データの再現性と再利用を促進するデータジャーナル―Scien fic Dataを例に―
2016.2.8

Open ResearchMarketing Manager
新谷洋子

Nature Publishing Group1

オープンアクセスから、より再利用可能な研究へ

ROARMAP, http://roarmap.eprints.org/[Title for presentation / Date to go here]
ROARMAP
http://roarmap.eprints.org/

1

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figshare.com/blog/[Title for presentation / Date to go here]

Hahnel, Mark (2015): Global funders who require data archiving as a condition of grants.
figshare. http://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.1281141

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なぜデータを公開するのか？
 投資への費用対効果を増大（研究費と時間）
 他者の目にさらすことで新しい仮説の検証を可能に 複数の研究結果を使ったメタ分析を効率的に行う
 異なるデータセット間の統合を可能に 科学的発見の再現性や妥当性の検証
 誤りや不正を未然に防ぐ
研究結果の透明性を高め、再現性を確証し、再利用や新しい発見を促すには論文をオープンアクセスにするだけでは不十分
 付随する他の成果物（データ、プロトコル、ソースコード）も自由に利用できる形で公開する必要がある[Title for presentation / Date to go here]

4•

すべての研究プロジェクトが研究成果に結びつくわけではない•

研究データが死蔵されてしまう•

価値のある情報が発見しにくい場所に置かれてしまう•

データリポジトリ不足またはデータリポジトリの認知不足•

データを公開するのは勿体無い•業績を出すことに負われてデータ公開に時間をかけられない•

データを整備して公開する作業に対する見返りが少ない•

自身が公開したデータの不適正な再利用に関する懸念•

公開されているデータの使い勝手が悪い•

データ自体の査読は主要なジャーナルでは行わない[Title for presentation / Date to go here]機会インセンティブ

有用性

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機会

インセンティブ

有用性

価値のある研究データが死蔵されてしまう

データを出版することで得られるインセンティブが不足

公開されているデータが本当に役立つのか微妙

データを出版し、データが世に出る機会を創出

引用可能な出版物としてクレジット（業績）になる

データ記述、データ自体も査読をして有用性を検証[Title for presentation / Date to go here]6

データ論文とは？

• データについて記述したものを査読して出版することでデータの利活用を促進• データ記述を引用可能な文献（業績）にし、データを公開したことがクレジットになるデータ論文を出版するデータジャーナルが誕生
GigaScience, Earth Systems Science Data, etc.
[Title for presentation / Date to go here]

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Key survey data
• 60％の研究者はすでに他の研究者とデータをシェアしている• 50％はそういったシェアされたデータを月に一度は見ている• 45％はどこにデータをポストしたらよいのかわからない• 90％がデータジャーナルのコンセプトを肯定的に受け止めた• 80％がデータジャーナルの存在がデータの共有を促すだろうと考えた
Survey respondent characteristics• 回答者 387 (329が現役の研究者)• 物理学(24%), 地球・環境科学(21%), ⽣物学(20%) ,化学(19%) その他(16%)[Title for presentation / Date to go here]

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データ出版に関して研究者が望むことは？
••••

96% データの認知度や見つけやすさの向上
95% データ自体のユーザビリティの向上
93% データを公開することによるクレジット
80% データセットやコンテンツの査読

Nature Publishing Group (2014): Data publication survey ‐ raw data. figshare.
http://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.1234052[Title for presentation / Date to go here]

9Credit：クレジット
引用可能な形で研究データを公開できるので、クレジットが得られます

Open：オープン
クリエイティブコモンズライセンスでデータの再利用を推進します

Reuse：再利用
データ記述をキュレーションによって標準化し再利用に役立てます

Quality：品質
各コミュニティーの基準に基づいた厳格な査読と社内キュレーションで品質と再利用性を保証します

既存のデータリポジトリの利用促進
各研究コミュニティに特化した既存のデータリポジトリへのデータ公開をサポートします[Title for presentation / Date to go here]10

http://www.nature.com/sdata/[Title for presentation / Date to go here]

11

•
•

2014年5月創刊
オンライン限定のオープンアクセス誌：誰でも利用可能•

自然科学、物理学、社会科学のデータセットを掲載する査読誌•

科学的に貴重なデータセットの記述を掲載•

新しい形式のコンテンツ「Data Descriptor」を掲載

Data Descriptorとは？
•

実験・観察データセットの詳細な記述を提供するための新しい論文形式•

論文ではなく“Data Descriptor”つまり、データについての説明を記述したもの•

データ収集の背景、データ所蔵場所、データ取得方法、データの品質を示す技術的分
析、データ利用方法などの記述•

新たな仮説の検証、知見、手法などは含まない•

コンピューター処理可能な形式に、実験デザイン情報【表】をメタデータとして落とし込んだものが論文に付随[Title for presentation / Date to go here]12

