令和３年度
神戸大学
先端バイオ工学研究センター
年次報告書

令和４年６月目

次

教員一覧表・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３
強み・特色について・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・４
教員及び専門分野・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・６
研究業績等
研究業績一覧・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・２３
１．論文発表（国際学術誌掲載論文，企業共著論文）・・・・・・・・・・・２４
２．学術発表（国内学術誌総説，紀要，報告書など) ・・・・・・・・・・・２６
３．著書・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・２７
４．国際招待講演・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・２７
５．国際学会発表・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・２７
６．国内招待講演・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・２８
７．国内学会発表・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・２９８．特許（出願）・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３１
９．特許（登録）・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３１
１０．国補助金事業・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３２
１１．民間企業共同研究・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３３
１２．奨学寄附金・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３３
１３．受賞・表彰・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３３
１４．プレス発表・新聞掲載等・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３３
１５．招聘外国人研究者・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３４
１６．その他の特記事項・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３４＜付録＞
１．掲載記事等・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・３７
２．第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会報告・・・・・・・・・・７２2

教員一覧表部門

職名・氏名等
教授

准教授

助教

近藤昭彦

(＊) ◇部門長

石井

純

(★)

酒井香奈江 (特)(＊)

蓮沼誠久

(★)

石川 周

(＊)

加藤悠一 (特)(★)
冨永将大 (特)(＊)◎センター長バイオベース
燃料・化学品

吉田健一

(＊)

田中 勉

(＊)

研究部門

竹中慎治

(協)

川口秀夫

(特)(＊)

今石浩正

(協)

秀瀬涼太

(特)(＊)

梅林恭平(特)(★)

内田和久(特)(＊)

伊藤洋一郎 (特)(＊)

中村泰之(特)(＊)

片山健太(特)(★)(協)◇部門長

バイオロジクス
山地秀樹

(＊)

遊佐敬介

(特)(＊)

白井康仁(協) ◇部門長

金丸研吾

(＊)

福田伊津子

芦田

均

(＊)

山崎将紀

(協)

佐々木大介 (特)(＊)

機能性食品

水野雅史

(協)

本田和久

(協)

藤倉 潮

素材・アグロ

上曽山 博 (協)

橋本堂史

(協)

HunzikerJohan (特)(＊)

山下陽子

(協)

宇野雄一

(協)

研究部門

バイオ研究部門(特)(＊)

田岡健一郎 (特)(＊)
荻野千秋(＊) ◇部門長

勝田知尚

(協)

林

昌彦

(＊)

中川敬三

(協)

化学・プロセス

森

敦紀

(協)

神尾英治

(協)

研究部門

大村直人

(協)

西山

覚

(協)

西野

孝

(協)
秋本誠志

(＊)

柘植謙爾

(客)

西田敬二

(★) ◇部門長

先端プラット○副センター長

フォーム技術

大西

洋

(＊)

開発部門

富永圭介

(協)

丸山達生

(協)

バイオエコノ山本一彦(＊) ◇部門長

ミー研究部門

忽那憲治

(＊)

谷屋啓太

(協)

黒田修司

(特)(★)※名前の右横の「特」は特命，「★」は主配置，「＊」は配置，「協」は協力教員，「客」は客員教員を示す。
※令和 3 年度中に一部期間でも在籍した者を含んで掲載している。

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強み・特色について
神戸大学先端バイオ工学研究センターは，神戸大学の強みと特色を生かし，先端バイオ工学
分野という先端融合領域における新たな学術分野の開拓推進を行うとともに，イノベーションの創出を目指す国内唯一の研究センターとして，2018 年 7 月 1 日に設立されました。
本研究センターは，産学官連携による先端的な研究開発を推進するとともに，研究開発のプ
ラットフォームを構築・集積し，ハード(研究スペース，機器)とソフト(研究者，知財)を整備したイノベーションハブとなることを目的としています。
先端バイオ工学における教育研究実績や，関係機関との連携協力関係を基盤として，国や社会の要請に応え，多様な有用物質のバイオプロダクションの実現をはじめとするイノベーショ
ン創出を行うことでバイオエコノミーを牽引することを目指してまいります。
(１) 学際研究，産学連携研究の促進
神戸大学のコア技術に基づく 6 つの研究部門(バイオベース燃料・化学品研究部門，バイオ
ロジクス研究部門，機能性食品素材・アグロバイオ研究部門，化学・プロセス研究部門，先端プラットフォーム技術開発部門，バイオエコノミー研究部門)を配し，部門間の連携研究を積極的に推進することで学際研究しやすい環境を整備しています。また，これまでの国補助金事業や共同研究で培ったノウハウを生かすとともに，複数分野にまたがる研究体制を整えることで，多様化する産業界のニーズへの対応力を高め，産学連携・オープンイノベーショ
ンの場を増やしています。
(２) 文理融合によるイノベーション創出の加速
文理融合型の研究センターとして，バイオエコノミー研究部門を配することで，自然科学系教員の中だけでなく，社会科学系教員との連携が可能となり，知的財産化，生産技術開
発，市場開拓を見通した事業化戦略の導出，イノベーションの創出をサポートしています。
(３) 先端バイオ工学推進機構およびバイオロジクス研究・トレーニングセンターとの連携
一般社団法人先端バイオ工学推進機構(Organization for Engineering Biology ; OEB)，一般社
団法人バイオロジクス研究・トレーニングセンター(Biologics Center for Research and Training ;BCRET)と連携することで，先端バイオ工学分野およびバイオロジクス分野の国際的な研究開
発動向や産業動向，産業ニーズ等に関する情報が集積され，予備的な研究開発を実施することにより，さらなる研究の発展や産業の振興，人材の育成につなげています。
(４) 国際的な共同研究の推進
先端バイオ工学におけるプラットフォーム技術を集約した「バイオファウンドリー」を議論する国際的なアライアンス(Global Biofoundry Alliance)に参画し，研究成果の発信や最先端研究動向の共有，ビジネスモデルの検討等により，バイオエコノミーの発展に貢献しています。

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(５) 研究スペースと機器使用機会の提供
多様な研究分野にまたがる先端バイオ工学(Engineering Biology)領域において，研究に必要な設備・機器を整備・集積しており，学内外において共同で利用できる仕組みを整えること
で学際研究，産学連携研究をサポートしています。

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教員及び専門分野【バイオベース燃料・化学品研究部門】
スマートセル開発を中心とした低酸素社会実現のための基盤構築
持続可能な低炭素社会を実現するために，バイオ燃料やバイオベース化学品の生産に関するさまざまな研究を展開しています。生理活性を有する機能性物質の生産にも取り組んでいます。
我が国では「高度に機能がデザインされ，機能の発現が制御された生物細胞」がスマートセ
ルと定義され，スマートセルを用いた次世代産業「スマートセルインダストリー」の構築が進められています。当部門では，この分野の社会実装に必要なブレイクスルーを起こすべく，次の 3 つの研究グループを設置し，革新的な技術開発を目指して研究を日々行っています。
＜原核スマートセル研究グループ＞
大腸菌や枯草菌，乳酸菌，放線菌，コリネ型細菌などの原核生物を宿主として，バイオ燃料やバイオベース化学品，機能性物質を生産する細胞の開発を行っています。
宿主の特性を生かした標的生産物の選定，代謝経路の設計，酵素の選択，遺伝子の設計等を通してスマートセルを設計し，ハイスループット技術やオミクス解析技術を活用した細胞の評価，計算科学的手法を活用した代謝ルールの学習を行うことで，スマートセルの開発を進めています。
氏名

職名

専門分野

近藤 昭彦

教授

生物機能・バイオプロセス，応用微生物学，合成生物
工学

蓮沼 誠久

教授

代謝工学，代謝分析化学，遺伝子工学，細胞生理学，
バイオプロセス工学

吉田 健一

教授

応用微生物学，ゲノム生物学，代謝工学，微生物生理，
遺伝子発現制御，生理活性物質

竹中 慎治

教授

応用微生物学，有用微生物の単離，微生物酵素，微生
物分解，物質変換

今石 浩正

教授

バイオマーカー，薬物安全性評価

石井 純

准教授

合成生物学，代謝工学，ゲノム工学，進化工学，バイ
オセンサー

石川 周

准教授

応用微生物学，分子生物学，ゲノム生物学

田中 勉

准教授

生物化学工学，細胞表層工学，代謝工学

川口 秀夫

特命准教授

代謝工学，応用微生物学，バイオマス，コリネ型細菌，
大腸菌

秀瀬 涼太

特命准教授

応用微生物学，応用生物化学

酒井 香奈江特命助教

分子微生物学6

■研究成果の概要
機械学習や AI を用いて新規代謝反応や新奇酵素を見出した研究成果が，英国科学誌
Nature Communications に掲載されました。また，光で有用物質を高生産する大腸菌の開発に成功した論文が国際科学誌 Metabolic Engineering に掲載されました。また，新エネルギ
ー・産業技術総合開発機構（NEDO）「官民による若手研究者発掘支援事業」に採択されました。
＜真核スマートセル研究グループ＞
出芽酵母や分裂酵母，メタノール資化性酵母をはじめとするノンコンベンショナル酵母，
糸状菌，植物細胞，動物細胞などの真核生物を宿主として，バイオ燃料やバイオベース化学
品，機能性物質を生産する細胞の開発を行っています。
真核生物は，オルガネラ(細胞内小器官)を有し，複雑な遺伝子発現・代謝制御系を有するため，原核生物とは異なるアプローチが必要であり，真核生物に特化したスマートセル構築技術を開発しています。また，真核生物の特性を生かし，真核生物ならではの標的物質(二次代謝物質，ペプチドなど)を生産する細胞の開発を進めています。
氏名

職名

専門分野

近藤 昭彦

教授

生物機能・バイオプロセス，応用微生物学，合成生物
工学

蓮沼 誠久

教授

代謝工学，代謝分析化学，遺伝子工学，細胞生理学，
バイオプロセス工学

石井 純

准教授

合成生物学，代謝工学，ゲノム工学，進化工学，バイ
オセンサー

田中 勉

准教授

生物化学工学，細胞表層工学，代謝工学伊藤 洋一郎

特命准教授

進化分子工学，合成生物学

梅林 恭平

特命准教授

酵母，遺伝学，脂質生物学，栄養源の取り込み，細胞シグナル伝達，抗真菌薬の作用酒井 香奈江特命助教

分子微生物学

中村 泰之

特命助教

合成生物工学，遺伝子工学，バイオセンサー，酵母

冨永 将大

特命助教

合成生物学，進化分子工学■研究成果の概要
酵母の遺伝子スイッチを人工的に作りだす新たな手法を開発した論文が英国科学誌 Nature
Communications に掲載されました。また，タンパク質生産に優れたピキア酵母において Onestep で複数 DNA をアセンブルする手法を開発した論文が米国科学誌 ACS Synthetic Biologyに掲載されました。また，科学技術振興機構（JST）「戦略的創造研究推進事業 CREST（ミニ型 CREST）」に採択されました。

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＜CO2 直接変換研究グループ＞
シアノバクテリアや光合成細菌，微細藻類(緑藻，珪藻，ハプト藻，ユーグレナ等)，植物
培養細胞等の光合成生物を利用して，バイオ燃料やバイオベース化学品，機能性物質を生産する研究を行っています。
代謝経路を改変する代謝工学に加え，炭酸固定能を促進する技術開発にも取り組み，低炭素化に直結するスマートセル構築技術の開発を進めています。
氏名

