オンライン講習会の手引き「MATLABの実行方法」

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はじめに
• 東京大学情報基盤センター（以下，本センター）ではお試しアカウント付き並列プログラミング講習会「MATLABの実行方法」を開催します。

• 本講習会ではWisteria/BDEC-01システムを利用した実習を実施します。
• 本講習会は，Zoomを用いたオンライン講習会として実施します。

• 本資料は，オンライン講習会受講の事前準備について記載します。

• 本講習会においては，Wisteria/BDEC-01システムへログインできるようになっていることを前提とします。

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お願い等
• ハンズオンのためのPC，Zoom及びスーパーコンピュータ（以下，スパコン）へ接続するためのネットワーク環境は各受講者でご準備ください。
• PCは Windows/Microsoft Update，Apple Security Updateなどで最新のセキュリティアップデートを行ってください。
• 必ずウィルス対策ソフトウェアをインストールし，ウィルス検索を実行して問題がないことを事前に確認してから受講してください。
• セキュリティ対策未実施の場合はオンライン講習会受講を認めません。

• OSは、Windows，Mac，Linuxどれでも構いませんが、SSHを用いてセンターのスパコンへ接続ができることが必要です（後述）。
• 演習の実施に当たり，受講生にセンターのスパコンを1月間利用できる無料アカウント（お試しアカウント）を発行します。
3• PC上のソフトウェア類の準備• スパコンへのログイン• ログインしたら・・・• 講習会で使うZoomの設定

SSH環境の準備• Mac/Linuxの方はTerminalからsshコマンドが実行できればOK- Macは「アプリケーション」→「ユーティリティ」→「ターミナル」- $sudo dnf install openssh-clients # RHEL系ディストリビューションの場合- $sudo apt install openssh-client # Debian系ディストリビューションの場合• Windowsの方の場合，下記の選択肢があります- OpenSSHクライアントをインストールして，PowerShellから使用• 「Win＋i」>アプリ>オプション機能で，OpenSSHクライアントを追加（デフォルトで入っていなかった場合）• （SSHしたいだけであれば）この方法が一番簡単だと思われます• この資料では，この手順だけ説明します- WSLを使用（インストールに管理者権限が必要．簡単にLinuxを使う方法）- VirtualBox/VMware上に構築したLinuxを使用（中・上級者向け）- Cygwinを使用（管理者権限は不要だが，手順が煩雑）
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Windows PowerShellの起動方法
1. [Windows] + rを入力し，「ファイル名を指定して実行」
2. 名前とある欄に「powershell」と入力し，[Enter]（あるいは，「OK」をクリック）• 上記は手軽に起動する方法の一例- スタート画面にピン止めしておく，などとすると楽• デフォルトで入っているバージョンは古いので，表示される画面にしたがってアップデートしておくことを推奨- アップデート後には，上記の「名前」欄には「pwsh」と入力すれば見つかる
6• 以下では，Windowsに「OpenSSHクライアント」がインストール済みであるかを確認する方法と，（インストールされていなかった場合のために）インストールする方法を書いておきます• おそらくはデフォルトでインストール済みなので，後述のssh-keygenなどがうまく実行できなかった際には，以下を参照してください• Mac/Linuxの方，WindowsでWSLやCygwinを使う方はスキップしてください- 12ページの内容から確認してください7

OpenSSHクライアントの確認（1/4）
1. [Windows] +iで「Windowsの設定」を開く
2. 「アプリ」をクリック

8

OpenSSHクライアントの確認（2/4）• 「オプション機能」をクリック

9OpenSSHクライアントの確認（3/4）• 「インストールされている機能」に「OpenSSHクライアント」が含まれていれば，何もしなくてOK• 含まれていなかったら，「機能の追加」から「OpenSSHクライアント」をインストール- 注：「OpenSSHサーバー」は不要です• 右側はWindows 11の例

- Windows 10の例は次のページ

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OpenSSHクライアントの確認（4/4）• 「インストールされている機能」に「OpenSSHクライアント」が含まれていれば，何もしなくてOK• 含まれていなかったら，「機能の追加」から「OpenSSHクライアント」をインストール- 注：「OpenSSHサーバー」は不要です• 右側はWindows 10の例

