統合進化科学研究センター
統合進化科学コース

ResearchCenterfor
Integrative
Evolutionary
Science統合進化科学研究センター／先端学術院統合進化科学コース

Marvels of
our past
and future

Research Center for Integrative Evolutionary Science

Contents

2

6

年間スケジュール Annual Schedule32

在学生の声 From Graduate Students

10

教員紹介 Faculties

34

Q&A Q & A

20

注目の講義を覗いてみた! Visit Classes!

36

卒業生の声 From Alumni

22

life
履修科目・学生生活 Graduate
and course work

38

統合進化科学研究センターの紹介 About
RCIES

30

学生支援 Student Aids3

先端学術院統合進化科学コース

Integrative evolutionary science program

コース概要
統合進化科学とは生物の変容、人間の諸活動の変遷、および地球規模の諸問題の進行を進化の視点から俯瞰的に捉え、生物学の発展のみならず人間の本質の理解や社会問題の解決を目指す新たな学問領域です。統合進化科学コースは統合進化科学研究センターと連携し、真理の追究と社会への還元に努め、本分野の将来を担う人材を輩出し、科学および社会の発展に広く貢献することを目指します。
本コースは、学士を受け入れる 5 年一貫制博士課程および修士を受け入れる博士後期課程の 2 つの課程から成り、本コースを履修する学生は神奈川県葉山キャンパスに所在する統Petaurista leucogenys

合進化科学研究センターで学修・研究活動を行います。

コース長挨拶
私たちが研究する原動力は何でしょうか。深く知りたいから。興味があるから。不思議に感じるから。未解明の問題を解決したいから。大発見をしたいから。原動力は人それぞれだと思います。それがどのようなものであれ、研究が好き、という点は共通していると思います。研究は大変です。
思うように研究が進まないことはよくあります。必ずしも望むような結果が得られるわけではありません。それでも私たちが研究を続けていけるのは、研究する対象やテーマ、研究という行為、研究者として過ごす時間が好きだからではないか。最近、そのようなことを考えています。
統合進化科学コースは、2023年度にスタートした新しいコースです。
前身である先導科学研究科・生命共生体進化学専攻は、2007年に第一期の大学院生を迎えて以来、多くの博士を輩出してきました。統合進化科学
コースは、生命共生体進化学専攻を礎としつつ、新たな方向性を取り入れて大学院教育を行います。進化、科学と社会が好きな学生と一緒に研究す
ることを楽しみにしています。

統合進化科学コース長

沓掛 展之Betta brownorum
4

5

年間スケジュール

Annual Schedule

入学式

葉山の海岸での磯観察・サンプル採集

総研大の入学式は春季（ 4 月）と秋季（10 月）に開催されます。葉山キャンパスで全コースの新入生が一堂に会します。

統合進化
科学実習
統合進化科学実習では、生物学の発展に寄与してきた重要かつ基礎的な実験方法の知識と技術に直接触れる
ことを通じて、実験生物学の俯瞰的な理解を目指します。主な実習内容
は分子生物学実験、細胞組織学実験、神経生理学実験、走査型／透過型電子顕微鏡実習、プログラミング実習、野外実習です。各実験技術だけでなく、レポート作成技術についても学
びます

５月

4月

6月

7月

8月

9月

10月

４月入学の場合9月卒業の場合

コース説明会

フレッシュマンコース
フレッシュマンコースは、主に新入生を対象とした集中講義です。この講義では、 2 つのことを主な目的とします。第一に、研究者を目指すす
べての人が身につけるべき技術・考えるべき問題を学びます。第二に、総研大ならではの知的広がりに触れる中で、異なる分野の人とのつながりを築きます。フレッシュマンコー

プログレス

夏入試

学位記授与式

オープン
キャンパス
オープンキャンパスでは入試の説明やラボツアーによる研究紹介を実施
しています。また、教員や在校生の研究内容をポスターにて知ることができる他、実際に話すことで情報交換、研究内容の相談などが可能です。

スは、「アカデミア探訪」
、
「研究者と
社会」
、
「研究者のための“伝える”技術」の 3 つのセッションから構成されています。この講義は、年に 2 回、日本語と英語で開催します。日本語（ 4 月開講）及び英語（10月開講）の授業内容は同じです。葉山キャン
パス（ 2 泊 3 日）の対面授業、およびオンデマンドで開講し、単位取得には全ての授業への参加が必要です。

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コース説明会
総研大の統合進化科学コースでは、
例年夏と冬に入試を行い、それに合わせて説明会を実施しています。数人の教員による講演と、コースの入試説明が主な内容です。会場では教員との面談が可能です。

7

Annual Schedule

年間スケジュール

統合進化科学研究センターX
東大三崎臨海実験所学生交流会

生命科学
リトリート

統合進化科学研究センターと東京大学大学院理学系研究科附属臨海実験所（「三崎臨海実験所」）は学生の交流、共同研究の促進を目的とした交生命科学研究に従事する総研大の学流会を開催しています。ポスター・

生と教員がコースの垣根を越えて集ロ頭での研究発表や、両者の研究施

い、学生主体の学術交流を実施して設の見学、懇親会での交流などが主います。学生間の交流などを通じてな内容です。2022年度は葉山キャン

生命科学に親しむことを目的として、

パス、2023年度は三崎臨海実験所でポスター発表や、著名な研究者によ行いました。両機関の交流が今後もる講演、現地ならではの交流イベン

継続され、共同研究への発展など、トなど様々な企画を用意しています。

新しい研究活動のきっかけになることが期待されます。

10月

11月

12月

1月

2月

3月

4月

3月卒業の場合10月入学の場合

入学式 フレッシュマンコース

入試説明会

オープンキャンパス

統合進化科学プログレス
統合進化科学コースでは年に 2 回、統合進化科学プログレスと題し、学生の研究進捗発表会を開催しています。 1 年次には主に研究計画の発表、2 年次には進級審査が行われます。
3 年次以上の学生は英語での発表が冬入試

学位記授与式
総研大の学位記授与式は葉山キャン
パスで行われます。式は春季と秋季の 2 回開催されます。卒業されるみなさんの今後の更なるご活躍を祈っております !

Congratulations!!!

求められます。また、副論文の審査や博士論文の予備審査もこのタイミングで行われます。
統合進化科学コースの教員、学生、研究員が参加し、熱心な質疑応答が行われる、大きなイベントです。

8

9

教員紹介

Faculties

准教授

Kaori Iida

Email
URL
研究分野

✉ iida_kaori@soken.ac.jp

💻 https://researchmap.jp/iida_k
🔍 科学技術史

キーワード 👉 生物学史・遺伝学史・育種・放射線

これまで、20世紀の日本の遺伝学を軸に生物学と社会の関係を分析してきました。例
えば、遺伝学と育種、遺伝学と放射線の影響（原子力の「平和利用」と放射線被害の両方）、
遺伝学と優生思想などのテーマを扱っていま

History of Science

飯田 香穂里す。現在、分析的枠組みとしては、国境間の知の流れや科学外交に関心があります。科学が「国際的」であるのは当たり前のように感じるかもしれませんが、どの知識も同じように国境を超えて自由に流れているわけではあ

代表的な論文・書籍

りません。流れの「滞り」について知るには、

Iida K（2023）「無知の大海に目を凝らす̶一九五〇年代の生物学的知の軌跡」『現代思想』（特集：無知学／ア
グノトロジーとは何か̶科学・権力・社会）6月号, pp.74-82.

トランス・ナショナルな視点の研究が必要になります。これまで特に冷戦期アジアの科学
は米国中心に描かれてきました。このような歴史観の偏りをシフトするため、アジアの国

Iida K (2020) Peaceful atoms inJapan: Radioisotopes as sharedtechnical and sociopoliticalresources for the Atomic Bomb
Casualty Commission and theJapanese scientific community
in the 1950s. Stud Hist Philos Biol
Biomed Sci 80:101240.

から冷戦期アジアの科学技術について分析するグループを立ち上げ、さまざまなケースから米国中心のナラティブを再検討しています。

教授

Naoki Irie

発生進化学研究室
Email
URL
研究分野

Faculties
10✉ irie_naoki@soken.ac.jp

💻 https://rcies.soken.ac.jp/labs/irie
🔍 発生進化生物学

キーワード 👉 動物発生・発生進化の法則性・
表現型進化の予測

生物の特徴（表現型）の進化は、完全に変幻自在ではなく、進化を通して変化しやすい
特徴とそうでないものがあります。なぜそう

Embryonic Evolution

入江 直樹

同士（トランス・アジア）の科学外交の視点した違いが生じるのでしょうか。単に自然選
択による選択圧の差が原因かもしれません。
一方で、そもそも多様化の素地になる表現型のバリエーションを生み出しにくい特徴があり、それらは多様化しにくかった可能性もあります。後者アイディア自体は古いものの、近年の研究で実証されつつあります。ではどういった仕組みで多様化の素地になるバリエーションの生み出しにくさが生じるのでしょ

代表的な論文・書籍
Hu H et al. (2017) Constrainedvertebrate evolution bypleiotropic genes. Nat Ecol Evol
1:1722–1730.
Uchida Y et al. (2023) Stability
in gene expression and bodyplan development leads toevolutionary conservation.
EvoDevo 14:4.

