2019
Biotechnology Research Center
Annual Report

東京大学生物生産工学研究センター
年報

2019

御挨拶

生物生産工学研究センター長
妹尾 啓史
Keishi SENOO

東京大学生物生産工学研究センター（Biotechnology Research Center: BRC）のセンター長に2013年4月1日に着任してから約7年半が経過いたしました。本センターの運営に関しまして、皆様の多大なご理解とご協力を頂きまして、誠に有難うございます。
本センターは人類が直面している食糧問題、環境問題、資源・エネルギーの枯渇等の解決を担
うバイオテクノロジーの教育と研究を行うことを使命とする全学センターです。この使命を踏まえ、先端的研究の推進、萌芽的研究の育成、教育研究基盤の提供などを強力に推し進めています。
ここに2019年度の年報をお届けします。本センターの目的である微生物・植物バイオテクノ
ロジー研究の学内外でのハブ機能をより一層強化することを目指して、2019年度もセンターは3基幹部門（環境保全工学部門、細胞機能工学部門、植物機能工学部門）と2寄付研究部門（微生物機能代謝工学（協和発酵バイオ）ならびに微生物膜輸送工学寄付研究部門（公益財団法人発酵研究所）の体制により、極めて活発な研究・教育・社会貢献活動を進めてまいりました。
2015年4月1日にスタートした3つの学外連携部門（環境生態工学、生合成工学、植物生産工学部門）においては今年度も6名の先生方（野村暢彦筑波大学教授、玉木秀幸産業技術総合研究
所研究グループ長、新家一男産業技術総合研究所研究グループ長、高橋俊二理化学研究所ユニットリーダー、石川雅之農業・食品産業総合研究機構ユニット長、木羽 隆敏名古屋大学准教授）に委嘱教員をお願いして、より活発な研究・教育活動の展開にご尽力いただきました。
センター教員により、また、センターの学内共同利用により、2019年度も国際的にインパクトの高い数多くの研究成果が生み出されました。数多くの大学院生や学術支援職員が学会、国際シンポジウムにおいて優秀発表賞、ポスター賞、トピックス賞などを受賞しました。
6月には学生・院生の企画・運営による国際ワークショップである第1回グローバルイノベー
ションワークショップを開催しました。学生・院生の国際交流と国際感覚を養う場として初めての試みであり、きわめて有益なものとなりました。10月に第12回北陸合同バイオシンポジウムに参加しました。11月に第24回センターシンポジウム「植物－微生物相互作用：農業生産性の視点から」を盛大に開催しました。また、国内外の研究者によるセンター主催学術講演会を数多く行いました。都立戸山高校ほか4校の高校生訪問を受け入れました。
一方、7月に微生物科学に関わる様々な学協会等が一堂に集結して1週間にわたって分野横断
的シンポジウム・交流を行った「微生物ウィーク2019」（主催：微生物科学イノベーション連携研究機構、農学生命科学研究科）の企画と運営に同連携研究機構の参画部局として大きく貢献しました。
今後もセンターのさらなる発展のためにセンター教職員・学生院生とともに尽力する所存でおります。関係各位のさらなる叱咤激励、ご支援、ご協力をよろしくお願い申し上げます。

1

目次
センター長からの御挨拶

1

研究・教育活動
研究部門紹介
環境保全工学部門
細胞機能工学部門
植物機能工学部門
微生物機能代謝工学（協和発酵バイオ）寄附部門
微生物膜輸送工学（発酵研究所）寄付部門
センター主催シンポジウム
センター研究発表会
報文
国内学会発表等
国際学会発表等
総説等
教員および学生の受賞
学位論文
センター主催学術講演会
海外からの来訪者
オープンキャンパス等の来訪者

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共同利用成果報文
国内学会発表等
国際学会発表等
総説等
教員および学生の受賞
学位論文

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生物生産工学研究センター
研究・教育活動●

研究部門紹介●環境保全工学部門
当研究部門では、微生物と植物の有用機能を解析し、その成果を環境汚染の低減化、汚染環境修復技術の開発に応用する研究を行っています。以下に主要な研究テーマと研究成果について紹介します。

●環境中での汚染物質分解能を制御するプラスミド機能の解明
難分解性物質による汚染を除去するためには、汚染物質分解菌がどのようにして分解力を発揮しているのかを良く知ることが重要
教授 野尻 秀昭です。環境汚染物質分解菌には接合伝達性プ●
ラスミドなどの可動性遺伝因子上に分解遺Hideaki NOJIRI伝子を持つものも多く、環境中では様々に宿主を変えて存在しています。汚染現場でこのような分解菌をうまく使い汚染の浄化を実現するためには、様々な宿主候補が混在する“環境”中の分解菌の振る舞いを知る必要があります。しかし、環境中で分解プラスミド
はどのような細菌に保持されているのか、分解プラスミドはなぜ・どうやって安定に保持 図 1 カ ル バ ゾ ー ル 分 解 プ ラ ス ミ ド pCAR1 と 宿 主
されるのか、分解遺伝子はうまく発現するの Pseudomonas putida KT2440 株染色体の間の相互作用接合伝達で細胞内に取り込まれた pCAR1 からの遺伝子発現准教授 岡田 憲典 か、分解プラスミドの宿主は“強い”分解菌に と、pCAR1 の存在が染色体の遺伝子発現量を変化させることなるのか、宿主が変わると何が・どの程度変●が、“プラスミドの負荷（metabolic burden）”の原因となる。まKazunori OKADA
わるのか等、現在の環境微生物学の知識では た、これら特異的な遺伝子発現変動が、プラスミドを持った宿良く理解されていない疑問が多くあります。 主細胞の形質を決定する事になる。これらの現象の一部は、
本研究室では、このような疑問を解決し、環 pCAR1 から発現した核様体タンパク質が染色体由来のホモロ
境中での分解菌の“上手な”利用法の提案を グとの相互作用を介して、染色体・プラスミド双方に作用する
目指して、多面的に研究しています。その一 ことで引き起こされる。
環として、カルバゾ ール分解プラ スミド
pCAR1 が、宿主である Pseudomonas 属細胞内でどのような現象を引き起こすのかを、機構も含めて精査しています。実際、“pCAR1 を持つ”というシグナルは、プラスミド上の遺伝子に直接的に依存しない
様々な現象を引き起こします。例えば、宿主染色体上の鉄取り込み関連遺伝子や多剤耐性トランスポータ
ーなど多数の遺伝子の発現を誘導したり、また、宿主細胞の緊縮応答を遅らせたりすること（図１）が明助教 水口（鈴木）千穂 らかになっています。さらに、これら現象の少なくとも一部は、プラスミド上にコードされている Pmr,●
Phu, Pnd といった核様体タンパク質と宿主のホモログとの間の相互作用を介して引き起こされるもので
Chiho Suzukiあることが明らかになってきました（図１）。このような事実は、環境中で分解プラスミドが接合伝達しMinakuchi
た場合に宿主の形質が予想より多様化することを示しています。今後は、この知見を分解プラスミド自身
やその宿主分解菌の制御に役立てることが重要です。
一方、このような現象は、従来、宿主自らに由来する“特殊な”形質を付加する“付加的なゲノム”として考えられてきたプラスミドに、染色体機能を調節する隠れた機能があることを示しています。これは、環境微生物学分野でのプラスミドの再発見とも言えるもので、細菌と細菌ゲノムの進化装置としての新しいプラスミド学を作る基盤となるものと考えられます。

●細菌由来芳香環水酸化ジオキシゲナーゼの解析
芳香族化合物の好気的分解では、芳香環に対する二水酸化が最初の反応となることが多く、この反応が進行するか否かが分解系全体の進行を左右することから分解系の鍵反応と言うことができます。当研究室では、種々の細菌から単離したカルバゾール水酸化ジオキシゲナーゼ(carbazole 1,9a-dixoxygenase, CARDO)を材料に、酸化反応メカニズムの解明を行っています。この酵素は、実際に酸化反応を触媒する末端酸化酵素(Oxy)とNADH からの電子を Oxy に伝達する電子伝達系（フェレドキシン[Fd]とフェレドキシン還元酵素[Red]）から成り立っています。Oxy、Fd、Red の３つのコンポー
ネントは全て細胞質に独立して存在する
ため Fd はシャトルのように Oxy と Redの間を行き来して電子の伝達を繰り返します。図 2 は Oxy に 2 回還元型 Fd が結4

図 2 CARDO の反応サイクル中の構造の解析
Oxy の鉄硫黄クラスターと活性中心鉄の酸化還元状態を下付
文字で順番に示す。同様に Fd の鉄硫黄クラスターの酸化還元
状態を下付文字で示している。酸化状態は ox、還元状態は redで示す。

合して、一分子の基質（CAR）が反応産物（ABP-diol）に変換される反応サイクルを、Oxy と Fd の酸化状態も合わせて示したものです。当研究室では、世界に先駆けて Oxy と Fd の結合状態の X 線結晶構造解析に成功し、酸化還元状態を制御して結晶構造解析を進めることで、リボンモデルで示した反応サイクル中の構造を明らかにすることに成功しました。その結果、1 回目の還元型 Fd の結合によって酸化型 Oxy が還元型 Oxy に変化し、基質と酸素分子が結合できる構造に移行する機構の詳細が明らかになりました。
芳香環水酸化オキシゲナーゼについては、一般に基質認識についての解析が先行してきた歴史があり、触媒に重要であるにもかかわらず、電子伝達にカップルする反応サイクル進行の詳細なメカニズムは長く不明のままでした。本研究は、芳香環水酸化
オキシゲナーゼの機能の理解に重要な一歩となるものです。

●植物における病害抵抗性発現機構の解明
重要穀物の代表であるイネに病原菌が感染すると、図３に示すように 、 病 原 菌 由 来 の 成 分で あ る キ チ ンオ リ ゴ 糖 な ど のエ リ シ ター
[Microbe-Associated Molecular Patterns (MAMPs)と総称される]が受容体に認識され、それが引き金となって、ジャスモン酸(JA)などの二次シグナルの生成、エリシター応答性転写因子遺伝子の発現・活性化とそれに続く標的遺伝子の発現誘導が起こり、最終的に抗菌性タンパ
DPF
ク質の発現やファイトアレキシンの生合成遺伝子の単離と機能解析を進めてきました。さらに、その生産制御機構の解明を目指し、植物に2000 種以上存在する転写制御因子の中から、WRKY 型、bZIP 型およbZIP79び bHLH 型転写因子など、病害抵抗性に関わるエリシター/JA 応答性
転写因子遺伝子を単離しています。これらの転写因子の機能をうまく利用することで、病虫害に強いイネの作出が可能になると考えていま
Flavonoid
す。これまでに WRKY 型の転写因子の研究として、OsWRKY53 の N末端側に存在するセリンをアスパラギン酸に置換した疑似リン酸化体
図 3 イネにおける基礎的病害抵抗性の発現モデルを作製すると転写活性化能が強化されることを見出しました。さらに
ファイトアレキシンをはじめとした Specialized metabolites
OsWRKY53 疑似リン酸化体の過剰発現イネにおいては、いもち病菌 の制御に関与する転写制御因子の情報が蓄積しつつある。活性をはじめとする代表的なイネの病原菌に対する病害抵抗性を高めるこ 化因子と抑制因子のバランスにより、環境変化に応答した緻密とに成功しています。また、農業生物資源研究所との共同研究により、 な制御を可能にしていると考えられる。
イネの耐病性に関与することが知られていた OsWRKY45 が、ファイ
トアレキシン生産の制御にもかかわることが明らかになりました。さらに、異なるタイプの OsWRKY76 が、ファイトアレキシンの生産を負に制御するような抵抗性の制御因子であることも明らかになりました。このように、WRKY 型転写因子ファミリー(OsWRKY53, OsWRKY45, OsWRKY76 等)による病害抵抗性の制御について詳細な理解が進みつつあります（図３）。
OsDXS3