職名

専門分野

蓮沼 誠久

教授

代謝工学，代謝分析化学，遺伝子工学，細胞生理学，
バイオプロセス工学

秀瀬 涼太

特命准教授

応用微生物学，応用生物化学

加藤 悠一

特命助教

応用微生物学，代謝工学，遺伝子工学，微細藻類，放射線生物学■研究成果の概要
オーピーバイオファクトリー社との共同によりハプト藻 Pavlova sp.を用いたフコキサン
チンの屋外培養生産に成功した論文のイラストが Marine Biotechnology 誌の表紙に選出されました。また，微細藻類において炭素リソースが炭水化物から油脂に再分配される仕組みを解明した論文が英国科学誌 Communications Biology に掲載されました。微細藻類において窒素源が豊富に存在する条件でも油脂を多く蓄積する変異株を育種することに成功した論文が Algal
Research に掲載されました。また， 窒素栄養源がラン藻の代謝に及ぼす影響を解明した論文が Metabolites に掲載されました。

8【バイオロジクス研究部門】
バイオ医薬品研究をベースとした新規モダリティや複雑なペプチド・核酸医薬，ナノ粒子への展開バイオロジクスは，動物細胞などの生命の力を用いて生産する構造が複雑な医薬品で，近年は抗体医薬を代表とするバイオ医薬品が脚光を浴びています。
最近では，同じような方法で，培養，精製，分析し，規制科学の対象になる「改変型の抗体医薬」，「遺伝子治療薬」，細胞治療用の「細胞医薬」に研究の主体が移りつつあり，当部門
では、特に「改変型抗体」と「遺伝子治療用ウイルスベクター」に着目した研究を行っています。さらには，合成品ではあるものの，複雑な構造を持つ点ではバイオロジクスと同様の研究
法が適用できるペプチド医薬やナノ技術+核酸医薬にもアプローチしています。
＜抗体医薬・遺伝子治療・ペプチド医薬研究グループ＞
CHO 細胞によるバイオ医薬品として有用な改変タンパク質の製造プロセス開発やそれに伴うプロセス分析，品質分析方法の研究や最新の抗体医薬の培養・精製の連続化に関する研究を行っています。また，増殖が速いという微生物の利点を活かして，ピキア酵母を用いた低分子抗体やバイオ医薬品の開発及び生産用の宿主開発に取り組んでいます。
タンパク医薬の培養や精製などと同様のプロセス設計が可能な遺伝子治療用ベクターの生産と分析，特に活性本体であるベクターに関する ddPCR や NGS などの核酸分析法を複数検討しています。DNA ウイルスであるアデノ随伴ウイルスやレトロウイルスであるレンチウイ
ルスを研究対象としています。また，ペプチド医薬の製造や分析に関する調査研究も行って
います。
氏名

職名

専門分野

山地 秀樹

教授

生物化学工学，細胞培養工学，バイオプロセス，組換
えタンパク質生産，バイオリアクター

内田 和久

特命教授

バイオ医薬品，遺伝子治療，製造プロセス，バイオロ
ジクス分析法，バイオ人材育成

近藤 昭彦

教授

生物機能・バイオプロセス，応用微生物学，合成生物
工学

石井 純

准教授

合成生物学，代謝工学，ゲノム工学，進化工学，バイオセンサー

伊藤 洋一郎

特命准教授

進化分子工学，合成生物学

中村 泰之

特命助教

合成生物工学，遺伝子工学，バイオセンサー，酵母

片山 健太

特命助教

合成生物学，脂質分子生物学，ゲノム編集，育種学，オルガネラ生物学，植物生理学

佐々木

大介

特命助教

微生物群集解析(水素・メタン発酵，電気培養，微生物
燃料電池，腸内フローラ)，ファインケミカル生産，培
養制御

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■研究成果の概要
昨年に引き続き、複数の PJ で日本医療研究開発機構（AMED）等より外部資金を獲得して研究を展開しています。①遺伝子治療に関係する AMED「再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業（遺伝子治療製造技術開発）」事業では、遺伝子治療用ベクターの核酸解析に関する次世代シークエンサー技術やデジタル PCR 技術を立ち上げ、医薬品の規制に関する国立医薬品食品衛生研究所と連携して、国内の製薬企業向けに関連情報を発信している。②国内のバイオ医薬品の開発・製造にかかわる産学の人材育成を重要な産業上の課題として捉え、アカデミアとして初めて、2020 年 6 月 15 日にアジア太平洋経済協力ライフサイ
エンスイノベーションフォーラム規制調和執行委員会から神戸大学が優良研修センターに認定されており、アジアをはじめとする APEC 域内の医薬品関連の規制当局担当者に対し英語でバイオ医薬品の製造プロセス開発や GMP 査察に関する研修プログラムを提供しました。ただし、コロナ禍であるため、海外からの来訪が困難なため、e-ラーニングや WEB によるワーク
ショップ形式で行いました。また、AMED の「国際競争力のある次世代抗体医薬品製造技術開発／次世代抗体医薬品の実用化に向けた物性・品質評価及び管理手法に関する技術的研究／
次世代抗体医薬品の実用化に向けた品質評価及び管理手法に関する技術的研究」、「新規なバイオ製造法を伴うワクチン等の高度な生産技術に関わる人材育成に資する教育プログラムの作成」といったプロジェクトの中で、次世代抗体(特に ADC 抗体やバイスペシフィック抗体)や mRNA ワクチンの開発・製造・分析に関する座学・実習教材の開発にも着手しました。
AMED「次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業（次世代抗体医薬品の製造基盤
技術開発）」に採択されました。また，タンパク質生産に優れたピキア酵母において Onestep で複数 DNA をアセンブルする手法を開発した論文が米国科学誌 ACS Synthetic Biologyに掲載されました。これらの成果をもとに複数の企業と共同研究を締結しています。
＜ウイルス安全性研究グループ＞
ICH ガイドライン Q5A に基づき，マウス白血病レトロウイルスやマウス微小ウイルスなどを扱う BSL2 レベルのラボを整備して，バイオ医薬品のウイルスクリアランス試験などのウ
イルス安全性評価に関する研究に取り組んでいます。
さらに，次世代シークエンス法とバイオインフォマティクスを用いて，バイオ医薬品や遺伝子治療製品、そして，細胞医薬などの再生医療分野において，新規のウイルスの品質評価手法の確立を行っており，国際的なコンソーシアムの中で情報発信をして，次のガイドライン作成につなげる研究に取り組んでいます。
氏名

職名

専門分野

内田 和久

特命教授

バイオ医薬品，遺伝子治療，製造プロセス，バイオロ
ジクス分析法，バイオ人材育成

遊佐 敬介

特命教授

バイオ医薬品，細胞加工製品，遺伝子治療用製品のウイルス安全性，レギュラトリーサイエンス■研究成果の概要
本分野でも、昨年に引き続き、AMED より外部資金を獲得して研究を展開している。特にICHQ5A ガイドラインの改定にも関連する「次世代シークエンス法とバイオインフォマティク
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スを用いて，バイオ医薬品や細胞治療製品のウイルスの品質評価手法の確立を行っており，
国際的なコンソーシアム」の中では、米国 FDA がリードし、複数の欧米製薬、分析機器企業が参画する状況で、MIT と神戸大学のみがアカデミアとして参画し、企業の都合にとらわれないデータの提供を積極的に行っています。特にシークエンスの方法論の進化が著しい中、その動きにも対応し、Long-read シークエンスに関してもコンソーシアム内でもデータを出すことに貢献しています。今年度「細胞加工製品における次世代シークエンサーを用いたウ
イルス安全性実現のための多施設国際共同研究」が最終年度を迎えましたが、事業の重要性から事業継続を計画しています。また、査読論文も複数掲載されていています。
＜医療用ナノ粒子・核酸医薬研究グループ＞
ナノ粒子を用いてより多くの抗がん剤などを腫瘍に効率的に輸送し，治療効果向上と副作用の軽減を狙う薬物送達システム(DDS)の試みがなされています。
抗がん剤のほか，遺伝子発現を制御する核酸をナノ粒子内に内包した「核酸医薬」の開発も行われています。
また，内包する核酸医薬の合成法に関して大量生産によるコスト削減や優れた品質の維持などの研究・調査を行っています。さらには，金属系複合ナノ粒子を用いたがん診断のためのイメージング技術の開発も行っています。
氏名

職名

専門分野

荻野 千秋

教授

バイオマス前処理，代謝工学，バイオプロセス■研究成果の概要
本年度は、新規な食品成分によってナノ粒子をコーティングする技術を確立した。これまでは石油由来の高分子を分散剤として利用してきたが、食品成分へと置換できたことから、より生体親和性が高い粒子へとなったと考える。食品成分を表面修飾材として利用し、培地
成分中においても、約 100nm の粒形を維持可能な技術を確立した。次年度は、動物細胞を用いた取込み率の変化確認や、動物モデルを用いた送達実験を行う計画である。

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【機能性食品素材・アグロバイオ研究部門】
農場から体内までを網羅した食の安全・安心科学の創成
異常気候による農畜水産物の生産性低減や「生活習慣病」の増加が深刻な社会問題となっている実情に鑑み，これらの問題を解消・予防するためにさまざまな先端研究を展開しています。農畜水産物とその加工食品素材のミクロからマクロレベルの多岐なる動態を十分に考慮に入れて，次の３つの研究グループを設置し，画期的な農産物の生産技術や真にヒトに実行する
機能性食品の開発を目指して研究に取り組んでいます。
＜アグロバイオ研究グループ＞
シロイヌナズナや葉物を用いて植物バイオマス増産に役立つ新規の植物活性化物質，ストレス耐性向上剤の探索と分子機構の解明，オルガネラ機能の植物生理学的な解析，イネやコムギで「食」資源としてだけでなくバイオリファイナリー資源としても活用できる新系統の開発等を農学，理学，工学研究科との連携で行っています。
氏名

職名

専門分野

金丸 研吾

准教授

葉緑体，レトログレードシグナリング，５－アミノレ
ブリン酸

山崎 将紀

准教授

イネを含む穀物の遺伝育種学

宇野 雄一

准教授

園芸学，植物分子生物学

田岡 健一郎

特命准教授

ゲノム編集、植物分子生物学、開花制御

藤倉 潮

特命助教

ゲノム編集，植物生理学，発生遺伝学，細胞培養工学，
分子遺伝学

HUNZIKER

特命助手

植物分子科学

Johan Francois
Jean■研究成果の概要
金丸らの研究グループは、植物に広範なストレス耐性と成長促進効果をもたらす 5-アミノレブリン酸のレトログレードシグナリング機能を検証するために非代謝性の類似体を使った網羅的遺伝子発現解析との比較を行い、どちらの物質でも発現が顕著に昂進あるいは抑制する遺伝子を同定しました。そのなかには気孔開閉、塩ストレス応答、転写制御、など 5−ALAの生理効果として知られているが分子機構が不明なものが含まれており、分子遺伝学、生化学、細胞生物学的検証を進めています。
宇野らは、レタスのストレス耐性改変を目的として、転写制御因子の過剰発現体を作出した。形質転換体の各種ストレスに対する応答性を評価し、デハイドリンなどの遺伝子群が上方制御されることを明らかにしました。また、アレルギー軽減型イチゴの育成に向けてRNAi によるメジャーアレルゲン遺伝子の抑制発現体の作出に取り組み、候補となる形質転換体を得ました。現在は作出系統を用いて目的とするタンパク質の含有量を評価しています。

