新学術領域研究「柔らかな分子系」ニュースレター

No. 38平成 28 年 10 月

業績紹介：ダイナミクス駆動アロステリック部位の特徴
田口 淳子
北尾 彰朗

（大鵬薬品工業）（東大・A01 計画研究代表者）のプロファイルを調べた。その結果、アロステリック結合部位を他のポケットと区別する最適なプロファイ
ルとして、リガンド周辺の揺らぎの変化ΔMSFbs を調論 文 題 目 ： "Dynamic profile analysis to characterize

べることが最適であることを明らかにした。これらのdynamics-driven allosteric sites in enzymes."

蛋白質は、動的性質の変化によってアロステリック効

著者：Junko Taguchi and Akio Kitao

果を示すというダイナミクス駆動アロステリック結合

雑誌巻号：Biophysics and Physicobiology 13, 117 (2016).の典型例とみなすことができる。創薬に活用できる潜在的な低分子結合部位を効果的に探索する方法として、

ΔMSFbs を使うことが示唆される。

本研究では、潜在的な薬の結合部位として利用可能と思われる、非自明な動的アロステリック結合部位の特徴を明らかにした。典型的な薬は、リガンド結合部位を直接ブロックするようにデザインされていることが多いが、今世紀に入って、機能的に重要なリガンド結合部位から部位に結合する新しいタイプの化合物が発見されるようになってきた[1]。これらの新しいタイプの結合部位は、薬剤耐性の克服や新しい知的財産を取得するための魅力的なターゲットとして考えられている。2004 年に Gunasekaran らは、アロステリック効果はよく知られているようなオリゴマー蛋白質に限定されるものではなく、すべての蛋白質の固有の特性として発見される可能性が高く、任意の部位への摂動が準安定構造分布の再分配につながる可能性を指摘した[2]。この概念は、アロステリック リガンドの結合が必ずしも大きな構造変化を誘導するものではなく、蛋白質のダイナミクスを変化させることでもたらされる可能性を示している。
これらの研究を踏まえ、大鵬薬品工業の田口淳子さんが中心となって、ダイナミクス駆動アロステリック部位と思われる部位を網羅的に探索し、そこにリガンドが結合した際と、それ以外の結合可能部位（いわゆ図 2 種類のダイナミクス駆動アロステリック蛋白質るポケット）に結合した際に生じる様々なダイナミクの立体構造と、既知のアロステリック部位（マゼンタ）、スの違いを明らかにし、アロステリック効果と関係す活性部位（シアン）と結合可能部位（黄色）に結合しると思われる性質を調べることにした。まず、包括的た疑似リガンド。

な検索によって Protein Data Bank から、アロステリックリガンドの結合によって立体構造がほとんど変化し参考文献ない複合体 10 構造を特定した。リガンドが様々なポ[1] Hardy, J. A., Wells, J. A. Searching for new allosteric

ケットに結合した複合体モデルを生成し、それぞれにsites in enzymes. Curr. Opin. Struct. Biol., 14, 706-715

関して弾性ネットワークモデルによる基準振動解析を(2004).

実行し、リガンド結合によってもたらされる動的性質[2] Gunasekaran, K., Ma, B., Nussinov, R. Is allostery anの変化を解析した。リガンド結合によるタンパク質ダ

intrinsic property of all dynamic proteins? Proteins: Struct.

イナミクスの変化を評価するために、我々はリガンド

Funct. Bioinform., 57, 433-443 (2004).

が結合するポケットの位置と動的特性を記述する 9 つ278

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No. 38平成 28 年 10 月

業績紹介：（６－４）光産物光回復酵素のヒスチジン残基プロトン化状態
Hisham M. Dokainish （東大・研究員）
北尾 彰朗（東大・A01 計画研究代表者）

