ゲノム研究分野
Division of Genomics Research
〒

―

岐阜市柳戸

番

E-mail：mgrc@gifu-u.ac.jp
TEL：

―

―

FAX：

―

―

目

次

―

分野長あいさつ ……………………………………………………………

―

ゲノム研究分野職員名簿 …………………………………………………

⑴ 専任教員………………………………………………………………………
⑵ 非常勤職員……………………………………………………………………
⑶ 研究員…………………………………………………………………………
平成 年度利用登録者及び研究テーマ………………………………………
ゲノム研究分野共同利用機器紹介……………………………………………
利用の手引き……………………………………………………………………
平成 年度活動状況報告⑴ 講習会・トレーニングコース・講演会等…………………………………
⑵ ゲノム研究分野利用状況……………………………………………………
⑶ 共同スペース利用状況………………………………………………………
⑷ 平成 年度業績論文等………………………………………………………
⑸ ゲノム研究分野教員の教育研究活動等……………………………………
⑹ 補助金関連採択状況…………………………………………………………
⑺ 新聞報道………………………………………………………………………

―

分野長あいさつゲノム研究棟で研究してみませんか？
ゲノム研究分野長

下澤伸行

ゲノム研究分野は岐阜大学構内東南の角にある 階建てのゲノム研究棟にあります。平成 年に生
命科学分野における全学的な研究基盤組織としてセンターが設置、改組されたのを期に、それまでの遺伝子実験施設からゲノム研究分野として、DNA シーケンスをはじめとしたオミクス解析機器の整備、全学利用支援を行っています。その中で、研究支援の根幹をなす受託シーケンスは平成 年度には利用料金のキャンペーンを継続し、 年度の ， サンプルから ， サンプスに増加し続けています。料金の値下げにより収入としては減少しましたが（図 ）、個々の研究者への貢献実績と中期的観点から 年度も利用し易い料金を継続しています。
さらに昨年度に導入したセルアナライザー、セルソータ、イメージングアナライザーに既存の共焦点レーザーにタイムラプスを可能にした細胞イメージング解析装置を整備し、技術補佐員の増員に加え、館内に細胞培養環境も導入して全学的な利用普及に努めています。
また平成 年度概算要求には、
学内アンケートでも最も要望の高かった次世代シーケンサの導入を挙げるとともに、利用普及には不可欠なバイオインフォマティクスの環境整備も目指しています。
ゲノム研究棟はその設置場所から全学利用、特に医学地区からの施設利用には難点はありますが、今年度はゲノム研究棟の館内整備にも取り組んでおり、図書コーナーも読み易い環境を整えています（図 ）。受託シーケンスはこちらから回収に出向いていることもあり、順調に利用拡大しています
が、館内解析機器につきましても、是非一度、ゲノム研究棟に来て試して頂き、最新の生命科学系雑誌を読みながら、利用を検討して頂ければと願っています。
皆様のお越しをお待ちしています。

図

ゲノム研究棟階玄関応接コーナー

生命科学系雑誌最新号

ゲノム研究棟

閲覧可

階図書コーナー

バックナンバー

―

―

貸出し可

―
⑴

ゲノム研究分野職員名簿（平成 年度）
専任教員．教授（分野長）
．准教授
．助教

⑵

非常勤職員（注：＊は、教員個人の研究費で雇用）．事務補佐員
．技術補佐員
．技術補佐員
．技術補佐員
．技術補佐員＊．研究補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊．技術補佐員＊

⑶

下澤 伸行
須賀 晴久
高島 茂雄

小林
平井
脇原
鷲見
船坂
本田
梶原
豊吉
大場
瀧瀬

陽子
さやか
祥子
真弓
美佳
綾子
尚美
佳代子
亜希子
康子

研究員

．特別協力研究員

野原 大輔（岐阜大学名誉教授）――

平成 年度利用登録者及び研究テーマ（平成 年 月現在）
学

部

講 座 等

利用責任者

登録番号

登録
人数

研 究 テ ー マ

教育学

理科教育（生物） 古 屋 康 則

ED―

ゲノムを用いた魚類の系統解析

教育学

理科教育（生物） 三 宅崇

ED―

植物―昆虫―菌類の相互作用

教育学

理科教育（生物） 須 山 知 香

ED―高等植物の系統解析

地域科学

地域政策

粕 谷 志 郎RS―

ユスリカの COI 領域の DNA シークエンスによる種同定

地域科学

地域政策

向 井 貴 彦RS―

魚類の DNA 解析

医学

細胞情報学

中 島

茂

MD―

外部刺激応答における細胞増殖・分化及び細胞死／生存シ
グナル制御機構の解明

医学

腫瘍病理学

久 野 壽 也
波多野裕一郎MD―

遺伝子改変マウスを用いたがん研究

医学

分子病態学

木 村 正 志MD―

ヒト細胞周期の研究

医学

病態情報解析医学

服 部 高 幸MD―

高脂血漿治療薬 スタチンによるポイントミューテーショ
ンの解析

医学

整形外科

秋 山 治 彦MD―

Ext コンディショナルノックアウトマウスを使用した肢芽発生におけるヘパラン硫酸の機能解析

医学

神経生物

中 川 敏 幸MD―神経発生・神経変性機構の分子メカニズムの解明

医学

医療管理学

永 井

淳

MD―

核 DNA ならびにミトコンドリア DNA の多型解析

医学

病態制御学

安 田

満

MD―

尿路性器感染症分離菌に関する研究

医学

総合病態内科学梶 田 和 男MD―

成熟脂肪細胞の増殖の意義

医学

産婦人科

森重 健一郎MD―

精巣性女性化症候群の患者と正常男性のアンドロゲンレセ
プターの細胞内局在の観察と同定 アンドロゲンレセプ
ター変異体とその細胞内局在

医学

腫瘍外科学

吉 田 和 弘MD―

臨床検体、細胞株の遺伝子解析

医学

消化器病態学 清 水 雅 仁

MD―受容体型チロシンキナーゼを標的とした EGCG、及び非環式レチノイドによる肝線維化・発癌予防の検討

医学

病理部

宮 崎 龍 彦MD―

病理組織検体を用いた変異遺伝子および多型遺伝子の解析

医学

再生医科学

青 木 仁 美MD―

遺伝子組換えマウスおよび iPS 細胞の作製及び解析

医学

再生分子統御学江 崎 孝 行MD―

微生物の分類と同定

医学

腫瘍制御学

後 藤 尚 絵MD―

悪性リンパ腫の予後因子検索

医学

再生医科学

本 橋

力

MD―

マウス神経堤細胞の遺伝子網羅的解析

医学

病態制御学

長 岡

仁

MD―

抗体遺伝子改変の分子機構の解析

医学

神経統御学

山 口

瞬

MD―

マウス・ラットの脳組織のイメージング解析および遺伝子
発現の解析

医学

神経内科・老年学

林

祐 一

MD―

idiopathic basal ganglia calcification の遺伝子検索

医学

生命機能分子設計

大 沢 匡 毅MD―

幹細胞制御分子をクローニングする

医学

免疫病理

竹 内

保

MD―

粘液癌形質と関係する TMEM の異常発現とそれにより影響を受ける分子経路メカニズムの検討

医学

小児病態学

大 西 秀 典MD―

原発性免疫不全症の病態解析

医学

組織・器官形成

手 塚 建 一MD―ヒト歯髄細胞のトランスフェクション効率の検討

医学

解剖学

東

華 岳

MD―

骨粗鬆症の形態学

医学

循環病態学

森下 健太郎MD―

心不全におけるインテグリン受容体の機能解析

EG―

タンパク質合成系に関わる因子の遺伝子解析とその遺伝子産物の機能解析工学

応用分子生物学

工学

生体反応工学 柴 田

綾

EG―

創薬を指向した機能性オリゴ核酸の開発に関する研究

工学

生命情報工学 上 田

浩

EG―三量体 G 蛋白質シグナルによる Rho 低分子量 G 蛋白質を介した細胞骨格制御機構の解明

工学

生体物質工学 石 黒亮EG―オリゴマータンパク質に対する圧力効果工学

生命情報工学 森 田 洋 子

EG―神経細胞の損傷および細胞死における神経栄養因子の働き

工学

機能材料工学 纐 纈EG―フラボノイド系化合物の分析

横 川 隆 志

守

―

―

学

部

講 座 等

利用責任者

登録番号

登録
人数

研 究 テ ー マ

敏EG―

ヒト皮膚系の脂質・糖質分析

夏 央

EG―

核酸類縁体の化学合成に関する研究において、合成した化合物の質量分析

生体物質工学 宮 地 秀 和

工学

生命情報工学 吉 田

工学

物質機能工学 岡

工学

EG―

超分子化合物の合成と物性

工学

生命化学

竹 内 豊 英EG―

微細藻類の単離と脂肪酸の定量

工学

機械工学

柿 内 利 文EG―

アルミニウム合金接合部材の組織観察．
（実体顕微鏡（Stemi＋）の利用希望．
）

応用生物科学 生産環境科学 百 町 満 朗

AG―

有用微生物を用いた植物病害の生物的防除

応用生物科学淳

AG―

動物ホルモン等の遺伝子の解析ならびに関連タンパク質の定量

応用生物科学 生産環境科学 山 本 謙 也

AG―

動物卵成熟過程における細胞骨格の役割

応用生物科学 獣医微生物学 福 井 博 一

AG―

園芸植物の形態形質に関する遺伝子解析

応用生物科学 食品生命科学 矢 部 富 雄

AG―

食品成分による生体機能調節機構の解析

応用生物科学 食品生命科学 中 村 浩 平

AG―

環境中原核生物の多様性解析、キシリトール高生産性 Aspergillus oryzae の遺伝子工学的創出、セルロース糖化液における高効率アルコール醗酵酵母のスクリーニングおよび遺伝子解析・生化学性状分析

