CBI学会2018年大会
Chem-Bio Informatics Society(CBI) Annual Meeting 2018

創薬と育薬のレギュラトリサイエンス〜AI創薬時代の新展開〜
Drug Lifecycle Management and Regulatory Sciences〜 Frontier of AI-driven Drug Discovery Age 〜

会期：2018年10月9日（火）-11日（木）
会場：タワーホール船堀（東京都江戸川区船堀4-1-1）

情報計算化学生物学会(CBI学会)

More than just AI
Since 1975. Bioinformatics with MKI
豊富な経験と実績を基に、AIをはじめとする最新のデータサイエンスを組み込み、お客様のビッグデータから新
しい『知』の創造をサポートいたします。
Structural Informatics
ホモロジーモデリングや分子動力学計算を駆使し、蛋白質の機能解明、安定性の評価、変異導入部位の提案、及びドッキングポーズの評価などを行っています。実験からシミュレーション系の研究者まで、幅広い方々にお客様になって頂いております。
ゲノムデータ解析
次世代シーケンサー技術の発展によって、ゲノム変異情報を高速に特定できるようになりました。しかし、NGS
解析には大規模な計算資源や、数あるデータ解析用ツール、アノテーションを行うためのデータベースに対する深い知見が必要です。大規模なゲノムデータの解析サービスや解析環境を提供します。
AI・Machine Learning
MKIでは長年、AIに取り組んでおり、多様な実績・スキルを保持しています。AIを活用し、配列やタンパク質
立体構造を学習し、構造予測をはじめとする様々な予測手法を開発しております。

バイオサイエンス部 バイオサイエンス室〒105-6215 東京都港区愛宕2-5-1 愛宕グリーンヒルズMORIタワー
TEL : 03-6376-1291 FAX : 03-3435-0522 E-mail : sales@ml.mki.co.jp© 2016 DBCLS

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

CBI 学会 2018 年大会
創薬と育薬のレギュラトリサイエンス～AI 創薬時代の新展開～
会期： 2018 年 10 月 9 日(火)－11 日(木)会場： タワーホール船堀（東京都江戸川区船堀 4-1-1）
CBI 学会 2018 年大会
大会長：

西島 正弘（国立医薬品食品衛生研究所 名誉所長）

実行委員長： 石田 誠一（国立医薬品食品衛生研究所）---------------------------------------------------------------------------------------------------------

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018
"Drug Lifecycle Management and Regulatory Sciences～Frontier of AI-driven Drug Discovery Age～"
Dates : October 9 (Tue) – 11 (Thu), 2018
Venue : Tower Hall Funabori (4-1-1 Funabori, Edogawa-ku, Tokyo)
Conference Chairperson :Masahiro Nishijima(Honorary Director of National Institute of Health Sciences, NIHS)
Organizing Chairperson :Seiichi Ishida(National Institute of Health Sciences, NIHS)

CBI 学会 2018 年大会事務局
Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018 Secretariat

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

CBI学会2018年大会プログラム
10月9日
２F

1F
日付

時間

展示
ホール

10:0010:20

10:2011:00

11:0012:00

福寿

桃源

3F
平安

瑞雲

303

＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-01
第2回オミックスを原理的なところから考える-「生命」と多様性を共存させる原理
は？-＜スポンサー企業企画枠＞
BIOSPIRE株式会社/ライフ
マティックス株式会社「次世代GPUシミュレーショ
ンと iPS疾患モデルが融合する創薬イノベーション」
座長：池田 和由（慶應義塾大学）
Giovanna Tedesco（Cresset）
Sunhwan Jo（SilcsBio）
Marcus Yeo（DefiniGEN）

開会式、会長挨拶
大会長講演
座長：片倉 晋一（第一三共RDノバーレ㈱）K-01 西島 正弘（国立医薬品食品衛生研究所名誉所長）「レギュラトリーサイエンスとは」＜プレナリー講演＞『創薬におけるAI利活用』
座長：小長谷 明彦（東京工業大学）
K-02 水口 賢司（(国研) 医薬基盤・健康・栄養研究所））「ライフインテリジェンスコンソーシアム（LINC）におけるAI開発の現状」
K-03
1-岩本 和樹（富士通㈱）「AIによる病理画像認識」
2-桐谷 太郎（㈱エクサウィザーズ）「Graph convolutional networkを用いた標的タンパ
ク質予測」
3-加藤 幸一郎（みずほ情報総研㈱）増田 友秀（東レ㈱）「機械学習を用いた高精度分子力場の構築に向けて」

12:0013:30

13:30- ポスター
14:00
発表
10
月
9
日
(火)
14:0015:30＜招待講演＞＜招待講演＞『インシリコ創薬におけるQM計算の役『創薬における安全性予測』割』
座長：鈴木 洋史（東京大学医学部附属病院）
座長：福澤 薫（星薬科大学）
I-01 諫田 泰成（国立医薬品食品衛生研究所）「ヒトiPS細胞を用いた新規試験法の開発と国際標 I-04 Alexander Heifetz (Evotec UK)
準化の戦略」"FMO guided drug discovery andstructural analysis"
I-02 植沢 芳広（明治薬科大学）「人工知能を駆使した毒性・副作用予測戦略」
I-05 常盤 広明（立教大学)「第一原理計算を利用した臨床治療薬
I-03 樋坂 章博（千葉大学）「薬物動態解析におけるマルコフ連鎖モンテカルロ の効能解析」
法の利用」
I-06 李 秀栄（理化学研究所）「ダイナミックドッキングによる結合親和性予測」

15:30- ポスター
16:00
発表

16:0017:30

17:30- ポスター
19:30
発表

＜スポンサードセッション＞＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
SS-01
FS-06
(国研) 日本医療研究開発機構
計算科学と構造生物学による神経変性
疾患克服への挑戦「AMED創薬支援推進事業『創薬支援インフォマ
ティクスシステム構築』」
後藤 俊男（理化学研究所）「創薬におけるADMETの重要性と予測プラット
フォームへの期待」
水口 賢司（(国研) 医薬基盤・健康・栄養研究所）「薬物動態・毒性予測の統合プラットフォームと企業連携」
浜本 隆二（(国研) 国立がん研究センター研究所）「AI技術を活用した統合的ながん医療システムの開発」
久米 俊行（田辺三菱製薬㈱）「製薬企業におけるインフォマティクス活用と産学連携」

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

10月9日
４F

5F
時間

小ホール

研修室

401

402

403

406

407

10:0010:20

10:2011:00

11:0012:00

12:0013:30＜ランチョンセミナー＞ ＜ランチョンセミナー＞
LS-02
LS-01
アークスパン合同会
株式会社モルシス「知識ベースを活用し 社
た医薬品開発の効率 「クラウド型次世代研化とリスク低減」
究情報管理システム
ArxLabのご紹介」
Jordi Mestres（Chemotargets SL）
宇佐 明人、團野 眞紀
Josep Prous Jr.
（アークスパン合同会（Bioinfogate）
社）

13:3014:00＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞＜JST分子ロボット倫理国際会議＞ ＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-03
SIG-MRE分子ロボット倫理研究会、 FS-02(国研)科学技術振興機構(JST)、(国 口頭発表 「創薬・医療 計算毒性学-基本技術研)科学技術振興機構社会技術研 AI」分野
編（ケモメトリックス、
究開発センター(HITE)QSAR、メタボロミクス）
司会：標葉 隆馬（成城大学）"Molecular Robotics, ELSI and TA
session"
小長谷 明彦（東京工業大学）
14:00"Molecular Robotics: Its Concept,
15:30
Technology and Ethics"
木賀 大介（早稲田大学）"Safety engineering by synthetic
biology"
Erika Szymanski (The University of
Edinburgh)“Designing RRI after ELSI: To
whom are we responsible?”＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-04
第7回個別化医療研究会 抗がん剤の個
別化医療のための新たな試み

15:3016:00＜JST分子ロボット倫理国際会議＞ ＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
SIG-MRE分子ロボット倫理研究会、 FS-07(国研)科学技術振興機構(JST)、(国 口頭発表 「インシリコ研)科学技術振興機構社会技術研 創薬」分野
究開発センター(HITE)"Interdisciplinary Technology
Assessment session"
河原 直人(九州大学）"Japanese Perspectives on
Molecular Robotics: Formulating
Ethical Principles of Molecular
16:00- Robotics (ver. 1.1)"
17:30 Kenneth Oye （MIT Political
Science, USA）
"On governing risks of emerging
technologies: Exemplary cases andcautionary tales from synthetic
biology"
Stephan Lingner（EA European
Academy of Technology andInnovation Assessment, Germany）"Interdisciplinary technology
assessment – practice and outlook
for responsible molecular robotics"
17:3019:30＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-08
計算毒性学-実践・適用編＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-09
幹細胞を用いた化合物リスク情報共有化
コンソーシアム
scChemRISCへの招待Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 201810月10日
２F

１F
日付

時間

展示
ホール

10:0011:30

福寿

桃源

3F
平安

瑞雲

＜プレナリー講演＞『創薬、育薬資源としてのバイオバンク』
座長：荻島 創一（東北メディカル・メガバンク機構）
K-04 西原 広史（慶應義塾大学）「オンデマンド型バンキングによる創薬支援の取り組みについて」K-05 田中 博 （東京医科歯科大学／東北メディカ
ル・メガバンク機構）「精密医療時代におけるリアルワールドデータに基づく臨床試験」

11:3013:00

13:00- ポスター
14:00
発表

10
月
10
日
(水)

14:0015:30＜招待講演＞『創薬、育薬資源としてのバイオバンク』
座長：石田 誠一（国立医薬品食品衛生研究所）
I-07 川上 浩一（国立遺伝学研究所）「ゼブラフィッシュ：基礎生物学から薬学・医学分野への応用まで」I-08 金 倫基（慶應義塾大学）「腸内細菌叢をターゲットにした創薬の現状と可能性について」
I-09 宮本 憲優（エーザイ㈱）「ヒト iPS 細胞由来神経細胞を用いた痙攣フェノタ
イプ評価法の開発に向けて」＜シンポジウム＞＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞「高機能細胞デバイスを用いた生体模倣モデ FS-10
ルの開発－国内産官学連携による国際競争 人工知能(AI)およびビッグデータ(BD)統合による「化学データサイエへの挑戦－」ンス」 -計算毒性学、創薬、物性評
モデレーター：
価、他への展開（１）平林 英樹（武田薬品工業㈱）講師：
金森 敏幸（産業技術総合研究所）
赤羽 隆文（幹細胞評価基盤技術研究組合）
松永 民秀（名古屋市立大学大学院）
小森 高文（エーザイ）

15:30- ポスター
16:00
発表

16:0017:30＜スポンサードセッション＞＜シンポジウム＞
SS-02「ヒトiPS細胞技術を用いた医薬品の新たな(国研) 日本医療研究開発機構
評価法の開発 －国際標準化に向けた取り「バイオバンクの利活用促進と倫理的・法的・社会 組み－」的課題（ELSI）」
諫田 泰成（国立医薬品食品衛生研究所）
荻島 創一（東北大学 東北メディカル・メガバンク機 佐藤 薫（国立医薬品食品衛生研究所）
構）石田 誠一（国立医薬品食品衛生研究所）「ゲノム医療実現推進のためのバイオバンク利活
用促進に向けたバイオバンク・ネットワーク構 築と運用支援に関する研究開発」
鶴山 竜昭（京都大学）「診療機関併設バイオバンクのネットワーク参画」
吉田 雅幸（東京医科歯科大学）「倫理的・法的・社会的側面からみたバイオバンク
資源利活用促進戦略」

17:30- ポスター
19:00
発表
19:0021:00

懇親会＜シンポジウム＞「毒性関連ビッグデータを用いた人
工知能による次世代型安全性予測
手法開発プロジェクト（AI-SHIPSプ
ロジェクト）」
モデレーター：
船津 公人（東京大学）
植沢 芳広（明治薬科大学）
座長：
庄野 文章（東京大学）
講師：
船津 公人（東京大学）
山崎 浩史（昭和薬科大学）
吉成 浩一（静岡県立大学）

303

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 201810月10日
４F

５F
時間

小ホール

研修室

401

402

403

406

407

10:0011:30＜ランチョンセミナー＞ ＜ランチョンセミナー＞
LS-03
LS-04
ドットマティクス
パトコア株式会社「クラウド及びオンプレ 「構造変換アイディア提
ミス共通型次世代創薬 示システム CRAIS
基盤システム」
TRANSFORMER ver.2」
福山 隆、ゾルト・レプ 「社内化学情報検索シ
ステム ChemLocator」（ドットマティクス）

11:3013:00

12:0013:00
CBI学会
評議員会

＜ランチョンセミナー＞
LS-07 CBI学会総会

13:0014:00＜シンポジウム＞「AMED/BINDSインシリコユニットにおける創薬支援研究」
モデレーター：
広川 貴次（産業技術総合研究所）
講師：
14:00- 田中 成典（神戸大学大学院）
15:30 森脇 由隆（東京大学大学院）
清水 謙多郎（東京大学大学院）
寺田 透（東京大学大学院）
池口 満徳（横浜市立大学）＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞＜スポンサー企業企画枠＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-11
＞
FS-12
口頭発表 「分子認識と In silico ADME-TOX／ 株式会社バイオモデリン
分子計算」分野
創薬活用の現状と課題 グリサーチ－製薬企業における取 「『創薬支援ソフト
り組み－
myPresto5』活用セミナー」
中村 寛則（㈱バイオモデ
リングリサーチ）＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-13
先端的計測技術

15:3016:00＜シンポジウム＞＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞「AMED/BINDSインシリコユニットに FS-14
おける創薬支援研究」
口頭発表 「バイオイン
富井 健太郎（産業技術総合研究
フォマティクスとその医学応用」分野所）
金谷 重彦（奈良先端科学技術大学
院大学）
関嶋 政和（東京工業大学）
由良 敬（早稲田大学）＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-15「創薬と育薬から適薬へ」＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞ ＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-16
FS-13
生命の起源：その現 先端的計測技術
状と展望

16:0017:30

17:3019:00
19:0021:00

ポスター
賞選考
委員会

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 201810月11日
２F

１F
日付

時間

展示
ホール

10:0012:00

福寿

桃源

3F
平安

＜プレナリー講演＞『育薬における副作用情報』
座長：水間 俊（帝京平成大学）
K-06 澤田 康文（東京大学）「育薬における副作用情報」
K-07 宇山 佳明（(独)医薬品医療機器総合機構 PMDA）「新薬世界同時承認時代のリアルワールドデータに基づく医薬品安全性評価」

12:0013:30

10
日
11
日
(木)
13:30- ポスター
14:00
発表

14:0015:30

15:3016:00
16:0016:10＜スポンサードセッション＞
SS-03
株式会社ツムラ「漢方ミクス（KAMPOmics）-超多成分系のインフォ＜パネルディスカッション＞
マティクス-」『AI創薬時代のレギュラトリーサイエンス』
花﨑 和弘（高知大学）
司会：諫田 泰成（国立医薬品食品衛生研究所）
西 明紀（㈱ツムラ）
パネリスト：
望（国立遺伝学研究所）
櫻井
本間 光貴（理化学研究所）
勝也（㈱ツムラ）大渕
片倉 晋一（第一三共RDノバーレ(株)）田中 博（東京医科歯科大学／東北メディカル・メガバン 松岡 由希子（システム ・バイオロジー研究機構）
ク機構）
西島 正弘（国立医薬品食品衛生研究所名誉所長）
宇山 佳明（PMDA）

ポスター賞授賞式／次年度大会の紹介／
CBIジャーナルの紹介
クロージング

瑞雲303

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 201810月11日
４F

５F
時間

小ホール

研修室

401

＜ランチョンセミナー＞
LS-05
株式会社GDEPアドバンス「GPU/AI創薬の進展と最新情報」
古屋 俊和（㈱エクサウィザーズ）種石 慶（理化学研究所、京都大学）
関嶋 政和（東京工業大学）＜ランチョンセミナー＞
LS-06
分子ロボット倫理研究会「分子ロボットは人類にとって敵か
味方か？」
小長谷 明彦（東京工業大学）
河原 直人（九州大学）
標葉 隆馬（成城大学）
Erika Szymanski (The Universityof Edinburgh, UK)
Kenneth Oye (MIT Political
Science, USA)
Stephan Lingner (EA European
Academy of Technology andInnovation Assessment, Germany)

10:0012:00

12:0013:30＜市民講座＞
若手の会
13:30「認知症と向き合うために」
キックオフミーティング
14:00
司会：石川 智久（NPO法人地方再興・
個別化医療支援）＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
中野 恵子（国際薬膳食育師・和漢膳 FS-17
プロフェッサー）
口頭発表 「医薬品研究とADMET」「健康増進のための身近な薬膳」
分野、「レギュラトリサイエンス」分
伊賀瀬 道也（愛媛大学大学院老年・ 野
神経・総合診療内科学・特任教授/愛媛大学医学部付属病院抗加齢予防
医療センター・センター長）
14:00- 「河内晩柑由来果汁飲料には認知機
15:30 能改善効果がある」
渡部 佳奈子（(一社)箏PLAN・代表理事、内閣府から海外派遣された唯一の箏回想士）「高齢者の尊厳を守る“笑顔と涙の箏
回想法：感動秘話”」

15:3016:00
16:0016:10＜ﾌｫｰｶｽﾄｾｯｼｮﾝ＞
FS-18
口頭発表 「他分野に属さない先進的研究」分野

402

403

406

407

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018目

次Contents
CBI 学会会長挨拶 .............................................................................................................. 1
CBI 学会 2018 年大会 大会長・実行委員長挨拶 ............................................................... 3
協賛・後援団体 .................................................................................................................. 5
大会スポンサー .................................................................................................................. 6
大会組織委員会 .................................................................................................................. 8
会場案内図 ....................................................................................................................... 12
プレナリー講演 ................................................................................................................ 17
招待講演........................................................................................................................... 29
パネルディスカッション ................................................................................................. 41
スポンサードセッション ................................................................................................. 45
企画シンポジウム ............................................................................................................ 53
JST 分子ロボット倫理国際会議 ...................................................................................... 63
市民講座........................................................................................................................... 67
ランチョンセミナー ........................................................................................................ 73
スポンサー企業企画枠 ..................................................................................................... 87
企業広告........................................................................................................................... 93
来年度大会のお知らせ ..................................................................................................... 99

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

CBI 学会会長挨拶－CBI 学会 2018 年大会の開催に向けて－
CBI 学会 2018 年大会は、西島正弘大会長、石田誠一実行委員長のもと、「創薬と育薬のレギュラトリサイエンス ～AI 創薬時代の新展開～」というテーマで開催されます。これまでの CBI 学会年次大会にはなかった育薬という新たな切り口を加え、新しい発見につながるような興味深い企画を提供していただきました。今までにない取り組み故、ご準備にはご苦労されたことと思いますが、西島正弘大会長、石田誠一実行委員長のご尽力のおかげで充実した CBI 学会 2018 年大会としての 3 日間となりました。両先生方には改めて御礼申し上げます。
これまで in silico 創薬を中心に開催してきた CBI 学会の年次大会ですが、今回はレギュ
ラトリサイエンスという視点から、薬の品質、有効性、安全性の評価、それらを確保するための規制というこれまであまり議論されてこなかった別の側面から薬を見てみたいと思います。一方でレギュラトリサイエンスにおいても in silico の役割はウェットとの両輪として、今後益々重要性は増してくるものと思われます。CBI 学会としてはかなり挑戦的なテーマでありますが、in silico 創薬の研究者とレギュラトリサイエンスの研究者との接点を提供し、議論の中で双方の新たな方向性を見出せるような CBI 学会らしい大会になるものと期待しております。
本大会では昨年に引き続き、創薬の抜本的な効率化が期待されている AI 創薬にも焦点を当てていきます。創薬における様々な場面で AI の取り組みがスタートしていますが、大会では副作用の予測や医療データの活用など、レギュラトリサイエンスに繋がっていくような研究に関しても紹介していただきます。合わせて iPS 細胞に関する研究などウェットの点からもご発表いただき、全体の理解を深めるよい機会になればと考えています。薬の信
頼性の根幹を支えるレギュラトリサイエンスの目線でこれまでの CBI 学会年次大会で議論されてきた幅広い領域を見直した時、AI を含めた in silico 研究との組み合わせが浮かんでくるでしょうか。今回の大会がそのような化学反応がおこる場となれば幸いです。
CBI 学会 2018 年大会が、創薬に関心をもつ様々な研究に携わる方々にとって活発な議論と新たな協業に結びつくような場となり、参加された皆様に有意義な 3 日間になることを祈念しております。

CBI 学会 会長
片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ株式会社）

－1－

－2－

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

CBI 学会 2018 年大会 大会長・実行委員長挨拶
CBI 学会 2018 年「創薬と育薬のレギュラトリサイエンス～AI 創薬時代の新展開～」
開催にあたってはじめに、CBI 学会 2018 年大会が、滞りなく開催できる運びになりましたこと、大会長並びに実行委員長として、多くの関係者、ご登壇いただく先生方、ならびに、ご参加いただきました皆様に心より御礼申し上げます。
近年の目まぐるしい技術革新の波は製薬産業にも押し寄せてきており、人工知能（AI）、シミュレーション、ビッグデータなどを活用した情報技術（IT）と、iPS 細胞やバイオバ
ンクによるヒトサンプル活用手法の開発の進展に伴い、新薬開発のプロセスに一大変革がもたらされつつあります。そのような流れの中で、過去２年間は、主に産業応用の視点から in silico 創薬について取り上げられてきました。
一方で、医薬品の薬効・安全性評価について新しい潮流として、承認審査を経て上市された医薬品について市販後も調査と評価を継続的に行い、有効で安全な医薬品に育てていく取り組みが始まっています。新しい医薬品を作り出す一連の過程を“創薬”と言うのに対し、市場に出た医薬品を有効性と安全性、使いやすさがより高いものに育てていくことを“育薬”と言います。
本大会では、産業界が進める in silico や AI などを用いた“創薬”の流れと、インフォマ
ティクスや医療ビッグデータを取り込んだ市販後調査などの“育薬”の展開により、いかに患者に有効で安全な医薬品を届けるかという基本的な課題を、“レギュラトリサイエンス”
をキーワードに議論したいと思います。
とかく先行する成功事例が広く世に広まるため、in silico 創薬の華々しい面に目が向きがちです。しかしながら、その成果を着実に社会還元するためには、社会的な基盤整備について十分に議論されることが必要です。本大会で、様々な分野の第一線で活躍される研究者や専門家から意見を頂くことで、問題点を浮き彫りにし将来的な解決方策を考える端緒となることを願っております。
3 日間という限られた日程ではございますが、これからの創薬研究の方向性を考えるう
えで有用な情報交換、意見交換の場となれば幸いです。

CBI 学会 2018 年大会
大会長

西島 正弘
（国立医薬品食品衛生研究所 名誉所長）

実行委員長

石田 誠一
（国立医薬品食品衛生研究所）

－3－

－4－

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

協賛・後援団体
Academic Association＜協賛＞<Cooperated by>

日本薬物動態学会

The Japanese Society for the Study of Xenobiotics

日本薬理学会

The Japanese Pharmacological Society

日本安全性薬理研究会

Japanese Safety Pharmacology Society

日本応用数理学会

The Japan Society for Industrial and Applied Mathematics

日本分子生物学会

The Molecular Biology Society of Japan

日本生理学会

The Physiological Society of Japan

日本生物物理学会

The Biophysical Society of Japan

日本バイオインフォマティクス学会 Japanese Society for Bioinformatics
情報処理学会

Information Processing Society of Japan

エイチ・エー・ビー研究機構
Human and Animal Bridging Research Organization（HAB 研究機構）
細胞アッセイ研究会
安全性評価研究会

Safety Evaluation Forum＜後援＞<Supported by>

日本毒性学会

The Japanese Society of Toxicology

国立研究開発法人 科学技術振興機構
Japan Science and Technology Agency（JST）
国立研究開発法人 科学技術振興機構
Human Information Technology Ecosystem
社会技術研究開発センター（HITE）－5－

大会スポンサー
Sponsors＜展示ブース＞<Exhibition Booth>

エルゼビア・ジャパン株式会社

Elsevier Japan KK

株式会社フィアラックス／
アトリビュート株式会社

FiatLux Corporation／
ATTRIBUTE CO., LTD.