12山崎らは、将来の食料増産と脱化石資源化に向けて、イネ新品種の利用やそのバイオマス
からのバイオ製品（化学物質、素材、燃料）生産がその解決手段の一つと考えています。そこで、農業生産は同時にエネルギーも消費するため、光合成により二酸化炭素を同化した植物由来のバイオ製品生産と食料増産の両立を目指し、バイオ製品生産特性（稲わら重やデン
プン量）とコメ収量性や玄米品質・食味について、選抜と遺伝的固定を重ねて有望系統が完成しました。今後、その特性調査や栽培技術の確立を行い、調査を重ねていきます。また白鶴酒造と酒米品種「山田錦」と「白鶴錦」の全ゲノム配列を明らかにし、その違いや来歴ならびに一般食用米との差異を示しました。
また田岡・藤倉・HUNZIKER らは従来の機能破壊型ゲノム編集ツールとは異なり標的遺伝
子の半合理的人工進化を促す新奇のゲノム編集技術の確立を進めています。これは標的遺伝
子領域を中心に幅広く変異を誘導する技術であり、現在は作出したゲノム編集植物を評価中です。また既存のゲノム編集技術を用いた分子育種の実用化、特にレタスを中心とした野菜の高付加価値化も進めています。
＜機能性食品素材腸内動態研究グループ＞
ヒト腸上皮由来培養細胞と免疫担当細胞の２層で構成される小腸モデル，および単槽連続嫌気培養によるヒト腸内細菌叢モデルを構築し，これらを用いてヒト介入試験に先立つ食品
素材のヒトでの機能性を効率よくプレ評価することを本学農学研究科の食の安全・安心科学センターおよび医学部消化器内科等と連携して行っています。
氏名

職名

専門分野

白井 康仁

教授

生化学，情報伝達学

水野 雅史

教授

免疫賦活，高分子多糖，活性酸素，抗腫瘍性，腸管免疫

福田 伊津子助教

食品科学，食品機能学

佐々木

特命助教

微生物群集解析(水素・メタン発酵，電気培養，微生物

大介

燃料電池，腸内フローラ)，ファインケミカル生産■研究成果の概要
腸内細菌グループは、in vitro 系ヒト腸内細菌叢モデルである Kobe University Human
Intestinal Microbiota Model (KUHIMM)よりも安価に行え、統計学的に信頼の高い成績が得られる小型・静置型のヒト腸内細菌叢モデル KUHIMM in Bottle (KUHIMMiB) を用いて、ヒト
糞便よりヒアルロン酸分解菌を同定しました。また、KUHIMMiB の問題点をさらに改良するた
めに、嫌気チャンバーを用いる KUHIMM in Chamber の培養条件検討に入りました。
また水野らは、フコイダンと同時に摂取することでアレルギー抑制効果を増強させる食品を探索しました。その結果、野菜類ではネギおよびタマネギに、藻類ではノリからの抽出物に増強効果が認められました。そこで活性が認められた野菜とそうでない野菜類中の各ポリフェノール類を比較したところ、ケルセチンやケンフェロールなどのフラボノール類が見出され、それらを豊富に含んでいるブロッコリーやオクラが列挙されました。
＜機能性食品素材体内動態研究グループ＞
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生活習慣病予防の観点から，多面的に食品成分の機能性と安全性を培養細胞，動物実験，
ヒト介入試験で評価するとともに，関与成分の体内動態解析も実施します。
さらに，農畜水産物の加工による有効性の評価も実施することで，特定保健用食品や機能性表示食品の開発に繋げる研究を行ってまいります。
氏名

職名

専門分野

芦田 均

教授

食品機能学，栄養化学，高血糖予防，肥満予防，環境
汚染物質の作用軽減

上曽山

博

橋本 堂史

教授

動物，栄養，脂質代謝，筋肉代謝，摂食調節准教授

食品化学，栄養化学，食品機能学，分子栄養学，生化学，細胞機能調節物質，薬物代謝学，熱帯医学

本田 和久

准教授

食欲，脂質代謝

山下 陽子

准教授

食品成分の生活習慣病予防改善効果とその作用機構解明■研究成果の概要
芦田と山下らは、ハーブや食用植物に含まれるペクトリナリンとそのアグリコンであるペ
クトナリンゲニンの直接的な抗酸化作用は知られているが、抗酸化酵素を介した間接的抗酸化作用について研究しました。その結果、ペクトナリンゲニンは Nrf2経路を介して抗酸化酵素を誘導することを HepG2細胞とマウス肝臓で見出しました。また、マウスでは経口投与したペクトナリンゲニンが代謝変換を受けずにアグリコンとして体内に取り込まれることも見出しました。次に、昨年度構築した腸管ホルモンである GLP-1の ELISA を用いて、紅茶ポリフェノールである難吸収性のテアフラビンが GLP-1分泌を促進することを培養 L 細胞で見出しました。さらに、クロダイズポリフェノールの摂取による非アルコール性脂肪肝の予防効
果を3つのモデル動物で検証することに成功しました。
橋本らは、これまでに遊離アミノ酸である L-オルニチンをマウス肝由来 Hepa1c1c 細胞またはヒト肝由来 HepG2 細胞に処理することで、アンモニア誘導性の細胞死を予防することを明らかにしてきました。本年度は L-オルニチンの処理が、細胞内の L-オルニチン量を増加させるだけでなく、細胞内アルギニン量の増加および培養液中の尿素量の上昇を誘導することを見出しました。つまり、尿素回路を亢進することにより有害なアンモニアを無毒な尿素に代謝し、アンモニアの細胞毒性を抑制することを明らかにしました。
また、上曽山らのグループは、あずきタンパク質について研究し、その供与が、消化管において産生されるあずきタンパク質分解物に含まれるある種のペプチドによるマウスの消化管からの胆汁酸の吸収抑制に基づき肝臓のコレステロール代謝を改善すること、及び肝臓に直接作用して、コレステロール合成系を抑制する可能性を示唆しました。

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【化学・プロセス研究部門】
化学プロセスとバイオプロセスの融合による新しいバイオプロセスの確立
物質生産を最適化する化学プロセス及びバイオプロセスに取り組んでいます。
具体的には，化学プロセスにおいてはバイオマスの熱・化学変換による高付加価値成分の選択的成分変換を目指します。
バイオプロセスにおいては，微生物の発酵に必要とされる化学工学的要素技術である混合特性や物質移動の解析を，実験と理論の両面から推進します。
また，発酵産物の精製に必要とされる膜分離技術に関しても検討を行います。
そして，最終的にはこれらの要素技術を統合化し，シームレスなバイオリファイナリープロ
セス構築を目指します。
＜バイオマス前処理・成分分離研究グループ＞
セルロース系バイオマスは，複雑で強固な構造を有しているため，微生物発酵の原料とす
るには，物理的・化学的に前処理した後に，少量の酵素で液化する必要があります。
本グループでは水熱処理法，アルカリ処理法，イオン液体処理等の各種前処理法を開発してきました。これらの実績をもとに，バイオマスの種類に依存した最適な前処理法を検討します。バイオマスの構造解析も進めます。
氏名

職名

専門分野

荻野 千秋

教授

バイオマス前処理，代謝工学，バイオプロセス

西野 孝

教授

高分子構造，高分子物性，高分子薄膜・表面，環境関
連高分子

谷屋 啓太

助教

触媒反応工学，化学工学■研究成果の概要
ブタノール成分分離を発展的に拡大し、様々なバイオマスに適用可能としました。そして、前処理されたバイオマスを用いて、大型前処理装置を用いて、効率的な糖化処理を可能としました。この内容に関しては、NEDO の先導研究に申請・採択され、令和３年度より本格研究へと移行する事が決定しました。
＜化学プロセス研究グループ＞
バイオマスの有効利用には生物学的変換の外に，熱化学的な変換が考えられております。
特にバイオマス中のリグニン成分の有効利用には，生物変換に限定しない広い範囲の技術の探索が求められます。
本グループでは，バイオマス前処理チームと連携して，バイオマスの特性を評価しながら，その成分分離や，リグニン成分の有効利用に向けた熱的変換を目指します。特に水素還元などの技術をベースにバイオオイルの効率的生産に関する研究を推進します。更には，触媒による糖類の化学変換による新しい価値創造も目指します。
氏名
林

昌彦

職名

専門分野

教授

有機化学，有機合成化学，触媒化学
15

森

敦紀

教授

有機合成化学，有機金属化学，有機材料科学，高分子
科学

西山 覚

教授

触媒反応工学

谷屋 啓太

助教

触媒反応工学，化学工学■研究成果の概要
バイオマス前処理後、水溶液画分にキシロースが溶出する事が明らかとなっています。このキシロース成分を用いて、熱反応によってベンゼンやトルエンといった石油成分へと変換するための熱反応を確立しました。令和３年度はこの研究は、日本触媒・出光興産との共同研究であり、熱反応に適した金属触媒の組成比に関して明らかにすることができました。
＜バイオプロセス研究グループ＞
バイオマス前処理物から有用物質をバイオ生産する際のプロセスの検討，スケールアップの検討を行います。バイオマス前処理物にはリグニンや発酵阻害物が含まれ，セルロース画分が固体化していることがあります。攪拌，発酵制御を含め，実用化に適したバイオリアク
ターの開発に取り組みます。
一方で，油脂からの酵素法による燃料生産に関しても，実バイオマスを念頭に置いた効率的バイオプロセスの開発を進めていきます。
氏名

職名

専門分野

大村 直人

教授

移動現象学，プロセス工学

勝田 知尚

准教授

生物化学工学荻野 千秋

教授

バイオマス前処理，代謝工学，バイオプロセス■研究成果の概要
撹拌翼の選定やデザインは微生物の培養において、せん断応力などの影響を与えるために、非常に重要です。令和３年度は令和２年度に引き続き、糸状菌、および酵母において、様々な撹拌翼を用いて物質生産に与える影響を評価しました。この研究は、大関酒造、高砂
香料工業、神鋼環境ソリューション、住友重機械プロセス機器との共同研究であり、令和４
年度は競争的資金の獲得に向けて実施していく計画です。
＜膜分離研究グループ＞
最終製品を得るためには，バイオリアクターで生産された有用物質を低コストかつシンプ
ルなプロセスで分離精製を行う必要があります。
本グループでは神戸大学独自の「膜分離」技術を用い，微生物と培養液の分離および目的物質の培養液から分離精製における革新的な技術を提供します。本グループが有する多くの知見をもとに，バイオプロダクションの有効な膜分離精製技術の開発が可能です。目的可能物の分離機能や透過特性を有する膜をテーラーメイドに作製するバイオプロセスに資する「統合的膜工学」の確立を目指します。

16

氏名

職名

専門分野

中川 敬三

准教授

ナノ材料工学，膜分離工学，触媒反応工学，エネルギ
ー有効利用技術，化学工学

神尾 英治

准教授

分離工学，化学工学，反応工学

荻野 千秋

教授

バイオマス前処理，代謝工学，バイオプロセス■研究成果の概要
令和３年度は、膜分離技術を用いて甜菜廃糖蜜の膜濃縮が可能かどうか、そして微生物発酵に適しているか同課の検討を行いました。更には、揮発性を有する標的化合物の発酵生産
後濃縮に関しても検討を行っており、令和３年度はバイオリファイナリーセンター内に大型膜分離装置を導入し、アルコールの濃縮実験を行いました。令和４年度は令和３年度の実績に基づいて、継続的に実証実験を行う計画です。

17

【先端プラットフォーム技術開発部門】
ブレイクスルーを生み出すプラットフォーム技術の開発と提供
未来の生命科学のプラットフォームとなるような基盤技術の開発と，その応用展開によるイ
ノベーションの駆動を目指しています。
バイオの設計図を書き換えるゲノム編集技術など，生命科学の幅広い分野へ波及するような技術の開発を行っています。
＜先端計測研究グループ＞
・液中環境において世界最高の力分解能(10 ピコニュートン)を発揮する原子間力顕微鏡(FMAFM)を駆使してソフトマテリアルと液体が接する界面の力学応答を計測評価する研究を進めています。ソフトマテリアルの表面構造ばかりでなく，これに接する液体の密度分布を可視化する技術をバイオベース材料や潤滑剤の開発へ活かしていきます。
・超高速時間分解蛍光分光法を用いて，光合成色素系の機能評価に取り組んでいます。
・プラスチック表面に存在する微量官能基を水中で定量する方法を開発しています。
・テラヘルツ帯の振動分光測定と量子化学計算をもちいて，分子間相互作用や高分子のゆっくりした振動運動を解析しています。
氏名

