事項索引

A
AC III alternative complex III
95
AcsF
144, 148, 230, 233, 234
125
ADP - リボシル化 ADP-ribosylation
ANI average nucleotide identity
27
AppA
241, 242
ATP 依存型クエン酸開裂酵素 ATP- citrate
lyase
115, 116
ATP 合 成 酵 素 ATP synthase83, 84, 99,
176, 178

B
B800 - 820 タイプ LH2
192, 196
B800 - 850 タイプ LH2
192, 196
B806 - 866 複合体
202
B820 複合体
181, 182
7～10, 25, 29, 32, 138, 139, 140,
BChl b142, 144, 146, 150, 151, 179～181, 183,
187, 188, 224
7～10, 25, 36, 39, 56, 138, 139,
BChl c141, 142, 146, 151～153, 196, 198, 201,
213, 219
BChl c 自己会合体 self - assembled BChl caggregate 198, 199
BChl c 同族体 BChl c homologs
153
37, 50, 138, 139, 141, 142, 146, 151
BChl d～153, 196, 198
BChl d 同族体 BChl d homologs
151
7, 25, 138, 139, 141, 142, 144,
BChl e146, 151～153, 196, 198, 201, 213
BChl e 同族体 BChl e homologs
153
7, 38, 102, 138, 139, 140, 146,
BChl g150, 212, 221
BChl 合成 BChl synthesis 143, 144～147,
150～153, 250, 252
BLAST Basic Local Alignment Search Tool
134, 135
BLUF ドメイン Blue Light Using FAD
290

domain241

C28, 36
Candidatus
Ca 結合部位
191
CbbR
114
113, 114
cbb オペロン cbb operon
CBP carotenoid binding protein of Chloracidobacteria
220
8～10, 96, 102, 138, 142, 143, 153,
Chl a
232, 250, 252
CsmA 197, 200, 201, 213
Csm タンパク質 Csm proteins
196, 197,
201
85, 88, 94
c 型ヘム c - type heme
C サブユニット［系Ⅱ型反応中心］
76,
88, 89, 90, 94, 186, 187

D
DDH 法 DNA - DNA hybridization test
27
DGGE denaturing gradient gel electrophoresis
48, 70DMSO dimethylsulfoxide
93, 122, 127,
128, 239
DMSO 還元酵素 DMSO reductase
128
DNA デ ー タ ベ ー ス・ サ ー ビ ス DNA database service
134
Dsr 酵素群 dissimilatory sulfate reductases
131, 133

E, F
E - value
135
Fe ニトロゲナーゼ Fe - nitrogenase125
FMO タンパク質 FMO protein
15, 36,37, 39, 175, 177, 197, 201, 202, 213, 214,
223＋
FNR ferredoxin - NAD(P) reductase
98,102Form I（II）Rubisco
112～114

事項索引
Form IV Rubisco Rubisco - like protein
113

G, H
GOLD Genomes OnLine Database134
GTA gene transfer agent
266, 267
HiPIP high-potential iron-sulfur protein
90, 91, 95, 223
H サブユニット［系Ⅱ型反応中心］ 76,
77, 78, 94, 186, 234

I, J
9, 25
in vivo 吸収スペクトルin vivo 吸収スペクトル分析［光合成細菌］
24, 70in vivo spectral analysis
J 会合体［バクテリオクロロフィル］
211～213J - aggregate

L, N
78, 175, 176, 179, 180～191, 195,
202, 209, 210, 212～214, 234
LH2
24, 166, 175, 176, 179, 192, 193～
196, 202, 205, 209, 212, 213, 215, 234,
235, 263
L（M）サブユニット［系Ⅱ型反応中心］
76, 77～79, 93～95, 134, 187, 234, 257～
259
NADH β - Nicotinamide - adenine dinucleotide（reduced form）
5～7, 87, 91,
95, 109, 110, 121, 122, 128, 131, 261
NADH 脱水素酵素 NADH dehydrogenase
80, 87, 91, 92, 100, 102, 261
NADPH β - Nicotinamide adenine dinucleotide 2′- phosphate（reduced form）
6, 73, 98, 100, 109, 119, 148, 261
NirM
89
LH1