OsNOMTk o k a d a 20 11●抵抗性化合物ファイトアレキシンの生産制御機構とその進化
ジテルペン型のファイトアレキシン生産制御機構の解明に向けた研究では、TGA ファクターの一種である OsTGAP1 や bZIP 型転写因子の DPF がモミラクトン生合成だけでなく、２番染色体に存在するファイトサン生合成遺伝子クラスターや上流の MEP 経路
および中間体ゲラニルゲラニル二リン酸の合成遺伝子等の発現制御にも関与し、ジテルペン型ファイトアレキシン生合成全体を制御するマスター転写因子であることを示してきました。その過程で、ChIP-seq を用いた OsTGAP1 のゲノム上の結合領域の網羅的な同定を行い、OsTGAP1 による転写制御には、プロモーターへの直接的な結合による制御と、それ以外の領域に結合しクラスター内の全ての遺伝子の転写を活性化させるような未知の制御機構の存在が示唆されました。さらにこれらの転写因子は、ファイ
トアレキシン生産を行わない野生イネでも保存されており、その機能が現代の栽培イネまで保存されてきたことが明らかになりつつあります。現在、これらの転写因子によるファイトアレキシン生産制御の詳細な分子機構の解明に向けた研究を続けています。
また、中国浙江大学との国際共同研究で、イネ以外でのジテルペン型ファイトアレキシンモミラクトンの生合成経路解明を進めました。現在確認されているモミラクトン生産植物は、イネ、水田雑草イヌビエ、ハイゴケの 3 種であり、進化的にかけ離れた
これらの植物がどのようにモミラクトンの生合成能を獲得あるいは進化させてきたのかは大きな謎です。さらに興味深いことに、これらの植物では、モミラクトン生合成遺伝子群がゲノム上で遺伝子クラスターを構成していることがわかりました。コケ類を含む下等植物での二次代謝化合物の生合成遺伝子クラスターの同定は、モミラクトンが初めての例です。これらのモミラクトン
生産植物では、生合成遺伝子の種類やゲノム上の配
14
A1
64
0A
97
P9
C1
AS
M
YP
置が異なっていることから、陸上植物の進化の過程
CY
DT
p
p
C
p
C
C
ハイゴケ
C
Cp
C. plumiforme
で独自に遺伝子をクラスター化し、収斂進化により⽔⽥
モミラクトン生合成能を獲得してきたと考えられま
E. crus-galli
イヌビエ
す。また、ハイゴケの遺伝子をタバコに導入することでコケ由来の生合成経路をタバコ体内で再構築
O. sativa
し、モミラクトンを生産させることにも成功し、生合成経路の全容が明らかとなりました。これらの成イネ果は、陸上植物がどのようにモミラクトン生合成遺伝子クラスターを用いて生きるための競争力を獲得
図 4 モミラクトン生産植物の生合成遺伝子クラスターしてきたのかを紐解く重要な手かがりとなるだけで ハイゴケのモミラクトン生合成遺伝子クラスターは 4 つの遺伝子で構成されるが、なく、作物の生産における天然農薬としてモミラク イネやイヌビエのクラスター遺伝子とはゲノム上の配置が異なる。P450 酸化酵素
トンを利用すると言った、環境調和型次世代農業へ もそれぞれ異なるファミリーに属す酵素によりモミラクトン A が生産される。
の第一歩となることが期待されます（図４）。
150 Kb

M
Ec

AS

P7
CY

6M

Ec

KS

L1

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CP

1

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CY

A
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Os

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A3

2
1
A S AS
M M
Os Os

Os

KS

L4

P
CY

A
99

2

180 Kb

DTC : bi-functional diterpene cyclase (Type A + Type B cyclases)

CPS/KSL : coparyldiphosphate synthase (Type B cyclase) or kaurene synthase like (Type A cyclase)
MAS : short-chain dehydrogenase (momilactone synthase)
P450 : cytochrome P450 monooxigenase5

細胞機能工学部門
細胞機能工学部門は、生物生産工学研究センターの2期がスタートした2003年4月に開設されました。私たちの研究室では、生物がもつ様々な有用な能力に着目し、背景にある生命活動に普遍的な原理をタンパク質や遺伝子などの分子レベルで解明することを目指しています。さらに、それらの成果を利用して有用な機能を人為的に更に強化し、より有用な酵素や化合物を創製する応用的な研究も行っています。そのため、アミノ酸や抗生物質のような生理活性低分子化合物を扱う天然物
化学から、遺伝子の発現制御解析を行う分子生物学、さらにはタンパク質や酵素については、機能解析からタンパク質工学、X線結晶構造解析まで、最先端のテクノロジーを用いて多種多様なレベルで研究を行っています。以下に主な研究テーマを紹介します。

教授

西山 真
●

Makoto NISHIYAMA

准教授 古園 さおり（2019 年 9 月着任）

●微生物におけるアミノ酸生合成経路の進化および多様性に関する研究
好熱菌のあるものは、他の代謝、生合成系と類似した原始的なリジン生合成系を持っており、同合成系の酵素は寛容な基質特異性を示します。生命の共通祖先に近縁とされる古細菌も同様の生合成系を有することから、これらを研究することにより、酵素の基質認識機構が解明されると同時に酵素の分子進化メカニズムについても明らかになることが期待されます。一方、私たちはリジン
生合成の後半部分がキャリアタンパク質を用いて不安定な生合成中間体を保護しながら進行することを明らかにしました（図１）。また、同様のシステムが好熱性のアーキアでは、リジンだけでなくアルギニンの生合成に用いられていることも明らかにしました。これはアミノ酸生合成におけるキャリアタンパク質の初めての発見であるだけでなく、高温条件における効率的なアミノ酸
発酵生産の基盤として期待されます。この研究は、科研費（基盤研究(S)）「アミノ基修飾型キャリ
アタンパク質を介した物質変換機構の解明と応用展開(平成24〜28年度)「アミノ基キャリアタンパ
ク質を介する生合成機構の解明と二次代謝産物構造多様性の拡張(平成29〜33年度)として推進し
ています。

●

Saori KOSONO

助教

富田 武郎
●

Takeo TOMITA

図 1 リジン生合成経路と関連する代謝経路（左）、アミノ酸キャリアタンパク質を用いる AAA からリジンへの変換反応（右）●微生物における新たなキャリアタンパク質による二次代謝生合成に関する研究
最近、キャリアタンパク質を介してリジン生合成に類似のシステムが放線菌の二次代謝物質の生産にも利用されていることを発見しました。このキャリアタンパク質はアミノ基に結合する新奇のキャリアタンパク質 でAminogroup carrier protein (AmCP)と名付けました。調べた放線菌では新奇のアミノ酸(DADH)の生合成に同キャリアタンパク質が使われていることが明らかになりました。
データベース解析から他の多数の放線菌にも類似のシステムが存在することが示唆されました。これ
により、まだ構造未知の天然化合物が多数発見できるものと期待さ
図 2 AmCP を介して生合成される新規アミノ酸 DADHれます。
それらの生合成系を解明し、新規有用物質の生産を目指しています。

6●代謝における新奇酵素・ミッシングリンクの探索
研究
既に多数の生物のゲノム配列が明らかになっていますが、それから推定される生体分子の代謝経路には何もアサインされないミッシングリンクと言われる部分が多数あります。最近、好塩性アーキアや一部のシアノバクテリアにおいて、あらたなビオチン生合成酵素を発見し、その機能を解明しました。その酵素は、一カ所の活性中心で3つの反応を行うユニークな酵素であることに加えて、酵素の定義を外れるような一回の反応で不活性型へと変換される「自殺酵素」であることを明らかにしました。私たちはまだ多数隠されているミッシングリンクを探索し、あらたな酵素反応の版権を目指しています。

図3

GdhBA

●微生物におけるアミノ酸シグナル伝達の生理的役割とその分子機構

GdhAC

GdhAE

Arg415D
Ala72D

GdhBB

GdhAF

2-OG

RandomGlu137
coil
Ala164
His197
Leu94 Ser135 Tyr297*

Tyr303*
His197
His292*

Glu13

LysineGlu137
Ala164
Leu94

Ser135
Glu193

Co2+

Glu193

Cu2+
His72

Gln16

Arg134C

Tyr38D

GdhAD

11

図4

His72

Arg133

Glu13

Asp92
Glu43

Arg133
Asp92
Glu43

Arg12

決定したアミノ酸代謝酵素の結晶構造

Protein (lysine) acylation
Carbon, fatty acids, amino acids
Metabolism

C H3

Acetyl
Propionyl

Acyl-CoA

CoA

KAT

NH3+

ButyrylO
R

CrotonylNH

Non-enzymatic
Pi

O-

Acyl lysine

H2O

Methylmalonyl

O
O

KDAC
NAD+

O
O-

RCOOH
Nicotinamide+
O-Acetyl-ADP-ribose

O-

N
H

O

LysineMalonylO-

N
H

Acetyl-P
Acetyl-CoA
Succinyl-CoAO

アセチル化に代表されるタンパク質（リジン）アシル化修飾は、生物に広く存在する翻訳後修飾です。アシル化修飾はアシル CoAやアシルリン酸など代謝中間体を利用して酵素・非酵素的に起こることから、細胞の代謝・栄養状態と密接に関連します。私たちは細菌のアシル化修飾（主にアセチル化とスクシニル化）が栄養条件や培養フェーズに応じてダイナミックに変化することを見出し、代謝酵素や翻訳関連因子に起こるアシル化修飾がタンパク質機能に与えるインパクトを明らかにしてきました。グルタミン酸発酵で知られる Corynebacterium glutamicum やモデ ル細菌 であ る枯草菌
（Bacillus subtilis）を対象に、栄養環境に応じて変化するアシル化
修飾が細胞の応答や機能にどのようなインパクトを与えるかを明らかにする研究を展開しています。また、代謝酵素の可逆的凝集体形成（メタボロン）とアシル化修飾の関連についても研究を進めています。

Tyr418D

Ile71D

Arg12●リジンアシル化修飾を介した細菌のタンパク質機能調
節と栄養応答に関する研究

Asp166F
Met170F

O

私たちは最近好熱菌由来のグルタミン酸脱水素酵素(GDH)がロイシ
ンにより顕著に活性化を受けることを発見し、結晶構造解析によってロイシンが新規なアロステリックサイトに結合していることを明らかにしました。ヒトのGDHもロイシンにより活性化を受けますが、この酵素はインスリン分泌や神経伝達に関与していると考えられています。これらのことから好熱菌でGDHを介したアミノ酸シグナル伝
達機構が存在することが予想されます。現在そのようなシグナル伝達の生物学的意義や分子機構、さらには構造基盤を明らかにするような研究を展開しています。一方、私たちはリジン発酵の鍵酵素であるコリネ菌のアスパラギン酸キナーゼの結晶構造を決定し、リジン高生産の分子機構を明らかにしました。
また、好熱菌のリジン生合成の初発酵素であるホモクエン酸合成酵
素の結晶構造を決定し、そのユニークなフィードバック阻害機構を明らかにしました。酵素の立体構造情報を利用しその触媒機構や調節機
構に関する詳細な解析を行うことにより、高活性化・高機能酵素への改変や、それらを組み合わせた新しいアミノ酸生合成経路の構築を目指しています。

シアノバクテリアで発見した自殺酵素 BioU

Succinyl
Glutaryl..& etc.

Zn2+-dependent
NAD+-dependent (sirtuin)

図5

タンパク質（リジン）アシル化修
飾7

植物機能工学部門
植物機能工学研究室では、植物機能の分子基盤を解明して、植物の有用物質の生産能力の向上や持続可能な農業の実現などを可能とする植物バイオテクノロジー技術を開発することを目指して研究を進めています。特に、植物機能の調節の分子メカニズムの解明に力を入れています。以下に主な研究テー
マと最近得られた研究成果を紹介します。

●高等植物における硝酸シグナル応答機構の解明

教授

柳澤 修一
●

Shuichi YANAGISAWA

講師

青野 俊裕
●

Toshihiro AONO

助教

植物は土壌中の無機態窒素を吸収して同化し、アミノ酸、核酸、クロロフィルなど、さまざまな成長に必須な窒素原子を含む有機化合物質を生合成しています。同化された窒素量が植物の成長量、植物生産量を決める主要な因子の一つとなっており、植物の窒素利用効率を高めることが植物バイオテクロジ
ーの大きな目標の一つとなっています。多くの植物で主たる窒素源となっている無機態窒素は土壌中の硝酸イオンですが、植物に取り込まれた硝酸イオンはシグナル伝達物質としても機能し、遺伝子発現パ
ターンや代謝バランスを変化させます。例えば、硝酸シグナルは、硝酸還元酵素や亜硝酸還元酵素といった同化経路の酵素をコードする遺伝子の発現を迅速に誘導して、窒素同化経路を活性化します。したがって、硝酸シグナルに応答した遺伝子発現の制御機構を明らかにすることは植物の窒素利用効率を高めるために極めて重要となっています。私たちの研究グループでは、硝酸シグナルに応答した遺伝子発現の制御機構を明らかにするために、モデル植物であるシロイヌナズナやイネを用いて解析を進めています。これまでに、亜硝酸還元酵素遺伝子のプロモーター解析によって硝酸シグナルに応答して転写を促進する配列（nitrate-responsive element, NRE）を明らかにして、この NRE に作用する転写因子として NIN 様転写因子（NLP）群を同定しています。この転写因子群は、硝酸還元酵素遺伝子や亜硝酸輸送体遺伝子などの発現も直接的に制御していることを見出して、硝酸同化関連遺伝子の発現を一括して制御していることを明らかにしました（図 1）。このことから、NLP 転写因子群は窒素利用効率を向上させるために有益な転写因子であると考えられます。さらには、硝酸同化関連酵素遺伝子のみならず、
他の制御タンパク質の遺伝子などの発現も制御しており、硝酸応答を司っている重要な転写因子群であることを明らかにしました。また、NLP 活性を抑制すると著しい生育不良が起こりますが、この生育不良は窒素同化能力の低下によってのみ引き起こされるわけではないことを示して、硝酸のシグナル分子としての役割が植物の成長を制御していることを実証しました。
シロイヌナズナには NLP 転写因子群に含まれる転写因子は 9 つありますが、これら 9 つのタンパク質の N 末端側領域に保存された領域に存在するセリン残基が硝酸シグナル伝達に応答してリン酸化され、この翻訳後制御によって活性化されることを明らかにしました。すなわち、硝酸シグナルの伝達の実体は NLP 転写因子群のリン酸化であることを示すことに成功しました。また、このリン酸化を担うタンパク質リン酸化酵素を同定することにも成功しました。