職名

専門分野

大西 洋

教授

界面分子科学・先端計測

富永 圭介

教授

溶液化学，分子分光学

丸山 達生

教授

界面工学，ソフトマテリアル，高分子表面，界面機能化，自己組織化，バイオマテリアル

秋本 誠志

准教授

光物理化学，超高速分光法，光合成初期過程■研究成果の概要
人工光合成光触媒が水を分解して水素燃料をつくりだす過程で水中へ放出される酸素分子を 0.1 秒の時間分解能で高速検出する計測法を開発しました。水溶液中における温度応答性
高分子のコイルグロービュル転移における、水の水 素結合の変化を振動分光から明らかにしました。ある種のがん細胞内の pH 環境に応じて自己組織化する薬剤を開発し、これを用いて選択的ながん細胞殺傷に成功しました。様々な光合成色素タンパク質複合体とその超複合体について、構造・機能・エネルギー伝達経路の解明を進めています。
＜ゲノム編集研究グループ＞
・神戸大学で開発された「切らないゲノム編集技術」を中心に，ゲノムをより安全に効率よ
く改変操作する技術群の開発と改良に取り組んでいます。
・世界的な気候変動への対応と持続可能な社会を実現すべく，ゲノム編集技術と細胞培養技
術を組み合わせて，高速かつ安全で高効率な育種技術および植物と微生物による物質生産技術の開発を進めています。
・疾患メカニズムの解明から創薬支援，バイオ医薬品の生産，また遺伝子治療に至るまで，ゲノムを高度に操作する技術の医学分野における応用に取り組んでいます。
18

氏名

職名

専門分野

西田 敬二

教授

合成生物学，ゲノム編集技術，合成進化工学

片山 健太

特命助教

オルガネラ生物学，脂質分子生物学，植物生理学，育種学，ゲノム編集，合成生物学■研究成果の概要
切らないゲノム編集技術である Target-AID について、標的とは異なる部位を編集してしまうオフターゲット効果を大幅に低下させ、なおかつ分子サイズの低減に成功し、ヒト細胞での有効性を示しました。更に分子構造を最適化して効率を高めました。これにより遺伝子治療などの医療応用の可能性が拓けます。
＜ゲノム合成研究グループ＞
合成生物学や代謝工学の実現に不可欠な，デザインされたゲノム DNA を合成する技術の開発を行っています。
神戸大学の独自技術である，枯草菌を用いた長鎖 DNA 合成法の OGAB 法を基盤技術とし，DNA の化学合成から長鎖 DNA の合成・精製までの一連のプロセスの自動化を図ること
で，どのような合成困難な配列を持つ長鎖 DNA でも，低コストで，短期間に，ハイスルー
プットに取得する技術の開発に取り組んでいます。
氏名

職名

専門分野

柘植 謙爾

特命准教授

長鎖 DNA 合成，ゲノムデザイン学，デザイン生命工学■研究成果の概要
大腸菌や酵母などの生産宿主に、一次代謝経路の遺伝子群を連結した長鎖ＤＮＡを導入することにより、有用物質の生産量の向上を迅速に達成できることを示しました。また、合成困難な長鎖ＤＮＡの合成を可能とする遺伝子組換え宿主の開発を行いました。
＜バイオファウンドリー研究グループ＞
代謝経路設計・酵素選定・遺伝子配列設計を行う情報解析技術，ハイスループットな DNA
合成技術・遺伝子組換え技術・ゲノム編集技術，合成生物学技術，メタボローム解析等の先端計測技術を集積したデジタル×バイオ×ロボティクスのプラットフォーム構築を進めています。
Dry(情報技術)と Wet(バイオ技術)の要素技術を最適に組み合わせ，汎用的なスマートセル
構築技術の開発に取り組んでいます。
氏名

職名

専門分野

近藤 昭彦

教授

生物機能・バイオプロセス，応用微生物学，合成生物
工学

蓮沼 誠久

教授

代謝工学，代謝分析化学，遺伝子工学，細胞生理学，
バイオプロセス工学

19

石井 純

准教授

合成生物学，代謝工学，ゲノム工学，進化工学，バイ
オセンサー

柘植 謙爾

特命准教授

長鎖 DNA 合成，ゲノムデザイン学，デザイン生命工学

黒田 修司

特命助手

合成生物学，代謝工学，ゲノム工学, バイオ工学, 自動
形質転換, ハイスループット分析, 酵母, 大腸菌■研究成果の概要
合成生物パーツとして重要な、堅牢かつフレキシブルな遺伝子スイッチを酵母の進化工学によって設計するプラットフォームを確立しました。また薬理作用のあるオピオイドの前駆体の合成について、情報技術の予測に基づく新たな代謝経路を設計することにより実現しま
した。また，タンパク質生産に使用されるピキア酵母用の DNA アセンブル技術を開発しました。これらの成果をもとに，科学技術振興機構（JST）「戦略的創造研究推進事業 CREST（ミニ型 CREST）」および新エネルギー・産業技術総合開発機構（NEDO）「官民による若手研究者発掘支援事業」に採択されました。
＜先端メタボロミクス研究グループ＞
細胞に含まれる代謝物を一斉に分析するメタボローム解析を用いると，細胞の特徴や状態を把握することができます。神戸大学では，メタボローム解析を用いることでバイオプロダ
クションの生産性に関わる代謝物質の特定や，優良細胞の選抜，培養条件の最適化を実現しています。
また，実験の再現性に影響を及ぼす前処理工程を自動化するためのロボティクス，高い SN
比で幅広い分子種への対応が可能な LC-MS/MS 分析技術の開発，CE-TOFMS を用いた代謝ターンオーバー解析技術の開発，GC-MS による代謝フィンガープリンティング，ユーザーフレ
ンドリーなデータ処理技術の開発等にも取り組んでいます。
氏名

職名

専門分野

蓮沼 誠久

教授

代謝工学，代謝分析化学，遺伝子工学，細胞生理学，
バイオプロセス工学

加藤 悠一

特命助教

応用微生物学，代謝工学，遺伝子工学，微細藻類，放射線生物学■研究成果の概要
細胞から代謝物をすばやくかつ再現性良く抽出して測定するには、その前処理作業を自動化することが重要と考えられます。またそれにより同時に多数のサンプルを扱うことも可能となります。このようなメタボローム解析ロボティクスについて、一連の前処理工程をシー
ムレスかつ正確に行う自動前処理システム（サンプリングユニットと抽出ユニットから構成される）の開発に成功し、現在は企業との共同研究開発テーマなどにおいて運用しています。

20

【バイオエコノミー研究部門】
イノベーション創出に関する調査・研究を通じたバイオエコノミー実現への貢献
バイオエコノミーという概念が注目されている。産業のエネルギー源は 1600 年代頃までの木材から，1700 年代半ばには石炭に主役が移り，蒸気機関による第一次産業革命が起こった。続
いて，石油へのシフトに伴い，1800 年代後半から 1900 年代前半にかけての第二次産業革命では，鉄鋼・機械・造船などの重工業や，肥料・化学繊維・医薬品などの化学工業での技術革新が進んだ。1900 年代後半に入り，電子工学の進歩によって第三次産業革命が起こった。現在
は，IoT(Internet of Things)，AI(人工知能)，ビッグデータの活用が産業構造を変化させつつある，第四次産業革命の途上である。
経済成長の負の側面の１つが，化石資源の大量消費による地球環境の悪化である。持続可能な仕組みでの経済成長が現代社会の課題であるが，近年，解決策として生物資源の利用が現実味を帯びてきた。再生可能な生物資源をエネルギー源として化石資源に代替させるだけでな
く，工業製品の素材などに利用することで，化石資源の使用を総合的に減らそうという取り組みである。生物資源とバイオテクノロジーの活用により，経済成長と地球環境対策の両立を図る概念は，その実現に向けたさまざまな研究開発や産業政策，経済活動などを包括し，バイオ
エコノミーと呼ばれている。
OECD(経済協力開発機構)の予測では，2030 年のバイオ市場は GDP の 2.7％(約 180 兆円)に成長し，そのうちの約４割を物づくりに生物資源を活かすインダストリアル・バイオ分野が占めるとされている。予測の背景には，ゲノム(遺伝情報)解析を劇的に効率化した次世代シーケンサーの出現，AI やオートメーション(自動化技術)の急速な発展と，ゲノム編集や DNA 合成な
どの合成生物学の分野での目覚ましい技術革新がある。つまり，近年急速に進歩したデジタル
テクノロジーとバイオテクノロジーの融合が，生命現象を解明し，生物機能の産業への応用を可能にしたことで，第五次産業革命ともいえる時代を迎えつつある。
一方でバイオエコノミーの実現には，これら先端技術だけでは足りない。技術上のブレイク
スルーをイノベーションにつなげ，経済的価値・社会的価値を創出しようとする企業家精神と，経済・経営の視点での戦略が不可欠である。本研究部門は，先端バイオ工学分野におけるイノベーション創出に関する調査・研究を通じて，バイオエコノミーの実現に貢献することを
目指す。
氏名

職名

専門分野

山本一彦

教授

アントレプレナー・ファイナンス，ストラテジック・
アントレプレナーシップ

忽那憲治

教授

アントレプレナー・ファイナンス，ストラテジック・
アントレプレナーシップ■研究成果の概要
先端バイオ工学分野におけるイノベーション創出に関する最新事例の調査・研究を継続的に行い、以下のセミナー、勉強会等において、研究成果に基づく講演･発表を行った。

21

【招待講演・パネルディスカッション等への登壇】
1． 東京大学公共政策大学院「バイオエコノミー勉強会」

講演（R3.8）

2． 国立国会図書館「科学技術に関する調査プロジェクト」シンポジウム
3． 独立行政法人中小企業基盤整備機構

講演（R3.9）

SDGs バイオコミュニティ人材交流セミナー（R3.11）
4． 関西経済同友会未来ビジネス委員会

講演（R3.12）

5． バイオコミュニティ関西（BiocK）バイオ戦略トークセミナー

22

講演（R3.12）

講演研究業績等【先端バイオ工学研究センター研究業績一覧】
項目

主配置：7 名配置：25 名

協力：20 名

合計：54 名

論文発表

35(1)

104(23)93(12)

163(34)

