ISSN 1349-6816

水産業の未来を拓く

Fisheries Research Agency News

特集

ゲノム研究最前線

Topics

28 年後に届いた漂流はがき
研究成果情報ワムシの入手と利用タイプの現状
水産生物遺伝資源保存事業（ジーンバンク事業）

2012.1
vol.

29

震災復興への取り組み

東北地方における
サケ漁業と増殖事業の復旧状況

Fisheries Research Agency News

Contents
震災復興への取り組み
東北地方におけるサケ漁業と増殖漁業の復旧状況････････････････････････････････････2
福島県への調査船の派遣･････････････････････････････････････････････････････････････････････5

特集 ゲノム研究最前線
水産総合研究センターの研究の現状と戦略･････････････････････････････････････････････6遺伝子ってなに？ ゲノムってなに？･･･････････････････････････････････････････････････8
魚の染色体を見てみよう !!･････････････････････････････････････････････････････････････････ 10
ノリのゲノム情報解析が進展･･新たに、高水温耐性に関連する遺伝子を発見････ 12
魚類養殖の生産性向上に有効な遺伝子を特定

筋肉量が約２倍になる品種開発が可能に･･･････････････････････････････････････････････ 14
ゲノム情報を利用した新しい水産用ワクチンの開発･････････････････････････････････ 15
海洋環境へのゲノム研究の応用例 メタゲノム解析の将来展望･･･････････････････ 18
さかな

あんじいの魚菜に乾杯
第18 回 冬に脂がのる旬のクロダイ
シンプルな塩焼きを香味オイルでアレンジ

うまこれが旨い！･････････････････････ 22

研究成果情報ワムシの入手と利用タイプの現状･･･････････････････････････････････････････････････････ 24
水産生物遺伝資源保存事業（ ジーンバンク事業 ）･･･････････････････････････････････ 25

会議・イベント報告
国際ワークショップを CLIOTOP と共同で開催････････････････････････････････････ 26
第 16･回地域水産加工技術セミナー･････････････････････････････････････････････････････ 26
第 2 回サイエンスステージ････････････････････････････････････････････････････････････････ 27
第４回瀬戸内海水産フォーラム･･････････････････････････････････････････････････････････ 27
韓国で開催された 2011 年日中韓水産研究機関長会議に出席･･･････････････････ 28「 養殖漁業の今と将来 」～シニア講座で出前講義を行いました～･････････････ 28
第 31 回全国豊かな海づくり大会に出展･･･････････････････････････････････････････････ 29
第 50 回･農林水産祭「 実りのフェスティバル 」に出展････････････････････････････ 29

Topics
28 年後に届いた漂流はがき･･････････････････････････････････････････････････････････････ 30

知的財産情報白化出現頻度が低いヒラメ家系を選ぶ～詳細化するヒラメ DNA 情報の活用～･･････････････････････････････････････････････ 31

ピックアップ・プレスリリース
クロマグロ稚魚が活発に食べる配合飼料を開発！
～天然資源に依存しない養殖技術へ一歩前進～･････････････････････････････････････ 32

刊行物報告

岩手県

宮古
釜石

宮城県

気仙沼
南三陸

福島県

石巻
塩釜

研究開発情報「 北の海から 」第 12 号･･･････････････････････････････････････････････････ 33
研究の動き 第 9 号･････････････････････････････････････････････････････････････････････････ 33
ななつの海から 第 1 号･･･････････････････････････････････････････････････････････････････ 33
瀬戸内通信 第 14 号･･･････････････････････････････････････････････････････････････････････ 33
増養殖研究レター 第 1 号････････････････････････････････････････････････････････････････ 33
研究の栞･････････････････････････････････････････････････････････････････････････････････････････ 33
海洋水産資源開発ニュース No.398･･････････････････････････････････････････････････ 33
海洋水産資源開発ニュース No.399、400、401･･･････････････････････････････ 34
平成 21 年度海洋水産資源開発事業報告書 No.3、4････････････････････････････ 34
おさかな瓦版 No.43、44････････････････････････････････････････････････････････････････ 34■おさかな チョット耳寄り情報 その 29
チヌとクロダイ･………………………………………………………………… 35■編集後記、執筆者一覧………………………………………………………… 35
表紙写真

CGによるDNA分子構造の立体モデル
vol.29 2012.1

2

水産総合研究センターは、東北地方の秋サケの漁期が始まったことをきっかけに、岩手県、宮城県、福島県、

日までに得られ（ 社）岩手県さけ・ます増殖協会、岩手県定置漁業協会、
月

カ所（

です。

％）が再開する見込みを記録している地域も認められます。

地域によっては、加工流通業が⑷ 加工流通の復旧状況

網 で 秋 サ ケ が 漁 獲 さ れ て い ま す。

十分に復旧しておらず、厳しい状

せきうち１０９隻（％）が操業を再た情報をもとに、東日本大震災で被災した地域におけ開する見込みです。定置網は、（ 宮古、釜石）および宮城県（ 気仙一 方 で、 当 セ ン タ ー が 岩 手 県

日時点では３０５カ所のうち沼、南三陸、石巻、塩釜）で調査

カ所（

月％）の再開に留まる見し た 結 果、 現 時 点 に お け る 両 県

月

月日までの沿岸漁獲数はています。
宮城県における

日までの沿岸漁獲数も万 ２ 千 尾（ 前 年 同 期 比％）と前年をやや下回っていますが、前年並み（ 前％） の 水 揚 げ

万 千トンに達すると推定され

レ、イクラ、ミール加工）は、約の秋サケの処理能力（ 主に、フィ日時点では通しでしたが、カ所の操業が確認されており、復旧が進んでいる塩釜地区だけで洋岸のえりも以東海区とえりも以⑶ 漁獲状況

ようすがうかがえます。
％ と 顕 著 で す。

これらのことから、本州太平洋岸％と岩 手 県、 宮 城 県 お よ び 水 産 総でも来遊数が予測を下回る可能性

１１１６万 千尾（ 前年同年同期の合研究センターの漁期前の予測でがあります。

岩手県における

は、今年度の太平洋沿岸へのサケ

月

西海区の落ち込みが、それぞれ前％に留まっており、とくに太平るサケ漁業および増殖事業の復旧状況と今後の見通しを取りまとめました。

１ ．サ ケ 漁 業 の 状 況

52

20 10

期比 ％）と前年を下回っ

千

年度、岩手県沿岸で千トン、宮城県沿岸で

秋サケは万

日までに１３５カ％）が操業中況におかれています。

今年度、刺し網漁業は２１１隻の宮城県では、主に刺し網と定置628⑵ 海面漁業の復旧状況⑴ 親魚の来遊予測

20

11
11

57

年同期比

7

水産加工流通業者などを通じて

84
4

23
来遊数は２０１０年度に比べ、増％増、宮城県沿岸：トンが漁獲されていました。

月

所のうち カ所（

置網は、

岩手県の秋サケの漁獲を担う定5加を見込んでいました（ 岩手県沿岸：前年比日時点で、北海％

前年比 ％増、北海道から茨城県

月までの太平洋沿岸：前年比
増）
。
しかし、

1

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3

75

10

20

83 78 107であり、今年の秋サケ漁期中には

3

11
95
1

8

99

10

10

28
68 11

7

11

道の来遊数の実績は前年同期の約

志津川魚市場（宮城県南三陸町）のサケとサバの水揚げ

86

50

20

57

震災復興への取り組みました。これは両県の沿岸と河川

千トンを上回り、マクロでにおける昨年度の来遊量の合計
万

見ると復旧に向けた関係者の取り組みが進んでいる状況もうかがえます。

．サケ 増 殖 事 業 の 状 況⑴ 河川における親魚捕獲の状況
河川で％）となっていますが、前での捕獲数は 万 千尾（ 前年同期比年度を上回る河川も少数ながら認められます。
宮城県では、昨年と同様に 河
川 で 捕 獲 が 実 施 さ れ ま す。 な お、
被災した 河川の捕獲施設でも復月日まで旧を行い、捕獲を実施する予定です。宮城県におけるの捕獲数は 万 千尾（ 前年同期
比１２０％）となっています。
河川のうち５推定され、２００８年度の放流数 億 千万
尾の約 ％となることが 見 込 ま れ て い ま す。

％

千１９２万

なお、 月 日までの採卵数は粒で、前年同期比となっています。

宮城県内のふ化場
カ所のすべてが、今
年度も放流を実施する

カ所では種苗生産を行予定です。ただし、河川のみで捕獲が実施される予定

福 島 県 で は、捕獲が実施される見込みです。岩

わず、稚魚をほかのふち、今年度は５カ所で放流を実施

カ所でのふ化場から譲り受けて放流するは種苗生産を行わず、稚魚をほか百万尾の ～ ％とな

千 百万

んでした。

千 百万尾の約 ％とについては、情報を入手できませなる見込みです。なお、採卵実績の放流数

で９６０万尾程度となり、 年度計画です。今年度の放流数は最大千万尾と推定され、 年度の放流数日までの採卵数はることが見込まれます。なお、千が、今年度の放流数は最大で ～放流する計画です。この結果、生で、主要な増殖河川である木戸川
うけどがわん。このため、福島県における

月 日までの捕獲数は 千尾（ 前年同期比 ％）となっています。

⑵ ふ化放流の状況
カ所のう

1

20 09

岩手県内のふ化場

カ 所 で 種 苗 生 産や

月

カ所のう

8

75

粒（ 前年同期比 ％）となっております。
福島県内のふ化場

4

ち、今年度は千万尾と98

放 流 を 実 施 で き る 見 通 し で す が、カ所ではふ化放流を休止する予億する予定です。ただし、月 日までの河川

手県における
20

河川遡上したサケ親魚（宮城県水尻川）

復旧中のふ化施設：水尻川ふ化場（宮城県南三陸町第二ふ化場）

産状況などにより変動はあります

化場から譲り受けて

3

5

11

90

8

岩手県では、昨年同様

4

10

6

11

や請戸川では捕獲が実施されませ11

4

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4

44

17

75

6

6

4

3

定です。このため、今年度の放流数は最大で 億～

3

10

22

28

5

3

08

10

10

5

11

1

14

1

10

17

7

5

60

10

6

2

10

27

12

2

2

Topics

福島県への調査船の派遣
福島県水産試験場の調査指導船「 いわき丸」が津波により沈没したため、福島県では、これまで行ってきた資源管理型漁業の推進に必要な海洋観測や水産資源調査などに支障をきたしていました。水産総合研究センターは、福島県から水産庁を通じて出されていた調査船の派遣・協力についての要望に応え、このたび、調査船「 こたか丸」を派遣、協力することとなりました。
「 こたか丸」は、10 月 10 日に福島県小名浜港に無事到着しました。福島県水産試験場では、各種調査を再開し、当センターも調査などに協力していきます。

■「こたか丸」の概要
竣

工1995 年３月･

総トン数

59 トン

全

30.0 メートル

長

航海速力

12 ノット福島県
小名浜港

10 月 10 日

5

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こたか丸が小名浜港に入港．まとめ

東北地方におけるサケ漁業と増殖事業は、関係者の懸命の努力に

より、地震発生直後に懸念された壊滅的状況から相当程度復旧が進んでいます。しかし、来遊実績が予測を下回る地域もあり、種卵確

保は予断を許さない状況です

今後も東北のサケ漁業と増殖事業が順調に進み、将来の回帰に重大な支障が生じることのないよう、関係者の取り組みに加え、当センターとしても増殖事業に対する技術的な支援を続け、サケ漁業と増殖事業の復旧状況に関するモ

