2021 年度（令和 3 年度）
総合研究大学院大学
先導科学研究科

研究科報

目

次

研究科長挨拶 ······································································································ 1
先導科学共働プログラム ······················································································· 2
生命共生体進化学専攻の教員及び専門分野 ······························································ 39

学生
2021 年度在籍者 ································································································ 40
博士研究 ·········································································································· 42
海外における活動 ······························································································ 43

教員
外国人招聘研究者 ······························································································ 44
アウトリーチ活動 ······························································································ 45

各教員の研究教育業績（分野別）
統合人類学分野 ································································································· 51
沓掛 展之（教授： 動物行動学、霊長類学） ··························································· 51
本郷 一美（准教授： 環境考古学（動物考古学）、先史人類学） ································· 56
蔦谷匠（助教： 生物考古学、自然人類学、霊長類学） ·········································· 63

進化生物学分野 ································································································· 67
颯田 葉子（教授： 生理進化学、ゲノム遺伝学） ····················································· 67
田辺 秀之（准教授： 分子細胞遺伝学、染色体ゲノム進化学） ··································· 72
大田 竜也（准教授： 分子進化学）······································································· 76
五條堀 淳（講師： 自然人類学、分子進化学、集団遺伝学） ······································ 80
寺井 洋平（助教： 適応と種分化の機構、分子進化生態学） ······································ 84
行動生物学分野 ································································································· 92
蟻川 謙太郎（教授： 神経行動学、感覚生理学） ····················································· 92
木下 充代（准教授： 神経行動学、生理行動学、認知科学） ······································ 96
渡邊 崇之（助教： 神経行動学、神経進化発生学、分子遺伝学） ······························ 100
理論物学分野 ·································································································· 105
佐々木 顕（教授： 数理生物学、理論進化学） ······················································ 105
印南 秀樹（教授： 集団遺伝学、ゲノム進化学） ··················································· 109

大槻 久（准教授： 理論生物学、進化ゲーム理論） ················································ 113
宅野 将平（助教： ゲノム進化学・エピジェネティクス） ······································· 117
科学と社会分野 ······························································································· 120
伊藤 憲二（准教授： 科学史）··········································································· 120
飯田 香穂里（准教授： 科学技術史）·································································· 125
大西 勇喜謙（助教： 科学哲学・科学技術社会論） ················································ 129
鈴木 和歌奈（助教： STS、科学技術の人類学） ··················································· 132
共同利用機器支援事業担当 ················································································ 135
松下 敦子（講師： 神経解剖学・微細形態学） ······················································ 135

参考資料
2021 年度年間授業計画・時間割 ········································································ 139
2021 年度シラバス ··························································································· 144

研究科長挨拶

総研大らしさ、という言葉をよく耳にする。総研大らしい研究、総研大らしい企画、総研大らしい考え方、などである。会話のなかでこの言葉が出ると、発した人も聞いている人も、同じものを思い浮かべているのかもしれない。総研大らしくない、という言

葉は聞いたことがない。

総研大らしさとは何だろう。今年度、このことをずっと考えてきた。その結果、総研

大らしさを構成する要素はいくつかわかった気がする。学部生がおらず大学院生以上で構成されていることによって醸成される雰囲気、基盤機関やキャンパスが分散されていることによって起きる局所性、大型施設や貴重なリソースを用いた最先端の研究、特定の分野を深く研究するスタイルなど。構成要素はわかったものの、総研大らしさという言葉の正体はいまだによくわからない。存在はするが誰もその姿を見たことがないサン

タクロースのようなものだと思っておけばいいのかもしれない。

昨年度、先導科学研究科は統合進化科学研究センターを設立するための慌ただしい一年を過ごした。進化、科学と社会を看板とする国内初の研究組織である。本研究科報はそんな一年間の活動の記録である。来年度のセンターへの本格移行に向けて、今年度はより慌ただしい一年となるだろう。統合進化科学研究センターは総研大らしい組織となるだろうか。

研究科長 沓掛展之1

先導科学共働プログラム2

2021先導科学共働プログラム採択課題
国際共同研究代表者氏名

研究課題

蟻川 謙太郎昆虫視覚系の進化神経行動学に関する国際共同研究

本郷 一美

東アジアのイヌ・オオカミの系統についての考古科学的研究

萌芽的共同研究
代表者氏名

研究課題

沓掛 展之

新世における適応進化：人工環境に暮らす野生動物の行動生態

颯田葉子

日本人の起源と由来を問う―東アジア人の全ゲノム配列と比較してー

伊藤憲二「科学と社会」の新物質主義的再構成：個体化・共生・市民参加を中心として

木下充代

チョウ類の嗅覚系における多様性と環境適応の解明

寺井洋平

物理障壁のない海洋での２つの生殖的隔離機構の進化過程の解明

渡邊 崇之

昆虫複眼の構造的バリエーションを生み出す発生プログラムの解明

プレリサーチ

人間プロジェクト

代表者氏名

研究課題

伊藤

憲二

学術雑誌の科学史研究への進化学的方法の適用についての予備的研究

印南秀樹

競走馬生産における遺伝子診断の導入

渡邊崇之

原始的な昆虫の脳の性差を規定する分子基盤の解明に向けた網羅的遺伝子発現解析

颯田葉子

ゲノムプロジェクトのこれから

3

2021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
国際共同研究研究課題

昆虫視覚系の進化神経行動学に関する国際共同研究
蟻川謙太郎

代表者氏名

Anna Stöckl

University of Würzburg (Germany)

Ronja Bigge

University of Würzburg (Germany)

共同研究者氏名（所Gregor Belušič

University of Ljbljana (Slovenia)

属）

Marko Ilić

University of Ljbljana (Slovenia)

Clément Cecetto

総研大・先導科学研究科

脇田大輝

総研大・先導科学研究科

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

1,800,000

0001,000,0000

800,000

執行額

1,799,610000493,0320

1,306,578

研究成果① 研究経緯私たちは昆虫の色覚メカニズムについて、i) 視細胞の生理学的性質と、ii) 視覚認知
行動の両面から研究を進めてきた。i)の成果として、アゲハを始めとする数種の昆虫で複眼視細胞の配列を完全に解明した。ii) では、アゲハがヒトを凌ぐ鋭い色覚を持つことを証明した。得られた成果からの論理的発展として、現在は、視細胞が受けた光情報が主観的な“色”に変換されるメカニズムを調べている。研究のコアは、色覚が貧弱なショ
ウジョウバエとアゲハの比較である。色覚メカニズムの何がどう進化したか、その実体を知るには、ショウジョウバエとアゲハを含む数種の昆虫での比較が必須と考えた。
このような背景のもと、私は2019年、昆虫視覚研究の第一線で活躍する中堅・若手研究者を数カ国から招へいし、昆虫視覚系の進化神経行動学の萌芽をつくるための議論と、実際の共同研究を行う計画を立てた。その後、方向性を少しずつ修正しながら2020年度と2021年度に本事業を実施、2020年度事業で比較研究の対象をチョウ目、バッタ目、ハチ目に絞ることを決め、University of WürzburgとUniversity of Ljubljanaの研究者と共に、実験的研究を開始した。2021年度事業では、進行中の実験を完了させることを目標に置
き、オンラインミーティングで随時連絡をとりながら研究を行った。結果、2編の原著論文を出版した。当初予算として160万円の配分を受け、年度途中で20万円の追加配分を受けた。
② 成果
Anna Stöckl 助教(Univ Würzburg)とは、チョウ目から2種のスズメガ（昼行性のホウ

4ジャク、夜行性のベニスズメ）を選定、視覚第一次中枢（視葉板）の解剖学的研究を進めた。総研大で視葉板の電子顕微鏡連続横断画像を取得したのち、スタックのデー
タをHDで送付、大学院生が解析を始めた。夜行性のベニスズメの解析がおおかた終了
し、一個眼由来のカートリッジには9本の視細胞軸索と５本の視覚二次ニューロンの軸索が含まれていることが明らかとなった。私は当該大学院生のPhD committee memberとして研究指導に当たっており、2021年度は３回のZoomミーティングを行った。ミーテ
ィングの中で、ベニスズメ視葉板の解剖学的研究の論文執筆について検討するとともに、昆虫視葉板の生理学・解剖学に焦点をあてた総説を共同執筆することを決め、現在原稿を準備中である。
Gregor Belušič 准教授(Univ Ljubljana)とは、チョウ目から２種のタテハチョウ（ミドリヒョウモンとメスグロヒョウモン）を選定し、これまでに網膜視細胞の分光感度を記録する生理学実験を行った。研究の過程で、視細胞分光感度が雌雄で異なることがわかったため、より綿密な測定を行なった。その結果、いずれの種も紫外線、青、緑にそれぞれ感度極大をもつ細胞をもち、加えてオスでは橙と赤にそれぞれ感度極大をもつ細胞が見つかった。赤受容細胞の存在は、短波長受容細胞における波長対比性か
ら強く示唆されたが、この細胞はきわめて小さな基底視細胞らしく、現在までに直接の生理学的記録は得られていない。小さな基底視細胞に電極を刺入するのは非常に困難なので、この時点で論文として発表することとした。
生きたアゲハにスクリーン上に投影した動き刺激を見せて、頭部の動き（視運動反応）を記録した行動学実験では、明るさの同じ２色でつくる動きが視運動反応を引き起こすことが分かっていた。行動実験で見られるこの現象の基礎にある神経メカニズ
ムを探るために、アゲハ中枢の動き感受性ニューロン活動の波長依存性をCecetto博士（先導研）とともに解析した。15個のニューロンから信頼性の高い記録が得られたた
め、共同で研究をすすめていた木下准教授とともに、論文を1編、出版した。
コロナ禍で海外渡航はすべて取りやめになったが、欧州の２大学と実質的な共同研究を展開することができた。Univ Ljubljana とは学術交流協定も締結してあるので、今後学生と教員の相互派遣などを通じてさらに活発な共同研究が行われることを期待している。

③ 発表リスト（査読つき原著論文）
1.

Céchetto C, Arikawa K, Kinoshita M (2022). Motion-sensitive neurons activated bychromatic contrast in a butterfly visual system. Philosophical Transactions of Royal
Society of London B, in press.

2.

Ilić M, Chen P.-J, Pirih P, Meglič A, Prevc J, Yago M, Belušič G, Arikawa K (2022).
Simple and complex, sexually dimorphic retinal mosaic of fritillary butterflies.
Philosophical Transactions of Royal Society of London B, in press.

他にリバイス中１編、準備中２編

5

2021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
国際共同研究（該当しないものを消してください）

研究課題

東アジアのイヌ・オオカミの系統についての考古科学的研究
本郷一美

代表者氏名

共同研究者氏名（所属）

袁靖（復旦大学科技考古研究院/中国社会科学院・考古研究所）
趙欣（中国社会科学院）
寺井洋平（総合研究大学院大学 先導科学研究科）
石黒直隆（総合研究大学院大学 先導科学研究科）
松村秀一（岐阜大学）
茂原信生（奈良文化財研究所）
覚張隆史（金沢大学 国際文化資源学研究センター）
菊地大樹（2021 年 9 月迄：総合研究大学院大学 先導科学研究科/
2021 年 10 月～：蘭州大学歴史文化科学院）
Xiayire Xiaokaiti（総合研究大学院大学 先導科学研究科）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

1,600,000+600,0000590,000

630,000+600,000

380,000

00

執行額

2,200,000

0

8,160

1,531,200

660,640

0

0

研究成果
①研究経緯
イヌの家畜化の初期過程は十分に解明されておらず、東アジアでのオオカミとイヌの分化過程に関しても不明な点が多い。日本列島でイヌが出現するのは縄文時代で、その状況からニホンオオカミが家畜化されたとは考えにくい。タイリクオオカミと日本固有種とされる絶滅したニホンオオカミとの関係および東アジア本土のイヌと日本犬の関係を探るために、現存するニホンオオカミの骨格および縄文時代の遺跡出土のオオカミ、イヌ骨格、中国大陸の遺跡から出土したイヌの形態を比較するための資料を収集するとともに、DNAの全ゲノム解析により、初期の家畜犬とニホンオオカミの遺伝的特徴と系統関係を検討した。これに加え、大学院生のシャイラー・ショケット
は博士論文研究の一部として中国社会科学院の趙欣と中国の遺跡出土犬の古代DNA分析を進めた。
②成果
小竹貝塚（富山、縄文時代前期)、上黒岩岩陰（愛媛、縄文時代早ー前期）、青谷上寺地遺跡（弥生時代）、須和田遺跡（千葉、8世紀後半）出土犬の古代DNAの抽出に成功し、ゲノム情報の解析を行った。小竹、須和田の試料の配列を決定し、データベー
ス上のイヌ、オオカミの配列と比較した。縄文時代のイヌは、イヌの中で最も古い系
統とされるディンゴよりさらに古い系統に属することがわかった。また、奈良時代のイヌは縄文時代のイヌの系統に連なることがわかった。ニホンオオカミのゲノム解析
から、ニホンオオカミと縄文犬は東アジアの絶滅したオオカミ集団を共通祖先とし、イヌの家畜化の起源が東ユーラシアにあることが示唆された。
③発表リスト（論文や学会発表、予定を含む）

6

原著論文（査読有）Matsumura S, Terai Y, Hongo H, Ishiguro N (2021) Analysis of mitochondrial genomes ofJapanese wolf specimens in the Siebold collection, Leiden. Zoological Science 38, 60-61.→
電子出版は 2020 年度
その他
Gojobori J, Arakawa N, Xiayire X, Matsumoto Y, Matsumura S, Hongo H, Ishiguro N, Terai Y.
(2021) The Japanese wolf is most closely related to modern dogs and its ancestral genome
has been widely inherited by dogs throughout East Eurasia.
bioRxiv, https://doi.org/10.1101/2021.10.10.463851
石黒直隆 松村秀一 寺井洋平 本郷一美（2021）オオカミやヤマイヌと呼ばれたシーボルトが残した二ホンオオカミ標本の謎

日本獣医師会誌 74：389-395

口頭発表
学会発表 (すべて招待)
本郷一美 本郷一美「家畜化過程におけるヒトー動物関係」 遺伝学研究所 行動遺伝学研究会「家畜化機構の解明」 (2021.12.21-22)
Terai, Y.

The evolutionary process of dogs domesticated from gray wolves.（AA 研 2021 年

度第 1 回研究会 2021. 9.）
寺井 洋平 「ニホンオオカミゲノムから明らかになったイヌの初期の進化」（第２回コンパニオンアニマルのゲノム医療研究会 2021. 12.)
寺井 洋平 「ニホンオオカミゲノムから見たイヌの初期の進化」（行動遺伝学研究会「家畜化機構の解明」 2021. 12. 国立遺伝学研究所）
寺井洋平 Japanese wolf genome and the origin of dogs（国立遺伝学研究所集団遺伝研究室

斎藤成也教授 退職記念シンポジウム 2022. 3.)

Xiaokaiti, X.( 2022) Archaeogenetical study of domestic dogs in East Asia. Ancient DNA
journal club, Dr. Yang's laboratory, （3 月 4 日オンライン Department ofArchaeology, Simon Fraser University）.
Xiaokaiti, X.( 2022) Archaeogenetical study of domestic dogs in East Asia. 斎藤成也教授退官記念シンポジウム（国立遺伝学研究所、3 月 5 日オンライン）
メディア関連Sciencehttps://www.science.org/content/article/mysterious-extinct-japanese-wolf-may-hold-cluesorigins-dogs#.YW4PnGW-RHc.twitter
NATURE 21 October 2021
https://www.nature.com/articles/d41586-021-02890-z
New Scientist, 19 Oct 2021
https://trueviralnews.com/52799-extinct-japanese-wolf-is-the-closest-wild-relative-of-dogs-yetfound.html
True Viral News, 19 Oct 2021
https://www.newscientist.com/article/2294090-extinct-japanese-wolf-is-the-closest-wildrelative-of-dogs-yet-7

found/?utm_campaign=RSS%7CNSNS&utm_source=NSNS&utm_medium=RSS&utm_conten
t=lifeExpress Informer, 20 Oct 2021
https://expressinformer.com/dna-confirms-japanese-wolf-extinct-for-115-years-is-the-closestknown-wild-relative-of-modern-dogs/
India Times Post, 20 Oct 2021
https://www.indiatimespost.com/dna-confirms-japanese-wolf-extinct-for-115-years-is-theclosest-known-wild-relative-of-modern-dogs/
Whats New, 20 Oct 2021
https://whatsnew2day.com/dna-confirms-japanese-wolf-extinct-115-years-is-most-known-wildrelative-of-modern-dogs/
The Japan Times, 21 Oct 2021
https://www.japantimes.co.jp/news/2021/10/21/national/science-health/japanese-wolf-dogorigins/
Phys.org, 21 Oct 2021 https://phys.org/news/2021-10-dna-japanese-wolf-closest-relative.html
Smithsonian Magazine, 21 Oct 2021
http://ct.moreover.com/?a=46155009257&p=1pl&v=1&x=Q1OcuhwQksCMIEpJsQgs_g
Yahoo! News, 26 Oct 2021
http://ct.moreover.com/?a=46195003424&p=1pl&v=1&x=0DvOU2cU1dHPtQztdgumKw
朝日小学生新聞 11 月 25 日

紹介読売新聞 11 月 27 日 紹介
朝日放送ラジオ「おはようパーソナリティ道上洋三です」 12 月 6 日 出演
NHK world 1 月 8 日 出演
東京新聞 1 月 8 日

紹介

日経新聞 1 月 11 日 紹介
NHK 総合 ５月５日（2022 年）「柴犬 深堀り」 出演④その他参考になることがら（任意）Matsumura et al. の論文は Zoological Science アワード受賞が内定した。

8

2021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究

研究課題

人新世における適応進化：人工環境に暮らす野生動物の行動生態
沓掛展之

代表者氏名

高畑優（総研大）
共同研究者氏名（所加藤貴大（総研大）属）内田健太（UCLA）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

1,300,000

800,000

250,000

30,000220,000

00

執行額

1,300,000

721,472

241,488

23,183313,857

00

研究成果① 初年度からの研究経緯
本研究プロジェクトは、2019,20年度に共働プロの萌芽的共同研究として採択、実施された「シナントロープの認知行動学：人新世における適応戦術」の方向性を継承し、人工環境に暮らす野生動物の行動生態を研究することにより、人新世(anthropocene)における適応進化を明らかにすることを目的としている。人工環境に着目する理由は、現在、様々な生物学的現象に人間活動が強い影響を及ぼしており、動物行動を理解する際、環境の人為的変容を無視することはできないためである。たとえば、環境の急激な人為的変容の結果、本来は適応的である形質が不適応なものとなっている事例は多い。逆に、生物が兼ね備えている形質が人工環境においてより適応的となり、人間環境への進出を後押しする要因となっている場合もある。これらの点から、人工環境に生息する野生動物の研究は、都市生態学や保全生
物学のみならず、動物行動学・進化生物学の観点からも重要である。
本研究は、北海道帯広地域に生息するキタリスとその餌付けをめぐる問題、また、東北地方の農村地域に生息するスズメ類の繁殖生態を対象として、大学院生と博士研究員と共同で行うものである。しかし、新型コロナの流行などによって、長距離移動の制限、研究活動の自粛、その他の事情により、野外調査が計画通り進まなかった。その結果、当初、予定した計画を縮小し、部分的に実施することとなった。

② 成果
キタリス：帯広地域におけるキタリス（エゾリス）を対象に、人付けと餌付けを

9

伴う都市部と、自然環境での生態を比較し、人工環境での行動変容、および適応度
成分への影響を検証した。本年は、春季と秋季の調査を継続して行い、個体の生活史データの収集、とくに生存確認とメスの繁殖記録に関するデータを収集した。今後、このデータをベイズ統計学的手法により分析し、都市と郊外での生活史パラメーターの比較を行う。また、都心と郊外の個体群に見られる遺伝的構造を調べ、その違いについて分析した。これらの成果は高畑の博士研究の中心となるものであり、本プロジェクト終了後にできるだけ早いうちに論文として発表する。なお、秋季の餌貯蔵行動（貯食）における経済的意思決定に関する成果は論文執筆を終えて、これから投稿する段階にある。また、キタリスに対する餌付けをテーマとした
社会調査も行い、十分なデータを得ることができた。この成果に関しても、今後、まとめる予定である。

スズメ：秋田県大潟村において、人為的影響が存在する農村部で調査を行い、スズメの繁殖パターンを調べた。とくに、農村などの人工環境に見られる営巣密度が高い地域と、人間の影響が小さく営巣密度が低い地域の比較を行った。本年は、出生地からの分散に見られる性差を分析し、論文として出版した(Kato et al. 2022, inpress)。この論文では、足輪により個体識別されたスズメを対象に、出生した地域から成鳥として再捕獲された場所までの分散距離を計測し、営巣密度と性別の効果を調べた。その結果、分散距離に性差はなかったが、出生地域以外で見つかる可能性はオスよりもメスの方が高いという性差が見つかった。ただし、高密度地域と低密度地域の間で、出生地域以外で再確認される可能性に違いはなかった。これらの結果は、スズメにおいて、オスよりもメスが分散する傾向にある種であることを示しており、スズメ目をはじめとする鳥類で幅広く見られる傾向がスズメでも見られることを発見した。また、営巣密度の効果が見られなかった点は、人為環境においても分散という基本的な行動傾向は不変であることを示している。分散以外には、営巣密度が母鳥のストレスレベルに与える影響を調べる目的で、糞中コルチコステ
ロンの分析を行った。これらの結果は今後、すみやかに論文として発表する予定である。

③ 発表リスト•

Kato T, Matsui S, Mikami OK, Ueda K, Kutsukake N. 2022, in press, Sex differencein natal dispersal in the Eurasian tree sparrow (Passer montanus). Ornithological
Science•

高畑優・内田健太・嶌本樹・沓掛展之・大槻久 都市郊外に生息するキタリスの生存率と寿命推定 第39回日本動物行動学会大会 2020/11/20-22 オンライン

10

④ その他
研究規模を縮小したために、年度途中で予算を一部返納した。

112021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究

日本人の起源と由来を問う―東アジア人の全ゲノム配列と比較し

研究課題

てー
颯田葉子

代表者氏名

岩﨑理紗

（総研大先導研）

藤戸尚子（国立遺伝学研究所）

Hie Lim Kim （シンガポール南洋工科大学）
Anik Budhi Dharmayanthi
Wanjing Zhang
共同研究者氏名（所属）Wen Ya Ko（インドネシア科学院）（米国 NIH ）（台湾陽明大学）

研究費執行状況
合計

人件費

予算額

1,600,000

1,200,000

執行額

1,559,736

1,160,298

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

0

400,000

150,000000357,174

42,26400

研究成果① 研究経緯:現生人類（ヒト）は今からおよそ６万年前にアフリカを出て、４.５万年前までにはユーラシア大陸やオセアニアの各地に拡散した。この拡散はアフリカとは異なった多様な局所的環境に適応するプロセスでもあった。本研究では、研究分担者の岩﨑理紗の研究で明らかになった、日本人特異的に頻度が高い胃がん関連のSNP(リスク
SNP)に関する非リスクSNPの日本人(JPT)と中国人(CHB)集団で働く自然選択について調べた。具体的には、JPTとCHB以外の1000 genome project (1KGP) 集団で独自に開発した2D-SFS(Two Dimensional Site Frequency Spectrum)法を用いて、自然選択のシグナルの検出を行った。また、東アジア人のゲノム中に検出される旧人デニソワから浸透したDNAを手がかりとして、初期の東アジア集団の構造（内陸集団と海岸線集団の分化）と日本人の移動経路（南回りルートと北回りルート）ならびに適応的浸透の例（e.g., デニソワ由来の寒冷地適応遺伝子WARS2）を明らかにする。大12

多数の集団に関しては公共データベース（1000genome projectや論文として発表されたもの）のデータを利用するが、アメリカ先住民は東アジア人の拡散と古代北ユー
ラシア集団との交雑を知るタイムカプセルなので、とくにCoriellから購入したブラジル先住民（Surui、２個体）の全ゲノム配列をMacrogen社に委託して決定し２集団のアンセストリーを詳細に調べる。

② 成果：
I.日本人特異的に頻度が高い胃がん関連のSNP(リスクSNP)の非リスクSNPに対する自然選択の働き方について、
JPTとCHBでは、非リスクSNPにかかる自然選択の様相が違っていることが明らかになっていた。２種類のハプロタイプ（CCA と CAG）が非リスクSNPを含んでいるが、このうちCHBでは両ハプロタイプに自然選択が働いている一方で、JPTではCCAのみに働いていた。そこで、両ハプロタイプの自然選択の働き方をJPT/CHB以外の集団で比較することにした。解析の対象を1000 genome project (1KGP)のヨーロッパ集団 (EUR)、
アフリカ集団 (AFR)、南アジア集団 (SAS)、アメリカ集団 (AMR)、JPTとCHB以外の東アジア集団 (EAS)に広げたところ、全ての集団に２種類のハプロタイプが存在する
ものの、EURとAMRでは自然選択のシグナルはいずれのハプロタイプでも検出されなかった。また、AFRではCAGのみに、一方、SASとEASではCCAのみに自然選択のシグナルが検出されるという結果を得た。この自然選択の様相をFstを基に描いた
population treeの上に載せてみると、異なる地域で自然選択のOn/Offが頻繁に起きている
ことが明らかになった。しかしこのOn/Offの時期をABC(Approximate BaysianComputation)法と標的となったハプロタイプのTMRCA(Time of Most Recent Common
Ancestor)を推定するという異なる二つの方法で推定したところ、どちらの方法でも、今からおよそ3万年ほど前となることがわかった。概ねどの集団でも同じような推定値を得た。この結果を、現在国際誌に投稿するように準備している。
II. 東アジア人のゲノム中に検出される旧人デニソワから浸透したDNA
アジア人のゲノム中にはD0,D1,D2という異なる３種類のデニソワ系統が浸透しており、D0は東アジア人(EAS)に特異的、D1はパプアニューギニア(PAP)に特異的、それに対して、D2は南アジア(SAS)を含めたアジア人全般に広く共有されている浸透DNAであることがわかっている。そこで、まず、これまでにデニソワの浸透DNAが調べられている1KGPおよびSGDP(Simon’s Genome DNA Project)のゲノムDNA中のD0,D1,D2の浸透量を定量的に記述することから始めた。その結果、PAPのゲノム中には他の集団よりもはるかに大量のデニソワの浸透DNAが存在し、かつその大部分（約80%）はD2由来、残りの20%がD1由来であることがわかった。また、SASは量的にはPAPには及ばないが、割合としては、PAPと同程度のD2浸透を含んでいるが、それと混在している浸透
DNAはD0由来であることがわかった。それに対して、EASでは、およそ40%がD0由来

13

60%がD2由来の浸透DNAであることも明らかになった。

③ 発表リストI.

Risa L. Iwasaki and Yoko Satta 「Spatial and temporal diversity of the positive
selection on shared haplotypes at PSCA locus among worldwide populations」
（投稿準
備中）

II.

Yoko Satta, Denisovan Introgression in Asia, 遺伝研研究集会 斉藤成也教授 退職記念シンポジウム、三島、2022.3.5〜3.6

III.

岩﨑理紗、颯田葉子 「standing variation によって生じたヒト集団ごとのadaptive allele に見られる多様性 日本進化学会第 23 回 東京大会(8/18-21)

IV.

Risa L. Iwasaki and Yoko Satta 「A diversity of selection modes has resulted fromchanging of target haplotypes in a gastric cancer-associated genomic region」 SMBE
2021 (7/3-8)

On line④ その他参考になることがら（任意）：
Iについては、今後は1KGP以外の集団について同様の解析を進めると同時に自然選択のOn/Offを決める生物学的要因の探索を進める。
IIについては、アジア人の由来を知る上で重要な位置づけになるアンダマン人のOngeお
よびアメリカ先住民のSuruiのゲノム（2021年度ゲノム配列を決定した）の解析を進める。

14

2021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究

研究課題「科学と社会」の新物質主義的再構成：個体化・共生・市民参加を中心として

伊藤憲二

代表者氏名

水島希（総研大／叡啓大学）
壹岐朔巳（総研大）吉沢剛（関西学院大学）
ヨーク・ケネンス（ルーヴァン・カトリック大学／ベルギー原子力
研究センター）
ミヒェル・ヴァン・アウドヒュースデン（ケンブリッジ大学）

共同研究者氏名（所属）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

予算額

140,000

900,0000

執行額

139,953929,672

0

役務等

消耗品

100,000

400,00000470,281

0

0

0

備品

謝金

研究成果
① 初年度からの研究経緯
本研究の目的は国際的・学際的な研究チームによって「科学と社会」分野を新物質主義的アプローチによって再検討し、科学と社会をめぐる具体的な問題のいくつかに適用することである。
伝統的な人文社会学は人間中心的な手法をとり、それが「科学と社会」を対象とするとき、「科学」は人間ないしその集合体の活動としての側面が分析の重点となる。
その結果、「科学」が対象とする「自然」はしばしば分析の対象からはずれ、依然として科学と社会の二項対立は残り続ける。しかし、近年の人文社会学においては、人間中心的な観点から脱却して人間活動や社会をとらえようとするポストヒューマニズ

15

ムと呼ばれる革新が進行しつつある。この潮流の一つは、人文社会学の課題においても物質の役割を大きくとらえる新物質主義である。このような観点から「科学と社会」の研究領域を再検討すれば、自然を対象とする科学と人間の集団の社会という二つの実体の相互作用というよりも、両者を物質的な基底を通して連続しているものとしてとらえることができ、真の意味での学融合的な研究枠組みが実現することが期待される。本研究は、このような基礎理論を発展させ、具体的な事例、とくに共生にかかわる事例に適用するものである。これによって、本専攻における「科学と社会」分
野の教育研究を深化させ、本専攻の重要概念である「共生」についての学際的研究を推進することが期待できる。
このようなアプローチの研究は日本ではまだ少ないが、理論面でも実証面での研究を水島が先進的に進めている。他機関に着任するまでの期間、水島を博士研究員として雇用し、水島を中心として研究を進め、国際的なチームによってサポートすること
によって、国際水準の成果として発表することを目指すものである。ただし、一年間の研究であるので、すべての成果が出版に到達したわけではない。
共同研究者としては、申請時に記載した上記の五名のほか、四月から着任した鈴木
和歌奈助教が加わった。共同研究は、ビデオ会議システムを用いたオンラインでの月
一回の定期会合とSlackを用いて連絡をとりつつ、各自担当箇所を進めた。
② 成果
参加者全体で、基礎理論の検討：新物質主義とそれに関連する理論のうち、「科学と社会」に関するものを検討し、その理論的発展を討論した。具体的にはActorNetwork theory、Karen Baradのagential realism、Manuel Delanda等のassemblage theoryなどである。
新物質主義を市民科学の分析に適用した。福島原発事故における放射能市民測定を事例とし、2019年度に共働プロ国際共同研究によって部分的に支援されてなされた実証研究を、本研究を通して発展させた。この成果の一部分は、期間内に論文として国際誌に発表された。
生命現象における個体性と共生について考察した。これは壱岐の副論文をもとに、論文化を目指したものである。当初は、比較的短期間で国内の和文誌に投稿することを想定していたが、検討の結果、国際誌を目指すことにし、次年度以降に持ち越された。
新物質主義的観点を災害、とくに地震についての人文社会学的研究に適用し、災害と社会に関する文化表象を検討して、災害時における政策決定の様々な理解の仕方を検討した。これは主に伊藤が担当し、『現代思想』に論文を発表した。
四月に着任した鈴木助教は、以前からアクターネットワーク理論やD・ハラウェイに関する研究を進めており、本研究の期間中に以前からの調査・研究の成果を含めた論文や翻訳が出版された。
③ 全発表リスト16

・伊藤憲二（2021年9月）「地球的災害の知の物語：『日本沈没』における科学と社会」『現代思想』49(11), 243-253.
・Kenens J, Van Oudheusden M, Van Hoyweghen I, Mizushima N (2021). Nonscalability of“citizen science” in post-Fukushima Japan: Unpacking articulations of citizen radiation
measuring organizations. Public Understanding of Science 096366252110547096366252110547.
④ その他参考になることがら
予算としては2021年度で終了であるが、共同研究は今後も継続し、研究成果の出版
を目指す。

17

2021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究

研究課題

チョウ類の嗅覚系における多様性と環境適応の解明
木下 充代

代表者氏名

Clément Cechetto（総研大・先導科学研究科）
大田 竜也（総研大・先導科学研究科）
安藤 規泰（前橋工科大学・工学部）
共同研究者氏名（所Giovanni Galizia（コンスタンツ大学・生物学部）

属）

研究費執行状況
合計

人件費

予算額

4,500,000

2,970,000

執行額

5,900,000

3,051,192

旅費
011,260

役務等

消耗品

備品

謝金

720,000

810,000

0442,395

640,323

1,659,680

095,150

研究成果
萌芽的共同研究① 研究経緯チョウ類の食草選択に関わる嗅覚系の多様性と進化学的研究を進めるため、1. 嗅覚の神経生理、2. 第一次嗅覚中枢構成の種間比較、3. 嗅覚受容体の分子進化の研究基盤を整えることを目的に１年間実験的研究を行った。また、計画実施直前に雇用予定であった高橋氏が他大学への就職が決まったため、昆虫における神経生理学の基礎的技術を持つ Clément Cechetto 博士を雇用、さらにカイコでの嗅覚情報処理機構の研究経験のある安藤規泰准教授（前橋工科大学）が新たに電気生理学実験アドバイザーとして共同研究に参加した。これにより、研究計画を一部変更して嗅覚の神経生理学では、主に触角における電気生理学的実験の系を立ち上げた。
② 成果
１． 嗅覚の神経生理学（担当：Cechetto、安藤、木下、Galizia）
最大の成果は、嗅覚情報処理の生理学的な実験に不可欠な刺激の提示方法を確立できたことである。刺激の提示方法が決まったことで、触角葉やより高次の脳領域
でのイメージングや細胞内記録を実施へ研究を発展させる基盤が固まったと言える。
昆虫の匂い受容器である触角には、匂い分子を受容する感覚子が多数分布し、そ18