うか。研究室では、動物などを対象に実験や大規模情報解析などなど様々な手法を使ってこの疑問に答えていこうと挑戦を続けています。最終的には、歴史学としての側面が主だ
った進化学を、どういった表現型が進化しやすいのかといった予測性をもった学問分野に変えることに貢献したいと考えています。

11

Faculties

教員紹介

生物の進化は、その設計図であるゲノムの

Hideki Innan

集団遺伝研究室
EmailURL✉ innan_hideki@soken.ac.jp

💻 https://rcies.soken.ac.jp/labs/innan/index.html

研究分野 🔍 集団遺伝学・ゲノム進化

キーワード 👉 進化・遺伝・理論

進化と考えられます。その背景にある普遍的な法則を理論的に解明することを目指します。
遺伝の法則はどの種でも基本的に同じである
ため、汎用性の高い理論構築が可能になります。場合によっては、自然選択や偶然のファ
クターを盛り込んだ、高度な数学を用いた研究になります。同時に理論を用いたゲノムデータ解析も行い、理論の検証も行います。

准教授

数式とコンピュータを用いて、生命現象のHisashi Ohtsuki

数理生物学研究室
Email
URL
研究分野

✉ ohtsuki_hisashi@soken.ac.jp

💻 https://rcies.soken.ac.jp/labs/ohtsuki/index.html
🔍 数理生物学

キーワード 👉 社会生物学・進化生態学・人間行動進化学

様々な謎を理論的に解明しています。マクロからミクロまで様々な現象に興味があります。
生物の社会性の創出・維持
これまでに、（1）機構の研究：微生物の血縁認識と集合的協力、
社会性昆虫の分業および繁殖スケジュールの進化、空間構造下での利他行動や罰の進化
進化生態学の理論研究：根粒菌とマメ科（2）植物の共生の維持機構、熱帯林群集の多様性
人間行動進化学の理論研究：間の説明 （3）
接互恵性による協力の進化、累積的文化進
疾病の理論研究：感染化、閉経の進化 （4）

代表的な論文・書籍

症の疫学動態、ガンの進化、不妊データの統Innan H and Kondrashov F(2010) The evolution of gene
duplications: classifying anddistinguishing between models.
Nat Rev Genet 11: 97-108.

計分析 などの研究を行ってきました。進化学、遺伝学、生態学などの理論を駆使し、進Innan H and Sakamoto T (2021)
Multi-dimensional diffusion
process of allele frequencies
in population genetics. Proc
Jpn Acad Ser B 97:134-143.

Molecular Evolution

大田 竜也

准教授

分子進化学研究室
EmailURL✉ ota@soken.ac.jp

💻 https://rcies.soken.ac.jp/labs/ota/

研究分野 🔍 分子進化学

代表的な論文・書籍化が適応や多様性をもたらす仕組みを解明

Fujimoto Y and Ohtsuki H (2023) Evolutionary stability ofcooperation in indirect reciprocity under noisy and private
assessment. Proc Natl Acad Sci USA 120:e2300544120.

し、過去や現在の生命現象に説明を与え、未長谷川寿一、長谷川眞理子、大槻久（2022）
進化と人間行動 第２版 東京大学出版会

Tatsuya Ota

キーワード 👉 分子進化・免疫・生殖・栽培化

分子進化学・集団遺伝学に基づいたデータ
解析で様々な生物の進化を調べています。特にゲノムやトランスクリプトームなどのメタデータを用いて生殖系や免疫系の遺伝子を調べ、種の存続に強くかかわり自然選択の影響を強く受けてきた生物システムの進化を明らかにしようとしています。人為選択によって形態学的な形質や生理学的な形質が大きく変化してきた栽培植物の進化についても研究し代表的な論文・書籍ています。具体的には、

Fawcett JA, Takeshima
R et al. (2023) Genome
sequencing reveals thegenetic architectureof heterostyly anddomestication history ofcommon buckwheat. Nat
Plants 9:1236–1251.

1.脊椎動物（ゼブラフィッシュ・ハイギョ・Thompson AW et al.
(2021) The bowfin
genome illuminates thedevelopmental evolutionof ray-finned fishes. Nat
Genet 53:1373-1384.

12

大槻 久

Mathematical Biology

教授

大西 勇喜謙研究分野✉ oonishi_yukinori@soken.ac.jp

💻 http://www.y-onishi.sakura.ne.jp/publications.html
🔍 科学哲学

キーワード 👉 科学的実在論論争・境界線問題・確証理論
科学的表象・自然種・機械学習

ム構造の進化2.タデ科植物における生殖の進化（特にフツウソバにおける異形花型自家不和合性の進化）

3.栽培植物（フツウソバやアズキなど）のド
メスティケーションなどの研究を行っています。

科学哲学は、科学の方法論や諸概念の分析、社会との関係、あるいは特定の科学理論が含意する世界像の分析など、科学の様々な側面を分析する学問です。この分野での私自身の関心は、主に科学知識の分析にあります。中でも、「科学的実在論論争」とよばれる、科
学知識の性質/限界に関する論争や、分類体
系・モデルといった科学的表象、それらを用いた推論のあり方などについて分析してきました。最近では、機械学習やデータ同化を用いた新しい科学のあり方についても関心をもっています。

シーラカンス・ガー・アミアなどの硬骨魚類）における免疫系遺伝子の進化やそのゲノ

講師

科学哲学研究室
URLやadaptive dynamics理論などの研究ツール自体の開発も行っています。

Yukinori Oonishi

Email

来の予測を行います。また、進化ゲーム理論

Philosophy of Science

Population Genetics

印南 秀樹

代表的な論文・書籍
Bueno O and Onishi Y(2020) The likelihood ratio
measure and the logicality
requirement. Erkenntnis
87: 459-475.
Onishi Y (2017) Defending
the selective confirmation
strategy. Stud Hist Philos
Sci Part A 64: 1-10.

13

Michiyo Kinoshita

神経行動学研究室
EmailURL✉ kinoshita_michiyo@soken.ac.jp

💻 https://researchmap.jp/m_kinoshita/

研究分野 🔍 神経行動学・視覚生態学・感覚生理学・
認知行動学・比較生理学

キーワード 👉 昆虫・訪花行動・物体認知

ヒト以外の動物は、この世界をどのように感じているのでしょう ?

残念ながら、彼らが感じる世界を完全に再現し我々が体感することはできません。なぜならヒトと動物では感覚系が同じではないからです。
神経行動学は、動物の世界をできるだけリアルに理解することを目指して、彼らの認知能力を行動学的な方法で見た上で、神経科学的な方法によって脳が行動を司る仕組みを調べる分野です。
私たちは、アゲハチョウが見ている世界を理解することを目標に、彼らの視覚能力と眼代表的な論文・書籍の仕組みとの関係を明らかにして来ました。

Kinoshita M andArikawa K (2023) ʻColorʼ
processing in the butterfly
visual system. Trends in
Neuroscience 46:338-340.

現在は、高次神経系での光情報処理ネトワー
クとその機能、訪花行動における視覚と嗅覚の統合、野外でアゲハチョウが訪れる花種などについて調べています。将来これらの知見

Kinoshita M et al. (2017)
Multisensory integrationin Lepidoptera: insight into
flower-visitor interactions.
Bioessays 39:1600086.

Animal Behaviour

沓掛 展之を、虫と花の共進化の研究に繋げていきたいと考えています。

教授

Nobuyuki Kutsukake

Email
URL

✉ kutsu@soken.ac.jp

💻 https://sites.google.com/view/nkutsukake/home
https://sites.google.com/site/sokendarwin/

研究分野 🔍 動物行動学・行動生態学・進化生物学・霊長類学

キーワード 👉 動物・行動・社会

代表的な論文・書籍
Yamakawa M et al. (2024)
Helping syndrome ispartially confirmed in theeusocial naked mole-rat.
Anim Behav 210:289-301.
沓掛展之、古賀庸憲（2012）「行動生態学」共立出版

14

准教授

動物を観察していると「どんな暮らしをしているのだろうか？」「何を考えているのだ

五條堀 淳
Jun Gojobori

人類進化遺伝学研究室
Email
URL
研究分野

💻 https://rcies.soken.ac.jp/labs/gojobori/🔍 自然人類学・分子進化学・集団遺伝学

URLています。これまで哺乳類を中心として、鳥研究分野

トの種特異的形質の進化を理解する事」と、「アフリカに出現したヒトの世界への拡散の過程を理解する事」の 2 つです。これらの進化の過程を主に分子進化学的手法と集団遺伝学的手法を用いてDNAレベルで解析します。
現在は古代DNA研究を中心に東アジアのヒが進行中ですが、そこから生まれる大量のヒト遺伝的多型のデータを活用する事で、医学的データの人類進化学への還元を目指します。
さらには人類進化に限らず、霊長類の進化、
ほ乳類の進化、脊椎動物の進化と、視点を広げての解析も行っています。

教授

Akira Sasaki

様」を進化生物学的に理解することを目指しという疑問に対して、 2 つのアプロー

因遺伝子のマーカーを探索するプロジェクト

Mizuno F, Gojobori J et al.
(2021) Population dynamics
in the Japanese Archipelago
since the Pleistocene
revealed by the complete
mitochondrial genome
sequences. Scientific reports
11:12018-12018.

