MM5­A1

遺伝子関連検査

検体品質管理マニュアル
Approved Guideline（承認文書）

平成 23 年 12 月

特定非営利活動法人

JCCLS 日 本 臨 床 検 査 標 準 協 議 会
JCCLS 遺伝子関連検査標準化専門委員会

CONTENTS
遺伝子関連検査 検体品質管理マニュアル Approved Guideline（承認文書）公開に際して ………………… 6
遺伝子関連検査 検体品質管理マニュアル Approved Guideline（承認文書）発刊に際して ………………… 7
はじめに
第……………………………………………………………………………………………………………… 8

1 章 遺伝子関連検査における検体品質管理マニュアル策定の背景 ……………… 11

１

国際的動向 ………………………………………………………………………………………………… 12

２2.1

我が国の取組み（遺伝子関連検査標準化専門委員会の検討体制）………………………… 13３3.1

検体品質管理の現状分析 ……………………………………………………………………………… 14

2.2

3.2

検体品質管理マニュアル検討（WG­2 委員会）の設置 ………………………………………………… 13
検体品質管理マニュアル検討（WG­2 委員会）活動の背景 …………………………………………… 13

不適切な検体の性状と測定への影響に関する実態調査 ……………………………………………… 14
遺伝子関連検査の測定前プロセス（プレアナリシス）の現状と課題 ………………………………… 143.2.1

遺伝子関連検査全般 ……………………………………………………………………………… 143.2.2

病原体遺伝子検査 ………………………………………………………………………………… 153.2.3

体細胞遺伝子検査 ………………………………………………………………………………… 153.2.4

遺伝学的検査（生殖細胞系列遺伝子検査） ……………………………………………………… 16４

検体品質管理マニュアルの作成 …………………………………………………………………… 17

５

検体の基礎的性状の分析と測定への影響 ……………………………………………………… 18

第2 章 遺伝子関連検査における検体品質管理マニュアル ………………………………… 19

１
遺伝子関連検査における検体保存と運搬 ………………………………………………………… 20
1.1 病原体遺伝子検査における検体保存と運搬 ……………………………………………………………… 21
1.1.1

血清・血漿等 ……………………………………………………………………………………… 21

1.1.2

尿 …………………………………………………………………………………………………… 22

1.1.3

喀痰 ………………………………………………………………………………………………… 22

1.2 体細胞遺伝子検査における検体保存と運搬 ……………………………………………………………… 23
1.2.1 組織・組織切片 …………………………………………………………………………………… 23
1.2.2

血液（白血球） ……………………………………………………………………………………… 24

1.2.3

尿・糞便 …………………………………………………………………………………………… 25

1.3 遺伝学的検査（生殖細胞系列遺伝子検査）における検体保存と運搬 ………………………………… 25
1.3.1外部委託による遺伝学的検査の実施 …………………………………………………………… 26

２遺伝子関連検査における検体取扱い ……………………………………………………………… 272.1 病原体遺伝子検査における検体取扱い …………………………………………………………………… 27
2.1.1

血清 ………………………………………………………………………………………………… 27

2.1.2

血漿 ………………………………………………………………………………………………… 28

2.1.3

喀痰 ………………………………………………………………………………………………… 30

2.1.4

糞便 ………………………………………………………………………………………………… 31

2.1.5

尿 …………………………………………………………………………………………………… 31

2.1.6

血液（白血球）、骨髄 ………………………………………………………………………………… 32

2.1.7

胸水、腹水、心嚢液、膵液、気管支肺胞洗浄液（BALF）等 ……………………………………… 33

2.1.8

リンパ節、固形組織（生検、手術材料） …………………………………………………………… 34

2.2 体細胞遺伝子検査における検体取扱い …………………………………………………………………… 35
2.2.1

リンパ節、固形組織（生検、手術材料） …………………………………………………………… 36

3 ・2.3３3.1

2.2.2

ホルマリン固定パラフィン包埋組織ブロック ………………………………………………… 37

2.2.3

血液（白血球）、骨髄 ………………………………………………………………………………… 39

2.2.4 胸水、腹水、心嚢液、膵液、気管支肺胞洗浄液（BALF）、尿（沈渣）、喀痰 ………………………… 41
2.2.5 培養細胞 …………………………………………………………………………………………… 43

遺伝学的検査（生殖細胞系列遺伝子検査）における検体取扱い ……………………………………… 43
2.3.1

血液（白血球） ……………………………………………………………………………………… 442.3.2

口腔粘膜 …………………………………………………………………………………………… 45

2.3.3

毛髪 ………………………………………………………………………………………………… 452.3.4

爪 …………………………………………………………………………………………………… 462.3.5

血痕 ………………………………………………………………………………………………… 472.3.6

臍帯（へその緒） …………………………………………………………………………………… 47

遺伝子関連検査における検体採取 ………………………………………………………………… 49
病原体遺伝子検査における検体採取 …………………………………………………………………… 493.1.1