論文題目："Computational assignment of the histidine
protonation state in (6-4) photolyase enzyme and its effecton the protonation step"
著者：Hisham M. Dokainish and Akio Kitao
雑誌巻号：ACS Catalysis, 6, 5500 (2016).
現在北尾グループは、神取グループと共同してDNA 光修復反応の研究を理論サイドから研究しているが[1]、本研究では理論に絞って(6-4)光回復酵素の基礎研究を行った。
(6-4)ピリミジンの修復機構に関する論争を解決するための最初のステップは、保存されている活性部位のヒスチジン残基 (ショウジョウバエでは His365 とHis369)のプロトン化状態を明らかにすることである。
これらのヒスチジン残基は触媒反応に重要であると考えられている。これまでのほとんどの理論的研究ではHis365 がプロトン化しており、そのプロトン移動が修復の第一歩だと考えているが、経験的・半経験的アプローチでは両方のヒスチジン残基がプロトン化されていないと示唆する結果が得られている。我々の研究では、(6-4) PHR/DNA 複合体の分子動力学シミュレーシ
ョン(MD)を、それぞれのヒスチジン残基が通常取りうる３つのプロトン化状態のすべての組み合わせ（9 通図 活性部位にある２つの重要なヒスチジン残基り）について実行し、X 線結晶構造と比較し、尤もら（H365 と H369）と 9 通りのプロトン化状態、重要なしいプロトン化状態を明らかにした。

水素結合距離と水分子の有無。

MD 計算の結果、結晶構造と辻褄があった３つのプロト ン 化 状 態 (HIP365/HID369 、 HID365/HIE369 、

参考文献

HID365/HIP369)が見出され、HIP365 (ND1 と NE2 がプ[1] Functional Conversion of CPD and (6–4) Photolyasesロトン化)と HID369 (ND1 のみプロトン化)が活性部位

by Mutation. Daichi Yamada, Hisham M. Dokainish,で最も可能性の高いプロトン化状態であることが明ら

Tatsuya Iwata, Junpei Yamamoto, Tomoko Ishikawa,かになった。MD 計算で得られた３つのプロトン化状態

Takeshi Todo, Shigenori Iwai, Elizabeth D. Getzoff, Akioの立体構造から出発して QM クラスターと QM/MM 計算をKitao,

行った結果、これらのすべての状態からプロトン移動

4173-4183 (2016).の可能性があることが示された。
この研究は、現在、北尾グループと神取グループが共同して進めている(6-4)光回復酵素の反応機構の全貌解明に向けた重要な試金石となるものである。

279

andHideki

Kandori,

Biochemistry,55(20),

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No. 38平成 28 年 10 月

業績紹介：DNA 光回復酵素間の機能転換研究
山田 大智 （名工大・A03 計画研究協力者）
Hisham M. Dokainish (東大・A01 計画研究協力者)
北尾 彰朗 (東大・A01 計画研究代表者)
神取 秀樹 （名工大・A03 計画研究代表者）

酸を変異させれば、CPD を修復できることがわかった。
一方、逆方向の変異では CPD 光回復酵素は(6-4)光産物を修復できず（CPD 光回復酵素→(6-4)光回復酵素）、結合サイトを構成する全てのアミノ酸（11 個）を置き換えても、機能の転換は起こらなかった。光回復酵素論 文 題 目 ： "Functional conversion of CPD and (6-4)
photolyases by mutation"
著者：Daichi Yamada, Hisham M. Dokainish, TatsuyaIwata, Junpei Yamamoto, Tomoko Ishikawa, Takeshi Todo,
Shigenori Iwai, Elizabeth D. Getzoff, Akio Kitao, andHideki Kandori
雑誌巻号：Biochemistry 55, 4173−4183 (2016).

間の非対称な機能転換が明らかになったのである（図１下）。これらの実験結果に対して、計算機上で機能転換に成功した変異酵素（(6-4)光回復酵素→CPD 光回復酵素）の構造を構築したところ、CPD との結合状態が再現され、CPD の修復を実験及び計算の両面から明らかにすることができた。一方、機能転換が成功しなかった変異酵素（CPD 光回復酵素→(6-4)光回復酵素）に

DNA 光回復酵素は、紫外線によって損傷した DNAついて計算機上で構造を構築したところ、(6-4)光産物を光のエネルギーを使って修復する酵素である。損傷との結合状態が天然型の構造とは異なる結果となったDNA には CPD と(6-4)光産物の 2 種類が存在し、それ（図２）。これが機能転換に成功しなかった原因だと考ぞれの基質に対する DNA 光回復酵素が知られている