櫻庭 康仁
●

Yasuhito SAKURABA

図 1 NLP 転写因子群による硝酸シグナル応答型の遺伝子発現の一括制御の概念図。硝酸シグナルをうけてリン酸化され活性化した NLP 転写因子は硝酸同化関連遺伝子の発現と制御タンパク質遺伝子の両方の発現を制御することにより、窒素応答の鍵因子として働いている。硝酸同化に関わる高親和性硝酸輸送体
遺伝子（NRT2.1）、硝酸還元酵素遺伝子（NIA1）、亜硝酸輸送体、亜硝酸還元酵素遺伝子（NIR1）など硝酸同化関連遺伝子の発現に加えて、転写因子をコードする遺伝子（NIGT1 など）の発現も NLP によって直接、制御されている。

●自然突然変異体のコレクションを利用したフェノーム解析による植物機能の制御能
力の遺伝的多様性の解明
自然界において植物は多様な環境に適応しています。このことにより、同じ植物種でも生育環境に適応するために遺伝情報に多様性が生じている可能性があります。世界の各地から集められたシロイヌナ
ズナの野生種とイネの栽培品種を用いて、栄養元素の取り込みの能力に関するフェノーム解析を行い、8

シロイヌナズナの野生種間であるいはイネ品種間で栄養元素の取り込み能力に数倍の違いがあることを明らかにしました。さらに、このことを引き起こしている原因遺伝子の一つを同定することに成功しました。

●植物の高 CO2 応答のメタボローム解析
よく知られているように大気中の二酸化炭素濃度は上昇し続けています。このような二酸化炭素濃度の上昇が、植物の物質生産にどのような影響を及ぼすかを代謝物の包括的な解析によって明らかにしました。質量分析装置（MS）とキャピラリー電気泳動法（CE）を組み合わせた CE-MS 分析やイオンクロマトグラフィーを用いたメタボローム解析によって、さまざまな栄養環境、
光環境における二酸化炭素濃度の違いが及ぼす影響を評価し、窒素栄養環境の相違によって植物の高 CO2 応答が異なることを明らかにしました。これにより、大気中の二酸化炭素濃度の上昇がもたらす植物生産への影響は、土地々々で異なる可能性を示しました。

●植物に特異的な Dof 転写因子の機能の解明
植物には動物には存在しないタイプの転写因子が存在します。私たちが発見した Dof 転写因子のファミリーは、そのような植物に固有の転写因子ファミリーの一つです。このファミリーの個々の因子は、それぞれに異なる生理的機能を持つことが予測され、これまでに栄養環境依存的な成長における役割などを明らかにしてきました。最近は、シロイヌナズナの Dof 転写因子の一つ AtDof5.8 は、植物ホルモンであるオーキシンに対する応答を司る転写因子
MONOPTEROS (ARF5)によって直接的に発現が制御されており、維管束形成に関わっていることを明らかにしています。

●植物における糖応答機構と核小体ストレスの解析
光合成によって生み出される糖は、エネルギーの貯蔵源となっているだけでなく、植物の成長を調整するホルモン様の活性を示すことが知られています。
私たちは、糖に応答して核小体に存在するリボソー
ム RNA の成熟過程に必須な因子の発現が誘導され、これに伴ってリボソーム自体の生合成自体が促進さ 図 2 多様な生育環境で栽培されたシロイヌナズナにおける個々の代謝物含量のれることを見出しました。さらに、この因子の発現が クラスター解析の一部低下すると核小体ストレスと呼ばれる現象が起こり、糖に応答した成長が正常に進まなくなることも明らかにしました。

●マメ科植物-根粒菌共生に関する研究
私たちは、熱帯マメ科植物セスバニアに共生する根粒菌
Azorhizobium caulinodans を用いて、非マメ科植物に窒素固定能を付与させるという課題に挑戦しています。A. caulinodans はセスバ
ニアの根と茎に窒素固定器官である根粒と茎粒を形成させます。私たちはこれまで、A. caulinodans の全ゲノム配列を解読することにより、A. caulinodans は根粒菌の進化の過程において先祖型に近いということを明らかにし、根粒の成熟と維持に関する遺伝子群をゲ
ノムワイドに探索してきました。根粒菌と植物の共生が成立するた
めには、養分の授受のように相手にとって有益な要因を双方が発現することが重要です。その一方で、相手にとって有害となる要因の発 現 を 双 方 が 抑 制 す るこ と も 同 時 に 重要 と な っ て き ます 。 A.
caulinodans のゲノム上には reb 遺伝子群という宿主殺傷に関与する遺伝子群が存在します。reb 遺伝子群はゾウリムシの絶対内性細菌で発見され、近年では多くの動植物病原細菌が保有することが判
図 3 A. caulinodans において想定される reb 遺伝子群の発現明しましたが、その機能の詳細は不明な部分が多く残されています。 抑制機構
私たちは A. caulinodans の reb 遺伝子群が高発現すると宿主とのパワーバランスが崩壊して宿主細胞を攻撃するようになる、つまり共生菌が病原菌的になることを見いだしました。また、reb 遺伝子群の発現制御機構の全容を先駆的に明らかにしつつあります。

9

微生物機能代謝工学（協和発酵バイオ）寄附部門

特任准教授
古園 さおり（2019 年 8 月転出）●

Saori KOSONO

微生物機能代謝工学
l Glucosel Fa y acid
部門は、2016 年 4 月よ
KAT: lysine (K) acyltransferasel Amino acidR;り協和発酵バイオ株
KDAC: lysine (K) deacetylase
C H 3 Acetyl
式会社の寄附部門とPropionyl
CoASH
Acyl-CoA
して第二期をスター
O
KAT+
Butyrylトしました。近年、細
NH3R
NH菌からヒトまで生物
CrotonylNon-enzyma c
Acetyl-P
Piに普遍的な翻訳後修
Acetyl-CoA
OMalonyl
Succinyl-CoA
飾として知られるよO
N
N
H
H
うになった「タンパクO - Methylmalonyl
KDAC
O
O
H2O
RCOOH*1
質のアシル化修飾」にO
LysineAcylated lysine
NAD+O
Nico namide*2
着目した研究を行っ
Succinyl+
OO-Acetyl-ADP-riboseています。アシル化修
NAD+/NADH
O- Glutaryl
飾はアシル CoA やア*1 Class-I, II, IV KDAC
O
*2 Class-III KDAC or sirtuin
セチルリン酸のような代謝化合物を利用することから、細胞内の代謝の状態を反映して変化し、代謝や栄養シグナルに応答したタンパク質の機能調節に関わると考えられています。扱いやすい細菌を用いて、アシル化修飾の新しい生物学的意義や全体像を明らかにするとともに、アシル化修飾を標的とした代謝改変や制御、微生物による物質生産の向上といった応用につなげることを目指しています。以下に主な研究テーマをご紹介します。

●コリネバクテリウム菌のグルタミン酸生産に関わるアシル化修飾の研究
特任教授
西山 真
●

Makoto NISHIYAMA

コリネバクテリウム菌（Corynebacterium glutamicum）は、グルタミン酸生産菌として分離されて以来、我が国の醗酵工業において重要な位置を占める細菌です。この菌は、生育必須因子であるビオチンの制限、脂肪酸エステル系界面活性剤の添加、抗生物質であるペニシリンの添加によってL-グルタミン酸を過剰生産することが知られています。上記の刺激は細胞膜上のメカノセンシティブチャネルを開口させグルタミン酸排出を引き起こすとともに、グルコースからグルタミン酸生産へ向かうような大規模な代謝フラックス変化をもたらします。私たちは、コリネバクテリウム菌を対象にアセチローム・
スクシニローム解析を実施し、グルタミン酸生産条件ではアセチル化やスクシニル化修飾が大規模に変化することを明らかにしました。こうしたアシル化修飾の変化が代謝フラックス変化やグルタミン
酸生産に及ぼすインパクトや役割について、解析を進めています。

●枯草菌をモデルとしたアシル化修飾の新規機能の発掘
枯草菌（Bacillus subtilis）は胞子形成能を有するグラム陽性の代表的なモデル細菌です。安定同位体ア
ミノ酸を用いたアセチローム・スクシニローム解析から、様々なタンパク質のアシル化修飾が栄養条件
や培養フェーズに応じて変化することが明らかとなってきました。そのなかで、RNAポリメラーゼやリ
ボソームなど転写・翻訳装置のアシル化に注目しています。アシル化修飾がRNAポリメラーゼやリボソームの活性や特異性に影響を及ぼすとすれば、転写や翻訳に与える影響は大きいと予想されます。アシル化修飾が栄養シグナルに応答した転写・翻訳制御に関わる未知のメカニズムを明らかにしようとし
ています。

10

微生物膜輸送工学（発酵研究所）寄附研究部門

特任教授
特任教授
川崎寿寿
川崎
●●

HisashiKAWASAKIKAWASAKI
Hisashi

微生物膜輸送工学部門は、2018 年 10 月より公益財団法人発酵研究所の寄附部門としてスタートしました。膜輸送タンパク質は生命活動に必須なエネルギーの生産やシグナル伝達、細胞外からの物質の取り込みや排出など、重要な役割を担っています。「パッチクランプ法」は、生体膜を横切るイオンの輸送を電流値として記録する
方法で、リアルタイムで計測できる、時間分解能が高い、定量性が高い、膜の両側の溶液組成の変更が容易である、膜電位を制御できるなど、膜輸送タンパク質解析法として優れた特徴を有しています。
さらに他の方法では困難な膜張力の制御が可能です。「パッチクランプ法」は動物細胞を対象とした研究では一般的ですが、微生物細胞を対象とした研究は非常に限定されています。我々は、計測に必要な巨大スフェロプラストを独自の方法で作製することに加え、装置面でもさまざまな工夫を凝らし、これまでの微生物パッチクラン
プシステムを凌駕するユニークなシステムを開発しました。このシステムを活用して、微生物や微生物を起源とする膜輸送タンパク質を解析すること、得られた知見を活用して有用物質の生産性を高めるなど応用につなげることを目指しています。以下に主要な研究テーマをご紹介します。

●有用物質生産のための膜輸送タンパク質の解析と応用

特任助教
橋本 賢一
●

Kenichi HASHIMOTO

社会の持続可能性をさらに高めるために、再生可能資源からの有用物質生産に対する期待がますます高まっています。最近のシステム代謝工学、合成生物学、生合成研究などの飛躍的発展によって微生物細胞内に目的化合物を大量に蓄積させることが可能になってきています。しかし、そのようにして細胞内に蓄積された目的化合物が細胞膜を超えて細胞外に効率よく輸送されるとは限
らず、しばしば微生物発酵技術のボトルネックとなっています。
私たちは、グルタミン酸の工業生産に利用されている
Corynebacterium glutamicum のNCgl1221遺伝子産物が膜張力で活浸透圧の上昇を感知して開口する性化されるメカノセンシティブチャネル（Msc）であること、このMscがグルタミン酸排出を直接担
うこと、基質寛容性があること、その輸送にはATP等は不要であることなどを明らかにしてきました。これらは、長年のグルタミン酸排出機構の議論に一定の決着をつけたばかりでなく、エネルギ
ー依存性についての定説を覆すものです。さらにこのMscが、生理的膜電位の下では、他のMscとは異なるグルタミン酸生産に有利な特性を持つこと明らかにしました。微生物発酵技術のボトルネッ
ク解消に向けて、膜輸送タンパク質のさらなる解析と共に膜輸送タンパク質のデザインを目指した研究も進めています。

●光合成や呼吸におけるイオン輸送の解析
生物がエネルギーを獲得する呼吸や光合成の根幹の一つはイオン輸送です。食物の酸化や光から得られるエネルギーは水ATP
葉緑体 ADP H
ミトコンドリアADP ATP
H
素イオン駆動力に変換され、それが ATP 合成に使われます。水
H
H
H
H
H
素イオン駆動力の生成と調節には、水素イオンばかりでなく複数種のイオン輸送が関わっています。我々は世界で初めて呼吸
H
H
H
H
H
H
酵素による水素イオン輸送を電流値として記録することに成功しています。また、呼吸酵素による水素イオン輸送について議論が続いている課題に決着をつける可能性があるデータを得ています。光合成については、水素イオン駆動力の調節に重要な陰イオ
ン輸送タンパク質の解析と共に、多数のイオン輸送タンパク質で構成された複雑な光合成システム
全体を理解するための実験方法の開発も進めています。光合成や呼吸についてさらに理解を深め、
微生物発酵生産において呼吸効率を高める、環境に適した光合成能を付与するなど社会の持続可能性を高める応用への展開も図っていきます。
+