ニタリングと関係者への情報提供を行い、東北水産業の復興に向けて尽力します。

3

タイセイヨウタラで全ゲノム配列がゲノム研究最前線
水産総合研究センターの研究の現状と戦略れました。これが、 年には、ワト

クリック両博士のＤＮＡ二重らせんに２００３年、ちょうどワトソン、

ロジェクトが世界で開始され、ついのか。１９９０年にヒトゲノム・プ

ちヒトの設計図は、どうなっているす。つまり生命の設計図です。私たた遺伝情報全体をゲノムと呼びま

はじめマウスやイネなどの動植物、大しています。これまでに、ヒトを界的なゲノム解読の動きが一気に拡

シーケンサーの登場です（ 図 ）。世

新的な進歩がありました。第 世代

るシーケンサーと呼ばれる機械の革これには、ＤＮＡ塩基配列を分析す

月、
１００万ドルで解読されました。

ソン博士個人のゲノムがたった カ態、飼育技術、さらに流通・消費まに沿って、海洋環境から魚介類の生とりまとめました（ ＊ ）。この戦略

いただき「 水産ゲノム研究戦略 」を確に行うため、専門の先生にも参画（ 写真 ）。ゲノム研究を効率よく的を中央水産研究所に導入しました

度に 台の“ 第 世代シーケンサー”

細胞の中のＤＮ Ａに書き込まれ構造解明から 周年目にあたる年、さまざまな微生物のゲノムが解読さでの幅広い範囲で、ＤＮＡ情報を活公表されています。

ム配列が明らかにされました。これれてきています。魚類では、
メダカ、

50

約 億の塩基からなるヒトの全ゲノ
30

約２億３千万ドルの予算がつぎ込ま

13

2

2

2

水産総合研究センターでは、 年には 年の歳月、多くの労力と総計用した革新的な技術の開発を進めて

09

08

ゼブラフィッシュ、フグ、トゲウオ、

2

特集＊「水産ゲノム研究戦略」

水産総合研究センターがとりまとめた「水産ゲノム研究戦略」は PDF ファイルで公開しています。ぜひご覧ください。

▶公開 URL

http://www.fra.affrc.go.jp/pressrelease/pr21/
220331/20110228besshi1.pdf

6

vol.29 2012.1

交流や親子の判別も可能で、すでにカー）を使うことによって、群れのなどに関係する遺伝子を見つけて、養殖では、成長や病気への抵抗性しました。また、疾病対策では、病のゲノム塩基配列の概要を明らかに

ノリ（ スサビノリ ）では、すでにそいます。
その活躍の場について、もう少しよい魚を作るような育種へ活用が可

図．シーケンサーの解読能力の向上

いろいろな魚種のマーカーを得ていヒトゲノム計画が始まった時代と比べ、第 2 世代シーケンサーの登場により、解読できる塩基数は飛躍的に増加しました。マグロのゲノムは 8 億塩基対程度
ですが、第 2 世代シーケンサー 1 回の分析でその程度あるいはそれ以上の塩基配列の情報を得ることができるようになっています。機器の進歩はめざましく、
第 3 世代シーケンサーでは、さらに解読性能が高くなると思われます。

具体的な例を紹介しましょう。まず、

1

切り身になってもＤＮＡから判別できます。このように、ＤＮＡ情報を活用したさまざまな技術の開発が進んでいます。

当 セ ン タ ー で は、 導 入 さ れ た 第世代シーケンサーをフル活用しつ

つ、研究対象としている海洋から食卓まで、水生生物のゲノム・遺伝子の研究を進展させて、水産業の発展と水産物の安定的な供給に貢献していきます。

本特集では、ゲノム・遺伝子について解説し、その活躍の場面の中から、海洋環境、養殖技術（ 育種への応用例として、 ページの知的財産紹介します。

疾病対策の最新の取り組みについて

情報に関連記事を掲載しています ）
、

31

2005
2000
1995
1990
1985

2

（年）

原体の遺伝子からワクチンの開発へ

10

2010

能です。例えば、クロマグロと食用

オートラジオグラフィーによる手分析

ます。

1000

ごと全部、ＤＮＡの情報から調べて1万います。次に魚介類。例えば、太平

10万す

写真．中央水産研究所に配備された
2 台の第 2 世代シーケンサー

魚介類が育つ環境では、肉眼では見第1世代シーケンサー
100万

取り組んでいます。魚介類の流通でRoche 454 FLX
1000万

洋の東と西に棲んでいる同じ種類の1億魚が、同じ群れか違う群れかという

10億

ことは、資源を管理するうえでは重要です。ＤＮＡ上の目印（ 遺伝マー

第2世代

えない細菌やプランクトンをはじめ
Illumina GAII

ヒトゲノム（約30億の塩基）
シーケンサー
マグロゲノム（約8億の塩基）100億一日あるいは一回あたりの解読塩基数

1000億

は、
魚介類が何という種類であるか、？

第3世代シーケンサー
1兆

いろいろな生物がいます。これを丸96本キャピラリー
オートシーケンサー（ ABI3730 ）
ゲル板オートシーケンサー（ ABI377 ）100

vol.29 2012.1

7

ゲノム研究最前線
特集

難易度★

難易度★★

は同じ意味ではありません。ＤＮＡが、“ 遺伝子 ”と“ ＤＮＡ ”は厳密に意外に思われるかもしれません

ゼ の 遺 伝 子 で は、 ５ ０ ３ 個 の ア デの唾液中の消化酵素であるアミラー

子ができあがります。例えば、ヒト

おり、それによってさまざまな遺伝含まれるすべての遺伝子をまとめてと推定されています。ある生き物に２万２千個、大腸菌では約４千３百個含まれています。例えば、人では約

生き物には、たくさんの遺伝子がす。例えば、“ ＡＧＴＣ ”という並び指し、その数を表す単位にもなりま

デオキシリボヌクレオチドのことをす。ちなみに、“ 塩基 ”とはここでは４６０万塩基である ”のように用いまる ”とか、“ 大腸菌ゲノムのサイズは遺伝子の集まりをゲノムと呼びます

は遺伝子の材料となる化学物質の名
ニン、４１９個のグアニン、５０９“ ゲノム ”と呼び、“ ヒトのゲノムに

8

vol.29 2012.1

遺伝子はＤＮＡからできています

前であり、正式にはデオキシリボ核個のチミンと３０５個のシトシンかの長さは 塩基と表します。
は ２ 万 ２千 個 の 遺 伝 子 が 含 ま れ て い

ラ ク タ ー ゼ の 遺 伝 子 で は、 そ れ ぞら で き て い ま す。 ま た、 胃 で 働 く形をしています。実際にはデオキシ

れ、１千５３６個、１千５８２個、一本のＤＮＡが折りたたまれたものを染色体と呼びます

難易度★★★

酸（ Deoxyribonucleic acid;Ｄ ＮＡ ）と呼ばれ、細長いひものようなリボヌクレオチドと呼ばれる化学物

１千４６４個、１千６９２個です。

下： ク ル マ エ ビ のDNA を読み取った結果 ( 緑 : アデニン , 黒 :グアニン , 赤 : チミン ,青 : シトシン )質がいくつも連なってひものように見えているのです。
デオキシリボヌクレオチドには、ており、例えば、ヒトであれば 本、マグロであれば 本です。

46

アデニン、グアニン、チミン、シト

だんだんと複雑になってきました

が、生物の体の中（ 正確には一つ一つの細胞の中 ）には、ＤＮＡが集まってできた染色体と呼ばれる物体があります。染色体は、電源のコードを束ねるように、ＤＮＡのひもが折り48

シンと呼ばれる つの種類があり、そ れ ぞ れ、
“ Ａ”
、
“ Ｇ”
、
“ Ｔ”
、
“ Ｃ ”と表します。これらが連なる数や順番は遺伝子によって異なって

上：塩基配列を読み取る装置(シーケン
サー )

4

核
DNA を
コンパクトに収納する
クロマチン構造

たたまれ、束ねられてできています。

また、すべてのＤＮＡが一つの染色体にまとめられているわけではな

く、数十～数百本に分けられています。この本数は生物によって異なっ

DNA
二重らせん

塩基対 A GACTG
T CTG
AC

染色体

細胞

4

なに？
なに？

難易度★★★★

遺伝子の伝わり方にはルールがあります

また、お父さん、お母さんもそれぞれ 本の染色体を持っていますので、同じきょうだい

でも受け継ぐ染色体は全く同じにはなりません。例えば、お母さんの 本の染色体のうち、ある 本をお兄さんが、残りの 本を妹さん表れます。このことは、遺伝子が伝わる仕組

だい同士でも、体のつくりや大きさに違いがように遺伝子を受け継いでいるはずのきょうと子は全く同じではありません。また、同じには親に似た特徴が表れます。けれども、親ています。個性を大切にすることは、進化の越えて子孫を残してこられたのだと考えられ体を生み出すことができ、環境の変化を乗り

物種は短い時間にさまざまな特徴を持った個です。こうした仕組みがあることで、ある生が受け継ぐ、といったようなことが起こるのヒトであれば、それぞれが持つ 本の染色体

みに答えがあります（ もちろんすべての違い

23

うえでも重要なのかもしれません。

23が遺伝子のせいではありません ）。例えば、遺伝子は親から子へ伝わっていき、子ども

46のうち、 本はお母さんから、もう 本はお

1 23 4 5 6 78

父さんから受け継いだものです。ですので、子どもはお母さんにも、お父さんにも似てい

1234567823

親から子への遺伝

両親の染色体の組み合わせによって、子どもでは最大 4 つの異なる組み合わせが生まれます。

子ども

46

て、
それでいて全く同じではなくなるのです。

子

難易度★★★★

り ま す。 最 近 で は Ｄ Ｎ Ａ の 分 析 によってクジラとカバが近い仲間であ46

それぞれ 2 種類のバンド（＝遺伝子）を持っていることが分かります。赤矢印の高さのバンドが母親から子どもに受け継がれた遺伝子を表しています。

DNA を使ったクルマエビでの親子判別

ＤＮＡを調べると生物の進化の歴史が見えてきます塩基の並びを“ 塩基配列 ”と呼び、生物の進化の過程でゆっくりと変化しており、その違いを見ることで生物の進化を捉えることができます。
例えば、ヒトとチンパンジーは進化的に近く、ゲノム全体の ％の塩基

トとネコではその割合は ％に下が配列には違いが見られませんが、ヒ

98

23

親

まずは言葉を知ろう！
ることが明らかになっています。

GC
T TCCCC ATC A AC T TCC TC AC TC
AC AC A AGA AGC TGCG…
C TCGGCC
T TGTATGTCG TG ACC C ATT T GAAA

GCTGGGCT
C GGG
TCCCCATCA ACT TCCTCACGCTCTACGTCACCGTCCAGCACAGC C
CCG CC G
AGA AGCTGCG…
メダカ

GGT
TCCCCATCA ACT TCCTCAC T CTC
ACACA AGA AGCTGCG…
GG T TGGCTTC TACGTCACCCTCGAC
CCC CG A A
トラフグ

遺伝子って
ゲノムって
90

母親

子ども

母親

GCT
AGA AGCTGCG…
C T T GG CT TCCCCATCA ACT TCCTCACGCTGTACGTCACAGTCCAGCACAGG C
AG CC G
ヒト

ウシ

vol.29 2012.1

9ゲノム研究最前線
特集

ヒト、ウシ、メダカおよびトラフグのロドプシン（目の中の光に反応する物質）遺伝子の DNA の違い。灰色部分に違いが見られます。

胞 個あたりが持つ染色体ですが、その数や形などの組み合わせ こ(れ

本、Ｖ字型の染色体が多い）、シロチョウザメ（ ２７０本、小を核型といいます は) 種によって大マグロ（

ＤＮＡは少しずつ折りたたまれていさい染色体が多い ）の染色体の写真

細 胞 が 分 裂 す る と き、 核 の 中 のき、ついには１本１本が顕微鏡でもちなみに、私たちヒトは 本の染色

きく違うことが分かると思います。

写真 1．魚の染色体をお見せします（ 写真１）
。どれも細

48

見える太さの棒状の物体になってじょうさいぼう娘細胞に分配されます。この棒状にみえるものが染色体です。染色体 ク(
ロモソーム、 chromosome)という名前の由来は、塩基性の色素によって 染 色 さ れ や す い と い う こ と で、
１８８８年、ヴァルデヤーという研究者によって名づけられました。
一般に、生物の持つ染色体の数や形、大きさは、種によって非常にバラエティーに富んでいます。このため、染色体の研究は古くから種判別などに利用されてきました。