うち国際共著論文

12

26

21

37

うち企業共著論文

4

6

21

学術発表

4

41

25

69

著書

9

11

5

14

国際招待講演

4

30

8

12

国際学会発表

3

24

20

39

国内招待講演

16

49

28

37

国内学会発表

37

67

199

237

特許（出願）

15

18

12

47

特許（登録）

6

15

2

83

国補助金事業

14

13

28

58

公的機関の研究助成

0

12

6

29

財団などの研究助成

0

2

8

6

民間企業共同研究

40

30

28

73

奨学寄附金

4

5

16

24

受賞・表彰

2

7

9

15

プレス発表・新聞掲載等

20

3

0

16

招聘外国人研究者

0その他の特記事項

2

教員区分※論文欄の（000）内は査読なし論文数。

※企業共著論文には，組合等との共著論文を含む。
※主配置教員の研究業績の詳細は次頁以降に記載。
※主配置教員以外の業績については重複は除外していない。

2310

１．論文発表（国際学術誌掲載論文，企業共著論文）
1. Yamaguchi, A., Maeshige, N., Ma, X., Uemura, M., Noguchi, H., Matsuda, M., Nishimura, Y.,
Hasunuma, T., Kondo, H., Fujino, H. Pulsed-ultrasound irradiation induces the production of itaconate
and attenuates inflammatory responses in macrophages, Journal of Inflammation Research, in press
2. Bamba, T., Guirimand, G., Kondo, A., Hasunuma, T. Enzyme display technology for lignocellulosic
biomass valorization by yeast cell factories, Current Opinion in Green and Sustainable Chemistry,
in press【国際】
3. Vavricka, CJ., Takahashi, S., Watanabe, N., Takenaka, M., Matsuda, M., Yoshida, T., Suzuki, R.,
Kiyota, H., Li, J., Minami, H., Ishii, J., Tsuge, K., Araki, M., Kondo, A., Hasunuma, T. (2022) Machinelearning discovery of missing links that mediate alternative branches to plant alkaloids, Nature
Communications, 13, 1405【国際】
4. Li, YH., Zhang, P., Zhu, DY., Yao, B., Hasunuma, T., Kondo, A., Zhao, XQ. (2022/01) Efficient
preparation of soluble inducer for cellulase production and saccharification of corn stover using inhouse generated crude enzymes, Biochemical Engineering Journal, 178, 108296【国際】
5. Chen, HQ., Zhang, MM., Xing, Q., Ye, PL., Hasunuma, T., Kondo, A., Zhao, XQ. (2022) Improved
ethanol fermentation by promoter replacement of zinc responsive genes IPL1, PRP6 and RTC1 in
Saccharomyces cerevisiae, Biochemical Engineering Journal, 178, 108274【国際】
6. Kobayashi, Y., Inokuma, K., Matsuda, M., Kondo, A., Hasunuma, T. (2022) Resveratrol production ofa recombinant Scheffersomyces stipitis strain from molasses, Biotechnology Notes, 3, 1-7
7. Kato, Y., Inabe, K., Hidese, R., Kondo, A., Hasunuma, T. (2022/01) Metabolomics-based engineeringfor biofuel and bio-based chemical production in microalgae and cyanobacteria: A review, Bioresource
Technology, 344(A): 126196
8. Ismail, KSK., Matano, Y., Sakihama, Y., Inokuma, K., Nambu, Y., Hasunuma, T., Kondo, A. (2022)
Pretreatment of extruded Napier grass by hydrothermal process with dilute sulfuric acid andfermentation using a cellulose-hydrolyzing and xylose-assimilating yeast for ethanol production,
Bioresource Technology, 343, 126071【国際】
9. Kawaguchi, H., Hasunuma, T., Ohnishi, Y., Sazuka, T., Kondo, A., Ogino, C. (2021) Enhanced
production of γ-amino acid 3-amino-4-hydroxybenzoic acid by recombinant Corynebacterium
glutamicum under oxygen limitation, Microbial Cell Factories, 20: 228
10. Oyama, T., Kato, Y., Satoh, K., Oono, Y., Matsuda, M., Hasunuma, T.*, Kondo, A. (2021)
Development of mutant microalgae that accumulate lipids under nitrate-replete conditions, Algal
Research, 60, 102544
11. Inabe, K., Miichi, A., Matsuda, M., Yoshida, T., Kato, Y., Hidese, R., Kondo, A., Hasunuma, T. (2021)
Nitrogen availability affects the metabolic profile in Cyanobacteria, Metabolites, 11, 867
12. Kobayashi, Y., Inokuma, K., Matsuda, M., Kondo, A., Hasunuma, T. (2021/12) Resveratrol production
from several types of saccharide sources by a recombinant Scheffersomyces stipitis strain, MetabolicEngineering Communications, 13: e00188
13. Zhang, C., Hasunuma, T., Lam, SS., Kondo, A., Ho, SH. (2021/11) Salinity-induced microalgal-based
mariculture wastewater treatment combined with biodiesel production, Bioresource Technology, 340,
125638【国際】
24

14. Cunha, JT. Gomes, DG. Romaní, A., Inokuma, K., Hasunuma, T., Kondo, A., Domingues, L. (2021/09)
Cell surface engineering of Saccharomyces cerevisiae for simultaneous valorization of corn cob andcheese whey via ethanol production, Energy Conversion and Management, 243, 114359【国際】
15. Inokuma, K., Kitada, Y., Bamba, T., Kobayashi, Y., Yukawa, T., den Haan, R., van Zyl, W. H., Kondo,
A., Hasunuma, T.* (2021/08) Improving the functionality of surface-engineered yeast cells by altering
the cell wall morphology of the host strain, Applied Microbiology and Biotechnology, 105(14-15):5895-5904【国際】
16. Chen, JH., Kato, Y., Matsuda, M., Chen, CY., Nagarajan, D., Hasunuma, T., Kondo, A., Chang, JS.
(2021/08) Lutein production with Chlorella sorokiniana MB-1-M12 using novel two-stage cultivation
strategies - metabolic analysis and process improvement, Bioresource Technology, 334, 125200【国際】
17. Xu, M., Harmon, J., Yuan, D., Yan, S., Lei, C., Hiramatsu, K., Zhou, Y., Loo, MH., Hasunuma, T.,
Isozaki, A., Goda, K. (2021/06) Morphological indicator for directed evolution of Euglena gracilis witha high heavy metal removal efficiency, Environmental Science and Technology, 55(12): 7880-7889【国際】
18. Isogai, S., Okahashi, N., Asama, R., Nakamura, T., Hasunuma, T., Matsuda, F., Ishii, J., Kondo, A.
(2021/06) Synthetic production of prenylated naringenins in yeast using promiscuous microbial
prenyltransferases, Metabolic Engineering Communications, 12, e00169
19. Ogawa, S., Shimidzu, H., Fukuda, K., Tsunekawa, N., Hirano, T., Sato, F., Yura, K., Hasunuma, T.,Ochi, K., Yamamoto, M., Sakamoto, W., Hashimoto, K., Ogata, H., Kanao, T., Nemoto, M., Inagaki,K., Tamura, T. (2021/05) Multiple mutations in RNA polymerase β-subunit gene rpoB in Streptomyces
incarnatus NRRL8089 enhance production of antiviral antibiotic sinefungin: Modeling rif cluster
region by density functional theory, Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 85(5), 1275-1282
20. Guirimand, G., Kulagina, N., Papon, N., Hasunuma, T.*, Courdavault, V.* (2021/05) Innovative tools
and strategies for optimizing yeast cell factories, Trends in Biotechnology, 39(5), 488-504【国際】
21. Kato, Y., Oyama, T., Inokuma, K., Vavricka, CJ., Matsuda, M., Hidese, R., Satoh, K., Oono, Y., Chang,JS., Hasunuma, T.*, Kondo, A. (2021/04) Enhancing carbohydrate repartitioning into lipid andcarotenoid by disruption of microalgae starch debranching enzyme, Communications Biology, 4: 450【国際】
22. Kashojiya S, Lu Y, Takayama M, Komatsu H, Minh LHT, Nishida K, Shirasawa K, Miura K, Nonaka
S, Masuda JI, Kondo A, Ezura H, Ariizumi T.(2022/01) Modification of tomato breeding traits andplant hormone signaling by target-AID, the genome-editing system inducing efficient nucleotide
substitution. Hortic Res, 19;9:uhab004.
23. Kawaguchi K, Takei-Hoshi R, Yoshikawa I, Nishida K, Kobayashi M, Kusano M, Lu Y, Ariizumi T,
Ezura H, Otagaki S, Matsumoto S, Shiratake K.(2021/11) Functional disruption of cell wall invertase
inhibitor by genome editing increases sugar content of tomato fruit without decrease fruit weight. Sci
Rep, 2;11(1):21534.
24. Nishida K, Kondo A.(2021/08) Transversion Expansion of Base Editing. CRISPR J, 4(4):462-463.
25. Yuan S, Kawasaki S, Abdellatif IMY, Nishida K, Kondo A, Ariizumi T, Ezura H, Miura K.(2021/04)
Efficient base editing in tomato using a highly expressed transient system. Plant Cell Rep, 40(4):66725

676.
26. Ito Y, Ishigami M, Terai G, Nakamura Y, Hashiba N, Nishi T, Nakazawa H, Hasunuma T, Asai K,
Umetsu M, Ishii J*, Kondo A*. (2022) A streamlined strain engineering workflow with genome-wide
screening detects enhanced protein secretion in Komagataella phaffii. Commun Biol in press【企業】
27. Ito Y, Ishigami M, Hashiba N, Nakamura Y, Terai G, Hasunuma T, Ishii J*, Kondo A*. (2022) Avoiding
entry into intracellular protein degradation pathways by signal mutations increases protein secretion in
Pichia pastoris. Microb Biotechnol in press【企業】
28. Tominaga M, Miyazaki K, Hataya S, Mitsui Y, Kuroda S, Kondo A, Ishii J*. (2022) Enhanced squalene
production by modulation of pathways consuming squalene and its precursor. J. Biosci. Bioeng. inpress
29. Tominaga M, Kondo A, Ishii J*. (2022/04) Engineering of synthetic transcriptional switches in yeast.
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30. Toya Y, Hirono-Hara Y, Hirayama H, Kamata K, Tanaka R, Sano M, Kitamura S, Otsuka K, AbeYoshizumi R, Tsunoda SP, Kikukawa H, Kandori H, Shimizu H, Matsuda F, Ishii J, Hara KY.
(2022/03) Optogenetic reprogramming of carbon metabolism using light-powering microbial proton
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31. Morita K, Seike T, Ishii J, Matsuda F, Shimizu H. (2022/03) Improvement of 2,3-butanediol production
by dCas9 gene expression system in Saccharomyces cerevisiae. J. Biosci. Bioeng, 133(3):208-212
32. Nishi T, Ito Y, Nakamura Y, Yamaji T, Hashiba N, Tamai M, Yasohara Y, Ishii J*, Kondo A*. (2022/02)
One-step in vivo assembly of multiple DNA fragments and genomic integration in Komagataella phaffii.
ACS Synth Biol, 11(2): 644-654【企業】
33. Katsurada K, Tominaga M, Kaishima M, Kato H, Matsuno T, Ogino C, Kondo A, Ishii J*, Takayama
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immunosorbents. J Gen Appl Microbiol, 67(6): 265-268
34. Yoshida E*, Kojima M, Suzuki M, Matsuda F*, Shimbo K, Onuki A, Nishio Y, Usuda Y, Kondo A,
Ishii J*. (2021/11) Increased carvone production in Escherichia coli by balancing limonene conversion
enzyme expression via targeted quantification concatamer proteome analysis. Sci. Rep., 11(1): 22126【企業】
35. Shoji S, Yamaji T, Makino H, Ishii J, Kondo A. (2021/05) Metabolic design for selective productionof nicotinamide mononucleotide from glucose and nicotinamide. Metab Eng,65: 167-177

２．学術発表（国内学術誌総説，紀要，報告書など）
1. 猪熊健太郎，蓮沼誠久，進化する酵母細胞表層工学 -バイオインターフェイスの高度利用に向けた技術戦略-，オレオサイエンス, 22(3), 99-105 (2022/03)
2. 加藤悠一，秀瀬涼太，蓮沼誠久，光合成メタボロミクスの物質生産への応用. 生物工学会誌
特集 藻類バイオマス利用のための新しい生物工学, 光合成メタボロミクスの物質生産への応用，生物工学会誌，99(9)，456-460 (2021/09)
3. 蓮沼誠久，新井宗仁，特集 藻類バイオマス利用のための新しい生物工学，生物工学会誌，
99(8)，403 (2021/08)
4. 片山健太，西田敬二，CRISPR 最新ツールボックス「塩基編集技術の最前線」 洋土社，202126

年 5 月 (2021 年 5 月号，第 39 巻，第 5 号，1201-1207)

３．著書
1. 猪熊健太郎，蓮沼誠久，「クリーンエネルギーの技術と市場 2022 第 9 章

バイオマス燃料生産の技術動向」，シーエムシー出版，84-91 (2022/02)
2. 蓮沼誠久，「醸造の辞典 第 2 章 醸造の科学 最近の育種技術」，朝倉書店，150-151 (2021/06)
3. 蓮沼誠久，「バイオリアクターのスケールアップと物質生産事例集, 第 11 章 スマートセルの動向と効率的創製に向けた AI 活用 第 1 節 国内におけるスマートセルの動向」，481-489，
技術情報協会 (2021/04)
4. Kato, Y., Hasunuma, T. Metabolic Engineering for Carotenoid Production Using Eukaryotic
Microalgae and Prokaryotic Cyanobacteria, Carotenoids: Biosynthetic and Biofunctional Approaches,
Springer, 121-135 (2021/04)
5. 蓮沼誠久，「メタボロミクス 実践ガイド応用・展望編 Ⅰ. 応用研究