こに含まれる嗅受容細胞から伸びた軸索群が触角神経束となって第一次嗅覚中枢（触角葉）に投射する。ある動物がどのような匂いに感度を持つかを調べる最も基礎的な計測法として、切断した触角の断端に電極につないで臭いへの反応を記録す
る触角電図の記録がある。これまでアゲハチョウ類では、他の鱗翅目昆虫と同じ方法で測定した触角電図の応答が解析に耐えないほど小さく、このことが研究の発展を大きく妨げていた。そこで、計測装置の改良に加え、改めて匂いの提示方法について検討した。その結果、匂いのパルスを与えるキャピラリーの先端から触角までの距離を変えて触角電図を測定したところ、2 cmの距離から匂いを与えるよりも、
10 cmの距離から与えた方が大きな応答が出ることがわかった。遠くから与えた刺激により大きく応答するという一見矛盾した結果から、ある程度の距離から匂いを与えたことで、長い触角に分散してある感覚子を広く刺激できたと考えている。今後、この仮説を確認するため触角上の感覚子の分布等を解析する
本実験では、匂い刺激にオレンジとユリの花の精油を用いた。オレンジの花の匂いは ユリに比べ大きな応答が得られており、高次での情報処理などの実験にも使用可能であることがわかった。また、匂い応答の濃度依存性が低いという特徴も見出した。今後は食草の匂い成分単体・人工的に合成した匂いも使い応答の雌雄差を測定する予定である。
年度内にカルシウムイメージングシステムの立ち上げに必要な機器類が揃えることができた。またGalizia 教授のアドバイスの元、実験でチョウを固定する専用プ
ラットフォームの試作などを行った。
２． 第一次嗅覚中枢の種間比較（担当：木下）
本項目では、アゲハチョウ亜科（Papilionidae）に属する６種と近縁であるウスバ
シロチョウ族、さらにタテハチョウ科に属する２種の全８種を対象に、全脳のシナ
プシン染色を行い、触角葉の糸球体構成について調べた。いずれの種の触角葉も６０個程度の糸球体を含んでいた。糸球体の数はカイコガやタバコスズメガの結果とほぼ一致するのに対し、ゴキブリやハナバチ類とは大きく異なっていたことから、鱗翅目昆虫の触角葉を構成する糸球体数が６０前後という特徴が明らかになった。
アゲハチョウ亜科には、アゲハチョウ属・アオスジアゲハチョウ属・ジャコウアゲ
ハチョウ属が含まれるが、メスの触覚葉に肥大化した性的二型を示す糸球体があることを、アゲハチョウ族に属する４種（ナミアゲハ・クロアゲハ・モンキアゲハ・キアゲハ）とアオスジアゲハで確認した。この性的二型を示す糸球体の数は、アオ
スジアゲハで１、クロアゲハ・モンキアゲハ・キアゲハで２、ナミアゲハでは３個と種によって異なっていた。一方、ジャコウアゲハ・ウスバシロチョウの触角では、肥大化した糸球体ひとつを雌雄共に確認した。タテハチョウ科に属するアサギ
マダラとツマグロヒョウモンの触角葉では、アゲハチョウのように特徴的な糸球体はなく、いずれの糸球体も同程度の大きさであった。これらの試料については、今
後定量的な解析を進める。
触角葉は、主に嗅受容細胞・投射神経・触角葉内在神経から成る。一般的に、糸球体の数は、その動物が受容できる匂い成分の数に、そのサイズは特定の嗅受容細19

胞の数に対応すると考えられている。このことから、鱗翅目昆虫が受容できる匂い
成分の数は約６０種類程度であり、そのうち１〜３の成分についてはメスがオスよりも高い感度を持つのだろうと考えている。
メスで肥大化する性的二型を示す糸球体は、アゲハチョウ族（４種）に特徴的であった。鱗翅目昆虫のメスは、特定の食草にのみ産卵する。このとき、遠方から匂いを手がかりに植物に接近して、葉に降り立った時前脚先端にある味覚受容器で食草の最終判定をする。そのため、メスはオスよりも食草の匂いに対して感度が高い
可能性がある。さらに、実際に食草から出ている緑葉臭は、複数の匂い成分から成り、そのうちにいくつかの成分の混合比が弁別における鍵情報になっていると考えられている。以上を考え合わせると、今回見つかったメスで肥大化している糸球体は、匂い弁別の鍵になる成分を受容する可能性があり、今後の研究における作業仮説を立てる上で重要な知見となった。
３．嗅覚受容体の分子進化（大田）多重遺伝子族を形成する嗅覚受容体（OR: Olfactory/Odorant Receptor）をアゲハチ
ョウ属の３種（ナミアゲハ・キアゲハ・シロオビアゲハ）について調べ、少なくともナミアゲハのゲノムに５７個、キアゲハのゲノムに５７個、シロオビアゲハのゲ
ノムに６２個のOR遺伝子が存在することを明らかにした。またキアゲハのOR遺伝
子はZおよびWの性染色体上には座上せず１８本の常染色体に散在していることを示した。これらのOR遺伝子とカイコガ・オオタバコガ・ハスモンヨトウおよびその近縁種のOR遺伝子を用いた系統解析で、鱗翅目のOR遺伝子がチヨウ目とトビケラ目が系統分化する以前から分岐したグループに分けられ、そのグループの多くが各進化系統で２億年以上にもわたる長い進化時間で保存されてきたことを示した。
これは鱗翅目におけるOR遺伝子の多くが機能的に分化し各生物種で保存されてきたことを示唆している。さらにOR遺伝子近辺のゲノム領域をナミアゲハとカイコガで比較したところシンテニーが観察され、個々のOR遺伝子によって範囲は異なるものの多くのOR遺伝子の周辺領域の遺伝子の並びも保存されてきたことも示された。一方で、一部のグループに属するOR遺伝子はカイコガなどのガで拡張した
り、アゲハチョウ属で消失していることが確認した。これらのグループのOR遺伝子の拡張や消失について、今後さらに解析をすすめ、その進化過程を明らかにする予定である。
これとともに大阪大学の志賀向子研究室の協力の下、ナミアゲハの触覚のRNAseq解析を雌雄個別に実施した。解析した個体は雌雄それぞれ２回と数が少なく予備的であるが、発現量に２倍以上の差があるもの（FDR 0.01の基準で）として３４遺伝子が同定された。雌で２倍以上多く発現している遺伝子にはOR遺伝子が１
つ、OBP(Odorant binding protein)遺伝子が２つあった。これはアゲハチヨウでは、一部の匂い成分に対してメスで高い感度をもつとともに、匂い成分全般に対しオスよりメスで感受性が高い可能性を提起している。今回の結果は今後の検証が必要なものの第一次嗅覚中枢の解剖学的な観察を補完するものである。

20

③ 全発表リスト（論文や学会発表、予定を含む）、学会発表（予定）
Kinoshita M. and Matsushita A. A comparative study of enlarged sexual dimorphic
glomeruli in female swallowtail butterflies (Papilionini). 日本比較生理生化学会 第４４回高知大会 １１月２６−２７日④ その他参考になることがら
該当なし

21

2021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究

研究課題

物理障壁のない海洋での２つの生殖的隔離機構の進化過程の解明
寺井 洋平

代表者氏名

佐々木 顕

（生命共生体進化学専攻・教授）

宅野 将平（生命共生体進化学専攻・助教）

共同研究者氏名（所仮屋園 志帆 （特別研究員）

属）

井口 亮

（産業技術総合研究所・主任研究員）

Zoe Richards（Curtis University 上級研究員）
David Miller （James Cook University, 教授）

研究費執行状況
旅
合計

人件費

役務等

消耗品

備品

謝金

費
予算額

3,600,000 + 200,000

2,129,854

0

1,067,206

862,32900

執行額

3,799,860

2,129,854

0

1,067,206

862,329

0

0

研究成果
①

初年度からの研究経緯 (研究期間は2021年度)
物理的障壁のない海洋で、どのように集団間の生殖的隔離、つまり種分化が起きるのだろうか。本研究はこの問いに、サンゴ礁を形成する造礁サンゴ（イシサンゴ
目）の中の遺伝的に近縁な２種に着目し取り組んできた。
サンゴで全ゲノム塩基配列が初めに解読された、コユビミドリイシに遺伝的に近縁だが生殖時期の違いにより、生殖的隔離が生じた種(コユビミドリイシ近縁種)が存在する。これら２種の配偶子は受精可能であるが、産卵時期の違いにより、これら２種は生殖的に隔離されている。そこで本研究は、これら２種のサンゴを海洋での種分化のモデルとして、集団ゲノム解析、分子進化解析、および数理生物学的アプローチから、種分化に関わるゲノム領域と遺伝子を明らかにし、環境情報も含めて生殖的隔離の進化条件等を解明することを目的とした。
研究計画の変更点としては、コユビミドリイシ近縁種の追加の採取を計画していたが、新型コロナウイルスの流行の影響によりサンプリングを実施できなかった。
そのため、配偶子認識による生殖的隔離についての研究は中止した。海外の共同研
究者とはメールを基本とした議論を行なった。

②

成果
共同研究者からこれまでに提供されていたサンプルを用いて、ゲノムDNAの抽出を行い、次世代シークエンスによりゲノムサイズの20x程度になるようにゲノムDNAの配列を決定した。研究対象(コユビミドリイシと近縁種)の２種それぞれ10個体以上

22

になるようにサンプルの選定をおこなった。これらゲノムのゲノムデータからSNPsを抽出して、系統関係と過去の交雑の歴史、および２種間で分化したゲノム領域を特定する解析をおこなった。これらの解析から以下のことが明らかとなった。
１、コユビミドリイシと近縁種は遺伝的にわずかに分化しているが、分化の程度は非常に小さい。系統樹を構築すると、コユビミドリイシと近縁種はそれぞれ単系統になるが、それぞれを分ける枝の長さは短く、また遺伝的分化の指標のFstも0に近く、分化の程度が小さいことをあらわしていた。
２、集団ゲノム解析により、過去に２種間でのゲノム浸透が起きていることが明らかになった。またゲノム浸透は片方の種からもう片方の種に大きく浸透していたるが、逆は小さいことが明らかになった。ゲノム浸透の非対称性について、
数理生物学的な考察を行なった。産卵時期を決める環境要因と、それによる１種の産卵時期の変化の幅、２種の集団サイズの違い等の要素を検討すること
で、交雑の一方向性を説明できる可能性あるという方向性が示された。
３、2種間が遺伝的に極めて近縁であるにもかかわらず、産卵時期が異なるため、2種間の違い(産卵時期や形態など)に関与する遺伝子の存在する領域は、2種間で完全に分化していることが予想されていた。そこで、得られたゲノム配列の解析を行うと、実際に完全に分化した座位を含む2種間で分化した領域が存在する
ことが明らかになった。これらの領域には遺伝子が存在しており、それら遺伝
子の産卵時期の違いでの役割を明らかにしようとしている。
これらの結果は、共同研究者のDavid Miller博士とZoe Richards博士と議論を行なった。そしてオーストラリアに生息する、同調時期の異なるミドリイシ属サンゴについて貴重な情報の提供を受けた。それに加え、本研究課題でおこなっている全ゲノム情報を用いた解析に興味を持っていただいたので、オーストラリアのサンゴを用いて同様の解析を始めたいとの連絡もあり、共同研究が益々発展すると期待される。

③

全発表リスト（論文や学会発表、予定を含む）

原著論文
Takahashi-Kariyazono S*, Terai Y*. Two divergent haplogroups of a sacsin-like gene in
Acropora corals Scientific Reports 11: 23018 (2021) 査読あり
学会発表
仮屋園志帆、井口亮、寺井洋平 ミドリイシ属サンゴの産卵時期決定の遺伝的基盤の解明にむけて 日本サンゴ礁学会第２４回大会(2021年11月27日-29日)
Shiho Takahashi-Kariyazonoa and Yohey Teraia Two divergent haplogroups of a sacsin-likegene trace back to the origin of Acroporidae corals SMBE 2021 3-8 July

23

仮屋園志帆、井口亮、寺井洋平 ミドリイシ属サンゴの産卵時期決定の遺伝的基盤の解明にむけて 日本進化学会 第23回東京大会(2021年8月18日-21日)④

その他参考になることがら242021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
萌芽的共同研究）

研究課題

昆虫複眼の構造的バリエーションを生み出す発生プログラムの解明
渡邊 崇之

代表者氏名

Mike Perry (UC San Diego・Assistant Professor)
蟻川 謙太郎 (総合研究大学院大学先導科学研究科・教授)

共同研究者氏名（所属）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

3,000,000

001,763,960

600,240

635,800

0

執行額

3,000,000

00863,236

1,388,764

748,000

0

研究成果① 初年度からの研究経緯
昆虫の複眼は８−９個の視細胞を持つ個眼が多数アレイ状に敷き詰められた基本構造を共有するが、種・系統ごとに驚くべき構造的バリエーションを有し、不完全変態
から完全変態への後胚期発生様式の進化に伴い発生様式が変化している。本研究では、複眼の構造的バリエーションのひとつである「複眼の領域化」について、原始的な不完全変態昆虫であるコオロギを材料にその発生プロセスを解明し、比較発生学的観点から昆虫複眼の構造的バリエーションの進化プロセスを考察することを目指す。
コオロギの複眼には青オプシンを持つ視細胞が背側辺縁部・腹側帯状領域の２領域に限局して分布する。ショウジョウバエやアゲハチョウでは青オプシン発現視細胞の分化が Spineless 遺伝子に依存することが示されており、本研究でも Spineless 遺伝子に着目して背側辺縁部・腹側帯状領域の領域化メカニズムを明らかにする。
本研究は単年度の研究であるため、今年度は今後本研究課題を本格的に実施していくための研究基盤の整備を進めた。

25

② 成果
1. コオロギ複眼で発現する Spiniless 遺伝子の配列決定
コオロギ Spineless タンパク質に対する特異的抗体の作成や、CRISPR/Cas9法による Spineless 遺伝子の遺伝子破壊を実施するために、コオロギ複眼で発現する Spineless 遺伝子の遺伝子クローニングを進めた。Spineless 遺伝子
は、ショウジョウバエでは 1000 アミノ酸残基を超える比較的分子量の大きな bHLH-PAS 型転写因子をコードする遺伝子であるが、これまでフタホシ
コオロギの Spineless ホモログの配列は決定されていなかった。そこでまず、フタホシコオロギドラフトゲノムデータから Blast 検索によってSpiniless 遺伝子のコード領域を探索した。その結果、フタホシコオロギゲノ
ム上に Spineless タンパク質の N-末端領域をコードするエクソン領域が推定できたが、C-末端領域についてはゲノム配列情報が欠損していることが明らかになった。そこで別種のコオロギ (エンマコオロギ２種、ハワイ産コオロギ１種) のドラフトゲノム情報を利用して C-末端領域をコードするエクソン領域の推定を進めた。次に、RT-PCR 法、degenerate PCR 法によって、Spineless タンパク質の N-末端領域・C-末端領域をコードする部分長 cDNAの増幅を試みた。その結果、N-末端領域をコードする cDNA は増幅できた
ものの、C-末端領域をコードする部分長 cDNA を増幅することができなかった。先に実施したコオロギ Spineless 遺伝子の推定では、コオロギ
Spineless タンパク質の C-末端領域をコードするエクソンに複数のトリプレ
ットリピート配列が見つかっており、この反復配列が PCR 増幅を強く阻害した結果、増幅が困難であったと考えている。
このように Spiniless 遺伝子の配列決定に予想以上の時間がかかったた
め、今年度行う予定であった Spineless タンパク質に対する特異的抗体の作成や Spineless 遺伝子の遺伝子破壊実験について、一部研究計画を変更する必要が生じた（詳しくは後述する）。

2. CRISPR/Cas9 法による Spineless 遺伝子ノックアウト系統の作成
コオロギ Spineless 遺伝子の遺伝子破壊系統の作出を目的として、コオロ
ギ初期胚を対象とした CRISPR/Cas9 法による遺伝子編集実験を遂行した。
まず、コオロギ Spineless 遺伝子の第１コーディングエクソンを標的とした guide RNA を２種類設計した。これら２種類の guide RNA の性能評価を
以下の手順で進めた。まず、guide RNA/Cas9 複合体を、産卵後 1 時間以内に低温処理により胚発生を停止させたコオロギ初期胚に顕微微量注入した。
この初期胚を４〜５日間培養して胚発生を進行させた後にゲノム DNA を抽出・精製した。次に、この胚由来のゲノム DNA を鋳型として guide RNAの標的配列を含む第１コーディングエクソン近傍の領域を PCR で増幅し、High resolution melting 法によって InDel 変異によって生じた塩基多型を検出した。その結果、２種類の guide RNA それぞれを顕微微量注入されたコオ26

ロギ胚で InDel 変異が検出された。このことから、本研究で設計したSpineless 遺伝子を標的とした２種類の guide RNA は生体内で標的配列を切断する活性を持つことが明らかになった。
Spineless 遺伝子の遺伝子破壊系統を得るためには、guide RNA/Cas9 複合体を顕微微量注入した G0 世代のコオロギを掛け合わせ、生じた G1 世代の個体から Spineless 遺伝子に InDel 変異の入った変異体を選抜する必要がある。この作業は非常に煩雑で実験コストがかかるため、本研究では
CRISPR/Cas9 の切断サイトに外来遺伝子を組み込む Knock-in 法を利用して、Spineless 遺伝子座に蛍光タンパク質遺伝子を組み込むことで、蛍光タン
パク質遺伝子の発現の有無を指標に Spineless 遺伝子の機能欠失型変異体を選抜する方法を採用した。Spineless 遺伝子座に挿入する蛍光タンパク質遺伝子として、複眼で赤色蛍光タンパク質を発現させる遺伝子発現カセット(3xP3-mScarlet-I) を準備し、このカセットの両末端に CRISPR/Cas9 切断サ
イトを付与しプラスミドベクターに組み込んだ。コオロギ初期胚に、①Spineless 遺伝子を標的とする guide RNA/Cas9 複合体、②3xP3-mScarlet-I カ
セットを含むプラスミドベクター、③プラスミドベクターを切断する guide
RNA/Cas9 複合体、これら３者の混合液を顕微微量注入した。インジェクシ
ョンを受けた G0 世代のコオロギ（~50 個体）は現在順調に生育している。
野生型・変異型の Spineless 遺伝子を持つ細胞のモザイクであると考えられ
る G0 世代は、少なくとも胚期・幼虫期には致死とならず、これまでのところ目立った表現系は見つかっていない。
3. コオロギオプシンタンパク質・Spiniless タンパク質に対する特異的抗体の作成
コオロギ複眼では青オプシン、紫外線オプシン、緑オプシンの３種類の光受容タンパク質が発現することが知られる。本研究ではこれら３種類の光受容タンパク質を特異的に認識する抗ペプチドポリクロナール抗体を作成した。データベース上に登録されているコオロギオプシンタンパク質のアミノ酸配列情報をもとに抗原ペプチドを設計し、マウス、モルモット、ラットにおける抗体作成を実施した（抗原ペプチドの合成、免疫は外注で実施）。
一方、コオロギ Spiniless タンパク質に対する抗体の作成については、計画通りに実施できなかった。当初、Spiniless タンパク質の C-末端領域を抗Spiniless 抗体の抗原として利用する予定であった（リコンビナントタンパク質の発現・精製、抗体作成の作業を外注）。しかし、前述の通り Spiniless タ
ンパク質の C-末端領域をコードする cDNA 配列の取得に想定以上の時間がかかったため、Spiniless タンパク質の N-末端領域を抗原として使用するとともに、リコンビナントタンパク質の発現・精製についても研究代表者の渡邊が実施する方向に研究方針を変更した。
Spiniless タンパク質の N-末端領域は、C-末端に ELP タグ・intein タグを融合したリコンビナントタンパク質として大腸菌で発現させた。まず、これ

27

ら２つのタグを組み込んだ大腸菌リコンビナントタンパク質発現ベクターを新規に構築し、このベクターに 1. の配列決定実験で得られた cDNA 配列を挿入した。ELP タグ融合タンパク質は逆転移サイクリングによって細胞粗抽出液より簡便に分離・精製することが可能で、その後 intein によるタグ
切断によって Spiniless リコンビナントタンパク質が得られる。予備的なタン
パク質発現実験により、新規に構築した発現ベクターよりリコンビナントタ
ンパク質が正しく発現すること、逆転移サイクリングによって ELP タグ融合タンパク質が分離できることを確認している。現在、intein タグの切断効率を向上させる変異を導入した改良型発現ベクターの構築を進めている。

③ 全発表リスト（論文や学会発表、予定を含む）
該当なし。次年度以降研究を継続し、論文、学会発表につなげる。
④ その他参考になることがら（任意）
該当なし。

28

2021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
プレリサーチ

研究課題
学術雑誌の科学史研究への進化学的方法の適用についての予備的研究

伊藤憲二

代表者氏名

共同研究者氏名（所属）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

200,000

129,600

予算額

509,600

180,000

執行額

509,566

488,566

21,000

研究成果① 研究経緯本研究は進化学の知見を学術雑誌に関する科学史的研究に適用するための予備的な研究を行うことを目的とする。進化学を科学の発展に適用することは、Karl PopperやThomas Kuhnなど、古典的な科学史・科学哲学において既に構想されていた。しかし、その段階での研究はごくあいまいに、ほとんどメタファーとして生物進化を用いているに過ぎなかった。より本格的に進化学的な発想を取り入れた科学史的研究は生物学の哲学者であるDavid Hull(1988)で、これは系統学諸学派の間の競争を進化学的に扱った。しかしこれも量的な分析まで踏み込んだものではない。科学史の分野は科学社会学、ないし科学哲学と比べても、いまのところ量的な研究はほとんど進んでいない（あるいは量的な研究は科学計量学と見なされている）。科学史の方法に関して「進化」という言葉が用いられても、その大部分は進化学とは無関係であるか、表面的にしか関係しないことが多く、文化進化学の発展も科学史の主流において科学史とは無関係のものとしてほぼ無視されている。しかし、この状況は今後デジタル・ヒューマ
ニティーズの発展に伴って、急速に変わっていくのではないかと考えている。
現在の科学史は基本的に人文学に属し、生物学における進化を安易に人間の歴史に適用することに対する強い警戒（いわゆるbiophobia）が残っている。進化学を生物に29

のみ関するものと見られたり、スペンサー流の社会進化論においてみられたように競争原理を軸とする俗流進化論で理解されたりすることが多く、それとまったく同じよ
うに社会や知識が発展するはずがない、あるいは競争原理の誇張とそれの社会における誤用は倫理的な問題を引き起こしてきたという（それ自体としては正しい）理由に
より、進化学の適用が忌諱されることが多い。しかし、生物学における進化以外の（つまり実際の生物においては偽とされるような）一般化された進化のモデルを考えることは可能であり、そのようなモデルが知識生産や社会の歴史的発展に対して有効である可能性は開かれている。
このような状況を背景として、本研究は改めて今日の科学史研究において数理的な手法をも含めた進化学的な方法の導入の可能性を検討しようとするものである。その際、種、遺伝子、個体、適応度等の生物学における諸概念が、知識生産の歴史において何に対応するのか（あるいはそもそも対応するものがあるのか）、それをどのように数量化し、数理的に扱うことができるのか、等が重要な課題となる。本研究においては、比較的数量化しやすく、科学計量学においてデータの蓄積のある学術雑誌や総合科学雑誌に注目する。日本の学術雑誌ないし総合科学雑誌をとりあげて量的・質的な分析の対象とし、学術雑誌を生物学における「種」にゆるやかに対応するものとして扱い、その進化学的理論と実証的なデータによるその科学史的検証の可能性を検討することを目指し、そのための準備を行う。
② 成果
本研究は実施期間が半年足らずのもので、将来の研究のための準備をするためのものである。具体的には次の事項を実施した。
１）

学術雑誌の歴史に関連する科学史的ないし進化学的研究の先行研究の収集と調査
本研究の先行研究として、次のような文献を収集し、検討した。
１） 学術雑誌に関する最近の歴史的研究。
２） 進化学の人文社会系分野への適用に関係する書籍。
３） 機械学習、科学計量学、人文社会科学における量的方法に関する書籍。
４） 学術雑誌の歴史的研究のための背景的知見を得るための先行研究。
２）

学術雑誌の歴史に関連する科学史的ないし進化学的研究を実施している研究者を講師としたセミナーの実施
学術雑誌の歴史的研究に進化学の知見を適用する際、鍵となると思われるのは、定量化の方法である。これに関する知見を得るために、考古学において量的方法を開発している中尾央南山大学准教授にセミナーを依頼すると同時に、助言を仰いだ。
３）

学術雑誌の歴史に関連する科学史的ないし進化学的研究の資料となる学術雑誌・総合科学雑誌の入手
学術雑誌のバックナンバーとして、中央公論社の『自然』と『日本数学物理学会
誌』を購入した。これらは備品として購入する予定であったが、一部当りの単価が小30さいため、予算上は消耗品扱いとなっている。当初、入手した学術雑誌のスキャンを行う予定であったが、著作権上の懸念と、時間的・予算的制約から今回は断念した。
③ 発表リスト（論文や学会発表、予定を含む）、なし。
④ その他参考になることがら
学術雑誌の科学史・科学社会学的研究に関する科研費・基盤（C）を申請し、採択された。本研究で手掛けた調査は、今後、この科研費の研究として継承・発展させる予
定である。

31

2021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
プレリサーチ

研究課題

競走馬生産における遺伝子診断の導入
印南秀樹

代表者氏名

印南秀樹 集団遺伝学 先導科学研究科 教授 総括
佐藤文夫 獣医学 JRA 日高育成牧場

研究員

獣医、育成実習

共同研究者氏名（所Jeffrey Fawcett ゲノム情報学 理化学研究所

上級研究員 解析属）

坂本貴洋 学生 先導科学研究科 学生 DNA データ解析
須田鷹雄 競馬評論家 フリー 現地検証デザイン等
若原隆宏 記者 東京中日スポーツ メディア担当

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

1,000,000

001,000,000

0

0

0

執行額

1,000,000

001,000,000

0

0

0

研究成果
① 初年度からの研究経緯
本研究プロジェクトの目的は、ゲノム遺伝の「机上の理論」を、いっきに現場検証レベルに発展させるためのものである。研究対象は競走馬（サラブレッド）で、ゲノム解析結果をウマの生産性向上に繋げる。本プロジェクトの一部に対して、２０１８―
２０２０年に先導科学共働プログラムで研究のサポートを受けた。現状、本プロジェ
クトは成長段階にあり、今後のさらなる発展を期待して、２０２１年度は「プレリサーチ」としてサポートを受けた。
なお、ギャンブルに関係する本研究対象は、JSPS などからの資金援助は困難なものと考える。
成果
本プロジェクトでは、過去１０年にわたって北海道の競走馬生産牧場と親密な関係を築くことに努めてきた。この信頼関係は、遺伝子情報による育種という新しい技術を導入するに必須となる。２０２１年度も継続して、牧場からサンプルの提供をお願いする一方、結果を現場に還元することに努めた。本年度は特に日高地方の個人牧場を対象としたサンプルを多く集めた。
結果として、ウマの競走能力や生産能力に関与する遺伝子の候補をいくつか発見することができた。例えば図の遺伝子領域では、ハプロタイプ A と a が多型になってお32

り、A は頻度が低く、２倍体レベルでは Aa、aa という組み合わせが混在している。本
研究では Aa の個体の方が著しく競走成績が良いことがわかった。ちなみに、このハプロタイプ A はおよそ３０年前にアメリカから持ち込んだ種牡馬が日本にもたらしたものである。現状、このハプロタイプは日本のサラブレッド集団において急速に頻度を増やしている。

これらの遺伝子情報を使って効率の良い種牡馬 x 繁殖牝馬の組み合わせを探すアルゴリズムを開発し、将来的には、実際の繁殖に導入を試みる。同時に、候補遺伝子の一つ一つは、さらなる検証を重ね、特許取得につなげたい。
海外からの研究者の招聘
なし

発表リスト
Fawcett, J. A., H. Innan, T. Tsuchiya, and F. Sato, 2021. The effects of the first and last mating
age on the relationship between the advancing age and reproductive performance of JapaneseThoroughbred broodmares. J. Equine Sci. 32: 31-37.
「風」（エッセイ）ぱどっく２０２１ vol.44「遺伝子研究が導く、未来の血統理論」Ownership ２０２１ Summer

332021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
プレリサーチ（

原始的な昆虫の脳の性差を規定する分子基盤の解明に向けた

研究課題

網羅的遺伝子発現解析
渡邊 崇之

代表者氏名

共同研究者氏名（所属）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

1,089,000

001,089,000

0

0

0

執行額

1,089,000

001,089,000

0

0

0

研究成果
①

研究経緯

昆虫の性は、性特異的なスプライシング因子 Transformer の制御下で、細胞自律的に決定される。モデル生物であるキイロショウジョウバエでは、Transformer の制御下で脳・神経回路の性決定を制御する因子として、fruitless 遺伝子・doublesex 遺伝子が知られる。これら２つの遺伝子は転写因子をコードするが、これらの転写産物が性特異的ス
プライシングを受けることで、機能雌雄差を有する転写因子が生じることになる。その結果としてこれらを発現する神経細胞の遺伝子発現パターンの雌雄差が生み出される、というストーリーが昆虫脳の性決定メカニズムである、と信じられてきた。しかし、研究代表者の渡邊は、フタホシコオロギをはじめとする原始的な不完全変態昆虫では、
fruitless 遺伝子が性特異的なスプライシングを受けないことを明らかにしており、ショ
ウジョウバエで知られるメカニズムが昆虫種間で必ずしも広く保存されているわけではないことが明らかになりつつある。

34このような経緯から本研究では、今後コオロギなどの原始的な昆虫グループを対象に Transformer の制御下で性特異的なスプライシングを受ける遺伝子群や脳内発現量に雌雄差のある遺伝子群の網羅的な探索を進める基盤を整備するため、超ロングリー
ド次世代シーケンス法を活用したコオロギ脳トランスクリプトームデータベースの整備解を進めた。
② 成果
フタホシコオロギ (Hokudai WT 系統) は、成虫脱皮後３−４日で性的に成熟し、雄同士の闘争行動や求愛・交尾行動、産卵行動を顕著に示すようになる。本研究では、コオロギを孵化後から個別飼育し、成虫脱皮後７日齢の雌雄より脳神経節・食道下神
経節を単離し、total RNA を精製した。この RNA サンプルについて、かずさ DNA 研
究所に Iso-seq 解析を委託し、超ロングリードトランスクリプトーム情報を取得した。
Iso-seq 解析は雌雄別に実施したが、データ解析に際してはこれらを一度統合し、成虫コオロギ脳の ”Spliceome” を構築した。フタホシコオロギのドラフトゲノム配列は2022 年度に公開されたが、遺伝子アノテーションがまだまだ不完全である。本研究で得られた Iso-seq データの配列解析は現在も継続中であるが、アセンブルを必要としない Iso-seq 解析によって、short-read RNA-seq データの de novo アセンブルでは得られない配列長のトランスクリプトーム情報が取得できていることを確認している。また、例えば性特異的なスプライシングを受けることが知られる Transformer 遺伝子では、RT-PCR 法によって確認できた性特異的スプライシング産物を網羅するトランス
クリプトーム情報が取得できていることから、「性特異的なスプライシングを受ける遺伝子群の探索のためのトランスクリプトームデータベースの構築」という当初の目的に叶う ”Spliceome” が構築できていると判断している。しかし、遺伝子によってはタ
ンパク質コード配列を含む 5’ 領域に欠失があることも確認している。2022 年度実施
予定の short-read RNA-seq 解析の配列データをもちいて Iso-seq データを補完することでより精度の高いコオロギ脳リファレンストランスクリプトームを構築し、性特異的なスプライシングを受ける遺伝子群や脳内発現量に雌雄差のある遺伝子群の網羅的な探索を進める予定である。

③ 発表リスト（論文や学会発表、予定を含む）
本研究の成果を含む昆虫脳の性分化機構の進化に関する研究成果について、2022 年
度東京（早稲田大学）で開催予定の第９３回日本動物学会にて学会発表を予定している。
⑤ その他参考になることがら（任意）
該当なし。

35

2021 年度 先導科学共働プログラム・個別事業報告書
プレリサーチ）

研究課題

ゲノムプロジェクトのこれから
颯田 葉子

代表者氏名

共同研究者氏名（所属）

研究費執行状況
合計

人件費

旅費

役務等

消耗品

備品

謝金

予算額

200,0000

100,000

100,000

0

0

0

執行額

106,240

0

5,240

46,00055,00000

研究成果① 研究経緯本研究は以下の３点に焦点を当てて調査を行う。
i)ヒトゲノム配列が決定された2002年以降、全ヒトゲノム配列が様々な民族集団で決定され、いわゆるビッグデータとしてヒトゲノム配列が供されるようになった。それに伴い解析法も凄まじい勢いで進歩を示してきた。これまでの、全ヒトゲノム配列を用いた解析は、主に「ヒトの集団動態」や「歴史の復元」が主だった。2010年から10年間ほどは,これに関する論文が、Nature, Science誌に毎年10報は掲載されていたが、最近では、このスピードがやや衰えたように思う。「ヒトの集団動態」や「歴史の復元」
に関する今解ける問題は、ほぼほぼ出尽くした感がある。今後ヒトゲノム配列解析の最前線はどこへ向かうのだろうか？
ii)一方、我々のグループは、新たな自然選択検出法の開発やヒトゲノム配列解析を通して、ヒトにおける社会性や文化の発展が“自然選択”を通じてヒトゲノム進化に影響を及ぼした「文化駆動的ゲノム進化」の解析を行ってきた。この「文化駆動的ゲノム
進化」は、ヒトゲノム配列解析に新たな視点を与える。例えば、「食文化」や「社会36

性」といったヒト自身が作り出した「文化」がヒトのゲノム進化に影響を及ぼしていることを明らかにしてきた。このことは、現代社会における人間活動に何らかの示唆を与えることができるか？
iii)また、ヒトゲノムプロジェクトの成功を受けて、現在全真核生物のゲノムを決定しようという世界的なプロジェクトが動き始めている。ヒトゲノムプロジェクトで扱う
サンプル数を遥かに凌駕する全ゲノム配列データに対して、どのような解析法が適用できるか、新たな解析技術の開発が期待される。また、このようなデータから、科学者が地球環境に対して、どのような貢献ができるか？

② 成果
上記の３つの観点のうち、i)とiii)に関しては他の研究者を招聘あるいは訪問して、相互に意見交換および文献調査により達成できると考えていた。この点に関しては、i)につ
いては、ある程度の進展が得られたが、iii)については、あまり進展しなかった。実際にi)については遺伝研で開催された研究集会や霊長研での研究集会に参加することで、ある程度の成果が得られた。たとえば、ゲノムの違いが表現型にもたらす効果を観察する方法として、特定組織由来細胞の「オルガノイド」を作成することが一つの解決法につながる可能性が見えた。「オルガノイド」とは幹細胞のもつ自己複製能と分化能を利用して、試験管の中で、組織を分化させて作った培養細胞系のことで、遺伝子発現系などを通して組織の特性を調べることができる。この「オルガノイド」を利用することで、たとえば、ヒトとチンパンジーの形態の違いを作り出している変異を特定することも可能かもしれない。また文献調査ではネアンデルターのような旧人ゲノ
ムの中に残っているエピジェネティクスの痕跡を読み出すことができることがわかった。今後オルガノイドを利用した研究や形態の変化と結びついたエピジェネティクス
研究がゲノム科学の潮流になるかもしれない。
また、ii)に関しては、国立遺伝学研究所の研究者・九州大学の研究者との共同研究
で、精神疾患に関連した遺伝子の進化を調べているが、遺伝子の転写活性の程度がヒトの脳の発達と社会性の発展に伴い自然選択のターゲットとなったことを議論し、その結果を国際誌に掲載した。また、霊長研での研究集会における発表の機会を得たことで、未知の外来異物に対する二つの個体防御システム MHC と CYP についてそれぞれに働く進化学的力という観点から、以前の仕事を見直すことができた。そのほかに、台湾で開催された、ISEGB 2022 (International Symposium on Evolutionary Genomics
and Bioinformatics 2022)に参加したことで、分類学の新たな潮流に接することができた。

③ 発表リスト37

•

Hayakawa T, Terahara M, Fujito NT, Matsunaga T, Teshima KM, Hane M, Kitajima K,
Sato C, Takahata N, Satta Y. (2021) Lower promoter activity of the ST8SIA2 gene has beenfavored in evolving human collective brains. PLOS ONE 16: e0259897.

