核酸合成用試薬
リバース用

RNAアミダイトと固相合成用支持担体

2'-TBDMS-3'-DMT-rA (n-bz)

1000Å CPG

500Å CPG

5'-CE Amidite

2'-TBDMS-3'-DMT-rC (n-acetyl)

1000Å CPG

500Å CPG

5'-CE Amidite

2'-TBDMS-3'-DMT-rG (n-ibu)

1000Å CPG

500Å CPG

2'-TBDMS-3'-DMT-rG (N-iPr PAC)
2'-TBDMS-3'-DMT-rU

5'-CE Amidite
1000Å CPG

500Å CPG

5'-CE Amidite

ChemGenesでは、高純度の治療薬用グレードで合成可能な５’→３’方向に合成するリバース用のRNA合成技術を提供しています（図１）。リバース用のA(N-Bz), C(N-Bz), C(N-Ac), G(iPrPAC), Uのアミダイトは、HPLCでの純度は98％以上で、31P-NMRでの純度は99%以上です。

図1：リバースRNA技術を用いたRNA合成

特徴・短いカップリング時間（2分以内）
・高いカップリン効率（通常のDNAアミダイトと同等）・長鎖のRNAオリゴヌクレオチドの合成が可能
・2'-TBDMS保護の従来のRNAアミダイトと同じ方法で使用・精製前でも後でも、オリゴマーは高純度
・簡便に高純度で３’修飾体の合成が可能
・オリゴ合成、精製のプロセスの間に３’の異性体が生成しない
・通常の3'→5’方向のRNA合成よりも、5’→3’方向の合成の方が高純度のRNA
・コレステロールやPEGなどの高分子を結合したRNAは、リバース方向のRNA合成後に簡単に精製（ Figure 23’末端にコレステロールを結合した21-merのRNA)（ Figure 33’末端にPEG2000を結合した21-merのRNA)

リバースRNA合成では、N+１のRNA合成副生成物は存在しません。これは、リバースRNAアミダイトのRNA合成においては、おそらく、オリゴ合成のカップリングステップ中には5-エチルチオテトラゾール（ETT)によって3'-DMTr基が切断されないためです。

応用
１．

高純度の治療薬グレードのRNAおよびsiRNAの合成

２．

独自の技術により、200塩基のRNAオリゴヌクレオチドを高純度で高効率で合成することに成功しています。
図4と図5は、リバースRNA技術を使って合成した74-merのRNAのESI/MSと電気泳動の分析結果です。

図４：

リバースRNAアミダイトを用いて合成した74-mer
RNAのESI/MS 分析の結果

３．

図５：

リバースRNAアミダイトを用いて合成した74-mer
RNAの電気泳動のゲルの結果

コレステロール、長鎖脂肪族鎖、蛍光色素、トリエチレングリコール、ヘキサエチレングリコール、PEGなどのレポーター分子のRNAの３’末端への結合は、これらのアミダイトを直接カップリングすることで容易に得られます。
４.

PEG2000やPEG4500アミダイトなどのポリエチレングリコールのRNA分子の3’末端への結合ができます。

５．

3'-チオールの誘導体化に用いることができます。

６．

ビオチンCPGを用いることなく、ビオチンのアミダイトを用いて、1ステップで3’-末端にビオチンを結合することができます。

７．

siRNAのセンス鎖の3’末端の修飾。siRNAのアンチセンスがターゲットの認識をするため、センス鎖（3'末端）のオーバーハングの修飾は標的のmRNAの認識に影響を与えないため、siRNAのデリバリー開発のための修飾体の構築が容易です。

References:
1. Srivastava, S. C.; Srivastava, N. P.; RNA Synthesis in the Reverse Direction, 2011, PCT Int. App., WO2011103468.
2. Srivastava, S. C.; Srivastava, N. P.; RNA Synthesis in the Reverse Direction, 2011, PCT App., Pub. US20110137010.
3. Srivastava, S. C.; Pandey, D.; Srivastava, N.; Bajpai, S. P. RNA Synthesis in the Reverse Direction, 2010, WO2010027512.
4. Srivastava, S. C.; Pandey, D.; Srivastava, N.; Bajpai, S. P. RNA Synthesis in the Reverse Direction, 2011, Curr. Pro. in Nuc. Acid Chem.;
Unit 3.20.

品名

商品コード

概要

容量100 mg, 1 g, 5 g

1000Å CPG2'-tBDSilyl-3'-DMT-

N-6201-10

Adenosine (n-bz) 5'-lcaa
CPGpack 440nmol, 0.2µmol, 1.0µmol
輸送上の注意500Å CPGN-6201-05

pack 1040nmol, 0.2µmol, 1.0 µmol

高温多湿に注意。速やかな輸送が好ましい。
FW

2'-tBDSilyl-3'-DMTAdenosine (n-bz) 5'-CED

988.19250 mg
ANP-3401

phosphoramidite

500 mg1, 2, 5 g輸送上の注意
高温多湿に注意。速やかな輸送が好ましい。

100 mg, 1 g
1000Å CPG2'-tBDSilyl-3'-DMT-N-6206-10

Cytidine (n-acetyl) 5'-lcaa
CPGpack 440nmol, 0.2µmol, 1.0µmol

500Å CPGN-6206-05

pack 1040nmol, 0.2µmol, 1.0 µmol

輸送上の注意高温多湿に注意。速やかな輸送が好ましい。
FW2'-tBDSilyl-3'-DMTCytidine (n-acetyl) 5'-CED

902.10250 mg
ANP-3405

phosphoramidite

500 mg1, 2, 5 g

輸送上の注意高温多湿に注意。速やかな輸送が好ましい。

100 mg, 1 g
1000Å CPG2'-tBDSilyl-3'-DMT-N-6203-10

Guanosine (n-ibu) 5'-lcaa
CPGpack 440nmol, 0.2µmol, 1.0µmol

500Å CPGN-6203-05

pack 1040nmol, 0.2µmol, 1.0 µmol

輸送上の注意高温多湿に注意。速やかな輸送が好ましい。
FW

2'-tBDSilyl-3'-DMTGuanosine (N-iPr PAC)

1076.30250 mg
ANP-3406

5'-CED phosphoramidite

500 mg1, 2, 5 g

輸送上の注意高温多湿に注意。速やかな輸送が好ましい。

★

金額はお問い合わせください。

★

規格外の容量をご希望の方はお問い合わせください。

構造式

品名

商品コード

概要

容量
100 mg, 1 g, 5 g

1000Å CPG2'-tBDSilyl-3'-DMTUridine 5'-lcaa CPG

N-6204-10

pack 440nmol, 0.2µmol, 1.0µmol

500Å CPGN-6204-05

pack 1040nmol, 0.2µmol, 1.0 µmol

輸送上の注意高温多湿に注意。速やかな輸送が好ましい。
FW

2'-tBDSilyl-3'-DMTUridine 5'-CED

861.05250 mg
ANP-3404

phosphoramidite

500 mg1, 2, 5 g

輸送上の注意高温多湿に注意。速やかな輸送が好ましい。

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金額はお問い合わせください。

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規格外の容量をご希望の方はお問い合わせください。

構造式