MALDI-TOF MS微生物迅速同定
スペクトル・ライブラリーの提供

MALDI-TOF MS微生物迅速同定
スペクトル・ライブラリーの提供

NITEでは、MALDI-TOF MSを用いた
より確実な微生物迅速同定法を開発しています。
マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量分析装置（MALDI-TOF MS）を用いた微生物の迅速同定技術は、遺伝子解析に比べて少量のサンプルで、迅速かつ簡便で、安価に解析を行えるという利点があり、この10年で急速に普及が進んでいます。微生物同定用
MALDI-TOF MSは、世界では医療機関を中心に600を超える機関で導入されており、我が国でも一般医療機器として認可され、更に国内の公設試験研究機関や工業・食品業界でも導入が進み、製品の品質管理への適用が模索されています。
Adding the MALDI Matrix (consumable
cost: approx. $0.20/sample)

MALDI-TOF MS

質量スペクトルの取得
菌をサンプルプレートに乗せ、マトリックスと混合（細菌の場合）

ghk@bdal.com

多検体を自動測定～1分/検体種A
種B
種C
データベース検索

種間でマススペクトルが異なるため、指紋判定により種レベルでの識別・同定が可能

MALDI-TOF MSによる微生物同定の流れ
MALDI-TOF MSを用いた微生物の同定法は、微生物毎のマススペクトラムを取得し、指紋判定法により種レベルもしくはそれ以下のグループを識別・同定する方法です。このためには、比較参照とするマススペクトラのライブラリーが欠かせません。臨床関連微生物を中心に市販
ライブラリーが提供されていますが、産業用微生物についてのライブラリーが不足している状況です。平成29年現在、MALDI-TOF MSによる微生物同定システムには2種類が販売されており、1つはブルカー・ダルトニクス社の「MALDI Biotyper®」、もう１つは島津製作所の「AXIMA®微生物同定システム」で、後者はシスメックス・ビオメリュー社から「VITEK®
MS」としても販売されています。注）2注）表記シスメックス・ビオメリュー株式会社につきましては、2017年7月の合弁解消に伴い、ビオメ
リュー・ジャパン株式会社へ社名が変更されています。
現在、ビオメリュー・ジャパン株式会社では引き続きSARAMIS Premium 及びVITEK MS後継機であるバイテックMS PRIMEを販売しています（VITEK MSは2023年現在販売終了）。

NITEで取り組む
ライブラリーの種類

MALDI-TOF MS
迅速同定

フィンガープリント法（指紋判定法）Bruker社
MALDI Biotyper®

MSスペクトラ
ライブラリー

バイオマーカー
迅速同定法

島津製作所
SARAMISTM

MSスペクトラ
ライブラリー（未実施）

SuperSpectra
ライブラリー

全機種対応

MSスペクトル
バイオマーカーライブラリー

MALDI-TOF MSは多くの利点がありますが、現状では、同定結果の不完全性と不確実性が課題に挙げられています。特に糸状菌や放線菌では得られる結果が一定でなく、参照用ライブ
ラリーと一致しないことがあります。
NITEでは、NBRCから提供している微生物を中心に、環境汚染物質分解機能を有する菌群
から食品産業に重要な菌群と、それらと区別しづらい日和見感染菌について、マススペクト
ラ・ライブラリーを構築し、提供しています。
また、これまで蓄積した微生物のゲノム情報とマススペクトラムを比較することにより、種の判別のマーカータンパク質の選定をしてより高精度な同定を目指しています。

対象微生物
グラム陰性細菌
グラム陽性細菌
放線菌
糸状菌
酵母

Acinetobacter, Pseudomonas
Lactococcus,
Leuconostoc, Bacillus
Nocardia
Aspergillus
Saccharomyces

基本的に、• MALDI-TOF MSデータの指紋判定法用ライブラリー化（２機種に対応）• 指紋判定同定法では困難な場合に、バイオマーカー構築

3

データライブラリーの種類
機種別
MALDI Biotyper®のフィンガープリント・ライブラリー
微生物株ごとに、4ウェル×2回計測×培養2ロット、計16ス
ペクトラを取得し、指紋判定のスコア値が2.3以上になるようにしたライブラリーを構築しています。システムの性格上、菌株レベルで照合、判別します。

SARAMISTMのSuperSpectra
リボソーム蛋白に限らないtotal タンパク質を用い、実験誤差を集約し、バイオマー
カー未満の種特異的な重み付けを行ったライブラリーです。NITEが提供するライブラ
リーでは、必要に応じて、株レベル、種レベル、グループレベルでの SuperSpectra
を、同種（株）に対する類似度90%以上を目標として作成しました。
種A

種A

種A

種B
種C
種D

ReferenceSpectra
イメージ

ConsensusSpectrum
イメージ

クラスター解析によるデンド
ログラム（樹形）を作成

微生物株ごとに、4ウェル
×2回計測×培養2ロット、計16スペクトラを取得

共通するピークを抽出

MALDIスペクトラ バイオマーカー

SuperSpectrum

イメージ

特異的・非特異的なピーク数から各ピークの重みづけを調整し、全種揃えれば完成

データ公開準備中
P1

P2

P3

A株 ATCGCATGCATGC…
B株 ATCGCATGCATGC…
C株 ATCGCATGCATGC…
標的菌種と近縁菌種のゲノム比較

Intensity (%)

P1

A株

P1
B株
C株
11400

標的菌種に特異的なタンパク質をバイオマー
カーに決定

m/z

実際のデータとの比較

解析条件の違いが結果に影響されないマススペクトルのピークのみを選抜したデータライブラリーです。NITEで行ったゲノム解析情報とあわせ、バイオマーカーのリボソー
ムタンパク質の理論分子量が紐付けされています。機種に依存しません。

4
ロゴマークは、ブルカー・ダルトニクス(株) 、ビオメリュー・ジャパン(株)及び (株)島津製作所の許諾を受けて使用しています。

公開中のライブラリー
各微生物の特徴2020年
新規提供

サッカロマイセス
Saccharomyces
10種99株Super
Spectra

Bio
typer

2019年
新規提供

狭義のサッカロマイセス（Saccharomyces sensu stricto）は、アルコー
ル発酵を行うことでパンやワイン、ビールなどを作る菌を含むことで知られています。食品などに利用できる有用な菌が多く含まれるため、簡便かつ精度の高い識別・同定が望まれる一方、それぞれの菌種同士が非常に近縁で従来法では識別・同定が非常に困難です。

クロコウジカビ
Aspergillus
niger，
awamori
14種49株

黒麹菌は胞子の色が黒褐色の糸状菌で、土壌や空気中、パンや穀物で見つかります。これらの仲間であるAspergillus nigerをはじめとする数菌種は、発がん性のあるカビ毒（オクラトキシンほか）を産生し、食品汚染やハウスダストなどの呼吸器系の疾患の原因となる危害菌として知られています。
一方、Aspergillus awamoriをはじめとした酒類の醸造や酵素の製造に用いられる有用な菌種も黒麹菌の仲間に含まれています。

Super
spectraBiotyper

乳酸菌（Lactococcus, Leuconostoc）、シュードモナス（Pseudomonas putida）、キコウジカビ（Aspergillus oryzae, flavus, sojae, parasiticus）、ノカルディア（Nocardia spp.）、アシネトバク
ター属についても引き続きライブラリー提供を行っています。こちらの5種について、以下、ライブラリーの詳細１～５をご覧ください。

キコウジカビAspergillus
oryzae, flavus,
sojae,parasiticus

2019にBiotyper版
追加公開

10 種,127 株

Biotyper

Super
Spectra乳酸菌
Lactococcus
Leuconostoc

シュードモナス
Pseudomonas
putida18 種, 33 株

11 種,77 株

Biotyper

Super
SpectraBiotyperﾊﾞｲｵﾏｰｶｰ
構築中

Super
Spectraノカルディア
Nocardia spp.

アシネトバクター
Acinetobacter

81 種, 96 株

34 種, 71 株

Super
SpectraBiotyper

Super
Spectraライブラリーの詳細 1
乳酸菌
Lactococcus
Leuconostoc
18 種, 33 株
Bio
typer

Super
Spectraラクトコッカス属はヨーグルト等の乳酸発酵食品に多く含まれるグラム陽性菌で、特に Lactococcus lactis は乳酸菌として最初に発見された種です。ラクトコッカス属は以前はストレプトコッカス属に位置づけられており、口腔、人畜、臨床試料などに見い出される乳酸菌とも深い関係があります。
ロイコノストック属は、生成する乳酸の異性体がＤ型となるヘテロ発酵型の乳酸菌です。なかでも Leuconostoc mesenteroides は植物の発酵に関係が深く、農場のサイレージ、ザワークラウト、ワインの製造過程に存在します。一方、稀にヒトにも日和見感染的な病原性を発揮する報告例もあります。

5

73 Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 12007

Lactococcus lactis subsp. hordniae NBRC 100931T
Lactococcus sp. NBRC 14714
89
66 Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 100933T
Lactococcus lactis subsp. cremoris NBRC 100676T
100
99 Lactococcus lactis subsp. tructae NBRC 110453T
Lactococcus taiwanensis NBRC 109049T
Lactococcus sp. RD011256
Lactococcus sp. RD011259
100
Lactococcus sp. RD011262
15
Lactococcus formosensis NBRC 109475T
13
Lactococcus
garvieae NBRC 100934T
33
68 Lactococcus garvieae JCM 8735
Lactococcus raffinolactis NBRC 100932T
100
Lactococcus plantarum NBRC 100936T
98

100

Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris NBRC107766T
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides NBRC100496T
Leuconostoc mesenteroides subsp. dextranicum NBRC100495T
63

Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides NBRC12060
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides NBRC3832
Leuconostoc mesenteroides subsp. dextranicum NBRC3349

90

Biotyper

Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris NBRC102479

66

SuperSpectra

0.01

用
ラ
イ
ブ
ラ
リ
ー
は
株
毎
に
作
成

ラ
イ
ブ
ラ
リ
ー
の
作
成

“Leuconostoc mesenteroides subsp. sake” NBRC102480“Leuconostoc mesenteroides subsp. sake” NBRC102481
Leuconostoc mesenteroides subsp. suionicum NBRC3426T

99

Leuconostoc pseudomesenteroides JCM 9696
Leuconostoc citreum NBRC102476
Leuconostoc lactis NBRC12455

out group
96

Leuconostoc sp. NBRC102475
100

Leuconostoc lactis NBRC102477
Leuconostoc lactis NBRC107866T

0.01

図1. 乳酸菌（Lactococcus, Leuconostoc属）の16S rRNAによる系統樹（NJ法）

乳酸菌 SARAMISTM用 SuperSpectra

色付きがNBRC製、黒字は既存のデータ（培養条件：嫌気, 2日, 30℃,ギ酸/アセニト処理, マトリクス：CHCA）
Similarity (%)
0

10

20

40

30

50

60

70

80

90

100

SuperSpectrum name（色付きがNBRC製）
superspectrum_Lactococcus_lactis_2_
superspectrum_Lactococcus_lactis_1_
superspectrum_Lactococcus_lactis_3_
Lactococcus_lactis_NBRCsuperspectrum2016
Lactococcus_taiwanensis_NBRC109049_NBRCsuperspectrum2016
superspectrum_Lactococcus_raffinolactis_1_
Lactococcus_raffinolactis_NBRC100932_NBRCsuperspectrum2016
Lactococcus_plantarum_NBRC100936_NBRCsuperspectrum2016
superspectrum_Lactococcus_garvieae_2_
superspectrum_Lactococcus_garvieae_1_
superspectrum_Lactococcus_garvieae_3_
Lactococcus_garvieae/formosensis_NBRCsuperspectrum2016

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90 100 110

SuperSpectrum name（色付きがNBRC製）
superspectrum_Leuconostoc_citreum_1_
superspectrum_Leuconostoc_sp._2_
Leuconostoc_citreum_NBRC102476_NBRCsuperspectrum2016
superspectrum_Leuconostoc_pseudomesenteroides_1_
superspectrum_Leuconostoc_sp._1_
superspectrum_Leuconostoc_sp._3_
Leuconostoc_mesenteroides_NBRCsuperspectrum2016
superspectrum_Leuconostoc_mesenteroides_1_
superspectrum_Leuconostoc_sp._4_
superspectrum_Leuconostoc_citreum_2_
superspectrum_Leuconostoc_lactis_1_
Leuconostoc_lactis_NBRCsuperspectrum2016

6

Consensus
Peaks
42
31
53
49
55
48
45
53
36
38
44
51

Total File
数
10
6
26
208
16
10
32
32
5
1
16
96

Consensus
Peaks
32
43
49
37
22
32
49
57
37
45
62
44

Total File
数
6
6
16
3
3
5
160
11
28
6
11
64

表1. 乳酸菌（Lactococcus & Leuconostoc）のライブラリーの内訳
学名

供試株

使用培地
#310 MRS Agar

Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 12007

1/10希釈MRS Agar
#814 TSYE Agar

Lactococcus sp.