•

颯田葉子、MHCとCYP: 未知の外来物に対抗する二つのシステムの霊長類における進化、共同利用研究会・第50回ホミニゼーション研究会「人類進化と遺伝子」
2022.3.22〜3.23•

Yoko Satta, Independent selective sweeps for lactase persistence (LP) in Europe and SouthAsia, International Symposium on Evolutionary Genomics and Bioinformatics 2022
(ISEGB 2022), Taipei (Online) 2022.3.12〜3.13④ その他参考になることがら（任意）
今年度は国内の研究会（遺伝研・霊長研）に参加する旅費として使用する予定であったが、霊長研での研究集会はハイブリッド開催であったため、on line での参加を選択した。そのために旅費の残金が出てしまった。また研究会も 2 回開催予定であったが、コロナ感染拡大の影響で 1 回だけの開催となった。

38

生命共生体進化学専攻の教員と専門分野
２０２１年度 教員一覧
氏名
職名等

研究分野

沓掛 展之

教授

研究科長

進化行動生態学、動物行動学

佐々木 顕

教授

専攻長

数理生物学、理論進化学

蟻川謙太郎

教授

学長補佐

神経行動学、感覚生理学

颯田 葉子

教授

副専攻長

生理進化学、ゲノム遺伝学

印南 秀樹

教授

学術情報基盤センター長（兼）、 副研究科長

集団遺伝学、ゲノム進化学

本郷 一美

准教授

環境考古学（動物考古学）、先史人類学

田辺 秀之

准教授

分子細胞遺伝学、染色体ゲノム進化学

大田 竜也

准教授

分子進化学、生物システム進化学

伊藤 憲二

准教授

科学史

飯田 香穂里

准教授

科学史

木下 充代

准教授

神経行動学、生理行動学

大槻 久

准教授

理論生物学、進化ゲーム理論

五條堀 淳

講師

自然人類学、分子進化学、集団遺伝学

大西 勇喜謙

講師

科学哲学

寺井 洋平

助教

種分化の機構、分子進化生態学

宅野 将平

助教

ゲノム進化学、エピジェネティクス

蔦谷 巧

助教

自然人類学、霊長類学、生物考古学

渡邊 崇之

助教

神経行動学、神経進化発生学

鈴木 和歌奈助教（4月1日就任）

STS、科学技術の人類学

松下 敦子

講師

共同利用機器支援事業担当

神経解剖学、微細形態学

39

学生
2021年度在籍者◎5年一貫制課程○2015年度（4月）入学
学生氏名
清古 貴

○2016年度（4月）入学
学生氏名
南木 悠

青野 圭

坂本 貴洋

桑野 友輔

高畑 優

山川 真徳

山田 優佳

沓掛 展之
大槻 久
寺井 洋平
飯田 香穂里本郷 一美
五條堀 淳
飯田 香穂里印南 秀樹
宅野 将平
大西 勇喜謙

研究タイトル

職名研究タイトル

准教授
教 授
野外のナミアゲハにおける花色選好性
助 教

職名研究タイトル

教授
准教授 チドリ目における対捕食者行動の意思決
助 教 定
准教授

職名

研究タイトル准教授
動物考古学的研究による先史時代の琉
講 師
球列島におけるイノシシとヒトの関係准教授
教 授
遺伝子変換を考慮したY染色体の進化モ
助 教
デル
講 師

指導教員

職名

研究タイトル

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導

佐々木 顕
大槻 久
大西 勇喜謙
沓掛 展之
寺井 洋平

教 授
生育環境にあわせた昆虫の休眠卵生産
准教授
戦略
講 師
教 授
餌付けがもたらすキタリスの繁殖成績へ
助 教
の影響評価

主任指導
副指導
副指導

沓掛 展之
寺井 洋平
大西 勇喜謙教 授
ハダカデバネズミにおける地中生活・集助 教
団生活への社会生態学適応講 師○2020年度（4月）入学
学生氏名
亀嶋 恵介

木下 充代
蟻川 謙太郎
寺井 洋平

指導教員

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導

○2019年度（4月）入学
学生氏名

職名

教 授
助 教 ウミヘビの視覚の段階的な海棲適応

指導教員

主任指導
副指導
副指導
副指導

○2018年度（4月）入学
学生氏名

颯田 葉子
寺井 洋平

指導教員

主任指導
副指導
副指導

○2017年度（4月）入学
学生氏名
西條 未来

指導教員

主任指導
副指導

指導教員

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導

専攻長（仮）
沓掛 展之
未
沓掛 展之
木下 充代
寺井 洋平
伊藤 憲二

職名

研究タイトル

教授
教 授
准教授 同時的雌雄同体のウミウシ類における多助 教 様な繁殖戦略
准教授

40◎5年一貫制課程（3年次編入学）○2017年度（4月）入学
指導教員
学生氏名
杉田 あき

濱崎 真夏

教 授
助 教 ムササビの森林内における分布と利用

主任指導
副指導
副指導

印南 秀樹
寺井 洋平
大西 勇喜謙教 授
助 教 ヒトセントロメアDNA配列の進化
講 師

指導教員

主任指導
副指導

○2020年度（4月）入学
学生氏名
安家 叶子

佐々木 未悠

職名

沓掛 展之
大槻 久
飯田 香穂里本郷 一美
寺井 洋平
飯田 香穂里

職名

佐々木 顕
大槻 久
大西 勇喜謙沓掛 展之
未
未研究タイトル

教 授 Cooperation and reconciliation in a
准教授 cooperative breeder, the African
准教授 painted dog Lycaon pictus

職名研究タイトル

教 授
Zooarchaeological study of domestic dog
助 教 in East Asia
准教授

指導教員

主任指導
副指導
副指導
主任指導
副指導
副指導

研究タイトル

教 授
ニホンザルにおける行動伝染と行動協調
准教授 の社会的影響要因

指導教員

主任指導
XUAYIRE XAOKAIT副指導
副指導○2021年度（4月）入学
学生氏名

沓掛 展之
大槻 久

指導教員

主任指導
副指導
副指導

○2020年度（4月）入学
学生氏名

熊田 隆一

研究タイトル

沓掛 展之
寺井 洋平

○2018年度（4月）入学
学生氏名
壹岐 朔巳

職名

主任指導
副指導

職名

研究タイトル

教 授
准教授 病原体に対抗する宿主応答の進化
講 師
教 授
助 教
准教授

41

博士研究
2021 年度課程博士取得者
氏名

学位取得

学位論文タイトル

副論文タイトル

清古 貴

2021
前期

博士
(理学)

Visual adaptation to the aquatic
environment in sea snakes

遺伝学的検査の普及した社会におけるリテラシー〜一般市民に必要な知識とは何か？～

壹岐

2021
後期

博士
(理学)

Social biases affecting self–other matching in Japanesemacaques

人新世における「個体」概
念の変容

朔巳

2021 年度副論文合格者
氏名

副論文合格者

坂本 貴洋

2021
前期

濱崎 真夏

2020
後期

副論文タイトル
Evaluation of resource allocation strategies to scientific researchfrom the perspective of division of cognitive labor(認知的分業の観点から考える研究資源の配分戦略の評価)
科学技術と LGBT+42

海外における活動
2021 年度

海外移動経費支援対象者※）2021 年は新型コロナウイルス感染症拡大の影響で海外派遣は中止となった。

43

教員
外国人招聘研究者※）2021 年は新型コロナウイルス感染症拡大の影響で外国人研究者の招聘はなし。

44

アウトリーチ活動（１）講演会

生命共生体進化学専攻における研究最前線（生命共生体進化学専攻説明会）

日付

場所

イベント・テーマ
新型コロナウイルスの流行予測、進化予測、防除 ‒数理生物学の挑戦‒

2021. 5.15

学術会議の創設と仁科芳雄 ‒占領期

オンライン開催

日本における科学の再建 ‒江戸、子墓、奉公 ‒生物考古学が解き明かす近世の人口史

講師
教授

佐々木

顕

准教授

伊藤

助教

蔦谷 匠

助教

寺井

洋平

助教

渡邊

崇之

助教

鈴木

和歌奈

憲二

大学院生との研究とは？ サンゴ、
地衣類、ヒトの皮膚、ウミヘビの研究からの紹介]2021.11.13

オンライン開催

昆虫脳の性はどう決まるのか？ 〜
進化・多様性の観点から〜 」
細胞培養とオノマトペ；実験室でのフィールドワークから（２）学術講演会（先導科学研究科）
日付
2021.11.3

場所

イベント・テーマ*新型コロナウイルス感染拡大防止のため開催中止

葉山キャンパス（３）横高アカデミア 2021
日付

内容

講師

2021. 5. 6

横高アカデミア講演 「動物のこころを探る」

教授

沓掛

展之

2021 年度

横須賀高校サイエンスハイスクールにおける学生指導

教授

沓掛

展之

（４）一般市民講座
内容

講師

渋谷ハチコウ大学「現代人に残る進化史の痕跡」（オンライン開催） 2022.2.5
文京アカデミー 総合研究大学院大学講師陣による『科学探求講座』 「現代人に残る進化史の痕跡」（オンライン開催） 2022.2.5
渋谷ハチコウ大学「日本犬の成り立ちをゲノムから探る」（オンライン開催） 2022.9.25

45

准教授

大槻

久

准教授

大槻

久

助教

寺井

洋平

文京アカデミー 総合研究大学院大学講師陣による『科学探求講座』 「日本犬の成り立ちをゲノムから探る」（オンライン開催） 2022. 9.25

准教授

寺井

洋平

准教授

大槻

久

准教授

飯田

香穂里

教授

蟻川

謙太郎

助教

蔦谷

匠

大学共同利用機関シンポジウム2021「宇宙・物質・エネルギー・生命・情報・人間文化：フロントの知を楽しもう」 「血縁淘汰理論とヒトの生活史の進化」（オンライン開催） 2021.10.24「優生学：人類の遺伝的 “改良” をめぐる歴史」（総研大講師陣による科学探求講座）中央区民カレッジ 2021.12.04
神奈川県立鎌倉高等学校においてサイエンスカフェ 2021.12 月

対面

HiF サロン(FENICS 共催イベント)「ハラスメントのもやもやを描く―アーテ
ィストとの対話」対談（５）特別講義
日付
2021.10 月

内容

講師

自由学園リビングアカデミーにて特別講義

対面

教授

蟻川

謙太郎

（６）執筆活動等
内容

教員＜プレスリリース＞仲良ししか触れない：野生ニホンザルにおいて他個体

教授

沓掛

展之

助教

蔦谷

匠

「ヒトゲノム事典」の執筆・編集

教授

颯田

葉子

「遺伝学の百科辞典」の執筆・編集

教授

颯田

葉子

教授

颯田

葉子

准教授

木下

充代

教授

印南

秀樹

教授

印南

秀樹

のアカンボウに接触する行動の機能を解明、2022/3/7＜プレスリリース＞2021.12.23 魚の骨から復元する過去の漁撈活動と気候変動＜プレスリリース＞「ネアンデルタール型」ヒト成長ホルモン受容体は、
先史時代の食糧が少ない状況下で有利にはたらいていたかもしれない
2021/12/23
JT 生命誌研究館 生命誌 106 号 Web 記事「ナミアゲハの生活を支える視覚情報」＜プレスリリース ＞「世界最大の花・ラフレシアの新産地とその生態の解明〜地域社会による生息域内保全の促進〜」「風」（エッセイ）ぱどっく２０２１ vol.44

46

「遺伝子研究が導く、未来の血統理論」Ownership ２０２１ Summer

教授

印南

秀樹

教授

佐々木

顕

講師

五條堀

淳

准教授

大槻

久

准教授

伊藤

憲二

准教授

伊藤

憲二

NHK ヒューマニエンス「肝臓」に出演

教授

颯田

葉子

読売新聞（大阪版）コメントのための取材を受ける

教授

颯田

葉子

教授

佐々木

顕

教授

佐々木

顕

教授

佐々木

顕

講師

五條堀

淳

講師

五條堀

淳

助教

寺井

洋平

＜プレスリリース ＞免疫やワクチンからの逃避を繰り返す病原体は高い病原性を進化させる、2022/1/17＜プレスリリース ＞「港川１号人骨のミトコンドリア DNA の解析で 過去
から現在までの日本列島人の遺伝的関係性を解明」2021/6/16（８）インタビュー報道等
内容

NHK（総合） NHK スペシャル ジェンダーサイエンス 第２集「月経 苦しみとタブーの真実」出演 2021.11.6 (再放送 2021.11.10）
日本の原爆開発〜未公開書簡が明かす仁科芳雄の軌跡〜. NHK ETV特集
取材協力およびインタビュー登場 2021年8月7日 テレビ・ラジオ番組.
専門知と民主主義、バランスは： 学術会議の論点、識者に聞く」 朝日新聞社 朝日新聞 21 面 2021 年 4 月 30 日 新聞・雑誌、朝日新聞デジタル
https://www.asahi.com/articles/DA3S14889362.html 2021

NHK おはよう日本「新ウイルスは重い症状で流行繰り返すか 数理モデル
で分析」、2022/2/7
NHK World Japan 「新ウイルスは重い症状で流行繰り返すか 数理モデル
で分析」2022/2/7
日刊工業新聞 「ゲノム解析で見えてきたコロナ「オミクロン株」の正体」、
2022/2/28
朝日新聞デジタル「日本人の祖先は「港川人」？ 旧石器時代、DNA で解析」2021/6/13
朝日新聞「ご先祖は 2 万年前の港川人？DNA 解析 日本人につながる可能性」2021/7/23
Science
Mysterious, extinct Japanese wolf may hold clues to origins of dogs
https://www.science.org/content/article/mysterious-extinct-japanesewolf-may-hold-clues-origins-dogs#.YW4PnGW-RHc.twitter 18 OCT 2021

47

NATURE
Daily briefing: Extinct Japanese wolf is dogs’ closest cousin
https://trueviralnews.com/52799-extinct-japanese-wolf-is-the-closest-

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

wild-relative-of-dogs-yet-found.html 21 Oct 2021
New Scientist,
Extinct Japanese wolf is the closest wild relative of dogs yet foundhttps://www.newscientist.com/article/2294090-extinct-japanese-wolf-isthe-closest-wild-relative-of-dogs-yetfound/?utm_campaign=RSS%7CNSNS&utm_source=NSNS&utm_medi
um=RSS 19 Oct 2021
True Viral News,
Extinct Japanese wolf is the closest wild relative of dogs yet foundhttps://trueviralnews.com/52799-extinct-japanese-wolf-is-the-closestwild-relative-of-dogs-yet-found.html

19 Oct 2021

Express Informer,
DNA confirms Japanese wolf extinct for 115 years is the closest known
wild relative of modern dogs
https://expressinformer.com/dna-confirms-japanese-wolf-extinct-for-115years-is-the-closest-known-wild-relative-of-modern-dogs/

20 Oct 2021

India Times Post, 20 Oct 2021
https://www.indiatimespost.com/dna-confirms-japanese-wolf-extinct-for115-years-is-the-closest-known-wild-relative-of-modern-dogs/
Whats New, 20 Oct 2021
https://whatsnew2day.com/dna-confirms-japanese-wolf-extinct-115years-is-most-known-wild-relative-of-modern-dogs/
The Japan Times,
Extinct Japanese wolf may hold key to unlocking origins of dogs
https://www.japantimes.co.jp/news/2021/10/21/national/sciencehealth/japanese-wolf-dog-origins/ 21 Oct 2021
Phys.org,
DNA shows Japanese wolf closest relative of domestic dogs
https://phys.org/news/2021-10-dna-japanese-wolf-closest-relative.html
21 Oct 2021

48

Smithsonian Magazine,
Ancient Japanese Wolves May Be the Closet Wild Relative of Modern
Dogs

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

東京新聞 1月8日「イヌのルーツ、東アジアか」

助教

寺井

洋平

伊勢新聞 1月9日「犬、東アジアで進化か ニホンオオカミが最も近縁」

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

助教

寺井

洋平

http://ct.moreover.com/?a=46155009257&p=1pl&v=1&x=Q1OcuhwQksC
MIEpJsQgs_g 21 Oct 2021
Yahoo! News,DNA linking dogs to extinct wolves suggests man’s best friend my haveorigins in East Asia, not Europe
http://ct.moreover.com/?a=46195003424&p=1pl&v=1&x=0DvOU2cU1d
HPtQztdgumKw 26 Oct 2021
朝日小学生新聞 11月25日掲載「イヌの起源、ニホンオオカミがカギ」
読売新聞
ニホンオオカミ、犬に最も近く…共通の祖先から東アジアで枝分かれか
11月27日掲載
朝日放送ラジオ「おはようパーソナリティ道上洋三です」12月6日出演
NHK wold 1月8日「Digging Deep: What Makes Shiba Inu Dogs So
Special?」

日経新聞 1 月 11 日 「犬、東アジアで進化か
ニホンオオカミが最も近縁 総研大など、骨の DNA 分析」
中国新聞社 1 月 12 日
「犬、東アジアで進化か ニホンオオカミが最も近縁」
雑誌 Fielder 3 月 Vol.61 絶滅野生生息記「イヌに最も近いオオカミはニ
ホンオオカミだった！」49

教員の研究教育業績【 分 野 別 】

50

統合人類学分野
沓掛 展之（教授：動物行動学、霊長類学）
1. 研究テーマ
哺乳類、鳥類、両生類、魚類の社会行動・コミュニケーション・認知を、野外・実験状況下にて研究した。今
年度は、霊長類の社会交渉、コミュニケーション、真社会性に関する論文などを発表した。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学（２単位、集中講義、「認知行動の進化」を担当）

2. 先導研実習（野外実習）
3. 進化行動生態学 （１単位、集中講義）
 研究指導1. 杉田あき （主任指導）「ムササビの生態」

2. 壹岐朔巳 （主任指導）「ニホンザルの社会行動」、博士号取得3. 安家叶子（主任指導、JSPS DC2）
4. 高畑優 （主任指導）「リカオンの社会行動」「エゾリスの都市生態」

5. 山川真徳 （主任指導、SOKENDAI 特別研究員）「ハダカデバネズミの行動」

6. 佐々木未悠（主任指導） 「ニュウナイスズメの生態」
7. 山田優佳（主任指導）「ウミウシの繁殖」

8. 亀嶋恵介（副指導） 「コミュニケーション」
 全学教育1. 統合進化学（１単位、「Animal Behaviour」を担当）

 他大学等における授業
1. なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）

1.

Miura T, Oguchi K, Yamaguchi H, Nakamura M, Sato D, Kutsukake N, Miura K, Hayashi Y, Hojo

M, Maekawa K, Shigenobu S, Kano T, Ishiguro A. (2022, in press) Understanding of superorganisms: collective
behavior, differentiation and social organization. Artificial Life and Robotics
2.

Sekizawa M, Kutsukake N (2022) Pattern, function, and constraint of infant handling in wild

Japanese macaques. Ethology 128, 412-423

51

3.

Iki S, Kutsukake N (2022, in press) Victims of play escalation rank below aggressors in Japanesemacaques (Macaca fuscata). International Journal of Primatology.
4.

Buffenstein R, Amoroso V, Andziak B, Avdieiev S, Azpurua J, Barker AJ, Bennett NC, Brieño-

Enríquez MA, Bronner GN, Coen C, Delaney MA, Dengler-Crish CM, Edrey YH, Faulkes CG, Frankel D,
Friedlander G, Gibney PA, Gorbunova V, Hine C, Holmes MM, Jarvis JUM, Kawamura Y, Kutsukake N,
Kenyon C, Khaled WT, Kikusui T, Kissil J, Lagestee S, Larson J, Lauer A, Lavrenchenko LA, Lee A, Levitt JB,
Lewin GR, Lewis Hardell KN, Lin TD, Mason MJ, McCloskey D, McMahon M, Miura K, Mogi K, Narayan
V, O'Connor TP, Okanoya K, O'Riain MJ, Park TJ, Place NJ, Podshivalova K, Pamenter ME, Pyott SJ, Reznick
J, Ruby JG, Salmon AB, Santos-Sacchi J, Sarko DK, Seluanov A, Shepard A, Smith M, Storey KB, Tian X,
Vice EN, Viltard M, Watarai A, Wywial E, Yamakawa M, Zemlemerova ED, Zions M, Smith ESJ. (2022) The
naked truth: a comprehensive clarification and classification of current 'myths' in naked mole-rat biology. Biology
Reviews 97, 115-140.
5.

Kato T, Matsui S, Mikami OK, Ueda K, Kutsukake N. (2022, in press) Sex difference in natal

dispersal in the Eurasian tree sparrow (Passer montanus). Ornithological Science
学術研究図書1. 山川真徳・沓掛展之・三浦恭子 2021 特異な哺乳類ハダカデバネズミの秘密−真社会性・
老化耐性・がん化耐性 医学の歩み 279, 7, 742-748
 学会発表学会発表
1. 杉田あき、繁田真由美、田村典子、沓掛展之、寺井洋平 DNA マーカーを用いたムササビの性別および個体識別方法と、糞 DNA を用いた野外調査への応用 日本哺乳類学会 2021 年度大会 2021/8（オンライン）
2. 安家叶子・沓掛展之 リカオンにおけるあくびとその伝染性 第 40 回動物行動学会（オンライン） 2021/9
3. 高畑優・内田健太・嶌本樹・沓掛展之 宝物は手間をかけて安全な場所へ：餌の質に応じたキタリスの貯
食行動の変化

第 40 回動物行動学会（オンライン） 2021/9

4. 工藤慎一・原野智広・沓掛展之・吉澤和徳 ツノカメムシ類のメス親の防衛行動は卵の変形を促すのか？
第 40 回動物行動学会（オンライン） 2021/9
5. 山川真徳・三浦恭子・沓掛展之 真社会性ハダカデバネズミにおける他集団個体に対する排他性 日本生態学会 2022/3、（オンライン）
6. 原野智広、沓掛展之イタチ科における水生適応に関連した出生時体サイズの進化 日本生態学会

2022/3、（オンライン）
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1. 沓掛展之 ヘテロな利己的協力社会における創発と相転移 JST/CREST「脳領域／個体／集団間のイ

ンタラクション創発原理の解明と適用」研究会 2021/10/26、オンライン52 外部資金
基盤 C 「種間比較に基づくカワスズメ科魚類の兄弟間対立を取り巻く生活史進化の解明」（代表：佐藤駿）、研究分担者、10 万円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動1. なし
 学外委員会活動
1. なし
 アウトリーチ活動
1. 横須賀高校サイエンスハイスクールにおける学生指導
2. 横高アカデミア講演 「動物のこころを探る」 横須賀高校 2021/5/6
3. （プレスリリース）仲良ししか触れない：野生ニホンザルにおいて他個体のアカンボウに接触する行動の機能を解明、2022/3/7
 学術誌編集活動
1. Primates, Editorial Board (2021-)
2. Journal of Ethology, Associate Editor (2011-)
3. Biology Letters, Editorial Board (2016-)

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献

53

1. 先導科学研究科⻑
2. 教育研究評議会
3. 運営会議
4. 個人情報保護委員会
5. 危機管理委員会
6. 環境安全管理協議会
7. 財務・マネジメント委員会
8. 不正防止計画室会議
9. 全学教育委員会
10. SOKENDAI 賞選考委員会
11. 全学評価委員会
12. 発明委員会
13. 知的財産室
14. 学術情報基盤センター運営委員会
15. 部局情報セキュリティ委員会
16. 附属図書館運営委員会
17. 動物研究検証委員会
 部局委員会等への貢献
1. スーパーサイエンスハイスクール担当
2. 共働プログラムワーキンググループ
3. センター化計画ワーキンググループ
4. 統合進化科学研究センター運営委員会
5. 過半数代表補佐
6. 研究科年報関係
7. 研究倫理相談委員会
 大学事業
1. なし
6.

その他の特筆すべき活動


博士研究員の受け入れ
関澤麻伊沙（先導研・特別研究員）
加藤貴大（先導研・特別研究員）
佐藤俊（JSPS PD）
野間野史明（JSPS PD）

研究室構成員による学術出版物①

原著論文（査読あり）
1.

Nomano. FY, Mitsui H, Kimura MT (2021) Assessment of putative species diversity of insect larvae

54

occurring in bamboo galls by a DNA barcoding analysis. Entomological Science 24, 338-344.
2.

Nomano FY, Savage JL, Rollins LA, Griffith SC, Russell AF (2021) Communal roosting shows dynamics
predicted by direct and indirect nepotism in chestnut-crowned babblers. Behavioral Ecology andSociobiology 75, 1-15

3.

Satoh S, Bshary R, Shibasaki M, Inaba S, Sogawa S, Hotta T, Awata S, Kohda M (2021) Prosocial andantisocial choices in a monogamous cichlid with biparental care. Nature Communications 12, 1775

4.

Satoh S (2021) First Report of Maternal Interference Behaviour towards Sibling Aggression in the Shellbrooding Cichlid Lamprologus ornatipinnis (Cichlidae). Journal of Ichthyology 61,992-996

5.

Satoh S, Nishida Y, Saeki T, Kawasaka K, Kohda M, Awata S (2021) The functional role of sibling
aggression and “best of a bad job” strategies in cichlid juveniles. Behavioral Ecology 32, 488-499②

学術研究図書なし



研究室構成員による外部資金
佐藤駿、基盤 C「種間比較に基づくカワスズメ科魚類の兄弟間対立を取り巻く生活史進化の解明」143 万円
野間野史明、若手「協同繁殖鳥類の社会構造に依存する腸内細菌群集構造と群居性のコスト」130 万円
佐藤駿、JSPS PD 研究費 120 万円
佐藤駿、海外学術「アマゾン浸水林において水域ー陸域連関を駆動する生物間相互作用の解明」分担加藤貴大、藤原ナチュラルヒストリー振興財団「スズメにおける子の性特異的死亡が持つ生態学的機能の解明」60 万円



研究室構成員の受賞
佐藤駿、魚類学会賞 (奨励賞) 受賞 日本魚類学会 2021 年 9 月
壹岐朔巳 研究科長賞受賞

55

統合人類学分野
本郷 一美（准教授： 環境考古学（動物考古学）、先史人類学）
1. 研究テーマ
1. 家畜化過程の研究
西アジアにおける偶蹄類（ヒツジ、ヤギ、ウシ、ブタ）の家畜化の過程に関する研究。家畜化過程において人間の祖先種への様々な介入により引き起こされた変化を進化学的視点で研究した。初期の定住狩猟採集民
による野生動物資源の利用、新石器時代の食糧生産開始、「新石器化」に伴う家畜の伝播、農耕牧畜社会の成立に至るまでの生業と社会の変化について、進化学的視点で研究を行った。複数の科研費の助成を受けている。
2. ニホンオオカミの形態と系統および古代犬の系統に関する共同研究
ニホンオオカミの起源と系統および日本在来犬との関係に関し、先導研および外部の研究者から成るグルー
プで、明治期のニホンオオカミ資料と、遺跡から出土するオオカミ、イヌの骨格の形態やサイズのデータを収集した。ニホンオオカミ、縄文時代、弥生時代、平安時代の遺跡と中国の複数の遺跡から出土したイヌの骨格試料から抽出した古代 DNA の全ゲノム解析を行った。大学院生の博士論文研究に関わる共同研究であ
る。

2. 教育
 担当授業
ミクロ・マクロ生物学 （1 コマを担当）
 研究指導1. 青野圭（主指導）「動物考古学的手法による先史時代の琉球列島におけるイノシシとヒトの関係についての研究」
2. ショカット・シャイラー（主指導、国費留学生）「日本と中国の遺跡から出土したイヌの系統」
 全学教育1. なし
 他大学等における授業
1. なし
 他大学等における博士論文外部審査委員
１．名古屋大学大学院環境学研究科

56

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）

1. Hongo, H., Kikuchi, H., Nasu, H. (2021) Beginning of pig management in Neolithic China: Comparison ofdomestication processes between northern and southern regions. Animal Frontiers, 11(3) 30-42.
https://doi.org/10.1093/af/vfab021
2. Cucchi, T., Domont, A., Harbers, H., Evin, A., Fors, R.A., Saña, M. Leduc, C., Guidez, A., Bridault, A., Hongo, H., Price,
M., Peters, J., Briois, F., Guilaine, J., and Vigne, J.-D. (2021) Bones geometric morphometrics illustrate 10th millennium cal.
BP domestication of autochthonous Cypriot wild boar (Sus scrofa circeus nov. ssp) Scientific Reports, 11: 11435.
https://doi.org/10.1038/s41598-021-909333. Matsumura S, Terai Y, Hongo H, Ishiguro N (2021) Analysis of mitochondrial genomes of Japanese wolf specimens in the
Siebold collection, Leiden. Zoological Science 38, 60-61.
4. Yamada, E., Hongo, H., Endo, H. (2021)
Analyzing historic human-suid relationships through dental microwear texture and geometric morphometric analyses ofarchaeological suid teeth in the Ryukyu Islands. Journal of Archeological Science, 132 105419,
https://doi.org/10.1016/j.jas.2021.105419
5. Nishioka, Y., Takai, M., Hongo, H. and Anezaki, T. (in press)
Fossil and archaeological remain records of Japanese macaques (Macaca fuscata). In Urbani, B., Youlatos, D., Antczak,
A.T. (eds) World Archaeoprimatology: Interconnections of Humans and Nonhuman Primates in the Past, pp.516-532.
Cambridge University Press.
プレプリントGojobori J, Arakawa N, Xiayire X, Matsumoto Y, Matsumura S, Hongo H, Ishiguro N, Terai Y. (2021) The Japanese wolf ismost closely related to modern dogs and its ancestral genome has been widely inherited by dogs throughout East Eurasia.
bioRxiv, https://doi.org/10.1101/2021.10.10.463851
学術研究図書
該当なし
その他
1. 本郷一美（2021)「外題：自然科学者との共同研究 〜家畜の動物考古学〜」丸山真史・菊地大樹（編）『松井章著
作集：動物考古学論』pp.108-113 新泉社 （総ページ数 376 頁)
2. 石黒直隆 松村秀一 寺井洋平 本郷一美（2021）オオカミやヤマイヌと呼ばれたシーボルトが残した二ホンオ
オカミ標本の謎

日本獣医師会誌 74：389-395

3. 本郷一美・櫻井秀雄・茂原信生2021「浅川扇状地遺跡群出土の動物骨」長野県文化振興事業団長野県埋蔵文化財センター編『長野市浅川扇状地遺跡群社会資本整備総合交付金（街路）事業に伴う埋蔵文化財発掘調査報告書ー（都）高田若槻線長野市桐原～吉田（1）第2 分冊』長野県文化振興事業団長野県埋蔵文化財センター, 241-255.
4. 本郷一美（印刷中）「ヒマラヤにおける家畜利用：高地の考古遺跡から出土した動物骨から」ビオストーリー 37号, pp.38-40.