体 を 持 っ て い ま す（ 写 真 ２）。ヒトなどの哺乳類の染色体と比べると、魚の核型は、（ １）染色体数が多い、（ ２）染色体のサイズが小さい、（ ３）
似たような形の染色体から構成されている、という特徴があります。
上の写真では見分けがつきません
が、実は魚類を含めた高等動物では、色体といい、一方は父親から受け継一つの細胞の中に同じ染色体が必ず一対含まれています。特殊な染色法

いだ染色体、もう一方は母親から受し まで染色体に縞模様（ バンド ）をつける

け継いだ染色体です。どちらの染色分類したものです。ニジマスは 本

写真３はニジマスの相同染色体をることから、
このように呼ばれます。

と、この対となった染色体を見つけ

写真 3．ニジマスの相同染色体を分類したものの染色体を持っているので、 対の60本（ １セット ）は雄から受け相同染色体があります。このうち一方の30

ここでは例として、ニジマス（

46

体も基本的に同じ遺伝子を持ってい写真 2．ヒトの染色体10vol.29 2012.1＊ μm： マイクロメートル。1 マイクロメートルは 1 ミリの千分の一の長さ1だすことができます。これを相同染

10μm

30

継いだ染色体、もう一方の 本 １(

30本、Ｘ字型の染色体が多い ）
、クロ

10μm

10μm＊
10μm
10μm

ニジマス
クロマグロ
シロチョウザメ

60

色体を
よう !!

魚の染
見てみ
仕組みを解き明かそうという研究を

ＮＡを解読することにより、生命のので、ゲノムを構成するすべてのＤ

要な働きを持つ「 動原体 」という特ロで、細胞分裂で染色体の分離に重かります。また、写真５はクロマグ

雌親のサクラマスから 本、雄親のきます。この雑種の場合は、理論上、け継いでいるのかを調べることがでニジマスから 本の染色体を受け継セット ）は雌から受け継いだ染色体

子やＤＮＡの染色体上の位置を調べめて検出する方法 ）を用いて、遺伝ている特定のＤＮＡを蛍光色素で染ダイゼーション法（ 染色体に含まれ最近ではインサイチューハイブリ

だけあることが分かります。写真６

べての染色体に共通して必ず１カ所います。この結果から、動原体はすまった部分が動原体の位置を示して部位を検出したものです。緑色に染

めふ化前に死んでしまいます ）。

ていないことが分かります（ このた

色体（ オレンジ色 ）を 本しか持っ体を失った結果、ニジマス由来の染ぐはずですが、受精後に一部の染色

殊な繰り返しＤＮＡからできているです。一般に相同染色体は、常染色付けられます。
この個体は雌なので、れ、次いで形や大きさの順に番号がめて検出しています。このような分色に、もう一方の遺伝子を緑色に染です。この場合、一方の遺伝子を赤

写真４は染色体上の位置を調べた例の染色体をオレンジ色に染めて検出

来の染色体を黄色に、ニジマス由来

染め分けたものです。サクラマス由

た雑種が持っている異種の染色体を）雄を掛け合わせ

現在、水産総合研究センターではクす。このような取り組みを通して、

Ａ配列の位置を調べることができま

いような情報、とくに遺伝子やＤＮは、ＤＮＡの分析だけでは分からな

以上のように、染色体の研究からジマス（ ２ｎ ＝１番から 番までの常染色体と、Ｘ

析 に よ り、 ヒ ラ メ で は こ れ ら ２ 種

ロマグロで遺伝子の地図を作ろうとわせが違う染色体 ）に大きく分けら

染色体という性染色体に分類されましています。これにより、雑種が両写真 6．ニジマスとサクラマスの交雑種

類の遺伝子が同じ染色体（ １番染色

ニジマス

努力しています。

18

10μm

親（ 種 ）から染色体をどのように受サクラマス体 ）上に並んでいるということが分

写真 5．クロマグロ動原体

す 雄( の性染色体はＸ染色体とＹ染

動原体

色体になります 。)なお、前述した

10μm

セ ッ ト を「 ゲ

赤に染まる部分染色体のノム 」と呼び「 ｎ 」で表しと表ま す。 こ の た め、 ニ ジ マ
ス の 核 型 は ２ｎ ＝

ノムにはその生物が必要

現 さ れ ま す。 概 念 上、 ゲ

60とするすべての遺伝情報

写真 4．ヒラメリボゾームで調べた 2 種類の遺伝子

66

10μm

60

緑に染まる部分

29

1

）雌とニ

は、サクラマス（ ２ｎ ＝

とくに「 ゲノム解析 」と呼びます。

33

る研究も行われています。例えば、

30体と性染色体（ 性別によって組み合

顕微鏡の世界をのぞいてみると…
が一とおりそろっているvol.29 2012.1

11ゲノム研究最前線
特集

葉体の長さは、野生種は 20 セン
チ程度ですが、養殖種は１メート
ルになることもあります。幅は数センチから十数センチ、厚さは数十マイクロメートル程度です。

ノリのゲノム情報解析が進展

新たに、高水温耐性に関連する遺伝子を発見

こうそう

ノリ養殖業でもっともよく栽培されている紅藻類の海藻「 スサビノリ 」（ 写真１）は北方系の種類なので、高水温に弱いという性質があります。

そのため、近年の高水温により秋の漁期の開始が遅れる傾向にあり、とくに２００７年には カ月も遅れるなどの問題が発生したため、環境変化に対応したノリ優良品種の作出が求められています。また、スサビノ

リが、高温に対して生理的にどのよ

解読し、その情報を研究に活用してノリ養殖業の主要対象種であるスサ

水 産 総 合 研 究 セ ン タ ー で は、 日

います。このたび、高水温に対するうに反応するのかは明らかではあり

立ソフトウェアエンジニアリング株

スサビノリの生理的な反応を分子レ

ビノリの全ゲノム塩基配列の概要を

式会社、日本ソフトウェアマネジメ

ベルで調べたところ、ノリが高水温ませんでした。

ント株式会社と共同で、これまでに

1

写真 1．スサビノリ＊1

熱ショックタンパク質（ HSP：Heat-Shock Protein）
生物が高温などのストレスにさらされたとき、量が増えて熱によるタンパク質

熱ショックの変性を抑えたり、壊れたタンパク質を修復したりする働きのあるタンパク質。
さまざまな種類があり、分子量（ 炭素原子の重さを 12 としたときの各分子の比

天然タンパク質

変性したタンパク質

HSP

較的な重さのこと。タンパク質は炭素、水素、酸素、チッ素、イオウの原子から作られている ）によって分類されています。例えば分子量が約 7 万の HSP は
HSP70、約 2 万の HSP は HSP20 と呼ばれています。高等植物では、HSP100
や HSP20 が高温耐性に大きな役割を持っていることが知られています。

HSP による
タンパク質の折りたたみ介助

熱ショックにより細胞内でHSP 量増加

熱ショックタンパク質（HSP）の働きの概念図

vol.29 2012.1

12

特集

ゲノム研究最前線にさらされた時に生体を守るためにになったことから、今後、これらの伝子がノリに存在することが明らか

より、
高温耐性のメカニズム解明や、働くと考えられる熱ショックタンパ

した。さらに、ノリ遺伝子全体の中高水温耐性を持つ新たな優良品種の遺伝子の働きをさらに調べることにから、外見では全く見分けがつかな

作出に役立てることができます。まつ発見しまいノリ製品を識別するための目印とた、作り出した優良品種の国内におク質（ ＊ １）遺伝子をなるマイクロサテライトＤＮＡ（ ＊ける育成者権を保護するためにも、製品でノリ品種を識別するＤＮＡ

マーカーを役立てることができます。

）マーカー候補も多数取得することができました。

これらの熱ショックタンパク質遺

2

3

＊2

マイクロサテライト DNA
全遺伝子を構成する DNA の中で 2 つから５つの DNA の単純な繰り返しとなっている部分。
繰り返し回数や種類が非常に多いため、個体識別や集団構造解析などの有用な目印として用いられています。また、有用な遺伝子の染色体上の位置情報を取得するためにも利用されています。

プライマー

a
b
c
d
e
f

分析の対象にしたマイクロサテライトDNAの例

プライマー

繰り返しの
回数

CACACA 〜 CACACACACACA 〜 CACACACACACACACA 〜 CACACACACACACACACACA 〜 CACACACACACACACACACACACA 〜 CACACACACACACACACACACACACACA 〜 CACACACACACACACACACACACACA

10 回
12回
14回
16回
18回
20回

分子の大きさや電荷の差を利用して電圧をかけて分離する方法である
電気泳動を行うと、マイクロサテライトDNAの長さの違い（繰り返し
回数の違い）が位置の違いとして現れる

a/a a/b c/c a/c b/f c/d e/e d/e e/f

電気泳動の
開始点
f
e
d
c
b
a

電気泳動による
各マイクロサテ
ライトDNAの到達点

プライマー
DNAを増幅するときに必要な、反応の開始点となる短いDNA配列のこと。通常はDNA20個程度の長さを持つ。プライマーのDNA配列は、増幅したいDNAの配列に対応して決まる。

左図は CA（シトシンとアデニン）の繰り返

しからなる CA リピートの例で、この場合の繰り返し数は 10 ～ 20 回です。電気泳動を行うと、マイクロサテライト DNA の長さの違い（繰り返し回数の違い）が位置の違いとして現れます。この違いにより、個体や品種、種の違いを区別することが可能となります。
横軸は、分析した９個体が持っている、分析の対象にしたマイクロサテライト DNA の種類（a/a、a/b など）を表しています。縦軸は、マイクロサテライト DNA の電気泳動の開始点からの移動距離を表していて、短いマイク

ロサテライト DNA（繰り返し回数が少ない）ほど長い距離（下側）に移動します。

ゲノム上に存在するマイクロサテライト DNA の例

13

vol.29 2012.1

魚類養殖の生産性向上に有効な遺伝子を特定な選抜育種によって高産肉性（ 肉がこさせて優良な品種の選抜を行う突らない突然変異を、より高頻度で起用いて自然には低い頻度でしか起こ

では、紫外線、放射線や化学物質をを発見しました。このメダカの筋肉が変異している遺伝子を持つメダカ

うに、ミオスタチン遺伝子に一部分

マッスルウシ（ ＊２）」と全く同じよの品種として知られている「 ダブル10mm

ダブルマッスルメダカ（左側）と通常メダカ（右側）ともに同週齢（ふ化後 18 週目）の雄ですが、ダブル
マッスルメダカは、通常メダカより体高、体幅が増加し、全身の筋肉量が多くなっています。