1112• PC上のソフトウェア類の準備• スパコンへのログイン• ログインしたら・・・• 講習会で使うZoomの設定

スパコンへのログイン• SSH公開鍵認証（SSH Public Key Authentication,SSH=Secure Shell）に基づく– パスワード認証よりも安全，と言われている• 手順– Windows：PowerShellを立ち上げる，Mac・Unix：Terminal起動– ①PC上で鍵（秘密鍵，公開鍵）を生成する• 秘密鍵，公開鍵• パスフレーズ（Passphrase）：鍵認証のためのパスワード– ②スパコンポータルサイトにログインする• センターから供給された利用者ＩＤ（tVWXYZ）と「初期パスワード」を使用• ポータルサイトにログイン後，パスワード（Password）変更を求められる，字数，使用文字等に色々規則があるので注意すること– ③スパコンポータルサイトに「公開鍵」を登録する– ④ＰＣからsshによってスパコンにログインする①PC上で鍵（秘密鍵，公開鍵）を生成（1/3）$ ssh-keygen -t rsaGenerating public/private rsa key pair.
Enter file in which to save the key (/home/user/.ssh/id_rsa):
Enter passphrase (empty for no passphrase): Your Favorite Passphrase
Enter same passphrase again: Same Passphrase
Enter
Your identification has been saved in /home/user/.ssh/id_rsa.
Your public key has been saved in /home/user/.ssh/id_rsa.pub.

EnterEnter

The key fingerprint is:
SHA256:vt88O+PTcscHkOyabvxGjeRsMWLAWds+ENsDcReNwKo nakajima@KNs-NEW-VAIO
The key's randomart image is:+---[RSA 2048]----+|. o=oo.o+ |操作手順|+ O... .|• ssh-keygen –t rsa <Enter>|.+o+.
||+oB.
|• <Enter>|So *o*|• お好きなPassphrase <Enter>
|.E
B.o |
|
.. = . o |• 同じPassphrase <Enter>|.=oB o +|• 「空のPassphrase」は厳禁|.+o+*O ..|+----[SHA256]-----+

①PC上で鍵（秘密鍵，公開鍵）を確認（2/3）$ cd .ssh$ ls
id_rsaid_rsa.pub⇒秘密鍵（Private Key）
⇒公開鍵（Public Key）

$ cat id_rsa.pub
ssh-rsa
AAAAB3NzaC1yc2EAAAADAQABAAABAQDa6InmOYYaCrWjQDukjiNEfdW8veUwJyZtEI3oDu0A28eey6p0wbtI7JB09xnI17O7HG4yYvOM81+/nlAHy5tAfJly0dsPzjTgdTBLdg
i3cSf5pWEY6U96yaEr0Ei8Wge1HkXrhcwUjGDVTzvT0Refe6zLdRziL/KNmmesSQfR5lsZ/ihsjMgFxGaKsHHq/IErCtHIIIf9V/Ds2yj6vkAaWH6asBn+ZsRiRFvwHPhkYAnp/j3LY6b8Qfqg0p4WZRenh/HgySWTYIGi8x67VzMaUlm9qlK0QFMCaK2rivX1fmbwyWJ/vrWDqiek6YXoxLDu+GPeQ4CPvxJcZnqF9gf3 nakajima@KNs-NEW-VAIO

①公開鍵をコピー（3/3）$ cd .ssh$ ls
id_rsaid_rsa.pub$ cat id_rsa.pub

操作手順• cat id_rsa.pub <Enter>• “ssh-rsa”にカーソルを合わせ• 最後の「nakaima@KNs-NEW-VAIO」まで含める。ここに漢字が含まれている場合は含めず、後で適当に付け足す。

ssh-rsa
AAAAB3NzaC1yc2EAAAADAQABAAABAQDa6InmOYYaCrWjQDukjiNEfdW8veUwJyZtEI3oDu0A
28eey6p0wbtI7JB09xnI17O7HG4yYvOM81+/nlAHy5tAfJly0dsPzjTgdTBLdgi3cSf5pWEY
6U96yaEr0Ei8Wge1HkXrhcwUjGDVTzvT0Refe6zLdRziL/KNmmesSQfR5lsZ/ihsjMgFxGaK
sHHq/IErCtHIIIf9V/Ds2yj6vkAaWH6asBn+ZsRiRFvwHPhkYAnp/j3LY6b8Qfqg0p4WZRenh/HgySWTYIGi8x67VzMaUlm9qlK0QFMCaK2rivX1fmbwyWJ/vrWDqiek6YXoxLDu+GPeQ4CP
vxJcZnqF9gf3 nakajima@KNs-NEW-VAIO

