先端タンパク質結晶学研究グループ
Advanced Protein Crystallography Research Group
グループディレクター

横

山

茂

之

YOKOYAMA, Shigeyuki
ポストゲノム研究の中心的な役割を担う構造ゲノム科学・プロテオミクス研究を強く推進するために，理研における「理化学研究所構造プロテオミクス研究（RSGI）」が 2001 年度に発足された。先端タンパク質結晶学研究グループは，横浜研究所ゲノム科学総合研究センタータンパク質構造・機能研究グループと協力して，特に，世界最高の SPring-8 を利用した放射光結晶解析による機能ゲノミクスを目指した網羅的タンパク質立体構造解析事業の一翼を担っている。2002 年度より，国の事業であるタンパク 3000 プロジェクトの委託を受け，大規模プロジェクトの研究体制を整備し，所期目標を着実に達成してきた。世界最強の大型放射光施設 SPring-8 に，完全自動結晶回折測定を目指したタンパク質結晶解析用ビームライ
ンとして播磨研究所の物理グループによって建設された理研専用の構造ゲノムビームライン（BL26B1/B2）を利用しつつ，
タンパク質結晶構造解析をより早く，より効率的に完成するために必要な自動化要素技術開発に成功している。BL26B2 では SPring-8 サイト外から凍結サンプルを宅配便で受け付け、ビームラインオペレータがユーザーに代わって実験を行う「メールインデータ収集」によるビームライン実験を開始している。網羅的解析プログラムを推進してきて 4 年目に入り，今後さらに効率的に目標を達成するために，研究進捗状況に合わせ，単にタンパク質の多種多量かつ高速な構造解析を行うのみにとどまらず，構造解析に資するタンパク質の結晶化に関する先端的な研究開発を，他の研究室等と連携して積極的に実施する組織として，当先端タンパク質結晶学研究グループが存在している。より能率的に研究を進めるために、多量体タン
パク質構造解析研究チームを除く他のチームメンバーは、播磨研究所の他のいずれかの研究室を兼務している。重複を避けるため、本報告では「多量体」チームを除くチームはチームメンバーと発表業績の記述のみに留める。
The RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) (http://www.rsgi.riken.jp) was organized in 2001 to undertake astructural genomics and proteomics project at RIKEN. The Advanced Protein Crystallography Research Group has been focusing on
the project by SR crystallography as a part of RSGI together with the Protein Research Group, Genomic Sciences Center. The Ministryof Education, Culture, Sports, Science, and Technology (MEXT) started the National Project on Protein Structural and Functional
Analyses (NPPSFA or Protein 3000) in 2002. RSGI has been integrated into the project as one center of the program for comprehensive
studies. For structural genomics beam-lines at SPring-8, we have succeeded the R & D for automated SR crystallography to accelerate
and improve the methodology development including protein crystallization and beam-line robotics. In June 2005, we began theservices for data collection of crystallized samples which are sent by express mails from the outside

先端タンパク質結晶学研究グループ
Advanced Protein Crystallography Research Group

Staff
Head
Dr. Shigeyuki YOKOYAMAMembers
Dr. Seiki KURAMITSU
Dr. Yoshitsugu SHIRO
Dr. Kouji TAKIO
Dr. Katsuhide YUTANI

誌 上 発 表Publications[ 雑誌 ]（原著論文）＊印は査読制度がある論文誌
Pioszak A. A., Murayama K., Nakagawa N., Ebihara A.,
Kuramitsu S., Shirouzu M., and Yokoyama S. : "Structures ofa putative RNA 5-methyluridine methyltransferase, {¥it
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＊
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播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報

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播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報

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神谷 信夫, 沈 建仁 : "光化学系Ⅱ複合体の構造と機能",蛋白質 核酸 酵素 50, No. 10, pp.1174--1179 (2005).
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（その他）
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油谷 克英 : "タンパク質の安定性", 生物工学ハンドブッ
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口頭

発

表

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Li H., Inoue M., Yabuki T., Aoki M., Seki E., Matsuda T.,
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Yabuki T., Aoki M., Seki E., Matsuda T., Hirota H., YoshidaM., Tanaka A., and Yokoyama S . : "Solution structure of the
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Annual Meeting of Japanese NMR Society and The 1st
Asia-Pacific NMR Symposium , Yokohama , Nov. (2005).
Inoue K., Nagashima T., Hayashi F., Shirouzu M., Terada T.,
Kigawa T., Inoue M., Yabuki T., Aoki M., Matsuda T., Seki E.,
Hirota H., Yoshida M., Tanaka A., Ohara O., and Yokoyama
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44th Annual Meeting of Japanese NMR Society and The 1st
Asia-Pacific NMR Symposium , Yokohama , Nov. (2005).
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and Hirota H . : "Solution structure of two human Myb-likeDNA-binding domain repeats", 44th Annual Meeting ofJapanese NMR Society and The 1st Asia-Pacific NMR
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Kigawa T., Terada T., Shirouzu M., Yoshida M., Tanaka A.,
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Society and The 1st Asia-Pacific NMR Symposium ,Yokohama , Nov. (2005).
Hatta R., Hayashi F., Nagashima K., Kurosaki C., Qin X.,
Yoshida M., Shirouzu M., Terada T., Kigawa T., Inoue M.,
Yabuki T., Aoki M., Matsuda T., Seki E., Hirota H., Tanaka
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Meeting of Japanese NMR Society and The 1st Asia-Pacific
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Kigawa T., Inoue M., Yabuki T., Aoki M., Matsuda T., Seki E.,
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Saito K., Kiso Y., Yokoyama S., and Hirota H. : "Screening of
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Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM
2005) , Honolulu , USA , Dec. (2005).
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Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2005) ,Honolulu , USA , Dec. (2005).
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Katayama Y., Hayashi F., Kubo S., Yoshitani N., Sato K., Inoue
M., Yabuki T., Aoki M., Seki E., Matsuda T., Yoshida M.,
Shirouzu M., Terada T., Arakawa T., Carninci P., Kawai J.,
Hayashizaki Y., Osanai T., Tanaka A., Yokoyama S., andHirota H . : "Solution structure and functional analysis of ageneral transcription factor 2I domain in mouse TFII-I protein",International Chemical Congress of Pacific Basin Societies(PACIFICHEM 2005) , Honolulu , USA , Dec. (2005).
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横山 茂之: "タンパク質の網羅的構造・機能解析：理研プ
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新井 亮一, 新野 睦子, 杤尾 広子, 森田 鋭, 加茂 友美,
赤坂 領吾, 衛藤 夕夏, 林崎 良英, 木川 隆則, 寺田
貴帆, 白水 美香子, 横山 茂之: "Enhancer of
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黒谷 篤之, 外山 光俊, 新屋 直子, 上野 美恵子, 藤倉
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之: "タンパク質構造解析における構造ドメイン予測の高効率化の検討", 第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 , 6
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大西 哲, 富澤 忠, 小柴 生造, 井上 真, 木川 隆則, 横山 茂之: "構造ゲノム科学で見つかった第二のクラスの異型ホメオドメイン", 第5回日本蛋白質科学会年会 ,福岡 , 6月 (2005).
村山 和隆, 川添 将仁, 白水 美香子, 横山 茂之: "大腸菌由来リボヌクレアーゼインヒビターBarstarの結晶構造解析", 第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 , 6月
(2005).
斉藤 講平, 小柴 生造, 栃尾 尚哉, 井上 真, 白水 美香
子, 小原 収, 長瀬 隆弘, 林崎 良英, 田仲 昭子, 木川隆則, 横山 茂之: "哺乳類CAP-Glyドメインの網羅的立体構造決定の試み", 第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 ,6月 (2005).
横山 茂之: 第36回今堀フォーラム , 東京 , 6月 (2005).
荒川 孝俊, 片岡 慎吾, 河野 能顕, 神谷 信夫, 片山 葉子, 養王田 正文, 尾高 雅文: "Thiobacillus thioparus
由来チオシアネート加水分解酵素のX線結晶構造解析",
第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 , 6--7月 (2005).
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平成 17 年度 研究年報

