Ambassade de France au Japon
Service pour la Science et la Technologie

Rapport d’Ambassade
Juillet 2017

Le Japon dans la Lutte contre lesMaladies Infectieuses :Acteurs Clés et Principales Initiatives

Rédacteur :Thibaut DUTRUEL
Chargé de Mission pour les Sciences de la Vie,
Ambassade de France au Japon« La connaissance des maladies infectieuses enseigne aux hommes qu’ils sont frères etsolidaires. Nous sommes frères parce que le même danger nous menace, solidaires parceque la contagion nous vient le plus souvent de nos semblables »Le Destin des maladies infectieuses (1933).
Charles Nicolle (1866-1936),
Prix Nobel de Physiologie ou Médecine, 1928,
Directeur de l’Institut Pasteur de Tunis,
Professeur au Collège de France.

PlanIntroduction.....................................................................................................................1
I) Histoire récente des maladies infectieuses au Japon ................................21) Aspects historiques et démographiques : les grandes dates ..................................... 22) Un pays longtemps leader dans le développement de molécules antibiotiques
et disposant d’une recherche académique de pointe .................................................. 63) La prévention et la surveillance des maladies infectieuses au Japon ................. 10II) Les acteurs japonais de la recherche sur les maladies
infectieuses ........................................................................................................................ 141) Les principales universités impliquées dans la recherche sur les maladies

infectieuses ............................................................................................................................... 152) Les centres de recherche publics sur les maladies infectieuses ........................... 223) Les principales agences de financement et le fonds GHIT ...................................... 25

III) Un pays engagé dans la lutte mondiale contre les maladies
infectieuses ........................................................................................................................ 291) Un engagement de longue date pour améliorer la santé mondiale ..................... 292) …en Asie ...................................................................................................................................... 331) …et en Afrique .......................................................................................................................... 382) …où la France est un partenaire clef ................................................................................ 413) La résistance aux antibiotiques, un nouvel enjeu mondial ..................................... 45

Conclusion et Perspectives......................................................................................... 48
Annexes................................................................................................................................ 51

Introduction

Le Japon et la France partagent tous deux une implication de longue date et constantedans les initiatives politiques et de financement pour l’amélioration de la santé mondiale,
notamment dans la lutte contre les maladies infectieuses.
La recherche scientifique d’excellence dans ce domaine est également une caractéristiquecommune aux deux pays. La France et le Japon se classent respectivement en 4ème et 5èmerangs mondiaux en termes de production d’articles scientifiques dans les domaines maladies
infectieuses, microbiologie et virologie (données InCites™/Web of Science™ de 1980 à 2017).
Ce secteur est par ailleurs un des principaux et plus anciens secteurs de coopération
scientifique entre la France et le Japon en sciences de la vie.
Ce rapport s’intéresse donc à l’activité scientifique japonaise dans ce domaine, enprésentant notamment les principaux acteurs académiques impliqués et en mettant l’accent
sur la coopération bilatérale, à la fois franco-japonaise mais aussi entre le Japon et d’autres
pays clés dans le domaine des maladies infectieuses, en Asie et en Afrique.
Combat sans frontière inscrit successivement à l’agenda des récents sommets des Chefs
d’Etats du G7, la lutte contre les maladies infectieuses et les crises sanitaires d’origineépidémique est considérée comme une priorité de santé globale où la collaborationinternationale est indispensable. La troisième partie de ce rapport met donc en lumière lacoopération tripartite franco-japonaise avec pays tiers dans le domaine des maladies
infectieuses. Porté côté français principalement par l’Institut Pasteur via son réseau uniquede 33 instituts répartis dans 26 pays, mais aussi par l’Inserm avec une coopération sur levirus Ebola, ce type de partenariat est encore relativement nouveau mais s’avère essentiel
dans la lutte à grande échelle contre les maladies infectieuses.
Ce rapport se veut donc un moyen pour le service scientifique de l’ambassade de France au
Japon de faire connaître l’état actuel de la recherche et des initiatives japonaises dans ledomaine des maladies infectieuses, de susciter l’émergence de nouvelles pistes decollaboration et de rappeler son soutien aux futures initiatives franco-japonaises dans ce
domaine.
1

I - Histoire récente des maladies infectieuses au Japon

1) Aspects historiques et démographiques1
Détaché depuis environ 20 000 ans du continent eurasiatique, le Japon a connu
plusieurs vagues de migrations plus ou moins continues en provenance de l’Asie aucours des différents millénaires passés.
Après avoir bravé les barrières maritimes qui font encore aujourd’hui du Japon un pays
relativement isolé géographiquement du reste du monde, différents groupes demigrants, habituellement nomades, sont arrivés au Japon et s’y sont sédentarisés. Le
pays étant peu propice à l’élevage, la culture du riz s’imposa rapidement. Nécessitantune forte main-d’oeuvre, la riziculture allait fonder une des caractéristiques clefs duJapon : une densité de population élevée. En effet, celle-ci a toujours été concentrée là où
la culture était possible (Sud-ouest, zones côtières, plaine du Kansai). De 1600 à 1725, lapopulation connait un bond de 15 millions à plus de 30 millions de personnes.
Lorsque les premiers européens arrivent au Japon en 1543, ceux-ci sont d’ailleurs trèssurpris de constater que la plupart des grandes épidémies européennes sont absentes
au Japon. A cette époque pourtant, la densité de population est déjà suffisamment
importante pour permettre aisément à une épidémie de se propager, de même que leséchanges commerciaux sont déjà très dynamiques entre les différentes régions du pays.
Les registres historiques révèlent toutefois la prévalence de plusieurs maladies
infectieuses dans l’archipel. La variole est notamment connue depuis le 5ème siècle au
Japon et entre 735 et 737, une sévère épidémie, appelée «mogasa», l’une des plus
importantes, affecta le pays.
Dans les onze siècles qui ont suivi, la fréquence des cas de variole ne cessa d’ailleursd’augmenter. La variole semble être la plus importante maladie infectieuse de l’ère prémoderne japonaise.

1

Ann Bowman Jannetta. Epidemics and Mortality in Early Modern Japan. Princeton University Press,
1987.

2

En 998, apparaissent les premiers écrits relatant de la prévalence de la rougeole au
Japon. Dès lors et jusqu’en 1868, 36 épidémies sont répertoriées. Moins nombreux que
les cas de variole, les registres montrent clairement une augmentation de leur fréquencedès l’arrivée des premiers européens au 16ème siècle et lors des contacts avec les pays
voisins. En 1871, le premier cas d’encéphalite japonaise a été documenté au Japon. Cevirus transmis par les moustiques est la cause la plus importante d’encéphalite virale en
Asie.
En revanche, aucun registre de l’ère prémoderne japonaise ne révèle l’existence de casde peste bubonique ou de typhus, pourtant deux des épidémies les plus ravageuses en
Europe. Plus tard cependant, le pays connaît une épidémie de typhus. La région nordouest, reposant depuis longtemps sur une économie agricole, s’intègre rapidement àd’autres telles que Hokkaido et le Kanto (principalement Tokyo) à la fin du 19ème siècle.
L’augmentation des industries et le développement des chemins de fer nécessitent une
main d’œuvre importante. Le flux de travailleurs accéléré par la crise de 1913 et la placede Tokyo, comme hub concentrant les allers et venues de ceux-ci, vont favoriserl’émergence d’une crise épidémiologique au printemps 1914.
La seconde guerre mondiale a également exposé le Japon aux maladies infectieuses en leplaçant dans des conditions sanitaires précaires et donc propices au développement deplusieurs maladies telles que la tuberculose, la fièvre typhoïde, la dysenterie, ladiphtérie, l’encéphalite japonaise et d’autres maladies parasitaires. C’est d’ailleurs àcette période que le contrôle des maladies infectieuses est devenu une priorité, avec lacréation du National Institute of Health (NIH) en 1947. Devenu aujourd’hui le National
Institute of Infectious Diseases (NIID), il n’est pas le premier établissement japonais à
avoir été dédié aux maladies infectieuses.
En 1892 déjà, un institut privé, l’Institute for Infectious Diseases (IID), a été fondé par le
Dr Kitasato Shibasaburō. Ce médecin japonais, qui a passé 6 ans à Berlin auprès deRobert Koch, contribua de manière considérable à l’avancée de la bactériologie. Il anotamment été le premier à être capable de faire la culture de Clostridium chauvoei, lepathogène responsable de la gangrène gazeuse chez les ovins et bovins, puis celle deClostridium tetani, cause du tétanos. Il a également participé à des recherches sur lapeste ainsi que sur la maladie du charbon. Quand l’IID a été fusionné en 1899 àl’Université de Tokyo, le Dr Kitasato en quitta la direction et fonda l’Institut Kitasato qui
3existe encore aujourd’hui. Contemporain de Louis Pasteur, le Dr Kitasato bénéficie d’une
renommée comparable à celle du chercheur français au sein de la communautéscientifique japonaise.
En 1958, une épidémie de poliomyélite à grande échelle force le pays à développer denouvelles infrastructures pour la fabrication de tests diagnostic et de tests pour lecontrôle qualité des vaccins. C’est au sein des laboratoires annexes du NIID à Musashi
Murayama que de nouvelles capacités de production sont construites au début desannées 1960.
En 1997, le NIH devient le NIID. La même année, le Département d’épidémiologie est
réorganisé en tant qu’Infectious Disease Surveillance Center pour collecter toutes les
informations relatives aux cas de maladies infectieuses. Etabli sur la base de rapports
annuels réalisés par le NIID en 2005, 2010 et 2015, le graphique suivant donne une
image de l’évolution des principaux cas de maladies infectieuses répertoriés au Japon il
y a une dizaine d’années jusqu’à récemment. Il convient de faire remarquer que les
informations concernant la tuberculose ne figurent pas dans le graphique faute dedonnées avant 2007. La lutte contre la tuberculose a cependant depuis longtemps été
une priorité du Japon, surnommée « Bokoku-Byo » (maladie qui détruit le pays en
fauchant de nombreuses vies), jusque dans les années 1950 elle était la première causede mortalité dans le pays. Dernièrement, un pic de 31 483 cas a été observé en 2011 et
depuis, la tendance est en baisse avec 26 629 cas rapportés en 2014 et 18 280 en 2015.

452) Un pays longtemps leader dans le développement de molécules
antibiotiques et disposant d’une recherche académique de pointe2
C’est seulement après la seconde guerre mondiale que les compagnies pharmaceutiques
japonaises, initialement spécialisées dans la conception de produits basée sur lamédecine des plantes, commencèrent à produire à grande échelle leurs propres
médicaments.
C’est sur la base d’une tradition d’abord alimentaire, la fermentation des aliments, que leJapon devint rapidement un leader dans la production d’antibiotiques, la fermentationétant un des processus clef de la production de ces molécules.
Dès 1948, le Japon devint le 3ème pays à devenir auto-suffisant dans la production depénicilline après les Etats-Unis et le Royaume-Uni. Plus de 80 compagnies japonaises
sont alors engagées dans la production de cette molécule révolutionnaire.
Si la surproduction conduisit très vite à une chute du prix de la pénicilline et parconséquence réduisit considérablement le nombre d’entreprises productrices, cette ère
proféra au japon une grande expérience et des ressources humaines importantes pour laproduction à venir d’autres antibiotiques.
Dans les années 1950, les chercheurs japonais découvrirent un grand nombre demolécules antibiotiques.
En 1950, le professeur Y. Koyama isola le premier la colistine. Cet antibiotique de lafamille des polymixines agissant contre les gram (-) fut abandonné au cours des années
70 du fait d’importants effets secondaires hépato- et neurotoxiques. L’émergence desouches bactériennes résistantes le remis rapidement dans le schéma thérapeutique. La
colistine est notamment utilisée aujourd’hui en dernier recours contre les souches dePseudomonas aeruginosa résistantes à plusieurs classes d’antibiotiques, un pathogène
opportuniste à la 3ème place des germes responsables d’infections nosocomiales. En
1952, S. Hosoya de l’Université de Tokyo découvrit la trichomycine, un important
antifongique. En 1953, T. Hata et ses collègues de l’Institut Kitasato découvrirent laleucomycine.
2

Takuji Hara, et al. Industrial Innovation in Japan. Routledge, 2012.