+

+

+

特任助教
浜本 晋
●

Shin HAMAMOTO

+

+

+

+

+

+

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+

+

●高浸透圧ストレスに応答する出芽酵母液胞膜の Ca2+チャネルの電気生理学的解析
工業的利用と基礎研究の両分野で重要な出芽酵母
高浸透圧ストレス（Saccharomyces cerevisiae ）は高浸透圧ストレスに晒される
細胞膜と、液胞膜の Ca2+チャネルが活性化して液胞から細胞質に Ca2+？
を放出することが知られています。しかし、高浸透圧ストレス
液胞を感知して Ca2+チャネルが活性化する分子機構は明らかになっていません。我々は、これまで困難とされてきたイオン輸送体
液胞膜
出芽酵母の機解析に効果的であるパッチクランプ法の出芽酵母への適用
2+
Ca チャネルに成功し、本 Ca2+チャネルの電気生理学的解析と生理的役割の解明を進めています。細胞外の浸透圧変化を感知して応答するイオンチャネルは真核生物に広く保存されており、この普遍的でありながら未知のメカニズムの解明を目指しています。
COOH

H2N

S1 S2 S3 S4 S5

S6

Ca2+

11

生物生産工学研究センターシンポジウム
植物-微生物相互作用 ―農業生産性の視点からー
生物生産工学研究センターでは、毎年、「生物資源・食料・環境問題の微生物・植物バイオテクノロジーの活用による解決」をキーワードにシンポジウムを開催している。2019 年度は、東京大学農学生命科学研究科との共催により、11
月 13 日に東京大学弥生講堂一条ホールに於いて「植物-微生物相互作用 ―農業生産性の視点からー」と題して開催された。植物-微生物相互作用の研究で第一線で活躍されている 6 人の研究者を講師として迎え、若手研究者や学生も多数参加し、熱気に満ちた雰囲気のなか活発な討論が行われた。他大学や企業からも多数参加頂き、参加者総数は 146 名と大変盛況な会となった。シンポジウムに引き続き、東京大学弥生講堂アネックスセイホクギャラリーにおいて懇談会が開催され、最後まで討論が行われた。

開催記念集合写真プログラム
13:30 開会の挨拶
13:35

妹尾 啓史
堤 伸浩

会場の様子

（東京大学生物生産工学研究センター長）（東京大学大学院農学生命科学研究科長）

座長：篠崎 和子（東京大学大学院農学生命科学研究科）
13:40 川口 正代司（基礎生物学研究所共生システム研究部門）「アーバスキュラー菌根菌の絶対共生性と非共生培養による祖先形質の復元」
14:10 東樹 宏和（京都大学生態学研究センター）「未利用の微生物機能と持続可能農業：コア微生物叢の設計」
14:40 休憩
座長：高山 誠司（東京大学大学院農学生命科学研究科）
14:55 寿崎 拓哉（筑波大学生命環境系・つくば機能植物イノベーション研究センター）「窒素栄養環境下におけるマメ科植物-根粒菌共生の制御」
15:25 青野 俊裕（東京大学生物生産工学研究センター）「真核細胞殺傷因子 R-body を生産するセスバニア根粒菌」
15:55 休憩
座長：浅見 忠男（東京大学大学院農学生命科学研究科）
16:10 高野 義孝（京都大学大学院農学研究科）「炭疽病菌と植物の間で繰り広げられる攻防戦」
16:40 西條 雄介（奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科）「植物細胞の水輸送制御をめぐる植物と病原細菌の攻防」
17:10 閉会の辞 妹尾 啓史（東京大学生物生産工学研究センター長）
17:30 懇談会 (東京大学弥生講堂アネックス セイホクギャラリー)

12

第1回

グローバルイノベーションワークショップ
1st Global Innovation Workshop

生物生産工学研究センターの学生・ポスドクがバイオテクノロジー分野における広い視野を持つことと切磋琢磨することを目指して、研究発表会が企画された。センターの研究室に加え、学外連携部門、応用生命化学・工学専攻の研究室からの学生、研究員、教員が 6 月 4 日に弥生講堂一条ホールに集まり、研究発表会が行われた。また 3 名の海外研究者を招待し、特別講演をして頂いた。会の運営や進行、発表は学生・ポスドクを主体として行われた。口頭発表とポス
ター発表は主に英語によって行われ、活発な議論がなされた。教員による公正な審査の結果、作田郁子さん、安田まり
奈さん、斎藤守秋さんに優秀発表賞が授与され、鳥居将太朗さん、Surachat Tangpranomkoen さん、Jie Zhang さんに敢闘賞が授与された。
12:55 Opening address (Director of BRC, Prof. Keishi Senoo)
Session 1 Keynote address Chair: Hibiki Kawano (D2, Lab. of Environmental Biotechnology), Moriaki Saito (D1,Lab. of Plant Functional Biotechnology), Sumire Kurosawa (D1, Lab. of Cell Biotechnology)
13:00 Dr. Xihui Shen (Microbiology college of Life Sciences, Northwest A&F University, Yanpling, Shaanxi,
China)
Beyond dueling: Roles of type VI secretion system in importing metal ions
13:30 Dr. Yen-Ping Hsueh (Institute of Molecular Biology, Academia Sinica, Nankang, Taipei, Taiwan)
Predator-prey interactions and coevolution between the nematode-trapping fungi and nematodes
14:00 Dr. Ren-Chao Zheng (College of Biotechnology and Bioengineering, Zhejiang University of Technology
No. 6, Zhaohui District Hangzhou, China)
Highly efficient chemoenzymatic synthesis of Pregabalin: From enantioselective hydrolysis of diester to dinitrile
14:30 BreakSession 2 Chair: Daisuke Yoshidome (D2, Lab. of Molecular and Cellular Breeding), Tomohiro Noguchi (D1, Lab.
of Molecular and Cellular Breeding)
14:45 Surachat Tangpranomkon (D3, Lab. of Organic Chemistry)
Identification and molecular studies of pollen factor involved in pollen-pistil interaction of Arabidopsis
15:00 Haibing He (D2, Lab. of Natural Product Chemistry)
Function and Structure Analysis of a Novel Cupin Enzyme SbzM in the Biosynthesis of Sulfonamide Antibiotics
15:15 Moriaki Saito (D1, Lab. of Plant Functional Biotechnology)
Nitrate nutrition-induced de novo NAD biosynthesis affects plant growth via multiple metabolic processes
15:30 Keisuke Kojima (D2, Lab. of Forest Chemistry)
The comparison of two fungal beta-xylosidases reveals the difference of fungal strategies for wood decay
15:45 Keita Kine (D2, Lab. of Forest Chemistry)
Function of an α-L-arabinofuranosidase in the cellulosic biomass degradation by the white-rot basidiomycete
Phanerochaete chrysosporium
16:00 BreakSession 3 Chair : Allan Arciaga Devanadera (D2, Lab. of Environmental Biotechnology), Keisuke Tomita (D2, Lab.
of Environmental Biotechnology)
16:15 Sachiko Sakamoto (D3, Lab. of Bioproduction Research Institute, AIST)
A novel route from methoxylated aromatic compounds to methane: syntrophic degradation in the deep subsurface
16:30 Jie Zhang (D2, Lab. of Molecular and Cellular Breeding)Studies on the biosynthesis of unusual methylbenzene-containing polyenes
16:45 Shotaro Torii (D2, Lab. of Environmental Public Health Engineering)
Repeated pressurization as a unique mechanism of deterioration in virus removal by reverse osmosis membrane usedin households
17:00 Nguyen Vu Giang Bac (D3, Nomura Lab., University of Tsukuba)
Sophorolipids: possible applied to prevent and disrupt Pseudomonas aeruginosa PAO1 biofilm

13

17:15 Marina Yasuda (D1, Nomura Lab., University of Tsukuba)
Phage gene may stimulate bacterial communication in Paracoccus denitrificans
17:30 Ayako Sakuda (D3, Nomura Lab. of Environmental Biochemistry)
Conjugative Selectivity of Plasmids Is Affected by Coexisting Recipient
17:45 Group photo
Poster session (17:45-18:30)
Naoki Takahashi (M2, Lab. of Cellular Genetics)
Adsorption to n-alkane and cell morphology of Yarrowia lipolytica
Shohei Yoshida (M2, Lab. of Applied Microbiology)
Study on oxidative stress resistance by alternative oxidase in Roseobacter denitrificans
Chaganzhana (M2, Lab. of Plant Functional Biotechnology)
A search for superior alleles leading to better growth of plants in nitrogen-deficient environments
Tomoki Ikeda (M1, Lab. of Plant Functional Biotechnology)
Functional Analysis of Biotin Uptake Systems in Stem-Nodulating N2-Fixer, Azorhizobium caulinodans
Yuma Onoue (M1, Lab. of Plant Functional Biotechnology)
Mechanisms for light signaling-induced activation of nutrient acquisition in Arabidopsis thaliana
Yuki Hirashima (M2, Lab. of Molecular Cellular Breeding)Studies on the biosynthesis using amino group carrier protein in Serratiasp. ATCC39006
Tomohiro Noguchi (D1, Lab. of Molecular and Cellular Breeding)Deamination mechanism common in the biosynthesis of meroterpenoids from Streptomyces
Kohei Nishi (M2, Lab. of Molecular and Cellular Breeding)
Mechanism of ribosome degradation induced by nutrient starvation in Saccharomyces cerevisiae
Naoko Hoshi (M1, Lab. of Applied Microbiology)
D-amino acids productivity of lactic acid bacteria isolated from traditional pot fermented rice black vinegar
Toshiya Higuchi (M2, Lab. of Environmental Biochemistry)
Existence of momilactone biosynthesis gene cluster in the moss Hypnum Pluumaeforme
Miki Wada (M2, Lab. of Environmental Biochemistry)
Transcriptional regulatory mechanism of rice stress-inducible prenyldiphosphate synthases
Iku Fujikawa (M2, Lab. of Environmental Biochemistry)
Identification of the elements determining the conjugation selectivity of plasmid
18:30 Reception
20:00 Closing remarks

14

生物生産工学研究センター
研究・教育活動●

報文、学会発表等●

●報文Konishi M, Yanagisawa S. The role of protein-protein interactions mediated by the PB1 domain of NLP transcription
factors in nitrate-inducible gene expression. BMC Plant Biol. 2019;19:90
Sakuraba Y, Kim D, Han SH, Kim SH, Piao W, Yanagisawa S, An G, Paek NC, Multilayered regulation of membranebound ONAC054 is essential for abscisic acid-induced leaf senescence. Plant Cell. 2020;32:630-649
Zhuo M, Sakuraba Y, Yanagisawa S. A jasmonate-activated MYC2-Dof2.1-MYC2 transcriptional loop promotes leaf
senescence in Arabidopsis. Plant Cell. 2020;32:242-262
Ueda Y, Kiba T, Yanagisawa S. Nitrate-inducible NIGT1 proteins modulate phosphate uptake and starvation signaling via
transcriptional regulation of SPX genes. Plant J. 2020;102:448-466
Matsuoka J, Ishizuna F, Ogawa T, Hidaka M, Siarot L, Aono T. Localization of the reb operon expression is inconsistent
with that of the R-body production in the stem nodules formed by Azorhizobium caulinodans mutants having a deletionof praR. J Gen Appl Microbiol. 2019;65:209–213
Sakaki K, Ohishi K, Shimizu T, Kobayashi I, Mori N, Matsuda K, Tomita T, Watanabe H, Tanaka K, Kuzuyama T,
Nishiyama M. A novel suicide enzyme catalyzes multiple reactions in a single active site for biotin biosynthesis incyanobacteria. Nat Chem Biol. 2020;16:415-422
Yashiro T, Sakata F, Sekimoto T, Shirai T, Hasebe F, Matsuda K, Kurosawa S, Suzuki S, Nagata K, Kasakura K,
Nishiyama M, Nishiyama C. Immunosuppressive effect of a non-proteinogenic amino acid from Streptomyces throughinhibiting allogeneic T cell proliferation. Biosci Biotechnol Biochem. 2019;83:1111-1116
Yoshida A, Yoshida M, Kuzuyama T, Nishiyama M, Kosono S. Protein acetylation on 2-isopropylmalate synthase from
Thermus thermophilus HB27. Extremophiles. 2019;23:377-388
Tomita T, Matsushita H, Yoshida A, Kosono S, Yoshida M, Kuzuyama T, Nishiyama M. Glutamate dehydrogenase from
Thermus thermophilus is activated by AMP as a complex with adenine phosphoribosyltransferase homolog. J
Bacteriol. 2019;201:e00710-18
Suzuki S, Kondo N, Yoshida M, Nishiyama M, Kosono S. Dynamic changes in lysine acetylation and succinylation of theelongation factor Tu in Bacillus subtilis. Microbiology. 2019;165:65-77
Romo AJ, Shiraishi T, Ikeuchi H, Lin G-M, Geng Y, Lee Y-H, Liem PH, Ma T, Ogasawara Y, Shin-ya K, Nishiyama M,
Kuzuyama T, Liu H-w. The amipurimycin and miharamycin biosynthetic gene clusters: unraveling the origins of 2aminopurinyl peptidyl nucleoside antibiotics. J Am Chem Soc. 2019;141:14152-14159
Kudo K, Koiwai H, Kagaya N, Nishiyama M, Kuzuyama T, Shin-ya K, Ikeda H. Comprehensive derivatization of
thioviridamides by heterologous expression. ACS Chem Biol. 2019;14:1135-1140
Suzuki T, Akiyama N, Yoshida A, Tomita T, Lassak K, Haurat MF, Okada T, Takahashi K, Albers S-V, Kuzuyama T,
Nishiyama M. Biochemical characterization of archaeal homocitrate synthase from Sulfolobus acidocaldarius. FEBS
Lett. 2019;594:126-134
Kobayashi M, Tomita T, Shin-ya K, Nishiyama M, Kuzuyama T. An unprecedented cyclization mechanism in thebiosynthesis of carbazole alkaloid in Streptomyces. Angew Chem Int Ed Engl. 2019;58:13349-13353
Murai K, Lauterbach L, Teramoto K, Quan Z, Barra L, Yamamoto T, Nonaka K, Shiomi K, Nishiyama M, Kuzuyama T,
Dickschat JS. An unusual skeletal rearrangement in the biosynthesis of the sesquiterpene trichobrasilenol fromTrichoderma. Angew Chem Int Ed Engl. 2019;58:15046-15050
Vejarano F, Suzuki-Minakuchi C, Ohtsubo Y, Tsuda M, Okada K, Nojiri H. Complete genome sequence ofThalassococcus sp. strain S3, a marine Roseobacter clade member capable of degrading carbazole. Microbiol Resour
Announc. 2019;8:e00231-19
Mpofu E, Chakraborty J, Suzuki-Minakuchi C, Okada K, Kimura T, Nojiri H. Biotransformation of monocyclic phenolic
compounds by Bacillus licheniformis TAB7. Microorganisms. 2019;8:E26
Sánchez-Sanuy F, Peris-Peris C, Tomiyama S, Okada K, Hsing YI, San Segundo B, Campo S. Osa-miR7695 enhancestranscriptional priming in defense responses against the rice blast fungus. BMC Plant Biol. 2019;19(1):563
Amemiya S, Toyoda H, Kimura M, Saito H, Kobayashi H, Hara K, Kamagata K, Kawabata R, Kato S, Nakashimada Y,
Furuta T, Hamamoto S, Uozumi N. The mechanosensitive channel YbdG from Escherichia coli has a role in adaptation
to osmotic up-shock. J Biol Chem. 2019;294:12281-12292
Tsujii M, Kera K, Hamamoto S, Kuromori T, Shikanai T, Uozumi N. Evidence for potassium transport activity of
Arabidopsis KEA1-KEA6. Sci Rep. 2019;9:10040