代謝工学分野へのメタ

ボロミクスの応用」，羊土社，302-304 (2021/04)
6. 片山健太，西田敬二，「塩基編集技術の最前線」，実験医学 2021 年 5 月号 Vol.39 No.8
7. 中村泰之，近藤昭彦，石井純，「酵母細胞を用いた G 蛋白質共役型受容体リガンド検出シス
テムの開発とメタボライトセンサへの応用」 Precision Medicine，2021 年 12 月（第 4 巻，第13 号，60-65）
8. 中村泰之，近藤昭彦，石井純，「酵母細胞を用いた G 蛋白質共役型受容体リガンド検出シス
テムの開発とメタボライトセンサへの応用」 アグリバイオ，2021 年 7 月（第 5 巻，第 7 号，58-63）
9. 中村泰之，近藤昭彦，石井純，「酵母シグナル伝達経路を利用したリガンド検出システムの開発とメタボライトセンサへの応用」 月刊細胞，2021 年 5 月（第 53 巻，第 5 号，37-40）

４．国際招待講演
1. Hasunuma, T., Metabolomics-directed synthetic bioproduction of alkaloid and challenge to establish
high-throughput analysis system, Metabolic Engineering 14, Hawaii/Online, 2021/7/15
2. Development and application of base editing technologies, Keiji Nishida, Future Trends and Emerging
Technologies in Synthetic Biology Connecting Australia and Japan through science and technology,
2022/3/16, オンライン, 口頭
3. Development of base editing technology for plant molecular biology and breeding, Keiji Nishida, IPSRInternational Plant Web Forum 2021, 2021/9/6, オンライン, 口頭
4. Development and improvement of Target-AID base editing technology and its applications, Keiji
Nishida, KSBB 2021 annual meeting, 2021/4/15, 国際オンライン, 口頭

５．国際学会発表
1. Kawaguchi, H., Hasunuma, T., Ohnishi, Y., Sazuka, T., Chiaki Ogino, C., Metabolome analysis-based
design of a metabolic pathway in Corynebacterium glutamicum for 3-amino-4-hydroxybenzoic acidproduction under oxygen limitation, Metabolic Engineering 14, Hawaii/Online, 2021.7
2. Xu, M., Harmon, J., Hasunuma, T., Isozaki, A., Goda, K., AI on a chip for identifying microalgal cells
27with high heavy metal removal efficiency, 2021 21st International Conference on Solid-State Sensors,
Actuators and Microsystems (Transducers), 2021.6.20-24.
3. Kondo A, Ito Y, Nakamura Y, Sasaki D, Ishii J. Development of engineering tools for methylotrophic
yeast Pichia pastoris and their applications to small antibody secretory production. The 15th
International Congress on Yeasts (ICY15). 2021, Aug 23–27, Online (University of Natural Resourcesand Life Sciences, Vienna (BOKU))

６．国内招待講演
1. 蓮沼誠久，バイオ DX によるスマートセル開発，化学工学会第 87 年会 異分野合同セッショ
ン データ駆動型研究開発の先端動向，神戸，2022/3/17
2. 蓮沼誠久，バイオ×デジタルの技術融合によるスマートセル創出と低炭素化技術への応用，
第 3 回東京理科大学総合研究院シンポジウム，2021/12/8
3. 蓮沼誠久，バイオ燃料の現状と将来―化石燃料代替の輸送用燃料からバイオものづくりまで―，地球環境と産業化研究会（SGEIS）／第 9 回「脱炭素と省エネビジネス」勉強会，2021/12/8
4. 蓮沼誠久，バイオとデジタルの技術融合によるスマートセルの創出，2021 年電気化学秋季大会シンポジウム／S4.生命科学と電気化学，2021/9/8
5. 西田敬二，「切らないゲノム編集」塩基編集技術の開発と応用，第 2 回ソニーライフサイエ
ンスウェビナー，2022/3/23，オンライン
6. 西田敬二，「切らないゲノム編集」塩基編集技術の開発と応用，先端バイオ工学推進機構「化学・素材・燃料分科会」第 12 回会合，2022/3/17，オンライン
7. 西田敬二，切る？切らない？「ゲノム編集技術」の開発と応用，東京六甲クラブ講演会，2022/1/25，オンライン
8. 西田敬二，「切らないゲノム編集」塩基編集技術の開発と応用，令和 3 年度兵庫県バイオ技術研究会秋の講演会，2021/11/2，オンライン
9. Keiji Nishida，Development and application of base editing technology，ERATO セミナー，
2021/10/5，オンライン
10. 西田敬二，塩基編集技術の開発と高精度化，第 72 回日本細胞生物学会 シンポジウム，
2021/6/31，オンライン
11. 石井純，「代謝工学と合成生物学によるモノづくり微生物の開発」2021 年度膜工学春季講演会・膜工学サロン，2022 年 3 月 29 日，オンライン開催
12. 石井純，「バイオエコノミー社会実現に向けた合成生物学の基盤開発と微生物での物質生産への展開」SONY “Life Science Spring Webinar 2022”，2022 年 3 月 23 日，オンライン開催
13. 石井純，「微生物モノづくりにおける合成生物学と実験自動化:バイオエコノミー社会の実現に向けて」第 12 回スクリーニング学研究会（企業セミナー：テカンジャパン），2021 年 11月 26 日，オンライン開催
14. 石井純，「データ駆動型の次世代微生物進化育種に向けて」バイオ DX の最前線 CREST 「データ駆動型・AI 駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新」キックオフシンポジウム，2021 年 11 月 21-22 日，オンライン開催
15. 石井純，「いっぱいデータを出したいがため微生物の組換え実験を自動化する」Laboratory
Automation 月例勉強会 / 2021.10，2021 年 10 月 30 日，オンライン開催
28

16. 石井純，「酵母における合成生物学のための基盤ツール開発と有用物質生産細胞育種への応用」酵母研究会第 89 回講演会，2021 年 8 月 6 日，オンライン開催

７．国内学会発表
1. 田中謙也，松田真実，白井智量，蓮沼誠久，シアノバクテリアにおける光合成開始時の代謝ダイナミクスの定量的解析，第 63 回植物生理学会，2022/3/22-24
2. 川口秀夫，蓮沼誠久，大西康夫，佐塚隆志，荻野千秋，近藤 昭彦，酸素制限条件におけるコリネ型細菌のアミノ酸代謝についてのメタボローム解析，農芸化学会 2022 年度大会，
2022/3/15-18
3. ヴァヴリッカクリストファー，高橋俊介，渡邉直暉，荒木通啓，近藤昭彦，蓮沼誠久，Machinelearning-based discovery of aryl acetaldehyde producing enzymes for the biosynthesis ofbenzylisoquinoline alkaloids，第 38 回農薬環境科学研究会，2021/10/28
4. 吉田江里菜，伊藤喜龍，加藤悠一，山崎千秋，蓮沼誠久，長期宇宙滞在に向けた微細藻類による水再生の検討，第 73 回日本生物工学会大会，2021/10/27-29
5. 田中謙也，嶋川銀河，草間翔子，松田真実，蓮沼誠久，中西周次，シアノバクテリアにおける NADP(H)の正確定量，第 73 回日本生物工学会大会，2021/10/27-29
6. 奥浜真乃助，番場崇弘，湯川貴弘，雲北 涼太，Christopher Johnavricka Jr.，Gazi Sakir Hossain，Ling Hua，Matthew Wook Chang，蓮沼誠久，近藤昭彦，油性酵母 Yarrowia lipolytica における
Ehrlich 経路工学による短鎖分岐脂肪酸生産，第 73 回日本生物工学会大会，2021/10/27-29
7. 岡本真美，吉田崇伸，堀江征司，荒尾洋平，渡邉淳，蓮沼誠久，LC/MS/MS による微生物中の一次代謝物一斉分析と代謝経路図を用いた可視化による解析，第 15 回メタボロームシン
ポジウム，2021/10/14-15
8. 秀瀬涼太，大林龍胆，加藤悠一，松田真実，蘆田弘樹，近藤昭彦，蓮沼誠久，ラン藻の核酸
分子グアノシン 4-リン酸（ppGpp）の生理的役割と応用，第１回先端バイオ工学研究センタ
ー成果発表会，2021/10/11
9. 番場崇弘，酒井香奈江，秀瀬涼太，柘植謙爾，石井純，蓮沼誠久，近藤昭彦，長鎖プラスミ
ドライブラリーを用いた微生物育種法の開発，第１回先端バイオ工学研究センター成果発表
会，2021/10/11
10. 工藤恒，Christopher J. Vavricka，竹中武蔵，蓮沼誠久，様々なアルデヒドに対応可能なアルカン合成酵素の開発，第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会，2021/10/11
11. 湯川貴弘，中野拓海，近藤昭彦，蓮沼誠久，酵母における鉄代謝工学の開発と新規キシロー
ス代謝経路構築への応用，第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会，2021/10/11
12. 牧野弘暉，稲辺宏輔，秀瀬涼太，蓮沼誠久，海洋性藍藻の代謝工学によるバイオプラスチッ
ク生産，第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会，2021/10/11
13. 宮本駿也，猪熊健太郎，小林優真，蓮沼誠久，近藤昭彦，酵母 Pichia pastoris の細胞表層における異種タンパク質提示および代謝改変による 4-ヒドロキシ安息香酸の合成，第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会，2021/10/11
14. 伏見圭司，秀瀬涼太，小倉一将，工藤恒，竹中武蔵，蓮沼誠久，近藤昭彦，テーラーメイド・
バイオ生産を可能にする α-ケト酸脱炭酸酵素の探索と創出，第１回先端バイオ工学研究セン
ター成果発表会，2021/10/11
29

