イワヒバ類の共有派⽣形質︓単細胞性頂端幹細胞、トラベキュラ、担根体
8．13 リンボク類とミズニラ類の共有派⽣形質︓維管束形成層、空隙のある根8．14 リンボク類の共有派⽣形質︓⽪層が分裂肥⼤する茎、リゾモルフ
8．15 ミズニラ類の共有派⽣形質︓特殊な内部構造の球茎、ベルム、トラベキュラ
トピックス︓⼆叉分枝と幹細胞
第9章 シダ植物と⽊質植物の共通祖先の進化
9．1 無限成⻑する主軸と有限成⻑し螺旋配列する側軸の分化
9．2 枝から葉への進化︓現代的なテローム説
トピックス︓流⽤cooption、新⽣de novo進化、モジュール
9．３ 胞⼦嚢の裂開⽅向の変化
9．4 トリメロフィトン類で茎が太くなり維管束が腕状に伸びだす
9．5 シダ植物の祖先で原⽣⽊部が⾸飾り様に配列
9．6 ⽊質植物の祖先で両⾯維管束形成層が進化
9．7 根の起源
トピックス︓WOX遺伝⼦の進化トピックス︓⼤葉植物
第10章 シダ植物
10．1 トクサ類
10．2 薄嚢シダ類、リュウビンタイ類、ハナヤスリ類、マツバラン類の共通祖先
10．3
10．4
10．5
10．6

薄嚢シダ類
リュウビンタイ類、ハナヤスリ類、マツバラン類の共通祖先
リュウビンタイ類
ハナヤスリ類とマツバラン類の共有派⽣形質166

10．7 ハナヤスリ類
10．8 マツバラン類
トピックス︓シダ植物の⽣殖器官の多様性と共通性
トピックス︓ワラビ巻き
第１1章 ⽊質植物
11・1 複数幹細胞を持つ茎頂分裂組織と根端分裂組織
11・2 両⾯維管束形成層11．3 葉の進化
第１2章 前裸⼦植物
12・1 中⼼柱の進化
12・2 異形胞⼦性
トピックス︓樹⽊第13章 シダ種⼦類
13．1 腋芽、複葉
トピックス︓葉と茎の制御
13．2 異形葉性トピックス︓応答基準
13．3 3花粉と胚珠の進化―イチョウの花粉と胚珠
トピックス︓銀杏 ギンナン
13．4 胚珠とキュピュール
13．5 雌性胞⼦が胞⼦体から散布されず雌性配偶体が胞⼦体に寄⽣する
13．6 雄性配偶体の細胞数の減数と花粉管形成第14章 現⽣種⼦植物の共通祖先
14．1 内原型真正中⼼柱の進化
14．2 雄性胞⼦の発芽⼝が近位から遠位⽅向に変わる
14．3 花粉管14．4 雌性胞⼦が遊離核分裂後に細胞化して雌性配偶体を形成する
第15章 現⽣裸⼦植物への進化
15．1 針葉樹類の進化
15．1・1 種鱗苞鱗複合体を持つ複合雌性胞⼦嚢穂の進化
15．1．2 花粉管受精15．1．3 前胚形成15．1．4 マツ⽬における短枝の進化
15．1．5 グネツム⽬の特殊化
15．2 イチョウ類
15．3 ソテツ類
第16章 被⼦植物の進化
16．1 ⾼次網状脈系の進化
167

16．2 茎頂に2細胞層以上の外⾐層
16．3 花形成の仕組み
16．4 花器官形成遺伝⼦の進化トピックス︓花は葉から進化したのではない
16．5
16．6
16．7
16．8

2胞⼦嚢を2組持つ雄性胞⼦葉（雄蕊）⼼⽪の獲得
外珠⽪の進化
花粉管受精と倒⽣胚珠

実施場所
オンライン配信
使⽤⾔語
⽇本語
教科書・参考図書「陸上植物の形態進化」（裳華房）
The above Japanese text book will be used.

168

講義コード

20DESh1201

講義名

先導科学特論ⅩⅡ（⽣物多様性特論）

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

先導科学特論授業を担当する教員

寺井 洋平

担当教員
⽒名
寺井

洋平

授業の概要
【隔年開講】
地球上には数百万の⽣物の「種」が⽣息しており、お互いに相互作⽤することによって⽣物の多様性を作り出している。 本特論では、⽣物多様性が創出されてきた機構と、それが維持される機構を講義する。また、学⽣が⾃⾝で考え参加する形式の講義を⾏う。（集中講義）
到達⽬標
本特論では、⽣物多様性が創出されてきた機構と、それが維持される機構の理解を⽬標とする。
成績評価⽅法授業への貢献度及びレポート
授業計画
担当教員︓寺井 洋平
開講⽇︓2021年 1⽉27， 28⽇
授業計画︓１­８の順序。
1. ⽣物多様性の概要
2. ⾃然選択
3. 性選択4. ⽣殖的隔離
5. 異所的種分化
6. ⼆次的接触
169

7. 側所的種分化と同所的種分化
8. ⽣物多様性の維持
実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
参考書︓
Evolutionary Analysis (5th Edition)(Herron and Freeman， 2013)
備考
Adaptation， speciation， natural selection， sexual selection.

