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遺伝子材料開発室

JCM

Info

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Plant

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DNA

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D47

Info

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遺伝子材料開発室では、国内ならびに海外で作製されたプラスミド、ライブラリー、組換えアデノウイルスなど遺伝子材料の寄託を受け、品質管理の後に利用者に提供していまCellす。収集した遺伝子材料は、各寄託者が独自に開発し、研究で実際に使用されたものであり、市販の遺伝子材料には無いユニークなものが多数有ります。

DNA

ウェブカタログには遺伝子材料検索のためのページを準備していますので、目的のクローンを探す際にご利用ください。

JCM

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．遺伝子導入、遺伝子発現のための材料

Info

遺伝子材料開発室では、遺伝子導入のための骨格ベクターならびに各種ベクターに遺伝子が搭載され、即実験に利用可能な遺伝子材料を提供しています。  リソース

理化学研究所バイオリソースセンター理研 は  年  月  日に 
 社 社の厚意によって、及びその変異体遺伝子が組み込まれたバイオリソース リソースについて、ライセンス料なしで、当センターへのご寄託、当センターから大学及び国公立の研究機関独立行政法人を含む
の非営利・学術研究への提供が可能となりました。是非、活発なご利用をお願い申し上げます。
 リソースのうち、京都大学武藤誠先生から寄託していただいた  
は  認識配列を持つレポーターで、 シグナルを可視化するために利用できます        。埼玉大学脳科学融合研究センター中井淳一先生から寄託していただいた   はカルシウムセンサーとして利用できます 。東京薬科大学濱田洋文先生から寄託していただいた   、アデノウイ
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 クラス  抗原をコードする  クローン（愛知県がんセンター研究所、赤塚美樹博
士より寄託）は、発現ベクターに組込まれており、遺伝子導入実験に即利用可能です。  
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法とは癌患者から摘出した癌組織から直接  を抽出し作製した発現  ライブラ

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癌患者で高発現している遺伝子を       

データも公開されています。発現ベクターに組込まれており、遺伝子導入実験に即利用
イオリソースセンターより寄託されました。

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遺伝子材料開発室に寄託されているクローンならびに培養細胞株から得た  断片を発現ベクターに組込んだクローンを構築して提供しています。組込んだ  全長の
塩基配列の確認ならびに当該ベクターを  細胞に導入し、ウエスタンブロッティング
あるいは免疫染色によるタンパク質産生の確認の後に提供リストに加えています。
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セルロース系バイオマスの分解に関与する酵素をクローニングベクターならびに大腸菌

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理研放射光科学総合研究センター及び大阪大学の倉光成紀先生より寄託していただいたもので、高度好熱菌（  ）の「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト」から産み出された構造解析用タンパク質発現用プラスミドおよび遺伝子破壊株作製
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D54

(http://www.thermus.org/j_index.htm)から検索することができます。

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Cell

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壊株作製用プラスミドは、理研放射光科学総合研究センターが提供するデータベース

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組換えアデノウイルスを産生するためのベクター（シャトルベクター）です。本クローンを 等  遺伝子を保有する細胞株に導入することにより、組換えウイルスを得ることDNAができます。（搭載遺伝子による細胞毒性等の理由から、組換えウイルスを産生できない場合があります）。

JCM

産生した組換えアデノウイルスも当開発室から提供可能です。本カタログの組換えアデノウイルスの項をご覧下さい。
本ベクターは定められた実験条件下で定められた宿主細胞に導入した時に組換えウイ