15. 稲辺宏輔，秀瀬涼太，松本圭司，佐藤俊輔，蓮沼誠久，海洋性ラン藻 Synechococcus sp. PCC
7002 を用いた生分解性プラスチック PHB 合成系の構築，第１回先端バイオ工学研究センタ
ー成果発表会，2021/10/11
16. 雲北涼太，番場崇弘，伊藤洋一郎，蓮沼誠久，近藤昭彦，酵母 Pichia pastoris による高効率な有用芳香族化合物生産プロセスの開発，第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会，
2021/10/11
17. 吉田江里菜，加藤悠一，金本昭彦，蓮沼誠久，網羅的代謝解析に基づく新規ハプト藻 Pavlova
sp.のフコキサンチン高生産技術の開発第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会，
2021/10/11
18. 伊藤喜龍，加藤悠一，蓮沼誠久，海洋性緑藻 Chlamydomonas sp.におけるゲノム編集技術の確立とバイオ燃料生産への応用，第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会，2021/10/11
19. 奥浜真乃助，番場崇弘，湯川貴弘，雲北涼太，Christopher Johnavricka Jr.，Gazi Sakir Hossain，Ling Hua，Matthew Wook Chang，蓮沼誠久，油性酵母 Yarrowia lipolytica における短鎖分岐脂肪酸の高生産化，第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会，2021/10/11
20. 中野拓海，湯川貴弘，蓮沼誠久，近藤昭彦，出芽酵母における鉄代謝工学に基づく鉄硫黄タ
ンパク質を要する代謝経路，第１回先端バイオ工学研究センター成果発表会，2021/10/11
21. 田中謙也，嶋川銀河，田畑裕，草間翔子，蓮沼誠久，中西周次，フェノール抽出によるシア
ノバクテリア細胞内の NADP レドックス状態の定量，
第 12 回日本光合成学会年会，2021/5/2021.
22. 伊藤沙也加，浅間梨々花，杉本美帆，桂田康平，近藤昭彦，石井純，「酵母シグナル伝達機
構を利用したタンパク質間相互作用分子探索および改変体創出」化学工学会第 87 年会，
2022/3/16-18，神戸大学 鶴甲第一キャンパス（オンライン併催）
23. 小林祐摩，佐野海瑚人，弘埜陽子，松田史生，石井純，原清敬，戸谷吉博，清水浩，「ロドプシンによる光駆動プロトンポンプが大腸菌の弱酸耐性に及ぼす影響」化学工学会第 87 年
会，2022/3/16-18，神戸大学 鶴甲第一キャンパス（オンライン併催）
24. 戸谷吉博，佐野海瑚人，田中涼，鎌田健太郎，松田史生，石井純，弘埜陽子，原清敬，清水浩，「ロドプシンを利用した光駆動 ATP 再生によるイソプレノールおよび 3 ヒドロキシプロ
ピオン酸生産の向上」化学工学会第 87 年会，2022/3/16-18，神戸大学 鶴甲第一キャンパス（オンライン併催）
25. 佐藤良樹，川崎真由，弘埜陽子，菊川寛史，中野祥吾，石井純，松田史生，戸谷吉博，伊藤創平，原清敬，「微生物生産能向上を目的とした微生物ロドプシンの改変」日本農芸化学会
2022 年度大会，2022/3/15-18，オンライン開催
26. 伊藤沙也加，浅間梨々花，杉本美帆，桂田康平，近藤昭彦，石井純，「酵母シグナル伝達機
構を利用したタンパク質間相互作用分子探索および改変体創出」日本農芸化学会関西支部第519 回講演会，2022/2/5，オンライン開催
27. 佐野海瑚人，田中涼，鎌田健太郎，松田史生，石井純，弘埜陽子，原清敬，戸谷吉博，清水浩，「光エネルギーを利用した大腸菌におけるメバロン酸のイソプレノールへの変換」第 73回日本生物工学会大会，2021/10/27-29，オンライン開催【第 73 回日本生物工学会大会トピッ
クス賞】
28. 松山千夏，清家泰介，岡橋伸幸，戸谷吉博，弘埜陽子，平山英伸，石井純，清水浩，原清敬，
30

松田史生，「光駆動プロトンポンプを発現させたメバロン酸生産大腸菌の代謝解析」第 73 回
日本生物工学会大会，2021/10/27-29，オンライン開催
29. 藤野紗代，景山裕也，弘埜陽子，菊川寛史，松田史生，戸谷吉博，石井純，原清敬，「Xanthophyllomyces dendrorhous によるレチナールの生産」第 73 回日本生物工学会大会，
2021/10/27-29，オンライン開催
30. 佐藤良樹，川崎真由，弘埜陽子，菊川寛史，中野祥吾，石井純，松田史生，戸谷吉博，伊藤創平，原清敬，「H＋ポンプ能向上を目的とした微生物ロドプシンの改変」第 73 回日本生物工学会大会，2021/10/27-29，オンライン開催
31. 冨永将大，川上和真，小川ひろ，能崎健太，近藤昭彦，石井純，「進化工学による酵母遺伝
子スイッチの開発とテルペノイドセンサへの応用」第 1 回神戸大学先端バイオ工学センター
成果発表会，2021/10/11，オンライン開催（10/11 口頭発表）
32. 中村泰之，佐々木大介，伊藤洋一郎，近藤昭彦，石井純，「ピキア酵母による低分子抗体高生産化」第 1 回神戸大学先端バイオ工学センター成果発表会，2021/10/11，オンライン開催
33. 堀川拓真，伊藤洋一郎，近藤昭彦，石井純，「分泌タンパク質精製のハイスループット自動化」第 1 回神戸大学先端バイオ工学センター成果発表会，2021/10/11，オンライン開催
34. 廣畑凌治，中村泰之，近藤昭彦，石井純，「メタノール資化性酵母 Pichia pastoris による有用化合物生産プロセス開発」第 1 回神戸大学先端バイオ工学センター成果発表会，2021/10/11，
オンライン開催
35. 梶川耕介，伊藤洋一郎，山田健人，南部由美子，西田敬二，近藤昭彦，石井純，「メタノール資化性酵母 Pichia pastoris におけるゲノム編集技術の開発」第 1 回神戸大学先端バイオ工学センター成果発表会，2021/10/11，オンライン開催
36. 白河原拓実，秀瀬涼太，酒井香奈江，冨永将大，近藤昭彦，石井純，「大腸菌における有用物質生産に適した鉄硫黄タンパク質発現系の構築」第 1 回神戸大学先端バイオ工学センター
成果発表会，2021/10/11，オンライン開催
37. 片山健太，寺本潤，田岡健一郎，西田敬二，近藤昭彦，シロイヌナズナにおける超速高効率
塩基編集法. 第 63 回日本植物生理学会年会. 2022/3/22-24，オンライン開催(3/24 発表)

８．特許（出願）
１５件（その他、国内移行手続きを行ったものが１５件）

９．特許（登録）
1. 特許 6883330 号「有機酸の製造方法」，日本，神戸大学，蓮沼誠久
2. 特許 7007658 号「攪拌装置及び前処理装置」，日本，神戸大学・株式会社島津製作所，蓮沼
誠久・虎井彩・松本好弘
3. 特許 6923205 号，11220693 号「標的化した DNA 配列の核酸塩基を特異的に変換する，単子葉植物のゲノム配列の変換方法，及びそれに用いる分子複合体」，日本・米国，神戸大学，
西田敬二・近藤昭彦・島谷善平
4. 特許 7001272 号，3021281 号「ゲノム配列改変技術における変異導入効率の向上方法，及びそれに用いる分子複合体」，日本・カナダ，神戸大学，西田敬二・近藤昭彦・荒添貴之・島谷善平
31

5. 特許 10-2280546 号，11201908782X 号「細胞内在性のＤＮＡ修飾酵素を利用して標的化したＤＮＡの核酸塩基を特異的に変換する，細胞の核酸配列の変換方法，及びそれに用いる分子複合体」，韓国・シンガポール，神戸大学，西田敬二・近藤昭彦・荒添貴之・吉岡伸
6. 特許 ZL2019800037187 号，10-2287880 号，11041169 号「細胞の有する二本鎖 DNA の標的部
位を改変する方法」，中国・韓国・米国，西田敬二

１０．国補助金事業
1. 新型コロナウィルス感染症（COVID-19）に対するワクチン開発．日本医療研究開発機構（AMED）．「新型コロナウィルス感染症（COVID-19）に対する経口ワクチンの開発（代表白川利朗）」．7,800 千円（2021 年度）．分担．
2. 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析シ
ステムの開発．新エネルギー・産業技術総合開発機構（NEDO）．59,765 千円（2021 年度）．
研究開発責任者．
3. ムーンショット型研究開発事業．新エネルギー・産業技術総合開発機構（NEDO）．「電気エネルギーを利用した大気 CO2 を固定するバイオプロセスの研究開発（代表 加藤創一郎）」．
4,830 千円（2021 年度）．分担．
4. 戦略的創造研究推進事業／先端的低炭素化技術開発（ALCA）．科学技術振興機構（JST）．
「ラン藻の発酵代謝工学－光合成を基盤としたコハク酸・乳酸生産（代表 小山内崇）」．
13,000 千円（2021 年度）．分担．
5. 戦略的創造研究推進事業／先端的低炭素化技術開発（ALCA）．科学技術振興機構（JST）．
「亜リン酸を用いたロバスト且つ封じ込めを可能とする微細藻類の培養技術開発（代表 廣田隆一）」．9,750 千円（2021 年度）．分担．
6. 未来社会創造事業（探索加速型）「地球規模課題である低炭素社会の実現」領域／「ゲームチェンジングテクノロジー」による低炭素社会の実現．科学技術振興機構（JST）．「細胞分裂制御技術による物質生産特化型ラン藻の創製と光合成的芳香族生産への応用」．17,420 千円（2021 年度）．代表．
7. ムーンショット型水産研究開発事業．生物系特定産業技術研究支援センター（BRAIN）．「藻類と動物細胞を用いたサーキュラーセルカルチャーによるバイオエコノミカルな培養食糧
生産システム（代表 清水達也）」．3,715 千円（2021 年度）分担．
8. 次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業．「腸内マクロバイオーム制御による次世代創薬技術の開発／課題 1(1)：リバーストランスレーショナル創薬に向けた包括的マイクロバイオーム制御基盤技術開発-マイクロバイオーム創薬エコシステム構築に向けて-」．
9,750 千円．分担．
9. 難治性疾患等実用化研究事業 (R2～R4・国立研究開発法人日本医療研究開発機構) 筋萎縮性側索硬化症（ALS）に対する遺伝子治療法の開発（代表：井上治久）分担、300 万円
10. 脳とこころの研究推進プログラム (R3 ～R5・国立研究開発法人日本医療研究開発機構) 神経
変性疾患の新規遺伝子治療確立に向けた生体内塩基編集による APOE 遺伝子型変換（代表：笹栗弘貴）分担、390 万円
11. 地域イノベーション・エコシステム形成プログラム (H29～R3・文部科学省）バイオ経済を加速する革新技術：ゲノム編集・合成技術の事業化（代表：近藤昭彦）分担、0 円
32

12. 戦略的創造研究推進事業 CREST（ミニ型 CREST）／データ駆動・AI 駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新（バイオ DX）領域，科学技術振興機構（JST）「データ駆動型の次世代微生物進化育種（代表 石井純）」9,000 千円（2021 年度），代表
13. 次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業／国際競争力のある次世代抗体医薬品製造技術開発/次世代抗体医薬品の製造基盤技術開発，日本医療研究開発機構（AMED）「高機能な次世代抗体を‘迅速に’創出・生産する「ロボティクス×デジタル」を基盤とした革新技
術開発（代表 近藤昭彦）」58,500 千円（2021 年度），分担
14. 未来社会創造事業（探索加速型）／地球規模課題である低炭素社会の実現領域，科学技術振興機構（JST）「光駆動 ATP 再生系による Vmax 細胞の創製（代表 原清敬）」13,650 千円（2021 年度），分担

１１．民間企業共同研究
４０件

１２．奨学寄附金
４件

１３．受賞・表彰
1. 蓮沼誠久・西田敬二，令和３年度学長表彰（財務貢献者），2021 年 10 月
2. 石井純，第 73 回日本生物工学会大会トピックス賞

１４．プレス発表・新聞掲載等
1. Research at Kobe，人工知能による酵素の発見:代謝のミッシングリンクを解読して医薬品を製造する，2022/3/25
https://www.kobe-u.ac.jp/research_at_kobe/NEWS/news/2022_03_25_02.html
2. 日経産業新聞，「微生物の受託製造」実現狙う 神戸大学・島津製作所，2022/1/19
https://www.nikkei.com/article/DGXZQOUF1255M0S2A110C2000000/
3. 日本経済新聞，完全自動実験室 革新の起爆剤に，2022/1/18
https://www.nikkei.com/article/DGKKZO79300080X10C22A1TEB000/
4. 日経バイオテク ONLINE，島津と神戸大、スマートセル分野でロボットや AI を活用した実験システムの実証開始，2021/1/13
https://bio.nikkeibp.co.jp/atcl/news/p1/22/01/11/09020/
5. 電波新聞，島津製作所と神戸大学が「スマートセルインダストリー」形成

自律型実験シス

テム「Autonomous Lab」プロトタイプの有用性検証を開始，2021/12/16
https://dempa-digital.com/article/262874
6. YAHOO!JAPAN ニュース，細胞がモノづくりする「スマートセルインダストリー」、島津と神戸大が実証開始，2021/12/13
https://monoist.itmedia.co.jp/mn/articles/2112/13/news061.html
7. 日本経済新聞，島津製作所と神戸大、ロボット対応 LC および LC-MS を含む自律型実験シ
33

ステムの有用性を検証，2021/12/10
https://www.nikkei.com/article/DGXLRSP623557_Q1A211C2000000/
8.

