名古屋大学情報基盤センター
共同利用システム速報

No.1922021 年 6 月 23 日発行

１.スーパーコンピュータ「不老」の定期保守について（再掲）・・・・・・・・・【１】２.【重要】TypeI サブシステム（FX1000）ノード割り当て方法の変更について・・・・【１】
３. 2020 年度(令和 2 年度)名古屋大学 HPC 計算科学連携研究プロジェクト成果報告会・【３】
４.利用者講習会・利用説明会の開催について・・・・・・・・・・・・・・・【３】５.ポータブル型 3D スキャナの利用サービス開始のお知らせ・・・・・・・・・・・・【３】
６. Singularity バージョンアップのお知らせ（再掲）・・・・・・・・・・・・・・・【４】

１.スーパーコンピュータ「不老」の定期保守について（再掲）スーパーコンピュータ「不老」（すべてのサブシステム）の定期保守作業を、下記日程で行います。
【すべてのサブシステム：TypeⅠ、TypeⅡ、TypeⅢ、クラウドシステム】
日時：2021 年 7 月 14 日（水）8：00～2021 年 7 月 15 日（木）20：00

保守時間内は計算サービスを停止いたします。
作業終了後、計算サービスは開始いたします。
利用者の皆様にはご迷惑をお掛けいたしますが、よろしくお願いいたします。

２.【重要】TypeⅠサブシステム（FX1000）ノード割り当て方法の変更についてTypeI サブシステム（FX1000）のジョブ投入時、資源オプションのノード割り当て方につきまして、省略時（標準）の設定が次回定期保守後（7 月 15 日（木）20:00 以降）「noncont :離散割り当て」に変更となります。
から、参考に投入時の資源オプション例の比較表を以下に示します。

1

ジョブ投入時、資源オプション
次回定期保守前

次回定期保守後

7 月 1４日（水）08:00 以前に投入した

7 月 15 日（木）20:00 以降に投入したジジョブ

ョブ

-L-L

node=<shape>:[torus|mesh|noncount]node=<shape>:[torus|mesh|noncount](標準:torus)(標準: noncont)torus :トーラスモード (標準)

torus :トーラスモード

mesh :メッシュモード

mesh :メッシュモード

noncont :離散割り当て

noncont :離散割り当て(標準)省略時は、torus

省略時は、noncont

ジョブスクリプト例：トーラスモード

ジョブスクリプト例：離散割り当てとなとなります。

ります。

$ cat multi-mpi.sh$ cat multi-mpi.sh#!/bin/sh#!/bin/sh#------ pjsub option --------##------ pjsub option --------##PJM -L rscunit=fx#PJM -L rscunit=fx#PJM -L rscgrp=fx-small#PJM -L rscgrp=fx-small#PJM -L node=2x6#PJM -L node=2x6#PJM --mpi proc=576#PJM --mpi proc=576#PJM -L elapse=1:00:00#PJM -L elapse=1:00:00#PJM -j#PJM -j#------- Program execution -------##------- Program execution -------#

mpiexec ./a.out

mpiexec ./a.out

・torus
通信性能が最大化される可能性が高い
12 ノード単位で割り当てる
12 ノード単位で固まって確保できないと割り当てられない為、12 ノード単位で切り上げてポイント消費される
・noncont
使いたいノード数分だけ割り当てるので無駄がない
混雑時もジョブ待ち時間が短くなる可能性がある※mesh や torus を指定する場合、実行したい TOFU 形状を明示する必要があります。
例： 2 次元(node=N1xN2:mesh) 3 次元(node=N1xN2xN3:torus)
2※ノード割り当て方法の詳細は、HPCPortal の「マニュアル」－「利用手引き書」－「TypeI 利用手引き書」－P.51「5.3.2. ジョブ資源オプション」 を参考ください。

３.2020 年度(令和 2 年度)名古屋大学 HPC 計算科学連携研究プロジェクト成果報告会
日時：2021 年 7 月 30 日(金) 13:00～17:05
場所：オンライン（Zoom + Slack）
主催：名古屋大学 情報基盤センター、宇宙地球環境研究所
新型コロナウイルス感染症対策のため、本年度の成果報告会は Zoom と Slackを用いて行います Zoom でライブ配信を行うとともに、Slack で議論が行えるようにします。
皆様のご参加をお待ちしています。
名古屋大学 HPC 計算科学連携研究プロジェクト：
https://cidas.isee.nagoya-u.ac.jp/Nagoya_HPC/
申し込み：https://icts.nagoya-u.ac.jp/ja/sc/news/event/2021-07-30-nhpc.html
４.利用者講習会・利用説明会の開催について
７月開催の講習会・利用説明会は下記のとおりです。
（１） 第 17 回スーパーコンピュータ「不老」利用型講習会
数値計算ライブラリ（初級）2021 年 7 月 5 日（月）10:00～17:30 オンライン開催（２） 第 18 回スーパーコンピュータ「不老」利用型講習会
OpenFOAM（初級）2021 年 7 月 6 日（火）10:00～18:00 オンライン開催「富岳」と同型の TypeⅠサブシステム（FX）を実際に使用した講習会です。
どちらも参加費は無料です。
詳細・申し込みは下記 URL をご参照ください。
http://www.icts.nagoya-u.ac.jp/ja/sc/

５.ポータブル型 3D スキャナの利用サービス開始のお知らせ
名古屋大学情報基盤センターでは、昨年度購入しましたポータブル型 3D スキャナ
「F6 SMART」の利用サービスを 7 月中旬より開始いたします。
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この 3D スキャナは、リバースエンジニアリングや解析モデルの生成等に利用できます。
https://ftr.co.jp/solution/hardware/f6_smart/利用開始にあたり講習会も予定しています。決まり次第、ホームページなどでお知らせいたします。
スーパーコンピュータ「不老」の利用者でしたら、どなたでもご利用いただけます。
ポータブル型 3D スキャナのご質問などは下記までお願いいたします。
問合せ先：名古屋大学情報推進部情報基盤課 共同利用担当（高橋・山田）
電子メール：kyodo@itc.nagoya-u.ac.jp
電話番号：052-789-4353

６.Singularity バージョンアップのお知らせ（再掲）
TypeⅡサブシステム/クラウドシステム（バッチジョブ実行）にて利用可能なSingularity につきまして、次回定期保守後（7 月 15 日（木）20:00 以降）からバージョンアップいたします。
・Singularity v3.5.3(module load singularity/3.5.3)→公開停止
・Singularity v3.7.3(module load singularity/3.7.3)→新規公開
・Singularity v3.7.1(module load singularity/3.7.1)→変更なし
設定：module load singularity/3.7.3 をご使用ください。
（module load singularity としても、3.7.3 が default としてロードされます。）【発行】
名古屋大学情報推進部情報基盤課 共同利用担当
電 話：052-789-4353
メール：kyodo@itc.nagoya-u.ac.jp

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