主なウイルス感染症 ……………………………………………………………………………… 49（1） 肝炎ウイルス ……………………………………………………………………………………… 49（2） 急性呼吸器感染症原因ウイルス ………………………………………………………………… 49（3） 下痢症原因ウイルス ……………………………………………………………………………… 50（4） 脳炎原因ウイルス ………………………………………………………………………………… 50（5） 無菌性髄膜炎原因ウイルス ……………………………………………………………………… 50（6） EB ウイルス（Epstein­Barr virus：EBV） …………………………………………………… 51（7） サイトメガロウイルス（Cytomegalovirus：CMV） ………………………………………… 51（8） ヒトパルボウイルス B19（Human parvo virus B19）……………………………………… 52（9） ヒトパピローマウイルス（Human papilloma virus：HPV）………………………………… 52（10） HTLV­I（Human T­lymphotropic virus type I：ヒト T リンパ球向性ウイルス­I 型） … 52（11） HIV（Human immunodeﬁciency virus: ヒト免疫不全ウイルス）………………………… 53
3.1.2

主な細菌感染症 …………………………………………………………………………………… 53（1） 結核菌・非結核性抗酸菌 ………………………………………………………………………… 53（2） レジオネラ菌 ……………………………………………………………………………………… 54（3） マイコプラズマ（4） クラミジアニューモニエ（Mycoplasma pneumoniae ） …………………………… 54

ニューモニエ / シッタシ（Chlamydia pneumoniae/psittaci ） …………… 55（5） クラミジア トラコマティス（Chlamydia trachomatis ）…………………………………… 55（6） 淋菌（Neisseria gonorrhoeae ）………………………………………………………………… 55（7） MRSA（Methicillin­resistant Staphylococcus aureus：メチシリン耐性黄色ブドウ球菌） 55

3.1.3

真菌・その他 ……………………………………………………………………………………… 56（1） 病原性真菌 ………………………………………………………………………………………… 56（2） ニューモシスチス

イロベチー（Pneumocystis jiroveci ）………………………………… 56

3.2 体細胞遺伝子検査における検体採取 ……………………………………………………………………… 57
3.2.1

固形腫瘍の遺伝子検査 …………………………………………………………………………… 57（1） 膵癌の K­ras 遺伝子（KRAS ）変異解析 ……………………………………………………… 57（2） 肺癌の EGFR 遺伝子（EGFR ）、K­ras 遺伝子（KRAS ）変異解析 …………………………… 57（3） 大腸癌の p53 遺伝子（TP53 ）、K­ras 遺伝子（KRAS ）変異解析 …………………………… 57（4） GIST の c­kit 遺伝子（KIT ）、PDGFR α遺伝子（PDGFRA ）変異解析 ……………………… 58（5） 乳癌および胃癌の HER2 遺伝子（ERBB2 ）増幅解析 ………………………………………… 58（6） 乳癌のリンパ節転移検査 ………………………………………………………………………… 59
3.2.2

造血器腫瘍の遺伝子検査 ………………………………………………………………………… 59（1） 白血病細胞の微小残存病変（MRD）の検出 …………………………………………………… 59（2） 悪性リンパ腫細胞の微小残存病変（MRD）の検出 …………………………………………… 59・4

3.3 遺伝学的検査（生殖細胞系列遺伝子検査）における検体採取 ………………………………………… 60

第3.3.1

遺伝学的検査 ……………………………………………………………………………………… 60

3.3.2

保険収載された遺伝学的検査 …………………………………………………………………… 61

3.3.2.1

保険収載された単一遺伝子疾患の遺伝学的検査 …………………………………………… 61

3.3.2.2

保険収載されたファーマコゲノミクス（pharmacogenomics: PGX）の遺伝学的検査 … 62

3 章 今後の課題と展望 …………………………………………………………………………………… 63

１．
今後の課題と検討の方向性 ……………………………………………………………………………………… 64２．
検体品質管理マニュアル作成の意義と効果 …………………………………………………………………… 65
おわりに…………………………………………………………………………………………………………… 67

資料…………………………………………………………………………………………………………… 68

１．参考文献 …………………………………………………………………………………………………………… 68
２．参考ガイドライン等 ……………………………………………………………………………………………… 69
３．略語集…………………………………………………………………………………………………………… 71

４. 参考資料 …………………………………………………………………………………………………………… 72

遺伝子関連検査標準化専門委員会および WG­2 委員会名簿 ……………………………………… 77

5 ・