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プロトフィラメントの解離・会合を圧力により制御する：高圧NMRを用いた研究", 第5回日本蛋白質科学会年
会 , 福岡 , 6--7月 (2005).
竹内 誠, 水口 峰之, 油谷 克英, 森 佳洋, 篠田 裕之,
河野 敬一: "リフォールディング初期中間体の立体構造", 第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 , 6--7月(2005).
高阪 諒子, 武田 理絵, 森 幸恵, 石井 亮平, 横山 茂之,
今野 美智子: "高度好熱菌由来メチオニルtRNA合成酵素のメチオニンの親和性に対するTyr225の効果", 第5回
日本蛋白質科学会年会 , (日本蛋白質科学会), 福岡 ,6--7月 (2005).
西尾 和也, 小笠原 京子, 森本 幸生, 月原 富武, 油谷
克英: "大腸菌トリプトファン合成酵素$\beta̲{2}$サブ
ユニットの安定化に果たす補酵素PLPの構造と物性からみた役割", 第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 , 6--7
月 (2005).
飯村 哲史, 小笠原 京子, 野田 康夫, 瀬川 新一, 油谷
克英: "超好熱菌由来のpyrrolidone carboxyl peptidaseの速度論的安定化のメカニズム", 第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 , 6--7月 (2005).

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播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報

大賀 拓史, 大橋 由明, 中川 紀子, 増井 良治, 曽我 朋
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近藤 寛, Hossain T., 安達 渉, 中井 忠志, 神谷 信夫,
増井 良治, 倉光 成紀, 鈴木 薫, 関口 武司, 竹中 章
郎: "{\it Thermus thermophilus} HB8がもつ２種類のE3(リポアミド脱水素酵素) のＸ線構造", 理研シンポジウ
ム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 , 8月 (2005).
岸下 誠一郎, 村山 和隆, 寺田 貴帆, 白水 美香子, 倉光成紀, 横山 茂之: "Crystal structures of the conserved
hypothetical proteins, TTHA0068 and TTHA0132, from{\it Thermus thermophilus} HB8", 理研シンポジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 ,播磨 , 8月 (2005).
村山 和隆, 中川 紀子, 村山 美幸, 海老原 章郎, 倉光成紀, 白水 美香子, 横山 茂之: "{\it Thermus
thermophilus} HB8および {\it Aeropyrum pernix} K1由来アミノアシルtRNA編集酵素の高分解能構造解析", 理
研シンポジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」
第4回連携研究会 , 播磨 , 8月 (2005).
新海 暁男, 柏原 愛子, 吉良 聡, 倉光 成紀, 横山 茂之:"{\it Thermus thermophilus} HB8株由来cAMPレセプター
タンパク質の生化学的性質", 理研シンポジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 ,8月 (2005).
仲野 徳, 粂井 麻希, 稲垣 栄二, 田中 智之, 新海 ふじ江, 倉光 成紀, 瀧尾 擴士, 新海 暁男, 横山 茂之:"{\it Thermus thermophilus} HB8由来TT0972タンパク質の構造", 理研シンポジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 , 8月 (2005).
岡崎 伸生, 仲野 徳, 粂井 麻希, 佐藤 伸哉, 満足 美穂,
倉光 成紀, 白水 美香子, 新海 暁男, 横山 茂之:"{\it Thermus thermophilus} HB8由来機能未知タンパ
ク質TT1045，およびTT1515のX線結晶構造解析", 理研シンポジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 , 8月 (2005).
保坂 俊彰, 村山 和隆, 村山 美幸, 寺田 貴帆, 白水 美
香子, 倉光 成紀, 横山 茂之: "高度好熱菌由来
TTHA1846-coenzymeA-Znの結晶構造解析", 理研シンポジ
ウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 , 8月 (2005).
新井 亮一, 西野 綾, 新野 睦子, 房富 絵美子, 長野 佳子, 加茂 友美, 河口 真一, 赤坂 領吾, 吉川 征子, 西本 まどか, 外山 光俊, 村山 和隆, 寺田 貴帆, 倉光成紀, 白水 美香子, 横山 茂之: "高度好熱菌由来機能未知タンパク質TTHA0516(TT1772)とTTHA1568(TT1639L)のＸ線結晶構造解析", 理研シンポジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 , 8月
(2005).
伊東 夏織, 新井 亮一, 房富 絵美子, 加茂 友美, 河口
真一, 赤坂 領吾, 寺田 貴帆, 倉光 成紀, 白水 美香子,