NBRC 14714#310 MRS Agar
#310 MRS Agar

Lactococcus lactis subsp.
cremoris

NBRC 100676

T

1/10希釈MRS Agar
#814 TSYE Agar

Lactococcus lactis subsp.
hordniae

1/10希釈MRS Agar
NBRC 100931T#814 TSYE Agar
#310 MRS Agar

Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 100933T#310 MRS Agar
1/10希釈MRS Agar

Lactococcus lactis subsp.
tructaeT

NBRC 110453#814 TSYE Agar

Lactococcus garvieae

NBRC 100934T#310 MRS Agar

Lactococcus formosensis

NBRC 109475T#310 MRS Agar

Lactococcus sp.
Lactococcus sp.
Lactococcus sp.

RD 011256
RD 011259
RD 011262#310 MRS Agar
#310 MRS Agar
#310 MRS Agar

Lactococcus garvieae

JCM 8735#310 MRS Agar
1/10希釈MRS Agar

Lactococcus raffinolactis

NBRC 100932T#814 TSYE Agar
1/10希釈MRS Agar

Lactococcus plantarum

NBRC 100936T#814 TSYE Agar

Lactococcus taiwanensis
Leuconostoc mesenteroides
subsp. dextranicum
Leuconostoc mesenteroides
subsp. suionicum

NBRC 109049T#310 MRS Agar

NBRC 3349#310 MRS AgarT

NBRC 3426#310 MRS Agar

Leuconostoc mesenteroides
subsp. mesenteroides

NBRC 3832#310 MRS Agar

Leuconostoc mesenteroides
subsp. mesenteroides

NBRC 12060#310 MRS Agar

Leuconostoc mesenteroides
subsp. dextranicum

NBRC 100495T#310 MRS Agar

Leuconostoc mesenteroides
subsp. mesenteroides

NBRC 100496T#310 MRS Agar

NBRC 102479#310 MRS Agar

NBRC 102480#310 MRS Agar

NBRC 102481#310 MRS Agar

NBRC 107766T#310 MRS Agar

Leuconostoc lactis

NBRC 12455#310 MRS Agar

Leuconostoc sp.

NBRC 102475#310 MRS Agar

Leuconostoc lactis

NBRC 102477

Leuconostoc mesenteroides
subsp. cremoris“Leuconostoc mesenteroides
subsp. sake”“Leuconostoc mesenteroides
subsp. sake”
Leuconostoc mesenteroides
subsp. cremoris

Leuconostoc lactis
Leuconostoc citreum

NBRC 107866
NBRC 102476#310 MRS Agar
T

#310 MRS Agar
#310 MRS Agar

Bruker Library名
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC
12007_MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC
12007_1/10MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC
12007_TSYE_NBRC2016
Lactococcus sp. NBRC
14714_MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. cremoris NBRC
100676_MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. cremoris NBRC
100676_1/10MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. cremoris NBRC
100676_TSYE_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. hordniae NBRC
100931_1/10MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. hordniae NBRC
100931_TSYE_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC
100933_MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC
100933_1/10MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC
100933_TSYE_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. tructae NBRC
110453_MRS_NBRC2016

Lactococcus garvieae NBRC
100934_MRS_NBRC2016
Lactococcus formosensis NBRC
109475_MRS_NBRC2016
Lactococcus RD 011256_MRS_NBRC2016
Lactococcus RD 011259_MRS_NBRC2016
Lactococcus RD 011262_MRS_NBRC2016

Lactococcus garvieae JCM
8735_MRS_NBRC2016
Lactococcus raffinolactis NBRC
100932_1/10MRS_NBRC2016
Lactococcus raffinolactis NBRC
100932_TSYE_NBRC2016
Lactococcus plantarum NBRC
100936_1/10MRS_NBRC2016
Lactococcus plantarum NBRC
100936_TSYE_NBRC2016
Lactococcus taiwanensis NBRC
109049_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp.
dextranicum NBRC 3349_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp.
suionicum NBRC 3426_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp.
mesenteroides NBRC
3832_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp.
mesenteroides NBRC
12060_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp.
dextranicum NBRC
100495_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp.
mesenteroides NBRC
100496_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp.
cremoris NBRC 102479_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp. sake
NBRC 102480_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp. sake
NBRC 102481_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp.
cremoris NBRC 107766_MRS_NBRC2016
Leuconostoc lactis NBRC
12455_MRS_NBRC2016
Leuconostoc sp. NBRC
102475_MRS_NBRC2016
Leuconostoc lactis NBRC
102477_MRS_NBRC2016
Leuconostoc lactis NBRC
107866_MRS_NBRC2016
Leuconostoc citreum NBRC
102476_MRS_NBRC2016

DATA数SuperSpectrum名

DATA数

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16
16

16
Lactococcus_lactis_NBRCs
uperspectrum2016

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16
16
16
16

Lactococcus_garvieae/form
osensis_NBRCsuperspectr
um2016

16
16
16
16
16
16

16
16
16
16
16

Lactococcus_raffinolactis_N
BRC100932_NBRCsupersp
ectrum201616

Lactococcus_plantarum_N
BRC100936_NBRCsupersp
ectrum201616

Lactococcus_taiwanensis_
NBRC109049_NBRCsuper
spectrum2016

16

16
16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

Leuconostoc_mesenteroides_NBRCsuperspectrum201
6

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16

16
16

Leuconostoc_lactis_NBRCs
uperspectrum2016

16
16

16
16
16

Leuconostoc_citreum_NBR
C102476_NBRCsuperspect
rum2016167

乳酸菌 Biotyper用 MSPデータのデンドログラム（MRS Agar, 1/10希釈MRS Agar, TSYE Agar, 嫌気, 2日 30℃,ギ酸/アセニト-HCCA）

Lactococcus spp.

1000

900

800

700

600

500

400

300

200

100

0

Leuconostoc pseudomesenteroides DSM 5624 DSM
Leuconostoc pseudomesenteroides DSM 20193T DSM
Leuconostoc sp. NBRC 110407
Leuconostoc inhae DSM 15101T LGL
Leuconostoc gelidum DSM 5578T LGL
Leuconostoc holzapfelii NBRC 110136TT
Leuconostoc holzapfelii NBRC 110136
Leuconostoc holzapfelii DSM 21478T LGL
Leuconostoc lactis NBRC 107866_MRS_NBRC2016
Leuconostoc lactis NBRC 107866T
Leuconostoc sp. NBRC 102475_MRS_NBRC2016
Leuconostoc lactis NBRC 12455_MRS_NBRC2016
Leuconostoc lactis NBRC 102477_MRS_NBRC2016
Leuconostoc lactis DSM 8581 DSM
Leuconostoc lactis DSM 20202T DSM
Leuconostoc lactis DSM 20192 DSM
Leuconostoc palmae NBRC 110137T
Leuconostoc palmae NBRC 110137T
Leuconostoc palmae DSM 21144T LGL
Leuconostoc citreum RV_3 LBK
Leuconostoc citreum NBRC 102476_MRS_NBRC2016
Leuconostoc citreum DSM 20188 DSM
Leuconostoc citreum DSM 5577T DSM
Leuconostoc citreum 24_A354 MHH
Leuconostoc mesenteroides ssp mesenteroides DSM 20240 DSM
Leuconostoc carnosum DSM 5576T LGL
Leuconostoc mesenteroides subsp. Mesenteroides NBRC 12060
Leuconostoc mesenteroides ssp mesenteroides DSM 20343T DSM
Leuconostoc mesenteroides ssp mesenteroides DSM 20241
DSM
Leuconostoc mesenteroides ssp cremoris DSM 20346T DSM
Leuconostoc mesenteroides ssp cremoris DSM 20200 DSM
Leuconostoc mesenteroides subsp.mesenteroides NBRC 3426
Leuconostoc mesenteroides subsp. suionicum NBRC 3426_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides ssp dextranicum DSM 20187 DSM
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides NBRC 12060_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp. sake NBRC 102480_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp. NBRC 107766T
Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris NBRC 107766_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris NBRC 102479_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp. Mesenteroides NBRC 100496T
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides NBRC 100496_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides NBRC 3349
Leuconostoc mesenteroides NBRC 102480T
Leuconostoc mesenteroides NBRC 100495
Leuconostoc mesenteroides subsp. dextranicum NBRC 100495_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides NBRC 102481
Leuconostoc mesenteroides subsp. sake NBRC 102481_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp. dextranicum NBRC 3349_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides NBRC 3832_MRS_NBRC2016
Leuconostoc mesenteroides NBRC 110676

Leuconostoc spp.
Distance Level
1000

8

900

800

700

600

500

400

Lactococcus taiwanensis NBRC
109049_MRS_NBRC2016
Lactococcus sp. NBRC 109049T
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 12007_110MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. hordniae NBRC 100931_TSYE_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. hordniae NBRC 100931_110MRS_NBRC2016
T
Lactococcus lactis subsp. hordniae NBRC 100931
Lactococcus lactis ssp hordniae DSM 20450T DSM
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 12007_TSYE_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 12007_MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis ssp lactis 3C1_QSA IBS
Lactococcus lactis ssp lactis DSM 20481T DSM
Lactococcus lactis subsp. tructae
NBRC 110453_MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis NBRC 110453T
Lactococcus lactis subsp. cremoris NBRC 100676_TSYE_NBRC2016
Lactococcus lactis ssp lactis DSM 20661 DSM
Lactococcus lactis ssp lactis DSM 20384 DSM
Lactococcus lactis NBRC 12007
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 100933_TSYE_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. cremoris NBRC 100676_MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. cremoris NBRC 100676_110MRS_NBRC2016
Lactococcus sp. NBRC 14714_MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 100933_MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis subsp. lactis TNBRC 100933_110MRS_NBRC2016
Lactococcus lactis NBRC 100933
Lactococcus lactis ssp lactis DSM 20175 DSM
Lactococcus lactis ssp cremoris DSM 20388TDSM
Lactococcus lactis ssp cremoris DSM 20069
DSM
Lactococcus lactis ssp tructae DSM 21502T DSM
Lactococcus lactis IBS_MS_6 IBS
Lactococcus raffinolactis NBRC 100932T
Lactococcus raffinolactis NBRC 100932_TSYE_NBRC2016
Lactococcus raffinolactis NBRC 100932_110MRS_NBRC2016
Lactococcus raffinolactis DSM 20443T DSM
Lactococcus plantarum NBRC 100936_110MRS_NBRC2016
Lactococcus plantarum NBRC 100936T
Lactococcus plantarum NBRC 100936_TSYE_NBRC2016
T DSM
Lactococcus plantarum DSM 20686
Lactococcus piscium DSM 6634T LGL
Lactococcus termitis NBRC 112715T
Lactococcus nasutitermitis NBRC 111537TT_814
Lactococcus nasutitermitis NBRC 111537 _310
Lactococcus garvieae DSM 20385 DSM
Lactococcus garvieae DSM 6783 DSM
Lactococcus formosensis NBRC
109475_MRS_NBRC2016
Lactococcus sp. NBRC 109475T T
Lactococcus garvieae DSM 20684 DSM
Lactococcus garvieae NBRC 100934_MRS_NBRC2016
Lactococcus garvieae JCM 8735_MRS_NBRC2016
Lactococcus garvieae NBRC 100934T
Lactococcus sp. RD 011256_MRS_NBRC2016
Lactococcus sp. RD 011262_MRS_NBRC2016
Lactococcus sp. RD 011259_MRS_NBRC2016