16

●国内学会発表等■第 19 回東京大学生命科学シンポジウム 2019 年 4 月 20 日 (東京)
Nitrate signaling influences multiple metabolic pathways through the promotion of de novo NAD biosynthesis in Arabidopsis.
斉藤 守秋,宮城 敦子,小西 美稲子,川合 真紀,柳澤 修一
The role of Dof2.1 plant-specific transcription factor in jasmonate signaling in Arabidopsis.
Mengna Zhuo, Yasuhito Sakuraba, Shuichi Yanagisawa
Structural insight into the mechanism of angular dioxygenation in carbazole 1,9a-dioxygenase.
Yixia Wang, Jun Matsuzawa, Joydeep Chakraborty, Zui Fujimoto, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri■第 19 回日本蛋白質科学会年会 第 71 回日本細胞生物学会大会合同年次大会 2019 年 6 月 24-26 日（神戸）Binding manner between ferredoxin and α3β3-type oxygenase components in Rieske non-heme iron dioxygenase
蔡 弼丞,Joydeep Chakraborty, 水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭■2019 年度国立遺伝学研究所 研究会「環境中の DNA 循環」 2019 年 8 月 19 日（静岡）接合伝達性プラスミドの二面性～遺伝情報の保存装置と進化駆動装置～
野尻 秀昭■第457回ビタミンB研究協議会 2019年8月30日(京都)シアノバクテリアに見出された新規ビオチン生合成酵素の触媒機構の解明
西山 真■日本土壌肥料学会 2019 年度静岡大会 2019 年 9 月 3 日-5 日(静岡)シロイヌナズナの窒素飢餓応答に関わるABCタンパク質の機能解析
櫻庭 康仁,馬渕 敦士,射場 厚,柳澤 修一
多品種トランスクリプトームを利用したイネにおける窒素条件を反映した転写制御ネットワークの解析
植田 佳明,門田 幸二,手塚 あゆみ,永野 惇,金容 賢,門脇 太朗,宮尾 光恵,柳澤 修一
シロイヌナズナ硝酸応答性転写因子 NLP2 の NLP7 とは異なる役割
小西 美稲子,沖津 孝幸,柳澤 修一
Possible involvement of Dof1.7 transcription factor in nitrogen-starvation responses in Arabidopsis
Mengna Zhuo, Yasuhito Sakuraba, Shuichi Yanagisawa
植物の硝酸応答を担う NLP 転写因子の分解機構の解析
有賀 琢人,小西 美稲子,柳澤 修一
セスバニア根粒菌 Azorhizobium caulinodans におけるビオチン輸送隊オペロン群の機能分担
池田 朋樹,柳澤 修一,青野 俊裕■第 37 回日本植物細胞分子生物学会 2019 年 9 月 7 日-8 日(京都)
窒素欠乏条件で高成長を示すシロイヌナズナ野生系統間の窒素応答性の比較解析
馬渕 敦士，門田 慧奈，井内 聖，小林 正智，祢冝 淳太郎，櫻庭 康仁，阿部 光知，柳澤 修一，射場 厚■日本植物学会第 83 回大会 2019 年 9 月 15 日-17 日(宮城)
極限低窒素環境において高成長を示すシロイヌナズナエコタイプの接木実験
馬渕 敦士，門田 慧奈，野田口 理孝，筒井 大貴，櫻庭 康仁，祢冝 淳太郎，阿部 光知，柳澤 修一，射場 厚■第 60 回大気環境学会年会 植物分科会 2019 年 9 月 18 日(東京)イネにおけるオゾンストレスおよび窒素栄養応答に関わる分子機構
植田 佳明■第５回 植物の栄養研究会 2019 年 9 月 20 日-21 日(広島)
硝酸応答とニコチンアミドアデニンジヌクレオチド合成
柳澤 修一■令和元年度グラム陽性菌ゲノム機能会議 2019 年 9 月 6 日-7 日 (茨城)Corynebacterium glutamicum 由来 PDH-ODH 複合体のユニークな分子構造と制御
衣川 寛知，近藤 直子，小峰（阿部） 理乃，西山 真，古園 さおり

17■第 10 回醗酵学フォーラム 2019 年 9 月 30 日-10 月 1 日（新潟）Corynebacterium glutamicum 由来 PDH-ODH 複合体のユニークな分子構造と制御■2019 年度 岡山大学資源植物科学研究所共同研究拠点ワークショップ“土の健康から人の健康まで〜栄養素階層フラックスの理解〜” 2019 年 10 月 16 日(岡山)
多様な環境での栄養獲得・利用の最適化のための植物メカニズム柳澤 修一■第12回北陸合同バイオシンポジウム 2019年10月25-26日（福井）セスバニア根粒菌の宿主殺傷能と β-lactam 系抗生物質耐性能は転写因子 AmpR を介して温度により制御される
平川 智基,松岡 淳一,諸橋 賢吾,青野 俊裕
大腸菌リジン脱アセチル化酵素の N 末端バリアントの発現・機能解析楳原 琢哉，西山 真，古園 さおり■第 18 回微生物研究会 2019 年 11 月 9 日（東京）H-NS ファミリータンパク質が制御する遺伝子群はプラスミド保持に伴い劇的に変化する
中村 泰輔,河野 響,兼崎 友,川崎 信治,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
H-NS ファミリータンパク質の塩基配列嗜好性とそのメカニズムの解析
津島 和生,角埜 裕基,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
プラスミド上の芳香族化合物分解遺伝子群の発現が細菌集団中で多様化するメカニズムの解析
武田 祐太郎,山本 夏実,高比良 早紀,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭■第 24 回東京大学生物生産工学研究センターシンポジウム 2019 年 11 月 13 日(東京)
真核細胞殺傷因子 R-body を生産するセスバニア根粒菌
青野 俊裕■植物化学調節学会 2019 年度大会 2019 年 11 月 15-17 日（鳥取）蘚類ハイゴケの染色体上でクラスター化したモミラクトン生合成遺伝子群の機能解析
樋口 俊哉,照屋 美優,藤原 薫,宮本 皓司,山根 久和,林 謙一郎,川出 洋,Longjiang Fan,野尻 秀昭,岡田 憲典
イネのジテルペン系ファイトアレキシン生合成遺伝子のノックアウトイネの作出と解析
石川 一輝,山村 千紘,和田 美樹,冨山 詩歩,前田 哲,岡田 憲典,鎌倉 高志,森昌樹■極限環境生物学会 2019 年度年会 2019 年 11 月 16-17 日（京都）プラスミド pCAR1 上のカルバゾール分解遺伝子群の発現が細菌集団中で多様化するメカニズムの解析
武田 祐太郎,山本 夏実,高比良 早紀,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭■福井県立大学 福井バイオインキュベーションセンター設立5周年記念特別講演会2019年11月29日（福井）微生物は未知の物質変換系の宝庫である
西山 真■第 42 回日本分子生物学会年会 2019 年 12 月 3-6 日（福岡）コリネ型細菌由来 PDHc/ODHc 超複合体の相互作用因子解析.
田口 智也,稲葉 龍生,山内 健太郎,古園 さおり,川崎 寿,夏目 亮■第 42 回日本分子生物学会年会 公募ワークショップ「遺伝子の水平伝播からゲノム進化を考える」2019 年 12 月 3-6 日（福岡）
Pseudomonas resinovorans CA10dm4 は各種プラスミドに非感受性を示す－宿主ゲノム進化における役割－
野尻 秀昭■第 14 回日本ゲノム微生物学会年会 2020 年 3 月 6-8 日（愛知）“Backup”だけではない-プラスミド由来 H-NS 様因子の機能中村 泰輔,河野 響,兼崎 友,川崎 信治,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
Pseudomonas 属細菌由来の核様体タンパク質 NdpA における多量体化ドメインの探索
佐道 陽弘,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭

18

■日本農薬学会第 45 回大会 2020 年 3 月 8-10 日（大阪）
新規殺菌剤トルプロカルブに関する研究（第 12 報）－イネにおけるジテルペン型ファイトアレキシン生合成経路の活性化－
萩原 寛之,髙橋 明里，鳥邉 翔，冨山 詩歩，富田 啓介，有村 源一郎，岡田 憲典，小原 敏明
新規殺菌剤トルプロカルブに関する研究（第 13 報）－イネにおけるジテルペン型ファイトアレキシン類の蓄積－
髙橋 明里,鳥邉 翔，冨山 詩歩，富田 啓介，有村 源一郎，萩原 寛之，小原 敏明，岡田 憲典■第 61 回日本植物生理学会年会 2020 年 3 月 19 日-21 日 (大阪)
イネの ABA により誘導される葉の老化機構における膜結合型 NAC 転写因子 ONAC054 の多重制御の役割
櫻庭 康仁,Gynheung An,柳澤 修一,Nam-Chon Paek
Involvement of Dof1.7 transcriptional activator in the NIGT1-regulated nitrogen starvation responses in Arabidopsis
Mengna Zhuo, Yasuhito Sakuraba and Shuichi Yanagisawa
An Arabidopsis NRT1.1 allele is a superior allele conferring better nitrogen use under nitrogen-deficient conditions
Chaganzhana, Yasuhito Sakuraba and Shuichi Yanagisawa
イネの共発現ネットワーク解析：窒素応答制御因子の同定に向けて
萩野 勝己,金 容賢,植田 佳明,柳澤 修一,宮尾 光恵
シロイヌナズナ野生系統が持つ窒素欠乏適応形質の接木による他系統への付与
馬渕 敦士，門田 慧奈，野田口 理孝，筒井 大貴，櫻庭 康仁，祢冝 淳太郎，阿部 光知，柳澤 修一，射場 厚
グルタミンによる NRT2.1 の発現抑制の分子機構
小西 美稲子,郭 鵬程,柳澤 修一
シロイヌナズナにおける赤色光による硝酸態窒素獲得の調節
尾上 佑真,櫻庭 康仁,柳澤 修一
シロイヌナズナの硝酸応答時における NRT2.1 の発現パターンの数理モデル
植田 佳明,柳澤 修一
植物の硝酸応答を担う NLP 転写因子の分解機構の解析
有賀 琢人,櫻庭 康仁,小西 美稲子,柳澤 修一
Identification of guard cell K+ channel inhibitors that contribute to drought tolerance in Arabidopsis thaliana.
Sato K, Suzuki K, Endo K, Shimada T, Kakei T, Arisawa M, Mizuno T, Isaka N, Yamaguchi T, Hamamoto S, Grenzi M, Costa
A, Bashir K, Seki M, Ishimaru Y, Uozumi N.
■日本農芸化学会 2020年度大会 2020年3月24−28日(福岡)
放線菌の生産するアザビシクロ環含有化合物vazabitide A生合成におけるアジリジン環合成経路に関する研究
黒澤 菫,松田 研一,長谷部 文人,富田 武郎,葛山 智久,西山 真
Serratia sp. ATCC 39006におけるアミノ基キャリアタンパク質を介した生合成についての研究平島 佑樹,曽根 祐輔,菊池 恒志郎,富田 武郎,葛山 智久,古園 さおり,西山 真
typeII AmCPを介して生合成されるマレイマイシン類の生合成機構に関する研究
曽根 祐輔,Muhammad Prima PUTRA,松田 研一,葛山 智久,古園 さおり,西山 真
プラスミド・宿主染色体由来の MvaT ホモログの DNA 結合能の評価
津島 和生,角埜 裕基,水口千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
Comparison of novel genome sequences reveal gene recruitment mechanisms of catabolic genes among nine diverse
carbazole-degrading bacteria.
Felipe VEJARANO, Chiho SUZUKI-MINAKUCHI, Yoshiyuki OHTSUBO, Masataka TSUDA, Kazunori OKADA, Hideaki
NOJIRI
プラスミドの受容菌認識における外膜タンパク質 OprH の機能解析
作田 郁子,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
IncP-7 群プラスミド pCAR1 上に新たに見出された TA システムの機能解析
高島 綾,河野 響,上田 朋美,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭

19H-NS ファミリータンパク質のレギュロンはプラスミド保持に伴い劇的に変化する
中村 泰輔,河野 響,兼崎 友,川崎 信治,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
細菌にプラスミドへの非感受性を与える転写制御ネットワークの解明
河野 響,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
Azoxystrobin transformation by Bacillus licheniformis strain TAB7 produces azoxystrobin amine as novel metabolite
Amirah ALIAS, Enock MPOFU, Keisuke TOMITA, Chiho SUZUKI-MINAKUCHI, Kenji TOMITA, Joydeep CHAKRABORTY,
Michal MALON, Yusuke OGURA, Hirosato TAKIKAWA, Kazunori OKADA, Toshiaki KIMURA, Hideaki NOJIRI
染色体由来の転写制御因子がプラスミド pCAR1 上の分解遺伝子群の発現を一細胞レベルで変化させる
武田 祐太郎,山本 夏実,高比良 早紀,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
Transcriptomic analysis of benzene-degrading nitrate-reducing Azoarcus sp. DN11 reveals the involvement of hydroxylation
as initial reaction in anaerobic benzene degradation pathway
Allan DEVANADERA, Chiho SUZUKI-MINAKUCHI, Yuki KASAI, Yoh TAKAHATA, Kazunori OKADA, Hideaki NOJIRI
Pseudomonas 属細菌の H-NS ファミリータンパク質における翻訳後修飾部位の同定
ヴァシレヴァ デリアナ,水口 千穂,孫 悦,古園 さおり,吉田 稔,岡田 憲典,野尻 秀昭
同一不和合性群に属するプラスミドであってもその宿主域は異なる
德田 真穂,千葉 怜碧,井上 謙吾,雪 真弘,大熊 盛也,水口 千穂,野尻 秀昭,金原 和秀,新谷 政己
蘚類ハイゴケの染色体上でクラスター化しているモミラクトン生合成遺伝子群の機能解析
樋口 俊哉, 照屋 美優, 藤原 薫, 宮本 皓司, 山根 久和, 林 謙一郎, 川出 洋, Longjiang Fan, 野尻 秀昭, 岡田 憲典
In vitro 再構成系を用いたグルタミン酸生産菌 Corynrbacterium glutamicum 由来 PDH-ODH 複合体の解析
近藤 直子,衣川 寛知,小峰（阿部）理乃,西山 真,古園 さおり●国際学会発表等■The 4th International Symposium on the Nitrogen Nutrition of Plants, September 21-25, 2019 (Nanjing, China)
Transcriptional cascades maintaining the balance of N and P acquisition
Shuichi Yanagisawa■International Congress of the Malaysian Society for Microbiology 2019, November 11-14, 2019 (Seremban, Malaysia)
Pseudomonas resinovorans CA10dm4 shows insensitivity to various plasmids: Its role in the host genome evolution
Hideaki Nojiri■BACELL 2019, April 9-10, 2019 (Ljubljana, Slovenia)
Dynamic changes in lysine acetylation and succinylation of the elongation factor Tu in Bacillus subtilis
Shota Suzuki, Naoko Kondo, and Saori Kosono■The 30th International Conference on Arabidopsis Research, June 16-21, 2019 (Wuhan, China)
The Transcriptional Feedforward Loop Consisting of Dof2.1 and MYC2 Enhances Jasmonate Responses in Arabidopsis
thaliana
Mengna Zhuo, Yasuhito Sakuraba and Shuichi Yanagisawa■ASM Microbe 2019, June 20-25, 2019 (San Francisco, USA)
Pseudomonas resinovorans CA10dm4 shows the novel trait “plasmid-insensitivity”
Hibiki Kawano, Tomomi Ueda, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri
Structural Insight into the Mechanism of Angular Dioxygenation in Carbazole 1,9a-dioxygenase
Yixia Wang, Jun Matsuzawa, Joydeep Chakraborty, Zui Fujimoto, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri■China conference on protein science, August 2-4, 2019 (Harbin, China)
Structural insight into the mechanism of angular dioxygenation in carbazole 1,9a-dioxygenase
Yixia Wang, Jun Matsuzawa, Joydeep Chakraborty, Zui Fujimoto, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri■TERPNET 2019 - The 14th International Meeting on Biosynthesis, Function and Synthetic Biology of Isoprenoids, August26-30, 2019 (Halle, Germany)
Chemical genomics approach to dissect the mode of action of momilactone B, a major contributor to chemical defense in
rice
Keisuke Tomita, Yasuhiro Matsuo, Makoto Kawamukai, Yoko Yashiroda, Minoru Yoshida, Hideaki Nojiri, Kazunori Okada

20

Regulators of stress-inducible prenyldiphosphate synthases that define types of terpenoids production in rice
Miki Wada, Tomonori Shinya, Ivan Galis, Rika Ozawa, Gen-ichiro Arimura, Masaki Mori, Hideaki Nojiri, Kazunori Okada■Thermophile 2019, September 2-6, 2019 (Fukuoka, Japan)
Identification of a novel lignoaromatic degradation pathway in Thermus oshimai JL-2 and its evolutionary implication
Joydeep Chakraborty, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri■Thermophiles 2019, 15th International Congress on Thermophiles, September 2-6, 2019 (Fukuoka, Japan)
Regulatory roles of catalytically-inactive enzyme homologs in metabolism of Thermus thermophilus
Makoto Nishiyama
Characterization of acetyl-CoA synthetases from Thermus thermophilus HB27
Keiichiro Takashima, Ayako Yoshida, Takeo Tomita, Tomohisa Kuzuyama, Makoto Nishiyama
Glutamate dehydrogenase from Thermus thermophilus is allosterically controlled by leucine and AMP as the complex witha homolog of adenine phosphoribosyltransferase
Takeo Tomita, Makoto Nishiyama
Regulatory function of CoA transferase from Thermus thermophilus HB27
Ayako Yoshida, Hiroyuki Yamamoto, Takeo Tomita, Minoru Yoshida, Saori Kosono, Tomohisa Kuzuyama, Makoto Nishiyama■17th International Symposium on Rice Functional Genomics, September 4-6, 2019 (Taipei, Taiwan)
Regulatory machinery for the coordinated expression on the phytoalexin biosynthetic gene clusters conserved in wild ricegenomeShiho Tomiyama, Ryouka Kawahara-Miki, Koji Miyamoto, Hisakazu Yamane, Hideaki Nojiri, Naoki Yamamoto, Kazunori
Okada.
■1st Japan-Germany-Switzerland Workshop for Enzyme Technology and Bioprocess Development, September 10-12,
2019 (Toyama, Japan)
Regulation of phosphoenolpyruvate carboxylase (PEPC) by reversible acetylation in Corynebacterium glutamicum: its
impact on L-glutamate overproduction.
Saori Kosono, Megumi Nagano-Shoji, Yuma Hamamoto, Yuta Mizuno, and Makoto Nishiyama.
■1st Japan-Germany-Switzerland Workshop for Enzyme Technology and Bioprocess Development, September 10-12,
2019 (Toyama, Japan)
Regulation of phosphoenolpyruvate carboxylase (PEPC) by reversible acetylation in Corynebacterium glutamicum: its
impact on L-glutamate overproduction
Saori Kosono, Megumi Nagano-Shoji, Yuma Hamamoto, Yuta Mizuno, Makoto Nishiyama
CoA transferase from Thermus thermophilus is regulated by catalytically inactive alanine dehydrogenase-like protein
Ayako Yoshida, Hiroyuki Yamamoto, Takeo Tomita, Minoru Yoshida, Saori Kosono, Tomohisa Kuzuyama, Makoto Nishiyama
Discovery of a novel suicide enzyme catalyzing multiple reactions in a single active site for biotin biosynthesis of
cyanobacteria
Makoto Nishiyama■64th Annual Meeting of the Biophysical Society, February 15-19, 2020 (San Diego, USA)
Corynebacterial “Force-From-Lipids” mechanosensation for MSG production.
Nakayama Y, Hashimoto K, Kawasaki H, Martinac B■15th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, May 26-30, 2019 (Lisbon, Portugal)
Nitrogen fixation of iron reducing bacteria in rice paddy soils – potent agents for sustainable crop production with low nitrogen
input.
Masuda Y, Yamanaka H, Itoh H, Shiratori Y, Amachi S, Aono T, Senoo K●総説等
Ueda Y, Yanagisawa S. Perception, transduction and integration of nitrogen and phosphorus. J Exp Bot. 2019;70:3709-3717
Kosono S. “Post-translational modifications in Corynebacterium glutamicum.” eds. Inui M and Toyoda K, Corynebacterium
glutamicum: Biology and Biotechnology Second edition (Microbiology Monographs 23), 2020, p149-172
Nakayama Y, Hashimoto K, Kawasaki H, Martinac B. “Force-From-Lipids” mechanosensation in Corynebacterium
glutamicum. Biophys Rev. 2019;11:327-333.
松田 研一, 西山 真, アミノ基キャリアタンパク質を介して生合成される新規天然物の探索と特異な N-N 結合形成機構の発見, 生化学, 2020;92:130-135

21

古園 さおり,西山 真, 古くて新しいグルタミン酸醗酵,遺伝子・細胞から見た応用微生物学(阪井 康能, 竹川 薫, 橋本
渉, 片山 高嶺編), 2020, p120-121
古園 さおり, 細菌の栄養環境応答とタンパク質アシル化修飾, 化学と生物,

2019;57:95–101

岡田 憲典, 3 章イソプレノイド, 基礎から学ぶ植物代謝生化学(水谷 正治,士反 伸和,杉山 暁史編), 2019, p59-80
岡田 憲典, 植物種を超えて存在するジテルペン型ファイトアレキシン生合成遺伝子クラスター, アグリバイオ 2019 年 4月号, 2019;3(4):63-67
岡田 憲典, 植物種におけるジテルペン型ファイトアレキシン生合成遺伝子クラスターの進化過程, アグリバイオ 2019 年
9 月号, 2019;3(10):82-86●教員および学生の受賞
斎藤 守秋：第 19 回東京大学生命科学シンポジウム
吉田 彩子：財団法人 農学会

ポスター賞

農学進歩賞

榊 渓：令和元年度東京大学大学院農学生命科学研究科

研究科長賞

Yixia Wang：China conference on protein science, outstanding poster award中村 泰輔：日本農芸化学会 2020 年度大会 ポスター発表選出
河野 響：日本農芸化学会 2020 年度大会 ポスター発表選出
河野 響：日本農芸化学会 2020 年度大会 トピックス賞

●学位論文
■博士論文
作田 郁子「細菌集団におけるプラスミドの受容菌選択機構」（指導教員野尻 秀昭）

ベハラノ フェリペ「Diversity and evolution of bacterial carbazole-degradative gene clusters（細菌のカルバゾール分解遺伝子群の多様性と進化）」（指導教員 野尻 秀昭）
アリアス アミラ「Characterization of bacterial degradation systems for cyclodiene and strobirulin pesticides（シクロジエ
ン系あるいはストロビルリン系農薬の微生物分解に関する研究）」（指導教員 野尻 秀昭）
蔡 弼丞「Mechanism of electron transfer between ferredoxin and α3β3-type oxygenase components of Rieske non-heme
iron oxygenase（Rieske non-heme iron oxygenase におけるフェレドキシンとオキシゲナーゼ間電子伝達機構の解明）」（指導教員 野尻 秀昭）■修士論文
Chaganzhana 「Analysis of NRT1.1 alleles associated with better nitrogen use in Arabidopsis」(指導教員柳澤 修一)