170

講義コード

20DESh1701

講義名先導科学特論ⅩⅦ（社会調査法特論）

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

1

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

先導科学特論授業を担当する教員

⽔島 希（先導科学研究科「科学と社会」分野）

担当教員
⽒名
⽔島

希

授業の概要
社会調査で⽤いられる質的・量的⼿法の基本概念とテクニックを学ぶ。研究デザイン、データ収集、分析⼿法を実践的に学んだ後、社会調査の倫理的側⾯についても議論する。（集中講義）
到達⽬標
社会調査法の基礎知識の習得。
成績評価⽅法議論への参加 70%， 最終レポート30%
授業計画
開講⽇︓7/8(⽔)， 7/9(⽊)（受講者は事前に講師に連絡のこと）
授業計画︓
1. 社会調査法概要
2. アンケート調査
3. インタビュー調査
4. 社会調査における倫理的課題
実施場所
葉⼭キャンパス171

使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
特になし
Not speciﬁed

172

講義コード30DESi0101,30DESi0201,30DESi0301,30DESi0401,30DESi0501

講義名

先導科学考究Ⅰ～Ⅴ

講義開講時期

通年(前期開始) Whole Year

基準単位数

2

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

先導科学考究授業を担当する教員

4．授業計画に記載した、8名の外部講師 → ⽥辺 秀之︓全体のレポート集計と成績

担当教員
⽒名
⽥辺

秀之

授業の概要
外部講師による８回のセミナー形式の講義。⽣命共⽣体進化学専攻の５つの研究分野から各界で活躍中の講師を選定する。それぞれの講師の研究内容を中⼼とした講義（1.5時間）と討論を
実施する。
到達⽬標
様々な分野で活躍中の各講師の研究内容と研究観を学び、討論する⼒をつけるとともに、広い視野を⾝につける。
成績評価基準

成績評価⽅法授業への貢献度およびレポート
授業計画
授業スケジュール︓
2020/6/16︓望⽉敦史（京都⼤学 教授）「ネットワーク構造から決まる複雑⽣命システムのダイナミクス」
2020/7/21︓藤本明洋（東京⼤学 教授）「ヒト集団における構造異常の同定と機能的意義の推定」
173

2020/9/15︓粕⾕英⼀（九州⼤学 准教授）
「統計的検定・推定とモデル選択が出会うところ－⽣態学のデータの解析における問題」
2020/10/13︓吉村 崇（名古屋⼤学 教授）「脊椎動物の季節適応の分⼦基盤」
2020/11/10︓丑丸敦史（神⼾⼤学 教授）「都市化の送粉ネットワークと送粉サービスに与える影響」
2020/12/15︓佐藤 靖（新潟⼤学 教授）「現代科学技術の構造変動と⽶国連邦政府」
2021/1/19︓⼆階堂雅⼈（東京⼯業⼤学・准教授）「分⼦系統学が解き明かした鯨類の起源と進化」
2021/2/2︓⻑⾕川奉延（慶応義塾⼤学 教授）「ヒトには6つの性がある」

Schedule of lectures:
2020/6/16︓Atsushi Mochizuki (Professor, Kyoto University)“Dynamics of complex biological systems determined from network structures.”2020/7/21︓Akihiro Fujimoto (Professor, University of Tokyo)“Identiﬁcation of structural variations and analysis of their functional roles.”
2020/9/15︓Eiiti Kasuya (Associate Professor, Kyushu University)“Where the statistical hypothesis testing and estimation meet the model selection:
problematic manners in statistical data analysis in ecology and related ﬁelds.”
2020/10/13︓Takashi Yoshimura (Professor, Nagoya University)“ʻMolecular basis of vertebrate seasonal adaptation.”
2020/11/10︓Atushi Ushimaru (Professor, Kobe University)“Eﬀects of urbanization on pollination networks and services.”
2020/12/15︓Yasushi Sato (Professor, Niigata University)“Structural changes of modern science and technology and the U.S. federal
government.”
2021/1/19︓Masato Nikaido（Associate Professor, Tokyo Institute of Technology）“Origin and Evolution of Cetaceans Revealed by Molecular Systematics”
2021/2/2︓Tomonobu Hasegawa (Professor, Keio University)“Six types of sex in human.”
実施場所
共通棟講義室
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
ESB専攻内の配布⽤資料に記載
174