O, P
102, 142, 143, 154
8 - OH - Chl a
P840
97
PAS 処理法
267, 270
PEP カルボキシラーゼ phosphoenolpyruvate carboxylase
108, 114, 116
PHA 顆粒 PHA granule
264
PpsR タンパク質239～242

PrrB/PrrA 2 成分制御系 PrrB/PrrA twocomponent regulatory system
239
PscC サブユニット
98, 129
PshB サブユニット
102143, 193, 235,
puc オペロン puc operon
239
231, 237
puf
PufC
90, 234
PufX
183～185, 234
143, 184, 234,
puf オペロン puf operon
235, 239
231, 237puh143, 234, 235
puh オペロン puh operon
123, 124P - クラスター P - cluster

Q
QA キノン QA quinone
78, 79, 188
QB キノン QB quinone
78, 79, 80, 83,
103, 187, 188
Qx 吸収帯［バクテリオクロロフィル］
Qx absorption band
179, 210, 211, 215
Qy 吸収帯［バクテリオクロロフィル］
Qy absorption band
77, 138, 179, 181,
188, 190, 192, 198, 200, 210, 211～215
Q サイクル Q - cycle
82, 83, 99

R
RegB/RegA 2 成分制御系 RegB/RegA two component regulatory system
238,
239
RLP Rubisco - like protein
112, 113
16S rRNA 16S ribosomal RNA
3, 12, 22,
26, 28, 38, 48, 70, 75, 91, 257, 258
r TCA 回路 reductive tricarboxylic acid cycle
38, 39, 108, 114
Rubisco ribulose-1,5-bisphosphatecarboxylase/oxygenase35, 95, 109,
110, 111, 112, 113, 122

S, T
SoxAX 複合体 SoxAX complex
129, 130
SoxYZ 複合体 SoxYZ complex
129, 130
TMAO trimethylamine N - oxide
93, 127,
128
TOMES thiosulfate oxidizing multi - enzyme
291

事項索引
system99, 130, 132

U, V, X, Z
UBCG up - to - date bacterial core gene27
V ニトロゲナーゼ vanadium nitrogenase
125
X 線結晶構造解析 X - ray crystallography76, 77, 221, 223, 224
16, 39, 60, 139, 142, 143, 153,
Zn - BChl a
254
73
Z - スキーム Z - scheme

あ亜鉛バクテリオクロロフィル Zn - BChl
16, 39, 60, 139, 142, 143, 153, 254
アクセサリーバクテリオクロロフィル
accessory bacteriochlorophyll
94
亜硝酸還元酵素 nitrite reductase
92,
126, 127
アデノシン - 5′- ホスホ硫酸 adenosine - 5′phosphosulfate
133
ア ン ヒ ド ロ ロ ド ビ ブ リ ン anhydrorhodovibrin
158, 165, 195
アンプリコン解析 amplicon analysis
70,
71

い
硫黄顆粒 sulfur globule21, 23, 29, 32,
33, 37, 48, 87, 88, 128～130, 131, 256
硫黄芝 sulfur-turf microbial mat
56, 57イソプレン isoprene
96, 100, 157
イソレニエラテン isorenieratene
156,
161, 162
イソレニエラテン経路
162
一次電子受容体 primary electron acceptor
96, 102, 203, 212, 214, 219, 252
一重項酸素 singlet oxygen
79, 208
一酸化炭素 carbon monoxide
93, 134
一酸化窒素 nitric oxide
125, 127
遺伝子水平移動 horizontal (lateral) genetransfer
40, 104, 114, 236, 257, 259

う，えヴァンニール C. B. van Niel 14, 21
ヴィノグラドスキー S. N. Winogradsky292

14, 44
──のカラム Winogradsky column 45,
47
エチルマロニル CoA 経路 ethylmalonyl CoA pathway
112, 118, 119, 120, 122
エリトロキサンチン硫酸 erythroxanthinsulfate 166
エントナー・ドゥードロフ経路 Entner Doudoroff pathway
121
エンドファイト endophyte
58, 59お2- オキソグルタル酸シンターゼ 2 - oxoglutarate synthase
114, 115
オケノン
161
オケノン経路 okenone pathway
159, 161
オシロール・ジラムノシド oscillol 2,2'dirhamnoside
164, 166
オーラシアニン auracyanin
94, 95
オルトログ ortholog
129, 135