6

Le Dr H. Umezawa, Directeur du Département des Antibiotiques, au National Institute of
Health et professeur au Research Institute of Applied Microbiology de l’Université deTokyo et ses coéquipiers découvrent la kanamycine en 1957, un nouvel antibiotiquehautement efficace contre les souches bactériennes résistantes à la pénicilline et à la
streptomycine. Les royalties de la kanamycine ont permis de fonder la Microbial
Chemistry Research Foundation (MCRF). De nombreuses autres molécules ont été
découvertes grâce aux chercheurs financés par cette institution jusqu’à aujourd’hui, à lafois anti-bactériennes mais aussi en immuno-oncologie.
Tous ces antibiotiques et bien d’autres partagent deux particularités, ils sont tous le fruitde recherches menées dans des établissements publics que ce soient des laboratoires ou
des universités, et ne sont pas des antibiotiques synthétiques mais d’origine naturelle.
Dans les années 1960, la production des antibiotiques qui devint semi-synthétique aux
Etats-Unis et en Europe n’empêcha pas le Japon de développer de nouveauxantibiotiques, bien au contraire, comme en témoigne le tableau ci-dessous présentant lesdifférentes molécules développées par le Japon entre 1967 et 19943.
Antibiotiques développés au Japon de 1967 à 1994.

3

Takuji Hara, et al. Industrial Innovation in Japan. Routledge, 2012.

7

Aujourd’hui encore, le Japon figure parmi les pays qui publient le plus dans les domaines
Maladies infectieuses-Virologie-Microbiologie. De 1980 jusqu’à aujourd’hui, 57 867
publications japonaises ont été consacrées à ces domaines, plaçant le pays au 5ème rang
mondial, derrière la France.

Pays ayant produit le plus de publications scientifiques dans les domaines Maladies infectieuses, Virologie
et Microbiologie de 1980 à 2017. Données InCites/Web of Science.

8

De nombreux chercheurs japonais se sont illustrés au cours des dernières décennies parleurs travaux de recherche dans le domaine des maladies infectieuses, en voici quelques
exemples.
Satoshi Omura, professeur à l’Institut Kitasato et Prix Nobel de Médecine ou Physiologie
en 2015, a découvert un composé chimique, l’avermectine, synthétisé naturellement par
un parasite trouvé dans le sol de la préfecture de Shizuoka. En partenariat avec
l’industriel américain Merck, cette découverte a permis de produire un dérivé de cettemolécule, l’ivermectine. Elle constitue une arme thérapeutique antiparasitaireincontournable dans la lutte contre la cécité des rivières (onchocercose) et la filariose
lymphatique chez l’Homme, deux problèmes majeurs de santé publique en Afrique. Cette
découverte constitue encore aujourd’hui l’un des meilleurs exemples de l’apport despartenariats public-privé pour l’amélioration de la santé mondiale.
Professeur émérite à l’Université de Tokyo, Soumei Kojima a consacré sa carrière à denombreux projets internationaux pour lutter contre plusieurs maladies tropicales. Il est
le premier à avoir réussi à produire un anticorps monoclonal (IgE) répondant au
candidat vaccin contre la bilharziose, une maladie parasitaire affectant plus de 200
millions de personnes dans le monde.
Toshihiro Horii, professeur au Research Institute for Microbial Diseases de l’Universitéd’Osaka, travaille activement au développement d’un vaccin contre le paludisme. Ilétudie également les relations hôte-parasite dans le cas de cette infection.
Kouichi Morita, professeur à l’Institute of Tropical Medicine de l’Université de Nagazaki,s’intéresse aux arbovirus et a contribué notamment aux travaux de recherche sur ladengue et autres maladies tropicales ainsi qu’au contrôle de ces infections dans les pays
en développement.

93) La prévention et la surveillance des maladies infectieuses au
Japon4
Comme présentée ci-dessus succinctement, l’histoire récente du Japon a été marquéepar plusieurs risques épidémiologiques, sans jamais atteindre pour autant l’ampleur desgrandes épidémies européennes telle que la peste noire.
Récemment, en 2014, le Japon a été confronté à une épidémie de dengue (160 cas
recensés), avec pour la 1ère fois depuis plus de 70 ans, une origine autochtone5. Cetépisode infectieux, parmi d’autres, a rappelé que la densité particulièrement élevée desa population, notamment au sein de grandes villes, et le dynamisme de ses échanges
avec le reste du monde, sont autant de facteurs qui exposent largement le Japon à unrisque de grande épidémie et l’obligent à rester vigilant.
Le Japon dispose de plusieurs mesures visant à garantir la prévention des maladies
infectieuses, à la fois par un dispositif de surveillance des cas infectieux et un système devaccination.
Instauré par la loi d’immunisation préventive en 1948, devenue aujourd’hui lePreventive Vaccination Act, le système de vaccination japonais est singulier. Il repose surune première catégorie de vaccination dite de routine, incluant le vaccin contre latuberculose (BCG), le vaccin combiné contre la diphtérie-téanos-poliomiéylite (DTPIPV), le vaccin combiné contre la rougeole et la rubéole (MR), le vaccin conjugué contre
le pneumocoque (PCV), ou encore le vaccin contre Haemophilus influenzae (Hib). Ces
vaccins, bien que fortement recommandés et disponibles gratuitement, ne sont pourautant plus obligatoires depuis 1995. Cependant, le taux de cette vaccination de routine
est parmi les plus élevés au monde. Il est important également de souligner que le vaccin
contre le papillomavirus humain (HPV), intégré aux programmes d’immunisation d’une
60aine de pays6 dans le but de prévenir le cancer du col de l’utérus, n’est plus
recommandé par le ministère de la santé japonais depuis 2016. Ce vaccin est cependanttoujours inscrit dans le schéma de vaccination de routine.

4

Kiyosu Taniguchi, et al. Overview of Infectious Diseases Surveillance System in Japan : 1999-2005.
Journal of Epidemiology, 2007.
5
Kutsuna S., et al. Autochthonous Dengue Fever, Tokyo, Japan, 2014. Emerg Infect Dis. 2015.
6
Bruni L., et al. Global estimates of human papillomavirus vaccination coverage by region and income
level: a pooled analysis. The Lancet Global Health. 201610

Enfin, la deuxième catégorie de vaccination est dite volontaire, incluant les vaccins
contre la grippe saisonnière, contre l’hépatite A et l’hépatite B, contre les oreillons,
contre le rotavirus ou encore contre le méningocoque (calendrier vaccinal en annexe 1),
le taux de cette vaccination est inférieur à celui de la vaccination de routine,
probablement car cette vaccination est à la charge des patients et que son coûtreprésente un facteur de limitation. Mais le facteur culturel est également à prendre encompte, 39% des parents s’inquièteraient des effets secondaires liés aux vaccins et
12,9% douteraient même de l’efficacité de la vaccination7. Les cas d’effets secondaires
recensés depuis les années 1970, entrainant souvent des retraits rapides des vaccins parle gouvernement japonais alors même que les liens entre effets observés et lavaccination n’étaient pas toujours avérés, sont sans doute à l’origine de cette crainte dela part des japonais vis à vis de la vaccination.
Ayant laissé s’introduire beaucoup moins de nouveaux vaccins sur son territoire que laplupart des autres pays développés dans les années 1990 et jusqu’au début des années
2000, le nombre des vaccins disponibles au Japon a augmenté lors de la dernière
décennie. Cependant, un décalage persiste encore aujourd’hui par rapport à d’autres
pays développés concernant la prévalence de certaines maladies infectieuses évitables
par la vaccination (oreillons, rubéole, rougeole), d’autant plus qu’avec une densité depopulation particulièrement élevée, les taux de vaccination de la population doivent êtresouvent plus élevés que dans les autres pays pour contenir les épidémies.
Bien que la loi cadre destinée à garantir la prévention des maladies transmissibles datede 1987, et que différents projets aient vu le jour jusque dans les années 1990, lesprogrammes de surveillance n’ont jamais vraiment eu de base légale avant 1999. Jusqu’à
cette date, les données collectées concernant les cas de maladies infectieuses sontrestées assez confinées et insuffisamment partagées à la fois entre le corps médical maisaussi au sein du public, entrainant un manque de motivation dans l’établissement derapport sur les maladies infectieuses au Japon. Ainsi, la surveillance de ces maladies alongtemps peu fonctionné comme outils du contrôle des maladies infectieuses, un point
important à souligner car les données de surveillance et d’épidémiologie orientent en
grande partie les politiques de recherche dans le domaine des maladies infectieuses.
7

Kuwabara N., et al. A Review of Factors Affecting Vaccine Preventable Disease in Japan. Hawaii J Med
Public Health. 2014.

11

En 1996, l’apparition d’infections entéro-hémorragiques causées par la souched’Escherichia coli 0157 à Sakai (Osaka) qui infecta plusieurs milliers de personnes, a
conduit à des changements dans la loi cadre de prévention des maladies transmissibles.
Complètement révisée et devenue l’Infectious Diseases Control Law en 1999, cettenouvelle loi introduisit pour la première fois le concept de « surveillance » dans la loi,
l’encadra et l’encouragea. La surveillance fut alors inscrite comme un pilier du contrôle
des maladies infectieuses.
Cette nouvelle loi pris par exemple en compte d’importants changements liés àl’organisation des villes, à l’habitat et à la répartition des populations, comme le besoind’un meilleur système d’évacuation des eaux usées pour réduire fortement les cas
d’infections liées aux eaux, ou encore la surveillance des systèmes d’air conditionné
propices au développement des infections transmises par l’air ou par des gouttelettes etsurtout l’augmentation accrue des risques de transmission provoquée par lamondialisation. Le risque élevé d’infections d’ordre alimentaire tout comme l’usage
fréquent et abusif des antibiotiques conduisant aux cas de résistance, sont également
des dangers que cette loi souhaita intégrer dans le contrôle des risques infectieux.
Enfin, même si cette loi a considérablement amélioré la surveillance des maladies
infectieuses et conduit à une diminution de l’incidence de la plupart d’entre elles après
1999, de nombreux enjeux infectieux demeurent encore aujourd’hui.
Les cas d’infections entéro-hémorragiques causées par E. Coli sont par exemple toujours
en hausse (4151 cas en 2014), de même que la légionellose (1248 cas) ou encorel’amibiase (1134 cas) pour la même année.
Certaines maladies sexuellement transmissibles sont également en progression commela syphilis qui a bondide 543 cas en 2005 à 1661 cas en 2014 ou le Virus del’Immunodéficience Humaine (VIH). Le rapport du NIID pour l’année 2015 fait état deprès de 1434 nouveaux cas de VIH recensés au Japon dont 30% à un stade Sida
(Syndrome d’Immunodéficience Acquise), signifiant que le dépistage tardif est encore unvrai problème au Japon8.

8

HIV/AIDS in Japan, 2015. Infectious Agents Surveillance Report. NIID.