Info

ルスを産生する様に設計されていますが、それ以外の条件下でウイルスが産生される可能性は否定できません。従いまして、ウイルス産生以外の目的で本ベクターを使用される
場合は、十分に注意して下さい。
組換えアデノウイルス産生用シャトルベクター（コスミドベクター）は、制限酵素を用いた
組換え  操作によりアデノウイルス由来遺伝子を取り除き、プラスミドベクターへの変換が可能です（アデノ落とし）。これにより発現ベクターとして使用できます。「アデノ落とし」については「実験医学     ５月号 クローズアップ実験法、寺島他
」をご覧下さい。
東京大学医科学研究所 菅野純夫博士より提供していただいたヒト完全長  を搭載した  を提供しています。オリゴキャップ法により単離構築された  クローンからインサートを切出し、組換えアデノウイル
ス作製用シャトルベクターに組込みました。組換えアデノウイルスの作製の他、「アデノ落とし」によりアデノウイルスゲノムの大部分を除いたプラスミドベクターを得ることができ、それを発現ベクターとして利用可能です。
カテゴリー毎に分類した一覧表は、下記をご覧下さい。

各遺伝子材料のさらに詳しい情報は、インターネットホームページ
 をご覧下さい。           
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D59

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Info

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D60

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当開発室で提供するアデノウイルスは、 細胞内で増殖させ  緩衝液中ていませんが，おおよそ   のウイルス液  μ を提供しております。お受け

Cell

で細胞破砕して取り出したものを感染性ウイルスとしてお送りしております。力価は測定し取り後は直ちに培養を開始するか、℃で保存して下さい。なお、輸送中に力価が低使用されることをお勧めします。
ジ又は  をご覧下さ

JCM

組換えアデノウイルスの簡便な精製方法は組換えウイルスデータベースの  のペーDNA下している可能性がありますので、一旦  細胞に感染させウイルスを増やしてからい。
 をご覧下さい。
組換えアデノウイルスに限らず、組換え  クローンは突然変異を起こす可能性があります。組込み遺伝
子（ファイバー変異体アデノウイルスはファイバー領域も）の性状を予め 、 シー
ケンシング、ウエスタンブロッティング等により確認されることをお勧めします。
当 開 発 室 の 組 換 え ア デ ノ ウ イ ル ス は 、 現 在 は 完 全 長 導 入 法      によ り作製し ておりますが 、過去のものは 法  により作製 さ れ て お り 、 作 製 過程 で 自 律 増殖 可 能 なア デ ノ ウイ ル ス  
が混入する可能性があります。また、組換えアデノウイルス増殖過程でも宿主である  細胞の持つ  遺伝子を組み換えにより獲得する場合があることが報告されています。 ポジティブなウイルスは細胞株を選ばずに増殖し、かつ組み換えにより目的遺伝子を失っている場合も多いため、組換えアデノウイルスを実験で使用する際には予め  ネガティブであることを確認する必要があります。当開発室から提供されるウイルスは  ネガティブであることを確認済みですが、ご自身で増殖させたウイルスは  あるいはホームページの「挿入遺伝子と  の確認」を参考にして  チェックを行って下さい。当開発室で使用している  が持つ  領域を検出するための  プライマー配列を   に示しております。
提供形態
組換えアデノウイルスは感染細胞ライセートとして提供しております。国内研究者にはドライアイス梱包でお送りします。


D61

Info

組換えアデノウイルスの輸送ならびに保存時の安定性については 

Animal
Plant
Cell

組換えアデノウイルスの宿主になる  細胞は理研細胞材料開発室または  から入手して下さい。ホームページは下記の通りです。 

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

各遺伝子材料のさらに詳しい情報は、
インターネットホームページをご覧下さい。

JCM

DNA

組換えウイルスの取り扱いは前述のページの他、組換えウイルスデータベースの  のページでも公開しています。

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組換えアデノウイルスに関する参考文献
 組換えアデノウイルスの取扱い