株式会社モルシス

MOLSIS Inc.

株式会社ワールドフュージョン

World Fusion Co., LTD.

英文校正のエディテージ
Cactus Communications K.K.
（カクタス・コミュニケーションズ株式会社）株式会社ナベ インターナショナル

NABE International Corp.

キシダ化学株式会社

KISHIDA CHEMICAL Co., Ltd.

神戸市／神戸医療産業都市推進機構

Kobe City／Foundation for Biomedical
Research and Innovation at Kobe

株式会社 Transition State Technology

Transition State Technology Co., Ltd.

株式会社クロスアビリティ

X-Ability Co., Ltd.

オープンアイ・ジャパン株式会社

OpenEye Japan Co., Ltd.

株式会社システム計画研究所

Research Institute of Systems Planning, Inc.

みずほ情報総研株式会社

Mizuho Information & Research Institute, Inc.

Schrödinger

Schrödinger

株式会社フェニックスバイオ

PhoenixBio Co., Ltd.

ナミキ商事株式会社

Namiki Shoji Co., Ltd.

SCSK 株式会社／
日本ヒューレット・パッカード株式会社

SCSK Corporation／
Hewlett-Packard Japan, Ltd.

京都大学化学研究所スーパーコンピュータ
システム

SuperComputer System, Institute for
Chemical Research, Kyoto University

ダッソー・システムズ株式会社

Dassault Systemes K.K.

株式会社富士通九州システムズ

FUJITSU KYUSHU SYSTEMS LIMITED

コンフレックス株式会社

CONFLEX Corporation＜スポンサードセッション＞<Sponsored Session>

国立研究開発法人 日本医療研究開発機構
Japan Agency for Medical Researchand Development（AMED）TSUMURA & CO.

株式会社ツムラ－6－

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

＜ランチョンセミナー＞<Luncheon Seminar>

株式会社モルシス

MOLSIS Inc.

アークスパン合同会社

Arxspan LLC

ドットマティクス

Dotmatics Ltd.

パトコア株式会社

Patcore, Inc.

株式会社 GDEP アドバンス

GDEP ADVANCE, Inc.

分子ロボット倫理研究会

Special Interest Group of Molecular Robot Ethics＜スポンサー企業企画枠＞<Sponsor's workshop >BIOSPIRE 株式会社／
ライフマティックス株式会社

Biospire Japan Ltd.／
Lifematics Inc.

株式会社バイオモデリングリサーチ

Biomodeling Research Co., Ltd.

＜広告掲載＞<Advertisement>

三井情報株式会社

MITSUI KNOWLEDGE INDUSTRY CO., LTD.

ドットマティクス

Dotmatics Ltd.

株式会社クロスアビリティ

X-Ability Co., Ltd.

株式会社ケー・エー・シー

KAC Co., Ltd.

みずほ情報総研株式会社

Mizuho Information & Research Institute, Inc.

株式会社知能情報システム

Chinou Jouhou Shisutemu Inc.

小野薬品工業株式会社

ONO PHARMACEUTICAL CO., LTD.

株式会社京都コンステラ・テクノロジーズ Kyoto Constella Technologies Co., Ltd.

＜寄付＞

<Contribution>

帝人ファーマ株式会社

Teijin Pharma Limited

大鵬薬品工業株式会社

TAIHO PHARMACEUTICAL CO., LTD.

－7－

大会組織委員会
CBI2018 Committee Members＜CBI 学会 2018 年大会大会長＞
西島 正弘（国立医薬品食品衛生研究所 名誉所長）＜大会実行委員会＞
実行委員長： 石田 誠一（国立医薬品食品衛生研究所）

石川 岳志（長崎大学）

植沢 芳広（明治薬科大学）

荻島 創一（東北メディカル・メガバンク機構）

片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ株式会社）上村 みどり（帝人ファーマ株式会社）

小長谷 明彦（東京工業大学）

佐藤 薫（国立医薬品食品衛生研究所）

中嶋 久士（興和株式会社）

広川 貴次（産業技術総合研究所）

福澤 薫（星薬科大学）本間 光貴（理化学研究所）

水間 俊（帝京平成大学）＜大会企画委員会＞
奥田 晴宏（国立医薬品食品衛生研究所）

諫田 泰成（国立医薬品食品衛生研究所）

鈴木 洋史（東京大学医学部附属病院）

髙柳 輝夫（公益財団法人 ヒューマンサイエンス振興財団）

田中 博（東京医科歯科大学／東北メディカル・メガバンク機構）－8－Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

<Conference Chairperson>
Masahiro Nishijima

Honorary Director of National Institute of
Health Sciences (NIHS)<Organizing Committee>
Chairperson: Seiichi Ishida

National Institute of Health Sciences (NIHS)

Takeshi Ishikawa

Nagasaki University

Yoshihiro Uesawa

Meiji Pharmaceutical University

Soichi Ogishima

Tohoku Medical Megabank Organization

Shinichi Katakura

DAIICHI SANKYO RD NOVARE CO., LTD.

Midori Kamimura

Teijin Pharma Limited

Akihiko Konagaya

Tokyo Institute of Technology

Kaoru Sato

National Institute of Health Sciences (NIHS)

Hisashi Nakashima

Kowa Company, Ltd.

Takatsugu Hirokawa

AIST

Kaori Fukuzawa

Hoshi University

Teruki Honma

RIKEN

Takashi Mizuma

Teikyo Heisei University<Planning Committee>
Haruhiro Okuda

National Institute of Health Sciences (NIHS)

Yasunari Kanda

National Institute of Health Sciences (NIHS)

Hiroshi Suzuki

The University of Tokyo Hospital

Teruo Takayanagi

Japan Health Sciences Foundation

Hiroshi Tanaka

Tokyo Medical and Dental University/
Tohoku Medical Megabank Organization－9－

＜プログラム委員会＞
委員長：

上村 みどり（帝人ファーマ株式会社）

池田 和由（慶應義塾大学）

石川 岳志（長崎大学）

石川 智久（NPO 法人地方再興・個別化医療支援）石田 誠一（国立医薬品食品衛生研究所）

植沢 芳広（明治薬科大学）

江崎 剛史（国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所）

荻島 創一（東北メディカル・メガバンク機構）

片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ株式会社）

河合 隆利（エーザイ株式会社）

熊澤 啓子（帝人ファーマ株式会社）

小長谷 明彦（東京工業大学）

関嶋 政和（東京工業大学）

高岡 雄司（ダッソー・システムズ株式会社）

高橋 一敏（味の素株式会社）

多田 幸雄（CBI 学会事務局）

多田隈 尚史（大阪大学蛋白質研究所）

田中 成典（神戸大学）

中嶋 久士（興和株式会社）中村 光浩（岐阜薬科大学）

広川 貴次（産業技術総合研究所）

福澤 薫（星薬科大学）

藤渕 航（京都大学 iPS 細胞研究所）

本間 光貴（理化学研究所）

増田 友秀（東レ株式会社）

水口 賢司（国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所）

水間 俊（帝京平成大学）

美宅 成樹（名古屋大学名誉教授）

茂櫛 薫（順天堂大学）

山岸 賢司（日本大学）

湯田 浩太郎（株式会社インシリコデータ）

渡邉 怜子（国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所）－ 10 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

<Program Committee>

Chairperson: Midori Kamimura

Kazuyoshi Ikeda

Teijin Pharma Limited
Keio University

Takeshi Ishikawa

Nagasaki University

Toshihisa Ishikawa

NGO Personalized Medicine & Healthcare

Seiichi Ishida

National Institute of Health Sciences (NIHS)

Yoshihiro Uesawa

Meiji Pharmaceutical University

Tsuyoshi Esaki

National Institutes of Biomedical Innovation,
Health and Nutrition

Soichi Ogishima

Tohoku Medical Megabank Organization

Shinichi Katakura

DAIICHI SANKYO RD NOVARE CO., LTD.

Takatoshi Kawai

Eisai Co., Ltd.

Keiko Kumazawa

Teijin Pharma Limited

Akihiko Konagaya

Tokyo Institute of Technology

Masakazu Sekijima

Tokyo Institute of Technology

Yuji Takaoka

Dassault Systemes K.K.

Kazutoshi Takahashi

Ajinomoto Co., Inc.

Yukio Tada

The Chem-Bio Informatics Society

Hisashi Tadakuma

Institute for Protein Research, Osaka University

Shigenori Tanaka

Kobe University

Hisashi Nakashima

Kowa Company, Ltd.

Mitsuhiro Nakamura

Gifu Pharmaceutical University

Takatsugu Hirokawa

AIST

Kaori Fukuzawa

Hoshi University

Wataru Fujibuchi

CiRA

Teruki Honma

RIKEN

Tomohide Masuda

TORAY INDUSTRIES INC.

Kenji Mizuguchi

National Institutes of Biomedical Innovation,
Health and Nutrition

Takashi Mizuma

Teikyo Heisei University

Shigeki Mitaku

Nagoya University

Kaoru Mogushi

Juntendo University

Kenji Yamagishi

Nihon University

Kotaro Yuta

In Silico Data, Ltd.

Reiko Watanabe

National Institutes of Biomedical Innovation,
Health and Nutrition－ 11 －

会場案内図Venue
１階：展示ホール（総合受付／企業展示／ポスター会場）
1F : Hall (Registration Desk / Exhibition Booth / Poster Session)

２階：福寿＋桃源・瑞雲・平安・蓬莱（講演／スポンサードセッション／パネルディスカッション／懇親会）
2F : Fukujyu+Togen, Zuiun, Heian, Horai(Lecture / Sponsored Session / Panel Discussion / Banquet)－ 12 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

３階：303（スポンサー企業企画枠）
3F : 303 (Sponsor's Workshop)

４階：研修室・401・402・403・406・407（ランチョンセミナー／フォーカストセッション／スポンサー企業企画枠）
4F : Training room, 401, 402, 403, 406, 407(Luncheon Seminar / Focused Session / Sponsor's Workshop)－ 13 －

５階：小ホール（シンポジウム／市民講座／JST 分子ロボット倫理国際会議）
5F : Small Hall (Symposium / Public Lecture /International Conference on Molecular Robot Ethics)－ 14 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

＜１階 展示ホール：展示ブース配置＞ (Booth layout)

エルゼビア・ジャパン株式会社 (Elsevier Japan KK)

1

株式会社フィアラックス／アトリビュート株式会社 (FiatLux Corporation/ATTRIBUTE CO., LTD.)2

株式会社モルシス (MOLSIS Inc.)3

株式会社ワールドフュージョン (World Fusion Co., LTD.)

4

英文校正のエディテージ（カクタス・コミュニケーションズ株式会社）(Cactus Communications K.K.)

5

株式会社ナベ インターナショナル (NABE International Corp.)6キシダ化学株式会社 (KISHIDA CHEMICAL Co., Ltd.)7神戸市／神戸医療産業都市推進機構 (Kobe City/Foundation for Biomedical Research andInnovation at Kobe)

8

株式会社 Transition State Technology (Transition State Technology Co., Ltd.)

9

株式会社クロスアビリティ (X-Ability Co., Ltd.)

10

オープンアイ・ジャパン株式会社 (OpenEye Japan Co., Ltd.)11

株式会社システム計画研究所 (Research Institute of Systems Planning, Inc.)

12

みずほ情報総研株式会社 (Mizuho Information & Research Institute, Inc.)

13

Schrödinger

14

株式会社フェニックスバイオ (PhoenixBio Co., Ltd.)

15

ナミキ商事株式会社 (Namiki Shoji Co., Ltd.)16SCSK 株式会社／日本ヒューレット・パッカード株式会社 (SCSK Corporation/
Hewlett-Packard Japan, Ltd.)
京都大学化学研究所スーパーコンピュータシステム (SuperComputer System, Institute for
Chemical Research, Kyoto University)

17
18

ダッソー・システムズ株式会社 (Dassault Systemes K.K.)

19

株式会社富士通九州システムズ (FUJITSU KYUSHU SYSTEMS LIMITED)

20

コンフレックス株式会社 (CONFLEX Corporation)21－ 15 －

＜フォーカストセッション＞
10 月 9 日（火）14:0015:30

16:0017:30

瑞雲FS-01 第 2 回オミックスを原理的なところから考える－「生命」と多様性を共存させる原理は？－研修室

FS-02 口頭発表 「創薬・医療 AI」分野

401

FS-03 計算毒性学－基本技術編（ケモメトリックス、QSAR、メタボロミクス）

403

FS-04 第 7 回個別化医療研究会 抗がん剤の個別化医療のための新たな試み

平安

FS-06 計算科学と構造生物学による神経変性疾患克服への挑戦

研修室

FS-07 口頭発表「インシリコ創薬」分野

401

FS-08 計算毒性学－実践・適用編

407

FS-09 幹細胞を用いた化合物リスク情報共有化コンソーシアム scChemRISC
への招待
10 月 10 日（水）14:0015:30

16:0017:30

瑞雲FS-10 人工知能(AI)およびビッグデータ(BD)統合による「化学データ
サイエンス」－計算毒性学、創薬、物性評価、他への展開（１）－

研修室

FS-11 口頭発表「分子認識と分子計算」分野

401

FS-12 In silico ADME-TOX／創薬活用の現状と課題－製薬企業における取り組み－407

FS-13 先端的計測技術

研修室

FS-14 口頭発表「バイオインフォマティクスとその医学応用」分野

401

FS-15 創薬と育薬から適薬へ

406

FS-16 生命の起源：その現状と展望

407

FS-13 先端的計測技術
10 月 11 日（木）14:0015:30

研修室

FS-17 口頭発表 「医薬品研究と ADMET」分野「レギュラトリサイエンス」分野

401

FS-18 口頭発表「他分野に属さない先進的研究」分野－ 16 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

プレナリー講演

プレナリー講演
K-01～K-07－ 17 －

プレナリー講演－ 18 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

K-01
レギュラトリーサイエンスとはWhat is Regulatory Science?

国立医薬品食品衛生研究所 名誉所長
National Institute of Health Sciences, Honorary Director

CBI2018 年大会のテーマは、「創薬と育薬のレギュラトリーサイエンス～AI 創薬時代の新展開～」であるが、この「レギュラトリーサイエンス（以下 RS と略）」という言葉は、
1987 年に国立衛生試験所（現在は国立医薬品食品衛生研究所に改称）の副所長であった内山充博士が提唱されたものであり、「科学の所産を人間との調和の上で、最も望ましい姿に調整 regulate する科学」と述べられている。この考えの重要性は最近まで広く認識されるには至っていなかったが、2011 年の第４次科学技術基本計画では RS の重要性が認識され、国の科学技術政策の重要課題の一つとして取り上げられるに至った。
国立医薬品食品衛生研究所（以下、国衛研と略）は、明治７年（1874 年）に医薬品試験機関として発足した、わが国で最も古い国立試験研究機関である。そのミッションは、医薬品や食品のほか、生活環境中に存在する多くの化学物質について、その品質、安全性および有効性を正しく評価するための試験・研究や調査を行うことであり、まさに RS そのものである。近年、新剤形医薬品や組換え DNA 医薬品のほか、医用材料、新開発食品、天然添加物など新たに評価の必要な対象物質が生まれてきており、さらに安全性評価のための新しいリスクアセスメントも必要となってきている。これらに対処するために AI 技術の導入も試みられつつある。本講演では RS の具体例として国衛研での取り組みのいくつかについて紹介したい。

－ 19 －

プレナリー講演西島 正弘
Masahiro Nishijima

K-02
ライフインテリジェンスコンソーシアム（LINC）における AI 開発の現状
The status of AI development in the Life Intelligence Consortium (LINC)
プレナリー講演水口 賢司
Kenji Mizuguchi
国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所 バイオインフォマティクスプロジェクト
National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition
http://mizuguchilab.org/

ライフ インテリジェンスコンソーシアム（LINC） は、ライフサイエンス分野における人工知能（AI: artificial intelligence）とビッグデータ技術の開発を加速する目的で、2016
年 11 月に設立された。当初より、IT 系とライフ系の企業・アカデミアの連携を促進することを目指してきたが、現在では参画機関の総数は約 100（その多くは民間企業）に上っている。約 30 に分かれるプロジェクトそれぞれで、研究計画、研究内容についての活発な議論が進められ、幾つかのプロジェクトについては、具体的な成果物イメージが示されるまでに至っている。また、アカデミアの技術やノウハウをより生かすための体制の強化が図られた。さらに、プロジェクト横断的な基盤整備の重要性が認識され、新たに設立された 2
つのワーキンググループ（WG9 知識ベース・自然言語処理と WG10 AI 基盤）の活動も本格的に開始している。
本講演では、これら LINC の最近の活動の現状を概観したのちに、・AI による病理画像処理・ドラッグリポジショニング・AI を用いた高精度分子力場の 3 つのプロジェクトについて、各プロジェクトメンバーから、現時点での成果を報告してもらう。

－ 20 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

K-03 -1
AI による病理画像認識
Pathological Recognition ｂy Artificial Intelligence

甲斐 清徳 4，
Kiyonori Kai

安野 恭平 4
Kyohei Yasuno

1

富士通株式会社
Fujitsu Limited2
シスメックス株式会社
Sysmex Corporation
3
大塚製薬株式会社
Otsuka Pharmaceutical Co., Ltd.
4
第一三共株式会社
Daiichi Sankyo Co., Ltd.

医薬品開発期間の短縮化は喫緊の課題である。前臨床試験では安全性評価を担うが、病
理検査は創薬シーズのスクリーニングで多大な時間と労力を要するため開発の律速になる場合がある。我々は深層学習を用いた病理所見の学習により、病理標本の毒性領域の判別（正常／異常）が可能なモデルを目指す。標本の判別（低リスク／高リスク）により前臨床の効率化が期待でき、かつ病変の詳細解析や機序検討など高次の精査にも資することが可能となる。

－ 21 －

プレナリー講演岩本 和樹 1， 袴田 和巳 2， 植松 直也 3， 土屋 卓磨 3
Kazuki Iwamoto Kazumi Hakamada Naoya Uematsu Takuma Tsuchiya

K-03 -2

プレナリー講演Graph convolutional network を用いた標的タンパク質予測
Prediction of Compound-Protein Interaction
Using the Graph Convolutional Network
桐谷 太郎
Taro Kiritani
株式会社エクサウィザーズ
ExaWizards Inc.

Graph convolutional network（GCN） は、低分子化合物の化学構造情報から物性情報の予測・抽出などの学習モデルに広く使われるようになっている。LINC PJ10 は GCN を用いた化合物とタンパク質の結合予測手法の開発を行なっている。本研究では、ChEMBLのバイオアッセイデータを学習データセットとして、標的タンパク質予測モデルを構築した。具体的には、シングルタスクモデルやマルチタスクモデルなどのモデルの検討により学習モデルの最適化を行い、化合物の記述子を用いた Deep Neural Networks（DNN）などの従来手法や、ChEMBL が提供している target prediction model との比較により、構築した予測モデルの予測精度の評価を行った。本講演では、構築した予測モデルのドラッグ
リポジショニングへの応用についても紹介したい。

－ 22 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

K-03 -3

加藤 幸一郎 1
Koichiro Kato

増田 友秀 2
Tomohide Masuda

1

みずほ情報総研株式会社
Mizuho Information & Research Institute, Inc.
2
東レ株式会社
Toray Industries, Inc.