300

200

100

0

ライブラリーの詳細 2
シュードモナス属は土壌などあらゆる環境に広く分布する細菌で、多様な分解能力に富むグラム陰性の桿菌です。特に Pseudomonas putida は、
その優れた油分解能力により環境浄化（バイオレメディエーション）に利用可能として世界で初めて特許登録された種です。

シュードモナス
Pseudomonas
putida
11 種,77 株
Bio
typer

Super
Spectraこの P. putida グループは16S rRNA配列だけでは近縁種同士の識別が難しかったところ、我々のSuperSpectraライブラリーでは、近縁種と明確に区別することが可能になった事に加えて、種 P. putida が更に細かくﾊﾞｲｵﾏｰｶｰ 13グループに分かれることが示唆されました。
構築中

表２. Pseudomonas putida 類縁菌のライブラリーの内訳（Heart Infusion Agar, 好気, 20時間, 30℃,ギ酸/アセニト-HCCA又はCHCA）
学名

供試株
T

Bruker Library名

Data数

SuperSpectrum名

Data数

1 Pseudomonas monteilii

NBRC 103158

Pseudomonas monteilii NBRC103158_HIA_NBRC2017

16

11

2 Pseudomonas sp.

NBRC 111118

Pseudomonas sp. NBRC 111118_HIA_NBRC2017

16

20

3 Pseudomonas putida

NBRC 100650

Pseudomonas putida NBRC 100650_HIA_NBRC2017

16

20

4 Pseudomonas sp.

NBRC 111121

Pseudomonas sp. NBRC 111121_HIA_NBRC2017

16

13

5 Pseudomonas sp.

NBRC 111122

Pseudomonas sp. NBRC 111122_HIA_NBRC2017

16

14

6 Pseudomonas sp.

NBRC 111125

Pseudomonas sp. NBRC 111125_HIA_NBRC2017

16

19

7 Pseudomonas sp.

NBRC 111133

Pseudomonas sp. NBRC 111133_HIA_NBRC2017

16

10

8 Pseudomonas sp.

NBRC 111136

Pseudomonas sp. NBRC 111136_HIA_NBRC2017

16

10
Pseudomonas_putida_Group_I+V_
NBRCsuperspectrum2017

9 Pseudomonas sp.

NBRC 111139

Pseudomonas sp. NBRC 111139_HIA_NBRC2017

16

10 Pseudomonas putida

GTC 16473

Pseudomonas putida GTC 16473_HIA_NBRC2017

16

19

11 Pseudomonas putida

GTC 16482

Pseudomonas putida GTC 16482_HIA_NBRC2017

16

18

12 Pseudomonas putida

NBRC 110654

Pseudomonas putida NBRC 110654_HIA_NBRC2017

16

12

13 Pseudomonas putida

NBRC 12668

Pseudomonas putida NBRC 12668_HIA_NBRC2017

16

13

14 Pseudomonas putida

NBRC 100988

Pseudomonas putida NBRC 100988_HIA_NBRC2017

16

14

15 Pseudomonas putida

NBRC 101019

Pseudomonas putida NBRC 101019_HIA_NBRC2017

16

15

16 Pseudomonas putida

NBRC 109109

Pseudomonas putida NBRC 109109_HIA_NBRC2017

16

14

17 Pseudomonas putida

NBRC 109110

Pseudomonas putida NBRC 109110_HIA_NBRC2017

16

14

18 Pseudomonas sp.

NBRC 111132

Pseudomonas sp. NBRC 111132_HIA_NBRC2017

16

19 Pseudomonas sp.

NBRC 111140

Pseudomonas sp. NBRC 111140_HIA_NBRC2017

16

T

17

Pseudomonas_putida_Group_II_NB
RCsuperspectrum2017

12

Pseudomonas_putida_Group_III_NB
RCsuperspectrum2017

12

Pseudomonas_putida_Group_IV_N
BRCsuperspectrum2017

10

17

20 Pseudomonas putida

NBRC 14164

Pseudomonas putida NBRC 14164_HIA_NBRC2017

16

21 Pseudomonas putida

NBRC 110666

Pseudomonas putida NBRC 110666_HIA_NBRC2017

16

22 Pseudomonas sp.

NBRC 111134

Pseudomonas sp. NBRC 111134_HIA_NBRC2017

16

23 Pseudomonas sp.

NBRC 111141

Pseudomonas sp. NBRC 111141_HIA_NBRC2017

16

24 Pseudomonas sp.

NBRC 111120

Pseudomonas sp. NBRC 111120_HIA_NBRC2017

16

12

25 Pseudomonas sp.

NBRC 111126

Pseudomonas sp. NBRC 111126_HIA_NBRC2017

16

20

26 Pseudomonas sp.

NBRC 111127

Pseudomonas sp. NBRC 111127_HIA_NBRC2017

16

27 Pseudomonas sp.

NBRC 111128

Pseudomonas sp. NBRC 111128_HIA_NBRC2017

16

28 Pseudomonas sp.

NBRC 111129

Pseudomonas sp. NBRC 111129_HIA_NBRC2017

16

10

29 Pseudomonas sp.

NBRC 111144

Pseudomonas sp. NBRC 111144_HIA_NBRC2017

16

16

30 Pseudomonas monteilii

GTC 16481

Pseudomonas monteilii GTC 16481_HIA_NBRC2017

16

11

14

20

12
Pseudomonas_putida_Group_VII_N
BRCsuperspectrum2017

11（次項へ続く）9

表２（続き）. Pseudomonas putida 類縁菌のライブラリーの内訳
学名

供試株

Bruker Library名

Data数

SuperSpectrum名

Data数

31 Pseudomonas putida

NBRC 12996

Pseudomonas putida NBRC 12996_HIA_NBRC2017

16

12

32 Pseudomonas putida

NBRC 15366

Pseudomonas putida NBRC 15366_HIA_NBRC2017

16

16

33 Pseudomonas putida

NBRC 109347 Pseudomonas putida NBRC 109347_HIA_NBRC2017

16

15

34 Pseudomonas putida

NBRC 109348 Pseudomonas putida NBRC 109348_HIA_NBRC2017

16

15

35 Pseudomonas putida

NBRC 109349 Pseudomonas putida NBRC 109349_HIA_NBRC2017

16

36 Pseudomonas putida

NBRC 109350 Pseudomonas putida NBRC 109350_HIA_NBRC2017

16

37 Pseudomonas putida

NBRC 110474 Pseudomonas putida NBRC 110474_HIA_NBRC2017

16

15

38 Pseudomonas putida

NBRC 110475 Pseudomonas putida NBRC 110475_HIA_NBRC2017

Pseudomonas_putida_Group_VIII_
NBRCsuperspectrum2017

14
16

16

14

Pseudomonas plecoglossicida NBRC
39 Pseudomonas plecoglossicida NBRC 108619
108619_HIA_NBRC2017

16

13

40 Pseudomonas sp.

NBRC 102089 Pseudomonas sp. NBRC 102089_HIA_NBRC2017

16

11

41 Pseudomonas sp.

NBRC 111142 Pseudomonas sp. NBRC 111142_HIA_NBRC2017

16

42 Pseudomonas sp.

NBRC 111143 Pseudomonas sp. NBRC 111143_HIA_NBRC2017

16

43 Pseudomonas sp.

NBRC 111137 Pseudomonas sp. NBRC 111137_HIA_NBRC2017

16

44 Pseudomonas sp.

NBRC 111138 Pseudomonas sp. NBRC 111138_HIA_NBRC2017

16

45 Pseudomonas sp.

NBRC 111117 Pseudomonas sp. NBRC 111117_HIA_NBRC2017

16

46 Pseudomonas putida

NBRC 3738

Pseudomonas putida NBRC 3738_HIA_NBRC2017

16

47 Pseudomonas sp.

NBRC 111130 Pseudomonas sp. NBRC 111130_HIA_NBRC2017

16

48 Pseudomonas putida

NBRC 110482 Pseudomonas putida NBRC 110482_HIA_NBRC2017

16

49 Pseudomonas sp.

NBRC 111119 Pseudomonas sp. NBRC 111119_HIA_NBRC2017

16

50 Pseudomonas parafulva

T

NBRC 16636

Pseudomonas parafulva NBRC 16636_HIA_NBRC2017

16

51 Pseudomonas parafulva

NBRC 16635

Pseudomonas parafulva NBRC 16635_HIA_NBRC2017

16

52 Pseudomonas fulva

T

NBRC 16637

Pseudomonas fulva NBRC 16637_HIA_NBRC2017

16

53 Pseudomonas fulva

NBRC 16638

Pseudomonas fulva NBRC 16638_HIA_NBRC2017

16

54 Pseudomonas fulva

NBRC 16639

Pseudomonas fulva NBRC 16639_HIA_NBRC2017

16

NBRC
55 Pseudomonas cremoricolorata
110779T

Pseudomonas cremoricolorata NBRC
110779_HIA_NBRC2017

16

56 Pseudomonas sp.

Pseudomonas sp. NBRC 13558_HIA_NBRC201716

NBRC 13558

NBRC
57 Pseudomonas japonica
103040T
NBRC
58 Pseudomonas plecoglossicida
103162T
59 Pseudomonas alkylphenolica
60 Pseudomonas taiwanensis
61 Pseudomonas mosselii

Pseudomonas japonica NBRC 103040_HIA_NBRC2017

JCM 16553T
T

DSM 21245

T

DSM 17497

Pseudomonas plecoglossicida NBRC
103162_HIA_NBRC2017
Pseudomonas alkylphenolica JCM
16553_HIA_NBRC2017
Pseudomonas taiwanensis DSM
21245_HIA_NBRC2017

16
16
16
16

Pseudomonas mosselii DSM 17497_HIA_NBRC2017

16
16

62 Pseudomonas vranovensis

DSM 16006

Pseudomonas vranovensis DSM
16006_HIA_NBRC2017

63 Pseudomonas monteilii

GTC 10897

Pseudomonas monteilii GTC 10897_HIA_NBRC2017

16

64 Pseudomonas monteilii

GTC 10899

Pseudomonas monteilii GTC 10899_HIA_NBRC2017

16

65 Pseudomonas sp.

NBRC 111123 Pseudomonas sp. NBRC 111123_HIA_NBRC2017

16

66 Pseudomonas sp.

NBRC 111124 Pseudomonas sp. NBRC 111124_HIA_NBRC2017

16

67 Pseudomonas sp.

NBRC 111131 Pseudomonas sp. NBRC 111131_HIA_NBRC2017

16

68 Pseudomonas sp.

NBRC 111135 Pseudomonas sp. NBRC 111135_HIA_NBRC2017

16

69 Pseudomonas putida

NBRC 12653

Pseudomonas putida NBRC 12653_HIA_NBRC2017

16

70 Pseudomonas putida

NBRC 13696

Pseudomonas putida NBRC 13696_HIA_NBRC2017

16

71 Pseudomonas putida

NBRC 14671

Pseudomonas putida NBRC 14671_HIA_NBRC2017

16

72 Pseudomonas putida

NBRC 14796

Pseudomonas putida NBRC 14796_HIA_NBRC2017

16

73 Pseudomonas putida

NBRC 101020 Pseudomonas putida NBRC 101020_HIA_NBRC2017

16

74 Pseudomonas putida

NBRC 102090 Pseudomonas putida NBRC 102090_HIA_NBRC2017

16

75 Pseudomonas putida

NBRC 102092 Pseudomonas putida NBRC 102092_HIA_NBRC2017

16

76 Pseudomonas putida

NBRC 102093 Pseudomonas putida NBRC 102093_HIA_NBRC2017

16

77 Pseudomonas putida

NBRC 110667 Pseudomonas putida NBRC 110667_HIA_NBRC2017

16

10

T

Pseudomonas_putida_Group_X_N
BRCsuperspectrum2017

918

Pseudomonas_putida_Group_XI_N
BRCsuperspectrum2017

20

Pseudomonas_putida_Group_XII_N
BRCsuperspectrum2017

12

Pseudomonas_putida_Group_XIII_NBRCsuperspectrum2017

9

20

15

15
14

Pseudomonas_parafulva_NBRCsup
erspectrum2017

11
16
14

Pseudomonas_fulva_NBRCsupersp
ectrum2017

16
13

Pseudomonas_cremoricolorata_NB
RCsuperspectrum2017
Pseudomonas_japonica_NBRC1030
40_NBRCsuperspectrum2017
Pseudomonas_plecoglossicida_NBR
C103162_NBRCsuperspectrum2017
Pseudomonas_alkylphenolia_JCM16
553_NBRCsuperspectrum2017
Pseudomonas_taiwanesis_DSM2124
5_NBRCsuperspectrum2017
Pseudomonas_mosselii_DSM17497_NBRCsuperspectrum2017
Pseudomonas_vranovensis_DSM16
006_NBRCsuperspectrum2017
Pseudomonas_monteilii_GTC10897_
NBRCsuperspectrum2017
Pseudomonas_monteilii_GTC10899_
NBRCsuperspectrum2017