12Le Japon, comme beaucoup d’autres pays développés, est conscient du fait qu’il doit
encore intensifier ses mesures de prévention des maladies infectieuses au niveau
national. D’autant plus qu’avec la population ayant l’espérance de vie la plus élevée aumonde et une part des plus de 65 ans qui ne cesse d’augmenter, le Japon est dans une
certaine mesure particulièrement vulnérable face aux risques infectieux, levieillissement de la population entrainant en effet une sensibilité accrue des personnesâgées face aux maladies infectieuses9.
Aussi, ce risque infectieux prend tout son sens dans un pays multi-dépendant de par son
aspect insulaire et donc au cœur de nombreux échanges mondialisés qui renforcent lecaractère transversal des menaces infectieuses.
Dans le 5ème plan cadre pour la science et la technologie mis en place par legouvernement japonais en 2016, le contrôle du risque infectieux est d’ailleurs annoncé
comme une priorité pour le pays. Ce plan préconise d’encourager et d’initier denouvelles coopérations internationales pour faire face à ce défi et n’hésite pas à afficher
l’ambition du Japon d’être un pays leader mondial dans la gestion des risques infectieux.

9

Elodie Crétel-Durand. Vieillissement du système immunitaire et sensibilité des personnes âgées aux
maladies infectieuses. Séminaire du Collège de France, 2013.

13

II- Les acteurs japonais de la recherche sur les maladies infectieuses
Pour la période 2006-2016, avec plus de 23 000 publications scientifiques, le Japon seclasse au 6ème rang mondial dans les domaines des Maladies infectieuses-MicrobiologieVirologie derrière les Etat-Unis, le Royaume-Uni, l’Allemagne, la Chine et la France.
Pour cette même période, 4 universités (Tokyo, Osaka, Hokkaido et Kyoto) et un institut
national, le NIID (National Institute of Infectious Diseases), ressortent en tête au regard
du nombre de publications scientifiques, comme l’illustre la représentation ci-dessous.
Cependant, d’autres universités et centres de recherche sont également dynamiques
notamment dans la coopération bilatérale avec la France, les pays de la zone ASEAN ou
encore les pays du continent Africain.

Principales universités et centres de recherche japonais impliqués dans la recherche sur les maladies
infectieuses, la virologie et la microbiologie en fonction du nombre de publications scientifiques de 2006 à
2016. Données InCites/Web of Science.

Plusieurs agences de financement et de coordination des programmes de recherche
encadrent la recherche sur les maladies infectieuses. Elles seront aussi détaillées dans lapartie suivante.

141) Les principales universités impliquées dans la recherche sur lesmaladies infectieuses

L’Institut des Sciences Médicales de l’Université de Tokyo (IMSUT)
Créé en 1892 par le Dr Kitasato Shibasaburō et anciennement connu comme l’Instituteof Infectious Diseases (IID), l’Institut des Sciences Médicales de l’Université de Tokyo(IMSUT) possède une forte expertise en immunologie. Il est composé d’un département
de microbiologie et d’immunologie au sein duquel la recherche sur les maladies
infectieuses s’étend sur 4 divisions : virologie, génétique des maladies infectieuses,
immunologie mucosale et virologie moléculaire.
L’essentiel de la recherche au sein de ce département couvre à la fois l’élucidation desinteractions moléculaires qui existent entre les pathogènes et leur hôte, les processus dereconnaissance par le système immunitaire mais aussi les mécanismes régulateurs de ladéfense immunitaire. Différents groupes de recherche travaillent en parallèle avec
chacun une thématique précise : infection bactérienne, infection virale, relation hôteparasite, immunologie cellulaire et moléculaire, immunité mucosale, modification
génétique chez l’hôte et régulation génique.
Cette recherche fondamentale a pour but d’apporter de nouvelles solutions dans laprévention et le contrôle des maladies infectieuses et des troubles du système
immunitaire. Elle s’appuie pour cela sur une collaboration avec d’autres groupes derecherche japonais mais aussi étrangers.

Le Research Center for Asian Infectious Diseases, soutenu par le programme J-GRIDde l’AMED dans le cadre du projet China-Japan Research Collaboration on Defense
against Emerging and Reemerging Infections, est un exemple de cette collaboration. Il
fait intervenir des chercheurs de l’IMSUT et des chercheurs chinois de l’Institute ofBiophysics et de l’Institute of Microbiology. Au sein de ces laboratoires conjoints, sontmenées des activités de recherche fondamentale et translationnelle concernant le VIH, lecoronavirus MERS, le virus de la dengue et le norovirus. L’IMSUT a également engagé unprogramme de recherche collaborative sur le virus de la grippe saisonnière avec leHarbin Veterinary Research Institute de l’académie chinoise des Sciences agricoles.
15

En 2011, l’IMSUT s’est doté d’un International Research and Development Center for
Mucosal Vaccine afin d’encourager la recherche multi-disciplinaire à l’échelle
internationale.
Ce centre a la particularité de mener une recherche fondamentale dans une disciplineémergente : la vaccinologie mucosale. Récemment, un vaccin contenant la sous-unité B
de la toxine cholérique, directement produit au sein de plants de riz modifiés (MucoRice
Cholera Toxin B subunit (CTB) vaccine), a été développé grâce à une recherche
interdisciplinaire en médecine, agronomie et ingénierie. Des premiers essais cliniquessont actuellement en cours.

Le 2 novembre 2016 a été signé l’accord général de coopération entre l’Institut Pasteurde Paris et la faculté de médecine de l’université de Tokyo. Il s’agit d’une première étape
vers la création d’une nouvelle unité internationale de recherche entre les deuxorganismes. Ce projet d’unité, issu du partenariat entre le Dr Hiroshi Kiyono (IMSUT,
International Research and Development Center for Mucosal Vaccine - Division of
Mucosal Immunology) et le Dr James Di Santo (Institut Pasteur), aura pour objectif demieux comprendre la complexité des réponses immunitaires face aux maladies
infectieuses en identifiant les paramètres et les biomarqueurs caractéristiques d’une
réponse immunitaire efficace et protectrice.
Enfin, l’IMSUT possède un International Research Center for Infectious Diseases
ouvert aux collaborations internationales et équipé d’un laboratoire de biosécurité deniveau 3 (BSL-3).

L’Université d’Hokkaido
Le Centre de Recherche pour le Contrôle des Zoonoses de l’Université d’Hokkaido
développe des mesures d’anticipation et de prévention des risques de zoonoses, d’abord
par le biais de la recherche fondamentale en identifiant les hôtes naturels porteurs de tel
ou tel pathogène puis en élucidant les voies de transmission et les facteurs impliqués
dans la propagation et la pathogénicité des maladies.

16Parmi les différents départements qui composent le centre de recherche, un est dédié à
la surveillance et au contrôle des zoonoses en Afrique australe (Hokudai Center for
Zoonosis Control in Zambia - HUCZCZ). L’ HUCZCZ sert de base de surveillance pourles études épidémiologiques en Afrique australe. Parmi les pathogènes suivis par celaboratoire de niveau 3, on trouve différents virus de la fièvre hémorragique(Arenavirus, Bunyavirus et Filovirus), l’influenza virus, les trypanozomes, le bacille deKoch (tuberculose), ou encore le bacille du charbon (anthrax).
Le Centre des Sciences Médicales et Environnementales (CEHS) de l’Universitéd’Hokkaido fait partie du réseau des centres collaboratifs de l’OMS pour la santé desenfants en lien avec leur environnement. Il prend part à de nombreux projets derecherche centrés principalement sur les populations vulnérables, dont les enfants, qui
s’intéressent aux effets néfastes que peuvent avoir certains environnements sur la santéet le développement de maladies infectieuses.
L’Institut de Médecine Génomique a été créé en 2000 et est le fruit de la réunion del’institut d’Immunologie et de l’Institut du cancer, le diagnostic et le développement denouvelles thérapies en réponse aux maladies infectieuses sont une de ses missions.

L’Université d’Osaka
Koan Ogata, médecin japonais qui fonda le plus grand hôpital dédié à la vaccination
contre la variole au Japon, est aussi à l’origine de l’école publique de médecine Tekijuku
en 1838 et qui devint un peu plus tard l’Université d’Osaka.
L’Université d’Osaka se distingue particulièrement dans le domaine de la recherche en
immunologie, où l’université est classée première nationale en termes de publications :elle comprend notamment l’Immunology Frontier Research Center (IFReC) qui, avec
un financement annuel de 3,5 milliards de yens (25 Millions d’euros), se caractérise parune recherche de haut niveau dans le domaine de l’immunologie. Il a été sélectionné
pour le programme d'initiative World Premier International (WPI) Research Center
initié par le Ministère de l'éducation, de la culture, des sports, des sciences et de latechnologie (MEXT) en 2007. Créés pour une durée de 15 ans, ces centres doivent
posséder un niveau de "visibilité mondiale" qui attire les meilleurs chercheurs du17

monde entier. C’est le cas de l’IFReC qui regroupe une vingtaine d’investigateurs
principaux (PI) reconnus en immunologie, à la fois japonais mais aussi internationaux.
Les scientifiques de l’IFReC s’intéressent à la compréhension de la dynamique dusystème immunitaire en utilisant notamment des techniques innovantes d’imagerie en
temps réel et de bio-informatique qui les renseignent sur le comportement des cellules
entre elles et les réseaux qu’elles créent. Ces informations contribuent à la fois à lacompréhension de la réponse des cellules-hôte face aux agents pathogènes mais aussi
face aux cellules cancéreuses.
L’Université de Kyoto
En octobre 2016, l’Institute for Virus Research et l’Institute for Frontier Medical
Sciences de l’Université de Kyoto ont été réunis pour former l’Institute for FrontierLife and Medical Sciences.
Cette fusion réunit deux instituts reconnus mondialement pour les avancées
scientifiques qu’ils ont apportées : c’est au sein de l’Institute for Virus Research qu’a été
identifié pour la première fois le virus T-lymphotropique humain, l’Institute for Frontier
Medical Sciences est quant à lui renommé pour ses recherches dans le champ de lamédecine régénérative. Le Professeur Yamanaka, Prix Nobel de Médecine ou Physiologie
2012, y a développé les cellules pluripotentes induites (cellules iPS) et les lymphocytes T
régulateurs y ont été découverts. Se basant sur le constat que la médecine régénérativeet la lutte contre les maladies infectieuses sont deux axes prioritaires de la recherchejaponaise, la réunion de ces deux instituts a pour ambition de construire une nouvellecommunauté de scientifiques et de faire émerger de nouvelles technologies médicales
pour faire face à ces défis.
Le Centre de Médecine Génomique de l’Université de Kyoto, s’intéresse aux gènes àl’origine de différentes maladies humaines et plus particulièrement aux variations qui
existent au sein de ces gènes entre différents groupes ethniques.

Le 2 novembre 2016, un accord de création d’une nouvelle unité internationale derecherche a été signé entre ce centre et l’Institut Pasteur de Paris. L’objectif de ce projet
est de constituer une unité mixte de recherche dans le domaine de la génétique des18maladies infectieuses basée sur une expertise complémentaire des deux laboratoires.
L’un des axes de recherche sera consacré à l’identification des molécules et de leurréseau impliqués dans la réponse immunitaire post-vaccination au virus de la grippe,
c’est-à-dire à la fois la réponse immunitaire innée et le développement des populations
de lymphocytes mémoires.
Cette unité est dirigée, côté japonais, par le Professeur Fumihiko Matsuda et côté Institut
Pasteur, par le Dr Anavaj Sakuntabhai.

L’Université du Tohoku
L’Université du Tohoku est composée d’un Department of Infection Control andLaboratory Diagnostics qui assure à la fois une activité de recherche fondamentale etclinique basée sur le contrôle des infections. Ce département fait partie du Regional
Infection Control Network créé en 2000 dont il assure le bon fonctionnement.
Le Department of Virology de l’Université du Tohoku mène de nombreuses recherches
concernant les maladies infectieuses notamment au-delà des frontières japonaises, aux
Philippines et en Mongolie.