応用生物科学 分子生命科学 中 川寅

AG―

血圧調節機構レニン―アンジオテンシン系の生化学

応用生物科学 植物細胞工学 小 山 博 之AG―

植物のストレス耐性

応用生物科学中 川 智 行AG―

ラットの腸内微生物層の解析 メチロトローフ酵母のメタ
ノール代謝制御に関する研究 出芽酵母のストレス応答機
構に関する研究 新規乳酸菌の分離と応用

応用生物科学 応用生命科学 岩 間 智 徳

AG―

細菌の走化性

応用生物科学 応用生命科学 長 岡利AG―

食品成分による脂質代謝関連遺伝子発現の総合解析

生態環境学

食品科学

岩 澤

応用生物科学応用獣医学

鈴 木 正 嗣AG―

外来生物に対する避妊ワクチンの開発（遺伝学的研究）および野生動物が保有するコロナウイルス等の遺伝学的解析

応用生物科学獣医学

前 田 貞 俊AG―

イヌおよびネコの免疫介在性疾患における分子病態の解明

村 瀬 哲 磨AG―

ウシ精子のキャパシテーションを調節するシグナル変換機
構

応用生物科学 環境生態科学 土 田 浩 治

AG―

昆虫の遺伝的多様性評価のためのマイクロサテライト領域とミトコンドリア遺伝子の分析

応用生物科学 分子生命科学 光 永

徹AG―

薬用熱帯植物から生物活性物質の単離と同定

AG―

椎動物脳における各種分子配列の解析

応用生物科学

応用生物科学

獣医解剖学

齋藤 正一郎応用生物科学

獣医病理学

酒 井 洋 樹AG―

伴侶動物腫瘍の分子病理学的研究

応用生物科学 獣医微生物学 福 士 秀 人AG―ウマヘルペスウイルスの分子学的病原性機構の解析

応用生物科学獣医学

西 飯 直 仁AG―

動物の糖脂質代謝、自己抗体および MHC 遺伝子に関する研究

応用生物科学

応用獣医学

杉 山

誠

AG―

人獣共通感染症病原体の遺伝子解析

応用生物科学 食品生命科学 岩 本 悟 志AG―

食品の高付加価値化に関する基礎的研究

応用生物科学

獣医寄生虫病学

高 島 康 弘AG―

寄生虫感染による宿主への影響

連合農学

ゲノム微生物学

鈴 木

徹

AG―

腸内細菌のゲノム解析

応用生物科学 応用動物科学 松 村 秀 一

AG―

哺乳類・鳥類の遺伝的多型の研究

応用生物科学山 本 義 治AG―

植物プロモーターの機能解析

応用生物科学 生物有機化学 柳 瀬 笑 子

植物分子生理学AG―

植物中の機能性成分の単離構造決定

応用生物科学 生物生産科学 只 野亮

AG―

ウズラのマイクロサテライト DNA マーカーの開発と遺伝的多様性解析

応用生物科学 生産環境科学 松 村 秀 一

AG―

マイクロサテライトマーカーを用いた岐阜県下に生息する
野生イノシシの遺伝的集団構造の解明

応用生物科学 生産環境科学 安 藤 正 規

AG―SSR マーカーを用いたニホンジカ地域集団の遺伝解析

応用生物科学 応用生命科学 岩 橋

均

AG―

酵母のゲノム研究応用生物科学

獣医分子病態学

村 上 麻 美AG―

イヌ腫瘍のゲノム研究

応用生物科学

植物遺伝育種学山 根 京 子AG―遺跡から出土した植物遺物（ムギ類）の DNA 鑑定

―

―

学

登録
人数

部

講 座 等

利用責任者

登録番号

研 究 テ ー マ

連合獣医

応用獣医学

浅 井 鉄 夫AG―

動物由来の薬剤耐性菌

連合創薬

医療情報学

桑 田 一 夫DM―

論理的創薬によるプリオン病やインフルエンザの治療薬開
発

連合創薬

創薬科学

赤 尾 幸 博DM―

プラスミド DNA のシーケンス

連合創薬

医療情報学

丹 羽 雅 之DM―

好中球の免疫蛍光染色観察

流域圏

植生資源研究部門

景 山 幸 二RY―

糸状菌の系統分類解析

流域圏

水質安全研究分野

李

富 生

RY―

水系・土壌環境における微生物群集構造の解析

情報メディア

情報メディア開発研究部門

篠 田 成 郎IM―

流域環境に及ぼす森林土壌微生物生息状況の影響評価

生命科学

ゲノム研究分野須 賀 晴 久LS―

フザリウム菌のゲノム解析

生命科学

ゲノム研究分野

下 澤 伸 行LS―

遺伝性疾患の診断、病態解明、治療法の開発

生命科学

動物実験分野 平 田 暁 大LS―

実験動物を用いた発がんメカニズムの解明

生命科学

嫌気性菌研究分野

田中 香お里LS―

細菌ゲノムのシーケンス

生命科学

機器分析分野 犬 塚 俊 康

LS―

生物活性物質の構造解析

生命科学

機器分析分野 鎌 足 雄 司

LS―タンパク質の立体構造、揺らぎ、相互作用研究

生命科学

ゲノム研究分野高 島 茂 雄LS―

ゼブラフィッシュ・メダカのゲノム解析

岐阜薬科大学 医薬品情報学 中 村 光 浩

PH―UPLC-MS を用いた薬物／生体バイオマーカーの測定系の開発とその応用――ゲノム研究分野共同利用機器紹介⑴

識別結果を見やすく表
示、＋／−アッセイサ

DNA 関連機器〈― 〉（― ） マルチキ ャ ピ
ラ リ ー DNA シ ー ケ ン
サー
ABI Prism

ンプルを自動的に判定、本体前面からの簡単なプレートセッティ

Genetic

ング、 色フィルタホ
イ ー ル と、CCD カ メラによる多色蛍光検

Analyzer
アプライドバイオシステ
ム社
色蛍光標識を用いた蛍光
ジデオキシターミネーター

出。

ABI

基準としたサンプルと
ABI PRISM
Real-time PCRの CT（Threshhold Cycle）値の差を用いる相対定量の実験、自動解析が可Genetic Analyzer

法及び 色蛍光プライマー法による DNA の塩基配列を決定する装置。電気泳動
キャピラリを 本装備。ポリマー充填、
サンプル注入、能。発現定量・SNP タイピング・細菌検査等幅広い
アプリケーションに対応。

分離と検出、データ解析は全て自動。GeneMapper により AFLP 解析、SNPs 解析にも対応。 ウェルある〈― 〉（― ） リアルタイム定量 PCRABI Step one plus

いは ウェルプレートを 枚セット可能。 ．時間で塩基× 試料の分析が可能、受託解析に使用。
台所有。本機で DNA シーケンスの受託解析も行ってアプライドバイオシステム社
色／ ウェルフォーマットで、精度の高い定量リア
ルタイム PCR を実現。FAMTM／SYBRⓇ Green、VICⓇ／JOETM、ROXTM、TAMRATM などの蛍光色素が検出でき、遺伝子発現解析、病原遺伝子の定量、SNP ジェ
ノタイピング、プラス／マイナス・アッセイなどの実験が出来る。従来の個体どうしの比較のみならず、集団間の比較を行うことが可能。