横山 茂之: "高度好熱菌由来機能未知タンパク質
TTHA0727(TT1628)のX線結晶構造解析", 理研シンポジウ
ム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 , 8月 (2005).
横山 茂之: "転写翻訳系", 理研シンポジウム「高度好熱菌
丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 , 8
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横山 茂之: "構造プロテオミクスの現状と将来への展望",
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スの基礎と応用」 , 長野 , 8月 (2005).
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横山 茂之: "タンパク質研究の将来と高性能コンピューテ
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ンピュータとシミュレーションの革新」 , 東京 , 9月
(2005).
神谷 信夫, 内藤 久志, 大熊 章郎, 川上 恵典, 古瀬 宗則, 西條 慎也, 逸見 隆博, 中里 勝芳, 宮原 郁子, 沈
建仁: "光合成系Ⅱ膜蛋白質複合体結晶のX線回折能改良の試みと構造精密化", 文部科学省科学研究費補助金特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第1回ワークショップ , 淡路 , 9月 (2005).
森久保 典子, 坂本 健作, 福田 頼之, 大竹 和正, 新屋
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神谷 信夫, 内藤 久志, 古瀬 宗則, 逸見 隆博, 大熊 章郎, 川上 恵典, 西條 慎也, 沈 建仁: "Crystal
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大会 , 神戸 , 10月 (2005).
王 宏飛, 堀 千重, 村山 和隆, 中山 亮子, 関根 俊一,
寺田 貴帆, 白水 美香子, 横山 茂之: "Crystal
Structure of {\it Thermus thermophilus} elongation
factor EF-G-2 in the GTP form", 第78回日本生化学会
大会 , 神戸 , 10月 (2005).
近藤 寛, Hossain T., 安達 渉, 中井 忠志, 神谷 信夫,
増井 良治, 倉光 成紀, 鈴木 薫, 関口 武志, 竹中 章
郎: "{\it Thermus thermophilus}由来の2種類のE3（リポアミドデヒドロゲナーゼ）の結晶構造", 第78回日本生化学会大会 , 神戸 , 10月 (2005).
赤坂 一之, 鎌足 雄司, 横山 茂之, 橘 秀樹:"Pressure-jump NMR study of dissociation andassociation of amyloid protofibrils", 第78回日本生化学会大会 , 神戸 , 10月 (2005).
横山 茂之: "Protein Structural Genomics/Proteomics
Research", 第78回日本生化学会大会 , 神戸 , 10月(2005).

播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報

末武 徹也, 林 文晶, 白水 美香子, 寺田 貴帆, 木川 隆
則, 井上 真, 矢吹 孝, 青木 雅昭, 松田 貴意, 関 英子, 廣田 洋, 好田 真由美, 田仲 昭子, 林崎 良英, 横山 茂之: "タイトジャンクション結合タンパク質TJP2のN
末端PDZドメインの溶液構造解析", 第43回日本生物物理学会年会 , 札幌 , 11月 (2005).
大西 哲, 栃尾 尚哉, 佐藤 真奈美, 小柴 生造, 行木 信
一, 井上 真, 木川 隆則, 横山 茂之: "Solution
structure of the SH3 domain of the human SRC-likeadopter protein (SLAP) reveals a novel molecular
recognition mechanism", 第43回日本生物物理学会年会 ,札幌 , 11月 (2005).
飯村 哲史, 梅嵜 太郎, 八木 宏昌, 小笠原 京子, 阿久津秀雄, 野田 康夫, 瀬川 新一, 油谷 克英: "NMRによる超好熱菌由来蛋白質の異常に遅いフォールディング機構の解明：NMRスペクトルの帰属とHD交換反応", 第43回日本
生物物理学会年会 , 札幌 , 11月 (2005).
栃尾 尚哉, 笹川 彩, 小柴 生造, 井上 真, 木川 隆則,
横山 茂之: "Solution structures of six fibronectin
type III domains of human", 第43回日本生物物理学会
年会 , 札幌 , 11月 (2005).
竹内 誠, 水口 峰之, 河野 隆英, 大木 進野, 油谷 克英,
森 佳洋, 篠田 裕之, 河野 敬一: "ＮＭＲによる超好熱菌由来のPyrrolidone carboxyl peptidaseのリフォール
ディング中間体に関する研究", 第43回日本生物物理学会年会 , 札幌 , 11月 (2005).
前野 覚大, 鎌足 雄司, 横山 茂之, 赤坂 一之: "高圧$^{1}$H-NMRと高圧蛍光測定法を用いて観測した鶏リゾ
チームの構造ゆらぎ", 第43回日本生物物理学会年会 ,札幌 , 11月 (2005).
由本 富巳, 岡村 哲至, 高橋 雅人, 保母 史郎, 井上 浩
司, 三木 孝史, 濱田 衛, 横山 茂之, 前田 秀明:"500MHz NMRにおける4K極低温プローブの開発", 2005年度秋季低温工学・超電導学会 , 新潟 , 11月 (2005).
福崎 智数, 横山 茂之, 前田 秀明, 松本 真治, 二森 茂
樹, 木吉 司: "高磁場NMRに用いるNb$̲{3}$Al超伝導線材の超伝導接続方法", 2005年度秋季低温工学・超電導学会 ,新潟 , 11月 (2005).
Tokmakov A. A., 寺澤 ゆみこ, 白水 美香子, 横山 茂之:"Differential expression of multiple it $Xenopus$ PDK
family genes during oogenesis, maturation,
fertilization, and early embryogenesis", 第28回日本
分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
李 華, 井上 真, 矢吹 孝, 青木 雅昭, 関 英子, 松田 貴意, 布川 絵未, 元田 容子, 小林 敦夫, 寺田 貴帆, 白
水 美香子, 小柴 生造, 林 意然, Guentert P., 鈴木 治
和, 林崎 良英, 木川 隆則, 横山 茂之: "Solution
Structure of the Mouse Enhancer of Rudimentary Protein
Reveals a Novel Fold", 第28回日本分子生物学会年会 ,福岡 , 12月 (2005).
佐藤 敦子, 武藤 裕, 桑迫 香奈子, 白水 美香子, 寺田
貴帆, 木川 隆則, 井上 真, 永田 崇, 鈴木 咲良, 染谷

