GBits

no. 41 Oct 2014

free and open access to biodiversity data

理事会

GBIF第21回理事会

1

GBIF第21回理事会
GB21ハイライト

組織運営

3

GBIF、2013年年次報告書を発表

GBIFネットワーク

3

ウルグアイ、議決権を有する参加国としてGBIFに加盟
生物多様性遺産ライブラリー、ナチュラ
リス、Canadensys がGBIFに加盟

データ公開

3

データの永続性をターゲットとした
新たなパートナーシップ

能力強化

4

GBIF、2014年の能力強化のための助成金獲得者を発表
メンタリングプロジェクト最新情報

新規データ

5

eBird
ベルギー
理事会初日の様子。写真：GBIF事務局

9月16日～18日にインド・ニューデリーのインディア・ハ
ビタットセンターでGBIFの第21回理事会（GB21）が開催され、代表団が一堂に会しました。主催はインド環境・
森林省、およびインド野生動物研究所です。32カ国を代表する89機関が参加した今回の理事会では、GBIFの予算と事業計画改訂が承認された他、GBIFを介して公開されるデータのライセンシングについてのアプローチ案が賛同を得ました。また、生物多様性情報機構の創設における成功点と課題について議論が交わされました。理事会の中ではGBIF諮問委員会および公開シンポジウムも併せて開催され、GBIFの最近の成果と今後の計画、国レベ
ルのツールとサービスの事例、およびGBIFが仲介するデータを使用した、持続可能な開発のサポートを目指す研
究に光があてられました。

チリ
チェコ共和国
ノルウェーおよびインド
ロシア
タイ
英国

GBIFネットワーク内外の活動
生物多様性データの活用
今後の予定

7
8
11

GBits ニ ュ ー スレ タ ーを 講読 す るに は 、
www.gbif.org/newsroom/summary#signupにアクセスするか info@gbif.org までメールをお送りください。

GBitsGB 21ハイライト

インドのPrakash Javadekar環境・森林省気候変動担
当大臣は、理事会を開始するにあたって、GBIFのコミ
ュニティがリーダーシップを発揮して、生物多様性イ
ンフォマティクスに関する能力向上が図られていることに賛辞を送りました。

また、現在GBIFのノードとのつながりを持たないデー
タ保有者も、BIFのネットワークを通じてデータをシェアする新たなオプションを得られることとなります。

詳しくはこちら ニュースリリース
GBIF事務局のスタッフが2014年公開シンポジウムを開催し、GBIF.orgを通じてアクセス可能なデータを充実させるための最近の進展について紹介しました。たとえば、GBIFデータを利用する際、データの帰属や引用を明確にするために、すべてのデータセットにデジタルオブジェクト識別子（DOI）を添付する計画や、GBIFの能力強化プログラムにおける新たな進展、またCBDなどのグローバルな活動に対するGBIFネットワ
ークの貢献などです。GBIFの参加国であるアイルラン
ド、ベナン、英国、およびオーストラリアは、インフォマティクスへの投資と協力が、各国における生物多様性への優先的な取り組みにどれほど貢献しているかを説明しました。
GB21の幕を開けるインドのPrakash Javedakar環境・森林
省気候変動担当大臣。 © 2014, Rupa Bhardwaj / WII

同大臣は、生物多様性データのための国の堅牢なインフラを開発するというコミットメントを示した上で、インドの代表団が今後GBIFの議決権参加者となるべ
く交渉していくとの意向を明らかにしました。インド
は2003年からGBIFの準参加者となっています。
詳しくはこちら ニュースリリース
生物の多様性に関する条約（CBD）の事務局長を務めるブラウリオ・ディアス氏がGB21へのメッセージを寄せ、これを理事会のピーター・シャルク議長が出席者に対し代読しました。彼の声明の中でDias氏は、GBIF
参加機関らおよびCBDの批准各国に対して、「発展可能性に満ちた、アクティブで、強力なGBIFがもたらした成果―特に、GBIFのおかげで自国の持続可能な開発計
画を策定する上で手がかりとなる情報にアクセスできるようになった国々にもたらされた利益を認識するよ
うに」求めました。
ダウンロード ブラウリオ・ディアス氏からのメッセージ・レター
広範囲にわたる意見聴取の後、理事会はGBIFを介して公開されるデータのライセンシングおよび承認に関する新たなアプローチを承認しました。
将来的に、GBIFネットワーク内に保有されるすべてのデータセットは、3つの機械読み込みが可能なライ
センス（クリエイティブ・コモンズのCC0、CC-BY、およびCC-BY-NCと同等の）のうちの１つを付与することになるでしょう。GBIFは公開者に対し、可能な限り最もオープンなライセンスを付与するよう促します。事務局のスタッフは、GBIFの各ノードが将来のデータ公開者を評価・承認する上で手引きとなるガイ
ドラインの作成をサポートします。