Email

か?

チを考えています。そのアプローチとは、「ヒ

国内や国外で様々な現代病を含む遺伝病の原

Xiaokaiti X et al. (2023)
The history of ancientJapanese dogs revealedby mitogenomes. Anthr Sci
230617.

佐々木 顕

ヒトという種がどのように成り立ったのト集団の解析を行なっています。また、日本代表的な論文・書籍

は、動物の行動や生態を分析し、その「生き体的には、野生動物が生息するフィールドに✉ gojobori_jun@soken.ac.jp

キーワード 👉 ヒト・遺伝・集団

ろうか？」などの多くの疑問が生じます。私や魚などの脊椎動物を研究してきました。具

講師✉ sasaki_akira@soken.ac.jp

💻 https://sites.google.com/site/sokendaisasaki/🔍 数理生物学・進化生物学・生態学

キーワード 👉 数理・進化・生態・行動

生物の複雑な行動や巧妙な戦略がどのように進化してきたのか、生物種間の相互関係はどのような方向に進化するのか、病原体や害虫、外来生物の伝播や将来の進化をどのように予測し、対策するのかといったテーマについて、数理モデルを用いて研究しています。
最近の研究例を紹介しますと、浅海や熱帯などの中心ニッチで新しい体制を獲得した新種滞在し、それぞれの個体に名前をつけて、彼が多く分岐し適応放散する結果、深海や高緯らの行動を日々記録するという地道な作業を度地域などの辺境ニッチに向かって生物流が行います。研究対象が夢に出てくるほど研究

生まれ、辺境に「生きた化石」が必然的に生対象をじっくりと観察することが、動物を理代表的な論文・書籍

じること、新型コロナウイルスやインフルエ

解する王道です。 その一方で、自分の研究

Ito HC and Sasaki A (2023)
The adaptation front equation
explains innovation-driven
taxonomic turnovers andliving fossilization. Am Nat
202:E163-E180.

ンザウイルスなど、ウイルス表面抗原を頻繁対象にとらわれる事なく、多くの動物に共通するパターンや理論を考える事が、動物を理解するうえで効率的な戦略です。大学院生や若手研究者と一緒に、この分野の発展に貢献するような研究ができればと考えています。

Sasaki A et al. (2022) Antigenic
escape selects for theevolution of higher pathogentransmission and virulence.
Nat Ecol Evol 6: 51-62.

Mathematical Biology

Behavioral Neuroscience

木下 充代

Evolutionary Human Genetics

Faculties

教員紹介に脱ぎ変えて宿主免疫から逃避する病原体では、宿主をより搾取する方向に進化が起きる
こと、熱水噴出孔でのハオリムシとイオウ細菌のようにお互いに協力しあう相利共生系の方が、たかりたかられる寄生系よりも「進化による共生システム崩壊」のリスクが大きいことなどを理論的に解明してきました。
15

教授

Yoko Satta

進化生理学研究室
EmailURL✉ satta@soken.ac.jp

💻 https://sites.google.com/site/sattalab/home

研究分野 🔍 ゲノム集団遺伝学・人類進化学

キーワード 👉 異種間浸透・祖先集団多型・コンピュータシミュレーション・偽遺伝子・自然選択

間」が自分自身の生物としての存在を十分認識していないことに起因します。生物としての存在を認識するためには、「人間」が自然界のなかでどのように進化してきたかを知ることが肝要です。一方形態や生理などの表現
型進化の多くは、その時その時の環境に適応した個体が子孫を残し、生き残ること（「自えます。つまり私たちの存在は現在の環境に適応したものであり、その意味で私たちのゲノムの中には環境適応の特異的な様子が描かれています。私たちの研究室ではこのようなSatta Y et al. (2019) Twodimensional site frequency
spectrum for detecting,classifying and dating
incomplete selective sweeps.
Genes Gen Syst 94:283-300.

環境適応をゲノムレベルで明らかにし、「生物としての人間」とは何か明らかにすることを目指しています。

Chromosome Biology

准教授

Hideyuki Tanabe

染色体生物学研究室
URL

このような問題の根本原因のひとつには「人の存在もその様な環境適応の結果であるとい

Lau Q et al. (2015) A limit to
the divergent allele advantage
model supported by variable
pathogen recognition across
HLA-DRB1 allele lineages.
Tissue Antigens 86:343-52.

Emailした人間は現在様々な問題に直面しています。

然選択」）により進められてきました。
「人間」

代表的な論文・書籍

田辺 秀之

科学・技術の発達により空前の繁栄を謳歌✉ tanabe_hideyuki@soken.ac.jp

💻 https://rcies.soken.ac.jp/scientists/scientists_hideyuki_tanabe.html

研究分野 🔍 分子細胞遺伝学・染色体生物学

細胞核内の染色体に着目し、染色体や遺伝子の空間配置がどのような仕組みで制御されているのか、各種培養細胞を用いて、FISH（fluorescence in situ hybridization）法を中心とした分子細胞生物学的なアプローチから探っています。間期核における染色体テリトリーからDNAに至る階層構造として、A/

蔦谷 匠

助教

人類や霊長類を中心としたいろいろな「わTakumi Tsutaya

生物人類学研究室
Email
URL
研究分野

✉ tsutaya_takumi@soken.ac.jp

💻 https://sites.google.com/view/anthr/🔍 自然人類学・霊長類学・生物考古学・古生物学

キーワード 👉 古代プロテオミクス・安定同位体・オランウータン

います。最近力を入れているテーマは以下の通りで、フィールドから実験室まで、分野をまたいで多岐にわたります。

•古代プロテオミクスを考古学へ応用し、疾の実態などを古生物標本の分子分析によって復元しています。

•野生オランウータンの調査地を共同運営し、霊長類生態学、人類進化、人獣共通感染症などに関わる研究を実施しています。

准教授

Yohey Terai

進化・生物多様性研究室
研究分野

からない進化や生命現象を遡及的に復元して•人類を含む絶滅動物の系統、進化史、絶滅

Tsutaya T et al. (2021)
Faecal proteomics as anovel method to study
mammalian behaviour andphysiology. Mol Ecol Resour
21:1808–1819.

URL

素の分析を利用して、DNAの分析からはわェンダーの実態などを調べています。

Uchida-Fukuhara Y et al.
(2024) Palaeoproteomic
investigation of an ancienthuman skeleton withabnormal deposition ofdental calculus. Sci Rep
14:5938.

Email

リーを調べています。特に、タンパク質や元病の歴史、ヒトと動植物の関わり、過去のジ代表的な論文・書籍

寺井 洋平

たしたち」の多様な生きざまやライフヒスト✉ terai_yohei@soken.ac.jp

💻 https://rcies.soken.ac.jp/labs/terai/🔍 適応・種分化・古代ゲノムしており、生物の多様性を作り出しています。
この生物多様性は 1 つの種が 2 つの種に分かれる「種分化」の過程と、生物が生息環境で生き残る「適応」の過程を経て獲得されてきました。私たちは生物の適応と種分化の機構を明らかにするために、次の 4 つの研究に注キーワード 👉 染色体テリトリー・FISH法・核型進化

Bコンパートメント、TADs（Topologically

代表的な論文・書籍

知られており、それらの核内空間配置の動態

種分化の研究をしています。[共生による適Kimura A et al. (2021)
Identification of chromosome
17 trisomy in a cynomolgus
monkey (Macaca fascicularis)by multicolor FISH techniques.
Cytogenet Genome Res 161:
243-248.

や制御の仕組み、核型進化との関係性につい

応］：火山ガスの噴出する付近にのみ生育すては未知な部分が多く残されています。そこる地衣類のイオウゴケをモデルに、共生によTanabe H et al. (2002)
Evolutionary conservationof chromosome territory
arrangements in cell nuclei
from higher primates. Proc
Natl Acad Sci USA 99: 44244429.