創薬研究において実施される分子動力学シミュレーションやインシリコスクリーニング
等では分子力場と呼ばれるパラメータが一般に用いられ、それらの計算精度は用いる分子力場の精度に大きく依存する。LINC PJ14 では、タンパク質に代表される生体高分子・医薬低分子化合物・それらの周囲に存在する水を対象とし、機械学習を用いた高精度な分子力場の構築を目指している。本講演では、(1)物理化学的描像に基づいた既存分子力場のポ
テンシャルエネルギー関数を用いずに、第一原理計算結果を教師データとした機械学習による分子力場の検討・構築状況と、(2)既存分子力場の精度向上を目的とした機械学習による FMO 原子電荷の高精度予測モデルの開発状況について紹介する。

謝辞
本研究は、AI 創薬コンソーシアム LINC（Life Intelligence Consortium）の活動の一部として実施された。また、FMO 計算については、FMO 創薬コンソーシアム FMODD（FMO
Drug Design Consortium）と LINC との連携により実施された。FMO 計算にはスーパーコンピュータ「京」を利用した（課題番号： hp180147）。PJ14 メンバー及び協力・支援を頂いた方々は以下の通りである。ここに感謝の意を表する。（順不同、敬称略）
氏名： 上田寛 1、谷村隆次 1、大島勘二 2、小野聡 3、宮川尚紀 4、溝内秀男 4、
渡邉千鶴 5、永瀬駿平 5、神坂紀久子 5、本間光貴 5、福澤薫 6、徳久淳師 5、
金田亮 5、千葉峻太朗 5、大田雅照 5、池口満徳 5,7
所属： 1 東レ、2 カネカ、3 田辺三菱製薬、4 みずほ情報総研、5 理化学研究所、
6 星薬科大学、7 横浜市立大学－ 23 －

プレナリー講演

機械学習を用いた高精度分子力場の構築に向けて
Toward A High-Accuracy Molecular Force Field
Using Machine LearningK-04
オンデマンド型バンキングによる創薬支援の取り組みについて
On-Demand type biobanking will promote drug discovery in Japan
プレナリー講演西原 広史
Hiroshi Nishihara
慶應義塾大学医学部腫瘍センター／クリニカルバイオバンク学会
Keio Cancer Center, Keio University School of Medicine / Society of Clinical Biobank

バイオバンクは一般的には、画一的な検体処理によって生体試料の品質を維持し、様々なリクエストに対応可能な検体の提供を可能にするシステムである。しかし、創薬研究に必要な生体試料は、例えば、手術の前後や、術後の多定点での検体採取、あるいは、研究
内容に応じた特殊な検体処理を必要とする場合など、既存の保管検体に対する方法論では対応できない場合がある。こうした、様々なリクエストに応えるために、前向きに検体を採取する「オンデマンド型バンキング」という方法論が近年、注目を浴びている。まず、生体試料の希望者のニーズに沿った臨床研究計画を策定後、電子カルテのオーダリングシ
ステムと連動することで効率よく生体試料を採取し、匿名化及び適切な処理を施した後、指定された保管条件下で検体を保管する。また、多用途に対応できる組織検体の処理方法の一つとして、PAXgene Tissue system（QIAGEN）にて固定し、PFPE（PAX 固定パラ
フィン包埋組織）を作製し、病理切片にて検体の状態を病理医が確認した後に-80℃で保管し、必要に応じて DNA・RNA・cfDNA を自動抽出装置にて抽出・保管することが可能となる。このようなオンデマンド型のバンキングは、従来型の網羅的バンキングに対して多くの利点を有する。特に、検体利用率が高く、また確実に必要なサンプルを入手できる点
で、臨床研究支援に適した新たなバイオバンクのシステムであり、こうした施設の拡充に
より日本全体の創薬・臨床研究の活性化が期待できる。
本講演では、北海道大学病院での経験を元に、今後の創薬基盤研究支援におけるクリニ
カルバイオバンクの果たす役割について述べる。

－ 24 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018K-05
精密医療時代におけるリアルワールドデータに基づく臨床試験
Clinical Research based on real world data in the era of precision medicine

東京医科歯科大学／東北大学東北メディカル・メガバンク機構
Tokyo Medical and Dental University /Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University

近年、医療の世界も、次世代シーケンサによるゲノム・オミックス医療の到来、電子化の普及による医療情報の集積、スマート革命による生体モニタリングなどの影響により、「ビッグデータ」時代を迎えつつある。医療における「ビッグデータ革命」は、これまでの臨床研究の方法論のパラダイムを変革しつつある。すなわち、従来の臨床研究のゴール
デンスタンダードであった、無作為化比較試験（RCT）や根拠に基づいた医療（EBM）に対してその有効性に対して疑義が投じられ、現実の医療のデータ、すなわちリアルワールド・ビッグデータに基づいた臨床研究への移行への動向が始まっている。
臨床医学や薬剤検定の王道であった RCT は次の 2 つの点で限界がある。まず RCT は周到に準備された患者集団に関する無作為化した臨床研究であるが、薬剤効果検出のための「人工的に組織化された患者集団」であり、「日常的医療実践の＜外＞」に存在するため、リアルワールドの医療実践と隔離し、多くの情報を逸している。いまや無作為化の標本抽出が必要のない程度に、母集団に近いレベルのデータが収集できる時代であり、収集したリアルワールドデータの中に多様な医療実践の本来の姿が潜んでいる。もう一つは、RCTや EBM が生まれた時代はまだ“one size fits for all”のポピュレーション医療の時代であったが、いまや同一疾患名で括られる患者集団でも、その疾患の成立機序において、多様な個別化された内因的サブタイプが多数存在していることが明白に成り（精密医療）、単なる無作為化ではこの内因的サブタイプの差異を消去できない。また、すべての個別性を含めれば、バイオバンク程度の治験規模にならざるを得ない。
RCT、EBM に代わる臨床研究のパラダイムはいまだ開発途上であるが、臨床診療データ
ベース（NBD, MID-NET, 電子カルテなど）などの利用や、バイオバンクあるいは疾患レジストリーをベースにする RCT などの概念が提案されている。北欧では疾患レジストリーに登録されている患者に臨床治験を行う Registry-based Clinical Trial（RRCT）が推進されている。また米国では実際の医療情報システムに格納された患者から臨床研究を行う
Learning Health System (LHS) を米国の医学アカデミーが推進している。RCT だけでな
く、相補的にリアルワールドデータで RCT の結果を補完し、広く薬剤開発の手がかりとするリアルワールドエビデンスアプローチは欧米の製薬企業で普及しつつある。講演ではこれらの状況と課題を紹介し、将来の方向を議論する。

－ 25 －

プレナリー講演田中 博
Hiroshi Tanaka

K-06
育薬における副作用情報
Information of adverse drug event in drug lifetime management (ikuyaku)
プレナリー講演

澤田 康文
Yasufumi Sawada
東京大学大学院 薬学系研究科
Graduate School of Pharmaceutical Sciences, The University of Tokyo

日々の診療・薬剤業務では、添付文書等にない出来事に遭遇することが少なくない。例
えば、新規の副作用・薬物相互作用が発現した、意外と個人差が大きく慎重な使用を要す
ることが明らかになった、使用してはいけない患者、症状・疾患が判明した等、医薬品の市販後には開発段階で未知であった問題点が度々惹起する。その問題点がなぜ起こるのか、どう対処したらよいのか、答えを出していかねばならない。これは正に研究であり、「育薬」という行為である。
育薬という観点で副作用情報について考えると、第一は未知や重大な副作用を可及的速やかに見出すことであろう。そのために、市販後調査や副作用報告制度等により、副作用情報の収集が粛々と行われている。一方で、収集した副作用情報を解析し、副作用を予測する研究も育薬においては重要となる。本講演では、副作用情報をもとにした我々の育薬研究を紹介したい。
(1) PK/PD モデル解析による副作用の予測
非ステロイド性消炎鎮痛薬（NSAIDs）は、妊娠末期の使用により胎児毒性（胎児動脈管収縮）を惹起する。In situ ヒト胎盤灌流実験で NSAIDs の胎盤透過の薬物動態学的（PK）
パラメータ、動物実験で胎仔動脈管収縮の薬力学（PD）パラメータを算出し、PK/PD モデ
ルを構築することで、妊娠末期の NDAIDs 使用による胎児動脈管収縮を予測可能となった。
(2) 多剤併用（ポリファーマシー）による副作用の予測
高齢化社会において多剤併用（ポリファーマシー）による副作用発現は重要な課題の一つである。高齢者介護施設における転倒に関する情報を収集し、ケース・コントロール研
究から薬剤および患者背景についての転倒リスク要因を明らかにするとともに、転倒リス
クアセスメントツールを開発した。また、地域薬局の薬剤師が把握した眠気に関する情報を収集し、服用薬剤の添付文書情報から多剤併用による眠気リスクを評価するアルゴリズ
ムを開発した。これらは、入手可能な情報の一部を用いて行ったが、解析に用いていない
多くの付帯情報があり、機械学習等による解析も進める必要がある。
(3) 副作用発現に繋がりうる医薬品取り違えリスクの予測
医薬品の取り違えは誤服用や過量服用による副作用を惹起しうる重要な問題である。取り違えの要因として、医薬品名の類似や包装外観の類似が挙げられる。取り違えの起こり
うる組み合わせを判別可能な、薬名類似度指標、PTP 外観の類似度指標を構築した。今後、処方パターン等を考慮し、画像認識技術等を取り入れ、機械学習等によりより高精度に取り違えリスクを予測できるように解析を進める必要がある。

－ 26 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

K-07

宇山 佳明
Yoshiaki Uyama(独)医薬品医療機器総合機構
Pharmaceuticals and Medical Devices Agency

医薬品開発は、近年国際化が進み、国際共同治験等を主な臨床試験成績として承認される新医薬品も増加しつつある。また、現在では承認審査にかかる時間は日本と欧米で同等となっており、日本で先駆けて、あるいは世界と同時に新薬が承認されることも珍しくなくなっている。
このことは新薬が日本の患者に早く届くという意味で非常に意義があるが、一方で、世界的に十分な使用経験がなく、未知の副作用の発現リスクなど安全性プロファイルが明確ではない医薬品を実臨床で用いることとなるという課題もある。
このような新薬世界同時承認時代においては、製造販売後の安全性監視やベネフィット／リスク評価がより重要となる。製造販売後の情報収集は、これまで副作用報告や使用成績調査等によって実施されることが多かったが、平成 30 年 4 月に施行された改正 GPSP 省
令により、製造販売後調査として製造販売後データベース調査が新たに加わり、リアルワールドデータに基づく安全性評価結果の活用が可能となった。電子診療情報等リアルワー
ルドデータを活用することで、効率的に医薬品安全性評価が実施されることが期待されるが、これらのデータにも限界はあるため、データベースの特徴等を十分に理解した上で評価を行っていく必要がある。
今後の医薬品安全性評価については、調査目的、すなわちリサーチクエスチョン（RQ）
を明確にした上で、その RQ に最も適したデータソースを選択していくことが求められ、
RQ があいまいなまま調査を実施することがないよう留意していく必要がある。
本講演では、近年における医薬品開発の現状やリアルワールドデータを活用した医薬品
安全性評価への取組みの現状を御説明し、今後の医薬品安全性評価の方向性等について私見を述べることとしたい。

－ 27 －

プレナリー講演

新薬世界同時承認時代のリアルワールドデータに基づく医薬品安全性評価
Drug Safety Assessment based on Electronic Medical Records in the era ofSimultaneous Global Approval of a New Drug

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

招待講演

招待講演
I-01～I-09－ 29 －

招待講演－ 30 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

I-01
ヒト iPS 細胞を用いた新規試験法の開発と国際標準化の戦略
Development of a new testing method using iPS cell technology and international
standardization strategy
諫田 泰成
Yasunari Kanda

ヒト iPS 細胞技術は、今まで入手が困難であったヒト細胞の利用を可能にすることから、再生医療に加えて創薬への応用が大変注目されている。特に、ヒト iPS 細胞由来分化細胞の利用によりヒトにおける安全性の予測精度を更に高めることができれば、被験者の安全性確保や医薬品開発の効率化・コスト削減など創薬プロセスの変革が実現できる。
ヒト iPS 細胞技術を活用した試験法を開発するために、我々は当初、細胞の規格化を行ってから薬理試験のプロトコルを作製しようと試みた。しかしながら、ヒト iPS 細胞の株による違いやヒト iPS 細胞由来分化細胞の機能にばらつきが大きいことが分かったため、我々は先に薬理試験のプロトコルから着手して、産官学により標準プロトコルを作製した。
その後に目的に適った細胞を検証するアプローチにより、世界に先駆けて標準プロトコルを開発して、オールジャパンチームによりヒト iPS 細胞技術を活用した試験法の有用性を示すことに成功した。さらに我々の取り組みをベースにして、米国 FDA らによりコード化
した化合物を用いた国際検証試験が実施され、日本からも参加した。国内外の大規模なス
タディーによって、ヒト iPS 細胞技術の有用性が明らかとなった。
試験法開発で重要な点は、国際的な枠組みで議論することである。我々は予備データやプロトコルを海外に先行して取得して、積極的に海外のグループに提示して情報を共有することにより、薬理試験の国際標準化を推進することに成功した。引き続き、国際連携のもとヒト iPS 細胞技術の実用化に向けた議論を進めている。
本講演では、国際連携のもとでヒト iPS 細胞技術を用いた試験法を先導的に開発するス
トラテジーを紹介する。現在、医薬品に加えて化学物質の安全性評価に対するヒト iPS 細
胞技術を活用した試験法などに取り組んでおり、将来的な展望とあわせて議論したい。

－ 31 －

招待講演

国立医薬品食品衛生研究所 薬理部
National Institute of Health SciencesI-02
人工知能を駆使した毒性・副作用予測戦略
A strategy for toxicity prediction based on artificial intelligence
植沢 芳広
Yoshihiro Uesawa

招待講演

明治薬科大学医療分子解析学研究室
Department of Medical Molecular Informatics
Meiji Pharmaceutical University

毒性および副作用は新規な医薬品・化学品の開発を中断させる大きな要因である。しかし、毒性発現メカニズムは未知もしくは複雑であるため、発症メカニズムの根拠を積み上げることによる演繹的な解釈は困難であることが多い。一方、多様な情報をコンピューターによって処理することにより、経験的に何らかのルールを見出すデータ駆動型のアプローチが近年多くの分野で脚光を浴びている。医薬品・化学品の化学構造を用いたデータ駆動型の毒性予測手法は定量的構造毒性相関（QSTR）解析法として知られている。しかし、特にヒトに対する毒性データの入手は極めて困難であることから、臨床上実用に足る予測精度を得ることは難しい場合が少なくない。そこで演者らは、（１）副作用データベースの活用、（２）有害性発現経路（AOP）における生体内初期イベント（MIE）関連活性情報の活用、および（３）ディープラーニング等の人工知能／機械学習技術の適用、によってこれらの問題点を克服するための戦略を提案してきた。
（１）近年、市販後調査によって構築された種々の副作用データベースが利用できるよ
うになった。演者らは PMDA が国内の症例から構築・公開している JADER、および米国
FDA が公開している FAERS を JAPIC が整理した JAPIC-AERS を用い、多様な副作用に対する網羅的な医薬品の副作用発現傾向の解析を実施してきた。本解析で得られた情報を
毒性のエンドポイントとすることにより、多様な化学構造と副作用の関連を解析できる。
（２）多くの毒性は多様な経路によって発現すると考えられる。化学物質が毒性等の生
理活性を発現するときの初期イベント（MIE）は、タンパク質や核酸等の生体高分子との相互作用である。多くの毒性発現に重要な初期イベントの対象として核内受容体やストレス応答パスウェイが挙げられる。化学構造からの MIE 関連活性の予測は対象分子の毒性発現予測に有用であると考えられる。
（３）毒性・副作用と化学構造情報の関係は線形であるとは限らないため、高度な予測モデルの構築を目的とする場合、機械学習は有効な選択肢である。本講演では、NIH 主催
による毒性予測コンペティションと、演者が考案したディープラーニングに対する新規な構造情報入力法について紹介する。
以上の戦略は日本化学工業協会 LRI 委託研究に採択され、その一部は AMED「創薬支援インフォマティクスシステム構築」、および経産省「毒性関連ビッグデータを用いた人工知能による次世代型安全性予測手法の開発（AI-SHIPS）」プロジェクトに採用されている。

－ 32 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

I-03
薬物動態解析におけるマルコフ連鎖モンテカルロ法の利用
Use of Markov Chain Monte Carlo Method in Pharmacokinetic Analysis
樋坂 章博
Akihiro Hisaka

薬物動態解析のモデルが複雑になるにつれ、求めたいパラメータの数が増加し、その信頼性が問題になる。この場合の解決法の１つとして、ここではマルコフ連鎖モンテカルロ（MCMC）法、特にその１つの技術であるギブスサンプリングの適用について述べたい。
MCMC 法は統計学、計算物理学、計算生物学あるいは画像解析の分野では十分な実績があるが、薬学分野のモデル解析ではほとんど使われていない。これは一般の最適化と異なり計算の収束が特定できないこと、パラメータの分布や事前分布の設定が必要なことが障壁となり、新奇な方法とのイメージが過剰に抱かれているように思われる。実際には薬学分野の解析で計算収束が問題になることは非常に希である。事前分布については通常の最適化でも頻用されるパラメータの値範囲の制限と同様に考えるのが良い。一方で MCMC 法の特長としては、例え過剰で不安定なパラメータがあっても解析に問題が生じないこと、またパラメータの分布関数を自由に設定可能なことはむしろメリットであり、パラメータの誤差の階層構造も自由に設定可能なことが挙げられる。
我々は日本人と非日本人の薬物動態の人種差を調べるために、80 薬剤の 662 の臨床試験の薬物血中濃度 AUC の情報を MCMC 法で解析した。ここで MCMC 法を用いたのは薬物
を薬物動態学的性質で分類した上で、個人間差、試験間差、薬物間差、そして人種差のそれぞれを正確に評価したかったからである。このような複雑な誤差の階層構造を解析できる方法は他にほとんどない。その結果、人種差の実態に加えて、薬物動態の試験間差について信頼できる情報を得ることができ、臨床試験をデザインするための貴重な情報となった。
薬物動態学的な薬物相互作用は、一般に薬物代謝酵素あるいはトランスポーターの基質薬と阻害薬あるいは誘導薬の間に起こる。臨床で使用される基質薬は 1000 種のオーダーで存在し、阻害薬、誘導薬も数十種をくだらない。相互作用を完全にマネージメントするためには、数種ある薬物代謝酵素・トランスポーターのそれぞれに対して薬剤の数だけのパラメータを評価しておく必要がある。また相互作用に関連する観測値としては、臨床試験
での薬物血中濃度の変化に加えて、in vitro 実験で得られた代謝や阻害、誘導の活性変化がある。我々はこれらの異種情報をすべて統合し、MCMC 法を用いて解析する方法を開発した。ここで MCMC 法を用いた理由は、情報不足で精度の高い評価ができない薬剤を含んで解析しても全体としては問題とならないこと、in vivo と in vitro のように性質や精度の異なる情報を含んでも柔軟な解析が可能なことが挙げられる。現在はまだ数十種の薬剤の適用に留まっているが、このようなアプローチはあらゆるデータを利用しつつ、その重要度は解析の過程で自動的に判別される点で、データ駆動型のモデル解析と見做すこともできよう。
パラメータが多すぎて特定できない問題は、現在注目を集めている定量システム薬理学（QSP）においても頻繁に生じている。このときにモデルを自動的に簡略化したり、意味のあるパラメータを選別する方法論が一般的であるが、そのような場合の解決策としてMCMC 法も検討に値すると思われる。
AlphaGo の活躍で機械学習型の AI が注目を集めるが、問題の性質によって最適な解析手段は異なる。その中で MCMC 法は１つの特徴を持つ方法として、今後も幅広い適用が可能と考えられる。

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招待講演

千葉大学大学院薬学研究院 臨床薬理学研究室
Clinical Pharmacology and Pharmacometrics,
Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Chiba University

I-04
FMO guided drug discovery and structural analysis
Alexander Heifetz1
1

Evotec (UK) Ltd., 114 Milton Park, Abingdon, Oxfordshire OX14 4SA, United Kingdom
alexander.heifetz@evotec.com

招待講演

The understanding of binding interactions between a protein and a small molecule isthe cornerstone of any efficient structure-based drug design (SBDD) process. X-ray
crystallography and homology modelling are the main sources of structural information
for rational SBDD. However, even with the crystal structure in hand, “visual inspection”
and the force field-based molecular mechanics calculations often used for therationalization of potency cannot always explain the full complexity of the molecularinteractions. Quantum mechanical (QM) approaches were always considered to be a
promising route to achieving this goal. However, traditional QM calculations are notfeasible for large biological systems, due to their high computational cost.
The fragment molecular orbital (FMO) method offers a considerable computational
speed-up over traditional QM methods. One of the additional key features of FMO isthat it can provide a list of the interactions formed between the ligand and the receptor
and a chemically intuitive breakdown of these interactions. Such information isessential for medicinal chemists to be able to rationally approach modification of leadcompounds in order to increase favourable interactions.
In my presentation, I will demonstrate how FMO can be prospectively applied in real
drug-discovery programs. 1,3,4 Recently, we have demonstrated that FMO can be evenfaster (seconds instead of hours) without compromising the accuracy by combining itwith the density-functional tight-binding (DFTB) method.2
We have also applied FMO for the analysis of 35 GPCR crystal structures. This
structural analysis revealed a consensus network of 51 inter-helical interactions
mediated by 69 topologically equivalent amino acids, providing a proof of concept that a
conserved inter-helical interaction network exists and affects GPCR structure-function.

(1) Chudyk, E. I.; Sarrat, L.; Aldeghi, M.; et. al.; Methods Mol Biol 2018, 1705, 179.
(2) Morao, I.; Fedorov, D. G.; Robinson, R.; et. al.; J Comput Chem 2017, 38, 1987.
(3) Heifetz, A.; Chudyk, E. I.; Gleave, L.; et. al.; J Chem Inf Model 2016, 56, 159.
(4) Heifetz, A.; Trani, G.; Aldeghi, M.; et. al.; J Med Chem 2016, 59, 4352.