えられ、(6-4)光産物の修復はより複雑な反応機構によ（図 1）。DNA 光回復酵素の研究は、2015 年のノーベり実現されていることがわかった。

ル化学賞の対象に含まれるなど注目されているが、そ(6-4)光回復酵素の方が進化的に新しいと考えられるのメカニズムはほとんどわかっていない。A03 神取グが、この酵素の結合サイトのアミノ酸を置換するだけループでは、類似タンパク質の機能転換を試みることで CPD を修復できた。一方、CPD 光回復酵素が(6-4)

で機能発現における柔らかさの問題に取り組んでいる光産物を修復するには、広範囲に渡ったアミノ酸の置が、今回、2 種類の DNA 光回復酵素の機能転換に挑戦換が必要なようだ。非対称の機能転換は真正細菌のイした。A01 北尾グループは結晶構造に基づく理論計算オンポンプにも観察されたが[1]、興味深いことにいずにより実験結果を見事に説明し、本論文は「柔らかなれも進化の上流に向かっての機能転換は限られた変異分子系」の代表的な共同研究成果の一つとなった。

で達成できた一方、逆は不可能であった。本論文は、実験では、最初に(6-4)光回復酵素に対して結合サイタンパク質分子の機能発現における柔らかさの実体にト周辺のいくつかのアミノ酸を CPD 型へと置き換えついて理論と実験が手を携えて挑んだ共同研究成果とた変異酵素（(6-4)光回復酵素→CPD 光回復酵素）を作位置付けることができる。

製し、その機能を測定したところ、最低 3 個のアミノ[1]Inoue, K., et al. J. Biol. Chem. 291, 9883 (2016).

図２. (6-4)光回復酵素と(6-4)光産物の結合様式（左、天然型）及び CPD 光回復酵素の変異体と(6-4)光産図１. 紫外線照射による光産物の形成（上）及び物の結合様式（右、変異酵素）。赤枠で酵素と(6-4)

DNA 光回復酵素の光修復と非対称な機能転換（下）。

光産物との相互作用の違いを示した。

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No. 38平成 28 年 10 月

業績紹介：バイセルを利用したシトクロム c の脂質膜相互作用部位の特定
長尾 聡（奈良先端大・A03 公募研究連携研究者）
廣田 俊（奈良先端大・A03 公募研究代表者）ていることが示唆された。CSP より推測される CL 含
有バイセルとの相互作用部位には正電荷を有する複数の Lys 残基が存在しており、cyt c は複数の Lys 残基を介して CL と相互作用することがわかった。また、

論文題目："Characterization of Cytochrome c MembraneBinding Site Using Cardiolipin-Containing Bicelles with

この相互作用部位は bc1 複合体やシトクロム c 酸化酵

NMR"

素との相互作用部位と良く対応していた（図 2）。本研

著者：Hisashi Kobayashi, Satoshi Nagao, and Shun Hirota

究により、膜中の CL と相互作用する cyt c の表面部位

雑誌巻号：Angew. Chem. Int. Ed. 55, 14019-14022 (2016).

を特定し、cyt c が複数の Lys 残基を介して膜中の複数の CL 分子と相互作用することが明らかとなった。本

シトクロム c （cyt c）はミトコンドリア膜間部に存手法はタンパク質と膜との相互作用を調べる新しい方在するヘムタンパク質であり、 bc1 複合体からシトク法となることが期待される。

ロム c 酸化酵素へ電子を運搬する。我々はこれまでに、cyt c が C 末端領域の α へリックスを分子間で交換する
180°

ドメインスワッピングによりポリマー化することを示した[1]。cyt c はミトコンドリア内膜に局在するリン脂質のカルジオリピン(CL)と相互作用し、CL との相互作用が強くなると N 末端 α ヘリックスと C 末端 α ヘリックスの相互作用が崩れることも報告されている[2]。CL による cyt c の機能変換の分子機構を理解す
るには、cyt c における CL との相互作用部位や、CLとの相互作用によって生じる cyt c の構造変化を原子