龍彦, 津田 健吾, 高橋 征三, 菅野 純夫, 横山 茂之:"Solution structure of the RNA recognition motif(RRM)
of human SF3b49/SAP49", 第28回日本分子生物学会年会 ,福岡 , 12月 (2005).
永田 崇, 武藤 裕, 白水 美香子, 寺田 貴帆, 井上 真,
木川 隆則, 林崎 良英, 横山 茂之: "Structural
analysis of Mouse Poly(A)-specific Ribonuclease", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
柴田 理恵, 別所 義隆, 西本 まどか, 房富 絵美子, 寺田
貴帆, 白水 美香子, 横山 茂之: "Aquifex tRNA
(mnm$^{5}$s$^{2}$U34) 修飾酵素MnmC2のX線結晶構造解析", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月(2005).
染谷 龍彦, 武藤 裕, 井上 真, 木川 隆則, 寺田 貴帆,
白水 美香子, 菅野 純夫, 横山 茂之:"Arginine/serine-rich splicing factor 10のRRM領域の構造解析", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月(2005).
嶋田 睦, 丹羽 英明, 寺田 貴帆, 白水 美香子, 田仲 昭子, 長瀬 隆弘, 小原 收, 横山 茂之: "BAF複合体サブユ
ニットhBAF250bのAT-rich interaction domain (ARID) の結晶構造解析", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 ,12月 (2005).
志田 明里, 高木 哲雄, 白水 美香子, 横山 茂之: "BAGドメインのアポトーシス抑制能の構造生物学的手法による解明", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月(2005).
葛西 卓磨, 木川 隆則, 森 浩禎, 林崎 良英, 横山 茂之:"BolAタンパク質の立体構造と機能の解析", 第28回日本
分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
仙石 徹, 横山 茂之: "DEAD-box RNA helicaseの反応機構", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
胡桃坂 仁志, 藤川 乃り映, 香川 亘, 朴 三用, 尾崎 省
吾, 片山 勉, 横山 茂之: "DnaAタンパク質の立体構造と複製開始のメカニズム", 第28回日本分子生物学会年会 ,福岡 , 12月 (2005).
松本 知子, 海津 陽子, 脇山 素明, 横山 茂之:"Drosophila S2細胞におけるlet-7 microRNAによる翻訳
抑制", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月(2005).
海津 陽子, 脇山 素明, 横山 茂之: "HEK293細胞由来の無細胞タンパク質合成系の開発", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
倉谷 光央, 石井 亮平, 別所 義隆, 福永 流也, 仙石 徹,
白水 美香子, 関根 俊一, 横山 茂之: "tRNA アデノシ
ンデアミナーゼ (TadA) のX線結晶構造解析", 第28回
日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
川添 将仁, 堀 千重, 上西 達也, 末次 京子, 白水 美香
子, 横山 茂之: "{\it Aeropyrum pernix} K1のBrixドメ
インタンパク質の構造解析", 第28回日本分子生物学会
年会 , 福岡 , 12月 (2005).

播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報

石井 亮平, 皆川 麻子, 高久 洋暁, 高木 正道, 梨本 正之, 横山 茂之: "{\it Thermotoga maritima}由来tRNase
ZのX線結晶構造解析", 第28回日本分子生物学会年会 ,福岡 , 12月 (2005).

西本 まどか, 別所 義隆, 村山 美幸, 中山 亮子, 寺田
貴帆, 白水 美香子, 横山 茂之: "古細菌におけるtRNAス
プライシングの基質認識機構", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).

黒谷 篤之, 外山 光俊, 新屋 直子, 上野 美恵子, 藤倉
由紀子, 矢吹 孝, 白水 美香子, 木川 隆則, 横山 茂
之: "タンパク質構造解析における構造ドメイン予測の高効率化の検討", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 ,12月 (2005).

董 雪松, 別所 義隆, 柴田 理恵, 白水 美香子, 倉光 成紀, 横山 茂之: "高度好熱菌 {\it Thermus
thermophilus} HB8由来のPseudouridine synthase I（TruA）のX線結晶構造解析", 第28回日本分子生物学会
年会 , 福岡 , 12月 (2005).

斉藤 講平, 井上 真, 小柴 生造, 長瀬 隆弘, 小原 收,
木川 隆則, 横山 茂之: "ヒトIQGAP1のC末端ドメインについてのNMR解析", 第28回日本分子生物学会年会 , 福
岡 , 12月 (2005).

舛谷 真美子, 森野 重信, 久武 幸司, Sonenberg N., 横山茂之, 今高 寛晃: "真核細胞翻訳開始因子eIF3の再構成", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).

香川 亜子, 香川 亘, 柴田 武彦, 胡桃坂 仁志, 横山 茂
之: "ヒトRad52タンパク質のhomologous pairingのメカ
ニズム", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月(2005).
皿井 直敬, 香川 亘, 田中 耕三, 宮川 清, 胡桃坂 仁志,
横山 茂之: "ヒトRad54Bタンパク質の機能解析", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
榎本 りま, 杵渕 隆, 佐藤 真, 八木 秀司, 胡桃坂 仁志,
横山 茂之: "ヒトTBPIP/Hop2-Mnd1複合体によるDNA鎖交
換反応の活性化", 第28回日本分子生物学会年会 , 福
岡 , 12月 (2005).
鈴木 咲良, 武藤 裕, 栃尾 尚哉, 井上 真, 木川 隆則,
寺田 貴帆, 白水 美香子, 菅野 純夫, 横山 茂之: "ヒトミトコンドリアリボソームL17の溶液構造", 第28回日本
分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
津田 健吾, 武藤 裕, 白水 美香子, 寺田 貴帆, 井上 真,
木川 隆則, 菅野 純夫, 横山 茂之: "ヒト由来CUG-BP1
におけるRBD3のNMR法による立体構造解析", 第28回日
本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
笹沼 麻貴, 胡桃坂 仁志, 横山 茂之: "ヒト由来ヒストン
H2AXを用いたヌクレオソームの再構成", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
三上 暁, 小林 富成, 横山 茂之, 今高 寛晃: "ヒト由来細胞を用いた無細胞タンパク質合成による糖タンパク質合成の効率化", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12
月 (2005).
杵渕 隆, 長島 真樹, 香川 亘, 榎本 りま, 滝沢 由政,
横山 茂之, 高田 穣, 胡桃坂 仁志: 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
中村 祥浩, 中野 和民, Padmanabhan B., 横山 茂之: "マウスガンキリンとS6ATPase（26Sプロテアソーム・サブユニット）複合体のX線結晶構造解析：pRbとの相互作用の生物学的重要性", 第28回日本分子生物学会年会 , 福
岡 , 12月 (2005).
伊良波 史枝, 坂本 健作, 横山 茂之: "遺伝暗号拡張のための大腸菌内在性チロシルtRNA合成酵素の置換", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).