②スパコンポータルサイトにログイン（1/3）
情報基盤センターから送付されたファイル

Wisteria/BDEC-01)
2021年5月20日

2021年6月

2021年7月

t00XYZPASSWORD

情報基盤センターから送付された利用者ID（t00XYZ）

情報基盤センターから送付された初期パスワード（8桁）

②スパコンポータルサイトにログイン（2/3）
https://wisteria-www.cc.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/hpcportal.ja/index.cgi

情報基盤センターから送付された利用者ID（t00XYZ）

情報基盤センターから送付された初期パスワード

②初期パスワードの変更（3/3）
情報基盤センターから送付された初期パスワード

変更後のパスワードを入力（2回）

パスワード規約に注意

③ 公開鍵登録（id_rsa.pub） (1/2)

1. 「SSH公開鍵登録」を選択
2. 先ほどCopyした「id_rsa.pub」を貼り付ける
3. 「登録」をクリック

③ 公開鍵登録（id_rsa.pub） (2/2)

4. ここを確認！

各システム情報・利用支援ポータルサイト• Wisteria/BDEC-01 日本語• https://www.cc.u-tokyo.ac.jp/supercomputer/wisteria/service/• https://wisteria-www.cc.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/hpcportal.ja/index.cgi• Wisteria/BDEC-01 English• https://www.cc.u-tokyo.ac.jp/en/supercomputer/wisteria/service/• https://wisteria-www.cc.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/hpcportal.en/index.cgi

22④PCからログイン（1/2）
Enter$ ssh t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp
The authenticity of host ‘wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp' can't be established.
ECDSA key fingerprint is SHA256:/XXXXX …
Enter
Are you sure you want to continue connecting (yes/no/[fingerprint])? yes
Warning: Permanently added ‘wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp' to the list of known hosts.
Enter passphrase for key '/home/user/.ssh/id_rsa: Your PassphraseEnter

1. ssh t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp <Enter>yes <Enter>2. yes
3. 鍵生成時に打ち込んだPassphrase <Enter>④PCからログイン（1/2）（2回目以降）$ ssh t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp
Enter passphrase for key '/home/user/.ssh/id_rsa:

Your Passphrase

1. ssh t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp <Enter>2. 鍵生成時に打ち込んだPassphrase <Enter>Enter

④PCからログイン（2/2）-------------------------------------------------------------------------------Wisteria/BDEC-01 Information
Date: May. 28, 2021-------------------------------------------------------------------------------Welcome to Wisteria/BDEC-01 system* Operation Schedule
05/28(Fri) 22:00 - 06/09(Fri) 08:30
06/09(Wed) 08:30 - 06/09(Wed) 17:30
06/09(Wed) 17:30 - 06/25(Fri) 09:00
06/25(Fri) 09:00 - 06/25(Fri) 22:00
06/25(Fri) 22:00 -Normal Operation
HPC Challenge
Normal Operation
System Maintenance
Normal Operation

ログインに成功したら，今後のメインテナンスのスケジュールなどが表示される

For more information about this service, see
https://www.cc.u-tokyo.ac.jp/supercomputer/schedule.php* How to use
Users Guide can be found at the User Portal (https://wisteria-www.cc.u-tokyo.ac.jp/).
If you have any questions, please refer to the following URL and contact us:
https://www.cc.u-tokyo.ac.jp/supports/contact/
Last login: Sat May 29 21:35:15 2021 from 133.11.59.131[t00XYZ@wisteria01 ~]$このURL（質問）にはアクセスしないこと

SSH公開鍵認証の手順（1/4）①PC上での秘密鍵・公開鍵作成$> ssh-keygen –t rsa
id_rsa
秘密鍵/Private Key+ Passphrase
id_rsa.pub
公開鍵/Public Key