2

2014年エビー・ニールセン賞受賞者のトニー・リース氏
写真：GBIF事務局

午後のセッションは、エビー・ニールセン賞受賞者であるトニー・リース氏による4つの革新的な生物多様性インフォマティクスツールの講演で幕が開きました。
2013年若手研究者賞を受賞したエマ・ゴメス氏の最新情報を伝える短いビデオが放映された後、2014年若手研究者賞はキーヴァ・マーシャル氏とビジェイ・バル
ウェ氏が受賞したことが発表されました。その後、科学委員会のロッド・ペイジ委員長が、GBIFデータの革新的利用の促進を目指す「エビー・ニールセン・チ
ャレンジ」を紹介しました（詳細は近日発表）。
シンポジウムはスペイン、英国、米国、インドからの専門家によるプレゼンテーションにより幕を閉じました。プレゼンテーションのテーマは、GBIFデータを利用した、生物多様性の保全、食糧安全保障、公衆衛生、侵略的生物種のコントロール、および人類のイノ
ベーションの支援などでした。

g 2 11

各講演者の動画は、彼らが行ったプレゼンテーション
とともにGBIF.orgからオンデマンドでご利用いただ
けます。あわせて、VimeoおよびYouTubeでも完全な動画をご覧いただけます。
詳しくはこちら
動画およびプレゼンテーションについて
2014年公開シンポジウム パンフレット
Vimeoで公開シンポジウムを観る
YouTubeで公開シンポジウムを観る

組織運営
GBIFが2013年の年次報告書を発表
GBIF は活動をまとめた
2013 年度の年次報告書を公開しました。同年のハイライトは GBIF.orgの立ち上げ、データへのリアルタイム・インデク
シング機能の導入、および Global Biodiversity
Informatics Outlook（地 球規模生物 多様性
情報 概況）の発 行でした。同報告書は数多くの共同プロジェクトとGBIF の 6 つの地域における データの公 開と利用の概略を説明する他、GBIF.orgへのアクセスやGBIFデータの利用に関す数値データも示しています。
ダウンロード 2013年年次報告書

GBIFネットワーク
ウルグアイ、議決権を有する参加国として
GBIFに加盟
ウルグアイが議決権参加者としてGBIFネットワー
クに加盟しました。ウルグアイはGBIFの中南米地
域の8番目の参加者であり、GBIFにおいて議決権をもつ38番目の国家政府となります。同国の開発イノ
ベーション・知識・技術局 （DICYT）の局長であるGabriel Aintablian氏が同国の文化教育省を代表してGBIF事務局との間でMOUに署名しました 。

no. 41 Oct 2014

生物多様性遺産ライブラリー、ナチュラリス、
CanadensysがGBIFに加盟
GBIFは新たに3つの機関を准参加者として迎えました。GBIFとの覚書に署名したこれらの参加機関は、様々なネットワークの活動に参画し、GBIFの理事会においては議決権を持たない代表権をもつこととなります。
生物多様性遺産図書館（BHL）は、ウェブベースのツールとサービスを通じて生物多様性情報へのオープンなアクセスを提供する生物多様性関連ライブラリーのコンソーシアムです。BHL は何百万ページにもわたる
分類学の文献をデジタル化してきました。これには1億5000万を超える種の名前に関する情報を含む10万編のデータが含まれます。GBIFのユーザーはすでにGBIF.org.上の分類群のページにあるリンクから、BHLの参照文献にアクセスすることができます。
ナチュラリス生物多様性センター（オランダ、ライデン）は、3700万を超える標本の生物学的コレクションを保有しています。2013年に、2001年からの准参加者であるETI Bioinformaticsと合併しました。
Canadensysは、モントリオール大学を拠点とし、カナダ国内の生物学的コレクションに保持されている生物多様性情報へのアクセスを提供するとともに、200を超える国々からデータの引き揚げを進めています。
CanadensysはGBIF 統合的公開ツールキット（IPT）の使用に関連するデータの公開のための多岐にわたる
ツールとリソースを開発してきました。

詳しくはこちら BHLに関する発表
ナチュラリスおよびCanadensysに関する発表

データ公開
データの永続性をターゲットとした
DataONEとの新たなパートナーシップ
GBIF事務局とDataONE（Data Observation Network
for Earth）は、GBIFを介してシェアされたデータセッ
トをアーカイブするパイロットリポジトリの設計に関する協力覚書を締結しました。このパートナーシップ
は、GBIFの大規模なテーブルデータを取り扱うためのソリューションを構築することによって、DataONEが自らのデータ・インデクシング・サービスを向上させる取り組みにも貢献するでしょう。

