Ichthy, Nat. Hist. Fish. Jpn.
ISSN 2435-7715

ICHTHYORIGINAL RESEARCH ARTICLE

Natural History of Fishes of Japan

https://www.museum.kagoshima-u.ac.jp/ichthy/articles.html
https://www.jstage.jst.go.jp/browse/ichthy/-char/jaedited and published by the Kagoshima University Museum

福井県嶺北地方で発見されたナガレホトケドジョウの新たな地域集団
中島

1

2

3

4

5

淳 ・西村俊明 ・井藤大樹 ・宮崎淳一 ・大井和之 ・平川周作

Author & Article Info1

福岡県保健環境研究所（太宰府市）
nakajima@fihes.pref.fukuoka.jp (corresponding author)
2
日本淡水魚類愛護会（名古屋市）
3
徳島県立博物館（徳島市）
4
山梨大学教育学部（甲府市）
5（一財）九州環境管理協会（福岡市）
Received
RevisedAccepted
Published
DOI

02 March 2021
08 March 2021
09 March 2021
10 March 2021
10.34583/ichthy.6.0_33

Jun Nakajima, Toshiaki Nishimura, Taiki Ito, Jun-Ichi Miyazaki, Kazuyuki Ooi
and Shusaku Hirakawa. 2021. Report of a genetic population of Lefua torrentis(Nemacheilidae) from Reihoku District, Fukui Prefecture, Honshu, Japan. Ichthy,
Natural History of Fishes of Japan, 6: 33–37.

1

本種には遺伝的に異なる複数の集団の存在が知られ，主に紀伊半島から四国に紀伊・四国集団が，それ以外の地域に山陽集団が分布している（Mihara et al., 2005；佐野ほか，2016；Hosoya et al., 2018； 細 谷，2019）． ま た， 京 都
府北部と福井県嶺南地方からは，ナガレホトケドジョウ以
外のホトケドジョウ属魚類からミトコンドリア DNA の遺伝子浸透を受けたと考えられる日本海集団が報告されている（Miyazaki et al., 2018）．形態的には体側および体背部と尾柄部に斑紋がない無斑型と，斑紋がある斑紋型が知られ，斑紋型は紀伊・四国集団に多く出現することが知られている（細谷，2019）．
著者らは 2018 年に福井県において採集されたホトケ
ドジョウ属 2 個体について，その形態とミトコンドリア

Abstract

DNA cytochrome b 領域の塩基配列の特徴を調査した．そのA newly found genetic population, characterized by mtDNA
cytb sequences, of Stream Eight-barbeled Loach, Lefua torrentis
Hosoya, Ito and Miyazaki, 2018 (Cypriniformes: Nemacheilidae), was reported from Reihoku District, Fukui Prefecture,
Honshu, Japan. The population is also characterized by themorphological characters, compared to two previously known
genetic populations of the species in Japan. The present study
provides meristic counts and color photographs of voucher specimens of the Reihoku population.

結果，これらの標本はナガレホトケドジョウに同定される
ものの，これまでに知られていない形態的・遺伝的特徴をもつことを確認したのでここに報告する．
材料と方法
標本は 2018 年 9 月 1 日に，福井県嶺北地方の九頭竜川水系の渓流域で採集された．本種は希少種であり乱獲の恐れがあることから，本報では詳細な採集地点の記載は行わない．調査によって 10 個体が採集されたが，そのうちのコ イ 目 フ ク ド ジ ョ ウ 科（Cypriniformes: Nemacheilidae）のホトケドジョウ属 Lefua は東アジア固有の純淡水魚類