いる。
〈
― 〉
（
― ） マルチキャピラリー DNA シーケンサー
ABI Prism
XL Genetic Analyzer
アプライドバイオシステム社
DNA の塩基配列決定やフラグメント解析に利用。
ジェネティックアナライザ同様、 本キャピラ
リーを搭載するが、新型ポリマーでより短時間で配列の決定が可能。

ABI Step one plus〈― 〉（― ） バイオアナライザ
Bioanalyzer
アジレントテクノロジー社
通常、DNA 分析ではゲル電気泳動、タンパク質分析
では SDS-PAGE で得る結果を、専用チップを使用しABI Prism
Genetic Analyzer〈― 〉（― ） DNA 多型解析ソフト
ジーンマッパーアプライドバイオシステム社て短時間、簡単に得るための装置（最大 サンプルの定性および定量のデジタル デ ー タ を 分 で 取 得 可能）。抽出した RNA の品質評価も可能。

DNA フラグメントのサイズコールからアレルコールを行うジェノタイピングソフトウェア。
〈― 〉（― ） リアルタイム定量 PCR
ABI PRISM
アプライドバイオシステム社
リアルタイム定量 PCR システムと専用試薬の組合せ
により、指数関数的な増幅領域での検出が可能。
多色プローブによる検出に対応、PCR 増幅プロットのリアルタイムモニタリング、融解曲線分布、アレル

Bioanalyzer

―

―

〈
― 〉
（
― ） ハイブリダイゼーションオーブン
GA

動植物細胞に DNA を導入に使用。

アジレントテクノロジー社
DNA マイクロアレイのハ
イブリダイゼーションため〈― 〉（― ） 遺伝子導入装置
Neon Transfection Systemのインキュベータ。取り外し可能なロータラックを備Life Technologies-Invitrogen 社

え、回転速度とハイブリダ
イゼーション温度の設定が可 能。最 大 個 の オ リ ゴ〈― 〉（― ） マルチビーズバイオアッセイ装置
Luminex
ミリポア社
少量（〜 μL）の試料をもとにマイクロビーズとフDNA マイクロアレイ用ハ
イブリダイゼーションチャG

ンバを固定可能。

ローサイトメトリーを利用して最大 項目までサイトカインやリン酸化タンパク質などの定量測定ができる他、SNPs など DNA、microRNA の分析などにも

A

〈
― 〉
（
― ） DNA マイクロアレイスキャナー（新）Array Scan

利用可能。

アジレントテクノロジー社
Cy 、Cy の二色法と単色法に対応する高機能スキャ
ナ。解像度が分析が可能。

μm でK／枚などの高密度アレイのLuminex〈― 〉（― ） パルスフィールドゲル電気泳動装置
CHEF-DR Ⅱ
バイオラッド社
数百から数メガベース以上の DNA のシャープな分離が可能。クロモゾームマッピング、RFLP 分析、ジー
ンマッピング等に使用。

Array Scan〈― 〉（― ） マイクロアレイ用データ解析ソフトウェア
GeneSpring
トミーデジタルバイオロジー社
遺伝子発現アレイなどの数値解析、生物学的解析など、さまざまな機能を搭載したデータマイニングソフ
トウェア。遺伝子発現解析機能に加え、miRNA、Real-CHEF-DR Ⅱ

TimePCR、CNV、SNP、Pathway 解析等も行う事が可能。

⑵ タンパク質・プロテオーム関連機器〈― 〉（― ） MALDI‐TOF／TOF 質量分析装置
Bruker Ultraflex
日本ブルカー・ダルトニクス社
MALDI-TOF に よ る 総

GeneSpring

MS 解 析 と、MALDITOF／TOF タンデム質〈― 〉（― ） エレクトロポレーター
Gene Pulser Ⅱ
バイオラッド社

量分析 を 用 い た 詳 細 な
MS／MS 解 析 に よ り、
高い確 度 と ハ イ ス ル ーエレクトロポレーショ
ンとは、電気パルスにプットでタンパク質の同定が可能。総括的な MS

より瞬間的に細胞に穿孔し DNA 等の高分子を細胞に導入する方／MS 情報が極微量の試料サンプルから数秒で得られる。 fmol 以下のペプチド試料についてアミノ酸配列の決定が可能。

法。大腸菌をはじめとする細菌の形質転換、Gene Pulser Ⅱ――

MALDI-TOF／TOF Bruker Ultraflex

〈
― 〉
（
― ） 質量分析装置
UPLC-MS〈― 〉（― ） 冷却 CCD カメラ
Ez―キャプチャー AE-

日本ウォーターズ社
耐圧性に優れ、 液によるグラディエント分析が可ATTO 社
冷却 CCD カメラを利用能。UV 検出器を備えている。ESI 法による質量分析が可能。

し て 発 光 を 検 出 す る。
ウ ェ ス タ ン・サ ザ ン・
ノーザンブロットにおけるケミルミ検出などに利
用可能。

〈
― 〉（
― ） 蛍光発光イ
メージングシステム
AEQUORIA

UPLC-MS⑶

Ez-キャプチャー AE-

浜松ホトニクス社
超高感度冷却 CCD カ

光学系分析機器

メラにより組織レベルの蛍光・発光の検出が
可能。

〈
― 〉
（
― ） マルチ蛍光スキャナー
Typhoon
アマシャムバイオサイエンス社
放射性同位体と蛍光、ケミルミネッセンスの つのス
キャンモードと、高い感度と解像度によるマイクロア
レイ解析、フラグメント解析や、二次元電気泳動解析
等に対応。

AEQUORIA〈― 〉（― ） 微量サンプル分光光度計
NanoVue
GE ヘルスケアバイオサイエンス社
キュベットを使用せず、少量試料の測定が可能。
CyDye 標識、核酸濃度・純度、タンパク質濃度などの測定に使用。

蛍光スキャナー Typhoon

NanoVue

〈
― 〉
（
― ）
、（ ） マルチラベルプレートリーダー
WallacARVOsx（ ）WallacARVO SX-DELFIA（ ）パーキンエルマーライフサイエンス社〈― 〉（― ） 分光光度計
Ultrospecpro
GE ヘルスケアバイオサイエンス社
紫外から可視領域における試料の吸光度が測定でき る 装 置。 μl の 微 量

ARVOsx は ウェルプレートをはじめ、様々プ
レートを用いて蛍光、発光、蛍光偏光をハイスループッ
トで測定可能。 、 、
ウェル標準プレート、、 、 、 ウェル培養プレートに対応。ARVOsxDELFIA は時間分解蛍光測定が可能。

試料に対応。核酸やタン
パク質の濃度測定などに利用。
Ultrospec

pro

〈
― 〉
（
― ） イメージン
WallacARVOsx（ ）WallacARVO SX-DELFIA（ ）グサイトメーター
IN Cell Analyzer
GE ヘルスケアバイオサイエンス社
マルチウェルプレートへ播種した細胞等の全自動――

IN Cell Analyzer

トルイメージング（近接した蛍光の分離、スペクトル

撮影及び統計学的解析が行える。 色の半導体ランプ
によって多色での蛍光観察と撮影が可能。全自動で撮

カーブの測定）も可能。

影された画像を付属のソフトウェアで統計処理。薬剤の量的評価や未知薬剤のスクリーニングなどにも使用
可能。

〈
― 〉
（
― ） 倒立型蛍光顕微鏡
Axiovert〈― 〉（― ） フローサイトメーター
セルアナライザー EC

カールツァイス社〈― 〉（― ） 正立型顕微鏡
Axioskop

ソニー社
蛍光抗体で標識した細胞を高速に解析。オートサ

カールツァイス社

ンプラーによる サンプ
ル連続自動測定が可能。

〈― 〉（― ） 実体顕微鏡
Stemi＋

本 の レ ー ザ ー（ ，， ， nm）と 個の蛍光検出器を搭載。

カールツァイス社
セルアナライザー EC

Axioskop⑸ バイオインフォマティクス関連機器〈― 〉（― ） フローサイトメーター
セルソーター SH〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置
Image Master Platinum

ソニー社
蛍光抗体で標識した細胞を分取（ソーティング）
することができる。 方向同時ソーティングおよび ウェルプレートまでのマルチウェルプレート
へのソ ー テ ィ ン グ が 可SH能。 本のレーザー（ ，， ， nm）と 個の蛍光検出器を搭載。

アマシャムバイオサイエンス社
二次元電気泳動で分離されたタンパク質スポットパ
ターン、等電点、分子量、ボリューム等を解析。ImageMaster D Elite、 D Database は 種類以上のゲルの比較解析からスポットの有無、増減の数値化やデー
タベース化をサポート。ゲル、ブロッティングメンブ
レンの画像はデスクトップスキャナー Image Scanner
またはバリアブルイメージアナライザー Typhoon な
どの画像解析装置からは TIFF 形式の取り込みが可
能。