詳しくはこちら ニュースリリース

3

GBits
その他に協力覚書の下で取り組まれる領域としては、生態系に関するデータを交換する効果的な方法の探索、
DataONEに加わる新たなメンバーとの連携に向けた
GBIFネットワークの活用、および大容量のデータを取り扱う効率的なツールの開発に向けたGBIFの活動の進展の周知などです。
このパートナーシップは、GBIFのサービスを向上させる新たな可能性を切り拓くものです。例えば、GBIF は
GBIFが仲介するデータをクリーニングした後に得られる新規のデータセットを提供することができるかもしれません。研究に利用するデータの抽出や追跡方法を改善することによって、後続研究者が発表済の研究を再現し易くなったり、より高い品質の「リファレンス・データセット」を利用できるようになるでしょう。
詳しくはこちら ニュースリリース

能力強化
GBIF、2014年の能力強化のための助成金獲得者を発表

 GBIFの欧州からの参加機関が国家的な種のチェックリストを作成するためのスキルと能力を向上させるため、Species 2000が立ち上げた集中的なオープンソース「hackathon」

詳しくはこちら 2014 能力強化プロジェクト

メンタリングプロジェクト最新情報
ベルギー、モーリタニアおよびトーゴ
2014年9月2～4日、ヌアクショット高等師範学校において、モーリタニア、トーゴおよびベルギーの
GBIFナショナルノードがデータ公開ワークショッ
プを共催しました。様々な学術界および政府機関から約15の機関が参加し、GBIFとデータの公開と利用について学びました。特に大きな重点を置かれたのがGBIFの統合的公開ツールキットを介してデータを作成、整理、公開する方法でした。

GBIF事務局は能力強化のための助成金をGBIFの国際的ネットワークの中の5つのプロジェクトに給付することを発表しました。これらのプロジェクトにはGBIFの6つの地域のうち5地域から、計31のパートナー（29カ国および2つの国際機関）が関与することとなります。
またこれらのプロジェクトは4万ユーロに加えて追加の7万ユーロを活用していくこととなります。
GBIF事務局長のドナルド・ホバーンは次のように述べました。
「これらのプロジェクトがフォーカスしている、
データのデジタル化と品質、規格、技術開発、侵略的外来種などはGBIFネットワークの関心事と共通であり、今後広範囲に渡って関わりと交流の機会があることでしょう」。
以下は助成金を受けるプロジェクトです。
 SiB コロンビアが主導するGBIFネットワークを介して公開される生物多様性データの品質をシス
テマティックに改善する中南米の取り組み
 イベロアメリカ科学技術開発プログラム（CYTED）が主導する科学論文、画像、およびマルチメディアデータのデジタル化およびその公開
機能を拡張するという、中南米の2つ目の取り組み
 メキシコのCONABIOが主導する、種の記載にPlinian Core規格を使用することによって、GBIF
データの品質と相互運用性を向上させるという、メンタリングプログラム
 GBIF モーリタニアが主導する、サブサハラアフ
リカにおいて侵略的外来種に対する早期警告・対応
ネットワークを構築するためのバイリンガルトレ
ーニングおよび交流

モーリタニア・ヌアクショットでのワークショップ© Koudjou, GBIF Togo

参加者らは、モーリタニアの5件のデータセット（モーリタニア国立植物標本室およびワニ類の分布記録、バン・ダルガン国立公園の植物、マメ科、および爬虫類のチェックリスト）に加えてトーゴの2件のデータセット（藻類およびマメ科のチェックリスト）を公開しました。
MrBIFはまた、すべての国の機関とGBIFの間のデータの共有を容易にするデータ公開会議を準備しています。
詳しくはこちら ワークショップ資料
IPT トーゴ
IPT モーリタニア

コロンビアおよびブラジル
8月、ブラジルはリオ・デ・ジャネイロ州、ペトロポリ
スにある国立計算科学研究所（LNCC）において第4回
かつ最終回となるメンタリングミーティングを開催しました。

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no. 41 Oct 2014ベルギー
開発者 の議論に参加 し、経験を シェアするた め、Canadensysのクリスチャン・ジェンドリュー氏が招待されました。
1週間にわたるプログラムの間、参加機関は協力関係を強化する方法について議論し、WingLongitudeのコ
ンセプトを創出しました。これは、チームでソフトウ
ェアを共有でき、ひいては他人の利用と貢献を容易にするニュートラルなコードのリポジトリです。