2 個体を以下の研究に用いた．なお，本標本は徳島県立博物館登録標本とした（TKPM-P 25896, 25897）．

のグループで，現在 7 有効種が知られている（Kottelat，

個体は生かしたまま実験室に持ち帰り，クローブオイ

2012； 中 島・ 内 山，2017；Hosoya et al., 2018；Ito et al.,ルを用いて麻酔をかけた後に右腹鰭を切除し，無水エタ

2019b）． こ の う ち ナ ガ レ ホ ト ケ ド ジ ョ ウ Lefua torrentis

ノール固定標本として後の遺伝子解析に用いた．また，本Hosoya, Ito and Miyazaki, 2018 は，主に河川源流域に生息す

体は 10% 中性ホルマリン水溶液で固定後，保存液を 70%

る日本固有種で，本州（福井県，滋賀県，京都府，大阪府，

エタノール水溶液に置換して形態計測に用いた．標本の兵庫県，奈良県，和歌山県，鳥取県，岡山県）と四国（徳計 数 お よ び 計 測 方 法 は Hubbs and Lagler (2004) に 従 い，

島県，香川県，愛媛県）に分布する（中島・内山，2017；

Hosoya et al. (2018) を参考にして，各鰭の鰭条を計数し，

Hosoya et al., 2018；細谷，2019）．本種は砂防ダム建設や森

標準体長，頭長，体高，体幅，尾柄高，尾柄長，背鰭前長，

林伐採の影響を受け，各地で個体数を減じていることから，

肛門前長，腹鰭前長，臀鰭基底長，胸鰭長，吻長，眼径，

環境省レッドリストにおいて絶滅危惧 IB 類に選定されて眼間幅を，それぞれデジタルノギスを用いて 0.1 mm の単いる（環境省，2020）．

位で計測した．
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Nakajima et al. — New population of Lefua torrentis from Fukui Prefecture
ゲ ノ ム DNA の 抽 出 は 前 述 し た 右 腹 鰭 か ら，DNeasy

model）に基づき，最尤法による系統推定を実行した．系

Blood & Tissue Kit（Qiagen） を 用 い て 行 っ た． そ の 後，

統樹の各分岐の信頼性は 1,000 回のブートストラップに

PCR 法によりミトコンドリア DNA（mtDNA）cytochrome

より評価した．モデル選択および系統推定には MEGA X

b 遺 伝 子 領 域（cytb） の 1,141 塩 基 対 を 増 幅 し た．PCR（Kumar et al., 2018）を使用した．

に 使 用 し た プ ラ イ マ ー は，Forward（loach_cytb_F1）：
5'- CAGTGACTTGAAGAACCACCG-3' お よ び Reverse

以上の形態的・遺伝的特徴に基づいて，中島・内山（2017），Ito et al. (2019b) に従い種の同定を行った．

（H15915）：5'- CTCCGATCTTCGGATTACAAGAC-3'（Xiaoet al., 2001）である．Forward Primer は Xiao et al. (2001) のL14724 をもとにシマドジョウ属 Cobitis およびドジョウ
属 Misgurnus の mtDNA 登 録 配 列 の 当 該 部 分 を，Reverse

Lefua torrentis Hosoya, Ito and Miyazaki, 2018
ナガレホトケドジョウ（Figs. 1, 2; Tables 1, 2）