－ 34 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

I-05
第一原理計算を利用した臨床治療薬の効能解析
Elucidating the efficacy of clinical drugs using the first-principles calculations
常盤 広明
Hiroaki Tokiwa
立教大学理学部化学科
Department of Chemistry, Rikkyo University

は、日増しに困難となり、その確率は大変小さくなってきている。そのため、従来とは一線を画する in silico 解析に基づく合理的創薬への期待が高まりを見せている。その一方で、昨今のメディア報道などでよく見受けられるように、日本における科学技術の空洞化の懸念が指摘されている。創薬を支える構造生物学は使用する大型実験装置への依存度が高くなっている。高額の研究費、大型設備、および多数の人員を必要とする創薬に対して、日本としてどのような舵取りをしていくのか、今まさにその岐路に立たされているのではな
いだろうか。政府肝いりの人工知能、機械学習、および量子コンピュータなどの第四次革新的技術への強力なテコ入れは、日本における創薬や生命科学へのカンフル剤となるのであろうか。これまでも創薬現場からの in silico（Dry）サイドへのラブコールは幾度となくあり、現在もそれは続いているのかもしれないが、実験結果の再現性や特定の静的構造に基づく構造活性相関解析の限界などについては、広く知られるところとなりつつあるのが現状であろう。大規模計算によるアプローチもまた、きわめて有効な方法であるが、結果として“薬物候補化合物”がいくつか得られました、では寂しい限りである。ではこのよ
うな苦しい状況に対して、どこに軸足をおいて対応すべきなのであろうか。答えは明快である。欧米や中国などの量的な研究資源に真正面から対抗するのではなく、日本独自開発の手法、アイディアを有効に活用し、きちんとした最終的なアウトプットを出すことに他ならない。本講演では、実際の販売市場において、上位を占める臨床糖尿病治療薬に対して、同一標的・同一機構であっても、各化合物がどのように作用に差が生ずるのかを分子論的に明らかとした第一原理計算からのアプローチを紹介する。さらには、患者への適用範囲を広げるため、今年、新たに承認された高脂血症治療薬に対する最新の解析結果も紹介する。日本が有する独自の解析手法の有する可能性、底力を、実際の臨床治療薬を実例としてお示しすることで、今後の Dry-Wet 融合創薬の一助になれば幸いである。

－ 35 －

招待講演

改めて述懐するまでもなく、薬物候補化合物を新たな臨床治療薬として上市させること

I-06
ダイナミックドッキングによる結合親和性予測
Prediction of protein-ligand binding affinity from dynamic docking
李 秀栄
Suyong Re
国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター
RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research
招待講演

タンパク質とリガンドの結合計算（ドッキング計算）は、インシリコ創薬の中核をなす計算技術である。その予測精度を上げるためには、タンパク質とリガンドの構造柔軟性を取り込むことが重要であることは良く知られており、Induced fit ドッキングやアンサンブ
ルドッキングなど様々な計算モデルが提案されている。分子動力学法を用いた「ダイナミックドッキング」は、タンパク質、リガンド、水分子の運動を全て取り込んだ最も直接的な手法であるが、計算コストが高く、ミリ秒〜秒スケールで起こるリガンド結合イベント
を十分にサンプルするのは難しい。本講演では、Src キナーゼと阻害剤の結合を例に、代表的な構造探索法であるレプリカ交換分子動力学法を用いたダイナミックドッキングの取り組みと最近の進歩を紹介する。従来法に比べ、リガンド結合・脱離イベントのサンプリン
グ数が圧倒的に増え、結合ポーズはもちろん、水和状態の予測精度も向上した。初期会合から中間的な結合状態、遷移状態に至るまで、これまで捉えられなかった結合過程の詳細が自由エネルギー変化に基づいて原子解像度で明らかになってきた。今後リガンド拡散を取り入れた包括的な計算が可能になれば、ダイナミックドッキングにより、結合親和性の高精度予測に加え、キネティクス（滞在時間など）の情報も得られるようになり、インシ
リコ創薬の可能性が大きく広がると期待する。

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Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

I-07
ゼブラフィッシュ：基礎生物学から薬学・医学分野への応用まで
Zebrafish: from basic biology to applications in pharmaceutical and medical sciences
川上 浩一
Koichi Kawakami
国立遺伝学研究所・初期発生研究部門
Division of Molecular and Developmental Biology, National Institute of Genetics

期発生過程の観察が容易である等の特長をもつため、1980 年頃からモデル動物として研究に用いられてきた。1990 年代に化学変異原を用いた大規模な形態異常変異のスクリーニン
グが行われ、それ以降遺伝学的解析が可能なモデル脊椎動物として、世界中の研究者により用いられるようになった。しかしながら、新しいモデル動物であったために遺伝学的方法論の開発は十分ではなかった。
我々は、メダカ由来の Tol2 トランスポゾンを用いて、効率の良いトランスジェニックゼ
ブラフィッシュ作製法の開発に成功した。さらに、BAC トランスジェネシス法、遺伝子ト
ラップ法、エンハンサートラップ法、Gal4-UAS 法等の有用な遺伝学的方法論の開発に成功してきた。我々はこれらの方法論を用いて、大規模な遺伝子トラップスクリーンを行い、酵母転写因子 Gal4 を様々な細胞・組織・器官に特異的に発現するトランスジェニックゼブ
ラフィッシュを合計 1500 系統以上作製してきた。これらの系統を用いると、様々な細胞・器官・組織を可視化したり、それらの機能を自由自在に操作したりすることが可能になる。
我々は、このような方法論やトランスジェニックフィッシュリソースを駆使して、脊椎動物の行動を制御する機能的神経回路の研究を行い、リアルタイムで脳活動を画像化する
ことや、ゼブラフィッシュの恐怖が関わる学習行動に重要な働きをしている哺乳動物の扁桃体に相当する脳神経細胞を同定することに成功してきた。また、ゼブラフィッシュの発癌モデルの作製も試み、これにも成功して来た。
最近では、CRISPR-Cas9 法によるゲノム編集も可能になり、ゼブラフィッシュのモデル
脊椎動物としての重要性はますます増大している。本講演では、初期発生研究、器官形成研究等の基礎生物学研究からヒト疾患モデル作製、創薬スクリーニングなどの医学・薬学
分野の応用研究まで、世界中でさかんに用いられているゼブラフィッシュについて、我々自身の研究を中心に、最新の研究の動向を紹介する。

－ 37 －

招待講演

小型熱帯魚ゼブラフィッシュは、繁殖・大量飼育が容易である、胚が透明で胚操作や初I-08
腸内細菌叢をターゲットにした創薬の現状と可能性について
Gut bugs as drugs
金 倫基
Yun-Gi Kim
慶應義塾大学薬学部
Faculty of Pharmacy, Keio University
招待講演

ヒトの体に生息する細菌・真菌・ウイルスなどの微生物（マイクロバイオータ）は、長い進化の過程で我々と共生関係を構築してきた。その中で、腸内細菌叢は数百種類、100兆個以上もの細菌から構成されており、ヒトのマイクロバイオータの中でも最も大きな微生物集団である。ヒトの遺伝子の数は約 23,000 であることが知られているが、腸内細菌叢
全体の遺伝子数はその 100 倍の約 3,000,000 であると言われている。そのため、ヒトにはない、腸内細菌由来の多くの遺伝子からさまざまな代謝物が作られ、これらが我々の生理機能に影響を与えていても何ら不思議はない。実際に、培養法によらない解析技術（次世代シークエンサーを用いた 16S rDNA やメタゲノム解析、トランスクリプトーム・プロテ
オーム・メタボローム解析など）の進歩によって、腸内細菌の組成や代謝物を含めた腸内環境の全容をより詳細に知ることができるようになり、その結果、腸内細菌叢がこれまで考えられていた以上に我々の生理機能と強く関連していることが明らかになってきた。腸内細菌叢が「忘れられたもう一つの臓器」と言われるようになった所以でもある。さらに、
腸内マイクロバイオータの構成異常（ディスバイオーシス）が、さまざまな疾患と関連していることも次第に報告されるようになってきた。そのため、この共生体である腸内細菌を創薬ターゲットとする動きが活発になり、欧米では多くの製薬会社やバイオベンチャー
が開発に乗りだしている。しかし、腸内細菌の解析方法の統一化、腸内ディスバイオーシスと疾患との因果関係、腸内細菌叢（環境）の変換・改善方法、各腸内細菌およびその代
謝産物の機能解析など、創薬に向けて解決しなければならない課題がまだ多く残されている。そこで本講演では腸内細菌叢をターゲットにした創薬の現状と可能性について最新の知見と筆者の考えを交えながら解説する。

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Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

I-09
ヒト iPS 細胞由来神経細胞を用いた痙攣フェノタイプ評価法の開発に向けて
Toward the development of assessment methodology for seizure phenotypes using
human iPSC-derived neurons
宮本 憲優
Norimasa Miyamoto

近年複数の共同研究団体で、げっ歯類の初代培養神経細胞や人工多能性幹細胞（induced
pluripotent stem cell：iPS 細胞）由来神経細胞の電気生理学的活動を、微小電極アレイ（マルチエレクトロ―ド・アレイ：MEA）システムで記録することにより、薬物誘発痙攣リスクを評価する方法の開発が試みられている。ヒト iPS 細胞応用安全性コンソーシアム（CSAHi）の神経チーム、国立医薬品食品研究所を中心とした AMED 研究費プロジェクト“医薬品のヒトにおける痙攣誘発リスクを予測するヒト iPS 細胞由来神経細胞を用いた

in vitro 安 全 性 薬 理 評 価 法 開 発 に 関 す る 研 究 （ iNCENS ）、 及 び 米 国 Health andEnvironmental Sciences Institute（HESI）の NeuTox MEA Subteam といった共同研究
団体が、いずれも MEA データ解析結果から痙攣リスクを捉えるエンドポイントとなる指標を何にするのが良いかを模索しているところである。これらの団体は連携して議論ができる状況にあり、実験技術的ノウハウの議論に留まらず、今後非臨床試験結果から臨床を予測するための戦略的議論にまで発展していくことが期待される。神経細胞レベルでの痙攣指標として最も注目されていることが、シナプスを介した神経伝達に基づく神経活動の同期性をいかに数値化するかということである。痙攣誘発陽性薬が濃度依存的に異所神経細胞のバースト興奮の同期性を高めることが、電気生理学的波形から直感的に理解できるような状況でも、数値化して示すことは想像以上に困難である。MEA 記録データが膨大となることもあり、機械学習など人工知能（AI）の手法による異常神経活動検知のためのデータ解析方法を開発する試みが始まっている。MEA による神経活動の異常パターンを知るた
めには、てんかんなどの疾患特異的 iPS 細胞由来の神経細胞を用いることも有用であり、理化学研究所バイオリソース研究センターの細胞バンクに寄託された iPS 細胞株を利用することが可能である。また今年開所した、理化学研究所けいはんな地区 iPS 細胞創薬基盤
開発連携拠点の iPS 創薬基盤開発チームが、バイオリソース研究センターのバンクに寄託された iPS 細胞株の創薬に向けた基盤開発を行う予定である。

－ 39 －

招待講演

エーザイ株式会社
Eisai Co., Ltd.

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

－ 41 －

パネルディスカッション

パネルディスカッション

AI 創薬時代のレギュラトリーサイエンス
Regulatory Sciences in the AI-driven Drug Discovery Age

開催趣旨
近年、人工知能（artificial intelligence: AI）を活用した新技術が活発に検討されており、創薬の現状の様々な問題点を革新できる新たなパラダイムとして期待されている。実際、国策として AI の活用を積極的に推進しており、内閣府の「未来投資戦略 2018」（平成 30年 6 月 15 日閣議決定）において、AI 技術等を活用して開発された革新的医薬品等について早期承認に向けた審査・調査体制整備を進める、と明記された。また、厚生労働省から
パネルディスカッション

も「保健医療分野における AI 活用推進懇談会」の報告書が公表されており、日本におけるAI 開発の現状の分析をもとに、保健医療分野において AI を活用すべき領域や、AI の活用にあたっての基盤構築、AI の有効性・安全性の確保について検討などがまとめられている。
さらに、産業界においても AI に関して様々なコンソーシアムが発足している。
このように、産官学において、創薬プロセスに向けた AI 技術の実用化は着々と進んでいる状況である。
創薬プロセスをもとに AI の活用法を考える場合、医薬品候補化合物の探索に関しては、
リード化合物の最適化やモデリング＆シミュレーション、タンパク質などとの相互作用の解析、薬理作用の予測など多岐にわたるアプローチがあげられる。特に、大量のデータか
ら単純に規則性や関連性を見出すだけではなく、複雑なデータから有効な化合物の組み合わせの予測、より有効性の高い化合物の設計や構造の最適化、高精度のシミュレーションなどに対する活用が進行中である。
また、非臨床試験以降のプロセスに関しては、申請電子データやリアルワールドデータ
における AI の活用も大きなポイントである。本年より、独立行政法人医薬品医療機器総合機構（PMDA）により MID-NET（Medical Information Database Network）の運用が開始され、製造販売後の安全対策の高度化などに向けて大きく動き出した。東北メディカル・
メガバンク事業や産学連携がんゲノムスクリーニングプロジェクト等により我が国において健常人や患者由来のゲノム情報も集積されてきている。今後、疾患登録情報などを用いて効率的な臨床研究や治験が実施できる環境を整備することにより、研究開発から安全対策までの一連の過程で大規模なリアルワールドデータの活用を推進できることが期待される。
一方、医薬品等の承認審査や安全対策などにどの程度 AI を活用できるのかはまだ現時点では明らかになっていない。例えば、学習させるデータの質をどう担保するのか、データベースのオープン化は可能なのか、どのように検証を進めるべきか、など多数の課題が残されている。そのためにも、まずは AI の現状を理解し、今後の課題の抽出や将来への展望について議論を深める必要がある。
そこで本シンポジウムでは、「AI 創薬時代のレギュラトリーサイエンス」と称して、創薬プロセスについて AI 技術の利活用を産官学で議論することを企画し、第一線で活躍されているパネリストを招聘した。将来的に、AI による医薬品の安全性評価などレギュラトリー
サイエンスに役立てるための戦略を議論したい。

－ 42 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

座長
諫田 泰成

（国立医薬品食品衛生研究所 薬理部）

パネリスト
（理化学研究所）

片倉 晋一（第一三共 RD ノバーレ株式会社）

田中 博（東京医科歯科大学／東北メディカル・メガバンク機構）

西島 正弘（国立医薬品食品衛生研究所 名誉所長）

宇山 佳明（独立行政法人医薬品医療機器総合機構、PMDA）－ 43 －

パネルディスカッション

本間 光貴

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

SS-01～SS-03

SS-01
国立研究開発法人 日本医療研究開発機構「AMED 創薬支援推進事業『創薬支援インフォマティクスシステム構築』」
SS-02
国立研究開発法人 日本医療研究開発機構「バイオバンクの利活用促進と倫理的・法的・社会的課題（ELSI）」
SS-03
株式会社ツムラ「漢方ミクス（KAMPOmics）-超多成分系のインフォマティクス-」－ 45 －

10/9
16:00-17:30

10/10
16:00-17:30

10/11
13:30-15:30

福寿桃源

福寿桃源

平安

スポンサードセッション

スポンサードセッションスポンサードセッション－ 46 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

医薬品創出に向けた新しい形の
！
す
ま
し
供
提
を
ト
ー
ポ
サ
ムレスな支援

アイデア

標的検証

応用研究

前臨床開発

「創薬ブースター」は、アカデミア研究者からの独創的で新しいアイデアを求めています。若手からの提案、大歓迎です！
経験豊富な創薬コーディネーターが以下のような項目を知識・技術・予算でサポートします！
• 研究戦略の策定• 創薬標的のバリデーション• ハイスループット
スクリーニング• 化合物などの最適化• 薬効試験
• 安全性試験• 知財戦略の策定、特許出願• 企業導出支援• 医師主導治験への橋渡し

詳しくはこちらをご覧ください。
www.amed.go.jp/program/list/06/03/001_01-01.html

国立研究開発法人日本医療研究開発機構 創薬戦略部 創薬企画・評価課－ 47 －

スポンサードセッション

けたシー
向
に
化
用
実
の
薬
創
ア
アカデミ

66

日時：  年  月  日 
場所：  階 福寿・桃源バイオバンクの利活用促進と倫理的・法的・社会的課題（(/6,）
$FWLYH8WLOL]DWLRQRI%LREDQNVDQGLWV(WKLFDO/HJDODQG6RFLDO,VVXHV (/6, スポンサードセッション
開催趣旨：
国立研究開発法人日本医療研究開発機構（$0('）では、３大バイオバンク（バイオバンク・ジャパン（%%-）／東北メディカル・メガバンク計画（東北 00）／ナショナルセンター・バイオバンクネットワーク（1&%1））に加え、中核的な大学病院等のバイオバンクのネットワーク化を推進することにより、試料・ 
情報の利活用を促進する環境を整備し、オールジャパンのプラットフォームの構築を目指す事業「ゲノム医療実現推進プラットフォーム事業（ゲノム研究プラットフォーム利活用システム ）」を本年度より推進する。  
本事業では、バイオバンクが共通して抱える (/6,（(WKLFDO/HJDODQG6RFLDO,VVXHV：倫理的・法的・社会的課題）についても検討を行うことで、研究に必要な試料・情報の横断的検索や関連情報の取得や
バイオバンクを活用したゲノム医療研究の促進、ゲノム医療実現化への導出が滞りなく、円滑に図られることを期待している。
 そこで本セッションでは、医療研究開発の成果を着実に社会還元するために必要な社会的基盤整備の 
一環として、バイオバンクの利活用促進と倫理的・法的・社会的課題について参加者全員と共有するとともに、解決に向けての議論を深めることにしたい。


モデレーター： 増井  徹  7RUX0DVXL慶應義塾大学 医学部 臨床遺伝学センター                           &HQWHUIRU0HGLFDO*HQHWLFV.HLR8QLYHUVLW\6FKRRORI0HGLFLQH勝井 恵子 .HLNR.DWVXL

国立研究開発法人日本医療研究開発機構（$0('）基盤研究事業部 バイオバンク課'LYLVLRQRI%LREDQN'HSDUWPHQWRI5HVHDUFK,QIUDVWUXFWXUH               -DSDQ$JHQF\IRU0HGLFDO5HVHDUFKDQG'HYHORSPHQW（$0('） ゲノム医療実現推進のためのバイオバンク利活用促進に向けたバイオバンク・ネットワーク構
築と運用支援に関する研究開発


5HVHDUFKDQG'HYHORSPHQWRI%LREDQN1HWZRUNDQG2SHUDWLRQDO6XSSRUWIRU
3URPRWLRQRI8WLOL]DWLRQRI%LREDQNWRZDUG5HDOL]DWLRQRI*HQRPLF0HGLFLQH

荻島 創一   6RLFKL2JLVKLPD






東北大学 東北メディカル・メガバンク機構
7RKRNX8QLYHUVLW\7RKRNX0HGLFDO0HJDEDQN2UJDQL]DWLRQ（7R00R）






京都大学 医学研究科 創薬医学講座
'HSDUWPHQWRI'UXJ'LVFRYHU\0HGLFLQH*UDGXDWH6FKRRORI0HGLFLQH.\RWR8QLYHUVLW\ 診療機関併設バイオバンクのネットワーク参画
 +RVSLWDOEDVHGFOLQLFDOELREDQNQHWZRUNSURMHFW  鶴山 竜昭   7DWVXDNL7VXUX\DPD 倫理的・法的・社会的側面からみたバイオバンク資源利活用促進戦略

 6WUDWHJ\WR(QKDQFH8WLOL]DWLRQRI%LREDQN5HVRXUFHYLD(WKLFDO/HJDODQG6RFLDO







$SSURDFK吉田 雅幸   0DVD\XNL<RVKLGD

東京医科歯科大学 統合研究機構 生命倫理研究センター
/LIH6FLHQFHDQG%LRHWKLFV5HVHDUFK&HQWHU5HVHDUFKDQG,QGXVWU\8QLYHUVLW\$OOLDQFH
2UJDQL]DWLRQ7RN\R0HGLFDODQG'HQWDO8QLYHUVLW\

全体討論：バイオバンクの利活用促進と倫理的・法的・社会的課題（(/6,）

*HQHUDO'LVFXVVLRQ：$FWLYH8WLOL]DWLRQRI%LREDQNVDQGLWV(WKLFDO/HJDODQG6RFLDO,VVXHV
(/6, 
－ 48 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

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「0*H1'」疾患バリアントデータベース
紹介と登録のお願い

遺伝子名・変異名等からのデータベース検索

ᵫᵥᶃᶌᵢ トップページ&OLQ9DU等の他'%でのエントリー情報

遺伝子名、変異名からの検索

疾患領域からの検索

日本人での頻度情報
関連する疾患（疾患横断的情報）、薬剤、遺伝子情報

0*HQ'登録者によるアノテーション情報
計算によって推定された
アノテーション情報

また、$0('では引き続き全国の研究者の先生方から疾患バリアントデータの0*H1'への登録をお願い
しております。具体的に登録をお願いしているデータは、疾患名、バリアントの位置と変異及び可能な範囲での
年齢・性別情報です。学術論文や報告書等既に発表済みのデータや、未発表でも研究に参加いただいている方からデータベースでの公開や論文発表に対する同意が取得できている場合には登録いただけます。国内外の人々の健康向上のために、ぜひご協力いただけますと幸いです。
登録していただける方は0*H1'登録管理委員会（GEMLPX#KRVSQFJPJRMS）にご連絡ください。
登録を検討していただける方も、また上記の条件等に当てはまらない場合でも、まずはお気軽に0*H1'登録委員会へお問い合わせください。データ変換やキュレーションについても適宜ご相談の上、可能な限り対応させていただきます。どうぞよろしくお願い申し上げます。

【0*H1'に関する問合せ】 $0('基盤研究事業部 バイオバンク課
電話： ／ (PDLOJHQRPHGE＠DPHGJRMS－ 49 －

スポンサードセッション

疾患の原因究明や治療法の開発に遺伝情報が欠かせない昨今、日本人の疾患関連遺伝子の情報をなるべく多く収集し、臨床現場に還元していくことが求められております。
$0('の臨床ゲノム情報統合データベース整備事業では、「希少・難治性疾患領域」、「がん領域」、「感染症領域」、「認知症その他領域」の研究班でクリニカルシークエンスやゲノム解析を進め、疾患感受性が確定したバリアント
情報をデータシェアリングし利活用を促進する研究を推進しています。この度アノテーションされた疾患バリアント情報を格納する疾患バリアントデータベース 45コードからもアクセスできます
0*H1'を開発し、公開を開始いたしました。
登録された情報は、&OLQ9DUなどの他のデータベースでの3DWKRJHQLFLW\の程度も付加して表示しております。
また、バリアントデータを疾患横断的に検索することも可能であり、臨床現場において患者さんの診断の精度を高めるために参照いただくことを目指しております。
ぜひ0*H1'（KWWSVPJHQGPHGN\RWRXDFMS）にアクセスし、データベースをご体感ください。

（株）ツムラ スポンサードセッション

漢方ミクス（.$032PLFV）超多成分系のインフォマティクス
日時： 年  月  日（木） ～
会場：タワーホール船堀（東京）) 平安の間
座長：広川貴次（産業技術総合研究所）、有田正規（国立遺伝学研究所）

漢方薬は日本で独自の発展を遂げた漢方医学を元に様々な疾患に対して処方されており、現代の日本の医療に不可欠な存在となっている。漢方薬の臨床上の有用性は明らかとなりつつある
ものの、その作用機序や漢方医学の概念については依然として不明な部分が多い。一つの漢方スポンサードセッション