自然森林研究所（INBO）がベルギー沿岸で繁殖す
るニシセグロカモメおよびセグロカモメのGPSトラ
ッキングデータを公開しました。このデータセットにはベルギー沿岸で繁殖する22羽のニシセグロカモ
メ（Larus fuscus）および5羽のセグロカモメ（Larus
argentatus）に装着した計27個のGPSトラッカーが2013年にとらえた440,000件を超える記録が含まれます。これらのデータは、Uva-BiTSおよびフランダー ス 海 洋 研 究 所 （ VLIZ ） と 共 同 で 運 営 す る
LifeWatchのための地上観察の一部として、INBOが記録したものです。GPSトラッカーを使用することで、観測者が鳥を観ることができる場所が限定されることによるバイアスを除去することが可能とな
り、カモメの移動パターンと生息場所利用の調査研究を推し進めることができます。また、GBIFに公開する際に個別のIDコードを使用することで、そのデータセットによりユーザーが時間を追って個々の動物の動きを追跡することが可能となることを示しています。

第4回目となるコロンビアとブラジルのメンタリン
グミーティング© 2014, Pedro Guimarães, SiBBr

また、参加機関は各々が独自にもつ生物多様性データ用
マネジメント・ソフトウェアの共通利用および改善を、より強力に進めていくことを決めました。この生物多様性情報コミュニティはまた、オープンソフトウェア・プ
ラットフォームであるWingLongitudeにも参加・貢献す
るよう招かれています。
コロンビア生物多様性情報システム（SiBコロンビア）
は、このメンタリング・プロジェクトを通じ、SiBブラ
ジルがGBIF統合的公開ツールキットを利用したデータ公開のためのプラットフォームを導入し、GBIFソースコードを利用した独自のデータポータルを開発する手助けをしました。SiBコロンビアはまた、大きなスケールで種の分布モデルを実行するためのLNCCの高性能コンピューティングに関する専門的知見を活用しています。
詳しくはこちら WingLongitude

新規データ

eBird
eBirdの観察データセット（EOD）の年次アップデート
により、GBIFを介して公開された観察データ数が伸び、5億件を超えるまでになりました。
コーネル大学鳥類学研究所および全米オーデュボン協会が運営するeBirdは、プロの鳥類学者や趣味の野鳥観
測家、および市民科学者などが収集した膨大な数の高品
質な観察データのコレクションです。

詳しくはこちら ニュースリリース

ニシセグロカモメ（Larus fuscus）.Photo CC BY-NC-SA 2.0
https://lic.kr/p/7UqCuV

ベルギー生物多様性情報ファシリティ（BeBIF）はThe
Flora of Northumberland and Durham（N.J. Winch1831）から得られた植物とキノコに関する5,583件の観察記録をデジタル化し、公開しました。ボタニーク・ド・メイーズ庭園のQ.グルーム博士は、意味を強化したXMLファイルを提供することから、この歴史的な文
献レファレンスのデジタル化を開始し、これに基づき
アカデミックな出版社であるPensoftが意味を強化したHTMLの再公開版を作成しました。
よりリッチになったこの植物相のオンライン上の再公開は、コンテンツのデータ抽出・照合、配布、および科学的使用・応用といったデジタル化がもたらすメ
リットとともに、オリジナルの文献の細部とうまく結びつきました。この公開は、北東イングランドの植物学に関する現在進行形の研究をサポートすることを目指しています。

5

GBitsチリ
GBIFチリはチリ環境省から得られた6つの国のデー
タセットをGBIF.orgを通じて公開するためにモビライズしました。これは、同国がGBIFを通じて公開する
初めてのデータセットであり、パートナーのコスタリ
カと共同のメンタリング・プロジェクトの成果でもあります。

ノルウェーおよびインド
生物多様性及び生態系サービスに関する政府間科学政策プラットフォーム（IPBES）の能力強化をデモン
ストレーションするパイロットプロジェクトの一部
として、オスロ自然史博物館（NHM-UiO）がノルウ
ェーとインド野生動物研究所（インドのGBIFナショ
ナルノード）の協力にもとづく4つのデータセットを公開しました。これらのデータセットにはインドで収集され、現在はノルウェー科学技術大学（NTNU）博
物館、ベルギー大学博物館（UiB）、およびオスロ大学自然史博物館（NHM-UiO）の博物学コレクションに所蔵される標本を含んでいます。
同じプロジェクトから、インドのデータセットも得られました。これはウッタラーカンド州のラジャジ国立
公 園 に お い て カ メ ラ ト ラ ッ プ に よ る 305 件 の ト ラ（Panthera tigris tigris）の出現データ、およびGBIF
事務局がインドとノルウェーのパートナーとともに作成した、カメラトラップ・データの公開の手引きが含まれます。

クロコンドル （Coragyps atratus）. Photo CC BY-NC-SA 2.0
https://lic.kr/p/e9cXxr

この種の分布に関するデータセットは15,541件あり、チリの国立自然史博物館の爬虫両生類の標本、扁形動物類（Platyhelminthes）、甲殻類および藻類のコレクションの他、GBIFのナショナルノードマネージャーであり環境省の部長であるシャリフ・タラ氏が提供した野生動物の観察データを含みます。