Wisteria

OBCXPortal Site
Wisteria

id_rsa
秘密鍵/Private Key+ Passphrase
id_rsa.pub
公開鍵/Public Key

tXYZZZ+ Password

tABCCC+ Password

Portal Site
OBCX

SSH公開鍵認証の手順（2/4）②スパコンポータルサイトへのログイン

Wisteria

OBCX

SSH公開鍵認証の手順（3/4）③公開鍵（id_rsa.pub）の登録

id_rsa
秘密鍵/Private Key+ Passphrase

id_rsa.pub
公開鍵/Public Key

Portal Site
OBCX

id_rsa.pub
公開鍵/Public Key

Portal Site
Wisteria

同じ公開鍵を複数のスパコンに登録可能

Wisteria

OBCX

SSH公開鍵認証の手順（3/4）③公開鍵（id_rsa.pub）の登録

id_rsa
秘密鍵/Private Key+ Passphrase

Portal Site
OBCX

Portal Site
Wisteria

同じ公開鍵を複数のスパコンに登録可能
id_rsa.pub
公開鍵/Public Key
Wisteria

id_rsa.pub
公開鍵/Public KeyOBCXSSH Public Key Authentication
SSH公開鍵認証• id_rsa

SSH= Secure Shell• Private Key（秘密鍵） ：PC上
• 文字通り「秘密」にしておくこと• 他の人に送ってはいけない• 基本的には作成した場所からコピーしたり移動することもしないこと• id_rsa.pub• Public Key（公開鍵）：スパコン上• コピー可能，他の人にe-mailで送ることも可能• もし複数のPCからスパコンにログインする場合は，各PCごとに「公開鍵・秘密鍵」のペアをssh-keygenによって作成• 各スパコンに複数の公開鍵を登録することは可能• スパコン上の公開鍵のうちの一つがPC上の「秘密鍵＋Passphrase」とマッチすると確認されるとログインできる30

SSH公開鍵認証の手順（4/4）④PCからスパコンへのログイン

id_rsa
秘密鍵/Private Key+ Passphrase

Portal Site
OBCX

id_rsa
秘密鍵/Private Key+ Passphrase

Portal Site
Wisteria

秘密鍵（id_rsa）＋Passphrase
id_rsa.pub
公開鍵/Public Key
Wisteria

id_rsa.pub
公開鍵/Public Key
OBCX

id_rsa
秘密鍵/Private Key

id_rsa
秘密鍵/Private Key+ Passphrase
id_rsa.pub+ Passphrase

公開鍵/Public Key

id_rsa.pub

公開鍵/Public Key

Portal SiteOBCX$> ssh-keygen –t rsa

Portal Site
Wisteria

複数のPCからスパコンへログインする場合には各PCで「公開鍵・秘密鍵」のペア作成
id_rsa.pub
公開鍵/Public Key
Wisteria

id_rsa.pub
OBCX
公開鍵/Public Key
OBCX

スパコンには複数の公開鍵を登録できる

スパコンには複数の公開鍵を登録できる$ cd .ssh$ ls authorized_keys
authorized_keys.ssh/authorized_keysには登録された公開鍵が格納されている。このファイルの後ろに新たな公開鍵（new_public.key）
を付け加えることもできる。

$ cat authorized_keys
ssh-rsa
HGCAB3NzaC1yc2EAAAABIwAAAQEA1r0Hr8M1JIJBO2n9S0GQm0xzGCwh3PpcJo7Z8oDr6HCAXhbKz
HA0ibRMJFCwDJCRGNJlYiHEYHWzouuXGNa9teso7aXYkq2PxbO76C60ZCPoLqf/jQRqnUSnjHJ4Ug
mDdlQWaAks+q/2ExOwjBB6GZmaHGijTximOFGiM1DI78OHkHC8pFzjvP2kT9yRvykvOVvlG10VYi+5CawYfuROiRBjfUS47RSOlCzjNP20pYO57DUCfOv+/8B1+l1wilbjKQHjuNp5XuclFfFdGaxfJchD/sB5sRxtYfz80xzwGmN8pVecpUjd//xAqdYYHmLAKUE2oH8MnBIRybpWGVie6w64
ssh-rsa
AAAAB3NzaC1yc2EAAAADAQABAAABAQDa6InmOYYaCrWjQDukjiNEfdW8veUwJyZtEI3oDu0A28eey
6p0wbtI7JB09xnI17O7HG4yYvOM81+/nlAHy5tAfJly0dsPzjTgdTBLdgi3cSf5pWEY6U96yaEr0E
i8Wge1HkXrhcwUjGDVTzvT0Refe6zLdRziL/KNmmesSQfR5lsZ/ihsjMgFxGaKsHHq/IErCtHIIIf
9V/Ds2yj6vkAaWH6asBn+ZsRiRFvwHPhkYAnp/j3LY6b8Qfqg0p4WZRenh/HgySWTYIGi8x67VzMa
Ulm9qlK0QFMCaK2rivX1fmbwyWJ/vrWDqiek6YXoxLDu+GPeQ4CPvxJcZnqF9gf3$ cp authorized_keys tmp$ cat tmp new_public.key > authorized_keys