Describe in the distribution materials of Department of ESB
関連URL

http://www.esb.soken.ac.jp/
関連URLの説明
ESB専攻 web site
備考
特になし

175

講義コード30DESi0102,30DESi0202,30DESi0302,30DESi0402,30DESi0502

講義名

先導科学考究Ⅰ～Ⅴ

講義開講時期

通年（後期開始） 2nd - 1st

基準単位数

2

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

先導科学考究授業を担当する教員

4．授業計画に記載した、8名の外部講師 → ⽥辺 秀之︓全体のレポート集計と成績

担当教員
⽒名
⽥辺

秀之

授業の概要
外部講師による８回のセミナー形式の講義。⽣命共⽣体進化学専攻の５つの研究分野から各界で活躍中の講師を選定する。それぞれの講師の研究内容を中⼼とした講義（1.5時間）と討論を
実施する。
到達⽬標
様々な分野で活躍中の各講師の研究内容と研究観を学び、討論する⼒をつけるとともに、広い視野を⾝につける。
成績評価基準

成績評価⽅法授業への貢献度およびレポート
授業計画
授業スケジュール︓
2020/6/16︓望⽉敦史（京都⼤学 教授）「ネットワーク構造から決まる複雑⽣命システムのダイナミクス」
2020/7/21︓藤本明洋（東京⼤学 教授）「ヒト集団における構造異常の同定と機能的意義の推定」
176

2020/9/15︓粕⾕英⼀（九州⼤学 准教授）
「統計的検定・推定とモデル選択が出会うところ－⽣態学のデータの解析における問題」
2020/10/13︓吉村 崇（名古屋⼤学 教授）「脊椎動物の季節適応の分⼦基盤」
2020/11/10︓丑丸敦史（神⼾⼤学 教授）「都市化の送粉ネットワークと送粉サービスに与える影響」
2020/12/15︓佐藤 靖（新潟⼤学 教授）「現代科学技術の構造変動と⽶国連邦政府」
2021/1/19︓⼆階堂雅⼈（東京⼯業⼤学・准教授）「分⼦系統学が解き明かした鯨類の起源と進化」
2021/2/2︓⻑⾕川奉延（慶応義塾⼤学 教授）「ヒトには6つの性がある」

Schedule of lectures:
2020/6/16︓Atsushi Mochizuki (Professor, Kyoto University)“Dynamics of complex biological systems determined from network structures.”2020/7/21︓Akihiro Fujimoto (Professor, University of Tokyo)“Identiﬁcation of structural variations and analysis of their functional roles.”
2020/9/15︓Eiiti Kasuya (Associate Professor, Kyushu University)“Where the statistical hypothesis testing and estimation meet the model selection:
problematic manners in statistical data analysis in ecology and related ﬁelds.”
2020/10/13︓Takashi Yoshimura (Professor, Nagoya University)“ʻMolecular basis of vertebrate seasonal adaptation.”
2020/11/10︓Atushi Ushimaru (Professor, Kobe University)“Eﬀects of urbanization on pollination networks and services.”
2020/12/15︓Yasushi Sato (Professor, Niigata University)“Structural changes of modern science and technology and the U.S. federal
government.”
2021/1/19︓Masato Nikaido（Associate Professor, Tokyo Institute of Technology）“Origin and Evolution of Cetaceans Revealed by Molecular Systematics”
2021/2/2︓Tomonobu Hasegawa (Professor, Keio University)“Six types of sex in human.”
実施場所
共通棟講義室
使⽤⾔語
⽇本語または英語
教科書・参考図書
ESB専攻内の配布⽤資料に記載
177

Describe in the distribution materials of Department of ESB
関連URL

http://www.esb.soken.ac.jp/
関連URLの説明
ESB専攻 web site
備考
特になし

178

2020年度先導科学考究 講師及び日程一覧
日程

講師・所属

タイトル

望月敦史
京都大学・教授

ネットワーク構造から決まる複雑生命システ
ムのダイナミクス
大槻久

第1回 2020年6月16日（火）Atsushi Mochizuki, Professor,
Kyoto University

Dynamics of complex biological systems
determined from network structures藤本明洋

ヒト集団における構造異常の同定と機能的意義の推定

東京大学大学院医学系研究科・教授

五條堀 淳

第2回 2020年7月21日（火）第3回 2020年9月15日（火）担当教員

Akihiro Fujimoto, Professor,
University of Tokyo

Identification of structural variations andanalysis of their functional roles

粕谷 英一
九州大学理学研究院・准教授

統計的検定・推定とモデル選択が出会うところ－生態学のデータの解析における問題

Eiiti Kasuya, Associate
Professor, Department of
Biology, Kyushu University

Where the statistical hypothesis testing andestimation meet the model selection:
problematic manners in statistical data
analysis in ecology and related fields