か化学合成独立栄養細菌 chemoautotrophic
bacteria
10, 108, 134, 247
化学合成無機栄養生物 chemolithotroph
5, 108, 114, 115
化学浸透圧説 chemiosmotic theory84
化学分類学 chemotaxonomy
26, 70
化学躍層 chemocline
46～50, 61
ガス胞 gas vacuole 33, 61
活性汚泥 activated sludge 43, 53, 58, 67,
70, 267, 269, 270
活性酸素種 reactive oxygen species：ROS
79, 217, 220
滑走運動 gliding motility
36, 61芽胞 spore
31, 58, 69
カルジオリピン cardiolipin
167, 168,
169, 186
カルビン回路 Calvin cycle
5, 7, 10, 29,
32, 35, 37, 58, 60, 73, 87, 108, 109, 110,
111, 113, 116, 122
カロテナール経路 carotenal pathway
159, 160
カロテノイドシフト carotenoid band shift
166

事項索引
カロテノイド生合成遺伝子 carotenoid biosynthesis genes
156, 230, 233
カロテノイドの構造式 structural formula ofcarotenoids
11, 158, 159, 161～163
カロテノソーム carotenosome
201
β- カ ロ テ ン β- carotene
11, 156, 158,
159, 161～163, 201
γ- カロテン γ- carotene
12, 154～156,
158, 159, 161, 162, 163, 200
OH -γ- カロテン・グルコシド・エステル
OH-γ- carotene glucoside ester
11,12, 156, 162, 163
ζ- カロテン ζ- carotene157
ζ- カロテン不飽和化酵素 ζ-carotene
desaturase
157
還元的 TCA 回路 reductive tricarboxylic
acid cycle
7, 23, 38, 98, 102, 114, 115,
116
還元的ペントースリン酸回路 reductive
pentose - phosphate cycle
108～110
カンタキサンチン canthaxanthin 164, 167き
基準株 type strain
26, 28, 264
基底状態［エネルギー準位］ ground state78, 86, 96, 203, 204, 210, 215～219
機能性 RNA functional RNA266
キノン quinone
24, 78, 79, 80, 81～83,
87, 94, 96, 129, 131, 133, 157, 167, 168,
170, 189, 190, 200, 220, 238
──の構造式 structural formula ofquinones169
キノンチャンネル quinone channel
189,
190
キノンプール quinone pool76, 80, 81～
83, 86, 87, 91～93, 96, 98, 100, 122, 125,
127, 170, 189
キノン輸送 quinone transport
183, 184,
190, 225
逆電子流 reverse electron flow
87, 88,95, 109
極限環境 extreme environment
43, 44,67
極性脂質 polar lipid
26, 167, 168, 170
菌体外核酸 extracellular nucleic acids

265

く
クエリ配列 query sequence
135
クライオ電子顕微鏡 cryo - electron
microscopy
184, 221, 223, 224
グラニック仮説 Granick hypothesis
250
グリオキシル酸回路 glyoxylic acid cycle
114, 119, 120, 122
クロマトフォア chromatophore
80, 84,85, 176, 178
クロラシドバクテリア Chloracidobacteria
4, 7, 14, 23, 39, 44, 61, 104, 132, 139, 142,
153, 157, 166～168, 175, 177, 196, 201,
210, 212, 213, 220, 252
クロリン環 chlorin ring
8, 9, 138, 139,
198, 210, 232, 251, 252
クロロソーム chlorosome
13, 24, 26, 36,
37, 39, 95, 139, 142, 162, 163, 167, 174,
177, 196, 197, 198, 200～202, 213～215,
219
クロロバクテン chlorobactene
11, 12,154～156, 161, 162, 200
OH - クロロバクテン・グルコシド・エステル
OH- chlorobactene glucoside ester
156, 162
クロロバクテン経路
162
クロロビウムキノン chlorobiumquinone
167, 168, 169, 200
クロロフィリド a chlorophyllide a146,
147～149, 151, 152, 249～252
クロロフィリド a 酸化還元酵素 chlorophyllide a oxidoreductase
144, 148,251
クロロフィル a chlorophyll a：Chl a
8～10, 96, 102, 138, 142, 143, 153, 232,
250, 252
クローンライブラリー解析 clone library
analysis70
群集構造解析 bacterial community structure
analysis70