叶 思言「Studies on the functions of LysV in Thermus thermophilus (高度好熱菌Thermus thermophilusにおけるLysVの機能解析）)」(指導教員 西山 真)
榊 渓「シアノバクテリアのビオチン生合成に関わる新奇脱水素酵素の構造と反応機構に関する研究」(指導教員 西山 真)
平島 佑樹「Serratia sp. ATCC 39006におけるアミノ基キャリアタンパク質を介して生合成される化合物の探索と生合成経路の解析」(指導教員 西山 真)
佐道 陽弘「プラスミド pCAR1 と宿主 Pseudomonas putida KT2440 株染色体上にコードされる NdpA ホモログの機能解析」（指導教員 野尻 秀昭）
和田 美樹「イネのストレス誘導型プレニル 2 リン酸合成酵素遺伝子の発現制御機構の解析」（指導教員野尻 秀昭）

孫 悦「Oligomerization mechanism of H-NS family proteins encoded on the chromosome of Pseudomonas putida KT2440

22and IncP-7 plasmid pCAR1（Pseudomonas putida KT2440 株の染色体と IncP-7 プラスミド pCAR1 にコードされた H-NS
ファミリータンパク質の多量体形成メカニズムの解析）」（指導教員 野尻 秀昭）
樋口 俊哉「蘚類ハイゴケにおけるモミラクトン生合成遺伝子クラスターの検証」（指導教員
藤川 郁「プラスミドの接合伝達における受容菌認識機構の解析」（指導教員野尻 秀昭）

野尻 秀昭）■卒業論文
林 勇太「アミノ基キャリアタンパク質を介した二次代謝産物に関する研究」(指導教員西山 真)
平山 健太「リジン生合成に関わる酵素の構造と機能に関する研究」(指導教員西山 真)武田 祐太郎「宿主染色体上の遺伝子がプラスミド上の遺伝子の発現及び代謝能に与える影響の一細胞レベルでの解析」（指導教員 野尻 秀昭）
高島 綾「IncP-7 群プラスミド pCAR1 上に新たに見出された TA システムの機能解析」（指導教員野尻 秀昭）●センター主催学術講演会
Arabinoxylan sensing and degradation by members of the human colonic microbiome.
Prof. Isaac Cann (University of Illinois, USA) 2019 年 7 月 11 日
大腸菌の呼吸鎖変異株が示す異常な糖代謝とその機能解析
横田 篤 教授 (北海道大学大学院農学研究員) 2019 年 11 月 15 日
Rheostatic control of ABA signaling through HOS15-mediated OST1 degradation.
Prof. Dae-Jin Yun (Konkuk University, Japan) 2019 年 12 月 5 日●海外からの来訪者
Prof. Dae-Jin Yun (Konkuk University, Korea) 2019 年 12 月 5 日
Dr. Georg Schaumann (SenseUp GmbH, Germany) 2019 年 6 月
Dr. Stephan Binder (SenseUp GmbH, Germany) 2019 年 6 月
Dr. Ren-Chao Zheng (Zhejian University of Technology, China) 2019 年 6 月
Dr. Onruthai Pinyakong (Chulalongkorn University, Thailand) 2019 年 4 月
Prof. Tang Xueming (Shanghai Academy of Agricultural Sciences, China) 2019 年 4 月
Dr. Jaka Widada (Gadjah Mada University, Indonesia) 2019 年 6 月
Prof. Li Li (Shandong University, China) 2019 年 6 月
Natthariga Laothamteep (Chulalongkorn University, Thailand) 2018 年 11 月～2019 年 8 月
Ken Zheng (Zhejiang University of Technology, China) 2019 年 7 月～9 月
Prof. Isaac Cann (University of Illinois, USA) 2019 年 7 月
Prof. Tian Zhang (Wuhan University of Technology, China) 2019 年 10 月
Prof. Pier-Luc Tremblay (Wuhan University of Technology, China) 2019 年 10 月
Shan Wang (Xi'an Jiaotong University, China) 2019 年 10 月～2020 年 9 月
Dr. Eva Knoch (Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology, Austria) 2020 年 2 月●オープンキャンパス等の来訪者
都立富士高等学校附属中学校 2019年11月2日 生徒120名 引率者6名
都立戸山高等学校 2019 年 7 月 10 日 学生 75 名、引率者 2 名
富山県立富山高等学校 2019 年 8 月 6 日 学生 66 名、引率者 3 名
大阪府立大手前高等学校見学 2019 年 10 月 4 日 学生 40 名、引率者 2 名

23

共同利用成果●

報文、学会発表等●

●報文Arai H, Ishii M. Complete genome sequence of a mesophilic obligately chemolithoautotrophic hydrogen-oxidizing
bacterium, Hydrogenovibrio marinus MH-110. Microbiol Resour Announc. 2019;8:e01132-19
Arai H, Ishii M. Draft genome sequence of Comamonas testosteroni TA441, a bacterium that has a cryptic phenol
degradation gene cluster. Microbiol Resour Announc. 2019;8:e00946-19
Chiba Y, Yoshida A, Shimamura S, Kameya M, Tomita T, Nishiyama M, Takai K. Discovery and analysis of a novel type ofthe serine biosynthetic enzyme phosphoserine phosphatase in Thermus thermophilus. FEBS J. 2019;286:726-736
Nguyen HT, Ishizuna F, Sato Y, Arai H, Ishii M. Physiological characterization of poly-beta-hydroxybutyrate accumulation in
the moderately thermophilic hydrogen-oxidizing bacterium Hydrogenophilus thermoluteolus TH-1. J Biosci Bioeng.
2019;127:686-689
Masuda Y, Matsumoto T, Isobe K, Senoo K. Denitrification in paddy soil as a cooperative process of different nitrogen oxide
reducers, revealed by metatranscriptomic analysis of denitrification-induced soil microcosm. Soil Sci Plant Nutr.
2019;65:342-345
Xu Z, Masuda Y, Itoh H, Ushijima N, Shiratori Y, Senoo K. Geomonas oryzae gen. nov., sp. nov., Geomonas edaphica sp.
nov., Geomonas ferrireducens sp. nov., Geomonas terrae sp. nov., four ferric-reducing bacteria isolated from paddy
soil, and reclassification of three species of the genus Geobacter as members of the genus Geomonas gen. nov..
Frontiers in Microbiology. 2019;10:2201
Nam YW, Nishimoto M, Arakawa T, Kitaoka M, Fushinobu S. Structural basis for broad substrate specificity of UDP-glucose
4-epimerase in the human milk oligosaccharide catabolic pathway of Bifidobacterium longum. Sci Rep. 2019;9(1):11081
Seki H, Huang Y, Arakawa T, Yamada C, Kinoshita T, Iwamoto S, Higuchi Y, Takegawa K, Fushinobu S. Structural basis forthe specific cleavage of core-fucosylated N-glycans by endo-β-N-acetylglucosaminidase from the fungus Cordyceps
militaris. J Biol Chem. 2019;294(45):17143-17154
Moriwaki Y, Yato M, Terada T, Saito S, Nukui N, Iwasaki T, Nishi T, Kawaguchi Y, Okamoto K, Arakawa T, Yamada C,
Fushinobu S, Shimizu K. Understanding the Molecular Mechanism Underlying the High Catalytic Activity of pHydroxybenzoate Hydroxylase Mutants for Producing Gallic Acid. Biochemistry. 2019;58(45):4543-4558
Mizuike A, Kobayashi S, Rikukawa T, Ohta A, Horiuchi H, Fukuda R. Suppression of respiratory growth defect of
mitochondrial phosphatidylserine decarboxylase deficient mutant by overproduction of Sfh1, a Sec14 homolog, in yeast.
PLoS ONE. 2019;14:e0215009
Sugahara A, Yoshimi A, Shoji F, Fujioka T, Kawai K, Umeyama H, Komatsu K, Enomoto M, Kuwahara S, Hagiwara D,
Katayama T, Horiuchi H, Miyazawa K, Nakayama M, Abe K. A novel antifungal compound Z-705 specifically inhibits
protein kinase C of filamentous fungi. Appl Environ Microbiol. 2019;85:e02923-18
Murai K, Lauterbach L, Teramoto K, Quan Z, Barra L, Yamamoto T, Nonaka K, Shiomi K, Nishiyama M, Kuzuyama T, Dickschat JS.
An Unusual Skeletal Rearrangement in the Biosynthesis of the Sesquiterpene Trichobrasilenol from Trichoderma.
Angew Chem Int Ed Engl. 2019;58:15046-15050
Kobayashi M, Tomita T, Shin-ya K, Nishiyama M, Kuzuyama T. An Unprecedented Cyclization Mechanism in the Biosynthesis of
Carbazole Alkaloids in Streptomyces. Angew Chem Int Ed Engl. 2019;58:13349-13353
Kudo K, Koiwai H, Kagaya N, Nishiyama M, Kuzuyama T, Shin-ya K, Ikeda H. Comprehensive Derivatization of
Thioviridamides by Heterologous Expression. ACS Chem Biol. 2019;14:1135-1140
Romo AJ, Shiraishi T, Ikeuchi H, Lin GM, Geng Y, Lee YH, Liem PH, Ma T, Ogasawara Y, Shin-ya K, Nishiyama M,
Kuzuyama T, Liu HW. The Amipurimycin and Miharamycin Biosynthetic Gene Clusters: Unraveling theOrigins of 2-Aminopurinyl Peptidyl Nucleoside Antibiotics. J Am Chem Soc. 2019;141:14152-14159
Shiraishi T, Nishiyama M, Kuzuyama T. Biosynthesis of the uridine-derived nucleoside antibiotic A-94964: identification andcharacterization of the biosynthetic gene cluster provide insight into the biosynthetic pathway. Org Biomol Chem. 2019;17:461466
Matsuoka JI, Ishizuna F, Ogawa T, Hidaka M, Siarot L, Aono T. Localization of the reb operon expression is inconsistent with that of
the R-body production in the stem nodules formed by Azorhizobium caulinodans mutants having a deletion of praR.
J Gen Appl Microbiol. 2019;65:209-213
Ryu S, Muramatsu T, Furihata K, Wei F, Koda M, Miyakawa T, Tanokura M. NMR-based metabolic profiling and comparisonof Japanese persimmon cultivars. Sci Rep. 2019;9:15011
Lu Y, Zhi Y, Miyakawa T, Tanokura M. Q Metabolic profiling of natural and cultured Cordyceps by NMR spectroscopy.
Sci Rep. 2019;9:7735

26

●国内学会発表等■極限環境生物学会第 20 回シンポジウム
水素細菌の代謝特性と低炭素社会実現に向けての展開
亀谷 将史,新井 博之,石井 正治■微生物ウィーク 2019
黒酢醸造に関わる微生物
石井 正治■第 92 回日本生化学会大会
好気性光合成細菌 Roseobacter denitrificans の alternative oxidase の生理的役割に関する研究
吉田 昇平,山本 麻衣子,亀谷 将史,石井 正治,新井 博之
好気性光合成細菌 Roseobacter denitrificans における LOV-HK ホモログによるエネルギー代謝の制御
山本 麻衣子,木村 真人,亀谷 将史,石井 正治,新井 博之■日本生物工学会東日本支部学生討論発表会
Comamonas testosteroni TA441 のフェノール代謝抑制機構について
新北 大樹
緑膿菌の硝酸および亜硝酸の膜輸送機構に関する研究岡本 洸彰
壺造り純米黒酢醸造過程に関わる酢酸菌と乳酸菌の研究
星 南穂子
Hydrogenobacter thermophilus TK-6 のメチオニン生合成経路の解明
篠原 駿介■日本農芸化学会 2020 年度大会
好気性光合成細菌 Roseobacter denitrificans において LOV-HK はストレス耐性に寄与する
山本 麻衣子,亀谷 将史,石井 正治,新井 博之
好気性光合成細菌 Roseobacter denitrificans の cyanide insensitive oxidase の生理的機能
吉田 昇平,山本 麻衣子,亀谷 将史,石井 正治,新井 博之
酢酸、酪酸存在下で見られる Hydrogenophilus thermoluteolus TH-1 株の生育阻害
岩本 啓志,亀谷 将史,新井 博之,石井 正治
Comamonas testosteroni TA441 のフェノール代謝に関する研究
新北 大樹,亀谷 将史,石井 正治,新井 博之
緑膿菌において亜硝酸で誘導発現する遺伝子群の機能解析岡本 洸彰,石田 菜津美,亀谷 将史,石井 正治,新井 博之
黒酢発酵液由来乳酸菌の D-アミノ酸生成能評価と酵素学的解析
星 南穂子,藤井 暁,橋口 和典,長野 正信,亀谷 将史,新井 博之,石井 正治
Sulfolobus tokodaii 由来 sulfur oxygenase reductase のクライオ電子顕微鏡を用いた近原子分解能単粒子解析
佐藤 優太,安達 成彦,守屋 俊夫,荒川 孝俊,川崎 政人,山田 千早,矢吹 崇吏,若木 高善,千田 俊哉,伏信 進矢
糸状菌 Aspergillus nidulans の細胞壁形成及び維持における AP2 複合体の機能
金 京運,岩間 亮,堀内 裕之
Saccharomyces cerevisiae の細胞膜における生体膜構成リン脂質の分布と機能の解析
林 透真,古尾谷 南沙,水池 彩,堀内 裕之,福田 良一
糸状菌の持つ分泌型ホスホリパーゼ A2 の構造および機能解析
関口 永莉,宮川 拓也,田之倉 優,吉田 稔,有岡 学