種の細胞資源化を通して、全生物種の染色体

Associating Domains）、クロマチン構造がで私は、マルチカラー3 D-FISH法等を駆使して、染色体テリトリーの核内配置分子基盤の解明を目指しています。また、様々な生物
カタログ化、核型の図鑑化を目指しています。

キーワード 👉 環境適応・視覚・マカク・地衣類・イヌ・ニホンオオカミ

地球上には膨大な数の生物の「種」が生息代表的な論文・書籍
Gojobori J et al. (2024) The
Japanese wolf is most closely
related to modern dogs andits ancestral genome has
been widely inherited by dogs
throughout East Eurasia. Nature
Communications 15:1680.
寺井洋平（2018）生物多様性の謎に迫る DOJIN選書

Evolutionary Biology

Evolutionary Physiology
16

颯田 葉子

Biological Anthropology

Faculties

教員紹介：ゲノム解析からス
力しています。[種分化］
ラウェシ島固有の 7 種のマカクやサンゴのり新たな環境に適応する機構を研究していま：ニホンオオカミとす。[ヒト環境への適応］
古代犬の古代ゲノムからイヌの起源とイヌがどのようにしてヒトとの生活環境に適応してきたかを研究しています。[光環境への視覚の適応］：魚類や爬虫類を用いて水中の異なる光環境に生物がどのように視覚を適応してきたか研究しています。
17

Faculties

教員紹介

准教授

Hitomi Hongo

生物考古学研究室
Email
URL✉ hongouhm@soken.ac.jp

💻 https://researchmap.jp/6613530/

研究分野 🔍 環境考古学・動物考古学・先史人類学

キーワード 👉 新石器時代・ドメスティケーション・動物遺存体
代表的な論文・書籍

人類史を通してヒトと環境との相互関係の変遷を考察し、過去・現在・未来の人類と環境の総合的な理解を目指します。考古遺跡から出土する動物骨、種子、花粉などを分析し、ヒトの活動が他の生物や周辺環境の変化に及ぼした影響、環境の変化がヒトの生業や社会に及ぼした影響を探っています。紀元前

1 万年の食糧生産の開始は文明社会の発達を可能にした一方、後の地球環境劣化を引き起

渡辺 佑基

教授
動物の体に計測機器を取り付ける「バイオYuuki Watanabe

ロギング」の手法を使って、大型魚類や海生

海洋生態学研究室
Email
URL

哺乳類の生態を調べています。最新鋭の機器✉ watanabe_yuuki@soken.ac.jp

💻 https://rcies.soken.ac.jp/labs/ywatanabe

研究分野 🔍 生態学・海洋生物学

キーワード 👉 バイオロギング・大型魚類・海生哺乳類

を使うことで、動物の行動パターンだけでなく、周囲の環境や体内の状態（体温、心拍数等）をも計測できます。また、ビデオカメラ
を動物の背中に取り付けて「動物目線」の映像を記録し、動物が海の中で何をしているのかを調べることもできます。野外調査で集めこす遠因となりました。ドメスティケーショ

代表的な論文・書籍

Hongo H et al. (2021)
Beginning of pig
management in Neolithic
China: Comparison ofdomestication processes
between northern andsouthern regions. Animal
Frontiers 11:30-42.

ン（家畜化・栽培化）の過程を、ヒトと動物たデータを解析し、他の研究手法や文献デー

Watanabe YY andPapastamatiou YP (2023)
Biologging and biotelemetry:
tools for understanding the
lives and environments ofmarine animals. Annu Rev
Anim Biosci 11:247-267.

タと適宜組み合わせながら、当該種の行動パ

Ervynck A et al. (2001) Born
Free? New Evidence for
the Status of Sus scrofa at
Neolithic Çayönü Tepesi(Southeastern Anatolia,
Turkey). Paléorient 27: 47-73.

関して、ユーラシア全域、東南アジア島嶼部、

Evo-devo Neurobiology

渡邊 崇之

や植物の共進化という観点から解明するため、偶蹄類の家畜化および経済・社会の変化について西アジア（トルコ、ヨルダン、イラク）や東アジアの新石器時代遺跡で調査をしています。また、イヌ、イノシシの家畜化過程に
日本の資料を用いて国内外の考古学、分子遺伝学、環境科学、文化人類学などの分野の研究者と共同研究をおこなっています。

助教

Takayuki Watanabe

神経進化発生学研究室
Email
URL

✉ watanabe_takayuki@soken.ac.jp

💻 https://rcies.soken.ac.jp/labs/twatanabe/

研究分野 🔍 神経行動学・分子進化学

キーワード 👉 神経遺伝学・社会行動・行動発達・コオロギ
代表的な論文・書籍
Watanabe T (2019) Evolution of
the neural sex-determination
system in insects: does fruitless
homolog regulate neuralsexual dimorphism in basal
insects? Insect Mol Biol 28:807827.
Watanabe T et al. (2018)
Immediate-early promoterdriven transgenic reporter
system for neuroethologicalresearches in a hemimetabolous
insect. eNeuro 5:e0061-18.2018.

昆虫を含む多くの動物は、成体へと至る過程で「変態」という発生学的プロセスを経てボディープランをダイナミックに変化させます。変態を介した新たなボディープランの獲得には、変態後の体を制御する神経系の再編成が必要となります。ショウジョウバエなどの完全変態昆虫では蛹期に神経系が大規模に再編成されます。一方、蛹期を持たない不完
全変態昆虫は大規模な神経系の構造的改変を伴わずに成虫になり、配偶行動などの幼虫期には見せなかった成虫特異的な行動を示すよ
うになります。私たちは不完全変態昆虫（コMarine Ecology

Bioarchaeology
18

本郷 一美

ターンや生理様式の進化を促した生態的意義（究極要因）を探るのが主要なアプローチです。
サメ類を始めとする大型魚類の研究が中心ですが、アザラシ類の研究もしています。国内
では神奈川（総研大葉山キャンパスから近い

Watanabe YY et al. (2020)
Ultrahigh foraging ratesof Baikal seals maketiny endemic amphipods
profitable in Lake Baikal.
Proc Natl Acad Sci USA
117:31242-31248.

松下 敦子

相模湾）
、高知、沖縄、国外では台湾、カナダ、
オーストラリア等で野外調査を行っています。

講師

統合進化科学研究センターを、進化学・科

Atsuko Matsushita

学と社会の研究拠点として、多角的に盛り上学術・研究支援EmailURL

げていきます。

✉ matsushita_atsuko@soken.ac.jp
💻 https://researchmap.jp/am9p

共同利用事業

研究費獲得の支援

広報

共焦点レーザー顕微鏡、走査型

研究費申請書の作成支援を行っ

統合進化科学研究センターの広電子顕微鏡、透過型電子顕微鏡ています。

報活動を行っています。

の利用支援を行います。

オロギ）を研究材料に、変態に付随して起こるであろう神経回路再編成の分子機構や機能的意義を理解するために研究を進めています。
コオロギで可能な遺伝子導入・改変技術を武器に、闘争行動や配偶行動などの成虫特異的・性特異的な社会行動の分子・神経基盤、発生学的メカニズムについて調査を進めています。

共同研究の仲介

環境安全

進化学に関連した研究を連携し実験室等研究環境の安全対策、ていきます。

化学物質や実験機器の管理、および周辺地域への環境安全管理の報告を行っています。

サイエンスカフェなど
講師派遣の依頼がありましたら
matsushita_atsuko@soken.ac.jp
までご連絡下さい。

19

注目の講義を覗いてみた!

Visit Classes!

講義

統合進化学実習
マクロ生物学トルコ

ハッサンケイフ・ホユック遺跡

本郷一美 准教授
講義

骨の形から
動物の特徴を比べます本

海洋動物生態学

郷研究室は現生と考古遺跡から出土し渡辺 佑基 教授

た骨や、骨格のキャストをたくさん所蔵しており、これらを活用して講義を行いま海の動物たちは、 海の中でどのような生活を送っているのでしょうかす。
マクロ生物学では、主に化石からわかった
形態の変化をもとに約600万年のヒトの進化について概説します。化石人類の頭骨や四肢サ骨のキャストを使い、猿人、原人、現生人類の違いを見ていきます。

か。かつて、それを調べることは技術的に困

ホンザル）、食肉類（イヌ、ネコ、クマ）、齧

難でした。しかし、20世紀の終わり頃から急歯類（リス、ネズミ）、草食動物（ヒツジ、ウマ、肢骨の各部位の特徴を、骨格標本を使いなが物たちは、私たちの目の届かない海の中でどのような生活を送っているのでしょう

統合進化科学実習では、霊長類（ヒト、ニシカ）、雑食のイノシシなどの歯、頸椎、四メやペンギンやアザラシなどの海の動速に発展した「バイオロギング」の技術が、
トルコ、チグリス川流域 ハッサンケイフ・ホユック遺跡（11500年前）

海洋動物の生態・生理の現場計測を可能にしました。小型の計測機器を動物の体に取り付

ら比較します。食性やロコモーションによるけ、動物の行動、体内の状態（体温、心拍数

骨格の違いを観察します。哺乳類以外の鳥やなど）、周囲の環境に関するパラメータを計

魚の骨も比較に使います。全身の骨を見てス測するという手法です。この技術のおかげで、ケッチをして哺乳類の骨の特徴をつかんだの

従来の常識を覆すような新発見が次々と生まち、新石器時代の遺跡から出土した骨の破片れています。たとえば、海の上を何か月にもを使い、同定分類を経験します。

わたって飛ぶグンカンドリは、滑空中に眠ることがわかりました。ナガスクジラなどのヒゲクジラ類は、異常に巨大化した口を使って、自分の体の体積よりも多くの海水を口内に入れ、魚やオキアミを摂取することがわかりま
現代のトルコで、放牧されるヒツジとヤギの混群した。一部のサメやマグロは、魚類としては
例外的に体温を水温よりも高く保っており、それが卓越した運動能力の主要因であることが示されました。本講義では、バイオロギン
グが明らかにした海洋動物の生態・生理に関する新発見を紹介し、そうした進化を促した
究極要因について考えてみたいと思います。