け蛍光発光スペクトル fluorescence emission
spectrum204～206293

事項索引
継代培養 subculture
68～70
ゲノム系統樹 phylogenomic tree27
ゲノムサイズ genome size
27, 32, 33,
37～39
ゲノム情報 genome information
18, 28,32, 34, 36, 38, 107, 131, 134, 233
ゲマティモナス Gemmatimonas
4, 7,
14, 22, 23, 34, 39, 61, 62, 73, 104, 112,
132, 139, 142, 156, 157, 166, 175, 236, 257,
259, 279
嫌気呼吸 anaerobic respiration
5, 32, 46,
91, 93, 125, 128, 238
嫌気培養 anaerobic culture
68, 271

こ
コア光捕集複合体 core light-harvesting
complex：LH1
78, 175, 176, 179,
180～191, 195, 202, 209, 210, 212～214,234
光化学系Ⅰ photosystem I：PS I
14, 73,212, 224, 246, 254, 256
光化学系Ⅰ型反応中心 PS I - type RC
4, 37～39, 73, 74, 75, 96, 97, 101, 102,
104, 108, 116, 142, 153, 177, 201, 202, 212,
252, 255
光化学系Ⅱ photosystem II：PS II
14, 73, 212, 224, 254, 256
光化学系Ⅱ型反応中心 PS II - type RC
4, 29, 32, 36, 40, 73, 74, 75, 77, 80, 86, 94,
104, 109, 142, 153, 177, 202, 212, 255
光学遷移 optical transition
204
光合成遺伝子クラスター photosynthesis
gene cluster：PGC
36, 40, 104, 143,
156, 163, 184, 220, 230, 231, 232, 237,
240, 257
光合成遺伝子の発現制御 regulation ofphotosynthetic gene expression
235,
238
光合成細菌の系統樹 phylogenetic tree ofphototrophic bacteria
3, 73, 75, 258
光合成電子伝達系 photosynthetic electrontransfer system
4, 6, 73, 85, 93, 96,
100, 103, 122, 131, 133, 256, 257
高電位鉄 - 硫黄タンパク質 high - potential
iron - sulfur protein：HiPIP
91, 223294

呼吸電子伝達系 respiratory chain
81,
109
国際原核生物命名規約 International Codeof Nomenclature of Prokaryotes：ICNP
28
国際光栄養細菌分類委員会 Subcommittee
on the Taxonomy of Phototrophic
Bacteria：STPB
27
混合栄養 mixotrophy
6, 118さ
細胞内膜 intracytoplasmic membrane
13, 17, 24, 31, 54, 96, 175～177
酸化還元電位 oxidation-reduction potential,
redox potential
4, 73, 74, 78, 79, 86,
89, 91, 97, 108, 125, 240, 256, 257
酸化還元バランス redox balance
108,
111, 113, 122
三重項励起状態 triplet excited state79,
208, 210, 217
酸素呼吸 oxygen respiration
2, 5, 17, 34,
91, 93, 95, 96, 104, 113, 121, 127, 128,
143, 230, 236, 238, 239, 245
酸素発生型光合成 oxygenic photosynthesis
5, 6, 10, 14～17, 96, 98, 102, 113, 210, 212,245～247
酸素非発生型光合成 anoxygenic photosynthesis
6, 21, 43, 245～247

しシアノバクテリア cyanobacteria
2, 4, 7,13, 28, 45, 54, 56, 73, 113, 156～158, 164,
175, 204, 232, 236, 245, 246, 254～256, 261
ジアポニューロスポレン 4,4' - diaponeurosporene
11, 154, 155, 157, 163, 164
ジケトスピリロキサンチン 2,2'-diketospirilloxanthin
160, 195
脂質一重層 lipid monolayer197
シス - スピリロキサンチン cis - spirilloxanthin186
シ ト ク ロ ム b cytochrome b：cyt b81,
98, 99, 103
シトクロム b6 f 複合体 cytochrome b6 f
complex73, 81, 85, 103
シトクロム bc1 複合体 cytochrome bc1