吉村 崇
名古屋大学・教授

脊椎動物の季節適応の分子基盤

沓掛展之

蟻川謙太郎

第4回 2020年10月31日（火）Takashi Yoshimura, Professor, MMolecular basis of vertebrate seasonal
Nagoya University
adaptation
丑丸 敦史
神戸大学・教授

都市化の送粉ネットワークと送粉サービスに与える影響

Atushi Ushimaru, Professor,
Kobe University

Effects of urbanization on pollination
networks and services

佐藤 靖
新潟大学・教授

現代科学技術の構造変動と米国連邦政府

Yasushi Sato, Professor,
Niigata University

Structural changes of modern science andtechnology and the U.S. federal government

二階堂雅人
東京工業大学・ 准教授

分子系統学が解き明かした鯨類の起源と進化

Masato Nikaido ,Associate
Professor, Tokyo Institute ofTechnology

Origin and Evolution of Cetaceans Revealed
by Molecular Systematics

長谷川奉延
慶應義塾大学・教授

ヒトには6つの性がある木下充代

第5回 2020年11月10日（火）飯田香穂里

第6回 2020年12月15日（火）第7回 2021年1月19日（火）

寺井洋平

田辺秀之

第8回 2021年2月2日（火）Tomonobu Hasegawa,
Professor, Keio University

Six types of sex in human179

2020年度 先導科学考究：

2020年 6月16日（火）ネットワーク構造から決まる複雑生命システムのダイナミクス
Dynamics of complex biological systems determined from network structures
望月敦史・京都大学・教授
Atsushi Mochizuki, Professor, Kyoto University
Abstract：
Many biological systems have been identified as complex network systems consisting of alarge number of biomolecules and interactions between them. Dynamics of molecular
activities based on such networks are the origin of biological functions. However, it has beena very difficult problem to understand dynamics of such complex systems. In this lecture, I
will introduce our novel mathematical theories, by which important aspects of dynamical
properties of systems are determined from information of the network structures, alone.
The first theory named Linkage Logic mathematically assures that i) any long-term
dynamical behavior of a whole system can be identified/controlled by a subset of moleculesin the system, and that ii) the subset is determined from the network topology alone as afeedback vertex set (FVS) of the network. We apply this theory to the gene regulatory
network for cell differentiation of ascidian embryo. We show that the dynamical system was
successfully controlled by a small set of genes identified as a FVS from the network.
In the second theory named Structural Sensitivity Analysis we show that i) sensitivity
responses of a steady state of a reaction system to perturbations of enzymes are determinedfrom the reaction network, alone. We found that ii) nonzero responses are localized in a
finite region in a network, and that the extent of nonzero responses are governed by anindex which is an analogue of the Euler characteristics. We apply our method to metabolic
network of E. coli. We demonstrate how the theories are practically useful to understandbehaviors of complex biological systems.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Mochizuki, A., Fiedler, B. et al. (2013) J. Theor. Biol., 335, 130-146.

2.

Kobayashi., et al. (2018) iScience 4, 281–293

3.

望月敦史 「ネットワーク構造に基づく生命システムの制御」 システム／制御／情報 2017年 61 巻 7 号 「「生体を探る・真似る・整える」総合特集号（古谷 栄光 編）」p283-289.

4.

Okada T. and Mochizuki A. (2016) Phys. Rev. Lett. 117, 048101.

180

5.

望月敦史 「オープン・システム・サイエンスに向けた理論生物学」 実験医学 2017 年 35
巻 1 号 「特集：オープン・システム・サイエンス（桜田一洋 編）」p15-20.

6.

Okada T., Tsai JC, Mochizuki A. (2018) Phys. Rev. E 98, 012417.