⑷

主要機能
・スポット検知、バックグラウンド削除
・ 枚までの自動スポットマッチング
・マーカー／マーカースポットからの分子量・等電点
決定

顕微鏡

〈
― 〉
（
― ） 共焦点レーザースキャン顕微鏡
LSM
カールツァイス社
倒立型顕微鏡。光源に Ar（・マッチングスポットの量変化の表示
・インターネットデータベースの検索

nm）

及 HeNe（ nm）レーザーを搭
載、ピンホールの自動制御によりクリアな共焦点蛍光像が得られる。細胞内におけるタンパク質の・

D DIGE に対応

局在等の解析に力を発揮。また、焦点面を変化させながら Z 軸の連続画像を取り込み、コンピュー
タ上で立体画像構築が可能。

LSM
Image Master Platinum〈― 〉（― ） 共焦点レー
ザースキャン顕微鏡
LSM

〈
― 〉
（
― ） 電気泳動ゲル画像解析装置
Image Master VDS
GE Healthcare Bioscience 社

カールツァイス社， ， ， ， nmのレーザーを搭載。タイム シ リ ー ズ、FRAP、
FRET の 他 に、ス ペ ク

LSM

―

―

〈
― 〉
（
― ） 蛋白質立体構造情報解析装置
DSModeling
Accelrys 社
蛋白質・核酸の立体構造を書としても使用可能。

次元的に可視化する装置。ホモロジーモデリング法とモレキュラーダイナ
ミックス法により高分子の立体構造を予測するシステ
ム。

IPA⑹ クロマトグラフィー・電気泳動関連機器〈― 〉（― ） タンパク精製用低圧クロマトグラフィー
AKTA prime
GE HealthcareBioscience 社
ポンプ、検出器、フラク
ションコレクターを内蔵した一体型の低圧クロマ
トグラフィーシステム。

DSModeling〈― 〉（― ） プロテオミクス支援システム
MASCOT

His-tag タンパク質 な どの精製に利用できる。

Matrix Science 社
タンパク質の遺伝子同定を 支 援 す る シ ス テ ム。
データベースをもとに仮
想上のペプチド断片のセットを発生、MALDITOF に よ る ペ プ チ ド
MS フ ィ ン ガ ー プ リ ン
MASCOTテ ィ ン グ や TOF／TOF
解析で得られる試料のデータと照合することにより遺伝子を同定。

〈― 〉（― ） 等電点電気泳動システム
IPGphor + SE Ruby+Ettan Dalt
アマシャムバイオサイエンス社
等 電 点 電 気 泳 動 と SDS
ポリアクリルアミドゲル
電気泳動により、数千個のタンパク質を 次元で展開。

IPGphor + SE

⑺

〈
― 〉
（
― ） プロテオミクス支援システム
ProteinLynx Global SERVER（PLGS）
Waters 社
Waters Xevo QTofの精密質量データを

Ruby

遠心分離機

〈
― 〉
（
― ） 超遠心分離機
Optima L- K
ベックマンコールター社

基 と し て、独 自 のフィルタリング機能

最 高 krpm。 ml×や計算機能を用いて解析を行う、定量的および定性的プロテ
オミクス研究の MS
インフォマティクス

AKTA prime

本の超遠心分離が可能。

ProteinLynx Global SERVER（PLGS）

Optima L- K

プラットフォーム。

〈― 〉（― ） 微量超遠心〈― 〉（― ） 分子間ネットワ ー ク／パ ス ウ ェ イ 解 析

分離機
Optima TL
ベックマンコールター

データベース
IPA

社
最高

トミーデジタルバイオロジー社
マイクロアレイやメタボロミクス、プロテオミクス、
RNA-Seq などの実験より得られたデータをもとにしkrpm。微量試料．ml× 本の超遠心分離が可能。

て生物学的な機能の解釈やパスウェイ解析を行うことができるソフトウェア。豊富な相互作用情報や分子情報がデータベース化されているため、分子生物学の辞――

Optima TL

⑻

〈
― 〉
（
― ） 凍結プレス破砕装置
クライオプレス CP-

培養機・細胞破砕機〈― 〉（― ） 振盪培養機

マイクロテック・ニチオン社
液体窒素で凍結させた試料を、ステン

TA- R-FF
高崎科学器械

レスチャンバーに入れ、圧搾空気により駆動されたハンマーで衝撃をあたえることで破砕。骨組織や、木質等も破本の ml フラスコを往復または旋回で振盪。
温度範囲： ℃〜 ℃。
振盪スピー ド： 〜
rpm。

砕が可能。

クライオプレス〈― 〉（― ） ストマッカー
Stmacher
Seward 社

上：往復振盪専用 下：旋回振盪専用

Circulator

ポリエチレンの袋にサンプルを入れ、圧縮をくり返すこと〈― 〉（― ） フレンチプレス
型

で温和な条件で組織をホモゲ
ナイズ。食品中の微生物検査
等に使用。

大岳製作所
大岳手動式プレス型の仕様変
更により、嫌気条件下での細胞破砕を可能にした装置。従来通りの使用も可能。 ml の標準セル（〜， kgf／cm ≒ ， psi）とストマッカー〈― 〉（― ） ポリトロンホモゲナイザー
PTKinematica 社
ドライブシャフトの先端にある回転刃を高速で回転させることで生じる水流と、キャビテーションによる超音波で試料を破砕。動物や植物の組織からのRNA 抽出等に使用。

ml の高圧対応セル（耐圧未定おそ ら く ， kgf / cm ≒ ，psi）で、酵母の粉砕等に使用。

フレンチプレス〈― 〉（― ） 密閉型超音波破砕機
Biorupter
コスモバイオ社
密閉式で複数試料の同時超音波処理 が 可 能。 ml 用
スピッツなら最大 本、．
ml マイクロチューブなら本、 ml チ ュ ー ブ な ら

ポリトロンホモゲナイザー〈― 〉（― ） 電動ミンサー
MS B
南常鉄工社
精肉店等で使われているものと同じ電動ミンチ。
牛、豚等の大量の組織からの抽出作業に威力を発揮。

本。マルチタイマーにより破砕時間のセット が 可ACBiorupter

能。
〈
― 〉
（
― ） マルチビーズショッカー

V で稼働。

電動ミンサー

MB GU（S）
安井器機株式会社
試料をガラスビーズやメタ
ルコーンと共に撹拌することで破砕。試料間のクロス
コンタミネーションや
RNase の 混 入 を 防 止。酵母、バクテリア、カビ、固い動物組織、植物組織を数
十秒〜数分で破砕。

マルチビーズショッカー――

利用の手引き（平成 年 月 日改訂）
．利用登録
① 生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野（以下「ゲノム研究分野」という。
）の共同利用機器・実験室等を利用する者は、利用責任者と経費負担責任者を明記した利用登録申請書を提出するものとする。
② 利用登録申請の方法については、ゲノム研究分野のホームページ内「利用登録申請」の項（http://www ．
gifu-u.ac.jp/~lsrc/dgr/touroku/）を参照するものとする。
．共同利用機器① 共同利用機器の内容及び利用料は、別紙のゲノム研究分野利用料金表に従うものとする。
② 利用者の資格利用できる者は、利用登録申請書を提出し、センター長の許可を得た者のうち、装置の説明会に参加した者、装置の操作に習熟した者及び装置の操作に習熟した者の下で利用する者とする。
③ 利用の手続き
利用する場合は、生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野（以下「ゲノム研究分野」という。
）のホームページ（http://www ．
gifu-u.ac.jp/~lsrc/dgr/）にて機器予約の手続きを行うものとする。
予約は ヶ月先の月末までを限度とし、 回分の予約は原則として 時間以内とする。同一グループの連日予約は原則 日までとし、更に連日の使用を希望する場合はゲノム研究分野に相談することとする。
④ 機器不調の報告
機器に不調がある場合は、直ちに管理室に連絡すること。不調のまま使用してはならない。
⑤ 機器の損傷
利用者の不注意によって機器を損傷したり、不調にした場合の修理費は経費負担責任者が負うものとする。
⑥ 機器の利用記録
使用記録簿が設置されている機器を利用した場合は、その都度必要事項を記入しなければならない。
．実験室等の利用① 利用手続き
植物用グロースキャビネット、実験台、実習室、研修セミナー室、P レベル実験室、植物
栽培室、P 温室を利用しようとする場合は、それぞれ利用申込書（別紙様式第 号〜第号）により手続きを行うものとする。
（書式のダウンロード http://www ．
gifu-u.ac.jp/~lsrc/dgr/dl/）② 利用料
別紙のゲノム研究分野利用料金表に従うものとする。
③ 利用終了、中止の際の原状復帰
利用者は、教育・研究を終了または中止したときは、速やかに実験室等を原状に復帰し、管理室に報告してゲノム研究分野の行う利用終了確認を受けなければならない。
④ ゲノム研究分野内の禁煙と飲食ゲノム研究分野内は禁煙とし、飲食は所定の場所で行うこととする。