事項索引
complex
80～83, 85, 86, 92, 93, 95, 98,
99, 176, 190
シトクロム bc/bf 複合体 cytochrome bc/bf
complex97, 99～101, 103, 129, 130
シトクロム c1 cytochrome c1：cyt c1
81,
83, 85, 98
シトクロム c2 cytochrome c2：cyt c2
80,
85, 86, 88, 89, 92, 95
シトクロム c2m cytochrome c2m：cyt c2m
89
シトクロム c4 cytochrome c4：cyt c4
91
シトクロム c8 cytochrome c8：cyt c8
89,91
シトクロム c - 553 cytochrome c - 553：cyt
101, 103c - 553
シトクロム c-554
97, 130
シトクロム c - 554/c - 555 cytochrome c - 554/
99, 129c - 555：cyt c - 554/c - 555
シトクロム c - 556 cytochrome c - 556：cyt
97～99, 130
c - 556
シトクロム cy cytochrome cy：cyt cy
89
シトクロム cz cytochrome cz：cyt cy
97～99, 104, 129
シトクロムサブユニット cytochrome
subunit88, 89, 94, 186, 187, 234
ジヒドロクロロバクテン dihydrochlorobactene
162
ジビニルクロロフィリド a divinylchlorophyllide
143, 148, 150
ジビニルクロロフィリド還元酵素 divinylchlorophyllide a 8 - vinyl - reductase
144, 148
脂肪酸組成 fatty acid composition170
ジメチルスルホキシド dimethylsulfoxide：
DMSO
69, 93, 122, 128
集積培養 enrichment culture
14, 21, 44,
45, 51, 58, 59, 67, 68～70, 87
周辺光捕集複合体 peripheral light-harvesting complex：LH2
24, 166, 175,
176, 179, 192, 193～196, 202, 205, 209,
212, 213, 215, 234, 235, 263
循環的電子伝達系 cyclic electron transportsystem6, 80, 86, 87, 88, 91, 92, 100,103
硝酸還元酵素 nitrate reductase
126, 127

硝酸呼吸
127

nitrate respiration

93, 125～

す水素

hydrogen6, 38, 87, 88, 93, 107, 124,
133, 134, 247, 256, 257, 261～263
水素発生 hydgrogen evolution
88, 111,122, 124, 261
ストークスシフト Stokes shift
206
スーパーオペロン super operon
143,
235
スピリロキサンチン spirilloxanthin
11,12, 154～156, 158, 159, 160, 164, 165,
166, 186, 188, 195, 233
スフェロイデノン spheroidenone
11,12, 154, 155, 156, 158, 160, 164, 165, 195
スフェロイデン spheroidene
11, 154,
155, 156, 158, 160, 165, 195, 219, 233
スフェロイデン経路 spheroidene pathway
158, 160, 164, 165
スペシャルペア special pair4, 13, 14,
77, 78, 79, 85, 86, 88, 89, 92, 94, 96, 98,
102, 103, 129, 142, 143, 174, 181, 188, 202,
204, 209, 211, 212, 214
スルフォキノボシルジアシルグリセロール
sulfoquinovosyldiacylglycerol：SQDG
167

せ，そゼアキサンチン zeaxanthin
195
正当名 valid name28, 29, 32, 36, 273
生分解性プラスチック biodegradable
plastic
263, 265
絶対嫌気性光合成細菌 obligately anaerobic
phototrophic bacteria
37, 38遷移双極子モーメント transition dipole
moment199～201, 211
閃光照射時間分解分光分析法 time - resolved
flash - photolysis spectroscopy
78
ソーレー帯［バクテリオクロロフィル］
Soret band
138, 179, 210