受け入れ担当教員：大槻 久

181

2020年度 先導科学考究：

2020年 7月21日（火）ヒト集団における構造異常の同定と機能的意義の推定
Identification of structural variations and analysis of their functional roles
藤本明洋・東京大学大学院医学系研究科・教授
Akihiro Fujimoto, Professor, University of Tokyo
Abstract：
Structural variations (insertions, deletions, copy number variations, inversions andtranslocations) are functionally important types of genetic variations. Structural variations
can influence structure, copy number and expression level of genes. However, identificationand interpretation of their functional roles are still difficult tasks in genetics studies. We
consider that there are large numbers of structural variations in the human and cancer
genomes, but most of them have not been identified. We developed methods to detect
structural variations and analyzed their functional impacts.
In this presentation, we would like to talk about analysis of structural variations in 300
liver cancer genomes, intermediate-size deletions in a Japanese population, and applicationof a long-reads sequencing technology to detect structural variations. Analysis of the cancer
genomes showed that large number of structural variations exists in the cancer genomes
and they can influence the gene expression level. Analysis of intermediate-size deletions
revealed previously unreported deletions in a Japanese population and a part of them wereassociated with gene expression level. We also developed a method to detect structuralvariations by analyzing data from a long-reads sequencing technology. The analysis detected
2-3 times larger number of structural variations than those from a current short-reads
sequencing technology.
We consider that our study can contribute to the understanding of the landscape ofstructural variations in the human genome, and interpretation of the importance of them.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：
Lappalainen T. et al.Genomic Analysis in the Age of Human Genome Sequencing. Cell. 2019
Mar 21;177(1):70-84. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.032.

受け入れ担当教員：五條堀 淳

1822020年度 先導科学考究：

2020年 9月15日（火）統計的検定・推定とモデル選択が出会うところ－生態学のデータの解析における問題
Where the statistical hypothesis testing and estimation meet the model
selection: problematic manners in statistical data analysis in ecology andrelated fields
粕谷 英一・九州大学理学研究院・准教授
Eiiti Kasuya, Associate Professor, Department of Biology, Kyushu University
Abstract：
Model selection based on one of information criteria (e.g. AIC and BIC) is widely used indata analysis in a broad range of fields including ecology. The model selection, however, hasbeen used in problematic manners in practice. I will illustrate the problematic use of themodel selection in practice that could cause erroneous conclusion with several examples. For
example, AIC was used as a substitute of the hypothesis testing in many cases in practice.
This manner could be considered a deviation from the objective of AIC. The magnitude of theerror by this problematic manner can be readily evaluated in a general, but simple case. I
also examine the magnitude of error in more realistic situations.
The model selection and estimation and hypothesis testing have often been used in a
combined manner, though they are based on different logics and the combined use of them is
not justified. The magnitude of the damage caused by the problematic use of the model
selection is examined. I will also discuss implications suggested by these inappropriatemanners in practical data analysis.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

粕谷英一（2015）生態学における AIC の誤用: AIC は正しいモデルを選ぶためのものではないので正しいモデルを選ばない．日本生態学会会誌、69:179-185．

2.

小西貞則・北川源四郎（2004）情報量規準 朝倉書店

3.

Kass, R.E. and A. E. Raftery (1995) Bayes Factors. Journal of the American Statistical
Association, 90: 773-795.

4.

エリオット・ソーバー（E.Sober 2008, Evidence and Evolution）科学と証拠―統計の哲学
入門．
（2012）名古屋大学出版会
Sober の上記の本では述べられていない点をつかむうえでは、以下が役に立ちます

183

5.

Mayo, D. (1996) Error and the Growth of Experimental Knowledge. University of
Chicago Press.

受け入れ担当教員：沓掛展之184

2020年度 先導科学考究：

2020年10月13日（火）脊椎動物の季節適応の分子基盤
Molecular basis of vertebrate seasonal adaptation
吉村 崇・名古屋大学・教授
Takashi Yoshimura, Professor, Institute of Transformative Bio-Molecules(WPI-ITbM) & Graduate School of Bioagricultural Sciences, Nagoya
University
Abstract：
The appropriate timing of various seasonal processes, such as reproduction, migration andhibernation, is crucial to the survival of animals living in temperate regions. Although thisphenomenon attracts great interest, its underlying mechanisms are not well understood. By
using non-model organisms that have highly sophisticated seasonal responses such as
Japanese quail, Siberian hamsters and masu salmon, we have uncovered the universalityand diversity in the signal transduction pathway regulating seasonal reproduction invertebrates.
Animal behavior is also seasonally regulated. We have recently discovered dynamic
plasticity in phototransduction regulates seasonal changes in color perception in medaka
fish (Oryzias latipes). Interestingly, seasonal changes in the environment lead todepression-like behavior in humans as well as animals. We observed decreased sociability
and increased anxiety-like behavior in medaka exposed to winter-like conditions.
Metabolomic and transcriptomic analyses in medaka found multiple signaling pathways
involved in depression. Chemical genomics approach further identified the specific pathway
regulating winter depression-like behavior. I will discuss the usefulness of comparative
biology approach and interdisciplinary approach.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Nakane, Y. and Yoshimura, T. (2019) Photoperiodic regulation of reproduction invertebrates. Annu Rev Anim Biosci 7, 173-194