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■日本土壌微生物学会 2019 年度大会
水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と応用－マイクロバイオーム解析から低窒素農業へ
増田 曜子,伊藤 英臣,白鳥 豊,妹尾 啓史
窒素固定能を有する脱窒細菌による N2O 固定
鈴木 里俊,早川 智恵,増田 曜子,西澤 智康,菅原 雅之,嵐田 遥,南澤 究,磯部 一夫,妹尾 啓史■日本土壌肥料学会 2019 年度大会
水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と低窒素農業への応用の試み －オミクス解析からサステイナブル農業へ－
妹尾 啓史,増田 曜子,伊藤 英臣,白鳥 豊
水田土壌における鉄還元菌窒素固定：鉄添加による窒素固定活性の増強
高野 諒,石田 敬典,増田 曜子,伊藤 英臣,白鳥 豊,妹尾 啓史
プライミング効果による埋没腐植層からの養分採掘機構の検証
早川 智恵,藤井 一至,稲垣 善之,妹尾 啓史
窒素固定遺伝子を有する脱窒細菌による N2O 固定の検証
鈴木 里俊,早川 智恵,増田 曜子,西澤 智康,菅原 雅之,嵐田 遥,南澤 究,磯部 一夫,妹尾 啓史■日本微生物生態学会第 33 回大会
水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と検証
増田 曜子,Zhenxing Xu,山中 遥加,伊藤 英臣,白鳥 豊,妹尾 啓史
Isolation and characterization of Geomonas species, a novel genus involved in reductive nitrogen transformation in paddy
soils.
Zhenxing Xu, Yoko Masuda, Hideomi Itoh, Keishi Senoo
窒素固定遺伝子を有する脱窒細菌による N2O 固定の検証
鈴木 里俊,早川 智恵,増田 曜子,西澤 智康,菅原 雅之,嵐田 遥,南澤 究,磯部 一夫,妹尾啓史■応用糖質科学シンポジウム
微生物によるレボグルコサン代謝
伏信 進矢■日本応用糖質科学会東日本支部ミニシンポジウム
コアフコースに特異的な N 型糖鎖切断酵素の結晶構造
伏信 進矢■酵母遺伝学フォーラム第 52 回研究報告会
Saccharomyces cerevisiae の細胞膜におけるリン脂質の局在と機能の解析
林 透真,古尾谷 南沙,水池 彩,堀内 裕之,福田 良一
酵母 Yarrowia lipolytica における n-アルカンへの吸着と細胞形態に関する研究髙橋 直熙,石丸 千晶,岩間 亮,渡邉 夏仁,志波 優,兼崎 友, 堀内 裕之,福田 良一■第 19 回糸状菌分子生物学コンファレンス
Aspergillus nidulans において rseA/cpsA の破壊は cell wall integrity (CWI) 経路と high osmolarity glycerol (HOG) 経路の活性化を引き起こす
小川 真弘,福田 良一,小山 泰二,堀内 裕之■第１９回東京大学生命科学シンポジウム
Analysis of the activation mechanism of Sirt1 by KPMF-8
Zhang M, lida K, Lu P, Katayama Y, Nagata K■第５６回植物化学シンポジウム
The activation mechanism of human SIRT1 by KPMF-8
Zhang M, Lu P, Sui M, Iida K, Katayama Y, Suzuki M, Yang J, Ishikawa T, Tatsuzaki J, Nagata K●国際学会発表等■11th Asian Symposium of Microbial Ecology, May 10-13, 2019 (Taichung, Taiwan)
Nitrogen fixation by iron reducing bacteria - previously overlooked diazotrophs essential for sustainable soil-plant
ecosystems

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Yoko Masuda, Haruka Yamanaka, Hideomi Itoh, Zhenxing Xu, Yutaka Shiratori, Seigo Amachi, Toshihiro Aono, Keishi Senoo■5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis & Nitrogen Fixation Program, May 15-17, 2019 (Miyagi, Japan)
Nitrogen fixation of iron reducing bacteria in paddy soils – previously overlooked diazotroph essential for sustainable soil
nitrogen fertility
Yoko Masuda, Haruka Yamanaka, Hideomi Itoh, Zhenxing Xu, Yutaka Shiratori, Seigo Amachi, Toshihiro Aono, Keishi Senoo
Boosting nitrogen fixation of iron-reducing bacteria in paddy soil by Fe(III) and rice straw application
Takanori Ishida, Yoko Masuda, Yutaka Shiratori, Hideomi Itoh, Keishi Senoo■15th symposium on Bacterial Genetics and Ecology, May 26-30, 2019 (Lisbon, Portugal)
Nitrogen fixation of iron reducing bacteria in rice paddy soils – potent agents for sustainable crop production with low nitrogen
input
Yoko Masuda, Haruka Yamanaka, Hideomi Itoh, Yutaka Shiratori, Seigo Amachi, Toshihiro Aono, Keishi Senoo■Seminar at National Engineering Research Center for Biotechnology and School of Biotechnology and PharmaceuticalEngineering, Nanjing Tech University, September 17, 2019 (Nanjing, China)
Nitrogen fixation of iron reducing bacteria in rice paddy soils - discovery, verification and application to low-nitrogenagriculture
Keishi Senoo■The EGU General Assembly 2020, May 3-8, 2020 (Vienna, Austria)
Glucose concentration can control priming effects and soil carbon storage under different land-use management in volcanic
ash soils of Hokkaido, Japan
Chie Hayakawa, Taichi Kobayashi, Kazumichi Fujii, Yoshiyuki Inagaki, and Keishi Senoo■13th Carbohydrate Bioengineering Meeting（Toulouse, France）
Structural analysis of β-L-arabinofuranosidases in GH127 and GH146
Shinya Fushinobu■ACS Fall National Meeting & Exposition (San Diego, USA)
Structural analysis for studying the reaction mechanism of β-L-arabinofuranosidases
Shinya Fushinobu●総説等
Kobayashi M, Kuzuyama T. Structural and Mechanistic Insight into Terpene Synthases that Catalyze the Irregular Non-Head
to-Tail Coupling of Prenyl Substrates. Chembiochem. 2019;20:29-33
Shiraishi T, Kuzuyama T. Recent advances in the biosynthesis of nucleoside antibiotics. J Antibiot (Tokyo). 2019;72:913-923
白石 太郎，葛山 智久 新奇骨格を創成する革新的生合成マシナリーの開拓，ファルマシア, 2019;55:679-683
増田 曜子,伊藤 英臣,白鳥 豊,妹尾 啓史 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と応用オミクス解析から低窒素農業
へ．化学と生物, 2020;58(3):143-150●教員および学生の受賞
2020 SSPN Award (日本土壌肥料学会欧文誌論文賞)
増田 曜子,伊藤 英臣,白鳥 豊,妹尾 啓史
2019 年度 長瀬研究振興賞
細菌のレボグルコサン代謝系の解明と特異的酵素を利用した検出・定量法の開発
伏信 進矢
2019 年度 長瀬研究振興賞
産業上有用な二形性酵母における細胞形態制御機構 の解明
福田 良一
JB 論文賞 2019 年(第 27 回)
張 榮維,佐藤 裕介,小川 哲弘,荒川 孝俊,深井 周也,伏信 進矢,正木 春彦
第 56 回植物化学シンポジウム 松尾仁賞
The activation mechanism of human SIRT1 by KPMF-8
張 迷敏

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●学位論文
■博士論文
金 京運「糸状菌 Aspergillus nidulans における AP2 複合体の機能解析」（指導教員堀内 裕之）

村井 恵一「新奇テルペン合成酵素の触媒する複雑環骨格形成機構に関する研究」（指導教員■修士論文
石田 敬典「水田土壌における鉄還元細菌窒素固定に関する研究」（指導教員葛山 智久）

妹尾 啓史）

浅野 泰英「好熱性水素細菌 Hydrogenobacter thermophilus TK-6 のフェレドキシン還元反応に関する研究」（指導教員 石井 正治）
岩本 啓志「Hydrogenophilus thermoluteolus TH-1 株における炭素及びエネルギー代謝に関する研究」（指導教員 石井 正治）
藤代 真理子「Hydrogenobacter thermophilus TK-6 の遺伝子発現制御機構に関する研究」（指導教員石井 正治）

吉田 昇平「好気性光合成細菌 Roseobacter denitrificans のエネルギー代謝に関する研究」（指導教員石井 正治）

中島 千穂「結核菌細胞壁多糖の鏡像体アラビナン分解酵素の結晶構造解析」（指導教員二宮 拓太「人為的変異によるGPCRの機能改変」（指導教員

伏信 進矢）

伏信 進矢）

山上 陽一郎「アミン作動性受容体の結晶化・構造解析についての研究」（指導教員

伏信 進矢）

石原 太郎「二形性酵母 Yarrowia lipolytica における生体膜構成リン脂質の機能と高温耐性機構の研究」（指導教員 堀内 裕之）
大野木 真行「麹菌 Aspergillus oryzae の形態形成、タンパク質分泌への細胞壁合成関連酵素遺伝子の関与に関する研究」（指導教員 堀内 裕之）
関口 永莉「糸状菌の持つ分泌型ホスホリパーゼ A2 の構造および機能解析」（指導教員吉田 稔）

青山 美和子「トリコスタチン類縁体の構造多様性創出機構に関する研究」（指導教員葛山 智久）

加藤 輝仁「放線菌の生産するブレニル化化合物フェナジノマイシンと JBIR-68 の生合成に関する研究」（指導教員智久）
山田 陸翠「普遍的リボヌクレアーゼ RNase T2 を介したストレス応答性 rRNA 分解機構の解析」（指導教員葛山日髙 真誠）

鵜沼 廣太朗「窒素固定細菌 Klebsiella oxytoca の窒素固定能増強に関わる非窒素固定細菌の機能の解析」（指導教員 日髙真誠）
西 晃平「栄養飢餓に応答したリボソーム分解機構に関する研究」（指導教員日髙 真誠）

小堺 瑞己「ヒト血清アルブミンの糖化を抑制する植物由来成分の同定および作用機構解析」（指導教員永田 宏次）■卒業論文
今井 達洋「Roseobacter denitrificans Och114 における NO ストレスに対する末端酸化酵素 AOX の寄与と NO 応答遺伝子 NsrRによる制御に関する研究」（指導教員 石井 正治）
長谷川 陸郎「Hydrogenobacter thermophilus TK-6 における rTCA サイクル中の代謝複合体解析」（指導教員石井 正治）

山本 将大「Hydrogenophilus thermoluteolus TH-1 株における PHB 合成機構および FNR における cbb3-type terminal
oxidase の制御に関する研究」（指導教員 石井 正治）
佐藤 咲良「水田の窒素肥沃度を維持する微生物メカニズムの解明」（指導教員妹尾 啓史）

喜多 祐介 「糸状菌 Aspergillus nidulans の二次代謝産物産生を支える一次代謝制御機構に関する研究」（指導教員 堀内

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裕之）
住田 苑子「酵母 Saccharomyces cerevisiae における細胞内ステロール輸送とその制御機構に関する研究」（指導教員 堀内 裕之）
村山 怜子「酵母 Yarrowia lipolytica における n-アルカンに対する応答および Sec14 ファミリータンパク質の機能に関する研究」（指導教員 堀内 裕之）
坂野 研人「ゲノムマイニングによる新奇ヌクレオシド系化合物の探索」（指導教員小林 瑶平「真菌由来反復型ポリタイド合成酵素の構造解析に向けた研究」（指導教員葛山 智久）
葛山 智久）

松田 悠太郎「ポリケチド合成酵素開始基質類縁体を利用した新規トリコスタチン A 類縁体創出に関する研究」（指導教員葛山 智久）
加藤 亜美「精油中のコラーゲン、ヘモグロビンに対する抗糖化活性物質の特定」（指導教員永田 宏次）

豊田 恵子「デュシェンヌ型筋ジストロフィーにおける SPARC タンパク質の機能解明」(指導教員西原 眞杉)

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生物生産工学研究センター年報

2019年度東京大学生物生産工学研究センター〒113-8657

東京都文京区弥生1-1-1 Tel : 03-5841-5097

URL : http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/biotec-res-ctr/

表紙デザイン協力：東京大学大学院農学生命科学研究科
アグリコクーン

産学官民連携室

仙元浩平