写真．ダブルマッスルメダカ（左側）と通常メダカ（右側）14

vol.29 2012.1

筋肉量が約２倍になる品種開発が可能に多くとれる性質 ）、高成長などの品

然変異育種法によって数多くの品種

量は、通常のメダカに比べて、体長子を調べたところ、高産肉性のウシ

種改良が進んでいます。家畜に比べが作出されています。このあたりの筋肉量（ 可食部位量 ）が１・ん。一個体が大量の種を作る農作物て育種の歴史が短い魚類では、優良突然変異育種法を、水産総５～ 倍多いことを確認しました。
今回の成果から、ミオスタチン遺ステーキ 100g

低価格で

家畜では長い年月をかけた伝統的品種の開発がほとんど進んでいませ合 研 究 セ ン タ ー は、 世 界に先駆けて、魚類の優良品なりました。また、農作物に用いら伝子の変異は、魚でもウシと同様に

当センターと慶應義塾れる突然変異育種法を利用して、魚種の開発に応用する研究を大学の研究グループは、突類でも高産肉性品種を含むさまざま

筋肉量を増大させることが明らかと然変異を人為的に起こさせな優良品種が開発できることが示さ

これらの手法により、長い時間がて、さまざまな遺伝子を持た。これらのメダカについかかる選抜育種を効率的に行うことれました。

て、筋肉量の調整に関わるができるようになります。

つメダカを作り出しまし行ってきました。

2
ミオスタチン（ ＊１）遺伝

品種改良

産肉性の向上を示す
ウシの遺伝子に注目

てっさ 半皿通常メダカ
ダブルマッスルメダカ

ステーキ 200g

図．生産性向上の模式図

スルウシは、ミオスタチン遺伝子に欠損がある

パでは高く評価されています。このダブルマッ

少なく軟らかい肉を生産することから、ヨーロッ

割 を 持 ち、 筋 肉 が 多 く な ら な い よ う に 抑 制 す る

ことが明らかにされています。近年、日本の和＊１ ミオスタチン： 筋 肉 細 胞 の 増 殖 分 化 に 重 要 な 役
働 き が あ り ま す。 こ の 遺 伝 子 が 損 な わ れ る と 筋り作出されています。

牛でも、ミオスタチン欠損個体が選抜育種によ肉量が増大することが知られています。

いるウシで、ピエモンテ種などがあり、脂肪が＊２ ダブルマッスルウシ： 優れた産肉特性を持ってによる感染症を起こしにくくなりまどと表現されます。つまり、病原体す。この現象は「 免疫がついた 」なが１９７６年に世界で初めて実用化あるに対するものYersinia ruckeri

レッドマウス 病（ ＊ １）の病原体で

水産用ワクチンは、サケ科魚類のゲノム情報を利用した
新しい水産用ワクチンの開発

す。毒性を無くした病原体などを私されました。以来、魚類に対するワ

低価格で

＊

年代後半

年にはオーストラリア

で も 発 生 が 確 認 さ れ、

ま し た。

キー山脈地帯の地方病とされていジマスに発生し、北アメリカのロッ１ ９５ ０年 代 に ア メ リ カ の 養 殖 ニがサケ科魚類にYersinia･ ruckeri
感染することで発生する病気です。

レッドマウス病 ： 病原細菌

1を示します。

や口部周辺の発赤などの外観症状

は 動 作 が 緩 慢 に な り、 体 色 の 黒 化

本 菌 は 病 原 性 が 高 く、 感 染 し た 魚にはヨーロッパにも広がりました。

70

水産用ワクチンの普及

るタンパク質があります。抗体は病たちがワクチンとして接種するのはクチン研究が世界中で積極的に行わ

品種改良

てっさ 一皿60

私たちの血液中には抗体と呼ばれ原体に強く結合し、病原体を無毒化

このためです。
魚類でもワクチンを接種することンが承認・販売されるまでに至りま種類の魚類病原体に対するワクチ

れています。日本でも、これまでにします。予防接種や感染により病原体やその成分が体内に入ると、私たで感染症を予防できることが分かっています。

ちの体はそれを記憶し、以後は抗体が効率よく産生されるようになりま

6vol.29 2012.1

15ゲノム研究最前線
特集

が１００億円まで軽減されました。

り、年間２００億円の感染症被害額した。これらのワクチンの普及によ

養性魚類病原体に対してワクチンがンです。ゆえに、いまだ多くの難培

原体を殺して利用する不活化ワクチ

産用ワクチンは、大量に培養した病が、高価な培地を用いても極少量し者が培養法の改良を試みてきました

難培養な魚類病原細菌が引き起発に手がつけられずにいました。

ゲノム解析技術の進歩とリバースワクチノロジー

近年のゲノム解析技術の進歩によって、細菌の全ゲノム解読が短期間にできるようになりました。これ

菌症と類結節症についてはすでに効

これら細菌性疾病のうち、レンサ球養殖の最重要疾病となっています。

ンサ球菌症、類結節症と並び、ブリ分野への応用が期待されています。

されており、細菌ゲノム情報の医学の性質を予測するプログラムも開発

列として暗号化しているタンパク質子の予測や遺伝子がＤＮＡの塩基配は、病原体を構成する成分のうち、

16

vol.29 2012.1

か培養できず、不活化ワクチンの開同時に、抗菌剤などの水産用医薬品
開発できずにいます。

もたらされました。今後も水産用ワ
こす感染症に、ブリの細菌性溶血性経費の軽減といった副次的な効果がクチンはますます使用されるように
おうだん

までに 千 百を超える菌株の全ゲノム配列が解析され、アメリカの国立生物工学情報センターのデータ

ベース上で閲覧することができま

果の高いワクチンが市販されていまその一つに、リバースワクチノロ

す。細菌のゲノム上に存在する遺伝す。ノカルジア症についても大学やジー（ Reverse Vaccinology）があ一方、ブリ細菌性溶血性黄疸原因

ワクチン効果に関わる成分（ 例えば、ります。リバースワクチノロジーと菌については、これまで多くの研究が進められています。

製薬メーカーによってワクチン開発億円以上 ）、ノカルジア症、レの使用量も大幅に減少し、食品とし

写真 2．病魚
ひ臓（赤色の矢印）の腫大や溶血によるエラ（黄色の矢印）の退色が観察されるブリの細菌性溶血性黄疸

4ての安全性の確保、環境への負荷や

約5黄疸があります（ 写真１、２）
。この

50

1

なるでしょう。

感染症は１９８０年代から養殖ブリるようになりました。出荷直前の大に発生し、西日本一帯に広く見られ日本の水産養殖場では、ウイルス型魚で発病が顕著なため、経済的損

水産用ワクチンの問題点

性、細菌性、真菌性および寄生虫性（スケールは 2.0 マイクロメートル）

失が大きく（ ２００７年推定被害額

写真 1．黄疸菌の電子顕微鏡写真の感染症を合わせると、実に 種類
以上の病原体により被害が発種類の魚生しています。それに対し、国内では、いまだで承認されているすべての水ることが挙げられます。日本

くが培養困難（ 難培養性 ）であ原体を含めた海洋微生物の多の理由の一つとして、魚類病開発されているだけです。そ類病原体に対するワクチンが6

宿主の抗体で認識されやすいタンパチンが開発できるのです（ 図１）。

水産総合研究センターを中核機関と世代シーケン

のワクチン開発が本格的に始動しま

協力を得て、ブリ細菌性溶血性黄疸

し、東京海洋大学および大分県農林ク質 ）をゲノム情報などから予測し、水産研究指導センター水産研究部のその成分を組換え技術を利用して合年度新たな農林水産政策

ブリ細菌性溶血性黄疸ワクチン開発に挑戦成することでワクチンを効率的に開平成した。
こ れ ま で に、 第サーを利用して、本病原細菌のドラ
フトゲノム解析（ ゲノム配列の概要
の解読）
に成功し、
２・０Ｍｂｐ（＊２）
程度のゲノムを持つことや、ゲノム上には 千 百個以上の遺伝子が存時にワクチンとなり得るタンパク質を作り出す遺伝子の予測を行い、数百個の候補遺伝子を選抜することができました。現在は、大腸菌を利用して候補遺伝子から組換えタンパク質を調製し、ワクチン効果を確認す、グアニン: cytosine)＊２ ｂｐ：病 塩 基 対のこと 。･(base･pair)
塩基にはアデニン Ａ、シ( : adenine)

トシン Ｃ
(

･

Ｇ
、チ
( : guanine)･･ ミン Ｔ( : tymine)の４種類があり、その水素結合の数のペアを作っています。このペアのこと違いから、Ａと Ｔ、 Ｇと Ｃが結合してこの事業を期に、水産用ワクチン

あらわします。

ています。１Ｍｂｐ ｓ は百万塩基対を子のサイズ）を表す単位として使われを塩基対といい、 ＤＮＡの長さ（遺伝病原体に対するワクチンが開発でき開発技術が向上し、より多くの魚類るための試験を進めています。

ワクチンの投与発するという概念です。これを水産を推進する実用技術開発事業の「 遺図 1．リバースワクチノロジーによるワクチン開発

用ワクチン開発に応用できれば、ブ

ワクチンとして実用化

2在することを明らかにしました。同522

伝子情報を利用した難培養性病原体

大腸菌
組換え抗原タンパク質

リ細菌性溶血性黄疸原因菌などの難組換え技術を利用してワクチンを調製に対するワクチン技術の開発 」で、ゲノム解析
抗原遺伝子予測

培養性病原体を培養しなくてもワク

病原体

第 2 世代シーケンサー

1

るようになると期待されています。

vol.29 2012.1

17ゲノム研究最前線
特集

初めて地球を見た時に、「 青くてな明を持つ宇宙人が、地球を発見し、地球と同等かそれ以上の高度な文

いとたいへん興味を持つと思います。

どの程度（ 何種類 ）いるのか調べた

球の海洋には、どのような生命体がす。もし宇宙人がいたとしたら、地植物
プランクトン

18

vol.29 2012.1

海洋環境へのゲノム研究の応用例

んて美しい星だ、この惑星にはどの

２００８年から 年にかけて相次

メタゲノム解析の将来展望

ような生命体が存在するのか？」といで商品化された第 世代シーケン
サ ー（ 生 物 の 持 つ ゲ ノ ム 情 報、 塩
基配列を読む機械 ）の登場により、生命科学とバイオ産業に大きな変革が起きています。第 世代と呼ばれるシーケンサーは、従来型シーケン
サーの数十～数百倍の性能を発揮します。このようなシーケンス革命の到来により、大量に得られるゲノム情報をフル活用した新しい技術を用いれば、海洋に何種類の生物がいるのかに対する解答が、それほど難し
くなく得られるようになってきました（ 図１）。

プライマーに識別タグ付加

DDBJ
NCBI
EMBL

DNA 抽出プランクトンの出現パターン、出現種多様性、環境項目間の相関評価

捕集

真正細菌

アメーボゾア界
古細菌

エクスカバータ界

ストロメノパイル界

オピストコンタ界

複数サンプルをまとめて、塩基配列を解析

11

リザリア界
植物界
アルベオラータ界

動物
プランクトン

遺伝子統合
データベースポリメラーゼ連鎖反応（ PCR：
Polymerase Chain Reaction ）により DNA を増やす機器を用いて、DNA を増やす