57 学会発表
1. 青野圭・本郷一美・片桐千亜紀「先史時代琉球列島におけるイノシシ属の利用について」日本動物考古学会第８回（２０２１年 7 月 3、4 日、オンライン）
2. 本郷一美「家畜化過程におけるヒトー動物関係」 遺伝学研究所 行動遺伝学研究会「家畜化機構の解明」(2021.12.21-22)（招待）
3. 本郷一美 「ラクダの家畜化とハイブリッドの生産」「西アジアと中央アジアの牧畜―それぞれのフィールドから―」科学研究費基盤（S）「中東部族社会の起源：アラビ
ア半島先原史遊牧文化の包括的研究」、基盤（A）「中央アジアにおける牧畜社会の動態分析―家畜化から気候変動まで」合同研究会（2022.1.22) （招待）企画したシンポジウム等
該当なし
講演
本郷一美 2022 年 「家畜化過程におけるヒトと動物の関係の変化」 中央区民カレッジ (2022.1.15. 中央区立築地社会教育会館）
取材「動物考古学にみる、肉食と私たち」（鈴木暁子）, 朝日新聞 GLOBE, 2021.11.7, p.10.
「テクノロジーと人類 8. 食を支える家畜: 変わる肉食の概念 揺らぐ持続性」（長内洋介）, 産経新聞, 2022.3.5,
p.9.
NHK 「ヒューマニエンス」の家畜化に関する取材
外部資金
代表
1. 基盤 B「定住狩猟採集民から農耕牧畜社会へ：ティグリス川上流域における 4 千年の過程を探る」(2018-2020、2022 年度
まで繰越）

2. 先導科学共働プログラム, 国際共同研究 「ニホンオオカミと東アジアのイヌの系統に関する考古科学的研究」
220 万円
分担
科研費
1.

2.
3.
4.
5.
6.

新学術領域（研究領域提案型）（2018〜22）「都市文明の本質：古代西アジアにおける都市の発生と変容の学際研
究」計画研究「西アジア先史時代における生業と社会構造」（領域代表者：筑波大学・山田重郎、計画研究代表者：
筑波大学・三宅 裕）650 万円
基盤 B（2018-21）「西アジア新石器時代における社会の複雑化」（研究代表者：筑波大学・三宅 裕）５万円
基盤 S (2019-23 年度) 中東部族社会の起源：アラビア半島先原史遊牧文化の包括的研究 （研究代表者：金沢大学・藤井純夫）50 万円
基盤 A (2019-22) ポスト古代ゲノム解読期における家畜化概念のヒューマンアニマルボンド的学融合刷新（研究代表者：東京大学総合研究博物館・遠藤秀紀）60 万円
基盤 C（一般）（2020-2014） 絶滅したニホンオオカミの遺伝的変遷と移動を探る動物考古学的研究（研究代表者：総合研究大学院大学先導科学研究科・客員研究員・石黒直隆）20 万円
基盤 B (2020-24) 東南アジア大陸部における後期更新世人類の環境適応の解明（研究代表者：新潟医療福祉大

58

7.
8.

学・澤田純明）52 万円
基盤 B（2021-25）アルメニア高地における初期農耕の北方適応の過程を探る（研究代表者：東海大学・有村誠）
40 万円
挑戦的研究（萌芽）（2021-23）古代西アジアに生息した未知のライオンの研究（研究代表者：大阪学院大学・渡辺千香子）50 万円研究室メンバーの業績

その他
人間文化研究機構 基幹研究プロジェクト『文明社会における食の布置』 「食と文明」研究ユニッ 海外出張
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし
4. 社会貢献
 学会活動1.International Council for Archaeozoology 理事、国際委員
2.International Council for Archaeozoology, ASWA (Archaeozoology of Southwest Asia and Adjacent
Areas) Working Group 代表
3.生き物文化誌学会 監事
4.日本人類学会 評議員、骨考古学分科会幹事、倫理委員
5.日本動物考古学会 役員
6.日本西アジア考古学会 監事
7.文化財科学会
8.第四紀学会
9.在来家畜研究会
 学外委員会活動
1. 若狭三方縄文博物館 運営委員
2. 吉田学記念 文化財科学研究助成基金 運営委員
 アウトリーチ活動
1. 該当なし
 学術誌編集活動
1.日本考古学協会

Japanese Journal of Archaeology 編集委員

 学術誌査読活動
1.Journal of Archaeological Science report
2.Anthropological Science59

3.Journal of Archaeological Method and Theory
4.帝京大学文化財研究所研究報告
5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 苦情等処理協議会
2. 全学学生支援委員会
3. 全学入試監理委員会
4. ヒトゲノム・遺伝子解析研究倫理委員会
 部局委員会等への貢献
入試委員
 大学事業
該当なし
6.

その他の特筆すべき活動


博士研究員の受け入れ
新井才二（先導研・特別研究員）
菊地大樹（先導研・特別研究員）
澤藤りかい（JSPS CPD）

研究室構成員による学術出版物

原著論文（査読あり）
1. 新井才二 2021 「南コーカサス新石器時代における骨角器インダストリーの成立と展開」『西アジア考古学 第 22号』日本西アジア考古学会、55-72 貢。
2.

Hirose, M., Y. I. Naito, K. Seiji, S. Arai, F. Farhad and Y. Nishiaki 2021 Investigating earlyhusbandry strategies in the southern Caucasus: intra-tooth sequential carbon and oxygen isotope
analysis of Neolithic goats, sheep, and cattle from Göytepe and Hacı Elamxanlı Tepe. Journal ofArchaeological Science: Reports 36: 102869-102869.
3.

Nishiaki, Y., O. Aripdjanov, S. Arai, C. Akashi, H. Nakata, B. Sayfullayev, O. Engeshed and R.
Suleimanov 2022 Neolithization during the 6th millennium BC in western Central Asia: New evidence
from Kaynar Kamar Rockshelter, Hissar Mountains, Southeast Uzbekistan. Archaeological Research in

Asia 30. DOI: 10.1016/j.ara.2022.100352.
4.

名島弥生(2022)「奄美大島・住用湾におけるホシレンコ漁」動物考古学 39: 15-30

5.

Hsu, Kai-hsuan、Eda, M. Kikuchi,H., Sun, G.（2021）Neolithic avifaunal resourceutilisation in thelower Yangtze River, Journal of Archaeological Science: Reports Vol. 37. pp.1-9.

6.

丸山真史・菊地大樹・孫国平・余翀・張穎2021「中国新石器時代の長江下流域における魚類利用−田螺山遺跡の分析から−」『動物考古学』38：1-9

7.

澤藤りかい, 蔦谷匠, 石田肇. ホモ属の拡散と生息時期ーアジア東部を中心にー. Anthropological Science(Japanese Series)(印刷中)

60

8.

Alpaslan-Roodenberg S, Anthony D, Babiker H, Bánffy E, Booth T, Capone P, Deshpande-Mukherjee A, Eisenmann
S, Fehren-Schmitz L, Frachetti M, Fujita R, Frieman CJ, Fu Q, Gibbon V, Haak W, Hajdinjak M, Hofmann KP,
Holguin B, Inomata T, Kanzawa-Kiriyama H, Keegan W, Kelso J, Krause J, Kumaresan G, Kusimba C, Kusimba S,
Lalueza-Fox C, Llamas B, MacEachern S, Mallick S, Matsumura H, Morales-Arce AY, Matuzeviciute GM, MushrifTripathy V, Nakatsuka N, Nores R, Ogola C, Okumura M, Patterson N, Pinhasi R, Prasad SPR, Prendergast ME,
Punzo JL, Reich D, Sawafuji R, Sawchuk E, Schiffels S, Sedig J, Shnaider S, Sirak K, Skoglund P, Slon V,
Snow M, Soressi M, Spriggs M, Stockhammer PW, Szécsényi-Nagy A, Thangaraj K, Tiesler V, Tobler R, Wang CC, Warinner C, Yasawardene S, Zahir M. 2021. Ethics of DNA Research on Human Remains: Five Globally
Applicable Guidelines. Nature 599 (7883): 41–46.

9.

Shiba, T., Komatsu, K., Sudo, T., Sawafuji, R., Saso, A., Ueda, S., Watanabe, T., Nemoto, T., Kano, C.,
Nagai, T., Ohsugi, Y., Katagiri, S., Takeuchi, Y., Kobayashi, H., & Iwata, T. (2021). Comparison of
Periodontal Bacteria of Edo and Modern Periods Using Novel Diagnostic Approach for Periodontitis With MicroCT. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 11, 723821.

10. Tsutaya, T., Mackie, M., Sawafuji, R., Miyabe-Nishiwaki, T., Olsen, J. V., & Cappellini, E. (2021). Faecal
proteomics as a novel method to study mammalian behaviour and physiology. Molecular Ecology Resources,21(6), 1808–1819.

学術研究図書1. 飯島武次 監修、角道亮介・鈴木舞・大日方一郎・湯沢丈・菊地大樹 編2021『秦の淵源－秦文化研究の最前線－』共編著：「秦馬の実像」pp.124-131. 株式会社外為印刷
2. 小宮孟 (2021) 「イヌと縄文人: ―狩猟の相棒、神へのイケニエ」吉川弘文館 209p
その他
上峯篤史・王法崗・渡邊貴亮・髙木康裕・麻柄一志・菊地大樹・覚張隆史2021「西白馬営：泥河湾盆地におけるMIS3の鋸歯縁石器群」『「アジアにおけるホモ・サピエンス定着プロセスの地理的編年的枠組み構築」2020 年度研究報
告』東京大学総合研究博物館，pp.32-67
吉永亜紀子（2022)「佐賀県吉野ヶ里遺跡・詫田西分遺跡・本分貝塚の出土動物遺体～筑後川流域における弥生時代
貝塚の資料調査～」『佐賀県立博物館・美術館調査研究書』46:28-47 佐賀県立博物館・美術館.
吉永亜紀子 (2022 印刷中)「間口洞窟遺跡の弥生人は動物資源をどう利用していた？」『特別展 洞窟遺跡を掘る－
海蝕洞窟の考古学－』図録 神奈川県立歴史博物館
吉永亜紀子(2022)「鳥取県青谷上寺地遺跡第 13 次調査出土イノシシ下顎骨を用いた卜骨について」動物考古学 39：
59-62.
吉永亜紀子 (2021)「和歌山県高山寺貝塚における縄文時代の動物資源利用」和歌山県立紀伊風土記の丘 令和 3 年度
秋期特別展「海に挑み、海をひらく-きのくに七千年の文化交流史-」関連シンポジウム 『紀伊半島をめぐる海の道と文化交流予稿集・論考集』 50-55.
吉永亜紀子(2021) 「栃原岩陰遺跡におけるシカ手骨格・足骨格利用の検討」 北相木村考古博物館研究紀要 (2)：2-16.
吉永亜紀子(2021) 「大阪府池上曽根遺跡出土貝類遺体についてー弥生時代におけるバカガイ利用ー」動物考古学
38：49-53.
講演61

青野圭 「先史時代琉球列島におけるイノシシ利用 -白保竿根田原洞穴遺跡出土のイノシシ資料を中心に-」 日本動物考古学会オンライン講演会「洞窟遺跡に残された動物骨とヒトの暮らし－沖縄における動物考古学研究の最前線」 2022 年 2 月５日
研究室構成員による外部資金

代表
石黒直隆 基盤 C「絶滅したニホンオオカミの遺伝的変遷と移動を探る動物考古学的研究」130 万円.
菊地大樹 学術変革 A 計画研究「動物考古学から探るユーラシア家畜文化のダイナミズム」1620 万円
澤藤りかい 基盤 B「人骨から読み解く日本列島人の食生活―食物の変遷と多様性の復元―」490 万円
澤藤りかい 特別研究員奨励費 「古代土壌 DNA を用いた遺跡の居住環境の復元」 300 万円
分担
新井才二
基盤 A 「原シルクロードの形成ー中央アジア山岳地帯の初期開発しに関する総合研究ー」（代表者：金沢大学、久米正吾）.
学術変革 A 「動物考古学から探るユーラシア家畜文化のダイナミズム」（代表者：菊地大樹）
菊地大樹
学術変革 A 「中国文明起源解明の新・考古学イニシアティブ」分担（代表者：金沢大学・中村伸一）
基盤 B「東アジアにおける家禽飼育の起源と拡散の解明」（代表者：北海道大学・江田真毅）
基盤 B「秦漢王朝に浸透した北方異民族要素の考古学的研究」（代表者：天理大学・小田木治太郎）
基盤 B「牛馬文化の渡来と変容過程の解明による新たな列島史像の構築」（代表者：帝京大学・植月学）
澤藤りかい
基盤 B「南米アンデスの初期帝国ワリの成立と地方支配に関する研究」（代表者：南山大学・渡辺森哉）
基盤 C「古人骨のプロテオミクス・ホルモン分析による妊娠マーカー検出法の開発」（代表者：総合研究大学院
大学・蔦谷匠）基盤 C「多面的新手法による中近世日本人のライフヒストリーの復元：生物考古学の新展開を探る」（代表者：
聖マリアンナ医科大学・長岡朋人）
基盤 C「元素・DNA 分析による土坑用途の研究-考古学・人類学・民俗学と自然科学の融合-」（代表者：島根大学・渡辺正巳）挑戦的研究（萌芽）「糞石ゲノム解析による縄文人の栄養・衛生・健康状態のマルチプロファイリング」（代表者：東京大学・太田博樹）
学術変革 A 計画研究「パレオゲノミクス解析プラットフォーム開発とその応用」（代表者：金沢大学・覚張隆史）国際共同研究加速基金（国威再共同研究強化 B）「古代プロテオミクスの基盤・拠点整備のための海外共同研究」（代表者：東京大学・太田博樹）

62

統合人類学分野
蔦谷 匠（助教： 自然人類学、生物考古学、霊長類生態学）
1. 研究テーマ
1. 生物考古学
遺跡から発掘された古人骨や動物骨を分析し、過去の人類や動物の生きざまを調べている。特に、出産、子育て、食べ物、死亡に注目している。これらは生物集団の人口動態や健康状態を決定する重要な要因である。どのような文化や自然環境のもとで人類や動物の生きざまが決まり、それが進化適応や社会情勢にどう影響していくかまでを明らかにすることを目指している。
安定同位体分析や古代プロテオミクス分析によって、遺物に残された微量の分子を調べ、そうした証拠をもとに、すでに観察することもできなくなった過去の生命現象を明らかにしている。考古学者や骨形態学者と共同で研究を進めており、発掘調査や骨標本の整理にも参加している。
2. 霊長類生態学
チンパンジーやオランウータンなど特にヒトに近縁な霊長類を対象にして、行動観察からは知るのが難しい
生命現象を調べている。観察対象の霊長類個体を識別して行動を観察すれば、多くのことがわかるが、観察からは知るのが難しい行動や、観察から調べるにはあまりの多くの手間と労力がかかる行動も多く存在する。安定同位体分析やプロテオミクス分析を応用することで、そうした問題を解決したいと考えている。
糞や体毛や採食物など、個体を傷つけないで手に入る試料を安定同位体分析したりプロテオミクス分析したりすることで、コドモの発達、食性、健康状態などを明らかにした。動物園などの飼育個体で基礎検討し、野生の個体に応用を進めている。霊長類学者や生態学者と共同で研究を進めており、野外調査にも参加している。
3. 生物と文化のミスマッチ
ヒトが進化を通じて身につけてきた生物学的な性質と、現代の社会や文化の現状がミスマッチを起こしている状況について、調査をしたり議論したりしている。また、夫婦や親族のあいだに閉じないシェアハウスでの子育てなど、現代日本での子育てのあり方の多様性を、社会学者と共同で研究している。
「どうして現代日本ではこんなに子育てが大変なんだろう？」という自身の思いから始まった研究であり、そのため特に妊娠出産や子育てに注目している。現代人の子育てを縛る常識や「当たり前」の価値観は、実は数年から数十年で変遷する。数百万年の時間軸を考慮する人類進化の知見を提供することで、すこし異なる視点を持ちこみ、よりすこやかな子育ての実現に貢献できると考えている。

2. 教育
 担当授業1. 生物人類学特論（2 単位、集中講義）を担当
 研究指導63

該当なし
 全学教育
該当なし
 他大学等における授業
⺠族学考古学特殊 IV（2 単位、半期、慶應大学）を米田穣教授（東京大学）と分担して担当

3. 研究
 学術出版物 (*は責任著者)
原著論文（査読あり）
1. Tsutaya T, Takahashi T, Omori T, Yamazaki K, Sato T, Yoneda M, Schulting RJ, Kato H, Weber AW. (2022).
Reconstruction of diachronic changes in human fishing activity and marine ecosystems from carbon and nitrogenstable isotope ratios of archaeological fish remains. Quaternary International 619, 46–55.
2. Tsutaya T, Yoneda M. (2021). Carbon and nitrogen stable isotopic data of premodern human skeletons from mainland
Japan and the Ryukyu islands. Data in Brief 38, 107359.
3. Tsutaya T, Ogawa NO, Nomura T, Shimizu M, Ohkouchi N, Kuze N. (2021). Carbon and nitrogen stable isotopic
offsets between diet and hair/feces in captive orangutans. Primates 62, 945–954.
4. Tsutaya T, Mackie M, Sawafuji R, Miyabe-Nishiwaki T, Olsen JV, Cappellini E. (2021). Faecal proteomics as a novel
method to study mammalian behaviour and physiology. Molecular Ecology Resources 21, 1808–1819.
書籍分担執筆（査読あり）
該当なし 学会発表1. 蔦谷匠. 生命科学・自然人類学分野における若手研究者のアカデミア就職事情. 第 75 回日本人類学会大会. 2021 年 10 月, 東京 (オンライン開催).
2. 蔦谷匠, 島村繁, 板垣徹, 鈴木美和, 谷川章雄, 澤藤りかい. 近世の合わせ口かわらけ内容物の古代プロテ
オミクス分析. 第 75 回日本人類学会大会. 2021 年 10 月, 東京 (オンライン開催).
企画したシンポジウム等
1. 河村正二, 蔦谷匠. 自然人類学の現状と将来. 第 75 回日本人類学会大会. 2021 年 10 月, 東京 (オンライン開催).
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金1. 日本学術振興会学術研究助成基金助成金基盤研究（C）「古人骨のプロテオミクス・ホルモン分析による妊娠64

マーカー検出法の開発」研究代表者：蔦谷匠（2019〜2021）総額 3,300 千円
2. 日本学術振興会学術研究助成基金助成金基盤研究（C）「絶滅危惧種オランウータンの野生復帰事業改善を目的とした法医学的研究」研究代表者：久世濃子（2019〜2022）総額 3,400 千円
3. 日本学術振興会学術研究助成基金助成金基盤研究（C）「多面的新手法による中近世日本人のライフヒストリ
ーの復元：生物考古学の新展開を探る」研究代表者：長岡朋人（2019〜2023）総額 3,400 千円
4. 日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B）「人骨から読み解く日本列島人の食生活―食物の変遷と多様性の復元―」研究代表者：澤藤りかい（2020〜2023）総額 4,400 千円
5. 日本学術振興会科学研究費補助金学術変革領域研究（A)「同位体比分析から見たヒトとモノの動態復元」研究代表者：米田穣（2020〜2024）総額 9,600 千円
6. 日本学術振興会学術研究助成基金助成金国際共同研究加速基金（国際共同研究強化 B）「古代プロテオミクスの基盤・拠点整備のための海外共同研究」研究代表者：太田博樹（2020〜2022）総額 8,400 千円
7. 日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B）「北海道における海洋生産性の長期変動とその人類への影
響」研究代表者：高瀬克範（2021〜2024）総額 1,000 千円
8. 日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B）「南東アラビア山麓峡谷における千年持続可能な社会基盤の歴史生態学的探究」研究代表者：近藤康久（2021〜2023）総額 1,500 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招へいした外国人
該当なし
総研大国際共同学位プログラム構築支援経費にて招へいした外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動該当なし
 学外委員会活動

65

該当なし
 アウトリーチ活動
以下プレスリリースの出版
https://www.soken.ac.jp/news/7218/
以下対談の実施
https://safefieldwork.live-on.net/2022/02/15/salon003/
 学術誌編集活動
該当なし
 学術誌査読活動
1. Anthropological Science
2. Archaeological Research in Asia
3. Isotopes in Environmental & Health Studies
4. Journal of Human Evolution
5. JSBi Bioinformatics Review
6. World Archaeology

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 人間を対象とする研究倫理審査委員会
 部局委員会等への貢献
該当なし
 大学事業
該当なし

6. その他の特筆すべき活動

海外渡航
2021 年 9 月〜2023 年 9 月（予定）：コペンハーゲン大学（デンマーク）66

進化生物学分野
颯田 葉子（教授： 生理進化学、ゲノム遺伝学）
1.研究テーマ
1.

旧人の異種間浸透がいつどこで起きたか？
ネアンデルタール人やデニソワ人と現生人類が交雑をして、そのゲノムの数％を受け継いでいるということはよく知られた事実である。ネアンデルタール人やデニソワ人との交雑は一様ではなく、それぞれ特徴を持っている。
特にデニソワ人では、3 回（現在は 4 回目があったという報告もある）のそれぞれ異なるデニソワ系統からの浸透が確認されている。この 3 回の浸透に関与したデニソワ系統は D0, D1, D2 と区別されている。D2 の浸透によるゲノム断片は東アジア、南アジア、シベリア、アメリカ先住民など広くアジアの集団に観察されている。それに対して、D1 はパプアニューギニア、また D0 は日本・中国をはじめとする東アジア集団に特異的に観察されている。これら、3 回の浸透がどこで、いつ起きたのかについて、明らかにすることを試みている。現在までに、現生人類の集団や古 DNA を用いて、どの集団にどれだけのデニソワの浸透があったのかを、D0,D1,D2 の区別をして定量的に記述することを試みている。また、それと同時に、現生人類集団での D0,D1,D2 のそれぞれの要素がゲノムのどの部分に入っているかを marker に現生人類集団の分岐や移動経路を復元することも試みている。

2.

ヒトのゲノムに刻まれた環境変化への適応
ヒトの疾病に関わる遺伝子の SNP（疾病 SNP）の多くが他の霊長類で保存されている祖先型であることがあきらかになっている。これらの SNP がヒトの疾病と関わるようになったのは、ヒト特異的な環境変化がその引き金となり、ヒトで新たに疾病抵抗性 SNP が出現したという仮説の元に、疾病 SNP と疾病抵抗性 SNP の分岐年
代や疾病抵抗性 SNP の正の自然選択の可能性等について解析している。独自に開発した 2DM SFS(twodimensional site frequency spectrum) 法を用いた解析を行い、ヒト成長ホルモン受容体遺伝子の多型に注目し、この多型に働く正の自然選択を明らかにし、その自然選択の生物学的理由を論じた。これは、ニューヨーク州立大学等の研究者との共同研究である。その結果は国際誌に掲載された(原著論文 1)。また、胃がんの非リスク SNPに働く自然選択の働き方が、集団、時間により異なることを明らかにしたので、この結果を現在まとめて論文投稿準備をしている。この研究はポスドクとの共同研究である。
九州大学、国立遺伝学研究所の共同研究者とともに、精神疾患に関連した遺伝子の進化を調べているが、遺伝子の転写活性の程度がヒトの脳の発達と社会性の発展に伴い自然選択のターゲットとなったことを議論した論文
が国際誌に掲載された(原著論文２)。また、その遺伝子の多様性形成に旧人からの異種間浸透が関与している可能性が明らかとなり、現在解析を進めている。

3.

ニワトリの家禽化プロセスの研究
これまでニワトリで、過剰な色素沈着のみられる Fibromelanosys という突然変異が固定したインドネシアのAyam Cemani という系統の進化と起源を解明する試みを行ってきた。Fibromelanosys の表現型の特徴の一つとして、羽の色が黒色になることが知られている。現在世界には、羽が黒色のニワトリの系統が多くあるが、全ての系統が Fibromelanosys ではない。Fibromelanosys の遺伝的原因は END3(Endothelin 3)を含む断片が、逆位を伴い重複したことによる。この重複を PCR とその後の制限酵素処理でできる断片の大きさで見分ける方法
をインドネシア科学院、横浜市大の研究者と共同研究で開発した。この成果を国際誌に投稿し、現在査読結果待ちである。この方法を用いることで、特にインドネシアの養鶏農場での Ayam Cemani の系統保存が効率的に67

行われることが期待される。
4.

その他の共同研究
１）2 年前に学位を授与した学生との共同研究で、ヒトの聴覚関連遺伝子の進化の過程が、特に社会制や医療の発達による機能的制約の緩みの影響をどのように受けたかを明らかにするプロジェクトを開始した。
２）霊長研の研究者との共同研究で、新世界ザルと旧世界ザルのゲノム中の Processed 偽遺伝子の分子進化についての共同研究で、偽遺伝子の挿入時期の推定を行った。現在成果を発表準備中。
３）台湾の研究者、沖縄琉球大学の研究者等との共同研究により、台湾に生息するタイワンオオコウモリと琉球諸島に分布するオリイコウモリの集団動態と分化の程度を調べた結果が国際誌に掲載された(原著論文
４）霊長研の研究者、長浜バイオ大学の研究者らとの共同研究で、種内に性決定システムの多型（XY 型と ZW型）を持つツチガエルのゲノム配列を決定し、その染色体の特性を機械学習の手法を用いて明らかにした論文を国際誌に掲載した(原著論文 4)。

2.教育 担当授業
1.ミクロ・マクロ生物学（2 単位、集中講義）
 研究指導1. 清古貴（主任指導）「Visual adaptation to the aquatic environment in the sea snakes」2021 年 9 月学位授与
2. 長田美沙（主任指導）「汽水域と浅海の異なる光環境への魚類視覚の適応」
 全学教育1. 統合進化学（２単位、集中講義）
 他大学等における授業
1. 北里大学にて遺伝学（後期）を担当（2021 年 9 月〜2022 年 1 月）

3.研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
1.

Saitou M, Resendez S, Pradhan AJ, Wu F, Lie NC, Hall NJ, Zhu Q, Reinholdt L, Satta Y, Nakagome S, Hanchard NA,
Churchill G, Lee C, Atilla-Gokcumen GE, Mu X, Gokcumen O. (2021) Sex-specific phenotypic effects and evolutionary
history of an ancient polymorphic deletion of the human growth hormone receptor. Sci. Adv. 7 : eabi4476.

2.

Hayakawa T, Terahara M, Fujito NT, Matsunaga T, Teshima KM, Hane M, Kitajima K, Sato C, Takahata N, Satta Y.
(2021) Lower promoter activity of the ST8SIA2 gene has been favored in evolving human collective brains. PLOS
ONE 16: e0259897.

68

3.

Lin KP, Chaw SM, Lo YH, Kinjo T, Tung CY, Cheng CH, Lau Q, Satta Y, Izawa M, Chen SF, Ko WY. (2021) Genetic
differentiation and demographic trajectory of the insular Formosan and Orii’s flying foxes, Journal of Heredity, 112: 192–
203.

4.

Katsura Y, Ikemura T, Kajitani R, Toyoda A, Itoh T, Ogata M, Miura I, Wada K, Wada Y, Satta Y. (2021) Comparative
genomics of Glandirana rugosa using unsupervised AI reveals a high CG frequency, Life Science Alliance. 4:
10.26508/lsa.202000905

学術研究図書1. 颯田葉子 「1.4 ヒト上科の進化」第１章「ヒトの進化」pp. 22-24, 「単一コピー遺伝子の偽遺伝子化：環境との関わり」第 10 章「偽遺伝子」pp.135-138,「ヒトゲノム事典（井ノ上逸郎・今西規・河村正二・斉藤成也・颯田葉子・田嶋敦 編) 一色出版(2021)
2. 颯田葉子 「環境適応とヒトゲノムの進化」遺伝学の百科事典（日本遺伝学会編）第５章「ヒトと遺伝学」
pp. 200-201, 丸善(2021)
 学会発表学会発表
１. 颯田葉子 「“文化駆動的”なゲノム進化：乳糖耐性を例に」 日本進化学会第 23 回東京大会（オンライン）シンポジウム 11:疾患関連遺伝子の多型と自然選択：”文化駆動的”な進化
２. 岩﨑理紗、颯田葉子 「standing variation によって生じたヒト集団ごとの adaptive allele に見られる多様性 日本進化学会第 23 回 東京大会(8/18-21)
３. Risa L. Iwasaki and Yoko Satta 「A diversity of selection modes has resulted from changing
of target haplotypes in a gastric cancer-associated genomic region」 SMBE 2021 (7/3-8)
企画したシンポジウム等
1.

日本進化学会第 23 回東京大会（オンライン）シンポジウム 11「疾患関連遺伝子の多型と自然選択：“文化駆動的”な進化」 2021 年 8 月 18 日〜21 日
基調講演・招待講演
1. Yoko Satta, Independent selective sweeps for lactase persistence (LP) in Europe and South Asia,
International Symposium on Evolutionary Genomics and Bioinformatics 2022 (ISEGB 2022), Taipei(Online) 2022.3.12~3.13
2. Yoko Satta, Denisovan Introgression in Asia, 遺伝研研究集会 斉藤成也教授 退職記念シンポジウム、
三島、2022.3.5~3.6
3. 颯田葉子、MHC と CYP: 未知の外来物に対抗する二つのシステムの霊長類における進化、共同利用研究会・第 50 回ホミニゼーション研究会「人類進化と遺伝子」2022.3.22~3.23
 外部資金日本学術振興会 研究補助金 基盤研究(C)「精神疾患関連遺伝子から探る現生人類における社会の変化・発展の遺伝的基盤」研究代表者：早川敏之、研究分担者：颯田葉子（2019〜2021）

69

 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

４.社会貢献 学会活動
1. 日本進化学会副会長
2. 日本遺伝学会評議員
 学外委員会活動
1. 日本遺伝学普及会評議員
2. 日本遺伝学会評議員
3. 公益信託進化学振興木村資生基金運営委員
4. ADRC(Asian DNA Repository Consortium) のメンバー
5. 山田科学振興財団研究助成第１次審査委員
 アウトリーチ活動
1. 「ヒトゲノム事典」の執筆・編集
2. 「遺伝学の百科辞典」の執筆・編集
3. NHK ヒューマニエンス「肝臓」に出演
4. 読売新聞（大阪版）コメントのための取材を受ける
5. （プレスリリース）「ネアンデルタール型」ヒト成長ホルモン受容体は、先史時代の食糧が少ない状況
下で有利にはたらいていたかもしれない 2021/12/23
 学術誌編集活動
1. Molecular Biology and Evolution, Associate Editor
2. Genome Biology and Evolution, Associate Editor
3. Scientific Reports, Senior Editor

70

4. Genes and Genetic Systems (GGS), Associate Editor

5.大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 統合進化科学研究センター準備委員会
2. 人間を対象とする研究倫理審査委員会（委員長）
3. ヒトゲノム・遺伝子研究倫理委員会（委員長）
4. 動物研究検証委員会（委員長）
5. 遺伝子組み換え安全委員6. 化学物質適正管理委員会（委員長）
7. 環境安全管理協議会（オブザーバー）
 部局委員会等への貢献
1. 副専攻長2. 試薬管理担当
3. 実験排水管理担当
4. 廃棄物管理担当
 大学事業
1. 統合進化科学研究センター準備委員会
2. 施設係の神奈川県横須賀三浦地域県政総合センター環境課への対応に協力した。

６.その他の特筆すべき活動


博士研究員の受け入れ
岩崎理沙（先導研・特別研究員）

71

進化生物学分野
田辺 秀之（准教授： 分子細胞遺伝学、染色体ゲノム進化学）
1. 研究テーマ
細胞核における染色体テリトリー・遺伝子領域の空間配置がどのように制御されているのか、染色体ゲノム進化
学的な観点から、分子細胞遺伝学的なアプローチ（マルチカラーFISH 法、2D-/3D-FISH 法）を駆使して、以下のテーマに取り組んでいる。
1. 染色体テリトリーの核内配置分子基盤に関する研究
テナガザルにおける急速な染色体進化に着目し、ヒト染色体の R/G バンド各領域における進化的転座切断点（Breaks of Synteny; BOS）における 3D-FISH 解析により、eHAP1 細胞を用いた検証を行った。
2. マウス受精卵・初期胚および異種間ハイブリッドにおける染色体テリトリー・遺伝子領域の空間配置解析
マウス初期胚に適したチャンバーグラス（EASI-FISH chamber）を用いた 3D-FISH 法による実験条件の検討、およびマウス異種間ハイブリッド細胞における核型分析、マルチカラーFISH 法による染色体解析を引き続き行った。また、マウス栄養膜巨細胞における共同研究の成果として論文発表を行った。
3. ヒト 21、18、13 トリソミー細胞における染色体テリトリーの核内空間配置解析
ヒト 21、18、13 トリソミー由来の各種細胞株および 21 トリソミー関連の iPS-アストロサイト分化誘導系を用いて、2D-/3D-FISH 法により、核内空間配置の検討を行った。カニクイザル 17 番染色体（ヒト 13 番染色体に対応）トリソミー個体を用いた 2D-FISH 法による解析結果の成果として論文発表を行った。
4. 遺伝子水平伝搬に関するに爬虫類、両生類を用いた分子細胞遺伝学的研究
ヘビからカエルに水平伝搬したと考えられる LINE トランスポゾン（Bov-B）の起源と進化を探ることを目的として、マダガスカル産カエル、ネッタイツメガエル、ヒキガエル、アイダイショウの各種細胞核、染色体標本の作製を行い、FISH 法による検討を行い、解析結果の一部を元に論文発表を行った。
5. 霊長類における反復配列 DNA のクロマチン動態と進化的意義
ヨザル 2 種（Aotus arazae, Aotus lemurinus）における視細胞核での 3 種類のメガサテライト反復配列
DNA（Owl-Rep、Owl-Alp1、Owl-Alp2）の核内空間配置の比較解析を行い、レンズとしての機能を獲得した年代の推定を行い、論文発表を行った。
6. 脊椎動物、無脊椎動物各種由来のバイオリソースとしての細胞資源化に関する研究
希少生物種の各種細胞の収集・樹立・染色体標本の作製を通じて、バイオリソースとしての研究資源化を図った。ウマ、ヘビ、カエル数種の繊維芽細胞の樹立、上皮系細胞の初代培養を行うとともに、海産無脊椎動
物のミドリイシサンゴの受精卵より、染色体標本の作製を行った。また、現代人ヒト集団稀少サンプル DNA（宝来コレクション）を活用した分子人類学的研究を推進し、共同研究の成果として論文発表を行った。

72

2. 教育 担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学（集中講義、進化生物学分野「生体物質と細胞・遺伝情報の発現・タンパク質」を担当）
2. 先導科学実習（「細胞組織科学」を担当）
3. 統合生命科学 統合進化学（“Chromosome organization, dynamics, and evolution”を担当）
 研究指導動物由来の初代細胞培養、蛍光顕微鏡および共焦点レーザースキャン顕微鏡を用いた観察実験等
 全学教育生命科学リトリート（オンライン）に参加
 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Kambayashi C, Kakehashi R, Sato Y, Mizuno H, Tanabe H, Rakotoarison A, Künzel S, Furuno N,
Ohshima K, Kumazawa Y, Nagy ZT, Mori A, Allison A, Donnellan SC, Ota H, Hoso M, Yanagida T, Sato
H, Vences M, Kurabayashi A (2022, in press) Geography-dependent horizontal gene transfer fromvertebrate predators to their prey. Molecular Biology and Evolution
2. Bigoni F, Tanabe H, Ikeya K, Nobayashi A (2021) Integrated Anthropology: a dialogue between
subdisciplines and museums. Museologia Scientifica nuova serie 15, 89-95.
3. Nishihara H, Stanyon R, Tanabe H, Koga A (2021) Replacement of owl monkey centromere satellite by
a newly evolved variant was a recent and rapid process. Genes to Cells 26, 979-986.
4. Kimura A, Yahashi S, Chatani F, Tanabe H (2021) Identification of chromosome 17 trisomy in acynomolgus monkey (Macaca fascicularis) by multicolor FISH techniques. Cytogenetic and Genome

Research 161, 243-248.
5. Morimoto H, Ueno M, Tanabe H, Kono T, Ogawa H (2021) Progesterone depletion results in Lamin B1
loss and induction of cell death in mouse trophoblast giant cells. PLoS One 16, e0254674.
6. Matsumae H, Ranacher P, Savage PE, Blasi DE, Currie TE, Kognebuchi K, Nishida N, Sato T, Tanabe
H, Tajima A, Brown S, Stoneking M, Shimizu KK, Oota H, Bickel B (2021) Exploring correlations in
genetic and cultural variation across language families in northeast Asia. Science Advances 7,
eabd9223.
7. Tanabe H, Kusakabe KT, Imai H, Yokota SI, Kuraishi T, Hattori S, Kai C, Koga A (2021)
The heterochromatin block that functions as a rod cell microlens in Owl monkeys formed within a 15Myr time span. Genome Biology and Evolution 13, evab021.