――

．機器の運搬① 機器の搬入利用者がゲノム研究分野に持ち込む機器は必要最小限の小型機器とし、大型機器を搬入してはならない。小型機器を搬入する場合は小型機器搬入申込書（別紙様式第 号）により手続きを行うものとする。
（書式のダウンロード http://www ．
gifu-u.ac.jp/~lsrc/dgr/dl/）② 搬入した小型機器の所属表示、維持・管理
搬入した小型機器には利用責任者の氏名、連絡先を明記することとし、その維持・管理は、利用責任者が行うものとする。
③ 搬入した小型機器の搬出搬入した小型機器の承認期間が満了したときは速やかに搬出するものとする。
④ 機器の搬出・貸出
利用者がゲノム研究分野所有の機器の搬出・貸出を希望する場合は、当分野に相談の上、申請書を作成するものとする。
．時間外の利用
ゲノム研究分野の定められた利用時間外に本分野を使用する者は、時間外利用願いを提出しなければならない。
（書式のダウンロード http://www ．
gifu-u.ac.jp/~lsrc/dgr/dl/）．ゲノム研究棟出入りの方法
ゲノム研究棟及びゲノム研究棟 RI 実験室への出入りは、利用登録申請書を提出し認証登録を完了した職員証カード、学生証カード、または Felica 式施設利用証を使用するものとする。
．利用料負担額
利用料は経費負担責任者が負うものとする。料金は別紙のゲノム研究分野利用料金表に従うものとし、運営費交付金、寄付金、受託研究費、科学研究費補助金の振替により行う。
．緊急事態発生の際の措置
緊急事態が発生した場合、各部屋に表示してある緊急避難経路、ガスの元栓の場所、電源の場所を参照して適切に対処すること。
．利用上の問題点の処理
利用者がゲノム研究分野を利用する上で、不便に感ずることなど問題が生じた場合は、ゲノム研究分野の専任教員を通じてセンター長に申し出ることとする。センター長は、必要に応じて運営委員会で審議の上、改善を図るものとする。
．業績の提出について
次年度に利用を継続する利用責任者は、利用登録申請書に従って、前年分（ 〜 月）の業
績（論文・著書）を提出するものとする。次年度に利用を継続しない場合は、当該年度の業績（論文・著書）を提出するものとする。

――

別紙 ゲノム研究分野利用料金表
事

平成 年 月改訂
項

料金

備考， 円／人・年

年度毎の更新 ／ 〜 ／．登録料（ ） 登録料．共同利用機器料金表 ※n−〈n〉−（n）は管理番号
DNA 関連機器
〈
― 〉
（
― ）
（
、 ） DNA シーケンサー

〈
― 〉
（
― ）
（
、 ） DNA シーケンサー

円／サンプル※ サンプル以上（ 〜 サンプル）
円／サンプル，（No．〜 ）
（反応済），

※ 〜 サンプル
円／サンプル円／サンプル※ サンプル以上（No．〜 ）
（反応前）
（ 〜 サンプル）
円／サンプル※大量サンプル応相談〈― 〉（― ） DNA シーケンサー

円／サンプル※ サンプル以上（No．）（フラグメント解析）（ 〜 サンプル）
円／サンプル〈― 〉（― ） DNA 多型解析ソフトジーンマッパー

―――

〈
― 〉
（
― ） リアルタイム定量 PCR ABI PRISM

円／使用

〈
― 〉
（
― ） リアルタイム定量 PCR ABI Step one plus

円／使用

〈
― 〉
（
― ） Agilent〈― 〉（― ） Agilent G

バイオアナライザ―――

A ハイブリダイゼーションオーブン， 円／使用〈― 〉（― ） Agilent DNA マイクロアレイスキャナ， 円／スキャン〈― 〉（― ） エレクトロポレーター Gene Pulser II―――

利用は要相談〈― 〉（― ） 遺伝子導入装置 Neon Transfection system―――

利用は要相談〈― 〉（― ） マルチビーズバイオアッセイ装置 Luminex

円／使用

〈
― 〉
（
― ） パルスフィールドゲル電気泳動装置 CHEF-DRII

円／泳動

タンパク質・プロテオーム関連機器〈― 〉（― ） 質量分析装置 MALDI-TOF/TOF， 円／時間〈― 〉（― ） 質量分析装置 UPLC-MS， 円／使用光学系分析機器〈― 〉（― ） マルチ蛍光スキャナ Typhoon

円／使用

〈
― 〉
（
― ） マルチラベルプレートリーダー Wallac〈― 〉（― ） マルチラベルプレートリーダー Wallac

ARVO SX

円／時間

ARVO SX-DELFIA

円／時間

〈
― 〉
（
― ） 冷却 CCD カメラ Ez-キャプチャー AE-

円／時間

〈
― 〉
（
― ） 蛍光発光イメージングシステム AEQUORIA

円／使用

〈
― 〉
（
― ） 微量サンプル分光光度計 NanoVue

―――

〈
― 〉
（
― ） 分光光度計 Ultrospec

―――

pro

〈
― 〉
（
― ） イメージングサイトメーター IN Cell Analyzer（撮影）

円／使用

〈
― 〉
（
― ） フローサイトメーター セルアナライザー EC

円／使用

〈
― 〉
（
― ） フローサイトメーター セルソーター SH

円／使用

顕微鏡
〈
― 〉
（
― ） 共焦点レーザースキャン顕微鏡 LSM

円／使用

〈
― 〉
（
― ） 共焦点レーザースキャン顕微鏡 LSM， 円／使用〈― 〉（― ） 倒立型蛍光顕微鏡 Axiovert

円／使用

〈
― 〉
（
― ） 正立顕微鏡 Axioskop

―――

〈
― 〉
（
― ） 実体顕微鏡 Stemi―――

バイオインフォマティクス関連機器〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置 Image Master D Platinum， 円／使用〈― 〉（― ） 電気泳動ゲル画像解析装置 Image Master VDS

―――

〈
― 〉
（
― ） タンパク質立体構造情報解析装置 DSModeling， 円／年又は＊ ， 円／使用〈― 〉（― ） プロテオミクス支援システム MASCOT

―――

〈
― 〉
（
― ） プロテオミクス支援システム ProteinLynx Global SERVER

―――

―

―

利用は要相談※解析ソフトのみの
利用は無料

〈
― 〉
（
― ） 分子間ネットワーク／パスウェイ解析データベース IPA

―――

〈
― 〉
（
― ） マイクロアレイ用データ解析ソフトウェア Gene Spring―――※継続検討中クロマトグラフィー・電気泳動関連機器〈― 〉（― ） タンパク精製用低圧クロマトグラフィー AKTA prime

， 円／日

〈
― 〉
（
― ） 等電点電気泳動システム IPGphor+SE， 円／使用Ruby+Ettan Dalt

遠心分離機
〈
― 〉
（
― ） 超遠心分離機 Optima L- K

， 円／時間〈― 〉（― ） 微量超遠心分離機 Optima TL， 円／時間培養機・細胞破砕機〈― 〉（― ） 振とう培養器 TA- R-FF

―――

〈
― 〉
（
― ） フレンチプレス

―――

型

〈
― 〉
（
― ） 密閉型超音波破砕機 Biorupter〈― 〉（― ） マルチビーズショッカー MB

―――
GU（S）

―――

〈
― 〉
（
― ） 凍結プレス破砕装置クライオプレス CP-

―――

〈
― 〉
（
― ） ストマッカー Stomacher―――

Circulator〈― 〉（― ） ポリトロンホモゲナイザー PT-

―――

〈
― 〉
（
― ） 電動ミンサー MS B―――

．実験室・実験台（ ） 動物遺伝子実験室（）実験台（ スペース分：中央実験台半分）（ ） P レベル実験室

， 円／月
， 円／週

（ ） 植物用グロースキャビネット コイトトロン（

）

， 円／月

（ ） 植物栽培室， 円／月（ ） P 温室， 円／月（ ） 研修セミナー室

円／時間

学外対象

円／使用

土日祝日他
当分野が定める休館日．時間外利用料金（ ） 時間外利用料金――

．平成 年度活動状況報告⑴

講習会・トレーニングコース・講演会等◆平成 年 月 日（金） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［マイクロアレイデータ解析ソフトウェア GeneSpring／分子間相互作用データベース IPA 講習会］
参加者 名
◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ： 、 ： 〜 ： 、日（水） ： 〜 ： 、 ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［共焦点レーザー顕微鏡 Carl Zeiss LSM