Aux Philippines, l’Université du Tohoku et le Research Institute for Tropical Medicine(RITM), centre national de référence sur les maladies émergences et ré-émergentes,
collaborent au sein du RITM-Tohoku Collaborating Research Center on Emerging
and Reemerging Infectious Diseases. Cette coopération passe d’abord parl’identification d’agents pathogènes et l’analyse épidémiologique des maladies
infectieuses majeures afin d’assurer un contrôle durable de ces maladies aux
Philippines. Les deux pays mènent aussi des recherches en commun avec les hôpitaux etautres organisations locales mais aussi avec des pays étrangers. Lors de l’apparition du
SRAS ou du virus H1N1, le RITM a pleinement joué son role de laboratoire national deréférence.
La faculté de Médecine de l’Université du Tohoku et le RITM ont également initié leprojet "Comprehensive Etiological and Epidemiological Study on Acute Respiratory

19

Infections in Children » qui a pour objectif d’apporter une meilleure prévention et uncontrôle des cas de pneumonies au sein de la population infantile aux Philippines.
Cette collaboration bénéficie du soutien du programme SATREPS (Science andTechnology Research Partnership for Sustainable Development).

L’Université de Nagasaki
Initialement intitulé l’East Asia Research Institute of Endemics, l’Institut de Médecine
Tropicale (IMT) de l’Université de Nagasaki est uniquement dédié à la médecine
tropicale.
Il est divisé en 4 unités : Microbiologie et Parasitologie, Médecine clinique et Recherche,
Biologie de l’hôte et des vecteurs, et Santé Publique et Environnementale. Ses missions
concernent à la fois une partie recherche en médecine tropicale et en santé mondialeainsi qu’une partie enseignement particulièrement ouverte aux étudiants étrangers au
sein de 15 départements académiques dont : Virologie, Bactériologie, Parasitologie,
Médecine clinique, Immunogénétique, Epidémiologie, Santé Publique, Environnementsocial et Ecologie.
L’institut dispose de plusieurs programmes d’échange universitaire avec 8 instituts àl’étranger et possède deux stations de recherche en dehors du Japon :- le National Institute of Hygiene and Epidemiology à Hanoï au Vietnam ;- et le Medical Research Institute à Nairobi au Kenya.
L’institut a été désigné par l’OMS comme centre de référence pour les maladies
tropicales et l’émergence des maladies infectieuses et comme centre d’excellence au
premier rang de la recherche scientifique par le Ministère Japonais de l’Education, de laCulture, des Sports et de la Science et de la technologie en 1995.
Le campus de l’Université de Nagasaki a le projet d’héberger dans les années à venir unlaboratoire de bio-sécurité de niveau 4 (BSL-4). Il sera le premier du pays à fonctionner
dans un but de recherche fondamentale. Cette activité de recherche est prévue dedébuter à l’horizon 2020 concernant des agents hautement pathogènes et fortement
contagieux tels que le virus Ebola.

20

L’Institut Kitasato
L’Institut Kitasato pour les sciences de la vie a été créé en 1914 par le Dr Kitasato
Shibasaburō, auparavant directeur de l’IID. L’institut mène une activité de recherche
centrée sur le contrôle des infections (Department of Infection Control and
Immunology). Cette action s’articule autour de la compréhension des mécanismes duprocessus infectieux et l’étude des fonctions biologiques activées en réponse à une
infection. L’institut participe également au développement de molécules bioactives(Department of Drug Discovery Sciences).

Depuis 2003, l’Institut Kitasato coopère avec le centre pour la recherche et la production
de vaccins (POLYVAC) vietnamien, pour la production locale de vaccins contre larougeole d’abord et de vaccins combinés rougeole-rubéole secondairement.

La Faculté de Médecine de l’Université de Tsukuba
Le Département de biologie infectieuse concentre ses recherches sur lacompréhension des mécanismes moléculaires de réplication et de développement desbactéries, virus et des parasites. Les résultats obtenus sont également utilisés pour lamise au point de nouvelles thérapies et la création de micro-organismes génétiquement
modifiés en laboratoire et à usage médicale. Une importance particulière est donnée àl’étude des différences épidémiologiques selon les populations et à l’acquisition derésistances aux antibiotiques. Le pathogène Staphylococcus aureus est particulièrementétudié au sein du laboratoire. Le développement d’un nouveau system in vitro pourétudier l’environnement nasal est d’ailleurs un des axes de recherche au sein de celaboratoire.

212) Les centres de recherche publics sur les maladies infectieuses
Le National Institute of Infectious Diseases (NIID)Le National Institute of Infectious Diseases (NIID) est un important centre derecherche sur les maladies infectieuses, avec un rôle essential de surveillance et deprotection contre les maladies infectieuses à la fois endémiques mais aussi extérieurespar le biais de coopérations avec l’international.
Au sein du NIID, l’Infectious Disease Surveillance Center (IDSC) assure une expertisetechnique pour différentes maladies infectieuses. Il s’agit d’un centre investigateur desépidémies à la fois localement et au-delà des frontières japonaises. Il est également encharge de la surveillance des maladies évitables par la vaccination.
L’importante masse d’informations collectée par l’IDSC sur les maladies infectieuses
permet d’améliorer leur suivi et leur contrôle ainsi que la prévention.
En particulier, le NIID dispose d’un Centre de Recherche sur le virus de la grippesaisonnière qui assure à la fois une part de recherche fondamentale sur le virus, lemécanisme de développement de la maladie, mais aussi la mise au point de nouvelles
méthodes de diagnostic, et la recherche de nouveaux moyens de prévention ainsi quedes méthodes de traitement.
Il est également en charge du développement d’un ensemble de produits nécessaires aucontrôle qualité des antibiotiques et des vaccins, comme c’est le cas pour celui contre
influenza. Il est d’ailleurs également très impliqué dans les essais cliniques etl’évaluation de ce vaccin sur le plan national. Il a été désigné comme centre collaboratif
concernant l’influenza, laboratoire de référence H5 ainsi que laboratoire régulateur par
l’OMS.
Enfin, le NIID dispose depuis 1981 d’un laboratoire conçu selon le niveau de bio-sécurité
4 (BSL-4) mais qui, face à l’opposition des résidents voisins du laboratoire, a toujours
fonctionné comme un laboratoire de bio-sécurité de niveau 3. Cependant, après la crised’Ebola survenue en Afrique en 2014, le gouvernement japonais et les autorités locales
ont signé un accord visant à permettre au laboratoire de fonctionner comme un BSL-4.
Contrairement au projet de laboratoire à Nagasaki, le BSL-4 du NIID n’a pour l’heureaucune vocation à poursuivre une activité de recherche. Il permettra cependant de22

confirmer des cas d’infections par des pathogènes tels qu’Ebola et de déterminer legénotype exact du virus pour adapter au mieux les traitements.

Le National Center for Global Health and Medicine (NCGM)
Le National Center for Global Health and Medicine (NCGM), à Tokyo, regroupe deux
hôpitaux généralistes, pour un total de 1400 lits, et héberge le Centre Clinique Nationalde Référence sur les maladies infectieuses (Disease Control and Prevention Center),mais aussi un institut de recherche. Le premier assure à la fois le diagnostic, letraitement des patients ainsi que des mesures de prévention et de santé publique.
Le centre est également compétent sur les questions de coopération médicale
internationale ; il dispose d’un budget global de recherche en 2014 de 3,7 milliards deyens (26 M€).
L’activité de recherche se répartie au sein de différents départements : un départementdes maladies infectieuses, un département de médecine tropicale et spécialisé sur lamalaria, un centre de recherche sur les hépatites et l’immunologie, et un départementdes maladies réfractaires.
Le département des maladies infectieuses assure une surveillance de plusieurs
maladies, telles que la tuberculose, le VIH, les infections à Staphylococcus aureus (MRSA)et à Pseudomonas aeruginosa, avec un suivi particulier des souches résistantes et multirésistantes. Au-delà de son rôle d’investigation, il a d’autres objectifs, comme ledéveloppement de médicaments anti-tuberculose, l’élaboration de kit rapides dediagnostic pour les cas de tuberculose multi-résistants, le développement d’un anticorps
humain dirigé contre le virus SRAS, le développement d’un vaccin oral contre la forme
entéro-hémorragique d’E. coli O157:H7, le développement de nouveaux adjuvantsutilisant la toxine cholérique, ou encore le développement de modèles animaux pourl’étude des maladies émergentes et ré-émergentes.
Il est impliqué également à l’international dans l’étude épidémiologique du choléra dansplusieurs pays en développement.
Le centre de recherche sur les hépatites et d’immunologie participe audéveloppement de nouveaux outils de diagnostic et de médicaments pour les maladies23

du foie. Les axes de recherche menés au sein de ce département sont notamment l’étude
des réponses immunitaires dans les cas d’hépatites virales, le microenvironnement
cellulaire des hépato-carcinomes et le développement de vaccins contre les virus del’hépatite.
Le département de médecine génomique fonde sa démarche sur la spécificité del’association entre un pathogène et son hôte. Il participe ainsi à la collecte des génomesde patients infectés par des virus tels que ceux de l’hépatite B, C, E, le VIH ou HTLV-1 etles combine avec sa base de données de séquences des virus afin d’identifier denouveaux facteurs viraux ou hôtes associés à l’apparition ou la progression de lamaladie.
Le département de médecine tropicale concentre ses recherches, fondamentales,cliniques et épidémiologiques pour le contrôle de la malaria, des maladies tropicales etdes maladies infectieuses émergentes et ré-émergentes.

La coopération avec l’international est un paramètre clef de son action, notamment au
Laos où depuis 2013 aux côtés de l’Institut Pasteur, un projet de recherche SATREPS surle paludisme a vu le jour. Ce partenariat représente un financement par le Japon de 100
millions de yens par an sur 5 ans (soit un total d’environ 4,5 M€) et a abouti à la créationd’une nouvelle unité de recherche au sein de l’Institut Pasteur du Laos. L’objectif
principal

concerne

ledéveloppementdenouvelles

techniques

génétiquesd’épidémiologie pour lutter contre la propagation du paludisme mais aussi des maladies
tropicales négligées telles que la bilharziose (S. mekongi) et l’opisthorchiase (O.
viverrini).
Le département des maladies infectieuses dites réfractaires axe ses efforts dans lacompréhension de la pathogénicité de maladies infectieuses contre lesquelles lesthérapies habituelles sont inefficaces, tels que la forme VIH-1 multi-résistante et laforme VHB résistante. Ces recherches comprennent à la fois l’étude des mécanismes derésistance développés par les virus mais aussi le développement de nouvelles solutions
thérapeutiques.

24

Le RIKEN
L’institut RIKEN est une institution de recherche pluridisciplinaire qui existe depuis
1917 et est devenue indépendante en 2003, tout en restant sous tutelle – et en grandepartie subventionnée par – le ministère japonais en charge de la recherche (MEXT). Avec
un budget annuel de 85 milliards de yens (607 M€) en 2014 et rassemblant plus de3300 chercheurs, il s’agit d’un acteur majeur dans le paysage de la recherche japonaise.
Le RIKEN dispose d’une quinzaine de centres de recherche en sciences de la vie, dont laplupart sont situés dans la région de Tokyo et du Kansai.
Le Center for Integrative Medical Sciences (IMS) à Yokohama est né en 2013 de lafusion du Research Center for Allergy and Immunology (RCAI) et du Center for Genomic
Medicine (CGM). Disposant d’une quarantaine de laboratoires et d’un budget de 4
milliards de yens (28 M€) en 2014, ce centre rassemble environ 400 chercheurs dontl’immunologie fait partie des principaux domaines d’expertise.

3) Les agences et programmes de financement liés à la recherche surles maladies infectieuses
L’AMED10
La Japan Agency for Medical Research and Development (AMED) est une agencenationale créée en 2015 dédiée au financement de la recherche médicale et qui accorde
une attention particulière à la recherche fondamentale comme à ses applications.
La recherche sur les maladies émergentes et ré-émergentes fait partie des 9 domainesprioritaires financés par l’AMED. Parmi les 126 milliards de yens engagés par l’agenceen 2017, 6,5 milliards (environ 55 M€) ont été attribués à ce domaine avec pour objectifd’encourager en particulier la collecte d’informations sur la génétique des pathogènes
en lien avec l’identification de cibles potentielles pour le développement de nouveauxmédicaments.