73

学術研究図書1 田辺秀之：第 3 章 ヒトゲノムの全体像 3.3 染色体のセントロメア構造 In: 斎藤成也 他 編: ヒトゲノム事典 pp 47-49 一色出版 東京 (2022).
2 田辺秀之：第 12 章 ヒトゲノムの変異 12.8 染色体の転座・逆位・融合 In: 斎藤成也 他 編: ヒトゲノム事典 pp 167-170 一色出版 東京 (2022).
3 田辺秀之：第 12 章 ヒトゲノムの変異 12.9 染色体数変異 In: 斎藤成也 他 編: ヒトゲノム事典 pp 170174 一色出版 東京 (2022).
 学会発表
学会発表
1. 田辺秀之：染色体研究の温故知新：日本の染色体研究の潮流とこれからの在り方について、日本遺伝学会
第 93 回大会、2021 年 9 月
2. 倉林 敦、神林千晶、掛橋竜祐、水野英明、大島一彦、田辺秀之、細 将貴、ミゲル = ベンセス：ヘビからカエルへの遺伝子水平伝播：脊椎動物間水平伝播の地理的特異性と発生様式に関する新知見、日本DNA 多型学会第 30 回学術集会、2021 年 12 月
企画したシンポジウム等
1. 染色体研究の温故知新：様々な生物ゲノムの基本となる染色体研究の面白さ
日本遺伝学会第 93 回大会ワークショップ
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金1. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（B）一般「マダガスカルでの遺伝子水平伝播パンデミックとヘビによる世界的な伝播因子拡散の実証」研究代表者：倉林 敦 研究分担者：田辺秀之（2018〜2022）
2. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（B）一般「ゲノム組成の変化を伴ってヨザルで実現した暗環境への適応：霊長類全般での再現性」研究代表者：古賀章彦 研究分担者：田辺秀之（2019〜2021）
3. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（C）一般「異種間顕微授精によるトゲネズミ雄性 2 倍体胚由来
ES 細胞の樹立と配偶子形成の誘導」研究代表者：三谷 匡 研究分担者：田辺秀之（2018〜2021）
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし

74

そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
優秀研究賞：倉林 敦、神林千晶、掛橋竜祐、水野英明、大島一彦、田辺秀之、細 将貴、ミゲル = ベン
セス：ヘビからカエルへの遺伝子水平伝播：脊椎動物間水平伝播の地理的特異性と発生様式に関する新
知見、日本 DNA 多型学会第 30 回学術集会

4. 社会貢献
 学会活動1. 一般財団法人 染色体学会 理事 ・遺伝学用語検討委員会委員長・将来構想委員会委員長
2. APCC（アジア太平洋染色体コロキウム）国際組織委員
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
1. 一般財団法人 染色体学会 Chromosome Science 誌 動物医学分野 編集長（70 周年記念誌特別号、英文誌、和文誌 編集、発刊）

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 安全衛生委員会
 部局委員会等への貢献
1. ヒトゲノム遺伝子解析研究倫理審査委員会
2. 遺伝子組換え実験安全委員会
3. 化学物質適正管理委員会
 大学事業
該当なし

6.

その他の特筆すべき活動
特になし

75

進化生物学分野
大田 竜也（准教授： 分子進化学）
1. 研究テーマ
1. 脊椎動物における免疫システムの進化の研究
硬骨魚類（主に新鰭亜綱に属する魚類）のゲノムおよびトランスクリプトーム解析に基づき、脊椎動物での免疫システムの分子進化・起源を探る（国際共同研究）。
2. 被子植物における生殖システムの進化の研究
タデ科植物での多様な生殖システムの進化を解明することを目的に、ソバ属植物のゲノム・トランスクリプ
トーム等の NGS データを解析する。特にフツウソバにおける異型花型自家不和合性を司る S 遺伝子領域の解明を行う（国内共同研究）。
3. 縄文時代の植物大型化のメカニズム解明
縄文時代の中期以降に観察される種子の大型化の進化的要因（人為選択の影響等）を明らかにするため、ア
ズキやダイズ等の栽培化（ドメスティケーション）の過程を考古学ならびに遺伝学的な観点から検証する（国内共同研究）。
4. 鱗翅目における嗅覚遺伝子の進化
鱗翅目における嗅覚の多様性およびその進化過程を明らかにするため、嗅覚遺伝子多重遺伝子族を分子進化学的な観点から検証する（先導科学研究科内共同研究）。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学（２単位、集中講義、「分子進化学・分子系統学」を担当）
2. 分子進化学特論 （１単位, 集中講義）
 研究指導該当なし
 全学教育3. フレッシュマンコース（２単位、集中講義、「研究者のための"伝える"技術①ライティング」を担当）
4. 統合進化学（２単位、集中講義、「ゲノム， 染色体， 細胞」を担当）
 他大学等における授業
該当なし

76

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Thompson AW, Hawkins BM, Parey E, Wcisel DJ, Ota T, Kawasaki, K, Funk E, Losilla M, Fitch OE,
Pan Q, Feron R, Louis A, Montfort J, Milhes M, Racicot BL, Childs KL, Fontenot Q, Ferrara A, David SR,
McCune AR, Dornburg A, Yoder JA,Guiguen Y, Roest Crollius H, Berthelot C, Harris MP, Braasch I (2021)
The bowfin genome illuminates the developmental evolution of ray-finned fishes. Nature Genetics 53,
1373-1384.
2. Dornburg A, Ota T, Criscitiello MF, Salinas I, Sunyer OJ, Magadán S, Boudinot P, Xu Z, Flajnik MF,
Singer A, Gambón-Deza F, Hansen JD, Yoder JA (2021) From IgZ to IgT: A Call for a Common
Nomenclature for Immunoglobulin Heavy Chain Genes of Ray-Finned Fish. Zebrafish 18, 343-345.
3. Dornburg A, Wcisel DJ, Zapfe K, Ferraro E, Roupe-Abrams L, Thompson AW, Braasch I, Ota T, Yoder JA(2021) Holosteans contextualize the role of the teleost genome duplication in promoting the rise ofevolutionary novelties in the ray-finned fish innate immune system. Immunogenetics 73, 479-497.
学術研究図書該当なし
 学会発表
学会発表
1. 法月 美悠, 菊池 真司, 安井 康夫, 大田 竜也, 平川 英樹 Oligo-FISH プローブによるフツウソバの染色体の識別と核型解析 染色体学会第７２回年会 （オンライン開催）
2. Dornburg A, Zapfe K, Ferraro E, Roupe-Abrams L, Wcisel DJ, Thompson AW, Braasch I, Ota T, Yoder
JA: Holosteans contextualize the role of the teleost genome duplication in promoting evolutionary noveltyof the ray-finned fish innate immune system. Society for Molecular Biology and Evolution 2021, 3-8 July
(online)3. Barker A, Dornburg A, Thompson A, Braasch I, Ota T, Yoder JA, Wcisel D; Proteasome subunit 8(PSMB8) of ray-finned fishes; cataloging trans-species polymorphisms. North American Comparative
Immunology Workshop 2021
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金基盤 B「考古学と遺伝学から探るダイズとアズキの栽培種誕生プロセスの解明」（代表：那須 浩郎）、研究分
担者、200 万円

77 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
1. 染色体学会第７２回年会 ベストプレゼンテーション賞

4. 社会貢献
 学会活動1. 一般社団法人日本進化学会 監事
 学外委員会活動
国際生物学オリンピック日本委員会 委員
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
1. 国際科学雑誌 Plant Gene Associate Editor
 学術誌編集査読活動

1. Plant Gene
5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 遺伝子組換え実験安全委員会
2. ヒトゲノム遺伝子解析実験倫理審査委員会
 部局委員会等への貢献
1. 統合部局情報セキュリティ委員会
2. 生命共生体進化学専攻 教務担当

78

3. 生命共生体進化学専攻 HP 担当
 大学事業
該当なし

6. その他の特筆すべき活動
該当なし

79

進化生物学分野
五條堀 淳（講師： 自然人類学、分子進化学、集団遺伝学）
1. 研究テーマ
1. 古代ゲノムを用いた東アジア人の成立の過程の解明
東アジア地域では一般に土壌の条件と気候から、古人骨が発掘されにくく、また古人骨に残存している DNA
も多くはない。次世代シーケンサの登場と DNA 抽出技術の進歩により、日本を含めた東アジア地域から出土される人骨から、全ゲノム塩基配列決定を行うことも可能になった。ゲノムの遺伝情報から、現代人と古代人のつながりや、時空間的な広がりの様子を明らかにすることができる。この研究では、旧石器時代、縄文時代、弥生時代の人骨からそれぞれ DNA を塩基配列を決定することで、東アジア人の成立の過程を明らかにすることを目的としている。本研究は東大、東邦大、中国杭州師範大学、農研機構、産総研との共同研究である。
2. 希少変異を用いたヤポネシアと近隣の集団の比較
集団中に見つかる希少変異（＝低頻度変異）は集団特異的なものが多く、集団間でそれが共有される場合には、より遺伝的に近い集団同士の組み合わせで、より多くの希少変異が共有されるという性質がある。この性質を用いて、古代人を含むヤポネシア集団と近隣の集団を比較し、ヤポネシア集団の形成史や極東地域の人類集団の形成史の解明につなげることが本研究の目的である。
3. 希絶滅したニホンオオカミの遺伝的特性をゲノムから明らかにする。
ニホンオオカミは明治時代に絶滅した日本列島の本州に分布していたオオカミである。ニホンオオカミの標本や骨から DNA 抽出を行い、全ゲノム塩基配列を決定した。タイプ標本であるオランダのライデンの剥製標本からも DNA 抽出を行い、全ゲノム塩基配列を決定した。また日本犬のゲノムも複数の個体について全
ゲノム塩基配列を決定した。これらの結果と、先行研究で発表されている様々な犬種やハイイロオオカミ、
古代のイヌやオオカミの全ゲノム塩基配列を比較することで、ニホンオオカミ集団の遺伝的位置づけや、ハイイロオオカミやイヌとの関連を明らかにする。本研究は先導研寺井先生、先導研本郷先生と岐阜大学との共同研究である。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ･マクロ生物学（2 単位、集中講義、「自然人類学、進化遺伝学」を担当）
2. 先導科学実習（2 単位、集中講義、「分子生物学」を担当）
3. 人類遺伝学特論（１単位、集中講義）
 研究指導1. 青野圭 （副指導）「琉球列島におけるイノシシとヒトの関係」

80

 全学教育
1. フレッシュマンコース（2 単位、「研究者のための“伝える”技術 2:プレゼンテーション」を担当）
2. 統合進化学 （1 単位、「Human Evolution Genetics, Adaptation, and Environment」を担当）
3. 生命科学リトリート（担当教員）

 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）*は責任著者

1. Mizuno F*, Gojobori J*, Kumagai M, Baba H, Taniguchi Y, Kondo O, Matsushita M, Matsushita T, Matsuda F,
Higasa K, et al. (2021) Population dynamics in the Japanese Archipelago since the Pleistocene revealed by thecomplete mitochondrial genome sequences. Sci. Rep. 11, 12018

原著論文（プレプリント）
1. Gojobori, J. et al. (2021) The Japanese wolf is most closely related to modern dogs and its ancestral genome has
been

widelyinherited

by

dogs

throughout

East

Eurasia.

Biorxiv

2021.10.10.463851(2021)

doi:10.1101/2021.10.10.463851.

学術研究図書1. “Evolution of the Human Genome II: Human Evolution Viewed from Genomes (Evolutionary Studies) “, Naruya

Saitou 編

Springer ISBN:978-4431569022 2021（” Mitochondrial DNA” の章を担当）

2. 「ヒトゲノム事典」（井ノ上逸郎・今西規・河村正二・斎藤成也・颯田葉子・田嶋敦編）一色出版 ISBN9784-910389-12-7 2021（「9.3：重複遺伝子の運命」「10.1：直列重複後に偽遺伝子化したもの」を担当）
 学会発表学会発表
1. Nishiyama, K., Satta, Y. & Gojobori, J. “The investigation of the sign of selection on genes associatedwith dyslexia of Chinese characters.” Cultural Evolution Society Conference. June 9-11, 2021 Online
2. 西山久美子, 颯田葉子, 五條堀淳「漢字の識字障害関連遺伝子群に対する自然選択の検定」第 75 回 日本人類学会大会. 2021/10/9-11 オンライン
3. 西山久美子, 颯田葉子, 五條堀淳「ヒト東アジア集団において識字障害関連遺伝子 DCDC2 上に見られる
自然選択の痕跡について」日本進化学会第 23 回東京大会. 2021/8/18-21
企画したシンポジウム等
該当なし

81

基調講演・招待講演
1. 五條堀淳「Rare allele sharing among Yaponesian and surrounding populations」国立遺伝学研究所集団遺伝研究 斎藤成也教授 退職記念シンポジウム 2022 年 3 月
 外部資金1. 文部科学省: 新学術領域研究(研究領域提案型) 計画研究「ヤポネシア人の人口推定を中心とした巨大データ解析」研究代表者:長田直樹 研究分担者:五條堀淳 (2018-2022) 総額 49,140 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動該当なし
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
１．朝日新聞デジタル「日本人の祖先は「港川人」？ 旧石器時代、DNA で解析」2021/6/13
２．プレスリリース「港川１号人骨のミトコンドリア DNA の解析で 過去から現在までの日本列島人の遺伝的関係性を解明」2021/6/16
３．朝日新聞「ご先祖は 2 万年前の港川人？DNA 解析 日本人につながる可能性」2021/7/23

 学術誌編集活動

82Molecular Biology and Evolution 誌 Academic Editor
PLOS ONE 誌 Academic Editor
iDarwin 誌 Academic Editor

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
化学物質適正管理委員会
 部局委員会等への貢献
試薬管理担当実験排水管理共働プログラムワーキンググループ
 大学事業
該当なし
6.

その他の特筆すべき活動
1. 博士研究員の受け入れ
西山久美子（先導研・特別研究員）
2. 研究室構成員による学術出版物①

原著論文（査読あり）

なし②

学術研究図書なし

3. 研究室構成員による外部資金
西山久美子、上廣倫理財団研究助成「進化学・遺伝学の基礎研究領域に見られ る障害学との概念的親和性の考察」60 万円
4. 研究室構成員の受賞なし

83進化生物学分野
寺井 洋平（助教： 適応と種分化の機構、分子進化生態学）
1. 研究テーマ
1. ニホンオオカミと日本犬ゲノム、イヌの起源の研究
これまでの研究で、日本犬ゲノムにはニホンオオカミ由来の領域が存在し、このような領域が日本犬の成立に関わった可能性を示してきた。本年度はニホンオオカミと日本犬(秋田犬、柴犬、紀州犬)、世界各地のハイ
イロオオカミと犬種のゲノム、計 140 個体程度の解析を行なった。その結果、ニホンオオカミはハイイロオ
オカミの独立した亜種であり、また全ハイイロオオカミの中で、最もイヌに近縁であることを示した。また
東ユーラシアのイヌの祖先と過去に交雑があったことを示した。これらの内容は bioRxiv に発表し、現在査読集である。また、共同研究者の協力により縄文時代、弥生時代、奈良平安時代、江戸時代、続縄文時代、オ
ホーツク文化期のイヌのゲノムの決定も行なった。現在これらのゲノムを解析し、日本犬の成立過程を明らかにしている。
2. 地衣類の共生による環境適応の研究
これまで硫黄噴出口付近に生育するイオウゴケは藻類、菌類、好酸性バクテリアの３者からなる基本構成である可能性を示してきた。今年度はイオウゴケから菌類、藻類、バクテリアすべての共生体で発現する遺伝
子を RNA 次世代シークエンスで決定し、解析を行なった。この解析から硫化水素の存在する場所でどのようにして共生しているかを推定した。また、菌類とバクテリアは全ゲノム配列を用いて、藻類は葉緑体 DNA
配列を用いて系統樹を構築した。菌類とバクテリアは地域ごとに分化した系統関係を示したが、藻類に地域分化は見られなかった。このことから菌類とバクテリアは共分散をして、藻類は現地調達により共生体を形成していると推定された。別の地衣類、ハコネサルオガセも菌類と藻類、バクテリアの共生系であることをこれまで明らかにしてきた。そのため、現在バクテリアも含めた遺伝子発現を調べるため、再合成株の形成を進めている。
3. サンゴの種間の違いに関わるゲノム領域
イシサンゴ目ミドリイシ科ミドリイシ属の 1 種、コユビミドリイシ(Acropora digitifera)には隠蔽種とされる近縁種がいることが報告されていた。これらの 2 種は形態的な類似性が高く、交雑も可能であるが産卵時期が異なるため分化していると考えられていた。本年度は A. digitifera に加えて近縁種のゲノムを複数個体で決定し解析を行なった。その結果、これら 2 種は遺伝的に極めて近縁であり、ほとんどのゲノム領域に分化は見られなかった。また、2 種間ではゲノム浸透があり、それが非対称であることを明らかにした。また 2
種間で分化したゲノム領域も明らかにした。
4. スラウェシ島固有のマカクを用いた種分化と適応の研究
これまでインドネシア スラウェシ島固有のマカクの全エキソン配列の決定を、分布が隣接する 6 種の複数個体を用いて行っていた。本年度はこれらの種の間の gene flow の解析を行なった。その結果、すべての境界を接する種の組み合わせで、gene flow があることが明らかになった。また、ある境界では gene flow が非対称

84

に起きていることも明らかにした。さらに、2 種の分布の間に１つの種が入っていても gene flow があることが明らかになった。このような１つの種を貫通するように gene flow は稀で、これだけ大規模に gene flow があるスラウェシマカクが種を維持している遺伝的な機構も明らかにしつつある。
5. ヒト特異的皮膚形質の遺伝子基盤に関する研究
これまでの研究で、他の類人猿の種と比較して、皮膚の構造タンパク質遺伝子の発現がヒト特異的に高くなっていることを明らかにしてきた。2020 年度に４つの構造タンパク質遺伝子のプロモーター領域をエピゲノ
ムデータから推定し、それをベクターに組み込みんだが、2022 年度はそれらのプロモーター活性を調べ、皮膚培養細胞を用いたアッセイ系の改良を進めた。このアッセイ系によりどの変異がヒト特異的遺伝子発現を作り出しているかを明らかにする予定である。
6. 海棲爬虫類の視覚の適応の研究
これまでの研究でウミヘビの薄明視を司る RH1 オプシンと長波長に感受性のある LWS オプシンの機能が多様化していることを示してきた。2021 年度は、対象をカメ類の海洋適応に移行した。これまでウミガメとヌマガメ 2 種の眼の全 RNA 次世代シークエンス解析を行なっていたが、さらに生息環境の異なるウミガメのRNA を眼から抽出し、全 RNA 次世代シークエンス解析を行なった。現在は、オプシンの発現量、配列から推測される機能の違い、進化解析を行いカメ類の海洋適応を明らかにしようとしている。
7. 魚類の河川と海の両環境へ適応の研究
魚類は異なる光環境に生息するため、魚類の視覚は適応進化の代表的な例として知られている。しかし海産魚の多くは河川に遡上するが、これらの種が河川に生息する際に視覚を切り替えるのか、河川と海の両方の環境に適応しているのかについてはほとんど知られていない。そこのこの研究では、河川と海の両方に生息するクサフグと海だけ、もしくは河川だけに生息するフグの仲間の眼での遺伝子発現解析を行なった。その結果、クサフグは視覚関連遺伝子の発現量を変化させることで視覚系を切り替えるのではなく、川と海という 2 つの環境に適応していると推定された。またクサフグは河川に移動する際に直面する環境の違いに、熱ショックタンパク質と関連遺伝子の発現量を増やすことで適応していることが示唆された。これらの結果はまとめて、bioRxiv に掲載し、また論文投稿も進めている。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ･マクロ生物学（2 単位、集中講義）
2. 学生実習(分子生物学実習)
 研究指導1. 清古 貴（副指導）「ウミヘビの視覚の段階的な海棲適応」(2021 年 9 月に学位取得)
2. 南木 悠（副指導）「野外のナミアゲハにおける花色選好性」
3. 杉田 あき（副指導）「ムササビの空間分布」
4. 西條 未来（副指導）「チドリ目における対捕食者行動の意思決定」(休学中)
5. 高畑 優（副指導）「都市に生息するエゾリスの餌付けによる影響」

85

6. 山川 真徳（副指導）「真社会性哺乳類ハダカデバネズミにおける社会生態学的適応」
7. 山田 優佳（副指導）「同時的雌雄同体のウミウシ類における多様な繁殖戦略」
8. XIAYIRE XIAOKAITI（副指導）「Zooarchaeological study of domestic dog in East Asia」
9. 長田美沙（副指導）「汽水域と浅海の異なる光環境への魚類視覚の適応」
 学位論文および進級審査
進級審査主査山田 優佳
 全学教育1. なし

 他大学等における授業
1. 麻布大学での講義「イヌの起源と日本犬の成り立ちをゲノムから探る」
2. 京都大学霊長類研究所の大学院生指導
3. 京都大学野生動物研究センターの大学院生指導協力
4. 東北大学大学院生命科学研究科の大学院生指導協力
5. 岐阜大学大学院の大学院生指導協力

3. 研究


学術出版物

発表論文（査読あり）

1.

2.
3.
4.

Yan X, Terai Y, Widayati KA, Itoigawa A, Purba LHPS, Badjeber F, Suryobroto B, Imai H (2022, in press)
Functional divergence of pigmentation gene melanocortin-1 receptor (MC1R) in six endemic Macaca species in
Sulawesi island Scientific Report
寺井洋平 (2022, in press) 全ゲノム情報から知るニホンオオカミ. Mammal Study (査読つき総説)
Takahashi-Kariyazono S, Terai Y (2021) Two divergent haplogroups of a sacsin-like gene in Acropora corals
Scientific Reports 11: 23018
Satoh A, Takasu M, Yano K, Terai Y (2021) De novo assembly and annotation of the mangrove cricket genome.
BMC Research Notes 14:387, https://doi.org/10.1186/s13104-021-05798-z

発表論文（査読なし）

1.
2.

Osada M, Terai Y (2022) Adaptation of the eyes of grass puffer (Takifugu niphobles) to the riverine and marine
environments. bioRxiv, doi: https://doi.org/10.1101/2022.04.28.489969
Gojobori J, Arakawa N, Xiayire X, Matsumoto Y, Matsumura S, Hongo H, Ishiguro N, Terai Y (2021) The
Japanese wolf is most closely related to modern dogs and its ancestral genome has been widely inherited by dogs
throughout East Eurasia. bioRxiv, doi: https://doi.org/10.1101/2021.10.10.463851

学術研究図書なし

86 学会発表
学会発表
1.

仮屋園志帆、井口亮、寺井洋平 ミドリイシ属サンゴの産卵時期決定の遺伝的基盤の解明にむけて 日本サンゴ礁
学会第２４回大会(2021 年 11 月 27 日-29 日)

2.

仮屋園志帆、井口亮、寺井洋平 ミドリイシ属サンゴの産卵時期決定の遺伝的基盤の解明にむけて 日本進化学会 第 23 回東京大会(2021 年 8 月 18 日-21 日)

3.

Shiho Takahashi-Kariyazonoa and Yohey Teraia Two divergent haplogroups of a sacsin-like gene trace back to the origin of
Acroporidae corals SMBE 2021 3-8 July4.

荒川那海, Kanthi Arum Widayati, Laurentia Henrieta Permita Sari Purba, Xiaochan Yan, 今井啓雄, Bambang Suryobroto, 寺
井洋平 隣接した生息域を持つスラウェシマカクでの遺伝的分化と gene flow 日本進化学会 2021 年度大会
2021/8/18-21

5.

Nami Arakawa, Kanthi Arum Widayati, Laurentia Henrieta Permita Sari Purba, Xiaochan Yan, Hiroo Imai, Bambang
Suryobroto, Yohey Terai Local adaptation may cause pseudogenization in the evolution of Sulawesi macaque species annual
meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution 2021/7/3-8

6.

Mieko Kono, Samantha Fernández-Brime, Lucia Muggia, Philipp Resl, Yohey Terai, Mats Wedin "Comparative genomic
approaches towards the genetic basis of fungal lifestyles in Stictidaceae” International association for lichenology 9th symposium2021/8/1-6

7.

河野美恵子、近芳明、大村嘉人、颯田葉子、寺井洋平「ハコネサルオガセ実験モデルから考察する地衣類における共生菌・共生藻相互作用の遺伝的背景」日本菌学会第 65 回大会 2021/8/23-29

8.

大村嘉人 寺井洋平 荒川那海 河野美恵子 近芳明 地衣類ハコネサルオガセおよび関連分類群 の全ゲノムデータ
による分子系統解析 日本植物分類学会 2022 年 3 月

9.

長田美沙 寺井洋平 海と河川の異なる光環境への魚類の視覚適応 日本動物学会関東支部大会 2022 年 3 月

10.

杉田あき、繁田真由美、田村典子、沓掛展之、寺井洋平 DNA マーカーを用いたムササビの性別および個体識
別方法と、糞 DNA を用いた野外調査への応用 日本哺乳類学会 2021 年度大会 2021/8/28-31

企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1.

Terai Y. The evolutionary process of dogs domesticated from gray wolves. AA 研 2021 年度第 1回研究会 2021 9 月

2.

寺井 洋平 ニホンオオカミゲノムから明らかになったイヌの初期の進化 第２回コンパニオンア
ニマルのゲノム医療研究会 2021 年 12 月

3.

寺井 洋平 ニホンオオカミゲノムから見たイヌの初期の進化 行動遺伝学研究会「家畜化機構の解明」2021 年 12 月

4.

寺井 洋平 Japanese wolf genome and the origin of dogs 国立遺伝学研究所集団遺伝研究室 斎
藤成也教授 退職記念シンポジウム 2022 年 3 月

5.

寺井 洋平 スラウェシマカク種間の gene flow 第 50 回ホミニゼーション研究会 「人類進化と遺伝子」2022 年 3 月 22 日

87 外部資金
1. 科学研究費補助金 新学術領域研究(公募研究)「日本列島への人類の渡来に伴って形成された日本犬ゲノムの多重構成」研究代表者：寺井洋平（2019〜2020）総額 750 万円
2. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 B (一般)「共生の第三の主役: 地衣類の共生細菌の役割を代謝
ネットワークから解明する」研究代表者：寺井洋平（2021〜2023）総額 1,300 万円
3. 日本学術振興会 科学研究費補助金国際共同研究強化 (B)「Wallacea 周辺における哺乳類の進化に対する分子的研究」研究分担者: 寺井洋平、（代表：今井啓雄）（2021〜2025）総額 1,200 万円
4. 科学研究費補助金 基盤研究B 「陸から海にもどった羊膜類の適応形質進化機構の法則を探」研究分担者: 寺
井洋平 (研究代表者: 土岐田 昌和)（2019〜2022）総額 1,320 万円
5. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 C「絶滅したニホンオオカミの遺伝的変遷と移動を探る動物考
古学的研究」研究分担者: 寺井洋平 (研究代表者: 石黒直隆)（2020〜2022）総額 300 万円
6. 日本学術振興会 研究拠点形成事業 先端拠点形成型「大型動物研究を軸とする熱帯生物多様性保全の国際研究拠点」(研究参加者) 研究代表者：幸島司郎（2017〜2022）総額 9,000 万円

 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本進化学会 代議員
 学外委員会活動なし

88 アウトリーチ活動
 文京アカデミアでの研究紹介
 渋谷ハチコウ大学での研究紹介
メディア出演での研究紹介

Sciencehttps://www.science.org/content/article/mysterious-extinct-japanese-wolf-may-hold-clues-originsdogs#.YW4PnGW-RHc.twitter
NATURE, 21 October 2021
https://www.nature.com/articles/d41586-021-02890-z
New Scientist, 19 Oct 2021
https://trueviralnews.com/52799-extinct-japanese-wolf-is-the-closest-wild-relative-of-dogs-yet-found.html
True Viral News, 19 Oct 2021
https://www.newscientist.com/article/2294090-extinct-japanese-wolf-is-the-closest-wild-relative-of-dogs-yetfound/?utm_campaign=RSS%7CNSNS&utm_source=NSNS&utm_medium=RSS&utm_content=life
Express Informer, 20 Oct 2021
https://expressinformer.com/dna-confirms-japanese-wolf-extinct-for-115-years-is-the-closest-known-wild-relativeof-modern-dogs/
India Times Post, 20 Oct 2021
https://www.indiatimespost.com/dna-confirms-japanese-wolf-extinct-for-115-years-is-the-closest-known-wildrelative-of-modern-dogs/
Whats New, 20 Oct 2021
https://whatsnew2day.com/dna-confirms-japanese-wolf-extinct-115-years-is-most-known-wild-relative-ofmodern-dogs/
The Japan Times, 21 Oct 2021
https://www.japantimes.co.jp/news/2021/10/21/national/science-health/japanese-wolf-dog-origins/
Phys.org, 21 Oct 2021
https://phys.org/news/2021-10-dna-japanese-wolf-closest-relative.html
Smithsonian Magazine, 21 Oct 2021
http://ct.moreover.com/?a=46155009257&p=1pl&v=1&x=Q1OcuhwQksCMIEpJsQgs_g89

Yahoo! News, 26 Oct 2021
http://ct.moreover.com/?a=46195003424&p=1pl&v=1&x=0DvOU2cU1dHPtQztdgumKw
朝日小学生新聞
読売新聞

11 月 25 日

11 月 27 日

朝日放送ラジオ「おはようパーソナリティ道上洋三です」 12 月 6 日
NHK world 1 月 8 日
東京新聞 1 月 8 日
日経新聞 1 月 11 日
NHK 総合 2022 年 5 月 5 日予定
 学術誌編集活動
1. iDarwin Associate Editor

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
なし
 部局委員会等への貢献
1. 研究体験実習担当
2. アカデミックアドバイザー
3. 実験排水管理
4. SNS 広報
 大学事業なし
6.

その他の特筆すべき活動
1.

博士研究員の受け入れ
荒川那海（先導研・特別研究員）
河野美恵子（先導研・特別研究員）
仮屋園志帆（先導研・特別研究員）

2.

研究室構成員による学術出版物①

原著論文（査読あり）
3 の学術出版物に記載②

学術研究図書なし

90

3.

研究室構成員による外部資金
1.

荒川那海 若手研究 「ヒトの強靭な皮膚はどうやってできてきた?ヒトの皮膚を形成した塩基置換の同定」 研究代表者、100 万円

2.