薬には数千を超える成分が含まれ（右ページ図の ,）、しかもこれらは服用後生体内で多様な変換を受ける（,,）。これらの成分は多彩な標的分子に作用し（,,,）、漢方薬の最終的な薬効はこ
れらの綜合的作用としてもたらされる（,9）。このため、漢方薬の解明に対して、主に単一成分についての解析手法として発展してきた従来の薬理学的・生物学的研究手法の限界は明らかである。このような薬剤の解明には、含有成分／活性成分及び生体に与える影響の包括的・網羅的解析が不可欠であり、マルチオミクスや 06 データからの化合物構造推定、LQ VLOLFR シミュ
レーションによる生物活性予測、漢方薬・生薬・天然物データベース 等を駆使し、またそれらをシステムバイオロジーによって統合的に理解することが必要である。情報解析技術の驚異的な進展は、かつては夢物語であったこのような研究アプローチを現実のものとしつつある。本
セッションでは、マルチオミクスによる漢方薬の成分・薬理研究へのバイオインフォマティク
ス、計算機科学の適用による統合的な解析の取り組みや関連するデータベース・データリポジ
トリなど技術基盤について共有し、漢方薬のような超多成分系を「科学する」ための展望を論じる。
【プログラム】
66ターゲット／ノンターゲット・メタボロミクスが拓く漢方薬の薬物動態研究
花﨑和弘（高知大学）
 66漢方薬の作用の包括的解析新しい抗炎症作用のかたち西明紀（ツムラ）
 66抱合体、フラボノイドの網羅的解析手法の紹介とその応用
櫻井望（国立遺伝学研究所）
 66漢方薬由来成分の LQVLOLFR活性予測
大渕 勝也（ツムラ）

66システムバイオロジーによる漢方薬研究の脱構築
松岡由希子（システム・バイオロジー研究機構）

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Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

漢方ミクス（KAMPOmics）

スポンサードセッション


関連データベース・データリポジトリ 0HWDERORPLFVMS KWWSPHWDERORPLFVMSZLNL0DLQB3DJH  )ODYRQRLG6HDUFK KWWSVZZZQDWXUHFRPDUWLFOHVV  .1$S6$F. KWWSNDQD\DQDLVWMS.1$S6$F.B)DPLO\  .(**0(',&86 KWWSVZZZNHJJMSNHJJPHGLFXV  和漢薬 :LNL データベース KWWSZDNDQNHQVDNXLQPXWR\DPDDFMSZLNL0DLQB3DJH  薬用植物総合情報データベース KWWSPSGEQLELRKQJRMS  伝統医薬データベース KWWSGHQWRPHGWR\DPDZDNDQQHW － 51 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

企画シンポジウム
企画シンポジウム

高機能細胞デバイスを用いた生体模倣モデルの開発－国内産官学連携による国際競争への挑戦－

10/10
14:00-15:30

平安国立研究開発法人日本医療研究開発機構「創薬等先端技術
10/10
支援基盤プラットフォーム」
14:00-15:30「AMED/BINDS インシリコユニットにおける創薬支援研究」 16:00-17:30

小ホール

10/10
ヒト iPS 細胞技術を用いた医薬品の新たな評価法の開発－国際標準化に向けた取り組み－
16:00-17:30

平安「毒性関連ビッグデータを用いた人工知能による次世代型安全性予測手法開発プロジェクト（AI-SHIPS プロジェクト）」

瑞雲－ 53 －

10/10
16:00-17:30

日時： 2018 年 10 月 10 日 14:00-15:30
場所： 2 階 平安

高機能細胞デバイスを用いた生体模倣モデルの開発－国内産官学連携による国際競争への挑戦－
Development of in vitro human body/tissue-mimicing model using high functional
cell devices- The challenge to global competition based on collaboration between industry,
government and academia in Japan 開催趣旨：

企画シンポジウム

近年、細胞の高機能化研究領域における競争は益々激しさの様相を呈している。特に、それら高機能性細胞のクラスターまたはオルガノイド化されたいわゆる “ミニ臓器” をデバイス上に搭載し、マイクロ流路で連結すること
で生体を模倣する in vitro システムは、動物試験を主としてきた医薬品/化粧品開発における次世代の評価系として、製薬メガ企業をはじめとして、世界のライフサイエンス業界がその研究の動向に注目している。本領域における国際競争の激化は凄まじく、先日、マサチューセッツ工科大学の研究チームが、大学機関紙 MIT News
(http://news.mit.edu/) 上で、最大 10 個までの臓器をマイクロ流路で連結した in vitro モデル、いわゆる“Human/Organs-on-a chip” を作成し、薬物応答をドナー由来の臓器間で網羅的に評価できるプラットフォームの開発に成功したと発表した。iPS 細胞という世界に誇る細胞機能化の大発見を生み出した我が国であるが、細胞システムの応用研究領域では世界に後塵を拝する状況であることは否めない。昨年度、この国際競争に挑むべくAMED 事業として発足した「再生医療技術を応用した創薬支援基盤技術の開発」プロジェクトでは、国内の官庁、アカデミアおよび企業が参画し、その英知を集結させて研究開発を推進する体制を整えた。当事業は、高機能細胞デバイスを用いた生体模倣モデル（Microphysiological System （以降、MPS））の開発をテーマとし、その究極の目的は、細胞・デバイスの開発者と企業のニーズを綿密にマッチさせ、徹底的に実用化研究に絞ることで、医薬品/化粧品開発研究戦略に真のブレークスルーをもたらそうとするものである。本セッションでは、当事業に参画する
各方面の代表者を招いて講演頂き、世界的動向を鑑みながらも、国内における高機能細胞デバイス開発への試みの現状と今後の展望について議論する。

モデレーター：

平林 英樹 Hideki Hirabayashi
武田薬品工業株式会社

1. ウェット in-vivo シミュレーターとしての MPS (Microphysiological System) への期待

Microphysiological Systems (MPS) as a Promising Wet Human-in-vivo Simulator

金森 敏幸
Toshiyuki Kanamori
産業技術総合研究所創薬基盤研究部門
Biotechnology Research Institute for Drug Discovery, National Institute of Advanced Industrial Science andTechnology

5 年ほど前に世界中を驚かせたいわゆる”Human-ion-a-chip”に関する米国の大型国家プロジェクトは、NIH 傘下の NCATS (National Center for Advancing Translational Sciences)が FDA と密接に連携しながら主導し、より現実的なMPS (Microphysiological System)の実用化へと大幅に軌道修正された。MPS とは、マイクロプロセスで精密に制御した環境下でヒト細胞を培養することにより、既存技術では期待できなかった高次な in vivo 機能を in vitro で発現させる技術体系を指す。我が国でも遅ればせながら昨年秋に AMED が MPS 開発を目的とした研究開発事業をスタートさせた。この事業では、ユーザーニーズを如何に引き出し、どの様にビジネス化するかが、成否の鍵となっている。解決すべき具体的な技術要素としては、①細胞の調達、②in vivo 機能の誘導、③培地灌流技術、④readout（検出技術の実装）、⑤チップ製造技術、が挙げられるが、この認識は NCATS でも全く同じである。我が国ではあまり問題とされてこなかったチップ材料の選択等、チップ製造技術について、ファーマのユーザーや biologist などにも認識されていることに驚かされる。MPS 開発もバイオ分野のいつもの構図、欧米対日本となっており、我が国の国際的プレゼンス確保のために、オールジャパン体制で推進しているところである。

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Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

2. 技術組合という活動形態による、最終成果への Roadmap と Commitment

Roadmap and Commitment to Put Cutting-edge Technology into Practical Use
utilizing Activities at Technology Research Association.
赤羽 隆文 Takafumi Akabane

幹細胞評価基盤技術研究組合
Stem Cell Evaluation Technology Research Association
医薬品の研究開発において、ヒトにおける薬理活性不足や毒性が要因で開発中止に至る事例は依然として大きな割合を占めている。これらの課題に対し、高機能性細胞をデバイスに搭載した MPS の関連技術に期待が高まっている。本会では、アカデミアや企業が持つ技術を相互利用して事業化に向けた共同研究を実施する技術組合の活動形態を活用することで、MPS にかかる研究成果を動物実験や従来の in vitro 試験に代わる創薬評価ツールとしてどのように実用化につなげ、創薬研究における開発中止リスク低減に貢献できるのかについて、産学連携研
究体制の在り方、創薬研究従事者から技術開発への期待、および創薬ニーズと技術のマッチングを中心に議論したい。

3. 企業との連携による MPS 用デバイスと細胞の創出
Creation of device and cells for MPS (Microphysiological System) throughcooperation with companies
松永 民秀 Tamihide Matsunaga

名古屋市立大学大学院薬学研究科
Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Nagoya City University

4. 製薬企業の視点から MPS への期待と提言

Future capability of MPS from a perspective of pharmaceutical industry
小森 高文 Takafumi Komori

エーザイ株式会社 筑波研究所 薬物動態室
Drug Metabolism and Pharmacokinetics, Tsukuba, Eisai Co., Ltd.
製薬企業では、高質な開発候補品を効果的・効率的に創出し、精度良くヒトでの薬効・毒性・体内動態を定量的に予測することは、医薬品開発の成功確度の向上のみならず、臨床開発の期間短縮ならびにコスト削減にも繋がる極めて重要なミッションの一つである。しかしながら、従来の動物や in vitro ヒト試料を用いたモデルでは、種差あるいは生体の高次機能性、複雑な生理学的環境を再現できていない課題がある。MPS は、マイクロ流路によるメカニカルな刺激を 2D あるいは 3D 培養細胞・組織に与え、生体の高次機能をより模倣した、細胞工学と細胞培養技術が融合された in vitro モデルとして、その有用性検証が数多く報告され、近年、実用化・商品化に向け目覚ましい進展を遂げている。本発表では、企業におけるヒト PK 予測での既存評価モデルの課題・ニーズと共に、
Liver-, Gut-, Kidney- or BBB-MPS の薬物動態・毒性評価への期待を紹介する。また、医薬品開発でのスクリーニン
グ評価、translational biomarker 探索、定量的 PK/PD 予測における応用実現性含め、MPS の学際的な将来展望にも言及したい。

－ 55 －

企画シンポジウム

MPS は、生体を模倣した in vitro 系により、薬物動態等のより正確な予測を行うことが期待されている。しかし、精度を上げるにはデバイスだけでなく、使用する細胞が適切でなければならない。また、研究者が独自の解釈のみで開発を行った場合、自己満足に陥る恐れがある。我々は、生体試料として入手することが極めて困難な小腸上皮細胞をヒト iPS 細胞から分化誘導する方法を見出し、より良い細胞を安定供給するため企業と連携して開発している。一方、デバイスはプラスチック容器製造を専門とする企業と連携し、設計から作製まで共同研究を通じて互いの専門性を活かしながら開発を進めている。また、デバイスと細胞の評価は、ユーザーとして期待される製薬企業との連携で行っている。昨年から国家プロジェクトが始まり、多くの専門家あるいは企業が連携することで、さらに優れた製品の開発が期待される。

㻌
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日時：㻌 㻞㻜㻝㻤 年 㻝㻜 月 㻝㻜 日㻌 㻝㻠㻦㻜㻜㻙㻝㻡㻦㻟㻜㻌㻌㻌
場所：㻌 㻡 階㻌 小ホール㻌

㻝㻢㻦㻜㻜㻙㻝㻣㻦㻟㻜㻌㻭㻹㻱㻰㻛㻮㻵㻺㻰㻿 インシリコユニットにおける創薬支援研究㻌㻾㼑㼟㼑㼍㼞㼏㼔㻌㼍㼏㼠㼕㼢㼕㼠㼕㼑㼟㻌㼒㼛㼞㻌㼟㼡㼜㼜㼛㼞㼠㼕㼚㼓㻌㼐㼞㼡㼓㻌㼐㼕㼟㼏㼛㼢㼑㼞㼥㻌㼎㼥㻌㼕㼚㻙㼟㼕㼘㼕㼏㼛㻌㼡㼚㼕㼠㻌㼛㼒㻌㻮㻵㻺㻰㻿㻌㻔㻭㻹㻱㻰㻕㻌㻌
開催趣旨：㻌
平成 㻞㻥 年 㻠 月より 㻭㻹㻱㻰 のプロジェクト「創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業」が開始されました。本プ
ロジェクトでは、医薬品等の実用化に向けて、構造解析、タンパク質生産、ケミカルシーズ・リード探索、構造展開、
ゲノミクス解析、インシリコスクリーニングなどの技術を有する最先端研究者の支援により、外部研究者の研究推進を強力にバックアップしています。本事業は、㻡 つのユニットから構成されており、インシリコユニットは、その一つとして、計算科学や情報科学の最新の技術を駆使して、分子・細胞レベルから創薬・医療・生命科学等の重要課
題に取り組む研究の支援と高度化を行っています。本セッションでは、これまでのインシリコユニットの支援・高度化研究の成果を通じて、より多くの皆様に本事業を知っていただき、インシリコ技術の活用の機会を見つけていた
だくことを目的としています。㻌
㻌

モデレーター：㻌 広川貴次㻌 㻌 㼀㼍㼗㼍㼠㼟㼡㼓㼡㻌㻴㼕㼞㼛㼗㼍㼣㼍㻌
産業技術総合研究所㻌 創薬分子プロファイリング研究センター㻌 㼙㼛㼘㼜㼞㼛㼒㻘㻌㻭㻵㻿㼀㻌
㻌
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㻝㻚 㻮㻵㻺㻰㻿 インシリコユニットの紹介㻌
企画シンポジウム㻌田中㻌 成典㻌 㻌 㻌 㻿㼔㼕㼓㼑㼚㼛㼞㼕㻌㼀㼍㼚㼍㼗㼍㻌 （インシリコユニット 㻼㻻）㻌㻌㻌
㻌

神戸大学㻌 大学院㻌 システム情報学研究科㻌 㻳㼞㼍㼐㼡㼍㼠㼑㻌㻿㼏㼔㼛㼛㼘㻌㼛㼒㻌㻿㼥㼟㼠㼑㼙㻌㻵㼚㼒㼛㼞㼙㼍㼠㼕㼏㼟㻘㻌㻷㼛㼎㼑㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌㻞㻚 タンパク質の複合体構造・分子間相互作用・ダイナミクス・機能の予測と解析㻌㻌森脇㻌 由隆 㻝、清水謙多郎 㻝㻘㻞、寺田㻌 透 㻝㻘㻞㻌 㻌 㼅㼛㼟㼔㼕㼠㼍㼗㼍㻌㻹㼛㼞㼕㼣㼍㼗㼕㻘㻌㻷㼑㼚㼠㼍㼞㼛㻌㻿㼔㼕㼙㼕㼦㼡㻌㼍㼚㼐㻌㼀㼛㼔㼞㼡㻌㼀㼑㼞㼍㼐㼍㻌 㻌㻌㻝 東京大学大学院農学生命科学研究科 㻳㼞㼍㼐㼡㼍㼠㼑㻌㻿㼏㼔㼛㼛㼘㻌㼛㼒㻌㻭㼓㼞㼕㼏㼡㼘㼠㼡㼞㼍㼘㻌㼍㼚㼐㻌㻸㼕㼒㼑㻌㻿㼏㼕㼑㼚㼏㼑㼟㻘㻌㼀㼔㼑㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌㼛㼒㻌 㻌㼀㼛㼗㼥㼛㻌
㻞㻌 東京大学大学院情報学環㻌 㻵㼚㼠㼑㼞㼒㼍㼏㼡㼘㼠㼥㻌㻵㼚㼕㼠㼕㼍㼠㼕㼢㼑㻌㼕㼚㻌㻵㼚㼒㼛㼞㼙㼍㼠㼕㼛㼚㻌㻿㼠㼡㼐㼕㼑㼟㻘㻌㼀㼔㼑㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌㼛㼒㻌㼀㼛㼗㼥㼛㻌㻌㻌㻟㻚 分子動力学計算による構造生物学データを活用した構造ダイナミクス研究㻌㻌

池口㻌 満徳㻌 㻌 㻌 㻹㼕㼠㼟㼡㼚㼛㼞㼕㻌㻵㼗㼑㼓㼡㼏㼔㼕㻌㻌㻌

横浜市立大学㻌 生命医科学研究科㻌 㻳㼞㼍㼐㼡㼍㼠㼑㻌㻿㼏㼔㼛㼛㼘㻌㼛㼒㻌㻹㼑㼐㼕㼏㼍㼘㻌㻸㼕㼒㼑㻌㻿㼏㼕㼑㼚㼏㼑㻘㻌㼅㼛㼗㼛㼔㼍㼙㼍㻌㻯㼕㼠㼥㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌㻠㻚 タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス
研究㻌
富井健太郎㻌 㻌 㻌 㻷㼑㼚㼠㼍㼞㼛㻌㼀㼛㼙㼕㼕㻌㻌㻌

産業技術総合研究所㻌 人工知能研究センター㻌 㻭㼞㼠㼕㼒㼕㼏㼕㼍㼘㻌㻵㼚㼠㼑㼘㼘㼕㼓㼑㼚㼏㼑㻌㻾㼑㼟㼑㼍㼞㼏㼔㻌㻯㼑㼚㼠㼑㼞㻘㻌㻭㻵㻿㼀㻌㻌㻡㻚 生薬データベースの高度化と構造創薬への応用㻌
金谷㻌 重彦㻌 㻌 㻌 㻿㼔㼕㼓㼑㼔㼕㼗㼛㻌㻷㼍㼚㼍㼥㼍㻌㻌㻌

奈良先端科学技術大学院大学㻌 先端科学技術研究科㻌 㻳㼞㼍㼐㼡㼍㼠㼑㻌㻿㼏㼔㼛㼛㼘㻌㼛㼒㻌㻵㼚㼒㼛㼞㼙㼍㼠㼕㼛㼚㻌㻿㼏㼕㼑㼚㼏㼑㻘㻌㻺㻵㻿㼀㻌㻢㻚 大規模分子シミュレーションによるインシリコスクリーニング支援と構造インフォマティクス
技術の高度化㻌関嶋㻌 政和㻌 㻌 㻌 㻹㼍㼟㼍㼗㼍㼦㼡㻌㻿㼑㼗㼕㼖㼕㼙㼍㻌㻌㻌
㻌

東京工業大学㻌 情報理工学院㻌 㻭㼐㼢㼍㼚㼏㼑㼐㻌㻯㼛㼙㼜㼡㼠㼍㼠㼕㼛㼚㼍㼘㻌㻰㼞㼡㼓㻌㻰㼕㼟㼏㼛㼢㼑㼞㼥㻌㼁㼚㼕㼠㻘㻌㼀㼛㼗㼥㼛㻌㻵㼚㼟㼠㼕㼠㼡㼠㼑㻌㼛㼒㻌㼀㼑㼏㼔㼚㼛㼘㼛㼓㼥㻌㻣㻚 創薬等ライフサイエンス研究を促進する研究支援とデータサイエンス㻌
由良㻌 敬㻌 㻌 㻌 㻷㼑㼕㻌 㼅㼡㼞㼍㻌㻌㻌

早稲田大学㻌 理工学術院㻌 㻲㼍㼏㼡㼘㼠㼥㻌㼛㼒㻌㻿㼏㼕㼑㼚㼏㼑㻌㼍㼚㼐㻌㻱㼚㼓㼕㼚㼑㼑㼞㼕㼚㼓㻘㻌㼃㻭㻿㻱㻰㻭㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌－ 56 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

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様々なインシリコ技術があなたの研究を支援いたします！

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㻮㻵㻺㻰㻿 は事業に参加する研究者が「外部研究者の皆様の研究が進むようにお手伝いする」事業です。㻌
外部研究者は、原則として無償で支援を受けることができます。㻌
まずは、ワンストップ窓口からコンサルティングの申請を行ってください。申し込みは、㼚㼛㼚㻙㼏㼛㼚㼒㼕㼐㼑㼚㼠㼕㼍㼘 情報で行っていただきます。コンサルティング開始以降は、ご相談内容、研究内容はご希望に応じて秘匿されます。㻌㻮㻵㻺㻰㻿 の支援を受けられた成果は、原則として公開をお願いします。成果公開の時期についてはご相談ください。㻌

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日時： 2018 年 10 月 10 日 16:00-17:30
場所： 2 階 平安

ヒト iPS 細胞技術を用いた医薬品の新たな評価法の開発－国際標準化に向けた取り組み－
Development of drug safety assessment using human iPS cell technology- The challenge toward global standardization 開催趣旨：
ヒト iPS 細胞の技術開発により、今まで入手が困難だったヒト細胞が in vitro 試験系に利用できることから、再生医療に加えて創薬への応用が大変注目されている。特に、ヒト iPS 細胞由来分化細胞を用いてヒトにおける安全性の予測性を更に高めることができれば、医薬品開発の効率化やコスト削減、被験者の安全性確保など創薬プロセスの変革が実現できる。政府の「健康・医療戦略」（2013 年 6 月 14 日）にも、「新薬開発の効率性の向上を図るた
め、iPS 細胞を用いた医薬品の安全性評価システムを開発する」と掲げられている。
ヒト iPS 細胞の実用化には、産官学が連携して一体となって評価法を開発して国際的なバリデーション（評価法の再現性、信頼性、妥当性の検証）を行うことが重要である。現在、ヒト iPS 細胞の応用は心臓安全性評価への実用が最も進んでおり、さらに心筋を先行モデルとして神経細胞や肝細胞など他の臓器細胞への期待も大きく、国立衛研が中心となり精力的に取り組んでいる。日本のプレゼンスを示しながらバリデーション研究を推進すること
により科学的根拠を取得して、国際協調のもと新たな評価法の提案を目指す必要がある。
本セッションでは、ヒト iPS 細胞を用いた新しい安全性評価法の開発と国際標準化を行う「レギュラトリーサイエンス」の研究を紹介し、今後の展望を議論したい。