id_rsa
秘密鍵/Private Key

id_rsa
秘密鍵/Private Key+ Passphrase
id_rsa.pub+ Passphrase

公開鍵/Public Key

id_rsa.pub

公開鍵/Public Key

Portal Site
OBCX$> ssh-keygen –t rsa

Portal Site
Wisteria

各スパコンに複数の鍵を登録する
id_rsa.pub
公開鍵/Public Key

id_rsa.pub

公開鍵/PublicWisteria Key
id_rsa.pub
OBCX
公開鍵/Public Key

id_rsa.pub

OBCX
公開鍵/PublicKey• PC上のソフトウェア類の準備• スパコンへのログイン• ログインしたら・・・• 講習会で使うZoomの設定

PCからログイン$ ssh t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp
Enter passphrase for key '/home/user/.ssh/id_rsa: Your Passphrase

1. ssh t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp <Enter>2. 鍵生成時に打ち込んだPassphrase <Enter>Enterログインしたら$ pwd/home/t00XYZ$ cd /work/gt00/t00XYZ$ pwd/work/gt00/t00XYZ
$ cd
$ pwd
/home/t00XYZ

1. ログインしたら「/home/t00XYZ」に入る
2. /homeは容量が少ないので「/work/gt00/t00XYZ」に移動すること
3. 「cd」でホームに戻れますCopy：PC to Wisteria$ scp ./a.dat

39t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp:

PC上のCurrent Directoryに例えば「a.dat」というファイルがあるとき、「a.dat」をWisteriaのホームディレクトリ（/home/t00XYZ）の下にコピーする$ scp ./a.dat

t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp:/work/gt00/t00XYZ/test/

PC上のCurrent Directoryに例えば「a.dat」というファイルがあるとき、「a.dat」をWisteria上のディレクトリ「/work/gt00/t00XYZ/test」の下にコピーする$ scp -r ./testL t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp:
PC上のCurrent Directory下に例えば「testL」というディレクトリがあるとき、「testL」及びその中身をWisteriaのホームディレクトリ（/home/t00XYZ）の下にコピーする$ scp -r ./testL t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp:/work/gt00/t00XYZ/test
PC上のCurrent Directory下に例えば「testL」というディレクトリがあるとき、 「testL」及びその中身をWisteria上のディレクトリ「/work/gt00/t00XYZ/test」の下にコピーするCopy：Wisteria to PC

40$ scp t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp:~/a.dat ./Wisteriaのホームディレクトリ（/home/t00XYZ）下に例えば「a.dat」があるとき、PC上のCurrentDirectory下に「a.dat」をコピーする$ scp t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp:/work/gt00/t00XYZ/test/a.dat ./Wisteria上にディレクトリ「/work/gt00/t00XYZ/test/」があり、その中に「a.dat」があるとき、「a.dat」をPC上のCurrent Directoryにコピーする$ scp -r t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp:~/L1 ./Wisteriaのホームディレクトリ（/home/t00XYZ）下にディレクトリ「L1」があるとき、「L1」とその中身をPC上のCurrent Directoryにコピーする$ scp -r t00XYZ@wisteria.cc.u-tokyo.ac.jp:/work/gt00/t00XYZ/test/L1 ./Wisteria上のディレクトリ「/work/gt00/t00XYZ/test/L1」があるとき、「L1」とその中身をPC上のCurrent Directoryにコピーするポータルサイトでのマニュアル等閲覧（1/2）

ポータルサイトでのマニュアル等閲覧（2/2）

• PC上のソフトウェア類の準備• スパコンへのログイン• ログインしたら・・・• 講習会で使うZoomの設定

Zoomの準備• ダウンロード：https://zoom.us/download#client_4meeting• クライアントを事前にインストールしてください。
– 今回、各自のZoomアカウントを作る必要はありません。

• インストール済みの方は、必ず最新バージョンに更新してください。
– 最新バージョンでないと接続できない可能性があります• 使い方：
https://utelecon.adm.u-tokyo.ac.jp/zoom/how_to_use