Info・
・ ・ ・寺島 美保、近藤 小貫、鐘ヶ江 裕美、斎藤 泉 アデノウイルスベクターの簡便な作製法 実験医学
・実験医学別冊、新訂新遺伝子工学ハンドブック、改訂第３版、村松正實、山本雅編、
 年株羊土社
・実験医学別冊、バイオマニュアル  シリーズ、改訂版分子生物学研究のためのタンパ
ク実験法、竹縄忠臣編、 年、株羊土社
・別冊実験医学、ザ・プロトコールシリーズ、遺伝子導入＆発現解析実験法、斎藤泉、菅野純夫編集、 年、株羊土社
・実験医学別冊、バイオマニュアル  シリーズ、遺伝子治療の基礎技術、島田隆、斎藤泉、小澤敬也編集、 年、株羊土社
・ウイルス実験プロトコール、永井美之、石浜明監修、小林信之、永田恭介編集、 年
メジカルビュー社
・実験医学別冊、バイオマニュアルシリーズ、遺伝子導入と発現・解析法、横田崇、新井賢一編集、 年、株羊土社
 組換えアデノウイルスの作製
完全長導入法によるもの
・  法によるもの
・
 に関する参考文献
・村田武英、鵜飼英世、鈴木恵理香、横山和尚 組換えアデノウイルスの安全性、細胞工


D62

Animal

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Plant・ ・
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Cell 細胞の  遺伝子を獲得することによる  の発生 発生を抑制した宿主細胞
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JCM・ 

DNA・ ・村田 武英、鵜飼 英世、横山 和尚  組換えウイルスバンクの創設と高度利用
・横山 和尚、鵜飼 英世、村田 武英  新世紀の感染症学（下）  ゲノム・グロー
バル時代の感染症アップデート   感染症の遺伝子学、ウイルスの遺伝子学、２本鎖
直鎖状  ウイルス、アデノウイルス 日本臨床
・横山 和尚、鵜飼 英世、村田 武英  組換えウイルスの高度利用と組換えウイル
ス・コアバンクの基盤化 細胞工学
・村田 武英  細胞工学
・李 海鴎、横山 和尚 臨床科学
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D63

Info

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Info

JCM

DNA

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D64

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コンストラクト（プロモーターシリーズ）を当室では提供しています。

Cell

域を収集し、それらをルシフェラーゼ遺伝子の上流に連結したプロモーター･レポーター
このプロモーターシリーズは個々のもしくは網羅的な遺伝子の転写調節を解析、また遺学術文献ならびにデータベースをもとに細胞株特異的に発現することが報告されている
ヒト由来のプロモーター領域を  により単離し、ルシフェラーゼ遺伝子を持つ 

JCM

遺伝子、またガン関連などで注目されている転写因子ファミリーの標的遺伝子について、

DNA伝子の組織特異的発現を行う際の有用な研究材料として使用していただけます。   もしくは      にており、また、インサート  両端の配列確認による品質検査を通ったものをラインナッ
プしております。
さらに、各種培養細胞でのレポーターコンストラクトの発現確認も行っており、これらの結果は当室のホームページにて公開しております。さらに詳しい情報は下記  のホーム
ページをご覧ください。

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D65

Info

挿入しております。すべてのレポーターコンストラクトは制限酵素によるサイズ確認を行っAnimal

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D66

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D67

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

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

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

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



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

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

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

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D68




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

Plant

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

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

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









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





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

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Cell

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
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

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

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

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



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

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

















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

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
















































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







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





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

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
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



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



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

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





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





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

D69

Info

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 





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

DNA

Cell

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





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





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



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


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















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







Info

JCM

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






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





















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



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









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



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























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

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



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

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






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D70





Animal  





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

Plant

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


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Cell

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

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DNA

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
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



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



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



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




























 






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





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





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


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D71



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 








Cell








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



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






















Info

JCM

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









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



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



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 



























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



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



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



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















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





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



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









D72




Animal  








Plant






 






 





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





JCM




 

Info




















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





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































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



































 







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
























DNA



Cell







D73






AnimalPlant


 








JCM

DNA

Cell

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











 



















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











Info





























 
















 

























































D74















Animal
 








Plant

































JCM





DNA



Cell





















































































































D75
















Info

AnimalPlant


 








Cell








 









JCM

DNA

































Info










































 
























 




























 



























 




