チェコ共和国
プラハ国立博物館がGBIF.orgを通じて、初めてのデー
タ公開となる7つのデータセットを公開しました。これ
らは55,000件を超える種のデータで構成されるものです。現在、GBIF.orgを通じて、同館が所蔵する古生物
学的な動植物相、昆虫、菌および動物のコレクションにアクセスすることができます。同博物館はまた、イランの41%をカバーする8,525件のレコード（地理参照情報つき）からなるイランのトカゲ類の文献的説明も公開しました。この詳細なデータセットは、イランのトカゲ類の分布に関する包括的なサマリーを示すデータペーパ
ーにより記述されています。チェコ共和国はまだGBIFの参加国ではないため、GBIFの准参加者である欧州分類学研究機関コンソーシアム（CETAF）が同博物館を新規の公開者として支持しました。

6

ロシア
GBIFの新規データ公開者であるモスクワ大学植物標本室（MW）は、ロシア・ヴラジーミル州のメスチェ
ラ国立公園における維管束植物の分布に関するグリッドベースのデータセットを公開しました。ロシアで2番目に大きい植物標本室であるMWには、維管束植物類およびユーラシア大陸の苔類に関する幅広い専門知見が備わっています。このデータセットはグリッド・スキームに基づき、メスチェラ国立公園で取得された812種の維管束植物類の22,600件を超えるユニー
クな分布記録を含んでいます。今回のGBIF.orgを通じた 初 め て の デ ー タ 公 開 に 続 き 、 今 後 MW か ら 約
100,000件の記録が追加される見込みです。ロシアは
まだGBIFの参加国ではないため、GBIFフィンランド
（議決権参加者）がモスクワ大学植物標本室を新規のデータ公開者として支持しました。

タイ
マハ・チャクリ・シリントーン王女自然史博物館（PSU Museum）はGBIF.orgを通じ、タイの機関初となるデータセットを公開しました。同博物館は今回、両生類のコレクションを公開するためにIPTを使用しました。このデータセットは600件の出現記録で構成され、その90%は東南アジアの生物多様性ホットスポットの一つである、タイの半島部で収集された標本で構成されています。PSU博物館は海草、プランクトン、無脊椎動物、脊椎動物および化石に関する幅広い博物学コレクションの標本デー
タを公開すると期待されています。公開された後、同博物館はこれらのアクティブなコレクションから得られたデータに対する継続的なアップデートを見込んでいます。

g 2 11

no. 41 Oct 2014

GBIF、中国の生物多様性カンファ
レンスに貢献8月に中国・瀋陽で中国科学院（CAS）が第11回生物多様性に関する科学および保全に関する全国的カンファレンスを開催し、300人を超える科学者および専門家達が参加しました。国際生物多様性計画中国委員会（DIVERSITAS）の事務局長であり、かつGBIFにおけるCAS代表団の代表である马克平博士がオー
プニングセレモニーの座長を務めました。

シロアゴガエル (polypedates leucomystax). Photo CC
BY-NC-SA 2.0
https://lic.kr/p/bfmmQK

この隔年で開催されるカンファレンスのミッション
は、生物多様性および保存の分野におけるアカデミ
ックな研究と協力を促進することです。今年のカン
ファレンスでは、生物多様性インフォマティクスについてのテーマセッションが設けられました。

タイはまだGBIFの参加国ではないため、ASEAN生物
多様性センター（GBIFの准参加者）がPSU博物館を新規のデータ公開者として支持しました。

英国
欧州分子生物学研究所（EMBL）が460万を超える地理情報をタグ付けされた遺伝子配列で構成されるデータセットを公開し、GBIFを通じた遺伝的データの公開に先鞭をつけました。

GBIFネットワーク内外の活動
中南米のGBIF
コロンビアおよびブラジル1週間にわたるメンタリング
プログラムに引続き、9月1～3日に第4回となる中南米
ノードミーティングが開催され、中南米からの6つの参加機関とウルグアイから1つのオブザーバーが参加しました。（上記プロジェクトアップデート参照）。
現在進行中のプロジェクトとイニシアティブについて提示した後、参加者らは地域的および国際的協力を強化する方策について協議し、地域のワークプランについて
概要をまとめました。参加したノードは生物多様性デー
タポータルの協力的発展、能力強化、および新メンバーのエンゲージメントを優先すべき分野として特定しました。能力強化に関する活動の中心は、データ品質、デジタル文書化およびPlinian Coreを用いた種の情報を重視したものとなるでしょう。
そのワークプランにはまた、ブラジルとコロンビアの間のメンタリング・プロジェクトなどの地域的な取り組み
や、アトラス・オブ・リビングオーストラリア（ALA）のワーキンググループとの国際的協力を通じた生物多様性データポータルの発展について、具体的な言及がなされました。