14
12
10
13
13
18
20
19
10
19

シュードモナス・プチダ 類縁菌 SARAMISTM用 SuperSpectra（Heart Infusion Agar, 好気, 20時間, 30℃,ギ酸/アセニト-CHCA）
Similarity (%)
20 30 40 50 60 70 80 90 100110

Consensus
Peaks

Total
File数

superspectrum_Pseudomonas_aeruginosa_7_

3114superspectrum_Pseudomonas_aeruginosa_9_

4025

superspectrum_Pseudomonas_aeruginosa_0_DSM 50071T_1_

3251

superspectrum_Pseudomonas_aeruginosa_10_

4727

superspectrum_Pseudomonas_aeruginosa_11_

4319superspectrum_Pseudomonas_nitroreducens_1_

68

4

superspectrum_Pseudomonas_sp._8_

52

14

superspectrum_Pseudomonas_citronellolis/delhiensis_1_

53

4

superspectrum_Pseudomonas_sp._4_

52

14

superspectrum_Pseudomonas_sp._6_

60

14

superspectrum_Pseudomonas_stutzeri_1_

54

11

superspectrum_Pseudomonas_stutzeri_4_

35

12superspectrum_Pseudomonas_stutzeri_5_

4512superspectrum_Pseudomonas_fluorescens_2_

31

16

superspectrum_Pseudomonas_fluorescens_6_

1065

superspectrum_Pseudomonas_fluorescens_7_

388

superspectrum_Pseudomonas_fluorescens_5_

28

16

Pseudomonas_putida_Group_XI_NBRCsuperspectrum2017

47

40

superspectrum_Pseudomonas_sp._9_

44

8superspectrum_Pseudomonas_sp._7_

43

11

Pseudomonas_alkylphenolia_JCM16553_NBRCsuperspectrum2017

38

13

Pseudomonas_putida_Group_XII_NBRCsuperspectrum2017

46

27

Pseudomonas_vranovensis_DSM16006_superspectrum2017

52

19

Pseudomonas_japonica_NBRC103040_NBRCsuperspectrum2017

53

10

superspectrum_Pseudomonas_putida_11_

4716

superspectrum_Pseudomonas_sp._2_

46

10

superspectrum_Pseudomonas_putida_9_

38

6

Pseudomonas_putida_Group_I+V_NBRCsuperspectrum2017

43

253

Pseudomonas_putida_Group_VIII_NBRCsuperspectrum2017

45

141

Pseudomonas_putida_Group_XIII_NBRCsuperspectrum2017

42

24

Pseudomonas_putida_Group_III_NBRCsuperspectrum2017

48

26

superspectrum_Pseudomonas_putida_10_

58

10

Pseudomonas_putida_Group_VII_NBRCsuperspectrum2017

47

92

Pseudomonas_monteilii_GTC10897_NBRCsuperspectrum2017

47

10superspectrum_Pseudomonas_putida_8_

46

9superspectrum_Pseudomonas_putida_7_

47

20

Pseudomonas_putida_Group_II_NBRCsuperspectrum2017

47

29

Pseudomonas_mosselii_DSM17497_NBRCsuperspectrum2017

42

20

Pseudomonas_fulva_NBRCsuperspectrum2017

51

43

Pseudomonas_plecoglossicida_NBRC103162_NBRCsuperspectrum2017

39

13

Pseudomonas_putida_Group_IV_NBRCsuperspectrum2017

44

30

Pseudomonas_parafulva_NBRCsuperspectrum2017

50

41

Pseudomonas_monteilii_GTC10899_NBRCsuperspectrum2017

46

19

superspectrum_Pseudomonas_putida_12_

47

7

Pseudomonas_taiwanesis_DSM21245_NBRCsuperspectrum2017

48

18

Pseudomonas_putida_Group_X_NBRCsuperspectrum2017

51

27

Pseudomonas_cremoricolorata_NBRCsuperspectrum2017

44

26

superspectrum_Pseudomonas_fluorescens_1_

53

7

superspectrum_Pseudomonas_pseudoalcaligenes_1_

54

4

superspectrum_Pseudomonas_sp._5_

40

9superspectrum_Pseudomonas_oryzihabitans_3_

58

8

superspectrum_Pseudomonas_oryzihabitans_4_

55

11

superspectrum_Pseudomonas_luteola_1_

4211superspectrum_Pseudomonas_luteola_2_

28

9superspectrum_Pseudomonas_luteola_3_47

9SuperSpectrum name（太字がNBRC製）

11

シュードモナス・プチダ類縁菌 Biotyper用 MSPデータのデンドログラム（Heart Infusion Agar, 好気, 20時間, 30℃,ギ酸/アセニト-HCCA）
Pseudomonas sp. NBRC 111135_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111138_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111137_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 101020_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 14796_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 12653_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 13696_HIA_NBRC2017
Pseudomonas japonica NBRC 103040_HIA_NBRC2017
Pseudomonas vranovensis DSM 16006_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111117_HIA_NBRC2017
Pseudomonas alkylphenolia JCM 16553_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 102093_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 3738_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111143_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111142_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 102090_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 13558_HIA_NBRC2017
Pseudomonas cremoricolorata NBRC 110779_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 102092_HIA_NBRC2017
Pseudomonas mosselii DSM 17497_HIA_NBRC2017
Pseudomonas taiwanensis DSM 21245_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 102089_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 15366_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111141_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111134_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111131_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111133_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111144_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111128_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111126_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111127_HIA_NBRC2017
Pseudomonas monteilii GTC 16481_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111129_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111120_HIA_NBRC2017
Pseudomonas plecoglossicida NBRC 103162_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111123_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111119_HIA_NBRC2017
Pseudomonas parafulva NBRC 16636_HIA_NBRC2017
Pseudomonas parafulva NBRC 16635_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111124_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111130_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 110482_HIA_NBRC2017
Pseudomonas plecoglossicida NBRC 108619_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 110475_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 110474_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 109350_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 109348_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 109349_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 109347_HIA_NBRC2017
Pseudomonas monteilii GTC 10899_HIA_NBRC2017
Pseudomonas fulva NBRC 16639_HIA_NBRC2017
Pseudomonas fulva NBRC 16637_HIA_NBRC2017
Pseudomonas fulva NBRC 16638_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 12996_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111140_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111132_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 14164_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 14671_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111139_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111136_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111118_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111125_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111122_HIA_NBRC2017
Pseudomonas monteilii NBRC103158_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 110667_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 110666_HIA_NBRC2017
Pseudomonas monteilii GTC 10897_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 109109_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 100988_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 101019_HIA_NBRC2017
Pseudomonas sp. NBRC 111121_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 100650_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 110654_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 12668_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida NBRC 109110_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida GTC 16482_HIA_NBRC2017
Pseudomonas putida GTC 16473_HIA_NBRC2017

Pseudomonas putida
and related species

1000

900

800

700

600

500

400

Distance Level

12

300

200

100

0

ライブラリーの詳細 3
ノカルディア
Nocardia spp.

放線菌の仲間で、土壌中に広く存在します。ノカルディア属は絶対好気性の抗酸性か部分的に抗酸性で、一般に長い菌糸状で、やがてそれが分断して桿状または球状の細胞となります。一方、ヒトや動物に対して、ノカルディア症（日和見感染症）の原因となる種（Nocardia asteroides, N.

81 種, 96 株

brasiliensis, N. farcinica, N. nova, N. otitidiscaviarum, N.
transvalensis など）が存在します。また、 N. vaccinii は植物へ、 N.
salmonicida は魚類への病原性が報告されています。
3種、N. soli, N. salmonicida, N. cummidelensは我々のライブラリー

Super
Spectraでは区別することができなかったため、１つのSuperSpectraとしてライブラリーが構築されています。

表3. ノカルディア属のライブラリーの内訳（Heart Infusion/ISP2/TSS/#229 Agar等。好気, 2日, 25/28/37℃,ギ酸/アセニト-CHCA）
学名