計測機器を取り付けたホホジロザ
メ（上）、ウェッデルアザラシ（中段左）、アカウミガメ（中段右）、アデリーペンギン（下）。生態、生理、環境応答に関する様々なデー
タを動物自身がとってきてくれる。

Watanabe and Papastamatiou(2023) Annu. Rev. Anim.
Biosci.より© ArchitectureVIZ | Dreamstime.com

20

21

履修科目・学生生活：フィールド調査（動物考古学）に基づく研究を行うAさんの場合
履修科目

Graduate life and course work: case 1

学生生活

1日 タイムスケジュール

趣味は?
1年次

計22単位

【前期】計10単位

1 、 2 年のうちに主要な単位を取得しておくことで、3年以降はより研究に集中できました。

フレッシュマンコース

3年次

動画視聴・散歩

計10単位

【前期】
なし

先導科学実習（新 統合進化科学実習）
科学と社会副論文入門（新 科学・技術と社会）
科学・技術と社会Ⅱ

環境考古学特論

生物統計学（新 統合進化科学セミナーⅢ）
先導科学考究Ⅲ

先導科学プログレスⅢ【後期】計3単位（新 科学哲学入門）
生命科学と社会Ⅰ（新 統合進化科学英語基礎1）
科学英語（基礎）Ⅰ【通年】計9単位（新 統合進化科学セミナーI）
先導科学考究Ⅰ（新 統合進化科学プログレスIA・IB）
先導科学プログレスⅠ（新 先端学術院特別研究IA・IB）
先導科学特別研究Ⅰ

バイトはしていますか?

（新 先端学術院特別研究ⅢA・ⅢB）
先導科学特別研究Ⅲ

不定期で資料整理のバイトや発掘調査に参加しています

計7単位

12:00

昼食

13:00

データ分析

🍴

ș
ș

15:00

先導科学特論ⅩⅨ（新 生物人類学特論）
ひとり暮らしです

【後期】

16:00

先導科学プログレスⅣ

研究はどこでしていますか?

論文執筆

17:00

（新 統合進化科学プログレスⅣA・ⅣB）【前期】

先導科学特別研究Ⅳ（新 先端学術院特別研究ⅣA・ⅣB）

なし

5年次

【後期】計3単位（新 統合進化科学英語上級1）
科学英語（上級）Ⅰ

統合人類学特論（新 ゲノム遺伝学特論）
先導科学特論Ⅹ【通年】計8単位（新 統合進化科学プログレスⅡA・
ⅡB）
先導科学プログレスⅡ（新 先端学術院特別研究ⅡA・
ⅡB）
先導科学特別研究Ⅱ
文系の学部出身で生物の分野には慣れていないことを考慮していただいたので、単位を取得する上での支障はありませんでした。

資料調査は沖縄の埋文センターで行い、収集したデータの分析は学校でやります。
基本的に家では作業はあまり進みません

計10単位

【前期】

どんな研究をしてますか？

なし
【後期】

沖縄県の遺跡から出土したイノシシ資料を用いて、先史時代のイノシシ利用を研究していますなし（新 統合進化科学セミナーⅡ）
先導科学考究Ⅱ

22

H

ゼミ（不定期）

一人暮らし？それとも実家やシェアハウスですか？

【前期】計1単位【通年】計6単位

計11単位

🚈

11:00

14:00

なし
2年次

通学（電車、バス）約30分（新 統合進化科学プログレスⅢA・ⅢB）

4年次

科学論文の書き方

9:00
10:00
友達とご飯 or
家でダラダラしています【通年】計8単位

進化行動生態学特論

起床

休日の過ごし方は?

【後期】計2単位

ミクロ・マクロ生物学

8:00【通年】計10単位
先導科学プログレスⅤ

18:00
19:00

自宅へ移動 約30分

20:00

帰宅、夕飯

21:00

入浴

22:00

明日の準備等🍴🚿（新 統合進化科学プログレスⅤA・ⅤB）（新 先端学術院特別研究ⅤA・ⅤB）
先導科学特別研究Ⅴ

副論文特別研究5年間トータル

60単位

23:00
0:00

就寝

🛏
23

履修科目・学生生活：フィールド調査（海洋生態学）に基づく研究を行うBさんの場合

Graduate life and course work: case 2
通学（電車、バス）1時間

履修科目

学生生活

1日 タイムスケジュール（通常）

1日 タイムスケジュール（フィールド調査中）

趣味は?
3年次

卓球、スキューバダイビング（たまに）、
格闘技観戦

計12単位

【前期】計5単位
統合進化科学実習
先端学術院特別研究ⅢA

休日の過ごし方は?

統合進化科学プログレスⅢA【後期】計5単位

必修ではない講義も受講しました（統合進化科学英語など）。ただし、自身の研究に時間を割けなくなると本末転倒なので、無理のな
い範囲で科目を選びました。

統合進化科学英語上級1
生命科学と社会先端学術院特別研究ⅢB
統合進化科学プログレスⅢB【通年】計2単位

友人と遊んだりゲームをしたりして、リフレッシュしています

統合進化科学セミナーⅢ

4年次【前期】計3単位

9:00

通学（自転車、バス）1時間

10:00

ゼミ（週1）

11:00

H

🍴

12:00

昼食

13:00

データ解析、 論文執筆など

ș

14:00
フィールドワークが入った
場合でも代替措置を取ってもらえて、とても助かりま
した。

計11単位

起床

バイトはしていますか?
リサーチアシスタントのみ

🚌

8:00

実家orひとり暮らし

15:00
ひとり暮らし研究はどこでしていますか?

先端学術院特別研究ⅣB
統合進化科学プログレスⅣB
科学・技術と社会

普段はパソコンさえあれば研究できるので、大学だけでなく自宅やカフェでも研究しています

副論文特別研究

5年次

簡単に研究内容を教えて下さい【前期】計3単位
先端学術院特別研究ⅤA
統合進化科学プログレスⅤA【後期】計3単位
先端学術院特別研究ⅤB
統合進化科学プログレスⅤB
3年間トータル

24

17:00
18:00

🚶🕺

大学の人たちと
卓球

19:00

計6単位

29単位

0:00

乗船

0:30

朝方まで仮眠

8:00

サメへの記録機器の取り付け（船上）

野生のサメに
行動記録機器（ビデオカメラなど）を取り付けて、その生態を調べています

10:00
11:00
12:00

帰港

13:00

昼食

15:00
16:00
17:00

20:00

帰宅

21:00

夕食、入浴

19:00

22:00

読書など

20:00

23:00
0:00

就寝

🍴

📖

🛏

Ľ

9:00

14:00

統合進化科学プログレスⅣA【後期】計8単位

起床、乗船の準備

16:00

先端学術院特別研究ⅣA

🚢

23:00

18:00

21:00

🍴

☕
休憩

記録機器のセッティング

🍴

夕食

就寝

🛏

22:00

25

履修科目・学生生活：実験とデータ解析に基づく研究を行うCさんの場合
履修科目
1年次

3年次

計24単位

開講される科目は都合が合えば積極的に参加しました。
専門外の講義も足並みを合わせてもらえるので、あまり構えなくても大丈夫です。

計10単位【前期】計11単位【前期】計3単位

フレッシュマンコース

先端学術院特別研究ⅢA

ミクロ・マクロ生物学

統合進化科学プログレスⅢA

先導科学実習（新 統合進化科学実習）【後期】計5単位

科学技術社会論入門

環境考古学特論

進化ゲーム理論特論

生物多様性特論（新 個体群生態学特論）
先導科学特論Ⅹ
Ⅰ

先端学術院特別研究ⅢB

先導科学特論ⅩⅨ（新 生物人類学特論）

統合進化科学プログレスⅢB【後期】計5単位【通年】計2単位

人類遺伝学特論

統合進化科学セミナーⅢ

分子進化学特論
進化行動生態学特論（新 ゲノム遺伝学特論）
先導科学特論Ⅹ

先導科学特論ⅩⅥ（エピジェネティクス･ゲノム進化特論）

4年次

(予定)

（新 統合進化科学セミナーI）
先導科学考究Ⅰ（新統合進化科学プログレスIA・IB）
先導科学プログレスⅠ（新 先端学術院特別研究IA・IB）
先導科学特別研究Ⅰ

計12単位

【前期】

研究が忙しくなる高学年に向けて、 1 、 2 年次に多めに講義を取りました。

趣味は?
将棋、麻雀、水族館巡り

統合進化科学プログレスⅣA

科学・技術と社会（旧 科学・技術と社会II）（旧 科学英語（基礎）II）
統合進化科学英語基礎２

副論文特別研究I
科学哲学入門）生命科学と社会（新

5年次

(予定)

計6単位

先端学術院特別研究ⅤA（新I
統合進化科学英語基礎1）
科学英語（基礎）統合進化科学プログレスⅤA（新 神経進化発生学特論）
先導科学特論ⅩⅩ【後期】計3単位（新 統合進化科学セミナーⅡ）
先導科学考究Ⅱ

通学（電車、バス）1時間

先端学術院特別研究ⅤB
統合進化科学プログレスⅤB

H

11:00

ゼミ（週1）

12:00

昼食

13:00

実験開始

小学生向けの実験教室の講師をしています

既婚なので、旦那と2人で住んでいます

研究はどこでしていますか?
実験が主なので、大学です。
データ解析や論文作成の業務は家で行うこともあります

どんな研究をしてますか？

14:00
15:00
16:00

魚類の視覚の進化を、
分子生物学的視点から研究しています

🍴

hV
ș

実験終了

18:00

事務作業、論文作成など

19:00

帰宅

20:00

帰宅、夕飯

21:00

アニメなどを見ながら
論文チェック

22:00

趣味の時間

26

5年間トータル

64単位

🍴

23:00
0:00

入浴、 明日の準備

0:30

就寝

（新 統合進化科学プログレスⅡA・
ⅡB）
先導科学プログレスⅡ（新 先端学術院特別研究ⅡA・
ⅡB）
先導科学特別研究Ⅱ

🚈

17:00

【前期】計3単位（新 科学・技術と社会）
科学・技術と社会Ⅱ【通年】計8単位

9:00

バイトはしていますか?