Data Descriptor
社内キュレーション:• 著者がデータを構造化されたコンテンツにする際のサポート• 実験メタデータにセマンティックな解釈など付加価値をつける

analysis
methodData file orrecord in a
database

script[Title for presentation / Date to go here]13

Data Descriptor

Human readable
Human readable
representation
ofrepresentation
study of study
i.e.i.e.
article(HTML&&PDF)
article(HTMLPDF)

1[Title for presentation / Date to go here]

Machine readable
representation of
study
i.e. metadata

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Data Descriptor

Humanreadable
Sections:
Humanreadable
representationof• Titlerepresentationof study• study
Abstract
i.e.i.e.
article(HTML&&PDF)& Summaryarticle(HTML• Background
PDF)• Methods• Data Records• Technical Validation• Usage Notes• Figures & Tables• References• Data Citations

1[Title for presentation / Date to go here]

Methods：
データの作成方法を記載
Machine readable
Data Records:
representation of
各データと情報の所在、フォーマットを記載
study
i.e. metadata
Technical Validation：
データの質を裏付けるのに必要な実験または分析を記載
Usage Note：
データの再利用に関する助言を記載 (optional)
Data Citations:
データの書誌情報

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Data Descriptor

Humanreadable
Sections:
Humanreadable
representationof• Titlerepresentationof study• study
Abstract
i.e.i.e.
article(HTML&&PDF)& Summaryarticle(HTML• BackgroundPDF)• Methods• Data Records• Technical Validation• Usage Notes• Figures & Tables• References• Data Citations

1[Title for presentation / Date to go here]

Methods：
データの作成方法を記載
Machine readable
Data Records:
representation of
各データと情報の所在、フォーマットを記載
study
i.e. metadata
Technical Validation：
データの質を裏付けるのに必要な実験または分析を記載
Usage Note：
データの再利用に関する助言を記載 (optional)
Data Citations:
データの書誌情報

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•
•
•
•

http://www.nature.com/articles/sdata201526[Title for presentation / Date to go here]16

New Dataset
Data in Dryad
Citizen science
Crowd science

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•
•
•
•

http://www.nature.com/articles/sdata201526[Title for presentation / Date to go here]17

New Dataset
Data in Dryad
Citizen science
Crowd science

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•
•
•
•

http://www.nature.com/articles/sdata201526[Title for presentation / Date to go here]18

New Dataset
Data in Dryad
Citizen science
Crowd science19

出版されたさまざまなData Descriptor
古いデータセット
計算に基づき作成されたデータとソースコー
ドの公開

インパクトの高い論文に付随するデータ

単一実験によるデータセット[Title for presentation / Date to go here]

1

キュレーションにより集約されたデータ
リソース
大規模研究コンソーシアムによるデータセット

著者が価値があると考え、他の人も使えるデータを対象とします20

Scientific Dataはコミュニティーに認知されたデータリポジトリにデータセットを登録することを推奨

約90のリポジトリと提携しています•

現在 80近くのデータリポジトリと提携•

生命科学、医学、化学、物理学、社会科学*どのリポジトリに登録するべきか、著者にアドバイスもしています[Title for presentation / Date to go here]

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[Title for presentation / Date to go here]

21

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2015年最もアクセスされたData Descriptor:
Snapshot Serengeti, high‐frequency annotatedcamera trap images of 40 mammalian species in an
African savanna*上記数値は2016年2月8日現在のもの

2015年最も引用されたData Descriptor:
Global integrated drought monitoring andprediction system
Publishing Better Science through Better Data (毎年開催）
ISA Explorer テスト運用開始(2015.12‐‐)

Data Curation Editor がRDAに合わせて来日[Title for presentation / Date to go here]

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 オープンサイエンスと研究データ公開義務化の波 研究データ公開における複数の課題
 解決策としてデータ論文、データジャーナルが誕生 データを発見・検索・理解しやすいフォーマットにより再現性を確保、再利用を促進 データを登録、保管するデータリポジトリとの協同によりデータ公開を促進 正しいデータ公開を促すことでオープンサイエンスを加速[Title for presentation / Date to go here]

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Supported byHonorary Academic Editor
Susanna-Assunta Sansone
Managing Editor
Andrew L. Hufton
Data Curation Editor
Varsha K. Khodiyar
Advisory Panel and Editorial Board
including senior researchers, funders,librarians and curators[Title for presentation / Date to go here]

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