荒川那海 基盤 B 「共生の第三の主役: 地衣類の共生細菌の役割を代謝ネットワークから解明する」研究分担者（代表：寺井洋平）
、5 万円

3.

荒川那海 国際共同研究強化 (B) 「Wallacea 周辺における哺乳類の進化に対する分子的研究」
研究分担者（代表：今井啓雄）20 万円

4.

仮屋園志帆 若手研究 「ミドリイシサンゴの環境ストレス耐性の遺伝的基盤:ゲノムの種内多型から探る」研究代表者 100 万5.

仮屋園志帆 基盤研究(A) 「造礁サンゴの高水温耐性向上可能性に関する総合的研究」研究分担者（代表：酒井一彦）30 万6.

仮屋園志帆 基盤研究(B) 「共生の第三の主役: 地衣類の共生細菌の役割を代謝ネットワークから解明する」研究分担者（代表：寺井洋平）5 万円

7.

河野美恵子 若手研究「ハコネサルオガセ再合成系を用いた地衣類の新たな共生メンバーと共生遺伝子の解明」（2022 年採択）総額 350 万円

91行動生物学分野
蟻川 謙太郎（教授： 神経行動学、感覚生理学）
1. 研究テーマ
1. アゲハ視覚系における波長情報処理機構の解析
アゲハの第一次視覚中枢（視葉板）はそれぞれが単一の個眼に由来するカートリッジというユニットでできている。個眼は、中に含まれる視細胞の分光感度の組合せによって I~III の 3 タイプに分かれるため、カートリッジにも 3 タイプが認められる。視葉板の連続横断電子顕微鏡画像を得、８本の隣り合うカートリッジ（タイプ I, II, III がそれぞれ３、3、２本）に含まれる視細胞と視覚二次ニューロンを合計 104 個のトレースを完了した。トレースした細胞同士がつくるシナプスを機械学習法で探索し、視葉板神経回路のマトリクス（コネクトーム）を作った。結果を論文として発表した。
アゲハの第一次視覚中枢（視葉板）に微小電極を刺入、視細胞の終末部および視覚二次ニューロン（LMC）の樹状突起付近から分光感度を記録した上で色素を注入、細胞の形態を調べた。明らかになった細胞形態を
電子顕微鏡連続画像から得られた細胞形態と照合した結果、電子顕微鏡でみとめられる５種類の LMC、
L1~L5 のうち、L4 を除く４種からは多くの記録が得られた。分光感度は細胞形態による差が小さく、むしろ細胞が含まれるカートリッジの個眼タイプに依存していることが分かった。これは上述の論文の中で行ったシミュレーションでも確認された。第二次視覚中枢（視髄）おける電子顕微鏡画像の解析と合わせ、現在論文を執筆中である。
アゲハ視髄で記録される動き感受性の高次ニューロンに微小電極を刺入し、反応の色感受性を調べた。結果、過去に明らかにした動き視覚の色感受性と非常によく似た反応が記録された。反応を記録したあとで色素を注入して細胞の形態を調べた結果、キノコ体から視髄にむかうフィードバックニューロンであることが分かった。結果をまとめて論文を出版した。
2. 昆虫視覚系の比較形態学にもとづく進化学研究
SBF-SEM を用いて、昆虫複眼の形態学的研究を進めた。チョウ目ではタテハチョウ科のヨーロッパコムラ
サキ、シロチョウ科のモンシロチョウ、ハチ目ではヨーロッパミツバチの視葉板の連続電顕画像を得た。モンシロチョウに関しては、３つのカートリッジの視細胞と視葉板二次ニューロンのトレースを完了した。
ミドリヒョウモンとメスグロヒョウモンで、複眼視細胞分光感度の性差を電気生理学的に検証した。いずれも紫外、青、緑の基本的セットに加え、オスのみで黄緑、黄、赤に極大をもつ視細胞が認められた。生理光
学実験の結果と併せて論文を出版した。
3. 昆虫視覚進化研究の国際的協力体制の構築
先導科学共働プログラムの国際共同研究として実施した。ドイツとスロベニアの若手研究者との共同研究を進めた。上記のアゲハ視葉板コネクトームとヒョウモン類での研究は、スロベニアとの共同研究である。ドイツとは、昼行性と夜行性のスズメガで、視葉板の構造を比較する解剖学研究を共同で進めている。これまでに昼行性スズメガでの細胞トレースをほぼ完了した。詳細は共働プログラムの報告書を参照。

92

2. 教育 担当授業
1. ミクロ･マクロ生物学（2 単位、集中講義）
 研究指導1. 秋山辰穂（主任指導）「鱗翅目昆虫における視覚の多様性と環境適応：色覚の性的二型、日周環境への適応」
2. 南木悠（副指導） 全学教育該当なし。
 他大学等における授業
1.

横浜市立大学大学院にて集中講義（2020 年 8 月、オンライン）

2.

信州大学理学部にて集中講義（2020 年 9 月、オンライン）

3.

自由学園最高学部にて集中講義（2020 年 10 月、オンライン）

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
1.

Matsushita A, Stewart FJ, Ilić M, Chen P.-J, Wakita D, Miyazaki N, Murata K, Michiyo K, Belušič G, Arikawa K (2022).
Connectome of the lamina reveals the circuit for early colour processing in the visual pathway of a butterfly. Current Biology,
https://doi.org/10.1016/j.cub.2022.03.066.

2.

Céchetto C, Arikawa K, Kinoshita M (2022). Motion-sensitive neurons activated by chromatic contrast in a butterfly visualsystem. Philosophical Transactions of Royal Society of London B, in press.

3.

Ilić M, Chen P.-J, Pirih P, Meglič A, Prevc J, Yago M, Belušič G, Arikawa K (2022). Simple and complex, sexually dimorphic
retinal mosaic of fritillary butterflies. Philosophical Transactions of Royal Society of London B, in press.

 学会発表1.

曽根蒼太，蟻川謙太郎，宮竹貴久．LED に対するコクヌストモドキの誘引性．第 66 回日本応用動物昆虫学会、2022 年 3 月、明治大学生田キャンパス、オンライン開催

2.

Wakita D, Kinoshita M, Arikawa K: Morphology and spectral sensitivity of lamina monopolar cells of a butterfly, Papilio
xuthus. The 43rd Annual Meeting of the Japanese Society for Comparative Physiology and Biochemistry, Dec 2021, Sapporo(Online) 企画したシンポジウム等
該当なし
 基調講演・招待講演

93

1.

蟻川謙太郎：アゲハの眼に星空―個眼蛍光と色覚研究―．ナリシゲシンポジウム「リサーチヒストリー：動物学研究の転換点」日本動物学会第 92 回大会、2021 年 10 月、米子（オンライン開催）

2.

蟻川謙太郎：チョウが見る世界をたずねて．日本視覚学会特別講演、2021 年 10 月、千葉（オンライン開催）

 外部資金1. 日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（S）「視細胞間シナプスがつくる波長対比性の神経行動学的解析」研究代表者：蟻川謙太郎（2018〜2022）総額 200,200 千円
 外国人招聘
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動1. 公益社団法人日本動物学会 副会長、理事
2. 日本比較生理生化学会 副会長
3. 視覚科学フォーラム 運営委員
 学外委員会活動
1. 日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
2. 大学改革支援・学位授与機構 専門委員
 アウトリーチ活動
1. 神奈川県立鎌倉高等学校にて、サイエンスカフェ（2021 年 12 月、対面）
2. 自由学園リビングアカデミーにて、特別講義（2020 年 10 月、対面）
 学術誌編集活動
1. Journal of Comparative Physiology A 編集委員
2. Frontiers in Physiology 編集委員
3. Journal of Experimental Zoology 編集顧問
4. Frontiers in Neuroscience 編集顧問
5. Arthropod Structure and Development 編集顧問
 学術誌査読活動
1. Journal of Comparative Physiology A
2. Journal of Experimental Biology
3. Current Biology
4. Science94

5. Philosophical Transactions of Royal Society of London B
6. Insects

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 教育研究評議会委員
2. 経営協議会委員
3. 学長選考委員会委員
4. ハラスメント防止委員会委員
5. 財務マネージメント委員会委員
6. その他、学長補佐として理事連絡会、理事懇談会などに出席
 部局委員会等への貢献
1. 先導科学共働プログラム WG 委員長
2. 遺伝子組み替え実験安全委員会委員長
3. 動物研究検証委員会委員
 大学事業
該当なし。

6.

その他の特筆すべき活動
該当なし。

95

行動生物学分野
木下 充代（准教授： 神経行動学、生理行動学、認知科学）
1. 研究テーマ
1. チョウ類の嗅覚系における多様性と環境適応の解明様性
チョウ目昆虫の多くが、特定の食草に産卵する。嗅覚情報処理系は、チョウ目食草選択において重要な役割を果たすため、アゲハチョウ類を中心にその多様性を、１．触角の感度、２．第一次嗅覚中枢の構成、３嗅受容レセプターの３つの方向から進めた。その結果、嗅覚情報処理系の実験系の確立に必要不可欠な刺激手法を確立した。また、第一次嗅覚中枢は、アゲハチョウとアオスジアゲハ族のチョウ４種では、明確な雌雄差が見られるのに対し、近縁のジャコウアゲハ・ウスバシロチョウには雌雄がないことがわかった。アゲハチョウの嗅受容レセプターは、アゲハチョウ族３種のゲノム情報から６０前後であることがわかった。またナミアゲハ触角の RNA seq 解析の結果、発現量に雌雄差が見られるものが少なくとも一つあることがわかった。
2. アゲハチョウの高次中枢における視覚神経を対象とした神経生理学的研究
視覚中枢から記憶・学習の中枢であるキノコ体に投射する３種類の神経群を対象に、細胞内記録と染色により分光特性を明らかにした。等光子量にした単色光（300-740nm）への応答は、いずれの神経も反対色性を示し、網膜にある光受容細胞に比べ非常に限られた波長域にのみ興奮応答を示した。また同じ波長域に興奮性を示す場合も、抑制性の応答は多様であった。このような特徴はサルの中枢神経で報告されていたものと酷似していた。この結果は鋭い色弁別をもち、かつ高い色学習能力を持つナミアゲハの色覚能力と関係していると考えている。
第二次視覚中枢と大脳をつなぐ動き感受性神経を対象に、その波長特性を細胞内記録と染色により明らかにした。これまで昆虫の動き感受性神経は、緑受容細胞からの情報に依存していると考えられてきた。今
回行動学的研究で指摘されていた、動き知覚における緑の他赤・広帯域受容細胞からの入力を受ける波長依存性を、動き感受性神経のレベルでも確認することができた。また記録した神経は第二次視覚中枢においてシナプス様の形態を多数持つことから、記録した神経の多くは、反対側の複眼からの動き情報を大脳で受けて、第二次視覚中枢に送っていると考えている。これらの神経は左右の情報を統合する役割を果たしている可能性が高い。
3. アゲハチョウの季節型と生得的に好む色
季節型による違いに注目してナミアゲハが生得的に好む色を明らかにした。訪花性昆虫の多くが求蜜行動
において生得的に好む色を示す。黒の背景に１０色の色紙を提示して最初の３回分の訪問をうけた色を生得的に好む色として記録した。また４色で行った先行研究で花の匂いが生得的な色の好みに影響することがわかっていたので、オレンジ・ユリの匂い下での観察も行った。その結果、季節型・匂いの有無によらず、１０色を提示すると限定的ではあるが生得的な色の好みに雌雄差があることがわかった。今回注目した季節型では、オレンジの匂い下のオスと匂いなしのメスで色の好みに違いが見られた。また、以上の結果から生得的な色の好みに見られる雌雄差は提示する色の種類に強く依存することがわかった。

96

4. アゲハチョウの訪花特性の解明
鱗翅目昆虫が野外で訪れる花の同定に、野外調査・体表花粉分析（形態・遺伝子情報）が有効な方法であることをヒメウラナミジャノメで検証した研究を取りまとめ、原著論文の執筆を行った。
ナミアゲハが、初夏から秋にかけて訪れる花を同定するため、野外調査分の取りまとめに加え、ヒメウラ
ナミジャノメで確立した方法を用いた体表花粉分析にも取り掛かった。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ･マクロ生物学（２単位、行動分野 集中講義）
2. 先導科学実習（２単位、実習）
 研究指導1. 南木 悠（主指導）「野外におけるアゲハチョウの訪花特性」
2. 山田 優佳（副指導）「ウミウシの繁殖」
3. 中井 喜隆 (大阪大学・クロスアポイントメント教員)「ナミアゲハの生得的好みの色と雌雄・季節型・匂い応答の違い」 全学教育フレッシュマンコース (２単位、集中講義）「研究者のための伝える技術」（オブザーバー） 他大学等における授業
大阪大学大学院（１単位、集中講義）Current Topics I「Behavioral neuroscience」

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり.＊印：責任著者）

1. Arikawa, K.＊, Nakai, Y. Koshitaka, H, Kinoshita M. (2021) Foraging small white butterflies, Pieris rapae, searchflowers using color vision. Frontiers in Ecology and Evolution. 9, 10.3389/fevo.2021.65

2. Nagaya, H. Stewart F. Kinoshita M.＊(2022) Swallowtail butterflies use multiple visual cues to select ovipoisition site.
Insects 12, 10.3390/insects12111047.

3. Kinoshita M.＊, Stewart J. F. (2022) Cortical-like colour-encoding neurons in the mushroom body of a butterfly. Current
biology 32, 114-115
 学会発表

1. Wakita, D.＊, Kinoshita M. Arikawa, K. Morphology and spectral sensitivity of lamina monopolar cells of a butterfly,
Papilio xuthus, 比較生理生化学会 第 43 回札幌大会, 2021 年 12 月 4-5 日
企画したシンポジウム等
該当なし

97

基調講演・招待講演
木下 充代「アゲハチョウの訪花行動における視覚の役割」日本学術会議 動物科学分科会 公開シンポジウム
動物科学の最前線：めくるめく多様性を科学する 2022 年 1 月 29 日オンライン開催
 外部資金1. 先導科学研究科・共働プログラム萌芽的共同研究 「チョウ類の嗅覚系における多様性と環境適応の解明」研究代表者：木下充代 (2021)
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本比較生理生化学会 将来計画委員
2. 日本比較生理生化学会 評議員
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
JT 生命誌研究館 生命誌 106 号 Web 記事「ナミアゲハの生活を支える視覚情報」
 学術誌編集活動• Journal Comparative Physiology A (Advisory board)• Zoological Science (Advisory board)• Frontier of Insect Science (Associate Editor)

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. ハラスメント相談（苦情相談）員・環境安全協議会オブザーバー

98 部局委員会等への貢献
1. 学術情報基盤センター本部図書館専門部会の葉山図書委員
 大学事業
該当なし

99

行動生物学分野
渡邊 崇之（助教： 神経行動学、神経遺伝学）
1. 研究テーマ
1. 性決定遺伝子 doublesex に依存した不完全変態昆虫神経系の性決定機構の解明
ショウジョウバエなどの進化的に後発な完全変態昆虫に属する昆虫は、神経系の性差を生み出す分子メカニズ
ムとして、転写因子である fruitless 遺伝子と doublesex 遺伝子に依存した２つの経路を有する。一方、コオロギなどの原始的な不完全昆虫に属する昆虫では fruitless 遺伝子は性決定に寄与しないことを明らかにしてきた。
本研究は、コオロギを材料に doublesex 遺伝子に依存した性決定システムが不完全変態昆虫の脳・神経回路の性決定に寄与するという仮説を立証することを目的としている。今年度は、CRISPR/Cas9 システムを利用して作出した doublesex 遺伝子破壊系統の解析を進めた。機能欠失型 doublesex 遺伝子をホモにもつ系統の樹立を目的として、遺伝子破壊個体を PCR によってスクリーニングしたが、機能欠失型 doublesex 遺伝子を持つコ
オロギは全てメスであり、オスを得ることができなかった。doublesex 遺伝子はコオロギの雄化を司る遺伝子であると考えられることから、この結果は doublesex 遺伝子が性染色体上に存在することを示唆しており、その場合、機能欠失型 doublesex 遺伝子をホモにもつ系統が樹立できないことになる。次に、doublesex 遺伝座への蛍光タンパク質遺伝子を挿入することによって、遺伝子破壊個体を簡便にスクリーニングする実験系の確立を進めた。現在系統樹立実験を進めており、作成した系統は来年度実施予定の RNA-seq 解析に供する予定である。また、昆虫の doublesex 遺伝子の分子進化の解析から、コオロギの Doublesex タンパク質は他昆虫のものと異なる DNA 結合能や共役因子との結合能を有することを予想できた。リコンビナント Doublesex タンパク質をもちいた SELEX-seq 解析の結果、コオロギを含むさまざまな昆虫の Doublesex タンパク質が ACAnTGT
を共通結合配列として持つことが明らかとなった。さらに今年度は脳内発現遺伝子の雌雄差を理解するために、
Iso-seq 解析による脳内発現遺伝子群のスプライスバリアントの網羅的発現解析にも着手している。来年度は、
遺伝子破壊系統を用いた RNA-seq 解析や遺伝子挿入系統の樹立、doublesex タンパク質の生化学的解析を進めていく予定である。
2. コオロギをモデルとした形態的多型に伴う行動多型の神経基盤の解明
多くの昆虫は集団密度に依存して形態的な多型を生じることが知られている。私の研究材料であるフタホシコ
オロギでは、幼虫期を単独で過ごした個体と集団中で過ごした個体で大サイズに明瞭な差が生じる。さらに、単独飼育群と集団飼育群には、成虫オス間の闘争行動の強度に差があることも報告されていた。本研究では単独飼育群と集団飼育群の闘争性の差を生み出す分子神経基盤について調査している。今年度は、単独飼育群と集団飼育群の脳で発現する遺伝子群を網羅的に比較するトランスクリプトーム解析を実施した。来年度以降、
攻撃性の亢進とリンクして発現量が変動する遺伝子群に着目し、RNAi/CRISPR•Cas9 法などを活用した機能解析実験を進めていく予定である。
3. コオロギ中枢神経系におけるオクトパミン・チラミン作動性神経細胞群の解剖学的解析
昆虫脳に含有される生体アミンの一種であるオクトパミンは、脊椎動物のノルアドレナリンのアナログとして、闘争行動や交尾行動などの社会行動、学習・記憶などの脳高次機能を担う神経伝達・修飾物質である。これま100

で、オクトパミンの前駆体であるチラミンの合成酵素である Tdc2 タンパク質に対する特異的抗体を作成し、コオロギの脳・食道下神経節に存在するチラミン作動性神経細胞群の分布を調査している。今年度、水波誠教授（北海道大学）と共同で、腹部神経束を構成する胸部神経節群・腹部神経節群についてチラミン作動性神経細胞群の脳内分布を調査し、コオロギ中枢神経系に存在する 500 細胞を越えるチラミン作動性神経細胞群の分布を明らかにした。さらに、オクトパミン合成酵素である TβH 遺伝子座に膜移行型蛍光タンパク質遺伝子を導入した遺伝子導入コオロギ系統の樹立を進めた。来年度は現在作成中の遺伝子導入系統を利用して、コオ
ロギ中枢神経系のオクトパミン作動性神経細胞群の分布を調査する予定である。
4. “コオロギ神経遺伝学” の基盤技術の開発
私の主要な実験材料であるフタホシコオロギは、遺伝子導入・遺伝子編集が比較的容易な昆虫であるが、本格的に機能ゲノム学研究を展開するための研究リソースはまだまだ不足している。現在、コオロギを材料とした機能ゲノム学研究を加速させるべく、コオロギにおける遺伝子操作の基盤技術を確立に取り組んでいる。今年
度は、CRISPR/Cas9 法を活用した配列特異的な遺伝子導入法の確立や、コオロギで利用可能なユビキタスプロ
モーター・組織特異的プロモーター候補を組み込んだ遺伝子導入ベクターの構築に取り組んだ。
5. 昆虫複眼の構造的バリエーションを生み出す発生プログラムの解明
昆虫の複眼は８−９個の視細胞を持つ個眼が多数アレイ状に敷き詰められた基本構造を共有するが、種・系統ごとに驚くべき構造的バリエーションを有し、不完全変態から完全変態への後胚期発生様式の進化に伴い発生様式が変化している。本研究では、複眼の構造的バリエーションのひとつである「複眼の領域化」について、原始的な不完全変態昆虫であるコオロギを材料にその発生プロセスを解明し、比較発生学的観点から昆虫複眼の構造的
バリエーションの進化プロセスを考察することを目指す (本学の蟻川謙太郎教授、Mike Perry 博士（UC San Diego・Assistant Professor） との共同研究)。今年度は本研究を遂行するための研究基盤を整備する目的で、複眼視細胞で発現する光受容タンパク質に対する特異的抗体の作成や、他昆虫種で視細胞の分化を制御する転写因子遺伝子
Spineless 遺伝子の単離、CRISPR/Cas9 法を利用した遺伝子破壊系統の作成に取り組んだ。今後は、作成した抗体や遺伝子破壊系統を利用した複眼発生プロセスの組織学的解析を進めていく。
6. ゴキブリ科昆虫の性フェロモン受容体遺伝子の進化・多様性の解析
ワモンゴキブリ、クロゴキブリなどのゴキブリ科昆虫はペリプラノン誘導体を性フェロモンとして利用することが知られる。現在、渡邉英博助教（福岡大学）、水波誠教授（北海道大学）、西野浩史助教（北海道大学）と共同で、ワモンゴキブリの触覚で発現する性特異的な嗅覚受容体遺伝子群の機能解析を通して、性フェロモン
受容体遺伝子の同定と機能解析を進めている。今年度はワモンゴキブリに近縁なゴキブリ科昆虫１３種に着目し、触角を対象としたトランスクリプトーム解析を実施した。その結果、これまで我々がワモンゴキブリで同定・機能解析を進めた２種類の嗅覚受容体遺伝子に構造的に類似した性フェロモン受容体候補遺伝子を多数得ることに成功した。興味深いことに、ワモンゴキブリの性フェロモン受容体が近縁種において高度に遺伝子重複していることが明らかになってきた。今後は、重複した性フェロモン受容体様遺伝子の遺伝子機能解析を進めていく予定である。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学 （２単位、集中講義、「神経進化発生学」を担当）

101

 研究指導該当なし。
 全学教育該当なし。
 他大学等における授業

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）
1.

Tateishi K*, Watanabe T*, Nishino H, Mizunami M, Watanabe H. (2022, in press) Silencing the odorant receptor coreceptor impairs the olfactory reception in a sensillum-specific manner in the cockroach. iScience (*equal contribution)

 学会発表
1. 立石康介、渡邊崇之、西野浩史、水波誠、渡邉英博 ワモンゴキブリの OR 型嗅覚受容体の分布と匂い応
答特性 九州沖縄植物学会（第 70 回）
・日本動物学会九州支部大会（第 73 回）
・日本生態学会九州地区会（第 65 回）三学会合同福岡大会（オンライン） 2021/6/6
2. Kosuke Tateishi, Takayuki Watanabe, Hiroshi Nishino, Makoto Mizunami, Hidehiro Watanabe Functional analysis
of odorant receptor co-receptor (ORco) in the antennae of the American cockroach Insect olfaction and taste in 24
hours around the globe (online) 2021/8/12
3. 渡邊崇之 “神経遺伝学”的方法論を取り入れたコオロギ行動学の確立に向けて～これまでの取り組み、
課題と展望～ 第 92 回日本動物学会（オンライン） 2021/9/2-4
4. 立石康介、渡邊崇之、西野浩史、水波誠、渡邉英博 ワモンゴキブリの性フェロモン受容体の同定 第 92回日本動物学会（オンライン） 2021/9/2-4
5. Kosuke Tateishi、Takayuki Watanabe、Hiroshi Nishino、Makoto Mizunami、Hidehiro Watanabe Sex pheromone
receptors in the American cockroach 第 43 回日本比較生理生化学会（オンライン） 2021/12/4-5
6. 立石康介、渡邊崇之、西野浩史、水波誠、渡邉英博 ワモンゴキブリ性フェロモン受容機構の解析 日本
動物学会・九州沖縄植物学会・日本生態学会 合同福岡例会（口頭発表） 2021/12/11
企画したシンポジウム等
1. 第 92 回日本動物学会（オンライン）サテライトシンポジウム「非モデル生物を材料とした神経行動学のイマとミライ」 2021/9/2 -4 共同オーガナイザー

基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金1. 日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（C）「形態的可塑性とリンクした行動戦略の多型はどのような神102

経基盤により生じるのか？」研究代表者：渡邊崇之（2019〜2021 年度）総額 3,400 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
総研大国際共同学位プログラム構築支援経費にて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動該当なし
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
1. Frontiers in Behavioral Neuroscience 編集委員
 学術誌査読活動

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
該当なし

103

 部局委員会等への貢献
該当なし
 大学事業
該当なし

104

理論生物学分野
佐々木 顕（教授： 数理生物学、理論進化学）
1. 研究テーマ
適応進化の私論的研究
相利共生系や寄生系における共進化動態、伝染病の流行予測と防除戦略、異質な環境のもとでのメタ個体群の進化動態などを理論的に研究した。今年度はクラス構造のもとでの量的形質の適応動態、急速に進化する伝染病の免疫エスケープ、熱水噴出孔でのハオリムシ・イオウ細菌の相利共生系の進化的脆弱性に関する論文を
発表した。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学（２単位、集中講義、「理論生物学」を担当）

2. 生物統計学
 研究指導1. 桑野友輔 （主任指導） 「変動環境下の休眠の進化」
2. 熊田隆一 （主任指導, JSPS DC1） 「ウイルスと宿主免疫の進化」
 他大学等における授業
1. なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）

1. Lion S, Boots M, Sasaki A (2022, in press) Multi-morph eco-evolutionary dynamics in structured
populations. American Naturalist
2. Sasaki A, Lion S, Boots M (2022) Antigenic escape selects for the evolution of higher pathogen transmission
and virulence. Nature Ecology and Evolution 6, 51-62
3. Sato M, Sasaki A (2021) Evolution and maintenance of mutualism between tubeworms and sulfur-oxidizing
bacteria. American Naturalist 197, 351-365
学術研究図書1. 佐々木顕 (2022) 免疫やワクチンをかいくぐって進化するウイルスを数理で捕らえる. 現代化学 611 50-53(2022 年 2 月号)

105

 学会発表
学会発表
1.

佐々木顕・Sebastien Lion・Mike Boots 抗原エスケープで進化する高い感染性と毒性 日本生態学会 2022/3、
オンライン

2.

熊田隆一・佐々木顕 寄生者が媒介する捕食抵抗性の進化とその個体群動態への影響

日本生態学会2022/3、オンライン3.

渡部輝明・佐々木顕 メタ R0 理論で解明するウイルス連続抗原変異の低次元性、及び多様性と進化速度

4.

第 31 回日本数理生物学会大会 2021/9、オンライン

5.

桑野友輔・佐々木顕 生息環境の変化にともなう蚊の休止時間の進化 第 31 回日本数理生物学会大会
2021/9、オンライン

6.

伊藤洋・佐々木顕 系統間選択の効果を環境収容力分布の形から推定する式 第 31 回日本数理生物学会大会 2021/9、オンライン

企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1. 佐々木顕 免疫やワクチンをかいくぐって進化するウイルスを数理で捕まえる 京都大学生態学研究セン
ター公開講演会 2022/2/19、オンライン
2. 佐々木顕 免疫逃避は病原体の強感染性や強毒性を進化させる 第 6 回理論免疫学ワークショップ
2022/3、オンライン
3. 佐々木顕 下水のコロナ調査で感染者数を推計する方法について 第 80 回日本公衆衛生学会 2021/12、新宿 NS ビル

 外部資金1.

科学研究費補助金・挑戦的研究（萌芽）「R0 中心性に基づく大規模階層ネットワーク上の流行動態・防除理論の新展開」研究代表 (2019-2022) 500 万円

2.

国立極地研究所一般共同研究「南極湖沼生態系の数理モデル化に関する研究」 研究代表 (2019-2021) 50万円

 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし

106

そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動1. なし
 学外委員会活動
1.

JST 創発的研究支援事業 事前評価 外部専門委員

2.

日本学術振興会科学研究費委員会専門委員

 アウトリーチ活動
1.

(プレスリリース）免疫やワクチンからの逃避を繰り返す病原体は高い病原性を進化させる、2022/1/17

2.

NHK おはよう日本「新ウイルスは重い症状で流行繰り返すか 数理モデルで分析」、2022/2/7

3.

NHK World Japan 2022/2/7

4.

日刊工業新聞 「ゲノム解析で見えてきたコロナ「オミクロン株」の正体」、2022/2/28

5.

佐々木顕 新型コロナウイルスの流行予測、進化予測、防除 ‒数理生物学の挑戦 生命共生体進化学専攻
における研究最前線 2021/5/15

 学術誌編集活動
1. Journal of Theoretical Biology, Co-Editor in Chief (2020-)

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1.

生命共生体進化学専攻長

2.

教育研究評議会評議員

3.

学長選考委員会委員

4.

財務マネジメント委員会会員

5.

ハラスメント協議会委員

6.

生命共生体進化学専攻入試委員長

 部局委員会等への貢献
1.

共働プログラムワーキンググループ

2.

統合進化科学研究センター運営委員会

 大学事業107

1. なし6.

その他の特筆すべき活動


博士研究員の受け入れ
伊藤洋（先導研・特別研究員）
鈴木清樹（先導研・特別研究員）



研究室構成員による学術出版物①

原著論文（査読あり）
1.

Kumata R, Iwanami S, Mar KB, Kakizoe Y, Misawa N, Nakaoka S, Koyanagi Y, Perelson AS, Schoggins
JW, Iwami S, Sato K (2022) Antithetic effect of interferon-α on cell-free and cell-to-cell HIV-1 infection.
PLOS Computational Biology 18②

学術研究図書なし



研究室構成員による外部資金
熊田隆一 JSPS DC1 特別研究員奨励費「メタトランスクリプトーム解析による原因不明疾患関連ウイル
スの網羅的探索と解明」 (2021-2023) 220 万円



研究室構成員の受賞なし

108

理論生物学分野
印南 秀樹（教授： 集団遺伝学、ゲノム進化学）
1. 研究テーマ
1. 遺伝学ベースのゲノム進化研究
ゲノムは生命体の設計図であり、これが突然変異によって変化すること、そしてそれが次世代に受け継がれることが、進化の源である。このプロセスを理論的に理解し、ゲノムデータを見ることによって、DNA レベ
ルの進化のメカニズムを解明する。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ･マクロ生物学（２単位、集中講義）
2. 副論文の書き方（１単位、集中講義）
3. 科学論文の書き方 （２単位、eLearning）
 研究指導1. 濱崎真夏 （主任指導）
2. 坂本貴洋 （主任指導）
3. 植松圭吾 （ポスドク）
4. Kent Kawashima （ポスドク）
5. Cian Glenfield （ポスドク）
6. Quintin Lao （ポスドク）

 全学教育なし
 他大学等における授業
京都大学農学部 「集団遺伝学」

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Sakamoto T, Innan H (2021) Establishment of a new sex-determining allele driven by sexuallyantagonistic selection. G3 11, 1-14.
2. Innan, H., V. Reiner and D. Govindaraju (2020) Genetic and epigenetic Muller’s ratchet as amechanism of frailty and morbidity during aging: a demographic genetic model. Hum. Genet. 139:109

409-420.
3. Fawcett JA, Innan H, Tsuchiya T, Sato F (2021) The effects of the first and last mating age on therelationship between the advancing age and reproductive performance of Japanese Thoroughbred
broodmares. J. Equine Sci. 32, 31-37.
4. Sakimura S, Nagayama S, Fukunaga M, Hu Q, Kitagawa A, Kobayashi Y, Hasegawa T, Noda M,
Kouyama Y, Shimizu D, Saito T, Niida A, Tsuruda Y, Otsu H, Matsumoto Y, Uchida H, Masuda T,
Sugimachi K, Sasaki S, Yamada K, Takahashi K, Innan H, Suzuki Y, Nakamura H, Totoki Y, Mizuno
S, Ohshima M, Shibata T, Mimori K (2021) Impaired tumor immune response in metastatic tumors is aselective pressure for neutral evolution in CRC cases. PLoS Genet. 17, e1009113.
5. Innan H, Vaiman D, Veitia RA (2021) Predictable increase in female reproductive window: A simple
model connecting age of reproduction, menopause and longevity. BioEssays 43, 2000233.
6. Glenfield C, Innan H (2021) Gene duplication and gene fusion are important drivers of tumourigenesis
during cancer evolution. Genes 12: 1376.
7. Sakamoto T, Innan H (2022) Muller's ratchet of the Y chromosome with gene conversion. Genetics
220, iyab204.
8. Takeuchi Y, Ohtsuki H, Innan H (2022) A Non-zero-sum neutrality test for the tropical rain forest
community using long-term between-census data Ecol. Evol. 12, e8462.
9. Guo B, Zou M, Sakamoto T, Innan H (2022) Frequently functional innovation through gene
duplication followed by frameshift mutation. Genes. 13, 190.
10. Sugihara Y, Young L, Yaegashi H, Natsume S, Shea DJ, Takagi H, Booker H, Innan H, Terauchi R,
Abe A (2022) High-performance pipeline for MutMap and QTL-seq. PeerJ 10, e13170.
11. Vietia RA, Innan H (2022) Pathogenic ‘germline’ variants associated with myeloproliferative disorders
in apparently normal individuals: inherited or acquired genetic alterations? Clin. Genet. 101, 371-374.
12. Diway B, Yasui Y, Innan H, Takeuchi Y (2022) New locality and bud growth of the world biggest
flower, Rafflesia tuan-mudae, in Naha Jaley, Sarawak, Malaysia. Tropics 30, 71-82.