ろ過

1 回に 100 万個の DNA 断片を処理可能
原生動物

……
……
……
……
……

（大量・高速シーケンス）

大量の塩基配列データを解析
第 2 世代シーケンサー

サンプル採集いう疑問を抱くと思います。地球表

いろんな生命体がむちゃくちゃたくさんいるらしいよ！

2

2

面の約７割が海洋でおおわれていま

海洋には一体
どんな生命体が何種類いるんだろう？

PCR 増幅情報プラットフォーム・
ネットワーク通信技術開発

図 1．プランクトンメタゲノム解析手法の概念図

ランクトンについても、これらから培養が困難であった微生物や植物プ測定機器の進歩により、これまで比較的大型（ど が、分 類 の 基準 と なって い ます。

組 成と 構 造、生活 史、遺 伝子 配列 な細胞の形態情報（ かたち ）、葉緑体の千～ 百マイクロメー

抽出したＤＮＡの塩基配列を直接決のように、天然環境サンプルから直定することが可能となりました。こ

してきましたが、採集した地点など

ム情報を登録したデータベースは充実

トル ）の植物プランクトンでは、ゲノ

マイクロメートルより小型の超微接回収された遺伝子群について解析とよびます。第 世代シーケンサーの詳しい情報が登録されておらず、5する手法をメタゲノム（ ＊１）解析

2

可能となりました。手法を用いて、植物プランクトンの大部分の検出がの活用により、海水中に出現する動で観察するだけでもたくさんの種類

かいまだに不明です。少し、顕微鏡細種の情報になると、何種類いるの

また、動物プランクトン・無脊椎動物群（ 貝類、ゴカイなど ）は、植物プランクトン同様、きわめて多様な動物群を含み、分布域、生活史な

どの生態も多様性に富んでいて、数動物プランクトンに特化したデータ

万種数の存在が推定されています。
最近の研究で、例えば藻類はおよ

ベースもあり、形態情報とゲノムのそと は、“ 高 次
(meta)の ” と い う 意 味 の ギ リ シ ャ 語 で、“ 遺 伝

付けて、年ほど前に命名されました。

言葉に、「高次」を表す接頭語「メタ」をの植物門に分類されています。

海洋に出現する
プランクトンの種類数とモニタリングの実情の比較を行いました。

して、生物から見た海域の特徴などがいることが分かります（ 図２）。

10

環境中の生物の集団をまとめて解析

2＊１ メ タ ゲ ノ ム ： メ タ

11情報全体”を意味する「ゲノム」という10

vol.29 2012.1

19ゲノム研究最前線
特集

プランクトンっておどろくほどたくさん種類があるな。

図 2．日本沿岸に出現するプランクトン

門数

綱数

属・種数

配列数

不明
配列数

検出
成功率

最小値

最大値

平均値

標準偏差
藻類

9

28

492

606

113

81.2

83.7

100

97.3

3.1

13,750
繊毛虫

1

5

39

51

13

76.5

90.3

100

97.2

3.1

1,439
原生生物

－

－

99

150

51

66.0

85.1

100

95.5

4.0

2,079

行われています。

情報の総合化をめざした取り組みがた（ 表 １）。 ２０ ０ ９ 年 に多様性の比較をしてみまし

半から、浅海定線調査事業などを利いる研究機関では、１９７０年代前

都道府県の海洋・水質調査をしてンクトン種の約 万個（ 総リリットルに出現したプラ

採集し、海水中各２５０ミ

優占種の情報がほとんどであり、希が 検 出 さ れ、 植 物 プ ラ ン

ち、４９２個について 門

クトンと海藻については、

すべての海洋プランクトンの染色綱に分類される生物群で

9
属名・種名を判別すること）。

驚いたことに、海綿、クラゲ、ホヤ、ができました（ 表

ツリガネムシ、ラッパムシなどの名・種名の判別が可能であり、アメー

列で属名・種名の判定が可能でした。

に属する種が検出され、すべての配綱化されている共通の遺伝子領

バなどの原生生物門では １５０個の一 方 で、 不 明 な 生 物 群（ 菌 類

門域について遺伝子増幅を個の 下 段 ）と し て ど の 生 物 門 に も 属

異なる配列が検出されたうち、で属名・種名の判定が可能でした。

さ な い ５２２ 個 の 異 な る 配 列 が 検

世代シーケ
ンサーを用いた配列解動物界（ 海産無脊椎動物＋魚類）
では、

出 さ れ（ 不 明 な 生 物 群 の 総 配 列行い、第析を行うことで、全出

１６７個の異なる配列が検出され、繊毛虫では貝類、ゴカイなど多数の動物門など

さまざまな生物門に属する海産無脊椎動物

個の配列で属

奇妙な生命体がたくさんいるな！

現種の記録と出現種の39

99

体上にＤＮＡの塩基配列として暗号

1

5

第 世代シ ーケンサ ーによるプランクトン出現種の分子モニタリング

少種や微細な植物プランクトンの情

5６０６個の異なる配列のう

1

28

16

31

167

167

0

100.0

86.6

100

97.5

2.4

2,014
－

－

45

62

17

72.6

84.9

100

97.8

2.9

117
不明

－

－

0

522

522

0.0

84.3

100

96.9

3.1

13,902
842

1,558

716

54.0

83.7

100

97.0

3.1

33,301

20

vol.29 2012.1

広島湾から表層海水を 回用して日本沿岸の環境モニタリング

千３０１を実施しており、その中で、動植物

個 ）の 配 列 に つ い て 調 べ

万プランクトンのモニタリングを行って み ま し た。 そ の 結 果、
千 ５８個の異なる配列

3
1

2

報はほとんどない状況にあります。

データは蓄積されてきたのですが、てきました。動植物プランクトンの

配列数：

5
3

3

2

表 1．広島湾におけるプランクトンメタゲノム解析結果の概略（予備的検討の結果）
地球人も高度な文明を持ち、技術革新が日進月歩だな！

＊ 第 2 世代シーケンサーによる解析で得られた各配列を遺伝子データベース上で検索
し、最も類似した配列とその相同性を比較した場合の最小値、最大値、平均値および標準偏差を示す。
見つかった異なる配列

相同性（％）＊

今回調べた数

動物

菌類

生物群全体

総配列数
生物群

千

数：
（

万
％、全総配列千 ９０２ 個 ）、配列数のような生物群と近縁であるか類別

今後、これら未登録の真核生物がどことは不可能なことです。従って、とができると予想しています。

差もこれまで以上に、明瞭に示すこ

異なる生態系における生物多様性の比較しました。約 ％で一致が見ら析した結果から、両海域の多様性を石垣島で広島湾と同様に調査・解５８個 ）の
千 ３ ０ １ 個 ）の う ち の

例えば、魚類などの餌場・産卵場

れたものの、出現種にかなりの差が万して整理するような、新たな解析技

あることを見いだしました（ 図３）。

％に及びました。

となる藻場、貝類の繁殖に必要な干このように、本解析は、海洋生物

も ば術の開発や記載方法の検討を行うこの分子モニタリング（ ＊２）手法としんかくせいぶつ

しかし、広島湾で、今回、遺伝子

潟域、砂浜における細かい砂と砂に島、北は北海道から南は石垣島、親して最もパワフルな手法の一つであ◇とで、これらの配列を今後の生物多挟まれた海水空間、サンゴ礁域、深潮や黒潮の流軸域、あるいは汚染のり、海洋に分布するほとんどすべて◇

データベースでの未登録の真核生物様性の解析に有効利用する必要が海域、太平洋上に位置する小笠原諸（ 種 ）もの遺伝子を検出する技術開進行した海底泥とそうでない海底泥の生物を検出・記録することが可能◇（ 細胞で核膜に包まれた核を持つ生あると考えています。今回、 リッ

出された配列のほとんどが登録済み発に成功しました。また、多数の有など、例を挙げだしたら、比較した

トル程度の海水から約 千 ００個の配列か、それにごく近縁の種であ害・有毒プランクトンだけではなく、の生物がこれに含まれる ）として検り、遺伝子データベースでの検索のこの結果は、これまで種や属の記載

域 の 富 栄 養 化 の 程 度や 底本手法を用いると、海を調べること。

の手がかりとして生物の種類やその数＊２ 分子モニタリング： ＤＮＡなどの分子たいと考えています。

活用できるよう、技術開発を継続しランクトンの出現モニタリングにもくの試験研究機関などでの動植物プ活用が期待されます。近い将来、多クトンのモニタリング手法としての加味することで、新たな海洋プラン

なく、定量性（ 出現密度の算出 ）をです。また、出現種の検出だけではがなされていない生物群が多数存在

質の汚染度の比較もおそ

図 3．広島湾・石垣島サンプル間の多様性比較い環境はとてもたくさんあるのです。

すること、また、今回得られた配列

らく可能であり、外来種・れました。

と同一種か、少なくとも近縁種の配侵入種の鋭敏な検出にもの平均値は ～ ％を示しました。

列登録があることを示しています。

有効な手法であると思います。出現する生物群の第境評価が可能です。また、特徴から、その海域の環海洋に生存・分布する多種多様な

動植物プランクトン、原モニタリングのこれから生物群のすべての種について、そのBLAST 検索というプログラムにより、最も類似性（相同性）の高い値を示した塩基配列（平均 95％以上）について、国際塩基配列データベースへの登録データから生物種名を決定し、その登録番号について、広島湾と石垣島で同じものが含まれているのかを比較しました。

5

約 40 ％ の一致

1

世代シ ーケンサ ーによる

97

1

96

生 動 物 の 分 布 域 の 把 握や

広島湾

(56%)
977

2

837

581
(63%)

石垣島

汚染指標となる動物群も多数検出さ

1

結果、第 位を示した配列の相同性

らんそう物群。細菌類と藍藻類を除く大多数

数（

34

40

3
3

5

1

1
3

42
形態的な特徴と遺伝情報を記載する

vol.29 2012.1

21

ゲノム研究最前線
特集

さ か な

乾杯

これが旨い！

シンプルな塩焼きを香味オイルでアレンジ
冬に脂がのる旬のクロダイ～ センチ以上になり、おおるので少し磯臭い場合があり、され、北海道南部以南の日本とロダイ属に分類

ズキ目タイ科ククロダイはスす。
近年では広島湾などで増え、で、全国の約２割を占めていま後です。漁獲量第１位は広島県

す。漁獲量は全国で 千トン前がよく漁獲され、流通していま

ロダイは格別で、まさに旬です。

ため、蓄積された脂がのったク

た、冬から春にかけて越冬する

め、お得な魚とも言えます。ま料理の工夫次第でいろいろ楽し

般的に安い魚です。そのため、

クロダイ

朝鮮半島、台湾、中国中南部のアサリや養殖ノリの食害の被害

市場ではあまり人気がなく、一東アジアの沿岸域に分布し、琉

耐え、淡水に近い塩分濃度の低の相性も良く、ムニエルなども

塩焼き、潮汁のみならず、油とまな料理に使えます。刺し身や身で旨味があることからさまざ

クロダイはおいしい魚で、白香りよく、おいしいクロダイのルな逸品を紹介します。簡単でた香味オイルを使ったスペシャ

香味野菜やハーブの香りを移しに、シンプルに塩焼きにして、しさがストレートに分かるよう

今回は、クロダイの旬のおいなどが報告されています。

い海水でも生息可能です。濁り人気があります。広島では「 チ香味焼きを楽しんでください。

にも強いことから沿岸の水深の後雌になります。産卵期は春までの１～３歳までは雄で、そ煮ほぐした身をクロダイのダシ

うです。
岡山の
「かけ飯」
という、

ダシもよくしみてうまいごちそかし、クロダイはなんでも食べかけて食すものも最高です。しから初夏です。雑食で、小魚やクロダイは大きくなると全長んでも食べます。

で煮た野菜と一緒にご飯にぶっ

うしおじる

うまみ

メートル以浅の内湾や岩礁域にヌ飯 」と呼ばれる炊き込みご飯℃の広範囲の水温に多く生息しています。また、雄が最高で、ほかのタイの炊き込

温が３～から雌に性転換をすることが知みご飯よりもご飯に粘りが出て環境への適応力が強い魚で、水球列島には生息していません。

むね全長 センチまでのサイズ

60

られていて、全長 センチ程度

4

22

vol.29 2012.1

3050

エビカニ類、貝類、海藻などな

25

50

30

18 回
第

に

あんじいの

ま
うま
う

あんじいレシピ

クロダイの塩焼き香味オイル掛け作り方

材料（4 人分 ）◦クロダイ

大１尾あるいは中２尾

◦ニンニク

１かけ

◦ショウガ

１かけ

◦万能ネギ

１本

は 5 センチ程度に切りそろえておく。

2．クロダイはウロコと内臓を取り、水道水でよく洗っ（5 ～ 6 センチ程度 ）たら水気を取る。オリーブオイルがしみやすいように身に切れ目を入れ、天然塩とバジル粉末を適宜振りかける。焼いたときにヒレがこげないように、化粧塩としてヒレには多めの塩をすりつけておく。