供試株

SuperSpectrum名T

Data数/培地

1 Nocardia inohanensis

NBRC 100128

Nocardia_inohanensis_NBRC100128_NBRCsuperspectrum2017

16

2 Nocardia asiatica

NBRC 100129T

Nocardia_asiatica_NBRC100129_NBRCsuperspectrum2017

16

3 Nocardia yamanashiensis

NBRC 100130T

Nocardia_yamanashiensis_NBRC100130_NBRCsuperspectrum2017

16

T

4 Nocardia niigatensis

NBRC 100131

Nocardia_niigatensis_NBRC100131_NBRCsuperspectrum2017

16

5 Nocardia higoensis

NBRC 100133T

Nocardia_higoensis_NBRC100133_NBRCsuperspectrum2017

16

6 Nocardia shimofusensis

NBRC 100134T

Nocardia_shimofusensis_NBRC100134_NBRCsuperspectrum2017

16

T

7 Nocardia araoensis

NBRC 100135

Nocardia_araoensis_NBRC100135_NBRCsuperspectrum2017

16

8 Nocardia pneumoniae

NBRC 100136T

Nocardia_pneumoniae_NBRC100136_NBRCsuperspectrum2017

16

9 Nocardia arthritidis

NBRC 100137T

Nocardia_arthritidis_NBRC100137_NBRCsuperspectrum2017

16

T

10 Nocardia crassostreae

NBRC 100342

Nocardia_crassostreae_NBRC100342_NBRCsuperspectrum2017

16

11 Nocardia pseudovaccinii

NBRC 100343T

Nocardia_pseudovaccinii_NBRC100343_NBRCsuperspectrum2017

16

12 Nocardia veterana

NBRC 100344T

Nocardia_veterana_NBRC100344_NBRCsuperspectrum2017

16T

13 Nocardia sienata

NBRC 100364

Nocardia_sienata_NBRC100364_NBRCsuperspectrum2017

16

14 Nocardia testacea

NBRC 100365T

Nocardia_testacea_NBRC100365_NBRCsuperspectrum2017

16

15 Nocardia paucivorans

NBRC 100373T

Nocardia_paucivorans_NBRC100373_NBRCsuperspectrum2017

16T

16 Nocardia abscessus

NBRC 100374

Nocardia_abscessus_NBRC100374_NBRCsuperspectrum2017

16

17 Nocardia cyriacigeorgica

NBRC 100375T

Nocardia_cyriacigeorgica_NBRC100375_NBRCsuperspectrum2017

16

18 Nocardia fluminea

NBRC 100377T

Nocardia_fluminea_NBRC100377_NBRCsuperspectrum2017

16

19 Nocardia africana

T

NBRC 100379

Nocardia_africana_NBRC100379_NBRCsuperspectrum2017

16

20 Nocardia vermiculata

NBRC 100427T

Nocardia_vermiculata_NBRC100427_NBRCsuperspectrum2017

16

21 Nocardia thailandica

NBRC 100428T

Nocardia_thailandica_NBRC100428_NBRCsuperspectrum2017

16T

22 Nocardia concava

NBRC 100430

Nocardia_concava_NBRC100430_NBRCsuperspectrum2017

16

23 Nocardia anaemiae

NBRC 100462T

Nocardia_anaemiae_NBRC100462_NBRCsuperspectrum2017

16

24 Nocardia exalbida

NBRC 100660T

Nocardia_exalbida_NBRC100660_NBRCsuperspectrum2017

16

25 Nocardia terpenica

NBRC 100888T

Nocardia_terpenica_NBRC100888_NBRCsuperspectrum2017

16

T

26 Nocardia cerradoensis

NBRC 101014

Nocardia_cerradoensis_NBRC101014_NBRCsuperspectrum2017

16

27 Nocardia tenerifensis

NBRC 101015T

Nocardia_tenerifensis_NBRC101015_NBRCsuperspectrum2017

1628 Nocardia kruczakiae

NBRC 101016T

Nocardia_kruczakiae_NBRC101016_NBRCsuperspectrum2017

1629 Nocardia sp.

NBRC 101287

Nocardia_sp._NBRC101287_NBRCsuperspectrum2017

1630 Nocardia xishanensis

NBRC 101358T

Nocardia_xishanensis_NBRC101358_NBRCsuperspectrum2017

16

31 Nocardia jiangxiensis

NBRC 101359T

Nocardia_jiangxiensis_NBRC101359_NBRCsuperspectrum2017

16

32 Nocardia amamiensis

T

NBRC 102102

Nocardia_amamiensis_NBRC102102_NBRCsuperspectrum2017

16

33 Nocardia jejuensis

NBRC 103114T

Nocardia_jejuensis_NBRC103114_NBRCsuperspectrum2017

16

34 Nocardia pseudobrasiliensis

NBRC 108224T

Nocardia_pseudobrasiliensis_NBRC108224_NBRCsuperspectrum2017

16T

35 Nocardia flavorosea

NBRC 108225

Nocardia_flavorosea_NBRC108225_NBRCsuperspectrum2017

16

36 Nocardia caishijiensis

NBRC 108228T

Nocardia_caishijiensis_NBRC108228_NBRCsuperspectrum2017

16

37 Nocardia neocaledoniensis

NBRC 108232T

Nocardia_neocaledoniensis_NBRC108232_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_puris_NBRC108233_NBRCsuperspectrum2017

16

38 Nocardia puris

T

NBRC 108233（次項へ続く）13

表3（続き）. ノカルディア属のライブラリーの内訳
学名SuperSpectrum名

Data数/培地

NBRC 108234T

Nocardia_alba_NBRC108234_NBRCsuperspectrum2017

16

40 Nocardia elegans

NBRC 108235T

Nocardia_elegans_NBRC108235_NBRCsuperspectrum2017

16

41 Nocardia miyunensis

T

NBRC 108239

Nocardia_miyunensis_NBRC108239_NBRCsuperspectrum2017

1642 Nocardia lijiangensis

NBRC 108240T

Nocardia_lijiangensis_NBRC108240_NBRCsuperspectrum2017

16

43 Nocardia gamkensis

T

NBRC 108242

Nocardia_gamkensis_NBRC108242_NBRCsuperspectrum2017

16

44 Nocardia mexicana

NBRC 108244T

Nocardia_mexicana_NBRC108244_NBRCsuperspectrum2017

1645 Nocardia ninae

NBRC 108245T

Nocardia_ninae_NBRC108245_NBRCsuperspectrum2017

16

46 Nocardia altamirensis

T

NBRC 108246

Nocardia_altamirensis_NBRC108246_NBRCsuperspectrum2017

16

47 Nocardia acidivorans

NBRC 108247T

Nocardia_acidivorans_NBRC108247_NBRCsuperspectrum2017

16

48 Nocardia harenae

NBRC 108248T

Nocardia_harenae_NBRC108248_NBRCsuperspectrum2017

16

49 Nocardia jinanensis

T

NBRC 108249

Nocardia_jinanensis_NBRC108249_NBRCsuperspectrum2017

16

50 Nocardia speluncae

NBRC 108251T

Nocardia_speluncae_NBRC108251_NBRCsuperspectrum2017

1651 Nocardia endophytica

NBRC 108773T

Nocardia_endophytica_NBRC108773_NBRCsuperspectrum2017

16

T

52 Nocardia mikamii

NBRC 108933

Nocardia_mikamii_NBRC108933_NBRCsuperspectrum2017

1653 Nocardia niwae

NBRC 108934T

Nocardia_niwae_NBRC108934_NBRCsuperspectrum2017

1654 Nocardia vulneris

NBRC 108936T

Nocardia_vulneris_NBRC108936_NBRCsuperspectrum2017

16

T

55 Nocardia amikacinitolerans

NBRC 108937

Nocardia_amikacinitolerans_NBRC108937_NBRCsuperspectrum2017

1656 Nocardia rhamnosiphila

NBRC 108938T

Nocardia_rhamnosiphila_NBRC108938_NBRCsuperspectrum2017

16

T

57 Nocardia grenadensis

NBRC 108939

Nocardia_grenadensis_NBRC108939_NBRCsuperspectrum2017

16

58 Nocardia brevicatena

NBRC 12119T

Nocardia_brevicatena_NBRC12119_NBRCsuperspectrum2017

1659 Nocardia uniformis

NBRC 13702T

Nocardia_uniformis_NBRC13702_NBRCsuperspectrum2017

16

T

60 "Nocardia fusca"

NBRC 14340

Nocardia_fusca_NBRC14340_NBRCsuperspectrum2017

1661 Nocardia brasiliensis

NBRC 14402T

Nocardia_brasiliensis_NBRC14402_NBRCsuperspectrum2017

16

62 Nocardia carnea

NBRC 14403T

Nocardia_carnea_NBRC14403_NBRCsuperspectrum2017

16

T

63 Nocardia otitidiscaviarum

NBRC 14405

Nocardia_otitidiscaviarum_NBRC14405_NBRCsuperspectrum2017

1664 Nocardia asteroides

NBRC 15531T

Nocardia_asteroides_NBRC15531_NBRCsuperspectrum2017

16

65 Nocardia transvalensis

NBRC 15921T

Nocardia_transvalensis_NBRC15921_NBRCsuperspectrum2017

16

T

66 Nocardia vaccinii

NBRC 15922

Nocardia_vaccinii_NBRC15922_NBRCsuperspectrum2017

1667 Nocardia beijingensis

NBRC 16342T

Nocardia_beijingensis_NBRC16342_NBRCsuperspectrum2017

16

68 Nocardia vinacea

NBRC 16497T

Nocardia_vinacea_NBRC16497_NBRCsuperspectrum2017

16

T

69 Nocardia arizonensis

NBRC 108935

Nocardia_arizonensis_NBRC108935_NBRCsuperspectrum2017

16

70 Nocardia shinanoensis

NBRC 109590T

Nocardia_shinanoensis_NBRC109590_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_cummidelens/salmonicida/soli_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_seriolae_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_takedensis_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_farcinica_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_aobensis/violaceofusca_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_exalbida/gamkensis_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_elegans/nova_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_coubleae/ignorata_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia_nova_NBRCsuperspectrum2017

16

Nocardia soli

T

NBRC 100376

71 Nocardia cummidelens

NBRC 100378T

Nocardia salmonicida

NBRC 13393T

72 Nocardia seriolae
73 Nocardia takedensis

74 Nocardia farcinica

75

76

77

78

NBRC 110360,
NBRC 15557T
NBRC 100417T,
NBRC 100418
NBRC 13510,
NBRC 15532T,
NBRC 3384,
NBRC 3423,
NBRC 3424,
NBRC 3927

Nocardia aobensis

NBRC 100429T"Nocardia violaceofusca"

NBRC 14427T

Nocardia exalbida

NBRC 100660T

Nocardia gamkensis

NBRC 108242T

Nocardia nova

NBRC 103080T

Nocardia elegans

NBRC 108235T

Nocardia ignorata

NBRC 108230T

Nocardia coubleae

NBRC 108252T

79 Nocardia nova

14

供試株

39 Nocardia alba

NBRC 103080,
NBRC 15556T

ライブラリーの詳細 4
2019年12月
Biotyper版
公開

キコウジカビAspergillus
oryzae, flavus,
sojae, parasiticus
10 種, 127 株
SuperSpectraBiotyper

世界中に広く分布する糸状菌で、本属の中に1000種近く知られます。
その多くは土壌の腐生菌や空中浮遊菌ですが、コウジカビ（A. oryzae、
A. sojae）は、酒をはじめとする発酵食品製造に使用されます。一方、食品・製品を腐敗・劣化させたり、マイコトキシンを産生したり（A. flavus,
A. parasiticus）、肺疾患を引き起こす種も存在しており、有用菌種と有害菌種が近縁で判別が難しいです。
total タンパクのピークを集めたSuperspectraライブラリーでは、 A.
oryzaeとA. flavusは区別できませんでしたが、A. parasiticus, A. sojae
はそれぞれ区別できることが可能です。

表4-1. キコウジカビの仲間（Aspergillus oryzae, flavus類縁菌）のライブラリーの内訳（Superspectra）（Potato Dextrose Agar, 好気, 10日, 25℃,ギ酸/アセニト-CHCA）
学名

供試株 （NBRC番号）

Aspergillus flavus

4186, 4221, 4230, 4249, 4250, 4251, 4257, 4277,
4295, 5839, 6343, 7600, 8558, 30106, 30107

Aspergillus flavus var. columnaris

5324T, 5768, 5770, 5785

Aspergillus flavus var. flavus

33021

Aspergillus oryzae

4075, 4078, 4079, 4134, 4135, 4136, 4138, 4176,
4177, 4178, 4182, 4183, 4184, 4190, 4191, 4193,
4194, 4202, 4203, 4206, 4209, 4210, 4214, 4215,
4228, 4235, 4240, 4242, 4254, 4255, 4265, 4290,
4296, 4348, 4370, 4379, 4384, 4385, 4390, 4405,
5238, 5240, 5375, 5387, 5388, 5389, 5710, 8871,
30104, 30105, 100537, 110971

Aspergillus oryzae var. brunneus

4083, 4181, 4220, 4261, 4268, 4278, 4377, 5239,
5786, 30102T, 30103, 100959, 109840

Aspergillus oryzae var. oryzae

6215T, 30113T

Aspergillus flavus

4186, 4221, 4249, 4250, 4251, 4277, 5839, 7600,
8558, 30107

Aspergillus flavus var. columnaris

5324T, 5768, 5770, 5785

Aspergillus flavus var. flavus

33021

Aspergillus oryzae

4134, 4135, 4138, 4177, 4178, 4182, 4190, 4191,
4193, 4194, 4202, 4206, 4209, 4214, 4215, 4228,
4254, 4265, 4290, 4296, 4370, 4379, 4384, 4385,
4405, 5238, 5240, 5375, 5387, 5388, 5389, 5710,
8871, 30105, 100537

Aspergillus oryzae var. brunneus

4083, 4181, 4220, 4261, 4278, 5239, 5786, 30102T,
30103, 100959, 109840

Aspergillus oryzae var. oryzae

6215T, 30113T

Aspergillus flavus

4186, 4221, 4230, 4257, 4277, 4295, 6343, 7600,
30106

Aspergillus flavus var. columnaris

5768, 5785

Aspergillus oryzae

4075, 4078, 4079, 4136, 4138, 4176, 4177, 4183,
4184, 4191, 4193, 4203, 4209, 4210, 4215, 4235,
4240, 4242, 4255, 4348, 4385, 4390, 30104, 30105,
110971Aspergillus oryzae var. brunneus

4083, 4220, 4268, 4377

1

2

3

4 Aspergillus sojae

4239, 4241, 4243, 4244T, 4252, 4274, 4279, 4386,
4391, 4403, 5241, 32074, 33082, 33083, 33084,
33085, 33087, 33088

5 Aspergillus sojae

4241, 33084, 33085, 33087, 33088
T

6 Aspergillus parasiticus

4082 , 4301, 7599, 30180, 33222, 33224

7 Aspergillus parasiticus

7540

Aspergillus nomius

8557, 33223T

Aspergillus sp.