学術研究図書
１、遺伝学百科事典 （編集委員）
 学会発表
学会発表
1. 坂本貴洋、印南秀樹 ２０２０年９月 日本数理生物学会 名古屋
企画したシンポジウム等なし
基調講演・招待講演なし

110 外部資金
1. 科研費 基盤 B セントロメア進化のミステリーを解き明かす（代表） ８４５万
2. 国際水産資源変動メカニズム等解析事業共同研究（代表） ３８０万
3. ゲノム情報によるマアジ太平洋系群等の集団遺伝学解析研究委託（代表） ４３５万
4. 理研 iThems 共同研究（代表） 合計７００万
5. 先導研共働プログラム 競走馬生産における遺伝子診断の導入（代表）１００万
6. 寄付金 サラブレッドゲノム（代表） 合計３００万
7. AMED 老化リボソームの実体解明と機能強化による健康寿命の延長（分担） ３００万
8. 集団ゲノミクスを用いた社会性進化の解析（分担） ２０万
9. The role of non-allelic gene conversion in the evolution of Transposable Elements（分担） １０万
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動なし
 学外委員会活動なし
 アウトリーチ活動
１、プレスリリース 「世界最大の花・ラフレシアの新産地とその生態の解明〜地域社会による生息域内保
全の促進〜」
２、「風」（エッセイ）ぱどっく２０２１ vol.44
３、「遺伝子研究が導く、未来の血統理論」Ownership ２０２１ Summer

111 学術誌編集活動
1. Journal of Theoretical Biology, Associate Editor
2. Genes and Genetic Systems, Associate Editor

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 苦情処理相談員
 部局委員会等への貢献
1.

情報セキュリティ委員会

2.

情報セキュリティ専門委員会

3.

情報システム専門委員会

4.

学術情報基盤センター本部図書館専門部会

5.

財務マネージメント委員会

 大学事業1. 学術情報基盤センター長（7 月まで）
2. 図書館長（7 月まで）112

理論生物学分野
大槻 久（准教授：理論生物学、進化ゲーム理論）
1. 研究テーマ
1. 変動環境下での分散戦略の進化
パッチの環境収容力やパッチにおける個体の繁殖力等が時空間的に変動する環境下で分散形質はどのように進化するかを数理モデルにより調べ、進化的に特異な戦略や進化的分岐条件を導出した。
2. 血縁淘汰による協力の進化
血縁集団で非線形 n 人公共財ゲームが行われる場合の協力の進化および維持条件を数理モデルにより調べた。その際、様々な異なるグループ形成モデルを考え、それらの間の差異を比較した。
3. 間接互恵性下での意見形成ダイナミクスの研究
既存の間接互恵性モデルをベースに、他者の協力／非協力行動を個人が独立に評価し評判を形成する仮定の下で、集団内の意見分布がどのようになるかを解析する新たな手法を開発し、各社会規範の下でその定常分布を導出した。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロ・マクロ生物学（社会生物学）（２単位授業の一部、集中講義）
2. 先導科学実習（プログラミング基礎）（２単位授業の一部、集中講義）
3. 生物統計学（２単位授業の後半、集中講義）
4. 進化ゲーム理論特論（１単位）
5. 統合進化学（数理生物学）（２単位授業の一部、集中講義）
 研究指導1. 壹岐 朔巳 （副指導）2. 西條 未来 （副指導）3. 安家 叶子 （副指導）4. 桑野 友輔 （副指導）5. 熊田 隆一 （副指導） 全学教育
該当なし
 他大学等における授業
1. 東京大学教養学部前期課程非常勤講師「適応行動論」 2021.10.7 – 2022.1.13

113

2. 九州大学「統合生物科学特論１」（オムニバス講義の１回を担当） 2021.7.19

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
1. Takeuchi Y, Ohtsuki H, Innan H. (2022) A non-zero-sum neutrality test for the tropical rain forest community using
long-term between-census data. Ecology and Evolution 12(1), e8462.
2. Ohtsuki H, Ujiyama S. (2022) Impact of social dominance on the evolution of individual learning. Journal of
Theoretical Biology 535, 110986.
3. Mullon C, Wakano JY, Ohtsuki H. (2021) Coevolutionary dynamics of genetic traits and their long-term extended
effects under non-random interactions. Journal of Theoretical Biology 525, 110750.
4. Konishi S, Kariya F, Hamasaki K, Takayasu L, Ohtsuki H. (2021) Fecundability and Sterility by Age: Estimates Using
Time to Pregnancy Data of Japanese Couples Trying to Conceive Their First Child with and without Fertility
Treatment. International Journal of Environmental Research and Public Health 18(10), 5486.
学術研究図書1. ケイリン・オコナー(Cailin O'Connor)（著）、中西大輔（監訳）「不平等の進化的起源 性差と差別の進化ゲーム」６章・付録訳担当 2021.11.15 大月書店
2. 小田 亮、橋彌和秀、大坪庸介、平石 界（編）「進化でわかる人間行動の事典」項目「所有する」（pp.131-134）担当 2021.5.1 朝倉書店
 学会発表学会発表
1. Yusuke Horinouchi, Hisashi Ohtsuki, Tatsuya Togashi. Zygote developmental variation provides insights into life cycle
evolution in green algae. The 9th EAFES International Congress オンライン（ハイブリット開催） 2021.7.10-13
2. 藤本悠雅、大槻 久「間接互恵性における信頼の個人間相関の形成」2021 年日本数理生物学会年会 オンライン学会（口頭） 2021.9
3. 藤本悠雅、大槻 久「間接互恵における個人感の信頼構造の解析計算」日本物理学会第 77 回年次大会 オ
ンライン学会（口頭） 2022.3
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1. 大槻 久 "月経はなぜあるのか 〜その進化的起源〜" 第 40 回日本思春期学会総会・学術集会 スポン
サードセミナー 2021.9.4
2. Hisashi Ohtsuki "Evolution of dispersal in a spatially heterogeneous population" RIMS workshop Toward an integrationof fluids, ecology, and evolution（オンライン参加） 2021.7.6
 外部資金114

1. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 C「進化動態理論の統合による自然選択の複合的理解：進化
ゲーム・血縁・繁殖価を軸として」研究代表者 大槻 久（2020-2022）2021 年度 500 千円（直接経費）
2. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究 B「「こころを想定するこころ」の進化と発達：「心理化傾向」仮説に基づく統合的検討」（代表：橋弥和秀）研究分担者 大槻 久（2019-2023）2021 年度分配金 250
千円（直接経費）
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本人間行動進化学会 理事
2. 日本数理生物学会 運営委員
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
1. 渋谷ハチコウ大学 「現代人に残る進化史の痕跡」（オンライン開催） 2022.2.5
2. 文京アカデミー 総合研究大学院大学講師陣による『科学探求講座』 「現代人に残る進化史の痕跡」（オンライン開催） 2022.2.5
3. NHK（総合） NHK スペシャル ジェンダーサイエンス 第２集「月経 苦しみとタブーの真実」出演
2021.11.6 (再放送 2021.11.10）
4. 大学共同利用機関シンポジウム 2021「宇宙・物質・エネルギー・生命・情報・人間文化：フロントの知を楽しもう」 「血縁淘汰理論とヒトの生活史の進化」（オンライン開催） 2021.10.24
 学術誌編集活動

115

1. Faculty member, Faculty of 100 (Theoretical Biology)
2. Reviewing Editor, Journal of Evolutionary Biology (2021.12 まで)
3. Editorial Board, Journal of Theoretical Biology
4. Associate Editor, Theoretical Population Biology

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 教育組織・教育課程再編実務担当者
2. 部局情報セキュリティ委員会（部局技術担当者）
 部局委員会等への貢献
1. 統合進化知研究センター検討 WG
2. 教務担当
3. オリエンテーション担当
4. ハラスメント窓口
5. サーバ管理担当
6. プリンタ、スキャナ、学生 PC 管理担当
 大学事業
該当なし

6. その他の特筆すべき活動
 博士研究員の受け入れ
藤本悠雅（JSPS PD)
 研究室構成員による学術出版物①

原著論文（査読あり）
1.

Fujimoto Y, Kaneko K. (2021). Exploitation by asymmetry of information reference in coevolutionary
learning in prisoner’s dilemma game. Journal of Physics: Complexity, 2(4), 045007.

②

学術研究図書
該当なし

 研究室構成員による外部資金
藤本悠雅、特別研究員奨励費「相互学習で情報の参照が作る社会関係の解明：囚人のジレンマで生じる非対称均衡を例に」 110 万円
 研究室構成員の受賞
該当なし

116

理論生物学分野
宅野 将平（助教： ゲノム進化学・エピジェネティクス）
1. 研究テーマ
1. 遺伝子ボディ領域における DNA メチル化の進化パターンの解明
被子植物 5 種、裸子植物 1 種において、遺伝子転写領域の DNA メチル化状態が遺伝子発現に与える影響を明らかにした。また、DNA メチル化状態が遺伝子配列進化に及ぼす影響を明らかにした (カリフォルニア大学
Gaut 教授との共同研究)。
2. 雑種強勢におけるエピジェネティクス機構の役割
シロイヌナズナやハクサイにおける雑種強勢の役割の解明を行った(神戸大学藤本准教授との共同研究)。
3. マカクの種分化機構に関する研究
スラウェシマカクの種分化プロセスの解明を行なった (生命共生体進化学専攻寺井洋平助教との共同研究)。
4. タルホコムギにおける集団遺伝学的研究
タルホコムギの種内変異のパターンを明らかにした (福井県立大学松岡准教授との共同研究)。

2. 教育
 担当授業
1. ミクロマクロ生物学（総括、集団遺伝学（自然選択）を担当、２単位、集中講義）
2. 先導科学実習（プログラミング実習を担当、２単位、集中講義）
3. 先導科学特論 XVI (エピジェネティクス・ゲノム進化学特論、２単位、集中講義)
 研究指導1. 濱崎真夏（副指導）2. 坂本貴洋（副指導） 全学教育
該当なし
 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物

117原著論文（査読あり）
該当なし
学術研究図書該当なし
 学会発表該当なし
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
該当なし

 外部資金1. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（B）「アポミクシス形質を獲得してクローン胚を形成するコムギの作出と関連遺伝子の同定」 研究分担者 (2019-2023) 総額 4,000 千円
2. 日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究（B）「アブラナ科野菜の雑種強勢発現機構の解明」 研究分担者 (2019-2021) 総額 1,500 千円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本エピジェネティクス研究会

118

2. 日本遺伝学会
 学外委員会活動
該当なし
アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
該当なし

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
該当なし
 部局委員会等への貢献
該当なし
 大学事業
1. 専攻ウェブサイト、SNS、計算機サーバ管理者
 その他の特筆すべき活動
該当なし

119

科学と社会分野
伊藤 憲二（准教授：科学技術史）
1. 研究テーマ「日本における高エネルギー物理学の成立とその社会文化的背景、1955-1971」
本研究の目的は、日本における高エネルギー物理学の成立を、物理学の内的な発展と同時に、社会文化的背景から理解することである。今年度は収集した資料と出版の準備を進めた。
「仁科芳雄の伝記的研究」
仁科芳雄は、戦前から戦後の日本の物理学において大きな役割を果たした。仁科芳雄の伝記を執筆し、今年度入稿して、校正作業に入った。
「占領期日本の科学技術政策の再検討」
Bowling Green State University の Walter Grunden 博士、Manchester 大学の Aya Homei 博士、および SUNY
Brockport の Takashi Nishiyama 博士と共同研究により、占領期日本のＧＨＱによる科学技術政策を見直す研究を行っている。
「日本における科学者の成立」
Cardiff University の Ruselle Meade 博士および Ian Rapley 博士と共同で、日本における「科学者」というカテゴ
リーの成立に関する共同研究を行っている。
「核外交の史的研究」
先導科学共働プログラムによって開催された国際シンポジウムをきっかけとして始まった共同研究である。
National Technical University of Athens の Maria Rentetzi 教授と、核開発の歴史研究を、外交と核物質・装置に焦点をおいて研究している。二つの学術雑誌に特集号を出版し、伊藤による単著論文が二本、共著論文が二本掲載されている。
「学術雑誌の歴史的研究」「フレッシュマンコース」における「研究の社会史」の授業のための基礎研究として、学術雑誌の歴史についてのレビューと独自研究を行っている。今年度の後半に共働プロプレリサーチとして行い、かつ科研費基盤（C）を申請し、採択された。
「グローバル時代の認識論」
グローバルな観点からの認識論についてのハンドブックの執筆チームに加わり、日本を例とした知識生産のグローバル化についての理論的な研究を行っている。本年度出版された。

120

「日本における女性科学者の誕生についての系統的研究」
古川安先導科学研究科客員研究員を研究代表者とする科研費研究プロジェクトである。古川研究員の著書、『津田梅子：科学への道、大学の夢』が出版された。
「科学と社会の新物質主義的」
新物質主義に基づいて「科学と社会」を非二項対立的に再構成することを目指して共同研究を行っている。
その成果の一つとして、『現代思想』に論文が出版された。

2. 教育
 担当授業1.

フレッシュマンコース（「研究の社会史」担当）

2.

科学と社会副論文入門（共同担当）

3.

科学技術社会論入門

4.

科学技術社会論特論（本年度は開講せず）

5.

科学・技術と社会Ⅱ（共同担当、本年度は開講せず）

 研究指導1. 山田優佳（副論文指導）「東京女子高等師範学校における生物学教育」

2. 安家叶子（副論文指導）「科学と社会ローテーション」

 全学教育 1
フレッシュマンコース（「研究の社会史」担当）
 他大学等における授業
1. なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）

1. Ito K (2022). Early Japanese reactions to the interpretation of quantum mechanics, 1927-1943. Oxford Handbook of
the History of Quantum Interpretations, Olival Freire, Jr. ed. (Oxford University Press, 2022), pp. 687-707.
2. Ito K (2021). Modelling the apparent spread of science: Some insights from the history of science in Japan. David
Ludwig, Inkeri Koskinen, Zinhle Mncube, Luana Poliseli, Luis Reyes-Galindo, eds., Global Epistemologies andPhilosophies of Science (Routledge), pp. 265-273.
3. Rentetzi M, Ito K (2021). The material culture and politics of artifacts in nuclear diplomacy. Centaurus 63, 233-243.
4. Ito K (2021). Three tons of uranium from the International Atomic Energy Agency: diplomacy over nuclear fuel for
the Japan Research Reactor-3 at the Board of Governors’ meetings, 1958–1959. History and Technology 37, 67-89.
5. Ito K, Rentetzi M (2021). The co-production of nuclear science and diplomacy: towards a transnational
understanding of nuclear things. History and Technology 37, 4-20.

121

6. Ito K (2021). The scientific object and material diplomacy: The shipment of radioisotopes from the United States toJapan in 1950. Centaurus 63, 296-319.
7. 伊藤憲二 (2021). アカデミーの系譜と日本学術会議の創設. 『日本の科学者』 54(4), 38-43.

学術研究図書1. 伊藤憲二(2021 年 12 月)「仁科芳雄と日独青年物理学者たち（五）：湯川秀樹の渡欧（前編）」『窮理』20号、54―63 頁.
2. 伊藤憲二（2021 年 9 月）
「地球的災害の知の物語：『日本沈没』における科学と社会」『現代思想』49(11), 243253.
3. 伊藤憲二（2021 年 8 月）
「仁科芳雄と日独青年物理学者たち（四）：渡邊慧と寺田物理学（後編）」『窮理』19号、58-67 頁.
4. 伊藤憲二（2021 年 4 月）
「仁科芳雄と日独青年物理学者たち（四）：渡邊慧と寺田物理学（前編）」『窮理』18号、58-65 頁.
 学会発表学会発表
1.

Kenji Ito, “UNESCO Cooperative Associations and Science Diplomacy in the Occupied Japan. International Workshop,“Science Popularization as Cultural Diplomacy: UNESCO (1946-1958)” (online), December 14, 2021.

2.

Kenji Ito, “The International Conference of Theoretical Physics in 1953 and the Rehabilitation of the Japanese Physics
Community,” IUPAP History Project Preliminary Workshop (online), December 10, 2021.
企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
1.

伊藤憲二「仁科芳雄と戦時核研究：マンハッタン計画史観を超えて」科学史学校、日本科学史学会、2021
年 10 月 23 日、オンライン.

2.

伊藤憲二「予期せざる結果としての初期日本学術会議」科学社会学会年次大会、2021 年 9 月 20 日、オンライン.

 外部資金1.

科学研究費助成事業・基盤研究(C)日本における高エネルギー物理学の成立とその社会文化的背景、1955‐
1971(研究代表者）

2.

科学研究費助成事業・基盤研究(C)日本における女性科学者の誕生についての系統的研究（分担研究者）

 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし

122

総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞なし

4. 社会貢献
 学会活動1. なし
 学外委員会活動
1. なし
 アウトリーチ活動
1.

日本の原爆開発〜未公開書簡が明かす仁科芳雄の軌跡〜. NHK ETV 特集 取材協力およびインタビュー
登場 2021 年 8 月 7 日 テレビ・ラジオ番組.

2.

「専門知と民主主義、バランスは： 学術会議の論点、識者に聞く」 朝日新聞社 朝日新聞 21 面 2021 年
4 月 30 日 新聞・雑誌、朝日新聞デジタル https://www.asahi.com/articles/DA3S14889362.html 2021

 学術誌編集活動
1. なし

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. フレッシュマンコース実施委員会
2. 入試広報員会
 部局委員会等への貢献
1. 共働プログラムワーキンググループ
 大学事業
1. なし

123

6.

その他の特筆すべき活動


博士研究員等の受け入れ
水島希（先導研・特別研究員）
古川安（先導研・客員研究員）


1.

研究室構成員による学術出版物
原著論文（査読あり）
1.

Furukawa Y (2021). Exploring the history of chemistry in Japan. Ambix 68, 302-317.

2.

Kenens J, Van Oudheusden M, Van Hoyweghen I, Mizushima N (2021). Nonscalability of “citizen science”
in post-Fukushima Japan: Unpacking articulations of citizen radiation measuring organizations. Public
Understanding of Science 096366252110547-096366252110547.

2.

学術研究図書1.

古川安（2022）『津田梅子—科学への道、大学の夢』東京大学出版会.

2.

古川安（2022）「歴史から見た科学・技術」藤山知彦（編）『規範としての民主主義・市場原理・科学技術—現代のリベラルアーツを考える』東京大学出版会、2022、217-234 頁.

3.


古川安（2021）「科学史」「有機化学」「化学の京都学派とその周辺」『科学史事典』丸善.

研究室構成員による外部資金

1.

古川安. 科学研究費助成事業・基盤研究(C). 日本における女性科学者の誕生についての系統的研究（研究代表者）.

2.

水島希. 科学研究費助成事業・基盤研究(C). 放射能市民測定運動におけるフェミニスト・スタ
ンドポイント研究.



研究室構成員の受賞なし

124

科学と社会分野
飯田 香穂里（准教授：科学技術史）
1. 研究テーマ
1. 戦後日本の生物医学のトランス・アジア史研究
これまで主に 1945-1960 年の間、日本の生物・医学系研究者が放射線の健康影響に関する問題をどのように扱ったのか、また一方で原子力平和利用をどのように推進したのかについて調査を行ってきた。今年度は、調査対象を日本のアジア隣国に拡大し、また戦前まで遡り、貫戦期の日本と他のアジア諸国との関係（トランス・アジア）を視野に研究を行った。今年度も、感染症の影響で新たな調査に行くことができなかったが、原爆傷害調査委員会（ABCC）などについて入手可能な資料で調査を進め、複数の国際学会で発表した。放射線災害・医科学研究拠点共同研究のほか、科研費共同研究（学術会議）、国際共同研究の一部として進めている。
2. 遺伝学史関連資料整理
引き続き、国立遺伝学研究所所蔵資料の調査・整理を行い、研究所設立期と草創期の資料の一部をデジタル化した（国立遺伝学研究所共同研究）。一部国内学会で発表した。

2. 教育
 担当授業
1. 科学と社会副論文入門 （１単位；分担） 研究指導【副論文指導担当】
1. 安家 叶子
2. Xiayire Xiaokaiti
3. 青野 圭4. 長田 美沙 全学教育
該当なし
 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）

125

該当なし
学術研究図書「遺伝学」「日本の遺伝学」『科学史事典』日本科学史学会編（丸善,2021）.
『科学史事典』日本科学史学会編（同上）編集委員.

 学会発表
学会発表
Iida, K. Atoms for Peace in Hiroshima: Kawaishi Kunio, the Atomic Bomb Casualty Commission, and the development

1.

of nuclear medicine in the bombed city in the 1950s, in the “International science, imperial transitions, and transpacificnetworks of knowledge at the early Cold War” panel. Association for Asian Studies (AAS) 2022 Annual Conference,
Honolulu, HI, USA (online), March 2022.
Iida, K. “Studying biological effects of radiation: Contested collaborations of Japanese and American scientists in the2.

bombed city Hiroshima,” in the “Contested collaboration in modern and contemporary East Asia” panel, History of
Science Society (HSS)-Society for the History of Technology (SHOT) joint meeting, New Orleans (online), November
2021.
Iida, K. and A. Kubota. “The Research Institute for Radiation Biology and Medicine and ABCC in Hiroshima: How3.

they collaborated with and also differentiated from each other,” The 6th International Symposium of the Network-type
Joint Usage/Research Center for Radiation Disaster Medical Science: Risk communication in radiation disaster, duringcrisis and reconstruction, online, Feb. 7, 2022 (poster).
4.

飯田香穂里「日本の植物・染色体図から見た『客観性』」生物学史分科会シンポジウム「ダストン／ギャ
リソン『客観性』をめぐって」2022 年 1 月（オンライン）.

5.

飯田香穂里「日本の染色体研究初期：木原均、牧野佐二郎らパイオニアの足跡をたどる」日本遺伝学会
第 93 回大会（東京） 2021 年 9 月（オンライン）.

6.

高岩義信、飯田香穂里、久保田明子、小沼通二、兵藤友博「日本の学術体制史研究—資料整備とその歴
史研究 その４」日本科学史学会（第68回年会）神戸大学 2021年5月（オンライン）.

企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金1.

令和３−５年度科学研究費（日本学術振興会）基盤研究（C）研究テーマ「『原子力平和利用』と放射線育種：貫戦期のアジアを視野に」（課題番号 21K00248）総額 2990 千円（研究代表）.

2.

平成３０−令和２年度（コロナ禍で延長）科学研究費（日本学術振興会）基盤研究（C）研究テーマ「『原子力の平和利用』キャンペーン：アイソトープと医学・生物学者の役割」総額 3,250 千円（研究

126

代表）.
3.

平成２９−令和２年度（コロナ禍で延長）科学研究費（日本学術振興会）挑戦的研究（開拓）「日本の学術体制史研究：研究基盤となる日本学術会議資料整備と研究環境構築の検討」総額 18,330 千円（分担）.

4.

「国立遺伝学研究所所蔵資料に基づく研究所設立過程
2021 年度 国立遺伝学研究所共同研究（Ａ）
ならびに草創期の研究 」142 千円（研究代表）.

5.

2021 年度放射線災害・医科学研究拠点共同研究（重点⑤）研究テーマ「ABCC/RERF 関連資料を利用した放射線災害による健康影響研究史の基礎的研究」200 千円（研究代表）.

 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動
1. 日本科学史学会生物学史分科会 生物学史研究 編集委員会
2. 日本科学史学会 欧文誌 Historia Scientiarum 編集委員会
3. 日本科学史学会 全体委員
4. American Philosophical Society, The Mendel Newsletter 編集委員
 学外委員会活動
1. 上記参照 アウトリーチ活動
1. 「優生学：人類の遺伝的 “改良” をめぐる歴史」（総研大講師陣による科学探求講座）中央区民カレッジ
2021.12.04.
 学術誌編集活動

127

1. 上記参照（生物学史研究；Historia Scientiarum）

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 学術情報基盤センター本部図書館専門部会
2. 附属図書館運営委員会電子資料専門部会
3. ハラスメント防止委員会
 部局委員会等への貢献
1. 図書委員
2. ハラスメント総合窓口
3. 統合進化科学研究センター運営委員会（オブザーバー）
4. 研究倫理相談委員会
 大学事業なし

6. その他の特筆すべき活動
 指導学生による学術出版物①

論文（査読あり）佐藤正都 (2021) 明治期における代表的な思想家たちの進化論解釈・利用と二次的な対立構造『生物学史研究』101, 41-53.

②

論文（研究ノート）
長屋ひろみ (2021) 理科教育からみる昆虫と社会：小学校理科教科書と名和昆虫博物館の変遷『生物学史研究』101, 55-67.

128

科学と社会分野
大西 勇喜謙（講師： 科学哲学）
1. 研究テーマ
1. 深層学習を用いた研究の科学的実在論論争への含意に関する研究
ディープ・ニューラルネットワーク（DNN）と呼ばれる機械学習技術は 2012 年頃を境に急激な発展を遂げており、基礎研究から応用研究まで、幅広く科学研究の手法として用いられるようになってきている。本研究
では、DNN を用いた研究の、科学的実在論論争への含意について考察している。2021 年度は新たに機械学習技術による人間の認識能力拡張に関する既存の議論を分析し、科学哲学会にて発表したほか、前年度までに進めていた科学の目的に関する論争への含意に関する論考を論文としてまとめ、現在投稿中。
2. データ同化についての科学哲学的分析
気象学や海洋学においては、近年、データ同化と呼ばれる、データを用いてシミュレーションモデルの精緻化などを行う手法が盛んに用いられるようになってきており、他の諸分野においてもさらなる応用が期待されている。2021 年度は、シミュレーションの哲学に関する先行研究の調査を行った。

2. 教育
 担当授業
1. 副論文入門（共同担当）
 研究指導（副論文担当）
1.

濱崎真夏

2.

坂本貴洋

3.

桑野友輔

4.

山川真徳

5.

熊田隆一

 全学教育1.

フレッシュマン・コース「研究者と社会」前期・後期（共同担当）

 他大学等における授業
1. 東京電機大学にて「研究者倫理」（前期 12 コマ）
2. 東京工業大学にて「科学者・技術者の倫理」（後期６コマ）129

3. 研究 学術出版物
原著論文（査読あり）
該当なし
学術研究図書該当なし
 学会発表学会発表
1. 大西勇喜謙「 GAN による認識能力拡張は新帰納法への有効な応答を与えるか」ワークショップ「科学的実在論論争の過去・現在・未来」日本科学哲学会年次大会. オンライン. 2021 年 11 月 28 日.
企画したシンポジウム等
1. オンライン合評会：松王政浩著『科学哲学からのメッセージ』（森北出版 2020 年）．登壇者：山岡耕春、松王政浩、三上直之、伊勢田哲治. 2021 年 11 月 21 日.
基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金1. 日本学術振興会 科学研究費 若手研究「科学的表象理論に基づく『データのモデル』の分析と科学的実在論論争への含意の検討」2018-2020 年度（延長）. 総額 3,250 千円 （研究代表）
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

130

4. 社会貢献
 学会活動査読担当：『科学基礎論研究』、The Southern Journal of Philosophy
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動
該当なし

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
該当なし
 部局委員会等への貢献
1. 教務係
2. 研究倫理相談委員会
 大学事業
該当なし

６．その他の特筆すべき活動
該当なし

131

科学と社会分野
鈴木 和歌奈（助教：ST S, 科学技術の人類学）
1. 研究テーマ
人間と多種の関係を民族誌として描く
１）博士課程の時に行った幹細胞研究や再生医療の実験室研究をさらに精査し、理論や概念研究を深めた。
２）新しい研究テーマとして、人間とウルシの関係、人間と微生物の関係を調査し始め、論文などを執筆した。

2. 教育
 担当授業
1. 副論文入門（科学と社会の先生と分担）

 研究指導（副論文）
1. 高畑 優リスの餌付けをめぐる社会科学的研究

2. 長田美沙
3. 安家叶子 論文執筆の基礎
 全学教育1. なし
 他大学等における授業
1. 大阪大学人間科学研究科 人類学教室「エスノグラフィを書く」院生向けの実習を担当

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読あり）

1. Wakana Suzuki, “From Representation to Care: Emerging Shifts in Laboratory Studies”, (2022, in press)
International Encyclopedia of Anthropology, Wiley
2. 鈴木和歌奈「細胞への配慮—幹細胞研究室における擬態語と身体化」（訳＝今関 裕太）メディウム第２号(2021.11 月刊行)

学術研究図書1.

鈴木和歌奈『ウルシと共に生きる――関西の二つの山村地域から』近藤祉秋、吉田真理子 編「喰う、食われる、食い合う マルチスピーシーズ民族誌の思考」青土社（2021,11 月刊行）

 学会発表

132

学会発表

1.

Wakana Suzuki “Listening to the Voices of Microbes”, 2022 Association for Asian Studies, Annual
Conference in Honolulu 2022.3.24-3.27（Online）

企画したシンポジウム等
該当なし
基調講演・招待講演なし
 外部資金基盤 A 「惑星的な課題とローカルな変革：人新世における持続可能性、科学技術、社会運動の研究」（代表：森田敦郎）、研究分担者、２０万円
 外国人招聘
総研大外国人教員として招聘した教員
該当なし
総研大海外学生・研究者招聘プログラムにて招聘した外国人
該当なし
先導科学共働プログラムにて招聘した外国人
該当なし
そのほかの資金で招聘した外国人
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動1. 該当なし
 学外委員会活動
1. 該当なし
 アウトリーチ活動
該当なし

133

 学術誌編集活動
該当なし

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
1. 広報委員会

 部局委員会等への貢献
該当なし
 大学事業
1. 該当なし
6.

その他の特筆すべき活動
該当なし

134

共同利用機器支援事業担当
松下 敦子（講師： 神経解剖学・微細形態学）
1. 研究テーマ
1.

昆虫視覚中枢の比較形態学的研究（学内共同研究）
チョウの網膜における個眼の配列は、視覚第一次中枢（視葉板）においても保存されるといわれてきたが、それを直接的に示した知見はなかった。今回、アゲハの網膜、視葉板、第一視交叉、視髄までの連続電顕画像を得て、レチノトピックな配列が保存されることを示した。本結果は、これまでのアゲハ視葉板におけるコネク
トーム解析の論文(in press)に含めた。その他、比較形態学の観点から他の昆虫（セイヨウミツバチ、オオカバマダラ）の複眼の試料調製を行って、網膜〜視葉板〜視髄の連続電顕画像を得た。本研究は本学蟻川謙太郎教
授の昆虫視覚系の比較形態学プロジェクトの一環である。

2.

チョウ類触角葉の種間および雌雄比較（学内共同研究）
脳を構成する個々の領域（神経叢）の大きさはその種の生態的背景（季節型、雌雄など）を反映していると予想される。領域の大きさはシナプシン陽性領域を指標にすることができる。本研究では、アゲハチョウ亜科のチョウの脳にシナプシン免疫蛍光染色を施し、嗅覚第一次中枢である触角葉を構成する糸球体の大きさに注目しながら共焦点レーザー顕微鏡にて観察した。その結果、モンキアゲハ、クロアゲハ、キアゲハのメスに側部-腹側に特異的に大きな糸球体が 3 つあり、これは同じアゲハチョウ族のナミアゲハの知見と共通していた。
一方、アオスジアゲハ（アオスジアゲハ族）およびジャコウアゲハ（ジャコウアゲハ族）ではこれまでのところ顕著な雌雄差はみつかっておらず、またアゲハチョウ族メスの側部-腹側にみられた大きな糸球体はなかった。本研究は本学木下充代准教授のチョウ類の脳地図作成プロジェクトの一環である。

3.

ゴキブリ触角葉における性フェロモン応答に関わる神経回路の免疫組織化学的研究（共同研究）
ゴキブリの匂い源定位のメカニズムを明らかにするため、ゴキブリ触角葉の性フェロモン特異的糸球体における、感覚神経と二次神経（S, L タイプ）とのシナプス接続を、免疫組織化学的手法を用いて探索している。これまでに両神経の直接の接続が見られないことから、介在神経の存在も考えられる。引き続き探索していく。
本研究は西野浩史博士（北海道大学・助教）との共同研究として実施している。

4.

弱電気魚中脳における位相差検出系神経経路の解剖学的研究（共同研究）
高周波（1kHz 以上）の交流電流(EOD)を発生する弱電気魚（アプテロノータス）の電気感覚系には EOD にフェーズロックして活動電位を出す位相応答型感覚神経および二次神経がある。
二次神経は中脳大細胞核(MMN)に投射する。MMN も細胞外記録より EOD にフェーズロックして応答しており、電気感覚の位相（時間）情報処理の初期中枢と考えられる。電気生理、細胞注入法、および電子顕微鏡観察によって、二次神経の投射先が MMN 内在性の大細胞細胞体であること、大細胞は小細胞細胞体にシナプス接続すること、さらに小細胞は樹状突起部位にも別の入力も受けており、かつ MMN の出力ニューロンであることがわかった。MMN におけるこれらの回路は他の弱電気魚の時間感覚系との共通性が高い。今年度はこれらの結果を論文にまとめた(inpress)。本研究は川崎雅司博士（バージニア大学・教授）との共同研究として実施した。

135

2. 教育 担当授業先導科学実習（分担）：走査型・透過型電子顕微鏡（主担当）、細胞組織科学（副担当）
 研究指導電子顕微鏡または光学顕微鏡使用者への技術指導
 全学教育
該当なし
 他大学等における授業
該当なし

3. 研究
 学術出版物
原著論文（査読有り）
1.

Leonard J, Matsushita A, Kawasaki M (2022, in press): Morphology and receptive field organization of a temporalprocessing region in Apteronotus albifrons. Journal of Comparative Physiology A, doi: 10.1007/s00359-022-01546-1
2.