受け入れ担当教員：蟻川謙太郎

185

2020年度 先導科学考究：

2020年11月10日（火）

都市化の送粉ネットワークと送粉サービスに与える影響
Effects of urbanization on pollination networks and services
丑丸 敦史・神戸大学・教授
Atushi Ushimaru, Professor, Kobe University
Abstract：
Urbanization has cause rapid degradation in ecological networks and their ecosystemservices worldwide. Pollination networks are ideal subjects for examining the effects ofurbanization on their network structures and function. Pollinators are considered to beparticularly vulnerable to human disturbance, such as habitat and resource loss; thus, theirrichness and abundance often decrease along urban gradients likely depending on land-use
composition within the urban areas. Reduced pollinator richness in a network can weakeninterspecific competition, which in turn may facilitate highly generalised interactions bysome pollinator species within a network. Network-level generalisation is hypothesized todegrade the community-wide pollination service, affecting native and cultivated plant
species in urban areas. In contrast, positive effects of urbanization on richness andabundance of some pollinator groups and on pollination services have been reported fromsome cities. Thus, the effects of urbanization are complex and context dependent. In thislecture, I would like to introduce recent progress in studies examining how urbanizationinfluences plant-pollinator networks and their ecosystem services.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Harrison T. and Winfree R. (2015). Urban drivers of plant-pollinator interactions.
Functional Ecology 29: 879–888. https://doi.org/10.1111/1365-2435.12486

2.

Wenzel A., Grass I., Belavadib V.V., Tscharntke T. (2020). How urbanization is driving
pollinator diversity and pollination – A systematic review. Biological Conservation
241:108321 https://doi.org/10.1016/j.biocon.2019.108321

受け入れ担当教員：木下充代

186

2020年度 先導科学考究：

2020年12月15日（火）現代科学技術の構造変動と米国連邦政府
Structural changes of modern science and technology and the U.S. federal
government
佐藤 靖・新潟大学・教授
Yasushi Sato, Professor, Niigata University
Abstract：
Since World War II, the power and risk of science and technology (S&T) has greatly
expanded. In the process, the U.S. federal government, along with other governments, hasplayed a key role, extending the frontier of S&T through massive military and civilian
investment and controlling various risks of S&T by setting up various institutions and rules.
The relationships between S&T and the U.S. federal government, however, have undergone
structural changes over the last 75 years. First, the overall configuration of S&T haschanged in correlation with the organizational environment which has fostered the growthof S&T, reflecting the long-term political transformation in the U.S. Second, the mechanismof social trust supporting the validity of S&T has changed, with the authority of academic
and professional judgments gradually replaced by statistical information based on data
analysis. Third, political expectation for S&T has changed, along with the form of scientificresearch, as innovation and competitiveness have become the U.S.’s foremost social concerns.
These three perspectives are related to the disciplinary fields of military and diplomatic
history, STS (Science and Technology Studies), and economic history and innovation studies,
respectively. Although the interaction between these academic fields has been limited in thepast, an integrated approach is called for to examine the nature and trends of modern S&T.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

佐藤 靖『科学技術の現代史－システム、リスク、イノベーション』（中央公論新社、2019年）

2.

小林信一「ポスト冷戦、ポスト 911 の科学技術イノベーション政策」、国立国会図書館調査及び立法考査局調査資料『冷戦後の科学技術政策の変容』、2017 年、83-93 頁

受け入れ担当教員：飯田香穂里

1872020年度 先導科学考究：2021年 1月 19日（火）分子系統学が解き明かした鯨類の起源と進化
Origin and Evolution of Cetaceans Revealed by Molecular Systematics
二階堂雅人・東京工業大学・准教授
Masato Nikaido, Associate Professor, Tokyo Institute of Technology
Abstract:
The extremely large and beautiful streamlined forms of cetaceans swimming in the ocean
have long fascinated many people. However, traditional systematics based on morphology
has failed to reveal which group of mammals are closely related to cetaceans. The
phylogenetic relationships within cetaceans have also remained largely unresolved. Ourgroup addressed the question of the origin and phylogeny of cetaceans based on the insertionof retroposons, which was established as a reliable phylogenetic tool as well as the common
molecular phylogenetic methods such as NJ and ML methods. As a result, it became clearthat cetaceans are closely related to even-toed ungulates, especially hippopotamuses, andthis overturned several traditional morphology and paleontology-based hypotheses. We also
addressed the issue of the monophyly or paraphyly of toothed cetaceans, which had been
controversial in molecular phylogenetics and morphology, and succeeded in showing thattraditional morphology-based hypothesis was correct. In this presentation, I hope you will
enjoy the results of our series of researches and the history of intense debates on the origin
and evolution of cetaceans.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Nikaido M, Rooney AP, Okada N. (1999) Phylogenetic relationships among
cetartiodactyls based on insertions of short and long interpersed elements:
hippopotamuses are the closest extant relatives of whales. PNAS. 96: 10261–10266.