RD053757, RD053560, RD053538, RD056499

8
9 Aspergillus tamarii

4099, 4142, 4287, 4347, 4357, 4358, 4359

10 Aspergillus tamarii

4883, 7465

SuperSpectrum名

Data数/株

Aspergillus_flavus/oryzae_01_NBRCsupers
pectrum2017

2

Aspergillus_flavus/oryzae_02_NBRCsupers
pectrum2017

1～2

Aspergillus_flavus/oryzae_03_NBRCsupers
pectrum2017

1～2

Aspergillus_sojae_01_NBRCsuperspectrum
2017

7～25

Aspergillus_sojae_02_NBRCsuperspectrum
2017
Aspergillus_parasiticus_01_NBRCsuperspe
ctrum2017
Aspergillus_parasiticus_02_NBRCsuperspe
ctrum2017
Aspergillus_nomius_01_NBRCsuperspectru
m2017
Aspergillus_tamarii_01_NBRCsuperspectru
m2017
Aspergillus_tamarii_02_NBRCsuperspectru
m2017

16～39
12~16
48
16
16～24
20～24

15

表4-2. キコウジカビの仲間（Aspergillus oryzae, flavus類縁菌）のライブラリーの内訳（Bruker）（Potato Dextrose Agar, 好気, 5日/10日, 25℃,エタノール/ギ酸-HCCA）
学名

供試株（NBRC番号）

1

4186

2

4249

3

4295
Aspergillus flavus

4

6343

5

7600

6

8558

7

5324T

8

5768
Aspergillus var. columnaris

9

5770

10

5785

11

Aspergillus var. flavus

33021

12

4075

13

4078

14

4079

15

4134

16

4177

17

4214
Aspergillus oryzae

18

4405

19

5238

20

5240

21

30104

22

30105

23

100537

24

4181

25

4377

26

5239

Aspergillus oryzae var. brunneus
27

30102T

28

30103

29

1009596215T

30Aspergillus oryzae var. oryzae

30113T

31
32

8557
Aspergillus nomius

33

33223T

Data
数

Bruker Library名
Aspergillus flavus NBRC 4186_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 4186_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 4249_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 4249_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 4295_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 4295_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 6343_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 6343_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 7600_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 7600_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 8558_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 8558_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 5324_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 5324_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 5768_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 5768_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 5770_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 5770_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 5785_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 5785_PDA_10d_FY2019
Aspergillus flavus NBRC 33021_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus flavus NBRC 33021_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 4075_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 4075_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 4078_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 4078_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 4079_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 4079_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 4134_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 4134_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 4177_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 4177_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 4214_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 4214_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 4405_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 4405_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 5238_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 5238_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 5240_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 5240_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 30104_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 30104_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 30105_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 30105_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 100537_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 100537_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 4181_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 4181_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 4377_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 4377_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 5239_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 5239_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 30102_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 30102_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 30103_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 30103_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 100959_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 100959_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 6215_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 6215_PDA_10d_FY2019
Aspergillus oryzae NBRC 30113_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus oryzae NBRC 30113_PDA_10d_FY2019
Aspergillus nomius NBRC 8557_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus nomius NBRC 8557_PDA_10d_FY2019
Aspergillus nomius NBRC 33223_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus nomius NBRC 33223_PDA_10d_FY2019（次項へ続く） 16

16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16

16
16
16
16
16

16
16
16
16
16

16
16
16
16
16

表4-2（続き） キコウジカビの仲間（Aspergillus oryzae, flavus類縁菌）のライブラリーの内訳（Bruker）（Potato Dextrose Agar, 好気, 5日/10日, 25℃,エタノール/ギ酸-HCCA）
学名

供試株（NBRC番号）

34

4099

35

4142

36

4287

37

4347

38

Aspergillus tamarii

4357

39

4358

40

4359

41

4883

42

7465

43

4082T

44

4301

45

7540

46

Aspergillus parasticus

7599

47

30180

48

33222

49

33224

50

4239

51

4241

52

4244T

53

4274

54

4403
Aspergillus sojae

55

5241

56

32074

57

33082

58

30084

59

33085

Bruker Library名

Data
数

Aspergillus tamarii NBRC 4099_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus tamarii NBRC 4099_PDA_10d_FY2019
Aspergillus tamarii NBRC 4122_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus tamarii NBRC 4122_PDA_10d_FY2019
Aspergillus tamarii NBRC 4287_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus tamarii NBRC 4287_PDA_10d_FY2019
Aspergillus tamarii NBRC 4347_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus tamarii NBRC 4347_PDA_10d_FY2019
Aspergillus tamarii NBRC 4357_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus tamarii NBRC 4357_PDA_10d_FY2019
Aspergillus tamarii NBRC 4358_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus tamarii NBRC 4358_PDA_10d_FY2019
Aspergillus tamarii NBRC 4359_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus tamarii NBRC 4359_PDA_10d_FY2019
Aspergillus tamarii NBRC 4883_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus tamarii NBRC 4883_PDA_10d_FY2019
Aspergillus tamarii NBRC 7465_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus tamarii NBRC 7465_PDA_10d_FY2019
Aspergillus parasticus NBRC 4082_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus parasticus NBRC 4082_PDA_10d_FY2019
Aspergillus parasticus NBRC 4301_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus parasticus NBRC 4301_PDA_10d_FY2019
Aspergillus parasticus NBRC 7540_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus parasticus NBRC 7540_PDA_10d_FY2019
Aspergillus parasticus NBRC 7599_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus parasticus NBRC 7599_PDA_10d_FY2019
Aspergillus parasticus NBRC 30180_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus parasticus NBRC 30180_PDA_10d_FY2019
Aspergillus parasticus NBRC 33222_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus parasticus NBRC 33222_PDA_10d_FY2019
Aspergillus parasticus NBRC 33224_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus parasticus NBRC 33224_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 4239_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 4239_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 4241_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 4241_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 4244_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 4244_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 4274_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 4274_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 4403_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 4403_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 5241_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 5241_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 32074_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 32074_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 33082_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 33082_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 33084_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 33084_PDA_10d_FY2019
Aspergillus sojae NBRC 33085_PDA_5d_FY2019,
Aspergillus sojae NBRC 33085_PDA_10d_FY2019

16

16
16
16
16
16

16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16
16

17

キコウジカビのSARAMISTM用 SuperSpectra（Potato Dextrose Agar, 好気, 10days, 25℃,ギ酸/アセニト-CHCA）

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90 100SuperSpectrum name（太字がNBRC製）

Consensus
total file数
Peaks

Aspergillus_flavus/oryzae_01_NBRCsuperspectrum2017

44

174

Aspergillus_flavus/oryzae_02_NBRCsuperspectrum2017

36

110

Aspergillus_flavus/oryzae_03_NBRCsuperspectrum2017

34

64

superspectrum_Aspergillus_flavus/oryzae_0_

46

20

superspectrum_Aspergillus_flavus_8_

3711

superspectrum_Aspergillus_flavus_9_

4212superspectrum_Aspergillus_flavus_1_

34

14

superspectrum_Aspergillus_flavus_6_

3112

superspectrum_Aspergillus_flavus/tamarii_1_

26

14superspectrum_Aspergillus_flavus_4_

425

superspectrum_Aspergillus_flavus/oryzae_1_

30

26

superspectrum_Aspergillus_tamarii_1_

4123

superspectrum_Aspergillus_tamarii_2_

378superspectrum_Aspergillus_tamarii_5_

33

4superspectrum_Aspergillus_tamarii_4_

434superspectrum_Aspergillus_tamarii_3_

39

4

superspectrum_Aspergillus_flavus_3_

329superspectrum_Aspergillus_flavus_5_

33

3

superspectrum_Aspergillus_flavus_2_3814Aspergillus_sojae_01_NBRCsuperspectrum2017

46

277

Aspergillus_sojae_02_NBRCsuperspectrum2017

48

136

Aspergillus_parasiticus_01_NBRCsuperspectrum2017

49

89

superspectrum_Aspergillus_tamarii_6_

434Aspergillus_parasiticus_02_NBRCsuperspectrum2017

36

48

Aspergillus_tamarii_01_NBRCsuperspectrum2017

41

150

Aspergillus_tamarii_02_NBRCsuperspectrum2017

46

44

Aspergillus_nomius_01_NBRCsuperspectrum2017

50

96

superspectrum_Aspergillus_flavus_7_

25

28

superspectrum_Aspergillus_parasiticus_1_

33

31

18

キコウジカビのBiotyper用 MSPデータのデンドログラム

19
A. tamari NBRC 4099

ライブラリーの詳細 ５
アシネトバクター
Acinetobacter
34 種, 71 株

Bio
typer

Super
Spectraアシネトバクター属は、土壌や河川水などの自然環境中に広く生息する
グラム陰性細菌で、約６０種が存在します。環境汚染物質分解菌や原油分
解 菌 な ど の 産 業 上 有 用 な 株 が 存 在 す る 一 方 、 A. baumannii 、 A.
haemolyticus をはじめとする病原菌種が存在し、更にいくつかのアシネ
トバクター属種は多剤耐性を獲得し、世界的な問題となっています。
そこで、安全で有用なアシネトバクター属細菌と、病原性を持つ種を迅
速・正確に識別する方法が求められています。
識別が難しいACB complex (A. calcoaceticus, A. baumannii)も、今回提供するライブラリーを用いることによって識別可能となっています。

表5. Acinetobacter属のライブラリーの内訳（Heart Infusion Agar, 好気, 20時間, 30℃,ギ酸/アセニト-HCCA又はCHCA）
学名

供試株

Bruker Library名

DATA数

T

NBRC 109757

Acinetobacter baumannii NBRC 109757_HIA_NBRC2017

16

13

NBRC 110489

Acinetobacter baumannii NBRC 110489_HIA_NBRC2017

16

12

NBRC 110493

Acinetobacter baumannii NBRC 110493_HIA_NBRC2017

16

10

NBRC 110490

Acinetobacter baumannii NBRC 110490_HIA_NBRC2017

16

12

GTC 03322

Acinetobacter baumannii GTC 03322_HIA_NBRC2017

16

12

GTC 03323

Acinetobacter baumannii GTC 03323_HIA_NBRC2017

16

14

GTC 03324

Acinetobacter baumannii GTC 03324_HIA_NBRC201716

GTC 03325

Acinetobacter baumannii GTC 03325_HIA_NBRC201716

NBRC 110491

Acinetobacter baumannii NBRC 110491_HIA_NBRC2017

16

10

NBRC 110494

Acinetobacter baumannii NBRC 110494_HIA_NBRC2017

16

11

GTC 03328

Acinetobacter baumannii GTC 03328_HIA_NBRC2017

16

9

GTC 03329

Acinetobacter baumannii GTC 03329_HIA_NBRC2017

16

10

NBRC 110495

Acinetobacter baumannii NBRC 110495_HIA_NBRC2017

16

12

NBRC 110492

Acinetobacter baumannii NBRC 110492_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter baumannii

Acinetobacter baylyi

GTC 3695

Acinetobacter baylyi GTC 3695_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter beijerinckii

GTC 14628T

Acinetobacter beijerinckii GTC 14628_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter bereziniae