た，ち
脱共役剤 uncoupler
脱窒 denitrification

85
93, 125～127, 239
295

事項索引
炭素同化 carbon assimilation
10, 32, 37,
73, 95, 98, 107, 108, 109, 112, 114, 116,
119, 122
チオ硫酸 thiosulfate
65, 66, 99, 128, 129,131
窒素固定 nitrogen fixation
32, 58, 88, 98,
102, 123, 124, 175, 239
長波長シフト［バクテリオクロロフィル］
red shift10, 154, 166, 180, 187, 198,
211

つ，て
通性嫌気性光合成細菌 facultative anaerobic
phototrophic bacteria
17, 29, 35, 53
デクスター機構 Dexter mechanism forenergy transfer207～210, 219
鉄 - 硫黄型反応中心 iron - sulfur typereaction center
73, 96, 100, 103, 212,
219, 220
鉄 - 硫黄クラスター iron - sulfur cluster
81, 83, 85, 91, 95, 96, 98, 102, 123, 124,
133, 201, 220, 222
鉄モリブデンコファクター FeMo cofactor：
FeMo - co123, 124
電荷再結合 charge recombination
79,
217, 219
電荷分離状態 charge separation
78, 96,
203, 214
電気化学ポテンシャル electrochemical
potential
83～85, 261
電子供与体 electron donor
5, 32, 128,
133, 247, 256―――としての亜硝酸 nitrite
134―――としての亜ヒ酸 arsenite
134―――としての水素 hydrogen 134, 247―――としての鉄（2 価）イオン ferrousion
32, 134, 257
電子受容体 electron acceptor
5, 93, 96,
100, 102, 103, 122, 125, 128, 202, 203,
214, 219
電子伝達系 electron transport system
1, 2, 5, 6, 8, 14, 73, 76, 81, 84, 85, 88, 91～
93, 96, 100, 103, 104, 122, 131, 133, 167,
174, 178, 247, 257, 261
電子伝達タンパク質 electron carrier
296

proteins
85, 86, 88～94, 129, 133, 178,223
電子励起状態 electronically excited state78, 203, 204, 208, 211, 213, 214とドイセンス L. M. N. Duysens
15
同族体［バクテリオクロロフィル］
homolog
139, 151, 153, 198, 200
独立栄養生物 autotroph
5, 108取り込み型ヒドロゲナーゼ uptake hydrogenase
133, 262
トリメチルアミン - N - オキシド trimethylamine N - oxide：TMAO
93, 128に，の二次電子受容体 secondary electron
acceptor
96, 100, 103
ニトロゲナーゼ nitrogenase88, 98, 122,
123, 124, 125, 252, 261～263
ニューロスポレン neurosporene 7, 156～
160, 165
ノストキサンチン nostoxanthin 156, 164
登り坂のエネルギー移動 uphill energy
transfer
181, 214, 215

は廃水処理 waste water treatment
53, 54,58, 62, 67, 267, 270, 275
バクテリオクロリン環 bacteriochlorin ring
8, 9, 138, 139, 142, 182, 187, 188, 194,
210, 211, 251, 252
バクテリオクロロフィリド a bacteriochloro144, 147, 149
phyllide a：BChlide a
バクテリオクロロフィル b bacteriochloro7～10, 25, 29, 32, 138,
phyll b：BChl b
139, 140, 142, 144, 146, 150, 151, 179～
181, 183, 187, 188, 224
バクテリオクロロフィル c BChl c
7～10, 25, 36, 39, 56, 138, 139, 141, 142,
146, 151～153, 196, 198, 201, 213, 219
バクテリオクロロフィル d BChl d
37,
50, 138, 139, 141, 142, 146, 151～153,
196, 198
バクテリオクロロフィル e BChl e
7, 25,

事項索引
138, 139, 141, 142, 144, 146, 151～153,
196, 198, 201, 213
バクテリオクロロフィル g BChl g
7, 38,
102, 138, 139, 140, 146, 150, 212, 221
バクテリオクロロフィルの構造 structural
formula of bacteriochlorophylls
8,140, 141
バクテリオクロロフィルの生合成 bacteriochlorophyll biosynthesis
143, 144～
153, 249
バクテリオフィトクロム bacteriophytochrome242
バクテリオフェオフィチン bacteriopheophytin：BPhe78, 79, 94, 142, 153,
179, 186, 212
バクテリオルビキサンチナール bacteriorubixanthinal
166, 195
バクテリオロドプシン bacteriorhodopsin
2, 104
発酵 fermentation
17, 32, 121, 122, 128,
133, 262
パラログ paralog
99, 135