10

http://www.amed.go.jp/en/aboutus/

25

L’AMED, très impliquée dans la collaboration avec l’international, finance un certain
nombre de programmes de recherche internationaux. Parmi eux, quatre sont consacrés
à la lutte contre les maladies infectieuses :- le volet Health research de l’e-ASIA Joint Research Program (e-ASIA JRP),- l’International Collaborative Research Program for tackling the Neglected
Tropical Diseases Challenges in African Countries (ICREP-NTDs)- la Japan Initiative for Global Research Network on Infectious Diseases (J-GRID)- le volet Infectious Diseases Control du programme Science and Technology
Research Partnership for Sustainable Development (SATREPS).
Les différents projets couverts par ces programmes font intervenir des institutions derecherche et des chercheurs dans 21 pays. Ciblant principalement l’Asie et l’Afrique, ces
projets seront détaillés dans la troisième partie de ce rapport.
L’AMED organise également des symposiums rassemblant des agences de financementsétrangères et des institutions de recherche d’autres pays dans le but d’identifier defutures pistes de recherche et d’initier de nouveaux partenariats scientifiques. L’agences’est par ailleurs engagée en février 2016 à améliorer le partage des données en lien
avec les crises sanitaires, en co-signant le « Statement on Data Sharing in Public Health
Emergencies », aux côtés des magazines scientifiques tels que le Science Journal et The
Lancet et d’autres parties prenantes telles que l’Institut Pasteur et la Fondation Mérieux
côté français ou encore l’AMED côté japonais.

L'Agence de Coopération Internationale du Japon (JICA)11
L'Agence de coopération internationale du Japon (JICA) coordonne l'aide publique
au développement du Japon. Elle a pour mission d’’encourager le développementéconomique et social des pays en développement et de promouvoir la coopérationinternationale. C’est une institution administrative indépendante depuis 2003.
Aux côtés de l’AMED, la JICA participe au financement du programme SATREPS. Prenant
en considération les besoins des pays développés, le programme SATREPS a été créédans le but d’apporter des réponses aux principaux enjeux mondiaux dans les domaines

11

https://www.jica.go.jp/english/our_work/thematic_issues/health/study.html

26

de l’environnement, des énergies renouvelables, des ressources naturelles, des risquesnaturels ou encore du contrôle des maladies infectieuses. Les projets vont de 3 à 5 ans.
La JICA alimente également la coopération à l’internationale par l’intermédiaire devolontaires. De 2006 à 2014, ils étaient 250 à être répartis dans les principales régions
du monde où les trois plus importantes maladies infectieuses, HIV/Sida, paludisme ettuberculose, font le plus de victimes.
Enfin, au-delà de ces 3 principales maladies infectieuses, la JICA se trouve aussi
impliquée dans la lutte contre les maladies émergentes et autres maladies parasitaires
en augmentation.

Le Global Health Innovative Technology Fund (GHIT Fund)12
Sponsorisé par le gouvernement japonais, des compagnies pharmaceutiques japonaises
et la fondation Bill & Melinda Gates, le fonds GHIT est le premier partenariat publicprivé japonais dans le domaine de la santé mondiale à investir dans le développement
de nouveaux médicaments contre les maladies tropicales négligées (NTDs) et autres
maladies infectieuses.
Ce système de partenariat vise à réduire la période de développement ainsi que les coûts
à travers une collaboration de proximité et très active entre les entreprises
pharmaceutiques, les universités et les instituts de recherche.
Créé il y a maintenant 5 ans, le fonds GHIT a investi à ce stade plus de 50 millions dedollars pour le développement de plus de 40 produits. En 2015, il a permis le lancement
de 6 essais cliniques : au Burkina Faso, en Bolivie, en Côte d’Ivoire, au Pérou, enTanzanie, en Thaïlande et en Ouganda, et 2 autres en 2016. La première molécule est
prévue d’achever son développement en 2018.
Au printemps 2017, l’entreprise japonaise Daiichi Sankyo a annoncé avoir identifié 3
séries de composés qui feront l’objet d’un développement afin de proposer de nouveauxmédicaments contre la leishmaniose et la maladie de Chagas dans le cadre d’un projet
co-financé par le fond GHIT.

12

https://www.ghitfund.org/

27

En 2015, le fonds GHIT a co-financé un projet de développement de vaccin candidat
contre la dengue (MVDVax) au stade préclinique à hauteur de 612 902 dollars. Ce vaccin,
qui a la particularité d’activer la réponse immunitaire humorale et cellulaire contre les 4sérotypes du virus simultanément, est le fruit d’un partenariat établi entre l’European
Vaccine Initiative, l’Université de Nagasaki, via le NEKKEN, et l’Institut Pasteur13.
Parmi les autres projets récemment soutenus par le fonds GHIT, le développement d’unvaccin pour prévenir l’émergence de la tuberculose chez les adolescents par deschercheurs de la Tokyo Medical and Dental University, le développement d’un vaccin
pour bloquer la transmission du paludisme par des chercheurs de l’université Ehime ou
encore la participation au financement d’un projet pour le développement et laproduction d’un vaccin abordable pour éradiquer la polio à hauteur de 38 millions dedollars par l’entreprise Takeda.
Le portfolio des différents projets soutenus actuellement par le fonds GHIT et ses
principaux partenaires industriels et académiques, que ce soit au stade de recherche
fondamentale, d’essais pré-cliniques ou cliniques, est présenté en annexe 2. Les autres
principaux projets concernant les maladies infectieuses menés récemment par lesindustriels pharmaceutiques japonais sont détaillés dans l’annexe 3.

13Preclinical development of MVDVax, a new dengue vaccine.
https://www.ghitfund.org/impact/portfolio/awpdetail/detail/71

28

III - Un pays engagé dans la lutte mondiale contre les maladies infectieuses

1) Un engagement de longue date pour améliorer la santémondiale
Le Japon bénéficie d’une longue expérience dans le soutien de projets de coopération,que ce soit en Asie et en Afrique, notamment dans le domaine de la santé. Dès 1963,
l’agence de coopération technique outre-mer (OTCA) proposait un programmed’apprentissage international pour le contrôle de la tuberculose. L’OTCA est ensuitedevenue la JICA qui a mis en œuvre de nombreux programmes pour améliorer l’accès
aux soins et les conditions sanitaires de pays en développement. Dans les années 1980,
la JICA a développé davantage ces actions pour le contrôle des maladies infectieuses en
Asie. Dans les années 1990, ses efforts se sont intensifiés en particulier dans la lutte
contre le VIH et la poliomyélite.
L’année 2000 est sans doute l’une des plus importantes dans l’histoire de l’engagement
du Japon à l’international dans la lutte contre les maladies infectieuses. A l’occasion dusommet des chefs d’Etats du G8 à Okinawa, le thème des maladies infectieuses y a été
inscrit à l’ordre du jour, l’Okinawa Infectious Diseases Initiative était lancée. Dans lafoulée, le gouvernement du premier ministre de l’époque, Ryutaro Hashimoto, a milité
activement pour la création d’un fonds mondial contre le VIH/Sida, la tuberculose et lamalaria.

29

En 2002, le Fonds Mondial a été instauré, le Japon en a été l’un des fondateurs et depuis
16 ans il en est toujours l’un des principaux donateurs, comme le montre le tableau cidessous14.

Dans son rapport World Health Statistics 2015, l’OMS rappelle que les maladies
infectieuses sont encore une cause très importante de mortalité dans les pays endéveloppement, en particulier parmi les enfants de moins de 5 ans, des infections qui
pourraient facilement se propager et atteindre l’archipel japonais notamment.
Face à ce constat, le MEXT a lancé la phase 1 du Program of Founding ResearchCenters for Emerging and Reemerging Infectious Disease de 2005 à 2009. Impliquant8 universités et 2 centres de recherche, ce programme avait pour vocation de (i) créer
une structure de recherche nationale encourageant la collecte de connaissances
fondamentales sur les maladies infectieuses, (ii) la mise en place de 13 centres derecherche extérieurs répartis dans 8 pays présentant un risque infectieux émergent ou
ré-émergent important, (iii) le développement d’un réseau actif entre la structure derecherche nationale et les centres de recherche internationaux, et enfin (iv) ledéveloppement de ressources humaines dans ce domaine15.

14

https://www.theglobalfund.org/media/1493/replenishment_2016japandonorsheet_report_en.pdf
Sumio Shinoda, et al. International collaborative research on infectious diseases by Japanese
universities and institutes in Asia and Africa, with a special emphasis on J-GRID. Biocontrol Sci, 2015.
1530

De 2010 à 2014, la phase II de ce projet fut instaurée sous la forme de la Japan Intiative
for Global Research Network on Infectious Diseases (J-GRID). Sept pays asiatiques(Philippines, Chine, Thaïlande, Indonésie, Inde, Vietnam, Myanmar) et trois pays
africains (Kenya, Zambie, Ghana) participèrent à ce projet. L’Asian-African Research
Forum on Infectious Diseases tenu au Japon annuellement depuis 2005 est l’occasion
pour chacun de ces centres collaborateurs répartis à travers le monde de présenter et departager leurs résultats. Si le nombre de publications présentées la première année était
faible, il avoisine désormais 100 articles publiés chaque année. Les axes de recherches
menés dans chaque centre collaboratif sont indépendants les uns des autres et couvrent
ainsi un large éventail de maladies infectieuses, cependant pour les publications 20122013 par exemple, plus de la moitié étaient consacrées aux virus avec d’abord influenza,puis le VIH et enfin le virus de la dengue.
En 2015, c’est au sein de l’AMED nouvellement créée, que la phase III de la J-GRID est
entrée en oeuvre. Cette nouvelle phase prend la forme d’une collaboration avec le NIID
dont les priorités sont la recherche sur influenza, la dengue, la résistance aux
antibiotiques et les maladies diarrhéiques. La tuberculose, le VIH, la pneumonie aigue del’enfant et le chikungunya constituent des cibles supplémentaires.
Par ailleurs, le Japon a proposé des actions concrètes face aux enjeux de santé mondialesoulevés lors des derniers sommets des chefs d’Etats du G7. En réponse au sommet de2015 tenu à Elmau en Allemagne, le Japon a notamment lancé le programme ICREPNTDs pour soutenir l’effort de R&D dans la lutte contre les maladies tropicales négligées
en Afrique, un programme soutenu par l’AMED. Il couvre à la fois des projets derecherche fondamentale et de développement de nouveaux médicaments, tout comme lamise en oeuvre de méthodes de diagnostic, de surveillance et de prévention. Les projets
de recherche concernant le déploiement de nouvelles politiques et d’actions de contrôle
des NTDs sont également encouragés par le programme. A l’issue de chacun de ces
projets, le programme ICREP-NTDs prévoit par ailleurs de continuer à promouvoirl’éducation et la formation des jeunes chercheurs africains localement.

31

Le tableau ci-dessous met en lumière les 8 maladies ciblées actuellement à travers leprogramme ICREP-NTDs de l’AMED parmi les 17 maladies désignées par l’OMS comme
NTDs à contrôler en priorité.
Liste des 8 maladies tropicales négligées (surlignées en couleur) cibléesà travers le programme ICREP-NTDs de l’AMED.