KCTC 23199T

Acinetobacter bereziniae KCTC 23199_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter bouvetii

GTC 3697T

Acinetobacter brisouii

Acinetobacter bouvetii GTC 3697_HIA_NBRC2017

16

T

Acinetobacter brisouii DSM 18516_HIA_NBRC2017

16

T

KCTC 2357

Acinetobacter calcoaceticus KCTC 2357_HIA_NBRC201716

NBRC 12552

Acinetobacter calcoaceticus NBRC
12552_HIA_NBRC2017

16

KCTC 12415T

Acinetobacter gerneri KCTC 12415_HIA_NBRC201716

DSM 18516

Acinetobacter calcoaceticus

Acinetobacter gerneri

T

Acinetobacter guillouiae

KCTC 23200

Acinetobacter guillouiae KCTC 23200_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter gyllenbergii

GTC 14627T

Acinetobacter gyllenbergii GTC 14627_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter haemolyticus

NBRC 109758T

Acinetobacter haemolyticus NBRC
109758_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter indicus

DSM 25388T

Acinetobacter indicus DSM 25388_HIA_NBRC201716

DSM 6963T

Acinetobacter johnsonii DSM 6963_HIA_NBRC201716

NBRC 102197

Acinetobacter johnsonii NBRC 102197_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter johnsonii

SuperSpectrum名

Acinetobacter_baumannii_NBRC
superspectrum2017

DATA数

11
9

9
Acinetobacter_baylyi_GTC3695_
NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_beijerinckii_GTC1
4628_NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_bereziniae_KCTC
23199_NBRCsuperspectrum201
7
Acinetobacter_bouvetii_GTC369
7_NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_brisouii_DSM1851
6_NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_calcoaceticus_NB
RCsuperspectrum2017

Acinetobacter_gerneri_KCTC124
15_NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_guillouiae_KCTC2
3200_NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_gyllenbergii_GTC1
4627_NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_haemolyticus_NB
RC109758_NBRCsuperspectrum
2017
Acinetobacter_indicus_DSM2538
8_NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_johnsonii_NBRCs
uperspectrum2017

14
12
14
13
14
20
13
15
15
13
12

13
19
16

20

表5（続き）. Acinetobacter属のライブラリーの内訳（Heart Infusion Agar, 好気, 20時間, 30℃,ギ酸/アセニト-HCCA又はCHCA）
学名

供試株

Bruker Library名

DATA数

T

NBRC 109759

Acinetobacter junii NBRC 109759_HIA_NBRC201716

NBRC 110497

Acinetobacter junii NBRC 110497_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter junii

Acinetobacter kyonggiensis

JCM 17071T

Acinetobacter lwoffii

NBRC 109760T Acinetobacter lwoffii NBRC 109760_HIA_NBRC2017

Acinetobacter sp.

NBRC 102608

Acinetobacter kyonggiensis JCM 17071_HIA_NBRC2017

16

DATA数

Acinetobacter_junii_NBRCsupers
pectrum2017

13

Acinetobacter_kyonggiensis_JC
M17071_NBRCsuperspectrum20
17
Acinetobacter_lwoffii_NBRCsupe
rspectrum2017

14
16
15

Acinetobacter sp. NBRC 102608_HIA_NBRC201716

LMG 10619

Acinetobacter nosocomialis LMG 10619_HIA_NBRC2017

16

14

NBRC 110500

Acinetobacter nosocomialis NBRC
110500_HIA_NBRC2017

16

14

GTC 03312

Acinetobacter nosocomialis GTC 03312_HIA_NBRC2017

16

9

GTC 03313

Acinetobacter nosocomialis GTC 03313_HIA_NBRC2017

16

T

Acinetobacter nosocomialis

16

SuperSpectrum名

NBRC 110501
NBRC 110502
NBRC 110503
NBRC 110498
NBRC 110499

Acinetobacter nosocomialis NBRC
110501_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC
110502_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC
110503_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC
110498_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC
110499_HIA_NBRC2017

16

16

14
Acinetobacter_nosocomialis_NB
RCsuperspectrum2017

14

16

13

16

12

16

12

16

11
Acinetobacter_oleivorans_KCTC
23045_NBRCsuperspectrum201
7
Acinetobacter_parvus_GTC3704_NBRCsuperspectrum2017

Acinetobacter oleivorans

KCTC 23045T

Acinetobacter oleivorans KCTC 23045_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter parvus

GTC 3704T

Acinetobacter parvus GTC 3704_HIA_NBRC201716

DSM 25618T

Acinetobacter pittii DSM 25618_HIA_NBRC2017

16

13

NBRC 110505

Acinetobacter pittii NBRC 110505_HIA_NBRC2017

16

21

NBRC 110506

Acinetobacter pittii NBRC 110506_HIA_NBRC2017

16

11

NBRC 110504

Acinetobacter pittii NBRC 110504_HIA_NBRC201716

NBRC 110507

Acinetobacter pittii NBRC 110507_HIA_NBRC201716

NBRC 110508

Acinetobacter pittii NBRC 110508_HIA_NBRC2017

16

13

NBRC 110509

Acinetobacter pittii NBRC 110509_HIA_NBRC2017

16

10

NBRC 110510

Acinetobacter pittii NBRC 110510_HIA_NBRC2017

16

16

Acinetobacter radioresistens NBRC
102413_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter pittii

T

NBRC 102413
Acinetobacter radioresistens

JCM 9327
JCM 9328T

Acinetobacter rudis

DSM 24031

Acinetobacter schindleri

GTC 3703T
T

Acinetobacter radioresistens JCM 9327_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter radioresistens JCM 9328_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter rudis DSM 24031_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter schindleri GTC 3703_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter soli

KCTC 22184

Acinetobacter soli KCTC 22184_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter baylyi

NBRC 109690

Acinetobacter baylyi NBRC 109690_HIA_NBRC2017

16

T

Acinetobacter_pittii_NBRCsupers
pectrum2017

12
14

18
21

14
Acinetobacter_radioresistens_NB
RCsuperspectrum2017

16
15

Acinetobacter_rudis_DSM24031_
NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_schindleri_GTC37
03_NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_soli_NBRCsupers
pectrum2017

10
14
14
14

Acinetobacter soli

KCTC 22184

Acinetobacter soli KCTC 22184_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter baylyi

GTC 3695T

Acinetobacter baylyi GTC 3695_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter baylyi

NBRC 109690

Acinetobacter baylyi NBRC 109690_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter sp.

NBRC 110496

Acinetobacter sp. NBRC 110496_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter_sp.NBRC110496_
NBRCsuperspectrum2017

14

Acinetobacter sp.

NBRC 108641

Acinetobacter sp. NBRC 108641_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter_sp.NBRC108641_
NBRCsuperspectrum2017

20

Acinetobacter sp.

JCM 13222

Acinetobacter baylyi NBRC 109690_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter_sp.JCM13222_NB
RCsuperspectrum2017

15

14
Acinetobacter_soli/baylyi_NBRCs
uperspectrum2017

14
14（次項へ続く） 21

表5（続き）. Acinetobacter属のライブラリーの内訳（Heart Infusion Agar, 好気, 20時間, 30℃,ギ酸/アセニト-HCCA又はCHCA）
学名

供試株

Bruker Library名

DATA数

Acinetobacter calcoaceticus

NBRC 13006

Acinetobacter calcoaceticus NBRC 13006_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter sp.

JCM 20657

Acinetobacter sp. JCM 20657_HIA_NBRC2017

16

T

Acinetobacter tandoii

KCTC 12417

Acinetobacter tandoii KCTC 12417_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter tjernbergiae

DSM 14971T

Acinetobacter tjernbergiae DSM 14971_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter towneri

KCTC 12419T

Acinetobacter towneri KCTC 12419_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter ursingii

GTC 3702T

Acinetobacter ursingii GTC 3702_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter ursingii

NBRC 110512

Acinetobacter ursingii NBRC 110512_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter ursingii

NBRC 110511

Acinetobacter ursingii NBRC 110511_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter ursingii

NBRC 110605

Acinetobacter ursingii NBRC 110605_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter venetianus

GTC 14626T

Acinetobacter venetianus GTC 14626_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter sp.

NBRC 100985

Acinetobacter sp. NBRC 100985_HIA_NBRC2017

16

Acinetobacter sp.

JCM 21237

Acinetobacter sp. JCM 21237_HIA_NBRC2017

16

SuperSpectrum名
Acinetobacter_sp.NBRC13006_N
BRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_sp.JCM20657_NB
RCsuperspectrum2018
Acinetobacter_tandoii_KCTC124
17_NBRCsuperspectrum2017
Acinetobacter_tjernbergiae_DSM
14971_NBRCsuperspectrum201
7
Acinetobacter_towneri_KCTC124
19_NBRCsuperspectrum2017

DATA数
16
32
15
15
14
14

Acinetobacter_ursingii_NBRCsup
erspectrum2017

13
14
9
13

Acinetobacter_venetianus_NBRC
superspectrum2017

14

Acinetobacter属 SARAMISTM用 SuperSpectra22

Acinetobacter属 Biotyper用 MSPデータのデンドログラム
MSP Dendrogram

Acinetobacter indicus DSM 25388_HIA_NBRC2017
Acinetobacter sp. NBRC 100985_HIA_NBRC2017
Acinetobacter venetianus GTC 14626_HIA_NBRC2017
Acinetobacter sp. NBRC 110496_HIA_NBRC2017
Acinetobacter sp. NBRC 108641_HIA_NBRC2017
Acinetobacter gyllenbergii GTC 14627_HIA_NBRC2017
Acinetobacter beijerinckii GTC 14628_HIA_NBRC2017
Acinetobacter junii NBRC 110497_HIA_NBRC2017
Acinetobacter junii NBRC 109759_HIA_NBRC2017
Acinetobacter parvus GTC 3704_HIA_NBRC2017
Acinetobacter calcoaceticus NBRC 13006_HIA_NBRC2017
Acinetobacter sp. JCM 13222_HIA_NBRC2017
Acinetobacter haemolyticus NBRC 109758_HIA_NBRC2017
Acinetobacter tjernbergiae DSM 14971_HIA_NBRC2017
Acinetobacter schindleri GTC 3703_HIA_NBRC2017
Acinetobacter sp. NBRC 102608_HIA_NBRC2017
Acinetobacter lwoffii NBRC 109760_HIA_NBRC2017
Acinetobacter ursingii NBRC 110605_HIA_NBRC2017
Acinetobacter ursingii NBRC 110511_HIA_NBRC2017
Acinetobacter ursingii NBRC 110512_HIA_NBRC2017
Acinetobacter ursingii GTC 3702_HIA_NBRC2017
Acinetobacter radioresistens JCM 9328_HIA_NBRC2017
Acinetobacter radioresistens JCM 9327_HIA_NBRC2017
Acinetobacter radioresistens NBRC 102413_HIA_NBRC201
Acinetobacter bouvetii GTC 3697_HIA_NBRC2017
Acinetobacter johnsonii NBRC 102197_HIA_NBRC2017
Acinetobacter johnsonii DSM 6963_HIA_NBRC2017
Acinetobacter towneri KCTC 12419_HIA_NBRC2017
Acinetobacter kyonggiensis JCM 17071_HIA_NBRC2017
Acinetobacter gerneri KCTC 12415_HIA_NBRC2017
Acinetobacter tandoii KCTC 12417_HIA_NBRC2017
Acinetobacter bereziniae KCTC 23199_HIA_NBRC2017
Acinetobacter guillouiae KCTC 23200_HIA_NBRC2017
Acinetobacter rudis DSM 24031_HIA_NBRC2017
Acinetobacter soli KCTC 22184_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baylyi NBRC 109690_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baylyi GTC 3695_HIA_NBRC2017
Acinetobacter brisouii DSM 18516_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC 110499_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC 110498_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC 110501_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis GTC 03313_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis GTC 03312_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC 110500_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii NBRC 110491_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC 110503_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis NBRC 110502_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii NBRC 110492_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii NBRC 110495_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii GTC 03329_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii NBRC 110494_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii GTC 03324_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii NBRC 110493_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii GTC 03325_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii NBRC 109757_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii GTC 03323_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii NBRC 110490_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii GTC 03328_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii GTC 03322_HIA_NBRC2017
Acinetobacter baumannii NBRC 110489_HIA_NBRC2017
Acinetobacter nosocomialis LMG 10619_HIA_NBRC2017
Acinetobacter calcoaceticus NBRC 12552_HIA_NBRC2017
Acinetobacter oleivorans KCTC 23045_HIA_NBRC2017
Acinetobacter calcoaceticus KCTC 2357_HIA_NBRC2017
Acinetobacter pittii NBRC 110505_HIA_NBRC2017
Acinetobacter sp. JCM 20657_HIA_NBRC2017
Acinetobacter pittii NBRC 110508_HIA_NBRC2017
Acinetobacter pittii DSM 25618_HIA_NBRC2017
Acinetobacter pittii NBRC 110510_HIA_NBRC2017
Acinetobacter sp. JCM 21237_HIA_NBRC2017
Acinetobacter pittii NBRC 110506_HIA_NBRC2017
Acinetobacter pittii NBRC 110504_HIA_NBRC2017
Acinetobacter pittii NBRC 110509_HIA_NBRC2017
Acinetobacter pittii NBRC 110507_HIA_NBRC2017
1000