企画シンポジウム

モデレーター：

諫田 泰成
Yasunari Kanda
国立医薬品食品衛生研究所 薬理部

1. ヒト iPS 細胞由来心筋細胞を用いた催不整脈作用の評価法の開発：JiCSA と CiPA の国際
協調
Development of proarrhythmia risk assessment using iPS cell-derived cardiomyocytes: international
collaboration between JiCSA and CiPA
Yasunari Kanda
諫田 泰成
国立医薬品食品衛生研究所 薬理部
Division of Pharmacology, NIHS
医薬品の心臓に対する安全性は QT 間隔延長作用をもとに評価されている。日米 EU 医薬品規制調和国際会議（ICH）のガイドラインでは、非臨床試験で hERG チャネル発現細胞を用いた評価ならびに大動物の心電図（QT/QTc
間隔）の評価を行い（S7B）、臨床試験で Through QT 試験が不整脈のサロゲートマーカーとして心電図の QT 間隔
延長作用を検証している（E14）。ガイドライン施行後、医薬品による致死的不整脈 torsade de pointes（TdP）の発生のために市場から撤退した実例はなく、ガイドラインにより被験者を TdP のような重篤な不整脈から守るという観点では一定の成功をおさめた。しかしながら、hERG 試験の結果は TdP 発生リスクと一致しないこと、QT 延長は TdP
発生リスクとは異なること、hERG 試験は偽陽性が多く有用な医薬品候補化合物の開発が中止にいたる可能性などが指摘されており、催不整脈作用のリスク評価としてはまだ不十分で改善の余地があると考えられる。
このような背景のもと、政府の「健康・医療戦略」において「iPS 細胞技術を応用した医薬品心毒性評価法の国際標準化への提言」が 2020 年頃までの達成目標として掲げられた。国立衛研が中心となり産官学オールジャパン
体制のコンソーシアムである JiCSA (Japan iPS Cardiac Safety Assessment) を結成し、多点電極アレイ（MEA）システ
ムを用いて催不整脈作用を検出するプロトコルを整備し、多施設間で検証を行った。また、海外においても、米国
FDA が 中心 とな り、 医薬品 の 心臓安 全性 評価に おける 新 規パラ ダイ ム とし て 統 合的な 心毒性 評価 CiPA（Comprehensive in vitro proarrhythmia assay）が提案され、ヒト iPS 細胞由来心筋細胞を用いた国際バリデーション
試験が実施され、日本からも参加した（現在、論文投稿中）。さらに、JiCSA と CiPA のデータセットを比較して試験法の再現性や信頼性などを検証中で、日米 EU 医薬品規制調和国際会議 S7B ガイドライン改訂を視野に入れた議論が本格化している。
本講演では、ヒト iPS 細胞由来心筋細胞を用いた安全性薬理試験法の開発および国際標準化に向けたオール
ジャパンの取り組みを概説し、今後の展望を議論したい。

－ 58 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

2. iPS 細胞から分化誘導したヒト神経細胞を用いた安全性薬理試験開発の取り組み
Attempts to develop non-clinical safety assessment systems using human neurons differentiated from iPS cells
佐藤 薫 Kaoru Sato
国立医薬品食品衛生研究所 薬理部
Division of Pharmacology, NIHS
動物実験で有望とされた新薬が、ヒトにおいて臨床的有意差を得るのは容易ではない。さらに、新薬開発において、神経系の副作用が臨床試験以降の開発後期にようやく明らかとなることも少なくない。臨床試験の潜在的リスクを低減し開発コストの莫大な損失を避けるために、非臨床安全性試験のヒト予測性向上が望まれる。そこで今、倫理的な垣根を越えたヒト神経細胞として注目されているのが、ヒト iPS 細胞から分化誘導した神経細胞（hiPSC-neuron）である。我々は、hiPSC-neuron を使った in vitro 評価系でどのような中枢神経系リスク予測ができるかという課題に取り組むため、2014 年、iPS Non-clinical Experiments for Nervous System: iNCENS プロジェクトを立ち上げ、現在は、医薬品のヒトにおける痙攣誘発リスクを定量的に予測可能な薬理評価系確立に取り組んでいる。この活動は PMDA との国内協調、米国シンクタンク との意見交換などと並行して進め、試験法提案を目指
すものである。hiPSC-neuron に加えて、AI といった、日本発の新しい技術を結集し、ヒト予測性向上を実現した非臨床試験を日本から発信するべく挑戦を続けている。

3. ヒト iPS 細胞から分化誘導した肝実質細胞様細胞の薬物動態と肝障害評価試験への応用

医薬品開発の非臨床試験における評価項目である薬物動態、薬物性肝障害において、肝実質細胞による invitro 評価が広く用いられてきた。従来、肝細胞資源のゴールデンスタンダードとされてきたヒト凍結肝細胞に代わり、iPS 細胞から分化誘導した肝細胞様細胞や HepaRG 細胞のような培養細胞系の開発が進み、細胞の供給源の多様化が進んできている。また、培地等の開発で必ずしも長期培養に適さないという状況からも脱してきている。
いかにヒト体内の肝臓の機能を再現・維持できる評価系を in vitro で再現するかは古くからある課題であるが、ここ数年の細胞培養技術の進歩により新たな開発段階に入ってきていると考えられる。本講演では、特にヒト iPS 細胞から分化誘導した肝実質細胞様細胞の薬物動態と肝障害評価試験への応用を目指し、国立医薬品食品衛生研
究所薬理部を中心とし国内で iPS 細胞の肝細胞分化研究をリードするアカデミア研究室と進める共同研究の成果を交え、最近の動向を紹介したい。

－ 59 －

企画シンポジウム

Recent trend of application of hepatic parenchymal-like cells differentiated from human iPS cells topharmacokinetic studies and drug-induced hepatotoxicity tests
石田 誠一 Seiichi Ishida
国立医薬品食品衛生研究所 薬理部
Division of Pharmacology, NIHS

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㻌
㻌
㻌
㻌

日時：㻌 㻞㻜㻝㻤 年 㻝㻜 月 㻝㻜 日 㻝㻢㻦㻜㻜㻙㻝㻣㻦㻟㻜㻌
場所：㻌 㻞 階㻌 瑞雲㻌

毒性関連ビッグデータを用いた人工知能による㻌
次世代型安全性予測手法開発プロジェクト（㻭㻵㻙㻿㻴㻵㻼㻿 プロジェクト）㻌
㻌㻭㻵㻙㻿㼡㼎㼟㼠㼍㼚㼏㼑㼟㻌㻴㼍㼦㼍㼞㼐㼛㼡㼟㻌㻵㼚㼠㼑㼓㼞㼍㼠㼑㼐㻌㻼㼞㼑㼐㼕㼏㼠㼕㼛㼚㻌㻿㼥㼟㼠㼑㼙㻌㻔㻭㻵㻙㻿㻴㻵㻼㻿㻕㻌㻼㼞㼛㼖㼑㼏㼠㻌㻌㻌㻌
開催趣旨：㻌

㻞㻜㻝㻣 年 㻢 月から、経済産業省による毒性関連ビッグデータを用いた人工知能による次世代型
安全性予測手法開発プロジェクト（㻭㻵㻙㻿㻴㻵㻼㻿 プロジェクト）がスタートした。現在、毒性発現メカニ
ズムに基づく毒性予測システム開発に取り組んでいるが、そのために必要となる各モデル構築のためのデータの整理及び実験によるデータ取得インビトロ実験を実施している。本セッションでは、㻭㻵㻙㻿㻴㻵㻼㻿 プロジェクトが何を目指し、そのために何を実施しているかを紹介するとともに、本プロジェクトで開発を進めている毒性予測モデル構築の考え方、システムを構成するモデル、モデル構築のために必要となるインビトロ実験などについてその概要を紹介する。㻌
㻌

企画シンポジウム

モデレーター：㻌㻌㻌㻌

船津㻌 公人㻌 㻷㼕㼙㼕㼠㼛㻌㻲㼡㼚㼍㼠㼟㼡㻌
東京大学㻌 㼀㼔㼑㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌㼛㼒㻌㼀㼛㼗㼥㼛㻌

植沢㻌 芳広㻌 㼅㼛㼟㼔㼕㼔㼕㼞㼛㻌㼁㼑㼟㼍㼣㼍㻌
明治薬科大学㻌 㻹㼑㼕㼖㼕㻌㻼㼔㼍㼞㼙㼍㼏㼑㼡㼠㼕㼏㼍㼘㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌㻌

座長：㻌 庄野㻌 文章㻌 㻲㼡㼙㼕㼍㼗㼕㻌㻿㼔㼛㼚㼛㻌
東京大学㻌 㼀㼔㼑㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌㼛㼒㻌㼀㼛㼗㼥㼛㻌㻝㻚

毒性発現メカニズムに基づく毒性予測システム（㻭㻵㻙㻿㻴㻵㻼㻿）開発プロジェクトの現状㻌㻼㼞㼑㼟㼑㼚㼠㻌㼟㼠㼍㼠㼡㼟㻌㼛㼒㻌㼜㼞㼛㼖㼑㼏㼠㻌㼒㼛㼞㻌㼐㼑㼢㼑㼘㼛㼜㼙㼑㼚㼠㻌㼛㼒㻌㼠㼛㼤㼕㼏㼕㼠㼥㻌㼜㼞㼑㼐㼕㼏㼠㼕㼛㼚㻌㼟㼥㼟㼠㼑㼙㻌㻔㻭㻵㻙㻿㻴㻵㻼㻿㻕㻌㻌

船津㻌 公人㻌 㻷㼕㼙㼕㼠㼛㻌㻲㼡㼚㼍㼠㼟㼡㻌

㻌
㻌
㻌

東京大学㻌
㼀㼔㼑㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌㼛㼒㻌㼀㼛㼗㼥㼛㻌㻭㻵㻙㻿㻴㻵㻼㻿 プロジェクトにおいて開発が進められている、毒性発現メカニズムに基づく毒性予測システムの開発の背景、目的、開発システムの概要および毒性予測システムを構成する予測モデル構築の考え方について紹介する。特に、予測モデルに関しては、毒性発現に関係すると思われる実験データから得られる情報を予測モデル構築時の記述子として導入することで、毒性未知の化学品に対して予測された毒性の発現メカニズムに関する情報提供が可能となることを目指している。このほか今後のシステム開発の方向性などについて、プロジェクトリーダーとしての考え方を述べる。㻌
㻌㻌㻞㻚

生理学的薬物動態㻌 㻔㻼㻮㻼㻷㻕㻌 モデルを活用する化学物質の体内動態評価技術㻌
Assessment of chemical toxicokinetics using physiologically based
pharmacokinetic (PBPK) modeling㻌山崎㻌 浩史㻌 Hiroshi Yamazaki㻌㻌昭和薬科大学㻌

Showa Pharmaceutical University

ラット 㻞㻤 日間反復経口投与試験では被験物質の血中濃度推移（曝露）に関する評価はほとん
ど行われていない。少数例ではあるが、血中化学物質濃度推移の文献・実測値を活用し、ラット
体内動態パラメータ値を算出し、生理学的薬物動態（㻼㻮㻼㻷）モデルを活用して仮想投与後の肝臓中濃度推移を予測した。調べた範囲において、単回投与時の 㻝 日あたりの肝中濃度時間曲線下面積と最小作用量は有意な逆相関を示した。本成果が契機となり、化学物質の薬物動態／㻼㻮㻼㻷
モデルを考慮する体内動態評価と安全性評価技術の統合に期待したい。㻌

－ 60 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018




㻟㻚

毒性発現機序に基づく肝毒性予測インシリコシステムの開発におけるインビトロ試験の活用㻌㻭㼜㼜㼘㼕㼏㼍㼠㼕㼛㼚㻌㼛㼒㻌㼕㼚㻌㼢㼕㼠㼞㼛㻌㼍㼟㼟㼍㼥㼟㻌㼠㼛㻌㼠㼔㼑㻌㼑㼟㼠㼍㼎㼘㼕㼟㼔㼙㼑㼚㼠㻌㼛㼒㻌㼠㼔㼑㻌㼙㼑㼏㼔㼍㼚㼕㼟㼙㻙㼎㼍㼟㼑㼐㻌㼕㼚㻌㼟㼕㼘㼕㼏㼛㻌㼜㼞㼑㼐㼕㼏㼠㼕㼛㼚㻌㼟㼥㼟㼠㼑㼙㻌㼛㼒㻌㼔㼑㼜㼍㼠㼛㼠㼛㼤㼕㼏㼕㼠㼥㻚㻌㻌

吉成㻌 浩一㻌 㻷㼛㼡㼕㼏㼔㼕㻌㼅㼛㼟㼔㼕㼚㼍㼞㼕㻌㻌㻌㻌

静岡県立大学㻌㼁㼚㼕㼢㼑㼞㼟㼕㼠㼥㻌㼛㼒㻌㻿㼔㼕㼦㼡㼛㼗㼍㻌㻌 化学物質の安全性評価においては、毒性発現機序に基づいた考察が重要であり、インシリコ毒性予測モデルの開発においても機序情報も提示可能なモデルが必要と考えられる。本研究では、ラット毒性試験の公的データベース（㻴㻱㻿㻿）を利用してインビボ毒性が明確な化学物質について
毒性発現機序と関連する多数のインビトロ試験を実施し、これらの実験結果をインビボ情報と関連させることで、本プロジェクトで目指している機序情報に基づいたインシリコ毒性予測モデルの構築に資することを目指す。本発表では、インビトロ試験の取り組みの状況、今後の展望を紹介する。㻌
㻌（ご参考）国際シンポジウム開催案内$,6+,36国際シンポジウム
～,Q6LOLFR による毒性予測手法開発の最前線～

プログラム（予定）：


















ご挨拶$,6+,363- リーダー東京大学
教授 船津公人
来賓挨拶 経済産業省
課長 宮本岩男
(3$ &RPSXWDWLRQDO 7R[LFRORJ\ 5HVHDUFK DQG QRQDQLPDO WHVWLQJDSSURDFK 仮 
86(QYLURQPHQWDO3URWHFWLRQ$JHQF\
5HVHDUFK7R[LFRORJLVW'U7LPRWK\-6KDIHU(XURSHDQ&RPSXWDWLRQDO7R[LFRORJ\5HVHDUFKDSSURDFKXSGDWH 仮 ,5&&6,VWLWXWRGL5LFHUFKH)DUPDFRORJLFKH0DULR1HJUL'U(PLOLR%HQIHQDWL
昼食
反復投与毒性予測モデル構築に向けたデータベースの準備について（仮）
静岡県立大学教授 吉成浩一
産業技術総合研究所
主任研究員 竹下潤一
休憩(3$ V+LJK7KURXJKSXW6FUHHQLQJDQG7R[LFRNLQHLWFV
86(QYLURQPHQWDO3URWHFWLRQ$JHQF\'U-RKQ):DPEDXJK$,6+,36 における $'0(3%3. の取り組み
昭和薬科大学教授 山崎浩史
ディスカッション＆閉会挨拶$,6+,363- リーダー東京大学
教授 船津公人

－ 61 －

企画シンポジウム
日時：  年  月  日（金）～
会場： 大手町サンスカイルーム ( 室〒東京都千代田区大手町  丁目  番  号 朝日生命大手町ビル  階Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

JST分子ロボット
倫理国際会議ＪＳＴ分子ロボット倫理国際会議－ 63 －

The 2nd International Conference on Molecular Robot Ethics
Date & Time: 9th Oct. (Tue), 2018 14:00-17:30
Place: Small Conference Room, 5th Floor, Tower-Hall Funabori, Tokyo

Molecular Robotics, an emerging interdisciplinary research field among robotics,
chemistry and biology has attracted interest from the viewpoint of futuretechnologies potentially applicable to intelligent drug delivery system and artificial
muscle for cancer therapy and regenerative medicine, to name a few. This conference
focuses on the ethics and technology assessment aspects of molecular robotics. The
topics of interest includes comparison between molecular robotics and systems
biology ethics, molecular robot guideline, responsible research and innovation anddual use issues in emergence technology, but not restricted to.
Program:
14:00-15:30

Moderator: Ryuma Shineha (Seijo University)<Molecular Robotics, ELSI and TA session>

Opening Remarks
Molecular Robotics: Its Concept, Technology and Ethics
Akihiko Konagaya (Tokyo Institute of Technology)
Safety engineering by synthetic biology
ＪＳＴ分子ロボット倫理国際会議

Daisuke Kiga (Waseda University)
Designing RRI after ELSI: To whom are we responsible?
Erika Szymanski (The University of Edinburgh, UK)
15:30-16:00

Break

16:00-17:30< Interdisciplinary Technology Assessment session>

Japanese Perspectives on Molecular Robotics: Formulating EthicalPrinciples of Molecular Robotics(ver. 1.1)

Naoto Kawahara (Kyushu University)
On governing risks of emerging technologies: Exemplary cases andcautionary tales from synthetic biology
Kenneth Oye (MIT Political Science, USA)Interdisciplinary technology assessment – practice and outlook for
responsible molecular robotics
Stephan Lingner (EA European Academy of Technology andInnovation Assessment, Germany)
Closing Remarks－ 64 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

Ethical Principles of Molecular Robotics (ver. 1.1)
分子ロボット技術倫理綱領第 1.1 版(First Edition, 8th August, 2018)(2018 年 3 月 5 日作成)
(2018 年 8 月 8 日案 改訂)

Preamble
Nowadays, it is an issue of extreme importance to establish an ethical framework with a
new view of material, information and life according to a technological development. With
ever-increasing progress in creativity and ingenuity of technology, new devices and systems
appear continuously. However, there are concerns about the ethical scope of molecularrobotics. In Japan, research and development of molecular robotics has been promoted,
taking advantage of an important elemental technology concerning senses, motions andintelligence. More complicated configurations of systems in molecular robotics areconceivable, which will be applied to informatics, engineering, chemistry, biology andmedicine in the near future. In this context, we formulate the following ethical principles.
We also request any person who engages in molecular robotics to comply with these principles.
今般、技術開発の進展に伴い、新しい物質・情報・生命観を想起し、倫理の枠組みを社会の中に確立させていくことは重要な課題といえよう。 モノづくりが進化し、これまでになかったデバイスやシステムが次々と現れる一方、分子ロボット技術の倫理的課題も多岐に及ぶ。わが国の分子ロボット技術は、感覚、運動、知能が重要な要素として捉えられ、それぞれの要素技術を活かした研究開発が進められているところである。将来的に、分子ロボット技
術は、より複雑な構成が実現可能になるとともに、情報学、工学、化学、生物学、そして、医学・医療などに応用されることが予想される。このような背景において、私たちは、以下の倫理綱領を定めるとともに、分子ロボット技術に携わるすべての者にその遵守を求めるものである。

Ethical Principles
１．Comprehensive assessment of risks and benefits▶ Any person who engages in molecular robotics shall make a comprehensive
assessment of potential harm for human beings or the environment as well as
predicted risks and benefits. Then they shall also take measures to minimize thoseburdens and risks.

２．Consideration for safety and environment▶ Any person who engages in molecular robotics shall take containment and safetymeasures for the environment. This includes ethical responsibility and consideration
for future generations.
安全と環境への配慮▶ 分子ロボット技術に携わる者は、環境への拡散防止のための措置、安全の確保に向けた取組を行う必要がある。これは、将来世代に対する責任と配慮を含む。

３． Paying attention to security and dual-use issues▶ Any person who engages in molecular robotics shall investigate security measures inconsideration of physical, personnel, transport, material, and information aspects.
They shall also pay attention to dual-use issues.
セキュリティとデュアルユース問題への留意▶ 分子ロボット技術に携わる者は、物理的・人的な観点のみならず、輸送や材料管理、情報の観点も考慮したセキュリティ対応を検討するべきである。併せて、デュアルユースに関する問題にも注意を払う必要がある。

４． Ensuring accountability and transparency▶ Any person who engages in molecular robotics shall ensure accountability andtransparency for the public good, making progress of the research and development
rooted in social justice.
説明責任と透明性の担保▶ 分子ロボット技術に携わる者は、社会正義に根ざした研究開発を進展させるにあたり、公共への説明責
任と透明性を担保しなければならない。

The above principles will continue to be revised as needed.

以上、この倫理綱領は今後も必要に応じて見直していくものとする。

－ 65 －

ＪＳＴ分子ロボット倫理国際会議

リスク・ベネフィットの総合評価▶ 分子ロボット技術に携わる者は、その技術の複雑化とともに、人間・環境への負担ならびに予測されるリ
スク及び利益についての総合的な評価を行うとともに、それらの負担及びリスクを最小化させ得る対策を講じなければならない。

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

市民講座
（江戸川区後援）

市民講座－ 67 －

市民講座－ 68 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

江戸川区後援 市民講座
認知症と向き合うために

日時： 2018 年 10 月 11 日（木） 午後 1 時 30 分～3 時 30 分
場所： タワーホール船堀 小ホール（東京都江戸川区船堀 4-1-1）
主催： 情報計算化学生物学会（CBI 学会）
共催： NPO 法人 地方再興・個別化医療支援
後援： 江戸川区
開催趣旨
市民講座ではこれまで癌、生活習慣病、呼吸器疾患、心と体の健康などをテーマとしてきました。現在日本では、認知症の患者数は約 600 万人で、65 歳以上の高齢者の 6～7 人に 1 人が認知症になっています。そこで 今年は、「認知症」をテーマとして、市民の皆さんに判りやすく説明いたします。まず、中野恵子先生は、薬膳による健康増進について、具体的な例を示しながら説明いたします。次いで、伊賀瀬道也先生は、河内晩柑由来果汁
飲料で認知機能低下を予防できるという画期的な医学データを発表いたします。そして、最後に渡部佳奈子先生が、箏回想法という音楽療法を用いて認知症患者の記憶を呼び起こ
して笑顔を取り戻せる感動秘話を紹介します。どうぞ奮ってご参加下さい！

プログラム
1.

中野 恵子

（国際薬膳食育師・和漢膳プロフェッサー、愛媛県・新居浜市）

2.

伊賀瀬 道也 （愛媛大学大学院老年・神経・総合診療内科学・特任教授／
愛媛大学医学部付属病院 抗加齢予防医療センター・センター長 、
愛媛県・東温市）「河内晩柑由来果汁飲料には認知機能改善効果がある」

3.