Enfin, en 2016, l’année du sommet des chefs d’Etats du G7 à Ise-Shima, le Japon a créé
son propre Plan d’Action Nationale de lutte contre la Résistance aux Antibiotiques,
conformément à l’une des recommandations adoptées à l’issue de ce sommet pour lutter
contre l’antibiorésistance. Ce sommet, pour son volet santé, a par ailleurs été l’occasionde voir émerger de nombreuses autres mesures ciblant les maladies infectieuses, que cesoit à travers l’appel au renforcement des systèmes de réponse aux crises sanitaires ou
encore via l’encouragement à intensifier l’effort de R&D notamment dans le domaine dela résistance aux antibiotiques et des NTDs.

322) … en Asie
Enregistrant le plus grand nombre de publications dans les domaines Maladies
infectieuses-Virologie-Microbiologie parmi les pays asiatiques sur les 20 dernières
années (plus de 40 500 publications, selon l’histogramme ci-dessous), le Japon est un
acteur clef de la recherche sur les maladies infectieuses en Asie.
Ses publications enregistrent par ailleurs le pourcentage de citations le plus élevé (plusde 87%), une place de plus en plus resserrée avec celle de la Chine, dont la progression
du nombre de publications dans ce domaine, en particulier ces dernières années, est très
forte. Rien que pour la période 2015-2016, la Chine a en effet affiché plus de 10 000
publications traitant des maladies infectieuses.

Pays de la zone Asie ayant produit le plus de publications scientifiques dans les domaines Maladies
infectieuses, Virologie et Microbiologie de 1996 à 2016. Données InCites/Web of Science.

Si le nombre des publications japonaises dans les domaines Maladies infectieusesVirologie-Microbiologie reste relativement constant chaque année, environ 2000
publications, les copublications Japon-ASEAN dans ce domaine sont à la hausse depuis
une vingtaine d’années, avec un rythme particulièrement élevé depuis ces 10 dernières
années.

33

Evolution du nombre de co-publications scientifiques Japon-ASEAN dans les domaines Maladies
infectieuses, Virologie et Microbiologie de 1996 à 2016. Données InCites/Web of Science.

Cette coopération Japon-ASEAN s’appuie notamment sur le volet Health Research de l’eAsia Joint Research Program, un programme soutenu par l’AMED et créé en juin 2012pour encourager des projets de recherche multilatérale en sciences et technologie entre
10 pays de la zone ASEAN et 8 autres pays dont le Japon fait partie. Le programme aégalement pour vocation de promouvoir le partage d’informations des bonnes pratiques
concernant la surveillance et le contrôle des maladies infectieuses, ainsi que l’échange
de jeunes chercheurs parmi les pays membres.
En principe, le Japon participe au financement du programme à hauteur de 156 000 à
312 000 dollars par projet par an sur une durée de trois ans.
Ci-après, les différents projets du volet Health Research du e-Asia Joint Research Program
initiés depuis 2013 pour lesquels le Japon est impliqué aux côtés d’autres pays
partenaires.

34

Le programme SATREPS, via son volet Infectious Diseases Control, même s’il ne cible pas
spécifiquement l’Asie, est l’autre outil important de coopération japonaise dans ce
domaine en Asie.
35

Ci-dessous, les projets de recherche sur les maladies infectieuses soutenus dans le cadre
du programme SATREPS. Parmi ces projets, deux impliquent comme partenaires desinstituts membres du réseau international des Instituts Pasteur, au Laos et au Vietnam.

36

En 2017, l’AMED et le NIH ont par ailleurs sélectionné 13 projets de R&D en réponse à
un appel à projets international portant sur les maladies infectieuses et la recherche en
immunologie. Parmi les lauréats figurent notamment l’Institut Pasteur au Vietnam etl’Université de l’Utah avec un projet collaboratif pour la surveillance du choléra basé surle développement d’un test de dépistage sur goutte de sang séché.
Si l’on s’intéresse un peu plus en détail à la place occupée par certains des pays
asiatiques dans cette coopération aux côtés du Japon, on remarque que pour la période
2015-2016, la Thaïlande a été le deuxième pays derrière les Etats-Unis à partager le plus
de publications (192) avec le Japon concernant les maladies infectieuses, lamicrobiologie et la virologie. La Chine, le Vietnam, la Corée du Sud et l’Indonésie sontégalement des partenaires scientifiques importants du Japon dans la lutte contre lesmaladies infectieuses.

Pays qui partagent le plus de de copublications scientifiques avec le Japon dans les domaines Maladies
infectieuses, Virologie et Microbiologie de 2015 à 2016. Données InCites/Web of Science.

La collaboration avec la Chine s’appuie notamment sur le projet Chine-Japon derecherche collaborative de défense contre les maladies infectieuses émergentes et réémergentes lancé en 2015 par l’AMED dans le cadre du programme J-GRID. Cette
collaboration a été décrite précédemment lors de la description des coopérations del’Institut des Sciences Médicales de l’Université de Tokyo (IMSUT) avec la Chine.

373) … et en Afrique
En Afrique, l’implication des chercheurs japonais dans la lutte contre les maladies
infectieuses n’est pas nouvelle. En 1927, le bactériologiste Hideyo Noguchi partait en
Afrique de l’Ouest pour y étudier la fièvre jaune dans un hôpital d’Accra, au Ghana.
Infecté lui-même par la maladie après avoir découvert le pathogène qui en était
responsable, il est le symbole des premières coopérations scientifiques japonaises avec
l’Afrique et est considérée comme un personnage très important au Japon, comme entémoigne son portrait que l’on retrouve sur les billets de mille yens.
En 1979, l’Institut Noguchi pour la Recherche Médicale (NMIMR) a été créé à Accra en sa
mémoire. Il emploie aujourd’hui plus de 334 personnes dont 49 chercheurs originaires
du Ghana, mais aussi du Japon, des Etats-Unis ou encore de France. En 2018, l’institut
intègrera une nouvelle installation, un centre de recherche avancée pour les maladies
infectieuses avec un laboratoire de biologie moléculaire conforme aux normes du niveau
3 de biosécurité.
Bien que moins nombreuses que dans la zone ASEAN, les copublications sur le continent
africain restent relativement importantes pour le Japon dans le domaine des maladies
infectieuses. Au cours des 20 dernières années, elles n’ont cessé d’augmenter commel’illustre le graphique ci-dessous.

Evolution du nombre de co-publications scientifiques Japon-Afrique dans les domaines Maladies
infectieuses, Virologie et Microbiologie de 1996 à 2016. Données InCites/Web of Science.

38

En Afrique, la coopération japonaise dans le secteur des maladies infectieuses s’inscrit
au coeur de plusieurs initiatives et fait intervenir de nombreux acteurs différents. Lesprincipaux projets de coopération en recherche menés en Afrique dans le domaine desmaladies infectieuses sont soutenus dans le cadre des programmes SATREPS et ICREPNTDs. Une carte de ces différents projets mis en œuvre depuis 2008 est présentée cidessous.

39

Le Japon est par ailleurs à l’origine d’une initiative majeure dans l’aide audéveloppement de l’Afrique.
En septembre 1992, seize Ambassadeurs japonais accrédités en Afrique subsaharienne,
au Royaume-Uni, aux Etats-Unis, et auprès des Nations Unies, se réunissaient à Tokyo
pour discuter de la nécessité d’une réunion internationale pour examiner la question dudéveloppement économique de l’Afrique. Aussitôt acceptée par le Gouvernement duJapon, cette proposition a été soumise puis adoptée à la 46ème session de l’Assemblée
Générale des Nations Unies, donnant naissance à la première Conférence Internationalede Tokyo pour le Développement de l’Afrique, la TICAD16.
En 2016, la TICAD s’est réunie pour la sixième fois et pour la première fois en Afrique, au
Kenya. Elle a mis en lumière les 3 grands défis émergents ayant eu un impact sur ledéveloppement de l’Afrique depuis la dernière conférence de 2013. Elle a également été
l’opportunité d’effectuer un bilan concernant les objectifs énoncés dans le Plan d’Action
de Yokohama (2013-2017), l’un des aboutissements de la 5ème TICAD fixant les objectifs
prioritaires à réaliser, notamment dans la lutte contre les maladies infectieuses17.
La surveillance et le contrôle de l’épidémie d’Ebola fut l’un deux. Cette crise sanitaire(2013-2014), en plus de causer des pertes humaines considérables en Afrique, a agi
comme un frein sur les activités socio-économiques des pays directement touchés parl’épidémie et a eu un grand impact sur le reste du continent.

La Global Research Collaboration for Infectious Disease Preparedness (GLoPIDR)18, dont fait partie l’AMED depuis 2015, est une initiative de coopération multipartite
lancée en 2013 par la commission européenne et les dirigeants des principalesorganisations internationales de la recherche biomédicale en réponse à la crise du virus
Ebola. Cette initiative a pour ambition de faciliter les échanges d’informations et depermettre une préparation concertée entre les pays en cas de crise infectieuse pour
assurer une réponse optimale dans les 48 heures.

16

http://www.mofa.go.jp/region/africa/ticad/
http://www.mofa.go.jp/mofaj/area/ticad/tc5/pdfs/tic5_mm_01_02_07.pdf
18
https://www.glopid-r.org/
17404)…où la France est un partenaire clef
Dans le domaine des maladies infectieuses, la France fait partie du Top 10 des pays qui
co-publient le plus avec le Japon comme l’illustre le graphique ci-dessous. La tête duclassement est occupée par les Etats-Unis, suivis par la Thaïlande et la Chine. Cependant,
parmi ce classement, c’est la France qui obtient de loin le pourcentage le plus élevé dedocuments cités (plus de 80%), témoignant de la qualité de ses co-publications avec leJapon dans ce domaine sur la scène internationale. L’impact normalisé de ces
publications est également de loin le plus haut puisqu’il atteint 3,6.

Place de la France parmi les pays qui partagent le plus de de copublications scientifiques avec le Japon
dans les domaines Maladies infectieuses, Virologie et Microbiologie de 2015 à 2016.
Données InCites/Web of Science.

41

Les co-publications franco-japonaises impliquant des partenaires dans des pays de lazone ASEAN sont importantes. Sur la période 2015-2016, le pourcentage de ces copublications franco-japonaises était de 16% dans le domaine des maladies infectieuses,
plaçant ainsi la France dans la moyenne en comparaison des autres pays qui publient leplus avec le Japon dans ce domaine. Seule la Corée du Sud se démarque plus nettement
avec une part à 27%.

Part des copublications avec les pays de la zone ASEAN
dans la collaboration avec le Japon (2015-2016)
30%
25%
20%
15%
10%
5%
0%
South
Korea

UK

China

CanadaFranceUSA

Germany*Les Pays représentés sont ceux qui affichent le plus de co-publications avec le Japon dans le domaine desmaladies infectieuses de 2015 à 2016, hors pays de la zone ASEAN. Données InCites/Web of Science.

L’Institut Pasteur, via son réseau international, est un partenaire important de lacoopération scientifique franco-japonaise impliquant des pays de la zone ASEAN, dans ledomaine des maladies infectieuses. En 2011 par exemple, aux côtés de l’Universitéd’Osaka et de l’Université de Ruykyu, l’Institut Pasteur de Nha Trang au Vietnam a prispart à un projet soutenu par le programme SATREPS pour élucider les mécanismes demulti-résistance bactérienne et limiter leur propagation. De même, depuis 2013, leNational Center for Global Health and Medicine (NCGM) et l’Institut Pasteur du Laos
collaborent sur un projet soutenu par le programme SATREPS concernant le paludisme
ainsi que des maladies tropicales négligées telles que la bilharziose (S. mekongi) etl’opisthorchiase (O. viverrini).

42

En Afrique, l’action du Japon pour lutter contre les maladies infectieuses s’inscrit au seind’une politique de soutien au développement et inévitablement elle rencontre les efforts
entrepris depuis longtemps par la France sur le continent.
Les deux pays partagent notamment une expertise scientifique reconnue dans ledomaine de la recherche en infectiologie. Sur la période 2015-2016, la collaboration
franco-japonaise impliquant l’Afrique représente ainsi 15% du total des copublications
de la France avec le Japon dans le domaine des maladies infectieuses, un pourcentage
que seul le Royaume-Uni dépasse légèrement, comme l’indique le graphique ci-dessous.