Matsushita A, Stewart F, Ilić M, Chen P-J, Wakita D, Miyazaki D, Murata K, Kinoshita M, Belušič G, Arikawa K(2022, in press): Connectome of the lamina reveals the circuit for early color processing in the visual pathway of a butterfly.
Current Biology doi: 10.1016/j.cub.2022.03.066
学会発表
該当なし
 企画したシンポジウム等
該当なし
 基調講演・招待講演
該当なし
 外部資金該当なし
 外国人招聘
該当なし
 研究活動による受賞
該当なし

4. 社会貢献
 学会活動
日本比較生理生化学会 評議員
 学外委員会活動
該当なし
 アウトリーチ活動
該当なし
 学術誌編集活動

136

該当なし

5. 大学運営
 全学委員会（葉山内委員会含む）への貢献
安全衛生委員会
環境安全管理協議会（オブザーバー）
 部局委員会等への貢献
化学物質適正管理委員会
試薬管理担当実験排水管理共同利用機器（透過型電子顕微鏡、走査型電子顕微鏡、共焦点レーザー顕微鏡）の葉山外研究者への技術提供
研究支援担当 大学事業
該当なし

6. その他の特筆すべき活動
該当なし

137

参考資料

138

2021年度 年間授業計画
4月
日
1 木
2 金

授業

CSR (Writing) Sechrist

EDA
CSR (Presentation)
Gorman

5月
授業

6月

イベント・他日

イベント・他

日フレッシュマン
コース

1 土

1 火

フレッシュマン
コース

2 日

2 水

3 土

3 月

憲法記念日

3 木

4 日

4 火

みどりの日

4 金

5 月

5 水

こどもの日

5 土

授業

先導科学
プログレス
先導科学プログレス

6 火

アカデミア探訪・CED
入学式・アカデミア探訪

フレッシュマンコース

6 木

先導科学実習7 水研究を多角的に捉える
研究者倫理フレッシュマンコース

7 金

先導科学実習8 木

研究の社会史研究を多角的に捉える

フレッシュマン
コース

8 土

8 火

先導科学実習予備日

9 金

伝える技術①
伝える技術②

フレッシュマン
コース

9 日

9 水

先導科学実習予備日

10 木

先導科学実習予備日

11 金

先導科学実習予備日

10 月

先導科学実習11 日

11 火

先導科学実習オリエンテーション・研究者
ガイダンス・実験安全講習会

図書館
ガイダンス

13 火
14 水
15 木
16 金

生物科学副論文入門

ミクロ・マクロ生物学（細胞組織科学）（細胞組織科学）12 水（安全講演会）

13 木

先導科学実習14 金

先導科学実習ミクロ・マクロ生物学（細胞組織科学）

入試説明会

16 日

（颯田・印南・宅野）

17 土

17 月

先導科学実習18 日

18 火

先導科学実習

19 月
20 火
21 水

ミクロ・マクロ生物学
ミクロ・マクロ生物学

20 木（渡邊・木下・沓掛）

ミクロ・マクロ生物学

21 金（本郷・五條堀・蔦谷）

22 木
23 金

（野外実習）（野外実習）

19 水（佐々木・大槻・蟻川）

科学と社会副論文入門
3-4限（安全講演会）

先導科学実習12 土

14 月

科学と社会副論文入門
科学技術社会論入門

15 火

先導科学考究①（菊水）

16 水

生物統計学 （佐々木）17 木

生物統計学 （佐々木）18 金

生物統計学 （佐々木）

19 土
20 日

（神経生理学・電子顕微鏡）

先導科学実習21 月（神経生理学・電子顕微鏡）

22 火

23 日

23 水

生物統計学 （大槻）24 木

生物統計学 （大槻）25 金

生物統計学 （大槻）先導科学実習

24 月

25 日

25 火

26 月

26 水

27 火

27 木

先導科学実習先導科学実習（神経生理学・電子顕微鏡）

先導科学実習（神経生理学・電子顕微鏡）

学生健康診断（プログラミング）

26 土
27 日

28 水

（安全講演会）

28 金

29 木

昭和の日

29 土

29 火

30 日

30 水

科学と社会副論文入門
3-4限

科学技術社会論入門

22 土

24 土

30 金

科学技術社会論入門

13 日（細胞組織科学）15 土（田辺・大田・寺井）

7 月（分子生物学）

10 土

12 月

6 日

（分子生物学）（プログラミング）

31 月

139

28 月

イベント・他

科学技術社会論入門

生物人類学特論
（蔦谷）

オンライン
専攻説明会

2021年度 年間授業計画
7月
日

授業

8月
イベント・他

生物人類学特論
（蔦谷）

日

9月

授業

イベント・他

日

授業

1 日

1 水

先導科学実習予備日

金

2 月

2 木

先導科学実習予備日

3

土

3 火

3 金

先導科学実習予備日

4

日

4 水

4 土

5

月

6

火

7

水

8

木

9

金

1

木

2

5 木

入試

5 日

6 金

入試

6 月

科学と社会副論文入門
3-4限

7 火

先導科学実習予備日

8 水

先導科学実習予備日

9 月

9 木

先導科学実習予備日

10 土

10 火

10 金

先導科学実習予備日

11 日

11 水

11 土

科学技術社会論入門

個体群生態学特論（松田）
個体群生態学特論
（松田）

7 土
山の日

8 日

12 月

科学と社会副論文入門
科学技術社会論入門

12 木

12 日

13 火

先導科学考究②
（久世）

13 金

13 月

14 土

14 火

15 日

15 水

16 金

16 月

16 木

17 土

17 火

17 金

18 日

18 水

18 土

14 水
15 木

進化ゲーム理論特論（大槻）
進化ゲーム理論特論
（大槻）

19 月

先導科学実習予備日

19 木

19 日

20 火

先導科学実習予備日

20 金

20 月

21 水

先導科学実習予備日

21 土

21 火

22 木

海の日

22 日

22 水

23 金

スポーツの
日

23 月

23 木

24 土

24 火

24 金

25 日

25 水

25 土

26 月

科学技術社会論入門

夏季休業

26 木

26 日

27 火

先導科学実習予備日

27 金

27 月

28 水

先導科学実習予備日

28 土

28 火

29 木

先導科学実習予備日

29 日

29 水

30 金

先導科学実習予備日

30 月

先導科学実習予備日

31 火

先導科学実習予備日

31 土

140

30 木

先導科学考究③（三浦）

イベント・他

夏季休業

2021年度 年間授業計画
10月
日

授業

11月
イベント・他

1 金

日
1 月

2 土

夏季休業

3 水

4 月

4 木

6 水
7 木
8 金

EDA・CED
入学式

EDA
RS1
RS2
RS3
CSR (Wrighting)
CSR (Presentation)

イベント・他

科学史・科学技術社会論Ⅱ
科学史・科学技術社会論Ⅲ

2 火

3 日

5 火

授業

12月

文化の日

統合進化学
（颯田）

日
1 水

人類遺伝学特論（五條堀）

2 木

人類遺伝学特論
（五條堀）

3 金

科学英語
（Todd Gorman）

フレッシュマンコー
ス

5 金

5 日

フレッシュマンコー
ス

6 土

6 月

フレッシュマンコー
ス

7 日

7 火

フレッシュマンコース

8 月

科学史・科学技術社会論Ⅱ

先導科学考究⑤
（佐藤）

9 木

10 日

10 水

統合進化学
（五條堀）

10 金

11 月

11 木

11 土

12 火

12 金

12 日

13 水

13 土

14 木

14 日

15 金

15 月

16 土

16 火

17 日

17 水

19 火

科学史・科学技術社会論Ⅲ

先導科学考究④
（河村）

入試説明会

13 月
14 火

科学史・科学技術社会論Ⅱ

科学史・科学技術社会論Ⅱ
科学史・科学技術社会論Ⅲ

先導科学考究⑥
（石川）

統合進化学
（沓掛）

統合進化学
（大槻）

17 金

科学英語
（Todd Gorman）

18 木

進化行動生態学特論
（沓掛）

18 土

19 金

進化行動生態学特論
（沓掛）

19 日
20 月

21 木

21 日

21 火

22 金

22 月

22 水

23 土

23 火

24 日

24 水

勤労感謝の
日

23 木
24 金

25 木

先導科学プログレス

25 土

26 火

26 金

先導科学プログレス

26 日

27 水

27 土

27 月

28 木

28 日

28 火

29 金

29 月

30 土

30 火

科学史・科学技術社会論Ⅲ

科学英語（Todd Gorman）

16 木

20 土

科学史・科学技術社会論Ⅱ

科学史・科学技術社会論Ⅲ

15 水

科学史・科学技術社会論Ⅲ

20 水

25 月

科学史・科学技術社会論Ⅱ

8 水

科学史・科学技術社会論Ⅲ

9 火

科学史・科学技術社会論Ⅱ

イベント・他

4 土

9 土

18 月

授業

科学史・科学技術社会論Ⅱ
科学史・科学技術社会論Ⅲ

29 水
30 木
31 金

31 日

141

冬季休業

2021年度 年間授業計画
1月
日

授業

2月
イベント・他

1 土
冬季休業

2 日

日

授業

3月
イベント・他

日

1 火

1 火

2 水

2 水

生命科学と社会Ⅱ

3 月

3 木

4 火

4 金

5 水

5 土

5 土

6 木

6 日

6 日

7 月

7 月

オープン
キャンパス

7 金

科学英語
（Todd Gorman）

4 金

8 土

8 火

先導科学考究⑧
（吉澤）

8 火

9 日

9 水

入試

9 水

10 木

入試

10 木

10 月
11 火

成人の日

先導科学考究⑦（Amano）

11 金

建国記念日

11 金

12 水

12 土

12 土

13 木

13 日

13 日

14 金

14 月

14 月

15 土

15 火

15 火

16 日

16 水

16 水

17 月

17 木

17 木

18 火

18 金

18 金
19 土

19 水

エピジェネティクス・
ゲノム進化学特論（宅野）

19 土

20 木

エピジェネティクス・
ゲノム進化学特論（宅野）

20 日

21 金

科学英語
（Todd Gorman）

21 月

21 月

22 土

22 火

22 火

23 日

23 水

24 月

24 木

24 木

25 火

25 金

25 金

春季休業

天皇誕生日

20 日

23 水

26 水

分子進化学特論
（大田）

26 土

27 木

分子進化学特論
（大田）

27 日

27 日

28 月

28 月

28 金

春季休業

26 土

29 土

29 火

30 日

30 水

31 月

統合進化学
（大田、田辺、颯田）

31 木

142

イベント・他

3 木（大西・飯田）生命科学と社会Ⅱ（大西・飯田）授業

春季休業

生命共生体進化学専攻 時間割 (２０２１年度）
前期 時間割
時間
9:00～
１限
10:30

月

２限

10:40～
12:10

３限

13:00～
14:30

科学と社会副論文入門
前期8時限

４限

14:40～
16:10

科学技術社会論入門
前期8時限

５限

16:20～
17:50

前期 講義日程
科学と社会副論文入門

火

水

木

金

集中講義科目（下記参照）
先導科学考究15:00～
前期３回

4/23(3-4限）,4/30(3-4限), 6/14（3限）, 7/12（3限）, 9/6（3-4限)

科学技術社会論入門

6/7, 6/14, 6/21, 6/28, 7/5, 7/12, 7/19, 7/26

先導科学考究6/15, 7/13, 9/14

先導科学プログレス

6/3, 6/4

前期 集中講義日程
フレッシュマンコース

4/6-9

生物科学副論文入門

4/14

生物統計学

6/16-18, 6/23-25

ミクロマクロ生物学

4/15-16, 4/19-21

先導科学実習5/6-7, 10-11, 13-14, 17-18, 20-21, 24-25, 27-28 *5/17-18は野外実習

進化ゲーム理論特論

7/14-15

生物人類学特論

6/30, 7/1

個体群生態学特論

7/7-8

後期 時間割
時間
9:00～
１限
10:30

月

２限

10:40～
12:10
13:00～
14:30

科学史・科学技術社会論Ⅱ

３限

14:40～
16:10

科学史・科学技術社会論Ⅲ

４限
５限

16:20～
17:50

火

後期 講義日程
統合進化学

先導科学考究15:00～
後期5回

11/4, 10, 17, 12/16, 1/31

科学英語Ⅰ～Ⅴ

10/15, 10/29, 11/12, 12/3, 12/17

科学史・科学技術社会論Ⅱ

10/18, 25, 11/1, 8, 15, 29, 12/6, 13

科学史・科学技術社会論Ⅲ

10/18, 25, 11/1, 8, 15, 29, 12/6, 13

先導科学考究10/19, 11/9, 12/14, 1/11, 2/8

先導科学プログレス

11/25-26

後期 集中講義日程
フレッシュマンコース

木

集中講義科目（下記参照）

後期8時限
後期8時限

水

10/5-8

生命科学と社会Ⅱ

2/3-4

人類遺伝学特論

12/1-2分子進化学特論

1/26-27

進化行動生態学特論

11/18-19

エピジェネティクス・ゲノム進化学特論

1/19-20143

金

科学英語Ⅰ～Ⅴ
後期 全10 時限(Office hour;
14:40-16:10)

2021 年度シラバス

144

0123401010
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145

0120345657
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146

0123401010
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HIBL

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2021年度先導科学考究 講師及び日程一覧
日程

講師・所属

タイトル

菊水健史
麻布大学・教授

ネットワーク構造から決まる複雑生命システ
ムのダイナミ社会神経内分泌学：社会を形成する内分泌の役割

第1回 2021年6月15日（火）ATakefumi Kikusui, Professor,
Azabu University

Social neuroedocrinology: Roles of
endocrine for social formation

久世濃子

最も「遅い」類人猿－オランウータン（Pongo属）の雌の繁殖戦略

一般社団法人 海外環境協力センター
・研究員

第2回 2021年7月13 日（火）

担当教員

大槻久

蔦谷匠

Noko Kuze, Researcher,Overseas Environmental
Cooperation Center, Japan

Reproductive strategy of female orangutans(Pongo spp) - “the slowest ape”

三浦恭子

長寿齧歯類ハダカデバネズミの発がん耐性

熊本大学大学院生命科学研究部・准教授 と老化耐性のメカニズム

第3回 2021年9月15日（火）Kyoko Miura, Associate
Professor, Kumamoto
Mechanisms of cancer-resistance andUniversity, Faculty of Life
delayed aging in the longest-lived rodent,
Sciences, Department of Aging the naked mole-rat
and Longevity Research
河村正二
東京大学・教授

真猿霊長類における色覚－嗅覚トレードオ
フ仮説の検証Shoji Kawamura, Professor,
University of Tokyo

Test of the trade-off relation hypothesis
between color vision and olfaction in simian
primates

佐藤矩行・沖縄科学技術大学
院大学・教授脊索動物の起源と進化

第4回 2021年10月19日（火）2021年12月14日
（火）
第6回 ↓
2022年1月15日（火）に変更大田竜也

颯田葉子

第5回 2021年11月9日（火） Noriyuki Satoh, Professor,

Okinawa Institute of Scienceand Technology Graduate
University

渡邊崇之

Chordate origins and evolution

石川由希・名古屋大学・講師「好み」の進化の神経分子機構の解明を目指してYuki Ishikawa, Nagoya
University, Lecturer

Towards an understanding of the neural andmolecular mechanism behind the evolutionof preference

木下充代

世界の生物多様性保全のために科学的知見を創出・統合する
沓掛展之第7回 2022年1月11日（火） Tatsuya Amano, Australian

Research Council Future
Fellow, University of
Queensland
吉澤 剛・関西学院大学 イノ
ベーション・システム研究セン
ター・客員研究員

Origin and Evolution of Cetaceans Revealed
by Molecular Systematics

科学の存在論的ガバナンス
大西勇喜謙

第8回 2022年2月8日（火） Go Yoshizawa, Visiting

Researcher, Kwansei University Ontological governance of science
Innovation System ResearchCenter193

2021年度 先導科学考究①：

2021年6月15日（火）

社会神経内分泌学：社会を形成する内分泌の役割
Social neuroedocrinology: Roles of endocrine for social formation
菊水健史・麻布大学・教授
Takefumi Kikusui, Professor, Azabu University

Abstract：
Animals show appropriate behavior within their respective groups and form stable social
relationships. Social behaviors are under the control of hormones, indeed sexual behavior,aggressive behavior, and parent-child relationships are hormone-dependent. For example,
when a juvenile under sexual maturity, hormones play a role in the development of male andfemale behaviors, and the transition to nurturing behaviors after the after copulation.
Therefore, hormones modulate emotional reactivity to external stimuli significantly,
depending on the timing and role of these biological activities. For example, when mice have
not yet given birth, they do not respond emotionally to the cries of their pups, but when theyexperience hormonal changes related to parturition, they show approach behavior to the criesof their pups. In this lecture, I will focus on sex hormones, glucocorticoids and oxytocin, which
are hormones that regulate sociality, and introduce their functions and evolution, especially
their roles in social development.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Kikusui, T, Nagasawa, M, Nomoto K, Kuse-Arata, S, Mogi, K. (2019) Endocrine
Regulations in Human-Dog Coexistence through Domestication. Trends Endocrinol
Metab. 11, 793-806

2.

Hattori, T., Osakada, T., Matsumoto, A., Matsuo, N., Haga-Yamanaka, S., Nishida, T.,
Mori, Y., Mogi, K., Touhara, K., & Kikusui T. (2016) Self-exposure to the male pheromone
ESP1 enhances male aggressiveness in mice. Curr Biol, 26: 1229-1234.

3.

Matsuo, T., Hattori, T., Asaba, A., Inoue, N., Kanomata, N., Kikusui, T., Kobayakawa, R.,& Kobayakawa, K. (2015) Genetic dissection of pheromone processing reveals main
olfactory system-mediated social behaviors in mice. Proc Natl Acad Sci U S A., 112(3):E311-20.

194

4.

Haga, S., Hattori, T., Sato, T., Sato, K., Matsuda, S., Kobayakawa, R., Sakano, H.,
Yoshihara, Y., Kikusui, T., & Touhara, K. (2010) The male mouse pheromone ESP1
enhances female sexual receptive behaviour through a specific vomeronasal receptor.

Nature, 466: 118-122.
5.

Watarai, A., Arai, N., Miyawaki, S., Okano, H., Miura, K., Mogi, K., & Kikusui T. (2018)
Responses to pup vocalizations in subordinate naked mole-rats are induced by estradiol
ingested through coprophagy of queen's feces. Proc Natl Acad Sci U S A, Sep
11;115(37):9264-9269.

受け入れ担当教員：大槻 久

1952021 年度 先導科学考究②：2021 年 7 月 13 日（火）最も「遅い」類人猿－オランウータン（Pongo属）の雌の繁殖戦略
Reproductive strategy of female orangutans (Pongo spp) - “the slowest ape”
久世濃子・一般社団法人 海外環境協力センター・研究員
Noko Kuze, Researcher, Overseas Environmental Cooperation Center,
Japan

Abstract：
Orangutan (Pongo spp.) is a species of great apes (Hominoidea) living in the rainforests ofSoutheast Asia (Borneo and Sumatra Island). We combine birth data from seven ﬁeld sites,
each with demographic data collection for at least 10 years (range 12-43 years) on wildorangutans to better document their life history. We found an average closed interbirthinterval of 7.6 years, as well as consistently very high pre-weaning survival for males andfemales. Female survival of 94% until age at ﬁrst birth (at around age 15 years) was higher
than reported for any other mammal species under natural conditions. Their high survival islikely due to their arboreal and nongregarious lifestyle (van Noordwijk et al. 2018).
On the other hand, there are few studies HOW orangutan maintain long interbirth interval.
To clarify the factors that affect the reproduction of female orangutans, we conducted longterm research of a wild population living at primary tropical rain forest at the Danum Vally
Conservation Area (Malaysia) in North part of Borneo Island since 2005. We found that theirpregnancies are clearly synchronize with supper annual fluctuating fruit production (mustfruiting) in lowland Dipterocarpaceae forest. In this lecture, I introduce reproduction as wellas the unique ecology of the orangutan, together with wonderful and persistent fieldwork.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1．久世濃子 (2018)「オランウータン－森の哲人は子育ての達人」東京大学出版会
2．金森朝子（2013）「野生のオランウータンを追いかけて－マレーシアに生きる世界最大の樹上生活者」東海大学出版会
3．van Noordwijk MA, Utami Atmoko SS, Knott CD, Kuze N, Morrogh-Bernard HC, OramF, Schuppli C, van Schaik CP, Willems EP. 2018 The slow ape: High infant survival andlong interbirth intervals in wild orangutans. Journal of Human Evolution 125:38-49.

196

4．Kanamori T, Kuze N, Bernard H, Malim TP, Kohshima S. 2017 Fluctuations of population
density in Bornean orangutans (Pongo pygmaeus morio) related to fruit availability in theDanum Valley, Sabah, Malaysia: a 10-year record including two mast fruitings and threeother peak fruitings. Primates 58(1):225-235.
5．2016/12/16 公開開始 Web ナショナルジオ「研究室に行ってみた。国立科学博物館
オランウータン 久世濃子」（インタビュー記事）（https://natgeo.nikkeibp.co.jp/atcl/web/16/112900019/）

受け入れ担当教員：蔦谷 匠

197

2021年度 先導科学考究③：

2021年9月14日（火）最長寿齧歯類ハダカデバネズミの発がん耐性と老化耐性のメカニズム
Mechanisms of cancer-resistance and delayed aging in the longest-lived
rodent, the naked mole-rat
三浦恭子・熊本大学大学院生命科学研究部・准教授
Kyoko Miura, Associate Professor, Kumamoto University, Faculty of Life
Sciences, Department of Aging and Longevity Research

Abstract：
Naked mole-rats (NMRs, Hadakadebanezumi in Japanese) are rodent species living
underground in Ethiopia, Kenya, and Somalia. NMRs have unique eusociality, similar to ants
and bees, and form underground colonies consisting of many individuals. Although NMRs
are small-sized rodents like mice, their maximum lifespan exceeds 37 years, and they also
have extraordinary cancer-resistance. Besides, NMRs are adapted to the underground low
oxygen environment (-6%) and have a remarkable hypoxia/anoxia tolerance. Because of theseunique characteristics, NMRs have been attracting many researchers' attention in recent
years. From 2011, we have developed several research tools for investigating NMRs and havestudied their unique characteristics. We generated iPS cells from NMRs and revealed theirtumor-resistance mechanisms (Miyawaki et al., Nat Commun, 2016), characterized NMR
macrophages and brown adipose tissues (Wada et al., Sci Rep, 2019, Oiwa et al., Sci Rep,
2020), and discovered the mechanisms of senescent cell death and marked cancer-resistancein NMRs ((Kawamura et al., bioRxiv, 2020, Fujioka & Oka et al., unpublished). In this lecture,
I would like to introduce NMR’s exciting characteristics, our current studies, and future
perspective.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Miyawaki S, Kawamura Y, Oiwa Y, Shimizu A, Hachiya T, Bono H, Koya I, Okada Y,
Kimura T, Tsuchiya Y, Suzuki S, Onishi N, Kuzumaki N, Matsuzaki Y, Narita M,
Ikeda E, Okanoya K, Seino K, Saya H, Okano H, Miura K.
Tumour resistance in induced pluripotent stem cells derived from naked mole-rats.

Nature Communications, 10;7:11471 (2016)

198

2.

河村佳見, 三浦恭子
ハダカデバネズミ―新しい老化モデル動物

細胞, Vol.52, No.11, 12-15. (2020） 2020年9月23日発行
3.

https://debalab.org/

受け入れ担当教員：渡邊崇之

1992021 年度 先導科学考究④：2021 年 10 月 19 日（火）

真猿霊長類における色覚－嗅覚トレードオフ仮説の検証
Test of the trade-off relation hypothesis between color vision and olfaction insimian primates
河村正二・東京大学・教授
Shoji Kawamura, Professor, University of Tokyo

Abstract：
Simian primates are comprised of catarrhines (humans, apes and African/Asian monkeys)
and platyrrhines (monkeys of Americas). In catarrhines and platyrrhine howler monkeys, L
and M opsin genes are juxtaposed on the X chromosome, enabling routine trichromatic color
vision for them. In other platyrrhines, these genes are alleles of a single locus, resulting inpolymorphic color vision (trichromatic phenotypes in some females and dichromatic
phenotypes in other females and all males). A trade-off relation between color vision andolfaction has been hypothesized based on comparison of the number of intact olfactory
receptor (OR) genes among species with different color-vision types. However, in simians, therelation remains elusive because public whole-genome sequence (WGS) data are often
incomplete regarding multigene families such as OR genes. Our lab has been conducting
enrichment of OR genes by target capture (TC) and massive-parallel sequencing for diverse
simian primates. The TC improved the sequencing depth for each OR gene and reliability ofgene identification. The relation between color vision and intact OR gene number is not
simple. In this lecture, I will present the up-to-date results of this trial and discuss the tradeoff hypothesis.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1. Melin, A. D., Nevo, O., Shirasu, M., Williamson, R. E., Garrett, E., Endo. M., Sakurai,K., Matsushita, Y., Touhara, K. and Kawamura, S. (2019). Fruit scent and observer
colour vision shape food-selection strategies in wild capuchin monkeys. Nature

Communications, 10:2407.
2. Melin, A. D., Chiou, K. L., Walco, E. R., Bergstrom, M., L., Kawamura, S. and Fedigan,
L. M. (2017). Trichromacy increases fruit intake rates of wild capuchins (Cebus

200

capucinus imitator). Proceedings of the National Academy of Sciences of the UnitedStates of America, 114: 10402–10407.
3. Kawamura, S. and Melin, A. D. (2017). Evolution of genes for color vision and thechemical senses in primates. In: Evolution of the Human Genome I: The Genome andGenes (Saitou, N. ed.), pp. 181-216, Springer Japan, Tokyo (https://doi.org/10.1007/9784-431-56603-8_10) (PDF available upon request to kawamura@edu.k.u-tokyo.ac.jp).
4.

Gilad Y, Przeworski M, Lancet D. (2004). Loss of olfactory receptor genes coincides
with the acquisition of full trichromatic vision in primates. PLoS Biology 2: e5.

受け入れ担当教員：大田竜也

201

2021 年度 先導科学考究⑤：2021 年 11 月 9 日（火）脊索動物の起源と進化
Chordate origins and evolution
佐藤矩行・沖縄科学技術大学院大学・教授
Noriyuki Satoh, Professor, Okinawa Institute of Science and Technology
Graduate University

Abstract：
The origin and evolution of chordates is one ofthe most mysterious and intriguing phenomena
in evolutionary developmentalbiology. Chordates are animals characterized by possession ofa notochord, adorsal neural tube, pharyngeal gill slits, and somites. They consist of threetaxa:
cephalochordates, urochordates (or tunicates), and vertebrates. Chordatesbelong to a superphyletic group of deuterostomes together with echinoderms and hemichordatesand arethought to have been derived from common ancestor(s) ofdeuterostomes. Vertebrates evolved
by developing a body plan with the greatestcomplexity among metazoans. In 1895, Charles
Darwin proposed the concept oforganismal evolution. Since then, the origin and evolution ofchordates have beenstudied, discussed, and debated vigorously for more than 150 year. Now
we haveinformation about genes and genomes of deuterostomes, and cellular andmolecularmechanisms involved in morphogenesis for construction of animal body plans.
Myspecial interest is the notochord, the most prominent feature of chordates. Howwas thenotochord born? I wish to discuss the evo-devo mechanism of chordateorigin(s) and evolution.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Satoh, N. 2016. Chordate Origins and Evolution. Academic Press, San Diego, USA.

2.

Holland, N.D. et al. 2015. Scenarios for the making of vertebrates. Nature 520, 450-455.

3.

Lowe, C.J. et al. 2015. The deuterostome context of chordate origins. Nature 520, 456465.

受け入れ担当教員：颯田葉子202

2021 年度 先導科学考究⑥：2021 年 12 月 14 日（火）「好み」の進化の神経分子機構の解明を目指して
Towards an understanding of the neural and molecular mechanism behindthe evolution of preference
石川由希・名古屋大学・講師
Yuki Ishikawa, Nagoya University, Lecturer

Abstract：
Preferences for mating and breeding are important for reproductive success. The preferences
are diverse among species and have changed during the process of adaptive evolution. While
the molecular basis of morphological evolution has been gradually revealed, the neural andmolecular mechanisms underlying the evolution of preferences remain largely unknown.
A fruit fly Drosophila melanogaster is a model organism of genetics and neuroscience, with awealth of genetic tools and publicly available neural circuit and genomic information. The
close relatives of D. melanogaster include many attractive species that exhibit preferences
and behaviors that are distinct from D. melanogaster. I am trying to elucidate the neuralmechanisms of preference evolution by transferring the tools and information of the modelorganisms to these non-model related species.
In this lecture, I will first give a brief introduction to the relationship between evolutionary
biology, ethology, and neuroscience, and then introduce recent progress on the neuralmechanisms of the evolution of mating preference in Drosophila, which I am currently
working on. I will also briefly introduce several topics about flower-visiting D. elegans, suchas breeding preference, territorial behavior, and genetic tool development, which I haverecently focused on as a model system connecting evolution, ecology, behavior, and neuralmechanisms.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

特になし；最新情報を話題提供する予定

受け入れ担当教員：木下充代

203

2021 年度 先導科学考究⑦：2022 年 1 月 11 日（火）Generating and synthesising scientific evidence for global biodiversity
conservation
世界の生物多様性保全のために科学的知見を創出・統合する
Tatsuya Amano, Australian Research Council Future Fellow, University of
Queensland

Abstract：
Biodiversity is being lost globally at an unprecedented rate, with one million species facing
the risk of extinction today. Compiling scientific evidence on the status of biodiversity andsolutions to its conservation represents one of the critical processes in informing decision
makers and halting the ongoing biodiversity crisis. Yet, we continue to find severe gaps andbiases in available scientific evidence, which impede the effective use of scientific evidence indecision making. This lecture will be based on my own research to date, where I have been
focused on the generation and synthesis of scientific evidence for global biodiversity
conservation. I will start by explaining why scientific evidence is important in conservation.
Then, I will outline how evidence that is available today is distributed over space, taxa andso on, and what the consequences of such gaps and biases in evidence are. The last part ofthe lecture will focus on how we can fill these existing gaps in evidence. As one solution, I
will introduce our translatE (transcending language barriers to environmental sciences)
project, where our aim is to understand the potential importance of scientific evidence
published only in languages other than English, and make better use of such evidence indecision making for global biodiversity conservation.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Amano, T., González-Varo, J.P. and Sutherland, W.J. (2016) Languages are still a major
barrier to global science. PLOS Biology 14: e2000933.
https://doi.org/10.1371/journal.pbio.2000933

2.

Christie, A.P., Amano, T., Martin, P.A., Petrovan, S.O., Shackelford, G.E., Simmons, B.I.,
Smith, R.K., Williams, D.R., Wordley, C.F.R., Sutherland, W.J. (2020) The challenge of
biased evidence in conservation. Conservation Biology.

204https://doi.org/10.1111/cobi.13577
3.

translatE project: https://translatesciences.com/

受け入れ担当教員：沓掛展之205

2021 年度 先導科学考究⑧：2022 年 2 月 8 日（火）科学の存在論的ガバナンス
Ontological governance of science
吉澤 剛・関西学院大学 イノベーション・システム研究センター・客員研究員
Go Yoshizawa, Visiting Researcher, Kwansei University Innovation System
Research Center

Abstract：
As the quintuple helix innovation model shows, science and technology have recently
developed in such a way as to involve not only university, industry and government, but also
citizens and the natural environment as actors. While existential risks to bring an end tohumanity become more serious, the concepts like Anthropocene and planetary boundaries
suggest a need for the governance of resources, means and outcomes of scientific development
as ‘things’ for the future, rather than the conventional public policy to regulate or promote
human activities. Against this backdrop, different academic disciplines have proposed the‘ontological turn’, which is based on the anxiety and uncanny of existence that is beyond ourreason, and also examined the concept of darkness. This lecture discusses how the object,directionality and methodology of science have been ontological and dark, by reference toartifacts and politics, value sensitive design, mundane governance, and object-oriented
democracy, as well as technological solutionism, anti-intellectualism, dark ecology, andcapitalist realism. By introducing citizen science on radioactive measurement after
Fukushima, and public engagement with genome editing as case studies, it also
demonstrates how a wide range of experts, stakeholders and citizens have a positive attitude
to the governance of research and innovation for future generations and distributeresponsibility in a more natural and proportional manner.

予め学生が読んでおくべき参考文献、論文、HPなど：

1.

Carayannis, E. G., Barth, T. D., and Campbell, D. F. J. (2012) The Quintuple Helix
innovation model: global warming as a challenge and driver for innovation. Journal of
Innovation and Entrepreneurship 1:2

2.

Fisher, M. (2013) Capitalist Realism: Is There No Alternative? Zero Books

206

3.

Friedman, B. (1996) Value-sensitive design. Interactions 3(6), 17-23

4.

Jensen, C. B. (2017) New ontologies? Reflections on some recent ‘turns’ in STS,
anthropology and philosophy. Social Anthropology 25(4), 525-545

5.

Latour, B. and Weibel, P. (eds.) (2005) Making Things Public: Atmospheres of Democracy.
MIT Press

6.

Morton, T. (2018) Dark Ecology: For a Logic of Future Coexistence. Columbia University
Press

7.

Moynihan, T. (2020) Existential risk and human extinction: an intellectual history.
Futures 116, 102495

8.

Winner, L. (1980) Do artifacts have politics? Daedalus 109(1), 121-136

9.

Woolgar, S. and Neyland, D. (2014) Mundane Governance: Ontology & Accountability.
Oxford University Press

10. 吉澤 剛「ダークサイエンスとポジティブエンゲージメント」研究技術計画 33(1): 26-38(2018)

受け入れ担当教員：水島 希・大西勇喜謙

207

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