ひ光栄養細菌 phototrophic bacteria
2, 3,
21, 29, 38, 39
光混合栄養 photomixotrophy
35, 37, 38,
60, 118
光従属栄養 photoheterotrophy
6, 17,
29, 32, 35, 39, 40, 53, 54, 60, 61, 66, 87, 93,
111, 113, 236
光障害 photodamage
154, 166, 200
光独立栄養 photoautotrophy
6, 32, 36～
38, 73, 87, 95, 96, 102, 107, 113, 118, 133,
134, 236
光保護機能［カロテノイド］ photoprotectivefunction
208, 220
光捕集 light - harvesting 14～16, 36, 165,
174, 175, 177, 179, 196, 200, 203, 207～
209, 215, 219
光捕集タンパク質 light-harvesting protein
15, 175～177, 195, 202, 239, 263
光有機栄養 photoorganotrophy6
非光化学的消光 non - photochemical
quenching204, 207, 210, 218, 219

微生物マット microbial mat
43, 44, 52,
54～57, 67, 69, 70
3 - ヒドロキシプロピオン酸回路 3 -hydroxypropionate /malyl - CoA cycle
23, 37,39, 58, 95, 108, 116, 117, 118
8 - ヒドロキシル - クロロフィル a 8 - OH 102, 142
chlorophyll a
ヒドロゲナーゼ hydrogenase37, 92,
133, 262, 263
非メバロン酸経路 non - mevalonate pathway
157
標準型スピリロキサンチン経路 normal
spirilloxanthin pathway
158～160,
164, 165
ピルビン酸シンターゼ pyruvate synthase114
ピルビン酸発酵 pyruvate fermentation
121, 123
ピルビン酸・リン酸ジキナーゼ pyruvateorthophosphate dikinase
115

ふ
フィチル基［バクテリオクロロフィル］
phytyl group
142, 149, 153, 157
フィトエン phytoene
157, 160, 161, 165
フィトエン合成酵素 phytoene synthase
156, 157
フィトエン不飽和化酵素 phytoene
desaturase
157, 160, 165
フェルスター機構 Förster mechanism forenergy transfer
201, 207～210
フェレドキシン ferredoxin
6, 96, 98,
100～103, 108, 114, 116, 122, 148, 202,
257, 261
フェレドキシン - NAD(P)＋還元酵素＋
ferredoxin - NAD(P) reductase
98
部分循環湖 meromictic lake44, 46～48,
61
フマール酸還元 fumarate reduction
122
フラボシトクロム c flavocytochrome c
92, 129, 130
ブルーム microbial bloom
21, 44, 45,
47, 48, 50～52, 54, 58, 62, 67, 70
プロテオロドプシン proteorhodopsin
2, 105297

事項索引
プロトクロロフィリドレダクターゼ protochlorophyllide reductase
148, 251
プロトポルフィリンⅨ protoporphyrin IX
143, 145, 146, 148, 153, 230, 249, 252,
253
プロトン駆動力 proton motive force
84,
96, 99, 100, 103, 109
プロトン濃度勾配 proton gradient73,
83, 84, 105, 125, 225
プロトン輸送 proton transport
73, 81,82, 92, 95, 99, 105
分子系統樹 molecular phylogenetic tree
75, 90, 99, 103, 135, 257～259へ
平均塩基相同性 average nucleotide identity：ANI
27
ベースプレート baseplate
197, 200,
201, 202, 213, 215
βポリペプチド［LH1］ β- polypeptide
181～183, 186, 187, 194
ペリプラズム periplasm
77, 79, 81, 83,
85, 88, 94, 98, 128, 131, 178, 202
変化型スピリロキサンチン経路 alternative
spirilloxanthin pathway
159, 160
変性濃度勾配（ゲル）電気泳動 denaturing
gradient gel electrophoresis：DGGE
48, 70ほ補充経路［TCA 回路］ anaplerotic pathway
108, 119
ホスファチジルグリセロール phosphatidylglycerol
167, 169
ホスホエノールピルビン酸 phosphoenolpyruvic acid：PEP
108, 114～116,
119, 122
3 - ホスホグリセリン酸 3 - phosphoglyceric
acid
109
ホスホリブロキナーゼ phosphoribulokinase110
ポリヒドロキシアルカン酸 polyhydroxyalkanoates：PHA
18, 31, 121, 122,
263, 264
ポリヒドロキシ酪酸 polyhydroxybutyrate：
298