］

参加者 名

◆平成 年 月 日（金） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［分子間相互作用データベース IPA Ingenuity Pathways Analysis ハンズオンセミナー］
参加者 名◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［メタボロミクス講習会］

参加者 名◆平成 年 月 日（金） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［マイクロアレイを使いこなそう講習会］

参加者 名◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ：中学生のための生命科学体験プログラム「君にもできる DNA 鑑定」

参加者 名◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ： 、 日（水） ： 〜 ：高校生のための生命科学体験プログラム「ゲノムって何？」

参加者 名◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ： 、 日（水） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［SH 次世代セルソーター］

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ： 、 ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［EC 新世代セルアナライザー］

参加者 名◆平成 年 月 日（火）、 日（水） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［イメージングサイトメーター IN Cell Analyzer］

参加者 名

―

―

◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［次世代シーケンサー MiSeq］

参加者 名◆平成 年 月 日（月） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［分子間相互作用データベース IPA Ingenuity Pathways Analysis ハンズオンセミナー］
参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［フローサイトメーター（基礎〜応用）セミナー講習会］

参加者 名◆平成 年 月 日（水） ： 〜 ： 、 ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［SH 次世代セルソーター］

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ： 、 ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［EC 新世代アナライザー］

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［マイクロアレイデータ解析ソフト GeneSpring／分子間相互作用データベース IPA］
参加者 名
◆平成 年 月 日（水） ： 〜 ： 、 ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［SH 次世代セルソーター］

参加者 名◆平成 年 月 日（木） ： 〜 ： 、 ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［EC 新世代アナライザー］

参加者 名◆平成 年 月 日（火） ： 〜 ：生命科学総合研究支援センターゲノム研究分野機器講習会［リアルタイム PCR 講習会］

参加者 名

―

―

⑵

ゲノム研究分野利用状況

ᆅᇦ⛉Ꮫ㒊
2䠄3ྡ䠅

䛭䛾௚
14䠄44ྡ䠅ᩍ⫱Ꮫ㒊
3䠄12ྡ䠅

ᛂ⏝⏕≀⛉Ꮫ㒊
33䠄209ྡ䠅ᕤᏛ㒊
11䠄42ྡ䠅་Ꮫ㒊
26䠄66ྡ䠅

H 年度

H 年度

H 年度

利用登録数

DNA シーケンサ

／

H 年度

H 年度

XL 利用推移

UPLC-MS（Q-tof）利用推移

シーケンス学部別受託件数（反応済）
H 年度

⑶

H 年度

リアルタイム定量 PCR 及び Step One Plus 利用推移

シーケンス学部別受託件数（反応前）

共焦点レーザー顕微鏡 LSM

及び LSM

利用推移

共同スペース利用状況
室名（室番号）

利用責任者（登録番号）

植物栽培室（ ）植物栽培室（ ）植物用グロースキャビネット
（平成 年 月迄）
P 温室
F 実験室

小山 博之（AG― ）百町 満朗（AG― ）須賀 晴久（LS― ）――百町 満朗（AG― ）光永徹（AG― ）

⑷平成 年度業績論文等

RS―［ ］向井貴彦、国崎亮、淀太我（）
。 岐阜県における 種の外来ナマズ目魚類の野外での初記
録と文献に基づく岐阜県産魚類目録の改訂岐阜県博物館調査研究報告 （ ）、 ―MD―［ ］Nagai, A., Hara, M., Ishihara, T., Tamura, A., Kido, A., Bunai, Y.:（）INDEL polymorphisms at―e
the DXS
flanking region in four racial populations. Forensic Sci Int Gene Supple , e［］Elmadaw, MA., Nagai, A., Gomaa, GM., Hegazy, HMR., Shaaban, FE., Bunai Y. “Investigation of―,
mtDNA control region sequences in an Egyptian population sample.” Legal Med ,.
MD―［ ］Huongle, T., Kobayashi, M, Nakata, M, Shioi, G, Miyachi, H, Honjo, T, Nagaoka, H.（）“In Vivo
Analysis of Aicda Gene Regulation: A Critical Balance between Upstream Enhancers and Intronic Silencers Governs Appropriate Expression.” PLoS One; : e.
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EG―［ ］Nomura, Y., Onda, Y., Ohno, S., Taniguchi, H., Ando, K., Oka, N., Nishikawa, K., Yokogawa, T.
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from Methanosarcina acetivorans.” Protein Expr Purif, , ―）“A simple［ ］Ikeda―Boku, A., Ohno, S., Hibino, Y., Yokogawa, T., Hayashi, N., Nishikawa, K.（
system for expression of proteins containing -azidotyrosine at a pre-determined site in Es―
cherichia coli.” J Biochem,,［ ］Yamamoto, H., Okada, R., Iguchi, K., Ohno, S., Yokogawa, T., Nishikawa, K., Unno, K., Hoshino, M.,
Takeda, A.（）“Involvement of plasmin-mediated extracellular activation of progalanin in an―.
giogenesis.” Biochem Biophys Res Commun,,［ ］Ikeda-Boku, A., Kondo, K., Ohno, S., Yoshida, E., Yokogawa, T., Hayashi, N., Nishikawa, K.（）“Protein fishing using magnetic nanobeads containing calmodulin site-specifically immobilized― .
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EG―
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serves longstanding use.” Phytopathology,:［ ］Ishiguro, Y., Asano, T., Otsubo, K., Suga, H., Kageyama, K.（）“Simultaneous detection by――multiplex PCR of the high-temperature-growing Pythium species: P. aphanidermatum, P. helicoi―
des and P. myriotylum” Journal of General Plant Pathology, :［ ］Li, M., Inada, M, Watanabe, H., Suga, H., Kageyama, K.（）“Simultaneous detection and quantification of Phytophthora nicotianae and P. cactorum, and distribution analyses in strawberry― .
greenhouses by duplex real-time PCR” Microbes and Environments, :［ ］Suga, H., Hirayama, Y., Morishima, M., Suzuki, T., Kageyama, K., Hyakumachi, M.（）“Devel―opment of PCR primers to identify Fusarium oxysporum f. sp. Fragariae” Plant Disease, :.
LS―［ ］下澤伸行（） ペルオキシソーム病ハンドブック〜全てのペルオキシソーム病患者の診断治療を目指して〜 日本臨床社．
［ ］下澤伸行監修，副腎白質ジストロフィー診療ハンドブック
作成委員会編集（） 副腎白質ジストロフィー診療ハンドブック〜ALD 患者を支えている関係者の皆様へ〜 ．
［ ］下澤伸行（） 原発性高シュウ酸尿症Ⅰ型・Ⅱ型 先天代謝異常ハンドブック pp ― ．
中山書店．
［ ］下澤伸行（） Zellweger spectrum 先天代謝異常ハンドブック pp ― ．中山書店．
［ ］下澤伸行（） rhizomelic chondrodysplasia punctate（RCDP）type
先天代謝異常ハン
ドブック pp ― ．中山書店．
［ ］下澤伸行（） 副腎白質ジストロフィー 先天代謝異常ハンドブック pp ― ．中山書店．
［ ］下澤伸行（） ペルオキシソーム β 酸化酵素欠損症 先天代謝異常ハンドブック pp ― ．
中山書店．
［ ］下澤伸行（） Refsum 病、rhizomelic chondrodysplasia punctate（RCDP）type ・先
天代謝異常ハンドブック pp ― ．中山書店．
［ ］下澤伸行（） ペルオキシソーム病 今日の神経疾患治療指針 第 版 水澤英洋、鈴木則
医学書院．
宏、梶 龍兜、吉良潤一、神田 隆、齊藤 延人編．pp ―［ ］下澤伸行（） ペルオキシソーム病 小児科診療 （ ） ― ．
［ ］塩田睦記、舟塚 真、小田絵里、白戸由理、竹下暁子、石垣景子、斉藤加代子、下澤伸行、大澤眞木子 （） 極長鎖脂肪酸の反復検査で診断し得た D-bifunctional protein 欠損症の 例
東京女子医科大学雑誌 ：E ― ．
［ ］Yamada, M., Tanaka, M., Takagi, M., Kobayashi, S., Taguchi, Y., Takashima, S., Tanaka, K., Touge
T, Hatsuta, H., Murayama, S., Hayashi, Y., Kaneko, M., Ishiura, H., Mitsui, J., Atsuta, N., Sobue, G.,
Shimozawa, N., Inuzuka, T., Tsuji, S., Hozumi, I.（）“Evaluation of SLC A mutations that― ．
cause idiopathic basal ganglia calcification in Japan．
” Neurology （ ）:［ ］Vu Chi Dung., Nobuyuki Shimozawa, Nguyen Ngoc Khanh, Bui Phuong Thao, Can Thi BichNgoc, Nguyen Phu Dat, Nguyen Thi Hoan.（）“Mutations of ABCD gene and phenotype ofVietnamese patients with X-linked adrenoleukodystrophy（X-ALD）.” International Journal of
Pediatric Endocrinology Suppl :.
［ ］Ohba, C., Osaka, H., Iai, M., Yamashita, S., Suzuki, Y., Aida, N., Shimozawa, N., Takamura, A., Doi,
H., Tomita-Katsumoto, A., Nishiyama, K., Tsurusaki, Y. , Nakashima, M. , Miyake, N. , Eto, Y. ,Tanaka, F., Matsumoto, N., Saitsu, H.（）“Diagnostic utility of whole exome sequencing in pa―
tients showing cerebellar and/or vermis atrophy in childhood.” Neurogenetics （ ― ）:.
［ ］Hama, K., Nagai, T., Nishizawa, C., Ikeda, K., Morita, M., Satoh, N., Nakanishi, H., Imanaka, T., Shimozawa, N., Taguchi, R., Inoue, K., Yokoyama,.K.（）“Molecular Species of Phospholipids
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［ ］Shuji Matsui., Masuko Funahashi, Ayako Honda, Nobuyuki Shimozawa.（）“Newly identified――