Part des copublications avec les pays africains dans la
collaboration avec le Japon (2015-2016)
16%
14%
12%
10%
8%
6%
4%
2%
0%
UK

FranceGermany Thailand

USA

China

South
Korea

* Les Pays représentés sont ceux qui affichent le plus de co-publications avec le Japon dans le domaine desmaladies infectieuses de 2015 à 2016. Données InCites/Web of Science.

La coopération franco-japonaise en Afrique s’est récemment dotée d’un cadre politiqueet institutionnel avec l’adoption en octobre 2015 du Plan Franco-Japonais pour leDéveloppement durable, la Santé et la Sécurité en Afrique19. Le volet santé visenotamment à renforcer la collaboration tripartite dans la lutte contre les maladies
infectieuses, avec le souhait de prendre comme exemple la coopération menée contrel’épidémie d’Ebola ainsi que la mobilisation conjointe dans le cadre du Fonds Mondial delutte contre le sida, la tuberculose et le paludisme. La France et le Japon se sontégalement accordés à cette occasion pour renforcer leurs partenariats, y compris dansles enceintes internationales, pour l’amélioration des systèmes de santé en Afrique, enfavorisant des solutions faisant appel à l’innovation.

19

http://www.mofa.go.jp/files/000103135.pdf

43

Le partenariat de coopération porté côté français par l’INSERM et côté japonais parl’Université St Luke et l’industriel Toyama (filiale de Fujifilm) est l’un de cespartenariats. L’essai clinique multicentrique mené en Guinée avec l'antiviral Favipiravir
est un exemple concret de cette coopération internationale dans la perspective d’untraitement contre le virus Ebola.

Extrait de la publication concernant l’essai multicentrique mené avec l’antiviral Favipiravir en Guinée etillustrant le nombre important de co-auteurs ayant contribué aux travaux de recherche.

Les partenariats établis avec le réseau international des Instituts Pasteur, qui ont été
détaillés précédemment, sont également des éléments clef de cette coopération
tripartite et continuent à se développer, à l’image de la mission exploratoire en 2016 dechercheurs japonais de la Dokkyo University à l’Institut Pasteur de Madagascar
soutenue par l’ambassade de France au Japon, pour étudier les possibilités decollaborations sur la schistosomiase (bilharziose).
Au cours de l’année 2017, une deuxième mission de ce type est prévue impliquant deschercheurs japonais de la Nagoya City University, du Translational Research InformaticCenter de Kobe et de l’Osaka University avec l’Institut Pasteur de Dakar sur le sujet deshépatites virales.

445) La résistance aux antibiotiques, un nouvel enjeu mondial
Au Japon aussi, la première prise de conscience de la résistance aux antibiotiques est
apparue avec l’émergence de cas de maladies nosocomiales lors d’hospitalisations dansles années 1980 et devenus de plus en plus nombreux avec l’augmentation des actes
chirurgicaux et le développement des dispositifs médicaux. Les cas principaux recensés
aujourd’hui concernent des infections bactériennes communes telles que Staphylococcus
aureus résistantes à la méthicilline, Enterococci résistantes à la vancomycine, pour lescocci gram(+) et Pseudomonas aeruginosa et différentes espèces d’Acinetobacter multirésistantes, pour les bacilles gram(-).
Ce problème grandissant n’est plus aujourd’hui uniquement associé aux établissements
médicaux, l’on parle d’infections résistantes acquises en collectivité. Les cas d’antibiorésistance sont aussi observés parmi les animaux soit suite au traitement d’une maladie
ou via l’alimentation contenant des antibiotiques et la transmission de ces souches àl’Homme pose un vrai problème de santé publique.
L’AMED est très impliquée dans la lutte contre la résistance aux antibiotiques. Elle fait
partie du Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance20 (JPIAMR)
depuis 2015. Tout comme le GLoPID-R, cette initiative lancée par l’Union Européenne
poursuit les mêmes objectifs mais concernant la lutte contre les organismes résistants
aux antibiotiques. Les pays membres de l’initiative partagent les bonnes pratiquesd’utilisation des antibiotiques, intensifient la surveillance coordonnée des résistances etse retrouvent lors de meeting.
Cette initiative s’inscrit dans le cadre du Plan d’Action Mondiale contre la Résistance
aux Antibiotiques engagé en 2015 par l’OMS. Ce plan d’action mondial reconnaît lanécessité de lutter contre l’antibio-résistance via l’approche «One Health». En prenant
en compte les besoins et défis spécifiques à chaque secteur impliqué, cette approche
multisectorielle guide l’élaboration de politiques et d’outils qui encouragent les efforts
des pays membres pour combattre l’antibio-résistance.
En 2016, lors du sommet des chefs d’Etats du G7 à Ise-Shima, ce sujet fut traité commeprioritaire, le Japon ayant même initié l’année précédente une taskforce nationale sur20

http://ec.europa.eu/dgs/health_food-safety/amr/docs/ev_20151022_co52_en.pdf

45

l’AMR (Anti-Microbial Resistance) impliquant à la fois le MHLW (ministère japonais dela santé, du travail et de la protection sociale) et d’autres ministères ainsi que son
propre Plan d’Action Nationale contre la Résistance aux Antibiotiques21, une
directive clairement engagée pour la promotion de la recherche et le développement sur
les résistances aux antibiotiques et leur contrôle dans les années à venir.
En octobre dernier, des chercheurs japonais financés par l’AMED ont participé au
JPIAMR workshop organisé à Oslo (“The interplay between AMR Surveillance andScience“) où plusieurs experts internationaux étaient présents pour échanger leursidées concernant la surveillance des souches résistances. Le Japon semble en effet
vouloir consolider le leadership en matière de politique globale de lutte contre l’antibiorésistance et promouvoir les collaborations avec l’internationale à ce sujet, en
particulier dans la région Asie-Pacifique.
De 2012 à 2017, le Japon a financé un projet au Vietnam, dans le cadre du programme
SATREPS, concernant le développement d’un système de surveillance et d’analyse descas de multi-résistance aux antibiotiques. Le Vietnam connait en effet une augmentation
dramatique des cas d’infections bactériennes multi-résistantes due notamment à une
utilisation abusive des antibiotiques dans le secteur médical et le milieu agroalimentaire
et des produits de la pêche. Ce projet de partenariat entre l’Université d’Osaka,l’Université du Ryukyu, le National Institute of Nutrition et l’Institut Pasteur de Nha
Trang, a donc pour but d’identifier les mécanismes d’infections et de mettre en évidence
les cas de mauvaise utilisation des antibiotiques et autres événements qui participent àla propagation de telles infections.
L’industrie pharmaceutique japonaise est également mobilisée sur le sujet. En 2014,
l’entreprise Otsuka a obtenu l’agrément par l’Agence européenne des médicaments del’utilisation de sa molécule Delamanid, pour le traitement de la tuberculose
multirésistante pulmonaire chez l’adulte. Elle est depuis distribuée dans plus de 45 pays.
En 2017, la molécule a été placée par l’OMS sur la liste des médicaments essentiels pourle traitement des cas de tuberculose MDR chez l’enfant et l’adolescent. Il s’agit dupremier nouveau médicament, depuis 50 ans, efficace contre la tuberculose.
21

http://www.mhlw.go.jp/file/06-Seisakujouhou-10900000Kenkoukyoku/0000138942.pdf?bcsi_scan_cabb249f18b09402=CNLxLrkwgAaB9wTES7pUcv/YPg8XAAA
AWV4rKQ==&bcsi_scan_filename=0000138942.pdf

46

Face à la résistance aux antibiotiques qui ne se limite plus aux infections communes,
c’est le cas par exemple des parasites vecteurs du paludisme qui sont devenus résistants
à l’artésunate et des cas de tuberculose multi-résistants aux traitements qui se
propagent à travers le globe, le Japon, qui dispose d’un système national de surveillancedes maladies nosocomiales particulièrement développé, a un rôle clef à jouer dans lastratégie de lutte contre les organismes résistants aux antibiotiques à l’échelle mondiale.

47

Conclusion et Perspectives
Relativement épargné au cours de son histoire par les grandes épidémies qui ont
marqué durablement les pays européens dont la France, il serait aisé de penser que leJapon ne dispose pas aujourd’hui de l’expérience acquise par ces pays au cours desprécédents siècles dans la lutte contre les maladies infectieuses.
Le Japon est pourtant l’un des principaux acteurs de cette lutte, sur le plan académiqueet clinique avec de grandes universités et instituts reconnus pour leur excellencescientifique en la matière, sur le plan politique avec plusieurs initiatives majeureslancées par le pays et sur le plan financier avec un budget conséquent dédié à larecherche sur les maladies infectieuses.
Particulièrement dynamique en Asie du Sud-Est et plus récemment en Afrique – les deux
principales zones d’émergence de maladies infectieuses –, où ses copublications n’ont
cessé d’augmenter ces 20 dernières années, le Japon est bien déterminé à renforcer son
rôle dans la surveillance et le contrôle des maladies infectieuses à l’échelle
internationale.
Militant fidèle de l’approche Global Health et régulièrement à l’initiative de nombreux
projets collaboratifs internationaux, le Japon représente un partenaire majeur aux côtésde la France dont il partage les valeurs de solidarité et d’universalité dans la lutte contre
les risques infectieux.
Avec une croissance démographique très forte – on estime à 2,4 milliards sa populationen 2050 –, dont une part importante de jeunes (40%) et une classe moyenne qui monte,
l’Afrique promet d’être un acteur encore plus important dans l’économie mondiale. Ceconstat signifie également que le continent africain sera plus que jamais confronté aux
problématiques épidémiologiques tout comme les pays avec lesquels il échangera.
En outre, avec l’urbanisation, qui atteindra très prochainement les 50% sur le continent,l’Afrique va devoir faire face à une concentration/accentuation de tous les paramètres
de risques. La prévalence de nombreuses maladies infectieuses augmentera très48

probablement, impliquant un effort accru de contrôle et de surveillance des risques
infectieux.
La crise Ebola de 2014, la plus sévère, la plus large et la plus longue de toutes les crises
depuis la découverte du virus, l’a d’ailleurs très bien démontré. Contrairement auxprécédentes crises, elle s’est propagée au travers des aires urbaines et des villes,
entrainant une transmission galopante en Guinée, au Libéria et en Sierra Léone.
La coopération scientifique internationale dans le domaine des maladies infectieuses est
donc plus que jamais nécessaire et l’excellence des recherches menées en France et au
Japon est une opportunité pour développer davantage les collaborations bilatérales
mais aussi tripartites, afin de soutenir la prévention et le contrôle de telles menaces sur
tous les continents.
Un autre enjeu de taille, autour duquel la France et le Japon ont grand intérêt à
développer des collaborations est la résistance aux antibiotiques. En 2016, 10 millions
de nouveaux cas de tuberculose ont été diagnostiqués dans le monde, dont 500 000 cas
résistant à plusieurs antibiotiques et conduisant à 250 000 décès. Toutes les infections
sont concernées et un rapport 2016 de la Banque Mondiale prévoit même qu’en 2050
l’impact de ces bactéries résistantes pourrait peser de 300 à 1000 milliards de dollars
sur les systèmes de santé et constituer la première cause de mortalité au monde.
A Ise-Shima en 2016, le Japon, assurant alors la présidence de l’événement, a réaffirmé
sa détermination à intensifier davantage les efforts de lutte contre l’antibio-résistance.
La même année, la ministre de la Santé française, Marisol Touraine, a créé une
délégation dédiée à l’antibio-résistance tout en rappelant qu’il s’agissait d’un sujet
prioritaire pour notre pays.
Dans les prochaines années, l’agenda japonais sera marqué par plusieurs événementsinternationaux qui seront l’occasion de renforcer son implication dans la lutte contre lesmaladies infectieuses. Le premier, en 2019, concernera la 7ème Conférence Internationale
pour le Développement de l’Afrique (TICAD VII) qui sera organisée au Japon avec denombreuses réunions ministérielles prévues en amont. Le second sera l’organisation desJeux Olympiques de 2020. Pour ce grand rendez-vous, le Japon a notamment développé
le projet Disease Information Innovation dont l’objectif est de détecter le plus
rapidement possible les cas de maladies infectieuses et de mettre en place un système49

de surveillance et de contrôle efficace des personnes malades. Deux événements à suivre
de près, le premier ayant un intérêt direct pour la coopération franco-japonaise en
Afrique, et le second pouvant constituer une expérience bénéfique à la France, pays
organisateur des Jeux Olympiques en 2024.