2.

Nikaido M, Matsuno F, Hamilton H, Brownell RL, Cao Y, Ding W, Zuoyan Z, Shedlock
AM, Fordyce RE, Hasegawa M, Okada N. (2001) Retroposon analysis of major cetacean
lineages: The monophyly of toothed whales and the paraphyly of river dolphins. PNAS.
98: 7384–7389.

3.

Nikaido M, Hamilton H, Makino H, Sasaki T, Takahashi K, Goto M, Kanda N, Pastene
LA, Okada N. (2006) Baleen whale phylogeny and a past extensive radiation event
revealed by SINE insertion analysis. Mol. Biol. Evol. 23: 866–873.

188

4.

二階堂雅人、岡田典弘 「哺乳類における海への再侵入と進化」『海洋の生命史(西田睦編)』
pp. 139-154, 2009.

5.

http://www.nikaido.bio.titech.ac.jp （二階堂研 HP: 公式）

受け入れ担当教員：寺井洋平

1892020年度 先導科学考究：2021年 2月2日（火）ヒトには6つの性がある
Six types of sex in human長谷川奉延・慶應義塾大学・教授
Tomonobu Hasegawa, Professor, Keio University
Abstract：
How we can define “sex”? XY-male and XX-female is too simplistic. In medicine, six typesof sex should be kept in mind, chromosome, gonad, internal genitalia, external genitalia,
gender identity, and legal (or registered) sex. Some are classed as having differences ordisorders of sex development (DSDs), in which their sex chromosomes, gonads, internal
genitalia, or external genitalia is atypical. We should understand diversity of each 6 types ofsex.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Lee PA, Houk CP, Ahmed SF, Hughes IA; International Consensus Conference on
Intersex organized by the Lawson Wilkins Pediatric Endocrine Society and theEuropean Society for Paediatric Endocrinology. (2006) Consensus statement on
management of intersex disorders. International Consensus Conference on Intersex.
Pediatrics 118, e488-500

2.

Ainsworth C. (2015) Sex redefined. Nature 518, 288-291

受け入れ担当教員：田辺秀之

190

講義コード90DESj010A,90DESj020A,90DESj030A,90DESj040A,90DESj050A

講義名

先導科学プログレスⅠ～Ⅴ

講義開講時期

通年(前期開始) Whole Year

基準単位数

2

代表曜⽇
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

⽣命共⽣体進化学専攻

科⽬区分

先導科学プログレス

授業を担当する教員

各主任指導教員

担当教員
⽒名
蟻川

謙太郎

授業の概要
⼤学院⽣の研究報告に基づいたセミナー
到達⽬標
・発表者として⾃らの研究進捗をまとめ、他者にプレゼンテーションを⾏う能⼒を⾝につける。
・聴講者として他者の研究を理解し、質問および討議を⾏う能⼒を⾝につける。
成績評価基準

成績評価⽅法・毎回必ず定められた様式でプログレスリポートを提出し、積極的に討議に参加すること。提出物および討議への参加と貢献度によって総合的に評価する。
・本科⽬の成績評価はＰ（合格）またはＦ（不合格）の２種類の評語をもって⾏う。
授業計画
・第１回開講⽇︓6/4， 5
・第２回開講⽇︓11/26， 11/27
・５年⼀貫制博⼠課程の１年次⽣は第１回は聴講し、第２回に博⼠研究の計画を発表する。
・３年次編⼊学者は⼊学年度の第１回に博⼠研究の計画を発表する。
・それ以外の学⽣は、年１回以上研究進捗状況の発表を⾏う。
191

・副論⽂審査、博⼠論⽂予備審査も原則としてこの中で⾏う。
実施場所
葉⼭キャンパス
使⽤⾔語
・⽇本語または英語

・先導科学プログレスIII， IV， Vの受講者は原則として英語で発表を⾏う。
教科書・参考図書
特になし
Not speciﬁed
備考
その他︓1年次第2回の発表内容を主任指導教員決定の際の参考とする。