坂本 健作, 松元 明子, 横山 茂之: "動物細胞におけるサプレッサーtRNAの誘導発現系", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
樋野 展正, 小林 隆嗣, 松元 明子, 坂本 健作, 横山 茂
之: "動物細胞内での非天然型アミノ酸のタンパク質への部位特異的導入と細胞内タンパク質間相互作用解析への応用", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月(2005).
平松 久和, 大野 敏, 横川 隆志, 伊良波 史枝, 坂本 健
作, 横山 茂之, 細谷 孝充, 平松 俊行, 鈴木 正昭, 田
中 信忠, 中村 和郎, 芳本 忠, 西川 一八: "部位特異的
ブロモチロシン導入7-$\alpha$HSDHの大腸菌生細胞内での発現と立体構造解析", 第28回日本分子生物学会年会 ,福岡 , 12月 (2005).
小林 富成, 三上 暁, 横山 茂之, 今高 寛晃: "無細胞タン
パク質合成系を用いたウイルスの生合成", 第28回日本
分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
坂本 健作, Chumpolkulwong N., 松元 明子, 伊良波 史枝,
新屋 直子, 松田 夏子, 木賀 大介, 漆畑 晶子, 白水
美香子, 木川 隆則, 横山 茂之: "無細胞翻訳系におけるレア・コドンの翻訳効率の解析", 第28回日本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
Ihsanawati., 村山 和隆, 白水 美香子, 倉光 成紀, 横山
茂之: "Crystal Structure of a Hypothetical Protein
TT1823", 理研シンポジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 , 12月 (2005).
岡崎 伸生, 菅原 光明, 仲村 勇樹, 田中 智之, 粂井 麻希, 宮野 雅司, 横山 茂之: 第6回計測自動制御学会シ
ステムインテグレーション部門講演会(SI2005) , 熊本県
西合志町 , 12月 (2005).
東浦 彰史, 宮崎 直幸, 内藤 久志, 萩原 恭二, 大村 敏
博, 神谷 信夫, 月原 富武, 中川 敦史: "高分解能X線結晶構造解析を目指したイネ萎縮ウイルスの結晶化", 日
本結晶学会2005年度年会および総会 , 姫路 , 12月(2005).
淺田 征彦, 澤野 雅英, 小笠原 京子, 中村 順司, 太田
元規, 黒石 千寿, 菅原 光明, 油谷 克英, 国島 直樹:"X線構造解析と示差走査熱量測定(DSC)を用いた高度好熱菌{\it Thermus thermophilus} HB8 由来トリプトファ

播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報

ン合成酵素$\alpha$サブユニットの安定化機構の検討",
日本結晶学会2005年度年会および総会 , 姫路 , 12月(2005).
Malay A. A., 梅原 崇史, 田仲 昭子, 堀越 正美,
Padmanabhan B., 横山 茂之: "The structure of Asf1
protein from S. pombe in complex with a histone H3
C-terminal peptide", 日本結晶学会2005年度年会および総会 , 姫路 , 12月 (2005).
村山 和隆, 村山 美幸, 中川 紀子, 海老原 章郎, 倉光成紀, 白水 美香子, 横山 茂之: "Trans-editing enzyme
ProXにおけるアミノ酸認識機構の解明", 日本結晶学会
2005年度年会および総会 , 姫路 , 12月 (2005).

パク3000プロジェクト 第3回産学連携フォーラム , 東
京 , 2月 (2006).
沈 建仁, 内藤 久志, 古瀬 宗則, 西條 慎也, 大熊 章郎,
川上 恵典, 逸見 隆博, 神谷 信夫: "光化学系II複合体の構造解析の現状と展望", 第47回日本植物生理学会年
会 , つくば , 3月 (2006).
大熊 章郎, 川上 恵典, 古瀬 宗則, 西條 慎也, 内藤 久
志, 逸見 隆博, 神谷 信夫, 沈 建仁: "好熱性シアノバ
クテリア{\it Thermosynechococcus vulcanus}由来PSII
結晶のＸ線結晶学的品質の改良", 第47回日本植物生理学会年会 , つくば , 3月 (2006).

構造解析高度化研究チーム
岡崎 伸生, 仲野 徳, 粂井 麻希, 佐藤 伸哉, 満足 美穂,
倉光 成紀, 白水 美香子, 新海 暁男, 横山 茂之:"{\it Thermus thermophilus} HB8由来機能未知タンパ
ク質TT1045、および TT1515のX線結晶構造解析", 日本
結晶学会2005年度年会および総会 , 姫路 , 12月(2005).

Protein Crystallographic Methodology Team

Staff
Head

保坂 俊彰, 村山 和隆, 村山 美幸, 寺田 貴帆, 白水 美
香子, 倉光 成紀, 横山 茂之: "高度好熱菌（{\itThermus thermophilus}）由来TTHA1846-coenzyme A-Znの結晶構造解析", 日本結晶学会2005年度年会および総会 ,姫路 , 12月 (2005).

Dr. Shigeyuki YOKOYAMA近藤 寛, ホセイン トファザル, 安達 渉, 中井 忠志, 神谷 信夫, 増井 良治, 倉光 成紀, 鈴木 薫, 関口 武司,
竹中 章郎: "Two different E3s(lipoamide
dehydrogenases) of 2-oxoacid dehydrogenase complexesof Thermus thermophilus ehydrogenase complexes ofThermus thermophilus ", 文部省科学研究費補助金特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」
第2回公開シンポジウム「生体超分子-構造・機能解明への果敢なる挑戦-」 , 金沢 , 12月 (2005).