Primer と Tm が一致するように改変したものである．PCRは 94˚C，10 秒間の加熱を行った後，98˚C：10 秒，55˚C：

標本

TKPM-P 25896， 標 準 体 長 35.5 mm，TKPM-P

5 秒，68˚C：15 秒のサイクルを 35 回繰り返した．PCR に25897，標準体長 32.4 mm，福井県嶺北地方（九頭竜川水系），

おける DNA ポリメラーゼには KOD One（TOYOBO）をたも網，2018 年 9 月 1 日，西村俊明・佐々木賀治採集．

使用した．PCR 増幅産物の精製には Exo-SAP IT（Thermo

記載

調査標本の計数形質および各部の計測値を Table

Fisher Scientific）
を使用した．
精製した各増幅産物について，

2 に示す．体は細長く円筒形でやや縦扁し，尾柄部はややPCR 時 と 同 じ プ ラ イ マ ー お よ び BigDye Terminator v3.1

側扁する．頭部は縦扁する．眼は頭部背側面に位置し，小（Thermo Fisher Scientific）を用いてサイクルシーケンシン

さく，頭長の約 12%．尾柄部の背面と腹面はキール状とグ 反 応 を 行 い，ABI 3500 Genetic Analyzer（Thermo Fisher

なり，キールを含む尾柄高は体高と同程度である．前鼻孔

Scientific）により塩基配列を決定した．得られた塩基配列

周辺の皮膚は 1 本の細長いひげ状となり，前鼻孔はひげ状

データは日本 DNA データバンク（DDBJ）に登録した（Table

突起の根本やや上方に開孔する．後鼻孔は前鼻孔よりも大1）．

きく，眼窩直前に開孔する．上口唇には 3 対の口ひげがあ

次に本研究で塩基配列を決定した 2 個体，および公開

る．いずれの口ひげも，眼径をはるかにこえる．体表は細されているナガレホトケドジョウの 2 系統，ホトケドジョ

かい鱗で覆われる．側線はない．胸鰭は第 3 分枝軟条が最ウ Lefua echigonia Jordan and Richardson, 1907 の 6 系統，トも長い．背鰭は体の中央よりも後方に位置し，その起点はウカイナガレホトケドジョウ Lefua tokaiensis Ito, Miyazaki

腹鰭基底後端よりも明らかに後方にある．尾鰭は楕円形で，and Hosoya, 2019，
エゾホトケドジョウ Lefua nikkonis (Jordan

側縁は丸い．

and Fowler, 1903)， ヒ メ ド ジ ョ ウ Lefua costata (Kessler,

色彩

生時は体全体が黄色みの強い褐色で，眼から吻1876)，外群としてフクドジョウ Barbatula oreas (Jordan and

端に向かう明瞭な黒褐色の縦帯を有する．体背部から体側

Fowler, 1903)，アユモドキ Parabotia curtus (Temminck and部，尾柄部にかけて全体に暗褐色の小斑点が散在する．そSchlegel, 1846) の塩基配列データを用いて（Table 1），遺伝

れら小斑点は最大のものでも眼径よりやや大きい程度であ子系統樹を作成した．系統推定には最尤法を使用した．まる．胸鰭は黄褐色で，基部および前半部に暗色斑紋を有す

ず，BIC（Bayesian Information Criterion）を基準に最適な

る．背鰭は黄褐色で，基部に近い部分に暗色斑紋を有する．

塩基置換モデルを決定し，選択されたモデル（HKY+G+I

尾鰭は基部から中央やや先端に近い部分が黄褐色で暗色斑

Table 1 . Localities and GenBank accession numbers for material analyzed in this study.
Species
Locality
Accession No.
Lefua torrentis (Reihoku population)
Japan: Reihoku, Fukui, Honshu
LC605831
Lefua torrentis (Sanyo population)
Japan: Kobe, Hyogo, Honshu
AB080182
Lefua torrentis (Kii-Shikoku population)
Japan: Kawanoe, Ehime, Shikoku
AB080183
Lefua echigonia (Hokuriku population)
Japan: Nagaoka, Niigata, Honshu
AB080147
Lefua echigonia (Tohoku population)
Japan: Sendai, Miyagi, Honshu
AB080155
Lefua echigonia (Kita-kanto population)
Japan: Imaichi, Tochigi, Honshu
AB080154
Lefua echigonia (Minami-kanto population)
Japan: Hachioji, Tokyo, Honshu
AB080159
Lefua echigonia (Tokai population)
Japan: Isobe, Mie, Honshu
AB080179
Lefua echigonia (Kinki population)
Japan: Kanadu, Fukui, Honshu
AB080176
Lefua tokaiensis
Japan: Shinshiro, Aichi, Honshu
LC079031
Lefua nikkonis
Japan: Ono, Hokkaido
AB100919
Lefua costata
China: Kaiyuan, Liaoning
DQ105196
Barbatula oreas
Japan: Kamiiso, Hokkaido
AB100917
Parabotia curtus
Japan: Kameoka, Kyoto, Honshu
AB496667

