BL14B2 XAFS 標準試料データベース(BENTEN 版)使用手順
2022.3.30 大渕 博宣
1. データベースサイトへの接続(1) インターネットブラウザより、SPring-8 実験データ転送システム BENTEN のURL(https://benten.spring8.or.jp/)を開く。URL を開くと、トップページ(図 1)が表示される。

図1

SPring-8 実験データリポジトリトップページ画面(2) UI サイト(SPring-8/SACLA 電子申請システム(https://user.spring8.or.jp/))のアカウントがある場合は、ユーザー名(SPring-8 ID)及びパスワードを入力し、Login ボタンをクリックする。
個人のメールアドレスでログインする場合は、Login ボタン下の”Guest login with Email”をクリックする。図 2 のようなゲストログイン画面が表示されるので、メールアドレスを入力し、Login ボタンをクリックする。正常にログインが行われると、メールアドレス認証(2 要素認証)に関する画面(図 3)が表示される。
※UI サイトのアカウントを新規作成後、本データベースサイトにログインできるまで手続きに一日程度かかります。

1

図 2 個人のメールアドレスでのゲストログイン画面

図3

メールアドレス認証(2 要素認証)に関する画面(3) 「次へ進む(メール送信)/Send Email」ボタンを押すと、メール確認を促す画面が表示される(図 4)。

2

図4

メール送信画面(4) UI サイトに登録されたメールアドレスに届いた BENTEN 承認に関するメールを確認する(図 5)。

図 5 BENTEN 認証に関するメール(5) メールに記載されたリンクをクリックすると、認証を促す画面(図 6)が表示される。
※「次回から同一端末からのログイン時による認証をスキップする」のチェックを入れておくと、次回から同一端末でのメールアドレス認証が一定期間省略される。

3

図 6 BENTEN 認証画面
(6) 「認証します/Authenticate」ボタンを押すと、認証完了画面(図 7)が表示される。
（確認後は画面を閉じてください。
）

図 7 アカウント認証画面(7) 図 4 のメール送信画面がデータ閲覧画面(図 8)にリダイレクトされる。

4

図 8 データ閲覧画面

5

2. 標準試料データの閲覧
2-1. データの閲覧(1) 画面左のツリー表示から、図 9(a)のような画面が表示される。ツリーのフォルダ階層は・root(図 9(a))
・SPring-8(図 9(b))
・BL14B2(図 9(c))
・XAFS_Standard (XAFS 標準試料データ登録フォルダ、図 9(d))
・吸収元素(図 9(e))
・吸収端(K 又は L3,2,1、図 9(f))
・結晶面(Si(111)又は Si(311)、図 9(g))
・標準試料名(図 9(h))の順番となっている。該当データ欄には、ツリー表示で選択したフォルダの一段下のフォルダ(最下層の場合、フォルダに含まれるデータファイル)の情報が表示される。

root を選択

ツリー表示画面
該当データ表示画面

該当データサムネイル画像及びメタデータ表示画面

図 9 (a) ツリー表示初期画面(ツリー表示のトップ(root)を選択)

6SPring-8 を選択(b) SPring-8 を選択した場合

BL14B2 を選択(c) BL14B2 を選択した場合

7

XAFS_Standard を選択(d) XAFS_Standard を選択した場合

Cu を選択(e) 元素名を選択した場合(Cu を選択)

8

K を選択(f) 吸収端を選択した場合(K を選択)

111 を選択(g) 結晶面を選択した場合(111 を選択)

9

Cu-foil を選択(h) 試料名を選択した場合(Cu-foil を選択)
2-2. 実験データ情報の閲覧(1) ツリー表示から閲覧したい試料のフォルダを選択し、該当データ画面を表示させる(図 10)。

図 10

該当データ画面の表示(Cu-foil を選択)

(2) 右上の該当データ画面内のいずれかのデータをクリックする。クリックすると、実験デー
タ情報(図 11(a)サムネイル画像、(b)簡易情報)が表示される。

10

いずれかをクリック

(a)

スクロール

(b)

図 11 実験データ情報画面((a) サムネイル画像 (b) 簡易情報(右下画面を下にスクロール))11

2-3. 実験データの種類(1) BL14B2 XAFS 標準試料データベースには、1 つの登録番号に対し 3 種類の実験データ(拡張子 dat,ex3,txt((fitted encoder 処理のある場合は 5 種類))、及び実験データの詳細情報(metadata.main.yml、metadata.data_format.yml、metadata.data_info.yml)が登録されている。

(a)

図 12

(b)

データベースの登録データ((a)Cu-foil、(b)Pd-foil)