in Collaboration with

内藤 久志, 宮崎 直幸, 萩原 恭二, 大村 敏博, 中川 敦
史, 月原 富武, 神谷 信夫: "ＲＤＶ外殻タンパク質Ｐ８の異なる分子環境への着座様式", 文部省科学研究費補
助金特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第2回公開シンポジウム「生体超分子-構造・機能解明への果敢なる挑戦-」 , 金沢 , 12月 (2005).
北原 亮, 畠 和澄, 横山 茂之, 赤坂 一之, Cheng J . :"Energy Landscape of SH3 Domain Revealed by Variable
Pressure NMR", 第3回「水と生体分子」公開ワークショ
ップ , (文科省科研費特定領域研究), 岡崎 , 1月
(2006).
鎌足 雄司, 赤坂 一之, 横山 茂之, 橘 秀樹:"Pressure-jump NMR study of dissociation andassociation of amyloid protofibrils", 第3回「水と生体分子」公開ワークショップ , (文科省科研費特定領域
研究), 岡崎 , 1月 (2006).
横山 茂之: "タンパク3000プロジェクト網羅的解析プログ
ラムの成果", 文部科学省タンパク3000プロジェクト 第3回産学連携フォーラム , 東京 , 2月 (2006).
倉光 成紀, 松本 武久, 別所 義隆: "解析タンパク質の例（1）感染症関連（ウイルス・細菌）", 文部科学省タンMembers
Dr. Tadashi NAKAI
Dr. Shinya SAIJO

Dr. Yoshiaki KAWANO
Dr. Hisashi NAITOW
Dr. Munenori FURUSE
Dr. Takahiro HENMI

Visiting Members
Dr. Nobuo KAMIYA (Osaka City Univ.）Dr. Masaki NOJIRI (Grad. Sch. Sci., Osaka Univ.)Dr. Masafumi ODAKA (Dept. Biotechnol. Life Sci., Tokyo
Univ. Agric. Technol.)Dr. Toshihide OKAJIMA (Osaka Univ.)
Dr. Kenjin SHIN (Okayama Univ.)Dr. Masafumi YOHDA (Dept. Biotechnol. Life Sci., Tokyo
Univ. Agric. Technol.)Trainees
Mr. Koichi HASHIMOTO (Fac. Sci., Univ. Hyogo.)
Mr. Akio OKUMA (Fac. Sci., Okayama Univ.)
Mr. Hisao OSUKA (Fac. Sci., Univ. Hyogo)

誌 上 発 表Publications[ 雑誌 ]（原著論文）＊印は査読制度がある論文誌

Nakai T., Nakagawa N., Maoka N., Masui R.,
Kuramitsu S., and Kamiya N. : "Structure of
P-protein of the glycine cleavage system: implications
for nonketotic hyperglycinemia", EMBO J. 24, No. 8,
pp.1523--1536 (2005). ＊Zako T., Iizuka R., Okochi M., Nomura T., Ueno
T., Tadakuma H., Yohda M., and Funatsu T. :"Facilitated release of substrate protein from prefoldin
播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報

by chaperonin", FEBS Lett. 579, 3718--3724 (2005).
＊
Iizuka R., Yoshida T., Ishii N., Zako T., TakahashiK., Maki K., Inobu T., Kuwajima K., andYohda M. : "Characterization of archaeal group II
chaperonin-ADP-metal fluoride complexes", J. Biol.
Chem. 280, No. 48, pp.40375--40383 (2005). ＊the Glycine cleavage system", 20th Congress of theInternational Union of Crystallography (IUCr2005) ,Florence , Italy , Aug. (2005).
Kawano Y., Hashimoto K., and Kamiya N . : "Dynamic
structures and reaction mechanism of active Fe-type
Nitrile Hydratase", 20th Congress of the International
Union of Crystallography (IUCr2005) , Florence , Italy ,Aug. (2005).

Miyazaki N., Hagiwara K., Naito H., Higashi T.,
Cheng H. R., Tsukihara T., Nakagawa A., andOmura T. : "Transcapsidation and the conserved
interactions of two major structural proteins of a pair of
Phytoreoviruses confirm the mechanism of assembly ofthe outer capsid layer", J. Mol. Biol. 345, 229--237(2005). ＊Zako T., Murase Y., Iizuka R., Yoshida T., Kanzaki T.,
Ide N., Maeda M., Funatsu T., and Yohda M . :"Interaction of archaeal prefoldin with group II
chaperonins affects delivery of a substrate protein
between them", International Symposium on Life ofProteins , Awaji , Oct.--Nov. (2005).

Katayama Y., Hashimoto K., Nakayama H., Mino
H., Nojiri M., Ono T., Nyunoya H., Yohda M.,
Takio K., and Odaka M. : "Thiocyanate hydrolase is acobalt-containing metalloenzyme with acysteine-sulfinic acid ligand", J. Am. Chem. Soc. 128,
728--729 (2006). ＊Kobayashi M., Hashimoto Y., Goda M., Nojiri M., andKamiya N . : "Novel enzyme, isonitrile hydratase,involved in nitrogen-carbon triple bond cleavage",
International Chemical Congress of Pacific Basin
Societies (PACIFICHEM 2005) , Honolulu , USA ,Dec. (2005).

（総説）
中川 敦史 ,内藤 久志 ,水野 洋 ,大村 敏博 : "イネ
萎縮ウイルスの立体構造決定", PHOTON
FACTORY NEWS 22, No. 3, pp.11--17 (2004).

(国内会議)
荒川 孝俊,片岡 慎吾,河野 能顕,神谷 信夫,片山 葉子,養王田 正文,尾高 雅文: "Thiobacillus thioparus由来チオシアネート加水分解酵素のX線結晶構造解析", 第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 , 6--7月(2005).

水野 洋 ,内藤 久志 : "２重殻をもつイネ萎縮ウイル
スのＸ線解析とその立体構造", 化学と生物 43, No.
7, pp.439--444 (2005).
神谷 信夫 ,沈 建仁 : "光化学系Ⅱ複合体の構造と機能", 蛋白質 核酸 酵素 50, No. 10, pp.1174--1179(2005).
大村 敏博 ,宮崎 直幸 ,内藤 久志 ,Holland C. R.,
中川 敦史 : "イネ萎縮ウイルスの自己組織化機構",
蛋白質 核酸 酵素 50, No. 10, pp.1349--1354 (2005).
[ 単行本 ]
（総説）
Shen J. R. and Kamiya N. : "3D Crystal Structure of the
Photosystem II Core", Advances in Photosynthesis andRespiration, Vol. 22``Photosystem II" The
Light-Driven Water: Plastoquinone Oxidoreductase ,Springer, Heidelberg, pp.449--467 (2005).
口