Reference
present study
Saka et al. (2003)
Saka et al. (2003)
Saka et al. (2003)
Saka et al. (2003)
Saka et al. (2003)
Saka et al. (2003)
Saka et al. (2003)
Saka et al. (2003)
Ito et al. (2019a)
Saka et al. (2003)
Tang et al. (2006)
Saka et al. (2003)
Watanabe et al. (2009)
Ichthy 6 ǀ 2021 ǀ 34

Nakajima et al. — New population of Lefua torrentis from Fukui Prefecture

Fig. 1. Lefua torrentis from Reihoku District, Fukui Prefecture, Japan. A, C, TKPM-P 25896, 35.5 mm SL; B, TKPM-P 25897, 32.4mm SL [preserved (A and B) and live (C) specimens].

があるが，周縁部は半透明で斑紋はない．腹鰭と臀鰭にはドジョウ，在来種のエゾホトケドジョウ，ホトケドジョ

斑紋はない．

ウ，ナガレホトケドジョウ，トウカイナガレホトケドジョ

遺伝的特徴

作成した遺伝子系統樹を Fig. 2 に示す．

ウの合計 5 種が確認されている（中島・内山，2017；細谷，

調査標本の mtDNAcytb 領域 1,134 塩基対の配列は，今回2019）．本研究の調査標本は，眼前部の暗色縦帯が明瞭で分析を行った 2 個体間で完全に一致した．その部分塩基配あること（エゾホトケドジョウ，ホトケドジョウでは不明列の特徴は，ナガレホトケドジョウの配列ともっとも類似瞭），尾鰭基底中央に暗色斑がないこと（エゾホトケドジョ

し，アラインメントされた領域の 1,026 塩基対では，山陽

ウ，ヒメドジョウでは三角形の暗色斑がある），眼が頭部集団である兵庫県神戸市産個体（AB080182）との塩基配

背側面にあること（エゾホトケドジョウ，ヒメドジョウ，

列の一致度は 89.4%，紀伊・四国集団である愛媛県四国中

ホトケドジョウでは側面にある），尾鰭基部の深層部に暗央市（旧川之江市）産個体（AB080183）との塩基配列の色横帯がないこと（トウカイナガレホトケドジョウでは暗一致度は 89.9% であった．

色の細い横帯がある），尾鰭後縁が丸いこと（トウカイナ
ガレホトケドジョウではやや角ばる）などの特徴をもち，考察
現在，国内ではホトケドジョウ属として外来種のヒメ

これらは中島・内山（2017），Ito et al. (2019b) に従うとナガレホトケドジョウに一致する．また，mtDNAcytb 領域
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Nakajima et al. — New population of Lefua torrentis from Fukui Prefecture

Fig. 2. Maximum likelihood phylogram based on mtDNA cytb sequences of species of Lefua and two outgroups. Arrow indicates Reihoku District population of Lefua torrentis. Numbers on each branch indicate bootstrap values with 1,000 replicates.

の塩基配列の特徴は，ナガレホトケドジョウにもっとも類
似した．
以上より，
今回調査した標本をナガレホトケドジョ

ウと同定した．
しかしながら，調査標本は体側から尾柄に小斑点が広く存在すること，背鰭・尾鰭に明瞭な斑紋があること，背Table 2. Counts and morphometric measurements of Lefua
torrentis collected from Reihoku District, Fukui Prefecture,
Japan.
TKPM-P 25896 TKPM-P 25897
Standard length (SL; mm)
35.5
32.4
Counts
Dorsal fin rays
iv+6
iii+6
Anal fin rays
iii+5
iii+5
Pectoral fin rays
i+11
i+11
Pelvic fin rays
i+5
i+5
Caudal fin rays*
6+7
5+7
Measurements (as %SL)
Head length (HL)
22.4
23.6
Body depth
13.3
13.5
Body width
13.0
13.4
Depth of caudal peduncle
12.5
13.1
Length of caudal peduncle
16.9
16.2
Predorsal length
65.7
64.2
Preanal length
71.6
74.4
Prepelvic length
56.8
59.4
Height of dorsal fin
12.8
13.9
Length of anal fin base
7.4
7.8
Pectoral fin length
16.4
14.8
Measurements (as %HL)
Snout length
35.7
36.3
Orbit diameter
11.7
11.7
Interorbital width
40.1
40.5
* Counted only branched rays.