渡部 佳奈子 （一般社団法人箏 PLAN・代表理事、内閣府から海外派遣された唯一の箏回想士、福島県・郡山市）「高齢者の尊厳を守る“笑顔と涙の箏回想法：感動秘話”」

司会： 石川 智久 （NPO 法人地方再興・個別化医療支援 理事長、愛媛県・西条市）－ 69 －

市民講座「健康増進のための身近な薬膳」

健康増進のための身近な薬膳“Yakuzen” is a familiar approach to our healthcare
中野 恵子
Keiko Nakano
からだ経営塾 国際薬膳食育師 特級師範 和漢膳プロフェッサー
Professor of “Wa-Kan-Zen”

人は元来、元気に生きられる力を、自分の体にを備えて生まれてきます。ただ、この世に生まれ、様々な環境の中で生きてゆくうちに、知らずしらず、からだに負担をかけてしまっていることがあります。
昔は「その辺の物」を食べていれば・・・いえ、その辺で出来た物しか手に入らなかったから、それらを調理して食べていました。たくさん取れる旬の食材は、保存食として「漬物」などに加工して。ところが、世の中が「便利」になったことで、旬を問わず、いつでも同じものが手に入る。輸送・冷凍・保存などの技術、農業技術の向上や変化、インター
ネットの一般普及などで世界中の食べ物が瞬時に手に入る！一見、食生活が豊かになった
錯覚を起こしてしまいますが、飽食時代の栄養失調なども問題になってきています。いわ
ゆる・・・自分の好きなものしか食べない（固食）
・・・という現象です。
日本の平均寿命は延びていますが、健康寿命はどうでしょうか？高齢化社会、医療技術の向上による医療費の激増・・・。病気になったら病院へ！の人任せではなく、病気にならないように、まず、食べて健康に調えましょう。「人は食べた物でしか体を作ることができません」この当たり前のことをもう一度、見直し、自分の体を「経営」してほしいのです。
人間も自然の中の生き物の一部です。自然に逆らって生きていくと、やがて、からだの
どこかが不具合になっていく。自然と同調しながら、自分の体と対話しつつ「食べて」か
らだを健康に調えていく・・・これが「薬膳」であり、「食養生」です。決して難しかった
り、手に入りにくい食材を使ったり、苦かったりするものではなく、今、この瞬間から、
市民講座

何もなくても健康に近づく方法や、今晩から食べられるものなど、皆さんのすぐそばに寄り添いながら、続けていくうちに、気が付いたら、風邪をひかなくなっていた、朝が楽になった、肩凝りが軽減されたなどを実感できるでしょう
ポイントは、まず「知って」そして「Try and Keep!」やってみて、続けること！
元気で生きてこその長寿です。人生は長い！少しずつ、当たり前のレベルをあげてずっと
笑顔の毎日を過ごしましょう。今日は、誰にでも出来る当たり前だけど、大切で続けてほしいことを、「なるほど、そ～ゆうことだったのか！」と、からだと食べ物の関わりを交えながらお話していきます。

－ 70 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

河内晩柑由来果汁飲料には認知機能改善効果がある
Auraptene in the Peels of Citrus Kawachiensis (Kawachibankan)
Contributes to the Preservation of Cognitive Function: A Randomized,
Placebo-Controlled, Double-Blind Study in Healthy Volunteers
伊賀瀬 道也Michiya Igase
愛媛大学大学院老年・神経・総合診療内科学
Department of Geriatrics and Neurology,
Ehime University Graduate School of Medicine【目的】オーラプテン（AUR）は柑橘類に含まれる機能性成分で、癌やメタボリック症
候群の予防的効果だけでなく、脳内での抗炎症効果が報告されている。AUR が豊富に含まれる河内晩柑果皮の果汁の認知機能低下に対する予防効果を検討した。
【方法】当院の抗加齢ドック受診者のうち本研究に同意いただいた被験者に、河内晩柑由
来の果汁飲料を 6 カ月間連日で飲用させた。
試験飲料は AUR 6 mg、対照飲料は AUR 0.1 mg
を含み、プラセボ対照二重盲検比較試験を行った。MCI screen（ミレニア社）の「CERAD
バ ッテリー 10 word recall」により認知機能を評価し、3 回の合計スコアを解析した。
【結果】82 名（71±9 歳）が試験を完了した。試験群（41 名）、対照群（41 名）とも副作
用は特になかった。両群ともに試験前後でスコアの有意な上昇はなかったが（試験群は前19.2±4.2／後 19.9±3.8、対照群は前 19.5±3.4／後 18.9±3.4）、その変化率では試験群と対照群で有意な差が認められた（試験群 6.3±18.9% vs. 対照群−2.4±14.8%、p<0.05）。各種交絡因子を補正した多変量解析でも、認知機能低下に対する試験飲料の独立した効果が示唆された。

（Igase et al, J Prev Alzheimers Dis, 2018）。

－ 71 －

市民講座【結論】AUR を豊富に含む河内晩柑果皮の果汁には認知機能低下を予防する可能性がある高齢者の尊厳を守る「笑顔と涙の箏回想法感動秘話」
Protect the dignity of elderly people "The koto remembrance of the smile and thetears The impressed secret story"
渡部 佳奈子Kanako Watanabe
一般社団法人 箏 PLAN
General Incorporated Association Koto PLAN

認知症高齢者 84,000 人以上に実施した箏を用いた音楽療法「箏回想法🄬🄬」の講演と実演。
内閣府から海外派遣された唯一の箏回想士は、活動の原点が自身の祖母の死だった。そして、大勢の方に実施するようになったきっかけは東日本大震災だった。
「なぜ」
・「何を」
・「どのように」のどれか一つでなく、自身の内面を変化させ外側に影響を与えてきた箏回想士としてのインサイド・アウトの原則に基づく講演内容。

市民講座－ 72 －

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

ランチョンセミナー
LS-01～LS-07

LS-01
株式会社モルシス (MOLSIS Inc.)「知識ベースを活用した医薬品開発の効率化とリスク低減」
LS-02
アークスパン合同会社 (Arxspan LLC)
「クラウド型次世代研究情報管理システム ArxLab のご紹介」

研修室
10/9
12:00-13:30
401

LS-03
ドットマティクス (Dotmatics Ltd.)「クラウド及びオンプ レミス共通型次世代創薬基盤システム」
10/10
11:30-13:00

LS-07

407

CBI 学会総会(CBI general meeting)LS-05
株式会社 GDEP アドバンス(GDEP ADVANCE, Inc.)「GPU/AI 創薬の進展と最新情報」
LS-06
分子ロボット倫理研究会(Special Interest Group of
Molecular Robot Ethics)「分子ロボットは人類にとって敵か味方か？」

401

研修室
10/11
12:00-13:30
401

ランチョンセミナー

LS-04
パトコア株式会社 (Patcore, Inc.)「構造変換アイディア提示システム CRAIS TRANSFORMER ver.2」「社内化学情報検索システム ChemLocator」

研修室

情報計算化学生物学会 2018 年大会 株式会社モルシス ランチョンセミナー

知識ベースを活用した医薬品開発の効率化とリスク低減
日時:2018 年 10 月 9 日
会場:タワーホール船堀

12:00 - 13:30

4 階 研修室

知識ベースを活用した化合物の薬理活性予測と化合物／ターゲットの両面からの潜在的な安全性の問題の把握は、医薬品開発の効率化とリスク低減には重要である。
Chemotargets 社の Chemotargets CLARITY は、化合物構造から作用機序と有害事象のエンドポイントを予測し、探索段階からオン／オフ・ターゲットと潜在的な安全性の問題の把握を支援する。また、BioInfoGate 社の OFF-X は、1 万件以上のターゲットを監視して医薬品・ターゲット・有害事象について包
括的な情報システムとして最新の安全性アラート情報を提供する。
本ランチョンセミナーでは、Chemotargets CLARITY と OFF-X の開発責任者を招聘し、最新の製品情報とともに、医薬品・ターゲット・副作用のトータル・ソリューションによる医薬品開発の効率化とリスク低減について紹介する。

ランチョンセミナー特⾧- ターゲットとの親和性を予測する 6 種類の計算手法- 安全性との関連を予測する 4 種類の計算手法- 代謝物を予測する知識ベースの計算手法- 100 万化合物を超える大規模なトレーニング・
セット- データ・サイエンティストによる特許や論文のキュレーション
- ChEMBL などの公共データベースや FAERS
データも収載活用領域- 化合物ライブラリーの仮想スクリーニング- 標的タンパク質決定後の解析- ドラッグ・リポジショニング- 潜在的な毒性や安全性の問題の予測- オフ・ターゲットの相互作用の判別- 代謝物に関連する安全性問題の把握

特⾧- 医薬品のターゲット（作用機序）と有害事象で分類された包括的な情報システム- 多数の薬物クラスに関係のある既知および新規の安全性問題の両方を収載- 幅広い情報源で報告された新規の安全性問題のアラートサービスを毎日提供

活用領域- パイプライン中のターゲットや新規のターゲットの安全性問題の把握- ターゲットと安全性転帰の間に成り立つ直接的な作用上の関連を判別- オフ・ターゲット効果の仮説と実験評価系の立案を支援- 化合物に関連した有害事象か、ターゲットに関連した有害事象かを判定- 特定の薬物クラスに関連する規制当局の関心の監視- トランスレーショナル・リサーチの戦略の観点から
in vitro アッセイと臨床転帰との相関を判別
Chemotargets 社／BioInfoGate 社 日本代理店

株式会社モルシス ライフサイエンス部
TEL: 03-3553-8030 E-mail: sales@molsis.co.jp
URL: https://www.molsis.co.jp/

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

CHEMOTARGETS CLARITY®: AN INTELLIGENCE AND ANALYTICS PLATFORM
FOR PREDICTIVE PHARMACOLOGY AND SAFETY OF SMALL MOLECULE DRUGSAND COSMETIC INGREDIENTS
Jordi Mestres, President,Chemotargets SL, jordi.mestres@chemotargets.com
There is an increasing amount of pharmacology and safety data available for small molecule drugs andcosmetic ingredients that requires purposely designed predictive analytics platforms. This is very
important for the pharmaceutical industry but even more so for the cosmetics industry, as pressure on
reducing animal testing is rising worldwide.
We introduce here some of the new features implemented in Chemotargets CLARITY® v3.0:
 New pharmacology data: the chemical space with pharmacology data has increased from 1.3 to 2.4
million molecules in v3.0
 New Drug Explorer: it allows the user to navigate on all pharmacology and safety data, both known
and predicted, available for drugs, both in the public domain as well as in patents
 New FAERS Explorer: the FDA Adverse Event Report System (FAERS) contains currently almost
10 million post-marketing records; the user can interrogate this data and extract the most importantsafety signals present in it MedChem Dashboard: new SAR tables allow the chemists to easily identify pharmacology trends
on substitution patterns

APPLICATIONSOFTHE
INTEGRATEDTRANSLATIONAL
SAFETYINTELLIGENCE PORTAL OFF-X IN DE-RISKING DRUG R&D PROJECTS
Josep Prous Jr., Vice President, Bioinfogate, jprous@bioinfogate.com
Reducing costs associated with unexpected safety issues is one way to optimize productivity in drug
R&D. Against this background, interest in secondary pharmacology has steadily grown in recent times.

Likewise, the ability to explain rapidly why a certain adverse event was observed during a new drug’s
clinical or pre-clinical development by assigning this safety issues to specific targets is of utmost
importance.
To address these challenges, Bioinfogate has developed OFF-X (www.targetsafety.info), thetranslational safety intelligence portal, that allows scientists and professionals involved in drug R&D
to be promptly informed of target modulating effects leading to preclinical toxicity or clinical adverse
events.
During the luncheon seminar, the conceptual framework applied to developing OFF-X will bepresented, alongside selected case studies from real-life pharmaceutical industry situations.

ランチョンセミナー

When considering opportunities for therapeutic intervention with new bioactive molecules, it isessential to identify not only beneficial mechanisms of action but also those which could be linked toundesired off-target activities leading to potential safety issues.

ランチョンセミナー

10月9日(火) 12:00～ 4F 401

クラウド型次世代研究情報管理システム
ArxLabのご紹介•

外部との共同研究の効率化•

強固なセキュリティで知財保護•

既存社内システムとのデータ統合

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クラウドの利便性を最大限に活用
データの一元管理
リアルタイムな情報共有、データ回収
各種ブラウザ対応
SAS70 Type II 準拠データセンター
Part 11準拠
CRAIS Checker™との連携
きめ細かな権限設定(個人,グループ,ノートブック,プロジェクト単位)

専用ツールにより、ArxLab内指定データを指定サーバにアップロード
ArxLab内データ更新時に自動転送

ランチョンセミナー

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

ArxLab/Notebook
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ChemDrawを標準サポート
標準テンプレート(合成, 生物, 分析, 着想）
カスタムテンプレート
Auto Text機能
監査証跡機能依頼管理機能• 合成, アッセイ, 分析等自在に依頼定義• ダッシュボードで進捗状況一元管理• 依頼項目の変更アラーム機能• 外部研究機関等に非表示項目の設定 他

ArxLab/Registration
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ChemDrawを標準サポート
登録物を自在に定義（低分子, 中分子, 高分子, 蛋白質, セルライン, 動物
他）
ID自動発番
登録物質毎にアクセス権設定（個人, グループ単位）同一物質条件の設定、重複物質チェック
Standardizerによる構造正規化機能
バルク登録機能 他
ArxLab/Inventory

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ChemDrawを標準サポート
管理対象(オブジェクト)を自在に定義 (サンプル, 試薬, プレート,
セルライン, 抗体 他）
管理場所, 管理体系を自在に設定
オブジェクトの階層毎にアクセス権設定（個人, グループ単位）
登録から破棄まで監査証跡
バルク登録機能 他

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登録テンプレート設定機能
カーブフィッティング機能
IC50, EC50等各種計算機能
ヒートマップ機能 他

ArxLab/Publisher

ArxLab内指定データを、ユーザ指定サーバーにアップロード
ArxLab内データ更新時に、自動データ転送
ユーザ管理者による、ArxLab内指定データの変更機能 他

アークスパン http://jp.arxspan.com/〒107-0062 東京都港区南青山2-2-15Win AoyamaビルUCF917
Tel: 03-6869-7507 email: info@Arxspan.com

ランチョンセミナー

ArxLab/Assay

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情報計算化学生物学会 2018 年大会 ドットマティクス日本支店 ランチョンセミナー

クラウド及びオンプレミス共通型次世代創薬基盤システム「低分子・ペプチド・核酸・抗体医薬品に対応した次世代創薬基盤システムを紹介します」
日時：2018 年 10 月 10 日（水） 11：30～13：00 ４F 研修室
多くの製薬会社では各種実験装置や既存アプリケーションシステム間との連携が必要なことから、創薬研究情報管理シス
テムを社内ネットワーク内に構築することが通常である。セキュリティ対策面でもオンプレミス環境がまだまだ一般的であり、そのニーズは非常に高い。その一方で、社外の共同研究者や CRO との協業が増え、如何に高いセキュリティを保ったまま
スピーディに効率よく共同研究を遂行できるかが生き残りをかけた最重要課題となってきている。
また、今までの低分子創薬を継続しつつ新規の創薬研究（ペプチド・核酸・抗体）も進めようとしたところ、既存の低分子化合物を対象に設計された創薬研究情報管理システムでは新規の創薬研究で生み出されたデータを効率よくハンドリング出来ない課題に直面している。
大手の製薬会社はこぞって電子実験ノートを導入したが複雑にカスタマイズされたクライアント-サーバ型の製品を利用していた為に、多額のバージョンアップ費用とランニングコストが創薬研究費を押し上げており、その対応策をマネージメント層から要望されている状況と思われる。
弊社は多くの製薬会社で抱えているこれら課題に関し、クラウド及びオンプレミス共通型次世代創薬基盤システムを利用することで下記の通り具体的なソリューションを提案し、日本の製薬会社様に導入実績を増やし続けております。
1． 弊社の Browser 統合・参照 Web ブラウザは各社の化合物構造式オラクルカートリッジ（BIOVIA Direct、ChemAxon
JChem、PerkinElmer CS Cartridge）と連携することで既存のアプリケーションと連携することが可能となっている。勿論、ChemDraw 及び BIOVIA Draw も利用可能。
2． 弊社の製品群は電子実験ノートを含めて Web アプリケーションベースで構成されており、社外との共同研究および CROとの協業（クラウド）や、社内システム（オンプレミス）のいずれのシチュエーションにも同一の製品で対応。
3． 弊社の Register は低分子化合物から数百までのペプチド（天然・非天然）を取り扱え、ChemDraw を利用することで配列形式（天然アミノ酸）での登録が可能。Bioregister ではペプチド・核酸・抗体などの配列情報を非天然モノマーの管理を含めて取り扱う事が可能。
4． 弊社は HTS/HCS スクリーニング用として Studies を、LTS/マニュアルアッセイには Studies Notebook/Nucleus を組み
ランチョンセミナー

合わせることでアッセイデータを比較的に簡単にオラクルデータベース化することが可能。
5． 弊社の製品群は全てワンプラットフォームで開発され Tomcat サーバでファイルを差し替えるだけでバージョンアップが完了。当然、全てのユーザの検索画面・クエリや管理者情報も引き継がれます。
今回のランチョンセミナーでは、ドットマティクス製品群が低分子や高分子創薬、化学、製剤化等のいずれの業務エリアでも、科学的データの検索と分析に十分な化学的知見と生物学的知見を持っていることを紹介します。具体的には、Browser
は、化学データベースに関する化学構造検索の結果とアッセイ結果を連係させ、解析用のデータセットを素早く収集し、計算された化学的特性を実験データとともに検索・表示することを紹介。 Vortex は、R グループ分析、化学クラスタリング、
MMP（matched molecular pairs）の組み合わせなどの豊富な化学情報の計算と解析ツールを提供し、2D-SAR（StructureActivity Relationship）などのプロットを使用して結果を表示します。 ChemSelector は、非常に大きな化学データセットを超高速に検索できる他、独自のフラグメントベース検索が可能です。これらドットマティクス製品群が非常に柔軟性を持ってシームレスに統合され、研究全体の意思決定に必要な時間を大幅に短縮する方法について説明します。

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

ドットマティクス製品群㻌

化合物・抗体インベントリー㻌

ドキュメント管理システム㻌

化合物登録管理システム㻌

'RFXPHQWPDQDJHPHQW VKDULQJ㻌&KHPLFDO   VDPSOHUHJLVWUDWLRQ㻌

低分子反応・設計ツール㻌

抗体・核酸登録管理システム㻌

5HDFWLRQ:RUN)ORZ㻌%LRORJLFDOVUHJLVWUDWLRQ PDQDJHPHQW㻌&KHPLFDOV ELRORJLFDOVLQYHQWRU\㻌

業務依頼・進捗管理システム㻌

:RUNUHTXHVWDQGWUDFNLQJ 㻌

HTS/HCS スクリーニング管理システム㻌
ケミカル・バイオ電子実験ノート㻌

作る㻌

テスト㻌

+76 +&6  VFUHHQLQJPDQDJHPHQW㻌

(/1IRUDOO

ダイナミック・ブラウザー
ダブラウザー㻌
'DWDIHGHUDWLRQTXHU\DQGUHSRUWOLYH
GDWD㻌

設計    㻌      分析㻌
LTS アッセイアップロードツール㻌

([FHO&696'ILOH'%8SORDG

超高速試薬データベース㻌
ースス&KHP6HOHFWRUH0ROHFXO

7RRO㻌

レポート㻌

0LFURVRIW®2IILFHDGGLQ㻌

超高速・多次元解析ツール㻌
ドットマティクス日本支店㻌
〒㻌
東京都港区新橋  新橋東急ビル３階
電話㻌
Mail: jp_sales@dotmatics.com㻌

,QWHUDFWLYHDQDO\WLFV YLVXDOLVDWLRQ㻌ランチョンセミナー

MS Office アドイン㻌ランチョンセミナー

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

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ランチョンセミナー

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Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

NVIDIA DGX SYSTEMS®

TM

NVIDIA Tesla V100 GPU 搭載ディープラーニングシステム®

NVIDIA DGX-2
GPU

16x Tesla V100 SXM2 (32GB)

演算性能

2 Peta Tensor FLOPS (GPU FP16)

GPU メモリ

512 GB（GPU 16 基の合計）

CPU

2 x Intel Xeon Platinum 8168

システムメモリ

1.5 TB DDR4

ストレージ
ネットワーク

OS: 2x 960GB NVME SSD
内部ストレージ: 30 TB (8x 3.84TB)
NVME SSD
10/25 GbE, 8x InfiniBand EDR

NVIDIA DGX-1
GPU

8x Tesla V100 SXM2 (32GB)

演算性能

1 Peta Tensor FLOPS (GPU FP16)

GPU メモリ

256 GB（GPU 8 基の合計）

CPU

2 x Intel Xeon E5-2698 v4 2.2 GHz

システムメモリ

512 GB DDR4

ストレージ

Data: 4x 1.92TB SSD RAID0
OS: 1x 480GB SSD

ネットワーク

2x 10 GbE, 4x InfiniBand EDR

NVIDIA DGX Station
4x Tesla V100 SXM2 (32GB)

演算性能

500 Tensor TFLOPS (GPU FP16)

GPU メモリ

128 GB（GPU 4 基の合計）

CPUIntel Xeon E5-2698 v4 2.2 GHz

システムメモリ

256 GB DDR4

ストレージ

Data: 3x 1.92 TB SSD RAID 0
OS: 1x 1.92 TB SSD

ネットワーク

2x 10 GbE, 4K 解像度

NVIDIA Advanced Technology Program (ATP) パートナー
詳細はこちらをご覧ください： https://www.nvidia.com/ja-jp/data-center/dgx-systems/© 2018 NVIDIA Corporation. All rights reserved. NVIDIA, the NVIDIA logo, and Iray are trademarks and/or registered trademarks of NVIDIA
Corporation. All company and product names are trademarks or registered trademarks of the respective owners with which they are associated.

ランチョンセミナー

GPUCBI 学会 2018 年大会
ランチョンセミナー「分子ロボットは人類にとって敵か味方か？」
10 月 11 日（木）12:00～13:30
小長谷明彦（東京工業大学）
河原直人（九州大学）
標葉隆馬（成城大学）
Erika Szymanski (The University of Edinburgh, UK)
Kenneth Oye (MIT Political Science, USA)
Stephan Lingner (EA European Academy of Technology andInnovation Assessment, Germany)
分子ロボットとは DNA ナノ技術を活用して運動・感覚・知能を持つ生体素材のロボットを作り出すことを目指す萌芽的学術分野である。この技術が実用化された場合の応用可能性は大きなものがあるが、同時にそれによってもたらされる負の影響も膨大なものとなる可能性がある。このようなジレンマを乗り越えて研究実践を継続するために、我々は倫理分野
や社会科学分野の専門家とも協同して、分子ロボット倫理原則の草案を検討してきた。
本セミナーでは、分子ロボット技術の現状についてのテクノロジーアセスメントを共有した後、我々の倫理原則草案を発表する。発表された草案をどのように改善するかをめぐって、フロアを交えて活発な議論を行いたい。

ランチョンセミナー

小長谷明彦

河原直人

標葉隆馬

Erika Szymanski

Kenneth Oye

Stephan Lingner

JST 社会技術開発センター（RISTEX）「人と情報のエコシステム」研究開発領域
情報技術・分子ロボティクスを対象とした議題共創のためのリアルタイム・テクノロジーアセスメントの構築(CoRTTA)
https://ristex.jst.go.jp/hite/

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

The Chem-Bio Informatics Society
Annual Meeting 2018
Luncheon Seminar“Is molecular robotics a friend or foe of the humanbeing?”