生物多様性インフォマティクスに関するワークショップを主導するGBIF事務局の柯智仁© 2014, CNC-DIVERSITASGBIF 事務局は、柯智仁氏が主導したこのセッションとあわせて、地理参照（geo-referencing）および GBIF
統合的公開ツールキット（IPT）を利用したデータ公開をデモンストレーションするワークショップの開催を手助けしました。このワークショップは、研究者がデータ管理を行う実用的なスキルを向上させつつ、中国における GBIF のデータ公開ワークフローに関する知識を向上させる一助となりました。

フィンランドのピン止めされた昆虫の大量デジタル処理
フィンランド博物学博物館のデジタル化センターであるDigitariumと東フィンランド大学は、ピン止めされた昆虫をデジタル化するための高性能システムをリリースしました。その最初のテストとして、Digitarium
はフィンランド博物学博物館のために、ヨウツセノの
グナー・ブロームクイスト氏のカブトムシのコレクシ
ョンを2カ月でデジタル化しました。このカブトムシのコレクションは15,000の標本で構成され、フィンランドで見られる甲虫類の種の約3分の2が含まれます。また、その中にはおよそ100の絶滅危惧種が含まれます。

7

GBitsI3Bワークショップ、種の分布モデルにフォーカス
イベロアメリカ生物多様性情報インフラストラクチャー（I3B）は、全4回を予定しているリージョナルトレ
ーニングおよび経験交換活動の第3回を開催しました。
このワークショップは6月にメキシコ、テポストランで開催され、生態ニッチモデリングの基礎と特徴にフォーカスしたものとなりました。生物地理学および保全
生物学の分野から30人の大学院生および若手研究者の他、9ヶ国（アルゼンチン、ブラジル、チリ、コロンビ
ア、コスタリカ、エクアドル、メキシコ、ウルグアイ、
スペイン）のI3B ネットワークメンバー9機関から生物多様性の保全計画専門家らが参加しました。

生物多様性データの活用
GBIF事務局は、科学的文献におけるGBIFが仲介するデータの利用をモニタリングするプログラムを継続的に実行しています。以下の査読済み論文は、最近のモニタリングの成果のハイライトの一部です。
Amirkia, V., et al. 2014. Alkaloids as drug leads A predictive structural and biodiversity-based
analysis. Phytochemistry Letters.
アルカロイドは現代医学で過小評価されているのではないか？著者らは、GBIFが仲介する知られたアル
カロイドの植物ソースに関する生物種の分布記録を部分的に使用して、アルカロイドは人類の治癒において4000年の歴史を持つにも関わらずアルカロイ
ドベースの新薬数が大幅に減っている潜在的な理由を検証しました。
Candela, L., et al. 2014. An
infrastructure-oriented approach for supporting
biodiversity research. Ecological Informatics.
著者らは、研究者がデータの品質評価やキュレーシ
ョンにかける時間を短縮することができるよう、
GBIFやOBIS、およびその他のソースからの種の分布記録の取得と準備作業をサポートする一連のツールを導入しました。このツールはD4Science
Data Infrastructureが開発したものです。

I3Bワークショップ © 2014, Cristina Villaverde / GBIF.ES

このワークショップの大きな目的は、生態ニッチモデ
リングの用途と限界とあわせて、この分野における最近の進展について理論的、実用的な概要を示すことでした。参加者たちは、ワークショップで学んだ内容を自国内に情報発信し、同時に彼らの研究分野に関連する生物学的な情報を利用可能な状態にとするべく努めていくことを約束しました。
こ の ワ ー ク シ ョ ッ プ は 、 GBIF の 准 参 加 者 で あ る
CYTEDをスポンサーとしてメキシコのCONABIOおよ
びGBIF スペイン（GBIF.ES）により共催されました。

Crafton, R. E. 2014. Modeling invasion risk forcoastal marine species utilizing environmental
and transport vector data. Hydrobiologia.
著者は、沿岸海洋に生息する5種の蟹により、侵略のリスクに晒されている沿岸海洋領域を特定する
ため、GBIFが仲介するデータを利用し、それらの到達可能性の高い場所と、生存可能性の高い場所を組み合わせるモデルを作成しました。この導入可能性と環境的な安定性を重視した評価のアプローチ
は、その他の海洋および非海洋種に適用することができるものですが、その適用可能性は種が生存することができる環境の全範囲を網羅した分布記録があるかどうかに左右されます。

