エンドポイント濁度測定装置

LT-16
LT-16 Manager
マニュアル(簡易マニュアル Version 3.0)

LT-16 Manager のインストール
LT-16 Manager は添付の CD に内蔵されています。LT-16 Manager は、Windows 7、Windows 8 および Windows 10において動作確認をしております (以下の図は Windows 8 使用時の表示図面です) 。ただし、推奨環境すべての PCについて動作を保証するものではありません。

■Microsoft 社 .NET Framework のインストール
1. パソコンに.NET Framework 4.5 以上がインストールされているか確認してください。(Windows 8.1 以降では、標準でインストールされていますので、本項目はスキップしてください。)
2. インストールされていない場合は、Microsoft 社ページにアクセスし、最新版をインストールしてください。

LT_16_Manager_1_0_2 フォルダを PC の任意の場所(デスクトップ、ドキュメント、等) にコピーします。

LT16Manager.exe をダブルクリックするとソフトウェアが起動します。なお、同じフォルダに格納されている msvcr110.dll はソフトウェアの動作上必要となるファイルですので、削除しないでください。LT16Manager.exe のショートカットを別の場所に作成し、ショートカットからソフトウェアを起動することは可能です。

LT-16 本体と PC を接続するためには、RS232C ケーブルとRS232C-USB 変換ケーブル (PC のシリアルポートを使用する場合は不要) を別途ご準備ください。
RS232C-USB 変換ケーブルを初めて使用する場合は、変換ケーブルの取扱説明書に従ってセットアップしてください。
LT-16 と PC を接続は以下の手順となります。
1. LT-16 と PC を起動
2. RS232C ケーブルを RS232C-USB 変換ケーブルに接続
3. RS232C ケーブルを LT-16 の PC コネクタに接続
4. RS232C-USB 変換ケーブルの USB 側コネクタを PC のUSB ポートに接続

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LT-16 Manager ホーム画面
LT-16 Manager を起動すると、左のメインウインドウが表示されます。
Measure ボックスのボタンでは、測定条件の設定操作ができます。
View Data ボックスのボタンでは、データの保存、閲覧、解析ができます。

各ボタンの説明
MeasureNew： 新規に測定条件を設定する場合に使用します。
Load： あらかじめ作成、保存した測定条件 (.lgc ファイル) を呼び出します。
Read： LT-16 内に設定されている測定条件を読み出します。
View Data
Load： 以前に保存した測定結果 (.lgd ファイル) を呼び出します。
Read： LT-16 内部に保存されている測定データを読み出します。
Exit

LT-16 Manager を終了します。

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測定条件の設定
New をクリックすると、左のウインドウが表示されます。
この Setting ウインドウで、測定条件を設定できます。
Left タブ、Right タブ
ここでは、測定条件を設定する測定部を選択できます。
LEFT (左側) 、RIGHT (右側) のいずれかを選択して、測定に使用するパラメーターを設定できます。
Wells タブWells タブでは、サンプル名及びグラフの色の入力、グラフを可視化するかどうかの選択が可能です。

Profile タブ
Profile タブでは、パラメーター名称と反応条件の設定や変更ができます。
Name： パラメーター名称
Isothermal Temperature： LAMP 法の反応温度
Inactivation Temperature： 反応後の酵素失活温度
Preheat Temperature： 反応前のプレヒート温度
Sampling Period： データ測定回数 (秒/回)
Isothermal Period： LAMP 法の反応時間
Inactivation Period： 反応後の酵素失活時間

Isothermal タブ
Isothermal タブでは、LAMP 法による等温遺伝子増幅の結果(濁度上昇の有無) を LT-16 に自動判定させるため解析条件の設定や変更ができます。
通常は変更する必要はありませんので、特別な場合を除き、下記の設定を使用してください。
Ratio Smoothing： 11
Derivative Smoothing： 11
Second Derivative Smoothing： 11
Derivative Threshold： 1000
Second Derivative Threshold： 203

全ての条件を入力したら、反応を開始することができます。
また、LT-16 本体への保存などもできます。
Save： 設定した測定条件をファイルとして保存できます。
Print： 表示されているウインドウを印刷できます。
Write： LT-16 に測定条件を保存します。
Run： 反応を開始します。
Close： ウインドウを閉じます。

Save を選択した場合、左のウインドウが表示されます。
パラメーター設定したタブを選択した後、OK を押して保存してください。

Write を選択した場合、左のウインドウが表示されますので、Position Setting のボックスで書き込み方法を選択します。
Start up Setting では、設定した測定条件を LT-16 に上書きします。
Memory Settings では、下のプルダウンメニューからLT-16 への保存場所を選択した後、Side select にてパラメーター設定したタブを選択します。

選択後、OK を押すと左のウインドウが表示されます。左上のプルダウンメニューから USB ポートを選択すると、Start が押せる状態に変化しますので、Start を押して書き込みを開始してください。

Run を選択した場合、左のウインドウが表示されます。左上のプルダウンメニューから USB ポートを選択すると、Start が押せる状態に変化しますので、Start を押して反応を開始してください。

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解析結果の表示例
反応完了後の測定データを読み出し、結果の確認とデータの保存を行うことができます。

メインウインドウから Read を選択した場合、左のウインドウが表示されます。左上のプルダウンメニューから USB ポートを選択すると、Start が押せる状態に変化しますので、Start を押して読み込みを開始してください。

データ読み込み後、左のデータウインドウが表示されます。
このウインドウで解析結果を確認します。
Left タブ、Right タブ
最上部の Left・Right タブを選択して、データを確認したい測定部を選択します。
Profile タブ
Profile タブでは、各ウェルの温度の経時的変化を確認できます。

Isothermal タブ
Isothermal タブでは、各ウェルの濁度の経時的変化(増幅曲線) を確認できます。

5Isothermal Ratio タブ
Isothermal Ratio タブでは、増幅曲線を微分解析した結果を表示します。
Tt 値 (増幅開始時間) 及び Df 値 (差分曲線ピークの高さ) を確認できます。

Results タブ
Result タブでは、各ウェルの解析結果を確認することができます。また、増幅の有無を判定色で示します。
ピンク色： 陽性
緑色： 陰性Tt： 任意に設定した閾値に到達した時間
Df： 増幅の差分曲線ピークの高さ
Output を押すと、内容を.csv 形式で PC に保存できます。また、Individual file にチェックを入れた場合、ウェル毎に分割して保存できます。

読み出したデータは、PC への保存や印刷することができます。
Save： 読み出したデータをファイルとして保存できます。
Print： 表示されているウインドウを印刷できます。
Setting： 読み出したデータの測定条件を確認できます。
Simulation： データの再解析を行うことができます。
Close： ウインドウを閉じます。

6再解析の例
読み込んだデータや一度保存したデータは解析条件を変更して再解析を行うことができます。
Load から対象のファイルを呼び出します。

データウインドウが表示されます。右下部の Simulation を押すと、Setting – Simulation ウインドウが表示されますので、測定条件を変更して OK をクリックすると、再解析された結果が表示されます。
下の図では、検出条件の Derivative Threshold を 7,000 から3,500 に変更しています。その結果、Isothermal Ratio で確認されたピークが Results に反映されています。

【解析前】

【解析後】

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【MEMO】

【MEMO】

【MEMO】

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本マニュアルの記載内容は 2022 年 4 月現在のものです。
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