milder phenotype of peroxisome biogenesis disorder caused by mutated PEX gene.” Brain― .
Dev （ ）:［ ］Yumi Mizuno, Yuichi Ninomiya, Yutaka Nakachi, Mioko Iseki, Hiroyasu Iwasa, Masumi Akita,
Tohru Tsukui, Nobuyuki Shimozawa, Chizuru Ito, Kiyotaka Toshimori, Megumi Nishimukai, Hiroshi Hara, Ryouta Maeba, Tomoki Okazaki, Ali Nasser, Ali Alodaib, Mohammed Al Amoudi,
Minnie Jacob, Fowzan S. Alkuraya, Yasushi Horai, Mitsuhiro Watanabe, Hiromi Motegi, Shigeharu Wakana, Tetsuo Noda, Igor V. Kurochkin, Yosuke Mizuno, Christian Schönbach, Yasushi
Okazaki.（）“Tysnd deficiency in mice interferes with the peroxisomal localization of PTS
enzymes, causing lipid metabolic abnormalities and male infertility.” PLOS Genetics （ ）:e．
［ ］Masashi Morita, Junpei Kobayashi, Kozue Yamazaki, Kosuke Kawaguchi, Ayako Honda, Kenji
Sugai, Nobuyuki Shimozawa, Reiji Koide Tsuneo Imanaka.（）“A novel double mutation in
the ABCD gene in a patient with X-linked adrenoleukodystrophy: Analysis of the stability andfunction of the mutant ABCD protein.” J Inher Metab Dis, Rep : ― .
［ ］Iwasa, M., Yamagata, T., Mizuguchi, M., Itoh, M., Matsumoto, A., Hironaka, M., Honda, A., Momoi,
M., Shimozawa, N.（）“Contiguous ABCD DXS
E deletion syndrome: Report of an― .
autopsy case.” Neuropathology （ ）:LS―［ ］Norihito Maru, Toshiyasu Inuzuka, Keita Yamamoto, Makoto Kitamura, Peter J. Schupp , Kaoru
Yamada, Daisuke Uemura（）“Relative configuration of luminaolide” Tetrahedron Letters―:⑸

ゲノム研究分野教員の教育研究活動等① 教育活動大学院連合創薬医療情報研究科（下澤）
代謝病態制御学特論
医学部（下澤）テュトーリアル「成育」コース小児病態学「遺伝性小児神経筋疾患」 時間
大学院連合農学研究科（須賀）副指導教員
大学院応用生物科学研究科（須賀）分子植物病学特論 単位
主指導教員
副指導教員
応用生物科学部（須賀）応用植物科学実験実習 I 単位 人で分担
微生物学 単位人で分担（ 回講義分）
卒業研究
単位
学外での講義（なし）② 研究活動〈学術論文〉（和文著書）
下澤伸行．ペルオキシソーム病ハンドブック―〜全てのペルオキシソーム病患者の診断治療を目―指して〜、大阪：日本臨床社；
年
下澤伸行監修、副腎白質ジストロフィー診療ハンドブック
作成委員会編集．副腎白質ジストロ
フィー診療ハンドブック〜ALD 患者を支えている関係者の皆様へ〜、岐阜：西濃印刷；
年
下澤伸行．原発性高シュウ酸尿症Ⅰ型・Ⅱ型．先天代謝異常ハンドブック、東京：中山書店．
年： ― ．
下澤伸行．Zellweger spectrum．
．先天代謝異常ハンドブック、東京：中山書店． 年： ― ．
下澤伸行．rhizomelic chondrodysplasia punctate（RCDP）type ．先天代謝異常ハンドブック、
東京：中山書店．
年： ― ．
下澤伸行．副腎白質ジストロフィー．先天代謝異常ハンドブック、東京：中山書店．
年： ―．
下澤伸行．ペルオキシソーム β 酸化酵素欠損症．先天代謝異常ハンドブック、東京：中山書店．
年： ― ．
下澤伸行．Refsum 病、rhizomelic chondrodysplasia punctate（RCDP）type ・ ．先天代謝異常
ハンドブック、東京：中山書店．
年： ― ．
下澤伸行．ペルオキシソーム病．今日の神経疾患治療指針第 版、東京：医学書院；
年： ―．
（英文原著）
Iwasa M, Yamagata T, Mizuguchi M, Itoh M, Matsumoto A, Hironaka M, Honda A, Momoi M, Shimozawa N. Contiguous ABCD DXS
E deletion syndrome: Report of an autopsy case. Neuro― ,.
pathology :Masashi Morita, Junpei Kobayashi, Kozue Yamazaki, Kosuke Kawaguchi, Ayako Honda, Kenji
Sugai, Nobuyuki Shimozawa, Reiji Koide Tsuneo Imanaka. A novel double mutation in the ABCD
gene in a patient with X-linked adrenoleukodystrophy: Analysis of the stability and function of.
the mutant ABCD protein. J Inher Metab Dis, Rep : ― ,Ohba C, Osaka H, Iai M, Yamashita S, Suzuki Y, Aida N, Shimozawa N, Takamura A, Doi H, TomitaKatsumoto A, Nishiyama K, Tsurusaki Y, Nakashima M, Miyake N, Eto Y, Tanaka F, Matsumoto
N, Saitsu H. Diagnostic utility of whole exome sequencing in patients showing cerebellar and/or― ,.
vermis atrophy in childhood. Neurogenetics :Hama K, Nagai T, Nishizawa C, Ikeda K, Morita M, Satoh N, Nakanishi H, Imanaka T, Shimozawa N,
Taguchi R, Inoue K, Yokoyama K. Molecular Species of Phospholipids with Very Long Chain―,.
Fatty Acids in Skin Fibroblasts of Zellweger Syndrome. Lipids :Shuji Matsui, Masuko Funahashi, Ayako Honda, Nobuyuki Shimozawa. Newly identified milder phe―,notype of peroxisome biogenesis disorder caused by mutated PEX gene. Brain Dev :.
Yamada M, Tanaka M, Takagi M, Kobayashi S, Taguchi Y, Takashima S, Tanaka K, Touge T, Hatsuta H, Murayama S, Hayashi Y, Kaneko M, Ishiura H, Mitsui J, Atsuta N, Sobue G, Shimozawa N,
Inuzuka T, Tsuji S, Hozumi I. Evaluation of SLC A mutations that cause idiopathic basal gan― ,.
glia calcification in Japan. Neurology :Vu Chi Dung, Nobuyuki Shimozawa, Nguyen Ngoc Khanh, Bui Phuong Thao, Can Thi Bich Ngoc,
Nguyen Phu Dat, Nguyen Thi Hoan. Mutations of ABCD gene and phenotype of Vietnamesepatients with X-linked adrenoleukodystrophy（X-ALD）. Int J Pediatr Endocrin Suppl :,.
Yumi Mizuno, Yuichi Ninomiya, Yutaka Nakachi, Mioko Iseki, Hiroyasu Iwasa, Masumi Akita, Tohru Tsukui, Nobuyuki Shimozawa, Chizuru Ito, Kiyotaka Toshimori, Megumi Nishimukai, Hiroshi
Hara,Ryouta Maeba, Tomoki Okazaki, Ali Nasser, Ali Alodaib, Mohammed Al Amoudi, Minnie Jacob, Fowzan S. Alkuraya, Yasushi Horai, Mitsuhiro Watanabe, Hiromi Motegi, Shigeharu Wakana,
Tetsuo Noda, Igor V. Kurochkin, Yosuke Mizuno, Christian Schönbach, Yasushi Okazaki. Tysnd――deficiency in mice interferes with the peroxisomal localization of PTS enzymes, causing lipid
metabolic abnormalities and male infertility. PLOS Genetics,; :e.
Ohba C, Osaka H, Shimozawa N, et al. Diagnostic utility of whole exome sequencing in patients― ,.
showing cerebellar and/or vermis atrophy in childhood. Neurogenetics :Geiser DM, Aoki T, Bacon CW, Baker SE, Bhattacharyya MK, Brandt ME, Brown DW, Burgess LW,
Chulze S, Coleman JJ, Correll JC, Covert SF, Crous PW, Cuomo CA, De Hoog GS, Di Pietro A, Elmer WH, Epstein L, Frandsen RJN, Freeman S, Gagkaeva T, Glenn AE, GordonTR, Gregory NF,
Hammond-Kosack KE, Hanson LE, Jímenez-Gasco MM, Kang S, Kistler HC, Kuldau GA, Leslie JF,
Logrieco A, Lu G, Lysøe E, Ma LJ, McCormick SP, Migheli Q, Moretti A, Munaut F, OʼDonnell K,
Pfenning L, Ploetz RC, Proctor RH, Rehner SA, Robert VARG, Rooney AP, Salleh B, Scandiani
MM, Scauflaire J Short DPG, Steenkamp E, Suga H, Summerell BA, Sutton DA, Thrane U, Trail F,
Diepeningen AV, VanEtten, HD, Viljoen A, Waalwijk C, Ward TJ, Wingfield MJ, Xu JR, Yang XB,
Yli-Mattila T and Zhang N, One fungus, one name: defining the genus Fusarium in a scientifically― ,．
robust way that preserves longstanding use. Phytopathology:
Ishiguro Y, Asano T, Otsubo K, Suga H and Kageyama K, Simultaneous detection by multiplex PCRof the high-temperature-growing Pythium species: P. aphanidermatum, P. helicoides and P. myrio― ,．
tylum. Journal of General Plant Pathology :Li M, Inada M,Watanabe H,Suga H and Kageyama K, Simultaneous detection and quantification of
Phytophthora nicotianae and P. cactorum, and distribution analyses in strawberry greenhouses― ,．
by duplex real-time PCR. Microbes and Environments :Suga H, Hirayama Y, Morishima M, Suzuki T, Kageyama K and Hyakumachi M, Development of― ,．
PCR primers to identify Fusarium oxysporum f. sp. fragariae. Plant Disease :Shigeo Takashima, Manash Paul, Patrick Aghajanian,Amelia Younossi-Hartenstein, Volker Hartenstein. Migration of Drosophila intestinal stem cells across organ boundaries. Development:―,．
（英文総説）
Shigeo Takashima, David Gold and Volker Hartenstein. Stem cells and lineages of the intestine: a de．
velopmental and evolutionary perspective. Development Genes and Evolution, ― ,（和文原著）
塩田睦記、舟塚 真、小田絵里、白戸由理、竹下暁子、石垣景子、斉藤加代子、下澤伸行、大澤眞木子．極長鎖脂肪酸の反復検査で診断し得た D-bifunctional protein 欠損症の 例．東京女子医科大学雑誌．
年； 巻 E ― ．
（和文総説）
下澤伸行．ペルオキシソーム病．小児科診療．
年； 巻： ― ．
（その他）なし
〈学会発表〉（国際招待講演）
Shimozawa N: Peroxisomal disorder. th Asian and Oceanian Congress on Child Neurology. Riyadh. September.
Shimozawa N: Diagnosis and treatment of Peroxisomal diseases. rd ACIMD＆ th JSIMD. Maihama. November.
（国際学会）Development of real-timePCR assey for quantitative detection of Phythium helicoides. Ishiguro Y, Li
M, Otsubo K, Suga H, Kageyama K, th International Phytophthora, Pythium, and Related Gen／
era Workshop, Beijing International Convention Centre, Beijing China,――