900

800

700

600

500
Distance Level

400

300

200

100

0

23

データライブラリーの取り扱いについて
NITEから提供するデータファイルはまとめてzipファイルに圧縮して送付します。受領後はzip圧縮を解凍し、各機種のインポート手順（ウェブサイトから詳細版をダウンロード可）に沿ってご使用ください。
バックアップを取ってからのインポート作業を推奨します。

for MALDI Biotyper® MSPsのインポート方法
ATTENTION:
NITEが提供するライブラリーはプロジェクトライブラリーであり、ブルカーのオフィシャルのライブラリー
ではありません。この段階でデータに対する信頼性はまだ評価されていません。
※ MALDIバイオタイパー 3.0以前のバージョンにはインポートすることができません。3.1以降にバージョン
アップを行ってから提供依頼をかけてください。
MSPファイル “XXXXXX.btmsp” をMALDI Biotyper が導入されているPCに保存してください。



MALDI Biotyper Offline Client（MALDIバイオタイパー 3.1 OC※）ソフトウエアを起動してください。
‘“Import MSP”の画面の中のツールボタン “Import MSP s into Server from a file”のボタンをクリックしてください。



ファイルを開くダイアログで、保存した “XXX
XXX.btmsp” を選択してください。

“All” にチェックを入れて選択してください。

“Import” をクリックしてインポートを開始してください。

MSP import が正常に終了すると、プロジェクト
ツリーに追加したデータの項目が表示されます。

for SARAMISTM SuperSpectra のインポート方法
ATTENTION:
インポートを実行する前に必ずデータベースのバックアップを行ってください。

＜データベースのバックアップ方法＞
 メニューから[Options]-> [Configuration]を選択して[Presettings]ウィンドウを表示させます。
 [Presettings]ウィンドウのメニューから[Options]->[Backup]->[Backup]で保存場所とファイル名を指定してバックアップ
ファイルを作成します。

次項へ

24

for SARAMISTM SuperSpectra のインポート方法（つづき）
前項から＜SuperSpectraのインポート＞
 インポートしたいSuperSpectraを含む「.rep」ファイルをデスクトップにコピーします。
 SARAMIS Premiumを起動します。
 メニューから[Options]の[Replication]から[Import
Replication]を選択します。
 表示されたファイル選択ダイアログ上で，コピーした「.rep」ファイルを選択して[OK]をクリックします。
注記；インポートするSuperSpectraと同じ属・種のフォルダがデータベース上に無い場合は自動的にフォルダが作成されますので、インストール先を指定する必要はありません。

 Logファイルの保存場所を指定して[Save]をクリックし、インポート処理を開始します。
注記；Logファイルは、どの「.rep」ファイルをインポートしたのか、インポート先のデータベースに同じSuperSpectraが存在するのかを確認した結果とその後の処理を記録したテキストファイルです。

 処理完了後，[Import Successful]メッセージが表示されます。[OK]をクリックして閉じます。
 メニューから[Options]の[Replication]から[Refresh
Tree]をクリックします。
 SARAMIS Premiumソフトウェアを再起動します。
 Spectra画面のツールバーにある[Tree]ボタン右側の▼ボタンをクリックして[Active Superspectra]を実行します。

＜インポートしたSuperSpectraのアクティベーション＞
 Spectra画面のツールバーにある[Tree]ボタン右側の▼ボタンをクリックして[Superspectra]を選択します。
 表示されたダイヤログツリーもしくは階層表示フォルダからインポートしたSuperSpectraが含まれる
フォルダを選択します。
 選択したフォルダに含まれるSuperSpectraの一覧からインポートしたSuperSpectraのSelectionのチェックボックスをクリックします。
 Spectra画面のツールバーにある[Unlock]ボタンをクリッ
クして、[Lock]の表示にさせます。
 右下の[Active SuperSpectra]ボタンをクリックします。
 チェックしたSuperSpectraをデータベースへ反映させるための許可を訪ねるウインドウが開きますので、[Yes]を選択。
 SARAMIS Premiumソフトウェアを再起動します。
 インポートしたSuperSpectraがアクティベート出来ているかを確認する場合は、Spectra画面のツールバーにある[Tree]ボタン右側の▼ボタンをクリックして[Active Superspectra]を選択します。アクティ
ベートされているSuperSpectraの一覧が表示されますので、インポートしたSuperSpectraが有ることを確認してください。
※VITEK MS後継機である、バイテックMS PRIMEを使用する場合でも、NITEから提供しているSARAMIS Premium用ライブラリーをご利用
いただけます。なお、VITEK MSやバイテックMS PRIMEのソフトウェアアップデートを行う場合、ユーザーが個別にインポートしたデータが削除されてしまうため、事前にバックアップを取っておくことを推奨します。

25

サンプル処理プロトコルの一例
各メーカーが提供するプロトコルとほとんど同じですが、NITEで行っているサンプル処理の例を紹介します。

Pseudomonas（バクテリア）とAspergillus（糸状菌）の例
用意するもの（一般的な実験器具、試薬は除く）◼ 器具類• ギ酸、アセトニトリル用のサンプルチューブとピペットチップは有機溶剤に溶けない素材のものを用いる。
• あらかじめ乾熱滅菌（160℃、2～3 時間）した爪楊枝• 【糸状菌の場合】滅菌済みの医療用綿棒◼ 誌薬など• ギ酸（LC/MS グレード）• アセトニトリル（HPLC グレード）• エタノール（HPLC グレード）• マトリクス： α-cyano-4-hydroxycinnamic acid• スタンダード用の大腸菌（Escherichia coli NBRC 3301 など）培地No. 802 で30±2℃、20時間、培養しておく。
培養(1) 本培養の前に適切な前培養を行ったものを用いる。
(2) 本培養を指定の条件で行う。
Pseudomonas ：市販の Heart Infusion Agar 培地、30℃、暗室、20時間
Aspergillus：市販の Potato Dextrose Agar 培地、25℃、10日間集菌（ギ酸／アセトニトリル処理をする場合）(3-1) Pseudomonas の場合：ループで菌体を掻き集め、サンプルチューブの少量（250 uL）の滅菌水に懸濁後、99.5%エタノール（1 mL）を添加して終濃度80%にする。
(3-2) Aspergillus の場合：滅菌水で十分に湿らせた綿棒を用いて、培養した菌体のコロニーを半量（6cm2）程度掻き取り、少量（250 uL）の滅菌水を入れた2.0 mL 滅菌チューブに懸濁後、99.5%エタノール（1 mL）を添加して終濃度80%にする。
(4) この状態でディープフリーザー（-80℃）で凍結すれば、一時中断、保存できる。
(5) 遠心分離（15,000×g, 2 分）にかけ、上清を捨て、ピペットで吸い取るなどしてエタノールが残らないようにする。
(6) ギ酸（98～100%）は揮発しやすいため、使用直前に70%に調整する。
サンプルの処理(7) (4) の沈殿物に70％ギ酸を30～50 uL を加え、軽くボルテックスしてよく懸濁する。
(8) 懸濁液にアセトニトリルを30～50 uL（前項で加えたギ酸と等量）を加え、軽くボルテックスして懸濁する。
(9) 遠心分離（15,000×g, 2 分）にかける。
(10) 上清1 uL を測定用プレートのウェルに滴下し、自然乾燥させる。
(11) 大腸菌をスタンダード用のウェルに爪楊枝で塗りつける。
(12) それぞれのサンプル上にマトリクスを1 uL を滴下し、自然乾燥させる。
MALDI-TOF MS 解析の条件は、各メーカー及び機種のプロトコルに準じる。
コツ ～安定した結果を得るために～✓✓✓

培養条件：ライブラリーデータを取得した際の培養条件に合わせると一致度がより高くなる。
（各の菌群の培養条件は、ウェブサイトの菌株リストから参考できる他、ライブラリーデータにも同じリストが添付して配布される。）
集菌する菌体量：多すぎないこと。各菌群で異なるが、うまくデータが取得できた時の量を記録し、その後の同類の菌群を用いる試験ではその量に統一すると良い。
解析装置の測定の最適化：レーザー強度、感度は適切に調整されているか？（メンテナンス側と要相談の場
合もあり）。

26

詳細及び提供のご依頼方法
本事業の詳細及びデータのお申し込み方法については、下記のウェブページでご覧いただけます。免
責事項をよくご確認いただき、ウェブページにある「MALDI-TOF MS用のデータライブラリー依頼書」に必要事項（氏名、連絡先、使用目的ほか）をご記入のうえ、メールに添付してご注文ください。

https://www.nite.go.jp/nbrc/industry/maldi/maldi.html

免責事項
本ライブラリーのご利用にあたっては、下記の免責事項をよくお読みいただき、ご了承のうえお使いく
ださい。
1. 本ライブラリーは、MALDI-TOF MSを用いた微生物同定のために作成した参照用ライブラリーです。
同定とは多層的 に判断するべきものであるため、本ライブラリーを用いて得られた結果のみでは、確
実な同定根拠を与えるものではありません。
2. 独立行政法人製品評価技術基盤機構 （以下「機構」）は本ライブラリーの利用者の以下の行為を禁止します。
（１） 本ライブラリーに含まれるデータ（ライブラリー名、微生物の種名、菌株名、作成年等）の加工及び修正。
（２） 本ライブラリーを用いての医療行為。
（３） 本ライブラリーやその複製品の第三者へ再配布。
3. 機構並びにMALDI-TOF MS微生物同定システムの製造者及びサプライヤーは、利用者が本ライブラ
リーの情報を用いて行う一切の行為及びその結果について、何ら責任を負いません。
4. 利用者は、本ライブラリーの使用に伴い直接又は間接に発生するあらゆる請求、訴訟、責任、費用及び支出において、機構、分析機器及びソフトウェアの、製造者及びその役員、従業員、代理人を免責補償するものとします。
5. 本ライブラリーは機構が独自に作成したものであり、ソフトウェアの製造者の検証を経て公開するものではありません。本ライブラリーの使用における全ての問い合わせは、利用者が機構に行うものとします。
6. 機構は、予告なしに本ライブラリーの内容を変更または削除することがあります。

お問い合わせ先独立行政法人製品評価技術基盤機構
バイオテクノロジーセンター 産業連携推進課 MALDI担当
TEL：0438-20-5764
FAX：0438-20-5582
住所：〒292-0818 千葉県木更津市かずさ鎌足2-5-8
メール：nbrc-maldi@nite.go.jp
2024/01/22