詳しくはこちら トレーニング資料
第1・2回のワークショップの結果
ワークショップの動画を観る

イソガニ (Hemigrapsus sanguineus). Photo CC bY-NC-SA 2.0
https://www.lickr.com/photos/21933510@N07/10929759593

8

g 2 11

Faulkner, K., et al. 2014. A simple, rapid
methodology for developing invasive species watch
lists. Biological Conservation.
資源に乏しい地域のための生物学的セキュリティ・ス
キームを開発するため、著者らは侵略的外来種（IAS）のウォッチリストを迅速かつ経済的に作成する手法を提案しました。この手法は、GBIFが仲介する419件の侵入生物種に関するデータを活用し、IASの侵略成功における一貫性のある予知因子（過去の前例、環境的な安定性、および導入のエフォート）を用いて重要な脅威の初期評価を行います。

no. 41 Oct 2014

Higgins, S. I., et al. 2014. Invasive plants havebroader physiological niches. Proceeding of the
National Academy of Sciences of the UnitedStates of America.
環境条件耐性がより高い種は、より侵略的になりやすいと報告する著者らは、彼らの生理学ベースの種の分布モデルとGBIFが仲介するデータを用いて、749のオーストラリアのアカシアおよびユーカリの種を対象に、過去1世紀にわたる外来種の出現を比較しました。
Hjarding, A., et al. 2014. Red List assessments ofEast African chameleons: a case study of why weneed experts. Oryx.
著者らは、GBIFが仲介する東アフリカの固有種である35のカメレオンの地理的分布データを、分類学の専門家によりまとめられたデータと比較し、種が脅かされている状況を評価するためにはオン
ラインデータベース単独では充分ではないと結論付けました。

Bitou Bushの花と果実(Chrysanthemoides monilifera).
Photo CC bY-NC-ND2.0 https://flic.kr/p/6UGDf1

Gasc, A., et al. 2014. Biodiversity Sampling Using a
Global Acoustic Approach: Contrasting Sites with
Microendemics in New Caledonia. PLoS ONE.
著者らは、ニューカレドニアの生物多様性を迅速に評価するための音響的手法を提案します。この手法は太平洋上の島としてのユニークな空間的構造と極めて狭い領域に分布する多くの固有種に対応したものです。
他の場所での大きな空間的・時間的スケールにおける本手法の適用性を検証するため、既存のインベントリ、
系統発生の情報、およびGBIFが仲介するデータに基づ
き、3つの山間部のサイトが選択されました。
Harsch, M. A., et al. 2014. Species distributions shiftdownward across western North America. Global
Change Biology.
GBIF.orgおよびその他のソースから得た北米西部の296の植物種の分布記録を利用。調査エリアでは一貫して温暖化の傾向があるにも関わらず、それらの植物の63%が、標高が低い土地にシフトしており、著者らは、
水分ストレスその他の直接の生理学的変化がどのようにこれに寄与しているかを検証しました。

Ikeda, D. H., et al. 2014. Incorporating Climate
Change and Exotic Species into Forecasts of
Riparian Forest Distribution. PloS ONE.
著者らはGBIFが仲介するデータを用いて、米穀西部の乾燥地帯の水辺に生息する4つの種について、
潜在的な気候変動の影響がその適した棲息地に与える影響を検証します。4つの種とは、3つの固有種（フレモントコットンウッド、カワヤナギおよびイ
ヌコリヤナギ）および現在では広まった外来種であるギョリュウです。その結果、フレモントコットン
ウッドは予想外に大幅に増加する可能性が示された一方で、ギョリュウが3つの種すべての分布に与える影響から、気候変動の直接・間接の影響の双方を検討に入れる必要性が示されました。
Pigott, D. M., et al. 2014. Mapping the zoonotic
niche of Ebola virus disease in Africa. eLife.
研究者らは、エボラウイルス病の保有宿主であると考えられている3つのコウモリの種の環境的な生態ニッチに基づき、アフリカの中でエボラウイ
ルス病のアウトブレイク（大発生）のリスクに潜在的に晒されている地域をマッピングしました。
現在西アフリカで起こっているようなヒト間でのアウトブレイクはこれまでほとんど起こったことがありませんが、この研究はGBIFが仲介するコウ
モリの分布記録を使用して、中央・西アフリカの22カ国の中で、エボラウイルス病のリスクに晒されている地域を特定しました。これらの地域は、計2200万人の人口を擁しています。

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GBitsPinkernell, S., et al. 2014. Potential effects ofclimate change on the distribution range of themain silicate sinker of the Southern Ocean.
Ecology and Evolution.
著者らはGBIFが仲介するデータを使用して、環南極海流全体にわたって支配的な珪藻種である
Fragilariopsis kerguelensisの分布モデルを作成しました。このめったにモデリングされることがないグループについて、著者らは重要なパイロッ
トモデルを構築し、この生物ケイ酸塩ポンプの主たる原動力というべき種に、気候変動が与えると見込まれる影響を検証しました。