頭 発

表

Oral Presentations(国際会議等)
Naito H., Shen J. R., and Kamiya N . : "Crystal Structure
analysis of Photosystem II complex from {¥it
Thermosynechococcus Vulcanus}", 8th International
Conference on Biology and Synchrotron Radiation(BSR2004) , Himeji , Sept. (2004).
Nakai T., Nakagawa N., Maoka N., Masui R., Kuramitsu
S., and Kamiya N . : "Crystal structure of P-protein of飯塚 怜,石井 則行,槙 亙介,桑島 邦博,吉田 尊雄,座古 保,養王田 正文: "リン酸アナログを用いた古細菌由来グループII型シャペロニンのATPaseサイク
ル解析", 第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 ,6--7月 (2005).
村瀬 陽介,座古 保,井出 直希,吉田 尊雄,飯塚 怜,養王田 正文: "超好熱菌由来シャペロニンにおけるプ
レフォルディンとの協調部位の同定と基質タンパ
ク質受け渡し機能の解析", 第5回日本蛋白質科学会年会 , 福岡 , 6--7月 (2005).
井出 直希,座古 保,村瀬 陽介,飯塚 怜,養王田 正文: "超好熱性古細菌由来プレフォルディンＮ末端欠損
体の基質及びシャペロニン認識への影響", 第5回
日本蛋白質科学会年会 , 福岡 , 6--7月 (2005).
中井 忠志,神谷 信夫: "大腸菌で発現させた高度好熱菌グリシン開裂系Ｈタンパク質の3種類の翻訳後修飾型の単離", 理研シンポジウム「高度好熱菌丸
ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 ,8月 (2005).
近藤 寛,Hossain T., 安達 渉,中井 忠志,神谷 信夫,増井 良治,倉光 成紀,鈴木 薫,関口 武司,竹中 章郎:"{¥it Thermus thermophilus} HB8がもつ２種類のE3(リポアミド脱水素酵素) のＸ線構造", 理研シンポ播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報

究費補助金特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第2回公開シンポジウム「生体超分子-構造・機能解明への果敢なる挑戦-」,
金沢 , 12月 (2005).

ジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播磨 , 8月 (2005).
神谷 信夫,内藤 久志,大熊 章郎,川上 恵典,古瀬 宗則,西條 慎也,逸見 隆博,中里 勝芳,宮原 郁子,沈
建仁: "光合成系Ⅱ膜蛋白質複合体結晶のX線回折能改良の試みと構造精密化", 文部科学省科学研究費補助金特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第1回ワークショップ , 淡
路 , 9月 (2005).
萩原 恭二,宮崎 直幸,東 貴彦,内藤 久志,中川 敦史,
月原 富武,大村 敏博: "イネ萎縮ウイルスとイネ・
ゴール・ドワーフ・ウイルスの外殻タンパク質のトランスカプシデーション", 文部科学省科学研究費補助金特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第1回ワークショップ , 淡
路 , 9月 (2005).

沈 建仁,内藤 久志,古瀬 宗則,西條 慎也,大熊 章郎,
川上 恵典,逸見 隆博,神谷 信夫: "光化学系II複合体の構造解析の現状と展望", 第47回日本植物生理学会年会 , つくば , 3月 (2006).
大熊 章郎,川上 恵典,古瀬 宗則,西條 慎也,内藤 久
志,逸見 隆博,神谷 信夫,沈 建仁: "好熱性シアノバ
クテリア{¥it Thermosynechococcus vulcanus}由来
PSII結晶のＸ線結晶学的品質の改良", 第47回日本
植物生理学会年会 , つくば , 3月 (2006).

転写制御タンパク質構造解析研究チーム
Transcription Regulation Protein Crystallography Team神谷 信夫,内藤 久志,古瀬 宗則,逸見 隆博,大熊 章郎,川上 恵典,西條 慎也,沈 建仁: "Crystal structureof Photosystem II Complex from {¥it
Thermosynechococcus vulcanus}", 第78回日本生化学会大会 , 神戸 , 10月 (2005).
近藤 寛,Hossain T., 安達 渉,中井 忠志,神谷 信夫,増井 良治,倉光 成紀,鈴木 薫,関口 武志,竹中 章郎:"{¥it Thermus thermophilus}由来の2種類のE3（リポ
アミドデヒドロゲナーゼ）の結晶構造", 第78回日本生化学会大会 , 神戸 , 10月 (2005).
村瀬 陽介,座古 保,飯塚 怜,井出 直希,吉田 尊雄,前田 瑞夫,養王田 正文: "超好熱菌由来シャペロニン
とプレフォルディンとのアフィニティーが及ぼす
基質受け渡し効率への影響", 第43回日本生物物理学会年会 , 札幌 , 11月 (2005).
東浦 彰史,宮崎 直幸,内藤 久志,萩原 恭二,大村 敏
博,神谷 信夫,月原 富武,中川 敦史: "高分解能X線
結晶構造解析を目指したイネ萎縮ウイルスの結晶化", 日本結晶学会2005年度年会および総会 , 姫
路 , 12月 (2005).
近藤 寛,ホセイン トファザル,安達 渉,中井 忠志,神谷 信夫,増井 良治,倉光 成紀,鈴木 薫,関口 武司,
竹中 章郎: "Two different E3s(lipoamide
dehydrogenases) of 2-oxoacid dehydrogenase
complexes of Thermus thermophilus ehydrogenase
complexes of Thermus thermophilus ", 文部省科学研究費補助金特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第2回公開シンポジウム「生体超分子-構造・機能解明への果敢なる挑戦-」,
金沢 , 12月 (2005).
内藤 久志,宮崎 直幸,萩原 恭二,大村 敏博,中川 敦
史,月原 富武,神谷 信夫: "ＲＤＶ外殻タンパク質Ｐ８の異なる分子環境への着座様式", 文部省科学研

Staff
Head
Dr. Tahir TAHIROVDr. Shigeyuki YOKOYAMAMembers
Dr. Peter REHSE
Mr. Eiji INAGAKI
Ms. Hitomi TAKAHASHI
Dr. Koushiki MINO
誌 上 発 表Publications[ 雑誌 ]（原著論文）＊印は査読制度がある論文誌