図 1 シトクロム c のカルジオリピン相互作用部位。

レベルで明らかにする必要がある。しかし、タンパク質－脂質膜複合体の原子レベルでの相互作用解析が困難であるために、cyt c と CL の相互作用様式の詳細は不明であった。溶液 NMR では原子レベルの相互作用解析が可能であるが、タンパク質と脂質膜の複合体の分子量が巨大であるために、脂質膜と相互作用したタンパク質の NMR シグナルの著しいブロードニングが起こり、解析が困難となる。そこで我々は、分子サイズが小さく均一な脂質二分子膜であるバイセルに CLを導入し、溶液 NMR により cyt c と CL 含有バイセルの相互作用解析を行った。
CL 含有バイセルと 15N 標識 cyt c を混合し、1H－15N

図 2 シトクロム c とカルジオリピン含有バイセル、bc1 複合体、シトクロム c 酸化酵素との相互作用の模式図。

HSQC スペクトルを測定したところ、先鋭で感度の良い cyt c の主鎖 NH シグナルが観測された。CL 含有バイセルの添加による cyt c の主鎖 NH シグナルの CSP

引用文献を算出したところ、cyt c の N 末端領域と Lys72/Lys73[1] S. Hirota et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107,

周辺の広い領域に CSP が観測された。CSP が観測さ12854-12859 (2010).

れたアミノ酸残基を cyt c の立体構造上にマッピング[2] J. Hanske et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 109,

すると、これらのアミノ酸残基は cyt c の同一面上に125-130 (2012).

存在しており（図 1）、cyt c は分子表面の広い領域のアミノ酸残基を介して CL 含有バイセルと相互作用し281

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No. 38平成 28 年 10 月

第 1７回 WRHI 国際ワークショップ 開催報告藤井 正明

（東工大化生研・総括班、事務局）

本新学術領域研究の第 17 回ワークショプが、平成
28 年 9 月 26 日（月）に、東京工業大学すずかけ台キャンパス（横浜市緑区）で開催された。本ワークショップは“WRHI International Workshop on Advanced
Laser Spectroscopy for Soft Molecular Systems”と題されており、柔らかな分子系のための先端的なレー益院長（左）と Dopfer 先生

ザー分光を中心とした国際研究集会である。このシンポジウムは本領域と、今年から東京工業大学が開始した World Research Hub Initiatives（WRHI）が共催して行われた。WRHI は世界トップクラスの研究者の異分野交流を促進し、革新的科学技術の創出等を担う「世界の研究ハブ」を目指す組織として開設されたもので、国際活動支援班を有する本領域とも相通じるところがあり、共催に至った。今回はベルリン工科大学・
Otto Dopfer 先生と領域外の諸先生を WRHI が招聘し、これに本領域メンバーおよび一般参加の方が加わって研究代表者）のプロトン付加水クラスターの非調和振総勢４５名の賑やかな会となった。

動解析、櫻井実先生（東工大 A01 研究代表者）の MD

ワークショップは益一哉・東京工業大学科学技術創理論解析、大島康裕先生（東工大 A02 研究分担者）の成研究院院長の Opening Remarks に始まり 12 件のvan der Waals クラスター、藤井朱鳥先生（東北大、招待講演、11 件のポスター発表が行われた。柔らかなA02 班友）の H2S クラスターは柔らかな分子同士の分子系の構造、ダイナミクスを明らかにする測定手法相互作用を解析するものであり、江幡孝之先生（広大）は急速に進歩しているが、特にエレクトロスプレーイの Dark state 解析、関谷博先生（九大 A02 班友）のオン化法と冷却イオントラップを備えたレーザー分光

結晶内プロトン移動は最先端の分光研究が柔らかな分装置の発達が著しい。石内俊一先生（東工大、A02 研子系を対象にするものとして大いに議論が盛り上がっ究分担者）、Dopfer 先生、Aude Bouchet 博士（東工た。さらに吉沢道人先生（A03 研究分担者）の超分子