なし【後期】計4単位

起床・朝食・準備

10:00【後期】計9単位
先端学術院特別研究ⅣB

8:00

休日の過ごし方は?

一人暮らし？それとも実家やシェアハウスですか？

【前期】計3単位

統合進化科学プログレスⅣB
2年次

1日 タイムスケジュール

計12単位

先端学術院特別研究ⅣA【通年】計8単位

学生生活

土曜日はバイト、
日曜日に友人とご飯に行くことが多いです

科学と社会副論文入門

集中講義が多いので授業の日数が少なく、研究に集中しやすいと思います。

Graduate life and course work: case 3🛏27

履修科目・学生生活：社会と科学の研究を行うDさんの場合

Graduate life and course work: case 4

履修科目

学生生活

1日 タイムスケジュール

趣味は?
1年次

3年次

計16単位

【前期】計9単位【前期】計4単位

フレッシュマンコース

分子進化学特論

科学技術社会論入門
先端学術院特別研究IA
統合進化科学プログレス IA

本格的に研究を始める前に視野を広げられるよう、基礎科目はなるべく早めに履修しました。

統合進化科学プログレスⅢA

一人暮らし？それとも実家やシェアハウスですか？

【通年】計2単位

4年次

統合進化科学セミナーⅠ

計11単位【前期】計4単位
国際インターンシップ
2年次

学振をもらうまでは塾講師をしていました

統合進化科学セミナーⅢ

統合進化科学プログレス IB

統合進化科学プログレスⅣA【前期】計5単位
生物統計学
先端学術院特別研究IIA
統合進化科学プログレスIIA

ひとり暮らし国際経験を積むため、国際インターンシップ
も履修しました。

先端学術院特別研究ⅣA

計14単位

研究テーマの基礎知識を得るため、生物学分野の科目も履修しました。

生命科学と社会科学・技術と社会
統合進化科学英語基礎１
先端学術院特別研究IIB
統合進化科学プログレス IIB【通年】計2単位
統合進化科学セミナーⅡ【後期】計7単位
先端学術院特別研究ⅣB
統合進化科学プログレスⅣBș

読書や執筆など同じ作業が続くので、カフェや図書館、研究室など、場所を変えてやっています

5年次

昼食

13:00

レポート作成

ș
H

14:00
15:00

ゼミ（週1）

16:00

休憩

17:00

読書会

18:00

帰宅・夕食

19:00

休憩

20:00

ゼミの論文読み📖【前期】計3単位
先端学術院特別研究ⅤA

機械学習を用いた研究における科学的説明のあり方について分析しています🍴📖

どんな研究をしてますか？

計6単位

🚈

🍴

12:00

副論文特別研究21:00

統合進化科学プログレスⅤA

22:00【後期】計3単位
先端学術院特別研究ⅤB
統合進化科学プログレスⅤB
5年間トータル28

研究の文献講読

研究はどこでしていますか?

【後期】計7単位
科学史・科学技術社会論2

9:00

11:00

バイトはしていますか?

【通年】計2単位

先端学術院特別研究 IB

通学（電車、バス）1時間

統合進化科学英語上級I

統合進化科学プログレスⅢB

科学哲学入門

8:00

10:00

先端学術院特別研究ⅢB

科学史・科学技術社会論１

起床・朝食・準備

本屋とカフェめぐり【後期】計5単位
科学史・科学技術社会論３【後期】計5単位

7:00

休日の過ごし方は?

先端学術院特別研究ⅢA

統合進化科学実習
生命科学副論文入門

ランニング

計11単位

58単位

自由時間

23:00
0:00

就寝

🛏
29

学生支援

Student Aids

総合研究大学院大学と統合進化科学コースでは、学生の生活・研究活動を支えるために充実したサポートシステムを整えています。

1.
統合進化科学コース
RA（リサーチ・アシスタント）制度

2.
SOKENDAI
研究派遣プログラム

本学（葉山キャンパス）が行う研究プロジェ

総研大の教育理念である「高い専門性」「広クト等に研究の補助として参画しつつ、研究

い視野」「国際的な通用性」を持つ研究者人

先導的で国際的に活躍できる高度な専門的知活動を効果的に推進し、若手研究者としての材の育成を推進するため、海外での短期の研識及び能力を学生に修得させ、国内外に通用

研究遂行能力を育むものです。日本学術振興

究活動や、将来のキャリア構築につながる国

する高度の研究的資質を持つ広い視野を備え会のDC1やDC2に採択されてもRAを続ける

内外での長期の共同研究等に主体的に取り組た研究者を養成することを目的としています。

ことが可能です。

む本学学生に対して必要な経費を支援するもここには、国内外の学会や国際会議等においのです。

て自己の研究成果を発表する場合の旅費・学RAに採用されると本学の非常勤職員として、修学に支障が生じない範囲で1日7時間以内、
週20時間以内の勤務を行うこととなります。
統合進化科学コースにおいては、年間授業料相当額程度の経済的支援を行うことを念頭に、2023年度においては時給単価1,600円で年間335時間（年額53万6000円）を上限として参考URL：
https://www.soken.ac.jp/education/
dispatch/sokendai_studentdispatchprogram/3.
統合進化科学コースにおける学生移動経費支援（国内および海外）

国内外で刊行される学術誌等への投稿・掲載に係る費用の全額又は一部を支援し、学生の研究活動を促進・奨励し、その成果を広く国内外に発信することを目的としています。

会参加費を支援することや国内外の研究機関で博士論文研究等に必要な研究活動・資料収集を行うことや実験を行うことが含まれています。
参考URL：
https://ies.soken.ac.jp/life.html

6.
その他
以上の制度の他にも、学生に個人専用のノート型パーソナルコンピューターを貸与し、その研究活動を支えています。また、葉山キャ積極的に採用を行っています。基本的には統ンパスでは一日の長時間にわたる研究活動を

合進化科学コース入学者全員が対象です。

支えるため、指導教員の許可のもと葉山キャ
ンパスの宿泊施設を利用することも可能です

参考URL：
https://ies.soken.ac.jp/life.html（洗濯機、シャワー施設有）。その他にも指導

4.
総研大学生移動経費支援
総研大のコースの枠を超えた教育研究活動を推進し、本学の理念である基礎学術分野において国際的に通用する高度の研究的資質を持
つ広い視野を備えた研究者の育成に資する正課の活動等を支給の対象とします。学生からの申請に基づき、葉山本部から学内規程に基づき経費の全額又は一部支援を行います。
参考URL：
https://www.soken.ac.jp/education/
dispatch/trv_supp/30

5.
統合進化科学コース
論文出版補助教員（主指導教員および副指導教員）の数に比べて学生の数が少ないことから、それぞれの学生への支援が充実しています。
また、いろいろな悩み事が生じた場合には、専門家に相談できる体制が整えられています。
学生生活や研究活動に関してアカデミックア
ドバイザーから細やかにサポートを受けることができ、外部のメンタルヘルスカウンセラ
ーによる相談窓口も月 1 回程度設けられています。
参考URL：
https://ies.soken.ac.jp/life.html

31

在学生の声

From Graduate Students
Q3 休みの日はどのように過ごしていますか？

五年一貫二年目（D2）の学生（海洋生態学）の声
Q1 なぜ総研大に入学しようと思いましたか？

朝早めに起きて銭湯に行ったり、海沿いをランニングしQ2 入学して良かったことは何ですか？

たり、おばあちゃんのような休日を過ごしています。笑Q5 学部生へのアドバイスはありますか？

統計学を学んでおくべきだったと痛感しています。デー
タ収集や解析と同時進行で、統計学を学んでいると、学んだ初期の解析手法よりも適したものがあると後で気づき、全てやり直すはめになります。入試後でもいいので、研究を行う上での環境が非常に整っていることが最大の「進化」というテーマに関して、遺伝学、神経学、行動理由です。まず、動物行動学において著名な研究者から、学等の様々な分野の先生から、ご講義頂ける点です。多

直接指導を受けその下で研究を行えること、その研究にくの大学では、似た分野の先生からしかコメントを頂く必要な機材や施設等が整備されていることが挙げられま機会が無いですが、多様な分野の第一人者の先生方から、す。また、 5 年一貫制の為、 1 つの研究テーマに継続しご講義やご助言を頂けるのは、とても刺激になると思いて注力できるのも、特に大学院生にとって大きなメリッます。

Q４どのように研究していますか？

データ解析が主なので、在宅がメインです。

Q3 休みの日はどのように過ごしていますか？

博士後期二年目（D4）の学生（数理生物学）の声

市民オーケストラの一員として楽器演奏をしております。

私の専門は生態学・進化生物学の数理モデリングです。
修士号取得までに、生物学の基本的知識を身に付けまし
たが、数学・物理の素養が足りないと感じておりました。
そこで、数理生物学の第一人者の一人である現在の指導
教員と日常的に議論するために当専攻（コース）を志望しました。

入学を希望する人への応援メッセージをお願いします

入試まであとちょっと（?）です。頑張ってください !