鰭がやや小さいことなど，これまで知られているナガレ
ホトケドジョウの形態的特徴とは異なる点も認められる．
mtDNAcytb 領域の塩基配列の特徴も，本種の山陽集団および紀伊・四国集団との違いはかなり大きい．また今回直接比較していないが，日本海集団は遺伝子浸透によりナガ
レホトケドジョウ以外のホトケドジョウ属魚類の mtDNAの特徴を有していることから（Miyazaki et al., 2018），この集団とも遺伝的に異なる可能性が高い．したがって，今回調査した標本はその形態と遺伝子の特徴から，これまでに未発見であったナガレホトケドジョウの地域集団と考えられ，その分布範囲については不明な点が残るが，ひとまず
嶺北集団と呼称することを提案する．今後は mtDNA の他の領域や核 DNA を含めたより詳細な遺伝子解析を行うと同時に，骨格形態も含めたより詳細な形態解析を行うこと
で，その系統学的・分類学的な位置づけを明らかにしていく必要がある．
福井県内のナガレホトケドジョウについては，嶺南地方の南川水系から山陽集団と日本海集団の分布が報告されている（Mihara et al., 2005；Miyazaki et al., 2018）．福井県内の淡水魚類相は嶺北地方と嶺南地方の間で，特に丹生山地を境にして大きく異なることが知られており（加藤，Ichthy 6 ǀ 2021 ǀ 36

Nakajima et al. — New population of Lefua torrentis from Fukui Prefecture
1998；松宮ほか，2007），アジメドジョウ Niwaella delicata(Niwa, 1937) においてもこの山地を境にその遺伝的・形態的特徴が異なることが報告されている（Kitagawa et al.,2001）．したがって，嶺南地方のナガレホトケドジョウと異なる特徴をもつ集団が嶺北地方に分布することに矛盾はなく，嶺北集団はそうした地史を反映した生物地理学的に重要な個体群と考えられる．また，ナガレホトケドジョウ
は福井県レッドデータブックにおいて絶滅危惧 I 類に選定されているが（福井県安全環境部自然環境課，2016），特に嶺北地方における生息状況には不明な点が多く，著者らの現地調査の結果からもその産地・生息数が少ないことが予想される．ナガレホトケドジョウ嶺北集団が生物多様性を保全する上で特に重要な個体群であることは明らかなことから，嶺北地方の河川源流域において環境改変などが行われる場合には，その存続に悪影響を与えることがないよ
う細心の注意が必要である．今後も当地域における嶺北集団に関する情報を集積し，積極的にその保全を図っていく
必要があるだろう．
謝辞
調査にご同行いただいた佐々木賀治氏，文献入手にご協力いただいた保科英人博士（福井大学）にこの場を借りてお礼申し上げる．なお，本研究の一部は JSPS 科研費
JP19K04682 によって実施された．
引用文献
福井県安全環境部自然環境課．2016．改訂版 福井県の絶滅のおそれ の あ る 野 生 動 植 物．https://www.pref.fukui.lg.jp/doc/shizen/rdb/
rdb_d/fil/reddatabook.pdf (11 Feb. 2021).
細谷和海．2019．山渓ハンディ図鑑 増補改訂 日本の淡水魚．山と渓谷社，東京．560 pp.
Hosoya, K., T. Ito and J. Miyazaki. 2018. Lefua torrentis, a new species ofloach from western Japan (Teleostei: Nemacheilidae). Ichthyological
Exploration of Freshwaters, 28: 193–201.
Hubbs, C.L. and K. F. Lagler .2004. Fishes of the Great Lakes region. Revised edition. University of Michigan Press, Bloomfield Hills. 250 pp.
Ito, G., Y. Koya, S. Kitanishi, T. Horiike and T. Mukai. 2019a. Genetic
population structure of the eight-barbel loach Lefua echigonia in the Ise
Bay region, a single paleo-river basin in central Honshu, Japan. Ichthyological Research, doi: 10.1007/s10228-019-00683-z (Feb. 2019), 66:
411–416 (July 2019).