Rehse P., Kitao T., and Tahirov T. : "Structure of aclosed-form uroporphyrinogen-III {¥itC}-methyltransferase from {¥it Thermus
thermophilus}", Acta Cryst. D 61, 913--919 (2005). ＊Rehse P. and Tahirov T. : "Structure of a putative 2'-5'RNA ligase from {¥it Pyrococcus horikoshii}", Acta
Cryst. D 61, 1207--1212 (2005). ＊Inagaki E., Takahashi H., Kuroishi C., and Tahirov
T. : "Crystallization and avoiding the problem ofhemihedral twinning in crystals of$¥Delta^{1}$-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenasefrom {¥it Thermus thermophilus}", Acta Cryst. F 61,
609--611 (2005). ＊Jeyaraman J., Inagaki E., Kuroishi C., and Tahirov
T. : "Structure of PIN-domain protein PH0500 from{¥it Pyrococcus horikoshii}", Acta Cryst. F F6,
463--468 (2005). ＊Artsimovitch I., Vassylyeva M. N., Svetlov D., Svetlov V.,
Perederina A., Igarashi N., Matsugaki N., Wakatsuki S.,
Tahirov T., and Vassylyev D. G. : "Allosteric
播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報modulation of the RNA polymerase catalytic reaction isan essential component of transcription control byrifamycins", Cell 122, No. 3, pp.351--363 (2005). ＊Chivers P. T. and Tahirov T. : "Structure of {¥it
Pyrococcus horikoshii} NikR: Nickel sensing andimplications for the regulation of DNA recognition", J.
Mol. Biol. 348, 597--607 (2005). ＊Katayama Y., Hashimoto K., Nakayama H., Mino H.,
Nojiri M., Ono T., Nyunoya H., Yohda M., Takio K.,
and Odaka M. : "Thiocyanate hydrolase is acobalt-containing metalloenzyme with acysteine-sulfinic acid ligand", J. Am. Chem. Soc. 128,
728--729 (2006). ＊口

Rehse P. and Tahirov T. : "Crystal structure of apurine/pyrimidine phosphoribosyltransferase-related
protein From {¥it Thermus thermophilus} HB8",
Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 61,
658--665 (2005). ＊Rehse P., Kumei M., and Tahirov T. : "Compact
reduced thioredoxin structure from the thermophilic
bacteria {¥it Thermus thermophilus}", Proteins:
Structure, Function, and Bioinformatics 61, 1032--1037(2005). ＊高等動物タンパク質構造解析研究チーム
Mammalian Protein Crystallography Team

Staff

頭

発

表

Oral Presentations(国際会議等)
Jeyaraman J., Taka J., Kitaguchi Y., Kuroishi C., Takada
K., Yokoyama S., Shiro Y., and Yutani K . : "Crystal
Structure of Putative Dipeptidase from thehyperthermophilic archaeon pyrococcus horikoshii
OT3", 3rd International Conference on Structural
Genomics (ICSG 2004) , Washington , USA , Nov.
(2004).
Fujibayashi A., Ohtani M., Dohmae N., Takio K.,
Yamakami M., Fukuda M., Waguri S., Yoshimori T.,
and Sekiguchi K . : "Potential role of human RME-8
homologue in membrane traffic through earlyendosomes", 58th Annual Meeting of the Japan Society
for Cell Biology , Saitama , June (2005).
Lokanath N. K., Ohshima N., Takio K., Shiromizu I.,
Kuroishi C., Okazaki N., Kuramitsu S., Yokoyama S.,
Miyano M., and Kunishima N . : "Crystal structure of
the NADP-dependent 3-hydroxyisobutyrate
dehydrogenase", 20th Congress of the International
Union of Crystallography (IUCr2005) , Florence , Italy ,Aug. (2005).

Head
Dr. Shigeyuki YOKOYAMAMembers
Dr. Kouji TAKIO
Dr. Katsuhide YUTANIDr. Yo SATO

Kodama K., Fukuzawa S., Nakayama H., Kigawa T.,
Sakamoto K., Yabuki T., Matsuda N., Shirouzu M.,
Takio K., Yokoyama S., and Tachibana K . :"Site-specific functionalization of proteins withpalladium-catalyst", International Chemical Congressof Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2005) ,Honolulu , USA , Dec. (2005).

in Collaboration with
Dr. Masaki YAMAMOTO

Trainees
Mr. Satoshi IIMURA (Kwansei Gakuin Univ.)

誌

上

発 表

Publications[ 雑誌 ]（原著論文）＊印は査読制度がある論文誌

Lokanath N. K., Ohshima N., Takio K., Shiromizu I.,
Kuroishi C., Okazaki N., Kuramitsu S., Yokoyama S.,
Miyano M., and Kunishima N. : "Crystal structure ofnovel NADP-dependent 3-hydroxyisobutyrate
dehydrogenase from {¥it Thermus thermophilus} HB8",
J. Mol. Biol. 352, 905--917 (2005). ＊Kodama K., Fukuzawa S., Nakayama H., Kigawa T.,
Sakamoto K., Yabuki T., Matsuda N., Shirouzu M.,
Takio K., Tachibana K., and Yokoyama S. :"Regioselective carbon-carbon bond formation inproteins with palladium catalysis; New protein
chemistry by organometallic chemistry",
ChemBioChem: A European Journal of Chemical
Biology 7, No. 1, pp.134--139 (2006). ＊(国内会議)
仲野 徳, 粂井 麻希, 稲垣 栄二, 田中 智之, 新海
ふじ江, 倉光 成紀, 瀧尾 擴士, 新海 暁男, 横山
茂之: "{¥it Thermus thermophilus} HB8由来TT0972
タンパク質の構造", 理研シンポジウム「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」第4回連携研究会 , 播
磨 , 8月 (2005).
神谷 守, 臼井 健悟, 田邉 陽一, 鈴木 治和, 荒川
貴博, 河合 純, 田上 道平, 村田 光義, 林田 賢吾,
甲斐 誓利, 瀧尾 擴士, 栗原 千登勢, 林 利蔵, 林
崎 良英: "パイロコッカスDNAブック", 第28回日
本分子生物学会年会 , 福岡 , 12月 (2005).
山本 雅貴, 新海 暁男, 国島 直樹: "X線関連技術",
文部科学省タンパク3000プロジェクト 第3回産学連携フォーラム , 東京 , 2月 (2006).

播磨研究所 放射光科学総合研究センター
平成 17 年度 研究年報