トだと感じます。

Q1 なぜ総研大に入学しようと思いましたか？

早めに手をつけていくことをお勧めします。

Q2 入学して良かったことは何ですか？

当キャンパスは、山の上にあるため研究に集中できる一方、逗子・横須賀付近にあるため、東京・神奈川に足を演奏会が近い場合はその練習に勤しみますが、それ以外は研究をせず、とにかく休むことを心がけております。

Q４どのように研究していますか？

Q5 学部生へのアドバイスはありますか？

読書の習慣を身に付けることです。活字を読む習慣がな
いと、論文読みが億劫になることがあります。

入学を希望する人への応援メッセージをお願いします

伸ばせるだけでなく、新幹線や空港にアクセスしやすく
全国に出張しやすいです。また、研究室間の垣根が低く、学生による新入生歓迎会や教員を含めた餅つき大会などのイベントが多いです。

在宅作業はダラダラしてしまうので、キャンパスに平日3日は来るようにしています。その他は在宅か他の研究機関におります。

一度きりの人生ですので、好きなテーマで研究に没頭してみるのも良いのではないでしょうか。指導教官との相性が良い !

研究環境が良い !

と思ったら、是非当コ

ースで一緒に研究しましょう。学生・教員一同お待ちしております !

Q3 休みの日はどのように過ごしていますか？

Q5 学部生へのアドバイスはありますか？

五年一貫四年目（D4）の学生（海洋分子生物学）の声
Q1 なぜ総研大に入学しようと思いましたか？

Q2 入学して良かったことは何ですか？

・研究の自由度がとても高いと感じたから。
（様々な分野・実現可能な研究の幅が広い点。枠にとらわれず、割との先生方がいらっしゃるため、実現可能な研究、実験な自由にテーマを選べる。

どの幅が広い）・研究資金に恵まれている点。設備も充実している。

・「対象生物の行動を観察しその行動の意味を探るとと・学生と先生方との距離も近く、研究の議論、相談など

もに、その中に多くの生物に当てはまる一般的な理論をも積極的に行える点（皆優しい）。

発見していく」進化行動生態学に興味を持ったから。

・学生同士の交流が活発（楽しい）。

・家にいるときは限界まで寝た後、動画・アニメ・推し・英語の勉強。単語、文法などの知識の蓄積はもちろんのコンテンツの鑑賞やゲームなどをしている。出来るだだが、英語を話すことに重点を置き、もっと慣れておく

けベッドの上から出ないことを心がける。外出するときとよかったと思う。

は散歩、買い物、水族館や神社仏閣巡り、ライブなどを・（もう何も覚えてないけれど）高校では物理選択だっ含めた推し活が多い。

たため、高校範囲を含めた生物学の基礎を早い段階で習・日によって活動量が極端に変わる。

得すればよかったと思う。
・研究対象生物を自力で採集できるようにする（した）。

Q４どのように研究していますか？

入学を希望する人への応援メッセージをお願いします・「ウミウシの研究を続けたい」「生物の行動を様々な視32点から解明したい」という希望も叶えられると思ったか

研究対象生物のライフサイクルに合わせて変わる。春〜ら。

夏は海での生物採集（フィールドワーク）
・解剖（学内）総研大は研究をする上でこれ以上ない、素敵な環境だとなど。秋〜冬は分子生物学的実験・データ解析（学内）思います !

など。場合によっては在宅。

さんにお会いできることを楽しみにしています !

研究者人生、一緒に謳歌しましょう !

皆33

Q&A 1年生に聞いてみた!

Q&A 入学希望者に聞いてみた!

総研大についての疑問を1年生に聞いてみました!! 1年生の声をまとめました!

入学希望者からいただく統合進化学コースについての質問をまとめてみました！

Q 1

Q 4

Q 1

院試対策は何をしましたか？

副論文について、 入学前と入学後でどのような印象を受けましたか？

入試の時に指導教員を決める必要はある？

英語：TOEFL-ITPの演習問題、TOEICの教材の勉強など

A 4

A 1

専門科目：指導を希望する教員が執筆した書籍や教員か入学前に思っていたよりもしっかりと研究を行うことや、

無いです!

A 1
ら薦められた書籍を読みました。細胞の分子生物学

Mole-cular Biology of the Cell (Albert et al.)、キャン
ベル生物学 Campbell Biology (Campbell et al.)、行
動生態学 An Introduction to Behavioural Ecology(Davies et al.)を読みました。また、自分の研究内容について繰り返し発表練習を行いました。

Q&A

テーマについて深く考える必要があったと感じた方もいました。研究者として社会を意識したり、本論文の対象を学際的に見直す機会にもなっているとのことでした。
統合進化科学コースでは、インタビューを行うのが技術的に難しいという意見もありました。

Q 2
コース内の指導教員や学生同士の関係はどんな感じ？

指導教員を決めずに入学することも可能です。入学後にローテーションを通して指導教員を考え、11月ごろのプログレス前に指導教員を決定します。いくつか研究室を見てから決めれば大丈夫です。

A 2
学生同士はもちろん、教員と学生、
ポスドクの関係もとても良好です。
学生だけでのパーティーや打ち上げもありますが、先生やポスドクも参加するパーティーなども頻繁に開催する

Q 2くらいの仲です。参加は自由なので、無理に参加しなく

Q 5

Q 3

研究テーマはいつ決めましたか？

当コース（専攻）のいいところを教えてください！

イベントはありますか？

A 2

A 5

A 3

元々やりたいテーマがあった人、大まかな研究対象を学

先生と学生の距離が近いので、他分野の先生でも相談が部 3 年時の冬頃に決めた人、入学後の 5 月に決めた人などがいました。研究テーマの決定時期は人それぞれです。

しやすいところ !

先生も学生も余裕があるので、相談しやすいです。
ほとんどの授業が集中講義なため、研究に集中することても大丈夫です。

あります! 参加は任意です。
皆さんで楽しみましょう!
新しいイベントも大歓迎!

ができるところ !
外部の方を呼ぶセミナーが定期的に開催されるため、さまざまな研究の話を聞くことができるところ !

Q 3
研究室訪問には行きましたか？

A 3

Q 6
学生同士で
遊びにいくことはありますか?

質問した 1 年生は全員、葉山キャンパスに来て研究室訪問に来ていました。
先生に直接連絡をして研究室訪問することも可能ですが、
葉山キャンパスで開催される説明会やオープンキャンパ
スの時に研究室訪問することもできます !
オンラインで総研大の他の専攻（コース）の説明会に参加した方もいました !

34

A 6
同期の間では映画、競馬場、水族館、外食などに遊びに行くことがあります。学内で開催される学生主催のイベントに参加し同期だけでなく先輩とも交流しています。

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卒業生の声1

XIAYIREXIAOKAITIFrom Alumni

2

3

その他

（シャイラー ショケット）

加藤 直子

山道 真人

2023年9月 学位取得

2012年3月 学位取得

2012年3月 学位取得

現在の職業
Assistant researcher,
Institute of Archaeology,
Chinese Academy of Social Sciences

桜美林大学准教授

学位取得後から現在に至るまでの経歴
2023年から現職

総研大での研究内容

My PhD research focused on the analysis of dog
remains from archaeological sites as dog was the
only animal domesticated by hunter-gatherers before
Neolithic period, and established close relationships
with humans. My work aims to reveal the origin andearly stages of dog evolution by genomic analysis ofancient DNA (aDNA) preserved in dog remains fromdifferent periods in East Asia which would ultimately
help us to reconstruct evolutionary process of dogs andhuman-animal relationships.
総研大での思い出
I had such a very wonderful time during my stay withthe excellent guidance, great support, and friendly helpthat I received from all the members of the Department
of Evolutionary Studies of Biosystem, SOKENDAI. My
accomplishment would not have been possible without them.
現在の職業を志した理由

I was sponsored by the scholarship (MEXT) for doctorate
study and was very fortunate to have the opportunity
to apply for this position at the most prestigious
institute for Archaeological research in China after thegraduation. With more attention given to the applicationof scientific methods in archaeological research, theinstitute established the Center of Archaeological
Sciences where I can apply the newest aDNA extraction
method and the genome analysis method that I havelearned during my PhD at SOKENDAI.
入学志望者に向けて一言

SOKENDAI is no doubt a great place where you canlearn how to do research and become a researcher.
It offers a cutting-edge and very relaxing research
environment, and has a great finical supporting system
for student. It is a place where my research life started,and I really appreciate for all the support that I havereceived from SOKENDAI. And I am looking forward tocarrying out collaborative research with SOKENDAI.