大・JSPS 研究員）
、石川春樹先生（北里大、A02 研究

カプセルはこれらの手法を用いる対象として強い興味分担者）と合わせて４件もの口頭発表が行われ、ポスター発表でも半数が同種の装置を用いた研究であった。

を引き、研究交流会でも大いに盛り上がった
最後に、シンポジウムの準備と運営を円滑に進めてやはり、レーザー分光、特に気相分光の精密さで柔らいただいた WRHI 事務局、本領域事務局メンバー、東かな分子系の性質を紐解こうとするのは大きなトレン

工大藤井研究室のスタッフ、学生の皆さんに深く感謝ドになりつつあると感じた。八木清先生（理研 A01申し上げる。

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No. 38平成 28 年 10 月

ICRP2016 参加および J. Heberle 研究室訪問報告久保田 真司
水谷グループ（阪大・A02 計画研究協力者・M2）

験条件や解析方法について議論することができた。ここでの議論は今後の研究の方向性を考える上で大変参考になった。

私はこの度、本新学術領域の研究者海外派遣支援を

学会参加後、ベルリン自由大学 Joachim Heberle 教

いただき、10 月 3 日から 7 日にかけてドイツ・ポツダ授の研究室に訪問してセミナーをさせていただいた。

ムにて行われた ICRP2016（The 17th International

Heberle 教授の研究室では時間分解赤外分光法によるConference on Retinal Proteins）に参加し、その後ベタンパク質のダイナミクスに関する研究を主として行

ルリン自由大学の Joachim Heberle 教授の研究室にっており、チャネルロドプシンなどの微生物型ロドプ訪問させていただいたので報告する。

シンの研究にも積極的に取り組まれている。ちなみにICRP はレチナールタンパク質を対象とする研究成

このセミナーは、同じくベルリン自由大学の果を発表する国際学会である。今年はポツダム大学にAna-Nicoleta Bonder 教授の研究室との合同セミナーて行われた。研究内容は主に分光法やシミュレーショとなった。これは、Bonder 研究室でのセミナーを予ンによるタンパク質のダイナミクスの解明や、オプト定していた同新学術領域・神取グループの伊藤奨太さジェネティクスへの応用などである。普段はダイナミんとの合同セミナーを、Heberle 研究室の安宅さんにクスについての研究を主に聴いていたため、オプトジ企画していただいたためである。思いがけず多くのェネティクスのような自分のテーマに関連した応用研方々に聴いていただくことになったこともあり、セミ究の話を聴けたのはいい刺激となった。私は 2 日目のナーでは多くの質問をしていただいた。印象的だった

午後にポスター発表を行った。内容は光駆動イオンポのは、結果の定量性に関する質問を多くいただいたこ

ンプ型ロドプシンとそれがプロトンポンプに機能転換とだ。私の発表では水素結合の強度の違いに関する議した変異体について発色団構造を調べて比較したとい論をしていたのだが、その議論はすべて発色団同士のう研究である。イオンポンプ型ロドプシンはたった数定性的な比較にとどまっていた。そのため、他の測定箇所の変異によって逆の電荷をもつイオンを輸送するをしている方々（特に Bonder 教授のように計算化学ことができる柔軟性をもっている興味深い分子である。

をされている方々）が水素結合のエネルギーについてそれらのポンプが輸送するイオンがどのようにして決気にするのは当然である。本セミナーは、他の実験結定しているのかは未だ分かっていない。この研究は機果やシミュレーション結果と比較する上で定量的な議能転換前後のポンプ同士の比較によって、ポンプのイ論は非常に重要である、ということを改めて認識する

オン選択性が生まれる要因が明らかになることを期待いい機会であった。

したものである。本発表の結論は、ポンプの発色団が最後に、国際学会への参加および研究室訪問の支援

形成する水素結合の強さや水素結合アクセプターがイをしていただいた本新学術領域に心より感謝申し上げ

オンの選択性を決める重要な役割を果たしている、とます。

いうものだ。本発表は様々な方に聴いていただき、実Heberle 教授とセミナー室にて.

学会は近くに Neues Palais を臨む落ち着いた雰囲気のもと行われた.