D76



Animal
 








Plant






































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D77

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D78

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D79

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D80

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  

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D84

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個別クローンでの提供をしています。

DNA

ットワークプロジェクト」で収集・整備したヒト完全長  クローンから構成されています。

Cell

Plant 
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Animal． クローンセット 

ゲノムネットワークプロジェクトクローンは、次の２種類です。
東京大学の菅野純夫教授ならびに理化学研究所の林崎良英領域長のグループがJCM

 ヒト完全長  コレクション
収集・整備。ヒトの全遺伝子の  割に相当するおよそ  遺伝子、約  万クローン。

Infoエントリークローン
ヒト完全長  コレクションから抜粋した  遺伝子分、約  万クローン。
エントリークローンのインサート  は、テクノロジーにより種々のデスティネーションベクター（発現ベクター）へ簡単に移入することができます。なお、エントリークローンには、独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発
研究機構「完全長  構造解析プロジェクト」において、バイオテクノロジー開発技術研究組合が作製したヒト  クローンから作製したクローンも含んでいます。
※これらのヒト完全長  クローンを用いたプロジェクトの成果は、下記論文で発表され、クローンの詳細情報やタンパク質発現情報等がゲノムネットワークプロジェクトの公開データベース ゲノムネットワークプラットフォーム 
から公開されています。
※テクノロジーについては  社のサイト
をご参照ください。
※ は  社の登録商標です。
※「完全長  構造解析プロジェクト」にて取得されたヒト  クローンについては、「独立行政法人製品評価技術基盤機構」の「バイオテクノロジー分野」ホームページ をご覧下さい。
           
  
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D85

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Plant         
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Cell 
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Info

国立障害者リハビリテーションセンター研究所にて開発され、解析が行われました。下記論文に掲載されたクローンが提供可能です。             
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D86

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JCM

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ェクト事業により樹立されたもので、 株のマウス  クローンから構成されています。個別クローンでの提供をしています。
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東京大学ならびに国立基礎生物学研究所にて開発され、解析が行われました。
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D87

Info

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JCM

DNA

Cell

京都大学にて開発され、解析が行われました。京都大学が提供するウェブサイトから目

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D88

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れており、実質ゲノム被覆度は です。

DNA

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Plant 
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ホームページで紹介する検索プログラムを用い、キーワード検索により、目的遺伝子を含 系統から樹立された  細胞株も理研  細胞材料開発室から提供されてJCM

むクローンの検索が可能です。
います。この  細胞を用いて作製したキメラマウスから  細胞由来の個体が生まれるこ

Infoとも確認済みです。合わせてご利用下さい。
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熊本大学ならびに理研  で作製され、理研  によるゲノム解析（ ゲノム情報等整備プログラムによる）が行われました。
ホームページで紹介する検索プログラムを用い、キーワード検索により、目的遺伝子を含むクローンの検索が可能です。 


京都大学にて開発され、理研  によるゲノム解析（ ゲノム情報等整備プログラムによる）が行われました。
ホームページで紹介する検索プログラムを用い、キーワード検索により、目的遺伝子を含むクローンの検索が可能です。
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岡崎国立共同研究機構・生理学研究所にて開発され、理研  によりゲノム解析


D89

Animal（ ゲノム情報等整備プログラムによる）が行われました。

Plant

ホームページで紹介する検索プログラムを用い、キーワード検索により、目的遺伝子を含むクローンの検索が可能です。 
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DNA

Cell



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Info

JCM

 クローンとして提供しています。
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理研  によ樹立されました。染色体をサイズにより分画し、クローニングベクターに組込んでいます。 
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理研  によ樹立されました。
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D90

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当開発室ではクローン化された遺伝子材料のみではなく、ライブラリーも扱っています。
Cell

各ライブラリーの詳しい情報はホームページをご覧下さい。
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DNA

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理研  に保存されている微生物株を微生物材料開発室で培養し、当開発室で抽出したゲノム  です。  理研  マウス由来ゲノム 
理研  実験動物開発室より受け取ったマウスより抽出したゲノム  です。
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