192

講義コード90DESk010A, 90DESk020A, 90DESk030A, 90DESk040A, 90DESk050A

講義名

先導科学特別研究Ⅰ～Ⅴ

講義開講時期

通年(前期開始) Whole Year

基準単位数

4

代表曜日
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

生命共生体進化学専攻

科目区分

先導科学特別研究

授業を担当する教員

各主任指導教員

担当教員
氏名蟻川 謙太郎
授業の概要
博士論文のための研究
到達目標
・自らが主体的に博士論文の基礎となる研究を遂行できること。
・博士論文を執筆し、完成させること。
成績評価基準

成績評価方法・研究への取り組みおよび達成度によって評価する。
・本科目の成績評価はＰ（合格）またはＦ（不合格）の２種類の評語をもって行う。
授業計画
主指導教員を中心として通年で研究指導を行う。
実施場所
葉山キャンパス
使用言語
193

日本語または英語
教科書・参考図書
特になし
None
備考
特になし

194

講義コード90DESk010B, 90DESk020B, 90DESk030B, 90DESk040B, 90DESk050B

講義名

先導科学特別研究Ⅰ～Ⅴ

講義開講時期

通年（後期開始） 2nd - 1st

基準単位数

4

代表曜日
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

生命共生体進化学専攻

科目区分

先導科学特別研究

授業を担当する教員

各主任指導教員

担当教員
氏名
蟻川

謙太郎

授業の概要
博士論文のための研究
到達目標
・自らが主体的に博士論文の基礎となる研究を遂行できること。
・博士論文を執筆し、完成させること。
成績評価基準

成績評価方法・研究への取り組みおよび達成度によって評価する。
・本科目の成績評価はＰ（合格）またはＦ（不合格）の２種類の評語をもって行う。
授業計画
主指導教員を中心として通年で研究指導を行う。
実施場所
葉山キャンパス
使用言語
195

日本語または英語
教科書・参考図書
特になし
None
備考
特になし

196

講義コード90DESk0601

講義名

副論文特別研究

講義開講時期

前期 1st Half

基準単位数

4

代表曜日
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

生命共生体進化学専攻

科目区分

先導科学特別研究

授業を担当する教員

副論文指導教員

担当教員
氏名
水島 希
授業の概要
・副論文のための研究
・生命共生体進化学専攻では博士論文の提出要件として、副論文を課している。実際には初年度から副論文にとりかかり、先導科学プログレスIVの第２回で副論文審査を受けることを推奨
している。
到達目標
・副論文の研究を通して、生物科学分野の学生は科学と社会分野の、科学と社会分野の学生は生物科学分野の知識と方法論の基礎を習得し、領域横断的な視点を身につけること。
成績評価方法・本科目の成績評価は副論文審査に基づき、Ｐ（合格）またはＦ（不合格）の２種類の評語をもって行う。
・副論文審査に合格した年度に合格とする。
授業計画
当該分野の副指導教員を中心として通年で研究指導を行う。
実施場所
葉山キャンパス
使用言語
197

日本語または英語
教科書・参考図書
特になし
Not specified
備考
副論文審査に合格した年度に単位が出るので、副論文を提出する予定の年度に履修申請すること。

198

講義コード90DESk0602

講義名

副論文特別研究

講義開講時期

後期 2nd Half

基準単位数

4

代表曜日
代表時限
研究科等

先導科学研究科

専攻・プログラム

生命共生体進化学専攻

科目区分

先導科学特別研究

授業を担当する教員

副論文指導教員

担当教員
氏名蟻川 謙太郎
授業の概要
・副論文のための研究
・生命共生体進化学専攻では博士論文の提出要件として、副論文を課している。実際には初年度から副論文にとりかかり、先導科学プログレスIVの第２回で副論文審査を受けることを推奨
している。
到達目標
・副論文の研究を通して、生物科学分野の学生は科学と社会分野の、科学と社会分野の学生は生物科学分野の知識と方法論の基礎を習得し、領域横断的な視点を身につけること。
成績評価方法・本科目の成績評価は副論文審査に基づき、Ｐ（合格）またはＦ（不合格）の２種類の評語をもって行う。
・副論文審査に合格した年度に合格とする。
授業計画
当該分野の副指導教員を中心として通年で研究指導を行う。
実施場所
葉山キャンパス
使用言語
199

日本語または英語
教科書・参考図書
特になし
Not specified
備考
副論文審査に合格した年度に単位が出るので、副論文を提出する予定の年度に履修申請すること。

200