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No. 38平成 28 年 10 月

17th International Conference on Retinal Proteins 参加
及び Heberle 研究室と Hegemann 研究室訪問報告
本会議終了後には、当研究室と同じくロドプシ山内 夢叶（名工大・A03 神取研・博士前期課

ンについて最先端の研究をしているベルリン自由程 1 年生）

大学の Joachim Heberle 教授の研究室とフンボルト大学の Peter Hegemann 教授の研究室を訪問し本新学術領域の若手研究者海外派遣支援をいたた。Heberle 研は、特に膜タンパク質について赤外だき、2016 年 10 月 2 日～7 日、ドイツ・ポツダ分光法やラマン分光法を用いて機能解析を行ってム大学で EMBO Conference として開かれた、レいる研究室である。そのため、Heberle 研究室を案

チ ナ ー ル タ ン パ ク 質 の 国 際 会 議 17th

内していただいた際には、赤外分光器やラマン分International Conference on Retinal Proteins に光器が研究室内に並んでおり、より質の高い研究参加した。

を行うために分光器の自作も行っていることが特

本会議はロドプシンに関する研究について総合に印象的であった。また、Ana-Nicoleta Bondar的に議論する国際会議であり、基礎研究から応用教授の研究室と共同でセミナーが開催された。

研究まで幅広い議論が行われた。微生物型ロドプ

Bondar 研では、タンパク質に関して理論研究を行

シンでは 2013 年に当研究室が報告した KR2 を始っており、ロドプシンについても解析を行っていめとするナトリウムイオンポンプ型ロドプシン及る。セミナーでは、当研究室の博士後期課程 3 年

び神経制御などの応用に注目されているカチオン生の伊藤さんが発表され、深い議論がなされた。

チャネル型ロドプシンに関する研究成果が多く報また Heberle 教授とは、研究内容だけでなく研究告されていた。

環境や研究姿勢に関してもお話させていただいた。

筆者は“Molecular functions of rhodopsin-like

翌日にはフンボルト大学の Hegemann 研究室をproteins from Guillardia theta”という題目で、2訪問した。Hegemann 研は、光受容体について基日目にポスター発表を行った。Guillardia theta と礎研究から応用研究まで幅広く行っている研究室いう藻類はゲノム上に 44 種類もの微生物型ロドプである。今回の国際会議を主催された Hegemann

シン様タンパク質をコードする遺伝子を保持し、教授は不在であったが、他の方に研究室を案内しこの中からアニオンチャネルロドプシンのようなていただく中で様々な議論をすることができた。

新規のロドプシンも 2 種類発見されている。しか藻類の培養・実験を行っているなどの点で筆者のしながら、その他には 6 種類のロドプシンしか機研究と類似する部分があり、参考となる点が多く、能に関する報告がされていない。今回筆者は、新今後の研究に活かしていきたい。

たな 1 種類のロドプシンについてパッチクランプ

最後に、今回の渡航にあたって多大なご支援い法や分光法を用いて機能測定を行い、その結果、ただいた本新学術領域の関係者の方々にこの場をカチオンチャネル型ロドプシンであることを明らお借りして深く御礼申し上げます。

かにし、詳しい分子機能に関しても発表を行った。
ポスター発表では、筆者の発表した分子とは別の分子ではあるが、同じく Guillardia theta のカチオンチャネルロドプシンについて発表された Oleg
A. Sineshchekov 博士と隣になり、議論を行うことができた。言いたい内容を上手く英語で表現できず、英語での議論の重要性を痛感したが、今後の研究につながる意見を得ることができた。今回、ロドプシンばかりが議論される国際会議でロドプシンの最先端の研究を学ぶだけでなく、自分の研究について発表できたことは、得るものが多く非常に良い経験となった。

ポスター発表の様子

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No. 38平成 28 年 10 月

17th International Conference on Retinal Proteins 参加
及び Glaubitz 研訪問報告
重田安里寿（横国大・A02 公募班 川村 G）

全 81 枚の内、計 9 枚のポスターが KR2 に関する発表であった。多くのポスターは日本のチームからは神取 G、ド本新学術領域の若手研究者海外派遣の支援を受け、イ ツ の グ ル ー プ か ら は ゲ ー テ 大 学 の Wachtveitl 研 、2016 年 10 月 2 日から 7 日にドイツ・ポツダム大学でGlaubitz 研、Max Planck Institute の Bamann 研により行わ