適宜

3．下処理のすんだクロダイは魚焼きグリルなどで皮が◦ローズマリー

適宜◦ミニトマト（ 一箱：８個程度 ）

◦生バジル

適宜

かんきつるい◦柑橘類

適宜◦天然塩（ 化粧塩も ）適宜◦バジル粉末

適宜◦オリーブオイル

1．薬味のニンニク、ショウガをスライスし、万能ネギ

適宜（ 香味オイル：大さじ５杯、ミニトマト焼き用は適宜 ）カリッとなるまで焼き、皿に盛りつける。

4．クロダイを焼いている間に、フライパンでオリーブオイルを熱し、「 1 」を少し焼き目が付くぐらいに焼いて取り出す。ミニトマトも軽く焼いて、盛り皿にトッピングする。同じフライパンでローズマリーを軽く熱し、香りをオリーブオイルに移す。

5．盛りつけたクロダイの上に、「 4 」の香味オイルを回しかけ、生バジル、焼き目がついたニンニク、ショ
ウガ、万能ネギを盛ればできあがり。好みで柑橘類をそえて。
かんきつるいできたての熱々が一番。ほどよく焼けた皮目のざくっとした食感と、ほっくりしっとりと脂ののった身を楽しめます。香味オイルに浸し、一口食べて目を閉じれば、“ 豊かな海 ”の風景が脳裏に広がります。

23

vol.29 2012.1

シオミズツボワムシ（ 以下、ワ
周年維持培養が行われていました

す。これまでワムシは機関ごとに②周年維持培養を行っていない機

かりました（ 図１）。

と共に半数以上を占めていました

増加したためと推測されます。

シ の 重 要 性 が 再 認 識 さ れ、 ま た、％と発をより深化させる必要があります。

24

vol.29 2012.1

ワムシの入手と利用タイプの現状ムシ）は、種苗生産機関で海産魚が、近年は種苗生産前に他機関か「 水産総合研究センター」で、最も利用されている入手先は関のワムシの入手先のふ化仔魚が最初に食べる動物プ

超小型タイプが SS 型、小型タイプが S 型、大型タイプが L 型と総称されている

ら種ワムシを入手する機関が増えています。また、ワムシには 型、年度が ・ ％、今回が ・ ％ありますが、種苗生産対象種の多

（ 図２）
。

Ｓ型、Ｌ型の３タイプ（ 写真）が様化により、利用するワムシのタ

シのタイプ
・ ％

型を含む）
」が

③各機関で主に利用しているワム

そこで、公的機関におけるワム「 Ｓ型のみ（イプが変化しています。
シの入手と利用タイプの現状を把

年度はと増えました（ 図３）。近年始まっ・ ％、今回が握するために２０１１年 ～ 月に 都 道 府 県、 水 産 総 合 研 究 セ ンたハタ類やカワハギなどの種苗生産に不可欠な 型ワムシの需要がターの合計 機関を対象に、聞き取り調査を行い、 年度の調査結果と比較しました。
周 年 維 持 培 養 は、 小 規 模 で も種苗の飼育環境も多様化している

今回の調査結果から、小型ワム
労力と経費を要することやワム

ことから、これらの飼育環境に最①ワムシの周年維持培養の有無

シの輸送技術が発達したことに適な小型のワムシ株の選定や、そ・の安定的な量産化に向けた研究開

よ り、 実 施 機 関 が 減 少 し て い ま％、 今 回 がす。周年維持培養の「 無し」が年度は年維持培養していないことが分

図１．ワムシの周年維持培養の有無（調査機関数：67 機関）図２．元種培養を行っていない
33 機関のワムシ株の入手先（調査ワムシ数：51 株）

図 3．調査対象機関で主に利用しているワムシのタイプ（調査機関数：67 機関）

19.6%

54.9%

ランクトンとして利用されていま

写真．国内の種苗生産機関で利用されているワムシの 3 タイプ

50.7 %

43.3%

06

6

06

7

有り

25.5%

54

53

SS

無し

近隣の種苗生産機関

0

0

SS

49.3%

Ｓ型のみ

48

販売業者

23.9%

06

水産総合研究
センター

Ｓ型とＬ型

7
3

10.4%

22.4%

60

SS

6

49

SS型とＳ型

Ｌ型のみ

06

0.1ミリ
0.1ミリ
0.1ミリ

67

や や 増 え、 ほ ぼ 半 数 の 機 関 で 周

46

L 型ワムシ奄美株

S 型ワムシ八重山株
SS 型ワムシタイ株

研究成果情報Research･result･information

ジ ー ン バ ン ク 事 業 は、
「 産 業へのい ま す。 過 去５ 年 間 の 実 績 で は、

いて、有償（ 手数料）で配布してきていると考えています。

の利用価値がしだいに認められて水産生物遺伝資源保存事業（ジーンバンク事業）
利用および研究素材としての活用」

１４８株（１年間に約 株）の配布がありました。今年度は、９月生産が容易で、いわゆる「 元種」

一の要望は、増殖力を保持し、再保存している株に求められる第を 目 標 と し て ２００１年 度 か ら 行

末日までに 件を超える有償配布

として養殖産業に実用化できるこ

株を高密度に培養し、５～ 10 リットルの容器に入れて配布
しています。これを「元種」にして拡大培養できます

年度からは、多くの海産魚類の種苗生産に必須の生の申し込みがありました。

図 2．大きさの異なるワムシ株や、貝類の餌となる微細藻類

われており、
物餌料であるワムシ類も加え、新に増殖する株を選抜し、高密度に培養したサンプルを配布しています（ 図２）。
そのほかに寄せられる要望に

高水温に耐性のある
キートセロス株植物プランクトンには、当面使用する培養液を付
けています■植物プランクトンの場合とです。そのためには、常に再生

微細藻類

は、 配 布 で き る 株 の 種 類 や、 それ ぞ れ の 配 布 量 を 増 や す こ と、
入手手続きの簡便化などがあり
ま す。 水 産 以 外 の 分 野 か ら の 要
号に掲

大きさが異なるワムシ株

配布先は、公的種苗生産機関の増養殖研究所日本海区水産研究所

たに体制を整えました（ 図１）。

▶ URL：http://nria.fra.affrc.go.jp/bank/index.html

能力を評価することが大切で、例

ジーンバンク事業は下記ウェブサイトよりご覧いただけます。

ほかに、養殖業を営む民間企業や３つのサブバンクをそれぞれの機関が分担しています。センターバンクは各サブバンク情報の取りまとめや、有償配布の窓口をしています

この事業では、保存している株

図１．ジーンバンク事業の構成

え ば、 生 物 餌 料 サ ブ バ ン ク で は、

西海区水産研究所

水産・生物分野の大学など研究機

遺伝資源の配布に関する窓口の役割をしています。

の特性を調査し、産業や研究に有遺伝資源の保存情報を管理し、適宜報告しています。

定期的に増殖試験を行い、高密度（増養殖研究所）

関もあり、事業で保有している株センターバンク

効利用できると分かった株につ

ワムシ類

アマノリ類

望（ Ｆ Ｒ Ａ Ｎ Ｅ Ｗ Ｓ 第載）もあることから、今後は環境保全や食品分野などより広い分
野でも利用してもらえるよう広報 す る と と も に、 い た だ い た 要
望 を 反 映 さ せ、 事 業 推 進 に 努 めていきます 。

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25

病原菌類

中央水産研究所

東北区水産研究所
北海道区水産研究所

27

海洋微生物

増養殖研究所
瀬戸内海区水産研究所

ワカメ、アラメ、
カジメ、コンブ

微生物
サブバンク
生物餌料
サブバンク

５～ 10 リットル容器に梱包して送ります■ワムシの場合

50

30

11

藻類
サブバンク

Research･result･information

研究成果情報国際ワークショップを
CLIOTOPと共同で開催
CLIOTOP（ CLimate Impacts on Oceanic TOp

動する GLOBEC/IMBER 傘下の国際研究計画です。

Predators）は、マグロ類などの食物連鎖の高位に

水 産 総 合 研 究 セ ン タ ー は、2011 年 9 月 20 ～位置する高次捕食者に対する気候変動の影響をメイ

23 日に静岡市の国際水産資源研究所で、国際ワー

ンテーマとして、2006 年から 10 年間の予定で活クショップ「 クロマグロ及び関連種の初期生活史、加入戦略に関する比較生態研究と海洋高次捕食者の資源変動に対する環境変動の影響 」を開催しました。日本、アメリカ、オーストラリア、スペインから 39 人の研究者が参加して 22 件の発表があり、海洋環境変動がクロマグロなどの仔稚魚や海産ほ乳類などの分布、食性に及ぼす影響について、活発な議論が行われました。今後、これらの成果を取りまとめて発表するとともに、次のステップへ向けて研

ワークショップに参加した各国の研究者たち究が進展することが期待されます。

第16 回 地域水産加工技術セミナー
水産総合研究センターでは、水産庁や地域と協力して、地域のための水産利用加工や関連情報を分かりやすく提供する水産加工技術セミナーを各地で開催しています。
2011 年 10 月 15 日に第 16 回となる今回のセ
ばかん

ミナーを、
「 食べり～ね、馬関の魚はぶちうまい！
－下関の売れ筋を磨く－ 」をテーマとして、水産大学校（ 下関市 ）で開催しました。本セミナーとしては 2004 年に続き 2 回目の下関市開催で、主催は当センターおよび水産庁のほか、水産大学校、下セミナー会場のようす

関唐戸魚市場仲卸協同組合、山口県漁業協同組合、児島県からも、漁業協同組合員や水産業関係者、試

下関南風泊水産団地協同組合、社団法人下関水産振験研究機関の方、学生など約 150 人の参加者があり、

興協会、下関ふく連盟、下関市豊浦町水産加工業協

熱心に講演を聴いていました。また、会場となった議会で、地元の方々にも数多く企画段階から参画し講義棟では、同日開催された水産大学校主催の「 下てもらいました。

関フードテクノフェスタ 」で、地元企業の水産加工

はえどまり

当日は、山口県を中心として遠方では長崎県や鹿品の展示も行われました。

vol.29 2012.1

26

第 2 回 サイエンスステージ
水産総合研究センター 中央水産研究所一般公開のプレイベントとして、横浜・八景島シーパラダイ
スで開催されるサイエンスステージも今年で２回目を迎えました。開催日の 10 月 15 日は、小雨のぱ
らつくあいにくのお天気にもかかわらず、多くの方が来場しました。
「 身近な魚の意外な話 」と題した今年の出題は、ハカセが身近な魚について分かりやすく解説しました『 次の魚の中で食用になるのは？』など５問で、『 いっ
けん怖そうに見えるハカセの解説はとても分かりやすかった 』と評判になりました。当センターのマス
コットキャラクター「 ふっくん 」と「 ふーちゃん 」
も応援に駆けつけ、
小さなお子さんに人気でしたが、水産総合研究センターのマスコット、ふっくん（左）とふーちゃん（右）ジャンケンに弱いことが発覚してしまった「 ふっくん 」の人気の方が少しだけ高かったようでした。