Schulp, C. J. E., et al. 2014. Wild food in Europe:
A synthesis of knowledge and data ofterrestrial wild food as an ecosystem service.
Ecological Economics.
野生の食糧を採集し、消費することは重要な文化的生態系サービスであると認識されていますが、これまで、これらの供給量を定量化することは困難でした。著者らは、GBIFその他のソースを通じて野生の食糧種のデータを合成することで、ヨーロッパ全土で食べられている野生の動物と植物の分布密度に基づく定量化とマッピングを行いました。
Singh, G., et al. 2014. Spatial Extent Models for
NaturalLanguage
Phrases
Involving
Directional Containment. Transactions in GIS.
GBIFが仲介したデータに何百万もの地理情報をもたないレコードが含まれていることをきっかけとして、著者らは空間的広がりを「中央北カリフォルニ
ア（central northern California）」などといった「地名索引」スタイルの名前に割り当てる方法を探究しました。矛盾のない、推奨されるべきアプローチを引き出せるという希望とともに彼らは2巻からなる
Ornithological Gazetteer of Brazil（Paynter andTraylor 1991）を利用して、複数の自然な言語のフレーズにおける空間的解釈を比較し、試験しました。
Shabani, F., et al. 2014. Distribution of datepalms in the Middle East based on futureclimate scenarios. Experimental Agriculture
高温で乾燥した砂漠のオアシスに適応した種である
ナツメヤシ（Phoenix dactylifera L.）は、気候変動によって劇的な影響を受ける可能性があります。著
者らはGBIFやその他のデータソース、科学論文から取得した分布記録を利用して、サウジアラビア、イラクおよびイランがこの重要な、利益性の高い作物に関して最も大きな影響を受ける可能性があるということを発見しました。一方で、イスラエル、ヨルダンおよびシリア西部にあって種の適合性が高まる
可能性があります。

後生動物の進化系図に見られるゲノムワイドな遺伝的多様性© 2014, authors c/o Nature PublishingGroup.

Romiguier, J., et al. 2014. Comparative population
genomics in animals uncovers the determinantsof genetic diversity. Nature.
遺伝的多様性は、ある種の別の個体の間のDNA
配列の相違を評価する尺度となります。著者らはGBIFが仲介する種の分布記録を利用して76種の動物の遺伝的多様性を検証し、「親の投資」というべき極めて重要な特徴を発見しました。すなわ
ち、短命で非常に多産の種は、抱卵する能力をもち寿命が長い多産でない種と比べて、より遺伝的に多様であるということです。

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Tingley, R., et al. 2014. Realized niche shift during
a global biological invasion. Proceedings of the
National Academy of Sciences of the UnitedStates of America.
GBIFおよびその他複数のソースからアクセス可能なオオヒキガエル（Rhinella marina）の分布記録を利用して、著者らは侵略的外来種の広がり予測の精度向上を図りました。この研究は、進化した環境耐性または根本的な生態ニッチの変化の生理学的な力学モデルと、侵略を受けた領域の生物的および非生物的条件（ニッチの変化が現実となったもの）に基づく相関モデルを組み合わせるものです。

g 2 11

no. 41 Oct 2014

Robertson, T., et al. 2014. The GBIF Integrated
Publishing Toolkit: Facilitating the Efkcient
Publishing of Biodiversity Data on the Internet.
PLoS ONE.

今後の予定

GBIF事務局の開発者が、米国のVertNETおよびベルギーのINBOからのパートナーとともに、統合的公開ツールキット（IPT）ソフトウェアの特徴と機能を説明しました。Discussionでは、IPTが生まれたきっかけとその作製、その絶え間ない
進化、そしてIPTが生物多様性研究コミュニティとデータ公開に与える影響が概説されています。

COP 12: 生物多様性条約（CBD）締約国会議
2014年10月6～17日、ピョンチャン（平昌）、
大韓民国

ミーティングとカンファレンス

アフリカの山岳地域フォーラム2014
2014年10月22～24日、アルーシャ、タンザニア
2014 TDWG カンファレンス
2014年10月27～31日、ヨンショーピング、
スウェーデン
IUCN 世界公園会議
2014年11月12～19日、シドニー、オーストラリア
第2回国際海洋研究カンファレンス
2014年11月17～21日、バルセロナ、スペイン
北極における生物多様性会議
2014年12月2～4日、トロンヘイム、ノルウェー

GBIFのVision 科学、社会及び持続可能な未来のために、生物多様性情報が全域で自由に利用可能な世界の実現を目指します。

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