EMBO Conference として開催された、レチナールタンパれ、両国の活発な研究成果を見聞した。

ク質の国際会議 17th International Conference on Retinal

学会終了後に訪問したゲーテ大学 Glaubitz 研は、膜タProteins (ICRP 2016)および、ドイツ・フランクフルトにあンパク質の固体 NMR 解析で近年非常に勢力を持ったグるゲーテ大学 Clemens Glaubitz 研を訪問したので報告す

ループで、プロテオロドプシンやチャネルロドプシン 2 をる。

始めとする微生物型ロドプシンの局所構造解析に加え、

ICRP は総勢 200 名ほどのロドプシン研究者が一堂に会

薬剤結合型 GPCR やマルチドラッグトランスポーターのする隔年開催の会議で、基礎研究からオプトジェネティ機能解析を、高分解能 NMR や DNP を利用して行ってきクスへの応用例まで幅広く発表される。これは唯一のロた。近年は KR2 の固体 NMR 解析も行っており、その勢ドプシンのみの会議で、1 週間最先端のロドプシン研究をいが目覚ましいことは、ICRP で発表されたポスターから集中して学ぶことのできる貴重な機会である。会議の前明らかであった。研究室訪問の際は、セミナーにて筆者の半に微生物型ロドプシン、後半にアニマルロドプシン及KR2 の研究を発表し、帰属の方法からラベルの位置の決びオプトジェネティクスに関する講演が行われた。微生定方法、データの示し方や論証の方法まで非常に多くの物型ロドプシンでは口頭発表、ポスター発表ともに、特に質問やコメントを受け大変に濃い時間となった。

ナトリウムイオンポンプ及びチャネルロドプシンの発表

研究室には NMR 系研究室で共有している固体・溶液が多く、関心の高さが窺えた。特にナトリウムイオンポン

NMR 群が併設されており、850 MHz や DNP 装置付きプに関しては A03 神取 G により共同研究が活発にされてNMR など研究室専用の固体 NMR が 4 台並んでいたほか、いるクロキノバクターロドプシン 2(KR2)のセッションが溶液 NMR に関しては 950 MHz、900 MHz のものに加え開かれ、神取先生および筆者を含む 4 人が登壇した。加え数年後には 1.2 GHz のものが導入されるとのことであって東大・濡木先生やゲーテ大学・Glaubitz 先生も KR2 のた。新旧約 13 台にも及ぶ NMR・EPR 装置が並んでいる講演を行われた。KR2 の注目度は非常に高く、ナトリウのは圧巻であった。DNP 装置付きの固体 NMR は同じ磁ムイオン輸送機構がポンプかチャネルか、タンパク質内場強度の EPR を用意することで、データの比較を容易にのナトリウムイオンの結合状態に関してなど、各セッシする工夫も見られた。

ョンの最後に設けられたセッション全体のディスカッシ

ラボで行っているプロジェクトに関して Glaubitz 先生ョンタイムでも議論は続いた。筆者は固体 NMR によるレから一対一でじっくりと話を聞く機会も頂き、これまでチナール結合ポケットの構造情報に関して(ニュースレタにあまり馴染みのなかった ABC トランスポーターの機能ー2016 年 9 月号参照)国際学会で口頭発表する貴重な機会

活性サイクルの解明や結合サイトの特定など、ATP やを頂け、今後の研究計画に役立つコメントを得ることがADP を化学修飾するなどの工夫により固体 NMR によるできた。

機能解析を可能にしていることを得た。総じて、研究室がKR2 に関する研究は、ポスター発表でも多く散見され、所有している固体 NMR の分解能だけでなく、綿密に練られた工夫によりタンパク質の構造と機能の解明を可能にしており、今後の研究の礎となる非常に重要な姿勢を学ぶことができた。このような有意義な機会を与えてくださった

ポツダム大学の学会会場

Glaubitz 研のメンバーと285

本新学術領域研究者の皆様に深く御礼申し上げます。