第４回 瀬戸内海水産フォーラム
今回のフォーラムは、“ 瀬戸内海における漁業が直面している栄養塩不足問題 ”に焦点をあて、一般の方に漁業がこのような状況に直面していることを知ってもらうために、「 きれいな海は豊かな海か？」という題で 10 月 15 日に広島市で開催しました。
当日は、瀬戸内海に面する府県から 102 人が参加し、漁業関係者だけではなく、環境問題に関心を持って参加された方も半数いました。フォーラム

パネルディスカッションでは参加者からも多くの意見が出されましたは、瀬戸内海の過去から現在の豊かさときれいさの
はりまなだ

変遷、環境管理施策の変遷、播磨灘のノリ・江田島
すおうなだ

湾のカキ・周防灘のアサリの状況とそれぞれの地域
での取り組みを紹介した後、パネルディスカッショ
ンを行いました。会場からの発言も活発で、範囲を限定した形での栄養塩の順応的な管理、合意形成の重要性、分野横断的なフォーラムの重要性など、こ松田･治瀬戸内海研究会議会長による基調講演「『豊かな海』をめざす里海と水産業」

27

vol.29 2012.1の問題への解決に向けた責任の大きさを再確認する
フォーラムになりました。

韓国で開催された2011年日中韓水産研究機関長会議に出席
水産総合研究センターは、2006 年 12 月に韓国

殖研究など 11 項目を定めた覚書付属書を承認しま

国立水産科学院と中華人民共和国水産科学研究院とした。次回の会議は、中国で 12 年 10 月に開催さの三国水産研究機関で研究協力に関する覚書を締結れる予定です。

しています。これに基づき、日中韓水産研究機関長
会議を 07 年から毎年日中韓持ち回りで開催しており、5 回目の今年は 10 月 21 日に韓国の統営市で開催されました。当センターからは松里壽彦理事長
ら 5 人、韓国国立水産科学院からは金永晩院長ら 8人、中国水産科学研究院からは張顕良院長ら 5 人が出席しました。
会議では、11 年の活動報告で連携・協力の順調な進捗状況を確認するとともに、大型クラゲに関する研究などでとくに進展があったと評価しました。

握手をする三国機関長（左から張院長、金院長、松里理事長）

また、今後の協力分野および協力活動として、増養「養殖漁業の今と将来」～シニア講座で出前講義を行いました～
10 月 12 日、NPO 法人「 杉の樹カレッジ 」が開れているもの催する「 杉の樹大学 」で講座を行いました。

で、１年にわた「 杉の樹大学 」とは、東京都杉並区でシニアの生り各種の講座が涯学習と社会参加活動をより活発化するために行わ行われています。

講演する鈴木研究主幹

今回は「 養殖漁業の今と将来 」と題し、約 50 人が参加しました。
日本や世界の漁業・養殖業の現状、水産総合研究センターで取り組んでいる「 持続的な養殖業の発展に向けた生産性向上技術と環境対策技術の開発 」について説明しました。
およそ２時間の講座でしたが、終了後も質問が出るなど、受講生の熱心さと関心の高さを実感するこ
多くの方が参加しましたとができました。

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28

第 31回 全国豊かな海づくり大会に出展
鳥取市で第 31回全国豊かな海づくり大会が催され、10 月 29 ～ 30 日には市内のコカ・コーラウエ
ストスポーツパークで一般の方に水産業に見て触れて楽しんでもらうふれあい交流行事が行われました。
この中で水産総合研究センターは研究対象となっているズワイガニの稚ガニ、アカアマダイなどの水槽展示やパネルでの紹介、ウナギのレプトセファルスの展示を行ったほか、タッチプールも設置。展示

晴天に恵まれ、大盛況でした

コーナーでは、多くの方が水槽を熱心に見ながら研究員の話に耳を傾やヒラメなどのさかなたちに触わり、その感触を楽けていました。

しんでいました。水産の生物を身近に感じてもらう

タッチプールは水槽の生き物の説明を熱心に聞いていました

よいきっかけになったのではないでしょうか。

子どもたちに大人

2 日 間 で、 ふ れ あ い 交 流 行 事 の 会 場 全 体 で は気で、ふだん触れ

52,000 人、当センターの展示ブースには約 3,000

ることがない、生

人が訪れました。次回は沖縄県糸満市で開かれる予

きているキジハタ

定です。

第 50 回 農林水産祭「実りのフェスティバル」に出展
11 月４～５日の 2 日間にわたり、東京国際展示当センターブースには、約 2,000 人が訪れ、展場で開催された第 50 回農林水産祭 ｢ 実りのフェス

示を見ていた人たちからは、「 テレビで見ました 」、

ティバル ｣ に政府特別展示として、水産庁と共同出「 早く完全養殖のウナギが食べられるようにしてく

展を行いました。

ださい 」など、うれしい言葉を多数もらいました。

2010 年に世界で初めて成功したウナギ完全養殖についてパネルなどで紹介し、今年の５月 28 日に生まれたウナギの仔魚のレプト
セファルス、ウナギ完全養殖で育成中の去年の 10 月１日に生まれたウナギや、｢ ウナギ捕獲に挑む
男たち！ ｣ の船上活動の映像を展示しました。

29

vol.29 2012.1

2010 年10 月1日にふ化した完全養殖ウナギを展示

ブースを訪れた人は、展示についてさかんに質問していましたTopics
水産総合研究センターでは、これまで

この調査はすでに終わっていますが、センターの中央水産研究所高知庁舎に届

２０１１年８月に一通の漂流はがきが当組んでいました。ブリやマアジの幼魚はけられました。

にブリやマアジの来遊機構の解明に取り海上を漂う流れ藻をすみかとし、黒潮に差出人は和歌山県西牟婁郡白浜町在

かけて流れ藻の漂流経路を調べることがため、１９７０年代から１９８０年代にけ、裏面の日時記入欄に「 昭和 」とあっ

市江崎海岸に行った時に岩の間で見つ明です。おそらく、放流された年の夏に付着物もなく朽ちてもおらず、文字も鮮はがきを密封しているビニール袋にはとも記録に残したいと思いました。

後の再捕報告は非常にまれであり、ぜひ

かし、放流からこれほどの長期間経った年の間海岸に打ち上げられたのではないかと推ところ、今年の台風６号によって市江崎

海底に沈み、長く砂の中に埋もれていた

た。皆さんは 年前、何を思い、何をし島太郎になったような気持ちになりまし

れを考えていると、まるで自分自身が浦に、世の中はずいぶん変わりました。そ28
測しています。このはがきの 年間の漂28

流経路を再現することは不可能です。していましたか？

28

乗って日本沿岸に運ばれてきます。その重要な調査研究課題となり、当センター

たことから、驚いてご返送いただいたと日に白浜町と和歌山県、徳島県 高知県、愛媛県、のことです。はがきの番号から１９８３

年 ７月

大分県、宮崎県、鹿児島県が共同して、

年５月９日に大分県沖の豊後水道南部で

いちえざき

漂流はがきを取り付けた流れ藻の放流調放流されたものと分かりました。放流か

住 の 方 で し た。

査を行いました。

らなんと 年が経っていました。

太平洋

鹿児島県

漂流はがきがたどり着いた地点

宮崎県

高知県

豊後水道

和歌山県

徳島県

このはがきが海中にあった

漂流はがきを放流した地点枯れた流れ藻とともに紫外線の届かない

28

大分県

31

11

今回届いた 28 年前の漂流はがき

愛媛県

30

vol.29 2012.1

年後に届いた漂流はがき

28

漂流はがきはどんなルートをたどってきたのでしょう・・・Ａ情報が蓄積され、約２千個からなる連鎖するＭＳマーカー

白化現象に関連する遺伝子の位置13.7

頻度がきわめて高い場合もあり、原因して除去しています。白化個体の出現

商品価値が低いので、小さい時に選別まで飼育し親魚とし、戻し交配（ 両親

仔稚魚、さらにはこの稚魚を成熟するにくい家系 」間交配で得られたヒラメ

白化個体が「 出やすい家系 」と「 出は約 千キロベースペア １( 千 ｋｂｐ 、
百万塩基対 に) 相当するといわれてとして飼育管理のほか、家系によってはさまざまです。そこで、白い部分のン（ Ｍ と) は染色体の上での遺伝子間の 距 離 を 表 す 単 位 の こ と で す。 １ｃＭ＊ 図中のセンチモルガン（ｃＭ）のモルガ

マーカー７と子どもの間での交配 ）で得られた稚神奈川県並びに水産総合研究センター

す。なお、この研究は東京海洋大学ととが効率的であることを証明していま

検出し、これを目印に選抜育種するこ

わる主導遺伝子に連鎖するマーカーを

この成果は、「 白化 」という形質に関特定することができました（ 図 ２）。

が深い遺伝子の近くにあるマーカーをか調べる解析を行い、「 白化 」に関連深く「 白化 」に関わるマーカーである

います。

1

の共同研究により得られた成果で、今知的財産情報に関する問い合わせ先 ▶ 水産総合研究センター 水産技術交流プラザ（知的財産担当） TEL：045-227-2718

め通 常、 ヒ ラ メ の 眼 が あ る 体 側（ 有Ｄ Ｎ Ａ マ ー カ ー（ 以 下、 マ ー カ ー と地図が詳細化されてきました。
そこで、眼側と呼びます ）の色は黒褐色で、白し、着底するまでの間に有眼側が白く白化原因遺伝子と関連の深いマーカー

略します ）が染色体上でどのような位な る こ と が あ り（ 図 １ ︱Ｂ ）、これをを見つけよう、そして、そのマーカー

い 星 状 斑 点 が あ り ま す（ 図 １ ︱Ａ ）。

「 白化 」個体と呼んでいます。白化個を持つ親魚は除いて採卵することで、置関係にあるか、いわゆるマーカーの体は成長に伴って着色してきますが、白化個体の出現防止に役立つ技術がでと こ ろ が、 ヒ ラ メ が 生 ま れ て、 変 態

ヒラメ特有の星状模様のある黒褐色にきるだろうと考えました。

15.8

頻度差がありそう（ つまり「 遺伝的要

はっかは な り ま せ ん（ 図 １ ︱Ｃ ）
。そのため

マーカー8

1ｃM＊

マーカー5
マーカー6

0.8

マーカー1
マーカー2
マーカー3
マーカー4

面積を測定し数値に置き換える作業、

図 1. ヒラメ仔稚魚期に見られる体色異常「 白化 」

魚について白化個体の出現頻度を調べ

白化ヒラメは成長して色がついてきますが、星状斑点のある黒褐色とは異なります

因も影響する 」）と い う こ と が 予 想 さCまた、多くのマーカーの中で、どれが白化ヒラメは有眼側が白色ですました。
「 白化 」とは言え、その程度

普通のヒラメは、有眼側が黒褐色で白い星状斑点があります

れていました。一方、ヒラメではＤＮ

A

1回、特許として承認されました。

vol.29 2012.1

31

上：正常なヒラメ
下：白化ヒラメ

BIntellectual property

 知的財産情報▶ 特許 4822210

白化出現頻度が低いヒラメ家系を選ぶ～詳細化するヒラメ DNA 情報の活用～

図 2. マイクロサテライト（MS）の分布を示す地図と、「 白化 」の原因となる遺伝子の位置の関係

クロマグロ稚魚が活発に食べる
配合飼料を開発！
～天然資源に依存しない養殖技術へ一歩前進～

PICK UP PRESS RELEASE

水産総合研究センターは、鹿児島れに合わせて餌を解凍するのに労力～７回に分けて餌を与えるため、こにかかる労力と時間を大幅に減らすであることから、生餌の解凍・給餌

90 日〜

全長

3 〜25 ミリ25 〜120 ミリ

120 〜200 ミリ

200 ミリ〜32

ピックアップ・プレスリリース

大学、
林兼産業株式会社と共同で「マことができます。

しこう

リ以上のクロマグロを配合飼料のみ

今回の成果によって、全長が ミのクロマグロ稚魚が活発に食べる配で育成することが可能となり、飼育の人工種苗による新規養殖技術の開＊ こ の 成 果 は、 新 た な 農 林 水 産 政 策 を