学取得者の進路

現在の職業

現在の職業
国立遺伝学研究所／
総合研究大学院大学・准教授

民間企業

⼤学・研究機関研究員（海外）⼤学・研究機関教員（海外）

学位取得後から現在に至るまでの経歴
2016年〜2016年 筑波大学 体育系 研究員
2016年〜2017年 茨城大学 農学部 研究員
2017年〜2019年 情報・システム研究機構

データサイエンス共同利用基盤施設／
統計数理研究所 特任研究員
2019年〜2021年 情報・システム研究機構
データサイエンス共同利用基盤施設／
統計数理研究所 特任助教
2021年〜2023年 情報・システム研究機構
データサイエンス共同利用基盤施設／
統計数理研究所 特任准教授
2023年から現職

学位取得後から現在に至るまでの経歴

科学と社会（科学技術社会論）（受入先：米国コーネル大学）
2014年〜2017年 京都大学白眉センター／
生態学研究センター特定助教2017年〜2020年 東京大学大学院総合文化研究科広域科学専攻講師
2020年〜2023年 豪州クイーンズランド大学
理学部生物科学科上級講師
2023年から現職

総研大での研究内容
表現型可塑性が駆動する個体群動態の理論
・捕食者が促進する一遺伝子種分化の理論
・ヒトとチンパンジーの種分化プロセスの推定

総研大での思い出

総研大での思い出

ンネルの中をひたすら歩くような苦しい状況が続いていまし

総研大ではいろいろな先生方にお世話になり、さまざまな理

たが、そのプレゼンの直前に目の前がぱっと開けるきっかけ

論・実証研究を行ったほか、学会・サマースクールに参加しがあり、トンネルを脱することができました。その結果、プたり、コーネル大学に数ヶ月滞在したり、海外大学との学術

レゼン当日は自信をもって発表することができ、博士研究に

交流セミナーに参加したりするなど、多様な経験を積むこと

必要な資金を配分いただけることになりました。そのプレゼができました。

ンに出席されていた当時の高畑学長が、「あのプレゼンを聞いて、ああ、加藤さんは離陸したな、と思ったよ。
」と、大現在の職業を志した理由

学院修了間際に声をかけてくださったことが、その後もずっ総研大でのさまざまな経験を通じて、海外で研究することや、と励みになっています。

数理生態学・集団遺伝学や理論・実証研究を組み合わせることの重要性を感じました。結果として、米国と豪州で研究を現在の職業を志した理由
私は社会人を経験してから総研大に入学しましたが、そこでー等を通して、既存の枠にとらわれず幅広い視点から独自の発想で自らの研究テーマにアプローチしていくための訓練をしていただきました。この経験が、学位取得後にも独立した研究者として研究成果を出し続けるための基盤になっていると思います。
入学志望者に向けて一言
独創的な研究に挑戦し続ける力を醸成できるよう、先生方が一丸となって学生をサポートしてくださり、唯一無二の教育を受けることができる大学院だと思います。

日本学術振興会・育志賞

2022年2月

つきました。
入学志望者に向けて一言
葉山の恵まれた環境を利用して研究を楽しんでください！

坂本貴洋さん
第13回日本学術振興会・育志賞

2018年2月

仮屋園志帆さん
第8回日本学術振興会・育志賞

SOKENDAI賞・長倉研究奨励賞・総研大未来科学者賞・総合研究大学院大学研究賞

2023年3月
2021年3月
2018年12月
2017年4月
2016年10月
2016年10月

坂本貴洋さん

第10回SOKENDAI賞

佐藤正都さん

第6回SOKENDAI賞

仮屋園志帆さん 第23回長倉研究奨励賞
加藤貴大さん

総研大未来科学者賞

武田浩平さん

第21長倉研究奨励賞

森田理仁さん

総合研究大学院大学研究賞

学会ポスター賞・口頭発表賞

2022年9月

桑野友輔さん
第三十二回日本数理生物学会大会行った後に、さらに研究を発展させることを目指して現職にの学びから研究が心から楽しいと思えるようになったため、研究者の道を目指すことを決めました。総研大では、セミナ

卒業生の授賞歴

・日本の保全生態学における研究対象の偏り

五年一貫博士課程の 4 年目に、学内の競争的資金獲得のためのプレゼンがありました。私の博士研究は、当初真っ暗なト

⼤学・研究機関研究員（⽇本）2012年〜2014年 日本学術振興会海外特別研究員

・被食者の迅速な進化と総研大での研究内容

⼤学・研究機関教員（⽇本）

最優秀ポスター賞

2021年11月

坂本貴洋さん日本遺伝学会 第 93回大会 BP賞受賞

2018年8月

清古貴さん
日本進化学会第20回大会 最優秀口頭発表賞

2016年10月

加藤貴大さん
日本鳥学会2016年度大会 ポスター賞

2016年9月

内海邑さん
第26回日本数理生物学会年会 ポスター賞

2016年9月

加藤貴大さん
日本鳥学会 2016年度大会 ポスター賞

2015年10月

大家岳さん

2014年12月

秋山辰穂さん2015年日本数理生物学会 ポスター賞
日本生理人類学会第70回大会 優秀発表賞

36

37

統合進化科学研究センターの紹介

About RCIES

概要

共同研究
統合進化科学研究センターでは、「進化」

さらには、人新世における地球規模の諸問題を軸にした国内唯一の研究拠点として国内外がどのように進行し、どのような解決策があの研究機関と連携し、人間の諸活動によってりえるのか、といったことも、進化という視

科学技術・文化・社会にもたらされた変化や点で俯瞰的に考えることを目指します。「統進化も研究対象とした「統合進化科学」とい合進化科学」は、このように「進化」というう新たな学術領域を創出します。

概念をとらえなおし、生物学の知識体系の発生物38億年の歴史の中で、生き物のシス

統合進化科学研究センターでは、進化に関連した研究を進める上で相談したい、あるいは協力を求めたいといった研究者の方々に、アドバイス、センター内のメンバーとの共同研究、国内外のセンター外でマッチしうる研究者の紹介など、様々な連携を支援すること

展のみならず、進化学の知見を人間理解と社で進化学研究を推進しています。

テムがどのように作られ変遷していったのか、 会問題解決へ取り込んだ新しい学術領域を目
また、人間の諸活動（社会、心理、言語、文指します。

化など）がどのように変化していったのか、

組織構成

共同利用施設統合進化科学研究センター
センター長

統合進化科学研究センターでは、学内外との共同研究を活性化するために研究機器（例
走査型電子顕微鏡、透過型電子顕微鏡、共焦

運営委員会

点レーザースキャン顕微鏡）の共同利用を推進しています。ご利用を希望される方は、

matsushita_atsuko@soken.ac.jpまでご連
絡下さい。

センター教員会議

走査型電子顕微鏡統合人間科学
研究部門

多様性進化学
研究部門

複雑適応系進化学
研究部門

役職員（２０２4年）

センター長
印南 秀樹 教授
副センター長
入江 直樹 教授
運営委員会委員 印南 秀樹 教授（委員長）
颯田 葉子 教授
沓掛 展之 教授
佐々木 顕 教授
入江 直樹 教授
渡辺 佑基 教授
小林 武彦 教授（学外委員）
佐藤 哲 特命教授（学外委員） 三浦 徹 教授（学外委員）
巌佐 庸 名誉教授（学外委員） 蟻川 謙太郎 特別教授（オブザーバー）
飯田 香穂里 准教授（オブザーバー）
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透過型電子顕微鏡

他機関との交流
統合進化科学研究センターでは他機関との交流を促進しています。例えば、これまで東京大学大学院理学系研究科附属臨海実験所と学生交流会を開催しています。

2022 年度は葉山キャンパスにおいてポスター発表会を開催し交流を深めました。

2023年度は三崎臨海実験所において口頭発表を中心に開催しました。

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統合進化科学研究センターから相模湾を望む

アクセス・連絡先
新横浜

小田原

統合進化科学研究センター

大船

鎌倉

逗子

逗子・葉山

湘南国際村センター前

総合研究大学院大学

統合進化科学研究センター

国立大学法人 総合研究大学院大学

https://www.soken.ac.jp/access/

成田空港

東京

品川
羽田空港

高速バス

京急蒲田

横浜

徒歩

横須賀中央

バス

金沢八景

汐入

JR
京浜急行

詳しい
アクセス方法はこちら

住所〒240-0193
神奈川県三浦郡葉山町（湘南国際村）
総合研究大学院大学
統合進化科学研究センター

電話

E-mail046-858-1577 または 046-858-1595
hayamajimu@ml.soken.ac.jp

協力：長田 美沙・知久 彩楓・山田 優佳
編集：統合進化科学研究センター・統合進化科学コース広報担当

Illustration by Yo Hosoyamada
Design by Hosoyamada Design office
作成 2024年 3 月／改訂 2024年 5 月