実験データのファイル名には、以下のような順番で測定情報が表記されている。
吸収元素－吸収端－試料名－結晶面－積算時間－測定年月日－(fe).拡張子
図 12 の各登録データのファイル名に表記された測定情報例を以下に示す。
(例 1) Cu-K_Cu-foil_Si111_50ms_120613.dat
吸収元素：Cu
吸収端：K 端試料名：Cu-foil
結晶名：Si(111)
積算時間：1 点あたり 50msec
測定年月日：2012 年 6 月 13 日
拡張子：測定データ(9809 フォーマット)(例 2) Pd-K_Pd-foil_Si111_50ms_150511_fe.txt
吸収元素：Pd
吸収端：K 端試料名：Pd-foil
結晶名：Si(111)
積算時間：1 点あたり 50msec
測定年月日：2015 年 5 月 11 日
fe：fitted encoder 処理あり(※)
拡張子：XAFS 解析ソフトウェア Athena で読み込み可能(※)「XAFS データ変換プログラム」マニュアル参照(http://support.spring8.or.jp/xafs.html よりダウンロード可能)
12また、実験データの拡張子のファイル形式を表 1 に示す。
表 1 拡張子のファイル形式
拡張子

ファイルの種類

dat

測定データ(9809 フォーマット)

ex3

XAFS 解析ソフトウェア REX2000 で読み込みが可能txt

XAFS 解析ソフトウェア Athena で読み込み可能

拡張子 yml のファイルには標準試料、測定条件、測定データ、主要項目等の情報が記載されている。これらは YAML 形式のテキストファイルであり、テキストエディタやブラウザにて
閲 覧 可 能 で あ る ( 図 12) 。 現 在 、 metadata.main.yml 、 metadata.data_format.yml 、metadata.data_info.yml の 3 種類が登録されている。各 yml ファイル内の項目を表 2 に示す。

図 13 metadata.main.yml ファイル (PbO、Visual Studio Code にて表示)
13

表 2 yml ファイルに記載されている各項目(a) metadata.main.yml
sample(サンプルのカテゴリ)
chemical_formula

試料の化学式

lot_number

試料のロット番号model_number

試料の品番

name

試料名

supplier

試料の製造会社名tag

本試料(main、I0-I1 検出器にて測定)
又は参照試料(reference、I1-I2 検出器にて測定)

measurement(測定パラメータのカテゴリ)
category

計測法カテゴリ

sub_category

計測法サブカテゴリ

absorption_edge

測定元素及び吸収端

instrument(測定器のカテゴリー)
vertical_size[mm]4D スリットサイズ((W)幅)horizontal_size[mm]4D スリットサイズ((H)高さ)

type

測定時の I0、I1、I2 検出器の種類

gas

I0、I1、I2 検出器に使用したガスの種類

HV[V]

I0、I1、I2 検出器への印可電圧値

amp_gain[V/A]

I0、I1、I2 検出器のゲイン値

localmeasurement_time[sec]測定開始から終了までにかかった時間

xafs_filename_list

実験データファイル名(9809 フォーマット)(b) metadata.data_format.yml

xafs_raw_data_format(測定データのカテゴリ)
extension

拡張子

name

項目名

unit

単位

additional_metadata

各項目の追加情報

xafs_processed_data_format(変換データのカテゴリ)
extension

拡張子

name

項目名

unit

単位

formula

測定データからの変換式

additional_metadata

各項目の追加情報14(c) metadata.data_info.yml
proposal_number

課題番号

access_rights

アクセス権限data_depositor(データ記入者のカテゴリ)
name

データ記入者の名前

organization

データ記入者の組織

contact_name(データ責任者のカテゴリ)
name

データ責任者の名前

organization

データ責任者の組織

role

データ責任者の役割

15

4．実験データのダウンロード
4-1 データのダウンロード方法(1) ダウンロードしたい試料の実験データにチェックを入れる(図 14)。

チェックを入れる

図 14

実験データ情報画面(Cu-foil)(2) 画面上の「DOWNLOAD CHECKED ITEMS」ボタンを押す。zip ファイル保存メッセージが表示されるので、任意のフォルダに保存する。

図 15

実験データ保存画面(Microsoft Edge の場合)

16

4-3 複数データのダウンロード方法(1)

複数のデータを一度にダウンロードしたい場合は、ダウンロードしたいデータのチェックボックスにチェックを入れて「DOWNLOAD CHECKED ITEMS」ボタンをクリックする(図16(a)-(c))。

図 16(a) 試料毎にダウンロードする場合(b)

結晶面毎にダウンロードする場合

17

(c) 吸収元素毎にダウンロードする場合

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改訂履歴
改訂年月日

改訂者

2020.1.7

大渕 博宣

2020.1.16

大渕 博宣

2020.4.23

大渕 博宣

2021.3.15

大渕 博宣

2022.3.30

大渕 博宣

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