合 飼 料 を 開 発 し ま し た（ 写 真 ）。このさらなる安定化が期待されます。

発」により得られたものです。

60 〜 90 日

推進する実用技術開発事業「マグロ類の飼料を与えた稚魚の成長は、生餌開発した配合飼料は冷蔵保存が可能

30 〜 60 日

クロマグロ稚魚は、ブリ、マダイ

0 〜 30 日などの稚魚用の栄養分を調整した人

ふ化後
日数

工の餌である配合飼料を食べないた
め、飼育には生餌（主にイカナゴな
どのシラス）を使用しています。生クロマグロの成長段階と与える餌の対応

餌は、鮮度や脂肪分などがロットに

全長 25 ミリで陸上水槽から海上いけすへ

全長 10 ミリより異なり品質が安定しない上に、

全長 30 ミリ開発した飼料が使用できるのは
全長 25 〜 120 ミリの稚魚

仔魚

冷凍保存が必要なため、大量確保に幼魚

クロマグロの大きさ

稚魚【餌】イカナゴ、配合飼料

マダイ仔魚

ワムシ

全長 400 ミリ

vol.29 2012.1と時間がかかります。

全長 250 ミリ

グロ稚魚の嗜好性を向上させる食感」を追求し、全長 ～１２０ミリ

25【餌】サバ、配合飼料【餌】【餌】シラス
プランクトン
マダイの仔魚など

は大きな冷凍庫が必要になります。

今回、開発した配合飼料で代替。
メリットは、

品質が一定
低コスト化が可能
飼育作業にかかる労力軽減など
マグロ稚魚に対応した配合飼料は開発されていなかった

また、クロマグロの飼育では１日４

写真．全長 40 ～ 80 ミリのクロ
マグロ稚魚用。少し弾力がある「 食感 」が特徴

若魚を与えたものと同様に良好でした。

25

刊行物報告研究開発情報「北の海から 」第12号
発 行 時 期：2011年 11月
問い合わせ先：北海道区水産研究所

業務推進部業務推進課

ウェブサイト：http://hnf.fra.affrc.go.jp/H-jouhou/news/kankoubutsu/
kitanoumikara12.pdf

研究の動き

第９号

発 行 時 期：2011年 10月
問い合わせ先：中央水産研究所

業務推進部図書資料館業務推進課

ウェブサイト：http://nrifs.fra.affrc.go.jp/ugoki/index.html

ななつの海から

第1号

発 行 時 期：2011年 9月
問い合わせ先：国際水産資源研究所

業務推進部業務推進課

ウェブサイト：http://fsf.fra.affrc.go.jp/nanatsunoumi/nanaumi1.pdf

瀬戸内通信

第14号

発 行 時 期：2011年 10月
問い合わせ先：瀬戸内海区水産研究所

業務推進部業務推進課

ウェブサイト：http://feis.fra.affrc.go.jp/publi/setotsuu/setotsuu14.pdf

増養殖研究レター

第１号

発 行 時 期：2011年 8月
問い合わせ先：増養殖研究所

業務推進部業務推進課

ウェブサイト：http://nria.fra.affrc.go.jp/hakko/letter/z1.pdf

研究の栞
発 行 時 期：2011年 9月
問い合わせ先：水産工学研究所

業務推進課

ウェブサイト：http://nrife.fra.affrc.go.jp/seika/H23/H23_seika_index.html

海洋水産資源開発ニュース No.398( 資源対応型：海外まき網 )Publication

発 行 時 期：2011年 7月
問い合わせ先：開発調査センター

33

開発業務課情報調査グループ＊ウェブサイト掲載はしておりません

vol.29 2012.1

刊行物報告海洋水産資源開発ニュース No.399( システム対応型：近海かつお釣 )発 行 時 期：2011年 7月
問い合わせ先：開発調査センター

開発業務課情報調査グループ＊ウェブサイト掲載はしておりません

海洋水産資源開発ニュース No.400( 資源対応型：近海はえなわ )発 行 時 期：2011年 8月
問い合わせ先：開発調査センター

開発業務課情報調査グループ＊ウェブサイト掲載はしておりません

海洋水産資源開発ニュース No.401( システム対応型：大中型まき網 )発 行 時 期：2011年 9月
問い合わせ先：開発調査センター

開発業務課情報調査グループ＊ウェブサイト掲載はしておりません

平成21年度海洋水産資源開発事業報告書 No.3
( 資源対応型：いか釣Ⅰ )発 行 時 期：2011年 7月
問い合わせ先：開発調査センター

開発業務課情報調査グループ＊ウェブサイト掲載はしておりません

平成21年度海洋水産資源開発事業報告書 No.4
( 資源対応型：いか釣Ⅱ )発 行 時 期：2011年 10月
問い合わせ先：開開発調査センター

開発業務課情報調査グループ＊ウェブサイト掲載はしておりません

おさかな瓦版

No.43

発 行 時 期：2011年 10月
問い合わせ先：経営企画部 広報室
掲 載 内 容：日本海のさかなたち

第４回

アカムツ

ウェブサイト：http://www.fra.affrc.go.jp/bulletin/letter/no43.pdf

おさかな瓦版

No.44
第５回

ハタハタ

ウェブサイト：http://www.fra.affrc.go.jp/bulletin/letter/no44.pdf

vol.29 2012.1

Publication

発 行 時 期：2011年 12月
問い合わせ先：経営企画部 広報室
掲 載 内 容：日本海のさかなたち

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編集後記

遺伝子が何となく分かるような気がする

遺伝子と聞いて皆さんは何を思い浮かべるでしょうか？ 最先端の研究、遺伝、ケなど呼び名が変わります。

と 思 っ て い た だ け る よ う、 簡 単 な 解 説 もにつれてチンチン、カイズ、クロダイ、関西ではババタレ、チヌ、オオス

二 重 ら せ ん 構 造、 Ｄ Ｎ Ａ と か 頭 が 痛 く なでもあります。地域によっても少し違うようですが、関東では大きくなる

含 め 今 回 の 特 集 を 組 ん で み ま し た。 遺 伝

クロダイはブリやボラなどのように、成長に伴って名前が変わる出世魚

りそうな言葉がいくつも思い浮かぶので西ではチヌの呼び名の方が有名ですね。

子が身近なものに思っていただければ幸釣り上げるのが難しく、引きが強いことで釣り人に人気のクロダイ。関はないでしょうか。

チヌ と クロダイ

私 た ち ヒ ト も 含 め、 生 き 物 す べ て に 遺伝 子 は あ り ま す。 水 産 に 関 連 す る さ ま ざ

29

おさかな
チョット
耳寄り情報

関西で呼ばれている「 チヌ 」の名前の由来は、古事記に大阪湾を「 ちぬもとおり のりながいずみ

周辺の「 ちぬの海 」に多く、名産であったことから、地名が魚の名称になっわかんさんさいずえたと記されています。また、江戸の百科事典である『 和漢三才図会 』にもち ぬ

和泉の古名の「 茅渟 」に由来することが書かれています。しかし、「 茅渟 」とは血沼・血渟とも書かれていて、神武天皇の東征の戦の時に流された血を洗って海が赤く染まったことからとも伝えられています。
せんなんし た る い

大阪府泉 南市樽 井には平安期からの航海安全などのご利益で知られる茅渟神社（ 角埜 彰 ）があり、チヌをモチーフにしたかわいい
お守りもあるようです。チヌ釣り愛好者
は大漁祈願で一度は訪れてみたいですね。

まな生き物についての研究紹介を通して、いです。

の海 」と呼び、江戸時代、本居宣長の『 古事記伝 』では、クロダイが和泉

執筆者一覧■特集 ゲノム研究最前線○水産総合研究センターの研究の現状と戦略･･････････････････････････････････････････････中央水産研究所○遺伝子ってなに？ ゲノムってなに？･･････････････････････････････････････････････････中央水産研究所○魚の染色体を見てみよう !! ････････････････････････････････････････････････････････････中央水産研究所

水産遺伝子解析センター
水産遺伝子解析センター
水産遺伝子解析センター

佐野
菅谷
藤原

○ゲノム情報を利用した新しい水産用ワクチンの開発･･････････････････････････････････････増養殖研究所 病害防除部 免疫グループ 高野○海洋環境へのゲノム研究の応用例 メタゲノム解析の将来展望････ 瀬戸内海区水産研究所 環境保全研究センター 有害・有毒藻類グループ 長井

元彦
琢磨
篤志
倫一
敏

さかな

■あんじいの魚菜に乾杯○第18 回 冬に脂がのる旬のクロダイ･･シンプルな塩焼きを香味オイルでアレンジ･･これが旨い！･････････････････････････････････････････････････････････････････････････････････瀬戸内海区水産研究所

養殖グループ山本

義久

初期餌料グループ

小磯

雅彦

阪地

英男･

養殖技術部

岡内

正典

養殖グループ山本義久□水産総合研究センター 広報誌編集委員
桑原 隆治
角埜
彰
濱田 桂一
大浦 哲也
高﨑 大輔
増村 純男
小池 幹人

足立
横山

純一
雅仁

■研究成果情報○ワムシの入手と利用タイプの現状････････････････････････････････････････････日本海区水産研究所

増養殖部

資源生産部

○水産生物遺伝資源保存事業（ジーンバンク事業）･･･････････････････････････････････････････････････････増養殖研究所■ Topics○ 28 年後に届いた漂流はがき･･･････････････････････････････････････････中央水産研究所■知的財産情報○白化出現頻度が低いヒラメ家系を選ぶ■おさかな

資源管理研究センター○チヌとクロダイ････････････････････････････････････････････････････････････････瀬戸内海区水産研究所

vol.
Fisheries Research Agency News

vol.29 2012.1

増養殖部

岡内

正典

29

□ 2012 年 1 月 1 日発行□編集：水産総合研究センター 広報誌編集委員会□発行：独立行政法人 水産総合研究センター〒 220-6115 神奈川県横浜市西区みなとみらい 2－3－3
TEL. 045－227－2600
FAX. 045－227－2700
URL. http://www.fra.affrc.go.jp/

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資源生態グループ～詳細化するヒラメ DNA 情報の活用～･･････････････････････････増養殖研究所

チョット耳寄り情報

養殖技術部

クイーンズタワーＢ棟 15 階アドバイザー：水野茂樹

デザイン：神長

郁子

vol.

29

Fisheries Research Agency News | 2012. 1〒 220-6115
神奈川県横浜市西区みなとみらい 2－3－3
クイーンズタワーＢ棟 15 階
FAX. 045－227－2700
TEL. 045－227－2600
URL. http://www.fra.affrc.go.jp/