Development of real-time PCR assay for quantitative detection of high-temperature tolerant,
filamentous-sporangium forming Pythium species, P. aphanidermatum and P. myriotylum. Kageyama K, Ishiguro Y, Li M, Otsubo K, Suga H, The th International Congress of Plant Pathol／ogy, Beijing International Convention Center, Beijing China,
Zebrafish as a model system to understand the pathology of peroxisomal disease. Takashima S,
Toyoshi K, and Shimozawa N. The
rd Asian Congress for Inherited Metabolic Diseases（ACIMD）／ The th Annual Meeting of the Japanese Society for Inherited Metabolic Siseases／（JSIMD）, Tokyo Bay Maihama Hotel Club Resort, Chiba, Japan,（国内学会）
遺伝子導入による Fusarium fujikuroi G 系統株のフモニシン産生能の回復．須賀晴久、スコット暁子、小林弘典、景山幸二、清水将文、百町満朗、第 回日本マイコトキシン学会学術講演会、神奈川（麻布大学）、／
ムギ類赤かび病菌のチオファネートメチル耐性．須賀晴久、畑作物の薬剤抵抗性病害虫の防除に関する検討会、愛知（桜華会館）、／
イネばか苗病菌 Fusarium fujikuroi に見出された 系統性．須賀晴久、平成 年度東海植物病学研究会、静岡（掛川グランドホテル）、／
ネギ属植物間の根圏細菌相の比較解析．西岡友樹、鈴木陽子、百町満朗、清水将文、須賀晴久、小林一成、小林裕子、The th International Symposium on Life Sciences、富山（富山大学）、／
ゲノム分析で見えてくるフザリウム菌の進化・生態．須賀晴久、第 回フザリウム研究会、茨城（筑
波山江戸屋）、／
Fusarium fujikuroi の G 系統株に見出だされたフモニシン産生遺伝子クラスターの部分欠失とFUM 遺伝子の発現異常．須賀晴久、スコット暁子、景山幸二、北嶋美葉、清水将文、百町満朗、
第 回日本マイコトキシン学会学術講演会、大阪府（大阪府立大学）、／
国内分離株に見られる Fusarium fujikuroi の 系統と国外分離株との関係．須賀晴久、新井満大、
船坂美佳、清水将文、景山幸二、百町満朗、日本植物病理学会西部会、岡山（岡山大学）、／
トマトの極少量培地栽培における Pythium aphanidermatum のモニタリング．石黒泰、大坪佳代
子、玉井大悟、谷明、須賀晴久、景山幸二、日本植物病理学会西部会、岡山（岡山大学）、／（セミナー等）
下澤伸行．
「極長鎖脂肪酸代謝異常症の病態解明と治療法の開発」
第 回小野医学研究財団 研究成果発表会 大阪、 月
下澤伸行．
「これだけは伝えたい診断法―ペルオキシソーム病」
第 回先天代謝異常学会セミナー、品川、 月
下澤伸行．
「副腎白質ジストロフィー 難病対策とハンドブックの紹介」
NPO 法人 ALD の未来を考える会 秋のセミナー in Osaka、大阪大学病院、 月、⑹

補助金関連採択状況

下澤伸行
平成 〜 年度 文部科学省科学研究費基盤研究（B）（研究代表者）「網羅的ペルオキシソーム機能解析による神経・代謝性疾患の病態解明」： ， 千円（ ， 千円）
平成 〜 年度 文部科学省科学研究費挑戦的萌芽研究（研究代表者）「多角的アプローチによる
副腎白質ジストロフィーの脱髄発症・病型規定因子の同定」： ， 千円（ ， 千円）
平成 年度厚生労働科学研究費補助金（難治性疾患克服研究事業）（分担研究者）「ライソゾーム病（ファブリ病含む）に関する調査研究」： ， 千円――

須賀晴久：	
 科学研究費補助金基盤研究（C）（研究代表者）「イネに寄生する糸状菌のカビ	
  毒産生能の遺伝的要因解明」（1，933千円）	
 農林水産省委託プロジェクト研究（カビ毒動態と生産低減技術の開発）（研究代表者）「イネにおけるフモニシン産生フザリウム菌の実態と生産管理がフモニシン汚染に与える影響の解明」（4，130千円）	
 高島茂雄：	
 科学研究費補助金若手研究（B）（研究代表者）「ゼブラフィッシュを用いたペルオキシ
ソーム病発症メカニズムの解明」（1，809千円）	
 — 45 —

――