Research at Kobe／島津製作所共同ニュースリリース，世界初のロボット対応 LC と LC-MSを含む「自律型実験システム」を島津製作所と有用性検証，2021/12/10
https://www.kobe-u.ac.jp/research_at_kobe/NEWS/collaborations/2021_12_10_01.html

9. 読売新聞，ゲノム編集トマト、甘さが 3 割アップ...名古屋大など開発・実の大きさ変わらず，
2021/11/10
https://www.yomiuri.co.jp/science/20211110-OYT1T50055/
10. 日経新聞，ゲノム編集でトマト糖度 3 割高く

名古屋大や神戸大， 2021/11/9

https://www.nikkei.com/article/DGXZQOUC098PE0Z01C21A1000000/
11. JST Science Japan，Kobe University and QST develop method of converting carbohydrates to fats
and oils by breeding a new strain of microalgal biofuel，2021/7/1
https://sj.jst.go.jp/news/202107/n0701-01k.html
12. Research at Kobe，Microalgae biofuels: Changing carbohydrates into lipids，2021/5/6
https://www.kobe-u.ac.jp/research_at_kobe_en/NEWS/news/2021_04_30_01.html
13. EurekAlert!，Microalgae biofuels: Changing carbohydrates into lipids
https://eurekalert.org/pub_releases/2021-05/ku-mbc050521.php
14. 科学新聞，微細藻類バイオ燃料を育種

炭水化物を油脂に変換

神戸大と QST が手法開発，

2021/4/30
https://www.fujisan.co.jp/product/1281682524/b/2097809/
15. 東京新聞（群馬県版），藻類でバイオ燃料効率化，2021/4/29
16. Nature Portfolio Chemistry Community，Microalgae biofuel: Transforming carbohydrateinto oil，
2021/4/27
https://chemistrycommunity.nature.com/posts/microalgae-biofuel-transforming-carbohydrate-into-oil
17. 上毛新聞（群馬県版），イオンビームで遺伝子変化 藻類の油脂生産倍増バイオ燃料に応用
期待，2021/04/10
18. 毎日新聞（群馬県版），バイオ燃料成分 藻類の油脂増量，2021/04/10
https://mainichi.jp/articles/20210410/ddl/k10/040/088000c
19. Research at Kobe，微細藻類バイオ燃料：炭水化物を油脂に変換，2021/4/9
https://www.kobe-u.ac.jp/research_at_kobe/NEWS/news/2021_04_09_01.html
20. 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構プレスリリース
物を油脂に変換，2021/4/9
https://www.qst.go.jp/site/press/20210409.html

１５．招聘外国人研究者
新型コロナウイルス感染症の影響により受入れなし。

１６．その他の特記事項
1. 株式会社島津製作所と共同で分析メソッドパッケージを開発
https://www.an.shimadzu.co.jp/aplnotes/lcms/an_01-00209-jp.pdf
34

微細藻類バイオ燃料：炭水化

http://www.egbrc.kobe-u.ac.jp/news/20211029.html
神戸大学と株式会社島津製作所の共同研究の成果が「主要水溶性代謝物 141 成分一斉分析法
による微生物中の代謝物分析と代謝経路への可視化」として公開されました。
2. 第１回先端バイオ工学研究センター研究成果発表会を開催
先端バイオ工学研究センター所属の若手研究者が、関係企業研究者を交えて招互に研究内容を発表し交流を深めることを目的に、10月11日（月）に第１回先端バイオ工学研究セン
ター研究成果発表会を開催しました。当日は、対面とオンラインのハイブリッド形式で開催し、延べ100名以上が参加する盛会となりました。
https://www.kobe-u.ac.jp/NEWS/info/2021_10_22_01.html

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付 録

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付録１
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2021/4/30

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付録２
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口頭
発表者

ポスター
発表者

審査員

その他
参加者

教員

4

1

6

3

14

学生

1

10

0

1

12

学術研究員・ポスドク

0

3

0

1

4

企業

0

0

2

14

16

計

5

14

8

19

46

計

Q. 本発表会では、若手研究者に焦点を当てて開催しましたが、このテーマはいかがでしたか。
非常に良かった

8

良かった

34

普通

4

あまり良くなかった

0

良くなかった

0

計

46

普通
9%

非常に良
かった
17%

良かった
74%

Q. 今後開催を希望するテーマなどがありましたらご記入ください。
・微生物育種・企業の若手研究者も・特にありません。
・分野別に実施。バイオファンドリーと医薬を分けるなど
・フレイルや認知機能に関するもの
・モノ造りに・可能であれば企業の研究者の方の発表も聞きたかったと思いました。
・テーマではありませんが、部門別にポスターやセッションが分かれていると、聞きたい発表を探しやすいように思います。
・AIや機械学習の活用
・しばらく、若手中心が良いと思いました・タンパク質工学、酵素工学分野の研究
Q. 以下の各セッションは、どのくらい有意義だと感じましたか。
非常に有意
義だった

有意義
だった

意義がな 参加しな
かった
かった

口頭発表1

11

34

0

1

ポスター発表1

13

31

1

1

ポスター発表2

14

28

1

3

口頭発表2

10

34

1

1

73

40
30
20
10
0

非常に有意義だった

有意義だった意義がなかった

参加しなかったQ. 開催時間についてお伺いします。
50

短かった

適切で
あった

長かった

口頭発表

8

38

0

30

ポスター発表

10

33

3

20

全体

3

40

3

10

40

0
口頭発表
短かった

ポスター発表全体

適切であった

長かった

Q. ポスター紹介の動画は発表を選択する参考になりましたか。
大変参考になった

7

参考になった26

どちらとも言えない7

あまり参考にならなかった

6

参考にならなかった

0

あまり参考にならなかった
13%

大変参考に
なった
15%

どちらとも言えない
15%

参考になった57%

Q. 発表者とのコミュニケーションについてお伺いします。
十分できた

5

できた

21

どちらとも言えない

9

あまりできなかった

9

できなかった1あまりできなかった20%

できなかった2%

どちらとも言
えない
20%

十分できた
11%

できた
47%

Q. 今回、WebExとSlackを併用しての開催でしたが、この併用についてお伺いします。
大変効果的であった

4

効果的であった

18

どちらとも言えない

15

あまり効果的ではなかった

7

効果的ではなかった2

効果的ではなかっ
あまり効果
的ではな
かった
15%

どちらとも言
えない
33%

74

大変効果的
であった
9%

効果的で
あった
39%

Q. システムについてご意見等がありましたらご記入ください。
・ブラウザ版のWebExでは画面の共有ができないことを事前に連絡していただけるとよかったです。
・Slackがあまり活用されていないようだった。
・Slackを併用したのはとても良かったが、WebExではトラブルがあった。講義などでZoomの方が慣れていると思う。
・WebExとSlack両方とも不慣れで、かつ業務の影響でポスター開催時間帯は参加できませんでした。
なので、意見がなくて申し訳ありません。
・WebEXだけでも、十分発表ができていたと思う。
・Slackは無くても良かった気がします。
・Slack上のポスター画面が小さく文字が見にくかった。
・完璧だとおもいます。ただフラッシュトークで解像度の悪いポスターがあったため、フォーマットの統一は必要かもしれません。
・アナログな学会と比較して、Slackで事前にポスターを確認できるのが非常に良いなと思いました。
・Slackでポスターを確認できるのが良かった。
・ウェブでのポスターセッションは、十分な情報が得られず、ストレスを感じました
・社内の規定でSlackを使用できないため、両方を活かすことが出来ませんでした。
・ブレイクアウトセッションで、参加人数がわかってしまい、やりづらいと思いました。
・ブレイクアウトセッション中にもポスター発表を見学に行かない方が多い印象をうけました。100人ほどの参加者がいるうち、50人も満たない方しか参加されていないのでは？
・Slackは使用いたしませんでした。
・ポスターや動画が企業や外部の人もダウンロードできてしまうので、その旨と拡散禁止をあらかじめ発表者や参加者に周知しておいた方がよいと思います。
・ポスターと動画をアップするだけなら、Google Driveでも代用できると思います。Google Driveの方はダ
ウンロード禁止も設定できたと思います。
・コミュニケーションツールとしては、Slack（組織向）ではなくDiscord（オープンコミュニティ向け）を使うという手もあります。Slackよりは気軽に投稿しやすいと思います。ただし、活用は参加者のマインド次第なのであまり馴染まないかもしれません。
・ポスターセッションでは、3分程度のポスター説明動画も準備されていると、待ち時間が減って時間を効率的に使えるかもしれません。

Q. オンライン環境はいかがでしたか。
安定して視聴できた

41

不安的なときがあった

5

不安定であった

0

Q. 開催時期はいかがでしたか。
9月以前がよい8

10月がよい

34

11月以降がよい

475

Q. どのような開催頻度が望ましいとお考えですか。
年に数回

5

年に1回

36

数年に1回

5

Q. 開催方式についてお伺いします。
オンライン開催の方が良い

22

リアル開催の方が良い

15

その他

9

（その他意見）・オンライン開催とリアル開催のハイブリッド形式が良い
・ハイブリッド開催
・ミックスタイプ
・ポスターは対面がいい
・少なくとも懇親会ができるのでリアルの方がいい
・オンラインでのポスターについて①字が小さく見えにくいことがあったので少し大きめに作成指示していただいた方が良いように思いました。②ノンバーバルなコミュニケーションや他の方の前では質問しにくいことも聞けたり回答できたりする機会が失われるように思いました。一方、オンラインは遠隔で入れるの大きなメリットがありました。
・オンラインかリアルかは一長一短なので、どちらもよいと思います。
・オンラインも気軽に口頭発表を聞けたり動画視聴ができるなどメリットありますが、システムが複雑になるので、対面でのポスター発表議論ができるのが簡単かつ盛り上がるように思います。
・コロナのため今回はオンラインになったと思いますが、どっちも長所と短所がいると思います。

Q. 発表会全体についてのフィードバックがありましたらご記入ください。
・科学技術イノベーション研究科以外からの参加も望まれる。
・ポスター発表の全体時間は決められていたが、1回の「発表＋質疑応答」の時間も定められていればよかったと思う。例えば、ポスター発表① 14:55~, ポスター発表② 15:10~, ポスター発表③ 15:25~のように設定されていたら、発表の途中から聞くこともなく、より効率的であったと感じた。
・若手研究者に発表の機会を与えるとともにセンターの活動を内外にアピールできる良い取り組みですので継続を期待しています。コロナ禍収束後は、リアル開催を基本にオンライン開催を加えた方式がよいと思いました。
・口頭発表については、全員参加マストになるため、ある程度質の確保のため事前審査または外部識者によるインビテーションは必要かもしれません。発表内容の分野が偏っていた点が残念に感じました。
・ポスターと動画を探り探り作成したので、様式など指定がある程度ある方が発表者として作成しやす
いかと思いました。動画やポスターの大きさなど各々で異なっていたように思います。
・良い企画と思いました。定期的な開催を希望します。
・ポスターは、例えば技術分野をまとめるなどされていれば、短時間ですべてを閲覧できるように思う。
・ポスターで聞きたい発表がありましたが、報告者が不在でお話しを聞けないケースがありました。また、私がオンライン形式のポスター発表に不慣れなだけかもしれませんが、ポスター発表があるなら、リアル開催の方が議論し易くて好ましいかなと感じております。
・事前準備大変だったかと思いますが、ありがとうございました。
座長も若手にする、remoやoViceを利用してみる、簡単な懇親会（交流会）を設ける、など、若手のさらなる積極的な参加・交流を促す取組みを今後検討していくといいと思いました。
76