Ito, T., K. Hosoya and J. Miyazaki. 2019b. Lefua tokaiensis, a new speciesof nemacheilid loach from central Japan (Teleostei: Nemacheilidae).
Ichthyological Research, doi: 10.1007/s10228-019-00690-0 (Apr. 2019),
66: 479–487 (Nov. 2019).
環境省．2020．環境省レッドリスト 2020．http://www.env.go.jp/press/
files/jp/114457.pdf (9 Jan. 2021).
加藤文男．1998．福井県の淡水魚類，pp. 125–203．福井県自然環境保全調査研究会 陸水生物部会（編）福井県の陸水生物．福井県，福井．
Kitagawa, T., M. Yoshioka, M. Kashiwagi and T. Okazaki. 2001. Population
structure and local differentiation in the delicate loach, Niwaella delicata, as revealed by mitochondrial DNA and morphological analyses.
Ichthyological Research, 48: 127–135.
Kottelat, M. 2012. Conspectus cobitidum: an inventory of the loaches of
the world (Teleostei: Cypriniformes: Cobitioidei). The Raffles Bulletinof Zoology, Supplement, 26: 1–199. (https://lkcnhm.nus.edu.sg/app/
uploads/2017/06/Conspectus_cobitidum.pdf)
Kumar, S., G. Stecher, M. Li, C. Knyaz and K. Tamura. 2018. MEGA X:
Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms.
Molecular Biology and Evolution, 35:1547–1549. (https://www.ncbi.
nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5967553/)
松宮由太佳・渡辺勝敏・井口恵一朗・岩田祐士・山本軍次・西田 睦．
2007．福井県嶺南地方を流れる南川水系の淡水魚類．魚類学雑誌，
48: 93–107.
Mihara, M., T. Sakai, K. Nakao, L.O. Martins, K. Hosoya and J. Miyazaki.
2005. Phylogeography of loaches of the genus Lefua (Balitoridae, Cypriniformes) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zoological
Science, 22: 157–168.
Miyazaki, J., T. Tamura, S. Hida and T. Sakai. 2018. Local introgression of
mitochondrial DNA in Eight-Barbel Loaches of the genus Lefua (Balitoridae, Cypriniformes). Zoological Science, 35: 140–148.
中島 淳・内山りゅう．2017．日本のドジョウ 形態・生態・文化と図鑑．山と渓谷社，東京．223 pp．
Saka, R., Y. Takehana, N. Suguro and M. Sakaizumi. 2003. Genetic population structure of Lefua echigonia inferred from allozymic and mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyological Research, 50: 301–309.
佐野 勲・切金 南・緒形健太・小林健介・東城幸治・宮崎淳一．
2016．ミトコンドリアチトクローム b 遺伝子の塩基配列に基づく
ホトケドジョウ類の系統．山梨大学教育学部紀要，25: 183–192.
Tang, Q., H. Liu, R. Mayden and B. Xiong. 2006. Comparison of evolutionary rates in the mitochondrial DNA cytochrome b gene and control
region and their implications for phylogeny of the Cobitoidea (Teleostei:
Cypriniformes). Molecular Phylogenetics and Evolution, 39: 347–357.
Watanabe, K., T. Abe and A. Iwata. 2009. Phylogenetic position and genericstatus of the Japanese botiid loach. Ichthyological Research, 56: 421–
425.
Xiao, W., Y. Zhang and H. Liu. 2001. Molecular systematics of Xenocyprinae (Teleostei: Cyprinidae): taxonomy, biogeography, and coevolutionof a special group restricted in East Asia. Molecular Phylogenetics andEvolution, 18: 163–173.

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