PHB
119, 121
αポリペプチド［LH1］ α- polypeptide
182, 187, 194
α(β)ポリペプチド［LH2］ α(β) - polypeptide
193, 196
γポリペプチド［LH1］ γ- polypeptide
183, 184, 187
ポリリン酸顆粒 polyphosphate particle
31

ま，み，む
膜電位 membrane potential
79, 83, 85,
96, 100, 166
マグネシウムキラターゼ（Mg - キラターゼ）
magnesium chelatase144, 148, 232,252～254
ミトコンドリア mitochondria
5, 80, 81,
91～93, 167, 175
ミヒェル H. Michel15
無色硫黄細菌 colorless sulfur bacteria
32, 48, 56

め
メタノール資化性細菌 methylotrophic
bacterium34
メタン生成菌 methanogen250
メナキノール - シトクロム c 酸化還元酵素
menaquinol - cytochrome c oxidoreductase
98
メナキノン menaquinone
38, 80, 94, 96,
100, 103, 168, 169, 170, 186, 189, 200
メバロン酸経路 mevalonate pathway
157

もモノガラクトシルジアシルグリセロール
monogalactosyldiacylglycerol
167,
168, 169, 196
モリブデン（Mo）型ニトロゲナーゼ
molybdenum nitrogenase123
モリブデン鉄タンパク質 MoFe - protein
123

や

行

ユビキノン ubiquinone
80, 87, 168,
169, 170, 183, 186, 187, 189, 190

事項索引
葉緑体 chloroplast2, 4, 6, 14, 74, 81, 84,
100, 157, 232, 236, 245ら
ラムノシルガラクトシルジアシルグリセロー
ル rhamnosylgalactosyldiacylglycerol
167, 168, 169, 196
藍色細菌 cyanobacteria
2, 21～23, 43
藍藻 blue - green algae
22

りリコペン lycopene
7, 76, 156, 157, 158,
159～163, 165
リコペン・シクラーゼ lycopene cyclase
158, 161, 162
リスケ鉄 - 硫黄タンパク質 Rieske iron - sulfur
protein81, 83, 98立体異性体［バクテリオクロロフィル］
epimer151, 198, 200, 212, 219
リブロース - 1,5 - ビスリン酸カルボキシラー
ゼ／オキシゲナーゼ ribulose - 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase：
Rubisco35, 95, 109, 110, 111, 112,
113, 122
硫化水素 hydrogen sulfide
5, 6, 21, 29,
32, 43, 45, 46, 50, 52, 64, 87, 88, 93, 99,
108, 129, 256, 257
硫化水素 - キノン還元酵素 sulfide quinone
reductase：SQR
87, 99, 129
硫酸 - アデニリルトランスフェラーゼ
sulfate adenylyltransferase
133
硫酸還元菌 sulfate reducing bacteria
46,
50, 131, 263
量子収率 quantum yield
203, 217, 218

ろ漏斗モデル funnel model of antenna structure
206, 207, 212, 214
ロドキノン rhodoquinone
122, 168, 170
ロドピナール rhodopinal
159, 160
ロドピン rhodopin
156, 158, 160, 165,195
ロドピングルコシド rhodopin glucoside196
ロドプシン型イオンポンプ rhodopsin ion
pump
3, 8, 104

れ
励起エネルギー転移 excitation energy
transfer
176, 189, 201, 203～212,
214, 216～219
励起子 exciton
13, 14, 174, 188, 208,
209～211, 214
励起子相互作用 excitonic interaction
188
レッドクロロフィル red chlorophyll
207, 215
299