October 11(Thu), 12:00-13:30

Akihiko Konagaya ( TITECH )Naoto Kawahara (Kyushu University)
Ryuma Shineha (Seijo University)
Erika Szymanski (The University of Edinburgh, UK)
Kenneth Oye (MIT Political Science, USA)
Stephan Lingner (EA European Academy of Technology andInnovation Assessment, Germany)

Japan Science and Technology Agency RISTEX
Human Information Technology Ecosystem
Co-Creation and Communication for Real-Time Technology Assessment on Information Technology and Molecular
Robotics(CoRTTA)
https://ristex.jst.go.jp/hite/

ランチョンセミナー

Molecular robotics is an emerging discipline involving the design andcreation of artificial biological robots with sense and intelligence based on
DNA nano-technology including DNA origami and DNA computing. Although
the current accomplishments are still in remaining at the experimental stage,
the potential applicability of molecular robotics is immense, and so are thenegative implications such as bioterrorism and dual use. In order to prevent
such negative repercussions while pursuing beneficial applications, we
propose, in collaboration with experts of ethics and social sciences, the EthicalPrinciples of Molecular Robotics as an essential guideline for any person
engaging in the field of molecular robotics.
Our seminar is composed of three sections. First, we provide atechnology assessment concerning the current situation of molecular robotics.
We shed light on the complex interdependence of benefit and risk yielded by
the future technological advancement of molecular robotics, focusing on the
genome editing function of molecular robots. We also note that the ontologicalambiguity of molecular robots might pose a serious threat to the current
international regulatory regime on biological and chemical weapons. Second,
based on the current state analysis, we present the draft of the EthicalPrinciples of Molecular Robotics. In the principles, we stress the importance ofgrasping the serious dilemma posed by the technology and intend to coverbroad risks from environmental damage to misuse by terrorists. Third, we
open the discussion to the floor. We will discuss together how to improve thedraft. Participants from various fields are welcome.

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

スポンサー企業企画枠

303

株式会社バイオモデリングリサーチ(Biomodeling Research Co., Ltd.)「『創薬支援ソフト myPresto5』活用セミナー」

402

10/10
14:00-15:30

スポンサー企業企画枠

BIOSPIRE 株式会社/ライフマティックス株式会社
10/9(Biospire Japan Ltd./Lifematics Inc.)「次世代 GPU シミュレーションと iPS 疾患モデルが融合 14:00-15:30
する創薬イノベーション」

～最新のScience Technologyを有する英米３社の特別講義・CBI学会スポンサー企業企画～『次世代GPUシミュレーションと iPS疾患モデルが融合する創薬イノベーション』

       
2018年10月9日（火）14:00～15:30 CBI学会2018年大会会場

3階 303室

座長
Chairman池田和由 氏Dr Kazuyoshi Ikeda
Email:

慶應義塾大学薬学部
Keio University
ikeda-kz@pha.keio.ac.jp

主催

BIOSPIRE株式会社 (www.biospire.jp)
ライフマティックス株式会社 (www.lifematics.co.jp)

創薬におけるスピードと手法が、iPSと、AIに代表される革新的なコンピューター技術(GPU)の進歩によって、大きな変化点を迎えています。本セミナーでは、英国と米国から講師を招き、計算化学における最先端の技術を２件、iPS創薬に関する技術を１件ご紹介します。
英Cresset社からは、昨年リリースされた最新のSBDDツール～Flare～を中心に全く新しい分子設計の方法をご紹介いたします。XED力場によるCressetソフト特有の精密な計算モデルを分子間相互作用に適用することで、インシリコによるヒット同定・拡張から、リガンド相互作用エネルギー論にもとづく残基の抽出、相互作用に関わる水分子の解析を高精度に行うことが可能です。
米SilcsBio社からは、小分子プローブを導入したマイクロ秒アンサンブル MD法をコア技術にしたヒットtoリードにおける創薬探索研究の事例をご紹介いたします。
これからの計算化学において、必要不可欠なGPU高速化MDシミュレーションを利用したPharmacoporeの作成、ポケットの発見、バーチャルスクリーニングの手法についてフォーカス致します。
英DeﬁniGEN社からは、ゲノム編集とiPS分化誘導を組合わせた新たな疾患モデル細胞作製に関する技術情報とグローバルフ
ァーマを中心とした受託プロジェクトの概要が説明されます。同一のiPS細胞を出発点とし、一方をゲノム編集により疾患化、一方を健常人細胞として同一の分化誘導プラットフォームに乗せた、疾患の有無のみが異なるisogenicコントロールが提供できるようになり、既に希少疾患を中心とした探索プログラムとフェノタイプスクリーニングに広く活用されはじめています。

スポンサー企業企画枠

URL

www.cresset-group.com

www.silcsbio.com

www.deﬁnigen.com

Emailjapan@cresset-group.com

info@silcsbio.com

info@deﬁnigen.com

日本語問合せ先japan@cresset-group.com

info@biospire.jp

masashi@deﬁnigen.com

国内代理店

ライフマティックス株式会社
03-6206-8412
cressetso�@lifema�cs.co.jp(担当 中村)ライフマティックス株式会社
03-6206-8412
silcs@lifema�cs.co.jp(担当 小田)キシダ化学株式会社
03-5625-5591
toda.kentaro@kishida.co.jp(担当 戸田)事業概要

ソフトウェアのライセンス販売(Flare, Spark, Blaze, Forge, Torch)
分子設計受託サービス

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iPS由来細胞の販売(肝細胞・膵β細胞・小腸オルガノイド)疾患モデルカスタム設計

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

Predicting biological activity using the electrostatic
complementarity of protein-ligand complexesMa�hias Bauer1, Mark Mackey1, Giovanna Tedesco1
Cresset, New Cambridge House, Bassingbourn Road, Litlington, Cambridgeshire,
SG8 0SS, UK

1Electrosta�c interac�ons between small molecules and their respec�ve receptors are a key contributor to the free energy of binding. Assessing theelectrosta�c match between ligands and binding pockets provides important insights into why ligands bind and what could be changed to improvebinding. The polarizable XED force ﬁeld is an excellent base for calcula�ng electrosta�c proper�es due to its descrip�on of anisotropic atomic charge
distribu�ons and rela�vely modest computa�onal costs. By compu�ng electrosta�c poten�als for both ligand and protein with XED, the Electrosta�cComplementarity™ of complexes can be assessed via (1) inverse correla�on of the respec�ve local electrosta�c poten�als (Pearson or Spearman rho
rank tests) or (2) calcula�ng a normalized surface complementarity integral, yielding electrosta�c complementarity scores. The la�er approach also
allows visualiza�on of the local electrosta�c matching on the van der Waals surface to iden�fy electrosta�c clashes and inform ligand design. We present
the theore�cal background of our Electrosta�c Complementarity descriptors along with several case studies showing the prac�cal applica�on of thescores to the predic�on of ac�vity and of the visualiza�on to ligand design.

Site Identiﬁcation by Ligand Competitive Saturation (SILCS)
Enables Rational Inhibitor Design for Glucocorticoid Receptor
Sirish Kaushik Lakkaraju1, Sunhwan Jo1, Alexander D. MacKerell Jr1,2.
SilcsBio, LLC. 8 Market Pl, Bal�more MD 21202.
2 Department of Pharmaceu�cal Sciences, School of Pharmacy, University of Maryland,Bal�more, 20 Penn St, Bal�more MD 21201, USA

1

Glucocor�coid receptor (GR) has therapeu�c relevance in autoimmune and inﬂammatory diseases. However, its deeply buried binding site oﬀers
signiﬁcant challenges for explicit solvent molecular simula�on-driven drug design campaigns. These challenges stem from diﬃculty in exchanges ofwater and other small molecules from the surrounding solu�on with its binding site. Addi�onally, recent evidence suggests signiﬁcant conforma�onal
changes at the binding pocket leads to addi�onal transient cavi�es not detected in most crystal structures but are nevertheless occupied by some highaﬃnity lead candidates. Site iden�ﬁca�on by ligand compe��ve satura�on (SILCS) is a mul�ple solute-solvent simula�on strategy that accurately
characterizes func�onal group aﬃnity pa�erns, called FragMaps, throughout the protein, including deeply buried sites. Using a hybrid Grand CanonicalMonte-Carlo/Molecular Dynamics (GCMC/MD) strategy, SILCS drives eﬃcient sampling of chemically diverse probes and water molecules into evendeeply buried pockets such as those found in the GR. SILCS FragMaps correctly recapitulated func�onal group pa�erns of previously known ligands.
Addi�onal pocket cavi�es driven by conforma�onal changes to N564, Q570 and Q642 in the binding site have been characterized through thesimula�ons and func�onal group aﬃni�es in these sites have been correctly iden�ﬁed. FragMap-based Ligand Grid Free Energy (LGFE) is a scoring metricthat rapidly rank-orders ligand favorability to a deﬁned binding site on the protein. LGFE scoring enabled rapid evalua�ons of virtual subs�tu�ons topreviously known lead candidates with a large library of fragment-like modiﬁca�ons. LGFE scoring correctly rank-ordered high-aﬃnity candidates alongwith iden�fying geometric growth vectors in lead candidates. SILCS thereby is an a�rac�ve solu�on to iden�fy func�onal group requirements for ﬂexible
binding pockets as well as eﬃciently driving hit-to-lead op�miza�on campaigns.

Validating novel determinants of metabolic disease using an
integrated CRISPR/Cas9 iPS diﬀerentiation platform
technology approachDeﬁniGEN Ltd. Babraham Research Campus, Cambridge CB22 3AT, UK.
2 Anne McLaren Laboratory of Regenera�ve Medicine, University of Cambridge, CB2 0SR, UK.

1

To validate the new therapeu�c target candidate outputs from disrup�ve AI approaches and a range “omic” technologies: gene�c, epigene�c andtranscriptomic, proteomic, and metabolomic, next genera�on phenotypic screening pla�orms are required. DeﬁniGEN pla�orm combines
CRISPR/Cas9-gene edi�ng, Nobel prize winning Yamanaka iPS stem cell and GMP-compa�ble directed diﬀeren�a�on to generate predic�ve diseasemodels for metabolic disease which are reﬂec�ve of the in vivo state. The pla�orm can generate models for complex diseases such as NAFLD/NASH in
which disease implicated loci are systema�cally modiﬁed alongside isogenic control lines which are iden�cal to the disease variant apart from theintroduced muta�on. This enables us to determine the contribu�on of a par�cular gene variant to the disease state. This approach is par�cularly
powerful for complex diseases where mul�ple genes and variants impact on the severity of disease progression.

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Marcus Yeo1, Filipa Soares1, Masashi Matsunaga1, Ludovic Vallier2Æ§uáQ26_Kdi;d>kG BZi>ktÈtÛÅ
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FOCUS ����(FOCUS)

Windows Server 2012R2/2016
MacOSX 10.13

�����������������:Ubuntu 14/16/18

Amazon Web Services(AWS)

RedHat 6/7

Microsoft Azure

CentOS 6/7

���� VPS(����������)��������:��������:������������(VNC)

PC �����MPI(OpenMPI, MPICH)

Windows PC����������

MacBookPro

web � � � � (Apache2, mySQL,
PHP, Perl, Python �)����������������
Tel: 052-720-7704
E-mail: info@biomodeling.co.jp
URL:

http://www.biomodeling.co.jp

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三井情報株式会社(MITSUI KNOWLEDGE INDUSTRY CO., LTD.)※表紙裏

ドットマティクス
(Dotmatics Ltd.)※裏表紙

株式会社クロスアビリティ(X-Ability Co., Ltd.)株式会社 ケー・エー・シー(KAC Co., Ltd.)
みずほ情報総研株式会社(Mizuho Information & Research Institute, Inc.)
株式会社知能情報システム(Chinou Jouhou Shisutemu Inc.)
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プロフェッショナル版・価格
・シングルライセンス：民間企業・官公庁 ￥150,000～、教育機関 ￥50,000～ (年間サブスクリプション版もあり)

・サイトライセンス(年間使用権) ：民間企業・官公庁 ￥600,000～、研究室 ￥100,000～ (複数年分のまとめ購入も可能)★ 2018年1月12日現在、自動車・電機・化学・素材・医薬品メーカー、国研・大学など644ユーザのシングルライセンス、
42機関での年間ライセンス契約があります。
＃ 全事業所で有効になるコーポレートライセンス (年間使用権) は、会社規模に応じてお見積もりいたします。
＃ 1ヶ月間全ての機能が使用可能なトライアル版が有ります。

企業広告＃ 教育機関に在籍中の学生限定で、プロフェッショナル版の約8割程度の機能を無償で使用可能な学生版もあります。
＃ 利用資格を限定しない分子モデリング及びMOPACを用いた計算のみが可能な無償版もあります。

株式会社クロスアビリティ

東京都文京区本郷4-1-5 石渡ビル3階

URL : https://winmostar.com/

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

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薬物動態試験・肝毒性試験に・・・+HSD5*®・初代肝細胞■+HSD5*®凍結バイアル■+HSD5*®増殖培養キット■+HSD5*®プレート播種タイプ■&<3$*5 +HSD5*®
 &<3$の発現を緑色蛍光で検出可能
鳥取大学（:2$薬物代謝酵素誘導および細胞毒性の評価方法、■ヒト凍結肝細胞

 接着 非接着 スフェロイド培養用■アニマル凍結肝細胞

 動物種：マウス、ラット、イヌ、サル 等

Stellate cells■ヒト凍結非実質肝細胞、星細胞■ヒト非凍結肝細胞（プレート播種タイプ）

ならびにそのためのベクターおよび細胞）が開発

'6ファーマバイオメディカル株式会社様から移管された、細胞、研究用試薬の取り扱いを開始いたしました!!

2018年
2018
年7月より、株式会社ケー・エー・シー
年7月より、株式会社ケー・エー・シーが運営しています。

各種細胞情報や細胞培養テクニカル動画
各種細胞情報や細胞培養テクニカルも配信しています。

株細胞、正常細胞、幹細胞から
株細胞、正常細胞、幹細胞
微生物株まで
微生物

受託試験■+HSDWRSDF®を使用した肝毒性の種差比較■近位尿細管上皮細胞を使用した腎毒性評価 等
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試薬事業部
KWWSZZZNDFQHWFRMS

研究用試薬7(/
(PDLOVKL\DNXLQIR#NDFQHWFRMSChem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

バイオ分子相互作用シミュレータ

MIZUHO/BioStation

従来計算することが困難であったタンパク質などの大規模分子や分子群の量子化学計算により、電子状態や精確な相互作用解析を可能にする量子化学計算プログラムパッケージです。
計算エンジンMIZUHO/ABINIT-MPと専用可視化プログラムMIZUHO/BioStation Viewerから構成されており、フラグメント分子軌道（FMO）法に基づいて計算された電子状態により、リガンド化合物とタンパク質との相互作用をアミノ酸残基や官能基単位で定量的に評価することができます。
詳細解析機能概要

IFIE解析
PIEDA解析IFIE map
VISCANA
CAFI
FILM
CHPI
グリッドデータ解析

フラグメント間相互作用エネルギー（IFIE）の定量的解析
IFIEを４つのエネルギー成分（静電項、交換反発項、電荷移動項、分散項）に分解して評価
全フラグメントペア間のIFIEを２次元マップにより表示し、相互作用パターンを解析
複数種のリガンド結合構造から得られるIFIEを用いた階層的クラスタリングによるリガンド類似性を解析
軌道レベルの電荷移動・分極相互作用解析
軌道レベルの分散相互作用解析（CH/π、π/π相互作用等）
CH/π相互作用を解析・可視化
電子密度、静電ポテンシャル、分子軌道、電場ベクトルを3次元的に可視化

計算手法・モデル
FMO法
エネルギー計算
基底関数
構造最適化
population解析
BSSE補正溶媒モデル

概要
フラグメントペア（FMO）、3体補正（FMO3）、4体補正（FMO4）
HF、MP2、LMP2、MP3（勾配計算：HF、MP2）
STO-3G、および6-31G基底系、モデルコアポテンシャル (MCP)BFGS法、CG法、PRCG法、部分構造最適化
Mulliken電荷、NBO電荷、ESP電荷Counterpoise法
Poisson-Boltzmann方程式に基づいた連続溶媒モデル

創薬分野におけるAI・機械学習／データ解析導入支援サービス
AI・機械学習・統計解析を活用した予測モデル構築、最適化、データ分析などの企画・プロトタイプ作成・システム構築サービスを通じて、創薬の研究開発・製造の課題解決をサポートいたします。

【導入プラン】

・適応局面の洗い出し・入手可能データ・情報の洗い出し・テーマと目標の設定
・最適なアルゴリズム、プログラム言語、
ライブラリ、環境の提案
・実現可能性の簡易評価

・データリポジトリの作成
・データ自動可能処理作成
・可視化機能の作成
・モデルの構築と検証・モデルの構築と検証・システム開発に向けた課題整理
・汎用利用を想定したシステム設計・開発
・ユーザーインターフェース作成
・講習、サポート【実装方法、開発ツール、基盤】※「㻮㼕㼛㻿㼠㼍㼠㼕㼛㼚」、「㻭㻮㻵㻺㻵㼀㻙㻹㻼」は、国立大学法人東京大学の登録商標であり、生産技術研究所革新的シミュレーション研究センター㻔㻯㻵㻿㻿㻕よりライセンス提供をいただいております。

お問い合わせ・資料のご請求

みずほ情報総研株式会社〒101-8443 東京都千代田区神田錦町二丁目番地
URL http://www.mizuho-ir.co.jp/solution/research/e-mail ss-sales@mizuho-ir.co.jp Tel 03-5281-5311

サイエンスソリューション部

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・開発言語：Python、R、C/C++、MATLABなど
・ライブラリ：TensorFlow、Chainer、scikit-learn、CNTK、OpenCVなど
・基盤：オンプレミス、クラウド（AWS、Azureなど）

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Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

CBI 学会 2019 年大会「構造生物学と情報科学の真の融合を目指して」
開催のご案内
会期：2019 年 10 月 22 日(火)－24 日(木)会場：タワーホール船堀（東京都江戸川区船堀 4-1-1）

開催趣旨：
SBDD が創薬に利用されるようになって久しくなります。しかしながら、それが日本の製薬会社における創薬研究で最大限に活用されているかといえば、現実はそれに程遠いものと感じられます。構造生物学が創薬に十分に生かされていない理由の主なものは、実際に見たいターゲットの構造をタイムリーに取得するのが難しく、そして、構造を解析する
速度が遅すぎて実際に製薬会社の求める創薬サイクルに供することができないことが挙げられると思います。これらの制限を回避するために、シミュレーションを利用する場合が多く、これまで構造生物学と情報科学は必ずしも最適な協調関係にあったとは言えません。
近年の構造生物学の進展は、この状況を一変させる可能性があります。一つはクライオ
電子顕微鏡を用いた単粒子解析により、結晶を用いなくても生体分子の原子分解能の構造を得られるようになったことです。これにより、構造解析の対象は超分子複合体や染色体のような巨大で柔軟な構造を持つものへと広がりつつあります。別の興味深い動きとしては、自由電子レーザーを用いた動的構造解析が挙げられます。これはフェムト秒パルスの X
線を用いてストロボ撮影のようにタンパク質の動きを捉える技術であり、これにより、数十フェムト秒で起こる化学反応から MD のシミュレーションでは計算機の能力から難しい
ミリ秒や秒にいたる広い範囲の時間分解能での構造変化のその場観察が可能になりました。
これらの二つの方法に共通しているのは、その解析に情報科学が大きな役割果たしうるという点です。単粒子解析のサンプルは異なった状態の構造が混ざっており、これをどのように処理していくかは大きな問題ですし、これを逆手にとって、多くの粒子のイメージ
からタンパク質の構造変化を一網打尽にできる可能性があります。自由電子レーザーの動的解析においては、タイムポイントをつなげるため、そして同期が徐々に外れていき複数の状態が混じったものを分離するためにも計算機科学との組み合わせは不可欠であると考えられます。
本大会では、上記の新手法やこれまでの方法の新展開なども含めて、構造生物学の新しい潮流をどのように情報科学と組み合わせ、それから創薬に役立つ情報を最大限に引き出すことができるのかについて、構造生物学と計算科学の専門家が集いディスカッションできればと考えています。

CBI 学会 2019 年大会
大会長

岩田 想

（京都大学大学院医学研究科）
実行委員長

上村 みどり（帝人ファーマ株式会社）－ 99 －CBI 学会 2018 年大会
2018 年 10 月 8 日発行

Chem-Bio Informatics Society Annual Meeting 2018

編集責任：西島 正弘 石田 誠一
制作責任：小長谷明彦
制作： 小澤陽子 小宮山直美 塚田優子
塩塚真理 岸早絵 高橋まき 藤田真澄
発行：CBI 学会 2018 年大会
事務局：〒160-0023
東京都新宿区西新宿 7-2-6 西新宿 K-1 ビル
新宿ビジネスガーデン 420 号室

Editor in chief : Masahiro Nishijima, Seiichi Ishida

October 8, 2018

Production Director : Akihiko Konagaya
Production Staff :Yoko Ozawa, Naomi Komiyama, Yuko Tsukada
Mari Shiozuka, Sae Kishi, Maki Takahashi, Masumi Fujita
Published by :Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2018

E-mail : cbi2018@cbi-society.org
URL: http://cbi-society.org/taikai/taikai18/
Copyright© 2018 CBI Society All rights reserved.
ISBN : 978-4-9909076-3-1

スケーラブル・サイエンティフィック
インフォマティックス・ソリューションズ

Dotmaticsの総合的な科学的なソリューションはバイオ医薬品および科学的な組織のための知識管理
データストレージ、企業のクエリとレポート作成およびデータ解析と可視化のためのツールが含まれています。

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