.

50

ANNEXE 1.
Calendrier de vaccination japonais au 1er octobre 2016. Source : NIID.

51

ANNEXE 2.
Portfolio des différents projets soutenus actuellement par le fonds GHIT et ses principaux partenaires
industriels et académiques, que ce soit au stade de recherche fondamentale, d’essais pré-cliniques
ou cliniques.

52

53

ANNEXE 3.
Principales initiatives récentes menées par les industriels pharmaceutiques japonais dans la lutte
contre les maladies infectieuses. Source : Japan Pharmaceutical Manufacturers Association (JPMA).

Eisai Co., Ltd.

Développement
d’antipaludiqueEisai est partenaire du programme de recherche de l’école deMédecine Tropicale de l’université de Liverpool pour le développement
de l’E209, un nouvel antipaludique. E209 pourrait être efficace contre
les parasites devenus résistants aux traitements à base d’artémisine.
Eisai mène également des recherches exploratoires pour trouver uncomposé capable d’inhiber sélectivement la fonction de GWT-1, uneprotéine cible de la maladie déjà identifiée par la compagnie.
Medicines for Malaria Venture (MMV) soutient ce projet de recherche.
Eisai fait également partie d’un projet de recherche avec le St. JudeChildren's Research Hospital et Medicines for Malaria dans l’objectif dedévelopper de nouveaux traitements rapidement efficaces, capables
d’agir en une seule fois et délivrant une protection durable. Une etude
Clinique de phase I est en cours au St. Jude Children's Research
Hospital.

Développement demédicament contre lafilariose

Eisai a initié des recherches en collaboration avec l’école de Médecine
Tropicale de l’Université de Liverpool pour identifier de nouvelles
molécules efficaces contre la filariose lymphatique et la cécité desrivières.

Eisai et l’initiative Drugs for Neglected Diseases ont signé un accord
Développement depour procéder à des essais cliniques avec l’antifongique E1224
médicament pour traiter le(fosravuconazole) pour le traitement du mycétome fongique, une desmycétome d’origine
maladies les plus négligées au monde, elle a été ajoutée à la liste desfongique
NTDs par l’OMS en 2016.

Participation à ladéclaration de Londres surles NTDs

Eisai a établi des partenariats internationaux de recherche public-privé
12 compagnies pharmaceutiques, la fondation Bill & Melinda Gates,
l’OMS, les gouvernements des Etats-Unis et du Royaume-Uni, laBanque Mondiale et d’autres gouvernements de pays où les NTDs sontendémiques. Eisai a également participé à la réalisation de ladéclaration de Londres pour venir à bout des NTDs d’ici 2020.

Programme pour limiter les Eisai est partenaire d’un programme sponsorisé par le fonds GHIT pourinfections dans les pays en identifier de nouveaux composés susceptibles de traiter le paludisme,54

développement (GHIT Fund la leishmaniose et la maladie de Chagas.
programs)
Eisai collabore avec le Sabin Vaccine Institute (Sabin), the Baylor
Développement de vaccins
College of Medicine et Aeras pour développer un vaccin contre lacontre la maladie de Chagas
maladie de Chagas. Ce projet porte sur un antagoniste du récepteur
et la Leishmaniose
TLR4, E6020.

Partenariat international
pour le développement denouveaux antipaludiques

Eisai participe au "Tuberculosis Drug Accelerator" ("TBDA"), un
partenariat dont le but est de mener des recherches pour ladécouverte de médicaments antipaludiques d’un nouveau genre,
agissant notamment en un mois seulement contrairement aux
traitements actuels qui durent plusieurs mois.

Projet R&D conjoint pour ledéveloppement demédicaments contre latuberculose et les NTDs

Eisai fait partie d’un projet de R&D pour le développement denouveaux medicaments contre les NTDs et la tuberculose aux côtés duBroad Institute, une infrastructure commune à l’université Harvard et
au Massachusetts Institute of Technology.

En tant que membre du "WIPO Research Consortium," Eisai fournit
Participation au "WIPO
des informations accessibles au public sur 7 molécules, afin qu’elles
Research Consortium" contre
profitent au développement d’autres médicaments pour traiter lesles maladies tropicales
maladies tropicales.

R&D de medicaments et
vaccins antipaludiques etcontre les NTDs

Développement demédicament contre lamaladie de Chagas

Eisai est engagé dans un accord R&D avec la fondation Oswaldo Cruz
au Brésil pour ciblant le paludisme et les NTDs. L’E6446, un
antagoniste du récepteur TLR9, est au centre de ce projet.
Aux côtés du groupe international à but non lucratif Neglected
Diseases initiative ("DNDi"), Eisai teste actuellement en étude cliniquede phase II l’E1224, une nouvelle molécule candidate contre lespathogènes responsables de la maladie de Chagas.

55

Takeda Co., Ltd.
Takeda Pharmaceutical est engagé dans le développement deDéveloppement demédicament contre la dengue. "DENVax" est un vaccin qui est
médicament contre la dengue efficace contre les 4 sérotypes du virus de la dengue. Il est
actuellement en étude clinique de phase II.

Développement
d’antipaludiqueProgramme pour limiter les
infections dans les pays endéveloppement (GHIT Fund
programs)

Nouveaux médicaments àdévelopper pour un“traitement idéal” de laleishmaniose viscérale

Takeda Pharmaceutical est engagé aux côtés de Medicines for
Malaria Venture (MMV) pour le développement de l’antipaludiqueDSM265 et la formulation de l’ELQ-300. DSM265 affiche déjà de bonsrésultats en étude clinique de phase I. Les attentes concernent
désormais surtout l’ELQ-300, qui agirait à petite dose.
Takeda Pharmaceuticals est partenaire d’un programme sponsorisé
par le fonds GHIT pour identifier de nouveaux composés susceptibles
de traiter le paludisme, la tuberculose, la leishmaniose, la maladie deChagas et la maladie du sommeil.

DNDi et Takeda collaborent pour identifier le meilleur candidat pourtraiter la leishmaniose viscérale.

Astellas Pharma Inc.
Astellas s’est engagé sans le développement d’une forme
Développement de formulations à
pédiatrique pour le traitement de la Schistosomiase à travers
usage pédiatrique pour le traitement un consortium incluant Merck, Lygature, le Swiss Tropical andPublic Health Institute, Farmanguinhos et Simcyp. Les essaisde la shistosomiasecliniques de phase II sont actuellement en cours.

Recherche collaborative avec le
National Institute of Advanced
Industrial Science and Technology(AIST) afin de trouver de nouveauxantiparasitaires actifs contre lamaladie de Chagas

Astellas mène une recherche collaborative avec l’AIST pouridentifier de nouveaux antiparasitaires contre la maladie deChagas. Sous cet accord, Astellas et l’AIST vont chercher àcomprendre quells genes sont cruciaux pour permettre lasurvie de Trypanosoma cruzi. Une fois que ces recherches
auront avancé davantage, un consortium mené par l’AIST sera
initié, réunissant plusieurs institutions de recherche afind’étendre l’étude d’édition du génome et la découverte denouveaux traitements contre la maladie de Chagas.

56

Avec le Tokyo Institute of Technology et l’université de Tokyo,
Astellas a développé la première base de données au mondeconsacrée à la découverte de nouveaux médicaments contre
les NTDs. Appelée "Integrated Neglected Tropical Disease
Database or "iNTRODB", cette base de données permet deDéveloppement d’une base dedonnées consacrée à la recherche de rassembler des informations provenant de diverses disciplines(génétique, biochimie, découverte de medicament,
médicaments ciblant les NTDs
physiopathologie…). Accessible gratuitement pour tous leschercheurs dans le monde, elle contribue à accélérer larecherche sur les NTDs.

Sumitomo Dainippon Pharma Co., Ltd.
Programme pour limiter les Sumitomo Dainippon Pharma est partenaire d’un programme
infections dans les pays en sponsorisé par le fonds GHIT pour identifier de nouveaux composésdéveloppement (GHIT Fund susceptibles de traiter le paludisme et la tuberculose.
programs)

Développement de vaccins
contre la tuberculose

Sumitomo Dainippon Pharma et le laboratoire Japan BCG ont établi
une joint venture, Create Vaccine Company. Leur programme dedéveloppement d’un nouveau vaccin contre la tuberculose, utilise une
nouvelle technologie de vecteur recombinant basé sur le virus parainfluenza humain. Ce programme est soutenu à travers le fonds GHIT
par le National Institute of Biomedical Innovation, l’Independent
Administrative Agency et Aeras. The vaccin repose sur l’induction del’immunité mucosale. En ciblant les muqueuses, il vise à empêcher lesbacilles de pénétrer à l’intérieur des poumons.

Shionogi & Co., Ltd.
Shionogi et ViiV Healthcare sont depuis longtemps engagés dans
un programme de R&D commun concernant le dolutegravir, unnouvel inhibiteur d’intégrase du VIH. Sous le nom de Tivicay®, lemedicament est désormais disponible à travers le monde.
Développement demédicaments contre le VIH

Triumeq®, une autre molécule qui combine cette fois ledolutegravir et deux inhibiteurs nucléosidiques de la transcriptase
inverse, l’abacavir et la lamivudine, a été approuvé en 2014 dansles cas d’infections par le VIH et est désormais dsiponible
mondialement.

57

Programme pour limiter les
infections dans les pays endéveloppement (GHIT Fund
programs)

Shionogi est partenaire d’un programme sponsorisé par le fonds
GHIT pour identifier de nouveaux composés susceptibles de traiterle la tuberculose, la leishmaniose et la maladie de Chagas.

Other japanese pharmaceutical companies.

Développement demédicaments contre latuberculose

Depuis plus de 30 ans, Otsuka Pharmaceutical est engagé dans larecherche et le développement de nouveaux traitements pour éliminer
la tuberculose. En 2014, l’entreprise a obtenu l’agrément par l’Agence
européenne des médicaments de l’utilisation de sa molécule
delamanid, pour le traitement de la tuberculose multirésistantepulmonaire chez l’adulte. Le médicament est depuis distribué dansplus de 45 pays. En 2017, la molécule a été placée par l’OMS sur la listedes médicaments essentiels pour le traitement des cas de Tuberculose
MDR chez l’enfant et l’adolescent.

Daiichi Sankyo est partenaire d’un programme sponsorisé par le fonds
GHIT pour identifier de nouveaux composés susceptibles de traiter lepaludisme et la tuberculose.

Programme pour limiter les
infections dans les pays endéveloppement (GHIT Fund
Kyowa Hakko Kirin participe en tant que partenaire affilié du fonds
programs)
GHIT.

Mitsubishi Tanabe Pharma fait partie du programme pour ladécouverte de molecules pour lutter contre la tuberculose et lepaludisme soutenu par le fonds GHIT.

58

59

Japonais représentés chassant la rougeole, Utagawa Yoshimori, 1862.

60